View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11463_low_3 (Length: 294)

Name: NF11463_low_3
Description: NF11463
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11463_low_3
NF11463_low_3
[»] chr2 (50 HSPs)
chr2 (35-218)||(6712931-6713114)
chr2 (37-173)||(5542648-5542783)
chr2 (38-185)||(15880251-15880397)
chr2 (35-173)||(36178626-36178763)
chr2 (35-184)||(6421374-6421522)
chr2 (35-173)||(1769892-1770029)
chr2 (51-173)||(14745704-14745825)
chr2 (35-180)||(962591-962735)
chr2 (37-173)||(5543021-5543156)
chr2 (35-178)||(35580745-35580886)
chr2 (35-145)||(33731676-33731785)
chr2 (35-173)||(37106188-37106325)
chr2 (35-173)||(41283496-41283633)
chr2 (35-183)||(15511516-15511661)
chr2 (35-183)||(28254260-28254405)
chr2 (35-180)||(42514642-42514786)
chr2 (93-185)||(38796296-38796388)
chr2 (49-185)||(40733505-40733640)
chr2 (35-173)||(37105924-37106061)
chr2 (37-183)||(38796641-38796788)
chr2 (35-180)||(40679650-40679794)
chr2 (35-183)||(36005901-36006047)
chr2 (96-183)||(31899507-31899594)
chr2 (38-145)||(36178195-36178301)
chr2 (35-145)||(40163393-40163503)
chr2 (35-144)||(6422139-6422247)
chr2 (78-182)||(12529091-12529195)
chr2 (65-184)||(16542438-16542556)
chr2 (54-180)||(28531354-28531479)
chr2 (65-173)||(36178320-36178427)
chr2 (37-185)||(40733871-40734017)
chr2 (35-136)||(23346274-23346373)
chr2 (98-173)||(7598609-7598684)
chr2 (61-185)||(31468797-31468916)
chr2 (53-180)||(37632636-37632762)
chr2 (52-173)||(14745332-14745452)
chr2 (64-145)||(31259666-31259746)
chr2 (116-185)||(36785664-36785733)
chr2 (35-119)||(3673122-3673205)
chr2 (36-111)||(6421793-6421867)
chr2 (79-145)||(28254176-28254242)
chr2 (41-161)||(29676547-29676660)
chr2 (54-180)||(33561491-33561616)
chr2 (35-180)||(5367448-5367592)
chr2 (37-173)||(7598228-7598363)
chr2 (37-184)||(29676892-29677043)
chr2 (53-129)||(33953810-33953885)
chr2 (37-111)||(6421688-6421761)
chr2 (64-181)||(37895111-37895227)
chr2 (54-178)||(37894732-37894855)
[»] chr7 (49 HSPs)
chr7 (35-183)||(45433231-45433378)
chr7 (35-183)||(23398-23545)
chr7 (37-183)||(22567062-22567206)
chr7 (35-185)||(1085637-1085786)
chr7 (37-183)||(45754706-45754850)
chr7 (35-184)||(45434625-45434773)
chr7 (35-183)||(7517570-7517717)
chr7 (37-185)||(30244258-30244405)
chr7 (52-183)||(16569186-16569316)
chr7 (52-183)||(16596346-16596476)
chr7 (64-185)||(22566712-22566832)
chr7 (52-185)||(30245065-30245197)
chr7 (49-185)||(7554013-7554148)
chr7 (39-183)||(24177425-24177568)
chr7 (35-182)||(36939754-36939900)
chr7 (35-170)||(37533385-37533519)
chr7 (35-145)||(19122759-19122868)
chr7 (49-183)||(34218069-34218202)
chr7 (35-173)||(37533032-37533168)
chr7 (35-183)||(40094795-40094942)
chr7 (51-183)||(43241485-43241616)
chr7 (35-166)||(11845198-11845328)
chr7 (55-171)||(6054562-6054677)
chr7 (50-173)||(29157565-29157687)
chr7 (35-180)||(8128462-8128606)
chr7 (35-168)||(30032572-30032704)
chr7 (55-183)||(36534825-36534952)
chr7 (54-184)||(47129084-47129213)
chr7 (104-185)||(30244689-30244770)
chr7 (44-185)||(1085278-1085419)
chr7 (37-143)||(24838724-24838830)
chr7 (89-180)||(28301617-28301708)
chr7 (106-185)||(30255327-30255406)
chr7 (55-173)||(14681510-14681627)
chr7 (100-182)||(36109002-36109084)
chr7 (106-183)||(30245484-30245561)
chr7 (35-183)||(118320-118469)
chr7 (35-170)||(9901648-9901780)
chr7 (51-178)||(40230328-40230454)
chr7 (49-183)||(20599304-20599439)
chr7 (52-129)||(30253536-30253612)
chr7 (35-114)||(37167840-37167918)
chr7 (35-142)||(41854665-41854771)
chr7 (51-127)||(28300290-28300366)
chr7 (36-183)||(36622950-36623096)
chr7 (35-102)||(40094434-40094500)
chr7 (54-119)||(37345972-37346036)
chr7 (35-80)||(47129461-47129506)
chr7 (35-87)||(28300589-28300641)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (37-183)||(5386-5532)
scaffold0734 (37-185)||(5765-5917)
[»] chr3 (52 HSPs)
chr3 (35-185)||(37990660-37990809)
chr3 (35-183)||(15772844-15772991)
chr3 (35-184)||(37990998-37991146)
chr3 (35-185)||(42342111-42342260)
chr3 (35-181)||(54017837-54017982)
chr3 (35-185)||(15773180-15773331)
chr3 (35-145)||(39934976-39935085)
chr3 (38-183)||(29644926-29645070)
chr3 (35-184)||(43346812-43346960)
chr3 (35-183)||(32589694-32589840)
chr3 (35-183)||(42342409-42342556)
chr3 (35-183)||(52634666-52634812)
chr3 (54-185)||(11661939-11662070)
chr3 (49-180)||(35946515-35946645)
chr3 (35-173)||(22304569-22304706)
chr3 (38-183)||(29644605-29644749)
chr3 (35-183)||(12114583-12114730)
chr3 (35-183)||(25739446-25739593)
chr3 (35-183)||(39914242-39914389)
chr3 (35-184)||(32462921-32463070)
chr3 (35-184)||(45901702-45901851)
chr3 (53-181)||(44160584-44160710)
chr3 (54-183)||(53118015-53118142)
chr3 (51-183)||(53577354-53577485)
chr3 (35-183)||(54018219-54018366)
chr3 (35-184)||(25755383-25755531)
chr3 (66-173)||(21832395-21832501)
chr3 (49-173)||(50612482-50612610)
chr3 (35-173)||(4823655-4823792)
chr3 (35-180)||(33803273-33803417)
chr3 (38-185)||(32462582-32462729)
chr3 (35-183)||(31190007-31190146)
chr3 (40-166)||(3135099-3135224)
chr3 (54-180)||(8327897-8328022)
chr3 (51-173)||(39389070-39389191)
chr3 (35-145)||(41359786-41359895)
chr3 (53-183)||(49336726-49336855)
chr3 (35-181)||(45395674-45395819)
chr3 (105-173)||(37726504-37726572)
chr3 (97-180)||(9240142-9240225)
chr3 (35-120)||(22303976-22304060)
chr3 (65-173)||(3384317-3384424)
chr3 (96-173)||(51886561-51886638)
chr3 (35-115)||(22303680-22303759)
chr3 (49-145)||(33362328-33362423)
chr3 (54-118)||(47964558-47964621)
chr3 (35-145)||(42584845-42584952)
chr3 (66-183)||(1634366-1634483)
chr3 (98-180)||(33175747-33175829)
chr3 (117-183)||(43346640-43346706)
chr3 (78-136)||(47508155-47508213)
chr3 (90-170)||(7767389-7767469)
[»] chr8 (56 HSPs)
chr8 (35-171)||(40579527-40579662)
chr8 (35-184)||(34834865-34835013)
chr8 (35-173)||(3669687-3669824)
chr8 (35-183)||(147441-147588)
chr8 (35-183)||(30359599-30359746)
chr8 (35-173)||(3670060-3670197)
chr8 (35-183)||(25561836-25561984)
chr8 (53-183)||(30359261-30359390)
chr8 (35-183)||(3038311-3038458)
chr8 (54-185)||(9309343-9309473)
chr8 (35-166)||(9482625-9482755)
chr8 (35-178)||(45122078-45122220)
chr8 (35-173)||(1013892-1014029)
chr8 (35-185)||(34835197-34835346)
chr8 (35-181)||(40518061-40518208)
chr8 (57-181)||(5420643-5420766)
chr8 (35-166)||(70295-70425)
chr8 (35-173)||(1014266-1014403)
chr8 (35-145)||(9483208-9483317)
chr8 (37-180)||(41972151-41972296)
chr8 (35-145)||(45121677-45121786)
chr8 (35-180)||(9608738-9608882)
chr8 (35-144)||(20870594-20870702)
chr8 (35-173)||(30441081-30441222)
chr8 (35-144)||(34835504-34835612)
chr8 (35-144)||(34835770-34835878)
chr8 (35-183)||(33113388-33113535)
chr8 (93-184)||(8794100-8794191)
chr8 (38-185)||(8918788-8918934)
chr8 (64-181)||(9507769-9507890)
chr8 (35-143)||(18372015-18372122)
chr8 (35-171)||(37544511-37544646)
chr8 (35-171)||(40518584-40518719)
chr8 (37-145)||(45122652-45122759)
chr8 (50-173)||(45121946-45122068)
chr8 (90-160)||(3037783-3037853)
chr8 (89-171)||(18372677-18372758)
chr8 (35-182)||(5915863-5916004)
chr8 (35-184)||(6876883-6877032)
chr8 (104-170)||(18372788-18372854)
chr8 (35-185)||(45122994-45123143)
chr8 (67-180)||(9308970-9309084)
chr8 (59-183)||(43274824-43274947)
chr8 (35-185)||(147817-147957)
chr8 (35-145)||(1513936-1514045)
chr8 (92-166)||(41416248-41416322)
chr8 (35-136)||(9609122-9609222)
chr8 (96-145)||(18373012-18373061)
chr8 (108-170)||(18372349-18372411)
chr8 (35-145)||(32305505-32305614)
chr8 (35-80)||(6731987-6732032)
chr8 (35-80)||(40579290-40579335)
chr8 (107-145)||(25561736-25561774)
chr8 (35-80)||(6651586-6651631)
chr8 (37-78)||(43274658-43274699)
chr8 (105-169)||(43398161-43398225)
[»] chr1 (52 HSPs)
chr1 (35-183)||(31767182-31767329)
chr1 (35-183)||(41156981-41157128)
chr1 (51-185)||(11977268-11977401)
chr1 (51-183)||(29798189-29798320)
chr1 (35-183)||(41142362-41142510)
chr1 (46-185)||(34364913-34365051)
chr1 (50-172)||(3550721-3550842)
chr1 (35-181)||(5319986-5320131)
chr1 (35-173)||(41759483-41759620)
chr1 (35-184)||(34364496-34364644)
chr1 (35-173)||(44290845-44290983)
chr1 (46-181)||(17294569-17294703)
chr1 (37-183)||(26661921-26662066)
chr1 (35-181)||(41157367-41157512)
chr1 (37-185)||(26661545-26661692)
chr1 (46-170)||(50052055-50052178)
chr1 (35-181)||(66493-66638)
chr1 (35-173)||(44290479-44290616)
chr1 (37-185)||(37556099-37556246)
chr1 (35-145)||(14318895-14319004)
chr1 (54-183)||(37850640-37850768)
chr1 (35-184)||(39066221-39066369)
chr1 (35-183)||(34649428-34649575)
chr1 (79-183)||(41184489-41184593)
chr1 (78-181)||(3875394-3875497)
chr1 (35-141)||(9955940-9956046)
chr1 (37-180)||(22077518-22077660)
chr1 (35-182)||(40082398-40082543)
chr1 (35-145)||(3537620-3537729)
chr1 (46-136)||(44043804-44043893)
chr1 (53-173)||(32594755-32594874)
chr1 (35-173)||(45084382-45084513)
chr1 (95-173)||(3537227-3537305)
chr1 (54-180)||(24600354-24600479)
chr1 (35-181)||(38804376-38804521)
chr1 (35-145)||(48588509-48588618)
chr1 (64-128)||(66137-66200)
chr1 (40-180)||(1188614-1188753)
chr1 (95-183)||(21378121-21378209)
chr1 (37-173)||(45493997-45494137)
chr1 (36-126)||(45839678-45839767)
chr1 (37-145)||(22077133-22077240)
chr1 (58-180)||(44685449-44685570)
chr1 (54-145)||(5575132-5575222)
chr1 (66-173)||(30630690-30630796)
chr1 (35-145)||(32168719-32168822)
chr1 (35-145)||(5528775-5528884)
chr1 (96-178)||(22077909-22077991)
chr1 (37-170)||(37555733-37555864)
chr1 (78-145)||(4956219-4956286)
chr1 (51-106)||(11977011-11977065)
chr1 (79-180)||(24132049-24132150)
[»] scaffold0391 (2 HSPs)
scaffold0391 (35-183)||(1127-1274)
scaffold0391 (54-126)||(1731-1802)
[»] chr6 (40 HSPs)
chr6 (35-183)||(16107668-16107815)
chr6 (35-173)||(29518503-29518640)
chr6 (35-173)||(29518920-29519057)
chr6 (35-173)||(32741179-32741316)
chr6 (35-173)||(3409259-3409396)
chr6 (35-183)||(2579893-2580040)
chr6 (35-173)||(3409660-3409797)
chr6 (35-185)||(16454895-16455044)
chr6 (36-143)||(3415488-3415594)
chr6 (49-171)||(2377756-2377877)
chr6 (35-173)||(2378126-2378263)
chr6 (35-185)||(2578464-2578612)
chr6 (35-173)||(3058226-3058363)
chr6 (35-173)||(26544049-26544186)
chr6 (35-173)||(35210204-35210341)
chr6 (35-180)||(10074012-10074156)
chr6 (84-185)||(16108051-16108152)
chr6 (53-180)||(10911558-10911685)
chr6 (35-183)||(16454565-16454712)
chr6 (35-142)||(1127391-1127497)
chr6 (35-173)||(1846748-1846885)
chr6 (63-168)||(32460629-32460733)
chr6 (54-173)||(593749-593867)
chr6 (35-170)||(1950206-1950340)
chr6 (52-183)||(5958641-5958771)
chr6 (54-180)||(10074403-10074528)
chr6 (35-167)||(2843560-2843692)
chr6 (35-171)||(5832048-5832182)
chr6 (64-173)||(14748388-14748496)
chr6 (36-172)||(2578857-2578991)
chr6 (35-170)||(6999817-6999951)
chr6 (96-167)||(9062430-9062501)
chr6 (54-180)||(10073656-10073779)
chr6 (35-185)||(2579130-2579275)
chr6 (35-168)||(2579513-2579645)
chr6 (56-136)||(2975589-2975668)
chr6 (53-129)||(8481970-8482045)
chr6 (90-136)||(14789279-14789325)
chr6 (49-181)||(6071124-6071255)
chr6 (37-169)||(17135092-17135223)
[»] chr4 (67 HSPs)
chr4 (35-183)||(4955336-4955483)
chr4 (35-183)||(25483326-25483473)
chr4 (38-184)||(22027983-22028128)
chr4 (35-173)||(41370357-41370494)
chr4 (54-183)||(34646687-34646815)
chr4 (54-185)||(52884875-52885006)
chr4 (35-173)||(54017614-54017751)
chr4 (35-180)||(52884688-52884833)
chr4 (35-183)||(1731666-1731813)
chr4 (35-145)||(54108941-54109049)
chr4 (35-185)||(39404386-39404535)
chr4 (35-161)||(44620365-44620490)
chr4 (79-185)||(49076510-49076616)
chr4 (35-180)||(32941142-32941286)
chr4 (35-180)||(36629230-36629374)
chr4 (35-183)||(50002416-50002563)
chr4 (53-173)||(55933161-55933280)
chr4 (46-173)||(49880160-49880286)
chr4 (38-145)||(50630777-50630883)
chr4 (35-172)||(16889555-16889691)
chr4 (35-180)||(20825829-20825973)
chr4 (37-186)||(36572006-36572154)
chr4 (53-185)||(3341116-3341247)
chr4 (35-183)||(10245910-10246056)
chr4 (35-188)||(22028388-22028542)
chr4 (35-171)||(39404020-39404155)
chr4 (50-185)||(45489366-45489499)
chr4 (35-179)||(49076850-49076992)
chr4 (35-178)||(3340802-3340944)
chr4 (35-170)||(50459724-50459858)
chr4 (35-182)||(51768079-51768225)
chr4 (35-180)||(39792879-39793023)
chr4 (38-185)||(43174494-43174641)
chr4 (35-145)||(44621030-44621139)
chr4 (54-144)||(54936225-54936314)
chr4 (54-183)||(22183302-22183430)
chr4 (54-183)||(36608699-36608827)
chr4 (35-167)||(20826223-20826354)
chr4 (38-185)||(44620648-44620793)
chr4 (54-180)||(3244489-3244614)
chr4 (95-180)||(2740693-2740778)
chr4 (100-181)||(3700357-3700438)
chr4 (35-171)||(40067045-40067181)
chr4 (35-151)||(54108558-54108674)
chr4 (35-183)||(4390120-4390267)
chr4 (53-145)||(18932786-18932877)
chr4 (49-145)||(45496833-45496928)
chr4 (46-173)||(6975486-6975612)
chr4 (35-185)||(16888835-16888985)
chr4 (35-143)||(49302934-49303043)
chr4 (99-180)||(54741260-54741341)
chr4 (35-127)||(18879852-18879943)
chr4 (35-183)||(19504695-19504833)
chr4 (35-119)||(23817700-23817783)
chr4 (54-181)||(41707503-41707628)
chr4 (35-145)||(54343027-54343129)
chr4 (107-185)||(44621414-44621492)
chr4 (99-145)||(54017784-54017830)
chr4 (64-173)||(2741071-2741179)
chr4 (40-180)||(28034222-28034361)
chr4 (35-178)||(34004604-34004744)
chr4 (54-129)||(15841406-15841480)
chr4 (54-119)||(3271841-3271904)
chr4 (107-183)||(44620286-44620362)
chr4 (54-129)||(34544150-34544225)
chr4 (64-122)||(31691203-31691260)
chr4 (107-145)||(44620973-44621011)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (54-185)||(26074600-26074730)
chr5 (35-185)||(13415781-13415930)
chr5 (35-173)||(27502057-27502194)
chr5 (35-183)||(40296336-40296483)
chr5 (35-181)||(3295366-3295509)
chr5 (35-173)||(32487394-32487530)
chr5 (38-180)||(41632775-41632916)
chr5 (35-183)||(11416998-11417143)
chr5 (51-183)||(25327925-25328056)
chr5 (35-173)||(6500451-6500587)
chr5 (35-183)||(15370089-15370236)
chr5 (51-183)||(26075198-26075330)
chr5 (35-183)||(34753046-34753193)
chr5 (35-183)||(36492238-36492385)
chr5 (35-145)||(15370430-15370539)
chr5 (54-180)||(26074186-26074311)
chr5 (35-183)||(42405619-42405764)
chr5 (35-171)||(18603141-18603276)
chr5 (35-167)||(41170640-41170771)
chr5 (46-173)||(9498686-9498812)
chr5 (35-173)||(624196-624333)
chr5 (35-183)||(299479-299626)
chr5 (35-183)||(12662673-12662820)
chr5 (37-173)||(29549278-29549413)
chr5 (51-185)||(26074818-26074952)
chr5 (35-183)||(6224186-6224333)
chr5 (38-145)||(3295039-3295145)
chr5 (35-173)||(6500823-6500959)
chr5 (54-180)||(36568607-36568732)
chr5 (35-180)||(1028538-1028682)
chr5 (55-144)||(35167879-35167967)
chr5 (35-162)||(33747782-33747908)
chr5 (67-181)||(42508604-42508718)
chr5 (54-178)||(35150002-35150124)
chr5 (35-173)||(623818-623955)
chr5 (54-181)||(31509615-31509742)
chr5 (35-173)||(5723812-5723949)
chr5 (105-175)||(26591000-26591070)
chr5 (35-80)||(26900038-26900083)
chr5 (35-168)||(38427553-38427684)
chr5 (49-129)||(31509775-31509855)
chr5 (47-183)||(35914839-35914974)
chr5 (54-129)||(13786041-13786115)
chr5 (105-144)||(41635281-41635320)
chr5 (54-180)||(36522277-36522402)
chr5 (107-144)||(300988-301025)
chr5 (95-128)||(26074363-26074396)
chr5 (35-80)||(38427311-38427356)
chr5 (95-180)||(39309677-39309761)
chr5 (36-80)||(795254-795298)
chr5 (67-171)||(42524719-42524822)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (52-181)||(5349-5477)
scaffold0078 (35-183)||(4972-5119)
[»] scaffold0702 (2 HSPs)
scaffold0702 (49-171)||(549-670)
scaffold0702 (95-173)||(223-300)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (56-185)||(17496-17626)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (35-183)||(47350-47497)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (96-171)||(10192-10267)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 50)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 35 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6713114 - 6712931
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6713114 tagaacaatcccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaaccttaaagcaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacattta 6713015  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacactaccgtgactcatatttaattatcacttaattgt 218  Q
    ||||||||||| || ||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6713014 ctgttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtatacaacaacactaccgtgactcatatttaattatcacttaattgt 6712931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 173
Target Start/End: Original strand, 5542648 - 5542783
Alignment:
Q  37 gaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttact 136  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5542648 gaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacc-aaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttact 5542746  T
Q  137 gttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
     |||||| | |||||  |||||||| |||||||||||    
T  5542747 attttattcgatatgggacatataactcacacttgca 5542783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 38 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 15880397 - 15880251
Alignment:
Q  38 aacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactg 137  Q
    ||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  15880397 aacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactc 15880299  T
Q  138 ttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
    |||||||| || || ||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  15880298 ttttatccgatgtggaacatataactcacacttgtacacaacaacact 15880251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 173
Target Start/End: Original strand, 36178626 - 36178763
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36178626 tagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 36178724  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    || |||||||| || ||  |||||||| |||||||||||    
T  36178725 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 36178763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 6421522 - 6421374
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6421522 tagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctc-aaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 6421424  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacac 184  Q
    || |||||||| || ||  |||||||| |||||||||   ||||||||||    
T  6421423 ctcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtgcacaacaacac 6421374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 1770029 - 1769892
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  ||||  ||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1770029 tagaacaacctcacaagcaagagagacaccacactcttattcaaag-cttcaaagctatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaactttta 1769931  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    || |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||    
T  1769930 ctcttttatccgatgtgtgacatataactcacacttgca 1769892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 51 - 173
Target Start/End: Original strand, 14745704 - 14745825
Alignment:
Q  51 gcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatat 150  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  14745704 gcaagagagacgccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccaatgt 14745802  T
Q  151 gtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    |  |||||||| |||||||||||    
T  14745803 gggacatataactcacacttgca 14745825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 35 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 962735 - 962591
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| | | |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  962735 tagaacaaccacacaagcaagagtgacaacacactcttacccaaaaccttaaga-caatgggtttatgggtcctctcacttataaggtgttcaaccttta 962637  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaaca 180  Q
    || || ||||| || ||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  962636 cttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgcatacaaca 962591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 173
Target Start/End: Original strand, 5543021 - 5543156
Alignment:
Q  37 gaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttact 136  Q
    |||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5543021 gaacaaccgcacaagcaatagagacaccacactcttacccaaaatctt-aaggcaataggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttact 5543119  T
Q  137 gttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
     |||||||  || ||  |||||||| |||||||||||    
T  5543120 attttatcggatgtgggacatataactcacacttgca 5543156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 178
Target Start/End: Original strand, 35580745 - 35580886
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||  | ||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35580745 tagaacaaccccacaaacaagagagacgccgcactcttacccaaaacctt-aaggcaatgggtttatg-gtcctctcacttataaggtgttcaacattta 35580842  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaa 178  Q
     |||||||||| || ||  |||||||| ||||||||||| ||||    
T  35580843 ttgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaa 35580886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 33731785 - 33731676
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  33731785 tagaacaaccgcataagcaagagagacaccatactcttacccaaaacctt-aaggcaataggtttatggatcctcttacttataaggtgctcaaccttta 33731687  T
Q  135 ctgttttatcc 145  Q
    || ||||||||    
T  33731686 ctcttttatcc 33731676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 37106325 - 37106188
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||| | || |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| || | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37106325 tagaacaatcgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaacctt-aaggaaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 37106227  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    || |||||||| || ||  |||||||| |||||||||||    
T  37106226 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 37106188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 173
Target Start/End: Original strand, 41283496 - 41283633
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || || ||||||||||  |||||||||||| |||| ||| || |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41283496 tagaacaaccacacaaacaagagagacgccacactcttacctaaaacctt-aaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 41283594  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    || |||||||| |||||  |||||||| |||||||||||    
T  41283595 ctattttatccgatatgggacatataactcacacttgca 41283633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Original strand, 15511516 - 15511661
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | | |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15511516 tagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaga-caatgggtttatgggtcctcttacttataacgtgttcaaccttta 15511614  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    || ||||||||  | ||| ||||||||  | |||||||| |||||||||    
T  15511615 ctcttttatccgttgtgtgacatataa--ctcacttgcacacaacaaca 15511661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Original strand, 28254260 - 28254405
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  28254260 tagaacaaccccacaag--agagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataagatgttcaaccttta 28254356  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    || || ||||| || ||  |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  28254357 cttttctatccgatgtgggacatataagtcacactggcacacaacaaca 28254405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 42514786 - 42514642
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42514786 tagaacaaccccacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaatctt-aaggcgatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 42514688  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaaca 180  Q
    || || ||||  || |   |||||||| ||||||||||||||||||    
T  42514687 cttttctatctgatgtaggacatataactcacacttgcatacaaca 42514642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 93 - 185
Target Start/End: Original strand, 38796296 - 38796388
Alignment:
Q  93 taggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  38796296 taggtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacact 38796388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 49 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 40733640 - 40733505
Alignment:
Q  49 aagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaat 148  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  40733640 aagcgagagagacaccacactcttacccaaaa-ctttaaggttgtaggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttacttttttatctgat 40733542  T
Q  149 atgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
     ||  |||||||| ||||||||| | |||| ||||||    
T  40733541 gtgggacatataactcacacttgtacacaataacact 40733505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 37106061 - 37105924
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  37106061 tagaacaaccgtacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatctt-aaggcaatgagtttatgggtccccttacttataaggtgttcaaccttta 37105963  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    || |||||| | || ||  |||||||| |||||||||||    
T  37105962 ctattttattcgatgtgggacatataactcacacttgca 37105924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 183
Target Start/End: Original strand, 38796641 - 38796788
Alignment:
Q  37 gaacaaccccataagcaagagagacatcaca--ctcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||| || |||||| ||||||  ||||  ||||||||||||| ||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38796641 gaacaaccacacaagcaatagagacgccacatactcttacccaaaacctt-aaggcattaggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 38796739  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
     |||||||||  || ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38796740 ttgttttatcagatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 38796788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 180
Target Start/End: Original strand, 40679650 - 40679794
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| || || || |||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||    
T  40679650 tagaacaaccccacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaatctt-aaggcgatgggtttatgggttctcttacttataaggtgttcaaccctta 40679748  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaaca 180  Q
    || || ||||| |||||  |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  40679749 cttttctatccgatatgggacatataactcacatttgcacacaaca 40679794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Original strand, 36005901 - 36006047
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||| ||| || |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36005901 tagaacaaccccacaagcaagagagacgccacacttttacccaaaacctt-aaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaactttta 36005999  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    || || ||| | || ||  |||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  36006000 ct-ttctattcgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 36006047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 183
Target Start/End: Original strand, 31899507 - 31899594
Alignment:
Q  96 gtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  31899507 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtggaacatataactcacactttcacacaacaaca 31899594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 145
Target Start/End: Original strand, 36178195 - 36178301
Alignment:
Q  38 aacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactg 137  Q
    ||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  36178195 aacaaccacacaagcaagagaggcaccacactcttacccaaaatctt-aaggcaatgggtttatgggttcccttacttataaggtgttcaacctttacta 36178293  T
Q  138 ttttatcc 145  Q
    ||||||||    
T  36178294 ttttatcc 36178301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 145
Target Start/End: Original strand, 40163393 - 40163503
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||  || |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  40163393 tagaacaaccacacaagcaagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaagacactaggttaatgggtcatcttacttataaggtgttcaaccttta 40163492  T
Q  135 ctgttttatcc 145  Q
    || || |||||    
T  40163493 cttttctatcc 40163503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 6422247 - 6422139
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||| || || |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  6422247 tagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactctta-cctaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttaattataatgtgttcaaccttta 6422149  T
Q  135 ctgttttatc 144  Q
    || |||||||    
T  6422148 cttttttatc 6422139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 182
Target Start/End: Original strand, 12529091 - 12529195
Alignment:
Q  78 aaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcataca 177  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||   || |   |||||||| |||||||||||||||    
T  12529091 aaaactttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttatacggtgttcaatctttactgttttatttgatgtaggacatataactcacacttgcataca 12529190  T
Q  178 acaac 182  Q
    |||||    
T  12529191 acaac 12529195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 16542556 - 16542438
Alignment:
Q  65 acactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtc 164  Q
    |||||||||| ||||| ||| || |||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||  || ||||| ||    
T  16542556 acactcttactcaaaatctt-aaggcaatgagtttataagtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacttataactc 16542458  T
Q  165 acacttgcatacaacaacac 184  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  16542457 acacttgcacacaacaacac 16542438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 180
Target Start/End: Original strand, 28531354 - 28531479
Alignment:
Q  54 agagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgta 153  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||| || |||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||| || ||      
T  28531354 agagagtcaccacactcttacccaaaatctt-aaggcaatgagtttatgggacctcttacttataaggtgttcaacctttgcttttctatccgatgtggg 28531452  T
Q  154 acatataagtcacacttgcatacaaca 180  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  28531453 acatataactcacacttgcacacaaca 28531479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 65 - 173
Target Start/End: Original strand, 36178320 - 36178427
Alignment:
Q  65 acactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtc 164  Q
    |||||||||||||||| ||| | | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |  ||  |||||||| ||    
T  36178320 acactcttacccaaaaccttaaga-caatgggtttatgagtccccttacttataaggtgttccacctttactattttatccgaagtgggacatataactc 36178418  T
Q  165 acacttgca 173  Q
    |||||||||    
T  36178419 acacttgca 36178427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 40734017 - 40733871
Alignment:
Q  37 gaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttact 136  Q
    |||||||| || |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  40734017 gaacaaccacacaagcgagacagacaccacactcttacccaaaa-ctttaaggctgtaggtt-atgagccctcttacttataaggtgttaaatctttact 40733920  T
Q  137 gttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
     |||||| | || ||  |||||||| ||||||||| | |||| ||||||    
T  40733919 cttttattcgatgtgggacatataactcacacttgtacacaataacact 40733871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23346373 - 23346274
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| || || |||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  23346373 tagaacaaccgcacaagcaagagagacatcacactctta-ccgaaaaccttaaggctatgggtttatgggccctctta-ttataaggtgtttaaccttta 23346276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 7598684 - 7598609
Alignment:
Q  98 ttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  || ||  |||||||| |||||||||||    
T  7598684 ttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 7598609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 185
Target Start/End: Original strand, 31468797 - 31468916
Alignment:
Q  61 catcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatata 160  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||  ||||||| |||||||||    |||| | |||||| |||||| |||||||| || ||  |||||||    
T  31468797 catcacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgagtttatgggtcctctta----taagatattcaacctttactattttatccgatgtgggacatata 31468891  T
Q  161 agtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
    | ||||||||||| |||||||||||    
T  31468892 actcacacttgcacacaacaacact 31468916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 180
Target Start/End: Original strand, 37632636 - 37632762
Alignment:
Q  53 aagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgt 152  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||  || |||||||| ||||||||||||||||  |||  ||| |||||| |||||||| || |      
T  37632636 aagagatacaccacactcttacccaaaacctt-aaagttatgggtttatgggtcctcttacttataaaatgtcaaacctttactattttatccgatgtag 37632734  T
Q  153 aacatataagtcacacttgcatacaaca 180  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  37632735 gacatataactcacacttgcacacaaca 37632762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 173
Target Start/End: Original strand, 14745332 - 14745452
Alignment:
Q  52 caagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatg 151  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||  ||||| |||||| | || ||    
T  14745332 caagagagacgccacactcttaccc-aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcatacttacaagatgttcaaccattactattttattcgatgtg 14745430  T
Q  152 taacatataagtcacacttgca 173  Q
      |||||||| ||||| |||||    
T  14745431 ggacatataactcacagttgca 14745452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 145
Target Start/End: Original strand, 31259666 - 31259746
Alignment:
Q  64 cacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatcc 145  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  31259666 cacactcttacccaaaacctt-aaggtgataggtttatgggtcatcttacttataaggtgttgaacctttactcttttatcc 31259746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 185
Target Start/End: Original strand, 36785664 - 36785733
Alignment:
Q  116 ataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| || ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  36785664 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacact 36785733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 3673205 - 3673122
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataa 119  Q
    |||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||  |||||||  |||||||||||||||    
T  3673205 tagaacaaccacactagtaagagagacatcacactcttagccaaaatc-ttaaagcaatgagtttatggatcctcttacttataa 3673122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 6421867 - 6421793
Alignment:
Q  36 agaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctctt 111  Q
    ||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  6421867 agaacaaccacacaagttagagagacaccacactcttaccc-aaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctctt 6421793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 145
Target Start/End: Original strand, 28254176 - 28254242
Alignment:
Q  79 aaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatcc 145  Q
    ||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||    
T  28254176 aaactttaaggcaaagtgtttatgagtcctcttacttataaagtgttcaacctttacttttctatcc 28254242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 29676660 - 29676547
Alignment:
Q  41 aaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttt 140  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||       || |||||  ||||||| || |||| |||||||| ||||||||  |||||| |||    
T  29676660 aaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaa-------aaggcaatgagtttatgggttctctcacttataatgtgttcaatctttactcttt 29676568  T
Q  141 tatccaatatgtaacatataa 161  Q
    |||||||| ||  ||||||||    
T  29676567 tatccaatgtgagacatataa 29676547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 180
Target Start/End: Original strand, 33561491 - 33561616
Alignment:
Q  54 agagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgta 153  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  ||||  ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||| |  ||| || ||||  || || |    
T  33561491 agagagatatcacactcttaccc-aaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgtttaacctccacttttctatctgatgtgga 33561589  T
Q  154 acatataagtcacacttgcatacaaca 180  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  33561590 acatataactcacacttgcacacaaca 33561616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 5367592 - 5367448
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||  || |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| || |  ||  ||| |||  || |||||||||||||||||||||| |||     
T  5367592 tagaacaactgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaacctt-aaggttatgtgttcatggatcatcttacttataaggtgttcaacctttg 5367494  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaaca 180  Q
    || |||||||| || ||  |||||||  ||||||||| | ||||||    
T  5367493 ctcttttatccgatctgggacatatatatcacacttgtacacaaca 5367448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 7598363 - 7598228
Alignment:
Q  37 gaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttact 136  Q
    |||||||| || |||  ||||||||| || | |||||||||||| ||| || || ||  ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  7598363 gaacaaccgcacaagtgagagagacaccatattcttacccaaaacctt-aaggctatgagtttatgggtcctcttatttataaggtgttgaacctttact 7598265  T
Q  137 gttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
     || ||| | || |  ||||||||| |||||||||||    
T  7598264 tttctattcgatgtagaacatataattcacacttgca 7598228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 29677043 - 29676892
Alignment:
Q  37 gaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtc-----ctcttacttataaggtgttcaacat 131  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||  |||  ||| || ||||| |||||||| |||     |||| || ||||||||||| ||| |    
T  29677043 gaacaaccccacaattaagagagacaccacactcttacttaaagcctt-aaggcaatgggtttatgggtcttctcctctcacctataaggtgttaaacct 29676945  T
Q  132 ttactgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacac 184  Q
    ||||| |||||||| || ||  |||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  29676944 ttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacctgcacacaacaacac 29676892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 129
Target Start/End: Original strand, 33953810 - 33953885
Alignment:
Q  53 aagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaac 129  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||    
T  33953810 aagagggacgtcacactcttaccc-aaaattttaaggcaacaggtttatgggtcctctcacttatatagtgttcaac 33953885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 6421761 - 6421688
Alignment:
Q  37 gaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctctt 111  Q
    |||||||| || |||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||| ||||||||    
T  6421761 gaacaaccacacaagttagagagacaccacactcttacccaaaaccttt-agtcaataggtttatgggtcctctt 6421688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 181
Target Start/End: Original strand, 37895111 - 37895227
Alignment:
Q  64 cacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagt 163  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||| || || |||||| |||||| |||||| |||| | || ||||| || ||  |||||||| |    
T  37895111 cacactcttaccc-aaaaccttaaggcaatgggtttatgtgttcttttacttttaaggttttcaacttttatttttctatccgatgtgggacatataact 37895209  T
Q  164 cacacttgcatacaacaa 181  Q
    || ||| ||| |||||||    
T  37895210 caaactcgcacacaacaa 37895227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 178
Target Start/End: Original strand, 37894732 - 37894855
Alignment:
Q  54 agagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgta 153  Q
    ||||| ||| |||||| ||| |||||| ||| || ||||| | |||||||||| ||||||||||||||| || | | |||||| || ||| |||| ||      
T  37894732 agagacacaccacacttttaaccaaaatctt-aaggcaatggatttatgagtcttcttacttataaggtttttagcctttacttttctattcaatgtggg 37894830  T
Q  154 acatataagtcacacttgcatacaa 178  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  37894831 acatataactcacatttgcacacaa 37894855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 49)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 45433378 - 45433231
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45433378 tagaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatctt-aaggcaataggtttatgagttctcttacttataaggtgttcaaccttta 45433280  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    || |||||||| || || | ||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  45433279 ctcttttatccgatgtggatcatataactcacacttgtacacaacaaca 45433231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Original strand, 23398 - 23545
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23398 tagaacaaccgcacatgcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 23496  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    || || ||||| || || ||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  23497 ctattgtatccgatgtggaacatataactcacaattgcacacaacaaca 23545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 37 - 183
Target Start/End: Original strand, 22567062 - 22567206
Alignment:
Q  37 gaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttact 136  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22567062 gaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttacc-aaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttact 22567160  T
Q  137 gttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
     |||||||| || ||  |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22567161 cttttatccgatgtg-gacatattactcacacttgcatacaacaaca 22567206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 185
Target Start/End: Original strand, 1085637 - 1085786
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  1085637 tagaacaaccacacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaaccttta 1085735  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
    || |||||||| || ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1085736 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacact 1085786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 45754850 - 45754706
Alignment:
Q  37 gaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttact 136  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45754850 gaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggctatgggtttatgagtcatcttacttataaggtgttcaacatttact 45754752  T
Q  137 gttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
     |||||||| || ||  |||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  45754751 attttatccgatgtg-gacatataactcacacttgtacacaacaaca 45754706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 45434773 - 45434625
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45434773 tagaacaactccacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaacctt-aaggcagtaagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 45434675  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacac 184  Q
    || |||||||| || ||  |||||||| | ||||||| | ||||||||||    
T  45434674 cttttttatccgatgtgggacatataacttacacttgtacacaacaacac 45434625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 7517717 - 7517570
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7517717 tagaacaaccacacaagtgagacagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 7517619  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    || |||||||| || ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  7517618 ctcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 7517570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 30244405 - 30244258
Alignment:
Q  37 gaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttact 136  Q
    |||||||| || |||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  30244405 gaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtcttcaacctttact 30244307  T
Q  137 gttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
     |||||||| || ||  |||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  30244306 cttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacact 30244258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 16569316 - 16569186
Alignment:
Q  52 caagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatg 151  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| || ||    
T  16569316 caagagagacaccgcactcttacc-aaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtg 16569218  T
Q  152 taacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16569217 agacatataactcacacttgcatacaacaaca 16569186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 183
Target Start/End: Original strand, 16596346 - 16596476
Alignment:
Q  52 caagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatg 151  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| || ||    
T  16596346 caagagagacaccgcactcttacc-aaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtg 16596444  T
Q  152 taacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16596445 agacatataactcacacttgcatacaacaaca 16596476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 185
Target Start/End: Original strand, 22566712 - 22566832
Alignment:
Q  64 cacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagt 163  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||  |||||| | |    
T  22566712 cacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatattact 22566810  T
Q  164 cacacttgcatacaacaacact 185  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22566811 cacacttgcatacaacaacact 22566832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 30245197 - 30245065
Alignment:
Q  52 caagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatg 151  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||    
T  30245197 caagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgagtttatgggtcgtcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtg 30245099  T
Q  152 taacatataagtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
     ||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  30245098 gaacatataactcacacttgtacacaacaacact 30245065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 7554148 - 7554013
Alignment:
Q  49 aagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaat 148  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| || || || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  7554148 aagcgagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggctatgggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgat 7554050  T
Q  149 atgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
     ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  7554049 gtgggacatataactcacacttgcacacaacaacact 7554013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 24177568 - 24177425
Alignment:
Q  39 acaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgt 138  Q
    |||||| || |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||| |    
T  24177568 acaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacc-aaaaactttaaggcaatgggtttatgggtccgcttacttataaggtgttcagcctttactct 24177470  T
Q  139 tttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    ||||||| || ||  |||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  24177469 tttatccgatgtgggacatataactcatacttgcacacaacaaca 24177425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 182
Target Start/End: Original strand, 36939754 - 36939900
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||| || ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36939754 tagaacaaccgcataagcaagagaaacaccacacttttacccaaaacctt-aaggcaatggatttatgggtcctcttacttataaggtgttcaactttta 36939852  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaac 182  Q
    || |||||| | || ||  |||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  36939853 ctattttatacgatttgggacatataactcacacttgcacagaacaac 36939900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 170
Target Start/End: Original strand, 37533385 - 37533519
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37533385 tagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatggatttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 37533483  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacactt 170  Q
    || |||||| |||| |  ||||||||| ||||||||    
T  37533484 ctattttattcaatgtagaacatataactcacactt 37533519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 19122868 - 19122759
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19122868 tagaacaaccacacaagcaagatagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatggatttatgagtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 19122770  T
Q  135 ctgttttatcc 145  Q
    || ||||||||    
T  19122769 ctattttatcc 19122759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 183
Target Start/End: Original strand, 34218069 - 34218202
Alignment:
Q  49 aagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaat 148  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| | | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  34218069 aagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaga-caatgggtttatgagtcctctcacttataaggtgttcaacatttacttttttatccgat 34218167  T
Q  149 atgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
     ||  |||||||| ||||| ||| | |||||||||    
T  34218168 gtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 34218202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 173
Target Start/End: Original strand, 37533032 - 37533168
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||| | || |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| || |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37533032 tagaacaagcgcacaagcaagagagacaccacact-ttacccaaaacctt-aaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 37533129  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    || ||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||    
T  37533130 ctattttatccaatgtgggacatataactcacacttgca 37533168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Original strand, 40094795 - 40094942
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | | | || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  40094795 tagaacaacctcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaga-cgatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttgaaccttta 40094893  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    || |||||| | || ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  40094894 ctcttttattcgatgtgagacatataactcacacttgcacacaacaaca 40094942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 51 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 43241616 - 43241485
Alignment:
Q  51 gcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatat 150  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||| ||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||| || |    
T  43241616 gcaagagagacatcatacttttacctaaaacctt-aagtcaataagtttatgagtccttttacttataaggtgttcaacctttatttttttatccgatgt 43241518  T
Q  151 gtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    | ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  43241517 ggaacatataactcacacttgcacacaacaaca 43241485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 11845328 - 11845198
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||  || |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| || ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11845328 tagaacaactgcacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaacctt-aaggcaatggatttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 11845230  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcac 166  Q
    || |||||||| || || ||||||||| ||||    
T  11845229 ctattttatccgatgtggaacatataactcac 11845198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 55 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 6054677 - 6054562
Alignment:
Q  55 gagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaa 154  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||  |    
T  6054677 gagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtgaga 6054579  T
Q  155 catataagtcacacttg 171  Q
    ||||||| | |||||||    
T  6054578 catataactaacacttg 6054562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 50 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 29157687 - 29157565
Alignment:
Q  50 agcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaata 149  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |     
T  29157687 agcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatggatttatgggtcgtcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccggtg 29157589  T
Q  150 tgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    ||  |||||||| |||||||||||    
T  29157588 tgggacatataactcacacttgca 29157565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 180
Target Start/End: Original strand, 8128462 - 8128606
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||| |||||| ||| || |  || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  8128462 tagaacaaccacataagcgagagtgacaccacactcttaaccaaaacctt-aaggttatgggtttatgggtcctcttacatataaggtgttcaaccttta 8128560  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaaca 180  Q
     | || ||||| |||||  |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  8128561 tttttctatccgatatgggacatataactcacacttgcacacaaca 8128606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 30032704 - 30032572
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||    
T  30032704 tagaacaaccgcacaagcaagagagatgtcacactcttacccaaaacctt-aaggctataggtttatggatactcttacttataaggtgttcaacactta 30032606  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacac 168  Q
    || |||||| | || ||  |||||||| ||||||    
T  30032605 ctcttttattcgatgtgggacatataactcacac 30032572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 55 - 183
Target Start/End: Original strand, 36534825 - 36534952
Alignment:
Q  55 gagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaa 154  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||| | | |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |  ||  |    
T  36534825 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaga-ctttaggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctctactgttttatccgaggtggga 36534923  T
Q  155 catataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  36534924 catataagttacacttgcacacaacaaca 36534952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 47129213 - 47129084
Alignment:
Q  54 agagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgta 153  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||| || ||      
T  47129213 agagagacaccacactcctacccaaaacctt-aaagcgatgggtttatgggtcctcttacttataagaggttcaacctttactattttatccgatgtgag 47129115  T
Q  154 acatataagtcacacttgcatacaacaacac 184  Q
    |||||||| |||||||||   ||||||||||    
T  47129114 acatataactcacacttgtgcacaacaacac 47129084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 104 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 30244770 - 30244689
Alignment:
Q  104 gtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  30244770 gtcctcttatttataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacact 30244689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 185
Target Start/End: Original strand, 1085278 - 1085419
Alignment:
Q  44 cccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttat 143  Q
    |||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| || |||||  ||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||    
T  1085278 cccacaaggaagagaaacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgagtttatgggttctcttacttatgagttgttcaacttttactattttat 1085376  T
Q  144 ccaatatgtaacat-ataagtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
    || |||||  |||| | || ||||||||||| |||||||||||    
T  1085377 ccgatatgggacataaaaactcacacttgcacacaacaacact 1085419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 143
Target Start/End: Original strand, 24838724 - 24838830
Alignment:
Q  37 gaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcc-tcttacttataaggtgttcaacatttac 135  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  |||  ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24838724 gaacaaccacacaagcaagagagacgtcacactcttaccc-aaaaccttaagacaacgggtttatggatccttcttacttataaggtgttcaacctttac 24838822  T
Q  136 tgttttat 143  Q
    | ||||||    
T  24838823 tcttttat 24838830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 89 - 180
Target Start/End: Original strand, 28301617 - 28301708
Alignment:
Q  89 gcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaaca 180  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||| || ||  |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  28301617 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcagcttttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgcacacaaca 28301708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 30255406 - 30255327
Alignment:
Q  106 cctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||  ||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  30255406 cctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacgcacacttgcacacaacaacact 30255327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 14681627 - 14681510
Alignment:
Q  55 gagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaa 154  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| | | |||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||  || ||  |    
T  14681627 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaga-caatgggtttatgggccctcttacttacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtggga 14681529  T
Q  155 catataagtcacacttgca 173  Q
    ||||||| | |||||||||    
T  14681528 catataacttacacttgca 14681510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 182
Target Start/End: Original strand, 36109002 - 36109084
Alignment:
Q  100 atgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaac 182  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||  | |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  36109002 atgaatcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagaaatataactcacacttgcacacaacaac 36109084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 30245561 - 30245484
Alignment:
Q  106 cctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  || ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  30245561 cctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 30245484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Original strand, 118320 - 118469
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagaga--gacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatt 132  Q
    |||||||||| || ||||||||||  |||  ||||||||||||||||| ||| |  | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  118320 tagaacaaccacacaagcaagagatagacgccacactcttacccaaaacctt-acggtaatgggtttatggatcctcttacttattaggtgttcaacctt 118418  T
Q  133 tactgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    |||| || ||||  || ||  |||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  118419 tacttttctatctgatgtgggacatataacttacacttgcacacaacaaca 118469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 9901780 - 9901648
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||  ||||  |||||||  ||||| ||| |||||| |||||||| ||||    
T  9901780 tagaacaaccgcactagcaagagagacaccacactcttaccc-aaaaccttaagacaatgagtttatggatcctc-tacgtataagatgttcaaccttta 9901683  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacactt 170  Q
    ||||||||||| || ||  |||||||| ||||||||    
T  9901682 ctgttttatccgatgtg-gacatataactcacactt 9901648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 178
Target Start/End: Original strand, 40230328 - 40230454
Alignment:
Q  51 gcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatat 150  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||| ||| | | | || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| | || |    
T  40230328 gcaagagagacaccagacttttacccaaaaccttaaga-ctatgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacttttacttttttattcgatgt 40230426  T
Q  151 gtaacatataagtcacacttgcatacaa 178  Q
    |  |||||||| | ||||||||| ||||    
T  40230427 gggacatataacttacacttgcacacaa 40230454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 20599439 - 20599304
Alignment:
Q  49 aagcaagagagacatcaca--ctcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatcca 146  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| |||| |||||  ||||||  ||||||||| |||||| ||||| | | |||||| ||||||||     
T  20599439 aagcaagagagacaccacactctcttaccc-aaaacgttaaggcaatgagtttatatgtcctcttatttataaagtgtttatcctttacttttttatccg 20599341  T
Q  147 atatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    |||||  |||||||| ||||||||  | |||||||||    
T  20599340 atatgggacatataactcacacttatagacaacaaca 20599304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 30253612 - 30253536
Alignment:
Q  52 caagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaac 129  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  30253612 caagagagacaccacactcttaccc-aaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttacttataaggtcttcaac 30253536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 37167918 - 37167840
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttact 114  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| | ||||||  ||||||||||    
T  37167918 tagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccc-aaaactttaagtcaatggatttatggatcctcttact 37167840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 41854771 - 41854665
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || ||| |||| |||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||  |||||  ||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  41854771 tagaacaaccgcacaagtaagaaagacgtcacactcttaccc-aaaaccttaaggcattatatttataggtcatcttgcttataaggtgttcaaccttta 41854673  T
Q  135 ctgtttta 142  Q
    || |||||    
T  41854672 ctctttta 41854665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 51 - 127
Target Start/End: Original strand, 28300290 - 28300366
Alignment:
Q  51 gcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttat-gagtcctcttacttataaggtgttca 127  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  28300290 gcaagagagacgccacactcttacccaaaatc-ttaaggcaatgggtttatggggttctcttacttataaggtgttca 28300366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 36623096 - 36622950
Alignment:
Q  36 agaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttac 135  Q
    ||||||| | || ||| ||||||| || || |||| ||||||||| ||| || ||||| | ||||||  ||||| |||||||||  |||| ||| |||||    
T  36623096 agaacaatcacacaagtaagagaggcaccatactcctacccaaaacctt-aaggcaatggatttatggatcctcctacttataaaatgtttaacctttac 36622998  T
Q  136 tgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    | |||||||| || ||  |||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  36622997 tattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaataaca 36622950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 102
Target Start/End: Original strand, 40094434 - 40094500
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatg 102  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||    
T  40094434 tagaacaaccacataagtaagaaagacgtcacactcttaccc-aaaactttaaagtaatgagtttatg 40094500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 37346036 - 37345972
Alignment:
Q  54 agagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataa 119  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||| ||||||||    
T  37346036 agagagacgtcacactcttactc-aaaactttaaggcaatatgtttatgggtcttctcacttataa 37345972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 47129506 - 47129461
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaa 80  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47129506 tagatcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa 47129461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Original strand, 28300589 - 28300641
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaa 87  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  28300589 tagaataaccacacaagcaagagagacaccacactcttaccccaaaaccttaa 28300641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 5532 - 5386
Alignment:
Q  37 gaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttact 136  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5532 gaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaactttaagacaatatgtttatgggccctcttacttataaggtgttcaacctttact 5433  T
Q  137 gttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
     |||||||| || |   |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5432 attttatccgatgtaggacatataactcacacttgcacacaacaaca 5386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 5917 - 5765
Alignment:
Q  37 gaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaact----ttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatt 132  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||| |||||  |    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5917 gaacaaccccacaagtaaaagagacaccacactcttactcaaaatttaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctt 5818  T
Q  133 tactgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
    |||| |||||||| || ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5817 tactattttatccgatgtgcgacatataactcacacttgcacacaacaacact 5765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 52)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 35 - 185
Target Start/End: Original strand, 37990660 - 37990809
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37990660 tagaacaatcacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 37990758  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
    || |||||||| || || ||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  37990759 ctattttatccgatgtggaacatataactcacacttgtacacaacaacact 37990809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 15772991 - 15772844
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15772991 tagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaacctt-aaagcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacattta 15772893  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    || |||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  15772892 ctcttttatccgatatgggacatataactcacacttgcacacgacaaca 15772844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 184
Target Start/End: Original strand, 37990998 - 37991146
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || || ||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37990998 tagaacaaccacataagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcgatgagtttataggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 37991096  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacac 184  Q
    || ||||||||||| ||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  37991097 ctattttatccaatgtgagacatataactcacacttgtacacaacaacac 37991146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 185
Target Start/End: Original strand, 42342111 - 42342260
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  42342111 tagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaggcattgaacattta 42342209  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
    || |||||||| || || ||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  42342210 ctcttttatccgatgtggaacatatgaatcacacttgcacacaacaacact 42342260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 181
Target Start/End: Original strand, 54017837 - 54017982
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54017837 tagaacaaccacacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcgttaggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 54017935  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaa 181  Q
    || |||||||| || |   |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  54017936 ctcttttatccgatgtaggacatataactcacacttgcacacaacaa 54017982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 15773331 - 15773180
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaag--agagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatt 132  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15773331 tagaacaaccacacaagcaagcaagagacatcacactcttacccaaaa-ctttaaggcaatgagcttatgagtcctcttacttataagatgttcaacttt 15773233  T
Q  133 tactgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
    |||| |||||| | || ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15773232 tactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacact 15773180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 145
Target Start/End: Original strand, 39934976 - 39935085
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39934976 tagaacaaccacacaagcaagagagacatcacactcttactcaaaa-ctttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaaccttta 39935074  T
Q  135 ctgttttatcc 145  Q
    || ||||||||    
T  39935075 ctcttttatcc 39935085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 183
Target Start/End: Original strand, 29644926 - 29645070
Alignment:
Q  38 aacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactg 137  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||     
T  29644926 aacaaccgcataagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaga-caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtttaacctttactc 29645024  T
Q  138 ttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    |||||||| || ||  |||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  29645025 ttttatccgatgtgggacatataacttacacttgcacacaacaaca 29645070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 35 - 184
Target Start/End: Original strand, 43346812 - 43346960
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43346812 tagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgagtttatgggttctcttacttataaggtgttcaaccttta 43346910  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacac 184  Q
    || |||||||  || ||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  43346911 ctattttatctgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacac 43346960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 32589840 - 32589694
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32589840 tagaacaaccacacaagcaagagagacatcgcactcttacccaaaacctt-aaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 32589742  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
     | |||||||  || ||  |||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  32589741 ttattttatcttatgtgggacatat-actcacacttgcacacaacaaca 32589694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Original strand, 42342409 - 42342556
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | | |||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  42342409 tagaacaaccgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaga-caatggatttatgggtcctcttacttataaggtgttgaaccttta 42342507  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    || |||||||  || ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  42342508 ctcttttatcggatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 42342556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 52634812 - 52634666
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  52634812 tagaacaactgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgggtttatgggtc-tcttacttataaggcgttcaaccttta 52634715  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    ||||||||||| || ||  |||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  52634714 ctgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 52634666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 11662070 - 11661939
Alignment:
Q  54 agagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgta 153  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||      
T  11662070 agagagacacctcactcttacccaaaaaccttaaggcaattggtttatgaggcctctcacttttaaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtggg 11661971  T
Q  154 acatataagtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
     ||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  11661970 gcatttaactcacacttacatacaacaacact 11661939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 35946645 - 35946515
Alignment:
Q  49 aagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaat 148  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| || ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  35946645 aagcaagagagacaccacacttttacccaaaacctt-aaggcaacgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgat 35946547  T
Q  149 atgtaacatataagtcacacttgcatacaaca 180  Q
     ||  |||||||| ||||||||| | ||||||    
T  35946546 gtgggacatataactcacacttgtacacaaca 35946515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 22304706 - 22304569
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22304706 tagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtattcaaccttta 22304608  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    || |||||||| || ||  |||||||  |||||||||||    
T  22304607 ctattttatccgatgtgggacatatagctcacacttgca 22304569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 183
Target Start/End: Original strand, 29644605 - 29644749
Alignment:
Q  38 aacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactg 137  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | | |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  29644605 aacaaccgcataagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaga-caatgggtttatgggttctcttacttataaggtgttcaacctttactc 29644703  T
Q  138 ttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    ||| |||| || ||  |||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  29644704 tttaatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaaaaca 29644749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Original strand, 12114583 - 12114730
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12114583 tagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaga-caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 12114681  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    || || ||||| || ||  | |||||| | ||||||||| |||||||||    
T  12114682 cttttctatccgatgtgggatatataacttacacttgcacacaacaaca 12114730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Original strand, 25739446 - 25739593
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  25739446 tagaactaccgcacaagctagagagacgtcacactcttacccaaaaccta-aaagcaatgagtttatgggtcctcttacttatatgatgttcaactttta 25739544  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    || |||||||| || ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25739545 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 25739593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 39914389 - 39914242
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||  || || ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  39914389 tagaacaaccgcataagtgagagagacaccacactcttatccaaaatatt-aaggcattaggtttatgggtcctcttatttataaggtgttcaacctcta 39914291  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    ||||||||||  || ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  39914290 ctgttttatctgatgtgagacatataactcacacttgcacacaacaaca 39914242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 184
Target Start/End: Original strand, 32462921 - 32463070
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaa-cattt 133  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||    
T  32462921 tagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttactcaaaacctt-aaggcaatgggtttatgagtcttcttacttataaggtattcaacctttt 32463019  T
Q  134 actgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacac 184  Q
    ||| || ||||| || ||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  32463020 actcttctatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacac 32463070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 45901851 - 45901702
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaa-cattt 133  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  45901851 tagaacaaccctataagtaagagagacaccacactcttacc-aaaaactttaaggccatgagtttatgcgtcctcttacttataaggtgttcaacctttt 45901753  T
Q  134 actgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacac 184  Q
      | |||||||| || ||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  45901752 tttcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacac 45901702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 181
Target Start/End: Original strand, 44160584 - 44160710
Alignment:
Q  53 aagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgt 152  Q
    |||||||||  |||| |||||||  ||||| ||||  |||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||     
T  44160584 aagagagacgccacattcttacc--aaaaccttaagacaatgggtttatggatcctcttatttataaggtgttcaacctttattgttttatccaatatga 44160681  T
Q  153 aacatataagtcacacttgcatacaacaa 181  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  44160682 aacatataactgacacttgcatacaacaa 44160710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 183
Target Start/End: Original strand, 53118015 - 53118142
Alignment:
Q  54 agagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgta 153  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |    
T  53118015 agagagacactacactcttacccaaaatctt-aaggcaatgggttt-tgaatcctctcacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatatgga 53118112  T
Q  154 acatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  53118113 acatataactcacacttgcccacaacaaca 53118142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 51 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 53577485 - 53577354
Alignment:
Q  51 gcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatat 150  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||  ||| |||| || |||| |||||||| ||||||||||||||| || |    
T  53577485 gcaagagagacaccacactcttacccaagacctt-aaggcaatatgtttatggatccacttatttttaagatgttcaacctttactgttttatccgatgt 53577387  T
Q  151 gtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  53577386 gtgacatataactcacacttgcacacaacaaca 53577354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Original strand, 54018219 - 54018366
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  54018219 tagaacaaccacacaagcatgagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcgttaggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaatcttta 54018317  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    || |||||||| ||     |||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  54018318 ctcttttatccgatgcaggacatataactcacacttgcacataacaaca 54018366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 25755531 - 25755383
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||  |||||| ||||||| || |||||   |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  25755531 tagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacacttttacccacaa-ctttaggacaatggatttatgagtcctcttacttataaggtattcaaccttta 25755433  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacac 184  Q
    || |||||||  || ||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  25755432 ctcttttatctgatgtgagacatataactcacacttgtacacaacaacac 25755383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 173
Target Start/End: Original strand, 21832395 - 21832501
Alignment:
Q  66 cactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtca 165  Q
    ||||||||||||||| ||| || || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||  |||||||| |||    
T  21832395 cactcttacccaaaacctt-aaggctatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccaatgtgggacatataactca 21832493  T
Q  166 cacttgca 173  Q
    ||||||||    
T  21832494 cacttgca 21832501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 173
Target Start/End: Original strand, 50612482 - 50612610
Alignment:
Q  49 aagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaa----taggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatc 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |  |     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  50612482 aagcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagataatatgttagatttatgagtcctcttacttataaggtgttcaatctttactattttatc 50612581  T
Q  145 caatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    | || ||  |||||||| |||||||||||    
T  50612582 cgatgtgggacatataactcacacttgca 50612610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 4823792 - 4823655
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    ||||||| || ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  4823792 tagaacatccgcataagcaaaaaagacaccacactcttacccaaaatctt-aaggcaatgagtttatgggtcctcctacttataaggtgtttaactttta 4823694  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    || |||||||| || ||  || ||||| |||||||||||    
T  4823693 ctattttatccgatgtgagacttataactcacacttgca 4823655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 180
Target Start/End: Original strand, 33803273 - 33803417
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||  || |||||  ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  33803273 tagaacaaccacacaagagagggagacgccacactcttacccaatacctt-aatgcaatgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaaccttta 33803371  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaaca 180  Q
    || |||||||| || ||  |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  33803372 ctattttatccgatgtgggacatataactcacaattgcacacaaca 33803417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 185
Target Start/End: Original strand, 32462582 - 32462729
Alignment:
Q  38 aacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaa-catttact 136  Q
    ||||| |||| || ||||||||||  |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  32462582 aacaatcccacaaacaagagagaccccacactcttatccaaaacctt-aaagcaataggtttatggatcatcttacttataaggtgttcaaccttttact 32462680  T
Q  137 gttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
     ||| || | || ||  |||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  32462681 ctttcattcgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacact 32462729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 31190146 - 31190007
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||        |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  31190146 tagaacaacccgacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggc--------tatgggtcctctaacttataaggtgttcaaccttta 31190056  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    || |||||||| || ||  |||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  31190055 ctcttttatccgatgtgggacatatcactcacacttgcacacaacaaca 31190007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 40 - 166
Target Start/End: Original strand, 3135099 - 3135224
Alignment:
Q  40 caaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgtt 139  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |  ||| | |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3135099 caaccgcacaagcaagagagacaccacactcttactcaaaacctt-atggcagtgggtttatgggttcttttacttataaggtgttcaacatttactatt 3135197  T
Q  140 ttatccaatatgtaacatataagtcac 166  Q
    |||||| || ||  |||||||| ||||    
T  3135198 ttatccgatgtgggacatataactcac 3135224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 8328022 - 8327897
Alignment:
Q  54 agagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgta 153  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||| || ||||||| || |||||||||||||| | |||| | |||||| |||||||| || ||      
T  8328022 agagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcattacgtttatgggttctcttacttataagatattcatcctttactcttttatccgatgtggg 8327924  T
Q  154 acatataagtcacacttgcatacaaca 180  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  8327923 acatataactcacacttgcacacaaca 8327897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 39389191 - 39389070
Alignment:
Q  51 gcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatat 150  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| | | |||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||| || |    
T  39389191 gcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaga-caatgggtttatgggtcctcttagttttaaggtgttcaacctttactattttatccgatgt 39389093  T
Q  151 gtaacatataagtcacacttgca 173  Q
       |||||||| |||||||||||    
T  39389092 aggacatataactcacacttgca 39389070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 145
Target Start/End: Original strand, 41359786 - 41359895
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||  |||| |||||||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  41359786 tagaacaaccacacaagcgagagagacgccacattcttacccaaaacctt-aaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaaccttta 41359884  T
Q  135 ctgttttatcc 145  Q
    || || |||||    
T  41359885 ctattgtatcc 41359895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 183
Target Start/End: Original strand, 49336726 - 49336855
Alignment:
Q  53 aagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgt 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||  | || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| || ||     
T  49336726 aagagagacaccacactcttacccagaa-ctttaagactatgggtttatgggtcctcttacttataaggtggtcaacctttacttttctatccgatgtga 49336824  T
Q  153 aacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
     |||| ||| ||||||||| | |||||||||    
T  49336825 gacatgtaactcacacttgtacacaacaaca 49336855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 181
Target Start/End: Original strand, 45395674 - 45395819
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||| |||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||  |||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  45395674 tagagcaaccccacaagtgagagagacaccacactcttaccc-aaaacattaagacaatgggtttatggatcctcttacttataacgtgtttaaccttta 45395772  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaa 181  Q
    || |||||| | || ||  | |||||| | ||||||||| |||||||    
T  45395773 ctcttttattcgatgtgggatatataacttacacttgcacacaacaa 45395819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 37726572 - 37726504
Alignment:
Q  105 tcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||  |||||||| |||||||||||    
T  37726572 tcctcttacttataaggtattcaacatttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgca 37726504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 9240225 - 9240142
Alignment:
Q  97 tttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaaca 180  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||  | ||||| || || ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  9240225 tttatgggtcctcttacttataaggtgttcagcttttacttctctatccgatgtggaacatataactcacacttgcacacaaca 9240142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 120
Target Start/End: Original strand, 22303976 - 22304060
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataag 120  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  22303976 tagaacaaccactcaagcaagagagacaccacactcttatcc-aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccgcttacttataag 22304060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 173
Target Start/End: Original strand, 3384317 - 3384424
Alignment:
Q  65 acactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtc 164  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||| | ||||||||||||  || ||  |||||||| ||    
T  3384317 acactcttacccaaaa-ctttaaggcattaagtttatgggtcctcttccttataaagtgtttaacctatactgttttatcatatgtgggacatataactc 3384415  T
Q  165 acacttgca 173  Q
    || ||||||    
T  3384416 acgcttgca 3384424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 51886638 - 51886561
Alignment:
Q  96 gtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||| | || ||  |||||||| |||||||||||    
T  51886638 gtttatgggtcctcttacttatatgatgttcaacctttactattttattcgatgtgagacatataactcacacttgca 51886561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 115
Target Start/End: Original strand, 22303680 - 22303759
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttactt 115  Q
    |||||||| | || ||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22303680 tagaacaatcgcacaagtaagagaaacaccacactcttaccc-aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 22303759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 145
Target Start/End: Original strand, 33362328 - 33362423
Alignment:
Q  49 aagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatcc 145  Q
    |||||||||||| |   ||| ||||||||||| ||| || | ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||    
T  33362328 aagcaagagagagacgccacacttacccaaaatctt-aaggaaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttattattttatcc 33362423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 118
Target Start/End: Original strand, 47964558 - 47964621
Alignment:
Q  54 agagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttata 118  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  47964558 agagagacgccacactcttacccaaaacctt-aaggcaataggtttatgggtcctctcacttata 47964621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 145
Target Start/End: Original strand, 42584845 - 42584952
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| | ||||| ||| | | |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  42584845 tagaacaaccgcataagtaagagacac--cacactctttctcaaaatcttaaga-caattggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaatcttta 42584941  T
Q  135 ctgttttatcc 145  Q
    || || |||||    
T  42584942 ctcttctatcc 42584952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 183
Target Start/End: Original strand, 1634366 - 1634483
Alignment:
Q  66 cactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaa-catttactgttttatccaatatgtaacatataagtc 164  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| || | |||| | || ||||| || ||  |||||||| ||    
T  1634366 cactcttacccaaaacctt-aagccaatgggtttatgggtcctcttacttataatgtgtttaaccttttatttttctatccgatgtgggacatataactc 1634464  T
Q  165 acacttgcatacaacaaca 183  Q
    ||||||||| ||| |||||    
T  1634465 acacttgcacacagcaaca 1634483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 180
Target Start/End: Original strand, 33175747 - 33175829
Alignment:
Q  98 ttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaaca 180  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||  || ||  |||||||| ||||||||| | ||||||    
T  33175747 ttatgggttctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgagacatataactcacacttgtacacaaca 33175829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 43346706 - 43346640
Alignment:
Q  117 taaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| || ||  ||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  43346706 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatacaactcacacttgcacacaacaaca 43346640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 136
Target Start/End: Original strand, 47508155 - 47508213
Alignment:
Q  78 aaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttact 136  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  47508155 aaaactataaggcattaggtttatgagtcatctcacttataaagtgttgaacatttact 47508213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 170
Target Start/End: Original strand, 7767389 - 7767469
Alignment:
Q  90 caataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcacactt 170  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| || ||||| || ||  |||||||| ||| ||||    
T  7767389 caatgggtttatgagtcctcttagttataaagtgtccaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcagactt 7767469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 56)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 35 - 171
Target Start/End: Original strand, 40579527 - 40579662
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    ||||||||||  | |||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40579527 tagaacaaccgtacaagcaatagagacaccacactcttacctaaaacctt-aaagcaataagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 40579625  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttg 171  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  40579626 ctattttatccaatatgaaacatataattcacacttg 40579662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 34835013 - 34834865
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  34835013 tagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgagtttatgagtcatcttacttataaggtgtttaaccttta 34834915  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacac 184  Q
    || ||||||||||| ||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  34834914 ctattttatccaatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacac 34834865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 3669824 - 3669687
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3669824 tagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 3669726  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    || |||||||  || ||  |||||||| |||||||||||    
T  3669725 ctattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 3669687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 147588 - 147441
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  147588 tagaactaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaa-ctttaaggcaataggtttatgggtcctcttatttataaggtgttcaaccttta 147490  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    || |||||||| || ||  |||||||| |||||||| ||  ||||||||    
T  147489 ctcttttatccgatgtgggacatataactcacacttacacgcaacaaca 147441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 30359746 - 30359599
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30359746 tagaacaaccgcataagtaagagagacaccacactcttacccaaaatctt-aaggttatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaactttta 30359648  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    || |||||||  || ||  |||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  30359647 ctcttttatctgatgtgagacatataactcacacttgtacacaacaaca 30359599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 3670197 - 3670060
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  3670197 tagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggaaataggtttatgggtcctcatacttataaggtgttaaaccttta 3670099  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    || |||||||| || ||  |||||||| |||||||||||    
T  3670098 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 3670060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Original strand, 25561836 - 25561984
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||  ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25561836 tagagcaaccacacaagcaagagagatgtcacactcttaccccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacgttta 25561935  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    || |||||||| || ||  |||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  25561936 ctcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtagacaacaaca 25561984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 53 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 30359390 - 30359261
Alignment:
Q  53 aagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgt 152  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||     
T  30359390 aagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggctatgggtttatgggtcctcttgcttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtga 30359292  T
Q  153 aacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
     |||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  30359291 gacatataactcacacttgtacacaacaaca 30359261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Original strand, 3038311 - 3038458
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || ||||||||||||   ||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  3038311 tagaacaaccacacaagcaagagagatgccacactcttaccc-aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttacttataaagtgttcaaccttta 3038409  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    || |||||||| || ||  |||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  3038410 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 3038458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 54 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 9309473 - 9309343
Alignment:
Q  54 agagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgta 153  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | | ||| || |||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||      
T  9309473 agagagacaccacactcttacccgacacctt-aaggcaatgagtttaagggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtggg 9309375  T
Q  154 acatataagtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  9309374 acatataactcacacttgcacacaacaacact 9309343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 166
Target Start/End: Original strand, 9482625 - 9482755
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||  ||||| |||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9482625 tagaacaaccgcacaagcaagagagataccacactcttatacaaaatctttag-gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 9482723  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcac 166  Q
    || |||||||| || || ||||||||| ||||    
T  9482724 ctcttttatcccatgtggaacatataactcac 9482755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 178
Target Start/End: Original strand, 45122078 - 45122220
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  |||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45122078 tagaacaaccccacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagaa-aatgagtttatgggttctcttacttataaggtgttcaaccttta 45122176  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaa 178  Q
    || |||||||| || ||  |||||||| ||||||||||| ||||    
T  45122177 ctattttatccgatgtgagacatataactcacacttgcacacaa 45122220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 173
Target Start/End: Original strand, 1013892 - 1014029
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || ||| || ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  1013892 tagaacaaccgcacaagtaaaagagacaacacactcttactcaaaa-ctctaaggcaatgggtttattggtcctcttacttatagggtgttcaactttta 1013990  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    || |||||||| || || ||||||||| |||||||||||    
T  1013991 ctattttatccgatgtggaacatataactcacacttgca 1014029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 34835346 - 34835197
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    ||||| |||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34835346 tagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaa-ctttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 34835248  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
    || |||||||  || ||  |||||||| |||| |||| | ||| |||||||    
T  34835247 ctattttatcggatgtgggacatataactcacccttgtacacagcaacact 34835197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 40518208 - 40518061
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  40518208 tagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcttaccc-aaaaccttaaggcattgggtttatgggtccatttacttataaggtgttcaaccttta 40518110  T
Q  135 c--tgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaa 181  Q
    |  | ||||||||||| || ||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  40518109 cttttttttatccaatgtggaacatataactcacacttgaacacaacaa 40518061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 5420766 - 5420643
Alignment:
Q  57 gagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaaca 156  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| || ||  |||    
T  5420766 gagacgtcacactcttaca-aaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacctttactattctatccgatgtgggaca 5420668  T
Q  157 tataagtcacacttgcatacaacaa 181  Q
    |||||  ||||||||||||||||||    
T  5420667 tataatacacacttgcatacaacaa 5420643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 166
Target Start/End: Original strand, 70295 - 70425
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||| || ||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  70295 tagaacaaccacacaagcaagatagacgtcacactcttacctaaaacctt-aaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacattta 70393  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcac 166  Q
    || |||||||| || ||  |||||||| ||||    
T  70394 ctcttttatccgatgtgggacatataactcac 70425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 173
Target Start/End: Original strand, 1014266 - 1014403
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||   ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1014266 tagaacaaccgcacaagcaggagagacaccacactcttacccaaaa-ctttaaggtaacgagtttacgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 1014364  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    || |||||||  || | | |||||||| |||||||||||    
T  1014365 ctattttatctgatgtatgacatataactcacacttgca 1014403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 145
Target Start/End: Original strand, 9483208 - 9483317
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| | | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9483208 tagaacaaccgcacgagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaga-caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 9483306  T
Q  135 ctgttttatcc 145  Q
    || ||||||||    
T  9483307 ctcttttatcc 9483317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 41972296 - 41972151
Alignment:
Q  37 gaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaa--aaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||| || ||||||||| |||  |||||||||||||||  ||||||||  ||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  41972296 gaacaaccacacaagcaagagtgacgccacactcttacccaacaaaactttatggcaatgggtttatgggtcctatcacttataaggtgttcaaccttta 41972197  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaaca 180  Q
    || || ||||| || ||  |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  41972196 cttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 41972151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 145
Target Start/End: Original strand, 45121677 - 45121786
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||| |||| ||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  45121677 tagaacaaccccataagtaagagagatatcacactcttactc-aaaaccttaaggctgtaggtttatggatcctcttacttataaggtgatcaaccttta 45121775  T
Q  135 ctgttttatcc 145  Q
    || ||||||||    
T  45121776 ctcttttatcc 45121786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 9608882 - 9608738
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||| || |  || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  9608882 tagaacaacctcactagcaagagagacgccacactcatacccaaaacctt-aaggtgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaaccttta 9608784  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaaca 180  Q
    || || ||||| |||||  |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  9608783 cttttctatccgatatgggacatataactcacacttgcacacaaca 9608738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 144
Target Start/End: Original strand, 20870594 - 20870702
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| || ||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20870594 tagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaatctt-aaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaaccttta 20870692  T
Q  135 ctgttttatc 144  Q
    || |||||||    
T  20870693 ctattttatc 20870702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 30441222 - 30441081
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttactta----taaggtgttcaaca 130  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||| | |||||||||||    |||||||||||||     
T  30441222 tagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccc-aaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataattaaggtgttcaacc 30441124  T
Q  131 tttactgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    |||||| ||||| || || ||  |||||||| |||||||||||    
T  30441123 tttactattttagccgatgtgggacatataactcacacttgca 30441081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 34835612 - 34835504
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    ||||| |||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  34835612 tagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaa-ctttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttaaaccttta 34835514  T
Q  135 ctgttttatc 144  Q
    || |||||||    
T  34835513 ctattttatc 34835504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 34835878 - 34835770
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    ||||| |||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  34835878 tagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaa-ctttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttaaaccttta 34835780  T
Q  135 ctgttttatc 144  Q
    || |||||||    
T  34835779 ctattttatc 34835770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Original strand, 33113388 - 33113535
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  33113388 tagaacaaccacactagcaagagagacaccacactcttacccaaaatc-ttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataagacgttcaaccttta 33113486  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    || |||||||| || |   |||||||| ||| ||||| | |||||||||    
T  33113487 ctattttatccgatgtaggacatataactcaaacttgtacacaacaaca 33113535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 8794191 - 8794100
Alignment:
Q  93 taggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacac 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| || ||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  8794191 taggtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacatttattcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtacacaacaacac 8794100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 185
Target Start/End: Original strand, 8918788 - 8918934
Alignment:
Q  38 aacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactg 137  Q
    ||||||| || | |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||     
T  8918788 aacaaccacacacgcaagaaagacgtcacactcttacccaaaacctt-aagtcaataggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactc 8918886  T
Q  138 ttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
    |  ||||  || ||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  8918887 tgctatctgatgtgggacatgtaactcacacttgcacacaacaacact 8918934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 9507890 - 9507769
Alignment:
Q  64 cacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactg---ttttatccaatatgta--acata 158  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   |||||||||||||| |  | |||    
T  9507890 cacactcttacccaaaacctt-aaggtaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtattcaacctttactgtacttttatccaatatggaggagata 9507792  T
Q  159 taagtcacacttgcatacaacaa 181  Q
    ||| ||||||||||| |||||||    
T  9507791 taactcacacttgcacacaacaa 9507769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 143
Target Start/End: Original strand, 18372015 - 18372122
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||| ||||| || |||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18372015 tagagcaaccgcacaagcgagagaaacaccacactcttacccaaaacctt-aaagcaatgagtttatggatcctcttacttataaggtgttcaaccttta 18372113  T
Q  135 ctgttttat 143  Q
    || ||||||    
T  18372114 ctattttat 18372122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 171
Target Start/End: Original strand, 37544511 - 37544646
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || ||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| | |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  37544511 tagaacaaccgcacaagtaagaaagacaccacactcttaccc-aaaaccttaaagtaatggatttatgggtcctctttcttataatgtgttcaaccttta 37544609  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttg 171  Q
    || |||||||| || ||  || ||||| |||||||||    
T  37544610 ctattttatccgatgtgcgacttataactcacacttg 37544646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 40518719 - 40518584
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||  || | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  40518719 tagaacaaccacacaagcaagagtgacgtcacactcttacccaaaacctt-aagtcattgggtttatgggtcctcttatttataaggtgttcaaccttta 40518621  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttg 171  Q
    || || ||||  || ||  |||||||| |||||||||    
T  40518620 cttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 40518584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 45122759 - 45122652
Alignment:
Q  37 gaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttact 136  Q
    |||||||| || |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||| | | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45122759 gaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcatacccaaaaccttaaga-caatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttact 45122661  T
Q  137 gttttatcc 145  Q
     ||||||||    
T  45122660 attttatcc 45122652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 173
Target Start/End: Original strand, 45121946 - 45122068
Alignment:
Q  50 agcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaata 149  Q
    ||||| ||||||  |||||| |||||||||| ||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| | ||     
T  45121946 agcaaaagagacgccacactgttacccaaaatctt-aaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatgcgatg 45122044  T
Q  150 tgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    ||  |||||||| |||||||||||    
T  45122045 tgggacatataactcacacttgca 45122068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 90 - 160
Target Start/End: Original strand, 3037783 - 3037853
Alignment:
Q  90 caataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatata 160  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || || ||||||||    
T  3037783 caatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactatttcatccgatgtggaacatata 3037853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 171
Target Start/End: Original strand, 18372677 - 18372758
Alignment:
Q  89 gcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttg 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| | ||| ||||||||| |||||||||    
T  18372677 gcaatgggtttatgagtcctcttacttataa-gtgttcaacctttactattttatccgaaatggaacatataaatcacacttg 18372758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 5916004 - 5915863
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||  ||||||| |||||||||    ||| ||||| ||| ||||    
T  5916004 tagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgagtttatgggtcctctta----taaagtgttaaac-ttta 5915911  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaac 182  Q
    |  ||||||||||| |   |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5915910 catttttatccaatgtaggacatataactcacacttgcacacaacaac 5915863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 184
Target Start/End: Original strand, 6876883 - 6877032
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||||| | | | | ||||  || |||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  6876883 tagaacaaccacacaaacaagagaaacaccacactcttacccaaaaccctaaga-caatgagtgtatgggtcatcttatttataaggtgttcaaccttta 6876981  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaac-atataagtcacacttgcatacaacaacac 184  Q
    || |||||||| || ||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6876982 cttttttatccgatgtgggactatataactcacacttgcacacaacaacac 6877032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 170
Target Start/End: Original strand, 18372788 - 18372854
Alignment:
Q  104 gtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcacactt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||| |||||||| ||||||||    
T  18372788 gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgtgacatataactcacactt 18372854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 45123143 - 45122994
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactct--tacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatt 132  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||| | |  |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| ||| ||    
T  45123143 tagaacaaccccacaaataagagagacaccacactctcttacccaaaaccttaagaa-aataggtttatgggtcatcttactta--aggtgtttaacctt 45123047  T
Q  133 tactgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
    |||| |||||||| || ||  |||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  45123046 tactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacagcaacact 45122994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 9309084 - 9308970
Alignment:
Q  67 actcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgta--acatataagtc 164  Q
    |||||| ||||||| |||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||  || ||||  |||||||| ||    
T  9309084 actcttgcccaaaacctttag-gcaatgggtttatgggtcctcttacttataacatgttcaacttttactcttttatctgatgtgtaggacatataactc 9308986  T
Q  165 acacttgcatacaaca 180  Q
    ||||||||| ||||||    
T  9308985 acacttgcacacaaca 9308970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 183
Target Start/End: Original strand, 43274824 - 43274947
Alignment:
Q  59 gacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacata 158  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||| |||||| |||||||  || || ||||||    
T  43274824 gacaccacactcttactcaaaaccttaaga-caataggtttatgggtcctcttacttataatatattcaacctttactcttttatctgatgtgaaacata 43274922  T
Q  159 taagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    ||| ||||||||  | |||||||||    
T  43274923 taactcacacttatacacaacaaca 43274947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 147957 - 147817
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||  || ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||         |||| | |||||||||||||    
T  147957 tagaacaactgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaataggtttatgggt---------tatatgttgttcaacattta 147868  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
    || |||||||  || ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  147867 cttttttatcagatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacact 147817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 145
Target Start/End: Original strand, 1513936 - 1514045
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    ||||| ||||||| | | |||||||| | |||||| |||||||||| ||| || |  || |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1513936 tagaataaccccacatgtaagagagataccacacttttacccaaaacctt-aaggttatgggtttaagggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 1514034  T
Q  135 ctgttttatcc 145  Q
    || ||||||||    
T  1514035 ctcttttatcc 1514045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 166
Target Start/End: Original strand, 41416248 - 41416322
Alignment:
Q  92 ataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcac 166  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||  |||||||| ||||    
T  41416248 ataggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 41416322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 9609222 - 9609122
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||| |||| | |||| || || |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  9609222 tagaacaaccacactagcaagagagacgccacactcttaccgaaaa-cattaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataagatgttcaaccttta 9609124  T
Q  135 ct 136  Q
    ||    
T  9609123 ct 9609122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 145
Target Start/End: Original strand, 18373012 - 18373061
Alignment:
Q  96 gtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatcc 145  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  18373012 gtttatgagtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatcc 18373061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 170
Target Start/End: Original strand, 18372349 - 18372411
Alignment:
Q  108 tcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcacactt 170  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||  |||||||| ||||||||    
T  18372349 tcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacactt 18372411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 32305614 - 32305505
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||  |||||| || | ||||  |||||||||| |||||| ||| || | ||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  32305614 tagaacaactgcataagtaataaagacgccacactcttatccaaaatctt-aaggtaatgggtttataggtcttcttacttataaggtgttcaaccttta 32305516  T
Q  135 ctgttttatcc 145  Q
    || ||||||||    
T  32305515 ctattttatcc 32305505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 6732032 - 6731987
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaa 80  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  6732032 tagaacaaccgcataagcaagagagacaccacactcttactcaaaa 6731987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 80
Target Start/End: Original strand, 40579290 - 40579335
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaa 80  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40579290 tagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa 40579335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 145
Target Start/End: Original strand, 25561736 - 25561774
Alignment:
Q  107 ctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatcc 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  25561736 ctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatcc 25561774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 6651631 - 6651586
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaa 80  Q
    |||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6651631 tagaacaatcgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa 6651586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 78
Target Start/End: Original strand, 43274658 - 43274699
Alignment:
Q  37 gaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaa 78  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  43274658 gaacaaccccataagtaagagagacaccacactcatacccaa 43274699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 105 - 169
Target Start/End: Original strand, 43398161 - 43398225
Alignment:
Q  105 tcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcacact 169  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||  | |||||| |||||||    
T  43398161 tcctcttatttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatatgagatatataactcacact 43398225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 52)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Original strand, 31767182 - 31767329
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| || ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31767182 tagaacaaccacacaagcaagatagacgtcacactcttacccaaaacctt-aaggcattaggttaatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 31767280  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    ||||||||||| || || |||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  31767281 ctgttttatccgatgtggaacatataacccacacttgcacacaacaaca 31767329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 41157128 - 41156981
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41157128 tagaacaaccacacaagcaatagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaagcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 41157030  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    || ||||||||  ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  41157029 ctcttttatccgttatgggacatataattcacacttgcacacaacaaca 41156981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 51 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 11977401 - 11977268
Alignment:
Q  51 gcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatat 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  11977401 gcaagagagacatcacactcttacccaaaacctt-aaggcattaggtttatgagtgctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttacccgatgt 11977303  T
Q  151 gtaacatataagtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
    |  |||||||| ||||||||| | ||| |||||||    
T  11977302 gggacatataactcacacttgtacacagcaacact 11977268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 51 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 29798320 - 29798189
Alignment:
Q  51 gcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatat 150  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| | ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  29798320 gcaagagagacaccacactcttatccaagacctt-aaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccaatgt 29798222  T
Q  151 gtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
       |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29798221 aggacatataactcacacttgcatacaacaaca 29798189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 41142510 - 41142362
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||  |||||||||  |||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  41142510 tagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactctttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttacttataaggtgttcaaccttta 41142411  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    ||||||||||| || ||  |||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  41142410 ctgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacagaacaaca 41142362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 34365051 - 34364913
Alignment:
Q  46 cataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatcc 145  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  34365051 cataagcgagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggctatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttattattttatcc 34364953  T
Q  146 aatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
     || ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  34364952 gatgtgtgacatataactcacacttgcacacaacaacact 34364913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 50 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 3550842 - 3550721
Alignment:
Q  50 agcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaata 149  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||     
T  3550842 agcaagagagacaccacactcttacccaaaa-ctttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatg 3550744  T
Q  150 tgtaacatataagtcacacttgc 172  Q
    ||  |||||||| ||||||||||    
T  3550743 tgggacatataactcacacttgc 3550721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 181
Target Start/End: Original strand, 5319986 - 5320131
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| || || ||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  5319986 tagaacaaccacataagcaagagagacactacactcttacccaaaacctt-aaggctatgagtttatgggtcctctcacttataaggtgttcaactttta 5320084  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaa 181  Q
    || || ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5320085 cttttctatccgatgtggaacatataactcacacttgcatacaacaa 5320131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 41759620 - 41759483
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| | ||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  41759620 tagaacaaccacataagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatggatttatggatcatcttacttataaggtgttcaactttta 41759522  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    || |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||    
T  41759521 ctattttatccgatgtgtgacatataactcacacttgca 41759483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 34364644 - 34364496
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || || || |||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34364644 tagagcaaccgcataagcgagagagacatcacactcttacccaaaacctt-aaggctatgggtttacggatcctcttacttataaggtgttcaaccttta 34364546  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacac 184  Q
    || |||||||| || ||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34364545 ctattttatccgatgtgagacatataactcacacttgcacacaacaacac 34364496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 173
Target Start/End: Original strand, 44290845 - 44290983
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||  || ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44290845 tagaacaaccgcacaagcaagagatacaccacactctttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 44290944  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    || |||||||| || ||  |||||||| |||||||||||    
T  44290945 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 44290983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 17294703 - 17294569
Alignment:
Q  46 cataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatcc 145  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  17294703 cataagcgagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactcttttatcc 17294605  T
Q  146 aatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaa 181  Q
     || ||  |||||||| ||||||||| | |||||||    
T  17294604 gatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaa 17294569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 183
Target Start/End: Original strand, 26661921 - 26662066
Alignment:
Q  37 gaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttact 136  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  26661921 gaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatcggtttatgggtcttctcacttataaggtgttcaacctttact 26662019  T
Q  137 gttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
     |||||||  |||||  | |||||| ||||||||| | |||||||||    
T  26662020 cttttatctgatatgggatatataactcacacttgtacacaacaaca 26662066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 41157512 - 41157367
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||  || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41157512 tagaacaaccacacaagcaagacagacaccacactcttactcaaaaccta-aaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaactttta 41157414  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaa 181  Q
    || |||||||  || ||  |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  41157413 ctcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 41157367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Original strand, 26661545 - 26661692
Alignment:
Q  37 gaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttact 136  Q
    |||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  26661545 gaacaaccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaggtgttcaacctttact 26661643  T
Q  137 gttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
     ||||| || || ||  |||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  26661644 cttttacccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacact 26661692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 46 - 170
Target Start/End: Original strand, 50052055 - 50052178
Alignment:
Q  46 cataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatcc 145  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  50052055 cataaacaagagagacaccacactcttacccaaaa-ctttaagaaaataggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatcc 50052153  T
Q  146 aatatgtaacatataagtcacactt 170  Q
     || ||  |||||||| ||||||||    
T  50052154 gatgtgggacatataactcacactt 50052178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 181
Target Start/End: Original strand, 66493 - 66638
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||   | |||||||||||||| ||| || || ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  66493 tagaacaaccgcacaagcgagagagacgctatactcttacccaaaacctt-aaggccatatgtttatggatcctcttacttataaggtgttcaaccttta 66591  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaa 181  Q
    || || ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  66592 cttttctatccgatatggaacatataactcacacttgcacacaacaa 66638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 173
Target Start/End: Original strand, 44290479 - 44290616
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    ||||||||||  | |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  44290479 tagaacaaccgtacaagcaagaaagacaccatactcttacccaaaacctt-aaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaaccttta 44290577  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    || |||||||| || ||  |||||||| |||||||||||    
T  44290578 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 44290616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 37556246 - 37556099
Alignment:
Q  37 gaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttact 136  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  37556246 gaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttaccc-aaaaccttaaggctatgggtttatg-gtcctcttacttataagatgttcaacctttact 37556149  T
Q  137 -gttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
      |||||||| || ||  |||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  37556148 atttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacact 37556099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 14319004 - 14318895
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  14319004 tagaacaaccgcacaaataagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatagatttatgggtcttcttacttataaggtgttcaaccttta 14318906  T
Q  135 ctgttttatcc 145  Q
    || ||||||||    
T  14318905 ctattttatcc 14318895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 183
Target Start/End: Original strand, 37850640 - 37850768
Alignment:
Q  54 agagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgta 153  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||| ||| ||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | || ||      
T  37850640 agagagacaccacactcttatccgaaaccttaaaa-cattaggtttatgggttctcttacttataaggtgttcaacctctactgttttatgcgatgtggg 37850738  T
Q  154 acatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  37850739 acatataactcacacttgcacacaacaaca 37850768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 184
Target Start/End: Original strand, 39066221 - 39066369
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||| | | ||||   |||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  39066221 tagaacaaccacataagtaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaga-caatgattttatgggtcatcttagttataaggtgttcaaccttta 39066319  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacac 184  Q
    || || ||||| || || || |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  39066320 cttttctatccgatgtggaatatataactcacacttgcacacaacaacac 39066369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 34649575 - 34649428
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||  | ||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||| || ||   |||||||||||||||||| ||||    
T  34649575 tagaacaaccacactagcaagagagacgcctcactcttacccaaaacctt-aaggcattaggtttatgggttcttgcacttataaggtgttcaaccttta 34649477  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    || |||||||| || ||  |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  34649476 ctcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtatacaacaaca 34649428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 183
Target Start/End: Original strand, 41184489 - 41184593
Alignment:
Q  79 aaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaa 178  Q
    |||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| || ||  |||||||| ||||||||||| ||||    
T  41184489 aaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgcacacaa 41184588  T
Q  179 caaca 183  Q
    |||||    
T  41184589 caaca 41184593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 78 - 181
Target Start/End: Original strand, 3875394 - 3875497
Alignment:
Q  78 aaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcataca 177  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| || ||| |||||||| | || |||||| |||    
T  3875394 aaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgtacaacctttacttttttatccgatgtgtgacatataactgactcttgcacaca 3875493  T
Q  178 acaa 181  Q
    ||||    
T  3875494 acaa 3875497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 9956046 - 9955940
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggttt-atgagtcctcttacttataaggtgttcaacattt 133  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  9956046 tagagcaaccgcacaagcaagagagacatcacactcttaccc-aaaaccttaaggcaattggtttaatgggtcctcttacttataatgtgttcaaccttt 9955948  T
Q  134 actgtttt 141  Q
    ||| ||||    
T  9955947 actttttt 9955940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 180
Target Start/End: Original strand, 22077518 - 22077660
Alignment:
Q  37 gaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttact 136  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||| || || |   ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22077518 gaacaaccgcataagtgagagagacgccacactcttacccaaaacctt-aaggctacgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttact 22077616  T
Q  137 gttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaaca 180  Q
     || ||||| || ||  |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22077617 tttctatccgatgtgagacatataactcacacttgcacacaaca 22077660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 40082543 - 40082398
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||| | || |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| || |||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40082543 tagaacaaacgcacaagcaagagagataccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgaatttatga-tcctcttacttataaggtgttcaaccttta 40082446  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaac 182  Q
    || |||||||| || |   |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  40082445 ctattttatccgatgtaggacatataactcacacttgcgcacaacaac 40082398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 145
Target Start/End: Original strand, 3537620 - 3537729
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||  |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  3537620 tagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaacctt-aagccaatgggtttataggtcctcttactcataaggtgttcaaccttta 3537718  T
Q  135 ctgttttatcc 145  Q
    || ||||||||    
T  3537719 ctattttatcc 3537729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Original strand, 44043804 - 44043893
Alignment:
Q  46 cataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttact 136  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | | |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44043804 cataaacaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaga-caatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacatttact 44043893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 53 - 173
Target Start/End: Original strand, 32594755 - 32594874
Alignment:
Q  53 aagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgt 152  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  || |      
T  32594755 aagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaga-caatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtag 32594853  T
Q  153 aacatataagtcacacttgca 173  Q
     |||||||| |||||||||||    
T  32594854 gacatataactcacacttgca 32594874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 45084513 - 45084382
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||      || | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45084513 tagaacaaccgcacaagcaagagagacaccactctcttacccaaaacctt------aagacgtt-atgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 45084421  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    ||||||||||| || ||  | |||||| |||||||||||    
T  45084420 ctgttttatccgatgtgggagatataactcacacttgca 45084382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 173
Target Start/End: Original strand, 3537227 - 3537305
Alignment:
Q  95 ggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||  |||||||| |||||||||||    
T  3537227 ggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 3537305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 180
Target Start/End: Original strand, 24600354 - 24600479
Alignment:
Q  54 agagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgta 153  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | | ||||  |||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||| || ||||| |||||      
T  24600354 agagagacaccacactcttacacaaaaccttaaga-caatgagtttatgagttctcttacttataatatgttcaacctttacttttctatccgatatggg 24600452  T
Q  154 acatataagtcacacttgcatacaaca 180  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24600453 acatataactcacacttgcacacaaca 24600479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 181
Target Start/End: Original strand, 38804376 - 38804521
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| || |  || ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  38804376 tagaacaaccgcacaagcaagagagacactacactcttacccaaaacctt-aaggttatgggtttatggatcctcttacttataatgtgttcaaccttta 38804474  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaa 181  Q
    || |||||| | || ||  || ||||| ||||||||| | |||||||    
T  38804475 ctcttttattcgatgtgggacgtataactcacacttgtaaacaacaa 38804521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 145
Target Start/End: Original strand, 48588509 - 48588618
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||| || |||||   |||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  48588509 tagaacaaccgcacaagtaagagagacaccgcactcttacccaaaacctt-aaggcaatgaatttacgggtcttcttacttataaggtgttcaaccttta 48588607  T
Q  135 ctgttttatcc 145  Q
    || ||||||||    
T  48588608 ctattttatcc 48588618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 128
Target Start/End: Original strand, 66137 - 66200
Alignment:
Q  64 cacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaa 128  Q
    ||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  66137 cacactcttacccaaaacctt-aaggccataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 66200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 180
Target Start/End: Original strand, 1188614 - 1188753
Alignment:
Q  40 caaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgtt 139  Q
    ||||| ||||||  ||||||||  |||||| |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||  | |||||| |  ||| ||    
T  1188614 caaccacataagtgagagagacgccacacttttacccaaaacctt-aaagcaatgagtttatgagtcttctcacttataaaatattcaacctccactttt 1188712  T
Q  140 ttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaaca 180  Q
     ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  1188713 ctatccgatatggaacatataactcacacttgcacacaaca 1188753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 183
Target Start/End: Original strand, 21378121 - 21378209
Alignment:
Q  95 ggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||| || ||  |||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  21378121 ggtttatgggtcctcttacttataagatattcaacctttactgttctatccgatctgggacatataactgacacttgcacacaacaaca 21378209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 173
Target Start/End: Original strand, 45493997 - 45494137
Alignment:
Q  37 gaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttact----tataaggtgttcaacatt 132  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||  || |||||||    |||| |||||||||| ||    
T  45493997 gaacaaccacataaggaagagagacaccacactcttatccaaaa-ctttaaggcaatgggtttatggatcatcttacttatatatatggtgttcaacctt 45494095  T
Q  133 tactgttttatccaatatgtaacatat-aagtcacacttgca 173  Q
    |||| |||||||| || ||  |||||| || |||||||||||    
T  45494096 tactattttatccgatgtgggacatataaactcacacttgca 45494137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 45839767 - 45839678
Alignment:
Q  36 agaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttc 126  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||| ||| ||  |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  45839767 agaacaatcccacaagcaagagagacaccacaatcttaccc-aaaaccttaaggcattacatttatgggtcttcttacttataaggtgttc 45839678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 37 - 145
Target Start/End: Original strand, 22077133 - 22077240
Alignment:
Q  37 gaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttact 136  Q
    |||||||| ||||||  || ||||| ||||||||||| |||||| ||| |  |||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  22077133 gaacaaccgcataagtgagggagacgtcacactcttatccaaaacctt-agggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttact 22077231  T
Q  137 gttttatcc 145  Q
     || |||||    
T  22077232 tttctatcc 22077240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 44685570 - 44685449
Alignment:
Q  58 agacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaa-catttactgttttatccaatatgtaaca 156  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |  |||| |||||  ||||||  ||||||||||||||||||| ||||| | |||||| || ||||| |||||  |||    
T  44685570 agacgtcacactgttacccaaaca--ttaaggcaatgagtttattggtcctcttacttataaggttttcaaacctttacttttctatccgatatgggaca 44685473  T
Q  157 tataagtcacacttgcatacaaca 180  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||    
T  44685472 tataactcacacttgcacacaaca 44685449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 5575222 - 5575132
Alignment:
Q  54 agagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatcc 145  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||| ||| ||||| || | |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  5575222 agagagacgccacactcttatccaaaacctt-aaagctatggatttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttctatcc 5575132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 173
Target Start/End: Original strand, 30630690 - 30630796
Alignment:
Q  66 cactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtca 165  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| || ||||||||||||| ||||  ||| |||| | |||||||| || ||  |||||||| |||    
T  30630690 cactcttacccaaaa-ctttaaggcaatgtgtttatgggttctcttacttataaagtgtcaaacctttaattttttatccgatgtgagacatataaatca 30630788  T
Q  166 cacttgca 173  Q
    ||||||||    
T  30630789 cacttgca 30630796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 145
Target Start/End: Original strand, 32168719 - 32168822
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||| ||||| | || ||||| |||||||| |||||||      ||||||||||||| ||||    
T  32168719 tagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttaccc-aaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcctct------taaggtgttcaaccttta 32168811  T
Q  135 ctgttttatcc 145  Q
    || ||||||||    
T  32168812 ctattttatcc 32168822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 145
Target Start/End: Original strand, 5528775 - 5528884
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||  |||||  |||||||||| ||| | |  |||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  5528775 tagaacaaccgcataaagaagagagacgccacacatttacccaaaaccttaagaa-aatgagtttatgagtcctcttatttataagatgttcaaccttta 5528873  T
Q  135 ctgttttatcc 145  Q
    || ||||||||    
T  5528874 ctcttttatcc 5528884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 178
Target Start/End: Original strand, 22077909 - 22077991
Alignment:
Q  96 gtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaa 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| | || ||||| || |  ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22077909 gtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttatttttctatccgatttaaaacatataactcacacttgcacacaa 22077991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 37555864 - 37555733
Alignment:
Q  37 gaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttact 136  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || |  | |||| | |||||||||||||||| || |||||| || |||    
T  37555864 gaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttaccc-aaaaccttaaggctaaggatttaag-gtcctcttacttataatgtattcaaccttcact 37555767  T
Q  137 gttttatccaatatgtaacatataagtcacactt 170  Q
     |||||||| || ||  || ||||| ||||||||    
T  37555766 attttatccgatgtgggacttataactcacactt 37555733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 4956286 - 4956219
Alignment:
Q  78 aaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatcc 145  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  4956286 aaaactttagagcaatgagtttatggatcctcttacttataagatgttcaacctttacttttctatcc 4956219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 11977065 - 11977011
Alignment:
Q  51 gcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtc 106  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  11977065 gcaagagagacaccacactcttaccc-aaaaccttaaggcattaggtttatgagtc 11977011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 180
Target Start/End: Original strand, 24132049 - 24132150
Alignment:
Q  79 aaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaa 178  Q
    |||| |||| |||||  |||||||  ||| |||| |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||  |  |||||||| ||||| ||||||||||    
T  24132049 aaaccttaaggcaatgagtttatggatccccttatttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgagggacatataactcacagttgcatacaa 24132148  T
Q  179 ca 180  Q
    ||    
T  24132149 ca 24132150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Original strand, 1127 - 1274
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  1127 tagaacaaccacataaacaagagagacaccatactcttacccaaaacctt-aaggcaatgggtttatgagtcctttttcttataaggtgttcaaccttta 1225  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    || ||||||||||| ||  |||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  1226 ctcttttatccaatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 1274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 126
Target Start/End: Original strand, 1731 - 1802
Alignment:
Q  54 agagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttc 126  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  1731 agagagacaccacactcttacc-aaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctcacttataaggtgttc 1802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 40)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 16107815 - 16107668
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16107815 tagagcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgtttaaccttta 16107717  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    || |||||||| || ||  |||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  16107716 cttttttatccgatgtgacacatataactcacacttgtacacaacaaca 16107668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 29518640 - 29518503
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29518640 tagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggtaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 29518542  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    || |||||||| || ||  |||||||| |||||||||||    
T  29518541 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 29518503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 29519057 - 29518920
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29519057 tagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggtaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 29518959  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    || |||||||| || ||  |||||||| |||||||||||    
T  29518958 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 29518920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 32741316 - 32741179
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32741316 tagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggtaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 32741218  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    || |||||||| || ||  |||||||| |||||||||||    
T  32741217 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 32741179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 3409396 - 3409259
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3409396 tagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 3409298  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    || |||||||  || ||  |||||||| |||||||||||    
T  3409297 ctattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 3409259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Original strand, 2579893 - 2580040
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| || ||  | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2579893 tagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacattcttacccaaaacctt-aaggctgtgggtttatgggtcctcttacttataatgtgttcaaccttta 2579991  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    || |||||||| || ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  2579992 ctcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 2580040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 3409797 - 3409660
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |  || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  3409797 tagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaaata-aaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaactttta 3409699  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    || |||||||  || ||  |||||||| |||||||||||    
T  3409698 ctattttatctgatgtggtacatataactcacacttgca 3409660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16455044 - 16454895
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  16455044 tagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaacctt-aaggcaataggtttatgggtcctattacttataaggtgttcaaccttta 16454946  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
    || |||||||  || ||  ||| |||| ||||| ||| | |||||||||||    
T  16454945 ctcttttatctgatgtgggacacataactcacatttgtacacaacaacact 16454895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 3415594 - 3415488
Alignment:
Q  36 agaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttac 135  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  3415594 agaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacc-aaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttac 3415496  T
Q  136 tgttttat 143  Q
    | ||||||    
T  3415495 tattttat 3415488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 2377877 - 2377756
Alignment:
Q  49 aagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaat 148  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||    
T  2377877 aagcaagaaagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttaaccgat 2377779  T
Q  149 atgtaacatataagtcacacttg 171  Q
     ||  |||||||| |||||||||    
T  2377778 gtgggacatataactcacacttg 2377756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 2378263 - 2378126
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||| || | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2378263 tagaacaaccactcaagcaagagagacaccacattcttacctaaaacctt-aaggtaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 2378165  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    || |||||||| || ||  |||||||| |||||||||||    
T  2378164 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 2378126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 185
Target Start/End: Original strand, 2578464 - 2578612
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| || || || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2578464 tagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggctatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaaccttta 2578562  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
    || ||||||||  | ||  |||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  2578563 ctcttttatcc-gtgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacact 2578612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 3058363 - 3058226
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  3058363 tagaaccaccctacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgggtttatggatcctcatacttataaggtgttcaaccttta 3058265  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    || |||||||| || ||  |||||||| | |||||||||    
T  3058264 ctattttatccgatgtgggacatataactaacacttgca 3058226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 26544186 - 26544049
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||  | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  26544186 tagaacaatcgcacaagcaagagagacatcacactcttactcaaaacctt-aaggcggtgggtttatgggtcctcttacttataacgtgttcaaccttta 26544088  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    || |||||||| || ||  |||||||| |||||||||||    
T  26544087 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 26544049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 35210341 - 35210204
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||| ||||| || |||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35210341 tagagcaaccgcacaagcaaaagaaacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatggttttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 35210243  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    || |||||||| || ||  |||||||| |||||||||||    
T  35210242 ctattttatccgatgtgagacatataactcacacttgca 35210204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 180
Target Start/End: Original strand, 10074012 - 10074156
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10074012 tagaacaaccaaataagcgagagagacaccacacttttacccaaaacctt-aaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacgttta 10074110  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaaca 180  Q
    || || ||||| || ||  | |||||| |||| |||||| ||||||    
T  10074111 cttttctatccgatgtgggatatataactcacccttgcacacaaca 10074156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16108152 - 16108051
Alignment:
Q  84 ttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || || ||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  16108152 ttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactcttttatctgatgtggaacatataactcacacttgtacacaacaaca 16108053  T
Q  184 ct 185  Q
    ||    
T  16108052 ct 16108051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 10911685 - 10911558
Alignment:
Q  53 aagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttac-tgttttatccaatatg 151  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||  || |     
T  10911685 aagagagacatcacactcttattcaaaa-ctttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactttttttatctgatgta 10911587  T
Q  152 taacatataagtcacacttgcatacaaca 180  Q
      |||||||| ||||||||||||||||||    
T  10911586 ggacatataactcacacttgcatacaaca 10911558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 16454712 - 16454565
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16454712 tagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttatccaaaatctt-aaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaactttta 16454614  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
     | |||||||  || ||  ||| |||| ||||||||| | |||||||||    
T  16454613 ttcttttatctgatgtgggacacataactcacacttgtacacaacaaca 16454565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 1127497 - 1127391
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1127497 tagagcaaccacataagtaagagagacgccacactcttacccaaaacctt-aaggtaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 1127399  T
Q  135 ctgtttta 142  Q
    || |||||    
T  1127398 ctatttta 1127391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 1846885 - 1846748
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||| || ||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1846885 tagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttatccaaaacctt-aaggcaatggatttatgggtgctcttacttataaggtgttcaaccttta 1846787  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    || |||||||| || ||  ||||| || |||||||||||    
T  1846786 ctattttatccgatgtgagacatagaattcacacttgca 1846748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 63 - 168
Target Start/End: Original strand, 32460629 - 32460733
Alignment:
Q  63 tcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataag 162  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | || ||  ||||||||     
T  32460629 tcacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatacgatgtgggacatataac 32460727  T
Q  163 tcacac 168  Q
    ||||||    
T  32460728 tcacac 32460733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 173
Target Start/End: Original strand, 593749 - 593867
Alignment:
Q  54 agagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgta 153  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||      
T  593749 agagagataccacactattacccaaaacctt-aaggcagtcggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggg 593847  T
Q  154 acatataagtcacacttgca 173  Q
    ||||| || |||||||||||    
T  593848 acatacaactcacacttgca 593867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 170
Target Start/End: Original strand, 1950206 - 1950340
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||| || ||| ||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  1950206 tagaacaaccgcacaagtaagagagacgtcacactcttactcaaaacctt-aaggcattagatttatggctcctcttacttgtaaggtgttcaaccttta 1950304  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacactt 170  Q
    || |||||||| || ||  |||||||| ||||||||    
T  1950305 ctcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 1950340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 183
Target Start/End: Original strand, 5958641 - 5958771
Alignment:
Q  52 caagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatg 151  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||  ||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |     
T  5958641 caagagagacatcacactctatcccaaaa-ctttaagacaatgagtttatgagttctcttatttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgta 5958739  T
Q  152 taacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
      |||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  5958740 acacatataactcacaattgcacaccacaaca 5958771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 180
Target Start/End: Original strand, 10074403 - 10074528
Alignment:
Q  54 agagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgta 153  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| || ||      
T  10074403 agagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtggg 10074501  T
Q  154 acatataagtcacacttgcatacaaca 180  Q
    || | ||| ||||||||||| ||||||    
T  10074502 acctctaactcacacttgcacacaaca 10074528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 2843692 - 2843560
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgag-tcctcttacttataaggtgttcaacattt 133  Q
    |||||||||| |  |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| || |||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2843692 tagaacaaccactcaagcaagagagataccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgagtttatggggtcctcttacttataaggtgttcaactttt 2843594  T
Q  134 actgttttatccaatatgtaacatataagtcaca 167  Q
    | | |||||||| || || ||||||||| |||||    
T  2843593 attattttatccgatgtgaaacatataactcaca 2843560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 171
Target Start/End: Original strand, 5832048 - 5832182
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||  |||   | | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5832048 tagaacaaccacacaagtaagagagacaccacacttttacccaaaatctt--aaggggtggctttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 5832145  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttg 171  Q
    || ||||||||||| ||  |||||||| | |||||||    
T  5832146 ctcttttatccaatgtgggacatataacttacacttg 5832182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 173
Target Start/End: Original strand, 14748388 - 14748496
Alignment:
Q  64 cacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagt 163  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||  |||||||| |    
T  14748388 cacactcttacccaaaacctt-aacgcaatgagtttatgggtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 14748486  T
Q  164 cacacttgca 173  Q
    ||||||||||    
T  14748487 cacacttgca 14748496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 36 - 172
Target Start/End: Original strand, 2578857 - 2578991
Alignment:
Q  36 agaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttac 135  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||| | |||  |||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2578857 agaacaaccacacaagcaaaagagacaccacactcttaccc-aaaaccttaaggtaatgagtttatggatcctcttatttataaggtattcaacatttac 2578955  T
Q  136 tgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgc 172  Q
    | |||||||| ||  |  |||||||| ||||||||||    
T  2578956 t-ttttatccgatgagggacatataaatcacacttgc 2578991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 170
Target Start/End: Original strand, 6999817 - 6999951
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| ||| || ||| |  |||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  6999817 tagaacaaccacattagcaagagagacgccacactcttatccaaaacctt-aaggcagtgagtttatggatcctcttacatataaggtgttcaactttta 6999915  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacactt 170  Q
    || |||||||| || |   |||||||| ||||||||    
T  6999916 cttttttatccgatgtaggacatataactcacactt 6999951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 167
Target Start/End: Original strand, 9062430 - 9062501
Alignment:
Q  96 gtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcaca 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| || ||  |||||||| |||||    
T  9062430 gtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 9062501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 180
Target Start/End: Original strand, 10073656 - 10073779
Alignment:
Q  54 agagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgta 153  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||  ||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| || ||      
T  10073656 agagagacaccacactcttacccaaaatctt-aagccaatgagtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttac--ttttctccgatgtggg 10073752  T
Q  154 acatataagtcacacttgcatacaaca 180  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||    
T  10073753 acatataactaacacttgcacacaaca 10073779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 185
Target Start/End: Original strand, 2579130 - 2579275
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||| |||||  ||| ||||  || ||||||||  ||||||||    ||||||||||||| ||||    
T  2579130 tagaacaaccacacgagcaagagagacaccacactcttagccaaagcctt-aaagttatgggtttatggttcctctta----taaggtgttcaactttta 2579224  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
    || |||||||| || ||  |||||||| | ||||||| | |||||||||||    
T  2579225 ctcttttatccgatgtgggacatataactaacacttgtacacaacaacact 2579275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 168
Target Start/End: Original strand, 2579513 - 2579645
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| || ||| |||||| ||||| |||| |||||  ||||||| | ||||||||||||||||| | | || ||||    
T  2579513 tagaacaaccacacaagcaagagagacaccatacttttaccc-aaaaccttaaggcaatgagtttatgggccctcttacttataaggtatccgaccttta 2579611  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacac 168  Q
    || |||| ||| || ||  |||||||| ||||||    
T  2579612 cttttttgtccgatgtgggacatataactcacac 2579645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 2975668 - 2975589
Alignment:
Q  56 agagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttact 136  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||  |||  | |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2975668 agagacatcacactcttattcaaaa-ctttaagacaaaggatttatgggtcatcttgcttataaggtgttcaacatttact 2975589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 8482045 - 8481970
Alignment:
Q  53 aagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaac 129  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||  ||||||||||| ||| | |||||| |||||||||    
T  8482045 aagagagacaccacactcttacccaaaatc-ttaaggcaatgagtttatgagtcatctcatttataaagtgttcaac 8481970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 136
Target Start/End: Original strand, 14789279 - 14789325
Alignment:
Q  90 caataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttact 136  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  14789279 caattggtttatgggtcctcttacttgtaaggtgttcaacctttact 14789325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 6071255 - 6071124
Alignment:
Q  49 aagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaat 148  Q
    |||| ||||||||  |||||||||| |||||| ||| || |||||  |||||||  || ||| |||||||| ||||||||| |  ||| || ||| ||||    
T  6071255 aagcgagagagacgccacactcttatccaaaatctt-aaggcaatgagtttatggatcatctcacttataaagtgttcaacctccacttttctattcaat 6071157  T
Q  149 atgtaacatataagtcacacttgcatacaacaa 181  Q
     ||  |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6071156 gtgggacatataactcacacttgcacacaacaa 6071124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 169
Target Start/End: Original strand, 17135092 - 17135223
Alignment:
Q  37 gaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttact 136  Q
    |||||||| || |||| | |||| | ||||||||||| || ||||||||  | ||||  |||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  17135092 gaacaaccgcacaagcgaaagagccgtcacactcttatcc-aaaactttctaacaatgagtttatgaatcctcttgcttataaggtattaaacatttact 17135190  T
Q  137 gttttatccaatatgtaacatataagtcacact 169  Q
      | ||||| || ||  |||||||| |||||||    
T  17135191 tctctatccgatgtgagacatataactcacact 17135223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 67)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Original strand, 4955336 - 4955483
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||| ||||| || ||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  4955336 tagagcaaccgcacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaaccttaa 4955434  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    || |||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  4955435 ctattttatccgatatgagacatataactcacacttgcacacaacaaca 4955483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 25483473 - 25483326
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  25483473 tagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgggtttatggatcctcttacttataagatgttcaaccttta 25483375  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    || |||||||| || ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25483374 ctattttatccgatgtgagacatataactcacacttgcacacaacaaca 25483326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 38 - 184
Target Start/End: Original strand, 22027983 - 22028128
Alignment:
Q  38 aacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactg 137  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |     
T  22027983 aacaaccacataagcgagagagacaccacattcttacccaaaacctt-aaggcaatatgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttcgta 22028081  T
Q  138 ttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacac 184  Q
    |||||||| || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22028082 ttttatccgatgtgggacatataagtcacacttgcacacaacaacac 22028128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 41370494 - 41370357
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41370494 tagaacaaccactcaagcaagagagacactacactcttacccaaaa-ctttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggttttcaacattta 41370396  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    || |||||||| || ||  |||||||| |||||||||||    
T  41370395 ctattttatccgatttgggacatataactcacacttgca 41370357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 183
Target Start/End: Original strand, 34646687 - 34646815
Alignment:
Q  54 agagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgta 153  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||      
T  34646687 agagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgagtttatgagtcctcttagttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtggg 34646785  T
Q  154 acatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  34646786 acatataactcacacttgtacacaacaaca 34646815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 52885006 - 52884875
Alignment:
Q  54 agagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgta 153  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||      
T  52885006 agagagacaccacattcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggg 52884907  T
Q  154 acatataagtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  52884906 acatataactcacacttgcacacaacaacact 52884875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 173
Target Start/End: Original strand, 54017614 - 54017751
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  54017614 tagaacaaccacataagcaagagagacatcacactcttacctaaaacctt-aaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaaccttta 54017712  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    || |||||||  |  ||  |||||||| |||||||||||    
T  54017713 ctattttatctgacgtgggacatataactcacacttgca 54017751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 35 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 52884833 - 52884688
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||   || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  52884833 tagatcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatcgatcatcttacttataaggtgttcaaccttta 52884734  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaaca 180  Q
    || |||||||| || ||  |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  52884733 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 52884688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Original strand, 1731666 - 1731813
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  1731666 tagaacaaccacacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaattggtttatgggtcctcttatttataagatgttcaaccttta 1731764  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    ||||||||||  || ||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  1731765 ctgttttatctgatgtgggacatataactcacatttgcacacaacaaca 1731813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 54109049 - 54108941
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||   |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54109049 tagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaac--ttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 54108952  T
Q  135 ctgttttatcc 145  Q
    || ||||||||    
T  54108951 ctattttatcc 54108941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 39404535 - 39404386
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  39404535 tagaacaaccacacaagcaagagagacaccacattcttgcccaaaacctt-aaggctataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttccaccttta 39404437  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
    || |||||||  || ||  |||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  39404436 ctcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacact 39404386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 44620490 - 44620365
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||| |  |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  44620490 tagaacaaccacacaagcaagagaaacatcacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgggtttatgggctctcttatttataaggtgttcaaccttta 44620392  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataa 161  Q
    ||||||||||| || || |||||||||    
T  44620391 ctgttttatccgatgtggaacatataa 44620365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 185
Target Start/End: Original strand, 49076510 - 49076616
Alignment:
Q  79 aaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaa 178  Q
    |||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| ||||    
T  49076510 aaactttaagacaatgggtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatatggtacatataactcacacttgcacacaa 49076609  T
Q  179 caacact 185  Q
    |||||||    
T  49076610 caacact 49076616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 180
Target Start/End: Original strand, 32941142 - 32941286
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  32941142 tagaacaaccgcacaagcaagagagacgtcacactcttaccc-aaaaccttaaggcaatgagtttatgagccctcttatttataaggtgttcaaccttta 32941240  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaaca 180  Q
    ||||| | ||| || |   |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  32941241 ctgttctttccgatgtaagacatataactcacacttgcagacaaca 32941286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 36629374 - 36629230
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  36629374 tagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgtttaactttta 36629276  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaaca 180  Q
    || || ||||| || ||  |||||||| ||||||||| | ||||||    
T  36629275 cttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgaacacaaca 36629230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 50002563 - 50002416
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | | |||| | |||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  50002563 tagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaga-caatggatttatgggtcctcttacttaaaaagtgttcaaccttta 50002465  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    || |||||||| || ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  50002464 ctcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaacaacaaca 50002416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 53 - 173
Target Start/End: Original strand, 55933161 - 55933280
Alignment:
Q  53 aagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgt 152  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || |      
T  55933161 aagagagacaccacactcttacccaaaa-ctttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacccttactattttatccgatgtag 55933259  T
Q  153 aacatataagtcacacttgca 173  Q
     |||||||| |||||||||||    
T  55933260 gacatataactcacacttgca 55933280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 46 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 49880286 - 49880160
Alignment:
Q  46 cataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatcc 145  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |    
T  49880286 cataaacaagagagacaccacgctcttacccaaaacctt-aaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattc 49880188  T
Q  146 aatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    ||| ||  |||||||| |||||||||||    
T  49880187 aatgtgggacatataactcacacttgca 49880160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 145
Target Start/End: Original strand, 50630777 - 50630883
Alignment:
Q  38 aacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactg 137  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||     
T  50630777 aacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataatgtgttcaacctttacta 50630875  T
Q  138 ttttatcc 145  Q
    ||||||||    
T  50630876 ttttatcc 50630883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 172
Target Start/End: Original strand, 16889555 - 16889691
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||| | || ||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16889555 tagaacaatcacacaaggaagagagacaccatactcttacccaaaa-ctttaaggcagtaggtttatgaatcctcttacttataaggtattcaaccttta 16889653  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgc 172  Q
    || || ||||| || ||  |||||||| ||||||||||    
T  16889654 cttttctatccgatttgagacatataactcacacttgc 16889691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 20825973 - 20825829
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| || || | ||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  20825973 tagaacaaccgcataaggaagagaaacaccacactcttacccaaaacctt-aaggctaaaggtttatgggtgctcttatttataaggtgttcaaccttta 20825875  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaaca 180  Q
    || |||||||| || || ||||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  20825874 ctcttttatccgatgtggaacatataactcacatttgtacacaaca 20825829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 36572154 - 36572006
Alignment:
Q  37 gaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttact 136  Q
    |||||||| || |||| ||||||||| || ||||| |||||||| ||| || ||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36572154 gaacaaccgcacaagcgagagagacaccatactctaacccaaaacctt-aaggcaatggatttatgggtcttcttacttataaggtgttcaacatttact 36572056  T
Q  137 gttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacacta 186  Q
     |||||| | || ||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  36572055 cttttattcgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacacta 36572006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 3341247 - 3341116
Alignment:
Q  53 aagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgt 152  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||| ||     
T  3341247 aagaaagacatcacactcttacccaaaatcttaaaa-caatgatgttatgggtcctcttacttataaagtgtttaacctttactcttttatccaatgtgg 3341149  T
Q  153 aacatataagtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  3341148 gacatataactcacacttgcacacaacaacact 3341116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 10246056 - 10245910
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| || ||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10246056 tagaacaaccagacaagcaagggagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggctttgggtttatg-gtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 10245959  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    || |||||||| || ||   ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10245958 ctcttttatccgatgtggggcatataactcacacttgcacacaacaaca 10245910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 188
Target Start/End: Original strand, 22028388 - 22028542
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||  ||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22028388 tagaacaacctcacaagcaagagagacaccacactcttaccc-aaaacattaagacaatgagtttatgggtcctcttactaataaggtgttcaaccttta 22028486  T
Q  135 --ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacactacc 188  Q
       | |||||||| || |   |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22028487 tttttttttatccgatgtaggacatataagtaacacttgcacacaacaacactacc 22028542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 39404155 - 39404020
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| || || ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  39404155 tagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaacctt-aatgctatgagtttatgagtcctcttacttataaagtgttcaaccttta 39404057  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttg 171  Q
    || |||||| |||| |   |||||||| |||||||||    
T  39404056 ctcttttattcaatgtaggacatataactcacacttg 39404020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 50 - 185
Target Start/End: Original strand, 45489366 - 45489499
Alignment:
Q  50 agcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaata 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||  || |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||     
T  45489366 agcaaaagagacatcacactcttaccaaaaatcttaaa--cagtaggtttaagagttctcttacttatatggtgttcaacctttactcttttatccgatg 45489463  T
Q  150 tgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
    ||  |||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  45489464 tgagacatataattcacacttgtacacaacaacact 45489499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 179
Target Start/End: Original strand, 49076850 - 49076992
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| || |  || |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  49076850 tagaacaaccgcacaagcaagaaagacaccacactctaacccaaaacctt-aaggttatgggtttatgggttctcttact-ataaggtgttcaaccttta 49076947  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaac 179  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  49076948 ctattttagccaatatggaacatataactcacacttgcacacaac 49076992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 3340944 - 3340802
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3340944 tagaacaaccccacaagcaagaaagacaccacactcttaccc-aaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataaggtgctcaaccttta 3340846  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaa 178  Q
    || ||| |||  ||  |  |||||||| ||||||||||| ||||    
T  3340845 ctctttcatctgatgcgggacatataactcacacttgcacacaa 3340802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 50459858 - 50459724
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| | |  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  50459858 tagaacaaccacacaagcaagagagacaccacgctcttacctaaaaccttaagat-aatgggtttatgagtcctcttacttataagatgttcaaccttta 50459760  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacactt 170  Q
    || ||||| || || || ||||||||| ||||||||    
T  50459759 ctcttttaaccgatgtggaacatataactcacactt 50459724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 182
Target Start/End: Original strand, 51768079 - 51768225
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||| ||| | | ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51768079 tagaacaatcccataagtaagagagacatcgtacttttacccaaaaccttaaga-caatgagtttatgagtcctcttatttataaggtgttcaacattta 51768177  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaac 182  Q
    || || ||| | ||||   |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  51768178 ctcttatattcgatataggacatataactcacatttgcacacaacaac 51768225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 180
Target Start/End: Original strand, 39792879 - 39793023
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39792879 tagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttaccc-aaaaccttaaggcaatgagtttacggttcctctttcttataaggtgttcaacattta 39792977  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaaca 180  Q
    || || ||||  || ||  |||||||| ||||||||| | ||||||    
T  39792978 cttttctatctgatgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 39793023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 43174641 - 43174494
Alignment:
Q  38 aacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttact- 136  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||||||||||||| | |||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  43174641 aacaaccatataaacaagagagacgccacactcttacccaaca-ctttaaggtcataggtttatgtgtcctcttacttataaggtgttcaacctttactc 43174543  T
Q  137 gttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
     |||||||  || |||  ||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  43174542 tttttatctgatgtgtggcatataactcacacttgtacacaacaacact 43174494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 44621139 - 44621030
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    ||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | | ||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44621139 tagaataaccgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaga-caatgagtttatgtgccctcttacttataaggtgttcaaccttta 44621041  T
Q  135 ctgttttatcc 145  Q
    |||||||||||    
T  44621040 ctgttttatcc 44621030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 54936314 - 54936225
Alignment:
Q  54 agagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatc 144  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  54936314 agagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgggtttatgggtcctcttacttacaaggtgttcaacctttactattttatc 54936225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 183
Target Start/End: Original strand, 22183302 - 22183430
Alignment:
Q  54 agagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgta 153  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||| ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| || ||      
T  22183302 agagagacgccacactcttatccaaaacctt-aaggcaatgggtttatgggtccttttacttataaattgttcaacatttactcttttatccgatgtggg 22183400  T
Q  154 acatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22183401 atatataactcacacttgcacacaacaaca 22183430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 183
Target Start/End: Original strand, 36608699 - 36608827
Alignment:
Q  54 agagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgta 153  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| | | |||| | ||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| || |       
T  36608699 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaga-caatggatttatggatcctcttacttatgaggtgttcaacttttactcttttatccgatgttgg 36608797  T
Q  154 acatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  36608798 acatataactcacacttgcacacaacaaca 36608827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 20826354 - 20826223
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || || || || |||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20826354 tagaacaatcgcataaggaagagagacatcacactcttacctaaaatgtt-aaggctatgggtttatgggttctcttacttataacgtgttcaactttta 20826256  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcaca 167  Q
    || |||||||| || ||  |||||||| |||||    
T  20826255 ctattttatccgatgtgggacatataactcaca 20826223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 44620793 - 44620648
Alignment:
Q  38 aacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactg 137  Q
    ||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| || |  || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||     
T  44620793 aacaaccgcacaagcaagagagaaaccacactcttacccaaaacctt-aaggttat-ggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctctacta 44620696  T
Q  138 ttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
    ||| |||| || ||  |||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  44620695 tttcatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacgacact 44620648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 180
Target Start/End: Original strand, 3244489 - 3244614
Alignment:
Q  54 agagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgta 153  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||| ||||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| || ||      
T  3244489 agagagacgacacattcttacccaaaa-ctttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttacttttctatccgatgtgag 3244587  T
Q  154 acatataagtcacacttgcatacaaca 180  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3244588 acatataactcacacttgcacacaaca 3244614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 2740778 - 2740693
Alignment:
Q  95 ggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaaca 180  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||  |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  2740778 ggtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttctatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaca 2740693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 3700438 - 3700357
Alignment:
Q  100 atgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaa 181  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |   |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  3700438 atgagtccttttacttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtaggacatataactcacacttgcacacaacaa 3700357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 40067181 - 40067045
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaac-attt 133  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| | | | | | |||| |||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  40067181 tagaacaaccacataagcaagagagacatcacacttttacccaaaatc-ttaaggtagtggatctatgtgtcctcttacttataatgtgttcaacttttt 40067083  T
Q  134 actgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttg 171  Q
    ||  |||||||| || |  ||||||||| |||||||||    
T  40067082 acacttttatccgatgtagaacatataactcacacttg 40067045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 54108674 - 54108558
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaat-aggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattt 133  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||| || ||||| |  |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  54108674 tagaacaaccacacaagcaagatagacaccacactcttagccaaaacctt-aaggcaatgaattttatgggtccttttacttataaggtgttcaaccttt 54108576  T
Q  134 actgttttatccaatatg 151  Q
    ||| |||||||| |||||    
T  54108575 actattttatcctatatg 54108558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Original strand, 4390120 - 4390267
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||  | | | |  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4390120 tagaacaactgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaacctt-aacgcaatgtgctaaaggatcctcttacttataaggtgttcaaccttta 4390218  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    || |||||||  || ||  | || ||| ||||||||||| |||||||||    
T  4390219 ctcttttatctgatgtgggatatgtaactcacacttgcacacaacaaca 4390267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 145
Target Start/End: Original strand, 18932786 - 18932877
Alignment:
Q  53 aagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatcc 145  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  18932786 aagagagacaccacactctta-cctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttatttataaggtattcaacctttactattttatcc 18932877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 49 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 45496928 - 45496833
Alignment:
Q  49 aagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatcc 145  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | | ||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  45496928 aagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaga-caatgagtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacgattttatcc 45496833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 173
Target Start/End: Original strand, 6975486 - 6975612
Alignment:
Q  46 cataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatcc 145  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |  ||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||     
T  6975486 cataagcaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaagat-aatggatttatgagtcctcttacttataagatattcaacctttactattttatcg 6975584  T
Q  146 aatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
     || ||  |||||||| ||||| |||||    
T  6975585 gatgtgagacatataactcacatttgca 6975612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 185
Target Start/End: Original strand, 16888835 - 16888985
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||| | | | | ||||  ||||||  || |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16888835 tagaacaatcgcacaaacaagagagacatcacactcttacccaaaaccgtaaga-caatgagtttataggttctcttacttataaggtattcaaccttta 16888933  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttg-catacaacaacact 185  Q
    || || ||||| || ||  |||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  16888934 cttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgccacacaacaacact 16888985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 49303043 - 49302934
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttac--ttataaggtgttcaacatt 132  Q
    |||||||| | |||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| ||    
T  49303043 tagaacaatcgcataagtaagagatacaccacactcttaccc-aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttttataagatgttcaacctt 49302945  T
Q  133 tactgttttat 143  Q
    |||| ||||||    
T  49302944 tacttttttat 49302934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 180
Target Start/End: Original strand, 54741260 - 54741341
Alignment:
Q  99 tatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaaca 180  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| || ||  |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  54741260 tatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataattcacacttgcacacaaca 54741341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18879943 - 18879852
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttca 127  Q
    |||||||||| || || ||| |||||| |||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  18879943 tagaacaaccacacaaccaaaagagacgtcacactcttacccaaaacctt-aaggaaataggtttataggtcatcttacttataaggtgttca 18879852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 19504833 - 19504695
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||         ||||||||| ||||    
T  19504833 tagaacaaccacacaagcaagatagacgccacactcttaccc-aaaactttaaggcaatagatttatgggtcctctt---------gtgttcaactttta 19504744  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    || |||||||| |||||  |||||||| ||| ||||| | |||||||||    
T  19504743 ctattttatccgatatgggacatataactcatacttgtacacaacaaca 19504695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 119
Target Start/End: Original strand, 23817700 - 23817783
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataa 119  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  23817700 tagaacaaccacactagcaagagagacaccacactcttaccc-aaaaccttaaggcaatgagtttatgaatcctcttacttataa 23817783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 181
Target Start/End: Original strand, 41707503 - 41707628
Alignment:
Q  54 agagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgta 153  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||  ||||  ||||||| || || ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| || ||      
T  41707503 agagagacaccacactcttacc--aaaaccttaagacaatgagtttatgggttcttttacttatatggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggg 41707600  T
Q  154 acatataagtcacacttgcatacaacaa 181  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||    
T  41707601 acatataactcacacttgtacacaacaa 41707628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 145
Target Start/End: Original strand, 54343027 - 54343129
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| ||       |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54343027 tagaacaaccactcaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatggg-------gtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 54343118  T
Q  135 ctgttttatcc 145  Q
    || ||||||||    
T  54343119 ctattttatcc 54343129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 44621492 - 44621414
Alignment:
Q  107 ctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |   |||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  44621492 ctcttacttataaggtgtttaacctttactgttttatcccatgttggacatataactcacacttgcacacaacgacact 44621414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 145
Target Start/End: Original strand, 54017784 - 54017830
Alignment:
Q  99 tatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatcc 145  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54017784 tatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatcc 54017830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 2741179 - 2741071
Alignment:
Q  64 cacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagt 163  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||| |  ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||  || ||  |||||||| |    
T  2741179 cacactcttacccaaaacctt-aaggcaatggagttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactattctatctgatgtgggacatataact 2741081  T
Q  164 cacacttgca 173  Q
    ||||||||||    
T  2741080 cacacttgca 2741071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 40 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 28034361 - 28034222
Alignment:
Q  40 caaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgtt 139  Q
    ||||| ||||||  ||||||||  |||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||| || |||| |||||||| ||||||||| |  ||| ||    
T  28034361 caaccgcataagtgagagagacgccacactcttacctaaaacctt-aaagcaataagtttatgggttctctcacttataaagtgttcaacctccactttt 28034263  T
Q  140 ttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaaca 180  Q
     ||||| ||  |  |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  28034262 ctatccgatgcgggacatataattcacacttgcacacaaca 28034222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 178
Target Start/End: Original strand, 34004604 - 34004744
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||  ||||||||  |||||||||| | |||| |||  ||| |||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  34004604 tagaacaaccgcacaagggagagagacggcacactcttatcgaaaacctt--aaggaatgagtttatgggtcctcttacttataagttgttcaaccttta 34004701  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaa 178  Q
     | |||||||  || ||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  34004702 gt-ttttatcatatgtgtgacatataactcacacttgcacacaa 34004744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 129
Target Start/End: Original strand, 15841406 - 15841480
Alignment:
Q  54 agagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaac 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||  |||||||| |||||| ||||| || |||||||||    
T  15841406 agagagacatcacactcttaccc-aaaaccttaaggcaatgtgtttatgaatcctctcacttacaaagtgttcaac 15841480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 3271904 - 3271841
Alignment:
Q  54 agagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataa 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  3271904 agagagaca-cacactcttacccaaaacctt-aaggcaataggtttatgggttctcttacttataa 3271841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 44620362 - 44620286
Alignment:
Q  107 ctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||  |||||||| ||| | ||| | |||||||||    
T  44620362 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcccatgtgggacatataactcatatttgtacacaacaaca 44620286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 34544225 - 34544150
Alignment:
Q  54 agagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaac 129  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| ||||||| | |||||| ||| |||||    
T  34544225 agagagataccacactcttacccaaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctcatttataaagtgatcaac 34544150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 31691260 - 31691203
Alignment:
Q  64 cacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggt 122  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  31691260 cacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggt 31691203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 44621011 - 44620973
Alignment:
Q  107 ctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatcc 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  44621011 ctcttacttataaggtgttcaacctttacagttttatcc 44620973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 54 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 26074730 - 26074600
Alignment:
Q  54 agagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgta 153  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |    
T  26074730 agagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatatgga 26074632  T
Q  154 acatataagtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
    |||||||| ||||||||| | |||| ||||||    
T  26074631 acatataactcacacttgtacacaaaaacact 26074600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 185
Target Start/End: Original strand, 13415781 - 13415930
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13415781 tagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaacctt-aaggtaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 13415879  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
    ||  ||||||| || ||  |||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  13415880 ctaatttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacagcact 13415930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 173
Target Start/End: Original strand, 27502057 - 27502194
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  27502057 tagaacaaccacacaagcaagagagacaccacacttttaccaaaaatctt-aaggcaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgtttaaccttta 27502155  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    || ||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||    
T  27502156 ctattttatccaatgtgggacatataactcacacttgca 27502194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Original strand, 40296336 - 40296483
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  40296336 tagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctc-aaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttt 40296434  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    || |||||||| || ||  |||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  40296435 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaccaaca 40296483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 181
Target Start/End: Original strand, 3295366 - 3295509
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3295366 tagaacaaccacacaagcaagagagacaacacactcttacc--aaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 3295463  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaa 181  Q
    || |||||||| || || ||||||| | |||||||| || |||||||    
T  3295464 ctattttatccgatgtggaacatat-actcacacttccacacaacaa 3295509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 32487530 - 32487394
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  32487530 tagaacaaccacataagcaagagatacgtcacactcttaccc-aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat-aggtgttcaaccttta 32487433  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    || |||||||| || ||  |||||||| |||||||||||    
T  32487432 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 32487394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 41632916 - 41632775
Alignment:
Q  38 aacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactg 137  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  41632916 aacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatctt-aaagcattgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactt 41632818  T
Q  138 ttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaaca 180  Q
    || ||||| || ||  |||||||| | ||||||||| ||||||    
T  41632817 ttctatccgatgtgagacatataacttacacttgcacacaaca 41632775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Original strand, 11416998 - 11417143
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11416998 tagaacaatcccacaagcaagagagagatcacactcttacacaaaacctt-aaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaaccttta 11417096  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    || |||||||| || || |||||||||  | |||||||| |||||||||    
T  11417097 ctattttatccgatgtggaacatataa--ctcacttgcacacaacaaca 11417143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 51 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 25328056 - 25327925
Alignment:
Q  51 gcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatat 150  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |    
T  25328056 gcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcattaggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttactgttttatccgatgt 25327958  T
Q  151 gtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
       |||||||| ||||||||  | |||||||||    
T  25327957 aggacatataactcacacttagacacaacaaca 25327925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 6500587 - 6500451
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6500587 tagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgggtttaaaggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 6500489  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    || |||||||| || ||  |||||||| |||||||||||    
T  6500488 ctattttatccgatgtg-gacatataactcacacttgca 6500451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 15370236 - 15370089
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||  | | |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15370236 tagaacaatcccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggctgtggatttatgggtcctcttacttataagatgttcaaccttta 15370138  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    || |||||| | || ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15370137 ctattttattcgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 15370089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 51 - 183
Target Start/End: Original strand, 26075198 - 26075330
Alignment:
Q  51 gcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatat 150  Q
    |||||||||||  |||||||||  || ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |    
T  26075198 gcaagagagacgacacactctttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgt 26075297  T
Q  151 gtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    |  |||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  26075298 gagacatataaatcacacttgtacacaacaaca 26075330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Original strand, 34753046 - 34753193
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  34753046 tagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatcggtttatgggtcttcttacttataaggtgttcaactttta 34753144  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    || || |||||||| ||  |||||||| | ||| ||| | |||||||||    
T  34753145 cttttctatccaatgtgggacatataacttacatttgtacacaacaaca 34753193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Original strand, 36492238 - 36492385
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  || | |||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36492238 tagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccta-aaggtaatgtgtttattggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 36492336  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    || |||||||| || ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  36492337 ctcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaacaacaaca 36492385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 15370539 - 15370430
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370539 tagaacaaccccacaaacaagagagacgccacactcttacgcaaaacctt-aaggctatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacattta 15370441  T
Q  135 ctgttttatcc 145  Q
    |||||| ||||    
T  15370440 ctgtttcatcc 15370430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 54 - 180
Target Start/End: Original strand, 26074186 - 26074311
Alignment:
Q  54 agagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgta 153  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||| || |||     
T  26074186 agagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgggttcatgggtcctcttacatatgaggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgtg 26074284  T
Q  154 acatataagtcacacttgcatacaaca 180  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  26074285 acatataactcacacttgcacacaaca 26074311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Original strand, 42405619 - 42405764
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  42405619 tagaacaaccgcacaagcaagagacac--cacactcttacccaaaacctt-aaggcattaggtttatgagtccttttacttgtaaggtgttcaaccttta 42405715  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    || |||||||| || |   |||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  42405716 ctattttatccgatgttggacatataactcacacttgtacacaacaaca 42405764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 171
Target Start/End: Original strand, 18603141 - 18603276
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||   ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18603141 tagaactaccacacaagcaagagagatgccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 18603239  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttg 171  Q
    || |||||||  || ||  |||||||| |||||||||    
T  18603240 ctattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 18603276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 41170771 - 41170640
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  41170771 tagaacaaccacacaagcaagaaaaacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaaccttta 41170673  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcaca 167  Q
    || |||||||| || ||  |||||||| |||||    
T  41170672 ctattttatccgatgtgggacatataactcaca 41170640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 46 - 173
Target Start/End: Original strand, 9498686 - 9498812
Alignment:
Q  46 cataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatcc 145  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||     
T  9498686 cataaacaagagagacaccacactcttacccaaaatctt-aaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattctatct 9498784  T
Q  146 aatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
     || ||  |||||||| ||||| |||||    
T  9498785 gatgtgagacatataactcacatttgca 9498812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 624333 - 624196
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||  || || || |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  624333 tagaacaaccccacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaacctc-aaggctatgggtttatgggtcatcttacttataacgtgttcaaccttta 624235  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    || |||||| |||| ||  |||||||| |||||||||||    
T  624234 ctattttatacaatgtgggacatataactcacacttgca 624196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 299626 - 299479
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    ||||||||||  | |||||| ||||||  ||||||||||| ||||| ||| || || ||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  299626 tagaacaaccgtacaagcaatagagacgccacactcttacacaaaacctt-aaggctatgagtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaaccttta 299528  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    ||||||||||| || ||  |||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  299527 ctgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcgcacaacaaca 299479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Original strand, 12662673 - 12662820
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    ||||| ||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||| | | |||| | |||||| ||  ||||||||||||  |||||||| ||||    
T  12662673 tagaagaaccccacaagcaagaaaggcaccacactcttacccaaaaacttaaga-caatggatttatgggttttcttacttataaaatgttcaaccttta 12662771  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    || |||||||| || ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  12662772 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaaca 12662820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 173
Target Start/End: Original strand, 29549278 - 29549413
Alignment:
Q  37 gaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttact 136  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||| || | |||  ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  29549278 gaacaaccacataagcaagagagacgccacactcttatccaaaacctt-aaggtaatgtgtttatgggtcttcttacttatatggtgttcatcctttact 29549376  T
Q  137 gttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
     |||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  29549377 attttatctgatatggaacatataactcacacttgca 29549413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 185
Target Start/End: Original strand, 26074818 - 26074952
Alignment:
Q  51 gcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatat 150  Q
    |||||||||||  |||||||||  || ||||| ||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| || |    
T  26074818 gcaagagagacgccacactctttacccaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcctacttatattgtgttcaacctttactcttttatccgatgt 26074917  T
Q  151 gtaacatataagtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
    |  |||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  26074918 gggacatataactcacacttgtacacaacaacact 26074952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 6224333 - 6224186
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||| ||||| || ||||||  ||| || |||||||||||| |||||| |||| || ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6224333 tagaccaaccgcacaagcaactgaggcaccacactcttacc-aaaaaccttaaggcgatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 6224235  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    || |||||||| |  ||  |||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  6224234 ctcttttatccgaagtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 6224186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 145
Target Start/End: Original strand, 3295039 - 3295145
Alignment:
Q  38 aacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactg 137  Q
    ||||||| || || ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||  || ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||     
T  3295039 aacaaccacacaaccaagagagacaccacactcatacccaaaacctc-aaggcaatgggtttatgggtcttcttacttataaggtgttcaacctttacta 3295137  T
Q  138 ttttatcc 145  Q
    ||||||||    
T  3295138 ttttatcc 3295145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 6500959 - 6500823
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    ||||| |||| || ||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||| || |||||  ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  6500959 tagaataaccgcacaagtaagagagacaccacactcttatccaaaacctt-aaggcaatgagtttatgggtccttttatttataaggtgttcaaccttta 6500861  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    || |||||||| || ||  |||||||| |||||||||||    
T  6500860 ctattttatccgatgtg-gacatataactcacacttgca 6500823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 180
Target Start/End: Original strand, 36568607 - 36568732
Alignment:
Q  54 agagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgta 153  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||| | ||| ||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||| || ||      
T  36568607 agagagacgccacactcttacc-aaaaaccttaaggcaatgggtttacgggtcatctcacttataaggtgttcaacttttacttttctatccgatgtggg 36568705  T
Q  154 acatataagtcacacttgcatacaaca 180  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  36568706 acatataactcacacttgcacacaaca 36568732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 180
Target Start/End: Original strand, 1028538 - 1028682
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||  ||||||||  |||||||||||| |||||| |||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  1028538 tagaacaaccgcacaagtgagagagacgccacactcttacc-aaaaaccttaaggttataggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcatccttta 1028636  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaaca 180  Q
    || || ||||| || ||  |||||||| ||||||||| | ||||||    
T  1028637 cttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaaca 1028682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 55 - 144
Target Start/End: Original strand, 35167879 - 35167967
Alignment:
Q  55 gagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatc 144  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  35167879 gagagacatcacactcttacc-aaaaacatcaaggcaatagatttatgggtcatcctacttataaggtgttcaacctttactcttttatc 35167967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 33747908 - 33747782
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||| || |||||  |||||||  ||||||||||||||| || || ||| ||||    
T  33747908 tagaacaaccgcataaggaagagagacaccacactcttatccaaaatctt-aaggcaatgagtttatggatcctcttacttataaagtatttaaccttta 33747810  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataag 162  Q
    || |||||||| || ||  |||||||||    
T  33747809 ctattttatccgatgtgggacatataag 33747782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 42508718 - 42508604
Alignment:
Q  67 actcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcac 166  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||| || ||||| || ||  | |||||| ||||    
T  42508718 actcatacccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttattagatgtttaacctttacttttctatccgatgtgggatatataattcac 42508619  T
Q  167 acttgcatacaacaa 181  Q
    ||||| | |||||||    
T  42508618 acttgtacacaacaa 42508604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 35150124 - 35150002
Alignment:
Q  54 agagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgta 153  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| ||| | | |||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| || ||      
T  35150124 agagagacaccacacttttacccaaaaccttaaga-caatggatttatgggtc-tcttacttataaggtgttcaaccttgactcttttatccgatgtggg 35150027  T
Q  154 acatataagtcacacttgcatacaa 178  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||    
T  35150026 acatataactcacacttgcacacaa 35150002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 623955 - 623818
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||| | ||||| |||| || ||| |||||||  ||  ||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  623955 tagaacaaccccacaagtgagagagacaccacactcttactc-aaaaccttaaggctataagtttatggctcaacttacttgtaaagtgttcaaccttta 623857  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    || || ||||| || ||  |||||||| |||||||||||    
T  623856 ctattatatccgatgtgagacatataactcacacttgca 623818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 31509742 - 31509615
Alignment:
Q  54 agagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgta 153  Q
    |||||||||  ||| ||||||| |||||| | || |||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |  ||| || ||||| || ||      
T  31509742 agagagacactacattcttaccaaaaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatccgatgtgag 31509643  T
Q  154 acatataagtcacacttgcatacaacaa 181  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  31509642 acatataactcacacttgcacacaacaa 31509615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 173
Target Start/End: Original strand, 5723812 - 5723949
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||  | |||||| ||||||| ||| | | |||||  || ||| || ||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  5723812 tagaacaaccgcacaagcaagagagacactatactctttcccaaaaccttaaga-caataaattaatgggttctcttacatataatgtgttcaactttta 5723910  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
     | |||||||| || ||  |||||||| |||||||||||    
T  5723911 ttattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 5723949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 175
Target Start/End: Original strand, 26591000 - 26591070
Alignment:
Q  105 tcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcata 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  || | ||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  26591000 tcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttcgattcgatatggaacatttaaatcacacttgcata 26591070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 80
Target Start/End: Original strand, 26900038 - 26900083
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaa 80  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26900038 tagaacaaacccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa 26900083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 38427684 - 38427553
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| || |||  |||||||| |||||||||||| | ||||| ||||  |||| | || ||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  38427684 tagaacaaccgcacaagtgagagagacgtcacactcttacac-aaaaccttaagacaatggattaatgggtcctc-tacttataagatgttcaaccttta 38427587  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacac 168  Q
    || || |||||||| ||  |||||||| ||||||    
T  38427586 cttttctatccaatgtgggacatataactcacac 38427553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 31509855 - 31509775
Alignment:
Q  49 aagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaac 129  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| | || |||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  31509855 aagcgagagagacaccacattcttaccaaaaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctctcacttataaagtgctcaac 31509775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 35914974 - 35914839
Alignment:
Q  47 ataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatcca 146  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||| |||| || ||||  ||||| | |||| | ||| ||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||     
T  35914974 ataagcaagagagataccacattcttatccaataa-tttagggcaatggatttacgggtcttcttacttataaaatgttcaacctttactcttttatccg 35914876  T
Q  147 atatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    || ||| |||||||| ||| ||||  | |||||||||    
T  35914875 atgtgtgacatataactcatacttatacacaacaaca 35914839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 129
Target Start/End: Original strand, 13786041 - 13786115
Alignment:
Q  54 agagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaac 129  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | ||||  |||||| |||| | ||| |||||||||||| |||||||||    
T  13786041 agagagacatcacactcttatccaaaatc-ttaagacaatagatttacgggtcatcttacttataaagtgttcaac 13786115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 144
Target Start/End: Original strand, 41635281 - 41635320
Alignment:
Q  105 tcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatc 144  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41635281 tcctcttatttataaggtgttcaacatttactcttttatc 41635320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 180
Target Start/End: Original strand, 36522277 - 36522402
Alignment:
Q  54 agagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgta 153  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||   ||| |||||||  ||||||| ||||||||  |||||||| |  | | || |||||||| ||      
T  36522277 agagagacaccacactcttaccc-aaaaccttaagataatgggtttattggtcctctcacttataaaatgttcaacttccatttttctatccaatgtgag 36522375  T
Q  154 acatataagtcacacttgcatacaaca 180  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||    
T  36522376 acatataactcacactttcatacaaca 36522402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 301025 - 300988
Alignment:
Q  107 ctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatc 144  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  301025 ctcttacttataaggtattcaacctttactgttttatc 300988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 26074396 - 26074363
Alignment:
Q  95 ggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaa 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26074396 ggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 26074363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 38427356 - 38427311
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaa 80  Q
    |||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  38427356 tagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaa 38427311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 39309761 - 39309677
Alignment:
Q  95 ggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaaca 180  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||| || ||  |||||||| ||| ||||| | ||||||    
T  39309761 ggtttatg-gtcctcttatttataatgtgttcaacatttacccttttatccgatgtgggacatataactcatacttgtacacaaca 39309677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 80
Target Start/End: Original strand, 795254 - 795298
Alignment:
Q  36 agaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaa 80  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  795254 agaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacctaaaa 795298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 42524822 - 42524719
Alignment:
Q  67 actcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcac 166  Q
    |||| ||||||||||| || |  |||| | |||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||| || ||||| || ||  |||||||| ||||    
T  42524822 actcatacccaaaaaccttcagacaatggatttatgagtcctcttattcataagatgttcaac-tttacttttctatccgatgtgagacatataattcac 42524724  T
Q  167 acttg 171  Q
    |||||    
T  42524723 acttg 42524719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 5477 - 5349
Alignment:
Q  52 caagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatg 151  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||    
T  5477 caagagagacaccacactcttatccaaaatctt-aaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttctatccgatgtg 5379  T
Q  152 taacatataagtcacacttgcatacaacaa 181  Q
     ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5378 gaacatataactcacacttgcacacaacaa 5349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 5119 - 4972
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| |||||  ||||||| ||| | ||||||||||| | || ||| ||||    
T  5119 tagagcaaccgcataagcgagagagacaccacactcttaccc-aaaaccataaggcaatgagtttatgggtctttttacttataagatattaaaccttta 5021  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    ||||| | ||| || ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5020 ctgttctctccgatgtgagacatataattcacacttgcacacaacaaca 4972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 171
Target Start/End: Original strand, 549 - 670
Alignment:
Q  49 aagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaat 148  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||    
T  549 aagcaagaaagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttaaccgat 647  T
Q  149 atgtaacatataagtcacacttg 171  Q
     ||  |||||||| |||||||||    
T  648 gtgggacatataactcacacttg 670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 173
Target Start/End: Original strand, 223 - 300
Alignment:
Q  95 ggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgca 173  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||  |||||||| |||||||||||    
T  223 ggtttatg-gtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 185
Target Start/End: Original strand, 17496 - 17626
Alignment:
Q  56 agagacatcacactcttacccaaaaa-ctttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaa 154  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| | |||| || || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||  || ||| |    
T  17496 agagacaccatactcttacccaaaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgtga 17595  T
Q  155 catataagtcacacttgcatacaacaacact 185  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  17596 catataactcacacttgcacacaacaacact 17626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 47497 - 47350
Alignment:
Q  35 tagaacaaccccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaactttaaagcaataggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacattta 134  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  47497 tagaacaaccgcgcaagcaagagagacaccacatttttacccaaaa-ctttaaggcaatgggtttatggattctcttacttataaggtgttcaaacttta 47399  T
Q  135 ctgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttgcatacaacaaca 183  Q
    || |||||||  || ||  |||| ||| ||||||||||| ||| |||||    
T  47398 ctattttatcggatgtgagacatttaattcacacttgcacacatcaaca 47350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 171
Target Start/End: Original strand, 10192 - 10267
Alignment:
Q  96 gtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccaatatgtaacatataagtcacacttg 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| || ||  |||||||| |||||||||    
T  10192 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttaccattttatccgatgtgagacatataactcacacttg 10267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University