View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11411_low_18 (Length: 238)

Name: NF11411_low_18
Description: NF11411
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11411_low_18
NF11411_low_18
[»] chr4 (32 HSPs)
chr4 (19-225)||(12570095-12570301)
chr4 (5-225)||(23843559-23843772)
chr4 (5-163)||(44675767-44675926)
chr4 (5-206)||(13569608-13569806)
chr4 (5-145)||(15093926-15094067)
chr4 (1-166)||(16487899-16488064)
chr4 (5-156)||(15124979-15125130)
chr4 (1-166)||(16356774-16356938)
chr4 (1-166)||(16348486-16348650)
chr4 (61-163)||(15353188-15353290)
chr4 (61-163)||(5338862-5338964)
chr4 (19-164)||(15121642-15121786)
chr4 (61-163)||(36133844-36133945)
chr4 (61-164)||(17810394-17810496)
chr4 (61-164)||(25555638-25555741)
chr4 (61-164)||(11250442-11250545)
chr4 (61-164)||(14757304-14757406)
chr4 (61-164)||(16351730-16351833)
chr4 (61-161)||(43256043-43256141)
chr4 (61-164)||(27534148-27534250)
chr4 (105-166)||(10712639-10712700)
chr4 (105-166)||(10926409-10926470)
chr4 (105-166)||(12487494-12487555)
chr4 (109-166)||(14954433-14954490)
chr4 (109-166)||(25689653-25689710)
chr4 (105-166)||(43256339-43256400)
chr4 (99-178)||(9556638-9556716)
chr4 (127-166)||(13812966-13813005)
chr4 (127-166)||(20157407-20157446)
chr4 (99-164)||(4561254-4561318)
chr4 (99-164)||(5756858-5756922)
chr4 (127-164)||(22634369-22634406)
[»] chr8 (35 HSPs)
chr8 (19-225)||(24755795-24756001)
chr8 (1-224)||(16184802-16185026)
chr8 (40-225)||(377352-377537)
chr8 (5-225)||(21168546-21168767)
chr8 (41-225)||(19259443-19259627)
chr8 (13-225)||(19983174-19983379)
chr8 (5-163)||(19899230-19899389)
chr8 (5-225)||(21161883-21162094)
chr8 (1-166)||(30643112-30643278)
chr8 (5-225)||(17353762-17353979)
chr8 (40-166)||(20465899-20466025)
chr8 (1-166)||(17926528-17926692)
chr8 (1-166)||(16410076-16410240)
chr8 (3-166)||(15602840-15603003)
chr8 (3-166)||(15611292-15611455)
chr8 (5-120)||(23776659-23776775)
chr8 (5-97)||(19976647-19976739)
chr8 (20-108)||(21395822-21395910)
chr8 (20-108)||(21790315-21790403)
chr8 (61-164)||(20856306-20856409)
chr8 (20-108)||(21389292-21389380)
chr8 (80-166)||(22010579-22010664)
chr8 (61-166)||(16861208-16861312)
chr8 (105-166)||(21828276-21828337)
chr8 (105-166)||(14398035-14398096)
chr8 (109-166)||(18862911-18862968)
chr8 (105-166)||(21410733-21410794)
chr8 (105-166)||(21805225-21805286)
chr8 (117-163)||(39094861-39094907)
chr8 (99-164)||(19278203-19278267)
chr8 (99-164)||(21972505-21972569)
chr8 (99-164)||(21976590-21976654)
chr8 (99-164)||(22111973-22112037)
chr8 (99-164)||(43251935-43251999)
chr8 (61-93)||(39094823-39094855)
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (19-225)||(15894268-15894474)
chr6 (16-225)||(21739858-21740067)
chr6 (16-166)||(18907241-18907391)
chr6 (5-225)||(19863059-19863274)
chr6 (5-164)||(25642008-25642168)
chr6 (5-187)||(19873237-19873416)
chr6 (1-166)||(21834711-21834874)
chr6 (1-187)||(22334712-22334896)
chr6 (5-212)||(22438892-22439096)
chr6 (5-212)||(22432342-22432546)
chr6 (1-108)||(16523224-16523331)
chr6 (61-164)||(17804319-17804421)
chr6 (61-164)||(19790660-19790763)
chr6 (61-164)||(20907863-20907966)
chr6 (61-164)||(22863068-22863170)
chr6 (80-166)||(18180623-18180708)
chr6 (61-163)||(23657302-23657403)
chr6 (72-164)||(22429923-22430014)
chr6 (61-164)||(14472392-14472494)
chr6 (61-164)||(25767050-25767152)
chr6 (73-163)||(27567503-27567593)
chr6 (105-166)||(16760078-16760139)
chr6 (20-77)||(31164687-31164744)
chr6 (105-166)||(31478072-31478133)
chr6 (61-145)||(27415824-27415907)
chr6 (61-164)||(18955645-18955747)
chr6 (80-166)||(22408205-22408290)
chr6 (105-166)||(1644491-1644552)
chr6 (21-110)||(15041391-15041480)
chr6 (125-166)||(16523330-16523371)
chr6 (109-166)||(22948891-22948948)
chr6 (109-166)||(22952847-22952904)
chr6 (105-166)||(23414763-23414824)
chr6 (109-166)||(23871335-23871392)
chr6 (109-166)||(23875291-23875348)
chr6 (105-178)||(27416120-27416193)
chr6 (105-166)||(27556521-27556582)
chr6 (82-149)||(22059645-22059712)
chr6 (120-166)||(14472054-14472100)
chr6 (120-166)||(18956040-18956086)
chr6 (99-164)||(1644827-1644891)
chr6 (99-164)||(11566984-11567048)
chr6 (20-77)||(16924719-16924776)
chr6 (99-164)||(19870712-19870776)
chr6 (99-164)||(23395190-23395254)
chr6 (99-164)||(23990042-23990106)
chr6 (128-164)||(8243983-8244019)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (19-224)||(34749-34954)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (1-225)||(2913-3137)
scaffold0158 (1-225)||(6579-6803)
[»] chr3 (58 HSPs)
chr3 (5-225)||(15060365-15060585)
chr3 (1-225)||(23052898-23053123)
chr3 (1-225)||(15051589-15051813)
chr3 (40-225)||(16909823-16910008)
chr3 (13-225)||(14878338-14878552)
chr3 (40-225)||(16369481-16369666)
chr3 (5-225)||(17524977-17525194)
chr3 (5-225)||(23408509-23408726)
chr3 (95-225)||(12172877-12173007)
chr3 (1-166)||(18383738-18383903)
chr3 (3-166)||(322721-322884)
chr3 (1-166)||(12496388-12496552)
chr3 (1-166)||(19725733-19725898)
chr3 (13-225)||(23077311-23077513)
chr3 (5-166)||(11862923-11863084)
chr3 (1-166)||(11298350-11298514)
chr3 (5-179)||(11851698-11851866)
chr3 (61-164)||(1982692-1982794)
chr3 (61-163)||(3389817-3389919)
chr3 (50-163)||(12037823-12037936)
chr3 (61-163)||(3402837-3402939)
chr3 (40-164)||(327025-327148)
chr3 (5-120)||(856314-856429)
chr3 (61-164)||(11557266-11557369)
chr3 (61-164)||(11595020-11595123)
chr3 (61-164)||(15482785-15482887)
chr3 (61-164)||(20461382-20461484)
chr3 (5-79)||(15877653-15877727)
chr3 (61-164)||(7793231-7793333)
chr3 (61-164)||(14499450-14499552)
chr3 (74-160)||(2897718-2897803)
chr3 (44-110)||(14179624-14179690)
chr3 (80-225)||(15877947-15878087)
chr3 (61-164)||(30066071-30066173)
chr3 (61-164)||(42326074-42326177)
chr3 (66-164)||(55022992-55023089)
chr3 (61-164)||(11070193-11070295)
chr3 (61-164)||(11854858-11854960)
chr3 (105-166)||(4589035-4589096)
chr3 (105-166)||(5223182-5223243)
chr3 (105-166)||(12339584-12339645)
chr3 (109-166)||(15964755-15964812)
chr3 (109-166)||(15968679-15968736)
chr3 (109-166)||(15972603-15972660)
chr3 (105-166)||(19775551-19775612)
chr3 (105-166)||(37439898-37439959)
chr3 (61-164)||(11165411-11165513)
chr3 (61-164)||(11300393-11300495)
chr3 (1-55)||(12173029-12173083)
chr3 (105-166)||(11300692-11300753)
chr3 (105-166)||(15464983-15465044)
chr3 (127-166)||(14665531-14665570)
chr3 (99-164)||(7109823-7109887)
chr3 (99-164)||(7113758-7113822)
chr3 (99-164)||(22321789-22321853)
chr3 (99-164)||(22336844-22336908)
chr3 (99-164)||(27409564-27409628)
chr3 (99-164)||(28949849-28949913)
[»] chr2 (35 HSPs)
chr2 (1-225)||(24673650-24673874)
chr2 (5-187)||(22758540-22758719)
chr2 (5-145)||(22798951-22799092)
chr2 (5-164)||(22740785-22740945)
chr2 (5-225)||(23038112-23038329)
chr2 (1-152)||(21918137-21918288)
chr2 (1-166)||(25963538-25963702)
chr2 (5-164)||(22811737-22811896)
chr2 (5-139)||(23019531-23019666)
chr2 (5-120)||(40622033-40622148)
chr2 (134-225)||(45678074-45678165)
chr2 (60-163)||(40428597-40428700)
chr2 (37-187)||(23103253-23103400)
chr2 (1-144)||(37524820-37524962)
chr2 (61-164)||(25961416-25961518)
chr2 (61-164)||(19688638-19688740)
chr2 (61-164)||(24174932-24175035)
chr2 (61-164)||(24655220-24655323)
chr2 (61-164)||(24735525-24735627)
chr2 (16-103)||(45677991-45678078)
chr2 (62-163)||(21327449-21327550)
chr2 (61-164)||(10101527-10101629)
chr2 (61-160)||(24716412-24716510)
chr2 (62-163)||(21318518-21318619)
chr2 (105-160)||(41531266-41531321)
chr2 (105-166)||(30345253-30345314)
chr2 (61-160)||(24870016-24870115)
chr2 (105-166)||(1283172-1283233)
chr2 (105-166)||(31344995-31345056)
chr2 (82-149)||(44370201-44370268)
chr2 (99-164)||(12901432-12901496)
chr2 (99-164)||(15477725-15477789)
chr2 (99-164)||(24649479-24649543)
chr2 (99-164)||(27601918-27601982)
chr2 (99-164)||(41530930-41530994)
[»] chr1 (32 HSPs)
chr1 (1-225)||(6151929-6152153)
chr1 (5-225)||(42865036-42865249)
chr1 (16-222)||(22831214-22831419)
chr1 (38-225)||(21022712-21022899)
chr1 (20-225)||(21714627-21714829)
chr1 (5-166)||(18181946-18182107)
chr1 (40-166)||(22449126-22449252)
chr1 (13-187)||(20091306-20091477)
chr1 (19-145)||(21787881-21788008)
chr1 (1-166)||(3472747-3472911)
chr1 (61-163)||(18393845-18393947)
chr1 (5-110)||(48603706-48603811)
chr1 (61-163)||(45310248-45310350)
chr1 (73-163)||(8761526-8761616)
chr1 (80-164)||(24783001-24783084)
chr1 (61-164)||(45489624-45489727)
chr1 (61-164)||(3704946-3705049)
chr1 (61-164)||(16080326-16080428)
chr1 (80-166)||(17678488-17678573)
chr1 (61-164)||(1010845-1010947)
chr1 (61-145)||(33797674-33797757)
chr1 (61-164)||(36819190-36819292)
chr1 (105-166)||(1925391-1925452)
chr1 (105-166)||(20229071-20229132)
chr1 (105-166)||(20924405-20924466)
chr1 (5-110)||(22468521-22468626)
chr1 (105-158)||(33797408-33797461)
chr1 (99-164)||(16375378-16375442)
chr1 (61-138)||(19212015-19212091)
chr1 (99-164)||(20228729-20228793)
chr1 (99-164)||(21407477-21407541)
chr1 (99-164)||(52639663-52639727)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (19-225)||(13916-14122)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (16-225)||(6914-7123)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (5-225)||(6176-6397)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (26-225)||(14745-14945)
scaffold0081 (26-225)||(23760-23960)
scaffold0081 (26-225)||(39184-39384)
[»] chr5 (40 HSPs)
chr5 (16-225)||(23501181-23501391)
chr5 (5-225)||(23201441-23201663)
chr5 (5-163)||(14079283-14079442)
chr5 (5-225)||(23512179-23512401)
chr5 (1-166)||(21366487-21366652)
chr5 (5-145)||(21873402-21873543)
chr5 (5-187)||(37724019-37724198)
chr5 (1-178)||(20805669-20805845)
chr5 (26-225)||(26704156-26704339)
chr5 (26-225)||(26973889-26974072)
chr5 (61-178)||(20767091-20767207)
chr5 (61-166)||(23458721-23458825)
chr5 (61-166)||(23462982-23463086)
chr5 (40-120)||(18769864-18769944)
chr5 (40-108)||(22032507-22032575)
chr5 (61-164)||(123187-123289)
chr5 (61-164)||(12028446-12028549)
chr5 (61-166)||(23451477-23451581)
chr5 (61-164)||(24222009-24222112)
chr5 (40-164)||(23572215-23572338)
chr5 (73-164)||(22757258-22757349)
chr5 (105-166)||(11220531-11220592)
chr5 (105-166)||(11225117-11225178)
chr5 (105-166)||(11228940-11229001)
chr5 (105-166)||(11230929-11230990)
chr5 (61-164)||(15236662-15236764)
chr5 (66-145)||(18356468-18356546)
chr5 (105-166)||(11226950-11227011)
chr5 (105-166)||(18356075-18356136)
chr5 (105-166)||(20911097-20911158)
chr5 (107-166)||(10753147-10753206)
chr5 (105-160)||(40723849-40723904)
chr5 (97-163)||(17919069-17919134)
chr5 (124-164)||(17410562-17410602)
chr5 (127-166)||(24767493-24767532)
chr5 (121-164)||(31342258-31342301)
chr5 (99-164)||(20295969-20296033)
chr5 (56-145)||(20910677-20910765)
chr5 (61-164)||(26680715-26680815)
chr5 (61-164)||(26952322-26952422)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (5-225)||(15494-15711)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (5-166)||(46552-46713)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (5-225)||(18317-18534)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (5-225)||(3823-4035)
scaffold0149 (5-225)||(8254-8466)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (5-225)||(9703344-9703561)
chr7 (16-166)||(12321578-12321728)
chr7 (1-166)||(14430012-14430177)
chr7 (20-225)||(18154676-18154877)
chr7 (19-211)||(24054560-24054749)
chr7 (8-225)||(19649312-19649525)
chr7 (5-93)||(11880459-11880547)
chr7 (61-164)||(3271955-3272058)
chr7 (61-164)||(12318249-12318351)
chr7 (61-164)||(15605154-15605256)
chr7 (5-120)||(17137888-17138003)
chr7 (61-164)||(11312770-11312872)
chr7 (61-164)||(16583378-16583479)
chr7 (40-108)||(12187205-12187273)
chr7 (72-164)||(15580813-15580904)
chr7 (61-164)||(33229-33331)
chr7 (61-164)||(70647-70749)
chr7 (61-164)||(74756-74858)
chr7 (61-164)||(9446040-9446143)
chr7 (80-163)||(2760265-2760347)
chr7 (61-164)||(13635351-13635453)
chr7 (61-164)||(20569477-20569580)
chr7 (105-166)||(15083979-15084040)
chr7 (105-166)||(39722049-39722110)
chr7 (61-142)||(42205257-42205338)
chr7 (109-166)||(45170272-45170329)
chr7 (107-166)||(25927431-25927490)
chr7 (127-178)||(39267847-39267898)
chr7 (105-166)||(1859012-1859073)
chr7 (105-166)||(13918706-13918767)
chr7 (99-164)||(39722388-39722452)
chr7 (80-139)||(2530044-2530102)
chr7 (105-160)||(2530316-2530371)
chr7 (127-166)||(2832389-2832428)
chr7 (127-166)||(9751703-9751742)
chr7 (99-164)||(12714986-12715050)
chr7 (99-164)||(12718790-12718854)
chr7 (99-164)||(12723701-12723765)
chr7 (99-164)||(16114363-16114427)
chr7 (99-164)||(16117516-16117580)
chr7 (99-164)||(16907121-16907185)
chr7 (99-164)||(18279525-18279589)
chr7 (99-164)||(18283488-18283552)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (5-225)||(8782-8999)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (5-225)||(32516-32728)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (1-166)||(6130-6295)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (1-166)||(21390-21555)
scaffold0037 (105-166)||(80616-80677)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (5-225)||(69875-70090)
scaffold0004 (66-164)||(10471-10568)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (5-186)||(18278-18456)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (5-225)||(65618-65834)
scaffold0031 (61-164)||(53687-53789)
scaffold0031 (105-166)||(36348-36409)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (5-166)||(290-451)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (1-166)||(1623-1788)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (27-225)||(4780-4979)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (26-225)||(20061-20256)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (5-225)||(1420-1634)
[»] scaffold1296 (1 HSPs)
scaffold1296 (1-166)||(523-688)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (26-225)||(36535-36731)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (5-145)||(16174-16315)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (40-166)||(18516-18642)
[»] scaffold1895 (1 HSPs)
scaffold1895 (5-145)||(1052-1193)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (61-166)||(15216-15321)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (47-166)||(42752-42871)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (13-164)||(715-868)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (1-166)||(6237-6401)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (1-166)||(1027-1191)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (1-166)||(1960-2124)
scaffold0104 (1-166)||(9642-9806)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (1-166)||(44211-44375)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (19-139)||(38318-38439)
scaffold0023 (19-139)||(23506-23626)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (20-187)||(174882-175046)
[»] scaffold1326 (1 HSPs)
scaffold1326 (63-166)||(1373-1476)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (16-166)||(1920-2071)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (5-186)||(48285-48464)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (61-166)||(4560-4665)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (49-225)||(23924-24094)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (5-120)||(27002-27117)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (61-163)||(5719-5820)
scaffold0476 (61-163)||(6914-7015)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (61-163)||(19173-19275)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (60-163)||(192197-192300)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (61-163)||(4106-4208)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (5-120)||(21631-21746)
scaffold0210 (5-120)||(29523-29638)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (143-221)||(7771-7849)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (61-163)||(2317-2419)
scaffold0439 (61-163)||(10177-10279)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (62-163)||(35393-35494)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (60-160)||(15090-15190)
scaffold0017 (60-160)||(19612-19712)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (76-164)||(413947-414035)
scaffold0003 (61-145)||(71454-71537)
scaffold0003 (105-158)||(71188-71241)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (61-164)||(7603-7706)
[»] scaffold1220 (1 HSPs)
scaffold1220 (61-166)||(1922-2026)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (40-120)||(2055-2135)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (61-164)||(8693-8796)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (61-164)||(66297-66399)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (61-130)||(445-514)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (87-166)||(17019-17097)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (65-139)||(4690-4764)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (61-164)||(13026-13128)
scaffold0044 (80-161)||(19313-19393)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (61-164)||(422413-422516)
scaffold0001 (72-164)||(173412-173503)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (72-166)||(30637-30730)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (61-161)||(13369-13468)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (40-120)||(7469-7549)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (61-164)||(12544-12646)
[»] scaffold0029 (5 HSPs)
scaffold0029 (61-164)||(80834-80936)
scaffold0029 (40-164)||(12894-13017)
scaffold0029 (105-166)||(80498-80559)
scaffold0029 (99-164)||(61532-61596)
scaffold0029 (99-164)||(65448-65512)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (98-164)||(18551-18616)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (105-166)||(14349-14410)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (105-166)||(207764-207825)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (105-166)||(189639-189700)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (61-157)||(9547-9642)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (5-57)||(15643-15695)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (61-164)||(3757-3859)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (61-131)||(485-555)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (61-163)||(7152-7253)
[»] scaffold0109 (3 HSPs)
scaffold0109 (61-131)||(45272-45342)
scaffold0109 (105-166)||(36202-36263)
scaffold0109 (99-164)||(35863-35927)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (105-166)||(6798-6859)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (105-166)||(32922-32983)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (105-166)||(31002-31063)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (61-157)||(19899-19994)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (105-159)||(20391-20445)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (105-166)||(11763-11824)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (73-164)||(11511-11592)
[»] scaffold1052 (1 HSPs)
scaffold1052 (127-166)||(3035-3074)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (127-166)||(9990-10029)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (99-164)||(5021-5085)
[»] scaffold0268 (1 HSPs)
scaffold0268 (99-164)||(928-992)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (99-164)||(58639-58703)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (137-166)||(73725-73754)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 32)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12570301 - 12570095
Alignment:
Q  19 ttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatg 118  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12570301 ttgcgacctgtgtcgcataacttgtttagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataggatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatg 12570202  T
Q  119 ttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgcttttatttgatatctttata 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12570201 ttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatgaatgattgagttgatgcttgattttatttgatatctttata 12570102  T
Q  219 tgatgtc 225  Q
    |||||||    
T  12570101 tgatgtc 12570095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23843772 - 23843559
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23843772 tgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtggtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 23843673  T
Q  105 gctgttatgaaatgttaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgctttta 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    || |||||||| |||||||| ||    |||||||||    
T  23843672 gctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgttttaatgattaattgtattacttga----gttatgaatgagtgattgagatg----ttgctttta 23843581  T
Q  204 tttgatatctttatatgatgtc 225  Q
    ||||||||| |||| |||||||    
T  23843580 tttgatatcgttatgtgatgtc 23843559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 44675926 - 44675767
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  44675926 tgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctaggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaa 44675827  T
Q  105 gctgttatgaaatgttaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttga 163  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44675826 gctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaatgattaattgcattacttga 44675767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13569806 - 13569608
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13569806 tgcaagtgaggatattgcgatccgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtattaatgtgacctatataagaagttaactgcaatctgtgaa 13569707  T
Q  105 gctgttatgaaatgttaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgctttta 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  13569706 gctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgtttaattgcattacttgaa----ttatgaatgaatgattgagatgatgcttactttta 13569611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 15094067 - 15093926
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15094067 tgcaagttaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttggttagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatctctgaa 15093968  T
Q  105 gctgttatgaaatgttaa-gttgattataatgtgatttaatg 145  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||    
T  15093967 gctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatg 15093926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 16487899 - 16488064
Alignment:
Q  1 tgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| | ||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||    
T  16487899 tgaatgcaagttaggatgttgcgatctgtttcgcataagttgatttgggatggacccttaggtagtaatgtgtcctatttaagatgttaattgagatctg 16487998  T
Q  101 tgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    |||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16487999 tgaagctactatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaat 16488064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 156
Target Start/End: Original strand, 15124979 - 15125130
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| ||||| || |||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  15124979 tgcaagtgaggatatttcgatatgtgtcgcataatttgtttagagttggacccctgggtagtaaagtgacctttttaa-atgttaactgcaatctgtgaa 15125077  T
Q  105 gctgttatgaaatgttaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcat 156  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15125078 gctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcat 15125130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 16356774 - 16356938
Alignment:
Q  1 tgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16356774 tgaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcgcataagttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctg 16356873  T
Q  101 tgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    |||||||||| |||| || ||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16356874 tgaagctgtt-tgaactgctaagttttttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaat 16356938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 16348486 - 16348650
Alignment:
Q  1 tgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16348486 tgaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcgcataagttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctg 16348585  T
Q  101 tgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||| || | || || ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  16348586 tgaagct-ttttaaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttaaaat 16348650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 163
Target Start/End: Original strand, 15353188 - 15353290
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15353188 ggtagtaatgaaacctatctaagatgttaactggaatttgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattact 15353287  T
Q  161 tga 163  Q
    |||    
T  15353288 tga 15353290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 163
Target Start/End: Original strand, 5338862 - 5338964
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||   ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  5338862 ggtagtagtgagacctatataagatgttaaatgaaatctgagaagctgttatgaaccattaagctgattatgatgtgatttattgattaattgcattact 5338961  T
Q  161 tga 163  Q
    |||    
T  5338962 tga 5338964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 164
Target Start/End: Original strand, 15121642 - 15121786
Alignment:
Q  19 ttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatg 118  Q
    |||||| |||||||| |||| ||| ||||| |||||||  | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||    
T  15121642 ttgcgatctgtgtcgaataacttgtttagacatggaccattaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaggctgatatgagatg 15121741  T
Q  119 -ttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
     || |||||||||| ||||  | ||||| |||  |||||||||||||    
T  15121742 tttgagttgattatgatgtattataatgttta--tgcattacttgaa 15121786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 163
Target Start/End: Original strand, 36133844 - 36133945
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||||||  | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  36133844 ggtattaatgagacctatttaagatattaactgggaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattact 36133942  T
Q  161 tga 163  Q
    |||    
T  36133943 tga 36133945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 17810496 - 17810394
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |  ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  17810496 ggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgttaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattact 17810398  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  17810397 tgaa 17810394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 25555741 - 25555638
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||||||  || ||| ||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  25555741 ggtagtaatgaaacttatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattact 25555642  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  25555641 tgaa 25555638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Original strand, 11250442 - 11250545
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  11250442 ggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacctatgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattaca 11250541  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  11250542 tgaa 11250545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Original strand, 14757304 - 14757406
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  14757304 ggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattact 14757402  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  14757403 tgaa 14757406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Original strand, 16351730 - 16351833
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||| | | ||| ||||||| | ||| ||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  16351730 ggtagtaatgaaacctatttaagatgttagccggaatttgtgaagtttttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattact 16351829  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  16351830 tgaa 16351833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 161
Target Start/End: Original strand, 43256043 - 43256141
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||  | |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||    
T  43256043 ggtactaatgagacctatttaagatgttaactgggaactgtgaagctattgtgaaatgttaag-tgattataatgtgatataat-attatatgcattact 43256140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 27534250 - 27534148
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||| ||||| ||||||| | ||||||||||||  |  ||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27534250 ggtactaatgagacctatctgagatgttaactgttaattgtgaagctatattgaaatgctaagttg-ttataatgtgatttattgattgattgcattact 27534152  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  27534151 tgaa 27534148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 10712700 - 10712639
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10712700 gctgttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 10712639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 10926470 - 10926409
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10926470 gctgttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 10926409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 12487555 - 12487494
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  12487555 gctgttatgaactgctaagttgtttttaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 12487494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 166
Target Start/End: Original strand, 14954433 - 14954490
Alignment:
Q  109 ttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14954433 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 14954490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 25689710 - 25689653
Alignment:
Q  109 ttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  25689710 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 25689653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Original strand, 43256339 - 43256400
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  43256339 gctgttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 43256400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 9556716 - 9556638
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatga 178  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  9556716 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattagtattgaatga 9556638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 166
Target Start/End: Original strand, 13812966 - 13813005
Alignment:
Q  127 attataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13812966 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaat 13813005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 166
Target Start/End: Original strand, 20157407 - 20157446
Alignment:
Q  127 attataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  20157407 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaat 20157446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Original strand, 4561254 - 4561318
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  4561254 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 4561318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Original strand, 5756858 - 5756922
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  5756858 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 5756922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 164
Target Start/End: Original strand, 22634369 - 22634406
Alignment:
Q  127 attataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  22634369 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaa 22634406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 35)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24756001 - 24755795
Alignment:
Q  19 ttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatg 118  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24756001 ttgcgacctgtgtcgcataacttgtttagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataggatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatg 24755902  T
Q  119 ttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgcttttatttgatatctttata 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  24755901 ttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatgaatgattgagttgatgcttgatttaatttgatatctttata 24755802  T
Q  219 tgatgtc 225  Q
    |||||||    
T  24755801 tgatgtc 24755795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16185026 - 16184802
Alignment:
Q  1 tgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16185026 tgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctg 16184927  T
Q  101 tgaagctgttatgaaatgttaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgct 199  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16184926 tgaagctgatatgagatgttaatgttgattataatgtgatttaatgtttaattgcattgcttgaaatgttaataaatgaatgattgagatgatgcttgct 16184827  T
Q  200 tttatttgatatctttatatgatgt 224  Q
    ||||||| |||||| || |||||||    
T  16184826 tttatttaatatctctacatgatgt 16184802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 40 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 377537 - 377352
Alignment:
Q  40 ttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgat 139  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  377537 ttgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgatcataatgtgat 377438  T
Q  140 ttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgcttttatttgatatctttatatgatgtc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  377437 ttaatgattaattgcattacttgagatgttaatgaatgaatgattgagttgatgcttgcttctatttgatatctttacatgatgtc 377352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Original strand, 21168546 - 21168767
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  21168546 tgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcatagtttgattagagatggacctttgggtagtaatataacctatacaagaagttaactgcaatctgtgaa 21168645  T
Q  105 gctgttatgaaatgttaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgctttta 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |  | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21168646 gctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtaagatgatgtttaattgcattacttgaaatgttaatgaatgaatgattgagatgatgcttgctttta 21168745  T
Q  204 tttgatatctttatatgatgtc 225  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21168746 tttgatatctttatatgatgtc 21168767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 41 - 225
Target Start/End: Original strand, 19259443 - 19259627
Alignment:
Q  41 tgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatt 140  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19259443 tgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctatacaagatgttaactgcaatctgtgaagctattatgaactgttaagttgattataatgtgatt 19259542  T
Q  141 taatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgcttttatttgatatctttatatgatgtc 225  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19259543 taatgattaatttcattacttgagatgttaatgaatgaatgattgagttgatgcttgcttttatttgatatccctatatgatgtc 19259627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19983379 - 19983174
Alignment:
Q  13 aggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttat 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19983379 aggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggaaccctgggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttat 19983280  T
Q  113 gaaatgttaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgcttttatttgatat 211  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    || |||||||| |||||||  ||    |||||||||||||||||    
T  19983279 gaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaatgattaattgcattacttga----gttatgaatgagtgattgaaatg----ttgcttttatttgatat 19983188  T
Q  212 ctttatatgatgtc 225  Q
    | |||| |||||||    
T  19983187 cgttatgtgatgtc 19983174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 19899389 - 19899230
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19899389 tgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaa 19899290  T
Q  105 gctgttatgaaatgttaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttga 163  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19899289 gctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaatgattaatttcattacttga 19899230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Original strand, 21161883 - 21162094
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  21161883 tgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgtatagtttgattagagatggacctttgggtagtaatataacctatacaagaagttaactgcaatctgtgaa 21161982  T
Q  105 gctgttatgaaatgttaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgctttta 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||          ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21161983 gctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgt----------ttaattgcattacttgaaatgttaataaatgaatgattgagatgatgcttgctttta 21162072  T
Q  204 tttgatatctttatatgatgtc 225  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21162073 tttgatatctttatatgatgtc 21162094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 30643112 - 30643278
Alignment:
Q  1 tgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30643112 tgaatgcaagttaggatgttgcgatctgtttcgcacaaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgcaatctg 30643211  T
Q  101 tg-aagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30643212 tgaaagctgttacgaactgttaagttgattataatatgatttaatgattaattgcattacttgaaat 30643278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Original strand, 17353762 - 17353979
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  17353762 tgcaagtgaggatattgcgatttgtgtcgcataattcgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaa 17353861  T
Q  105 gctgttatgaaatg-ttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgctttta 203  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||  | ||| || ||| |||||||||||    | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  17353862 gctgttatgaaatgtttatgttgaatatgatgtgagatgatgtttgatttcattacttgaa----ttatgaatgaatgattgagatgatgcttgcttgta 17353957  T
Q  204 tttgatatctttatatgatgtc 225  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  17353958 tttgatatcgttatatgatgtc 17353979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 40 - 166
Target Start/End: Original strand, 20465899 - 20466025
Alignment:
Q  40 ttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgat 139  Q
    |||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20465899 ttgattagggacggacccttaggtagtaatgtgacctatataagaggttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgctaagttgattataatgtgat 20465998  T
Q  140 ttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  20465999 ttaatgattaattgcattacttgaaat 20466025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 17926528 - 17926692
Alignment:
Q  1 tgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctg 100  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  17926528 tgaatgcaaattagtatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaattgaaatctg 17926627  T
Q  101 tgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    |||||||||| |||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17926628 tgaagctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaat 17926692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 16410076 - 16410240
Alignment:
Q  1 tgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||    
T  16410076 tgaatgcaaattaggatgttgcgatctgtgtcgcacaaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatattaactgaaatatg 16410175  T
Q  101 tgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||| |||||| |||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16410176 tgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaat 16410240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 15602840 - 15603003
Alignment:
Q  3 aatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtg 102  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||| | ||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15602840 aatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcgcataagttgattagggttggacccttaagtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtg 15602939  T
Q  103 aagctgttatgaaa-tgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    |||||||| ||||| || |||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15602940 aagctgtt-tgaaactgctaagttgtctgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaat 15603003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Original strand, 15611292 - 15611455
Alignment:
Q  3 aatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtg 102  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||| | ||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15611292 aatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcgcataagttgattagggttggacccttaagtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtg 15611391  T
Q  103 aagctgttatgaaa-tgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    |||||||| ||||| |  |||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15611392 aagctgtt-tgaaactactaagttgtctgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaat 15611455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 23776659 - 23776775
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgac-ctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtga 103  Q
    |||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  23776659 tgcaagctaggatattgcgaatctgtgtcgcataatttggttagagatggacacttaggtagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatttgtga 23776758  T
Q  104 agctgttatgaaatgtt 120  Q
    |||||||||||||||||    
T  23776759 agctgttatgaaatgtt 23776775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 19976739 - 19976647
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaat 97  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19976739 tgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggaaccctaggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactgcaat 19976647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 108
Target Start/End: Original strand, 21395822 - 21395910
Alignment:
Q  20 tgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctg 108  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  21395822 tgcgatctgtgtcgcatgatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 21395910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 108
Target Start/End: Original strand, 21790315 - 21790403
Alignment:
Q  20 tgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctg 108  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  21790315 tgcgatctgtgtcgcatgatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 21790403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Original strand, 20856306 - 20856409
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| || |||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20856306 ggtagtaatgtgacctattaaagatgttagctgagatctgtgaacctgttatgaattgctaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattact 20856405  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  20856406 tgaa 20856409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 108
Target Start/End: Original strand, 21389292 - 21389380
Alignment:
Q  20 tgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctg 108  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| || ||||| || ||| ||||||||||    
T  21389292 tgcgatctgtgtcgcatgatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagaccaatatatgaagttaattgtaatatgtgaagctg 21389380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 166
Target Start/End: Original strand, 22010579 - 22010664
Alignment:
Q  80 taagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | |||| |||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22010579 taagatgttaactgaaatctgtgaggttgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaat 22010664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 61 - 166
Target Start/End: Original strand, 16861208 - 16861312
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||| || ||| ||| ||||| |||| ||| ||||||| | |||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16861208 ggtagtagtgagacatatttaagaggttagctgaaatctgtaaggctgtt-tgaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatacattact 16861306  T
Q  161 tgaaat 166  Q
    ||||||    
T  16861307 tgaaat 16861312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Original strand, 21828276 - 21828337
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21828276 gctgttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 21828337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Original strand, 14398035 - 14398096
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14398035 gctgttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 14398096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 166
Target Start/End: Original strand, 18862911 - 18862968
Alignment:
Q  109 ttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18862911 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 18862968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 21410794 - 21410733
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21410794 gctgttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 21410733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 21805286 - 21805225
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21805286 gctgttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 21805225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 163
Target Start/End: Original strand, 39094861 - 39094907
Alignment:
Q  117 tgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttga 163  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  39094861 tgttaagttgtttgtaatgtaatttaatgattaaatgcattacttga 39094907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Original strand, 19278203 - 19278267
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  19278203 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 19278267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Original strand, 21972505 - 21972569
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21972505 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 21972569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Original strand, 21976590 - 21976654
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21976590 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 21976654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 22112037 - 22111973
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  22112037 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 22111973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 43251999 - 43251935
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  43251999 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 43251935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 93
Target Start/End: Original strand, 39094823 - 39094855
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactg 93  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39094823 ggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactg 39094855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 175; Significance: 2e-94; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 15894268 - 15894474
Alignment:
Q  19 ttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatg 118  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15894268 ttgcgtcctgtgtcgcataacttgtttagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataggatgttaactacaatctgtgaagctgttatgaaatg 15894367  T
Q  119 ttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgcttttatttgatatctttata 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15894368 ttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatgaatgattgagttgatgcttgattttatttgatatctttata 15894467  T
Q  219 tgatgtc 225  Q
    |||||||    
T  15894468 tgatgtc 15894474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 16 - 225
Target Start/End: Original strand, 21739858 - 21740067
Alignment:
Q  16 atgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaa 115  Q
    ||||||||| ||||||| ||| | ||| |||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21739858 atgttgcgatctgtgtcacatgagttgtttagggatggactcttaggtagtaatgtgacctatataggatgttaattgcaatctgtgaagctgttatgaa 21739957  T
Q  116 atgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgcttttatttgatatcttt 215  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  21739958 atgttaagctggttataatgtgacttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatgaatgattgagttgatacttgcatctatttgatatcttt 21740057  T
Q  216 atatgatgtc 225  Q
    ||||||||||    
T  21740058 atatgatgtc 21740067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 18907391 - 18907241
Alignment:
Q  16 atgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaa 115  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18907391 atgttgcgatctgtgtcgcatgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgcaatatgtgaagctgttatgaa 18907292  T
Q  116 atgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18907291 ctgttaagttcattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 18907241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19863274 - 19863059
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19863274 tgcaagtaaggatattgcgatctgtgtcacatcatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaa 19863175  T
Q  105 gctgttatgaaatgtta-agttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgctttta 203  Q
    |||||||||| ||||||  ||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| || ||| || |||||    
T  19863174 gctgttatgagatgttagtgttgaatgtgatgtgatataatgattaattgcattacttgaaat----atgaatgaatgattgagatgttgc-tgttttta 19863080  T
Q  204 tttgatatctttatatgatgtc 225  Q
     |||||||| |||| |||||||    
T  19863079 -ttgatatcgttatgtgatgtc 19863059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 164
Target Start/End: Original strand, 25642008 - 25642168
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  25642008 tgcaagtgaggatattgcgaactgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctttgaa 25642107  T
Q  105 gctgttatgaaatgttaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    | |||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25642108 gttgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaa 25642168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 19873416 - 19873237
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19873416 tgcaagtaaggatattgcgatctgtgtcgcatcattttattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaa 19873317  T
Q  105 gctgttatgaaatgtta-agttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgag 187  Q
    |||||||||| ||||||  ||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  19873316 gctgttatgagatgttagtgttgaatgtgatgtgatataatgattaattgcattacttgaaat----atgaatgaatgattgag 19873237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 21834711 - 21834874
Alignment:
Q  1 tgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||| |  |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21834711 tgaatgcaagttaggatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggatggacccttcagtagtaatctgacctatttaagatgttaactgaaatctg 21834810  T
Q  101 tgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    |||||||||  | || || ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  21834811 tgaagctgt--ttaactgctaagttgattataatgtgatttaatgattaaatgtattacttgaaat 21834874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 22334712 - 22334896
Alignment:
Q  1 tgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctg 100  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22334712 tgaatgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagttggacccctgggtagcaatgagacctatataagaagttaactgcaatctg 22334811  T
Q  101 tgaagctgttatgaaatgttaa-gttgattataatgtgatttaatgatt-aattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgag 187  Q
    | |||||||||||| || | || | |||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    | |||||||||||||||||    
T  22334812 taaagctgttatgagatataaatggtgaacataatgtgatttaatgattaaattgcactacttgaa----ttatgaatgaatgattgag 22334896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22439096 - 22438892
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| || || |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22439096 tgcaagtgagaatattgcgatctgtgtcgcataattcgatttgagatggacccttgggtagtaatgagatctatataagaagttaactgcaatctgtgaa 22438997  T
Q  105 gctgttatgaaatgtta-agttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgctttta 203  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||| ||| | |||||| |||||||||||    | | |||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  22438996 gctgttatgagatgttagtgttgattatgatgtgatataaagtttaattacattacttgaa----ttacgaatgaatgattaagatgatacttgctttta 22438901  T
Q  204 tttgatatc 212  Q
     ||||||||    
T  22438900 cttgatatc 22438892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22432546 - 22432342
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22432546 tgcaagttagtatattgcgatctgtgtctcattatttgatttgagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactacaatctgtgaa 22432447  T
Q  105 gctgttatgaaatgtta-agttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgctttta 203  Q
    |||||||||| |||| |  ||||||||| ||||||| || || |||||| |||||||||||    | |  |||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  22432446 gctgttatgagatgtcagtgttgattatgatgtgatatattgtttaattacattacttgaa----ttacaaatgaatgattgagatgatatttgctttta 22432351  T
Q  204 tttgatatc 212  Q
     ||||||||    
T  22432350 cttgatatc 22432342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 16523224 - 16523331
Alignment:
Q  1 tgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||| | |||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  16523224 tgaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggttggatccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctg 16523323  T
Q  101 tgaagctg 108  Q
    ||||||||    
T  16523324 tgaagctg 16523331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 17804421 - 17804319
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||||||  | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  17804421 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattact 17804323  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  17804322 tgaa 17804319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Original strand, 19790660 - 19790763
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  19790660 ggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattact 19790759  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  19790760 tgaa 19790763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Original strand, 20907863 - 20907966
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||  |||||| |||| ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20907863 ggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactagaatctgggaagttgttaagaattgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattact 20907962  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  20907963 tgaa 20907966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 22863170 - 22863068
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22863170 ggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctgtattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattact 22863072  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  22863071 tgaa 22863068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 18180708 - 18180623
Alignment:
Q  80 taagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||||| | || |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18180708 taagatgttaactgaaatctgtaaggctgtt-tcaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaat 18180623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 163
Target Start/End: Original strand, 23657302 - 23657403
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||||| ||| |||| | ||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||| || || ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  23657302 ggtagtaatatgatctatgtgagatgttaactgagatctgtgaggctgttatgatatgttaagctg-ttgtaatgtgatttaaagattaaatgcattact 23657400  T
Q  161 tga 163  Q
    |||    
T  23657401 tga 23657403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 72 - 164
Target Start/End: Original strand, 22429923 - 22430014
Alignment:
Q  72 gacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||| |||||||||| |||  | |||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  22429923 gacctatttaagatgttagctgagaactgtgaagttattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 22430014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 14472494 - 14472392
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  14472494 ggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattact 14472396  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  14472395 tgaa 14472392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Original strand, 25767050 - 25767152
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||||||  | ||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  25767050 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaaactattatgaaatgctaagt-gattataatgtaatttattgattgattgcattact 25767148  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  25767149 tgaa 25767152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 163
Target Start/End: Original strand, 27567503 - 27567593
Alignment:
Q  73 acctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttga 163  Q
    |||||| |||||||| | | | ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  27567503 acctatttaagatgtcagccgaaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttga 27567593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 16760139 - 16760078
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  16760139 gctgttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 16760078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 77
Target Start/End: Original strand, 31164687 - 31164744
Alignment:
Q  20 tgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgaccta 77  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  31164687 tgcgacctgtgtcgcatgttttgattagagatggacccctgggtagtagtgagaccta 31164744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Original strand, 31478072 - 31478133
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31478072 gctgttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaat 31478133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 145
Target Start/End: Original strand, 27415824 - 27415907
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatg 145  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||  | |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  27415824 ggtactaatgagacctatttaagatgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaag-tgattataatgtgatataatg 27415907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Original strand, 18955645 - 18955747
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |  ||||||| |||| || ||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  18955645 ggtactaatgagacctatataagatgttaactgttaattgtgaagctatattgaaatgctaag-tgtttataatgtgattgattgattgattgcattact 18955743  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  18955744 tgaa 18955747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 166
Target Start/End: Original strand, 22408205 - 22408290
Alignment:
Q  80 taagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || |||||||||  ||||| |||| || ||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  22408205 taagatgttaattgaaatctgtgagactgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaaat 22408290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 1644552 - 1644491
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  1644552 gctgttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 1644491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 110
Target Start/End: Original strand, 15041391 - 15041480
Alignment:
Q  21 gcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgtt 110  Q
    |||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   | |||||||  | |||||||| ||||||||    
T  15041391 gcgatctgtatcgcatgttttgattagagatggacccctgggtagtaatgagacctaatgatgatgttagatacaatctgtaaagctgtt 15041480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 166
Target Start/End: Original strand, 16523330 - 16523371
Alignment:
Q  125 tgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16523330 tgattataatgtgatttaatgattaattgcattacctgaaat 16523371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 22948948 - 22948891
Alignment:
Q  109 ttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22948948 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 22948891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 22952904 - 22952847
Alignment:
Q  109 ttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22952904 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 22952847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 23414824 - 23414763
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  23414824 gctgttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 23414763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 23871392 - 23871335
Alignment:
Q  109 ttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  23871392 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 23871335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 23875348 - 23875291
Alignment:
Q  109 ttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  23875348 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 23875291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 178
Target Start/End: Original strand, 27416120 - 27416193
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatga 178  Q
    ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||    
T  27416120 gctgttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactctaaatattaatgaatga 27416193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 27556582 - 27556521
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  27556582 gctgttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 27556521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 149
Target Start/End: Original strand, 22059645 - 22059712
Alignment:
Q  82 agatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgatta 149  Q
    |||||||||  | ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  22059645 agatgttaaacgaaatatgtgaagctgttatgaactattaagctgattatgatgtgatttattgatta 22059712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 14472100 - 14472054
Alignment:
Q  120 taagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14472100 taagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 14472054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 166
Target Start/End: Original strand, 18956040 - 18956086
Alignment:
Q  120 taagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18956040 taagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 18956086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 1644891 - 1644827
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  1644891 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 1644827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 11567048 - 11566984
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  11567048 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 11566984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 20 - 77
Target Start/End: Original strand, 16924719 - 16924776
Alignment:
Q  20 tgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgaccta 77  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||    
T  16924719 tgcgatctgtgtcgcatgctttgattaggagtggacccctgggtagtaatgagaccta 16924776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 19870776 - 19870712
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  19870776 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 19870712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 23395254 - 23395190
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  23395254 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 23395190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 23990106 - 23990042
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  23990106 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 23990042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 8244019 - 8243983
Alignment:
Q  128 ttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  8244019 ttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 8243983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 174; Significance: 9e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 224
Target Start/End: Original strand, 34749 - 34954
Alignment:
Q  19 ttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatg 118  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34749 ttgcgacctttgtcacataacttgtttagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaattg 34848  T
Q  119 ttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgcttttatttgatatctttata 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34849 ttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatgaatgattgagttgatgcttgattttatttgatatctttata 34948  T
Q  219 tgatgt 224  Q
    ||||||    
T  34949 tgatgt 34954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 3137 - 2913
Alignment:
Q  1 tgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||| | ||||| | | ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  3137 tgaatgcaagataggatgttgtgatctgtgtcgcataaattgattagggttggactcttaggtagtagtgtgacctatataggatgttaattgcaatctg 3038  T
Q  101 tgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3037 tgaagctgttatgaaatgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatgaatgattgagttgatacttgctt 2938  T
Q  201 ttatttgatatctttatatgatgtc 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  2937 ctatttgatatctttatatgatgtc 2913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6803 - 6579
Alignment:
Q  1 tgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctg 100  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||| | ||||| | | ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  6803 tgaatgcaagataggatgttgtgatctgtgtcgcataaattgattagggttggactcttaggtagtagtgtgacctatataggatgttaattgcaatctg 6704  T
Q  101 tgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6703 tgaagctgttatgaaatgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatgaatgattgagttgatacttgctt 6604  T
Q  201 ttatttgatatctttatatgatgtc 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  6603 ctatttgatatctttatatgatgtc 6579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 58)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15060585 - 15060365
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15060585 tgcaagttaggatgttgcgatctgtgtcgcatgaattgattagggatggacccttaggtagtattgtgacctatataagatggtaactgcaatctgtgaa 15060486  T
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgcttttat 204  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15060485 gctattatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgattaatttcattacttgagatgttaatgaatgaatgattgagttgatgcttgcttttat 15060386  T
Q  205 ttgatatctttatatgatgtc 225  Q
    ||||||||  |||||||||||    
T  15060385 ttgatatccctatatgatgtc 15060365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 23052898 - 23053123
Alignment:
Q  1 tgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctg 100  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| | |||| | ||    
T  23052898 tgaatgcaagtgaggatgttacgacctgtgtcgcataacttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgatctatttaggatgtttaatgcagtttg 23052997  T
Q  101 tgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatg-gtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgct 199  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23052998 tgaagctattatgaaattttaagttgtttataatgtgatttaattattaattgcattacttgaaatgattaatgaatgaatgattgagatgatgcttgct 23053097  T
Q  200 tttatttgatatctttatatgatgtc 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  23053098 tttatttgatatctttatatgatgtc 23053123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15051813 - 15051589
Alignment:
Q  1 tgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15051813 tgaatgcaagttaggatgttgtgatctgtgtcgcatgaattgattagggatggacccttaggtagtattgtgacctatataagatgttaactgcaatttg 15051714  T
Q  101 tgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgctt 200  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15051713 tgaagctattatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgattaatttcattacctgagatgttaatgaatgaatgattgagttgatgcttgatt 15051614  T
Q  201 ttatttgatatctttatatgatgtc 225  Q
    |||||||||||   |||||||||||    
T  15051613 ttatttgatattcctatatgatgtc 15051589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 40 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16910008 - 16909823
Alignment:
Q  40 ttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgat 139  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16910008 ttgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctatacaagatgttaactgcaatctgtgaagcttttatgaattgttaagttgattataatgtgat 16909909  T
Q  140 ttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgcttttatttgatatctttatatgatgtc 225  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16909908 ttaatgattaattttattacttgagatgttaatgaatgaatgattgagttgatgcttgcttttatttgatatccctatatgatgtc 16909823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 14878338 - 14878552
Alignment:
Q  13 aggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccc-tgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgtta 111  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  14878338 aggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggaccccctaggtagtaatgtgacttatataagaagttaactgcaatctgtgaagctatta 14878437  T
Q  112 tgaaatgttaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgcttttatttgata 210  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||| |  | | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14878438 tgaaatgttaatgttgaatatgatgtaagatgaagtttaattgcattacttgaaatgttaatgaatgaatgattgagatgatgcttgcttttatttgata 14878537  T
Q  211 tctttatatgatgtc 225  Q
    || ||||||||||||    
T  14878538 tccttatatgatgtc 14878552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 40 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16369666 - 16369481
Alignment:
Q  40 ttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgat 139  Q
    |||||||| |||  |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16369666 ttgattagggatacacccttaggtagtaatgtgatctatataagatgttaactccaatatgtgaagctgttatgaactgttaagttgattataatgtgat 16369567  T
Q  140 ttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgcttttatttgatatctttatatgatgtc 225  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16369566 ttaatcattaatttcattacttgagatgttaatgaatgaatgattgagttgatgcttgcttttatttgatatccctatatgatgtc 16369481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Original strand, 17524977 - 17525194
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17524977 tgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatctgtgaa 17525076  T
Q  105 gctgttatgaaatgttaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgctttta 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  | | | ||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  17525077 gctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgagatgacgtttaattgcattacttgaa----ttatgaatgaatgattgagatgatgcatactttta 17525172  T
Q  204 tttgatatctttatatgatgtc 225  Q
    ||||||||| |||| |||||||    
T  17525173 tttgatatcgttatgtgatgtc 17525194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23408726 - 23408509
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  23408726 tgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtattgttacctattttagaagttaactgcaatctgtgaa 23408627  T
Q  105 gctgttatgaaatgtta-agttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgctttta 203  Q
    |||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23408626 gctgttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattacattacttgaa----ttatgaatgaatgattgagatgatgcttgctttta 23408531  T
Q  204 tttgatatctttatatgatgtc 225  Q
     |||||||| || |||||||||    
T  23408530 attgatatcgttgtatgatgtc 23408509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 95 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12173007 - 12172877
Alignment:
Q  95 aatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |    
T  12173007 aatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatgaatgattgagttggtac 12172908  T
Q  195 ttgcttttatttgatatctttatatgatgtc 225  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12172907 ttgcttttatttgatatctttacatgatgtc 12172877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 18383738 - 18383903
Alignment:
Q  1 tgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |    
T  18383738 tgaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatcag 18383837  T
Q  101 tgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18383838 tgaagctgttatgaactgttaagctgattttaatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 18383903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 322884 - 322721
Alignment:
Q  3 aatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtg 102  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | |||||||| |||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||    
T  322884 aatgcaagttagtatgttgcgatctatttcgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactaagatctgtg 322785  T
Q  103 aagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  322784 aagctgttatgaagtgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 322721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 12496552 - 12496388
Alignment:
Q  1 tgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12496552 tgaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcgcataagttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctg 12496453  T
Q  101 tgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    |||||||||| |||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12496452 tgaagctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaat 12496388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 19725733 - 19725898
Alignment:
Q  1 tgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| | ||||||| | ||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  19725733 tgaatacaagttaggatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacccatttaagatgtcaactgaaatctg 19725832  T
Q  101 tgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    |||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19725833 tgaaactgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattacattacttgaaat 19725898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 23077311 - 23077513
Alignment:
Q  13 aggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttat 112  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  23077311 aggattttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttaggtagtaatgagacctatatgagaagtttactgtaatttgtgaagctgttat 23077410  T
Q  113 gaaatg-ttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgcttttatttgatat 211  Q
    |||||| ||| |||| |||| ||||          ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  23077411 gaaatgtttatgttggttatgatgt----------ttaattgcattacttgaaatgttaatgaatgaatgattgagatgatgtttgc-tttatttgatat 23077499  T
Q  212 ctttatatgatgtc 225  Q
    | ||||||||||||    
T  23077500 ccttatatgatgtc 23077513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 11863084 - 11862923
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||   ||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||    
T  11863084 tgcaagttaggatgttgcgatctgtttcgtataaattgattaggattggacccttaggtattaatgtgacctatttaagatgttatttgaaatctgtgaa 11862985  T
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11862984 gctgctatgaactgttaagctgattatgatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 11862923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 11298350 - 11298514
Alignment:
Q  1 tgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctg 100  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||    
T  11298350 tgaatgcaatttagtatgttgcgatctgtttctcataatttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatattaactgaaatttg 11298449  T
Q  101 tgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||| |||||| |||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11298450 tgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaat 11298514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 11851866 - 11851698
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||   ||||||| |       |||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||    
T  11851866 tgcaagttaggatgttgcgatctgtttcgtataaattgattaggattggaccctta------aatgtgacctatttaagatgttatctgaaatttgtgaa 11851773  T
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaa 179  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  11851772 gctgctatgaactgttaagctgattatgatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgaa 11851698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Original strand, 1982692 - 1982794
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1982692 ggtagtaatgtgacctaattaagatgttaactgcaatatgtgaagttgttatgaactgttaagtt-attgtaatgtgatttaatgattaaatgcattact 1982790  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  1982791 tgaa 1982794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 163
Target Start/End: Original strand, 3389817 - 3389919
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3389817 ggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagacctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattact 3389916  T
Q  161 tga 163  Q
    |||    
T  3389917 tga 3389919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 163
Target Start/End: Original strand, 12037823 - 12037936
Alignment:
Q  50 atggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgatta 149  Q
    ||||||||||| |||| || |||| |||| || |||||| | || |||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12037823 atggacccctgagtagcaacgtgatctatttaggatgtttaatgaaatctgtgaaaccattttgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgatta 12037922  T
Q  150 attgcattacttga 163  Q
    ||||||||||||||    
T  12037923 attgcattacttga 12037936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 163
Target Start/End: Original strand, 3402837 - 3402939
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  3402837 ggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagacctgtgaagctattatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattcct 3402936  T
Q  161 tga 163  Q
    |||    
T  3402937 tga 3402939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 164
Target Start/End: Original strand, 327025 - 327148
Alignment:
Q  40 ttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgat 139  Q
    ||||||||| | ||| || | |||| ||||| ||||||| |||||| |||||||  | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  327025 ttgattagaaaaggaaccttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgat 327123  T
Q  140 ttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||    
T  327124 ttattgattgattgcattacttgaa 327148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 856429 - 856314
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| || |||||| || |||||| || | | |||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  856429 tgcaagtgagaatgttgtgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaa 856330  T
Q  105 gctgttatgaaatgtt 120  Q
    |||  ||||| |||||    
T  856329 gcttatatgagatgtt 856314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Original strand, 11557266 - 11557369
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||||||  |||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  11557266 ggtagtaatgaaacctatttaaggtgttagctggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattact 11557365  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  11557366 tgaa 11557369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Original strand, 11595020 - 11595123
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  11595020 ggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattact 11595119  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  11595120 tgaa 11595123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 15482887 - 15482785
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||||||  | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15482887 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattact 15482789  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  15482788 tgaa 15482785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Original strand, 20461382 - 20461484
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||||||  | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20461382 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattact 20461480  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  20461481 tgaa 20461484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 79
Target Start/End: Original strand, 15877653 - 15877727
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctata 79  Q
    ||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15877653 tgcaagtgaggatattgcgatcagtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctata 15877727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Original strand, 7793231 - 7793333
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||||||  | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  7793231 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttgttgattgattgcattact 7793329  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  7793330 tgaa 7793333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 14499552 - 14499450
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  14499552 ggtagtaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaa-ttgtttataatgtgatttattgattgattgcattact 14499454  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  14499453 tgaa 14499450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 74 - 160
Target Start/End: Original strand, 2897718 - 2897803
Alignment:
Q  74 cctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||| ||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  2897718 cctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattact 2897803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 14179690 - 14179624
Alignment:
Q  44 ttagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgtt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||    
T  14179690 ttagagatggacccctgggtagtattgtgacctatataagaagttaattataatctgtgaagctgtt 14179624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 225
Target Start/End: Original strand, 15877947 - 15878087
Alignment:
Q  80 taagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgtta-agttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatga 178  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||    | ||||||||    
T  15877947 taagaagttaactgcaatctgtgatgttgttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgattaatttcattacttgaa----ttatgaatga 15878042  T
Q  179 atgattgagttgatgcttgcttttatttgatatctttatatgatgtc 225  Q
    ||||||||| || ||| || ||||| |||||||| |||| |||||||    
T  15878043 atgattgagatgttgc-tgttttta-ttgatatcgttatgtgatgtc 15878087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 30066173 - 30066071
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  30066173 ggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattact 30066075  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  30066074 tgaa 30066071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 42326177 - 42326074
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||||||  |  ||||||| ||||| ||| |||||| ||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  42326177 ggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacttgtgaagttgttaagaactgttaacttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattact 42326078  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  42326077 tgaa 42326074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 55023089 - 55022992
Alignment:
Q  66 taatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  55023089 taatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 55022992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 11070295 - 11070193
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |   |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11070295 ggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatatcgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattact 11070197  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  11070196 tgaa 11070193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 11854960 - 11854858
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||  |  ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11854960 ggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttaattgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattact 11854862  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  11854861 tgaa 11854858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Original strand, 4589035 - 4589096
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  4589035 gctgttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 4589096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 5223243 - 5223182
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  5223243 gctgttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 5223182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 12339645 - 12339584
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  12339645 gctgttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 12339584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 15964812 - 15964755
Alignment:
Q  109 ttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15964812 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 15964755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 15968736 - 15968679
Alignment:
Q  109 ttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15968736 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 15968679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 15972660 - 15972603
Alignment:
Q  109 ttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15972660 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 15972603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 19775612 - 19775551
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19775612 gctgttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 19775551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Original strand, 37439898 - 37439959
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  37439898 gctgttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 37439959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Original strand, 11165411 - 11165513
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||  || |||||| || |  |||||||  |||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11165411 ggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaaactatattgaaatgccaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattact 11165509  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  11165510 tgaa 11165513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Original strand, 11300393 - 11300495
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||  |  ||| ||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11300393 ggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttaattgtaaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattact 11300491  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  11300492 tgaa 11300495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 12173083 - 12173029
Alignment:
Q  1 tgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggac 55  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  12173083 tgaatgcaagttaggatgttgctatctgtgtcgcataaattgattaaggatggac 12173029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Original strand, 11300692 - 11300753
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11300692 gctgttatgaactgctaagttgtttgtaatttgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 11300753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 15465044 - 15464983
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15465044 gctgttatgaactgctaagttgtttgtagtgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 15464983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 14665570 - 14665531
Alignment:
Q  127 attataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14665570 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaat 14665531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 7109887 - 7109823
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  7109887 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 7109823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 7113822 - 7113758
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  7113822 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 7113758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 22321853 - 22321789
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  22321853 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 22321789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 22336908 - 22336844
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  22336908 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 22336844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Original strand, 27409564 - 27409628
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  27409564 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 27409628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 28949913 - 28949849
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  28949913 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 28949849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 35)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24673874 - 24673650
Alignment:
Q  1 tgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||| | |  |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  24673874 tgaatgcaagttaggatgttgcgatctgtgtcgcataaattgattagggttggactcttaagtagtaatgtgacctatataggatgttaattgcgatctg 24673775  T
Q  101 tgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgctt 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24673774 tgaagctattatgaaatgttaagctgattatactgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatgaatgattgagttgatacttgctt 24673675  T
Q  201 ttatttgatatctttatatgatgtc 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  24673674 ctatttgatatctttatatgatgtc 24673650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Original strand, 22758540 - 22758719
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  22758540 tgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaaattaactgcaatctatgaa 22758639  T
Q  105 gctgttatgaaatgttaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgag 187  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||    
T  22758640 gctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaa----ttatgaatgaatgattgag 22758719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Original strand, 22798951 - 22799092
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  22798951 tgcaagttaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatttgtgaa 22799050  T
Q  105 gctgttatgaaatgttaa-gttgattataatgtgatttaatg 145  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||    
T  22799051 gctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatg 22799092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 164
Target Start/End: Original strand, 22740785 - 22740945
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22740785 tgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctttgaa 22740884  T
Q  105 gctgttatgaaatgttaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    | |||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22740885 gttgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaa 22740945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23038329 - 23038112
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| ||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  23038329 tgcaagtgaggaaattgcgatctgtgtcgcatgatttgattagagatggacccttgggtagtattgagacctatataagaagttatctgcaatctgtgaa 23038230  T
Q  105 gctgttatgaaatgtta-agttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgctttta 203  Q
    ||| |||||| ||||||  ||| | ||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    | ||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  23038229 gctcttatgagatgttagtgttaaatatgatgtgatataatgtttaattgaattacttgaa----ttatgaatgaatgattgagatgttgcttgttttta 23038134  T
Q  204 tttgatatctttatatgatgtc 225  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  23038133 tttgatatcgttatatgatgtc 23038112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 21918137 - 21918288
Alignment:
Q  1 tgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||  | ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21918137 tgaatgcaagttaggatgttgcgatctgtttcgcataaattgattatggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctg 21918236  T
Q  101 tgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaatt 152  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21918237 tgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaatt 21918288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 25963538 - 25963702
Alignment:
Q  1 tgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||| |||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  25963538 tgaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttctcataagttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaattgaaatctg 25963637  T
Q  101 tgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    |||||||||| |||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25963638 tgaagctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaat 25963702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 164
Target Start/End: Original strand, 22811737 - 22811896
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |  ||||| |||||||| | ||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  22811737 tgcaagttaggatgttgcgatctgtttt-cataaattgattagtgttggacctttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaagtgaaatctgtgaa 22811835  T
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgatt-aattgcattacttgaa 164  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22811836 gctgctatgaactattaagttgattataatgtgatttaatgattaaattgcattacctgaa 22811896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 139
Target Start/End: Original strand, 23019531 - 23019666
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||    
T  23019531 tgcaagtcaggatattgcgatctgtgtcgcataatttaattagagttggacccttgggtagtaatgtgacctatataagaagttatttgcaatttgtgaa 23019630  T
Q  105 gctgttatgaaatgttaa-gttgattataatgtgat 139  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  23019631 gcttttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgat 23019666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 40622033 - 40622148
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40622033 tgcaagtgaggatattgcgatctgtttcgcatattttgtttagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaa 40622132  T
Q  105 gctgttatgaaatgtt 120  Q
    |||||||||| |||||    
T  40622133 gctgttatgagatgtt 40622148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 134 - 225
Target Start/End: Original strand, 45678074 - 45678165
Alignment:
Q  134 tgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgcttttatttgatatctttatatgatgtc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  45678074 tgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatgaatgattgagttgatacttgcttctatttgatacctttatatgatgtc 45678165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 40428700 - 40428597
Alignment:
Q  60 gggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattac 159  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40428700 gggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattac 40428601  T
Q  160 ttga 163  Q
    ||||    
T  40428600 ttga 40428597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Original strand, 23103253 - 23103400
Alignment:
Q  37 aatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgtta-agttgattataatg 135  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||  | | |||    
T  23103253 aatttgattagagatggaccctttggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgttagtgttggatttgatg 23103352  T
Q  136 tgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgag 187  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||    | |||||||||||||||||    
T  23103353 tgatataatgtttaattgcatgacttgaa----ttatgaatgaatgattgag 23103400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 37524962 - 37524820
Alignment:
Q  1 tgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||| |||||||  | ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||    
T  37524962 tgaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcacataagttgattaaggttggacccttaggtagtaatgtgacctat-taagatgttaattgaagtctg 37524864  T
Q  101 tgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaat 144  Q
    |||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  37524863 tgaagctgctatgaactgttaggctgattataatgtgatttaat 37524820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Original strand, 25961416 - 25961518
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25961416 ggtagtaatgaaacctatttaagatgttagctgcaatatgtgaatttgttatgaactgttaagttg-ttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattact 25961514  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  25961515 tgaa 25961518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Original strand, 19688638 - 19688740
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||||||  | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19688638 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattact 19688736  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  19688737 tgaa 19688740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 24175035 - 24174932
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||| | | ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  24175035 ggtagtaatgaaacctatttaagatgttagccggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattact 24174936  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  24174935 tgaa 24174932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Original strand, 24655220 - 24655323
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||| | | ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  24655220 ggtagtaatgaaacctatttaagatgttagccggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattact 24655319  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  24655320 tgaa 24655323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 24735627 - 24735525
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||||||  | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  24735627 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgatcgcattact 24735529  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  24735528 tgaa 24735525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 103
Target Start/End: Original strand, 45677991 - 45678078
Alignment:
Q  16 atgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtga 103  Q
    |||||| || ||||||||||| | |||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  45677991 atgttgtgatctgtgtcgcatgagttgattagggatggactcttaggtagtaatgtgacctatataggatgttaattgcaatctgtga 45678078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 163
Target Start/End: Original strand, 21327449 - 21327550
Alignment:
Q  62 gtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattactt 161  Q
    |||||| || ||| ||| ||| ||||||| || | ||||||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21327449 gtagtagtgagacatatttaaaatgttaagtgaattctgtgaagctgttatgaactattaagctgtttatgatgtgatttattgattaattgcattactt 21327548  T
Q  162 ga 163  Q
    ||    
T  21327549 ga 21327550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Original strand, 10101527 - 10101629
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  10101527 ggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattact 10101625  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  10101626 tgaa 10101629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 160
Target Start/End: Original strand, 24716412 - 24716510
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||| |||| || ||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  24716412 ggtagtagtgagacctatttaagatgttaactgaaacctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattact 24716510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 163
Target Start/End: Original strand, 21318518 - 21318619
Alignment:
Q  62 gtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattactt 161  Q
    |||||| || ||| ||| ||||||||||| || | | |||||||||| |||||| | ||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21318518 gtagtagtgagacatatttaagatgttaagtgaattatgtgaagctgctatgaactattaagctgtttatgatgtgatttattgattaattgcattactt 21318617  T
Q  162 ga 163  Q
    ||    
T  21318618 ga 21318619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 160
Target Start/End: Original strand, 41531266 - 41531321
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41531266 gctgttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattact 41531321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Original strand, 30345253 - 30345314
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  30345253 gctgttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 30345314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 24870115 - 24870016
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||| | | ||||||||| | ||||| ||| || ||||||| || ||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  24870115 ggtagtaatgaaacctatttaagatgttagccggaatctgtgaggttgttaagaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatacattact 24870016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 1283233 - 1283172
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  1283233 gctgttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgattaaatgattaaatgcattactcgaaat 1283172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 31345056 - 31344995
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  31345056 gctgttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttcatgattaaatgcattactcgaaat 31344995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 149
Target Start/End: Original strand, 44370201 - 44370268
Alignment:
Q  82 agatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgatta 149  Q
    |||||||||  | ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  44370201 agatgttaaacgaaatatgtgaagctgttatgaactattaagctgattatgatgtgatttattgatta 44370268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Original strand, 12901432 - 12901496
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  12901432 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 12901496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 15477789 - 15477725
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  15477789 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 15477725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 24649543 - 24649479
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  24649543 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 24649479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 27601982 - 27601918
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  27601982 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 27601918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Original strand, 41530930 - 41530994
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  41530930 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 41530994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 32)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6152153 - 6151929
Alignment:
Q  1 tgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctg 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  6152153 tgaatgcatgttaggatgttgcgatctgtgtcgcatgaattgattagggatggactcttaggtagtaatgtgacctatataggatgttaattgcaatctg 6152054  T
Q  101 tgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgctt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6152053 tgaagctgttatgaaatgttaagctgtttataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttagtgaatgaatgattgagttgatacttgctt 6151954  T
Q  201 ttatttgatatctttatatgatgtc 225  Q
     |||||||||| |||||||||||||    
T  6151953 ctatttgatatatttatatgatgtc 6151929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Original strand, 42865036 - 42865249
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42865036 tgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 42865135  T
Q  105 gctgttatgaaatgttaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgctttta 203  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    || |||||||| |||||||| ||    |||||||||    
T  42865136 gctgttatgaaaggttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttga----gttatgaatgagtgattgagatg----ttgctttta 42865227  T
Q  204 tttgatatctttatatgatgtc 225  Q
    ||||||||| |||| |||||||    
T  42865228 tttgatatcgttatgtgatgtc 42865249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Original strand, 22831214 - 22831419
Alignment:
Q  16 atgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaa 115  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||| |||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22831214 atgttgcgatctgtgtcgcatgacttgtttagggatggactcttaggtagtaatgtgacctatataggatgttaattgcaatctgtgaagctgttatgaa 22831313  T
Q  116 atgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgcttttatttgatatcttt 215  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  22831314 atgtta-gctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatgaatgactgagttgatacttgcttctatttgatatcttt 22831412  T
Q  216 atatgat 222  Q
    |||||||    
T  22831413 atatgat 22831419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 38 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21022899 - 21022712
Alignment:
Q  38 atttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtg 137  Q
    |||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  21022899 atttgattaaggatggacccttaggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctattatgaactgttaagctgattataatgtg 21022800  T
Q  138 atttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgcttttatttgatatctttatatgatgtc 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  21022799 aattaatgattaattgcattacttgaaatattaattaatggatgattgagttgatacttgcttctatttgatgtctttatatgatgtc 21022712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21714829 - 21714627
Alignment:
Q  20 tgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgt 119  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21714829 tgcgatctgtgtcgcatgatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgt 21714730  T
Q  120 ta-agttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgcttttatttgatatctttata 218  Q
    ||  ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||    
T  21714729 tagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa----ttatgaatgaatgattgagatgttgcttgtttttatttgatatcgttata 21714634  T
Q  219 tgatgtc 225  Q
    |||||||    
T  21714633 tgatgtc 21714627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 166
Target Start/End: Original strand, 18181946 - 18182107
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| | | |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18181946 tgcaagttaggatgttgcgatctgtgtcgcataaattgattagggatggactcttaggtagtaatgtgacttgtataagaagttaactgcaaactgtgaa 18182045  T
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18182046 gctgttatgagatgctaagttgtttataatgtgattcaatgattaattgcattacttgaaat 18182107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 40 - 166
Target Start/End: Original strand, 22449126 - 22449252
Alignment:
Q  40 ttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgat 139  Q
    ||||||||  |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22449126 ttgattaggaatggacccttaggtagtaatgtgacatatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaactgttaagttgattataatgtgat 22449225  T
Q  140 ttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  22449226 ttaatgattaatttcattacttgaaat 22449252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 20091306 - 20091477
Alignment:
Q  13 aggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttat 112  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  20091306 aggatattgcgatctgtgtcgcataatttgatttgagatggacccttgggtagtaatgagacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttac 20091405  T
Q  113 gaaatgttaa-gttgattataatgtgatttaatgattaa-ttgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgag 187  Q
    |  ||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||  ||||||| |    |||||||||||||||||    
T  20091406 gtgatgttaatgttgaatatgatgtg-tttaatgattaaattgcacgacttgaatt----atgaatgaatgattgag 20091477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 145
Target Start/End: Original strand, 21787881 - 21788008
Alignment:
Q  19 ttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatg 118  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21787881 ttgcgacctgtgtcgcataacttgtttagagatggacccttgggtagtaatgtaacctatataagaagttaactgcaatctatgcagctgttatgaaatg 21787980  T
Q  119 tt-aagttgattataatgtgatttaatg 145  Q
    || | ||||||||| |||| || |||||    
T  21787981 ttgatgttgattatgatgttatataatg 21788008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 3472747 - 3472911
Alignment:
Q  1 tgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctg 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||| | ||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||    
T  3472747 tgaatgcaaaataggatgttgcgatctgtttcgcacaaactgattagggttggactcttaggtagtaatgtgacctat-taagatgttaatgggaatctg 3472845  T
Q  101 tgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  3472846 tgaagctgttatgaaatgctaagttgtttgaaatgtgatttaatgattaaatgaattacttgaaat 3472911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 163
Target Start/End: Original strand, 18393845 - 18393947
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18393845 ggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattact 18393944  T
Q  161 tga 163  Q
    |||    
T  18393945 tga 18393947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 48603811 - 48603706
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||    
T  48603811 tgcaagttaggatgttgcgatctgtgttgcatgaattgattagagatggacccctaggtagtattgtgacctatataagaagttaattataatctgtgaa 48603712  T
Q  105 gctgtt 110  Q
    ||||||    
T  48603711 gctgtt 48603706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 163
Target Start/End: Original strand, 45310248 - 45310350
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  45310248 ggtagtaatgtggcctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattgct 45310347  T
Q  161 tga 163  Q
    |||    
T  45310348 tga 45310350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 73 - 163
Target Start/End: Original strand, 8761526 - 8761616
Alignment:
Q  73 acctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttga 163  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8761526 acctatataagatgttaaatgaaatctgtgaagctgttatgaactattaagctaattatgatgtgatttattgattaattgcattacttga 8761616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 164
Target Start/End: Original strand, 24783001 - 24783084
Alignment:
Q  80 taagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  24783001 taagatgttaactgaaaattgtgaagctgttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattaattaattgcattacttgaa 24783084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Original strand, 45489624 - 45489727
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  45489624 ggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattact 45489723  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  45489724 tgaa 45489727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Original strand, 3704946 - 3705049
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||| | | ||||||||||| ||||| ||| | |||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  3704946 ggtagtaatgaaacctatttaagatgttagccggaatctgtgaagttgttaagaactattaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattact 3705045  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  3705046 tgaa 3705049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Original strand, 16080326 - 16080428
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||  |||||||  | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16080326 ggtactaatgagacctatttaagagattaactgagaactgtgaagcttttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattact 16080424  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  16080425 tgaa 16080428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 166
Target Start/End: Original strand, 17678488 - 17678573
Alignment:
Q  80 taagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17678488 taagatgttaactgaaatctgtaaggctgtt-tgaactgttaagttgtttgtaatgttatttaatgattaaatgcattacttgaaat 17678573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 1010947 - 1010845
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  1010947 ggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattact 1010849  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  1010848 tgaa 1010845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 33797757 - 33797674
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatg 145  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||  | |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  33797757 ggtactaatgagacctatttaagatgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaag-tgattataatgtgatataatg 33797674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Original strand, 36819190 - 36819292
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||  | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||| |||||||| ||    
T  36819190 ggtactaatgagacctatttaagatattaaatgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaag-tgattatattgtgatttatttattgattgcatttct 36819288  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  36819289 tgaa 36819292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Original strand, 1925391 - 1925452
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  1925391 gctgttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 1925452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Original strand, 20229071 - 20229132
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20229071 gctgttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 20229132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Original strand, 20924405 - 20924466
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20924405 gctgttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 20924466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 110
Target Start/End: Original strand, 22468521 - 22468626
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| ||| | ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |  ||| || ||| |  ||||||||||    
T  22468521 tgcaagtgagggtattgcgatatgtgtcgcataattcgattagagatggacccttgggtagtattgagaccttttgaagttggtaattataatctgtgaa 22468620  T
Q  105 gctgtt 110  Q
    ||||||    
T  22468621 gctgtt 22468626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 33797461 - 33797408
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcatta 158  Q
    ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  33797461 gctgttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcatta 33797408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Original strand, 16375378 - 16375442
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16375378 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 16375442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 19212091 - 19212015
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtga 138  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| || ||||  | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19212091 ggtactaatgagacctataaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaag-tgattataaagtga 19212015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Original strand, 20228729 - 20228793
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  20228729 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 20228793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 21407541 - 21407477
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21407541 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 21407477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 52639727 - 52639663
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  52639727 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 52639663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 13916 - 14122
Alignment:
Q  19 ttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatg 118  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13916 ttgcgacctgtgtcgcataacttatttagagaaggacccttgggtagtaaaatgacctatataggatgttaactgaaatctgtgaagctgttatgaaatg 14015  T
Q  119 ttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgcttttatttgatatctttata 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14016 ttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgaattacttgaaatgttaatgaatgaatgattgagttgatgcttgatttaatttgatatctttata 14115  T
Q  219 tgatgtc 225  Q
    |||||||    
T  14116 tgatgtc 14122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 225
Target Start/End: Original strand, 6914 - 7123
Alignment:
Q  16 atgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaa 115  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6914 atgttgcgatctgtgtcgcatgagttgattagggatgggcccttaggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaa 7013  T
Q  116 atgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgcttttatttgatatcttt 215  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||    
T  7014 atgttaagctgattataatgagatttaatgattaattgcattacttgagatgttaatgaatgaatgattgagttgatatttgcctctatttgatatcttt 7113  T
Q  216 atatgatgtc 225  Q
     |||||||||    
T  7114 gtatgatgtc 7123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6397 - 6176
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  6397 tgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggatccctgggtagtaaagaaacctatacaagaagttaactgcaatctgtgaa 6298  T
Q  105 gctgttatgaaatgttaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgctttta 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |  | ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6297 gctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtaagatgatgtttaattgcatttcttgaaatgttaatgaatgaatgattgagatgatgcttgctttta 6198  T
Q  204 tttgatatctttatatgatgtc 225  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6197 tttgatatctttatatgatgtc 6176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14945 - 14745
Alignment:
Q  26 ctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaa-gt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14945 ctgtgtcgcataatttgattagagatggactcctgggtagtaatgaaacctatacaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgt 14846  T
Q  125 tgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgcttttatttgatatctttatatgatgt 224  Q
    ||| ||| |||| |  | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14845 tgaatatgatgtaagatgatgtttaattgcattacttgaaatgttaatgaatgaatgattgagatgatgcttgcttttatttgatatctttatatgatgt 14746  T
Q  225 c 225  Q
    |    
T  14745 c 14745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23960 - 23760
Alignment:
Q  26 ctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaa-gt 124  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23960 ctgtgtcgcataatttgataagagatggacacctgggtagtaatgaaacctatacaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgt 23861  T
Q  125 tgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgcttttatttgatatctttatatgatgt 224  Q
    ||| ||| |||| |  | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23860 tgaatatgatgtaagatgatgtttaattgcattacttgaaatgttaatgaatgaatgattgagatgatgcttgcttttatttgatatctttatatgatgt 23761  T
Q  225 c 225  Q
    |    
T  23760 c 23760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39384 - 39184
Alignment:
Q  26 ctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaa-gt 124  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39384 ctgtgtcgcataatttgataagagatggacacctgggtagtaatgaaacctatacaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgt 39285  T
Q  125 tgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgcttttatttgatatctttatatgatgt 224  Q
    ||| ||| |||| |  | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39284 tgaatatgatgtaagatgatgtttaattgcattacttgaaatgttaatgaatgaatgattgagatgatgcttgcttttatttgatatctttatatgatgt 39185  T
Q  225 c 225  Q
    |    
T  39184 c 39184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 40)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 225
Target Start/End: Original strand, 23501181 - 23501391
Alignment:
Q  16 atgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaa 115  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23501181 atgttgcgatctgtgtcgtataagttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaattgcaatctgtgaagctgttatgaa 23501280  T
Q  116 atgttaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgcttttatttgatatctt 214  Q
     |||||| ||||| ||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  23501281 ttgttaatgttgaatatgatgtgagatgatgtttaattgcattacttgaaatgttaatgaatgaatgattgagatgatgcttgcttttatttgatatcgt 23501380  T
Q  215 tatatgatgtc 225  Q
    |||||||||||    
T  23501381 tatatgatgtc 23501391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23201663 - 23201441
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctggg-tagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtga 103  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  23201663 tgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgtttagagatggacccttggggtagtaatgagacctatagaagaagttaactgcaatctgtga 23201564  T
Q  104 agctgttatgaaatgttaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgctttt 202  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||| | ||||  | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23201563 agctgttatgaattgttaatgttgaatatgacgtgagatgatgtttaattgcattacttgaaatgttaatgaatgaatgattgagatgatgcttgctttt 23201464  T
Q  203 atttgatatctttatatgatgtc 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  23201463 atttgatatcgttatatgatgtc 23201441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 14079442 - 14079283
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14079442 tgcaagtgaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaa 14079343  T
Q  105 gctgttatgaaatgttaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttga 163  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14079342 gctcttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaatgattaattgcattacttga 14079283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23512401 - 23512179
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  23512401 tgcatgttaggatgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagaggtggacccttgggtagtattatgacctatataagaagtttactgcaatctttgaa 23512302  T
Q  105 gctgttatgaaatgttaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttg-aaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgctttt 202  Q
    | | |||| ||||||||| ||||| ||| |||| || | ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23512301 gatcttataaaatgttaatgttgaatatgatgtaatatgatgtttaattgcattacttgaaaatgttaatgaatgaatgattgagatgatgcttgctttt 23512202  T
Q  203 atttgatatctttatatgatgtc 225  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  23512201 atttgatatctttatacgatgtc 23512179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 21366487 - 21366652
Alignment:
Q  1 tgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  21366487 tgaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctg 21366586  T
Q  101 tgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21366587 tgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 21366652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 21873543 - 21873402
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21873543 tgcaagttaggatattgagatctgtgtcgcataatttgattagagatgaacccttgggtagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatctgtgaa 21873444  T
Q  105 gctgttatgaaatgttaa-gttgattataatgtgatttaatg 145  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||    
T  21873443 gctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatg 21873402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 37724198 - 37724019
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37724198 tgcaagtgaggagattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttcggtagtattgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaa 37724099  T
Q  105 gctgttatgaaatgtta-agttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgag 187  Q
    |||||| ||| ||||||  ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||    
T  37724098 gctgttttgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa----ttatgaatgaatgattgag 37724019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 20805845 - 20805669
Alignment:
Q  1 tgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||||||| | | ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20805845 tgaatgcaaattaggatgttgcgatctgtgtcgcacaaattgattagggtttgacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctg 20805746  T
Q  101 tgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatga 178  Q
    ||| |||||| |||| || ||||||  |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  20805745 tgaggctgtt-tgaactgctaagttattggtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatgttattgaatga 20805669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26704339 - 26704156
Alignment:
Q  26 ctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgtta-agt 124  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  26704339 ctgtgtcgcatgatttgattagggatggacccttgggtagtaatgagacatatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgttagtgt 26704240  T
Q  125 tgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgcttttatttgatatctttatatgatgt 224  Q
    ||| |||||||           |||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||| |||||||||||    
T  26704239 tgaatataatg-----------ttaattgcattacttgaact----atgaatgaatgattgagatgctgct--gttttatttgatatcgttatatgatgt 26704157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26974072 - 26973889
Alignment:
Q  26 ctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgtta-agt 124  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  26974072 ctgtgtcgcatgatttgattagggatggacccttgggtagtaatgagacatatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgttagtgt 26973973  T
Q  125 tgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgcttttatttgatatctttatatgatgt 224  Q
    ||| |||||||           |||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||| |||||||||||    
T  26973972 tgaatataatg-----------ttaattgcattacttgaact----atgaatgaatgattgagatgctgct--gttttatttgatatcgttatatgatgt 26973890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 20767207 - 20767091
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |  ||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20767207 ggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactactaagttgttggtaatgtgatttaatgattaaatgcattact 20767109  T
Q  161 tgaaatggtaatgaatga 178  Q
    ||||||| || |||||||    
T  20767108 tgaaatgttattgaatga 20767091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 23458825 - 23458721
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| || ||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  23458825 ggtagtagtgagacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattact 23458727  T
Q  161 tgaaat 166  Q
    ||||||    
T  23458726 tgaaat 23458721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 23463086 - 23462982
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| || ||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  23463086 ggtagtagtgagacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattact 23462988  T
Q  161 tgaaat 166  Q
    ||||||    
T  23462987 tgaaat 23462982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 120
Target Start/End: Original strand, 18769864 - 18769944
Alignment:
Q  40 ttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgtt 120  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18769864 ttgattagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgatatgagatgtt 18769944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 22032575 - 22032507
Alignment:
Q  40 ttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctg 108  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22032575 ttgattagagatggacccttaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg 22032507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Original strand, 123187 - 123289
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  123187 ggtagtaatatgacctatgtgagatgttaactgagatctgtgaggctgttatgaattgttaagctg-ttgtaatgtgatttaaagattaaatgcattact 123285  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  123286 tgaa 123289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Original strand, 12028446 - 12028549
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  12028446 ggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattact 12028545  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  12028546 tgaa 12028549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 23451581 - 23451477
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| || ||||||| || ||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  23451581 ggtagtagtgagacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaaagtgatttaacgattaaatgcattact 23451483  T
Q  161 tgaaat 166  Q
    ||||||    
T  23451482 tgaaat 23451477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 24222112 - 24222009
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| |||| | | ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  24222112 ggtagtaatgaaacctatttaagacgttagccggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattact 24222013  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  24222012 tgaa 24222009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 23572338 - 23572215
Alignment:
Q  40 ttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatg-ttaagttgattataatgtga 138  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||| ||| || |||||||||| ||||      
T  23572338 ttgattagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatttgtgaagttgatatgagatgtttgagttgattatgatgtat 23572239  T
Q  139 tttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    | ||||| |||  |||||||||||||    
T  23572238 tataatgttta--tgcattacttgaa 23572215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 22757349 - 22757258
Alignment:
Q  73 acctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    |||||| ||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||| || ||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  22757349 acctatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaa 22757258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 11220592 - 11220531
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11220592 gctgttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 11220531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 11225178 - 11225117
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11225178 gctgttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 11225117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 11229001 - 11228940
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11229001 gctgttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 11228940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 11230990 - 11230929
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11230990 gctgttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 11230929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Original strand, 15236662 - 15236764
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  15236662 ggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattaattgattgcattact 15236760  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  15236761 tgaa 15236764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 66 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 18356546 - 18356468
Alignment:
Q  66 taatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatg 145  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||  | |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18356546 taatgagacctatttaagatgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaag-tgattataatgtgatataatg 18356468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 11227011 - 11226950
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    |||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11227011 gctgatatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 11226950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 18356136 - 18356075
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18356136 gctgttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 18356075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Original strand, 20911097 - 20911158
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20911097 gctgttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 20911158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 10753206 - 10753147
Alignment:
Q  107 tgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10753206 tgttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 10753147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 160
Target Start/End: Original strand, 40723849 - 40723904
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40723849 gctgttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattact 40723904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 163
Target Start/End: Original strand, 17919069 - 17919134
Alignment:
Q  97 tctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttga 163  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  17919069 tctgtgagactgttatgaattgttaagttg-ttgtaatgtgatttaaagattaaatgcattacttga 17919134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 17410602 - 17410562
Alignment:
Q  124 ttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  17410602 ttgattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 17410562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 166
Target Start/End: Original strand, 24767493 - 24767532
Alignment:
Q  127 attataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24767493 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaat 24767532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 31342301 - 31342258
Alignment:
Q  121 aagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31342301 aagttgtttgtaatgtgatttaacgattaattgcattacttgaa 31342258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 20296033 - 20295969
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  20296033 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 20295969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 145
Target Start/End: Original strand, 20910677 - 20910765
Alignment:
Q  56 ccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatg 145  Q
    |||| |||| ||||| ||||||| |||||||||| |||    |||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  20910677 ccctaggtactaatgagacctatttaagatgttatctgaggactgtgaagctattgtgaaatgctaagt-gattataatgtgatataatg 20910765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 26680815 - 26680715
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||||||  |  ||||||| ||||| |||    ||||||| || ||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  26680815 ggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacttgtgaagttgttaagaa---ctaagttgtttgtaatgtgatttaacgatcaaatgcattact 26680719  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  26680718 tgaa 26680715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 26952422 - 26952322
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||||||  |  ||||||| ||||| |||    ||||||| || ||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  26952422 ggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacttgtgaagttgttaagaa---ctaagttgtttgtaatgtgatttaacgatcaaatgcattact 26952326  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  26952325 tgaa 26952322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Original strand, 15494 - 15711
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| ||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15494 tgcaagtgaggatattgtgatctgtgtcgcttaatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaa 15593  T
Q  105 gctgttatgaaatgttaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgctttta 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  15594 gctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgagataatgattaattgcattacttgaa----ttatgaatgaatgattgagatgatgcttgcttata 15689  T
Q  204 tttgatatctttatatgatgtc 225  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  15690 tttgatatcgttatatgatgtc 15711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 166
Target Start/End: Original strand, 46552 - 46713
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46552 tgcaagttaggatgttgcgatctgtgtcgcataaattgattagggatggactcttaggtagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatctgtgaa 46651  T
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46652 gctgttatgaaatgctaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 46713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18534 - 18317
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18534 tgcaagtgaggatattgcgatatgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatctgtgaa 18435  T
Q  105 gctgttatgaaatgttaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgctttta 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  | | | ||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  18434 gctgttatgaaatgttaatgttgattatgatgtgagattacgtttaattgcattacttgaa----ttatgaatgaatgattgagatgatgcatactttta 18339  T
Q  204 tttgatatctttatatgatgtc 225  Q
    ||||||||| |||| |||||||    
T  18338 tttgatatcgttatgtgatgtc 18317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4035 - 3823
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  4035 tgcaagtgaggatgttgcgatctgtatcgcata-tttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataagatattaattgcaatctgtgaa 3937  T
Q  105 gctgttatgaaatgttaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgctttta 203  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    || |||||| | |||||||| ||    |||||||||    
T  3936 gctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttga----gttatgaataagtgattgagatg----ttgctttta 3845  T
Q  204 tttgatatctttatatgatgtc 225  Q
    ||||||||| |||| |||||||    
T  3844 tttgatatcgttatgtgatgtc 3823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8466 - 8254
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  8466 tgcaagtgaggatgttgcgatctgtatcgcata-tttgattagagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataagatattaattgcaatctgtgaa 8368  T
Q  105 gctgttatgaaatgttaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgctttta 203  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    || |||||| | |||||||| ||    |||||||||    
T  8367 gctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttga----gttatgaataagtgattgagatg----ttgctttta 8276  T
Q  204 tttgatatctttatatgatgtc 225  Q
    ||||||||| |||| |||||||    
T  8275 tttgatatcgttatgtgatgtc 8254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 9703561 - 9703344
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9703561 tgcaagtgaggatattgcgatccgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtattaatgtgacctatataagaagttaactgcaatctgtgaa 9703462  T
Q  105 gctgttatgaaatgttaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgctttta 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  | | | ||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  9703461 gctgttatgaaatgttaatgttgattatgatgtgagattacgtttaattgcattacttgaa----ttatgaatgaatgattgagatgatgcatactttta 9703366  T
Q  204 tttgatatctttatatgatgtc 225  Q
    ||||||||| |||| |||||||    
T  9703365 tttgatatcgttatgtgatgtc 9703344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 166
Target Start/End: Original strand, 12321578 - 12321728
Alignment:
Q  16 atgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaa 115  Q
    |||| |||| ||||||||||| | |||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12321578 atgtagcgatctgtgtcgcatgaattgattagggatggactcttaggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaaactgttatgaa 12321677  T
Q  116 atgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12321678 ctgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 12321728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 14430177 - 14430012
Alignment:
Q  1 tgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  14430177 tgaatgcaagttagtatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctg 14430078  T
Q  101 tgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14430077 tgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 14430012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 20 - 225
Target Start/End: Original strand, 18154676 - 18154877
Alignment:
Q  20 tgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgt 119  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18154676 tgcgatctgtgtcgcatgatttgattaaagatggaccattgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatatgtgaagctgttatgagatgt 18154775  T
Q  120 taa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgcttttatttgatatctttata 218  Q
    ||| ||||| ||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||     
T  18154776 taatgttgaatatgatgcgatataatgtttaattgcattacttgaa----ttatgaatgaatgattgagatgttgcttg-ttttatttgatatcgttatg 18154870  T
Q  219 tgatgtc 225  Q
    |||||||    
T  18154871 tgatgtc 18154877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 24054749 - 24054560
Alignment:
Q  19 ttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatg 118  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24054749 ttgcgatctgtgtcgcataattcgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataaggagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatg 24054650  T
Q  119 tta-agttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgcttttatttgatat 211  Q
    |||  ||||||||| ||||||| | ||| |||| | |||||||||||    | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24054649 ttagtgttgattatgatgtgatatgatgtttaaatacattacttgaa----ttatgaatgaaagattgagatgatgcttgcttttaattgatat 24054560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 225
Target Start/End: Original strand, 19649312 - 19649525
Alignment:
Q  8 aagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagct 107  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| || ||| |||||||||||||||||||||     
T  19649312 aagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtattgagacctaaattagaagttaactgcaatctgtgaagca 19649411  T
Q  108 gttatgaaatgtta-agttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgcttttattt 206  Q
    |||| |  ||||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||| || ||| || ||||||||    
T  19649412 gttaagtgatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaa----ttatgaatgaatgattgagatgttgc-tgtttttattt 19649506  T
Q  207 gatatctttatatgatgtc 225  Q
    |||||  |||| |||||||    
T  19649507 gatattgttatgtgatgtc 19649525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 11880547 - 11880459
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactg 93  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11880547 tgcaagtgaggatgttgcgatatgtgtcgcataatttgatttgagatggacccttgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactg 11880459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 3272058 - 3271955
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  3272058 ggtagtagtgagacctatataagatgttaaatgaaatatgtgaagctgttatgaactattaagctgattatgatgtgatttactgattaattgcattact 3271959  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  3271958 tgaa 3271955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 12318351 - 12318249
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12318351 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgttaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattact 12318253  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  12318252 tgaa 12318249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Original strand, 15605154 - 15605256
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||||||  | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15605154 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgttaag-tgattataatgtgatttattgattgattgcattact 15605252  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  15605253 tgaa 15605256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 17137888 - 17138003
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| || |||||| || |||||| || | | |||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17137888 tgcaagtgagaatgttgtgatctgtgttgcttgaattgattagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaa 17137987  T
Q  105 gctgttatgaaatgtt 120  Q
    |||| ||||| |||||    
T  17137988 gctgatatgagatgtt 17138003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 11312872 - 11312770
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||||||  | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11312872 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattact 11312774  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  11312773 tgaa 11312770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 16583479 - 16583378
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||  | |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  16583479 ggtactaatgagacctatataagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgattt-atgattgattgcattact 16583382  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  16583381 tgaa 16583378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 12187273 - 12187205
Alignment:
Q  40 ttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctg 108  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12187273 ttgattagagatggaccattaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg 12187205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 15580904 - 15580813
Alignment:
Q  72 gacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||| || ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  15580904 gacctatttaggatgttaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaag-tgattataatgtgatttattaattgattgcattacttgaa 15580813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 33331 - 33229
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  33331 ggtagtaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattact 33233  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  33232 tgaa 33229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Original strand, 70647 - 70749
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  70647 ggtagtaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattact 70745  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  70746 tgaa 70749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Original strand, 74756 - 74858
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  74756 ggtagtaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattact 74854  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  74855 tgaa 74858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Original strand, 9446040 - 9446143
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||||||  || ||| |||||||||| | | ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  9446040 ggtagtaatgaaacatatttaagatgttagccggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattact 9446139  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  9446140 tgaa 9446143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 2760347 - 2760265
Alignment:
Q  80 taagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttga 163  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| | || || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2760347 taagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-taaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttga 2760265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Original strand, 13635351 - 13635453
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||| ||||| | ||||| |||||| ||||| |  | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13635351 ggtactaatgaggcctatttaagatattaacagagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattact 13635449  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  13635450 tgaa 13635453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Original strand, 20569477 - 20569580
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||| |||  |  ||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20569477 ggtagtaatgaaacctatttaagatgttagctgatacatgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattact 20569576  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  20569577 tgaa 20569580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 15084040 - 15083979
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15084040 gctgttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 15083979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 39722110 - 39722049
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  39722110 gctgttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 39722049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 42205338 - 42205257
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgattta 142  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||  | |||||||||||||||||| | ||||| |  || ||||||||||||    
T  42205338 ggtagtaatgtgacctatttgagatgttaactgagacctgtgaagctgttatgaattattaagctatttgtaatgtgattta 42205257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 166
Target Start/End: Original strand, 45170272 - 45170329
Alignment:
Q  109 ttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  45170272 ttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 45170329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 166
Target Start/End: Original strand, 25927431 - 25927490
Alignment:
Q  107 tgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  25927431 tgttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 25927490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 178
Target Start/End: Original strand, 39267847 - 39267898
Alignment:
Q  127 attataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatga 178  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  39267847 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatagtattgaatga 39267898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Original strand, 1859012 - 1859073
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  1859012 gctgttatgaactgctaagttgtttgtagtgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 1859073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Original strand, 13918706 - 13918767
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  13918706 gctgttatgaactgctaagttgtttgtagtgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 13918767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 39722452 - 39722388
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39722452 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattaattgcattacttgaa 39722388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 139
Target Start/End: Original strand, 2530044 - 2530102
Alignment:
Q  80 taagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgat 139  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  2530044 taagatgttaactgggaactgtgaagctattgtgaaatgttaag-tgattataatgtgat 2530102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 160
Target Start/End: Original strand, 2530316 - 2530371
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||| ||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2530316 gctgtcatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattact 2530371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 166
Target Start/End: Original strand, 2832389 - 2832428
Alignment:
Q  127 attataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  2832389 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaat 2832428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 166
Target Start/End: Original strand, 9751703 - 9751742
Alignment:
Q  127 attataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  9751703 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaat 9751742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 12715050 - 12714986
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  12715050 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 12714986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 12718854 - 12718790
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  12718854 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 12718790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 12723765 - 12723701
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  12723765 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 12723701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 16114427 - 16114363
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16114427 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 16114363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 16117580 - 16117516
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16117580 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 16117516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Original strand, 16907121 - 16907185
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16907121 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 16907185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 18279589 - 18279525
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  18279589 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 18279525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 18283552 - 18283488
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  18283552 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 18283488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Original strand, 8782 - 8999
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  8782 tgcaagtgaggatattgcgacctgtgtcgcataattcgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgtaatctgtgaa 8881  T
Q  105 gctgttatgaaatgtt-aagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgctttta 203  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||  | ||| || ||| |||||||||||    | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  8882 gctgttatgaaatgttgatgttgaatatgatgtgagatgatgtttgatttcattacttgaa----ttatgaatgaatgattgagatgatgcttgcttgta 8977  T
Q  204 tttgatatctttatatgatgtc 225  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  8978 tttgatatcgttatatgatgtc 8999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 32728 - 32516
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||    
T  32728 tgcaagtgaggatatcgcgatctgtgtcgcataatttgtttagagttggacccctgggtagtaaagtgacct-tttaaaatgttaattgcaatctgtgaa 32630  T
Q  105 gctgttatgaaatgttaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgctttta 203  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||| ||    |||||||||    
T  32629 gctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttga----gttatgaatgaatgattgagatg----ttgctttta 32538  T
Q  204 tttgatatctttatatgatgtc 225  Q
    ||||||||| |||| |||||||    
T  32537 tttgatatcgttatgtgatgtc 32516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 6130 - 6295
Alignment:
Q  1 tgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||    
T  6130 tgaatgcaagtgaggatgttgcgacttgtgtcgcataacttgattagagatggacccctaagtagtaatgtgatctatttaggatgttaaatgcaatctg 6229  T
Q  101 tgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6230 tgaagctattatgaaatgttaagttgtttatattgtgatttaattattaattgcattacttgaaat 6295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 21390 - 21555
Alignment:
Q  1 tgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  21390 tgaatgcaagttaggatgttgcgatctgtttcgcataaattgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatttg 21489  T
Q  101 tgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21490 tgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgtattacttgaaat 21555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Original strand, 80616 - 80677
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || |||||||  | |||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  80616 gctgttatgaactgctaagttgtctgtaatgtgatttaatgattaaatgcattgctcgaaat 80677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 70090 - 69875
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  70090 tgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaa 69991  T
Q  105 gctgttatgaaatgtta-agttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgctttta 203  Q
    |||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||| || ||| || |||||    
T  69990 gctgttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaa----ttatgaatgaatgattgagatgttgc-tgttttta 69896  T
Q  204 tttgatatctttatatgatgtc 225  Q
     |||||||| |||| |||||||    
T  69895 -ttgatatcgttatgtgatgtc 69875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 164
Target Start/End: Original strand, 10471 - 10568
Alignment:
Q  66 taatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||  | |||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10471 taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatactaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 10568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 186
Target Start/End: Original strand, 18278 - 18456
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  18278 tgcaagtgaggatattgcgatttgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatttaagaagttaactacaatctgtgaa 18377  T
Q  105 gctgttatgaaatgttaa-gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattga 186  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    || ||||||||||||||||    
T  18378 gctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatttaacgaataattgcattacttga----gttatgaatgaatgattga 18456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Original strand, 65618 - 65834
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||     
T  65618 tgcaagtgaggatattgcgatctttgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaacctgtgat 65717  T
Q  105 gctgttatgaaatgtta-agttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgctttta 203  Q
     ||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||    | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  65718 cctgttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattaattgaa----ttatgaatgaatgattgagatgatgcttg-tttta 65812  T
Q  204 tttgatatctttatatgatgtc 225  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  65813 tttgatatccttatatgatgtc 65834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 53789 - 53687
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||||||  | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  53789 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattact 53691  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  53690 tgaa 53687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Original strand, 36348 - 36409
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  36348 gctgttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 36409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 451 - 290
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||||||||| ||  || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||    
T  451 tgcaagttaggatatttggatctgtgtcgcataaattgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctaattaagatgttaacggaaatctgtgaa 352  T
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  351 gctgttatgaactgttaagttgattataatgtgatttaatgactaattgcattacttgaaat 290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 1788 - 1623
Alignment:
Q  1 tgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||| |||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  1788 tgaatgcaagttagtatgttgcgatctgttttgcataaattgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctg 1689  T
Q  101 tgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1688 tgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 1623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 27 - 225
Target Start/End: Original strand, 4780 - 4979
Alignment:
Q  27 tgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaa-gtt 125  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4780 tgtgtcgcataatttgatcagaggtggactcttgggtagcattatgacctatataagaagtttactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgtt 4879  T
Q  126 gattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgcttttatttgatatctttatatgatgtc 225  Q
    || ||| |||| |  | ||| ||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4880 gaatatgatgtaagatgatgtttattggcaatacttgaaatgttaatgaatgaatgattgagatgatgcttgcttttatttgatatccttatatgatgtc 4979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20256 - 20061
Alignment:
Q  26 ctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgtta-agt 124  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  20256 ctgtgtcgcatgatttgattagggatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaacctgtgaagctgttatgagatgttagtgt 20157  T
Q  125 tgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgcttttatttgatatctttatatgatgt 224  Q
    ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  20156 tgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaa----ttatgaatgaatgattgagatgatgcttg-ttttatttgatattgttatatgatgt 20062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1634 - 1420
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||  |||    
T  1634 tgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttgggtagtattgagacctatataagaagttaaatgcaatctacgaa 1535  T
Q  105 gctgttatgaaatgtta-agttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgctttta 203  Q
    |||||||| | ||||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||   |||| |||||||||    
T  1534 gctgttattagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaa----ttatgaatgaatgattga---gatgattgctttta 1442  T
Q  204 tttgatatctttatatgatgtc 225  Q
    ||||||||| ||  ||||||||    
T  1441 tttgatatcgttgcatgatgtc 1420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 688 - 523
Alignment:
Q  1 tgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| | ||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||  |||||    
T  688 tgaatgcaagttaggatgttgcgatctgtttcgcataagttgatttgggatggacccttaggtagtaatgcgacctatttaagatgttaattgagatctg 589  T
Q  101 tgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    |||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  588 tgaagctactatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaat 523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 36731 - 36535
Alignment:
Q  26 ctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgtta-agt 124  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  36731 ctgtgtcgcatgatttgtttagagaaggacccttgggtagtaatgagacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgttagtgt 36632  T
Q  125 tgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgcttttatttgatatctttatatgatgt 224  Q
    ||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||| || ||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  36631 tgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaact----atgaatgaatgattgagatgttgcgtgtttatatttgatatcgttatatgatgt 36536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Original strand, 16174 - 16315
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16174 tgcaagtgaggttgttgcgatctgtgtcgcataatttgattagaggtggacccttgggtagtaatatgacctatataagaagttaactgcaatctgtgaa 16273  T
Q  105 gctgttatgaaatgttaa-gttgattataatgtgatttaatg 145  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||    
T  16274 gctgttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatg 16315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 40 - 166
Target Start/End: Original strand, 18516 - 18642
Alignment:
Q  40 ttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgat 139  Q
    |||||| | ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18516 ttgatttgggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatggtatgttgattataatgtgat 18615  T
Q  140 ttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18616 ttaatgattaattccattacttgaaat 18642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1895 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold1895
Description:

Target: scaffold1895; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Original strand, 1052 - 1193
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  1052 tgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggatccttgggtagtaatatgacctatataagaagttaactgcaatcagtgaa 1151  T
Q  105 gctgttatgaaatgttaa-gttgattataatgtgatttaatg 145  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||| |||||    
T  1152 gctgttatgaaatattaatgttgaatatgatgtgatataatg 1193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 61 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 15321 - 15216
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15321 ggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttataaaaagttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 15222  T
Q  161 tgaaat 166  Q
    ||||||    
T  15221 tgaaat 15216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 42871 - 42752
Alignment:
Q  47 gagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatga 146  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  42871 gagatggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaactgttaagctgattctaatgtgatttaatga 42772  T
Q  147 ttaattgcattacttgaaat 166  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  42771 ttaaatgcattacttgaaat 42752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 868 - 715
Alignment:
Q  13 aggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttat 112  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  868 aggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggacccttcggtagtaatgagacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctgttac 769  T
Q  113 gaaatgttaa-gttgattataatgtgatttaatgatt-aattgcattacttgaa 164  Q
    |  ||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  768 gtgatgttaatgttgaatatgatgcgatttaatgattaaattgcactacttgaa 715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 6237 - 6401
Alignment:
Q  1 tgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctg 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| |||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  6237 tgaatgcaagttaggatattgcgatttgtttcgcataagttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatatg 6336  T
Q  101 tgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    |||||||||| |||| || ||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  6337 tgaagctgtt-tgaactgctaacttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 6401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 1191 - 1027
Alignment:
Q  1 tgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctg 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||||||| | ||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  1191 tgaatgcaaattaggatgttgcgatctgtgtcgcacaaattgattagggttggacccttaagtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctg 1092  T
Q  101 tgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||| |||||| |||  || ||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  1091 tgaggctgtt-tgacctgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaaat 1027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 2124 - 1960
Alignment:
Q  1 tgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctg 100  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||| || |||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  2124 tgaatacaagttgggatgttgcgatctgtttcgcacaaattgattagagttggacccttagggagtaatgtgacctatttaagatgttaaccgaaatctg 2025  T
Q  101 tgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    |||| ||||| |||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2024 tgaaactgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaat 1960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 9806 - 9642
Alignment:
Q  1 tgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctg 100  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||| || |||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  9806 tgaatacaagttgggatgttgcgatctgtttcgcacaaattgattagagttggacccttagggagtaatgtgacctatttaagatgttaaccgaaatctg 9707  T
Q  101 tgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    |||| ||||| |||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9706 tgaaactgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaat 9642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 44375 - 44211
Alignment:
Q  1 tgaatgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||| |||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  44375 tgaatgcaagttagtatgttgcgatctttttcgcataagttgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctg 44276  T
Q  101 tgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||| || | || || ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  44275 tgaagct-ttttaaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttaaaat 44211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 139
Target Start/End: Original strand, 38318 - 38439
Alignment:
Q  19 ttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatg 118  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  38318 ttgcgatctgtgtcgcataatttgattagagttggacccttgggtagtaatgtgacctatataagaagttagttgcaatctgtgaagctgttatgaaatg 38417  T
Q  119 ttaa-gttgattataatgtgat 139  Q
    |||| ||||| ||| |||||||    
T  38418 ttaatgttgaatatgatgtgat 38439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 139
Target Start/End: Original strand, 23506 - 23626
Alignment:
Q  19 ttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatg 118  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  23506 ttgcgatctttgtcgcataatttgattaatgttggacccttgggtagtaatgtgacctata-aagaagttagttgcaatctgtgaagctgttatgaaatg 23604  T
Q  119 ttaa-gttgattataatgtgat 139  Q
    |||| ||||| ||| |||||||    
T  23605 ttaatgttgaatatgatgtgat 23626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 175046 - 174882
Alignment:
Q  20 tgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgt 119  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  175046 tgcgatctgtgtcgcatgatttgattagagatggaccctttggtagtaatgagacctatataagaagttaactgaaatctgtgaagctattatgagatgt 174947  T
Q  120 ta-agttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgag 187  Q
    ||  ||||| ||| | ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    | |||||||||||||||||    
T  174946 tagtgttgaatatgacgtgatataatgtttagttgcattacttgaa----ttatgaatgaatgattgag 174882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1326 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1326
Description:

Target: scaffold1326; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 63 - 166
Target Start/End: Original strand, 1373 - 1476
Alignment:
Q  63 tagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttg 162  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  1373 tagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgattataatgtgacttaacgaataattgcattacttg 1472  T
Q  163 aaat 166  Q
    ||||    
T  1473 aaat 1476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 166
Target Start/End: Original strand, 1920 - 2071
Alignment:
Q  16 atgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatg-a 114  Q
    |||||| || ||||||||||| | | |||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  1920 atgttgtgatctgtgtcgcatgaatcgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatattaactgaaatatgtgaagctgttatgaa 2019  T
Q  115 aatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    |||| ||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2020 aatgctaagttgtttgtaatgtaatttaatgattaaatgcattacttgaaat 2071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 186
Target Start/End: Original strand, 48285 - 48464
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| || || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  48285 tgcaagtaagaatattgcgatctgtgtcacataatttgattagagatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaaatgcaatatgtgaa 48384  T
Q  105 gctgttatgaaatgttaa-gttgattataatgtgatttaatgattaa-ttgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattga 186  Q
    |||||| ||  ||||||| ||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||  ||||||| |    ||||||||||||||||    
T  48385 gctgttgtgtgatgttaaagttgaatatgacgtgatttaataattaaattgcaccacttgaatt----atgaatgaatgattga 48464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 61 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 4665 - 4560
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||||||| || ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4665 ggtagtagtgagacctatataagaagttaactgtaaactgtgaaactattatgaaatgctaagttgattataatgtgatttattgattaattgcattact 4566  T
Q  161 tgaaat 166  Q
    ||||||    
T  4565 tgaaat 4560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24094 - 23924
Alignment:
Q  49 gatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgtta-agttgattataatgtgatttaatgat 147  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||| ||| ||||||| ||||| |    
T  24094 gatggacccttgggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttaagagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatg-t 23996  T
Q  148 taattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgcttttatttgatatctttatatgatgtc 225  Q
    ||||| ||||||||||| |    ||||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||  ||||||||||||    
T  23995 taatttcattacttgaact----atgaatgaatgattgagatgttgct--gttttatttgatattgttatatgatgtc 23924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 27117 - 27002
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||| ||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27117 tgcaagtgaggatattgcgatctgtttcgaatattttgtttagagatggacccttgggtagtaatgagacatatataagaagttaactgcaatctgtgaa 27018  T
Q  105 gctgttatgaaatgtt 120  Q
    |||||||||| |||||    
T  27017 gctgttatgagatgtt 27002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 5820 - 5719
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5820 ggtagtaatgtgacctat-taagatgttaactgagatctttgaagctgttatgaattgttaagctgattataatgtgattaaatgaataattgcattact 5722  T
Q  161 tga 163  Q
    |||    
T  5721 tga 5719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 7015 - 6914
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  7015 ggtagtaatgtgacctat-taagatgttaactgagatctttgaagctgttatgaattgttaagctgattataatgtgattaaatgaataattgcattact 6917  T
Q  161 tga 163  Q
    |||    
T  6916 tga 6914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 163
Target Start/End: Original strand, 19173 - 19275
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  19173 ggtagtagtgagacctatataagatgttaaatgaaatctgtgaagctgttatgaactattaagctgattatgatgtgatttattgattaattgcattact 19272  T
Q  161 tga 163  Q
    |||    
T  19273 tga 19275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 163
Target Start/End: Original strand, 192197 - 192300
Alignment:
Q  60 gggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattac 159  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  192197 gggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagttgttatgaatttttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattac 192296  T
Q  160 ttga 163  Q
    ||||    
T  192297 ttga 192300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 163
Target Start/End: Original strand, 4106 - 4208
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||| |||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4106 ggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatatgtgaatctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattact 4205  T
Q  161 tga 163  Q
    |||    
T  4206 tga 4208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 21631 - 21746
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| || |||||| || |||||| || | | ||| |||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21631 tgcaagtgagaatgttgtgatctgtgttgcttgaattggttagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 21730  T
Q  105 gctgttatgaaatgtt 120  Q
    |||||||||| |||||    
T  21731 gctgttatgagatgtt 21746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 29523 - 29638
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 104  Q
    ||||||| || |||||| || |||||| || | | ||| |||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29523 tgcaagtgagaatgttgtgatctgtgttgcttgaattggttagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagatgttaactgcaatctgtgaa 29622  T
Q  105 gctgttatgaaatgtt 120  Q
    |||||||||| |||||    
T  29623 gctgttatgagatgtt 29638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 143 - 221
Target Start/End: Original strand, 7771 - 7849
Alignment:
Q  143 atgattaattgcattacttgaaatggtaatgaatgaatgattgagttgatgcttgcttttatttgatatctttatatga 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  7771 atgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatgactgattgagatgatgcttgcttttatttgatatcgttacatga 7849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 163
Target Start/End: Original strand, 2317 - 2419
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||||||  |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  2317 ggtagtaatgaaacctatcttagatgttaactggaatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatacattact 2416  T
Q  161 tga 163  Q
    |||    
T  2417 tga 2419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 163
Target Start/End: Original strand, 10177 - 10279
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||||||  |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  10177 ggtagtaatgaaacctatcttagatgttaactggaatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatacattact 10276  T
Q  161 tga 163  Q
    |||    
T  10277 tga 10279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 163
Target Start/End: Original strand, 35393 - 35494
Alignment:
Q  62 gtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattactt 161  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||  | |||||||||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35393 gtagtaatgtgacctatttgagatgttaactgagacctgtgaagctgttatgaattattaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactt 35492  T
Q  162 ga 163  Q
    ||    
T  35493 ga 35494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 160
Target Start/End: Original strand, 15090 - 15190
Alignment:
Q  60 gggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattac 159  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||  | || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15090 gggtagtaatgtgacctacttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgctaagcagtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattac 15189  T
Q  160 t 160  Q
    |    
T  15190 t 15190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 160
Target Start/End: Original strand, 19612 - 19712
Alignment:
Q  60 gggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattac 159  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||  | || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19612 gggtagtaatgtgacctacttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgctaagcagtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattac 19711  T
Q  160 t 160  Q
    |    
T  19712 t 19712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 76 - 164
Target Start/End: Original strand, 413947 - 414035
Alignment:
Q  76 tatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  413947 tatataagatgttaactggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaa 414035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 71537 - 71454
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatg 145  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||  | |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  71537 ggtactaatgagacctatttaagatgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaag-tgattataatgtgatataatg 71454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 71241 - 71188
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcatta 158  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  71241 gctgttatgaactgttaagttgtttgtaatgtgattttatgattaaatgcatta 71188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 7706 - 7603
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||| ||||||| || ||| |||||||||    
T  7706 ggtagtaatgaaacctatataagatgttaactggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgcgatttaacgaataaatgcattact 7607  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  7606 tgaa 7603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 2026 - 1922
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||| |||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2026 ggtagtagtgagacctatataagatgttaaatgaaatatgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattact 1928  T
Q  161 tgaaat 166  Q
    ||||||    
T  1927 tgaaat 1922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 2135 - 2055
Alignment:
Q  40 ttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgtt 120  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  2135 ttgattagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgatatgagatgtt 2055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 8796 - 8693
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  8796 ggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattact 8697  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  8696 tgaa 8693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Original strand, 66297 - 66399
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||||||  | |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  66297 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattact 66395  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  66396 tgaa 66399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 514 - 445
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgatta 130  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  514 ggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgatta 445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 166
Target Start/End: Original strand, 17019 - 17097
Alignment:
Q  87 ttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||| | ||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17019 ttaactgaattctatgaagctattataaactgt-aagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 17097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 139
Target Start/End: Original strand, 4690 - 4764
Alignment:
Q  65 gtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaa-gttgattataatgtgat 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  4690 gtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-tatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgat 4764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 13128 - 13026
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||||||  | ||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13128 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtggagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattact 13030  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  13029 tgaa 13026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 19393 - 19313
Alignment:
Q  80 taagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattactt 161  Q
    |||||| |||||||  | ||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19393 taagatattaactgagaactgtggagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattactt 19313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Original strand, 422413 - 422516
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| | |||||||| || ||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  422413 ggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactagaatctgtgaagttgttaagaactattaagttgtttgtaatgtgatttaacgactaaatgcattact 422512  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  422513 tgaa 422516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 173503 - 173412
Alignment:
Q  72 gacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    |||||||  ||||| |||||||  | || ||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  173503 gacctattaaagatattaactgagaactttgaagctattatgaaatgctaagt-gattatattgtgatatattgattgattgcattacttgaa 173412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 166
Target Start/End: Original strand, 30637 - 30730
Alignment:
Q  72 gacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||| |  ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30637 gacctatttaagatgttaactgaaatctgtaaagttgtt-tgaacttctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaat 30730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 161
Target Start/End: Original strand, 13369 - 13468
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||||||  | ||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13369 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgataactgtgtagctattatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattact 13467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 7549 - 7469
Alignment:
Q  40 ttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgtt 120  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||    
T  7549 ttgattagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctatgaaactgatatgagatgtt 7469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 12646 - 12544
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12646 ggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattact 12548  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  12547 tgaa 12544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 5)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 80936 - 80834
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||| |||| || ||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  80936 ggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctgtattgaaatgctaag-tgtttataatgtgatttattaattgattgcattact 80838  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  80837 tgaa 80834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 13017 - 12894
Alignment:
Q  40 ttgattagagatggacccctgggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgtt-aagttgattataatgtga 138  Q
    |||||||  ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||| |||||  |||||||||| ||||      
T  13017 ttgattatggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatttgtgaagctaatatgagatgttggagttgattatgatgtat 12918  T
Q  139 tttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    | ||||| |||  |||||||||||||    
T  12917 tataatgttta--tgcattacttgaa 12894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 80559 - 80498
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| |  ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  80559 gctgttatgaactactaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 80498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Original strand, 61532 - 61596
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  61532 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 61596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Original strand, 65448 - 65512
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  65448 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 65512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 164
Target Start/End: Original strand, 18551 - 18616
Alignment:
Q  98 ctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  18551 ctgtgaagcttttatgaaatgctaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 18616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Original strand, 14349 - 14410
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14349 gctgttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 14410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Original strand, 207764 - 207825
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  207764 gctgttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaat 207825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Original strand, 189639 - 189700
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  189639 gctgttatgaactgctaagttgtttataatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 189700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 157
Target Start/End: Original strand, 9547 - 9642
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcatt 157  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||||||  | |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  9547 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagcttttatgaaattttaagt-gattataatgtgatttattgattgatcgcatt 9642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 15695 - 15643
Alignment:
Q  5 tgcaagttaggatgttgcgacctgtgtcgcataatttgattagagatggaccc 57  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15695 tgcaagtgaggatattgcgatctgtgtcgcataatttgattagagatggaccc 15643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 61 - 164
Target Start/End: Original strand, 3757 - 3859
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    |||| ||||| ||||||| | ||||||||||||  || ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  3757 ggtactaatgagacctatctgagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattact 3855  T
Q  161 tgaa 164  Q
    ||||    
T  3856 tgaa 3859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 555 - 485
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattat 131  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||    
T  555 ggtagtagtgagacctatataagatgttaaatgaaatctgtgaagttgttatgaactattaagctgattat 485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 163
Target Start/End: Original strand, 7152 - 7253
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 160  Q
    ||||||| | ||| |||| | ||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||  || || ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  7152 ggtagtattatgatctatgtgagatgttaactgagatctgtgaggctgttatgaaaagttaaactg-ttgtaatgtgatttaaagattaaatgcattact 7250  T
Q  161 tga 163  Q
    |||    
T  7251 tga 7253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 45342 - 45272
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattat 131  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||    
T  45342 ggtagtagtgagacctatataagatgttaaatgaaatctgtgaagttgttatgaactattaagctgattat 45272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Original strand, 36202 - 36263
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    |||||| |||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  36202 gctgttgtgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 36263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Original strand, 35863 - 35927
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  35863 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 35927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 6859 - 6798
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  6859 gctgttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 6798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Original strand, 32922 - 32983
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  32922 gctgttatgaactgctaagttgtttttaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 32983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 31063 - 31002
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  31063 gctgttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 31002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 157
Target Start/End: Original strand, 19899 - 19994
Alignment:
Q  61 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcatt 157  Q
    |||| ||||| |||||||  ||||| |||| ||  | |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19899 ggtactaatgagacctattaaagatattaattgagaactgtgaagcttttatgaaacgttaagt-gattataatgtgatttattgattgattgcatt 19994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 159
Target Start/End: Original strand, 20391 - 20445
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattac 159  Q
    ||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20391 gctgttatgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattac 20445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Original strand, 11763 - 11824
Alignment:
Q  105 gctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11763 gctgttatgaactgctaagttgtttttaatgcgatttaatgattaaatgcattactcgaaat 11824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 11592 - 11511
Alignment:
Q  73 acctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||          ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  11592 acctatttaagatgttaactggaatctgtgaagctgtta----------agttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaa 11511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1052 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1052
Description:

Target: scaffold1052; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 3074 - 3035
Alignment:
Q  127 attataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3074 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaat 3035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 166
Target Start/End: Original strand, 9990 - 10029
Alignment:
Q  127 attataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  9990 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaat 10029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Original strand, 5021 - 5085
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  5021 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 5085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0268
Description:

Target: scaffold0268; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Original strand, 928 - 992
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  928 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Original strand, 58639 - 58703
Alignment:
Q  99 tgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaa 164  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  58639 tgtgaagctatattgaaatgctaagt-gtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaa 58703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 166
Target Start/End: Original strand, 73725 - 73754
Alignment:
Q  137 gatttaatgattaattgcattacttgaaat 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73725 gatttaatgattaattgcattacttgaaat 73754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University