View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11453A_low_611 (Length: 224)

Name: NF11453A_low_611
Description: NF11453A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11453A_low_611
NF11453A_low_611
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (2-215)||(31891537-31891750)
chr2 (2-216)||(34156829-34157043)
chr2 (2-216)||(34303512-34303726)
chr2 (1-216)||(27118506-27118721)
chr2 (2-216)||(3784472-3784686)
chr2 (2-216)||(16163417-16163631)
chr2 (1-207)||(21703372-21703578)
chr2 (4-207)||(19456632-19456835)
chr2 (1-192)||(27434652-27434846)
chr2 (1-192)||(23128774-23128968)
chr2 (63-211)||(27392813-27392961)
chr2 (2-165)||(28882080-28882246)
chr2 (2-192)||(12655381-12655574)
chr2 (2-183)||(20837766-20837950)
chr2 (2-165)||(13936753-13936919)
chr2 (2-165)||(34279315-34279481)
chr2 (2-165)||(37925359-37925525)
chr2 (2-162)||(34286223-34286386)
chr2 (2-162)||(34291283-34291446)
chr2 (89-165)||(11635488-11635564)
chr2 (89-165)||(11641677-11641753)
chr2 (89-165)||(21677481-21677557)
chr2 (2-165)||(32049664-32049830)
chr2 (34-165)||(261009-261140)
chr2 (1-165)||(16829546-16829713)
chr2 (1-165)||(16891768-16891935)
chr2 (101-168)||(37375024-37375091)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (4-216)||(2880-3092)
[»] chr1 (5 HSPs)
chr1 (4-216)||(20340557-20340769)
chr1 (63-207)||(20460935-20461079)
chr1 (1-172)||(16208250-16208418)
chr1 (4-54)||(28151845-28151895)
chr1 (89-165)||(41793618-41793694)
[»] chr4 (23 HSPs)
chr4 (4-207)||(15227716-15227919)
chr4 (2-216)||(24460825-24461039)
chr4 (4-207)||(1900103-1900306)
chr4 (4-207)||(15285150-15285353)
chr4 (1-207)||(14235744-14235953)
chr4 (1-210)||(24592533-24592742)
chr4 (1-210)||(14664858-14665070)
chr4 (1-210)||(34189179-34189388)
chr4 (4-211)||(15391560-15391764)
chr4 (1-209)||(24112506-24112714)
chr4 (1-183)||(17013867-17014052)
chr4 (1-165)||(6569738-6569905)
chr4 (2-168)||(14763524-14763693)
chr4 (1-168)||(36344734-36344901)
chr4 (1-210)||(14098381-14098593)
chr4 (1-165)||(21969586-21969753)
chr4 (1-210)||(54833230-54833439)
chr4 (89-165)||(5005755-5005831)
chr4 (2-165)||(27163537-27163703)
chr4 (1-210)||(31126737-31126949)
chr4 (109-210)||(19373101-19373202)
chr4 (89-165)||(18800932-18801008)
chr4 (89-165)||(30753627-30753703)
[»] chr8 (19 HSPs)
chr8 (2-216)||(9354444-9354658)
chr8 (2-216)||(19659218-19659432)
chr8 (4-216)||(44562923-44563135)
chr8 (1-192)||(16283292-16283486)
chr8 (2-165)||(14557497-14557660)
chr8 (2-192)||(16277397-16277590)
chr8 (1-165)||(27609083-27609250)
chr8 (1-192)||(2137437-2137631)
chr8 (4-211)||(22081059-22081263)
chr8 (1-210)||(18710411-18710623)
chr8 (1-210)||(19687923-19688135)
chr8 (89-165)||(19674308-19674384)
chr8 (2-54)||(33244649-33244701)
chr8 (1-210)||(19286290-19286499)
chr8 (89-210)||(31490019-31490140)
chr8 (2-165)||(31354394-31354560)
chr8 (89-165)||(3329788-3329864)
chr8 (89-165)||(19518412-19518488)
chr8 (89-165)||(29829183-29829259)
[»] chr7 (26 HSPs)
chr7 (2-216)||(31088570-31088784)
chr7 (2-216)||(45733283-45733497)
chr7 (1-207)||(16041155-16041361)
chr7 (4-207)||(16450106-16450309)
chr7 (1-192)||(16503485-16503679)
chr7 (1-192)||(16518521-16518715)
chr7 (1-165)||(10916973-10917137)
chr7 (1-210)||(5127818-5128030)
chr7 (1-210)||(5159348-5159557)
chr7 (2-165)||(11424882-11425048)
chr7 (1-168)||(26435125-26435295)
chr7 (2-168)||(5147446-5147615)
chr7 (4-54)||(2109113-2109163)
chr7 (4-54)||(26484679-26484729)
chr7 (89-165)||(2154444-2154520)
chr7 (89-165)||(16736656-16736732)
chr7 (89-165)||(16751710-16751786)
chr7 (89-165)||(17523403-17523479)
chr7 (89-165)||(17529736-17529812)
chr7 (4-54)||(18540784-18540834)
chr7 (4-54)||(39211131-39211181)
chr7 (2-165)||(4145229-4145395)
chr7 (4-54)||(2775344-2775394)
chr7 (89-165)||(11441431-11441507)
chr7 (89-165)||(45387214-45387290)
chr7 (2-165)||(26319975-26320141)
[»] chr6 (37 HSPs)
chr6 (2-216)||(13522236-13522450)
chr6 (2-216)||(33374419-33374633)
chr6 (2-215)||(28162477-28162690)
chr6 (2-216)||(8892473-8892687)
chr6 (2-216)||(8903708-8903922)
chr6 (4-207)||(22477438-22477644)
chr6 (2-168)||(20160568-20160734)
chr6 (2-168)||(22172097-22172263)
chr6 (2-192)||(22935043-22935233)
chr6 (2-192)||(23857488-23857678)
chr6 (2-210)||(24304781-24304992)
chr6 (2-192)||(13299114-13299307)
chr6 (1-210)||(29549300-29549509)
chr6 (1-192)||(15424479-15424673)
chr6 (2-165)||(16749721-16749887)
chr6 (2-165)||(26988868-26989034)
chr6 (1-165)||(26999940-27000107)
chr6 (1-192)||(24863557-24863751)
chr6 (4-78)||(22457099-22457176)
chr6 (34-165)||(27629907-27630038)
chr6 (1-210)||(26918202-26918414)
chr6 (2-66)||(27290533-27290597)
chr6 (4-54)||(14143450-14143500)
chr6 (4-54)||(26787925-26787975)
chr6 (4-54)||(27196298-27196348)
chr6 (4-54)||(27252892-27252942)
chr6 (1-165)||(4525156-4525320)
chr6 (1-165)||(27044257-27044421)
chr6 (35-210)||(29501228-29501403)
chr6 (1-211)||(30558178-30558391)
chr6 (89-165)||(3695930-3696006)
chr6 (89-165)||(4546037-4546113)
chr6 (89-165)||(4724396-4724472)
chr6 (89-165)||(17025129-17025205)
chr6 (89-165)||(26777880-26777956)
chr6 (89-165)||(27007579-27007655)
chr6 (89-165)||(28207309-28207385)
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (2-216)||(13184765-13184979)
chr5 (2-216)||(13440611-13440825)
chr5 (2-216)||(33877078-33877292)
chr5 (2-216)||(11325625-11325839)
chr5 (1-207)||(22888310-22888516)
chr5 (1-192)||(25198884-25199075)
chr5 (5-192)||(23892058-23892248)
chr5 (1-192)||(24969876-24970064)
chr5 (2-165)||(30934515-30934678)
chr5 (2-162)||(11549236-11549399)
chr5 (1-210)||(33292362-33292571)
chr5 (2-165)||(23718105-23718271)
chr5 (2-165)||(23752567-23752733)
chr5 (1-210)||(33777321-33777533)
chr5 (1-165)||(22999230-22999397)
chr5 (8-192)||(24688280-24688467)
chr5 (1-66)||(29889198-29889263)
chr5 (1-165)||(32599588-32599752)
chr5 (2-165)||(9548660-9548826)
chr5 (1-165)||(34616400-34616564)
chr5 (1-211)||(18375528-18375741)
chr5 (89-211)||(30168302-30168424)
chr5 (89-165)||(31431307-31431383)
chr5 (89-168)||(3789402-3789481)
chr5 (1-211)||(33516189-33516402)
chr5 (89-165)||(8665682-8665758)
chr5 (2-165)||(15658877-15659043)
chr5 (89-165)||(18500955-18501031)
chr5 (89-165)||(43078128-43078204)
chr5 (89-165)||(6874181-6874257)
chr5 (2-165)||(12132034-12132200)
chr5 (89-165)||(28649105-28649181)
chr5 (89-165)||(37358862-37358938)
chr5 (89-165)||(37671699-37671775)
[»] chr3 (46 HSPs)
chr3 (2-216)||(17994045-17994259)
chr3 (2-216)||(4625727-4625941)
chr3 (2-216)||(5652170-5652384)
chr3 (4-207)||(16626769-16626972)
chr3 (1-207)||(18530186-18530386)
chr3 (2-216)||(5713007-5713224)
chr3 (2-216)||(5723917-5724134)
chr3 (2-216)||(5757343-5757560)
chr3 (2-216)||(5768234-5768451)
chr3 (1-210)||(15892966-15893178)
chr3 (1-210)||(8301527-8301736)
chr3 (1-192)||(18051066-18051260)
chr3 (1-210)||(4892999-4893208)
chr3 (1-210)||(22387838-22388047)
chr3 (2-210)||(35880552-35880763)
chr3 (1-209)||(32438944-32439152)
chr3 (1-192)||(8295779-8295970)
chr3 (1-165)||(4796913-4797080)
chr3 (2-210)||(18330460-18330666)
chr3 (1-165)||(29149015-29149182)
chr3 (1-210)||(8211527-8211736)
chr3 (1-165)||(20065877-20066041)
chr3 (2-168)||(18277313-18277482)
chr3 (2-168)||(18292614-18292783)
chr3 (2-168)||(18307915-18308084)
chr3 (2-210)||(4721417-4721628)
chr3 (2-210)||(6192102-6192313)
chr3 (1-165)||(4346947-4347111)
chr3 (2-165)||(7073043-7073209)
chr3 (89-165)||(15741433-15741509)
chr3 (1-165)||(28021109-28021273)
chr3 (4-54)||(32292697-32292747)
chr3 (1-162)||(10395970-10396131)
chr3 (1-211)||(17985216-17985429)
chr3 (89-168)||(29665336-29665415)
chr3 (4-54)||(31034380-31034430)
chr3 (2-165)||(7996393-7996559)
chr3 (2-165)||(10642901-10643067)
chr3 (89-165)||(28116308-28116384)
chr3 (89-165)||(47023284-47023360)
chr3 (35-210)||(5596663-5596838)
chr3 (88-165)||(5466816-5466893)
chr3 (89-165)||(11110712-11110788)
chr3 (1-210)||(18224977-18225189)
chr3 (89-165)||(6542825-6542901)
chr3 (89-165)||(36997440-36997516)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (63-207)||(20240-20384)
scaffold0124 (1-192)||(30296-30489)
scaffold0124 (1-39)||(20387-20425)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (1-184)||(29614-29800)
scaffold0089 (1-184)||(40288-40474)
scaffold0089 (1-165)||(47204-47371)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (4-211)||(21391-21595)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (2-192)||(27135-27328)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (2-210)||(350-561)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (4-66)||(250-312)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-211)||(15149-15362)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (55-165)||(8102-8212)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (2-165)||(7459-7625)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (89-165)||(7807-7883)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Original strand, 31891537 - 31891750
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31891537 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggta 31891636  T
Q  102 cctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagc 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31891637 cctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagc 31891736  T
Q  202 agcattgatgtcca 215  Q
    ||||||||||||||    
T  31891737 agcattgatgtcca 31891750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 34157043 - 34156829
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  34157043 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggta 34156944  T
Q  102 cctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  34156943 cctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagc 34156844  T
Q  202 agcattgatgtccat 216  Q
    |||||||||||||||    
T  34156843 agcattgatgtccat 34156829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 34303512 - 34303726
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  34303512 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacgacattaacgggta 34303611  T
Q  102 cctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  34303612 cctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagc 34303711  T
Q  202 agcattgatgtccat 216  Q
    |||||||||||||||    
T  34303712 agcattgatgtccat 34303726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 27118721 - 27118506
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggt 100  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27118721 caacatcggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggt 27118622  T
Q  101 acctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27118621 acctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatgcgggtacgacggaggtagctgag 27118522  T
Q  201 cagcattgatgtccat 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  27118521 cagcattgatgtccat 27118506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3784686 - 3784472
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  3784686 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctactgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggta 3784587  T
Q  102 cctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  3784586 cctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagc 3784487  T
Q  202 agcattgatgtccat 216  Q
    |||||||||||||||    
T  3784486 agcattgatgtccat 3784472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16163631 - 16163417
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  16163631 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggta 16163532  T
Q  102 cctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16163531 cctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagc 16163432  T
Q  202 agcattgatgtccat 216  Q
    |||||||||||||||    
T  16163431 agcattgatgtccat 16163417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 21703372 - 21703578
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggt 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21703372 caacattggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgttgaacgacggcattaacgggt 21703471  T
Q  101 acctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||  |    
T  21703472 acctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacggaggtaactagg 21703571  T
Q  201 cagcatt 207  Q
    |||||||    
T  21703572 cagcatt 21703578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 207
Target Start/End: Original strand, 19456632 - 19456835
Alignment:
Q  4 cattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacc 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||    
T  19456632 cattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctaaacgatggcattaacgggcacc 19456731  T
Q  104 tgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcag 203  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||    
T  19456732 tgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgaaagtattgcgcatatgggtacgacggaggtaactgggcag 19456831  T
Q  204 catt 207  Q
    ||||    
T  19456832 catt 19456835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 27434652 - 27434846
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacg 97  Q
    |||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  |||||||||    
T  27434652 caacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacg 27434751  T
Q  98 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 192  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||    
T  27434752 ggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggagg 27434846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 23128774 - 23128968
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacg 97  Q
    |||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||    
T  23128774 caacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacg 23128873  T
Q  98 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 192  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||  |||||||    
T  23128874 ggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 23128968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 63 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 27392961 - 27392813
Alignment:
Q  63 gctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctg 162  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||  ||    ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27392961 gctgttgttgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcggtggcggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctg 27392862  T
Q  163 agagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgatg 211  Q
    ||||||||||   ||| |||||   ||||||||||||||||||| ||||    
T  27392861 agagtattgcatgtactggtacggtggaggtagctgagcagcatcgatg 27392813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 28882246 - 28882080
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  ||||||||||    
T  28882246 aacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgg 28882147  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  28882146 gtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 28882080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 12655574 - 12655381
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  ||||||||||    
T  12655574 aacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgg 12655475  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 192  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  || || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||  |||||||    
T  12655474 gtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggagg 12655381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 20837950 - 20837766
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  ||||||||||    
T  20837950 aacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgg 20837851  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggta 183  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  || || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||    
T  20837850 gtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggta 20837766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Original strand, 13936753 - 13936919
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttga---tgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||| |||| || |||||||| ||||| |||   ||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||    
T  13936753 aacatcggtatcggagggaaagtaggtctggcttgctgactttgctgttgttgttgaaccggcagctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgg 13936852  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    | || ||||||||||||| ||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  13936853 gcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 13936919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 34279481 - 34279315
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  ||||| ||||    
T  34279481 aacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgg 34279382  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    | || ||||||||||||| ||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  34279381 gcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 34279315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 37925525 - 37925359
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    |||||||||||| |||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||    
T  37925525 aacattggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgg 37925426  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    | || ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  37925425 gcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 37925359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 34286386 - 34286223
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||  |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | || ||||| ||||    
T  34286386 aacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaactgcattgacgg 34286287  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctg 162  Q
    ||||  |||||||||||| ||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  34286286 gtactggaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctg 34286223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 34291446 - 34291283
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||  |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | || ||||| ||||    
T  34291446 aacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaactgcattgacgg 34291347  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctg 162  Q
    ||||  |||||||||||| ||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  34291346 gtactggaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctg 34291283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Original strand, 11635488 - 11635564
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  11635488 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 11635564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Original strand, 11641677 - 11641753
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  11641677 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 11641753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Original strand, 21677481 - 21677557
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  21677481 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 21677557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 32049830 - 32049664
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  ||||| ||||    
T  32049830 aacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgg 32049731  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    | || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  32049730 gcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 32049664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 165
Target Start/End: Original strand, 261009 - 261140
Alignment:
Q  34 ttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattga 133  Q
    |||||| || |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||    
T  261009 ttgttgttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactga 261108  T
Q  134 tgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  261109 tgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 261140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 16829546 - 16829713
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacg 97  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| |||    
T  16829546 caacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacg 16829645  T
Q  98 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    || || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  16829646 ggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 16829713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 16891935 - 16891768
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacg 97  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| |||    
T  16891935 caacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacg 16891836  T
Q  98 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    || || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  16891835 ggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 16891768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 37375091 - 37375024
Alignment:
Q  101 acctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 168  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  37375091 acctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggcgggaagaacggatgctgagagta 37375024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 177; Significance: 1e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 2880 - 3092
Alignment:
Q  4 cattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacc 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  2880 cattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgctgatgctgttgttgttgagctggaggctgttgttgcatttgttgaacgacggcattgacgggtacc 2979  T
Q  104 tgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcag 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2980 tgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcgtacgggtacgacggaggtagctgagcag 3079  T
Q  204 cattgatgtccat 216  Q
    |||||||||||||    
T  3080 cattgatgtccat 3092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 177; Significance: 1e-95; HSPs: 5)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Original strand, 20340557 - 20340769
Alignment:
Q  4 cattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacc 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20340557 cattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgctgatgctgttgttgttgagctggaggctgttgttgcatttgttgaacgacggcattgacgggtacc 20340656  T
Q  104 tgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcag 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20340657 tgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcgtacgggtacgacggaggtagctgagcag 20340756  T
Q  204 cattgatgtccat 216  Q
    |||||||||||||    
T  20340757 cattgatgtccat 20340769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 63 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20461079 - 20460935
Alignment:
Q  63 gctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctg 162  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20461079 gctgttgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatattgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctg 20460980  T
Q  163 agagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcatt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||    
T  20460979 agagtattgcgcatacgggtacggcggaggtaactgggcagcatt 20460935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 16208250 - 16208418
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  16208250 caacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatg---ttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgatggcattaatgggt 16208346  T
Q  101 acctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgc 172  Q
    |||||||| |||||||||||    ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16208347 acctgaggctgacccgatggtggtggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgc 16208418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 28151895 - 28151845
Alignment:
Q  4 cattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  28151895 cattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 28151845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Original strand, 41793618 - 41793694
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||    
T  41793618 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgttgaga 41793694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 23)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15227919 - 15227716
Alignment:
Q  4 cattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacc 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15227919 cattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctgaacgacagcattaacgggtacc 15227820  T
Q  104 tgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcag 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  15227819 tgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtaactgggcag 15227720  T
Q  204 catt 207  Q
    ||||    
T  15227719 catt 15227716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 24460825 - 24461039
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  24460825 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggta 24460924  T
Q  102 cctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  24460925 cctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagc 24461024  T
Q  202 agcattgatgtccat 216  Q
    |||||||||||||||    
T  24461025 agcattgatgtccat 24461039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1900306 - 1900103
Alignment:
Q  4 cattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacc 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900306 cattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgttgttgctgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacc 1900207  T
Q  104 tgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcag 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||    
T  1900206 tgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacggaggtaactgggcag 1900107  T
Q  204 catt 207  Q
    ||||    
T  1900106 catt 1900103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 207
Target Start/End: Original strand, 15285150 - 15285353
Alignment:
Q  4 cattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacc 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  15285150 cattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagttggtggctgttgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggcacc 15285249  T
Q  104 tgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcag 203  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||    
T  15285250 tgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatatgggtacaatggaggtaactgggcag 15285349  T
Q  204 catt 207  Q
    ||||    
T  15285350 catt 15285353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 14235744 - 14235953
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgct---gttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacg 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  14235744 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgttgctgctgttgttgctgagccggcggctgttgttgcatttgctgagcaatggcattaacg 14235843  T
Q  98 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagct 197  Q
    |||||||  || ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||  | |||||| ||    
T  14235844 ggtacctatgggtgacccgatggtagagggtactgatgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatatactggtacggcagaggtaact 14235943  T
Q  198 gagcagcatt 207  Q
    ||||||||||    
T  14235944 gagcagcatt 14235953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 24592533 - 24592742
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggt 100  Q
    |||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| |||  ||||||||||||    
T  24592533 caacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggt 24592632  T
Q  101 acctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgag 200  Q
    || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| |||||  ||||||| |  ||||    
T  24592633 acttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgag 24592732  T
Q  201 cagcattgat 210  Q
    | ||||||||    
T  24592733 ctgcattgat 24592742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14665070 - 14664858
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacg 97  Q
    |||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||    
T  14665070 caacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacg 14664971  T
Q  98 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagct 197  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  | ||||| |||||  ||||||| |  |    
T  14664970 ggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggtgcatatgggtatgacggaggcattt 14664871  T
Q  198 gagcagcattgat 210  Q
    | |||||||||||    
T  14664870 gggcagcattgat 14664858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 34189179 - 34189388
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggt 100  Q
    ||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||  || ||| ||| |||||| || ||     
T  34189179 caacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacaggg 34189278  T
Q  101 acctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgag 200  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||  |||| || | |||||    
T  34189279 acctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgag 34189378  T
Q  201 cagcattgat 210  Q
    ||||||||||    
T  34189379 cagcattgat 34189388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Original strand, 15391560 - 15391764
Alignment:
Q  4 cattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacc 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||   | |  | |||||||| |||||||||||| | | |||||| | |||||||    
T  15391560 cattggtatcggaggaaaggtaggtctggtttgttgctgctgttgttg---agccagcggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgatgggtacc 15391656  T
Q  104 tgaggttgacccg---atggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgag 200  Q
    |||||||||||||   |||||   ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||| | |||  ||||||||||||||    
T  15391657 tgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtagctgag 15391753  T
Q  201 cagcattgatg 211  Q
    || ||||||||    
T  15391754 caacattgatg 15391764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24112714 - 24112506
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggt 100  Q
    ||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||  || ||| ||| |||||| || ||     
T  24112714 caacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacaggg 24112615  T
Q  101 acctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgag 200  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||  |||| || | |||||    
T  24112614 acctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgag 24112515  T
Q  201 cagcattga 209  Q
    |||||||||    
T  24112514 cagcattga 24112506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 17014052 - 17013867
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacg 97  Q
    |||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| | |  |||||||||    
T  17014052 caacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacg 17013953  T
Q  98 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggta 183  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||    
T  17013952 ggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggta 17013867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 6569905 - 6569738
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttg---ttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacg 97  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||  ||||||||   |||||||||   |||||||| ||| || ||  | |  |||||||||    
T  6569905 caacattggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgctgttgaactggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattaacg 6569806  T
Q  98 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  6569805 ggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 6569738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 168
Target Start/End: Original strand, 14763524 - 14763693
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||  | || |||||||  || ||| ||| |||||| || |    
T  14763524 aacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacag 14763623  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 168  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14763624 gaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 14763693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 36344734 - 36344901
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggt 100  Q
    |||||| |||||  ||||||| || |||||||  | ||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||  || ||| ||| |||||| || ||     
T  36344734 caacataggtataggaggaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacagga 36344833  T
Q  101 acctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 168  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||    
T  36344834 acctgaggttggcccggtggcaaaggatactgatgataaaacggtaggaagaacggatgctgagagta 36344901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14098593 - 14098381
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacg 97  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| |||    
T  14098593 caacattggtataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacg 14098494  T
Q  98 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagct 197  Q
    || || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |||||  ||||||| |  |    
T  14098493 ggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcattt 14098394  T
Q  198 gagcagcattgat 210  Q
    |||| ||||||||    
T  14098393 gagctgcattgat 14098381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 21969753 - 21969586
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacg 97  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  ||||| |||    
T  21969753 caacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacg 21969654  T
Q  98 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    || || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  21969653 ggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggcgggaagaaaggatgctgaga 21969586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 54833439 - 54833230
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggt 100  Q
    |||||| |||||  ||||||| || |||||||  | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |  || ||| | | |||||| || ||     
T  54833439 caacataggtataggaggaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcaatggcattgacagga 54833340  T
Q  101 acctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgag 200  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||  ||||||| |  ||||    
T  54833339 acctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgag 54833240  T
Q  201 cagcattgat 210  Q
    | ||||||||    
T  54833239 ctgcattgat 54833230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 5005831 - 5005755
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  5005831 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 5005755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Original strand, 27163537 - 27163703
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  ||||| ||||    
T  27163537 aacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgg 27163636  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    | || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  27163637 gcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 27163703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 31126737 - 31126949
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacg 97  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| |||    
T  31126737 caacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacg 31126836  T
Q  98 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagct 197  Q
    || || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |||||  ||||||| |  |    
T  31126837 ggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcattt 31126936  T
Q  198 gagcagcattgat 210  Q
    |||| ||||||||    
T  31126937 gagctgcattgat 31126949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19373202 - 19373101
Alignment:
Q  109 ttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattg 208  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||    
T  19373202 ttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattg 19373103  T
Q  209 at 210  Q
    ||    
T  19373102 at 19373101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Original strand, 18800932 - 18801008
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  18800932 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 18801008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 30753703 - 30753627
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||  |||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  30753703 gcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 30753627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 175; Significance: 2e-94; HSPs: 19)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9354658 - 9354444
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  9354658 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggta 9354559  T
Q  102 cctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  9354558 cctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagc 9354459  T
Q  202 agcattgatgtccat 216  Q
    |||||||||||||||    
T  9354458 agcattgatgtccat 9354444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 19659218 - 19659432
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  19659218 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggttgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggta 19659317  T
Q  102 cctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19659318 cctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagc 19659417  T
Q  202 agcattgatgtccat 216  Q
    |||||||||||||||    
T  19659418 agcattgatgtccat 19659432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 44563135 - 44562923
Alignment:
Q  4 cattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  44563135 cattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacggcggcattaacgggtacc 44563036  T
Q  104 tgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcag 203  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44563035 tgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacggaggtagctgagcag 44562936  T
Q  204 cattgatgtccat 216  Q
    |||||||||||||    
T  44562935 cattgatgtccat 44562923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16283486 - 16283292
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg---aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacg 97  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  ||||||| |    
T  16283486 caacatcggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaatg 16283387  T
Q  98 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 192  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||    
T  16283386 ggtacctgaggttgacctggtggcaaaggatactaatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggagg 16283292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 14557660 - 14557497
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggta 101  Q
    |||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||| ||||    
T  14557660 aacattggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacaggta 14557561  T
Q  102 cctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    | ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14557560 cttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgaga 14557497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16277590 - 16277397
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  ||||||||||    
T  16277590 aacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgg 16277491  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 192  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||  |||||||    
T  16277490 gtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 16277397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 27609083 - 27609250
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacg 97  Q
    |||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||    
T  27609083 caacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacg 27609182  T
Q  98 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  27609183 ggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 27609250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 2137437 - 2137631
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacg 97  Q
    |||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||    
T  2137437 caacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacg 2137536  T
Q  98 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 192  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||  |||||||    
T  2137537 ggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatgacggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 2137631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Original strand, 22081059 - 22081263
Alignment:
Q  4 cattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacc 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||   | |    |||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||||    
T  22081059 cattggtatcggaggaaaggtaggtctggtttgttgctgctgctgttg---agccaacggctgttgctgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacc 22081155  T
Q  104 tgaggttgacccg---atggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgag 200  Q
    |||||||||||||   |||||   ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||| | |||  ||||||||||||||    
T  22081156 tgaggttgacccggcgatggc---ggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgatacggcggaggtagctgag 22081252  T
Q  201 cagcattgatg 211  Q
    |||||||||||    
T  22081253 cagcattgatg 22081263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18710623 - 18710411
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagc---ttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacg 97  Q
    ||||||||||||  ||||||| || ||||||||   ||| || ||||| ||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | || ||||| |||    
T  18710623 caacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaactgcattgacg 18710524  T
Q  98 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagct 197  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||  ||||||| |  |    
T  18710523 ggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcattt 18710424  T
Q  198 gagcagcattgat 210  Q
    |||| ||||||||    
T  18710423 gagctgcattgat 18710411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19688135 - 19687923
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacg 97  Q
    |||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| |    |||||||| ||| || ||| | |  |||||||||    
T  19688135 caacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccgacaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacg 19688036  T
Q  98 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagct 197  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||  ||||||| |||||  ||||||| |  |    
T  19688035 ggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactggtgatagaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcgcatatgggtatgacggaggcattt 19687936  T
Q  198 gagcagcattgat 210  Q
    | |||||||||||    
T  19687935 gggcagcattgat 19687923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 19674384 - 19674308
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  19674384 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 19674308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 33244701 - 33244649
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  33244701 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttg 33244649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19286499 - 19286290
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggt 100  Q
    |||||| |||||  ||||||| || |||||||  | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |  || ||| | | |||||| || ||     
T  19286499 caacataggtataggaggaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcaatggcattgacagga 19286400  T
Q  101 acctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgag 200  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||  ||||||| |  ||||    
T  19286399 acctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgag 19286300  T
Q  201 cagcattgat 210  Q
    | ||||||||    
T  19286299 ctgcattgat 19286290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 210
Target Start/End: Original strand, 31490019 - 31490140
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 188  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |||||  |||    
T  31490019 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacg 31490118  T
Q  189 gaggtagctgagcagcattgat 210  Q
    |||| |  ||||| ||||||||    
T  31490119 gaggcatttgagctgcattgat 31490140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 31354560 - 31354394
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||  | || ||||| |  || ||| ||| |||||| || |    
T  31354560 aacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacag 31354461  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  31354460 gaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 31354394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Original strand, 3329788 - 3329864
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  3329788 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgaga 3329864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Original strand, 19518412 - 19518488
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  19518412 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 19518488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 29829259 - 29829183
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  29829259 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 29829183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 175; Significance: 2e-94; HSPs: 26)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 31088570 - 31088784
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  31088570 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggta 31088669  T
Q  102 cctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  31088670 cctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagc 31088769  T
Q  202 agcattgatgtccat 216  Q
    |||||||||||||||    
T  31088770 agcattgatgtccat 31088784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 45733497 - 45733283
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  45733497 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggta 45733398  T
Q  102 cctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  45733397 cctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagc 45733298  T
Q  202 agcattgatgtccat 216  Q
    |||||||||||||||    
T  45733297 agcattgatgtccat 45733283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16041361 - 16041155
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggt 100  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16041361 caacattggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggaattaacgggt 16041262  T
Q  101 acctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgag 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||| |    
T  16041261 acctgaggttgacccgatgacaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacggaggtaactggg 16041162  T
Q  201 cagcatt 207  Q
    |||||||    
T  16041161 cagcatt 16041155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 207
Target Start/End: Original strand, 16450106 - 16450309
Alignment:
Q  4 cattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacc 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16450106 cattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgctgttgagctggtggctgttgttgcacttgctgaacgacggcattaatgggtacc 16450205  T
Q  104 tgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcag 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  16450206 tgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgataaaatggtggaaagaagggatgctgagagtactgcgcgtacgggtacgacggaggtaactgggcag 16450305  T
Q  204 catt 207  Q
    ||||    
T  16450306 catt 16450309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 16503485 - 16503679
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacg 97  Q
    |||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| || ||| | |  |||||||||    
T  16503485 caacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagctgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacg 16503584  T
Q  98 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 192  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||    
T  16503585 ggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggagg 16503679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 16518521 - 16518715
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacg 97  Q
    |||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| || ||| | |  |||||||||    
T  16518521 caacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagctgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacg 16518620  T
Q  98 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 192  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||    
T  16518621 ggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggagg 16518715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 10916973 - 10917137
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggt 100  Q
    |||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||| |||    
T  10916973 caacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacaggt 10917072  T
Q  101 acctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10917073 acttgaggttgacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgaga 10917137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 5128030 - 5127818
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacg 97  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  |||||||||    
T  5128030 caacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacg 5127931  T
Q  98 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagct 197  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| |||||  ||||||| |  |    
T  5127930 ggtacttgaggttgacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcattt 5127831  T
Q  198 gagcagcattgat 210  Q
    |||| ||||||||    
T  5127830 gagctgcattgat 5127818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 5159557 - 5159348
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggt 100  Q
    ||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||  || ||| ||| |||||| || ||     
T  5159557 caacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacaggg 5159458  T
Q  101 acctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgag 200  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||  |||| || | |||||    
T  5159457 acctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgag 5159358  T
Q  201 cagcattgat 210  Q
    ||||||||||    
T  5159357 cagcattgat 5159348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Original strand, 11424882 - 11425048
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  ||||||||||    
T  11424882 aacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgg 11424981  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  11424982 gtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 11425048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 26435295 - 26435125
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacg 97  Q
    ||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| |||    
T  26435295 caacattggtataggaggaaaagttggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacg 26435196  T
Q  98 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 168  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26435195 ggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 26435125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 168
Target Start/End: Original strand, 5147446 - 5147615
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||  ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||    
T  5147446 aacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagcttgttgattttgttgttgttgttgaatcggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgg 5147545  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 168  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5147546 gtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 5147615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 54
Target Start/End: Original strand, 2109113 - 2109163
Alignment:
Q  4 cattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  2109113 cattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 2109163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 26484729 - 26484679
Alignment:
Q  4 cattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  26484729 cattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 26484679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 2154520 - 2154444
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  2154520 gcattaacggatacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 2154444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Original strand, 16736656 - 16736732
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16736656 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 16736732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Original strand, 16751710 - 16751786
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16751710 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 16751786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 17523479 - 17523403
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  17523479 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 17523403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Original strand, 17529736 - 17529812
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  17529736 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 17529812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 18540834 - 18540784
Alignment:
Q  4 cattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 54  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18540834 cattggtatcagaggaaaagtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 18540784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 54
Target Start/End: Original strand, 39211131 - 39211181
Alignment:
Q  4 cattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  39211131 cattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgcggtcgttgttg 39211181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Original strand, 4145229 - 4145395
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||  | || ||||| |  || ||| ||| |||||| || |    
T  4145229 aacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacag 4145328  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  4145329 gaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 4145395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 2775394 - 2775344
Alignment:
Q  4 cattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||    
T  2775394 cattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctactgtcgttgttg 2775344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 11441507 - 11441431
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  11441507 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 11441431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 45387290 - 45387214
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  45387290 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 45387214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Original strand, 26319975 - 26320141
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| || | |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||    
T  26319975 aacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcgtctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgg 26320074  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    | || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  26320075 gcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 26320141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 175; Significance: 2e-94; HSPs: 37)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 13522236 - 13522450
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13522236 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggta 13522335  T
Q  102 cctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  13522336 cctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagc 13522435  T
Q  202 agcattgatgtccat 216  Q
    |||||||||||||||    
T  13522436 agcattgatgtccat 13522450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 33374419 - 33374633
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  33374419 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggta 33374518  T
Q  102 cctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  33374519 cctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagc 33374618  T
Q  202 agcattgatgtccat 216  Q
    |||||||||||||||    
T  33374619 agcattgatgtccat 33374633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 28162690 - 28162477
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28162690 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggta 28162591  T
Q  102 cctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagc 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  28162590 cctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgatggaggtagctgagc 28162491  T
Q  202 agcattgatgtcca 215  Q
    ||||||||||||||    
T  28162490 agcattgatgtcca 28162477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 8892473 - 8892687
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8892473 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggta 8892572  T
Q  102 cctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  8892573 cctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagc 8892672  T
Q  202 agcattgatgtccat 216  Q
    |||||||||||||||    
T  8892673 agcattgatgtccat 8892687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 8903708 - 8903922
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8903708 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggta 8903807  T
Q  102 cctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  8903808 cctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagagatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagc 8903907  T
Q  202 agcattgatgtccat 216  Q
    |||||||||||||||    
T  8903908 agcattgatgtccat 8903922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 207
Target Start/End: Original strand, 22477438 - 22477644
Alignment:
Q  4 cattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgt---tgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||||    
T  22477438 cattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgttgtcgttgttgttgaaccggtgactgttgttgcatttgttgagcaattgcattaacgggt 22477537  T
Q  101 acctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||  || |    
T  22477538 acctgaggttgacccgatggcaaaggatactaatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtactgcgcatacgggtacgacagaggtaattggg 22477637  T
Q  201 cagcatt 207  Q
    |||||||    
T  22477638 cagcatt 22477644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 20160734 - 20160568
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggta 101  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | | ||||||||||||||    
T  20160734 aacatcggtatcggaggaaaggtaggtctagtttgttgctgttgttgttgttgagctggtggctgttgctgtttttgctgagcaatggcattaacgggta 20160635  T
Q  102 cctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 168  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  20160634 cctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgagagta 20160568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 168
Target Start/End: Original strand, 22172097 - 22172263
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggta 101  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| | | ||||||||||||||    
T  22172097 aacatcggtatcggaggaaaggtaggtctagtttgttgctgttgttgttgttgagctggtggctgttgctgtttttgctgagcaatggcattaacgggta 22172196  T
Q  102 cctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 168  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  22172197 cctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgagagta 22172263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 192
Target Start/End: Original strand, 22935043 - 22935233
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggta 101  Q
    ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  ||||| |||||||    
T  22935043 aacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggta 22935142  T
Q  102 cctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 192  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||  |||||||    
T  22935143 cctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 22935233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 192
Target Start/End: Original strand, 23857488 - 23857678
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggta 101  Q
    ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  ||||| |||||||    
T  23857488 aacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggta 23857587  T
Q  102 cctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 192  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||  |||||||    
T  23857588 cctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaagggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 23857678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Original strand, 24304781 - 24304992
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  ||||||||||    
T  24304781 aacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggaaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgg 24304880  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctg 198  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| |||||  ||||||| |  ||    
T  24304881 gtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttg 24304980  T
Q  199 agcagcattgat 210  Q
     |||||||||||    
T  24304981 ggcagcattgat 24304992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 192
Target Start/End: Original strand, 13299114 - 13299307
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  ||||||||||    
T  13299114 aacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgg 13299213  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 192  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||  |||||||    
T  13299214 gtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 13299307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 29549509 - 29549300
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggt 100  Q
    ||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||  || ||| ||| |||||| || ||     
T  29549509 caacattggtataggaggaaaagttggtctagcgtattgctgctgctgttgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacagga 29549410  T
Q  101 acctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgag 200  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  || |||| |||||  ||||||| |  ||||    
T  29549409 acctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgag 29549310  T
Q  201 cagcattgat 210  Q
    | ||||||||    
T  29549309 ctgcattgat 29549300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 15424479 - 15424673
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg---aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacg 97  Q
    |||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||   ||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||    
T  15424479 caacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttcaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacg 15424578  T
Q  98 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 192  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||  |||||||    
T  15424579 ggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 15424673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 16749887 - 16749721
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| |||  ||||||||||    
T  16749887 aacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgg 16749788  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16749787 gtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 16749721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 26989034 - 26988868
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttg---ttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||   ||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  ||||||||||    
T  26989034 aacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgatgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgg 26988935  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  26988934 gtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 26988868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 27000107 - 26999940
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacg 97  Q
    |||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  |||||||||    
T  27000107 caacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacg 27000008  T
Q  98 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  27000007 ggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 26999940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 24863751 - 24863557
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacg 97  Q
    |||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  |||||||||    
T  24863751 caacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacg 24863652  T
Q  98 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 192  Q
    ||||| || ||||||| || ||| | ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||  |||||||    
T  24863651 ggtacttggggttgactcggtggtagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtaggacggagg 24863557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 78
Target Start/End: Original strand, 22457099 - 22457176
Alignment:
Q  4 cattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgct---gttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttg 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  22457099 cattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgttgtcgttgttgttgaaccggtgactgttgttgcatttg 22457176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 165
Target Start/End: Original strand, 27629907 - 27630038
Alignment:
Q  34 ttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattga 133  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||| || | || || || |  ||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  27629907 ttgttgctgttgttgttgctgaactggtggttgttgtggcttctgttgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattga 27630006  T
Q  134 tgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    || || || ||||| ||||| |||||||||||    
T  27630007 tggtaaaacggtgggaagaatggatgctgaga 27630038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 26918414 - 26918202
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacg 97  Q
    |||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| | | || ||| | |  ||||| |||    
T  26918414 caacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcgtctgttgagcaattgcattgacg 26918315  T
Q  98 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagct 197  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| |||||  ||||||| |  |    
T  26918314 ggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcattt 26918215  T
Q  198 gagcagcattgat 210  Q
    |||| ||||||||    
T  26918214 gagctgcattgat 26918202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Original strand, 27290533 - 27290597
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctg 66  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||    
T  27290533 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttattgctgctgtcgttgttgagccggtggctg 27290597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 54
Target Start/End: Original strand, 14143450 - 14143500
Alignment:
Q  4 cattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14143450 cattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 14143500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 26787975 - 26787925
Alignment:
Q  4 cattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  26787975 cattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 26787925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 27196348 - 27196298
Alignment:
Q  4 cattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27196348 cattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 27196298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 54
Target Start/End: Original strand, 27252892 - 27252942
Alignment:
Q  4 cattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27252892 cattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 27252942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 4525320 - 4525156
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggt 100  Q
    ||||||||||||  ||||||| || |||||||  |  || ||||| || ||||||||||| || || ||||| |  || ||| ||| |||||| || ||     
T  4525320 caacattggtataggaggaaaagttggtctagtatactgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacagga 4525221  T
Q  101 acctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  4525220 acctgaggttggcctggtggcaaaggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 4525156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 27044421 - 27044257
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggt 100  Q
    |||||| |||||  ||||||| || |||||||  | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |  || ||| ||| |||||| || ||     
T  27044421 caacataggtataggaggaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacagga 27044322  T
Q  101 acctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  27044321 acctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 27044257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 29501403 - 29501228
Alignment:
Q  35 tgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgat 134  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||| || || |||||    |||||| ||| |||||| || || ||||||||||| || | ||||||||| || ||||    
T  29501403 tgttgttgttgttgttgttgaattggcggttgatgttgtgcctgctgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgat 29501304  T
Q  135 gatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 210  Q
    |||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||| ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  29501303 gataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggtacgacggaggcatttgagctgcattgat 29501228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 30558178 - 30558391
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacg 97  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| |||    
T  30558178 caacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacg 30558277  T
Q  98 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagct 197  Q
    || || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |||||  ||||||| |  |    
T  30558278 ggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcattt 30558377  T
Q  198 gagcagcattgatg 211  Q
    |||| |||||||||    
T  30558378 gagctgcattgatg 30558391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 3696006 - 3695930
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  3696006 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 3695930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Original strand, 4546037 - 4546113
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  4546037 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 4546113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Original strand, 4724396 - 4724472
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  4724396 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 4724472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 17025205 - 17025129
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  17025205 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 17025129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Original strand, 26777880 - 26777956
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  26777880 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 26777956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 27007655 - 27007579
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  27007655 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgaga 27007579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 28207385 - 28207309
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  28207385 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 28207309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 175; Significance: 2e-94; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 13184765 - 13184979
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13184765 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggta 13184864  T
Q  102 cctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  13184865 cctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagc 13184964  T
Q  202 agcattgatgtccat 216  Q
    |||||||||||||||    
T  13184965 agcattgatgtccat 13184979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 13440611 - 13440825
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13440611 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggta 13440710  T
Q  102 cctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  13440711 cctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagc 13440810  T
Q  202 agcattgatgtccat 216  Q
    |||||||||||||||    
T  13440811 agcattgatgtccat 13440825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33877292 - 33877078
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  33877292 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggta 33877193  T
Q  102 cctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  33877192 cctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagc 33877093  T
Q  202 agcattgatgtccat 216  Q
    |||||||||||||||    
T  33877092 agcattgatgtccat 33877078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11325839 - 11325625
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11325839 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctgaacgacggcattaacgggta 11325740  T
Q  102 cctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagc 201  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  11325739 cctgaggttgtcccaatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagc 11325640  T
Q  202 agcattgatgtccat 216  Q
    |||||||||||||||    
T  11325639 agcattgatgtccat 11325625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22888516 - 22888310
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggt 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22888516 caacattggtatcggagggaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacggtt 22888417  T
Q  101 acctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||| |    
T  22888416 acctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacggaggtaactggg 22888317  T
Q  201 cagcatt 207  Q
    |||||||    
T  22888316 cagcatt 22888310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 25199075 - 25198884
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggt 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  25199075 caacattggtatcggagaaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcgttaacgagt 25198976  T
Q  101 acctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||    
T  25198975 acctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggagg 25198884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 23892248 - 23892058
Alignment:
Q  5 attggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg---aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggta 101  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23892248 attggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttgttgaaccggtggctgttgttgcatttgctgaacgatggcattgacgggta 23892149  T
Q  102 cctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||    
T  23892148 cctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgttggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggagg 23892058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 24970064 - 24969876
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggt 100  Q
    |||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||  ||||||||| ||| || ||| | |  ||||||||||||    
T  24970064 caacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgttgatg---ttgttgttgaaccggcagctgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggt 24969968  T
Q  101 acctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 192  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||| |||||||    
T  24969967 acctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtacgacggagg 24969876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 30934678 - 30934515
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggta 101  Q
    ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||||||    
T  30934678 aacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggta 30934579  T
Q  102 cctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    | ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  30934578 cttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgaga 30934515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 11549399 - 11549236
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  ||||||||||    
T  11549399 aacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgg 11549300  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctg 162  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  11549299 gtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggtggaaagaaaggatgctg 11549236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 33292571 - 33292362
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggt 100  Q
    ||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||  || ||| ||| |||||| || ||     
T  33292571 caacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgttgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacaggg 33292472  T
Q  101 acctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgag 200  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||  |||| || | |||||    
T  33292471 acctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgag 33292372  T
Q  201 cagcattgat 210  Q
    ||||||||||    
T  33292371 cagcattgat 33292362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Original strand, 23718105 - 23718271
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  ||||||||||    
T  23718105 aacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgg 23718204  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  23718205 gtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 23718271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Original strand, 23752567 - 23752733
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  ||||||||||    
T  23752567 aacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgg 23752666  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  23752667 gtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 23752733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 33777533 - 33777321
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacg 97  Q
    |||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||    
T  33777533 caacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacg 33777434  T
Q  98 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagct 197  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| |||||  ||||||| |  |    
T  33777433 ggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcattt 33777334  T
Q  198 gagcagcattgat 210  Q
    |||| ||||||||    
T  33777333 gagctgcattgat 33777321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 22999230 - 22999397
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacg 97  Q
    |||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||    
T  22999230 caacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacg 22999329  T
Q  98 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| |||||||||||||  |||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  22999330 ggtacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 22999397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 192
Target Start/End: Original strand, 24688280 - 24688467
Alignment:
Q  8 ggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacct 104  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| | |  | |||||||||||| |    
T  24688280 ggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgtattaacgggtactt 24688379  T
Q  105 gaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 192  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  ||||||| |||||  |||||||    
T  24688380 gaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 24688467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 29889198 - 29889263
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctg 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||    
T  29889198 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctg 29889263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 32599588 - 32599752
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggt 100  Q
    ||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |  |||||| ||| |||||| || ||     
T  32599588 caacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgctgagcgatggcattgacagga 32599687  T
Q  101 acctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||||||||| || | ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  32599688 acctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 32599752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Original strand, 9548660 - 9548826
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||  ||   |||||||| ||| || ||| | |  ||||| ||||    
T  9548660 aacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaatcggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgg 9548759  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  9548760 gtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 9548826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 34616564 - 34616400
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggt 100  Q
    ||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |  || ||| ||| |||||| || ||     
T  34616564 caacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacagga 34616465  T
Q  101 acctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||||||||  || | ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  34616464 acctgaggttagccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 34616400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 18375528 - 18375741
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacg 97  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| |||    
T  18375528 caacattggtataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacg 18375627  T
Q  98 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagct 197  Q
    || || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |||||  ||||||| |  |    
T  18375628 ggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcattt 18375727  T
Q  198 gagcagcattgatg 211  Q
    |||| |||||||||    
T  18375728 gagctgcattgatg 18375741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 30168424 - 30168302
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacg 188  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |||||  |||    
T  30168424 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacg 30168325  T
Q  189 gaggtagctgagcagcattgatg 211  Q
    |||| |  ||||| |||||||||    
T  30168324 gaggcatttgagctgcattgatg 30168302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 31431383 - 31431307
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  31431383 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 31431307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 3789481 - 3789402
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 168  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3789481 gcattgacgggcacctgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 3789402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 33516402 - 33516189
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacg 97  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| |||    
T  33516402 caacattggtataggaggaaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacg 33516303  T
Q  98 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagct 197  Q
    || || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |||||  ||||||| |  |    
T  33516302 ggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcattt 33516203  T
Q  198 gagcagcattgatg 211  Q
    |||| |||||||||    
T  33516202 gagccgcattgatg 33516189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Original strand, 8665682 - 8665758
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| || || ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  8665682 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 8665758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Original strand, 15658877 - 15659043
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||  |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  ||||| ||||    
T  15658877 aacatcggtattggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgg 15658976  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    | || ||||||||||||| ||||| ||| || ||||| || || || |||||||| |||||||||||    
T  15658977 gcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaacggcggaaagaaaggatgctgaga 15659043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Original strand, 18500955 - 18501031
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  18500955 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 18501031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 43078204 - 43078128
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  43078204 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 43078128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 6874257 - 6874181
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  6874257 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 6874181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 12132200 - 12132034
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| || | |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||    
T  12132200 aacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcgtctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgg 12132101  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    | || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  12132100 gcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 12132034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 28649181 - 28649105
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  28649181 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 28649105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Original strand, 37358862 - 37358938
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  37358862 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 37358938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Original strand, 37671699 - 37671775
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  37671699 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 37671775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 175; Significance: 2e-94; HSPs: 46)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 17994045 - 17994259
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  17994045 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggta 17994144  T
Q  102 cctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  17994145 cctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagc 17994244  T
Q  202 agcattgatgtccat 216  Q
    |||||||||||||||    
T  17994245 agcattgatgtccat 17994259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4625941 - 4625727
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  4625941 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacgacattaacgggta 4625842  T
Q  102 cctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  4625841 cctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagc 4625742  T
Q  202 agcattgatgtccat 216  Q
    |||||||||||||||    
T  4625741 agcattgatgtccat 4625727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5652384 - 5652170
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggta 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  5652384 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttgagctggaggctgttgttgcattcgctggacgacggcattaacgggta 5652285  T
Q  102 cctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagc 201  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  5652284 cctgaggttgacccgattgcaaacgatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctgagc 5652185  T
Q  202 agcattgatgtccat 216  Q
    |||||||||||||||    
T  5652184 agcattgatgtccat 5652170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 207
Target Start/End: Original strand, 16626769 - 16626972
Alignment:
Q  4 cattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacc 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16626769 cattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgttgttgagctggtggctgttgttgcatttgctgaacgatggcattaacgggtacc 16626868  T
Q  104 tgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcag 203  Q
     |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  16626869 ggaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaacggtggaaagaagggatgctgagagtattgtgcatacgggtacgacggaggtaactgggcag 16626968  T
Q  204 catt 207  Q
    ||||    
T  16626969 catt 16626972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18530386 - 18530186
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggt 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||      | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18530386 caacattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttg------agctggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggc 18530293  T
Q  101 acctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgag 200  Q
    || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |    
T  18530292 acttgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgatggaggtaactggg 18530193  T
Q  201 cagcatt 207  Q
    |||||||    
T  18530192 cagcatt 18530186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5713224 - 5713007
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||| |||| || |||||||| ||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  |||  ||||| ||||    
T  5713224 aacatcggtatcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgg 5713125  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctg 198  Q
    | || ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  5713124 gcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctg 5713025  T
Q  199 agcagcattgatgtccat 216  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5713024 agcagcattgatgtccat 5713007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5724134 - 5723917
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||| |||| || |||||||| ||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  |||  ||||| ||||    
T  5724134 aacatcggtatcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgg 5724035  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctg 198  Q
    | || ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  5724034 gcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctg 5723935  T
Q  199 agcagcattgatgtccat 216  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5723934 agcagcattgatgtccat 5723917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 5757343 - 5757560
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||| |||| || |||||||| ||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  |||  ||||| ||||    
T  5757343 aacatcggtatcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgg 5757442  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctg 198  Q
    | || ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  5757443 gcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctg 5757542  T
Q  199 agcagcattgatgtccat 216  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5757543 agcagcattgatgtccat 5757560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 216
Target Start/End: Original strand, 5768234 - 5768451
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||| |||| || |||||||| ||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  |||  ||||| ||||    
T  5768234 aacatcggtatcggagggaaagtaggtctggcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgg 5768333  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctg 198  Q
    | || ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  5768334 gcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgtgtacgacggaggtagctg 5768433  T
Q  199 agcagcattgatgtccat 216  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5768434 agcagcattgatgtccat 5768451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 15892966 - 15893178
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg---aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacg 97  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||   ||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  |||||||||    
T  15892966 caacattggtatcggagggaaagtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacg 15893065  T
Q  98 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagct 197  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |  |    
T  15893066 ggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaagggcggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggaggcattt 15893165  T
Q  198 gagcagcattgat 210  Q
    | |||||||||||    
T  15893166 gggcagcattgat 15893178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 8301527 - 8301736
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggt 100  Q
    |||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| | |  ||||||||||||    
T  8301527 caacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggt 8301626  T
Q  101 acctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgag 200  Q
    || ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| | |||| ||||||| |  || |    
T  8301627 acttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgagtacgacggaggcatttggg 8301726  T
Q  201 cagcattgat 210  Q
    ||||||||||    
T  8301727 cagcattgat 8301736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18051260 - 18051066
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacg 97  Q
    |||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||    
T  18051260 caacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacg 18051161  T
Q  98 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 192  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  ||||||| |||||  |||||||    
T  18051160 ggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgttgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 18051066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4893208 - 4892999
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggt 100  Q
    ||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||  || ||| ||| |||||| || ||     
T  4893208 caacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacaggg 4893109  T
Q  101 acctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgag 200  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||  |||| || | |||||    
T  4893108 acctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgag 4893009  T
Q  201 cagcattgat 210  Q
    ||||||||||    
T  4893008 cagcattgat 4892999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 22387838 - 22388047
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggt 100  Q
    ||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||  || ||| ||| |||||| || ||     
T  22387838 caacattggtataggaggaaaagtcggtctagcatattgttgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacaggg 22387937  T
Q  101 acctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgag 200  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || | ||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||  |||| || | |||||    
T  22387938 acctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacgatgggaagaacggatgctgagagtatggtgcataagggtaggacgggggaaactgag 22388037  T
Q  201 cagcattgat 210  Q
    ||||||||||    
T  22388038 cagcattgat 22388047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 35880763 - 35880552
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  ||||||||||    
T  35880763 aacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgg 35880664  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctg 198  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| |||||  ||||||| |  ||    
T  35880663 gtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttg 35880564  T
Q  199 agcagcattgat 210  Q
    ||| ||||||||    
T  35880563 agctgcattgat 35880552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32439152 - 32438944
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggt 100  Q
    ||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||  || ||| ||| |||||| || ||     
T  32439152 caacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacaggg 32439053  T
Q  101 acctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgag 200  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||  |||| || | |||||    
T  32439052 acctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgcataagggtaggacgggggaaactgag 32438953  T
Q  201 cagcattga 209  Q
    |||||||||    
T  32438952 cagcattga 32438944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8295970 - 8295779
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggt 100  Q
    |||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||| |||    
T  8295970 caacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgaattggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacaggt 8295871  T
Q  101 acctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 192  Q
    || ||||||||||||| || || ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||  |||||||    
T  8295870 acttgaggttgacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 8295779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 4796913 - 4797080
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacg 97  Q
    |||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  |||||||||    
T  4796913 caacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacg 4797012  T
Q  98 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  4797013 ggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 4797080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18330666 - 18330460
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  ||||||||||    
T  18330666 aacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgg 18330567  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctg 198  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||     ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  || |||| |||||  ||||||| |  ||    
T  18330566 gtacttgaggttgacccggtggcagagg-----gatgataaaatggtggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttg 18330472  T
Q  199 agcagcattgat 210  Q
    ||| ||||||||    
T  18330471 agctgcattgat 18330460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 29149015 - 29149182
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacg 97  Q
    |||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||    
T  29149015 caacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacg 29149114  T
Q  98 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    || || ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  29149115 ggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 29149182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 8211736 - 8211527
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggt 100  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||  ||||||  | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |  || ||| ||| |||||| || ||     
T  8211736 caacattggtataggaggaaaagttagtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacagga 8211637  T
Q  101 acctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgag 200  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||| |  ||||    
T  8211636 acctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgag 8211537  T
Q  201 cagcattgat 210  Q
    | ||||||||    
T  8211536 ctgcattgat 8211527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 20066041 - 20065877
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggt 100  Q
    ||||||||||||  ||||||| || |||||||  | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |  || ||| ||| |||||| || ||     
T  20066041 caacattggtataggaggaaaagttggtctagtatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacagga 20065942  T
Q  101 acctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  20065941 acctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 20065877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 168
Target Start/End: Original strand, 18277313 - 18277482
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||  | || |||||||  || ||| ||| |||||| || |    
T  18277313 aacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacag 18277412  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 168  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18277413 gaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 18277482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 168
Target Start/End: Original strand, 18292614 - 18292783
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||  | || |||||||  || ||| ||| |||||| || |    
T  18292614 aacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacag 18292713  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 168  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18292714 gaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 18292783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 168
Target Start/End: Original strand, 18307915 - 18308084
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||  | || |||||||  || ||| ||| |||||| || |    
T  18307915 aacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcagttgatgttgcacctgttgagcgatggcattgacag 18308014  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 168  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18308015 gaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 18308084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4721628 - 4721417
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   ||||||||  || || ||| | |  ||||| ||||    
T  4721628 aacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgttttatctgttgagcaattgcattgacgg 4721529  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctg 198  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||  || |||| |||||  ||||||| |  ||    
T  4721528 gtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaagatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttg 4721429  T
Q  199 agcagcattgat 210  Q
    ||| ||||||||    
T  4721428 agctgcattgat 4721417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 6192313 - 6192102
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| | |  ||||| ||||    
T  6192313 aacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgg 6192214  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctg 198  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||| || | |||||| ||||| | |||||| ||||||||||| ||  || |||| |||||  ||||||| |  ||    
T  6192213 gtacttgaggttgacccggtggcagagggtactaatgataaaatggcgaaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttg 6192114  T
Q  199 agcagcattgat 210  Q
    ||| ||||||||    
T  6192113 agctgcattgat 6192102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 4346947 - 4347111
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggt 100  Q
    ||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |  || ||| ||| |||||| || ||     
T  4346947 caacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacagga 4347046  T
Q  101 acctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||||||||| || | ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  4347047 acctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 4347111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 7073209 - 7073043
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  ||||| ||||    
T  7073209 aacatcggtatcggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgg 7073110  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    | || ||||||||||||| ||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  7073109 gcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 7073043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Original strand, 15741433 - 15741509
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  15741433 gcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 15741509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 28021273 - 28021109
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggt 100  Q
    ||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |  || ||| ||| |||||| || ||     
T  28021273 caacattggtataggaggaaaagttggtctagcatattgctgctgctgctgttgaactggcggttgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacagga 28021174  T
Q  101 acctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||||||||| || | ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  28021173 acctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 28021109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 32292747 - 32292697
Alignment:
Q  4 cattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  32292747 cattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgtcgttgttg 32292697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 10396131 - 10395970
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacg 97  Q
    |||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   |||||||  |   || ||| ||| |||||| ||     
T  10396131 caacataggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtacc---tgttgagcgatggcattgaca 10396035  T
Q  98 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctg 162  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  10396034 ggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctg 10395970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 17985216 - 17985429
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacg 97  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| |||    
T  17985216 caacattggtataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacg 17985315  T
Q  98 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagct 197  Q
    || || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |||||  ||||||| |  |    
T  17985316 ggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcattt 17985415  T
Q  198 gagcagcattgatg 211  Q
    |||| |||||||||    
T  17985416 gagctgcattgatg 17985429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 89 - 168
Target Start/End: Original strand, 29665336 - 29665415
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagta 168  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29665336 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagta 29665415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 54
Target Start/End: Original strand, 31034380 - 31034430
Alignment:
Q  4 cattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  31034380 cattggtatcagaggaaaggtaggtctagcctgttgctgctgtcgttgttg 31034430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 7996559 - 7996393
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  ||||| ||||    
T  7996559 aacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgg 7996460  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    | || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  7996459 gcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 7996393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 10643067 - 10642901
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  ||||| ||||    
T  10643067 aacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgg 10642968  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    | || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  10642967 gcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 10642901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Original strand, 28116308 - 28116384
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  28116308 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgctgaga 28116384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 47023360 - 47023284
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  47023360 gcattgacgggcacctgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 47023284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 210
Target Start/End: Original strand, 5596663 - 5596838
Alignment:
Q  35 tgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgat 134  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||| || || |||||    |||||| ||| |||||| || || ||||||||||| || | ||||||||| || ||||    
T  5596663 tgttgttgttgttgttgttgaattggcggttggtgttgtgcctgctgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgat 5596762  T
Q  135 gatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcattgat 210  Q
    |||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||  ||| |||||| ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  5596763 gataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggtacgacggaggcatttgagctgcattgat 5596838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 5466893 - 5466816
Alignment:
Q  88 ggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    |||||| || || ||||||||||| || | ||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  5466893 ggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaatggtgggaagaacggatgctgaga 5466816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Original strand, 11110712 - 11110788
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  11110712 gcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 11110788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18225189 - 18224977
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgtt---gttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacg 97  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||  |||||||   ||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| |||    
T  18225189 caacattggtataggagggaaggtaggcctagcttgttgattttgttgttgttgttgaaccggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacg 18225090  T
Q  98 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagct 197  Q
    || || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |||||  ||||||| |  |    
T  18225089 ggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcattt 18224990  T
Q  198 gagcagcattgat 210  Q
    |||| ||||||||    
T  18224989 gagctgcattgat 18224977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Original strand, 6542825 - 6542901
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  6542825 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 6542901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Original strand, 36997440 - 36997516
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || | ||||| ||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  36997440 gcattgacgggcacctgaggttggccgggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggatgctgaga 36997516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 63 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20384 - 20240
Alignment:
Q  63 gctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctg 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20384 gctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgatggaaagaagggatgctg 20285  T
Q  163 agagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcagcatt 207  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  20284 agagtatggcgcatatgggtacgacggaggtaactgggcagcatt 20240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 30489 - 30296
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacg 97  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||    
T  30489 caacattggtataggaggaaag-taggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacg 30391  T
Q  98 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 192  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||  |||||||    
T  30390 ggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 30296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 20425 - 20387
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttg 39  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  20425 caacattggtatcgggggaaaggtaggtctagcttgttg 20387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 29800 - 29614
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttg---aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacg 97  Q
    |||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||   ||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  |||||||||    
T  29800 caacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgttgatgttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagctattgcattaacg 29701  T
Q  98 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtac 184  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  29700 ggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatacgggtac 29614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 40288 - 40474
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacg 97  Q
    |||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  ||||| |||    
T  40288 caacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcatttacg 40387  T
Q  98 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtac 184  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||||    
T  40388 ggtacctgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcagaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtac 40474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 47204 - 47371
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacg 97  Q
    |||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  |||||||||    
T  47204 caacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacg 47303  T
Q  98 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||  || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  47304 ggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 47371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 21595 - 21391
Alignment:
Q  4 cattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacc 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||    | |  |  |||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||    
T  21595 cattggtatcggaggaaaggtaggtctggtttgttgttgctgctgtta---agccagcagctgttgttgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacc 21499  T
Q  104 tgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctgagcag 203  Q
    |||||||||||||  ||    ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||| |||||  |||||||||||||| ||    
T  21498 tgaggttgacccggcggtggtggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactggtacggcggaggtagctgagaag 21399  T
Q  204 cattgatg 211  Q
    ||||||||    
T  21398 cattgatg 21391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 27328 - 27135
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||   |||||||| ||| || ||| |||  ||||||||||    
T  27328 aacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaactggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgg 27229  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggagg 192  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||  |||||||    
T  27228 gtacttgaggttgacccggtggtagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcgcatatgggtatgacggagg 27135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Original strand, 350 - 561
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||| | |  ||||||||||    
T  350 aacatcggtatcggagggaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgg 449  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagctg 198  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| |||||  ||||||| |  ||    
T  450 gtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttg 549  T
Q  199 agcagcattgat 210  Q
    ||| ||||||||    
T  550 agctgcattgat 561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 66
Target Start/End: Original strand, 250 - 312
Alignment:
Q  4 cattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgatgctgttgttgttgaactggtggctg 66  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  250 cattggtatcggaggaaaggtaggtctagcttgttgctgctgttgctgttgagctggtggctg 312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 15149 - 15362
Alignment:
Q  1 caacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacg 97  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||| ||   |||||||| ||| || ||  | |  ||||| |||    
T  15149 caacattggtataggaggaaaagtaggtctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacg 15248  T
Q  98 ggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacaacggaggtagct 197  Q
    || || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||  ||| |||||  ||||||| |  |    
T  15249 ggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcattt 15348  T
Q  198 gagcagcattgatg 211  Q
    |||| |||||||||    
T  15349 gagctgcattgatg 15362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 8212 - 8102
Alignment:
Q  55 aactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaag 154  Q
    |||||| ||||| ||||| |  || ||| ||| |||||| || || ||||||||||| || | |||||||||||| |||||||| || ||||| |||||     
T  8212 aactggcggctgatgttgtacctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcctggtggcaaaggatactgatgataaaacggtgggaagaac 8113  T
Q  155 ggatgctgaga 165  Q
    |||||||||||    
T  8112 ggatgctgaga 8102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 165
Target Start/End: Original strand, 7459 - 7625
Alignment:
Q  2 aacattggtatcagaggaaaggtaggtctagcttgttgat---gctgttgttgttgaactggtggctgttgttgcatttgctgaacgacggcattaacgg 98  Q
    ||||| |||||| |||| || ||||| |||||||| ||||   | |||||||||||||| || | |||||||| ||| || ||  | |  ||||| ||||    
T  7459 aacatcggtatcggagggaaagtaggcctagcttgctgattttgttgttgttgttgaaccggcgtctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgg 7558  T
Q  99 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    | || ||||| || ||||  |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  7559 gcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 7625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 7883 - 7807
Alignment:
Q  89 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 165  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  7883 gcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgaga 7807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University