View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1145_high_8 (Length: 641)

Name: NF1145_high_8
Description: NF1145
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1145_high_8
NF1145_high_8
[»] chr6 (58 HSPs)
chr6 (6-607)||(15389214-15389818)
chr6 (6-607)||(27537179-27537776)
chr6 (6-607)||(27551388-27551985)
chr6 (6-607)||(33299884-33300485)
chr6 (6-606)||(35090139-35090740)
chr6 (6-607)||(5486923-5487522)
chr6 (6-607)||(23927352-23927952)
chr6 (6-607)||(30822981-30823581)
chr6 (6-607)||(5996418-5997019)
chr6 (6-608)||(20530497-20531102)
chr6 (6-607)||(19826377-19826977)
chr6 (6-607)||(14475346-14475951)
chr6 (9-606)||(25713510-25714111)
chr6 (6-609)||(25993341-25993945)
chr6 (6-609)||(25552175-25552779)
chr6 (9-607)||(13491796-13492392)
chr6 (148-607)||(16302770-16303224)
chr6 (147-607)||(16588922-16589377)
chr6 (147-607)||(16606003-16606458)
chr6 (148-607)||(21708370-21708825)
chr6 (148-609)||(18204937-18205397)
chr6 (148-607)||(18219938-18220396)
chr6 (10-612)||(12451316-12451900)
chr6 (148-607)||(16635319-16635775)
chr6 (148-607)||(16645276-16645732)
chr6 (147-609)||(27047045-27047506)
chr6 (147-607)||(27057291-27057750)
chr6 (148-607)||(24920381-24920835)
chr6 (147-598)||(24485252-24485701)
chr6 (148-607)||(30995327-30995785)
chr6 (147-607)||(18111832-18112289)
chr6 (147-607)||(18126377-18126834)
chr6 (9-410)||(13827528-13827924)
chr6 (195-607)||(27960228-27960637)
chr6 (147-598)||(25653891-25654339)
chr6 (9-361)||(25692775-25693131)
chr6 (9-361)||(25699416-25699772)
chr6 (148-607)||(28304133-28304591)
chr6 (147-598)||(21358422-21358873)
chr6 (147-598)||(23962404-23962855)
chr6 (147-598)||(23982514-23982965)
chr6 (373-607)||(13827922-13828156)
chr6 (378-607)||(28267593-28267822)
chr6 (378-607)||(28346342-28346571)
chr6 (413-607)||(8719657-8719848)
chr6 (419-607)||(25699770-25699958)
chr6 (148-488)||(28266420-28266758)
chr6 (148-488)||(28345169-28345507)
chr6 (393-608)||(11063824-11064035)
chr6 (431-607)||(5008128-5008304)
chr6 (388-598)||(16097687-16097898)
chr6 (475-598)||(18587362-18587485)
chr6 (419-524)||(25693129-25693234)
chr6 (506-616)||(335277-335388)
chr6 (535-607)||(15141656-15141728)
chr6 (537-599)||(18842945-18843007)
chr6 (10-211)||(18753564-18753766)
chr6 (147-187)||(16089648-16089688)
[»] chr7 (51 HSPs)
chr7 (6-607)||(18302861-18303463)
chr7 (6-607)||(13832513-13833113)
chr7 (6-607)||(13840543-13841143)
chr7 (6-607)||(24185927-24186525)
chr7 (6-607)||(1886732-1887327)
chr7 (6-607)||(1900833-1901428)
chr7 (6-608)||(4661688-4662290)
chr7 (6-607)||(17739183-17739789)
chr7 (147-609)||(5198978-5199436)
chr7 (147-607)||(5208097-5208553)
chr7 (233-607)||(10449321-10449693)
chr7 (147-607)||(16545360-16545813)
chr7 (147-607)||(16619849-16620302)
chr7 (10-379)||(10441978-10442350)
chr7 (147-598)||(17211194-17211638)
chr7 (148-598)||(16909646-16910089)
chr7 (147-612)||(29096635-29097096)
chr7 (147-607)||(17514148-17514604)
chr7 (147-607)||(17538610-17539066)
chr7 (147-607)||(29081876-29082332)
chr7 (147-611)||(27965753-27966214)
chr7 (147-607)||(15185445-15185903)
chr7 (147-607)||(27975210-27975667)
chr7 (147-608)||(16889548-16890005)
chr7 (297-607)||(4940091-4940401)
chr7 (147-607)||(15200065-15200523)
chr7 (147-598)||(40679867-40680317)
chr7 (147-598)||(29023320-29023770)
chr7 (147-598)||(16227657-16228108)
chr7 (148-607)||(16120492-16120954)
chr7 (148-607)||(16147232-16147694)
chr7 (9-597)||(43600353-43600939)
chr7 (147-607)||(44075014-44075472)
chr7 (147-598)||(16244535-16244986)
chr7 (148-607)||(558254-558712)
chr7 (148-607)||(568164-568622)
chr7 (147-607)||(2548852-2549310)
chr7 (147-607)||(2562738-2563196)
chr7 (147-598)||(27435152-27435605)
chr7 (147-598)||(27444182-27444635)
chr7 (147-523)||(29031758-29032133)
chr7 (329-608)||(19383909-19384187)
chr7 (378-607)||(13491880-13492106)
chr7 (149-607)||(36476574-36477026)
chr7 (10-308)||(33533462-33533758)
chr7 (416-607)||(13478068-13478255)
chr7 (6-528)||(4323562-4324083)
chr7 (447-598)||(38255625-38255777)
chr7 (447-598)||(38263200-38263352)
chr7 (413-612)||(48498506-48498706)
chr7 (404-599)||(43139053-43139246)
[»] chr5 (53 HSPs)
chr5 (6-607)||(43596506-43597109)
chr5 (6-607)||(43629300-43629903)
chr5 (9-607)||(31423523-31424125)
chr5 (10-612)||(31412620-31413224)
chr5 (6-608)||(28853559-28854163)
chr5 (6-607)||(1726619-1727221)
chr5 (6-608)||(24955293-24955895)
chr5 (6-607)||(28844949-28845552)
chr5 (6-607)||(24963754-24964355)
chr5 (17-612)||(19225643-19226231)
chr5 (6-607)||(20396266-20396846)
chr5 (148-607)||(41093548-41094010)
chr5 (6-607)||(20370578-20371143)
chr5 (147-607)||(33835130-33835586)
chr5 (147-607)||(33843829-33844285)
chr5 (147-607)||(20377654-20378111)
chr5 (147-607)||(20386443-20386900)
chr5 (148-607)||(26088336-26088791)
chr5 (148-607)||(26078357-26078812)
chr5 (298-611)||(23348538-23348851)
chr5 (148-607)||(11812423-11812880)
chr5 (148-607)||(11802347-11802804)
chr5 (148-607)||(12170129-12170587)
chr5 (148-607)||(12179558-12180016)
chr5 (149-607)||(3476764-3477221)
chr5 (149-607)||(3491534-3491991)
chr5 (147-599)||(23038996-23039445)
chr5 (147-607)||(36458526-36458981)
chr5 (147-599)||(17642366-17642815)
chr5 (147-593)||(21850650-21851093)
chr5 (10-321)||(21931231-21931546)
chr5 (147-612)||(27063970-27064433)
chr5 (148-607)||(27220141-27220602)
chr5 (147-598)||(23827754-23828206)
chr5 (148-607)||(27223148-27223607)
chr5 (148-607)||(27232619-27233078)
chr5 (147-598)||(31548052-31548501)
chr5 (147-609)||(21986163-21986628)
chr5 (147-598)||(23637226-23637678)
chr5 (147-598)||(23835212-23835664)
chr5 (147-598)||(26176970-26177419)
chr5 (147-607)||(21994813-21995276)
chr5 (147-598)||(23984641-23985093)
chr5 (298-599)||(21856805-21857108)
chr5 (381-607)||(21931541-21931765)
chr5 (298-593)||(21858564-21858861)
chr5 (378-607)||(29190253-29190478)
chr5 (378-607)||(344880-345105)
chr5 (378-607)||(359519-359744)
chr5 (147-598)||(23762288-23762740)
chr5 (147-291)||(23025805-23025946)
chr5 (418-481)||(27586827-27586890)
chr5 (422-488)||(19071767-19071833)
[»] chr2 (66 HSPs)
chr2 (6-607)||(17684935-17685538)
chr2 (6-607)||(6855957-6856557)
chr2 (6-609)||(35039713-35040315)
chr2 (6-607)||(34527846-34528451)
chr2 (6-607)||(34541820-34542425)
chr2 (6-607)||(20364529-20365135)
chr2 (6-607)||(41232315-41232917)
chr2 (6-607)||(35147970-35148572)
chr2 (6-607)||(35139629-35140231)
chr2 (7-607)||(15942988-15943591)
chr2 (6-607)||(42564376-42564979)
chr2 (6-607)||(42573000-42573603)
chr2 (7-607)||(15951498-15952102)
chr2 (6-607)||(44374811-44375413)
chr2 (6-607)||(44390392-44390994)
chr2 (9-607)||(24293204-24293802)
chr2 (6-607)||(26731633-26732231)
chr2 (10-609)||(25495612-25496209)
chr2 (6-607)||(26717500-26718098)
chr2 (9-605)||(24286636-24287231)
chr2 (51-607)||(26896528-26897083)
chr2 (159-604)||(42247477-42247923)
chr2 (9-607)||(20920483-20921089)
chr2 (148-608)||(34068673-34069123)
chr2 (148-609)||(28481147-28481602)
chr2 (6-337)||(20623360-20623692)
chr2 (147-607)||(16274574-16275032)
chr2 (147-607)||(16283750-16284208)
chr2 (148-607)||(21151235-21151689)
chr2 (147-598)||(30524527-30524972)
chr2 (148-607)||(15600531-15600991)
chr2 (148-608)||(34436891-34437348)
chr2 (148-609)||(29855142-29855602)
chr2 (147-586)||(33306576-33307011)
chr2 (147-607)||(42385921-42386377)
chr2 (147-607)||(42400805-42401261)
chr2 (147-607)||(3754885-3755340)
chr2 (148-607)||(10681324-10681785)
chr2 (147-607)||(2652834-2653289)
chr2 (147-607)||(3764936-3765391)
chr2 (147-598)||(27680932-27681385)
chr2 (147-608)||(21850121-21850582)
chr2 (147-607)||(21858557-21859017)
chr2 (147-599)||(31354719-31355171)
chr2 (148-598)||(22187134-22187585)
chr2 (147-607)||(34685499-34685959)
chr2 (147-598)||(42245347-42245798)
chr2 (147-607)||(34707922-34708380)
chr2 (298-607)||(35304648-35304954)
chr2 (147-599)||(11622049-11622504)
chr2 (17-607)||(21111029-21111613)
chr2 (417-607)||(38153999-38154189)
chr2 (378-607)||(19655563-19655789)
chr2 (9-391)||(17095633-17096007)
chr2 (399-607)||(30683105-30683312)
chr2 (440-607)||(25493307-25493474)
chr2 (378-607)||(21320618-21320845)
chr2 (378-607)||(14630437-14630662)
chr2 (9-318)||(17069159-17069464)
chr2 (9-318)||(17075152-17075457)
chr2 (474-608)||(38611414-38611545)
chr2 (6-76)||(44374481-44374551)
chr2 (441-540)||(39842078-39842174)
chr2 (534-596)||(23283970-23284032)
chr2 (336-405)||(17069048-17069117)
chr2 (418-467)||(17881341-17881390)
[»] chr1 (45 HSPs)
chr1 (6-607)||(3431401-3432004)
chr1 (6-607)||(31540961-31541563)
chr1 (6-607)||(31549530-31550132)
chr1 (17-607)||(32135108-32135698)
chr1 (6-607)||(28991106-28991712)
chr1 (10-607)||(13803853-13804449)
chr1 (6-607)||(13451833-13452437)
chr1 (9-607)||(41744502-41745095)
chr1 (9-607)||(2384976-2385571)
chr1 (12-608)||(43455847-43456450)
chr1 (10-607)||(23355413-23356014)
chr1 (148-607)||(21496882-21497340)
chr1 (9-607)||(28459589-28460189)
chr1 (9-608)||(51055114-51055711)
chr1 (242-607)||(13477078-13477442)
chr1 (148-607)||(20502063-20502516)
chr1 (148-607)||(31553306-31553763)
chr1 (148-607)||(31562440-31562897)
chr1 (151-599)||(22479580-22480025)
chr1 (147-598)||(32608539-32608986)
chr1 (187-607)||(21054866-21055280)
chr1 (305-607)||(23952221-23952522)
chr1 (147-598)||(22472503-22472952)
chr1 (147-609)||(38123425-38123882)
chr1 (147-598)||(3350534-3350982)
chr1 (147-598)||(16135066-16135514)
chr1 (242-606)||(8240865-8241229)
chr1 (148-598)||(34336620-34337070)
chr1 (148-598)||(12464053-12464506)
chr1 (9-599)||(36848507-36849100)
chr1 (370-608)||(35097377-35097615)
chr1 (298-607)||(52101236-52101542)
chr1 (413-607)||(13461138-13461332)
chr1 (399-609)||(21244869-21245079)
chr1 (414-607)||(46776801-46776994)
chr1 (9-274)||(11950125-11950392)
chr1 (475-599)||(22495867-22495991)
chr1 (447-598)||(8513942-8514094)
chr1 (148-425)||(18702405-18702676)
chr1 (483-597)||(18780118-18780232)
chr1 (440-607)||(25337131-25337294)
chr1 (413-598)||(27311794-27311980)
chr1 (243-607)||(4282507-4282866)
chr1 (459-594)||(2248397-2248532)
chr1 (418-486)||(17018892-17018961)
[»] chr8 (40 HSPs)
chr8 (10-608)||(4837361-4837962)
chr8 (6-607)||(17662267-17662869)
chr8 (6-607)||(30939290-30939892)
chr8 (6-607)||(17681396-17681998)
chr8 (6-607)||(17528834-17529435)
chr8 (6-607)||(39836010-39836613)
chr8 (6-607)||(39844052-39844655)
chr8 (7-607)||(25584851-25585449)
chr8 (6-607)||(16775036-16775641)
chr8 (6-607)||(16760599-16761204)
chr8 (9-607)||(26871212-26871829)
chr8 (9-607)||(17975437-17976043)
chr8 (148-607)||(22103424-22103884)
chr8 (148-610)||(36248655-36249115)
chr8 (9-607)||(23922855-23923456)
chr8 (148-603)||(36252300-36252750)
chr8 (148-599)||(19850723-19851177)
chr8 (148-599)||(19856759-19857213)
chr8 (147-607)||(36576543-36576999)
chr8 (293-608)||(4842806-4843121)
chr8 (148-607)||(25718966-25719418)
chr8 (238-607)||(4583602-4583972)
chr8 (298-607)||(15832007-15832315)
chr8 (147-599)||(6582682-6583131)
chr8 (147-598)||(23092654-23093102)
chr8 (14-599)||(26912534-26913124)
chr8 (147-607)||(14204439-14204901)
chr8 (147-607)||(14219080-14219542)
chr8 (148-607)||(31000605-31001064)
chr8 (147-598)||(31207505-31207957)
chr8 (147-598)||(16190398-16190849)
chr8 (363-607)||(25796693-25796937)
chr8 (373-612)||(1388087-1388326)
chr8 (148-599)||(17129206-17129677)
chr8 (298-598)||(22418206-22418509)
chr8 (298-599)||(22366732-22367038)
chr8 (378-609)||(14335741-14335968)
chr8 (381-610)||(23600856-23601082)
chr8 (418-488)||(17809453-17809523)
chr8 (205-328)||(22023032-22023149)
[»] chr3 (82 HSPs)
chr3 (6-608)||(27338858-27339453)
chr3 (6-607)||(30062629-30063228)
chr3 (6-608)||(41016348-41016951)
chr3 (9-607)||(4435387-4435984)
chr3 (9-607)||(4456178-4456775)
chr3 (6-607)||(50826316-50826913)
chr3 (9-607)||(27550643-27551247)
chr3 (6-607)||(50848940-50849544)
chr3 (6-607)||(18949441-18950043)
chr3 (6-608)||(8153127-8153730)
chr3 (9-609)||(51922058-51922660)
chr3 (6-607)||(39706805-39707403)
chr3 (9-607)||(17364673-17365275)
chr3 (9-607)||(17360031-17360633)
chr3 (9-607)||(8196217-8196817)
chr3 (10-607)||(3711560-3712152)
chr3 (10-608)||(13507238-13507842)
chr3 (6-607)||(17935023-17935628)
chr3 (10-607)||(2256387-2256984)
chr3 (148-607)||(14425728-14426188)
chr3 (9-476)||(18900462-18900931)
chr3 (147-607)||(15711119-15711578)
chr3 (147-607)||(15694516-15694975)
chr3 (187-607)||(8204028-8204447)
chr3 (152-607)||(18351134-18351585)
chr3 (61-607)||(43468073-43468620)
chr3 (9-522)||(18040857-18041373)
chr3 (148-612)||(2214914-2215374)
chr3 (147-555)||(15696829-15697236)
chr3 (6-429)||(16814560-16814981)
chr3 (9-415)||(18890340-18890748)
chr3 (147-607)||(10720700-10721157)
chr3 (147-598)||(6293524-6293970)
chr3 (147-607)||(27978685-27979139)
chr3 (147-607)||(6563701-6564158)
chr3 (147-607)||(6577370-6577827)
chr3 (6-356)||(41007569-41007920)
chr3 (147-607)||(5144265-5144721)
chr3 (148-599)||(16290794-16291242)
chr3 (301-607)||(17630358-17630664)
chr3 (147-608)||(1004108-1004567)
chr3 (147-612)||(11918192-11918656)
chr3 (147-607)||(11932767-11933226)
chr3 (147-609)||(22965768-22966228)
chr3 (147-608)||(17562686-17563147)
chr3 (147-607)||(22951794-22952252)
chr3 (147-599)||(31278579-31279028)
chr3 (147-607)||(25264700-25265155)
chr3 (147-607)||(25274194-25274649)
chr3 (147-599)||(15675078-15675525)
chr3 (147-598)||(13274799-13275250)
chr3 (147-599)||(15683620-15684067)
chr3 (147-598)||(1479978-1480429)
chr3 (298-607)||(13847669-13847977)
chr3 (147-598)||(4503364-4503815)
chr3 (10-296)||(9183894-9184178)
chr3 (116-610)||(21185412-21185902)
chr3 (150-598)||(7063629-7064077)
chr3 (150-598)||(7096476-7096924)
chr3 (147-607)||(24215984-24216430)
chr3 (148-598)||(17616482-17616932)
chr3 (9-366)||(27958025-27958376)
chr3 (9-580)||(27884540-27885101)
chr3 (320-599)||(27957185-27957459)
chr3 (399-607)||(10713426-10713634)
chr3 (399-607)||(29730411-29730621)
chr3 (40-607)||(27880175-27880733)
chr3 (9-596)||(9567282-9567867)
chr3 (440-607)||(18881928-18882095)
chr3 (379-607)||(13555526-13555750)
chr3 (460-612)||(14520707-14520859)
chr3 (9-172)||(8223119-8223285)
chr3 (362-598)||(12468968-12469207)
chr3 (9-169)||(18886343-18886505)
chr3 (9-142)||(14536879-14537009)
chr3 (187-317)||(27957882-27958011)
chr3 (502-609)||(18900357-18900464)
chr3 (195-420)||(30102060-30102286)
chr3 (518-607)||(22094837-22094926)
chr3 (548-608)||(18041374-18041434)
chr3 (147-199)||(30101998-30102049)
chr3 (565-607)||(15697231-15697273)
[»] chr4 (33 HSPs)
chr4 (9-612)||(27341507-27342107)
chr4 (11-607)||(772960-773553)
chr4 (10-608)||(10640153-10640751)
chr4 (6-608)||(8092735-8093336)
chr4 (85-608)||(52297571-52298095)
chr4 (6-607)||(8101541-8102141)
chr4 (10-607)||(12998337-12998935)
chr4 (9-607)||(12425216-12425815)
chr4 (6-607)||(1875344-1875949)
chr4 (6-607)||(1889459-1890064)
chr4 (9-607)||(21530105-21530710)
chr4 (154-607)||(55584160-55584607)
chr4 (147-607)||(4747401-4747858)
chr4 (147-607)||(18009988-18010442)
chr4 (244-607)||(20865659-20866021)
chr4 (275-607)||(4522214-4522545)
chr4 (297-611)||(26033957-26034271)
chr4 (147-598)||(26210390-26210839)
chr4 (147-598)||(26219150-26219599)
chr4 (147-598)||(19644871-19645320)
chr4 (147-599)||(21398827-21399278)
chr4 (147-607)||(10786565-10787024)
chr4 (147-598)||(34842605-34843054)
chr4 (147-598)||(19759730-19760183)
chr4 (147-598)||(19774486-19774939)
chr4 (301-609)||(25652447-25652753)
chr4 (147-598)||(25247163-25247613)
chr4 (147-598)||(14718505-14718963)
chr4 (307-607)||(21810865-21811167)
chr4 (326-598)||(14736790-14737064)
chr4 (9-213)||(20866022-20866220)
chr4 (148-257)||(24924531-24924638)
chr4 (147-266)||(14737083-14737205)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (9-607)||(4160-4759)
[»] scaffold0015 (3 HSPs)
scaffold0015 (9-607)||(188332-188931)
scaffold0015 (147-607)||(194662-195118)
scaffold0015 (298-607)||(159154-159462)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (52-606)||(109202-109754)
scaffold0002 (6-252)||(122953-123197)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (94-607)||(29778-30286)
scaffold0056 (504-607)||(11481-11584)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (9-607)||(10187-10782)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (148-607)||(9802-10255)
[»] scaffold0257 (1 HSPs)
scaffold0257 (202-608)||(10139-10546)
[»] scaffold1804 (1 HSPs)
scaffold1804 (249-609)||(1-361)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (147-599)||(63135-63581)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (9-465)||(19565-20028)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (10-366)||(38672-39028)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (274-608)||(4297-4629)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (298-607)||(80338-80648)
scaffold0044 (298-607)||(63938-64246)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (152-602)||(46457-46902)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (148-546)||(1-396)
[»] scaffold0451 (1 HSPs)
scaffold0451 (198-607)||(4491-4899)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (298-607)||(21451-21760)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (147-598)||(83332-83783)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (148-607)||(14775-15236)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (298-607)||(145283-145591)
scaffold0023 (310-607)||(136321-136617)
[»] scaffold0545 (1 HSPs)
scaffold0545 (9-287)||(8011-8293)
[»] scaffold0455 (1 HSPs)
scaffold0455 (147-599)||(3579-4028)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (6-237)||(25384-25616)
[»] scaffold0497 (1 HSPs)
scaffold0497 (9-267)||(12494-12753)
[»] scaffold0156 (2 HSPs)
scaffold0156 (372-607)||(29569-29803)
scaffold0156 (9-172)||(33162-33315)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (399-607)||(21929-22138)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (298-479)||(421-603)
scaffold0031 (530-607)||(346-423)
[»] scaffold0392 (1 HSPs)
scaffold0392 (447-612)||(16390-16555)
[»] scaffold0077 (3 HSPs)
scaffold0077 (134-427)||(32325-32622)
scaffold0077 (434-607)||(29775-29945)
scaffold0077 (474-607)||(32642-32772)
[»] scaffold1481 (1 HSPs)
scaffold1481 (148-497)||(1402-1751)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (434-607)||(9796-9966)
[»] scaffold1199 (1 HSPs)
scaffold1199 (399-612)||(2205-2417)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (443-607)||(172567-172731)
[»] scaffold0007 (3 HSPs)
scaffold0007 (378-581)||(63287-63488)
scaffold0007 (9-286)||(19404-19677)
scaffold0007 (9-254)||(26354-26598)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (336-598)||(22717-22980)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (424-598)||(15382-15557)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (461-607)||(13635-13781)
[»] scaffold1120 (1 HSPs)
scaffold1120 (9-172)||(1258-1419)
[»] scaffold0605 (1 HSPs)
scaffold0605 (387-598)||(7744-7957)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (402-598)||(1-199)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (447-599)||(55757-55910)
scaffold0046 (147-187)||(37844-37884)
[»] scaffold0945 (1 HSPs)
scaffold0945 (447-598)||(27-180)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (498-599)||(8432-8533)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (534-608)||(1-75)
[»] scaffold0386 (1 HSPs)
scaffold0386 (534-609)||(1-76)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (545-612)||(9943-10010)
[»] scaffold1547 (1 HSPs)
scaffold1547 (148-327)||(1485-1662)
[»] scaffold2020 (1 HSPs)
scaffold2020 (418-481)||(708-771)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (418-481)||(164724-164787)
scaffold0009 (418-470)||(149519-149571)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (418-481)||(28579-28643)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 542; Significance: 0; HSPs: 58)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 542; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 15389818 - 15389214
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15389818 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatgataga 15389719  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa--tctt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  15389718 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaaaatctt 15389619  T
Q  204 aaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15389618 aaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaattacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttc 15389519  T
Q  304 caaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcac 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15389518 caaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatgaatttagcac 15389419  T
Q  404 aagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgata 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15389418 aagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgata 15389319  T
Q  504 agggtttttact-cattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacga 602  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15389318 agggtttttactccattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacga 15389219  T
Q  603 gcaca 607  Q
    |||||    
T  15389218 gcaca 15389214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 481; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Original strand, 27537179 - 27537776
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27537179 ctcccaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataataga 27537278  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatctta 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||  ||    
T  27537279 cttgacttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaact-attttcaaaaat--ta 27537375  T
Q  205 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 304  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27537376 aaatcaacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 27537473  T
Q  305 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcaca 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27537474 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcctccattctttcacttagatttttagataataattttcaaataagcaaatcaatttagcaca 27537573  T
Q  405 agataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataa 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27537574 agataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgataa 27537673  T
Q  505 gggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagc 604  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27537674 gggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgagc 27537773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 481; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Original strand, 27551388 - 27551985
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27551388 ctcccaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataataga 27551487  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatctta 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||  ||    
T  27551488 cttgacttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaact-attttcaaaaat--ta 27551584  T
Q  205 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 304  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27551585 aaatcaacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 27551682  T
Q  305 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcaca 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27551683 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcctccattctttcacttagatttttagataataattttcaaataagcaaatcaatttagcaca 27551782  T
Q  405 agataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataa 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27551783 agataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgataa 27551882  T
Q  505 gggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagc 604  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27551883 gggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgagc 27551982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 480; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Original strand, 33299884 - 33300485
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttt---ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33299884 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataat 33299983  T
Q  103 agacttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatc 201  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| |||||| |||||     
T  33299984 agacttgattttcttgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaacc-attttctaaaat- 33300081  T
Q  202 ttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcct 301  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  33300082 ttaaaatcaacc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcatgagatttttatcct 33300180  T
Q  302 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagc 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33300181 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccc-ccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaatttagc 33300279  T
Q  402 acaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcga 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  33300280 acaagataaattaggtaagaggttcatatggaataccatagacgcttagggtgctagtaccttcccttcgcgtaactaacccccgaatccaaagtctcga 33300379  T
Q  502 taagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacg 601  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33300380 caagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacg 33300479  T
Q  602 agcaca 607  Q
    ||||||    
T  33300480 agcaca 33300485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 35090740 - 35090139
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttcctttt-attttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatag 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  35090740 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgtttaattgaattaatattcatattag 35090641  T
Q  105 acttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctc--atgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatct 202  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  35090640 acttgattttcttgtaattaaaatgtgaacaacctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctttcttttcttaaaacccattttcaaaaatct 35090541  T
Q  203 taaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 302  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  35090540 taaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttttttttaaagatatgtaggcataaaatttttatcctt 35090443  T
Q  303 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagca 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35090442 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaatttagca 35090343  T
Q  403 caagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgat 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35090342 caagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgat 35090243  T
Q  503 aagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacga 602  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35090242 aagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacga 35090143  T
Q  603 gcac 606  Q
    ||||    
T  35090142 gcac 35090139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 5487522 - 5486923
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatag 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5487522 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggcttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatagtag 5487423  T
Q  105 acttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatctt 203  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| |||||| |||||||     
T  5487422 acttgattttcttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaacc-attttctaaaatct- 5487325  T
Q  204 aaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttc 303  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5487324 aaaatcaacc-aacccaccaaaaagaaacttttgaggtgaactacagtggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttc 5487226  T
Q  304 caaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcac 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||    
T  5487225 caaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttccccctccattctttcatttagacttttaggtaataattttcaaataagcaa-tgattttagcac 5487127  T
Q  404 aagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgata 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5487126 aagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgtttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgata 5487027  T
Q  504 agggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgag 603  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5487026 agggtttttacttattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgag 5486927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Original strand, 23927352 - 23927952
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23927352 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 23927451  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatctta 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||| |||||| |||||| ||||| |||    
T  23927452 cttgatttctt-gtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcttcttatcccttcttaaaacc-attttctaaaat-tta 23927548  T
Q  205 aaatcaacctaacccacc-aaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttc 303  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  23927549 aaatcaacc-aacccaccaaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttcttaaagggtatgtaggcatgggatttgtatccttc 23927647  T
Q  304 caaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaa-taattttcaaataagcaaatcaattcagca 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  23927648 caaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaattaattttcaaataagc-aatgaatttagca 23927746  T
Q  403 caagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgat 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  23927747 caagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttctcttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtcccgat 23927846  T
Q  503 aaggg-tttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacg 601  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  23927847 aagggttttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaaaattaacgattcaaatcaattaatgatttgatatccgaaaatcacg 23927946  T
Q  602 agcaca 607  Q
    ||||||    
T  23927947 agcaca 23927952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 30823581 - 30822981
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagt-gtttttccttttatttt-cttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataata 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30823581 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggcttgtaacccaagttgcttttccttttatttttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataata 30823482  T
Q  104 gacttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttc-aaaaatc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||||| |||||| |||||||    
T  30823481 gacttgatttctttgtaattaaaattcgac-aacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatcccttcttgaaacc-attttctaaaaatc 30823384  T
Q  202 ttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcct 301  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30823383 t-aaaatcaacc-aacccaccaaaaagaaacttttcaggtgaactacattggttttgatcccttttcttaaagggtatgtaggcataggatttttatcct 30823286  T
Q  302 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagc 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||    
T  30823285 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaa-tgaatttagc 30823187  T
Q  402 acaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcga 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30823186 acaagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcga 30823087  T
Q  502 taagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacg 601  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30823086 tgagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacg 30822987  T
Q  602 agcaca 607  Q
    ||||||    
T  30822986 agcaca 30822981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Original strand, 5996418 - 5997019
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtg--tttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataata 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5996418 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggcttgtaacccaagtgcttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataata 5996517  T
Q  104 gacttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcacctt-attttatctcatgcctggaggcctcttt-ctcttctaaaaacccattttcaaaaatc 201  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| |||||| |||||| |||||     
T  5996518 gacttgattttcttgtaattaaaatttgaccaacctcacctttattttatctcatgccttgaggcttcttttcccttcttaaaacc-attttctaaaat- 5996615  T
Q  202 ttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcct 301  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5996616 ttaaaatcaac-taacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcct 5996714  T
Q  302 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagc 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||| |||    
T  5996715 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcccctcattctttcacttagatttttaggtaaaatttttcaaataagcaa-tgaatttagc 5996813  T
Q  402 acaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcga 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5996814 acaagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcga 5996913  T
Q  502 taagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacg 601  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  5996914 caagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggcttgatatccgaaaatcacg 5997013  T
Q  602 agcaca 607  Q
    ||||||    
T  5997014 agcaca 5997019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 453; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 20531102 - 20530497
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgt----ttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20531102 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggcttgtaacccaagtgtctttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataa 20531003  T
Q  102 tagacttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaat 200  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| |||||| |||||    
T  20531002 tagacttgattttcttgtaattaaaattttaccaacctcaccttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaacc-attttctaaaat 20530904  T
Q  201 cttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 300  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20530903 ct-aaaatcaacc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 20530806  T
Q  301 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagat-ttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattca 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |    
T  20530805 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatcttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaattta 20530707  T
Q  400 gcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctc 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20530706 gcacaagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtgaccaacccccgaatccaaagtctc 20530607  T
Q  500 gataaggg-tttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20530606 gatgagggttttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatc 20530507  T
Q  599 acgagcacac 608  Q
    | ||||||||    
T  20530506 aagagcacac 20530497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 19826977 - 19826377
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19826977 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 19826878  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatctta 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||  |||    
T  19826877 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaa-ctattttcaaaaa--tta 19826781  T
Q  205 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 304  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19826780 aaatcaacctaacccacc--aaagaaattctttaggtgaactacattggttttgatcccttttcttaaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 19826683  T
Q  305 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcaca 404  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||  ||||||    
T  19826682 aaatcaaataaaaatgaccaaaaacatacttcttttccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaagtaagc-aatgaatgtagcaca 19826584  T
Q  405 agataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataa 504  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  19826583 agataagttaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgatga 19826484  T
Q  505 gg----gtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcac 600  Q
    ||     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19826483 ggttttttttttactcattttttcccttcccacgaataaaaattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcac 19826384  T
Q  601 gagcaca 607  Q
    |||||||    
T  19826383 gagcaca 19826377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Original strand, 14475346 - 14475951
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgt---ttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataat 102  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14475346 ctccaaaaacattttcttaataaaccttggcttgtaacccaagtgtcctttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataat 14475445  T
Q  103 agacttgatttcttt-gtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaat 200  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| ||||||  ||||    
T  14475446 agacttgattttttttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaacc-attttctgaaat 14475544  T
Q  201 cttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 300  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14475545 ct-aaaatcaacc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccattttatttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 14475642  T
Q  301 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-tttttaggtaa-taattttcaaataagcaaatcaattc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||     
T  14475643 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagattttttaggtaattaattttcaaataagc-aatgaattt 14475741  T
Q  399 agcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtct 498  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  14475742 agcacaagataatttaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtct 14475841  T
Q  499 cgataaggg-tttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaat 597  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14475842 cgataagggttttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcagatcaattaatggtttgatatccgaaaat 14475941  T
Q  598 cacgagcaca 607  Q
    ||||||||||    
T  14475942 cacgagcaca 14475951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 606
Target Start/End: Original strand, 25713510 - 25714111
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaa-ttgaattaatattcataatagac 106  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  25713510 caaaaatattttcttaataaatcttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaaattgaattaatattcatattggac 25713609  T
Q  107 ttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttatttta-tctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatctta 204  Q
     ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||| |  || || ||||| |||||| |||||| ||||| | |    
T  25713610 ctgattttcttgtaattaaaatttgaccaacctcatcttatttttctctcatgccttgaggacaattatcccttcttaaaacc-attttctaaaat-tga 25713707  T
Q  205 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 304  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25713708 aaatcaacc-aacccaccaaaaaaaaactttttaggtgaactacattgattttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 25713806  T
Q  305 aaatcaaataaaaataa----ccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcag 400  Q
    |||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||| ||    
T  25713807 aaatcaaataaaaaaaaaaaaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataactttcagataagcaa-tgaatttag 25713905  T
Q  401 cacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcg 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25713906 cacaagataaattaggtaagaggttcctacggaataccaaagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcg 25714005  T
Q  501 ataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcac 600  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25714006 atgagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagacttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcac 25714105  T
Q  601 gagcac 606  Q
    ||||||    
T  25714106 gagcac 25714111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 609
Target Start/End: Original strand, 25993341 - 25993945
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25993341 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattaga 25993440  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctc--atgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatct 202  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||  |||||||  |||||   |||  |||| | |    
T  25993441 cttgattttcttgtaattaaaatttgaacaacctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctaatctcttcgtaaaacttttttctaaaattgt 25993540  T
Q  203 taaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 302  Q
    ||||||||| | |||||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25993541 taaaatcaatccaacccatcaaaa-gattttttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcagaggatttttatcctt 25993639  T
Q  303 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaa-catacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagc 401  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||    
T  25993640 ccaaatcaaataaaaataatcaaaaaacatacttcttctcccccaattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaa-tgaatttagc 25993738  T
Q  402 acaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcga 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  25993739 acaagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaacaacccccgaatccaaagtctcga 25993838  T
Q  502 taagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacg 601  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  25993839 caagggtttttactca-tttttcccttctcacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcaag 25993937  T
Q  602 agcacaca 609  Q
    ||||||||    
T  25993938 agcacaca 25993945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 609
Target Start/End: Original strand, 25552175 - 25552779
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttcctttt-attttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatag 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25552175 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattag 25552274  T
Q  105 acttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctc--atgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatc 201  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||   |||||||||| ||||  |||||| |||||||||  |||||||| |||     |||| |||| |     
T  25552275 acttgattttcttgcaattaaaatttgaacaacgcaaccttattttttctctcatgccttgaggcctctaatctcttcttaaattttttttt-aaaattg 25552373  T
Q  202 ttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcct 301  Q
    ||||||||||   ||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  25552374 ttaaaatcaattcaacccaccaaaaaaaaaattt--aggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcagagcatttttatcct 25552471  T
Q  302 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaa-catacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcag 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||    
T  25552472 tccaaatcaaataaaaataatcaaaaaacatacttcttctcccccaattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataaacaa-tgaatttag 25552570  T
Q  401 cacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcg 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  25552571 cacaagataaattaggtaagaggttcctaaggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcacgtaaacaacccccgaatccaaagtctcg 25552670  T
Q  501 ataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcac 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  25552671 ataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatagtttgatatccgaaaatcac 25552770  T
Q  601 gagcacaca 609  Q
    |||| ||||    
T  25552771 gagcgcaca 25552779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 607
Target Start/End: Original strand, 13491796 - 13492392
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgt-ttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagact 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||| || |||| ||||||    
T  13491796 caaaaatattttcttagtaaaccttggattttaacccaagtgccttttccttttattttcttaatcaaatgtttaatcaatttaacatccatattagact 13491895  T
Q  108 tgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatc-tcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaa 205  Q
    ||| ||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| | |||||||| |||||||| |||||  |||||||||||| ||||    
T  13491896 tgaatttcttgtaat-aaaatttgaccaacctcatctcattttttcctcatgccttggggcctcttatctcttcttaaaac--attttcaaaaatattaa 13491992  T
Q  206 aatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcca 305  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |   |||||||||    
T  13491993 aatcaatctaacccaccaaaaagaaattttttaggtgaactacattggttttgatccctttcatttaagggtatgtaggcaaaggagtca-atccttcca 13492091  T
Q  306 aatcaaataaaa-ataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcaca 404  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13492092 aatcaaataaaaaataaccaaacacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttagataataattttcaaataagcaaatcaatttagcaca 13492191  T
Q  405 agataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataa 504  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |||    
T  13492192 agataaattaggcaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcacattcccttcccgtaaccaacccccgaatccaaagtct---taa 13492288  T
Q  505 gggtttttactca-ttttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgag 603  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  13492289 gggtttttactcatttttttcccttcccatgaataaaaatcgtgagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatattcaaaaatcacgag 13492388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 148 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 16303224 - 16302770
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaacta 247  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||    
T  16303224 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgaggtgaacta 16303127  T
Q  248 cattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcca 347  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16303126 cattggttttgatcccttt-ctttaagggtatgtaggtaggggagtcaaatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcca 16303028  T
Q  348 ttctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgc 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16303027 ttctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctagataagaggttcctatggaataccaaagacgc 16302928  T
Q  447 ttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcga 546  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16302927 ttaaggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtct---taagggtttttactcattttttcccttctcacgaataaaaatcga 16302831  T
Q  547 gagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16302830 gagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 16302770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Original strand, 16588922 - 16589377
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||| ||  |||||    
T  16588922 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaatctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaact 16589019  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 346  Q
    || | ||||||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16589020 acgtcggttttgatccctttcccaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 16589117  T
Q  347 attctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgc 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| |||| ||    
T  16589118 attctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaa-tgaatttagcacaagataatctaggtaagaggttcctacgggataccgtagatgc 16589216  T
Q  447 ttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcga 546  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16589217 ttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaattcaaagtctcgaaaagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcga 16589316  T
Q  547 gagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16589317 gagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 16589377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 16606458 - 16606003
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||| ||  |||||    
T  16606458 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaatctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaact 16606361  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 346  Q
    || | ||||||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16606360 acgtcggttttgatccctttcccaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 16606263  T
Q  347 attctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgc 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| |||| ||    
T  16606262 attctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaa-tgaatttagcacaagataatctaggtaagaggttcctacgggataccgtagatgc 16606164  T
Q  447 ttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcga 546  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16606163 ttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaattcaaagtctcgaaaagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcga 16606064  T
Q  547 gagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16606063 gagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 16606003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 148 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 21708825 - 21708370
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa--tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||    
T  21708825 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccatttccaaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgaggtgaac 21708728  T
Q  246 tacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21708727 tacattggttttgatcccttt-ctttaagggtatgtaggcaagggagtca-atccttccaaatcaaataaaagtaaccaaaaacatacttgttctccctc 21708630  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagac 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21708629 cattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagaggtttctatggaataccatagac 21708530  T
Q  445 gcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatc 544  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  21708529 gcttagggttctagcaccttccctgcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtct---taagggtttttactcattttttcccttctcacgaataaaaatc 21708433  T
Q  545 gagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  21708432 gagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 21708370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 148 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 18205397 - 18204937
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttc--aaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  ||||    
T  18205397 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcgaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaac 18205300  T
Q  246 tacattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 344  Q
    ||| | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18205299 tacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 18205202  T
Q  345 ccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18205201 ccattctttcacttagctttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaaaataatctaggtaagaggttcctatggaataccataga 18205102  T
Q  444 cgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaat 543  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18205101 cgcttaggatgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcga-aagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaat 18205003  T
Q  544 cgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcacaca 609  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  18205002 tgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcacaca 18204937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 148 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 18220396 - 18219938
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttc--aaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  ||||    
T  18220396 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcgaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaac 18220299  T
Q  246 tacattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 344  Q
    ||| | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18220298 tacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 18220201  T
Q  345 ccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18220200 ccattctttcacttagctttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaaaataatctaggtaagaggttcctatggaataccataga 18220101  T
Q  444 cgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaat 543  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18220100 cgcttaggatgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcga-aagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaat 18220002  T
Q  544 cgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  18220001 tgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 18219938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 10 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 12451900 - 12451316
Alignment:
Q  10 aaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttg 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |            |||| | |||| ||||||||    
T  12451900 aaaaatattttcttagtaaaccttggactttaacccaagtgtttt-ccttttattttcttaatcaatt------------taatgtccatattagacttg 12451814  T
Q  110 atttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaat 208  Q
    | ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||  ||||||| |||  |||||||    
T  12451813 aatttcttgtaattaaaatttgaccaacctcatcttatttt-tctcatgccttgaggcttcttatctcttctcaaaact-attttcataaactttaaaat 12451716  T
Q  209 caacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaat 308  Q
    ||| | |||||||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |   ||||||||||||    
T  12451715 caatccaacccaccaaa--gaatttttttaggggaactacattggttttgatccattttctttaagggtatgtaggcaaaggagtca-atccttccaaat 12451619  T
Q  309 caaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagattttt--aggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaag 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||     
T  12451618 caaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctctcacttaaatatttctaggtaataattttcaaataagcaaattgatttagcacaaa 12451519  T
Q  407 ataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagg 506  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||   |||||    
T  12451518 ataatttaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaattcagagtct---taagg 12451422  T
Q  507 gtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcac 606  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  12451421 gtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatttagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatgatttgatatctgaaaatcacgagcac 12451322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 148 - 607
Target Start/End: Original strand, 16635319 - 16635775
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa--tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||  ||||    
T  16635319 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcaaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattcttgagtggaac 16635416  T
Q  246 tacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    ||| | ||||||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16635417 tacgtcggttttgatccctttcccaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaataaaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 16635514  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  16635515 cattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataaacaa-tgaatttagcacaaaataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagatg 16635613  T
Q  446 cttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcg 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16635614 cttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcg 16635713  T
Q  546 agagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16635714 agagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 16635775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 148 - 607
Target Start/End: Original strand, 16645276 - 16645732
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa--tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||  ||||    
T  16645276 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcaaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattcttgagtggaac 16645373  T
Q  246 tacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    ||| | ||||||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16645374 tacgtcggttttgatccctttcccaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaataaaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 16645471  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  16645472 cattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataaacaa-tgaatttagcacaaaataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagatg 16645570  T
Q  446 cttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcg 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16645571 cttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcg 16645670  T
Q  546 agagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16645671 agagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 16645732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 147 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 27047506 - 27047045
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa-tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||||    
T  27047506 ttttatctcatgccttgaggcctcttcctcttcttaaaacc-attttcaaaaagtctaaaaatcaatctaacccaccaaa--gaaatttttgaggtgaac 27047410  T
Q  246 tacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27047409 tacattggttttgatcccttttcttaaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 27047310  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagac 444  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||| ||| ||| | || | ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27047309 cattctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaagtaaacaagt-aacttagcacaagataatctaagtaagaggttcctatggaataccatagac 27047212  T
Q  445 gcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataaggg-tttttactca-ttttttcccttgccacgaataaaaa 542  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  27047211 gcttaggatgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgaaaagggttttttactcatttttttcccttcccaagaataaaaa 27047112  T
Q  543 tcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcacaca 609  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  27047111 tcgagagttcaaagatcgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatcgcgagcacaca 27047045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 27057750 - 27057291
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa-tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||||    
T  27057750 ttttatctcatgccttgaggcctcttcctcttcttaaaacc-attttcaaaaagtctaaaaatcaatctaacccaccaaa--gaaatttttgaggtgaac 27057654  T
Q  246 tacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27057653 tacattggttttgatcccttttcttaaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 27057554  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagac 444  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||| ||| ||| | || | ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27057553 cattctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaagtaaacaagt-aacttagcacaagataatctaagtaagaggttcctatggaataccatagac 27057456  T
Q  445 gcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataaggg-tttttactca-ttttttcccttgccacgaataaaaa 542  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  27057455 gcttaggatgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgaaaagggttttttactcatttttttcccttcccaagaataaaaa 27057356  T
Q  543 tcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  27057355 tcgagagttcaaagatcgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatcgcgagcaca 27057291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 148 - 607
Target Start/End: Original strand, 24920381 - 24920835
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa--tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  ||||    
T  24920381 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttagaacccattttcaaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaac 24920478  T
Q  246 tacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    ||| | ||||||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24920479 tacgtcggttttgatccctttccaa-aagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaatgaccaaaaacatacttcttctccctc 24920575  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagac 444  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24920576 cattctttcacttagatttttaagtaataatttttcaagtaagcaaataaatttaacacaagataatctaggtaagaggttcctatgggataccatagac 24920675  T
Q  445 gcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatc 544  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24920676 gcttagggtgctaacaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtct---taagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatc 24920772  T
Q  545 gagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  24920773 gagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 24920835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 24485701 - 24485252
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||  |||||    
T  24485701 ttttatctcatgccgtaaggcctctttctcttcttaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccacc--aaagaaatttttgagtggaact 24485604  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 346  Q
    || | ||||||||||||||| |   ||||| | ||||||| ||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24485603 acgtcggttttgatccctttcccaaaagggcacgtaggcagagga--ttcgtccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 24485506  T
Q  347 attctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagc-aaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagac 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  24485505 attctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaaatgattttagcacaagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagat 24485406  T
Q  445 gcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatc 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  24485405 gcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaatc 24485306  T
Q  545 gagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  24485305 gagagttcaaagatcgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatc 24485252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 148 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 30995785 - 30995327
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttc--aaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||  ||||    
T  30995785 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcgaaaaaaccttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattcttgagtggaac 30995688  T
Q  246 tacattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 344  Q
    ||| | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30995687 tacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 30995590  T
Q  345 ccattctttcacttagatttttaggtaataa--ttttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatag 442  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||||   ||||||||||| ||| |   || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30995589 ccattctttcacttagacttt-aggcaatatatttttcaaataaacaagtagctt-agcacaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatag 30995492  T
Q  443 acgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaa 542  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  30995491 acgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaa 30995392  T
Q  543 tcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  30995391 tcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatcgcgagcaca 30995327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Original strand, 18111832 - 18112289
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtg-aac 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||  ||| |||    
T  18111832 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccatttcgaaaaatcttaaaatcaacctaacccactaaa--gaaattttttgagtggaac 18111929  T
Q  246 tacattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 344  Q
    ||| | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18111930 tacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 18112027  T
Q  345 ccattctttcacttagatttttaggtaataatttt--caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatag 442  Q
    |||||||||||||||||  || ||| |||||||||  ||||||| ||| | | || ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18112028 ccattctttcacttagacatt-aggcaataattttttcaaataaacaagt-agtttagcacaaaataatctaggtaagaggttcctatggaataccatag 18112125  T
Q  443 acgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaa 542  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18112126 acgcttaggatgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcga-aagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaa 18112224  T
Q  543 tcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  18112225 ttgagagttcaaagattgatgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 18112289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Original strand, 18126377 - 18126834
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtg-aac 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||  ||| |||    
T  18126377 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccatttcgaaaaatcttaaaatcaacctaacccactaaa--gaaattttttgagtggaac 18126474  T
Q  246 tacattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 344  Q
    ||| | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18126475 tacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 18126572  T
Q  345 ccattctttcacttagatttttaggtaataatttt--caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatag 442  Q
    |||||||||||||||||  || ||| |||||||||  ||||||| ||| | | || ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18126573 ccattctttcacttagacatt-aggcaataattttttcaaataaacaagt-agtttagcacaaaataatctaggtaagaggttcctatggaataccatag 18126670  T
Q  443 acgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaa 542  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18126671 acgcttaggatgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcga-aagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaa 18126769  T
Q  543 tcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  18126770 ttgagagttcaaagattgatgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 18126834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 9 - 410
Target Start/End: Original strand, 13827528 - 13827924
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagactt 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13827528 caaaaatatttt-ttaataaaccttggtttgtaacccaagtgcttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagactt 13827625  T
Q  109 gatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaa 207  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||| |||||   ||||||||| | ||||||    
T  13827626 gatttctt-gtaattaaa-tttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaactttttttcaaaattattaaaa 13827723  T
Q  208 tcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaa 307  Q
    ||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  13827724 tcaacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcatgagatttttatacttccaaa 13827821  T
Q  308 tcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaat-aattttcaaataagcaaatcaattcagcacaag 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  13827822 tcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcccgtcattctttcacttagatttttaggtaataaatgttcaaataagc-aatgaatttagcacaag 13827920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 195 - 607
Target Start/End: Original strand, 27960228 - 27960637
Alignment:
Q  195 aaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggattt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  ||||||| | ||||||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||| ||    
T  27960228 aaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaactacgtcggttttgatccctttccaaaaagggtacgtaggcagaggactt 27960325  T
Q  295 ttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaa-taagcaaa- 391  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||| ||     
T  27960326 gt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttt-aggaaataatttttcaaagtaagccaag 27960422  T
Q  392 tcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatcc 491  Q
    | |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27960423 tgaatttagcataagataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttaggatgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatcc 27960522  T
Q  492 aaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagcc 591  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27960523 aaagtctcgataaggg-ttttactcattttttcccttcccaagaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatcc 27960621  T
Q  592 gaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||| ||||||||    
T  27960622 gaaaatcgcgagcaca 27960637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Original strand, 25653891 - 25654339
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||  |||||    
T  25653891 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaatttttttagtggaact 25653987  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 346  Q
    || | ||||||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25653988 acgtcggttttgatccctttcccaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 25654085  T
Q  347 attctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 445  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||  || ||    
T  25654086 attctttcacttaaatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagaggttccttcggagtaccgaagtcg 25654185  T
Q  446 cttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatc 544  Q
     |||||||||| | ||||| ||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  25654186 tttagggtgcttaacacctaccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatt 25654285  T
Q  545 gagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    || |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  25654286 gaaagttcaaagattgatgattcaaatcaatcaatggtttgatatccgaaaatc 25654339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 9 - 361
Target Start/End: Original strand, 25692775 - 25693131
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaa-ttgaattaatattcataatagac 106  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  25692775 caaaaatattttcttaataaatcttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaaattgaattaatattcatattggac 25692874  T
Q  107 ttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttatttta-tctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatctta 204  Q
     ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| |||||| ||||| |||    
T  25692875 ctgattttcttgtaattaaaatttgaccaacctcatcttatttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaacc-attttctaaaat-tta 25692972  T
Q  205 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 304  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25692973 aaatcaacc-aacccaccaaaaaaaaactttttaggtgaactacattgattttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 25693071  T
Q  305 aaatcaaat---aaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga 361  Q
    |||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25693072 aaatcaaataaaaaaaaaaaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga 25693131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 9 - 361
Target Start/End: Original strand, 25699416 - 25699772
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaa-ttgaattaatattcataatagac 106  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  25699416 caaaaatattttcttaataaatcttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaaattgaattaatattcatattggac 25699515  T
Q  107 ttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttatttta-tctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatctta 204  Q
     ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| |||||| ||||| |||    
T  25699516 ctgattttcttgtaattaaaatttgaccaacctcatcttatttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaacc-attttctaaaat-tta 25699613  T
Q  205 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 304  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25699614 aaatcaacc-aacccaccaaaaaaaaactttttaggtgaactacattgattttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 25699712  T
Q  305 aaatcaaat---aaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga 361  Q
    |||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25699713 aaatcaaataaaaaaaaaaaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga 25699772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 148 - 607
Target Start/End: Original strand, 28304133 - 28304591
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa--tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||  ||||    
T  28304133 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccatttccaaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattcttgagtggaac 28304230  T
Q  246 tacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataacca-aaaacatacttcttctccct 344  Q
    ||| | ||||||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||| || |   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  28304231 tacgtcggttttgatccctttcccaaaagggtacgtaggcagaggacttgtt--cttccaaatcaaataaaaataacaagaaaacatacttcttctccct 28304328  T
Q  345 ccattctttcacttagatttttaggtaataatttt--caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatag 442  Q
    |||||||||||||||||  || ||| |||||||||  ||||| | ||| | | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  28304329 ccattctttcacttagacatt-aggcaataattttttcaaatgaacaagt-attttagcacaagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtag 28304426  T
Q  443 acgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaa 542  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  28304427 attcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgaaaagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaa 28304526  T
Q  543 tcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  28304527 tcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccaaaaatcgcgagcaca 28304591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 21358873 - 21358422
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||    
T  21358873 ttttatctcatgccttgaggtctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattttttagtggaact 21358777  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaa--gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 344  Q
    || | ||||||||||||||| |   ||  ||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21358776 acgtcggttttgatccctttcccaaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 21358679  T
Q  345 ccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataag-caaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatag 442  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  ||    
T  21358678 ccattctttcacttaga-ttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaag 21358580  T
Q  443 acgcttagggtgc-tagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaa- 540  Q
     || ||||||||| || ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  21358579 tcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacacccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaag 21358480  T
Q  541 aatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  21358479 aattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaatcaatggtttgatatccgaaaatc 21358422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 23962855 - 23962404
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||    
T  23962855 ttttatctcatgccttgaggtctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattttttagtggaact 23962759  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaa--gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 344  Q
    || | ||||||||||||||| |   ||  ||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23962758 acgtcggttttgatccctttcccaaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 23962661  T
Q  345 ccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataag-caaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatag 442  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  ||    
T  23962660 ccattctttcacttaga-ttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaag 23962562  T
Q  443 acgcttagggtgc-tagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaa- 540  Q
     || ||||||||| || ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  23962561 tcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacacccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaag 23962462  T
Q  541 aatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  23962461 aattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaatcaatggtttgatatccgaaaatc 23962404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 23982965 - 23982514
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||    
T  23982965 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattttttagtggaact 23982869  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaa--gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 344  Q
    || | ||||||||||||||| |   ||  ||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23982868 acgtcggttttgatccctttcccaaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 23982771  T
Q  345 ccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataag-caaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatag 442  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  ||    
T  23982770 ccattctttcacttaga-ttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaag 23982672  T
Q  443 acgcttagggtgc-tagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaa- 540  Q
     || ||||||||| || ||||||||||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  23982671 tcgtttagggtgcttaacaccttccctatttgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaag 23982572  T
Q  541 aatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  23982571 aattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaatcaatggtttgatatccgaaaatc 23982514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 373 - 607
Target Start/End: Original strand, 13827922 - 13828156
Alignment:
Q  373 taattttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgc 472  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13827922 taattttcaaataagcaa-tgaatttagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgc 13828020  T
Q  473 gtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataaggg-tttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaat 571  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13828021 gtaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggttttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaat 13828120  T
Q  572 caattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  13828121 caattaatggtttgatatccaaaaatcacgagcaca 13828156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 378 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 28267822 - 28267593
Alignment:
Q  378 ttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaac 477  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28267822 ttcaaataagcaaagcaatttagcacaagataaattaggtaagaggttcctacggagtaccgtagacgcttagggtgctagcaccttccctttgcgtaac 28267723  T
Q  478 caactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaatta 577  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  28267722 caacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcgaatcaatta 28267623  T
Q  578 atggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  28267622 atggtttgacatccgaaaatcacgagcaca 28267593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 378 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 28346571 - 28346342
Alignment:
Q  378 ttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaac 477  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28346571 ttcaaataagcaaagcaatttagcacaagataaattaggtaagaggttcctacggagtaccgtagacgcttagggtgctagcaccttccctttgcgtaac 28346472  T
Q  478 caactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaatta 577  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  28346471 caacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcgaatcaatta 28346372  T
Q  578 atggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  28346371 atggtttgacatccgaaaatcacgagcaca 28346342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 413 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 8719848 - 8719657
Alignment:
Q  413 taggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggttttt 512  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||    
T  8719848 taggaaagaggttcctatgggataacatagacgcttagggtgctaacaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtct---taagggttttt 8719752  T
Q  513 actcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8719751 actcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgagcaca 8719657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 419 - 607
Target Start/End: Original strand, 25699770 - 25699958
Alignment:
Q  419 agaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcat 518  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25699770 agagtttcctacggaataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgatgagggtttttactcat 25699869  T
Q  519 tttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25699870 tttttctcttcccaaaaataaaaatcgagagttcaaagattaaagattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgagcaca 25699958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 148 - 488
Target Start/End: Original strand, 28266420 - 28266758
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa--tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||   |||    
T  28266420 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccatttccaaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattcttgagtgtaac 28266517  T
Q  246 tacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    ||| | ||||||||||||||| |    |||||| ||||||| |||| || |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  28266518 tacgtcggttttgatccctttcccaacagggtacgtaggcagaggacttgtt--cttccaaatcaaataaaaataacagaaaacatacttcttctccctc 28266615  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataatttt--caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    ||||||||||||||||  || ||| |||||||||  ||||| | ||| | | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  28266616 cattctttcacttagacatt-aggcaataattttttcaaatgaacaagt-attttagcacaagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtaga 28266713  T
Q  444 cgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaa 488  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  28266714 tgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaa 28266758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 148 - 488
Target Start/End: Original strand, 28345169 - 28345507
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa--tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||   |||    
T  28345169 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccatttccaaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattcttgagtgtaac 28345266  T
Q  246 tacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    ||| | ||||||||||||||| |    |||||| ||||||| |||| || |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  28345267 tacgtcggttttgatccctttcccaacagggtacgtaggcagaggacttgtt--cttccaaatcaaataaaaataacagaaaacatacttcttctccctc 28345364  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataatttt--caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    ||||||||||||||||  || ||| |||||||||  ||||| | ||| | | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  28345365 cattctttcacttagacatt-aggcaataattttttcaaatgaacaagt-attttagcacaagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtaga 28345462  T
Q  444 cgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaa 488  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  28345463 tgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaa 28345507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 393 - 608
Target Start/End: Original strand, 11063824 - 11064035
Alignment:
Q  393 caattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatcca 492  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11063824 caatttagcacaagataaattaagtaaaaggttcctacggagtaccgtagacgcttagggtgctaacaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatcca 11063923  T
Q  493 aagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattc-aaatcaattaatggtttgatagcc 591  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  11063924 aagtct---taagggtttttactcattttttccc-tcccacgaat-aaaattgagagttcaaagattgacgattcaaaatcaattaatggtttgatatcc 11064018  T
Q  592 gaaaatcacgagcacac 608  Q
    |||||||||||||||||    
T  11064019 gaaaatcacgagcacac 11064035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 431 - 607
Target Start/End: Original strand, 5008128 - 5008304
Alignment:
Q  431 ggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgc 530  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  5008128 ggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttct 5008227  T
Q  531 cacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
     | ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5008228 tatgaataaatattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgagcaca 5008304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 388 - 598
Target Start/End: Original strand, 16097687 - 16097898
Alignment:
Q  388 caaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccg 486  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  || || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| ||||    
T  16097687 caaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaagtcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccg 16097786  T
Q  487 aatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttga 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  16097787 aatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaatcaatggtttga 16097886  T
Q  587 tagccgaaaatc 598  Q
    || |||||||||    
T  16097887 tatccgaaaatc 16097898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 475 - 598
Target Start/End: Original strand, 18587362 - 18587485
Alignment:
Q  475 aaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaa 574  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18587362 aaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaa 18587461  T
Q  575 ttaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    | |||||||||||| |||||||||    
T  18587462 tcaatggtttgatatccgaaaatc 18587485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 419 - 524
Target Start/End: Original strand, 25693129 - 25693234
Alignment:
Q  419 agaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcat 518  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25693129 agagtttcctacggaataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgatgagggtttttactcat 25693228  T
Q  519 tttttc 524  Q
    ||||||    
T  25693229 tttttc 25693234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 506 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 335388 - 335277
Alignment:
Q  506 ggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatca-cgagc 604  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  335388 ggtttttactcattttttccctttccacgaataaaaattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcagggagc 335289  T
Q  605 acacatattgat 616  Q
    ||| ||||||||    
T  335288 acagatattgat 335277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 535 - 607
Target Start/End: Original strand, 15141656 - 15141728
Alignment:
Q  535 aataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  15141656 aataaaaattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatctgaaaatcgcgagcaca 15141728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 537 - 599
Target Start/End: Original strand, 18842945 - 18843007
Alignment:
Q  537 taaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatca 599  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18842945 taaaaattgagagttcaaagattgacgatttaaaccaattaatggtttgatatccgaaaatca 18843007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 18753766 - 18753564
Alignment:
Q  10 aaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtg-tttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagactt 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||| || |||||||||||||||  ||||||||||| |||||  | ||||||| ||||   |||||    
T  18753766 aaaaatatttgcttaataaaccttggattttaactcaaatgttttttccttttatttctttaatcaaatgtttaatcaatttaatatccata--tgactt 18753669  T
Q  109 gatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctc-ttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaa 206  Q
    |  ||  || ||||||||||||||  ||| ||| |||||||| ||||||| || || ||||||| |||| || |||||||   |||||| |||| |||||    
T  18753668 gggtttcttataattaaaatttgaaaaacttcatcttattttctctcatgtcttgatgcctcttatctctttttaaaaactttttttcacaaatgttaaa 18753569  T
Q  207 atcaa 211  Q
    |||||    
T  18753568 atcaa 18753564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 187
Target Start/End: Original strand, 16089648 - 16089688
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacc 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  16089648 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc 16089688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 535; Significance: 0; HSPs: 51)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 535; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 18303463 - 18302861
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18303463 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 18303364  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa-tctta 204  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  18303363 cttgatttctttgtaattaaaattcgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaaatttta 18303264  T
Q  205 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18303263 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 18303164  T
Q  305 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcaca 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18303163 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaatttagcaca 18303064  T
Q  405 agataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataa 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  18303063 agataaattaggtaagaggttcctactgaataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcacgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgatga 18302964  T
Q  505 gggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagc 604  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18302963 gggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgagc 18302864  T
Q  605 aca 607  Q
    |||    
T  18302863 aca 18302861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Original strand, 13832513 - 13833113
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttcctttt-attttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatag 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13832513 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattag 13832612  T
Q  105 acttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctc--atgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatct 202  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  13832613 acttgattttcttgtaattaaaatgtgaacaacctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctttcttttcttaaaacccattttcaaaaatct 13832712  T
Q  203 taaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 302  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13832713 taaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttttcttaaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 13832810  T
Q  303 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagca 402  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  13832811 ccaaatcaaataaaa-taaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaa-tgaatttagca 13832908  T
Q  403 caagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgat 502  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13832909 caagataatttaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttccctttgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgat 13833008  T
Q  503 aagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacga 602  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13833009 aagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgatttaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacga 13833108  T
Q  603 gcaca 607  Q
    |||||    
T  13833109 gcaca 13833113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Original strand, 13840543 - 13841143
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttcctttt-attttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatag 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13840543 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattag 13840642  T
Q  105 acttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctc--atgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatct 202  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  13840643 acttgattttcttgtaattaaaatgtgaacaacctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctttcttttcttaaaacccattttcaaaaatct 13840742  T
Q  203 taaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 302  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13840743 taaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttttcttaaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 13840840  T
Q  303 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagca 402  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  13840841 ccaaatcaaataaaa-taaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaa-tgaatttagca 13840938  T
Q  403 caagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgat 502  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13840939 caagataatttaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttccctttgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgat 13841038  T
Q  503 aagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacga 602  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  13841039 aagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgatttaaatcaattaatggtttgatatctgaaaatcacga 13841138  T
Q  603 gcaca 607  Q
    |||||    
T  13841139 gcaca 13841143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 24186525 - 24185927
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24186525 ctcccaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 24186426  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatctta 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||  ||    
T  24186425 cttgacttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaact-attttcaaaaat--ta 24186329  T
Q  205 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 304  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24186328 aaatcaacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 24186231  T
Q  305 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagattttt-aggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcac 403  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||    
T  24186230 aaatcaagtaaaaataaccaaaaacatacttcttcttcccccattctttcacttagattttttaggtaataaatttcaaataagcaa-tgaatttagcac 24186132  T
Q  404 aa-gataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgat 502  Q
    || |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  24186131 aaagataaattaggtaagaggttcctacgggataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtcttgat 24186032  T
Q  503 aagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacga 602  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24186031 gagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacga 24185932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 1887327 - 1886732
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1887327 ctcccaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 1887228  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatctta 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||  ||    
T  1887227 cttgacttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaact-attttcaaaaat--ta 1887131  T
Q  205 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 304  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1887130 aaatcaacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 1887033  T
Q  305 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagattttt-aggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcac 403  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||    
T  1887032 aaatcaagtaaaaataaccaaaaacatacttcttccccc---attctttcacttagattttttaggtaataaatttcaaataagcaa-tgaatttagcac 1886937  T
Q  404 aa-gataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgat 502  Q
    || |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1886936 aaagataaattaggtaagaggttcctacgggataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgat 1886837  T
Q  503 aagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacga 602  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1886836 gagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacga 1886737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 1901428 - 1900833
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1901428 ctcccaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 1901329  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatctta 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||  ||    
T  1901328 cttgacttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaact-attttcaaaaat--ta 1901232  T
Q  205 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 304  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1901231 aaatcaacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 1901134  T
Q  305 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagattttt-aggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcac 403  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||    
T  1901133 aaatcaagtaaaaataaccaaaaacatacttcttccccc---attctttcacttagattttttaggtaataaatttcaaataagcaa-tgaatttagcac 1901038  T
Q  404 aa-gataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgat 502  Q
    || |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1901037 aaagataaattaggtaagaggttcctacgggataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgat 1900938  T
Q  503 aagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacga 602  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1900937 gagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacga 1900838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 4662290 - 4661688
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaa-taaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatag 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4662290 ctccaaaaatattttcttaaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatag 4662191  T
Q  105 acttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttatttta-tctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccatttt----caaaa 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||| |||||||||  |||||||| ||||||  ||||    |||||    
T  4662190 acttgatttctt-gtaattaaaatttgaccaacctcactttatttttctcttatgccttgaggcctctaatctcttcttaaaacctttttttttacaaaa 4662092  T
Q  199 atcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttat 298  Q
     | ||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4662091 ttgttaaaattaatccaacccaccaaaaagaaattttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcatagaatttttat 4661992  T
Q  299 ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattc 398  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  4661991 ccttccaaatcaaataaaaataacaaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaattt 4661893  T
Q  399 agcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtct 498  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4661892 agcacaagataatttaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtct 4661793  T
Q  499 cgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4661792 cgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaat-aaaatcgagagttcacag----acgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatc 4661698  T
Q  599 acgagcacac 608  Q
    ||||||||||    
T  4661697 acgagcacac 4661688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 17739789 - 17739183
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||| || |||| ||||    
T  17739789 ctccaaaaatattttcttaataaaccttgctttgtaacccaattgttttttcttttattttcttaatcaaatgcttaatcaatttaacatccatattaga 17739690  T
Q  106 cttga-tttctttgtaattaaaatttgaccaacctcacctta-ttttatctcatgcctggaggcctct-ttctcttctaaaaacc----cattttcaaaa 198  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||      |||||||||    
T  17739689 cttaattttctttttaattaaaatttgaccaacctcatcttatttttctctcatgccttgaggcctctaatctcttcttaaaaccttttttttttcaaaa 17739590  T
Q  199 atcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttat 298  Q
     | |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  || ||    
T  17739589 ttattaaaatcaatctaacccaccaaaaagaacttttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggaaaagga-gttaat 17739491  T
Q  299 ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-tttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaatt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17739490 ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagattttttaggcaataattttcaaataagcaaatgaatt 17739391  T
Q  398 cagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtc 497  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  17739390 tagcacaagataaattaggcaagaggttcctacggagtaccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaaatc 17739291  T
Q  498 tcgataagggtttttactca-ttttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaa 596  Q
    |   |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17739290 t---taagggtttttactcatttttttcccttctcacgaataaaaattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaa 17739194  T
Q  597 tcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||    
T  17739193 tcacgagcaca 17739183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 147 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 5199436 - 5198978
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa--tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaa 244  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||||||    
T  5199436 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaaaatcttaaaaccaacctaacccaccaaa--gaaatttttgaggtgaa 5199340  T
Q  245 ctacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 344  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5199339 ctacattggttttgatcccttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 5199241  T
Q  345 ccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| ||| | | || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5199240 ccattctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaaataaacaagt-agtttagcacaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccataga 5199143  T
Q  444 cgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaat 543  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  5199142 cgcttaggatgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcga-aagggtttttactcattttttcccttctcaagaataaaaat 5199044  T
Q  544 cgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcacaca 609  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  5199043 cgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccaaaaatcgcgagcacaca 5198978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 5208553 - 5208097
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa--tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaa 244  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||||||    
T  5208553 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaaaatcttaaaaccaacctaacccaccaaa--gaaatttttgaggtgaa 5208457  T
Q  245 ctacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 344  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5208456 ctacattggttttgatcccttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 5208358  T
Q  345 ccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| ||| | | || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5208357 ccattctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaaataaacaagt-agtttagcacaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccataga 5208260  T
Q  444 cgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaat 543  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  5208259 cgcttaggatgctagcaccttctcttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcga-aagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaat 5208161  T
Q  544 cgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  5208160 cgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccaaaaatcgcgagcaca 5208097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 233 - 607
Target Start/End: Original strand, 10449321 - 10449693
Alignment:
Q  233 tttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacata 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10449321 tttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacata 10449420  T
Q  333 cttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatg 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  10449421 cttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaatcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagagattcctatg 10449520  T
Q  432 gaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgcc 531  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  10449521 ggataccatagacgcttagggtgctagcatcttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtct---taagggttttcattcattttttcccttccc 10449617  T
Q  532 acgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  10449618 acgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatattcgaaaatcgcgagcaca 10449693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Original strand, 16545360 - 16545813
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  |||||    
T  16545360 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaaac-attttcagaaatattaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaact 16545456  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 346  Q
    || | ||||||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16545457 acgtcggttttgatccctttcccaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataatcagaaacatacttcttctccctcc 16545554  T
Q  347 attctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16545555 attctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatataggtaagaggttcctatggaataccatagacg 16545654  T
Q  446 cttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcg 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16545655 cttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaattcagagtct---taagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcg 16545751  T
Q  546 agagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16545752 agagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 16545813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 16620302 - 16619849
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  |||||    
T  16620302 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaaac-attttcagaaatattaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaact 16620206  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 346  Q
    || | ||||||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16620205 acgtcggttttgatccctttcccaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataatcagaaacatacttcttctccctcc 16620108  T
Q  347 attctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16620107 attctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatataggtaagaggttcctatggaataccatagacg 16620008  T
Q  446 cttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcg 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16620007 cttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaattcagagtct---taagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcg 16619911  T
Q  546 agagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16619910 agagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 16619849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 10 - 379
Target Start/End: Original strand, 10441978 - 10442350
Alignment:
Q  10 aaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttt--ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagact 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10441978 aaaattattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagact 10442077  T
Q  108 tgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttatttta-tctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatc-tta 204  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||  ||||   ||||  |||    
T  10442078 tgatttctt-gtaattaaaatttgaccaacctcatcttatttttctctcatgccttgaggcctctaatctcttcttaaaacctttttttttaaattgtta 10442176  T
Q  205 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 304  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10442177 aaatcaacc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 10442275  T
Q  305 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttt 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10442276 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttt 10442350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Original strand, 17211194 - 17211638
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||| |||||||||    
T  17211194 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaatcttaaaatcaacctaatccaccaaa--gaaatttttgaggtgaact 17211290  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 346  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||  ||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17211291 acatgggttttgatccgttt-cttcaagggtatgtaggcaggggaatcat-tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 17211388  T
Q  347 attctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 445  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  17211389 attcttttacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaggataatctaggtaagagggttttatggaataccatagacg 17211488  T
Q  446 cttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcg 545  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  17211489 cttagggtgctagcacattcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtct---taagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaatcg 17211585  T
Q  546 agagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17211586 agagttcaaagattgacgatttaaaccaattaatggtttgatatccgaaaatc 17211638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 148 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 16910089 - 16909646
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaacta 247  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||| ||||||    
T  16910089 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacctattttcaaaaatcataaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgaggggaacta 16909992  T
Q  248 cattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcca 347  Q
    | | ||||||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16909991 cgtcggttttgatccctttcccaaaagggtacgtaggcaaaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttccccctcca 16909894  T
Q  348 ttctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgct 447  Q
     |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  16909893 ctctttcacttagatttttagctaacaattttcaagtaagcaaatgattttagcacaagataagttaggtaagaggttcctacgggataccgtagacgct 16909794  T
Q  448 tagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgag 547  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16909793 tagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaagtcagagtct---taagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaatcgag 16909697  T
Q  548 agttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16909696 agttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatc 16909646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 147 - 612
Target Start/End: Original strand, 29096635 - 29097096
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||| ||  |||||    
T  29096635 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccatttcgaaaaatcttaaaatcaacctaacccactaaa--gaaatttttgagtggaact 29096732  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    || | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29096733 acgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 29096830  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataatttt--caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||   | || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29096831 cattctttcacttagatttt-aggtaataattttttcaaataagcaacaaagtt-agcacaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccataga 29096928  T
Q  444 cgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaat 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29096929 cgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcga-aggggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaat 29097027  T
Q  544 cgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcacacatat 612  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| ||||    
T  29097028 cgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatcgtgagcacatatat 29097096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 17514604 - 17514148
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  |||||    
T  17514604 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccatttcgaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaact 17514507  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    || | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17514506 acgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaccatacttcttctccctc 17514409  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagac 444  Q
    ||||||||||||||||  || ||| ||||||||| ||||||| ||| | | || ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17514408 cattctttcacttagacatt-aggcaataatttttcaaataaacaagt-agtttagcacaaaataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagac 17514311  T
Q  445 gcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatc 544  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17514310 gtttaggatgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaatc 17514211  T
Q  545 gagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  17514210 gagagttcaaagattgacgattcaaatcaatcaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 17514148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Original strand, 17538610 - 17539066
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  |||||    
T  17538610 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccatttcgaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaact 17538707  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    || | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17538708 acgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaccatacttcttctccctc 17538805  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagac 444  Q
    ||||||||||||||||  || ||| ||||||||| ||||||| ||| | | || ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17538806 cattctttcacttagacatt-aggcaataatttttcaaataaacaagt-agtttagcacaaaataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagac 17538903  T
Q  445 gcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatc 544  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17538904 gtttaggatgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaatc 17539003  T
Q  545 gagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  17539004 gagagttcaaagattgacgattcaaatcaatcaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 17539066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Original strand, 29081876 - 29082332
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||| ||  |||||    
T  29081876 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccatttcgaaaaatcttaaaatcaacctaacccactaaa--gaaatttttgagtggaact 29081973  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    || | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29081974 acgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 29082071  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataatttt--caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||   | || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29082072 cattctttcacttagatttt-aggtaataattttttcaaataagcaacaaagtt-agcacaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccataga 29082169  T
Q  444 cgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaat 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29082170 cgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcga-aggggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaat 29082268  T
Q  544 cgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||  |||||||    
T  29082269 cgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgacatctgaaaatcgtgagcaca 29082332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 147 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 27966214 - 27965753
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa--tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaa 244  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  |||    
T  27966214 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaa 27966118  T
Q  245 ctacattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccc 343  Q
    |||| | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27966117 ctacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccc 27966020  T
Q  344 tccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatag 442  Q
    ||||||||||||||||||  || ||| ||||||||| ||||||| ||| | | || ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27966019 tccattctttcacttagacatt-aggcaataatttttcaaataaacaagt-agtttagcacaaaataatctaggtaagaggttcctatggaataccatag 27965922  T
Q  443 acgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaa 542  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27965921 acgcttaggatgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaa 27965822  T
Q  543 tcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcacacata 611  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  27965821 tcgagagttcaaaggttgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatcgcgagcacacata 27965753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Original strand, 15185445 - 15185903
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa-tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||  ||||    
T  15185445 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattcttgagtggaac 15185542  T
Q  246 tacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    ||| | ||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15185543 tacgtcggttttgatcccttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 15185640  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataatttt--caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    ||||||||||||||||  || ||| |||| ||||  ||||||| ||| | | || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15185641 cattctttcacttagacatt-aggcaatatttttttcaaataaacaagt-agtttagcacaaaataatttaggtaagaggttcctatggaataccatgga 15185738  T
Q  444 cgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaat 543  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15185739 cgcttaggatgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaat 15185838  T
Q  544 cgagagttcaaagattaacgattcaaatcaatt-aatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  15185839 cgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaaatggtttgacatccgaaaatcgcgagcaca 15185903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 27975667 - 27975210
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa--tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaa 244  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  |||    
T  27975667 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaa 27975571  T
Q  245 ctacattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccc 343  Q
    |||| | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27975570 ctacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccc 27975473  T
Q  344 tccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatag 442  Q
    ||||||||||||||||||  || ||| ||||||||| ||||||| ||| | | || ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27975472 tccattctttcacttagacatt-aggcaataatttttcaaataaacaagt-agtttagcacaaaataatctaggtaagaggttcctatggaataccatag 27975375  T
Q  443 acgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaa 542  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27975374 acgcttaggatgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaa 27975275  T
Q  543 tcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  27975274 tcgagagttcaaaggttgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatcgcgagcaca 27975210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 147 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 16890005 - 16889548
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  |||||    
T  16890005 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaact 16889909  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    || | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16889908 acgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 16889811  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagac 444  Q
    ||||||||||||||||  || ||| ||||||||| ||| ||| ||| |   || ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16889810 cattctttcacttagacatt-aggcaataatttttcaagtaaacaagtagctt-agcacaaaataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagac 16889713  T
Q  445 gcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggt-ttttactcattttttcccttgccacgaataaaaat 543  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16889712 gcttaggatgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggttttttactcattttttcccttcccaagaataaaaat 16889613  T
Q  544 cgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcacac 608  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  16889612 cgagagttcaaagatcgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcacac 16889548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 297 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 4940401 - 4940091
Alignment:
Q  297 atccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  4940401 atccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataagcaa-tgaac 4940303  T
Q  397 tcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagt 496  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4940302 ttagcacaagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagaagcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagt 4940203  T
Q  497 ctcgataagggtttttactcatt-ttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaa 595  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  4940202 ctcgataagggtttttactcatttttttcccttcccacgaataaaaattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggcttgatatccgaaa 4940103  T
Q  596 atcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||    
T  4940102 atcacgagcaca 4940091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Original strand, 15200065 - 15200523
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa-tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||  ||||    
T  15200065 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattcttgagtggaac 15200162  T
Q  246 tacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    ||| | ||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15200163 tacgtcggttttgatcccttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 15200260  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataatttt--caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    ||||||||||||||||  || ||| |||| ||||  |||||||  || | | || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15200261 cattctttcacttagacatt-aggcaatatttttttcaaataaagaagt-agtttagcacaaaataatttaggtaagaggttcctatggaataccatgga 15200358  T
Q  444 cgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaat 543  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  15200359 cgcttaggatgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaat 15200458  T
Q  544 cgagagttcaaagattaacgattcaaatcaatt-aatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  15200459 cgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaaatggtttgacatccgaaaatcgcgagcaca 15200523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Original strand, 40679867 - 40680317
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa--tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaa 244  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| ||  |||    
T  40679867 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaaaatcttaaaatcaacctagcccaccaaa--gaaatttttgagtggaa 40679963  T
Q  245 ctacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 344  Q
    |||| | ||||||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40679964 ctacgtcggttttgatccctttcccaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 40680061  T
Q  345 ccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  ||     
T  40680062 ccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaagt 40680161  T
Q  444 cgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaa 542  Q
    || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40680162 cgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaa 40680261  T
Q  543 tcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  40680262 ttgagagttcaaagattgacgattcaaatcaatcaatggtttgatatccgaaaatc 40680317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Original strand, 29023320 - 29023770
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||  |  |||||    
T  29023320 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgtgtggaact 29023417  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    || | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29023418 acgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactt--atccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 29023515  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagc-aaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  ||     
T  29023516 cattctttcacttagatttt-aggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaagt 29023614  T
Q  444 cgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaa 542  Q
    || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29023615 cgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgacaagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaa 29023714  T
Q  543 tcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  29023715 ttgagagttcaaagattgacgattcaaatcaatcaatggtttgatatccgaaaatc 29023770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Original strand, 16227657 - 16228108
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||    
T  16227657 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattttttagtggaact 16227753  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    || | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16227754 acgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatactccttctccctc 16227851  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataag-caaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  ||     
T  16227852 cattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaagt 16227951  T
Q  444 cgcttagggtgc-tagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaat-aaaa 541  Q
    || ||||||||| || ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  16227952 cgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaa 16228051  T
Q  542 atcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16228052 attgagagttcaaagatttacgattcaaatcaatcaatggtttgatatccgaaaatc 16228108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 148 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 16120954 - 16120492
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa--tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||  ||||    
T  16120954 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcaaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattcttgagtggaac 16120857  T
Q  246 tacattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 344  Q
    ||| | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16120856 tacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 16120759  T
Q  345 ccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagc-aaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatag 442  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||  ||    
T  16120758 ccattctttcacttagatttt-aggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttagcacaagataatttaggtaagcggttccttcggagtaccgaag 16120660  T
Q  443 acgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaa 541  Q
     || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16120659 tcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaa 16120560  T
Q  542 atcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaatt--aatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16120559 attgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaaaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 16120492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 148 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 16147694 - 16147232
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa--tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||  ||||    
T  16147694 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcaaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattcttgagtggaac 16147597  T
Q  246 tacattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 344  Q
    ||| | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16147596 tacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 16147499  T
Q  345 ccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagc-aaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatag 442  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||  ||    
T  16147498 ccattctttcacttagatttt-aggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttagcacaagataatttaggtaagcggttccttcggagtaccgaag 16147400  T
Q  443 acgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaa 541  Q
     || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16147399 tcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaa 16147300  T
Q  542 atcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaatt--aatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16147299 attgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaaaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 16147232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 597
Target Start/End: Original strand, 43600353 - 43600939
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagact 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||  | |||| ||||||    
T  43600353 caaaaatattttcttaagaaaccttggattttaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaatcaatttaacctccatattagact 43600452  T
Q  108 tg-atttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctcttt-ctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaa 205  Q
    || |||||||  ||||||||||||  |||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||   ||||||||||| ||||    
T  43600453 tggatttctta-taattaaaatttagccaatctcatcttattttctctcatgccttgaggcctcttagctcttcttaaaactttttttcaaaaatgttaa 43600551  T
Q  206 aatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcca 305  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||| ||  |||||||   ||||||||||||||  ||||| ||||| |||| || |||||||  |||||||||    
T  43600552 aatcaatccaacccaccaaaaagaa-cttttgagtggaactacgacggttttgatcccttcccttta-gggtacgtagtcaaaggattt--atccttcca 43600647  T
Q  306 aatcaaataaaaataaccaaaa-acatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcaca 404  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  43600648 aatcaaataaaaacaacaaaaaaacatacttcttctccctccattctttcacctagactcttaggcaataattttcaaataagcaaaataatttagcaca 43600747  T
Q  405 agataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgc-tagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgata 503  Q
    |||||| ||||| || ||||||||| |||||||| ||| ||  |||||||| |   |||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||  |     
T  43600748 agataagttaggcaataggttcctacggaataccgtagtcgtgtagggtgcgtcaaaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctc--tt 43600845  T
Q  504 agggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaat 597  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43600846 aaggtttttactcattttttcccttcccacggataaaagttgagagttcgaagattgaagattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaat 43600939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 44075472 - 44075014
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttc--aaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaa 244  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  |||    
T  44075472 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcgaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaa 44075375  T
Q  245 ctacattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccc 343  Q
    |||| | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| || |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44075374 ctacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cctcccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccc 44075277  T
Q  344 tccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatag 442  Q
    |||||||||||||| |||  || ||| ||||||||| ||||||| ||| |   || ||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| |||    
T  44075276 tccattctttcactcagacatt-aggcaataatttttcaaataaacaagtagctt-agcacaagataatctaggtaagaggttcctacgaaataccgtag 44075179  T
Q  443 acgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaa 542  Q
    | ||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  44075178 atgcttaggatgctagcactttcacttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgaaaagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaa 44075079  T
Q  543 tcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  44075078 tcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccaaaaatcgcgagcaca 44075014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Original strand, 16244535 - 16244986
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||    
T  16244535 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattttttagtggaact 16244631  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    || | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16244632 acgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatactccttctccctc 16244729  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataag-caaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  ||     
T  16244730 cattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaagt 16244829  T
Q  444 cgcttagggtgc-tagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaat-aaaa 541  Q
    || ||||||||| || ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  16244830 cgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaa 16244929  T
Q  542 atcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16244930 attgagagtttaaagattgacgattcaaatcaatcaatggtttgatatccgaaaatc 16244986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 148 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 558712 - 558254
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttc--aaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||  ||||    
T  558712 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcgaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattcttgagtggaac 558615  T
Q  246 tacattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 344  Q
    ||| | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  558614 tacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaagcatacttcttctccct 558517  T
Q  345 ccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    |||||||||||||||||  || ||| ||||||||| ||||||| ||| | | || ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  ||     
T  558516 ccattctttcacttagacatt-aggcaataatttttcaaataaacaagt-agtttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaagt 558419  T
Q  444 cgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaa 542  Q
    || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  558418 cgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaa 558319  T
Q  543 tcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  558318 ttgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 558254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 148 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 568622 - 568164
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttc--aaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||  ||||    
T  568622 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcgaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattcttgagtggaac 568525  T
Q  246 tacattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 344  Q
    ||| | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  568524 tacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaagcatacttcttctccct 568427  T
Q  345 ccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    |||||||||||||||||  || ||| ||||||||| ||||||| ||| | | || ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  ||     
T  568426 ccattctttcacttagacatt-aggcaataatttttcaaataaacaagt-agtttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaagt 568329  T
Q  444 cgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaa 542  Q
    || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  568328 cgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaa 568229  T
Q  543 tcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  568228 ttgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 568164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Original strand, 2548852 - 2549310
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa-tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  ||||    
T  2548852 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaac 2548948  T
Q  246 tacattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 344  Q
    ||| | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2548949 tacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaagcatacttcttctccct 2549046  T
Q  345 ccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    |||||||||||||||||  || ||| ||||||||| ||||||| ||| | | || ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  ||     
T  2549047 ccattctttcacttagacatt-aggcaataatttttcaaataaacaagt-agtttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaagt 2549144  T
Q  444 cgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcatttt-ttcccttgccacgaataaaa 541  Q
    || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2549145 cgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcatttttttcccttcccacgaataaaa 2549244  T
Q  542 atcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  2549245 attgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 2549310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Original strand, 2562738 - 2563196
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa-tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  ||||    
T  2562738 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaac 2562834  T
Q  246 tacattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 344  Q
    ||| | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2562835 tacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaagcatacttcttctccct 2562932  T
Q  345 ccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    |||||||||||||||||  || ||| ||||||||| ||||||| ||| | | || ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  ||     
T  2562933 ccattctttcacttagacatt-aggcaataatttttcaaataaacaagt-agtttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaagt 2563030  T
Q  444 cgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcatttt-ttcccttgccacgaataaaa 541  Q
    || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2563031 cgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcatttttttcccttcccacgaataaaa 2563130  T
Q  542 atcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  2563131 attgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 2563196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Original strand, 27435152 - 27435605
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||| ||  |||||    
T  27435152 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccatttcgaaaaatcttaaaatcaacctaacccactaaa--gaaatttttgagtggaact 27435249  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    || | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  27435250 acgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacataattcttctctctc 27435347  T
Q  346 cattctttcacttagattttt-aggtaataatttt-caaataagcaaa-tcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatag 442  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||| | |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  ||    
T  27435348 cattcttttacttagattttttaggtaataatttttcgagtaagcaaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaag 27435447  T
Q  443 acgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaa 541  Q
     || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  27435448 tcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccatgaataaaa 27435547  T
Q  542 atcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaa-ttaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  27435548 attgagagttcaaagattgacgattcaaatcaagtaaatggtttgatatccgaaaatc 27435605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Original strand, 27444182 - 27444635
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||| ||  |||||    
T  27444182 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccatttcgaaaaatcttaaaatcaacctaacccactaaa--gaaatttttgagtggaact 27444279  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    || | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  27444280 acgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacataattcttctctctc 27444377  T
Q  346 cattctttcacttagattttt-aggtaataatttt-caaataagcaaa-tcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatag 442  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||| | |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  ||    
T  27444378 cattcttttacttagattttttaggtaataatttttcgagtaagcaaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaag 27444477  T
Q  443 acgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaa 541  Q
     || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  27444478 tcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttctcttcccatgaataaaa 27444577  T
Q  542 atcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaa-ttaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  27444578 attgagagttcaaagattgacgattcaaatcaagtaaatggtttgatatccgaaaatc 27444635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 147 - 523
Target Start/End: Original strand, 29031758 - 29032133
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||  |  |||||    
T  29031758 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgtgtggaact 29031855  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    || | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29031856 acgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactt--atccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 29031953  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataag-caaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||||| ||||| |  ||| ||||  ||     
T  29031954 cattctttcacttaga-ttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttcgttcggagtaccgaagt 29032052  T
Q  444 cgcttagggtgc-tagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcatttttt 523  Q
    || ||||||||| || ||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29032053 cgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgacaagggtttttactcatttttt 29032133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 329 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 19384187 - 19383909
Alignment:
Q  329 catacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcc 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||| ||||||| ||| | | || ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  19384187 catacttcttctccctccattctttcacttagacatt-aggcaataatttttcaaataaacaagt-agtttagcacaagataatctaggtaagaggttcc 19384090  T
Q  428 tatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttccct 527  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19384089 tatggaataccatagacgcttaggatgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatcc-aagtctcgataagggtttttactcattttttccct 19383991  T
Q  528 tgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatc-aattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcacac 608  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  19383990 tcccaagaataaaaatcgagagttcaaagatcgacgattcaaatcaaatcaatggtttgacatccgaaaatcgcgagcacac 19383909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 378 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 13492106 - 13491880
Alignment:
Q  378 ttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaac 477  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13492106 ttcaaataagcaaagcaatttagcacaagatgaattaggtaaaaggttcctacggagtaccgtagacgcttagggtgctaacaccttcccttcgcgtaac 13492007  T
Q  478 caactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaatta 577  Q
    |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13492006 caacccccgaatccaaagtct---taagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaatta 13491910  T
Q  578 atggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  13491909 attgtttgatatccgaaaatcacgagcaca 13491880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 149 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 36477026 - 36476574
Alignment:
Q  149 ttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactac 248  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||     |||| ||  ||||||     
T  36477026 ttatctcatgccttgaggcccctttctcttcttaaaacccattttcaaaattaataaaatcaacctaacccaccaaaaa-----ttttgagtggaactat 36476932  T
Q  249 attggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaa-taacca-aaaacatacttcttctccctcc 346  Q
     | ||||||||||||||| |   ||||||| ||||||| | || |  |  |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  36476931 gtcggttttgatccctttccaaaaagggtacgtaggcaaatgactcgt--ccttccaaatcaaataaaaaataacaacaaaacatacttcttctccctcc 36476834  T
Q  347 attctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 445  Q
    |||||||||||||||  ||  || ||||||||| ||||| | ||| | |||| |||| | ||||| ||||||||| ||||| |  ||| ||||  || ||    
T  36476833 attctttcacttagacattg-ggcaataatttttcaaatgaacaagt-aatttagcaaatgataatttaggtaagcggttcattcggagtaccgaagtcg 36476736  T
Q  446 cttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatc 544  Q
     |||||||||| |  |||||||||  ||| ||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36476735 tttagggtgcttaataccttccctatgcgaaaccaacccccggatctaaagtctc-ataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatc 36476637  T
Q  545 gagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  36476636 gagagttcaaagattgaagattcaaatcaattaatggtttgatatctgaaaatcacgagcaca 36476574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 33533758 - 33533462
Alignment:
Q  10 aaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtg-tttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagactt 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||| |||| |||||||    
T  33533758 aaaaatattttcttagtaaaccttggattttaacccaagtgctttttccttttattttcttaatcaaatgtttaatcaatttaatatccatattagactt 33533659  T
Q  109 gatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaa 207  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| |  |||||    
T  33533658 gaatttcttgtaattaaaatttgaccaacctcatcttattttctctcatgccttgaagcctcttatctcttcttcaaa-ccattttcaaaacttctaaaa 33533560  T
Q  208 tcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaa 307  Q
    |||| | ||||||||  ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||    
T  33533559 tcaatccaacccacc--aaagaaattccttaggggaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcaaagga-gttaatccttccaaa 33533463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 416 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 13478255 - 13478068
Alignment:
Q  416 gtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttact 515  Q
    |||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  13478255 gtaaaaggttcctacggagtaccgtagacgcttagggtgctaacaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtct---taagggtttttact 13478159  T
Q  516 cattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13478158 cattttttccctc-ccacaaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgagcaca 13478068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 528
Target Start/End: Original strand, 4323562 - 4324083
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtg-tttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatag 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||| |||| |||    
T  4323562 ctccaaaaatattttcttattaaaccttggattttaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgtttaatcaatttaatatccatattag 4323661  T
Q  105 actt-gatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcacctta-ttttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacc-cattttcaaaaat 200  Q
     ||| |||||| ||| |||||||| || |||||| ||| |||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||   |||||||||||    
T  4323662 gcttggatttc-ttgcaattaaaa-ttaaccaacttcatcttatttttctctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaacctttttttcaaaaat 4323759  T
Q  201 cttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttag-gtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatc 299  Q
     |||||||||| |||||||||||||    || |||| || | |||||||| || ||||||| || ||| |    || |||||||||| |||||||   ||    
T  4323760 gttaaaatcaatctaacccaccaaa---taatttttgagagagaactacaatgattttgattccatttgt----ggatatgtaggcaaaggatttcattc 4323852  T
Q  300 cttcca----aatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaa 395  Q
    ||||||    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||| | ||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  4323853 cttccaaatcaatcaaataaaaacaa-caaaaacatacttcttctcccccctttctttcatctagactcttaggcaataattttcaaataagcaaaataa 4323951  T
Q  396 ttcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgc-tagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaa 494  Q
    || |||| ||| |||| |||| ||||||||||||  ||||| | ||| || || |||||| || |||||||||||   | ||||||| || | |||||||    
T  4323952 tttagcaaaagttaaagtaggcaagaggttcctacagaatatcgtagtcgattcgggtgcttaacaccttcccttattgaaaccaacccctggatccaaa 4324051  T
Q  495 gtctcgataagggtttttactcattttttccctt 528  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4324052 gtctc-ataaggatttttact-attttttccctt 4324083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 447 - 598
Target Start/End: Original strand, 38255625 - 38255777
Alignment:
Q  447 ttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcg 545  Q
    |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  38255625 ttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaattg 38255724  T
Q  546 agagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38255725 agagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatc 38255777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 447 - 598
Target Start/End: Original strand, 38263200 - 38263352
Alignment:
Q  447 ttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcg 545  Q
    |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  38263200 ttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaattg 38263299  T
Q  546 agagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38263300 agagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatc 38263352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 413 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 48498706 - 48498506
Alignment:
Q  413 taggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttt 511  Q
    |||||||| |||||||  ||| ||||  || || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48498706 taggtaagcggttccttcggagtaccgaagtcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttt 48498607  T
Q  512 tactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcacacata 611  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||| |||    
T  48498606 tactcattttttcccttcccacgaataaaaattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatcgcgaacacaaata 48498507  T
Q  612 t 612  Q
    |    
T  48498506 t 48498506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 404 - 599
Target Start/End: Original strand, 43139053 - 43139246
Alignment:
Q  404 aagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgata 503  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||    
T  43139053 aagataaattaggcaagaggttcctacgaaataccgtagacgcttaggatgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatcc-aagtctc--ta 43139149  T
Q  504 agggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaa-atcaattaatggtttgatagccgaaaatca 599  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||| | | ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  43139150 agggtttttactcactttttcctttcccacgaataaaagttgagagttcaaagattgaaggttcaataccaattgatggtttgatacccgaaaatca 43139246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 524; Significance: 0; HSPs: 53)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 524; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 43597109 - 43596506
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43597109 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 43597010  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa-tctta 204  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43597009 cttgatttctttgtaattaaaattcgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctctttcccttctaaaaacccattttcaaaaaatctta 43596910  T
Q  205 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43596909 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 43596810  T
Q  305 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcac 403  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||    
T  43596809 aaatcaaataaaaataaacaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagacttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcac 43596710  T
Q  404 aagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgata 503  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43596709 aagataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgata 43596610  T
Q  504 agggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgag 603  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  43596609 agggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatgatttgatatccgaaaatcacgag 43596510  T
Q  604 caca 607  Q
    ||||    
T  43596509 caca 43596506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 524; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 43629903 - 43629300
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43629903 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 43629804  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa-tctta 204  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43629803 cttgatttctttgtaattaaaattcgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctctttcccttctaaaaacccattttcaaaaaatctta 43629704  T
Q  205 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43629703 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 43629604  T
Q  305 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcac 403  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||    
T  43629603 aaatcaaataaaaataaacaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagacttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcac 43629504  T
Q  404 aagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgata 503  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43629503 aagataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgata 43629404  T
Q  504 agggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgag 603  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  43629403 agggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatgatttgatatccgaaaatcacgag 43629304  T
Q  604 caca 607  Q
    ||||    
T  43629303 caca 43629300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 483; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 607
Target Start/End: Original strand, 31423523 - 31424125
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtg----tttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatag 104  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31423523 caaaaatgttttcttaataaaacttggtttgtaatccaagtcactttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatag 31423622  T
Q  105 acttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaa-atctt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31423623 acttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctctttcccttctaaaaacccattttcaaaaaatctt 31423722  T
Q  204 aaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31423723 aaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgcaggcataggatttttatccttc 31423822  T
Q  304 caaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcac 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||    
T  31423823 caaatcaaataaaaataaccaaaaacacactttttctccctccattctttcatttagacttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaattaaacac 31423921  T
Q  404 aagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgata 503  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31423922 aagataaattagataagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgata 31424021  T
Q  504 agggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgag 603  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31424022 agggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgag 31424121  T
Q  604 caca 607  Q
    ||||    
T  31424122 caca 31424125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 481; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 612
Target Start/End: Original strand, 31412620 - 31413224
Alignment:
Q  10 aaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagt-gtttttccttttattttcttaatcaaa-tgcttaattgaattaatattcataatagact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31412620 aaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagttgcttttccttttattttcttaatcaaaatgcttaattgaattaatattcataatagact 31412719  T
Q  108 tgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctc-atgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa-tcttaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31412720 tgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctctatgccttgaggcctctttctcttctaaaaatccattttcaaaaaatcttaa 31412819  T
Q  206 aatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcca 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31412820 aatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcca 31412919  T
Q  306 aatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttt-taggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcaca 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||    
T  31412920 aatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccc--cattctttcacttagattttctaggtaataattttcaaataagcaa-tgaacttagcaca 31413016  T
Q  405 agataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataa 504  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  31413017 agataagttaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccgacccccgaatccaaagtctcgataa 31413116  T
Q  505 gggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagc 604  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31413117 gggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgagc 31413216  T
Q  605 acacatat 612  Q
    ||| ||||    
T  31413217 acatatat 31413224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 465; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 608
Target Start/End: Original strand, 28853559 - 28854163
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttcctttt-attttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatag 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28853559 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattag 28853658  T
Q  105 acttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctc--atgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatct 202  Q
    |||||||||  ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  28853659 acttgattttcttgtaattaaaacgtgaacaacctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctttcttttcttaaaacccattttcaaaaatct 28853758  T
Q  203 taaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttt-tatcct 301  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28853759 taaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggattttttatcct 28853856  T
Q  302 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagc 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  28853857 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaagtaagcaaatcaatttagc 28853956  T
Q  402 acaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcga 501  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  28853957 acaaggtaaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttccctttgcataaccaacccccgaatccaaagtctcga 28854056  T
Q  502 taagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacg 601  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28854057 tgagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcatatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacg 28854156  T
Q  602 agcacac 608  Q
    |||||||    
T  28854157 agcacac 28854163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 464; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 1727221 - 1726619
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagt-gtttttccttttatttt-cttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataata 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1727221 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggcttgtaacccaagttgcttttccttttatttttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataata 1727122  T
Q  104 gacttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatct 202  Q
    ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| |||||| |||||||    
T  1727121 gacctgattttcttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaacc-attttctaaaatct 1727023  T
Q  203 taaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 302  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1727022 -aaaatcaacc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 1726925  T
Q  303 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagattttt--aggtaataattttcaaataagcaaatcaattcag 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  1726924 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttttaggtaataattttcaaataagcaa-tgaatttag 1726826  T
Q  401 cacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcg 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1726825 cacaagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcg 1726726  T
Q  501 ataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcac 600  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  1726725 atgagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcagttaatggtttgatatccgaaaatcac 1726626  T
Q  601 gagcaca 607  Q
    |||||||    
T  1726625 gagcaca 1726619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 464; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 24955895 - 24955293
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttcctttt-attttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatag 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  24955895 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattaa 24955796  T
Q  105 acttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctc--atgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatct 202  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  24955795 acttgattttcttgtaattaaaatgtgaacaacctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctttcttttcttaaaacccattttcaaaaatct 24955696  T
Q  203 taaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 302  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24955695 taaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 24955598  T
Q  303 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagca 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  24955597 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcctccattctttcacttagatttttagataataattttcaaataagcaaatcagtttagca 24955498  T
Q  403 caagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgat 502  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24955497 caag-taaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgat 24955399  T
Q  503 aagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacga 602  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  24955398 aagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggcttgatatccgaaaatcacga 24955299  T
Q  603 gcacac 608  Q
    ||||||    
T  24955298 gcacac 24955293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 464; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Original strand, 28844949 - 28845552
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttcctttt-attttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatag 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28844949 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattag 28845048  T
Q  105 acttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctc--atgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatct 202  Q
    |||||||||  ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  28845049 acttgattttcttgtaattaaaacgtgaacaacctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctttcttttcttaaaacccattttcaaaaatct 28845148  T
Q  203 taaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttt-tatcct 301  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28845149 taaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggattttttatcct 28845246  T
Q  302 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagc 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  28845247 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaagtaagcaaatcaatttagc 28845346  T
Q  402 acaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcga 501  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  28845347 acaaggtaaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttccctttgcataaccaacccccgaatccaaagtctcga 28845446  T
Q  502 taagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacg 601  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28845447 tgagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcatatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacg 28845546  T
Q  602 agcaca 607  Q
    ||||||    
T  28845547 agcaca 28845552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 463; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 24964355 - 24963754
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttcctttt-attttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatag 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  24964355 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattaa 24964256  T
Q  105 acttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctc--atgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatct 202  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  24964255 acttgattttcttgtaattaaaatgtgaacaacctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctttcttttcttaaaacccattttcaaaaatct 24964156  T
Q  203 taaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 302  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24964155 taaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 24964058  T
Q  303 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagca 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  24964057 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcctccattctttcacttagatttttagataataattttcaaataagcaaatcagtttagca 24963958  T
Q  403 caagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgat 502  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24963957 caag-taaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgat 24963859  T
Q  503 aagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacga 602  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  24963858 aagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggcttgatatccgaaaatcacga 24963759  T
Q  603 gcaca 607  Q
    |||||    
T  24963758 gcaca 24963754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 612
Target Start/End: Original strand, 19225643 - 19226231
Alignment:
Q  17 ttttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgatttctt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  19225643 ttttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtatttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattagacttgattttct 19225742  T
Q  117 tgtaattaaaatttgaccaacctcaccttatttta-tctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacct 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  19225743 tgtaattaaaatttgaccaacctcatcttatttttctctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaacc-attttcaaaaat--taaaatcaacct 19225839  T
Q  215 aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaata 314  Q
    |||||||| ||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19225840 aacccaccgaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctttcaaatcaaata 19225937  T
Q  315 aaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-tttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaatt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  19225938 aaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagattttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaagataaatt 19226036  T
Q  414 aggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggttttta 513  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    ||||||||||||    
T  19226037 aggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttagggtgctagcacctccccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtc----taagggttttta 19226132  T
Q  514 ctcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcacacatat 612  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  19226133 ctcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgatttaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgagcacatatat 19226231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 20396846 - 20396266
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20396846 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 20396747  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatctta 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| || ||||| |||||| |||||| ||||| |||    
T  20396746 cttgatttctt-gtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctgatgccttgaggcttcttatcccttcttaaaacc-attttctaaaat-tta 20396650  T
Q  205 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 304  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20396649 aaatcaacc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggattttcatccttcc 20396551  T
Q  305 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcaca 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||      |||||             ||||||    
T  20396550 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagacttttaggtaata------aaata-------------agcaca 20396470  T
Q  405 agataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataa 504  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20396469 agataaattaggcaagaggttcctacggaataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgataa 20396370  T
Q  505 gggtttttactca-ttttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgag 603  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20396369 gggttttcactcatttttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgag 20396270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 148 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 41094010 - 41093548
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaacta 247  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41094010 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaacta 41093911  T
Q  248 cattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcca 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41093910 cattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcca 41093811  T
Q  348 ttctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgc 446  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  41093810 ttctttcaattatacttttaggtaataatttttcaaataagcaaatcaatttagcacaagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgc 41093711  T
Q  447 ttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactca--ttttttcccttgccacgaataaaaatc 544  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  41093710 ttagggtgctagcacctccccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttttcccttcccacgaataaaaatc 41093611  T
Q  545 gagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  41093610 gagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcaggagcaca 41093548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 20371143 - 20370578
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20371143 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 20371044  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatctta 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| || ||||| |||||| |||||| ||||| |||    
T  20371043 cttgatttctt-gtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctgatgccttgaggcttcttatcccttcttaaaacc-attttctaaaat-tta 20370947  T
Q  205 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 304  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20370946 aaatcaacc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggattttcatccttcc 20370848  T
Q  305 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcaca 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||      ||||||||||             |    
T  20370847 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagacttttaggtaata------aaataagcaa-------------a 20370767  T
Q  405 agataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataa 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||               | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20370766 agataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttag---------------ctttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgataa 20370682  T
Q  505 gggtttttactca-ttttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgag 603  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20370681 gggttttcactcatttttttcccttcccatgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgag 20370582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 33835586 - 33835130
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||    
T  33835586 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaaccattttaaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgaggtgaact 33835489  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33835488 acattggttttgatcccttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 33835390  T
Q  347 attctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 445  Q
    |||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| ||| | |  | ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  33835389 attctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaaataaacaagt-agcttagcacaagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagatg 33835292  T
Q  446 cttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcg 545  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  33835291 cttaggatgctagcaccttcctttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgaaaagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaatcg 33835192  T
Q  546 agagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  33835191 agagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccaaaaatcgcgagcaca 33835130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 33844285 - 33843829
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||    
T  33844285 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaaccattttaaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgaggtgaact 33844188  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 346  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33844187 acattggttttgatcccttt-ctttaagggtatgtaggcatatgatttttatccttccaaatcaaataaaagtaaccaaaaacatacttcttctccctcc 33844089  T
Q  347 attctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 445  Q
    |||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| ||| | |  | ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  33844088 attctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaaataaacaagt-agcttagcacaagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagatg 33843991  T
Q  446 cttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcg 545  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  33843990 cttaggatgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgaaaagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaatcg 33843891  T
Q  546 agagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||    
T  33843890 agagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccaaaaatcgggagcaca 33843829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Original strand, 20377654 - 20378111
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa-tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||    
T  20377654 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgaggtgaac 20377750  T
Q  246 tacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 344  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  20377751 tacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataactaaaagcatacttcttctccct 20377850  T
Q  345 ccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| ||| | |  | ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20377851 ccattctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaaataaacaagt-agcttagcacaagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtaga 20377948  T
Q  444 cgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaat 543  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  20377949 tgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaaccctcgaatccaaagtctcgaaaagggtttttactcatttttt-ccttcccaagaataaaaat 20378047  T
Q  544 cgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
     ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  20378048 tgagagttcaaagatcgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatcgcgagcaca 20378111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Original strand, 20386443 - 20386900
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa-tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||    
T  20386443 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgaggtgaac 20386539  T
Q  246 tacattggttttgatccctttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 344  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  20386540 tacattggttttgatccctttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataactaaaagcatacttcttctccct 20386639  T
Q  345 ccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| ||| | |  | ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20386640 ccattctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaaataaacaagt-agcttagcacaagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtaga 20386737  T
Q  444 cgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaat 543  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  20386738 tgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaaccctcgaatccaaagtctcgaaaagggtttttactcatttttt-ccttcccaagaataaaaat 20386836  T
Q  544 cgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
     ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  20386837 tgagagttcaaagatcgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatcgcgagcaca 20386900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 148 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 26088791 - 26088336
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaacta 247  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||  ||||||    
T  26088791 tttatctcatgccttgaggcctctttctattcttaaaacc-attttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattcttgagtggaacta 26088695  T
Q  248 cattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcca 347  Q
    | | ||||||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26088694 cgtcggttttgatccctttccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaatagccaaaaacatacttcttctccctcca 26088597  T
Q  348 ttctttcacttagatttttaggtaataat-tttcaaa-taagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 445  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||  | || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26088596 ttttttcacttagatttt-aggtaataatctttcaaagtaagccaagtagtttagcacaaaataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 26088498  T
Q  446 cttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcg 545  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  26088497 cttaggatgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaatcg 26088398  T
Q  546 agagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  26088397 agagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 26088336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 148 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 26078812 - 26078357
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaacta 247  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||  ||||||    
T  26078812 tttatctcatgccttgaggcctctttctattcttaaaacc-attttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattcttgagtggaacta 26078716  T
Q  248 cattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcca 347  Q
    | | ||||||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26078715 cgtcggttttgatccctttccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaatagccaaaaacatacttcttctccctcca 26078618  T
Q  348 ttctttcacttagatttttaggtaataat-tttcaaa-taagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 445  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||  | || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26078617 ttttttcacttagatttt-aggtaataatctttcaaagtaagccaagtagtttagcacaaaataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 26078519  T
Q  446 cttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcg 545  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  26078518 cttaggatgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggttttcactcattttttcccttcccaagaataaaaatcg 26078419  T
Q  546 agagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  26078418 agagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 26078357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 298 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 23348851 - 23348538
Alignment:
Q  298 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaatt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23348851 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtagtaattttcaaataagcaaatcaatt 23348752  T
Q  398 cagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtc 497  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  23348751 tagcacaagataatttaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaaccctcgaatccaaagtc 23348652  T
Q  498 tcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaat 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  23348651 tcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgatagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaatt 23348552  T
Q  598 cacgagcacacata 611  Q
    ||||||||||||||    
T  23348551 cacgagcacacata 23348538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 148 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 11812880 - 11812423
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttc--aaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||  ||||    
T  11812880 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcgaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattcttgagtggaac 11812783  T
Q  246 tacattggttttgatcccttt-tctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 344  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11812782 tacgtcggttttgatccctttctcaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 11812685  T
Q  345 ccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    |||||||||||||||||  || ||| |||| |||| ||||||| ||| | | || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11812684 ccattctttcacttagacgtt-aggcaatattttttcaaataaacaagt-agtttagcacaaaataatctaggtaagaggttcctatggaataccataga 11812587  T
Q  444 cgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaat 543  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  11812586 cgcttaggatgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaat 11812487  T
Q  544 cgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  11812486 cgagagttcaaagatcgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatcgcgagcaca 11812423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 148 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 11802804 - 11802347
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttc--aaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||  ||||    
T  11802804 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcgaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattcttgagtggaac 11802707  T
Q  246 tacattggttttgatcccttt-tctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 344  Q
    ||| | ||||||||||| ||| ||   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11802706 tacgtcggttttgatccatttctcaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 11802609  T
Q  345 ccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    |||||||||||||||||  || ||| |||| |||| ||||||| ||| | | || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11802608 ccattctttcacttagacgtt-aggcaatattttttcaaataaacaagt-agtttagcacaaaataatctaggtaagaggttcctatggaataccataga 11802511  T
Q  444 cgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaat 543  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  11802510 cgcttaggatgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaat 11802411  T
Q  544 cgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  11802410 cgagagttcaaagatcgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatcgcgagcaca 11802347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 148 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 12170587 - 12170129
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttc---aaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaa 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||  |||    
T  12170587 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcgaaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattcttgagtggaa 12170490  T
Q  245 ctacattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccc 343  Q
    |||| | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12170489 ctacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccc 12170392  T
Q  344 tccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatag 442  Q
    ||||||||||||||||||  || ||| |||| |||| ||||||| ||| | | || ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12170391 tccattctttcacttagacgtt-aggcaatattttttcaaataaacaagt-agtttagcacaaaataatctaggtaagaggttcctatgaaataccatag 12170294  T
Q  443 acgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaa 542  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  12170293 acgcttaggatgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaa 12170194  T
Q  543 tcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  12170193 tcgagagttcaaagatcgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatcgcgagcaca 12170129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 148 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 12180016 - 12179558
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttc---aaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaa 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||  |||    
T  12180016 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcgaaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattcttgagtggaa 12179919  T
Q  245 ctacattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccc 343  Q
    |||| | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12179918 ctacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccc 12179821  T
Q  344 tccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatag 442  Q
    ||||||||||||||||||  || ||| |||| |||| ||||||| ||| | | || ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12179820 tccattctttcacttagacgtt-aggcaatattttttcaaataaacaagt-agtttagcacaaaataatctaggtaagaggttcctatgaaataccatag 12179723  T
Q  443 acgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaa 542  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  12179722 acgcttaggatgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaa 12179623  T
Q  543 tcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  12179622 tcgagagttcaaagatcgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatcgcgagcaca 12179558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 149 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 3477221 - 3476764
Alignment:
Q  149 ttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa-tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaacta 247  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  ||||||    
T  3477221 ttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaacta 3477124  T
Q  248 cattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 346  Q
    | | ||||||||||||||  |   || ||||| ||||||| |||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3477123 cgtcggttttgatcccttccccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 3477026  T
Q  347 attctttcacttagatttttaggtaataatttt--caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagac 444  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||||||||  ||||||| ||| |   || ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  3477025 attctttcacttagacatt-aggcaataattttttcaaataaacaagtagctt-agcacaagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagat 3476928  T
Q  445 gcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatc 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  3476927 gcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaatc 3476828  T
Q  545 gagagttcaaagattaacgattcaaatcaatt-aatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  3476827 gagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 3476764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 149 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 3491991 - 3491534
Alignment:
Q  149 ttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa-tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaacta 247  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  ||||||    
T  3491991 ttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaacta 3491894  T
Q  248 cattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 346  Q
    | | ||||||||||||||  |   || ||||| ||||||| |||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3491893 cgtcggttttgatcccttccccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 3491796  T
Q  347 attctttcacttagatttttaggtaataatttt--caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagac 444  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||||||||  ||||||| ||| |   || ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  3491795 attctttcacttagacatt-aggcaataattttttcaaataaacaagtagctt-agcacaagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagat 3491698  T
Q  445 gcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatc 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  3491697 gcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaatc 3491598  T
Q  545 gagagttcaaagattaacgattcaaatcaatt-aatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  3491597 gagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 3491534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 147 - 599
Target Start/End: Original strand, 23038996 - 23039445
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||  |||||    
T  23038996 ttttatctcatgtcttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccacc--aaagaaattttttagtggaact 23039092  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 346  Q
    || | ||||||||||||||| |   || |||| ||||||| ||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23039093 acgtcggttttgatccctttcccaaaatggtacgtaggcagagga--cttgtccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 23039190  T
Q  347 attctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  || ||    
T  23039191 attctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaagtcg 23039290  T
Q  446 cttagggtgc-tagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatc 544  Q
     ||||||||| || ||||||||||   || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  23039291 tttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaattcaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatt 23039390  T
Q  545 gagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatca 599  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  23039391 gagagttcaaaaattgacgattcaaatcaattaatagtttgatatccgaaaatca 23039445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Original strand, 36458526 - 36458981
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  |||||    
T  36458526 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaact 36458622  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataa-ccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    || | |||||||||||||||     ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36458623 acgtcggttttgatccctttctcaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaaccaaaaacatacttcttctccctc 36458720  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagac 444  Q
    ||||||||||||||||  || ||| ||||||||| ||||| | ||| | | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  36458721 cattctttcacttagacatt-aggcaataatttttcaaatgaacaagt-attttagcacaagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagat 36458818  T
Q  445 gcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatc 544  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  36458819 gcttaggatgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgaaaagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaatc 36458918  T
Q  545 gagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  36458919 gagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccaaaaatcgcgagcaca 36458981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 147 - 599
Target Start/End: Original strand, 17642366 - 17642815
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  |||||    
T  17642366 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaact 17642462  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 346  Q
    || | ||||||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17642463 acgtcggttttgatccctttcccaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccttcc 17642560  T
Q  347 attctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||| ||||||||||||  |||||||  |||||||  ||| ||||  || ||    
T  17642561 attctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcgaatgaatttagcacaagataatctaggtaaacggttccttcggagtaccgaagtcg 17642660  T
Q  446 cttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatc 544  Q
     |||||||||| |  |||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  17642661 tttagggtgcttaataccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttccattcccacgaataaaaatt 17642760  T
Q  545 gagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatca 599  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17642761 gagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatca 17642815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 147 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 21851093 - 21850650
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||  |||||    
T  21851093 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaata--aatttttgagtggaact 21850997  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 346  Q
    || | ||||||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21850996 acgtcggttttgatccctttcccaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccttcc 21850899  T
Q  347 attctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  || ||    
T  21850898 attctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaagtcg 21850799  T
Q  446 cttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatc 544  Q
     |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||     
T  21850798 tttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactttttttttcccttcccatgaataaaaatt 21850699  T
Q  545 gagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccga 593  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21850698 gagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccga 21850650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 10 - 321
Target Start/End: Original strand, 21931231 - 21931546
Alignment:
Q  10 aaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagactt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21931231 aaaaatattttcttaataaaccttggttagtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattagactt 21931330  T
Q  109 gatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttat--ctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaa-atctta 204  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||| |||||||||| | |||||| |||||| |||||||||| || |||    
T  21931331 gattttcttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttgttttttttctcatgccttgaggcctcttatttcttcttaaaacc-attttcaaaacatatta 21931429  T
Q  205 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 304  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21931430 aaatcaatccaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactgcattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 21931529  T
Q  305 aaatcaaataaaaataa 321  Q
    |||||||||||||||||    
T  21931530 aaatcaaataaaaataa 21931546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 147 - 612
Target Start/End: Original strand, 27063970 - 27064433
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa-tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||  ||||    
T  27063970 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaactcattttcaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattcttgagtggaac 27064067  T
Q  246 tacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    ||| | ||||||||||||||  |   ||||||||||||||| |||| |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27064068 tacgtcggttttgatcccttcccaa-aagggtatgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 27064164  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagc-aaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||  ||     
T  27064165 cattctttcacttagatttt-aggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttagcacaagataatttaggtaagcggttccttcggagtaccgaagt 27064263  T
Q  444 cgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaa 542  Q
    || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27064264 cgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgaaaagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaa 27064363  T
Q  543 tcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcacacatat 612  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||    
T  27064364 tcgagagttcaaagatcgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatcgcgagcacatatat 27064433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 148 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 27220602 - 27220141
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttc--aaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  ||||    
T  27220602 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcgaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaac 27220505  T
Q  246 tacattggttttgatcccttttctttaa---gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 342  Q
    ||| | ||||||||||||||| |   ||   ||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27220504 tacgtcggttttgatccctttcccaaaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 27220407  T
Q  343 ctccattctttcacttagatttttaggtaataa--ttttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccat 440  Q
    |||||| ||||||||||||  || ||| ||||   ||||||||||| ||| |   || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27220406 ctccatactttcacttagacatt-aggcaatatatttttcaaataaacaagtagctt-agcacaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccat 27220309  T
Q  441 agacgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataa 539  Q
    || || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  27220308 agtcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccaagaataa 27220209  T
Q  540 aaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  27220208 aaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatcgcgagcaca 27220141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 23828206 - 23827754
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa--tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaa 244  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||  |||    
T  23828206 ttttatctcatgccttgaggcctctttctattcttaaaacc-attttcaaaaaaatcttaaaaccaacctaacccaccaaa--gaaattttttagtggaa 23828110  T
Q  245 ctacattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccc 343  Q
    |||| | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23828109 ctacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccc 23828012  T
Q  344 tccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaa-taagc-aaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccata 441  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||  |    
T  23828011 tccattctttcacttagatttt-aggtaataattttttaagtaagccaaatgaatttagcacaagataatttaggtaagcggttccttcggagtaccgaa 23827913  T
Q  442 gacgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaa 540  Q
    | || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23827912 gtcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaa 23827813  T
Q  541 aatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaatt-aatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  23827812 aattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaaatggtttgatatccgaaaatc 23827754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 148 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 27223607 - 27223148
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttc--aaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||  ||||    
T  27223607 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcgaaaaaaccttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattcttgagtggaac 27223510  T
Q  246 tacattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 344  Q
    ||| | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27223509 tacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 27223412  T
Q  345 ccattctttcacttagatttttaggtaataa--ttttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatag 442  Q
    |||| ||||||||||||  || ||| ||||   ||||||||||| ||| |   || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27223411 ccatactttcacttagacatt-aggcaatatatttttcaaataaacaagtagctt-agcacaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatag 27223314  T
Q  443 acgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaa 541  Q
     || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  27223313 tcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaa 27223214  T
Q  542 atcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  27223213 atcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatcgcgagcaca 27223148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 148 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 27233078 - 27232619
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttc--aaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||  ||||    
T  27233078 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcgaaaaaaccttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattcttgagtggaac 27232981  T
Q  246 tacattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 344  Q
    ||| | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27232980 tacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 27232883  T
Q  345 ccattctttcacttagatttttaggtaataa--ttttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatag 442  Q
    |||| ||||||||||||  || ||| ||||   ||||||||||| ||| |   || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27232882 ccatactttcacttagacatt-aggcaatatatttttcaaataaacaagtagctt-agcacaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatag 27232785  T
Q  443 acgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaa 541  Q
     || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  27232784 tcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaa 27232685  T
Q  542 atcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  27232684 atcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatcgcgagcaca 27232619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 31548501 - 31548052
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  |||||    
T  31548501 ttttatctcatgccttgaggcatctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaact 31548405  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 346  Q
    || | ||||||||||||| | |   ||||||| || |||| |||| || |  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31548404 acgtcggttttgatccctgtcccaaaagggtacgtgggcagaggacttgt--cattccaaatcaaataaaaacaaccaaaaacatacttcttctccctcc 31548307  T
Q  347 attctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 445  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  || ||    
T  31548306 attcttttacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaagtcg 31548207  T
Q  446 cttagggtgc-tagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataaggg-tttttactcattttttcccttgccacgaataaaaat 543  Q
     ||||||||| || ||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  31548206 tttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggttttttactcattttttccctgcccacaaataaaaat 31548107  T
Q  544 cgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  31548106 tgagagttcaaagattgacgattcaaatcaatcaatggtttgatatccgaaaatc 31548052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 147 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 21986628 - 21986163
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa---tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtga 243  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  ||    
T  21986628 ttttatctcatgccttgaggcatctttctcttcttaaaaaccattttcaaaaagaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtgga 21986531  T
Q  244 actacattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 342  Q
    ||||| | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21986530 actacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 21986433  T
Q  343 ctccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaa-tcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccat 440  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| || | |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||      
T  21986432 ctccattctttcacttagattttaag-taataatttttcaagtaagccaagtgaatttagcacaagataatttaggtaagcggttccttcggagtaccga 21986334  T
Q  441 agacgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataa 539  Q
    || || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21986333 agtcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataa 21986234  T
Q  540 aaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaatt-aatggtttgatagccgaaaatcacgagcacaca 609  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||  |||||||||    
T  21986233 aaattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaaatggtttgacatccgaaaatcgtgagcacaca 21986163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Original strand, 23637226 - 23637678
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa--tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaa 244  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||  |||    
T  23637226 ttttatctcatgccttgaggcctctttctattcttaaaacc-attttcaaaaaaatcttaaaaccaacctaacccaccaaa--gaaattttttagtggaa 23637322  T
Q  245 ctacattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccc 343  Q
    |||| | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23637323 ctacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccc 23637420  T
Q  344 tccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaa-taagc-aaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccata 441  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||  |    
T  23637421 tccattctttcacttagatttt-aggtaataattttttaagtaagccaaatgaatttagcacaagataatttaggtaagcggttccttcggagtaccgaa 23637519  T
Q  442 gacgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaa 540  Q
    | || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23637520 gtcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttctactcattttttcccttcccacgaataaa 23637619  T
Q  541 aatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaatt-aatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  23637620 aattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaaatggtttgatatccgaaaatc 23637678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 23835664 - 23835212
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa--tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaa 244  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||  |||    
T  23835664 ttttatctcatgccttgaggcctctttctattcttaaaacc-attttcaaaaaaatcttaaaaccaacctaacccaccaaa--gaaattttttagtggaa 23835568  T
Q  245 ctacattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccc 343  Q
    |||| | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23835567 ctacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccc 23835470  T
Q  344 tccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaa-taagc-aaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccata 441  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||  |    
T  23835469 tccattctttcacttagatttt-aggtaataattttttaagtaagccaaatgaatttagcacaagataatttaggtaagcggttccttcggagtaccgaa 23835371  T
Q  442 gacgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaa 540  Q
    | || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23835370 gtcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttctactcattttttcccttcccacgaataaa 23835271  T
Q  541 aatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaatt-aatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  23835270 aattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaaatggtttgatatccgaaaatc 23835212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Original strand, 26176970 - 26177419
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa-tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  ||||    
T  26176970 ttttatctcaagccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaac 26177066  T
Q  246 tacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    ||| | ||||||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  26177067 tacgtcggttttgatccctttcccaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataacccaaaacatacttattctccctc 26177164  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagac 444  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  || |    
T  26177165 cattcttttacatagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaagtc 26177264  T
Q  445 gcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttt-tactcattttttcccttgccacgaataaaaa 542  Q
    | |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26177265 gtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaac-cccgaatccaaagtctcgataagggttttttactcattttttcccttcccacgaataaaaa 26177363  T
Q  543 tcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  26177364 ttgagagttcaaagattgacgattcaaatcaatcaagggtttgatatccgaaaatc 26177419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 21995276 - 21994813
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa---tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtga 243  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  ||    
T  21995276 ttttatctcatgccttgaggcatctttctcttcttaaaaaccattttcaaaaagaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtgga 21995179  T
Q  244 actacattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 342  Q
    ||||| | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21995178 actacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 21995081  T
Q  343 ctccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaa-tcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccat 440  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| || | |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||      
T  21995080 ctccattctttcacttagattttaag-taataatttttcaagtaagccaagtgaatttagcacaagataatttaggtaagcggttccttcggagtaccga 21994982  T
Q  441 agacgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataa 539  Q
    || || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21994981 agtcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataa 21994882  T
Q  540 aaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaatt-aatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||  |||||||    
T  21994881 aaattgagagttcaaaaattgacgattcaaatcaattaaatggtttgacatccgaaaatcgtgagcaca 21994813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Original strand, 23984641 - 23985093
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||    
T  23984641 ttttatctcatgccttgaggcctcttactcttcttaaaacc-attttcaaaaatcataaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattttttagtggaact 23984737  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    || | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| ||||  | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23984738 acgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacctgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatactccttctccctc 23984835  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataag-caaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  ||     
T  23984836 cattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaagt 23984935  T
Q  444 cgcttagggtgc-tagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgat--aagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaa 540  Q
    || ||||||||| || ||||||||||   || ||||||| ||||||||||| ||||||||  |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23984936 cgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaggtctcgataaaagtttttttactcattttttcccttcccacgaataaa 23985035  T
Q  541 aatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  23985036 aattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaatcaatggtttgatatccgaaaatc 23985093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 298 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 21857108 - 21856805
Alignment:
Q  298 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  21857108 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccttccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaat 21857009  T
Q  397 tcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaag 495  Q
    | ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  || || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||    
T  21857008 ttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaagtcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaag 21856909  T
Q  496 tctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaa 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21856908 tctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaa 21856809  T
Q  596 atca 599  Q
    ||||    
T  21856808 atca 21856805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 381 - 607
Target Start/End: Original strand, 21931541 - 21931765
Alignment:
Q  381 aaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaa 480  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21931541 aaataagcaa-tgaatttagcacaagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaa 21931639  T
Q  481 ctcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatg 580  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21931640 cccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatg 21931739  T
Q  581 gtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||    
T  21931740 gtttgat-tccgaaaatcacgagcaca 21931765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 298 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 21858861 - 21858564
Alignment:
Q  298 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  21858861 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccttccattctttcacttaaatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaat 21858762  T
Q  397 tcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaag 495  Q
    | ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  || || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||    
T  21858761 ttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaagtcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaag 21858662  T
Q  496 tctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccga 593  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21858661 tctcgataagggtttttactttttttttcccttcccatgaataaaaattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccga 21858564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 378 - 607
Target Start/End: Original strand, 29190253 - 29190478
Alignment:
Q  378 ttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaac 477  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29190253 ttcaaataagcaaagcaatttagcacaagataaattaggtaagaggttcctacggagtaccgtagacgcttagggtgctaacaccttcccttcgcgtaac 29190352  T
Q  478 caactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaatta 577  Q
    |||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29190353 caacccccgaatccaaagtct---tgagggtttttactca-tttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaatta 29190448  T
Q  578 atggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29190449 atggtttgatatccgaaaatcacgagcaca 29190478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 378 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 345105 - 344880
Alignment:
Q  378 ttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaac 477  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  345105 ttcaaataagcaaagcaatttagcacaagataaattaagtaaaaggttcctacggagtaccgtagacgcttagggtgctaacaccttcccttcgcgtaac 345006  T
Q  478 caactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattc-aaatcaatt 576  Q
    |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  345005 caacccccgaatccaaagtct---taagggtttttactcattttttccc-tcccacgaat-aaaattgagagttcaaagattgacgattcaaaatcaatt 344911  T
Q  577 aatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  344910 aatggtttgacatccgaaaatcacgagcaca 344880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 378 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 359744 - 359519
Alignment:
Q  378 ttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaac 477  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  359744 ttcaaataagcaaagcaatttagcacaagataaattaagtaaaaggttcctacggagtaccgtagacgcttagggtgctaacatcttcccttcgcgtaac 359645  T
Q  478 caactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattc-aaatcaatt 576  Q
    |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  359644 caacccccgaatccaaagtct---taagggtttttactcattttttccc-tcccacgaat-aaaattgagagttcaaagattgacgattcaaaatcaatt 359550  T
Q  577 aatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  359549 aatggtttgacatccgaaaatcacgagcaca 359519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 23762740 - 23762288
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttca--aaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaa 244  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| | || | |||||| |||||||  |||||||||||| ||||||| ||| |||||  || | |||||||  |||    
T  23762740 ttttatcttatgcctagaggcctctttatatttttaaaacc-attttcataaaaatcttaaaaccaacctatccctccaaa--gatattttttagtggaa 23762644  T
Q  245 ctacattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccc 343  Q
     ||  | |||||| |||||||| |   || ||||||||||||| |||| || |   ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23762643 atatgtcggtttttatccctttcccaaaaagggtatgtaggcagaggacttgtt--ctttcaaatcaaataaaaataaccaaaaacatatttcttctccc 23762546  T
Q  344 tccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataag-caaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccata 441  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||| ||||| |||| |||||||||||| |||| |||| ||||| | |||| |||   |    
T  23762545 tccattctttcacttaga-ttttaggtaataattttttaagtaagccaaatgaatttagcacaagataatttagataagcggttcttttggagtactgaa 23762447  T
Q  442 gacgcttagggtgc-tagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaa 540  Q
    |  | ||||||||| || |||||| |||    | ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||    
T  23762446 gttgtttagggtgcttaacacctttcctattagaaaccaacccccgaatacaaagtcttgataagggttttttctcattttttatctttccacgaataaa 23762347  T
Q  541 aatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaatt-aatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  23762346 aatagagagttcaaagattgtcgattcaaatcaattaaatggttttatatccgaaaatc 23762288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 147 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 23025946 - 23025805
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||  |||||    
T  23025946 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccacc--aaagaaattttttagtggaact 23025850  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcatagga 291  Q
    || | |||||| |||||||| |   ||||||| ||||||| ||||    
T  23025849 acgtcggttttaatccctttcccaaaagggtacgtaggcagagga 23025805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 418 - 481
Target Start/End: Original strand, 27586827 - 27586890
Alignment:
Q  418 aagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaac 481  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27586827 aagaggttcctatagagtactatagacatttagggtgctaacaccttccctttgcgtaaccaac 27586890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 422 - 488
Target Start/End: Original strand, 19071767 - 19071833
Alignment:
Q  422 ggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaa 488  Q
    ||||||||| || ||| ||||||| |||||| ||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19071767 ggttcctatagagtactatagacgtttagggggctaataccttccctttgcgtaaccaacccccgaa 19071833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 521; Significance: 0; HSPs: 66)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 521; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 17685538 - 17684935
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17685538 ctccaaaagtattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 17685439  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa--tctt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  17685438 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctctttctcttctaaaaactcattttcaaaaaaatctt 17685339  T
Q  204 aaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17685338 aaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttc 17685239  T
Q  304 caaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcac 403  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17685238 caattcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaatttagcac 17685139  T
Q  404 aagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgata 503  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17685138 aaggtaaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcatgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgata 17685039  T
Q  504 agggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgag 603  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17685038 agggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgatttaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgag 17684939  T
Q  604 caca 607  Q
    ||||    
T  17684938 caca 17684935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 519; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 6856557 - 6855957
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6856557 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 6856458  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatctta 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| ||    
T  6856457 cttgatttctt-gtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaacc-attttcaaaaatcata 6856360  T
Q  205 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6856359 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 6856260  T
Q  305 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcaca 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6856259 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcaca 6856160  T
Q  405 agataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataa 504  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6856159 agataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctaacaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgataa 6856060  T
Q  505 gggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagc 604  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6856059 gggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcaagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgagc 6855960  T
Q  605 aca 607  Q
    |||    
T  6855959 aca 6855957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 505; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 609
Target Start/End: Original strand, 35039713 - 35040315
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35039713 ctccaaaaatattttcttaataaaccttgatttgtaacccaagtgttttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 35039812  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35039813 cttgatttctttgtaattaaaatccgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaa 35039912  T
Q  206 aatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcca 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35039913 aatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttagatgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcca 35040012  T
Q  306 aatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaa 405  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  35040013 aatcaaataaaaataaccaaaaa-atgcttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaa 35040110  T
Q  406 gataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataag 505  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35040111 gataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttagggtgctaacaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgataag 35040210  T
Q  506 gg-tttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagc 604  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  35040211 ggttttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacggttcaaatcaattaattgtttgatatccgaaaatcacgagc 35040310  T
Q  605 acaca 609  Q
    |||||    
T  35040311 acaca 35040315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 481; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 34528451 - 34527846
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttt--ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataata 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34528451 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataata 34528352  T
Q  104 gacttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccatttt--caaaaat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||  ||||  ||||| |    
T  34528351 gacttgatttctt-gtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccttttttttcaaaatt 34528253  T
Q  201 cttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34528252 gttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 34528153  T
Q  301 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcag 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34528152 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcctccattctttcacttagatttttaggtattaattttcaaataagcaaatcaatttag 34528053  T
Q  401 cacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcg 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  34528052 cacaagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcg 34527953  T
Q  501 ataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcac 600  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34527952 atgagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagatcgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcac 34527853  T
Q  601 gagcaca 607  Q
    |||||||    
T  34527852 gagcaca 34527846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 481; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 34542425 - 34541820
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttt--ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataata 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34542425 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataata 34542326  T
Q  104 gacttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccatttt--caaaaat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||  ||||  ||||| |    
T  34542325 gacttgatttctt-gtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaaccttttttttcaaaatt 34542227  T
Q  201 cttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34542226 gttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 34542127  T
Q  301 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcag 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34542126 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcctccattctttcacttagatttttaggtattaattttcaaataagcaaatcaatttag 34542027  T
Q  401 cacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcg 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  34542026 cacaagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcg 34541927  T
Q  501 ataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcac 600  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34541926 atgagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagatcgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcac 34541827  T
Q  601 gagcaca 607  Q
    |||||||    
T  34541826 gagcaca 34541820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 479; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 20365135 - 20364529
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgt----ttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20365135 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggctggtaacccaagtgtccctttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataa 20365036  T
Q  102 tagacttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa-t 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  20365035 tagacttgatttttttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctctttctcttctaaaaacccatttttaaaaaat 20364936  T
Q  201 cttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20364935 cttaaaatcaacctaacccaccaaaaagtaacttttttggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 20364836  T
Q  301 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagattttt-aggtaataattttcaaataagcaaatcaattca 399  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||| |    
T  20364835 ttccaaatcaaataaaaatgaccaaaaacatacttcttctcctcccattctttcacttagattttttaggtaataattttcaaataaccaa-tgaattta 20364737  T
Q  400 gcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctc 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20364736 gcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccgtagacgcttagggtgctagcacatttccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctc 20364637  T
Q  500 gataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatca 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20364636 gataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaattgagagttcaaagattgacgattcagatcaattaatggtttgatatccgaaaatca 20364537  T
Q  600 cgagcaca 607  Q
    ||||||||    
T  20364536 cgagcaca 20364529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 479; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 41232917 - 41232315
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttcctttt-attttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatag 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41232917 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattag 41232818  T
Q  105 acttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctc--atgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatct 202  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  41232817 acttgattttcttgtaattaaaatgtgaacaacctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctttcttttcttaaaacccattttcaaaaatct 41232718  T
Q  203 taaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 302  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41232717 taaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 41232620  T
Q  303 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagca 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41232619 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcctccattctttcacttagatttttagataataattttcaaataagcaaatcaatttagca 41232520  T
Q  403 caagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgat 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41232519 caagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgat 41232420  T
Q  503 aagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacga 602  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  41232419 aagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagatttacgattcaaatcaattaatggtttgatatccaaaaatcacga 41232320  T
Q  603 gcaca 607  Q
    |||||    
T  41232319 gcaca 41232315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 471; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Original strand, 35147970 - 35148572
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttcctttt-attttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatag 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35147970 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattag 35148069  T
Q  105 acttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctc--atgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatct 202  Q
    |||||||||  ||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  35148070 acttgattttcttgtaattaaaacgtgaacaatctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctttcttttcttaaaacccattttcaaaaatct 35148169  T
Q  203 taaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 302  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35148170 taaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 35148267  T
Q  303 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagca 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35148268 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcctccattctttcacttagatttttagataataattttcaaataagcaaatcaatttagca 35148367  T
Q  403 caagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgat 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  35148368 caagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcaat 35148467  T
Q  503 aagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacga 602  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35148468 aagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacga 35148567  T
Q  603 gcaca 607  Q
    |||||    
T  35148568 gcaca 35148572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 467; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Original strand, 35139629 - 35140231
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttcctttt-attttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatag 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35139629 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattag 35139728  T
Q  105 acttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctc--atgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatct 202  Q
    |||||||||  ||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  35139729 acttgattttcttgtaattaaaacgtgaacaatctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctttcttttcttaaaacccattttcaaaaatcg 35139828  T
Q  203 taaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 302  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35139829 taaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 35139926  T
Q  303 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagca 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35139927 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcctccattctttcacttagatttttagataataattttcaaataagcaaatcaatttagca 35140026  T
Q  403 caagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgat 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  35140027 caagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcaat 35140126  T
Q  503 aagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacga 602  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35140127 aagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacga 35140226  T
Q  603 gcaca 607  Q
    |||||    
T  35140227 gcaca 35140231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 465; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 15943591 - 15942988
Alignment:
Q  7 tccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttcctttt-attttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15943591 tccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattaga 15943492  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctc--atgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatctt 203  Q
    ||||||||  ||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  15943491 cttgattttcttgtaattaaaacgtgaacaatctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctttcttttcttaaaacccattttcaaaaatctt 15943392  T
Q  204 aaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggattttt--atcct 301  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  15943391 aaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttttatcct 15943294  T
Q  302 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagc 401  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  15943293 tccaagtcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaagtaagcaaatcaatttagc 15943194  T
Q  402 acaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcga 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  15943193 acaagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcga 15943094  T
Q  502 taagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacg 601  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15943093 taagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacg 15942994  T
Q  602 agcaca 607  Q
    ||||||    
T  15942993 agcaca 15942988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 464; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 42564979 - 42564376
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttcctttt-attttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatag 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42564979 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattag 42564880  T
Q  105 acttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctc--atgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatct 202  Q
    |||||||||  ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  42564879 acttgattttcttgtaattaaaacgtgaacaacctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctttcttttcttaaaacccattttcaaaaatct 42564780  T
Q  203 taaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggattttt-atcct 301  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42564779 taaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggattttttatcct 42564682  T
Q  302 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagc 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  42564681 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaagtaagcaaatcaatttagc 42564582  T
Q  402 acaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcga 501  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  42564581 acaaggtaaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttccctttgcataaccaacccccgaatccaaagtctcga 42564482  T
Q  502 taagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacg 601  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42564481 tgagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcatatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacg 42564382  T
Q  602 agcaca 607  Q
    ||||||    
T  42564381 agcaca 42564376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 464; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 42573603 - 42573000
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttcctttt-attttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatag 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42573603 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattag 42573504  T
Q  105 acttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctc--atgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatct 202  Q
    |||||||||  ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  42573503 acttgattttcttgtaattaaaacgtgaacaacctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctttcttttcttaaaacccattttcaaaaatct 42573404  T
Q  203 taaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggattttt-atcct 301  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42573403 taaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggattttttatcct 42573306  T
Q  302 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagc 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  42573305 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaagtaagcaaatcaatttagc 42573206  T
Q  402 acaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcga 501  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  42573205 acaaggtaaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttccctttgcataaccaacccccgaatccaaagtctcga 42573106  T
Q  502 taagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacg 601  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42573105 tgagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcatatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacg 42573006  T
Q  602 agcaca 607  Q
    ||||||    
T  42573005 agcaca 42573000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 463; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 15952102 - 15951498
Alignment:
Q  7 tccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttcctttt-attttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15952102 tccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattaga 15952003  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctc--atgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatctt 203  Q
    ||||||||  ||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||| ||||  || ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  15952002 cttgattttcttgtaattaaaacgtgaacaatctcaccttattttttctctcataccttgaggcctctttcttttcttaaaacccattttcaaaaatctt 15951903  T
Q  204 aaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggattttt---atcc 300  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  15951902 aaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggattttttttatcc 15951805  T
Q  301 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcag 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  15951804 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaagtaagcaaatcaatttag 15951705  T
Q  401 cacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcg 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  15951704 cacaagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcg 15951605  T
Q  501 ataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcac 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15951604 ataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcac 15951505  T
Q  601 gagcaca 607  Q
    |||||||    
T  15951504 gagcaca 15951498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Original strand, 44374811 - 44375413
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44374811 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 44374910  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatctta 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||  |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  44374911 cttgatttctt-gtaattaaaatctgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcctttcttaaaacc-attttcaaaaatctta 44375008  T
Q  205 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 304  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44375009 aaatcaacctaacccacaaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcatatgatttttatccttcc 44375108  T
Q  305 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga--tttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagca 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  44375109 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcctccattctttcacttagatttttttaggtaacagttttcaaataagc-aatgaatttagca 44375207  T
Q  403 caagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgat 502  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44375208 caagataatttaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgat 44375307  T
Q  503 aagggtttttactca-ttttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacg 601  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  44375308 aagggtttttactcatttttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccaaaaatcgcg 44375407  T
Q  602 agcaca 607  Q
    ||||||    
T  44375408 agcaca 44375413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Original strand, 44390392 - 44390994
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44390392 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 44390491  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatctta 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||  |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  44390492 cttgatttctt-gtaattaaaatctgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcctttcttaaaacc-attttcaaaaatctta 44390589  T
Q  205 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 304  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44390590 aaatcaacctaacccacaaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcatatgatttttatccttcc 44390689  T
Q  305 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga--tttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagca 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  44390690 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcctccattctttcacttagatttttttaggtaacagttttcaaataagc-aatgaatttagca 44390788  T
Q  403 caagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgat 502  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44390789 caagataatttaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgat 44390888  T
Q  503 aagggtttttactca-ttttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacg 601  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  44390889 aagggtttttactcatttttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccaaaaatcgcg 44390988  T
Q  602 agcaca 607  Q
    ||||||    
T  44390989 agcaca 44390994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 607
Target Start/End: Original strand, 24293204 - 24293802
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtg--tttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagac 106  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24293204 caaaaatattttcttaataaaacttggtttgtaacccaagttgctttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatactagac 24293303  T
Q  107 ttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaa 205  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| |||||| ||||| ||||    
T  24293304 ttgattttcttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaacc-attttctaaaat-ttaa 24293401  T
Q  206 aatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcca 305  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  24293402 aatcaacc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcagaggattgttatcctttca 24293500  T
Q  306 aatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaa 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24293501 aatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctctctccgttctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaatttagcacaa 24293600  T
Q  406 gataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataag 505  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24293601 gataatttaggtaagaggttcttacggaataccgtagacgcttagggtgctagcaccttccctgcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgataag 24293700  T
Q  506 ggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagca 605  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  24293701 ggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgatttaaatcaattaatggtttgagatccgaaaatcacgagca 24293800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 26732231 - 26731633
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26732231 ctcccaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 26732132  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatctta 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||  ||    
T  26732131 cttgacttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaact-attttcaaaaat--ta 26732035  T
Q  205 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 304  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26732034 aaatcaacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 26731937  T
Q  305 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagattttt-aggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcac 403  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||    
T  26731936 aaatcaagtaaaaataaccaaaaacatacttcttcttcccccattctttcacttagattttttaggtaataaatttcaaataagcaa-tgaatttagcac 26731838  T
Q  404 aa-gataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgat 502  Q
    || |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  26731837 aaagataaattaggtaagaggttcctacgggataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtcttgat 26731738  T
Q  503 aagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacga 602  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26731737 gagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacga 26731638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 609
Target Start/End: Original strand, 25495612 - 25496209
Alignment:
Q  10 aaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttt--ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagact 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25495612 aaaaatatttttttaataaaccttggcttgtaacccaagtgtttttttccttttatttccttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagact 25495711  T
Q  108 tgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaa 206  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||  |||||    
T  25495712 tgattttcttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcttcttatctcttcttaaaacc-attttcaaaaaa-ttaaa 25495809  T
Q  207 atcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaa 306  Q
    |||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25495810 atcaacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatctttccaa 25495907  T
Q  307 atcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaag 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  25495908 atcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcag-taagcaaatgaatttagcacaag 25496006  T
Q  407 ataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagg 506  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  25496007 ataatctaggtaagaggttcctatgtaataccatagacgcttagggtgctagcaccttccctttgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgatgaag 25496106  T
Q  507 gtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcac 606  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25496107 gtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgagcac 25496206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 26718098 - 26717500
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26718098 ctcccaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 26717999  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatctta 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||  ||    
T  26717998 cttgacttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaact-attttcaaaaat--ta 26717902  T
Q  205 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 304  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26717901 aaatcaacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 26717804  T
Q  305 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagattttt-aggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcac 403  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||    
T  26717803 aaatcaagtaaaaataaccaaaaacatacttcttcttcccccattctttcacttagattttttaggtaataaatttcaaataagcaa-tgaatttagcac 26717705  T
Q  404 aa-gataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgat 502  Q
    || |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  26717704 aaagataaattaggtaagaggttcctacgggataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtcttgat 26717605  T
Q  503 aagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacga 602  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26717604 gagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaataaagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacga 26717505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 429; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 605
Target Start/End: Original strand, 24286636 - 24287231
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtg--tttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagac 106  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24286636 caaaaatattttcttaataaaacttggtttgtaacccaagttgctttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatactagac 24286735  T
Q  107 ttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaa 205  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| |||||| ||||| ||||    
T  24286736 ttgattttcttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaacc-attttctaaaat-ttaa 24286833  T
Q  206 aatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcca 305  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  24286834 aatcaacc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactatattggttttgatcccttttctttaaaggtatgtaggcagaggattgttatcctttca 24286932  T
Q  306 aatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaa 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24286933 aatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccgttctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaatttagcacaa 24287032  T
Q  406 gataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataag 505  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24287033 gataatttaggtaagaggttcttacggaataccgtagacgcttagggtgctagcaccttccctgcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgataag 24287132  T
Q  506 ggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagca 605  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  24287133 ggtttttactca-tttttcccttctcacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgatttaaatcaattaatggtttgagatccgaaaatcacgagca 24287231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 51 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 26897083 - 26896528
Alignment:
Q  51 tttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttatttt 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26897083 tttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatactagacttgattttcttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttatttt 26896984  T
Q  151 atctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactaca 249  Q
     |||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26896983 ctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaacc-attttctaaaat-ttaaaatcaacc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactaca 26896887  T
Q  250 ttggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccatt 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26896886 ttggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcagaggacttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccatt 26896787  T
Q  350 ctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgctt 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  26896786 ctttcacttagatttttaggtaataaattttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagaggttcctatgggataccatagatgctt 26896687  T
Q  449 agggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgaga 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  26896686 agggtgctagcaccttcccttcgcgtaatcaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacaaataaaaattgaga 26896587  T
Q  549 gttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  26896586 gttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccaaaaatcacgagcaca 26896528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 42247923 - 42247477
Alignment:
Q  159 cctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttg 258  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42247923 cctggaggcctctttctcttcttaaaactcattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttg 42247824  T
Q  259 atcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcactt 358  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42247823 atcccttttctttaagggtatgtatgcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcactt 42247724  T
Q  359 agatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctag 458  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42247723 agacttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaatttagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccgtagacgcttagggtgctag 42247624  T
Q  459 caccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcatt-ttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaaga 557  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42247623 caccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcatttttttcccttcccacgaataaaaatcgagaattcaaaga 42247524  T
Q  558 ttaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagc 604  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  42247523 ttgaagattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcaggagc 42247477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 607
Target Start/End: Original strand, 20920483 - 20921089
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagactt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| || |||| |||||||    
T  20920483 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgcagc--aagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaatcaatttaacatccatattagactt 20920580  T
Q  109 gatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttat------ctcatgcctggaggcctctt-------tctcttctaaaaacccattttca 195  Q
     | ||  |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |      || |||||| ||||||||||       |||||||| ||||||  ||||||    
T  20920581 aaatttcttgtaattaaaatttgaccaacatcatctttttttttttttctcttatgccttgaggcctcttattcttatctcttcttaaaaccttttttca 20920680  T
Q  196 aaaa-tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggattt 294  Q
    |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  20920681 aaaaatattaaaatcaatctaacccaccaaaaagaaattttttaggcgaactacattggttttgatcccttt-ctttaagggtatgtagggaaaggattt 20920779  T
Q  295 ttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatca 394  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||      
T  20920780 ttgtccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatgtttaggcaataattttcaaataagcaaattg 20920879  T
Q  395 attcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaa 494  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  20920880 atttagcacaagataaattaggcaagaggttcctacggagtaccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccaaatccaaa 20920979  T
Q  495 gtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaa 594  Q
     |||   |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20920980 atct---taagggtttttactcattgttttccttcccacgaataaaaattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaa 20921076  T
Q  595 aatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||    
T  20921077 aatcacgagcaca 20921089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 148 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 34069123 - 34068673
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaacta 247  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34069123 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacctattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaacta 34069024  T
Q  248 cattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcca 347  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34069023 cattggttttgatcccttt-ctttaagggtatataggcaggggagtca-atccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcca 34068926  T
Q  348 ttctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgct 447  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||    |  |||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34068925 ttctttcacttagatttt-aggtaataatttt----tttgcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgct 34068831  T
Q  448 tagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgag 547  Q
    ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  34068830 taggacgctagtaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtct---taagggtttttactcattttttccattcccacggataaaaatcgag 34068734  T
Q  548 agttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcacac 608  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  34068733 agttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatattcgaaaatcacgagcacac 34068673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 148 - 609
Target Start/End: Original strand, 28481147 - 28481602
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaacta 247  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  ||||||    
T  28481147 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaacta 28481244  T
Q  248 cattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcca 347  Q
    | | ||||||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28481245 cgtcggttttgatccctttcccaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcca 28481342  T
Q  348 ttctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgc 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28481343 ttctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagaggttcctatgggataccatagacgc 28481442  T
Q  447 ttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcga 546  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28481443 ttagggtgctaacaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtct---taagggttttaactcatttttccccttcccacgaataaaaatcga 28481539  T
Q  547 gagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcacaca 609  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28481540 gagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgagcacaca 28481602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 6 - 337
Target Start/End: Original strand, 20623360 - 20623692
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttt-tccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatag 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20623360 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggcttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatagtag 20623459  T
Q  105 acttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatctta 204  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623460 acttgattttcttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcacgccttgaggcctctttcccttctaaaaacccattttcaaaaatctta 20623559  T
Q  205 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20623560 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcatgggatttttatccttcc 20623659  T
Q  305 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttct 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623660 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttct 20623692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Original strand, 16274574 - 16275032
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttc--aaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaa 244  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||    
T  16274574 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcgaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgaggtgaa 16274671  T
Q  245 ctacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  16274672 ctacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttctt----ct 16274767  T
Q  345 ccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  ||     
T  16274768 ccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaagt 16274867  T
Q  444 cgcttagggtgc-tagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaa 542  Q
    || ||||||||| || ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16274868 cgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaa 16274967  T
Q  543 tcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||  |||||||    
T  16274968 ttgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatgatttgacatccgaaaatcgtgagcaca 16275032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Original strand, 16283750 - 16284208
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttc--aaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaa 244  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||    
T  16283750 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcgaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgaggtgaa 16283847  T
Q  245 ctacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  16283848 ctacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttctt----ct 16283943  T
Q  345 ccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  ||     
T  16283944 ccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaattttgcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaagt 16284043  T
Q  444 cgcttagggtgc-tagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaa 542  Q
    || ||||||||| || ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16284044 cgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaa 16284143  T
Q  543 tcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||    
T  16284144 ttgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatcgtgagcaca 16284208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 148 - 607
Target Start/End: Original strand, 21151235 - 21151689
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa--tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtg-aa 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||| |||| ||    
T  21151235 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccata--gaaa-tttttgggtggaa 21151331  T
Q  245 ctacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 344  Q
    |||| | | ||||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21151332 ctacgtcgattttgatccctttcccaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 21151429  T
Q  345 ccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21151430 ccattctttcacttagatttt-aggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaatataatctaggtaagaggttcctatggaataccataga 21151528  T
Q  444 cgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaat 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21151529 cgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaattcagagtct---taagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaat 21151625  T
Q  544 cgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  21151626 cgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtgtgatatccgaaaatcgcgagcaca 21151689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 30524972 - 30524527
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  |||||    
T  30524972 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaact 30524876  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataa-ccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    || | ||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||  || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30524875 acgtcggttttgatcccttcccaa-aagggtacgtaggcagagggcttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaaccaaaaacatacttcttctccctc 30524779  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 445  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  30524778 cattcttttacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaa-tgaatgtagcacaagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacg 30524680  T
Q  446 cttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcg 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  30524679 cttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcaataagggtttttactcattttgtcccttcccacgaataaaaattg 30524580  T
Q  546 agagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  30524579 agagttcaaagattgacgattcaaatcaatcaatggtctgatatccgaaaatc 30524527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 148 - 607
Target Start/End: Original strand, 15600531 - 15600991
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttc--aaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||   |||| | || ||  ||||    
T  15600531 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcgaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaag--gaaattcttgagtggaac 15600628  T
Q  246 tacattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaa-taaccaaaaacatacttcttctccc 343  Q
    ||| | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| |  |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15600629 tacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaaataaccaaaaacatacttcttctccc 15600726  T
Q  344 tccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatag 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  15600727 tccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaataaatttagcacaagataatctaggtaagcggttcctacggaataccgtag 15600826  T
Q  443 acgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaa 542  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15600827 atgcttaggatgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgaaaaaggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaa 15600926  T
Q  543 tcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  15600927 tcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatcgcgagcaca 15600991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 148 - 608
Target Start/End: Original strand, 34436891 - 34437348
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa-tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  |||||    
T  34436891 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaact 34436988  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    || | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34436989 acgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 34437086  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagac 444  Q
    ||||||||||||||||  || ||| ||||||||| ||||||| ||| |   || ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  34437087 cattctttcacttagacatt-aggcaataatttttcaaataaacaagtagctt-agcacaagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagat 34437184  T
Q  445 gcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatc 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  34437185 gcttagggtgctagcaccttcccttcgcataatcaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaatc 34437284  T
Q  545 gagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcacac 608  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  34437285 gagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatcgcgagcacac 34437348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 148 - 609
Target Start/End: Original strand, 29855142 - 29855602
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttc--aaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||  ||||    
T  29855142 tttatctcatgccttgaggcctctttcttttcttaaaacccattttcgaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattcttgagtggaac 29855239  T
Q  246 tacattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 344  Q
    ||| |  |||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29855240 tacgtcagttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 29855337  T
Q  345 ccattctttcacttagatttttaggtaataatttt--caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatag 442  Q
    |||||||||||||||||  || ||| |||||||||  ||||||| ||| | | || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29855338 ccattctttcacttagacatt-aggcaataattttttcaaataaacaagt-agtttagcacaaaataatttaggtaagaggttcctatggaataccatgg 29855435  T
Q  443 acgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaa 542  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  29855436 acgcttaggatgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttaccttcccaagaataaaaa 29855535  T
Q  543 tcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcacaca 609  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  29855536 tcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcacaca 29855602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 147 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 33307011 - 33306576
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||| ||  |||||    
T  33307011 ttttatctcatgccttgaggcctctt-ctcttcttgaaacccatttcaaaaaatcttaaaatcaacctaacccactaaa--gaaatttttgagtggaact 33306915  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    || | ||||||||||||||| ||  || ||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33306914 acgtcggttttgatccctttcctaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataactaaaaacatacttcttctccctc 33306817  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagac 444  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| |   || ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  33306816 cattctttcacttagagttc-aggtaataatttttcaaataagcaattttttttagcacaagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagat 33306718  T
Q  445 gcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatc 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  33306717 gcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaatc 33306618  T
Q  545 gagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttga 586  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33306617 gagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttga 33306576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Original strand, 42385921 - 42386377
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  |||||    
T  42385921 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaact 42386017  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    || | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42386018 acgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 42386115  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagac 444  Q
    ||||||||||||||||  || ||| ||||||||| ||||||| ||| | | || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42386116 cattctttcacttagacatt-aggcaataatttttcaaataaacaagt-agtttagcacaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagtc 42386213  T
Q  445 gcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaat 543  Q
    | |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  42386214 gtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaat 42386313  T
Q  544 cgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  42386314 cgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 42386377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Original strand, 42400805 - 42401261
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  |||||    
T  42400805 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaact 42400901  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    || | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42400902 acgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 42400999  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagac 444  Q
    ||||||||||||||||  || ||| ||||||||| ||||||| ||| | | || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42401000 cattctttcacttagacatt-aggcaataatttttcaaataaacaagt-agtttagcacaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagtc 42401097  T
Q  445 gcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaat 543  Q
    | |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  42401098 gtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaat 42401197  T
Q  544 cgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  42401198 cgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 42401261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 3755340 - 3754885
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa-tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  ||||    
T  3755340 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaac 3755244  T
Q  246 tacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    ||| | |||||||||||||||     ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3755243 tacgtcggttttgatccctttctcaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatgcttcttctccctc 3755146  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagac 444  Q
    |||||||||| |||||  || |||  |||||||| ||||||| ||| | | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  3755145 cattctttcatttagacatt-aggcgataatttttcaaataaacaagtaactt-agcacaagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagat 3755048  T
Q  445 gcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatc 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  3755047 gcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaatc 3754948  T
Q  545 gagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  3754947 gagagttcaaagatcgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatcgcgagcaca 3754885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 148 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 10681785 - 10681324
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttc---aaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaa 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||  |||    
T  10681785 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcgaaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattcttgagtggaa 10681688  T
Q  245 ctacattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccc 343  Q
    |||| | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10681687 ctacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccc 10681590  T
Q  344 tccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatag 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  ||    
T  10681589 tccattctttcacttagatttttaggtgataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaag 10681490  T
Q  443 acgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaa 541  Q
     || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  10681489 tcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaa 10681390  T
Q  542 atcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  10681389 atcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatcgcgagcaca 10681324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Original strand, 2652834 - 2653289
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa-tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  ||||    
T  2652834 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaac 2652930  T
Q  246 tacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    ||| | |||||||||||||||     ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2652931 tacgtcggttttgatccctttctcaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatgcttcttctccctc 2653028  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagac 444  Q
    ||| |||||| |||||  || |||  |||||||| ||||||| ||| | | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  2653029 catcctttcatttagacatt-aggcgataatttttcaaataaacaagtaactt-agcacaagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagat 2653126  T
Q  445 gcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatc 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  2653127 gcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaatc 2653226  T
Q  545 gagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  2653227 gagagttcaaagatcgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatcgcgagcaca 2653289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 3765391 - 3764936
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa-tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  ||||    
T  3765391 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaac 3765295  T
Q  246 tacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    ||| | |||||||||||||||     ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3765294 tacgtcggttttgatccctttctcaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatgcttcttctccctc 3765197  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagac 444  Q
    |||||||||| |||||  || |||  |||||||| ||||||| ||| | | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  3765196 cattctttcatttagacatt-aggcgataatttttcaaataaacaagtaactt-agcacaagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagat 3765099  T
Q  445 gcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatc 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  3765098 gcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaatc 3764999  T
Q  545 gagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||    
T  3764998 gagagttcaaagatcgacgattcaaatcaattaatggtttaacatccgaaaatcgcgagcaca 3764936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 27681385 - 27680932
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||    
T  27681385 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattttttagtggaact 27681288  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    || | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27681287 acgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 27681190  T
Q  346 cattctttcacttagattttta-ggtaataatttt--caaataagcaaatc-aattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccata 441  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| ||||| || | |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  |    
T  27681189 cattctttcacttagatttttttggtaataattttttcaagtaagccaaacgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaa 27681090  T
Q  442 gacgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaa 540  Q
    | || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27681089 gtcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaa 27680990  T
Q  541 aatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  27680989 aattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaatcaatggtttgatatccgaaaatc 27680932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 147 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 21850582 - 21850121
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||  |||| |||| ||  |||||    
T  21850582 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccatttcgaaaaatcttaaaatcagcctaacccactaaa--gaaatttttgagtggaact 21850485  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    || | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21850484 acgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 21850387  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagc-aaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||  ||| ||||  ||     
T  21850386 cattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttagcacaagataatttaagtaagcggttccttcggagtaccgaagt 21850287  T
Q  444 cgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaa 542  Q
    || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21850286 cgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaa 21850187  T
Q  543 tcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcacac 608  Q
    | ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  21850186 ttgagagttcaaagatcgacgattcaaatcaaataatggtttgacatccgaaaatcgcgagcacac 21850121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 21859017 - 21858557
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||  |||| |||| ||  |||||    
T  21859017 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccatttcgaaaaatcttaaaatcagcctaacccactaaa--gaaatttttgagtggaact 21858920  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    || | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21858919 acgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 21858822  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagc-aaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||  ||| ||||  ||     
T  21858821 cattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttagcacaagataatttaagtaagcggttccttcggagtaccgaagt 21858722  T
Q  444 cgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaa 542  Q
    || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21858721 cgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaa 21858622  T
Q  543 tcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    | ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  21858621 ttgagagttcaaagatcgacgattcaaatcaaataatggtttgacatccgaaaatcgcgagcaca 21858557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 147 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 31355171 - 31354719
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa--tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaa 244  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||| ||  |||    
T  31355171 ttttatctcaagccttgaggcctctttctcttctaaaaacc-attttcaaaaaaatcttaaaatcaacttaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaa 31355075  T
Q  245 ctacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 344  Q
    |||| | ||||||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31355074 ctacgtcggttttgatccctttcccaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 31354977  T
Q  345 ccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  ||     
T  31354976 ccattcttttacatagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaagt 31354877  T
Q  444 cgcttagggtgc-tagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactca-ttttttcccttgccacgaataaaa 541  Q
    || ||||||||| || ||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  31354876 cgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcatttttttcccttcccacgaataaaa 31354777  T
Q  542 atcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatca 599  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  31354776 attgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatca 31354719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 148 - 598
Target Start/End: Original strand, 22187134 - 22187585
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaacta 247  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  ||||||    
T  22187134 tttatctcatgccttgaggcctctttcttttcttaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaacta 22187231  T
Q  248 cattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 346  Q
    | |  |||||||||||||| |   || ||||| ||||| | |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22187232 cgtcagttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggtagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatactcctgctccctcc 22187329  T
Q  347 attctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataag-caaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagac 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||  || |    
T  22187330 attctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttagcacaagataatttaggtaagcggttccttcggagtaccgaagtc 22187429  T
Q  445 gcttagggtgc-tagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataaggg-tttttactcattttttcccttgccacgaataaaaa 542  Q
    | ||||||||| || ||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22187430 gtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggttttttactcattttttcccttcccacgaataaaaa 22187529  T
Q  543 tcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  22187530 ttgagagttcaaagattgacgattcaaatcaatcaatggtttgatatccgaaaatc 22187585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Original strand, 34685499 - 34685959
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa--tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaa 244  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  |||    
T  34685499 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaa 34685595  T
Q  245 ctacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 344  Q
    |||| | ||||||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34685596 ctacgtcggttttgatccctttcccaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 34685693  T
Q  345 ccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagc-aaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatag 442  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||  ||    
T  34685694 ccattctttcacttagatttt-aggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttagcacaagataatttaggtaagcggttccttcggagtaccgaag 34685792  T
Q  443 acgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaa 541  Q
     || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  34685793 tcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgaaaagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaa 34685892  T
Q  542 atcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaatt-aatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  34685893 atcgagagttcaaagatcgacgattcaaatcaattaaatggtttgacatccgaaaatcgcgagcaca 34685959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Original strand, 42245347 - 42245798
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||    
T  42245347 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaatcttaaaaccaacctaacccaccaaa--gaaattttttagtggaact 42245443  T
Q  247 acattggttttgatcccttt-tctttaa---gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 342  Q
    || | ||||||||||||||| ||   ||   ||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245444 acgtcggttttgatccctttctcaaaaaaaggggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 42245541  T
Q  343 ctccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccata 441  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||||||||  |    
T  42245542 ctccattctttcacttagatttt-aggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggaataccgaa 42245640  T
Q  442 gacgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaa 540  Q
    | || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  42245641 gtcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgaaaagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaa 42245740  T
Q  541 aatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  42245741 gatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaatcgatggtttgatatccgaaaatc 42245798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Original strand, 34707922 - 34708380
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa-tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||  ||||    
T  34707922 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattcttgagtggaac 34708019  T
Q  246 tacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    ||| | ||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34708020 tacgtcggttttgatcccttcccaa-aagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 34708116  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaa-tcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| || | |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||  ||     
T  34708117 cattctttcacttagatttt-aggtaataatttttcaagtaagccaagtgaatttagcacaagataatttaggtaagcggttccttcggagtaccgaagt 34708215  T
Q  444 cgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaa 542  Q
    || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  34708216 cgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgaaaagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaa 34708315  T
Q  543 tcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  34708316 tcgagagttcaaagatcgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatcgcgagcaca 34708380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 298 - 607
Target Start/End: Original strand, 35304648 - 35304954
Alignment:
Q  298 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaaatcaat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  35304648 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaaatttttaggtaataaattttcaagtaagcaaatgaat 35304747  T
Q  397 tcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagt 496  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  35304748 ttagcacaagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaaga 35304847  T
Q  497 ctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattc-aaatcaattaatggtttgatagccgaaa 595  Q
    ||   || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35304848 ct---taggggtttttactcattttttcccttcccacaaataaaaatc--gagttcaaagattgacgattcaaaatcaattaatggtttgatatccgaaa 35304942  T
Q  596 atcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||    
T  35304943 atcacgagcaca 35304954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 147 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 11622504 - 11622049
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa---tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtga 243  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  ||    
T  11622504 ttttatctcatgccttgaggcatctttctcttcttaaaaaccattttcaaaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtgga 11622407  T
Q  244 actacattggttttgatcccttttctttaag--ggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctc 341  Q
    ||||| | ||||||||||||||| |   ||   |||| ||||||| |||| || |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11622406 actacgtcggttttgatccctttcccaaaaaatggtacgtaggcagaggacttgt--cctcccaaatcaaataaaaacaaccaaaaacatacttcttctc 11622309  T
Q  342 cctccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccat 440  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  || ||||| |||||||  ||| ||||      
T  11622308 cctccattcttttacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaagtaagcggttccttcggagtaccga 11622209  T
Q  441 agacgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataa 539  Q
    || || |||||||||| | || |||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11622208 agtcgtttagggtgcttaacatcttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataa 11622109  T
Q  540 aaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatca 599  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11622108 aaattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatca 11622049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 607
Target Start/End: Original strand, 21111029 - 21111613
Alignment:
Q  17 ttttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgatttctt 116  Q
    |||||||| ||||| |||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||| |||| |||  ||  |    
T  21111029 ttttcttattaaactttggattttaacccaattgtttttcctttt-ttttcttaatcaaatgtttaatcaatttaatatctatattagatttgggtttct 21111127  T
Q  117 tgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccatttt--caaaaatcttaaaatcaacc 213  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||   ||||  ||||||| |||||||||| |    
T  21111128 tataattaaaatttgaccaacctcatcttattttctctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaacattttttttcaaaaatgttaaaatcaatc 21111227  T
Q  214 taacccaccaaaaagaaacttttt-ag-gtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaa-tca 310  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| || | ||||||| ||| ||||||||||| ||     || ||| ||||||| | |||||  |||||| |||| |||    
T  21111228 taacccaccaaaaataatttttttgagagagaactac-ttgattttgatccctcttg----agagtacgtaggcaaatgattt--atccttacaaaatca 21111320  T
Q  311 aataaaaataaccaaaaa--catacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaagat 408  Q
    ||||| || ||| |||||  |||| ||||||| || |||||||| ||| |||| | ||||  |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  21111321 aataacaacaacaaaaaaaacatatttcttctacccccattcttccacctagactcttagc-aataattttcaaataagcaaaataatttagcacaagat 21111419  T
Q  409 aaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggt 508  Q
    || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||     |||||    
T  21111420 aatttaggcaagaggttcctacggaataccatagacgcttagggttctagcaccttcccttcgcgtaaccaacctctgaattcaaagtct-----agggt 21111514  T
Q  509 ttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21111515 ttttactcactttttcccttcccacgaataaaagttgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcaagagcaca 21111613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 417 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 38154189 - 38153999
Alignment:
Q  417 taagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactc 516  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38154189 taagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactc 38154090  T
Q  517 attttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38154089 attttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgagcaca 38153999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 378 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 19655789 - 19655563
Alignment:
Q  378 ttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaac 477  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19655789 ttcaaataagcaaagcaatttagcacaagataaattatgtaaaaggttcctacggagtaccgtagacgcttagggtgctaacaccttcccttcgcgtaac 19655690  T
Q  478 caactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaatta 577  Q
    |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19655689 caacccccgaatccaaagtct---taagggtttttactcatttttttccctcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaatta 19655593  T
Q  578 atggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19655592 atggtttgatatccaaaaatcacgagcaca 19655563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 17096007 - 17095633
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagactt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||| || |||| |||||||    
T  17096007 caaaaatattttcttaataaaccttcgattttaacccaaatgtttttccttttattttcttaatcaaatgtttaatcaatttaacatccatattagactt 17095908  T
Q  109 gatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaa 207  Q
    |  ||  || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||| || ||||| |||| | |||||||||||| ||||||    
T  17095907 gggtttcttataattaaaatttgatcaacctcatcttattttctctcatgtcttgaggcctcttatcccttcttaaaa-caattttcaaaaat-ttaaaa 17095810  T
Q  208 tcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaa 307  Q
    |||| | ||||||||  ||||||| | ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  || |||||||||||    
T  17095809 tcaatccaacccacc--aaagaaattctttacaggaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcaaaaga-gttaatccttccaaa 17095713  T
Q  308 tcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaa 391  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||   || ||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||    
T  17095712 tcaaataaaaacaacaaaagacatacttctt---cccccattctttcacttagactctta-gcaataattttcaaataagcaaa 17095633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 399 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 30683312 - 30683105
Alignment:
Q  399 agcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtct 498  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30683312 agcacaagataatctaagtaagaggttcctatggaataccatagacgcttaggatgctaacaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtct 30683213  T
Q  499 cgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  30683212 cga-aagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaatcgagagttcaaagatcgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatc 30683114  T
Q  599 acgagcaca 607  Q
     ||||||||    
T  30683113 gcgagcaca 30683105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 440 - 607
Target Start/End: Original strand, 25493307 - 25493474
Alignment:
Q  440 tagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataa 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25493307 tagacgcttagggtgctagcaccttccctttgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgatgagggtttttactcattttttcccttcccacgaataa 25493406  T
Q  540 aaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25493407 aaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgagcaca 25493474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 378 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 21320845 - 21320618
Alignment:
Q  378 ttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaac 477  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21320845 ttcaaataagcaaagcaatttagcacaagataaattaggtaaaaggttcctacggagtaccgtagacgcttagggtgctaacaccttcccttcgcgtaac 21320746  T
Q  478 caactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattc-aaatcaatt 576  Q
    |||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  21320745 caacccctgaatccaaagtct---taagggtttttactcattttttccc-tcccacgaataaaaattgagagttcaaagattgacgattcaaaatcaatt 21320650  T
Q  577 -aatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21320649 aaatggtttgatatccgaaaatcacgagcaca 21320618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 378 - 607
Target Start/End: Original strand, 14630437 - 14630662
Alignment:
Q  378 ttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaac 477  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14630437 ttcaaataagcaaagcaatttagcacaagataaattaagtaaaaggttcctacggagtaccgtagacgcttagggtgctaacaccttcccttcgcgtaac 14630536  T
Q  478 caactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattc-aaatcaatt 576  Q
    |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  14630537 caacccccgaatccaaagtct---taagggtttttactcattttttccc-tcccacgaat-aaaattgagagttcaaagattgacgattcaaaatcaatt 14630631  T
Q  577 aatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14630632 aatggtttgatatccgaaaatcacgagcaca 14630662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 17069464 - 17069159
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagactt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||| || |||| |||||||    
T  17069464 caaaaatattttcttaataaaccttcgagtttaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgtttaatcaatttaacatccatattagactt 17069365  T
Q  109 gatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctc-tttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaa 207  Q
    |  ||  || |||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||| || |||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  17069364 gggtttcttataattaaaatttgatcaacctcatcttattttctcccatgtcttgaggcctcatatctcttcttaaaa-ccattttcaaaaat-ttaaaa 17069267  T
Q  208 tcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaa 307  Q
    |||| | ||||||||  ||||||| | || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||  || |||||||||||    
T  17069266 tcaatccaacccacc--aaagaaattcttcacgagaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtagggaaaaga-gttaatccttccaaa 17069170  T
Q  308 tcaaataaaaa 318  Q
    |||||||||||    
T  17069169 tcaaataaaaa 17069159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 17075457 - 17075152
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagactt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||| || |||| |||||||    
T  17075457 caaaaatattttcttaataaaccttcgagtttaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgtttaatcaatttaacatccatattagactt 17075358  T
Q  109 gatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctc-tttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaa 207  Q
    |  ||  || |||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||| || |||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  17075357 gggtttcttataattaaaatttgatcaacctcatcttattttctcccatgtcttgaggcctcatatctcttcttaaaa-ccattttcaaaaat-ttaaaa 17075260  T
Q  208 tcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaa 307  Q
    |||| | ||||||||  ||||||| | || | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||  || |||||||||||    
T  17075259 tcaatccaacccacc--aaagaaattcttcacgagaactacattggttttgatcccttttcttgaagggtatgtagggaaaaga-gttaatccttccaaa 17075163  T
Q  308 tcaaataaaaa 318  Q
    |||||||||||    
T  17075162 tcaaataaaaa 17075152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 474 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 38611545 - 38611414
Alignment:
Q  474 taaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatca 573  Q
    |||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38611545 taaccaacccccgaatccaaagtct---taagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatca 38611449  T
Q  574 attaatggtttgatagccgaaaatcacgagcacac 608  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  38611448 attaatgatttgatatccgaaaatcacgagcacac 38611414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 76
Target Start/End: Original strand, 44374481 - 44374551
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaa 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44374481 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaa 44374551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 441 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 39842174 - 39842078
Alignment:
Q  441 agacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaa 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  39842174 agacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaattct---taagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaa 39842078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 534 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 23284032 - 23283970
Alignment:
Q  534 gaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaa 596  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  23284032 gaataaaaattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaatcaatggtttgatatccgaaaa 23283970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 336 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 17069117 - 17069048
Alignment:
Q  336 cttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaa 405  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  17069117 cttcttcccccattctttcacttagactcttaggcaataattttcaaataagcaaaataatttagcacaa 17069048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 418 - 467
Target Start/End: Original strand, 17881341 - 17881390
Alignment:
Q  418 aagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttccc 467  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  17881341 aagaggttcctatagaatactatagacgtttagggtgctaataccttccc 17881390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 509; Significance: 0; HSPs: 45)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 509; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 3432004 - 3431401
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagt-gtttttccttttatttt-cttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataata 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3432004 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggcttgtaacccaagttgcttttccttttatttttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataata 3431905  T
Q  104 gacttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa-tct 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3431904 gacttgatttctttgtaattaaaattcgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaaatct 3431805  T
Q  203 taaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 302  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3431804 taaaatcaacctaacccaacaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 3431705  T
Q  303 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagca 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||    
T  3431704 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataa-ccaatgaatttagca 3431606  T
Q  403 caagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgat 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3431605 caagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgat 3431506  T
Q  503 aagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacga 602  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  3431505 aagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggcttgatatccgaaaatcacga 3431406  T
Q  603 gcaca 607  Q
    |||||    
T  3431405 gcaca 3431401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 479; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Original strand, 31540961 - 31541563
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttcctttt-attttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatag 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  31540961 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattaa 31541060  T
Q  105 acttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctc--atgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatct 202  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  31541061 acttgattttcttgtaattaaaatgtgaacaacctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctttcttttcttaaaacccattttcaaaaatct 31541160  T
Q  203 taaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 302  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31541161 taaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 31541258  T
Q  303 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagca 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31541259 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcctccattctttcacttagatttttagataataattttcaaataagcaaatcaatttagca 31541358  T
Q  403 caagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgat 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31541359 caagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgat 31541458  T
Q  503 aagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacga 602  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31541459 aagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacga 31541558  T
Q  603 gcaca 607  Q
    |||||    
T  31541559 gcaca 31541563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 479; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Original strand, 31549530 - 31550132
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttcctttt-attttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatag 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  31549530 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattaa 31549629  T
Q  105 acttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctc--atgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatct 202  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  31549630 acttgattttcttgtaattaaaatgtgaacaacctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctttcttttcttaaaacccattttcaaaaatct 31549729  T
Q  203 taaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 302  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31549730 taaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 31549827  T
Q  303 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagca 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31549828 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcctccattctttcacttagatttttagataataattttcaaataagcaaatcaatttagca 31549927  T
Q  403 caagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgat 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31549928 caagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgat 31550027  T
Q  503 aagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacga 602  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31550028 aagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacga 31550127  T
Q  603 gcaca 607  Q
    |||||    
T  31550128 gcaca 31550132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 469; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 32135698 - 32135108
Alignment:
Q  17 ttttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgatttctt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  32135698 ttttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattagacttgattttct 32135599  T
Q  117 tgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaaccta 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||  ||| ||||| | ||||||| |||| |    
T  32135598 tgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttctctcatgccttgaggcctctaatctcttcttaaaacctttttccaaaattgttaaaattaacc-a 32135500  T
Q  216 acccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataa 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32135499 acccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataa 32135400  T
Q  316 aaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattag 415  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  32135399 aaataaccaaaaatatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaagataaattag 32135301  T
Q  416 gtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataaggg-tttttac 514  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32135300 gtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttagggtgctaacaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggttttttac 32135201  T
Q  515 tcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32135200 tcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgagcaca 32135108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 28991712 - 28991106
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgt--------ttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattc 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28991712 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggcttgtaacccaagtgtctttttttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattc 28991613  T
Q  98 ataatagacttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaa 196  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| |||||| |    
T  28991612 ataatagacctgattttcttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaacc-attttcta 28991514  T
Q  197 aaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggattttt 296  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28991513 aaatct-aaaatcaacc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggattttt 28991416  T
Q  297 atccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  28991415 atccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaa-tgaat 28991317  T
Q  397 tcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagt 496  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28991316 ttagcacaagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagt 28991217  T
Q  497 ctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaa 596  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28991216 ctcgatgagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaagatcgagagttcaaagatttacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaa 28991117  T
Q  597 tcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||    
T  28991116 tcacgagcaca 28991106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 461; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 13804449 - 13803853
Alignment:
Q  10 aaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13804449 aaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagggtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttg 13804350  T
Q  110 atttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatc 209  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||| || ||||||    
T  13804349 attttcttgtaattaaaatttgaccaacctcatcttattttatctcatgccttgaggcctctttcccttcttaaaacc-attttctaaaacct-aaaatc 13804252  T
Q  210 aacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatc 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13804251 aacc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaagcataggatttttatccttccaaatc 13804153  T
Q  310 aaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaagata 409  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13804152 aaataaaaataacaaaaaacatatttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtagtaattttcaaataagcaaatcaatttagcacaagata 13804053  T
Q  410 aattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataaggg-- 507  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||      
T  13804052 atttaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccggatccaaagtctcgatgagggtt 13803953  T
Q  508 tttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13803952 tttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgagcaca 13803853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Original strand, 13451833 - 13452437
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttt---ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13451833 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttttttccttttattttattaatcaaatgcttaattgaattaatattcatatt 13451932  T
Q  103 agacttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttatttta-tctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaat 200  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| |||||| |||||    
T  13451933 agactcgattttcttgtaattaaaatttgaccaagctcatcttatttttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaacc-attttctaaaat 13452031  T
Q  201 cttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 300  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13452032 -ttaaaatcaacc-aacccaccaaagagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 13452129  T
Q  301 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattca 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |    
T  13452130 ttccaaaacaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccatgctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaattta 13452229  T
Q  400 gcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctc 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13452230 gcacaagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctc 13452329  T
Q  500 gataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatca 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13452330 gataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatca 13452429  T
Q  600 cgagcaca 607  Q
    ||||||||    
T  13452430 cgagcaca 13452437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 41745095 - 41744502
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagactt 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41745095 caaaaatatttt-ttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagactt 41744998  T
Q  109 gatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaa 207  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||  ||||| ||||| ||||||    
T  41744997 gatttctt-gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaaccatttttctaaaat-ttaaaa 41744900  T
Q  208 tcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaa 307  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41744899 tcaacc-aacccaccaaaa-gaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaa 41744802  T
Q  308 tcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagattttt-aggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaag 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |    
T  41744801 tcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagattttttaggtaataattttcaaataagcaa-tgaatttagcacagg 41744703  T
Q  407 ataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagg 506  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  41744702 ataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgtttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgacaagg 41744603  T
Q  507 gtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcac 606  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41744602 atttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgagcac 41744503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 607
Target Start/End: Original strand, 2384976 - 2385571
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttc---cttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2384976 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtttttttttttcttttattctcttaatcaaatgcttatttgaattaatattcatattaga 2385075  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatctta 204  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| |||||| ||||| |||    
T  2385076 cttgattttcttgtaattaaaatttgatcaacctcaccttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaacc-attttctaaaat-tta 2385173  T
Q  205 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaacttttt-aggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttc 303  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||    
T  2385174 aaatcaacc-aacccacccaaaagaaacttttttaggtgaactacattggttttgatccctttcctttaagggtatgtaggcaaagg--tttaatccttc 2385270  T
Q  304 caaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcac 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2385271 caaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaatttagcac 2385370  T
Q  404 aagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgata 503  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||    
T  2385371 aagataatttagataagaggttcctacggaataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgtgtaaccaacccccgaatccaaagtct---ta 2385467  T
Q  504 agggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgag 603  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  2385468 agggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcatgag 2385567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 608
Target Start/End: Original strand, 43455847 - 43456450
Alignment:
Q  12 aaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttt--ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  43455847 aaatattttcttaataaaccttggttggtaacccaagtgtttttttccttttactttcttaatcaaatgcttaattgacttaatattcatattagacttg 43455946  T
Q  110 atttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttatttta-tctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccatttt--caaaaatcttaa 205  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||| |||| |  ||||  ||||| | ||||    
T  43455947 attttcttgtaattaaaatttgaccaacctcatcttatttttctctcatgccttgaggcctctaatctcttcttaaaatctttttttacaaaattgttaa 43456046  T
Q  206 aatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcca 305  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| |    
T  43456047 aatcaatccaacccaccaaaaagaaattttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatataggcaaaggagtta-atccttcaa 43456145  T
Q  306 aatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttt--taggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcac 403  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43456146 aatcaaataaaaataaccaaaaatatacttcttctccctccattctttcacttagatttttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaatttagcac 43456245  T
Q  404 aagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgata 503  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  43456246 aagataatttaggtaagaggttcctatgaaataccatagacgcctagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccaaatccaaagtcttgata 43456345  T
Q  504 agggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgag 603  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43456346 agggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgag 43456445  T
Q  604 cacac 608  Q
    |||||    
T  43456446 cacac 43456450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 23356014 - 23355413
Alignment:
Q  10 aaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttg 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  23356014 aaaaatattttcttgataaaccttggtttgtaatccaagtgttttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattagatttg 23355915  T
Q  110 atttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttat----ctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatctta 204  Q
    ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||| |||| |    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||    
T  23355914 attttcttgcaattaaaatta-accaacctcaccttgttttttttttctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaacc-attttcaaaaatatta 23355817  T
Q  205 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23355816 aaatcaatctaacccaccaaaaagaatttttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 23355717  T
Q  305 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttag----atttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcag 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23355716 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccgcccattctttcgcatagtagattttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaatttag 23355617  T
Q  401 cacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcg 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||      
T  23355616 cacaagataaattaggtaagaggttcatatgaaatatcatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaatcaacccccgaatccaaagtct-- 23355519  T
Q  501 ataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcac 600  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23355518 -taagggtttttactcattttttccctttccacgaataaaaatcgagagttcaaagattatcgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcac 23355420  T
Q  601 gagcaca 607  Q
    |||||||    
T  23355419 gagcaca 23355413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 148 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 21497340 - 21496882
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaacta 247  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21497340 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaacta 21497241  T
Q  248 cattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcca 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21497240 cattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcca 21497141  T
Q  348 ttctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgct 447  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  21497140 ttctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaatttagcacaagataagttaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgat 21497041  T
Q  448 tagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgag 547  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  21497040 tagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcatttttttccttcccacgaataaaaatcgag 21496941  T
Q  548 agttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21496940 agttcaaaga-tgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcaggagcaca 21496882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 607
Target Start/End: Original strand, 28459589 - 28460189
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagactt 108  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28459589 caaaaataattt-ttaataaaccttggtttgtaacctaagtgtttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagactt 28459686  T
Q  109 gatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccatttt-caaaaatcttaaa 206  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||  |||| ||||| | |||||    
T  28459687 gatttctt-gtaattaaaatttgaccaacctcactttatttt--ctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaacctttttttcaaaattgttaaa 28459783  T
Q  207 atcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaa 306  Q
    |||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28459784 atcaacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattgattttgatcccttttctttaagggtatgtagacataggatttttatccttccaa 28459881  T
Q  307 atcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaaatcaattcagcacaa 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  28459882 atcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaacaatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaa 28459981  T
Q  406 gataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccg------aatccaaagtctc 499  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      |||||||||||||    
T  28459982 gataatttaggtaagaggttcctgcggaataccgtagacgtttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaatccaaagtctc 28460081  T
Q  500 gataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatca 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  28460082 gataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaattcaatcaatggtttgatatccgaaaatca 28460181  T
Q  600 cgagcaca 607  Q
    ||||||||    
T  28460182 cgagcaca 28460189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 51055711 - 51055114
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaaccc-aagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||| |||| ||||||    
T  51055711 caaaaatattttcttaataaaccttggactttaaccccaagtgtttt-ccttttattttctcaatcaaatgcttaatcaatttaatatccatattagact 51055613  T
Q  108 tgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatc-ttaa 205  Q
    ||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||  ||||| |||||  ||||    
T  51055612 tgagtttcttgtaattaaaatttgaccaacctcatcttattttctctcatgccttgaggcctctaatctcttcttaaaacctgttttccaaaattgttaa 51055513  T
Q  206 aatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcca 305  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || || | ||  |||||||||    
T  51055512 aatcaatctaacccaccaaaaagaacctttttaggtgaactacattggttttgatccctttcttttaagggtatgtagccaaagaagtta-atccttcca 51055414  T
Q  306 aatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaa 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  51055413 aatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagacttttaggcaataatttttaaataagcaaattaatttagcacaa 51055314  T
Q  406 gataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataag 505  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||   |||    
T  51055313 gataaattaggcaagaggttcctatggagtaccgtagacgtttagggtgctagcatcttcccttcgcgtaattaaccccaaaatccaaagtctc---aag 51055217  T
Q  506 ggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagca 605  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  51055216 ggtttttactcacgttttcccttcccacgaataaaagttgagagttcaaagattgacgattcgaatcaattaatggtttgatattcgaaaatcacgagca 51055117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 242 - 607
Target Start/End: Original strand, 13477078 - 13477442
Alignment:
Q  242 gaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctc 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13477078 gaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctc 13477177  T
Q  342 cctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccata 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  13477178 cctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaa-tgaatttagcacaagataatttaggtaagaggttcctacgggataccgta 13477276  T
Q  442 gacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaa 541  Q
    || ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13477277 gatgcttagggtgctaacaccttccctacgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttccctgcccacgaataaaa 13477376  T
Q  542 atcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  13477377 atcgagagttcaaagattgacgattctaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 13477442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 148 - 607
Target Start/End: Original strand, 20502063 - 20502516
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaacta 247  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||  ||||||    
T  20502063 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccacc--aaagaaatttttgagtggaacta 20502160  T
Q  248 cattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcca 347  Q
    | | ||||||||||||||| |   ||||||| ||||| | ||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20502161 cgtcggttttgatccctttcccaaaagggtacgtaggtagagga--cttgtccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcca 20502258  T
Q  348 ttctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgc 446  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  20502259 ttcttccacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagacaatctaggtaagaggttcctacgggataccgtagacgc 20502358  T
Q  447 ttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcga 546  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  20502359 ttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaattcagagtct---taagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaatcga 20502455  T
Q  547 gagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20502456 gagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 20502516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 148 - 607
Target Start/End: Original strand, 31553306 - 31553763
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa-tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||    
T  31553306 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaaatcttaaaaccaacctaacccaccaaa--gaaatttttgaggtgaact 31553402  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31553403 acattggttttgatcccttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 31553501  T
Q  347 attctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 445  Q
    |||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| ||| | | || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31553502 attctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaaataaacaagt-agtttagcacaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagtcg 31553599  T
Q  446 cttagggtgc-tagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataaggg-tttttactcattttttcccttgccacgaataaaaat 543  Q
     ||||||||| || ||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  31553600 tttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggttttttactcattttttcccttcccaagaataaaaat 31553699  T
Q  544 cgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  31553700 cgagagttcaaagattgacgtttcaaatcaatcaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 31553763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 148 - 607
Target Start/End: Original strand, 31562440 - 31562897
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa-tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||    
T  31562440 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaaatcttaaaaccaacctaacccaccaaa--gaaatttttgaggtgaact 31562536  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31562537 acattggttttgatcccttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 31562635  T
Q  347 attctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 445  Q
    |||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| ||| | | || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31562636 attctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaaataaacaagt-agtttagcacaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagtcg 31562733  T
Q  446 cttagggtgc-tagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataaggg-tttttactcattttttcccttgccacgaataaaaat 543  Q
     ||||||||| || ||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  31562734 tttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggttttttactcattttttcccttcccaagaataaaaat 31562833  T
Q  544 cgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  31562834 cgagagttcaaagattgacgtttcaaatcaatcaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 31562897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 151 - 599
Target Start/End: Original strand, 22479580 - 22480025
Alignment:
Q  151 atctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa-tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactaca 249  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  |||||||     
T  22479580 atctcatgccttgaggcctctttctcttctttaaacc-attttcaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaactacg 22479676  T
Q  250 ttggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccat 348  Q
    | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22479677 tcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccat 22479774  T
Q  349 tctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgct 447  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  22479775 tctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaataattttagcacaagataa-ttaggtaagaggttcctacgggataccgtagacgct 22479873  T
Q  448 tagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgag 547  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  22479874 tagggtgctagtaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaataaag 22479973  T
Q  548 agttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatca 599  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  22479974 agttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccaaaaatca 22480025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Original strand, 32608539 - 32608986
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa-tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  ||||    
T  32608539 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaac 32608635  T
Q  246 tacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataa-ccaaaaacatacttcttctccct 344  Q
    ||| | ||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||  || |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32608636 tacgtcggttttgatcccttcccaa-aagggtacgtaggcagagggcttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaaccaaaaacatacttcttctccct 32608732  T
Q  345 ccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagac 444  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  32608733 ccattcttttacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaa-tgaatgtagcacaagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagac 32608831  T
Q  445 gcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttt-tcccttgccacgaataaaaat 543  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  32608832 gcttagggtgctaacaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcaataagggtttttactcatttttgtcccttcccacgaataaaaat 32608931  T
Q  544 cgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  32608932 tgagagttcaaagattgacgattcaaatcaatcaatgatttgatatccgaaaatc 32608986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 187 - 607
Target Start/End: Original strand, 21054866 - 21055280
Alignment:
Q  187 ccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaacttttt-aggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggc 285  Q
    |||||||||||||| |   |||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21054866 ccattttcaaaaattt---aatcaatccaacccaccaaaaagaaattttttcaggggaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtagga 21054962  T
Q  286 ataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaata 385  Q
    | |||  ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21054963 aaaggcgtta-atcattccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattcttttacttagatttttaggcaataattttcaaata 21055061  T
Q  386 agcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactccc 485  Q
    ||| ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||  || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  21055062 agcgaattaatttagcacaggataaattaggcaagaggttcctacagagtaccgtagacgcttagagtgctagcaccttcccttcgcgtaatcaaccccc 21055161  T
Q  486 gaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttg 585  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21055162 gaatccaaagtctc---aagggtttttactaactttttcacttcccacgaataaaagttgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttg 21055258  T
Q  586 atagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  21055259 atatccgaaaatcacgagcaca 21055280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 305 - 607
Target Start/End: Original strand, 23952221 - 23952522
Alignment:
Q  305 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcaca 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  23952221 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaa-tgaatttagcaca 23952319  T
Q  405 agataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataa 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  23952320 agataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgatga 23952419  T
Q  505 gggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagc 604  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23952420 gggtttttactcattttttcccatcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcgattaatggtttgatatccgaaaatcacgagc 23952519  T
Q  605 aca 607  Q
    |||    
T  23952520 aca 23952522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Original strand, 22472503 - 22472952
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||    
T  22472503 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattttttagtggaact 22472599  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 346  Q
    || | ||||||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22472600 acgtcggttttgatccctttcccaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatactccttctccctcc 22472697  T
Q  347 attctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagc-aaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagac 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  || |    
T  22472698 attctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaagtc 22472797  T
Q  445 gcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaat 543  Q
    | |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22472798 gtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaat 22472897  T
Q  544 cgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  22472898 tgagagttcaaagattgacgattcaaatcaatcaatggtttgatatccgaaaatc 22472952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 147 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 38123882 - 38123425
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||| ||  |||||    
T  38123882 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccatttcgaaaaatcttaaaatcaacctaacccactaaa--gaaatttttgagtggaact 38123785  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    || | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38123784 acgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 38123687  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagac 444  Q
    ||||||||||||||||  || ||| ||||||||| ||||||| ||| | | || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38123686 cattctttcacttagacatt-aggcaataatttttcaaataaacaagt-agtttagcacaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagac 38123589  T
Q  445 gcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatc 544  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |   ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  38123588 gcttaggatgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatcc-aattttttttaagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaatc 38123490  T
Q  545 gagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcacaca 609  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  38123489 gagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatcgcgagcacaca 38123425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 3350982 - 3350534
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa-tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  ||||    
T  3350982 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaac 3350886  T
Q  246 tacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    ||| ||||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3350885 tacgttggttttgatcccttcccaa-aagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaacaaccaaaaacatacttcttctccctc 3350789  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagac 444  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  || ||||| ||||| |  ||| ||||  || |    
T  3350788 cattcttttacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaagtaagcggttctttcggagtaccgaagtc 3350689  T
Q  445 gcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaat 543  Q
    | |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3350688 gtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaat 3350589  T
Q  544 cgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3350588 tgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatc 3350534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Original strand, 16135066 - 16135514
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  |||||    
T  16135066 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaact 16135162  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    || | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16135163 acgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 16135260  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagac 444  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  || |    
T  16135261 cattctttcacttagatttt-aggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaagtc 16135359  T
Q  445 gcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaat 543  Q
    | |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16135360 gtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcctttcccacgaataaaaat 16135459  T
Q  544 cgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  16135460 tgagagttcaaagattgacgattcaaatcaatcaatggtttgatatccgagaatc 16135514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 242 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 8241229 - 8240865
Alignment:
Q  242 gaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaa-catacttcttct 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  8241229 gaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcaaaggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaaacttacttcttct 8241130  T
Q  341 ccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccat 440  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| |    
T  8241129 ccccccattctttcacttagacttttaggcaataattttcaaataagcaaattaatttagcacaagataaattaggcaagagattcctacggagtaccgt 8241030  T
Q  441 agacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaa 540  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  8241029 agatgcttagggtgctatcaccttcccttcgcgtaatcaacccctgaatccaaagtctc--taagggtttttactcactttttcccttcccacgaataaa 8240932  T
Q  541 aatcgagagttcaaagattaacgattc-aaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcac 606  Q
    | | ||||||||||||||| | | ||| ||| |||| ||||| ||||||  |||||||||| |||||    
T  8240931 agttgagagttcaaagattgaaggttcaaaaccaatcaatggcttgatactcgaaaatcacaagcac 8240865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 148 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 34337070 - 34336620
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa-tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |   | |||||||  |||||    
T  34337070 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaga---attttttagtggaact 34336975  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    || | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34336974 acgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 34336877  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataatttt--caaataagcaaatc-aattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatag 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| || | |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  ||    
T  34336876 cattctttcacttagatttttaggtaataattttttcaagtaagccaaacgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaag 34336777  T
Q  443 acgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaa 541  Q
     || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34336776 tcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaa 34336677  T
Q  542 atcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  34336676 attgagagttcaaagattgacgattcaaatcaatcaatggtttgatatccgaaaatc 34336620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 148 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 12464506 - 12464053
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa---tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaa 244  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||  |||| | || ||  |||    
T  12464506 tttatctcataccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcaaaaaaaatcttaaaatcaatctaacccaccaaa--gaaattcttgagtggaa 12464409  T
Q  245 ctacattggttttgatcccttttctttaa---gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctc 341  Q
    |||| | ||||||||||||||| |   ||   ||||| ||||| | |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  12464408 ctacgtcggttttgatccctttcccaaaaaaagggtacgtaggtagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaa-catacttattctc 12464312  T
Q  342 cctccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccat 440  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||      
T  12464311 cctccattcttttacatagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccga 12464212  T
Q  441 agacgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataa 539  Q
    || || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12464211 agtcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataa 12464112  T
Q  540 aaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  12464111 aaattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaatcaatggtttgatatccgaaaatc 12464053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 9 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 36849100 - 36848507
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttt-----ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataata 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| | |||| ||    
T  36849100 caaaaatattttcttaagaaaccttggattttaacccaagtgttttttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaatcaatttaatctccatatta 36849001  T
Q  104 gacttg-atttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatc 201  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||     
T  36849000 gacttggatttctta-taattaaaatttgaccaacctcatcttattttctctcatgccttgaggcctcttatctcttctaaaaactttttttcaaaaatt 36848902  T
Q  202 ttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcct 301  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||  || ||||   |||||||||||| || | || |||||| ||||||| || |  |||||| |    
T  36848901 ttaaaatcaatccaacccaccaaaaag-aacttttgagtggatctacgacggttttgatccc-ttccgtttagggtacgtaggcaaagaa--tttatcat 36848806  T
Q  302 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagc 401  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||| ||||  |||  | || |||    
T  36848805 tccaaatcaaataaaaacaacaaaaaacatacttcttctccctccattctttcacctagactcttaggcaataattttcatataaataaaatattttagc 36848706  T
Q  402 acaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgc-tagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcg 500  Q
    |||| |||| ||||| || ||||| ||| ||| |||||||| |   ||||| || |   |||||||||   |  ||||||| |||||||||||||||||     
T  36848705 acaaaataagttaggcaaaaggtttctacggagtaccatagtcatgtagggggcgtcaaaccttccctattcaaaaccaacccccgaatccaaagtctc- 36848607  T
Q  501 ataaggg-tttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatca 599  Q
     |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  36848606 ttaagggatttttactcactttttcccttcccacgaataaaagttgagagttcaaagattgaagatttaaatcaattaatggtttgatattcgaaaatca 36848507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 370 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 35097615 - 35097377
Alignment:
Q  370 taataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttccctt 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35097615 taataattttcaaataagcaaatcaatttagcacaagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttccctt 35097516  T
Q  470 cgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaa 569  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35097515 cgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcatacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaa 35097416  T
Q  570 atcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcacac 608  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35097415 atcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgagcacac 35097377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 298 - 607
Target Start/End: Original strand, 52101236 - 52101542
Alignment:
Q  298 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  52101236 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatatttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaaataagcaaatgaat 52101335  T
Q  397 tcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagt 496  Q
    | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||    
T  52101336 ttagcacaagataatctaggtaagaggttcctatggaatatcatagacgcttagggtgctagcaccttccctttgcgtaaccaacccccgaatcc-aggt 52101434  T
Q  497 ctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattc-aaatcaattaatggtttgatagccgaaa 595  Q
    ||   ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||| |||| ||||| |||||| ||||||    
T  52101435 ct---taaaggtttttactcattttttccc-tcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgaaggttcaaaaccaatcaatggcttgatacccgaaa 52101530  T
Q  596 atcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||    
T  52101531 atcacgagcaca 52101542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 413 - 607
Target Start/End: Original strand, 13461138 - 13461332
Alignment:
Q  413 taggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggttttt 512  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13461138 taggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggttttt 13461237  T
Q  513 actcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13461238 actcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgagcaca 13461332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 399 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 21245079 - 21244869
Alignment:
Q  399 agcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtct 498  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  21245079 agcacaagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttaggatgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtct 21244980  T
Q  499 cgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  21244979 cgaaaagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccaaaaatc 21244880  T
Q  599 acgagcacaca 609  Q
     ||||||||||    
T  21244879 gcgagcacaca 21244869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 414 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 46776994 - 46776801
Alignment:
Q  414 aggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggttttta 513  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46776994 aggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggttttta 46776895  T
Q  514 ctcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  46776894 ctcattttttcccttcccaagaataaaaatcgagagttcaaaggttgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatcgcgagcaca 46776801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Original strand, 11950125 - 11950392
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagactt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | |||| ||||||| |||||||    
T  11950125 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacataagcgtttt-ccttttattttcttaatcaaatgtttaatcaacttaacattcatactagactt 11950223  T
Q  109 -gatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttatttta-tctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccatttt-caaaaatc-tt 203  Q
     |||||||| | ||||||||||  | |||||||| ||||||||  ||| |||||| |||| ||||  |||||||| ||||||  |||| |||||||  ||    
T  11950224 tgatttctt-gcaattaaaatta-atcaacctcatcttatttttctcttatgccttgaggtctctaatctcttcttaaaaccttttttacaaaaattgtt 11950321  T
Q  204 aaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaag 274  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11950322 aaaatcaatccaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgataccttttctttaag 11950392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 475 - 599
Target Start/End: Original strand, 22495867 - 22495991
Alignment:
Q  475 aaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaa 574  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22495867 aaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaa 22495966  T
Q  575 ttaatggtttgatagccgaaaatca 599  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  22495967 ttaatggtttgatatccgaaaatca 22495991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 447 - 598
Target Start/End: Original strand, 8513942 - 8514094
Alignment:
Q  447 ttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcg 545  Q
    |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  8513942 ttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaattg 8514041  T
Q  546 agagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  8514042 agagttcaaagattgacgattcaaatcaatcaatggtttgatatccgaaaatc 8514094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 148 - 425
Target Start/End: Original strand, 18702405 - 18702676
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaacta 247  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||  |||||    
T  18702405 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaactcattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccacc--aaagaaatttttgagggaaacta 18702502  T
Q  248 cattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcca 347  Q
    | | ||||||||||||||| |   ||||||| |||||||  |||   || |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  18702503 cgtcggttttgatccctttcccaaaagggtacgtaggcaaggga--cttgtccttccaaatc-aataaaaaataccaaaaacatactttttctccctcca 18702599  T
Q  348 ttctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggtt 425  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||| | ||| | || | |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18702600 ttctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaaatgaacaagt-aacttagcacaagataatttaggtaagcggtt 18702676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 483 - 597
Target Start/End: Original strand, 18780118 - 18780232
Alignment:
Q  483 cccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggt 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18780118 cccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggt 18780217  T
Q  583 ttgatagccgaaaat 597  Q
    |||||| ||||||||    
T  18780218 ttgatatccgaaaat 18780232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 440 - 607
Target Start/End: Original strand, 25337131 - 25337294
Alignment:
Q  440 tagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataa 539  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |    
T  25337131 tagacgcttagggtgctaacaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtct---taagggtttttactcattttttccc-tcccacgaat-a 25337225  T
Q  540 aaatcgagagttcaaagattaacgattc-aaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  25337226 aaattgagagttcaaagattgacgattcaaaatcaattaatggtttgacatccgaaactcacgagcaca 25337294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 413 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 27311980 - 27311794
Alignment:
Q  413 taggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttt 511  Q
    |||||||| |||||||  ||| ||||  || || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27311980 taggtaagcggttccttcggagtaccgaagtcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttt 27311881  T
Q  512 tactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  27311880 tactcattttttccctgcccacgaataaaaattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaatcaatggtttgatatccgaaaatc 27311794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 243 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 4282866 - 4282507
Alignment:
Q  243 aactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 342  Q
    ||||||| |||||||||||||||||     |||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||    
T  4282866 aactacaatggttttgatcccttttt----agggtatgtaggcaaatgattt--atccttccaaatcaaataaaaacaacaaaaaacatgtttcttctcc 4282773  T
Q  343 ctccattctttcacttagatttttaggtaataattttc--aaataagcaaatcaattcagcacaagataaa-ttaggtaagaggttcctatggaatacca 439  Q
    |||||||| ||||||||  ||| ||   ||| ||||||  ||||| || ||| |||| |||||||  |||| ||||||| |||||||||| ||||||||     
T  4282772 ctccattc-ttcacttaattttgtaaacaattattttcgaaaataggc-aattaatttagcacaaattaaagttaggtaggaggttcctacggaataccg 4282675  T
Q  440 tagacgcttagggtgc-tagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaata 538  Q
    ||| || ||||||||| || ||||||| |    || ||||||| |||| ||||||||| |  ||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  4282674 tagtcgtttagggtgcttaacaccttcacgattcggaaccaacccccggatccaaagt-tttataaggg-ttttactcactttttctcttcccacgaata 4282577  T
Q  539 aaaatcgagagttcaaagattaacgattc-aaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||| | ||||||||||||||| | | ||| ||| ||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||    
T  4282576 aaagttgagagttcaaagattgaaggttcaaaaccaattaatggtttgatacccgaatttcaagagcaca 4282507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 459 - 594
Target Start/End: Original strand, 2248397 - 2248532
Alignment:
Q  459 caccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagat 558  Q
    |||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| | | ||||||||||||    
T  2248397 caccttcccttttcgaaaccaacccccgaatccaaagtctc-ataagggtttttactcactttttcccttctcacgaataaaagttgggagttcaaagat 2248495  T
Q  559 taacgattc-aaatcaattaatggtttgatagccgaa 594  Q
    | | | ||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  2248496 tgaaggttcaaaaccaattaatggtttgatacccgaa 2248532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 418 - 486
Target Start/End: Original strand, 17018892 - 17018961
Alignment:
Q  418 aagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgc-tagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccg 486  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  17018892 aagagcttcctatagaataccatagacgtttagggtgcttaaaaccttctctttgcgtaaccaacccccg 17018961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 501; Significance: 0; HSPs: 40)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 501; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 4837962 - 4837361
Alignment:
Q  10 aaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtg----tttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4837962 aaaaatatttt--taataaaccttggtttgtaacccaagttgcttttttttcttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 4837865  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa-tctta 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4837864 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaaatctta 4837765  T
Q  205 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4837764 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctgtaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 4837665  T
Q  305 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagattttt-aggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcac 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||   |||| |||||    
T  4837664 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagattttttaggtgataattttcaaataagcaatgaaatt-agcac 4837566  T
Q  404 aagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgata 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4837565 aagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgata 4837466  T
Q  504 agggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgag 603  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4837465 agggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgag 4837366  T
Q  604 cacac 608  Q
    |||||    
T  4837365 cacac 4837361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 17662869 - 17662267
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17662869 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttataacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataataga 17662770  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaat--ctt 203  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||    
T  17662769 cttgatttctt-gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctttcatgccttgaggcctctttcccctctaaaaacccattttcaaaaatatctt 17662671  T
Q  204 aaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17662670 aaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggttttttatccttc 17662571  T
Q  304 caaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcac 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||    
T  17662570 caaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataa-ccaatgaatttagcac 17662472  T
Q  404 aagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgata 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17662471 aagataaattaggtaagaggttcctacggagtaccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgata 17662372  T
Q  504 aggg-tttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacga 602  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  17662371 agggttttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcagttaatggcttgatatccgaaaatcacga 17662272  T
Q  603 gcaca 607  Q
    |||||    
T  17662271 gcaca 17662267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 479; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Original strand, 30939290 - 30939892
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttcctttt-attttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatag 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30939290 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattag 30939389  T
Q  105 acttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctc--atgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatct 202  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  30939390 acttgattttcttgtaattaaaatgtgaacaacctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctttcttttcttaaaacccattttcaaaaatct 30939489  T
Q  203 taaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 302  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30939490 taaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 30939587  T
Q  303 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagca 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30939588 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcctccattctttcacttagatttttagataataattttcaaataagcaaatcaatttagca 30939687  T
Q  403 caagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgat 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30939688 caagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgat 30939787  T
Q  503 aagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacga 602  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30939788 aagagtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacga 30939887  T
Q  603 gcaca 607  Q
    |||||    
T  30939888 gcaca 30939892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 17681998 - 17681396
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17681998 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttataacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataataga 17681899  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaat--ctt 203  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||    
T  17681898 cttgatttctt-gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctttcatgccttgaggcctctttcccctctaaaaacccattttcaaaaatatctt 17681800  T
Q  204 aaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17681799 aaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcattc 17681700  T
Q  304 caaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcac 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||    
T  17681699 caaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataa-ccaatgaatttagcac 17681601  T
Q  404 aagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgata 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17681600 aagataaattaggtaagaggttcctacggagtaccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgata 17681501  T
Q  504 aggg-tttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacga 602  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  17681500 agggttttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcagttaatggcttgatattcgaaaatcacga 17681401  T
Q  603 gcaca 607  Q
    |||||    
T  17681400 gcaca 17681396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 463; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Original strand, 17528834 - 17529435
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttt-----ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17528834 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggcttgtaacccaagtgttttttttttccttttattttcttaatctaatgcttaattgaattaatattcata 17528933  T
Q  101 atagacttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaat 200  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||    
T  17528934 atagacttgattttcttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttctctcatgccttgaggcctctttttcttcttaaaacc-attttctaaaat 17529032  T
Q  201 cttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 300  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17529033 ct-aaaatcaacc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgcaggcataggatttttatcc 17529130  T
Q  301 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcag 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  17529131 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaatatacttcttctccc-ccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaa-tgaatttag 17529228  T
Q  401 cacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcg 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17529229 cacaagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcg 17529328  T
Q  501 ataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcac 600  Q
    || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17529329 atgaggggttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcac 17529428  T
Q  601 gagcaca 607  Q
    |||||||    
T  17529429 gagcaca 17529435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 39836613 - 39836010
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttcctttt-attttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatag 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39836613 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattag 39836514  T
Q  105 acttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctc--atgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatct 202  Q
    |||||||||  ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  39836513 acttgattttcttgtaattaaaacgtgaacaacctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctttcttttcttaaaacccattttcaaaaatct 39836414  T
Q  203 taaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggattttt-atcct 301  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39836413 taaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggattttttatcct 39836316  T
Q  302 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagc 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  39836315 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaagtaagcaaatcaatttagc 39836216  T
Q  402 acaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcga 501  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  39836215 acaaggtaaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgtttagggtgctagcaccttccctttgcataaccaacccccgaatccaaagtctcga 39836116  T
Q  502 taagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacg 601  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39836115 tgagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcatatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacg 39836016  T
Q  602 agcaca 607  Q
    ||||||    
T  39836015 agcaca 39836010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 39844655 - 39844052
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttcctttt-attttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatag 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39844655 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattag 39844556  T
Q  105 acttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctc--atgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatct 202  Q
    |||||||||  ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  39844555 acttgattttcttgtaattaaaacgtgaacaacctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctttcttttcttaaaacccattttcaaaaatct 39844456  T
Q  203 taaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggattttt-atcct 301  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39844455 taaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggattttttatcct 39844358  T
Q  302 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagc 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  39844357 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaagtaagcaaatcaatttagc 39844258  T
Q  402 acaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcga 501  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  39844257 acaaggtaaattaggtaagaggttcctacagaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttccctttgcataaccaacccccgaatccaaagtctcga 39844158  T
Q  502 taagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacg 601  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39844157 tgagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcatatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacg 39844058  T
Q  602 agcaca 607  Q
    ||||||    
T  39844057 agcaca 39844052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 25585449 - 25584851
Alignment:
Q  7 tccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagac 106  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25585449 tccaaaaatagtttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagac 25585350  T
Q  107 ttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||   ||   |||||  ||||    
T  25585349 ttgatttctttgtaattaaaattcgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaactatttaaaaaaaaaattaa 25585250  T
Q  206 aatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcca 305  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25585249 aatcaacctaacccgccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcca 25585152  T
Q  306 aatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaa 405  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  25585151 aatcaaataaaaataaccaaaaatatacttcttctccctccactctttcatttagatttttaggtaataattttcaaataagcaa-tgaatttagcacaa 25585053  T
Q  406 gataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataag 505  Q
    | ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25585052 ggtaatttaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttatggtgctagcaccttccctttgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgataag 25584953  T
Q  506 ggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagca 605  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25584952 ggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgagca 25584853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Original strand, 16775036 - 16775641
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgt---ttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataat 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16775036 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggcttgtaacccaagtgtcctttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataat 16775135  T
Q  103 agacttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccatttt-caaaaat 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||  |||| ||||| |    
T  16775136 agacttgatttctt-gtaattaaaatttgaccaaccgcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaacctttttttcaaaatt 16775234  T
Q  201 cttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16775235 gttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttctcttcaagggtatgtaggcatgggatttgtatcc 16775334  T
Q  301 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaat-aattttcaaataagcaaatcaattca 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||| |    
T  16775335 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatgcttcttcttcccccattctttcacttagatttttaggtagttaattttcaaataagcaa-tgaattta 16775433  T
Q  400 gcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctc 499  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  16775434 gcacaagataatttaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctc 16775533  T
Q  500 gataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatca 599  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  16775534 gatgagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagatcgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcg 16775633  T
Q  600 cgagcaca 607  Q
    ||||||||    
T  16775634 cgagcaca 16775641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Original strand, 16760599 - 16761204
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgt---ttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataat 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16760599 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggcttgtaacccaagtgtcctttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataat 16760698  T
Q  103 agacttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccatttt-caaaaat 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||  |||| ||||| |    
T  16760699 agacttgatttctt-gtaattaaaatttgaccaaccgcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaacctttttttcaaaatt 16760797  T
Q  201 cttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  16760798 gttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttctcttcaagggtatataggcatgggatttgtatcc 16760897  T
Q  301 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaat-aattttcaaataagcaaatcaattca 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||| |    
T  16760898 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatgcttcttcttcccccattctttcacttagatttttaggtagttaattttcaaataagcaa-tgaattta 16760996  T
Q  400 gcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctc 499  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  16760997 gcacaagataatttaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctc 16761096  T
Q  500 gataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatca 599  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  16761097 gatgagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagatcgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcg 16761196  T
Q  600 cgagcaca 607  Q
    ||||||||    
T  16761197 cgagcaca 16761204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 26871829 - 26871212
Alignment:
Q  9 caaaaatatttt-cttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttc--cttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  26871829 caaaaatatttttcttaataaaccttggttagtaacccaagtgttttttttcttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattata 26871730  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttat--------------ctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccat 190  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |              ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  26871729 cttgattttcttgtaattaaaatttgaccaacctcactttgttttttttgtttttttttttctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaacc-at 26871631  T
Q  191 tttcaaaaa---tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcat 287  Q
    |||||||||   | |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26871630 tttcaaaaaaaatattaaaatcaatccaacccaccaaaaagaaattttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcat 26871531  T
Q  288 aggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataag 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26871530 aggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataag 26871431  T
Q  388 caaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccga 487  Q
    ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26871430 caa-tgaatttagcacaagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccga 26871332  T
Q  488 atccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgat 587  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  26871331 atccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgatttaaatcaattaatggtttgat 26871232  T
Q  588 agccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  26871231 atccgaaaatcacgagcaca 26871212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 607
Target Start/End: Original strand, 17975437 - 17976043
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaa-taaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagact 107  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17975437 caaaaatattttcttaagtaaaacttggttcgtaacccaagtgttttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattagact 17975536  T
Q  108 tgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttat---ctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccatttt--caaaaatc 201  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||  ||||  ||||| |     
T  17975537 tgatttgcttgtaattaaaatttgaacaacctcaccttatttttttctctcatgccttgaggcctctaatctcttcttaaaaccttttttttcaaaattg 17975636  T
Q  202 ttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttt-taggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17975637 ttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaatttttttaggtgaactacattggttttgatccctattctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 17975736  T
Q  301 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcag 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| ||    
T  17975737 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagacttttaggtaataactttcagataagc-aatgaatttag 17975835  T
Q  401 cacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcg 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17975836 cacaagataaattaggtaagaggttcctacggagtaccgtagacgcttaggatgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcg 17975935  T
Q  501 ataagggtttttactca-ttttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatca 599  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17975936 ataagggtttttactcatttttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgttatccgaaaatca 17976035  T
Q  600 cgagcaca 607  Q
    ||||||||    
T  17976036 cgagcaca 17976043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 148 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 22103884 - 22103424
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaacta 247  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22103884 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacttaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaacta 22103785  T
Q  248 cattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcca 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22103784 cattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaactaaccaaaaacatacttcttctccctcca 22103685  T
Q  348 ttctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgc 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22103684 ttctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatctagcacaagataatctatgtaagaggttcctatggaataccatagacgc 22103585  T
Q  447 ttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcga 546  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  22103584 ttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaggtctcgataagggtttttactcatttttttccttcccacgaataaaaatcga 22103485  T
Q  547 gagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22103484 gagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgagcaca 22103424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 148 - 610
Target Start/End: Original strand, 36248655 - 36249115
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaacta 247  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36248655 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaatcttaaaatcaacttaacccaccaaaaagaaattttttaggtgaacta 36248753  T
Q  248 cattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcca 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  36248754 cattggttttgatcccttttcttcaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataacaaaaaacatacttcttctcccccca 36248853  T
Q  348 ttctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgct 447  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  36248854 ttctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgct 36248952  T
Q  448 tagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgag 547  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36248953 tagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgatgagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgag 36249052  T
Q  548 agttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcacacat 610  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  36249053 agttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatattcgaaaatcacgagcacacat 36249115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 23923456 - 23922855
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||  ||| ||||||    
T  23923456 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaatcaatttaacatcaatattagact 23923357  T
Q  108 tg-atttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttatttta-tctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatc-tt 203  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||| ||||  |||||||| ||||||  ||||| ||| |  ||    
T  23923356 tggatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcatcttatttttctctcatgccttgaggtctctaatctcttcttaaaaccttttttccaaacttgtt 23923257  T
Q  204 aaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttc 303  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  23923256 aaaatcaatctagcccaccaaaaagatattttttagatgaactacattggttttgatccctttcttttaacggtatgtaggcaaagaatttttatccttc 23923157  T
Q  304 caaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-tttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagca 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23923156 caaatcaaataaaaataaccaaaaacatatttctcctccctccattctttcacttagaccttttaggcaataattttcaaataagcaaattaatttagca 23923057  T
Q  403 caagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgat 502  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  23923056 caagataaattaggcaagaggttcctacggaataccgtagacgcttaggatgctagtaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtct---t 23922960  T
Q  503 aagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacga 602  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||    
T  23922959 aagagtttttactcattttttctcttcccacgaataaaaattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatctgaaaatcatga 23922860  T
Q  603 gcaca 607  Q
    |||||    
T  23922859 gcaca 23922855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 148 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 36252750 - 36252300
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaacta 247  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  36252750 tttatctcatgcctt-aggcctctttctcttcttaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaactttttaggtgaacta 36252654  T
Q  248 cattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcca 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  36252653 cattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcaagggagtca-atccttccaaatcaaataaaaataaccaaaagcatactacttctccctcca 36252555  T
Q  348 ttctttcacttagatttttaggtaataatttt--caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  36252554 ttctttcacttagatttttaggtaataattttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagaggttcctacgggataccgtagacg 36252455  T
Q  446 cttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcg 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  36252454 cttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtct---gaagggtttttactcattttttcccttctcatgaataaaaatcg 36252358  T
Q  546 agagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgag 603  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  36252357 agagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttaatatccgaaaatcacgag 36252300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 148 - 599
Target Start/End: Original strand, 19850723 - 19851177
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaa-atcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19850723 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaaccaatttcaaaaaaatcttaaaagcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 19850822  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 346  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19850823 acattggttttgatcccttttcttaaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctctctcc 19850922  T
Q  347 attctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| ||||||| |||| ||||  || ||    
T  19850923 attctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttcctttggagtaccgaagtcg 19851022  T
Q  446 cttagggtgc-tagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatc 544  Q
     ||| ||||| || ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  19851023 tttaaggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatt 19851122  T
Q  545 gagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatca 599  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19851123 gagtgttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatca 19851177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 148 - 599
Target Start/End: Original strand, 19856759 - 19857213
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaa-atcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19856759 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaaccaatttcaaaaaaatcttaaaagcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 19856858  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 346  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19856859 acattggttttgatcccttttcttaaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctctctcc 19856958  T
Q  347 attctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| ||||||| |||| ||||  || ||    
T  19856959 attctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttcctttggagtaccgaagtcg 19857058  T
Q  446 cttagggtgc-tagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatc 544  Q
     ||| ||||| || ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  19857059 tttaaggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatt 19857158  T
Q  545 gagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatca 599  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19857159 gagtgttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatca 19857213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 36576999 - 36576543
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa--tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaa 244  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||  |||    
T  36576999 ttttatcttatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattcttgagtggaa 36576903  T
Q  245 ctacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 344  Q
    |||| ||||||||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36576902 ctacgttggttttgatccctttcccaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 36576805  T
Q  345 ccattctttcacttagatttttaggtaataat-tttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    |||||||||||||||||  || ||| |||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36576804 ccattctttcacttagacatt-aggcaataatctttcaaataagcaa-tgaatttagcacaagataaattaggcaagaggttcctatggaataccataga 36576707  T
Q  444 cgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaat 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36576706 cgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaatcaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaat 36576607  T
Q  544 cgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  36576606 tgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 36576543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 293 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 4843121 - 4842806
Alignment:
Q  293 ttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagattttt-aggtaataattttcaaataagcaaa 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||     
T  4843121 ttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagattttttaggtgataattttcaaataagcaat 4843022  T
Q  392 tcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatcc 491  Q
      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4843021 gaaatt-agcacaagataaattaggtaagaggttcctaaggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatcc 4842923  T
Q  492 aaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagcc 591  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4842922 aaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatcc 4842823  T
Q  592 gaaaatcacgagcacac 608  Q
    |||||||||||||||||    
T  4842822 gaaaatcacgagcacac 4842806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 148 - 607
Target Start/End: Original strand, 25718966 - 25719418
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaacta 247  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |   ||||||    
T  25718966 tttatctcatgccttgaggcctctttctctaattaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgattggaacta 25719063  T
Q  248 cattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcca 347  Q
    | | ||||||||| ||||| |   ||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25719064 cgtcggttttgattcctttcccaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcca 25719161  T
Q  348 ttctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgc 446  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  25719162 ttctttcacttagatttt-aggtaataatttttcgagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgc 25719260  T
Q  447 ttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcga 546  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||    
T  25719261 ttaaggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtct---taagggtttttactcatttttttccttcccacgaataaaaattga 25719357  T
Q  547 gagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25719358 gagttcaaagattgatgattcaaatcaattaatggtttgatattcgaaaatcacgagcaca 25719418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 238 - 607
Target Start/End: Original strand, 4583602 - 4583972
Alignment:
Q  238 aggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttct 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4583602 aggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcaggggagtca-atccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttct 4583700  T
Q  338 tctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaatac 437  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  4583701 tcttcctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcatgtaagcaaatcaatttagcacaggataatttaggtaagaggttcctacggaatac 4583800  T
Q  438 catagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaat 537  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4583801 cgtagacacttagggtgctagcaccttctcttcgtgtaaccaac-cccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaat 4583899  T
Q  538 aaaaatcgagagttcaaagat---taacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||| ||||||||||||||   | |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  4583900 aaaaattgagagttcaaagattgatgacgatttaaatcaattaatggtttgatatccggaaatcacgagcaca 4583972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 298 - 607
Target Start/End: Original strand, 15832007 - 15832315
Alignment:
Q  298 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaatt 397  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  15832007 tccttccaaatcaaataaaaaaaaccaaaaacatatttcttctccctccattctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataagcaa-tgaatt 15832105  T
Q  398 cagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtc 497  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15832106 tagcacaagataatttaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttagggtgctagcaccttccctttgcgtaaccaacccccgaatccaaagtc 15832205  T
Q  498 tcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaat 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15832206 tcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgataaccgaaaat 15832305  T
Q  598 cacgagcaca 607  Q
    | ||||||||    
T  15832306 cgcgagcaca 15832315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 147 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 6583131 - 6582682
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa-tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||  ||||    
T  6583131 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaaatcttaaaatcaacctaacccac----aagaaattttttagtggaac 6583037  T
Q  246 tacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    ||| | | ||||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6583036 tacgtcgattttgatccctttcccaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 6582939  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataatttt--caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| ||||| |  ||| ||||| ||     
T  6582938 cattctttcacttagatttttaggtaataattttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttcattcggagtaccaaagt 6582839  T
Q  444 cgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaa 542  Q
    || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6582838 cgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaa 6582739  T
Q  543 tcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatca 599  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6582738 ttgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatca 6582682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Original strand, 23092654 - 23093102
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||  |  |||||    
T  23092654 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgtgtggaact 23092751  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 346  Q
    || | ||||||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23092752 acgtcggttttgatccctttcccaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 23092849  T
Q  347 attctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  || ||    
T  23092850 attctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtacctaagtcg 23092949  T
Q  446 cttagggtgc-tagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatc 544  Q
     ||||||||| || ||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  23092950 tttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataaggg-ttttactcattttttcctttcccacgaataaaaatt 23093048  T
Q  545 gagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  23093049 gagagttcaaaaattgacgattcaaatcaatcaatggtttgatatccgaaaatc 23093102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 14 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 26913124 - 26912534
Alignment:
Q  14 atattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttcctttt-attttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgatt 112  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  | ||||||| |||| |||| |||| |    
T  26913124 atattttcttaataaacctttgattttaatccaagtgttttttctttttattttcttaatcaaatgtttaatcaatttaatatccatattagagttgagt 26913025  T
Q  113 tctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccatttt-------caaaaatctta 204  Q
    |   | ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||  ||| || |||||||||| |||||||| ||||||  ||||       ||||||| |||    
T  26913024 ttcgtataattaaaatttgaccaacctcatcttattctttc--atgtcttgaggcctcttatctcttcttaaaaccttttttttcttttcaaaaatgtta 26912927  T
Q  205 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaa--ctttttaggt-gaactacattgg-ttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 300  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |   ||||| ||   ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||    
T  26912926 aaatcaatctaacccaccaaaaatcatttcttttgagaacgaactacgttgggttttgatcccttttctttaagagtatgtaggcaaaggattt--atcc 26912829  T
Q  301 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcag 400  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  26912828 ttccaaatcaaataaaaacaac-aaaaacatacttcttctccc-ccattctttcacctagactcttaggcaataattttcaaataagcaaaataatttag 26912731  T
Q  401 cacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcg 500  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  26912730 cacaagataa-ttaggcaagaggttcctacggagtaccgtagacgcttagggtgatagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaaatctc- 26912633  T
Q  501 ataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatca 599  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  26912632 ataagggtttttactcactttttcccttcccacgaataaaagtagagagttcaaagattgaatattcaaatcaattaatgagttgatatccgaaaatca 26912534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Original strand, 14204439 - 14204901
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa----tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtg 242  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  |    
T  14204439 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtgg 14204535  T
Q  243 aactacattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctc 341  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14204536 aactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctc 14204633  T
Q  342 cctccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccat 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||| |||||||  ||| ||||      
T  14204634 cctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaaaataatctaggtaagcggttccttcggagtaccga 14204733  T
Q  441 agacgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataa 539  Q
    || || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  14204734 agtcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccaagaacaa 14204833  T
Q  540 aaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  14204834 aaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 14204901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Original strand, 14219080 - 14219542
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa----tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtg 242  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  |    
T  14219080 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtgg 14219176  T
Q  243 aactacattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctc 341  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14219177 aactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctc 14219274  T
Q  342 cctccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccat 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||| |||||||  ||| ||||      
T  14219275 cctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaaaataatctaggtaagcggttccttcggagtaccga 14219374  T
Q  441 agacgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataa 539  Q
    || || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  14219375 agtcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccaagaacaa 14219474  T
Q  540 aaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  14219475 aaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 14219542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 148 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 31001064 - 31000605
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttc-aaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  || | || ||  |||||    
T  31001064 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcgaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaata--aattcttgagtggaact 31000967  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    || |  |||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31000966 acgtcagttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 31000869  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagc-aaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||  ||     
T  31000868 cattctttcacttagatttt-aggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttagcacaagataatttaggtaagcggttccttcggagtaccgaagt 31000770  T
Q  444 cgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaa 542  Q
    || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  31000769 cgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgaaaagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaa 31000670  T
Q  543 tcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  31000669 tcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccaaaaatcgcgagcaca 31000605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 31207957 - 31207505
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa--tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaa 244  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||    
T  31207957 ttttatctcatgccttgaggcctctttctattcttaaaacc-attttcaaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattttttagtggaa 31207861  T
Q  245 ctacattggttttgatcccttttctttaa--gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 342  Q
    |||| | ||||||||||||||| |   ||  ||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31207860 ctacgtcggttttgatccctttcccaaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttcccc 31207763  T
Q  343 ctccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccata 441  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  |    
T  31207762 ctccattcttttacatagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaa 31207663  T
Q  442 gacgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaa 540  Q
    | || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  31207662 gtcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccatgaataaa 31207563  T
Q  541 aatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  31207562 aattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaatcaatggtttgatatccgaaaatc 31207505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 16190849 - 16190398
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa--tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaa 244  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||  |||    
T  16190849 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattcttgagtggaa 16190753  T
Q  245 ctacattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccc 343  Q
    |||| | ||||||||| ||||| |   || ||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16190752 ctacgtcggttttgattcctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccc 16190655  T
Q  344 tccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagc-aaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccata 441  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||  |    
T  16190654 tccattctttcacttagatttt-aggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttagcacaagataatttaggtaagcggttccttcggagtaccgaa 16190556  T
Q  442 gacgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaa 540  Q
    | || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16190555 gtcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaa 16190456  T
Q  541 aatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16190455 aattgagagttcgaagattgacgattcaaatcaatcaatggtttgatatccgaaaatc 16190398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 363 - 607
Target Start/End: Original strand, 25796693 - 25796937
Alignment:
Q  363 ttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcacc 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  25796693 ttttaggtaataattttcaaataagcaa-tgaatttagcacaagataaattaggtaagaggttcctacggattaccgtagacgcttagggtgctagcacc 25796791  T
Q  463 ttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactca-ttttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaa 561  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25796792 ttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgatgagggtttttactcatttttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaa 25796891  T
Q  562 cgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25796892 cgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgagcaca 25796937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 373 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 1388326 - 1388087
Alignment:
Q  373 taattttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgc 472  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1388326 taattttcaagtaagcaaatcaatttagcacaaggtaaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttccctttgc 1388227  T
Q  473 gtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatc 572  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1388226 ataaccaacccccgaatccaaagtctcgatgagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcatatc 1388127  T
Q  573 aattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcacacatat 612  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  1388126 aattaatggtttgatatccgaaaatcacgagcacaaatat 1388087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 148 - 599
Target Start/End: Original strand, 17129206 - 17129677
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaacta 247  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  ||||||    
T  17129206 tttatctcatgccttgaggcctctttcttttcttaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaacta 17129303  T
Q  248 cattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatact------------- 334  Q
    | | ||||||||||||||| |   ||||||| ||||||| || | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 
T  17129304 cgtcggttttgatccctttcccaaaagggtacgtaggcagagaacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatactaaaaataaccaaa 17129401  T
Q  335 --------tcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagc-aaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggt 424  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||    
T  17129402 aacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggt 17129501  T
Q  425 tcctatggaataccatagacgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcatttttt 523  Q
    ||||  ||| ||||  ||  | |||||||||| | |||||||| |   || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17129502 tccttcggagtaccgaagttgtttagggtgcttaacaccttccatattcgaaaccaagccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcatttttt 17129601  T
Q  524 cccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatca 599  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17129602 cccttccctcgaataaaaattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatca 17129677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 298 - 598
Target Start/End: Original strand, 22418206 - 22418509
Alignment:
Q  298 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagc-aaatcaa 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||    
T  22418206 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatactccttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaa 22418305  T
Q  396 ttcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaa 494  Q
    || ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  || || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| ||||||||||||    
T  22418306 tttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaagtcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaa 22418405  T
Q  495 gtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaa 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22418406 gtctcgataagggtttttactcatttttccccttcccacgaataaaaattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaatcaatggtttgatatccgaa 22418505  T
Q  595 aatc 598  Q
    ||||    
T  22418506 aatc 22418509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 298 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 22367038 - 22366732
Alignment:
Q  298 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagattttt-aggtaataatttt-caaataagcaaa-tca 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||| | |    
T  22367038 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacataattcttctctctccattcttttacttagattttttaggtaataatttttcgagtaagcaaaatga 22366939  T
Q  395 attcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaa 493  Q
    ||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  || || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||    
T  22366938 atttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaagtcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaa 22366839  T
Q  494 agtctcgataagggttttt-actcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccg 592  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  22366838 agtctcgataagggttttttactcattttttcccttcccatgaataaaaattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatgggttgacatccg 22366739  T
Q  593 aaaatca 599  Q
    |||||||    
T  22366738 aaaatca 22366732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 378 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 14335968 - 14335741
Alignment:
Q  378 ttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaac 477  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14335968 ttcaaataagcaaagcaatttagcacaagataagttaagtaaaaggttcctacggagtaccgtagacgcttagggtgctaacaccttcccttcgcgtaac 14335869  T
Q  478 caactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattc-aaatcaatt 576  Q
    |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  14335868 caacccccgaatccaaagtct---taagggtttttactcattttttccc-tcccacgaat-aaaattgagagttcaaagattgacgattcaaaatcaatt 14335774  T
Q  577 aatggtttgatagccgaaaatcacgagcacaca 609  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14335773 aatggtttgatatccgaaaatcacgagcacaca 14335741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 381 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 23601082 - 23600856
Alignment:
Q  381 aaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaa 480  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23601082 aaataagcaaagcaatttagcacaagataaattaagtaaaaggttcctacggagtaccgtagacgcttagggtgctaacaccttcccttcgcgtaaccaa 23600983  T
Q  481 ctcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattc-aaatcaattaat 579  Q
    | | |||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  23600982 cccacgaaaccaaagtct---taagggtttttactcattttttccc-tcccacaaaaaaaaattgagagttcaaagattgacgattcaaaatcaattaat 23600887  T
Q  580 ggtttgatagccgaaaatcacgagcacacat 610  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  23600886 ggtttgacatccgaaaatcacgagcacacat 23600856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 418 - 488
Target Start/End: Original strand, 17809453 - 17809523
Alignment:
Q  418 aagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaa 488  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||| ||| |||||||  || ||||||| |||||||||||| |||||    
T  17809453 aagaggttcctatagagtactatagacgtttaaggtgctaatacattccctttgcgtaaccaacttccgaa 17809523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22023149 - 22023032
Alignment:
Q  205 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 304  Q
    ||||||| | ||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||  || |||||||||| | || || |||||||||    
T  22023149 aaatcaatccaacccaccaaata--aatttttgaggtgaactacattgattttgatccattttcctt--ggatatgtaggca-aagaattctatccttcc 22023055  T
Q  305 aaatcaaataaaaataaccaaaaa 328  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||    
T  22023054 aaatc-aataaaaacaacaaaaaa 22023032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 493; Significance: 0; HSPs: 82)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 493; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 27339453 - 27338858
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27339453 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttt-cctttt------ttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 27339361  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa-tctta 204  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27339360 cttgatttctttgtaattaaaattagaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaaatctta 27339261  T
Q  205 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27339260 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaacttttttggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 27339161  T
Q  305 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcaca 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  27339160 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcaca 27339062  T
Q  405 agataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataa 504  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  27339061 agataatttaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcatagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcaataa 27338962  T
Q  505 gggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagc 604  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27338961 gggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgagtcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgagc 27338862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 490; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 30063228 - 30062629
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30063228 ctccaaaaatatttt-ttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataataga 30063131  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaat--ctt 203  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  30063130 tttgatttctt-gtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctctttcccttctaaaaacccattttcaaaaatatctt 30063032  T
Q  204 aaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30063031 aaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcatgggatttttatccttc 30062932  T
Q  304 caaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagat-ttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagca 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  30062931 caaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagattttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagca 30062833  T
Q  403 caagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgat 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30062832 caagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgat 30062733  T
Q  503 aagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacga 602  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30062732 aagggtttttactcatttttt-ccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacaattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacga 30062634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 484; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 608
Target Start/End: Original strand, 41016348 - 41016951
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttcctttt-attttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatag 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41016348 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattag 41016447  T
Q  105 acttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctc--atgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatct 202  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  41016448 acttgattttcttgtaattaaaatgtgaacaacctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctttcttttcttaaaacccattttcaaaaatct 41016547  T
Q  203 taaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 302  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41016548 taaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 41016645  T
Q  303 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagca 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41016646 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcctccattctttcacttagatttttagataataattttcaaataagcaaatcaatttagca 41016745  T
Q  403 caagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgat 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41016746 caagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgat 41016845  T
Q  503 aagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacga 602  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41016846 aagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacga 41016945  T
Q  603 gcacac 608  Q
    ||||||    
T  41016946 gcacac 41016951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 483; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 607
Target Start/End: Original strand, 4435387 - 4435984
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagactt 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  4435387 caaaaatatttt-ttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagattt 4435484  T
Q  109 gatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaat--cttaaa 206  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  4435485 gatttctt-gtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctctttcccttctaaaaacccattttcaaaaatatcttaaa 4435583  T
Q  207 atcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4435584 atcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggattttcatccttccaa 4435683  T
Q  307 atcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaag 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||    
T  4435684 atcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcctccattctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatgtagcacaag 4435782  T
Q  407 ataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagg 506  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4435783 ataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagg 4435882  T
Q  507 gttttt-actcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagca 605  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4435883 gtttttcactcattttttccctttccacgaataaaaatcaagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgagca 4435982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 479; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 607
Target Start/End: Original strand, 4456178 - 4456775
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagactt 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  4456178 caaaaatatttt-ttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagattt 4456275  T
Q  109 gatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaat--cttaaa 206  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  4456276 gatttctt-gtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctctttcccttctaaaaacccattttcaaaaatatcttaaa 4456374  T
Q  207 atcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4456375 atcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggattttcatccttccaa 4456474  T
Q  307 atcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaag 406  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||    
T  4456475 atcaaataaaaataaccaaaaatatacttcttctccctccattctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatgtagcacaag 4456573  T
Q  407 ataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagg 506  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4456574 ataaattaggtaagaggttcctacgaaatagcgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagg 4456673  T
Q  507 gttttt-actcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagca 605  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4456674 gtttttcactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgagca 4456773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 479; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Original strand, 50826316 - 50826913
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50826316 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataataga 50826415  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatctta 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| |||||| ||||||| |    
T  50826416 cttgatttctt-gtaattaaaatttgaccaacctcatcttattttatctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaacc-attttctaaaatct-a 50826512  T
Q  205 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 304  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50826513 aaatcaacc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 50826611  T
Q  305 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcaca 404  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||    
T  50826612 aagtcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataagcaacg-aatttagcaca 50826710  T
Q  405 agataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataa 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50826711 agataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgataa 50826810  T
Q  505 gggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagc 604  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  50826811 gggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccaaaaatcacgagc 50826910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 464; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 27551247 - 27550643
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgt------ttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27551247 caaaaatattttcttaataaaccttggcttgtaacccaagtgtccttttttttcctttcattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataat 27551148  T
Q  103 agacttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatc 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||  |||| |||||| |||||||||||||    
T  27551147 agacttgatttctt-gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcctttcttaaaacc-attttcaaaaatc 27551050  T
Q  202 ttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcct 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27551049 ttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcct 27550950  T
Q  302 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagc 401  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27550949 tccaaatcaagtaaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttagatattaattttcaaataagcaaatcaatttagc 27550850  T
Q  402 acaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcga 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  27550849 acaagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcga 27550750  T
Q  502 taagggtttttactcatttttt-cccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcac 600  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27550749 tgagggtttttactcattttttcccctccccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcac 27550650  T
Q  601 gagcaca 607  Q
    |||||||    
T  27550649 gagcaca 27550643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 50849544 - 50848940
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttt--ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataata 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50849544 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataata 50849445  T
Q  104 gacttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttc---aaaaa 199  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| ||||||   |||||    
T  50849444 gacttgatttctt-gtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaacc-attttctaaaaaaa 50849347  T
Q  200 tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggattttt--a 297  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  50849346 tct-aaaatcaacc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttcaa 50849249  T
Q  298 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaatt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  50849248 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataagcaacg-aatt 50849150  T
Q  398 cagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtc 497  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50849149 tagcacaagataaattaggtaagaggttcctacggaataccaaagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtc 50849050  T
Q  498 tcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaat 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  50849049 tcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccaaaaat 50848950  T
Q  598 cacgagcaca 607  Q
    ||||||||||    
T  50848949 cacgagcaca 50848940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 18950043 - 18949441
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtg--tttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataata 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18950043 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggcttgtaacccaagtgcttttttccttttatttccttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataata 18949944  T
Q  104 gacttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttc-aaaaatc 201  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| |||||| |||||||    
T  18949943 gacttgattttcttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatcccttctcaaaacc-attttctaaaaatc 18949845  T
Q  202 ttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcct 301  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18949844 t-aaaatcaacc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcct 18949747  T
Q  302 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagattttt-aggtaataattttcaaataagcaaatcaattcag 400  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  18949746 tccaagtcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccctattctttcacttagattttttaggtaataattttcaaataagcaa-tgaatttag 18949648  T
Q  401 cacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcg 500  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18949647 cacaagatagattaggtaagaggttcctatggaataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaattcccgaatccaaagtctcg 18949548  T
Q  501 ataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcac 600  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18949547 atgagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgatttaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcac 18949448  T
Q  601 gagcaca 607  Q
    |||||||    
T  18949447 gagcaca 18949441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 8153730 - 8153127
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagt-gtttttccttttatttt-cttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataata 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8153730 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggcttgtaacccaagttgcttttccttttatttttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataata 8153631  T
Q  104 gacttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttc-aaaaatc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| |||||| |||||||    
T  8153630 gacttgatttctttgtaattaaaattcgac-aacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaacc-attttctaaaaatc 8153533  T
Q  202 ttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggattttta-tcc 300  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  8153532 t-aaaatcaacc-aacccaccaaaaagaaacttttcaggtgaactacattggttttgatcccttttgtttaagggtatgtaggcataggattttcaatcc 8153435  T
Q  301 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcag 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8153434 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaatttag 8153335  T
Q  401 cacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcg 500  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  8153334 cacaaggtaaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttccctttgcataaccaacccccgaatccaaagtctcg 8153235  T
Q  501 ataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcac 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8153234 ataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgatttaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcac 8153135  T
Q  601 gagcacac 608  Q
    ||||||||    
T  8153134 gagcacac 8153127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 51922660 - 51922058
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgt---ttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51922660 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtttgctttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatactaga 51922561  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatctta 204  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| || ||||| |||||| |||||| ||||  |||    
T  51922560 cttgattttcttgtaattaaaatttgactaacctcaccttattttctctcatgccttaaggcctcttatcccttcttaaaacc-attttctaaaaattta 51922462  T
Q  205 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 304  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51922461 aaatcaacc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacgttggttttgatcccctttctttaaaggtatgtaggcagaggatttttatccttcc 51922363  T
Q  305 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcaca 404  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  51922362 aaatcaaagaaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataaacaaatcaatttagcaca 51922263  T
Q  405 agataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataa 504  Q
    ||||||  |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51922262 agataatctaggtaagaggttcttacggaataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgataa 51922163  T
Q  505 gggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagc 604  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51922162 gggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgagc 51922063  T
Q  605 acaca 609  Q
    |||||    
T  51922062 acaca 51922058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Original strand, 39706805 - 39707403
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39706805 ctcccaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 39706904  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatctta 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||  ||    
T  39706905 cttgacttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaact-attttcaaaaat--ta 39707001  T
Q  205 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 304  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39707002 aaatcaacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggattttcatccttcc 39707099  T
Q  305 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcaca 404  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39707100 aaatcaaataaaaataatcaaaaacatacttcctcttcctccattctttcacttagatttttaggtattaattttcaaataagcaaatcaatttagcaca 39707199  T
Q  405 agataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataa 504  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  39707200 agataatttaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgatga 39707299  T
Q  505 gggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaatt-aatggtttgatagccgaaaatcacgag 603  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  39707300 gggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcacagattgaagattcaaatcaattaaatggtttgatatccgaaaatcgcgag 39707399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 607
Target Start/End: Original strand, 17364673 - 17365275
Alignment:
Q  9 caaaaatatttt-cttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttt---ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatag 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17364673 caaaaatatttttcttaataaaccttggttagtaacccaagtgttttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatag 17364772  T
Q  105 acttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaa---t 200  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||   |    
T  17364773 acttgattttcttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttctctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaacc-attttcaaaaaaaat 17364871  T
Q  201 cttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 300  Q
     |||||||||||||||||||| ||| |  || |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17364872 attaaaatcaacctaacccactaaata--aatttttgaggtgagctacaatggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 17364969  T
Q  301 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcag 400  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17364970 ttccaaatcaaataaaaaaaac-aaaaacatacttcttctccctccattatttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaatttag 17365068  T
Q  401 cacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcg 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17365069 cacaagataaattaggtaagaggttcctacggagtaccgtagacgcttagggtgctaacaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcg 17365168  T
Q  501 ataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcac 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17365169 ataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcac 17365268  T
Q  601 gagcaca 607  Q
    |||||||    
T  17365269 gagcaca 17365275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 607
Target Start/End: Original strand, 17360031 - 17360633
Alignment:
Q  9 caaaaatatttt-cttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttt---ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatag 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17360031 caaaaatatttttcttaataaaccttggttagtaacccaagtgttttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattag 17360130  T
Q  105 acttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaa---t 200  Q
     ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||   |    
T  17360131 tcttgattttcttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttctctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaacc-attttcaaaaaaaat 17360229  T
Q  201 cttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 300  Q
     |||||||||||||||||||| ||| |  || |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17360230 attaaaatcaacctaacccactaaata--aatttttgaggtgagctacaatggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 17360327  T
Q  301 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcag 400  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17360328 ttccaaatcaaataaaaaaaac-aaaaacatacttcttctccctccattatttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaatttag 17360426  T
Q  401 cacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcg 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17360427 cacaagataaattaggtaagaggttcctacggagtaccgtagacgcttagggtgctaacaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcg 17360526  T
Q  501 ataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcac 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17360527 ataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcac 17360626  T
Q  601 gagcaca 607  Q
    |||||||    
T  17360627 gagcaca 17360633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 8196817 - 8196217
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgt---ttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8196817 caaaagtattttcttaataaaacttggtttgtaacccaagtttgctttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatactaga 8196718  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatctta 204  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||| |    
T  8196717 cttgattttcttgaaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaacc-attttctaaaatct-a 8196620  T
Q  205 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggattttta-tccttc 303  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  8196619 aaatcaaccaaacc-accaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggattttcaatccttc 8196521  T
Q  304 caaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcac 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  8196520 caaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctctctccattctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataagaaaatcaatttagcac 8196421  T
Q  404 aagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgata 503  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  8196420 aagataatttaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttaccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgaga 8196321  T
Q  504 agggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgag 603  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  8196320 agggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaaataatggtttgatatccaaaaatcacgag 8196221  T
Q  604 caca 607  Q
    ||||    
T  8196220 caca 8196217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 607
Target Start/End: Original strand, 3711560 - 3712152
Alignment:
Q  10 aaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttt---ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagac 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||             
T  3711560 aaaaatattttcttaataaaccttggcttgtaacccaagtgttttttttccttttatttttttaatcaaatgcttaattgaattaatattcc-------- 3711651  T
Q  107 ttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccatttt---caaaaatct 202  Q
      |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||  ||||   | ||||| |    
T  3711652 --gattttcttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaacctttttttttctaaaat-t 3711748  T
Q  203 taaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 302  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3711749 taaaatcaacc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcacaggatttttatcctt 3711847  T
Q  303 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagca 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  3711848 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataagcaaatgaatttagca 3711947  T
Q  403 caagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgat 502  Q
    |||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3711948 caagataaattaggtaagaggtccatacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgat 3712047  T
Q  503 aagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacga 602  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  3712048 aagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatctcga 3712147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 13507842 - 13507238
Alignment:
Q  10 aaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttt-------ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataat 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13507842 aaaaatattttcttaataaaccttggcttgtaacccaagtgttttttttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatatt 13507743  T
Q  103 agacttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatc 201  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||   ||| |||| |||||||| ||||||    
T  13507742 agacttgattttcttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcattccttgaggcctcttatcctctcttaaaa-ccattttctaaaatc 13507644  T
Q  202 ttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttt-tatcc 300  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  13507643 -taaaatcaacc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactgcattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggattttcaatcc 13507546  T
Q  301 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcag 400  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  13507545 ttccaaatcgaataaaaataaccaaaaacatacctcttctccccccattctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttag 13507447  T
Q  401 cacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcg 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13507446 cacaagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttaggatgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcg 13507347  T
Q  501 ataaggg-tttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatca 599  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13507346 ataagggttttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgaagattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatca 13507247  T
Q  600 cgagcacac 608  Q
    | |||||||    
T  13507246 caagcacac 13507238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Original strand, 17935023 - 17935628
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttt------------ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaat 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17935023 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttttttttttttttccttttattttcttaatcaaatgctttattgaattaat 17935122  T
Q  94 attcataatagacttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattt 192  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  17935123 attcatattagacttgattttcttgtaattaaaacttgaccaacctcaccttattttctctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaacc-attt 17935221  T
Q  193 tcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggat 292  Q
    || ||||| |||||||||||| |||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  17935222 tctaaaat-ttaaaatcaaccaaacccaccaaaaa--aatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttt-ctttaagggtatgtaggcaaaggag 17935317  T
Q  293 ttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaat 392  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17935318 tta-atccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaat 17935416  T
Q  393 caattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatcca 492  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17935417 caatttagcacaagataaattaggtaagaggttcctacggagtaccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatcca 17935516  T
Q  493 aagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccg 592  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17935517 aagtct---taagggtttttactcattttttcccttcccacaaataaaaattgagagttcaaagatttacgattcaaatcaattaatggtttgatatccg 17935613  T
Q  593 aaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||||    
T  17935614 aaaatcacgagcaca 17935628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 607
Target Start/End: Original strand, 2256387 - 2256984
Alignment:
Q  10 aaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagt-gtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagactt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2256387 aaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagttgcttttccttt-attttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattagactt 2256485  T
Q  109 gatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctc-tttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaa 207  Q
    |||||  || ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  2256486 gattttcttctaattaaaacttgaccaacctcacctcattttctctcatgccttgaggcttcctttctcttcttaaaacctattttcaaaaatcttaaaa 2256585  T
Q  208 tcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaa 307  Q
    ||||| |||| | |||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2256586 tcaacttaactcgccaaa--gaaatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcagaggatttttatccttccaaa 2256683  T
Q  308 tcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaaga 407  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  2256684 tcaaataaaaataaccaaaaatatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaaga 2256782  T
Q  408 taaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataaggg 507  Q
    ||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  2256783 taatttaggtaagaggttcctacagaataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgacaaggg 2256882  T
Q  508 tttttactca-ttttttcccttgccac-gaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagca 605  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2256883 tttttactcatttttttcccttcccacggaataaaaattgagagttcaaatattgacgatgcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgagca 2256982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 148 - 607
Target Start/End: Original strand, 14425728 - 14426188
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaacta 247  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14425728 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacttaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaacta 14425827  T
Q  248 cattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcca 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14425828 cattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcca 14425927  T
Q  348 ttctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgc 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14425928 ttctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatctagcacaagataatctatgtaagaggttcctatggaataccatagacgc 14426027  T
Q  447 ttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcga 546  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  14426028 ttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccaaatccaaagtctcgataaggatttttactcatttttttccttccaacgaataaaaatcga 14426127  T
Q  547 gagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14426128 gagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgagcaca 14426188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 18900931 - 18900462
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtg---tttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18900931 caaaaatattttcttaataaaacttggtttgtaatccaagttgcttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatactaga 18900832  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaa 205  Q
    |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18900831 cttattttctt-gtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttctctcatgcctcgaggcctttttcccttctaaaaacccattttcaaaaatcttaa 18900733  T
Q  206 aatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcca 305  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18900732 aatcaacctaacccatcaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcca 18900633  T
Q  306 aatcaaataaaaataacca-aaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcaca 404  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  18900632 aatcaaataaaaataaccaaaaaacatactccttctccccccattctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcaca 18900534  T
Q  405 agataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaa 476  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18900533 agataatttaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaa 18900462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Original strand, 15711119 - 15711578
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15711119 ttttatctcatgcctagaggcctctttcttttcttaaaacc-attttcaaaaaccttaaaatcaacccaacccaccaaaaagaaattttttaggtgaact 15711217  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||    
T  15711218 acattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaccatacttcttcttccccc 15711317  T
Q  347 attctttcacttagatttttaggtaa-taattttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  15711318 attctttcacttagatttttaggtaaataactttcaaataagcaa-tgaatttagcacaagataaattaggcaagaggttccaatggaataccatagacg 15711416  T
Q  446 cttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcg 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  15711417 cttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaatcaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaattg 15711516  T
Q  546 agagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15711517 agagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 15711578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Original strand, 15694516 - 15694975
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15694516 ttttatctcatgcctagaggcctctttcttttcttaaaacc-attttcaaaaaccttaaaatcaacccaacccaccaaaaagaaattttttaggtgaact 15694614  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||    
T  15694615 acattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaccatacttcttcttccccc 15694714  T
Q  347 attctttcacttagatttttaggtaa-taattttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  15694715 attctttcacttagatttttaggtaaataactttcaaataagcaa-tgaatttagcacaagataaattaggcaagaggttcctatataataccatagacg 15694813  T
Q  446 cttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcg 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  15694814 cttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaatcaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaattg 15694913  T
Q  546 agagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15694914 agagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 15694975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 187 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 8204447 - 8204028
Alignment:
Q  187 ccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggca 286  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8204447 ccattttctaaaatct-aaaatcaacc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggca 8204350  T
Q  287 taggattttta-tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaata 385  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8204349 taggattttcaatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctctctccattctttcacttagacttttaggtaataattttcaaata 8204250  T
Q  386 agcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactccc 485  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  8204249 agcaaatcaatttagcacaagataatttaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaaccccc 8204150  T
Q  486 gaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttg 585  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8204149 gaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttg 8204050  T
Q  586 atagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8204049 atagccgaaaatcacgagcaca 8204028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 607
Target Start/End: Original strand, 18351134 - 18351585
Alignment:
Q  152 tctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacatt 251  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18351134 tctcatgccttaaggcctctttctcttcttaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacatt 18351233  T
Q  252 ggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattct 351  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |   |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18351234 ggttttgatcccttt-ctttaagggtatgtaggcaggggagtca-atccttccaatttaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattct 18351331  T
Q  352 ttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttag 450  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18351332 ttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagaggttcctatgggataccatagacgcttag 18351431  T
Q  451 ggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagt 550  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18351432 ggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccaaatccaaagtct---taagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagt 18351528  T
Q  551 tcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18351529 tcagagattgacaattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgagcaca 18351585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 61 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 43468620 - 43468073
Alignment:
Q  61 tattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttg-atttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgc 159  Q
    |||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||||||    
T  43468620 tattttcttaatcaaatgtttaatcaacttaatattcatattagacttggatttctt-gcaattaaaatta-atcaacctcatcttattttctctcatgc 43468523  T
Q  160 ctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccatttt------caaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattg 252  Q
    || |||||||||  |||||||| ||||||  ||||      ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43468522 cttgaggcctctaatctcttcttaaaacctttttttttcttcaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattg 43468423  T
Q  253 gttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctt 352  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||    
T  43468422 gttttgatccctttcttttaagggtatgtaggcaaaggagtta-atccttccaaatcaaataaaaataaccaaaa-catactttttctcccccctttctt 43468325  T
Q  353 tcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttaggg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43468324 tcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaatttaacacaagataatttaggtaagaggttcatatggaataccatagacgcttaggg 43468225  T
Q  453 tgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttc 552  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43468224 tgctagcacattcccttcgcgtaaccaacccctgaatccaaagtct---taagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttc 43468128  T
Q  553 aaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  43468127 aaagattgacgattcgaatcaattaatggtttgatattcgaaaattacgagcaca 43468073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 9 - 522
Target Start/End: Original strand, 18040857 - 18041373
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagactt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18040857 caaaaatattttcttaataaaccttggttcgtaacccaaatgttttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattagactt 18040956  T
Q  109 gatttct-ttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttatttta---tctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccatttt---caaaaat 200  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    | |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||  ||||   ||||| |    
T  18040957 gatttttcttgtaattaaaatttgaacaacctcaccttatttttctctgtcatgccttgaggcctctaatctcttcttaaaaccttttttttacaaaatt 18041056  T
Q  201 cttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 300  Q
     |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||  ||||    
T  18041057 gttaaaatcaatccaacccaccaaaaaaaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttt-ctttaagggtatgtaggcaagggagtta-atcc 18041154  T
Q  301 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcag 400  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  18041155 ttccaaatcaaatataaataaccaagaacatgcttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatattcaaataagcaaatcaatttag 18041254  T
Q  401 cacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcg 500  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||      
T  18041255 cacaagataatttagttaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgtgtaaccaacccccgaatccaaagtct-- 18041352  T
Q  501 ataagggtttttactcattttt 522  Q
     || ||||||||||||||||||    
T  18041353 -taggggtttttactcattttt 18041373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 148 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 2215374 - 2214914
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccatttt-caaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||    
T  2215374 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccatttttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgaggtgaact 2215277  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2215276 acattggttttgatcccttt-ctttaagggtatgtaggcaagggagtca-atccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttattctccctcc 2215179  T
Q  347 attctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2215178 attctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 2215079  T
Q  446 cttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactca-ttttttcccttgccacgaataaaaatc 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  2215078 cttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtct---taaggatttttactcatttttttccattcccacgaataaaaatc 2214982  T
Q  545 gagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcacacatat 612  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  2214981 gagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgagcacaaatat 2214914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 147 - 555
Target Start/End: Original strand, 15696829 - 15697236
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15696829 ttttatctcatgcctagaggcctctttcttttcttaaaacc-attttcaaaaaccttaaaatcaacccaacccaccaaaaagaaattttttaggtgaact 15696927  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||    
T  15696928 acattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaccatacttcttcttccccc 15697027  T
Q  347 attctttcacttagatttttaggt-aataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 445  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15697028 attctttcacttagatttttaggtaaataactttcaaataagc-aatgaatttagcacaagataaattaggcaagaggttcctatggaataccatagacg 15697126  T
Q  446 cttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcg 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |    
T  15697127 cttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaatcaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccatgaataaaaattg 15697226  T
Q  546 agagttcaaa 555  Q
    ||||||||||    
T  15697227 agagttcaaa 15697236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 6 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 16814981 - 16814560
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatag 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16814981 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattag 16814882  T
Q  105 acttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatctt 203  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||| ||    
T  16814881 acttgattttcttgtaattaaaacttgaccaacctcaccttattttctctcatgccttgaggcctcttatctcttctcaaaacc-attttctaaaat-tt 16814784  T
Q  204 aaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttc 303  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||  |||||||    
T  16814783 aaaatcaaccaaacccatcaaaaagaaattatttaggtgaactacattggttttgatcccttt-ctttaagggtatgtaggcaaagaagtta-atccttc 16814686  T
Q  304 caaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcac 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16814685 caaatcaaataaaaataaccaaaaacatactttttctcccttcattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaatttagcac 16814586  T
Q  404 aagataaattaggtaagaggttccta 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  16814585 aagataaattaggtaagaggttccta 16814560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 9 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 18890748 - 18890340
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtg---tttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18890748 caaaaatattttcttaataaaacttggtttgtaatccaagttgcttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatactaga 18890649  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaa 205  Q
    |||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18890648 cttattttctt-gtaattaaaatttgaccaacctcatcttattttctctcatgcctcgaggcctctttcccttctaaaatcccattttcaaaaatcttaa 18890550  T
Q  206 aatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcca 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18890549 aatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcca 18890450  T
Q  306 aatcaaataaaaataacca-aaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcaca 404  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  18890449 aatcaaataaaaataaccaaaaaacatactccttctcctcccattctttcacttagacttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcaca 18890351  T
Q  405 agataaattag 415  Q
    |||||| ||||    
T  18890350 agataatttag 18890340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 10721157 - 10720700
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| |||| |||||||||    
T  10721157 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaatcttaaaatcaatctaaaccaccaaa--gaaatttttgaggtgaact 10721061  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaat-aaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10721060 acattggttttgatcccttttcttaaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaaccaaaaacatacttcttctccctc 10720961  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagac 444  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||| | ||| | | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  10720960 cattctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaaatgaacaagt-attttagcacaagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagat 10720863  T
Q  445 gcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatc 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  10720862 gcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaatc 10720763  T
Q  545 gagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  10720762 gagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccaaaaatcgcgagcaca 10720700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 6293970 - 6293524
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||| |||||||||    
T  6293970 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-atcttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccatcaaa--gaaatttttgaggtgaact 6293874  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6293873 acattggttttgatcccttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 6293775  T
Q  347 attctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 445  Q
    |||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| | | | || | ||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6293774 attctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaaataaacgagt-aacttagcacaaaataatctaagtaagaggttcctatggaataccatagacg 6293677  T
Q  446 cttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcg 545  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  6293676 cttaggatgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaatcg 6293577  T
Q  546 agagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6293576 agagttcaaagatcgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatc 6293524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Original strand, 27978685 - 27979139
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  |||||    
T  27978685 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaact 27978782  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 346  Q
    || | ||||||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27978783 acgtcggttttgatccctttcccaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcccttc 27978880  T
Q  347 attctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 445  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27978881 attctttcatttatatttttaggtaataatttttcaagtaatcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 27978980  T
Q  446 cttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcg 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27978981 cttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtct---taagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcg 27979077  T
Q  546 agagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  27979078 agagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 27979139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Original strand, 6563701 - 6564158
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa--tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaa 244  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||    
T  6563701 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgaggtgaa 6563797  T
Q  245 ctacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaa-catacttcttctccc 343  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6563798 ctacattggttttgatcccttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaaacatacttcttctccc 6563896  T
Q  344 tccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatag 442  Q
    |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||| ||||||| ||| |   || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6563897 tccattctttcacttaaacatt-aggcaataatttttcaaataaacaagtagctt-agcacaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatag 6563994  T
Q  443 acgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaa 542  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6563995 acgcttaggatgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcga-aagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaa 6564093  T
Q  543 tcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  6564094 tcgagagttcaaagatcgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatcgcgagcaca 6564158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Original strand, 6577370 - 6577827
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa--tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaa 244  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||    
T  6577370 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgaggtgaa 6577466  T
Q  245 ctacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaa-catacttcttctccc 343  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6577467 ctacattggttttgatcccttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaaacatacttcttctccc 6577565  T
Q  344 tccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatag 442  Q
    |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||| ||||||| ||| |   || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6577566 tccattctttcacttaaacatt-aggcaataatttttcaaataaacaagtagctt-agcacaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatag 6577663  T
Q  443 acgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaa 542  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6577664 acgcttaggatgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcga-aagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaa 6577762  T
Q  543 tcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  6577763 tcgagagttcaaagatcgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatcgcgagcaca 6577827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 6 - 356
Target Start/End: Original strand, 41007569 - 41007920
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttcctttt-attttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatag 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41007569 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtctttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattag 41007668  T
Q  105 acttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctc--atgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatct 202  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  41007669 acttgattttcttgtaattaaaatgtgaacaacctcaccttattttttctctcatgccttgaggcctctttcttttcttaaaacccattttcaaaaatct 41007768  T
Q  203 taaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 302  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41007769 taaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcctt 41007866  T
Q  303 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcac 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41007867 ccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcctccattctttcac 41007920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 5144721 - 5144265
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||| ||  |||||    
T  5144721 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccatttcgaaaaatcttaaaatcaacctaacccactaaa--gaaatttttgagtggaact 5144624  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    || | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5144623 acgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 5144526  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataatttt--caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||   | || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5144525 cattctttcacttagatttt-aggtaataattttttcaaataagcaacaaagtt-agcacaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccataga 5144428  T
Q  444 cgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaat 543  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  5144427 cgcttaggatgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcga-aagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaat 5144329  T
Q  544 cgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||    
T  5144328 cgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatcgtgagcaca 5144265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 148 - 599
Target Start/End: Original strand, 16290794 - 16291242
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaacta 247  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||    
T  16290794 tttatctcatgccttgaggcctctttcttttcttaaaacc-attttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaaattttgaggtgaacta 16290890  T
Q  248 cattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcca 347  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16290891 cattggttttgatcccttt-ctttaagggtatgtaggcaggggagtca-atccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcca 16290988  T
Q  348 ttctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgc 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||| |||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||  ||| ||||  || ||     
T  16290989 ttctttcacttagatttttaggttataatttttcaagtaaacaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcagttccttcggagtaccgaagtcgt 16291088  T
Q  447 ttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcg 545  Q
    |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  16291089 ttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaattg 16291188  T
Q  546 agagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatca 599  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16291189 agagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatca 16291242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 301 - 607
Target Start/End: Original strand, 17630358 - 17630664
Alignment:
Q  301 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcag 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17630358 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcctccattctttcacttagatttttagataataattttcaaataagcaaatcaatttag 17630457  T
Q  401 cacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcg 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  17630458 cacaagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcg 17630557  T
Q  501 ataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcac 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17630558 ataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagaacaaagataaacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcac 17630657  T
Q  601 gagcaca 607  Q
    |||||||    
T  17630658 gagcaca 17630664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 147 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 1004567 - 1004108
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa-tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||||    
T  1004567 ttttatctcatgccttgaggcctcttcctcttcttaaaacc-attttcaaaaagtctaaaaatcaatctaacccaccaaa--gaaatttttgaggtgaac 1004471  T
Q  246 tacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1004470 tacattggttttgatcccttttcttaaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaagcatacttcttctccctc 1004371  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagac 444  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| ||| | | || ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  || |    
T  1004370 cattctttcacttaga-cattaggcaataatttttcaaataaacaagt-agtttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaagtc 1004273  T
Q  445 gcttagggtg-ctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaat 543  Q
    | ||||||||  || ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1004272 gtttagggtgtttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaat 1004173  T
Q  544 cgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcacac 608  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  1004172 tgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcacac 1004108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 147 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 11918656 - 11918192
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa-tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  ||||    
T  11918656 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaac 11918560  T
Q  246 tacattggttttgatcccttt-tctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 344  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11918559 tacgtcggttttgatccctttctcaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 11918462  T
Q  345 ccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  ||     
T  11918461 ccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaagt 11918362  T
Q  444 cgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaa 542  Q
    || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  11918361 cgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaa 11918262  T
Q  543 tcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcacacatat 612  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  11918261 tcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcacagatat 11918192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 11933226 - 11932767
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa-tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  ||||    
T  11933226 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaac 11933130  T
Q  246 tacattggttttgatcccttt-tctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 344  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11933129 tacgtcggttttgatccctttctcaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 11933032  T
Q  345 ccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  ||     
T  11933031 ccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaagt 11932932  T
Q  444 cgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaa 542  Q
    || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  11932931 cgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaa 11932832  T
Q  543 tcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  11932831 tcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 11932767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 147 - 609
Target Start/End: Original strand, 22965768 - 22966228
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa--tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaa 244  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  |||    
T  22965768 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaa 22965864  T
Q  245 ctacattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccc 343  Q
    |||| | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22965865 ctacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccc 22965962  T
Q  344 tccattctttcacttagatttttaggtaataatttt--caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccata 441  Q
    |||||||| ||| |||||  || ||| |||||||||  ||| ||| ||| | | || ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22965963 tccattctctcatttagacatt-aggcaataattttttcaagtaaacaagtaactt-agcacaagataatctaagtaagaggttcctatggaataccata 22966060  T
Q  442 gacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaa 541  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  22966061 gacgcttaggatgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaa 22966160  T
Q  542 atcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcacaca 609  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  22966161 atcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatcgcgagcacaca 22966228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 147 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 17563147 - 17562686
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa--tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaa 244  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  |||    
T  17563147 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaa 17563051  T
Q  245 ctacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaa-taaccaaaaacatacttcttctccc 343  Q
    |||| | |||||||||||||||||   ||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17563050 ctacgtcggttttgatcccttttccaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaaataaccaaaaacatacttcttctccc 17562953  T
Q  344 tccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagc-aaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccata 441  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||  |    
T  17562952 tccattctttcacttagatttt-aggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttagcacaagataatttaggtaagcggttccttcggaataccgaa 17562854  T
Q  442 gacgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaa 540  Q
    | || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17562853 gtcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaa 17562754  T
Q  541 aatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcacac 608  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  17562753 aattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcacac 17562686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Original strand, 22951794 - 22952252
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa--tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaa 244  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  |||    
T  22951794 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaa 22951890  T
Q  245 ctacattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccc 343  Q
    |||| | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22951891 ctacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccc 22951988  T
Q  344 tccattctttcacttagatttttaggtaataatttt--caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccata 441  Q
    |||||||| ||| |||||  || ||| |||||||||  ||| ||| ||| | | || ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22951989 tccattctctcatttagacatt-aggcaataattttttcaagtaaacaagtaactt-agcacaagataatctaagtaagaggttcctatggaataccata 22952086  T
Q  442 gacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaa 541  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  22952087 gacgcttaggatgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaa 22952186  T
Q  542 atcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  22952187 atcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatcgcgagcaca 22952252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 147 - 599
Target Start/End: Original strand, 31278579 - 31279028
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  |||||    
T  31278579 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaact 31278675  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 346  Q
     | | ||||||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||| |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31278676 gcgtcggttttgatccctttcccaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcccttc 31278773  T
Q  347 attctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 445  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  || ||    
T  31278774 attctttcacttagatttttaggaaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaagtcg 31278873  T
Q  446 cttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatc 544  Q
     |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  31278874 tttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatt 31278973  T
Q  545 gagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatca 599  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31278974 gagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatca 31279028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Original strand, 25264700 - 25265155
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||| ||  |||||    
T  25264700 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-atcttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccactaaa--gaaatttttgagtggaact 25264796  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    || | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25264797 acgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataactaaaaacatacttcttctccctc 25264894  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 445  Q
    ||||||||||||||||  || ||  |  | ||||||||| | ||| | | || ||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  25264895 cattctttcacttagacattaagcaatgatttttcaaatgaacaagt-attttagcacaagataatctagataagaggttcctacggaataccgtagacg 25264993  T
Q  446 cttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcg 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |    
T  25264994 cttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaattg 25265093  T
Q  546 agagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  25265094 agagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatcgcgagcaca 25265155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Original strand, 25274194 - 25274649
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||| ||  |||||    
T  25274194 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-atcttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccactaaa--gaaatttttgagtggaact 25274290  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    || | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25274291 acgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataactaaaaacatacttcttctccctc 25274388  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 445  Q
    ||||||||||||||||  || ||  |  | ||||||||| | ||| | | || ||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  25274389 cattctttcacttagacattaagcaatgatttttcaaatgaacaagt-attttagcacaagataatctagataagaggttcctacggaataccgtagacg 25274487  T
Q  446 cttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcg 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |    
T  25274488 cttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaattg 25274587  T
Q  546 agagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  25274588 agagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatcgcgagcaca 25274649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 147 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 15675525 - 15675078
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| |||| ||  |||||    
T  15675525 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacctatttcgaaaaatcttaaaatcaacctaatccactaaa--gaaatttttgagtggaact 15675428  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 346  Q
    || | ||||||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||| || |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15675427 acgtcggttttgatccctttcccaaaagggtacgtaggcagaggacttgtt--cttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 15675330  T
Q  347 attctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 445  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||| ||||| | ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  15675329 attctttcacttagacatt-aggcaataatttttcaaatgaacaagt-agtttagcacaagataatttaggtaagaggttcctacggaataccgtagatg 15675232  T
Q  446 cttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcg 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  15675231 cttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtttcgaaaagggtttttactcattttttcccttcccaagaataagaatcg 15675132  T
Q  546 agagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatca 599  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15675131 agagttcaaagatcgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatca 15675078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Original strand, 13274799 - 13275250
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||  |||||    
T  13274799 ttttatctcatgccttgaggtctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaga-atattttttagtggaact 13274896  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    || | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13274897 acgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatactccttctccctc 13274994  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagc-aaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  ||     
T  13274995 cattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaagt 13275094  T
Q  444 cgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaa 542  Q
    || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13275095 cgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaa 13275194  T
Q  543 tcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  13275195 ttgagagttcaaagattgacgattcaaatcaatcaatggtttgatatccgaaaatc 13275250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 147 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 15684067 - 15683620
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||  |||| |||| ||  |||||    
T  15684067 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacctatttcgaaaaatcttaaaatcaacctaatccactaaa--gaaatttttgagtggaact 15683970  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 346  Q
    || | ||||||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||| || |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15683969 acgtcggttttgatccctttcccaaaagggtacgtaggcagaggacttgtt--cttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 15683872  T
Q  347 attctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 445  Q
    |||||||||||||||  || ||| ||||||||| ||||| | ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||| |    
T  15683871 attctttcacttagacatt-aggcaataatttttcaaatgaacaagt-agtttagcacaagataatttaggtaagaggttcctacggaatatcgtagatg 15683774  T
Q  446 cttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcg 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  15683773 cttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtttcgaaaagggtttttactcattttttcccttcccaagaataagaatcg 15683674  T
Q  546 agagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatca 599  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15683673 agagttcaaagatcgacgattcaaatcaattaaaggtttgatatccgaaaatca 15683620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Original strand, 1479978 - 1480429
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa--tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaa 244  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  |||    
T  1479978 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaa 1480074  T
Q  245 ctacattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccc 343  Q
    |||| | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1480075 ctacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccc 1480172  T
Q  344 tccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagc-aaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccata 441  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||  |    
T  1480173 tccattctttcacttagatttt-aggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttagcacaagataatttaggtaagcggttccttcggagtaccgaa 1480271  T
Q  442 gacgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaa 540  Q
    | || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1480272 gtcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaa 1480371  T
Q  541 aatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  1480372 aattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaatcaatggtttgatatccgaaaatc 1480429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 298 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 13847977 - 13847669
Alignment:
Q  298 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaa-catacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13847977 tccttccaaatcaaataaaaataatcaaaaaacatacttcttctccctccattctttcatttagattcttaagtaataattttcaaataagcaaatcaat 13847878  T
Q  397 tcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagt 496  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  13847877 ttagcacaagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttagggtgctagcacctttcctttgcataaccaacccccgaatccaaagt 13847778  T
Q  497 ctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattc-aaatcaattaatggtttgatagccgaaa 595  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13847777 ct---taagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaaatcaattaatggtttgatatccgaaa 13847681  T
Q  596 atcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||    
T  13847680 atcacgagcaca 13847669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 4503815 - 4503364
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  |||||    
T  4503815 ttttatctcatgccgtgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaact 4503718  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaa--gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 344  Q
    || | ||||||||||||||| |   ||  ||||| ||||| | |||| || |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  4503717 acgtcggttttgatccctttcccaaaaaagggtacgtaggtagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaaaaaccaaaaacatatttcttctccct 4503620  T
Q  345 ccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagc-aaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatag 442  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| |||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  ||    
T  4503619 ccattctttcacttagatttt-agataataatttttcaagtaagccaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaag 4503521  T
Q  443 acgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaa 541  Q
     || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4503520 tcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaa 4503421  T
Q  542 atcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  4503420 attgagagttcaaagattgacgattcaaatcaatcaatggtttgatatccgaaaatc 4503364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 10 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 9184178 - 9183894
Alignment:
Q  10 aaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9184178 aaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttg 9184079  T
Q  110 atttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaat 208  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||| || ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||    
T  9184078 attttcttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttatattctctcatgccttgaagcctcttatcccttcttaaaa-ccattttctaaaat-ttaaaat 9183981  T
Q  209 caacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggattttt 296  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9183980 caacc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgatctacattggttttgatcccttttcttaaagggtatgtaggcataggattttt 9183894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 116 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 21185902 - 21185412
Alignment:
Q  116 ttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttat-ctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacc 213  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||| |    
T  21185902 ttgtaattaaaatttgatcaacctcatcttatttttttctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaacc-attttcaaaaaatttaaaatcaatc 21185804  T
Q  214 taacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaat 313  Q
     ||| |||||||  |||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||   |||||  || |||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  21185803 caactcaccaaa--gaaattctttaggggaactgcattggttttgatcccaaatctttt-ggatatgtaggcaaaggagtta-atccttccaaatcaaat 21185708  T
Q  314 aaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaatt 413  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  21185707 aaaaacaacaaaaaacatacttcttctcccttcattctttcacttagacctttaggcaataattttcaaataagcaaattaatttaacacaagataaatt 21185608  T
Q  414 aggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggttttta 513  Q
    ||| |||||||||||| | | |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||   ||||||||||||    
T  21185607 aggcaagaggttcctacgaagtaccgtagacgcttaggatgccagcaccttcccttcgcgtaatcaacccctgaatccaaagtct---taagggttttta 21185511  T
Q  514 ctca-ttttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattc-aaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcacacat 610  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||| | | ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||    
T  21185510 ctcacttttttcccttcccacgaataaaagttgagagttcaaatattgaaggttcaaaatcaattaatggtttgatacccgaatttcatgagcacacat 21185412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 150 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 7064077 - 7063629
Alignment:
Q  150 tatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa-tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactac 248  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |   |||||||    
T  7064077 tatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgattggaactac 7063981  T
Q  249 attggttttgatcccttttctttaa--gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 346  Q
     | ||||||||||||||| |   ||  ||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7063980 gtcggttttgatccctttcccaaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttattctccctcc 7063883  T
Q  347 attctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 445  Q
    ||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  | | ||||  || ||    
T  7063882 attcttttatatagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcgaagtaccgaagtcg 7063783  T
Q  446 cttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatc 544  Q
     |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  7063782 tttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttccctgcccacgaataaaaatt 7063683  T
Q  545 gagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  7063682 gagagttcaaagattgacgattcaaatcaatcaatggtttgatatccgaaaatc 7063629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 150 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 7096924 - 7096476
Alignment:
Q  150 tatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa-tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactac 248  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |   |||||||    
T  7096924 tatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgattggaactac 7096828  T
Q  249 attggttttgatcccttttctttaa--gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 346  Q
     | ||||||||||||||| |   ||  ||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  7096827 gtcggttttgatccctttcccaaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaattaaccaaaaacatacttattctccgtcc 7096730  T
Q  347 attctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 445  Q
    ||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  || ||    
T  7096729 attcttttatatagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaagtcg 7096630  T
Q  446 cttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatc 544  Q
     |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  7096629 tttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttccctgcccacgaataaaaatt 7096530  T
Q  545 gagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  7096529 gagagttcaaagattgacgattcaaatcaatcaatggtttgatatccgaaaatc 7096476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 24216430 - 24215984
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  |||||    
T  24216430 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaact 24216334  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    || | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| |  |  ||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||    
T  24216333 acgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaata----------tacttcttctccctc 24216246  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagac 444  Q
    ||||||||||||||||  || ||| ||||||||| ||||||| ||| | | || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24216245 cattctttcacttagacatt-aggcaataatttttcaaataaacaagt-agtttagcacaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagtc 24216148  T
Q  445 gcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaat 543  Q
    | |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24216147 gtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaat 24216048  T
Q  544 cgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  24216047 cgagagttcaaagattgacgtttcaaatcaatcaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 24215984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 148 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 17616932 - 17616482
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaacta 247  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||  |||| | || ||  ||||||    
T  17616932 tttatctcataccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcaaaaaaaataaaatcaatctaacccaccaaa--gaaattcttgagtggaacta 17616835  T
Q  248 cattggttttgatcccttttctttaa---gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 344  Q
    | | ||||||||||||||| |   ||   ||||| ||||| | |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17616834 cgtcggttttgatccctttcccaaaaaaagggtacgtaggtagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaa-catacttattctccct 17616738  T
Q  345 ccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  ||     
T  17616737 ccattcttttacatagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaagt 17616638  T
Q  444 cgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaa 542  Q
    || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17616637 cgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaa 17616538  T
Q  543 tcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  17616537 ttgagagttcaaagattgaagattcaaatcaaccaatggtttgatatccgaaaatc 17616482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 9 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 27958376 - 27958025
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagactt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  27958376 caaaaatattttcttaataaaccttggttggtaacccaagtgtttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcacattagactt 27958278  T
Q  109 gatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttat--tttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaa 205  Q
     ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||| | |||||||||| |||||||| | || |||||||||||||| ||||    
T  27958277 tattttcttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattcttttttccatgctttgaggcctcttatctcttcttagaa-ccattttcaaaaat-ttaa 27958180  T
Q  206 aatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcca 305  Q
    ||||||   ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  27958179 aatcaattcaacccactaaaaagaaattttttaggtgaacgacattgattttgatccctttcatttaaaggtatgtaggcaaaggatttttatcattcca 27958080  T
Q  306 aatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagattttt 366  Q
    ||||||||||    ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27958079 aatcaaataa----aaccaaaaacatgtttcttctcc--ccattctttcacttagattttt 27958025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 9 - 580
Target Start/End: Original strand, 27884540 - 27885101
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagact 107  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||| |||| ||||||    
T  27884540 caaaaatattttcctaataagccttggattttaacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgtttaatcaatttaatatccatattagact 27884639  T
Q  108 tgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaa 206  Q
    ||  || |||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||| | |||||    
T  27884640 tgtattttttgtaattaaaatta-accaacttcatcttattttctctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaacc-atttccaaaacttttaaa 27884737  T
Q  207 atcaacctaacccaccaaaaagaaacttttt-ag-gtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 304  Q
    ||||| | ||||||||||| |    |||||| || | |||||||| |||||||||| ||  || |    || |||||||||| ||||| |  ||||||||    
T  27884738 atcaatccaacccaccaaata----ctttttgagagagaactacaatggttttgattccgcttgt----ggatatgtaggcaaaggatcta-atccttcc 27884828  T
Q  305 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaa-taagcaaatcaattcagcac 403  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  27884829 aaatcaaataaaaacaac-aaaaacatacttcttctccatccattctttcacttagacttttaagtaagcattttcaaaataagcaaat-aatt-agcac 27884925  T
Q  404 aagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgat 502  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| |||||||  ||| || || ||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||| ||||||| |||| ||    
T  27884926 aagataaagtaggcaagaggttcctacggaatacagtagtcgattcgggtgcttaacaccttccctaatcgaaaccaacccccggatccaaaatctc-at 27885024  T
Q  503 aagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatg 580  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27885025 aatggttttt-ctcattttttcccttcccacaaataaaagtagagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatg 27885101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 320 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 27957459 - 27957185
Alignment:
Q  320 aaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagattttt-aggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggta 418  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  27957459 aaccaaaaacatacttcttctccc-ccattctttcacttatattttttaggcaataattttcaaataagcaaatcaatttagcacaagataatttaggta 27957361  T
Q  419 agaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcat 518  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |   |||||||||||||||||    
T  27957360 agaggttcctacggaataccgtagacgcttagaatgctagcacctttccttcgcgtaaccaacacccgaatctaaagttt---taagggtttttactcat 27957264  T
Q  519 tttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatca 599  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  27957263 tttttcccttcccacgaataaaaat--tgagttcaaaaattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgtaaatca 27957185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 399 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 10713634 - 10713426
Alignment:
Q  399 agcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtct 498  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  10713634 agcacaagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtct 10713535  T
Q  499 cgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  10713534 cgataagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccaaaaatc 10713435  T
Q  599 acgagcaca 607  Q
     ||||||||    
T  10713434 gcgagcaca 10713426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 399 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 29730621 - 29730411
Alignment:
Q  399 agcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtct 498  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29730621 agcacaaaataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttaggatgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtct 29730522  T
Q  499 cgataagggt--ttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaa 596  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  29730521 cgataagggtttttttactcattttttcccttcccaagaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaatcaatggtttgatatccgaaaa 29730422  T
Q  597 tcacgagcaca 607  Q
    || ||||||||    
T  29730421 tcgcgagcaca 29730411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 40 - 607
Target Start/End: Original strand, 27880175 - 27880733
Alignment:
Q  40 taacccaagtgttttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacc 138  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||| |||| ||||||||  ||  ||||||||||||||  ||||||     
T  27880175 taacccaagtgttttttccttttattttcttaatcaaatgtttaatcaatttaatatccatattagacttgggtttcttgtaattaaaatta-accaact 27880273  T
Q  139 tcaccttat----tttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaact 233  Q
    ||| |||||    ||| |||||||||  |||||||||| |||||||| |||||  |||||||||| | |||||||||| | ||||||||||| |    ||    
T  27880274 tcatcttatatattttctctcatgccctgaggcctcttatctcttcttaaaact-attttcaaaacttttaaaatcaatccaacccaccaaata----ct 27880368  T
Q  234 tttt-ag-gtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacat 331  Q
    |||| || | |||||||| |||||||||| ||  || |    || ||||   ||| ||||| |  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  27880369 ttttgagagagaactacaatggttttgattccacttgt----ggatatg---gcaaaggatcta-atccttccaaatcaaataaaaacaac-aaaaacat 27880459  T
Q  332 acttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaa-taagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctat 430  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||     
T  27880460 acttcttcttcctccattctttcacttagacttttaagtaagcattttcaaaataagcaaat-aatt-agcacaagataaagtaggcaagaggttcctac 27880557  T
Q  431 ggaataccatagacgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttg 529  Q
    |||||||| ||| || || ||||||| | ||||||||||   || ||||||| | || |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||     
T  27880558 ggaataccgtagtcgattcgggtgcttaacaccttccctaatcgaaaccaaccctcggatccaaagtctc-ataagggttttt-ctcactttttcccttc 27880655  T
Q  530 ccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  27880656 ccacgaataaaagtagagagttcaaagattgaagattcaaatcaattaatggtttgatatccaaaaatcacgagcaca 27880733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 9567867 - 9567282
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtg--tttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagac 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  || ||| |||||||  |||||| || |||||||||||||||||  |||||  | ||||||| |||| ||||     
T  9567867 caaaaatattttcttaagaaaccttgaattttaatccaagtgcctttttctttatattttcttaatcaaatctttaatcaatttaatatccatattagat 9567768  T
Q  107 ttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaaccc-attttcaaaaatctta 204  Q
    |||  ||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||   |||||||||||| |||    
T  9567767 ttgggtttcttataattaaaatttgaccaacctcatcttattttctctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaactttattttcaaaaatgtta 9567668  T
Q  205 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttag-gtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttc 303  Q
    ||||||| ||||||||||||| |  || |||| || | ||||||||  | ||||||| ||  || |    || |||||||||| | |||    |||||||    
T  9567667 aaatcaatctaacccaccaaata--aatttttaagagagaactacaacgattttgattccacttgt----ggatatgtaggcaaacgatcca-atccttc 9567575  T
Q  304 caaatcaaataaaaataaccaaaaa-catacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagca 402  Q
    |||||||| |||||  ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||  | || ||||||||||||||||| |||| | ||    
T  9567574 caaatcaa-taaaagaaacaaaaaaacatacttcttcttcctccattctttcacttagactcttagacatta-ttttcaaataagcaaattaatttaaca 9567477  T
Q  403 caagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgc-tagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcga 501  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||| || |  |||||| || ||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||     
T  9567476 caagataaagtaggcaagaggttcctatgggataccgtagtcgatgtgggtgcttaacaccttccctaatcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcg- 9567378  T
Q  502 taagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatc-aattaatggtttgatagccgaaaa 596  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||| | |  ||||| | |||||||| ||||||| |||||||    
T  9567377 taagggtttttactcactttttcccttcccacgaataaaagttgagagtccaaagattgaaggctcaaaactaattaatgttttgatacccgaaaa 9567282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 440 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 18882095 - 18881928
Alignment:
Q  440 tagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataa 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18882095 tagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataa 18881996  T
Q  540 aaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  18881995 aaattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttggtatctgaaaatcatgagcaca 18881928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 379 - 607
Target Start/End: Original strand, 13555526 - 13555750
Alignment:
Q  379 tcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaacc 478  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13555526 tcaaataagcaaagcaatttagcacaagataaattaagtaaaaggttcctgcggagtaccgtagacgcttagggtgctaacaccttcccttcgcgtaacc 13555625  T
Q  479 aactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattc-aaatcaatta 577  Q
    ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  13555626 aacccccgaatccaaagtct---taagggtttttactcattttttccc-tcccactaat-aaaattgagagttcaaagattgacgattcaaaatcaatta 13555720  T
Q  578 atggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13555721 atggtttgatatccgaaaatcacgagcaca 13555750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 460 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 14520859 - 14520707
Alignment:
Q  460 accttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagatt 559  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14520859 accttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgacaagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaattaagagttcaaagatt 14520760  T
Q  560 aacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcacacatat 612  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  14520759 gacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgagcacatatat 14520707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 8223285 - 8223119
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgt---ttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  8223285 caaaaatattttcttaataaaacttggtttgtaacccaagtttgctttttccttttattttcttaatcaaatgcataattgaattaatattcatactaga 8223186  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt 172  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8223185 cttgattttcttgaaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctctt 8223119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 362 - 598
Target Start/End: Original strand, 12468968 - 12469207
Alignment:
Q  362 tttttaggtaataatttt-caaataagc-aaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgct-ag 458  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  || || |||||||||| |     
T  12468968 tttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaagtcgtttagggtgcttaa 12469067  T
Q  459 caccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagat 558  Q
    ||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12469068 caccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttacttatttttttccttcccacgaataaaaattgagagttcaaagat 12469167  T
Q  559 taacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  12469168 tgacgattcaaatcaatcaatggtttgatatccgaaaatc 12469207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 18886505 - 18886343
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtg---tttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18886505 caaaaatattttcttaataaaacttggtttgtaatccaagttgcttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatactaga 18886406  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcct 169  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  18886405 ctt-attttcttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttctctcatgcctcgaggcct 18886343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 14537009 - 14536879
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagactt 108  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14537009 caaaaatatttt-ttaataaaccttggttcgtaacccaagtgtttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagactt 14536912  T
Q  109 gatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcac 142  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14536911 gatttc-ttgtaattaaaatttgaccaacctcac 14536879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 187 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 27958011 - 27957882
Alignment:
Q  187 ccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggca 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27958011 ccattttcaaaaat-ttaaaatcaattcaacccacaaaaaagaaattttttaggtgaactacattggttttgatccctttcatttaagggtatgtaggca 27957913  T
Q  287 taggatttttatccttccaaatcaaataaaa 317  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27957912 aaggatttttatcattccaaatcaaataaaa 27957882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 502 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 18900464 - 18900357
Alignment:
Q  502 taagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacg 601  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  18900464 taagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaatgattgacgattcaaatcaattaatggtttggtatccaaaaatcacg 18900365  T
Q  602 agcacaca 609  Q
    ||||||||    
T  18900364 agcacaca 18900357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 195 - 420
Target Start/End: Original strand, 30102060 - 30102286
Alignment:
Q  195 aaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaa---gggtatgtaggcatagga 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||  ||||||| | ||||||||||| ||| |   ||   ||||| ||||||| ||||    
T  30102060 aaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaa--tttttagtggaactacgtcggttttgatccttttcccaaaaaaagggtacgtaggcagagga 30102155  T
Q  292 tttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttaga-tttttaggtaataa--ttttcaaataag- 387  Q
     || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||     
T  30102156 cttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagattttttaggtaataattttttcaagtaagc 30102253  T
Q  388 caaatcaattcagcacaagataaattaggtaag 420  Q
    ||||  |||| ||||||||||||  ||||||||    
T  30102254 caaacgaatttagcacaagataatctaggtaag 30102286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 518 - 607
Target Start/End: Original strand, 22094837 - 22094926
Alignment:
Q  518 ttttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22094837 ttttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcatatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgagcaca 22094926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 548 - 608
Target Start/End: Original strand, 18041374 - 18041434
Alignment:
Q  548 agttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcacac 608  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18041374 agttcaaagattaacgattcaaatcaattaatgatttgatatccgaaaatcacgagcacac 18041434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 199
Target Start/End: Original strand, 30101998 - 30102049
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  30101998 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaa-ccattttcaaaaa 30102049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 565 - 607
Target Start/End: Original strand, 15697231 - 15697273
Alignment:
Q  565 ttcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15697231 ttcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 15697273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 488; Significance: 0; HSPs: 33)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 488; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 27342107 - 27341507
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagactt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27342107 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagactt 27342008  T
Q  109 gatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||     
T  27342007 gatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctctttcccttcttaaaaaccattttctaaaat-ttaaaag 27341909  T
Q  209 caacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaat 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27341908 caacc-aacccaccaaaaagaaattttttaggtgaactacattggttttgatcccttttcttaaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaat 27341810  T
Q  309 caaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaagat 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||    
T  27341809 caaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagacttttaggtaataattttcag-taagcaaatgaatttagcacaagat 27341711  T
Q  409 aaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggt 508  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27341710 aatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggt 27341611  T
Q  509 ttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcacac 608  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||     
T  27341610 ttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagatggacgattcaaatcaattaatggtttgatatccaaaaatcacgagcacag 27341511  T
Q  609 atat 612  Q
    ||||    
T  27341510 atat 27341507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 607
Target Start/End: Original strand, 772960 - 773553
Alignment:
Q  11 aaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  772960 aaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagggtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttga 773059  T
Q  111 tttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatc 209  Q
    |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  773060 ttttcttgtaattaaaatttgactaacctcaccttattttatctcgtgccttgaggcctcttatcccttcttaaaacc-attttctaaaatct-aaaatc 773157  T
Q  210 aacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatc 309  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  773158 aacc-aacccaccaaaaataaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttcttaaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatc 773256  T
Q  310 aaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaagata 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  773257 aaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaa-tgaatttagcacaagata 773355  T
Q  410 aattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtt 509  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  773356 atttaggtaagaggttcctatggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtt 773455  T
Q  510 tttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  773456 tttactcattttttcccttcccacgaataaagatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgagcaca 773553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 465; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 608
Target Start/End: Original strand, 10640153 - 10640751
Alignment:
Q  10 aaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttc---cttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagac 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10640153 aaaaatattttcttaataaaccttggcttgtaacccaagtgtttttttttcttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagac 10640252  T
Q  107 ttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaa 205  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| |||||| ||||||| ||    
T  10640253 ttgattttcttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaacc-attttctaaaatct-aa 10640350  T
Q  206 aatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcca 305  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10640351 agtcaacc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcca 10640449  T
Q  306 aatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaa 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||  |||||||    
T  10640450 aatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagacttttaagtaataattttcaaataagcaa-tgaatgtagcacaa 10640548  T
Q  406 gataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataag 505  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10640549 gataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgataag 10640648  T
Q  506 ggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagca 605  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  10640649 ggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggttggatatccgaaaatcacgagca 10640748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 463; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 8093336 - 8092735
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagt-gtttttccttttatttt-cttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataata 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8093336 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggcttgtaacccaagttgcttttccttttatttttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataata 8093237  T
Q  104 gacttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttc-aaaaatc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| |||||| |||||||    
T  8093236 gacttgatttctttgtaattaaaattcgac-aacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaacc-attttctaaaaatc 8093139  T
Q  202 ttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcct 301  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8093138 t-aaaatcaacc-aacccaccaaaaagaaacttttcaggtgaactacattggttttgatcccttttcttaaagggtatgtaggcataggatttttatcct 8093041  T
Q  302 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagc 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||    
T  8093040 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaa-tgaatttagc 8092942  T
Q  402 acaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcga 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8092941 acaagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcga 8092842  T
Q  502 taagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacg 601  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8092841 tgagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacg 8092742  T
Q  602 agcacac 608  Q
    |||||||    
T  8092741 agcacac 8092735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 459; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 85 - 608
Target Start/End: Original strand, 52297571 - 52298095
Alignment:
Q  85 tgaattaatattcataatagacttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaa 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52297571 tgaattaatattcataatagacttgatttatt-gtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctctttctcttctaaaa 52297669  T
Q  185 acccattttcaaaa--atcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgta 282  Q
     |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  52297670 ccccattttcaaaaaaatcttaaaatcaacttaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttcttaaaaggtatgta 52297769  T
Q  283 ggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaa 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52297770 ggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaa 52297869  T
Q  383 ataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaact 482  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  52297870 ataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacc 52297969  T
Q  483 cccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggt 582  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52297970 cccgaatccaaagtcacgataagggtttttactcactttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggt 52298069  T
Q  583 ttgatagccgaaaatcacgagcacac 608  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  52298070 ttgatatccgaaaatcacgagcacac 52298095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 8102141 - 8101541
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagt-gtttttccttttatttt-cttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataata 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8102141 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggcttgtaacccaagttgcttttccttttatttttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataata 8102042  T
Q  104 gacttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttc-aaaaatc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||||| |||||| |||||||    
T  8102041 gacttgatttctttgtaattaaaattcgac-aacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatcccttcttgaaacc-attttctaaaaatc 8101944  T
Q  202 ttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcct 301  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8101943 t-aaaatcaacc-aacccaccaaaaagaaacttttcaggtgaactacattggttttgatcccttttcttaaagggtatgtaggcataggatttttatcct 8101846  T
Q  302 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagc 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||    
T  8101845 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcccccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaa-tgaatttagc 8101747  T
Q  402 acaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcga 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8101746 acaagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcga 8101647  T
Q  502 taagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacg 601  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8101646 tgagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacg 8101547  T
Q  602 agcaca 607  Q
    ||||||    
T  8101546 agcaca 8101541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 607
Target Start/End: Original strand, 12998337 - 12998935
Alignment:
Q  10 aaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtg----tttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12998337 aaaaatatttttttaataaaccttggtttgtaacccaagttgctttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatactaga 12998436  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatctta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||| |||||| |||||| ||||| |||    
T  12998437 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttatctcatgccttgaggcttcttatcccttcttaaaacc-attttctaaaat-tta 12998534  T
Q  205 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 304  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  12998535 aaatcaacc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcaaaagaattttatccttcc 12998633  T
Q  305 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcaca 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||    
T  12998634 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttatccctccattctttcacttagacttttaggtaataatttttaaataagcaa-tgaatttagcaca 12998732  T
Q  405 agataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataa 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |    
T  12998733 agataaattaggtaagaggttcctacggaatacagtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgattccaaagtcttgatga 12998832  T
Q  505 gggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagc 604  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12998833 gggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagtgcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgagc 12998932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 12425815 - 12425216
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtg--tttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12425815 caaaaatattttcttaataaaccgtggttcgtaacccaagttgctttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattagac 12425716  T
Q  107 ttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttatttta-tctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaat-ctta 204  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| || ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  12425715 ttgattttcttgtaattaaaatttgaccaacctcatcttatttttctctcatgacttgaggcctctttcttttcttaaaacc-attttcaaaaattctta 12425617  T
Q  205 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 304  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12425616 aaatcaacctaacccatcaaa--gaaatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 12425519  T
Q  305 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagattttt-aggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcac 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  12425518 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatactttttctccccccattctttcacttagattttttaggtaataattttcaaataagcaa-tgaatttagcac 12425420  T
Q  404 aagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgata 503  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12425419 aagataatttaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgata 12425320  T
Q  504 agggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgag 603  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12425319 agggtttttactcatttttttccttcccatgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgag 12425220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 1875949 - 1875344
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgt---ttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataat 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1875949 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggcttgtaacccaagtgtcctttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataat 1875850  T
Q  103 agacttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccatttt-caaaaat 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||  |||| ||||| |    
T  1875849 agacttgatttctt-gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaacctttttttcaaaatt 1875751  T
Q  201 cttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1875750 gttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttctcttcaagggtatgtaggcatgggatttgtatcc 1875651  T
Q  301 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaat-aattttcaaataagcaaatcaattca 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||| |    
T  1875650 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatgcttcttcttcccccattctttcacttagatttttaggtagttaattttcaaataagcaa-tgaattta 1875552  T
Q  400 gcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctc 499  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  1875551 gcacaagataatttaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctc 1875452  T
Q  500 gataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatca 599  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  1875451 gatgagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagatcgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcg 1875352  T
Q  600 cgagcaca 607  Q
    ||||||||    
T  1875351 cgagcaca 1875344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 1890064 - 1889459
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgt---ttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataat 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1890064 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggcttgtaacccaagtgtcctttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataat 1889965  T
Q  103 agacttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccatttt-caaaaat 200  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||  |||| ||||| |    
T  1889964 agacttgattttcttgtaattaaaatt-gaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaacctttttttcaaaatt 1889866  T
Q  201 cttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcc 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1889865 gttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttctcttcaagggtatgtaggcatgggatttgtatcc 1889766  T
Q  301 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaat-aattttcaaataagcaaatcaattca 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||| |    
T  1889765 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatgcttcttcttcccccattctttcacttagatttttaggtagttaattttcaaataagcaa-tgaattta 1889667  T
Q  400 gcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctc 499  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  1889666 gcacaagataatttaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctc 1889567  T
Q  500 gataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatca 599  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  1889566 gatgagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagatcgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcg 1889467  T
Q  600 cgagcaca 607  Q
    ||||||||    
T  1889466 cgagcaca 1889459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 21530710 - 21530105
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgt-----ttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataata 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21530710 caaaaatattttcttaataaaccttggcttgtaacccaagtgtcctttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataata 21530611  T
Q  104 gacttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaa-tc 201  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||  |||| |||||| ||||||||||| ||    
T  21530610 gacttgattttcttgtaattaaaatttgaccaacctcatcttattttctctcatgcctcgaggcctcttatcctttcttaaaacc-attttcaaaaaatc 21530512  T
Q  202 ttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcct 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  21530511 ttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttctcttcaagggtatgtaggcatgggatttgtatcct 21530412  T
Q  302 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaat-aattttcaaataagcaaatcaattcag 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||| ||    
T  21530411 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatgcttcttcttcccccattctttcacttagatttttaggtagttaattttcaaataagcaa-tgaatttag 21530313  T
Q  401 cacaagataaattagg-taagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctc 499  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  21530312 cacaagataatttagggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctc 21530213  T
Q  500 gataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatca 599  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21530212 gatgagggtttttactcatttttttccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagatcgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatca 21530113  T
Q  600 cgagcaca 607  Q
    ||||||||    
T  21530112 cgagcaca 21530105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 154 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 55584607 - 55584160
Alignment:
Q  154 tcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattgg 253  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||    
T  55584607 tcatgccttgaggcctttttctcttcttaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaaccaaccaaa--gaaatttttgaggtgaactacattgg 55584510  T
Q  254 ttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattcttt 353  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55584509 ttttgatcccttt-ctttaagggtatgtaggcaagggagtca-atccttcgaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcctctccctccattcttt 55584412  T
Q  354 cacttagatttttaggtaataattttcaaa-taagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttaggg 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55584411 cacttagatttttaggtaataattttccaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttaggg 55584312  T
Q  453 tgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttc 552  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  55584311 tgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccagagtct---taagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgatatttc 55584215  T
Q  553 aaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  55584214 aaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgagcaca 55584160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 4747858 - 4747401
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa-tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||    
T  4747858 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaaatcttaaaaccaacctaacccaccaaa--gaaatttttgaggtgaac 4747762  T
Q  246 tacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4747761 tacattggttttgatcccttt-ctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttctcctccctc 4747663  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataatttt--caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    ||||||||||||||||  || ||| |||||||||  ||||||| ||| | | || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4747662 cattctttcacttagacatt-aggcaataattttttcaaataaacaagtaactt-agcacaagataatttaggcaagaggttcctatggaataccataga 4747565  T
Q  444 cgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaat 543  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  4747564 cgcttaggatgctagtaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttctcttcccaagaataaaaat 4747465  T
Q  544 cgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  4747464 cgagagttcaaagatcgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatcgcgagcaca 4747401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Original strand, 18009988 - 18010442
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  |||||    
T  18009988 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaact 18010085  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 346  Q
    || | ||||||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18010086 acgtcggttttgatccctttcccaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcccttc 18010183  T
Q  347 attctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 445  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18010184 attctttcatttatatttttaggtaataatttttcaagtaatcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 18010283  T
Q  446 cttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcg 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18010284 cttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtct---taagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcg 18010380  T
Q  546 agagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  18010381 agagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 18010442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 244 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 20866021 - 20865659
Alignment:
Q  244 actacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccc 343  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20866021 actacattgattttgatcccttttcttaaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatactttttctccc 20865922  T
Q  344 tccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20865921 tccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaa-tgaatttagcacaagataatttaggtaagaggttcctacggaataccgtaga 20865823  T
Q  444 cgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaat 543  Q
     ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20865822 tgcttagggtgctagcaccttccctttgcataaccaacccccgaatccaaagtttcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaat 20865723  T
Q  544 cgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20865722 cgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgagcaca 20865659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 275 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 4522545 - 4522214
Alignment:
Q  275 ggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaata 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4522545 ggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaata 4522446  T
Q  375 attttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgt 474  Q
    |||||||||||| ||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4522445 attttcaaataaccaa-tgaatgtagcacaagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgt 4522347  T
Q  475 aaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaa 574  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4522346 aaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaa 4522247  T
Q  575 ttaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  4522246 ttaatggcttgatatccgaaaatcacgagcaca 4522214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 297 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 26034271 - 26033957
Alignment:
Q  297 atccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26034271 atccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacattcttcttcttcctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaagtaagcaaatcaat 26034172  T
Q  397 tcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagt 496  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26034171 ttagcacaagataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctaacaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagt 26034072  T
Q  497 ctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaa 596  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26034071 ctcgacaagggtttttactcattttttcctttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaa 26033972  T
Q  597 tcacgagcacacata 611  Q
    |||||||||||||||    
T  26033971 tcacgagcacacata 26033957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 26210839 - 26210390
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa---tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtga 243  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| |||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||  ||    
T  26210839 ttttatctcatgccttgaggcctctttctattattaaaacc-attttcaaaaaaaatcttaaaaccaacctaacccaccaaa--gaaattttttagtgga 26210743  T
Q  244 actacattggttttgatcccttttctttaa--gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctc 341  Q
    ||||| | ||||||||||||||| |   ||  ||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26210742 actacgtcggttttgatccctttcccaaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctc 26210645  T
Q  342 cctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccata 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26210644 cctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataaac-aatgaatttagcacaagataatctaggtaagaggttcctatgggataccata 26210546  T
Q  442 gacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaa 541  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  26210545 gacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcga-aggggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaa 26210447  T
Q  542 atcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  26210446 atcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaatcaatggtttgatatccgaaaatc 26210390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 26219599 - 26219150
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa---tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtga 243  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| |||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||  ||    
T  26219599 ttttatctcatgccttgaggcctctttctattattaaaacc-attttcaaaaaaaatcttaaaaccaacctaacccaccaaa--gaaattttttagtgga 26219503  T
Q  244 actacattggttttgatcccttttctttaa--gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctc 341  Q
    ||||| | ||||||||||||||| |   ||  ||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26219502 actacgtcggttttgatccctttcccaaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctc 26219405  T
Q  342 cctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccata 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26219404 cctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataaac-aatgaatttagcacaagataatctaggtaagaggttcctatgggataccata 26219306  T
Q  442 gacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaa 541  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  26219305 gacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcga-aggggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaa 26219207  T
Q  542 atcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  26219206 atcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaatcaatggtttgatatccgaaaatc 26219150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 19645320 - 19644871
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||  |  |||||    
T  19645320 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgtgtggaact 19645223  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 346  Q
    || | ||||||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19645222 acgtcggttttgatccctttcccaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 19645125  T
Q  347 attctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagc-aaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagac 444  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  || |    
T  19645124 attctttcacttagatttt-aggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaagtc 19645026  T
Q  445 gcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaat 543  Q
    | |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19645025 gtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaat 19644926  T
Q  544 cgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  19644925 tgagagttcaaagattgacgattcaaatcaatcaatggtttgatatccgaaaatc 19644871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 147 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 21399278 - 21398827
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa--tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaa 244  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||    
T  21399278 ttttatctcatgccttgaggcctctttcccttcttaaaacc-attttcaaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattttttagtggaa 21399182  T
Q  245 ctacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 344  Q
    |||| | ||||||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21399181 ctacgtcggttttgatccctttcccaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatatttcttctccct 21399084  T
Q  345 ccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||  ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||| ||     
T  21399083 ccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatctagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccaaagt 21398984  T
Q  444 cgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaa 542  Q
    || |||||||||| | ||||||||||   || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  21398983 cgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaatcaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccatgaataaaaa 21398884  T
Q  543 tcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatca 599  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21398883 ttgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatca 21398827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Original strand, 10786565 - 10787024
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa-tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| |||| ||  ||||    
T  10786565 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacctatttcaaaaaaatcttaaaatcaacctaacccactaaa--gaaatttttgagtggaac 10786662  T
Q  246 tacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    ||| | ||||||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10786663 tacgtcggttttgatccctttccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 10786760  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagc-aaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||  ||     
T  10786761 cattctttcacttagatttt-aggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttagcacaagataatttaggtaagcggttccttcggagtaccgaagt 10786859  T
Q  444 cgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaa 542  Q
    || |||||||||| | |||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  10786860 cgtttagggtgcttaacaccttccctactcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgaaaagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaa 10786959  T
Q  543 tcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  10786960 tcaagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatcgcgagcaca 10787024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Original strand, 34842605 - 34843054
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||  |||||    
T  34842605 ttttatctcatgccttgaggtctctttttcttcttaaaacc-attttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaatttttttagtggaact 34842701  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 346  Q
    || | ||||||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  34842702 acgtcggttttgatccctttcccaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatactccttcttcctcc 34842799  T
Q  347 attctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagc-aaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagac 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| ||||||||||||  || ||||| |||||||  ||| ||||  || |    
T  34842800 attctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttagcacaagataatctatgtaagcggttccttcggagtaccgaagtc 34842899  T
Q  445 gcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaat 543  Q
    | |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34842900 gtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaat 34842999  T
Q  544 cgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  34843000 ttagagttcaaagattgacgattcaaatcaatcaatggtttaatatccgaaaatc 34843054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Original strand, 19759730 - 19760183
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa---tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtga 243  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||| ||  ||    
T  19759730 ttttatctcaagccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaaaaatcttaaaatcaacttaacccaccaaa--gaaatttttgagtgga 19759826  T
Q  244 actacattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 342  Q
    ||||| | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19759827 actacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 19759924  T
Q  343 ctccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatc-aattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccat 440  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||  |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||      
T  19759925 ctccattctttcacttagatttt-aggtaataatttttcaagtaagccaattgaatttagcacaagataatttaggtaagcggttccttcggagtaccga 19760023  T
Q  441 agacgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataa 539  Q
    || || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19760024 agtcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataa 19760123  T
Q  540 aaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaatt-aatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  19760124 aaattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaaatggtttgatatccgaaaatc 19760183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Original strand, 19774486 - 19774939
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa---tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtga 243  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||| ||  ||    
T  19774486 ttttatctcaagccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaaaaatcttaaaatcaacttaacccaccaaa--gaaatttttgagtgga 19774582  T
Q  244 actacattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 342  Q
    ||||| | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19774583 actacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcc 19774680  T
Q  343 ctccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatc-aattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccat 440  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||  |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||      
T  19774681 ctccattctttcacttagatttt-aggtaataatttttcaagtaagccaattgaatttagcacaagataatttaggtaagcggttccttcggagtaccga 19774779  T
Q  441 agacgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataa 539  Q
    || || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19774780 agtcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataa 19774879  T
Q  540 aaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaatt-aatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  19774880 aaattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaaatggtttgatatccgaaaatc 19774939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 301 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 25652753 - 25652447
Alignment:
Q  301 ttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattca 399  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||| |    
T  25652753 ttccaaatcaaataaaaataatcaaaaacatatttcttttctctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtacccaaatgaattta 25652654  T
Q  400 gcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctc 499  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  25652653 gcacaagataatctaggtaagaggtttctacggaataccgtagacgcttagggtgctagcactttcccttcgcgtaaccagctcccgaatccaaagtctt 25652554  T
Q  500 gataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatca 599  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25652553 ga---gggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgaaagttcaaagattaacgattaaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatca 25652457  T
Q  600 cgagcacaca 609  Q
    ||||||||||    
T  25652456 cgagcacaca 25652447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 25247613 - 25247163
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||  |||||    
T  25247613 ttttatctcatgccttgaggcctctttttcttcttaaaacc-attttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaatttttttagtggaact 25247517  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    || | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25247516 acgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatactccttctccctc 25247419  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataag-caaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  ||     
T  25247418 cattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaagt 25247319  T
Q  444 cgcttagggtgc-tagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataaggg-tttttactcattttttcccttgccacgaataaaa 541  Q
    || ||||||||| || ||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25247318 cgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcaataagggttttttactca-tttttcccttcccacgaataaaa 25247220  T
Q  542 atcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  25247219 attgagagttcaaagattgacgattcaaatcaatcaatggtttaatatccgaaaatc 25247163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 14718963 - 14718505
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttc----aaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtg 242  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||     ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||  |||||||  |    
T  14718963 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacctttttttcaaaaaaaatcttaaaaccaacctaacccaccaaaga-aatttttttagtgg 14718865  T
Q  243 aactacattggttttgatcccttttctttaa----gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttctt 338  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |   ||    ||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14718864 aactacgtcggttttgatccctttcccaaaaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttctt 14718767  T
Q  339 ctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaatac 437  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| |||    
T  14718766 ctccctccattcttttacatagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtac 14718667  T
Q  438 catagacgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaa 536  Q
    |  || || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  14718666 cgaagtcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagtgtttttactcattttttccctgcccacgaa 14718567  T
Q  537 taaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  14718566 taaaaattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaatcaatggtttgatatccgaaaatc 14718505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 307 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 21811167 - 21810865
Alignment:
Q  307 atcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagc-aaatcaattcagcaca 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||| |||| ||||||    
T  21811167 atcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttt-aggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttagcaca 21811069  T
Q  405 agataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgata 503  Q
    |||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||  || || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  21811068 agataatttaggtaagcggttccttcggagtaccgaagtcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgaaa 21810969  T
Q  504 agggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgag 603  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  21810968 agggtttttactcattttttcccttcccatgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatcgcgag 21810869  T
Q  604 caca 607  Q
    ||||    
T  21810868 caca 21810865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 326 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 14737064 - 14736790
Alignment:
Q  326 aaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggt 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||    
T  14737064 aaacatacttcttctccctccattcttttacatagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggt 14736965  T
Q  425 tcctatggaataccatagacgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcatttttt 523  Q
    ||||  ||| ||||  || || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14736964 tccttcggagtaccgaagtcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcatttttt 14736865  T
Q  524 cccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  14736864 ccctgcccacgaataaaaattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaatcaatggtttgatatccgaaaatc 14736790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20866220 - 20866022
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagactt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||    
T  20866220 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagggtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataa-----tt 20866126  T
Q  109 gatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaa 207  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||| |||| |||||||| |||||| |||||    
T  20866125 gattttcttgtaattaaaatttgactaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttattccttcttaaaa-ccattttctaaaatc-taaaa 20866028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 257
Target Start/End: Original strand, 24924531 - 24924638
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaacta 247  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||    
T  24924531 tttatctcatgccttgaggcctctttttcttcttaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccacc--aaagaaatttttgaggtgaacta 24924628  T
Q  248 cattggtttt 257  Q
    ||||||||||    
T  24924629 cattggtttt 24924638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14737205 - 14737083
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccatttt----caaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtg 242  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||     ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||  |||||||  |    
T  14737205 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacctttttttcaaaaaaaatcttaaaaccaacctaacccaccaaaga-aatttttttagtgg 14737107  T
Q  243 aactacattggttttgatcccttt 266  Q
    |||||| | |||||||||||||||    
T  14737106 aactacgtcggttttgatcccttt 14737083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 430; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 607
Target Start/End: Original strand, 4160 - 4759
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtg--tttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4160 caaaaatattttcttaataaaccgtggttcgtaacccaagttgctttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatattagac 4259  T
Q  107 ttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttatttta-tctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaat-ctta 204  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| || ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  4260 ttgattttcttgtaattaaaatttgaccaacctcatcttatttttctctcatgacttgaggcctctttcttttcttaaaacc-attttcaaaaattctta 4358  T
Q  205 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 304  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4359 aaatcaacctaacccatcaaa--gaaatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 4456  T
Q  305 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagattttt-aggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcac 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  4457 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatactttttctccccccattctttcacttagattttttaggtaataattttcaaataagcaa-tgaatttagcac 4555  T
Q  404 aagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgata 503  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4556 aagataatttaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgata 4655  T
Q  504 agggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgag 603  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4656 agggtttttactcatttttttccttcccatgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgag 4755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 420; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 607
Target Start/End: Original strand, 188332 - 188931
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtg--tttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagac 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  188332 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagttgctttttctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcatactagac 188431  T
Q  107 ttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaa 205  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||| |||||  |||||| ||||| ||||    
T  188432 ttgattttcttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcatcttatcccttcttaaaact-attttctaaaat-ttaa 188529  T
Q  206 aatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcca 305  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  188530 aatcaacg-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccattttctttaagggtatgtaggcaagggatttttatctttcca 188628  T
Q  306 aatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttt-taggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcaca 404  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  188629 aaacaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagattttttaggtaataattttcaagttagcaaatgaatttagcaca 188728  T
Q  405 agataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataa 504  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  188729 agataatttaggtaagaggatcatatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttccctttgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcaacaa 188828  T
Q  505 gggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagc 604  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  188829 gggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaacggtttgatatccgaaaatcacgagc 188928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #2
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 147 - 607
Target Start/End: Original strand, 194662 - 195118
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa--tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaa 244  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  |||    
T  194662 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaaaattttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaa 194758  T
Q  245 ctacattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccc 343  Q
    |||| | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  194759 ctacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccc 194856  T
Q  344 tccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatag 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  194857 tccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatag 194956  T
Q  443 acgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaa 542  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  194957 atgcttagggtgctagcaccttctcttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtct---taagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaa 195053  T
Q  543 tcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  195054 tcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgagcaca 195118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 298 - 607
Target Start/End: Original strand, 159154 - 159462
Alignment:
Q  298 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||| ||||||| ||| | | |    
T  159154 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaagcatacttcttctccctccattctttcacttagacatt-aggcaataatttttcaaataaacaagt-agt 159251  T
Q  397 tcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagt 496  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  159252 ttagcacaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttaggatgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatcc-aagt 159350  T
Q  497 ctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatc-aattaatggtttgatagccgaaa 595  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  159351 ctcgataagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaatcgagagttcaaagatcgacgattcaaatcaaatcaatggtttgatatccgaaa 159450  T
Q  596 atcacgagcaca 607  Q
    ||| ||||||||    
T  159451 atcgcgagcaca 159462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 387; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 52 - 606
Target Start/End: Original strand, 109202 - 109754
Alignment:
Q  52 ttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttatttta 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  109202 ttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagacttgatttctt-gtaattaaaatttgaccaacctcactttattttc 109300  T
Q  152 tctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccatttt-caaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactaca 249  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||  |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||    
T  109301 tctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaacctttttttcaaaattgttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattctttaggtgaactaca 109398  T
Q  250 ttggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggattttt-atccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccat 348  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  109399 ttggttttgatcccttttcttaaagggtatgtaggcatatgattttttatccttcaaaaccaaataaaaataacaaaaaaaatgcttcttctccctccat 109498  T
Q  349 tctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgctt 448  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  109499 tctttcactcagatttttaggtaataattttcaaataagcaa-tgaatttagcacaagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtagacgctt 109597  T
Q  449 agggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgaga 548  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  109598 agggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccacgaatccaaagtctcga-aagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgaga 109696  T
Q  549 gttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcac 606  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  109697 gttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgagcac 109754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Original strand, 122953 - 123197
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  122953 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaaaccaagtgtttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataataga 123051  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacc-cattttcaaaaatctt 203  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||   ||||||||| | ||    
T  123052 cttgatttc-ttgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaacctttttttcaaaattgtt 123150  T
Q  204 aaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattg 252  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  123151 aaaatcaacctaacccacc--aaagaaattctttaggtgaactacattg 123197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 351; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 94 - 607
Target Start/End: Original strand, 29778 - 30286
Alignment:
Q  94 attcataatagacttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| ||||    
T  29778 attcataatagacttgatttctt-gtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaacc-attt 29875  T
Q  193 tcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggat 292  Q
    || ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  29876 tctaaaatat-aaaatcaacc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaacctcattggttttgatcccttt-ctttaagggtatgtaggcagaggat 29972  T
Q  293 ttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagattttt--aggtaataattttcaaataagcaa 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29973 ttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttcttcccccattctttcacttagatttttttaggtaataattttcaaataagcaa 30072  T
Q  391 atcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatc 490  Q
     | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30073 -tgaatttagcacaagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagacacttagggtgctagcaacttcccttcgcgtaaccaacccccgaatc 30171  T
Q  491 caaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagc 590  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30172 caaagtctcgataagggtttttactcattttttctcttcccacgaataaaaatc--gagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatatc 30269  T
Q  591 cgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||||||    
T  30270 cgaaaatcacgagcaca 30286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 504 - 607
Target Start/End: Original strand, 11481 - 11584
Alignment:
Q  504 agggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgag 603  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11481 agggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagtgttcagagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgag 11580  T
Q  604 caca 607  Q
    ||||    
T  11581 caca 11584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 344; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 607
Target Start/End: Original strand, 10187 - 10782
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagactt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  10187 caaaaatattttcttaataaaccttggactttaacccaagtgtttt-ccttttattttcttaattaaatgcttaattgaattaatgttcatattagactt 10285  T
Q  109 gatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcacctta-ttttatctcatgcctggaggcctct-ttctcttctaaaaac--ccattttcaaaaatctta 204  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||  |||||||| |||||     ||||||||| | |||    
T  10286 gattttcttgtaattaaaatttgaccaacctcatcttatttttctctcatgccttgaggcctctaatctcttcttaaaactttttttttcaaaattgtta 10385  T
Q  205 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttcc 304  Q
    ||||||| |  |||||  | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  10386 aaatcaatcctaccca--acaaagaaactttttaggtaagctacattggttttgatccc-tttccttaagggtatgtaggcaaagga-gttaatccttcc 10481  T
Q  305 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaaatcaattcagcac 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||| |||||    
T  10482 aaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtatgcaaatgaatttagcac 10581  T
Q  404 aagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgata 503  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||| ||   ||    
T  10582 aagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttaaggtgctagcaccttcccttcgcgtaacgaacccccgaatataaaggct---ta 10678  T
Q  504 agggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgag 603  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10679 agggtttttattcattttctccctttccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgag 10778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 148 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 10255 - 9802
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaacta 247  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||    
T  10255 tttatctcatgccttgaggcctctttcttttcttaaaacc-attttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgaggtgaacta 10159  T
Q  248 cattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcca 347  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10158 cattggttttgatcctttttctttaagggtatgtaggcaagggagtca-atccttccaaatcaaataaaaatagccaaaaacatacttcttctccctcca 10060  T
Q  348 ttctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgc 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10059 ttctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagaggtttctatggaataccatagacgc 9960  T
Q  447 ttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcga 546  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9959 ttagggtgctaacacattcccttcgcgtaaccaacgcccgaatccaaagtct---taagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcga 9863  T
Q  547 gagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9862 gagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgagcaca 9802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0257 (Bit Score: 297; Significance: 1e-166; HSPs: 1)
Name: scaffold0257
Description:

Target: scaffold0257; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 202 - 608
Target Start/End: Original strand, 10139 - 10546
Alignment:
Q  202 ttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcct 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  10139 ttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttctcttcaagggtatgtaggcatgggatttgtatcct 10238  T
Q  302 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaat-aattttcaaataagcaaatcaattcag 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||| ||    
T  10239 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatgcttcttcttcccccattctttcacttagatttttaggtagttaattttcaaataagcaa-tgaatttag 10337  T
Q  401 cacaagataaattagg-taagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctc 499  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  10338 cacaagataatttagggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctc 10437  T
Q  500 gataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatca 599  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10438 gatgagggtttttactcatttttttccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagatcgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatca 10537  T
Q  600 cgagcacac 608  Q
    |||||||||    
T  10538 cgagcacac 10546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1804 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 1)
Name: scaffold1804
Description:

Target: scaffold1804; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 249 - 609
Target Start/End: Original strand, 1 - 361
Alignment:
Q  249 attggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccat 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 attggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccat 100  T
Q  349 tctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgctt 448  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  101 tcattcacttagatttttaggtaataattttcaaataagc-aatgaatttagcacaagataaattaggtaagaggttcctacagaataccgtagacgctt 199  T
Q  449 agggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactca-ttttttcccttgccacgaataaaaatcgag 547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  200 agggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgatgagggtttttactcatttttttcccttcccacgaataaaaatcaag 299  T
Q  548 agttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcacaca 609  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  300 agttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttaatatccgaaaatcacgagcacaca 361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 147 - 599
Target Start/End: Original strand, 63135 - 63581
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  |||||    
T  63135 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc-attttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaact 63231  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 346  Q
    || | ||||||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  63232 acgtcggttttgatccctttcccaaaagggtacgtaggcagaggactcgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 63329  T
Q  347 attctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  63330 attctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagaggttcctatgggataccatagacg 63429  T
Q  446 cttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcg 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  63430 cttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaag--tcgataagggtttttactcatattttcccttcccaagaataaaaatcg 63527  T
Q  546 agagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatca 599  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  63528 agagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatca 63581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 9 - 465
Target Start/End: Original strand, 19565 - 20028
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttc---cttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  19565 caaaaatattttcttaataaaccttggtctgtaacccaagtgtttttttttcttttattttcttaatcaaatgctaaattgaattaacattcatattaga 19664  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcacctta-ttttatctcatgcctggaggcctct-ttctcttctaaaaacccatttt--caaaaatc 201  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||| |||||| |||||||||  |||||||| ||||||  ||||  ||||| |     
T  19665 cttgatttgcttgtaattaaaatttgaacaacctcatcttatttttctcttatgccttgaggcctctaatctcttcttaaaacctttttttacaaaattg 19764  T
Q  202 ttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatcct 301  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |  |||||    
T  19765 ttaaaatcaacccaactcaccaaaaagaatttttttaggtgaactacattggtgttgatcccttttctttaagggtatgtaggca-agggagtcaatcct 19863  T
Q  302 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaaatcaattcag 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||    
T  19864 tccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttag 19963  T
Q  401 cacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttc 465  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19964 cacaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttc 20028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 265; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 10 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 39028 - 38672
Alignment:
Q  10 aaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttc--cttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagact 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39028 aaaaatattttcttaataaaccttggcttgtaacccaagtgttttttttcttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaagattcataatagact 38929  T
Q  108 tgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaa 206  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||  |||||| ||||||| |||    
T  38928 tgattttcttgtaattaaaatttgaccaacctaaccttattttatctcatgccttgaggcctcttatcccttcttaaaact-attttctaaaatct-aaa 38831  T
Q  207 atcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaa 306  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38830 gtcaacc-aacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaa 38732  T
Q  307 atcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagattttt 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38731 atcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagactttt 38672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 260; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 274 - 608
Target Start/End: Original strand, 4297 - 4629
Alignment:
Q  274 gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaat 373  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4297 gggtacgtaggcaaaggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccccccattctttcacttagatttttaggtaat 4396  T
Q  374 aattttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcg 473  Q
    |||||| || ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  4397 aatttttaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatttaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagagtgctagcaccttcccttcgtg 4496  T
Q  474 taaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatca 573  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  4497 taaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatc--gagttcaaagattgacgactcaaatca 4594  T
Q  574 attaatggtttgatagccgaaaatcacgagcacac 608  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  4595 attaatggtttgatatccgaatatcacgagcacac 4629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 255; Significance: 1e-141; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 298 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 80648 - 80338
Alignment:
Q  298 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  80648 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaat 80549  T
Q  397 tcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagt 496  Q
    | || |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  80548 ttagaacaagataatctaggtaagaggttcctatgggataccatagacgcttagggtgctagcacgttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagt 80449  T
Q  497 ctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaa 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  80448 ctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaa 80349  T
Q  597 tcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||    
T  80348 tcacgagcaca 80338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 298 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 64246 - 63938
Alignment:
Q  298 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaat 396  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||    
T  64246 tcctaccaaatcaaataaaaataaccaaaaatatacttcttcttcctccattctttcagttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaaggaat 64147  T
Q  397 tcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagt 496  Q
    | ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  64146 ttagcacaagataatctaggtaagaggttcctatgggataccatagacgcttagggtgctagcaccttcctttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagt 64047  T
Q  497 ctcgataagggtttttactca-ttttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaa 595  Q
    ||   |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  64046 ct---taagggtttttactcatttttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaa 63950  T
Q  596 atcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||    
T  63949 atcacgagcaca 63938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 245; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 152 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 46902 - 46457
Alignment:
Q  152 tctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacatt 251  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||| |||| ||  ||||||| |     
T  46902 tctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaactcattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacctgccaaa--gaaatttttgagtggaactacgtc 46805  T
Q  252 ggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattc 350  Q
    ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46804 ggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattc 46707  T
Q  351 tttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgctta 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||  |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46706 tttcacttagatttttaggtaataatttttcaagcaattaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagaggttcctatggtataccatagacgctta 46607  T
Q  450 gggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagag 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||    
T  46606 gggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtct---taaggatttttactcattttttcgcttcccacgaataaaaatcgatag 46510  T
Q  550 ttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacga 602  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  46509 ttcaaatattgacgatttaaatcaaataatggtttaatatccgaaaatcacga 46457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 148 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 396 - 1
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaa--tcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaac 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||  ||||    
T  396 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcaaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattcttgagtggaac 299  T
Q  246 tacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    ||| | ||||||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  298 tacgtcggttttgatccctttcccaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaataaaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 201  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacg 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  200 cattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataaacaa-tgaatttagcacaaaataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagatg 102  T
Q  446 cttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcg 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  101 cttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcg 2  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0451 (Bit Score: 235; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0451
Description:

Target: scaffold0451; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 198 - 607
Target Start/End: Original strand, 4491 - 4899
Alignment:
Q  198 aatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggattttt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||  ||||||| | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| || |    
T  4491 aatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattcttgagtggaactacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt 4588  T
Q  297 atccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccc-tccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatca 394  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  4589 --ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctcccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatga 4686  T
Q  395 attcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaa 494  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4687 atttagcacaagataatctaggtaagaggttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaa 4786  T
Q  495 gtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaa 594  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  4787 gtctcgataagggattttactcattttttcccttcccaagaataaaaatcgagagttcaaagatcgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaa 4886  T
Q  595 aatcacgagcaca 607  Q
    |||| ||||||||    
T  4887 aatcgcgagcaca 4899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 298 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 21760 - 21451
Alignment:
Q  298 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataattttcaaataagcaaatcaatt 397  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21760 tcctcccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatgcttcttcttcctccattctttcatttagatttttaggtaataattttcaagtaagcaaatcaatt 21661  T
Q  398 cagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtc 497  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21660 tagcacaagataatttaggtaagaggttcctacggaatattgtagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtc 21561  T
Q  498 tcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaat 597  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  21560 tcgataaggttttttactcatttttttccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatctgaaaat 21461  T
Q  598 cacgagcaca 607  Q
    || |||||||    
T  21460 caagagcaca 21451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 147 - 598
Target Start/End: Original strand, 83332 - 83783
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||  |  |||||    
T  83332 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaactcaccaaa--gaaatttttgtgtggaact 83429  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaa--gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 344  Q
    || | ||||||||||||||| |   ||  ||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  83430 acgtcggttttgatccctttcccaaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccct 83527  T
Q  345 ccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccataga 443  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  ||     
T  83528 ccatttttttacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaagt 83627  T
Q  444 cgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaa 542  Q
    || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  83628 cgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaatgaaaa 83727  T
Q  543 tcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  83728 ttgagagttcaaagattgacgattcaaatcaatcaatggtttgatatccgaaaatc 83783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 148 - 607
Target Start/End: Original strand, 14775 - 15236
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttc---aaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaa 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||   ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||  |||    
T  14775 tttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaacactatttttttaaaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaattcttgagtggaa 14872  T
Q  245 ctacattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaat-aaccaaaaacatacttcttctcc 342  Q
     ||| | ||||||||||||||| |   || ||||| ||||||| |||| || |  ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14873 atacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagaggacttgt--cctcccaaatcaaataaaaaacaaccaaaaacatacttcttctcc 14970  T
Q  343 ctccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccata 441  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||| ||    
T  14971 ctccattcttttacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaagtaagaggttcctacggaataccgta 15070  T
Q  442 gacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaa 541  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  15071 gatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaa 15170  T
Q  542 atcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||    
T  15171 atcgagagttcaaagatcgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatcgtgagcaca 15236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 298 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 145591 - 145283
Alignment:
Q  298 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagattttt-aggtaataatttt-caaataagcaaatcaa 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||    
T  145591 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagcttttttaggtaataatttttcatgtaagcaaatgaa 145492  T
Q  396 ttcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaag 495  Q
    || ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  145491 tttagcacaagataatctaggtaagaggttcctttggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttccctccgcgtaaccaacccccgaatccaaag 145392  T
Q  496 tctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaa 595  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  145391 tct---taagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaattgagagttcaaagattgacgactcaaatcaattaatggtttgatatccgaaa 145295  T
Q  596 atcacgagcaca 607  Q
    |||| |||||||    
T  145294 atcatgagcaca 145283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 310 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 136617 - 136321
Alignment:
Q  310 aaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagattttt-aggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaaga 407  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  136617 aaataaatataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagattttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaaga 136518  T
Q  408 taaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataaggg 507  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||    
T  136517 taatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacacttagcgtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtct---taaggg 136421  T
Q  508 tttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  136420 tttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgactcaaatcaattaatggtttgatatctgaaaatcacgagcaca 136321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0545 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0545
Description:

Target: scaffold0545; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 9 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 8293 - 8011
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgt-----ttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataata 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8293 caaaaatattttcttaataaaccttggcttgtaacccaagtgtcctttttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataata 8194  T
Q  104 gacttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatct 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||  |||| |||||| ||||||||||||||    
T  8193 gacttgatttctt-gtaattaaaatttgaccaacctcatcttattttctctcatgcctcgaggcctcttatcctttcttaaaacc-attttcaaaaatct 8096  T
Q  203 taaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcat 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8095 taaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcat 8011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0455 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0455
Description:

Target: scaffold0455; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 147 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 4028 - 3579
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||  |  |||||    
T  4028 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaa-cccattttcaaaaatcttaaaatcaacctaacccatc--aaagaaatttttgtgtggaact 3932  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctcc 346  Q
    || | ||||||||||||||| |   || |||| ||||||| ||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3931 acgtcggttttgatccctttcccaaaaaggtacgtaggcagagga--cttgtccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatactccttctccctcc 3834  T
Q  347 attctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataag-caaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagac 444  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||   ||||||| |||||||  ||| ||||  || |    
T  3833 attctttcatttagatttttaggtaataatttttcaagtaagccaaatgaatttagcacaagataatccaggtaagcggttccttcggagtaccgaagtc 3734  T
Q  445 gcttagggtgc-tagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaat 543  Q
    | ||||||||| || ||||||||||    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3733 gtttagggtgcttaacaccttccctatttgaaaccaac-cccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaat 3635  T
Q  544 cgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatca 599  Q
     ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3634 tgagagttcaaagattgacgatttaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatca 3579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 237
Target Start/End: Original strand, 25384 - 25616
Alignment:
Q  6 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25384 ctccaaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttcctttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataataga 25483  T
Q  106 cttgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttc-aaaaatctta 204  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25484 cttgatttctttgtaattaaaattcgaccaacctcaccttattttatctcatgccttgaggcctcttcctcttctaaaaacccattttcaaaaaatctta 25583  T
Q  205 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaacttttt 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25584 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaacttttt 25616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497 (Bit Score: 184; Significance: 3e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0497
Description:

Target: scaffold0497; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 9 - 267
Target Start/End: Original strand, 12494 - 12753
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagt-gtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagact 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12494 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagttgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagact 12593  T
Q  108 tgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatct--catgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatctta 204  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||  |||    
T  12594 tgatttc-ttgtaattaaaatttgaccaacctcatcttattttttctcccatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaa-ccattttcaaaaa-atta 12690  T
Q  205 aaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12691 aaatcaacctaacccaccaaaaaaaaactttttaggtgaactacattggttttgatccctttt 12753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 184; Significance: 3e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 372 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 29803 - 29569
Alignment:
Q  372 ataattttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcg 471  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29803 ataattttcaaataagcaa-tgaatttagcacaagataaattaggtaagaggttcctacggaataccgtcgacgcttagggtgctagcaccttcccttcg 29705  T
Q  472 cgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaat 571  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29704 cgtaaccaacccccaaatccaaagtcttgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcatat 29605  T
Q  572 caattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29604 caattaatggtttgatatccgaaaatcacgagcaca 29569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 33315 - 33162
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagactt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||       ||||||| |||||||| ||||| || ||||||| |||| |||||||    
T  33315 caaaaatattttcttaataaacctt---tcgtaacccaagtgttttt-------ttttctttatcaaatgtttaatcgatttaatatccatattagactt 33226  T
Q  109 g-atttctttgtaattaaaatttgaccaacctcacctta-ttttatctcatgcctggaggcctctt 172  Q
    | ||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  33225 ggatttctt-gtaattaaaa-ctaaccaacctcaccttatttttctctcatgccttgaggcctctt 33162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 162; Significance: 4e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 399 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 22138 - 21929
Alignment:
Q  399 agcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtct 498  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22138 agcacaaaataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttaggatgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtct 22039  T
Q  499 cgataagggt-ttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaat 597  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22038 cgataagggttttttactcattttttcccttcccaagaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaat 21939  T
Q  598 cacgagcaca 607  Q
    | ||||||||    
T  21938 cgcgagcaca 21929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 298 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 603 - 421
Alignment:
Q  298 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaat 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  603 tccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctccattcattcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaagcaaatgaat 504  T
Q  397 tcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaacca 479  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  503 ttagcacaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgggtaacca 421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 530 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 423 - 346
Alignment:
Q  530 ccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  423 ccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatattcgaaaatcacgagcaca 346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0392 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0392
Description:

Target: scaffold0392; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 447 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 16555 - 16390
Alignment:
Q  447 ttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcga 546  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16555 ttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcga 16456  T
Q  547 gagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcacacatat 612  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  16455 gagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgagcacatatat 16390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 134 - 427
Target Start/End: Original strand, 32325 - 32622
Alignment:
Q  134 caacctcaccttatttta-tctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccatttt---caaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaag 228  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||  ||||   ||||| | |||||||||| | ||||||||||||||    
T  32325 caacctcaccttatttttctctcatgccttgaggcctctaatctcttcttaaaaccttttttttacaaaattgttaaaatcaatccaacccaccaaaaag 32424  T
Q  229 aaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaa 328  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32425 aaatttttgaggtgaactacattggttttgatcccttt-ctttaagggtatgtaggcaagggagtca-atccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaa 32522  T
Q  329 catacttcttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcc 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||| |||| |||||||  || ||||||||||||    
T  32523 catacttattctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttttcaagtaatcaaatgaatttagcataagataatctaagtaagaggttcc 32622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 434 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 29945 - 29775
Alignment:
Q  434 ataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccac 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  29945 ataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtct---taaggatttttactcattttttcccttcccac 29849  T
Q  534 gaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  29848 gaataaaaatagagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 29775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 474 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 32772 - 32642
Alignment:
Q  474 taaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatca 573  Q
    |||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32772 taaccaacccccgaatccaaagtct---taagggtttttactcattttttcccttccaacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatca 32676  T
Q  574 attaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    || |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  32675 ataaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 32642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1481 (Bit Score: 140; Significance: 5e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold1481
Description:

Target: scaffold1481; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 148 - 497
Target Start/End: Original strand, 1402 - 1751
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttc-aaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaact 246  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||  |||||    
T  1402 tttatcttatgccttgaggcctcttcctcttcttaaaacccattttcgaaaaatcttaaaatcaacctaacccaccaaa--gaaatttttgagtggaact 1499  T
Q  247 acattggttttgatcccttttctttaa-gggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 345  Q
    || | |||||||||||||||     || ||||| ||||||| |||| |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1500 acgtcggttttgatccctttcaaaaaaagggtacgtaggcagaggactagt--ccttccaaatcaaataaaaataaccaaaaacatacttcttctccctc 1597  T
Q  346 cattctttcacttagatttttaggtaataa-ttttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagac 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||  || |    
T  1598 cattctttcacttagatttttaggtattaatttttcaagtaaccaaatgaatttagcacaagataacttaggtaagcggttccttcggagtaccgaagtc 1697  T
Q  445 gcttagggtgc-tagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtc 497  Q
    | ||||||||| || ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||    
T  1698 gtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtc 1751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 140; Significance: 5e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 434 - 607
Target Start/End: Original strand, 9796 - 9966
Alignment:
Q  434 ataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccac 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9796 ataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtct---taagggtttttactcattttttcccttcccac 9892  T
Q  534 gaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  9893 gaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcaggagcaca 9966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1199 (Bit Score: 138; Significance: 8e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold1199
Description:

Target: scaffold1199; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 399 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 2417 - 2205
Alignment:
Q  399 agcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtct 498  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |    
T  2417 agcacaagataatctaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttaggatgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaattttt 2318  T
Q  499 cgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
       ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  2317 tt-taagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatc 2219  T
Q  599 acgagcacacatat 612  Q
      ||||||| ||||    
T  2218 gtgagcacagatat 2205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 443 - 607
Target Start/End: Original strand, 172567 - 172731
Alignment:
Q  443 acgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaa 542  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  172567 acgcttaggatgctagcaccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccaagaataaaaa 172666  T
Q  543 tcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  172667 tcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcaca 172731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 135; Significance: 5e-70; HSPs: 3)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 378 - 581
Target Start/End: Original strand, 63287 - 63488
Alignment:
Q  378 ttcaaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaac 477  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  63287 ttcaaataagcaaagcaatttagcacaagataaattaggtaagaggttcctacggagtaccgtagacgcttagggtgctaataccttcccttcgcgtaac 63386  T
Q  478 caactcccgaatccaaagtctcgataaggg-tttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaatt 576  Q
    |||| ||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  63387 caacccccgaatccaaagtct---taagggttttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgatccaaatcgatt 63483  T
Q  577 aatgg 581  Q
    |||||    
T  63484 aatgg 63488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 19677 - 19404
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgttttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagact 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||  | ||||||| |||| ||||||    
T  19677 caaaaatattttcttagtaaaccttggatt-taacccaagtgttttttccttttatttccttaatcaaatgtttaatcaatttaatatccatattagact 19579  T
Q  108 tgatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatcttaaa 206  Q
    ||| ||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||| |||||    
T  19578 tgaatttcttgtaattaaaatttgaccaaccttaacttatttt-tctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaa-ccaatttcaaaaat-ttaaa 19482  T
Q  207 atcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggca 286  Q
    ||||| | ||||||||  ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19481 atcaatccaacccacc--aaagaaattctttaggggaactacattggttttgatcccttttctttaagggtatgtaggca 19404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26598 - 26354
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagt-gtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagact 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    ||||||| |||| ||||||    
T  26598 caaaaatattttcttagtaaaccttggatt-taacccaagtacttttttcttttatttccttaatcaaatgtttaatcattttaatatccatattagact 26500  T
Q  108 t-gatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcacc--ttattttatctcatgcctggaggcctctt-tctcttctaaaaacccattttcaaaaatctt 203  Q
    | |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |  || |||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||    
T  26499 tggatttc-ttgcaattaaaatttgaccaatctcatctttttttttttctcatgccttgaggcctcttatctcttcttaaaa-ccattttcaaaaat-tt 26403  T
Q  204 aaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtgaactacattggt 254  Q
    |||||||| | ||||||||  ||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  26402 aaaatcaatccaacccacc--aaagaaattctttaggggaactacattggt 26354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 133; Significance: 8e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 336 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 22980 - 22717
Alignment:
Q  336 cttctccctccattctttcacttagatttttaggtaataatttt-caaataagcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaa 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  |||     
T  22980 cttctccctccattctttcacttagatttt-aggtaataatttttcaagtaagcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggag 22882  T
Q  435 taccatagacgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccac 533  Q
    ||||  || || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  22881 taccgaagtcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgaaaagggtttttactcattttttcccttcccaa 22782  T
Q  534 gaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  22781 gaataaagatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaatcgatggtttgatatccgaaaatc 22717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 424 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 15557 - 15382
Alignment:
Q  424 ttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcatt-ttt 522  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15557 ttcctacggaataccgtagatgcttagggtgctagcaccttcccttcgcataaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcatttttt 15458  T
Q  523 tcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  15457 tcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgacatccgaaaatc 15382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 461 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 13781 - 13635
Alignment:
Q  461 ccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagatta 560  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13781 ccttcccttcgcgtaaccaacccccgaatccaaagtctcgatgagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaatcgagagttcaaagatta 13682  T
Q  561 acgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcaca 607  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13681 acgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcacgagcaca 13635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1120 (Bit Score: 128; Significance: 8e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold1120
Description:

Target: scaffold1120; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 172
Target Start/End: Original strand, 1258 - 1419
Alignment:
Q  9 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttttccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaatattcataatagactt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1258 caaaaatattttcttaataaaccttggtttgtaacccaagtgtttt-ccttttattttcttaatcaaatgcttaattgaattaacattcataatagactt 1356  T
Q  109 gatttctttgtaattaaaatttgaccaacctcaccttattttatctcatgcctggaggcctctt 172  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  1357 gatttc-ttgtaattaaaatttgaccaacctcactttattttctctcatgtcttgaggcctctt 1419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0605 (Bit Score: 106; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0605
Description:

Target: scaffold0605; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 387 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 7957 - 7744
Alignment:
Q  387 gcaaatcaattcagcacaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactccc 485  Q
    |||||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  || || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||    
T  7957 gcaaatgaatttagcacaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaagtcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaaccccc 7858  T
Q  486 gaatccaaagtctcgataagggtttttactcatttttt-cccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggttt 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7857 gaatccaaagtctcgataagggtttttactcttttttttcccttcccacgaataaaaattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggttt 7758  T
Q  585 gatagccgaaaatc 598  Q
    |||| |||||||||    
T  7757 gatatccgaaaatc 7744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 99; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 402 - 598
Target Start/End: Original strand, 1 - 199
Alignment:
Q  402 acaagataaattaggtaagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcg 500  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||  ||| ||||  || || |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1 acaagataatctaggtaagcggttccttcggagtaccgaagtcgtttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcg 100  T
Q  501 ataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaatt-aatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  101 ataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaaatggtttgacatccgaaaatc 199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 98; Significance: 6e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 447 - 599
Target Start/End: Original strand, 55757 - 55910
Alignment:
Q  447 ttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcg 545  Q
    |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  55757 ttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaattg 55856  T
Q  546 agagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatca 599  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  55857 agagttcaaagattgacgattcaaatcaatcaattgtttgatatccgaaaatca 55910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 187
Target Start/End: Original strand, 37844 - 37884
Alignment:
Q  147 ttttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacc 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  37844 ttttatctcatgccttgaggcctctttctcttcttaaaacc 37884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0945 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0945
Description:

Target: scaffold0945; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 447 - 598
Target Start/End: Original strand, 27 - 180
Alignment:
Q  447 ttagggtgct-agcaccttcccttcgcgtaaccaactcccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaa-aatc 544  Q
    |||||||||| | ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  27 ttagggtgcttaacaccttccctattcgaaaccaacccccgaatccaaagtctcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaagaatt 126  T
Q  545 gagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatc 598  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  127 gagagttcaaagattgacgattcaaatcaatcaatggtttgatatccgaaaatc 180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 86; Significance: 9e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 498 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 8533 - 8432
Alignment:
Q  498 tcgataagggtttttactcattttttcccttgccacgaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaat 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8533 tcgataagggtttttactcattttttcccttcccacgaataaaaattgagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaat 8434  T
Q  598 ca 599  Q
    ||    
T  8433 ca 8432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 534 - 608
Target Start/End: Original strand, 1 - 75
Alignment:
Q  534 gaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcacac 608  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  1 gaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaatcaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcacac 75  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0386 (Bit Score: 56; Significance: 7e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0386
Description:

Target: scaffold0386; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 534 - 609
Target Start/End: Original strand, 1 - 76
Alignment:
Q  534 gaataaaaatcgagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcacaca 609  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  1 gaataaaaatcgagagttcaaagattgacgattcaaatcaataaatggttggatatccgaaaatcgcgagcacaca 76  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 545 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 10010 - 9943
Alignment:
Q  545 gagagttcaaagattaacgattcaaatcaattaatggtttgatagccgaaaatcacgagcacacatat 612  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  10010 gagagttcaaagattgacgattcaaatcaattaatggtttgatatccgaaaatcgcgagcacagatat 9943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1547 (Bit Score: 51; Significance: 7e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1547
Description:

Target: scaffold1547; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 148 - 327
Target Start/End: Original strand, 1485 - 1662
Alignment:
Q  148 tttatctcatgcctggaggcctctttctcttctaaaaacccattttcaaaa----atcttaaaatcaacctaacccaccaaaaagaaactttttaggtga 243  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| |  ||    
T  1485 tttatctcatgccttgaggcctctttaccttcttaaaacc-attttcaaaaaaaaatcttaaaatcaacctaacccacc--aaagaa--ttttttgtgga 1579  T
Q  244 actacattggttttgatcccttt-tctttaagggtatgtaggcataggatttttatccttccaaatcaaataaaaataaccaaaa 327  Q
    ||||| | |||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| ||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1580 actacgtcggttttgatccctttcccaaaaagggtacgtaggcagagga--cttgtccttccaaatcaaataaaaataaccaaaa 1662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2020 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold2020
Description:

Target: scaffold2020; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 418 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 771 - 708
Alignment:
Q  418 aagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaac 481  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  771 aagaggttcctatagaataatatagacgtttagggtgctaacaccttcccttcacgtaaccaac 708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 418 - 481
Target Start/End: Original strand, 164724 - 164787
Alignment:
Q  418 aagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttcgcgtaaccaac 481  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  164724 aagaggttcctatagaataatatagacgtttagggtgctaacaccttcccttcacgtaaccaac 164787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 418 - 470
Target Start/End: Original strand, 149519 - 149571
Alignment:
Q  418 aagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgctagcaccttcccttc 470  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  149519 aagaggttcctatagaatattatagacgtttagggtgttaacaccttcccttc 149571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 418 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 28643 - 28579
Alignment:
Q  418 aagaggttcctatggaataccatagacgcttagggtgc-tagcaccttcccttcgcgtaaccaac 481  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||  || ||||||| |||||||||||    
T  28643 aagaggttcgtatggaataccatagaagtttagggtgcttaaaacattccctttgcgtaaccaac 28579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University