View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11461_low_15 (Length: 373)

Name: NF11461_low_15
Description: NF11461
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11461_low_15
NF11461_low_15
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (10-340)||(20333663-20334001)
chr1 (9-312)||(14692162-14692473)
chr1 (9-312)||(14694844-14695155)
chr1 (9-312)||(14697528-14697839)
chr1 (9-286)||(14700209-14700494)
chr1 (10-340)||(20467458-20467796)
chr1 (9-340)||(16201276-16201615)
chr1 (11-363)||(21890997-21891357)
chr1 (13-295)||(51644941-51645230)
chr1 (9-312)||(41786580-41786890)
chr1 (9-286)||(10969371-10969656)
chr1 (9-286)||(28156433-28156717)
chr1 (9-282)||(28591813-28592093)
chr1 (32-282)||(3647879-3648136)
chr1 (8-286)||(10951820-10952106)
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (9-363)||(24585616-24585978)
chr4 (14-340)||(15234500-15234834)
chr4 (8-340)||(15379482-15379822)
chr4 (8-334)||(15275870-15276204)
chr4 (8-312)||(14671699-14672011)
chr4 (68-340)||(1906949-1907229)
chr4 (24-312)||(17019738-17020034)
chr4 (9-312)||(36323583-36323893)
chr4 (9-312)||(36337792-36338102)
chr4 (9-363)||(54840050-54840410)
chr4 (9-312)||(6576545-6576856)
chr4 (9-312)||(14752762-14753072)
chr4 (9-286)||(27156572-27156856)
chr4 (9-363)||(20331681-20332041)
chr4 (9-295)||(5701255-5701548)
chr4 (9-286)||(31119756-31120040)
chr4 (9-297)||(39857339-39857634)
chr4 (9-282)||(18793889-18794169)
chr4 (9-286)||(21976439-21976723)
chr4 (9-312)||(24119350-24119661)
chr4 (9-286)||(40098879-40099163)
chr4 (9-363)||(5012540-5012902)
chr4 (9-282)||(14105283-14105563)
chr4 (32-320)||(34182226-34182521)
chr4 (9-363)||(33667046-33667407)
chr4 (9-363)||(30760423-30760784)
chr4 (9-189)||(24814547-24814726)
chr4 (4-189)||(24813637-24813822)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (14-340)||(21696427-21696761)
chr2 (8-340)||(27397005-27397345)
chr2 (9-340)||(34268156-34268495)
chr2 (8-340)||(19449644-19449985)
chr2 (9-312)||(23117472-23117783)
chr2 (9-312)||(27427706-27428018)
chr2 (8-312)||(20844591-20844903)
chr2 (12-312)||(28888930-28889238)
chr2 (11-363)||(34297797-34298155)
chr2 (32-312)||(31868065-31868353)
chr2 (9-363)||(37679132-37679492)
chr2 (9-363)||(37694397-37694757)
chr2 (9-363)||(19409718-19410078)
chr2 (9-286)||(13929845-13930129)
chr2 (9-312)||(12662166-12662478)
chr2 (9-363)||(16168126-16168486)
chr2 (9-297)||(37384368-37384663)
chr2 (9-363)||(27810351-27810711)
chr2 (9-363)||(39896717-39897077)
chr2 (9-286)||(16822572-16822856)
chr2 (9-286)||(16898624-16898908)
chr2 (9-286)||(11628419-11628703)
chr2 (9-286)||(32056476-32056760)
chr2 (9-363)||(253886-254246)
chr2 (9-363)||(9343221-9343581)
chr2 (9-363)||(21670407-21670767)
chr2 (8-295)||(31882986-31883280)
chr2 (9-363)||(37932025-37932385)
chr2 (9-286)||(27123224-27123508)
chr2 (9-363)||(3789091-3789452)
chr2 (8-286)||(22921377-22921662)
chr2 (9-286)||(39045116-39045401)
chr2 (14-286)||(12709863-12710142)
chr2 (13-286)||(34161565-34161845)
chr2 (9-363)||(34868282-34868643)
chr2 (9-286)||(27782947-27783231)
chr2 (9-363)||(37945099-37945459)
chr2 (9-363)||(12593462-12593822)
chr2 (8-282)||(40240251-40240532)
chr2 (4-189)||(3790473-3790658)
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (14-340)||(16443138-16443472)
chr7 (9-363)||(26508837-26509198)
chr7 (9-312)||(5154759-5155070)
chr7 (13-340)||(16047981-16048316)
chr7 (8-312)||(5165060-5165372)
chr7 (8-363)||(16511576-16511939)
chr7 (9-312)||(2161248-2161558)
chr7 (9-312)||(11417931-11418242)
chr7 (9-340)||(10848253-10848592)
chr7 (8-312)||(10910077-10910389)
chr7 (9-363)||(26663041-26663401)
chr7 (9-363)||(26678233-26678593)
chr7 (13-363)||(31083756-31084113)
chr7 (9-312)||(2779920-2780230)
chr7 (9-312)||(22148564-22148874)
chr7 (14-286)||(31130618-31130898)
chr7 (9-295)||(45393933-45394226)
chr7 (9-286)||(4138374-4138658)
chr7 (13-286)||(26441967-26442247)
chr7 (9-286)||(16744649-16744933)
chr7 (9-286)||(39206293-39206577)
chr7 (9-286)||(45738003-45738287)
chr7 (9-295)||(31557533-31557827)
chr7 (9-363)||(26519454-26519814)
chr7 (13-286)||(26596378-26596659)
chr7 (9-286)||(4206098-4206382)
chr7 (9-280)||(5140466-5140744)
chr7 (8-286)||(24585663-24585949)
chr7 (4-312)||(3451927-3452243)
chr7 (9-295)||(11447602-11447896)
chr7 (9-286)||(26312992-26313277)
chr7 (14-363)||(26268219-26268574)
chr7 (148-312)||(22152791-22152963)
chr7 (148-312)||(22208706-22208878)
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (9-360)||(27283574-27283924)
chr6 (11-312)||(16756497-16756806)
chr6 (9-312)||(27209575-27209886)
chr6 (9-312)||(27239342-27239653)
chr6 (9-340)||(22928067-22928406)
chr6 (9-286)||(15405743-15406028)
chr6 (9-286)||(15417530-15417815)
chr6 (8-297)||(24870399-24870696)
chr6 (8-312)||(24298972-24299284)
chr6 (13-312)||(26927428-26927735)
chr6 (9-312)||(27025818-27026129)
chr6 (9-311)||(27031698-27032008)
chr6 (4-363)||(27622914-27623272)
chr6 (9-312)||(13292157-13292469)
chr6 (9-312)||(33369643-33369953)
chr6 (9-286)||(4538972-4539256)
chr6 (9-297)||(29508112-29508407)
chr6 (9-278)||(20131229-20131500)
chr6 (9-278)||(22201370-22201641)
chr6 (9-363)||(28214094-28214454)
chr6 (9-286)||(26792518-26792802)
chr6 (9-286)||(27200899-27201183)
chr6 (9-286)||(27248050-27248334)
chr6 (9-312)||(29556232-29556542)
chr6 (8-286)||(13517406-13517691)
chr6 (9-312)||(27014400-27014710)
chr6 (9-363)||(29579660-29580020)
chr6 (9-286)||(30551193-30551477)
chr6 (9-363)||(34457699-34458059)
chr6 (9-286)||(27355296-27355580)
chr6 (9-282)||(28167200-28167480)
chr6 (9-286)||(26109614-26109899)
chr6 (9-286)||(27491840-27492125)
chr6 (9-286)||(4531996-4532280)
chr6 (9-282)||(8898890-8899170)
chr6 (9-282)||(16937219-16937499)
chr6 (9-363)||(26665850-26666210)
chr6 (9-363)||(26771821-26772181)
chr6 (9-282)||(16680865-16681145)
chr6 (9-312)||(14138624-14138924)
chr6 (9-295)||(4779604-4779897)
chr6 (9-363)||(27064127-27064477)
chr6 (9-286)||(4764464-4764738)
chr6 (8-190)||(20175368-20175543)
chr6 (8-190)||(22160448-22160623)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (14-340)||(22895084-22895418)
chr5 (9-340)||(23898552-23898892)
chr5 (9-312)||(23726922-23727233)
chr5 (9-286)||(22992286-22992571)
chr5 (9-312)||(33784167-33784478)
chr5 (9-282)||(11556069-11556350)
chr5 (9-312)||(24976529-24976840)
chr5 (8-312)||(24608930-24609242)
chr5 (9-280)||(13179962-13180241)
chr5 (9-311)||(23632656-23632966)
chr5 (14-340)||(25206966-25207300)
chr5 (14-340)||(25271122-25271456)
chr5 (9-284)||(33299249-33299532)
chr5 (9-312)||(9543874-9544184)
chr5 (9-297)||(6881013-6881308)
chr5 (9-312)||(30941315-30941626)
chr5 (9-295)||(28952941-28953234)
chr5 (9-282)||(43084989-43085262)
chr5 (9-363)||(15752004-15752364)
chr5 (13-286)||(18121583-18121864)
chr5 (9-312)||(15651907-15652217)
chr5 (9-286)||(32589421-32589705)
chr5 (9-286)||(37351810-37352094)
chr5 (9-363)||(30036081-30036441)
chr5 (8-286)||(33881837-33882122)
chr5 (9-363)||(37761629-37761989)
chr5 (9-286)||(31438168-31438452)
chr5 (9-286)||(33523115-33523399)
chr5 (9-286)||(37745495-37745779)
chr5 (9-286)||(18493914-18494198)
chr5 (9-312)||(2517750-2518060)
chr5 (9-363)||(40466695-40467055)
chr5 (9-295)||(30158742-30159035)
chr5 (9-286)||(31819567-31819851)
chr5 (9-295)||(8658639-8658932)
chr5 (9-286)||(34623230-34623514)
chr5 (8-274)||(5644543-5644816)
chr5 (9-286)||(13435815-13436099)
chr5 (14-286)||(24730680-24730959)
chr5 (9-286)||(28655976-28656260)
chr5 (9-344)||(3796207-3796548)
chr5 (13-282)||(11330369-11330645)
chr5 (14-363)||(13317977-13318332)
chr5 (9-282)||(18368676-18368956)
chr5 (9-286)||(37664650-37664934)
chr5 (8-286)||(30175199-30175484)
chr5 (9-286)||(9324194-9324479)
chr5 (9-286)||(26487104-26487389)
chr5 (14-297)||(41681405-41681693)
chr5 (9-295)||(12138884-12139177)
chr5 (4-189)||(13178639-13178824)
[»] chr8 (26 HSPs)
chr8 (8-340)||(22074135-22074475)
chr8 (9-312)||(15774251-15774562)
chr8 (9-340)||(22139563-22139902)
chr8 (9-311)||(21341394-21341705)
chr8 (8-338)||(19694767-19695105)
chr8 (9-310)||(14569834-14570143)
chr8 (9-286)||(18797412-18797697)
chr8 (9-312)||(33249040-33249351)
chr8 (9-363)||(16260564-16260926)
chr8 (9-363)||(19654550-19654912)
chr8 (8-312)||(2130491-2130803)
chr8 (8-286)||(19910390-19910676)
chr8 (9-277)||(31361267-31361542)
chr8 (9-312)||(27602137-27602448)
chr8 (9-363)||(29835976-29836336)
chr8 (9-286)||(18716185-18716469)
chr8 (9-363)||(28355161-28355521)
chr8 (9-286)||(33265449-33265733)
chr8 (15-363)||(12085943-12086297)
chr8 (9-363)||(31483080-31483440)
chr8 (9-286)||(19201592-19201877)
chr8 (9-295)||(44567700-44567995)
chr8 (9-363)||(19681109-19681470)
chr8 (9-282)||(9361337-9361616)
chr8 (4-189)||(15775288-15775473)
chr8 (11-107)||(22389094-22389190)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (8-340)||(27966-28304)
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (9-312)||(5658774-5659085)
chr3 (9-363)||(15886026-15886388)
chr3 (9-340)||(16617776-16618116)
chr3 (9-312)||(29142063-29142374)
chr3 (9-340)||(15367877-15368217)
chr3 (9-312)||(18057908-18058219)
chr3 (9-335)||(4690292-4690626)
chr3 (9-310)||(8282769-8283078)
chr3 (9-340)||(22041041-22041381)
chr3 (9-312)||(4728266-4728577)
chr3 (9-312)||(6208535-6208846)
chr3 (9-340)||(19701029-19701368)
chr3 (9-312)||(4789940-4790251)
chr3 (17-320)||(16422839-16423150)
chr3 (9-312)||(22380889-22381200)
chr3 (9-312)||(35887400-35887711)
chr3 (9-312)||(11103671-11103981)
chr3 (9-286)||(15734425-15734710)
chr3 (9-286)||(5020399-5020683)
chr3 (9-286)||(18337290-18337575)
chr3 (9-363)||(24334788-24335148)
chr3 (9-344)||(32297262-32297603)
chr3 (9-312)||(31029553-31029863)
chr3 (9-363)||(10649683-10650042)
chr3 (9-312)||(4339986-4340296)
chr3 (9-312)||(4630421-4630731)
chr3 (9-312)||(18285666-18285976)
chr3 (9-312)||(18300967-18301277)
chr3 (9-282)||(18249410-18249690)
chr3 (9-286)||(28109250-28109534)
chr3 (9-286)||(5717743-5718027)
chr3 (9-286)||(5728653-5728937)
chr3 (9-286)||(5763431-5763715)
chr3 (4-286)||(18231880-18232169)
chr3 (8-286)||(28345859-28346144)
chr3 (9-312)||(32445792-32446102)
chr3 (9-286)||(16404079-16404363)
chr3 (9-286)||(17978238-17978522)
chr3 (9-282)||(21681412-21681692)
chr3 (9-286)||(48472598-48472882)
chr3 (11-286)||(4423584-4423866)
chr3 (9-295)||(6536029-6536323)
chr3 (8-286)||(5589642-5589927)
chr3 (9-363)||(29658254-29658614)
chr3 (9-286)||(20072701-20072985)
chr3 (9-286)||(22864151-22864435)
chr3 (9-286)||(22879210-22879494)
chr3 (9-286)||(5602599-5602884)
chr3 (8-286)||(31957742-31958027)
chr3 (9-282)||(10402844-10403124)
chr3 (13-286)||(20570147-20570427)
chr3 (9-363)||(47030068-47030428)
chr3 (9-282)||(8218317-8218597)
chr3 (9-312)||(5473629-5473929)
chr3 (14-286)||(17970172-17970452)
chr3 (9-363)||(51788634-51788995)
chr3 (42-286)||(28027959-28028210)
chr3 (9-189)||(16599406-16599585)
chr3 (9-189)||(7080022-7080201)
chr3 (199-312)||(7079868-7079981)
chr3 (14-128)||(35221712-35221826)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (14-340)||(444-778)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (9-340)||(12722-13062)
scaffold0322 (9-363)||(2307-2667)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (8-340)||(25814-26154)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (9-312)||(3861-4172)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (9-312)||(33972-34283)
scaffold0143 (14-295)||(10635-10925)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (32-311)||(8929-9217)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (8-312)||(24218-24530)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (9-363)||(14592-14952)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (9-312)||(12716-13026)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (9-295)||(8187-8480)
[»] scaffold0159 (3 HSPs)
scaffold0159 (9-286)||(2422-2707)
scaffold0159 (9-101)||(23842-23935)
scaffold0159 (238-286)||(18534-18582)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (9-282)||(16306-16586)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (9-312)||(39858-40180)
[»] scaffold0685 (1 HSPs)
scaffold0685 (9-112)||(1309-1412)
[»] scaffold0477 (1 HSPs)
scaffold0477 (9-112)||(13221-13324)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (247-312)||(6742-6807)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 10 - 340
Target Start/End: Original strand, 20333663 - 20334001
Alignment:
Q  10 tgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgca 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  20333663 tgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 20333762  T
Q  110 tgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaat 201  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||    
T  20333763 tgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaat 20333862  T
Q  202 cctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgcta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  20333863 cctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgctg 20333962  T
Q  302 gggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggt 340  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  20333963 gggataatgccatcactgctgggcatttcagtgctgggt 20334001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Original strand, 14692162 - 14692473
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  14692162 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 14692261  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  14692262 atggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 14692361  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||    
T  14692362 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 14692461  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  14692462 gggaataatgcc 14692473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Original strand, 14694844 - 14695155
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  14694844 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 14694943  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  14694944 atggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 14695043  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||    
T  14695044 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 14695143  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  14695144 gggaataatgcc 14695155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Original strand, 14697528 - 14697839
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  14697528 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 14697627  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  14697628 atggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 14697727  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||    
T  14697728 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 14697827  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  14697828 gggaataatgcc 14697839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Original strand, 14700209 - 14700494
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  14700209 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 14700308  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  14700309 atggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 14700408  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14700409 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 14700494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 20467796 - 20467458
Alignment:
Q  10 tgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgca 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  20467796 tgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 20467697  T
Q  110 tgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaat 201  Q
    |||  |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |        || | |||||    
T  20467696 tgactgttggcagcttgtagacaccgtttcgtagagacagacaaggcattggagtattggccacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaat 20467597  T
Q  202 cctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgcta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||     
T  20467596 cctctttggagataacgtcgttgggagacatatcggaaccatggctgagggtaggtagctatgtaacttgctggggatagaatctcggaagactctgctg 20467497  T
Q  302 gggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggt 340  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||    
T  20467496 gggataatgccgtcatcgctgggcatttcagtgttgggt 20467458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 9 - 340
Target Start/End: Original strand, 16201276 - 16201615
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  16201276 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16201375  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |        || | ||||    
T  16201376 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcatgctatattacacattcctggaaa 16201475  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||    
T  16201476 tcctctttggagataacaccgttgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgcaacttgctgggggtagaatctcggaagactctact 16201575  T
Q  301 agggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggt 340  Q
     ||||||||| | |||||| ||||||| |  |||||||||    
T  16201576 ggggataatgtcgtcattgttgggcatttatgtgctgggt 16201615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 363
Target Start/End: Original strand, 21890997 - 21891357
Alignment:
Q  11 gacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcat 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||| || ||||||     
T  21890997 gacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcctgtaatgcac 21891096  T
Q  111 gatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatc 202  Q
    ||  ||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || | |        ||||||    
T  21891097 gactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacatacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaatc 21891196  T
Q  203 ctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgctag 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| || |    
T  21891197 ctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatctcggaagactctactgg 21891296  T
Q  303 ggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
    | |||||||| ||||| | |||||| ||||||| || | | || | ||| |||||||||||    
T  21891297 gaataatgccgtcattaccgggcatttcagtgccggatgtatcgtggatgtcgcatctgtg 21891357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 51645230 - 51644941
Alignment:
Q  13 cattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  51645230 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 51645131  T
Q  113 tggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcct 204  Q
      ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||    
T  51645130 ctgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcct 51645032  T
Q  205 ctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagact 295  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  51645031 ctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggagatagaatcttggaagact 51644941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Original strand, 41786580 - 41786890
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  41786580 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 41786679  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  41786680 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacgtcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 41786778  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||   |||||| | ||    
T  41786779 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccacggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttgaaagactttact 41786878  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     |||||||||||    
T  41786879 ggggataatgcc 41786890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 10969656 - 10969371
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  10969656 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 10969557  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 199  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || | |        |||    
T  10969556 catgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtgactcgtgctatattacacattcttggaa 10969458  T
Q  200 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10969457 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgccacttgctggggatagaatct 10969371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 28156717 - 28156433
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  28156717 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 28156618  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  28156617 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 28156519  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28156518 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 28156433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 28592093 - 28591813
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  28592093 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 28591994  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  28591993 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 28591895  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 282  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  28591894 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggctggtaggtatgtaacttgctagggataga 28591813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 32 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 3648136 - 3647879
Alignment:
Q  32 atggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagac 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |    
T  3648136 atggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggc 3648037  T
Q  132 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgtcgtt 223  Q
    ||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | |        || ||||||| ||||||| ||||||||    
T  3648036 acgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgtt 3647938  T
Q  224 gggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  3647937 gggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgtaacttgctggggataga 3647879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 10952106 - 10951820
Alignment:
Q  8 attgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaat 106  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||    
T  10952106 attgatattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaat 10952007  T
Q  107 gcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------ga 198  Q
    ||||||  ||||||||||||||| |||   ||  | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||    
T  10952006 gcatgactgttggcagtttgtaggcacgactttacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgga 10951908  T
Q  199 aatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  10951907 aatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccacggctgagggcaggtagctaaacaacttgctggagatagaatct 10951820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Original strand, 24585616 - 24585978
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  24585616 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 24585715  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  24585716 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 24585815  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||    
T  24585816 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcagatagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 24585915  T
Q  301 agggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
     || |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  24585916 gggaataatgccgtcattgccgggcatttcagtgctgggtatgttgtagatatcgcatctgtg 24585978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15234834 - 15234500
Alignment:
Q  14 attggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgat 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||    
T  15234834 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatggtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgat 15234735  T
Q  114 ggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctc 205  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||    
T  15234734 tgtgggcagcttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctc 15234635  T
Q  206 tttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgctaggga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  15234634 tttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctgctgggga 15234535  T
Q  306 taatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggt 340  Q
    ||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||    
T  15234534 taatgccgtcatcgctgggcattttagtgctgggt 15234500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 8 - 340
Target Start/End: Original strand, 15379482 - 15379822
Alignment:
Q  8 attgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| || ||| | ||||| ||||    
T  15379482 attgacattggaaatgcaacatgtatgggtggtataatagttttattaaatgtatggacacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaacgcttgtaatg 15379581  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaa 199  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||        | |||    
T  15379582 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggaatattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaa 15379681  T
Q  200 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgc 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  15379682 atcctctttggatataacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctgc 15379781  T
Q  300 tagggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggt 340  Q
    | | ||||||||| |||| ||||||||| | |||| |||||    
T  15379782 tggagataatgccgtcatcgctgggcattttagtgttgggt 15379822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 8 - 334
Target Start/End: Original strand, 15275870 - 15276204
Alignment:
Q  8 attgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  15275870 attgacattggaaatgcaacatgtataggtggtataatagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 15275969  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaa 199  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        | |||    
T  15275970 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaa 15276069  T
Q  200 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgc 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||| ||    
T  15276070 atcctctttggagataacgttgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgacttgctggggacagaatctcggaagactccgc 15276169  T
Q  300 tagggataatgccctcattgctgggcatgtcagtg 334  Q
    ||| |||||| || |||| ||| ||||| ||||||    
T  15276170 tagagataataccgtcatcgctaggcatttcagtg 15276204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 8 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 14672011 - 14671699
Alignment:
Q  8 attgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  14672011 attgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 14671912  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 199  Q
    || ||  ||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | |||    
T  14671911 cacgactgttggcgatttgtggacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaa 14671812  T
Q  200 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgc 299  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  14671811 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctac 14671712  T
Q  300 tagggataatgcc 312  Q
    |||| ||||||||    
T  14671711 taggaataatgcc 14671699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 68 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 1907229 - 1906949
Alignment:
Q  68 cataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtatt 167  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1907229 cataatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggtagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtatt 1907130  T
Q  168 gggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtag 259  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |        |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1907129 gggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcattgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtag 1907030  T
Q  260 ctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgctagggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  1907029 ctatgcaacttgctggggatagaatctcggaaggctctactggggataatgccgtcattgctgggcatttcagtgctgggt 1906949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 24 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 17020034 - 17019738
Alignment:
Q  24 caacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagt 123  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |    
T  17020034 caacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgat 17019935  T
Q  124 ttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagata 215  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |        || | ||||||||||||||||||     
T  17019934 ttgtagacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatg 17019835  T
Q  216 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgctagggataatgcc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||||||    
T  17019834 acgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgcc 17019738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Original strand, 36323583 - 36323893
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  36323583 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatgtgcatgattatgcatgcatgaatgcttgtaatgc 36323682  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  36323683 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 36323781  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  36323782 tcctccttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggcatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 36323881  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  36323882 gggaataatgcc 36323893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Original strand, 36337792 - 36338102
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  36337792 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatgtgcatgattatgcatgcatgaatgcttgtaatgc 36337891  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  36337892 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 36337990  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  36337991 tcctccttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggcatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 36338090  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  36338091 gggaataatgcc 36338102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 54840410 - 54840050
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  54840410 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 54840311  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  54840310 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattggattattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 54840212  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |  ||    
T  54840211 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacccgact 54840112  T
Q  301 agggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
     |||| || ||| |   |||||||||| |||| |||||||||||  |||| || |||||||||    
T  54840111 ggggaaaacgccgt-tgtgctgggcatttcagcgctgggtatgttgtagacattgcatctgtg 54840050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 6576856 - 6576545
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  6576856 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 6576757  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   |||   | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  6576756 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcatgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 6576658  T
Q  201 tcctc-tttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgc 299  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |    
T  6576657 tcctcttttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaagtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactccac 6576558  T
Q  300 tagggataatgcc 312  Q
    | |||||||||||    
T  6576557 tggggataatgcc 6576545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Original strand, 14752762 - 14753072
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  14752762 ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 14752861  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  14752862 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 14752960  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  14752961 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 14753060  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  14753061 gggaataatgcc 14753072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Original strand, 27156572 - 27156856
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27156572 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27156671  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  27156672 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggaga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27156770  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27156771 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatct 27156856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Original strand, 20331681 - 20332041
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  20331681 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 20331780  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  20331781 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 20331879  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctg-c 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |    
T  20331880 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac-ctgac 20331978  T
Q  300 tagggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
    | |||| |||||| |   |||||||||| ||||||||||||||||  |||| || |||||||||    
T  20331979 tggggaaaatgccgt-tgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtg 20332041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 5701548 - 5701255
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  5701548 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5701449  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  5701448 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 5701350  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagact 295  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  5701349 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagact 5701255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Original strand, 31119756 - 31120040
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  31119756 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 31119855  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  31119856 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 31119954  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31119955 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatct 31120040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 39857634 - 39857339
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  39857634 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 39857535  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||     
T  39857534 atgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaat 39857436  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactct 297  Q
    || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  39857435 tcttctgtggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactct 39857339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 282
Target Start/End: Original strand, 18793889 - 18794169
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  18793889 ttgacattggaaatgcgatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 18793988  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  18793989 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 18794087  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 282  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  18794088 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggataga 18794169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 21976723 - 21976439
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  21976723 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 21976624  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  21976623 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagatatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 21976525  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21976524 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatct 21976439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 24119661 - 24119350
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  24119661 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 24119562  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata---------gaa 199  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |          ||    
T  24119561 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaaa 24119463  T
Q  200 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgc 299  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  24119462 atcctctttggagatgacatcgttgggagacgtatcgggaccaaggctgagggccagtagatatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctac 24119363  T
Q  300 tagggataatgcc 312  Q
    | || ||||||||    
T  24119362 tgggaataatgcc 24119350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Original strand, 40098879 - 40099163
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  40098879 ttgatattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 40098978  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||| | ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  40098979 atgactgttggtattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 40099077  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  40099078 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatct 40099163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 5012902 - 5012540
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcatt-aaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  5012902 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcatttaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 5012803  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattggg-cacgtagtggctcgtgctacatcata--------ga 198  Q
    | |||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| || | |        ||    
T  5012802 cgtgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtgttggggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgga 5012704  T
Q  199 aatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatc-tgagaagactct 297  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |     
T  5012703 aatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccacggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgag-agacccg 5012605  T
Q  298 gctagggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
     || |||||||  || |   ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5012604 actggggataacaccat-tgtgctgggcatgtcagcgctgggtatgtcgtagatatcgcatctgtg 5012540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 14105563 - 14105283
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  14105563 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 14105464  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  || |||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        || |    
T  14105463 atgactgtgggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaga 14105365  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 282  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  14105364 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggtcggtaggtatgtaacttgctggggataga 14105283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 32 - 320
Target Start/End: Original strand, 34182226 - 34182521
Alignment:
Q  32 atggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagac 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| || |||| |    
T  34182226 atggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcaattcgtaggc 34182325  T
Q  132 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgtcgtt 223  Q
    ||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || | |        |||||||||||||||||| ||||||||    
T  34182326 acgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacatagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgtt 34182424  T
Q  224 gggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgctagggataatgccctcattgc 320  Q
    ||||||||| |||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||| || || |||||||| |||||||    
T  34182425 gggagacgtgtcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagagtcttgggagactctactgggaataatgccgtcattgc 34182521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Original strand, 33667046 - 33667407
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||| ||||    
T  33667046 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgtaatg 33667145  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 199  Q
    |||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  33667146 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 33667244  T
Q  200 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgc 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | |    
T  33667245 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttac 33667344  T
Q  300 tagggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
    | |||| || ||| |   |||||||||| ||||||||||||| ||  |||| || |||||||||    
T  33667345 tggggaaaacgccgt-tgtgctgggcatttcagtgctgggtacgttgtagacattgcatctgtg 33667407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 30760784 - 30760423
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||| ||||    
T  30760784 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgtaatg 30760685  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 199  Q
    |||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  30760684 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 30760586  T
Q  200 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgc 299  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | |    
T  30760585 atcctttttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttac 30760486  T
Q  300 tagggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
    | |||| || ||| |   |||||||||| ||||||||||||| ||  |||| || |||||||||    
T  30760485 tggggaaaacgccgt-tgtgctgggcatttcagtgctgggtacgttgtagacattgcatctgtg 30760423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 189
Target Start/End: Original strand, 24814547 - 24814726
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  24814547 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 24814646  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 189  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||  | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24814647 atgactgttggcattttgtaggcacgactttacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 24814726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Original strand, 24813637 - 24813822
Alignment:
Q  4 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttg 102  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | ||  ||||||||||||| |||| |||||| ||| |||    
T  24813637 tgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattg 24813736  T
Q  103 aaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 189  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||   |||   | || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24813737 aaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcatgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgcta 24813822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 21696427 - 21696761
Alignment:
Q  14 attggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgat 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||     
T  21696427 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgac 21696526  T
Q  114 ggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaatcctc 205  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | |||||||||    
T  21696527 tgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcaatattacacattcctggaaatcctc 21696626  T
Q  206 tttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgctaggga 305  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| || ||||    
T  21696627 tttggagataacgccgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaaggctctactgggga 21696726  T
Q  306 taatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggt 340  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  21696727 taatgccgtcattgctgggcatttcagtgctgggt 21696761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 8 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 27397345 - 27397005
Alignment:
Q  8 attgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  27397345 attgacattggaaatgcaacatgtatggatggtataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 27397246  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaa 199  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        | |||    
T  27397245 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgtagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaa 27397146  T
Q  200 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgc 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  27397145 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactccgc 27397046  T
Q  300 tagggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggt 340  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||    
T  27397045 tggggataatgccgtcatcgctgggcatttcagtgttgggt 27397005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 9 - 340
Target Start/End: Original strand, 34268156 - 34268495
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  34268156 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 34268255  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaa 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | ||||    
T  34268256 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcctggaaa 34268355  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  34268356 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 34268455  T
Q  301 agggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggt 340  Q
     ||||||||||  ||||||| | |||| ||||||||||||    
T  34268456 ggggataatgctgtcattgccgagcatttcagtgctgggt 34268495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 8 - 340
Target Start/End: Original strand, 19449644 - 19449985
Alignment:
Q  8 attgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    |||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| || |    
T  19449644 attgacattgaaaatgcaatatacatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacg 19449743  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaa 199  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||        |||||    
T  19449744 catgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgcgctatatcacacattcttagaa 19449843  T
Q  200 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagc-tatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  19449844 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcgggtagcatatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactccg 19449943  T
Q  299 ctagggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggt 340  Q
    || | |||||| || |||| ||||||||| |||||| |||||    
T  19449944 ctggagataataccgtcatcgctgggcatttcagtgttgggt 19449985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 23117783 - 23117472
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||| ||| |||||    
T  23117783 ttgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgtttgtaatgc 23117684  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  23117683 atgactgtttgcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 23117584  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||    
T  23117583 tcctctttggagatgacgtcgttgggaggcgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctact 23117484  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  23117483 gggaataatgcc 23117472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Original strand, 27427706 - 27428018
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27427706 ttgacattggaaatgcaacatgcctgaatgatataacagtttcattaaatgcatggacacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27427805  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | ||||    
T  27427806 atgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaa 27427905  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagc-tatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgc 299  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| | |    
T  27427906 tcctccttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagcttatgcaacttgctggggacagaatctcggaagactatac 27428005  T
Q  300 tagggataatgcc 312  Q
    | || ||||||||    
T  27428006 tgggaataatgcc 27428018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 8 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 20844903 - 20844591
Alignment:
Q  8 attgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  20844903 attgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcataggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 20844804  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 199  Q
    || ||  ||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |        || | |||    
T  20844803 cacgactgttggcgatttgtaaacatagttccgcagagacagacaagacactggagtattaggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaa 20844704  T
Q  200 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgc 299  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  20844703 atcatctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctac 20844604  T
Q  300 tagggataatgcc 312  Q
    | || ||||||||    
T  20844603 tgggaataatgcc 20844591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 28889238 - 28888930
Alignment:
Q  12 acattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatg 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||| || ||| |||||||  |||||||    
T  28889238 acattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggtgtgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgttatgcatg 28889139  T
Q  112 atggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcc 203  Q
    |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |        || | |||||||    
T  28889138 actgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagatgttggagtattgggcatgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcc 28889039  T
Q  204 tctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgctagg 303  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| || ||    
T  28889038 tctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactggg 28888939  T
Q  304 gataatgcc 312  Q
     ||||||||    
T  28888938 aataatgcc 28888930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 34298155 - 34297797
Alignment:
Q  11 gacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcat 110  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||    
T  34298155 gacattggaaatgcaaaatgaatggatgatataacagtttcactaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcat 34298056  T
Q  111 gatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatc 202  Q
    ||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||||    
T  34298055 gactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatc 34297957  T
Q  203 ctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgctag 302  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |    
T  34297956 ctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgg 34297857  T
Q  303 ggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
    | | |||||| |   |||||||||| ||||||||||||||||  |||| || |||||||||    
T  34297856 gaaaaatgccgt-tgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtg 34297797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 32 - 312
Target Start/End: Original strand, 31868065 - 31868353
Alignment:
Q  32 atggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagac 131  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||    
T  31868065 atggatgatataacagtctcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtagac 31868164  T
Q  132 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgtcgtt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  31868165 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgtt 31868264  T
Q  224 gggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgctagggataatgcc 312  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||| || || ||||||||    
T  31868265 gggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtaggtatgaaacttgatggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgcc 31868353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Original strand, 37679132 - 37679492
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  37679132 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 37679231  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        || |    
T  37679232 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaga 37679330  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctg-c 299  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |    
T  37679331 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac-ctgac 37679429  T
Q  300 tagggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
    | |||| |||||| |   |||||||||| ||||||||||||||||  |||| || |||||||||    
T  37679430 tggggaaaatgccgt-tgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtg 37679492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Original strand, 37694397 - 37694757
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  37694397 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 37694496  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        || |    
T  37694497 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaga 37694595  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctg-c 299  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |    
T  37694596 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac-ctgac 37694694  T
Q  300 tagggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
    | |||| |||||| |   |||||||||| ||||||||||||||||  |||| || |||||||||    
T  37694695 tggggaaaatgccgt-tgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtg 37694757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Original strand, 19409718 - 19410078
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  19409718 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 19409817  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  19409818 atgaccgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 19409916  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |  ||    
T  19409917 tcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagaccccact 19410016  T
Q  301 agggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
     |||| || ||| |   |||||||||| ||||||||||||||||  |||| || |||||||||    
T  19410017 ggggaaaacgccgt-tgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtg 19410078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Original strand, 13929845 - 13930129
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  13929845 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 13929944  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  13929945 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 13930043  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  13930044 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaaacaacttgctggagatagaatct 13930129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 12662478 - 12662166
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  12662478 ttgatattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcaggggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 12662379  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||  |||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |        || | ||||    
T  12662378 atgactgttggcgatttgtaaacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 12662279  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgc-tggggatagaatctgagaagactctgc 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||  ||||||||| |    
T  12662278 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgcttgaggatagaatctcggaagactctac 12662179  T
Q  300 tagggataatgcc 312  Q
    | || ||||||||    
T  12662178 tgggaataatgcc 12662166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 16168486 - 16168126
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  16168486 ttgacattggaaatgcgatatgtatggatgatataacattttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16168387  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  16168386 atgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 16168288  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctg-c 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |    
T  16168287 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac-ctgac 16168189  T
Q  300 tagggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
    | |||| |||||| |   |||||||||| ||||||||||||||||  |||| || |||||||||    
T  16168188 tggggaaaatgccgt-tgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtg 16168126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 37384663 - 37384368
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  37384663 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 37384564  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  37384563 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaat 37384465  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactct 297  Q
    || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  37384464 tcttctgtggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactct 37384368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 27810711 - 27810351
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27810711 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaataggcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27810612  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  27810611 atgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27810513  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctg-c 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |    
T  27810512 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac-ctgac 27810414  T
Q  300 tagggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
    | |||| |||||| |   |||||||||| ||||||||||||||||  |||| || |||||||||    
T  27810413 tggggaaaatgccgt-tgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtg 27810351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 39897077 - 39896717
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||| | |||||    
T  39897077 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctcgtaatgc 39896978  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| | |   ||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  39896977 atgactgttggcattttgtaggcgcgacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 39896879  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||    
T  39896878 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttggaagactttact 39896779  T
Q  301 agggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
     |||| || ||| |   |||||||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||||||||    
T  39896778 ggggaaaacgccgt-tgtgctgggcatttcagtgctgggtacgttgtggatatcgcatctgtg 39896717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Original strand, 16822572 - 16822856
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  16822572 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16822671  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  16822672 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 16822770  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16822771 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatct 16822856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 16898908 - 16898624
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  16898908 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16898809  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  16898808 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 16898710  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16898709 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatct 16898624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Original strand, 11628419 - 11628703
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  11628419 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcactaaatgcatgggtacgtaatatgtatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 11628518  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  11628519 atgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 11628617  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11628618 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatct 11628703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 32056760 - 32056476
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  32056760 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 32056661  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  32056660 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 32056562  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32056561 tcctctttggagatgacgtcgttgggagatgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatct 32056476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Original strand, 253886 - 254246
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  253886 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 253985  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  253986 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 254084  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctg-c 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |    
T  254085 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatacaacttgctggagatagaatcttggaagac-ctgac 254183  T
Q  300 tagggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
    | |||| |||||| |   |||||| ||| ||||||||||||||||  |||| || |||||||||    
T  254184 tggggaaaatgccgt-tgtgctggacatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtg 254246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Original strand, 9343221 - 9343581
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  9343221 ttgacattggaaatgcgatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 9343320  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || | |        ||||    
T  9343321 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtgactcgtgctatattacacattcttggaaa 9343419  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctg-c 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |    
T  9343420 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac-ctgac 9343518  T
Q  300 tagggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
    | |||| |||||| |   |||||||||| ||||||||||||||||  |||| || |||||||||    
T  9343519 tggggaaaatgccgt-tgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtg 9343581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Original strand, 21670407 - 21670767
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||| |||||    
T  21670407 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgcttatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 21670506  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  21670507 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 21670605  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctg-c 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |    
T  21670606 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac-ctgac 21670704  T
Q  300 tagggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
    | |||| || ||| |   |||||||||| ||||||||||||||||  |||| || |||||||||    
T  21670705 tggggaaaacgccgt-tgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtg 21670767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 31883280 - 31882986
Alignment:
Q  8 attgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  31883280 attgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 31883181  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 199  Q
    |||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  31883180 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 31883082  T
Q  200 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagact 295  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  31883081 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagact 31882986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 37932385 - 37932025
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  37932385 ttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 37932286  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  37932285 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 37932187  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |  ||    
T  37932186 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgact 37932087  T
Q  301 agggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
     |||| || ||| |   |||||||||| |||| |||||||||||  |||| || |||||||||    
T  37932086 ggggaaaacgccgt-tgtgctgggcatttcagcgctgggtatgttgtagacattgcatctgtg 37932025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 27123508 - 27123224
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27123508 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27123409  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  27123408 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27123310  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27123309 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 27123224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 3789452 - 3789091
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  3789452 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattagtatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 3789353  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 199  Q
    |||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  3789352 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 3789254  T
Q  200 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgc 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |  |    
T  3789253 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgac 3789154  T
Q  300 tagggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
    | |||| || ||| |   |||||||||| |||| |||||||||||  |||| || |||||||||    
T  3789153 tggggaaaacgccgt-tgtgctgggcatttcagcgctgggtatgttgtagacattgcatctgtg 3789091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 22921377 - 22921662
Alignment:
Q  8 attgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  22921377 attgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaattttattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 22921476  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 199  Q
    |||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  22921477 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 22921575  T
Q  200 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22921576 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatct 22921662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Original strand, 39045116 - 39045401
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  39045116 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 39045215  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | ||||    
T  39045216 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaa 39045314  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaac-ttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  39045315 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaactttgctggagatagaatct 39045401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 286
Target Start/End: Original strand, 12709863 - 12710142
Alignment:
Q  14 attggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgat 113  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||     
T  12709863 attggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgac 12709962  T
Q  114 ggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctc 205  Q
     ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| || | |        |||||||||    
T  12709963 tgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggcccgtgctatattacacattcttggaaatcctc 12710061  T
Q  206 tttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12710062 tttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgccacttgctggggatagaatct 12710142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 34161845 - 34161565
Alignment:
Q  13 cattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 112  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||| ||| |||||||||    
T  34161845 cattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcgttaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgtttgtaatgcatga 34161746  T
Q  113 tggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaatcct 204  Q
      ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | ||||||||    
T  34161745 ctgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaatcct 34161647  T
Q  205 ctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34161646 ctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagagccaaggctgagggctggtaggtatgcaacttgctggggatagaatct 34161565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 34868643 - 34868282
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  34868643 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 34868544  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 199  Q
    |||||  ||||||| |||||||||||   ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  34868543 catgactgttggcattttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 34868445  T
Q  200 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgc 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | |    
T  34868444 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttac 34868345  T
Q  300 tagggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
    | |||| || ||| |   |||||||||| ||||||||||||| ||  |||| || |||||||||    
T  34868344 tggggaaaacgccgt-tgtgctgggcatttcagtgctgggtacgttgtagacattgcatctgtg 34868282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 27783231 - 27782947
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27783231 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27783132  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  27783131 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27783033  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  27783032 tcctctatggagatgatgtcgttggtagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagaatct 27782947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Original strand, 37945099 - 37945459
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    ||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| | |||||    
T  37945099 ttgacattggaaacgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctggtaatgc 37945198  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||   |||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  37945199 atgactattggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 37945297  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctg-c 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |    
T  37945298 tcctctttggagatgacgtcgttgggagatgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac-ctgac 37945396  T
Q  300 tagggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
    | |||| |||||| |   |||||||||| |||||| |||||||||  |||| || |||||||||    
T  37945397 tggggaaaatgccgt-tgtgctgggcatttcagtgttgggtatgttgtagacattgcatctgtg 37945459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 12593822 - 12593462
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||| |||| || |||||    
T  12593822 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttactaaatgcatgggcacgtaatacgcatgattatgcatgtatgaatgcctgtaatgc 12593723  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  |||| |||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | |        || |    
T  12593722 atgactgttgacagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggaga 12593624  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctg-c 299  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |    
T  12593623 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac-ctgac 12593525  T
Q  300 tagggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
    | |||| |||||| |   |||||||||| ||||||||||||||||  |||| || |||||||||    
T  12593524 tggggaaaatgccgt-tgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtg 12593462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 40240532 - 40240251
Alignment:
Q  8 attgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||| ||||    
T  40240532 attgatattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaaggcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatg 40240433  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 199  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  | | |        ||     
T  40240432 catgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggag 40240334  T
Q  200 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 282  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  40240333 atcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggataga 40240251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 3790658 - 3790473
Alignment:
Q  4 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttg 102  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | ||  ||||||||||||| |||| |||||| ||| |||    
T  3790658 tgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattg 3790559  T
Q  103 aaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 189  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3790558 aaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgcta 3790473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Original strand, 16443138 - 16443472
Alignment:
Q  14 attggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgat 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||     
T  16443138 attggaaatgcaatatgtatggatgatataaaagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgac 16443237  T
Q  114 ggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctc 205  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |        || | |||||||||    
T  16443238 tgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgaagtattgggcatgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctc 16443337  T
Q  206 tttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgctaggga 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  16443338 tttggagataacgtcgttgggagacgtatcggagccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctgctgggga 16443437  T
Q  306 taatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggt 340  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  16443438 taatgccgtcattgctgggcatttcagtgctgggt 16443472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Original strand, 26508837 - 26509198
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||| ||| |||||    
T  26508837 ttgacattgggaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatggttgtaatgc 26508936  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        || | ||||    
T  26508937 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacattacacattcctggaaa 26509036  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||||| |  ||    
T  26509037 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaacttgctgggggtagaatcttggaagacccgact 26509136  T
Q  301 agggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
     ||||||| ||| | | |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26509137 ggggataacgccgtta-tgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagatatcgcatctgtg 26509198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 5155070 - 5154759
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  5155070 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5154971  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  5154970 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 5154871  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||    
T  5154870 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 5154771  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  5154770 gggaataatgcc 5154759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 13 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16048316 - 16047981
Alignment:
Q  13 cattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 112  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||| | || ||| ||||| | |||||||||    
T  16048316 cattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatacatgtatgaatgctcgtaatgcatga 16048217  T
Q  113 tggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcct 204  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||    
T  16048216 ctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcct 16048117  T
Q  205 ctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgctaggg 304  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||    
T  16048116 ctttggagataaagtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctgttgggg 16048017  T
Q  305 ataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggt 340  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||    
T  16048016 ataatgccgtcatcgctgggcatttcagtgttgggt 16047981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 8 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 5165372 - 5165060
Alignment:
Q  8 attgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  5165372 attgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 5165273  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 199  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  5165272 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaa 5165173  T
Q  200 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgc 299  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||| |    
T  5165172 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagagtcttgggagactctac 5165073  T
Q  300 tagggataatgcc 312  Q
    |||||||||||||    
T  5165072 tagggataatgcc 5165060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 8 - 363
Target Start/End: Original strand, 16511576 - 16511939
Alignment:
Q  8 attgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  16511576 attgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 16511675  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 199  Q
    |||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |        || | |||    
T  16511676 catgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatgactcgtgctatattacacattcctggaa 16511775  T
Q  200 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgc 299  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  16511776 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctac 16511875  T
Q  300 tagggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
    | || |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| | | || | ||| |||||||||||    
T  16511876 tgggaataatgccgtcattgccgggcatttcagtgctggatgtatcgtggatgtcgcatctgtg 16511939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 2161558 - 2161248
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  2161558 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 2161459  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  2161458 atgattgttggcagctggtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 2161359  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||    
T  2161358 tcctctttggagacgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggca-gtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 2161260  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  2161259 gggaataatgcc 2161248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Original strand, 11417931 - 11418242
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  11417931 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 11418030  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  11418031 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacgcattcctggaaa 11418130  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||    
T  11418131 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctact 11418230  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  11418231 gggaataatgcc 11418242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10848592 - 10848253
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || | ||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| || ||    
T  10848592 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcagatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgc 10848493  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaa 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||        | ||||    
T  10848492 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgcgctatatcacacattcttggaaa 10848393  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  10848392 tcctctttggagataacgtcattgggagacgtatcggaaccatggctgagggcgggttgctacgcgacttgctggggacagaatctcggaagactctgct 10848293  T
Q  301 agggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggt 340  Q
     | ||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||    
T  10848292 ggagataatgccgtcatcgctgggcatttcagtgttgggt 10848253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 8 - 312
Target Start/End: Original strand, 10910077 - 10910389
Alignment:
Q  8 attgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  10910077 attgacattggaaatgcaatatgtatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 10910176  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 199  Q
    || ||  ||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | |||    
T  10910177 cacgactgttggcgatttgtagacacagttcagcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaa 10910276  T
Q  200 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgc 299  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||| |    
T  10910277 atcctctttggagatgacgttgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgaggatagaatctcgggagactctac 10910376  T
Q  300 tagggataatgcc 312  Q
    | || ||||||||    
T  10910377 tgggaataatgcc 10910389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Original strand, 26663041 - 26663401
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  26663041 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtgatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 26663140  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  26663141 atgactgttggcagtttgtaggcatgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 26663239  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctg-c 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |    
T  26663240 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac-ctgac 26663338  T
Q  300 tagggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
    | |||| |||||| |   |||||||||| ||||||||||||||||  |||| || |||||||||    
T  26663339 tggggaaaatgccgt-tgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtg 26663401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Original strand, 26678233 - 26678593
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  26678233 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtgatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 26678332  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  26678333 atgactgttggcagtttgtaggcatgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 26678431  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctg-c 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |    
T  26678432 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac-ctgac 26678530  T
Q  300 tagggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
    | |||| |||||| |   |||||||||| ||||||||||||||||  |||| || |||||||||    
T  26678531 tggggaaaatgccgt-tgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtg 26678593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 363
Target Start/End: Original strand, 31083756 - 31084113
Alignment:
Q  13 cattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 112  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  31083756 cattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 31083855  T
Q  113 tggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcct 204  Q
       |||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||    
T  31083856 ctattggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcct 31083954  T
Q  205 ctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgc-tggggatagaatc-tgagaagactctgctag 302  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||  |  |    
T  31083955 ctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaaacaacttgcttggggatagaatcttgag-agactccaccgg 31084053  T
Q  303 ggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
    ||| || ||| |   ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31084054 ggaaaacgccgt-tgtgctgggcatgtcagcgctgggtatgtcgtagatatcgcatctgtg 31084113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 2780230 - 2779920
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  2780230 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 2780131  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  2780130 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 2780032  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  2780031 tcctctttgaagatgacgccgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggcatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 2779932  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  2779931 gggaataatgcc 2779920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 22148874 - 22148564
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  22148874 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataatagtttcattaaatgcatgggcacgtaatgtgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 22148775  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  22148774 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 22148676  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||| ||    
T  22148675 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccctggctgagggcaggtaggcatgcaactggctggggataggatctcggaagactctact 22148576  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  22148575 gggaataatgcc 22148564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 31130898 - 31130618
Alignment:
Q  14 attggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgat 113  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||     
T  31130898 attggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgac 31130799  T
Q  114 ggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctc 205  Q
     ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||||||||    
T  31130798 tgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctc 31130700  T
Q  206 tttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaacca-tggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31130699 tttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccaatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 31130618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 45394226 - 45393933
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  45394226 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 45394127  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcataga--------aa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| || | | |        ||    
T  45394126 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcatgctatattacacattcttgggaa 45394028  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagact 295  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  45394027 tcctctttggagatgacgtcgttgagagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggagatagaatcttggaagact 45393933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Original strand, 4138374 - 4138658
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  4138374 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 4138473  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  4138474 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 4138572  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4138573 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatct 4138658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 26442247 - 26441967
Alignment:
Q  13 cattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 112  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  26442247 cattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcgttaaatgcatgggcacgtaatacgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 26442148  T
Q  113 tggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcct 204  Q
      ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||||||    
T  26442147 ctgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcct 26442049  T
Q  205 ctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26442048 ctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgcaacttgctggggatagaatct 26441967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Original strand, 16744649 - 16744933
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  16744649 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16744748  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  16744749 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 16744847  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  16744848 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgacggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatct 16744933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Original strand, 39206293 - 39206577
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  39206293 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 39206392  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  39206393 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 39206491  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39206492 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctgaggatagaatct 39206577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 45738287 - 45738003
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  45738287 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 45738188  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  45738187 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 45738089  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45738088 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaatttgctggggatagaatct 45738003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 295
Target Start/End: Original strand, 31557533 - 31557827
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||| ||||||| |||||    
T  31557533 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattacgcatgtatgaatgcttgtaatgc 31557632  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||        | || | ||||    
T  31557633 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtagctcgtgctatattacaccttcttggaaa 31557731  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgc-tggggatagaatctgagaagact 295  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  31557732 tcctctttggagatggcgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtaaacaacttgcttggggatagaatcttggaagact 31557827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 26519814 - 26519454
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  26519814 ttgacattggaactgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 26519715  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  26519714 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 26519616  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||    
T  26519615 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttact 26519516  T
Q  301 agggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
     |||| || ||| |   |||||||||| ||||||||||||| ||  |||| || |||||||||    
T  26519515 ggggaaaacgccgt-tgtgctgggcatttcagtgctgggtacgttgtagacattgcatctgtg 26519454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 26596659 - 26596378
Alignment:
Q  13 cattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 112  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  || ||| ||||||| |||||||||    
T  26596659 cattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgcatga 26596560  T
Q  113 tggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcct 204  Q
      ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |        || | ||||||||    
T  26596559 ctgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcatgctatattacacattcttggaaatcct 26596461  T
Q  205 ctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaacc-atggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  26596460 ctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccaatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatct 26596378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 4206382 - 4206098
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  4206382 ttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcactaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 4206283  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  4206282 atgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtgttgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 4206184  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4206183 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgccggaaccatggccgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatct 4206098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 280
Target Start/End: Original strand, 5140466 - 5140744
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  5140466 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5140565  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | |        || |    
T  5140566 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggaga 5140664  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggata 280  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  5140665 tcctctatggagatgacgtcattgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggata 5140744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 24585663 - 24585949
Alignment:
Q  8 attgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| || |    
T  24585663 attgatattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacg 24585762  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagaca-ttggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcataga 198  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||   ||  | | || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||    
T  24585763 catgactgttggcagtttgtaggcacgactttacgggga-agacaagacatttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgga 24585861  T
Q  199 aatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24585862 aatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgaaggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatct 24585949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 3452243 - 3451927
Alignment:
Q  4 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttg 102  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | ||  ||||||||||||| |||| |||||| ||| |||    
T  3452243 tgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattg 3452144  T
Q  103 aaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata------ 196  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| | | || || ||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| || | |          
T  3452143 aaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agccaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattct 3452045  T
Q  197 --gaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagac 294  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  3452044 tggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtaccggagccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 3451945  T
Q  295 tctgctagggataatgcc 312  Q
    ||| || || ||||||||    
T  3451944 tctactgggaataatgcc 3451927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 11447896 - 11447602
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||| ||| ||| ||||    
T  11447896 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggcacgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgtttgtaatg 11447797  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 199  Q
    |||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  11447796 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 11447698  T
Q  200 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagact 295  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  11447697 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagact 11447602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Original strand, 26312992 - 26313277
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||| || |||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  26312992 ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataaaagattcattaagtgcacgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 26313091  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||   |||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  26313092 atgactattggcattttgtaggcaagacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 26313190  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgc-tggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  26313191 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaactaaacaacttgcttggggatagaatct 26313277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 363
Target Start/End: Original strand, 26268219 - 26268574
Alignment:
Q  14 attggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | ||  ||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  26268219 attggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattgaaatgcatga 26268318  T
Q  113 tggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcct 204  Q
    |||||| |||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||||||    
T  26268319 tggttgacagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcct 26268417  T
Q  205 ctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgctaggg 304  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | || |||    
T  26268418 ctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgg-acctaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactgggg 26268516  T
Q  305 ataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
    | || ||| |   |||||||||| ||||| ||||||||||  |||| || |||||||||    
T  26268517 aaaacgccgt-tgtgctgggcatttcagtactgggtatgttgtagacattgcatctgtg 26268574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 148 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 22152963 - 22152791
Alignment:
Q  148 agacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaa 239  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22152963 agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaa 22152864  T
Q  240 ccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgctagggataatgcc 312  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||| || || ||||||||    
T  22152863 ccctggctgagggcaggtaggcatgcaactggctggggataggatctcggaagactctactgggaataatgcc 22152791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 148 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 22208878 - 22208706
Alignment:
Q  148 agacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaa 239  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22208878 agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaa 22208779  T
Q  240 ccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgctagggataatgcc 312  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||| || || ||||||||    
T  22208778 ccctggctgagggcaggtaggcatgcaactggctggggataggatctcggaagactctactgggaataatgcc 22208706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 9 - 360
Target Start/End: Original strand, 27283574 - 27283924
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27283574 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27283673  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcatagaaatcctcttt 208  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27283674 atgactgttggcagtttgtagacacagttttgaagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcatagaaatcctcttt 27283773  T
Q  209 ggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaa-tctgagaagactctgctagggata 307  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||  |||||| |||||||||||| |||| |||||| |  || ||||||    
T  27283774 ggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggtagatagctaatcaacttactggggatagaattctg-gaagacccgactggggata 27283872  T
Q  308 atgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatct 360  Q
    | ||| | | |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  27283873 acgccgtta-tgctgggcatttcagtgctgggtacgtcgtagatatcgcatct 27283924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 16756806 - 16756497
Alignment:
Q  11 gacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcat 110  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||    
T  16756806 gacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcat 16756707  T
Q  111 gatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatc 202  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||    
T  16756706 gactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatc 16756607  T
Q  203 ctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgctag 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |    
T  16756606 ctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgg 16756507  T
Q  303 ggataatgcc 312  Q
    | ||||||||    
T  16756506 gaataatgcc 16756497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 27209886 - 27209575
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27209886 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatggttatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27209787  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacat--cata------gaaa 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||       |||    
T  27209786 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagatagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctagattacatattccagtaaa 27209687  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||    
T  27209686 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctact 27209587  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  27209586 gggaataatgcc 27209575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Original strand, 27239342 - 27239653
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27239342 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatggttatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27239441  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacat--cata------gaaa 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||       |||    
T  27239442 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagatagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctagattacatattccagtaaa 27239541  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||    
T  27239542 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctact 27239641  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  27239642 gggaataatgcc 27239653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 9 - 340
Target Start/End: Original strand, 22928067 - 22928406
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||  ||||    
T  22928067 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtgatgc 22928166  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | ||||    
T  22928167 atgactgttggcgatttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaa 22928266  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  22928267 tcctctttggagataacatcgttgggagatgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 22928366  T
Q  301 agggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggt 340  Q
    |||||||||||| || |||| |||||| ||||||| ||||    
T  22928367 agggataatgccgtcgttgccgggcatttcagtgccgggt 22928406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Original strand, 15405743 - 15406028
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  15405743 ttgatattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcgtgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 15405842  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || |  |||    
T  15405843 atgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctgaaaa 15405942  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15405943 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 15406028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Original strand, 15417530 - 15417815
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  15417530 ttgatattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcgtgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 15417629  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || |  |||    
T  15417630 atgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctgaaaa 15417729  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15417730 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 15417815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 8 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 24870696 - 24870399
Alignment:
Q  8 attgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  24870696 attgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 24870597  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 199  Q
    |||||  | ||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | |||    
T  24870596 catgactgctggcgatttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaa 24870497  T
Q  200 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactct 297  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  24870496 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactct 24870399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 312
Target Start/End: Original strand, 24298972 - 24299284
Alignment:
Q  8 attgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  24298972 attgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 24299071  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 199  Q
    |||||  ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |        || | |||    
T  24299072 catgactgttggcgatttgtagacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 24299171  T
Q  200 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgc 299  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  24299172 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctac 24299271  T
Q  300 tagggataatgcc 312  Q
    | || ||||||||    
T  24299272 tgggaataatgcc 24299284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 26927735 - 26927428
Alignment:
Q  13 cattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 112  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  26927735 cattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 26927636  T
Q  113 tggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcct 204  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||    
T  26927635 ctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcct 26927536  T
Q  205 ctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgctaggg 304  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||  ||||| ||||||||||||||||  | ||||||| || ||     
T  26927535 ctttggagataacgccgttgggagacgtatcggaaccaaggctgaggatagatagctaatcaactcgctggggatagaatctcgggagactctactggga 26927436  T
Q  305 ataatgcc 312  Q
    ||||||||    
T  26927435 ataatgcc 26927428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 27026129 - 27025818
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||| |||||    
T  27026129 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgc 27026030  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || |  |||    
T  27026029 atgactgttggcgatttgtagacaaagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctgaaaa 27025930  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||    
T  27025929 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccaaggctgagggccggtagttatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctact 27025830  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  27025829 gggaataatgcc 27025818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27032008 - 27031698
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||| ||| |||||    
T  27032008 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgtttgtaatgc 27031909  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |        || | ||||    
T  27031908 atgactgttggcgatttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagcattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27031809  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||    
T  27031808 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctggggataggatctcggaagactctact 27031709  T
Q  301 agggataatgc 311  Q
     || |||||||    
T  27031708 gggaataatgc 27031698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 363
Target Start/End: Original strand, 27622914 - 27623272
Alignment:
Q  4 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttg 102  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | ||  ||||||||||||| |||| || ||| ||| |||    
T  27622914 tgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgattg 27623013  T
Q  103 aaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcatagaaatc 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623014 aaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcatagaaatc 27623112  T
Q  203 ctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgctag 302  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||| |  || |    
T  27623113 ctctttggagataacgccgttgggagacgtaccagaaccatggctgagggtagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgg 27623212  T
Q  303 ggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
    |||||| ||| | | |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27623213 ggataacgccgtta-tgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagatatcgcatctgtg 27623272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Original strand, 13292157 - 13292469
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||| |||||    
T  13292157 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgc 13292256  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  13292257 atgactgttggcgatttgtagacacaatttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 13292356  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtag-ctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgc 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |    
T  13292357 tcctctttggagatgacgtcgttgggggacgtatcgggaccaaggctgagggccggtagtctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctac 13292456  T
Q  300 tagggataatgcc 312  Q
    | || ||||||||    
T  13292457 tgggaataatgcc 13292469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Original strand, 33369643 - 33369953
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  33369643 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 33369742  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  33369743 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 33369841  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  33369842 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 33369941  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  33369942 gggaataatgcc 33369953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Original strand, 4538972 - 4539256
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  4538972 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 4539071  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  4539072 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 4539170  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4539171 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 4539256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 29508407 - 29508112
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  29508407 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcataattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 29508308  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  29508307 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggaga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 29508209  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactct 297  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  29508208 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgtaacttgctggggatagaatctcggaagactct 29508112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 20131500 - 20131229
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20131500 ttgacattggaaatgcaacatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatggatgcttgaaatgc 20131401  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaa 200  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||       |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||        | ||||    
T  20131400 atgatggttggcaatttgta-agacagtttc------tcagacaagacatcggagtgttgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcctggaaa 20131308  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggca-ggtagctatgcaacttgctgggga 278  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  20131307 tcctctttggagatatcgtcgttgggagacgtatcgaaaccatggctgagggcagggtagttatgcaacttactgggga 20131229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 278
Target Start/End: Original strand, 22201370 - 22201641
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22201370 ttgacattggaaatgcaacatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatggatgcttgaaatgc 22201469  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaa 200  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||       |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||        | ||||    
T  22201470 atgatggttggcaatttgta-agacagtttc------tcagacaagacatcggagtgttgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcctggaaa 22201562  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggca-ggtagctatgcaacttgctgggga 278  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  22201563 tcctctttggagatatcgtcgttgggagacgtatcgaaaccatggctgagggcagggtagttatgcaacttactgggga 22201641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 28214454 - 28214094
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  28214454 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 28214355  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  28214354 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 28214256  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||  |||| || | ||    
T  28214255 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatacaacttgctggaaattgaatctcggaaggctttact 28214156  T
Q  301 agggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
     |||| || ||| | | |||||||||| ||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  28214155 ggggaaaacgccgtta-tgctgggcatttcagtgctgggtacgttgtagacatcgcatctgtg 28214094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 26792802 - 26792518
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  26792802 ttgacattggaaatgcaatattcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 26792703  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  26792702 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 26792604  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26792603 tcctctttggagacgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatct 26792518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 27201183 - 27200899
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27201183 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27201084  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| || | |        ||||    
T  27201083 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgagctatattacaccttcttggaaa 27200985  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27200984 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 27200899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Original strand, 27248050 - 27248334
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27248050 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27248149  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| || | |        ||||    
T  27248150 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgagctatattacaccttcttggaaa 27248248  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27248249 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 27248334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 29556542 - 29556232
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  29556542 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 29556443  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  29556442 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 29556344  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  29556343 tcctttttgaagatgacgccgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcagataggcatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 29556244  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  29556243 gggaataatgcc 29556232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 13517406 - 13517691
Alignment:
Q  8 attgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  13517406 attgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 13517505  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 199  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  13517506 catgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 13517604  T
Q  200 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  13517605 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatct 13517691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 27014710 - 27014400
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27014710 ttgacattggaaatgcagtatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27014611  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  27014610 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27014512  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  27014511 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcgactcgctggggatagaatctcggaagactctact 27014412  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  27014411 gggaataatgcc 27014400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 29580020 - 29579660
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  29580020 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 29579921  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |        || | ||||    
T  29579920 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggcccgtgctatattacacattcttggaaa 29579822  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctg-c 299  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |    
T  29579821 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtgtgcaacttgctggagatagaatcttggaagac-ctgac 29579723  T
Q  300 tagggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
    | |||| |||||| |   |||||||||| ||||||||||||||||  |||| || |||||||||    
T  29579722 tggggagaatgccgt-tgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtg 29579660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Original strand, 30551193 - 30551477
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  30551193 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 30551292  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  30551293 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagatatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 30551391  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30551392 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatct 30551477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Original strand, 34457699 - 34458059
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| || ||    
T  34457699 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgc 34457798  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |        || | ||||    
T  34457799 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacatagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 34457897  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctg-c 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  |||||| ||| |    
T  34457898 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagagtcttggaagac-ctgac 34457996  T
Q  300 tagggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
    | |||| |||||| |   |||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  34457997 tggggaaaatgccgt-tgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacatcgcatctgtg 34458059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Original strand, 27355296 - 27355580
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27355296 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27355395  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  27355396 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27355494  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27355495 tcctctatggagatgacgtcgttgggggacgtatcggagccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatct 27355580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 28167480 - 28167200
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  28167480 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 28167381  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  28167380 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 28167282  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 282  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28167281 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggataga 28167200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Original strand, 26109614 - 26109899
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    ||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  26109614 ttgacattgaaaatgcaatatgcacggatgatataacgatttcattaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 26109713  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||        | || | ||||    
T  26109714 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacaccttcttggaaa 26109812  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgtt-gggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26109813 tcctctttggagatgacgtcgtttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 26109899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 27492125 - 27491840
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27492125 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27492026  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||        | || | ||||    
T  27492025 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtagctcgtgctatattacaccttcttggaaa 27491927  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgc-tggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||    
T  27491926 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggaccatggctgagggcaggtaggtaaacaacttgcttggggatagaatct 27491840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 4532280 - 4531996
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  4532280 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 4532181  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |        || | ||||    
T  4532180 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgagctatattacacattcttggaaa 4532082  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4532081 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggctggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 4531996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 282
Target Start/End: Original strand, 8898890 - 8899170
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  8898890 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 8898989  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | |        || |    
T  8898990 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggaga 8899088  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 282  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  8899089 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggataga 8899170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 282
Target Start/End: Original strand, 16937219 - 16937499
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  16937219 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16937318  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        || |    
T  16937319 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaga 16937417  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 282  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  16937418 ttctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtgacttgctggggataga 16937499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Original strand, 26665850 - 26666210
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    ||||| |||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||     
T  26665850 ttgacgttggaaatgtgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgt 26665949  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  26665950 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatgacacattcttggaaa 26666048  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||  || || ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||    
T  26666049 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggtgggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttact 26666148  T
Q  301 agggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
     |||| || ||| |   |||||||||| ||||||||||||| ||  |||| || |||||||||    
T  26666149 ggggaaaacgccgt-tgtgctgggcatttcagtgctgggtacgttgtagacattgcatctgtg 26666210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Original strand, 26771821 - 26772181
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    ||||| |||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||     
T  26771821 ttgacgttggaaatgtgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgt 26771920  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  26771921 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatgacacattcttggaaa 26772019  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||  || || ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||    
T  26772020 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggtgggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttact 26772119  T
Q  301 agggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
     |||| || ||| |   |||||||||| ||||||||||||| ||  |||| || |||||||||    
T  26772120 ggggaaaacgccgt-tgtgctgggcatttcagtgctgggtacgttgtagacattgcatctgtg 26772181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16681145 - 16680865
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  16681145 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16681046  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||  | | |        || |    
T  16681045 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacatagtggctcgtgctatgttacacattctcggaga 16680947  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 282  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  16680946 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggataga 16680865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Original strand, 14138624 - 14138924
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    ||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||           ||| ||||||| |||||    
T  14138624 ttgacattgaaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgt----------atgaatgcttgtaatgc 14138713  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  14138714 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 14138812  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  14138813 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaactcgctggggatagaatctcggaagactctact 14138912  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  14138913 gggaataatgcc 14138924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 4779897 - 4779604
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  4779897 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacggtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 4779798  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  4779797 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagaattttgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 4779699  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagact 295  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  4779698 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagact 4779604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 27064477 - 27064127
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||           ||| ||||||| |||||    
T  27064477 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcatgtaatatgcatgt----------atgaatgcttgtaatgc 27064388  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  27064387 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27064289  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||| ||||||||||  |||||| |  ||    
T  27064288 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccatggctgagggcaggcaagtatgcgacttgctggagatagaatcttggaagacccgact 27064189  T
Q  301 agggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
     |||| || ||| |   |||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  27064188 ggggaaaacgccgt-tgtgctgggcatttcagcgctgggtatgttatagacattgcatctgtg 27064127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 4764738 - 4764464
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    ||||||||| |||||||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||           ||| ||||||| |||||    
T  4764738 ttgacattgaaaatgcaatatacacggaggatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgt----------atgaatgcttgtaatgc 4764649  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  4764648 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 4764550  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4764549 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatct 4764464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 20175543 - 20175368
Alignment:
Q  8 attgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | | ||||||||||||    
T  20175543 attgacattgggaatgcaaaatgcatggatgatataatagttttattaaatgcatgggcacatagtatgcatgattatgcatgtacgaatgcttgaaatg 20175444  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 190  Q
    || ||||||||| | |||||| | |||||||        ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20175443 cacgatggttggtaatttgta-agacagttt------ttcagacgagacatcggagtattgagcacgtagtggctcgtgctac 20175368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 190
Target Start/End: Original strand, 22160448 - 22160623
Alignment:
Q  8 attgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | | ||||||||||||    
T  22160448 attgacattgggaatgcaaaatgcatggatgatataatagttttattaaatgcatgggcacatagtatgcatgattatgcatgtacgaatgcttgaaatg 22160547  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 190  Q
    || ||||||||| | |||||| | |||||||        ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22160548 cacgatggttggtaatttgta-agacagttt------ttcagacgagacatcggagtattgagcacgtagtggctcgtgctac 22160623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22895418 - 22895084
Alignment:
Q  14 attggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgat 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||     
T  22895418 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgcaatgcatgac 22895319  T
Q  114 ggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctc 205  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||    
T  22895318 tgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagtcattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctc 22895219  T
Q  206 tttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgctaggga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||    
T  22895218 tttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcagatagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggga 22895119  T
Q  306 taatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggt 340  Q
    | ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  22895118 tgatgccatcattgttgggcatttcagtgctgggt 22895084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 23898892 - 23898552
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  || | | ||||||| ||||     
T  23898892 ttgacattgaaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcatcaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtacgaatgcttgtaatgt 23898793  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | ||||    
T  23898792 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaa 23898693  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgc-tggggatagaatctgagaagactctgc 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |    
T  23898692 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgcttggggatagaatctcggaagactctac 23898593  T
Q  300 tagggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggt 340  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  23898592 tggggataatgccgtcattgccgggcatttcagtgccgggt 23898552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 23727233 - 23726922
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  23727233 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 23727134  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  23727133 atgactgtcggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 23727034  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||    
T  23727033 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 23726934  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  23726933 gggaataatgcc 23726922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Original strand, 22992286 - 22992571
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||| |||||    
T  22992286 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgc 22992385  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  22992386 atgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 22992485  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22992486 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 22992571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 33784478 - 33784167
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  33784478 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 33784379  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  33784378 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacgcattcctggaaa 33784279  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||   | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||    
T  33784278 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaagttgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 33784179  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  33784178 gggaataatgcc 33784167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 9 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 11556350 - 11556069
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  11556350 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 11556251  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  11556250 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacgcattcctggaaa 11556151  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 282  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11556150 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggataga 11556069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 24976840 - 24976529
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  24976840 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 24976741  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |        || | ||||    
T  24976740 atgactgttggcgatttgtagacacagttctgcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 24976641  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  24976640 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 24976541  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  24976540 gggaataatgcc 24976529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 24609242 - 24608930
Alignment:
Q  8 attgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  24609242 attgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 24609143  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 199  Q
    || ||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | |||    
T  24609142 cacgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaa 24609043  T
Q  200 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgc 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  24609042 atcctctttggagatgacgtcgttgagagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctac 24608943  T
Q  300 tagggataatgcc 312  Q
    | || ||||||||    
T  24608942 tgggaataatgcc 24608930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 9 - 280
Target Start/End: Original strand, 13179962 - 13180241
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  13179962 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 13180061  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  13180062 atgactgttggcattttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 13180161  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggata 280  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  13180162 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtaggtatgcaactcgctggggata 13180241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23632966 - 23632656
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  23632966 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 23632867  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| |        || | ||||    
T  23632866 atgactgttggcagtttgtagacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcggtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 23632767  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  23632766 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcagatagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 23632667  T
Q  301 agggataatgc 311  Q
     || |||||||    
T  23632666 gggaataatgc 23632656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 25207300 - 25206966
Alignment:
Q  14 attggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgat 113  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||     
T  25207300 attggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgac 25207201  T
Q  114 ggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctc 205  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        || | | |||||||    
T  25207200 tgttggcagtttgtagacacagtttcacagagatagtcaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacattacacattcctgggaatcctc 25207101  T
Q  206 tttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgctaggga 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  |||    
T  25207100 tttggagataacgtcgtcgggagacgtatcagaaccagggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgagga 25207001  T
Q  306 taatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggt 340  Q
    ||||| | ||| ||| |||||| ||| ||| ||||    
T  25207000 taatgtcgtcactgccgggcatttcaatgccgggt 25206966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 25271456 - 25271122
Alignment:
Q  14 attggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgat 113  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||     
T  25271456 attggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgac 25271357  T
Q  114 ggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctc 205  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        || | | |||||||    
T  25271356 tgttggcagtttgtagacacagtttcacagagatagtcaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacattacacattcctgggaatcctc 25271257  T
Q  206 tttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgctaggga 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  |||    
T  25271256 tttggagataacgtcgtcgggagacgtatcagaaccagggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgagga 25271157  T
Q  306 taatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggt 340  Q
    ||||| | ||| ||| |||||| ||| ||| ||||    
T  25271156 taatgtcgtcactgccgggcatttcaatgccgggt 25271122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 33299532 - 33299249
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  33299532 ttgacatcggaaacgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 33299433  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  33299432 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 33299333  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaat 284  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33299332 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggcggagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaat 33299249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Original strand, 9543874 - 9544184
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  9543874 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 9543973  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  9543974 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 9544072  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  9544073 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaactcgctggggatagaatctcggaagactctact 9544172  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  9544173 gggaataatgcc 9544184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 6881308 - 6881013
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  6881308 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 6881209  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  6881208 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 6881110  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactct 297  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  6881109 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactct 6881013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 30941626 - 30941315
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||| |||||||||| || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  30941626 ttgatattggaaatgtaatatgcatgaatgatagaacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 30941527  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |        || | ||||    
T  30941526 atgactgttggcgatttgtagacacagttccgcggagacagacaagacactggagtattgggcacacagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 30941427  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||| ||    
T  30941426 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgaggatagaatctcgggagactctact 30941327  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  30941326 gggaataatgcc 30941315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 295
Target Start/End: Original strand, 28952941 - 28953234
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  28952941 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 28953040  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacat--cata------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||       |||    
T  28953041 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacatattcttgaaaa 28953139  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagact 295  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||    
T  28953140 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggacagaatctcggaagact 28953234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 43085262 - 43084989
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  43085262 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 43085163  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca-tcatagaaatcctctt 207  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | || | ||||||||||     
T  43085162 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattcttggaaatcctctc 43085064  T
Q  208 tggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  43085063 tggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggataga 43084989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Original strand, 15752004 - 15752364
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  15752004 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 15752103  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  15752104 atgaccgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 15752202  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |  ||    
T  15752203 tcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgact 15752302  T
Q  301 agggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
     |||| || ||| |   |||||||||| |||| |||||||||||  |||| || |||||||||    
T  15752303 ggggaaaacgccgt-tgtgctgggcatttcagcgctgggtatgttgtagacattgcatctgtg 15752364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 286
Target Start/End: Original strand, 18121583 - 18121864
Alignment:
Q  13 cattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 112  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  18121583 cattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 18121682  T
Q  113 tggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagaca-ttggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaatcc 203  Q
      ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||        | |||||||    
T  18121683 ctgttggcagtttgtaggcacgacttcaccggga-agacaagacatttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacgcattcctggaaatcc 18121781  T
Q  204 tctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18121782 tctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccaaggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 18121864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Original strand, 15651907 - 15652217
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  15651907 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 15652006  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  15652007 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 15652105  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||    
T  15652106 tcctctttggagatgatgtcgttgggagacgtgtcgaaaccaaggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 15652205  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  15652206 gggaataatgcc 15652217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Original strand, 32589421 - 32589705
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  32589421 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcacgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 32589520  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||   ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  32589521 atgatcgttggcagtttgtaggcacgacttcgc-gggaaagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 32589619  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  32589620 tcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatacaacttgctggagatagaatct 32589705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Original strand, 37351810 - 37352094
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  37351810 ttgatattggaaatgcaatatgcatggatgttataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 37351909  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||| || |||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  37351910 atgactgttggcatttggtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 37352008  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37352009 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 37352094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 30036441 - 30036081
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  30036441 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 30036342  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  30036341 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 30036243  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |  ||    
T  30036242 tcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgact 30036143  T
Q  301 agggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
     |||| || ||| |   |||||||||| |||| |||||||||||  |||| || |||||||||    
T  30036142 ggggaaaacgccgt-tgtgctgggcatttcagcgctgggtatgttgtagacattgcatctgtg 30036081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 33882122 - 33881837
Alignment:
Q  8 attgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  33882122 attgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 33882023  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 199  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  33882022 catgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 33881924  T
Q  200 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  33881923 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatct 33881837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 37761989 - 37761629
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  37761989 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 37761890  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  37761889 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagatatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 37761791  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||    
T  37761790 tcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctgtgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttact 37761691  T
Q  301 agggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
     |||| || ||| |   |||||||||| ||||||||||||||||  |||| || |||||||||    
T  37761690 ggggaaaacgccgt-tgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtg 37761629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 31438452 - 31438168
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  31438452 ttgacattggaaatgcagcatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 31438353  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  31438352 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 31438254  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  31438253 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaagtatgcaacttgctggggatagaatct 31438168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 33523399 - 33523115
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  33523399 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 33523300  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  33523299 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 33523201  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33523200 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatct 33523115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Original strand, 37745495 - 37745779
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  37745495 ttgacattggaaatgtgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 37745594  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  37745595 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacggggaaa-acaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacaccttcttggaaa 37745693  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37745694 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaactcgctggggatagaatct 37745779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Original strand, 18493914 - 18494198
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  18493914 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 18494013  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta-------cat-catagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||       ||| | | ||||    
T  18494014 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacatagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaa 18494112  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494113 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggccagtagctatgcaacttgctggggatagaatct 18494198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 2518060 - 2517750
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  2518060 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 2517961  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  2517960 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 2517862  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||   |||||| | ||    
T  2517861 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtaccggagccacggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttgaaagactttact 2517762  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     |||||||||||    
T  2517761 ggggataatgcc 2517750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Original strand, 40466695 - 40467055
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  40466695 ttgacattggaaatgcgatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 40466794  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  40466795 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 40466893  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctg-c 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |    
T  40466894 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac-ctgac 40466992  T
Q  300 tagggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
    | |||| |||||| |   |||||||||| ||||||||||||||||  |||| || |||||||||    
T  40466993 tggggaaaatgccgt-tgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtg 40467055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 30159035 - 30158742
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  30159035 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 30158936  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  30158935 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggaga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 30158837  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagact 295  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  30158836 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccaaggctgaggataggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagact 30158742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Original strand, 31819567 - 31819851
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  31819567 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 31819666  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||| || | |        ||||    
T  31819667 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacatagtggctcatgctatattacacattcttggaaa 31819765  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  31819766 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatct 31819851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 295
Target Start/End: Original strand, 8658639 - 8658932
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  8658639 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 8658738  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  8658739 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtgttgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 8658837  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagact 295  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||    
T  8658838 tcctctttggagatgacgtcgctgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggaaatagaatctcggaagact 8658932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 34623514 - 34623230
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  34623514 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 34623415  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  34623414 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 34623316  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34623315 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgggggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatct 34623230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5644816 - 5644543
Alignment:
Q  8 attgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    ||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  5644816 attgacattggaaatgcgatgtgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 5644717  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 199  Q
    |||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  5644716 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 5644618  T
Q  200 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctg 274  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5644617 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctg 5644543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Original strand, 13435815 - 13436099
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  13435815 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 13435914  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  13435915 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 13436013  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13436014 tcctctttggagatgacgtcattgggagacgtatcagagccaaggctgagggctggtaggtatgcaacttgctggggatagaatct 13436099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 24730959 - 24730680
Alignment:
Q  14 attggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgat 113  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||     
T  24730959 attggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgac 24730860  T
Q  114 ggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctc 205  Q
     ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| || | |        |||||||||    
T  24730859 tgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggcccgtgctatattacacattcttggaaatcctc 24730761  T
Q  206 tttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24730760 tttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgccacttgctggggatagaatct 24730680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 28656260 - 28655976
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  28656260 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcgttaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 28656161  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | ||||    
T  28656160 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaa 28656062  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  28656061 tcttctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagtcaaggctgagggcaggtaggtatgcaccttgctggggatagaatct 28655976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 3796548 - 3796207
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  3796548 ttgacattggaaatgcaatatgcatggacgatataacagattcattaaatgcatggatacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 3796449  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  3796448 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 3796350  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||    
T  3796349 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttact 3796250  T
Q  301 agggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgt 344  Q
     |||| || ||| |   |||||||||| ||||||||||||||||    
T  3796249 ggggaaaacgccgt-tgtgctgggcatttcagtgctgggtatgt 3796207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 11330645 - 11330369
Alignment:
Q  13 cattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 112  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  11330645 cattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 11330546  T
Q  113 tggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcct 204  Q
      ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |        || | ||||||||    
T  11330545 ctgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagcggctcgtgctatattacacattcttggaaatcct 11330447  T
Q  205 ctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 282  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  11330446 ctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggataga 11330369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 363
Target Start/End: Original strand, 13317977 - 13318332
Alignment:
Q  14 attggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgat 113  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||     
T  13317977 attggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgac 13318076  T
Q  114 ggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctc 205  Q
     ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||    
T  13318077 tgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctc 13318175  T
Q  206 tttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgctaggga 305  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | || ||||    
T  13318176 tttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactgggga 13318275  T
Q  306 taatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
     || ||| |   |||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  13318276 aaacgccgt-tgtgctgggcatttcagtgctgggtacgttgtagatatcgcatctgtg 13318332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 282
Target Start/End: Original strand, 18368676 - 18368956
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  18368676 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 18368775  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        || |    
T  18368776 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaga 18368874  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 282  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  18368875 ttctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggataga 18368956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Original strand, 37664650 - 37664934
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  37664650 ttgacattggaaatgtgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 37664749  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  37664750 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 37664848  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  37664849 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccaaggctgagggtgggcaggtatgcaacttgctggagatagaatct 37664934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 30175484 - 30175199
Alignment:
Q  8 attgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| ||| || ||| ||||||| ||||    
T  30175484 attgatattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtattacgcatgattgtgcatgtatgaatgcttgtaatg 30175385  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 199  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||   ||  | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  30175384 catgactgttggcagtttgtaggcacgactttacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 30175286  T
Q  200 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  30175285 atcttctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatct 30175199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 9324479 - 9324194
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||| || |||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  9324479 ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataaaagattcattaagtgcacgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 9324380  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  9324379 atgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 9324281  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgc-tggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  9324280 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaactaaacaacttgcttggggatagaatct 9324194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 26487389 - 26487104
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||| || |||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  26487389 ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataaaagattcattaagtgcacgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 26487290  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  26487289 atgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 26487191  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgc-tggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  26487190 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaactaaacaacttgcttggggatagaatct 26487104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 41681693 - 41681405
Alignment:
Q  14 attggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgat 113  Q
    ||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||| |||     || ||||||     
T  41681693 attggaaatacgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcgtgattatgcatgtatgaatgt----aacgcatgac 41681598  T
Q  114 ggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacat----cat------agaaatcc 203  Q
     ||||||||||||||| |||   ||| | | || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||      | ||||||    
T  41681597 tgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagtcattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaaaatcc 41681499  T
Q  204 tctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactct 297  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  41681498 tctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatgactgagggcaggtaactatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactct 41681405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12139177 - 12138884
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||| || |||||||| |||| ||| |  |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  12139177 ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataaaagattcattaagtgcacgggtatgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 12139078  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  12139077 atgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 12138979  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagact 295  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  12138978 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagact 12138884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Original strand, 13178639 - 13178824
Alignment:
Q  4 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttg 102  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | ||  ||||||||||||| |||| |||||| ||| |||    
T  13178639 tgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattg 13178738  T
Q  103 aaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 189  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13178739 aaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgcta 13178824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 26)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 8 - 340
Target Start/End: Original strand, 22074135 - 22074475
Alignment:
Q  8 attgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  22074135 attgacattggaaatgcaacatgtatgggtggtataatagttttattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 22074234  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaa 199  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||        | |||    
T  22074235 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggaatattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaa 22074334  T
Q  200 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgc 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22074335 atcctctttggatataacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctgc 22074434  T
Q  300 tagggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggt 340  Q
    | | ||||||||| |||| ||||||||| | |||| |||||    
T  22074435 tggagataatgccgtcatcgctgggcatttaagtgttgggt 22074475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 15774562 - 15774251
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  15774562 ttgacattggaaatgcgacatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 15774463  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        || | ||||    
T  15774462 atgactgttggcagctggtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacattacacattcctggaaa 15774363  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  15774362 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 15774263  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  15774262 gggaataatgcc 15774251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22139902 - 22139563
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  22139902 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgacataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcgtgtatgaatgcttgtaatgc 22139803  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  22139802 atgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 22139703  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||    
T  22139702 tcctctttggagataacgtcgttgggagacttatcggaaccatgactgagggcaggtagctatacaacttgctggggacagaatctcggaagactctact 22139603  T
Q  301 agggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggt 340  Q
     ||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| ||||    
T  22139602 ggggataatgtcgtcattaccgggcatttcagtgccgggt 22139563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 9 - 311
Target Start/End: Original strand, 21341394 - 21341705
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  21341394 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 21341493  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  21341494 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 21341593  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgc-tggggatagaatctgagaagactctgc 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||| |    
T  21341594 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgcttgaggatagaatctcggaagactctac 21341693  T
Q  300 tagggataatgc 311  Q
    | || |||||||    
T  21341694 tgggaataatgc 21341705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 8 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 19695105 - 19694767
Alignment:
Q  8 attgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  19695105 attgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatggacacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 19695006  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 199  Q
    |||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |        || | |||    
T  19695005 catgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgttatattacacattcctggaa 19694906  T
Q  200 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgc 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  19694905 atcctctttggagatgacgtcgttgagagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctac 19694806  T
Q  300 tagggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgg 338  Q
    | || |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  19694805 tgggaataatgccgtcattgccgggcatttcagtgctgg 19694767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14570143 - 14569834
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  14570143 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 14570044  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |        || | ||||    
T  14570043 atgattgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacacagtggctcgtgctatactacacattcttggaaa 14569944  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  14569943 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaactcgctggggatagaatctcggaagactctact 14569844  T
Q  301 agggataatg 310  Q
     || ||||||    
T  14569843 gggaataatg 14569834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 18797697 - 18797412
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  18797697 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatggtataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 18797598  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  18797597 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 18797498  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18797497 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctaaggatagaatct 18797412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 33249351 - 33249040
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  33249351 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 33249252  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  33249251 atgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacaaacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 33249152  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  33249151 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccaaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttggaagactctact 33249052  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  33249051 gggaataatgcc 33249040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 16260926 - 16260564
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||  ||||    
T  16260926 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacggtttcatcaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgttatgc 16260827  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | ||||    
T  16260826 atgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaa 16260727  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||    
T  16260726 tcctctttggagataacgtcgttgggagacttatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaaggctctact 16260627  T
Q  301 agggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
     || |||||||| ||||| | |||||| ||||||  |||| | || | ||| |||||||||||    
T  16260626 gggaataatgccgtcattaccgggcatttcagtgtcgggtgtatcgtggatgtcgcatctgtg 16260564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Original strand, 19654550 - 19654912
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||     
T  19654550 ttgacattggaaattcaatatgcatggatgatatgacagtttcatcaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgt 19654649  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | ||||    
T  19654650 atgactgttgacagttggtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaa 19654749  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||    
T  19654750 tcctctttggagataacgtcgttgggagacttatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaaggctctact 19654849  T
Q  301 agggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
     || |||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||| | || | ||| |||||||||||    
T  19654850 gggaataatgccgtcattaccgggcatttcagtgccgggtgtatcgtggatgtcgcatctgtg 19654912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 312
Target Start/End: Original strand, 2130491 - 2130803
Alignment:
Q  8 attgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  2130491 attgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 2130590  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 199  Q
    |||||  | ||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  2130591 catgactgctggcgatttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaa 2130690  T
Q  200 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgc 299  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  2130691 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcagatagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctac 2130790  T
Q  300 tagggataatgcc 312  Q
    | || ||||||||    
T  2130791 tgggaataatgcc 2130803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 19910390 - 19910676
Alignment:
Q  8 attgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  19910390 attgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 19910489  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 199  Q
    |||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |        || | |||    
T  19910490 catgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacacagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 19910589  T
Q  200 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19910590 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgaggatagaatct 19910676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 31361542 - 31361267
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  31361542 ttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 31361443  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  31361442 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaaa 31361344  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 277  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31361343 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 31361267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Original strand, 27602137 - 27602448
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27602137 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27602236  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| |        || | ||||    
T  27602237 atgactgttggcgatttgtagacgcagtttcgcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcggtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27602336  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||    
T  27602337 tcctctttggagctgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctaaggatagaatcttgggagactctact 27602436  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  27602437 gggaataatgcc 27602448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 29836336 - 29835976
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  29836336 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 29836237  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  29836236 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 29836138  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |  ||    
T  29836137 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacccgact 29836038  T
Q  301 agggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
     |||| || ||| |   |||||||||| ||||||||||||||||  |||| || |||||||||    
T  29836037 ggggaaaacgccgt-tgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtg 29835976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 18716469 - 18716185
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||| ||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  18716469 ttgacattggaagtgcgatatgcgtggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 18716370  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  18716369 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 18716271  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18716270 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 18716185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Original strand, 28355161 - 28355521
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  28355161 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaacgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 28355260  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  28355261 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 28355359  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctg-c 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |    
T  28355360 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac-ctgac 28355458  T
Q  300 tagggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
    | |||| |||||| |   |||||||||| ||||||||||||||||  |||| || |||||||||    
T  28355459 tggggaaaatgccgt-tgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtg 28355521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 33265733 - 33265449
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  33265733 ttgacattggaaatgcgatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatggatggacacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 33265634  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  33265633 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 33265535  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33265534 tcctctttggaaatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatct 33265449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 12085943 - 12086297
Alignment:
Q  15 ttggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatg 114  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||      
T  12085943 ttggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgact 12086042  T
Q  115 gttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctct 206  Q
    ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||||||||    
T  12086043 gttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctct 12086141  T
Q  207 ttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgctagggat 306  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||  |||| || | || ||||     
T  12086142 ttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatacaacttgctggaaattgaatctcggaaggctttactggggaa 12086241  T
Q  307 aatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
    || ||| | | |||||||||| ||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  12086242 aacgccgtta-tgctgggcatttcagtgctgggtacgttgtagacatcgcatctgtg 12086297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Original strand, 31483080 - 31483440
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  31483080 ttgacattggaaatgcactgtgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 31483179  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  || |||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  31483180 atgactgtcggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 31483278  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||| | ||    
T  31483279 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaatttgctggagatagaatcttggaagactttact 31483378  T
Q  301 agggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
     |||| || ||| |   |||||||||| ||||| ||||||||||  |||| || |||||||||    
T  31483379 ggggaaaacgccgt-tgtgctgggcatttcagtactgggtatgttgtagacattgcatctgtg 31483440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Original strand, 19201592 - 19201877
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  19201592 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 19201691  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||  ||||  ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  19201692 atgactgttggcagtttgtaagcacaacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 19201790  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgc-tggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  19201791 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccacagctgagggcaggtaactaaacaacttgcttggggatagaatct 19201877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 44567995 - 44567700
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  44567995 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 44567896  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata---------ga 198  Q
    |||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||| || | |         ||    
T  44567895 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagcggctcgcgctatattacacatttcttgga 44567797  T
Q  199 aatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagact 295  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||    
T  44567796 aatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgaggacaggtagctatgcaacttgctggaaatagaatcttggaagact 44567700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 19681470 - 19681109
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||| ||||    
T  19681470 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgtaatg 19681371  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 199  Q
    |||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  19681370 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 19681272  T
Q  200 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgc 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | |    
T  19681271 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttac 19681172  T
Q  300 tagggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
    | |||| || ||| |   |||||||||| ||||||||||||| ||  |||| || |||||||||    
T  19681171 tggggaaaacgccgt-tgtgctgggcatttcagtgctgggtacgttgtagacattgcatctgtg 19681109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 9361616 - 9361337
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  9361616 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 9361517  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || |  |||    
T  9361516 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgaaaa 9361418  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 282  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  9361417 tcctctttggagatgacgtcgttgggggacgtatcgg-accatagctgagggccggtaggtatgtaactggctggggataga 9361337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15775473 - 15775288
Alignment:
Q  4 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttc-attaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttg 102  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || | ||| || | ||  ||||||||||||| |||| |||||| ||| |||    
T  15775473 tgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattg 15775374  T
Q  103 aaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 189  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15775373 aaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgcta 15775288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 22389094 - 22389190
Alignment:
Q  11 gacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  22389094 gacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 22389190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 28304 - 27966
Alignment:
Q  8 attgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  28304 attgacatgggaaatgcaacatgtatggatggtataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 28205  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta-ca-----tcatagaaat 201  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||     || | |||||    
T  28204 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgctgagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgttatatcacacattcttggaaat 28105  T
Q  202 cctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgcta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||| |||     
T  28104 cctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatataacttgctggggatagaatctcggaagactccgctg 28005  T
Q  302 gggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggt 340  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||    
T  28004 gggataatgccgtcatcgctgggcatttcagtgttgggt 27966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 5659085 - 5658774
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  5659085 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5658986  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaaa 200  Q
    ||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | || | ||||    
T  5658985 atgactgttggcagctggtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacaccttcctggaaa 5658886  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||    
T  5658885 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 5658786  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  5658785 gggaataatgcc 5658774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Original strand, 15886026 - 15886388
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  15886026 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 15886125  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | ||||    
T  15886126 atgactgttggcgatttgtagacatagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaa 15886225  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  15886226 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatctcggaagactctact 15886325  T
Q  301 agggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
     || |||||||| ||||||| |||||| || ||||||| | | || | ||| |||||||||||    
T  15886326 gggaataatgccgtcattgccgggcatttctgtgctggatgtatcgtggatgtcgcatctgtg 15886388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 9 - 340
Target Start/End: Original strand, 16617776 - 16618116
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||| ||| || ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  16617776 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatggtataacagttttatcaaatgtatggacacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgaaatgc 16617875  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaa 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||        | ||||    
T  16617876 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtagctcgtgctatatcacacattcttggaaa 16617975  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagc-tatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgc 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  16617976 tcctctttggagatatcgtcgttgggagacgcatcggaaccatggctgagggcgggtagcatatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactccgc 16618075  T
Q  300 tagggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggt 340  Q
    | ||||||||||  |||| ||||||||| |||||| |||||    
T  16618076 tggggataatgctgtcatcgctgggcatttcagtgttgggt 16618116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Original strand, 29142063 - 29142374
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  29142063 ttgacattggaaacgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 29142162  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  29142163 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 29142262  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||    
T  29142263 tcctcttcggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 29142362  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  29142363 gggaataatgcc 29142374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 9 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15368217 - 15367877
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || | ||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  15368217 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcagatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 15368118  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaa 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        | ||||    
T  15368117 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcccagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgcgctacatcacacattcttggaaa 15368018  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagc-tatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgc 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  15368017 tcctctttggagataacgtcattgggagacgtatcggaaccatggttgagggcgggtagcatatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctgc 15367918  T
Q  300 tagggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggt 340  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||    
T  15367917 tggggataatgccgtcatcgctgggcatttcagtgttgggt 15367877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 18058219 - 18057908
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  18058219 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 18058120  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  18058119 atgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 18058020  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||    
T  18058019 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 18057920  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  18057919 gggaataatgcc 18057908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 9 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 4690626 - 4690292
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  4690626 ttgatattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 4690527  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |        || | ||||    
T  4690526 atgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 4690427  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||    
T  4690426 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 4690327  T
Q  301 agggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgc 335  Q
     || |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  4690326 gggaataatgccgtcattgctgggcatttcagtgc 4690292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Original strand, 8282769 - 8283078
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  8282769 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 8282868  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |        || | ||||    
T  8282869 atgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 8282968  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  8282969 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 8283068  T
Q  301 agggataatg 310  Q
     || ||||||    
T  8283069 gggtataatg 8283078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 9 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22041381 - 22041041
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||| ||| || ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  22041381 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatggtataacagttttatcaaatgtatggacacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgaaatgc 22041282  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaa 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||        | ||||    
T  22041281 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtagctcgtgctatatcacacattcttggaaa 22041182  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagc-tatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgc 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  22041181 tcctctttggagatatcgtcgttgggagacgcatcggaaccatggctgagggcgggtagcatatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactccgc 22041082  T
Q  300 tagggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggt 340  Q
    | | |||||| |  |||| ||||||||| |||||| |||||    
T  22041081 tggagataatacagtcatcgctgggcatttcagtgttgggt 22041041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 4728577 - 4728266
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||| |||||    
T  4728577 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgc 4728478  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  4728477 atgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 4728378  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||    
T  4728377 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctact 4728278  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  4728277 gggaataatgcc 4728266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 6208846 - 6208535
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||||| |||||    
T  6208846 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgc 6208747  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  6208746 atgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 6208647  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||    
T  6208646 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctact 6208547  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  6208546 gggaataatgcc 6208535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 9 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 19701368 - 19701029
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||     
T  19701368 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcatcaaatgcatgggcttgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgt 19701269  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  19701268 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcatagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 19701169  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  19701168 tcttctttggagataacgccattgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtagctatacaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 19701069  T
Q  301 agggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggt 340  Q
     ||||||||||| ||||||| |||| | ||||||| ||||    
T  19701068 ggggataatgccgtcattgccgggcctttcagtgccgggt 19701029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Original strand, 4789940 - 4790251
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  4789940 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatggtataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 4790039  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | ||||    
T  4790040 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaa 4790139  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  | ||||||| ||    
T  4790140 tcctcttcggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctaaggatagaatcttgggagactctact 4790239  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  4790240 gggaataatgcc 4790251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16423150 - 16422839
Alignment:
Q  17 ggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggt 116  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||    
T  16423150 ggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattatatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgt 16423051  T
Q  117 tggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctcttt 208  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||    
T  16423050 tggcggtttgtagacacagttccgcagagacagacaaggcactggagtattgggtacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctcttt 16422951  T
Q  209 ggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgctagggataa 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| || |||||||    
T  16422950 ggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgcaggggatagaatctcggaagactctactggggataa 16422851  T
Q  309 tgccctcattgc 320  Q
    |||| |||||||    
T  16422850 tgccgtcattgc 16422839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Original strand, 22380889 - 22381200
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||| | |||||    
T  22380889 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatacaacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctcgtaatgc 22380988  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||        ||||    
T  22380989 atgactgttggcgatttgtagacatagtttcgcagagacagacaggacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattatactttcctggaaa 22381088  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||    
T  22381089 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 22381188  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  22381189 gggaataatgcc 22381200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 35887711 - 35887400
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  35887711 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 35887612  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |        || |  |||    
T  35887611 atgactgttgacagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgaagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctgaaaa 35887512  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||| ||    
T  35887511 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagagtcttgggagactctact 35887412  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  35887411 gggaataatgcc 35887400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Original strand, 11103671 - 11103981
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  11103671 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 11103770  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  11103771 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 11103869  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  11103870 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 11103969  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  11103970 gggaataatgcc 11103981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Original strand, 15734425 - 15734710
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| || |||| |||||    
T  15734425 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcataggcacataatatgcatgactatgcatgtatgaattcttgtaatgc 15734524  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  15734525 atgactgttggcgatttgtagacacagtttcgtagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 15734624  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15734625 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggttgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 15734710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 5020683 - 5020399
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  5020683 ttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5020584  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  5020583 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaaa 5020485  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5020484 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggggatagaatct 5020399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 18337575 - 18337290
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||| | |||||    
T  18337575 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatacaacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctcgtaatgc 18337476  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||        ||||    
T  18337475 atgactgttggcgatttgtagacatagtttcgcagagacagacaggacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattatactttcctggaaa 18337376  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18337375 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccctggctgagggcaggtagctacgcaacttgctggggatagaatct 18337290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 24335148 - 24334788
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  24335148 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 24335049  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  24335048 atgaccgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 24334950  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |  ||    
T  24334949 tcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagaccccact 24334850  T
Q  301 agggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
     |||| || ||| |   |||||||||| ||||||||||||||||  |||| || |||||||||    
T  24334849 ggggaaaacgccgt-tgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtg 24334788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 32297603 - 32297262
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  32297603 ttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 32297504  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        || |    
T  32297503 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaga 32297405  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctg-c 299  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||| |    
T  32297404 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgcaactcgctggagatagaatcttggaagac-ctgac 32297306  T
Q  300 tagggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgt 344  Q
    | |||| |||||| |   |||||||||| ||||||||||||||||    
T  32297305 tggggaaaatgccgt-tgtgctgggcatttcagtgctgggtatgt 32297262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Original strand, 31029553 - 31029863
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  31029553 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 31029652  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||| |||||||  ||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  31029653 atgactgttggcattttgtaggtacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 31029751  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  31029752 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccacggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 31029851  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  31029852 gggaataatgcc 31029863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 10650042 - 10649683
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  10650042 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 10649943  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  10649942 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 10649844  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||    
T  10649843 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttggaagact-tact 10649745  T
Q  301 agggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
     |||| || ||| |   |||||||||| ||||||||||||||||  |||| || |||||||||    
T  10649744 ggggaaaacgccgt-tgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtg 10649683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Original strand, 4339986 - 4340296
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  4339986 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggtacataatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 4340085  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  4340086 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 4340184  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||    
T  4340185 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctact 4340284  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     |||||||||||    
T  4340285 ggggataatgcc 4340296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 4630731 - 4630421
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  4630731 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 4630632  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta-------cat-catagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||       ||| | | ||||    
T  4630631 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaa 4630533  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  4630532 tcctctttggtgatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcatgtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 4630433  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  4630432 gggaataatgcc 4630421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Original strand, 18285666 - 18285976
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||| ||||||| |||||    
T  18285666 ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattacgcatgtatgaatgcttgtaatgc 18285765  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  18285766 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 18285864  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  18285865 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 18285964  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  18285965 gggaataatgcc 18285976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Original strand, 18300967 - 18301277
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||| ||||||| |||||    
T  18300967 ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattacgcatgtatgaatgcttgtaatgc 18301066  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  18301067 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 18301165  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  18301166 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 18301265  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  18301266 gggaataatgcc 18301277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18249690 - 18249410
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  18249690 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 18249591  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  18249590 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 18249492  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 282  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  18249491 tcctctatggagatgacgtcgttgggggacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggataga 18249410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Original strand, 28109250 - 28109534
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||| |||||||  ||||    
T  28109250 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatggttatgcatgtatgaatgcttgtgatgc 28109349  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||| ||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  28109350 atgactgttagcagtttgtaggcacgacttcaccggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 28109448  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  28109449 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaaacaacttgctggagatagaatct 28109534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 5718027 - 5717743
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  5718027 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5717928  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | | || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  5717927 atgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-aggcaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 5717829  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  5717828 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatct 5717743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 5728937 - 5728653
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  5728937 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5728838  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | | || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  5728837 atgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-aggcaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 5728739  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  5728738 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatct 5728653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Original strand, 5763431 - 5763715
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  5763431 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5763530  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | | || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  5763531 atgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-aggcaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 5763629  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  5763630 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatct 5763715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 18232169 - 18231880
Alignment:
Q  4 tgacattgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttga 103  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  18232169 tgacgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgt 18232070  T
Q  104 aatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata------- 196  Q
    |||||||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |           
T  18232069 aatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctt 18231971  T
Q  197 -gaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18231970 ggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatct 18231880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 28346144 - 28345859
Alignment:
Q  8 attgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  28346144 attgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaattttattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 28346045  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 199  Q
    |||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  28346044 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacaccttcttggaa 28345946  T
Q  200 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  28345945 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatct 28345859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 32446102 - 32445792
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  32446102 ttgacattggaaatgcaatatgcatagatgacataacagttttattaaatgcgtgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 32446003  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta-------cat-catagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||       ||| | | ||||    
T  32446002 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaa 32445904  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||    
T  32445903 tcctctttggtgatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctact 32445804  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  32445803 gggaataatgcc 32445792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Original strand, 16404079 - 16404363
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  16404079 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16404178  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  16404179 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 16404277  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16404278 tcctctatggagatgacgtcgttgggggacgtatcggagccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatct 16404363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Original strand, 17978238 - 17978522
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  17978238 ttgacattggaactgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 17978337  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  17978338 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggggaaa-acaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 17978436  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17978437 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatct 17978522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21681692 - 21681412
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  21681692 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 21681593  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        || |    
T  21681592 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaga 21681494  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 282  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  21681493 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggataga 21681412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 48472882 - 48472598
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  48472882 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 48472783  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  48472782 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 48472684  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48472683 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 48472598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 4423866 - 4423584
Alignment:
Q  11 gacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcat 110  Q
    ||||||||| |||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||    
T  4423866 gacattggacatgcagtatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcat 4423767  T
Q  111 gatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatc 202  Q
    ||  ||||||| ||| ||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||||    
T  4423766 gactgttggcattttataggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatc 4423668  T
Q  203 ctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4423667 ctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatct 4423584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 295
Target Start/End: Original strand, 6536029 - 6536323
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  6536029 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 6536128  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 199  Q
    |||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  6536129 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 6536227  T
Q  200 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagact 295  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  6536228 atcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggagatagaatcttggaagact 6536323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 5589642 - 5589927
Alignment:
Q  8 attgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  5589642 attgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 5589741  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 199  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |        || | |||    
T  5589742 catgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtgactcgtgctatattacacattcttggaa 5589840  T
Q  200 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  5589841 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtaggtatgcaacttgctagagatagaatct 5589927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Original strand, 29658254 - 29658614
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  29658254 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatgtaacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 29658353  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| | |   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | ||||    
T  29658354 atgactgttggcagtttgtaggcgcgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaa 29658452  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctg-c 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |    
T  29658453 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgttggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac-ctgac 29658551  T
Q  300 tagggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
    | |||| |||||| |   |||||||||| ||||||||||||||||  |||| || |||||||||    
T  29658552 tggggaaaatgccgt-tgtgctgggcatttcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtg 29658614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 20072985 - 20072701
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  20072985 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 20072886  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||    || | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  20072885 atgactgttggcattttgtaggcacgacatcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 20072787  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20072786 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 20072701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Original strand, 22864151 - 22864435
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  22864151 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaggttcatcaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 22864250  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   |||   | || ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  22864251 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcatgggga-agacaagacgtcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 22864349  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22864350 tcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatct 22864435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Original strand, 22879210 - 22879494
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  22879210 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaggttcatcaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 22879309  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   |||   | || ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  22879310 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcatgggga-agacaagacgtcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 22879408  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22879409 tcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatct 22879494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Original strand, 5602599 - 5602884
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  5602599 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 5602698  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 199  Q
    |||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  5602699 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 5602797  T
Q  200 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  5602798 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatct 5602884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 286
Target Start/End: Original strand, 31957742 - 31958027
Alignment:
Q  8 attgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  31957742 attgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaattttattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 31957841  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 199  Q
    |||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  31957842 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 31957940  T
Q  200 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  31957941 atcctctttggagatgacgttgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatct 31958027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 10403124 - 10402844
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  10403124 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 10403025  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | |        || |    
T  10403024 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggaga 10402926  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 282  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  10402925 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgggggccggtaggtatgtaacttgctggggataga 10402844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 286
Target Start/End: Original strand, 20570147 - 20570427
Alignment:
Q  13 cattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 112  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  20570147 cattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcgttaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 20570246  T
Q  113 tggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcct 204  Q
      ||||||||||||||| |||   ||| | | |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||    
T  20570247 ctgttggcagtttgtaggcacgacttcac-gggggagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcct 20570345  T
Q  205 ctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  20570346 ctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgaggaccggtaggtatgtaacttgctggggatagaatct 20570427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 47030428 - 47030068
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  47030428 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatatagcagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 47030329  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  47030328 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 47030230  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaac-ttgctggggatagaatctgagaagactctgc 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||  |    
T  47030229 tcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgcatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaactttgctggagatagaatcttggaagactccac 47030130  T
Q  300 tagggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
    | |||| || ||| |   |||||||||| ||||||||||||||||  |||| || |||||||||    
T  47030129 tggggaaaacgccgt-tgtgctgggcat-tcagtgctgggtatgttgtagacattgcatctgtg 47030068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 8218597 - 8218317
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| | ||||| |||||    
T  8218597 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaacgcttgtaatgc 8218498  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || ||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||| |        || | ||||    
T  8218497 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaaggcgttagagtattgggcacgtggtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 8218399  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 282  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  8218398 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggagataga 8218317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 5473929 - 5473629
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    ||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||           ||| ||||||| |||||    
T  5473929 ttgacattgaaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgt----------atgaatgcttgtaatgc 5473840  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  5473839 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 5473741  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  5473740 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaactcgctggggatagaatctcggaagactctact 5473641  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  5473640 gggaataatgcc 5473629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 286
Target Start/End: Original strand, 17970172 - 17970452
Alignment:
Q  14 attggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgat 113  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||     
T  17970172 attggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaagtgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgac 17970271  T
Q  114 ggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctc 205  Q
      |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||    
T  17970272 tattggcactttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctc 17970370  T
Q  206 tttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgc-tggggatagaatct 286  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  17970371 tttggagatgacgtcgttgggagacatattggaaccatggctgagggcaggtaactaaacaacttgcttggggatagaatct 17970452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 51788995 - 51788634
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||||||||||| | || ||| ||||||| ||||    
T  51788995 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattagtatgcatgggtacgtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgtaatg 51788896  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 199  Q
    |||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  51788895 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 51788797  T
Q  200 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgc 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | |    
T  51788796 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttac 51788697  T
Q  300 tagggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
    | |||| || ||| |   |||||||||| ||||||||||||| ||  |||| || |||||||||    
T  51788696 tggggaaaacgccgt-tgtgctgggcatttcagtgctgggtacgttgtagacattgcatctgtg 51788634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 42 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 28028210 - 28027959
Alignment:
Q  42 taacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgc 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||    ||| |    
T  28028210 taacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcatgacttcac 28028111  T
Q  142 agagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgta 233  Q
     | || |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||        || | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||     
T  28028110 gggga-agacaagacattagagtaatgggcaagtagtggctcgtgctacattacacattcttggaaatcctcttcggagatgacgtcgttgggagacgtg 28028012  T
Q  234 tcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||| |||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28028011 tcgggacctaggctgagggccggtaggtatgcaacttgctggggatagaatct 28027959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 16599585 - 16599406
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  16599585 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16599486  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 189  Q
    ||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16599485 atgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 16599406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 7080201 - 7080022
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  7080201 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaataggcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 7080102  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 189  Q
    ||||  ||||||| || |||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7080101 atgaccgttggcaattcgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 7080022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 199 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 7079981 - 7079868
Alignment:
Q  199 aatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctg 298  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  7079981 aatcttctctggggataacgtcgttgggagacgtgtcggaaccaaggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactcta 7079882  T
Q  299 ctagggataatgcc 312  Q
    || || ||||||||    
T  7079881 ctgggaataatgcc 7079868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 35221826 - 35221712
Alignment:
Q  14 attggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgat 113  Q
    ||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| || ||||||     
T  35221826 attggaaatgcactatgcacggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgcatgac 35221727  T
Q  114 ggttggcagtttgta 128  Q
     ||||||||||||||    
T  35221726 tgttggcagtttgta 35221712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 778 - 444
Alignment:
Q  14 attggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgat 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||    
T  778 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcactttgtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgat 679  T
Q  114 ggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctc 205  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |        |||||||||    
T  678 tgtgggcagcttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtgtctcgtgctatattacacattcccggaaatcctc 579  T
Q  206 tttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgctaggga 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  578 tttggagataacgtcgttgggagacgtatcagaaccatggttgagggcaggtagctatgcaacctgctggggatagaatctcggaagactctgctgggga 479  T
Q  306 taatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggt 340  Q
    ||||||| | || | ||||||| ||||||||||||    
T  478 taatgccgttatcgttgggcatttcagtgctgggt 444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 9 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13062 - 12722
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||     
T  13062 ttgacattggaaatgcaatatgcatgggtgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgt 12963  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacat--------catagaaa 200  Q
    ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | | ||||    
T  12962 atgactgttggcagttagtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacattacacatccctggaaa 12863  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||  ||||||||||||    
T  12862 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccacggccgagggcaggtagctatgaaacttgttgcggatagaatctcggaagactctgct 12763  T
Q  301 -agggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggt 340  Q
      ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  12762 gggggataatgccgtcattgctgggcatttcagtgctgggt 12722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 2667 - 2307
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  2667 ttgacattggaaatgcaatatgcatggttgatataacagtttcattaaatgcatggatacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 2568  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  2567 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 2469  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctg-c 299  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |    
T  2468 tcctctttggagatgacgttgttgggagacgtgtcggaaccaaagctgagggcaggtagatatacaacttgctggagatagaatcttggaagac-ctgac 2370  T
Q  300 tagggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
    | |||| |||||| |   |||||||||| |||| |||||||||||  |||| || |||||||||    
T  2369 tggggaaaatgccgt-tgtgctgggcatttcagggctgggtatgttgtagacattgcatctgtg 2307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 8 - 340
Target Start/End: Original strand, 25814 - 26154
Alignment:
Q  8 attgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  25814 attgacattggaaatgaaagatgtatgggtggtataatagttttatcaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 25913  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaa 199  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||        | |||    
T  25914 catgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacacacaaaacattggactattgggcacgtagtggctcatgctatatcacacattcttggaa 26013  T
Q  200 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgc 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||    
T  26014 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaagcaacttgctggggaaagaatctcggaagactccgc 26113  T
Q  300 tagggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggt 340  Q
    | | |||||| || |||| ||||||||| |||||| |||||    
T  26114 tggagataataccgtcatcgctgggcatttcagtgttgggt 26154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Original strand, 3861 - 4172
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  3861 ttgacattggaaatgcgatatgcgtggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 3960  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |        || | || |    
T  3961 atgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcttggaca 4060  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||    
T  4061 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctaagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctact 4160  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  4161 gggaataatgcc 4172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 34283 - 33972
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  34283 ttgatattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 34184  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |        || | ||||    
T  34183 atgactgttggcgatttgtagacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 34084  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||| ||    
T  34083 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgaggatagaatctcgggagactctact 33984  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  33983 gggaataatgcc 33972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 10925 - 10635
Alignment:
Q  14 attggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 112  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  10925 attggaaatgtaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 10826  T
Q  113 tggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata---------gaaatcc 203  Q
      ||||||||||||||  |||   ||| ||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || | |         |||||||    
T  10825 ctgttggcagtttgtaagcacgacttcacaggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacatttcttggaaatcc 10727  T
Q  204 tctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagact 295  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||    
T  10726 tctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgaggacaggtagctatgcaacttgctggaaatagaatcttggaagact 10635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 32 - 311
Target Start/End: Original strand, 8929 - 9217
Alignment:
Q  32 atggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagac 131  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||    
T  8929 atggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagac 9028  T
Q  132 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgtcgtt 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | || ||||||||||||||| ||||||||    
T  9029 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggacatcctctttggagatgacgtcgtt 9128  T
Q  224 gggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgc-tggggatagaatctgagaagactctgctagggataatgc 311  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||  ||||||||| || || |||||||    
T  9129 gggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagccatgcaacttgcttgaggatagaatctcggaagactctactgggaataatgc 9217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 8 - 312
Target Start/End: Original strand, 24218 - 24530
Alignment:
Q  8 attgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  24218 attgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagttttattaaatgcatgggcatgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 24317  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 199  Q
    || ||  | ||||  ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | |||    
T  24318 cacgactgctggcgatttgtagacgcagttccgcggagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaa 24417  T
Q  200 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgc 299  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  24418 attctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctac 24517  T
Q  300 tagggataatgcc 312  Q
    | || ||||||||    
T  24518 tgggaataatgcc 24530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 146; Significance: 8e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 14952 - 14592
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  14952 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 14853  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  14852 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 14754  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||  |||| || | ||    
T  14753 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatacaacttgctggaaattgaatctcggaaggctttact 14654  T
Q  301 agggataatgccctcattgctgggcatgtcagtgctgggtatgtcatagatatcgcatctgtg 363  Q
     |||| || ||| | | |||||||||| ||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  14653 ggggaaaacgccgtta-tgctgggcatttcagtgctgggtacgttgtagacatcgcatctgtg 14592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 13026 - 12716
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  13026 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 12927  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  12926 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 12828  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgct 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||| ||    
T  12827 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagagtcttgggagactctact 12728  T
Q  301 agggataatgcc 312  Q
     || ||||||||    
T  12727 gggaataatgcc 12716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 295
Target Start/End: Original strand, 8187 - 8480
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  8187 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 8286  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  8287 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 8385  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagact 295  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  8386 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagact 8480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 126; Significance: 7e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Original strand, 2422 - 2707
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 107  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  2422 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 2521  T
Q  108 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaa 199  Q
    |||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||    
T  2522 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 2620  T
Q  200 atcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  2621 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatct 2707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Original strand, 23842 - 23935
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaa-atgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgctt 101  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  23842 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctt 23935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 238 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 18582 - 18534
Alignment:
Q  238 aaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 286  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  18582 aaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatct 18534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16586 - 16306
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||| ||||||| |||||    
T  16586 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattgtgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16487  T
Q  109 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 200  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| || |        || | ||||    
T  16486 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaaaacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgttatattacacattcttggaaa 16388  T
Q  201 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 282  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  16387 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaactggctggggataga 16306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Original strand, 39858 - 40180
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaat-gcaacatgtatgga-tgatataacagtttca-ttaaatgcat-gggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaa 104  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |    
T  39858 ttgacattggaaatagcaacatgcatggaatgatataacagtttcaattaaatgcattgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgta 39957  T
Q  105 atgcatgatggttggcag-tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagta-ttgggca-cgtagtggctcgtgctacatcataga--- 198  Q
    ||||||||  ||||||   |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| || |||||||||||||| || | | |       
T  39958 atgcatgactgttggcgtatttgtagacacagttctgcagagacagacaagacactggagtggttgggcaacgcagtggctcgtgctatattacacattt 40057  T
Q  199 -------aatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctga-gggcaggtagct-atgcaacttgctggggatagaatctgag 289  Q
           |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |    
T  40058 cctggaaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgaggggcaggtagttaatgcaacttgctggggatagaatctcgg 40157  T
Q  290 aagactctgctagggataatgcc 312  Q
    |||||||| || || ||||||||    
T  40158 aagactctactgggaataatgcc 40180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0685 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0685
Description:

Target: scaffold0685; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 112
Target Start/End: Original strand, 1309 - 1412
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  1309 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 1408  T
Q  109 atga 112  Q
    ||||    
T  1409 atga 1412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 112
Target Start/End: Original strand, 13221 - 13324
Alignment:
Q  9 ttgacattggaaatgcaacatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacataatatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 108  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  13221 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 13320  T
Q  109 atga 112  Q
    ||||    
T  13321 atga 13324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 247 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 6807 - 6742
Alignment:
Q  247 tgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctgagaagactctgctagggataatgcc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||||||    
T  6807 tgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgcc 6742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University