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Alignment Overview

Query: NF11453A_high_9 (Length: 489)

Name: NF11453A_high_9
Description: NF11453A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11453A_high_9
NF11453A_high_9
[»] chr5 (20 HSPs)
chr5 (17-470)||(38968377-38968830)
chr5 (17-470)||(42537429-42537881)
chr5 (19-470)||(8701567-8702017)
chr5 (12-470)||(42941823-42942279)
chr5 (17-470)||(7757604-7758057)
chr5 (17-470)||(8579846-8580298)
chr5 (17-441)||(17658631-17659054)
chr5 (17-470)||(28876923-28877375)
chr5 (118-470)||(512214-512565)
chr5 (144-470)||(19228140-19228465)
chr5 (201-470)||(28241325-28241592)
chr5 (247-470)||(14260-14482)
chr5 (235-470)||(40624473-40624716)
chr5 (235-470)||(20422219-20422463)
chr5 (17-140)||(14136-14259)
chr5 (232-351)||(5197371-5197490)
chr5 (244-351)||(19040685-19040792)
chr5 (247-351)||(27673224-27673328)
chr5 (244-349)||(30705536-30705641)
chr5 (30-111)||(40624389-40624470)
[»] chr6 (14 HSPs)
chr6 (19-470)||(6319906-6320356)
chr6 (17-470)||(24088123-24088575)
chr6 (17-470)||(31768981-31769438)
chr6 (247-351)||(21601002-21601106)
chr6 (232-351)||(24722326-24722445)
chr6 (232-351)||(26423395-26423514)
chr6 (232-351)||(3501567-3501686)
chr6 (208-441)||(3381082-3381313)
chr6 (244-347)||(6201550-6201653)
chr6 (244-347)||(11688517-11688620)
chr6 (244-351)||(22301578-22301685)
chr6 (244-351)||(27617113-27617220)
chr6 (244-347)||(30829220-30829323)
chr6 (386-466)||(30424143-30424223)
[»] chr4 (39 HSPs)
chr4 (17-470)||(51683482-51683934)
chr4 (17-470)||(48255912-48256364)
chr4 (17-470)||(55407128-55407580)
chr4 (17-470)||(21022229-21022681)
chr4 (17-470)||(50901760-50902211)
chr4 (17-470)||(37021418-37021876)
chr4 (17-470)||(40357621-40358073)
chr4 (17-470)||(50275014-50275448)
chr4 (240-470)||(67871-68100)
chr4 (201-441)||(30726267-30726505)
chr4 (201-470)||(1089110-1089377)
chr4 (201-470)||(1308640-1308907)
chr4 (240-458)||(46436536-46436753)
chr4 (17-184)||(68085-68252)
chr4 (208-470)||(14315654-14315925)
chr4 (232-470)||(21538008-21538255)
chr4 (193-351)||(11050040-11050198)
chr4 (232-470)||(10752983-10753230)
chr4 (232-470)||(10966752-10966999)
chr4 (226-470)||(14297405-14297658)
chr4 (232-470)||(11083562-11083809)
chr4 (232-351)||(50023099-50023218)
chr4 (232-351)||(41933179-41933298)
chr4 (232-351)||(50030217-50030336)
chr4 (244-351)||(9892836-9892943)
chr4 (244-351)||(41798563-41798670)
chr4 (247-470)||(4719949-4720161)
chr4 (240-351)||(30704421-30704532)
chr4 (232-364)||(44679631-44679762)
chr4 (232-351)||(3184354-3184473)
chr4 (232-351)||(3185440-3185559)
chr4 (232-351)||(3185648-3185767)
chr4 (244-347)||(6181358-6181461)
chr4 (244-347)||(49090822-49090925)
chr4 (244-351)||(49165431-49165538)
chr4 (244-347)||(31422099-31422203)
chr4 (243-335)||(50193893-50193985)
chr4 (17-100)||(21537875-21537958)
chr4 (240-268)||(21537947-21537975)
[»] chr1 (43 HSPs)
chr1 (17-470)||(45825156-45825609)
chr1 (17-470)||(51320994-51321445)
chr1 (17-470)||(35258219-35258666)
chr1 (17-470)||(31783068-31783521)
chr1 (19-470)||(19526886-19527336)
chr1 (17-470)||(52802411-52802864)
chr1 (17-470)||(23275463-23275897)
chr1 (19-470)||(47502595-47503015)
chr1 (193-470)||(49857463-49857736)
chr1 (201-470)||(19925022-19925289)
chr1 (201-470)||(30890341-30890608)
chr1 (19-184)||(19526699-19526864)
chr1 (17-184)||(19525375-19525542)
chr1 (17-184)||(19526510-19526677)
chr1 (17-184)||(19524527-19524694)
chr1 (17-162)||(11196268-11196413)
chr1 (19-184)||(19524716-19524881)
chr1 (17-155)||(19526036-19526174)
chr1 (19-155)||(19524903-19525039)
chr1 (19-155)||(19525564-19525700)
chr1 (17-133)||(49857338-49857454)
chr1 (232-351)||(50343525-50343644)
chr1 (232-351)||(21141425-21141544)
chr1 (232-364)||(47656256-47656386)
chr1 (17-109)||(2424549-2424641)
chr1 (247-468)||(17514267-17514497)
chr1 (358-470)||(29622105-29622217)
chr1 (232-351)||(97504-97623)
chr1 (244-351)||(2365634-2365741)
chr1 (232-350)||(2424924-2425040)
chr1 (244-351)||(19156413-19156520)
chr1 (232-350)||(22524534-22524650)
chr1 (239-351)||(38127045-38127158)
chr1 (382-470)||(11183461-11183549)
chr1 (386-470)||(11196160-11196244)
chr1 (244-347)||(3731949-3732052)
chr1 (244-351)||(13639591-13639698)
chr1 (244-347)||(26876059-26876162)
chr1 (17-109)||(22524871-22524962)
chr1 (416-469)||(22524407-22524460)
chr1 (275-347)||(8474187-8474259)
chr1 (416-470)||(2425114-2425168)
chr1 (248-322)||(25166976-25167050)
[»] chr3 (42 HSPs)
chr3 (17-470)||(20917356-20917810)
chr3 (17-470)||(20926318-20926772)
chr3 (17-470)||(42165442-42165895)
chr3 (17-470)||(42756433-42756883)
chr3 (17-470)||(30255343-30255795)
chr3 (17-470)||(44229993-44230445)
chr3 (17-470)||(47073547-47074000)
chr3 (17-470)||(48889023-48889466)
chr3 (17-470)||(4007663-4008116)
chr3 (17-470)||(3975986-3976439)
chr3 (17-431)||(42805602-42806016)
chr3 (17-470)||(49195806-49196240)
chr3 (17-470)||(50963234-50963690)
chr3 (17-470)||(48563223-48563659)
chr3 (196-470)||(50216398-50216671)
chr3 (241-470)||(597038-597266)
chr3 (261-470)||(3501477-3501685)
chr3 (17-184)||(49268609-49268776)
chr3 (305-470)||(51807249-51807413)
chr3 (232-351)||(16611475-16611594)
chr3 (232-351)||(22047659-22047778)
chr3 (231-349)||(17567619-17567737)
chr3 (17-145)||(50216281-50216408)
chr3 (232-351)||(41612765-41612884)
chr3 (17-109)||(597541-597633)
chr3 (232-351)||(20351042-20351161)
chr3 (244-351)||(52390964-52391071)
chr3 (244-351)||(2274482-2274589)
chr3 (244-351)||(29009257-29009364)
chr3 (247-470)||(31045165-31045386)
chr3 (232-351)||(36127834-36127953)
chr3 (244-347)||(42903758-42903861)
chr3 (244-347)||(46389363-46389466)
chr3 (244-347)||(50480352-50480455)
chr3 (244-347)||(54386525-54386628)
chr3 (247-351)||(4178201-4178305)
chr3 (244-347)||(49144031-49144133)
chr3 (244-347)||(34045778-34045880)
chr3 (244-347)||(46701593-46701696)
chr3 (247-351)||(4172203-4172307)
chr3 (144-210)||(54681976-54682042)
chr3 (17-58)||(54682060-54682101)
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (17-470)||(36977878-36978330)
chr7 (17-470)||(9494137-9494588)
chr7 (17-470)||(47776614-47777066)
chr7 (17-470)||(37340584-37341036)
chr7 (17-470)||(17835356-17835809)
chr7 (17-470)||(27452960-27453412)
chr7 (17-470)||(47672436-47672878)
chr7 (12-470)||(34738646-34739101)
chr7 (17-441)||(14689406-14689822)
chr7 (136-470)||(39460808-39461141)
chr7 (193-470)||(10517260-10517536)
chr7 (201-470)||(15073754-15074021)
chr7 (201-470)||(42507553-42507820)
chr7 (247-470)||(17741019-17741251)
chr7 (232-351)||(5541096-5541215)
chr7 (235-351)||(556205-556321)
chr7 (232-349)||(16675186-16675303)
chr7 (232-349)||(17649554-17649671)
chr7 (232-364)||(46740103-46740234)
chr7 (244-351)||(41880888-41880995)
chr7 (244-351)||(48403755-48403862)
chr7 (244-347)||(35609984-35610087)
chr7 (20-98)||(10517546-10517624)
chr7 (244-335)||(45257401-45257492)
chr7 (244-314)||(9370958-9371028)
chr7 (77-133)||(39461126-39461182)
chr7 (284-351)||(17465329-17465396)
chr7 (284-351)||(17587818-17587885)
chr7 (30-111)||(556121-556202)
chr7 (244-281)||(17462862-17462899)
chr7 (244-281)||(17590315-17590352)
chr7 (302-351)||(41734561-41734610)
[»] chr8 (34 HSPs)
chr8 (17-470)||(34822357-34822810)
chr8 (17-470)||(43211785-43212238)
chr8 (17-470)||(43188329-43188781)
chr8 (17-470)||(40076600-40077043)
chr8 (17-469)||(15036068-15036520)
chr8 (17-470)||(39846340-39846779)
chr8 (17-470)||(39938558-39939009)
chr8 (17-466)||(5303580-5304010)
chr8 (17-470)||(39252292-39252734)
chr8 (17-470)||(45064521-45064963)
chr8 (17-470)||(41249448-41249866)
chr8 (208-470)||(39601995-39602256)
chr8 (201-441)||(489155-489393)
chr8 (223-470)||(42485086-42485331)
chr8 (232-470)||(24249763-24249999)
chr8 (193-470)||(2984402-2984678)
chr8 (240-470)||(37327084-37327292)
chr8 (357-470)||(25864620-25864732)
chr8 (232-351)||(35552063-35552182)
chr8 (232-351)||(20857683-20857802)
chr8 (237-351)||(45128147-45128261)
chr8 (244-347)||(25095-25198)
chr8 (244-347)||(1052926-1053029)
chr8 (232-351)||(5677468-5677587)
chr8 (244-347)||(23021889-23021992)
chr8 (244-347)||(26659848-26659951)
chr8 (232-335)||(34371450-34371553)
chr8 (17-107)||(2984721-2984811)
chr8 (17-66)||(39602271-39602320)
chr8 (385-441)||(22495216-22495272)
chr8 (247-351)||(22495315-22495419)
chr8 (407-453)||(35026740-35026786)
chr8 (232-267)||(34370133-34370168)
chr8 (240-268)||(2984681-2984709)
[»] chr2 (26 HSPs)
chr2 (18-470)||(39947880-39948332)
chr2 (17-470)||(28468921-28469373)
chr2 (17-470)||(45428871-45429323)
chr2 (17-470)||(32955699-32956147)
chr2 (17-340)||(45136645-45136956)
chr2 (201-470)||(21998470-21998737)
chr2 (201-470)||(17420847-17421114)
chr2 (17-265)||(22686863-22687111)
chr2 (261-470)||(25965100-25965308)
chr2 (297-470)||(7185309-7185481)
chr2 (357-470)||(45137112-45137225)
chr2 (232-351)||(25515366-25515484)
chr2 (232-351)||(29401160-29401279)
chr2 (232-349)||(36655906-36656023)
chr2 (238-351)||(45284570-45284683)
chr2 (238-351)||(45291933-45292046)
chr2 (232-351)||(10828581-10828700)
chr2 (244-351)||(20938294-20938401)
chr2 (244-347)||(3940297-3940400)
chr2 (244-347)||(5352367-5352470)
chr2 (244-351)||(15831526-15831633)
chr2 (244-347)||(30496515-30496618)
chr2 (244-347)||(43978922-43979025)
chr2 (244-347)||(43539306-43539409)
chr2 (386-470)||(35464313-35464397)
chr2 (382-470)||(31367309-31367397)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (21-470)||(14966-15416)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (197-470)||(250-521)
[»] scaffold0634 (2 HSPs)
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[»] scaffold0238 (1 HSPs)
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[»] scaffold0155 (4 HSPs)
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scaffold0155 (17-133)||(10881-10988)
scaffold0155 (136-184)||(10848-10896)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
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[»] scaffold0007 (2 HSPs)
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[»] scaffold0101 (1 HSPs)
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Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 421; Significance: 0; HSPs: 20)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 38968830 - 38968377
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38968830 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcttcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 38968731  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactata 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||    
T  38968730 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccaaaaaaacaatatacacttaaccaaactata 38968631  T
Q  217 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38968630 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 38968531  T
Q  317 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttc 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38968530 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactac 38968431  T
Q  417 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38968430 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccctaaccacatgcaaact 38968377  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 42537881 - 42537429
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42537881 acatcattttcataacttaaaatcattcaatatattcatcattacaataagatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaa 42537782  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactata 216  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||        ||||||||||||||||||||||||    
T  42537781 catacacttaatcatttatatacacttaatcatttgtgttcatcataattctcgtaaccttaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactata 42537682  T
Q  217 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42537681 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataaatttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 42537582  T
Q  317 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttc 416  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42537581 aacatattcaaattatgttcatttgccaccattca-aagccacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactac 42537483  T
Q  417 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  42537482 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaattaaccctaacaacatgcaaact 42537429  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 470
Target Start/End: Original strand, 8701567 - 8702017
Alignment:
Q  19 atcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaaca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8701567 atcatttccataacctaaaatcattcaatataatcattattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaaca 8701666  T
Q  119 tacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactataat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||        |||||||||||||| |||||||||||    
T  8701667 tacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattttcataacctaaactaactaaacaatcaatatacacttaatcaaactataat 8701766  T
Q  219 taacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaa 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8701767 taacatcatttctatcatttccataacctaaacaaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaa 8701866  T
Q  319 catattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttcac 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8701867 catattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgatttaaacaacatatgcaactactacattcatttatcaattcataaactacac 8701965  T
Q  419 atgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||||||||||||||||||||||     ||||| | ||||||||||||||||    
T  8701966 atgcaatcatcaaattgtcaattcatttataaaacctaaccacatgcaaact 8702017  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 470
Target Start/End: Original strand, 42941823 - 42942279
Alignment:
Q  12 gatggacatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaata 111  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| || |||||||    
T  42941823 gatgaacatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccacaataatctaaacatccttcaata 42941922  T
Q  112 attaacatacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaa 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||| |    
T  42941923 attaacatacaattaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaga 42942022  T
Q  212 ctataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42942023 ctataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaa-aatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaag 42942121  T
Q  312 tataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataa 411  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42942122 tataaaacatattcaaattatgttcatttgccacaattca-aagccatattatgatttaaacagcataggcaacaactacattcatttatcaattcctaa 42942220  T
Q  412 acttcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  42942221 actacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaact 42942279  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 7758057 - 7757604
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  7758057 acatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatttatatccatcatttccataataatctaaacatcattcaataattaa 7757958  T
Q  117 catacacttaatcatttctataca-cttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  7757957 catacacttaatcatttctatacaactaaatcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactat 7757858  T
Q  216 aattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtata 315  Q
    ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7757857 aatttctatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtata 7757758  T
Q  316 aaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactt 415  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  7757757 aaacatgttcaaattgtgttcatttgccaccattca-aaaccacattataatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcctaaacta 7757659  T
Q  416 cacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  7757658 cacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatacaaact 7757604  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Original strand, 8579846 - 8580298
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8579846 acatcatttccataacctaaaatcatttaatataatcatcattacaataaaatttatgtctatcattttcataataacctaaacatcattcaataattaa 8579945  T
Q  117 catacacttaatcatttctataca-cttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||        ||| |||||||||||||||||||    
T  8579946 catacacttaatcatttctatacaactaaatcatttgtgtccatcgtaattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaaaatacacttaaccaaactat 8580045  T
Q  216 aattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtata 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8580046 aattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtata 8580144  T
Q  316 aaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactt 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||     
T  8580145 aaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagctacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcaattatcaatttctaaacta 8580243  T
Q  416 cacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||    
T  8580244 cacatgcaatcatcaaattgtcaattttgaaatcaaccctaaccacatacaaact 8580298  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 17 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 17659054 - 17658631
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  17659054 acatcattttcataatctaaaatcattcaatataatcatcattacaataacatttatgtccatcatttccataataatctaaatatcattcaataattaa 17658955  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactata 216  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||    
T  17658954 catacacttaatcatttttatacatttaatcatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactata 17658855  T
Q  217 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17658854 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtatgcaaagtataa 17658755  T
Q  317 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttc 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  17658754 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aaaccacattatgatttaaacaacataggccacaactacattcatttatcaataaataaactac 17658656  T
Q  417 acatgcaatcatcaaattgtcaatt 441  Q
    ||||||||| || ||||||||||||    
T  17658655 acatgcaatgatgaaattgtcaatt 17658631  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 28877375 - 28876923
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28877375 acatcatttccataacctgaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaa 28877276  T
Q  117 catacacttaatcatttctataca-cttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||| |||||||||||||||||||    
T  28877275 catacacttaatcatttctatacaactaaatcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaaaatacacttaaccaaactat 28877176  T
Q  216 aattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtata 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28877175 aattaacatcatttctatcatttccataacc-aaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacacttggtgtgcaaagtata 28877077  T
Q  316 aaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactt 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||     
T  28877076 aaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aacccacattatgatttaaacaatataggcaacaactacatttaattatcaatttctaaacta 28876978  T
Q  416 cacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||||||| ||||||    
T  28876977 cacatgcaatcatcaaattctcaattttgaattcaaccctaaccacatacaaact 28876923  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 118 - 470
Target Start/End: Original strand, 512214 - 512565
Alignment:
Q  118 atacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactataa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||        ||||||||||||||| |||||||||    
T  512214 atacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtatccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaactaaactataa 512313  T
Q  218 ttaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaa 317  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  512314 ttaacatcatttctataattttcataacctaaactaactaaataagcaatataattttcattgaggtatttgatcaaacactttgggtgcaaagtataaa 512413  T
Q  318 acatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttca 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  512414 acatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgatttaaacaacatagacaacaactacattcatttatcaattcataaactaca 512512  T
Q  418 catgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  512513 catgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaact 512565  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 144 - 470
Target Start/End: Original strand, 19228140 - 19228465
Alignment:
Q  144 aatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccata 243  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  19228140 aatcatttgtgtctatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaatcaaactataattaacatcatttttatcattttcata 19228239  T
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19228240 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattatgttcatttgcc 19228339  T
Q  344 accattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaatttt 443  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19228340 accattca-aagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaatttt 19228438  T
Q  444 aaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  19228439 aaaatcaaccctaaccacatgcaaact 19228465  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 201 - 470
Target Start/End: Original strand, 28241325 - 28241592
Alignment:
Q  201 acttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||||    
T  28241325 acttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcgaacactt 28241423  T
Q  301 tgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcattta 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  28241424 tgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattataatttaaactacataggcaacatctacattcattta 28241522  T
Q  401 tcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||     ||||| | ||||||||||||||||    
T  28241523 tcaatacataaactacacatgcaatgatgaaattgtcaattcatttataaaacctaaccacatgcaaact 28241592  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 247 - 470
Target Start/End: Original strand, 14260 - 14482
Alignment:
Q  247 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 346  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14260 taaactaactaaataatcaataaaattatcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 14359  T
Q  347 attcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaa 446  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  14360 attca-aagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacatttatttatcaattcctaaactacgcatgcaatcatcaaattttcaattttgaa 14458  T
Q  447 ataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    || |||| ||||||||| ||||||    
T  14459 atcaaccctaaccacatacaaact 14482  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 235 - 470
Target Start/End: Original strand, 40624473 - 40624716
Alignment:
Q  235 atttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgt 334  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40624473 attttcataatctaaactaactaaataatcaataaaattgttattaaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgt 40624572  T
Q  335 tcatttgccaccattcataagtcacatt----------atgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttcacatgcaa 424  Q
    ||||||| ||||||||| ||  ||||||          || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  40624573 tcatttgtcaccattca-aaaccacattatcattaaacatcatttaaacagcataggcaacaactacattcatttatcaattcataaaatacacatgcaa 40624671  T
Q  425 tcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  40624672 tcatcaaattgtcaattttaaaattaaccctaa-cacatgcaaact 40624716  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 235 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 20422463 - 20422219
Alignment:
Q  235 atttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  20422463 atttccataacctaaactaactaaataatcaaaataattgtcattggggcattttatcaaacactttgtgtgaaaagtatcaaacatattcaaaatgtgt 20422364  T
Q  335 tcatttgccaccattcataagtcacatt----------atgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttcacatgcaa 424  Q
    ||||||| ||||||| | || | |||||          || |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  20422363 tcatttggcaccatttaaaact-acattatactagaacatcatttaaataacatagacaacaactacattcatttatcaattcatacactacacatccaa 20422265  T
Q  425 tcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||||||||||||||||   | || |||| ||||||||||||||||    
T  20422264 tcatcaaattgtcaattcctacatcaaccctaaccacatgcaaact 20422219  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 140
Target Start/End: Original strand, 14136 - 14259
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14136 acatcatttccataacctaaaatcatttaatataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttcgataataacctaaacatcattcaataattaa 14235  T
Q  117 catacacttaatcatttctataca 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  14236 catacacttaatcatttctataca 14259  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 232 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 5197490 - 5197371
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 331  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  5197490 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 5197391  T
Q  332 tgttcatttgccaccattca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  5197390 tgttcttttgccaccattca 5197371  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 244 - 351
Target Start/End: Original strand, 19040685 - 19040792
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19040685 acctaaactaactaaataatcaataaatttgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 19040784  T
Q  344 accattca 351  Q
    ||||||||    
T  19040785 accattca 19040792  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 247 - 351
Target Start/End: Original strand, 27673224 - 27673328
Alignment:
Q  247 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 346  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  27673224 taaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaaatatcaaacatactcaaaatgtgttcttttgccacc 27673323  T
Q  347 attca 351  Q
    |||||    
T  27673324 attca 27673328  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 244 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 30705641 - 30705536
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||| ||||||| ||||||    
T  30705641 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaaatatcaaacatactaaaaatgtgttcttttgcc 30705542  T
Q  344 accatt 349  Q
    ||||||    
T  30705541 accatt 30705536  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 111
Target Start/End: Original strand, 40624389 - 40624470
Alignment:
Q  30 aacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaata 111  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||  || ||||||||||| ||||||||||    
T  40624389 aacctaaaaccattcaatataatcatcatttcaatataatttatgtgcatcatttctatcataacctaaacatcattcaata 40624470  T

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Target: chr6 (Bit Score: 371; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 470
Target Start/End: Original strand, 6319906 - 6320356
Alignment:
Q  19 atcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaaca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6319906 atcatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaaca 6320005  T
Q  119 tacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactataat 218  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||    
T  6320006 tacacttaattatttctatatacttaatcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataat 6320105  T
Q  219 taacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaa 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6320106 taacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacgctttgtgtgcaaagtataaaa 6320205  T
Q  319 catattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttcac 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6320206 catattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactacac 6320304  T
Q  419 atgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  6320305 atgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaact 6320356  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Original strand, 24088123 - 24088575
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24088123 acatcattttcataacctaaaatcattcaatataatcatcattactataaaatttgtgtcaatcatttccatcataacctaaacatcattcaataattaa 24088222  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactata 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||        |||||||||| ||| ||||||||     
T  24088223 catacactgaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacctaatcaaactatc 24088322  T
Q  217 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24088323 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgagacatttgatcaaacactttgtgtacaaagtataa 24088422  T
Q  317 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttc 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24088423 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatcatttaaacaacatagacaacaactacattcatttatcaattcataaactac 24088521  T
Q  417 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  24088522 acatgcaattatcaaattgtcaattttaaaatcaacactaaccacatgcaaact 24088575  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 31769438 - 31768981
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  31769438 acatcattttcataacctaaaatcattcaatataatcatcattataataaaatttatttccatcatttccataataacataaatatcattcaataattaa 31769339  T
Q  117 catacacttaatcatttctataca-cttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  31769338 catacacttaatcatttctatacaactaaatcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactat 31769239  T
Q  216 aattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtata 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31769238 aattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaataaatttgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtata 31769139  T
Q  316 aaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactt 415  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||      
T  31769138 aaacatattcaaattgtgttcttttgccaccattca-aaaccacattatgatttaaacaacataagcaacaactacattcatttgtcaattcctaaacca 31769040  T
Q  416 cacat----gcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||||    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  31769039 cacatgcaagcaatcatcaaattgtcgattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaact 31768981  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 247 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 21601106 - 21601002
Alignment:
Q  247 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21601106 taaactaactaaataatcaatataattctcatttgggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatattcaaattgtgttcatttgtcacc 21601007  T
Q  347 attca 351  Q
    |||||    
T  21601006 attca 21601002  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 232 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 24722445 - 24722326
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 331  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  24722445 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacgcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 24722346  T
Q  332 tgttcatttgccaccattca 351  Q
    ||||| |||| |||||||||    
T  24722345 tgttcttttgacaccattca 24722326  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 232 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 26423514 - 26423395
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 331  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  26423514 atcatatccataacataaactaactaaataaacaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 26423415  T
Q  332 tgttcatttgccaccattca 351  Q
    || || ||||||||||||||    
T  26423414 tgatcttttgccaccattca 26423395  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 232 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 3501686 - 3501567
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 331  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  3501686 atcatatccataacctaaactaactaaataaacaataaaattgtccttgaggcattttctcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 3501587  T
Q  332 tgttcatttgccaccattca 351  Q
    || || ||||||||||||||    
T  3501586 tgatcttttgccaccattca 3501567  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 208 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 3381313 - 3381082
Alignment:
Q  208 caaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgc 307  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||            ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  3381313 caaactataattaacatcattttaatcatttccataacataaactaattaaataatca------------ttgaggcattttatcaaccactttgtgtgc 3381226  T
Q  308 aaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtc---acatta-------tgattttaacaacataggcaacaactacattcat 397  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||   |||| |       | |||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3381225 aatatataaaacatattcaaattgtgttcatttgacaccattcatttatcaatacataaactacattcattgaaacagcataggcaacaactatattcat 3381126  T
Q  398 ttatcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaatt 441  Q
    | |||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  3381125 tcatcaatgcataaactacacatgcaatgatgaaattgtcaatt 3381082  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 244 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 6201653 - 6201550
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  6201653 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 6201554  T
Q  344 acca 347  Q
    ||||    
T  6201553 acca 6201550  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 244 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 11688620 - 11688517
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  11688620 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 11688521  T
Q  344 acca 347  Q
    ||||    
T  11688520 acca 11688517  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 244 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 22301685 - 22301578
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  22301685 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 22301586  T
Q  344 accattca 351  Q
    || |||||    
T  22301585 acaattca 22301578  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 244 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 27617220 - 27617113
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||| ||||||    
T  27617220 acctaaactaactaaataatcaataaatttgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtattcttttgcc 27617121  T
Q  344 accattca 351  Q
    ||||||||    
T  27617120 accattca 27617113  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 244 - 347
Target Start/End: Original strand, 30829220 - 30829323
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  30829220 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 30829319  T
Q  344 acca 347  Q
    ||||    
T  30829320 acca 30829323  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 386 - 466
Target Start/End: Original strand, 30424143 - 30424223
Alignment:
Q  386 aactacattcatttatcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgca 466  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||   | ||||||  ||||||||||||    
T  30424143 aactacattcatttatcaattcctaaactatacatgcaatcatcaaaatgtcaattcatacataaactctaaccacatgca 30424223  T

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Target: chr4 (Bit Score: 369; Significance: 0; HSPs: 39)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 51683934 - 51683482
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51683934 acatcatttccataacttaaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaa 51683835  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||    
T  51683834 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactata 51683735  T
Q  217 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51683734 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 51683635  T
Q  317 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttc 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  51683634 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgatttaaacaacatagacaacaactacattcatttatcaattcataaaatac 51683536  T
Q  417 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  51683535 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaact 51683482  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Original strand, 48255912 - 48256364
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48255912 acatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaa 48256011  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||    
T  48256012 catacacttaatcatttctatacacttaatcatctgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactata 48256111  T
Q  217 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48256112 attaacatcatttctatcatttccataacttaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 48256211  T
Q  317 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttc 416  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48256212 aacatattcaaattgttttcatttgccaccattca-aagccacattatgatttaaactacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactac 48256310  T
Q  417 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  48256311 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaattaaccctaaccacatgcaaact 48256364  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Original strand, 55407128 - 55407580
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  55407128 acatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatttatgtcaataatttccacaataacctaaacatcattcaataattaa 55407227  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||| ||||||||    
T  55407228 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaacgaaactata 55407327  T
Q  217 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  55407328 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcaatgaggcattcgatcaaacattttgtgtgcaaagtataa 55407427  T
Q  317 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttc 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55407428 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactac 55407526  T
Q  417 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  55407527 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaact 55407580  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Original strand, 21022229 - 21022681
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21022229 acatcatttccataacctaaaatcatttaatataatcatcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacatcattcaataattaa 21022328  T
Q  117 catacacttaatcatttctataca-cttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  21022329 catacacttaatcatttctatacaactaaatcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactat 21022428  T
Q  216 aattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtata 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21022429 aattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtata 21022527  T
Q  316 aaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactt 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  21022528 aaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcctaaacta 21022626  T
Q  416 cacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||    
T  21022627 cacatgcaatcatcaaattgtcaattttgaaatcaaccctaaccacatacaaact 21022681  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 50902211 - 50901760
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50902211 acattatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaa 50902112  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactata 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||    
T  50902111 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtctatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactata 50902012  T
Q  217 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  50902011 attaacatcatttctatcatttccataacttaaactaactaaa-aatcaataaaattgtcattgaaacattttatcaaacactttgtgtgcaaaatataa 50901913  T
Q  317 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttc 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  50901912 aacatattcaaattgtgttcatttaacaccattca-aagccacattatgaattaaacaacatagacaacaactacattcatttatcaattcctaaactac 50901814  T
Q  417 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  50901813 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgtaaact 50901760  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Original strand, 37021418 - 37021876
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37021418 acatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcattataataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacatcattcaataattaa 37021517  T
Q  117 catacacttaatcatttctataca-cttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaata-----tacacttaaccaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         ||||     |||||||||||||    
T  37021518 catacacttaatcatttctatacaactaaatcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaattaatataatatacacttaaccaa 37021617  T
Q  211 actataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaa 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  37021618 actataattaacatcatttctatcattttcataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaagcattttatcaaacactttgtgtgcaaa 37021717  T
Q  311 gtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcata 410  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37021718 gtataaaagatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgatttaaacaacatatgcaacaactacattcatttatcaattccta 37021816  T
Q  411 aacttcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||    
T  37021817 aactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaactctaaccacatacaaact 37021876  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Original strand, 40357621 - 40358073
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40357621 acatcatttcgataacctaaaatcatttaatataatcatcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacatcattcaataattaa 40357720  T
Q  117 catacacttaatcatttctataca-cttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||        ||| |||||||||||||||||||    
T  40357721 catacacttaatcatttctatacaactaaatcatttgtgtccatcataattctcgtaacttaaactaactaaaaaatcaaaatacacttaaccaaactat 40357820  T
Q  216 aattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtata 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  40357821 aattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacacttggtgtgcaaagtata 40357919  T
Q  316 aaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactt 415  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||     
T  40357920 aaacatattcaaactgtgttcatttgccaccattca-aatccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcaattatcaatttctaaacta 40358018  T
Q  416 cacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||    
T  40358019 cacatgcaatcatcaaattctcaattttgaaatcaaccctaaccacatacaaact 40358073  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 50275448 - 50275014
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  50275448 acatcatttccataacctaaaatcatttaatataatcaacattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcattatttaa 50275349  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactata 216  Q
    ||||||||||                  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||        ||||||||| ||||||||||||||    
T  50275348 catacactta------------------atcatttgtgtccatcataattctcgtaacctacactaactaaaaaatcaatatacatttaaccaaactata 50275267  T
Q  217 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  50275266 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactacataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagcataa 50275167  T
Q  317 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttc 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  50275166 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattctgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcctaaactac 50275068  T
Q  417 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  50275067 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaattaaccctaaccacatgcaaact 50275014  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 240 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 68100 - 67871
Alignment:
Q  240 cataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatt 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  68100 cataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttatgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatt 68001  T
Q  340 tgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaa 439  Q
    ||| |||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  68000 tgctaccattca-aagccacattatcatttaaacaacataggcaacaactacatttatttatcaattcataaactacacatgcaatcattaaattgtcaa 67902  T
Q  440 ttttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  67901 ttttaaaatcaaccctaaccacatgcaaact 67871  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 201 - 441
Target Start/End: Original strand, 30726267 - 30726505
Alignment:
Q  201 acttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactt 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  30726267 acttaaccaaagtataattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactt 30726365  T
Q  301 tgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcattta 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30726366 tgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgatttaaactacataggcaacaactacattcattta 30726464  T
Q  401 tcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaatt 441  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||| || ||||||||||||    
T  30726465 tcaatacataaactacacgtgcaatgatgaaattgtcaatt 30726505  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 201 - 470
Target Start/End: Original strand, 1089110 - 1089377
Alignment:
Q  201 acttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  1089110 acttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactt 1089208  T
Q  301 tgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcattta 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  1089209 tgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattattatttaaactacatatgcaacatctacattcattta 1089307  T
Q  401 tcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||| || ||||||||||||     ||||| | ||||||||||||||||    
T  1089308 tcaatacataaactacacttgcaatgatgaaattgtcaattcatttataaaacctaaccacatgcaaact 1089377  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 201 - 470
Target Start/End: Original strand, 1308640 - 1308907
Alignment:
Q  201 acttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||||    
T  1308640 acttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcgaacactt 1308738  T
Q  301 tgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcattta 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  1308739 tgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattataatttaaactacatatgcaacatctacattcattta 1308837  T
Q  401 tcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||     ||||| | ||||||||||||||||    
T  1308838 tcaatacataaactacacatgcaatgatgaaattgtcaattcatttataaaacctaaccacatgcaaact 1308907  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 240 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 46436753 - 46436536
Alignment:
Q  240 cataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatt 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46436753 cataacctaaactaactaaataatcaataaaattgccattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatt 46436654  T
Q  340 tgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaa 439  Q
    |||||||||||| ||  |||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46436653 tgccaccattcagaa-ccacaatatcatttaaacagcataagcaacaactacattcgtttattaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaa 46436555  T
Q  440 ttttaaaataaaccataac 458  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  46436554 ttttaaaattaaccctaac 46436536  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 68252 - 68085
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  68252 acatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcattattacaataaaatttgtgtccatcatttccatcataacctaaacatcattcaataattaa 68153  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaac 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  68152 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaac 68085  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 208 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 14315925 - 14315654
Alignment:
Q  208 caaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgc 307  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||| ||||    
T  14315925 caaactataattaacatcatttcaatcatttccataacctaaactaactcaataatcaatacaattttcatttgggcattttgtcaaacactttgcgtgc 14315826  T
Q  308 aaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacatt----------atgattttaacaacataggcaacaactacattcat 397  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||  ||||||          || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14315825 aaagtataaaacatactcaaaatgtgttcatttggcaccattca-aaaccacatttttattatacatcatttaaacaacataggcaacaactacattcat 14315727  T
Q  398 ttatcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||     ||||| | ||||||||||||||||    
T  14315726 ttatcaattcataaactacacatgcaatgatgaaattgtcaattcattcataaaacctaaccacatgcaaact 14315654  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 232 - 470
Target Start/End: Original strand, 21538008 - 21538255
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21538008 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattatcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacagattcaaattg 21538107  T
Q  332 tgttcatttgccaccattcataagtcacatt----------atgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttcacatg 421  Q
    |||||||||| || |||||| ||  ||||||          || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  21538108 tgttcatttggcatcattca-aaaccacattatcattaaacatcatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactacccatg 21538206  T
Q  422 caatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||  ||||||||||||||     ||||||| ||||||||||||||||    
T  21538207 caatgttcaaattgtcaattcattcataaaccctaaccacatgcaaact 21538255  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 193 - 351
Target Start/End: Original strand, 11050040 - 11050198
Alignment:
Q  193 caatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatc 292  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  11050040 caatatacactttatcaaactatcattaacatcctctccatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgatgcattttatc 11050139  T
Q  293 aaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca 351  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11050140 aaatactttgtgtgcaaagtatcaaacatattcaaattgtgttcatttggcaccattca 11050198  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 232 - 470
Target Start/End: Original strand, 10752983 - 10753230
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 331  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  10752983 atcatttcaataacctaaactaattaaataatcaatataattatcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatatttaaagag 10753082  T
Q  332 tgttcatttgccaccattcataagtcacatt----------atgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttcacatg 421  Q
    ||| |||||||||||||||| ||  ||||||          || |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10753083 tgtccatttgccaccattca-aaaccacattatcattaaacatcatttaaacagcataggcaacatctacattcatttatcaattcataaactacacatg 10753181  T
Q  422 caatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||  ||||||||||||||     ||||||| ||||||||||||||||    
T  10753182 caatgttcaaattgtcaattcattcataaaccctaaccacatgcaaact 10753230  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 232 - 470
Target Start/End: Original strand, 10966752 - 10966999
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 331  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  10966752 atcatttcaataacctaaactaattaaataatcaatataattatcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatatttaaagag 10966851  T
Q  332 tgttcatttgccaccattcataagtcacatt----------atgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttcacatg 421  Q
    ||| |||||||||||||||| ||  ||||||          || |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10966852 tgtccatttgccaccattca-aaaccacattatcattaaacatcatttaaacagcataggcaacatctacattcatttatcaattcataaactacacatg 10966950  T
Q  422 caatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||  ||||||||||||||     ||||||| ||||||||||||||||    
T  10966951 caatgttcaaattgtcaattcattcataaaccctaaccacatgcaaact 10966999  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 226 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 14297658 - 14297405
Alignment:
Q  226 atttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattc 325  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  14297658 atttcaatcatttccataacctaaactaactcaataatcaatacaattttcatttgggcattttgtcaaacactttgcgtgcaaagtataaaacatactc 14297559  T
Q  326 aaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacatt----------atgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactt 415  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||| ||  ||||||          || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14297558 aaaatgtgttcatttggcaccattca-aaaccacatttttattatacatcatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacta 14297460  T
Q  416 cacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||||||||| || ||||||||||||     ||||| | ||||||||||||||||    
T  14297459 cacatgcaatgatgaaattgtcaattcattcataaaacctaaccacatgcaaact 14297405  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 232 - 470
Target Start/End: Original strand, 11083562 - 11083809
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 331  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||    
T  11083562 atcattttcataacctaaactaactcaataatcagtacaattttcatttgggcattttgtcaaacactttgtgtgcaaagcatcaaacatactcaaaatg 11083661  T
Q  332 tgttcatttgccaccattcataagtcacatt----------atgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttcacatg 421  Q
    |||||||||| ||||||||| ||  ||||||          || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11083662 tgttcatttgacaccattca-aaaccacatttttattatacatcatttaaacagcataggcaacaactacattcatttatcaatacataaactacacatg 11083760  T
Q  422 caatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||| |||||||||||||||     ||||||| ||||||||||||||||    
T  11083761 caatgatcaaattgtcaattcattcataaaccctaaccacatgcaaact 11083809  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 232 - 351
Target Start/End: Original strand, 50023099 - 50023218
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 331  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  50023099 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 50023198  T
Q  332 tgttcatttgccaccattca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  50023199 tgttcttttgccaccattca 50023218  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 232 - 351
Target Start/End: Original strand, 41933179 - 41933298
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 331  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  41933179 atcatttccataatctaaactaactcaataatcaatataattttcattggggctttttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatattcaaataa 41933278  T
Q  332 tgttcatttgccaccattca 351  Q
    | |||||||| |||||||||    
T  41933279 tcttcatttgacaccattca 41933298  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 232 - 351
Target Start/End: Original strand, 50030217 - 50030336
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 331  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  50030217 atcatatccataacctaaactaactaaataatcagtaaaattgtcattgatgcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 50030316  T
Q  332 tgttcatttgccaccattca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  50030317 tgttcttttgccaccattca 50030336  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 244 - 351
Target Start/End: Original strand, 9892836 - 9892943
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  9892836 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttcttttgcc 9892935  T
Q  344 accattca 351  Q
    ||||||||    
T  9892936 accattca 9892943  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 244 - 351
Target Start/End: Original strand, 41798563 - 41798670
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | || || ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41798563 accttaactaactaaataatcaataaatttgtcgttgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgct 41798662  T
Q  344 accattca 351  Q
    ||||||||    
T  41798663 accattca 41798670  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 247 - 470
Target Start/End: Original strand, 4719949 - 4720161
Alignment:
Q  247 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 346  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||||    
T  4719949 taaactaagtaaataatcaatgcaattttcatttgggcattttgtcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatattctcattgtgttaatttgacacc 4720048  T
Q  347 attcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaa 446  Q
    ||||| || |||||||          | || ||  || ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | |     
T  4720049 attca-aaatcacatt----------ctacttaaacatcaattacattcatttaccaattcataaactacacacgcaatcatcaaaatgtcaattcttac 4720137  T
Q  447 ataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
     |||||| ||||||||||||||||    
T  4720138 gtaaaccctaaccacatgcaaact 4720161  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 240 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 30704532 - 30704421
Alignment:
Q  240 cataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatt 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||| ||    
T  30704532 cataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagatattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactaaaaatgtgttcttt 30704433  T
Q  340 tgccaccattca 351  Q
    | ||||||||||    
T  30704432 tcccaccattca 30704421  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 232 - 364
Target Start/End: Original strand, 44679631 - 44679762
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 331  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||    
T  44679631 atcatatctataacctaaactaactaaataatcaatgaaatggtcattgaaacattttatcaaacactttgtgtgcaaaatatcaaacatactcaaaatg 44679730  T
Q  332 tgttcatttgccaccattcataagtcacattat 364  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  44679731 tgttcttttgccaccattca-aaatcacattat 44679762  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 232 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 3184473 - 3184354
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 331  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  3184473 atcatatccataacccaaactaactaaataaaaaataaaattgtcattgaggcattttctcaaacactttgggtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 3184374  T
Q  332 tgttcatttgccaccattca 351  Q
    || || ||||||||||||||    
T  3184373 tgatcttttgccaccattca 3184354  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 232 - 351
Target Start/End: Original strand, 3185440 - 3185559
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 331  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  3185440 atcatatccataacccaaactaactaaataaaaaataaaattgtcattgaggcattttctcaaacactttgggtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 3185539  T
Q  332 tgttcatttgccaccattca 351  Q
    || || ||||||||||||||    
T  3185540 tgatcttttgccaccattca 3185559  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 232 - 351
Target Start/End: Original strand, 3185648 - 3185767
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 331  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  3185648 atcatatccataacccaaactaactaaataaaaaataaaattgtcattgaggcattttctcaaacactttgggtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 3185747  T
Q  332 tgttcatttgccaccattca 351  Q
    || || ||||||||||||||    
T  3185748 tgatcttttgccaccattca 3185767  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 244 - 347
Target Start/End: Original strand, 6181358 - 6181461
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  6181358 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 6181457  T
Q  344 acca 347  Q
    ||||    
T  6181458 acca 6181461  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 244 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 49090925 - 49090822
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  49090925 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 49090826  T
Q  344 acca 347  Q
    ||||    
T  49090825 acca 49090822  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 244 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 49165538 - 49165431
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  49165538 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaactatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 49165439  T
Q  344 accattca 351  Q
    ||||||||    
T  49165438 accattca 49165431  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 244 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 31422203 - 31422099
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgat-caaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgc 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  |||||    
T  31422203 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttattcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgc 31422104  T
Q  343 cacca 347  Q
    |||||    
T  31422103 cacca 31422099  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 243 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 50193985 - 50193893
Alignment:
Q  243 aacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 335  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  50193985 aacctaaactaagtaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttatgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgtt 50193893  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 100
Target Start/End: Original strand, 21537875 - 21537958
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  21537875 acatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcatttcaatataatttgtgtgcatcatttccatcataacctaaac 21537958  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 268
Target Start/End: Original strand, 21537947 - 21537975
Alignment:
Q  240 cataacctaaactaactaaataatcaata 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21537947 cataacctaaactaactaaataatcaata 21537975  T

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Target: chr1 (Bit Score: 362; Significance: 0; HSPs: 43)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 45825609 - 45825156
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45825609 acatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaa 45825510  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactata 216  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||        ||||||||||||||||||||||||    
T  45825509 catacacttaatcatttttatacatttaatcatttgtgtccatcataattctcgtaacttaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactata 45825410  T
Q  217 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgc-aaagtata 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45825409 attaacatcatttctatcatttccataacctaaattaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaaagtata 45825310  T
Q  316 aaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactt 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45825309 aaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacta 45825211  T
Q  416 cacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  45825210 cacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaact 45825156  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 51321445 - 51320994
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51321445 acatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaa 51321346  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactata 216  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||    
T  51321345 catacgcttaatcatttttatacacttaatcatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaac-taaaaatcaatatacacttaaccaaactata 51321247  T
Q  217 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51321246 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaaatataa 51321147  T
Q  317 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttc 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51321146 aacatattcaaattgtgttcatttgccactattca-aagtcacattatgatttaaacaatataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactac 51321048  T
Q  417 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  51321047 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaact 51320994  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Original strand, 35258219 - 35258666
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||     |||||||| |||||||||||||||    
T  35258219 acatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcattacaataaattttatgtccatcatttcca-----acctaaacatcattcaataattaa 35258313  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||        |||||||||||||| |||||||||    
T  35258314 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaatcaaactata 35258413  T
Q  217 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 316  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35258414 attaacatcatttctatcatttctataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 35258513  T
Q  317 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttc 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  35258514 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactaaattcatttatcaattcataaactac 35258612  T
Q  417 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  35258613 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaact 35258666  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Original strand, 31783068 - 31783521
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31783068 acatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaa 31783167  T
Q  117 catacacttaatcatttctataca-cttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  31783168 catacacttaatcatttctatacaactaaatcatttgtgtcaatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactat 31783267  T
Q  216 aattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtata 315  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31783268 aattaacatcatttatatcatttccataatctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtata 31783367  T
Q  316 aaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactt 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||     
T  31783368 aaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgatttaaagaacataggcaacaactacatttatttatcaattcctaaacta 31783466  T
Q  416 cacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  31783467 cacatacaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatacaaact 31783521  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 19 - 470
Target Start/End: Original strand, 19526886 - 19527336
Alignment:
Q  19 atcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaaca 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || || |||    
T  19526886 atcatttccataacttaaaatcattcaatataatcaacattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcattattttaca 19526985  T
Q  119 tacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactataat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||        |||||||||||||||||||||||||     
T  19526986 tacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattctcgtaacctacactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataac 19527085  T
Q  219 taacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaa 318  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||    
T  19527086 taacatcatttctatcattttcataacctaaattaactacataatcaataaaattgttattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaaacataaaa 19527185  T
Q  319 catattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttcac 418  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  19527186 catattcaaattgtgtccatttgccaccattca-aagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaaatacac 19527284  T
Q  419 atgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19527285 atgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccataaccacatgcaaact 19527336  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 52802864 - 52802411
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52802864 acatcatttccataacataaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatttatgtcaatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaa 52802765  T
Q  117 catacacttaatcatttctataca-cttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactat 215  Q
    || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  52802764 cacacacttaatcatttctatacaactaaatcatttgtgtctatcataattctcttaacctaaactaacaaaaaaatcaatatacacttaaccaaactat 52802665  T
Q  216 aattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtata 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52802664 aattaacatcatttctatcatttccatagcctaaactaactaaacaatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtata 52802565  T
Q  316 aaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactt 415  Q
    ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  52802564 aaagatattcaaattgtgttattttgccaccattca-aaatcacattatgacttaaacaacataagcaacaactacattcatttatcaattcttaaacta 52802466  T
Q  416 cacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  52802465 cacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaact 52802411  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Original strand, 23275463 - 23275897
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23275463 acatcatttccataacttaaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaa 23275562  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactata 216  Q
    ||||||||||                  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||    
T  23275563 catacactta------------------atcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactata 23275644  T
Q  217 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 316  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23275645 -ttaacatcatttctatcatttccataacttaaactgactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 23275743  T
Q  317 aacatattcaaattgtgttcatttgcca-ccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactt 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23275744 aacatattcaaattgtgttcatttgtcacccattca-aagtcacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacta 23275842  T
Q  416 cacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23275843 cacatgcaatcatcaaattgtcaatttaaaaatcaaccctaaccacatgcaaact 23275897  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 19 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 47503015 - 47502595
Alignment:
Q  19 atcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaaca 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  47503015 atcatttccataacataaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacttaaacatcattcaataattaaca 47502916  T
Q  119 tacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactataat 218  Q
    ||||||||                  ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||    
T  47502915 tacactta------------------atcatttgtctccatcataattcttgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataat 47502834  T
Q  219 taacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaa 318  Q
    |||||||||||||||         |||||   |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  47502833 taacatcatttctat---------aacct---ctaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttaccaaacactttgtgtgcaaagtataaaa 47502746  T
Q  319 catattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttcac 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  47502745 catattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcctaaattacac 47502647  T
Q  419 atgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  47502646 atgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaactctaaccacatgcaaact 47502595  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 193 - 470
Target Start/End: Original strand, 49857463 - 49857736
Alignment:
Q  193 caatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatc 292  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  49857463 caatatacacttaatcaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattt---ttgaggcatttgatc 49857559  T
Q  293 aaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactaca 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  49857560 aaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattctcatttaaacaacataggcaacaactaca 49857658  T
Q  393 ttcatttatcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||| || ||||| ||||||     ||||| | ||||||||||||||||    
T  49857659 ttcatttatcaaaacataaactacacatgcaatgataaaattatcaattcatttataaaacctaaccacatgcaaact 49857736  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 201 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 19925289 - 19925022
Alignment:
Q  201 acttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||||    
T  19925289 acttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcgaacactt 19925191  T
Q  301 tgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcattta 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  19925190 tgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattataatttaaactacataggcaacatctacattcattta 19925092  T
Q  401 tcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||     ||||| | ||||||||||||||||    
T  19925091 tcaatacataaactacacatgcaatgatgaaattgtcaattcatttataaaacctaaccacatgcaaact 19925022  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 201 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 30890608 - 30890341
Alignment:
Q  201 acttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||||    
T  30890608 acttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcgaacactt 30890510  T
Q  301 tgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcattta 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  30890509 tgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattataatttaaactacataggcaacatctacattcattta 30890411  T
Q  401 tcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||     ||||| | ||||||||||||||||    
T  30890410 tcaatacataaactacacatgcaatgatgaaattgtcaattcatttataaaacctaaccacatgcaaact 30890341  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 184
Target Start/End: Original strand, 19526699 - 19526864
Alignment:
Q  19 atcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaaca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  19526699 atcatttccataacctaaaatcattcaatataatcaacattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcattatttaaca 19526798  T
Q  119 tacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaac 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  19526799 tacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattctcgtaacctacactaac 19526864  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 184
Target Start/End: Original strand, 19525375 - 19525542
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  19525375 acatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcaacattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcattatttaa 19525474  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaac 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||    
T  19525475 catacacttaatcatttatatacacttaatcatttgtgtccaatataattctcgtaacctacactaac 19525542  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 184
Target Start/End: Original strand, 19526510 - 19526677
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  19526510 acatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcaacattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcattatttaa 19526609  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaac 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||    
T  19526610 catacacttaatcatttatatacacttaatcatttgtgtccaatataattctcgtaacctacactaac 19526677  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 184
Target Start/End: Original strand, 19524527 - 19524694
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| || ||||    
T  19524527 acatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcaacattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacataaacatcattcattatttaa 19524626  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaac 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||    
T  19524627 catacacttaatcatttatatacacttaatcatttgtgtccaatataattctcgtaacctacactaac 19524694  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 11196413 - 11196268
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11196413 acatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatttatgtccattagttccataataacctaaacatcattcaataattaa 11196314  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcat 162  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11196313 tatacacttaaacatttctatacacttaatcatttgtgtccatcat 11196268  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 184
Target Start/End: Original strand, 19524716 - 19524881
Alignment:
Q  19 atcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaaca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| || ||||||    
T  19524716 atcatttccataacctaaaatcattcaatataatcaacattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacataaacatcattcattatttaaca 19524815  T
Q  119 tacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaac 184  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||    
T  19524816 tacacttaatcatttatatacacttaatcatttgtgtccaatataattctcgtaacctacactaac 19524881  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 155
Target Start/End: Original strand, 19526036 - 19526174
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| || ||||    
T  19526036 acatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcaacattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacataaacatcattcattatttaa 19526135  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19526136 catacacttaatcatttctatacacttaatcattggtgt 19526174  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 155
Target Start/End: Original strand, 19524903 - 19525039
Alignment:
Q  19 atcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaaca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| || ||||||    
T  19524903 atcatttccataacctaaaatcattcaatataatcaacattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacataaacatcattcattatttaaca 19525002  T
Q  119 tacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19525003 tacacttaatcatttctatacacttaatcattggtgt 19525039  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 155
Target Start/End: Original strand, 19525564 - 19525700
Alignment:
Q  19 atcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaaca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| || ||||||    
T  19525564 atcatttccataacctaaaatcattcaatataatcaacattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacataaacatcattcattatttaaca 19525663  T
Q  119 tacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19525664 tacacttaatcatttctatacacttaatcattggtgt 19525700  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 133
Target Start/End: Original strand, 49857338 - 49857454
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  49857338 acatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcattgcaataaaatttatgtccaccatttccatcataacctaaacatcattcaataattaa 49857437  T
Q  117 catacacttaatcattt 133  Q
    |||||||||||||||||    
T  49857438 catacacttaatcattt 49857454  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 232 - 351
Target Start/End: Original strand, 50343525 - 50343644
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 331  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  50343525 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 50343624  T
Q  332 tgttcatttgccaccattca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  50343625 tgttcttttgccaccattca 50343644  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 232 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 21141544 - 21141425
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 331  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  21141544 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 21141445  T
Q  332 tgttcatttgccaccattca 351  Q
    || || ||||||||||||||    
T  21141444 tgatcttttgccaccattca 21141425  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 232 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 47656386 - 47656256
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 331  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  47656386 atcatatccataacc-aaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 47656288  T
Q  332 tgttcatttgccaccattcataagtcacattat 364  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  47656287 tgttcttttgccaccattca-aaatcacattat 47656256  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 109
Target Start/End: Original strand, 2424549 - 2424641
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  2424549 acatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatttatatccatcatttccataataacctaaacatcattcaa 2424641  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 247 - 468
Target Start/End: Original strand, 17514267 - 17514497
Alignment:
Q  247 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 346  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17514267 taaattaactaaataatcaatataatttttatttgggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagaatcaaacatattcaaattgtgttcatttggcacc 17514366  T
Q  347 attcataagtcacattatg----------attttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgt 436  Q
    ||||| ||  ||||||||           |||| |||| ||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||    
T  17514367 attcaaaac-cacattatacttatacatcatttaaacatcaattacaacaactatattcatttatcaattcataaactacacacgtaatcttcaaaatgt 17514465  T
Q  437 caattttaaaataaaccataaccacatgcaaa 468  Q
    |||||     ||||||| ||||||||||||||    
T  17514466 caattcatttataaaccctaaccacatgcaaa 17514497  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 358 - 470
Target Start/End: Original strand, 29622105 - 29622217
Alignment:
Q  358 acattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataa 457  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||    
T  29622105 acattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcaattatcaatttctaaactacacatgcaatcatcaaattctcaattttgaaatcaaccctaa 29622204  T
Q  458 ccacatgcaaact 470  Q
    |||||| ||||||    
T  29622205 ccacatacaaact 29622217  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 232 - 351
Target Start/End: Original strand, 97504 - 97623
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 331  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||    
T  97504 atcatatccataacctaaactaactaaataaacaataaaattatcattgaggcattttctcaaacactttgtgtacaaagtatcaaacatactcaaaatg 97603  T
Q  332 tgttcatttgccaccattca 351  Q
    || || ||||||||||||||    
T  97604 tgatcttttgccaccattca 97623  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 244 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 2365741 - 2365634
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  2365741 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttcttttgcc 2365642  T
Q  344 accattca 351  Q
    ||||||||    
T  2365641 accattca 2365634  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 232 - 350
Target Start/End: Original strand, 2424924 - 2425040
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 331  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2424924 atcatatccataacctaaactaaataaataatcaataaaattgttattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaac--attcaaattg 2425021  T
Q  332 tgttcatttgccaccattc 350  Q
    |||| ||||| | ||||||    
T  2425022 tgtttatttggctccattc 2425040  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 244 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 19156520 - 19156413
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  19156520 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttcttttgcc 19156421  T
Q  344 accattca 351  Q
    ||||||||    
T  19156420 accattca 19156413  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 232 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22524650 - 22524534
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 331  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  22524650 atcatatccatgatctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaac--attcaaatta 22524553  T
Q  332 tgttcatttgccaccattc 350  Q
    |||| ||||| | ||||||    
T  22524552 tgtttatttggctccattc 22524534  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 239 - 351
Target Start/End: Original strand, 38127045 - 38127158
Alignment:
Q  239 ccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtg-ttca 337  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||| ||      
T  38127045 ccataacctaaactaactaagtaatcaataaaattttcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactaaaaatgtgttttt 38127144  T
Q  338 tttgccaccattca 351  Q
    ||||||||||||||    
T  38127145 tttgccaccattca 38127158  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 382 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 11183549 - 11183461
Alignment:
Q  382 caacaactacattcatttatcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  11183549 caacaactacattaatttatcaattcataaactacacatgtaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaactctaaccacatgcaaact 11183461  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 386 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 11196244 - 11196160
Alignment:
Q  386 aactacattcatttatcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  11196244 aactacattaatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaaatgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaact 11196160  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 244 - 347
Target Start/End: Original strand, 3731949 - 3732052
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  3731949 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 3732048  T
Q  344 acca 347  Q
    ||||    
T  3732049 acca 3732052  T

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Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 244 - 351
Target Start/End: Original strand, 13639591 - 13639698
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  13639591 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 13639690  T
Q  344 accattca 351  Q
    || |||||    
T  13639691 acaattca 13639698  T

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Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 244 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 26876162 - 26876059
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  26876162 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 26876063  T
Q  344 acca 347  Q
    ||||    
T  26876062 acca 26876059  T

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Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 22524962 - 22524871
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  22524962 acatcatttc-ataacctaaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatttatatccaccatttccataataacctaaacattattcaa 22524871  T

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Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 22524460 - 22524407
Alignment:
Q  416 cacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaac 469  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  22524460 cacatgcaatcatcaaattatcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaac 22524407  T

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Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 8474259 - 8474187
Alignment:
Q  275 tcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacca 347  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||||||    
T  8474259 tcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgccacca 8474187  T

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Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 416 - 470
Target Start/End: Original strand, 2425114 - 2425168
Alignment:
Q  416 cacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||    
T  2425114 cacatgcaatcatcaaattatcaattttaaaatcaactctaaccacatacaaact 2425168  T

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Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 25167050 - 25166976
Alignment:
Q  248 aaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacata 322  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||  ||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  25167050 aaactaacaaaaaaatcaatgtaatcctcatttaggaattttatcaaacactttgagtgcaaagtatgaaacata 25166976  T

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Target: chr3 (Bit Score: 356; Significance: 0; HSPs: 42)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Original strand, 20917356 - 20917810
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20917356 acatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcattgcaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaa 20917455  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacac--ttaaccaaacta 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||  ||||||||||||    
T  20917456 catacacttaatcatttctgtacacttaatcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacacttaaccaaacta 20917555  T
Q  215 taattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtat 314  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917556 taattaacatcatttcaatcatttccataacttaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtat 20917655  T
Q  315 aaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaact 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917656 aaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaact 20917754  T
Q  415 tcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  20917755 atacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaact 20917810  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Original strand, 20926318 - 20926772
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20926318 acatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcattgcaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaa 20926417  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacac--ttaaccaaacta 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||  ||||||||||||    
T  20926418 catacacttaatcatttctgtacacttaatcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacacttaaccaaacta 20926517  T
Q  215 taattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtat 314  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20926518 taattaacatcatttcaatcatttccataacttaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtat 20926617  T
Q  315 aaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaact 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20926618 aaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaact 20926716  T
Q  415 tcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  20926717 atacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaact 20926772  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 42165895 - 42165442
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42165895 acatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaa 42165796  T
Q  117 catacacttaatcatttctataca-cttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  42165795 catacacttaatcatttctatacaactaaatcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactat 42165696  T
Q  216 aattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtata 315  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42165695 aattaacatcatttatatcatttccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtata 42165596  T
Q  316 aaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactt 415  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  42165595 aaatatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcctaaacta 42165497  T
Q  416 cacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  42165496 cacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatacaaact 42165442  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 42756883 - 42756433
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42756883 acatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacatcattcaataattaa 42756784  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactata 216  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||        |||||||||||||| |||||||||    
T  42756783 catacgcttaatcatttctatagacttaatcatttgcgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaatcaaactata 42756684  T
Q  217 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42756683 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaata--attttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 42756586  T
Q  317 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttc 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  42756585 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagcgacattatgatttaaacaacatagacaacaactacatccatttatcaattcataaactac 42756487  T
Q  417 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  42756486 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaact 42756433  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Original strand, 30255343 - 30255795
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30255343 acatcatttccataacctaaaatcattcgatataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaa 30255442  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||        |||||||||||||| |||||||||    
T  30255443 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaatcaaactata 30255542  T
Q  217 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 316  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30255543 attaacatcatttctatcatttccttaacctgaactaactaaataatcaatataaatttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 30255642  T
Q  317 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttc 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||      
T  30255643 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttagcaattcacaaactaa 30255741  T
Q  417 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  30255742 acatgcaatcatcaaattgtcaactttaaaatcaaccctaaccacatgcaaact 30255795  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 44230445 - 44229993
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44230445 acatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatttatgtccataatttccgtaataacctaaacatcattcaataattaa 44230346  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||    
T  44230345 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactata 44230246  T
Q  217 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  44230245 attaacatcatttctatcatttccataacctaaaccaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacacattgtgtgcaaagtataa 44230146  T
Q  317 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttc 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  44230145 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccgttca-aagccacattatgttttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcctaaactac 44230047  T
Q  417 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  44230046 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaact 44229993  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Original strand, 47073547 - 47074000
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47073547 acatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcattacaatagaatttatgtctatcattttcataataacctaaacatcattcaataattaa 47073646  T
Q  117 catacacttaatcatttctataca-cttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  47073647 catacacttaatcatttctatacaactaaatcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactat 47073746  T
Q  216 aattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtata 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47073747 aattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtata 47073846  T
Q  316 aaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactt 415  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  47073847 aaatatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgatttaaacaatataggcaacaactacattcatttatcaattcctaaacta 47073945  T
Q  416 cacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  47073946 cacatgcattcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatacaaact 47074000  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 48889466 - 48889023
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  48889466 acatcatttccataacctaaaataattcaatataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaactgcattcaataattaa 48889367  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||    
T  48889366 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactata 48889267  T
Q  217 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 316  Q
    ||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48889266 attaacatcatttc---------cataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcctttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 48889176  T
Q  317 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttc 416  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48889175 aacatattcaaattatgttcatttaccaccattca-aagtcacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactac 48889077  T
Q  417 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  48889076 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaact 48889023  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Original strand, 4007663 - 4008116
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4007663 acatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaa 4007762  T
Q  117 catacacttaatcatttctataca-cttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||        |||||||||||||| ||||||||    
T  4007763 catacacttaatcatttctatacaactaaatcatttgtgtccatcataattcttgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaatcaaactat 4007862  T
Q  216 aattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtata 315  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4007863 aattaacatcctttatatcatttccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtata 4007962  T
Q  316 aaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactt 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  4007963 aaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcctaaacta 4008061  T
Q  416 cacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  4008062 cacatgcaatcatcgaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatacaaact 4008116  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 3976439 - 3975986
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3976439 acatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatttatgtccaccatttccataataacctaaacatcattcaataattaa 3976340  T
Q  117 catacacttaatcatttctataca-cttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  3976339 catacacttaatcatttctatacaactaaatcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactat 3976240  T
Q  216 aattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtata 315  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3976239 aattaacatcctttatatcatttccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtata 3976140  T
Q  316 aaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactt 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||  ||||||     
T  3976139 aaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgatttaaactacataggcaacaactacattcaattgccaatttctaaacta 3976041  T
Q  416 cacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||    
T  3976040 cacatgcaatcatcaaattgtcaatttttaaatcaaccctaaccacatacaaact 3975986  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 17 - 431
Target Start/End: Original strand, 42805602 - 42806016
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  42805602 acatcattttcataacctaaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccatcataacctaaacatcattcaataattaa 42805701  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnn-caatatacacttaaccaaactat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||         |||||||||| ||| ||||||||    
T  42805702 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaaatcaatatacacctaatcaaactat 42805801  T
Q  216 aattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtata 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42805802 aattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacattttgtgtgcaaagtata 42805901  T
Q  316 aaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactt 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42805902 aaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatcatttaaacaacatagacaacaactacattcatttatcaattcataaacta 42806000  T
Q  416 cacatgcaatcatcaa 431  Q
     ||||||||| |||||    
T  42806001 tacatgcaattatcaa 42806016  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Original strand, 49195806 - 49196240
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  49195806 acatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattta 49195905  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactata 216  Q
    ||||||||||                  |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||        ||||||||| ||||||||||||||    
T  49195906 catacactta------------------atcatttgtgtccatcataattcttgtaagctaaactaactaaaaaatcaatatacaattaaccaaactata 49195987  T
Q  217 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 316  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49195988 attaacatcatttctatcattttcataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaagcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 49196087  T
Q  317 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttc 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  49196088 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactac 49196186  T
Q  417 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  49196187 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccttaaccacatgcaaact 49196240  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 50963690 - 50963234
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaata----a 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    |    
T  50963690 acatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatttatgtctatcatttccataataacctaaacatcattcaatatataa 50963591  T
Q  113 ttaacatacacttaatcatttctataca-cttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaa 211  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||    
T  50963590 ttaacgtacactcaatcatttctatacaactaaatcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaa 50963491  T
Q  212 ctataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaag 311  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  50963490 ctata-ttaacatcatttatatcatttccataacctaaactaactaaataatttataaaattgtcactgaggcattttatcaaacactttgtgtgtaaag 50963392  T
Q  312 tataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataa 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50963391 tataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcctaa 50963293  T
Q  412 acttcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  50963292 actacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatacaaact 50963234  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 48563659 - 48563223
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  48563659 acatcatttccataacttaaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatttatgcccatcattttcataataacataaacatcattcaataattaa 48563560  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactata 216  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||        ||||||||||||||||||||||||    
T  48563559 catacacttaatcatttctatgcacttaatcatttgtgtccatcataattcttgtaatctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactata 48563460  T
Q  217 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48563459 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacattttgtgtgcaaagtataa 48563360  T
Q  317 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttc 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||                |  ||||||||||||||| ||| |    
T  48563359 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagacacattatgatttaaacaac----------------tatatttatcaattcatagactac 48563277  T
Q  417 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  48563276 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccttaaccacatgcaaact 48563223  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 196 - 470
Target Start/End: Original strand, 50216398 - 50216671
Alignment:
Q  196 tatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaa 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||    
T  50216398 tatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaaccacataatcaataaaattgtcattgaagcattttatcaaa 50216497  T
Q  296 cactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattc 395  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50216498 cactttgtgtgcaaagcataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aaaccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattc 50216596  T
Q  396 atttatcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  50216597 atttatcaattcctaaattacacatgcaatcatcaaattatcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaact 50216671  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 241 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 597266 - 597038
Alignment:
Q  241 ataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcattt 340  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||    
T  597266 ataacctaagctaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacataatcaaaatgtgttctttt 597167  T
Q  341 gccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaat 440  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  597166 gccaccattca-aagccacattatgatttaaacaacatgggcaacaactacattcatttatcaattcctaaactacacatgcaatcatcaaattgtcaat 597068  T
Q  441 tttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
     || |||| |||| ||||||||||||||||    
T  597067 atttaaatcaaccctaaccacatgcaaact 597038  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 261 - 470
Target Start/End: Original strand, 3501477 - 3501685
Alignment:
Q  261 aatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcaca 360  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  3501477 aatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aacccaca 3501575  T
Q  361 ttatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataacca 460  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||    
T  3501576 ttatgatttaaacaacataggcaacaactacattcaattatcaatttctaaactacacatgcaatcatcaaattctcaattttgaaatcaaccctaacca 3501675  T
Q  461 catgcaaact 470  Q
    ||| ||||||    
T  3501676 catacaaact 3501685  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 184
Target Start/End: Original strand, 49268609 - 49268776
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  49268609 acatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcattacaatttaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcatccaataattaa 49268708  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaac 184  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49268709 catacacataatcatttctatacacttaatcatttgcgtccatcataattctcgtaacctaaactaac 49268776  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 305 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 51807413 - 51807249
Alignment:
Q  305 tgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaa 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51807413 tgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgatttaaacaacatagacaacaactacattcatttatcaa 51807315  T
Q  405 ttcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  51807314 tttctaaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaatcataaccacatgcaaact 51807249  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 232 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 16611594 - 16611475
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 331  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  16611594 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 16611495  T
Q  332 tgttcatttgccaccattca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  16611494 tgttcttttgccaccattca 16611475  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 232 - 351
Target Start/End: Original strand, 22047659 - 22047778
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 331  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  22047659 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 22047758  T
Q  332 tgttcatttgccaccattca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  22047759 tgttcttttgccaccattca 22047778  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 231 - 349
Target Start/End: Original strand, 17567619 - 17567737
Alignment:
Q  231 tatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaatt 330  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  17567619 tatcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaat 17567718  T
Q  331 gtgttcatttgccaccatt 349  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  17567719 gtgttcttttgccaccatt 17567737  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 145
Target Start/End: Original strand, 50216281 - 50216408
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||  | ||||    
T  50216281 acatcatttccataaccttaaatcattcaatataatcaacat-acaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacattattcatcatttaa 50216379  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaa 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50216380 catacacttaatcatttctatacacttaa 50216408  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 232 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 41612884 - 41612765
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 331  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  41612884 atcatatccataaactaaactaactagataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 41612785  T
Q  332 tgttcatttgccaccattca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  41612784 tgttcttttgccaccattca 41612765  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 597633 - 597541
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  597633 acatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatttatatccatcatttccataataacctaaacatcattcaa 597541  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 232 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 20351161 - 20351042
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggca-tttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaatt 330  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  20351161 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttaatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaa-t 20351063  T
Q  331 gtgttcatttgccaccattca 351  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  20351062 gtgttcttttgccaccattca 20351042  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 244 - 351
Target Start/End: Original strand, 52390964 - 52391071
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  52390964 acctaaactaactaaataatcaataaatttgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatattcaaattgtgttattttgcc 52391063  T
Q  344 accattca 351  Q
    ||||||||    
T  52391064 accattca 52391071  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 244 - 351
Target Start/End: Original strand, 2274482 - 2274589
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| ||    
T  2274482 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttcttttccc 2274581  T
Q  344 accattca 351  Q
    ||||||||    
T  2274582 accattca 2274589  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 244 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 29009364 - 29009257
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  29009364 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 29009265  T
Q  344 accattca 351  Q
    ||||||||    
T  29009264 accattca 29009257  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 247 - 470
Target Start/End: Original strand, 31045165 - 31045386
Alignment:
Q  247 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 346  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||| |||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| ||||    
T  31045165 taaactaactaaataataaatgcaattctcattttggcattttgtcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatattcacattgtgttattttgacacc 31045264  T
Q  347 attcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaa 446  Q
    ||||| ||  |||||| | | || |||| ||    ||  |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||         
T  31045265 attca-aaaccacatt-ttacttaaacatcaattacattaactacattcgtttatcaatttataaactacacatgcaatcatcaaaatgtcaattcattc 31045362  T
Q  447 ataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  31045363 ataaaccctaaccacatgcaaact 31045386  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 232 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 36127953 - 36127834
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 331  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  36127953 atcatatccatagcctaaactaaccaaataatcaagaaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 36127854  T
Q  332 tgttcatttgccaccattca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  36127853 tgttcttttgccaccattca 36127834  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 244 - 347
Target Start/End: Original strand, 42903758 - 42903861
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  42903758 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 42903857  T
Q  344 acca 347  Q
    ||||    
T  42903858 acca 42903861  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 244 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 46389466 - 46389363
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  46389466 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 46389367  T
Q  344 acca 347  Q
    ||||    
T  46389366 acca 46389363  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 244 - 347
Target Start/End: Original strand, 50480352 - 50480455
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  50480352 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 50480451  T
Q  344 acca 347  Q
    ||||    
T  50480452 acca 50480455  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 244 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 54386628 - 54386525
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  54386628 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 54386529  T
Q  344 acca 347  Q
    ||||    
T  54386528 acca 54386525  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 247 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 4178305 - 4178201
Alignment:
Q  247 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 346  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| | |||||||| ||||    
T  4178305 taaactaactaaataatcaataaaattttcatttgggcattttgtcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaaagtattcaaattatcttcatttgacacc 4178206  T
Q  347 attca 351  Q
    |||||    
T  4178205 attca 4178201  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 244 - 347
Target Start/End: Original strand, 49144031 - 49144133
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||||||    
T  49144031 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaa-atattcaaaatgtgttattttgcc 49144129  T
Q  344 acca 347  Q
    ||||    
T  49144130 acca 49144133  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 244 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 34045880 - 34045778
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||  ||||||    
T  34045880 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaa-atactcaaaatgtgttattttgcc 34045782  T
Q  344 acca 347  Q
    ||||    
T  34045781 acca 34045778  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 244 - 347
Target Start/End: Original strand, 46701593 - 46701696
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| ||  ||||||    
T  46701593 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatgctcaaaatgtcttattttgcc 46701692  T
Q  344 acca 347  Q
    ||||    
T  46701693 acca 46701696  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 247 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 4172307 - 4172203
Alignment:
Q  247 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 346  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||| | |||||||  ||||    
T  4172307 taaactaactaaataatcaataaaattctcatttgggcattttgtcaaacactttttgtgcaaagtatcaaaagtattcaaattatcttcatttaacacc 4172208  T
Q  347 attca 351  Q
    |||||    
T  4172207 attca 4172203  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 54682042 - 54681976
Alignment:
Q  144 aatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||    
T  54682042 aatcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaa 54681976  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 54682101 - 54682060
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcat 58  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  54682101 acattatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcat 54682060  T

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Target: chr7 (Bit Score: 353; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 36978330 - 36977878
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36978330 acatcattttcataacctaaaatcattcaacataatcatcattacaataaaaattatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaa 36978231  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactata 216  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||    
T  36978230 tatacacttaatcatttctatacacttaatcatctgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactata 36978131  T
Q  217 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36978130 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 36978031  T
Q  317 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttc 416  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36978030 aacatattcaaattatgttcatttaccaccattca-aagtcacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactac 36977932  T
Q  417 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  36977931 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaact 36977878  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Original strand, 9494137 - 9494588
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
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T  9494137 acatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaa 9494236  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||        |||||||||||||| |||||||||    
T  9494237 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaatcaaactata 9494336  T
Q  217 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 316  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9494337 attaacatcatttctatcatt-ccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgacgcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 9494435  T
Q  317 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttc 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  9494436 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaattac 9494534  T
Q  417 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  9494535 acatgcaaccatcaaattttcaattttaaaatcaacccaaaccacatgcaaact 9494588  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 47777066 - 47776614
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47777066 acatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaa 47776967  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||| ||||||    
T  47776966 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgttcatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccagactata 47776867  T
Q  217 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47776866 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaataaatttgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 47776767  T
Q  317 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttc 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  47776766 aacatattcaaattgtgttcatttgtcaccattca-aagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcctaaactac 47776668  T
Q  417 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  47776667 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaact 47776614  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 37341036 - 37340584
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37341036 acatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaa 37340937  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactata 216  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||         ||||||| |||||||||||||||    
T  37340936 catacacttaatcatttctacacacttaatcatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaacaaattaatatactcttaaccaaactata 37340837  T
Q  217 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37340836 attaacagcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 37340737  T
Q  317 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttc 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  37340736 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgatttaaacaacataggcaacaagtacattcatttttcaattcataaactac 37340638  T
Q  417 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||    
T  37340637 acatgaaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaatcctaaccacatccaaact 37340584  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 17835809 - 17835356
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||| |||    
T  17835809 acatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaatattattcaataaataa 17835710  T
Q  117 catacacttaatcatttctataca-cttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  17835709 catacacttaatcatttctatacaactaaatcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactat 17835610  T
Q  216 aattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtata 315  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17835609 aattaacatcatttatatcatttccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtata 17835510  T
Q  316 aaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactt 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  17835509 aaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcctaaacta 17835411  T
Q  416 cacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  17835410 cacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccttaaccacatacaaact 17835356  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Original strand, 27452960 - 27453412
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27452960 acatcatttccataaccaaaaatcattcaatataatcatcattaaaataaaatttatgttcatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaa 27453059  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||    
T  27453060 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactata 27453159  T
Q  217 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27453160 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactgactaaataatcaataaaattgtcaatgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 27453259  T
Q  317 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttc 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  27453260 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgatttaaacaacataggtaacaactacattcatttatcaattcctaaactac 27453358  T
Q  417 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||    
T  27453359 acatgcaatcatcaaattgtcaattttgaaatcaactctaaccacatgcaaact 27453412  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Original strand, 47672436 - 47672878
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||          ||| |||||||||||||||    
T  47672436 acatcatttccataacctaaaatcattaaatataatcatcattacaataaaatttatgttcatcatttcca----------aacatcattcaataattaa 47672525  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactata 216  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||        |||||||||||||| |||||||||    
T  47672526 catacacttaatcatttctatatacttaatcatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactagaaaatcaatatacacttaatcaaactata 47672625  T
Q  217 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47672626 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 47672725  T
Q  317 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttc 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |      
T  47672726 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcatagattat 47672824  T
Q  417 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  47672825 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaact 47672878  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 12 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 34739101 - 34738646
Alignment:
Q  12 gatggacatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaata 111  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  34739101 gatgaacatcatttccataacctaa--tcattcaatataatcaatattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacatcattcatta 34739004  T
Q  112 attaacatacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaa 211  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||        |||||||||||||| ||||    
T  34739003 tttaacatacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattctcgtaacttacactaactaaaaaatcaatatacacttaatcaaa 34738904  T
Q  212 ctataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaag 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  34738903 ctataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactacataatcaataaaattgtcatcgagacattttatcaaacactttgtgagcaaag 34738804  T
Q  312 tataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataa 411  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34738803 cataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgatttaaacaacataggtaacaactacattcatttatcaattcctaa 34738705  T
Q  412 acttcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  34738704 actacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaact 34738646  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 17 - 441
Target Start/End: Original strand, 14689406 - 14689822
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14689406 acatcatttccataacctcaaatcaatcaatataatcatcattacaataacatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaa 14689505  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |       |||| |||||||||        |||||||||||||||||||| |||    
T  14689506 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccattaca-------taacataaactaactaaataatcaatatacacttaaccaaacaata 14689598  T
Q  217 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14689599 attaacatcatttttatcatttccataacataaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtatgcaaagtataa 14689698  T
Q  317 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttc 416  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||  ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  14689699 aagatattcaaattgtgtttatttgccactattca-aagctacattatcatttaaacaacatagacaacaactacattcatttatcaataaataaactac 14689797  T
Q  417 acatgcaatcatcaaattgtcaatt 441  Q
    ||||||||| || ||||||||||||    
T  14689798 acatgcaatgatgaaattgtcaatt 14689822  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 136 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 39461141 - 39460808
Alignment:
Q  136 atacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39461141 atacacttaatcatttgtgtccatcataattcttgtaacctaaactaactaaaacatcaatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctacca 39461042  T
Q  236 tttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 335  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39461041 tatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 39460942  T
Q  336 catttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattg 435  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39460941 catttgccaccattca-aagccacattatgatttaaacaaaataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattg 39460843  T
Q  436 tcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  39460842 tcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaact 39460808  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 193 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 10517536 - 10517260
Alignment:
Q  193 caatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatc 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||    
T  10517536 caatatacacttaaccaaactataattaacatcatttatatcatttccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatc 10517437  T
Q  293 aaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactaca 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10517436 aaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactaca 10517338  T
Q  393 ttcatttatcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  10517337 ttcatttatcaattcctaaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatacaaact 10517260  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 201 - 470
Target Start/End: Original strand, 15073754 - 15074021
Alignment:
Q  201 acttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  15073754 acttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactt 15073852  T
Q  301 tgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcattta 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15073853 tgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgatttaaactacataggcaacaactacattcattta 15073951  T
Q  401 tcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||     ||||| | ||||||||||||||||    
T  15073952 tcaatacataaactacacatgcaatgatgaaattgtcaattcatttataaaacctaaccacatgcaaact 15074021  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 201 - 470
Target Start/End: Original strand, 42507553 - 42507820
Alignment:
Q  201 acttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  42507553 acttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactt 42507651  T
Q  301 tgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcattta 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42507652 tgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgatttaaactacataggcaacaactacattcattta 42507750  T
Q  401 tcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| || ||||||| ||||     ||||| | ||||||||||||||||    
T  42507751 tcaatacataaactacacatgcaatgatgaaattgttaattcatttataaaacctaaccacatgcaaact 42507820  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 247 - 470
Target Start/End: Original strand, 17741019 - 17741251
Alignment:
Q  247 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  17741019 taaactaactaaataatcaatataattctcatttgggaattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatattcaaattgtgttcatatggcacc 17741118  T
Q  347 attcataagtcacatt----------atgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgt 436  Q
    ||||| ||  ||||||          || |||| || | ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  17741119 attca-aaaccacattatacttaaacatcatttaaatatcaattacaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcttcaaaatgt 17741217  T
Q  437 caattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||||     ||||||| ||||||||||||||||    
T  17741218 caattcattcataaaccctaaccacatgcaaact 17741251  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 232 - 351
Target Start/End: Original strand, 5541096 - 5541215
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 331  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |     
T  5541096 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacaatttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaata 5541195  T
Q  332 tgttcatttgccaccattca 351  Q
    || || ||||||||||||||    
T  5541196 tgatcttttgccaccattca 5541215  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 235 - 351
Target Start/End: Original strand, 556205 - 556321
Alignment:
Q  235 atttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgt 334  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||    
T  556205 attttcataacataaactaactaaataataaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtatgcaaagtatcaaacatactcaaaatatgt 556304  T
Q  335 tcatttgccaccattca 351  Q
    |||||||||||||||||    
T  556305 tcatttgccaccattca 556321  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 232 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 16675303 - 16675186
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 331  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  16675303 atcatatccataacctaaactaacaaaataatcaataaaattgtcattgagacattttattaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 16675204  T
Q  332 tgttcatttgccaccatt 349  Q
    | ||| ||||||||||||    
T  16675203 tattcttttgccaccatt 16675186  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 232 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 17649671 - 17649554
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 331  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  17649671 atcatatccataacctaaactaacaaaataatcaataaaattgtcattgagacattttattaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 17649572  T
Q  332 tgttcatttgccaccatt 349  Q
    | ||| ||||||||||||    
T  17649571 tattcttttgccaccatt 17649554  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 232 - 364
Target Start/End: Original strand, 46740103 - 46740234
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 331  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  46740103 atcatatccatgacctaaactaattaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaatcactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 46740202  T
Q  332 tgttcatttgccaccattcataagtcacattat 364  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  46740203 tgttcttttgccaccattca-aaatcacattat 46740234  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 244 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 41880995 - 41880888
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  41880995 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 41880896  T
Q  344 accattca 351  Q
    ||||||||    
T  41880895 accattca 41880888  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 244 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 48403862 - 48403755
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  48403862 acctaaactaactaaataatcaataaaattatcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 48403763  T
Q  344 accattca 351  Q
    ||||||||    
T  48403762 accattca 48403755  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 244 - 347
Target Start/End: Original strand, 35609984 - 35610087
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  35609984 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 35610083  T
Q  344 acca 347  Q
    ||||    
T  35610084 acca 35610087  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 10517624 - 10517546
Alignment:
Q  20 tcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10517624 tcatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcatttcaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaa 10517546  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 244 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 45257492 - 45257401
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgtt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  45257492 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgtt 45257401  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 244 - 314
Target Start/End: Original strand, 9370958 - 9371028
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9370958 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtat 9371028  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 39461182 - 39461126
Alignment:
Q  77 catcattttcataataacctaaacctcattcaataattaacatacacttaatcattt 133  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39461182 catcatttccataataacctaaatatcattcaataattaacatacacttaatcattt 39461126  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 284 - 351
Target Start/End: Original strand, 17465329 - 17465396
Alignment:
Q  284 catttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  17465329 cattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgccaccattca 17465396  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 284 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 17587885 - 17587818
Alignment:
Q  284 catttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  17587885 cattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgccaccattca 17587818  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 111
Target Start/End: Original strand, 556121 - 556202
Alignment:
Q  30 aacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaata 111  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| || ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  556121 aacctaaaatcattcaatataatcatcatttcaatataatttgtgtgcaacatttccatcataacctaaacatcattcaata 556202  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 281
Target Start/End: Original strand, 17462862 - 17462899
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattga 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  17462862 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattga 17462899  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 17590352 - 17590315
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattga 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  17590352 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattga 17590315  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 41734610 - 41734561
Alignment:
Q  302 gtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca 351  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  41734610 gtgtgcaaagtatcaaacatactaaaaatgtgttcttttgccaccattca 41734561  T

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Target: chr8 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Original strand, 34822357 - 34822810
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34822357 acatcattttcataacctaaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacatcattcaataattaa 34822456  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnn-caatatacacttaaccaaactat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||    
T  34822457 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaaatcaatatacacttaaccaaactat 34822556  T
Q  216 aattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtata 315  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34822557 aattaatatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcagagtata 34822656  T
Q  316 aaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactt 415  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   |||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34822657 aaacatatttaaattgtgttcatttgcagtcattca-aagccacattatgatttaaccaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacta 34822755  T
Q  416 cacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  34822756 cacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaact 34822810  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 43212238 - 43211785
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  43212238 acatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacttaaacatcattcaataattaa 43212139  T
Q  117 catacacttaatcatttctataca-cttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  43212138 catacacttaatcatttctatacaactaaatcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactat 43212039  T
Q  216 aattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtata 315  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43212038 aattaacatcatttatatcatttccttaacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtata 43211939  T
Q  316 aaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactt 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  43211938 aaacatattcaaattgtgttcatttcccaccattca-aagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcctaaacta 43211840  T
Q  416 cacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||    
T  43211839 cacatgcaatcatcgaattgtcaattttaaaatcaaccctaagcacatacaaact 43211785  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 43188781 - 43188329
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43188781 acatcattttcataacctaaaatcattcaaaataatcatcattacaataaaatttatgttcatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaa 43188682  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||| |||||||||    
T  43188681 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtttccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaatcaaactata 43188582  T
Q  217 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  43188581 attaacatcatttatatcatttccataacataaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaaacattttatcaaacactttgtatgcaaagtataa 43188482  T
Q  317 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttc 416  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  43188481 aacatattcaaatcgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgatttaaacaacatagacaacaactacattcatttattaattcctaaactac 43188383  T
Q  417 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43188382 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccataaccacatgcaaact 43188329  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Original strand, 40076600 - 40077043
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  40076600 acatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacttaaacatcattcaataattaa 40076699  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactata 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||    
T  40076700 catacacttaatcatttctatacacttaattatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactata 40076799  T
Q  217 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 316  Q
    |||| |||||||||| |         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40076800 attatcatcatttctgt---------aacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaattataa 40076890  T
Q  317 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttc 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40076891 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgatttaaacaacataggcaacagctacattcatttatcaattcataaactac 40076989  T
Q  417 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  40076990 acatataatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaact 40077043  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 17 - 469
Target Start/End: Original strand, 15036068 - 15036520
Alignment:
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T  15036068 acatcatttccataacctaaaatcatttaatataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttcgataataacctaaacatcattcaataattaa 15036167  T
Q  117 catacacttaatcatttctataca-cttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  15036168 catacacttaatcatttctatacaactaaatcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactat 15036267  T
Q  216 aattaaca-tcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtat 314  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15036268 aattaaccctaatttctatcatttccataac-taaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtat 15036366  T
Q  315 aaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaact 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  15036367 aaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcctgaact 15036465  T
Q  415 tcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaac 469  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||    
T  15036466 acacatgcaatcatcaaattgtcaattttgaaatcaaccctaaccacatacaaac 15036520  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Original strand, 39846340 - 39846779
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39846340 acatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatgtatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaa 39846439  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactata 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||        ||||||||||||||||||||||||    
T  39846440 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatca-------------ctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactata 39846526  T
Q  217 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  39846527 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcatggagacagtttatcaaacactttgtgtacaaagtataa 39846626  T
Q  317 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttc 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  39846627 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcctaaactac 39846725  T
Q  417 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  39846726 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaact 39846779  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Original strand, 39938558 - 39939009
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  39938558 acatcatttccataacctaaattcattcaatataatcaacattacaataaaatttatttccatcatttccataataacctaaacatcattcattaattaa 39938657  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactata 216  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||        |||||||||||||| |||||||||    
T  39938658 cacacacttaatcatttctatac-cttaatcatttgtgtccatcataattctcgtaacctacactaactaaaaaatcaatatacacttaatcaaactata 39938756  T
Q  217 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  39938757 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactacataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaatactttgtgtgcaaagtataa 39938856  T
Q  317 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttc 416  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  39938857 aacttattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccccattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcctaaactat 39938955  T
Q  417 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  39938956 acatgtaatcatcaaattatcaattttaaaatcaaccctaaccacatgtaaact 39939009  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 17 - 466
Target Start/End: Original strand, 5303580 - 5304010
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  5303580 acatcatttccgtaacttaaaatcattcaatttaatcatcattacaataacatttatgtccatcatttccataataacctaaacatctttcaataattaa 5303679  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactata 216  Q
    ||||||||||                  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||    
T  5303680 catacactta------------------atcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactata 5303761  T
Q  217 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5303762 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 5303861  T
Q  317 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttc 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5303862 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgatttaaacaacatagacaacaactacattcatttatcaattcataaactac 5303960  T
Q  417 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgca 466  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  5303961 acatgcaatcatgaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgca 5304010  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 39252734 - 39252292
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39252734 acatcatttccataacctaaaatcatt-aatataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaa 39252636  T
Q  117 catacacttaatcatttctataca-cttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactat 215  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||| ||||||||||    
T  39252635 catacacttgatcatttctatacaactaaatcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttgaccaaactat 39252536  T
Q  216 aattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtata 315  Q
    |||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39252535 aattaacatcatttc---------cataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtata 39252445  T
Q  316 aaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactt 415  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  39252444 aaacatattcaaattgtattcatttgccaccattca-aagccacattatgatttaaacaacatatgcaacaactacattcatttattaattcctaaacta 39252346  T
Q  416 cacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  39252345 cacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaacc-taaccacatacaaact 39252292  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 45064963 - 45064521
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45064963 acatcatttccataacctaaaatcatttaatataatcatcattacaataaaatttatgtctatcattttcataataacctaaacatcattcaataattaa 45064864  T
Q  117 catacacttaatcatttctatac-acttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||        ||| |||||||||||||||||||    
T  45064863 catacacttaatcatttctatacaactaaatcatttgtgtccatcataattctcctaacctaaactaactaaaaaatcaaaatacacttaaccaaactat 45064764  T
Q  216 aattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtata 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||          
T  45064763 aattaacatcatttctatcatttccataa-ctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaa------ 45064671  T
Q  316 aaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactt 415  Q
        | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||     
T  45064670 ----aaattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattaagatttaaacaacataggcaacaactacattcaattatcaatttctaaacta 45064576  T
Q  416 cacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||    
T  45064575 cacatgcaatcatcaaattgtcaattttgaaatcaaccctaaccacatacaaact 45064521  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Original strand, 41249448 - 41249866
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  41249448 acatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcactcattaattaa 41249547  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactata 216  Q
    ||||||||||                  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||        |||||||||||||| |||||||||    
T  41249548 catacactta------------------atcatttgtgtccatcataattctcgtaacctacactaactaaaaaatcaatatacacttaatcaaactata 41249629  T
Q  217 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||| |                |||||||||||||    
T  41249630 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactacataatcaataaaattgtcattgcggcaat----------------gtgcaaagtataa 41249713  T
Q  317 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttc 416  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  41249714 agcatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcctaaactac 41249812  T
Q  417 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  41249813 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatctaccctaaccacatgcaaact 41249866  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 208 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 39602256 - 39601995
Alignment:
Q  208 caaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgc 307  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39602256 caaaatataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgc 39602157  T
Q  308 aaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39602156 aaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattc 39602058  T
Q  408 ataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  39602057 ctaaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatacaaact 39601995  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 201 - 441
Target Start/End: Original strand, 489155 - 489393
Alignment:
Q  201 acttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||||    
T  489155 acttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcgaacactt 489253  T
Q  301 tgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcattta 400  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  489254 tgtgtgcaaagtataaaacatatttaaattgtgttcatttgcaaccattca-aagccacattataatttaaactacataggcaacatctacattcattta 489352  T
Q  401 tcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaatt 441  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  489353 tcaatacataaactacacatgcaatgatgaaattgtcaatt 489393  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 223 - 470
Target Start/End: Original strand, 42485086 - 42485331
Alignment:
Q  223 atcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacata 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42485086 atcatttctatcatttccataac-taaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcgaacactttgtgtgcaaagtataaaacata 42485184  T
Q  323 ttcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttcacatgc 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  42485185 ttcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattataatttaaactacataggcaacatctacattcatttatcaatacataaactacacatgc 42485283  T
Q  423 aatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||| || ||||||||||||     ||||| | ||||||||||||||||    
T  42485284 aatgatgaaattgtcaattcatttataaaacctaaccacatgcaaact 42485331  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 232 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 24249999 - 24249763
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 331  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  24249999 atcatttccataacctaaactgactaaataatcaatataattctcattggggcattttatcaaatactttatgtgcaaagtatcaaacatattcaaaatg 24249900  T
Q  332 tgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttcacatgcaatcatcaa 431  Q
    || ||||||| ||||||||| ||  |||||||| | || |||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24249899 tgctcatttgacaccattca-aaaccacattat-acttaaacatcaattacaacaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaa 24249802  T
Q  432 attgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||||||||   | || |||| ||||||||||||||||    
T  24249801 attgtcaattcctatatcaaccctaaccacatgcaaact 24249763  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 193 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 2984678 - 2984402
Alignment:
Q  193 caatatacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatc 292  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  2984678 caatatacactttatcaaactataattaacatcattttcatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattgtcgttgaggcattttatc 2984579  T
Q  293 aaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacat--aggcaacaacta 390  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || |||||| ||  |||||||| | || || | |||  |   | ||| ||    
T  2984578 aaacactttgtgtgcaaagtatgaaacttattcaaattgtgtttatttggcatcattca-aaaccacattat-acttaaaaatcattcaaagatcaatta 2984481  T
Q  391 cattcatttatcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||||| ||| |  || | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  2984480 cattcatctataacatc-ttaacaacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaact 2984402  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 240 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 37327292 - 37327084
Alignment:
Q  240 cataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatt 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37327292 cataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatt 37327193  T
Q  340 tgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaa 439  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||                    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37327192 tgccaccattca-aaatcacattatcatt--------------------tacattcatttatcaattcataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaa 37327114  T
Q  440 ttttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  37327113 ttttaaaattaaccctaa-cacatgcaaact 37327084  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 357 - 470
Target Start/End: Original strand, 25864620 - 25864732
Alignment:
Q  357 cacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccata 456  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  25864620 cacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcat-aactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaacccta 25864718  T
Q  457 accacatgcaaact 470  Q
    ||||||||||||||    
T  25864719 accacatgcaaact 25864732  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 232 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 35552182 - 35552063
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 331  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  35552182 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 35552083  T
Q  332 tgttcatttgccaccattca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  35552082 tgttcttttgccaccattca 35552063  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 232 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 20857802 - 20857683
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 331  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  20857802 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacaatttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 20857703  T
Q  332 tgttcatttgccaccattca 351  Q
    ||||| ||||| ||||||||    
T  20857702 tgttcttttgcaaccattca 20857683  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 237 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 45128261 - 45128147
Alignment:
Q  237 ttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttc 336  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  45128261 ttccataacctaaactaactcaataatcaatacaattcacattggggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaacgtgttc 45128162  T
Q  337 atttgccaccattca 351  Q
     ||||||||||||||    
T  45128161 ttttgccaccattca 45128147  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 244 - 347
Target Start/End: Original strand, 25095 - 25198
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  25095 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 25194  T
Q  344 acca 347  Q
    ||||    
T  25195 acca 25198  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 244 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1053029 - 1052926
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  1053029 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgatacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 1052930  T
Q  344 acca 347  Q
    ||||    
T  1052929 acca 1052926  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 232 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 5677587 - 5677468
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 331  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||  || ||||||| ||||| ||    
T  5677587 atcatttccataacctaaacttactcgataatcaatataattttcattggggcattttatcaaacactttctgtgcaaaacatcaaacatactcaaaatg 5677488  T
Q  332 tgttcatttgccaccattca 351  Q
    | ||| ||||| ||||||||    
T  5677487 tattcttttgctaccattca 5677468  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 244 - 347
Target Start/End: Original strand, 23021889 - 23021992
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  23021889 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 23021988  T
Q  344 acca 347  Q
    ||||    
T  23021989 acca 23021992  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 244 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 26659951 - 26659848
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  26659951 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 26659852  T
Q  344 acca 347  Q
    ||||    
T  26659851 acca 26659848  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 232 - 335
Target Start/End: Original strand, 34371450 - 34371553
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 331  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  34371450 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaaaaaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 34371549  T
Q  332 tgtt 335  Q
    ||||    
T  34371550 tgtt 34371553  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 2984811 - 2984721
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattc 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  2984811 acatcatttccataacctaaaaccattccatataatcatcatttcaatataatttgtgtgcatcatttccatcataacctaaacatcattc 2984721  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 39602320 - 39602271
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataa 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  39602320 acatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcattacaataa 39602271  T

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Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 385 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 22495272 - 22495216
Alignment:
Q  385 caactacattcatttatcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaatt 441  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22495272 caactacattcatttatcaattcgtaaactacacatgcaaccatcaaaatgtcaatt 22495216  T

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Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 247 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 22495419 - 22495315
Alignment:
Q  247 taaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacc 346  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||||| |||||| |   | |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||||    
T  22495419 taaactaagtaaataatcaatgcaattttcatttgggcattttatcaaaaaacatttgtgcaaagtatcaaacatattctcattgtgttaatttgacacc 22495320  T
Q  347 attca 351  Q
    |||||    
T  22495319 attca 22495315  T

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Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 407 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 35026786 - 35026740
Alignment:
Q  407 cataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaacc 453  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35026786 cataaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaacc 35026740  T

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Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 267
Target Start/End: Original strand, 34370133 - 34370168
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaat 267  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34370133 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaat 34370168  T

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Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 240 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 2984709 - 2984681
Alignment:
Q  240 cataacctaaactaactaaataatcaata 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2984709 cataacctaaactaactaaataatcaata 2984681  T

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Target: chr2 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 26)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 39948332 - 39947880
Alignment:
Q  18 catcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaac 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39948332 catcatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatttatatccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaac 39948233  T
Q  118 atacacttaatcatttctataca-cttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactata 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||    
T  39948232 atacacttaatcatttctatacaactaaatcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactata 39948133  T
Q  217 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39948132 attaacatcatttatatcatttccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 39948033  T
Q  317 aacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttc 416  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  39948032 aacatattcaaattgtgttcttttgccaccattca-aagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcctaaactac 39947934  T
Q  417 acatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  39947933 acatgcaatcatcgaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatacaaact 39947880  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 28469373 - 28468921
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28469373 acatcatttccataacctaaaatcatttaatataatcatcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacatcattcaataattaa 28469274  T
Q  117 catacacttaatcatttctataca-cttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||| |||||||||||||||||||    
T  28469273 catacacttaatcatttctatacaactaaatcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaaaatacacttaaccaaactat 28469174  T
Q  216 aattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtata 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28469173 aattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtata 28469075  T
Q  316 aaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactt 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||     
T  28469074 aaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgatttaaacaacataggcaacaattacattcaattatcaatttctaaacta 28468976  T
Q  416 cacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  28468975 cacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatacaaact 28468921  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 45429323 - 45428871
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45429323 acatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaa 45429224  T
Q  117 catacacttaatcatttctataca-cttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  45429223 catacacttaatcatttctatacaactaaatcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacacttaaccaaactat 45429124  T
Q  216 aattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtata 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45429123 aattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtata 45429025  T
Q  316 aaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactt 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||     
T  45429024 aaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgatttaaactacgtaggcaacaactacattcaattatcaatttctaaacta 45428926  T
Q  416 cacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||| ||||||    
T  45428925 cacatgcaatcatcaaattgtcattttttaaatcaaccctaaccacatacaaact 45428871  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 17 - 470
Target Start/End: Original strand, 32955699 - 32956147
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32955699 acatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaa 32955798  T
Q  117 catacacttaatcatttctataca-cttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||| |||||||||    
T  32955799 catacacttaatcatttctatacaactaaatcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacactta-ccaaactat 32955897  T
Q  216 aattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtata 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  32955898 aattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaa----attgtcattgaggcattttatcaaacactttgcgtgcaaagtata 32955993  T
Q  316 aaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactt 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||     
T  32955994 aaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattataatttaaacaacataggcaacaagtacattcatttatcaattcctaaacta 32956092  T
Q  416 cacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||    
T  32956093 cacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaacccaaaccacatacaaact 32956147  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 340
Target Start/End: Original strand, 45136645 - 45136956
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45136645 acatcatttccata-cctaaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaa 45136743  T
Q  117 catacacttaatcatttctatacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactata 216  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||||||    
T  45136744 catacacttaatcatttatatacacttaatcatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaatatacatttaaccaaactata 45136843  T
Q  217 attaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45136844 attaacatcatttctatcatttccataacctaaacta-----------aataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataa 45136932  T
Q  317 aacatattcaaattgtgttcattt 340  Q
    || ||||| |||||||||||||||    
T  45136933 aatatatttaaattgtgttcattt 45136956  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 201 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 21998737 - 21998470
Alignment:
Q  201 acttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  21998737 acttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactt 21998639  T
Q  301 tgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcattta 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||| |||    
T  21998638 tgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgatttaaacaacatagacaacaaataaattcaatta 21998540  T
Q  401 tcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  21998539 tcaattactaaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatacaaact 21998470  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 201 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 17421114 - 17420847
Alignment:
Q  201 acttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  17421114 acttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataac-taaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactt 17421016  T
Q  301 tgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcattta 400  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  17421015 gatgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aacccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcaatga 17420917  T
Q  401 tcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  17420916 tcaatttctaaactacacatgcaatcatcaaattctcaattttgaaatcaaccctaaccacatgcaaact 17420847  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22687111 - 22686863
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  22687111 acatcatttccataacctaaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatttatgtctatcattttcataataacctaaacatcattcaataatcaa 22687012  T
Q  117 catacacttaatcatttctatac-acttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnncaatatacacttaaccaaactat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||| |||||||||||||||||||    
T  22687011 catacacttaatcatttctatacaactaaataatttgtgtccatcataattctcgtaacctaaactaactaaaaaatcaaaatacacttaaccaaactat 22686912  T
Q  216 aattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatca 265  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22686911 aattaacatcatttctaccatttccataa-ctaaactaactaaataatca 22686863  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 261 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 25965308 - 25965100
Alignment:
Q  261 aatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcaca 360  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  25965308 aatcaataaaattatcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaacattca-aagccaca 25965210  T
Q  361 ttatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataacca 460  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  25965209 ttatgatttaaacaacataggaaacaactacattcatttatcaattcctaaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaacca 25965110  T
Q  461 catgcaaact 470  Q
    ||||||||||    
T  25965109 catgcaaact 25965100  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 297 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 7185481 - 7185309
Alignment:
Q  297 actttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattca 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7185481 actttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattca 7185383  T
Q  397 tttatcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  7185382 tttatcaattcctaaacaacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatacaaact 7185309  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 357 - 470
Target Start/End: Original strand, 45137112 - 45137225
Alignment:
Q  357 cacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccata 456  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  45137112 cacattatgatttaaataacataggcaagaactacattcatttatcaattcctaaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaacctta 45137211  T
Q  457 accacatgcaaact 470  Q
    ||||||||||||||    
T  45137212 accacatgcaaact 45137225  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 232 - 351
Target Start/End: Original strand, 25515366 - 25515484
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  25515366 atcatttccataacctaaactaactcaataatcaatataattctcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaatcg 25515465  T
Q  332 tgttcatttgccaccattca 351  Q
    || || ||||||||||||||    
T  25515466 tgctc-tttgccaccattca 25515484  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 232 - 351
Target Start/End: Original strand, 29401160 - 29401279
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 331  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  29401160 atcatatccataagctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 29401259  T
Q  332 tgttcatttgccaccattca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  29401260 tgttcttttgccaccattca 29401279  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 232 - 349
Target Start/End: Original strand, 36655906 - 36656023
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 331  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  36655906 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaatgttcattgagacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 36656005  T
Q  332 tgttcatttgccaccatt 349  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  36656006 tgttcttttgccaccatt 36656023  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 238 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 45284683 - 45284570
Alignment:
Q  238 tccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttca 337  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||     
T  45284683 tccataatctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagccattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatacttaaaatgtgttct 45284584  T
Q  338 tttgccaccattca 351  Q
    ||||||||||||||    
T  45284583 tttgccaccattca 45284570  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 238 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 45292046 - 45291933
Alignment:
Q  238 tccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttca 337  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||     
T  45292046 tccataatctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagccattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatacttaaaatgtgttct 45291947  T
Q  338 tttgccaccattca 351  Q
    ||||||||||||||    
T  45291946 tttgccaccattca 45291933  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 232 - 351
Target Start/End: Original strand, 10828581 - 10828700
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 331  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||    
T  10828581 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgagacattttatcaaacactttgtgtccaaagtatcaaacatactcaaaatg 10828680  T
Q  332 tgttcatttgccaccattca 351  Q
     |||| |||||||| |||||    
T  10828681 cgttcttttgccacaattca 10828700  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 244 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 20938401 - 20938294
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  20938401 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttcttttgcc 20938302  T
Q  344 accattca 351  Q
    ||||||||    
T  20938301 accattca 20938294  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 244 - 347
Target Start/End: Original strand, 3940297 - 3940400
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  3940297 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 3940396  T
Q  344 acca 347  Q
    ||||    
T  3940397 acca 3940400  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 244 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 5352470 - 5352367
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  5352470 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 5352371  T
Q  344 acca 347  Q
    ||||    
T  5352370 acca 5352367  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 244 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 15831633 - 15831526
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  15831633 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaagactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 15831534  T
Q  344 accattca 351  Q
    ||||||||    
T  15831533 accattca 15831526  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 244 - 347
Target Start/End: Original strand, 30496515 - 30496618
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  30496515 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 30496614  T
Q  344 acca 347  Q
    ||||    
T  30496615 acca 30496618  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 244 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 43979025 - 43978922
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  43979025 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaacactttgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 43978926  T
Q  344 acca 347  Q
    ||||    
T  43978925 acca 43978922  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 244 - 347
Target Start/End: Original strand, 43539306 - 43539409
Alignment:
Q  244 acctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgcc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||    
T  43539306 acctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgacacattttatcaaaaacattgtgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatgtgttattttgcc 43539405  T
Q  344 acca 347  Q
    ||||    
T  43539406 acca 43539409  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 386 - 470
Target Start/End: Original strand, 35464313 - 35464397
Alignment:
Q  386 aactacattcatttatcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||   | ||||| | ||||||||||||||||    
T  35464313 aactacattcatttataaattcataaactacacatgcaatcatcagaatgtcaattcatacataaatcctaaccacatgcaaact 35464397  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 382 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 31367397 - 31367309
Alignment:
Q  382 caacaactacattcatttatcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||| | ||||||   | || |||| ||||||||||||||||    
T  31367397 caacaaataaattcatttataaattcataaactatatatgcaatcatcaaaatatcaattcctacatcaaccctaaccacatgcaaact 31367309  T

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Target: scaffold0180 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 470
Target Start/End: Original strand, 14966 - 15416
Alignment:
Q  21 catttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaacata 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14966 catttccataacctaaaatcattcaatataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttccataataacctaaacatcattcaataattaacata 15065  T
Q  121 cacttaatcatttctataca-cttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaaccnnnnnnn-caatatacacttaaccaaactataat 218  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||    
T  15066 cacttaatcatttctatacaactaaatcatttgtgtccatcataattcttgtaacctaaactaaccaaaaaaatcaatatacacttaaccaaactataat 15165  T
Q  219 taacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaa 318  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15166 taacatcatttatatcatttccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaa 15265  T
Q  319 catattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttcac 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  15266 catattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgatttaaacaacataggcaataactacattcatttatcaatttctaaactacac 15364  T
Q  419 atgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  15365 atgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatacaaact 15416  T

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Target: scaffold0293 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 197 - 470
Target Start/End: Original strand, 250 - 521
Alignment:
Q  197 atacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaac 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||| |||||||    
T  250 atacacttaaccaaactataattaacatcatttctatcattttcataac-taaactaactaaataattaataaaattgtcattgagacattttatcaaac 348  T
Q  297 actttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattca 396  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  349 acgttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccaccattca-aagccacattatgatttaaactacataggcaacaactacattca 447  T
Q  397 tttatcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
     |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||    
T  448 attatcaatttctaaactacacatgcaatcatcaaattgtcaattttgaaatcaaccctaaccacatacaaact 521  T

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Target: scaffold0634 (Bit Score: 165; Significance: 5e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 242 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 7925 - 7698
Alignment:
Q  242 taacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttg 341  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7925 taacctaaactaactaaaaaatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaatactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttg 7826  T
Q  342 ccaccattcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaatt 441  Q
    ||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7825 ccatcattca-aagccacattatgatttaaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcctaaactacacatgcaatcatcaaattgtcaatt 7727  T
Q  442 ttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    || |||| |||| ||||||||| ||||||    
T  7726 ttgaaatcaaccctaaccacatacaaact 7698  T

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Target: scaffold0634; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 38 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 8059 - 7912
Alignment:
Q  38 atcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaacatacacttaatcatttctat 137  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8059 atcatttaatataatcatcattacaataaaatttatgtccatcatttcgataataacctaaacatcattcaataattaacatacacttaatcatttctat 7960  T
Q  138 ac-acttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaac 184  Q
    || ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  7959 acaactaaatcatttgtgtccataataattctcgtaacctaaactaac 7912  T

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Target: scaffold0238 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0238
Description:

Target: scaffold0238; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 232 - 351
Target Start/End: Original strand, 18489 - 18608
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 331  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  18489 atcatatccataacctaaactaactaaataatcaataaaattgtcattgaggcattttatcaaacactttgcgtgcaaagtatcaaacatactcaaaatg 18588  T
Q  332 tgttcatttgccaccattca 351  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  18589 tgttcttttgccaccattca 18608  T

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Target: scaffold0155 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 4)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 371 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 8582 - 8483
Alignment:
Q  371 aacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  8582 aacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaactatacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaatcaaccctaaccacatgcaaact 8483  T

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Target: scaffold0155; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 240 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10863 - 10761
Alignment:
Q  240 cataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatt 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10863 cataacctaaactaactaaataatcaatataattgtcattgagacattttttcaaacactttgtgtgtaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatt 10764  T
Q  340 tgc 342  Q
    |||    
T  10763 tgc 10761  T

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Target: scaffold0155; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 10988 - 10881
Alignment:
Q  17 acatcatttccataacctaaaatcattgaatataatcctcattacaataaaatttatgtccatcattttcataataacctaaacctcattcaataattaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||         |||| |||||| |||||||||||||||    
T  10988 acatcatttccataacctaaaaccattcagtataatcatcattacaatatagtttgtgtccatc---------ataatctaaacatcattcaataattaa 10898  T
Q  117 catacacttaatcattt 133  Q
    |||||||||||| ||||    
T  10897 catacacttaattattt 10881  T

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Target: scaffold0155; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 10896 - 10848
Alignment:
Q  136 atacacttaatcatttgtgtccatcataattcccgtaacctaaactaac 184  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  10896 atacacttaattatttgtgtccatcataattctcataacctaaactaac 10848  T

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Target: scaffold0877 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 232 - 349
Target Start/End: Original strand, 4210 - 4327
Alignment:
Q  232 atcatttccataacctaaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattg 331  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||| ||    
T  4210 atcattttcataccctaaactaactcaataatcaatataattctcattggggcactttatcaaacactttgtgtgcaaaacatcaaacatactcaaaatg 4309  T
Q  332 tgttcatttgccaccatt 349  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  4310 tgttcttttgccaccatt 4327  T

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Target: scaffold0007 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 248 - 470
Target Start/End: Original strand, 251048 - 251268
Alignment:
Q  248 aaactaactaaataatcaatataattttcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatattcaaattgtgttcatttgccacca 347  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||   ||||||  |||| |||||| |||| ||| ||| ||||||||||  |||||||| ||||| |||||    
T  251048 aaactaagtaaataatcaatgcaattttcatttgagcattttgtcaatcactttatgtgtaaaatatcaaacatattcttattgtgttaatttgacacca 251147  T
Q  348 ttcataagtcacattatgattttaacaacataggcaacaactacattcatttatcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaa 447  Q
    |||| ||  |||||| |  ||  |||| ||    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||   |      
T  251148 ttcaaaac-cacattcttctta-aacatcaattacatcaactacattcatttatcaattcataaactacacatgcaattatcaaaatgccaattcatacg 251245  T
Q  448 taaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||||| |||||| |||||||||    
T  251246 taaaccctaaccatatgcaaact 251268  T

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Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 246228 - 246180
Alignment:
Q  275 tcattgaggcatttgatcaaacactttgtgtgcaaagtataaaacatat 323  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  246228 tcatttaggcattttatcaaacactttgggtgcaaagtataaaacatat 246180  T

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Target: scaffold0101 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 388 - 470
Target Start/End: Original strand, 40746 - 40828
Alignment:
Q  388 ctacattcatttatcaattcataaacttcacatgcaatcatcaaattgtcaattttaaaataaaccataaccacatgcaaact 470  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||     ||||| | ||||||||||||||||    
T  40746 ctacattcatttatcaatacataaactacacatgcaatgatgaaattgtcaattcatttataaaacctaaccacatgcaaact 40828  T

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