View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11453A_low_618 (Length: 223)

Name: NF11453A_low_618
Description: NF11453A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11453A_low_618
NF11453A_low_618
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (15-223)||(123369-123577)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (15-223)||(9582893-9583101)
chr7 (15-223)||(16119856-16120064)
chr7 (15-223)||(23515067-23515275)
chr7 (15-223)||(14551098-14551307)
chr7 (15-223)||(8717865-8718073)
chr7 (15-223)||(13673856-13674064)
chr7 (15-223)||(18593359-18593567)
chr7 (15-223)||(18618117-18618325)
chr7 (25-223)||(4312567-4312765)
chr7 (25-223)||(538762-538961)
chr7 (25-223)||(12567023-12567222)
chr7 (29-223)||(9003965-9004160)
chr7 (25-223)||(12548812-12549010)
chr7 (25-223)||(8780943-8781143)
chr7 (25-223)||(20108378-20108577)
chr7 (25-223)||(48801783-48801981)
chr7 (25-223)||(9264946-9265145)
chr7 (25-223)||(13657876-13658074)
chr7 (25-223)||(11921314-11921509)
chr7 (25-223)||(16532103-16532304)
chr7 (25-223)||(16633358-16633559)
chr7 (167-223)||(16465623-16465679)
chr7 (174-223)||(825783-825832)
chr7 (174-223)||(4461249-4461298)
chr7 (174-223)||(14221725-14221774)
chr7 (174-223)||(15916783-15916832)
chr7 (174-223)||(18287761-18287810)
chr7 (174-223)||(27291496-27291545)
chr7 (167-223)||(15206591-15206647)
chr7 (172-223)||(5397273-5397324)
chr7 (181-223)||(15065935-15065977)
chr7 (174-223)||(6713075-6713124)
chr7 (177-223)||(9194551-9194597)
chr7 (174-214)||(15522517-15522557)
chr7 (174-220)||(15348532-15348578)
chr7 (174-223)||(4791389-4791438)
chr7 (52-100)||(16465743-16465791)
[»] chr6 (30 HSPs)
chr6 (15-223)||(15699555-15699763)
chr6 (15-223)||(22165556-22165764)
chr6 (15-223)||(22243812-22244020)
chr6 (15-223)||(22061510-22061718)
chr6 (25-223)||(24855252-24855450)
chr6 (15-223)||(22767123-22767331)
chr6 (15-223)||(20170242-20170451)
chr6 (25-223)||(20107787-20107986)
chr6 (28-223)||(23023099-23023295)
chr6 (25-223)||(18448143-18448342)
chr6 (25-223)||(2181063-2181262)
chr6 (25-223)||(25625694-25625892)
chr6 (30-223)||(18854026-18854219)
chr6 (25-223)||(21560561-21560759)
chr6 (25-223)||(25631276-25631474)
chr6 (25-223)||(29595699-29595897)
chr6 (25-223)||(25963251-25963450)
chr6 (25-223)||(25967898-25968097)
chr6 (27-223)||(30671814-30672011)
chr6 (27-150)||(19585622-19585745)
chr6 (16-119)||(20016339-20016443)
chr6 (167-223)||(18184881-18184937)
chr6 (173-221)||(35270971-35271019)
chr6 (167-223)||(18731868-18731924)
chr6 (167-223)||(20218988-20219044)
chr6 (167-223)||(22113013-22113069)
chr6 (174-223)||(11204004-11204053)
chr6 (174-223)||(23517838-23517887)
chr6 (174-219)||(29686601-29686646)
chr6 (25-62)||(29686452-29686489)
[»] chr4 (22 HSPs)
chr4 (15-223)||(11496621-11496829)
chr4 (15-223)||(13822913-13823121)
chr4 (25-223)||(42709738-42709936)
chr4 (16-223)||(15254349-15254556)
chr4 (25-223)||(10630760-10630958)
chr4 (25-223)||(3354649-3354848)
chr4 (25-223)||(18291947-18292146)
chr4 (25-223)||(18081466-18081666)
chr4 (25-223)||(17484917-17485116)
chr4 (25-223)||(45234239-45234438)
chr4 (25-223)||(38426747-38426931)
chr4 (25-223)||(56580546-56580746)
chr4 (25-100)||(8092559-8092634)
chr4 (167-223)||(14654005-14654061)
chr4 (174-223)||(15865647-15865696)
chr4 (174-223)||(10650547-10650596)
chr4 (174-223)||(15260116-15260165)
chr4 (174-223)||(16682913-16682962)
chr4 (179-223)||(15409534-15409578)
chr4 (170-219)||(8092438-8092487)
chr4 (174-223)||(9488885-9488934)
chr4 (181-223)||(17296256-17296298)
[»] chr3 (47 HSPs)
chr3 (15-223)||(10602479-10602687)
chr3 (15-223)||(13504888-13505096)
chr3 (15-223)||(11947407-11947615)
chr3 (15-223)||(16448767-16448975)
chr3 (15-223)||(15556949-15557157)
chr3 (15-223)||(7600355-7600563)
chr3 (15-223)||(9360978-9361186)
chr3 (15-223)||(16373572-16373780)
chr3 (15-223)||(12187083-12187291)
chr3 (15-223)||(37942378-37942586)
chr3 (25-223)||(12193497-12193695)
chr3 (15-223)||(6814868-6815076)
chr3 (15-223)||(10147011-10147219)
chr3 (15-223)||(15645001-15645209)
chr3 (15-223)||(10160180-10160388)
chr3 (15-223)||(13187424-13187632)
chr3 (25-223)||(3245595-3245793)
chr3 (25-220)||(2721307-2721502)
chr3 (25-223)||(4382754-4382954)
chr3 (25-223)||(13001432-13001632)
chr3 (25-215)||(1992806-1992996)
chr3 (25-223)||(13097714-13097912)
chr3 (25-223)||(10546943-10547145)
chr3 (25-223)||(20156522-20156719)
chr3 (25-223)||(13690611-13690809)
chr3 (25-223)||(11398218-11398417)
chr3 (25-223)||(14348595-14348794)
chr3 (25-223)||(22637702-22637901)
chr3 (25-223)||(3279193-3279392)
chr3 (25-223)||(17387839-17388038)
chr3 (25-223)||(12160214-12160413)
chr3 (15-113)||(16655798-16655897)
chr3 (134-222)||(17045814-17045902)
chr3 (134-222)||(17047974-17048062)
chr3 (174-223)||(27356735-27356784)
chr3 (173-223)||(13601220-13601270)
chr3 (174-223)||(3339233-3339282)
chr3 (174-223)||(12776541-12776590)
chr3 (174-223)||(13136217-13136266)
chr3 (174-223)||(20584262-20584311)
chr3 (179-223)||(15946773-15946817)
chr3 (172-223)||(14445775-14445826)
chr3 (174-220)||(15619293-15619339)
chr3 (174-223)||(13195465-13195514)
chr3 (175-223)||(8686394-8686442)
chr3 (167-223)||(20225761-20225817)
chr3 (179-223)||(13068306-13068350)
[»] chr2 (30 HSPs)
chr2 (15-223)||(22665062-22665270)
chr2 (15-223)||(117543-117751)
chr2 (15-223)||(22044667-22044875)
chr2 (15-223)||(25357511-25357719)
chr2 (15-223)||(16775651-16775859)
chr2 (25-223)||(11622-11820)
chr2 (27-223)||(17590419-17590615)
chr2 (15-223)||(24795292-24795500)
chr2 (15-223)||(27627580-27627789)
chr2 (25-223)||(25144764-25144963)
chr2 (25-223)||(5500272-5500471)
chr2 (28-223)||(25804274-25804469)
chr2 (25-223)||(25370892-25371090)
chr2 (25-223)||(23798929-23799127)
chr2 (25-150)||(24502171-24502297)
chr2 (25-223)||(23643953-23644153)
chr2 (76-223)||(24178200-24178348)
chr2 (174-223)||(23159392-23159441)
chr2 (174-223)||(23570649-23570698)
chr2 (174-223)||(27631655-27631704)
chr2 (174-223)||(27768823-27768872)
chr2 (179-223)||(24171510-24171554)
chr2 (174-220)||(23257579-23257625)
chr2 (174-223)||(24321328-24321377)
chr2 (167-223)||(24506802-24506858)
chr2 (167-222)||(25337659-25337714)
chr2 (169-211)||(23648123-23648165)
chr2 (184-214)||(29955868-29955898)
chr2 (181-222)||(21512574-21512615)
chr2 (174-222)||(24019075-24019123)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (15-223)||(27046874-27047082)
chr1 (15-223)||(17094608-17094816)
chr1 (15-223)||(21798669-21798878)
chr1 (15-223)||(20237456-20237664)
chr1 (25-223)||(8653126-8653324)
chr1 (25-223)||(52938628-52938827)
chr1 (25-223)||(3989947-3990147)
chr1 (29-223)||(19364043-19364237)
chr1 (142-223)||(14070632-14070713)
chr1 (172-223)||(19875651-19875702)
chr1 (167-223)||(21784479-21784535)
chr1 (174-223)||(16382582-16382631)
chr1 (167-223)||(4027832-4027888)
chr1 (167-223)||(8947522-8947578)
chr1 (25-103)||(21784598-21784675)
[»] chr5 (27 HSPs)
chr5 (15-223)||(20595838-20596046)
chr5 (15-223)||(20602124-20602332)
chr5 (15-223)||(20608415-20608623)
chr5 (15-223)||(15735534-15735742)
chr5 (15-205)||(23710701-23710892)
chr5 (15-223)||(23748051-23748259)
chr5 (25-212)||(20622172-20622359)
chr5 (25-223)||(24940543-24940742)
chr5 (15-223)||(18072900-18073108)
chr5 (15-223)||(24953181-24953389)
chr5 (15-223)||(20790721-20790929)
chr5 (25-222)||(23600644-23600842)
chr5 (25-223)||(24219755-24219954)
chr5 (25-223)||(20444846-20445045)
chr5 (36-223)||(21387410-21387598)
chr5 (26-223)||(20916463-20916660)
chr5 (25-100)||(22948521-22948596)
chr5 (25-146)||(20575512-20575633)
chr5 (174-223)||(22317520-22317569)
chr5 (174-223)||(25006815-25006864)
chr5 (174-223)||(30759662-30759711)
chr5 (167-223)||(18484219-18484275)
chr5 (180-223)||(25116178-25116221)
chr5 (174-223)||(22855723-22855772)
chr5 (174-223)||(26847803-26847852)
chr5 (185-223)||(25175268-25175306)
chr5 (185-223)||(27270563-27270601)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (15-223)||(15678-15886)
[»] chr8 (26 HSPs)
chr8 (15-223)||(21382093-21382302)
chr8 (15-223)||(21098801-21099009)
chr8 (15-223)||(21104122-21104330)
chr8 (15-223)||(23911441-23911648)
chr8 (15-223)||(8314467-8314676)
chr8 (15-223)||(8322853-8323062)
chr8 (25-223)||(21843531-21843730)
chr8 (25-223)||(21940003-21940203)
chr8 (25-223)||(20038988-20039186)
chr8 (25-221)||(23454947-23455144)
chr8 (25-223)||(17620757-17620954)
chr8 (51-223)||(24034049-24034223)
chr8 (25-223)||(16418627-16418827)
chr8 (25-219)||(14352181-14352376)
chr8 (41-222)||(21538573-21538757)
chr8 (119-223)||(20712537-20712642)
chr8 (174-223)||(11346960-11347009)
chr8 (174-223)||(19767684-19767733)
chr8 (174-223)||(22370102-22370151)
chr8 (179-223)||(20002279-20002323)
chr8 (25-91)||(20712473-20712539)
chr8 (174-223)||(22033562-22033611)
chr8 (174-223)||(22099662-22099711)
chr8 (174-223)||(22102552-22102601)
chr8 (179-223)||(21831181-21831225)
chr8 (179-223)||(22817755-22817799)
[»] scaffold0404 (2 HSPs)
scaffold0404 (15-223)||(1038-1246)
scaffold0404 (157-223)||(3451-3517)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (15-223)||(622-831)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (25-223)||(223-421)
[»] scaffold0825 (1 HSPs)
scaffold0825 (25-223)||(2859-3058)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (30-223)||(11064-11257)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (25-223)||(251877-252076)
[»] scaffold0506 (1 HSPs)
scaffold0506 (25-223)||(2294-2493)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (25-223)||(834-1034)
[»] scaffold0773 (1 HSPs)
scaffold0773 (25-223)||(482-680)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (25-223)||(14669-14867)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (25-223)||(120956-121155)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (25-223)||(7944-8142)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (72-223)||(164410-164562)
scaffold0011 (167-223)||(172254-172310)
scaffold0011 (167-223)||(161995-162051)
[»] scaffold0974 (1 HSPs)
scaffold0974 (25-223)||(1111-1311)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (25-223)||(58635-58835)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (25-223)||(97733-97933)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (25-223)||(517-715)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (112-223)||(10213-10325)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (22-223)||(13009-13210)
[»] scaffold0582 (1 HSPs)
scaffold0582 (112-223)||(8750-8862)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (25-223)||(35111-35307)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (69-223)||(12450-12604)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (69-223)||(232794-232948)
[»] scaffold0096 (2 HSPs)
scaffold0096 (129-223)||(38515-38610)
scaffold0096 (50-100)||(38625-38675)
[»] scaffold1095 (1 HSPs)
scaffold1095 (25-89)||(2862-2926)
[»] scaffold0512 (1 HSPs)
scaffold0512 (167-223)||(5232-5288)
[»] scaffold0258 (1 HSPs)
scaffold0258 (167-223)||(22162-22218)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (167-223)||(42237-42293)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (167-223)||(50513-50569)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (172-223)||(912-963)
[»] scaffold0566 (1 HSPs)
scaffold0566 (174-223)||(2762-2811)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (179-223)||(12743-12787)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (167-222)||(37751-37806)
scaffold0116 (25-103)||(37869-37946)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (174-223)||(10720-10769)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (174-223)||(1193-1242)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (174-223)||(54856-54905)
[»] scaffold1225 (1 HSPs)
scaffold1225 (167-223)||(1839-1895)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (167-223)||(22756-22811)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (172-223)||(37868-37919)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (167-223)||(45235-45291)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (174-214)||(83174-83214)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (180-223)||(72579-72622)
scaffold0037 (180-223)||(84769-84812)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (185-223)||(18218-18256)


Alignment Details
Target: scaffold0029 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 123369 - 123577
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  123369 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 123468  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  123469 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 123568  T
Q  215 gtgggggag 223  Q
    |||||||||    
T  123569 gtgggggag 123577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 9582893 - 9583101
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9582893 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 9582992  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9582993 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 9583092  T
Q  215 gtgggggag 223  Q
    |||||||||    
T  9583093 gtgggggag 9583101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16120064 - 16119856
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16120064 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 16119965  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16119964 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgtttgtgctactatgtatatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 16119865  T
Q  215 gtgggggag 223  Q
    |||||||||    
T  16119864 gtgggggag 16119856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 23515067 - 23515275
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23515067 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 23515166  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23515167 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 23515266  T
Q  215 gtgggggag 223  Q
    |||||||||    
T  23515267 gtgggggag 23515275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 14551098 - 14551307
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaa-attacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaa 113  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14551098 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa 14551197  T
Q  114 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14551198 gcccttgaggggacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataaccgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 14551297  T
Q  214 tgtgggggag 223  Q
    ||||||||||    
T  14551298 tgtgggggag 14551307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 8717865 - 8718073
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  8717865 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaacacttgagtttgtgattagtgtacacttgggatttaag 8717964  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8717965 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactattggtgctactatgtttatgcattttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 8718064  T
Q  215 gtgggggag 223  Q
    |||||||||    
T  8718065 gtgggggag 8718073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 13673856 - 13674064
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13673856 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaaaaaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 13673955  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13673956 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgttgatgctactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 13674055  T
Q  215 gtgggggag 223  Q
     ||||||||    
T  13674056 atgggggag 13674064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18593567 - 18593359
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  18593567 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagattccaagaaatacttgagtttgtaattagtgtacattttggatttaag 18593468  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18593467 cccttgaggagacatgtactttaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 18593368  T
Q  215 gtgggggag 223  Q
     ||||||||    
T  18593367 atgggggag 18593359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 18618117 - 18618325
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  18618117 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagattccaagaaatacttgagtttgtaattagtgtacattttggatttaag 18618216  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18618217 cccttgaggagacatgtactttaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 18618316  T
Q  215 gtgggggag 223  Q
     ||||||||    
T  18618317 atgggggag 18618325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Original strand, 4312567 - 4312765
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  ||  ||||| |||||||    
T  4312567 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgagga 4312666  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||  | ||||||||||||||||| |||||    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4312667 gacataagttttaattgaattgtcatatgataatcttgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 4312765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 538961 - 538762
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaa-tgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||  |||  ||| || ||||| |||    
T  538961 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaaaaaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaaacccttcagg 538862  T
Q  124 agacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  538861 agacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 538762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Original strand, 12567023 - 12567222
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||  ||| |||||||||||||    
T  12567023 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgtttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttgagga 12567122  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||| |||||  | || || || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12567123 gacatgagttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgttctaccatgtttatgcattttgcttgaggacaagcaaaaattcaagtgtgggggag 12567222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 223
Target Start/End: Original strand, 9003965 - 9004160
Alignment:
Q  29 acactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagaca 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||   |||  ||  ||||| |||||||||||    
T  9003965 acactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagatcacaagaaatgcttgagtttgtaattagtgtatgcttgaaataaaagcctttgaggagaca 9004064  T
Q  129 tgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |  | ||||||||||||||||| ||||| |  ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9004065 taagttttaattgaattgtcatatgataaacttgttttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtgtgggggag 9004160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12549010 - 12548812
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||  ||| |||||||||||||    
T  12549010 acacacactcacttgaagcttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtggacgcttgaaattgaagcccttgagga 12548911  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgat-ataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||| |||| |||    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12548910 gacatgt-atttaattaaattgtcatatgataatattattttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgttggggag 12548812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8781143 - 8780943
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||  ||||| |||||||    
T  8781143 acacacactaccttgaaacttgattgttgggttgaataaaggttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacacttgaaataaaagcctttgagga 8781044  T
Q  125 gacat--gtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 222  Q
    |||||  ||  ||||||||||||||||| || ||    ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8781043 gacataagttttttaattgaattgtcatatgttaatcttgtttatgctgctatgtttatgccttttgtttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 8780944  T
Q  223 g 223  Q
    |    
T  8780943 g 8780943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Original strand, 20108378 - 20108577
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||  ||  ||||| |||||||    
T  20108378 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagcctttgagga 20108477  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||  | |||||||||||| |||| |||||    || ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20108478 gacatcagttttaattgaattctcatatgataaccttgttttatgctactatgtttatgtcttttgcttgaggacaataaaagattcaagtgtgggggag 20108577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 48801981 - 48801783
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    ||||| ||||||||   ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||| |||||||    
T  48801981 acacatactcactttttacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgtttgaaattaaagcctttgagga 48801882  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataa-ct--gttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 221  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||   |||||| ||   ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48801881 gacatgagttttgattgaattgtcat---atataatcttgtttattgctactatgtgtatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggggg 48801785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9265145 - 9264946
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||  ||  ||| | |||||||    
T  9265145 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagtctttgagga 9265046  T
Q  125 gacatgtg-ctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||  |  ||| ||||||||||||| || ||    || |  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9265045 gacataagttttttattgaattgtcatatgttaatcttgcttatgctgctatgtttatgccttttgtttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 9264946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Original strand, 13657876 - 13658074
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |   |||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| ||||| |||||||    
T  13657876 acacacactcatttgaaacttgattgttgggtggaaaagggattacaaagaatgcttgagtttgtgattagtgtacacttgaaattaaagcctttgagga 13657975  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    || ||||| ||||||| |||||||||    ||    ||||   ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13657976 gatatgtgttttaattaaattgtcatgaagtaatcttgtttacgctaccatgttgatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 13658074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11921509 - 11921314
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtaca-tttgggatttaagcccttgagg 123  Q
    ||||||||||||||   ||| ||| ||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||  ||  ||||| ||||||    
T  11921509 acacacactcacttaggactagattgttgggttgaaaaaggattataagaaatgcttgcgtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttgagg 11921410  T
Q  124 agacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||| |||   || ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11921409 agacgtgtgctttaatgtaattgtcatgtga---aaatgtta-tgctaccatgtttatgacttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 11921314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Original strand, 16532103 - 16532304
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcg-ttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaa-gcccttgag 122  Q
    ||||||||||| || | ||||||| | |||||||||| |||  ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||  || | | | || ||| |||||    
T  16532103 acacacactcaattaagacttgattgattgggttgaaaaaaggttataagaaatacttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaatgcctttgag 16532202  T
Q  123 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 221  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    | ||   |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16532203 gagacatgtgctttaatgtaattgtcatatgaaaatgttattttatgctaccatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatggggg 16532302  T
Q  222 ag 223  Q
    ||    
T  16532303 ag 16532304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16633559 - 16633358
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcg-ttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaa-gcccttgag 122  Q
    ||||||||||| || | ||||||| | |||||||||| |||  ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||  || | | | || ||| |||||    
T  16633559 acacacactcaattaagacttgattgattgggttgaaaaaaggttataagaaatacttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaatgcctttgag 16633460  T
Q  123 gagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 221  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||| |    | ||   |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16633459 gagacatgtgctttaatgtaattgtcatatgaaaatgttattttatgctaccatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatggggg 16633360  T
Q  222 ag 223  Q
    ||    
T  16633359 ag 16633358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16465679 - 16465623
Alignment:
Q  167 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16465679 tgctactatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 16465623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Original strand, 825783 - 825832
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  825783 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 825832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4461298 - 4461249
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4461298 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggag 4461249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14221774 - 14221725
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14221774 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 14221725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15916832 - 15916783
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15916832 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 15916783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Original strand, 18287761 - 18287810
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18287761 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 18287810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Original strand, 27291496 - 27291545
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27291496 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 27291545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15206647 - 15206591
Alignment:
Q  167 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15206647 tgctgctatgtctatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 15206591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 223
Target Start/End: Original strand, 5397273 - 5397324
Alignment:
Q  172 ctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5397273 ctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtaggggag 5397324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 223
Target Start/End: Original strand, 15065935 - 15065977
Alignment:
Q  181 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15065935 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 15065977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6713124 - 6713075
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  6713124 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtataggggag 6713075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9194597 - 9194551
Alignment:
Q  177 tttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  9194597 tttatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtatgggggag 9194551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 214
Target Start/End: Original strand, 15522517 - 15522557
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15522517 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagt 15522557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 220
Target Start/End: Original strand, 15348532 - 15348578
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15348532 atgtttatgccttttacttgaggacaaacaaagattcaagtttgggg 15348578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4791438 - 4791389
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4791438 atgtctatgcattctgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggag 4791389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 16465791 - 16465743
Alignment:
Q  52 tgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtac 100  Q
    ||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16465791 tgggttgaaaaaggattataagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 16465743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 30)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 15699555 - 15699763
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15699555 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 15699654  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15699655 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 15699754  T
Q  215 gtgggggag 223  Q
    |||||||||    
T  15699755 gtgggggag 15699763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22165764 - 22165556
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22165764 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 22165665  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22165664 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 22165565  T
Q  215 gtgggggag 223  Q
    |||||||||    
T  22165564 gtgggggag 22165556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 22243812 - 22244020
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22243812 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 22243911  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22243912 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 22244011  T
Q  215 gtgggggag 223  Q
    |||||||||    
T  22244012 gtgggggag 22244020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22061718 - 22061510
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22061718 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 22061619  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22061618 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 22061519  T
Q  215 gtgggggag 223  Q
     ||||||||    
T  22061518 atgggggag 22061510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24855450 - 24855252
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacattt-gggatttaagcccttgagg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24855450 acacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaagcccttgagg 24855351  T
Q  124 agacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24855350 agacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggag 24855252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22767331 - 22767123
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacattt-gggatttaa 113  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22767331 tggacttcacacacactctcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 22767232  T
Q  114 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22767231 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactgttgatgttactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 22767133  T
Q  214 tgtgggggag 223  Q
    | ||||||||    
T  22767132 tatgggggag 22767123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 20170242 - 20170451
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtaca-tttgggatttaa 113  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20170242 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 20170341  T
Q  114 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatat-aactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20170342 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 20170440  T
Q  213 gtgtgggggag 223  Q
    || ||||||||    
T  20170441 gtatgggggag 20170451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20107986 - 20107787
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  ||  ||||| |||||||    
T  20107986 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaatgaaagcctttgagga 20107887  T
Q  125 gacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataac-tgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 222  Q
    |||||  | ||| |||||||||||||| || | || | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20107886 gacataagttttcaattgaattgtcatatg-tttatcttgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 20107788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 223
Target Start/End: Original strand, 23023099 - 23023295
Alignment:
Q  28 cacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagac 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  ||| ||||||||||||||||    
T  23023099 cacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttgaggagac 23023198  T
Q  128 atgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||| |  |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23023199 atgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttatgctaccatgtttaagacttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 23023295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Original strand, 18448143 - 18448342
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  ||| |||||||||||||    
T  18448143 acacacagtcacttgaaacttgactgttgggatgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttgagga 18448242  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | || || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18448243 gacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccaagtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 18448342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Original strand, 2181063 - 2181262
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| | ||| |  | |  |||||||||||||||||    
T  2181063 acacacactcacttgaaacttggttgttgagttgaataaggattacgagaaatgcttaagtttgtgattaatgtgcgctcgaaatttaagcccttgagga 2181162  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg-gtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2181163 gacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 2181262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Original strand, 25625694 - 25625892
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  ||| |||||||| ||||    
T  25625694 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttaagga 25625793  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||| |||||  | ||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  25625794 gacatatgttttaattaaattgtcatatgataatattgtttatgctaccatgtttacaccttttgcttgaggacaagcaaaaattcaagtatgggggag 25625892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 223
Target Start/End: Original strand, 18854026 - 18854219
Alignment:
Q  30 cactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacat 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |  ||| ||||||||||||||||||    
T  18854026 cactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgctggaaattaaagcccttgaggagacat 18854125  T
Q  130 gtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||  |||||| ||||||||| |||||  | ||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  18854126 gtgtattaattaaattgtcatatgataatattgtttatgctaccatatttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtatgggggag 18854219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21560759 - 21560561
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| ||||| |||||||    
T  21560759 acacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaaagaatgcttgagtttgtgattagtgtacacttgaaattaaagcctttgagga 21560660  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||    ||    ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21560659 gacatgtgttttaattaaattgacatgaagtaatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggag 21560561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25631474 - 25631276
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  ||| ||||| |||| ||    
T  25631474 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcctttgaaga 25631375  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataa-ct--gttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 221  Q
    || ||  | |||||||||||||||||   |||||| ||   ||  |||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25631374 gatataagttttaattgaattgtcat---atataatcttgtttattgctaccatgtttatgcatttttcctgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 25631278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Original strand, 29595699 - 29595897
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||| | || |||||||| |||  ||| ||||||||| |||    
T  29595699 acacacagtcatttgaaacttgattattgggttgaaaaaggattacaagaaatgtttgagttttttattagtgtacacttgaaattaaagcccttgggga 29595798  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||    | ||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29595799 gacatgtgttttaattaaatcgtcatgtgataatcttatttatgctaccatgtttatgctttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgagggag 29595897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Original strand, 25963251 - 25963450
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||   |||  ||  ||||| |||||||    
T  25963251 acacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattaaaggaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagcctttgagga 25963350  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataact-gttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    ||||     ||||||||||||||||| || ||   || | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25963351 gacacaaattttaattgaattgtcatatgttaagtcttgcttatgctactatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 25963450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Original strand, 25967898 - 25968097
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||   |||  ||  ||||| |||||||    
T  25967898 acacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattaaaggaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagcctttgagga 25967997  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataact-gttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    ||||     ||||||||||||||||| || ||   || | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25967998 gacacaaattttaattgaattgtcatatgttaagtcttgcttatgctactatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 25968097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30672011 - 30671814
Alignment:
Q  27 acacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgaggaga 126  Q
    ||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  ||  ||||| ||| ||| |    
T  30672011 acacactcaattagaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttggggaaa 30671912  T
Q  127 catgtgctttaattgaattgtcatttgatataact-gttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    ||     ||||||||||||||||| || ||   || | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30671911 cacaaattttaattgaattgtcatatgttaagtcttgcttatgctactatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 30671814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 19585745 - 19585622
Alignment:
Q  27 acacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgaggaga 126  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  ||  ||||| || ||||||    
T  19585745 acacactcacttaaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgtgtttgtgattagtgtacgtttgaaataaaagccttttaggaga 19585646  T
Q  127 catgtgctttaattgaattgtcat 150  Q
    |||| | |||||||| ||||||||    
T  19585645 catgagttttaattgtattgtcat 19585622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 20016443 - 20016339
Alignment:
Q  16 ggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtaca-tttgggatttaag 114  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||| ||||||||||  || |||||||| |||||||||||||    
T  20016443 ggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttggatagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgcaattagtgtacattttgggatttaag 20016344  T
Q  115 ccctt 119  Q
    |||||    
T  20016343 ccctt 20016339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18184937 - 18184881
Alignment:
Q  167 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18184937 tgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggag 18184881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 221
Target Start/End: Original strand, 35270971 - 35271019
Alignment:
Q  173 tatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 221  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35270971 tatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 35271019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 18731868 - 18731924
Alignment:
Q  167 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18731868 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagctaagattcaagtgtggaggag 18731924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20219044 - 20218988
Alignment:
Q  167 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  20219044 tgctgctatgtttatgccttttgcttgaagagaagcaaagattcatgtgtgggggag 20218988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22113069 - 22113013
Alignment:
Q  167 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  22113069 tgctgctatgtttatgccttttgcttgaagagaagcaaagattcatgtgtgggggag 22113013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Original strand, 11204004 - 11204053
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  11204004 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaatatttaagtgtgggggag 11204053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23517887 - 23517838
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  23517887 atgtgtatgccttttgcttgaggataagcaaagattcaagtatgggggag 23517838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 219
Target Start/End: Original strand, 29686601 - 29686646
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 219  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  29686601 atgtttatgcctcttgcttgaggacaagaaaagattcaagtatggg 29686646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 62
Target Start/End: Original strand, 29686452 - 29686489
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaata 62  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  29686452 acacacactcacttgagacttgattgttgggttgaata 29686489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 22)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11496829 - 11496621
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11496829 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 11496730  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11496729 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 11496630  T
Q  215 gtgggggag 223  Q
    |||||||||    
T  11496629 gtgggggag 11496621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 13822913 - 13823121
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13822913 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 13823012  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13823013 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 13823112  T
Q  215 gtgggggag 223  Q
    |||||||||    
T  13823113 gtgggggag 13823121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 42709936 - 42709738
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42709936 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgagatttaagcccttgagga 42709837  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42709836 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 42709738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 15254349 - 15254556
Alignment:
Q  16 ggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagc 115  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  15254349 ggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattttggatttaaac 15254448  T
Q  116 ccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtg 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15254449 ccttaaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgtgcaactacgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtg 15254548  T
Q  216 tgggggag 223  Q
    ||||||||    
T  15254549 tgggggag 15254556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Original strand, 10630760 - 10630958
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  |||||||||||||||||    
T  10630760 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgagga 10630859  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |  ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10630860 gacatgtgctttaattaaattgtcatatgata-atatgtcttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 10630958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Original strand, 3354649 - 3354848
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  ||| |||||||||||||    
T  3354649 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttgagga 3354748  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3354749 gacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaactattcaagtgtgggggag 3354848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Original strand, 18291947 - 18292146
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||  ||| |||||||||||||    
T  18291947 acacacgctcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgactttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttgagga 18292046  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | || || ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18292047 gacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgcctttttcttgtggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 18292146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18081666 - 18081466
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtaca-tttgggatttaagcccttgagg 123  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||  ||  ||||| ||||||    
T  18081666 acacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttgagg 18081567  T
Q  124 agacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 222  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    ||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18081566 agacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttctatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 18081467  T
Q  223 g 223  Q
    |    
T  18081466 g 18081466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17485116 - 17484917
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||  ||  |||||| ||||||    
T  17485116 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggattataagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcccctgagga 17485017  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||  | ||||||| ||||||||| |||||    || ||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17485016 gacataagttttaattaaattgtcatgtgataatcttgttttatgctaccatatttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 17484917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 45234438 - 45234239
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||  ||  ||||| |||||||    
T  45234438 acacacactcacttgaaacttgatagttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattactgtacgcttgaaataaaagcctttgagga 45234339  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||  | ||||||| ||||||||| |||||    || ||  ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45234338 gacattagttttaatttaattgtcatatgataatcttgttttatgccaccatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtctgggggag 45234239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Original strand, 38426747 - 38426931
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  ||| |||||||||||||    
T  38426747 acacacactcacttgaaacttgattgttggcttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttgagga 38426846  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||             || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38426847 gacatgtgttttaattaaattgtcatatgata------------atatta--tttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 38426931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 56580746 - 56580546
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtaca-tttgggatttaagcccttgagg 123  Q
    |||||||||||||| | |||||||   ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||  ||  ||||| ||||||    
T  56580746 acacacactcacttaagacttgatttatgggttgaaaaatgattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttgagg 56580647  T
Q  124 agacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 222  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||||    | ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56580646 agacatgtgctttaatttaattgtcagatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 56580547  T
Q  223 g 223  Q
    |    
T  56580546 g 56580546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 8092634 - 8092559
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtac 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8092634 acacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 8092559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14654061 - 14654005
Alignment:
Q  167 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14654061 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 14654005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Original strand, 15865647 - 15865696
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15865647 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 15865696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Original strand, 10650547 - 10650596
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10650547 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggag 10650596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15260165 - 15260116
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15260165 atgtctatgccttttgcttgaggaaaagcaaagattcaagtgtgggggag 15260116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Original strand, 16682913 - 16682962
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16682913 atgtctatgccttttgcttgatgacaagcaaagattcaagtgtgggggag 16682962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 223
Target Start/End: Original strand, 15409534 - 15409578
Alignment:
Q  179 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15409534 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattctagtgtgggggag 15409578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8092487 - 8092438
Alignment:
Q  170 tactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 219  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8092487 tactatgtttatgtctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtatggg 8092438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9488934 - 9488885
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  9488934 atgttcatgccttttgcttgaggacaagcaaagattgaagtatgggggag 9488885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17296298 - 17296256
Alignment:
Q  181 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17296298 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagcatgggggag 17296256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 47)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10602687 - 10602479
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10602687 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 10602588  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10602587 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 10602488  T
Q  215 gtgggggag 223  Q
    |||||||||    
T  10602487 gtgggggag 10602479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13505096 - 13504888
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13505096 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 13504997  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13504996 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 13504897  T
Q  215 gtgggggag 223  Q
    |||||||||    
T  13504896 gtgggggag 13504888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 11947407 - 11947615
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11947407 tggacttcacacacacactcatttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 11947506  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11947507 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagtaaagattcaagt 11947606  T
Q  215 gtgggggag 223  Q
    |||||||||    
T  11947607 gtgggggag 11947615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16448975 - 16448767
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  16448975 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacatttggaatttaag 16448876  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448875 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 16448776  T
Q  215 gtgggggag 223  Q
     ||||||||    
T  16448775 atgggggag 16448767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15557157 - 15556949
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15557157 tggacttcatacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaagatttcaagaaatgcttaagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 15557058  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15557057 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgaattaactattgatgctactatgtttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagt 15556958  T
Q  215 gtgggggag 223  Q
    |||||||||    
T  15556957 gtgggggag 15556949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 7600355 - 7600563
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7600355 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 7600454  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7600455 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 7600554  T
Q  215 gtgggggag 223  Q
     ||||||||    
T  7600555 atgggggag 7600563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9361186 - 9360978
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  9361186 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacatttggaatttaag 9361087  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9361086 cccttgaggagacatgtcctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 9360987  T
Q  215 gtgggggag 223  Q
     ||||||||    
T  9360986 atgggggag 9360978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16373780 - 16373572
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacattt-gggatttaa 113  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16373780 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 16373681  T
Q  114 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16373680 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 16373582  T
Q  214 tgtgggggag 223  Q
    | ||||||||    
T  16373581 tatgggggag 16373572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12187291 - 12187083
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacattt-gggatttaa 113  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  12187291 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 12187192  T
Q  114 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12187191 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 12187093  T
Q  214 tgtgggggag 223  Q
    | ||||||||    
T  12187092 tatgggggag 12187083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 37942378 - 37942586
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacattt-gggatttaa 113  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  37942378 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaggaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 37942477  T
Q  114 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37942478 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 37942576  T
Q  214 tgtgggggag 223  Q
    | ||||||||    
T  37942577 tatgggggag 37942586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12193695 - 12193497
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacattt-gggatttaagcccttgagg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12193695 acacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaagcccttgagg 12193596  T
Q  124 agacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12193595 agacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaggtatgggggag 12193497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 6814868 - 6815076
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacattt-gggatttaa 113  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||     
T  6814868 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttat 6814967  T
Q  114 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6814968 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aactgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 6815066  T
Q  214 tgtgggggag 223  Q
    | || |||||    
T  6815067 tatgagggag 6815076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 10147011 - 10147219
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacattt-gggatttaa 113  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10147011 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 10147110  T
Q  114 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10147111 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aactgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagactcaag 10147209  T
Q  214 tgtgggggag 223  Q
    | ||||||||    
T  10147210 tatgggggag 10147219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 15645001 - 15645209
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacattt-gggatttaa 113  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15645001 tggacttcacacacacactcacttgaaacttaattgttgggtagaataaagatttcaagaaacacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 15645100  T
Q  114 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15645101 gcccttgaggagacatgtgctttaattga-ttgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 15645199  T
Q  214 tgtgggggag 223  Q
    | ||||||||    
T  15645200 tatgggggag 15645209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10160388 - 10160180
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacattt-gggatttaa 113  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  10160388 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggattaaa 10160289  T
Q  114 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10160288 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aactgtcattcgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 10160190  T
Q  214 tgtgggggag 223  Q
    | ||||||||    
T  10160189 tatgggggag 10160180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13187632 - 13187424
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacattt-gggatttaa 113  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  13187632 tggacttcacacacacactcacttgaaactcgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggattaaa 13187533  T
Q  114 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13187532 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aactgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 13187434  T
Q  214 tgtgggggag 223  Q
    | ||||||||    
T  13187433 tatgggggag 13187424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3245793 - 3245595
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  ||  ||||| |||||||    
T  3245793 acacatactcacttgagacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgagga 3245694  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||  | ||||||||||||||||| |||||    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3245693 gacataagttttaattgaattgtcatatgataatcttgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 3245595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 220
Target Start/End: Original strand, 2721307 - 2721502
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||   |  ||||| |||||||    
T  2721307 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaattaaaagcctttgagga 2721406  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 220  Q
    |||||  | ||||||||||||||||| | |||    ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2721407 gacataagttttaattgaattgtcatattataatcttgtttatgctgctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 2721502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Original strand, 4382754 - 4382954
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtaca-tttgggatttaagcccttgagg 123  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||  ||  ||||| ||||||    
T  4382754 acacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttgagg 4382853  T
Q  124 agacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 222  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    ||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4382854 agacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttctatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 4382953  T
Q  223 g 223  Q
    |    
T  4382954 g 4382954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13001632 - 13001432
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtaca-tttgggatttaagcccttgagg 123  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||  ||  ||||| ||||||    
T  13001632 acacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttgagg 13001533  T
Q  124 agacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 222  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    ||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13001532 agacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 13001433  T
Q  223 g 223  Q
    |    
T  13001432 g 13001432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 215
Target Start/End: Original strand, 1992806 - 1992996
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  ||  ||||| |||||||    
T  1992806 acacacactcacttgaaatttgattgttgagttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgagga 1992905  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtg 215  Q
    |||||  | ||||||| ||||||||| |||||    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  1992906 gacataagttttaatttaattgtcatatgataatcttgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgagcataagcaaagattcaagtg 1992996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Original strand, 13097714 - 13097912
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| ||||| |||||||    
T  13097714 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaaagaatgcttgagtttgtgattagtgtacacttgaaattaaagcctttgagga 13097813  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||    ||    ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13097814 gacatgtgttttaattaaattgtcatgaagtaatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaaatgtgggggag 13097912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10547145 - 10546943
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaa--attacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtaca-tttgggatttaagcccttga 121  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||  ||  ||||| ||||    
T  10547145 acacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttga 10547046  T
Q  122 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgata-taactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 220  Q
    ||||||||||||||  | | ||||||||| ||||| || |  ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10547045 ggagacatgtgcttcgaattaattgtcatatgataatatcgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 10546946  T
Q  221 gag 223  Q
    |||    
T  10546945 gag 10546943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20156719 - 20156522
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||  ||  ||||| |||||||    
T  20156719 acacacactcacttgagacttgattgttgggttgaataaagtttacaagaaatgcttgagcttgtgattagtgtaaaattgaaataaaagcctttgagga 20156620  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataac-tgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||| |||| || | ||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20156619 gacatgagttttaatttaattgtcatatgat-tatcttgtttatgctaccatgtttatgcattttgcttgaggacaagc-aagattcaagtgtgggggag 20156522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Original strand, 13690611 - 13690809
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||| |||| ||| |||  ||| ||||| |||||||    
T  13690611 acacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaaagaatgcttgagtttgtgattagtggacacttgaaattaaagcctttgagga 13690710  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||   |||    ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  13690711 gacatgtgttttaattaaattgtcatgaaataatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgatgacaactaaagattcaagtgtgggggag 13690809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Original strand, 11398218 - 11398417
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||   ||  ||||| |||| ||    
T  11398218 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttatgattagtgtacgctttaaataaaagcctttgaaga 11398317  T
Q  125 gacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||  | ||| |||||||||||| | || ||    ||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11398318 gacataagttttcaattgaattgtcgtatgttaatcttgtttatgctgctatatttatgccttttgcttgaggacaagcaaatattcaagtgtgggggag 11398417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14348794 - 14348595
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  ||  ||||| |||||||    
T  14348794 acacacactcacttagaacttgattgtttggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgagga 14348695  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataac-tgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    ||||   | ||||||||||||||||| || ||   | || |  || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14348694 gacacaagttttaattgaattgtcatatgttaagtcttgcttatgttaccatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 14348595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Original strand, 22637702 - 22637901
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||  |||  ||  ||| | |||||||    
T  22637702 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaattgcttaagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagtctttgagga 22637801  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    | |||  | ||||||||||||||||| |||||    || ||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22637802 ggcataagttttaattgaattgtcatatgataatcttgttttatgctaccatgttgatgccttttgcttgagcacaagtaaagattcaagtgtaggggag 22637901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Original strand, 3279193 - 3279392
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||  ||  ||| | |||||||    
T  3279193 acacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgttcgagtttgtgattagtgtacacttgaaataaaagtctttgagga 3279292  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgat-ataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    ||||   | ||||||| ||||||||| || | |  | ||||  || | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3279293 gacacaagttttaatttaattgtcatatgttaagtattgtttatgttgctatgtctatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtgtgggggag 3279392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Original strand, 17387839 - 17388038
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||    |||  ||  ||||| |||||||    
T  17387839 acacacactcactttaaacttgattgttgggttgaataaagatttcaagaattgcttgagtttgtgattagtgtgtgcttgaaataaaagcctttgagga 17387938  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    || ||  | ||||||||||||||||  |||||    || ||  |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17387939 gatataagttttaattgaattgtcacatgataatcttgttttatgctaccatgttgatgccttttgcttaaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 17388038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12160413 - 12160214
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtaca-tttgggatttaagcccttgagg 123  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | || |||||||  ||||  ||  || |  ||||||    
T  12160413 acacacactcacttaagacttgattgttgggttgaa-aagaattacaagaaatgcttgagttttttattagtgtactctttgaaataaaaacatttgagg 12160315  T
Q  124 agacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 222  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| |||||    | ||   ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12160314 agacatgttctttaatttaattgtcatatgataatgttattttatgccaccatgtttatgcattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 12160215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 113
Target Start/End: Original strand, 16655798 - 16655897
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtaca-tttgggatttaa 113  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16655798 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 16655897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 222
Target Start/End: Original strand, 17045814 - 17045902
Alignment:
Q  134 tttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 222  Q
    ||||||||||||||||| || ||    ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17045814 tttaattgaattgtcatatgttaatcttgtttatgctactatttttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 17045902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 222
Target Start/End: Original strand, 17047974 - 17048062
Alignment:
Q  134 tttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 222  Q
    ||||||||||||||||| || ||    ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17047974 tttaattgaattgtcatatgttaatcttgtttatgctactatttttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 17048062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27356784 - 27356735
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356784 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 27356735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 173 - 223
Target Start/End: Original strand, 13601220 - 13601270
Alignment:
Q  173 tatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13601220 tatgtttatgccttttgcttgagaacaagcaaagattcaagtgtgggggag 13601270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3339282 - 3339233
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3339282 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 3339233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12776590 - 12776541
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12776590 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 12776541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13136266 - 13136217
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13136266 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 13136217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Original strand, 20584262 - 20584311
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20584262 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 20584311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 179 - 223
Target Start/End: Original strand, 15946773 - 15946817
Alignment:
Q  179 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15946773 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 15946817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14445826 - 14445775
Alignment:
Q  172 ctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14445826 ctatgtctatgccttttgctttaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 14445775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15619339 - 15619293
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15619339 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 15619293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13195514 - 13195465
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13195514 atgtctatgcattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgtgggag 13195465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8686442 - 8686394
Alignment:
Q  175 tgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8686442 tgtttatgctttttgtttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggag 8686394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20225817 - 20225761
Alignment:
Q  167 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  20225817 tgctgctatgtttatgtcttttgcttgaggacaaacaaagatttaagtatgggggag 20225761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 223
Target Start/End: Original strand, 13068306 - 13068350
Alignment:
Q  179 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13068306 tatgtcttttggttgaggacaagtaaagattcaagtgtgggggag 13068350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 30)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 22665062 - 22665270
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22665062 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 22665161  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22665162 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 22665261  T
Q  215 gtgggggag 223  Q
    |||||||||    
T  22665262 gtgggggag 22665270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 117543 - 117751
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  117543 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 117642  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  117643 cccttgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgagctactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaatatgcaagt 117742  T
Q  215 gtgggggag 223  Q
    |||||||||    
T  117743 gtgggggag 117751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22044875 - 22044667
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22044875 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 22044776  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044775 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 22044676  T
Q  215 gtgggggag 223  Q
     ||||||||    
T  22044675 atgggggag 22044667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 25357511 - 25357719
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25357511 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 25357610  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25357611 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 25357710  T
Q  215 gtgggggag 223  Q
     ||||||||    
T  25357711 atgggggag 25357719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 16775651 - 16775859
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16775651 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 16775750  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16775751 cccttgaggagacatgtgctttaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 16775850  T
Q  215 gtgggggag 223  Q
     ||||||||    
T  16775851 atgggggag 16775859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11820 - 11622
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11820 acacacactcacttaaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 11721  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  11720 gatatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgagctactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagaggcaagtgtgggggag 11622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 223
Target Start/End: Original strand, 17590419 - 17590615
Alignment:
Q  27 acacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgaggaga 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17590419 acacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaatagagatttccagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggaga 17590518  T
Q  127 catgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17590519 catgtgctttaatttaattgtcatttgatttaactgttgctgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggag 17590615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24795500 - 24795292
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24795500 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 24795401  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24795400 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgctgatggtactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 24795301  T
Q  215 gtgggggag 223  Q
     ||||||||    
T  24795300 atgggggag 24795292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 27627580 - 27627789
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttg-ggatttaa 113  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||    
T  27627580 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattaatgtacattttaggatttaa 27627679  T
Q  114 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27627680 gcccttgaggagacatgtgctttaattaatttgtcatttgattcaactgtcgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 27627779  T
Q  214 tgtgggggag 223  Q
    | ||||||||    
T  27627780 tatgggggag 27627789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25144963 - 25144764
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  ||| |||||||||||||    
T  25144963 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttgagga 25144864  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25144863 gacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 25144764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5500471 - 5500272
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||   ||||  |||||||||||||||||||| |||||||  |||  ||| |||||||||||||    
T  5500471 acacacactcacttgaaacttgattgttgagttgaataaggtttacgtgaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttgagga 5500372  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5500371 gacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 5500272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 28 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25804469 - 25804274
Alignment:
Q  28 cacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagac 127  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||   |  ||||| ||||||| ||    
T  25804469 cacactcacttgaaatttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacgcttgaattaaaagcctttgaggatac 25804370  T
Q  128 atgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    ||  | ||||||||||||||||| || ||    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25804369 ataagttttaattgaattgtcatatgttaatcttgtttgtgctgctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 25804274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25371090 - 25370892
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||  |||  ||| ||||| |||||||    
T  25371090 acacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattataagaaatgcttgagtttgtaattagtgtacgcttgaaattaaagcctttgagga 25370991  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataa--ctg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 221  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||   ||||||  ||| ||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25370990 gacatgagttttgattgaattgtcat---atataatcctgtttattgttactatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 25370894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23799127 - 23798929
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  ||  ||||| |||||||    
T  23799127 acacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaaggatacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgagga 23799028  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| ||  ||     ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  23799027 gacatgagttttgattgaattgtcatatgtaatcttgttttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggataatcaaagattcaagtgtgggggag 23798929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 150
Target Start/End: Original strand, 24502171 - 24502297
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||  ||||  |||||||    
T  24502171 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgtttgaaataaaagcatttgagga 24502270  T
Q  125 gacatgtg-ctttaattgaattgtcat 150  Q
    |||||  |  |||||||||||||||||    
T  24502271 gacataagtttttaattgaattgtcat 24502297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Original strand, 23643953 - 23644153
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacat-ttgggatttaagcccttgagg 123  Q
    |||| ||| ||||| | ||||||| || |||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||   |||  ||  ||||| ||||||    
T  23643953 acacgcacccacttaagacttgattgtagggttgaaaaaggattacaggaaatgcttgagtttgtgattagtgtactccttgaaataaaagcctttgagg 23644052  T
Q  124 agacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 222  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    | ||   |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23644053 agacacgtgctttaatttaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 23644152  T
Q  223 g 223  Q
    |    
T  23644153 g 23644153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24178348 - 24178200
Alignment:
Q  76 atgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataactgttggtgctacta 174  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||  ||||  ||||||||||||  | ||| |||| ||||||||| |||||    ||||  |||| |||    
T  24178348 atgcttgagtttgtgattagtgtacgtttgaaataaaagcttttgaggagacataagtttttaattaaattgtcatatgataatcttgtttatgctgcta 24178249  T
Q  175 tgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24178248 tgtttatgccttttgtttgaagacaagcaaagattcaagtgtgggggag 24178200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23159441 - 23159392
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23159441 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 23159392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23570698 - 23570649
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23570698 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 23570649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Original strand, 27631655 - 27631704
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27631655 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 27631704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27768872 - 27768823
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27768872 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 27768823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 179 - 223
Target Start/End: Original strand, 24171510 - 24171554
Alignment:
Q  179 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24171510 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 24171554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23257625 - 23257579
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23257625 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggg 23257579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Original strand, 24321328 - 24321377
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24321328 atgtttacgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggag 24321377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 24506802 - 24506858
Alignment:
Q  167 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24506802 tgctgctatgtttatgtcttttgcttgaggacaataaaagattcaagtgtgggggag 24506858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25337714 - 25337659
Alignment:
Q  167 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 222  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25337714 tgctgctatatttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtatggggga 25337659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 211
Target Start/End: Original strand, 23648123 - 23648165
Alignment:
Q  169 ctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattca 211  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23648123 ctactatgtctatgcattttgcttgaggacaagcaaagattca 23648165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 214
Target Start/End: Original strand, 29955868 - 29955898
Alignment:
Q  184 cttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29955868 cttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 29955898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21512615 - 21512574
Alignment:
Q  181 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  21512615 tgccttttgcttgaggacaagcaaggattcaagcatggggga 21512574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24019123 - 24019075
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 222  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  24019123 atgtttatgtcttttgtttgaggacaaaaaaagattcaagtatggggga 24019075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 27046874 - 27047082
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27046874 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 27046973  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27046974 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggagctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 27047073  T
Q  215 gtgggggag 223  Q
    |||||||||    
T  27047074 gtgggggag 27047082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17094816 - 17094608
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17094816 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaagatttcaagaaatgcttaagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 17094717  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17094716 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgaattaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 17094617  T
Q  215 gtgggggag 223  Q
    |||||||||    
T  17094616 gtgggggag 17094608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21798878 - 21798669
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21798878 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaaaatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 21798779  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21798778 cccttgaggagacatgtgctttaaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 21798679  T
Q  214 tgtgggggag 223  Q
    | ||||||||    
T  21798678 tatgggggag 21798669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 20237456 - 20237664
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  20237456 tggacttcacacaaacactcacttaaagcttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtggttagtgtacatttgggatttaag 20237555  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | || ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20237556 cccttgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattatttgtgctactgcatttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 20237655  T
Q  215 gtgggggag 223  Q
    |||||||||    
T  20237656 gtgggggag 20237664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Original strand, 8653126 - 8653324
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  ||| ||||| |||||||    
T  8653126 acacacacacacttagaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcctttgagga 8653225  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataa-ct--gttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 221  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||   |||||| ||   ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8653226 gacatgagttttgattgaattgtcat---atataatcttgtttattgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 8653322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 52938827 - 52938628
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  ||  ||||| |||||||    
T  52938827 acacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactcttgaaataaaagcctttgagga 52938728  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||    || ||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52938727 gacatgtgatttgatttaattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgattatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 52938628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Original strand, 3989947 - 3990147
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtac-atttgggatttaagcccttgagg 123  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||  ||  ||||| |||| |    
T  3989947 acacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgcactctttgaaataaaagcctttgacg 3990046  T
Q  124 agacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 222  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    || ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  3990047 agacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtatggggga 3990146  T
Q  223 g 223  Q
    |    
T  3990147 g 3990147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 223
Target Start/End: Original strand, 19364043 - 19364237
Alignment:
Q  29 acactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagaca 128  Q
    ||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  ||  ||||| |||||||||||    
T  19364043 acactcacttagaactggattgttgggttgaataaagactacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgaggagaca 19364142  T
Q  129 tgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    || | ||| ||||||||||||| ||  ||     ||  |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19364143 tgagttttgattgaattgtcatatgtaatcttgttttatgctgctatgtctatgcattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 19364237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 142 - 223
Target Start/End: Original strand, 14070632 - 14070713
Alignment:
Q  142 aattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14070632 aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggag 14070713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19875702 - 19875651
Alignment:
Q  172 ctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19875702 ctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 19875651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21784535 - 21784479
Alignment:
Q  167 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21784535 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaatattcaagtgtgggggag 21784479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16382631 - 16382582
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16382631 atgtttattccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggag 16382582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 4027832 - 4027888
Alignment:
Q  167 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  4027832 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggaaaagcaaagattcaagggtgggggag 4027888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8947578 - 8947522
Alignment:
Q  167 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8947578 tgctgctatgtctatgtcttttccttgaggacaagtaaagattcaagtgtgggggag 8947522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 21784675 - 21784598
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatt 103  Q
    |||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||  | ||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  21784675 acacacactcacttaagacttgtt-gttgggttgaataaagttcacaagaaatacttgaagttgtgattagtgtacatt 21784598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 27)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20596046 - 20595838
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20596046 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 20595947  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20595946 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataaccgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 20595847  T
Q  215 gtgggggag 223  Q
    |||||||||    
T  20595846 gtgggggag 20595838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20602332 - 20602124
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20602332 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 20602233  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20602232 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataaccgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 20602133  T
Q  215 gtgggggag 223  Q
    |||||||||    
T  20602132 gtgggggag 20602124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20608623 - 20608415
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20608623 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 20608524  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20608523 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataaccgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 20608424  T
Q  215 gtgggggag 223  Q
    |||||||||    
T  20608423 gtgggggag 20608415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 15735534 - 15735742
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15735534 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaacacttgagtttgtgattagtgtacacttgggatttaag 15735633  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735634 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 15735733  T
Q  215 gtgggggag 223  Q
    |||||||||    
T  15735734 gtgggggag 15735742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 15 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 23710892 - 23710701
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23710892 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 23710793  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23710792 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaa 23710701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 23748051 - 23748259
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23748051 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 23748150  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23748151 cccttgaggagacatgtgctttaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 23748250  T
Q  215 gtgggggag 223  Q
     ||||||||    
T  23748251 atgggggag 23748259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 212
Target Start/End: Original strand, 20622172 - 20622359
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622172 acacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 20622271  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622272 gacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaattgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 20622359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Original strand, 24940543 - 24940742
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacattt-gggatttaagcccttgagg 123  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  24940543 acactcactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtttacattttgggatttaagcccttgagg 24940642  T
Q  124 agacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24940643 agacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggag 24940742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 18072900 - 18073108
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacattt-gggatttaa 113  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18072900 tggacttcacacacacactcacttgaaacttaattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 18072999  T
Q  114 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18073000 gcccttgaggagacatgtgctttaattga-ttgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 18073098  T
Q  214 tgtgggggag 223  Q
    | ||||||||    
T  18073099 tatgggggag 18073108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24953389 - 24953181
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacattt-gggatttaa 113  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24953389 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 24953290  T
Q  114 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24953289 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttataccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 24953191  T
Q  214 tgtgggggag 223  Q
    | ||||||||    
T  24953190 tatgggggag 24953181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20790929 - 20790721
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacattt-gggatttaa 113  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  20790929 tggacttcacacacacactcgcttgaaacttgattgttaggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggattaaa 20790830  T
Q  114 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20790829 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aactgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 20790731  T
Q  214 tgtgggggag 223  Q
    | ||||||||    
T  20790730 tatgggggag 20790721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23600842 - 23600644
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  |||||||||||||||||    
T  23600842 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgagga 23600743  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 222  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||| |||||  | ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23600742 gacatgtgttctaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 23600644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Original strand, 24219755 - 24219954
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  ||| |||||||||||||    
T  24219755 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttgagga 24219854  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24219855 gacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagactcaagtgtgggggag 24219954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20445045 - 20444846
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  ||| |||||||||||||    
T  20445045 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttgagga 20444946  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgat-ataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||    || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20444945 gacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattattttgtgctaccatatttatgccttttgcttgaggacaatcaaagattcaagtgtgggggag 20444846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 223
Target Start/End: Original strand, 21387410 - 21387598
Alignment:
Q  36 cttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctt 135  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  ||  ||| | ||||||||||||  | ||    
T  21387410 cttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaatgaaagtctttgaggagacataagttt 21387509  T
Q  136 t-aattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    | |||||||||||||| || ||    |||  ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21387510 tcaattgaattgtcatatgttagtcttgtgtgtgctgctatgtttatgcatttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 21387598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20916660 - 20916463
Alignment:
Q  26 cacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgaggag 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||  ||  ||||| ||||||||    
T  20916660 cacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagttcgtgattagtgtacggttgaaataaaagcctttgaggag 20916561  T
Q  126 acatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    ||||| | ||| ||| ||||||| | ||  ||     ||  |||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||    
T  20916560 acatgagttttgatttaattgtcctatgtaatcttattttatgcagctatgtctatgccttttgcttgaggacaaccaaaaattcatgtgtaggggag 20916463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 100
Target Start/End: Original strand, 22948521 - 22948596
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22948521 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaaaaaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 22948596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 146
Target Start/End: Original strand, 20575512 - 20575633
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  ||  ||||| |||||||    
T  20575512 acacgcactcacttgaaacttgattgtcgggttgaataaagactacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgagga 20575611  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattg 146  Q
    |||||| | ||| |||||||||    
T  20575612 gacatgagttttgattgaattg 20575633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22317569 - 22317520
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22317569 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 22317520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25006864 - 25006815
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25006864 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 25006815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30759711 - 30759662
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759711 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 30759662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18484275 - 18484219
Alignment:
Q  167 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18484275 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgttggggag 18484219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25116221 - 25116178
Alignment:
Q  180 atgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25116221 atgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 25116178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Original strand, 22855723 - 22855772
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22855723 atgtctatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 22855772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Original strand, 26847803 - 26847852
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26847803 atgtctatgccttttggttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 26847852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25175306 - 25175268
Alignment:
Q  185 ttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175306 ttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 25175268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 223
Target Start/End: Original strand, 27270563 - 27270601
Alignment:
Q  185 ttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27270563 ttttgcttgaggacaagcaatgattcaagtgtgggggag 27270601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 15678 - 15886
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15678 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgagatttaag 15777  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15778 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 15877  T
Q  215 gtgggggag 223  Q
    |||||||||    
T  15878 gtgggggag 15886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 182; Significance: 1e-98; HSPs: 26)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 21382093 - 21382302
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21382093 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 21382192  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21382193 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 21382292  T
Q  214 tgtgggggag 223  Q
    | ||||||||    
T  21382293 tatgggggag 21382302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21099009 - 21098801
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21099009 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcattgggttgaataaaaatgacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacatttgggatttaag 21098910  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21098909 cccttgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 21098810  T
Q  215 gtgggggag 223  Q
    |||||||||    
T  21098809 gtgggggag 21098801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21104330 - 21104122
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21104330 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcattgggttgaataaaaatgacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacatttgggatttaag 21104231  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21104230 cccttgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 21104131  T
Q  215 gtgggggag 223  Q
    |||||||||    
T  21104130 gtgggggag 21104122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 23911441 - 23911648
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  23911441 tggacttcacacacacactcacttgaaatttgatc-ttgggttgaataaaaattacaagaaatgtttaagtttgtgattagtgtacatctgggatttaag 23911539  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23911540 cccttgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgatataactattggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 23911639  T
Q  215 gtgggggag 223  Q
     ||||||||    
T  23911640 atgggggag 23911648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 8314467 - 8314676
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8314467 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 8314566  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8314567 cccttgaggagacatgtgctttaaatttaattgtcatttgatttaaatgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 8314666  T
Q  214 tgtgggggag 223  Q
    | ||||||||    
T  8314667 tatgggggag 8314676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8323062 - 8322853
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacattt-gggatttaa 113  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8323062 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 8322963  T
Q  114 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8322962 gcccttgaggagacatgtgctttaattaatttgtcatttgatttaactgtcgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 8322863  T
Q  214 tgtgggggag 223  Q
    | || |||||    
T  8322862 tatgagggag 8322853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21843730 - 21843531
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||  |||||||||||||||||    
T  21843730 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattactgtacgcttgaaatttaagcccttgagga 21843631  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21843630 gacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 21843531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21940203 - 21940003
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtaca-tttgggatttaagcccttgagg 123  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||  ||  ||||| ||||||    
T  21940203 acacacactcacttcagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaatgaaagcctttgagg 21940104  T
Q  124 agacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 222  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    | ||   |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21940103 agacatgtgctttaatttaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgcttgagaacaagcaaagattcaagtgtggggga 21940004  T
Q  223 g 223  Q
    |    
T  21940003 g 21940003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20039186 - 20038988
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||  ||| ||||| |||| ||    
T  20039186 acacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatacttgagtttgtgattattgtacatttgaaattaaagcctttgaaga 20039087  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||   ||| || || |||||| ||||     ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20039086 gacatgtatcttagttaaaatgtcatgtgatgatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 20038988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 221
Target Start/End: Original strand, 23454947 - 23455144
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||  ||  ||||| |||||||    
T  23454947 acacacactcacttgaaacttgattgttggattgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaatgaaagcctttgagga 23455046  T
Q  125 gacatgtgcttt-aattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 221  Q
    |||||    ||| |||||||||||||| ||  |    ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23455047 gacataaattttcaattgaattgtcatatgtgagtcttgtttatgctactatgtttatgccttttgctcgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 23455144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Original strand, 17620757 - 17620954
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||  ||||||||||||| |||| || ||||| |||  ||| ||||| |||||||    
T  17620757 acacacactcacttgaaacttgattgttgg-ttgaaaaaggattacaaagaatgcttgagtttatgattagggtacacttgaaattaaagcctttgagga 17620855  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||    ||    ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17620856 gacatgtgttttaattaaattgtcatgaagtaatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaaaattcaagtgtgggggag 17620954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 51 - 223
Target Start/End: Original strand, 24034049 - 24034223
Alignment:
Q  51 ttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgcttt-aattgaattgtca 149  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  24034049 ttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacgcttgaaattaaagcctttgaggagacataagttttcaattgaattgtca 24034148  T
Q  150 tttgat-ataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    | |  | ||  |  ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24034149 tatattaatctcgtttattgctactatgtttatgccttttgcttgtggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 24034223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16418827 - 16418627
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtaca-tttgggatttaagcccttgagg 123  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||  ||  ||||| ||||||    
T  16418827 acacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattataagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttgagg 16418728  T
Q  124 agacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 222  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||| |||||    | ||   |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16418727 agacatgtgttttaatgtaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgcttgagaacaagcaaagattcaagtgtggggga 16418628  T
Q  223 g 223  Q
    |    
T  16418627 g 16418627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14352376 - 14352181
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| || || |||||||  |||  ||  |||||   |||||    
T  14352376 acacacactcacttgagacttgattgttgggttgaataaagattacaaagaatgcttgagttagtaattagtgtacgcttgaaataaaagcctcggagga 14352277  T
Q  125 gacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataact-gttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 219  Q
    |||||| | |||||||  ||||||||| | || || || |||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14352276 gacatgagttttaattttaattgtcatataat-tatcttgtttatgctaccatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 14352181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 41 - 222
Target Start/End: Original strand, 21538573 - 21538757
Alignment:
Q  41 aacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatca--gtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaa 138  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||| |  ||||||  |||  ||| ||| | ||||||||||||  | |||||    
T  21538573 aacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaaccctggagtttgtgattatagtgtacgattgaaattaaagtctttgaggagacataagttttaa 21538672  T
Q  139 ttgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 222  Q
    |||||||||||| |||||    ||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21538673 ttgaattgtcatatgataatcttgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaaaatttaagtgtggggga 21538757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 223
Target Start/End: Original strand, 20712537 - 20712642
Alignment:
Q  119 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg-gtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 217  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  20712537 tgaggagacatgtgctttgattaaattgtcatatgataatgttgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagatttaagtgta 20712636  T
Q  218 ggggag 223  Q
    ||||||    
T  20712637 ggggag 20712642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11347009 - 11346960
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11347009 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 11346960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Original strand, 19767684 - 19767733
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19767684 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 19767733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Original strand, 22370102 - 22370151
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22370102 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 22370151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 179 - 223
Target Start/End: Original strand, 20002279 - 20002323
Alignment:
Q  179 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20002279 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 20002323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 91
Target Start/End: Original strand, 20712473 - 20712539
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtga 91  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  20712473 acacacactcatttgagacttgattgttgggttgaaaaaagattacaagaaatgattgagtttgtga 20712539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22033611 - 22033562
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22033611 atgtctatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 22033562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22099711 - 22099662
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22099711 atgtctatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 22099662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Original strand, 22102552 - 22102601
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22102552 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtaggggag 22102601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 223
Target Start/End: Original strand, 21831181 - 21831225
Alignment:
Q  179 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21831181 tatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 21831225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 223
Target Start/End: Original strand, 22817755 - 22817799
Alignment:
Q  179 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22817755 tatgtcttttgcttgaggaaaagcaaagattcaagtgtgggggag 22817799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 1038 - 1246
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaag 114  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1038 tggacttcacacatacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 1137  T
Q  115 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1138 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgctgatgctactacgtttatgccttttgcttgaggaaaagcaaagattcaagt 1237  T
Q  215 gtgggggag 223  Q
     ||||||||    
T  1238 atgggggag 1246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 157 - 223
Target Start/End: Original strand, 3451 - 3517
Alignment:
Q  157 taactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3451 taactgctgatgctactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggag 3517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 831 - 622
Alignment:
Q  15 tggacatcagacacacactcacttgaaa-cttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaa 113  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  831 tggacttcacacacacactcacttaaaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa 732  T
Q  114 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 213  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| || |||| ||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  731 tcccttgaggagacttgtgctttaatcgaattgtgatttgataaaattgtttgtgctaccatatttatgctttttgctttaggacaagcaaagattcaag 632  T
Q  214 tgtgggggag 223  Q
    ||||||||||    
T  631 tgtgggggag 622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 111; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Original strand, 223 - 421
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||   ||| |||||||||||||    
T  223 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttcagtttgtgattagtgtacgctttaaattaaagcccttgagga 322  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||  ||||  | ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  323 gacatgtattttaattaaattgtcatacgataatattgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggag 421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3058 - 2859
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||  ||| |||||||| ||||    
T  3058 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacacatgaaattaaagcccttaagga 2959  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  2958 gacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgtgggag 2859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 102; Significance: 8e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 30 - 223
Target Start/End: Original strand, 11064 - 11257
Alignment:
Q  30 cactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacat 129  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||   ||| ||||||||||||||||||    
T  11064 cactcacttgaaacttaatttttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttaaaattaaagcccttgaggagacat 11163  T
Q  130 gtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    ||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11164 gtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggag 11257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 252076 - 251877
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||  ||| |||||||||||||    
T  252076 acacacactcacttggaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgactagtgtacgcttgaaattaaagcccttgagga 251977  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||  |||||  | || || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  251976 gacatgtgttttaattaaattgtcaaatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccatttgcttgaggacaagtaaagattcaagtgtgggggag 251877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2493 - 2294
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  ||  ||||| |||||||    
T  2493 acacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactcttgaaataaaagcctttgagga 2394  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| |||||    || ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2393 gacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggag 2294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Original strand, 834 - 1034
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtaca-tttgggatttaagcccttgagg 123  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||  ||  ||||| ||||||    
T  834 acacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttgagg 933  T
Q  124 agacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactg-ttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 222  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    |  ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  934 agacatgtgctttaatttaattgtcatatgataatgttaatttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 1033  T
Q  223 g 223  Q
    |    
T  1034 g 1034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0773 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0773
Description:

Target: scaffold0773; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Original strand, 482 - 680
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||  ||  ||||  |||||||    
T  482 acacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaaaaaatggttgagtttgtgattagtgtacacttgaaataaaagcttttgagga 581  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||    ||||||||||||||||| |||||    ||||  |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  582 gacattaattttaattgaattgtcatatgataatcttgtttatgctgctatgtttatacattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14867 - 14669
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||   ||||||||||||||||||||| |||  | |||||  |||  ||| |||||||||||||    
T  14867 acacacactcacttgaaacttgattgttgggtttcataaggtttacaagaaatgcttgagtttatgaataatgtacgcttgaaattaaagcccttgagga 14768  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||| |||||  | ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14767 gacatgtgttttaattaaattttcatatgataatattgtttatgctaccatgtttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggag 14669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Original strand, 120956 - 121155
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    |||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||  ||| |||||||||||||    
T  120956 acacacacacacttggaacttggttgttgggttgaataaggtttacaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttgagga 121055  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcat-ttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||| || |||| ||||||||| |  | |||    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  121056 gacatgtgtttcaattaaattgtcatataaaaatattattttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 121155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Original strand, 7944 - 8142
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| |||| ||    
T  7944 acacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgctcgagtttgtgattagtgtacatttgaaattaaagcctttgaaga 8043  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||| |||| || || |||||| | ||     ||||  ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8044 gacatgtgttttagttaaaatgtcatgtaatgatcttgtttatgctaccgtgtttatgccttttgcttgaagacaagcaaagattcaagtgtgggggag 8142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 72 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 164562 - 164410
Alignment:
Q  72 agaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttg-gtgct 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |  ||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||||  |||||    
T  164562 agaaatgcttgagtttgtgattagtgtgcgctttaaattgaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgct 164463  T
Q  171 actatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  164462 accatgtttatgccttttgcttgaggataagcaaagattcaagtgtgggggag 164410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 172254 - 172310
Alignment:
Q  167 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  172254 tgctgctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 172310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 161995 - 162051
Alignment:
Q  167 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  161995 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 162051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0974 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0974
Description:

Target: scaffold0974; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Original strand, 1111 - 1311
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtaca-tttgggatttaagcccttgagg 123  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||| | |||||  ||||  ||  ||||| ||||||    
T  1111 acacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattataagaaatgcttgagtttgtgattaatgtactctttgaaataaaagcctttgagg 1210  T
Q  124 agacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 222  Q
     ||||||||| |||||  ||||||||| |||||    | ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1211 ggacatgtgccttaatgtaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 1310  T
Q  223 g 223  Q
    |    
T  1311 g 1311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 58835 - 58635
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtaca-tttgggatttaagcccttgagg 123  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||  ||  ||||  ||||||    
T  58835 acacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattataagaaatggttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcatttgagg 58736  T
Q  124 agacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 222  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||    | ||   |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58735 agacatgtgctttaatgtaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 58636  T
Q  223 g 223  Q
    |    
T  58635 g 58635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 97933 - 97733
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtaca-tttgggatttaagcccttgagg 123  Q
    ||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||  ||  ||||  ||||||    
T  97933 acacatactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattataagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcatttgagg 97834  T
Q  124 agacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 222  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||    | ||   |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  97833 agacatgtgctttaatgtaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgctttaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 97734  T
Q  223 g 223  Q
    |    
T  97733 g 97733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 715 - 517
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 124  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||  ||  ||||| |||||||    
T  715 acacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaaggttacaagaaatgtttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgagga 616  T
Q  125 gacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    || ||  | ||| ||||||||||||| ||  ||     ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  615 gatataagttttgattgaattgtcatatgtaatcttgttttatgctactatatttatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtatgggggag 517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 112 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10325 - 10213
Alignment:
Q  112 aagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgt-tggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattc 210  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  | ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10325 aagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattc 10226  T
Q  211 aagtgtgggggag 223  Q
    |||| ||||||||    
T  10225 aagtttgggggag 10213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13210 - 13009
Alignment:
Q  22 cagacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttga 121  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||||   ||  ||  ||||| ||||    
T  13210 cagacacgcactcacttgaaacttgattcttgggtttaataaagattacaagaaatgcttgagtatggtattagtgtacgcatgaaataaaagcctttga 13111  T
Q  122 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 221  Q
    | ||||||  | |||||||||||| | || |||||    || |  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13110 gaagacataagttttaattgaattattatatgataatcttggttatgctactatgtttatgcctcttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggcgg 13011  T
Q  222 ag 223  Q
    ||    
T  13010 ag 13009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0582 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0582
Description:

Target: scaffold0582; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 112 - 223
Target Start/End: Original strand, 8750 - 8862
Alignment:
Q  112 aagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttgg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattc 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    ||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8750 aagcctttgaggagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattc 8849  T
Q  211 aagtgtgggggag 223  Q
    |||||||||||||    
T  8850 aagtgtgggggag 8862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 35307 - 35111
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaa------ttacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagccct 118  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||      |||| |  |||||||||||||||||| | |||||| |||  ||| ||||| |    
T  35307 acacacactcatttgaaacttcattgttgggttgaaaaaaaaaaaagattaccaagaatgcttgagtttgtgattactgtacacttgaaattaaagcctt 35208  T
Q  119 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 218  Q
      |||||||||||| |||| |||||||||||| |        ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35207 aaaggagacatgtgttttagttgaattgtcatct--------tgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaaggaaagattcaagtgtgg 35116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 69 - 223
Target Start/End: Original strand, 12450 - 12604
Alignment:
Q  69 acaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataa--ctgttgg 166  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||   |||  ||  ||| | |||||||||||||   ||| |||||||||||||   ||||||  |||||      
T  12450 acaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagtctttgaggagacatgaattttgattgaattgtcat---atataatcctgttta 12546  T
Q  167 t-gctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12547 ttgctactatgtttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 12604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 69 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 232948 - 232794
Alignment:
Q  69 acaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataa--ctgttgg 166  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||   |||  ||  ||| | |||||||||||||   ||| |||||||||||||   ||||||  |||||      
T  232948 acaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagtctttgaggagacatgaattttgattgaattgtcat---atataatcctgttta 232852  T
Q  167 t-gctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  232851 ttgctactatgtttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 232794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 129 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 38610 - 38515
Alignment:
Q  129 tgtgctttaattgaattgtcatttgata-taactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||| ||  | || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38610 tgtgttttaattaaattgtcatatgataatatttttttgtgctaccatgtttatgctttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 38515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 38675 - 38625
Alignment:
Q  50 gttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtac 100  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  38675 gttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattaatgtac 38625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1095 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1095
Description:

Target: scaffold1095; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 89
Target Start/End: Original strand, 2862 - 2926
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgt 89  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  2862 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgt 2926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0512 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0512
Description:

Target: scaffold0512; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 5232 - 5288
Alignment:
Q  167 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5232 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 5288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22218 - 22162
Alignment:
Q  167 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22218 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 22162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 42237 - 42293
Alignment:
Q  167 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42237 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 42293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 50569 - 50513
Alignment:
Q  167 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50569 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 50513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 223
Target Start/End: Original strand, 912 - 963
Alignment:
Q  172 ctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  912 ctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0566 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0566
Description:

Target: scaffold0566; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Original strand, 2762 - 2811
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2762 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 2811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 179 - 223
Target Start/End: Original strand, 12743 - 12787
Alignment:
Q  179 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12743 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 12787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 37806 - 37751
Alignment:
Q  167 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 222  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37806 tgctgctatgtctattccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 37751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 37946 - 37869
Alignment:
Q  25 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacatt 103  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||  | ||||| ||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  37946 acacacactcacttaagacttgat-gttgggttgaataaagttcacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacatt 37869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Original strand, 10720 - 10769
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10720 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattaaagtgtgggggag 10769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Original strand, 1193 - 1242
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1193 atgtttatgccttttgcttgtggacaagcaaagattcaagtatgggggag 1242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 54905 - 54856
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54905 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagcgtgggggag 54856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1225 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1225
Description:

Target: scaffold1225; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 1839 - 1895
Alignment:
Q  167 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  1839 tgctgctatatttatgccttttgcttgagaacaatcaaagattcaagtgtgggggag 1895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 22756 - 22811
Alignment:
Q  167 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22756 tgctgctatgtctatgccttt-gcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 22811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 172 - 223
Target Start/End: Original strand, 37868 - 37919
Alignment:
Q  172 ctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  37868 ctatgtttatggcttttgcttgagggcaagaaaagattcaagtgtgggggag 37919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 45291 - 45235
Alignment:
Q  167 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  45291 tgctgctatgtctatgtcttttgcttgagaacaagcaaagattcaggtgtgggggag 45235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 83214 - 83174
Alignment:
Q  174 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  83214 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaatattcaagt 83174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 72622 - 72579
Alignment:
Q  180 atgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  72622 atgccttttgcttgaggaaaagtaaagattcaagtgtgggggag 72579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 84812 - 84769
Alignment:
Q  180 atgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  84812 atgccttttgcttgaggaaaagtaaagattcaagtgtgggggag 84769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 223
Target Start/End: Original strand, 18218 - 18256
Alignment:
Q  185 ttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18218 tttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 18256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University