View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11456_low_2 (Length: 595)

Name: NF11456_low_2
Description: NF11456
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11456_low_2
NF11456_low_2
[»] chr1 (52 HSPs)
chr1 (17-477)||(9038305-9038766)
chr1 (37-395)||(9030231-9030589)
chr1 (47-379)||(9047657-9047983)
chr1 (475-595)||(20089465-20089585)
chr1 (472-595)||(16052087-16052210)
chr1 (472-595)||(39260437-39260560)
chr1 (476-595)||(43905649-43905768)
chr1 (477-595)||(1168499-1168617)
chr1 (477-591)||(52753242-52753356)
chr1 (470-595)||(29288138-29288263)
chr1 (484-595)||(29078519-29078630)
chr1 (477-595)||(25897370-25897488)
chr1 (477-595)||(26580361-26580479)
chr1 (470-592)||(26663247-26663369)
chr1 (477-595)||(41928586-41928704)
chr1 (477-589)||(1940844-1940956)
chr1 (477-595)||(1170535-1170653)
chr1 (481-591)||(8079804-8079914)
chr1 (475-591)||(32671573-32671689)
chr1 (475-595)||(38829063-38829183)
chr1 (481-595)||(2473722-2473836)
chr1 (481-595)||(19715252-19715366)
chr1 (478-595)||(12682817-12682934)
chr1 (478-595)||(42370886-42371003)
chr1 (478-595)||(52696788-52696905)
chr1 (478-595)||(970615-970734)
chr1 (475-595)||(46409429-46409549)
chr1 (472-595)||(49146163-49146286)
chr1 (477-595)||(2347652-2347770)
chr1 (34-155)||(9040621-9040743)
chr1 (477-595)||(33510480-33510598)
chr1 (482-595)||(8120870-8120983)
chr1 (480-595)||(5215384-5215499)
chr1 (478-595)||(40092488-40092605)
chr1 (472-592)||(15203103-15203223)
chr1 (477-595)||(17591687-17591802)
chr1 (475-595)||(13996814-13996934)
chr1 (481-595)||(46760966-46761080)
chr1 (479-595)||(29695673-29695790)
chr1 (478-595)||(51359308-51359424)
chr1 (477-571)||(15554259-15554353)
chr1 (478-595)||(23498457-23498574)
chr1 (475-595)||(6765453-6765573)
chr1 (477-595)||(52086263-52086381)
chr1 (497-595)||(17587596-17587694)
chr1 (473-595)||(38171824-38171946)
chr1 (475-595)||(7145201-7145321)
chr1 (483-595)||(15717787-15717898)
chr1 (515-595)||(40149497-40149577)
chr1 (494-595)||(23322931-23323032)
chr1 (475-550)||(5675099-5675174)
chr1 (477-575)||(5217895-5217992)
[»] chr5 (28 HSPs)
chr5 (475-595)||(9008148-9008268)
chr5 (472-595)||(24105762-24105885)
chr5 (472-595)||(33491287-33491410)
chr5 (477-595)||(27679260-27679378)
chr5 (475-595)||(19358523-19358643)
chr5 (475-595)||(35782735-35782855)
chr5 (477-595)||(1579035-1579153)
chr5 (477-595)||(1605662-1605780)
chr5 (475-595)||(27420855-27420975)
chr5 (473-595)||(16069348-16069470)
chr5 (475-592)||(20992240-20992357)
chr5 (484-595)||(3386577-3386688)
chr5 (472-595)||(16737538-16737661)
chr5 (477-595)||(8374429-8374547)
chr5 (476-595)||(4120935-4121054)
chr5 (475-595)||(20992372-20992496)
chr5 (476-595)||(31883142-31883261)
chr5 (485-595)||(1165692-1165802)
chr5 (473-595)||(5202967-5203089)
chr5 (477-595)||(33991139-33991257)
chr5 (486-595)||(33284666-33284775)
chr5 (475-595)||(3921578-3921698)
chr5 (477-595)||(38598541-38598659)
chr5 (478-595)||(26603033-26603140)
chr5 (478-595)||(31410476-31410593)
chr5 (537-595)||(27025015-27025073)
chr5 (544-595)||(41818554-41818605)
chr5 (477-595)||(25634581-25634697)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (472-595)||(36696-36819)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (476-595)||(18594534-18594653)
chr8 (477-595)||(39206584-39206702)
chr8 (478-595)||(14422702-14422819)
chr8 (478-595)||(35118122-35118239)
chr8 (479-595)||(34842456-34842572)
chr8 (475-595)||(40117943-40118063)
chr8 (472-595)||(26783824-26783947)
chr8 (478-595)||(29938060-29938177)
chr8 (481-595)||(13110406-13110520)
chr8 (483-595)||(2042615-2042727)
chr8 (481-595)||(8021721-8021835)
chr8 (477-595)||(10836846-10836964)
chr8 (477-595)||(24113257-24113375)
chr8 (477-595)||(33287116-33287234)
chr8 (477-595)||(39218775-39218893)
chr8 (475-595)||(4035843-4035963)
chr8 (475-595)||(6144364-6144484)
chr8 (475-595)||(34998987-34999107)
chr8 (477-595)||(22260721-22260839)
chr8 (485-595)||(44805035-44805145)
chr8 (482-595)||(41575516-41575629)
chr8 (480-595)||(7791412-7791527)
chr8 (484-595)||(34679548-34679659)
chr8 (477-595)||(7774762-7774880)
chr8 (482-595)||(144397-144510)
chr8 (478-595)||(5320563-5320680)
chr8 (481-595)||(28639280-28639398)
chr8 (483-595)||(42571598-42571709)
chr8 (473-595)||(38167246-38167368)
chr8 (477-595)||(7811993-7812111)
chr8 (478-595)||(33278399-33278516)
chr8 (475-595)||(2322103-2322223)
chr8 (476-588)||(36491154-36491266)
chr8 (484-575)||(5005171-5005262)
chr8 (482-595)||(66271-66384)
chr8 (481-566)||(9806875-9806960)
chr8 (481-594)||(39220258-39220371)
chr8 (558-595)||(9807339-9807376)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (477-595)||(6086690-6086808)
chr6 (473-595)||(26704430-26704552)
chr6 (477-594)||(2837543-2837660)
chr6 (478-595)||(26946967-26947084)
chr6 (478-595)||(30691850-30691967)
chr6 (477-595)||(52834-52952)
chr6 (475-595)||(3347614-3347734)
chr6 (480-595)||(3955857-3955972)
chr6 (477-595)||(35198282-35198399)
chr6 (481-595)||(17261164-17261278)
chr6 (475-595)||(18613534-18613654)
chr6 (477-595)||(11167238-11167356)
chr6 (477-595)||(21893453-21893571)
chr6 (482-592)||(34887386-34887496)
chr6 (478-595)||(9459562-9459679)
chr6 (477-595)||(16307099-16307217)
chr6 (472-595)||(20726784-20726903)
chr6 (481-595)||(28199598-28199714)
chr6 (489-595)||(1153603-1153709)
chr6 (483-595)||(30699020-30699132)
chr6 (476-557)||(33463698-33463779)
chr6 (552-595)||(33464402-33464445)
[»] chr4 (57 HSPs)
chr4 (473-595)||(14987784-14987906)
chr4 (473-595)||(23776538-23776660)
chr4 (475-595)||(20877041-20877161)
chr4 (480-595)||(1756843-1756958)
chr4 (476-595)||(54189540-54189659)
chr4 (480-595)||(54412627-54412742)
chr4 (473-595)||(30423643-30423765)
chr4 (478-595)||(19913709-19913826)
chr4 (475-595)||(8932257-8932377)
chr4 (475-595)||(50353795-50353915)
chr4 (477-592)||(6611442-6611557)
chr4 (477-595)||(15241107-15241225)
chr4 (482-595)||(19165050-19165164)
chr4 (477-595)||(27488727-27488845)
chr4 (477-595)||(50055180-50055298)
chr4 (477-595)||(53717543-53717661)
chr4 (482-595)||(16700782-16700895)
chr4 (478-595)||(38055154-38055271)
chr4 (479-595)||(37968836-37968952)
chr4 (479-595)||(40428799-40428915)
chr4 (476-595)||(44784996-44785115)
chr4 (477-595)||(2481487-2481605)
chr4 (477-595)||(28032791-28032909)
chr4 (473-595)||(45424613-45424735)
chr4 (477-595)||(48909842-48909960)
chr4 (477-595)||(50053439-50053557)
chr4 (479-595)||(11639657-11639773)
chr4 (478-584)||(6688711-6688817)
chr4 (477-595)||(15669179-15669297)
chr4 (481-595)||(35490852-35490966)
chr4 (477-595)||(37464717-37464835)
chr4 (481-595)||(52139203-52139317)
chr4 (482-595)||(53875658-53875771)
chr4 (475-595)||(23704288-23704408)
chr4 (474-595)||(53353048-53353173)
chr4 (484-595)||(28360433-28360544)
chr4 (481-595)||(1617084-1617198)
chr4 (481-595)||(8591171-8591285)
chr4 (477-595)||(43290039-43290157)
chr4 (482-595)||(30171581-30171694)
chr4 (485-595)||(27583711-27583821)
chr4 (481-595)||(31969681-31969795)
chr4 (490-595)||(38071399-38071504)
chr4 (479-595)||(47632032-47632149)
chr4 (475-566)||(23265865-23265956)
chr4 (480-595)||(44375844-44375959)
chr4 (477-595)||(44379266-44379384)
chr4 (477-579)||(55344920-55345022)
chr4 (477-595)||(27536183-27536297)
chr4 (490-595)||(33703850-33703955)
chr4 (485-595)||(40680117-40680227)
chr4 (477-595)||(16703821-16703935)
chr4 (473-577)||(44548238-44548343)
chr4 (477-536)||(9595973-9596031)
chr4 (558-595)||(23269125-23269162)
chr4 (554-595)||(51780797-51780838)
chr4 (475-595)||(17493327-17493447)
[»] chr3 (37 HSPs)
chr3 (477-595)||(37698220-37698338)
chr3 (474-595)||(42307982-42308103)
chr3 (480-595)||(38856089-38856204)
chr3 (478-595)||(25999382-25999499)
chr3 (477-595)||(54534404-54534521)
chr3 (475-595)||(15520219-15520339)
chr3 (473-595)||(20842425-20842547)
chr3 (477-595)||(22175067-22175185)
chr3 (477-595)||(50528922-50529040)
chr3 (484-595)||(21581042-21581153)
chr3 (477-592)||(29445481-29445596)
chr3 (473-595)||(25494362-25494484)
chr3 (477-595)||(38933939-38934056)
chr3 (477-595)||(54870251-54870369)
chr3 (475-595)||(8042598-8042718)
chr3 (475-595)||(12117735-12117855)
chr3 (471-595)||(15520623-15520747)
chr3 (479-595)||(20699144-20699260)
chr3 (475-595)||(32244111-32244231)
chr3 (472-595)||(35643205-35643328)
chr3 (484-595)||(50529850-50529961)
chr3 (477-595)||(46452239-46452357)
chr3 (478-595)||(26122808-26122925)
chr3 (472-595)||(32359247-32359370)
chr3 (472-595)||(35226435-35226558)
chr3 (477-595)||(34700334-34700452)
chr3 (484-595)||(44609410-44609521)
chr3 (475-595)||(49128040-49128160)
chr3 (488-595)||(42105048-42105155)
chr3 (477-595)||(24835776-24835894)
chr3 (478-595)||(2895179-2895296)
chr3 (478-595)||(44688760-44688872)
chr3 (484-592)||(48925083-48925189)
chr3 (537-594)||(16354399-16354456)
chr3 (477-595)||(53028218-53028328)
chr3 (473-526)||(24366081-24366134)
chr3 (507-595)||(12915930-12916017)
[»] chr7 (42 HSPs)
chr7 (476-595)||(30181105-30181224)
chr7 (477-595)||(33846605-33846723)
chr7 (475-595)||(42965077-42965197)
chr7 (480-595)||(7164184-7164299)
chr7 (476-595)||(12101259-12101378)
chr7 (478-595)||(33359171-33359288)
chr7 (475-595)||(42204149-42204270)
chr7 (475-595)||(4347268-4347388)
chr7 (479-595)||(20346487-20346603)
chr7 (475-591)||(43068058-43068174)
chr7 (472-595)||(36890911-36891033)
chr7 (477-595)||(24792413-24792531)
chr7 (478-595)||(22649775-22649892)
chr7 (483-595)||(1803029-1803141)
chr7 (475-595)||(3511318-3511438)
chr7 (485-592)||(43156718-43156825)
chr7 (473-595)||(6394744-6394866)
chr7 (477-595)||(32041539-32041657)
chr7 (482-595)||(4477402-4477515)
chr7 (475-595)||(15655907-15656027)
chr7 (475-588)||(19828265-19828378)
chr7 (475-595)||(933280-933400)
chr7 (475-595)||(5280855-5280975)
chr7 (481-595)||(46891420-46891535)
chr7 (473-575)||(37704973-37705075)
chr7 (478-595)||(25748485-25748602)
chr7 (483-592)||(38866547-38866656)
chr7 (479-595)||(8630665-8630781)
chr7 (480-595)||(17753600-17753715)
chr7 (473-595)||(43021657-43021779)
chr7 (478-591)||(12097675-12097788)
chr7 (475-595)||(37005892-37006012)
chr7 (480-592)||(46134388-46134500)
chr7 (481-592)||(9452591-9452702)
chr7 (475-589)||(43405015-43405129)
chr7 (482-595)||(42673467-42673576)
chr7 (475-595)||(16894588-16894698)
chr7 (537-595)||(48865690-48865748)
chr7 (485-569)||(27691433-27691517)
chr7 (478-588)||(36849625-36849735)
chr7 (473-525)||(30075379-30075431)
chr7 (547-595)||(20163886-20163934)
[»] chr2 (25 HSPs)
chr2 (480-595)||(30420258-30420373)
chr2 (473-595)||(33906138-33906260)
chr2 (478-595)||(31517306-31517423)
chr2 (477-595)||(18806975-18807093)
chr2 (477-595)||(39635448-39635566)
chr2 (478-595)||(3873335-3873452)
chr2 (475-595)||(1108274-1108393)
chr2 (477-595)||(4232233-4232351)
chr2 (477-595)||(6174919-6175037)
chr2 (481-595)||(28329928-28330042)
chr2 (474-595)||(26323277-26323398)
chr2 (482-595)||(1482994-1483106)
chr2 (475-595)||(19901229-19901348)
chr2 (481-595)||(4016039-4016153)
chr2 (477-595)||(42937715-42937833)
chr2 (477-595)||(5733395-5733513)
chr2 (473-595)||(30270770-30270892)
chr2 (485-595)||(16066385-16066495)
chr2 (477-595)||(2178860-2178978)
chr2 (477-595)||(16588867-16588985)
chr2 (481-595)||(850997-851111)
chr2 (479-595)||(44947633-44947749)
chr2 (477-595)||(42446660-42446778)
chr2 (482-595)||(429817-429930)
chr2 (495-589)||(19384032-19384126)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (478-595)||(23042-23159)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (481-595)||(145336-145450)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (479-595)||(3708-3824)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (477-595)||(97-215)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (473-595)||(10230-10352)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (480-595)||(386-501)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (481-595)||(96-212)
[»] scaffold2089 (1 HSPs)
scaffold2089 (477-505)||(1066-1094)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 426; Significance: 0; HSPs: 52)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 9038766 - 9038305
Alignment:
Q  17 acatagctaggaaaatgaaa-taatttcaataaaagtacctcaagatgatcaccaagctgaatgagtatagcatgatgaggaatattaacattaatccac 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9038766 acatagctaggaaaatgaaactaatttcaataaaagtacctcaagatgatcaccaagctaaatgagtatagcatgatgaggaatattaacattaatccac 9038667  T
Q  116 tttcctttatgtgataggatttggagacccccatttacatcttgcattagggttaccacaaatccaggatcagtgtggtcagggagaccaatattaccct 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9038666 tttcctttatgtgataggatttggagacccccatttacatcttgcattagggttaccacaaatccaggatcagtgtggttagggagaccaatattaccct 9038567  T
Q  216 tggatttagaatttggtggataaagattcatggccatcacatcaaaccctgacttcatgttgaatgctttttctatgtagtcttcatcaaaccctaagtt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9038566 tggatttagaatttggtggataaagattcatggccatcacatcaaaccctgacttcatgttgaatgctttttctatgtagtcttcatcaaaccctaagtt 9038467  T
Q  316 ttttgacatttctcttgctaacccagctacaatctttcgcatttcttggttatattcttctataatatttctgatgcacattaataatttcattgttaaa 415  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9038466 ttttgaaatttctcttgctaacccagctacaatctttcgcatttcttggttatattcttctataatatttctgatgcacatcaataatttcattgttaaa 9038367  T
Q  416 cacttaactgtatttttggaagagtcaatcaaagctgacaaataagaactaattaggactaa 477  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9038366 cacttaattgtacttttggaagagtcaatcaaagctgacaaataaggactaattaggactaa 9038305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 37 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 9030589 - 9030231
Alignment:
Q  37 taatttcaataaaagtacctcaagatgatcaccaagctgaatgagtatagcatgatgaggaatattaacattaatccactttcctttatgtgataggatt 136  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  9030589 taatttcaagaaaaatacctcaagatggtcaccaagctggatgagtatagcatgatggggaatataaacattaatccacgttcctttgtgggataggatt 9030490  T
Q  137 tggagacccccatttacatcttgcattagggttaccacaaatccaggatcagtgtggtcagggagaccaatattacccttggatttagaatttggtggat 236  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9030489 tgaagacccccatttacatcttgcactagggttaccacaaagccaggatcagtgtggttagggagaccaatatcacccttggatttagaatttggtggat 9030390  T
Q  237 aaagattcatggccatcacatcaaaccctgacttcatgttgaatgctttttctatgtagtcttcatcaaaccctaagttttttgacatttctcttgctaa 336  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  9030389 aaagattcatggccattacatcaaaccctgacttcatgttgaatgcttcctctatgtagttttcatcaaaccctaagttttctgacattgatcttgctaa 9030290  T
Q  337 cccagctacaatctttcgcatttcttggttatattcttctataatatttctgatgcaca 395  Q
     ||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  9030289 tccaactacaatctttctcatttctttgttataatcttcaataattttgctgatgcaca 9030231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 47 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 9047983 - 9047657
Alignment:
Q  47 aaaagtacctcaagatgatcaccaagctgaatgagtatagcatgatgaggaatattaacattaatccactttcctttatgtgataggatttggagacccc 146  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9047983 aaaagtaccacaagatgatcaccaagctggattagtatagcatgatgaggaatatgaacattaatccaatttcctttatgtgataggatttggagacccc 9047884  T
Q  147 catttacatcttgcattagggttaccacaaatccaggatcagtgtggtcagggagaccaatattacccttggatttagaatttggtggataaagattcat 246  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||  ||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9047883 -atttacatcttgcattagggttaccacaaa-----gatcagtgtggctagggataccaatatcactcttggatttagaattgggtggataaagattcat 9047790  T
Q  247 ggccatcacatcaaaccctgacttcatgttgaatgctttttctatgtagtcttcatcaaaccctaagttttttgacatttctcttgctaacccagctaca 346  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||    
T  9047789 ggccatcacatcaaaacctgacttcatgttgaatgctttttctatgtagttttcatcaaaccctaagttttttgacactgctcttgctagctcagctaca 9047690  T
Q  347 atctttcgcatttcttggttatattcttctata 379  Q
    | ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  9047689 acctttctcatttgtttgtaatattcttctata 9047657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 475 - 595
Target Start/End: Original strand, 20089465 - 20089585
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20089465 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 20089564  T
Q  575 tcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20089565 tcatagtttcataagctgctt 20089585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 472 - 595
Target Start/End: Original strand, 16052087 - 16052210
Alignment:
Q  472 gactaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagc 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16052087 gactaaggccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgggcttatctacttccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 16052186  T
Q  572 ttatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16052187 ttatcatagtttcataagctgctt 16052210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 472 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 39260560 - 39260437
Alignment:
Q  472 gactaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagc 571  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39260560 gacttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 39260461  T
Q  572 ttatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  39260460 ttatcatagtttcataagttgctt 39260437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 476 - 595
Target Start/End: Original strand, 43905649 - 43905768
Alignment:
Q  476 aaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttat 575  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43905649 aaggctccgtttggattggcttattttgagcttatttgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 43905748  T
Q  576 catagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  43905749 catagtttcataagctgctt 43905768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Original strand, 1168499 - 1168617
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1168499 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 1168598  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1168599 atagtttcataagctgctt 1168617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 477 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 52753356 - 52753242
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52753356 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 52753257  T
Q  577 atagtttcataagct 591  Q
    |||||||||||||||    
T  52753256 atagtttcataagct 52753242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 470 - 595
Target Start/End: Original strand, 29288138 - 29288263
Alignment:
Q  470 aggactaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaata 569  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29288138 aggacttaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaata 29288237  T
Q  570 gcttatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  29288238 gtttatcatagtttcataagctgctt 29288263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 484 - 595
Target Start/End: Original strand, 29078519 - 29078630
Alignment:
Q  484 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29078519 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 29078618  T
Q  584 cataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||    
T  29078619 cataagctgctt 29078630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Original strand, 25897370 - 25897488
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25897370 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcatatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 25897469  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  25897470 atagtttcataagctgctt 25897488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 26580479 - 26580361
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26580479 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaagtaaataaaaatagcttatc 26580380  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26580379 atagtttcataagctgctt 26580361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 470 - 592
Target Start/End: Original strand, 26663247 - 26663369
Alignment:
Q  470 aggactaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaata 569  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  26663247 aggattaagaccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaata 26663346  T
Q  570 gcttatcatagtttcataagctg 592  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  26663347 gcttatcatagtttcataagctg 26663369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 41928704 - 41928586
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  41928704 aggccccgtttggattggcttattttgaacttatgtggacttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 41928605  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  41928604 atagtttcataagctgctt 41928586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 477 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 1940956 - 1940844
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1940956 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 1940857  T
Q  577 atagtttcataag 589  Q
    |||||||||||||    
T  1940856 atagtttcataag 1940844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 1170653 - 1170535
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  1170653 aggccccgtttggattggcttattttgagcttttgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatc 1170554  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1170553 atagtttcataagctgctt 1170535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 481 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 8079914 - 8079804
Alignment:
Q  481 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatag 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8079914 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 8079815  T
Q  581 tttcataagct 591  Q
    |||||||||||    
T  8079814 tttcataagct 8079804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 475 - 591
Target Start/End: Original strand, 32671573 - 32671689
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32671573 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagctta 32671672  T
Q  575 tcatagtttcataagct 591  Q
    |||||||||||||||||    
T  32671673 tcatagtttcataagct 32671689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 475 - 595
Target Start/End: Original strand, 38829063 - 38829183
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38829063 taaggctctgtttggattggcttattttgagcttatgtcggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 38829162  T
Q  575 tcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  38829163 tcatagtttcataagctgctt 38829183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 481 - 595
Target Start/End: Original strand, 2473722 - 2473836
Alignment:
Q  481 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatag 580  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2473722 cccgtttggatcggtttattttgagcttatgtgggcttatctacgcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatag 2473821  T
Q  581 tttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||    
T  2473822 tttcataagctgctt 2473836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 481 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 19715366 - 19715252
Alignment:
Q  481 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatag 580  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |    
T  19715366 cccgtttggattggtttattttgagcttatgtgagcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcattg 19715267  T
Q  581 tttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||    
T  19715266 tttcataagctgctt 19715252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 478 - 595
Target Start/End: Original strand, 12682817 - 12682934
Alignment:
Q  478 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatca 577  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12682817 ggccctgtttggattgacttattttgagtttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 12682916  T
Q  578 tagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||    
T  12682917 tagtttcataagctgctt 12682934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 478 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 42371003 - 42370886
Alignment:
Q  478 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatca 577  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  42371003 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaaaaacttatca 42370904  T
Q  578 tagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||    
T  42370903 tagtttcataagctgctt 42370886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 478 - 595
Target Start/End: Original strand, 52696788 - 52696905
Alignment:
Q  478 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatca 577  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  52696788 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatca 52696887  T
Q  578 tagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||    
T  52696888 tagtttcataagctgctt 52696905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 478 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 970734 - 970615
Alignment:
Q  478 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc- 576  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  970734 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatca 970635  T
Q  577 -atagtttcataagctgctt 595  Q
     |||||||||||||||||||    
T  970634 tatagtttcataagctgctt 970615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 475 - 595
Target Start/End: Original strand, 46409429 - 46409549
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46409429 taaggctccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatctaatctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 46409528  T
Q  575 tcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  46409529 tcatagtttcataagctgctt 46409549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 472 - 595
Target Start/End: Original strand, 49146163 - 49146286
Alignment:
Q  472 gactaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagc 571  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  49146163 gactaaggctccgtttggattggtttattttgagcttatgtggatttatatactcccataagtttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagc 49146262  T
Q  572 ttatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  49146263 ttatcatagtttcataagctgctt 49146286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Original strand, 2347652 - 2347770
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  2347652 aggccccgtttggatttgtttattttgagtttatgcgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 2347751  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  2347752 atagtttcataagctgctt 2347770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 34 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 9040743 - 9040621
Alignment:
Q  34 aaataatttcaataa-aagtacctcaagatgatcaccaagctgaatgagtatagcatgatgaggaatattaacattaatccactttcctttatgtgatag 132  Q
    ||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9040743 aaataattttaataagaagtgccacaagatgatcaccaagctggatgagtatagcatgatggggaatatgaacattaatccaatttcctttatgtgatag 9040644  T
Q  133 gatttggagacccccatttacat 155  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  9040643 gattttgagacccccatttacat 9040621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Original strand, 33510480 - 33510598
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||   |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  33510480 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatc 33510579  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  33510580 atagtttcataagctgctt 33510598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 482 - 595
Target Start/End: Original strand, 8120870 - 8120983
Alignment:
Q  482 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  8120870 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatcatagt 8120969  T
Q  582 ttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||    
T  8120970 ttcataagctgctt 8120983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 480 - 595
Target Start/End: Original strand, 5215384 - 5215499
Alignment:
Q  480 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcata 579  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||  |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5215384 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactttcataagcctttttaaagatgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcata 5215483  T
Q  580 gtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||| |||||    
T  5215484 gtttcataagttgctt 5215499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 478 - 595
Target Start/End: Original strand, 40092488 - 40092605
Alignment:
Q  478 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatca 577  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  40092488 ggccctgtttggattgacttattttgagcttatatgagcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatatcttatca 40092587  T
Q  578 tagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||    
T  40092588 tagtttcataagctgctt 40092605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 472 - 592
Target Start/End: Original strand, 15203103 - 15203223
Alignment:
Q  472 gactaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagc 571  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15203103 gactatggccccgtttgaattgacttattttaagcttttgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgttagggtaaataaataaaaatagc 15203202  T
Q  572 ttatcatagtttcataagctg 592  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15203203 ttatcatagtttcataagctg 15203223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Original strand, 17591687 - 17591802
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  17591687 aggccccgtttggattggcttatt--gagcttatgtgg-cttatctactcccataagccttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatc 17591783  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17591784 atagtttcataagctgctt 17591802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 475 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 13996934 - 13996814
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  13996934 taaggccctgtttggattggcttattttgaaattatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagctta 13996835  T
Q  575 tcatagtttcataagctgctt 595  Q
    | || ||||||||||||||||    
T  13996834 taatggtttcataagctgctt 13996814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 595
Target Start/End: Original strand, 46760966 - 46761080
Alignment:
Q  481 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatag 580  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||   ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46760966 cccgtttggattgacttattttgaacttatatgagcttatctacttgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 46761065  T
Q  581 tttcataagctgctt 595  Q
    |||||||| ||||||    
T  46761066 tttcataaactgctt 46761080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 479 - 595
Target Start/End: Original strand, 29695673 - 29695790
Alignment:
Q  479 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgtttt-aaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatca 577  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  | |||| |||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||    
T  29695673 gccctgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcccataatttttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaataatttatca 29695772  T
Q  578 tagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29695773 tagtttcataagctgctt 29695790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 478 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 51359424 - 51359308
Alignment:
Q  478 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatca 577  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||  | |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  51359424 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgcgggcttatttactgccataagccttcttaaaggt-tttgggtaaataattaaaaatagcttatca 51359326  T
Q  578 tagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||| |||||    
T  51359325 tagtttcataaggtgctt 51359308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 477 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 15554353 - 15554259
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagc 571  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15554353 aggccccgtttggattggcttaagttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 15554259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 478 - 595
Target Start/End: Original strand, 23498457 - 23498574
Alignment:
Q  478 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatca 577  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||    
T  23498457 ggccctgtttgaattggcttattttaagcttatgtgggcttatctacttccacaagcctttttcaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttcatca 23498556  T
Q  578 tagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||| |||||    
T  23498557 tagtttcataagttgctt 23498574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 475 - 595
Target Start/End: Original strand, 6765453 - 6765573
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||  |||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  6765453 taagaccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgaatttatctacttttataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 6765552  T
Q  575 tcatagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||| |||||| ||||||||    
T  6765553 tcatattttcatgagctgctt 6765573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Original strand, 52086263 - 52086381
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||| |  |||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||    
T  52086263 aggccctgtttggattgacttattttaagcttatgtgggtttatctgctcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaatcagtaaaaataacttatc 52086362  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  52086363 ataatttcataagctgctt 52086381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 497 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 17587694 - 17587596
Alignment:
Q  497 tattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17587694 tattttgagcttatgtgagcttatctattcgcataagcctttttaaaggtgtttggctaaataaataaaaacagcttatcatattttcataagctgctt 17587596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 473 - 595
Target Start/End: Original strand, 38171824 - 38171946
Alignment:
Q  473 actaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagct 572  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||||  |||||||  |||||||||||  |||| |  |||||||||||||| | |||||||||||||| || |    
T  38171824 actaaggctccgtttgcattgacttattttgaatttatgtgaacttatctactcacataaacctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaacagtt 38171923  T
Q  573 tatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  38171924 tatcatagtttcataagctgctt 38171946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 475 - 595
Target Start/End: Original strand, 7145201 - 7145321
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttatttt-gagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctt 573  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||| ||||||  ||||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||    
T  7145201 taaggtcccgtttggattgacttatttttgagcttatgtgtatttatctactcccataagcctttttaaaagtgttg-ggtaaataaacaaaaatagttt 7145299  T
Q  574 atcatagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  7145300 atcatagtttcataagctgctt 7145321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 483 - 595
Target Start/End: Original strand, 15717787 - 15717898
Alignment:
Q  483 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 582  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||| |   ||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15717787 cgtttggattgacttattttgagtttatgttggcctatctaatttcataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagctt-tcatagtt 15717885  T
Q  583 tcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||    
T  15717886 tcataagctgctt 15717898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 515 - 595
Target Start/End: Original strand, 40149497 - 40149577
Alignment:
Q  515 gcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  40149497 gcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataatttatcatagttttataagctgctt 40149577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 494 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 23323032 - 23322931
Alignment:
Q  494 gcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgc 593  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| || |||| |||| ||||   ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23323032 gcttattttgagcttatataggcttatctactcccataaactttttttaaggcgtttgaataaatcaataaaaatagtttatcataatttcataagctgc 23322933  T
Q  594 tt 595  Q
    ||    
T  23322932 tt 23322931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 475 - 550
Target Start/End: Original strand, 5675099 - 5675174
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgttt 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||   ||||||| ||| |||| |||||    
T  5675099 taaggccccgtttggattggcttattttaagcttatgttagcttatctactaacataagctttttgaaagatgttt 5675174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 477 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 5217992 - 5217895
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttat 575  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||   ||||||| ||| |||    ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  5217992 aggcctcgtttggattggcttattttaagcttatgagagcttatctactaacataagctctttcaaatacatttgggtaaat-aataaaaatagcttat 5217895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 28)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 475 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 9008268 - 9008148
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9008268 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 9008169  T
Q  575 tcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9008168 tcatagtttcataagctgctt 9008148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 472 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 24105885 - 24105762
Alignment:
Q  472 gactaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagc 571  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24105885 gactaaggctccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 24105786  T
Q  572 ttatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  24105785 ttatcatagtttcataagctgctt 24105762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 472 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 33491410 - 33491287
Alignment:
Q  472 gactaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagc 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33491410 gactaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 33491311  T
Q  572 ttatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  33491310 ttatcatagtttcataagctgctt 33491287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 27679378 - 27679260
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27679378 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 27679279  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27679278 atagtttcataagctgctt 27679260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 475 - 595
Target Start/End: Original strand, 19358523 - 19358643
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19358523 taaggccccgtttggattgccttattttgagcttatgtgagcttatctactcctataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 19358622  T
Q  575 tcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  19358623 tcatagtttcataagctgctt 19358643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 475 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 35782855 - 35782735
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35782855 taaggccccgtttggattgccttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 35782756  T
Q  575 tcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  35782755 tcatagtttcataagctgctt 35782735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Original strand, 1579035 - 1579153
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  1579035 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 1579134  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1579135 atagtttcataagctgctt 1579153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 1605780 - 1605662
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  1605780 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 1605681  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1605680 atagtttcataagctgctt 1605662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 475 - 595
Target Start/End: Original strand, 27420855 - 27420975
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  27420855 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagttta 27420954  T
Q  575 tcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27420955 tcatagtttcataagctgctt 27420975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 473 - 595
Target Start/End: Original strand, 16069348 - 16069470
Alignment:
Q  473 actaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagct 572  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16069348 actaaggtcccgtttggattgacttattttgagcttatgtaggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagct 16069447  T
Q  573 tatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16069448 tatcatagtttcataagctgctt 16069470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 475 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 20992357 - 20992240
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  20992357 taaggccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtggtcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcata 20992258  T
Q  575 tcatagtttcataagctg 592  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20992257 tcatagtttcataagctg 20992240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 484 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 3386688 - 3386577
Alignment:
Q  484 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386688 gtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 3386589  T
Q  584 cataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||    
T  3386588 cataagctgctt 3386577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 472 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 16737661 - 16737538
Alignment:
Q  472 gactaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagc 571  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16737661 gactaaggtctcgtttgaattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 16737562  T
Q  572 ttatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16737561 ttatcatagtttcataagctgctt 16737538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 8374547 - 8374429
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  8374547 aggccccgtttggattgccttattttaagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 8374448  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  8374447 atagtttcataagctgctt 8374429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 476 - 595
Target Start/End: Original strand, 4120935 - 4121054
Alignment:
Q  476 aaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttat 575  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||    
T  4120935 aaggccccgtttggaatggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcccttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaataatttat 4121034  T
Q  576 catagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4121035 catagtttcataagctgctt 4121054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 475 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 20992496 - 20992372
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgt----gggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatag 570  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20992496 taaggccctgtttggattggcttattttgagcttatgtacatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatag 20992397  T
Q  571 cttatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  20992396 catatcatagtttcataagctgctt 20992372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 476 - 595
Target Start/End: Original strand, 31883142 - 31883261
Alignment:
Q  476 aaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttat 575  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  31883142 aaggctccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatctactctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttat 31883241  T
Q  576 catagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31883242 catagtttcataagctgctt 31883261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 485 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 1165802 - 1165692
Alignment:
Q  485 tttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 584  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1165802 tttggattgacttattttgagcttatgtgagcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 1165703  T
Q  585 ataagctgctt 595  Q
    ||||| |||||    
T  1165702 ataagttgctt 1165692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 473 - 595
Target Start/End: Original strand, 5202967 - 5203089
Alignment:
Q  473 actaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagct 572  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  5202967 actatggccccgtttggattgacttattttgagtttatgttggtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtt 5203066  T
Q  573 tatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  5203067 tatcatagtttcataagctgctt 5203089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Original strand, 33991139 - 33991257
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33991139 aggccccgtttgaattgacttattttgagtttatgtggacttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 33991238  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  33991239 atagtttcataagttgctt 33991257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 486 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 33284775 - 33284666
Alignment:
Q  486 ttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 585  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33284775 ttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttaagtaaataaataaaaatagcttatcatagtttta 33284676  T
Q  586 taagctgctt 595  Q
    ||| ||||||    
T  33284675 taaactgctt 33284666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 475 - 595
Target Start/End: Original strand, 3921578 - 3921698
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||   |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  3921578 taaggtcccgtttggattgatttattttgagtttatatgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagctta 3921677  T
Q  575 tcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  3921678 tcatagtttcataagctgctt 3921698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 38598659 - 38598541
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||  ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  38598659 aggcccggtttggattggcttactttgaacttatgtgagcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatc 38598560  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  38598559 atagtttcataagctgctt 38598541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 478 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 26603140 - 26603033
Alignment:
Q  478 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatca 577  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26603140 ggccccgtttggattggcttattttgagcttat----------ctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 26603051  T
Q  578 tagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  26603050 tagtttcataaactgctt 26603033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 478 - 595
Target Start/End: Original strand, 31410476 - 31410593
Alignment:
Q  478 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatca 577  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||| |||| |||| |||||||| || |||||   ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  31410476 ggccgcgtttggattgatttattttgagtttatatgggtttatctacccccataagtctttttaaaggtgtttgagtaaacaaataaaaatagcttatca 31410575  T
Q  578 tagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||| |||||||||||    
T  31410576 tagttttataagctgctt 31410593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 537 - 595
Target Start/End: Original strand, 27025015 - 27025073
Alignment:
Q  537 ttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27025015 ttttaaagatgttcgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 27025073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 544 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 41818605 - 41818554
Alignment:
Q  544 ggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  41818605 ggtgtttaggtaaattaataaaaatagcttatcatatttttataagctgctt 41818554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Original strand, 25634581 - 25634697
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | | |||||||||   ||||||| ||| |||   |||| |||||||||   ||||||||||||     
T  25634581 aggccccgtttagattggcttattttaagcttatgagagtttatctactaacataagctctttcaaatacgtttgggtaaataa--taaaatagcttata 25634678  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    | | |||||||||| ||||    
T  25634679 acaatttcataagccgctt 25634697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 472 - 595
Target Start/End: Original strand, 36696 - 36819
Alignment:
Q  472 gactaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagc 571  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36696 gacttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 36795  T
Q  572 ttatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  36796 ttatcatagtttcataagctgctt 36819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 476 - 595
Target Start/End: Original strand, 18594534 - 18594653
Alignment:
Q  476 aaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttat 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18594534 aaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 18594633  T
Q  576 catagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18594634 catagtttcataagctgctt 18594653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Original strand, 39206584 - 39206702
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39206584 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 39206683  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  39206684 atagtttcataagctgctt 39206702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 478 - 595
Target Start/End: Original strand, 14422702 - 14422819
Alignment:
Q  478 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatca 577  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14422702 ggccccgtttggattggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 14422801  T
Q  578 tagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14422802 tagtttcataagctgctt 14422819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 478 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 35118239 - 35118122
Alignment:
Q  478 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatca 577  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35118239 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagccttttgaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 35118140  T
Q  578 tagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||    
T  35118139 tagtttcataagctgctt 35118122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 479 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 34842572 - 34842456
Alignment:
Q  479 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcat 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  34842572 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 34842473  T
Q  579 agtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||    
T  34842472 agtttcataagctgctt 34842456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 475 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 40118063 - 40117943
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40118063 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 40117964  T
Q  575 tcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  40117963 tcatagtttcataagctgctt 40117943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 472 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 26783947 - 26783824
Alignment:
Q  472 gactaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagc 571  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  26783947 gactaaggcctcgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagc 26783848  T
Q  572 ttatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  26783847 ttatcatagtttcataagctgctt 26783824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 478 - 595
Target Start/End: Original strand, 29938060 - 29938177
Alignment:
Q  478 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatca 577  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  29938060 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatatactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatca 29938159  T
Q  578 tagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29938160 tagtttcataagctgctt 29938177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 481 - 595
Target Start/End: Original strand, 13110406 - 13110520
Alignment:
Q  481 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatag 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13110406 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccatatgcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 13110505  T
Q  581 tttcataagctgctt 595  Q
    ||| |||||||||||    
T  13110506 tttaataagctgctt 13110520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 483 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 2042727 - 2042615
Alignment:
Q  483 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2042727 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtt 2042628  T
Q  583 tcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||    
T  2042627 tcataagctgctt 2042615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 481 - 595
Target Start/End: Original strand, 8021721 - 8021835
Alignment:
Q  481 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatag 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8021721 cccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 8021820  T
Q  581 tttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||    
T  8021821 tttcataagctgctt 8021835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 10836964 - 10836846
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  10836964 aggcctcgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 10836865  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  10836864 atagtttcataaactgctt 10836846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 24113375 - 24113257
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  24113375 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaccctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagattatc 24113276  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24113275 atagtttcataagctgctt 24113257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 33287234 - 33287116
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  33287234 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcccatatgcttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatc 33287135  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  33287134 atagtttcataagctgctt 33287116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Original strand, 39218775 - 39218893
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  39218775 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatggtttatc 39218874  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  39218875 atagcttcataagctgctt 39218893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 475 - 595
Target Start/End: Original strand, 4035843 - 4035963
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  4035843 taaggccccgtttggattggtttatttttagcttatatgggcttatctactcccataagttttattaaaggtgtttgggtaaacaaataaaaatagctta 4035942  T
Q  575 tcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  4035943 tcatagtttcataagctgctt 4035963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 475 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 6144484 - 6144364
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||  ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6144484 taaggccccgtttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccatatgcctttttaacagtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 6144385  T
Q  575 tcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  6144384 tcatagtttcataagctgctt 6144364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 475 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 34999107 - 34998987
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34999107 taaggtcccgtatggattggcttattttgagcttatacgggtttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 34999008  T
Q  575 tcatagtttcataagctgctt 595  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  34999007 tcttagtttcataagctgctt 34998987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 22260839 - 22260721
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  22260839 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagtctttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttatc 22260740  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
     ||||||||||||||||||    
T  22260739 ctagtttcataagctgctt 22260721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 485 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 44805145 - 44805035
Alignment:
Q  485 tttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 584  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44805145 tttgaattggcttattttgagcttatgtaggtttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttagataaataaataaaaatagcttatcatagtttc 44805046  T
Q  585 ataagctgctt 595  Q
    |||||||||||    
T  44805045 ataagctgctt 44805035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 482 - 595
Target Start/End: Original strand, 41575516 - 41575629
Alignment:
Q  482 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41575516 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtagacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaattgcttatcatagt 41575615  T
Q  582 ttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||    
T  41575616 ttcataagctgctt 41575629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 480 - 595
Target Start/End: Original strand, 7791412 - 7791527
Alignment:
Q  480 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcata 579  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7791412 ccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcata 7791511  T
Q  580 gtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||    
T  7791512 gtttcataagctgctt 7791527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 484 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 34679659 - 34679548
Alignment:
Q  484 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34679659 gtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgaataaataaataaaaatagtttatcatagttt 34679560  T
Q  584 cataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||    
T  34679559 cataagctgctt 34679548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Original strand, 7774762 - 7774880
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  7774762 aggcctcgtttagattggcttattttgagcttatgcgggtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatc 7774861  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  7774862 atagtttcataagctgctt 7774880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 482 - 595
Target Start/End: Original strand, 144397 - 144510
Alignment:
Q  482 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 581  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  144397 ccgtttggattgacttattttgagcatatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaagtaaataaaaatagtttatcatagt 144496  T
Q  582 ttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||    
T  144497 ttcataagctgctt 144510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 478 - 595
Target Start/End: Original strand, 5320563 - 5320680
Alignment:
Q  478 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatca 577  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  5320563 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaagttgttttggtaaataaataaaaataatttatca 5320662  T
Q  578 tagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||| |||||    
T  5320663 tagtttcataagttgctt 5320680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 481 - 595
Target Start/End: Original strand, 28639280 - 28639398
Alignment:
Q  481 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctata----agctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  28639280 cccgtttgaattggcttattttaagcttatgtgagcttatctactcctatatacaagcttttttaaaggtgttttggtaaataaataaaaatagtttatc 28639379  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  28639380 atagtttcataagctgctt 28639398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 483 - 595
Target Start/End: Original strand, 42571598 - 42571709
Alignment:
Q  483 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 582  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42571598 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaat-aataaaaatagcttatcatagtt 42571696  T
Q  583 tcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||    
T  42571697 tcataagctgctt 42571709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 473 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 38167368 - 38167246
Alignment:
Q  473 actaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagct 572  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  38167368 actatggccctgtttggattggcctattttgagtttatgtgggcttatctattcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaactagtt 38167269  T
Q  573 tatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  38167268 tatcatagtttcataagctgctt 38167246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Original strand, 7811993 - 7812111
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| | || ||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  7811993 aggccccgttttgattggcttattttgagtttatgtgagtttatctacttccattagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatc 7812092  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  7812093 atagtttcataagctgctt 7812111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 478 - 595
Target Start/End: Original strand, 33278399 - 33278516
Alignment:
Q  478 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatca 577  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||   |||||   |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  33278399 ggccccgtttggattggcttattttgagtttatatggacttatctactttcataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatca 33278498  T
Q  578 tagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||    
T  33278499 tagtttcataagctgctt 33278516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 475 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 2322223 - 2322103
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||  |||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  2322223 taaggccccgtttggattggcttattcggagcttatatggatttatctactaacataagcttttttaaaggtgtttgggtaaatcaataaaaacagctta 2322124  T
Q  575 tcatagtttcataagctgctt 595  Q
    ||| | |||||||||||||||    
T  2322123 tcacaatttcataagctgctt 2322103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 476 - 588
Target Start/End: Original strand, 36491154 - 36491266
Alignment:
Q  476 aaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttat 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  |||||   |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  36491154 aaggccccatttggattggcttattttaagcttatgtgggattatctaatcgcataagtctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttat 36491253  T
Q  576 catagtttcataa 588  Q
    |||||||||||||    
T  36491254 catagtttcataa 36491266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 484 - 575
Target Start/End: Original strand, 5005171 - 5005262
Alignment:
Q  484 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttat 575  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  5005171 gtttggattggcttatcttaagcttatgtgggcttatctacttccataagcttttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttat 5005262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 482 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 66384 - 66271
Alignment:
Q  482 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 581  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||| ||| |   ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  66384 ccgtttagattggcttattttgagtttctgtaggcttatctattcccatatgtctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaataacttataatagt 66285  T
Q  582 ttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||    
T  66284 ttcataagctgctt 66271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 481 - 566
Target Start/End: Original strand, 9806875 - 9806960
Alignment:
Q  481 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaa 566  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||| ||  ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  9806875 cccgtttggattgacttattttgagtttatatgtgcttatctactcccatatgcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaa 9806960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 481 - 594
Target Start/End: Original strand, 39220258 - 39220371
Alignment:
Q  481 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatag 580  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||  |||||||||  | ||| |   ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||   |     
T  39220258 cccgtttgaattgacttattttgagcttatatgaacttatctacatccatatgtctttttaaaggtgtttgagtaaatcaataaaaatagcttattccaa 39220357  T
Q  581 tttcataagctgct 594  Q
    ||||||||||||||    
T  39220358 tttcataagctgct 39220371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 558 - 595
Target Start/End: Original strand, 9807339 - 9807376
Alignment:
Q  558 taaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9807339 taaataaaaatagcttatcatagcttcataagctgctt 9807376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 103; Significance: 6e-51; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 6086808 - 6086690
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6086808 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 6086709  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6086708 atagtttcataagctgctt 6086690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 473 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 26704552 - 26704430
Alignment:
Q  473 actaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagct 572  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26704552 actagggccccgtttggattggtttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 26704453  T
Q  573 tatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  26704452 tatcatagtttcataagctgctt 26704430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 477 - 594
Target Start/End: Original strand, 2837543 - 2837660
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2837543 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 2837642  T
Q  577 atagtttcataagctgct 594  Q
    |||||||||| |||||||    
T  2837643 atagtttcatgagctgct 2837660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 478 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 26947084 - 26946967
Alignment:
Q  478 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatca 577  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26947084 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 26946985  T
Q  578 tagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26946984 tagtttcataagctgctt 26946967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 478 - 595
Target Start/End: Original strand, 30691850 - 30691967
Alignment:
Q  478 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatca 577  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30691850 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 30691949  T
Q  578 tagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30691950 tagtttcataagctgctt 30691967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Original strand, 52834 - 52952
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52834 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactaacataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 52933  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  52934 atagtttcataagctgctt 52952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 475 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 3347734 - 3347614
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  3347734 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaacagctta 3347635  T
Q  575 tcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  3347634 tcatagtttcataagctgctt 3347614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 480 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 3955972 - 3955857
Alignment:
Q  480 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcata 579  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3955972 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 3955873  T
Q  580 gtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||| ||||||    
T  3955872 gtttcataaactgctt 3955857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Original strand, 35198282 - 35198399
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35198282 aggccccgtttgaattggcttattttgaacttatgtgggcttatctacttccataagct-ttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 35198380  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  35198381 atagtttcataagctgctt 35198399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 481 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 17261278 - 17261164
Alignment:
Q  481 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatag 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  17261278 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttctaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttataatat 17261179  T
Q  581 tttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||    
T  17261178 tttcataagctgctt 17261164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 475 - 595
Target Start/End: Original strand, 18613534 - 18613654
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18613534 taaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgcggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagctta 18613633  T
Q  575 tcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  18613634 tcatagttccataagctgctt 18613654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Original strand, 11167238 - 11167356
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |   ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11167238 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgtgcttatttattttcataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 11167337  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  11167338 atagtttcataagctgctt 11167356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Original strand, 21893453 - 21893571
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  21893453 aggccccgtttggatcgatttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaatatataaaaatagcttatc 21893552  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  21893553 atagtttcataagctgctt 21893571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 482 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 34887496 - 34887386
Alignment:
Q  482 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 581  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34887496 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctcctcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 34887397  T
Q  582 ttcataagctg 592  Q
    |||||||||||    
T  34887396 ttcataagctg 34887386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 478 - 595
Target Start/End: Original strand, 9459562 - 9459679
Alignment:
Q  478 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatca 577  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | | ||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9459562 ggccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgagcttatctatttccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatca 9459661  T
Q  578 tagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9459662 tagtttcataagctgctt 9459679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 16307217 - 16307099
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  16307217 aggccccgtttggattgacttattttgagcttatgttggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttggataaataaataaaaacagcttatc 16307118  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16307117 atagtttcataagctgctt 16307099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 472 - 595
Target Start/End: Original strand, 20726784 - 20726903
Alignment:
Q  472 gactaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagc 571  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||    |||||||||||| |    
T  20726784 gactatggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggg----taaataaaaataac 20726879  T
Q  572 ttatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  20726880 ttatcatagtttcataagctgctt 20726903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 28199714 - 28199598
Alignment:
Q  481 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatc---tactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatca 577  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28199714 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatcatctactcc-ataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 28199616  T
Q  578 tagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||| |||||||    
T  28199615 tagtttcatatgctgctt 28199598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 489 - 595
Target Start/End: Original strand, 1153603 - 1153709
Alignment:
Q  489 gattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataa 588  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  1153603 gattggcttattttaagcttatgttggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagattatcatagtttcataa 1153702  T
Q  589 gctgctt 595  Q
    |||||||    
T  1153703 gctgctt 1153709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 483 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 30699132 - 30699020
Alignment:
Q  483 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 582  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||| || | |||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30699132 cgtttggattgacttattatgagtttatgtgagcttatttatttctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 30699033  T
Q  583 tcataagctgctt 595  Q
    | || ||||||||    
T  30699032 ttattagctgctt 30699020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 476 - 557
Target Start/End: Original strand, 33463698 - 33463779
Alignment:
Q  476 aaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaa 557  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  33463698 aaggtcccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaa 33463779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 552 - 595
Target Start/End: Original strand, 33464402 - 33464445
Alignment:
Q  552 ggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33464402 ggtaaataagtaaaaatagtttatcatagtttcataagctgctt 33464445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 103; Significance: 6e-51; HSPs: 57)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 473 - 595
Target Start/End: Original strand, 14987784 - 14987906
Alignment:
Q  473 actaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagct 572  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14987784 actaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatatactcccataagccattttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 14987883  T
Q  573 tatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  14987884 tatcatagtttcataagctgctt 14987906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 473 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 23776660 - 23776538
Alignment:
Q  473 actaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagct 572  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23776660 actagggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 23776561  T
Q  573 tatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23776560 tatcatagtttcataagctgctt 23776538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 475 - 595
Target Start/End: Original strand, 20877041 - 20877161
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  20877041 taaggtcccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 20877140  T
Q  575 tcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20877141 tcatagtttcataagctgctt 20877161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 480 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 1756958 - 1756843
Alignment:
Q  480 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcata 579  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1756958 ccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcata 1756859  T
Q  580 gtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||    
T  1756858 gtttcataagctgctt 1756843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 476 - 595
Target Start/End: Original strand, 54189540 - 54189659
Alignment:
Q  476 aaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttat 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54189540 aaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 54189639  T
Q  576 catagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  54189640 catagtttcataagctgctt 54189659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 480 - 595
Target Start/End: Original strand, 54412627 - 54412742
Alignment:
Q  480 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcata 579  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  54412627 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcata 54412726  T
Q  580 gtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||    
T  54412727 gtttcataagctgctt 54412742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 473 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 30423765 - 30423643
Alignment:
Q  473 actaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagct 572  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30423765 actaaggtcccgtttggattggcttattttgagtttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 30423666  T
Q  573 tatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  30423665 tatcatagtttcataagctgctt 30423643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 478 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 19913826 - 19913709
Alignment:
Q  478 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatca 577  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  19913826 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaattaaaacagcttatca 19913727  T
Q  578 tagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19913726 tagtttcataagctgctt 19913709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 475 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 8932377 - 8932257
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8932377 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgcgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagctta 8932278  T
Q  575 tcatagtttcataagctgctt 595  Q
     | ||||||||||||||||||    
T  8932277 acgtagtttcataagctgctt 8932257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 475 - 595
Target Start/End: Original strand, 50353795 - 50353915
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50353795 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttctgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 50353894  T
Q  575 tcatagtttcataagctgctt 595  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  50353895 tgatagtttcataagctgctt 50353915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 477 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 6611557 - 6611442
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6611557 aggccccgtttggattggtttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 6611458  T
Q  577 atagtttcataagctg 592  Q
    ||||||||||||||||    
T  6611457 atagtttcataagctg 6611442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 15241225 - 15241107
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  15241225 aggcctcgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatc 15241126  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15241125 atagtttcataagctgctt 15241107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 482 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 19165164 - 19165050
Alignment:
Q  482 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataag-ctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatag 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19165164 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 19165065  T
Q  581 tttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||    
T  19165064 tttcataagctgctt 19165050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 27488845 - 27488727
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27488845 aggccccgtttggattggcttaagttgagcttatctgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 27488746  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27488745 atagtttcataagctgctt 27488727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 50055298 - 50055180
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  50055298 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaatgaaaatagcttatc 50055199  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    || ||||||||||||||||    
T  50055198 atggtttcataagctgctt 50055180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 53717661 - 53717543
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53717661 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 53717562  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  53717561 atagtttcataagctgctt 53717543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 482 - 595
Target Start/End: Original strand, 16700782 - 16700895
Alignment:
Q  482 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16700782 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagt 16700881  T
Q  582 ttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||    
T  16700882 ttcataagctgctt 16700895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 478 - 595
Target Start/End: Original strand, 38055154 - 38055271
Alignment:
Q  478 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatca 577  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  38055154 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatca 38055253  T
Q  578 tagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||    
T  38055254 tagtttcataagctgctt 38055271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 479 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 37968952 - 37968836
Alignment:
Q  479 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcat 578  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37968952 gccccatttagattggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 37968853  T
Q  579 agtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||    
T  37968852 agtttcataagctgctt 37968836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 479 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 40428915 - 40428799
Alignment:
Q  479 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcat 578  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40428915 gccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 40428816  T
Q  579 agtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||    
T  40428815 agtttcataagctgctt 40428799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 476 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 44785115 - 44784996
Alignment:
Q  476 aaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttat 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  44785115 aaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttgtaaaagtgtttgggtaaacaaataaaaatagcttat 44785016  T
Q  576 catagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  44785015 catagtttcataagttgctt 44784996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 2481605 - 2481487
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  2481605 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatc 2481506  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  2481505 atagtttcataagctgctt 2481487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 28032909 - 28032791
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28032909 aggccctgtttagattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 28032810  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  28032809 atagtatcataagctgctt 28032791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 473 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 45424735 - 45424613
Alignment:
Q  473 actaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagct 572  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  45424735 actaaggccccgtttggattgacttattttgagcttatgttggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtt 45424636  T
Q  573 tatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  45424635 tatcatagtttcataagctgctt 45424613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Original strand, 48909842 - 48909960
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  48909842 aggccctgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatc 48909941  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  48909942 atagtttcataagctgctt 48909960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Original strand, 50053439 - 50053557
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  50053439 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatatggacttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggcaaataaataaaaatagcttatc 50053538  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  50053539 atagtttcataagctgctt 50053557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 479 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 11639773 - 11639657
Alignment:
Q  479 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcat 578  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11639773 gccccgtttggattggtttattttgaacttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 11639674  T
Q  579 agtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||    
T  11639673 agtttcataagctgctt 11639657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 478 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 6688817 - 6688711
Alignment:
Q  478 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatca 577  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6688817 ggccccgtttggattgacttattttgagtttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 6688718  T
Q  578 tagtttc 584  Q
    |||||||    
T  6688717 tagtttc 6688711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Original strand, 15669179 - 15669297
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||   |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  15669179 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctaatcacataagactttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatc 15669278  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15669279 atagtttcataagctgctt 15669297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 481 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 35490966 - 35490852
Alignment:
Q  481 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatag 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  35490966 cccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatccactctcataagcttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 35490867  T
Q  581 tttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||| |||||    
T  35490866 tttcataagttgctt 35490852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Original strand, 37464717 - 37464835
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  37464717 aggccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatc 37464816  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  37464817 atagtttcataagctgctt 37464835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 481 - 595
Target Start/End: Original strand, 52139203 - 52139317
Alignment:
Q  481 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatag 580  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52139203 cccgtttggattggcttattttgaacttatgtgggtttatctatttctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 52139302  T
Q  581 tttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||    
T  52139303 tttcataagctgctt 52139317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 482 - 595
Target Start/End: Original strand, 53875658 - 53875771
Alignment:
Q  482 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 581  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53875658 ccgtttggattggcttattttaagcttatgtgggcttatatactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 53875757  T
Q  582 ttcataagctgctt 595  Q
    || |||||||||||    
T  53875758 tttataagctgctt 53875771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 475 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 23704408 - 23704288
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  23704408 taaggccctgtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactcacataagccttttgaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 23704309  T
Q  575 tcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23704308 tcatagtttcataagctgctt 23704288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 474 - 595
Target Start/End: Original strand, 53353048 - 53353173
Alignment:
Q  474 ctaaggccccgtttggattggcttattttgagctta----tgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaata 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||| ||| |   |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53353048 ctaaggccccgtttggattggcttattttgagcttaattatatgggcttatctactcccatatgtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaata 53353147  T
Q  570 gcttatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  53353148 gcttatcatagtttcataagctgctt 53353173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 484 - 595
Target Start/End: Original strand, 28360433 - 28360544
Alignment:
Q  484 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 583  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28360433 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttttctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 28360532  T
Q  584 cataagctgctt 595  Q
     |||||||||||    
T  28360533 tataagctgctt 28360544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 481 - 595
Target Start/End: Original strand, 1617084 - 1617198
Alignment:
Q  481 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatag 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1617084 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctattctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatag 1617183  T
Q  581 tttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||    
T  1617184 tttcataagctgctt 1617198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 481 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 8591285 - 8591171
Alignment:
Q  481 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatag 580  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8591285 cccgtttgacttggcttattttgagtttatgtgggtttatctacttctataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 8591186  T
Q  581 tttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||    
T  8591185 tttcataagctgctt 8591171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 43290157 - 43290039
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  43290157 aggctccgtttggattggcttattttgagcttttatgtgcttatctactcacataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatc 43290058  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  43290057 atagtttcataagctgctt 43290039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 482 - 595
Target Start/End: Original strand, 30171581 - 30171694
Alignment:
Q  482 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | | ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30171581 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatcttattccataagcttttttaaaggtgtttggataaataaatgaaaatagcttatcatagt 30171680  T
Q  582 ttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||    
T  30171681 ttcataagctgctt 30171694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 485 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 27583821 - 27583711
Alignment:
Q  485 tttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 584  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  27583821 tttggattgacttattttgagcttatgtaggcttatctactcccataagcttttttaaagatgtttggataaataaataaaaataacttatcatagttgc 27583722  T
Q  585 ataagctgctt 595  Q
    |||||||||||    
T  27583721 ataagctgctt 27583711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 481 - 595
Target Start/End: Original strand, 31969681 - 31969795
Alignment:
Q  481 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatag 580  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31969681 cccgtttgaattgatttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 31969780  T
Q  581 tttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||    
T  31969781 tttcataagctgctt 31969795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 490 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 38071504 - 38071399
Alignment:
Q  490 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 589  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38071504 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataatcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 38071405  T
Q  590 ctgctt 595  Q
    ||||||    
T  38071404 ctgctt 38071399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 479 - 595
Target Start/End: Original strand, 47632032 - 47632149
Alignment:
Q  479 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaa-ggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatca 577  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||| |  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  47632032 gccccgtttggattggcttattttgagtttatgtggacttatctactctcataaacctttttaaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttctca 47632131  T
Q  578 tagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||    
T  47632132 tagtttcataagctgctt 47632149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 475 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 23265956 - 23265865
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaa 566  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23265956 taaggtcccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcggataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaa 23265865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 480 - 595
Target Start/End: Original strand, 44375844 - 44375959
Alignment:
Q  480 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcata 579  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||  |  ||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44375844 ccccgtttggattggcttattttaagcttatgtgggcttatctattccaatagccatttttataggtgttcgggtaaataaataaaaatagtttatcata 44375943  T
Q  580 gtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||| ||||||    
T  44375944 gtttcataaactgctt 44375959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 44379384 - 44379266
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| | |||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  44379384 aggccctgtttggattgacttattttgagtttatataggcttatctacttccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 44379285  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  44379284 atagtttcataagttgctt 44379266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 477 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 55345022 - 55344920
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  55345022 aggccccgtttgaattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactctcataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 55344923  T
Q  577 ata 579  Q
    |||    
T  55344922 ata 55344920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 27536297 - 27536183
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    |||| ||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  27536297 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatacgggctta----ctcccataagccttcttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 27536202  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  27536201 atagtttcataaactgctt 27536183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 490 - 595
Target Start/End: Original strand, 33703850 - 33703955
Alignment:
Q  490 attggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 589  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  33703850 attgacttattttgagcttatgtgagtttatctactcggataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacaacttatcatagtttcataag 33703949  T
Q  590 ctgctt 595  Q
    ||||||    
T  33703950 ctgctt 33703955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 485 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 40680227 - 40680117
Alignment:
Q  485 tttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 584  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||| | |||||   |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40680227 tttggattgacttattttgaatttatgtgagcttatctacttccataagtctttttaaaggtatttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttc 40680128  T
Q  585 ataagctgctt 595  Q
    |||||||||||    
T  40680127 ataagctgctt 40680117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Original strand, 16703821 - 16703935
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||| ||||||||||| ||||    |||||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||| |||||   ||||||||||||||||| |||||    
T  16703821 aggcctcgtttggattgactta----gagcttatgtgaacttatctacttccataagcttttttaaagttgtttgaataaataaataaaaatagtttatc 16703916  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16703917 atagtttcataagctgctt 16703935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 473 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 44548343 - 44548238
Alignment:
Q  473 actaaggccccgtttggattggc-ttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagc 571  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||  |||||||||||||| | ||||| |||||||| | |    
T  44548343 actaaggccccgtttgaattggccttatttggagcttatgtgggcttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttggataaatcaataaaaacatc 44548244  T
Q  572 ttatca 577  Q
    ||||||    
T  44548243 ttatca 44548238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 477 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 9596031 - 9595973
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctg 536  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  9596031 aggccccgtttggattggcttattt-gagtttatgtgggcttatctactctcataagctg 9595973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 558 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 23269162 - 23269125
Alignment:
Q  558 taaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23269162 taaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 23269125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 554 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 51780838 - 51780797
Alignment:
Q  554 taaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51780838 taaatcaataaaaatagcttatcataatttcataagctgctt 51780797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 475 - 595
Target Start/End: Original strand, 17493327 - 17493447
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    |||||||  ||| |||||| ||||||||||  |||| ||  | |||||||||||||||||  |||||| || ||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  17493327 taaggccatgttaggattgacttattttgaatttatatgaacatatctactcctataagcatttttaagggcgtttgagtaaatcaataaaaatatctta 17493426  T
Q  575 tcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |  || ||| |||||||||||    
T  17493427 ttctaattttataagctgctt 17493447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 103; Significance: 6e-51; HSPs: 37)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 37698338 - 37698220
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37698338 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 37698239  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  37698238 atagtttcataagctgctt 37698220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 474 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 42308103 - 42307982
Alignment:
Q  474 ctaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctt 573  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  42308103 ctaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggcgtttgggtaaataaataaaaatagctt 42308004  T
Q  574 atcatagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  42308003 atcatagtttcataagctgctt 42307982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 480 - 595
Target Start/End: Original strand, 38856089 - 38856204
Alignment:
Q  480 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcata 579  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38856089 ccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 38856188  T
Q  580 gtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||    
T  38856189 gtttcataagctgctt 38856204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 478 - 595
Target Start/End: Original strand, 25999382 - 25999499
Alignment:
Q  478 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatca 577  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25999382 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 25999481  T
Q  578 tagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25999482 tagtttcataagctgctt 25999499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 54534521 - 54534404
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54534521 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 54534422  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    || |||| |||||||||||    
T  54534421 atggttt-ataagctgctt 54534404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 475 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 15520339 - 15520219
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15520339 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataactta 15520240  T
Q  575 tcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||| ||||||||| ||||||    
T  15520239 tcatcgtttcataaactgctt 15520219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 473 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 20842547 - 20842425
Alignment:
Q  473 actaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagct 572  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  20842547 actaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacaact 20842448  T
Q  573 tatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20842447 tatcatagtttcataagctgctt 20842425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 22175185 - 22175067
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  22175185 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatc 22175086  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22175085 atagtttcataagctgctt 22175067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Original strand, 50528922 - 50529040
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  50528922 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatc 50529021  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  50529022 atagtttcataagctgctt 50529040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 484 - 595
Target Start/End: Original strand, 21581042 - 21581153
Alignment:
Q  484 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 583  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21581042 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagttt 21581141  T
Q  584 cataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||    
T  21581142 cataagctgctt 21581153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 477 - 592
Target Start/End: Original strand, 29445481 - 29445596
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29445481 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 29445580  T
Q  577 atagtttcataagctg 592  Q
    ||||||||||||||||    
T  29445581 atagtttcataagctg 29445596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 473 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 25494484 - 25494362
Alignment:
Q  473 actaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagct 572  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25494484 actatggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctattcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 25494385  T
Q  573 tatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  25494384 tatcatagtttcataagctgctt 25494362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Original strand, 38933939 - 38934056
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  38933939 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgg-cttatctactcccataagccttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatc 38934037  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  38934038 atagtttcataagctgctt 38934056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 54870369 - 54870251
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54870369 aggccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 54870270  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    || ||||||||||||||||    
T  54870269 atcgtttcataagctgctt 54870251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 475 - 595
Target Start/End: Original strand, 8042598 - 8042718
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  8042598 taaggccccgtttggatgggcttattttgagcttatgtgagcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagttta 8042697  T
Q  575 tcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  8042698 tcatagtttcataagctgctt 8042718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 475 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 12117855 - 12117735
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
T  12117855 taaggccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagttta 12117756  T
Q  575 tcatagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  12117755 tcatagtttcataagttgctt 12117735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 471 - 595
Target Start/End: Original strand, 15520623 - 15520747
Alignment:
Q  471 ggactaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatag 570  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  15520623 ggacttaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacag 15520722  T
Q  571 cttatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  15520723 cttatcatagtttcataagctgctt 15520747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 479 - 595
Target Start/End: Original strand, 20699144 - 20699260
Alignment:
Q  479 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcat 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20699144 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcat 20699243  T
Q  579 agtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||    
T  20699244 agtttcataagctgctt 20699260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 475 - 595
Target Start/End: Original strand, 32244111 - 32244231
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  32244111 taaggtcccgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 32244210  T
Q  575 tcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  32244211 tcatagtttcataagctgctt 32244231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 472 - 595
Target Start/End: Original strand, 35643205 - 35643328
Alignment:
Q  472 gactaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagc 571  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  35643205 gactaaagccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgaacttatctacttccataagcctttttaaaggtgcttgggtaaataaataaaaatagc 35643304  T
Q  572 ttatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  35643305 ttatcatagtttcataagctgctt 35643328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 484 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 50529961 - 50529850
Alignment:
Q  484 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 583  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50529961 gtttggattgacttattttgagtttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 50529862  T
Q  584 cataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||    
T  50529861 cataagctgctt 50529850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 46452357 - 46452239
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  46452357 aggccccgtttggattggcttaagttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 46452258  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  46452257 atagtttcataagttgctt 46452239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 478 - 595
Target Start/End: Original strand, 26122808 - 26122925
Alignment:
Q  478 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatca 577  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  26122808 ggcccagtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctattcccatgagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatca 26122907  T
Q  578 tagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26122908 tagtttcataagctgctt 26122925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 472 - 595
Target Start/End: Original strand, 32359247 - 32359370
Alignment:
Q  472 gactaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagc 571  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | | ||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||     
T  32359247 gactaaggtcccgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctatttccataagcttttataaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagt 32359346  T
Q  572 ttatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  32359347 ttatcatagtttcataagctgctt 32359370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 472 - 595
Target Start/End: Original strand, 35226435 - 35226558
Alignment:
Q  472 gactaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagc 571  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  35226435 gacttaggccctgtttggattggcctattttgagcttatgtgggcttatctatttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaatcagc 35226534  T
Q  572 ttatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  35226535 ttatcatagtttcataagctgctt 35226558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Original strand, 34700334 - 34700452
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  34700334 aggccccgtttagattggtttattttgagcttatgtgggtttatttacttccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatc 34700433  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  34700434 atagtttcataagctgctt 34700452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 484 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 44609521 - 44609410
Alignment:
Q  484 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44609521 gtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctacttgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagttt 44609422  T
Q  584 cataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||    
T  44609421 cataagctgctt 44609410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 475 - 595
Target Start/End: Original strand, 49128040 - 49128160
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  49128040 taaggccccgtttggattgacttattttaaacttatgtgggcttatctactcctataagtctttttaaagatgtttgggtaaatcaataaaaataactta 49128139  T
Q  575 tcatagtttcataagctgctt 595  Q
    || || |||||||||||||||    
T  49128140 tcgtaatttcataagctgctt 49128160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 488 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 42105155 - 42105048
Alignment:
Q  488 ggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcata 587  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42105155 ggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaacatttttaaaggtgtttggataaaaaaataaaaatagtttatcatagtttcata 42105056  T
Q  588 agctgctt 595  Q
    ||||||||    
T  42105055 agctgctt 42105048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 24835894 - 24835776
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| | | |||||| ||||| ||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||     
T  24835894 aggccccgtttggattgatttattttgagcttatatagacttatcaactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatt 24835795  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24835794 atagtttcataagctgctt 24835776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 478 - 595
Target Start/End: Original strand, 2895179 - 2895296
Alignment:
Q  478 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatca 577  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||    
T  2895179 ggccccatttgaattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaaaaaattatca 2895278  T
Q  578 tagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2895279 tagtttcataagctgctt 2895296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 478 - 595
Target Start/End: Original strand, 44688760 - 44688872
Alignment:
Q  478 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatca 577  Q
    ||||||||||| ||||||||||     ||||||||||| ||||||||| | ||||||  |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  44688760 ggccccgtttgaattggcttat-----gcttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttatca 44688854  T
Q  578 tagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||    
T  44688855 tagtttcataagctgctt 44688872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 484 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 48925189 - 48925083
Alignment:
Q  484 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 583  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||| | ||||||| ||||||| ||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48925189 gtttggattggcttatttagagtttatatgggtttatctacttccataagcttttttaaaagt--ttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 48925092  T
Q  584 cataagctg 592  Q
    |||||||||    
T  48925091 cataagctg 48925083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 537 - 594
Target Start/End: Original strand, 16354399 - 16354456
Alignment:
Q  537 ttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgct 594  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16354399 ttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagtttcataagctgct 16354456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Original strand, 53028218 - 53028328
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||         ||||||||||||||||||||||||||    
T  53028218 aggccctgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagtcttttta--------gaggtaaataaataaaaatagcttatc 53028309  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    ||| |||||||| ||||||    
T  53028310 atattttcataaactgctt 53028328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 473 - 526
Target Start/End: Original strand, 24366081 - 24366134
Alignment:
Q  473 actaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactc 526  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24366081 actaaggccccttttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactc 24366134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 507 - 595
Target Start/End: Original strand, 12915930 - 12916017
Alignment:
Q  507 ttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||| ||||||   || || |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  12915930 ttatgtgggcttatttactccataaatct-ttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcataatttcataaactgctt 12916017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 100; Significance: 4e-49; HSPs: 42)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 476 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 30181224 - 30181105
Alignment:
Q  476 aaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttat 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30181224 aaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 30181125  T
Q  576 catagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  30181124 catagtttcataagctgctt 30181105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 33846723 - 33846605
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33846723 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 33846624  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  33846623 atagtttcataaactgctt 33846605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 475 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 42965197 - 42965077
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42965197 taaggccccttttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 42965098  T
Q  575 tcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  42965097 tcatagtttcataagctgctt 42965077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 480 - 595
Target Start/End: Original strand, 7164184 - 7164299
Alignment:
Q  480 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcata 579  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7164184 ccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 7164283  T
Q  580 gtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||    
T  7164284 gtttcataagctgctt 7164299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 476 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 12101378 - 12101259
Alignment:
Q  476 aaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttat 575  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12101378 aaggccccatttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 12101279  T
Q  576 catagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12101278 catagtttcataagctgctt 12101259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 478 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 33359288 - 33359171
Alignment:
Q  478 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatca 577  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33359288 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 33359189  T
Q  578 tagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||    
T  33359188 tagtttcataagctgctt 33359171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 475 - 595
Target Start/End: Original strand, 42204149 - 42204270
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataag-ctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctt 573  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  42204149 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagtcttttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagctt 42204248  T
Q  574 atcatagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  42204249 atcatagtttcataagctgctt 42204270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 475 - 595
Target Start/End: Original strand, 4347268 - 4347388
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4347268 taaggccccgtttggattgacttattttaagcttatgtgggcttatctactcccataaacttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 4347367  T
Q  575 tcatagtttcataagctgctt 595  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  4347368 ccatagtttcataagctgctt 4347388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 479 - 595
Target Start/End: Original strand, 20346487 - 20346603
Alignment:
Q  479 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcat 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  20346487 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcat 20346586  T
Q  579 agtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||    
T  20346587 agtttcataagctgctt 20346603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 475 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 43068174 - 43068058
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43068174 taaggccccgtttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 43068075  T
Q  575 tcatagtttcataagct 591  Q
    |||||||||||||||||    
T  43068074 tcatagtttcataagct 43068058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 472 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 36891033 - 36890911
Alignment:
Q  472 gactaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagc 571  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36891033 gactaaggccccgtttggattgacttattt-gagcttatgtaggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 36890935  T
Q  572 ttatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  36890934 ttatcatagtttcataagttgctt 36890911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 24792531 - 24792413
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24792531 aggccccgtttggattggcttaagttgagcttatctgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 24792432  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24792431 atagtttcataagctgctt 24792413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 478 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 22649892 - 22649775
Alignment:
Q  478 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatca 577  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  22649892 ggccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 22649793  T
Q  578 tagtttcataagctgctt 595  Q
    || |||||||||||||||    
T  22649792 taatttcataagctgctt 22649775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 483 - 595
Target Start/End: Original strand, 1803029 - 1803141
Alignment:
Q  483 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 582  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1803029 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 1803128  T
Q  583 tcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||    
T  1803129 tcataagctgctt 1803141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 475 - 595
Target Start/End: Original strand, 3511318 - 3511438
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  3511318 taaggtcccgtttggattgtcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaatagataaaaatagctta 3511417  T
Q  575 tcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  3511418 tcatagtttcataagctgctt 3511438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 485 - 592
Target Start/End: Original strand, 43156718 - 43156825
Alignment:
Q  485 tttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43156718 tttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 43156817  T
Q  585 ataagctg 592  Q
    ||||||||    
T  43156818 ataagctg 43156825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 473 - 595
Target Start/End: Original strand, 6394744 - 6394866
Alignment:
Q  473 actaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagct 572  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  6394744 actaaggccccgtttagattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtt 6394843  T
Q  573 tatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  6394844 tatcatggtttcataagctgctt 6394866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Original strand, 32041539 - 32041657
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||   ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32041539 aggccccgtttggattggcttattttgtgcttatgtgggcttatctacttccataagtctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 32041638  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  32041639 atagtttcataagctgctt 32041657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 482 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 4477515 - 4477402
Alignment:
Q  482 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4477515 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtcttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatggt 4477416  T
Q  582 ttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||    
T  4477415 ttcataagctgctt 4477402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 475 - 595
Target Start/End: Original strand, 15655907 - 15656027
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  |||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  15655907 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctgctcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagctta 15656006  T
Q  575 tcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15656007 tcatagtttcataagctgctt 15656027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 475 - 588
Target Start/End: Original strand, 19828265 - 19828378
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  19828265 taaggccccgtttgaattggcttattttgagtttatgttggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggctaaataaataaaaatagctta 19828364  T
Q  575 tcatagtttcataa 588  Q
    ||||||||||||||    
T  19828365 tcatagtttcataa 19828378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 475 - 595
Target Start/End: Original strand, 933280 - 933400
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  933280 taaggccctgtttgaattggcttattttgagctcatgtggacttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 933379  T
Q  575 tcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  933380 tcatagtttcataagctgctt 933400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 475 - 595
Target Start/End: Original strand, 5280855 - 5280975
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  5280855 taaggtcccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctattcacataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 5280954  T
Q  575 tcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5280955 tcatagtttcataagctgctt 5280975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 481 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 46891535 - 46891420
Alignment:
Q  481 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctat-aagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcata 579  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  46891535 cccgtttggattggcttattttgagcttatataggcttatctactcctataaaccttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttgtcata 46891436  T
Q  580 gtttcataagctgctt 595  Q
    |||| |||||||||||    
T  46891435 gttttataagctgctt 46891420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 473 - 575
Target Start/End: Original strand, 37704973 - 37705075
Alignment:
Q  473 actaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagct 572  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37704973 actaaggccccgtttgggttgacttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 37705072  T
Q  573 tat 575  Q
    |||    
T  37705073 tat 37705075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 478 - 595
Target Start/End: Original strand, 25748485 - 25748602
Alignment:
Q  478 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatca 577  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| |  | ||||||||||| |||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25748485 ggccccgtttggattggcttaagttgagcttatattagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 25748584  T
Q  578 tagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25748585 tagtttcataagctgctt 25748602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 483 - 592
Target Start/End: Original strand, 38866547 - 38866656
Alignment:
Q  483 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 582  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38866547 cgtttggatcgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataattttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtt 38866646  T
Q  583 tcataagctg 592  Q
    ||||||||||    
T  38866647 tcataagctg 38866656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 479 - 595
Target Start/End: Original strand, 8630665 - 8630781
Alignment:
Q  479 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcat 578  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  8630665 gccccgtttggatttgtttattttgaggttatgtgggttgatctactcccataagcctttttaaaggtgttcgggtaaataaataaaaatagtttatcat 8630764  T
Q  579 agtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||    
T  8630765 agtttcataagctgctt 8630781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 480 - 595
Target Start/End: Original strand, 17753600 - 17753715
Alignment:
Q  480 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcata 579  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||  |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17753600 ccccgtttggattagcttattttgagcttatacaagcttatctactcctataagccttttagaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttaacata 17753699  T
Q  580 gtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||    
T  17753700 gtttcataagctgctt 17753715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 473 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 43021779 - 43021657
Alignment:
Q  473 actaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagct 572  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| | |||||   |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  43021779 actaaggccccatttggattggcttattttaagtttatgtggacttatctacttcaataagtctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaataact 43021680  T
Q  573 tatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  43021679 tattatagtttcataagctgctt 43021657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 478 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 12097788 - 12097675
Alignment:
Q  478 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatca 577  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  12097788 ggccccatttggattggcttaagttgagcttatatgagcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatca 12097689  T
Q  578 tagtttcataagct 591  Q
    ||||||||||||||    
T  12097688 tagtttcataagct 12097675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 475 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 37006012 - 37005892
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||    
T  37006012 taaggctccgtttggattggcttattttaagcttatgtgagtttatctacttctataagtttttttaaaggcgtttgggtaaatcagtaaaaatagctta 37005913  T
Q  575 tcatagtttcataagctgctt 595  Q
    || || |||||||||||||||    
T  37005912 tcgtaatttcataagctgctt 37005892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 480 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 46134500 - 46134388
Alignment:
Q  480 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcata 579  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||    
T  46134500 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctactcctataactctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttattata 46134401  T
Q  580 gtttcataagctg 592  Q
    |||||||||||||    
T  46134400 gtttcataagctg 46134388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 481 - 592
Target Start/End: Original strand, 9452591 - 9452702
Alignment:
Q  481 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatag 580  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  9452591 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgaacttatctattctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagtttatcatag 9452690  T
Q  581 tttcataagctg 592  Q
    ||||||||||||    
T  9452691 tttcataagctg 9452702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 475 - 589
Target Start/End: Original strand, 43405015 - 43405129
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  43405015 taaggccccgtttgaattgacttattttaagcttatgttggcttatctactcctataagtctttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagctta 43405114  T
Q  575 tcatagtttcataag 589  Q
    || || |||||||||    
T  43405115 tcgtaatttcataag 43405129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 482 - 595
Target Start/End: Original strand, 42673467 - 42673576
Alignment:
Q  482 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 581  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||    |||||||||| |||||||||||||    
T  42673467 ccgtttggattgacttatttggagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttggg----taaataaaaacagcttatcatagt 42673562  T
Q  582 ttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||    
T  42673563 ttcataagctgctt 42673576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 475 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 16894698 - 16894588
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||    
T  16894698 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttat----------ctactcccataagcttttttaaaggtatttgggtaaacaaataaaaatagttta 16894609  T
Q  575 tcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16894608 tcatagtttcataagctgctt 16894588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 537 - 595
Target Start/End: Original strand, 48865690 - 48865748
Alignment:
Q  537 ttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48865690 ttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgctt 48865748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 485 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 27691517 - 27691433
Alignment:
Q  485 tttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaata 569  Q
    |||| ||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27691517 tttgaattggtttattttgaatttatatgggcttatctactcccataaatctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaata 27691433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 478 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 36849735 - 36849625
Alignment:
Q  478 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatca 577  Q
    |||||||||||||||| ||||||   |||||||||||| || ||||||   ||| | | |||||||||||||| | ||||| |||||||  |||||||||    
T  36849735 ggccccgtttggattgacttattcgaagcttatgtgggtttgtctactaacatatgtttttttaaaggtgtttggataaatcaataaaatcagcttatca 36849636  T
Q  578 tagtttcataa 588  Q
     | ||||||||    
T  36849635 caatttcataa 36849625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 473 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 30075431 - 30075379
Alignment:
Q  473 actaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctact 525  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  30075431 actatggccccgtttggattgacttattttaagcttatgtgagtttatctact 30075379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 547 - 595
Target Start/End: Original strand, 20163886 - 20163934
Alignment:
Q  547 gtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||| ||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20163886 gtttgggtgaattaattaaaatagcttatcacagtttcataagctgctt 20163934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 96; Significance: 9e-47; HSPs: 25)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 480 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 30420373 - 30420258
Alignment:
Q  480 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcata 579  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30420373 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 30420274  T
Q  580 gtttcataagctgctt 595  Q
    | ||||||||||||||    
T  30420273 ggttcataagctgctt 30420258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 473 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 33906260 - 33906138
Alignment:
Q  473 actaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagct 572  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33906260 actaaggccctgtttggattgacttattttgaacttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 33906161  T
Q  573 tatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  33906160 tatcatagtttcataagctgctt 33906138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 478 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 31517423 - 31517306
Alignment:
Q  478 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatca 577  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31517423 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatttgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 31517324  T
Q  578 tagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  31517323 tagtttcataaactgctt 31517306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 18807093 - 18806975
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18807093 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 18806994  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18806993 atagtttcataagctgctt 18806975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Original strand, 39635448 - 39635566
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  39635448 aggccccgtttggattagcttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatc 39635547  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  39635548 atagtttcataagctgctt 39635566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 478 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 3873452 - 3873335
Alignment:
Q  478 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatca 577  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  3873452 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatca 3873353  T
Q  578 tagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3873352 tagtttcataagctgctt 3873335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 475 - 595
Target Start/End: Original strand, 1108274 - 1108393
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  1108274 taaggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 1108372  T
Q  575 tcatagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  1108373 tcatagtttcataagttgctt 1108393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 4232351 - 4232233
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||   ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4232351 aggccccgtttggattggcttattttgtgcttatgtgggcttatctacttccataagtctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 4232252  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4232251 atagtttcataagctgctt 4232233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 6175037 - 6174919
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  6175037 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatatactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatc 6174938  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6174937 atagtttcataagctgctt 6174919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 481 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 28330042 - 28329928
Alignment:
Q  481 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatag 580  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28330042 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacacccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 28329943  T
Q  581 tttcataagctgctt 595  Q
    |||||||| ||||||    
T  28329942 tttcataaactgctt 28329928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 474 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 26323398 - 26323277
Alignment:
Q  474 ctaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctt 573  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||   |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  26323398 ctaaggccccgtttggattggtttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagtctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagctt 26323299  T
Q  574 atcatagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  26323298 atcatagtttcataagctgctt 26323277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 482 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 1483106 - 1482994
Alignment:
Q  482 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 581  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  1483106 ccgttttgattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcc-ataagcttttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattattgt 1483008  T
Q  582 ttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||    
T  1483007 ttcataagctgctt 1482994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 475 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 19901348 - 19901229
Alignment:
Q  475 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagctta 574  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19901348 taaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttctctacttccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaat-aataaaaatagctta 19901250  T
Q  575 tcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  19901249 tcatagtttcataaactgctt 19901229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 481 - 595
Target Start/End: Original strand, 4016039 - 4016153
Alignment:
Q  481 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatag 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  4016039 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtgaataaataaaaataacgtatcatag 4016138  T
Q  581 tttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||    
T  4016139 tttcataagctgctt 4016153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Original strand, 42937715 - 42937833
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | | ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  42937715 aggctccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctatttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatc 42937814  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  42937815 atagtttcataagctgctt 42937833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Original strand, 5733395 - 5733513
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||    
T  5733395 aggccccatttagattggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccatcagcctttttaaaggtgtttgggtgaataaataaaaacaacttatc 5733494  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5733495 atagtttcataagctgctt 5733513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 473 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 30270892 - 30270770
Alignment:
Q  473 actaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagct 572  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||| ||||||  ||||||| |||||| | ||||||||  ||||||| |    
T  30270892 actaaggccccgtttggattggcttattttaagcttatatgagtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttggataaataaaataaaatagtt 30270793  T
Q  573 tatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  30270792 tatcatagtttcataagctgctt 30270770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 485 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 16066495 - 16066385
Alignment:
Q  485 tttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataag-ctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 583  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16066495 tttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctgctttcataagtcttttttaaag-tgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 16066397  T
Q  584 cataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||    
T  16066396 cataagctgctt 16066385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 2178978 - 2178860
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||| ||  |||||   |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  2178978 aggccccgtttggattgatttattttaagtttatgtggacttatctattcgcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatc 2178879  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  2178878 atagtttcataagctgctt 2178860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 16588985 - 16588867
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||   |||||   ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||     
T  16588985 aggctccgtttggattggcttattttgtgtttatgtgggcttatctactttcataagtctttttaaagaagtttgggtaaataaataaaaatagcttatt 16588886  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16588885 atagtttcataagctgctt 16588867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 481 - 595
Target Start/End: Original strand, 850997 - 851111
Alignment:
Q  481 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatag 580  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||     
T  850997 cccgtttggatttgcttattttaagcttatgtaggcttatctactctcataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaatagagcttatcataa 851096  T
Q  581 tttcataagctgctt 595  Q
    ||| |||||||||||    
T  851097 ttttataagctgctt 851111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 479 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 44947749 - 44947633
Alignment:
Q  479 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcat 578  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| | | ||||||  ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  44947749 gccccatttgtattggcttattttgatcttatgtgagtttatctagtgccataagcatttttaaaagtgtttggataaataaataaaaatagtttatcat 44947650  T
Q  579 agtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||    
T  44947649 agtttcataagctgctt 44947633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 42446778 - 42446660
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |  ||||||||||   ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  42446778 aggccccgtttggattggcttattcggagtttatgcgaacttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttaggtaaatcaataaaaacaacttatc 42446679  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    | | |||||||||||||||    
T  42446678 acaatttcataagctgctt 42446660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 482 - 595
Target Start/End: Original strand, 429817 - 429930
Alignment:
Q  482 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 581  Q
    ||||||| |||  ||||||||||  ||||||||  ||||||||||  ||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  429817 ccgtttgaattcccttattttgaatttatgtggatttatctactctcataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcataat 429916  T
Q  582 ttcataagctgctt 595  Q
    |||||||| |||||    
T  429917 ttcataagttgctt 429930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 495 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 19384126 - 19384032
Alignment:
Q  495 cttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 589  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||| ||  |||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19384126 cttattttgagtttatatgagcttatctattctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 19384032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 478 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 23159 - 23042
Alignment:
Q  478 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatca 577  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23159 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 23060  T
Q  578 tagtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23059 tagtttcataagctgctt 23042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 91; Significance: 8e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 481 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 145450 - 145336
Alignment:
Q  481 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcatag 580  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  145450 cccgtttggattgacttattttgagtttatgtggacttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 145351  T
Q  581 tttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||    
T  145350 tttcataagctgctt 145336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 479 - 595
Target Start/End: Original strand, 3708 - 3824
Alignment:
Q  479 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcat 578  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3708 gccccgtttggattggtttattttgaacttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 3807  T
Q  579 agtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||    
T  3808 agtttcataagctgctt 3824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 477 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 215 - 97
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatc 576  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  215 aggccccgtttgtattggcttaagttgagtttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 116  T
Q  577 atagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||    
T  115 atagtttcataagctgctt 97  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 473 - 595
Target Start/End: Original strand, 10230 - 10352
Alignment:
Q  473 actaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagct 572  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  10230 actaaggccccgtttggattgacttattttgagcttatatgggtttatctactctcataagccttcttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtt 10329  T
Q  573 tatcatagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  10330 tatcatagtttcataagctgctt 10352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 480 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 501 - 386
Alignment:
Q  480 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcata 579  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  501 ccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcata 402  T
Q  580 gtttcataagctgctt 595  Q
    ||||||||||||||||    
T  401 gtttcataagctgctt 386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 481 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 212 - 96
Alignment:
Q  481 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatc---tactcctataagctgttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatca 577  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  212 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatcatctactcc-ataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 114  T
Q  578 tagtttcataagctgctt 595  Q
    |||||||||| |||||||    
T  113 tagtttcatatgctgctt 96  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2089 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold2089
Description:

Target: scaffold2089; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 477 - 505
Target Start/End: Original strand, 1066 - 1094
Alignment:
Q  477 aggccccgtttggattggcttattttgag 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1066 aggccccgtttggattggcttattttgag 1094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University