View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11427_low_24 (Length: 253)

Name: NF11427_low_24
Description: NF11427
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11427_low_24
NF11427_low_24
[»] chr5 (56 HSPs)
chr5 (18-216)||(31705541-31705738)
chr5 (18-203)||(7208793-7208976)
chr5 (18-212)||(14919457-14919651)
chr5 (18-193)||(23954718-23954893)
chr5 (18-203)||(22255244-22255428)
chr5 (18-203)||(27318416-27318600)
chr5 (18-193)||(22980865-22981039)
chr5 (18-216)||(22974011-22974209)
chr5 (18-193)||(699222-699396)
chr5 (18-216)||(30969253-30969451)
chr5 (18-203)||(5829963-5830138)
chr5 (27-216)||(38528175-38528363)
chr5 (17-193)||(21088694-21088869)
chr5 (18-204)||(35504426-35504611)
chr5 (17-193)||(36866834-36867009)
chr5 (17-193)||(36860495-36860671)
chr5 (18-216)||(17157960-17158157)
chr5 (71-214)||(24886154-24886297)
chr5 (18-193)||(26268146-26268320)
chr5 (25-174)||(12910446-12910594)
chr5 (17-193)||(40133457-40133632)
chr5 (25-193)||(5837627-5837794)
chr5 (18-212)||(23116151-23116345)
chr5 (17-216)||(33908281-33908480)
chr5 (52-216)||(9200281-9200445)
chr5 (25-178)||(31786582-31786734)
chr5 (20-193)||(39572891-39573063)
chr5 (25-216)||(19119907-19120098)
chr5 (25-216)||(27330354-27330543)
chr5 (38-178)||(8741835-8741974)
chr5 (39-193)||(6824429-6824584)
chr5 (25-193)||(5112250-5112416)
chr5 (52-216)||(32563197-32563361)
chr5 (19-144)||(35934015-35934141)
chr5 (25-178)||(25500862-25501014)
chr5 (18-193)||(35511411-35511580)
chr5 (43-212)||(43308606-43308774)
chr5 (71-193)||(1429127-1429248)
chr5 (52-216)||(7693278-7693442)
chr5 (18-178)||(15992469-15992628)
chr5 (52-193)||(22019704-22019844)
chr5 (18-142)||(13956291-13956415)
chr5 (18-214)||(35826415-35826608)
chr5 (18-116)||(2888374-2888472)
chr5 (19-193)||(15724562-15724733)
chr5 (52-193)||(28416490-28416630)
chr5 (72-144)||(14409310-14409382)
chr5 (52-144)||(42342851-42342942)
chr5 (18-178)||(8437053-8437211)
chr5 (18-60)||(24886291-24886333)
chr5 (83-144)||(8466864-8466925)
chr5 (25-60)||(1429098-1429133)
chr5 (18-53)||(14409270-14409305)
chr5 (19-63)||(8466928-8466972)
chr5 (127-193)||(11898074-11898139)
chr5 (109-193)||(25668721-25668804)
[»] chr1 (51 HSPs)
chr1 (18-216)||(37451330-37451527)
chr1 (21-216)||(15382977-15383172)
chr1 (28-216)||(18422695-18422883)
chr1 (18-216)||(28564717-28564913)
chr1 (18-216)||(10922771-10922969)
chr1 (18-216)||(30326886-30327084)
chr1 (18-216)||(51128903-51129101)
chr1 (18-216)||(8222175-8222370)
chr1 (18-216)||(28769697-28769895)
chr1 (18-216)||(2959792-2959990)
chr1 (18-212)||(32267082-32267276)
chr1 (18-193)||(15752097-15752271)
chr1 (18-181)||(25160712-25160874)
chr1 (25-216)||(19899710-19899901)
chr1 (18-216)||(9902988-9903186)
chr1 (25-203)||(23999405-23999582)
chr1 (18-178)||(27227419-27227578)
chr1 (18-212)||(30254472-30254665)
chr1 (18-216)||(32216099-32216297)
chr1 (18-193)||(47279257-47279431)
chr1 (25-191)||(10181949-10182114)
chr1 (17-178)||(238446-238606)
chr1 (25-216)||(27763252-27763442)
chr1 (25-144)||(4330397-4330516)
chr1 (18-193)||(42721107-42721281)
chr1 (18-178)||(7078997-7079156)
chr1 (18-203)||(27267134-27267317)
chr1 (18-165)||(33725534-33725680)
chr1 (18-178)||(38759612-38759775)
chr1 (25-216)||(46931455-46931644)
chr1 (18-144)||(15168212-15168338)
chr1 (18-216)||(16415689-16415888)
chr1 (18-144)||(47682428-47682554)
chr1 (18-216)||(38823258-38823456)
chr1 (18-216)||(40884857-40885055)
chr1 (52-193)||(48620705-48620845)
chr1 (18-141)||(22170830-22170953)
chr1 (18-177)||(27532915-27533072)
chr1 (18-193)||(27563839-27564013)
chr1 (52-216)||(37618860-37619028)
chr1 (18-216)||(34012316-34012509)
chr1 (50-216)||(3534976-3535142)
chr1 (71-192)||(11742338-11742457)
chr1 (18-144)||(31621488-31621613)
chr1 (19-144)||(39393499-39393625)
chr1 (18-216)||(14758085-14758274)
chr1 (50-214)||(41926209-41926373)
chr1 (20-131)||(1547408-1547519)
chr1 (17-216)||(3309192-3309396)
chr1 (18-67)||(1359869-1359918)
chr1 (120-203)||(21289730-21289812)
[»] chr4 (47 HSPs)
chr4 (18-216)||(50697290-50697487)
chr4 (26-199)||(37663714-37663886)
chr4 (18-216)||(25184161-25184359)
chr4 (26-216)||(19089426-19089616)
chr4 (18-216)||(879513-879711)
chr4 (18-216)||(55477856-55478058)
chr4 (18-212)||(25701021-25701216)
chr4 (18-216)||(3042659-3042865)
chr4 (18-216)||(19440613-19440811)
chr4 (18-215)||(6864084-6864281)
chr4 (18-193)||(17173362-17173536)
chr4 (25-216)||(32912552-32912743)
chr4 (18-212)||(35021000-35021194)
chr4 (25-193)||(17167785-17167952)
chr4 (25-214)||(42199779-42199968)
chr4 (18-178)||(28002951-28003110)
chr4 (18-194)||(33341470-33341644)
chr4 (18-193)||(36493654-36493827)
chr4 (18-216)||(38011902-38012100)
chr4 (25-144)||(1815421-1815540)
chr4 (18-178)||(4934167-4934326)
chr4 (18-194)||(55241070-55241244)
chr4 (25-216)||(34361464-34361654)
chr4 (33-193)||(54499217-54499378)
chr4 (18-216)||(23761120-23761317)
chr4 (26-193)||(27396688-27396854)
chr4 (18-178)||(5047931-5048089)
chr4 (18-216)||(34948060-34948260)
chr4 (30-117)||(46884087-46884172)
chr4 (47-193)||(9139317-9139462)
chr4 (25-216)||(29584172-29584361)
chr4 (27-214)||(46888132-46888318)
chr4 (18-131)||(47253873-47253986)
chr4 (18-144)||(32579566-32579692)
chr4 (25-146)||(17272082-17272203)
chr4 (52-193)||(32592165-32592305)
chr4 (52-216)||(4598041-4598203)
chr4 (52-193)||(37775741-37775879)
chr4 (18-131)||(7703642-7703755)
chr4 (18-131)||(35025561-35025674)
chr4 (18-193)||(49376039-49376213)
chr4 (71-165)||(33816551-33816644)
chr4 (93-193)||(50764802-50764901)
chr4 (18-67)||(33816481-33816530)
chr4 (52-131)||(30002631-30002710)
chr4 (18-124)||(37287866-37287974)
chr4 (18-69)||(7152169-7152220)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (18-203)||(408368-408551)
scaffold0002 (18-193)||(206-380)
scaffold0002 (27-212)||(94331-94516)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (26-216)||(7935-8125)
[»] chr7 (51 HSPs)
chr7 (18-216)||(38258568-38258766)
chr7 (18-203)||(18797364-18797548)
chr7 (18-216)||(27283767-27283965)
chr7 (26-216)||(30055550-30055740)
chr7 (18-216)||(17842524-17842724)
chr7 (18-216)||(37109895-37110095)
chr7 (25-216)||(24211764-24211955)
chr7 (24-216)||(7334817-7335009)
chr7 (25-216)||(10481627-10481819)
chr7 (18-216)||(21991659-21991857)
chr7 (25-216)||(31579011-31579207)
chr7 (18-212)||(32820993-32821187)
chr7 (17-193)||(43686088-43686262)
chr7 (26-193)||(32432499-32432665)
chr7 (17-193)||(4582966-4583141)
chr7 (18-216)||(15612699-15612896)
chr7 (20-203)||(11071243-11071425)
chr7 (18-216)||(27421320-27421517)
chr7 (18-203)||(37347059-37347242)
chr7 (18-214)||(41765018-41765214)
chr7 (18-216)||(5657421-5657619)
chr7 (18-193)||(10359154-10359328)
chr7 (18-144)||(23111285-23111413)
chr7 (18-131)||(37703438-37703551)
chr7 (18-203)||(9355766-9355950)
chr7 (18-144)||(37704252-37704378)
chr7 (18-216)||(48928237-48928434)
chr7 (25-144)||(15672709-15672828)
chr7 (18-216)||(33688202-33688400)
chr7 (18-216)||(48928504-48928701)
chr7 (17-216)||(6546542-6546741)
chr7 (20-216)||(22687262-22687458)
chr7 (50-216)||(44413351-44413517)
chr7 (18-178)||(25691484-25691643)
chr7 (71-178)||(31520717-31520822)
chr7 (18-144)||(44598761-44598887)
chr7 (78-193)||(29173587-29173701)
chr7 (52-193)||(12165799-12165939)
chr7 (18-175)||(43925167-43925322)
chr7 (18-131)||(46481069-46481182)
chr7 (25-216)||(8861308-8861499)
chr7 (20-118)||(26588026-26588124)
chr7 (71-203)||(38053523-38053646)
chr7 (71-216)||(12390623-12390768)
chr7 (71-193)||(26980370-26980491)
chr7 (18-91)||(35353256-35353329)
chr7 (71-143)||(32593182-32593254)
chr7 (18-60)||(32593146-32593188)
chr7 (25-60)||(31520688-31520723)
chr7 (25-60)||(38053640-38053675)
chr7 (18-60)||(29173702-29173744)
[»] chr3 (56 HSPs)
chr3 (26-216)||(42506022-42506212)
chr3 (18-216)||(3655141-3655339)
chr3 (18-216)||(40552198-40552396)
chr3 (17-216)||(54828639-54828837)
chr3 (18-216)||(26941199-26941397)
chr3 (18-203)||(48354994-48355178)
chr3 (25-216)||(47481561-47481752)
chr3 (18-193)||(34132998-34133172)
chr3 (18-173)||(46994600-46994754)
chr3 (18-203)||(4761587-4761772)
chr3 (27-216)||(37203106-37203295)
chr3 (26-216)||(21009749-21009939)
chr3 (18-216)||(46297701-46297899)
chr3 (18-193)||(11466887-11467061)
chr3 (18-193)||(39282715-39282889)
chr3 (18-142)||(32373583-32373707)
chr3 (27-216)||(37157747-37157935)
chr3 (83-214)||(20373300-20373431)
chr3 (18-144)||(52040861-52040987)
chr3 (18-177)||(22446004-22446162)
chr3 (53-203)||(51212955-51213104)
chr3 (18-141)||(22622657-22622780)
chr3 (25-178)||(24488908-24489060)
chr3 (25-165)||(43348349-43348487)
chr3 (29-216)||(54505847-54506033)
chr3 (17-144)||(44891608-44891735)
chr3 (18-141)||(53229091-53229214)
chr3 (18-177)||(33378724-33378882)
chr3 (18-143)||(33698265-33698390)
chr3 (18-177)||(3362332-3362492)
chr3 (25-193)||(4015523-4015690)
chr3 (18-144)||(22451079-22451205)
chr3 (18-175)||(24708054-24708212)
chr3 (18-193)||(2007996-2008169)
chr3 (25-178)||(53176132-53176284)
chr3 (25-144)||(11835573-11835693)
chr3 (52-144)||(29163929-29164021)
chr3 (27-176)||(38591778-38591926)
chr3 (25-177)||(7327428-7327579)
chr3 (55-193)||(29099418-29099555)
chr3 (31-193)||(35844389-35844550)
chr3 (25-141)||(36012251-36012368)
chr3 (71-216)||(27480371-27480516)
chr3 (18-173)||(25579822-25579976)
chr3 (52-144)||(14586643-14586735)
chr3 (18-98)||(20373183-20373263)
chr3 (18-193)||(21193669-21193844)
chr3 (25-137)||(1089811-1089924)
chr3 (83-193)||(44186505-44186614)
chr3 (19-144)||(45174616-45174742)
chr3 (71-144)||(11357356-11357429)
chr3 (93-216)||(40936030-40936153)
chr3 (20-177)||(43975836-43975985)
chr3 (18-60)||(11357320-11357362)
chr3 (23-60)||(27480310-27480347)
chr3 (25-67)||(11357096-11357138)
[»] chr8 (39 HSPs)
chr8 (18-216)||(37970464-37970662)
chr8 (18-216)||(43643540-43643738)
chr8 (18-203)||(1149577-1149761)
chr8 (18-216)||(10555149-10555345)
chr8 (18-216)||(1204974-1205172)
chr8 (18-193)||(12876180-12876355)
chr8 (18-193)||(36694911-36695085)
chr8 (18-193)||(6098463-6098637)
chr8 (18-193)||(9864219-9864393)
chr8 (18-178)||(16222949-16223108)
chr8 (25-216)||(23854383-23854574)
chr8 (18-216)||(27082783-27082981)
chr8 (18-203)||(31933831-31934015)
chr8 (18-144)||(33906331-33906457)
chr8 (18-216)||(16446820-16447018)
chr8 (25-216)||(30654535-30654726)
chr8 (25-190)||(7890909-7891073)
chr8 (62-213)||(1150094-1150245)
chr8 (18-188)||(1953933-1954104)
chr8 (25-216)||(8803769-8803953)
chr8 (18-216)||(11727071-11727269)
chr8 (17-176)||(35459655-35459813)
chr8 (17-193)||(40862491-40862665)
chr8 (18-138)||(4132631-4132750)
chr8 (18-216)||(38644025-38644223)
chr8 (18-144)||(41910933-41911059)
chr8 (18-216)||(13307670-13307868)
chr8 (18-192)||(5299891-5300064)
chr8 (18-214)||(39099064-39099258)
chr8 (18-216)||(34895014-34895207)
chr8 (25-141)||(43025824-43025940)
chr8 (71-193)||(34952029-34952150)
chr8 (52-193)||(465913-466053)
chr8 (70-203)||(41362576-41362708)
chr8 (19-178)||(44869583-44869741)
chr8 (71-141)||(7998416-7998487)
chr8 (48-113)||(18259233-18259298)
chr8 (26-81)||(12585298-12585353)
chr8 (19-60)||(7998481-7998522)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (18-216)||(37905756-37905956)
chr2 (19-216)||(43648203-43648400)
chr2 (18-193)||(3177011-3177185)
chr2 (25-216)||(19289287-19289478)
chr2 (18-216)||(33550944-33551141)
chr2 (18-177)||(17071694-17071852)
chr2 (17-193)||(4166994-4167169)
chr2 (25-191)||(29242102-29242267)
chr2 (18-216)||(26357625-26357823)
chr2 (27-193)||(4763703-4763868)
chr2 (25-216)||(11366345-11366536)
chr2 (18-144)||(31861972-31862098)
chr2 (18-215)||(35958958-35959142)
chr2 (18-193)||(4264033-4264208)
chr2 (18-168)||(45327817-45327966)
chr2 (18-178)||(17054053-17054212)
chr2 (19-214)||(36642036-36642233)
chr2 (18-193)||(41463807-41463981)
chr2 (27-144)||(41960960-41961077)
chr2 (18-178)||(44913749-44913910)
chr2 (18-212)||(2325335-2325521)
chr2 (17-193)||(39167325-39167494)
chr2 (18-216)||(19424585-19424783)
chr2 (19-168)||(31570692-31570840)
chr2 (19-203)||(33902128-33902311)
chr2 (52-193)||(5881611-5881750)
chr2 (52-193)||(27349930-27350069)
chr2 (53-216)||(33660360-33660523)
chr2 (18-144)||(44286069-44286195)
chr2 (18-216)||(33709189-33709387)
chr2 (18-141)||(41465624-41465747)
chr2 (52-193)||(19313924-19314063)
chr2 (19-216)||(4478417-4478610)
chr2 (52-216)||(43770830-43770994)
chr2 (18-167)||(18494238-18494385)
chr2 (71-193)||(7006931-7007052)
chr2 (91-193)||(13711536-13711637)
chr2 (25-123)||(18258251-18258349)
chr2 (25-67)||(19500879-19500921)
chr2 (94-144)||(19501773-19501822)
[»] chr6 (16 HSPs)
chr6 (25-216)||(1945882-1946073)
chr6 (18-193)||(3879877-3880051)
chr6 (18-203)||(6091120-6091305)
chr6 (25-216)||(5627439-5627630)
chr6 (18-216)||(7234973-7235170)
chr6 (18-144)||(30353296-30353422)
chr6 (19-216)||(4318761-4318959)
chr6 (25-177)||(7055160-7055311)
chr6 (18-193)||(21017050-21017224)
chr6 (18-193)||(15491687-15491861)
chr6 (25-216)||(29182211-29182403)
chr6 (52-216)||(33892975-33893138)
chr6 (19-193)||(8513305-8513473)
chr6 (18-165)||(20768184-20768328)
chr6 (88-144)||(33618954-33619010)
chr6 (18-60)||(33619029-33619071)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (18-203)||(44019-44202)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (18-203)||(154585-154768)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (25-203)||(145962-146139)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (18-177)||(267372-267531)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (18-164)||(12010-12155)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 56)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 31705541 - 31705738
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31705541 caaacagagttgatgatattatgtgatggtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 31705640  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31705641 tgttaatctgatgaattgatgatactagagga--ctggacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacatttttgatgttatagtgt 31705738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 203
Target Start/End: Original strand, 7208793 - 7208976
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7208793 caaacagagttgaaaatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgtttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtct 7208892  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacatttt 203  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7208893 tgttaatctgatgaattgatgatactagagga--ctgaacttttgatgtcaatgtacaaacggtagggtgttactcgttgcatttt 7208976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 212
Target Start/End: Original strand, 14919457 - 14919651
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  14919457 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacaatttgtgaggtgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagttt 14919556  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttata 212  Q
    | |||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||  |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  14919557 tgttaatatgatgagttgatgatactatgagga--ctgaacttttgatgtcattatataaacagtgaggtgttactcattacatttttgatgttata 14919651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Original strand, 23954718 - 23954893
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23954718 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtct 23954817  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtca-ttgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||| || | ||| |||| || |||||||||||    
T  23954818 tgttaatatgatgaattgatgatacta-tggaaactgaacttttgatgccactagtaaaaacagtggggtgttactc 23954893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22255428 - 22255244
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||    
T  22255428 caaacatagttgatgatattatgtaatagttttaagtgttacactttgtgtggtgttacgcttataacaaaataggctaaaattagattaagtgtagtct 22255329  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacatttt 203  Q
    | ||||| |||||||||||||||| || ||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22255328 tgttaatctgatgaattgatgataatatgagaa--ctgaacttttgatgccattgtacaaacggtggggtgttactcattacatttt 22255244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 203
Target Start/End: Original strand, 27318416 - 27318600
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27318416 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtct 27318515  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatact-agaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacatttt 203  Q
    | ||||||||||||||||||||||||  ||| |  || |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||  ||||||||    
T  27318516 tgttaatatgatgaattgatgatactgtgagaa--ctaaacttttgatgtcattgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttt 27318600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22981039 - 22980865
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22981039 caaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtct 22980940  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||  ||||| || |||| ||||||    
T  22980939 tgttaatctgatgaattgatgatactatgggga--ctgaacttttgatgtcattgctcaaacagtggggtattactc 22980865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 22974011 - 22974209
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  22974011 caaacagagttgataatattatgtaatagtcttaagtgttacattttgtgaggtgttacgcttataacaagataggataaaattagattaagtgtagtct 22974110  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttac-attttgatgttatagtgt 216  Q
    | ||| | |||||| ||||||||| ||   || | |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  22974111 tgttattctgatgagttgatgataatatgagaat-tgaacttttgatgttattgtacaaacagtgggatgttactcattacttttttgatgttatagtgt 22974209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 699396 - 699222
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  699396 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtggagtgttacacttaaaataaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 699297  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    | ||||| |||||||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  699296 tgttaatctgatgaattgatgatattatgatga--ctgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactc 699222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 30969253 - 30969451
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  30969253 caaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattct 30969352  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtg 215  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  30969353 tgttaatctgatgaattgatgatactatgagga--ctgaacttttgatgtcattgtataaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtg 30969450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 5830138 - 5829963
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  5830138 caaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaagataaaatgagattaagtgtagtct 5830039  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacatttt 203  Q
    | ||         |||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5830038 tgtt---------aattgatgatactatgagga--ctaaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcattacatttt 5829963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 27 - 216
Target Start/End: Original strand, 38528175 - 38528363
Alignment:
Q  27 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatat 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  38528175 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaagataaaattagattaagtgcagtcttgttaatct 38528274  T
Q  127 gatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttac-attttgatgttatagtgt 216  Q
    |||||||||||||||||  | ||  ||||||||||||||||| |||| ||||  | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  38528275 gatgaattgatgatact--atgagactgaacttttgatgtcactgtataaacaatggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgt 38528363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 193
Target Start/End: Original strand, 21088694 - 21088869
Alignment:
Q  17 acaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtc 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||    
T  21088694 acaaacatagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaagttagattaaatgtattc 21088793  T
Q  117 ttattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    || ||| |||||||||||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  21088794 ttgttagtatgatgaattgttgatactatgggga--ctgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgtcactc 21088869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 35504611 - 35504426
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  35504611 caaacagatttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataatatggtaggataaaattatattaagtgtagtct 35504512  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacattttg 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |    | |||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  35504511 tgttaatatgatgaattgatgatactataatgat-tgaacttttgatgtcatcatacaaacggtgaggtgttactcattacattttg 35504426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 36867009 - 36866834
Alignment:
Q  17 acaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtc 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  36867009 acaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattc 36866910  T
Q  117 ttattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    || ||| | |||||||||| ||||||||  ||   |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  36866909 ttgttagtctgatgaattgttgatactatcgg-gactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactc 36866834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 36860671 - 36860495
Alignment:
Q  17 acaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgctt-ataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||| |||| |    
T  36860671 acaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaaaaaaggtaggataaaattagattaaatgtact 36860572  T
Q  116 cttattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    ||| ||| |||||||||||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  36860571 cttgttagtatgatgaattgttgatactatgggga--ctgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactc 36860495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 17157960 - 17158157
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||||    
T  17157960 caaacagagttgataatattatgtgatggtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataataaggtaagatacaattatactaagtgtagtct 17158059  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtg 215  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||||  | |||   |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  17158060 tgttaatctgatgaattaatgatactataatgac---gaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattacattttttatgttatagtg 17158156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 71 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24886297 - 24886154
Alignment:
Q  71 tgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcat 169  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  24886297 tgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatgagttgatgatactatgagga--ctgaacttttgatgtcat 24886200  T
Q  170 tgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagt 214  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  24886199 tgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagt 24886154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 26268320 - 26268146
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||    
T  26268320 caaacatagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgcggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaatttgattaattgtattct 26268221  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| | |||  || ||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||    
T  26268220 tgttaatctgatgaattgatgatactatgtgga--ctaaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttactc 26268146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 12910594 - 12910446
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  12910594 agttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcatgttaat 12910495  T
Q  125 atgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtac 174  Q
     ||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  12910494 ctgatgaattgacgatactatgagga--ctgaacttttgatgtcactgtac 12910446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 40133632 - 40133457
Alignment:
Q  17 acaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtc 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  40133632 acaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattc 40133533  T
Q  117 ttattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    || ||| | |||||||||| ||||| || | |||  |||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||    
T  40133532 ttgttagtctgatgaattgttgatattatgggga--ctgaacttttgatgccattgtacaaatagtggggtgttactc 40133457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 5837794 - 5837627
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||| |||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  5837794 agttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaatgtaggattaaattagattaagtgtattcttgttaat 5837695  T
Q  125 atgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    ||||||||||||||||||||  |||  ||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  5837694 atgatgaattgatgatacta-tggagactgaaattttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactc 5837627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 212
Target Start/End: Original strand, 23116151 - 23116345
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  23116151 caaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatat 23116250  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttata 212  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||  | |  |||||||||||||  || ||||||||| || ||||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  23116251 tgttaatctgatgaattgatgatacta-tgtaaactgaacttttgattccactgtacaaacagtggggtgctactcactacagttttgatgttata 23116345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33908480 - 33908281
Alignment:
Q  17 acaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtc 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33908480 acaaacatagttgacgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctggggtgttacatttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgcagtc 33908381  T
Q  117 ttattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagt 214  Q
    || ||||| |||  |||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||  |||||||| || | ||| |||||  |||| |||||||| ||||||    
T  33908380 ttgttaatctgaataattgatgatactatgagga--ctgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggagtgctactcactacacttttgatgatatagt 33908283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 52 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9200445 - 9200281
Alignment:
Q  52 agtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatact-agaggac 150  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  9200445 agtgttacactttgtggaatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaagagga- 9200347  T
Q  151 tctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
     || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  9200346 -ctaaacttttgatgtcactgtacaaactgtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgt 9200281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 178
Target Start/End: Original strand, 31786582 - 31786734
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  | |||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  31786582 agttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaagtgcagtcttgttaat 31786681  T
Q  125 atgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaac 178  Q
     ||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||| || |||||||||    
T  31786682 ctgatgaattgatgatactatgagga--ttgaacttttgatgccactgtacaaac 31786734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 39573063 - 39572891
Alignment:
Q  20 aacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtctta 119  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||     
T  39573063 aacagagttgttgatatcatgtgatagtctcgagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttg 39572964  T
Q  120 ttaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| ||| |  ||||||||||||||||| || |||||| || | |||||||||    
T  39572963 ttaatctgatgaatttatgatactatgagaa--ctgaacttttgatgtcactgcacaaacagtggagtgttactc 39572891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19120098 - 19119907
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||  |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| || |||| |||||    
T  19120098 agttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttatacttaaaacaaggtaggataaaattagagtaagtttattcttgttaat 19119999  T
Q  125 atgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
     |||||||||||||| |||| | |||  ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |  ||| |||||||| ||||||||    
T  19119998 ctgatgaattgatgacactatgggga--ctgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactagcaacacttttgatgctatagtgt 19119907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 27330543 - 27330354
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||  || | |||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  27330543 agttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacacttcatggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaat 27330444  T
Q  125 atgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacattttgatgttatagtgt 216  Q
     ||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  27330443 ctgatgaattgatgatactatgaaga--ctgaacttttgatgccattgtacaaacagtaaggtgttactcaacac-ttttgatgttatagtgt 27330354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 178
Target Start/End: Original strand, 8741835 - 8741974
Alignment:
Q  38 atgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  8741835 atgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtatgacaaaattagattaattgtattcttgttaatttgatgaattgat 8741934  T
Q  138 gatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaac 178  Q
    |||||||  |||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  8741935 gatacta-tggagactgaacttttgatgccattgtacaaac 8741974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 193
Target Start/End: Original strand, 6824429 - 6824584
Alignment:
Q  39 tgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatg 138  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||    
T  6824429 tgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgataaattgatg 6824528  T
Q  139 atacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    |||||| || ||||    ||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  6824529 atactatgaagactgaacacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtgttactc 6824584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Original strand, 5112250 - 5112416
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||| | | |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  5112250 agttgatgatattatgtgaaagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacatggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaat 5112348  T
Q  125 atgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
     | ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||    
T  5112349 ttaatgaattgatgatactatgggga--ctgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactc 5112416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 32563361 - 32563197
Alignment:
Q  52 agtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatactagaggact 151  Q
    ||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| || |||       
T  32563361 agtgttacactttgtgggctgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatatta-agggga 32563263  T
Q  152 ctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || || | |||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  32563262 ctgaacttttgatgtcactgtacagacagtggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgt 32563197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 35934141 - 35934015
Alignment:
Q  19 aaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgat-aaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||| |||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||    
T  35934141 aaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaactagattaagtgtattct 35934042  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta 144  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||    
T  35934041 tgttaatctgatgaattgatgatacta 35934015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 178
Target Start/End: Original strand, 25500862 - 25501014
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    ||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||| || |||| |||||    
T  25500862 agttgctgatatcatgtgatgatcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtttattcttgttaat 25500961  T
Q  125 atgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaac 178  Q
     ||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||| || |||||||||    
T  25500962 ctgatgaattgatgatactatagg-gacttaacttttgatggcagtgtacaaac 25501014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Original strand, 35511411 - 35511580
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| | |||||| |||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  35511411 caaacagatttgatgatattatgtgatagt-----gtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtagtct 35511505  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    | ||||| |||||||||| ||||| || || ||  ||||||||||||||||| | ||||||| || | |||||||||    
T  35511506 tgttaatctgatgaattggtgatagtatgatga--ctgaacttttgatgtcactttacaaacagtggagtgttactc 35511580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 212
Target Start/End: Original strand, 43308606 - 43308774
Alignment:
Q  43 atagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatac 142  Q
    |||||||||||||||||| |||    | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||  |||||| ||||||||||    
T  43308606 atagtcttaagtgttacacttttcagggtgttacacttataacaaggtaagataaaattagattaagtatagttttgttaagctgatgagttgatgatac 43308705  T
Q  143 ta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttata 212  Q
    || |||||  |||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  43308706 tatgagga--ctgaacttttgatgccattgtacgaacagt-gggtgttattcattacatttttgatgttata 43308774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 193
Target Start/End: Original strand, 1429127 - 1429248
Alignment:
Q  71 tgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcatt 170  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||  ||||| |||||||| || |    
T  1429127 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatacta-tggagactgaatttttgatgccagt 1429225  T
Q  171 gtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  1429226 gtacaaacagtggggtgttactc 1429248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7693442 - 7693278
Alignment:
Q  52 agtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatact-agaggac 150  Q
    ||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| || | ||||| | |||||||||||||||| ||||||     
T  7693442 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagcgtattcatgttaatctaatgaattgatgatactaagagga- 7693344  T
Q  151 tctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
      ||||||||||||| || ||||||||| || || ||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  7693343 -ttgaacttttgatgccactgtacaaacagtgggatgttactcacaacacttttgatgttatagtgt 7693278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 178
Target Start/End: Original strand, 15992469 - 15992628
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||  |||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||| | |||| | || | | |||||||  |||||||||||| ||||||| |||    
T  15992469 caaacagagttcctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttgcactcaaatcaaggtagaataaaattagatcaagtgtattct 15992568  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaac 178  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15992569 tgttaatctgatgaattgatgatactatgaaga--ctgaacttttgatgtcactgtacaaac 15992628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22019844 - 22019704
Alignment:
Q  52 agtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatactagaggact 151  Q
    ||||||| | |||||| | |||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||       
T  22019844 agtgttatactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaagtgatgatacta-agggga 22019746  T
Q  152 ctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    || |||||||||||||| | |||||||  | |||||||||||    
T  22019745 cttaacttttgatgtcactatacaaacaatggggtgttactc 22019704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 142
Target Start/End: Original strand, 13956291 - 13956415
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||  | |||||| |||  |||||| ||  |||||||||||||||||| ||| |    
T  13956291 caaacaaatttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacgctttgtagggtgttacacttgaaacaagataaaataaaattagattaagtgaagttt 13956390  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatac 142  Q
    | ||||| |||||||||||||||||    
T  13956391 tgttaatctgatgaattgatgatac 13956415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Original strand, 35826415 - 35826608
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| ||||||   ||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||| ||| || |    
T  35826415 caaacagagttgatgatattatg--ataatcttaagggttacactttgtggagtgttacgcttaaaacaatgtagaataaaattagattaaatgtggtat 35826512  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagt 214  Q
    | ||||| | ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||  |   |||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  35826513 tgttaatct-atgaactgatgatactatgagga--ctgaacttttgatgtcactgtacaaacaatgaagtgttactcagtacatttttgatgttatagt 35826608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 116
Target Start/End: Original strand, 2888374 - 2888472
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtc 116  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||  |||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2888374 caaacatatttgatgatattatctgatagtcttaagtgttacactttatggaatgttaaacttgaaacaaggtaaaataaaattagattaagtgtagtc 2888472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15724733 - 15724562
Alignment:
Q  19 aaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtctt 118  Q
    ||||| ||||| |||||| || |||||||||||| || |||| |||| |   |||||  |||| || ||||||  ||||||||| |||||||||| ||||    
T  15724733 aaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattctt 15724634  T
Q  119 attaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
     ||||| |||||||||||||||| ||  |||  |||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  15724633 gttaatttgatgaattgatgatattatggga--ctgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactc 15724562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 193
Target Start/End: Original strand, 28416490 - 28416630
Alignment:
Q  52 agtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatactagaggact 151  Q
    ||||||||| |||||| | |||||| |||| || |||| |  |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| || ||||      
T  28416490 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataaggcagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatatta-aggaga 28416588  T
Q  152 ctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
     ||||||||||||  || ||||||||| || || ||||||||    
T  28416589 ttgaacttttgattccactgtacaaacagtgggatgttactc 28416630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 144
Target Start/End: Original strand, 14409310 - 14409382
Alignment:
Q  72 gttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatacta 144  Q
    ||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14409310 gttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta 14409382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 42342942 - 42342851
Alignment:
Q  52 agtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatacta 144  Q
    ||||||||| ||||||   | |||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  42342942 agtgttacactttgtggtgtattacacttaaaacaag-taagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta 42342851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 8437211 - 8437053
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| | |||    |||| ||||||| | |||||||||||||||||  |||| |    
T  8437211 caaacagagttgatcatattatgtgataatcttaagtgttacacattgtggggtgtataacttaaaacaaggcaggataaaattagattaagcatagttt 8437112  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaac 178  Q
    | | ||| |||||  |||||||||  | |||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8437111 tgtaaatctgatg-gttgatgatataatgagga--ctgaacttttgatgtcactgtacaaac 8437053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 24886333 - 24886291
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 60  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24886333 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 24886291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 8466925 - 8466864
Alignment:
Q  83 aacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatacta 144  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8466925 aacaaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatacta 8466864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 60
Target Start/End: Original strand, 1429098 - 1429133
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 60  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1429098 agtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 1429133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 53
Target Start/End: Original strand, 14409270 - 14409305
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaag 53  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14409270 caaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaag 14409305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 8466972 - 8466928
Alignment:
Q  19 aaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattt 63  Q
    ||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  8466972 aaacagagttggtgatatcatatgatagtcttaagtgttacattt 8466928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 11898139 - 11898074
Alignment:
Q  127 gatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  11898139 gatgaattgatgatactatgaggacta--aacttttgatgtcactgtacaactagtagggtgttactc 11898074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 25668804 - 25668721
Alignment:
Q  109 gtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| || ||| ||||| || |||||||||||    
T  25668804 gtgtattcttgttaatctaatgaattgatgatacta-aggggactgaacttttgatgccactgttcaaacagtggggtgttactc 25668721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 51)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 37451527 - 37451330
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  37451527 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttttgaggtgttacacttataacaaggtcagataaaattagattaagtgtagtct 37451428  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  37451427 tgttaatatgataaattgatgatactagagga--ctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttacttattacatttttgatgttatagtgt 37451330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15383172 - 15382977
Alignment:
Q  21 acatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  15383172 acatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgt 15383073  T
Q  121 taatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15383072 taatctgatgaattgatgatactacgatga--ctgaacttttgatgacattgtacaaacggtgggatgttactcattacatttttgatgttatagtgt 15382977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18422883 - 18422695
Alignment:
Q  28 tgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatg 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  18422883 tgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcatataacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctg 18422784  T
Q  128 atgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
    |||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  18422783 atgaattgatgatattatgagga--ctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcgttatatttttgatgttatagtgt 18422695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 28564717 - 28564913
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||  | | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28564717 caaacagagttgatgatattatgtgatagt--taagtgttacactttacggggtgttatgcttataacaaggcatgataaaattagattaagtgtagtct 28564814  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtg 215  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  28564815 tgttaatatgatgaattgatgatactatgagga--ctgaacttttgatgtcattgtacaaacagtaaggtgttactcattacatttttgatgttatagtg 28564912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 10922969 - 10922771
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10922969 caaacagagttgatgatattatgtgacagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacccttataacaaggtatgataaaataagattaagtgtagtct 10922870  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtg 215  Q
    | ||||| |||||| |||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  10922869 tgttaatctgatgagttgatgatactatgagga--ttgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtcttactcattacattttttatgttatagtg 10922772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 30326886 - 30327084
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  30326886 caaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagttt 30326985  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtg 215  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  30326986 tgttaatctgatgaattgatgatactatgatga--ctgaacttttgatgctattgtacaaacggttgggtattactcattacatttttgatgttatagtg 30327083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 51129101 - 51128903
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51129101 caaacagagttgatgatattatgtgatagttttaattgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtct 51129002  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtg 215  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  | ||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  51129001 tgttaatatgatgaattgatgatactataatga--ctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattacattttttatgttatagtg 51128904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8222370 - 8222175
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  8222370 caaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagtct 8222271  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtg 215  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| ||||||   ||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8222270 tgttaatatgatgaattgatgatactatgagaa--ctgaacttttgatgccattgt---aacggtgtggtgttactcattacatttttgatgttatagtg 8222176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 28769895 - 28769697
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgaga-tgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtc 116  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28769895 caaacagaggtgatgatattatgtgatagtcttaagcgttacactttgtgggggtgttacgtttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtc 28769796  T
Q  117 ttattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagt 214  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  28769795 ttgttaatatgatgaattgatgatactatgagga--ccgaacctttgatgccattgtacaaacggt-gggtgttactcattacatttttgatgtcatagt 28769699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2959990 - 2959792
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  2959990 caaacatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacaatttgtgggatgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtggtct 2959891  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtg 215  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||   |||| ||||||||||||||||    
T  2959890 tgttaatctgatgaattgatgacactatgagga--ctgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttacttactacagttttgatgttatagtg 2959793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 32267276 - 32267082
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  32267276 caaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttgagtgttacactttgtggagtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatct 32267177  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttata 212  Q
    | ||||| |||||  ||||||||| || |||||   |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  32267176 tgttaatctgatgggttgatgataatatgagga--gtgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttata 32267082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15752271 - 15752097
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15752271 caaacagagttaatgatattatgtgatactcttaagtgttacactttatggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtct 15752172  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||    
T  15752171 tgttaatctgatgaattgatgatactatgagga--ctgaacttttgatgccattgtacaaacagtgaggtgttactc 15752097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 25160874 - 25160712
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  25160874 caaacaaagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagtct 25160775  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggt 181  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25160774 tattaatctaatgaattgatgatactatgagga--ctgaacttttgatgccattgtacaaacggt 25160712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 216
Target Start/End: Original strand, 19899710 - 19899901
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  19899710 agttggtgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaatgtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaac 19899809  T
Q  125 atgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
     ||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||| |||| ||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19899810 ctgatgaattgatgatactatgagg--gttgaacttttgatgccattctacaaacagtgaggtgttactcgttacatttttgatgttatagtgt 19899901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 9902988 - 9903186
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9902988 caaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtagtct 9903087  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtg 215  Q
    | ||||| |||||||||||||||| || | |||   |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  9903088 tgttaatttgatgaattgatgatagtatgtgga--ttgaacttttgatgtcactgtacaaacagcggggtgttactcactacagttttgatgttatagtg 9903185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 23999582 - 23999405
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  23999582 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaac 23999483  T
Q  125 atgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacatttt 203  Q
     |||||||||||| |||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||| |||||    
T  23999482 ctgatgaattgataatactatgagg--gctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcgttatatttt 23999405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 178
Target Start/End: Original strand, 27227419 - 27227578
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| | |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  27227419 caaacatagttgatgatatcatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatct 27227518  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaac 178  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| || |||||||||    
T  27227519 tgttaatctgatgaattgatgatactatgagga--ctgaacttttgatgccactgtacaaac 27227578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 30254665 - 30254472
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |  | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  30254665 caaacagagttgatgttattatgtgacagtcttaagtgttacactttatagggtgttatgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtctagtct 30254566  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatac-tagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttata 212  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||| || | || |||||| ||||| |||||||||||||    
T  30254565 tgttaatctgatgaattgatgatactttgagga--ctgaacttttgatgtcattgtacaaacagt-gtgtattactcattacatttttgatgttata 30254472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 32216297 - 32216099
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |    
T  32216297 caaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatttgattaagtttagttt 32216198  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtg 215  Q
    | ||||| | ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| | |||||||||||| || | |||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  32216197 tgttaatctaatgaattgatgatactacgagga--ctgaacttttgacgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttatagtg 32216100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 47279431 - 47279257
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  47279431 caaacatagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatgggatgttacaattaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattct 47279332  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| || ||||||||| || |||||||||||    
T  47279331 tgttaatctgatgaattgatgatactatgagga--ctgaactttcgatgccactgtacaaacagtggggtgttactc 47279257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 191
Target Start/End: Original strand, 10181949 - 10182114
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10181949 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaat 10182048  T
Q  125 atgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttac 191  Q
     ||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||| || ||||||||| || | |||||||    
T  10182049 ctgatgaattgacgatactatgagga--ctgaacttttgatgccactgtacaaacagtggcgtgttac 10182114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 178
Target Start/End: Original strand, 238446 - 238606
Alignment:
Q  17 acaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  238446 acaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattc 238545  T
Q  117 ttattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaac 178  Q
    || ||| | |||| ||||| |||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  238546 ttgttagtctgattaattgttgatactatgggga--ctgaacttttgatgtcattgtacaaac 238606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 216
Target Start/End: Original strand, 27763252 - 27763442
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  27763252 agttgattatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtagggtgttacgcttagaactaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaac 27763351  T
Q  125 atgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
     |||| |||||||||||||| ||||   ||| ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27763352 ctgataaattgatgatactatgagg--gctggacttttgatgtcattctacaaactat-gggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 27763442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 4330516 - 4330397
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  4330516 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaat 4330417  T
Q  125 atgatgaattgatgatacta 144  Q
     |||| ||||||||||||||    
T  4330416 ctgataaattgatgatacta 4330397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 42721281 - 42721107
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||| | | |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42721281 caaacaaagttgatgatattacgtgataatcttaagtgttatactttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtct 42721182  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||  ||  | |||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||    
T  42721181 tgttaatctgatgaattgatgatactatggggat-tgaacttttgatgttactgtacaaacagtggggtgttactc 42721107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 178
Target Start/End: Original strand, 7078997 - 7079156
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| | |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  7078997 caaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtcttatactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattct 7079096  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaac 178  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  7079097 tgttaatttgatgaattgatgatactatgatga--ctgaacttttgatgtcattgtacaaac 7079156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 203
Target Start/End: Original strand, 27267134 - 27267317
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||| || | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  27267134 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtggggtgttacactcaaaacaaggta-gattaaattagattaagtgtagtct 27267232  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacatttt 203  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||  |||  |||||||||| ||| || ||||||||| || |||||| ||||  ||||||||    
T  27267233 tgttaatctgatgaattgatgatacta-tggagactgaacttttaatgccactgtacaaacagtggggtgtcactcactacatttt 27267317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 165
Target Start/End: Original strand, 33725534 - 33725680
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || | |||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  33725534 caaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaaatgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtct 33725633  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatg 165  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  33725634 tgttaatatgatgaattgatgatactatgagga--ctgaacttttgatg 33725680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 38759775 - 38759612
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| |||| || ||| ||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  38759775 caaacatagttggtgatattatctgatagtctcaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataagatatgataaaattaaattaaatgtagttt 38759676  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggact--ctgaacttttgatgtcattgtacaaac 178  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  38759675 tattaatatgatgaattgatgatattacgaagactggctgaacttttgatgtcactgtacaaac 38759612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 46931644 - 46931455
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  46931644 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgctga--acaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaac 46931547  T
Q  125 atgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
     |||||||||||||||| || ||||   ||||| |||||||| | || ||||||| || |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  46931546 ctgatgaattgatgatattatgagg--gctgaatttttgatgccgttctacaaacagtggggtattactcattacatttttgatgttatagtgt 46931455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 15168338 - 15168212
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  15168338 caaacatagttgatgatattatgcgatagccttaagtgttacactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaactgcagtct 15168239  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta 144  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||    
T  15168238 tgttaatctgatgaattgatgatacta 15168212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16415888 - 16415689
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| | | |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16415888 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacaatatgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtct 16415789  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaac-ggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagt 214  Q
    | ||||| | ||||||||||||||||| || |   |||||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||  |||| |||||||| ||||||    
T  16415788 tgttaatctaatgaattgatgatactatgatg--gctgaacttttgatgccactgtacaaacatttagggtgttactcactacacttttgatgctatagt 16415691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Original strand, 47682428 - 47682554
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||||||| |||| ||||||||    
T  47682428 caaacatagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggcagaataaaattagtttaaatgtagtct 47682527  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta 144  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||    
T  47682528 tgttaatctgatgaattgatgatacta 47682554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 38823456 - 38823258
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||| |||| || || ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  38823456 caaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgttgggtgttacacttaaaataaagtaggataaaattagattaagtgtattct 38823357  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttac-attttgatgttatagtgt 216  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||  ||  | ||||||||||||| || ||||||||  || ||||||||||||  || ||||||||| ||||||||    
T  38823356 tgttaatctgatgaattgatgatactatggggat-tgaacttttgatgacactgtacaaatagtggggtgttactcgcaacaattttgatgctatagtgt 38823258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40885055 - 40884857
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |  ||||||| |||| |||||| || ||||||| ||||||||||| | |||    
T  40885055 caaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacacttttcggaatgttacacttaaaacaagataggataaaactagattaagtgcaatct 40884956  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||| ||  |||||||| || ||||| |||||  |||| |||||||||||| ||||    
T  40884955 tgttaatctgatgaattgaagatactatagg-gactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgttatggtgt 40884857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 48620845 - 48620705
Alignment:
Q  52 agtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatactagaggact 151  Q
    ||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||       
T  48620845 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta-agggga 48620747  T
Q  152 ctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  48620746 ctgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactc 48620705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 22170953 - 22170830
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||  ||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  22170953 caaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacatttgaaacaaggtaggatgaaattagattaagtgtagtgt 22170854  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgata 141  Q
    ||||||| | ||||||||||||||    
T  22170853 tattaatctaatgaattgatgata 22170830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 177
Target Start/End: Original strand, 27532915 - 27533072
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| | ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  27532915 caaacagaattgctgatatcatgtgatagtcttgagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt-gattaagtgtattct 27533013  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaa 177  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||  ||  | ||||||||||||| || ||||||||    
T  27533014 tgttaatctgatgaattgatgatactatggggat-tgaacttttgatgccactgtacaaa 27533072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Original strand, 27563839 - 27564013
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |||||| | | |||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27563839 caaacagagttgatgaaattatatgatagtcttaagtgttcctctttgtggggtattatacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtct 27563938  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    | ||||| |||||||||||| ||| ||  |||  ||||||||||||||||| | ||||||| || | |||||||||    
T  27563939 tgttaatctgatgaattgataatattatcgga-actgaacttttgatgtcactatacaaacagtggagtgttactc 27564013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 216
Target Start/End: Original strand, 37618860 - 37619028
Alignment:
Q  52 agtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatg--atacta-gagg 148  Q
    ||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||  |||||| |||     
T  37618860 agtgttacactttatgggatgttatgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtattgttaatctgatgaattgatgatatactatgaga 37618959  T
Q  149 actctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtg--ttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||  |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  37618960 a--ctgaacttttgatgtcattttacaaacagtggggtgttttactcattaaatttttgatgttatagtgt 37619028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 34012316 - 34012509
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| | |||||| |||  ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||    
T  34012316 caaacagatttgatgatattatgtgatagt-----gtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtaatct 34012410  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtg 215  Q
    | ||||| |||||||||||||||| || || ||  |||||||||||||| || | ||||||| || | |||||||||  |||| | ||||||||||||||    
T  34012411 tgttaatctgatgaattgatgatagtatgatga--ctgaacttttgatgccactttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatgttatagtg 34012508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3535142 - 3534976
Alignment:
Q  50 taagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatactagagga 149  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||| ||| || |||     
T  3535142 taagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggcaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgataatatta-aggg 3535044  T
Q  150 ctctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
      ||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  3535043 gactgaacttttgatgtcactgcacaaacagtaaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgt 3534976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 192
Target Start/End: Original strand, 11742338 - 11742457
Alignment:
Q  71 tgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcatt 170  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| |    
T  11742338 tgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgatattatggga--ctgaacttttgatgtcact 11742435  T
Q  171 gtacaaacggtagggtgttact 192  Q
    |||||||| || ||||||||||    
T  11742436 gtacaaacagtggggtgttact 11742457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Original strand, 31621488 - 31621613
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  || | | || | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  31621488 caaacatagttgttgatattatgcgatagtcttaagtgtcacacttc-tggggtattgcacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtct 31621586  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta 144  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||    
T  31621587 tgttaatctgatgaattgatgatacta 31621613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 39393625 - 39393499
Alignment:
Q  19 aaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgat-aaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    ||||| ||||| | |||| || |||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||    
T  39393625 aaacagagttgctaatatcatatgatagtcttaagtgttacactttgtaggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagatgaagtgtattct 39393526  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta 144  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||||    
T  39393525 tgttaatctgatgaatttatgatacta 39393499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14758274 - 14758085
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||         ||| || | |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  14758274 caaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaa---------tttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtct 14758184  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtg 215  Q
    | ||||| | |||||||||||| |||| | |||  |||||||||||||| ||  |||||||| || | ||| |||||  |||| ||||||||||||||||    
T  14758183 tgttaatctaatgaattgatgaaactatgggga--ctgaacttttgatgccaccgtacaaacagttgtgtgctactcactacacttttgatgttatagtg 14758086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 41926373 - 41926209
Alignment:
Q  50 taagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatactagagga 149  Q
    ||||||||||| ||||||   |||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  41926373 taagtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatagg- 41926275  T
Q  150 ctctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagt 214  Q
      |||||||| ||||| || ||||||||| || || | ||||||  || | |||||||||||||||    
T  41926274 gactgaacttgtgatgccactgtacaaacagtgggatattactcactatatttttgatgttatagt 41926209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 1547519 - 1547408
Alignment:
Q  20 aacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtctta 119  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||| || ||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||     
T  1547519 aacagagttgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtatttttg 1547420  T
Q  120 ttaatatgatga 131  Q
    ||||| ||||||    
T  1547419 ttaatctgatga 1547408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3309396 - 3309192
Alignment:
Q  17 acaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtg-----agatgttacgcttataacaaggtatgataaaa-ttagattaagt 110  Q
    ||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||| || |||     || ||||||  ||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||    
T  3309396 acaaacagagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacacttagtgtagtgaggtgttacatttaaaacaaagtaggttaaaaattagattaagt 3309297  T
Q  111 gtagtcttattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgt 208  Q
    ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||  || ||||||||| || |||||||||||   ||| |||||||||    
T  3309296 gtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaaga--ttgaacttttgataccactgtacaaacagt-gggtgttactcacaacacttttgatgt 3309200  T
Q  209 tatagtgt 216  Q
    ||||||||    
T  3309199 tatagtgt 3309192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 67
Target Start/End: Original strand, 1359869 - 1359918
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtg 67  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  1359869 caaacatagttgatgatattatatgataatcttaagtgttacactttgtg 1359918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21289812 - 21289730
Alignment:
Q  120 ttaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacatttt 203  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||  ||||||||    
T  21289812 ttaatctgatgaattgatgatactataggga-ctgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacatttt 21289730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 47)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 50697487 - 50697290
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  50697487 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtgtggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtct 50697388  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  50697387 tgttaatctgatgaattgatgatactagagaa--ttgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttatattttttatgttatagtgt 50697290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 199
Target Start/End: Original strand, 37663714 - 37663886
Alignment:
Q  26 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaata 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  37663714 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatc 37663813  T
Q  126 tgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  37663814 tgatgaattgatgatactatgagga--ctgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattaca 37663886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25184359 - 25184161
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  25184359 caaacagagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagatcaagtgtagtct 25184260  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtg 215  Q
    | ||||| |||||| |||||||||||| || ||   |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  25184259 tgttaatctgatgagttgatgatactatgaaga--ttgaactttggatgtcattgtacaaacagtagagtgttactcattacatttttgatgttatagtg 25184162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 216
Target Start/End: Original strand, 19089426 - 19089616
Alignment:
Q  26 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaata 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  19089426 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcatatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatc 19089525  T
Q  126 tgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttac-attttgatgttatagtgt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  19089526 tgatgaattgatgatactatgagga--ctgaacttttgatgtcattatacaaacagtggggtgttactcattacaattttgatattatagtgt 19089616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 879513 - 879711
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  879513 caaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaaatgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattatgtgtagtct 879612  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtg 215  Q
    | ||||| |||||| |||||||||||| || ||   | ||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  879613 tgttaatctgatgagttgatgatactatgaaga--ttaaacttttgatgtcattgtacaaacaatgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtg 879710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 55477856 - 55478058
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  55477856 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttcagtgttacacgttgtggggtgttacacttataacaagttaggataaaattagattaagtgtagtct 55477955  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacg----gtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttat 211  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||     || | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55477956 tgttaatctgatgaattgatgatactatgaggact--gaacttttgatgtcattgtacaaacaaacagtggagtgttactcgttacatttttgatgttat 55478053  T
Q  212 agtgt 216  Q
    |||||    
T  55478054 agtgt 55478058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 212
Target Start/End: Original strand, 25701021 - 25701216
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgag-atgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtc 116  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25701021 caaacaaagttgatgatgttatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatttagtgtagtc 25701120  T
Q  117 ttattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttata 212  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  25701121 ctgttaatctgatgaattgatgatactatgagga--ctgaacttttgatgtcactgtacaaacagtagggtgttactcactacacttttgatgttata 25701216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3042865 - 3042659
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  3042865 caaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataataaggtatgataaaattatattaagtgtaatct 3042766  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatac-tagaggact-------ctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacattttg-atgt 208  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | ||  |||       ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||    
T  3042765 tgttaatatgatgaattgatgatacattga-tactctaatgactgaatttttgatgtcattgtataaacggtggggtattactcattacattttgtatgt 3042667  T
Q  209 tatagtgt 216  Q
    ||||||||    
T  3042666 tatagtgt 3042659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 19440613 - 19440811
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||  ||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  19440613 caaacagagttgatgatattatgttataaacttaagggttacacgttgtggggtgttacgcttataacaagctaagataaaattagattaagtgtagtct 19440712  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtg 215  Q
    | ||||| |||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  19440713 tgttaatctgatgaattgatgatattatgagga--ctgaacttttgatgccattgtacaaacggtggagtgttaatcattacatttttgatgttatagtg 19440810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 6864281 - 6864084
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6864281 caaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtatgataaaattaaattaaatgtagtct 6864182  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtg 215  Q
    | ||||| |||| |||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||  ||||||||||  || || ||||| || ||| | ||||||||||||||||    
T  6864181 tgttaatctgataaattgatgatactatgagga--ctggacttttgatgctattgtacaaaaagttggatgttattcattaaatttttgatgttatagtg 6864084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 17173536 - 17173362
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  17173536 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattct 17173437  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    | ||| | ||||||||| |||||||||  |||   |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  17173436 tcttagtctgatgaattaatgatacta-tggagattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactc 17173362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 216
Target Start/End: Original strand, 32912552 - 32912743
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  32912552 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaac 32912651  T
Q  125 atgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
     |||| ||||||||||| || |||    ||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  32912652 ctgataaattgatgatattatgag--tgctgaacttttgatatcattctacaaatactagggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 32912743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 212
Target Start/End: Original strand, 35021000 - 35021194
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  35021000 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttt 35021099  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttata 212  Q
    | ||||| | ||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| | || ||||||||| || | |||||||||  |||| |||||||||||||    
T  35021100 tgttaatctaatgaattgatgatactacgagga--cgaaacttttgacgccaatgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttata 35021194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 17167952 - 17167785
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  17167952 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagt 17167853  T
Q  125 atgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
     ||||||||| |||||||||  |||   |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  17167852 ctgatgaattaatgatacta-tggagaatgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactc 17167785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 42199968 - 42199779
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  42199968 agtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaat 42199869  T
Q  125 atgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagt 214  Q
     ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| |||||||| ||||||   | |||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  42199868 ctgatgaattgatgatactatgagg--gctgaactttttatgtcattctacaaataatggggtattactcattacatttttgatgttatagt 42199779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 178
Target Start/End: Original strand, 28002951 - 28003110
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || | |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  28002951 caaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtct 28003050  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaac 178  Q
    | |||||  |||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  28003051 tgttaatccgatgaattgatgatactatgatga--ctgaacttttgatgtcactgtacaaac 28003110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 33341644 - 33341470
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||| || |||    
T  33341644 caaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtatattct 33341545  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcg 194  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||| || ||||||||| || ||||||| ||||    
T  33341544 tgttaatctgatgaattgatgatactatggga--ctgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttcctcg 33341470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Original strand, 36493654 - 36493827
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||  |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36493654 caaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtg-gagtttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtagtct 36493752  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    | ||||| | ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||    
T  36493753 tgttaatttaatgaattgatgatactatgggga--ctgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactc 36493827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 38012100 - 38011902
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  38012100 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagcgttacactttctgggatgttacacttaaaacaaggtataataaaattaaattaagtgtagtct 38012001  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtg 215  Q
    | ||||| |||||||||||| ||| || | |||  |||||||||||||| ||  |||||||| || ||||| || ||  |||| ||||||||||||||||    
T  38012000 tgttaatctgatgaattgataatattatgggga--ctgaacttttgatggcaccgtacaaacagtggggtgctattcactacacttttgatgttatagtg 38011903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 1815540 - 1815421
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  1815540 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacccttaaaacaaggtaggataaaattagagtaaatgtagtcttgttaat 1815441  T
Q  125 atgatgaattgatgatacta 144  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1815440 atgatgaattgatgatacta 1815421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 178
Target Start/End: Original strand, 4934167 - 4934326
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||   |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4934167 caaacatagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttggacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtagtct 4934266  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaac 178  Q
    | ||||| ||||||| ||||||||||| |||||   ||||||||||||| || |||||||||    
T  4934267 tgttaatctgatgaaatgatgatactatgagga--ttgaacttttgatgccagtgtacaaac 4934326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Original strand, 55241070 - 55241244
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  55241070 caaacagagttgctgacatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattct 55241169  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcg 194  Q
    | || || |||| |||||||||||||| | |||  |||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||    
T  55241170 tctt-atctgataaattgatgatactatgggga--ctgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcg 55241244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 216
Target Start/End: Original strand, 34361464 - 34361654
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||     
T  34361464 agttgatgatattatgtgatagctttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtaattttgttaac 34361563  T
Q  125 atgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
      ||||||||||||||| || ||||   |||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  34361564 cggatgaattgatgatattatgagg---ctgaacttttaatgtcattctacaaacagtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgt 34361654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 193
Target Start/End: Original strand, 54499217 - 54499378
Alignment:
Q  33 atattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaa-ttagattaagtgtagtcttattaatatgatga 131  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||| |||||  | |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  54499217 atatcatgtgatagtcttaaaagttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaaattagattaagtatattcttgttaatatgatga 54499316  T
Q  132 attgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcatt-gtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  54499317 attgatgatactata-gagactgaacttttgatgtcattagtacaaacggtggggtgttactc 54499378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23761317 - 23761120
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||| ||| ||| ||| |||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  23761317 caaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaaatgtgacactttatgaggtgttacacttaaaacaaggta-gataaaattagattaagtgtattct 23761219  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtg 215  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||| | ||||||| ||  ||||||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  23761218 tgttaatctgatgaattgatgatactatgggga--ctgaacttttgatgtcactatacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtg 23761121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 27396854 - 27396688
Alignment:
Q  26 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaata 125  Q
    |||| |||||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||| || |||||||| |||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| |||| |||||     
T  27396854 gttgctgatatcatgcgatggtcttaagtgtgacactttatgggatgttacacttaaaacaaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatc 27396755  T
Q  126 tgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27396754 tgatgaattgatgatactatgagga--cgaaacttttgatgtcattgtacaaacagtagggtgttactc 27396688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 178
Target Start/End: Original strand, 5047931 - 5048089
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | | |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  5047931 caaacatagtttatgatatcatgtgatagtcttaagtgttacattttgcg-ggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgcagtct 5048029  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaac 178  Q
    | ||||| | |||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  5048030 tgttaatctcatgaattgatgatactatggga-actgaacttttgatatcatcgtacaaac 5048089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 34948060 - 34948260
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagt--gttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagt 115  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||| | |||| | |||  |||||| || ||||||||||||||||||||| |    
T  34948060 caaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtacgttacactttgtggggtgttgcactttaaacaagataggataaaattagattaagtgtatt 34948159  T
Q  116 cttattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatag 213  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||| || | ||||||| || |||||||||||   ||| ||||||||||||||    
T  34948160 cttgttaatatgatgaattgatgatattatgagga--ctgaacttttgatgccactttacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatag 34948257  T
Q  214 tgt 216  Q
    |||    
T  34948258 tgt 34948260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 117
Target Start/End: Original strand, 46884087 - 46884172
Alignment:
Q  30 atgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46884087 atgatattatgtgatagt-ttaagtgttacattttgtgagatgtta-gcttataacaagatatgataaaattagattaagtgtagtct 46884172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 47 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 9139462 - 9139317
Alignment:
Q  47 tcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatactaga 146  Q
    |||||||||||||| |||||  | ||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||      
T  9139462 tcttaagtgttacactttgtagggtgttacagttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatg 9139363  T
Q  147 ggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    ||  | ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9139362 gggat-tgaactttttatgtcactgtacaaacggtggggtgttactc 9139317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 216
Target Start/End: Original strand, 29584172 - 29584361
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||  || | ||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  29584172 agttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacacttcatggggtgtaacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaat 29584271  T
Q  125 atgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacattttgatgttatagtgt 216  Q
     ||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  29584272 ctgatgaattgatgatactatgaaga--ctgaacttttgatgccattgtacaaacagtgaggtgttactcaacac-ttttgatgttatagtgt 29584361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 214
Target Start/End: Original strand, 46888132 - 46888318
Alignment:
Q  27 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatat 126  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  46888132 ttgatgatattatgtgatagtct-aagtgttacgttttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatct 46888230  T
Q  127 gatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttac-attttgatgttatagt 214  Q
    |||||||| | |||| || | |||  |||||||||||||| |  ||||||||  || |||| ||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  46888231 gatgaattaacgatagtatgggga--ctgaacttttgatgccgctgtacaaatagtggggtattactcactacaattttgatgttatagt 46888318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 47253986 - 47253873
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  47253986 caaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtattct 47253887  T
Q  118 tattaatatgatga 131  Q
    | ||||| ||||||    
T  47253886 tgttaatctgatga 47253873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 32579692 - 32579566
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||| |||| | |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||     
T  32579692 caaacatagttgatgatattataagatagtcttaagagttacactttctgaggtcttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtacagtca 32579593  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta 144  Q
    | ||||| ||||||| |||| ||||||    
T  32579592 tgttaatctgatgaactgataatacta 32579566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 17272203 - 17272082
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||  || | |||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  17272203 agttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacacttcatggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaat 17272104  T
Q  125 atgatgaattgatgatactaga 146  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  17272103 ctgatgaattgatgatactaga 17272082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 32592305 - 32592165
Alignment:
Q  52 agtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatactagaggact 151  Q
    ||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||       
T  32592305 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta-agggga 32592207  T
Q  152 ctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| || | |||||||||    
T  32592206 ctgaacttttgatgtcactatacaaacagtggagtgttactc 32592165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4598203 - 4598041
Alignment:
Q  52 agtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatactagaggact 151  Q
    ||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||  | |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||| |||       
T  4598203 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaagc-aggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgagtcta-agggga 4598106  T
Q  152 ctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacattttgatgttatagtgt 216  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  4598105 ctgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacactttgatgttatagtgt 4598041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 37775879 - 37775741
Alignment:
Q  52 agtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatactagaggact 151  Q
    ||||||||| |||||| | |||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||  ||       
T  37775879 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggg--- 37775783  T
Q  152 ctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
      |||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||    
T  37775782 gggaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactc 37775741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 7703755 - 7703642
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||   |||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  7703755 caaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtgacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattct 7703656  T
Q  118 tattaatatgatga 131  Q
    | ||||| ||||||    
T  7703655 tgttaatctgatga 7703642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 131
Target Start/End: Original strand, 35025561 - 35025674
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || | ||| || |||| |||||| || |||||||||| ||||| || |||||    
T  35025561 caaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctggggtgtgacacttaaaacaagataggataaaattatattaaatgcagtct 35025660  T
Q  118 tattaatatgatga 131  Q
    | ||||| ||||||    
T  35025661 tgttaatctgatga 35025674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 49376213 - 49376039
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| | |||    |||| | ||||| |  |||||||||||| ||| ||| |||    
T  49376213 caaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacacattgtggggtgtataacttaaatcaaggcagaataaaattagatcaagcgtaatct 49376114  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||| || ||||||| | || |||||||||||    
T  49376113 tgttaatctgatgaattgatgatactatgaaga--ctgaacttttgatgccactgtacaagcagtggggtgttactc 49376039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 165
Target Start/End: Original strand, 33816551 - 33816644
Alignment:
Q  71 tgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatg 165  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||| ||||||||||||||  |||  ||||||||||||||    
T  33816551 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgataaattgatgatacta-tggagactgaacttttgatg 33816644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 50764901 - 50764802
Alignment:
Q  93 gataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttac 191  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||    
T  50764901 gataaaattagattaaatgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgagga--ttgaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttac 50764804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 67
Target Start/End: Original strand, 33816481 - 33816530
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtg 67  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  33816481 caaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttgtg 33816530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 131
Target Start/End: Original strand, 30002631 - 30002710
Alignment:
Q  52 agtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatga 131  Q
    ||||||||| |||||| | |||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  30002631 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 30002710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 37287974 - 37287866
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgt-gagatgttacgcttataacaaggtatgat-aaaattagattaagtgtagt 115  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |  ||||| |||| ||||| ||| | | |||||||||||||||||| |    
T  37287974 caaacaaagttgctgatatcatgtgctagtcttaagtgttacattttgtgggggcgttacacttaaaacaaagtaggttaaaaattagattaagtgtatt 37287875  T
Q  116 cttattaat 124  Q
    ||| |||||    
T  37287874 cttgttaat 37287866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 7152169 - 7152220
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgag 69  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  7152169 caaacagagttgatgatgttatgtgatagtattaagtgttatactttgtgag 7152220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 203
Target Start/End: Original strand, 408368 - 408551
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  408368 caaacagagttgatgatattgtgtgatagtcttaagtgttccactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtct 408467  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacatttt 203  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  408468 tgttaatctgatgaattgatgatactagagga--ctgaacttttgatttcattttacaaacggtaaggtgttactcattacatttt 408551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 380 - 206
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||| |||| || ||| || |||||||||||||||| |||| |||    
T  380 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatggggtgttacacttaaaataagataggataaaattagattaaatgtattct 281  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    | ||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||    
T  280 tgttagtctgatgaattgatgatactatgagga--ctgaacttttgatgccattgtacaaacagtggagtgttactc 206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 212
Target Start/End: Original strand, 94331 - 94516
Alignment:
Q  27 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatat 126  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||  |||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  94331 ttgatgatattatgtaatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaagctagaataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatct 94430  T
Q  127 gatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttac-attttgatgttata 212  Q
     |||||||||||||| || | |||  |  ||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  94431 catgaattgatgatagtatgggga--ccaaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttata 94516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8125 - 7935
Alignment:
Q  26 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaata 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  8125 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaagttaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatc 8026  T
Q  126 tgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttac-attttgatgttatagtgt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  8025 tgatgaattgatgatactatgagga--ctgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacaattttgatgttatagtgt 7935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 51)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 38258766 - 38258568
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  38258766 caaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtct 38258667  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtg 215  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  38258666 tgttaatctgatgaattgatgatactatgagga--ttgaacttttgatgtcattgtacaaacggtgtggtgttactcattacattttttatgttatagtg 38258569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 18797548 - 18797364
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18797548 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtct 18797449  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacatttt 203  Q
    | ||||| |||||| |||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  18797448 tgttaatctgatgagttgatgatactatgagga--ttgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttt 18797364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 27283965 - 27283767
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  27283965 caaacatagttgataatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtatagtct 27283866  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtg 215  Q
    | ||||| |||| ||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27283865 tgttaatctgataaattgataatactatgagga--ctgaacttttgatttcattgtacaaacggtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtg 27283768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 30055740 - 30055550
Alignment:
Q  26 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaata 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  30055740 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatc 30055641  T
Q  126 tgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttac-attttgatgttatagtgt 216  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  30055640 tgatgaattaatgatactatgagga--ctgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacaattttgatattatagtgt 30055550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 17842524 - 17842724
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtat--gataaaattagattaagtgtagt 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  17842524 caaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacgcttataacaaggtataggataaaattatattaagtgtagt 17842623  T
Q  116 cttattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatag 213  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||| ||  | ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  17842624 cttgttaatctgatgaattgatgatattataatga--ctgagcttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatag 17842721  T
Q  214 tgt 216  Q
    |||    
T  17842722 tgt 17842724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 37110095 - 37109895
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtat--gataaaattagattaagtgtagt 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  37110095 caaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtataggataaaattatattaagtgtagt 37109996  T
Q  116 cttattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatag 213  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||| ||  | ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  37109995 cttgttaatctgatgaattgatgatattataatga--ctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatag 37109898  T
Q  214 tgt 216  Q
    |||    
T  37109897 tgt 37109895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24211955 - 24211764
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  24211955 agttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtaggatgttacacttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaac 24211856  T
Q  125 atgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
     ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24211855 ctgatgaattgatgatactatgagg--gctgaacttttgatgccattctataaacagtagggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 24211764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7335009 - 7334817
Alignment:
Q  24 tagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaa 123  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7335009 tagttgatgatattatctgataatcttaagtgttacactctgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaa 7334910  T
Q  124 tatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacat-tttgatgttatagtgt 216  Q
      |||||| |||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  7334909 gctgatgagttgatgatactatgagaa--ctgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatattttatgttatagtgt 7334817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 10481819 - 10481627
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  10481819 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattagattaagcgtagtcttgttaat 10481720  T
Q  125 atgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggt-agggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
     ||||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||    
T  10481719 ctgatgaattgatgatactata-aagactgaatttttgatgtcattgtacaaacagtgggggtgttactcattatattttttatgttatagtgt 10481627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21991857 - 21991659
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  21991857 caaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattct 21991758  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttac-attttgatgttatagtg 215  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||  || ||||||||| |||||||    
T  21991757 tgttaatctgatgaattgatgatactatgggga--ctgaacttttgatgacactgtacaaacagtggggtgttactcgcaacaattttgatgctatagtg 21991660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 216
Target Start/End: Original strand, 31579011 - 31579207
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  | |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31579011 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatagggtgttatacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 31579110  T
Q  125 atgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgta-----caaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
     ||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||      |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31579111 ctgatgaattgatgatactatgaaga--ctgaacttttgatgtcattgtataaattaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 31579207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 212
Target Start/End: Original strand, 32820993 - 32821187
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||    
T  32820993 caaacagagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttatggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaactaaattaactgtagtct 32821092  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttata 212  Q
    | ||||| | ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||  |||| |||||||||||||    
T  32821093 tgttaatctaatgaattgatgatactacgagga--ctgaacttttgatgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactacatttttgatgttata 32821187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 43686262 - 43686088
Alignment:
Q  17 acaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtc 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  43686262 acaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattc 43686163  T
Q  117 ttattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    || ||| | |||||||||| |||||||| |||   |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  43686162 ttgttagtctgatgaattgttgatactatagg-gactgaacttttgatgccattgtacaaacagt-gggtgttactc 43686088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 32432665 - 32432499
Alignment:
Q  26 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaata 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || |||||| |||||||||| ||||| |||| |||| ||| |     
T  32432665 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattatattaactgtattcttgttagtc 32432566  T
Q  126 tgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    |||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  32432565 tgatgaattgatgatacta-tggagactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatggggtgttactc 32432499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 4583141 - 4582966
Alignment:
Q  17 acaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtc 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  4583141 acaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaaatgtattc 4583042  T
Q  117 ttattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    || ||| | |||||||||| |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  4583041 ttgttagtctgatgaattgttgatactatgggga--ctgaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactc 4582966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 15612699 - 15612896
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  15612699 caaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtattct 15612798  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacattttgatgttatagtgt 216  Q
    | ||||| |||||||||||||||| || |||   |||||||||||||| || | |||||||  | ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  15612799 tgttaatctgatgaattgatgatattatagg-gactgaacttttgatgccactctacaaacactggggtgttactcataacactttgatgttatagtgt 15612896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 11071425 - 11071243
Alignment:
Q  20 aacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtctta 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | | |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||     
T  11071425 aacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagcgtagtgttg 11071326  T
Q  120 ttaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacatttt 203  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||| || |||||    
T  11071325 ttaatctgatgaattgatgatactatgagaa--ctgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtgttactcgctatatttt 11071243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 27421320 - 27421517
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  27421320 caaacagagttgctgatatcatacgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattct 27421419  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
    | ||||| |||| |||| |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  27421420 tgttaatctgataaatttatgatattatagga--ctgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtgt 27421517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 37347242 - 37347059
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||  |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  37347242 caaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtg-gagtttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtagtcc 37347144  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacatttt 203  Q
    | ||||| | || |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||| ||| |||||    
T  37347143 tgttaatttaataaattgatgatactatgagga--ctgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactcattatatttt 37347059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Original strand, 41765018 - 41765214
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||| |||| |||||||||   ||||||||||||||||| |||||    
T  41765018 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtagagtaaaattagattaagtgcagtct 41765117  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagt 214  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||| ||  |||||||| || ||||| |||||  |||| |||||||| ||||||    
T  41765118 tgttaatctgatgaattgatgatactatgagga--ctggacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgctatagt 41765214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 5657421 - 5657619
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||| | |||||| |||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||| | |    
T  5657421 caaacatagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtattacactttgtgggctgttacacttaaaacaaagtaggataaaattaaattaagtgtatttt 5657520  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtg 215  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  5657521 tgttaatatgatgaattgatgatactatgaaga--ctgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtg 5657618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Original strand, 10359154 - 10359328
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattaga-ttaagtgtagtc 116  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10359154 caaacagagttgatgttgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagatttaagtgtagtc 10359253  T
Q  117 ttattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    || || || |||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||| |||| |||  ||||| ||||||||    
T  10359254 ttgttgatctgatgaattgatgatactatcaga--ctgaacttttgatgtcactgtataaatagtaggatgttactc 10359328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 23111413 - 23111285
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatg--ataaaattagattaagtgtagt 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23111413 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaagtatgatataaaattagattaagtgtagt 23111314  T
Q  116 cttattaatatgatgaattgatgatacta 144  Q
    ||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  23111313 cttgttaatctaatgaattgatgatacta 23111285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 131
Target Start/End: Original strand, 37703438 - 37703551
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37703438 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtggtacactttgtgggatgttacacttaaaataagatatgataaaattagattaagtgtagtct 37703537  T
Q  118 tattaatatgatga 131  Q
    ||||||| ||||||    
T  37703538 tattaatctgatga 37703551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 203
Target Start/End: Original strand, 9355766 - 9355950
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  9355766 caaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggatgaaattagattaagtgtagtct 9355865  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacatttt 203  Q
    | ||||| ||||||||| | |||| || ||| |  || |||||||||||||| ||||||||| || |||| || |||  ||||||||    
T  9355866 tgttaatctgatgaattaacgataatatgagaa--ctaaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtattgctcactacatttt 9355950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 37704378 - 37704252
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  37704378 caaacagagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtct 37704279  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta 144  Q
    | ||||| |||| ||||||||||||||    
T  37704278 tgttaatctgataaattgatgatacta 37704252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 48928237 - 48928434
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| |||| |||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  48928237 caaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagcattacactttctgaggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcaatct 48928336  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
    | ||||| |||||||||||| ||||||  |||  |||||||||||||| ||  |||||||  || ||||| |||||  |||| |||||||||||||||||    
T  48928337 tgttaatctgatgaattgataatactatggga--ctgaacttttgatggcaccgtacaaatagtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgt 48928434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 144
Target Start/End: Original strand, 15672709 - 15672828
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  15672709 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttagt 15672808  T
Q  125 atgatgaattgatgatacta 144  Q
     |||||||||||||||||||    
T  15672809 ctgatgaattgatgatacta 15672828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 33688202 - 33688400
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||| |||||| || |||||||||| | ||||||| ||| ||   |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33688202 caaacagagttgctgatatcatatgatagtcttgaatgttacactttatggagtgttacacttaaaacaaagtatgataaaattagattaagtgtattct 33688301  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||| || || |||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  33688302 tgttaatctgatgaattgatgatactata-gagactgaacttttgatgccactggacaaacagtaggatgttactcataacacttttgatgttatagtgt 33688400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 48928504 - 48928701
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| |||| |||||| |||| || || ||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  48928504 caaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagcattacactttctgaggtgttacacttaaaataatgtaggataaaattagattaagtgcaatct 48928603  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
    | ||||| |||||||||||| ||||||  |||  |||||||||||||| ||  |||||||  || ||||| |||||  |||| |||||||||||||||||    
T  48928604 tgttaatctgatgaattgataatactatggga--ctgaacttttgatggcaccgtacaaatagtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgt 48928701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6546741 - 6546542
Alignment:
Q  17 acaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtc 116  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||| | |||||| | |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  6546741 acaaacagagttgctgatatcatgtgataatattaagtgttatactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattc 6546642  T
Q  117 ttattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtg 215  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||  |||   | |||||||||||| | ||||||||  || ||||||||||||  ||| |||||||| |||||||    
T  6546641 ttgttaatctgatgaattgatgatacta-tggatagtaaacttttgatgttactgtacaaatagtggggtgttactcgcaacacttttgatgctatagtg 6546543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22687458 - 22687262
Alignment:
Q  20 aacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtctta 119  Q
    |||| ||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||     
T  22687458 aacagagttgttgatatcatgagatagtcttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattattg 22687359  T
Q  120 ttaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||  || || |||||| || | |||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  22687358 ttaatctgatgaattgatgatactatgggga--ctgaacttttgataccactgcacaaacagtggagtgttactcacaacatttttgatgttatagtgt 22687262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 50 - 216
Target Start/End: Original strand, 44413351 - 44413517
Alignment:
Q  50 taagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatactagagga 149  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||  |||    
T  44413351 taagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagccttgttaatttgatgaattgaagatacta-tgga 44413449  T
Q  150 ctctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
      | ||||||||||| ||| |||||||||  | |||||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  44413450 gaccgaacttttgatttcagtgtacaaacattggggtgttactcactatatttttgatgttatagtgt 44413517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 178
Target Start/End: Original strand, 25691484 - 25691643
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||| |||| || |||||| |||||||||||||||| |||| | |    
T  25691484 caaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtatttt 25691583  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaac 178  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| | ||  ||||||| |||||| || |||||||||    
T  25691584 tgttaatatgatgaattgataatactataaga-actgaactgttgatgccactgtacaaac 25691643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 178
Target Start/End: Original strand, 31520717 - 31520822
Alignment:
Q  71 tgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcatt 170  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||| |    
T  31520717 tgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggga--ctgaacttttgatgtcact 31520814  T
Q  171 gtacaaac 178  Q
    ||||||||    
T  31520815 gtacaaac 31520822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 44598887 - 44598761
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||| |||    
T  44598887 caaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaaatgtattct 44598788  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta 144  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||||    
T  44598787 tgttaatctgatgaatttatgatacta 44598761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 78 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 29173701 - 29173587
Alignment:
Q  78 cttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaa 176  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  29173701 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttagtttgatgaattgatgatactatgagga--ctgaacttttgatgtcattgtacaa 29173604  T
Q  177 acggtagggtgttactc 193  Q
    || || | |||||||||    
T  29173603 acagtggagtgttactc 29173587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12165939 - 12165799
Alignment:
Q  52 agtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatactagaggact 151  Q
    ||||||||| |||||| | |||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||  |||       
T  12165939 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacttaagg-ga 12165841  T
Q  152 ctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    || ||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||    
T  12165840 cttaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactc 12165799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 43925322 - 43925167
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||| |  ||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  43925322 caaacagagttgatgatattatgtgattgtattaagtattaaacgttgtgaggtgttgcacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattat 43925223  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtaca 175  Q
    | ||| | |||| | ||||||||||||  | |  ||||||||||||||||||||||||    
T  43925222 tgttagtctgat-agttgatgatacta-tgtagactgaacttttgatgtcattgtaca 43925167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 131
Target Start/End: Original strand, 46481069 - 46481182
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||| |||  ||||||||| || |||| ||||||    
T  46481069 caaacaaagttaatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatgagatgttacacttaaaacaatgtagaataaaattacatcaagtatagtct 46481168  T
Q  118 tattaatatgatga 131  Q
    | ||||| ||||||    
T  46481169 tgttaatctgatga 46481182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8861499 - 8861308
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||| | | |||||| |||| || |||||| |||||||||||||||| |||| | || |||||    
T  8861499 agttgctgatatcatgtgatggtcttgagtgttacactttgcggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattgttgttaat 8861400  T
Q  125 atgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
     |||| |||||||||||||| | |||  || ||||||||||| || ||||||||| || |||||||| || | ||| |||||||| ||||||||    
T  8861399 ctgattaattgatgatactatgggga--cttaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttattcataacacttttgatgctatagtgt 8861308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 118
Target Start/End: Original strand, 26588026 - 26588124
Alignment:
Q  20 aacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtctt 118  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  26588026 aacagagttgttgatatcatgtgatagtcttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattctt 26588124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 38053646 - 38053523
Alignment:
Q  71 tgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcat 169  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||        ||||||| |||| ||| |  ||||||||||||||||||    
T  38053646 tgttacacttataacaaagtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaat--------ttgatgacactatgagaa--ctgaacttttgatgtcat 38053557  T
Q  170 tgtacaaacggtagggtgttactcgttacatttt 203  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  38053556 tgtacaaacagtagggttttactcattacatttt 38053523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 216
Target Start/End: Original strand, 12390623 - 12390768
Alignment:
Q  71 tgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcat 169  Q
    |||||| |||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| | |||  |  ||||||||||||||     
T  12390623 tgttacacttaaaagaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatactatgggga--cataacttttgatgtcac 12390720  T
Q  170 tgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
    || |||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12390721 tgcacaaacagtgggatgttactcattacacttttgatgttatagtgt 12390768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 26980491 - 26980370
Alignment:
Q  71 tgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcat 169  Q
    |||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| || | |||  |||||||||||||| ||     
T  26980491 tgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatgggga--ctgaacttttgatgccac 26980394  T
Q  170 tgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    ||||||||| || |||||||||||    
T  26980393 tgtacaaaccgtggggtgttactc 26980370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 35353329 - 35353256
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggta 91  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| |||||||||    
T  35353329 caaatatagttgatgatattatgagatagtcttaagtgttacattttctggggtgttacacttaaaacaaggta 35353256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 143
Target Start/End: Original strand, 32593182 - 32593254
Alignment:
Q  71 tgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatact 143  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||  |||| ||||||||||||||||||    
T  32593182 tgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaaatgcagttttgataatctgatgaattgatgatact 32593254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 60
Target Start/End: Original strand, 32593146 - 32593188
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32593146 caaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttaca 32593188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 60
Target Start/End: Original strand, 31520688 - 31520723
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31520688 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 31520723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 38053675 - 38053640
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38053675 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 38053640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 18 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 29173744 - 29173702
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 60  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29173744 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtaaca 29173702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 56)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 216
Target Start/End: Original strand, 42506022 - 42506212
Alignment:
Q  26 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaata 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  42506022 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatc 42506121  T
Q  126 tgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttac-attttgatgttatagtgt 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  42506122 tgatgaattgatgatactatgagga--ctgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtattactcattacaattttgatgttatagtgt 42506212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 3655141 - 3655339
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  3655141 caaacagagctgatgatatcatgtgatagttttaagtgttacattttgtggtgtgttacgcttctaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattct 3655240  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtg 215  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  3655241 tgttaatctgatgaattgatgatactatgagga--ctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtg 3655338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 40552198 - 40552396
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |    
T  40552198 caaacagagttgatgatattatgtgacaatcctaagtgttacacgttgtgggatgttacgcttataacaagctaagataaaattaaattaagtgtagtgt 40552297  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtg 215  Q
    | ||||| |||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  40552298 tgttaatctgatgaattgatgatattatgagga--ctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattacatttttgatgttatagtg 40552395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 216
Target Start/End: Original strand, 54828639 - 54828837
Alignment:
Q  17 acaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtc 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54828639 acaaacatagttgatgatattatttgatagttttaagtgttacactttgtgggatgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagtc 54828738  T
Q  117 ttattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacattttgatgttatagtg 215  Q
    || || |||||||||||||||||| ||| || ||   |||| |||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  54828739 ttgttcatatgatgaattgatgatgctatgaaga--atgaatttttgatgtcgttgtttaaacggtggggtgttactcattacatttttatgttatagtg 54828836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 26941199 - 26941397
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26941199 caaacagagttgatgatattatatgatagttttaagtgttacactttatgaggtattacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtct 26941298  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgtta-cattttgatgttatagtg 215  Q
    | ||||| ||||||||| ||||||| | |||||  ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||  |||||||| ||||||||    
T  26941299 tgttaatctgatgaattaatgataccatgagga--ctgaacttttgatgtcattatacaaacagtggggtgttactcattataattttgattttatagtg 26941396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 48355178 - 48354994
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  48355178 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggtatgttacatttataacaaggtaggataaaattagactaagtgtagtct 48355079  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacatttt 203  Q
    | ||||| |||||| |||||||||||| ||| |  |||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||    
T  48355078 tgttaatctgatgagttgatgatactatgagaa--ctgaacttttgatgccattgtacaaacaatggggtgttactcattacatttt 48354994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 47481752 - 47481561
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  47481752 agtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaataaggtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaac 47481653  T
Q  125 atgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
    |||||||||||||||||||| ||||   || |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  47481652 atgatgaattgatgatactatgagg--gctaaacttttgatgtcattctacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 47481561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 34133172 - 34132998
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  34133172 caaacaaaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtgtattct 34133073  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    ||||| | |||||||||||||||| || | |||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  34133072 tattagtctgatgaattgatgatattatgggga--ctgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactc 34132998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 173
Target Start/End: Original strand, 46994600 - 46994754
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46994600 caaacataattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggcgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtct 46994699  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgta 173  Q
    | |||||   |||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  46994700 tgttaatcatatgagttgatgatactatgagga--ctgaacttttgatgtcattgta 46994754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 203
Target Start/End: Original strand, 4761587 - 4761772
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgaga-tgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtc 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |  |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4761587 caaatatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttatactttgtgggggtgttatacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtc 4761686  T
Q  117 ttattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacatttt 203  Q
    || |||||  ||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||    
T  4761687 ttgttaatcagatgagttgatgatactatgagga--ctgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgaagtgttactcattacatttt 4761772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 27 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 37203295 - 37203106
Alignment:
Q  27 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatat 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||| || | || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  37203295 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgatacactaaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatct 37203196  T
Q  127 gatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttac-attttgatgttatagtgt 216  Q
     ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  37203195 tatgaattgatgatactatgagga--ctgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttatagtgt 37203106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 216
Target Start/End: Original strand, 21009749 - 21009939
Alignment:
Q  26 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgaga-tgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  21009749 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-agagtgttatgcttagaacaagttatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaac 21009847  T
Q  125 atgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
     |||||||||||||||| || ||||   ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21009848 ctgatgaattgatgataatatgagg--gctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 21009939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 46297701 - 46297899
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||| |    
T  46297701 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaagtttgattaagtgtagttt 46297800  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtg 215  Q
    | ||||| | ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| | |||||||||||| || | |||||||||  || | ||||||||||||||||    
T  46297801 tgttaatctaatgaattgatgatactacgggga--ctgaacttttgacgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactatatttttgatgttatagtg 46297898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 11467061 - 11466887
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  11467061 caaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattct 11466962  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| | |||  || ||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||    
T  11466961 tgttaatctgatgaattgatgatactatgggga--ctaaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactc 11466887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 39282889 - 39282715
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39282889 caaacatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtct 39282790  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    | ||||| |||||||| ||||||| || ||| |  |||||||||||||| || |||| |||| || |||| ||||||    
T  39282789 tgttaatctgatgaatggatgataatatgagaa--ctgaacttttgatgccactgtataaacagtggggtattactc 39282715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 32373707 - 32373583
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  32373707 caaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtcacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattct 32373608  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatac 142  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  32373607 tgttaatatgatgaattgatgatac 32373583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 37157935 - 37157747
Alignment:
Q  27 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatat 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  37157935 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatct 37157836  T
Q  127 gatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttac-attttgatgttatagtgt 216  Q
     || |||||||||||||| || ||  |||||||||||||| || ||||| ||| || |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  37157835 tataaattgatgatactatgatga--ctgaacttttgatgccactgtac-aacagtggggtgttactcactacaattttgatgttatagtgt 37157747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 214
Target Start/End: Original strand, 20373300 - 20373431
Alignment:
Q  83 aacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggt 181  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20373300 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgataccatgagaa--ctgaacttttgatgtcattgtacaaacagt 20373397  T
Q  182 agggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagt 214  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20373398 ggggtgttactcgttacatttttgatgttatagt 20373431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Original strand, 52040861 - 52040987
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | | |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  52040861 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactatgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatct 52040960  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta 144  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||    
T  52040961 tgttaatctgatgaattgatgatacta 52040987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 177
Target Start/End: Original strand, 22446004 - 22446162
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |  ||||||| |||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22446004 caaaaatagttgatgatattatatgatagtcttgagtgttatacattgtgag-tgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtagtct 22446102  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaa 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||| || ||||||||    
T  22446103 tatttatatgatgaattgatgatactatgagg-gtttgaacttttgatgccactgtacaaa 22446162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 53 - 203
Target Start/End: Original strand, 51212955 - 51213104
Alignment:
Q  53 gtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatacta-gaggact 151  Q
    |||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  51212955 gtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggact 51213054  T
Q  152 ctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacatttt 203  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||    
T  51213055 c--aacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttgctcattacatttt 51213104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 141
Target Start/End: Original strand, 22622657 - 22622780
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22622657 caaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacgctttgtggggtgttacacttgaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttt 22622756  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgata 141  Q
    | ||||| ||||||||||||||||    
T  22622757 tgttaatctgatgaattgatgata 22622780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 178
Target Start/End: Original strand, 24488908 - 24489060
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  24488908 agttgatgatattgtgtgatagtcttaagtgttacaccttgtgaggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttagt 24489007  T
Q  125 atgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaac 178  Q
     |||||||||||||||| || | |||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  24489008 ctgatgaattgatgataatatgggga--ctgaacttttgatgtcattgtgcaaac 24489060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 43348487 - 43348349
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  43348487 agttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgtcacactttatgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaat 43348388  T
Q  125 atgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatg 165  Q
     ||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||    
T  43348387 ctgatgaattgatgatactaaaaga--ctgaacttttgatg 43348349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 54506033 - 54505847
Alignment:
Q  29 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgaga-tgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   |    
T  54506033 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt-agagtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccg 54505935  T
Q  128 atgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
    ||| ||| ||||||||| ||||   ||||| ||||||||||||| || |||   | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  54505934 atgtatttatgatactatgagg---ctgaatttttgatgtcattctataaataatggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 54505847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 44891735 - 44891608
Alignment:
Q  17 acaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtc 116  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  44891735 acaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattc 44891636  T
Q  117 ttattaatatgatgaattgatgatacta 144  Q
    || ||||| |||| ||||||||||||||    
T  44891635 ttgttaatctgattaattgatgatacta 44891608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 141
Target Start/End: Original strand, 53229091 - 53229214
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||| |||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  53229091 caaacaaagttgatgatactatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggagttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaactgtagtct 53229190  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgata 141  Q
    | ||||| ||||||||||||||||    
T  53229191 tgttaatctgatgaattgatgata 53229214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 177
Target Start/End: Original strand, 33378724 - 33378882
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||  || | |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  33378724 caaacatagttgatgagattatgcgatagtcttaagtattacacttcttggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtct 33378823  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaa 177  Q
    | ||||| |||||||||||| |||||| | |||  |||||||||||||||||  |||||||    
T  33378824 tgttaatctgatgaattgataatactatgggga--ctgaacttttgatgtcaccgtacaaa 33378882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 33698390 - 33698265
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| |||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  33698390 caaacagagttgccgatatcatgcgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattct 33698291  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatact 143  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||    
T  33698290 tgttaatctgatgaattgatgatact 33698265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 3362492 - 3362332
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagatta--agtgtagt 115  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| | |||| || |||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  3362492 caaacagagttgatgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgtttcacttaaaataaggtaggataaaattagattaatagtgtagt 3362393  T
Q  116 cttattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaa 177  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||| | |||||   ||||||||||||| || ||||||||    
T  3362392 cttgttaacatgatgaattgatgataccatgagga--gtgaacttttgatgccactgtacaaa 3362332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 4015690 - 4015523
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    ||||| |||||  ||| ||||||||||||||| ||| |||||| | |||||| |||| ||||| ||| |||||||||||| ||| | || |||| |||||    
T  4015690 agttgttgatacaatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagactaattatattcttgttaat 4015591  T
Q  125 atgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||    
T  4015590 atgatgaattgatgatactatgagga--ctgaacttttgatgtcactctacaaacagttgggtgttactc 4015523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22451205 - 22451079
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||| ||  || | |||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  22451205 caaacatagttgatgatattatacgatagtgttaaatgttacacttactggggtgttacacttaaaacaaggtaaggtaaaattagattaagtgcagtct 22451106  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta 144  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  22451105 tgttaatatgatgaattgatgatacta 22451079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 175
Target Start/End: Original strand, 24708054 - 24708212
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagat--taagtgtagt 115  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| | |||||| |||  ||||||||| |||||||||||||   |||||||||    
T  24708054 caaacaaatttgatgatattatgtgattgttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagatcaaaagtgtagt 24708153  T
Q  116 cttattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtaca 175  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  24708154 cttgttaatctgatgaattgatgatactatgaaga--ctgaacttttgatgtcactgtaca 24708212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 2008169 - 2007996
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   ||| || |||| ||| ||||| |||||||||||||||||| || |||    
T  2008169 caaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgt-acacttaaaacgaggtaggataaaattagattaagtatattct 2008071  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    | ||||| ||||||||||||||| |||  ||  | ||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||    
T  2008070 tgttaatctgatgaattgatgatgctatggggat-tgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactc 2007996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 53176284 - 53176132
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||   ||| ||  ||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  53176284 agttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttatatttaaaatgaggttggataaaattagattaagtgtaatcttgttaat 53176185  T
Q  125 atgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaac 178  Q
     ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  53176184 ctgatgaattgatgatactatgagga--ctgaacttttgatgttattgtacaaac 53176132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 144
Target Start/End: Original strand, 11835573 - 11835693
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaa-attagattaagtgtagtcttattaa 123  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||  | |||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | || ||||    
T  11835573 agttgatgatatcatgtgatagtcttaattgttacactttgtaggttgttacacttaaaacaaggtaggataaatattagattaagtgtatttttgttaa 11835672  T
Q  124 tatgatgaattgatgatacta 144  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  11835673 tatgataaattgatgatacta 11835693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 29164021 - 29163929
Alignment:
Q  52 agtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatacta 144  Q
    ||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29164021 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatctgatgaattgatgatacta 29163929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 38591926 - 38591778
Alignment:
Q  27 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatat 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | | |||| |||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  38591926 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtcacgttttgtggggtattacacttgaaacaagataggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatct 38591827  T
Q  127 gatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaa 176  Q
    ||||| ||||| ||| || | |||  || ||||||||||| ||||||||||    
T  38591826 gatgagttgataataatatgtgga--cttaacttttgatgccattgtacaa 38591778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 177
Target Start/End: Original strand, 7327428 - 7327579
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||   || |||||| ||||||| || |||||||||| |||| |||||    
T  7327428 agttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacactagaaagaaggtaggataaaaataaattaagtgtattcttgttaat 7327527  T
Q  125 atgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaa 177  Q
      |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7327528 ccgatgaattgatgatactatgggga--ctgaacttttgatgtcactgtacaaa 7327579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 29099555 - 29099418
Alignment:
Q  55 gttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatactagaggactctg 154  Q
    |||||| |||||| | |||||| |||| || |||| | |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||   |||    
T  29099555 gttacactttgtggggtgttacacttaaaataaggcacgataaaattaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatacta-aggggactg 29099457  T
Q  155 aacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  29099456 aactttagatgtcactgtacaaacagtggggtgttactc 29099418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 35844550 - 35844389
Alignment:
Q  31 tgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaa-ttagattaagtgtagtcttattaatatgat 129  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||  | |||||| |||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  35844550 tgatatcatgtgata-tcttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaactaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 35844452  T
Q  130 gaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    ||||||||||||||| | |||  || |||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||    
T  35844451 gaattgatgatactatgggga--ctaaacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactc 35844389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 36012368 - 36012251
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgat-aaaattagattaagtgtagtcttattaa 123  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| || |    
T  36012368 agttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtgggatgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaggtgtattcttgttca 36012269  T
Q  124 tatgatgaattgatgata 141  Q
    | ||||||||||||||||    
T  36012268 tctgatgaattgatgata 36012251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 71 - 216
Target Start/End: Original strand, 27480371 - 27480516
Alignment:
Q  71 tgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcat 169  Q
    |||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||     
T  27480371 tgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgggga--ctgaacttttgatgtcac 27480468  T
Q  170 tgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
     ||||||||  | || || ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  27480469 cgtacaaacaattggatgctactcattatacttttgatgttatagtgt 27480516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 25579976 - 25579822
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  25579976 caaacagagttgctgatatcatgtaatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacactaaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtatttt 25579877  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgta 173  Q
    | ||||| | || || |||||||| || | |||  ||||||||||||||||| ||||    
T  25579876 tgttaatctaataaactgatgataatatgggga--ctgaacttttgatgtcactgta 25579822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 144
Target Start/End: Original strand, 14586643 - 14586735
Alignment:
Q  52 agtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatacta 144  Q
    ||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14586643 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaagttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta 14586735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 98
Target Start/End: Original strand, 20373183 - 20373263
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaa 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  20373183 caaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttatgggatattacgcttataacaaggtaggataaa 20373263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21193844 - 21193669
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtctt-aagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtc 116  Q
    |||||| ||||| |||||| || |||||||||| ||||||||   ||| ||   |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  21193844 caaacagagttgctgatatcatatgatagtctttaagtgttatcctttatggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattc 21193745  T
Q  117 ttattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    || ||||| ||||||||| ||||||| | | |||  ||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||    
T  21193744 ttgttaatctgatgaattaatgataccatgggga--ctgaacttttgatgtcactctacaaacagtggggtgttactc 21193669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 1089924 - 1089811
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgt-gagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaa 123  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||| | || |    
T  1089924 agttgttgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatttaatgtagtcctgttga 1089825  T
Q  124 tatgatgaattgat 137  Q
    | |||| |||||||    
T  1089824 tctgataaattgat 1089811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 193
Target Start/End: Original strand, 44186505 - 44186614
Alignment:
Q  83 aacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggt 181  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||| |||| |||| |     
T  44186505 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatttgatgaattgatgatactatgggga--ctgaacttttgatgtcactgtataaacagc 44186602  T
Q  182 agggtgttactc 193  Q
     |||||||||||    
T  44186603 ggggtgttactc 44186614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 45174742 - 45174616
Alignment:
Q  19 aaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgaga-tgttacgcttataacaaggtatgataaaa-ttagattaagtgtagtc 116  Q
    ||||| ||||| |||||| || | |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| |||| ||    
T  45174742 aaacagagttgctgatatcatattatagtcttaagtgttacactttgt-agagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattaaattaaatgtattc 45174644  T
Q  117 ttattaatatgatgaattgatgatacta 144  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||    
T  45174643 ttgttaatctgatgaattgatgatacta 45174616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 144
Target Start/End: Original strand, 11357356 - 11357429
Alignment:
Q  71 tgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatacta 144  Q
    |||||| |||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11357356 tgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta 11357429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40936153 - 40936030
Alignment:
Q  93 gataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttac 191  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||| ||||  |  ||||||||    
T  40936153 gataaaattatattaagtgtattcttgttaatctgatgaatagatgatactatgaggact--gaacttttgatgtcactgtataaacaatgaggtgttac 40936056  T
Q  192 tcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
    |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  40936055 tcgcaacacttttgatgctatagtgt 40936030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 177
Target Start/End: Original strand, 43975836 - 43975985
Alignment:
Q  20 aacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtctta 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||       |||||| ||| || | |||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||| | | ||     
T  43975836 aacatagttgatgatattatgcgatagt-------gttacactttctggggtgttacacttaaaacaagataagataaaattagattaagtgcaattttg 43975928  T
Q  120 ttaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaa 177  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||   | ||||||||||||||| |||||||    
T  43975929 ttaatctgatgaattgatgatattatgagga--ttaaacttttgatgtcatcgtacaaa 43975985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 60
Target Start/End: Original strand, 11357320 - 11357362
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 60  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11357320 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 11357362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 60
Target Start/End: Original strand, 27480310 - 27480347
Alignment:
Q  23 atagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 60  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27480310 atagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttaca 27480347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 67
Target Start/End: Original strand, 11357096 - 11357138
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtg 67  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  11357096 agttgatgatattatatgatagtcttgagtgttacactttgtg 11357138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 39)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 37970464 - 37970662
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37970464 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtct 37970563  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtg 215  Q
    | |||||   ||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  37970564 tgttaatcatatgaattgatgatactatgagg--gctgaacttttgatggcattgtacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtg 37970661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 43643540 - 43643738
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  43643540 caaacagagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagatcaagtgtagtct 43643639  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtg 215  Q
    | ||||| |||||| |||||||||||| || ||   |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  43643640 tgttaatctgatgagttgatgatactatgaaga--ttgaactttggatgtcattgtacaaacagtagagtgttactcattacatttttgatgttatagtg 43643737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 203
Target Start/End: Original strand, 1149577 - 1149761
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1149577 caaacaaagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtct 1149676  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacatttt 203  Q
    | ||||| |||||| |||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||    
T  1149677 tgttaatctgatgagttgatgatactatgagga--cagaacttttgatgtcattgtacaaacagtgggttgttactcattacatttt 1149761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 10555149 - 10555345
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10555149 caaacaaagttgatgatattatgtgatagtc--aagtgttacgttttgtgaggtgttgcgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtct 10555246  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtg 215  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  10555247 tgttaatctgatgaattgatgatactatgagga--ttgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggagtgttactcattacattttttatgttatagtg 10555344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1205172 - 1204974
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  1205172 caaacagagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtaatct 1205073  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtg 215  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||  |||| |||| |||||||||||    
T  1205072 tgttaatatgatgaactgatgatactatgagga--ctgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgatgtgttactcactacattttttatgttatagtg 1204975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12876355 - 12876180
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtctt-aagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtc 116  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  12876355 caaacagagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtatcc 12876256  T
Q  117 ttattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  12876255 ttcttaatctgatgaattgatgatactatgagga--ctgaacttttgatgtcattgtacaaacagttgggtgttactc 12876180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Original strand, 36694911 - 36695085
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  36694911 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattct 36695010  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    | ||| | ||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  36695011 tcttagtctgatgaattgatgatactatgggga--ctgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactc 36695085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Original strand, 6098463 - 6098637
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  6098463 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaaatgtagtct 6098562  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||||| | |||  ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  6098563 tgttaatctgatgaattgacgatactatgggga--ctgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactc 6098637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 9864393 - 9864219
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||    
T  9864393 caaacaaaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtgtattct 9864294  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    ||||| | |||||||||||||||| || | |||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  9864293 tattagtctgatgaattgatgatattatgggga--ctgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactc 9864219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16223108 - 16222949
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || | ||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16223108 caaacaaagttgatgatattatgtgatactcttaagtgttacactttttggggtgttacgtttaaaacaaggaaggataaaattagattaagtgtagtct 16223009  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaac 178  Q
    | |||||  |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16223008 tgttaatcggatgaattgatgatactatgagga--ctgaacttttgatgtcattgtacaaac 16222949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 216
Target Start/End: Original strand, 23854383 - 23854574
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || | |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  23854383 agttgatgatattatgtgattgtcttaagtgttacactttatgcggtgttacacttataactaggtaagataaaattagattaattgtagtattgttaat 23854482  T
Q  125 atgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
     | |||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  23854483 ctaatgagttgatgatactatgagga--ctgaacttttgatgtcattgcacaaacagttgggtgttactcattacattttttatgttatagtgt 23854574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 27082783 - 27082981
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||  |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27082783 caaacatagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgcggggtgttagacttaaaacatggtaagataaaattagattaagtgtagtct 27082882  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtg 215  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| || || |||||| || |||||||||||  |||| |||||||| |||||||    
T  27082883 tgttaatttgatgaattgatgatactatgagga--ctgaacttttaatgccactgcacaaacagtggggtgttactcactacacttttgatgctatagtg 27082980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 203
Target Start/End: Original strand, 31933831 - 31934015
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31933831 caaacagacttgatgatattatgtgataattttaagtgttacactttgtgcggtattatgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 31933930  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacatttt 203  Q
    | |||||  ||||||||||||||||||  | ||  |||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||| ||| |||||    
T  31933931 tgttaatcggatgaattgatgatactataatga--ctgaacttttgatgtcattgtataaagagtggggtgttactcattatatttt 31934015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 33906457 - 33906331
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33906457 caaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttttggaatgttacccttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgcagtct 33906358  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta 144  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||    
T  33906357 tgttaatctgatgaattgatgatacta 33906331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 16446820 - 16447018
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||| |||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  16446820 caaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacgctttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtct 16446919  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttac-attttgatgttatagtg 215  Q
    | ||||| |||||||||||||||| || | |||  || ||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  16446920 tgttaatctgatgaattgatgatagtatgggga--ctaaacttttgatgccattatacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttatagtg 16447017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 216
Target Start/End: Original strand, 30654535 - 30654726
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  30654535 agtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaatgtatggtaaaattaaattaagtgtagtcttgttaac 30654634  T
Q  125 atgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
     ||||||| |||||||||||  | |  |||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  30654635 ctgatgaagtgatgatacta-tgaaggctgaacttttgatgtcattcaacaaacagtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgt 30654726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 7890909 - 7891073
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  7890909 agttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacacgttgtggggtgttacgcttataacaaagtaagataaaactagattgagtgtagtcttgttaat 7891008  T
Q  125 atgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgtta 190  Q
     |||||||||||||||| || |||||  | |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  7891009 ctgatgaattgatgatattatgagga--ccgaacttttgatgccattgtacaaacggtggagtgtta 7891073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 62 - 213
Target Start/End: Original strand, 1150094 - 1150245
Alignment:
Q  62 tttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttt 160  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| || ||  |||||||||    
T  1150094 tttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatga--ctgaacttt 1150191  T
Q  161 tgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatag 213  Q
    ||||||| |||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1150192 tgatgtcgttgtacaaacagtgggatgttactcattacatttttgatgttatag 1150245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 188
Target Start/End: Original strand, 1953933 - 1954104
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgag-atgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtc 116  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1953933 caaacagagttgatgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagatttagtgtagtc 1954032  T
Q  117 ttattaatatgatgaattgat-gatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgt 188  Q
     ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||    
T  1954033 atattaatctgatgaattgatagatactatgagg--gctgaacttttgatgccactgtccaaatagtagggtgt 1954104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 216
Target Start/End: Original strand, 8803769 - 8803953
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |  | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  8803769 agttgatgatattatgtgatagtattaagtgttacactttttagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaac 8803868  T
Q  125 atgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
     |||| ||||||||||     |||   ||||||||||||||||||| ||||||  || | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8803869 ctgataaattgatgat-----agg---ctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggagtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 8803953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11727269 - 11727071
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || |||||| |||||||||||||||| |||| |||    
T  11727269 caaacaaagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattct 11727170  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtg 215  Q
    | ||||| |||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||| || | ||||||  || ||||||||||    ||| ||||||||||||||||    
T  11727169 tgttaatttgatgaattgatgatattatgagga--ctgaacttttgatgccactatacaaatagtggggtgttacttacaacacttttgatgttatagtg 11727072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 176
Target Start/End: Original strand, 35459655 - 35459813
Alignment:
Q  17 acaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtc 116  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||| ||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35459655 acaaacagaattgatgatattatgtaatagtcttaagtgttataatctgtgggatgttacatttataacaaagtaggataaaattagattaagtgtagtc 35459754  T
Q  117 ttattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaa 176  Q
    || ||||| |||||| ||||||||| || |||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  35459755 ttgttaatctgatgagttgatgatattatgagga--ctgaacttttaatgtcattgtacaa 35459813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 40862665 - 40862491
Alignment:
Q  17 acaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtc 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |     
T  40862665 acaaacatagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttacacttagaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattt 40862566  T
Q  117 ttattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    || ||| |||||  ||||||||||||   | ||  |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  40862565 ttgttagtatgaaaaattgatgatac--catgagactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactc 40862491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 138
Target Start/End: Original strand, 4132631 - 4132750
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4132631 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttatgtgttacactttgtggggtgttacactta-aacaaggtagaataaaattagattaagtgtagtct 4132729  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatg 138  Q
    | ||||| |||||||||||||    
T  4132730 tgttaatttgatgaattgatg 4132750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 38644223 - 38644025
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||| |||||| || |||||||||| ||||||||| ||| ||   |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  38644223 caaacagagttgctgatatcatatgatagtcttgagtgttacactttatggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattct 38644124  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||| || |  |||||| || |||||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  38644123 tgttaatctgatgaattgatgatacta-tggagactgaacttttgatgccactagacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgt 38644025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Original strand, 41910933 - 41911059
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||    
T  41910933 caaacagagttggtgatatcatgtgatagtattaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattct 41911032  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta 144  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||    
T  41911033 tgttaatctgatgaattgatgatacta 41911059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13307868 - 13307670
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||  ||| || || ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  13307868 caaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaataaagtaggataaaattagattaagtgtattct 13307769  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtg 215  Q
    |  |||| |||||||||||| |||||| | |||  ||||||||||||||||| ||||||||  ||  ||||||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  13307768 tgctaatctgatgaattgataatactatgggga--ctgaacttttgatgtcactgtacaaatagtgaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtg 13307671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 192
Target Start/End: Original strand, 5299891 - 5300064
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| | ||| |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||    
T  5299891 caaacaaaattgctgatatcatttgataatcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggttggataaaattagattaagtgtattct 5299990  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttact 192  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||| ||||    
T  5299991 tgttaatctgatgaattgatgatactataagga--ctgaacttttgatgccactgtacaaacagtagagtgctact 5300064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Original strand, 39099064 - 39099258
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| | | |||||| |||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  39099064 caaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgatactttgtgggatgttacacttaaaacagggtaagataaaattagattaagtgtatttt 39099163  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacattttgatgttatagt 214  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||  | ||||||||  || |||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  39099164 tgttaatctgatgaattgacgatactatgagga--ctgaacttttgatgctagtgtacaaagagtggggtgttacttgcaac-ttttgatgttatagt 39099258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 34895207 - 34895014
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| | |||||| |||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  34895207 caaacagatttgatgatattatgtgatagt-----gtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtagtct 34895113  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtg 215  Q
    | ||||| |||||||||||||||| || || ||  |||||||||||||| || | ||||||| || | |||||||||  |||| | ||||||||||||||    
T  34895112 tgttaatctgatgaattgatgatagtatgatga--ctgaacttttgatgccactttacaaacagtggagtgttactcactacagtgttgatgttatagtg 34895015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 43025940 - 43025824
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||  ||| || |||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||| |    
T  43025940 agttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacattttgtggggtgttacagttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattcttcttagt 43025841  T
Q  125 atgatgaattgatgata 141  Q
     ||||||||||||||||    
T  43025840 ctgatgaattgatgata 43025824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 71 - 193
Target Start/End: Original strand, 34952029 - 34952150
Alignment:
Q  71 tgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcatt 170  Q
    |||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| |    
T  34952029 tgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatttgatgaattgatgatactaaagg-gactgaacttttgatgtcact 34952127  T
Q  171 gtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    |||||||| || || ||||||||    
T  34952128 gtacaaacagtgggctgttactc 34952150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 52 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 466053 - 465913
Alignment:
Q  52 agtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatactagaggact 151  Q
    ||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||       
T  466053 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta-agggga 465955  T
Q  152 ctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||| || |||||||||||    
T  465954 ctgaatttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactc 465913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 70 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 41362708 - 41362576
Alignment:
Q  70 atgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtca 168  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  41362708 atgttacacttaaaacaaggtatgataaaattatatcaagtttagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagg--tctgaacttttgatgtca 41362611  T
Q  169 ttgtacaaacggtagggtgttactcgttacatttt 203  Q
     | ||||||  || |||||||||||  ||||||||    
T  41362610 ctatacaaatagtggggtgttactcactacatttt 41362576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 44869741 - 44869583
Alignment:
Q  19 aaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaa-ttagattaagtgtagtct 117  Q
    ||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |     || |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |    
T  44869741 aaacaaagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacactttgtggggaca-acacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattat 44869643  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaac 178  Q
    | ||||| |||| |||||||||||||| || ||   |||||||||||||||||||| |||||    
T  44869642 tgttaatctgataaattgatgatactatgacga--ttgaacttttgatgtcattgtgcaaac 44869583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 7998487 - 7998416
Alignment:
Q  71 tgttacgcttataacaaggtatgataaaa-ttagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgata 141  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  7998487 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgtattgatgata 7998416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 18259298 - 18259233
Alignment:
Q  48 cttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgta 113  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18259298 cttaggtgttacactttgtgggatgttacacttaaaataaggtatgataaaattaaattaaatgta 18259233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 12585353 - 12585298
Alignment:
Q  26 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgctta 81  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  12585353 gttgatgatgttatgtgatagtattaagtgttagattttgtggggtgttacactta 12585298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 7998522 - 7998481
Alignment:
Q  19 aaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 60  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7998522 aaacagagttgttgatattatgtgatagtattaagtgttaca 7998481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 37905956 - 37905756
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgaga--tgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagt 115  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  37905956 caaacagagttaatgatattatgcgatagttttaagtgttacactttgtggggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtatt 37905857  T
Q  116 cttattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatag 213  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  37905856 cttgttaatctgatgaattgatgatactatgagga--ctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcgttacattttttatgttatag 37905759  T
Q  214 tgt 216  Q
    |||    
T  37905758 tgt 37905756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 216
Target Start/End: Original strand, 43648203 - 43648400
Alignment:
Q  19 aaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtctt 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43648203 aaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttatactttgtgtggtgttacacttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtctt 43648302  T
Q  119 attaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
     ||||| |||||| |||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  43648303 gttaatctgatgagttgatgatactatgatga--ctgaacttttgatgtcattatacaaacagtgaggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 43648400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 3177185 - 3177011
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  3177185 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtattct 3177086  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    | ||| | ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  3177085 tcttagtctgatgaattgatgatactatgagga--ctgaacttttgatgtcattgtacaaacagttgcgtgttactc 3177011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 216
Target Start/End: Original strand, 19289287 - 19289478
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19289287 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacatttataacaatgtaggataaaattagattaagtgtagtcttattaat 19289386  T
Q  125 atgatgaattgatgatact-agaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
     |||||| |||||||||||  ||| |  || ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  19289387 ctgatgagttgatgatactgtgagaa--cttaacttttgatgtcattgtacaaacaatggggtgttactcattatatttttgatgttatagtgt 19289478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 33550944 - 33551141
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33550944 caaacatagttgatgatattatacg-tagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaacgtaggataaaattagattaagtgtagtct 33551042  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtg 215  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  33551043 tgttaatctgatgaattgatgatactatgaaga--ccgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcactacatttttgatgttatagtg 33551140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 177
Target Start/End: Original strand, 17071694 - 17071852
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17071694 caaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtct 17071793  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaa 177  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||  | |  | ||||||||||||||||||||||||    
T  17071794 tgttaatctgatgaattgatgatacta-tgaataccgaacttttgatgtcattgtacaaa 17071852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 4167169 - 4166994
Alignment:
Q  17 acaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtc 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  4167169 acaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattc 4167070  T
Q  117 ttattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    || ||| | |||||||||| |||||||| | |||  |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  4167069 ttgttagtctgatgaattgttgatactatgggga--ctgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactc 4166994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 191
Target Start/End: Original strand, 29242102 - 29242267
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  29242102 agttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaat 29242201  T
Q  125 atgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttac 191  Q
     ||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||  || ||||||||| || |||||||||    
T  29242202 ctgatgaattgatgatactatgaaga--ctgaacttttgataccactgtacaaacagtggggtgttac 29242267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 26357823 - 26357625
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  26357823 caaacacatttgataatattatgtgatagttttaagtgttacaatttgtgggatgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtgatct 26357724  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
    | |||||||||||||||||| |  ||| | ||  ||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  26357723 tgttaatatgatgaattgataactctataaga-actgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttactcactacagttttgatgttatagtgt 26357625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 4763868 - 4763703
Alignment:
Q  27 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatat 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||| |||  |||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  4763868 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgctacacttgaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtagttttgttaatct 4763769  T
Q  127 gatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    ||||||||||| ||||||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  4763768 gatgaattgattatactatggga-actgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactc 4763703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 216
Target Start/End: Original strand, 11366345 - 11366536
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||| | ||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||     
T  11366345 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgtttagaacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttgttaac 11366444  T
Q  125 atgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
     ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||||||  ||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  11366445 ctgatgaattgatgatactatgagg--gctgaacttttgatgtcattatacaaatagtgagatgttactcattacatttttgatgttatagtgt 11366536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 31862098 - 31861972
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31862098 caaacagacttgatgatattatgtgataattttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaatgtatgttaaaattagattaagtgtagtct 31861999  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta 144  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||    
T  31861998 tgttaatctgatgaattgatgatacta 31861972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 35959142 - 35958958
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||    
T  35959142 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaactgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggat-aaattatattaagtgcagtct 35959044  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtg 215  Q
    | |||||||||||||||||||             |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  35959043 tgttaatatgatgaattgatg-------------ctgaacttttaatgtcattgtacaaacagtggggtgttgctcattacattttttatgttatagtg 35958958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Original strand, 4264033 - 4264208
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgt-gatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtc 116  Q
    |||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  4264033 caaacagagttgctgatatcatgttgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaaacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattc 4264132  T
Q  117 ttattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||    
T  4264133 ttcttaatatgatgaattgataatacta-tggagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttactc 4264208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 45327966 - 45327817
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  45327966 caaacatagtttatgatattatgcgatagtcttatgtgttacactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtct 45327867  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtca 168  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  45327866 tgttaatctgatgaattgatgatactatgatga--ctgaacttttgatgtca 45327817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 178
Target Start/End: Original strand, 17054053 - 17054212
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  17054053 caaacaaatttgatgatattatgtgatagtnttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtggtct 17054152  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaac 178  Q
    | ||||| |||||||||||||||| ||  | |  | | |||||||||||||||||||||||    
T  17054153 tgttaatctgatgaattgatgatatta-tgaataccgnacttttgatgtcattgtacaaac 17054212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 36642233 - 36642036
Alignment:
Q  19 aaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaa--ttagattaagtgtagtc 116  Q
    ||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||| |||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||    
T  36642233 aaacagagttgctggtatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaaattagattaagtgtattc 36642134  T
Q  117 ttattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagt 214  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||  ||| |||||||| ||||||    
T  36642133 ttgttaatttgatgaattgatgatactatgagga--ctgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcgcaacacttttgatgctatagt 36642036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Original strand, 41463807 - 41463981
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||||||||||| |||||  ||| |||    
T  41463807 caaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaaatgttacattttgtgaggtgttacaattaaaacaaagtatgataaaattatattaaaagtattct 41463906  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||| || ||||||||| ||  ||||||||||    
T  41463907 tgttaatatgatgaattgatgatactatgagga--ttgaacttttgatgccactgtacaaacagtgaggtgttactc 41463981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 41961077 - 41960960
Alignment:
Q  27 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatat 126  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  41961077 ttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatct 41960978  T
Q  127 gatgaattgatgatacta 144  Q
    ||||||||||||||||||    
T  41960977 gatgaattgatgatacta 41960960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 44913910 - 44913749
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgaga-tgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtc 116  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44913910 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggggtgttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtattc 44913811  T
Q  117 ttattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaac 178  Q
    || ||| | |||||||||||||||||||  ||    ||||||||| |||||||| |||||||    
T  44913810 ttgttagtctgatgaattgatgatactatgggggattgaactttttatgtcattttacaaac 44913749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 212
Target Start/End: Original strand, 2325335 - 2325521
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2325335 caaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtct 2325434  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacattt-tgatgttata 212  Q
    | |||||        |||||||||||| |||||  |||||||||||||| || |||||||||  | |||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  2325435 tgttaat--------ttgatgatactatgagga--ctgaacttttgatgccagtgtacaaacaatggggtgttactcaatacatttatgatgttata 2325521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 193
Target Start/End: Original strand, 39167325 - 39167494
Alignment:
Q  17 acaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtc 116  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||      ||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  39167325 acaaacagagttgatgatattatgtgatagt------tgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtataataaaattagaataagtgtattc 39167418  T
Q  117 ttattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    || ||| | | ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  39167419 ttgttactctaatgaattgatgatactatgagga--ctgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgaggtgttactc 39167494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 19424585 - 19424783
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  19424585 caaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagcgtattct 19424684  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtg 215  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| || | || ||||  | |||||||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  19424685 tgttaatctgatgaattgatgatactatgagga--ctaaacttttgatgccactatataaacaatggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtg 19424782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 168
Target Start/End: Original strand, 31570692 - 31570840
Alignment:
Q  19 aaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtctt 118  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  31570692 aaacagagttgttgatatcatgtgacagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattctt 31570791  T
Q  119 attaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtca 168  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||| | |||  |||||||||||||||||    
T  31570792 gttaatctgatgaattcatgatactatgtgga--ctgaacttttgatgtca 31570840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 33902311 - 33902128
Alignment:
Q  19 aaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtctt 118  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| | || ||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||    
T  33902311 aaacagagttaatgatattatgtgatactattaagtgttacactttgtggggtgctacccttaaaacaaggtaggataaaattcgattaaatatagtctt 33902212  T
Q  119 attaatatgatgaattgatgatac-tagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacatttt 203  Q
     ||||| ||||||| ||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||  ||||||||    
T  33902211 gttaatctgatgaactgatgatactttgagga--ctgaacttttgatgtcattttacaaacagtggggtattactcactacatttt 33902128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 5881750 - 5881611
Alignment:
Q  52 agtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatact-agaggac 150  Q
    ||||||||| |||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  5881750 agtgttacactttgtgaggtattacacttaaaacaaggtatgataaa-ttagattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggac 5881652  T
Q  151 tctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    ||  |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  5881651 tc--aacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactc 5881611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 193
Target Start/End: Original strand, 27349930 - 27350069
Alignment:
Q  52 agtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatactagaggact 151  Q
    ||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||  |||      
T  27349930 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggttggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggga-- 27350027  T
Q  152 ctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||    
T  27350028 ctgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgtggtgttactc 27350069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 53 - 216
Target Start/End: Original strand, 33660360 - 33660523
Alignment:
Q  53 gtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatact-agaggact 151  Q
    |||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||| | |||||||||||||||| ||||||      
T  33660360 gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcctgttaatctaatgaattgatgatactaagagga-- 33660457  T
Q  152 ctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  33660458 ctgaacttttgatgccactgtacaaacagttgggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgt 33660523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 44286195 - 44286069
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| | |    
T  44286195 caaacaaagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattat 44286096  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta 144  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||||    
T  44286095 tgttaatctgatgaatttatgatacta 44286069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 33709189 - 33709387
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||  | |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  33709189 caaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagcgtattct 33709288  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtg 215  Q
    | ||||| |||  | |||||||||||| | |||  ||||||||||||||||| ||||| ||| || | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  33709289 tgttaatctgaatatttgatgatactatgggga--ctgaacttttgatgtcactgtactaacagtggagtgttactcgcaacacttttgatgttatagtg 33709386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 41465747 - 41465624
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||    
T  41465747 caaacataattgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagttcagtct 41465648  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgata 141  Q
    | | ||| | ||||||||||||||    
T  41465647 tgtgaatctaatgaattgatgata 41465624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 52 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19314063 - 19313924
Alignment:
Q  52 agtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatactagaggact 151  Q
    ||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||      
T  19314063 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattcgattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatagga-- 19313966  T
Q  152 ctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||  ||| ||||||||||    
T  19313965 ctgaacttttgatgtcactgtataaatagtaaggtgttactc 19313924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4478610 - 4478417
Alignment:
Q  19 aaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaa-ttagattaagtgtagtct 117  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||     |||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||    
T  4478610 aaacagagttggtgatatcatgtgatagacttaagtgttacactttgtg-----ttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattct 4478516  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtg 215  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| || |||||||||  | | |||||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  4478515 tgttaatctgatgaattgatgatactatgagga--ctaaacttttgatgccactgtacaaacaatggagtgttactcacaacacttttgatgttatagtg 4478418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 216
Target Start/End: Original strand, 43770830 - 43770994
Alignment:
Q  52 agtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatactagaggact 151  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||| | |||||||||| ||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||| || |||       
T  43770830 agtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggcaggataaaattaaattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatatta-agggga 43770928  T
Q  152 ctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
    |||||||||||||| || |||| |||| || |||||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  43770929 ctgaacttttgatgccactgtataaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgt 43770994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 167
Target Start/End: Original strand, 18494238 - 18494385
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||| | |||| ||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||    
T  18494238 caaacagagtcgttgatatcatgtgatagtcttaagtgtgactctttgtgaggt-ttacacttaatacaaggtaggataaaattagatcaagtgtattct 18494336  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtc 167  Q
      | ||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  18494337 agtgaatctgatgaattgatgatactatgagga--ctgaacttttgatgtc 18494385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 193
Target Start/End: Original strand, 7006931 - 7007052
Alignment:
Q  71 tgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcatt 170  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | || ||||||||||||||  |||  || |||||||||||  | |    
T  7006931 tgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatcttataaattgatgatactatggga-actaaacttttgatgctact 7007029  T
Q  171 gtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    |||||||| || || ||||||||    
T  7007030 gtacaaacagtgggatgttactc 7007052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13711637 - 13711536
Alignment:
Q  91 atgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgtt 189  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | | |||  || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  13711637 atgataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgataccatgtgga--ctaaacttttgatgtcactgtacaaactgtggggtgtt 13711540  T
Q  190 actc 193  Q
    ||||    
T  13711539 actc 13711536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 123
Target Start/End: Original strand, 18258251 - 18258349
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaa 123  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||| |||| || || ||| |||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  18258251 agttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatggggtgttacacttaaaaaaatgtaggataaaattagattaagtttattcttgttaa 18258349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 67
Target Start/End: Original strand, 19500879 - 19500921
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtg 67  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500879 agttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtg 19500921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 144
Target Start/End: Original strand, 19501773 - 19501822
Alignment:
Q  94 ataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatacta 144  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  19501773 ataaaattagattaaatgtagt-ttgttaatctgatgaattgatgatacta 19501822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1946073 - 1945882
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  1946073 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaac 1945974  T
Q  125 atgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
     ||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1945973 ttgatgaattcatgatactatgagg--gctgaacttttgatgtcattctacaaacagtggggtgttactcattacatttttgatgttatagtgt 1945882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Original strand, 3879877 - 3880051
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||  ||| ||||||||| |||||||||||| ||||| || |||    
T  3879877 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagaataagtatattct 3879976  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    | ||| | |||||||||||||||||||  ||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3879977 tgttagtctgatgaattgatgatactatggggat-tgaacttttgatgtcattgtacaaacagtagggtgttactc 3880051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 203
Target Start/End: Original strand, 6091120 - 6091305
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtctt-aagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtc 116  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6091120 caaacagagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttgttgggtgttacgcttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtt 6091219  T
Q  117 ttattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacatttt 203  Q
    || ||||| | ||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| ||||||||||||  | | |||||||||  ||||||||    
T  6091220 ttgttaatctaatgaattgatgatactacgagta--ctgaacttttgatggcattgtacaaacaatggtgtgttactcactacatttt 6091305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5627630 - 5627439
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  5627630 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaac 5627531  T
Q  125 atgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
     |||||||||||| |||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||    
T  5627530 ctgatgaattgataatactatgagg--gctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcattatattttttatgttatagtgt 5627439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 7234973 - 7235170
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| || | |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  7234973 caaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagcgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtct 7235072  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
    | ||||| |||||||||||| |||||  | ||  |||||||||||||| ||  |||||||| || ||||| |||||  |||| |||||||||||||||||    
T  7235073 tgttaatctgatgaattgataatact--atgagactgaacttttgatggcaccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgt 7235170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 144
Target Start/End: Original strand, 30353296 - 30353422
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  30353296 caaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggcatgataaaattagattaagtgtattct 30353395  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta 144  Q
    | || ||||||||||||||||||||||    
T  30353396 tgtttatatgatgaattgatgatacta 30353422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 216
Target Start/End: Original strand, 4318761 - 4318959
Alignment:
Q  19 aaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgat-aaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  | |||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||    
T  4318761 aaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattct 4318860  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
    | ||||| | |||||||||||||||||  ||  | |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  4318861 tgttaatctaatgaattgatgatactatgggggt-tgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcataacacttttgatgttatagtgt 4318959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 177
Target Start/End: Original strand, 7055160 - 7055311
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  7055160 agttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtagcgtgttacacttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaac 7055259  T
Q  125 atgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaa 177  Q
     ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||||||    
T  7055260 ctgatgaattgatgatactatgagg--gctgaacttttgatgtcattctacaaa 7055311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Original strand, 21017050 - 21017224
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||| || || ||| |||||||||||||||||| || |||    
T  21017050 caaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataacgtaggataaaattagattaagtttattct 21017149  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    | ||| | ||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||| |||||||||||   | |||||||||||    
T  21017150 tgttagtctgatgaattgatgatactatggggact--gaacttttgatgccattgtacaaataatggggtgttactc 21017224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15491861 - 15491687
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| | ||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  15491861 caaacagaattgctgatatcatgtgatatttttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgcattct 15491762  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| || ||||||||  || |||||||||||    
T  15491761 tgttaatctgatgaattgatgatactatgagg--gctgaacttttgatgccactgtacaaatagtggggtgttactc 15491687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29182403 - 29182211
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgaga-tgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaa 123  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |  |||||| |||| || | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29182403 agttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatgggggtgttacacttaaaatatggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaa 29182304  T
Q  124 tatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
    | |||||||||||||||| ||  |||  |||||||||||||| || |||| |||| || |||||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  29182303 tctgatgaattgatgataata-tggagactgaacttttgatgacactgtataaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgt 29182211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 52 - 216
Target Start/End: Original strand, 33892975 - 33893138
Alignment:
Q  52 agtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatactagaggact 151  Q
    ||||||||| |||||| | |||||  | || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||  |||      
T  33892975 agtgttacactttgtggggtgttatacataaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggga-- 33893072  T
Q  152 ctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttaca-ttttgatgttatagtgt 216  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  || |||||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  33893073 ctgaacttttaatatcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgt 33893138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 8513473 - 8513305
Alignment:
Q  19 aaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaa-ttagattaagtgtagtct 117  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||       ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||    
T  8513473 aaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttaa------aacaaggtaggataaaaattagatcaagtgtattct 8513380  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactc 193  Q
    | |||||||||||||||||||||| || | |||  ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  8513379 tgttaatatgatgaattgatgatattatgggga--ctgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactc 8513305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 20768328 - 20768184
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||| || |||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||  ||| |||    
T  20768328 caaacataattgatgatattatgcgatgatcttaagtgttacactttatgggatgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaa--gtaatct 20768231  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatg 165  Q
    | ||||| ||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  20768230 tgttaatctgatgaattaatgatactatgagga--ctgaacttttgatg 20768184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 33619010 - 33618954
Alignment:
Q  88 ggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatatgatgaattgatgatacta 144  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  33619010 ggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta 33618954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 33619071 - 33619029
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttaca 60  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  33619071 caaacatagttgatgatattatgcgatactcttaagtgtcaca 33619029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 44202 - 44019
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  44202 caaacaaagttgatgatattatgtgatag-cttaagtgttacactttgtggggtgttaagcttataacaagatatgataaaattatattaaatgtagtct 44104  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacatttt 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||||    ||||||||||| |||||||||    
T  44103 tattaatctgatgaattgatgatactatgagga--ctgaactttttatgccattgtacaaacaacggggtgttactcattacatttt 44019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 203
Target Start/End: Original strand, 154585 - 154768
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  154585 caaacaaagttgatgatattatgtgatag-cttaagtgttacactttgtggggtgttaagcttataacaagatatgataaaattatattaaatgtagtct 154683  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacatttt 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||||    ||||||||||| |||||||||    
T  154684 tattaatctgatgaattgatgatactatgagga--ctgaactttttatgccattgtacaaacaacggggtgttactcattacatttt 154768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 203
Target Start/End: Original strand, 145962 - 146139
Alignment:
Q  25 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttattaat 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  145962 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaac 146061  T
Q  125 atgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacatttt 203  Q
     |||||||||||||||||||  | |  ||||||||||||||||||| ||||||   | ||||||||||| |||||||||    
T  146062 ctgatgaattgatgatacta-tgaaggctgaacttttgatgtcattctacaaataatggggtgttactcattacatttt 146139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 267531 - 267372
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtctt-aagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtc 116  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  267531 caaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttgtgggatgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtc 267432  T
Q  117 ttattaatatgatgaattgatgatactagaggactctgaacttttgatgtcattgtacaaa 177  Q
    ||  |||| | |||||||||||||| || | ||  |||||||||||||| || ||||||||    
T  267431 ttgctaatctaatgaattgatgatattata-gagactgaacttttgatgacactgtacaaa 267372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 12155 - 12010
Alignment:
Q  18 caaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtct 117  Q
    |||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||| | |||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||    
T  12155 caaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaagtgtattct 12056  T
Q  118 tattaatatgatgaattgatgatacta-gaggactctgaacttttgat 164  Q
    | ||||| |||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||    
T  12055 tgttaatctgatgaattgatgatattatgagga--ctgaacttttgat 12010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University