View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11455_high_6 (Length: 536)

Name: NF11455_high_6
Description: NF11455
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11455_high_6
NF11455_high_6
[»] chr7 (39 HSPs)
chr7 (58-526)||(3923921-3924386)
chr7 (59-526)||(14287644-14288109)
chr7 (56-526)||(14298826-14299294)
chr7 (56-526)||(36875472-36875939)
chr7 (56-526)||(5049740-5050207)
chr7 (56-526)||(23612316-23612783)
chr7 (56-526)||(2446573-2447040)
chr7 (54-526)||(1378872-1379341)
chr7 (56-526)||(6795365-6795832)
chr7 (55-526)||(6020692-6021161)
chr7 (56-526)||(48353308-48353776)
chr7 (56-526)||(15914565-15915032)
chr7 (56-526)||(26601839-26602306)
chr7 (56-526)||(48346924-48347392)
chr7 (56-526)||(15949086-15949553)
chr7 (66-526)||(8185220-8185678)
chr7 (66-526)||(8192780-8193238)
chr7 (56-526)||(8142273-8142741)
chr7 (54-526)||(1948461-1948931)
chr7 (56-526)||(9642744-9643214)
chr7 (56-526)||(19089734-19090202)
chr7 (56-526)||(21642449-21642912)
chr7 (56-526)||(39432835-39433301)
chr7 (56-526)||(33850471-33850938)
chr7 (56-526)||(45433512-45433980)
chr7 (56-411)||(5056250-5056603)
chr7 (56-410)||(37025975-37026326)
chr7 (72-471)||(21901071-21901469)
chr7 (280-425)||(13774059-13774204)
chr7 (62-452)||(10831027-10831415)
chr7 (62-452)||(11024819-11025207)
chr7 (56-182)||(1941972-1942095)
chr7 (211-517)||(7412753-7413062)
chr7 (54-126)||(28442370-28442440)
chr7 (56-106)||(41455162-41455212)
chr7 (56-104)||(41542386-41542434)
chr7 (306-521)||(28442628-28442842)
chr7 (274-400)||(8881291-8881419)
chr7 (308-452)||(10861392-10861536)
[»] chr6 (34 HSPs)
chr6 (56-526)||(32328321-32328788)
chr6 (52-526)||(1428251-1428722)
chr6 (56-529)||(34711382-34711852)
chr6 (56-526)||(4186612-4187079)
chr6 (56-526)||(4020063-4020531)
chr6 (56-526)||(4026489-4026957)
chr6 (56-526)||(34655177-34655645)
chr6 (56-526)||(34648726-34649194)
chr6 (56-526)||(9864588-9865056)
chr6 (67-526)||(31547833-31548289)
chr6 (55-526)||(4738151-4738620)
chr6 (56-526)||(7069530-7069995)
chr6 (56-526)||(13671645-13672112)
chr6 (55-452)||(11058052-11058446)
chr6 (56-526)||(21262402-21262870)
chr6 (56-522)||(27670021-27670484)
chr6 (292-526)||(7062344-7062578)
chr6 (317-526)||(29907044-29907253)
chr6 (317-526)||(30117127-30117336)
chr6 (56-258)||(7062579-7062779)
chr6 (56-287)||(29906817-29907045)
chr6 (56-287)||(30117335-30117563)
chr6 (56-520)||(1167313-1167791)
chr6 (155-520)||(10081396-10081762)
chr6 (56-106)||(1461190-1461240)
chr6 (290-504)||(9846679-9846893)
chr6 (56-104)||(7825914-7825962)
chr6 (56-104)||(10800822-10800870)
chr6 (56-104)||(24908347-24908395)
chr6 (56-104)||(14118809-14118857)
chr6 (240-400)||(11015367-11015529)
chr6 (306-459)||(24908603-24908756)
chr6 (306-398)||(14118511-14118603)
chr6 (55-83)||(14122859-14122887)
[»] chr4 (22 HSPs)
chr4 (56-526)||(55462600-55463067)
chr4 (54-526)||(27590230-27590699)
chr4 (54-526)||(37368143-37368612)
chr4 (56-526)||(41372913-41373381)
chr4 (55-526)||(8103807-8104275)
chr4 (56-526)||(17456781-17457249)
chr4 (56-526)||(13594032-13594502)
chr4 (56-455)||(30238187-30238583)
chr4 (56-526)||(16405269-16405740)
chr4 (56-526)||(16838187-16838654)
chr4 (56-526)||(36754619-36755094)
chr4 (55-526)||(30211364-30211823)
chr4 (56-425)||(7780334-7780700)
chr4 (55-520)||(5660383-5660850)
chr4 (56-228)||(48914826-48914996)
chr4 (56-520)||(2947772-2948233)
chr4 (56-323)||(13003817-13004082)
chr4 (467-526)||(37356177-37356236)
chr4 (18-56)||(27945585-27945623)
chr4 (18-56)||(27437093-27437131)
chr4 (362-471)||(13003689-13003798)
chr4 (20-56)||(27549098-27549134)
[»] chr3 (30 HSPs)
chr3 (56-526)||(32746297-32746764)
chr3 (56-526)||(6036193-6036660)
chr3 (56-526)||(24179001-24179468)
chr3 (55-526)||(27501795-27502265)
chr3 (55-526)||(4311314-4311782)
chr3 (53-521)||(25893154-25893625)
chr3 (56-526)||(23068391-23068858)
chr3 (56-481)||(13014913-13015335)
chr3 (56-520)||(9570382-9570845)
chr3 (56-520)||(9576884-9577347)
chr3 (56-526)||(10941132-10941599)
chr3 (56-526)||(43931509-43931971)
chr3 (59-526)||(43994997-43995471)
chr3 (56-520)||(20650959-20651429)
chr3 (56-258)||(41353788-41353987)
chr3 (56-282)||(41354142-41354365)
chr3 (56-452)||(4590721-4591115)
chr3 (56-165)||(18341481-18341587)
chr3 (56-194)||(3577098-3577233)
chr3 (104-504)||(2785680-2786078)
chr3 (104-520)||(20952588-20953013)
chr3 (423-526)||(47441092-47441195)
chr3 (283-522)||(9330970-9331209)
chr3 (55-104)||(4674853-4674902)
chr3 (56-104)||(18866705-18866753)
chr3 (283-383)||(4644320-4644420)
chr3 (378-521)||(27900777-27900920)
chr3 (273-392)||(461339-461460)
chr3 (422-504)||(25692267-25692349)
chr3 (306-459)||(4675108-4675261)
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (55-526)||(36782012-36782481)
chr2 (56-526)||(42931200-42931667)
chr2 (56-526)||(34834640-34835107)
chr2 (56-526)||(34841084-34841551)
chr2 (54-526)||(43267783-43268253)
chr2 (56-526)||(2157539-2158006)
chr2 (56-526)||(12950723-12951190)
chr2 (54-526)||(45011907-45012377)
chr2 (55-526)||(15852475-15852944)
chr2 (56-526)||(2163955-2164422)
chr2 (55-526)||(21331822-21332290)
chr2 (54-526)||(2021276-2021745)
chr2 (56-526)||(13901784-13902252)
chr2 (53-522)||(16856319-16856784)
chr2 (53-522)||(16817162-16817627)
chr2 (55-526)||(21067785-21068253)
chr2 (55-387)||(29484852-29485182)
chr2 (55-357)||(21341879-21342178)
chr2 (58-520)||(41455535-41455994)
chr2 (107-356)||(45700642-45700897)
chr2 (58-520)||(13162737-13163207)
chr2 (397-526)||(21341754-21341883)
chr2 (104-517)||(11909787-11910210)
chr2 (414-526)||(29485177-29485289)
chr2 (189-451)||(17788994-17789257)
chr2 (308-520)||(36841964-36842176)
chr2 (56-161)||(36838070-36838172)
chr2 (56-104)||(44611169-44611217)
chr2 (56-104)||(33033678-33033726)
chr2 (346-392)||(45700590-45700636)
chr2 (56-104)||(43669693-43669741)
chr2 (56-163)||(17784638-17784744)
chr2 (189-349)||(17784443-17784604)
chr2 (306-471)||(33033932-33034097)
[»] chr1 (39 HSPs)
chr1 (56-526)||(45015708-45016175)
chr1 (56-526)||(6238582-6239049)
chr1 (54-526)||(42091821-42092290)
chr1 (54-526)||(39059538-39060007)
chr1 (56-526)||(29001658-29002125)
chr1 (56-526)||(39053166-39053633)
chr1 (55-526)||(43686553-43687023)
chr1 (55-526)||(1174531-1175000)
chr1 (56-526)||(26621396-26621864)
chr1 (56-526)||(41297443-41297911)
chr1 (56-526)||(4599455-4599923)
chr1 (55-526)||(9869031-9869499)
chr1 (56-526)||(44241284-44241751)
chr1 (66-526)||(41305347-41305800)
chr1 (56-526)||(31072245-31072712)
chr1 (66-498)||(41299044-41299474)
chr1 (56-526)||(32797663-32798117)
chr1 (56-526)||(11913090-11913556)
chr1 (54-526)||(1115810-1116280)
chr1 (56-526)||(44916257-44916732)
chr1 (271-526)||(23762164-23762419)
chr1 (54-323)||(27240161-27240428)
chr1 (56-274)||(23764512-23764727)
chr1 (54-471)||(28413556-28413971)
chr1 (340-526)||(35085217-35085400)
chr1 (59-290)||(5445028-5445255)
chr1 (56-520)||(39805984-39806445)
chr1 (56-191)||(2824982-2825114)
chr1 (58-232)||(38672889-38673061)
chr1 (104-520)||(47646632-47647058)
chr1 (104-520)||(23251315-23251740)
chr1 (104-520)||(5357581-5358003)
chr1 (242-520)||(45619978-45620258)
chr1 (56-104)||(27041109-27041157)
chr1 (488-526)||(28996371-28996409)
chr1 (306-471)||(27048298-27048463)
chr1 (308-471)||(13432025-13432188)
chr1 (283-400)||(7063571-7063688)
chr1 (362-520)||(38672611-38672769)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (54-526)||(4833-5302)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (55-526)||(36005310-36005778)
chr8 (56-526)||(7311276-7311743)
chr8 (53-526)||(6464404-6464874)
chr8 (55-526)||(36021627-36022096)
chr8 (56-526)||(11358021-11358489)
chr8 (56-526)||(8013148-8013615)
chr8 (55-526)||(36075893-36076361)
chr8 (54-526)||(36425558-36426028)
chr8 (55-526)||(16710496-16710965)
chr8 (56-526)||(1238140-1238608)
chr8 (56-452)||(41242018-41242411)
chr8 (55-526)||(15012314-15012782)
chr8 (56-425)||(12768671-12769037)
chr8 (161-526)||(45068244-45068609)
chr8 (208-526)||(26250419-26250737)
chr8 (56-444)||(31017326-31017698)
chr8 (55-520)||(7933760-7934223)
chr8 (104-184)||(14393706-14393786)
chr8 (308-471)||(24220154-24220317)
chr8 (308-370)||(14393898-14393960)
[»] chr5 (25 HSPs)
chr5 (55-526)||(30041072-30041540)
chr5 (56-526)||(34357116-34357583)
chr5 (56-526)||(34358907-34359374)
chr5 (67-526)||(29980397-29980853)
chr5 (56-526)||(22359891-22360358)
chr5 (56-526)||(40958445-40958912)
chr5 (54-526)||(25894477-25894947)
chr5 (56-526)||(2957785-2958253)
chr5 (56-526)||(2966254-2966722)
chr5 (56-526)||(5876145-5876612)
chr5 (56-526)||(22313757-22314224)
chr5 (56-526)||(42150745-42151213)
chr5 (54-526)||(4973485-4973957)
chr5 (55-526)||(29414497-29414965)
chr5 (66-526)||(2438738-2439195)
chr5 (104-526)||(12505593-12506023)
chr5 (56-470)||(33794019-33794430)
chr5 (56-520)||(2155954-2156413)
chr5 (66-520)||(9843286-9843737)
chr5 (283-522)||(12918782-12919021)
chr5 (283-520)||(30580024-30580261)
chr5 (308-522)||(3413122-3413336)
chr5 (56-104)||(40821581-40821629)
chr5 (271-400)||(34738329-34738460)
chr5 (306-459)||(40821220-40821373)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (56-526)||(49618-50084)
scaffold0053 (56-127)||(55599-55667)
[»] scaffold0510 (2 HSPs)
scaffold0510 (56-526)||(8709-9177)
scaffold0510 (66-526)||(2388-2846)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (58-526)||(2574-3039)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (56-526)||(11877-12327)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (55-526)||(15097-15565)
[»] scaffold0936 (1 HSPs)
scaffold0936 (56-526)||(3092-3558)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (56-238)||(99841-100020)
[»] scaffold0173 (2 HSPs)
scaffold0173 (56-323)||(24276-24541)
scaffold0173 (362-471)||(24148-24257)
[»] scaffold0744 (1 HSPs)
scaffold0744 (56-134)||(6912-6987)
[»] scaffold0045 (3 HSPs)
scaffold0045 (56-126)||(9355-9422)
scaffold0045 (56-126)||(2973-3040)
scaffold0045 (306-520)||(2572-2785)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 431; Significance: 0; HSPs: 39)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 58 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 3924386 - 3923921
Alignment:
Q  58 atgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattcta 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  3924386 atgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggattagtgcgatatcgcggaccgttcgataccaaatatcattcca 3924290  T
Q  158 agttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgat 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3924289 agttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgat 3924190  T
Q  258 cgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattg 357  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3924189 cgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaatattg 3924090  T
Q  358 tgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatg 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3924089 tgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatg 3923990  T
Q  458 ataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3923989 ataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 3923921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 59 - 526
Target Start/End: Original strand, 14287644 - 14288109
Alignment:
Q  59 tgtagtatttttgcatcaaac-aattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattcta 157  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14287644 tgtagtatttttgcatcaaaataattgtaagtatttatatcgtctcc---tcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattcta 14287740  T
Q  158 agttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgat 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14287741 agttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaatcttgttaggattagagttccttgat 14287840  T
Q  258 cgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattg 357  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14287841 cgaacgtcgcacgtaccctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaatattg 14287940  T
Q  358 tgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatg 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14287941 tgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatg 14288040  T
Q  458 ataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14288041 ataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 14288109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 14298826 - 14299294
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaac-aattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcatt 154  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14298826 tgatgtagtatttttgcatcaaaataattgtaagtatttatatcgtctcc---tcagggactagtgcgatatcgcgaaccgtttgacaccaaatatcatt 14298922  T
Q  155 ctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14298923 ctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 14299022  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaata 354  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14299023 gatcgaacgtcgcacgtaccctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 14299122  T
Q  355 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14299123 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 14299222  T
Q  455 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14299223 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 14299294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 36875472 - 36875939
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36875472 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcc---tcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 36875568  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36875569 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattggagttccttg 36875668  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36875669 atcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatatatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaatat 36875768  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36875769 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttattgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 36875868  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36875869 tgataagaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaatctatg 36875939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 5050207 - 5049740
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5050207 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 5050111  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
     |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5050110 caagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 5050011  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5050010 atcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaatat 5049911  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5049910 tgtgaaatcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaa 5049811  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5049810 tgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatg 5049740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 23612316 - 23612783
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23612316 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcc---tcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacacgaaatatcattc 23612412  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23612413 caagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattacaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 23612512  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||| |||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  23612513 atcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaatat 23612612  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23612613 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtatcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 23612712  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23612713 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 23612783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 2446573 - 2447040
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  2446573 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcc---tcagggactagtgcgatatcgcggaccattcgacaccaaatatcattt 2446669  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
     |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2446670 caagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 2446769  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2446770 atcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaatat 2446869  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2446870 tgtgaaatcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaa 2446969  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2446970 tgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatg 2447040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 54 - 526
Target Start/End: Original strand, 1378872 - 1379341
Alignment:
Q  54 actgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1378872 actgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcc---tcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcat 1378968  T
Q  154 tctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcct 253  Q
    |  |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1378969 ttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcct 1379068  T
Q  254 tgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaat 353  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1379069 tgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgagcatacatggattctagcttgtctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaat 1379168  T
Q  354 attgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattg 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1379169 attgtgaaatcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatta 1379268  T
Q  454 aatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1379269 aatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatg 1379341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 6795365 - 6795832
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6795365 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaaatatttatatcatctcc---tcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattt 6795461  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
     |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6795462 caagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 6795561  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6795562 atcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaatat 6795661  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6795662 tgtgaaatcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaa 6795761  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6795762 tgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatg 6795832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 6021161 - 6020692
Alignment:
Q  55 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcatt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6021161 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaataccatt 6021065  T
Q  155 ctaagttaaaa-gataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcct 253  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6021064 ccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagagttcct 6020965  T
Q  254 tgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaat 353  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  6020964 tgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaat 6020865  T
Q  354 attgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattg 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  6020864 attgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctataa 6020765  T
Q  454 aatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6020764 aatgataagaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 6020692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 48353776 - 48353308
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48353776 tgatgtagtattttttcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaataccattc 48353680  T
Q  156 taagtt-aaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48353679 caagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagagttcctt 48353580  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaata 354  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  48353579 gatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaata 48353480  T
Q  355 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  48353479 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattga 48353380  T
Q  455 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48353379 atgctaagaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 48353308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 15914565 - 15915032
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15914565 tgatgtagtatttttgcatcaaacaaatgtaagtatttgtatcgtctcc---tcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 15914661  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15914662 taagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 15914761  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  15914762 atcaagcgtcgcacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaatat 15914861  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15914862 tgtgaaatcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 15914961  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15914962 tgataacaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 15915032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 26601839 - 26602306
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26601839 tgatgtagtatttttacatcaaacaattgtaagtatttgtatcgtctcc---tcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 26601935  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26601936 taagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagaattccttg 26602035  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||| |||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26602036 atcaagcgtcacacataacctaatgaacatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaatat 26602135  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26602136 tgtgagatcaattgtatcattcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 26602235  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26602236 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 26602306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 48347392 - 48346924
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48347392 tgatgtaatattttttcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaataccattc 48347296  T
Q  156 taagtt-aaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  48347295 caagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcatgaaacttgttaggattagagttcctt 48347196  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaata 354  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  48347195 gatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaata 48347096  T
Q  355 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  48347095 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattga 48346996  T
Q  455 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48346995 atgctaagaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 48346924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 15949086 - 15949553
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15949086 tgatgtagtatttttgcatcaaataattgtaagtatttgtatcgtctcc---tcagggactagtgtgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 15949182  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15949183 taagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 15949282  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  15949283 atcaagcgtcgcatataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaatat 15949382  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15949383 tatgaaatcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 15949482  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15949483 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtggttatccaaacatcgattccatgtctagaacctatg 15949553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 66 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 8185678 - 8185220
Alignment:
Q  66 tttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaa 164  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  8185678 ttttttcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaa 8185582  T
Q  165 agataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgt 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8185581 agataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgt 8185482  T
Q  265 cgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatc 364  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  8185481 cgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaatattgtgaaatc 8185382  T
Q  365 aattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaa 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  8185381 aattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgctaagaa 8185282  T
Q  465 agctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8185281 agctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 8185220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 66 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 8193238 - 8192780
Alignment:
Q  66 tttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaa 164  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  8193238 ttttttcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaa 8193142  T
Q  165 agataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgt 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8193141 agataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgt 8193042  T
Q  265 cgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatc 364  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  8193041 cgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaatattgtgaaatc 8192942  T
Q  365 aattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaa 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  8192941 aattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgctaagaa 8192842  T
Q  465 agctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8192841 agctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 8192780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 8142741 - 8142273
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8142741 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattt 8142645  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
     |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8142644 caagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattacaaatgatacaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 8142545  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8142544 atcgagcgtcgcacgtaacctaatgagcatacatggattctagcttgtctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaatat 8142445  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatcta-ttga 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  8142444 tgtgaaatcaattgtatcattcaatggttgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaattgatgatttctcaatctatttaa 8142345  T
Q  455 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8142344 atgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacgtcgattccatgtctagaacctatg 8142273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 54 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 1948931 - 1948461
Alignment:
Q  54 actgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcat 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1948931 actgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttgtatcgtctcctc---agagactagtgcgatatcgcggaccgttcaacaccaaatatcat 1948835  T
Q  154 tctaagttaaaagataattggtt-gtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcc 252  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1948834 tctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagataaagttgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagagttcc 1948735  T
Q  253 ttgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaa 352  Q
    || ||| |||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  1948734 ttaatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagattttctttgagattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaa 1948635  T
Q  353 tattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatt 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1948634 tattgtgaaatcaattgtatcattcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatt 1948535  T
Q  453 gaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1948534 gaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 1948461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 9643214 - 9642744
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaac-aattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcatt 154  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9643214 tgatgtagtatttttgcatcaaaataattgtaagtatttgtatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcatt 9643118  T
Q  155 ctaagttaaaa-gataat-tggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcc 252  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9643117 ctaagttaaaaagataatatgtttgtttgttttagtaactaaattgctaatgtaaaagttgagattaacagggcgtaaaacttgttaggattagagttcc 9643018  T
Q  253 ttgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaa 352  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9643017 ttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaa 9642918  T
Q  353 tattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatt 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9642917 tattgtgaaatcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcattcaatcgatgatttctcaatctatt 9642818  T
Q  453 gaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9642817 gaatgataaggaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 9642744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 19089734 - 19090202
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19089734 tgatgtagtacttttgcatcaaactatagtaagtatttgtatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 19089830  T
Q  156 taagttaaaagataattggtt-gtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19089831 taagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 19089930  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaata 354  Q
    |||| |||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19089931 gatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctaacttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaata 19090030  T
Q  355 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 454  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19090031 ttgtgaaatcaattgtatcactcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 19090130  T
Q  455 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19090131 atgataagaaaactttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 19090202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 21642449 - 21642912
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||    
T  21642449 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggacaagtgcgatatcgcggaccgttcaacacca----tcattc 21642541  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21642542 taagttaaacgataatttgttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagagttccttg 21642641  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||| ||| || ||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  21642642 atcaagcatcacacataacctaatgaacaaacatggattctagcttttcattgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaatat 21642741  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  21642742 tgtgaaatcaattatatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtacaatcgatgatttctaaatctattgaa 21642841  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21642842 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 21642912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 39432835 - 39433301
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   | |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  39432835 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaaatatttatatcgtctcctc---aaggactagtgcgatattacggaccgttcgacaacaaatatcattc 39432931  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  39432932 taagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagt-gcaaatgataaagttgagattaataaggtgtgaaacttgttaggattagagttccttg 39433030  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  39433031 atcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatgaattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacgccattcgtgtccaaacaatat 39433130  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  39433131 tgtgaaatcaattgtatctgtcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttttcatttaatcgatgatttctcaatctattgaa 39433230  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39433231 tgataagaaagctttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatg 39433301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 33850938 - 33850471
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||    
T  33850938 tgatgtagtatttttgcatcaaaaaatggtaagtatttatatcgtctcctcat---ggactagtgcgatatcacataccgtttgacaccaaatatcattc 33850842  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |  ||| |||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  33850841 taagttaaaagtcaatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaatagtaaaagttgagagtagtaaggcgttaaacttgttaggattagagttcctta 33850742  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||| |||||| || ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33850741 atcaagcgtcacacgtaacctaatgactatacatgtattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaatat 33850642  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33850641 tgtaaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 33850542  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  33850541 tgataagaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacttatg 33850471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 45433512 - 45433980
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  45433512 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtgagtatttatatcgtctcctt---agggtctagtgcgatatcacagaccgttcgacaccaaatatcattc 45433608  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaa-cttgttaggattagagttcctt 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  |  ||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45433609 taagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagtttcaagagtaaaagttgagagtaataaggcgtaaaaacttgttaggattagagttcctt 45433708  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaata 354  Q
     ||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  45433709 aatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagattttctttgatattatcatgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacagta 45433808  T
Q  355 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 454  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||    
T  45433809 ttgtgagatcaattgtaccattcaatagtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcaatgatttctcaatttattga 45433908  T
Q  455 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  45433909 atgataagaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacttatg 45433980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 56 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 5056603 - 5056250
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  5056603 tgatgtagtattttttcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaattatcattt 5056507  T
Q  156 taagttaaaagataa-ttggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
     |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5056506 caagtaaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 5056407  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaata 354  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5056406 gatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 5056307  T
Q  355 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaa 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5056306 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaa 5056250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 56 - 410
Target Start/End: Original strand, 37025975 - 37026326
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  37025975 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcc---tcagggactagtgcgatatcacagaccgttcgacaccaaatatcattc 37026071  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37026072 taagttaaacgataatttgttgtttgtttgactaactaagttgtaaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttaggattagagttccttg 37026171  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37026172 atcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacattgattctagtttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaatat 37026271  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattca 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37026272 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattca 37026326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 72 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 21901469 - 21901071
Alignment:
Q  72 catcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataa- 170  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  21901469 catcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccatatatcattctaagttgaaagataat 21901373  T
Q  171 ttggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcatg 270  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |  ||| |||||| |||||||||||||||   ||||| || |||||||||||||  ||||||  |      
T  21901372 ttgtttgtttgttttagtaactaaatttcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtaaaa-acgttagaatcagagttccttgattaagcgtcaaaca 21901274  T
Q  271 taacctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaatt 368  Q
    ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||| |||  |||||||||||||    
T  21901273 taatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaacaagattattcgtgtccaaataatcgtgtgaaatcaatt 21901174  T
Q  369 gtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagct 468  Q
    ||||  |||||| || ||| || ||||||||| ||  || |||  |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||    
T  21901173 gtattgttcaatagttgatttcccaaactattaaacaatccaattgtcgatcgaatcgtttaatcgatgatttctcaatctattcaacgatccgaaagct 21901074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 280 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 13774204 - 13774059
Alignment:
Q  280 gatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaa 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13774204 gatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacatcattcgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaa 13774105  T
Q  380 tcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatc 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13774104 tcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatc 13774059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 62 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 10831415 - 10831027
Alignment:
Q  62 agtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt 161  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10831415 agtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcctc---aaggactagtgcgatatcacggaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt 10831319  T
Q  162 aaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcgag 261  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |  ||| |||||| ||||| |||||||||   ||| | ||||||||||||||||  ||    
T  10831318 aaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagttgcaaaagtaaaagttgagagtaataaggcgtaaaa-acgttggaattagagttccttgattaag 10831220  T
Q  262 cgtcgcatgtaacctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtg 359  Q
    ||||  |  ||||||||| ||  |||| |||||||||||  |||    |||||||||||||||| ||| |||| |  || | |||||||| |||  ||||    
T  10831219 cgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagagttttaccgatattatcacgtatcgctcaacaagattattcatgtccaaataatcgtgtg 10831120  T
Q  360 aaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatt 452  Q
    | |||||||||||  |||| | || ||| || ||||||||| ||  || |||  ||||||   |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  10831119 agatcaattgtattgttcagtagttgatttcccaaactattaaacaatccaattgtcgattggatcgtttaatcgacgatttctcaatctatt 10831027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 62 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 11025207 - 11024819
Alignment:
Q  62 agtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt 161  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11025207 agtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcctc---aaggactagtgcgatatcacggaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt 11025111  T
Q  162 aaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcgag 261  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |  ||| |||||| ||||| |||||||||   ||| | ||||||||||||||||  ||    
T  11025110 aaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagttgcaaaagtaaaagttgagagtaataaggcgtaaaa-acgttggaattagagttccttgattaag 11025012  T
Q  262 cgtcgcatgtaacctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtg 359  Q
    ||||  |  ||||||||| ||  |||| |||||||||||  |||    |||||||||||||||| ||| |||| |  || | |||||||| |||  ||||    
T  11025011 cgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagagttttaccgatattatcacgtatcgctcaacaagattattcatgtccaaataatcgtgtg 11024912  T
Q  360 aaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatt 452  Q
    | |||||||||||  |||| | || ||| || ||||||||| ||  || |||  ||||||   |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11024911 agatcaattgtattgttcagtagttgatttcccaaactattaaacaatccaattgtcgattggatcgtttaatcgacgatttctcaatctatt 11024819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 56 - 182
Target Start/End: Original strand, 1941972 - 1942095
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  1941972 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttgtatcgtctcctc---aaggactagtgcgatatcgcagaccgttcgacaccaaatatcatta 1942068  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgt 182  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1942069 taagttaaacgataatttgttgtttgt 1942095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 211 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 7413062 - 7412753
Alignment:
Q  211 ttgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatg--gattctagcttttctttg 308  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||  |||||||||||||| |||||| ||  || ||| || ||||| ||||||| ||   |||||||||||||    |    
T  7413062 ttgagagtaataaggtataaaactttctaggattagagttcattgatcaagtatcacatatagcctaacgatcatatatacagattctagcttttaagcg 7412963  T
Q  309 atattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaa-atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgat 407  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||| |||  ||||||||||  ||||| ||||| || |||||| ||| |||||||||||| ||  ||    
T  7412962 atattatcatgtatccctcgacaacatcattcatgtctaaatgatattgtgaagttcaatcgtatcttttaatcgttgatttctcaaactattaaacaat 7412863  T
Q  408 tcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgat 507  Q
     ||| | |||||| ||| ||| ||| || ||||||||| |||| | || |||  |||||| | | | || ||||| ||| ||||||||||||||||  ||    
T  7412862 ccaatattcgatcgtattgtttaattgacgatttctcagtctactaaacgatccgaaagcatgaagcttagatactcaaagtgattatcaaaacataaat 7412763  T
Q  508 tccatgtcta 517  Q
     |||||||||    
T  7412762 cccatgtcta 7412753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 126
Target Start/End: Original strand, 28442370 - 28442440
Alignment:
Q  54 actgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagta-tttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatat 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||| |||||||||    
T  28442370 actgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtattttatatcgt---ctcctcagggactggtgcgatat 28442440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 41455212 - 41455162
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41455212 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcctc 41455162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 104
Target Start/End: Original strand, 41542386 - 41542434
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  41542386 tgatgtagtatttttgcatcaaataatagtaagtatttatatcgtctcc 41542434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 306 - 521
Target Start/End: Original strand, 28442628 - 28442842
Alignment:
Q  306 ttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatg 405  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||| ||| |||||||||| ||| | ||||| || ||||  || ||||||||| ||| || ||||||| |||| |    
T  28442628 ttgatattatcacatatcgctcaacaacatcattcgtgtccaaataatgtcgtgaattctattgagtcgttcaatcgttgatttcccaaactactgaacg 28442727  T
Q  406 attcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcg 505  Q
    || ||  |||||||  |||||||  || | ||||||| ||| ||||| ||||||   ||||||||| |||   |||  ||| ||||||| |||||| |      
T  28442728 atccactagtcgattgtatcgttgtatagttgatttcccaaactattcaatgatgcaaaagctttaagttccaatagtcaaagtgattaccaaaacct-a 28442826  T
Q  506 attccatgtctagaac 521  Q
    ||||||||||||||||    
T  28442827 attccatgtctagaac 28442842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 274 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 8881419 - 8881291
Alignment:
Q  274 cctaatgatcatacat--ggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgta 371  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||  | ||||||||||||||||  ||||||| | ||| | |||| |||  ||||||||| || |||||||    
T  8881419 cctaatgatcatatatatggattctagctttttatcgatattatcacgtatcgttcgacaatatcattcatgtctaaatgatattgtgagattaattgta 8881320  T
Q  372 tcattcaatcgtcgatgtctcaaactatt 400  Q
    || || |||||  ||| |||||| |||||    
T  8881319 tcgtttaatcgaagatttctcaatctatt 8881291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 308 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 10861536 - 10861392
Alignment:
Q  308 gatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgat 407  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||| |||  ||||| |||||||||||  |||||| || ||| || ||||||||| ||  ||    
T  10861536 gatattatcacgtatcgctcaacaagattattcgtgtccaaataatcgtgtgagatcaattgtattgttcaatagttgatttcccaaactattaaacaat 10861437  T
Q  408 tcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatt 452  Q
     |||  || |||   |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  10861436 ccaattgttgattggatcgtttaatcgacgatttctcaatctatt 10861392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 421; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 32328788 - 32328321
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32328788 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccagatatcattc 32328692  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32328691 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 32328592  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32328591 atcgagcgtcacatataacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaatat 32328492  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32328491 tgtgaaatcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaa 32328392  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32328391 tgataagaaaggtttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatg 32328321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 52 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 1428722 - 1428251
Alignment:
Q  52 ggactgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatc 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1428722 ggactgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatc 1428626  T
Q  152 attctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttc 251  Q
    |||  |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1428625 atttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaataaggcgtaaaacttgttaggattagagttc 1428526  T
Q  252 cttgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaaca 351  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1428525 cttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaaca 1428426  T
Q  352 atattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctat 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1428425 atattgtgaaatcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctat 1428326  T
Q  452 tgaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1428325 taaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatg 1428251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 34711852 - 34711382
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34711852 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattt 34711756  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
     |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34711755 caagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 34711656  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34711655 atcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaatat 34711556  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  34711555 tgtgaaatcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcaatgatttctcaatccattgaa 34711456  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatgctt 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34711455 tgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaatctatgctt 34711382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 4186612 - 4187079
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4186612 tgatgtagtatttttgcctcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcc---tcagggactagtgcgatattgcggaccgttcgacaccaaatataattc 4186708  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4186709 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtagaacttgttaggattagagttccttg 4186808  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4186809 atcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctaacttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaatat 4186908  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  4186909 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgttgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaa 4187008  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4187009 tgataagaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaatctatg 4187079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 4020531 - 4020063
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4020531 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaataccattc 4020435  T
Q  156 taagttaaaa-gataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4020434 caagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagagttcctt 4020335  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaata 354  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  4020334 gatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaata 4020235  T
Q  355 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  4020234 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattga 4020135  T
Q  455 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4020134 atgctaagaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 4020063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 4026957 - 4026489
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4026957 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaataccattc 4026861  T
Q  156 taagttaaaa-gataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4026860 caagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagagttcctt 4026761  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaata 354  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  4026760 gatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaata 4026661  T
Q  355 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  4026660 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattga 4026561  T
Q  455 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4026560 atgctaagaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 4026489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 34655177 - 34655645
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34655177 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaataccattc 34655273  T
Q  156 taagttaaaa-gataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34655274 caagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagagttcctt 34655373  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaata 354  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  34655374 gatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaata 34655473  T
Q  355 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  34655474 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattga 34655573  T
Q  455 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34655574 atgctaagaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 34655645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 34648726 - 34649194
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34648726 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaataccattc 34648822  T
Q  156 taagttaaaa-gataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34648823 caagttaaaaagataattggttgtttgttttagtatctcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagagttcctt 34648922  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaata 354  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  34648923 gatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaata 34649022  T
Q  355 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  34649023 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattga 34649122  T
Q  455 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34649123 atgctaagaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 34649194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 9865056 - 9864588
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9865056 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcttctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaataccattc 9864960  T
Q  156 taagttaaaa-gataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9864959 taagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagagttcctt 9864860  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaata 354  Q
    |||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||    
T  9864859 gatcaagcgtcacacgtaacttaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaatactattcgtgtccaaacaata 9864760  T
Q  355 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 454  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9864759 ttgtgcaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctgttga 9864660  T
Q  455 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9864659 atgataagaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 9864588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 67 - 526
Target Start/End: Original strand, 31547833 - 31548289
Alignment:
Q  67 ttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaag 166  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31547833 ttttacatcaaacaattataagtatttatatcgtctcttt---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattcttagttaaaag 31547929  T
Q  167 ataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcg 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  31547930 ataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtca 31548029  T
Q  267 catgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaa 366  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  31548030 cacgtaacctaatgatcacacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaatattgtgaaatcaa 31548129  T
Q  367 ttgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaag 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31548130 ttgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatagaatgataagaaag 31548229  T
Q  467 ctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31548230 ctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 31548289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 4738620 - 4738151
Alignment:
Q  55 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcatt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4738620 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcaataacgcggaccgttcgacaccaaataccatt 4738524  T
Q  155 ctaagttaaaa-gataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcct 253  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4738523 ccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagagttcct 4738424  T
Q  254 tgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaat 353  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  4738423 tgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacactattcgagtccaaacaat 4738324  T
Q  354 attgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattg 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  4738323 attgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttcttgatctattg 4738224  T
Q  454 aatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4738223 aatgataagaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 4738151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 7069995 - 7069530
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||    
T  7069995 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttc---accaaataccattc 7069902  T
Q  156 taagttaaaa-gataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7069901 caagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagagttcctt 7069802  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaata 354  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7069801 gatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaata 7069702  T
Q  355 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  7069701 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaacagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattga 7069602  T
Q  455 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7069601 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 7069530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 13672112 - 13671645
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13672112 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatctcgtctcctt---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcatta 13672016  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13672015 taagttaaacgataatttgttgtttatttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataatgcgtgaaacttgttaggattagagttccttg 13671916  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  13671915 atcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattagtgtccaaacaatat 13671816  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  13671815 tgtgaaatcaactgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaa 13671716  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13671715 tgataagaaagctttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatg 13671645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 11058446 - 11058052
Alignment:
Q  55 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcatt 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11058446 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcatt 11058350  T
Q  155 ctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
      |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11058349 tcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 11058250  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaata 354  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11058249 gatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 11058150  T
Q  355 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatt 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11058149 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatt 11058052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 21262870 - 21262402
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21262870 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttgtatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggatcgttcgacaccaaatatcattc 21262774  T
Q  156 taagttaaaagataattggtt-gtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21262773 taagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 21262674  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaata 354  Q
    |||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21262673 gattaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagtttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 21262574  T
Q  355 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 454  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||    
T  21262573 ttgtgagatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaacttttgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatggatgatttctcaatctataga 21262474  T
Q  455 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21262473 atgataaaagagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatg 21262402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 522
Target Start/End: Original strand, 27670021 - 27670484
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   || |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  27670021 tgatgtaatatttttgcatcaaacaatagtaaatatttatatcgtctcctc---agagactagtgcgatatcatggatcgttcgacaccaaatatcattc 27670117  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  27670118 taagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataaagtgtgaaacttgttaggattagagttccttg 27670217  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||| || ||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  27670218 atcaagtgtcacacgtaacctaataatcatacatgaattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacatcattcgtgtccaaacaatat 27670317  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  27670318 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatcaattgaa 27670417  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacc 522  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27670418 tgataagaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacc 27670484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 292 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 7062578 - 7062344
Alignment:
Q  292 attctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtct 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7062578 attctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtct 7062479  T
Q  392 caaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtga 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7062478 caaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaagtga 7062379  T
Q  492 ttatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7062378 ttatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 7062344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 317 - 526
Target Start/End: Original strand, 29907044 - 29907253
Alignment:
Q  317 acgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtc 416  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29907044 acgtgtccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtattatttaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtc 29907143  T
Q  417 gatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtct 516  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29907144 ggtcttatcgttcaataaatgatttctcaatctattgaatgataagaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatgtct 29907243  T
Q  517 agaacctatg 526  Q
    ||||| ||||    
T  29907244 agaacttatg 29907253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 317 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 30117336 - 30117127
Alignment:
Q  317 acgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtc 416  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30117336 acgtgtccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtattatttaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtc 30117237  T
Q  417 gatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtct 516  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30117236 ggtcttatcgttcaataaatgatttctcaatctattgaatgataagaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatgtct 30117137  T
Q  517 agaacctatg 526  Q
    ||||| ||||    
T  30117136 agaacttatg 30117127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 56 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 7062779 - 7062579
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7062779 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaataccattc 7062683  T
Q  156 taagttaaaa-gataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7062682 caagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagagttcctt 7062583  T
Q  255 gatc 258  Q
    ||||    
T  7062582 gatc 7062579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 56 - 287
Target Start/End: Original strand, 29906817 - 29907045
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  29906817 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcctt---agggactagtgcgatatcacagaccgttcgacactaaatatcattc 29906913  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29906914 taagttaaaatataatttgttgtttgttttagtaactaaattgctaataataaaattgagattaataaggcgtgaaacttgttaggattagagttccttg 29907013  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatac 287  Q
    ||| |||||| || |||||||||||| |||||    
T  29907014 atcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatac 29907045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 56 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 30117563 - 30117335
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  30117563 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcacagaccgttcgacactaaatatcattc 30117467  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30117466 taagttaaaatataatttgttgtttgttttagtaactaaattgctaataataaaattgagattaataaggcgtgaaacttgttaggattagagttccttg 30117367  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatac 287  Q
    ||| |||||| || ||||||||| || |||||    
T  30117366 atcaagcgtcacacgtaacctaaggaccatac 30117335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 56 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 1167791 - 1167313
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtattt-atatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcatt 154  Q
    |||||||||||||||||  | | |||  |||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  1167791 tgatgtagtatttttgccacgatcaaaagtaagtattttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcacggaccgttcgacactaaatatcatt 1167695  T
Q  155 ctaagttaaaagataattggttgtttgtttt-------agt-aactaaattgcaaatgataaaa--ttgagattaatagggcgtaaaacttgttaggatt 244  Q
     ||||||||| |   |||| | |||||||||       ||| |||||  || | || | |||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  1167694 ttaagttaaaggtagattgat-gtttgttttgaaactaagttaactatttttcgaaag-taaaagtttgagattaataaggcgtgaaacttgttaggatt 1167597  T
Q  245 agagttccttgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgat-------attatcacgtatccctcgacaacacca 337  Q
    ||| ||| |||||| |||||| ||  |||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||       ||||||| ||||||||| |||| | |     
T  1167596 agaattctttgatcaagcgtcacacataacctgatgatcatatacggattctagttttttttttattttttatattatcatgtatccctcaacaatatcg 1167497  T
Q  338 tccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatg 437  Q
    | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||  || |||||| |    
T  1167496 ttcgtgtccaaataatattgtgaattcaattgtatcgttttatcgttgatgtctcaaactattaaacgatccaagagtcgatcttatgatttaatcgacg 1167397  T
Q  438 atttctcaatctatt-gaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaa 520  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  1167396 atttctcaatctattaaaatgataagaaagctttaagtttggatacaaagagtgattatcaaaacatcaattccatatctagaa 1167313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 155 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 10081762 - 10081396
Alignment:
Q  155 ctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||  |  ||| |||||| ||||| |||||||||   ||| | |||||||||||||    
T  10081762 ctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagaaactaagttgcaagagtaaaatttgagagtaataaggcgtaaaaac-gttggaattagagttcctt 10081664  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaa 352  Q
    |||  ||||||  |  ||||||||| ||||  || |||||||||||| |||    ||||||||||| |||| ||| |||| |  || |||||||||| ||    
T  10081663 gattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacatatcgctcaacaagattattcgtgtccaaataa 10081564  T
Q  353 tattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatt 452  Q
    | |||||| |||||||||||  |||||| || ||| || ||||||||| ||  || |||  ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  10081563 tcttgtgagatcaattgtattgttcaatagttgatttcccaaactattaaaaaatccaattgtcgatcgtatcgtttaatcgacgatttctcaatatatt 10081464  T
Q  453 gaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaa 520  Q
     || |||   ||||||||| || | |||||     ||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10081463 caacgatccaaaagctttacgtatcgataccttgtgtgattatcaaaacatcaatcctatgtctagaa 10081396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 106
Target Start/End: Original strand, 1461190 - 1461240
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc 106  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1461190 tgatgtaatatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc 1461240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 290 - 504
Target Start/End: Original strand, 9846679 - 9846893
Alignment:
Q  290 ggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgt 389  Q
    |||||||||| |||  | |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||  || ||||||  |||||||| |  || |||||| ||| |    
T  9846679 ggattctagcattttatcgatattatcacgtatcgctcgacaacatcattcgtgttcaaatgatcttgtgagttcaattgtgttgtttaatcgttgattt 9846778  T
Q  390 ctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggt 489  Q
    | ||||||||| ||  || ||| | |||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||| || |||  |||||||||| |||  |||||     ||    
T  9846779 cccaaactattaaacaatccaatattcgatcgtatcgtttaatccacgatttctcaatctattaaacgatctgaaagctttaagttctgatactttgtgt 9846878  T
Q  490 gattatcaaaacatc 504  Q
    |||||||||||||||    
T  9846879 gattatcaaaacatc 9846893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 104
Target Start/End: Original strand, 7825914 - 7825962
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7825914 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcc 7825962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 10800870 - 10800822
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10800870 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcc 10800822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 104
Target Start/End: Original strand, 24908347 - 24908395
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24908347 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcc 24908395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 14118857 - 14118809
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  14118857 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattttaagtatttgtatcgtctcc 14118809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 400
Target Start/End: Original strand, 11015367 - 11015529
Alignment:
Q  240 ggattagagttccttgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacat--ggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacacca 337  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||| ||  ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||   ||||||||||| ||||| ||| || ||| ||    
T  11015367 ggattagagttcgttgatcaaacgtcgaatacaacctaatgatcacatataaggattctagctttttactgatattatcatgtatcactcaacgacatca 11015466  T
Q  338 tccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactatt 400  Q
    | | |||| ||| |||||||||| ||| || ||||| || ||||| |||| |||||| |||||    
T  11015467 ttcatgtctaaataatattgtgagatcgatcgtatcgtttaatcgacgatttctcaatctatt 11015529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 459
Target Start/End: Original strand, 24908603 - 24908756
Alignment:
Q  306 ttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatg 405  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||  || | ||||| || ||||  || ||||||||| ||| || ||||||| | || |    
T  24908603 ttgatattatcacatatcgctcgacaacatcattcgtgtccaaatgatgtcgtgaattctattgagtcgttcaatcgttgatttcccaaactactaaacg 24908702  T
Q  406 attcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgat 459  Q
    || ||  |||||||  |||||||  || | ||||||| ||| ||||| ||||||    
T  24908703 atccactagtcgattgtatcgttgtatagttgatttcccaaactattcaatgat 24908756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 306 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 14118603 - 14118511
Alignment:
Q  306 ttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaacta 398  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||||||||||  || | ||||| || ||||  |||||||||||| ||| || |||||||    
T  14118603 ttgatattatcacatattgctcgacaacatcattcgtgtccaaatgatgtcgtgaattctattgagtcattcaatcgttgatttcccaaacta 14118511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 55 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 14122887 - 14122859
Alignment:
Q  55 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaatt 83  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14122887 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaatt 14122859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 421; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 55463067 - 55462600
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55463067 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 55462971  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  55462970 caagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagagttccttg 55462871  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  55462870 atcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaatat 55462771  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55462770 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgttgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 55462671  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55462670 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 55462600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 54 - 526
Target Start/End: Original strand, 27590230 - 27590699
Alignment:
Q  54 actgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27590230 actgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcc---tcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaataccat 27590326  T
Q  154 tctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcct 253  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27590327 tccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagagttcct 27590426  T
Q  254 tgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaat 353  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  27590427 tgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaat 27590526  T
Q  354 attgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattg 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  27590527 attgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattg 27590626  T
Q  454 aatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27590627 aatgataagaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 27590699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 54 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 37368612 - 37368143
Alignment:
Q  54 actgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37368612 actgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaataccat 37368516  T
Q  154 tctaagttaaaa-gataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcc 252  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37368515 tccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagagttcc 37368416  T
Q  253 ttgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaa 352  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  37368415 ttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaa 37368316  T
Q  353 tattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatt 452  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37368315 t-ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcgatctatt 37368217  T
Q  453 gaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37368216 gaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 37368143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 41372913 - 41373381
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  41372913 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgcaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatattgcagaccgttcgacaccaattatcattc 41373009  T
Q  156 taagttaaaagataa-ttggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41373010 taagttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 41373109  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaata 354  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  41373110 gatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacatcattcgtgtccaaacaata 41373209  T
Q  355 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41373210 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaa 41373309  T
Q  455 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41373310 atgataagaaagctttaggcttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatg 41373381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 526
Target Start/End: Original strand, 8103807 - 8104275
Alignment:
Q  55 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcatt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8103807 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaataccatt 8103903  T
Q  155 ctaagttaaaa-gataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcct 253  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8103904 ccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagagttcct 8104003  T
Q  254 tgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaat 353  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  8104004 tgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcacacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaat 8104103  T
Q  354 attgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattg 453  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8104104 attgtgaaatcaattgtatc-ttcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatag 8104202  T
Q  454 aatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8104203 aatgataagaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 8104275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 17456781 - 17457249
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17456781 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaataccattc 17456877  T
Q  156 taagtt-aaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17456878 caagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgacaaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagagttcctt 17456977  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaata 354  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  17456978 gatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcatgtccaaacaata 17457077  T
Q  355 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  17457078 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattga 17457177  T
Q  455 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17457178 atgctaagaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 17457249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 13594032 - 13594502
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaac-aattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcatt 154  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13594032 tgatgtagtatttttgcatcaaaataattgtaagtatttgtatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcatt 13594128  T
Q  155 ctaagttaaaa-gataat-tggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcc 252  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13594129 ctaagttaaaaagataatatgtttgtttgttttagtaactaaattgctaatgtaaaagttgagattaacagggcgtaaaacttgttaggattagagttcc 13594228  T
Q  253 ttgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaa 352  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13594229 ttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaa 13594328  T
Q  353 tattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatt 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  13594329 tattgtgaaatcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctatt 13594428  T
Q  453 gaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13594429 gaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 13594502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 455
Target Start/End: Original strand, 30238187 - 30238583
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30238187 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---aaggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 30238283  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30238284 caagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 30238383  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||| |||||| ||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  30238384 atcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatgtattctagcttttctttgatattatcatttatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaatat 30238483  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30238484 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgttgatttctcaatctattgaa 30238583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 16405269 - 16405740
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  16405269 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcctt---agggactagtgcgatatcacagaccgttcgacaccaaatatcgttc 16405365  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16405366 taagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataaggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 16405465  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatat----tatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaaca 351  Q
    ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16405466 atcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatatatattataatgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaaca 16405565  T
Q  352 atattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctat 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16405566 atattgtgaaatcaattgtatcattcaattgtcaatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctat 16405665  T
Q  452 tgaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  16405666 tgaatgataagaaagctttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaatcatcaattccatgtctagaatctatg 16405740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 16838654 - 16838187
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcgg-accgttcgacaccaaatatcatt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||   | |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16838654 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcttctcctc---aaggactagtgcgatatcacgggaccgttagacaccaaatatcatt 16838558  T
Q  155 ctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |  ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16838557 ctaagttaaa-gatgatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaagagtaaaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttaggattagagttcctt 16838459  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaata 354  Q
    |||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16838458 gatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctatcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 16838359  T
Q  355 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 454  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16838358 ttgtgaaatcaattgtatcatccaatcgtcgatgtctcagactattaaatgattcaagagtcggtcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 16838259  T
Q  455 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16838258 atgataagaaagctttaagtttggataaaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatg 16838187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 36755094 - 36754619
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  36755094 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcctcat---ggactagtgcgatatcacggactattcgacaccaaatatcattc 36754998  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaa---------attgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattag 246  Q
    ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||         |||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||      
T  36754997 taaattaaaagatagtttgttgtttgttttagtaactaagttaactatattg-aaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttattaggattga 36754899  T
Q  247 agttccttgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtcc 346  Q
    |||||||| ||| |||||| ||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  36754898 agttccttaatcaagcgtcacacattacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacaccattcgtgtcc 36754799  T
Q  347 aaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaa 446  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36754798 aaacaatattgtgagatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgatccaagagtcggtcttatcattcaatcgatgatttctcaa 36754699  T
Q  447 tctattgaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  36754698 tctattgaatgataagaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacttatg 36754619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 55 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 30211823 - 30211364
Alignment:
Q  55 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcatt 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||        
T  30211823 ctgatgtagtatttttgcatcaaa-aatagtaagtatttatatcgtcttctc---agggactagtgcgatatcacagaccgttcgacaccaaatat---- 30211732  T
Q  155 ctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  30211731 ----gttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaataataaaattgagattaataaggcatgaaacttgttatgattagagttcctt 30211636  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaata 354  Q
     ||| |||||| ||  |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  30211635 aatcaagcgtcacacataacttaatgaccatacatggattctagattttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaaaaata 30211536  T
Q  355 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  30211535 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcggtgatttctcaatctattga 30211436  T
Q  455 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||    
T  30211435 atgataagaaagctttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatccatttcatatctagaacttatg 30211364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 56 - 425
Target Start/End: Original strand, 7780334 - 7780700
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7780334 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacactaaatatcattc 7780430  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaa-ttgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7780431 taagttaaa-gatgatttgttgtttgttttagtaacgaaattgcaaatgataaaagttgagagtaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 7780529  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaata 354  Q
    |||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  7780530 gattaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacatcattcgtgtccaaacaata 7780629  T
Q  355 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatc 425  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  7780630 ttacgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcagtcttatc 7780700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 55 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 5660850 - 5660383
Alignment:
Q  55 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcatt 154  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5660850 ctgatgtagtatttttccttcaaacaaaagtaactatttatata-tcgtctcctcagggactagtgcgatatcacggaccgttcgacaccaaatatcatt 5660752  T
Q  155 ctaagttaaaagataattggttgtttgtttta-----gt-aactaaattgcaaatgataaaa-ttgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattaga 247  Q
     |||||||| ||||   || |||||||||| |     || |||||| ||||||   |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5660751 ttaagttaagagat---tgtttgtttgtttaaactatgtgaactaatttgcaaga-ataaaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttaggattaga 5660656  T
Q  248 gttccttgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtcca 347  Q
    ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  5660655 gttccttgatcaagcatcacatgtaacctaatgatcatatacggattctaacttttctttgatataatcacgtatccctcgacaatatcattcgtgtcca 5660556  T
Q  348 aacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaat 447  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  5660555 aataatattgtgagatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgatccaagagtcagtcttatcatttaatcgatgatttctcaat 5660456  T
Q  448 ctattgaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaa 520  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5660455 ctattaaatgctaagaaagcgttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaa 5660383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 56 - 228
Target Start/End: Original strand, 48914826 - 48914996
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48914826 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaataccattc 48914922  T
Q  156 taagtt-aaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgt 228  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48914923 caagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgt 48914996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 56 - 520
Target Start/End: Original strand, 2947772 - 2948233
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2947772 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcc---tcagggactagtgcgatattgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 2947868  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||| |  ||| |  ||| |||||| |||||||||||||||    || | ||||||||||||||    
T  2947869 taagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaaccaaa-tataaaagtgaaagttgagagtaatagggcgtaaaa-acattggaattagagttccttg 2947966  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaat 353  Q
    ||| ||| ||  || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||| |||    
T  2947967 atcaagcatcaaatataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaacaagattattcgtgtccaaataat 2948066  T
Q  354 attgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattg 453  Q
      ||||||||| |||||||  |||||| || ||| ||||||||| |||||  || |||   ||||||  || ||| |||||| ||||||||||||||||     
T  2948067 cgtgtgaaatccattgtattgttcaatagttgatttctcaaactgttgaacaatccaattatcgatcggatagtttaatcgacgatttctcaatctattc 2948166  T
Q  454 aatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaa 520  Q
    || |||  |||||||||| ||   |||||     ||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  2948167 aacgatccgaaagctttatgtaccgataccttgtgtgattatcaaaacatcaatcctatgtctagaa 2948233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 56 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 13004082 - 13003817
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||     
T  13004082 tgatgtagtattttagcatcaaacaatattaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcacagactgttcgacaccaaatatcatta 13003986  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||  |  ||| |||||| ||||| |||||||||   ||| | |||||||||| |||    
T  13003985 taagttaaaagacaatttgttgtttgttttagtaacaaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaggcgtaaaa-acgttggaattagagttctttg 13003887  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 323  Q
    ||  ||||||  |  ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||    ||||||||||||||||    
T  13003886 attaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatc 13003817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 467 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 37356236 - 37356177
Alignment:
Q  467 ctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37356236 ctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 37356177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 56
Target Start/End: Original strand, 27945585 - 27945623
Alignment:
Q  18 acaagatttgcaggggacgaaatatctgtggagtggact 56  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27945585 acaagatttgcaggggacgaaatatctgtggagtggact 27945623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 56
Target Start/End: Original strand, 27437093 - 27437131
Alignment:
Q  18 acaagatttgcaggggacgaaatatctgtggagtggact 56  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27437093 acaagatttgcagaggacgaaatatctgtggagtggact 27437131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 362 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 13003798 - 13003689
Alignment:
Q  362 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 461  Q
    |||||||||||  |||||| || ||| |||||||||||| ||  || |||  ||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||| || |||      
T  13003798 atcaattgtattgttcaatagttgatttctcaaactattaaacaatccaattgtcgatcgtatcgtttaattgacgatttctcaatctattcaacgatcc 13003699  T
Q  462 gaaagcttta 471  Q
    ||||||||||    
T  13003698 gaaagcttta 13003689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 27549134 - 27549098
Alignment:
Q  20 aagatttgcaggggacgaaatatctgtggagtggact 56  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27549134 aagatttgtaggggacgaaatatctgtggagtggact 27549098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 421; Significance: 0; HSPs: 30)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 32746297 - 32746764
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32746297 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcc---tcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 32746393  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32746394 caagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 32746493  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||| |||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  32746494 atcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaatat 32746593  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32746594 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 32746693  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32746694 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 32746764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 6036193 - 6036660
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  6036193 tgatgtagtatttttgcatcaaataattgtaagtatttatatcgtctcc---tcagggactagtgcgatatcgcggaccgtttgacaccaaatataattc 6036289  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6036290 caagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgaaaatgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagagttccttg 6036389  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  6036390 atcaagcgtcactcgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaatat 6036489  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6036490 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 6036589  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6036590 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 6036660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 24179001 - 24179468
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24179001 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctca----ggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaataccattc 24179096  T
Q  156 taagttaaaa-gataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24179097 caagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagagttcctt 24179196  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaata 354  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  24179197 gatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaata 24179296  T
Q  355 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24179297 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcgatctattga 24179396  T
Q  455 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24179397 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 24179468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 27502265 - 27501795
Alignment:
Q  55 ctgatgtagtatttttg-catcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcat 153  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27502265 ctgatgtagtatttttttcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaataccat 27502169  T
Q  154 tctaagtt-aaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcc 252  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27502168 tccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagagttcc 27502069  T
Q  253 ttgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaa 352  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  27502068 ttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaa 27501969  T
Q  353 tattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatt 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  27501968 tattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctatt 27501869  T
Q  453 gaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27501868 gaatgctaagaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 27501795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 4311782 - 4311314
Alignment:
Q  55 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcatt 154  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  4311782 ctgatgtagtatttttgcaacaaacaattgtaagtatttgtatcgtctcctc---agggactagtgcgatattgaggaccgttcaacaccaaatatcatt 4311686  T
Q  155 ctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4311685 ctaagttaaatgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 4311586  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaata 354  Q
    |||| | |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  4311585 gatcaatcgtcgcacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaata 4311486  T
Q  355 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4311485 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 4311386  T
Q  455 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4311385 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 4311314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 53 - 521
Target Start/End: Original strand, 25893154 - 25893625
Alignment:
Q  53 gactgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatca 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25893154 gactgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatacca 25893250  T
Q  153 ttctaagttaaaa-gataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagtt- 250  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  25893251 ttctaagttaaaaagttaattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagagtta 25893350  T
Q  251 ----ccttgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtcc 346  Q
        |||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||    
T  25893351 aattccttgatcaagcgtcacacgtaacttaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaatactattcgtgtcc 25893450  T
Q  347 aaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaa 446  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25893451 aaacaatattgtgcaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaa 25893550  T
Q  447 tctattgaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaac 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25893551 tctattgaatgataagaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaac 25893625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 23068391 - 23068858
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  23068391 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttgtatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcagaccgttcgtcaccaaatatcattc 23068487  T
Q  156 taagttaaaa-gataat-tggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcct 253  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  23068488 taagttaaaaagataatctgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgaaattaatagggcggaaa-cttgttaggattagagttctt 23068586  T
Q  254 tgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaat 353  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23068587 tgatcgagcatcgcacgtaacctaatgatcatacatggattcta-cttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaat 23068685  T
Q  354 attgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattg 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23068686 attgtgaaatcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattg 23068785  T
Q  454 aatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23068786 aatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 23068858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 481
Target Start/End: Original strand, 13014913 - 13015335
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13014913 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcc---tcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 13015009  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13015010 caagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgctaatgtaaaagttgagattaacagggcgtaaaacttgttaggattagagtttcttg 13015109  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||| |||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  13015110 atcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaatat 13015209  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13015210 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 13015309  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggata 481  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  13015310 tgataagaaagctttaggtttagata 13015335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 9570845 - 9570382
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  9570845 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatattgcagaccgttcgacaccaattatcattc 9570749  T
Q  156 taagtt-aaaagataa-ttggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcct 253  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9570748 taagtttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactaaattgcagatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagaattcct 9570649  T
Q  254 tgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaat 353  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  9570648 tgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaataccattcgtgtccaaacaat 9570549  T
Q  354 attgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattg 453  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  9570548 attgtgagatcacttatatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattg 9570449  T
Q  454 aatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaa 520  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9570448 aatgataagaaagcgttaaatttggatacaaaagatgattatcaaaacatcgattccatgtctagaa 9570382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 9577347 - 9576884
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||    
T  9577347 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatattgcagaccgttcgacaccaattattattc 9577251  T
Q  156 taagtt-aaaagataa-ttggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcct 253  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9577250 taagtttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactaaattgcagatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagaattcct 9577151  T
Q  254 tgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaat 353  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  9577150 tgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaataccattcgtgtccaaacaat 9577051  T
Q  354 attgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattg 453  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  9577050 attgtgagatcacttatatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattg 9576951  T
Q  454 aatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaa 520  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9576950 aatgataagaaagcgttaaatttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaa 9576884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 10941599 - 10941132
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| ||||    
T  10941599 tgatgtagtatttttgcatcaaccaatagtaagtatttatatcgtctcctc---aaggactagtgcgatatcacagaccgtttgacacctaatataattc 10941503  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  10941502 taagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaataataaaattgagattaataaggcgtgaaacttgttaggattagagttcctta 10941403  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||| |||||| || |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10941402 atcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatatatggattctaacttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaatat 10941303  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10941302 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcaatgtctcaaactattgaatatttcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaa 10941203  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  10941202 tgataagaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatatctagaacttatg 10941132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 43931509 - 43931971
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  43931509 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcctt---agggactagtgcgatatcacggaccgtccgacaccaaataccattc 43931605  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  43931606 taagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcggataataaaattgagattaataaggcgtgaaacttgttaggattagagttcctta 43931705  T
Q  256 atcgagcgtcgcat--gtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaat 353  Q
    ||| |||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  43931706 atcaagcgtcacatacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctt-------atcacgtatccctcgacaacaccattcgtgttcaaacaat 43931798  T
Q  354 attgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattg 453  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||  ||||||||||    
T  43931799 attgtgagatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttgccaatctattg 43931898  T
Q  454 aatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  43931899 aatgataagaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacttatg 43931971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 59 - 526
Target Start/End: Original strand, 43994997 - 43995471
Alignment:
Q  59 tgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattctaa 158  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  43994997 tgtagtatttttgcatcaaacaaaagtaagtatttatatcgtgtc-tcctcagggactagtgcgatatcacggaccattcgacatcaaatatcattctaa 43995095  T
Q  159 gttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgc--------aaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagtt 250  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||         |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  43995096 gttaaaagatagtttgttgtttgttttagaaactaagttgactatgttgaaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtcaggattagagtt 43995195  T
Q  251 ccttgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttcttt-gatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaa 349  Q
    |||| | | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43995196 ccttaaccaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttcttttgatattattacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaa 43995295  T
Q  350 caatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatct 449  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  43995296 caatattatgagatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgatccaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatct 43995395  T
Q  450 attgaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||    
T  43995396 attgaatgataagaaagctttaagtttggatacaaaaggt-attatcaaaacatcaatttcatgtccagaacttatg 43995471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 56 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 20651429 - 20650959
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||     
T  20651429 tgatgtagtattttttcatcaaataaaagtaagtatttatata-tcgtctccttagggactagtgtgatatcatggactgttcgacaccaaatatcattt 20651331  T
Q  156 taagttaaaagataa-ttggttgtttgtttta-----gt-aactaaattgcaaatgataaaa-ttgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattaga 247  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||||| |     || |||||| ||||||   |||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  20651330 taagttaaaagattggttgtttgtttgtttaaactatgtgaactaatttgcaaga-ataaaagttgagattaataaggcgtgaaactcgttaggattaga 20651232  T
Q  248 gttccttgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtcca 347  Q
    ||||||||||| ||| || || ||||  ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||  |    
T  20651231 gttccttgatcaagcatcacacgtaatttaatgatcatatacggattctaccttttctttgatattatcacgtatcccttgacaatatcattcgtgttta 20651132  T
Q  348 aacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaat 447  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||    
T  20651131 aataatattgtgagatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgatccaagagtcggttttatcatttaatcgatgatttctcaat 20651032  T
Q  448 ctattgaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaa 520  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20651031 ctattgaatgataagaaggcgttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacattaattccatgtctagaa 20650959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 56 - 258
Target Start/End: Original strand, 41353788 - 41353987
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41353788 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttgtatcgtcttctt---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattt 41353884  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41353885 taagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataggacgtaaaacttgttaggattagagttccttg 41353984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 56 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 41354365 - 41354142
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  41354365 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgcaagtatttatatcgtctcctc---aaggactagtgcgatatcatggaccgttcgacaccaaatatcattc 41354269  T
Q  156 taagttaaaagataattggtt-gtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
    |||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41354268 taagttgaaa-ataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtgaaacttgttaggattagagttcctt 41354170  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgat 282  Q
    || | |||||| || |||||||||||||    
T  41354169 gagcaagcgtcacacgtaacctaatgat 41354142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 56 - 452
Target Start/End: Original strand, 4590721 - 4591115
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  4590721 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgt---ctcctcagggactagtgcgatattgcagaccgttcgacaccaattatcattc 4590817  T
Q  156 taagttaaaagataa-ttggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
     |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |  ||| | |||| |||||| |||||||||||||||   ||| | |||||||||||||    
T  4590818 caagttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaaccaaa-tataaaagttaaagttgagagtaatagggcgtaaaa-acgttggaattagagttcctt 4590915  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaa 352  Q
    |||| ||| ||  || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||| ||    
T  4590916 gatcaagcatcaaatataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaacaagattattcgtgtccaaataa 4591015  T
Q  353 tattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatt 452  Q
    |  ||||| ||| ||||||| ||||||  || ||| ||||||||| |||||  || |||   ||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  4591016 tcgtgtgagatccattgtattattcaacagttgatttctcaaactgttgaacaatccaattatcgatcggatagtttaatcgatgatttctcaatctatt 4591115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 56 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 18341587 - 18341481
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18341587 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaataccattc 18341491  T
Q  156 taagttaaaa 165  Q
     |||||||||    
T  18341490 caagttaaaa 18341481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 56 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 3577233 - 3577098
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||    
T  3577233 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtct---cctcagggactagtgcgatataaaagaccgttcgacaccaaatattattc 3577137  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaa 194  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  3577136 taagttaaatgataatttgttgtttgtttgaataactaa 3577098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 104 - 504
Target Start/End: Original strand, 2785680 - 2786078
Alignment:
Q  104 ctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagat-aattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | | |||||||  ||||||||| || |||| ||||||||||| |  ||||||| | | ||    
T  2785680 ctcctcagggactagtgcgatatcatggaccgttcgacatcgattatcatttcaagttaaaacattaatttgttgtttgtttaa--aactaaaatacgaa 2785777  T
Q  203 tgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatca----tacatggattctag 298  Q
     |||||| ||||||   ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||| || ||| |||||  |||| ||    |||||  |||||||    
T  2785778 -gataaagttgaga---atatggcgtaaaacatgttaggattagagtttcttgaccaagcatcacatataaccatatgaccacatatacat--attctag 2785871  T
Q  299 cttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaacta 398  Q
    |||||  | ||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||  || | ||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||    
T  2785872 cttttaatcgatattatcacgtatccctcgacaaaatcatttgtgtccaaatgatctcgtgaaatcaattgtatcgtttaatcgttgatttctcaaacta 2785971  T
Q  399 ttgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagc-tttaggtttggatacacaaggtgattatca 497  Q
     | || ||| ||| | ||| || ||||||| |||||| |||||||| ||| ||| || |||  |||||| |  || |||| ||||| |||||||||||||    
T  2785972 ctaaacgatccaatattcggtcgtatcgtttaatcgacgatttctccatcgattaaacgatccgaaagcatgaagctttgaatacaaaaggtgattatca 2786071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 20953013 - 20952588
Alignment:
Q  104 ctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaaga-taattggttgtttgttt-----ta--gtaactaaa 195  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||     ||   |||||||     
T  20953013 ctcctcaggtactagtgcgatatcacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagagtaattgtttgtttctttgcaactaagttaactaat 20952914  T
Q  196 ttgcaaatgataaaa-ttgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgat--catacatgga 292  Q
    |||| ||  |||||| |||||| ||||| |||||||||   ||| | ||||||||||||||||  ||||||  |  ||||||||| ||  |||| |||||    
T  20952913 ttgc-aagaataaaagttgagagtaataaggcgtaaaa-acgttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcgcatatatgga 20952816  T
Q  293 ttctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctc 392  Q
    |||||||  ||    |||||||||||||||| ||| |||| |  || | |||||||| ||| |||||| |||||||||||  |||| |||| ||| || |    
T  20952815 ttctagcgctttaccgatattatcacgtatcgctcaacaagattattcatgtccaaataatcttgtgagatcaattgtattgttcagtcgttgatttccc 20952716  T
Q  393 aaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgat 492  Q
    |||||||| ||  || ||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||  |||||||||| |||  |||||     |||||    
T  20952715 aaactattaaacaatccaatagtcgatcgtatcgtttaatcgacgatttcttaatctattcaacgatccgaaagctttaagttccgatactttgtgtgat 20952616  T
Q  493 tatcaaaacatcgattccatgtctagaa 520  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||    
T  20952615 tatcaaaacatcaatcctatgtctagaa 20952588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 423 - 526
Target Start/End: Original strand, 47441092 - 47441195
Alignment:
Q  423 atcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacc 522  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||     
T  47441092 atcgtttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagttttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaatttcatgtctagaact 47441191  T
Q  523 tatg 526  Q
    ||||    
T  47441192 tatg 47441195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 283 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 9331209 - 9330970
Alignment:
Q  283 catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcg 382  Q
    |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||| | ||  |||| || || |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  9331209 catatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtaccgcttaacaagactattcgtgcccaaataatcttgtgaaatcaattgtattgttcaatcg 9331110  T
Q  383 tcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagctttaggtttggatac 482  Q
    | ||| || ||||||||| |   || ||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||| || |||  |||||||||| ||   |||||    
T  9331109 ttgatttcccaaactattaagcaatccaatagtcgatcgtatcgtttaatcgacgatttctccatctattaaacgatctgaaagctttaagtcccgatac 9331010  T
Q  483 acaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacc 522  Q
         |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9331009 tttgtgtgattatcaaaacattgattccatgtctagaacc 9330970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 55 - 104
Target Start/End: Original strand, 4674853 - 4674902
Alignment:
Q  55 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4674853 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttgtatcgtctcc 4674902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 104
Target Start/End: Original strand, 18866705 - 18866753
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18866705 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttaaatcgtctcc 18866753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 4644420 - 4644320
Alignment:
Q  283 catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcg 382  Q
    |||| |||||||||||| |||    ||||||||||||||||  || |||| || || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  4644420 catatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgttcaacaagactattcgtgtccaaataatcttgtgaaatcaattgtattgttcaatcg 4644321  T
Q  383 t 383  Q
    |    
T  4644320 t 4644320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 378 - 521
Target Start/End: Original strand, 27900777 - 27900920
Alignment:
Q  378 aatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagctttaggtttg 477  Q
    |||||||||| || ||||||||| || ||| ||| ||||||| ||||  ||  || | ||||||| ||| ||||| |||||||  ||||||||| |||      
T  27900777 aatcgtcgatttcccaaactattaaacgatccaatagtcgattttattattgcatagttgatttcccaaactattaaatgatacaaaagctttaagttcc 27900876  T
Q  478 gatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaac 521  Q
     |||  ||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  27900877 aatattcaaagtgattatcaaaacctaaattccatgtctagaac 27900920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 461460 - 461339
Alignment:
Q  273 acctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgt 370  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||  | ||||||| |||| ||| | |||||||| ||| | |||| |||  ||||||||| |||||| ||    
T  461460 acctaatgatcacatatatggattctagctttttatcgatattaccacgcatcgcccgacaacatcattcatgtctaaatgatattgtgagatcaatcgt 461361  T
Q  371 atcattcaatcgtcgatgtctc 392  Q
    ||| || ||||| |||| ||||    
T  461360 atcgtttaatcgacgatttctc 461339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 422 - 504
Target Start/End: Original strand, 25692267 - 25692349
Alignment:
Q  422 tatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatc 504  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || || |||  |||||||||| ||| ||||||     |||||||||||||||||    
T  25692267 tatcgtttaatcgatgatttctcaatcttttaaaagatctgaaagctttaagttcggatactttgtgtgattatcaaaacatc 25692349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 459
Target Start/End: Original strand, 4675108 - 4675261
Alignment:
Q  306 ttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatg 405  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||  || | ||||| || ||||  || ||||||||| ||| || ||||||| | || |    
T  4675108 ttgatattatcacatatcgctcgacaacatcattcgtgtccaaatgatgtcgtgaattctattgagtcgttcaatcgttgatttcccaaactactaaacg 4675207  T
Q  406 attcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgat 459  Q
    || ||  |||||||  |||||||  || | ||||||| ||| ||||| ||||||    
T  4675208 atccactagtcgattgtatcgttgtatagttgatttcccaaactattcaatgat 4675261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 419; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 36782481 - 36782012
Alignment:
Q  55 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcatt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36782481 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaataccatt 36782385  T
Q  155 ctaagttaaaa-gataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcct 253  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36782384 ccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcct 36782285  T
Q  254 tgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaat 353  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36782284 tgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaat 36782185  T
Q  354 attgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattg 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36782184 attgtgaaatcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattg 36782085  T
Q  454 aatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36782084 aatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 36782012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 42931667 - 42931200
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42931667 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 42931571  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42931570 caagttaacagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagagttccttg 42931471  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  42931470 atcaaatgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaatat 42931371  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42931370 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 42931271  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42931270 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 42931200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 34835107 - 34834640
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34835107 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattt 34835011  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
     |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34835010 caagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactagattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 34834911  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34834910 atcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaatat 34834811  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34834810 tgtgaaatcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaacgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaa 34834711  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34834710 tgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatg 34834640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 34841551 - 34841084
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34841551 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattt 34841455  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
     |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34841454 caagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactagattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 34841355  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34841354 atcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaatat 34841255  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34841254 tgtgaaatcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaacgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaa 34841155  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34841154 tgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatg 34841084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 54 - 526
Target Start/End: Original strand, 43267783 - 43268253
Alignment:
Q  54 actgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43267783 actgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaattatcat 43267879  T
Q  154 tctaagttaaaagataa-ttggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcc 252  Q
    |  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43267880 ttcaagttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcc 43267979  T
Q  253 ttgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaa 352  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43267980 ttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaa 43268079  T
Q  353 tattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatt 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43268080 tattgtgaaatcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttttcaatctatt 43268179  T
Q  453 gaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43268180 aaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatg 43268253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 2157539 - 2158006
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2157539 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcc---tcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattt 2157635  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
     |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2157636 caagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 2157735  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2157736 atcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctatcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaatat 2157835  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2157836 tgtgaaatcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaa 2157935  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2157936 tgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatg 2158006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 12950723 - 12951190
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  12950723 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcc---tcagggactagtgcgatatcacggaccgttcgacaccaaatatcattt 12950819  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
     |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12950820 caagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaataaggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 12950919  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12950920 atcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaatat 12951019  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12951020 tgtgaaatcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaa 12951119  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12951120 tgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatg 12951190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 54 - 526
Target Start/End: Original strand, 45011907 - 45012377
Alignment:
Q  54 actgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45011907 actgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaataccat 45012003  T
Q  154 tctaagttaaaa-gataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcc 252  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45012004 tccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagagttcc 45012103  T
Q  253 ttgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaa 352  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  45012104 ttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaa 45012203  T
Q  353 tattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatt 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  45012204 tattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctatt 45012303  T
Q  453 gaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45012304 gaatgctaagaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 45012377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 526
Target Start/End: Original strand, 15852475 - 15852944
Alignment:
Q  55 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcatt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15852475 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaataccatt 15852571  T
Q  155 ctaagttaaaa-gataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcct 253  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15852572 ccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagagttcct 15852671  T
Q  254 tgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaat 353  Q
    ||||| |||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15852672 tgatcaagcgtcacacttaacctaatgatcacacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaat 15852771  T
Q  354 attgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattg 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15852772 attgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatag 15852871  T
Q  454 aatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15852872 aatgataagaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 15852944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 2163955 - 2164422
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  2163955 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatagtctcc---tcagggactagtgcgatatcgcagaccgttcgacaccaaatatcattt 2164051  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
     |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2164052 caagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 2164151  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2164152 atcgagcgtcgcacgtaacctaatgattatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaatat 2164251  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2164252 tgtgaaatcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaa 2164351  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2164352 tgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatg 2164422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 21332290 - 21331822
Alignment:
Q  55 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcatt 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21332290 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtatcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcatt 21332194  T
Q  155 ctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21332193 ctaagttaaaagatagttggttgtttgttttaatgactaaatttcaaatgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagagttcctt 21332094  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaata 354  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21332093 gatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcatgtccaaacaata 21331994  T
Q  355 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 454  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21331993 ttgtgaaatcaattgtgtcattcaatcgttgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattga 21331894  T
Q  455 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21331893 atgataagaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcagaacatcaattccatgtctagaacctatg 21331822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 54 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 2021745 - 2021276
Alignment:
Q  54 actgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  2021745 actgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttgtatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcgaaacgttcgacaccaaatatcat 2021649  T
Q  154 tctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcct 253  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2021648 tctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggtgtaaaacttgttaggattagagttcct 2021549  T
Q  254 tgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaat 353  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  2021548 tgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaat 2021449  T
Q  354 attgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattg 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2021448 attgtgaaatcaattgtatcattcaattgtcaatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattg 2021349  T
Q  454 aatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2021348 aatgataagaaagttttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgatttcatgtctagaacctatg 2021276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 13902252 - 13901784
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13902252 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattt 13902156  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
     |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13902155 caagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 13902056  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13902055 atcgagcgtcgcacgtaacctaatgagcatacatggattctagcttgtctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaatat 13901956  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatcta-ttga 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  13901955 tgtgaaatcaattgtatcattcaatggttgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaattgatgatttctcaatctatttaa 13901856  T
Q  455 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13901855 atgataagaaagctttaggtttggatacctaaggtgattatcaaaacgtcgattccatgtctagaacctatg 13901784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 53 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 16856784 - 16856319
Alignment:
Q  53 gactgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatca 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16856784 gactgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttgtatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacagcaaatatca 16856688  T
Q  153 ttctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcc 252  Q
    ||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  16856687 ttcaaagttaaa-gataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaanacttgttaggattagagtttc 16856589  T
Q  253 ttgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaa 352  Q
    |||||| |||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16856588 ttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaa 16856489  T
Q  353 tattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatt 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16856488 tattgtgaaatcaattgtatcattcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatt 16856389  T
Q  453 gaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacc 522  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16856388 gaatgataagaaagctttaggtttggatgcacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacc 16856319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 53 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 16817627 - 16817162
Alignment:
Q  53 gactgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatca 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16817627 gactgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttgtatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacagcaaatatca 16817531  T
Q  153 ttctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcc 252  Q
    ||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  16817530 ttcaaagttaaa-gataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaacacttgttaggattagagtttc 16817432  T
Q  253 ttgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaa 352  Q
    |||||| |||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16817431 ttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaa 16817332  T
Q  353 tattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatt 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16817331 tattgtgaaatcaattgtatcattcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatt 16817232  T
Q  453 gaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacc 522  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16817231 gaatgataagaaagctttaggtttggatgcacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacc 16817162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 21068253 - 21067785
Alignment:
Q  55 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcatt 154  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21068253 ctgatgtagtatttttacatcaaacaattg-aagtatttgtatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcatt 21068158  T
Q  155 ctaagttaaaagataattggtt-gtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcct 253  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |  ||| |||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  21068157 ctaagttaaaagataatttgtttgtttgtattagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggtgtgaaactt-ttaggattagagttcct 21068059  T
Q  254 tgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaat 353  Q
    ||| |  || || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  21068058 tgagcaggcatcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaat 21067959  T
Q  354 attgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattg 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21067958 attgtgaaatcaattgtatcattcaattgttgatgtctcaaactattgaatgattcaagagacgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattg 21067859  T
Q  454 aatgat-aagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21067858 aatgataaaaaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 21067785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 55 - 387
Target Start/End: Original strand, 29484852 - 29485182
Alignment:
Q  55 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcatt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29484852 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaataccatt 29484948  T
Q  155 ctaagttaaaa-gataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcct 253  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29484949 ccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagagttcct 29485048  T
Q  254 tgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaat 353  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  29485049 tgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaat 29485148  T
Q  354 attgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgat 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29485149 attgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgat 29485182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 55 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 21342178 - 21341879
Alignment:
Q  55 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcatt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342178 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgt---attctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcatt 21342082  T
Q  155 ctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21342081 ctaagttaaaagataattggttgtttgttttaatgactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagagttcctt 21341982  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaata 354  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21341981 gatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcatgtccaaacaata 21341882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 58 - 520
Target Start/End: Original strand, 41455535 - 41455994
Alignment:
Q  58 atgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattcta 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  41455535 atgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcc---tcagggactagtgcgatatcacagaccgttcgacaccaaatatcattcta 41455631  T
Q  158 agttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgat 257  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||| |  ||| |||||| ||||| |||||||||   ||| | ||||||||||||||||    
T  41455632 agttaaaagataatttgttgtttgttttagtaac-caagtgcaaaagtaaaagttgagagtaataaggcgtaaaa-acgttggaattagagttccttgat 41455729  T
Q  258 cgagcgtcgcatgtaacctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
      ||||||  |  ||||||||| ||  |||| |||||||| | | |||    |||||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||| |||      
T  41455730 taagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattccaccgttttaccgatattatcacgtatcactcaacaagattattcgtgtccaaataatcg 41455829  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    ||||| |||||||||||  |||||| || ||  || ||||||||| ||  || |||  |||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||| ||    
T  41455830 tgtgagatcaattgtattgttcaatagttgaattcccaaactattaaacaatccaattgtcgatcggatcgtttaatcgacgatttctcaatctattcaa 41455929  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaa 520  Q
     |||  |||||||||| ||   |||||     ||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  41455930 cgatccgaaagctttatgtactgataccttgtgtgattatcaaaacatcaatcctatgtctagaa 41455994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 107 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 45700897 - 45700642
Alignment:
Q  107 ctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaaagata-attggttgtttgttt-tag--taactaaa-ttgca 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||  ||||| |   |||  ||||||   ||||     
T  45700897 ctcagggactagtgcgatatcacggaccgttcgacaccaaatatcattataagtttaaaaaatagattgtctgtttataactaggttaactattgttgcg 45700798  T
Q  201 aatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagct 300  Q
    ||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45700797 aataataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagaattagagttccttgatcaaacgtcacacataacctaatgatcatacctggattctagct 45700698  T
Q  301 tttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatatt 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  45700697 tttctttgatattatcacgtatccctcgacaacatcattcgtgtccaaacaatatt 45700642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 58 - 520
Target Start/End: Original strand, 13162737 - 13163207
Alignment:
Q  58 atgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatt-tatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattct 156  Q
    |||||||||||||  ||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||    ||||||| ||| | | ||||||| |    
T  13162737 atgtagtatttttctatcaatcaaaagtaagtattgtatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcataaaccgttcaacatcgattatcatttt 13162833  T
Q  157 aagttaaaagataatt-ggttgtttgttttagt-------aactaaattgcaaatgataaaa-ttgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattaga 247  Q
    ||||||||   ||||| |||||||||||| |         ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13162834 aagttaaagattaatttggttgtttgtttaaaactacaagaactaaattgcgaa-gataaaagttgagagtaataaggcgtaaaacttgttaggattaga 13162932  T
Q  248 gttccttgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatg--gattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtc 345  Q
    |||| |||| | ||  |||||| |||| ||||||||| | ||   |||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  13162933 gttcattgaccaagaatcgcatataacataatgatcacatatacagattctagcttttaatcaatattatcacgtatccctcgacaacatcattcatgtc 13163032  T
Q  346 caaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctca 445  Q
     |||  |||||||||||||||||||||| || |||||| ||| || ||||||||| || ||| ||| | |||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  13163033 taaatgatattgtgaaatcaattgtatcgtttaatcgttgatttcccaaactattaaacgatccaacattcgatcgtatcgtttaatcgacgatttctca 13163132  T
Q  446 atctattgaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaa 520  Q
     |||||| || |||  |||| | | | | || ||||| |||||||||||||||||| |  || ||||||||||||    
T  13163133 ctctattaaacgatctgaaaccatgaagcttagatactcaaggtgattatcaaaacgtaaatcccatgtctagaa 13163207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 397 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 21341883 - 21341754
Alignment:
Q  397 tattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatc 496  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21341883 tattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatc 21341784  T
Q  497 aaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21341783 agaacatcaattccatgtctagaacctatg 21341754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 104 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 11910210 - 11909787
Alignment:
Q  104 ctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataattggtt-gtttgttt------ta-gtaa-ctaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||| ||||||||||| |||||||||   ||||||||| ||||||||      || |||| ||||    
T  11910210 ctcctcagggactagtgcgatatcacaaaccgtttgacatcaaatatcattttaagttaaagattaattggtttgtttgtttagaaactatgtaaactaa 11910111  T
Q  195 attgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcatgtaacctaatga--tcatacatgga 292  Q
     ||||||   |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||| | |||||   |||| | |||    
T  11910110 tttgcaaga-ataaaagtgagattaataaggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcaagcatcccatataatccaatgaccacatatacgga 11910012  T
Q  293 ttctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctc 392  Q
    |||||||||||  |  |||||||||||||||  ||||||| |  || |||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| | ||| ||||    
T  11910011 ttctagcttttaatctatattatcacgtatcagtcgacaatattattcgtgtccaaataatattgtgaaatcaattgtctcgtttaatcattgatttctc 11909912  T
Q  393 aaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgat 492  Q
    ||||||   || ||| ||| | |||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||| || |||   ||||| | | |||| ||||||  | |||||    
T  11909911 aaactaccaaacgatccaatattcgatcgtatcgtttaatcgacgatttctcagtctattaaacgattcaaaagcatgaagtttagatacaagaagtgat 11909812  T
Q  493 tatcaaaacatcgattccatgtcta 517  Q
    |||||||||||| |||| |||||||    
T  11909811 tatcaaaacatcaattctatgtcta 11909787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 414 - 526
Target Start/End: Original strand, 29485177 - 29485289
Alignment:
Q  414 gtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatg 513  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29485177 gtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaatgctaagaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatg 29485276  T
Q  514 tctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||    
T  29485277 tctagaacctatg 29485289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 17789257 - 17788994
Alignment:
Q  189 aactaaattgcaaatgataaaa-ttgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgat--cat 285  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||   ||| | ||||||||||||||||  ||||||  |  |||| |||| ||  |||    
T  17789257 aactaatttgcaaa-gataaaagttgagagtaataaggcgtaaaagc-gttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacataataatcacat 17789160  T
Q  286 acatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcg 385  Q
    | |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||  || ||||||  ||||||||||  || ||| || |    
T  17789159 atatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcgacaacatcattcctgtccaaatgatcttgtgagttcaattgtattgtttaattgttg 17789060  T
Q  386 atgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctat 451  Q
    || |||||||||||| |   || ||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  17789059 atttctcaaactattaagcaatccaatagtcgatcgtatcgtttaatcgacgatttctcaatctat 17788994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 308 - 520
Target Start/End: Original strand, 36841964 - 36842176
Alignment:
Q  308 gatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgat 407  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||| ||| |||||| ||||| |||||  |||||| || ||| || ||||||||| ||  ||    
T  36841964 gatattatcacgtatcgctcaacaagattattcgtgtccaaataatcttgtgagatcaactgtattgttcaatagttgatttcccaaactattaaacaat 36842063  T
Q  408 tcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgat 507  Q
     ||| | |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||  ||||||| || |||  |||||     ||||||||||||||||| ||    
T  36842064 ccaataatcgatcgtatcgtttaatcgacgatttctcaatctattcaacgatctgaaagctctacgttccgataccttgtgtgattatcaaaacatcaat 36842163  T
Q  508 tccatgtctagaa 520  Q
     | ||||||||||    
T  36842164 cctatgtctagaa 36842176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 56 - 161
Target Start/End: Original strand, 36838070 - 36838172
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||   ||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||| ||| ||| || ||||     
T  36838070 tgatgtagtatttttgcatcaaacaaaagtaagtatttatatcgt---ctccttagggattagtgcgatatcacggacctttcaacatcaattaccatta 36838166  T
Q  156 taagtt 161  Q
    ||||||    
T  36838167 taagtt 36838172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 104
Target Start/End: Original strand, 44611169 - 44611217
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44611169 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcc 44611217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 104
Target Start/End: Original strand, 33033678 - 33033726
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  33033678 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttgtatcatctcc 33033726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 346 - 392
Target Start/End: Original strand, 45700590 - 45700636
Alignment:
Q  346 caaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctc 392  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45700590 caaacaatattgtgagatcaattgtatcattcaatcgtctatgtctc 45700636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 104
Target Start/End: Original strand, 43669693 - 43669741
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  43669693 tgatgtagtatttttgcatcaaacaataataaatatttatatcgtctcc 43669741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 17784744 - 17784638
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||  ||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| | | |||||||     
T  17784744 tgatgtagtatttttctatcaatcaaaagtaagtatttatata-tcgtctcctcagggactagtgcgatatcacaaaccgttcaacatcgattatcattt 17784646  T
Q  156 taagttaa 163  Q
    ||||||||    
T  17784645 taagttaa 17784638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 17784604 - 17784443
Alignment:
Q  189 aactaaattgcaaatgataaaa-ttgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatca--t 285  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||   ||| | ||||||||||||||||  ||||||  |  ||||||||| ||||  |    
T  17784604 aactaatttgcaaa-gataaaagttgagagtaataaggcgtaaaagc-gttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacat 17784507  T
Q  286 acatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaa 349  Q
    | ||| |||||||| |||    |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  17784506 atatgaattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcgacaacatcattcgtgtccaaa 17784443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 471
Target Start/End: Original strand, 33033932 - 33034097
Alignment:
Q  306 ttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatg 405  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||||||||||  || | ||||| || ||||  || ||||||||| ||| || ||||||| | || |    
T  33033932 ttgatattatcacatattgctcgacaacatcattcgtgtccaaatgatgtcgtgaattctattgagtcgttcaatcgttgatttcccaaactactaaacg 33034031  T
Q  406 attcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagcttta 471  Q
    |||||  |||||||  |||||||  || | ||||||| ||| | ||| |||||||  |||||||||    
T  33034032 attcactagtcgattgtatcgttgtatagttgatttcccaaaccattcaatgatacaaaagcttta 33034097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 409; Significance: 0; HSPs: 39)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 45015708 - 45016175
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45015708 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcc---tcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattt 45015804  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
     |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45015805 caagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 45015904  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45015905 atcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaatat 45016004  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45016005 tgtgaaatcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaa 45016104  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45016105 tgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatg 45016175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 6238582 - 6239049
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6238582 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcc---tcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattt 6238678  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
     |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6238679 caagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactagattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 6238778  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6238779 atcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaatat 6238878  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6238879 tgtgaaatcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaacgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaa 6238978  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6238979 tgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatg 6239049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 54 - 526
Target Start/End: Original strand, 42091821 - 42092290
Alignment:
Q  54 actgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcat 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42091821 actgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcc---tcagggactagtgcgatatcacggaccgttcgacaccaaatatcat 42091917  T
Q  154 tctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcct 253  Q
    |  |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42091918 ttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcct 42092017  T
Q  254 tgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaat 353  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42092018 tgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaat 42092117  T
Q  354 attgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattg 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42092118 attgtgaaatcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatta 42092217  T
Q  454 aatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42092218 aatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatg 42092290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 54 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 39060007 - 39059538
Alignment:
Q  54 actgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39060007 actgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcat 39059911  T
Q  154 tctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcct 253  Q
    |  |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39059910 ttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagagttcct 39059811  T
Q  254 tgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaat 353  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  39059810 tgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaat 39059711  T
Q  354 attgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattg 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  39059710 attgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattg 39059611  T
Q  454 aatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39059610 aatgctaagaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 39059538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 29001658 - 29002125
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29001658 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttgtatcgtctcctcc---gggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 29001754  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29001755 taagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataaggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 29001854  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
     ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||    
T  29001855 gtcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcatgtccaaataatat 29001954  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29001955 tgtgaaatcaattgtatcattcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 29002054  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29002055 taataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 29002125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 39053633 - 39053166
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39053633 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattt 39053537  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
     |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39053536 caagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagagttccttg 39053437  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  39053436 atcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaatat 39053337  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  39053336 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattgaa 39053237  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39053236 tgctaagaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 39053166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 526
Target Start/End: Original strand, 43686553 - 43687023
Alignment:
Q  55 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcatt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43686553 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaataccatt 43686649  T
Q  155 ctaagttaaaa-gataat-tggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcc 252  Q
    | ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43686650 ccaagttaaaaagataatctgtttgtttgttttagtaactaaattgctaatgtaaaagttgagattaacagggcgtaaaacttgttaggattagagttcc 43686749  T
Q  253 ttgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaa 352  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43686750 ttgatcgagcgtctcatttaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaa 43686849  T
Q  353 tattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatt 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43686850 tattgtgaaatcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatt 43686949  T
Q  453 gaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43686950 gaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 43687023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 526
Target Start/End: Original strand, 1174531 - 1175000
Alignment:
Q  55 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcatt 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1174531 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcatctcctc---agggactagtgcgatatcatggaccgttcgacaccaaatatcatt 1174627  T
Q  155 ctaagttaaaagataattggtt-gtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcct 253  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1174628 ctaagttgaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtgaaacttgttaggattagagttcct 1174727  T
Q  254 tgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaat 353  Q
    ||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1174728 tgagcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaat 1174827  T
Q  354 attgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattg 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1174828 attgtgagatcaattgtatcattcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcgctcaatcgatgatttctcaatctattg 1174927  T
Q  454 aatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1174928 aatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaatcatcgattccatgtctagaacctatg 1175000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 26621396 - 26621864
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26621396 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttgtatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 26621492  T
Q  156 taagttaaaagataattggtt-gtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26621493 taagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaatttcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtaaaacttgttaggattagggttcctt 26621592  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaata 354  Q
    |||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26621593 gattaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 26621692  T
Q  355 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  26621693 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattga 26621792  T
Q  455 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26621793 atgataagaaaactttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatg 26621864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 41297443 - 41297911
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41297443 tgatgtagtatttttgcatcaaataattgtaagtatttctatcgtctcctc---aaggactagtgcgatatcgcggaccgttcgactccaaatatcattc 41297539  T
Q  156 taagttaaaagataattggtt-gtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
    |||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41297540 taagttgaaagatagtttgtttgtttgttttagtaactaaattgctaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 41297639  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaata 354  Q
    |||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41297640 gatcgatcctcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 41297739  T
Q  355 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 454  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41297740 ttgtgaaatcaattctatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 41297839  T
Q  455 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41297840 atgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 41297911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 4599455 - 4599923
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4599455 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 4599551  T
Q  156 taagttaaaagataattggtt-gtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4599552 taagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 4599651  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaata 354  Q
    |||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4599652 gattaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 4599751  T
Q  355 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 454  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  4599752 ctgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcaatgatttctcaatctattga 4599851  T
Q  455 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  4599852 atcataagaaagctttaagtttggatacaaaaagtgattaccaaaacatcaattccatgtctataacctatg 4599923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 526
Target Start/End: Original strand, 9869031 - 9869499
Alignment:
Q  55 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcatt 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||| ||||| ||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  9869031 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatattgtctcctc---aggaactagcgcgatatcataaaccgttcgacaccaaatatcatt 9869127  T
Q  155 ctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  9869128 ctaagttaaaagataattggtagtttgttttaatgactaagttgcaaatgataaaattgagattaataaggtgtgaaacttgttaggattagagttcctt 9869227  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaata 354  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  9869228 gatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacatctttcgtgtccaaacaata 9869327  T
Q  355 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |    
T  9869328 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcatcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaattgatgatttctcaatctattaa 9869427  T
Q  455 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9869428 atgataagaaagctttaggtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatg 9869499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 44241284 - 44241751
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  44241284 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaaatatttatatcgtctcctc---aggaactattgcgatatcacagaccgttcgacaccaaatatcattc 44241380  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  44241381 taagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgatgaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttaggattagagttcattg 44241480  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44241481 atcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaatat 44241580  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  44241581 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtgtcaaactattgaatgattcaagagtcagtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaa 44241680  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  44241681 tgataagaaagctttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaatttcatgtctagaatctatg 44241751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 66 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 41305800 - 41305347
Alignment:
Q  66 tttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaa 165  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41305800 tttttgcatcaaacaatagtaagtatttgtatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattctaagtttaaa 41305704  T
Q  166 gataattggtt-gtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgt 264  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  41305703 gataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgattaagcgt 41305604  T
Q  265 cgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatc 364  Q
    | ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  41305603 cacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcatgtccaaacaatattgtgaaatc 41305504  T
Q  365 aattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaa 464  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |     |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41305503 aattgtatcattcgaacgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcatct-----aatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaa 41305409  T
Q  465 agctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41305408 agctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 41305347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 31072245 - 31072712
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  31072245 tgatgtagtagttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcc---tcagggactagtgcgatatcacagaccgttcgacaccaaatatcattc 31072341  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||     
T  31072342 taagctaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaataataaaattgagattaataaggcatgaaacttgttaggattagagttcctta 31072441  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||| |||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31072442 atcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggactctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaatat 31072541  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    ||||||||||||||||| | | |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||    
T  31072542 tgtgaaatcaattgtataaataaataatagatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcataaaatcaatgatttctcaatctattgaa 31072641  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31072642 tgataagaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacttatg 31072712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 66 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 41299474 - 41299044
Alignment:
Q  66 tttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaa 165  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41299474 tttttgcatcaaacaatactaagtatttgtatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcacggaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaa 41299378  T
Q  166 gataattggtt-gtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgt 264  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  41299377 gataatttatttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgattaagcgt 41299278  T
Q  265 cgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatc 364  Q
    | ||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  41299277 cacatataacctaatgaccattcatggattcaagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacaccattcttttccaaacaatattgtgaaatc 41299178  T
Q  365 aattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaa 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41299177 aattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatctaatcaatgatttctcaatctattgaatgataagaa 41299078  T
Q  465 agctttaggtttggatacacaaggtgattatcaa 498  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  41299077 agctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaa 41299044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 32797663 - 32798117
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32797663 tgatgtggtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcctc---agagactagtgcgatatcacggaccgttcgacaccaaatatcattc 32797759  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaa-cttgttaggattagagttcctt 254  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||             || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32797760 taagttaaa-gataatttgttgtttgttttagaaactaagttgcaa-------------gagtaatagggcgtaaaaacttgttaggattagagttcctt 32797845  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaata 354  Q
     ||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  32797846 aatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacacaattcgtgtccaaacaata 32797945  T
Q  355 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||    
T  32797946 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgttgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctatcga 32798045  T
Q  455 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  32798046 atgataagaaaactttaagtttggatacaaaatgtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacttatg 32798117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 11913556 - 11913090
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  11913556 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcctcat---ggactagtgcgatatcacgaaccattcgacaccaaatatcattc 11913460  T
Q  156 taagtt-aaaagata-attggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcct 253  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||||||| |   ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11913459 taagtttaaaagatagattgtttgtttgtttaa---actaagttgcgaataataaaattgagattaataaggcgtgaaacttgttaggattagagttcct 11913363  T
Q  254 tgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaat 353  Q
    ||| | ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11913362 tgaccaagcatcacatgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaat 11913263  T
Q  354 attgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattg 453  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||| || ||||||||| |||||||    
T  11913262 attgcgagatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtttcaaactattgaatgatccaagagtcggtcttatcatttaattgaagatttctcagtctattg 11913163  T
Q  454 aatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  11913162 aatgataagaaagctttaagttttgatacaaaaggtgattatcaaaacataaattccatgtctagaacttatg 11913090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 54 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 1116280 - 1115810
Alignment:
Q  54 actgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  1116280 actgatgtagtatttttgcatcaaacaata-taagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcacataccgttcgacaccaaatatcat 1116185  T
Q  154 tctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcct 253  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||  |  ||| |||||| ||||| || || |||||| ||| |||||||||||||    
T  1116184 tctaagttaaaagctaatttgttgtttgttt-agtaactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaggtgtgaaacttcttatgattagagttcct 1116086  T
Q  254 tgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac---catccgtgtccaaac 350  Q
    | ||| |||||| || ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||  ||||||||||    
T  1116085 taatcaagcgtcacacgtaacctaatgactatacatggattctaccttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacactaccatttgtgtccaaac 1115986  T
Q  351 aatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatcta 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1115985 aatattgtgaaatcaattgtatcattctatcgtcaatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcgttcaatcgatgatttctcaatcta 1115886  T
Q  451 ttgaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  1115885 ttgaatgataataaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacttatg 1115810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 44916257 - 44916732
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |    | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  44916257 tgatgtggtatttttgcatcaaacaaaagtaagtatttatatcgtctcatt---acggactagtgcgatatcacggaccattcgacaccaaatatcattc 44916353  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgc--------aaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattaga 247  Q
    ||| |||||||||| || |||||||||||||  |||||| ||          |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  44916354 taaattaaaagatagtttgttgtttgttttaaaaactaagttaactatgttgaaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttaggattaga 44916453  T
Q  248 gttccttgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtcca 347  Q
     |||||| | | | |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44916454 attccttaaccaaacgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacaccattcgtgtcca 44916553  T
Q  348 aacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaat 447  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  44916554 aacaatattgtgagatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgatccaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaat 44916653  T
Q  448 ctattgaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  44916654 ctattgaacgataagaaaactttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattccatatctagaacttatg 44916732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 271 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 23762419 - 23762164
Alignment:
Q  271 taacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgt 370  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23762419 taacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgt 23762320  T
Q  371 atcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagcttt 470  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23762319 atcattcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagcttt 23762220  T
Q  471 aggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  23762219 aggtttggatacacaaagtgattatcaaaaaatcaattccatgtctagaacctatg 23762164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 54 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 27240428 - 27240161
Alignment:
Q  54 actgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27240428 actgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaataccat 27240332  T
Q  154 tctaagttaaaa-gataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcc 252  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27240331 tccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaataaggcgtgaaacttgttaggattagagttcc 27240232  T
Q  253 ttgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 323  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27240231 ttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 27240161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 56 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23764727 - 23764512
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23764727 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtgtttgtatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 23764631  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23764630 taagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 23764531  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaac 274  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  23764530 atcaagcgtcgcatgtaac 23764512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 54 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 28413971 - 28413556
Alignment:
Q  54 actgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcat 153  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28413971 actggtgtaatatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcacggaccgttcgacaccaaatatcat 28413875  T
Q  154 tctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcct 253  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |  ||| |||||| ||||| |||||||||   ||| | ||||||||||||    
T  28413874 tctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagttgcaaaagtaaaagttgagagtaataaggcgtaaaa-acgttggaattagagttcct 28413776  T
Q  254 tgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaaca 351  Q
    ||||  ||||||  |  ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||     ||||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||| |    
T  28413775 tgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcattttaccaatattatcacgtatcgctcaacaagattattcgtgtccaaata 28413676  T
Q  352 atattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctat 451  Q
    ||  ||||| |||||||||||  |||||| || ||| || ||||||||| ||  || |||  ||| |||  |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  28413675 atcgtgtgagatcaattgtattgttcaatagttgatttcccaaactattaaacaatccaattgtcaatcagatcgtttaatcgacgatttctcaatctat 28413576  T
Q  452 tgaatgataagaaagcttta 471  Q
    | || |||  ||||||||||    
T  28413575 tcaacgatccgaaagcttta 28413556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 340 - 526
Target Start/End: Original strand, 35085217 - 35085400
Alignment:
Q  340 cgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgat 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||| || ||||||||||    
T  35085217 cgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtc---agtatcatttaatcgatgat 35085313  T
Q  440 ttctcaatctattgaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  35085314 ttctcaacctattgaatgataagaaagctttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaatctatg 35085400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 59 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 5445255 - 5445028
Alignment:
Q  59 tgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattctaa 158  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5445255 tgtattatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatattgtctcctc---agagactagtgcgatatcacggaccgttcgacaccaactatcattctaa 5445159  T
Q  159 gttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatc 258  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |  ||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5445158 gttaaa-gataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaagagtaaaagttgagattaataaggtgtgaaacttgttaggattagagttccttgatc 5445060  T
Q  259 gagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatg 290  Q
     ||| || ||  ||||||||||| ||||||||    
T  5445059 aagcctcacacataacctaatgaccatacatg 5445028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 56 - 520
Target Start/End: Original strand, 39805984 - 39806445
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   || || |||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||     
T  39805984 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatggtaagtatttatatcgt---cttcttagggactagtgcgatatcacaaaccgtttgacaccaaatatcattt 39806080  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||||   ||| | ||||||||||||||    
T  39806081 taagtt-aaagataatttgttgttcgttttagaaactaagttgcaagagtaaaaattgagagtaataaggcgtaaaa-acgttggaattagagttccttg 39806178  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaat 353  Q
    ||  ||||||  |  ||||||||| ||  |||| |||||||| ||| |||    |||||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||| |||    
T  39806179 attaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattccagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaacaagattattcgtgtccaaataat 39806278  T
Q  354 attgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattg 453  Q
      ||||| |||||||||||  |||||| || ||| || ||||||||  ||  || |||  ||||||| ||||||| ||| || |||||||||||| |||     
T  39806279 cgtgtgagatcaattgtattgttcaatagttgatttcccaaactatcaaacaatccaattgtcgatcatatcgtttaatagacgatttctcaatccattc 39806378  T
Q  454 aatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaa 520  Q
    || |||  |||||||||| ||   |||||     |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  39806379 aacgatccgaaagctttatgtactgataccttgtgtgattatcaaaacatcgatcctatgtctagaa 39806445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 56 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2825114 - 2824982
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2825114 tgatgtaatatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccattcgacaccaaatatcattc 2825018  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaac 191  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  2825017 taagttaaaagataatatgttgtttgttttagtaac 2824982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 58 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 38673061 - 38672889
Alignment:
Q  58 atgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattcta 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  38673061 atgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcaccgaccgttcgacaccaaatatcattcta 38672965  T
Q  158 ag-ttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaa 232  Q
    || || |||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||  |  ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  38672964 agtttgaaagataatttgttgttcgttttagaaactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaggcgtaaaa 38672889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 104 - 520
Target Start/End: Original strand, 47646632 - 47647058
Alignment:
Q  104 ctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagat-aattggttgtttgttttagt-------aactaaa 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| | | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |         |||||||    
T  47646632 ctcctcagggactagtgcgatatcgtaaaccgttcaacatcgactatcattttaagttaaaagattaattggttgtttgtttgaaactaaatgaactaaa 47646731  T
Q  196 ttgcaa-atgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacat--gga 292  Q
    |||||| || | ||  |||||   |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||  || ||| |||||||||||||| | ||  |||    
T  47646732 ttgcaagattacaag-ttgaggggaataaggcgtaaaacttgttatgattagagttcgttgaccaagaatcacatataacctaatgatcacatatacgga 47646830  T
Q  293 ttctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctc 392  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||  |||||||||| ||||| || || || |||||| ||| ||||    
T  47646831 ttctagcttttaatcgatattatcacgtatccctcgacaacatcattcatgtctaaatgatattgtgaagtcaatcgtgtcgtttaatcgttgatttctc 47646930  T
Q  393 aaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgat 492  Q
    || ||||| || ||| ||| | ||  || ||||||| |||||| ||||| ||| |||||| || |||  |||||| | | | || ||||| ||| |||||    
T  47646931 aatctattaaacgatccaatattcagtcgtatcgtttaatcgacgatttttcagtctattaaacgatctgaaagcatgaagcttagatactcaaagtgat 47647030  T
Q  493 tatcaaaacatcgattccatgtctagaa 520  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||    
T  47647031 tatcaaaacatcaatcccatgtctagaa 47647058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 520
Target Start/End: Original strand, 23251315 - 23251740
Alignment:
Q  104 ctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaaga-taattggttgtttgttttagtaacta--------a 194  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||  |||||||        |    
T  23251315 ctcctcagggactattgcgatatcacggaccgttcgacaccaaatatcattcgaagttaaaagagtagttgtttgtttgttt--gtaactaagttaacta 23251412  T
Q  195 attgcaaatgataaaa-ttgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgat--catacatgg 291  Q
    |||   ||  |||||| |||||| ||||| |||||||||   ||| | ||||||||||||||||  ||||||  |  ||||||||| ||  |||| ||||    
T  23251413 attcgcaagaataaaagttgagagtaataaggcgtaaaa-acgttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcgcatatatgg 23251511  T
Q  292 attctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtct 391  Q
    |||||||| |||    |||||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||  ||| |||||| |||||||||||  |  |||| | ||| ||     
T  23251512 attctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaacaagattattcgtgtccaagtaatcttgtgagatcaattgtattgtataatctttgatttcc 23251611  T
Q  392 caaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtga 491  Q
    ||||||||| ||  || ||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||  |||||     ||||    
T  23251612 caaactattaaacaatccaatagtcgatcgtatcgtttaatcgacgatttctcaatctattcaatgatccgaaagctttaagttccgatactttgtgtga 23251711  T
Q  492 ttatcaaaacatcgattccatgtctagaa 520  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||    
T  23251712 ttatcaaaacatcaatcctatgtctagaa 23251740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 5358003 - 5357581
Alignment:
Q  104 ctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatt-ggttgtttgt---tttagtaactaaattgc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||| ||| || |||| |||||||||  ||| || ||||||||||   | ||  |||||| ||||    
T  5358003 ctcctcagggactagtgcgatatcagggaccattcaacatcaattaccattttaagttaaagaatagtttggttgtttgtagctataaaaactaatttgc 5357904  T
Q  200 aaatgataaaa-ttgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatca--tacatggattct 296  Q
    |||   ||||| |||||| |||||  ||||||||   ||| | ||||||||||||||||  ||||||  |  ||||||||| ||||  || |||||||||    
T  5357903 aaagtttaaaagttgagagtaataaagcgtaaaaac-gttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattct 5357805  T
Q  297 agcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaac 396  Q
    ||| |||     ||||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||| ||| |||||| |||||||||||  |||||| || ||| || |||||    
T  5357804 agcattttcccaatattatcacgtatcgctcaacaagattattcgtgtccaaataattttgtgagatcaattgtattgttcaattgttgatttcccaaac 5357705  T
Q  397 tattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatc 496  Q
    |||| ||  |||||| |||||| | ||||||| ||||||  ||||||||||||||| || |||  |||||||||| |||   ||||     |||||||||    
T  5357704 tattaaacaattcaatagtcgaccgtatcgtttaatcgacaatttctcaatctattcaacgatccgaaagctttaagttccaatactttgtgtgattatc 5357605  T
Q  497 aaaacatcgattccatgtctagaa 520  Q
    |||||||| || | ||||||||||    
T  5357604 aaaacatcaatcctatgtctagaa 5357581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 242 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 45620258 - 45619978
Alignment:
Q  242 attagagttccttgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatc 339  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||  |  ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||||| |  ||     
T  45620258 attagagttccttgattaagcttcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcgacaagattatt 45620159  T
Q  340 cgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgat 439  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||||||||  ||||||||| ||| || || |||||| ||  || ||| |||| ||  ||||||| |||| | |||    
T  45620158 cgtgtccaaataatcttgtgagatcaattgtattgttcaatcgttgatttcccagactattaaacaatccaatagtccattgtatcgtttaatcaacgat 45620059  T
Q  440 ttctcaatctattgaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaa 520  Q
    ||||||||||||| || |||  |||||||||| |||  |||||     |||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  45620058 ttctcaatctattaaacgatccgaaagctttaagttccgatactttgtgtgattatcaaaacattgatcctatgtctagaa 45619978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 104
Target Start/End: Original strand, 27041109 - 27041157
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27041109 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcc 27041157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 488 - 526
Target Start/End: Original strand, 28996371 - 28996409
Alignment:
Q  488 gtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28996371 gtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 28996409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 306 - 471
Target Start/End: Original strand, 27048298 - 27048463
Alignment:
Q  306 ttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatg 405  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||||||||||  |||| ||||| || ||||  || ||||||||||||| || ||||||| | || |    
T  27048298 ttgatattatcacatattgctcgacaacatcattcgtgtccaaatgatatcgtgaattctattgagtcgttcaatcgtcgatttcccaaactactaaacg 27048397  T
Q  406 attcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagcttta 471  Q
    || ||  ||||||| ||||||||  || | ||||||  ||| ||||| |||||||  |||||||||    
T  27048398 atccactagtcgattttatcgttgtatagttgattttccaaactattcaatgatacaaaagcttta 27048463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 308 - 471
Target Start/End: Original strand, 13432025 - 13432188
Alignment:
Q  308 gatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgat 407  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||  | ||||||||  || |||| |  |||||| |||  || ||| || ||| |||||||||| | ||  ||    
T  13432025 gatattatcacgtatcgctcgacaataccactcatgtccaaatgatcttgtcaggtcaattttattgtttaattgttgatttctcaaactaataaacaat 13432124  T
Q  408 tcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagcttta 471  Q
     ||| | |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||  ||||||||||    
T  13432125 ccaatattcgatcgtatcgtttaatcgacgatttctcaatctattaaacgatctgaaagcttta 13432188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 283 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 7063688 - 7063571
Alignment:
Q  283 catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcg 382  Q
    |||| ||||||||||||||||  | |||||||||||  ||| |||||||||| ||| | |||| ||| |||||  |||  ||||||||||| || |||||    
T  7063688 cataaatggattctagcttttaatcgatattatcacaaatcactcgacaacatcattcatgtctaaataatatcatgatttcaattgtatcgtttaatcg 7063589  T
Q  383 tcgatgtctcaaactatt 400  Q
     |||| |||||| |||||    
T  7063588 acgatttctcaatctatt 7063571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 362 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 38672769 - 38672611
Alignment:
Q  362 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 461  Q
    |||||||||||  |||||| || ||| || ||||||||| ||  || |||  ||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||| || |||      
T  38672769 atcaattgtattgttcaatagttgatttcccaaactattaaacaatccaattgtcgatcgtatcgtttaattgacgatttctcaatctattcaacgatcc 38672670  T
Q  462 gaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaa 520  Q
    |||||||||| ||   |||||     ||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  38672669 gaaagctttatgtaccgataccttgtgtgattatcaaaacatcaatcctatgtctagaa 38672611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 407; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 54 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 5302 - 4833
Alignment:
Q  54 actgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcat 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5302 actgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcat 5206  T
Q  154 tctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcct 253  Q
    |  |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5205 ttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcct 5106  T
Q  254 tgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaat 353  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5105 tgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaat 5006  T
Q  354 attgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattg 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5005 attgtgaaatcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatta 4906  T
Q  454 aatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4905 aatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatg 4833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 406; Significance: 0; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 36005778 - 36005310
Alignment:
Q  55 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcatt 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36005778 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcatt 36005682  T
Q  155 ctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
      |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36005681 tcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 36005582  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaata 354  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36005581 gatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 36005482  T
Q  355 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36005481 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaa 36005382  T
Q  455 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36005381 atgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatg 36005310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 7311276 - 7311743
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7311276 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcc---tcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattt 7311372  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
     |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7311373 caagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 7311472  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7311473 atcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaatat 7311572  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7311573 tgtgaaatcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaa 7311672  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7311673 tgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatg 7311743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 53 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 6464874 - 6464404
Alignment:
Q  53 gactgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatca 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6464874 gactgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatca 6464778  T
Q  153 ttctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcc 252  Q
    ||  |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6464777 tttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaactcgttaggattagagttcc 6464678  T
Q  253 ttgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaa 352  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6464677 ttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaa 6464578  T
Q  353 tattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatt 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6464577 tattgtgaaatcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatt 6464478  T
Q  453 gaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6464477 aaatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatg 6464404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 36022096 - 36021627
Alignment:
Q  55 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcatt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36022096 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaattatcatt 36022000  T
Q  155 ctaagttaaaagataa-ttggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcct 253  Q
      |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36021999 tcaagtaaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcct 36021900  T
Q  254 tgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaat 353  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36021899 tgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaat 36021800  T
Q  354 attgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattg 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36021799 attgtgaaatcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatta 36021700  T
Q  454 aatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36021699 aatgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaagcatcgattccatgtctagaacctatg 36021627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 11358489 - 11358021
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11358489 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaataccattc 11358393  T
Q  156 taagttaaaa-gataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11358392 caagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagagttcctt 11358293  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaata 354  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  11358292 gatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaata 11358193  T
Q  355 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11358192 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcgatctattga 11358093  T
Q  455 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11358092 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 11358021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 8013615 - 8013148
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  8013615 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcacggaccgttcgacaccaaatatcattt 8013519  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
     |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8013518 caagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 8013419  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8013418 atcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaatat 8013319  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8013318 tgtgaaatcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaa 8013219  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8013218 tgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatg 8013148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 526
Target Start/End: Original strand, 36075893 - 36076361
Alignment:
Q  55 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcatt 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36075893 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcc---tcagggactagtgcgatatcgcagaccgttcgacaccaaatatcatt 36075989  T
Q  155 ctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
      ||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36075990 tcaagttaaacaatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 36076089  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaata 354  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36076090 gatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 36076189  T
Q  355 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36076190 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaa 36076289  T
Q  455 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36076290 atgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatg 36076361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 54 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 36426028 - 36425558
Alignment:
Q  54 actgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcat 153  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36426028 actgatgttgtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaataccat 36425932  T
Q  154 tctaagttaaaa-gataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcc 252  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36425931 tccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagagttcc 36425832  T
Q  253 ttgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaa 352  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  36425831 ttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaa 36425732  T
Q  353 tattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatt 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  36425731 tattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttcttgatctatt 36425632  T
Q  453 gaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36425631 gaatgctaagaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 36425558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 16710965 - 16710496
Alignment:
Q  55 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcatt 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16710965 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgactccaaatatcatt 16710869  T
Q  155 ctaagttaaaagataat-tggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcct 253  Q
    ||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| || |  ||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16710868 ctaagttgaaagatagtatgtttgtttgttttagtaactaaattgctaaagtaaaagttgagagcaatagggcataaaacttgttaggattagagttcct 16710769  T
Q  254 tgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaat 353  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16710768 tgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatgaattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaat 16710669  T
Q  354 attgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattg 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16710668 attgtgaaatcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattg 16710569  T
Q  454 aatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16710568 aatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 16710496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 1238140 - 1238608
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1238140 tgatgtaatatttttgcatcaaacaattgtaagtatttgtatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcacggaccgttcgacaccaaatatcattc 1238236  T
Q  156 taagttaaaagataattggtt-gtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| |  ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1238237 taagttaaaaaataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgaaaaagtaaaagttgagagtaatagagcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 1238336  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaata 354  Q
    |||| |||||| ||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1238337 gatcaagcgtcacaaataacctgatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaata 1238436  T
Q  355 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1238437 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatagtcgatgtcacaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatagatgatttctcaatctattga 1238536  T
Q  455 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1238537 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 1238608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 41242411 - 41242018
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||     
T  41242411 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgtttgacaccaaatatctttt 41242315  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
     |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41242314 caagttaaatgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 41242215  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41242214 atcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaatat 41242115  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatt 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41242114 tgtgaaatcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatt 41242018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 55 - 526
Target Start/End: Original strand, 15012314 - 15012782
Alignment:
Q  55 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcatt 154  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  15012314 ctgatgtagtatttttgcatcacacaatagtaagtatttatatcgtctcc---tcagggactagtgcgatatcacggaccactcgacaccaaatatcatt 15012410  T
Q  155 ctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||  |  ||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15012411 ctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagttactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaatagggtgtgaaacttgttaggattagagttcctt 15012510  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaata 354  Q
     ||| |||||| || | ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15012511 aatcaagcgtcacacggaacctaatgactatacatggattctatcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 15012610  T
Q  355 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 454  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||    
T  15012611 ttgtgaagtcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaattgatgatttcttaatctattga 15012710  T
Q  455 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  15012711 atgataagaaagctttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtttagaacttatg 15012782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 56 - 425
Target Start/End: Original strand, 12768671 - 12769037
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12768671 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agagactagtgcgatatcacggaccgttcgacaccaaatatcattc 12768767  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  12768768 taagttaaatgataattcgttgtttgttttaataactaaattgcaaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttaggattagagttctttg 12768867  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||| ||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12768868 atcaagcttcacacgtaacctaatgattatacatggattctagattttctttgatattatcatgtatccctcgacaagaccattcgtgtccaaacaatat 12768967  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatc 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12768968 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatc 12769037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 161 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 45068609 - 45068244
Alignment:
Q  161 taaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcga 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |  ||| |||||| |||||   ||||||| |||||||||||||||||| || ||| |    
T  45068609 taaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaaacgtaaaatttgttaggattagagttctttaatcaa 45068510  T
Q  261 gcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtga 360  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  45068509 gcgtcgcacgtaacctaatgaccatacatggattctagtttttctttgatattatcatgtaaccctcgataacaccattcgtgtccgaacaatattgtga 45068410  T
Q  361 aatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgata 460  Q
     |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45068409 gatcaattgtaccattcaatagtcgatgtttcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgata 45068310  T
Q  461 agaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  45068309 agaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattcaatgtctagaacttatg 45068244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 208 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 26250737 - 26250419
Alignment:
Q  208 aaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttcttt 307  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||||    
T  26250737 aaattgagattaataaggcgtgaaatttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaatctaataaccatacatggtttatagcttttcttt 26250638  T
Q  308 gatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgat 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26250637 gatattatcacgtatccctcgacaatatcattcgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgttgatgtctcaaactattgaatgat 26250538  T
Q  408 tcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgat 507  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  26250537 tcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttttcaatctattgaatgataagaaagcttttagtttggatacaaaaggtgattattaaaacatcaat 26250438  T
Q  508 tccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  26250437 tccatgtctagaacttatg 26250419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 56 - 444
Target Start/End: Original strand, 31017326 - 31017698
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |  |   ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||     
T  31017326 tgatgtagtatttttgtatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctctttat---ggactagtgcgatatcatagaccgttcgacaccaaatatcattt 31017422  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||| ||||               ||||| ||||| |||||||||||||||| ||     
T  31017423 taagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaacaaagttgcgaataataa---------------ggcgtgaaactagttaggattagagttcttta 31017507  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcata--catggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaat 353  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  31017508 atcaagcgtcacatgtaacctaatgaccatatacatggattctaatttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaaaaat 31017607  T
Q  354 attgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctc 444  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  31017608 attgtgagttcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctc 31017698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 55 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 7934223 - 7933760
Alignment:
Q  55 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcatt 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7934223 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatattgcggaccgttcgacaccaaatatcatt 7934127  T
Q  155 ctaa-gttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcct 253  Q
    |||| |||||| |||| ||| | ||||||||||||||| ||| |  ||| |  ||| |||||| |||||||||||||||    || | ||||||||||||    
T  7934126 ctaaggttaaacgatagttgatggtttgttttagtaaccaaa-tataaaagtgaaagttgagagtaatagggcgtaaaa-acattggaattagagttcct 7934029  T
Q  254 tgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaaca 351  Q
    ||||| ||| ||  || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||| |    
T  7934028 tgatcaagcatcaaatataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaacaagattattcgtgtccaaata 7933929  T
Q  352 atattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctat 451  Q
    ||  ||||||||| |||||||  |||||| || ||| ||||||||| |||||  || |||   ||||||  || ||| |||||| |||||||||||||||    
T  7933928 atcgtgtgaaatccattgtattgttcaatagttgatttctcaaactgttgaacaatccaattatcgatcggatagtttaatcgacgatttctcaatctat 7933829  T
Q  452 tgaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaa 520  Q
    | || |||  |||||||||| ||   |||||     ||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  7933828 tcaacgatccgaaagctttatgtaccgataccttgtgtgattatcaaaacatcaatcctatgtctagaa 7933760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 184
Target Start/End: Original strand, 14393706 - 14393786
Alignment:
Q  104 ctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgttt 184  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||    
T  14393706 ctcctcagggactagtgcgatatcacggaccgttcgacaccaaatatcattttaagttaaaggttgattggttgtttgttt 14393786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 308 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 24220317 - 24220154
Alignment:
Q  308 gatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgat 407  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||| |  || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||| ||| || ||||||||| ||  ||    
T  24220317 gatattatcacatatcgctcaacaagaatattcgtgtccaaataatcttgtgaaatcaattgtattgttgaatcgttgatttcccaaactattaaacaat 24220218  T
Q  408 tcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagcttta 471  Q
     ||| |||||||  ||||||| |||||| |||||||| ||||||| || |||  ||||||||||    
T  24220217 ccaatagtcgattgtatcgtttaatcgaggatttctccatctattaaacgatctgaaagcttta 24220154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 308 - 370
Target Start/End: Original strand, 14393898 - 14393960
Alignment:
Q  308 gatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgt 370  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||  || |||||| |||||||||    
T  14393898 gatattatcacgtatcgctcgacaaaatcattcgtgtccaaatgatcttgtgagatcaattgt 14393960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 406; Significance: 0; HSPs: 25)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 30041540 - 30041072
Alignment:
Q  55 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcatt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30041540 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcatt 30041444  T
Q  155 ctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
      |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30041443 tcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 30041344  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaata 354  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30041343 gatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 30041244  T
Q  355 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30041243 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaa 30041144  T
Q  455 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30041143 atgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatg 30041072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 34357583 - 34357116
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34357583 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattt 34357487  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
     |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34357486 caagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 34357387  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34357386 atcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaatat 34357287  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34357286 tgtgaaatcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaa 34357187  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34357186 tgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatg 34357116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 34359374 - 34358907
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34359374 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattt 34359278  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
     |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34359277 caagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 34359178  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34359177 atcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaatat 34359078  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34359077 tgtgaaatcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaa 34358978  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34358977 tgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatg 34358907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 67 - 526
Target Start/End: Original strand, 29980397 - 29980853
Alignment:
Q  67 ttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaag 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  29980397 ttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcc---tcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacg 29980493  T
Q  167 ataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcg 266  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29980494 atagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcg 29980593  T
Q  267 catgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaa 366  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29980594 cacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaatattgtgaaatcaa 29980693  T
Q  367 ttgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaag 466  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29980694 ttgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattaaatgataagaaag 29980793  T
Q  467 ctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29980794 ctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaaactatg 29980853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 22359891 - 22360358
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22359891 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttgtatcgtctcc---tcagggactagtgtgatatcgcggaccgttcgacaccaaatattattc 22359987  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22359988 taagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 22360087  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  22360088 atcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaatat 22360187  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22360188 tgtgaaatcaattgtatcattcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 22360287  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22360288 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 22360358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 40958912 - 40958445
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40958912 tgatgtagtattattgcatcaaacaattataagtatttatatcgtctcctcg---gggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 40958816  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40958815 caagttaaaagataattggttatttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaacacttgttaggattagagttccttg 40958716  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||| |||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  40958715 atcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtattcctcgacaacactattcgtgtccaaacaatat 40958616  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40958615 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaaccattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 40958516  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40958515 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 40958445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 54 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 25894947 - 25894477
Alignment:
Q  54 actgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25894947 actgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaataccat 25894851  T
Q  154 tctaagttaaaa-gataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcc 252  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25894850 tccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagagttcc 25894751  T
Q  253 ttgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaa 352  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  25894750 ttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatcgattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaa 25894651  T
Q  353 tattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatt 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  25894650 tattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctatt 25894551  T
Q  453 gaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25894550 gaatgctaagaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 25894477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 2957785 - 2958253
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2957785 tgatgtagtattttttcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaataccattc 2957881  T
Q  156 taagtt-aaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2957882 caagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagagttcctt 2957981  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaata 354  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  2957982 gatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaata 2958081  T
Q  355 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  2958082 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattga 2958181  T
Q  455 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2958182 atgctaagaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 2958253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 2966254 - 2966722
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2966254 tgatgtagtattttttcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaataccattc 2966350  T
Q  156 taagtt-aaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2966351 caagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagagttcctt 2966450  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaata 354  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  2966451 gatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaata 2966550  T
Q  355 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  2966551 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgtccaatcgatgatttctcgatctattga 2966650  T
Q  455 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2966651 atgctaagaaagctttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 2966722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 5876145 - 5876612
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  5876145 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttgtatcgtctcc---tcagggactagtgcgatatcgcgaaccgttcaacaccaaatatcattc 5876241  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5876242 taagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 5876341  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5876342 atcaagcgtcgcacataacctaatgaccatacatggattctagattttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaatat 5876441  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5876442 tgtgaaatcaattgtatcattcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 5876541  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5876542 tgataagaaaactttaggtttggatacacaaagtgattatcaaaacatcgattccatgtctataacctatg 5876612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 22313757 - 22314224
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22313757 tgatgtagtatttttgaatcaaacaattgtaagtatttgtatcgtctcctt---agggactagtgcgatattgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 22313853  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22313854 taagttaaacgataatttgttatttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 22313953  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||| |||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  22313954 atcaagcgtcacacgtaacctaatgaccgtacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaatat 22314053  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22314054 tgtgaaatcaattgtatcattcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgataatttctcaatctattgaa 22314153  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22314154 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctaaaacctatg 22314224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 42150745 - 42151213
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42150745 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgactccaaatatcattc 42150841  T
Q  156 taagttaaaagataattggtt-gtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
    |||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42150842 taagttgaaagatagtttgtttgtttgttttagtaactaaattgctaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 42150941  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaata 354  Q
     ||| |||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |    
T  42150942 aatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagtttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaaga 42151041  T
Q  355 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42151042 ttgtgaaatcaattgtatcattcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 42151141  T
Q  455 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42151142 atggtaagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 42151213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 54 - 526
Target Start/End: Original strand, 4973485 - 4973957
Alignment:
Q  54 actgatgtagtattttt---gcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatat 150  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  4973485 actgatgtagtattttttttgcatcaaacaattgtaagtatttgtatcgtctcc---tcagggactagtgcgatatcacaaaccgttcgacaccaaatat 4973581  T
Q  151 cattctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagtt 250  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||    
T  4973582 cattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaaatgataaaattgagattaataaggggtgaaacttgttaggatcagagtt 4973681  T
Q  251 ccttgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaac 350  Q
    |||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  4973682 ccttgatcaagcgtcacacgtaacataatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgacaacatcattcgtgtccaaac 4973781  T
Q  351 aatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatcta 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  4973782 aatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatctaatcgatgatttctcaatcta 4973881  T
Q  451 ttgaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4973882 ttgaatgataagaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattattaaaacatcaattccatgtctagaacctatg 4973957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 29414965 - 29414497
Alignment:
Q  55 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcatt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29414965 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttgtatcgtctcctt---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcaacaccaaatatcatt 29414869  T
Q  155 ctaagttaaaagataattggtt-gtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcct 253  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||   ||||   ||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  29414868 ctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaagcaaatataaaattg-aaagtcgagagtaatagggcgtaaaacttattaggattagaatttct 29414770  T
Q  254 tgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaat 353  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||    
T  29414769 tgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacatcattcatgttcaaacaat 29414670  T
Q  354 attgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattg 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29414669 attgtgaaatcaattgtatcattcaattatcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattg 29414570  T
Q  454 aatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29414569 aatgataagaaagctttagggttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 29414497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 66 - 526
Target Start/End: Original strand, 2438738 - 2439195
Alignment:
Q  66 tttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaa 165  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  2438738 tttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcacagaccgtccgataccaaaaatcattataagttaaaa 2438834  T
Q  166 gataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtc 265  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2438835 gaaaatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaataataaaagtgagattaataaggcgtgaaacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtc 2438934  T
Q  266 gcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatca 365  Q
     || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  2438935 acacgtaacctaatga-catgcatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacatcatttgtgtccaaacaatattgtgagatca 2439033  T
Q  366 attgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaa 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2439034 attgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagccggtcttatcatttaatcgatgatttttcaatctattgaatgataagaaa 2439133  T
Q  466 gctttaggtttggat-acacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||| |||||||| | | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2439134 gctttaagtttggataaaaaaaggtgattatcaagacatcaattccatgtctagaacttatg 2439195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 104 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 12506023 - 12505593
Alignment:
Q  104 ctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgtttt-------agt-aactaaa 195  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||| |||        ||| |||||      
T  12506023 ctcctcaggaactagtgcgatatcacggacctttcgacaccaaataccattttaagttaaaagatagtttgttgtttatttagaaactaagttaactatg 12505924  T
Q  196 ttgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattc 295  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  12505923 ttgcgaataataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttaggattagagttccttgatcaagagtcccacgtaacctaatgattatacatggattc 12505824  T
Q  296 tagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaa 395  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12505823 tagcttctctttgatattatcacgtatccctcgacaacatcattcgtgtccaaacaatattgtaatatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaa 12505724  T
Q  396 ctattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattat 495  Q
     ||||||||| | ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  12505723 atattgaatggtccaagagtcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattat 12505624  T
Q  496 caaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  12505623 caaaacatcaattccatgtctagaatctatg 12505593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 56 - 470
Target Start/End: Original strand, 33794019 - 33794430
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  33794019 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcc---tcagggactagtgcgatatcacggaccgtttgacaccaaatatcattc 33794115  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||  |  ||| |||||| ||||| |||||||||  |||| | |||||||||| |||    
T  33794116 taagtt-aaagataatttgttgtatgttttagaaactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaggcgtaaaa-atgttggaattagagttctttg 33794213  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaat 353  Q
    ||  ||||||  |  ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||||| ||| |||| |  || ||| |||||| |||    
T  33794214 attaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttactgatattatcacgtatcgctcaacaagattattcgtatccaaataat 33794313  T
Q  354 attgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattg 453  Q
      ||||| |||||||||||  |||||| || ||| || ||||||||| ||  || |||  ||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||     
T  33794314 catgtgagatcaattgtattgttcaatagttgatttcccaaactattaaacaatccaattgtcgatcgtatcgtttaattgacgatttctcaatctattc 33794413  T
Q  454 aatgataagaaagcttt 470  Q
    || |||  |||||||||    
T  33794414 aacgatccgaaagcttt 33794430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 56 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 2156413 - 2155954
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2156413 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgtgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 2156317  T
Q  156 taag-ttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||  || || ||| |  ||| |||||| ||||| |||||||||   ||| | |||||||||||||    
T  2156316 taagtttaaaagataat---ttgtttgttttagtaac-caagtgtaaaagtgaaagttgagagtaataaggcgtaaaa-acgttggaattagagttcctt 2156222  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaa 352  Q
    |||  ||||||  |  ||||||||| ||  |||| |||||||||||  |||    |||||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||| ||    
T  2156221 gattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagtgttttaccgatattatcacgtatcgctcaacaagattattcgtgtccaaataa 2156122  T
Q  353 tattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctatt 452  Q
    |  ||||| |||||||||||  |||||| || ||| || ||||||||| ||  || | |  |||||||  |||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  2156121 ttgtgtgagatcaattgtattgttcaatagttgatttcccaaactattaaacaatcccattgtcgatcggatcgtttaatcgacaatttctcaatctatt 2156022  T
Q  453 gaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaa 520  Q
     || |||  |||||||||| ||   |||||     ||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  2156021 caacgatctgaaagctttatgtaccgataccttgtgtgattatcaaaacatcaatcctatgtctagaa 2155954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 66 - 520
Target Start/End: Original strand, 9843286 - 9843737
Alignment:
Q  66 tttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaa 165  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9843286 tttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcc---tcagggactagtgcgatattgcggaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac 9843382  T
Q  166 gataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtc 265  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||| |  ||| |  ||| |||||| |||||||||||||||    || | ||||||||||||||||| ||| ||    
T  9843383 gatagttgattgtttgttttagtaaccaaa-tataaaagtgaaagttgagagtaatagggcgtaaaa-acattggaattagagttccttgatcaagcatc 9843480  T
Q  266 gcatgtaacctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaat 363  Q
      || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| ||| |||| |  || |||||||||| | |  ||||||||    
T  9843481 aaatataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaacaagattattcgtgtccaaatactcgtgtgaaat 9843580  T
Q  364 caattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataaga 463  Q
    | |||| ||  |||||| || ||| ||||||||| |||||  || |||   ||||||  || ||| |||||| |||||||||||||||| || |||  ||    
T  9843581 ccattgcattgttcaatagttgatttctcaaactgttgaacaatccaattatcgatcggatagtttaatcgacgatttctcaatctattcaacgatccga 9843680  T
Q  464 aagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaa 520  Q
    |||||||| ||   |||||     ||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  9843681 aagctttatgtaccgataccttgtgtgattatcaaaacatcaatcctatgtctagaa 9843737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 283 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 12919021 - 12918782
Alignment:
Q  283 catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcg 382  Q
    |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| ||| |||| || || |||||||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||    
T  12919021 catatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaacaagactattcgtgtccaaataatcttgtgaaatcaattgtgttgttcaatcg 12918922  T
Q  383 tcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagctttaggtttggatac 482  Q
    | ||| || ||||||||| ||  || |||  ||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| || | |||||    
T  12918921 ttgatttcccaaactattaaacaatccaattgtcgatcgtatcgtttaatcgacgatttctccatctattgaatgatccgaaagctttaagtcttgatac 12918822  T
Q  483 acaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacc 522  Q
         |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12918821 tttgtgtgactatcaaaacattgattccatgtctagaacc 12918782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 283 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 30580261 - 30580024
Alignment:
Q  283 catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcg 382  Q
    |||| |||||||||||| |||  | ||||||||||||||||  ||||| ||| ||| ||||||||||  || |||| |  |||||||| |  || |||||    
T  30580261 catatatggattctagcgttttatcgatattatcacgtatcggtcgacgacatcattcgtgtccaaatgatcttgtaagttcaattgtgttttttaatcg 30580162  T
Q  383 tcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagctttaggtttggatac 482  Q
    | ||| || ||||||||| ||  || ||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  30580161 ttgatttcccaaactattaaacaatccaatatttgatcgtatcgtttaatcgatgatttctcaatctattaaatgatatgaaagctttaagtttcgatac 30580062  T
Q  483 acaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaa 520  Q
         ||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  30580061 tttgtgtgattatcaaaacatcaatcctatgtctagaa 30580024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 308 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 3413336 - 3413122
Alignment:
Q  308 gatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgat 407  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||| |  || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||| || ||||||||| ||  ||    
T  3413336 gatattatcatgtatcgctcaacaagattattcgtgtccaaataatcttgtgaaatcaattgtattgttcaatcgttgatttcccaaactattaaacaat 3413237  T
Q  408 tcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgat 507  Q
     ||| || ||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||| || |||  |||||||||| ||   |||||     ||||||| |||||||| |||    
T  3413236 ccaatagccgatcgtatcgtttaatcgacgatttctccatctattaaacgatccgaaagctttaagtcctgatactttgtgtgattaccaaaacattgat 3413137  T
Q  508 tccatgtctagaacc 522  Q
    |||||||||||||||    
T  3413136 tccatgtctagaacc 3413122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 40821629 - 40821581
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40821629 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgtctcc 40821581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 400
Target Start/End: Original strand, 34738329 - 34738460
Alignment:
Q  271 taacctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaatt 368  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||| |||||  | |||||||||||||||| | |||||| |||||   |||| |||  ||||||||| ||||||     
T  34738329 taacctaatgatcacatatatggattctaactttttatcgatattatcacgtatcacccgacaataccatttatgtctaaatgatattgtgagatcaatc 34738428  T
Q  369 gtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactatt 400  Q
    ||||| || ||||| |||| |||||| |||||    
T  34738429 gtatcgtttaatcgacgatttctcaatctatt 34738460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 40821373 - 40821220
Alignment:
Q  306 ttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatg 405  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||  || | ||||| || ||||  || ||||||||| ||| || ||||||| | || |    
T  40821373 ttgatattatcacatatcgctcgacaacatcattcgtgtccaaatgatgtcgtgaattctattgagtcgttcaatcgttgatttcccaaactactaaacg 40821274  T
Q  406 attcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgat 459  Q
    || ||  |||||||  |||||||  || | ||||||| ||| ||||| ||||||    
T  40821273 atccactagtcgattgtatcgttgtatagttgatttcccaaactattcaatgat 40821220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 377; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 49618 - 50084
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  49618 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttgtatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcacagaccgttcgacaccaaatatcattc 49714  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  49715 taagttaaa-gataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttc 49813  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  49814 atcaagcgtcgcacataacctaatgaccatacacggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaatat 49913  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49914 tgtgaaatcaattgtatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 50013  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50014 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 50084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Original strand, 55599 - 55667
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatc 127  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  55599 tgatgtagtattgttgcatcaaacaatagtaagtatttgtatcgt---ctcctcagggactagtgcgatatc 55667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510 (Bit Score: 362; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0510
Description:

Target: scaffold0510; HSP #1
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 9177 - 8709
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9177 tgatgtagtatttttgcatcaaataattgtaagtatttctatcgtctcctc---aaggactagtgcgatatcgcggaccgttcgactccaaatatcattc 9081  T
Q  156 taagttaaaagataattggtt-gtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
    |||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9080 taagttgaaagatagtttgtttgtttgttttagtaactaaattgctaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 8981  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaata 354  Q
    |||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8980 gatcgatcctcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 8881  T
Q  355 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 454  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8880 ttgtgaaatcaattctatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 8781  T
Q  455 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8780 atgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 8709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510; HSP #2
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 66 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 2846 - 2388
Alignment:
Q  66 tttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaa 165  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2846 tttttgcatcaaacaatactaagtatttgtatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcacggaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaa 2750  T
Q  166 gataattggtt-gtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgt 264  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  2749 gataatttatttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgattaagcgt 2650  T
Q  265 cgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatc 364  Q
    | ||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  2649 cacatataacctaatgaccattcatggattcaagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacaccattcatgtccaaacaatattgtgaaatc 2550  T
Q  365 aattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaa 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2549 aattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcatctaatcaatgatttctcaatctattgaatgataagaa 2450  T
Q  465 agctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2449 agctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtttagaacctatg 2388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 343; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 58 - 526
Target Start/End: Original strand, 2574 - 3039
Alignment:
Q  58 atgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattcta 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  2574 atgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttctatcgtctcc---tcagggactagtgcgataccacagaccgttcgacaccaaatatcattcta 2670  T
Q  158 agttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgat 257  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2671 agttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagctgcaaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttaggattagagttccttgat 2770  T
Q  258 cgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattg 357  Q
    | |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  2771 caagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattatagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacaccattcgtatccaaacaatattg 2870  T
Q  358 tgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatg 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2871 tgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttatcattaaatcgatgatttctcaatctattgaatg 2970  T
Q  458 ataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2971 ataagaaagctttaagtttggatacaaaaagtgattatcaaaacatcaattccatgtctagaacctatg 3039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 335; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Original strand, 11877 - 12327
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11877 tgatgtagtatttttgcatcaaataattgtaagtatttgtatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcgcggaccgttcgactccaaatatcattc 11973  T
Q  156 taagttaaaagataattggtt-gtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
    |||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||                  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11974 taagttgaaagatagtttgtttgtttgttttagtaactaa------------------gagagtaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 12055  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaata 354  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12056 gatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcataaatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 12155  T
Q  355 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 454  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12156 ttgtgaaatcaattctatcattcaatggtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 12255  T
Q  455 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12256 atgataagaaagctttaggtttggatactcaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 12327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 55 - 526
Target Start/End: Original strand, 15097 - 15565
Alignment:
Q  55 ctgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcatt 154  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||    
T  15097 ctgatgtagtatttttgcattaaacaatagtaagtatttatatcgtctcc---tcagggactagtgcgatatcacagacctttcgacacaaaatatcatt 15193  T
Q  155 ctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttcctt 254  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15194 ctaacttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaatagtaaaattgagattaataaggcgtgaaacttgttaggattagagttcctt 15293  T
Q  255 gatcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaata 354  Q
      || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  15294 attccagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacaccgttcgtgtccaaacaata 15393  T
Q  355 ttgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattga 454  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15394 atgtgagatcaattgtatcattcaatcgttgatgtctcacactattgaatgattcaagaatcggtcttatcatttaatcgatgatttctcaatctattga 15493  T
Q  455 atgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  15494 atgataagaaagctttaagtttggatacaaaaggtgattatcaaaacatcaattcaatgtctagaacttatg 15565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0936 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 1)
Name: scaffold0936
Description:

Target: scaffold0936; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 56 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 3558 - 3092
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||   || || |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  3558 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagcaagtagttatatcgtctcctc---agagattagtgcgatatcacggaccattcgacactaaatatcattc 3462  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |  ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3461 taagttaaa-gatgatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaagagtaaaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttaggattagagttccttg 3363  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatat 355  Q
    ||| ||| || ||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  3362 atcaagcttcacacttaacctaattaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacatcattcgtgtccaaacaatat 3263  T
Q  356 tgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaa 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3262 tgtgaaatcaattgtatcattcaattgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcggtcttaccgttcaatcgatgatttctcaatctattgat 3163  T
Q  456 tgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcgattccatgtctagaacctatg 526  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  3162 tgataagaaagctttaagtttggatacacaagatgattatcaaaacatgaattccatgtctagaacttatg 3092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 56 - 238
Target Start/End: Original strand, 99841 - 100020
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  99841 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttgtatcgtcttctc---agggacttgtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 99937  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgtt 238  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  99938 taagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtgaaacttgtt 100020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 56 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 24541 - 24276
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggaccgttcgacaccaaatatcattc 155  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||     
T  24541 tgatgtagtattttagcatcaaacaatattaagtatttatatcgtctcctc---agggactagtgcgatatcacagactgttcgacaccaaatatcatta 24445  T
Q  156 taagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttg 255  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||  |  ||| |||||| ||||| |||||||||   ||| | |||||||||| |||    
T  24444 taagttaaaagacaatttgttgtttgttttagtaacaaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaggcgtaaaa-acgttggaattagagttctttg 24346  T
Q  256 atcgagcgtcgcatgtaacctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 323  Q
    ||  ||||||  |  ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||    ||||||||||||||||    
T  24345 attaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatc 24276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 362 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 24257 - 24148
Alignment:
Q  362 atcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatgattcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataa 461  Q
    |||||||||||  |||||| || ||| |||||||||||| ||  || |||  ||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||| || |||      
T  24257 atcaattgtattgttcaatagttgatttctcaaactattaaacaatccaattgtcgatcgtatcgtttaattgacgatttctcaatctattcaacgatcc 24158  T
Q  462 gaaagcttta 471  Q
    ||||||||||    
T  24157 gaaagcttta 24148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0744 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0744
Description:

Target: scaffold0744; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 56 - 134
Target Start/End: Original strand, 6912 - 6987
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatatcgcggacc 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6912 tgatgtagtatttttgcatcaaacaatagtaagtatttatatcgt---ctcctcagggactagtgcgatatcgcggacc 6987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 56 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 9422 - 9355
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatat 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  9422 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtct---cctcagggactagtgcgatat 9355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 56 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 3040 - 2973
Alignment:
Q  56 tgatgtagtatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtctcctcctcagggactagtgcgatat 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||    
T  3040 tgatgtaatatttttgcatcaaacaattgtaagtatttatatcgtct---cctcagggactaatgcgatat 2973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 2785 - 2572
Alignment:
Q  306 ttgatattatcacgtatccctcgacaacaccatccgtgtccaaacaatattgtgaaatcaattgtatcattcaatcgtcgatgtctcaaactattgaatg 405  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||||||||||  || | ||||| || ||||  || ||| ||||||||| |||||||||| |||| |    
T  2785 ttgatattatcacatattgctcgacaacatcattcgtgtccaaatgatgtcgtgaattctattgagtcgttcgatcgtcgatttctcaaactactgaacg 2686  T
Q  406 attcaagagtcgatcttatcgttcaatcgatgatttctcaatctattgaatgataagaaagctttaggtttggatacacaaggtgattatcaaaacatcg 505  Q
    || ||  |||||||  |||||||  || | ||||||| ||| | ||| |||||||  ||||||||| |||   |||  ||| ||||||| |||||| |      
T  2685 atccactagtcgattgtatcgttgtatagttgatttcccaaaccattcaatgatacaaaagctttaagttccaatattcaaagtgattaccaaaacct-a 2587  T
Q  506 attccatgtctagaa 520  Q
    |||||||||||||||    
T  2586 attccatgtctagaa 2572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University