View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11419_low_7 (Length: 410)

Name: NF11419_low_7
Description: NF11419
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11419_low_7
NF11419_low_7
[»] chr1 (28 HSPs)
chr1 (1-403)||(25277328-25277729)
chr1 (1-403)||(45045464-45045857)
chr1 (1-403)||(37345106-37345499)
chr1 (21-403)||(26224506-26224887)
chr1 (21-396)||(27088078-27088442)
chr1 (32-404)||(33600104-33600475)
chr1 (21-403)||(6817677-6818050)
chr1 (40-403)||(50555064-50555417)
chr1 (32-379)||(46582573-46582911)
chr1 (32-389)||(15105247-15105595)
chr1 (32-301)||(51895228-51895488)
chr1 (32-322)||(31237556-31237829)
chr1 (32-301)||(3012516-3012776)
chr1 (32-245)||(2870400-2870612)
chr1 (32-302)||(52642698-52642959)
chr1 (21-157)||(4855164-4855300)
chr1 (21-157)||(34777335-34777471)
chr1 (32-172)||(8168514-8168654)
chr1 (327-403)||(37087316-37087392)
chr1 (71-184)||(9120813-9120926)
chr1 (71-184)||(1443400-1443513)
chr1 (71-184)||(47012213-47012326)
chr1 (318-386)||(42558848-42558916)
chr1 (318-386)||(3369967-3370035)
chr1 (308-380)||(51122987-51123059)
chr1 (40-124)||(3370338-3370422)
chr1 (358-386)||(5784211-5784239)
chr1 (322-386)||(32086009-32086073)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (21-410)||(14388047-14388436)
chr2 (21-410)||(6798315-6798696)
chr2 (21-403)||(16763755-16764128)
chr2 (32-403)||(2767734-2768096)
chr2 (32-403)||(39455979-39456341)
chr2 (21-403)||(17697016-17697389)
chr2 (32-403)||(24206492-24206864)
chr2 (21-336)||(19907308-19907613)
chr2 (32-403)||(6784249-6784612)
chr2 (33-301)||(40561046-40561305)
chr2 (195-403)||(44708783-44708983)
chr2 (144-403)||(34401144-34401394)
chr2 (267-403)||(42518389-42518525)
chr2 (21-142)||(39663994-39664115)
chr2 (21-116)||(44708996-44709091)
chr2 (264-386)||(4047377-4047499)
chr2 (71-184)||(37021388-37021501)
chr2 (263-386)||(20941734-20941856)
chr2 (318-386)||(26581545-26581613)
chr2 (264-386)||(161432-161554)
chr2 (239-302)||(19581960-19582023)
chr2 (34-79)||(37646238-37646283)
chr2 (318-383)||(38149341-38149406)
chr2 (40-124)||(161216-161300)
chr2 (308-379)||(7744707-7744778)
chr2 (358-386)||(11022252-11022280)
chr2 (32-64)||(42518524-42518556)
[»] chr6 (15 HSPs)
chr6 (1-403)||(32517641-32518034)
chr6 (21-396)||(18644063-18644437)
chr6 (21-403)||(7371944-7372316)
chr6 (21-410)||(32438035-32438414)
chr6 (21-379)||(20524177-20524526)
chr6 (32-353)||(11356010-11356321)
chr6 (32-302)||(7050560-7050821)
chr6 (71-404)||(33267838-33268155)
chr6 (21-302)||(10569192-10569462)
chr6 (257-403)||(9399135-9399281)
chr6 (80-302)||(6901999-6902212)
chr6 (81-184)||(32455022-32455125)
chr6 (32-86)||(6900287-6900341)
chr6 (318-386)||(17935548-17935616)
chr6 (361-403)||(11356316-11356358)
[»] chr8 (30 HSPs)
chr8 (1-403)||(5037207-5037599)
chr8 (21-404)||(41041545-41041918)
chr8 (32-379)||(27691967-27692305)
chr8 (21-379)||(33707795-33708144)
chr8 (21-400)||(40338637-40339014)
chr8 (32-403)||(29237995-29238357)
chr8 (32-403)||(15307094-15307455)
chr8 (32-403)||(15487463-15487824)
chr8 (40-403)||(27405104-27405458)
chr8 (32-301)||(22273060-22273328)
chr8 (32-403)||(3152492-3152862)
chr8 (32-301)||(42942595-42942855)
chr8 (32-302)||(26239504-26239765)
chr8 (51-387)||(13485114-13485417)
chr8 (30-302)||(41824733-41824996)
chr8 (21-239)||(9672292-9672509)
chr8 (21-157)||(8609005-8609141)
chr8 (21-157)||(13107571-13107707)
chr8 (32-157)||(38548028-38548153)
chr8 (32-302)||(7744193-7744454)
chr8 (32-172)||(35510217-35510357)
chr8 (21-157)||(13283186-13283317)
chr8 (32-172)||(33761642-33761782)
chr8 (32-171)||(600809-600948)
chr8 (35-401)||(11720339-11720697)
chr8 (264-383)||(12515887-12516006)
chr8 (318-383)||(28432939-28433004)
chr8 (318-386)||(25371236-25371304)
chr8 (264-347)||(24285797-24285880)
chr8 (344-386)||(10770940-10770982)
[»] chr4 (30 HSPs)
chr4 (21-404)||(35402628-35403002)
chr4 (21-403)||(49523922-49524295)
chr4 (32-403)||(41760688-41761050)
chr4 (21-403)||(11254891-11255264)
chr4 (21-379)||(43520228-43520577)
chr4 (21-403)||(51012717-51013090)
chr4 (21-410)||(2692239-2692620)
chr4 (21-363)||(42981410-42981743)
chr4 (32-302)||(48645809-48646070)
chr4 (32-302)||(54386942-54387203)
chr4 (40-323)||(834096-834370)
chr4 (21-172)||(41782312-41782463)
chr4 (40-323)||(5438593-5438863)
chr4 (263-387)||(11641112-11641236)
chr4 (32-172)||(319845-319985)
chr4 (32-172)||(4172685-4172825)
chr4 (32-172)||(33265386-33265526)
chr4 (32-172)||(43508029-43508169)
chr4 (34-245)||(11640853-11641068)
chr4 (21-109)||(52867414-52867502)
chr4 (325-403)||(41760561-41760638)
chr4 (32-116)||(11602478-11602562)
chr4 (318-383)||(32652936-32653001)
chr4 (264-386)||(28101484-28101606)
chr4 (318-386)||(4614587-4614655)
chr4 (273-386)||(7150446-7150559)
chr4 (331-386)||(27385571-27385626)
chr4 (329-383)||(13449570-13449624)
chr4 (40-124)||(7150221-7150305)
chr4 (318-370)||(10544180-10544232)
[»] chr3 (39 HSPs)
chr3 (32-403)||(54899254-54899624)
chr3 (21-404)||(27898075-27898448)
chr3 (32-403)||(30599169-30599530)
chr3 (32-403)||(17516131-17516491)
chr3 (32-403)||(43765942-43766304)
chr3 (21-379)||(44795009-44795358)
chr3 (21-403)||(46198530-46198902)
chr3 (21-363)||(2225165-2225506)
chr3 (32-403)||(44275179-44275539)
chr3 (21-379)||(2661024-2661373)
chr3 (32-403)||(2377817-2378172)
chr3 (32-403)||(21349515-21349877)
chr3 (21-389)||(610404-610763)
chr3 (32-388)||(46113288-46113635)
chr3 (92-403)||(53188661-53188963)
chr3 (32-301)||(23292232-23292492)
chr3 (21-232)||(35904849-35905059)
chr3 (32-302)||(48829886-48830147)
chr3 (32-302)||(51685412-51685673)
chr3 (32-245)||(42280308-42280521)
chr3 (21-157)||(7884091-7884227)
chr3 (21-157)||(41978538-41978674)
chr3 (263-404)||(35904709-35904850)
chr3 (32-172)||(38192456-38192596)
chr3 (32-172)||(53093196-53093336)
chr3 (32-169)||(46609724-46609861)
chr3 (32-164)||(46309812-46309944)
chr3 (34-180)||(24845686-24845833)
chr3 (266-385)||(13466205-13466324)
chr3 (21-96)||(53190118-53190196)
chr3 (318-386)||(32843436-32843504)
chr3 (319-386)||(23876220-23876287)
chr3 (318-383)||(41945414-41945479)
chr3 (318-386)||(35862440-35862508)
chr3 (318-369)||(2976359-2976410)
chr3 (35-124)||(22219218-22219308)
chr3 (308-380)||(49495067-49495139)
chr3 (208-245)||(13466155-13466192)
chr3 (40-116)||(35862699-35862775)
[»] scaffold0564 (1 HSPs)
scaffold0564 (21-403)||(9059-9432)
[»] chr7 (39 HSPs)
chr7 (34-403)||(38473085-38473445)
chr7 (27-403)||(22154696-22155063)
chr7 (27-403)||(22210611-22210978)
chr7 (21-403)||(6604315-6604688)
chr7 (21-403)||(45360127-45360499)
chr7 (32-384)||(23905232-23905575)
chr7 (26-403)||(34775923-34776290)
chr7 (21-389)||(35692326-35692684)
chr7 (21-379)||(27665031-27665380)
chr7 (21-403)||(24227382-24227755)
chr7 (32-403)||(46438470-46438833)
chr7 (21-379)||(29995501-29995850)
chr7 (21-336)||(39858271-39858576)
chr7 (26-403)||(47385168-47385539)
chr7 (32-301)||(37114591-37114851)
chr7 (21-245)||(13168873-13169096)
chr7 (32-302)||(38550316-38550593)
chr7 (249-403)||(69133-69287)
chr7 (239-388)||(48310947-48311096)
chr7 (33-240)||(37792150-37792356)
chr7 (21-172)||(35402544-35402694)
chr7 (21-180)||(48851499-48851657)
chr7 (62-164)||(69032-69134)
chr7 (264-386)||(11683621-11683743)
chr7 (71-184)||(20478921-20479034)
chr7 (264-387)||(32840488-32840610)
chr7 (318-383)||(4321800-4321865)
chr7 (264-371)||(7402914-7403021)
chr7 (266-369)||(23168648-23168751)
chr7 (34-180)||(48310767-48310914)
chr7 (318-383)||(34691873-34691938)
chr7 (308-380)||(34784575-34784647)
chr7 (309-386)||(40360951-40361028)
chr7 (21-66)||(66870-66915)
chr7 (40-124)||(13035621-13035705)
chr7 (318-374)||(13035937-13035993)
chr7 (319-383)||(48302873-48302936)
chr7 (297-336)||(13169123-13169162)
chr7 (145-178)||(63302-63335)
[»] chr5 (25 HSPs)
chr5 (21-403)||(2180564-2180934)
chr5 (21-396)||(21841791-21842157)
chr5 (32-379)||(2853253-2853591)
chr5 (26-336)||(12800723-12801023)
chr5 (40-403)||(42472444-42472798)
chr5 (26-336)||(12737900-12738200)
chr5 (32-322)||(30464679-30464960)
chr5 (32-301)||(8540472-8540732)
chr5 (32-301)||(32134897-32135157)
chr5 (202-403)||(28821364-28821557)
chr5 (21-183)||(28821170-28821332)
chr5 (21-157)||(7268635-7268771)
chr5 (285-403)||(17575700-17575819)
chr5 (285-403)||(17577011-17577130)
chr5 (281-403)||(18624276-18624398)
chr5 (285-403)||(17574980-17575099)
chr5 (21-117)||(24540429-24540525)
chr5 (56-245)||(41494553-41494741)
chr5 (71-184)||(40781430-40781543)
chr5 (71-183)||(29620912-29621024)
chr5 (264-383)||(1344229-1344348)
chr5 (320-386)||(28036377-28036443)
chr5 (266-383)||(1343744-1343861)
chr5 (318-379)||(18341214-18341275)
chr5 (308-380)||(27349967-27350039)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (21-403)||(107547-107919)
[»] scaffold0345 (2 HSPs)
scaffold0345 (32-353)||(363-682)
scaffold0345 (361-403)||(677-719)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (21-184)||(4094-4257)
scaffold0058 (21-184)||(5266-5429)
[»] scaffold0920 (2 HSPs)
scaffold0920 (239-387)||(1497-1643)
scaffold0920 (119-184)||(1686-1751)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 28)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 25277729 - 25277328
Alignment:
Q  1 atatgacttatgatggtatacaaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25277729 atatgacttatgatggtatacaaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatgtctgttgtgaaaatt 25277630  T
Q  101 caaggacctatttgatgatattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataag 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | ||||||    
T  25277629 caaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaattttttt-gacataag 25277531  T
Q  201 ggtttggttcattcattgacaacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaa 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25277530 ggtttggttcagtcattgacaacctcttttcattacaacattacaacattacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaa 25277431  T
Q  301 aatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcct 400  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  25277430 aatactcatatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctttgcccctatcct 25277331  T
Q  401 ttg 403  Q
    |||    
T  25277330 ttg 25277328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 45045857 - 45045464
Alignment:
Q  1 atatgacttatgatggtatacaaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45045857 atatgacttatgatggtatacaaaatgtctatcttttactttttactttgttcaacaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctattgtgaaaatt 45045758  T
Q  101 caaggacctatttgatgatattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | ||||||    
T  45045757 caaggacctatttgatgatattttcactaatttgaagatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaa-tttttttgacataag 45045659  T
Q  201 ggtttggttcattcattgacaacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45045658 ggtttggttcattcattgacaacttcttttcattacaaca--------ttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaa 45045567  T
Q  301 aatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcct 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  45045566 aatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaagcttgccctccaaacctcttctttgcccctatcct 45045467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 403
Target Start/End: Original strand, 37345106 - 37345499
Alignment:
Q  1 atatgacttatgatggtatacaaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37345106 atatgacttatgatggtatacaaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatgtctgttgtgaaaatt 37345205  T
Q  101 caaggacctatttgatgatattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataag 200  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | ||||||    
T  37345206 caaggaactatttgatggtattttcactaatttgaggatcggtatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaa-tttttttgacataag 37345304  T
Q  201 ggtttggttcattcattgacaacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaa 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37345305 ggtttggttcagtcattgacaacctcttttcattacaaca--------ttacatggacttgacacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaa 37345396  T
Q  301 aatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcct 400  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  37345397 aatactcatatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctttgcccatatcct 37345496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 21 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 26224887 - 26224506
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  26224887 caaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatttgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtc 26224788  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||        | ||||| |||||| |||||||||||||    
T  26224787 ttttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgcatataattcaaggaccaatgtgattgaattttttt-gacataaaggtttgattcattcattgac 26224689  T
Q  221 aacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 320  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26224688 aacctcttttcagtacaacattacaacattacatggacttggcacaatacaataacattttaaacaactcagtcaaacaaaatactcctatcaatatctt 26224589  T
Q  321 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  26224588 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgcccttcaaacctcttctcttcccctatcttttg 26224506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 21 - 396
Target Start/End: Original strand, 27088078 - 27088442
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  27088078 caaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaagtcaaggacctatttgatggta 27088177  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||        | || || |||||| |||||||||||||    
T  27088178 ttttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgcatataattcaaggaccaatgtgattgaattttt---gacagaaaggtttgattcattcattgac 27088274  T
Q  221 aacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27088275 aacctcttttcattacaacattac--------atggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcagtcaaacaaaatactcctatcaatatctt 27088366  T
Q  321 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctcccccta 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  27088367 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgtcctccaaacctcttctctgccccta 27088442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 32 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 33600475 - 33600104
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  33600475 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacattgatatctgttgtgaaaattcaaggacatatttgatagtattttcactaat 33600376  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||        | || || |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  33600375 ttgaggatcgaaaggatggatatgcatataattcaaggaccgatttgattgaattttttttgacagaaaggtt-gattcattcattgacaacctcttttc 33600277  T
Q  232 attacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaa 331  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33600276 attacaactttacaacattacatggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaa 33600177  T
Q  332 gctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttgc 404  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  33600176 gctgccttcctagacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttccctgcccctatcatttgc 33600104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 21 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 6818050 - 6817677
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  6818050 caaagtgtctgtctttcactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaaaccaaggacctatttgatggta 6817951  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        | || || |||||| |||||||||||||    
T  6817950 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaattttttt-gacagaaaggtttgattcattcattgac 6817852  T
Q  221 aacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||| |        || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6817851 aacctcttttcattacaacattata--------tgtacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcatatcaatatctt 6817760  T
Q  321 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6817759 aatcaacctaagctcacttcttacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcctttg 6817677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 40 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 50555417 - 50555064
Alignment:
Q  40 tttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaatttgaggat 139  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50555417 tttttaccttgttcagtaaatgtatgcaccaaggatcacaatgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaatttgaggat 50555318  T
Q  140 cgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttcattacaac 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        | || || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50555317 cgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaatttttt-gacagaatgatttgattcattcattgacaacctcttttcattacaac 50555219  T
Q  240 attacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcactt 339  Q
    ||||||        |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50555218 attaca--------tggacttggcacaat-caataacattttaaacaactccatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaaactcactt 50555128  T
Q  340 cctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50555127 cctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcctttg 50555064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 32 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 46582911 - 46582573
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  46582911 tcttttactttttactttgttcagcagatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatttaaactaat 46582812  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||        | || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46582811 ttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaa-atattttgacagaaaggtttggttcattcattgacaacctcttttc 46582713  T
Q  232 attacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaa 331  Q
    |||||||||         |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46582712 attacaaca--------atacatggacttggcacaatacaatatcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcatatcaatatcttaatcaacctaa 46582621  T
Q  332 gctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaa 379  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  46582620 gctcacttcctacaaaatcaagtttatccatcaaccttgtcctccaaa 46582573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 32 - 389
Target Start/End: Original strand, 15105247 - 15105595
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  15105247 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaagatcacaatgatttatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatggtattttcactaat 15105346  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    ||| ||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||          || || |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  15105347 ttggggatcgatatgatggatagacatacaatagaaggaccaatttgattgaaatttcttaa-cagaatggttggattcattcattgacaacctcttttc 15105445  T
Q  232 attacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaa 331  Q
    ||||||||||||||      ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15105446 attacaacattaca------ca--gacttgacacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaattactcctatcaatatcttaatcaacctaa 15105537  T
Q  332 gctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctct 389  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  15105538 gctcatttcctacacaatcaacttcatccatcaaccttgtcatccaaacctcttctct 15105595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 32 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 51895488 - 51895228
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51895488 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacaatgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 51895389  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||        | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51895388 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaagggccaatttgattgaa-tttttttgacataaaggtttgattcattcattgacaacctcttttc 51895290  T
Q  232 attacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 301  Q
    |||||||||        |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51895289 attacaaca--------ttacatggacatgacataatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaa 51895228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 32 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 31237829 - 31237556
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  31237829 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattatcactaat 31237730  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        |  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31237729 ttgaggatcgatataatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaa-attttttgatagaagggtttgattcattcattgacaacctcttttc 31237631  T
Q  232 attacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaa 322  Q
    |                |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31237630 a----------------ttacatggacttggtacaatacaatatcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaa 31237556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 32 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 3012776 - 3012516
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3012776 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacaatgatatctgttgtgaaaatccaaggacctatttgatggtattttcactaat 3012677  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        | || || |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  3012676 ttgaggatcaatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaa-attttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctattttc 3012578  T
Q  232 attacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 301  Q
    || ||||||        ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  3012577 atcacaaca--------ttacatggacttggcacaatacaataacattttaaataactcaatcaaacaaa 3012516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 32 - 245
Target Start/End: Original strand, 2870400 - 2870612
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  2870400 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacaatgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatatttaaactaat 2870499  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||        | || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2870500 ttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaa-atattttgacagaaaggtttggttcattcattgacaacctcttttc 2870598  T
Q  232 attacaacattaca 245  Q
     |||||||||||||    
T  2870599 gttacaacattaca 2870612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 32 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 52642959 - 52642698
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  52642959 tcttttactttttactttgttcagcaaatatatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatggtattttcactaat 52642860  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    ||  ||||||||||||||||||  |||  ||| ||| ||||||||||||||||        | || |||||||   ||||||||||| ||||||||||||    
T  52642859 ttagggatcgatatgatggatagacatgcaatagaaagaccaatttgattgaa-attttttgacagaagggttaaattcattcattggcaacctcttttc 52642761  T
Q  232 attacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaa 302  Q
    |||||||||||||      |||  |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  52642760 attacaacattac------aca--gacttggcacaatgcaataacattttaaacaactcaatcacacaaaa 52642698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 4855300 - 4855164
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4855300 caaattgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggattacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggta 4855201  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgca 157  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4855200 ttttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgca 4855164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 34777471 - 34777335
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34777471 caaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttatgaaaattcaaggacctatttgatggta 34777372  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgca 157  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34777371 ttttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgca 34777335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 32 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 8168654 - 8168514
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  8168654 tcttttacattttactttgtttagcaaatgtatgcacaaaggatcacattgatatctgttatgataattcaatgaccaatttgatggtattttcactaat 8168555  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggacc 172  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  8168554 ttgaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggacc 8168514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 327 - 403
Target Start/End: Original strand, 37087316 - 37087392
Alignment:
Q  327 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37087316 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcatttg 37087392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 71 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 9120926 - 9120813
Alignment:
Q  71 aggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaagga 170  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||    
T  9120926 aggatcacattgatctctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcattaatttgaggatcgaaatgatggatatgattataattcaagga 9120827  T
Q  171 ccaatttgattgaa 184  Q
    ||||| ||||||||    
T  9120826 ccaatgtgattgaa 9120813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 71 - 184
Target Start/End: Original strand, 1443400 - 1443513
Alignment:
Q  71 aggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaagga 170  Q
    ||||| ||| |||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||    
T  1443400 aggattacattgatctctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcattaatttgaggatcgaaatgatggatatgattataattcaagga 1443499  T
Q  171 ccaatttgattgaa 184  Q
    ||||| ||||||||    
T  1443500 ccaatgtgattgaa 1443513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 71 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 47012326 - 47012213
Alignment:
Q  71 aggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaagga 170  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||| |||||    
T  47012326 aggatcacattgatctctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcattaatttgaggatcgaaatgattgatatgattataattcaagga 47012227  T
Q  171 ccaatttgattgaa 184  Q
    ||||| ||||||||    
T  47012226 ccaatgtgattgaa 47012213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 318 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 42558916 - 42558848
Alignment:
Q  318 cttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42558916 cttaatcaacctaagctcacttcctacacagtcaactttgtccatcaaccatgccctccaaacctcttc 42558848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 318 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 3370035 - 3369967
Alignment:
Q  318 cttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 386  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||  | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3370035 cttaatcaaccaaagctcactccctacgtagtcaactttgtccatcaaccttgtcctccaaacctcttc 3369967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 380
Target Start/End: Original strand, 51122987 - 51123059
Alignment:
Q  308 ctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaac 380  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||| |||||| ||||  ||||||||||    
T  51122987 ctatcaaaaacttaatcaacctaagctcagttcctaaagtatcaactttgtccatctacctcaccctccaaac 51123059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 3370422 - 3370338
Alignment:
Q  40 tttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatatttt 124  Q
    |||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||   | ||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  3370422 tttttactttattatgcacatatatgcaccaaggatcacattgacatctgtttaaataattcaaagacttatttgatggtatttt 3370338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 386
Target Start/End: Original strand, 5784211 - 5784239
Alignment:
Q  358 tccatcaaccttgccctccaaacctcttc 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5784211 tccatcaaccttgccctccaaacctcttc 5784239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 322 - 386
Target Start/End: Original strand, 32086009 - 32086073
Alignment:
Q  322 atcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 386  Q
    ||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| || || |||||| ||||||    
T  32086009 atcaatctaaactcacttactaaacaatcaactttgtccatcaacatttccttccaaaactcttc 32086073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 21 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 14388436 - 14388047
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  14388436 caaagtgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatagta 14388337  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||          ||||| |||||| |||||||||||||    
T  14388336 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaagttttttta-cataaaggtttgattcattcattgac 14388238  T
Q  221 aacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14388237 aacctcttttcattacaacattacaacattacatggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 14388138  T
Q  321 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatccttt-gcttctcc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  14388137 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcatttagcttctcc 14388047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 21 - 410
Target Start/End: Original strand, 6798315 - 6798696
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  6798315 caaagtgtctgtcttttactttttactttgttcatcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacatatttgatggta 6798414  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||        | || || ||||||  ||||||||||||    
T  6798415 ttttcactaatttgaggatcgatttgatgaatatgtatacaattgaaggaccaatttgattgaattttttt-gacagaaaggtttgactcattcattgac 6798513  T
Q  221 aacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6798514 aacctcttttcattacaacattac--------atggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 6798605  T
Q  321 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatc-ctttgcttctcc 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  6798606 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttattcatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatctcttggcttctcc 6798696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 21 - 403
Target Start/End: Original strand, 16763755 - 16764128
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  16763755 caaagtgtctatcttttactttttactctgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgtaaattcaatgacctatttgatggta 16763854  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||        | ||||| |||||| |||||||||||||    
T  16763855 ttttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgcatataattcaaggaccaatgtgattgaattttttt-gacataaaggtttgattcattcattgac 16763953  T
Q  221 aacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16763954 aacctcttttcattacaacattac--------atggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcagtcaaacaaaatactcctatcaatatctt 16764045  T
Q  321 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  16764046 aatcaacctaagttcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctctaaacctcttctctgcccctatcatttg 16764128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 32 - 403
Target Start/End: Original strand, 2767734 - 2768096
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||     
T  2767734 tcttttactttttactttgttcagaaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctattgtgaaaattcaaggaccaatttgatggtattttcactaaa 2767833  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||        | ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  2767834 ttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaattttttt-gacataaaggttttattcattcattgacaacctcttttc 2767932  T
Q  232 attacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaa 331  Q
    ||||||||||||||        |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2767933 attacaacattaca--------tgggtttggcacaatacaatagcattttaaacaacttaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaa 2768024  T
Q  332 gctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2768025 gcttacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 2768096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 32 - 403
Target Start/End: Original strand, 39455979 - 39456341
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39455979 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcatagtgatatctgttgtgaaaatttaaggacctatttgatgatattttcactcat 39456078  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||        | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39456079 ttgagaatcaatatgatgaatatgcatataattcaatgaccaatttgattgaattttttt-gacaaaagggtttgattcattcattgacaacctcttttc 39456177  T
Q  232 attacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaa 331  Q
    |||||||||||||        ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  39456178 attacaacattac--------atggacttggcacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcttatcaatatcttaattaacctaa 39456269  T
Q  332 gctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39456270 gctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcctttg 39456341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 21 - 403
Target Start/End: Original strand, 17697016 - 17697389
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17697016 caaagtgtctgtcttctactttttactttgttcaacaaatgtatccaccaaggatcatagtgatgtatgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggta 17697115  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||        | || || |||||| ||||||| |||||    
T  17697116 ttttcaccaattttaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccagtttgattgaaatttttt-gacagaaaggtttgattcattcgttgac 17697214  T
Q  221 aacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 320  Q
    ||||||||||||| ||||||||||        ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17697215 aacctcttttcataacaacattac--------atggacttggcataatacaatagcattttaaacaattcaatcaaacaaaatactcatatcaatatctt 17697306  T
Q  321 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17697307 aatcaacttaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcatttg 17697389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 32 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 24206864 - 24206492
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttc--acta 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| | |||| |||||| | | |||||||||||| |||||||||| ||||   ||||    
T  24206864 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgtccaaaggatcaaattgatttctgttataataattcaaggaccaatttgatgatttttttttacta 24206765  T
Q  130 atttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttt 229  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||        | || || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24206764 atttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaatattttt-gacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttt 24206666  T
Q  230 tcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacct 329  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24206665 tcattacaacattacaacattacatggacttagaacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacct 24206566  T
Q  330 aagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  24206565 aagctcacttcctacataatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcatttg 24206492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 19907613 - 19907308
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  19907613 caaagtgtctgtcttttagtttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaatgatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttcatggta 19907514  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        | || || |||||| ||||||||||||     
T  19907513 ttttcactcatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaa-attttttgacagaatggtttgattcattcattgat 19907415  T
Q  221 aacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||        ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19907414 aacctcttttcattacaaca--------ttacatggacttggcacaat-caataacattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 19907324  T
Q  321 aatcaacctaagctca 336  Q
    ||||||||||||||||    
T  19907323 aatcaacctaagctca 19907308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 6784612 - 6784249
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttc-actaa 130  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||  | |||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||| | ||||  |||||    
T  6784612 tcttttacttttgactttgttcagcaaatgtatgtccaaaggatccaattgatttctgttatgataattcaaggaccaatttgatgtttttttttactaa 6784513  T
Q  131 tttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctctttt 230  Q
    ||| | |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||        | || || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6784512 tttaaagatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaattttttt-gacagaaaggtttgattcattcattgacaacctctttt 6784414  T
Q  231 cattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaaccta 330  Q
    |||||||||||||||        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6784413 cattacaacattaca--------tggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaaccta 6784322  T
Q  331 agctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  6784321 agttcacttcctaaacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctttgcccctatcatttg 6784249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 33 - 301
Target Start/End: Original strand, 40561046 - 40561305
Alignment:
Q  33 cttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaatt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40561046 cttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacattgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaatt 40561145  T
Q  133 tgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttca 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||          || || |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  40561146 tgaggatcgatatgatggatgtgcatataatttaaggaccaatttaattgaaatttttta-acaaaaaggtttgattcattcattgacaacatcttttca 40561244  T
Q  233 ttacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 301  Q
    ||||||||        ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40561245 ttacaaca--------ttacatggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 40561305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 195 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 44708983 - 44708783
Alignment:
Q  195 cataagggtttggttcattcattgacaacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatc 294  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44708983 cataagggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattaca--------tggacttggcgcaatacaataacattttaaacaactcaatc 44708892  T
Q  295 aaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccc 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44708891 aaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagcccacttcctacacaattaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccc 44708792  T
Q  395 tatcctttg 403  Q
    |||||||||    
T  44708791 tatcctttg 44708783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 144 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 34401394 - 34401144
Alignment:
Q  144 atgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttcattacaacatta 243  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||          || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34401394 atgatggatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaattttttaa-caaaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacatta 34401296  T
Q  244 caacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttccta 343  Q
    ||        || ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34401295 ca--------tgaacttggcacaatgcaataacattttaaacaactcaatcaaacaaaataatcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttccta 34401204  T
Q  344 cacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34401203 ctcaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 34401144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 267 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 42518525 - 42518389
Alignment:
Q  267 atacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaac 366  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42518525 atacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaataaacctaagatcacttcttacacaatcaactttatccatcaac 42518426  T
Q  367 cttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42518425 cttgccctccaaacttcttctctccccctatcctttg 42518389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 39664115 - 39663994
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39664115 caaagtgtctgtcttttagtttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggta 39664016  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcga 142  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  39664015 ttttcactaatttgaggatcga 39663994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 44709091 - 44708996
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgat 116  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44709091 caaagtgtctgtctttgactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggaccaatttgat 44708996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 264 - 386
Target Start/End: Original strand, 4047377 - 4047499
Alignment:
Q  264 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 363  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||   |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  4047377 acaatacaatagcatgttaaacaactcaaacaagcaaattatgactatcaaatacttaatcaacctaagctcacttcctacacagtcaactttgtccatt 4047476  T
Q  364 aaccttgccctccaaacctcttc 386  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  4047477 aactttgccctccaaacctcttc 4047499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 71 - 184
Target Start/End: Original strand, 37021388 - 37021501
Alignment:
Q  71 aggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaagga 170  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||| |||||    
T  37021388 aggatcacattgatatctgttatgataattcaaggaccaatttgatggttttttcattaatttgaggatcaaaatgatggatatgattataattcaagga 37021487  T
Q  171 ccaatttgattgaa 184  Q
    ||||| ||||||||    
T  37021488 ccaatgtgattgaa 37021501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 263 - 386
Target Start/End: Original strand, 20941734 - 20941856
Alignment:
Q  263 cacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccat 362  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||||||| ||| |||| ||   |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20941734 cacaatacagtaacatgttaaacaactcaaacaagcaaattatgactatcaaatacttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttgtccat 20941833  T
Q  363 caaccttgccctccaaacctcttc 386  Q
    |||||||| | |||||||||||||    
T  20941834 caaccttg-catccaaacctcttc 20941856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 318 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 26581613 - 26581545
Alignment:
Q  318 cttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26581613 cttaatcaacctaagctcacttcatacacaatcaactttgtccatcaaccttcccctctaaacctcttc 26581545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 264 - 386
Target Start/End: Original strand, 161432 - 161554
Alignment:
Q  264 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 363  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||| ||| |||| ||   |||||||   ||||||||||| || ||||||| ||||| | |||||||| ||||||    
T  161432 acaatagagtagcatgttaaacaactcaaacaagcaaattatgactatcaaatacttaatcaaccaaacctcactttctacatagtcaactttgtccatc 161531  T
Q  364 aaccttgccctccaaacctcttc 386  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  161532 aaccttgccctctaaacctcttc 161554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 239 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 19582023 - 19581960
Alignment:
Q  239 cattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaa 302  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  19582023 cattacaacattacagagacttgacacaatacaataacattttaaacaattcaatcaaacaaaa 19581960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 79
Target Start/End: Original strand, 37646238 - 37646283
Alignment:
Q  34 ttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcaca 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  37646238 ttttactttttactttgttcagcaaatatatgcaccaaagatcaca 37646283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 383
Target Start/End: Original strand, 38149341 - 38149406
Alignment:
Q  318 cttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 383  Q
    |||||||| || || |||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38149341 cttaatcaccccaatctcactttttatacaatcaactttgtccatcaaccttgccctccaaacctc 38149406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 124
Target Start/End: Original strand, 161216 - 161300
Alignment:
Q  40 tttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatatttt 124  Q
    |||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||  ||| |||||||   | ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  161216 tttttactttgttatgcacatatatgcaccaaggatcacgttgacatctgtttaaataattcaaggacttatttgatggtatttt 161300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 308 - 379
Target Start/End: Original strand, 7744707 - 7744778
Alignment:
Q  308 ctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaa 379  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||| |||||| |  ||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  7744707 ctatcaaaaacttaataaacctaagctcaattcctaaagtatcaactttgtccatcaacctcaccctccaaa 7744778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 11022280 - 11022252
Alignment:
Q  358 tccatcaaccttgccctccaaacctcttc 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11022280 tccatcaaccttgccctccaaacctcttc 11022252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 42518556 - 42518524
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtat 64  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42518556 tcttttattttttactttgttcagcaaatgtat 42518524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 15)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 403
Target Start/End: Original strand, 32517641 - 32518034
Alignment:
Q  1 atatgacttatgatggtatacaaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32517641 atatgacttatgatggtatacaaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatgtctgttgtgaaaatt 32517740  T
Q  101 caaggacctatttgatgatattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataag 200  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | ||||||    
T  32517741 caaggaactatttgatggtattttcactaatttgaggatcggtatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaa-tttttttgacataag 32517839  T
Q  201 ggtttggttcattcattgacaacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaa 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32517840 ggtttggttcagtcattgacaacctcttttcattacaaca--------ttacatggacttgacacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaa 32517931  T
Q  301 aatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcct 400  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  32517932 aatactcatatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctttgcccatatcct 32518031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 21 - 396
Target Start/End: Original strand, 18644063 - 18644437
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18644063 caaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggta 18644162  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||        | || || |||||| |||||||||||||    
T  18644163 ttttcactaatttgatgatcgaaataatggatatgcatataattcaaggaccaatgtgattgaattttttt-gacagaaaggtttgattcattcattgac 18644261  T
Q  221 aacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 320  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18644262 aatctcttttcattacaacattacaacattacacagacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcagtcaaacaaaatactcctatcaatatctt 18644361  T
Q  321 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctcccccta 396  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18644362 aatcaacctaagttcacttcctactcaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgccccta 18644437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 21 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 7372316 - 7371944
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7372316 caaagtgtctgtcttttactttttactttgttcaacaaatgtatgcaccaaggatcacagtgat-tcgattgtgaaaattcaaggacctatttgatggta 7372218  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||         | || || |||||| |||||||||||||    
T  7372217 ttttcactaatttgaggatcgatatgatgaatatgtatataattcaaggaccaatttgattga-tattttttgacagaaaggtttgattcattcattgac 7372119  T
Q  221 aacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||        |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372118 aacctcttttcattacaacattaca--------tggacttggcacaatacaataccattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 7372027  T
Q  321 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7372026 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccttatcctttg 7371944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 21 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 32438414 - 32438035
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32438414 caaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatggaccaaggatcatagtgatatctattgtgaaaattcaaggacctatttgatggta 32438315  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||        | || || |||||| |||||||||||||    
T  32438314 ttttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgcatataattaaaggaccaatatgattgaattttttt-gacagaaaggtttgattcattcattgac 32438216  T
Q  221 aacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 320  Q
    || ||||||||||||||||||||||        |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32438215 aatctcttttcattacaacattaca--------tggacttggcacaatgcaatagcattttaaacaactcagtcaaacaaaatactcctatcaatatctt 32438124  T
Q  321 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttgcttctcc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| | |||||||||||    
T  32438123 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacc-cttctttgcccctagcatttgcttctcc 32438035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 21 - 379
Target Start/End: Original strand, 20524177 - 20524526
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20524177 caaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcatagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggta 20524276  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||          ||||| |||||| |||||||||||||    
T  20524277 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatacatatataattcaaggaccaatttgattgaatttttttt-acataaaggtttgattcattcattgac 20524375  T
Q  221 aacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||        ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |    
T  20524376 aacctcttttcattacaaca--------ttacatgaacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaataaaacaaaatactcatatcaatatcat 20524467  T
Q  321 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaa 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20524468 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaa 20524526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 32 - 353
Target Start/End: Original strand, 11356010 - 11356321
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  11356010 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctgtttgatggtatttttactaat 11356109  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    |||||||||||||||         ||||||||| |||||||||||||||||||        | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  11356110 ttgaggatcgatatg---------catataattcaaggaccaatttgattgaaacttttt-gacataagggtttgattcattcattgaccacctcttttc 11356199  T
Q  232 attacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaa 331  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  11356200 attacaacattacaacattacatgaacttggcacaatagaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatacttctatcaatatcgtaatcaacctaa 11356299  T
Q  332 gctcacttcctacacaatcaac 353  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  11356300 gctgacttcctacacaatcaac 11356321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 32 - 302
Target Start/End: Original strand, 7050560 - 7050821
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  7050560 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaattcaatgacttatttgatggtattttcactaat 7050659  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    ||| ||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||        | || |||||||   ||||| ||||||||||||||||||    
T  7050660 ttggggatcgatatgatggatagacatacaatagaaggaccaatttgattgaa-tttttttgacaaaagggttaaattcatccattgacaacctcttttc 7050758  T
Q  232 attacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaa 302  Q
    |||||||||||||      |||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7050759 attacaacattac------aca--gacttggcacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaaa 7050821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 71 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 33268155 - 33267838
Alignment:
Q  71 aggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaagga 170  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||  ||||        |||    
T  33268155 aggatcacattgatatatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatggtattttcaataatttagggatcgatatgatggatagacatac-------gga 33268063  T
Q  171 ccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatac 270  Q
    ||||||  ||||||         | | |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||||||||    
T  33268062 ccaattcaattgaaattttttgag-agaagggttgaattcattcattgacaacctcttttcattacaacattacaaca-------gacttggcacaatac 33267971  T
Q  271 aatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 370  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33267970 aataacattttaaacagctcattcaaacaaattactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 33267871  T
Q  371 ccctccaaacctcttctctccccctatcctttgc 404  Q
     || |||||||| | |||| || |||||||||||    
T  33267870 acc-ccaaacctatactctgccactatcctttgc 33267838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 302
Target Start/End: Original strand, 10569192 - 10569462
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  10569192 caaagtgtctgttttttactttttactttgtttagcaaatgtatgcaccaaggatcacaatgatatatgttg--aaaattcaaggacttatttgatggta 10569289  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||| |||||| |||||||||||||        |  | |||||||   |||||||||||||    
T  10569290 ttttcactaatttggggatcgatatgatggatagacatacaatagaaggatcaatttgattgaa-attttttgatagaagggttaaattcattcattgac 10569388  T
Q  221 aacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaa 302  Q
    ||||||||||||||||||||        |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10569389 aacctcttttcattacaaca--------ttacatagacttggcacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaaa 10569462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 257 - 403
Target Start/End: Original strand, 9399135 - 9399281
Alignment:
Q  257 acttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaacttt 356  Q
    ||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9399135 acttggcacaataaaataacattctaaacaactcaaacaaacaaatcactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcatttcctacacaatcaacttt 9399234  T
Q  357 atccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  9399235 atccatcaactttgccttccaaacctcttctctgccactatcctttg 9399281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 80 - 302
Target Start/End: Original strand, 6901999 - 6902212
Alignment:
Q  80 gtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttga 179  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||    
T  6901999 gtgatatatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatgatattttcactaatttggggattgatatgatggatagacatacaatagaaggaccaatttga 6902098  T
Q  180 ttgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcatt 279  Q
    |||||        | || |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||  ||||||||||||||||||| | ||    
T  6902099 ttgaa-tttttttgacagaagggttaaattcattcattgacaacctcttttcattacaacattac------gca--gacttgacacaatacaataacttt 6902189  T
Q  280 ttaaacaactcaatcaaacaaaa 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  6902190 ttaaacaactcaatcacacaaaa 6902212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 81 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 32455125 - 32455022
Alignment:
Q  81 tgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgat 180  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||| | ||    
T  32455125 tgatctctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcattaatttgaggatcgaaatgatggatatgattataattcaaggaccaatgtaat 32455026  T
Q  181 tgaa 184  Q
    ||||    
T  32455025 tgaa 32455022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 86
Target Start/End: Original strand, 6900287 - 6900341
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6900287 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgaaccaaggatcacagtgatat 6900341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 318 - 386
Target Start/End: Original strand, 17935548 - 17935616
Alignment:
Q  318 cttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 386  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  17935548 cttaatcaacctaagctcacatcctactcagtcaactttgtccctcaaccttaccctccaaaactcttc 17935616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 361 - 403
Target Start/End: Original strand, 11356316 - 11356358
Alignment:
Q  361 atcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  11356316 atcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcatttg 11356358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 30)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 403
Target Start/End: Original strand, 5037207 - 5037599
Alignment:
Q  1 atatgacttatgatggtatacaaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaatt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5037207 atatgacttatgatggtatacaaa-tgtctgtcttttactttttactttgttcaacaaatgtatgcaccaaggatcacaatgatatctgttgtgaaaatt 5037305  T
Q  101 caaggacctatttgatgatattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        | ||||||    
T  5037306 caaggacctatttgatgatattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaa-tttctttgacataag 5037404  T
Q  201 ggtttggttcattcattgacaacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaa 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5037405 ggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaaca--------ttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaa 5037496  T
Q  301 aatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcct 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |    
T  5037497 aatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatcgatcaaccttgccttccaaacctcttctcttcccctatcat 5037596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 21 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 41041918 - 41041545
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41041918 caaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacaatggtatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggta 41041819  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||        | || ||  ||||| |||||||||||||    
T  41041818 ttttcactaatttgaggatcgatatgatgaatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaatttttg--gacagaaatgtttgattcattcattgac 41041721  T
Q  221 aacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||        |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41041720 aacctcttttcattacaacattaca--------tggacttggcaaaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 41041629  T
Q  321 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttgc 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41041628 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgcccttcaaacctcttctctccccctatcctttgc 41041545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 32 - 379
Target Start/End: Original strand, 27691967 - 27692305
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  27691967 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatttaaactaat 27692066  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||        | || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27692067 ttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaa-atattttgacagaaaggtttggttcattcattgacaacctcttttc 27692165  T
Q  232 attacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaa 331  Q
    |||||||||        ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27692166 attacaaca--------ttacatggacttggcacaatacaatatcatttttaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaa 27692257  T
Q  332 gctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaa 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27692258 gctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgtcctccaaa 27692305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 21 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 33708144 - 33707795
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33708144 caaagtgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggaacacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggta 33708045  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||        | || || ||||||||||||||||||||    
T  33708044 tttaaactaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaatgaccaatttgattgaa-atattttgacagaaaggtttggttcattcattgac 33707946  T
Q  221 aacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||        |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33707945 aacctcttttcattacaaca--------ttacatagacttggcacaatacaatatcattttaaacaactcaatcaaacaaaatacttctatcaatatctt 33707854  T
Q  321 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaa 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33707853 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgtcctccaaa 33707795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 21 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 40339014 - 40338637
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  40339014 caaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaacaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgattgta 40338915  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||        | || || |||||| |||||||||||||    
T  40338914 ttttcactaatttgaggatcgatacgatgaatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaa-attttttgacagaaaggtttgattcattcattgac 40338816  T
Q  221 aacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||         ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40338815 aacctcttttcattacaacattaca---------ggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 40338725  T
Q  321 aatcaacctaagctc--------acttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcct 400  Q
    ||||| |||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40338724 aatcagcctaagctcacttcctaacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccgtatcct 40338637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 32 - 403
Target Start/End: Original strand, 29237995 - 29238357
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  29237995 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcacaaatgatcaaattgatttctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcactaat 29238094  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||        | || || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29238095 ttgaggatcgaaatgacggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaattttttt-gacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttc 29238193  T
Q  232 attacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaa 331  Q
    |||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29238194 attacaacattac--------atggacttgacacaatacaatagcattttaaataactcaaccaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaa 29238285  T
Q  332 gctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  29238286 gcttacttcctacacaatcaactttatccaccaaccttgcccttcaaacctcttctctgcccctatcatttg 29238357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 32 - 403
Target Start/End: Original strand, 15307094 - 15307455
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| || || ||||| | |||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||| | |||| ||||||    
T  15307094 tcttttactttt-actttgttcagcaaatatatgtacaaatgatcaaattgatttctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtttttttactaat 15307192  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    || |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||        | || || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15307193 ttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaattttttt-gacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttc 15307291  T
Q  232 attacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaa 331  Q
    |||||||||||||        ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15307292 attacaacattac--------atggacttggcacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaa 15307383  T
Q  332 gctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15307384 gctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcatttg 15307455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 32 - 403
Target Start/End: Original strand, 15487463 - 15487824
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||| || || ||||| | |||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||| | |||| ||||||    
T  15487463 tcttttactttt-actttgttcagcaaatatatgtacaaatgatcaaattgatttctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtttttttactaat 15487561  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    || |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||        | || || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15487562 ttaaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaattttttt-gacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttc 15487660  T
Q  232 attacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaa 331  Q
    |||||||||||||        ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15487661 attacaacattac--------atggacttggcacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaa 15487752  T
Q  332 gctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15487753 gctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcatttg 15487824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 40 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 27405458 - 27405104
Alignment:
Q  40 tttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaatttgaggat 139  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||| | |||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||    
T  27405458 ttttttctttgttcagcaaatgtatgtccaaaggatcaaattgatttctgttatgataattcaaggaccaatttgatgttttttttactaatttaaggat 27405359  T
Q  140 cgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttcattacaac 239  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||        | || || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27405358 cgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaatattttt-gacagaaaggtttgattcattcattgacaaccttttttcattacaac 27405260  T
Q  240 attacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcactt 339  Q
    ||||||        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  27405259 attaca--------tggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagttcactt 27405168  T
Q  340 cctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  27405167 cctagacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcatttg 27405104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 32 - 301
Target Start/End: Original strand, 22273060 - 22273328
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22273060 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaagatcacaatgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaat 22273159  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        |  | || |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  22273160 ttgatgatcgatacgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaa-attttttgatagaaaggtttgattcatttattgacaacctcttttc 22273258  T
Q  232 attacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 301  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22273259 attacaacattacaacattacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 22273328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 32 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 3152862 - 3152492
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||| || ||||||||||    
T  3152862 tcttttactttttactttgttcagtagatgtatgcaccaaggatcacattgatttatgttgtgaaaattcaagaactgatttgatggtaatttcactaat 3152763  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    ||| ||||  || |||||||||  |||| ||| |||| |||||||||||||||        | || |||||||   |||||||||||||||| |||||||    
T  3152762 ttggggatgaatgtgatggatagacatacaatagaagaaccaatttgattgaattttttt-gacagaagggttgaattcattcattgacaacttcttttc 3152664  T
Q  232 attacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaa 331  Q
    |||| ||||||||||| |||||   ||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3152663 attataacattacaacattacacacacttgacacaataaaataacattttaaacgacttaatcaaacaaattactcctatcaatattttaatcaacctaa 3152564  T
Q  332 gctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||    
T  3152563 gctcacttcctatacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaagcctcttctctaacactatcctttg 3152492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 32 - 301
Target Start/End: Original strand, 42942595 - 42942855
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  42942595 tcttttactttttactttgttcaacaaatgtatgcaccaaggatcacaatgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcaataat 42942694  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        | || || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42942695 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaa-attttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttc 42942793  T
Q  232 attacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 301  Q
    |||||||||        ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42942794 attacaaca--------ttacatggacttggcacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaa 42942855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 32 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 26239765 - 26239504
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  26239765 tcttttactttttactttgttgagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaattcaatgacttatttgatggtattttcactaat 26239666  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    ||| ||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||| |||||||        | || |||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  26239665 ttggggatcgatatgatggatagacatacaatagaaggaccaattggattgaa-attttttgacagaagggttaaattcattcattgacaacctcttttc 26239567  T
Q  232 attacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaa 302  Q
    |||||||||||||      |||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  26239566 attacaacattac------aca--gacttgatacaatacaataacattttaaacaactcaatcacacaaaa 26239504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 51 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 13485417 - 13485114
Alignment:
Q  51 ttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaatttgaggatcgatatgatgg 150  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||                    ||||||||||||    
T  13485417 ttcagcaaatgtatgcctcaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattgaaggacctatttgatga--------------------tcgatatgatgg 13485338  T
Q  151 atatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttcattacaacattacaacgtt 250  Q
    ||||| | |||||| ||||||||||||||||           | || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  13485337 atatgtacataattcaaggaccaatttgatt-----ttttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattaca----- 13485248  T
Q  251 acatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatc 350  Q
       ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  13485247 ---tggacttggtacaatacaatagcattttaaacaactcaatcgaataaaatactcatatcaatatcttaatcaacataagttcgcttcctacacaatc 13485151  T
Q  351 aactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttct 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13485150 aactttatccatcaaccttgccctccaaaccttttct 13485114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 30 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 41824996 - 41824733
Alignment:
Q  30 tatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcacta 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41824996 tatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaagcatcacggtgatatatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatgatattttcacta 41824897  T
Q  130 atttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttt 229  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  |||| ||| ||| ||||||||||||||||        | || |||||||   ||||||||||| ||||||||||    
T  41824896 atttggggatcaatatgatggatagacatacaatagaatgaccaatttgattgaa-tttttttgacagaagggttaaattcattcattggcaacctcttt 41824798  T
Q  230 tcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaa 302  Q
    |||||||||||||||      |||  | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  41824797 tcattacaacattac------aca--ggcttggcacaatacaataacattttaaacaactcaatcacacaaaa 41824733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 9672509 - 9672292
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  9672509 caaagtgtctgtcttttactttttagtttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatggta 9672410  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||        | || ||||||| | |||||||||||||    
T  9672409 ttttcactaatttggggatcgatacgatggatagacatacaatagaaggaccaatttgattgaa-ttttttcgacagaagggttggattcattcattgac 9672311  T
Q  221 aacctcttttcattacaac 239  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  9672310 aacatcttttcattacaac 9672292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 8609141 - 8609005
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8609141 caaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggta 8609042  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgca 157  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8609041 ttttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgca 8609005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 13107707 - 13107571
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13107707 caaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggta 13107608  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgca 157  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13107607 ttttcactaatttgagaatcgaaatgatggatatgca 13107571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 32 - 157
Target Start/End: Original strand, 38548028 - 38548153
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38548028 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaat 38548127  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgca 157  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||    
T  38548128 ttgaggatcaaaatgatggatatgca 38548153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 32 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 7744454 - 7744193
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  7744454 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaagaataaaagtgaaatatgatgtgaaaattcaaggacttatttgatggtgttttcactaat 7744355  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    ||| ||||||||||||||||||  |||| ||| |||| |||||||||||||||        | || |||||||   |||||||||||||| |||||||||    
T  7744354 ttggggatcgatatgatggatagacatacaatagaagaaccaatttgattgaa-attttttgacagaagggttaaattcattcattgacagcctcttttc 7744256  T
Q  232 attacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaa 302  Q
    ||||||||||||      ||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  7744255 attacaacatta------taca--gacttggcacaatacaataacattttaaacaactcaatcacacaaaa 7744193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 32 - 172
Target Start/End: Original strand, 35510217 - 35510357
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  35510217 tcttttacattttactttgttcagcaaatgtatgcacaaaggaccacattgatatctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcactaat 35510316  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggacc 172  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  35510317 ttgaggatcgaaatgatggatatgaatataatttaaggacc 35510357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 157
Target Start/End: Original strand, 13283186 - 13283317
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  13283186 caaagtgtctgtcttttactttttactttgttgagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatat-----gtgaaaattcaaggacctatttgatcgta 13283280  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgca 157  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13283281 ttttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgca 13283317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 32 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 33761782 - 33761642
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  33761782 tcttttacattttactttgtttagcaaatgtatgcacaaaggatcacattgatatctgttatgataattcaatgaccaatttgatggtattttcactaat 33761683  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggacc 172  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  33761682 ttgaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggacc 33761642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 32 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 600948 - 600809
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  600948 tcttttactttttactttattcagcaaatgtatgcacaaaggatcaaattgatttctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcactaat 600849  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggac 171  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  600848 ttgaggatcgaaatgacggatatgaatataattcaaggac 600809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 35 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 11720697 - 11720339
Alignment:
Q  35 tttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatatttt-cactaattt 133  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||  || | ||   ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |    
T  11720697 tttactttttactttgttcaacacatatatgcaccaaggatcacattgtcatatttttaaaaacttcaaggacttatttgatgatatttttcactaatgt 11720598  T
Q  134 gaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttcat 233  Q
      | |||||| ||||  |||  || | |||| ||||||||||||||| |||        | || || ||||   ||||||||||  ||||||||||||||    
T  11720597 aggaatcgatttgatatatagacaaacaatttaaggaccaatttgatggaaagatttt-gacaaaatggttgcattcattcattttcaacctcttttcat 11720499  T
Q  234 tacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagc 333  Q
    ||||| ||||||      ||  || ||  ||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||| ||   ||||||||||||||||    
T  11720498 tacaatattaca------ca--gaattagcacaatacagtagcatgttaaacaacttaaacaaacaaattactcctattaaatacttaatcaacctaagc 11720407  T
Q  334 tcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctt 401  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  11720406 tcacttcctacacagtcaactttgtccatcaaccttgtccttcaaacctcttcactgccactatcctt 11720339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 264 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 12516006 - 12515887
Alignment:
Q  264 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 363  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||| ||   |||| || | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  12516006 acaatacaatagcatgttaaaaaactcaaacaagcaaattatgactattaaaaacttaatcaacctaagctcacttcccatacaatcaactttgtccatc 12515907  T
Q  364 aaccttgccctccaaacctc 383  Q
    ||| || |||||||||||||    
T  12515906 aacatttccctccaaacctc 12515887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 28433004 - 28432939
Alignment:
Q  318 cttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 383  Q
    |||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  28433004 cttaatcaccctcagctcacttcttatacaatcaactttgcccatcaaccttgccctccaaacctc 28432939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 318 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 25371304 - 25371236
Alignment:
Q  318 cttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 386  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  25371304 cttattcaacctaagttcacttcctacacactcaactttgtccatcaatcttgctctccaaacatcttc 25371236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 347
Target Start/End: Original strand, 24285797 - 24285880
Alignment:
Q  264 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatc-aatatcttaatcaacctaagctcacttcctacaca 347  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||   ||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  24285797 acaatacaatagcatgttaaacaactcaaacaagcaaattatgactatcaaatat-ttaatcaacttaatctcacttcctacaca 24285880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 10770982 - 10770940
Alignment:
Q  344 cacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 386  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10770982 cacagtcaactttgtccatcaaccttgccttccaaacctcttc 10770940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 30)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 21 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 35403002 - 35402628
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35403002 caaagtgtctgtcgtttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 35402903  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||        | |||||||||||| |||||||||||||    
T  35402902 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaagaaccaatttgattgaa-attttttgacataagggtttgattcattcattgac 35402804  T
Q  221 aacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||        ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35402803 aacctcttttcattacaaca--------ttacacggacttggcacagtacaatagcattttaaacaactcaatcaaaaaaaatactcctatcaatatctt 35402712  T
Q  321 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttgc 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35402711 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcctttgc 35402628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 21 - 403
Target Start/End: Original strand, 49523922 - 49524295
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  49523922 caaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagttatatttgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggta 49524021  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||        | || ||||||||| |||||||||||||    
T  49524022 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaatgaccaatttgattgaaatatttt-gacagaagggtttgattcattcattgac 49524120  T
Q  221 aacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||        || ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49524121 aacctcttttcattacaacattaca--------tgaacttggcacaatacaataatattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 49524212  T
Q  321 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49524213 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcctttg 49524295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 32 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 41761050 - 41760688
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41761050 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctggtatgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaat 41760951  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||        | || || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41760950 ttgaggatcgatatgatgaatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaatttttt-gccagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttc 41760852  T
Q  232 attacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaa 331  Q
    ||||||||||||||        |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41760851 attacaacattaca--------tggacttggcacaatacaatagcattttcaacaactcaatcaaacaaaatactcatatcaatatcttaatcaacctaa 41760760  T
Q  332 gctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41760759 gctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 41760688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 21 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 11255264 - 11254891
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11255264 caaagtgtctgtcttttactttttactttgctcagcaaatgtatgcactaatgatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggta 11255165  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||        | ||||| |||||| |||||||||||||    
T  11255164 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaacgatcaatttgattgaaatttttt-gacataaaggtttgattcattcattgac 11255066  T
Q  221 aacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||        |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11255065 aacctcttttcattacaacattaca--------tggacttggcacaatataatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 11254974  T
Q  321 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11254973 aatcaacctaagctcacttcctacacaattaactttatccaacaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 11254891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 21 - 379
Target Start/End: Original strand, 43520228 - 43520577
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  43520228 caaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggatctatttgatggta 43520327  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||        | || || ||||||||||||||||||||    
T  43520328 tttaaactaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaa-atattttgacagaaaggtttggttcattcattgac 43520426  T
Q  221 aacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||        ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43520427 aacctcttttcattacaaca--------ttacatggacttggcacaatacaatatcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 43520518  T
Q  321 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaa 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  43520519 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttattcatcaaccttgtcctccaaa 43520577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 21 - 403
Target Start/End: Original strand, 51012717 - 51013090
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  51012717 caaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcgcagtaatatctgttgtgaaaatttaaggacctatttgatggta 51012816  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||        |  | || |||||| |||||||||||||    
T  51012817 ttttcactaatttgaggattgaaatgatggatatgcatataattcaaggaccaatgtgattgaattttttt-gatagaaaggtttgattcattcattgac 51012915  T
Q  221 aacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51012916 aacctcttttcattacaacattac--------atggacttggcacaatacaatagcattttaaacaacccagtcaaacaaaatactcctatcaatatctt 51013007  T
Q  321 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  51013008 aatcaacctaagcttacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcatttg 51013090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 2692620 - 2692239
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2692620 caaagtgtctgtcttttactttttactttgttcaacaaatgtatgaaccaaggatcacaatgatatatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatgata 2692521  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||| |||        | || |||| ||   ||||||| |||||    
T  2692520 ttttcactaatttggggatcgatatgatggatagacatacaatagaaggaccaatttgatggaaatttttt-gacagaaggattgaattcattcgttgac 2692422  T
Q  221 aacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 320  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |        ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2692421 aacctcttttaattacaacattacagag--------acttggcacaatacaataacattttaaacaacttaatcaaacaaattactcctatcaatatctt 2692330  T
Q  321 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatccttt-gcttctcc 410  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  2692329 aatcaacctaagctgacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgccactatcctttagcttctcc 2692239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 42981410 - 42981743
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42981410 caaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatacctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggta 42981509  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||        | || || |||||| ||||||||| |||    
T  42981510 ttttcactaatttaaggatcgatatgatagatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaa-attttttgacagaaaggtttgattcattcatcgac 42981608  T
Q  221 aacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||         |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42981609 aacctcttttcattacaaca--------atacatgaacttggcacaatacaataacattttaaacaactcaatgaaacaaaatactcctatcaatatctt 42981700  T
Q  321 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 363  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42981701 aatcaatctaagctcatttcctacacaatcaactttatccatc 42981743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 32 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 48646070 - 48645809
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  48646070 tcttttactttttactttattcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatggtattttcactaat 48645971  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    ||| ||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||        | || |||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  48645970 ttggggatcgatatgatggatagacatacaatagaaggaccaatttgattgaa-attttttgacagaagggttaaattcatttattgacaacctcttttc 48645872  T
Q  232 attacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaa 302  Q
    |||||||||        |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48645871 attacaaca--------ttacatagacttggcacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaaa 48645809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 32 - 302
Target Start/End: Original strand, 54386942 - 54387203
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  54386942 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaagaattgcagtgatatatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatggtattttcactaat 54387041  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    ||| |||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||||||||||        | || |||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  54387042 ttggggatcgatatgatggagagacatacaatcgaaggaccaatttgattgaa-attttttgacagaagggttaaattcattcattgacaacctcttttc 54387140  T
Q  232 attacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaa 302  Q
    |||||||||||||      |||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  54387141 attacaacattac------aca--gacttggcacaatacaataacattttaaacaactcaatcacacaaaa 54387203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 40 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 834370 - 834096
Alignment:
Q  40 tttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaatttgaggat 139  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||| | |||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||    
T  834370 ttttttctttgttcagcaaatgtatgtccaaaggatcaaattgatttctgttatgataattcaaggaccaatttgatgttttttttactaatttaaggat 834271  T
Q  140 cgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttcattacaac 239  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||        | || || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  834270 cgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaatattttt-gacagaaaggtttgattcattcattgacaaccttttttcattacaac 834172  T
Q  240 attacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaat 323  Q
    ||||||        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  834171 attaca--------tggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaat 834096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 172
Target Start/End: Original strand, 41782312 - 41782463
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  41782312 caaagtgtctgtcttttactttttactttgtttagcaaatgtatgcaccaaggatcacggtgatatctgttgtgaaaaatcaaggaccaatttgatgata 41782411  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggacc 172  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41782412 ttttcactaatttgaggattgatatgatggatatgcatataattcaaggacc 41782463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 40 - 323
Target Start/End: Original strand, 5438593 - 5438863
Alignment:
Q  40 tttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaatttgaggat 139  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||| | |||| |||||| ||| ||||||||||    ||||||| | |||| |||||||| |||||    
T  5438593 ttttttctttgttcagcaaatgtatgtccaaaggatcaaattgatttctgttatgataattcaagga----tttgatgttttttttactaatttaaggat 5438688  T
Q  140 cgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttcattacaac 239  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||        | || || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5438689 cgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaatattttt-gacagaaaggtttgattcattcattgacaaccttttttcattacaac 5438787  T
Q  240 attacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaat 323  Q
    |||||        ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5438788 attac--------atggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaat 5438863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 263 - 387
Target Start/End: Original strand, 11641112 - 11641236
Alignment:
Q  263 cacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccat 362  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11641112 cacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaattactcctatcaacatcttaatcaacctaagttcacttcctacacaatcaactttatccat 11641211  T
Q  363 caaccttgccctccaaacctcttct 387  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  11641212 caaccttgccctccaatcctcttct 11641236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 32 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 319985 - 319845
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  319985 tcttttacattttactttgttcagcaaatgtatgcacaaaggatcacattgatatctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcactaat 319886  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggacc 172  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  319885 ttgaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggacc 319845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 32 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 4172825 - 4172685
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  4172825 tcttttacattttactttgttcagcaaatgtatgcacaaaggatcacattgatatctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcactaat 4172726  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggacc 172  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  4172725 ttgaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggacc 4172685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 32 - 172
Target Start/End: Original strand, 33265386 - 33265526
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  33265386 tcttttacattttactttgttcagcaaatgtatgcacaaaggatcacattgatatctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcactaat 33265485  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggacc 172  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  33265486 ttgaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggacc 33265526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 32 - 172
Target Start/End: Original strand, 43508029 - 43508169
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  43508029 tcttttacattttactttgttcagcaaatgtatgcacaaaggatcacattgatatttgttatgataattcaaggaccaatttgatggtatcttcactaat 43508128  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggacc 172  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  43508129 ttgaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggacc 43508169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 34 - 245
Target Start/End: Original strand, 11640853 - 11641068
Alignment:
Q  34 ttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaattt 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  11640853 ttttactttttactttgttcagcagatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaattgaacgacttatttgattgtattttcactaattt 11640952  T
Q  134 gaggatcgatatgat-----ggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctctt 228  Q
    |  ||||||||||||     |||||  |||| ||| |||||||||||||||| |||        | || || ||||   |||||||||||||||| ||||    
T  11640953 ggagatcgatatgatatgatggatagacatacaatagaaggaccaatttgatggaaatatttt-gacagaatggttgaattcattcattgacaacatctt 11641051  T
Q  229 ttcattacaacattaca 245  Q
    ||| |||||||||||||    
T  11641052 ttctttacaacattaca 11641068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 52867502 - 52867414
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacct 109  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52867502 caaagtgtctgtcttctactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacct 52867414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 325 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 41760638 - 41760561
Alignment:
Q  325 aacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41760638 aacctaagctcacttcctacccaatcaactttatgcatcaaccttgccctccaaacctcttctct-cccctatcctttg 41760561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 116
Target Start/End: Original strand, 11602478 - 11602562
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgat 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  11602478 tcttttactttttactttgtttagcagatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaattgaacgacttatttgat 11602562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 318 - 383
Target Start/End: Original strand, 32652936 - 32653001
Alignment:
Q  318 cttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 383  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32652936 cttaatcaccctaagctcacttcctatacaatcaactttttccatcaaccttgccctccaaacctc 32653001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 264 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 28101606 - 28101484
Alignment:
Q  264 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 363  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || | | | ||   |||||||   ||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||| ||||||    
T  28101606 acaatacaatagcatgttaaacaactcaaacagatatattatgactatcaaatacttaatcaacctaagttcattttctacacagtcaactttgtccatc 28101507  T
Q  364 aaccttgccctccaaacctcttc 386  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  28101506 gaccttgccctccaaacctcttc 28101484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 318 - 386
Target Start/End: Original strand, 4614587 - 4614655
Alignment:
Q  318 cttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 386  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4614587 cttaatcaacttaagctcacttcctacatagtcaactttgtccatcaaccatgccctccaaacctcttc 4614655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 273 - 386
Target Start/End: Original strand, 7150446 - 7150559
Alignment:
Q  273 tagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgcc 372  Q
    |||||| |||||||||||||  || |||| ||   |||||||   |||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  7150446 tagcatgttaaacaactcaaaaaaccaaattatgactatcaaatacttaatcaacctaacctcacttcttacatagtcaactttgtccatcaaccttgcc 7150545  T
Q  373 ctccaaacctcttc 386  Q
    ||| ||||||||||    
T  7150546 ctctaaacctcttc 7150559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 331 - 386
Target Start/End: Original strand, 27385571 - 27385626
Alignment:
Q  331 agctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 386  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  27385571 agctcagttcctatacaatcaactttgtccatcaaccttgtcttccaaacctcttc 27385626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 13449624 - 13449570
Alignment:
Q  329 taagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 383  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13449624 taagctcacttcatatgcaatcaactttgtccatcaactttgccctccaaacctc 13449570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 124
Target Start/End: Original strand, 7150221 - 7150305
Alignment:
Q  40 tttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatatttt 124  Q
    ||||||||||||||  || || ||||| |||||||||||| ||| |||||||   | |||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  7150221 tttttactttgttctacacatatatgcgccaaggatcacattgacatctgtttaaataattaaaggacttatttgatggtatttt 7150305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 318 - 370
Target Start/End: Original strand, 10544180 - 10544232
Alignment:
Q  318 cttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttg 370  Q
    |||||| || |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  10544180 cttaatgaatctaagctcactatctacacaatcaactttctccatcaatcttg 10544232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 39)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 32 - 403
Target Start/End: Original strand, 54899254 - 54899624
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54899254 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaat 54899353  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||        | |  || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54899354 ttgaggatcgaaatgatggatatgcatataattcaaggaccgatgtgattgaattttttt-gacggaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttc 54899452  T
Q  232 attacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaa 331  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54899453 attacaacattacaacattacatggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcagtcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaa 54899552  T
Q  332 gctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  54899553 gctcacttcctacacaatcaactttacccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccttatcatttg 54899624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 21 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 27898448 - 27898075
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27898448 caaagtgtctgtcttttagtttttactttgttcagcaaatgtatgcaccagggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggta 27898349  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||        | || ||||||||| |||||||||||||    
T  27898348 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaacttgattgaa-tttttttgacaaaagggtttgattcattcattgac 27898250  T
Q  221 aacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||        ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27898249 aacctcttttcattacaaca--------ttacatggacttggcacaat-caatagcattttaaacaacttaatcaaacaaaatactcctatcaatatatt 27898159  T
Q  321 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttgc 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  27898158 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcatttgc 27898075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 32 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 30599530 - 30599169
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30599530 tcttttactttttactttgttctgcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaat 30599431  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||        | || || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30599430 ttgaggatcaatatgatgaatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaattttt--gacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttc 30599333  T
Q  232 attacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaa 331  Q
    ||||||||||||||        |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30599332 attacaacattaca--------tggacttggcacaatacaataacattttaaacaactcaatgaaacaaaatactcatatcaatatcttaatcaacctaa 30599241  T
Q  332 gctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30599240 gctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 30599169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 32 - 403
Target Start/End: Original strand, 17516131 - 17516491
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  17516131 tcttttactttttactttgttaagcaaatgtatgcaccaaggatcacaatgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtatttttactaat 17516230  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||        | || || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17516231 ttgagtatcgatatgatggatatg-atataattcaaggaccaatttgattgaaatttttt-gacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttc 17516328  T
Q  232 attacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaa 331  Q
    ||||||||||||||        |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17516329 attacaacattaca--------tggaattggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatacttctatcaatatcttaatcaacctaa 17516420  T
Q  332 gctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17516421 gctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccc-atcctttg 17516491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 32 - 403
Target Start/End: Original strand, 43765942 - 43766304
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  43765942 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcatagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacatatttgatagtattttcactaat 43766041  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||        |  | || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43766042 ttgatgatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaatttttt-gatagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttc 43766140  T
Q  232 attacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaa 331  Q
    |||||||         |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  43766141 attacaat--------gttacatgaacttgacacaataaaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatattaatcaatctaa 43766232  T
Q  332 gctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43766233 gctcacttcctacacaatcagctttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 43766304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 21 - 379
Target Start/End: Original strand, 44795009 - 44795358
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44795009 caaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggta 44795108  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||        | ||||| |||||||||||||||| |||    
T  44795109 tttaaactaatttgaggatcgatatgatggatatggatataattcaagaaccaatttgattgaa-atattttgacataatggtttggttcattcatcgac 44795207  T
Q  221 aacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||        ||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44795208 aacctcttttcattacaaca--------ttacatggacttggcataatacaatattattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 44795299  T
Q  321 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaa 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44795300 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgtcctccaaa 44795358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 21 - 403
Target Start/End: Original strand, 46198530 - 46198902
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||    
T  46198530 caaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcatcaaagatcacaatgatatctgttgtaaaaatcca-ggacctatttgatggta 46198628  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||        | |||||  ||||| |||||||||||||    
T  46198629 tttttactaatttgaggatcgatatgatagatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaatttttt-gacataaatgtttgattcattcattgac 46198727  T
Q  221 aacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46198728 aacctcttttcattacaacattac--------atggacttgacacaatataataacattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 46198819  T
Q  321 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46198820 aatcaacctaagtccacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 46198902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 2225506 - 2225165
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2225506 caaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggta 2225407  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||  || ||||        | || ||  ||||| |||||||||||||    
T  2225406 ttttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgtatataattcaaggaccaatgcgaatgaattttttt-gacagaaatgtttgattcattcattgac 2225308  T
Q  221 aacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  2225307 aacctcttttcattacaacattacaacattacatggacttggcacaatacaataacattttaaacaactcagtcaagcaaaatactcctatcaatatatt 2225208  T
Q  321 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2225207 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 2225165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 32 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 44275539 - 44275179
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  44275539 tcttttaatttttactttgttcagcaaatgtatgcatcaaggatcacaatgatatctattgtgaaaattcaagaacctatttgatggtattttcactaat 44275440  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||          || || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44275439 ttgaggatcgatatgatggatatgtgtataattcaaggaccaatttgattgaaatttttt---cagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttc 44275343  T
Q  232 attacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaa 331  Q
    ||||||||||||||        || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44275342 attacaacattaca--------tgaacttggcacaatacaataccattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaa 44275251  T
Q  332 gctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44275250 gctcccttccttcacaatcaaatttatccatcaaccttgccctccaaacgtcttctctccccctatcctttg 44275179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 21 - 379
Target Start/End: Original strand, 2661024 - 2661373
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2661024 caaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggta 2661123  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||        | || || ||||||||||||||||||||    
T  2661124 tttaaaccaatttgaggatcgatatgatgaatatgtatataattcaaggaccaatttgatt-aaaatattttgacagaaaggtttggttcattcattgac 2661222  T
Q  221 aacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||        |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2661223 aacctcttttcattacaaca--------ttacatggacatggcacaatacaatatcattttaaacaactcaatcaaacaaaatacccctatcaatatctt 2661314  T
Q  321 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaa 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2661315 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgtcctccaaa 2661373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 32 - 403
Target Start/End: Original strand, 2377817 - 2378172
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2377817 tcttttagtttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaat 2377916  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||          |||||||||||| ||||||     |||||||||||||    
T  2377917 ttgaggatcgttatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaatttttta-acataagggtttgattcatt-----acaacctcttttc 2378010  T
Q  232 attacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaa 331  Q
    |||||||||        ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2378011 attacaaca--------ttacatggacttggcacaat-caataacattttaaacaactcaatcaaa-aaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaa 2378100  T
Q  332 gctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2378101 gctcatttcctacgcaatcaactttatccatcaaccttgctctccaaacctcttctctgcccctatcctttg 2378172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 32 - 403
Target Start/End: Original strand, 21349515 - 21349877
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21349515 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggaccacagtgataattgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaat 21349614  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||           || || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21349615 ttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaatgaccaatttgattgattttttttta-cagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttc 21349713  T
Q  232 attacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaa 331  Q
    |||||||||||||        ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||    
T  21349714 attacaacattac--------atggacttggcgcaatagaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcatatcaatgtcttaatcaacataa 21349805  T
Q  332 gctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  21349806 gctcacttcctacacaatcaactttattcatcaaccttgccctcaaaacttcttctctccccctatcctttg 21349877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 389
Target Start/End: Original strand, 610404 - 610763
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  610404 caaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcatagtgatttatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatggta 610503  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||        | || |||||||   |||||||||||||    
T  610504 ttttcactaatttggggatcgatgcgatggatagacatacaatagaaggaccaatttgattgaattttttt-gacagaagggttgaattcattcattgac 610602  T
Q  221 aacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||      |||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  610603 aacctcttttcattacaacattaca------cat--acttggcacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaattactcctatcaatatctt 610694  T
Q  321 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctct 389  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  610695 aataaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaagccttttctct 610763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 32 - 388
Target Start/End: Original strand, 46113288 - 46113635
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||    
T  46113288 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatttatgttgtgaaaattcaaggacttgtttgatggtatcttcactaat 46113387  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    ||  |||| ||| |||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||        | || ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  46113388 ttagggattgatgtgatggataaacatacaatagaaggaccaatttgattgaaatttttt-gacagaagggttggattcattccttgacaacctcttttc 46113486  T
Q  232 attacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaa 331  Q
    ||||||||||||||      ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46113487 attacaacattaca------ca--gacttgacacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaattactcctatcaatatcttaatcaacctaa 46113578  T
Q  332 gctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctc 388  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  46113579 gctcacttcccgcacaatcaactttatccatcagccttgccctccaagcctcttctc 46113635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 92 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 53188963 - 53188661
Alignment:
Q  92 gtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnn 191  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||           
T  53188963 gtgaaaattcaatgacctatttgatgacattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgcatataattcaaggaccaatgtgattgaattttttt 53188864  T
Q  192 nggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactca 291  Q
     | || || |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53188863 -gacagaaaggtttcattcattcattgacaacctattttcattacaacattaca--------tggacttggcacaatacaataacattttaaacaactca 53188773  T
Q  292 atcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctcc 391  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  53188772 gtcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaatctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaactttgccctccaaacctcttctctgc 53188673  T
Q  392 ccctatcctttg 403  Q
    ||||||| ||||    
T  53188672 ccctatcatttg 53188661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 32 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 23292492 - 23292232
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23292492 tcttttactttttactttgttcagcaaatttatgcaccaaggatcacaatgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 23292393  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||        | || ||  ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  23292392 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggatcaatttgattgaa-attttttgacagaaaagtttgattcattcattgacaacctattttc 23292294  T
Q  232 attacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 301  Q
    |||||||||        ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23292293 attacaaca--------ttatatggacttgtcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 23292232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 35905059 - 35904849
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  35905059 caaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaatgacctatttgatggta 35904960  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||        | || || |||||| |||||||||||||    
T  35904959 ttttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgcatataattcaaggaccaatgtgattgaa-tttttttgacagaaaggtttgattcattcattgac 35904861  T
Q  221 aacctcttttca 232  Q
    ||||||||||||    
T  35904860 aacctcttttca 35904849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 32 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 48830147 - 48829886
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  48830147 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcactaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaattcaaggacttgtttgatggtattttcactaat 48830048  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    |||  |||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||        | ||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||    
T  48830047 ttggagatcgatatgatggatagacatacaatagaaggaccaatttgattgaa-tttttttgacataagggttaaattcattcattgacaaccacttttc 48829949  T
Q  232 attacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaa 302  Q
    |||||||||||||      |||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48829948 attacaacattac------aca--gacttggcacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaaa 48829886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 32 - 302
Target Start/End: Original strand, 51685412 - 51685673
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  51685412 tcttttactttttactttgttcagcaaatatatgcaccaacgatcacagtgatatatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatggtattttcactaat 51685511  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    ||| |||| |||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||        | || || ||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  51685512 ttggggattgatatgatcgatagacatacaatagaaggaccaatttgattgaa-attttttgacagaaaggttaaattcattcattgacaacctcttttc 51685610  T
Q  232 attacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaa 302  Q
    |||||||||||||      |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  51685611 attacaacattac------aca--gacttgacacaatacaataacatttcaaacaactcaatcacacaaaa 51685673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 32 - 245
Target Start/End: Original strand, 42280308 - 42280521
Alignment:
Q  32 tcttttactttt-tactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaa 130  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42280308 tcttttacttttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacaatgatatatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatgatattttcactaa 42280407  T
Q  131 tttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctctttt 230  Q
    |||| |||| |||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||        | || |||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  42280408 tttggggattgatatgatggatagacatacaatagaaggaccaatttgattgaa-attttttgacagaagggttaaattcattcattgacaacctctttt 42280506  T
Q  231 cattacaacattaca 245  Q
    |||||||||||||||    
T  42280507 cattacaacattaca 42280521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 7884227 - 7884091
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7884227 caaagtgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggta 7884128  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgca 157  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  7884127 ttttcactaatttgaggattgaaatgatggatatgca 7884091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 157
Target Start/End: Original strand, 41978538 - 41978674
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41978538 caaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggta 41978637  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgca 157  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41978638 ttttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgca 41978674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 263 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 35904850 - 35904709
Alignment:
Q  263 cacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccat 362  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35904850 cacaatacaataacattttaaacaactcagtcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaaactcacttcctacacaatcaactttatccat 35904751  T
Q  363 caaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttgc 404  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  35904750 caaccttgccctccaaacctgttctctgcccctatcgtttgc 35904709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 32 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 38192596 - 38192456
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  38192596 tcttttacattttactttgttcagcaaatgtatgcacaaaggatcacattgatatctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcactaat 38192497  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggacc 172  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  38192496 ttgaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggacc 38192456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 32 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 53093336 - 53093196
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  53093336 tcttttacattttactttgttcagcaaatgtatgcacaaaggatcacattgatatctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcactaat 53093237  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggacc 172  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  53093236 ttgaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaaggacc 53093196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 46609861 - 46609724
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  46609861 tcttttacattttactttgttcagcaaatgtatgcacaaaggatcacattgatatctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcactaat 46609762  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaagg 169  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  46609761 ttgaggatcgaaatgatggatatgaatataattcaagg 46609724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 32 - 164
Target Start/End: Original strand, 46309812 - 46309944
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  46309812 tcttttacattttactttgttcagcaaatgtatgcacaaatgatcacattgatatctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcactaat 46309911  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataatt 164  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  46309912 ttgaggatcgaaatgatggatatgaatataatt 46309944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 34 - 180
Target Start/End: Original strand, 24845686 - 24845833
Alignment:
Q  34 ttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata-ttttcactaatt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||| || |||| |||||||    
T  24845686 ttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaagatcacattgatatatgttgtgataattcaaagacttatttgatggtatttttaactaatt 24845785  T
Q  133 tgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgat 180  Q
    |  ||| |||| ||||| |||  || | ||| ||||||||||||||||    
T  24845786 tagggaacgatttgatgcatagacaaacaatagaaggaccaatttgat 24845833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 266 - 385
Target Start/End: Original strand, 13466205 - 13466324
Alignment:
Q  266 aatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaa-tatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatca 364  Q
    |||||| |||||| ||||||||  |||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13466205 aatacagtagcatgttaaacaatccaatcaaacaaattacacctatcaaatat-ttaatcaacctaaactcacttcctacacaatcaactttgtccatca 13466303  T
Q  365 accttgccctccaaacctctt 385  Q
    ||||| |||||||| ||||||    
T  13466304 acctttccctccaatcctctt 13466324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 53190196 - 53190118
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttact---ttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaa 96  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53190196 caaagtgtctgtcttttactttttaataatttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaa 53190118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 318 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 32843504 - 32843436
Alignment:
Q  318 cttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 386  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  32843504 cttaatcaacctaagctcacatcctacacagtcaactttgtcgatcaaccttgccctccaaaactcttc 32843436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 319 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 23876287 - 23876220
Alignment:
Q  319 ttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 386  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23876287 ttaatcaacctaaactcacttcatacagagtcaactttgtccatcaaccttgccctccaaacctcttc 23876220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 318 - 383
Target Start/End: Original strand, 41945414 - 41945479
Alignment:
Q  318 cttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 383  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  41945414 cttaatcaccctaagctcacttcctatacaatcaactttgtccatcaaccttgtcctctaaacctc 41945479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 318 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 35862508 - 35862440
Alignment:
Q  318 cttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 386  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||    
T  35862508 cttaatcaacttaagctcgcttcctacacaatcaactttgttcatcaaccttgccatgcaaacctcttc 35862440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 2976410 - 2976359
Alignment:
Q  318 cttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaacctt 369  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  2976410 cttaatcaacctaagctcaattcctacacactcaactttgtccatcaacctt 2976359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 22219308 - 22219218
Alignment:
Q  35 tttactttt-tactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatatttt 124  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||| || ||| |||||||   | ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22219308 tttacttttgtactttgttctgcacatatatgcaccaaggatcgcattgacatctgtttaaataattcaaggatttatttgatgatatttt 22219218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 49495139 - 49495067
Alignment:
Q  308 ctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaac 380  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||| |||||| ||||  ||||||||||    
T  49495139 ctatcaaaaacttaatcaacctaagctcagttcctaaaatatcaactttgtccatctacctcaccctccaaac 49495067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 245
Target Start/End: Original strand, 13466155 - 13466192
Alignment:
Q  208 ttcattcattgacaacctcttttcattacaacattaca 245  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13466155 ttcattcattttcaacctcttttcattacaacattaca 13466192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 35862775 - 35862699
Alignment:
Q  40 tttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgat 116  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||| ||| |||||||   | ||||||||||| ||| ||||    
T  35862775 tttttactttgttctgcacatatatgcaacaaggatcacattgacatctgtttaaataattcaaggacttatctgat 35862699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0564 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0564
Description:

Target: scaffold0564; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 21 - 403
Target Start/End: Original strand, 9059 - 9432
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9059 caaagtgtctgtcttttactttttactttgttcggcagatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctattgtgaaaattcaaggacctatttgatggta 9158  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||        | |||||||||||| |||||||||||||    
T  9159 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggactaatttgattgaattttttt-gacataagggtttgattcattcattgac 9257  T
Q  221 aacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9258 aacctcttttcattacaacattac--------atggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 9349  T
Q  321 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  9350 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatcgatcaaccttgccctccaaacctcttctctgctcctatcatttg 9432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 39)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 34 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 38473445 - 38473085
Alignment:
Q  34 ttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaattt 133  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38473445 ttttactttttactttgtttagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaattt 38473346  T
Q  134 gaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttcat 233  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||        | || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38473345 gaggatcgatatgatgagtatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaatttttt-gacaaaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttcat 38473247  T
Q  234 tacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagc 333  Q
    ||||||||||||        |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38473246 tacaacattaca--------tggacttggcaaaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagt 38473155  T
Q  334 tcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38473154 tcacttcctacacaatcaactttatccatcaactttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 38473085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 27 - 403
Target Start/End: Original strand, 22154696 - 22155063
Alignment:
Q  27 gtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttca 126  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22154696 gtctgtcttttactttttactttgtttagcaaatatatgcaccatggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttca 22154795  T
Q  127 ctaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctc 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        | || || |||||| |||||||||||||||||||    
T  22154796 ctaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaatttttt-gacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 22154894  T
Q  227 ttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 326  Q
    ||||||||||||||||||        ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22154895 ttttcattacaacattac--------atggacttggcacaatacaataacattttaaacaattcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 22154986  T
Q  327 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22154987 cctaagctcacttcctacacgatcaactttatccatcaaccttgtcctccaaacctcttctctgcccctatcctttg 22155063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 27 - 403
Target Start/End: Original strand, 22210611 - 22210978
Alignment:
Q  27 gtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttca 126  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22210611 gtctgtcttttactttttactttgtttagcaaatatatgcaccatggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttca 22210710  T
Q  127 ctaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctc 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        | || || |||||| |||||||||||||||||||    
T  22210711 ctaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaatttttt-gacagaaaggtttgattcattcattgacaacctc 22210809  T
Q  227 ttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 326  Q
    ||||||||||||||||||        ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22210810 ttttcattacaacattac--------atggacttggcacaatacaataacattttaaacaattcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaa 22210901  T
Q  327 cctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22210902 cctaagctcacttcctacacgatcaactttatccatcaaccttgtcctccaaacctcttctctgcccctatcctttg 22210978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 21 - 403
Target Start/End: Original strand, 6604315 - 6604688
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  6604315 caaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagtaaatgtatgcaccaatgatcacagtgatatatgttgtgaaaagtcaaggacctatttgatggta 6604414  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        | || || |||||| |||||||||||||    
T  6604415 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaaatttttt-gacagaaaggtttgattcattcattgac 6604513  T
Q  221 aacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||        || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6604514 aacctcttttcattacaacattaca--------tgaacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctc 6604605  T
Q  321 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  6604606 aatcaacctaagctcacttcctatacaatcaactttatccatcaaccttgcccttcaaacctcttctttgcccctatcctttg 6604688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 21 - 403
Target Start/End: Original strand, 45360127 - 45360499
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  45360127 caaagtgtttatcttttagtttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaattcaaagacctatttgatggta 45360226  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        | |||||||||||| |||||||||||||    
T  45360227 ttttcactaattttaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaa-attttttgacataagggtttgattcattcattgac 45360325  T
Q  221 aacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||        ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45360326 aacctcttttcattacaaca--------ttacatggacttggcacaat-cattagcattttaaacaactcaatccaacaaaatactcctatcaatatctt 45360416  T
Q  321 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  45360417 aatcaacctaaactcacttcctatacaatcaactttttccatcaaccttgccctccaaacctcttctccgcccctatcctttg 45360499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 32 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 23905575 - 23905232
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23905575 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaagatcacaatgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaat 23905476  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||        | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23905475 ttgaggatcgatatgattgatatgcatataattcaatgaccaatttgatttaaatttttt-gacagaagggtttgattcattcattgacaacctcttttc 23905377  T
Q  232 attacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaa 331  Q
    ||||||||||||||        |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23905376 attacaacattaca--------tggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactgaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaa 23905285  T
Q  332 gctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctct 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23905284 gctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgtcctccaaacctct 23905232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 26 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 34776290 - 34775923
Alignment:
Q  26 tgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttc 125  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  34776290 tgtctgtcttttagtttttactttgtttagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaagatctatttgatggtattttc 34776191  T
Q  126 actaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacct 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||        | || ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  34776190 actaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgatt-aaaaaaatttgacagaagagtttgattcattcattgacaacct 34776092  T
Q  226 cttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatca 325  Q
    |||||||||||||||        |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34776091 cttttcattacaaca--------ttacatggacttgggacaat-caatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatacacctatcaatatcttaatca 34776001  T
Q  326 acctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  34776000 acctaagctcacttcctacacaatcaactttattcatcaaccttgccctccaaacctcttctttgcccctatcatttg 34775923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 21 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 35692684 - 35692326
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  35692684 caaagtgtctgtcttttgctttttacttcgttcggcaaatatatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaatgacctatttgatggta 35692585  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        | || || |||||| |||||||||||||    
T  35692584 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaa-attttttgacagaaaggtttgattcattcattgac 35692486  T
Q  221 aacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||        ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  35692485 aacctcttttcattacaaca--------ttacatggacttggcacaatacaatagca-tttaaacaacacaatcaaacaaaatacttttatcaatatctt 35692395  T
Q  321 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctct 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35692394 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccaccaaccttgccctccaaacctcttctct 35692326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 21 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27665380 - 27665031
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  27665380 caaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacatatttgatggta 27665281  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||        | || || ||||||||||||||||||||    
T  27665280 tttaaactaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaatttgatt-aaaatattttgacagaaaggtttggttcattcattgac 27665182  T
Q  221 aacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||        ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27665181 aacctcttttcattacaaca--------ttacatggacttggcacaatacaatatcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 27665090  T
Q  321 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaa 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27665089 aatcaacctaagctcacttcctacacagttaattttatccatcaaccttgtcctccaaa 27665031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 21 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 24227755 - 24227382
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||    
T  24227755 caaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgtaccaatgatcacagtgatatctgttgtgaaaattaaatgtcctatttgatggta 24227656  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||  |||||||||||        | ||  | |||||| |||||||||||||    
T  24227655 ttttcactaatttgaggattgatatgatggatgtgtatataatttaaggacatatttgattgaaatttttt-gacaacaaggtttgattcattcattgac 24227557  T
Q  221 aacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 320  Q
    |||||||||||||| ||||||||||        |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24227556 aacctcttttcattgcaacattaca--------tggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatgaaacaaaatactcctatcaatatctt 24227465  T
Q  321 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  24227464 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacttcttctctccccttatcgtttg 24227382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 32 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 46438833 - 46438470
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  46438833 tcttctactttttactctattcagcaaatgtatccaccaaggatcaaagtgatatctgttgtgaaaattcaatgacctatttgatggtattttcacttat 46438734  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||        | ||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  46438733 ttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaaatttttt-gacatataggtttgattcattcgttgacaacctcttttc 46438635  T
Q  232 attacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaa 331  Q
    | ||||||||||||        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46438634 agtacaacattaca--------tggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaaccaaacaaaatactcatatcaatatcttaatcaacctaa 46438543  T
Q  332 gctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctc-cccctatcctttg 403  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  46438542 gctcacttcctacacagtcaactttatccatcaaccttgtcctccaaacttcttctctcccccctatcctttg 46438470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 29995850 - 29995501
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  29995850 caaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatttgttgtgaaaattcaaggacctatttcatggta 29995751  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||        | || ||  ||||||||||||||||||     
T  29995750 tttaaactaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataatttaaggatcaatttgattgaa-atattttgacagaaatgtttggttcattcattgaa 29995652  T
Q  221 aacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 320  Q
    ||||||| ||||||||||||        |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29995651 aacctctgttcattacaaca--------ttacatagacttggcacaatacaatatcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 29995560  T
Q  321 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaa 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29995559 aatcaacctaagctcacttcctacacagtcaactttatccatcaaccttgtcctccaaa 29995501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 39858576 - 39858271
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  39858576 caaagtgtctgtcttttagtttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaatgatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttcatggta 39858477  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        | || || |||||| |||||||||||||    
T  39858476 ttttcactcatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaa-attttttgacagaatggtttgattcattcattgac 39858378  T
Q  221 aacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||        ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39858377 aacctcttttcattacaaca--------ttacatggacttggcacaat-caataacattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 39858287  T
Q  321 aatcaacctaagctca 336  Q
    ||||||||||||||||    
T  39858286 aatcaacctaagctca 39858271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 26 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 47385539 - 47385168
Alignment:
Q  26 tgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttc 125  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||    
T  47385539 tgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcat----gatcaca-tgatgtatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatggtaatttc 47385445  T
Q  126 actaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacct 225  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||        | || || ||||   |||||||||||||||||     
T  47385444 actaatttggggatcgatatgatggatagacatataatagaaggaccaatttgattgaattttttt-gacagaaaggttgaattcattcattgacaacca 47385346  T
Q  226 cttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatca 325  Q
    || ||||||||||||||||| | |||||  |||||| ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  47385345 ctgttcattacaacattacagcattacacagacttggcacaataaaataaaattctaaacaactcaatcaaacaaatcactcctatcaatatcttaatca 47385246  T
Q  326 acctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  47385245 acctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccttccaaacctcttctctgccactatcctttg 47385168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 37114851 - 37114591
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37114851 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggattacaatgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaat 37114752  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        | || || | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37114751 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaa-attttttgacaaaaagatttgattcattcattgacaacctcttttc 37114653  T
Q  232 attacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 301  Q
    | |||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37114652 aatacaaca--------ttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 37114591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Original strand, 13168873 - 13169096
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13168873 caaagtgtctgtcttttagtttttattttgttcagcgaatgtatgcaccaaggatcacattgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggta 13168972  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        | || || |||||| |||||||||||||    
T  13168973 tgttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaa-attttttgacagaaaggtttgattcattcattgac 13169071  T
Q  221 aacctcttttcattacaacattaca 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  13169072 aacctcttttcattacaacattaca 13169096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 32 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 38550593 - 38550316
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  38550593 tcttttactttttattttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtaaaaattcaaggacttatttgatggtattttcactaat 38550494  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    ||| ||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||| ||||||||||||          ||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  38550493 ttggggatcgatatgatggatagacatacaatagaaggactaatttgattgaatttttttt-acataagggttaaattcatttattgacaacctcttttc 38550395  T
Q  232 attacaaca--------ttacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaa 302  Q
    |||||||||        ||||||| |||||  |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  38550394 attacaacataacaactttacaacattacacagactttgcacaatacaataacattttaaacaactcaataacacaaaa 38550316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 249 - 403
Target Start/End: Original strand, 69133 - 69287
Alignment:
Q  249 ttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaa 348  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69133 ttacatggacttggcacagtacaatagtatttaaaacaactcaatcaaacaaaatactcatattaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaa 69232  T
Q  349 tcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  69233 tgaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcatttg 69287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 239 - 388
Target Start/End: Original strand, 48310947 - 48311096
Alignment:
Q  239 cattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcact 338  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  48310947 cattacaacattacacagacttgacataatataatagcattttaaacaattcaatcaaacaaattactcatgtcaatatcttaatcaacctaagttcact 48311046  T
Q  339 tcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctc 388  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48311047 tcctacacaatcgactttatccatcaacattgccctccaaacctcttctc 48311096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 33 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 37792356 - 37792150
Alignment:
Q  33 cttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaatt 132  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  37792356 cttttactttttactttgtacaacaaatgtatgcaccaatgatcacagtgatatatggtgtgaaaattcaaggacttatttgatggtattttcactaatt 37792257  T
Q  133 tgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttca 232  Q
    || ||||| ||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||| |||        | || |||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  37792256 tggggatcaatatgatggatagacatgcaatagaaggaccaatttgatggaa-atattttgacagaagggttgaattcattcattgacaacctcttttca 37792158  T
Q  233 ttacaaca 240  Q
    ||||||||    
T  37792157 ttacaaca 37792150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 35402694 - 35402544
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  35402694 caaagtgtttatcttttacattttactttgttcagcaaatatatgctcaaaggatcacattgatatctgttatgataattcaaggaccaatttgatgata 35402595  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggacc 172  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||    
T  35402594 ttttcactaatttgaggatcgaaatgatggat-tgaatataattcaaggacc 35402544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 48851657 - 48851499
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  48851657 caaagtgtctgtcttttactttttactttggtcagcaaatgtatgccccaaggatcacaatgatatatgttgtgaaaattcaaggacttatttgatgaga 48851558  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgat 180  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||| ||  |||| ||| || |||||||||||||    
T  48851557 ttttcactaattt-tggatcaatatgatgggtagacatacaatagagggaccaatttgat 48851499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 62 - 164
Target Start/End: Original strand, 69032 - 69134
Alignment:
Q  62 tatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatata 161  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  69032 tatgcaccaaggatcacattgatatctgttatgataattcaaggacctatttgatggtattttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgcatata 69131  T
Q  162 att 164  Q
    |||    
T  69132 att 69134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 264 - 386
Target Start/End: Original strand, 11683621 - 11683743
Alignment:
Q  264 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 363  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||  ||| ||   ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  11683621 acaatacaatagcatgttaaaaaactcaaacaagtaaattatgactatcaaaaacttaatcaacctaagctcacttcctatacactcaactttgtccatc 11683720  T
Q  364 aaccttgccctccaaacctcttc 386  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  11683721 aaccttgccctccaaacctcttc 11683743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 71 - 184
Target Start/End: Original strand, 20478921 - 20479034
Alignment:
Q  71 aggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaagga 170  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||    
T  20478921 aggatcacattgatctctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcattaatttgaggatcgaaatgatggatatgattataattcaagga 20479020  T
Q  171 ccaatttgattgaa 184  Q
    ||||| ||||||||    
T  20479021 ccaatgtgattgaa 20479034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 264 - 387
Target Start/End: Original strand, 32840488 - 32840610
Alignment:
Q  264 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 363  Q
    ||||||||||| ||| ||||| || |||| ||| |||| ||  ||||||||   |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32840488 acaatacaataacatgttaaaaaattcaaacaagcaaattatgcctatcaaatacttaatcatc-taagttcacttcctacacaatcaactttgtccatc 32840586  T
Q  364 aaccttgccctccaaacctcttct 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  32840587 aaccttgccctccaaacctattct 32840610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 318 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 4321865 - 4321800
Alignment:
Q  318 cttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 383  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4321865 cttaatcaccctaagcttacttcctatacaatcaactttgtccatcaaccttgccctccaaacctc 4321800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 264 - 371
Target Start/End: Original strand, 7402914 - 7403021
Alignment:
Q  264 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 363  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||| ||   |||||||   |||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||    
T  7402914 acaatacagtagcatgttaaacaacccaaacaaacaaattatgactatcaaatacttaatcaacctaatcttacatcctacacaatcaactttgtccatc 7403013  T
Q  364 aaccttgc 371  Q
    ||||||||    
T  7403014 aaccttgc 7403021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 266 - 369
Target Start/End: Original strand, 23168648 - 23168751
Alignment:
Q  266 aatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaa 365  Q
    ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||| || |||| |||||||   ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  23168648 aatacaataacatgttaaacaatccaatcaaacgaattacttctatcaaatacttaatcaatctaaactcacttcgtacacaatcaactttatccgtcaa 23168747  T
Q  366 cctt 369  Q
    ||||    
T  23168748 cctt 23168751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 180
Target Start/End: Original strand, 48310767 - 48310914
Alignment:
Q  34 ttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata-ttttcactaatt 132  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | ||| ||||| | |||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  48310767 ttttattttctactttgttcagcaaatatatgtagcaaagatcatattgatatatgttgtgataattcaatgacttatttgatgatatttttcactaatt 48310866  T
Q  133 tgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgat 180  Q
    |  | |||||| ||||| |||  || | ||| ||| ||||||||||||    
T  48310867 taggaatcgatttgatgcatagacaaacaatagaatgaccaatttgat 48310914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 318 - 383
Target Start/End: Original strand, 34691873 - 34691938
Alignment:
Q  318 cttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 383  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  34691873 cttaatcaacctaagttcacttcatatacaatcaactttgtccatcaacgttgccctccaaacctc 34691938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 308 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 34784647 - 34784575
Alignment:
Q  308 ctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaac 380  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  34784647 ctatcaaaaacttaatcaacctaagctcacttcttatacaatcaactttgtccatcaacattgcccttcaaac 34784575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 386
Target Start/End: Original strand, 40360951 - 40361028
Alignment:
Q  309 tatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 386  Q
    |||||||  ||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  40360951 tatcaattactttatcaatctaagctcactttctaaacaatcaactttgtccatcaaccttgctctccaaacttcttc 40361028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 66
Target Start/End: Original strand, 66870 - 66915
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgc 66  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66870 caaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgc 66915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 124
Target Start/End: Original strand, 13035621 - 13035705
Alignment:
Q  40 tttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatatttt 124  Q
    |||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||   | ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  13035621 tttttactttgttttgcacatatatgcaccaaggatcacattgacatctgtttaaataattcaaggacttatttgatggtatttt 13035705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 374
Target Start/End: Original strand, 13035937 - 13035993
Alignment:
Q  318 cttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccct 374  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  13035937 cttaatcaacctaatctcacttcctacatagtcaactttctccatcaaccttcccct 13035993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 48302936 - 48302873
Alignment:
Q  319 ttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 383  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  48302936 ttaatcaccctaagctcacttcctgtacaatcaactttgtccatcaacgttg-cctccaaacctc 48302873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 297 - 336
Target Start/End: Original strand, 13169123 - 13169162
Alignment:
Q  297 acaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctca 336  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13169123 acaaaatattcctatcaatatcttaatcaacctaagctca 13169162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 178
Target Start/End: Original strand, 63302 - 63335
Alignment:
Q  145 tgatggatatgcatataattgaaggaccaatttg 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  63302 tgatggatatgcatataattgaaggaccattttg 63335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 25)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 21 - 403
Target Start/End: Original strand, 2180564 - 2180934
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2180564 caaagtgtctgtcttttagtttttactttgttcagcaaatgtatgcatcaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggta 2180663  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        | || ||||||||| |||||||||||||    
T  2180664 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaa-attttttgacacaagggtttgattcattcattgac 2180762  T
Q  221 aacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||        ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2180763 aacctcttttcattacaaca--------ttacatggacttggcacaat-caataacattttaa--aactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 2180851  T
Q  321 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  2180852 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatcgatcaaccttgtcctccaaacctcttctttgcccctgtcctttg 2180934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 21 - 396
Target Start/End: Original strand, 21841791 - 21842157
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21841791 caaagtgtctgtcttttactttttactttcttcagcaaatgtatgcactaagaatcacagtgatatctattgtgaaaattcaaggacctatttgatggta 21841890  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||        | || || |||||| |||||||||||||    
T  21841891 ttttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgcatataattcaaggaccaatgtgattgaattttttt-gacagaaaggtttgattcattcattgac 21841989  T
Q  221 aacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21841990 aacctcttttcattacaacattac--------atggacttgccacaatacaataacattttaaacaactcagtcaaacaaaatactcctatcaatatctt 21842081  T
Q  321 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctcccccta 396  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  21842082 agtcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgtcctccaaacctcttctctgccccta 21842157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 32 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 2853591 - 2853253
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  2853591 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaagacctatttgatgatatttaaactaat 2853492  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||        | ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  2853491 ttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaatttcattgaa-atattttgacataaaggtttggttcattcattgacaatctattttc 2853393  T
Q  232 attacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaa 331  Q
    |||||||||        ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  2853392 attacaaca--------ttacatggacttggcacattacaatatcattttaaacaactcaatcaaacaaaatattcatatcaatatcttaatcaacctaa 2853301  T
Q  332 gctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaa 379  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2853300 gctcacttcttacacaatcaactttatccatcaaccttgtcctccaaa 2853253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 26 - 336
Target Start/End: Original strand, 12800723 - 12801023
Alignment:
Q  26 tgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttc 125  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  12800723 tgtctgtcttttagtttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaatgacctatttggtggtattttc 12800822  T
Q  126 actaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacct 225  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        | || || |||||| ||||||||||||||||||    
T  12800823 actaatttgatgatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaa-attttttgacagaatggtttgattcattcattgacaacct 12800921  T
Q  226 cttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatca 325  Q
    |||||||||||||||        ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12800922 cttttcattacaaca--------ttacatggacttggcacaat-caatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatca 12801012  T
Q  326 acctaagctca 336  Q
    |||||||||||    
T  12801013 acctaagctca 12801023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 40 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 42472798 - 42472444
Alignment:
Q  40 tttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaatttgaggat 139  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||| | |||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||    
T  42472798 ttttttctttgttcagcaaatgtatgtccaaaggatcaaattgatttctgttatgataattcaaggaccaatttgatgttttttttactaatttaaggat 42472699  T
Q  140 cgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttcattacaac 239  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||        | || || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42472698 cgaaatgatggatatgaatataattcaaggaccaatgtgattgaatattttt-gacagaaaggtttgattcattcattgacaaccttttttcattacaac 42472600  T
Q  240 attacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcactt 339  Q
    ||||||        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42472599 attaca--------tggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaataacttaatcaacctaagctcactt 42472508  T
Q  340 cctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  42472507 cctagacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctgcccctatcatttg 42472444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 26 - 336
Target Start/End: Original strand, 12737900 - 12738200
Alignment:
Q  26 tgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttc 125  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  12737900 tgtctgtcttttagtttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaatgacctatttggtggtattttc 12737999  T
Q  126 actaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacct 225  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        | || || |||||| ||||||||| ||||||||    
T  12738000 actaatttgatgatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaa-attttttgacagaatggtttgattcattcatcgacaacct 12738098  T
Q  226 cttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatca 325  Q
    ||||| |||||||||        ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12738099 ctttttattacaaca--------ttacatggacttggcacaat-caatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatca 12738189  T
Q  326 acctaagctca 336  Q
    |||||||||||    
T  12738190 acctaagctca 12738200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 32 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 30464960 - 30464679
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  30464960 tcttttactttttactttgttcagcaaatatatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattatcactaat 30464861  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30464860 tttaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaa-attttttgacagaagggtttgattcattcattgacaacctcttttc 30464762  T
Q  232 attacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaa 322  Q
    |||||||||        ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30464761 attacaaca--------ttacatggacttggcacaatacaatatcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatgaatatcttaa 30464679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 301
Target Start/End: Original strand, 8540472 - 8540732
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8540472 tcttttactttttactttgttcagcaaatttatgcaccaaggatcacaatgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 8540571  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||        | || || |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  8540572 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggatcaatttgattgaa-attttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctattttc 8540670  T
Q  232 attacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 301  Q
    |||||||||        ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8540671 attacaaca--------ttacatggatttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 8540732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 32135157 - 32134897
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32135157 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatctccgttgtgaaaattcaaggacctatttgatggtattttcactaat 32135058  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttc 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        | || || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32135057 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaa-attttttgacagaaaggtttgattcattcattgacaacctcttttc 32134959  T
Q  232 attacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 301  Q
    |||||||||        |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32134958 attacaaca--------ttacatcgacttgacacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaa 32134897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 202 - 403
Target Start/End: Original strand, 28821364 - 28821557
Alignment:
Q  202 gtttggttcattcattgacaacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 301  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28821364 gtttgattcattcattgacaacctcttttcattacaacattaga--------tggacttggcacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaa 28821455  T
Q  302 atactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctt 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  28821456 atactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaacctttccctccaaacctcttatatccctctatcctt 28821555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 183
Target Start/End: Original strand, 28821170 - 28821332
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28821170 caaaatgtttgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcatcaaagatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgtta 28821269  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattga 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  28821270 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgtatataattcaaggaccaatttgattga 28821332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 157
Target Start/End: Original strand, 7268635 - 7268771
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7268635 caaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgtta 7268734  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgca 157  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7268735 ttttcactaatttgaggatcgaaatgatggatatgca 7268771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 285 - 403
Target Start/End: Original strand, 17575700 - 17575819
Alignment:
Q  285 caactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcactt-cctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 383  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17575700 caactcagtcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcactttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 17575799  T
Q  384 ttctctccccctatcctttg 403  Q
    |||||| |||||||| ||||    
T  17575800 ttctctgcccctatcatttg 17575819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 285 - 403
Target Start/End: Original strand, 17577011 - 17577130
Alignment:
Q  285 caactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcactt-cctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 383  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17577011 caactcagtcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcactttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctc 17577110  T
Q  384 ttctctccccctatcctttg 403  Q
    |||||| |||||||| ||||    
T  17577111 ttctctgcccctatcatttg 17577130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 281 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 18624398 - 18624276
Alignment:
Q  281 taaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaac 380  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  18624398 taaacaactcaatcaaacaaattactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaacttcatccatcaaccttgtcatccaaac 18624299  T
Q  381 ctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    |||||||||  | ||||||||||    
T  18624298 ctcttctctgacactatcctttg 18624276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 285 - 403
Target Start/End: Original strand, 17574980 - 17575099
Alignment:
Q  285 caactcaatcaaacaaaatactcctatcaatat-cttaatcaacctaagctcactt-cctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacct 382  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17574980 caactcagtcaaacaaa-tactcctatcaatatacttaatcaacctaagctcactttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacct 17575078  T
Q  383 cttctctccccctatcctttg 403  Q
    ||||||| |||||||| ||||    
T  17575079 cttctctgcccctatcatttg 17575099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 24540525 - 24540429
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatg 117  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24540525 caaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatatgttgtgaaaattcaaggacctatttgatg 24540429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 41494741 - 41494553
Alignment:
Q  56 caaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatg 155  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||      
T  41494741 caaatatatgcactaaggattacagtgatatatgttgtgaaaattcaaggaattatttgatggtattttcacaaatttggggatcaatatgatggataga 41494642  T
Q  156 catataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctcttttcattacaacattaca 245  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||        |  | |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41494641 catacaatagaaggaccaatttgatggaa-agattttgataaaagggttgaattcattcattgacaacctcttttcattactacattaca 41494553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 71 - 184
Target Start/End: Original strand, 40781430 - 40781543
Alignment:
Q  71 aggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaagga 170  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||    
T  40781430 aggatcacattgatctctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcattaatttgaggatcgaaatgatggatatgattataattcaagga 40781529  T
Q  171 ccaatttgattgaa 184  Q
    ||||| ||||||||    
T  40781530 ccaatgtgattgaa 40781543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 29621024 - 29620912
Alignment:
Q  71 aggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaagga 170  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||  | ||||| |||||    
T  29621024 aggatcacattgatctctgttatgataattcaaggaccaatttgatggtattttcattaatttgaggatcaaaatgatggatatgattgtaattcaagga 29620925  T
Q  171 ccaatttgattga 183  Q
    ||||| |||||||    
T  29620924 ccaatgtgattga 29620912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 264 - 383
Target Start/End: Original strand, 1344229 - 1344348
Alignment:
Q  264 acaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatc 363  Q
    ||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||| |||| ||   |||| || | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  1344229 acaatacagcagcatgttaaaaaactcaaacaagcaaattatgactatgaaaaacttaatcagcctaagctcacttcctatacaatcaactttgtccatc 1344328  T
Q  364 aaccttgccctccaaacctc 383  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1344329 aaccttgccctccaaacctc 1344348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 320 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 28036443 - 28036377
Alignment:
Q  320 taatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttc 386  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28036443 taatcaatctaagctcacttcctacacaatcaattttgtccatcaaccttgccctccaaacttcttc 28036377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 266 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 1343861 - 1343744
Alignment:
Q  266 aatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaa 365  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||| ||| |||| ||   ||||||| | |||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  1343861 aatacagtagcatgttaaaaaactcaaacaagcaaattatgactatcaaaaacttaatcagcataagctcactttctatacaatcaactttgtccatcaa 1343762  T
Q  366 ccttgccctccaaacctc 383  Q
    ||||| ||| ||||||||    
T  1343761 ccttgtccttcaaacctc 1343744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 318 - 379
Target Start/End: Original strand, 18341214 - 18341275
Alignment:
Q  318 cttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaa 379  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  18341214 cttaatcaatttaagctcacttcctacacaatcaactttgtccatcaacattgccctccaaa 18341275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 380
Target Start/End: Original strand, 27349967 - 27350039
Alignment:
Q  308 ctatcaatatcttaatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaac 380  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  27349967 ctatcaaaaacttaatcaacctaagctcaattcctaaagtatcaactttgtccatcaacctcaccctccaaac 27350039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 107919 - 107547
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||| |||||| ||||||||| ||    
T  107919 caaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaatgatcacagtgatttatattgtgaaaatttaaggacttatttgatggta 107820  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgac 220  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||| ||| ||||||||||||||||        | || ||||||| | |||||||||||||    
T  107819 ttttcactaatttagggatcgatatgatggatagacatacaatagaatgaccaatttgattgaaatttttt-gacagaagggtt-gattcattcattgac 107722  T
Q  221 aacctcttttcattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatctt 320  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||      ||   ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  107721 aaccttttttcattactacattaca------caa--acttggcacaatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaattactcctatcaatatctt 107630  T
Q  321 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  | ||||||||||    
T  107629 aatcaacctaagctcacttcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctcaaaacctcttcgctgacactatcctttg 107547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0345 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0345
Description:

Target: scaffold0345; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 32 - 353
Target Start/End: Original strand, 363 - 682
Alignment:
Q  32 tcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgatattttcactaat 131  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  363 tcttttactttttactttgttcggcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctgtttgatggtatttttactaat 462  T
Q  132 ttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaannnnnnnnggcataagggtttggttcattcattgacaacctctttt- 230  Q
    |||||||||         ||||||||||||||| |||||||||||||||||||        | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||     
T  463 ttgaggatc---------gatatgcatataattcaaggaccaatttgattgaa-actttttgacataagggtttgattcattcattgaccacctcttttc 552  T
Q  231 -------cattacaacattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaat 323  Q
           ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  553 attacaacattacaacattacaacattacatgaacttggcacaatagaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatacttctatcaatatcgtaat 652  T
Q  324 caacctaagctcacttcctacacaatcaac 353  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  653 caacctaagctgacttcctacacaatcaac 682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0345; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 361 - 403
Target Start/End: Original strand, 677 - 719
Alignment:
Q  361 atcaaccttgccctccaaacctcttctctccccctatcctttg 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  677 atcaaccttgccctccaaacctcttctctacccctatcatttg 719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 136; Significance: 8e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 184
Target Start/End: Original strand, 4094 - 4257
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4094 caaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 4193  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaa 184  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  4194 tttaaactaatttgaggatcgatatgatgaatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaa 4257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 184
Target Start/End: Original strand, 5266 - 5429
Alignment:
Q  21 caaaatgtctatcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 120  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5266 caaagtgtctgtcttttactttttactttgttcagcaaatgtatgcaccaaggatcacagtgatatctgttgtgaaaattcaaggacctatttgatgata 5365  T
Q  121 ttttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaa 184  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  5366 tttaaactaatttgaggatcgatatgatgaatatgtatataattcaaggaccaatttgattgaa 5429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 239 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 1643 - 1497
Alignment:
Q  239 cattacaacgttacatggacttgacacaatacaatagcattttaaacaactcaatcaaacaaaatactcctatcaatatcttaatcaacctaagctcact 338  Q
    ||||||||| |||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||  |||||    
T  1643 cattacaacattacatagacttggcataatacaataacattttaaacaactcaatcaaacaaattactcctatcaacatcttaatcagcctaaattcact 1544  T
Q  339 tcctacacaatcaactttatccatcaaccttgccctccaaacctcttct 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  1543 tcctacacaatcaactttatccat--accttgccctccaaacctcttct 1497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 1751 - 1686
Alignment:
Q  119 tattttcactaatttgaggatcgatatgatggatatgcatataattgaaggaccaatttgattgaa 184  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  1751 tattttcactaatttggagatcgatatgatggatagacatacaatagaaggaccaatttgatggaa 1686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University