View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1145_low_28 (Length: 512)

Name: NF1145_low_28
Description: NF1145
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1145_low_28
NF1145_low_28
[»] chr1 (32 HSPs)
chr1 (30-504)||(18059582-18060057)
chr1 (30-504)||(17004595-17005070)
chr1 (30-504)||(38054915-38055390)
chr1 (153-504)||(17148647-17149000)
chr1 (78-452)||(46523394-46523768)
chr1 (210-504)||(19962323-19962617)
chr1 (209-498)||(22227947-22228236)
chr1 (209-449)||(22232644-22232882)
chr1 (192-452)||(22035568-22035827)
chr1 (192-452)||(7640810-7641069)
chr1 (240-478)||(5072237-5072472)
chr1 (209-410)||(2116393-2116589)
chr1 (209-410)||(45051561-45051757)
chr1 (240-392)||(18601052-18601202)
chr1 (379-478)||(15861258-15861358)
chr1 (388-458)||(18598845-18598914)
chr1 (209-330)||(20913168-20913287)
chr1 (209-330)||(20931483-20931602)
chr1 (240-330)||(20445846-20445936)
chr1 (33-77)||(13377085-13377129)
chr1 (30-74)||(21650295-21650339)
chr1 (240-330)||(20531611-20531701)
chr1 (240-330)||(20893632-20893722)
chr1 (240-330)||(37844456-37844546)
chr1 (30-82)||(17148524-17148576)
chr1 (33-73)||(20177133-20177173)
chr1 (67-115)||(22035442-22035490)
chr1 (209-329)||(41394360-41394478)
chr1 (30-74)||(44035226-44035270)
chr1 (336-452)||(51452765-51452882)
chr1 (72-114)||(20254311-20254353)
chr1 (67-115)||(7641147-7641195)
[»] chr3 (42 HSPs)
chr3 (30-504)||(49232393-49232868)
chr3 (30-504)||(1467563-1468038)
chr3 (41-504)||(12264615-12265080)
chr3 (67-499)||(25058733-25059168)
chr3 (33-488)||(22275168-22275626)
chr3 (33-504)||(15468162-15468637)
chr3 (67-478)||(5228307-5228719)
chr3 (170-504)||(12811938-12812273)
chr3 (55-410)||(12902008-12902364)
chr3 (153-504)||(18911073-18911427)
chr3 (145-452)||(54651529-54651837)
chr3 (242-499)||(18896871-18897130)
chr3 (67-410)||(44228979-44229323)
chr3 (30-499)||(16821096-16821564)
chr3 (240-478)||(55316387-55316622)
chr3 (240-478)||(41270243-41270478)
chr3 (55-189)||(18897139-18897273)
chr3 (240-410)||(15936553-15936723)
chr3 (240-410)||(15938395-15938565)
chr3 (210-410)||(15614973-15615168)
chr3 (142-330)||(11986172-11986361)
chr3 (209-504)||(14842392-14842686)
chr3 (379-504)||(23492696-23492823)
chr3 (378-452)||(8268609-8268683)
chr3 (378-452)||(8275709-8275783)
chr3 (142-330)||(17912489-17912675)
chr3 (209-330)||(51158024-51158143)
chr3 (240-330)||(15859030-15859120)
chr3 (240-336)||(13839061-13839157)
chr3 (240-330)||(12030153-12030243)
chr3 (30-74)||(16934229-16934273)
chr3 (30-74)||(17956240-17956284)
chr3 (30-82)||(18910950-18911002)
chr3 (239-452)||(2449111-2449335)
chr3 (191-476)||(13954738-13955033)
chr3 (33-74)||(13838854-13838895)
chr3 (45-81)||(33369149-33369185)
chr3 (379-430)||(30153265-30153316)
chr3 (240-330)||(2049977-2050067)
chr3 (210-476)||(45860945-45861220)
chr3 (40-81)||(1990767-1990808)
chr3 (379-452)||(38168237-38168310)
[»] chr6 (37 HSPs)
chr6 (30-504)||(22225562-22226037)
chr6 (30-504)||(16376197-16376672)
chr6 (30-504)||(16383521-16383996)
chr6 (30-504)||(10488656-10489131)
chr6 (30-494)||(16555973-16556438)
chr6 (30-494)||(16632529-16632994)
chr6 (41-499)||(1555974-1556434)
chr6 (67-478)||(19610012-19610425)
chr6 (153-478)||(16231972-16232297)
chr6 (153-461)||(18086690-18086999)
chr6 (210-504)||(19299375-19299669)
chr6 (246-504)||(22251390-22251648)
chr6 (153-452)||(23977849-23978149)
chr6 (153-410)||(13620712-13620970)
chr6 (192-478)||(29869627-29869911)
chr6 (240-496)||(27653814-27654067)
chr6 (142-406)||(29665942-29666208)
chr6 (209-504)||(14625953-14626243)
chr6 (240-453)||(25175731-25175945)
chr6 (42-160)||(33314387-33314505)
chr6 (240-410)||(1650022-1650189)
chr6 (273-399)||(16825678-16825803)
chr6 (193-504)||(15862592-15862916)
chr6 (193-504)||(1657566-1657890)
chr6 (379-452)||(4991396-4991470)
chr6 (394-488)||(16814837-16814930)
chr6 (138-255)||(27740903-27741021)
chr6 (240-330)||(35009445-35009535)
chr6 (240-330)||(23153614-23153704)
chr6 (30-82)||(16231849-16231901)
chr6 (33-77)||(18381928-18381972)
chr6 (30-74)||(19983547-19983591)
chr6 (30-82)||(23977726-23977778)
chr6 (30-74)||(35015413-35015457)
chr6 (30-82)||(18087070-18087122)
chr6 (30-82)||(13621041-13621093)
chr6 (45-81)||(18629852-18629888)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (30-504)||(39060-39535)
scaffold0076 (210-504)||(43137-43426)
[»] chr7 (46 HSPs)
chr7 (30-504)||(7822685-7823160)
chr7 (30-504)||(7829996-7830471)
chr7 (30-504)||(27176390-27176865)
chr7 (30-504)||(27101461-27101936)
chr7 (30-504)||(27108809-27109284)
chr7 (30-504)||(38783553-38784028)
chr7 (30-504)||(15950614-15951090)
chr7 (41-499)||(15759941-15760401)
chr7 (153-478)||(18979872-18980197)
chr7 (153-478)||(15927648-15927973)
chr7 (153-452)||(13758450-13758750)
chr7 (153-504)||(14250721-14251074)
chr7 (240-504)||(2437625-2437888)
chr7 (209-504)||(16478786-16479075)
chr7 (191-496)||(13910855-13911156)
chr7 (205-410)||(48622584-48622788)
chr7 (240-478)||(10989577-10989814)
chr7 (210-478)||(13572816-13573079)
chr7 (192-410)||(10000288-10000505)
chr7 (240-410)||(18253761-18253931)
chr7 (192-410)||(16418618-16418835)
chr7 (191-452)||(13321134-13321407)
chr7 (327-410)||(15862174-15862257)
chr7 (379-453)||(15516719-15516793)
chr7 (209-330)||(47481037-47481156)
chr7 (209-452)||(16211904-16212144)
chr7 (30-82)||(14251145-14251197)
chr7 (239-452)||(30262002-30262226)
chr7 (30-74)||(371045-371089)
chr7 (30-82)||(13758327-13758379)
chr7 (30-82)||(15927525-15927577)
chr7 (336-452)||(7293289-7293406)
chr7 (239-452)||(11516393-11516617)
chr7 (239-452)||(15441437-15441661)
chr7 (240-330)||(11580745-11580835)
chr7 (240-330)||(13037020-13037110)
chr7 (41-111)||(15852425-15852494)
chr7 (67-115)||(10000583-10000631)
chr7 (67-115)||(16418492-16418540)
chr7 (33-77)||(17224183-17224227)
chr7 (30-82)||(18980268-18980320)
chr7 (355-410)||(14113904-14113959)
chr7 (336-410)||(14423555-14423629)
chr7 (30-74)||(1937256-1937300)
chr7 (41-81)||(13377495-13377535)
chr7 (41-77)||(17947837-17947873)
[»] chr2 (47 HSPs)
chr2 (30-504)||(11231162-11231637)
chr2 (30-504)||(22513009-22513484)
chr2 (30-504)||(24685605-24686080)
chr2 (30-504)||(28775631-28776106)
chr2 (30-452)||(12728349-12728772)
chr2 (30-452)||(34824432-34824855)
chr2 (41-504)||(16935561-16936027)
chr2 (41-504)||(17006221-17006687)
chr2 (55-410)||(23777963-23778319)
chr2 (153-452)||(8943926-8944226)
chr2 (153-504)||(42177791-42178145)
chr2 (153-452)||(12635744-12636044)
chr2 (153-449)||(3798482-3798779)
chr2 (153-452)||(12641518-12641818)
chr2 (67-363)||(21141889-21142187)
chr2 (240-504)||(19886484-19886745)
chr2 (192-452)||(23774257-23774516)
chr2 (192-410)||(5888548-5888765)
chr2 (209-410)||(7507758-7507969)
chr2 (379-496)||(24826531-24826646)
chr2 (379-452)||(25213372-25213446)
chr2 (209-452)||(462876-463116)
chr2 (240-330)||(25265396-25265486)
chr2 (30-74)||(22283911-22283955)
chr2 (30-82)||(42178216-42178268)
chr2 (239-410)||(19689316-19689498)
chr2 (30-82)||(3798850-3798902)
chr2 (30-82)||(12636115-12636167)
chr2 (30-74)||(22274678-22274722)
chr2 (30-77)||(12641894-12641941)
chr2 (239-452)||(14906313-14906537)
chr2 (210-410)||(17396568-17396776)
chr2 (239-452)||(23820237-23820461)
chr2 (240-330)||(8891409-8891499)
chr2 (41-115)||(23774106-23774179)
chr2 (240-330)||(43642963-43643053)
chr2 (30-75)||(8943803-8943848)
chr2 (241-330)||(20627319-20627408)
chr2 (33-74)||(25601982-25602023)
chr2 (209-330)||(36982447-36982566)
chr2 (41-81)||(67958-67998)
chr2 (67-115)||(5888843-5888891)
chr2 (142-330)||(24341395-24341583)
chr2 (240-330)||(19794710-19794800)
chr2 (355-452)||(20015304-20015401)
chr2 (41-81)||(23821846-23821886)
chr2 (41-81)||(23830925-23830965)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (30-504)||(31266-31741)
scaffold0107 (30-361)||(39603-39935)
[»] chr8 (33 HSPs)
chr8 (30-504)||(271184-271659)
chr8 (30-504)||(644261-644736)
chr8 (30-504)||(829996-830471)
chr8 (30-504)||(22088618-22089093)
chr8 (30-504)||(15318983-15319458)
chr8 (30-504)||(15499352-15499827)
chr8 (30-478)||(22006107-22006557)
chr8 (30-504)||(13662087-13662564)
chr8 (153-504)||(13720750-13721104)
chr8 (67-452)||(16195224-16195611)
chr8 (153-452)||(16872927-16873227)
chr8 (209-504)||(6774083-6774371)
chr8 (209-504)||(24549120-24549409)
chr8 (240-496)||(30120890-30121144)
chr8 (210-504)||(21844394-21844684)
chr8 (210-504)||(21851787-21852077)
chr8 (191-461)||(16674258-16674524)
chr8 (193-476)||(17345690-17345985)
chr8 (30-82)||(13721175-13721227)
chr8 (239-452)||(22907087-22907311)
chr8 (240-330)||(16404981-16405071)
chr8 (240-330)||(24928797-24928887)
chr8 (30-74)||(3431536-3431580)
chr8 (209-329)||(16193723-16193841)
chr8 (464-504)||(17142854-17142894)
chr8 (239-452)||(5238253-5238477)
chr8 (30-77)||(16873303-16873350)
chr8 (239-452)||(24661121-24661345)
chr8 (239-452)||(43685712-43685936)
chr8 (33-74)||(24929053-24929094)
chr8 (33-77)||(23837156-23837200)
chr8 (209-324)||(43373480-43373593)
chr8 (30-64)||(24717128-24717162)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (30-504)||(21932205-21932680)
chr5 (30-504)||(21938375-21938850)
chr5 (30-504)||(22882908-22883383)
chr5 (30-504)||(35581993-35582468)
chr5 (30-504)||(36989594-36990069)
chr5 (30-452)||(1219396-1219819)
chr5 (67-478)||(7425318-7425729)
chr5 (153-504)||(10777794-10778146)
chr5 (33-488)||(17471427-17471885)
chr5 (67-478)||(35790947-35791361)
chr5 (41-504)||(11211886-11212352)
chr5 (153-504)||(23514641-23514995)
chr5 (240-504)||(18777815-18778076)
chr5 (209-496)||(29188116-29188397)
chr5 (240-504)||(19500067-19500327)
chr5 (240-504)||(12542-12803)
chr5 (240-504)||(21073418-21073679)
chr5 (240-496)||(22366311-22366565)
chr5 (191-496)||(4199816-4200117)
chr5 (210-478)||(27009981-27010244)
chr5 (192-452)||(23328678-23328937)
chr5 (240-453)||(25426796-25427009)
chr5 (192-452)||(24616282-24616541)
chr5 (192-452)||(24712658-24712917)
chr5 (192-452)||(24745676-24745935)
chr5 (240-461)||(43443261-43443479)
chr5 (379-504)||(11343008-11343133)
chr5 (142-330)||(32950762-32950952)
chr5 (379-504)||(16105967-16106092)
chr5 (193-327)||(34939398-34939531)
chr5 (240-330)||(18531073-18531163)
chr5 (209-330)||(23507103-23507222)
chr5 (30-77)||(23514518-23514565)
chr5 (30-74)||(9730638-9730682)
chr5 (30-82)||(10778217-10778269)
chr5 (239-410)||(25900321-25900503)
chr5 (239-452)||(20623135-20623359)
chr5 (239-452)||(21233401-21233625)
chr5 (142-330)||(22053839-22054027)
chr5 (72-115)||(23328557-23328600)
chr5 (355-452)||(37053037-37053134)
chr5 (75-115)||(24616165-24616205)
chr5 (75-115)||(24712541-24712581)
chr5 (75-115)||(24745559-24745599)
chr5 (239-330)||(37052910-37053001)
chr5 (240-330)||(27182553-27182643)
chr5 (355-452)||(16536490-16536587)
chr5 (41-81)||(3673828-3673868)
chr5 (41-81)||(5451084-5451124)
chr5 (41-77)||(23234730-23234766)
chr5 (41-81)||(23493885-23493925)
[»] chr4 (45 HSPs)
chr4 (30-504)||(18168927-18169402)
chr4 (67-478)||(15287096-15287507)
chr4 (67-461)||(15294221-15294616)
chr4 (46-410)||(19020459-19020824)
chr4 (153-504)||(7131887-7132241)
chr4 (67-504)||(17145479-17145919)
chr4 (153-452)||(20000803-20001103)
chr4 (67-422)||(18248212-18248568)
chr4 (193-410)||(22738390-22738607)
chr4 (211-504)||(10644360-10644647)
chr4 (207-478)||(22351915-22352184)
chr4 (192-452)||(26339140-26339399)
chr4 (286-401)||(8378365-8378480)
chr4 (67-288)||(8374502-8374724)
chr4 (240-478)||(47357822-47358057)
chr4 (142-286)||(40885604-40885748)
chr4 (378-504)||(14996444-14996572)
chr4 (335-410)||(9795490-9795564)
chr4 (379-478)||(14952085-14952183)
chr4 (142-330)||(15675095-15675283)
chr4 (142-330)||(10104256-10104444)
chr4 (67-114)||(22738263-22738310)
chr4 (209-452)||(26680338-26680590)
chr4 (240-330)||(54118250-54118340)
chr4 (209-330)||(122027-122146)
chr4 (30-74)||(5682783-5682827)
chr4 (30-82)||(20000680-20000732)
chr4 (67-115)||(22352260-22352308)
chr4 (30-74)||(25119464-25119508)
chr4 (372-410)||(8378486-8378524)
chr4 (191-286)||(13048271-13048365)
chr4 (239-410)||(16327841-16328023)
chr4 (355-452)||(16608972-16609069)
chr4 (191-286)||(31115748-31115842)
chr4 (33-74)||(34395215-34395256)
chr4 (30-82)||(7132312-7132364)
chr4 (55-115)||(26339002-26339062)
chr4 (239-330)||(10488728-10488819)
chr4 (240-330)||(13246597-13246687)
chr4 (36-82)||(14901193-14901239)
chr4 (35-77)||(41166191-41166233)
chr4 (41-81)||(15044794-15044834)
chr4 (41-81)||(15109590-15109630)
chr4 (41-81)||(15851597-15851637)
chr4 (45-81)||(40905174-40905210)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (30-504)||(153829-154306)
scaffold0023 (298-499)||(169738-169938)
scaffold0023 (243-496)||(36264-36514)
scaffold0023 (240-330)||(48765-48855)
[»] scaffold0213 (2 HSPs)
scaffold0213 (30-461)||(29119-29551)
scaffold0213 (442-504)||(29565-29626)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (67-478)||(1424-1837)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (67-488)||(2386-2810)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (67-482)||(10184-10601)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (153-504)||(1336-1690)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (67-504)||(7279-7718)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (67-504)||(33980-34420)
scaffold0012 (33-77)||(253234-253278)
scaffold0012 (240-330)||(247448-247538)
[»] scaffold1666 (1 HSPs)
scaffold1666 (55-323)||(1-270)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (210-504)||(20937-21228)
scaffold0139 (210-504)||(13883-14173)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (209-504)||(5034-5329)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (240-478)||(3890-4129)
[»] scaffold0066 (3 HSPs)
scaffold0066 (65-410)||(54408-54755)
scaffold0066 (142-410)||(45099-45369)
scaffold0066 (65-114)||(45003-45052)
[»] scaffold0183 (2 HSPs)
scaffold0183 (192-461)||(6718-6986)
scaffold0183 (72-115)||(6597-6640)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (205-410)||(54008-54212)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (240-504)||(3130-3395)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (298-504)||(10570-10778)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (209-484)||(13169-13438)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (240-478)||(1153-1388)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (191-496)||(31506-31807)
scaffold0008 (240-330)||(128175-128265)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (205-370)||(3547-3711)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (210-478)||(64372-64640)
scaffold0026 (240-410)||(107914-108084)
scaffold0026 (41-81)||(90085-90125)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (212-478)||(177-438)
scaffold0116 (33-74)||(30049-30090)
[»] scaffold0155 (2 HSPs)
scaffold0155 (192-478)||(23600-23884)
scaffold0155 (67-115)||(23962-24010)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (379-504)||(130880-131005)
scaffold0028 (240-330)||(89460-89550)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (192-410)||(7330-7547)
scaffold0003 (67-115)||(7204-7252)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (209-410)||(9266-9462)
scaffold0215 (209-410)||(16164-16360)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (379-493)||(17127-17241)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (142-330)||(56105-56294)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (191-488)||(803-1100)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (240-478)||(5922-6160)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (306-410)||(12045-12149)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (207-330)||(3324-3447)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (335-410)||(13268-13342)
scaffold0032 (379-504)||(107980-108107)
scaffold0032 (33-74)||(13541-13582)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (240-410)||(34374-34556)
scaffold0075 (33-77)||(4899-4943)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (386-478)||(154282-154373)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (209-330)||(3588-3707)
scaffold0266 (209-330)||(1262-1381)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (191-330)||(13625-13763)
scaffold0132 (379-411)||(42677-42709)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (210-336)||(5668-5792)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (239-330)||(12279-12370)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (240-330)||(540-630)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (240-330)||(41815-41905)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (240-330)||(9016-9106)
scaffold0025 (209-330)||(148859-148978)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (209-330)||(19344-19463)
scaffold0195 (209-330)||(21428-21547)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (239-452)||(22706-22930)
scaffold0141 (239-452)||(26961-27185)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (244-330)||(8186-8272)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (240-330)||(48354-48444)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (240-330)||(51188-51278)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (240-330)||(123170-123260)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (209-330)||(36919-37038)
scaffold0077 (45-81)||(6514-6550)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (30-74)||(6339-6383)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (30-74)||(31536-31580)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (30-74)||(41264-41308)
scaffold0078 (239-330)||(37072-37163)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (33-77)||(77092-77136)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (239-452)||(1455-1679)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (209-330)||(9016-9135)
[»] scaffold1734 (1 HSPs)
scaffold1734 (33-74)||(1357-1398)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (33-74)||(162435-162476)
scaffold0016 (33-64)||(166523-166554)
scaffold0016 (33-77)||(116758-116802)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (41-81)||(2421-2461)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (33-64)||(171865-171896)
scaffold0001 (33-64)||(177568-177599)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (379-452)||(837-910)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (379-452)||(9841-9914)
[»] scaffold0253 (2 HSPs)
scaffold0253 (45-81)||(7372-7408)
scaffold0253 (45-81)||(16797-16833)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (41-81)||(2557-2597)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (242-330)||(41898-41986)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (45-81)||(1308-1344)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (45-81)||(23913-23949)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (33-73)||(271985-272025)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 436; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 18060057 - 18059582
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  18060057 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 18059958  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18059957 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 18059858  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18059857 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 18059758  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18059757 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattatacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccta 18059658  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18059657 acccttgcttcaattcagctcctaggtcaccccaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 18059582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 504
Target Start/End: Original strand, 17004595 - 17005070
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17004595 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 17004694  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17004695 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 17004794  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17004795 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 17004894  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  17004895 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 17004994  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17004995 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 17005070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 38055390 - 38054915
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  38055390 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 38055291  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38055290 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 38055191  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  38055190 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaataacatcacagtaaaagcacgaatttaacaacaa 38055091  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  38055090 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaagatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 38054991  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38054990 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 38054915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 153 - 504
Target Start/End: Original strand, 17148647 - 17149000
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 251  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17148647 atatgatttacatctcatttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 17148746  T
Q  252 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17148747 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 17148846  T
Q  352 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaa-cccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcc 450  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17148847 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaaccccccttacctttgaagttgattatccccaacccttgcttcaattcagctcc 17148946  T
Q  451 taggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17148947 tatgtcaccccacttgattcctcaagctttcccttcaaccctcttgttcttctc 17149000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 78 - 452
Target Start/End: Original strand, 46523394 - 46523768
Alignment:
Q  78 tcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatc 177  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46523394 tcaatccataattaagtatacccaagtcatgattcactcacaacagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcatttcaatc 46523493  T
Q  178 aaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatc 276  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  46523494 aaaacatatcaaatttcatcaatgaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataacataaacatc 46523593  T
Q  277 aattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  46523594 aattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-atgga 46523692  T
Q  377 acatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||| |||| | ||||||    
T  46523693 acatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgctttaatttatctccta 46523768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 210 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 19962617 - 19962323
Alignment:
Q  210 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaag 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  19962617 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattccacccataaacataccataatcatcaattcaaacacaagaaaatagcattacagcaag 19962518  T
Q  310 agcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 409  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19962517 agcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 19962418  T
Q  410 ttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    |||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19962417 ttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcgcccaaattgaatccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 19962323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 209 - 498
Target Start/End: Original strand, 22227947 - 22228236
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 308  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||  |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22227947 tttcataacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaa 22228044  T
Q  309 gagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc 408  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22228045 gagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc 22228144  T
Q  409 tttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgtt 498  Q
    ||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||| | || | |||| ||||||||| ||||| | |||||||||| || ||||||    
T  22228145 tttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcttaagcttaccccaattgattcttcaagttattcccttcaaaacccttgtt 22228236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 209 - 449
Target Start/End: Original strand, 22232644 - 22232882
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 308  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||  |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22232644 tttcataacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaa 22232741  T
Q  309 gagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc 408  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22232742 gagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc 22232841  T
Q  409 tttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctc 449  Q
    ||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||    
T  22232842 tttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctc 22232882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 192 - 452
Target Start/End: Original strand, 22035568 - 22035827
Alignment:
Q  192 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaaga 291  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  22035568 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataaga 22035667  T
Q  292 aaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 391  Q
    ||  |||| || | |||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  ||||||||||||    
T  22035668 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgataa 22035766  T
Q  392 taactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 452  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||||    
T  22035767 taactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctccta 22035827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 192 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 7641069 - 7640810
Alignment:
Q  192 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaaga 291  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||     
T  7641069 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataag- 7640971  T
Q  292 aaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 391  Q
    ||| |||| || | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||| |  ||||||||||||    
T  7640970 aaacagcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataa 7640871  T
Q  392 taactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 452  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  7640870 taactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 7640810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 240 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 5072472 - 5072237
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 339  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  5072472 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaa 5072373  T
Q  340 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttc 439  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || | |||||||    
T  5072372 cccattttcatacaacttgagtaaatgcaaaaat--tacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaatctttgcttc 5072275  T
Q  440 aattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 478  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  5072274 aattcagctcctaagtcaccc-acttgattcctaaagct 5072237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 209 - 410
Target Start/End: Original strand, 2116393 - 2116589
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 308  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| |||||||| ||    
T  2116393 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaa 2116490  T
Q  309 gagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc 408  Q
     ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  2116491 aagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccatttttatacaacatgagaaaatgcaaa-at--tacatgattatgataatcactaacccctttacc 2116587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 209 - 410
Target Start/End: Original strand, 45051561 - 45051757
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 308  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  ||  || |||||||| ||    
T  45051561 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaa 45051658  T
Q  309 gagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc 408  Q
    || ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  45051659 gaacacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-at--cacatgattatgataaagactaacccccttacc 45051755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 240 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 18601202 - 18601052
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 339  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  18601202 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcatgaatttagcatgaattgttcatcaa 18601103  T
Q  340 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataat 392  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||    
T  18601102 cccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat--tacatgattgtgataat 18601052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 379 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 15861358 - 15861258
Alignment:
Q  379 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctag-gtcacccaaattgattcctcaagc 477  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||  | | || ||||||||||||||||    
T  15861358 atgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctagacttatcccaattgattcctcaagc 15861259  T
Q  478 t 478  Q
    |    
T  15861258 t 15861258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 388 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 18598914 - 18598845
Alignment:
Q  388 ataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcac 458  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  18598914 ataataactaacccccttaccttagaagaagatta-acccaactcttgcttcaattcagctcctaagtcac 18598845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 330
Target Start/End: Original strand, 20913168 - 20913287
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 308  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |||| | ||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||       
T  20913168 tttcataacttatcatttttacata-tatgaa-catgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttg 20913265  T
Q  309 gagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20913266 gagcacgaatttagcaacaatt 20913287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 330
Target Start/End: Original strand, 20931483 - 20931602
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 308  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |||| | ||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||       
T  20931483 tttcataacttatcatttttacata-tatgaa-catgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttg 20931580  T
Q  309 gagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20931581 gagcacgaatttagcaacaatt 20931602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 240 - 330
Target Start/End: Original strand, 20445846 - 20445936
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| |||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  20445846 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaatt 20445936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 13377129 - 13377085
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatca 77  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  13377129 ttcaccaatttcacaaaaccgccaacaacaattcatttctcatca 13377085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 21650339 - 21650295
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21650339 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctca 21650295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 330
Target Start/End: Original strand, 20531611 - 20531701
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || |||  ||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  20531611 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacatttggagcacgaatttagcaacaatt 20531701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 20893722 - 20893632
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||||    
T  20893722 aacatgtaatttcaacaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcaagaatttagcaacaatt 20893632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 37844546 - 37844456
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   ||||| ||||||||||||||||    
T  37844546 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcatgaatttagcaacaatt 37844456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Original strand, 17148524 - 17148576
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaat 82  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  17148524 aacttcatcaatttcacaaaaccaccaccaacatcttatttctcatcaacaat 17148576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 73
Target Start/End: Original strand, 20177133 - 20177173
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctc 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20177133 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctc 20177173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 115
Target Start/End: Original strand, 22035442 - 22035490
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 115  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22035442 atttttcatcatcaatccataattaagtatacccaagttataattcact 22035490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 329
Target Start/End: Original strand, 41394360 - 41394478
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 308  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||||| ||||| |  || ||| ||||| ||       
T  41394360 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaacttcaccaacaatcatacaattatcatcaatttatgcatacaaacatatcatcatagttg 41394457  T
Q  309 gagcacgaatttagcaacaat 329  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  41394458 gagcacgaatttagcaacaat 41394478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 44035270 - 44035226
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  44035270 aacttcaccaattgcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 44035226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 452
Target Start/End: Original strand, 51452765 - 51452882
Alignment:
Q  336 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaaccct 433  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || ||||||||| |||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||      
T  51452765 tcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattaagataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaaccta 51452863  T
Q  434 tgcttcaattcagctccta 452  Q
     ||||||||| ||||||||    
T  51452864 ggcttcaatttagctccta 51452882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 114
Target Start/End: Original strand, 20254311 - 20254353
Alignment:
Q  72 tcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcac 114  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  20254311 tcatcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcac 20254353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 7641195 - 7641147
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 115  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  7641195 atttttcatcatcaatccataattaagtacacccaagttataattcact 7641147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 428; Significance: 0; HSPs: 42)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 504
Target Start/End: Original strand, 49232393 - 49232868
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  49232393 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 49232492  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49232493 ttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 49232592  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49232593 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 49232692  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  49232693 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 49232792  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49232793 acccttgcttcaattcagctcataggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 49232868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 1468038 - 1467563
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  1468038 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 1467939  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1467938 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 1467839  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1467838 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 1467739  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  1467738 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 1467639  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1467638 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 1467563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 41 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 12265080 - 12264615
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataac 140  Q
    ||||||||||| || |||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  || | | |||||||| | |  |||    
T  12265080 tttcacaaaacaac-aacaacatctcatttctcatcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaac 12264982  T
Q  141 cacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa--tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttg 238  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12264981 aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatcaaaatttcatcaattaagtataatctcataacttaacatttatacatactttg 12264882  T
Q  239 aaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatca 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12264881 aaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatca 12264782  T
Q  339 acccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgctt 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12264781 acccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaatcccaacctttgctt 12264682  T
Q  439 caattcagctcctaggtca-cccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12264681 caattcagctcctaggtcaccccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 12264615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 67 - 499
Target Start/End: Original strand, 25058733 - 25059168
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatc 166  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||| || ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  25058733 atttctcatcatcaattcacaattaagtatactcaaatcatgattcactcacaatagcataagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatc 25058832  T
Q  167 tcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacata 265  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25058833 tcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacata 25058932  T
Q  266 ccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaat 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25058933 ccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaat 25059032  T
Q  366 gcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaat 464  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||   ||||||||||||||||||| || | |||| |||    
T  25059033 gcaaaaattgtgcatgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaatttttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaat 25059132  T
Q  465 tgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttc 499  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||    
T  25059133 tgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttc 25059168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 33 - 488
Target Start/End: Original strand, 22275168 - 22275626
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttat-ttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagtt 131  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||  | || | ||||| ||   || ||||| | || ||| ||||||||    
T  22275168 ttcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacctaagcaatgattcattcacaataacatcagtt 22275267  T
Q  132 gacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatac 230  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  22275268 aacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcatgacttaacatttatac 22275367  T
Q  231 atactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22275368 atactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatggcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 22275467  T
Q  331 gttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaac 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||    
T  22275468 gttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccttaac 22275567  T
Q  431 ccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaa 488  Q
      ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22275568 ttttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcctcaagctattcccttcaa 22275626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 33 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 15468637 - 15468162
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttat-ttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagtt 131  Q
    ||||| |||||||| ||| || ||||||||||| |  |||||||||||||| ||  | || | ||||||||   || ||||| | || ||| ||||||||    
T  15468637 ttcacaaatttcaccaaaacaacaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcattcacaataacatcagtt 15468538  T
Q  132 gacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatac 230  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  15468537 aacaataacaacatcaatggaatatgaattacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcatgacttaacatttatac 15468438  T
Q  231 atactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15468437 atactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcatagcaagagcacgaatttagcaacaatt 15468338  T
Q  331 gttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaac 430  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||     
T  15468337 gttcctcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaatttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaat 15468238  T
Q  431 ccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
     |||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  15468237 tcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 15468162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 67 - 478
Target Start/End: Original strand, 5228307 - 5228719
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatc 166  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  5228307 atttctcataatcaattcacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacacc 5228406  T
Q  167 tcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacata 265  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5228407 tcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatctcataacttaacatttatacatattttgaaacatgtaatttcacccacaaacata 5228506  T
Q  266 ccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaat 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  5228507 ccataatcatcaattcatgcacaaggaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa-tgttcatcaacccattttcataacacatgagaaaat 5228605  T
Q  366 gcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaat 464  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||| ||||||||||||||| || | |||| |||    
T  5228606 gcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgtttcaattcagctcctaagcttaccccaat 5228705  T
Q  465 tgattcctcaagct 478  Q
    ||||||||||||||    
T  5228706 tgattcctcaagct 5228719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 170 - 504
Target Start/End: Original strand, 12811938 - 12812273
Alignment:
Q  170 tttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacatacca 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  12811938 tttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataaattcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattccacccataaacatacca 12812037  T
Q  269 taatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgca 368  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12812038 taatcatcaattcaagcacaagaaaatagcattacagcaagagcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatacaatatgagaaaatgca 12812137  T
Q  369 aagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgat 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12812138 aagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttaaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgat 12812237  T
Q  469 tcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12812238 tccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 12812273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 55 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 12902364 - 12902008
Alignment:
Q  55 caacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaat 154  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| || |||| ||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  12902364 caacaacatcttatttctcatcattaatccacaattaagtatatccaaatcatgattcactcacaatagtatcagttaataataacaacatcaatggaat 12902265  T
Q  155 atgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttca 253  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902264 atgaattacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttaatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttca 12902165  T
Q  254 cccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcataca 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  12902164 cccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaaaaattattcatcaacccattttcataca 12902065  T
Q  354 acatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 410  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12902064 acatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt 12902008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 153 - 504
Target Start/End: Original strand, 18911073 - 18911427
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 251  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18911073 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 18911172  T
Q  252 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18911173 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 18911272  T
Q  352 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct 451  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||    
T  18911273 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcct 18911372  T
Q  452 -aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
     |  | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  18911373 aatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 18911427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 145 - 452
Target Start/End: Original strand, 54651529 - 54651837
Alignment:
Q  145 tcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaaca 243  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||  |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54651529 tcaatggaacatgaattacatctcatttcaacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtataatttcataacttaacatttatacatactttgcaaca 54651628  T
Q  244 tgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaaccca 343  Q
    || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54651629 tgcaatttcactcacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattattcatcaaccca 54651728  T
Q  344 ttttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaatt 443  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |  || |||||||||||||| || ||||||||  || |||  |||||||||||    
T  54651729 ttttcatacaacatgagaaattgcaaaaattgaacatgattatgatgaagacaaacccccttaccttagatgatgattaacccaaacttttgcttcaatt 54651828  T
Q  444 cagctccta 452  Q
     ||||||||    
T  54651829 aagctccta 54651837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 242 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 18897130 - 18896871
Alignment:
Q  242 catgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacc 341  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18897130 catgtaattccacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttatcaacaattgttcatcaacc 18897031  T
Q  342 cattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaa 441  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||    
T  18897030 cattttcatacaacatgagaaaatacaaaacttgtacatgattatgataataactaacccccttaccttggaagaagattaacccaaactcttgcttcaa 18896931  T
Q  442 ttcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttc 499  Q
    |||||||||| || | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||    
T  18896930 ttcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttc 18896871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 67 - 410
Target Start/End: Original strand, 44228979 - 44229323
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatc 166  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  || | | |||||||| | |  ||  || | ||||||| ||||||||||||    
T  44228979 atttttcatcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatggaacatgaatcacatc 44229078  T
Q  167 tcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacata 265  Q
    |||||| ||  | ||||||||||  ||||  |||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44229079 tcattttaacaacaacatatcaagattcactaattgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacata 44229178  T
Q  266 ccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaac-atgagaaaa 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  44229179 ccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacggatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa- 44229277  T
Q  365 tgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 410  Q
    || ||| |||  |  |||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  44229278 tgaaaaaatttgaattgattatgatgaaaacaaacccccttacctt 44229323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 499
Target Start/End: Original strand, 16821096 - 16821564
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||  | || | | ||||||   || |||||   | ||||  ||||     
T  16821096 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaccatttatttatcatcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaa 16821195  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatca--atttcatcaattaagcataatt-tcataacttaacattt 226  Q
     | ||| | |  |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||  | ||| ||  |  | |||| ||||| |||| |||  ||||| ||||||||||    
T  16821196 ataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcatagcttaacattt 16821295  T
Q  227 atacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaac 326  Q
     |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||| ||||| |  || ||| |||||||||||||||||| ||||  ||      
T  16821296 ttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatttatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacggatttgacata 16821393  T
Q  327 aattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcc 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |    
T  16821394 aattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagaagattaacac 16821490  T
Q  427 caacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttc 499  Q
     ||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| | |||||||||| || |||||||    
T  16821491 aaactcttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcttcaagttattcccttcaaaacccttgttc 16821564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 240 - 478
Target Start/End: Original strand, 55316387 - 55316622
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 339  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  55316387 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaa 55316486  T
Q  340 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttc 439  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  || || |||||||||    
T  55316487 cccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat--tacatgattgtgataataactaacccctttacctttgaagaagattaaccctaatccttgcttc 55316584  T
Q  440 aattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 478  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  55316585 aattcagctcctaagtcaccc-acttgattcctaaagct 55316622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 240 - 478
Target Start/End: Original strand, 41270243 - 41270478
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 339  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  41270243 aacatgtaattccaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaa 41270342  T
Q  340 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttc 439  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || |||||||||    
T  41270343 cccattttcatacaacatgagtagatgcaaaaat--tacatgattgtgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaatccttgcttc 41270440  T
Q  440 aattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 478  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  41270441 aattcagctcctaagtcaccc-acttgattcctaaagct 41270478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 55 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18897273 - 18897139
Alignment:
Q  55 caacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaat 154  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18897273 caacaacattttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataacaacatcaatggaat 18897174  T
Q  155 atgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa 189  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18897173 atgaattacatctcatttcaatcaaaacatatcaa 18897139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 240 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 15936723 - 15936553
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 339  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15936723 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaattgttcatcaa 15936624  T
Q  340 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  15936623 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattataatgataactaacccccatacctt 15936553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 240 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 15938565 - 15938395
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 339  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||   |  || ||| ||| ||||   ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  15938565 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgattacaaacatatcattacagttggagcacgtatttagtaacaattgttcatcaa 15938466  T
Q  340 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  15938465 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattataatgataactaacccccttacctt 15938395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 210 - 410
Target Start/End: Original strand, 15614973 - 15615168
Alignment:
Q  210 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaag 309  Q
    |||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| || |||||||||||||||| |  || ||| || ||||| |||    
T  15614973 ttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcctacaattatcatcaattcatgcatacaaatataacaccacagtaag 15615070  T
Q  310 agcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 409  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15615071 agcacaaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-at--tacatgattatgataaagactaacccccttacct 15615167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 142 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 11986361 - 11986172
Alignment:
Q  142 acatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaa 240  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||||  | ||| || |||  ||||  | || |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  11986361 acatcaatggaacatgaatcacatatcttttcaacaacaacttagcaaaattcactatttgagcacaatttcataacttgacattaatacatactttaaa 11986262  T
Q  241 acatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  11986261 acatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcattaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaatt 11986172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 209 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 14842686 - 14842392
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 308  Q
    |||||||||||| ||||| |||| | |||||| |||| ||||||||| |||| ||||| || ||| |||||||||||| |  || ||| ||||||||       
T  14842686 tttcataacttatcatttttacaca-tttgaa-catgcaatttcaccaacaatcatacaattatcttcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttg 14842589  T
Q  309 gagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacat--gagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccctta 406  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| | | || || ||||||||||  |||||  |||||||  || | |||||||||||||  |||||||||||||    
T  14842588 gagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaatt-catacaacatttgagaatttgcaaag--tgaagatgattatgataaagactaaccccctta 14842492  T
Q  407 cctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    |||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||| || | |||| ||||||| ||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  14842491 ccttagaagaagattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgatccctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 14842392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 379 - 504
Target Start/End: Original strand, 23492696 - 23492823
Alignment:
Q  379 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagc 477  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  23492696 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttacccaaattgattcctcaagc 23492795  T
Q  478 t-ttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    | ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  23492796 tattctcttcaaaacccttgttcttctc 23492823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 378 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 8268683 - 8268609
Alignment:
Q  378 catgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  8268683 catgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 8268609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 378 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 8275783 - 8275709
Alignment:
Q  378 catgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  8275783 catgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 8275709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 17912675 - 17912489
Alignment:
Q  142 acatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaatttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaa 240  Q
    ||||| || ||| |||||||| | |||| |||||  | |||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||  ||||| |||||| ||  ||    
T  17912675 acatcgattgaacatgaatcatagctcaattcaactacaacatatcaaattcatcaattttgcacaattttcataacttttcatttttacatattt--aa 17912578  T
Q  241 acatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
T  17912577 acatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatca-agttggagcacgaatttagcaacaatt 17912489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 209 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 51158143 - 51158024
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 308  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||       
T  51158143 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttg 51158046  T
Q  309 gagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  51158045 gagcacgaatttagcaacaatt 51158024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 15859120 - 15859030
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  15859120 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaatt 15859030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 240 - 336
Target Start/End: Original strand, 13839061 - 13839157
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcat 336  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||    
T  13839061 aacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattattcat 13839157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 240 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 12030243 - 12030153
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  12030243 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaatt 12030153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 16934273 - 16934229
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16934273 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctca 16934229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 17956284 - 17956240
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17956284 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 17956240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Original strand, 18910950 - 18911002
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaat 82  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  18910950 aacttcatcaatttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcatcaacaat 18911002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 2449335 - 2449111
Alignment:
Q  239 aaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcat-- 336  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||| | |||      
T  2449335 aaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattc 2449236  T
Q  337 --------caacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcc 426  Q
            |||||||||| ||| |||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  ||    
T  2449235 attcatttcaacccattt-catccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagacc 2449137  T
Q  427 caacccttgcttcaattcagctccta 452  Q
     ||||   ||||||||| ||||||||    
T  2449136 aaacctaggcttcaatttagctccta 2449111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 13955033 - 13954738
Alignment:
Q  191 ttcatcaattaagcataat-ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaa 289  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||| ||| || ||  |||||||||||| |||| |||| ||||| || |||| ||||||||||| |     
T  13955033 ttcatcaattgagcacaatattcataactgatcatttttacttattt--aaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatac 13954936  T
Q  290 gaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcat----------caacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgta 377  Q
     || ||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||| | |||          |||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || |    
T  13954935 -aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattcattcctttcaacccattt-catacaattcatgaaaaattgcaaagaatgaa 13954838  T
Q  378 catgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaag 476  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||| || |||||||| | ||||| |||||    
T  13954837 catgattatggtaaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctcacccaattggattcttcaag 13954738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Original strand, 13838854 - 13838895
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13838854 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 13838895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 33369185 - 33369149
Alignment:
Q  45 acaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33369185 acaaaaccaacaacaacaatttatttctcatcatcaa 33369149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 379 - 430
Target Start/End: Original strand, 30153265 - 30153316
Alignment:
Q  379 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaac 430  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||    
T  30153265 atgattatgataaaaactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaac 30153316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 240 - 330
Target Start/End: Original strand, 2049977 - 2050067
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||| || |||||||||||| ||| |  || ||| | ||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  2049977 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcaggcatacaaacatatcgtcacagttggagcacgaatttagcaacaatt 2050067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 210 - 476
Target Start/End: Original strand, 45860945 - 45861220
Alignment:
Q  210 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaag 309  Q
    ||||||||||| ||||| ||| || ||  |||||||||||| |||| |||| ||||| || |||| ||||||||||| |  || ||| ||||| ||   |    
T  45860945 ttcataacttatcatttttacttattt--aaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttgg 45861041  T
Q  310 agcacgaatttagcaacaattgttcat----------caacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataacta 397  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||          |||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || | ||||||||| |||  ||||    
T  45861042 agcacgaatttagcaacaattatccattcattcctttcaacccattt-catacaattcatgaaaaattgcaaagaatgaatatgattatggtaaagacta 45861140  T
Q  398 acccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaag 476  Q
    ||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||| || |||||||| | ||||| |||||    
T  45861141 acccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctcacccaattggattcttcaag 45861220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 81
Target Start/End: Original strand, 1990767 - 1990808
Alignment:
Q  40 atttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  1990767 attttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcatcaa 1990808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 379 - 452
Target Start/End: Original strand, 38168237 - 38168310
Alignment:
Q  379 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 452  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||    ||||||||| ||||||||    
T  38168237 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctccta 38168310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 416; Significance: 0; HSPs: 37)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 22226037 - 22225562
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22226037 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaagaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 22225938  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22225937 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatttcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 22225838  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  22225837 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagaaagagcacgaatttaacaacaa 22225738  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  22225737 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccatacctttgaagatgattattccta 22225638  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22225637 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttccattcaacactcttgttcttctc 22225562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 16376672 - 16376197
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  16376672 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 16376573  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16376572 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 16376473  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16376472 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 16376373  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  16376372 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 16376273  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16376272 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 16376197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 16383996 - 16383521
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  16383996 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 16383897  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16383896 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 16383797  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16383796 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 16383697  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  16383696 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 16383597  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16383596 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 16383521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 504
Target Start/End: Original strand, 10488656 - 10489131
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  10488656 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 10488755  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10488756 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 10488855  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10488856 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 10488955  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  10488956 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 10489055  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10489056 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 10489131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 16556438 - 16555973
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  16556438 aactttaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 16556339  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16556338 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 16556239  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16556238 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaggagcacgaatttaacaacaa 16556139  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  16556138 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 16556039  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactct 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16556038 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactct 16555973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 16632994 - 16632529
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  16632994 aactttaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 16632895  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16632894 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 16632795  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16632794 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaggagcacgaatttaacaacaa 16632695  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  16632694 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 16632595  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactct 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16632594 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactct 16632529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 41 - 499
Target Start/End: Original strand, 1555974 - 1556434
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataac 140  Q
    ||||||||||| || |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||    
T  1555974 tttcacaaaacaac-aacaacatctcatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcactcacaataacatcagttaacaataac 1556072  T
Q  141 cacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttga 239  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1556073 aacatcaatggaatatgaattacatctcatttcaattaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttga 1556172  T
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1556173 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 1556272  T
Q  340 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttc 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||   | ||| ||||||||    
T  1556273 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttaccttagaagaagattaacacaaactcttgcttc 1556372  T
Q  440 aattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttc 499  Q
    |||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||    
T  1556373 aattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttc 1556434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 67 - 478
Target Start/End: Original strand, 19610012 - 19610425
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatc 166  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  19610012 atttctcatcatcaatccataattaagtatacccaagtcatgattcactcacaacagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaactacatc 19610111  T
Q  167 tcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacata 265  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19610112 tcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaatgaagtataattttataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacata 19610211  T
Q  266 ccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaat 365  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19610212 ccataaccatcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaataattgttcatcaacccattttcatacaacatcagaaaat 19610311  T
Q  366 gcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaat 464  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||| || | |||| |||    
T  19610312 gcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaat 19610411  T
Q  465 tgattcctcaagct 478  Q
    ||||||||||||||    
T  19610412 tgattcctcaagct 19610425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 153 - 478
Target Start/End: Original strand, 16231972 - 16232297
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 251  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16231972 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 16232071  T
Q  252 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232072 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 16232171  T
Q  352 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct 451  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||    
T  16232172 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcct 16232271  T
Q  452 aggtcacccaaattgattcctcaagct 478  Q
    | ||||||| | ||||||||| |||||    
T  16232272 aagtcaccc-acttgattcctaaagct 16232297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 153 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 18086999 - 18086690
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 251  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18086999 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 18086900  T
Q  252 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18086899 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 18086800  T
Q  352 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct 451  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||    
T  18086799 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatactaataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcct 18086700  T
Q  452 aggtcaccca 461  Q
    | ||||||||    
T  18086699 aagtcaccca 18086690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 210 - 504
Target Start/End: Original strand, 19299375 - 19299669
Alignment:
Q  210 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaag 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  19299375 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattccacccataaacataccataatcatcaattcaaacacaagaaaatagcattacagcaag 19299474  T
Q  310 agcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 409  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19299475 agcacgaatttaacaacaattgtccatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 19299574  T
Q  410 ttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    |||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19299575 ttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcgcccaaattgaatccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 19299669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 246 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 22251648 - 22251390
Alignment:
Q  246 taatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccatt 345  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22251648 taatttcacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccatt 22251549  T
Q  346 ttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattca 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22251548 ttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccatacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattca 22251449  T
Q  446 gctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22251448 gctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttccattcaacactcttgttcttctc 22251390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 153 - 452
Target Start/End: Original strand, 23977849 - 23978149
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 251  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23977849 atatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 23977948  T
Q  252 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23977949 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 23978048  T
Q  352 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct 451  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| |||||||    
T  23978049 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacgcccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcct 23978148  T
Q  452 a 452  Q
    |    
T  23978149 a 23978149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 153 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 13620970 - 13620712
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 251  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13620970 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgcaattt 13620871  T
Q  252 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13620870 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 13620771  T
Q  352 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 410  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||    
T  13620770 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgaagaagactaacccccttacctt 13620712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 192 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 29869911 - 29869627
Alignment:
Q  192 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaaga 291  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||     
T  29869911 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacacttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataag- 29869813  T
Q  292 aaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtaca-tgattatgata 390  Q
    ||| |||| || | |||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| || | |||||||||||    
T  29869812 aaacagcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaa-attttaaattgattatgata 29869714  T
Q  391 ataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 478  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| |  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  29869713 ataactaacccccttaccttagaagaagatcaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattcctaaagct 29869627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 240 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 27654067 - 27653814
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 339  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  |  ||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  27654067 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaagcataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgatttgttcatcaa 27653968  T
Q  340 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttc 439  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||  | ||||||||||||    
T  27653967 tccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataatcactaaccccctcacctttgaagttgattatctctaacccttgcttc 27653869  T
Q  440 aattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttg 496  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  27653868 aattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 27653814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 142 - 406
Target Start/End: Original strand, 29665942 - 29666208
Alignment:
Q  142 acatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaa 240  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||  | ||| || |||  |||| ||||| || | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  29665942 acatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagtacaatttcataacttgacatttatgcatactttgaa 29666041  T
Q  241 acatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaac 340  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||| |    
T  29666042 acatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaatttaacaacaattatccatcacc 29666141  T
Q  341 ccattttcatacaac-atgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccctta 406  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||  |||| ||||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  29666142 ccattttcatacaacaatgagaaattgcaataattgaacatgattatgatgaagactaacccactta 29666208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 209 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 14626243 - 14625953
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 308  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| |||||||||||    
T  14626243 tttcataacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa 14626146  T
Q  309 gagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacat--gagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccctta 406  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||| | | || || || |||||||  |||||  || ||||  || | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  14626145 gagcacgaatttagcaataattatccataatcacaatt-caaacaacatttgagaatttgtaaag--tgaagatgattgtgataataactaaccccctta 14626049  T
Q  407 cctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  14626048 cctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctcaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctc 14625953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 240 - 453
Target Start/End: Original strand, 25175731 - 25175945
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 339  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25175731 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaa 25175830  T
Q  340 cccattttcatacaacatgag-aaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattat-tcccaacccttgct 437  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||    
T  25175831 tccattttcatacaacatgagaaaaatgcaaa-attatacatgattatggtaatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaaccccttgct 25175929  T
Q  438 tcaattcagctcctag 453  Q
    ||||||||||||||||    
T  25175930 tcaattcagctcctag 25175945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 42 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 33314505 - 33314387
Alignment:
Q  42 ttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataacc 141  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  33314505 ttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcacttacaatagcatcagttaacaataacc 33314406  T
Q  142 acatcaatggaatatgaat 160  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  33314405 acattaatggaatatgaat 33314387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 240 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 1650189 - 1650022
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 339  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  ||  || |||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  1650189 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagagcacgaatctagcatgaattgttcatcaa 1650090  T
Q  340 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1650089 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-at--tacatgattatgataaagactaacccccttacctt 1650022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 273 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 16825803 - 16825678
Alignment:
Q  273 catcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaga 372  Q
    |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16825803 catcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-a 16825705  T
Q  373 ttgtacatgattatgataataactaac 399  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||    
T  16825704 ttacacatgattatgataatcactaac 16825678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 193 - 504
Target Start/End: Original strand, 15862592 - 15862916
Alignment:
Q  193 catcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaaga 291  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||   ||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  |    
T  15862592 catcaattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattg--aacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaa 15862689  T
Q  292 aaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcat----------caacccattttcatacaaca--tgagaaaatgcaaagattgtaca 379  Q
    | ||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||| | |||          |||||||| |||||||||||  ||||||| |||||  | || |||    
T  15862690 acataacatcacagttagagcacgaatttagtaacaattatccatttattcaattcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatgaaca 15862789  T
Q  380 tgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct 478  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||| ||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  15862790 tgattatgatgaagactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcacctcctaagcttaccccaattgattcctcaagct 15862889  T
Q  479 -ttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
     ||| |||||| |||||||||| ||||    
T  15862890 attctcttcaaaactcttgttcttctc 15862916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 193 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 1657890 - 1657566
Alignment:
Q  193 catcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaaga 291  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||| |||||| |||||| ||   ||||||| |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    |    
T  1657890 catcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattg--aacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatccaa 1657793  T
Q  292 aaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcat----------caacccattttcatacaaca--tgagaaaatgcaaagattgtaca 379  Q
    | ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||          |||||||| |||||||||||  ||||||| |||||  | || |||    
T  1657792 acataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccatttattcaattcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatgaaca 1657693  T
Q  380 tgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct 478  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||| ||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  1657692 tgattatgatgaagactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgtttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagct 1657593  T
Q  479 -ttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
     ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  1657592 attctcttcaaaacccttgttcttctc 1657566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 379 - 452
Target Start/End: Original strand, 4991396 - 4991470
Alignment:
Q  379 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcc-caacccttgcttcaattcagctccta 452  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  4991396 atgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaactcttgcttcaattcagctccta 4991470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 394 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 16814930 - 16814837
Alignment:
Q  394 actaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaa 488  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||| ||||||||||    
T  16814930 actaaccctcttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccccacttgattgctaaagc-ttcccttcaa 16814837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 255
Target Start/End: Original strand, 27740903 - 27741021
Alignment:
Q  138 aaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactt 236  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||  |  || || |||  |||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27740903 aaccacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacgacttagcaaaattcaccaattgagcacaatttcataacttgacatttatacatactt 27741002  T
Q  237 tgaaacatgtaatttcacc 255  Q
     ||||||||||||||||||    
T  27741003 cgaaacatgtaatttcacc 27741021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 35009535 - 35009445
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  ||  || ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  35009535 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacttaacatcacagttagagcacgaatttagcaacaatt 35009445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 240 - 330
Target Start/End: Original strand, 23153614 - 23153704
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||   |||||||||||||| |||||||    
T  23153614 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagaaacaatt 23153704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Original strand, 16231849 - 16231901
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaat 82  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  16231849 aacttcatcaatttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcatcaacaat 16231901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 18381972 - 18381928
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatca 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18381972 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatca 18381928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 19983591 - 19983547
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19983591 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 19983547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Original strand, 23977726 - 23977778
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaat 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||    
T  23977726 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaataacatcttatttctcatcaacaat 23977778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 35015457 - 35015413
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  35015457 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 35015413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 18087122 - 18087070
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaat 82  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  18087122 aacttcatcaatttcacaaaaccaccaccaacatcttatttctcatcaacaat 18087070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 13621093 - 13621041
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaat 82  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||    
T  13621093 aacttcattaatttcacaaaaccaccaacaacatcttattgctcatcaacaat 13621041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 18629888 - 18629852
Alignment:
Q  45 acaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18629888 acaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 18629852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 400; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 504
Target Start/End: Original strand, 39060 - 39535
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  39060 aacttcaccaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 39159  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39160 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 39259  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39260 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 39359  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  39360 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 39459  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39460 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 39535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 210 - 504
Target Start/End: Original strand, 43137 - 43426
Alignment:
Q  210 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaag 309  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| |||| |||||||    
T  43137 ttcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatagaaacataacatcccagcaag 43234  T
Q  310 agcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgag-aaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc 408  Q
    |||||||||||  ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  43235 agcacgaatttgacatgaattgctcatcaacccattttcatacaacatgagaaaaatgcaaa-at--tacatgtttgtgatagtaactaacccccttacc 43331  T
Q  409 tttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||| ||||||| |  || ||| |||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  43332 tttgaagttgattatccttaatcctagcttcacttcagctcctagatcaccc-acttgattcctcaagcttcccctccaacactcttgttcttctc 43426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 400; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 504
Target Start/End: Original strand, 7822685 - 7823160
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  7822685 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 7822784  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7822785 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 7822884  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7822885 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 7822984  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  7822985 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 7823084  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7823085 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 7823160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 504
Target Start/End: Original strand, 7829996 - 7830471
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  7829996 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 7830095  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7830096 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 7830195  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7830196 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 7830295  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  7830296 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 7830395  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7830396 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 7830471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 504
Target Start/End: Original strand, 27176390 - 27176865
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27176390 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 27176489  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27176490 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 27176589  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27176590 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 27176689  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  27176690 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 27176789  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27176790 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 27176865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 27101936 - 27101461
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27101936 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 27101837  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101836 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 27101737  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27101736 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 27101637  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  27101636 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 27101537  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27101536 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 27101461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 27109284 - 27108809
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27109284 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 27109185  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27109184 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 27109085  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27109084 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 27108985  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  27108984 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 27108885  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27108884 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 27108809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 38784028 - 38783553
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  38784028 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 38783929  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38783928 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 38783829  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38783828 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 38783729  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  38783728 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 38783629  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38783628 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 38783553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 15951090 - 15950614
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  15951090 aacttcaccaatttcagaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcacttacaatagcatcag 15950991  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15950990 ttaacaataatcacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 15950891  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15950890 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 15950791  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |    
T  15950790 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaacccaa 15950691  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    || |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||| ||||    
T  15950690 actcttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcctcaagctatttccttcaaaacccttgttcttctc 15950614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 41 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 15760401 - 15759941
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataac 140  Q
    ||||||||||| || |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||| ||||||||    
T  15760401 tttcacaaaacaac-aacaacatctcatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcattattcactcacaataacatcagttaacaataac 15760303  T
Q  141 cacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttga 239  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15760302 aacatcaatggaatatgaattacatctcatttcaattaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttga 15760203  T
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15760202 aacatgtaatttcacccacaaacatatcataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaataattgttcatcaa 15760103  T
Q  340 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttc 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||   | ||| ||||||||    
T  15760102 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttaccttagaagaagattaacacaaactcttgcttc 15760003  T
Q  440 aattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttc 499  Q
    |||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||    
T  15760002 aattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttc 15759941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 153 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 18980197 - 18979872
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 251  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18980197 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 18980098  T
Q  252 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18980097 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 18979998  T
Q  352 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct 451  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||    
T  18979997 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcct 18979898  T
Q  452 aggtcacccaaattgattcctcaagct 478  Q
    | ||||||| | ||||||||| |||||    
T  18979897 aagtcaccc-acttgattcctaaagct 18979872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 153 - 478
Target Start/End: Original strand, 15927648 - 15927973
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 251  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15927648 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 15927747  T
Q  252 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 351  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  15927748 cacccacaagcataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgatcatcaatccattttcata 15927847  T
Q  352 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct 451  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||    
T  15927848 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcct 15927947  T
Q  452 aggtcacccaaattgattcctcaagct 478  Q
    | ||||||| | ||||||||| |||||    
T  15927948 aagtcaccc-acttgattcctaaagct 15927973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 153 - 452
Target Start/End: Original strand, 13758450 - 13758750
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 251  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13758450 atatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 13758549  T
Q  252 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13758550 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 13758649  T
Q  352 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct 451  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| |||||||    
T  13758650 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcct 13758749  T
Q  452 a 452  Q
    |    
T  13758750 a 13758750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 153 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 14251074 - 14250721
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 251  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14251074 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 14250975  T
Q  252 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 351  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14250974 cacccaaaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttaacaacaattgttcatcaacccattttcata 14250875  T
Q  352 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct 451  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| | | | ||| ||||||||||||||||||||    
T  14250874 caacatgagaaaatgcaaaaaatgaacatgattacgatgataactaacccccttaccttagaagaagataact-caaactcttgcttcaattcagctcct 14250776  T
Q  452 -aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
     |  | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  14250775 aatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 14250721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 240 - 504
Target Start/End: Original strand, 2437625 - 2437888
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 339  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |  | |||||||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |     
T  2437625 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcattat 2437724  T
Q  340 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttc 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2437725 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttc 2437823  T
Q  440 aattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  2437824 aattcagctcctaggtcaccccaattgattcctcaagctttcccttcaacactcctgttcttctc 2437888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 209 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 16479075 - 16478786
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 308  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| |||| ||| ||    
T  16479075 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcgcagtaa 16478978  T
Q  309 gagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc 408  Q
    |||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16478977 gagcacgaatctaacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-at--taaatgattatgataatcactaacccccttacc 16478881  T
Q  409 tttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||| ||||||| |  |||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  16478880 tttgaagttgattatccttaaccctagcttcacttcagctcctaggtcaccc-acttgattcctcaagcttcccctccaacactcttgttcttctc 16478786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 191 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 13911156 - 13910855
Alignment:
Q  191 ttcatcaattaagcataat-ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaa 289  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||| | |||| |||||||||||||| |||| ||||| || | |||||||||||||| |     
T  13911156 ttcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcata-tatgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattaacatcaattcatgcatac 13911059  T
Q  290 gaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgat 389  Q
     || ||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||    
T  13911058 aaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagaatatgcaaa-attacacatgattatgat 13910960  T
Q  390 aataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaac 489  Q
    ||| | |||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||    
T  13910959 aatcaataacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaac 13910862  T
Q  490 actcttg 496  Q
     ||||||    
T  13910861 cctcttg 13910855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 205 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 48622788 - 48622584
Alignment:
Q  205 ataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcaca 304  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48622788 ataatttcacaacttaacaattatgcatgctttgaa-catgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcaca 48622690  T
Q  305 gcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccct 404  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||  |  |||||||||| | ||| ||||||||    
T  48622689 gtaagagcacgaatttagcatcaattgttcatcaacccattttcgtaaaacatgagaaaatgcaaaaatttgaattgattatgatgaaaacaaaccccct 48622590  T
Q  405 tacctt 410  Q
    ||||||    
T  48622589 tacctt 48622584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 240 - 478
Target Start/End: Original strand, 10989577 - 10989814
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 339  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  10989577 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgatttgttcatcaa 10989676  T
Q  340 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttc 439  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  10989677 cccattttcatacaacatgagaatatgcaaa-attatacatgattatgataatcactaacccccatacctttgaagttgattatccctaacccttgcttc 10989775  T
Q  440 aattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 478  Q
    |||| |||||||| ||||||  | |||||||||||||||    
T  10989776 aattaagctcctatgtcacctcacttgattcctcaagct 10989814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 210 - 478
Target Start/End: Original strand, 13572816 - 13573079
Alignment:
Q  210 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaag 309  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||| |||| || || || |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||    
T  13572816 ttcataacttatcatttttacatattt--aaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaag 13572913  T
Q  310 agcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 409  Q
    |||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13572914 agcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat--tacatgattgtgataataactaacccccttacct 13573011  T
Q  410 ttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 478  Q
    | ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  13573012 tagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattcctaaagct 13573079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 192 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 10000505 - 10000288
Alignment:
Q  192 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaaga 291  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  10000505 tcatcaattaagcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataaga 10000406  T
Q  292 aaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 391  Q
    ||  | || || | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||| |  |||||||||| |    
T  10000405 aacaa-caacataacaagagcacgaatttgacataaattgttcatcaacccatttttatacaacatgagaagatgcaaaatttgaaattgattatgatga 10000307  T
Q  392 taactaacccccttacctt 410  Q
      || ||||||||||||||    
T  10000306 agacaaacccccttacctt 10000288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 240 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 18253931 - 18253761
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 339  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18253931 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaattgttcatcaa 18253832  T
Q  340 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18253831 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattataatgataactaacccccttacctt 18253761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 192 - 410
Target Start/End: Original strand, 16418618 - 16418835
Alignment:
Q  192 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaaga 291  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||     
T  16418618 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataag- 16418716  T
Q  292 aaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 391  Q
     || |||| || | |||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  |||||||||| |    
T  16418717 caacagcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgatga 16418816  T
Q  392 taactaacccccttacctt 410  Q
     ||| ||||||||||||||    
T  16418817 aaacaaacccccttacctt 16418835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 191 - 452
Target Start/End: Original strand, 13321134 - 13321407
Alignment:
Q  191 ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaag 290  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |      
T  13321134 ttcaccaattgagcacaatttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcataca 13321233  T
Q  291 aaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttca----------tcaacccattttcatacaac--atgagaaaatgcaaagattgtac 378  Q
    || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||          ||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||  | || ||    
T  13321234 aacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccacttattcaattcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatgaac 13321333  T
Q  379 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 452  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| ||||   |||||| || ||||||||    
T  13321334 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacctaggcttcactttagctccta 13321407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Original strand, 15862174 - 15862257
Alignment:
Q  327 aattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15862174 aattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattatacatgattatgataataactaacccccttacctt 15862257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 379 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 15516793 - 15516719
Alignment:
Q  379 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctag 453  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15516793 atgattatgataaagactaacccccttacatttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctag 15516719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 209 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 47481156 - 47481037
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 308  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||  |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||  |    
T  47481156 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtta 47481059  T
Q  309 gagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  47481058 gagcacgaatttagcaacaatt 47481037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 452
Target Start/End: Original strand, 16211904 - 16212144
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 308  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||| ||||||||  |||| | ||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||       
T  16211904 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgcaatttcacaaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttg 16212001  T
Q  309 gagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc 408  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || | |  ||||||||||||  |||| | || | | ||   |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16212002 gagcacgaatttagcaacaattgtccat-aagcaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacc 16212100  T
Q  409 tttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 452  Q
    || || || ||||| |||||||    ||||||||| ||||||||    
T  16212101 ttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctccta 16212144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 14251197 - 14251145
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaat 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  14251197 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcatcaacaat 14251145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 30262226 - 30262002
Alignment:
Q  239 aaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcat-- 336  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||| | |||      
T  30262226 aaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattc 30262127  T
Q  337 --------caacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcc 426  Q
            |||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  ||    
T  30262126 attcatttcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagacc 30262028  T
Q  427 caacccttgcttcaattcagctccta 452  Q
     ||||   ||||||||| ||||||||    
T  30262027 aaacctaggcttcaatttagctccta 30262002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Original strand, 371045 - 371089
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  371045 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctca 371089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Original strand, 13758327 - 13758379
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaat 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||    
T  13758327 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaataacatcttatttctcatcaacaat 13758379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Original strand, 15927525 - 15927577
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaat 82  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  15927525 aacttcatcaatttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcatcaacaat 15927577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 336 - 452
Target Start/End: Original strand, 7293289 - 7293406
Alignment:
Q  336 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaaccct 433  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||      
T  7293289 tcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaaccta 7293387  T
Q  434 tgcttcaattcagctccta 452  Q
     ||||||||| ||||||||    
T  7293388 ggcttcaatttagctccta 7293406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 452
Target Start/End: Original strand, 11516393 - 11516617
Alignment:
Q  239 aaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcat-- 336  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||| | |||      
T  11516393 aaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattc 11516492  T
Q  337 --------caacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcc 426  Q
            |||||||||| ||| |||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  ||    
T  11516493 attcatttcaacccattt-catccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagacc 11516591  T
Q  427 caacccttgcttcaattcagctccta 452  Q
     ||||   ||||||||| ||||||||    
T  11516592 aaacctaggcttcaatttagctccta 11516617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 15441661 - 15441437
Alignment:
Q  239 aaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcat-- 336  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||| | |||      
T  15441661 aaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattc 15441562  T
Q  337 --------caacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcc 426  Q
            |||||||||| ||| |||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  ||    
T  15441561 attcatttcaacccattt-catccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagacc 15441463  T
Q  427 caacccttgcttcaattcagctccta 452  Q
     ||||   ||||||||| ||||||||    
T  15441462 aaacctaggcttcaatttagctccta 15441437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 11580835 - 11580745
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || |||  |||||||   ||||||||||||||||| ||||    
T  11580835 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaataatt 11580745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 13037110 - 13037020
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    |||||| ||||||| | |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  13037110 aacatgcaatttcatcaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaatt 13037020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 111
Target Start/End: Original strand, 15852425 - 15852494
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataatt 111  Q
    ||||||||||| || |||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  15852425 tttcacaaaacaac-aacaacatctcatttctcatcatcaatccataattatgtatacccaagtcataatt 15852494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 10000631 - 10000583
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 115  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  10000631 atttttcatcatcaatccataattaagtatacccaagttataattcact 10000583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 115
Target Start/End: Original strand, 16418492 - 16418540
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 115  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  16418492 atttttcatcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcact 16418540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 17224227 - 17224183
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatca 77  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  17224227 ttcaccaattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatca 17224183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 18980320 - 18980268
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaat 82  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  18980320 aacttcatcaatttcacaaaaccaccaccaacatcttatttctcatcaacaat 18980268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 14113959 - 14113904
Alignment:
Q  355 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 410  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14113959 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 14113904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 14423629 - 14423555
Alignment:
Q  336 tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 410  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14423629 tcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataa-gactaacccccttacctt 14423555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 1937300 - 1937256
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  1937300 aacttcatcaatttcacaaaaccaccaacaataatccatttctca 1937256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 81
Target Start/End: Original strand, 13377495 - 13377535
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  13377495 tttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 13377535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 17947873 - 17947837
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatca 77  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17947873 tttcacaaaaccaacaacaacaatttatttcacatca 17947837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 400; Significance: 0; HSPs: 47)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 11231637 - 11231162
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11231637 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 11231538  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11231537 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 11231438  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11231437 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 11231338  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  11231337 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 11231238  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11231237 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 11231162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 22513484 - 22513009
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22513484 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 22513385  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22513384 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 22513285  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22513284 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 22513185  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  22513184 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 22513085  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22513084 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 22513009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 24686080 - 24685605
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24686080 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacctaaatcataattcacttacaatagcatcag 24685981  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24685980 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaaacacatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 24685881  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24685880 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 24685781  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  24685780 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 24685681  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24685680 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacacttttgttcttctc 24685605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 28776106 - 28775631
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  28776106 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 28776007  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28776006 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 28775907  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28775906 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 28775807  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  28775806 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 28775707  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28775706 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 28775631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 452
Target Start/End: Original strand, 12728349 - 12728772
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||    
T  12728349 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcag 12728448  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12728449 ttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaataaaaacatatcaaatttcatcaattaagaataatttcataacttaacatttat 12728548  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12728549 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 12728648  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || |    
T  12728649 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaa 12728748  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctccta 452  Q
    || |||||||||||| ||||||||    
T  12728749 actcttgcttcaatttagctccta 12728772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 452
Target Start/End: Original strand, 34824432 - 34824855
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||    
T  34824432 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcag 34824531  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34824532 ttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaataaaaacatatcaaatttcatcaattaagaataatttcataacttaacatttat 34824631  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34824632 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 34824731  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  || |    
T  34824732 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataatcactaacccccttaccttagaagaagattaacccaa 34824831  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctccta 452  Q
    || |||||||||||| ||||||||    
T  34824832 actcttgcttcaatttagctccta 34824855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 41 - 504
Target Start/End: Original strand, 16935561 - 16936027
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataac 140  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||| || ||||||||    
T  16935561 tttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcatttaacaataac 16935660  T
Q  141 cacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttga 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16935661 cacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaataaagtataatttcataacttaacatttatacatactttga 16935760  T
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 339  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  16935761 aacatgtaatttcacgcacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcatgaatttaacaacaattgttcatcaa 16935860  T
Q  340 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttc 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||| ||||    
T  16935861 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactctttcttc 16935960  T
Q  440 aattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    |||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  16935961 aattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 16936027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 41 - 504
Target Start/End: Original strand, 17006221 - 17006687
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataac 140  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||| || ||||||||    
T  17006221 tttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcatttaacaataac 17006320  T
Q  141 cacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttga 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17006321 cacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaataaagtataatttcataacttaacatttatacatactttga 17006420  T
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 339  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  17006421 aacatgtaatttcacgcacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcatgaatttaacaacaattgttcatcaa 17006520  T
Q  340 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttc 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||| ||||    
T  17006521 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactctttcttc 17006620  T
Q  440 aattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    |||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  17006621 aattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 17006687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 55 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 23778319 - 23777963
Alignment:
Q  55 caacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaat 154  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23778319 caacaacatcttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataacaacatcaatggaat 23778220  T
Q  155 atgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttca 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23778219 atgaattacatctcatttcaatcaaatcatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttca 23778120  T
Q  254 cccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcataca 353  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23778119 tccacaaacataccataatcatcaattcatgcataagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcataca 23778020  T
Q  354 acatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 410  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  23778019 acatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccctttacctt 23777963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 153 - 452
Target Start/End: Original strand, 8943926 - 8944226
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 251  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8943926 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 8944025  T
Q  252 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 351  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8944026 cacccacaaatataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 8944125  T
Q  352 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct 451  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| |||||||    
T  8944126 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcct 8944225  T
Q  452 a 452  Q
    |    
T  8944226 a 8944226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 153 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 42178145 - 42177791
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 251  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42178145 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 42178046  T
Q  252 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 351  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42178045 cacccaaaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 42177946  T
Q  352 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct 451  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |  ||| |||||||||||||||| |||    
T  42177945 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacctaaactcttgcttcaattcagcccct 42177846  T
Q  452 -aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
     |  | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  42177845 aatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 42177791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 153 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 12636044 - 12635744
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 251  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12636044 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 12635945  T
Q  252 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12635944 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacctattttcata 12635845  T
Q  352 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct 451  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| |||||||    
T  12635844 caacatgaggaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcct 12635745  T
Q  452 a 452  Q
    |    
T  12635744 a 12635744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 153 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 3798779 - 3798482
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 251  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3798779 atatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 3798680  T
Q  252 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3798679 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 3798580  T
Q  352 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctc 449  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| |||||    
T  3798579 caacatgagaaaatgcaaaaattatacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctc 3798482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 153 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 12641818 - 12641518
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 251  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12641818 atatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 12641719  T
Q  252 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 351  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12641718 cagccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 12641619  T
Q  352 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct 451  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||  || ||| |||||||||||| |||||||    
T  12641618 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcct 12641519  T
Q  452 a 452  Q
    |    
T  12641518 a 12641518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 67 - 363
Target Start/End: Original strand, 21141889 - 21142187
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatc 166  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||  || | | |||||||| | |  ||  || | ||||||| ||||||||||||    
T  21141889 atttttcatcatcaatccataattatgtatacccaagtcgtaattcacccacaacaacatcagttaatagcaataaccttaatggaacatgaatcacatc 21141988  T
Q  167 tcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacata 265  Q
    |||||| ||  | ||||||||||  ||||  |||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21141989 tcattttaacaacaacatatcaagattcactaattgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacata 21142088  T
Q  266 ccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaa-catgagaaa 363  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21142089 ccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa 21142187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 240 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 19886745 - 19886484
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 339  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19886745 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaa 19886646  T
Q  340 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttc 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  || ||| | |||    
T  19886645 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagtttc 19886547  T
Q  440 aattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19886546 aattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctc 19886484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 192 - 452
Target Start/End: Original strand, 23774257 - 23774516
Alignment:
Q  192 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaaga 291  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  23774257 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataaga 23774356  T
Q  292 aaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 391  Q
    ||  |||| || | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||| || ||||||||||||    
T  23774357 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaacttgattatgataa 23774455  T
Q  392 taactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 452  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  23774456 taactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 23774516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 192 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 5888765 - 5888548
Alignment:
Q  192 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaaga 291  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||     
T  5888765 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataag- 5888667  T
Q  292 aaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 391  Q
     || |||| || | |||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  |||||||||| |    
T  5888666 caacagcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgatga 5888567  T
Q  392 taactaacccccttacctt 410  Q
     ||| ||||||||||||||    
T  5888566 aaacaaacccccttacctt 5888548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 209 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 7507969 - 7507758
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 308  Q
    ||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7507969 tttcataacttattatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaa 7507872  T
Q  309 gagcacgaatttagcaacaattgttca----------tcaacccattttcatacaac--atgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataact 396  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||          ||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||  | || ||||||||||||| |  |||    
T  7507871 gagcacgaatttagcaataattattcattcattcaattcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatgaacatgattatgatgaagact 7507772  T
Q  397 aacccccttacctt 410  Q
    ||||||||||||||    
T  7507771 aacccccttacctt 7507758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 379 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 24826646 - 24826531
Alignment:
Q  379 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 478  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||     
T  24826646 atgattatgatgatgactaacccctttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc- 24826549  T
Q  479 ttcccttcaacactcttg 496  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  24826548 ttcccttcaaccctcttg 24826531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 379 - 452
Target Start/End: Original strand, 25213372 - 25213446
Alignment:
Q  379 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcc-caacccttgcttcaattcagctccta 452  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  25213372 atgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaactcttgcttcaattcagctccta 25213446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 452
Target Start/End: Original strand, 462876 - 463116
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 308  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||       
T  462876 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcacagttg 462973  T
Q  309 gagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc 408  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| || | |  ||||||||||||  ||||||  | | | ||   |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  462974 gagcacgaatttagcaacaattatccat-aagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacc 463072  T
Q  409 tttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 452  Q
    || ||  | ||||| |||||||    ||||||||| ||||||||    
T  463073 ttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctccta 463116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 25265486 - 25265396
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  25265486 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaatt 25265396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Original strand, 22283911 - 22283955
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22283911 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaattcatttctca 22283955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 42178268 - 42178216
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaat 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  42178268 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcatcaacaat 42178216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 19689498 - 19689316
Alignment:
Q  239 aaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcat-- 336  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||| | |||      
T  19689498 aaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattc 19689399  T
Q  337 --------caacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 410  Q
            |||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19689398 attcatttcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 19689316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 3798902 - 3798850
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaat 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||    
T  3798902 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaataacatcttatttctcatcaacaat 3798850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 12636167 - 12636115
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaat 82  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  12636167 aacttcatcaatttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcatcaacaat 12636115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Original strand, 22274678 - 22274722
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22274678 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 22274722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 12641941 - 12641894
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatca 77  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  12641941 aacttcatcaatttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcatca 12641894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 14906537 - 14906313
Alignment:
Q  239 aaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcat-- 336  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||| | |||      
T  14906537 aaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattc 14906438  T
Q  337 --------caacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcc 426  Q
            |||||||||| ||| |||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  ||    
T  14906437 attcatttcaacccattt-catccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagacc 14906339  T
Q  427 caacccttgcttcaattcagctccta 452  Q
     ||||   ||||||||| ||||||||    
T  14906338 aaacctaggcttcaatttagctccta 14906313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 210 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 17396776 - 17396568
Alignment:
Q  210 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaag 309  Q
    ||||||||||| ||||| ||| || ||  ||||||||||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||| |  || ||| ||||| ||   |    
T  17396776 ttcataacttatcatttttacttattt--aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttgg 17396680  T
Q  310 agcacgaatttagcaacaattgttcat----------caacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataacta 397  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||          |||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || ||||||||||| |||  ||||    
T  17396679 agcacgaatttagcaacaattatccattcattcatgtcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatggtaaagacta 17396581  T
Q  398 acccccttacctt 410  Q
    |||||||||||||    
T  17396580 acccccttacctt 17396568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 452
Target Start/End: Original strand, 23820237 - 23820461
Alignment:
Q  239 aaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcat-- 336  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||| | |||      
T  23820237 aaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattc 23820336  T
Q  337 --------caacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcc 426  Q
            |||||||||| ||| |||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  ||    
T  23820337 attcatttcaacccattt-catccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagacc 23820435  T
Q  427 caacccttgcttcaattcagctccta 452  Q
     ||||   ||||||||| ||||||||    
T  23820436 aaacctaggcttcaatttagctccta 23820461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 330
Target Start/End: Original strand, 8891409 - 8891499
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || |||  |||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  8891409 aacatgtaatttcgccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaatt 8891499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 115
Target Start/End: Original strand, 23774106 - 23774179
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 115  Q
    ||||||||||| || |||||||  | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23774106 tttcacaaaacaac-aacaacatctcatttttcatcatcaatccataattaagtatacccaagttataattcact 23774179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 43643053 - 43642963
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| |||||||    |||||| |||||||||||||||    
T  43643053 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacaaatttagcaacaatt 43642963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 75
Target Start/End: Original strand, 8943803 - 8943848
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcat 75  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  8943803 aacttcatcaatttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcat 8943848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 241 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 20627408 - 20627319
Alignment:
Q  241 acatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |||| |  || ||| ||||||||   ||||||||||||| ||||||||    
T  20627408 acatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcgtgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaatt 20627319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Original strand, 25601982 - 25602023
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  25601982 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 25602023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 36982566 - 36982447
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 308  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||  ||| | ||| || |||||||||||||| | |  || ||| ||||||||       
T  36982566 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccagcaatcttacaattatcatcaattcatgaatacaaacatatcatcacagttg 36982469  T
Q  309 gagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  36982468 gagcacgaatttagcaacaatt 36982447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 81
Target Start/End: Original strand, 67958 - 67998
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  67958 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 67998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 5888891 - 5888843
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 115  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  5888891 atttttcatcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcact 5888843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 24341583 - 24341395
Alignment:
Q  142 acatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttga 239  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||| |||||  | ||| || |||  |||| ||||| |||| ||||| || ||||| |||||| |||||| ||       
T  24341583 acatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattg-- 24341486  T
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||    |||| ||||||||||||||||    
T  24341485 aacatataatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcatgaatttagcaacaatt 24341395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 240 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 19794800 - 19794710
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || || ||||||||||||| |  || ||| ||||||||   ||||||||||||| | ||||||    
T  19794800 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacgacaatt 19794710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 452
Target Start/End: Original strand, 20015304 - 20015401
Alignment:
Q  355 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 452  Q
    ||||| ||| |||||||| || ||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  20015304 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgatcatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 20015401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 23821886 - 23821846
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  23821886 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaa 23821846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 23830965 - 23830925
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  23830965 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaa 23830925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 396; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 504
Target Start/End: Original strand, 31266 - 31741
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  31266 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 31365  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31366 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 31465  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31466 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 31565  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  31566 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 31665  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31666 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 31741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 30 - 361
Target Start/End: Original strand, 39603 - 39935
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||    
T  39603 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaaattatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcag 39702  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39703 ttaacaataacaacatcaatgaaatatgaataacatctcatttcaaaaaaaacatatcaaatttcatcaattaagaataatttcataacttaacatttat 39802  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39803 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaaaataccataatcatcaattcatgcacaggaaaatagaatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 39902  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgaga 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39903 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgaga 39935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 396; Significance: 0; HSPs: 33)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 271659 - 271184
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  271659 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 271560  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  271559 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 271460  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  271459 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 271360  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  271359 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 271260  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  271259 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 271184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 504
Target Start/End: Original strand, 644261 - 644736
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  644261 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 644360  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  644361 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 644460  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  644461 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 644560  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  644561 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 644660  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  644661 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 644736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 504
Target Start/End: Original strand, 829996 - 830471
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  829996 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 830095  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  830096 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 830195  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  830196 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 830295  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  830296 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 830395  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  830396 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 830471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 22089093 - 22088618
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22089093 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 22088994  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22088993 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 22088894  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22088893 acatactttgaaacatgtaatttcacctataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 22088794  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  22088793 ttgttcaccaacacattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgatgataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 22088694  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22088693 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 22088618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 15319458 - 15318983
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15319458 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 15319359  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15319358 ttaacaataaccacattaatggaacatgaatcacatctcttttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataactcaacatttat 15319259  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15319258 acatacttagaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagtatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 15319159  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  15319158 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 15319059  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15319058 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagcttttccttcaacactcttgttcttctc 15318983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 15499827 - 15499352
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15499827 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 15499728  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15499727 ttaacaataaccacattaatggaacatgaatcacatctcttttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataactcaacatttat 15499628  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15499627 acatacttagaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagtatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 15499528  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  15499527 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 15499428  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15499427 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagcttttccttcaacactcttgttcttctc 15499352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 22006557 - 22006107
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||| ||||||    
T  22006557 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcagtccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaataacatcag 22006458  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006457 ttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 22006358  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006357 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 22006258  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   | |    
T  22006257 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaactcaa 22006158  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct 478  Q
    || |||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  22006157 actcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagct 22006107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 13662564 - 13662087
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||    
T  13662564 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttagttctcatcatcaatccataattatgtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcag 13662465  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13662464 ttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 13662365  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13662364 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatncattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 13662265  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || |    
T  13662264 ttgtttatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaa 13662165  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    || |||||||||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  13662164 actcttgcttcaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 13662087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 153 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 13721104 - 13720750
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 251  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13721104 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 13721005  T
Q  252 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13721004 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 13720905  T
Q  352 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct 451  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||    
T  13720904 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcct 13720805  T
Q  452 -aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
     |  | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  13720804 aatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 13720750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 67 - 452
Target Start/End: Original strand, 16195224 - 16195611
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatc 166  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||||| || |||||||||||   | | | |||||||| | |  ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16195224 atttctcatcatcaatccataattatatatacctaagtcataattcaccctcaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatc 16195323  T
Q  167 tcatttcaatcaaaacatatcaa--tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacat 264  Q
    |||||||||  | ||||||||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16195324 tcatttcaacaacaacatatcaaaatttcataaattaagtataatctcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacat 16195423  T
Q  265 accataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaa 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16195424 accataatcatcaattcatgcacaagaacatagcatcacagcacgagaacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaa 16195523  T
Q  365 tgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 452  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  || ||| |||||||||||||| ||||||    
T  16195524 tgcaaaaattgtacatgattatgataataattaacccccttaccttagaagatgattaacccaaactcttgcttcaattcaactccta 16195611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 153 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 16873227 - 16872927
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 251  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16873227 atatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 16873128  T
Q  252 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16873127 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 16873028  T
Q  352 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct 451  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||   | ||| |||||||||||| |||||||    
T  16873027 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaactcaaactcttgcttcaatttagctcct 16872928  T
Q  452 a 452  Q
    |    
T  16872927 a 16872927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 209 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 6774371 - 6774083
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 308  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| |||||||| ||    
T  6774371 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaa 6774274  T
Q  309 gagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc 408  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6774273 gagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatataacatgagaaaatgcaaa-at--tacatgattatgataatcactaacccccttacc 6774177  T
Q  409 tttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  6774176 tttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctccta-gtcaccc-acttgattcctcaagcttcccctccaacactcttgttcttctc 6774083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 209 - 504
Target Start/End: Original strand, 24549120 - 24549409
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 308  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| |||||||| ||    
T  24549120 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaa 24549217  T
Q  309 gagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc 408  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24549218 gagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-at--tacatgattatgataatcactaacccccttacc 24549314  T
Q  409 tttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    || |||| ||||||| |  |||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  24549315 ttagaagttgattatccttaaccctagcttcacttcagctcctaggtcaccc-acttgattcctcaagcttcccctccaacactcttgttcttctc 24549409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 240 - 496
Target Start/End: Original strand, 30120890 - 30121144
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 339  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |  | ||| |||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  30120890 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaa 30120989  T
Q  340 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttc 439  Q
    | ||||||||||||||||||||  || |||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||    
T  30120990 ctcattttcatacaacatgagattatacaaaaattacacatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagatgattatctctaacccttacttc 30121089  T
Q  440 aattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttg 496  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  30121090 aattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 30121144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 210 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 21844684 - 21844394
Alignment:
Q  210 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaag 309  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||    
T  21844684 ttcataacttatcatttttacatattt--aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaag 21844587  T
Q  310 agcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 409  Q
    |||||||||||  ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  21844586 agcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccaatttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat--tacatgattgtgataataactaacccccttaccg 21844489  T
Q  410 ttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctt-tcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    |||||| ||||||| |  || ||| ||| || ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||    
T  21844488 ttgaagttgattatccttaatcctagctccacttcagcttctaggtcaccc-acttgattcctcaagcttccccctccaacactcttgttcttctc 21844394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 210 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 21852077 - 21851787
Alignment:
Q  210 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaag 309  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||  |||||| |||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||    
T  21852077 ttcataacttatcatttttacatattt--aaacatttaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaag 21851980  T
Q  310 agcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 409  Q
    |||||||||||  ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21851979 agcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccaatttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat--tacatgattgtgataataactaacccccttacct 21851882  T
Q  410 ttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctt-tcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    |||||| ||||||| |  || ||| ||| || ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||    
T  21851881 ttgaagttgattatccttaatcctagctccacttcagcttctaggtcaccc-acttgattcctcaagcttccccctccaacactcttgttcttctc 21851787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 191 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 16674524 - 16674258
Alignment:
Q  191 ttcatcaattaagcataat-ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaa 289  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||| | |||| |||||||||||||| |||| ||||| |  | ||| |||||||||| ||    
T  16674524 ttcaccaattaagcacaatattcataacttatcatttttgcata-tatgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgcataa 16674427  T
Q  290 gaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgat 389  Q
     || ||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||    
T  16674426 aaacataacatcacagaaagagcacgaatttagcatgaattgttcaacaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat--tacatgattgtgat 16674329  T
Q  390 aataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccca 461  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  | |||| |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16674328 aataactaacccccttaccttagaagaagatta-actcaactcttgcttcaattcagctcataagtcaccca 16674258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 193 - 476
Target Start/End: Original strand, 17345690 - 17345985
Alignment:
Q  193 catcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaaga 291  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||| |||||| |||||| ||   ||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  |    
T  17345690 catcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattg--aacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatataa 17345787  T
Q  292 aaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcat----------caacccattttcatacaaca--tgagaaaatgcaaagattgtaca 379  Q
    | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||| | |||          |||||||| |||||||||||  ||||||| |||||  | || |||    
T  17345788 acataacatcacagttagagcacgaatttcgcaacaattatccatttattcaattcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatgaaca 17345887  T
Q  380 tgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaag 476  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||    
T  17345888 tgattatgatgaagactaacccccttacctaagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaag 17345985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 13721227 - 13721175
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaat 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  13721227 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcatcaacaat 13721175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 22907311 - 22907087
Alignment:
Q  239 aaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcat-- 336  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||| | |||      
T  22907311 aaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattc 22907212  T
Q  337 --------caacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcc 426  Q
            |||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  ||    
T  22907211 attcatttcaacccattt-catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagacc 22907113  T
Q  427 caacccttgcttcaattcagctccta 452  Q
     ||||   ||||||||| ||||||||    
T  22907112 aaacctaggcttcaatttagctccta 22907087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 240 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16405071 - 16404981
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||||    
T  16405071 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaataatt 16404981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 240 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 24928887 - 24928797
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || |||  |||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  24928887 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatataatcacagttggagcacgaatttagcaacaatt 24928797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 3431580 - 3431536
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3431580 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctca 3431536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 16193841 - 16193723
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 308  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||| || |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||| ||       
T  16193841 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttccccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttg 16193744  T
Q  309 gagcacgaatttagcaacaat 329  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16193743 gagcacgaatttagcaacaat 16193723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 464 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 17142894 - 17142854
Alignment:
Q  464 ttgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17142894 ttgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 17142854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 452
Target Start/End: Original strand, 5238253 - 5238477
Alignment:
Q  239 aaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcat-- 336  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||| | |||      
T  5238253 aaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattc 5238352  T
Q  337 --------caacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcc 426  Q
            |||||||||| ||| |||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  ||    
T  5238353 attcatttcaacccattt-catccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagacc 5238451  T
Q  427 caacccttgcttcaattcagctccta 452  Q
     ||||   ||||||||| ||||||||    
T  5238452 aaacctaggcttcaatttagctccta 5238477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 16873350 - 16873303
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatca 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  16873350 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaataacatcttatttctcatca 16873303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 24661345 - 24661121
Alignment:
Q  239 aaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcat-- 336  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||| | |||      
T  24661345 aaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattc 24661246  T
Q  337 --------caacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcc 426  Q
            |||||||||| ||| |||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  ||    
T  24661245 attcatttcaacccattt-catccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagacc 24661147  T
Q  427 caacccttgcttcaattcagctccta 452  Q
     ||||   ||||||||| ||||||||    
T  24661146 aaacctaggcttcaatttagctccta 24661121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 452
Target Start/End: Original strand, 43685712 - 43685936
Alignment:
Q  239 aaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcat-- 336  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||| | |||      
T  43685712 aaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattc 43685811  T
Q  337 --------caacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcc 426  Q
            |||||||||| ||| |||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  ||    
T  43685812 attcatttcaacccattt-catccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagacc 43685910  T
Q  427 caacccttgcttcaattcagctccta 452  Q
     ||||   ||||||||| ||||||||    
T  43685911 aaacctaggcttcaatttagctccta 43685936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 24929094 - 24929053
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  24929094 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 24929053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 77
Target Start/End: Original strand, 23837156 - 23837200
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatca 77  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  23837156 ttcaccaatttcacaaaaccaccaccaacaactcatttctcatca 23837200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 43373593 - 43373480
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 308  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||  || |||||||||||||||| |  ||  || ||||||||       
T  43373593 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttg 43373496  T
Q  309 gagcacgaatttagca 324  Q
    ||||||||||||||||    
T  43373495 gagcacgaatttagca 43373480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 24717162 - 24717128
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaat 64  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24717162 aacttcaccaattttacaaaaccaccaacaacaat 24717128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 396; Significance: 0; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 21932680 - 21932205
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  21932680 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatggcatcag 21932581  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21932580 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 21932481  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21932480 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 21932381  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  21932380 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 21932281  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21932280 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 21932205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 21938850 - 21938375
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  21938850 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatggcatcag 21938751  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21938750 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 21938651  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21938650 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 21938551  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  21938550 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 21938451  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21938450 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 21938375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 22883383 - 22882908
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22883383 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 22883284  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22883283 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 22883184  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  22883183 acatactttgaaacatgtaatttcatccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacaaatttaacaacaa 22883084  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |    
T  22883083 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttatctttgaagttgattatcccta 22882984  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22882983 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgatttcccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 22882908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 504
Target Start/End: Original strand, 35581993 - 35582468
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  35581993 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 35582092  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35582093 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 35582192  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35582193 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 35582292  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  35582293 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 35582392  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35582393 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 35582468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 36990069 - 36989594
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  36990069 aacttcactaatttcacaaaaccatcaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcataattcacttacaatagcatcag 36989970  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36989969 ttaacaataaccacattaatggaatatgaatcacatctcttttcaatcaaagcatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 36989870  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  36989869 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataccataatcatcaattcaagcacaagaaaatagcatcacagctagagcacgaatttaacaacaa 36989770  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |    
T  36989769 ttgttcaccaacccattttcatacaacatgagaaattgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctcta 36989670  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36989669 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattccccaagctttcccttcaacactcttgttcttctc 36989594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 1219819 - 1219396
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||    
T  1219819 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcag 1219720  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1219719 ttaacaataaccacatcaatgaaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 1219620  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1219619 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattaatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 1219520  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  || |    
T  1219519 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataatcactaacccccttaccttagaagaagattaacccaa 1219420  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctccta 452  Q
    || |||||||||||| ||||||||    
T  1219419 actcttgcttcaatttagctccta 1219396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 67 - 478
Target Start/End: Original strand, 7425318 - 7425729
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatc 166  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||| || | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  7425318 atttctcatcatcaatccataattaagtatatccaagtcatgattcactcacaacagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatc 7425417  T
Q  167 tcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacata 265  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7425418 tcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaatgaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacata 7425517  T
Q  266 ccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaat 365  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7425518 ccataaccatcgattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaataattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaat 7425617  T
Q  366 gcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaatt 465  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  7425618 gcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-actt 7425716  T
Q  466 gattcctcaagct 478  Q
    ||||||| |||||    
T  7425717 gattcctaaagct 7425729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 153 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 10778146 - 10777794
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 251  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10778146 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 10778047  T
Q  252 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10778046 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 10777947  T
Q  352 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct 451  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  10777946 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataatcactaccccccttacctttgaagatgattatccttaacccttgcttcaattcagctcct 10777847  T
Q  452 aggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  10777846 aggtcaccccacttgattcctcaagcttccccttcaactctcttgttcttctc 10777794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 33 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 17471885 - 17471427
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttat-ttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagtt 131  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||  | || |  |||||||   || ||||| | || ||| ||||||||    
T  17471885 ttcaccaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcgtacccaagcaatgattcattcacaataacatcagtt 17471786  T
Q  132 gacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatac 230  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  17471785 aacaataacaacatcaatggaatatgaattacatcttatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcattacttaacatttatac 17471686  T
Q  231 atactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17471685 atactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttatcaacaatt 17471586  T
Q  331 gttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaac 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||    
T  17471585 gttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatacaaaatttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaactcaaac 17471486  T
Q  431 ccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaa 488  Q
     |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17471485 tcttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcctcaagctattcccttcaa 17471427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 67 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 35791361 - 35790947
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatc 166  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||   | | | |||||||| | |  ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  35791361 atttctcatcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcaccctcaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatc 35791262  T
Q  167 tcatttcaatcaaaacatatcaa--tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacat 264  Q
    |||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35791261 tcatttcaacaacaacatatcaaaatttcatcaattaagtataatctcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcactcacaaacat 35791162  T
Q  265 accataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaa 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35791161 accataatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaa 35791062  T
Q  365 tgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaa 463  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||| || | |||| ||    
T  35791061 tgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaa 35790962  T
Q  464 ttgattcctcaagct 478  Q
    |||||||||||||||    
T  35790961 ttgattcctcaagct 35790947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 41 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 11212352 - 11211886
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataac 140  Q
    ||||||||||| || |||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||  || | | |||||||| | |  |||    
T  11212352 tttcacaaaacaac-aacaacatctcatttctcatcatcaatccataattatgtatacccaagtcataatccacccacaacaacatcagttaatagcaac 11212254  T
Q  141 cacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttga 239  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||| ||  ||||  | || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11212253 aacatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatattaaaattcactacttgagtataatttcataacttaacatttatacacactttga 11212154  T
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11212153 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaa 11212054  T
Q  340 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttc 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||    
T  11212053 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttc 11211954  T
Q  440 aattcagctcctaggtcacccaaa--ttgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    |||||||||||||| | |||| ||  ||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||| ||||    
T  11211953 aattcagctcctagcttaccccaattttgattcttcaagctattcccttcaaaacccttgttcttctc 11211886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 153 - 504
Target Start/End: Original strand, 23514641 - 23514995
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 251  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23514641 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 23514740  T
Q  252 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23514741 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 23514840  T
Q  352 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct 451  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||    
T  23514841 caacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcct 23514940  T
Q  452 -aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
     || | |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  23514941 aagcttaccccaattgattcctcaagttattctcttcaaaacccttgttcttctc 23514995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 240 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 18778076 - 18777815
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 339  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  18778076 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttaacatgaattgttcatcaa 18777977  T
Q  340 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttc 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||  | ||||||||||||    
T  18777976 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttaattatctctaacccttgcttc 18777878  T
Q  440 aattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18777877 aattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctcaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctc 18777815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 209 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 29188397 - 29188116
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 308  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| |||||||| ||    
T  29188397 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaa 29188300  T
Q  309 gagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc 408  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  29188299 gagcacgaatctagcatgaattgttcatcgacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-at--tacatgattataataatcactaacccccttacc 29188203  T
Q  409 tttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttg 496  Q
    ||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  29188202 tttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccccacttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 29188116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 240 - 504
Target Start/End: Original strand, 19500067 - 19500327
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 339  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  19500067 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaagtgttcatcaa 19500166  T
Q  340 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttc 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||    
T  19500167 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttc 19500265  T
Q  440 aattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19500266 aattcagctccta-gtcaccc-acttgattcctcaagc-ttcccttcaactctcttgttcttctc 19500327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 240 - 504
Target Start/End: Original strand, 12542 - 12803
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 339  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  12542 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaa 12641  T
Q  340 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttc 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  || |||  ||||    
T  12642 cccattttcatacaacatgagaaaatacaaa-attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctaacttc 12740  T
Q  440 aattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  12741 aattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctc 12803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 240 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 21073679 - 21073418
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 339  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||| ||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  21073679 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatccattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcattaa 21073580  T
Q  340 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttc 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  || ||| |||||    
T  21073579 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatccttaatcctagcttc 21073481  T
Q  440 aattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21073480 aattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaaccctcttgttcttctc 21073418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 240 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 22366565 - 22366311
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 339  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  22366565 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgctcatcaa 22366466  T
Q  340 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttc 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||    
T  22366465 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttc 22366367  T
Q  440 aattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttg 496  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||| || |||| ||||||||||| ||||||    
T  22366366 aattcaactcctaggtcaccccacttgattgctaaagc-ttcccttcaaccctcttg 22366311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 191 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 4200117 - 4199816
Alignment:
Q  191 ttcatcaattaagcataat-ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaa 289  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||| | |||| |||||||||||||| |||| ||||| |  | |||||||||||||| |     
T  4200117 ttcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcata-tatgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatac 4200020  T
Q  290 gaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgat 389  Q
     || ||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||    
T  4200019 aaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcatgaattattcatcaactcattttcatacaacatgagaatatgcaaa-attacacatgattatgat 4199921  T
Q  390 aataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaac 489  Q
    |||  ||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||    
T  4199920 aatccctaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaac 4199823  T
Q  490 actcttg 496  Q
     ||||||    
T  4199822 cctcttg 4199816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 210 - 478
Target Start/End: Original strand, 27009981 - 27010244
Alignment:
Q  210 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaag 309  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||| |||  ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||    
T  27009981 ttcataacttatcatttttacatattt--aaacatgtaatttcaccaacactcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaag 27010078  T
Q  310 agcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 409  Q
    |||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27010079 agcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaat--tacatgattgtgataataactaacccccttacct 27010176  T
Q  410 ttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 478  Q
    | ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  27010177 tagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattcctaaagct 27010244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 192 - 452
Target Start/End: Original strand, 23328678 - 23328937
Alignment:
Q  192 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaaga 291  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||     
T  23328678 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataag- 23328776  T
Q  292 aaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 391  Q
    ||| |||| || | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||| |  ||||||||||||    
T  23328777 aaacagcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataa 23328876  T
Q  392 taactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 452  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  23328877 taactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 23328937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 240 - 453
Target Start/End: Original strand, 25426796 - 25427009
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 339  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25426796 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaa 25426895  T
Q  340 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattat-tcccaacccttgctt 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||    
T  25426896 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attacacatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaaccccttgctt 25426994  T
Q  439 caattcagctcctag 453  Q
    |||||||||||||||    
T  25426995 caattcagctcctag 25427009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 192 - 452
Target Start/End: Original strand, 24616282 - 24616541
Alignment:
Q  192 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaaga 291  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | | |||     
T  24616282 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataattatcaattcaagtataag- 24616380  T
Q  292 aaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 391  Q
    ||| |||| || | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||| |  ||||||||||||    
T  24616381 aaacagcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataa 24616480  T
Q  392 taactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 452  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  24616481 taactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 24616541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 192 - 452
Target Start/End: Original strand, 24712658 - 24712917
Alignment:
Q  192 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaaga 291  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | | |||     
T  24712658 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataattatcaattcaagtataag- 24712756  T
Q  292 aaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 391  Q
    ||| |||| || | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||| |  ||||||||||||    
T  24712757 aaacagcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataa 24712856  T
Q  392 taactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 452  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  24712857 taactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 24712917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 192 - 452
Target Start/End: Original strand, 24745676 - 24745935
Alignment:
Q  192 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaaga 291  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | | |||     
T  24745676 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataattatcaattcaagtataag- 24745774  T
Q  292 aaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 391  Q
    ||| |||| || | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||| |  ||||||||||||    
T  24745775 aaacagcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataa 24745874  T
Q  392 taactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 452  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  24745875 taactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 24745935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 240 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 43443479 - 43443261
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 339  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  43443479 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttaacatgaattgttcatcaa 43443380  T
Q  340 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttc 439  Q
     ||||||||||| |||||||||| ||||||   ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||    
T  43443379 tccattttcatataacatgagaatatgcaa---ttacacatgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttc 43443283  T
Q  440 aattcagctcctaggtcaccca 461  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  43443282 aattcagctcctaggtcaccca 43443261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 379 - 504
Target Start/End: Original strand, 11343008 - 11343133
Alignment:
Q  379 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 478  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  11343008 atgattatgataaaaactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaacctctgcttcaattcagctcctaggtcaccccacttgattcctcaagct 11343107  T
Q  479 ttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  11343108 ttcccttcaacactcttgttcttctc 11343133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 142 - 330
Target Start/End: Original strand, 32950762 - 32950952
Alignment:
Q  142 acatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacata-tcaatttcatcaattaagcataatttcataactta-acatttatacatactttga 239  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||  | |||||| | || |||| || || |||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  32950762 acatcaatggaacatgaatcacatctcttttcaacaacaacatagtaaaattcaccatttgagcacaatttcataactttgacctttatacatactttga 32950861  T
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  32950862 aacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcatcaaatcatacacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaatt 32950952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 379 - 504
Target Start/End: Original strand, 16105967 - 16106092
Alignment:
Q  379 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 478  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||  |  ||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  16105967 atgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaacctaaactcttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcctcaagct 16106066  T
Q  479 ttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16106067 ttcccttcaacactcttgttcttctc 16106092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 327
Target Start/End: Original strand, 34939398 - 34939531
Alignment:
Q  193 catcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaaga 291  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||| |||||| |||||| ||   ||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  |    
T  34939398 catcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattg--aacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaa 34939495  T
Q  292 aaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaaca 327  Q
    | ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  34939496 acataacatcacagttagagcacgaatttagcaaca 34939531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 18531163 - 18531073
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  18531163 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaatt 18531073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 330
Target Start/End: Original strand, 23507103 - 23507222
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 308  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| |||||||        
T  23507103 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaaatg 23507200  T
Q  309 gagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  23507201 gagcacgaatttagcaacaatt 23507222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 77
Target Start/End: Original strand, 23514518 - 23514565
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatca 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23514518 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcatca 23514565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 9730682 - 9730638
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9730682 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctca 9730638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 10778269 - 10778217
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaat 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  10778269 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaccaacatcttatttctcatcaacaat 10778217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 25900503 - 25900321
Alignment:
Q  239 aaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt----gttc 334  Q
    |||||| |||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   ||||||||||||||||||||||    ||||    
T  25900503 aaacatataatttaaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccgttc 25900404  T
Q  335 at------caacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 410  Q
    ||      |||||||||| ||| |||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25900403 attcatttcaacccattt-catccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 25900321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 452
Target Start/End: Original strand, 20623135 - 20623359
Alignment:
Q  239 aaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcat-- 336  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||| | |||      
T  20623135 aaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattc 20623234  T
Q  337 --------caacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcc 426  Q
            |||||||||| ||| |||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  ||    
T  20623235 attcatttcaacccattt-catccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagacc 20623333  T
Q  427 caacccttgcttcaattcagctccta 452  Q
     ||||   ||||||||| ||||||||    
T  20623334 aaacctaggcttcaatttagctccta 20623359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 21233625 - 21233401
Alignment:
Q  239 aaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcat-- 336  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||| | |||      
T  21233625 aaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattc 21233526  T
Q  337 --------caacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcc 426  Q
            |||||||||| ||| |||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  ||    
T  21233525 attcatttcaacccattt-catccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagacc 21233427  T
Q  427 caacccttgcttcaattcagctccta 452  Q
     ||||   ||||||||| ||||||||    
T  21233426 aaacctaggcttcaatttagctccta 21233401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 22054027 - 22053839
Alignment:
Q  142 acatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttga 239  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||| |||||  | ||| || |||  |||| ||||| |||| ||||| || ||||| |||||| |||||| ||       
T  22054027 acatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattg-- 22053930  T
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||| || |  || ||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  22053929 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactatcatcaattcatacatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaatt 22053839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 115
Target Start/End: Original strand, 23328557 - 23328600
Alignment:
Q  72 tcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23328557 tcatcatcaatccacaattaagtatacccaagttataattcact 23328600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 355 - 452
Target Start/End: Original strand, 37053037 - 37053134
Alignment:
Q  355 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 452  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  37053037 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 37053134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Original strand, 24616165 - 24616205
Alignment:
Q  75 tcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24616165 tcatcaatccacaattaagtatacccaagttataattcact 24616205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Original strand, 24712541 - 24712581
Alignment:
Q  75 tcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24712541 tcatcaatccacaattaagtatacccaagttataattcact 24712581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Original strand, 24745559 - 24745599
Alignment:
Q  75 tcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24745559 tcatcaatccacaattaagtatacccaagttataattcact 24745599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 330
Target Start/End: Original strand, 37052910 - 37053001
Alignment:
Q  239 aaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
T  37052910 aaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt 37053001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 240 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 27182643 - 27182553
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||| || ||||||| |||||||| |  || ||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||||    
T  27182643 aacatgtaatttcatcaacaatcatacaattatcatcagttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcatgaatttagcaacaatt 27182553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 452
Target Start/End: Original strand, 16536490 - 16536587
Alignment:
Q  355 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 452  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  16536490 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttatcttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 16536587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 81
Target Start/End: Original strand, 3673828 - 3673868
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  3673828 tttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 3673868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 5451124 - 5451084
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  5451124 tttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 5451084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 23234766 - 23234730
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatca 77  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  23234766 tttcacaaaaccaacaacaacaatttatttcacatca 23234730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 81
Target Start/End: Original strand, 23493885 - 23493925
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  23493885 tttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 23493925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 361; Significance: 0; HSPs: 45)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 504
Target Start/End: Original strand, 18168927 - 18169402
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||| || ||||||| |     
T  18168927 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaattcacaattaagtatatccaaatcatgattcactcacaatagcattat 18169026  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18169027 ttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 18169126  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18169127 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 18169226  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  || |    
T  18169227 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttacc-ttgaagaagattaacccta 18169325  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    |  |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  18169326 attcttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 18169402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 67 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 15287507 - 15287096
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatc 166  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  15287507 atttctcatcatcaatccataattaagtatacccaagtcatgattcactcacaacagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatc 15287408  T
Q  167 tcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacata 265  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15287407 tcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaatggagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacata 15287308  T
Q  266 ccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaat 365  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15287307 ccataaccatcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagctataattgttcatcatcccattttcatacaacatgagaaaat 15287208  T
Q  366 gcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaatt 465  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  15287207 gcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-actt 15287109  T
Q  466 gattcctcaagct 478  Q
    ||||||| |||||    
T  15287108 gattcctaaagct 15287096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 67 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 15294616 - 15294221
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatc 166  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  15294616 atttctcatcatcaatccataattaagtatacccaagtcatgattcactcacaacagcatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatc 15294517  T
Q  167 tcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacata 265  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15294516 tcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaatggagtataatttcataacttaacatttatatatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacata 15294417  T
Q  266 ccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaat 365  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15294416 ccataaccatcgattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagctataattgttcatcatcccattttcatacaacatgagaaaat 15294317  T
Q  366 gcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccca 461  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15294316 gcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccca 15294221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 46 - 410
Target Start/End: Original strand, 19020459 - 19020824
Alignment:
Q  46 caaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacat 145  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||    
T  19020459 caaaacaaccaacaacatcttatttctcatcatcaatccacaattaagtatactcaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataacaacat 19020558  T
Q  146 caatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacat 244  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19020559 caatggaatatgaattacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatccattaaggataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacat 19020658  T
Q  245 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccat 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19020659 gtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccat 19020758  T
Q  345 tttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 410  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19020759 tttcatacaacatgacaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatggtaactaacccccttacctt 19020824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 153 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 7132241 - 7131887
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 251  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7132241 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 7132142  T
Q  252 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7132141 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 7132042  T
Q  352 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct 451  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  7132041 taacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaatccaaactcttgcttcaattcagctcct 7131942  T
Q  452 -aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
     |  | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  7131941 aatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 7131887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 67 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 17145919 - 17145479
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatc 166  Q
    |||| |||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||  || | | |||||||| | |  ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  17145919 atttttcatcatcaatccgtaattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatc 17145820  T
Q  167 tcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacata 265  Q
    |||||||||  | ||||||||||  ||||  |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17145819 tcatttcaacaacaacatatcaaaattcactaattgagtataatttcacaacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacata 17145720  T
Q  266 ccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaat 365  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17145719 ccataatcatcaattcatgtacaagaaaatagcatcacagtaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagaaaat 17145620  T
Q  366 gcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaat 464  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||   | ||| ||| |||||||||||||||| || | |||| |||    
T  17145619 gcaaaaattgaacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacacaaactcttacttcaattcagctcctaagcttaccccaat 17145520  T
Q  465 tgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  17145519 tgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 17145479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 153 - 452
Target Start/End: Original strand, 20000803 - 20001103
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 251  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20000803 atatgatttacatctcatttcaaccaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 20000902  T
Q  252 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 351  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20000903 cacccagaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaataacattacaacaagagcacgaatttagccacaattgttcatcaacccattttcata 20001002  T
Q  352 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct 451  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| |||||||    
T  20001003 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcct 20001102  T
Q  452 a 452  Q
    |    
T  20001103 a 20001103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 67 - 422
Target Start/End: Original strand, 18248212 - 18248568
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatc 166  Q
    |||| |||||||||||| | ||||| ||||||| || |||||||||||  || | | |||||||| | |  ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  18248212 atttttcatcatcaatcgataattatgtataccaaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatc 18248311  T
Q  167 tcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacata 265  Q
    |||||||||  | ||||||| ||  ||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18248312 tcatttcaacaacaacatattaaaattcactaattgagtataatttcatatcttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacata 18248411  T
Q  266 ccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaat 365  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18248412 ccataatcctcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaat 18248511  T
Q  366 gcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgatta 422  Q
    | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  18248512 gtaaaaattgtacaagattatgataataactaacccccttaccttagatgatgatta 18248568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 193 - 410
Target Start/End: Original strand, 22738390 - 22738607
Alignment:
Q  193 catcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaa 292  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22738390 catcaattaagcataatttcacaacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaa 22738489  T
Q  293 aatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataat 392  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| |     
T  22738490 aatagcatcacagcaagaacacgaatttaacatcaattgttcctcagcccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaaattgattatgatgaa 22738589  T
Q  393 aactaacccccttacctt 410  Q
     || ||||||||||||||    
T  22738590 gacaaacccccttacctt 22738607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 211 - 504
Target Start/End: Original strand, 10644360 - 10644647
Alignment:
Q  211 tcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaga 310  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||  |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||    
T  10644360 tcataacttaacatttttacata-tttgaa-catgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaaga 10644457  T
Q  311 gcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 410  Q
    ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10644458 gcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacctt 10644554  T
Q  411 tgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||| ||||||| |  || |||  ||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  10644555 tgaagttgattatccttaatcctaacttcacttcagctcctagatcaccc-acttgattcctcaagcttcccctccaacactcttgttcttctc 10644647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 207 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 22352184 - 22351915
Alignment:
Q  207 aatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagc 306  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||| || | |    
T  22352184 aatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataagaaac-agcaacataac 22352086  T
Q  307 aagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccctta 406  Q
    ||||||| ||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22352085 aagagcatgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccctta 22351986  T
Q  407 cctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 478  Q
    |||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  22351985 ccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattcctaaagct 22351915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 192 - 452
Target Start/End: Original strand, 26339140 - 26339399
Alignment:
Q  192 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaaga 291  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||     
T  26339140 tcattaattaagcaaaatttcacaacttgacatttatacatagattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcaagtataag- 26339238  T
Q  292 aaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 391  Q
    ||| |||| || | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||| |  ||||||||||||    
T  26339239 aaacagcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgaaaagatgtaaaatttgaaattgattatgataa 26339338  T
Q  392 taactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 452  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  26339339 taactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctccta 26339399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 286 - 401
Target Start/End: Original strand, 8378365 - 8378480
Alignment:
Q  286 acaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgatta 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8378365 acaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgtaaaaattgtacatgatta 8378464  T
Q  386 tgataataactaaccc 401  Q
    ||||||||||||||||    
T  8378465 tgataataactaaccc 8378480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 67 - 288
Target Start/End: Original strand, 8374502 - 8374724
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatc 166  Q
    |||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||  ||||||||||  || | | |||||||| | |  ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  8374502 atttttcatcatcaatcgataattatgtatacccaagccataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatc 8374601  T
Q  167 tcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacata 265  Q
    |||||||||  | ||||||| ||  ||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8374602 tcatttcaacaacaacatattaaaattcactaattgagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaagcatgtaatttcacccacaaacata 8374701  T
Q  266 ccataatcatcaattcatgcaca 288  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  8374702 ccataatcatcaattcatgcaca 8374724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 240 - 478
Target Start/End: Original strand, 47357822 - 47358057
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 339  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |  | ||||||| |||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  47357822 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatccatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaa 47357921  T
Q  340 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttc 439  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||| ||||||||    
T  47357922 cccattttcatacaacatgaggaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttaccttagaagaagatta-acccaactcttgcttc 47358017  T
Q  440 aattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct 478  Q
    |||||||||||| || | |||| ||||||||||| |||||    
T  47358018 aattcagctcctaagcttaccccaattgattccttaagct 47358057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 40885748 - 40885604
Alignment:
Q  142 acatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaa 240  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||| |||||  | ||| || |||  |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  40885748 acatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagcaaagttcaccaattgagcataatttcataacttgacatttatacatactttg-a 40885650  T
Q  241 acatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 286  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | || |||| |||||||||||    
T  40885649 acatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgca 40885604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 378 - 504
Target Start/End: Original strand, 14996444 - 14996572
Alignment:
Q  378 catgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaag 476  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||| |  | |||| |||||||||||||||    
T  14996444 catgattatgataataactaacccccttaccttaaaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaaacttaccccaattgattcctcaag 14996543  T
Q  477 ct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    || ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  14996544 ctattctcttcaaaacccttgttcttctc 14996572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 410
Target Start/End: Original strand, 9795490 - 9795564
Alignment:
Q  335 atcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 410  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9795490 atcaacccattt-catacaacatgagaaaatgaaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt 9795564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 379 - 478
Target Start/End: Original strand, 14952085 - 14952183
Alignment:
Q  379 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 478  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  14952085 atgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattcctaaagct 14952183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 15675283 - 15675095
Alignment:
Q  142 acatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttga 239  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||| |||||  | ||| || |||  |||| ||||| |||| ||||| || ||||| |||||| |||||| ||       
T  15675283 acatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattg-- 15675186  T
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  15675185 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaatt 15675095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 10104444 - 10104256
Alignment:
Q  142 acatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttga 239  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||| |||||  | ||| || |||  |||| ||||| |||| ||||| || ||||| |||||| |||||| ||       
T  10104444 acatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattg-- 10104347  T
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  10104346 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacggatttagcaacaatt 10104256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 114
Target Start/End: Original strand, 22738263 - 22738310
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcac 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22738263 atttctcatcattaatccacaattaagtatacccaagtcataattcac 22738310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 209 - 452
Target Start/End: Original strand, 26680338 - 26680590
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 308  Q
    |||||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||||||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||||| |  || ||| ||||| ||       
T  26680338 tttcataacttttcatttttacatattt--aaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttg 26680435  T
Q  309 gagcacgaatttagcaacaattgttca----------tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataact 396  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||          |||||||| || |||||||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||    
T  26680436 gagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaaccca-ttccatacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagact 26680534  T
Q  397 aacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 452  Q
    |||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  26680535 aacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 26680590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 240 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 54118340 - 54118250
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| |||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  54118340 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaatt 54118250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 330
Target Start/End: Original strand, 122027 - 122146
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 308  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||       
T  122027 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttg 122124  T
Q  309 gagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  122125 gagcacaaatttagcaacaatt 122146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 5682827 - 5682783
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5682827 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 5682783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Original strand, 20000680 - 20000732
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaat 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||    
T  20000680 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaataacatcttatttctcatcaacaat 20000732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 22352308 - 22352260
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22352308 atttctcatcatcaatccataattaagtatacccaagttataattcact 22352260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 25119508 - 25119464
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  25119508 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 25119464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 410
Target Start/End: Original strand, 8378486 - 8378524
Alignment:
Q  372 attgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8378486 attgtacatgattatgataataactaatccccttacctt 8378524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 191 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 13048365 - 13048271
Alignment:
Q  191 ttcatcaattaagcataat-ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 286  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||| | ||| |||||| ||  ||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  13048365 ttcatcaattgagcacaatattcataacttatcctttttacatattt--aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaaatcatgca 13048271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 239 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 16328023 - 16327841
Alignment:
Q  239 aaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcat-- 336  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||| | |||      
T  16328023 aaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattc 16327924  T
Q  337 --------caacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 410  Q
            |||||||||| ||| |||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16327923 attcatttcaacccattt-catccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttacctt 16327841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 355 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 16609069 - 16608972
Alignment:
Q  355 catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 452  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||    
T  16609069 catgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctccta 16608972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 191 - 286
Target Start/End: Original strand, 31115748 - 31115842
Alignment:
Q  191 ttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgca 286  Q
    |||| ||||| |||||||||| || ||||| |||||| |||||| |  | |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  31115748 ttcaccaattgagcataattttcacaacttcacatttttacataat--ggaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 31115842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Original strand, 34395215 - 34395256
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  34395215 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 34395256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 7132364 - 7132312
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaat 82  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  7132364 aacttcatcaatttcacacaaccaccaacaacatcttatttctcatcaacaat 7132312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 115
Target Start/End: Original strand, 26339002 - 26339062
Alignment:
Q  55 caacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 115  Q
    |||||||| || |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26339002 caacaacatttcatttttcatcattaatccataattaagtatacccaagttataattcact 26339062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 330
Target Start/End: Original strand, 10488728 - 10488819
Alignment:
Q  239 aaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
T  10488728 aaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt 10488819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 240 - 330
Target Start/End: Original strand, 13246597 - 13246687
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||| |  || ||| ||||||||    |||||||||||| ||||||||    
T  13246597 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcattaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgtagcacgaatttaacaacaatt 13246687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 82
Target Start/End: Original strand, 14901193 - 14901239
Alignment:
Q  36 accaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaat 82  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  14901193 accaattttacaaaaccaccaacaacaacccatttctcatcatcaat 14901239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 41166233 - 41166191
Alignment:
Q  35 caccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatca 77  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  41166233 caccaatttcacaaaaccacccacaacaactcatttctcatca 41166191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 81
Target Start/End: Original strand, 15044794 - 15044834
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  15044794 tttcaccaaagcaacaacaacaatttatttctcatcatcaa 15044834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 15109630 - 15109590
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  15109630 tttcaccaaagcaacaacaacaatttatttctcatcatcaa 15109590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 15851637 - 15851597
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  15851637 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaa 15851597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 40905210 - 40905174
Alignment:
Q  45 acaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  40905210 acaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 40905174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 354; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 154306 - 153829
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  || ||||||| ||    
T  154306 aacttcaccaatttcacaaaaccaccatcaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcacccacaatagcataag 154207  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  154206 ttaacaataaccacatcaatggaatatgattcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 154107  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  154106 acatactttgaaacatgtaacttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 154007  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||   | |    
T  154006 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaactcaa 153907  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    || |||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  153906 actcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 153829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 298 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 169938 - 169738
Alignment:
Q  298 catcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataacta 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  169938 catcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attatacatgattatgataatcacta 169840  T
Q  398 acccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgt 497  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  169839 acccccttacttttgaagatgattatcactaacccttgcttcaattcagctcttatgtcaccccacttgattcctcaagcttcgccttcaactctcttgt 169740  T
Q  498 tc 499  Q
    ||    
T  169739 tc 169738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 243 - 496
Target Start/End: Original strand, 36264 - 36514
Alignment:
Q  243 atgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaaccc 342  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| |  | ||||||||||| || |  || ||| ||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  36264 atgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatacatacaaacataacatcactacaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaaccc 36363  T
Q  343 attttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaat 442  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  36364 agtttcatacaacatgagaatatgcaaa-attacacatgattatgataatcattaacccccttacctttgaagttgattatccctaacccttgcttcaat 36462  T
Q  443 tcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttg 496  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  36463 tcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagcttt-ccttcaaccctcttg 36514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 330
Target Start/End: Original strand, 48765 - 48855
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  48765 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaatt 48855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 461
Target Start/End: Original strand, 29119 - 29551
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcag 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||| ||| |     
T  29119 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatatctcatcatcaatacacaattaagtataaccaaatcataattcactaacaataacataaa 29218  T
Q  130 ttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttat 228  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29219 ttaacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttac 29318  T
Q  229 acatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29319 acatactttgaaacatgtaatttcacccataaacataacataatcaacaattcaagcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttaacaacaa 29418  T
Q  329 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattccca 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |    
T  29419 ttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatcctta 29518  T
Q  429 acccttgcttcaattcagctcctaggtcaccca 461  Q
    | ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  29519 atcctagcttcacttcagctcctaggtcaccca 29551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 504
Target Start/End: Original strand, 29565 - 29626
Alignment:
Q  442 ttcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  29565 ttcagctcctaggtcacccac-ttgattcctcaagcttcccctccaacactcttgttcttctc 29626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 67 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 1837 - 1424
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatc 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||   |||||| | |||||    
T  1837 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataacaacatcaattttatatgatttacatc 1738  T
Q  167 tcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacata 265  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1737 tcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacata 1638  T
Q  266 ccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaat 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1637 ccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagtgcacgattttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaat 1538  T
Q  366 gcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaat 464  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||| || | |||| |||    
T  1537 gcaaaaattgaacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaacccttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaat 1438  T
Q  465 tgattcctcaagct 478  Q
    ||||||||||||||    
T  1437 tgattcctcaagct 1424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 67 - 488
Target Start/End: Original strand, 2386 - 2810
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatc 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| || ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  2386 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaaccatgattcactcacaataacatcagttaacaataacaacatcaatggaatatgaattacatc 2485  T
Q  167 tcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacata 265  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2486 tcatttcaataaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcatgacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacata 2585  T
Q  266 ccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaat 365  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2586 ccataagcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacggcaagagcacgaattgagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaat 2685  T
Q  366 gcaaaga-ttgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaat 464  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||    
T  2686 gcaaaaatttgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctagcttaccccaat 2785  T
Q  465 tgattcctcaagct-ttcccttcaa 488  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  2786 tgattcctcaagctattcccttcaa 2810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 67 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 10601 - 10184
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatc 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || || |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  10601 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaagtcatgattccctcacaatagcatcagttaacaacaacaacatcaatggaatatgaattacatc 10502  T
Q  167 tcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacata 265  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10501 tcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttagcatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacata 10402  T
Q  266 ccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaat 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10401 ccataatcatcaattcatgcacaagaaaatatcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattattcatcaacccattttcatacaacatgagaaaat 10302  T
Q  366 gcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaat 464  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  |  || |||||||||||||| || ||||||||  ||||||    |||||| || ||||| | || | |||| |||    
T  10301 gcaaaaattgaacatgattatgaagaagacaaacccccttaccttagatgatgattaaccccaacttaggcttcactttagctcataagcttaccccaat 10202  T
Q  465 tgattcctcaagctttcc 482  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10201 tgattcctcaagctttcc 10184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 153 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 1690 - 1336
Alignment:
Q  153 atatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 251  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1690 atatgatttacatctcatttcaatcaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaattt 1591  T
Q  252 cacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 351  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1590 cacccataaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcattacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcata 1491  T
Q  352 caacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct 451  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |  ||| ||||||||||||||||||||    
T  1490 caacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacctaaactcttgcttcaattcagctcct 1391  T
Q  452 -aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
     |  | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  1390 aatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 1336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 67 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 7718 - 7279
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatc 166  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| || | | |||||||| | || ||  || | ||||||| ||||||||||||    
T  7718 atttttcatcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcactcacaacaacatcagttaataacaataaccttaatggaacatgaatcacatc 7619  T
Q  167 tcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacata 265  Q
    |||||| ||  | ||||||||||  ||||  |||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7618 tcattttaacaacaacatatcaagattcactaattgagtataatttcatagcttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcatccacaaacata 7519  T
Q  266 ccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaat 365  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7518 ccataatcttcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagtaataattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaat 7419  T
Q  366 gcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaatt 465  Q
    ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||  |||||||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  7418 gcaaaaatggaacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaattcttgcttcaattcagctcctagcttaccccaatt 7319  T
Q  466 gattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  7318 gattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 7279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 67 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 34420 - 33980
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcacatc 166  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| | |  ||| |||| ||||||| |||||||| |||    
T  34420 atttctcatcatcaatccataatttagtatacccaagtcatgattcactcacaatagcatcagttaatagcaacaacattaatggaacatgaatcatatc 34321  T
Q  167 tcatttcaatcaaaacatatc-aatttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacata 265  Q
    |||||||||  | |||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34320 tcatttcaacaacaacatatccaaattcatcaattaagtataacttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacata 34221  T
Q  266 ccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaac-atgagaaaa 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34220 ccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcttcacagcaagagcacgaatttagcaacaatttttcatcaaccca-tttcatacaacaatgagaaaa 34122  T
Q  365 tgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaa 463  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||| |||||||||||| ||||||| || | || | ||    
T  34121 tgcaaaaattgaacatgattatgatgaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacgccaa 34022  T
Q  464 ttgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  34021 ttgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 33980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 253278 - 253234
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatca 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  253278 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcatca 253234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 247538 - 247448
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||| ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  247538 aacatgaaatttcaccctcaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaatt 247448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1666 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:

Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 55 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 270 - 1
Alignment:
Q  55 caacaacaatttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaat 154  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||    
T  270 caacaacatcttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaaatcatgattcactcacaatagcatcagttaacaataactacatcaatgtaat 171  T
Q  155 atgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaa-tttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttca 253  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  170 atgaattacatctcatttcaattaaaacatatcaaatttcatcaattaagtataatttcataacttaacatttacacatactttgaaacatgtaatttca 71  T
Q  254 cccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagc 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  70 cccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcctcacagcaagagcacgaatttagc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 175; Significance: 5e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 210 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 21228 - 20937
Alignment:
Q  210 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaag 309  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||  |||| ||||  || |||||||||| ||| | |  || ||| ||||||| ||||    
T  21228 ttcataacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattaatggatacaaacataacatcacaacaag 21131  T
Q  310 agcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 409  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21130 agcacgaatttagcaagaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attgtacatgattatgataataactaacccccttacct 21032  T
Q  410 ttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  21031 ttgaagatgattaatcctaacccttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcctcaagctttcccttcaaaactcttgttcttctc 20937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 210 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 14173 - 13883
Alignment:
Q  210 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaag 309  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||   |||||||||||||||  |||| ||||  || |||||||||||||||| |   | ||| ||||||||||||    
T  14173 ttcataacttatcatttttacatatttc--aacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacagacataacatcacagcaag 14076  T
Q  310 agcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacct 409  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14075 agcacga-tttagcaagaattgtgcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attgtacatgattatgataataactaacccccttacct 13978  T
Q  410 ttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  13977 ttgaagatgattaatcctaacccttgcttcaattcagctcctagcttaccccaattgattcctcaagctttcccttcaaaactcttgttcttctc 13883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 209 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 5329 - 5034
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 308  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5329 tttcataacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 5232  T
Q  309 gagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc 408  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5231 gagcacgaatttaacaagaattgttcatcaacccattttcatacaacgtgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaactcccttacc 5132  T
Q  409 tttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||| ||||||| ||||||| || || ||||||| ||||    
T  5131 tttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcttcaagctattcccttaaaaacccttgttcttctc 5034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 168; Significance: 8e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 240 - 478
Target Start/End: Original strand, 3890 - 4129
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 339  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3890 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacaacaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaa 3989  T
Q  340 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttc 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||||||    
T  3990 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataactaaaccccttaccttagaagatgattaaccctaactcttgcttc 4089  T
Q  440 aattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct 478  Q
    |||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  4090 aattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagct 4129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 168; Significance: 8e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 65 - 410
Target Start/End: Original strand, 54408 - 54755
Alignment:
Q  65 ttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcacttaccatagcatcagttgacaataaccacatcaatggaatatgaatcaca 164  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||| ||||||  || | | |||||||| | |  ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  54408 ttatttctcatcatcaatccataaatatgtatacccaactcatgattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcaca 54507  T
Q  165 tctcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaaca 263  Q
    |||||||||||  | ||||||||||  |||| ||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  54508 tctcatttcaacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtacaatttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgcaatttcacccacaatca 54607  T
Q  264 taccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaac-atgagaa 362  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54608 tacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaaggacacgaatttaacaacaattattcatcaacccattttcatacaacaatgagaa 54707  T
Q  363 aatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 410  Q
    | |||||  |||| ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||    
T  54708 attgcaataattgaacatgattatgatgaagactaaccaccttacctt 54755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 142 - 410
Target Start/End: Original strand, 45099 - 45369
Alignment:
Q  142 acatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaa 240  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||| ||||| || | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  45099 acatcaatggaacatgaatcacatctcatttcaacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtacaatttcaaaacttgacatttatacatactttgaa 45198  T
Q  241 acatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaac 340  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  45199 acatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgcacatcaaaatagcatcacaacaagggcacgaatttaacaacaattattcatcaac 45298  T
Q  341 ccattttcatacaac-atgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 410  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||  |||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  45299 ccattttcatacaacaatgagaaattgcaataattgaacatgattatgatgaagactaacccccttacctt 45369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 114
Target Start/End: Original strand, 45003 - 45052
Alignment:
Q  65 ttatttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcac 114  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||| ||||||    
T  45003 ttatttctcatcatcaatccataaatatgtatacccaagtcatgattcac 45052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 192 - 461
Target Start/End: Original strand, 6718 - 6986
Alignment:
Q  192 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaaga 291  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  6718 tcattaattaagcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataaga 6817  T
Q  292 aaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 391  Q
    ||  |||| || | |||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  ||||||||||||    
T  6818 aac-agcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgataa 6916  T
Q  392 taactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccca 461  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6917 taactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccca 6986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 115
Target Start/End: Original strand, 6597 - 6640
Alignment:
Q  72 tcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  6597 tcatcatcaatccacaattaagtatacccaagttataattcact 6640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 205 - 410
Target Start/End: Original strand, 54008 - 54212
Alignment:
Q  205 ataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcaca 304  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54008 ataatttcacaacttaacaattatacatgctttgaa-catgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaacagcatcaca 54106  T
Q  305 gcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccct 404  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |  |||||||||| | ||| ||||||||    
T  54107 gtaagagcacgaatttagcatcaattgttcatcaacccattttcataaaacatgagaaaatgcaaaaatttgaattgattatgatgaaaacaaaccccct 54206  T
Q  405 tacctt 410  Q
    ||||||    
T  54207 tacctt 54212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 240 - 504
Target Start/End: Original strand, 3130 - 3395
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 339  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||| | |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3130 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatggatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaagaattgttcatcaa 3229  T
Q  340 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttc 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||  |  ||| ||||||||    
T  3230 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa-attgtacataattatgataataattaacccccttaccttagaagaagattaaccgaaactcttgcttc 3328  T
Q  440 aattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    |||||||||||| || | |||| ||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||| ||||    
T  3329 aattcagctcctaagcttaccccaattgattcttcaagctattcccttcaaaacccttgttcttctc 3395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 133; Significance: 6e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 298 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 10778 - 10570
Alignment:
Q  298 catcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataacta 397  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10778 catcacaacaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgtacatgattatgataataacta 10679  T
Q  398 acccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactctt 495  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| |  | |||  ||||||||||||||||| ||| |||||| || |||    
T  10678 acccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctaatcttaccacaattgattcctcaagctattctcttcaaaaccctt 10579  T
Q  496 gttcatctc 504  Q
    |||| ||||    
T  10578 gttcttctc 10570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 209 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 13438 - 13169
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 308  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| |||||||  ||    
T  13438 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacactaa 13341  T
Q  309 gagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc 408  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13340 gagcacgaatctagcatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatg-aaaaat--tacatgattatgataatcactaacccccttacc 13244  T
Q  409 tttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttccct 484  Q
    ||||||| ||||||| |  |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  13243 tttgaagttgattatccttaaccctagcttcacttcagttcctaggtcaccc-acttgattcctcaagcttcccct 13169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 240 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 1388 - 1153
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 339  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |  | |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1388 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaa 1289  T
Q  340 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttc 439  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  || || |||||||||    
T  1288 cccattttcatacaacatgagtaaatgcaaaaat--tacatgattgtgataataactaacccccctacctttgaagaagattaaccctaatccttgcttc 1191  T
Q  440 aattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 478  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||    
T  1190 aattcagctcctaagtca-ccaacttgattcctaaagct 1153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 191 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 31807 - 31506
Alignment:
Q  191 ttcatcaattaagcataat-ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaa 289  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||| | ||||  ||||||||||||| |||| ||||| |  | ||||||||||||||       
T  31807 ttcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcata-tatgaat-atgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcattc 31710  T
Q  290 gaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgat 389  Q
     || ||| ||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||    
T  31709 aaacataacatcaccacaagagcacgaatttagcatgaattgttcatcaactcattttcatacaacatgagaatatgcaaa-attacacatgattatgat 31611  T
Q  390 aataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagctttcccttcaac 489  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||    
T  31610 aatcactaacccccttacatttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccc-acttgattcctaaagc-ttcccttcaac 31513  T
Q  490 actcttg 496  Q
     ||||||    
T  31512 cctcttg 31506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 128265 - 128175
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||    |||||||||||||||||||||    
T  128265 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcacgaatttagcaacaatt 128175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 205 - 370
Target Start/End: Original strand, 3547 - 3711
Alignment:
Q  205 ataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcaca 304  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  3547 ataatttcacaacttaacaattatacatgctttgaa-catgtaatttcacccacaatcataccataatcatcaattcatggacaagaaaacaacatcaca 3645  T
Q  305 gcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaa 370  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3646 gtaagagcactaatttagcatcaattgttcatcaacccattttcataaaacatgagaaaatgcaaa 3711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 210 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 64640 - 64372
Alignment:
Q  210 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaat-----tcatgcacaagaaaatagcatcaca 304  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||     ||||||| |  || ||| |||||||    
T  64640 ttcataacttatcatttttacatattt--aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaatataattcatgcatataaacataacatcaca 64543  T
Q  305 gcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccct 404  Q
    ||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  64542 gcaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaaaatt--acatgattgtgataataactaaccccct 64445  T
Q  405 tacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 478  Q
    |||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  64444 taccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattccttaagct 64372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 240 - 410
Target Start/End: Original strand, 107914 - 108084
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 339  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  107914 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaattgttcatcaa 108013  T
Q  340 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  108014 cccattttcatacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattataatgataactaacccccttacctt 108084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 90125 - 90085
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  90125 tttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 90085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 212 - 478
Target Start/End: Original strand, 177 - 438
Alignment:
Q  212 cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagag 311  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||||    
T  177 cataacttatcatttttacatattt--aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagag 274  T
Q  312 cacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttaccttt 411  Q
    |||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  275 cacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatataacatgag-caatgcaaa-at--tacatgattttgataataactaacccccttacctta 370  T
Q  412 gaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct 478  Q
    ||||| ||||| ||| ||| || ||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  371 gaagaagattaatccaaactctcgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagct 438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Original strand, 30049 - 30090
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  30049 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 30090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 192 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 23884 - 23600
Alignment:
Q  192 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaaga 291  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||    
T  23884 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaatccatgtataaga 23785  T
Q  292 aaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 391  Q
    ||  | || || | | |||||||||||||  ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  ||| ||||||||    
T  23784 aacaa-caacataaccagagcacgaatttgacatgagttgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgaatatgataa 23686  T
Q  392 taactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 478  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  23685 taactaacccccttaacttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagttcctaagtcaccc-acttgattcctaaagct 23600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 24010 - 23962
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 115  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  24010 atttttcatcatcaatccataattaagtacacccaagttataattcact 23962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 379 - 504
Target Start/End: Original strand, 130880 - 131005
Alignment:
Q  379 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 478  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  130880 atgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattatgcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccccaattgattcctcaagct 130979  T
Q  479 ttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  130980 ttcccttcaacactcttgttcttctc 131005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 89550 - 89460
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  89550 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaatt 89460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 192 - 410
Target Start/End: Original strand, 7330 - 7547
Alignment:
Q  192 tcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaaga 291  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||     
T  7330 tcattaattaggcaaaatttcacaacttgacatttatacatacattgaaccatgtaatttcatccacaaacataccataatcatcaattcatgtataag- 7428  T
Q  292 aaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataa 391  Q
     || |||| || | |||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |  |||||||||| |    
T  7429 caacagcaacataacaagagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaagatgtaaaatttgaaattgattatgatga 7528  T
Q  392 taactaacccccttacctt 410  Q
     ||| ||||||||||||||    
T  7529 aaacaaacccccttacctt 7547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 115
Target Start/End: Original strand, 7204 - 7252
Alignment:
Q  67 atttctcatcatcaatccacaattaagtatacccaattcataattcact 115  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  7204 atttttcatcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcact 7252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 209 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 9462 - 9266
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 308  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| |||||||||||    
T  9462 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa 9365  T
Q  309 gagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc 408  Q
     |||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9364 aagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacc 9268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 209 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 16360 - 16164
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 308  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| |||||||||||    
T  16360 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaa 16263  T
Q  309 gagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacc 408  Q
     |||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16262 aagcacgaatttgacatgaattgttcatcaacccattttcatacaacatgagcaaatgcaaa-at--tacatgattgtgataataactaacccccttacc 16166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 379 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 17241 - 17127
Alignment:
Q  379 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 478  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17241 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagaagattattattcctaacccttgcttcaattcagctcctaggtcaccccaattgattcctcaagct 17142  T
Q  479 ttcccttcaacactc 493  Q
    |||| ||||||||||    
T  17141 ttcctttcaacactc 17127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 142 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 56294 - 56105
Alignment:
Q  142 acatcaatggaatatgaatcacatctcatttcaatcaaaacatatcaat-ttcatcaattaagcataatttcataacttaacatttatacatactttgaa 240  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||||  | ||| || |||  |||| || || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  56294 acatcaatggaacatgaatcacatatcttttcaacaacaacttagcaaaattcaccatttgagcacaatttcataacttgacatttatacatactttaaa 56195  T
Q  241 acatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  56194 acatgtaatttcagccacaatcatacaattatcatcaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaatt 56105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 191 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 1100 - 803
Alignment:
Q  191 ttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaa 289  Q
    |||||||||| |||| ||||| || ||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |     
T  1100 ttcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac 1003  T
Q  290 gaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaacat--gagaaaatgcaaagattgtacatgattatg 387  Q
     || ||| ||||||||   |||||||||||||||||||||| | ||| | | || || ||||||||||  |||||  || ||||  || | |||||||||    
T  1002 aaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaatt-catacaacatttgagaatttgtaaag--tgaagatgattatg 906  T
Q  388 ataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct-ttccctt 485  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||| |||| ||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  905 ataaagactaacccccttaccttagaagaagattaaccccaactcttgattcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattccctt 806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 240 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 6160 - 5922
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaa 339  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||   |||||||||||||||||||||| | ||| |     
T  6160 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataat 6061  T
Q  340 cccattttcatacaaca--tgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttga-agatgattattcccaacccttgc 436  Q
    | ||  |||||||||||  ||||||  |||||||  || | |||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||| ||| |||||    
T  6060 caca-attcatacaacatttgagaatttgcaaag--tgaaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagataga-gattaatcctaactcttgc 5965  T
Q  437 ttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagct 478  Q
    ||||||||||||||| || | || | |||||||||||||||||    
T  5964 ttcaattcagctcctaagcttactctaattgattcctcaagct 5922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 306 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 12149 - 12045
Alignment:
Q  306 caagagcacgaatttagcaacaattgttcatcaacccattttcatacaac-atgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaaccccct 404  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||  ||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  12149 caagagcacgaatttaacatcaattgttcatcaacccattttcatacaaccatgagaaa-tgaaaaatttgaaattgattatgataataactaaccccct 12051  T
Q  405 tacctt 410  Q
    ||||||    
T  12050 tacctt 12045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 207 - 330
Target Start/End: Original strand, 3324 - 3447
Alignment:
Q  207 aatttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagc 306  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| |||||||||| |  ||  || |||||||||    
T  3324 aatttcataacttgatatttatacatactttgaaatatgtaatttcaccaacaatcatacaaatatcattaattcatgcatacaaacttaacatcacagc 3423  T
Q  307 aagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
     ||||||||||||||||| |||||    
T  3424 tagagcacgaatttagcatcaatt 3447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 335 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 13342 - 13268
Alignment:
Q  335 atcaacccattttcatacaacatgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 410  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13342 atcaacccattt-catacaacatgagaaaatgcaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttacctt 13268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 379 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 108107 - 107980
Alignment:
Q  379 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagc 477  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||| | |||||    ||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||| ||    
T  108107 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaattccaacttaggcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcacgc 108008  T
Q  478 t-ttcccttcaacactcttgttcatctc 504  Q
    | ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  108007 tattctcttcaaaacccttgttcttctc 107980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 13582 - 13541
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  13582 ttcaccaatttcacaaaaccactaacaacaatccatttctca 13541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 240 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 34556 - 34374
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttca---- 335  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||| | ||        
T  34556 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaataattatccattca 34457  T
Q  336 ------tcaacccattttcatacaac--atgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctt 410  Q
          ||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||  | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34456 ttcaattcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaataaatgaacatgattatgataataactaaccctcttacctt 34374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 77
Target Start/End: Original strand, 4899 - 4943
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatca 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4899 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcatca 4943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 386 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 154373 - 154282
Alignment:
Q  386 tgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctcctaggtcacccaaattgattcctcaagct 478  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||    
T  154373 tgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagtcaccc-acttgattcctaaagct 154282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 209 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 3707 - 3588
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 308  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||       
T  3707 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttg 3610  T
Q  309 gagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  3609 gagcacgaatttagcaacaatt 3588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 330
Target Start/End: Original strand, 1262 - 1381
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 308  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| || || ||||||||||||| |  || ||| ||||| ||       
T  1262 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatactaacatatcatcaaagttg 1359  T
Q  309 gagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  1360 gagcacgaatttagcaacaatt 1381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 330
Target Start/End: Original strand, 13625 - 13763
Alignment:
Q  191 ttcatcaattaagcataattt-cataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaa 289  Q
    |||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| |||||| ||   |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |     
T  13625 ttcatcaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac 13722  T
Q  290 gaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
     || ||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  13723 aaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaatt 13763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 379 - 411
Target Start/End: Original strand, 42677 - 42709
Alignment:
Q  379 atgattatgataataactaacccccttaccttt 411  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42677 atgattatgataaaaactaacccccttaccttt 42709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 210 - 336
Target Start/End: Original strand, 5668 - 5792
Alignment:
Q  210 ttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaag 309  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   |    
T  5668 ttcatgacttatcatttttacatattt--aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttgg 5765  T
Q  310 agcacgaatttagcaacaattgttcat 336  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  5766 agcacgaatttagcaacaattattcat 5792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 239 - 330
Target Start/End: Original strand, 12279 - 12370
Alignment:
Q  239 aaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12279 aaacatgtattttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttagagcacgaatttagcaacaatt 12370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 630 - 540
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  630 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaatt 540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 330
Target Start/End: Original strand, 41815 - 41905
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  41815 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaatt 41905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 330
Target Start/End: Original strand, 9016 - 9106
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  9016 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagatggagcacgaatttagcaacaatt 9106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 330
Target Start/End: Original strand, 148859 - 148978
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 308  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||       
T  148859 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttg 148956  T
Q  309 gagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    |||||| |||||| ||||||||    
T  148957 gagcacaaatttaacaacaatt 148978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 330
Target Start/End: Original strand, 19344 - 19463
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 308  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||       
T  19344 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttg 19441  T
Q  309 gagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19442 gagcacgaatttagcaacaatt 19463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 330
Target Start/End: Original strand, 21428 - 21547
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 308  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||       
T  21428 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttg 21525  T
Q  309 gagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21526 gagcacgaatttagcaacaatt 21547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 452
Target Start/End: Original strand, 22706 - 22930
Alignment:
Q  239 aaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttca--- 335  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||       
T  22706 aaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattattcattc 22805  T
Q  336 -------tcaacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcc 426  Q
           |||||||| |||||| |||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  ||    
T  22806 attcatttcaaccca-tttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagacc 22904  T
Q  427 caacccttgcttcaattcagctccta 452  Q
     ||||   ||||||||| ||||||||    
T  22905 aaacctaggcttcaatttagctccta 22930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 452
Target Start/End: Original strand, 26961 - 27185
Alignment:
Q  239 aaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcat-- 336  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||| | |||      
T  26961 aaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattc 27060  T
Q  337 --------caacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcc 426  Q
            |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  ||    
T  27061 attcatttcaacccattt-catccaaatcatgaaaaattgcaaagaaggaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagacc 27159  T
Q  427 caacccttgcttcaattcagctccta 452  Q
     ||||   ||||||||| ||||||||    
T  27160 aaacctaggcttcaatttagctccta 27185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 8272 - 8186
Alignment:
Q  244 tgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    |||||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||| |  || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8272 tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcaccaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaatt 8186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 240 - 330
Target Start/End: Original strand, 48354 - 48444
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||| ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  48354 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaatt 48444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 240 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 51278 - 51188
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  51278 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaatt 51188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 240 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 123260 - 123170
Alignment:
Q  240 aacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |  || ||| |||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  123260 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaatt 123170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 37038 - 36919
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 308  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||| | ||| || |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||       
T  37038 tttcacaacttatcatttttacata-tttgaa-catgtaatttcaccaacaagcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttg 36941  T
Q  309 gagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  36940 gagcacgaatttaacaacaatt 36919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 81
Target Start/End: Original strand, 6514 - 6550
Alignment:
Q  45 acaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  6514 acaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 6550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 6383 - 6339
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6383 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 6339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 31580 - 31536
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  31580 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 31536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Original strand, 41264 - 41308
Alignment:
Q  30 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  41264 aacttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 41308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 37163 - 37072
Alignment:
Q  239 aaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
T  37163 aaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatt 37072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 77136 - 77092
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatca 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  77136 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatca 77092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 1679 - 1455
Alignment:
Q  239 aaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaattgttcat-- 336  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||| | |||      
T  1679 aaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccattc 1580  T
Q  337 --------caacccattttcatacaa--catgagaaaatgcaaagattgtacatgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcc 426  Q
            |||||||||| ||| |||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  ||    
T  1579 attcatttcaacccattt-catccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaacatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagacc 1481  T
Q  427 caacccttgcttcaattcagctccta 452  Q
     ||||   ||||||||| ||||||||    
T  1480 aaacctaggcttcaatttagctccta 1455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 330
Target Start/End: Original strand, 9016 - 9135
Alignment:
Q  209 tttcataacttaacatttatacatactttgaaacatgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaa 308  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||| |||| | ||| || |||||| ||||||||| |  || ||| |||||||        
T  9016 tttcacaacttaacatttttacataattg--aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcgattcatgcatacaaacataacatcacaaatg 9113  T
Q  309 gagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9114 gagcacgaatttagcaacaatt 9135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1734
Description:

Target: scaffold1734; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Original strand, 1357 - 1398
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1357 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 1398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 162476 - 162435
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctca 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  162476 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctca 162435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 166554 - 166523
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaat 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166554 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaat 166523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 116802 - 116758
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatca 77  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  116802 ttcaccaattttacaaaaccaccaacaacaatccatttttcatca 116758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 81
Target Start/End: Original strand, 2421 - 2461
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  2421 tttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 2461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 64
Target Start/End: Original strand, 171865 - 171896
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaat 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  171865 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaat 171896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 64
Target Start/End: Original strand, 177568 - 177599
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaat 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  177568 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaat 177599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 379 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 910 - 837
Alignment:
Q  379 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 452  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||    ||||||||| ||||||||    
T  910 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctccta 837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 379 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 9914 - 9841
Alignment:
Q  379 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcccaacccttgcttcaattcagctccta 452  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||    ||||||||| ||||||||    
T  9914 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctccta 9841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0253
Description:

Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 81
Target Start/End: Original strand, 7372 - 7408
Alignment:
Q  45 acaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  7372 acaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 7408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 81
Target Start/End: Original strand, 16797 - 16833
Alignment:
Q  45 acaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16797 acaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 16833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 2597 - 2557
Alignment:
Q  41 tttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  2597 tttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 2557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 242 - 330
Target Start/End: Original strand, 41898 - 41986
Alignment:
Q  242 catgtaatttcacccacaaacataccataatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaatt 330  Q
    |||||||||||||| ||||    || || |||||||||||||||| |  || ||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  41898 catgtaatttcaccaacaatatgacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaatt 41986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 81
Target Start/End: Original strand, 1308 - 1344
Alignment:
Q  45 acaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  1308 acaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaa 1344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 23949 - 23913
Alignment:
Q  45 acaaaaccaccaacaacaatttatttctcatcatcaa 81  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  23949 acaaaaccaacaacaacaatttatttttcatcatcaa 23913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 73
Target Start/End: Original strand, 271985 - 272025
Alignment:
Q  33 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttatttctc 73  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  271985 ttcactaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctc 272025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University