View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1143_low_6 (Length: 437)

Name: NF1143_low_6
Description: NF1143
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1143_low_6
NF1143_low_6
[»] chr6 (77 HSPs)
chr6 (30-427)||(27718406-27718803)
chr6 (30-426)||(27724872-27725267)
chr6 (30-427)||(27698521-27698916)
chr6 (30-407)||(27611029-27611406)
chr6 (30-427)||(28786041-28786438)
chr6 (30-405)||(28792184-28792559)
chr6 (30-427)||(28780902-28781299)
chr6 (30-427)||(27604732-27605135)
chr6 (33-427)||(26802201-26802599)
chr6 (41-427)||(26655752-26656138)
chr6 (41-427)||(26761723-26762109)
chr6 (75-420)||(27229004-27229347)
chr6 (32-392)||(27678744-27679104)
chr6 (37-358)||(27593054-27593375)
chr6 (32-392)||(27706431-27706791)
chr6 (32-358)||(27677643-27677969)
chr6 (30-400)||(31284078-31284448)
chr6 (41-427)||(27338103-27338482)
chr6 (41-427)||(27398843-27399222)
chr6 (30-335)||(26646334-26646639)
chr6 (30-335)||(26752302-26752607)
chr6 (41-308)||(27531235-27531502)
chr6 (30-324)||(26884029-26884325)
chr6 (30-410)||(26823626-26824000)
chr6 (30-361)||(26622805-26623136)
chr6 (30-361)||(26728783-26729114)
chr6 (44-296)||(25579613-25579865)
chr6 (44-296)||(25481636-25481888)
chr6 (44-296)||(26142759-26143011)
chr6 (44-296)||(26055820-26056072)
chr6 (44-296)||(26075790-26076042)
chr6 (44-296)||(26048739-26048991)
chr6 (44-296)||(26069908-26070160)
chr6 (44-296)||(25538434-25538686)
chr6 (56-360)||(26861446-26861750)
chr6 (66-316)||(28234438-28234688)
chr6 (30-408)||(27427633-27428006)
chr6 (42-352)||(28139379-28139689)
chr6 (55-324)||(28325347-28325616)
chr6 (30-292)||(28242702-28242964)
chr6 (50-334)||(28180970-28181254)
chr6 (50-334)||(28185222-28185506)
chr6 (50-313)||(28226827-28227090)
chr6 (41-247)||(26848603-26848809)
chr6 (41-216)||(28149912-28150086)
chr6 (40-211)||(26937073-26937244)
chr6 (44-324)||(26341975-26342255)
chr6 (75-186)||(25506981-25507092)
chr6 (50-316)||(28297760-28298026)
chr6 (50-316)||(28514047-28514313)
chr6 (59-343)||(28098425-28098709)
chr6 (87-259)||(29825958-29826130)
chr6 (36-295)||(27214312-27214571)
chr6 (36-295)||(27234657-27234916)
chr6 (331-411)||(26055738-26055818)
chr6 (55-295)||(26635585-26635825)
chr6 (55-295)||(26741551-26741791)
chr6 (36-295)||(25071554-25071813)
chr6 (332-411)||(25481554-25481633)
chr6 (332-407)||(25538356-25538431)
chr6 (332-411)||(26048657-26048736)
chr6 (332-411)||(26069826-26069905)
chr6 (332-411)||(26075708-26075787)
chr6 (332-411)||(26142677-26142756)
chr6 (55-244)||(27665169-27665358)
chr6 (36-260)||(26949591-26949815)
chr6 (60-244)||(26974998-26975182)
chr6 (131-246)||(26811453-26811568)
chr6 (332-411)||(25579529-25579610)
chr6 (165-286)||(26959069-26959190)
chr6 (36-295)||(2184183-2184442)
chr6 (37-208)||(2184880-2185051)
chr6 (165-247)||(26617269-26617351)
chr6 (165-247)||(26723197-26723279)
chr6 (75-313)||(26893543-26893781)
chr6 (286-353)||(26018770-26018837)
chr6 (286-353)||(26139474-26139541)
[»] scaffold0349 (3 HSPs)
scaffold0349 (30-427)||(14383-14777)
scaffold0349 (32-426)||(3450-3844)
scaffold0349 (264-427)||(8062-8225)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (30-405)||(4698-5073)
scaffold0277 (30-427)||(13659-14056)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (30-427)||(7295-7685)
[»] scaffold1254 (1 HSPs)
scaffold1254 (96-427)||(10-334)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (30-403)||(18699414-18699787)
chr4 (29-403)||(18655490-18655864)
chr4 (30-403)||(18679581-18679954)
chr4 (30-403)||(18731518-18731891)
chr4 (30-363)||(18724099-18724432)
chr4 (30-408)||(18073549-18073922)
chr4 (51-408)||(17989088-17989440)
chr4 (50-286)||(5091001-5091237)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (30-387)||(28164376-28164733)
chr1 (30-363)||(268371-268704)
chr1 (30-384)||(28127693-28128042)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (30-352)||(29273797-29274119)
chr8 (159-313)||(31903728-31903882)
[»] scaffold0038 (4 HSPs)
scaffold0038 (50-316)||(34599-34865)
scaffold0038 (55-324)||(116662-116931)
scaffold0038 (30-292)||(42864-43126)
scaffold0038 (50-313)||(27325-27588)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (55-316)||(58334-58595)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (30-408)||(59357-59730)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (55-286)||(3279592-3279823)
chr2 (55-357)||(17993736-17994038)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (66-227)||(16688974-16689135)
[»] scaffold0713 (1 HSPs)
scaffold0713 (286-353)||(5915-5982)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (138-182)||(214469-214513)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 77)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 427
Target Start/End: Original strand, 27718406 - 27718803
Alignment:
Q  30 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27718406 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 27718505  T
Q  130 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27718506 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 27718605  T
Q  230 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggat 329  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  27718606 aagagccttgtagagatttccggtaaaactgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccatgggagaatgaagaggat 27718705  T
Q  330 gaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27718706 gaggaaggtgattgtatagccatgagaattgagagaaataggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtgaatttttgtgttctgtg 27718803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 426
Target Start/End: Original strand, 27724872 - 27725267
Alignment:
Q  30 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27724872 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaataggcatagttgatagaaaacacaggaataa 27724971  T
Q  130 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27724972 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 27725071  T
Q  230 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggat 329  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27725072 aagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggat 27725171  T
Q  330 gaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgt 426  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  27725172 gaggaaggtgattgtatagccatgacaattgagagaaataggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatg-gtaaatttttgtggtctgt 27725267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 427
Target Start/End: Original strand, 27698521 - 27698916
Alignment:
Q  30 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 129  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  27698521 aaaacgaggcgaccctttgtctcgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttgagagaaaacacaggaataa 27698620  T
Q  130 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27698621 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 27698720  T
Q  230 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggat 329  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27698721 aagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactgatgaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggat 27698820  T
Q  330 gaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27698821 gaggaaggtgattgtatagccatgagaattgagagaaataggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaa-ttttgtgttctgtg 27698916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 407
Target Start/End: Original strand, 27611029 - 27611406
Alignment:
Q  30 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27611029 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 27611128  T
Q  130 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27611129 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctcttggaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 27611228  T
Q  230 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggat 329  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  27611229 aagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaagaa 27611328  T
Q  330 gaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatga 407  Q
    ||||||| | |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27611329 gaggaagctaattgcatagccatgaaaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatga 27611406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 30 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 28786438 - 28786041
Alignment:
Q  30 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 129  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||    || | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28786438 aaaacgaggcgaccttttgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgatgtggcgtagttgatagaaaacacaggaataa 28786339  T
Q  130 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 229  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  28786338 aaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagt 28786239  T
Q  230 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggat 329  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28786238 aagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggat 28786139  T
Q  330 gaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||| ||||||    
T  28786138 gaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaatgagtttgtttttgtggtctgtg 28786041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 30 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 28792559 - 28792184
Alignment:
Q  30 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 129  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||    || | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28792559 aaaacgaggcgaccttttgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgatgtggcgtagttgatagaaaacacaggaataa 28792460  T
Q  130 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 229  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  28792459 aaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagt 28792360  T
Q  230 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggat 329  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28792359 aagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggat 28792260  T
Q  330 gaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaat 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28792259 gaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaat 28792184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 30 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 28781299 - 28780902
Alignment:
Q  30 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 129  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28781299 aaaacgaggcgaccttttgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataa 28781200  T
Q  130 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 229  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  28781199 aaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagt 28781100  T
Q  230 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggat 329  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||     
T  28781099 aagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagaggaaaatgaagaggaa 28781000  T
Q  330 gaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtg 427  Q
    ||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||| ||||||    
T  28780999 gaggaaggtaattgcatagccatgataattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaatgagtttgtttttgtggtctgtg 28780902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 30 - 427
Target Start/End: Original strand, 27604732 - 27605135
Alignment:
Q  30 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 129  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27604732 aaaacgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaaggaagaagaggcatatttgatagaaaacacaggaataa 27604831  T
Q  130 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 229  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27604832 aaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattttcatcaatgaaggtatgaattcccttgtcagt 27604931  T
Q  230 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaa------ 323  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||          
T  27604932 aagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaaatgaagaggat 27605031  T
Q  324 gtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttc 423  Q
    | ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  27605032 gaggatgaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtc 27605131  T
Q  424 tgtg 427  Q
    ||||    
T  27605132 tgtg 27605135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 33 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 26802599 - 26802201
Alignment:
Q  33 acgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaa 132  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26802599 acgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaa 26802500  T
Q  133 tcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaag 232  Q
    | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26802499 ttctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataag 26802400  T
Q  233 agccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgag 332  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  26802399 agccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagaggatgag 26802300  T
Q  333 gaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaa----aaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtg 427  Q
    ||||| || || |||||||| | ||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26802299 gaaggagactgcatagccatgaaaattgtgagaaattggatgaaaaaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 26802201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 41 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 26656138 - 26655752
Alignment:
Q  41 accctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagat 140  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||| |||    
T  26656138 accctttgtcttatagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggat 26656039  T
Q  141 tcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgt 240  Q
    || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  26656038 tcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgt 26655939  T
Q  241 agagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtga 340  Q
    ||||||| | |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26655938 agagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtatttaaacccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtga 26655839  T
Q  341 ttgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtg 427  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26655838 ttgtatagccatgagaattgagagaaaatggatgaaaaaagagtttgggaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 26655752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 41 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 26762109 - 26761723
Alignment:
Q  41 accctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagat 140  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||| |||    
T  26762109 accctttgtcttatagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggat 26762010  T
Q  141 tcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgt 240  Q
    || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  26762009 tcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgt 26761910  T
Q  241 agagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtga 340  Q
    ||||||| | |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26761909 agagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtatttaaacccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtga 26761810  T
Q  341 ttgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtg 427  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26761809 ttgtatagccatgagaattgagagaaaatggatgaaaaaagagtttgggaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 26761723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 75 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 27229347 - 27229004
Alignment:
Q  75 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 174  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27229347 agttcgttcaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatccgagattcgtcaatggccttgacgagtgatggtgtgattt 27229248  T
Q  175 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 274  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  27229247 cgtctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgagtgtcagt 27229148  T
Q  275 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatg 374  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  27229147 gcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatccaaaggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgtatagccatgagacttgagagaaattggatg 27229048  T
Q  375 aaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtg 420  Q
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27229047 --aaaagagttttagaatgcagaatatgaatgagtatgtttttgtg 27229004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 32 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 27679104 - 27678744
Alignment:
Q  32 aacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaa 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27679104 aacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaa 27679005  T
Q  132 atcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaa 231  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  27679004 atcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagaccattcttatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaa 27678905  T
Q  232 gagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatga 331  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||  ||||||||| | || || ||||||||||| ||||||||  || |  ||||||||| ||||||||| ||    
T  27678904 gagccttgtagagattcccggtgaaaccgtaccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgtactcataggaaattgaagtggaaga 27678805  T
Q  332 ggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaat 392  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27678804 ggaaggtgattgcatagccatgagattttagagaaattagatgaaaaaagagtttgagaat 27678744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 37 - 358
Target Start/End: Original strand, 27593054 - 27593375
Alignment:
Q  37 ggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcct 136  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27593054 ggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtggtcaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcct 27593153  T
Q  137 agattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagcc 236  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27593154 agactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagaccattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagcc 27593253  T
Q  237 ttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaag 336  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||  ||||||||| | || || ||||||||||| ||||||||  || |  ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  27593254 ttgtagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgtaatcataggaaattgaagtggaagaggaag 27593353  T
Q  337 gtgattgtatagccataagaat 358  Q
    ||||||| |||||||| |||||    
T  27593354 gtgattgcatagccatgagaat 27593375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 32 - 392
Target Start/End: Original strand, 27706431 - 27706791
Alignment:
Q  32 aacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaa 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27706431 aacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcataggtgatagaaaacacaggaataaaa 27706530  T
Q  132 atcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaa 231  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  27706531 atcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatcccttctttgaagttcatgattgtcaatgaaggtgtggattcccttgtcatcaa 27706630  T
Q  232 gagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatga 331  Q
     ||||||||||||||| |  || |||||||  |||||||||   || || ||||||||||| ||||||||  || |  ||||||||| ||||||||| ||    
T  27706631 aagccttgtagagattgcctgtgaaaccgtaccgagtgtcacctcctctgaaactgaggaatacttggtatttgtactcataggaaattgaagtggaaga 27706730  T
Q  332 ggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaat 392  Q
    | |||||||||| |||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27706731 gaaaggtgattgcatagccatgagattttagagaaattagatgaaaaaagagtttgagaat 27706791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 358
Target Start/End: Original strand, 27677643 - 27677969
Alignment:
Q  32 aacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaa 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27677643 aacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacagcaataaaa 27677742  T
Q  132 atcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaa 231  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  27677743 atcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatcccctctttgaagttcatgattgtcaatgaaggtgtggattcccttgtcatcaa 27677842  T
Q  232 gagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatga 331  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||  ||||||||| | || || ||| ||||||| ||||||||  || |  ||||||||| ||||||||| ||    
T  27677843 gagccttgtagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcacttcctctgaaattgaggaatacttggtatttgtactcataggaaattgaagtggaaga 27677942  T
Q  332 ggaaggtgattgtatagccataagaat 358  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||    
T  27677943 ggaaggtgattgcatagccatgagaat 27677969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 30 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 31284448 - 31284078
Alignment:
Q  30 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 129  Q
    |||||||||||||| |||  ||| ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| || ||||    
T  31284448 aaaacgaggcgaccattttgcttatacaagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgacgaagaggcatagttggcagaaaacacggggataa 31284349  T
Q  130 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 229  Q
    |||||||||| || |||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31284348 aaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtgtgatttcatcccctctttgaagttcactatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagt 31284249  T
Q  230 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggat 329  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||| |  ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||||| |||     
T  31284248 aagagccttgtagagattgccggtgaaaccataccgagtgtcacttcccctgaaactaaggaatacttggtatttgaatacataggaaattgaagaggaa 31284149  T
Q  330 gaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaata 400  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31284148 gaggaagatgattgcatagccatgagatttgagagaatatggatgaagaaagaatttgagaatgcagaata 31284078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 41 - 427
Target Start/End: Original strand, 27338103 - 27338482
Alignment:
Q  41 accctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagat 140  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||   |||||| |  ||||| |||||||||||     
T  27338103 accccttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagatgcatagtttgcagaaaatatgggaatcaaaatcctagac 27338202  T
Q  141 tcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgt 240  Q
    || |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  27338203 tcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgctttcatctcctctttcaagatcgttgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcaataagagccttgt 27338302  T
Q  241 agagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtga 340  Q
    ||||||| | |||||||||||   |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| |||||| ||||| ||| |||||| ||||    
T  27338303 agagattgccggtaaaaccgtaaagagtgtcaatgtccctaaaactgaggaacacatggtatttgaacccagaggaaattgaagaggaagaggaaagtga 27338402  T
Q  341 ttgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtg 427  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||       ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27338403 ttgcatagccatgagaattgagagaaataagatgaaaaaaaagtttg-------agaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 27338482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 41 - 427
Target Start/End: Original strand, 27398843 - 27399222
Alignment:
Q  41 accctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagat 140  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||   |||||| |  ||||| |||||||||||     
T  27398843 accccttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagatgcatagtttgcagaaaatatgggaatcaaaatcctagac 27398942  T
Q  141 tcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgt 240  Q
    || |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  27398943 tcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgctttcatctcctctttcaagatcgttgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcaataagagccttgt 27399042  T
Q  241 agagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtga 340  Q
    ||||||| | |||||||||||   |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| |||||| ||||| ||| |||||| ||||    
T  27399043 agagattgccggtaaaaccgtaaagagtgtcaatgtccctaaaactgaggaacacatggtatttgaacccagaggaaattgaagaggaagaggaaagtga 27399142  T
Q  341 ttgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtg 427  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||       ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27399143 ttgcatagccatgagaattgagagaaataagatgaaaaaaaagtttg-------agaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 27399222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 30 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 26646639 - 26646334
Alignment:
Q  30 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26646639 aaaacgagacgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatttagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 26646540  T
Q  130 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 229  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  26646539 aaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctcttaagatcacaatcatcaatgaaggtgtgaattcccttgtcagt 26646440  T
Q  230 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggat 329  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| ||||||| | ||| |||     
T  26646439 aagagccttgtagagatgtccagtaaaaccgtcacgagtgtcactgcccctgaagttgaggaagacctggtaggtgaatccgtaggaaattaaagaggaa 26646340  T
Q  330 gaggaa 335  Q
    ||||||    
T  26646339 gaggaa 26646334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 30 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 26752607 - 26752302
Alignment:
Q  30 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26752607 aaaacgagacgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatttagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 26752508  T
Q  130 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 229  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  26752507 aaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctcttaagatcacaatcatcaatgaaggtgtgaattcccttgtcagt 26752408  T
Q  230 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggat 329  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| ||||||| | ||| |||     
T  26752407 aagagccttgtagagatgtccagtaaaaccgtcacgagtgtcactgcccctgaagttgaggaagacctggtaggtgaatccgtaggaaattaaagaggaa 26752308  T
Q  330 gaggaa 335  Q
    ||||||    
T  26752307 gaggaa 26752302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 41 - 308
Target Start/End: Original strand, 27531235 - 27531502
Alignment:
Q  41 accctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagat 140  Q
    ||||||||| | |||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||||| || ||||||||||||||||||    
T  27531235 accctttgtatcgtagcaatgagtgatgtgaacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttttcagaaaatacgggaataaaaatcctagat 27531334  T
Q  141 tcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgt 240  Q
    |  |||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27531335 ttttcaatggcattttttagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatagattcccttgtcagtaagagccttgt 27531434  T
Q  241 agagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaat 308  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27531435 agagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtccgcgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaat 27531502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 30 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 26884325 - 26884029
Alignment:
Q  30 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatta--tgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaat 127  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||    
T  26884325 aaaacgaggcgaccctttgtctcgtagcagtgaatgacatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaat 26884226  T
Q  128 aaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtca 227  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  26884225 aaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtta 26884126  T
Q  228 gtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaag 324  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||| |  ||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26884125 gtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaag 26884029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 30 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 26824000 - 26823626
Alignment:
Q  30 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 129  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||  | |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26824000 aaaacgaggcgccccttttccttgtagacgcgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttggcagaaaacacaggaataa 26823901  T
Q  130 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 229  Q
    |||||||||| || |||||||| ||   ||||||| ||  ||||| ||| ||||||||||| |||   |||||||  ||||| |||||||||||||| ||    
T  26823900 aaatcctagactcttcaatggcattattgagtgattgttcgattttatcccctctttgaagttcacgatcatcaaaaaaggtgtggattcccttgtctgt 26823801  T
Q  230 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggat 329  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||  | |  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||  |||| |||| ||||          
T  26823800 aagagccttgtagagattgccggtaaattcataccgagtgtcagcgcctctaaaactgagaaacacttggtatttgaaatcatatgaaactgaa------ 26823707  T
Q  330 gaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagta 410  Q
    ||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26823706 gaggaagttgactgcatagccatgagaattgagagaaattggacgaagaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagta 26823626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 26623136 - 26622805
Alignment:
Q  30 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 129  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||  |||||||||||||||||    
T  26623136 aaaacgagacgaccctttgttttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaatgaagaatatgcatagttgggagaaaacacaggaataa 26623037  T
Q  130 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 229  Q
    |||||||||| || || || || |||   ||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26623036 aaatcctagactcttcgatagcattgtcaagtgatggtttgatttcgtcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagt 26622937  T
Q  230 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggat 329  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||  ||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| ||||| |||     
T  26622936 aagagccttgtagagatttccagtgaaaccgtaccgagtgtcactgcctctgaaacttaggaacacttggtatttgaattgataggaaattgaagaggaa 26622837  T
Q  330 gaggaaggtgattgtatagccataagaattga 361  Q
    ||||| |||||||| |||||||| | ||||||    
T  26622836 gaggatggtgattgcatagccatgataattga 26622805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 26729114 - 26728783
Alignment:
Q  30 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 129  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||  |||||||||||||||||    
T  26729114 aaaacgagacgaccctttgttttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaatgaagaatatgcatagttgggagaaaacacaggaataa 26729015  T
Q  130 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 229  Q
    |||||||||| || || || || |||   ||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26729014 aaatcctagactcttcgatagcattgtcaagtgatggtttgatttcgtcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagt 26728915  T
Q  230 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggat 329  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||  ||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| ||||| |||     
T  26728914 aagagccttgtagagatttccagtgaaaccgtaccgagtgtcactgcctctgaaacttaggaacacttggtatttgaattgataggaaattgaagaggaa 26728815  T
Q  330 gaggaaggtgattgtatagccataagaattga 361  Q
    ||||| |||||||| |||||||| | ||||||    
T  26728814 gaggatggtgattgcatagccatgataattga 26728783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 44 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 25579865 - 25579613
Alignment:
Q  44 ctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattca 143  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||     
T  25579865 ctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattct 25579766  T
Q  144 tcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtaga 243  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  25579765 tcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattatcatcaaagaaggtacgaattcccttgtcaacaagagccttataga 25579666  T
Q  244 gatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacact 296  Q
    |||| | |||||||  || |||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  25579665 gattaccggtaaaagtgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgaggaacact 25579613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 44 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 25481888 - 25481636
Alignment:
Q  44 ctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattca 143  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||| |||||||||||||     
T  25481888 ctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatacaaatcctagattct 25481789  T
Q  144 tcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtaga 243  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  25481788 tcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaacaagagccttataga 25481689  T
Q  244 gatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacact 296  Q
    |||| | |||||||  || |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  25481688 gattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcccctgaaattgaggaacact 25481636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 44 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 26143011 - 26142759
Alignment:
Q  44 ctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattca 143  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||     
T  26143011 ctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattct 26142912  T
Q  144 tcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtaga 243  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  26142911 tcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaacaagagccttataga 26142812  T
Q  244 gatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacact 296  Q
    |||| | ||||||   || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26142811 gattaccggtaaatttgttgcgagtgtcactgcccctgaaactgaggaacact 26142759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 44 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 26056072 - 26055820
Alignment:
Q  44 ctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattca 143  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||| ||||||     
T  26056072 ctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcccagattct 26055973  T
Q  144 tcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtaga 243  Q
    || ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  26055972 tcgatggccttgacaagtgatgatgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtattaattcccttgtcaacaagagccttataga 26055873  T
Q  244 gatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacact 296  Q
    |||| | |||||||  || |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  26055872 gattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcccctgaaaatgaggaacact 26055820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 44 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 26076042 - 26075790
Alignment:
Q  44 ctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattca 143  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||| ||||||     
T  26076042 ctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcccagattct 26075943  T
Q  144 tcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtaga 243  Q
    || ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  26075942 tcgatggccttgacaagtgatgatgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtattaattcccttgtcaacaagagccttataga 26075843  T
Q  244 gatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacact 296  Q
    |||| | |||||||  || |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  26075842 gattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcccctgaaattgaggaacact 26075790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 44 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 26048991 - 26048739
Alignment:
Q  44 ctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattca 143  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||     
T  26048991 ctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattct 26048892  T
Q  144 tcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtaga 243  Q
    || ||||||||||  |||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||| | |||||||| ||||    
T  26048891 tccatggccttgacaagtttgggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacaaattcccttgtcaatgagagccttataga 26048792  T
Q  244 gatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacact 296  Q
    |||| | |||||||  || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26048791 gattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcccctgaaactgaggaacact 26048739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 44 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 26070160 - 26069908
Alignment:
Q  44 ctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattca 143  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||     
T  26070160 ctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattct 26070061  T
Q  144 tcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtaga 243  Q
    || ||||||||||  |||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||| | |||||||| ||||    
T  26070060 tccatggccttgacaagtttgggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacaaattcccttgtcaatgagagccttataga 26069961  T
Q  244 gatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacact 296  Q
    |||| | |||||||  || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26069960 gattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcccctgaaactgaggaacact 26069908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 44 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 25538686 - 25538434
Alignment:
Q  44 ctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattca 143  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||| ||||||||     
T  25538686 ctttgtcttgtagcagtgaatgatctggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaattctagattct 25538587  T
Q  144 tcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtaga 243  Q
    || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||   ||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  25538586 tcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatctatgaaagtactaattcccttgtcaacaagagccttataga 25538487  T
Q  244 gatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacact 296  Q
    |||| | ||||||   || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25538486 gattaccggtaaatttgttgcgagtgtcactgcccctgaaactgaggaacact 25538434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 56 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 26861750 - 26861446
Alignment:
Q  56 gcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttg 155  Q
    ||||| ||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||    
T  26861750 gcagttaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttggcagaaaacacaggaatgaaaattctagactcttcaatggcattg 26861651  T
Q  156 aggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaa 255  Q
      |||||||  | |||||||||| ||||||||||| |||   ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  26861650 tcgagtgatcttttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattaccggtaa 26861551  T
Q  256 aaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataag 355  Q
    |||| |  ||||||||| | || || ||||||||||| || |||||  |||||||||||||||  |||| ||| ||| |||||||||| |||||||| ||    
T  26861550 aaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacctggtatttgaatccataggaaatggaagaggaagagcaaggtgattgcatagccatcag 26861451  T
Q  356 aattg 360  Q
    |||||    
T  26861450 aattg 26861446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 66 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28234688 - 28234438
Alignment:
Q  66 atgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatg 165  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||  |||||||    
T  28234688 atgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatg 28234589  T
Q  166 gtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcg 265  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||  | |||||||||  ||||||||| | |||    
T  28234588 gtgttatttcatctcctccttgaagctccctgtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtgacaaagagctctatagagattttcggtaaaaccatagcg 28234489  T
Q  266 agtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccatagga 316  Q
    ||||||| | || |||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||    
T  28234488 agtgtcactacctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccatagga 28234438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 408
Target Start/End: Original strand, 27427633 - 27428006
Alignment:
Q  30 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 129  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||| | |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||| |    
T  27427633 aaaacgaggcaacccttggttttgtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatca 27427732  T
Q  130 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgat-ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatc------aatgaaggtatggattccct 222  Q
    ||||||| ||||| |||||          | |||| ||||||| ||  |||| ||||||||||||| |||||||      |  ||||||| | |||||||    
T  27427733 aaatcctggattcttcaat----------aatgattggtgtgactttgtctcttctttgaagatcactgtcatcgtcatcatggaaggtacgaattccct 27427822  T
Q  223 tgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatga 322  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||| | ||| |||||||  |||||||| |||||| || || |||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||    
T  27427823 tgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgaggaacacatcgtaactgaatgcataggaaaatga 27427922  T
Q  323 agtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgag 408  Q
    || |||  || ||||| |||| || ||||| |||||||||||||||  ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27427923 agaggaatagaaaggtaattgcatggccatgagaattgagagaaataagatg--agaagagtttgagaatgcagaatatgaatgag 27428006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 28139689 - 28139379
Alignment:
Q  42 ccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagatt 141  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  28139689 ccctttgtgttgaagcagtcaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaacgaagaagaggcatagttgatggaaaacacagggatgaaaatcctagatt 28139590  T
Q  142 catcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgta 241  Q
    | |||||||| || | |||||| ||||  ||||| || |||| |||||| ||  | |||||||| || || ||||||||   ||||  |||||| |||||    
T  28139589 cttcaatggcttttacgagtgacggtgatatttcgtcacctccttgaagctccctatcatcaataaaagtgtggattccacagtcacgaagagctttgta 28139490  T
Q  242 gagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgat 341  Q
    ||||||||  || ||||||   ||||||||| |||| || || ||||| || || | ||| ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||| |    
T  28139489 gagatttccagtgaaaccgaaacgagtgtcactgcctctgaagctgagaaagacatcgtatgtgaagccataggagaaagaagtagaagaagaaggtggt 28139390  T
Q  342 tgtatagccat 352  Q
    || | ||||||    
T  28139389 tgcaaagccat 28139379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 28325616 - 28325347
Alignment:
Q  55 agcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggcctt 154  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || | |||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  28325616 agcagtgaataatgtggacaagttcatccaagcaaaaggaagaagaagcataattgatagacaaaataggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 28325517  T
Q  155 gaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggta 254  Q
    ||  ||||| ||||| ||||| || |||| |||||| || |||||||||||||||||| | |||| |||   |  |||| | |||||||||||||  |||    
T  28325516 gaaaagtgacggtgttatttcgtcacctcgttgaaggtctttgtcatcaatgaaggtacgaattctcttcctacaaagatctttgtagagatttccagta 28325417  T
Q  255 aaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaag 324  Q
    ||||| |  ||||||||| | || |||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||    
T  28325416 aaaccataacgagtgtcactacctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccataggaaaaggaag 28325347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 28242964 - 28242702
Alignment:
Q  30 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 129  Q
    ||||| ||||| || ||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |    
T  28242964 aaaactaggcgtccatttttcttgcagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatga 28242865  T
Q  130 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 229  Q
    |||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| ||||  || |||| | |||| ||  ||||||||||||||||  | |||||||| | |      
T  28242864 aaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatggtgttattttgtcacctcctggaagttctctgtcatcaatgaaggtgcgaattcccttcttaca 28242765  T
Q  230 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaa 292  Q
    |||| | |||||||||||||  |||||||| |  ||||||||| | || |||||||| |||||    
T  28242764 aagatctttgtagagatttccagtaaaaccataacgagtgtcactacctctaaaactaaggaa 28242702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 50 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 28181254 - 28180970
Alignment:
Q  50 cttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatg 149  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||||    
T  28181254 cttgaagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactcttcaatg 28181155  T
Q  150 gccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttc 249  Q
    |||||||  ||||||| ||| ||||| || |||| |||||| ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||||||  | | ||||||||    
T  28181154 gccttgaaaagtgatgatgttatttcttcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctattgagatttc 28181055  T
Q  250 tggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgagga 334  Q
      |||||||| |  |||||||||   || ||||| || |||||| | |  || |||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  28181054 cagtaaaaccataacgagtgtcaccacctctaaagctaaggaacgcgtcataggtgaatccataggagaaggaagaggatgagga 28180970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 50 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 28185506 - 28185222
Alignment:
Q  50 cttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatg 149  Q
    |||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||||    
T  28185506 cttgaagcagttaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactcttcaatg 28185407  T
Q  150 gccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttc 249  Q
    |||||||  ||||||| ||| ||||| || |||| |||||| ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||||||  | | ||||||||    
T  28185406 gccttgaaaagtgatgatgttatttcttcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctattgagatttc 28185307  T
Q  250 tggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgagga 334  Q
      |||||||  |  ||||||||| | || ||||| || |||||||| |  || |||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  28185306 cagtaaaacgataacgagtgtcactacctctaaagctaaggaacacgtcataggtgaatccataggagaaggaagaggatgagga 28185222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 50 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 28227090 - 28226827
Alignment:
Q  50 cttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatg 149  Q
    |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  28227090 cttgaagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagattcttcaatg 28226991  T
Q  150 gccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttc 249  Q
     ||||||  ||||||| ||| |||||||| |||| |||||| ||  | ||||||| ||| || || |||||||| | |  |||| |  ||||||||||||    
T  28226990 accttgaaaagtgatgatgttatttcatcacctccttgaagctctctatcatcaaagaatgtgtgaattcccttcttacaaagatcactgtagagatttc 28226891  T
Q  250 tggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccata 313  Q
      |||||||| |  ||||||||| | || |||||||| |||||||| |  || |||||||||||    
T  28226890 cagtaaaaccataacgagtgtcaatacctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccata 28226827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 26848809 - 26848603
Alignment:
Q  41 accctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagat 140  Q
    |||||||  |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||| || ||| ||||  ||||||| ||     
T  26848809 acccttttccttggagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagtggcatagttctcagagaatacaagaatggaaatcctcgag 26848710  T
Q  141 tcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgt 240  Q
    || ||||||  ||||||||| || |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| || |    
T  26848709 tcttcaatgttcttgaggagcgaaggtgtgatctcatcaccactctgaagatccttgtcatcaatgaaggttcggattccattgtcagaaagagctttat 26848610  T
Q  241 agagatt 247  Q
    |||||||    
T  26848609 agagatt 26848603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 41 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 28150086 - 28149912
Alignment:
Q  41 accctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagat 140  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| || |  ||||| |||||||| ||     
T  28150086 accctttgccttgaagcagtgaataatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagtatagttgatagagaagattggaatgaaaatcctggac 28149987  T
Q  141 tcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatgga 216  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| || ||| ||  | |||||||||||||| ||||    
T  28149986 tcttcaatggccttga-gagtgatggtgtgatttcgtcccctcgttaaagctccgtatcatcaatgaaggtgtgga 28149912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 26937244 - 26937073
Alignment:
Q  40 gaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctaga 139  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||   |||||  ||    
T  26937244 gaccttttgtcttgaagcagtcaacgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtggcatagttgatagagaatacaggtatggcaatcccgga 26937145  T
Q  140 ttcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 211  Q
     || ||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||  || || || |||||||||||||||||    
T  26937144 atcttcaattgccttgacaagtgatggtgtgatttcttctcctccatggagctccttgtcatcaatgaaggt 26937073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 324
Target Start/End: Original strand, 26341975 - 26342255
Alignment:
Q  44 ctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattca 143  Q
    ||||| |||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||| |||||||| || ||     
T  26341975 ctttgccttgaagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaagcatagttgattgagaaaattggaatgaaaatcctggactct 26342074  T
Q  144 tcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtaga 243  Q
    |||||||| ||||  |||||| |||||||||  || ||||  ||||| ||  | ||||||||||||||  ||| |||   ||||   |||||  | ||||    
T  26342075 tcaatggctttgacaagtgattgtgtgattttgtcacctccatgaagctccctatcatcaatgaaggtgcggactccaccgtcacatagagctctataga 26342174  T
Q  244 gatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaag 324  Q
     ||| |  |||||||| | ||||||| || ||||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||| || |||||||    
T  26342175 tattgccagtaaaaccatagcgagtgccaatgcccctaaaattgaggaacacatcatatgtgaatccatatgagaatgaag 26342255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 186
Target Start/End: Original strand, 25506981 - 25507092
Alignment:
Q  75 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 174  Q
    ||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||  ||| || ||||||||||||||    
T  25506981 agttcctccaaacaaaattttgaagaggcatagttgatagaaagaaccggaataaaaatcctagattcttcaatggcgatgacgactgatggtgtgattt 25507080  T
Q  175 catctcctcttt 186  Q
    ||||||||||||    
T  25507081 catctcctcttt 25507092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 316
Target Start/End: Original strand, 28297760 - 28298026
Alignment:
Q  50 cttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatg 149  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||  || ||||||    
T  28297760 cttgaagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattggtagataagacaggaatgaaaatcctagtctcttcaatg 28297859  T
Q  150 gccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttc 249  Q
      |||||  ||||||||||| ||||| || |||| || ||| ||  ||||||||||||||||  | ||||||||   |  |||| | |||| ||||||||    
T  28297860 tgcttgaaaagtgatggtgttatttcgtcacctcctttaagctctctgtcatcaatgaaggtgcgaattcccttcctacaaagatctttgtggagatttc 28297959  T
Q  250 tggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccatagga 316  Q
       |||||| || ||| |||||| | || |||||||| ||||| || |  | |||||||||||||||    
T  28297960 caataaaactgtagcgtgtgtcactacctctaaaacttaggaaaacgtcatgagtgaatccatagga 28298026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28514313 - 28514047
Alignment:
Q  50 cttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatg 149  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||  || ||||||    
T  28514313 cttgaagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattggtagataagacaggaatgaaaatcctagtctcttcaatg 28514214  T
Q  150 gccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttc 249  Q
      |||||  ||||||||||| ||||| || |||| || ||| ||  ||||||||||||||||  | ||||||||   |  |||| | |||| ||||||||    
T  28514213 tgcttgaaaagtgatggtgttatttcgtcacctcctttaagctctctgtcatcaatgaaggtgcgaattcccttcctacaaagatctttgtggagatttc 28514114  T
Q  250 tggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccatagga 316  Q
       |||||| || ||| |||||| | || |||||||| ||||| || |  | |||||||||||||||    
T  28514113 caataaaactgtagcgtgtgtcactacctctaaaacttaggaaaacgtcatgagtgaatccatagga 28514047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 59 - 343
Target Start/End: Original strand, 28098425 - 28098709
Alignment:
Q  59 gtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgagg 158  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||  |||| || || ||||| |||||||| || || || ||||||||||      
T  28098425 gtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcatagttcttagagaagaccggaattaaaatcctggactcttcgatggccttgaca 28098524  T
Q  159 agtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaac 258  Q
    || ||| ||||||||  ||| |||   |||||||| || |  |||||||||||  ||| |||   ||||  |||||| |||||||||||||  |||||||    
T  28098525 agggattgtgtgattctatcaccttcatgaagatctttatggtcaatgaaggtgcggactcctccgtcacaaagagctttgtagagatttccagtaaaac 28098624  T
Q  259 cgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattg 343  Q
    | |  |||||||| |||||||||||| | || ||||| |  || ||||||||||| || ||||||| | | ||||||| ||||||    
T  28098625 cataccgagtgtcggtgcccctaaaattaagaaacacgtcataggtgaatccataagagaatgaagagaaagaggaagatgattg 28098709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 29826130 - 29825958
Alignment:
Q  87 caaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctcttt 186  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||| || | ||||||    ||||||||||| | ||| ||||| |  ||||| ||||||||||| || |||||||    
T  29826130 caaaacgaagaagaagcataattggtagagaaaataggaatggctatcctagattcttgaattgccttcacaagtgagggtgtgatttcgtcccctcttt 29826031  T
Q  187 gaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaacc 259  Q
    |||| || |||||||||||||||||  | |||  ||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  29826030 gaagctctttgtcatcaatgaaggtgcgaattttcttgtcagttagagctttgtagagattgccggtaaaacc 29825958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 36 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 27214571 - 27214312
Alignment:
Q  36 aggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcc 135  Q
    |||||||| |||  |||| |||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    || || |||  || | ||||||    
T  27214571 aggcgacctttttccttggagcaatgagtgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtagcatagttctctgagaatacaataacagaaatcc 27214472  T
Q  136 tagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagc 235  Q
    | || || |||||   |||| |||| || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||  ||||||    
T  27214471 tcgagtcttcaattttcttgtggagcgaagatgtgatttcgtcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggattcctttgtcacaaagagc 27214372  T
Q  236 cttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 295  Q
     || |||||||| | ||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| | ||||||    
T  27214371 tttatagagattaccggtgaaaccgtgtcgagtgtcggtacccctgaaactaatgaacac 27214312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 36 - 295
Target Start/End: Original strand, 27234657 - 27234916
Alignment:
Q  36 aggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcc 135  Q
    |||||||| |||  |||| |||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    || || |||  || | ||||||    
T  27234657 aggcgacctttttccttggagcaatgagtgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtagcatagttctctgagaatacaataacagaaatcc 27234756  T
Q  136 tagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagc 235  Q
    | || || |||||   |||| |||| || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||  ||||||    
T  27234757 tcgagtcttcaattttcttgtggagcgaagatgtgatttcgtcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggattcctttgtcacaaagagc 27234856  T
Q  236 cttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 295  Q
     || |||||||| | ||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| | ||||||    
T  27234857 tttatagagattaccggtgaaaccgtgtcgagtgtcggtacccctgaaactaatgaacac 27234916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 331 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 26055818 - 26055738
Alignment:
Q  331 aggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaa 411  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  26055818 aggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa 26055738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 55 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 26635825 - 26635585
Alignment:
Q  55 agcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggcctt 154  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |   |||| || ||   |||   |||||| || || ||||||  |||    
T  26635825 agcaatgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcatattccttagagaaaacgataatggcaatcctcgactcttcaatgctctt 26635726  T
Q  155 gaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggta 254  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||| || ||||| || | |||     
T  26635725 gaggagcgaaggtgtgatttcatccccttttttaagctccttgtcatcaatgaaggtgttgattcctttgtcagaaagagctttatagaggttaccggtg 26635626  T
Q  255 aaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 295  Q
    ||||||    ||||||| |||||||| ||||| | ||||||    
T  26635625 aaaccgaattgagtgtcggtgcccctgaaactaatgaacac 26635585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 55 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 26741791 - 26741551
Alignment:
Q  55 agcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggcctt 154  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |   |||| || ||   |||   |||||| || || ||||||  |||    
T  26741791 agcaatgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcatattccttagagaaaacgataatggcaatcctcgactcttcaatgctctt 26741692  T
Q  155 gaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggta 254  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||| || ||||| || | |||     
T  26741691 gaggagcgaaggtgtgatttcatccccttttttaagctccttgtcatcaatgaaggtgttgattcctttgtcagaaagagctttatagaggttaccggtg 26741592  T
Q  255 aaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 295  Q
    ||||||    ||||||| |||||||| ||||| | ||||||    
T  26741591 aaaccgaattgagtgtcggtgcccctgaaactaatgaacac 26741551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 36 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 25071813 - 25071554
Alignment:
Q  36 aggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcc 135  Q
    ||||||| ||||  |||| || ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||   |||| || ||   |||   ||| |    
T  25071813 aggcgactcttttccttgaagtagtgaatgatgtggacaagttcgtctaaacaaaatgaagaagaagcatagtctttagagaagacgataatggcaattc 25071714  T
Q  136 tagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagc 235  Q
    | || || ||||||  |||| |||| || ||||||||||| || ||||| | ||| || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  25071713 tcgaatcttcaatgctcttgcggagcgaaggtgtgatttcgtcacctctcttaagctctttgtcatcaataaaggtgtggattcctttgtcagaaagagc 25071614  T
Q  236 cttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 295  Q
     || || ||||| | ||||||||||   |||||||| || ||||| ||||| | ||||||    
T  25071613 tttataaagattaccggtaaaaccgaatcgagtgtcggtacccctgaaactaatgaacac 25071554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 332 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 25481633 - 25481554
Alignment:
Q  332 ggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaa 411  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  25481633 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaaaactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa 25481554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 332 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 25538431 - 25538356
Alignment:
Q  332 ggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatga 407  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  25538431 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatga 25538356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 332 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 26048736 - 26048657
Alignment:
Q  332 ggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaa 411  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  26048736 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa 26048657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 332 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 26069905 - 26069826
Alignment:
Q  332 ggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaa 411  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  26069905 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa 26069826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 332 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 26075787 - 26075708
Alignment:
Q  332 ggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaa 411  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  26075787 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa 26075708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 332 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 26142756 - 26142677
Alignment:
Q  332 ggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaa 411  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  26142756 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa 26142677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 55 - 244
Target Start/End: Original strand, 27665169 - 27665358
Alignment:
Q  55 agcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggcctt 154  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||||  ||||||||  |||| || | |  |||   |||||| ||||| ||||||  |||    
T  27665169 agcaatgaatgatgtggacaagttcatctaaacaaaatgaagaagtagcatagttcttagagaatataataatggcaatcctcgattcttcaatgctctt 27665268  T
Q  155 gaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagag 244  Q
      ||||||| ||||||||||| || ||  || |||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  27665269 ccggagtgaaggtgtgatttcgtcaccagttggaagctccttgtcatcaatgaaggtgtggattcctttgtcagaaagagccttatagag 27665358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 36 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26949815 - 26949591
Alignment:
Q  36 aggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcc 135  Q
    |||||||| |||  |||| || ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |   ||||||| ||   |||   ||| |    
T  26949815 aggcgacctttttccttgaagtagtgaatgatatggacaagttcgtctaaacaaaatgaagaagaagcatattccttagaaaagacgataatggcaattc 26949716  T
Q  136 tagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagc 235  Q
    | ||||| |||||   |||||||||||| ||||||||||| || ||| | ||||| || || ||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||    
T  26949715 tcgattcttcaattctcttgaggagtgaaggtgtgatttcgtcacctttctgaagctccttatcatcaatgaaggttcggattcccttgtcagagagagc 26949616  T
Q  236 cttgtagagatttctggtaaaaccg 260  Q
     || |||||||| | ||| ||||||    
T  26949615 tttatagagattaccggtgaaaccg 26949591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 26975182 - 26974998
Alignment:
Q  60 tgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgagga 159  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||   |||| || ||   |||   |||||| || || ||||||  ||||||||    
T  26975182 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagtctttagagaagacgataatggtaatcctcgagtcttcaatgctcttgagga 26975083  T
Q  160 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagag 244  Q
    | || ||||||||||| || ||| ||| ||| || ||||||||||||||| | | |||||| ||||||| |||||| || |||||    
T  26975082 gcgaaggtgtgatttcgtccccttttttaagctccttgtcatcaatgaagatgttgattcctttgtcagaaagagctttatagag 26974998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 26811568 - 26811453
Alignment:
Q  131 aatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagta 230  Q
    ||||||||| |  ||||||  ||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||  |    
T  26811568 aatcctagagtgttcaatgctcttgaggagcgaaggtgtgatttcgtcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggattcctttgtcacaa 26811469  T
Q  231 agagccttgtagagat 246  Q
    ||||| || |||||||    
T  26811468 agagctttatagagat 26811453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 332 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 25579610 - 25579529
Alignment:
Q  332 ggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatga--aaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaa 411  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  25579610 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaataaaaaaactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa 25579529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 26959190 - 26959069
Alignment:
Q  165 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggc 264  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||| || ||||| || | ||| |||| |   |    
T  26959190 ggtgtgatttcatccccttttttaagctctttgtcatcaatgaaggtgtcgattcctttgtcagaaagagctttatagaggttaccggtgaaactgaatc 26959091  T
Q  265 gagtgtcagtgcccctaaaact 286  Q
    ||||||| |||||||| |||||    
T  26959090 gagtgtcggtgcccctgaaact 26959069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 2184442 - 2184183
Alignment:
Q  36 aggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcc 135  Q
    ||||| ||||||| |||| || |  |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  | || || ||||| || ||||| |    
T  2184442 aggcgtccctttgacttggagtaacgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagttctttgagaaaacagggatgaaaattc 2184343  T
Q  136 tagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagc 235  Q
    | || || |||||||| || |  ||||||| ||| |||||| | |||| |||||| || | ||||||  |||| || |||| |||  | | |   |||||    
T  2184342 tggactcttcaatggctttcataagtgatgctgttatttcaccccctcgttgaagctcctcgtcatccttgaaagtgtggactccacttttacatagagc 2184243  T
Q  236 cttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 295  Q
     | ||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||  || || ||||| ||||||||    
T  2184242 atcgtaaagattgccggtaaaaccatggcgagtgtcagctcctctgaaacttaggaacac 2184183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 2185051 - 2184880
Alignment:
Q  37 ggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcct 136  Q
    |||| ||||||| |||| ||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||   | || || ||||| || ||||| ||    
T  2185051 ggcgtccctttgacttggagcaacgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagtcctttgagaaaacagggatgaaaattct 2184952  T
Q  137 agattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaa 208  Q
     ||||| |||||||| || |  || |||||||| |||||| | |||| |||||| || | |||||| |||||    
T  2184951 ggattcttcaatggctttcacaagcgatggtgttatttcaccccctcgttgaagctcttcgtcatccatgaa 2184880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 26617351 - 26617269
Alignment:
Q  165 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatt 247  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||  |||||| || ||||||||    
T  26617351 ggtgtgatttcatcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggactcctttgtcacaaagagctttatagagatt 26617269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 26723279 - 26723197
Alignment:
Q  165 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatt 247  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||  |||||| || ||||||||    
T  26723279 ggtgtgatttcatcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggactcctttgtcacaaagagctttatagagatt 26723197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 313
Target Start/End: Original strand, 26893543 - 26893781
Alignment:
Q  75 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgattt 174  Q
    ||||| |||||||||||   |||||| |||||||||||||| |  || |||||  | ||| |||| || ||||| |||||||  |||||||||| |||||    
T  26893543 agttcttccaaacaaaatatagaagaagcatagttgatagagaggactggaatgtatatcatagactcttcaattgccttgataagtgatggtgagattt 26893642  T
Q  175 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagt 274  Q
    | || ||||| ||||| ||  | |||||||||||||| || |||||  | |||  |||||| || || ||||  |  ||||||||    ||||||||||     
T  26893643 cgtcacctctatgaagctctgtatcatcaatgaaggtgtgaattccactatcacaaagagctttataaagatgacccgtaaaaccaaaacgagtgtcaga 26893742  T
Q  275 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccata 313  Q
    ||| |||||| ||||||| || | ||| |||||||||||    
T  26893743 gcctctaaaattgaggaagacatcgtaggtgaatccata 26893781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 353
Target Start/End: Original strand, 26018770 - 26018837
Alignment:
Q  286 tgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccata 353  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||  || ||||||||||| |||||||||    
T  26018770 tgaggaacacttggtatgtgagtccataggaaaaggatgaggtagacgaaggtgattgaatagccata 26018837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 353
Target Start/End: Original strand, 26139474 - 26139541
Alignment:
Q  286 tgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccata 353  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||  |||||||||||||| ||| |||||    
T  26139474 tgaggaacacttggtatgtgagtccataggaaaaggatgaggtagaggaaggtgattgaataaccata 26139541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 350; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 427
Target Start/End: Original strand, 14383 - 14777
Alignment:
Q  30 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14383 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaa-aggcatagttgatagaaaacacaggaataa 14481  T
Q  130 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14482 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 14581  T
Q  230 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggat 329  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14582 aagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactgatgaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggat 14681  T
Q  330 gaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtg 427  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14682 gaggaaggtgattgtatagccatgagaattgagagaaataggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaa-ttttgtgttctgtg 14777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 426
Target Start/End: Original strand, 3450 - 3844
Alignment:
Q  32 aacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatag-ttgatagaaaacacaggaataaa 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3450 aacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcataggttgatagaaaacacaggaataaa 3549  T
Q  131 aatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagta 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3550 aatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagta 3649  T
Q  231 agagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatg 330  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3650 agagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggatg 3749  T
Q  331 aggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgt 426  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  3750 aggaaggtgattgtatagccatgacaattgagagaaataggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatg-gtaaatttttgtggtctgt 3844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 264 - 427
Target Start/End: Original strand, 8062 - 8225
Alignment:
Q  264 cgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgaga 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8062 cgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccatgggagaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgaga 8161  T
Q  364 gaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtg 427  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8162 gaaataggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtgaatttttgtgttctgtg 8225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 328; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 405
Target Start/End: Original strand, 4698 - 5073
Alignment:
Q  30 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  4698 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaaaaggcatagaagatagaaaacacaggaataa 4797  T
Q  130 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  4798 aaatcctagattcatcaatggccttgcggagggatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagt 4897  T
Q  230 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggat 329  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4898 aagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggat 4997  T
Q  330 gaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaat 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4998 gaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaat 5073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 30 - 427
Target Start/End: Original strand, 13659 - 14056
Alignment:
Q  30 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 129  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13659 aaaacgaggcgaccttttgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcgtagttgatagaaaacacaggaataa 13758  T
Q  130 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 229  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  13759 aaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagt 13858  T
Q  230 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggat 329  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||     
T  13859 aagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagaggaaaatgaagaggaa 13958  T
Q  330 gaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtg 427  Q
    ||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||| ||||||    
T  13959 gaggaaggtaattgcatagccatgataattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaatgagtttgtttttgtggtctgtg 14056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 30 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 7685 - 7295
Alignment:
Q  30 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 129  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7685 aaaacgaggcgaccttctgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcgtagttgatagaaaacacaggaataa 7586  T
Q  130 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 229  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  7585 aaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagt 7486  T
Q  230 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggat 329  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||     
T  7485 aagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcatatgaaaatgaagaggaa 7386  T
Q  330 gaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtg 427  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||       |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  7385 gagggaggtgattgcatagccatgagaattgagagaaattagatgaaaaaagagtttga-------gaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1254 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold1254
Description:

Target: scaffold1254; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 96 - 427
Target Start/End: Original strand, 10 - 334
Alignment:
Q  96 gaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcat 195  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10 gaagtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcat 109  T
Q  196 tgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 295  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  110 tgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacac 209  T
Q  296 ttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgca 395  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||       |    
T  210 ttggtaagtgaatgcatatgaaaatgaagaggaagagggaggtgattgcatagccatgagaattgagagaaattagatgaaaaaagagtttg-------a 302  T
Q  396 gaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtg 427  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  303 gaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 30 - 403
Target Start/End: Original strand, 18699414 - 18699787
Alignment:
Q  30 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 129  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18699414 aaaacgagacgaccttttgtcttgtagcagtgaatgatgtgaacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatga 18699513  T
Q  130 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 229  Q
    | |||||||| || |||||||| |||  |||||||||| |||||||||| || ||||| || |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18699514 agatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatccccactttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagt 18699613  T
Q  230 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggat 329  Q
    |||||| ||||||||||  |  ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18699614 aagagctttgtagagatggccagtaaaaccgtcacgagtgtcagtgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagaggat 18699713  T
Q  330 gaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatga 403  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18699714 gaggaaggtgattgcatagccatgagaattgagagaaactagatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatga 18699787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 29 - 403
Target Start/End: Original strand, 18655490 - 18655864
Alignment:
Q  29 aaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaata 128  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18655490 aaaaacgagacgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgcggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaata 18655589  T
Q  129 aaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcag 228  Q
    || |||||||| || | |||||| |||  |||||||||| |||||||||| || ||||| || |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18655590 aagatcctagactcttgaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatccccactttgcagctcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcag 18655689  T
Q  229 taagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtgga 328  Q
    ||||||| ||||||||||  |  ||||||||||  ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  18655690 taagagctttgtagagatgcccagtaaaaccgttacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagagga 18655789  T
Q  329 tgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatga 403  Q
    |||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18655790 tgaggaaggtgattgcctagccatgaaaattgagagaaactggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatga 18655864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 30 - 403
Target Start/End: Original strand, 18679581 - 18679954
Alignment:
Q  30 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 129  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18679581 aaaacaagacgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatga 18679680  T
Q  130 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 229  Q
    | |||||||| || |||||||| |||  |||||||||| |||||||||| |||||||| || |||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  18679681 agatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcctttgtcagt 18679780  T
Q  230 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggat 329  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||||||||  ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||    
T  18679781 aagagccttgtagagatgaccagtaaaaccgttacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagagaat 18679880  T
Q  330 gaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatga 403  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18679881 gaggaaggtgattgcatagccatgaaaatagagagaaactggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatga 18679954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 30 - 403
Target Start/End: Original strand, 18731518 - 18731891
Alignment:
Q  30 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 129  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18731518 aaaacaagacgaccctttgtcttgtagcagtgcatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatga 18731617  T
Q  130 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 229  Q
    | |||||||| || |||||||| |||  |||||||||| |||||||||| |||||||| || |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18731618 agatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagt 18731717  T
Q  230 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggat 329  Q
    ||||||  |||||||||  |  ||||||||||  ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18731718 aagagctctgtagagatggccagtaaaaccgtcacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagaggat 18731817  T
Q  330 gaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatga 403  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18731818 gaggaaggtgattgcatagccatgaaaatcgagagaaactggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatga 18731891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 30 - 363
Target Start/End: Original strand, 18724099 - 18724432
Alignment:
Q  30 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 129  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18724099 aaaacaagacgaccctttgtcttgtagcagtgcatgatgtggacaagttcgttcaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatga 18724198  T
Q  130 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 229  Q
    | |||||||| || |||||||| |||  |||||||||| |||||||||| |||||||| || |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18724199 agatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagt 18724298  T
Q  230 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggat 329  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||||||||  ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18724299 aagagccttgtagagatgaccagtaaaaccgttacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagaggat 18724398  T
Q  330 gaggaaggtgattgtatagccataagaattgaga 363  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  18724399 gaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaga 18724432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 18073922 - 18073549
Alignment:
Q  30 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 129  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||| | |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||| |    
T  18073922 aaaacgaggcaacccttggttttgtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatca 18073823  T
Q  130 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgat-ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatc------aatgaaggtatggattccct 222  Q
    ||||||| ||||| |||||          | |||| ||||||| ||  |||| ||||||||||||| |||||||      |  ||||||| | |||||||    
T  18073822 aaatcctggattcttcaat----------aatgattggtgtgactttgtctcttctttgaagatcactgtcatcgtcatcatggaaggtacgaattccct 18073733  T
Q  223 tgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatga 322  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||| | ||| |||||||  |||||||| |||||| || || |||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||    
T  18073732 tgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgaggaacacatcgtaactgaatgcataggaaaatga 18073633  T
Q  323 agtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgag 408  Q
    || |||  || ||||| |||| || ||||| |||||||||||||||  ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18073632 agaggaatagaaaggtaattgcatggccatgagaattgagagaaataagatg--agaagagtttgagaatgcagaatatgaatgag 18073549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 51 - 408
Target Start/End: Original strand, 17989088 - 17989440
Alignment:
Q  51 ttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatgg 150  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||| | |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||| |||||||| ||||| |||||      
T  17989088 ttgtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaat-- 17989185  T
Q  151 ccttgaggagtgat-ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatc------aatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtaga 243  Q
            | |||| ||||||| ||  |||| ||||||||||||| |||||||      |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||  |||    
T  17989186 --------aatgattggtgtgactttgtctcttctttgaagatcactgtcatcgtcatcatggaaggtacgaattcccttgtcaataagagccttcaaga 17989277  T
Q  244 gatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattg 343  Q
    |||| | ||| |||||||  |||||||| |||||| || || |||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||| |||  || ||||| ||||    
T  17989278 gattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgaggaacacatcgtaactgaatgcataggaaaatgaagaggaatagaaaggtaattg 17989377  T
Q  344 tatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgag 408  Q
     || ||||| |||||||||||||||  ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17989378 catggccatgagaattgagagaaataagatg--agaagagtttgagaatgcagaatatgaatgag 17989440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 50 - 286
Target Start/End: Original strand, 5091001 - 5091237
Alignment:
Q  50 cttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatg 149  Q
    |||| |||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||   ||| | |||| ||||||| | ||||    
T  5091001 cttggagcagtgaataatatggacaagttcatctaaacaaaacgaagaagaagcatagtggttagagaaaacgataatgacaatcttagattcttgaatg 5091100  T
Q  150 gccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttc 249  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||  ||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||||| ||   ||||| |  ||||||||||    
T  5091101 gccttgagaagtgacggtgttatttggtctcctcgctgaagctctctgtcatcaatgaaggtgtgaattcccttgacacgtagagcttcatagagatttc 5091200  T
Q  250 tggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaact 286  Q
      ||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||    
T  5091201 cagtaaaaccgtaacgagtgtcggtgcctctaaaact 5091237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 30 - 387
Target Start/End: Original strand, 28164376 - 28164733
Alignment:
Q  30 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 129  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28164376 aaaactaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagataacacaggaataa 28164475  T
Q  130 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 229  Q
    |||| | |||||  ||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||| | |||||||   ||||||||||| || || |||||||||||       
T  28164476 aaattcaagatttttcaatggccttgatgaatgacggtgtgatttcttctcctctctcaagatcacaatcatcaatgaatgtgtgaattcccttgtcgtc 28164575  T
Q  230 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggat 329  Q
    ||| ||||| |||||||  |  || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||     
T  28164576 aagggccttatagagatggccagtgaaaccgtcacgagtgtcactgcccctaaaactgaggaacacttggtatgtgaatccataggaaattgaagaggaa 28164675  T
Q  330 gaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttg 387  Q
    |||||| | ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  28164676 gaggaatgcgatcgtatagccatgagaattgacagaaattggatgagaaaagagtttg 28164733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 30 - 363
Target Start/End: Original strand, 268371 - 268704
Alignment:
Q  30 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 129  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  268371 aaaatgagacgaccctttttcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 268470  T
Q  130 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 229  Q
    |||||||||| || |||||||| |||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  268471 aaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagt 268570  T
Q  230 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggat 329  Q
    |||||||||||||||||  |   ||||||| |  |||||||||  ||| || ||  ||||||| || ||||| |  |||||||| || | ||||| |||     
T  268571 aagagccttgtagagatggccaataaaaccctcacgagtgtcaccgcctctgaagttgaggaagacctggtaggcaaatccatatgagattgaagaggaa 268670  T
Q  330 gaggaaggtgattgtatagccataagaattgaga 363  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  268671 gaggaaggtgattgcatagccatgagaactgaga 268704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 384
Target Start/End: Original strand, 28127693 - 28128042
Alignment:
Q  30 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 129  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  28127693 aaaactaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtgcacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttggtagaaaatacaggaataa 28127792  T
Q  130 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcat-ctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcag 228  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |  ||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||| |   ||||||||||| || |||||||||||||||     
T  28127793 aaattctagattcttcaatggcctttaaaagtgacggtgtgatttttttctcctctctcaagattacaatcatcaatgaatgtgtggattcccttgtcat 28127892  T
Q  229 taagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtgga 328  Q
     ||| |||||||||||||  |  || |||||||  ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||         
T  28127893 aaagggccttgtagagatggccagtgaaaccgtcacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtatgtgaatccataggaaattgaa----- 28127987  T
Q  329 tgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagt 384  Q
     |||||| ||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  28127988 -gaggaatgtgattgcatagccatgagaattgacaaaaattggatgagaaaagagt 28128042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 30 - 352
Target Start/End: Original strand, 29273797 - 29274119
Alignment:
Q  30 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 129  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29273797 aaaatgagacgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 29273896  T
Q  130 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 229  Q
    |||| ||||| || |||||| | |||  |||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29273897 aaattctagactcttcaatgacattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagt 29273996  T
Q  230 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggat 329  Q
    ||||| |||||||||||  |   |||||||||  |||||||||  ||| |||||  ||||||| || ||||||||||||||||| || | ||||| |||     
T  29273997 aagagtcttgtagagatggccaataaaaccgtcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaa 29274096  T
Q  330 gaggaaggtgattgtatagccat 352  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  29274097 gaggaaggtgattgcatagccat 29274119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 31903882 - 31903728
Alignment:
Q  159 agtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaac 258  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||  |||||||    
T  31903882 agtgatggtgtgatttcatgtcctctttgaagttcttcatcgtcaataaaggtgtggattcccttatcataaagagctttgtagagatttccagtaaaac 31903783  T
Q  259 cgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccata 313  Q
    | | |||||||||   ||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  31903782 catagcgagtgtctaagcctctaaagctgaggaacacatcgtaggtgaatccata 31903728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 4)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 50 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 34865 - 34599
Alignment:
Q  50 cttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatg 149  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  34865 cttgaagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatg 34766  T
Q  150 gccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttc 249  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||  | |||||||||     
T  34765 gccttgaaaagtgatggtgttatttcatctcctccttgaagctccctgtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtgacaaagagctctatagagatttt 34666  T
Q  250 tggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccatagga 316  Q
     ||||||||| | |||||||||| | || |||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||    
T  34665 cggtaaaaccatagcgagtgtcactacctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccatagga 34599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 116931 - 116662
Alignment:
Q  55 agcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggcctt 154  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || | |||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  116931 agcagtgaataatgtggacaagttcatccaagcaaaaggaagaagaagcataattgatagacaaaataggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 116832  T
Q  155 gaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggta 254  Q
    ||  ||||| ||||| ||||| || |||| |||||| || |||||||||||||||||| | |||| |||   |  |||| | |||||||||||||  |||    
T  116831 gaaaagtgacggtgttatttcgtcacctcgttgaaggtctttgtcatcaatgaaggtacgaattctcttcctacaaagatctttgtagagatttccagta 116732  T
Q  255 aaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaag 324  Q
    ||||| |  ||||||||| | || |||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||    
T  116731 aaaccataacgagtgtcactacctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccataggaaaaggaag 116662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 43126 - 42864
Alignment:
Q  30 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 129  Q
    ||||| ||||| || ||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |    
T  43126 aaaactaggcgtccatttttcttgcagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatga 43027  T
Q  130 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagt 229  Q
    |||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| ||||  || |||| | |||| ||  ||||||||||||||||  | |||||||| | |      
T  43026 aaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatggtgttattttgtcacctcctggaagttctctgtcatcaatgaaggtgcgaattcccttcttaca 42927  T
Q  230 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaa 292  Q
    |||| | |||||||||||||  |||||||| |  ||||||||| | || |||||||| |||||    
T  42926 aagatctttgtagagatttccagtaaaaccataacgagtgtcactacctctaaaactaaggaa 42864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 50 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 27588 - 27325
Alignment:
Q  50 cttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatg 149  Q
    |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27588 cttgaagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagattcttcaatg 27489  T
Q  150 gccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttc 249  Q
     ||||||  ||||||| ||| |||||||| |||| |||||| ||  | ||||||| ||| || || |||||||| | |  |||| |  ||||||||||||    
T  27488 accttgaaaagtgatgatgttatttcatcacctccttgaagctctctatcatcaaagaatgtgtgaattcccttcttacaaagatcactgtagagatttc 27389  T
Q  250 tggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccata 313  Q
      |||||||| |  ||||||||| | || |||||||| |||||||| |  || |||||||||||    
T  27388 cagtaaaaccataacgagtgtcaatacctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccata 27325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 316
Target Start/End: Original strand, 58334 - 58595
Alignment:
Q  55 agcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggcctt 154  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || | |||||||||    
T  58334 agcagtgaatgatgtggacaagttcgttcaagcaaaatgaagaagaagcatagttgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactctttaatggcctt 58433  T
Q  155 gaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggta 254  Q
    ||  ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||  |||    
T  58434 gaaaagtgatggtgttatttcgtcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctgtagagatttccagta 58533  T
Q  255 aaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccatagga 316  Q
    ||||| | ||||||||||   || ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  58534 aaaccatagcgagtgtcacaacctctaaagctaaggaacacgtgataggtgaatccatagga 58595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 59730 - 59357
Alignment:
Q  30 aaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataa 129  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||| | |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||| |    
T  59730 aaaacgaggcaacccttggttttgtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatca 59631  T
Q  130 aaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgat-ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatc------aatgaaggtatggattccct 222  Q
    ||||||| ||||| |||||          | |||| ||||||| ||  |||| ||||||||||||| |||||||      |  ||||||| | |||||||    
T  59630 aaatcctggattcttcaat----------aatgattggtgtgactttgtctcttctttgaagatcactgtcatcgtcatcatggaaggtacgaattccct 59541  T
Q  223 tgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatga 322  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||| | ||| |||||||  |||||||| |||||| || || |||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||    
T  59540 tgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgaggaacacatcgtaactgaatgcataggaaaatga 59441  T
Q  323 agtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgag 408  Q
    || |||  || ||||| |||| || ||||| |||||||||||||||  ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  59440 agaggaatagaaaggtaattgcatggccatgagaattgagagaaataagatg--agaagagtttgagaatgcagaatatgaatgag 59357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 55 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 3279823 - 3279592
Alignment:
Q  55 agcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggcctt 154  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| || || |||||||||||| | || || || ||||||||    
T  3279823 agcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatatagaagaagcatagttgatagagaagaccggaataaaaatcatggactcttcgatggcctt 3279724  T
Q  155 gaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggta 254  Q
    ||  |||||| ||||||||||||| ||||  ||||| ||  | ||||||||||||||   || |||   |||| | | |||  | ||||||||||  |||    
T  3279723 gacaagtgattgtgtgatttcatcacctccatgaagctccctatcatcaatgaaggtgcagaatccaccgtcacttaaagctctatagagatttccagta 3279624  T
Q  255 aaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaact 286  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  3279623 aaaccatagcgagtgtcagtgcccctaaaact 3279592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 55 - 357
Target Start/End: Original strand, 17993736 - 17994038
Alignment:
Q  55 agcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggcctt 154  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||   | || || ||   |||   ||| || || || ||||||  |||    
T  17993736 agcattgaatgatgtggacaagttcgtctaaacaaaatgaagaagaagcatagtcctttgagaagacgataatcgcaattcttgagtcttcaatgctctt 17993835  T
Q  155 gaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggta 254  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||  | ||||||||||||| |||||| || |||||||| | |||     
T  17993836 gaggagcgacggtgtgatttcatcacctctctgaagctctttgtcatcgatgaaggttcgaattcccttgtcagaaagagctttatagagattaccggtg 17993935  T
Q  255 aaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataa 354  Q
    ||||| |  ||||| || || ||||| ||||| | |||||| | | |  |||| ||||| || || || |  || |||||||||||||| ||||||||||    
T  17993936 aaaccatatcgagtatcggtacccctgaaactaatgaacacatcgaagctgaaaccataagataaggaggaagaggaggaaggtgattgcatagccataa 17994035  T
Q  355 gaa 357  Q
    |||    
T  17994036 gaa 17994038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16689135 - 16688974
Alignment:
Q  66 atgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatg 165  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||||| || ||   |||||| || || ||||| |||||||  |||||||    
T  16689135 atgttgacaagttcatccaaacaaaacgaggaaaatgcatagttcttagaaaacacggggattgcaatccttgagtcttcaattgccttgataagtgatg 16689036  T
Q  166 gtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtca 227  Q
    |||||||||  || ||||| ||||| || |||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  16689035 gtgtgattttgtcacctctctgaagttccttgtcatcaatgaagacacggattcccttgtca 16688974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0713 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0713
Description:

Target: scaffold0713; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 5982 - 5915
Alignment:
Q  286 tgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccata 353  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||  |||||||||||||| ||| |||||    
T  5982 tgaggaacacttggtatgtgagtccataggaaaaggatgaggtagaggaaggtgattgaataaccata 5915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 182
Target Start/End: Original strand, 214469 - 214513
Alignment:
Q  138 gattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcct 182  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  214469 gattcatcaattgccttgaaaagtgatggtgtaatttcatctcct 214513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University