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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF11468_low_5 (Length: 416)
Name: NF11468_low_5
Description: NF11468
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF11468_low_5 |
 |  |
|
| [»] scaffold0037 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0021 (5 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0008 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0035 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0077 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0240 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0001 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0338 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0359 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0012 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0014 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0673 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0117 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0190 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0022 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0447 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0383 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0396 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0160 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1867 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0610 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0068 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0044 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0025 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0120 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1164 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0011 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0480 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0310 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0158 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0034 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0103 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0083 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0075 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0016 (4 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0554 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0031 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0740 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0092 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0342 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0049 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0095 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0465 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0234 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0122 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0251 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0175 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0032 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0574 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0597 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0243 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0816 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0706 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0004 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0195 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0039 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0053 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0091 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0303 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0876 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0589 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0184 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0078 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0116 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0686 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0162 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0013 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0244 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0833 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0009 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0700 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0150 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0006 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0123 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0483 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0409 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0028 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0456 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0010 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0970 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0026 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1272 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0018 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0389 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0521 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0080 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0058 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0125 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0132 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0138 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1734 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0193 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0260 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0165 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 17 - 402
Target Start/End: Original strand, 35054718 - 35055103
Alignment:
| Q |
17 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
35054718 |
ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttattccacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaaca |
35054817 |
T |
 |
| Q |
117 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
35054818 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacagttcatcaactacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatac |
35054917 |
T |
 |
| Q |
217 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaac |
316 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
35054918 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaattaaatcatttatgaac |
35055017 |
T |
 |
| Q |
317 |
aattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
35055018 |
aattaaccaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaatagaaataagtgattatgatgaattttaaccccctta |
35055103 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 65 - 402
Target Start/End: Original strand, 49967660 - 49967997
Alignment:
| Q |
65 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaaca |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
49967660 |
atgaatcatgcaaaccgaagcaatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgatcatgaaacgtatcacaattcatcaacaaca |
49967759 |
T |
 |
| Q |
165 |
taacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttca |
264 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
49967760 |
atgtataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattttttataatttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
49967859 |
T |
 |
| Q |
265 |
tacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaa |
364 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
49967860 |
tacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatgatttttgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatgcaaataattgaaa |
49967959 |
T |
 |
| Q |
365 |
attgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49967960 |
attacaataagtgattacgatgaattctaaccccctta |
49967997 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 65 - 394
Target Start/End: Original strand, 21718238 - 21718566
Alignment:
| Q |
65 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaaca |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
21718238 |
atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaaatcatcaacaaca |
21718337 |
T |
 |
| Q |
165 |
taacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttca |
264 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21718338 |
tagcataattcaccaattgagcatattttgaacacataccaatttctcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttca |
21718437 |
T |
 |
| Q |
265 |
tacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aa |
363 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||| || |
|
|
| T |
21718438 |
tacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatccatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatac-aataattgaaa |
21718536 |
T |
 |
| Q |
364 |
aattgcaataagtgattatgatgaattctaa |
394 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
21718537 |
aattgcaataa-tgattatattgaattctaa |
21718566 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 60 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 22403351 - 22403010
Alignment:
| Q |
60 |
aaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaa |
159 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
22403351 |
aaatcatgaatcatgaa-acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacaacagttaatcatgaaacttatcacaattcatcaa |
22403253 |
T |
 |
| Q |
160 |
caacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccat |
257 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||| |
|
|
| T |
22403252 |
caacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttt-catacactttgaacatgtaattcaactaaca-caatttaattattcat |
22403155 |
T |
 |
| Q |
258 |
aacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaata |
357 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22403154 |
aacttcatacatctagacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaata |
22403055 |
T |
 |
| Q |
358 |
attgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22403054 |
attgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
22403010 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 19 - 400
Target Start/End: Original strand, 41212033 - 41212415
Alignment:
| Q |
19 |
attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccact---taac |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||| | ||||| ||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||| |
|
|
| T |
41212033 |
attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaac |
41212132 |
T |
 |
| Q |
116 |
aacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcata |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
41212133 |
aacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacagtgcataattcactaattgagcatatttt-tacacatacccatttttcata |
41212231 |
T |
 |
| Q |
216 |
ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaa |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
41212232 |
ctttgaacatacagttcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacctctaaacaggtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaa |
41212331 |
T |
 |
| Q |
316 |
caattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccct |
400 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41212332 |
caattaatcaattcatccaattaaacacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaaccccct |
41212415 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 115 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 9784248 - 9783964
Alignment:
| Q |
115 |
caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcat |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | | || |||| |
|
|
| T |
9784248 |
caacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaatt---caacaacaaagcataattcaccaattaagcatattttcaacatataccaacttctcat |
9784152 |
T |
 |
| Q |
215 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatga |
314 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
9784151 |
actttgaacatgtaattcaatcaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcacttatga |
9784052 |
T |
 |
| Q |
315 |
acaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9784051 |
acaatttatcaattcacccaattaagcacttttcataccaataattgaaaattgcagtaagtgattatgatgaattctaaccccctta |
9783964 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 27330035 - 27329666
Alignment:
| Q |
19 |
attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac |
118 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
27330035 |
attttcaccaaaccaacaacaacaacttatttg---acaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaac |
27329939 |
T |
 |
| Q |
119 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccattttt--catac |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||| |||| ||||| |
|
|
| T |
27329938 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttc-acata-acccacttttcacatac |
27329841 |
T |
 |
| Q |
217 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaac |
316 |
Q |
| |
|
||||| |||| | || || |||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
27329840 |
tttgatcatgaagtttcaccaacaacaattcaattat-cataacttcatatatacaaacatgtcatcataattggagcacgaattct----------aac |
27329752 |
T |
 |
| Q |
317 |
aattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||| ||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27329751 |
aattaatcaatt-acacaattaaacacttattcatac-cataattgaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
27329666 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 222 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 35522432 - 35522252
Alignment:
| Q |
222 |
acatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaatta |
321 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35522432 |
acatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaatta |
35522333 |
T |
 |
| Q |
322 |
atcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
35522332 |
atcaattcacccaattaagcccttttcatacaaataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaactccctta |
35522252 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 51627947 - 51627563
Alignment:
| Q |
19 |
attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac |
118 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||||||| | ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| |||| |
|
|
| T |
51627947 |
atttttaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacagcaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacatcatcacttagcaac |
51627848 |
T |
 |
| Q |
119 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattc-accaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatac |
216 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
51627847 |
aacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaccatatcataattcaaccaattgaacata-tttcaacatata-ccattttctcatac |
51627750 |
T |
 |
| Q |
217 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaac |
316 |
Q |
| |
|
|||||||||| | || |||||||||||||||||| || | || ||||| ||| || ||| |||||||||| |||||| |||| || | |||||||| |
|
|
| T |
51627749 |
tttgaacatgaagtttcactaacaacaattcaatcatcaacaaattcatgcattcaagcatatcatcataattggagcacaaattctaacgattatgaac |
51627650 |
T |
 |
| Q |
317 |
aattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgca--ataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| | ||||||||||||| |||| | || |||||||| || || | || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51627649 |
aaataatcaattact-caattaagcacttattcatgc-aacaattgaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaaccccctta |
51627563 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 345
Target Start/End: Original strand, 20177134 - 20177464
Alignment:
| Q |
14 |
tcaccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccactta |
113 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||| ||||||||| | ||||| |||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||| | |||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
20177134 |
tcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcttcaacaaatcatgaattatgaatatccaagccatgaatcatcatcaacaacatcactta |
20177233 |
T |
 |
| Q |
114 |
acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttc |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| | ||| ||| ||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||||| ||| || |
|
|
| T |
20177234 |
gcaacaacaacatcaattgaacttgacttttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctc |
20177332 |
T |
 |
| Q |
213 |
atactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttat |
312 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || | |||||| | ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||| |
|
|
| T |
20177333 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcgtgcattaaaacatatcatcataattggagcacgaattctaacaattat |
20177432 |
T |
 |
| Q |
313 |
gaacaattaatcaattaatccaattaagcactt |
345 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
20177433 |
gaacaattaatcaattact-caattaagcactt |
20177464 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Original strand, 21859974 - 21860145
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| Q |
18 |
cattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaa |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || | |||||| || | ||| ||||| |
|
|
| T |
21859974 |
cattttcaccaaaccaacaacaacaattcatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaacccgagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaa |
21860073 |
T |
 |
| Q |
118 |
caacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21860074 |
caacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
21860145 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 35522601 - 35522432
Alignment:
| Q |
19 |
attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||| | ||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||| |
|
|
| T |
35522601 |
attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacgtatcaac |
35522503 |
T |
 |
| Q |
119 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35522502 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcata |
35522432 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 118 - 402
Target Start/End: Original strand, 16645975 - 16646261
Alignment:
| Q |
118 |
caacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatac |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||| | ||||| ||| ||| || ||||| ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
16645975 |
caacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattaatcaatttgagaataatt-caacatatatcactttctcatac |
16646073 |
T |
 |
| Q |
217 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaac |
316 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| || |||| ||||| ||| || | |||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||| |
|
|
| T |
16646074 |
tttgaacatgaaattttaccaacatcaattaaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaac |
16646173 |
T |
 |
| Q |
317 |
aattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaatt---gcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || || ||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16646174 |
aattaatcaattact-caattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaaccccctta |
16646261 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 116 - 402
Target Start/End: Original strand, 16656699 - 16656987
Alignment:
| Q |
116 |
aacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcat |
214 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| || ||||| ||||| ||| |||| |
|
|
| T |
16656699 |
aacaacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattgatcaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcat |
16656797 |
T |
 |
| Q |
215 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatga |
314 |
Q |
| |
|
|||||||||| | | || || |||||||||||||| || | ||||| || ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||| |
|
|
| T |
16656798 |
actttgaacacgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatga |
16656897 |
T |
 |
| Q |
315 |
acaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaatt---gcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || || ||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16656898 |
acaattaatcaattact-caattaagcacttattcatac-aacaattgaaaattaacactaaaaatgattatgatgaattctaaccccctta |
16656987 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 189
Target Start/End: Original strand, 22366981 - 22367152
Alignment:
| Q |
17 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| || | |||||| || | ||| |||| |
|
|
| T |
22366981 |
ccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaatatgactaaaca |
22367080 |
T |
 |
| Q |
117 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22367081 |
acaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcat-attcaccaattgagcata |
22367152 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15861717 - 15861547
Alignment:
| Q |
17 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| || | |||||| || | ||| |||| |
|
|
| T |
15861717 |
ccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgcatcatcatcaacaatatgactaaaca |
15861618 |
T |
 |
| Q |
117 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15861617 |
--aacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
15861547 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 261 - 402
Target Start/End: Original strand, 19603303 - 19603444
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ttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataat |
359 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || |||||| |
|
|
| T |
19603303 |
ttcatacattcaaacataacatcataattggagcacgaattttaacaattatgaacaattaatcaattact-caattaagcacttattcatac-aataat |
19603400 |
T |
 |
| Q |
360 |
tgaaaa-ttgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
19603401 |
tgaaaatttgcactaaatgattatgatgaattctagccccctta |
19603444 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 22143636 - 22143264
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caaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacat |
126 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| ||||| | || ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||| || | |||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
22143636 |
caaaccaacaacaacaatcgatttctcatcatcaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcagcaacaacat |
22143537 |
T |
 |
| Q |
127 |
ccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacat |
225 |
Q |
| |
|
| ||||| |||| || |||| |||| | |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || || | || | || | |||||||||||||| |
|
|
| T |
22143536 |
caattgagcatggttctcatcataattcaacaacaacatagcataattcaaccatttgagcataatt-cataagttaacatttatacatactttgaacat |
22143438 |
T |
 |
| Q |
226 |
gtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatca |
325 |
Q |
| |
|
| || | || |||||||||||||| || || ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
22143437 |
gcaaattcaccaacaacaattcaattatcacaaatttcatgcatacaaacacatcatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatca |
22143338 |
T |
 |
| Q |
326 |
attaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaa-ttgcaataag-tgattatgatgaattctaacccc |
398 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22143337 |
ttta-tccaattaagcacttattcatacaa-taattgaaaaattacactaaaatgattatgatgaattctaacccc |
22143264 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 44035266 - 44035092
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| Q |
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tcaccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccactta |
113 |
Q |
| |
|
|||||| || ||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | | | |||||| | | ||| | |
|
|
| T |
44035266 |
tcaccaattgcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaactcaagccatta-tcatcatcaactatatgactaa |
44035168 |
T |
 |
| Q |
114 |
acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
44035167 |
acaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaaatgagcata |
44035092 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 261 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 22829466 - 22829325
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| Q |
261 |
ttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataat |
359 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||| ||| |
|
|
| T |
22829466 |
ttcatacattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaataattaatcaattactc-aattaagcacttattcatacaac-aat |
22829369 |
T |
 |
| Q |
360 |
tgaaaa-ttgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22829368 |
tgaaaaattgcactaaatgattatgatgaattctaaccccctta |
22829325 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 13377128 - 13376966
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tcaccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccactta |
113 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||| | |||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
13377128 |
tcaccaatttcacaaaaccgccaacaacaattcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatactcaagccatgaatcaacatcaacaacatcactta |
13377029 |
T |
 |
| Q |
114 |
acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca |
176 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||| | | || |||| | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13377028 |
gcaacaacaacatcaattgagcatgactttcaccataattcaacaacaacataacataattca |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 59 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 9784343 - 9784237
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158 |
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| |
|
||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||| || || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
9784343 |
caaatcatgaatcatgcaagcccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcttgaaacttatcacaattcaaca |
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T |
 |
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acaacat |
165 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
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acaacat |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 402
Target Start/End: Original strand, 17608951 - 17609276
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78 |
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177 |
Q |
| |
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| T |
17608951 |
acccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttaacaacaacaacaacaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaa |
17609050 |
T |
 |
| Q |
178 |
caatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaaca |
276 |
Q |
| |
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| T |
17609051 |
catttagagcata-attcaacatataacactttcatatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaatccaattatcaccaatttcatgcattcaaata |
17609149 |
T |
 |
| Q |
277 |
tgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataa |
374 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||| || ||| |
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| T |
17609150 |
tatcatcataattagagcacgaattctaacaactatgatcaactaatcacttact-caattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaa |
17609247 |
T |
 |
| Q |
375 |
gtgattatga-tgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17609248 |
atgattatgattgaattctaaccccctta |
17609276 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
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Target Start/End: Complemental strand, 37234084 - 37233759
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78 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
177 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| | || ||| || | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||| | | |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
37234084 |
acccaagtcatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaaccacaacatagcataattcaa |
37233985 |
T |
 |
| Q |
178 |
caatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaaca |
276 |
Q |
| |
|
|| || ||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| ||||| |
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|
| T |
37233984 |
catttagagcata-attcaacatatatcactttcatatactttgaacatgcaattttaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaaca |
37233886 |
T |
 |
| Q |
277 |
tgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataa |
374 |
Q |
| |
|
| |||||||| || |||||||||| || || ||| |||||||| ||| ||| | ||||||||||||| | | || |||||||| |||||| || ||| |
|
|
| T |
37233885 |
tatcatcataactaaagcacgaattctaacaactattaacaattactcacttact-caattaagcacttaataatac-aataattgaaaaattacactaa |
37233788 |
T |
 |
| Q |
375 |
gtgattatga-tgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37233787 |
atgattatgattgaattctaaccccctta |
37233759 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 261 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 20955480 - 20955339
Alignment:
| Q |
261 |
ttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataat |
359 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| || || ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||| || || ||| |
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|
| T |
20955480 |
ttcatacattcaaacataacatcataattggagcacaaattctaacaattatgaacaattaatcatttact-caattaagcacttattcatac-aacaat |
20955383 |
T |
 |
| Q |
360 |
tgaaaa-ttgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
20955382 |
tgaaaatttgcactaaatgattatgatgaattataaccccctta |
20955339 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 345
Target Start/End: Original strand, 21194987 - 21195303
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| Q |
28 |
aaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatc |
127 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| | ||||| | || ||||| |||| | ||| | ||||||||||||||| | || ||| || | | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21194987 |
aaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatt |
21195086 |
T |
 |
| Q |
128 |
cattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatg |
226 |
Q |
| |
|
||| | ||||| || ||||||||| | ||||||| || || |||||| ||||| ||||||| || || | ||||| ||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
21195087 |
aattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacctagcacaattcaacaatttgagcataatt-cacaatatatcattttcacatactatgaacata |
21195185 |
T |
 |
| Q |
227 |
taattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaa |
326 |
Q |
| |
|
|||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
21195186 |
caatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcac |
21195285 |
T |
 |
| Q |
327 |
ttaatccaattaagcactt |
345 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
21195286 |
tt-attcaattaagcactt |
21195303 |
T |
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Target: chr1; HSP #27
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Target Start/End: Complemental strand, 13376951 - 13376757
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210 |
ttcatactttgaacatgtaatt-caactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcat |
308 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| ||| || | |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| | | ||||| |
|
|
| T |
13376951 |
ttcatactttgaacatgaaatttcaacga-caacaatttaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgattctcatcat |
13376853 |
T |
 |
| Q |
309 |
ttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaat-aagtgattatga-tgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| || |||||||| |||||| || | || ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13376852 |
ctatgaacaattaatcaattact-aaattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaaccccctta |
13376757 |
T |
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Target: chr1; HSP #28
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Query Start/End: Original strand, 280 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 36356315 - 36356191
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| Q |
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catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaatt---gcaataag |
375 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| || || | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || || ||||||||||| | | || |
|
|
| T |
36356315 |
catcataataggagcacgaattctaacaatcatgaacaattaatcaattact-caattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaa |
36356218 |
T |
 |
| Q |
376 |
tgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36356217 |
tgattatgatgaattctaaccccctta |
36356191 |
T |
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Target: chr1; HSP #29
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Target Start/End: Complemental strand, 5768361 - 5768289
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| Q |
110 |
cttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
5768361 |
cttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaattaacaacaacataacacaattcaacaatt |
5768289 |
T |
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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
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Target Start/End: Original strand, 27674801 - 27674881
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| Q |
60 |
aaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaa |
140 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||| ||| | ||||| |||||| |
|
|
| T |
27674801 |
aaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcaataacaacatcacttaacaacaactacaccaattgaacatgaa |
27674881 |
T |
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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
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Target Start/End: Complemental strand, 36356537 - 36356455
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| Q |
58 |
acaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaa |
140 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||| | ||||||||||| ||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
36356537 |
acaaatcatgaattatgaacacccaagccataaatcatcatcaacaacatcacttagaaacaacaacatcaattgaacatgaa |
36356455 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #32
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Query Start/End: Original strand, 373 - 402
Target Start/End: Original strand, 20346342 - 20346371
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| Q |
373 |
aagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20346342 |
aagtgattatgatgaattctaaccccctta |
20346371 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 345
Target Start/End: Original strand, 27675021 - 27675085
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| Q |
280 |
catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt |
345 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| || || | |||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
27675021 |
catcataattggagcacgaattctaacagtcatgaacaaataatcaattact-caattaagcactt |
27675085 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 41229227 - 41229102
Alignment:
| Q |
14 |
tcaccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccactta |
113 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||| | ||||||||| | ||||| | | |||||| |||||| ||| | || |||||||||||| | | ||| |||| |||||| |
|
|
| T |
41229227 |
tcaccaattttaccaaactaccaacaacaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaacactcaagccatgaatcattaacaacaacatcactta |
41229128 |
T |
 |
| Q |
114 |
acaacaacaacatccattgatcatga |
139 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
41229127 |
gcaacaacaacatcaattgaacatga |
41229102 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #35
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Query Start/End: Original strand, 72 - 231
Target Start/End: Original strand, 20445697 - 20445856
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| Q |
72 |
atgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacata |
171 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| | | || | | |||| || |||||| | | |||||| |||||||| ||| | || ||||||| | ||||||| || || | |
|
|
| T |
20445697 |
atgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaa |
20445796 |
T |
 |
| Q |
172 |
attcaccaattgagca-tattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaatt |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| ||| |||| || ||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
20445797 |
attcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctac-ttgaacatgtaatt |
20445856 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 72 - 231
Target Start/End: Original strand, 20531462 - 20531621
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| Q |
72 |
atgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacata |
171 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| | | || | | |||| || |||||| | | |||||| |||||||| ||| | || ||||||| | ||||||| || || | |
|
|
| T |
20531462 |
atgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaa |
20531561 |
T |
 |
| Q |
172 |
attcaccaattgagca-tattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaatt |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| ||| |||| || ||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
20531562 |
attcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctac-ttgaacatgtaatt |
20531621 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 22829691 - 22829583
Alignment:
| Q |
35 |
caacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgat |
134 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || | || | ||||||||||||| ||||| || || |
|
|
| T |
22829691 |
caacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcaatagaaaaatcacttaacaacaattacatcaatggaa |
22829592 |
T |
 |
| Q |
135 |
catgaaact |
143 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
22829591 |
catgaaact |
22829583 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 18 - 402
Target Start/End: Original strand, 3894988 - 3895371
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18 |
cattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaa |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
3894988 |
cattttcaccaaaccaacaacaacaacttattttacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaa |
3895087 |
T |
 |
| Q |
118 |
caacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatact |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
3895088 |
caacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatact |
3895187 |
T |
 |
| Q |
218 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaaca |
317 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
3895188 |
ttgaacatgcaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatttcatcagaattagagcatgaatttcatcaattatgaaca |
3895287 |
T |
 |
| Q |
318 |
attaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3895288 |
attaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaaccccctta |
3895371 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 19 - 402
Target Start/End: Original strand, 11287381 - 11287763
Alignment:
| Q |
19 |
attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac |
118 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||| |
|
|
| T |
11287381 |
attttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaac |
11287480 |
T |
 |
| Q |
119 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactt |
218 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || |||||||| |
|
|
| T |
11287481 |
aacaacatcaactgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
11287580 |
T |
 |
| Q |
219 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaa |
318 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
11287581 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcaacataatcagagcactaatttcatcatttatgaacaa |
11287680 |
T |
 |
| Q |
319 |
ttaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11287681 |
ttaatcaattcacccaattaaacacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaaccccctta |
11287763 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 17 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 26070549 - 26070169
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116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||| |||||| || |
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|
| T |
26070549 |
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26070450 |
T |
 |
| Q |
117 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcata |
215 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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acaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacataacataattcaccaattaagcatattttcaacatata-ccattttctcata |
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T |
 |
| Q |
216 |
ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaa |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
26070350 |
ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaa |
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T |
 |
| Q |
316 |
caattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccc |
398 |
Q |
| |
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|
|
| T |
26070250 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
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Target Start/End: Complemental strand, 26094336 - 26093956
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116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||| |||||| || |
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T |
 |
| Q |
117 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcata |
215 |
Q |
| |
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|
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T |
 |
| Q |
216 |
ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaa |
315 |
Q |
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| T |
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ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaa |
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T |
 |
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caattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccc |
398 |
Q |
| |
|
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|
|
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26094037 |
caattaatcaatt-acacaattaagcacttattcatac-cataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
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Target Start/End: Complemental strand, 12370125 - 12369740
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116 |
Q |
| |
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||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | || | |||| |||||| || |
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ccattttcaccaaaccaacaactacaacttatttctcaataacaaatcatgaatcatgcatacctaagccatgaataattatgcacaacatcacttagca |
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T |
 |
| Q |
117 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac |
216 |
Q |
| |
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acaacaacatcaattaatcatgaaagttatcacaattcaacaacaacaaggcataattcaccaattgagcatattttcaacagatacccatttttcatac |
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T |
 |
| Q |
217 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaac |
316 |
Q |
| |
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| T |
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tttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatccgtaacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttaatcatttatgaac |
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T |
 |
| Q |
317 |
aattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 58 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 45452410 - 45452068
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157 |
Q |
| |
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|
| T |
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45452311 |
T |
 |
| Q |
158 |
aacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccat |
257 |
Q |
| |
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|
| T |
45452310 |
aacaacatagcatg--tcacaaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaatccaattatccat |
45452213 |
T |
 |
| Q |
258 |
aacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaata |
357 |
Q |
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| T |
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aacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaata |
45452113 |
T |
 |
| Q |
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attgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
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Target: chr7; HSP #7
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Query Start/End: Original strand, 58 - 402
Target Start/End: Original strand, 12758990 - 12759335
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157 |
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| |
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|
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T |
 |
| Q |
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aacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccat |
257 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
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258 |
aacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaata |
357 |
Q |
| |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
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attg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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attgaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
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Target: chr7; HSP #8
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Target Start/End: Complemental strand, 15822712 - 15822332
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|
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|
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T |
 |
| Q |
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caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac--tt |
218 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |
|
|
| T |
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caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccatttgagcatattttcaacatata-ccatttt-catacattt |
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T |
 |
| Q |
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tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaa |
318 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaa-catgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaa |
15822416 |
T |
 |
| Q |
319 |
ttaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
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Target Start/End: Original strand, 143651 - 143986
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|
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|
|
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T |
 |
| Q |
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caacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccat |
257 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |
|
|
| T |
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caacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttt-catacactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattatttat |
143841 |
T |
 |
| Q |
258 |
aacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaata |
357 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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aacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcactttttatacaaata |
143941 |
T |
 |
| Q |
358 |
attgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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attgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
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T |
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Target: chr7; HSP #10
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| |
|
||||||| ||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||| | |||| |||||| |||| |
|
|
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T |
 |
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aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatac |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||| |
|
|
| T |
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12248206 |
T |
 |
| Q |
217 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaac |
316 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
12248205 |
tttaaacatgaaattcaactaataacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaac |
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T |
 |
| Q |
317 |
aattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aagtaatcaatt-atccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaatatatgattatgatgaattctaaccccctta |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
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| |
|
|||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||| || | |||||||||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
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caacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccat |
257 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |
|
|
| T |
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caacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttt-catacactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcat |
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T |
 |
| Q |
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aacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaata |
357 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
358 |
attg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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attgaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
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Target Start/End: Original strand, 44865233 - 44865577
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| |
|
|||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||| || |
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|
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T |
 |
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caacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctc |
254 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |
|
|
| T |
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caacaaaaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttt-catacactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatt |
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T |
 |
| Q |
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cataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaa |
354 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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cataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaa |
44865530 |
T |
 |
| Q |
355 |
ataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
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| |
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||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
44865531 |
ataattgaaaattacaataagtgattatgatgaa-tctaaccccctta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
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Query Start/End: Original strand, 28 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 7284333 - 7283961
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128 |
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227 |
Q |
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T |
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327 |
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T |
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T |
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T |
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315 |
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T |
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T |
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T |
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251 |
Q |
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T |
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350 |
Q |
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T |
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Q |
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Q |
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T |
 |
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251 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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350 |
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| T |
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T |
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T |
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Q |
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T |
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316 |
Q |
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T |
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T |
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Q |
| |
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T |
 |
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Q |
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402 |
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T |
 |
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252 |
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T |
 |
| Q |
253 |
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351 |
Q |
| |
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||||| ||||||| | |||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||| |||||| |||| |
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T |
 |
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| |
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T |
 |
| Q |
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Q |
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T |
 |
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402 |
Q |
| |
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T |
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atgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcata |
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Q |
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T |
 |
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Q |
| |
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T |
 |
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ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaa |
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Q |
| |
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T |
 |
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caattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaatt---gcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
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Q |
| |
|
||||||||| |||| | |||| || ||||| |||| || || ||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||| |
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|
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caattaatcgattact-caatgaatcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaaccccctta |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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|
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116 |
aacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2190380 |
aacatcaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
2190307 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 42056583 - 42056410
Alignment:
| Q |
17 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaa-ttatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaac |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |
|
|
| T |
42056583 |
ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataatatcacttaac |
42056484 |
T |
 |
| Q |
116 |
aacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42056483 |
aacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
42056410 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 32494339 - 32494167
Alignment:
| Q |
17 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | | ||| |||| |
|
|
| T |
32494339 |
ccattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacacaagccatgaattatcatcaatcatatgactaaaca |
32494240 |
T |
 |
| Q |
117 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32494239 |
acaacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
32494167 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 111560 - 111390
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| Q |
18 |
cattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaa |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||| ||||| |
|
|
| T |
111560 |
cattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaatt-tgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaa |
111462 |
T |
 |
| Q |
118 |
caacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
111461 |
caacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
111390 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 17224226 - 17223896
Alignment:
| Q |
14 |
tcaccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccactta |
113 |
Q |
| |
|
|||||| ||| || |||||| ||||||||| | ||||| | |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | ||| || |||| |||||| |
|
|
| T |
17224226 |
tcaccaattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcattaacaacatcactta |
17224127 |
T |
 |
| Q |
114 |
acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttc |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| | |||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||| || |
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|
| T |
17224126 |
gcaacaacaacatcaattgaacatgactcttacaacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagtata-attcaacatatatcactttctc |
17224028 |
T |
 |
| Q |
213 |
atactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttat |
312 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||| |||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| || || | | |
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|
| T |
17224027 |
atactttgaacatgaaatttcacaaacaacaattcaattatccacaacttcgtgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattataacaacttt |
17223928 |
T |
 |
| Q |
313 |
gaacaattaatcaattaatccaattaagcactt |
345 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
17223927 |
gaacaattaattatttact-caattaagcactt |
17223896 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 189
Target Start/End: Original strand, 126377 - 126549
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| Q |
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ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca |
116 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || | |||||| | | ||| |||| |
|
|
| T |
126377 |
ccattttctccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacagtatgactaaaca |
126476 |
T |
 |
| Q |
117 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
126477 |
acaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
126549 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 78 - 402
Target Start/End: Original strand, 48356667 - 48356992
Alignment:
| Q |
78 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
177 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | || ||| || | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || |||| |||| | ||||||||||||| |||||| |
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|
| T |
48356667 |
acccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacataacacaattcaa |
48356766 |
T |
 |
| Q |
178 |
caatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaaca |
276 |
Q |
| |
|
|| || ||||||| ||||||| ||| | ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
48356767 |
catttagagcata-attcaacatataacactttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaaca |
48356865 |
T |
 |
| Q |
277 |
tgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaataag |
375 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||| | |||||||||| || ||| |||| ||| |||||| || ||| |
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|
| T |
48356866 |
tatcatcataattagagcacaaattttaacaactatgaacaattaatcacttact-caattaagcatttaatcatacaacgaatgaaaaattacactaaa |
48356964 |
T |
 |
| Q |
376 |
tgattatga-tgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48356965 |
tgattatgattgaattctaaccccctta |
48356992 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 78 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16915152 - 16914886
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| Q |
78 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
177 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | || ||| || | ||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || |||| |||| | |||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
16915152 |
acccaagccatgaatcatcaacaacaatatgacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaa |
16915053 |
T |
 |
| Q |
178 |
caatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaaca |
276 |
Q |
| |
|
| || ||||||| || ||||| ||| | ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
16915052 |
cgtttagagcataatt-caacatataacactttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaaca |
16914954 |
T |
 |
| Q |
277 |
tgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt |
345 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
16914953 |
tatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcacttact-caattaagcactt |
16914886 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 325
Target Start/End: Original strand, 9838932 - 9839149
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| Q |
108 |
cacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatcca |
206 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || |||| |||| | |||||||||| || |||||| || || ||||||| || ||||| ||| | |
|
|
| T |
9838932 |
cacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataatt-caacatataacac |
9839030 |
T |
 |
| Q |
207 |
tttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatc |
306 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
9839031 |
tttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaac |
9839130 |
T |
 |
| Q |
307 |
atttatgaacaattaatca |
325 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
9839131 |
aactatgaacaattaatca |
9839149 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 108 - 325
Target Start/End: Original strand, 9611360 - 9611578
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| Q |
108 |
cacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattg--agcatattttcaacacatatcc |
205 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || |||| |||| | |||||||||| || |||||| || || |||||| || ||||| ||| | |
|
|
| T |
9611360 |
cacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagaagcataatt-caacatataaca |
9611458 |
T |
 |
| Q |
206 |
atttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttat |
305 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9611459 |
ctttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaa |
9611558 |
T |
 |
| Q |
306 |
catttatgaacaattaatca |
325 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
9611559 |
caactatgaacaattaatca |
9611578 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 34241297 - 34241106
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| Q |
212 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcattta |
311 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||| || |
|
|
| T |
34241297 |
catacttttaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacataacatcataattataacacgaattttatcaacta |
34241198 |
T |
 |
| Q |
312 |
tgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatga-tgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| | ||||||| ||||| ||| |||| ||| |||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34241197 |
tgaacaattaatcacttact-caattaatcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaaccccctta |
34241106 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 1937289 - 1937173
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| Q |
21 |
tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa |
120 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| || | |||||| || | ||| |||| ||| |
|
|
| T |
1937289 |
tttcacaaaaccaccaacaataatccatttctcaacaaaaaattatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaatatgactaaacatcaa |
1937190 |
T |
 |
| Q |
121 |
caacatccattgatcat |
137 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
1937189 |
caacaaccattgatcat |
1937173 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 231
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| Q |
109 |
acttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccat |
207 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| ||| | || || |||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||| | |
|
|
| T |
16919613 |
acttagcaacaacaacatcaattaaacacgattcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcata-attcaacatatatcact |
16919711 |
T |
 |
| Q |
208 |
ttttcatactttgaacatgtaatt |
231 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
16919712 |
ttctcatattttgaacatgaaatt |
16919735 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 345
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| Q |
59 |
caaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatca |
158 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| | || ||| || | | | |||||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||| | || |
|
|
| T |
31501177 |
caaatcatgactcatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcataacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaaca |
31501276 |
T |
 |
| Q |
159 |
acaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccat |
257 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||| ||| |||||||| | |||| | ||||| ||| |||||| |||||||| |||| || || ||||||||||| || |
|
|
| T |
31501277 |
acaacatagcacaattcaacaatttgagcat-tattcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaataacaattcaattatcacc |
31501375 |
T |
 |
| Q |
258 |
aacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt |
345 |
Q |
| |
|
|| ||||| || ||||||| | ||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| |||||| || || ||||||||||||| |
|
|
| T |
31501376 |
aatttcatgtatttaaacatatcttcataattagatcactaatttcatcaactatgaacaaataatcactt-attcaattaagcactt |
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T |
 |
Back To:
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Target: chr7; HSP #38
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212 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcattta |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||| || | || ||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||| | || || |
|
|
| T |
14271989 |
catactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattgaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaatttga-caacta |
14271891 |
T |
 |
| Q |
312 |
tgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaa |
365 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
14271890 |
tgaacaattaatcatttact-caattaagcacttattcatac-aataattgaaaa |
14271838 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #39
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37 |
acaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatca |
136 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| | || ||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| | || ||| || | | |||||||||||||||||| ||| | || |
|
|
| T |
4484709 |
acaacaacttatttctcatcatcaaatcatgattcatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaaca |
4484808 |
T |
 |
| Q |
137 |
tgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt |
182 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||| | |||||| ||| || |||||| ||||| |
|
|
| T |
4484809 |
tgattctcatcacaattcaacaacaatatagcacaattcaacaatt |
4484854 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 9724031 - 9723927
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78 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
177 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| | || |||||| | | |||||||||||||||||| ||| | |||||| || ||||||| | | |||||||||| || |||||| |
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|
| T |
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acccaagctatgaatcatcaacaataatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaa |
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T |
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caatt |
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Q |
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9723931 |
caatt |
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T |
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Target: chr7; HSP #41
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Target Start/End: Complemental strand, 20583821 - 20583674
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20583722 |
T |
 |
| Q |
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catgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt |
182 |
Q |
| |
|
||||| || |||| |||| | |||||||||| || |||||| ||||| |
|
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20583721 |
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T |
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Target: chr7; HSP #42
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Q |
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T |
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Target: chr7; HSP #43
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182 |
Q |
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cttaacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaatt |
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T |
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Target: chr3 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 75)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
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Q |
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T |
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aacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcata |
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Q |
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| T |
17100714 |
aacaataacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatgtttcata |
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T |
 |
| Q |
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315 |
Q |
| |
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| T |
17100814 |
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17100913 |
T |
 |
| Q |
316 |
caattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
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| T |
17100914 |
caattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaa-aattgaaaatagcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
17100999 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
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Target Start/End: Original strand, 17101299 - 17101684
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ccattttcaccaaaccagcaa-caacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaac |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |
|
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| T |
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ccattttcaccaaaccaacattcaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaac |
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T |
 |
| Q |
116 |
aacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcata |
215 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |
|
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| T |
17101399 |
aacaataacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatgtttcata |
17101498 |
T |
 |
| Q |
216 |
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315 |
Q |
| |
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|
| T |
17101499 |
ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgga |
17101598 |
T |
 |
| Q |
316 |
caattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17101599 |
caattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaa-aattgaaaatagcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
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T |
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Target: chr3; HSP #3
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Target Start/End: Original strand, 54423975 - 54424359
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116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||| |||||| || |
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|
| T |
54423975 |
ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcat-aacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacgtcacttagca |
54424073 |
T |
 |
| Q |
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acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac |
216 |
Q |
| |
|
| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
54424074 |
ataacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatcaatttctcatac |
54424173 |
T |
 |
| Q |
217 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaac |
316 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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tttgaacatgtaattcaactaaccacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatggcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaac |
54424273 |
T |
 |
| Q |
317 |
aattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54424274 |
aattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgaaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
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T |
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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
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Target Start/End: Complemental strand, 50112288 - 50111951
Alignment:
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164 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
50112288 |
atgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaca |
50112189 |
T |
 |
| Q |
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taacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttca |
264 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
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50112089 |
T |
 |
| Q |
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364 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
50112088 |
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50111989 |
T |
 |
| Q |
365 |
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402 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50111988 |
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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
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Target Start/End: Complemental strand, 12349828 - 12349439
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| | |||| || |
|
|
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ccattttcac-aaaccaaaaacaacaacttatttctcatcatcaaattatgaatcatgcaaaccatggccaagccatgatttatcatctacaacatgaca |
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T |
 |
| Q |
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taacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccattttt |
211 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || | |
|
|
| T |
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tatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataacaacttct |
12349630 |
T |
 |
| Q |
212 |
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311 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
12349629 |
cacactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataaatttatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcattta |
12349530 |
T |
 |
| Q |
312 |
tgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12349529 |
tggacaattaattaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
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T |
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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
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Target Start/End: Original strand, 14295402 - 14295785
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Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||| |
|
|
| T |
14295402 |
attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagaaac |
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T |
 |
| Q |
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aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatac |
216 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
14295502 |
aacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacatata-ccattttctcatac |
14295600 |
T |
 |
| Q |
217 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaac |
316 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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tttgaacatgaatttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaac |
14295700 |
T |
 |
| Q |
317 |
aattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
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|||||||||||| | ||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aattaatcaattcacccattttagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaaccccctta |
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T |
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Target: chr3; HSP #7
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Q |
| |
|
|||||||||||| |||| || |||||||| | ||||| |||||||| | |||| || || || |||||||||||||| |||||| |||| ||| | |
|
|
| T |
317796 |
tcaccattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctccacaacaaaccaagaattatacaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaa |
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T |
 |
| Q |
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acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttca |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
317696 |
acaacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaatttagcatattttca-cacatacccatttttca |
317598 |
T |
 |
| Q |
214 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatg |
313 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |
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|
| T |
317597 |
tactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcatacttagagcacgaatttcatcacttatg |
317498 |
T |
 |
| Q |
314 |
aacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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317497 |
aacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaaccccctta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
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Target Start/End: Complemental strand, 22144553 - 22144172
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Q |
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|
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tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgtattatcatcaacaacatggcttaacaacaa |
22144454 |
T |
 |
| Q |
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caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac--tt |
218 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |
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| T |
22144453 |
caacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcatacttcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttt-catacactt |
22144355 |
T |
 |
| Q |
219 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaa |
318 |
Q |
| |
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| T |
22144354 |
tgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcagttatgaacag |
22144256 |
T |
 |
| Q |
319 |
ttaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
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| T |
22144255 |
ttaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaaaaagtgattatgatgaattctaaccccctta |
22144172 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 402
Target Start/End: Original strand, 14298386 - 14298768
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| |
|
|||||||||||| || |||||||| | ||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| || || || |
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| T |
14298386 |
attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatattaat |
14298484 |
T |
 |
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119 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactt |
218 |
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| |
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|
| T |
14298485 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcgacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacgtaaccatatcatacactt |
14298584 |
T |
 |
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219 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaa |
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Q |
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| T |
14298585 |
tgaacatgtaattcaactaaccacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaa |
14298684 |
T |
 |
| Q |
319 |
ttaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
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|||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14298685 |
ttaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaaccccctta |
14298768 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 402
Target Start/End: Original strand, 14304013 - 14304395
Alignment:
| Q |
19 |
attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||| | ||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| || || || |
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| T |
14304013 |
attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatattaat |
14304111 |
T |
 |
| Q |
119 |
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218 |
Q |
| |
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| T |
14304112 |
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14304211 |
T |
 |
| Q |
219 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaa |
318 |
Q |
| |
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| T |
14304212 |
tgaacatgtaattcaactaaccacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaa |
14304311 |
T |
 |
| Q |
319 |
ttaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14304312 |
ttaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaaccccctta |
14304395 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 16996346 - 16995961
Alignment:
| Q |
14 |
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113 |
Q |
| |
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|
| T |
16996346 |
tcaccattttcatcaaaacaccaaca-caactcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaa |
16996248 |
T |
 |
| Q |
114 |
acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttca |
213 |
Q |
| |
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|
|
| T |
16996247 |
acaacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccatttttca |
16996149 |
T |
 |
| Q |
214 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatg |
313 |
Q |
| |
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| T |
16996148 |
tactttgaacatacaattcaagtaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcaccacttatg |
16996049 |
T |
 |
| Q |
314 |
aacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
16996048 |
aataattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaaccccctta |
16995961 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 19261121 - 19260839
Alignment:
| Q |
17 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca |
116 |
Q |
| |
|
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| T |
19261121 |
ccattttcaccaaactaacaacaac---ttatttcataacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacattcataacatcatttaaca |
19261025 |
T |
 |
| Q |
117 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac |
216 |
Q |
| |
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|
| T |
19261024 |
acaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacttagtataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatac |
19260925 |
T |
 |
| Q |
217 |
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302 |
Q |
| |
|
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|
| T |
19260924 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatatcatcataattagagcacgaattt |
19260839 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 60 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 6154572 - 6154231
Alignment:
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159 |
Q |
| |
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| T |
6154572 |
aaattatgaatcatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaataacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaa |
6154474 |
T |
 |
| Q |
160 |
caacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcata--ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccat |
257 |
Q |
| |
|
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|
| T |
6154473 |
taacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttt-cataaactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaactattcat |
6154376 |
T |
 |
| Q |
258 |
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357 |
Q |
| |
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| T |
6154375 |
aatttcatacatctaaacatgtcattataattagaggacgaatttcatgacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatagaaata |
6154276 |
T |
 |
| Q |
358 |
attgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6154275 |
attgaaaattataataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
6154231 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 402
Target Start/End: Original strand, 14301029 - 14301412
Alignment:
| Q |
19 |
attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| | |||||| |||| |||||| ||| |
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|
| T |
14301029 |
attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaacatgaatcatgcaaaccaaagacatgaataatcatcaacaacatcacttagaaac |
14301128 |
T |
 |
| Q |
119 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatac |
216 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
14301129 |
aacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacatata-ccattttctcatac |
14301227 |
T |
 |
| Q |
217 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaac |
316 |
Q |
| |
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| T |
14301228 |
tttgaacatgaatttcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaac |
14301327 |
T |
 |
| Q |
317 |
aattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
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|
| T |
14301328 |
aattaatcaattcacccattttagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaaccccctta |
14301412 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 19 - 398
Target Start/End: Original strand, 35123661 - 35124038
Alignment:
| Q |
19 |
attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||| | ||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| || || |||| |
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|
| T |
35123661 |
attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaac |
35123759 |
T |
 |
| Q |
119 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatact- |
217 |
Q |
| |
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| T |
35123760 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaataacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacataccc--ttttcatacac |
35123857 |
T |
 |
| Q |
218 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaaca |
317 |
Q |
| |
|
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| T |
35123858 |
tttaacatgtaattcgactaacaacaattcaattatccataatttcatacatccaaacacgtcatcataattaaagtacgaatttcatcatttatgaaca |
35123957 |
T |
 |
| Q |
318 |
attaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccc |
398 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35123958 |
attaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaacccc |
35124038 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 66 - 402
Target Start/End: Original strand, 8631801 - 8632137
Alignment:
| Q |
66 |
tgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacat |
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Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||| || || ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
8631801 |
tgaatcatgcaaacccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatttgttatgaaacttatcacaatccaacaacaacaa |
8631900 |
T |
 |
| Q |
166 |
aacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcat |
265 |
Q |
| |
|
| |||||||||| || | ||||||||||||||| ||| | | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
8631901 |
agcataattcactaaataagcatattttcaacatataccaacttctcaaactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcat |
8632000 |
T |
 |
| Q |
266 |
acatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaa |
365 |
Q |
| |
|
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|
| T |
8632001 |
acatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcacttaagaacaattaattaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaa |
8632100 |
T |
 |
| Q |
366 |
ttgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8632101 |
ttgcaataagtgattatgatgaatcctaaccccctta |
8632137 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 17523174 - 17522790
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115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || |||||||| | ||||| |||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || | ||||| | |
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| T |
17523174 |
ccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcataaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaaaattgacttagc |
17523076 |
T |
 |
| Q |
116 |
aacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcat |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | || |
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| T |
17523075 |
aacaacaacatcaattggtcatgaaacttatcacaattcatcaataacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatata-ccattttgttat |
17522977 |
T |
 |
| Q |
215 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatga |
314 |
Q |
| |
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|
|
| T |
17522976 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccacatcttcatacatccaaaactgtcatcataattagagcacgaagttcatcatttatga |
17522877 |
T |
 |
| Q |
315 |
acaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| | |||| ||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
17522876 |
acaaataatcaattcacccaaataagcacttctcatac-aataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaaccccctta |
17522790 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 132 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 34439513 - 34439250
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Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
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34439513 |
gatcatgaaacttatcataattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttaaacacatacccattttacatactttgaacatgtaatt |
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T |
 |
| Q |
232 |
caactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatc-taaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaa |
330 |
Q |
| |
|
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| T |
34439413 |
caaccaacaacaattcatttatccataacttcatacctcataaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattca |
34439314 |
T |
 |
| Q |
331 |
tccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaa |
394 |
Q |
| |
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| T |
34439313 |
tccaattaaacacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 55441132 - 55440758
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| Q |
19 |
attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac |
118 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||| || | |
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|
| T |
55441132 |
attttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaaaaaatcatgaattatgcatacccaagtcatgaattatcatcaacaacatcacttagcatc |
55441033 |
T |
 |
| Q |
119 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatact |
217 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||| |
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|
| T |
55441032 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaaccacaacatagtataattcaaccagttgagcatattttcatcatatatcattttctcatact |
55440933 |
T |
 |
| Q |
218 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaaca |
317 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
55440932 |
ttgaacatgaaattccactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaaca |
55440833 |
T |
 |
| Q |
318 |
attaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55440832 |
attaatcaattcacccaattaagcacttattcatac-----------aattgcaataaatgattatgatgaattctaaccccctta |
55440758 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 67 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 16182180 - 16181847
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| Q |
67 |
gaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacata |
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Q |
| |
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| T |
16182180 |
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T |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
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Target Start/End: Original strand, 13817474 - 13817857
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Q |
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T |
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| Q |
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213 |
Q |
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| T |
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T |
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311 |
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T |
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402 |
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13817768 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
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Target Start/End: Complemental strand, 19570923 - 19570594
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Q |
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T |
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264 |
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T |
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364 |
Q |
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T |
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Q |
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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
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Target Start/End: Original strand, 17938584 - 17938922
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Q |
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T |
 |
| Q |
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264 |
Q |
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| T |
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17938782 |
T |
 |
| Q |
265 |
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364 |
Q |
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| T |
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17938882 |
T |
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T |
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216 |
Q |
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T |
 |
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316 |
Q |
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T |
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402 |
Q |
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T |
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Target: chr3; HSP #25
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Target Start/End: Original strand, 38527842 - 38528074
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Q |
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T |
 |
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365 |
Q |
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T |
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Q |
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T |
 |
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252 |
Q |
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T |
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Q |
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T |
 |
| Q |
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254 |
Q |
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| T |
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11329009 |
T |
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353 |
Q |
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| T |
11329008 |
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11328916 |
T |
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402 |
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Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
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Target Start/End: Complemental strand, 12560484 - 12560136
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Q |
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T |
 |
| Q |
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tatcaacaacataacataattc-accaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcc |
252 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
253 |
tccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcaca |
351 |
Q |
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| T |
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tcaataacttcaagcattcaatcataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattact-caattaagcacttattcata |
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T |
 |
| Q |
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caaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
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Q |
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T |
 |
| Q |
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acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcat |
214 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
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actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatga |
314 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
315 |
acaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
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acaaataattaatt-atccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaatta-tgattatgatgaattccaaccccctta |
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| |
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 |
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acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
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| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
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53898598 |
T |
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160 |
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257 |
Q |
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| T |
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53898500 |
T |
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317 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 12489011 - 12488684
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116 |
Q |
| |
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T |
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215 |
Q |
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T |
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315 |
Q |
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| T |
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12488713 |
T |
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316 |
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345 |
Q |
| |
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caattaattaatgact-caattaagcactt |
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T |
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Target: chr3; HSP #33
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19 |
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117 |
Q |
| |
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attttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaa |
3992612 |
T |
 |
| Q |
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Q |
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3992613 |
caacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
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T |
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Target: chr3; HSP #34
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Query Start/End: Original strand, 17 - 189
Target Start/End: Original strand, 23492335 - 23492507
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116 |
Q |
| |
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ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaactatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaaca |
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T |
 |
| Q |
117 |
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189 |
Q |
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| T |
23492435 |
acaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatccataattcaccatttgagcata |
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T |
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Target: chr3; HSP #35
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Q |
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14059360 |
T |
 |
| Q |
156 |
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254 |
Q |
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| T |
14059359 |
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14059261 |
T |
 |
| Q |
255 |
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353 |
Q |
| |
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| T |
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14059163 |
T |
 |
| Q |
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402 |
Q |
| |
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| T |
14059162 |
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T |
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Q |
| |
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T |
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| Q |
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Q |
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| T |
2844252 |
aacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaagaaccatgcataattcaccaattgagcata |
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T |
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Target: chr3; HSP #37
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Target Start/End: Original strand, 53771002 - 53771175
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ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaa-ttatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaac |
115 |
Q |
| |
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53771002 |
ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaac |
53771101 |
T |
 |
| Q |
116 |
aacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
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| T |
53771102 |
aacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
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T |
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Target: chr3; HSP #38
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Q |
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6146889 |
T |
 |
| Q |
160 |
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257 |
Q |
| |
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| T |
6146888 |
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6146791 |
T |
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| Q |
258 |
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284 |
Q |
| |
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|
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aacttcatacatctaaacatgtcatca |
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T |
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116 |
Q |
| |
|
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ccattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaaca |
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T |
 |
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Q |
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acaacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcat-gcataattcaccaattgagcata |
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T |
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Target Start/End: Original strand, 16880133 - 16880472
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Q |
| |
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|||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||| |||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||| | |||||||| |
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| T |
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16880232 |
T |
 |
| Q |
165 |
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263 |
Q |
| |
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| T |
16880233 |
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16880331 |
T |
 |
| Q |
264 |
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362 |
Q |
| |
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| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||| || || |||||| |
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| T |
16880332 |
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16880429 |
T |
 |
| Q |
363 |
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402 |
Q |
| |
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| T |
16880430 |
aaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaaccccctta |
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T |
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Q |
| |
|
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aaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaa |
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T |
 |
| Q |
160 |
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189 |
Q |
| |
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| T |
16261558 |
caaccatgcataattcaccaattgagcata |
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T |
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ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca |
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Q |
| |
|
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ccattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttcttaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaactatatgactaaaca |
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T |
 |
| Q |
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189 |
Q |
| |
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| T |
54038317 |
acaacaacaaccattaatcatgaaacatatcacatttcatcaacaaccatgcataattcaccaatttagcata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
| |
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caaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcattcatacccaagccatgaattaccatcaacaacatcacttagcaacaacaacat |
14528188 |
T |
 |
| Q |
127 |
ccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattc-accaattgagcatattttca |
195 |
Q |
| |
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|
| T |
14528187 |
caattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcatgattcaaccaattgagcatattttca |
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T |
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Q |
| |
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| T |
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aaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacccctaaaccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaaccacatc |
39656598 |
T |
 |
| Q |
128 |
cattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatg |
226 |
Q |
| |
|
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| T |
39656599 |
aattgaacatgaatcttacaacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgagcatattt-caacatatatcactttctcatactttgaacatg |
39656697 |
T |
 |
| Q |
227 |
taattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaa |
326 |
Q |
| |
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| T |
39656698 |
aaatttcactaacaacaattcaattatcaccaatttcataaattcaaacataacatcataattggagcacggattttaacaattatgaacaattaatcat |
39656797 |
T |
 |
| Q |
327 |
ttaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
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||| | ||||||||||||| |||| || || ||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |
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| T |
39656798 |
ttact-caattaagcacttattcatac-aacaattgaaaaattgcactaaatgattatgatcaattctaactccctta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
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Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |
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aaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacctaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgca |
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T |
 |
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ataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
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|||| ||||||||||||||||||||||||||| |
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|
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14528011 |
ataaatgattatgatgaattctaaccccctta |
14527980 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #46
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Q |
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| T |
17191542 |
caacaaatcatgaattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaacattacttagcaacagcaacatcaattaaacatgattcttatcacaattca |
17191641 |
T |
 |
| Q |
156 |
tcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctc |
254 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| | ||| ||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||| || || |
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|
| T |
17191642 |
gcaacaacataacataattcatcaatttgagcata-attcaacataaatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcgattatc |
17191740 |
T |
 |
| Q |
255 |
cataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagca |
342 |
Q |
| |
|
| || ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||| |
|
|
| T |
17191741 |
aacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttatcatctatgaacaattaatcatttact-caattaagca |
17191827 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 304 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 6146767 - 6146669
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304 |
atcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6146767 |
atcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
6146669 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 60 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12349971 - 12349822
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60 |
aaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaa |
159 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
12349971 |
aaatcatgaatcatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaa |
12349873 |
T |
 |
| Q |
160 |
caacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttt |
210 |
Q |
| |
|
| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
12349872 |
ctacgatgcataattcaccaattgagcatattatcaacacacacccatttt |
12349822 |
T |
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Target: chr3; HSP #49
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Query Start/End: Original strand, 17 - 189
Target Start/End: Original strand, 30152904 - 30153076
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| Q |
17 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || | |||||| || | ||| |||| |
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|
| T |
30152904 |
ccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaatatgactaaaca |
30153003 |
T |
 |
| Q |
117 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30153004 |
acaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
30153076 |
T |
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Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
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Target Start/End: Complemental strand, 17956280 - 17956109
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| Q |
14 |
tcaccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccactta |
113 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| || | |||||| || | ||| | |
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|
| T |
17956280 |
tcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaatatgactaa |
17956181 |
T |
 |
| Q |
114 |
acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgag |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
17956180 |
acaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataatacaccaattgag |
17956109 |
T |
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Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 58 - 330
Target Start/End: Original strand, 15876071 - 15876343
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| Q |
58 |
acaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatc |
157 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| | ||| || |||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| | | |
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|
| T |
15876071 |
acaaatcatgaattatgaatacctaagccatgaatcatcattaacaacatcacttaccaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaac |
15876170 |
T |
 |
| Q |
158 |
aacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctcca |
256 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||| || ||| ||||| || ||||| | ||||| ||| |||||||| |||||| |||| | |||||||||||| | || | |
|
|
| T |
15876171 |
aacaacttatgataatccaacaatttgagtat-cattcaagatatatcactttctcatacttggaacataaaatttcatcaacaacaattcagttatcaa |
15876269 |
T |
 |
| Q |
257 |
taacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaa |
330 |
Q |
| |
|
||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15876270 |
caacatcatgcatttaaacatattatcataattagagcacgaatttcatcatctatgaacaattaatcaattaa |
15876343 |
T |
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Target: chr3; HSP #52
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Target Start/End: Original strand, 33341855 - 33342015
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| Q |
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aaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatc |
127 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | | ||| ||||||||||||| | |
|
|
| T |
33341855 |
aaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaac |
33341953 |
T |
 |
| Q |
128 |
cattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33341954 |
cattgatcatgaaacatatcataattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
33342015 |
T |
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Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 54685582 - 54685422
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| Q |
28 |
aaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatc |
127 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| | | ||| ||||||||||||| | |
|
|
| T |
54685582 |
aaaccagcaacagcaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaatccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaac |
54685484 |
T |
 |
| Q |
128 |
cattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54685483 |
cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
54685422 |
T |
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Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 101
Target Start/End: Original strand, 28558169 - 28558252
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| Q |
18 |
cattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaa |
101 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
28558169 |
cattttcaccaaacaaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaa |
28558252 |
T |
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Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 3576705 - 3576396
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35 |
caacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgat |
134 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||| | |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| | || | | || | ||||| ||||||||||||| || | |
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|
| T |
3576705 |
caacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaaccacaatattacttagcaacaacaacatcaatcaaa |
3576606 |
T |
 |
| Q |
135 |
catgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattca |
233 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||| || ||||| ||||||| || ||| | ||||| ||| |||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
3576605 |
catgactcttatcacaattcaacaacaacatagcataatccatcaatttgagcataatt-caatatatatcactttctcatacattgaacatgaaatttc |
3576507 |
T |
 |
| Q |
234 |
actaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatcc |
333 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||| || | |||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||| || || | |||||||||||||| ||| | | |
|
|
| T |
3576506 |
accaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagtacgaattataacaactttgaacaattaatcatttact-c |
3576408 |
T |
 |
| Q |
334 |
aattaagcactt |
345 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
3576407 |
aattaagcactt |
3576396 |
T |
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Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
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Target Start/End: Original strand, 7853956 - 7854116
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| Q |
28 |
aaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatc |
127 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| | ||||| |||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| | | ||| ||||||||||||| | |
|
|
| T |
7853956 |
aaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgattcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaac |
7854054 |
T |
 |
| Q |
128 |
cattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaa-cataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
7854055 |
cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcat-gcataattcaccaattgaacata |
7854116 |
T |
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Target: chr3; HSP #57
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Query Start/End: Original strand, 192 - 345
Target Start/End: Original strand, 17204818 - 17204970
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| Q |
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ttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattag |
291 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||| || || | || ||||| ||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
17204818 |
ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcgattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattag |
17204917 |
T |
 |
| Q |
292 |
agcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt |
345 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
17204918 |
agcacgaattttatcatctatgaacaattaatcatttact-caattaagcactt |
17204970 |
T |
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Target: chr3; HSP #58
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Target Start/End: Complemental strand, 11196393 - 11196293
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228 |
aattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaat |
327 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11196393 |
aattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatatcatcattattagagcacaaatttcatcatccatgaacaattaatcaat |
11196294 |
T |
 |
| Q |
328 |
t |
328 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
11196293 |
t |
11196293 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
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Target Start/End: Original strand, 30207278 - 30207565
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acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattga-gcatattttcaacacatatccatttttcata |
215 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||| | |||| |||||||||||| | |||||||||| || |||||| ||||| | ||||| || ||||| ||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
30207278 |
acaacaacttcaattgaacttgaatcttatcacaattgaacaacaacatagcacaattcatcaatttaagcataatt-caacatatatcactttctcata |
30207376 |
T |
 |
| Q |
216 |
ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaa |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||| | || || |||||||||||||| || | |||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || | |||||| |
|
|
| T |
30207377 |
ctttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaaccagtatgaa |
30207476 |
T |
 |
| Q |
316 |
caattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaatt---gcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || || ||||||||||| | | || ||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
30207477 |
taattaatcaattact-caattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattataaccccctta |
30207565 |
T |
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280 |
catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt |
345 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
15517856 |
catcataattagagcacgaattttaacatttatgaacaattaatcacttact-caattaagcactt |
15517920 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #61
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ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca |
116 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||| ||||||||| | ||||| | || ||||| ||||| ||| | ||||||| ||||||| | || ||| || | ||||||||| |
|
|
| T |
9591039 |
ccatttttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgaactatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatcacttaaca |
9590940 |
T |
 |
| Q |
117 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattc-accaattgagcatattttcaacacatatccatttttcata |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |||| || |||| || | | |||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||| | ||| |||| |
|
|
| T |
9590939 |
acaacaacatcaattgaacatggttctcatcagaactcaacaacaacatagcataattcaacaaattgagcata-attcatatcataccactttcacata |
9590841 |
T |
 |
| Q |
216 |
ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaa |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||| | || || |||||||||||||| || || || || ||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| || |||||| |
|
|
| T |
9590840 |
ctttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttaatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacggattttaacaactatgaa |
9590741 |
T |
 |
| Q |
316 |
caattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||| || || || ||||||||||||| ||| |||| | ||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
9590740 |
caattaaccactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaatttgaaaaattacactaaatgattatgatgaattctaatcccctta |
9590653 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #62
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192 |
ttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattag |
291 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || | |||||||| ||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
47784876 |
ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattag |
47784777 |
T |
 |
| Q |
292 |
agcacgaattttatca--tt--tatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaatt---gcaataagtgattatg |
383 |
Q |
| |
|
|||||||||| || || || | |||||||| ||||| ||| | ||||||||||||| |||| || || ||||||||||| | | || |||||||| |
|
|
| T |
47784776 |
agcacgaattataacaacttcctttgaacaataaatcatttact-caattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttacactaaaaatgattatg |
47784679 |
T |
 |
| Q |
384 |
atgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47784678 |
atgaattctaaccccctta |
47784660 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #63
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Target Start/End: Complemental strand, 11882248 - 11882118
Alignment:
| Q |
272 |
aaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttt-tcacacaaataattgaaaattgca |
370 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||| ||| || | ||| || |||||| |||||| ||| || |||||||||||| ||| |||| |||| ||| || || |
|
|
| T |
11882248 |
aaacataccatcataattagagcatgaaattcaacatctaagaacaaataatcacttattc-aattaagcacttaatcatacaacaaattaaaagttaca |
11882150 |
T |
 |
| Q |
371 |
ataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11882149 |
ctaaatgattatgatgaattctaaccccctta |
11882118 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #64
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| Q |
65 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaa |
140 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
38811245 |
atgaattatgcacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaa |
38811170 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #65
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| Q |
28 |
aaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatc |
127 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||| || || ||||||||||||| |
|
|
| T |
19946672 |
aaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatc |
19946770 |
T |
 |
| Q |
128 |
cattga |
133 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
19946771 |
aattga |
19946776 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #66
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| Q |
35 |
caacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgat |
134 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||| | |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| | | ||| |||| |||||||||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
47785014 |
caacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcattaacaacaacatcacttaacaacaacaacatcaactgaa |
47784915 |
T |
 |
| Q |
135 |
catgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||| | |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
47784914 |
catgtttcttactacaattcaacaacaacatagcataattca |
47784873 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #67
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| Q |
212 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcattta |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || | |||||| |||||||||| || || ||||| ||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| ||| || |
|
|
| T |
14080666 |
catactttgaacatgcaaattcactaaccacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattttaacatcta |
14080765 |
T |
 |
| Q |
312 |
tgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaatt---gcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||| || ||| ||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14080766 |
tgcacaattaatc-atttatccaattaaacacttattcatac-catagttgaaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaaccccctta |
14080858 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #68
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| Q |
35 |
caacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgat |
134 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| | || |||||||||| ||||| | || || |||||||| | || ||| || | | |||||||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
14815032 |
caacaacaacttatttctcatcatcaaattatgattcatgaacacgcaggccatgaaacatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa |
14814933 |
T |
 |
| Q |
135 |
catgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt |
182 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| | |||||||||| || |||||| ||||| |
|
|
| T |
14814932 |
catgattcttatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatt |
14814885 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr3; HSP #69
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| Q |
17 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca |
116 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||| ||||||||| | ||||| | || ||||| |||| | ||| | ||||||||||||||| | || ||| || | | |||| || |
|
|
| T |
12952926 |
ccatttttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttagca |
12953025 |
T |
 |
| Q |
117 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcata |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| | ||| || || ||||||||| | |||||||||| || |||||| || || ||||||| ||||||| ||| | ||| ||| |
|
|
| T |
12953026 |
acaacaacatcaattaaacataaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcata-attcaacatataacactttcatata |
12953124 |
T |
 |
| Q |
216 |
ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatc-atttatga |
314 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| || ||||||||| ||| || || ||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||| || | | | |||| |
|
|
| T |
12953125 |
ctttgaacatgcaatttcaccaacaacaatctaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagaacacgaattctaacaactaatga |
12953224 |
T |
 |
| Q |
315 |
acaattaatcaattaatccaattaagcactt |
345 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
12953225 |
acaattaatcacttact-caattaagcactt |
12953254 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
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Target Start/End: Original strand, 34559903 - 34560020
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| Q |
59 |
caaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatca |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||| | || |||||||||||| | || ||| || | |||||| ||||||||||||| || || |||||| || |||| |||| | || |
|
|
| T |
34559903 |
caaattatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatcgaacatgaatctcatcataattcaaca |
34560002 |
T |
 |
| Q |
159 |
acaacataacataattca |
176 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
34560003 |
actacataacataattca |
34560020 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #71
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Target Start/End: Original strand, 15550918 - 15550950
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| Q |
372 |
taagtgattatgatgaattctaacccccttatc |
404 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15550918 |
taagtgattatgatgaattctaacccccttatc |
15550950 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #72
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Query Start/End: Original strand, 56 - 176
Target Start/End: Original strand, 17204701 - 17204821
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| Q |
56 |
caacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaattta |
155 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| || | ||||||||||||||| | || ||| || | ||||| ||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||| | |
|
|
| T |
17204701 |
caacaaatcatgaattataaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattacttagcaacaacaacatccattaaacatgattcctatcacaattca |
17204800 |
T |
 |
| Q |
156 |
tcaacaacataacataattca |
176 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
17204801 |
acaacaatatagcataattca |
17204821 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #73
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Target Start/End: Complemental strand, 38811030 - 38810980
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| Q |
280 |
catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaa |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| || || | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38811030 |
catcataattggagcacgaattctaacaatcatgaacaattaatcaattaa |
38810980 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
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Target Start/End: Original strand, 1990828 - 1990937
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| Q |
80 |
ccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcacca |
179 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | || ||| || | | |||||||||||||||||| || | ||||| || |||||| || | ||||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
1990828 |
ccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcatttaaacatgattctcatcacagttcaacaacaacataacacaattcacaa |
1990927 |
T |
 |
| Q |
180 |
attgagcata |
189 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
1990928 |
tttgagcata |
1990937 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 366 - 402
Target Start/End: Original strand, 40939437 - 40939473
Alignment:
| Q |
366 |
ttgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40939437 |
ttgcaatgaatgattatgatgaattctaaccccctta |
40939473 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0037 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:
Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
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| Q |
18 |
cattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaa |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
25012 |
cattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgaatacccaagccaagaattaacatccataacatcacttaacaa |
24913 |
T |
 |
| Q |
118 |
caacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatact |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
24912 |
caacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatatgttcaacacatacccatttttcatact |
24813 |
T |
 |
| Q |
218 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaaca |
317 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
24812 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaatttaattatcaataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatggaca |
24713 |
T |
 |
| Q |
318 |
attaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24712 |
attaatcaattcacctaattaagcacttttcatacaaataattgaaaatttcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
24628 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 189
Target Start/End: Original strand, 94937 - 95109
Alignment:
| Q |
17 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| || |
|
|
| T |
94937 |
ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaaaccatgaattagcatccataacatcacttatca |
95036 |
T |
 |
| Q |
117 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
95037 |
acaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcactaattgagcata |
95109 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 37)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 17 - 402
Target Start/End: Original strand, 20712038 - 20712423
Alignment:
| Q |
17 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
20712038 |
ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatcaacaacatgacttaaca |
20712137 |
T |
 |
| Q |
117 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
20712138 |
acaacaacatcaattgatcatgcaacttatcacaattcatcaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattatcaacacatacccatttttcatac |
20712237 |
T |
 |
| Q |
217 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaac |
316 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
20712238 |
tttgaacatgtaattcaatcaacaacaattcagttatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatca-ttatgaac |
20712336 |
T |
 |
| Q |
317 |
aattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgc-aataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20712337 |
aattaatcaattcactcaattaagcacttttcatacaagtaattgaaaattgcaaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
20712423 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 1168489 - 1168105
Alignment:
| Q |
17 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca |
116 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || |||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| || |
|
|
| T |
1168489 |
ccattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagca |
1168390 |
T |
 |
| Q |
117 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
1168389 |
acaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacattgcataattcaccaattgagcatattttcaacatatatcattttctcatac |
1168290 |
T |
 |
| Q |
217 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaac |
316 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1168289 |
tttgaacatgtaattcaactaacaaccattctattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcatttatgaac |
1168190 |
T |
 |
| Q |
317 |
aattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | | || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1168189 |
aattaatcaattcaccaaaataagcatttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtga-tatgatgaattctaaccccctta |
1168105 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 65 - 402
Target Start/End: Original strand, 21397099 - 21397439
Alignment:
| Q |
65 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa---caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaaca |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
21397099 |
atgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaataacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaaca |
21397198 |
T |
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| Q |
162 |
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259 |
Q |
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| T |
21397199 |
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21397296 |
T |
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359 |
Q |
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| T |
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T |
 |
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402 |
Q |
| |
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|
|
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T |
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Target: chr5; HSP #4
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Query Start/End: Original strand, 65 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 11337423 - 11337086
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Q |
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T |
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263 |
Q |
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T |
 |
| Q |
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362 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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402 |
Q |
| |
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T |
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Target: chr5; HSP #5
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112 |
Q |
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T |
 |
| Q |
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212 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
213 |
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312 |
Q |
| |
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| T |
4865420 |
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4865519 |
T |
 |
| Q |
313 |
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402 |
Q |
| |
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|
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4865520 |
gaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaaccccctta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
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Target Start/End: Original strand, 28261520 - 28261862
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153 |
Q |
| |
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| T |
28261520 |
aacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcagcaacatgactaaacaacaacaacaacaattgatcataaaacatatcacaatt |
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T |
 |
| Q |
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253 |
Q |
| |
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|
| T |
28261620 |
tatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatat----ttttcatactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaatcat |
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T |
 |
| Q |
254 |
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353 |
Q |
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| T |
28261715 |
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28261814 |
T |
 |
| Q |
354 |
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402 |
Q |
| |
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| T |
28261815 |
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Target: chr5; HSP #7
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Q |
| |
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caaatcatgaatcatgcaaacccaagccattaattatcatcaa---catgacatatcaacaacaccatcaattgatcatgaaactcatcacaattcaaca |
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T |
 |
| Q |
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acaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccata |
258 |
Q |
| |
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| T |
24183275 |
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T |
 |
| Q |
259 |
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358 |
Q |
| |
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| T |
24183175 |
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24183076 |
T |
 |
| Q |
359 |
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402 |
Q |
| |
|
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|
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ttgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaaccccctta |
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T |
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Target: chr5; HSP #8
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Q |
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|
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|
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T |
 |
| Q |
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253 |
Q |
| |
|
| ||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |
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| T |
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T |
 |
| Q |
254 |
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352 |
Q |
| |
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| T |
19405737 |
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19405836 |
T |
 |
| Q |
353 |
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402 |
Q |
| |
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Q |
| |
|
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21647023 |
cattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaataattatacaaacccaagccatgaattatcatcaacatcatgactaaacaa |
21646924 |
T |
 |
| Q |
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216 |
Q |
| |
|
||||| || | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||| |
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| T |
21646923 |
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21646826 |
T |
 |
| Q |
217 |
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315 |
Q |
| |
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| T |
21646825 |
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21646727 |
T |
 |
| Q |
316 |
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402 |
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| |
|
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|
|
| T |
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catttaatcaattcacccaaataagcacttttcatacaaataattg-aaattgcaataagtgattatgatgaattttaaccccctta |
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T |
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Target: chr5; HSP #10
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Q |
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|
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|
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T |
 |
| Q |
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taacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttca |
264 |
Q |
| |
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|
|
| T |
21906827 |
tagcataattcatcaattgaacatatttt------------------catactttgaacatgtaattcaaccaacatcaattcaattatccataacttca |
21906908 |
T |
 |
| Q |
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tacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaa |
364 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
21906909 |
tatgtctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaattaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaa |
21907008 |
T |
 |
| Q |
365 |
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398 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||||| ||||||| |||| |
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|
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21907009 |
attgtgataaatgattatgataaattctaccccc |
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Target: chr5; HSP #11
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| |
|
|||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| | | ||| ||||||||||||| |||||||| |
|
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T |
 |
| Q |
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catgaaacttatcacaatttatcaacaacataa---cataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaatt |
231 |
Q |
| |
|
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| T |
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catgaaacatatcacaattcaacaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatatacccttttcatacacttgaaacatgaattt |
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T |
 |
| Q |
232 |
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331 |
Q |
| |
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|
| T |
11584231 |
caactaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaatatgtcatcataaatagagcacgaatttcaccactcatgaacaattaattaattcat |
11584330 |
T |
 |
| Q |
332 |
ccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
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|
|
| T |
11584331 |
ccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaaccccctta |
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Target: chr5; HSP #12
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| |
|
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 |
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caacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac- |
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Q |
| |
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| T |
24475646 |
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T |
 |
| Q |
217 |
-tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaa |
315 |
Q |
| |
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ctttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagaacacgaatttcatcacttatgaa |
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T |
 |
| Q |
316 |
caattaatcaattaatccaattaa |
339 |
Q |
| |
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||||||||||||| |||||||||| |
|
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caattaatcaattcatccaattaa |
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Target: chr5; HSP #13
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| |
|
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|
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caacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaatttcgcata-tctcaacatatacctattcttcatac |
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T |
 |
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tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaac |
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Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| ||||||| || ||||||||||| || || |||||||| |
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|
| T |
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23494267 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
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Target Start/End: Original strand, 3673824 - 3674210
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Q |
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T |
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Q |
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| T |
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T |
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Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
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Target Start/End: Original strand, 21650657 - 21650829
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116 |
Q |
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T |
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189 |
Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
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Target Start/End: Original strand, 19862183 - 19862558
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128 |
Q |
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T |
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227 |
Q |
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T |
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327 |
Q |
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| T |
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19862481 |
T |
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402 |
Q |
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T |
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Target: chr5; HSP #17
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Query Start/End: Original strand, 17 - 189
Target Start/End: Original strand, 21204887 - 21205060
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Q |
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T |
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Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5451128 - 5450804
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116 |
Q |
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T |
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| Q |
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215 |
Q |
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T |
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| Q |
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315 |
Q |
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5450830 |
T |
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| Q |
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342 |
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Target: chr5; HSP #19
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Q |
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T |
 |
| Q |
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254 |
Q |
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T |
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| Q |
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353 |
Q |
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| T |
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7728718 |
T |
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402 |
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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
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Target Start/End: Original strand, 16595472 - 16595855
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T |
 |
| Q |
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218 |
Q |
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| T |
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16595670 |
T |
 |
| Q |
219 |
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318 |
Q |
| |
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| T |
16595671 |
tgaacatgaaatttctctatcaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaa |
16595770 |
T |
 |
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Target: chr5; HSP #21
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Query Start/End: Original strand, 17 - 402
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Q |
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Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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315 |
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| T |
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432723 |
T |
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| Q |
316 |
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402 |
Q |
| |
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|
| T |
432724 |
caattaatcatttact-caattaagcacttattcatgc-aacaattgaaaaattgcagtaaatgattatgatgaattctaaccccctta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
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Target Start/End: Original strand, 23466456 - 23466782
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T |
 |
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251 |
Q |
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T |
 |
| Q |
252 |
ctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcac |
350 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
351 |
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402 |
Q |
| |
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ac-aataattgaaaattgcaataattgattatgatgaattctaaccccctta |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
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Q |
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T |
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| Q |
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Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 116 - 402
Target Start/End: Original strand, 28902252 - 28902540
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|
| T |
28902252 |
aacaacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattgatcaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcat |
28902350 |
T |
 |
| Q |
215 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatga |
314 |
Q |
| |
|
|||||||||| | | || || |||||||||||||| || | ||||| || ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||| |
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|
| T |
28902351 |
actttgaacacgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatga |
28902450 |
T |
 |
| Q |
315 |
acaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaatt---gcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || || ||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28902451 |
acaattaatcaattact-caattaagcacttattcatac-aacaattgaaaattaacactacaaatgattatgatgaattctaaccccctta |
28902540 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 116 - 402
Target Start/End: Original strand, 28938647 - 28938935
Alignment:
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116 |
aacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcat |
214 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| || ||||| ||||| ||| |||| |
|
|
| T |
28938647 |
aacaacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattgatcaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcat |
28938745 |
T |
 |
| Q |
215 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatga |
314 |
Q |
| |
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|||||||||| | | || || |||||||||||||| || | ||||| || ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||| |
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|
| T |
28938746 |
actttgaacacgaagtttcaccaacaacaattcaattatcaacaactttatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatga |
28938845 |
T |
 |
| Q |
315 |
acaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaatt---gcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
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||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || || ||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
28938846 |
acaattaatcaattact-caattaagcacttattcatac-aacaattgaaaattaacactacaaatgattatgatgaattctaaccccctta |
28938935 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 189
Target Start/End: Original strand, 11342646 - 11342819
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| Q |
17 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaac- |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || | |||||| || | ||| ||| |
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|
| T |
11342646 |
ccattttcaccaagacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaatatgactaaaca |
11342745 |
T |
 |
| Q |
116 |
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189 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11342746 |
aacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
11342819 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 59 - 402
Target Start/End: Original strand, 21617020 - 21617365
Alignment:
| Q |
59 |
caaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatca |
158 |
Q |
| |
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||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||| || | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||| | || |
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|
| T |
21617020 |
caaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcaacaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaaca |
21617119 |
T |
 |
| Q |
159 |
acaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccat |
257 |
Q |
| |
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|||||||| | |||||| || || ||||||| ||||||| ||| | ||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||| || |
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|
| T |
21617120 |
acaacatagaacaattcaacatttagagcata-gttcaacatataacactttcatatacttggaacatgcaatttcactaacaacaatccaattatcacc |
21617218 |
T |
 |
| Q |
258 |
aacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatc-atttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaa |
355 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| || | | | |||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| || || |
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| T |
21617219 |
aatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattctaacaactaatgaacaattaatcccttact-caattaagcacttaatcatac-aa |
21617316 |
T |
 |
| Q |
356 |
taattg-aaaattgcaataagtgattatga-tgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21617317 |
taattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaaccccctta |
21617365 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 215 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 21310796 - 21310608
Alignment:
| Q |
215 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatga |
314 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
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|
| T |
21310796 |
actttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacgaattttaacatttatga |
21310697 |
T |
 |
| Q |
315 |
acaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaat-aagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| |||| ||| |||||| || | || ||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
21310696 |
acaattaatcacttact-caattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaaatgattatgatgaattttaaccccctta |
21310608 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 21222802 - 21222583
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| Q |
108 |
cacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatcca |
206 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||| || |||| | || || ||||||| || ||||| ||| | |
|
|
| T |
21222802 |
cacttagcaacaacaacattaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcacaattaaacatttagagcataatt-caacatataacac |
21222704 |
T |
 |
| Q |
207 |
tttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatc |
306 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||| |||| || |||||||||| ||| || || ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| || | |
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| T |
21222703 |
tttcatatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattctaac |
21222604 |
T |
 |
| Q |
307 |
atttatgaacaattaatcaat |
327 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21222603 |
aactatgaacaattaatcaat |
21222583 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 21297262 - 21297074
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| Q |
215 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatga |
314 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| | | |||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21297262 |
actttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcgttcaaacatatcatcatagttagaggacgaattttaacatttatga |
21297163 |
T |
 |
| Q |
315 |
acaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaat-aagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| |||| ||| |||||| || | || | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21297162 |
acaattaatcacttact-caattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaaataattatgatgaattctaaccccctta |
21297074 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #32
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Target Start/End: Original strand, 6456604 - 6456751
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| Q |
35 |
caacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgat |
134 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| | || ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| | || ||| | | | |||||||||||||||||| ||| | |
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|
| T |
6456604 |
caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgattcatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacgatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa |
6456703 |
T |
 |
| Q |
135 |
catgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt |
182 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
6456704 |
catgattctcatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacaatt |
6456751 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 32966171 - 32966107
Alignment:
| Q |
280 |
catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt |
345 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
32966171 |
catcataattggagcacgaattttaacaattatgaacaattaatcatttact-caattaagcactt |
32966107 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
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Target Start/End: Original strand, 37983598 - 37983712
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| Q |
289 |
tagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatga-tg |
386 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| |||| ||| |||||| || ||| ||||||||| || |
|
|
| T |
37983598 |
tagagcacaaattttaacaactatgaacaattaatcacttact-caattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattg |
37983696 |
T |
 |
| Q |
387 |
aattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
37983697 |
aattctaaccccctta |
37983712 |
T |
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Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
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Target Start/End: Complemental strand, 22054072 - 22053963
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acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
177 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| | | || ||| |||| || |||||| ||| |||||| ||||| |||||| | |||| ||||| | ||||||| || || ||||||| |
|
|
| T |
22054072 |
acccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcac |
22053973 |
T |
 |
| Q |
178 |
caattgagca |
187 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
22053972 |
caattgagca |
22053963 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
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Target Start/End: Original strand, 29917929 - 29918086
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| Q |
19 |
attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac |
118 |
Q |
| |
|
||||| || |||||| | |||| |||||||||| |||| ||||| |||| | ||| | ||||||||||||||| | || ||| || | | |||| |||| |
|
|
| T |
29917929 |
atttttacaaaaccaacgacaataatttatttctcaacatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttagcaac |
29918028 |
T |
 |
| Q |
119 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca |
176 |
Q |
| |
|
||||||||| || | ||||| || |||| |||| | ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
29918029 |
aacaacatcagttaaacatgattctcatcataattcaacaacaacataacacaattca |
29918086 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 182
Target Start/End: Original strand, 21109805 - 21109877
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| Q |
110 |
cttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||| | | ||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
21109805 |
cttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacataacacaattcaacaatt |
21109877 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 42)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
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Target Start/End: Original strand, 18570243 - 18570625
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cattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaa |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18570243 |
cattttcaccaaaccaacaacaacactt-atttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaggccatgaattagcatccataacatcacttaacaa |
18570341 |
T |
 |
| Q |
118 |
caacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatact |
217 |
Q |
| |
|
|||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
18570342 |
caactacttctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatact |
18570441 |
T |
 |
| Q |
218 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaaca |
317 |
Q |
| |
|
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|
| T |
18570442 |
ttgaacatgtaatttaactaataacaattcaattatccataacatcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcacttatgaaca |
18570541 |
T |
 |
| Q |
318 |
attaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18570542 |
attaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aattgattatgatgaattctaaccccctta |
18570625 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 19 - 402
Target Start/End: Original strand, 18777110 - 18777476
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| Q |
19 |
attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac |
118 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
18777110 |
attttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaac |
18777209 |
T |
 |
| Q |
119 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactt |
218 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
18777210 |
aacaacattcattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgaacatattttcaacacatacccatttttcatactt |
18777309 |
T |
 |
| Q |
219 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaa |
318 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
18777310 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagaacacgaatttcatcttttatgaa--- |
18777406 |
T |
 |
| Q |
319 |
ttaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18777407 |
--------------caattaagcacttttcatacaaataattgaaaattccaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
18777476 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 21 - 402
Target Start/End: Original strand, 32898756 - 32899137
Alignment:
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21 |
tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||| || | ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
32898756 |
tttcaccaaaacaccaacatcatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccattaattatcatcaacaacatgactaaacaacaa |
32898855 |
T |
 |
| Q |
121 |
caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttg |
220 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
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|
| T |
32898856 |
caacttcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttg |
32898955 |
T |
 |
| Q |
221 |
aacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaatt |
320 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32898956 |
aacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaatt |
32899055 |
T |
 |
| Q |
321 |
aatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
32899056 |
aatcaattcaccaaattaagcacttttcataccaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
32899137 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
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Target Start/End: Original strand, 16086022 - 16086364
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159 |
Q |
| |
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|||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| || |||| || || ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| | ||| |
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| T |
16086022 |
aaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgaattatcattaacaacatgacatatcaacaacaacatcaaatgatcatgaaacttatcataattcaacaa |
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T |
 |
| Q |
160 |
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259 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
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| T |
16086122 |
caacaaggtataattcaccaattaagcatattttcaacacatacccatttttcgtactttgaacatgtaattcaacaaacaacaattcaattatccataa |
16086221 |
T |
 |
| Q |
260 |
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359 |
Q |
| |
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| T |
16086222 |
cttcatacatctaaacatatcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaattaattcacccaattaagcacttttcatacaattaat |
16086321 |
T |
 |
| Q |
360 |
tgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
16086322 |
tgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaaccccctta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 86 - 402
Target Start/End: Original strand, 16106547 - 16106863
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185 |
Q |
| |
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| T |
16106547 |
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T |
 |
| Q |
186 |
catattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcat |
285 |
Q |
| |
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|
| T |
16106647 |
catattttcaacacatactcatttttcatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcat |
16106746 |
T |
 |
| Q |
286 |
aattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgat |
385 |
Q |
| |
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| T |
16106747 |
aattagagcacaaatttcatcatttacgaacaattaattaattcactcaattaagcacttttcatacaattaattgaaaattgcaataagtgattatgat |
16106846 |
T |
 |
| Q |
386 |
gaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16106847 |
gaattctaaccccctta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
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Query Start/End: Original strand, 60 - 402
Target Start/End: Original strand, 22440940 - 22441280
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159 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | || || |
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|
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T |
 |
| Q |
160 |
caacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataa |
259 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||| | ||||| |
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| T |
22441039 |
caacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaactcatacccatttttcatacttttaacatgtaattcaccccatcacaattcaattattcataa |
22441138 |
T |
 |
| Q |
260 |
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359 |
Q |
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| T |
22441139 |
cttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagtacgaatttcatcatatatgaacaattaatcaattcactcaattaagcacttatcatacaaataat |
22441238 |
T |
 |
| Q |
360 |
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402 |
Q |
| |
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| T |
22441239 |
tgaaaattgcaa-aagtgattatgatgaattctaaccccctta |
22441280 |
T |
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Target: chr6; HSP #7
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Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |
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|
| T |
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18432755 |
T |
 |
| Q |
168 |
cataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatac |
267 |
Q |
| |
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| T |
18432756 |
cataattcaccaattaagcatattttcaacatacacccatttttcatacttttaacatgtaattcaatcaacaacaattcaagtattcataacttcatac |
18432855 |
T |
 |
| Q |
268 |
atctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaa-t |
366 |
Q |
| |
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| T |
18432856 |
atctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcatttatgaacaaataatcaattcacccaattaagctcttttcatac-aataattgaaaatt |
18432954 |
T |
 |
| Q |
367 |
tgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
18432955 |
tgcaataa-tgattatgatgaattctaaccccctta |
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T |
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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 67 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 13014943 - 13014608
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166 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||| || ||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13014943 |
gaatcatgca-acccaagccacgaattatcatcaacaacatgacttaacatcagcaacaacaattgatcttgaaacttatcacaattcatcaacaacaat |
13014845 |
T |
 |
| Q |
167 |
acataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcata |
266 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
13014844 |
gcataattcaccaattgagcatatttccaactcatacccatttttcatacttc-aacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcata |
13014746 |
T |
 |
| Q |
267 |
catctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaa--ataattgaaa |
364 |
Q |
| |
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|
| T |
13014745 |
catctaaacatgtcatcataattaaagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaatttagcacttttcatacaaacataattgaaa |
13014646 |
T |
 |
| Q |
365 |
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402 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
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|
| T |
13014645 |
attacaataagtgattatgataaattctaaccccctta |
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T |
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Target: chr6; HSP #9
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Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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acaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattc |
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T |
 |
| Q |
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254 |
Q |
| |
|
| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
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|
| T |
31628368 |
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31628467 |
T |
 |
| Q |
255 |
cataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaa |
339 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
31628468 |
aataacttcatacatctaaacatgtaatcataattcgaatacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaa |
31628552 |
T |
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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
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Target Start/End: Original strand, 18398948 - 18399285
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164 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
18398948 |
atgaattatgcacacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaaca |
18399047 |
T |
 |
| Q |
165 |
taacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataactt |
262 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || | ||||| |
|
|
| T |
18399048 |
tagcataattcaacaatttgagcata-tttcaacatata-ctattttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaattatcaacaactt |
18399145 |
T |
 |
| Q |
263 |
catacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg |
361 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||| || |||||||| |
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|
| T |
18399146 |
catgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattagtcaattact-caattaagcacttattcatac-aataattg |
18399243 |
T |
 |
| Q |
362 |
aaaattgcaat-aagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||| || || | || ||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18399244 |
aaatttacactaaaatgattatgaagaattctaaccccctta |
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Target: chr6; HSP #11
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
15742516 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaaca |
15742417 |
T |
 |
| Q |
117 |
acaac---aacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15742416 |
acaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
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cattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaa |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
26089699 |
cattttcacccaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaa-ttatgaatcatgcatacccaaaccatgaattagcatccataacatcacttaacaa |
26089797 |
T |
 |
| Q |
118 |
caacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26089798 |
caacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
26089869 |
T |
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Target: chr6; HSP #13
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ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaa-ttatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaac |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
23994884 |
ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaac |
23994983 |
T |
 |
| Q |
116 |
aacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23994984 |
aacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
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caacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaattta |
155 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| | |
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|
| T |
25367483 |
caacaattcatgaatcatgcacacccaagccatgaattatcgataacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattca |
25367384 |
T |
 |
| Q |
156 |
tcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctc |
254 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||| | | | ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || || |
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|
| T |
25367383 |
acaacaacataacacaattcaacaatttgagcata-tttcaacataaaccactttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaacaattccattatc |
25367285 |
T |
 |
| Q |
255 |
-cataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacac |
352 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || |
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|
| T |
25367284 |
aaaaaacttcatacattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattgct-caattaagcacttattcatac |
25367186 |
T |
 |
| Q |
353 |
aaataattgaaaa-ttgcaat-aagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || | || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25367185 |
-aataattgaaaatttacactaaaatgattatgatgaattctaaccccctta |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
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18 |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18002787 |
cattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaagt-atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacgtcacttaacaa |
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T |
 |
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118 |
caacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
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Q |
| |
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|||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |
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|
| T |
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caacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcatcaattgagcata |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
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Query Start/End: Original strand, 58 - 402
Target Start/End: Original strand, 21623171 - 21623517
Alignment:
| Q |
58 |
acaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatc |
157 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||| ||||||||||||||| | | | || |||| |||||| ||||||||||||| || || ||||| |||| ||||||| | | |
|
|
| T |
21623171 |
acaaatcatgaattatgaatacccaagccatgactcattaacatcaacatcacttagcaacaacaacatcaatagaacatgattcttaccacaattcaac |
21623270 |
T |
 |
| Q |
158 |
aacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctcca |
256 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| || ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| || | |
|
|
| T |
21623271 |
aacaacatagcataattcaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcagcaacaacaattcaattatcaa |
21623369 |
T |
 |
| Q |
257 |
taacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaa |
355 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || || |
|
|
| T |
21623370 |
caacttcatgcattcaaacataccatcataattggagcacgaattctaacatttatgaacaattaatcaattact-caattaagcacttattcatac-aa |
21623467 |
T |
 |
| Q |
356 |
taattga-aaattgcaat-aagtgattatga-tgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| || | || ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21623468 |
caattgagaaattacactaaaatgattatgattgaattctaaccccctta |
21623517 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 18381971 - 18381660
Alignment:
| Q |
14 |
tcaccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccactta |
113 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||| ||||||||| | ||||| | |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||| |||| |||||| |
|
|
| T |
18381971 |
tcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcactta |
18381872 |
T |
 |
| Q |
114 |
acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttc |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| | ||||||||| ||| || |||||| ||||||| ||||| ||| || |
|
|
| T |
18381871 |
gcaacaacaacatcaattgaacatgactcttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaacaatttaagcata-attcaacatatatcactttctc |
18381773 |
T |
 |
| Q |
213 |
atactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttat |
312 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| || |||||| ||||||| || | |||||||| || ||| || ||||||||||||||||| |||| || || | | |
|
|
| T |
18381772 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaaccattcaattatcaacaacttcatgtattcaaaaatatcatcataattagagcacaaattataacaacttt |
18381673 |
T |
 |
| Q |
313 |
gaacaattaatca |
325 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
18381672 |
gaacaattaatca |
18381660 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 35015453 - 35015278
Alignment:
| Q |
14 |
tcaccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccactta |
113 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || | |||||| || | ||| | |
|
|
| T |
35015453 |
tcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaa |
35015354 |
T |
 |
| Q |
114 |
acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35015353 |
acaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
35015278 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 65 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22362002 - 22361742
Alignment:
| Q |
65 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaaca |
164 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||| || | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
22362002 |
atgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatttcatcacaattcaacaacaaca |
22361903 |
T |
 |
| Q |
165 |
taacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttc |
263 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| ||||| ||||||| || |||| || || ||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| || | || ||| |
|
|
| T |
22361902 |
tagcataattcatcaatttgagcataatt-caacttatgtcactttctcatactttgaacatgaaatttcagcaacaacaattcaattatcaacaatttc |
22361804 |
T |
 |
| Q |
264 |
atacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatca |
325 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
22361803 |
atgcattcaaacatatcatcataattagagcacaaattttatcatctatgaacaattaatca |
22361742 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19983587 - 19983412
Alignment:
| Q |
14 |
tcaccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccactta |
113 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || | |||||| || | ||| | |
|
|
| T |
19983587 |
tcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaa |
19983488 |
T |
 |
| Q |
114 |
acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaa-cataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| | | |||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
19983487 |
acaacaacaacaaccactaaccatgaaacatatcacaattcatcaacaatcat-gcataattcactaattgagcata |
19983412 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 25744499 - 25744331
Alignment:
| Q |
16 |
accattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaac |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| || |||||||| | ||||| |||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||| |
|
|
| T |
25744499 |
accattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctctacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaac |
25744400 |
T |
 |
| Q |
116 |
aacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattga |
184 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
25744399 |
aacaacaacaacatttgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccacttga |
25744331 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 21411191 - 21410949
Alignment:
| Q |
160 |
caacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataa |
259 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||| ||| | ||| |||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||| || | || |
|
|
| T |
21411191 |
caacatagcataattcacaatttgagcatattt-caacatataccactttctcatactttgaacatgaaatttatttaacaaccattcaattatcaacaa |
21411093 |
T |
 |
| Q |
260 |
cttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataa |
358 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | |||| |||||||||| |||||| |||| || | ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| || ||||| |
|
|
| T |
21411092 |
cttcatgcattcatacataacatcataattggagcacaaattctaacgattatgaacaattagtcaattcct-caattaagcacttattcatac-aataa |
21410995 |
T |
 |
| Q |
359 |
ttgaaaa-ttgcaat-aagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||| || || | || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21410994 |
ttgaaaatttacactaaaatgattatgatgaattctaaccccctta |
21410949 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 28195324 - 28195101
Alignment:
| Q |
72 |
atgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaa-cttatcacaatttatcaacaacataacat |
170 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||| ||| | ||||||||| ||| || ||||||||| | ||||| ||| ||| |
|
|
| T |
28195324 |
atgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaaccacaacaattgatcataaaatctcatcacaattcaacaacatcatggcat |
28195225 |
T |
 |
| Q |
171 |
aattcacc-aattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcataca |
268 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||| |||| || || ||| ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||| |
|
|
| T |
28195224 |
aattcaactaattgagcacattt-catcatata-ccattttctcatactatgaacatgaaattttactaacaacaattcaattatcaacaacttcataca |
28195127 |
T |
 |
| Q |
269 |
tctaaacatgccatcataattagagc |
294 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
28195126 |
ttcaaacatatcatcataattggagc |
28195101 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 402
Target Start/End: Original strand, 33324703 - 33325041
Alignment:
| Q |
65 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaaca |
164 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||| |||| |||||| ||| ||||||||| ||||| |||| || |||| |||| | | |||| | |
|
|
| T |
33324703 |
atgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaaccacaata |
33324802 |
T |
 |
| Q |
165 |
taacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttc |
263 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| ||||||||||||| || || | || | || | || |||||||||||| || | || |||||||||||||| || | || ||| |
|
|
| T |
33324803 |
tagcataattcatccaattgagcataatt-cataagttagcacttatacacactttgaacatgcaaattcac-aacaacaattcaattatcaacaatttc |
33324900 |
T |
 |
| Q |
264 |
atacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattga |
362 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||| |||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| || | ||||||| |
|
|
| T |
33324901 |
atgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcaatt-atccaattaatcacttattcatac-attaattga |
33324998 |
T |
 |
| Q |
363 |
a--aattgcaat-aagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
| |||| || | || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33324999 |
aataattacactaaaatgattatgatgaattctaaccccctta |
33325041 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 18629698 - 18629507
Alignment:
| Q |
212 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcattta |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
18629698 |
catactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaacta |
18629599 |
T |
 |
| Q |
312 |
tgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatga-tgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || || ||||||| ||||| ||| |||| ||| |||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18629598 |
tgaacaattaatcactt-attcaattaaacacttaatcatacaacaaataaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaaccccctta |
18629507 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 35136249 - 35135911
Alignment:
| Q |
65 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaaca |
164 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||| |||| |||||| ||| ||||||||| ||||| |||| || |||| |||| | | |||| | |
|
|
| T |
35136249 |
atgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaaccacaata |
35136150 |
T |
 |
| Q |
165 |
taacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttc |
263 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| ||||||||||||| || || | || | || | || |||||||||||| || | || |||||||||||||| || || ||| |
|
|
| T |
35136149 |
tagcataattcatccaattgagcataatt-cacaagttagcacttatacacactttgaacatgcaaattcac-aacaacaattcaattatcatcaatttc |
35136052 |
T |
 |
| Q |
264 |
atacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg- |
361 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||| |||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||| || |||||||| |
|
|
| T |
35136051 |
atgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatcaatt-atctaattaatcacttattcatac-aataattga |
35135954 |
T |
 |
| Q |
362 |
-aaaattgcaat-aagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35135953 |
aaaaattacactaaaatgattatgatgaattctaaccccctta |
35135911 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 189
Target Start/End: Original strand, 18583377 - 18583451
Alignment:
| Q |
115 |
caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18583377 |
caacaacaacatcaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
18583451 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Original strand, 25651199 - 25651432
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17 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||| | || | ||| |||| | ||| | ||||||||||||||| | || ||| || | |||||| || |
|
|
| T |
25651199 |
ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattctcatcatccaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagca |
25651298 |
T |
 |
| Q |
117 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcata |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |||||| || |||| |||| | |||||||||| || |||||| || || ||||||| ||||||| ||| | ||| |||| |
|
|
| T |
25651299 |
acaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcata-attcaacatataacactttcacata |
25651397 |
T |
 |
| Q |
216 |
ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaat |
250 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
25651398 |
ctttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaat |
25651432 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 17083384 - 17083098
Alignment:
| Q |
115 |
caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttca |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| | |||||| || ||||||||| | |||||||||| || |||||| || || ||||| | || ||||| ||||| ||| || |
|
|
| T |
17083384 |
caacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcacaatt-caacatatatcattttcaca |
17083286 |
T |
 |
| Q |
214 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatg |
313 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||| |
|
|
| T |
17083285 |
tactatgaacatacaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaa-ttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaatattaacaactatg |
17083187 |
T |
 |
| Q |
314 |
aacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || ||||||||||||| ||| |||| ||| |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17083186 |
aacaattaatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattaaaatgaattctaaccccctta |
17083098 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 16888029 - 16887690
Alignment:
| Q |
65 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaaca |
164 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||||||| | | |||||||| ||| || ||||||| ||| ||||| |||| || |||| |||| | |||||||| |
|
|
| T |
16888029 |
atgaattatgtatacccaagccatgaatcattaacaataacatcacatagtgacaacaaaatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaaca |
16887930 |
T |
 |
| Q |
165 |
taacataattcacc-aattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttc |
263 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| || || | || | || | || |||||||||||| || | || ||||||| |||||| || || ||| |
|
|
| T |
16887929 |
taacataattcacccaattgagcataatt-cacaagttagcacttatacacactttgaacatgcaaattcaccaacaacagttcaattatcatcaatttc |
16887831 |
T |
 |
| Q |
264 |
atacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattga |
362 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||| |||| || ||||||||| |
|
|
| T |
16887830 |
atgcatacaaacatattatcatagttagagcacgaattttaacatctatgaacaattaatc-atttattcaattaatcacttattcatac-aataattga |
16887733 |
T |
 |
| Q |
363 |
aaa---ttgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||| | | | || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16887732 |
aaaattatactaaaaatgattatgatgaattctaaccccctta |
16887690 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 35009684 - 35009569
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| Q |
72 |
atgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacata |
171 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| | | || ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| |||| || |||| |||| | |||||||||| || | |
|
|
| T |
35009684 |
atgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaa |
35009585 |
T |
 |
| Q |
172 |
attcaccaattgagca |
187 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
35009584 |
attcaccaattgagca |
35009569 |
T |
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Target: chr6; HSP #32
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Query Start/End: Original strand, 212 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 17557107 - 17556977
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| Q |
212 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcattta |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| || || |
|
|
| T |
17557107 |
catactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcatc-aaacatatcatcataattagagcacgaa-tttaacaacta |
17557010 |
T |
 |
| Q |
312 |
tgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt |
345 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
17557009 |
tgaacaaataatcaatt-attcaattaagcactt |
17556977 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
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Target Start/End: Complemental strand, 33538389 - 33538269
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| Q |
283 |
cataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgatta |
381 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| |||| ||| |||||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
33538389 |
catagttagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcacttact-caattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgatta |
33538291 |
T |
 |
| Q |
382 |
tga-tgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33538290 |
tgattgaattctaaccccctta |
33538269 |
T |
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Target: chr6; HSP #34
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| Q |
17 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| | || || | |||| | ||| | |||||||| |||||| | || ||| || | | ||||||| |
|
|
| T |
34966829 |
ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcacgaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaaca |
34966928 |
T |
 |
| Q |
117 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| | ||||| || ||||||| | | |||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
34966929 |
acaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacatagcataattcaacaatt |
34966994 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #35
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Target Start/End: Complemental strand, 18823633 - 18823565
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| Q |
65 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattga |
133 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||| || || ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18823633 |
atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga |
18823565 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 18839488 - 18839420
Alignment:
| Q |
65 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattga |
133 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||| || || ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18839488 |
atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga |
18839420 |
T |
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Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 400
Target Start/End: Original strand, 15740454 - 15740576
Alignment:
| Q |
280 |
catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaatt---gcaataag |
375 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| | || || | ||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||| | | || |
|
|
| T |
15740454 |
catcataattggagcacgaaatctaacaatcatgaacaattaatcaattact-caattaagtacttattcatacaaa-aattgaaaatttacactaaaaa |
15740551 |
T |
 |
| Q |
376 |
tgattatgatgaattctaaccccct |
400 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
15740552 |
tgattatgatgaattctaactccct |
15740576 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 94
Target Start/End: Original strand, 18583307 - 18583372
Alignment:
| Q |
28 |
aaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaatta |
94 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18583307 |
aaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaatta |
18583372 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 372 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 25640491 - 25640461
Alignment:
| Q |
372 |
taagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25640491 |
taagtgattatgatgaattctaaccccctta |
25640461 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 138
Target Start/End: Original strand, 25919614 - 25919696
Alignment:
| Q |
56 |
caacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatg |
138 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||| |||| || || ||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
25919614 |
caacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcatatagcaacaacaacatcaattgaacatg |
25919696 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 66 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15079944 - 15079820
Alignment:
| Q |
66 |
tgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacat |
165 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||||| |||||||| | || ||| |||| |||||| ||| ||||| ||| ||||| |||| || |||| |||| | |||||| || |
|
|
| T |
15079944 |
tgaattatgaatacccaaaccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaatatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaatat |
15079845 |
T |
 |
| Q |
166 |
aacataattca-ccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15079844 |
agcataattcacccaattgagcata |
15079820 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 281 - 325
Target Start/End: Original strand, 25654350 - 25654394
Alignment:
| Q |
281 |
atcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatca |
325 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |
|
|
| T |
25654350 |
atcataattagagcacgaattttaacaactctgaacaattaatca |
25654394 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 42)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 12837481 - 12837101
Alignment:
| Q |
17 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
12837481 |
ccattttcaccaaaccaacaacaac---ttatttctca-caacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaaca |
12837386 |
T |
 |
| Q |
117 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||| |
|
|
| T |
12837385 |
acaacaacatccattgaccatgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatataccaatttctcatac |
12837286 |
T |
 |
| Q |
217 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaac |
316 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |
|
|
| T |
12837285 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatatcatcatttatggac |
12837186 |
T |
 |
| Q |
317 |
aattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12837185 |
aattaatcaattcacccaattaagcacttttcattcaaa-aattgaaaatagcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
12837101 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 21 - 402
Target Start/End: Original strand, 44055881 - 44056261
Alignment:
| Q |
21 |
tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| || ||| |||| |
|
|
| T |
44055881 |
tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatggctaaaccacaa |
44055980 |
T |
 |
| Q |
121 |
caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttg |
220 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
44055981 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatattcatttttcatactttg |
44056080 |
T |
 |
| Q |
221 |
aacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaatt |
320 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44056081 |
aacatgtaattcaactaacaacaattcaa-aattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaatt |
44056179 |
T |
 |
| Q |
321 |
aatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44056180 |
aatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
44056261 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 14 - 402
Target Start/End: Original strand, 34395216 - 34395604
Alignment:
| Q |
14 |
tcaccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccactta |
113 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||| || || |
|
|
| T |
34395216 |
tcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacata |
34395315 |
T |
 |
| Q |
114 |
acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttca |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |
|
|
| T |
34395316 |
gcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttt-ca |
34395414 |
T |
 |
| Q |
214 |
tac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcattta |
311 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
34395415 |
tacactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattattcattacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcattta |
34395513 |
T |
 |
| Q |
312 |
tgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34395514 |
tgaacaattaatcagttcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgataatgatgaattctaaccccctta |
34395604 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 60 - 402
Target Start/End: Original strand, 30457909 - 30458250
Alignment:
| Q |
60 |
aaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaa |
159 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
30457909 |
aaataatgaattatgca-acccaagccatgaattatcatcaaccacatgacttaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaa |
30458007 |
T |
 |
| Q |
160 |
caacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataa |
259 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
30458008 |
caacaatgcgtaattcaccaattgagcatattttcaacacatacccattttacatactttgaacatgtaattcaaccaacaacaatttaattatccataa |
30458107 |
T |
 |
| Q |
260 |
cttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataat |
359 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
30458108 |
cttcatacatctaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataat |
30458207 |
T |
 |
| Q |
360 |
tgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30458208 |
tcaaaattacaataagtaattatgatgaattctaaccccctta |
30458250 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 35 - 402
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134 |
Q |
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21959730 |
caacaacatttaatttctcaaccacaaactatgaatcatgcaagcccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatcaattgat |
21959631 |
T |
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| Q |
135 |
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234 |
Q |
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| T |
21959630 |
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21959532 |
T |
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| Q |
235 |
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334 |
Q |
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| T |
21959531 |
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21959432 |
T |
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402 |
Q |
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21959431 |
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T |
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Target: chr4; HSP #6
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tcaccattttcacgaaaacaccaacaacatctcatttctcaaccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactta |
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T |
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213 |
Q |
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23270024 |
T |
 |
| Q |
214 |
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311 |
Q |
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| T |
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23269925 |
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| Q |
312 |
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402 |
Q |
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| T |
23269924 |
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T |
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tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaa |
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T |
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Q |
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T |
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Q |
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T |
 |
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T |
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Q |
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T |
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T |
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402 |
Q |
| |
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T |
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T |
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Q |
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T |
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taatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
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Q |
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T |
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T |
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374 |
Q |
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tatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcc |
252 |
Q |
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|| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
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T |
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253 |
tccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacac |
352 |
Q |
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|
| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |
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T |
 |
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Q |
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|
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|
|
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T |
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|
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aacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaata |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
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cacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaata |
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T |
 |
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attgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccc |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |
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|
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|
|
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T |
 |
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catgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccattttt--catactttgaacatgtaattc |
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Q |
| |
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||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||| |||| |||||||||| |||| | || |
|
|
| T |
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catgaaacttatcacaatttaacaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttc-acata-acccacttttcacatactttgatcatgaagttt |
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T |
 |
| Q |
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aactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatc |
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Q |
| |
|
|| |||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
30232565 |
caccaacaacaattcaattat-cataacttcatatatacaaacatgtcatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaatt-aca |
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T |
 |
| Q |
333 |
caattaagcactt-ttcacacaaataattg--aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
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Q |
| |
|
||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
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Q |
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|
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|
|
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T |
 |
| Q |
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Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaattaagcatttttcatacaaataatttaaaattgcaataagtgattatgatgaatt |
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T |
 |
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ctaaccccctta |
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Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
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ctaaccccctta |
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
820154 |
aaatcatgaatcatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaaca---attgatcatgaaacttatcacaattcatcaa |
820059 |
T |
 |
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160 |
caacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataa |
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Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||| |||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
820058 |
caacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacacatttt-caca-----aac--------caac-aacaacaattcaattatccataa |
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T |
 |
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Q |
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| T |
819873 |
taaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
819831 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
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Target Start/End: Complemental strand, 53907980 - 53907609
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Q |
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53907881 |
T |
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217 |
Q |
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53907880 |
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T |
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218 |
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317 |
Q |
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53907685 |
T |
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318 |
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402 |
Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
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Target Start/End: Original strand, 27960984 - 27961319
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Q |
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27961083 |
T |
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266 |
Q |
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T |
 |
| Q |
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365 |
Q |
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| T |
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27961280 |
T |
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402 |
Q |
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27961281 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
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Target Start/End: Complemental strand, 13809758 - 13809410
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Q |
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T |
 |
| Q |
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251 |
Q |
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| T |
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13809561 |
T |
 |
| Q |
252 |
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350 |
Q |
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| T |
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13809462 |
T |
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| Q |
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402 |
Q |
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ac-aataattgaaaaatggcaataaatgattatgatgaattctaaccccctta |
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T |
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Target: chr4; HSP #19
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Target Start/End: Complemental strand, 18494611 - 18494229
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Q |
| |
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| T |
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18494512 |
T |
 |
| Q |
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215 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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315 |
Q |
| |
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| T |
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18494315 |
T |
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| Q |
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402 |
Q |
| |
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18494314 |
caattgatcaatt-acacaattaagcacctattcatac-cataattgaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaaccccctta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
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Target Start/End: Complemental strand, 52265793 - 52265408
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Q |
| |
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| T |
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ccattttcaccaaaccaacaacatcaacttatttcacatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacatcaatatcacttagca |
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T |
 |
| Q |
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215 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
216 |
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315 |
Q |
| |
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| T |
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ctttgaacataaaatttctctaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattagagcacgaatttcatcatctatgaa |
52265495 |
T |
 |
| Q |
316 |
caattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
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|
| T |
52265494 |
caattaatcaatt-acccaattaaacacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaaccccctta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
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Target Start/End: Original strand, 15044790 - 15045176
Alignment:
| Q |
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Q |
| |
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| T |
15044790 |
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T |
 |
| Q |
117 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttcata |
215 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
216 |
ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaa |
315 |
Q |
| |
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|
| T |
15044989 |
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T |
 |
| Q |
316 |
caattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaa--taagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || || |||||| |||| || || ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
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caattaatcaattact-caattaagcacttattcatac-aacaattgagaatttaaactaaaatgattatgatgaaatctaaccccctta |
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T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 189
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Q |
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T |
 |
| Q |
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Q |
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| T |
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T |
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| Q |
117 |
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215 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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315 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
316 |
caattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaa--taagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
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| T |
15109335 |
taattaatcaattact-caattaagcacttattcatac-aacaattgagaatttaaactaaaatgattatgatgaaatctaaccccctta |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #24
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Q |
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T |
 |
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tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatg |
313 |
Q |
| |
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tactttgaacttgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttatcatttatg |
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T |
 |
| Q |
314 |
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332 |
Q |
| |
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| T |
47535053 |
aacaattaatcatttaatc |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #25
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ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca |
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Q |
| |
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| T |
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ccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaatatgactaaata |
14951823 |
T |
 |
| Q |
117 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
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acaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
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Target: chr4; HSP #26
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Q |
| |
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tcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaaattatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcattatcaacaatatgacta |
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T |
 |
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aacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
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Q |
| |
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| T |
25119404 |
aacaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaaaaaccatgcataattcaccaattgatcata |
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T |
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| Q |
115 |
caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttca |
213 |
Q |
| |
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|
| T |
41166133 |
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41166035 |
T |
 |
| Q |
214 |
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250 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41166034 |
tactttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaat |
41165998 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 78 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 7186068 - 7185744
Alignment:
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78 |
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177 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | || |||||| | | |||| ||||||||||||| ||| | |||||| || ||||||||| | |||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
7186068 |
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7185969 |
T |
 |
| Q |
178 |
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276 |
Q |
| |
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|| || | ||| | || ||||| ||||| ||| |||||| ||||||| |||| || |||||||||||||| || ||| ||||| ||| ||||| |
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| T |
7185968 |
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7185870 |
T |
 |
| Q |
277 |
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375 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||| |||| ||| |||||| || ||| |
|
|
| T |
7185869 |
tatcatcataattagagcacaaattttaacaactatgaacaattaatcactt-attcaattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaa |
7185771 |
T |
 |
| Q |
376 |
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402 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
7185770 |
tgattatgatgaattctaacctcctta |
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T |
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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
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Target Start/End: Complemental strand, 5682823 - 5682648
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14 |
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113 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| || | |||||| || | | | | |
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|
| T |
5682823 |
tcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagacatatatcatcatcaacaatatgaataa |
5682724 |
T |
 |
| Q |
114 |
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189 |
Q |
| |
|
| |||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5682723 |
aaaacaacaacaaccaataatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
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T |
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Target: chr4; HSP #30
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Target Start/End: Original strand, 14901242 - 14901579
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65 |
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164 |
Q |
| |
|
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|
| T |
14901242 |
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14901341 |
T |
 |
| Q |
165 |
taacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttc |
263 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| || || |||||||||| |||| ||||| ||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||| |||| || | || ||| |
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|
| T |
14901342 |
tatcataattcaacattttgagcatattta-aacatatatcactttctcatacttcaaacatgaaatttcaccaacaacaat-caattttcaacaatttc |
14901439 |
T |
 |
| Q |
264 |
atacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg- |
361 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||| || |||||||| |
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|
| T |
14901440 |
atacattcaaacatattgtcataattagagcacgaattataacaaatatgaacaattaatcatttact-caattaagcacttattcatac-aataattga |
14901537 |
T |
 |
| Q |
362 |
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402 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
14901538 |
aaaattgcaataaaatgattatgatgaaatttaaccccctta |
14901579 |
T |
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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
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Target Start/End: Original strand, 18276457 - 18276778
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177 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| | || ||| || | ||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||| | |||||| ||| || |||||| |
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|
| T |
18276457 |
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18276556 |
T |
 |
| Q |
178 |
caatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaaca |
276 |
Q |
| |
|
|| || ||||||| || ||||| ||| | ||| ||| ||||||||||| |||| || |||||||||| ||| || || ||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
18276557 |
catttagagcataatt-caacatataacactttcacatgctttgaacatgcaatttcaccaacaacaatttaattatcaccaatttcatgcattcaaaca |
18276655 |
T |
 |
| Q |
277 |
tgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataa |
374 |
Q |
| |
|
| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| ||| ||| |
|
|
| T |
18276656 |
tatcatcatatttagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcacatact-caattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaatcgcactaa |
18276753 |
T |
 |
| Q |
375 |
gtgattatga-tgaattctaacccc |
398 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
18276754 |
atgattatgattgaattctaacccc |
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T |
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Target: chr4; HSP #32
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127 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| | ||||| | || ||||| |||| | ||| | |||||| |||||||| | || ||| || | | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41256643 |
aaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatc |
41256544 |
T |
 |
| Q |
128 |
cattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatg |
226 |
Q |
| |
|
||| | |||| || ||||||||| | ||||||| || || |||||| ||||| ||||||| || || | ||||| ||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
41256543 |
aattaaacatggttctcatcacaattcaacaacaacctagcacaattcaacaatttgagcataatt-cacaatatatcattttcacatactatgaacatg |
41256445 |
T |
 |
| Q |
227 |
taattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaa |
326 |
Q |
| |
|
|||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
41256444 |
caatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcat-tcaacatttcatcataattagagcacgaatttcaacaactatgaacaattaatcac |
41256346 |
T |
 |
| Q |
327 |
ttaatccaattaagcactt |
345 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
41256345 |
tt-attcaattaagcactt |
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T |
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Target: chr4; HSP #33
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aaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatc |
127 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| | ||||| | || ||||| |||| | ||| | || |||||||||||| | || ||| || | |||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
7964985 |
aaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaaaatc |
7964886 |
T |
 |
| Q |
128 |
cattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatg |
226 |
Q |
| |
|
||| | ||||| || |||| |||| | |||||||||| || |||||| || || ||||||| || ||||| ||| | ||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
7964885 |
aattaaacatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcacatactt-gaacatg |
7964788 |
T |
 |
| Q |
227 |
taattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaa |
326 |
Q |
| |
|
|||| || |||||||||||||| || || ||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
7964787 |
caatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgtattcaaacatatcatcataattagagcacggattttaacaactatgaacaattactcac |
7964688 |
T |
 |
| Q |
327 |
ttaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatga-tgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| ||| |||| ||| |||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7964687 |
ttact-caattaagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaaccccctta |
7964611 |
T |
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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
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177 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | || ||| || | | |||||||||||||| ||| ||| | ||||| || ||||||||| | ||||||| || || |||||| |
|
|
| T |
15013506 |
acccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaatatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacctagcacaattcaa |
15013407 |
T |
 |
| Q |
178 |
caatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaaca |
276 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| || || | || || ||| |||||| |||||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| | |||| |
|
|
| T |
15013406 |
caatttgagcataatt-cacaatatgtcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcat-tcaaca |
15013309 |
T |
 |
| Q |
277 |
tgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt |
345 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| || || ||||||||||||| |
|
|
| T |
15013308 |
tatcatcataattagagcacgaatttaaacaactatgaacaattaatcactt-attcaattaagcactt |
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T |
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Target: chr4; HSP #35
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Q |
| |
|
|||||||||| |||| | | || ||| |||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||| | |||| ||||| | ||||||| || || ||||| |
|
|
| T |
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atacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattc |
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T |
 |
| Q |
176 |
accaattgagca |
187 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
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accaattgagca |
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T |
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Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
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19822022 |
caacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacatagcaacaacaacatcaattgaacatg |
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T |
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atacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattc |
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Q |
| |
|
|||||||||| |||| | | || ||| |||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||| | |||| ||||| | ||||||| || | ||||| |
|
|
| T |
31115651 |
atacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttaggaaaattc |
31115750 |
T |
 |
| Q |
176 |
accaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
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accaattgagcata |
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T |
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caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagca |
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Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||| | |||| ||||| | ||||||| || || ||||||||||||||||| |
|
|
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caacaacaacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagca |
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T |
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acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
177 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| | || |||||| | | |||||||||||||||||| ||| | |||||| || ||||||| | | |||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
13590298 |
acccaagctatgaatcatcaacaataatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaa |
13590199 |
T |
 |
| Q |
178 |
caatt |
182 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
13590198 |
caatt |
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T |
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177 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | || ||| || | | |||||||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||| | | ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
54398406 |
acccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacataacacaattcaa |
54398505 |
T |
 |
| Q |
178 |
caatt |
182 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
54398506 |
caatt |
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T |
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Target: chr4; HSP #41
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Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||||| ||||||| | || || | |||| | ||| | |||||||| |||||| | || ||| || | | ||||||||| |
|
|
| T |
18238440 |
attttcacgaaaccaacaacaacaacttatttcacatcactaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaac |
18238341 |
T |
 |
| Q |
119 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt |
182 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| | ||||| || ||||||||| | |||||||||| || |||||| ||||| |
|
|
| T |
18238340 |
aacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatt |
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T |
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| |
|
||||||||||||| ||||| |||||| | |||| ||||| | ||| ||| || || | ||||||||||||||||| ||||| |
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|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:
Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 54 - 402
Target Start/End: Original strand, 88274 - 88622
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54 |
aacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatt |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
88274 |
aacaacaaattatggatcatgcatacccaagccaagaattagcatccataacatcacttaacaacagcaacatctattgatcatgaaacttatcacaatt |
88373 |
T |
 |
| Q |
154 |
tatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcct |
253 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |
|
|
| T |
88374 |
catcaacaacatagcataattcaccaattgatcatattttcaacacatacccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacattttaattat |
88473 |
T |
 |
| Q |
254 |
ccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacaca |
353 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
88474 |
tcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattatagcacgaatttcatcatttatggacaattaatcaattcacccaattaaacacttttcataca |
88573 |
T |
 |
| Q |
354 |
aataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
88574 |
aataattgaaaatagcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
88622 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 21 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 132531 - 132149
Alignment:
| Q |
21 |
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120 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
132531 |
tttcaccaaaacaccaacaacatttcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaa |
132432 |
T |
 |
| Q |
121 |
caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttg |
220 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
132431 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacgatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttg |
132332 |
T |
 |
| Q |
221 |
aacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaatt |
320 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
132331 |
aacatataattcaacaaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttatgaacaatt |
132232 |
T |
 |
| Q |
321 |
aatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
132231 |
aatcaattcacccaattaagcacttttcatagaaataattgaaaaattgcaataagtgattatgatgaattccaaccccctta |
132149 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 27 - 402
Target Start/End: Original strand, 11659 - 12036
Alignment:
| Q |
27 |
caaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacat |
126 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
11659 |
caaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcataaccaagccatgaattatcatcaacaacgtcacttagcaacaacaacat |
11758 |
T |
 |
| Q |
127 |
ccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacat |
225 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
11759 |
caattgatcatgaaacttatcacaattctacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatgttttcaactcatatctttttctcatactttgaacat |
11858 |
T |
 |
| Q |
226 |
gtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatca |
325 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11859 |
gaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattgaaacatgtcatcataattagagcacgaaattcatcatttatgaacaattaatca |
11958 |
T |
 |
| Q |
326 |
attaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgca--ataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||| | |||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
11959 |
attgacccaattaagcacttattcatac-aataattg-aaattgcaccaaaaatgattatgatgaattctaaccacctta |
12036 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 178 - 402
Target Start/End: Original strand, 16022 - 16248
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| Q |
178 |
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277 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16022 |
caatggagcatattttcaactcatatcattttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacat |
16121 |
T |
 |
| Q |
278 |
gccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaac-aattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgca--ata |
373 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| | | |
|
|
| T |
16122 |
gtcatcataattagagcacggatttcatcatttatgaacaaattaatcaattcacccaattaagcacttgttcatac-aataattg-aaattgcaccaaa |
16219 |
T |
 |
| Q |
374 |
agtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16220 |
aatgattatgatgaattctaaccccctta |
16248 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 178 - 402
Target Start/End: Original strand, 25553 - 25779
Alignment:
| Q |
178 |
caattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacat |
277 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
25553 |
caatggagcatattttcaactcatatcattttctcatactttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattaaaacat |
25652 |
T |
 |
| Q |
278 |
gccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaac-aattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgca--ata |
373 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| | | |
|
|
| T |
25653 |
gtcatcataattagagcacggatttcatcatttatgaacaaattaatcaattcacccaattaagcacttgttcatac-aataattg-aaattgcaccaaa |
25750 |
T |
 |
| Q |
374 |
agtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25751 |
aatgattatgatgaattctaaccccctta |
25779 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 17 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 36890970 - 36890586
Alignment:
| Q |
17 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||| |||||| || |
|
|
| T |
36890970 |
ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcaacaacaaatcaagaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacatcacttagca |
36890871 |
T |
 |
| Q |
117 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcata |
215 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| |
|
|
| T |
36890870 |
acaacaacaacaattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacatagcataattcaccaattaagcatattttcaacatat-tccattttctcata |
36890772 |
T |
 |
| Q |
216 |
ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaa |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
36890771 |
ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgccatcacaattagagcacgaatttcatcatttatgaa |
36890672 |
T |
 |
| Q |
316 |
caattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | |||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36890671 |
caattaatcaattcacccaaataagcacttttcatac-cataattgaaaataacaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
36890586 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 402
Target Start/End: Original strand, 25601983 - 25602372
Alignment:
| Q |
14 |
tcaccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccactta |
113 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||| || |||| || || |
|
|
| T |
25601983 |
tcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacctaagccatgatttatcataaacaacatgacata |
25602082 |
T |
 |
| Q |
114 |
acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttca |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |
|
|
| T |
25602083 |
gcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaaccacatagcataactcaccaattgagcatattttcaacatatatcaatttctca |
25602182 |
T |
 |
| Q |
214 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatg |
313 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
25602183 |
tactttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagtacgaatttcatcatccatg |
25602282 |
T |
 |
| Q |
314 |
aacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25602283 |
aacaattaatcaattcacccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaaccccctta |
25602372 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 58 - 402
Target Start/End: Original strand, 271173 - 271516
Alignment:
| Q |
58 |
acaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatc |
157 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
271173 |
acaaatcatgaatcatgcaaacccaagctatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaac |
271272 |
T |
 |
| Q |
158 |
aacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccat |
257 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
271273 |
aacaacaaaacataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttcatacactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccat |
271372 |
T |
 |
| Q |
258 |
aacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaata |
357 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||| |
|
|
| T |
271373 |
aacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcttcatttatgaataattaatcaattcacccaattaagcacttttcatac-aata |
271471 |
T |
 |
| Q |
358 |
attg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
271472 |
attgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaaccccctta |
271516 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 58 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 4448377 - 4448033
Alignment:
| Q |
58 |
acaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatc |
157 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | | |
|
|
| T |
4448377 |
acaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcataattcaac |
4448278 |
T |
 |
| Q |
158 |
aacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccat |
257 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4448277 |
aacaacaaagcatcattcaccaattgaacatattttcaacacaaacccatttcatacactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccat |
4448178 |
T |
 |
| Q |
258 |
aacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaata |
357 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
4448177 |
aacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcactcaattaagcacttttcatataaata |
4448078 |
T |
 |
| Q |
358 |
attg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4448077 |
attgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaaccccctta |
4448033 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 402
Target Start/End: Original strand, 28974013 - 28974395
Alignment:
| Q |
19 |
attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac |
118 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| || |||||||| | ||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||| |
|
|
| T |
28974013 |
attttcactaaaacaccaacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaac |
28974112 |
T |
 |
| Q |
119 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatact |
217 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
28974113 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttaccacaattcatcaacaacatagcataattcgccaaatgagcatattttcaacatata-ccattttctcatact |
28974211 |
T |
 |
| Q |
218 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaaca |
317 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
28974212 |
ttgaacatgtaattcaattaacaacaattctattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaaca |
28974311 |
T |
 |
| Q |
318 |
attaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||||||| | | |||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28974312 |
attaatcaattcaccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgaaataa-tgattatgatgaattctaaccccctta |
28974395 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 398
Target Start/End: Original strand, 32465824 - 32466199
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| Q |
21 |
tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
32465824 |
tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaa |
32465923 |
T |
 |
| Q |
121 |
caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttg |
220 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32465924 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaagaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatatccatttttcatactttg |
32466022 |
T |
 |
| Q |
221 |
aacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaatt |
320 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
32466023 |
aacatacaattcaactaacaacaattcaatcattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaatt |
32466122 |
T |
 |
| Q |
321 |
aatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccc |
398 |
Q |
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32466199 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
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Target Start/End: Complemental strand, 23836993 - 23836606
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113 |
Q |
| |
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| T |
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23836894 |
T |
 |
| Q |
114 |
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213 |
Q |
| |
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|
| T |
23836893 |
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23836795 |
T |
 |
| Q |
214 |
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311 |
Q |
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| T |
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23836696 |
T |
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312 |
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402 |
Q |
| |
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|
| T |
23836695 |
tgaacaattaatcaattcatctaattaagcacttatcattcaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaaccccctta |
23836606 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
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Target Start/End: Complemental strand, 25876204 - 25875821
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| Q |
17 |
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116 |
Q |
| |
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| T |
25876204 |
ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaataacaagccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaca |
25876105 |
T |
 |
| Q |
117 |
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216 |
Q |
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| T |
25876104 |
ataacaacaacatttgatcatgaagcatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccatttt-catac |
25876007 |
T |
 |
| Q |
217 |
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314 |
Q |
| |
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25875908 |
T |
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402 |
Q |
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|
| T |
25875907 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
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Target Start/End: Original strand, 27261772 - 27262151
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120 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||| |
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| T |
27261772 |
tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttcttaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaa |
27261871 |
T |
 |
| Q |
121 |
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220 |
Q |
| |
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| T |
27261872 |
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27261968 |
T |
 |
| Q |
221 |
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320 |
Q |
| |
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| T |
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27262068 |
T |
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| Q |
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402 |
Q |
| |
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|
|
| T |
27262069 |
aatcaattcatccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaactccctta |
27262151 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
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Target Start/End: Complemental strand, 24571574 - 24571195
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118 |
Q |
| |
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||||| ||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||| ||| |||||| |||| ||||||||||| |
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| T |
24571574 |
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T |
 |
| Q |
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217 |
Q |
| |
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| T |
24571475 |
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T |
 |
| Q |
218 |
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317 |
Q |
| |
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| T |
24571376 |
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24571277 |
T |
 |
| Q |
318 |
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400 |
Q |
| |
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| T |
24571276 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
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Target Start/End: Complemental strand, 22580106 - 22579763
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154 |
Q |
| |
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| T |
22580106 |
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22580009 |
T |
 |
| Q |
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252 |
Q |
| |
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| T |
22580008 |
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22579911 |
T |
 |
| Q |
253 |
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351 |
Q |
| |
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| T |
22579910 |
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22579813 |
T |
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| Q |
352 |
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402 |
Q |
| |
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22579812 |
c-aataattgaaaaattgcaat-agtgattatgatgaattctaaccccctta |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 402
Target Start/End: Original strand, 67954 - 68341
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116 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| | || ||||| |||||| ||| | || |||||||||||| | || ||| || | |||||| || |
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| T |
67954 |
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68053 |
T |
 |
| Q |
117 |
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215 |
Q |
| |
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| T |
68054 |
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68152 |
T |
 |
| Q |
216 |
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315 |
Q |
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| T |
68153 |
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68252 |
T |
 |
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402 |
Q |
| |
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|
|
| T |
68253 |
caattaatctattact-caattaagcacttattcatac-aacaattgaaaatttatactaaaaatgattatgatgaattctaaccccctta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
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Target Start/End: Complemental strand, 9653189 - 9653021
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Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
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|
| T |
9653189 |
cattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaaca |
9653090 |
T |
 |
| Q |
117 |
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185 |
Q |
| |
|
||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
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|
| T |
9653089 |
acatcaacatctattgatcatgaaaaatatcgcaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21274341 - 21274174
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115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |
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|
| T |
21274341 |
ccattttcaccaaaccaacaaca-caacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgc-tacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaac |
21274244 |
T |
 |
| Q |
116 |
aacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgag |
185 |
Q |
| |
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|
|
| T |
21274243 |
aacaacaacatctattgatcatgaaacatattacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgag |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 56 - 402
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| Q |
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155 |
Q |
| |
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|||||| | |||||| ||||| ||| | ||||||| ||| |||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||| || ||| ||||| |||||| | |
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| T |
31146426 |
caacaattcatgaattatgcacacctaggccatgatttatcatcaacaacatcacttagcaacagtaacatcaattgaacaggaatcttattacaattca |
31146327 |
T |
 |
| Q |
156 |
tcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctc |
254 |
Q |
| |
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||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |
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| T |
31146326 |
acaaca-catagcataattcaacaatttgagcatattt-caacatatatcactttctcatactttgaacataaaatttctctaacaacaattcaattatc |
31146229 |
T |
 |
| Q |
255 |
cataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacaca |
353 |
Q |
| |
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| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||||||| | || |||||||||| |||| ||| |
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| T |
31146228 |
aacaacttcatgcattcaaacataccatcataattggaacacgaattctaacaattatggacaattaatcaattact-cagttaagcacttattcataca |
31146130 |
T |
 |
| Q |
354 |
aataattgaaaatt---gcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
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| | ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
31146129 |
acaatttgaaaatttacacaaaagatgattatgatgaattctaaccccctta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
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Query Start/End: Original strand, 58 - 325
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Q |
| |
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| T |
43645896 |
acaaatcatgaattatgaacacccaagtcatgaatcatcgacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgattcttaccacagttcaac |
43645995 |
T |
 |
| Q |
158 |
aacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctcca |
256 |
Q |
| |
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|
| T |
43645996 |
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43646094 |
T |
 |
| Q |
257 |
taacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatca |
325 |
Q |
| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
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| |
|
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 |
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acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
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| |
|
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|
|
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22274856 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
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Query Start/End: Original strand, 14 - 189
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| |
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22283915 |
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T |
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acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
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||| ||| |||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22284014 |
acatcaaaaacaacgattgatcatgaaacacatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
22284089 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
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Query Start/End: Original strand, 281 - 398
Target Start/End: Original strand, 722617 - 722733
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281 |
atcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgat |
379 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||| || || ||||| |||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
722617 |
atcataattggagcacgaattttaacaattatgaacaattaatcatttact-caattaagcacttattcatac-aacaattgcaaattgcactaaatgat |
722714 |
T |
 |
| Q |
380 |
tatgatgaattctaacccc |
398 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
722715 |
tatgatgaattctaacccc |
722733 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 231
Target Start/End: Original strand, 25305425 - 25305622
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35 |
caacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgat |
134 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||| | |||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||| | || ||| |||| |||||| | ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
25305425 |
caacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaggccatgaatcatcaacaacaacatcacttagccacaacaacatcaattgaa |
25305524 |
T |
 |
| Q |
135 |
catgaaacttatcacaatttatcaa-caacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaatt |
231 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||| | ||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
25305525 |
catgactcttaccacaattcaacaatcaacatagcataattcaacaatttgagcata-attcaacacatatcactttctcatactttgaacatgaaatt |
25305622 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
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Target Start/End: Original strand, 6879460 - 6879591
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78 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
177 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||| |||||| |||| ||| || |||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
6879460 |
acccaagacatgtattatcatcaacaacatgactaaataacaacaacaacaattgatcattaaacatatcacaattcatcaataacaatgcataattcac |
6879559 |
T |
 |
| Q |
178 |
caattgagcatattttcaacacatatccatttt |
210 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
6879560 |
caattgagtatattttc-acacatacccatttt |
6879591 |
T |
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Target: chr2; HSP #22
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Target Start/End: Original strand, 19666501 - 19666875
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28 |
aaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatc |
127 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| ||||| | || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | || | | || | |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
19666501 |
aaaccaacaacaacaatccatttctcatcatcaaaacatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacgacaatatcacttagcaacaacaacatc |
19666600 |
T |
 |
| Q |
128 |
cattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatg |
226 |
Q |
| |
|
||||| |||| || |||| |||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || || | || | || | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
19666601 |
aattgaacatggttctcatcataattcaataacaacatagcataattcaaccatttgagcataatt-cataagttaacacttatacatactttgaacatg |
19666699 |
T |
 |
| Q |
227 |
taattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaa |
326 |
Q |
| |
|
|| | || || ||||||||||| || || ||||| ||| |||||| ||| ||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
19666700 |
caaattcaccaaaaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcattatagttagagcatgaattttaacaactatgaacaattaatcac |
19666799 |
T |
 |
| Q |
327 |
ttaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaa-ttgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||| || |||| |||| |||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19666800 |
ttattc-aattaagcatttattcatacaa-taattgaaaaattacactaaatgattatgatgaattctaaccccctta |
19666875 |
T |
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Target: chr2; HSP #23
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| Q |
17 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| | || ||||| |||||| ||| | ||||| ||||||||| | || ||| || | |||||| || |
|
|
| T |
23821890 |
ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatgaattatgaacacccatgccatgaatcatcaacaacaatatcacttagca |
23821791 |
T |
 |
| Q |
117 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca |
176 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |||||| || |||| |||| | ||| |||||| || |||||| |
|
|
| T |
23821790 |
acaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaataacatagcacaattca |
23821731 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23830969 - 23830810
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| Q |
17 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| | || ||||| |||||| ||| | ||||| ||||||||| | || ||| || | |||||| || |
|
|
| T |
23830969 |
ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatgaattatgaacacccatgccatgaatcatcaacaacaatatcacttagca |
23830870 |
T |
 |
| Q |
117 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca |
176 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |||||| || |||| |||| | ||| |||||| || |||||| |
|
|
| T |
23830869 |
acaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaataacatagcacaattca |
23830810 |
T |
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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 23821714 - 23821597
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| Q |
227 |
taattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaa |
326 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || | |||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
23821714 |
taattcaatcaacaacaattcaattatcaacaacttcctgcattcaaacataacatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcac |
23821615 |
T |
 |
| Q |
327 |
ttaatccaattaagcactt |
345 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
23821614 |
ttact-caattaagcactt |
23821597 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 23830793 - 23830676
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| Q |
227 |
taattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaa |
326 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| || | |||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
23830793 |
taattcaatcaacaacaattcaattatcaacaacttcctgcattcaaacataacatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcac |
23830694 |
T |
 |
| Q |
327 |
ttaatccaattaagcactt |
345 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
23830693 |
ttact-caattaagcactt |
23830676 |
T |
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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 19669346 - 19669012
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| Q |
65 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaaca |
164 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||||||| | || |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||| | |||| |||| | |||||||| |
|
|
| T |
19669346 |
atgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatggttcacatcataattcaacaacaaca |
19669247 |
T |
 |
| Q |
165 |
taacataattc-accaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttc |
263 |
Q |
| |
|
|| |||||||| ||||||| ||||| |||| | || | || ||||||| ||||||| |||| || |||||||| ||||| || || ||| |
|
|
| T |
19669246 |
tatcataattcaaccaattaagcat-gattcacaagttaacacttacacatacttagaacatgcaatttcaccaacaacaactcaattatcatcaatttc |
19669148 |
T |
 |
| Q |
264 |
atacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg- |
361 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||| || |||| |||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||| || |||||||| |
|
|
| T |
19669147 |
atgcatacaaacatatcaccatagttagagcatggattttaacatctatgaacaattaatc-atttatccaattaatcacttattcatac-aataattga |
19669050 |
T |
 |
| Q |
362 |
aaaattgcaat-aagtgattatgatgaattctaacccc |
398 |
Q |
| |
|
|||||| || | || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19669049 |
aaaattacactaaaatgattatgatgaattctaacccc |
19669012 |
T |
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Target: chr2; HSP #28
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Target Start/End: Complemental strand, 25265635 - 25265520
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72 |
atgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacata |
171 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | | | ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| |||| || |||| |||| | |||||||||| || | |
|
|
| T |
25265635 |
atgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaa |
25265536 |
T |
 |
| Q |
172 |
attcaccaattgagca |
187 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
25265535 |
attcaccaattgagca |
25265520 |
T |
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Target: chr2; HSP #29
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Target Start/End: Complemental strand, 19433606 - 19433452
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| Q |
28 |
aaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatc |
127 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| | ||||| | |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||| || | | |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
19433606 |
aaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttagcaacaacaacatc |
19433507 |
T |
 |
| Q |
128 |
cattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt |
182 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||| |||||| | ||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19433506 |
aattgaacatgattcttacaacaattcaataacaacatagcataattcaacaatt |
19433452 |
T |
 |
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Target: chr2; HSP #30
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280 |
catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt |
345 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
24087409 |
catcataattagagcccgaattttaacatttatgaataattaatcacttact-caattaagcactt |
24087345 |
T |
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Target: chr2; HSP #31
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atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaa |
140 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||||||||| | |||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
3478 |
atgaattatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaa |
3403 |
T |
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Target: chr2; HSP #32
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caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttca |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||| | | |||||||| ||||||||| || |||| || | ||||||| |||| ||| ||| |
|
|
| T |
22775392 |
caacaacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaactacaacatagcataattcataaatttgaacaca-attcaacatatataactttctca |
22775294 |
T |
 |
| Q |
214 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaatt |
301 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | || || |||||||||||||| | | |||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
22775293 |
tactttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
22775206 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #33
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caacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttca |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||| | | |||||||| ||||||||| || |||| || | ||||||| |||| ||| ||| |
|
|
| T |
22780770 |
caacaacaacttcaattgaacatgaatcttatcacaattcaactacaacatagcataattcataaatttgaacaca-attcaacatatataactttctca |
22780672 |
T |
 |
| Q |
214 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaatt |
301 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | || || |||||||||||||| | | |||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
22780671 |
tactttgaacatgaagtttcaccaacaacaattcaattaccaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt |
22780584 |
T |
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Target: chr2; HSP #34
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ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaatt-atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaac |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||| | ||||| | |||| | ||| |||||||||| |||||| | || ||| || | | |||||| |
|
|
| T |
6094678 |
ccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatt-ccacatcacaaactcatgatttatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaac |
6094776 |
T |
 |
| Q |
116 |
aacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| | ||||| || ||||||| | | ||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
6094777 |
aacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacataacacaattcaacaatt |
6094843 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #35
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58 |
acaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaa |
140 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||| |||| |||||||||||| | |||||| | || |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
24294767 |
acaaatcatgaattatgaatactcaagccatgaatcatcatcaacatcatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaa |
24294685 |
T |
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gaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
17366958 |
gaaaattacaataagtgattatgattaattctaaccccctta |
17366999 |
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Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
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aattgaatattacaataagtgattatgatgaattctaaccctctta |
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T |
 |
Back To:
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Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 24341595 - 24341519
Alignment:
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111 |
ttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagca |
187 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||| |||||| | |||| ||||| | ||||||| || || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24341595 |
ttaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagca |
24341519 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 182
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| Q |
35 |
caacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgat |
134 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| | || ||||| |||| | ||| ||||||||| |||||| | || ||| || | | |||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
24277741 |
caacaacaacttatttcacatcatcaaatcatgatttatgagtacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcatttaaa |
24277840 |
T |
 |
| Q |
135 |
catgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt |
182 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
24277841 |
catgattctcatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacaatt |
24277888 |
T |
 |
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Target: chr2; HSP #40
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Target Start/End: Original strand, 25305634 - 25305720
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| Q |
258 |
aacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt |
345 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
25305634 |
aacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattataacaactttgaacaattaatcatttact-caattaagcactt |
25305720 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
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Target Start/End: Original strand, 9636707 - 9636940
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| Q |
17 |
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116 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||| ||||||||| ||||||| | || || | |||| | ||| |||||||| | |||||| | || ||| || | | ||||||| |
|
|
| T |
9636707 |
ccattttaacaaaaccaacaacaacaagttatttcacatcacaaactcatgatttatgaatacccaaactatgaatcatcaacaacaatatctcttaaca |
9636806 |
T |
 |
| Q |
117 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcata |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||| | |||||||||| || |||||| ||||| ||||||| |||| | ||||| ||| |||| |
|
|
| T |
9636807 |
acaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcata-attcacaatatatcattttcacata |
9636905 |
T |
 |
| Q |
216 |
ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaat |
250 |
Q |
| |
|
|| |||||||| |||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
9636906 |
ctatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaat |
9636940 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #42
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Target Start/End: Original strand, 16935557 - 16935591
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| Q |
17 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttc |
51 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16935557 |
ccattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttc |
16935591 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 51
Target Start/End: Original strand, 17006217 - 17006251
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| Q |
17 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttc |
51 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17006217 |
ccattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttc |
17006251 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 329
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Alignment:
| Q |
280 |
catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaatta |
329 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| || || | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24294545 |
catcataattggagcacgaattctaacaatcatgaacaattaatcaatta |
24294496 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:
Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 21 - 402
Target Start/End: Original strand, 22657 - 23038
Alignment:
| Q |
21 |
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120 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||| | ||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||| |
|
|
| T |
22657 |
tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaataacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacaaaacaacaa |
22756 |
T |
 |
| Q |
121 |
caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttg |
220 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22757 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaaaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatactttg |
22856 |
T |
 |
| Q |
221 |
aacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaatt |
320 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22857 |
aacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcaaaacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaatt |
22956 |
T |
 |
| Q |
321 |
aatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22957 |
aatcaattcatccaattaagcacttttgatacaaataattgaaaattacaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
23038 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 53)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 402
Target Start/End: Original strand, 20481567 - 20481950
Alignment:
| Q |
17 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
20481567 |
ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatcaacaacatgacttaaca |
20481666 |
T |
 |
| Q |
117 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20481667 |
acaacaacatcaattgatcatgcaacttatcacaattcatcaacaacaaagtataattcaccaattgagcatattatcaacacatatccatttttcatac |
20481766 |
T |
 |
| Q |
217 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaac |
316 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
20481767 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatccatgaac |
20481866 |
T |
 |
| Q |
317 |
aattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| |||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
20481867 |
aaataatcaatt-atccaattaagcacttattcatac-attaattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattttaaccccctta |
20481950 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 21 - 402
Target Start/End: Original strand, 41246624 - 41247004
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| Q |
21 |
tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
41246624 |
tttcaccaaaacaccaacaacatttcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaa |
41246723 |
T |
 |
| Q |
121 |
caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttg |
220 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
41246724 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattaagcatattt-catcatatacccatttttcctactttt |
41246822 |
T |
 |
| Q |
221 |
aacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaatt |
320 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
41246823 |
aacatgtaattcaaccaacaacaatttaattattcataacttcatacatctaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaaaaatt |
41246922 |
T |
 |
| Q |
321 |
aatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
41246923 |
aatcaattcatccaattaagcacttttcatacaactaattgaaaattacaataagtgattatgatgaactctaaccccctta |
41247004 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 20573474 - 20573092
Alignment:
| Q |
19 |
attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||| | ||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||| |
|
|
| T |
20573474 |
attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaac |
20573376 |
T |
 |
| Q |
119 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactt |
218 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||| |
|
|
| T |
20573375 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaggataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccttttcatacactt |
20573276 |
T |
 |
| Q |
219 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaa |
318 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
20573275 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaa |
20573176 |
T |
 |
| Q |
319 |
ttaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20573175 |
ttaatcaattcacccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaaccccctta |
20573092 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 14 - 402
Target Start/End: Original strand, 37611627 - 37612015
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| Q |
14 |
tcaccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaatt-atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccactt |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| || |||||||| || ||||| | |||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |
|
|
| T |
37611627 |
tcaccattttcatcaaaacaccaacaacatttcatttctccataacaaaatcatgaattatgca-acccaagccatgaattatcatcaaccacatgactt |
37611725 |
T |
 |
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aacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttc |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
37611726 |
aacaacaacaacaacaattgatcatgaaacttttcacaattcatcaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttt-c |
37611824 |
T |
 |
| Q |
213 |
atac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcattt |
310 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
37611825 |
atacactttgaacatgtaattcaactaaca-caattcaattatttataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcactt |
37611923 |
T |
 |
| Q |
311 |
atgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37611924 |
atgaacaattaatcaattcatctaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattataataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
37612015 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 123 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 20561810 - 20561531
Alignment:
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123 |
acatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaa |
222 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||| ||| | |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
20561810 |
acatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattaaacataatttcaacatataccaatttctcatactttgaa |
20561711 |
T |
 |
| Q |
223 |
catgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaa |
322 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20561710 |
catgtaattcaactaacaacaattcaattatctataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaa |
20561611 |
T |
 |
| Q |
323 |
tcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20561610 |
tcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaaccccctta |
20561531 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 19993342 - 19992957
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| |
|
||||||||||||||||| || |||||||| | ||||| |||||||| | |||| ||||| |||| |||||||||||| |||||| |||| ||| | |
|
|
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19993342 |
tcaccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaatccaagaattatgcaaaccctagccatgaattatcatcaacaacatgactaa |
19993243 |
T |
 |
| Q |
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acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttca |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |
|
|
| T |
19993242 |
acaacaacaacaacaattgatgatgaaatttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttca-cacatacccatttt-ca |
19993145 |
T |
 |
| Q |
214 |
tac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcattta |
311 |
Q |
| |
|
||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
19993144 |
tacactttgaacaagtaattcaactaaca-caattcaattattcataacttcgtacatctaaacatgtcatcataattagagtacggatttcatcattta |
19993046 |
T |
 |
| Q |
312 |
tgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
19993045 |
tgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattg-aaattacaa-aagtgattatgatgaattataaccccctta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 54 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 22235051 - 22234705
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| |
|
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|
|
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aacaacaaaccaagaattatgcaaacccaatccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaatt |
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T |
 |
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tatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatc |
251 |
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22234705 |
T |
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Target: chr8; HSP #8
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Target Start/End: Original strand, 21681002 - 21681351
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Q |
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T |
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253 |
Q |
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T |
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Target: chr8; HSP #9
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118 |
Q |
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| T |
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T |
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217 |
Q |
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| T |
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39446851 |
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317 |
Q |
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| T |
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39446751 |
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402 |
Q |
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39446750 |
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T |
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Q |
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T |
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254 |
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20653953 |
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263 |
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Q |
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T |
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212 |
Q |
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T |
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312 |
Q |
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T |
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313 |
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Q |
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Q |
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25122717 |
T |
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| Q |
331 |
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402 |
Q |
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| T |
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T |
 |
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249 |
Q |
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T |
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Target Start/End: Complemental strand, 21198439 - 21198049
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Q |
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21198439 |
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21198340 |
T |
 |
| Q |
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213 |
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| |
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| T |
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21198241 |
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 |
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313 |
Q |
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| T |
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21198141 |
T |
 |
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314 |
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404 |
Q |
| |
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| T |
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Q |
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T |
 |
| Q |
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Q |
| |
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274505 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
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Q |
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ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgattcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaaca |
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| Q |
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Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
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T |
 |
| Q |
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acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
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Q |
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827150 |
ataacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgaacata |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
117 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
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T |
 |
| Q |
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tcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcct |
253 |
Q |
| |
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acaacaacatagcataattcaataatttgagcata-tttcaacatata-ccattttctcatactttgaacatgagatttctctaacaacaattcaattat |
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T |
 |
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254 |
ccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaatta |
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| |
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| | |||||||| ||| |||||| |||||||||| ||| ||||||| || || ||||||||||||| ||||||| |
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Target Start/End: Original strand, 22981351 - 22981617
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caactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaat |
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ccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
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| |
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ccaattaagcacttattcatacaa--aattgaaaaattgcaatatatgattatgatgaattctaaccccctta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 41507105 - 41506930
Alignment:
| Q |
14 |
tcaccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccactta |
113 |
Q |
| |
|
|||||| || ||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || | ||| | |
|
|
| T |
41507105 |
tcaccaattccactaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaatatgactaa |
41507006 |
T |
 |
| Q |
114 |
acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41507005 |
acaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
41506930 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 24386037 - 24385916
Alignment:
| Q |
17 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaa-ttatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaac |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |
|
|
| T |
24386037 |
ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttacttcataacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataaaatcacttaac |
24385938 |
T |
 |
| Q |
116 |
aacaacaacatccattgatcat |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
24385937 |
aacaacaacatctattgatcat |
24385916 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Original strand, 39115239 - 39115409
Alignment:
| Q |
18 |
cattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaa |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| | | ||| ||||| |
|
|
| T |
39115239 |
cattttcaccaa-ccaacaataacaatttatttctcaacaataaattatgaatcatgcatacacaagtcatgaattatcatcaaccatatgactaaacaa |
39115337 |
T |
 |
| Q |
118 |
caacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39115338 |
caacaacaaccattgatcatgaaacatatcacgattcatcaacaactatgcataattcaccaattgagcata |
39115409 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 312 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 20529843 - 20529753
Alignment:
| Q |
312 |
tgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
20529843 |
tgaacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattataaccccctta |
20529753 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 325
Target Start/End: Original strand, 26011467 - 26011764
Alignment:
| Q |
28 |
aaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatc |
127 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||| ||| | || ||||| |||| | ||| | ||||||||||||||| | || ||| || | |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
26011467 |
aaaccaacaacaacaacttaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatc |
26011566 |
T |
 |
| Q |
128 |
cattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatg |
226 |
Q |
| |
|
||| | |||||| || ||||||||| | |||||||||| || |||||| || || ||||||| || ||||| ||| | ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
26011567 |
aattcaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacatttagagcataatt-caacatataacactttcacatactttgaacatg |
26011665 |
T |
 |
| Q |
227 |
taattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatca |
325 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
26011666 |
taatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatca |
26011764 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 78 - 402
Target Start/End: Original strand, 15933321 - 15933646
Alignment:
| Q |
78 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
177 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | || ||| || | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || |||| |||| | ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15933321 |
acccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaacaacataacacaattcaa |
15933420 |
T |
 |
| Q |
178 |
caatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaaca |
276 |
Q |
| |
|
|| || ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
15933421 |
catttagagcataatt-caacatttaacactttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaaca |
15933519 |
T |
 |
| Q |
277 |
tgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataa |
374 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||| || ||| |
|
|
| T |
15933520 |
tatcatcataattagagcacaaattttaacaactatgaacaattaatcacttact-caattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaa |
15933617 |
T |
 |
| Q |
375 |
gtgattatga-tgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
15933618 |
atgattatgatttaattctaaccccctta |
15933646 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 24717158 - 24716983
Alignment:
| Q |
14 |
tcaccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccactta |
113 |
Q |
| |
|
|||||| ||| || |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||| || | ||| | |
|
|
| T |
24717158 |
tcaccaattttacaaaaccaccaacaacaatccatttatcaacaacaaattatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaa |
24717059 |
T |
 |
| Q |
114 |
acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24717058 |
acatcaacaacaaccattgaacatgaaacaaatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
24716983 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 78 - 402
Target Start/End: Original strand, 5854637 - 5854962
Alignment:
| Q |
78 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
177 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | || ||| || | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||| | |||||||||| || || ||| |
|
|
| T |
5854637 |
acccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaactcaa |
5854736 |
T |
 |
| Q |
178 |
caatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaaca |
276 |
Q |
| |
|
|| || ||||||| || ||||| ||| | ||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
5854737 |
catttagagcataatt-caacatataacactttcatatactttgaacatgctatttcaccaacaacaattcaattatcgccaatttcatgcattcaaaca |
5854835 |
T |
 |
| Q |
277 |
tgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataa |
374 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||| || ||| |
|
|
| T |
5854836 |
tatcatcataattagagcacgaattttaacaactatgaacaattaatcacttact-caattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaa |
5854933 |
T |
 |
| Q |
375 |
gtgattatga-tgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
5854934 |
atgattatgattgaattctaacctcctta |
5854962 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 192 - 345
Target Start/End: Original strand, 17285341 - 17285493
Alignment:
| Q |
192 |
ttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattag |
291 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
17285341 |
ttcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcatttaaacatatcatcataattgg |
17285440 |
T |
 |
| Q |
292 |
agcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt |
345 |
Q |
| |
|
|||||||||| || || ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
17285441 |
agcacgaattctaacaattatgaacaattattcaatt-attcaattaagcactt |
17285493 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 310 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 7000616 - 7000525
Alignment:
| Q |
310 |
tatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
7000616 |
tatgaacaattaatcaattcatcctattaagcacttatcatacaaataattgaaaatt-aaaaaagtgattatgatgaaaactaaccccctta |
7000525 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 280 - 402
Target Start/End: Original strand, 15970046 - 15970168
Alignment:
| Q |
280 |
catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtg |
377 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| || |||| || |||||||| ||||||||| ||| || |
|
|
| T |
15970046 |
catcataattggagcacgaattttaacaattatgaacaattaatcatttact-caattaagcatttattcatac-aataattgaaaaattgcactaaatg |
15970143 |
T |
 |
| Q |
378 |
attatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
15970144 |
attatgatgaattccaaccccctta |
15970168 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 22736084 - 22735958
Alignment:
| Q |
56 |
caacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaattta |
155 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| |||| || ||| ||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
22736084 |
caacaattcatgaattatgcacacccaagccatgaattaacaacaacaacatcagttagcaagaacaacatcaattgaacatgaatcttatcacaatcca |
22735985 |
T |
 |
| Q |
156 |
tcaacaacataacataattcaccaatt |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
22735984 |
acaacaacatagtataattcatcaatt |
22735958 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 59 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 23226319 - 23225982
Alignment:
| Q |
59 |
caaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatca |
158 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||| || | |||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||| |||| | || |
|
|
| T |
23226319 |
caaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaaca |
23226220 |
T |
 |
| Q |
159 |
acaacataacataattc-accaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccat |
257 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | || ||||||||| |||| | || | || | |||||||| ||||| || | || |||||||| ||||| || |
|
|
| T |
23226219 |
acaacataacataattcaatcatttgagcata-attcataagttaacacttatacatacttttgacatgcaaattcaccaacaacaactcaattatcatc |
23226121 |
T |
 |
| Q |
258 |
aacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcac-ttttcacacaaat |
356 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| || ||| |
|
|
| T |
23226120 |
aatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacaaattttaacatctatgaacaattaatc----attccaattaaacactttttcatac-aat |
23226026 |
T |
 |
| Q |
357 |
aattg-aaaattgcaat-aagtgattatgatgaattctaacccc |
398 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23226025 |
aattgaaaaattgcactaaaatgattatgatgaattctaacccc |
23225982 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 345
Target Start/End: Original strand, 29306470 - 29306706
Alignment:
| Q |
108 |
cacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatcca |
206 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| ||| | |||||| || ||||||||| | |||||||||| || |||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
29306470 |
cacttagcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcata-attcaacatatatcat |
29306568 |
T |
 |
| Q |
207 |
tttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatc |
306 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||| || | || |||||||||||||| || ||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
29306569 |
tttcacaaactttgaacatacaaattcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgcattagaacatatcatcatagttagagcacgaatattaac |
29306668 |
T |
 |
| Q |
307 |
atttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt |
345 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||||| || || ||||||||||||| |
|
|
| T |
29306669 |
atctatgaacaatcaatcactt-attcaattaagcactt |
29306706 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 38635915 - 38635768
Alignment:
| Q |
35 |
caacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgat |
134 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||| | ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| | || ||| || | | |||||||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
38635915 |
caacaacaacttgtttctcatcaacaaattatgattcatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaattaaa |
38635816 |
T |
 |
| Q |
135 |
catgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt |
182 |
Q |
| |
|
||||| || |||| |||| | ||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
38635815 |
catgattctcatcataattcaacaacaacataacacaattcaacaatt |
38635768 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 137
Target Start/End: Original strand, 25122542 - 25122618
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| Q |
60 |
aaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcat |
137 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
25122542 |
aaatcatgaatcatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatctattgatcat |
25122618 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
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19 |
attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||| | ||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||| |
|
|
| T |
20567440 |
attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaac |
20567342 |
T |
 |
| Q |
119 |
aacaacatc |
127 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
20567341 |
aacaacatc |
20567333 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 20573633 - 20573526
Alignment:
| Q |
19 |
attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||| | ||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||| |
|
|
| T |
20573633 |
attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaac |
20573535 |
T |
 |
| Q |
119 |
aacaacatc |
127 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
20573534 |
aacaacatc |
20573526 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 27233352 - 27233193
Alignment:
| Q |
17 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca |
116 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||| ||||||||| ||||||| | | ||||| |||| | ||| | ||||||||||||||| | || ||| || | | ||||||| |
|
|
| T |
27233352 |
ccatttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcattatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaaca |
27233253 |
T |
 |
| Q |
117 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca |
176 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||| | ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
27233252 |
acaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacataacacaattca |
27233193 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 345
Target Start/End: Original strand, 23149785 - 23150068
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| Q |
59 |
caaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatca |
158 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||| |||| |||||||||||| | || ||| |||| |||||| |||||| |||| | ||||| ||||| || |||| |||| || |
|
|
| T |
23149785 |
caaatcatgaattatgaatactcaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaaaaacaactattgaacatgattctcatcataatt---ca |
23149881 |
T |
 |
| Q |
159 |
acaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaa-catgtaattcaactaacaacaattcaatcctcca |
256 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||||| ||||||||||||| || || |||| | ||| |||| |||||| |||| |||| || |||||||||||| | || |
|
|
| T |
23149882 |
acaacttagcataattcaaccaattgagcataattcatac-cataccactttcacatattttgaatcatgaaatttcaccaacaacaattcatttatcac |
23149980 |
T |
 |
| Q |
257 |
taacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt |
345 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
23149981 |
tagtttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattttaacaattatgaacaattaatcatttact-caattaagcactt |
23150068 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 189
Target Start/End: Original strand, 23158167 - 23158295
Alignment:
| Q |
59 |
caaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatca |
158 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||| | ||||| |||| || |||| |||| | || |
|
|
| T |
23158167 |
caaatcatgaattatgaacacccaagccatgaat---catcaacaacatcacttaggaacaacaacaactattgaacatggttctcatcataattcaaca |
23158263 |
T |
 |
| Q |
159 |
acaacataacataattc-accaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
23158264 |
acaacataacataattcaaccaattgagcata |
23158295 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #42
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Query Start/End: Original strand, 19 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 20567281 - 20567195
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| Q |
19 |
attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataaca |
106 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||| | ||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
20567281 |
attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaaca-caaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaaca |
20567195 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 402
Target Start/End: Original strand, 33528607 - 33528773
Alignment:
| Q |
237 |
aacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaat |
336 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || | || ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| | || | ||| || ||||||||||||| || || |||| |
|
|
| T |
33528607 |
aacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacggaattcaacatctaagaacaattaatcactt-attcaat |
33528705 |
T |
 |
| Q |
337 |
taagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatga-tgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||| ||| |||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33528706 |
taagcacttaatcatacaacaaatgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaaccccctta |
33528773 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 24552762 - 24552690
Alignment:
| Q |
110 |
cttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
24552762 |
cttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaattaacaacaacataacacaattcaacaatt |
24552690 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #45
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Query Start/End: Original strand, 272 - 404
Target Start/End: Original strand, 23158378 - 23158507
Alignment:
| Q |
272 |
aaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgca |
370 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||| |||| |||| | ||||||| || |
|
|
| T |
23158378 |
aaacatatcatcataattggagcatgaattttaacaattatgaacaattaatcatttact-caaataagcacttattcatacaacaa---gaaaattaca |
23158473 |
T |
 |
| Q |
371 |
ataagtgattatgatgaattctaacccccttatc |
404 |
Q |
| |
|
||| ||||||| ||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
23158474 |
ctaaatgattataatgaattataactcccttatc |
23158507 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 216 - 323
Target Start/End: Original strand, 25296319 - 25296426
Alignment:
| Q |
216 |
ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaa |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| || |||| ||||||||| || ||| ||||| ||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
25296319 |
ctttgaacatgcaatttcaccaacagcaattcaattatcattaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagggcacgaattttaacatgtatgaa |
25296418 |
T |
 |
| Q |
316 |
caattaat |
323 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
25296419 |
caattaat |
25296426 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 216 - 323
Target Start/End: Original strand, 25758339 - 25758446
Alignment:
| Q |
216 |
ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaa |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| || |||| ||||||||| || ||| ||||| ||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
25758339 |
ctttgaacatgcaatttcaccaacagcaattcaattatcattaatttcatgcattcaaacatatcatcatagttagggcacgaattttaacatgtatgaa |
25758438 |
T |
 |
| Q |
316 |
caattaat |
323 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
25758439 |
caattaat |
25758446 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 88
Target Start/End: Original strand, 29759904 - 29759975
Alignment:
| Q |
17 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccat |
88 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
29759904 |
ccatttacaccaaaacaccaacaacaaaccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccat |
29759975 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 280 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 31194346 - 31194222
Alignment:
| Q |
280 |
catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaa-ttgca--ataag |
375 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||| || || ||||||||| ||||| | || |
|
|
| T |
31194346 |
catcgtaattagagcacgaattctaacaatcatgaacaattaatcaattact-caattaagcaattattcatac-aacaattgaaaatttgcactaaaaa |
31194249 |
T |
 |
| Q |
376 |
tgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
31194248 |
tgattatgatgaaaactaaccccctta |
31194222 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 372 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 21259426 - 21259396
Alignment:
| Q |
372 |
taagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21259426 |
taagtgattatgatgaattctaaccccctta |
21259396 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 18261756 - 18261591
Alignment:
| Q |
17 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca |
116 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||| ||||||||| ||| ||| | || ||| | |||| | ||| | |||||||| |||||| | || ||| || | | ||||||| |
|
|
| T |
18261756 |
ccatttttacaaaaccaacaacaacaacttaattctcatcatcaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaaca |
18261657 |
T |
 |
| Q |
117 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||| | |||||||||| || |||||| ||||| |
|
|
| T |
18261656 |
acaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatt |
18261591 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #52
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| Q |
110 |
cttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||| | | ||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
18041724 |
cttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacataacacaattcaacaatt |
18041652 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 45559129 - 45559057
Alignment:
| Q |
110 |
cttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||| | |||||||||| || |||||| ||||| |
|
|
| T |
45559129 |
cttaacaacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatt |
45559057 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0035 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:
Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 19 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 118246 - 117862
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| Q |
19 |
attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac |
118 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||| |
|
|
| T |
118246 |
attttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaccccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaac |
118147 |
T |
 |
| Q |
119 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactt |
218 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | | || |||||||| |
|
|
| T |
118146 |
aacaacatcaactgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgaacatattttcaacatataccaacttctcatactt |
118047 |
T |
 |
| Q |
219 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaa |
318 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
118046 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaa |
117947 |
T |
 |
| Q |
319 |
ttaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg---aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
117946 |
ttaatcaattcagccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaaccccctta |
117862 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 19 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 109745 - 109361
Alignment:
| Q |
19 |
attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac |
118 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||| |
|
|
| T |
109745 |
attttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaatcccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaac |
109646 |
T |
 |
| Q |
119 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactt |
218 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||| | ||| | |||| |||||||| |
|
|
| T |
109645 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacttagcataattcaccaatttatcatattttcaatatataccaatttctcatactt |
109546 |
T |
 |
| Q |
219 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaa |
318 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
109545 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgaacaa |
109446 |
T |
 |
| Q |
319 |
ttaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg---aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
109445 |
ttaatcaattcagccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaaccccctta |
109361 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0077 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:
Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 15759 - 15372
Alignment:
| Q |
17 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |
|
|
| T |
15759 |
ccattttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaaaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatctataacatgactaaaca |
15660 |
T |
 |
| Q |
117 |
acaac---aacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatcca-tttttc |
212 |
Q |
| |
|
||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
15659 |
acaacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttc-acacatacccattttttt |
15561 |
T |
 |
| Q |
213 |
atactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttat |
312 |
Q |
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| T |
15560 |
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15461 |
T |
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313 |
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402 |
Q |
| |
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| T |
15460 |
gaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataatttaaaattacaa-aagtgattatgatgaatgctaaccccctta |
15372 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0240 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:
Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 67 - 402
Target Start/End: Original strand, 7581 - 7917
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Q |
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| T |
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gaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcataatttatcaacaacaat |
7680 |
T |
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| Q |
167 |
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266 |
Q |
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| T |
7681 |
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7780 |
T |
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| Q |
267 |
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365 |
Q |
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| T |
7781 |
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7880 |
T |
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| Q |
366 |
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402 |
Q |
| |
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|
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| T |
7881 |
ttacaataagtaattatgatgaattctaaccccctta |
7917 |
T |
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Target: scaffold0001 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:
Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 58 - 402
Target Start/End: Original strand, 60809 - 61154
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157 |
Q |
| |
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| T |
60809 |
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60908 |
T |
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| Q |
158 |
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257 |
Q |
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| T |
60909 |
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61008 |
T |
 |
| Q |
258 |
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357 |
Q |
| |
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| T |
61009 |
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61108 |
T |
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| Q |
358 |
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402 |
Q |
| |
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| T |
61109 |
attgaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
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T |
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Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 70903 - 70538
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120 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||| ||| |||||||| |
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| T |
70903 |
tttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaa |
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T |
 |
| Q |
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220 |
Q |
| |
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| T |
70803 |
caacatccaatgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaataatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacctacttttcatactttg |
70704 |
T |
 |
| Q |
221 |
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319 |
Q |
| |
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| T |
70703 |
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70604 |
T |
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| Q |
320 |
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385 |
Q |
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taatcaactcatccaaataagcacttttcttacaaataattgaaaattacaatgagttattatgat |
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T |
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Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
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Target Start/End: Complemental strand, 79925 - 79790
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267 |
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Q |
| |
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| T |
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catctaaacatgtcatcataattagagcatgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaat |
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T |
 |
| Q |
367 |
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402 |
Q |
| |
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|
| T |
79825 |
tacaatgagtgattatgatcaattctaaccccctta |
79790 |
T |
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Target: scaffold0338 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:
Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 402
Target Start/End: Original strand, 8951 - 9334
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Q |
| |
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| T |
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attttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcaagcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaac |
9050 |
T |
 |
| Q |
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218 |
Q |
| |
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| T |
9051 |
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9150 |
T |
 |
| Q |
219 |
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318 |
Q |
| |
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| T |
9151 |
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9250 |
T |
 |
| Q |
319 |
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402 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
9251 |
ttaatcaattcactcaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaaattgcaataa-tgattatgataaattctaaccccctta |
9334 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0359 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:
Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 54 - 401
Target Start/End: Original strand, 1316 - 1661
Alignment:
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153 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1316 |
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1415 |
T |
 |
| Q |
154 |
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253 |
Q |
| |
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| T |
1416 |
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1515 |
T |
 |
| Q |
254 |
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353 |
Q |
| |
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| T |
1516 |
ccataacttcatacatctaaacatgtcatcatgattagagcacgaatttcatcatttatacacaattaatcaattcattcaattaaccacttttcataca |
1615 |
T |
 |
| Q |
354 |
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401 |
Q |
| |
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|
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| T |
1616 |
aataattg--aattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctt |
1661 |
T |
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Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 78 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 11875 - 11553
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78 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
177 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11875 |
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11779 |
T |
 |
| Q |
178 |
caattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaac |
275 |
Q |
| |
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| T |
11778 |
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11680 |
T |
 |
| Q |
276 |
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375 |
Q |
| |
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| T |
11679 |
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11580 |
T |
 |
| Q |
376 |
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402 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
11579 |
tgattatgatgaattctaaccccctta |
11553 |
T |
 |
Back To:
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Target: scaffold0012 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
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Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 253277 - 252902
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14 |
tcaccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccactta |
113 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| |
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|
| T |
253277 |
tcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcatcaagaaatcatgaatcatgcaaacccaagccttgaattatcatcaacaacatgactta |
253178 |
T |
 |
| Q |
114 |
acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttca |
213 |
Q |
| |
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| T |
253177 |
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253078 |
T |
 |
| Q |
214 |
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313 |
Q |
| |
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||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |
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| T |
253077 |
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252978 |
T |
 |
| Q |
314 |
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389 |
Q |
| |
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| T |
252977 |
cacaattaatcaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaat |
252902 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0014 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:
Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 21 - 402
Target Start/End: Original strand, 85298 - 85678
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| Q |
21 |
tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
85298 |
tttcaccaaaacaccaacaacgtctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaa |
85397 |
T |
 |
| Q |
121 |
caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttg |
220 |
Q |
| |
|
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| T |
85398 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacctagcataattcaccaattaagcatattttcaatatataccaatttctcatactttg |
85497 |
T |
 |
| Q |
221 |
aacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaatt |
320 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
85498 |
aacatgtaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcatttataaacaatt |
85597 |
T |
 |
| Q |
321 |
aatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
85598 |
aatcaattcacccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaaccccctta |
85678 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 402
Target Start/End: Original strand, 159266 - 159646
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19 |
attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac |
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Q |
| |
|
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| T |
159266 |
attttcaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccaaaaattatcatcaa---catcacttagcaac |
159362 |
T |
 |
| Q |
119 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatact |
217 |
Q |
| |
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| T |
159363 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacatcaacatagcataattcaaccaattgagcataatttcaactcatatcattttctcatact |
159462 |
T |
 |
| Q |
218 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaaca |
317 |
Q |
| |
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| T |
159463 |
ttgaacatgaaattcaactaacaacaatgccattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaaca |
159562 |
T |
 |
| Q |
318 |
attaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
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|
| T |
159563 |
attaatcaattcacccaattaagcacttttcgtac-aataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaaccccctta |
159646 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0673 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:
Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 21 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 1103 - 722
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Q |
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| T |
1103 |
tttcaccaaatcaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaa |
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T |
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| Q |
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caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttg |
220 |
Q |
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1003 |
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904 |
T |
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221 |
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320 |
Q |
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804 |
T |
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402 |
Q |
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803 |
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T |
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Target Start/End: Complemental strand, 7137 - 6749
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Q |
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7038 |
T |
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| Q |
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209 |
Q |
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6940 |
T |
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| Q |
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307 |
Q |
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6840 |
T |
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| Q |
308 |
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398 |
Q |
| |
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catatgaacaattaatcaattcacccaattaagcactgatcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccc |
6749 |
T |
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Target: scaffold0117; HSP #1
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Q |
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| T |
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11713 |
T |
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257 |
Q |
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| T |
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T |
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357 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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399 |
Q |
| |
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|
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attaaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccc |
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T |
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Target: scaffold0190; HSP #1
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Q |
| |
|
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| T |
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T |
 |
| Q |
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252 |
Q |
| |
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| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
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10134 |
T |
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| Q |
253 |
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352 |
Q |
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| T |
10135 |
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10234 |
T |
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| Q |
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402 |
Q |
| |
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aaagaattgaaaatttgcaataa-tgattattatgaattctaaccccctta |
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Target: scaffold0022; HSP #1
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Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
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aacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaatta---tcaacaacatgacttaacaacaacaacataaattgatcatgaaacttatcacaatt |
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T |
 |
| Q |
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253 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
254 |
ccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacaca |
353 |
Q |
| |
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| T |
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tcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcacccaaataagtacttttcatac- |
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T |
 |
| Q |
354 |
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402 |
Q |
| |
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|||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
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aataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaaccccctta |
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Target: scaffold0022; HSP #2
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Q |
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|
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caacaattcatgaattatgcacacccaaaccatgaattatcatcaacaacatcacttagaaacaataacatcaattgaacatgaatgttatcacaattca |
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T |
 |
| Q |
156 |
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254 |
Q |
| |
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| T |
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102970 |
T |
 |
| Q |
255 |
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353 |
Q |
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| |||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || |
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| T |
102969 |
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102872 |
T |
 |
| Q |
354 |
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402 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
102871 |
aacaattgaaaatttacacaaaaaatgattatgatgaattataaacccctta |
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Target: scaffold0022; HSP #3
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Q |
| |
|
||||| ||||||| | |||||||| | ||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||| |
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|
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109554 |
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T |
 |
| Q |
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217 |
Q |
| |
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| T |
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109752 |
T |
 |
| Q |
218 |
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317 |
Q |
| |
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| T |
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109852 |
T |
 |
| Q |
318 |
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330 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
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109853 |
attaatcaattaa |
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T |
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Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | || ||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| | || ||| || | |||||| |||| |
|
|
| T |
4527 |
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T |
 |
| Q |
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217 |
Q |
| |
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| T |
4627 |
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4726 |
T |
 |
| Q |
218 |
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317 |
Q |
| |
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| T |
4727 |
ttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatatatgaaca |
4826 |
T |
 |
| Q |
318 |
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402 |
Q |
| |
|
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|
| T |
4827 |
attaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaatt---acaagtgattatgatgaattctaaccccctta |
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Q |
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|
||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | || ||||| ||| || ||| | ||||||||||||||| | || ||| || | |||||| |||| |
|
|
| T |
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attttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaac |
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T |
 |
| Q |
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217 |
Q |
| |
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|
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| T |
9241 |
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9340 |
T |
 |
| Q |
218 |
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317 |
Q |
| |
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| T |
9341 |
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9440 |
T |
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318 |
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402 |
Q |
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aacaacatccaattgaaaatgaatattatcacaattaaacaacaacatagcataattcaaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatac |
7334 |
T |
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| Q |
217 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaac |
316 |
Q |
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| T |
7335 |
tttgaacatgtaattcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatatatgaac |
7434 |
T |
 |
| Q |
317 |
aattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
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7435 |
aattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaatt---acaagtgattatgatgaattctaaccccctta |
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Q |
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| T |
11945 |
atgaaccatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcaaaattcatcaacaaca |
11846 |
T |
 |
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taacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttca |
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Q |
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| T |
11845 |
atgcataattcaccaattgagcatattttcaactaatacccatttttcatactttgaacatgtaattcatccaacaacaattcaattattcataacttca |
11746 |
T |
 |
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tacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaa |
364 |
Q |
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| T |
11745 |
tacatctaaacatgtcatcacaattagagtacaaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaa |
11646 |
T |
 |
| Q |
365 |
attgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11645 |
attacaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
11608 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0160 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0160
Description:
Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 35 - 402
Target Start/End: Original strand, 1 - 365
Alignment:
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35 |
caacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgat |
134 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| || | || || ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1 |
caacaacaatccatttctcaacaacaaataatgaaacatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaagatgacatagcaacaacaacatcaattgat |
100 |
T |
 |
| Q |
135 |
catgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaa |
234 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
101 |
catgaaacttatcacaattcatcaaccacgtagcataattcacgaattgagcatattttcaacatataccaatttctcatactttgaacatgcaattcaa |
200 |
T |
 |
| Q |
235 |
ctaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatcca |
334 |
Q |
| |
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| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||| |
|
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| T |
201 |
ccaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatg---tcatcattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaattaattcaccca |
297 |
T |
 |
| Q |
335 |
attaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
298 |
attaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaagactaaccccctta |
365 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0160; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 127
Target Start/End: Original strand, 3478 - 3591
Alignment:
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14 |
tcaccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccactta |
113 |
Q |
| |
|
|||||| || ||| |||||| |||||||| | ||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| || | || || |
|
|
| T |
3478 |
tcaccaattccactaaaccaccaacaacattccatttctcaacaacaaataatgaaacatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaagatgacata |
3577 |
T |
 |
| Q |
114 |
acaacaacaacatc |
127 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
3578 |
gcaacaacaacatc |
3591 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1867 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:
Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
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Target Start/End: Original strand, 118 - 491
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127 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| | ||||| | |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| || || ||||||||||||| |
|
|
| T |
118 |
aaaccaacaacaacaactcatttctcagcaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatc |
216 |
T |
 |
| Q |
128 |
cattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgt |
227 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| | |||| |||||| |
|
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| T |
217 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattgagcatattttcaacatatacccttttcatacacttgaaacatga |
316 |
T |
 |
| Q |
228 |
aattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaat |
327 |
Q |
| |
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| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
317 |
atttcaaccaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaat |
416 |
T |
 |
| Q |
328 |
taatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
417 |
tcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgattaattctaaccccctta |
491 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0610 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:
Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
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Target Start/End: Complemental strand, 859 - 476
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| Q |
19 |
attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||| |
|
|
| T |
859 |
attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgccaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaac |
760 |
T |
 |
| Q |
119 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatact |
217 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
759 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaaatgagcatattttcaacatata-ccattttctcatact |
661 |
T |
 |
| Q |
218 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaaca |
317 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
660 |
ttgaacatgtaattcaattaacaacaattctattatccataatttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaaca |
561 |
T |
 |
| Q |
318 |
attaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
560 |
attaatcaattcacccaattaagcacttattcatac-aataattgaaaaatagcaataaatga-tatgatgaattctaaccccctta |
476 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0068 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:
Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 60 - 398
Target Start/End: Original strand, 48153 - 48488
Alignment:
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159 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
48153 |
aaatcatgaattatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatggcttaacaacaataataacaattgatcatgaaacttttcacaattcatcaa |
48251 |
T |
 |
| Q |
160 |
caacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataa |
259 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
48252 |
caacaaaacataattcaccaattgagcatatttt-aacacatacccatttttcatactttgaacataaaattcaactaacaacaattcaatcattcataa |
48350 |
T |
 |
| Q |
260 |
cttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataat |
359 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
48351 |
cttcatacatctaaacatttcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataat |
48450 |
T |
 |
| Q |
360 |
tgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccc |
398 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
48451 |
tgaaaattacaa-aagtgattatgataaattctaacccc |
48488 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 60 - 398
Target Start/End: Original strand, 61601 - 61936
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159 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
61601 |
aaatcatgaattatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatggcttaacaacaataataacaattgatcatgaaacttttcacaattcatcaa |
61699 |
T |
 |
| Q |
160 |
caacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataa |
259 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
61700 |
caacaaaacataattcaccaattgagcatatttt-aacacatacccatttttcatactttgaacataaaattcaactaacaacaattcaatcattcataa |
61798 |
T |
 |
| Q |
260 |
cttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataat |
359 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
61799 |
cttcatacatctaaacatttcatcataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataat |
61898 |
T |
 |
| Q |
360 |
tgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaacccc |
398 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
61899 |
tgaaaattacaa-aagtgattatgataaattctaacccc |
61936 |
T |
 |
Back To:
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Target: scaffold0044 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:
Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 21 - 402
Target Start/End: Original strand, 38264 - 38645
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tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||| || | ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
38264 |
tttcaccaaaacaccaacatcatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagttatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaa |
38363 |
T |
 |
| Q |
121 |
caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttg |
220 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| || | ||||| |
|
|
| T |
38364 |
caacgtcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcgccaattgagcatattttcaacatatacccatttctcttcctttg |
38463 |
T |
 |
| Q |
221 |
aacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaatt |
320 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38464 |
aacatgtaattcaaccaacaaaaattcaattattcataaattcataaatctaaacatgtcatcataattagagcgcgtatttcatcatttatgaacaatt |
38563 |
T |
 |
| Q |
321 |
aatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38564 |
aattaattcacccaattaagcacttttcatacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
38645 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:
Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 302
Target Start/End: Original strand, 146563 - 146848
Alignment:
| Q |
17 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
146563 |
ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaaaaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatgcataacatcacttaaca |
146662 |
T |
 |
| Q |
117 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
146663 |
acaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacctagcataattcaccaattgagcatattttcaacacatacccatttttcatac |
146762 |
T |
 |
| Q |
217 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattt |
302 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
146763 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacagttcaattatacataacttcatacatctaaacatgtcatcataattaaagcatgaattt |
146848 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 402
Target Start/End: Original strand, 53399 - 53694
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cacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatcca |
206 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||| ||| ||||||| | || || ||||||| ||||||| ||| | |
|
|
| T |
53399 |
cacttagcaacaacaacatccattgaacatgaatctcatcacaattcatcaacaaaatagcataattgaacatttagagcata-attcaacatataacac |
53497 |
T |
 |
| Q |
207 |
tttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatc |
306 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || || |||| ||| |||||| |||||| ||||||||| ||||| || | |
|
|
| T |
53498 |
cttcacatactttgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatatcatgcattcaaacatatcatcattattagagcatgaattctaac |
53597 |
T |
 |
| Q |
307 |
atttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatga-tgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53598 |
aactatgaacaattaatcacttact-caattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaaccccctta |
53694 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025; HSP #3
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Query Start/End: Original strand, 212 - 342
Target Start/End: Original strand, 85690 - 85818
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212 |
catactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcattta |
311 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | || || |
|
|
| T |
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catactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcat-taaacatatcatcataattagagcacgaatttcaacaacta |
85788 |
T |
 |
| Q |
312 |
tgaacaattaatcaattaatccaattaagca |
342 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || || |||||||||| |
|
|
| T |
85789 |
tgaacaattaatcactt-attcaattaagca |
85818 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 3)
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Description:
Target: scaffold0120; HSP #1
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Query Start/End: Original strand, 28 - 402
Target Start/End: Original strand, 21485 - 21857
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127 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21485 |
aaaccaccaacaacaactcatttcttaacaacaattcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatc |
21584 |
T |
 |
| Q |
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cattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatactttgaacatg |
226 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
21585 |
aaataatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcatattttcaacatata-ccattttctcatactttgaacatg |
21683 |
T |
 |
| Q |
227 |
taattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaa |
326 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21684 |
taattcaactaacaacaatccaattat-cataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaa |
21782 |
T |
 |
| Q |
327 |
ttaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
21783 |
ttcgcccaattaagcctttttcatac-aataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattataaccccctta |
21857 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 28 - 402
Target Start/End: Original strand, 31184 - 31556
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Q |
| |
|
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|
| T |
31184 |
aaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaattcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaaaaacatc |
31283 |
T |
 |
| Q |
128 |
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226 |
Q |
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| T |
31284 |
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31382 |
T |
 |
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227 |
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326 |
Q |
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| T |
31383 |
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31481 |
T |
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327 |
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402 |
Q |
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| T |
31482 |
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31556 |
T |
 |
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Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
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Target Start/End: Complemental strand, 47554 - 47450
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395 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47554 |
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47457 |
T |
 |
| Q |
396 |
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402 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
47456 |
cccctta |
47450 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1164 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:
Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
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Target Start/End: Original strand, 1343 - 1727
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17 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca |
116 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
1343 |
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1442 |
T |
 |
| Q |
117 |
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216 |
Q |
| |
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| T |
1443 |
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1542 |
T |
 |
| Q |
217 |
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316 |
Q |
| |
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1543 |
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1642 |
T |
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| Q |
317 |
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402 |
Q |
| |
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|
|
| T |
1643 |
aattaatcaattcacccaattaagcacttatcatccaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccctta |
1727 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:
Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
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Target Start/End: Complemental strand, 255095 - 254715
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120 |
Q |
| |
|
|||||| ||| || |||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||| || || |||||| |
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|
| T |
255095 |
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T |
 |
| Q |
121 |
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218 |
Q |
| |
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||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
254995 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacataccca-ttttcatacactt |
254897 |
T |
 |
| Q |
219 |
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318 |
Q |
| |
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| T |
254896 |
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254798 |
T |
 |
| Q |
319 |
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402 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
254797 |
ttaatcaattcatccaattaaacacttatcatacaaataattg-aaattacaataagtgattatgatgaattatatccccctta |
254715 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 261701 - 261321
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21 |
tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa |
120 |
Q |
| |
|
|||||| ||| || |||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||| || || |||||| |
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|
| T |
261701 |
tttcacgaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaa |
261602 |
T |
 |
| Q |
121 |
caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcat--actt |
218 |
Q |
| |
|
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| T |
261601 |
caacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcaacacataccca-ttttcatacactt |
261503 |
T |
 |
| Q |
219 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaa |
318 |
Q |
| |
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| T |
261502 |
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261404 |
T |
 |
| Q |
319 |
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402 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
261403 |
ttaatcaattcatccaattaaacacttatcatacaaataattg-aaattacaataagtgattatgatgaattatatccccctta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0480 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:
Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
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Target Start/End: Complemental strand, 5534 - 5148
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113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
5534 |
tcaccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatgactta |
5435 |
T |
 |
| Q |
114 |
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213 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |
|
|
| T |
5434 |
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5337 |
T |
 |
| Q |
214 |
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311 |
Q |
| |
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| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |
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| T |
5336 |
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5238 |
T |
 |
| Q |
312 |
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402 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
5237 |
tgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattagaa-aagtgattatgatgaattctaaccccctta |
5148 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
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Target Start/End: Complemental strand, 9130 - 8781
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153 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9130 |
aacaacaaatcatgaatcatgcatacctaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaatt |
9031 |
T |
 |
| Q |
154 |
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252 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
9030 |
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8932 |
T |
 |
| Q |
253 |
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351 |
Q |
| |
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|
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| T |
8931 |
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8832 |
T |
 |
| Q |
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402 |
Q |
| |
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|
|
| T |
8831 |
c-aataattg-aaattgcaccaaaaatgattatgatgaactctaaccccctta |
8781 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0310 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:
Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 65 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 351 - 15
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atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaaca |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||| || || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
351 |
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252 |
T |
 |
| Q |
165 |
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264 |
Q |
| |
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|
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| T |
251 |
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152 |
T |
 |
| Q |
265 |
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364 |
Q |
| |
|
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| T |
151 |
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52 |
T |
 |
| Q |
365 |
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402 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
51 |
attacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccctta |
15 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 119 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 6591 - 6309
Alignment:
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119 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactt |
218 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | | || |||||||| |
|
|
| T |
6591 |
aacaacatcaattgatcattaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcacgaattaagcatattttcaacatataccaacttctcatactt |
6492 |
T |
 |
| Q |
219 |
tgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaa |
318 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
6491 |
tgaacatgtatttcaactaacaacaatccaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataaatatagcacgaatttcatcatttatgaacag |
6392 |
T |
 |
| Q |
319 |
ttaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
6391 |
ttaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccctta |
6309 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0158 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:
Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 65 - 402
Target Start/End: Original strand, 25222 - 25558
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atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaaca |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| | || ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
25222 |
atgaatcatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatgccatatcaacaacaacaacaattgatcgtgaaacttatcacaattcaacaacaaca |
25320 |
T |
 |
| Q |
165 |
taacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttca |
264 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| | |||| |||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
25321 |
aaacataattcaccaattgagcatattttcaacatatacccttttcctacacttgaaacatgaatttcaactaacaacaattcaattattcataacttca |
25420 |
T |
 |
| Q |
265 |
tacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaa |
364 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
25421 |
tacatccaaacatgtcatcataaatagagcacaaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttttcatacaaataattgaaa |
25520 |
T |
 |
| Q |
365 |
attgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
25521 |
attgcaataagtgattatgatgaagactaaccccctta |
25558 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 307
Target Start/End: Original strand, 24933 - 25210
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28 |
aaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatc |
127 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| | || ||||||||||| | |
|
|
| T |
24933 |
aaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgca-acccaagccatgaattatcatcaacaacatgccatatcaacaacaacaac |
25030 |
T |
 |
| Q |
128 |
cattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgt |
227 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| | |||| |||||| |
|
|
| T |
25031 |
aattgatcgtgaaacttatcacaattcaacaacaacaaaacataattcaccaattgagcatattttcaacatatacccttttcctacacttgaaacatga |
25130 |
T |
 |
| Q |
228 |
aattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatca |
307 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
25131 |
atttcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatccaaacatgtcatcataaatagagcacaaatttcatca |
25210 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:
Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 402
Target Start/End: Original strand, 40620 - 41005
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17 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca |
116 |
Q |
| |
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||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||| || | |||||| || |
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|
| T |
40620 |
ccattttcaccaaaccaacaacaacagcttatttcaaattatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagca |
40719 |
T |
 |
| Q |
117 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttca--t |
214 |
Q |
| |
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| T |
40720 |
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T |
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313 |
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402 |
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214 |
Q |
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313 |
Q |
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46424 |
T |
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314 |
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402 |
Q |
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46425 |
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T |
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Target: scaffold0034; HSP #3
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Q |
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T |
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Q |
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Target: scaffold0103; HSP #1
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Q |
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216 |
Q |
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| T |
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33823 |
T |
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Q |
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33923 |
T |
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402 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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Q |
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T |
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215 |
Q |
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| T |
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15032 |
T |
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216 |
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313 |
Q |
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| T |
15033 |
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15131 |
T |
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| Q |
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402 |
Q |
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T |
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Target: scaffold0083; HSP #2
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Q |
| |
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T |
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Q |
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T |
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Target: scaffold0075; HSP #1
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
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213 |
Q |
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T |
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| Q |
214 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatg |
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Q |
| |
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T |
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Q |
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T |
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Q |
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T |
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| Q |
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213 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
214 |
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311 |
Q |
| |
|
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|
| T |
164372 |
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164470 |
T |
 |
| Q |
312 |
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402 |
Q |
| |
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|
|
| T |
164471 |
tgaaaaattaatcaattcatccaattaagcacttaccatacaattaattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaaccccctta |
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T |
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Q |
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T |
 |
| Q |
114 |
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189 |
Q |
| |
|
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|
| T |
162375 |
acaaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcagaattcaccaattgagcata |
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T |
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tcaccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccactta |
113 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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| Q |
114 |
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189 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
166457 |
acaacaacaac---cattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcagaattcaccaattgagcata |
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T |
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Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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Q |
| |
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||||||||||||| |
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| T |
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gcaacaacaacatc |
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T |
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Q |
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| T |
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1979 |
T |
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aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccattttt-catac |
216 |
Q |
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| T |
1980 |
aacaacatcaattgatcatgaatcttataacaaatcaacaaca-catagcataattcaaccaattgagcatattttcatcatata-ccattttcgcatac |
2077 |
T |
 |
| Q |
217 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaac |
316 |
Q |
| |
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| T |
2078 |
tttgaacatgaaattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacattcaaacatgtcatcataattagagcacaaatttcatcatttatgagc |
2177 |
T |
 |
| Q |
317 |
aattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
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|
| T |
2178 |
aattaatcaattcacccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataa-tgattatgatgaattctaaccccctta |
2262 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0031 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:
Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 399
Target Start/End: Original strand, 31008 - 31387
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19 |
attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac |
118 |
Q |
| |
|
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| T |
31008 |
atttttaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaagtcatgaatcatgcatacccaagccataaattatcatcaaaaacctcacatatcagc |
31107 |
T |
 |
| Q |
119 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataa-ttcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatac |
216 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||| |
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|
| T |
31108 |
aacaacatcaattaatcatgaaacttatcacaattcaacaactaca-aacataacttaacaaattgagcatattttcaacatata-ccattttcttatac |
31205 |
T |
 |
| Q |
217 |
tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaac |
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Q |
| |
|
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|
| T |
31206 |
tttgaacatg-aattcaactaaccacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgtcatcataattagagcacgaattttatcatttatgaac |
31304 |
T |
 |
| Q |
317 |
aattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccc |
399 |
Q |
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|
| T |
31305 |
aaataatcaattcacccaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaatgaatgattatgatgaattctaaccccc |
31387 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 118 - 402
Target Start/End: Original strand, 70676 - 70959
Alignment:
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118 |
caacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttt-tcata |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| |
|
|
| T |
70676 |
caacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaaccaattaagcatattttcaacatat-tccattttctcata |
70774 |
T |
 |
| Q |
216 |
ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaa |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |
|
|
| T |
70775 |
ctttgaacatg-aattcaactaacaacaattcaattatccataacttcatacatccaaacatgacatcataattagagcacgaatttcatcatttataaa |
70873 |
T |
 |
| Q |
316 |
caattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
| |||||| |||| | |||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
70874 |
ctattaattaattcacccaattaagcacttttcatac-aataactgaaaattacaataaatgattatgatgaattctaaccccctta |
70959 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 78 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 97422 - 97175
Alignment:
| Q |
78 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
177 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| | || |||||| | || ||| |||||||| ||| ||||| |||||| || |||| |||| | || ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
97422 |
acccaaggcatgaatcatcaacaataatatcaattagtaacaacaatatcaattgaacatgaatctcatcataattcaacaccaacatagcataattcaa |
97323 |
T |
 |
| Q |
178 |
caatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaaca |
276 |
Q |
| |
|
|| || ||||||| || ||||| ||| | ||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || || ||| ||||| |
|
|
| T |
97322 |
catttagagcataatt-caacatataacactttcacatactttgaacatgcaattccaccaacaacaattcaattatcaccaattttatgcattcaaaca |
97224 |
T |
 |
| Q |
277 |
tgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatca |
325 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
97223 |
tatcatcataattagagcacgaatcttaacaactatgaacaattaatca |
97175 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0740 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0740
Description:
Target: scaffold0740; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 129 - 402
Target Start/End: Original strand, 4359 - 4630
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| Q |
129 |
attgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac--tttgaacatg |
226 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
4359 |
attgatcataaaacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgaacatattttca-cacatacccatttt-catacactttgaacatg |
4456 |
T |
 |
| Q |
227 |
taattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaa |
326 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4457 |
taattcaactaaca-caattcaattattcataatttgatacatctaaacatgtcattataattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaa |
4555 |
T |
 |
| Q |
327 |
ttaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4556 |
ttcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-acgtgattatgatgaattctaaccccctta |
4630 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0740; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 106
Target Start/End: Original strand, 4266 - 4358
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| Q |
14 |
tcaccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataaca |
106 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||| | ||||| ||||||||| | |||| ||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
4266 |
tcaccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaaca |
4358 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0092 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:
Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 54 - 402
Target Start/End: Original strand, 3318 - 3666
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| Q |
54 |
aacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatt |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
3318 |
aacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccacaacatcacttagcaacatcaacatcaattgatcatgaatcttatcacaatt |
3417 |
T |
 |
| Q |
154 |
tatcaacaacataacataatt-caccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcc |
252 |
Q |
| |
|
| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
3418 |
caactacaacatagcataattggaccaattgagcatattttc-acatataccactttctcatactttgaacattaaatttctctaacaacaattcaatta |
3516 |
T |
 |
| Q |
253 |
tccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcaca |
351 |
Q |
| |
|
| |||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| | |
|
|
| T |
3517 |
taaataacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaacaattatgaacaattaatcaattact-caattaagcacttattcata |
3615 |
T |
 |
| Q |
352 |
caaataattg-aaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3616 |
c-aataattgtaaaattgcaataaatgattatgatgaattctaaccccctta |
3666 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0342 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0342
Description:
Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 374
Target Start/End: Original strand, 5902 - 6261
Alignment:
| Q |
17 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | || ||||| ||| || ||| | || |||||||||||| | || ||| || | |||||| || |
|
|
| T |
5902 |
ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatggattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagca |
6001 |
T |
 |
| Q |
117 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca-ccaattgagcatattttcaacacatatccatttttc--a |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| | |||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |
|
|
| T |
6002 |
acaacaacatcaattgaacatgaatattatcacaattcaacaaccacatagcataatttaaccaattgagcatattttcaacatata-ccatttttctca |
6100 |
T |
 |
| Q |
214 |
tactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatg |
313 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
6101 |
tactttgaacatgaaattctaccaacaacaatccaattatccataacttcatacattcaaacatgtcgtcataattagagcacgaatttcatcatttatg |
6200 |
T |
 |
| Q |
314 |
aacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattg-aaaattgcaataa |
374 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | | |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
6201 |
aacaattaatcaattcaccaaattaagcacttttcatac-aataattgaaaaattgcaataa |
6261 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 739 - 572
Alignment:
| Q |
22 |
ttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaac |
121 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || | |||||| || | | | || | |||| |
|
|
| T |
739 |
ttcacaaaaccaccaacaataatccatttctcaacaacaaattattaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgagtaaatatcaac |
640 |
T |
 |
| Q |
122 |
aacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
639 |
aacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
572 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0049 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:
Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 157 - 402
Target Start/End: Original strand, 20274 - 20519
Alignment:
| Q |
157 |
caacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctc |
254 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
20274 |
caacaacaaagcataattaaccaattgagcatattttcaacatatatctatttt-catacactttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattatt |
20372 |
T |
 |
| Q |
255 |
cataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaa |
354 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
20373 |
cataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaa |
20472 |
T |
 |
| Q |
355 |
ataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
20473 |
ataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccctta |
20519 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0095 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:
Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 34010 - 33627
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| Q |
19 |
attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac |
118 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| | |||||||| | ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||| |
|
|
| T |
34010 |
atttttaccaaactaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcat-aatcatgcatacccaagccatgaattattatcaacaacatcacttagcaac |
33912 |
T |
 |
| Q |
119 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattc-accaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatact |
217 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||| | || |||||||| |
|
|
| T |
33911 |
aacaacatcaattgatcatgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaaccaatttagcata-tttcaacatataacacttcttcatact |
33813 |
T |
 |
| Q |
218 |
ttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaaca |
317 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||| |
|
|
| T |
33812 |
ttaaacatgaaattccactaacaacaattcaattatccacaacttcaagcattcaaacatgtcatcataattggagcatgaattctaacaattatgaaca |
33713 |
T |
 |
| Q |
318 |
attaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgca--ataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||| || |||| || || |||||||| || || | || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33712 |
attaatcaattact-caattaagcatttattcatac-aacaattgaaatttacactaaaaatgattatgatgaattctaaccccctta |
33627 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0465 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:
Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 10255 - 10094
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| Q |
21 |
tttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaa |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
10255 |
tttcaccaaaccatcaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaa |
10156 |
T |
 |
| Q |
121 |
caacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||| |
|
|
| T |
10155 |
caacatccattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccaagcataattcgccaatt |
10094 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0234 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:
Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 17697 - 17525
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17 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca |
116 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
17697 |
ccatttccaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacatattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaaca |
17598 |
T |
 |
| Q |
117 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17597 |
acaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
17525 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0122 (Bit Score: 116; Significance: 7e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:
Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 215 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 20041 - 19855
Alignment:
| Q |
215 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatga |
314 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
20041 |
actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
19942 |
T |
 |
| Q |
315 |
acaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
19941 |
acaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccctta |
19855 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 215 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 24345 - 24159
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| Q |
215 |
actttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatga |
314 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
24345 |
actttgaacatacaattcaactaacaacaattcaattattcataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacatatga |
24246 |
T |
 |
| Q |
315 |
acaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
24245 |
acaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaacactaaccccctta |
24159 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 24471 - 24374
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| Q |
28 |
aaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaaca |
125 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||| || || ||||||||||| |
|
|
| T |
24471 |
aaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagacatgaattatcatcaacaacatgacatagcaacaacaaca |
24374 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0251 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:
Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 13680 - 13507
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17 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaa-ttatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaac |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
13680 |
ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaac |
13581 |
T |
 |
| Q |
116 |
aacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13580 |
aacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
13507 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 21654 - 21481
Alignment:
| Q |
17 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaa-ttatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaac |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
21654 |
ccattttcaccaaactaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaac |
21555 |
T |
 |
| Q |
116 |
aacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21554 |
aacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
21481 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0175 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:
Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 189
Target Start/End: Original strand, 14910 - 15083
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| Q |
17 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaa-ttatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaac |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
14910 |
ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaac |
15009 |
T |
 |
| Q |
116 |
aacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15010 |
aacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
15083 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:
Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 189
Target Start/End: Original strand, 55542 - 55715
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| Q |
17 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaa-ttatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaac |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
55542 |
ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttattttacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaac |
55641 |
T |
 |
| Q |
116 |
aacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55642 |
aacaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
55715 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 56 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 94018 - 93730
Alignment:
| Q |
56 |
caacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaattta |
155 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||| |||||| |||| |||||| || ||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
94018 |
caacaaatcatgaattatgttcacccaaatcatgaattatcatcaacaacatcacttattaataacaacatcaattgaacatgaatttcatcacaattta |
93919 |
T |
 |
| Q |
156 |
tcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttt-tcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcct |
253 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| |||| || ||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
93918 |
acaac-acatagcatacttcaataatttgagcata-tttcaacaaata-ccattttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaaccattcaattat |
93822 |
T |
 |
| Q |
254 |
ccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattt-tatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt |
345 |
Q |
| |
|
| | |||||||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
93821 |
caaaaacttcatgcatacatacatatcatcataattggagcacgaatttctaacagttatgaacaattaat-aatttacccaattaagcactt |
93730 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 104645 - 104523
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| Q |
280 |
catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtg |
377 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||| || |||| || || ||||| |||||| || ||| || |
|
|
| T |
104645 |
catcatagttagagcatgaattttaacatctatgaacaattaatcacttact-caattaagcaattattcatac-aacaattgaaaaattacactaaatg |
104548 |
T |
 |
| Q |
378 |
attatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
104547 |
attatgatgaattctaacccactta |
104523 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0574 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:
Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 9800 - 9628
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| Q |
17 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
9800 |
ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacgtcacttaaca |
9701 |
T |
 |
| Q |
117 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
9700 |
acaacaacatctattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataagtcactaattgagcata |
9628 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0597 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:
Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 1272 - 1099
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| Q |
17 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaa-ttatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaac |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
1272 |
ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaac |
1173 |
T |
 |
| Q |
116 |
aacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1172 |
aacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
1099 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0243 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:
Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 2601 - 2216
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| Q |
17 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaaca |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | || |||| |||||| ||| | |||||||||||||| | |||||| |||| |||||| | |
|
|
| T |
2601 |
ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaaacatgaattatgaacgcccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagga |
2502 |
T |
 |
| Q |
117 |
acaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttcata |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||| | |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||| || || ||| ||||| |
|
|
| T |
2501 |
acaacaacatcaattgaacatgagtcttatcataattcaacaacaacatagcataattcatcaatttgagcata-attcaacatatgtcactttctcata |
2403 |
T |
 |
| Q |
216 |
ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaa |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| || |||||||||||||| || | |||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || | |||||| |
|
|
| T |
2402 |
ctttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaattctaataattatgat |
2303 |
T |
 |
| Q |
316 |
caattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaat-aagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || || |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2302 |
taattaatcaattact-caattaagcacttattcatac-aacaattaaaaattgcactaaaatgattatgatgaattctaaccccctta |
2216 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0816 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0816
Description:
Target: scaffold0816; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 255 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 3112 - 2966
Alignment:
| Q |
255 |
cataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaa |
354 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||| |
|
|
| T |
3112 |
cataacttcatacatctaaacatgtcatcacaattagagcacgaatttcatcacttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcatttatcatacaa |
3013 |
T |
 |
| Q |
355 |
ataattgaaaattgcaataagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3012 |
ataattgaaaattacaa-aagtgattatgatgaattctaaccccctta |
2966 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0706 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:
Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 30 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 6823 - 6664
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| Q |
30 |
accagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatcca |
129 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
6823 |
accaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaagatcta |
6724 |
T |
 |
| Q |
130 |
ttgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6723 |
ttgatcatcaaacttatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
6664 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0004 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:
Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 193781 - 193609
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| Q |
17 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaa-ttatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaac |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
193781 |
ccattttcacgaaaccaacaacaacaacttatttcgcaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaac |
193682 |
T |
 |
| Q |
116 |
aacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
193681 |
aacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaa-taatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
193609 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 186822 - 186647
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| Q |
17 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaat---ttatttccaaacaacaaa-ttatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccactt |
112 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
186822 |
ccattttcaccaaaccaacaacaacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcactt |
186723 |
T |
 |
| Q |
113 |
aacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
186722 |
aacaacaacaacatctattgatcatgaaacatatcacaa-taatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
186647 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0195
Description:
Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 801 - 617
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| Q |
19 |
attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||| |
|
|
| T |
801 |
attttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgccaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagtaac |
702 |
T |
 |
| Q |
119 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatat |
203 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
701 |
aacaacatcaattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaaatgagcatattttcaacatatat |
617 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 72 - 231
Target Start/End: Original strand, 19224 - 19383
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| Q |
72 |
atgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacata |
171 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| | | || ||| |||| || |||||| ||| |||||| ||||| || ||| | || | ||||| | ||||||| || || | |
|
|
| T |
19224 |
atgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaa |
19323 |
T |
 |
| Q |
172 |
attcaccaattgagca-tattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaatt |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| || |||| |||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
19324 |
attcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatt |
19383 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 72 - 231
Target Start/End: Original strand, 21308 - 21467
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| Q |
72 |
atgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacata |
171 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| | | || ||| |||| || |||||| ||| |||||| ||||| || ||| | || | ||||| | ||||||| || || | |
|
|
| T |
21308 |
atgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaa |
21407 |
T |
 |
| Q |
172 |
attcaccaattgagca-tattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaatt |
231 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| || |||| |||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
21408 |
attcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacata-tttgaacatgtaatt |
21467 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0039 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:
Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 12811 - 12641
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| Q |
19 |
attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac |
118 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||| |||||| |
|
|
| T |
12811 |
attttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaac |
12712 |
T |
 |
| Q |
119 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaa-cataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12711 |
aacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcat-gcataattcaccaattgagcata |
12641 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 19192 - 19049
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| Q |
19 |
attttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaac |
118 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||| |||||| |
|
|
| T |
19192 |
attttcaccaaaccaacaacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaac |
19093 |
T |
 |
| Q |
119 |
aacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaa |
162 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
19092 |
aacaacaaccattaatcatgaaacatatcacaattcatcaacaa |
19049 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0053 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:
Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 77135 - 76745
Alignment:
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14 |
tcaccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccactta |
113 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||| ||||||||| | ||||| | |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | || || || | |||||| |
|
|
| T |
77135 |
tcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaataacaatatcactta |
77036 |
T |
 |
| Q |
114 |
acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttc |
212 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||| || | ||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||| || |||| || ||||| ||||| ||| || |
|
|
| T |
77035 |
gcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatttgaacataatt-caacatatatcactttctc |
76937 |
T |
 |
| Q |
213 |
atactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttat |
312 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || | || ||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
76936 |
atactttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaatttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcatgaatttcatcatctat |
76837 |
T |
 |
| Q |
313 |
gaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaat-aagtgattatga-tgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| | |||||||| |||| ||| || |||||||| |||||| || | || ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
76836 |
gaacaattactcaattact-caattaagtacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaaatgattatgattgaattctaaccccctta |
76745 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0091 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:
Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Original strand, 32162 - 32379
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| Q |
14 |
tcaccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccactta |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||| | ||||| ||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| | |
|
|
| T |
32162 |
tcaccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaaggattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaa |
32261 |
T |
 |
| Q |
114 |
acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttca |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
32262 |
acaacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaattcataattcaccaattgagcatattttcaa-acataccca-ttttca |
32359 |
T |
 |
| Q |
214 |
t--actttgaacatgtaatt |
231 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32360 |
tacactttgaacatgtaatt |
32379 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 42141 - 41924
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| Q |
14 |
tcaccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccactta |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||| | ||||| ||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| | |
|
|
| T |
42141 |
tcaccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaaggattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaa |
42042 |
T |
 |
| Q |
114 |
acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcatattttcaacacatatccatttttca |
213 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
42041 |
acaacaacaacaacaattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaattcataattcaccaattgagcatattttcaa-acataccca-ttttca |
41944 |
T |
 |
| Q |
214 |
t--actttgaacatgtaatt |
231 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41943 |
tacactttgaacatgtaatt |
41924 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0303 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:
Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 308 - 149
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| Q |
30 |
accagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatcca |
129 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
308 |
accaacaacaacaacttatttcacaacaataaattatgaatcatgcatactcaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacattta |
209 |
T |
 |
| Q |
130 |
ttgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
208 |
ttgatcatgaaacttatcataattcatcaattattatgcataattcaccaattgagcata |
149 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0876 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:
Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 282 - 402
Target Start/End: Original strand, 1 - 120
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tcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcacttttcacacaaataattgaaaattgcaataagtgatta |
381 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
1 |
tcataaatagagcacgaatttcatcatttatgaacaattaatcaattcatccaattaagcacttatcatacaaataattgaaaattacaa-aagtgatta |
99 |
T |
 |
| Q |
382 |
tgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
100 |
tgatgaacactaaccccctta |
120 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0589 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0589
Description:
Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 176 - 402
Target Start/End: Original strand, 7927 - 8152
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| Q |
176 |
accaattgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaac |
275 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||| | ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
7927 |
accaattgagcatattttca-catataccactttctcatactttgaacatgaaatttctctaacaacaattcaattataaataacttcatgcattcaaac |
8025 |
T |
 |
| Q |
276 |
atgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaata |
373 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8026 |
ataacatcataattggagcacgaattctaacaaatatgaacaattaatcaattact-caattaagcacttattcatac-aataattgtaaaattgcaata |
8123 |
T |
 |
| Q |
374 |
agtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8124 |
aatgattacgatgaattctaaccccctta |
8152 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0589; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 134
Target Start/End: Original strand, 7833 - 7913
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| Q |
54 |
aacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgat |
134 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
7833 |
aacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgat |
7913 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0184 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:
Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 31576 - 31401
Alignment:
| Q |
14 |
tcaccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccactta |
113 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || | |||||| || | ||| | |
|
|
| T |
31576 |
tcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaacctaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaa |
31477 |
T |
 |
| Q |
114 |
acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31476 |
acaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
31401 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0078 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:
Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 189
Target Start/End: Original strand, 41268 - 41443
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| Q |
14 |
tcaccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccactta |
113 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || | |||||| || | ||| | |
|
|
| T |
41268 |
tcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaacctaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaa |
41367 |
T |
 |
| Q |
114 |
acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41368 |
acaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
41443 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0116 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:
Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 163
Target Start/End: Original strand, 30050 - 30199
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| Q |
14 |
tcaccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccactta |
113 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || | ||| | |
|
|
| T |
30050 |
tcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaatatgactaa |
30149 |
T |
 |
| Q |
114 |
acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaac |
163 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
30150 |
acaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaac |
30199 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0686 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:
Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 6379 - 6204
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| Q |
14 |
tcaccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccactta |
113 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| || | |||||| || | ||| | |
|
|
| T |
6379 |
tcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaatattactaa |
6280 |
T |
 |
| Q |
114 |
acaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6279 |
acaacaacaacaaccattgatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatgcataattcaccaattgagcata |
6204 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0162 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:
Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 56 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 7271 - 6983
Alignment:
| Q |
56 |
caacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaattta |
155 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||| ||| | || |||||||||||| | || ||| || | |||||| || |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
7271 |
caacaattcatgaattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcagcaacaacatcaattgaacatgattcttatcacaatcca |
7172 |
T |
 |
| Q |
156 |
tcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctc |
254 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||||| ||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
7171 |
ataacaacataacataattaaacaatttgagcataatt-caacatatatcactttctcatactttgaacattaaatttcactaacaacaattcaattatc |
7073 |
T |
 |
| Q |
255 |
cataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt |
345 |
Q |
| |
|
| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
7072 |
aacaacttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaattttgacaattatgaacaacaaatcatttact-caattaagcactt |
6983 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0013 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:
Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 56 - 301
Target Start/End: Original strand, 35479 - 35724
Alignment:
| Q |
56 |
caacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaattta |
155 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||| |||| |||||| |||||| |||||| ||||| ||||| |||| |||| || | |
|
|
| T |
35479 |
caacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaaaaacatcaattgaacatgactcttaccacatttca |
35578 |
T |
 |
| Q |
156 |
tcaacaacataacataattcaccaa-ttgagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctc |
254 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
35579 |
acaacaacatagcataaatcaacaatttgagtata-attcaacatatatcactttctcatactttgaacatgaaatttcactaacaacaattcaattatc |
35677 |
T |
 |
| Q |
255 |
cataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaatt |
301 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
35678 |
aataacttcatgcattcaaacatatcatcatgattggagcacgaatt |
35724 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0244 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:
Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 22797 - 22701
Alignment:
| Q |
17 |
ccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccactta |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
22797 |
ccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaaaccatgaattagcatccataacatcactta |
22701 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0833 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:
Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
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Target Start/End: Original strand, 3273 - 3407
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| Q |
28 |
aaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatc |
127 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| || || ||||||||||||| |
|
|
| T |
3273 |
aaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatc |
3371 |
T |
 |
| Q |
128 |
cattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaac |
163 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
3372 |
aattgatcatgaaacttatcacaattcatcaacaac |
3407 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0009 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:
Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 78 - 404
Target Start/End: Original strand, 69480 - 69807
Alignment:
| Q |
78 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcac |
177 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | || ||| || | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||| | |||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
69480 |
acccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaa |
69579 |
T |
 |
| Q |
178 |
caatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaaca |
276 |
Q |
| |
|
|| || ||||||| || ||||| ||| | ||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||||||| | || ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
69580 |
catttagagcataatt-caacatataacactttcacatactttaaacatgcaatttcacctacaacaattcaattataaccaatttcatgcatttaaaca |
69678 |
T |
 |
| Q |
277 |
tgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataa |
374 |
Q |
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T |
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375 |
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Q |
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T |
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Q |
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T |
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226 |
Q |
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T |
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325 |
Q |
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2697 |
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T |
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Name: scaffold0150
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Target: scaffold0150; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 28509 - 28781
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Q |
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T |
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128 |
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226 |
Q |
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| T |
28609 |
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T |
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| Q |
227 |
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300 |
Q |
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taatttcaccaacaacaattcagttatcaacaagttcatgcattcaaacatatcatcataattagagcacgaat |
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T |
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Target: scaffold0006; HSP #1
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Q |
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T |
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Q |
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| T |
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T |
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375 |
Q |
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| T |
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197180 |
T |
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376 |
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402 |
Q |
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Target: scaffold0123; HSP #1
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Q |
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| Q |
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263 |
Q |
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| T |
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362 |
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402 |
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T |
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Target: scaffold0483 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
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Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
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28 |
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Q |
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T |
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Q |
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| Q |
227 |
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301 |
Q |
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6907 |
T |
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Target: scaffold0409; HSP #1
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Q |
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| T |
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T |
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Target: scaffold0409; HSP #2
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376 |
Q |
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9625 |
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9528 |
T |
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| Q |
377 |
gattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
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| T |
9527 |
gattatgatgaattctaaccccctta |
9502 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:
Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 116 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 89655 - 89584
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187 |
Q |
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|
|||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |
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T |
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Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
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164 |
Q |
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| T |
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79648 |
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263 |
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| T |
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264 |
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361 |
Q |
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79748 |
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79845 |
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398 |
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| T |
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79883 |
T |
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Target: scaffold0456 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
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Target: scaffold0456; HSP #1
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Q |
| |
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| T |
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402 |
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| |
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| T |
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1445 |
T |
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Target: scaffold0456; HSP #2
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Query Start/End: Original strand, 237 - 402
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336 |
Q |
| |
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| T |
8756 |
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T |
 |
| Q |
337 |
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402 |
Q |
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| T |
8657 |
taagcacttattcatac-aataattgaaaatttacactaaaataattatgatgaattctaaacccctta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0010 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:
Target: scaffold0010; HSP #1
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Q |
| |
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| T |
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31171 |
T |
 |
| Q |
207 |
tttttcatactttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatc |
306 |
Q |
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| T |
31172 |
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31271 |
T |
 |
| Q |
307 |
atttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatga-tgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
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| T |
31272 |
aactatgaacaattaatcacttact-caattaagcacttaatcatac-aataattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaaccccctta |
31368 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0970 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
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Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
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Q |
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| T |
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attttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaataaggaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaac |
2518 |
T |
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| Q |
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Q |
| |
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| T |
2519 |
aacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatatcataa |
2572 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
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Target: scaffold0026; HSP #1
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Q |
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attatgatgaattctaaccccctta |
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Q |
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| T |
89789 |
attatgatgaattctaaccccctta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1272 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:
Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 182
Target Start/End: Original strand, 282 - 436
Alignment:
| Q |
28 |
aaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatc |
127 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| | ||||| | |||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||| | || ||| |||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
282 |
aaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgagcacccaaggcatgaataatcaacaaaaacatcacttagcaacaacaacatc |
381 |
T |
 |
| Q |
128 |
cattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt |
182 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||| ||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
382 |
aattgaacatgactcttaccacaattcaacaataacatagcataattcaacaatt |
436 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0018 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:
Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 51389 - 51312
Alignment:
| Q |
110 |
cttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaattgagca |
187 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51389 |
cttaaccacaacaacatcaattaaacatgattctcatcacaattcatcaaccacataacataattcaccaattgagca |
51312 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0389 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:
Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 402
Target Start/End: Original strand, 10887 - 11009
Alignment:
| Q |
280 |
catcataattagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgcaataag-tg |
377 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||| | ||| || |
|
|
| T |
10887 |
catcatagatagagcacgaattataacatctatgaacaattaattattta-tccaattaatcacttattcatacaa-taattgaaaattatactaaaatg |
10984 |
T |
 |
| Q |
378 |
attatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10985 |
attatgatgaattctaaccccctta |
11009 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0521 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:
Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 398
Target Start/End: Original strand, 11066 - 11438
Alignment:
| Q |
27 |
caaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacat |
126 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||||||| | || ||||| |||| ||| | ||| ||||||||||| | | ||| |||| ||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
11066 |
caaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatctatgaacacctaagccatgaatcataaacaacaacatcacatagcaacaacaacat |
11165 |
T |
 |
| Q |
127 |
ccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattcaccaatt-gagcatattttcaacacatatccatttttcatactttgaacat |
225 |
Q |
| |
|
| ||||| |||| || |||| |||| | |||||| ||| |||| |||| | ||| ||||||| || ||||| ||||| ||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
11166 |
caattgaacatggttctcatcataattcaacaacaagatagcatatttcaactatttgagcataatt-caacatatatcactttcacacactttgaacat |
11264 |
T |
 |
| Q |
226 |
gtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaatttt-atcatttatgaacaattaatc |
324 |
Q |
| |
|
| |||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| |||||| |||||||||| || || ||||||| | || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
11265 |
gaaatttcacaaacaacaattcaattatcactagtttcatgcattcaaacatatcatcataattggaacatgaatttttaacaattatgaacaattaatc |
11364 |
T |
 |
| Q |
325 |
aattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaa-ttgcaataagtgattatgatgaattctaacccc |
398 |
Q |
| |
|
| || || |||||||||||| |||| |||| |||||||||| || || ||| ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
11365 |
atctactc-aattaagcacttattcatacaa-taattgaaaaattacactaaatgattatgatgaattataacccc |
11438 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0080 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:
Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 43884 - 43697
Alignment:
| Q |
216 |
ctttgaacatgtaattcaactaacaacaattcaatcctccataacttcatacatctaaacatgccatcataattagagcacgaattttatcatttatgaa |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||| |
|
|
| T |
43884 |
ctttgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcatgcattcaaacatagcatcataattagagcattaattttaacaactatgaa |
43785 |
T |
 |
| Q |
316 |
caattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattg-aaaattgcaataagtgattatga-tgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| || || ||||| |||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43784 |
caattaatcacttact-caattaagcacttaatcatac-aacaattgaaaaattacactaaatgattatgattgaattctaaccccctta |
43697 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0058 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:
Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 70329 - 70206
Alignment:
| Q |
280 |
catcataattagagcacgaatttt-atcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataattgaaaattgca-ataagt |
376 |
Q |
| |
|
||||||| || ||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| | || |||| ||||| |||| |||| |||||||||||| || | || | |
|
|
| T |
70329 |
catcatagttggagtacgaatttttaacatctatgaacaattaatcaatta-tacatttaatcacttattcatacaa-taattgaaaatttcacaaaaat |
70232 |
T |
 |
| Q |
377 |
gattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
70231 |
gattatgatgaattctaaccccctta |
70206 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 70543 - 70418
Alignment:
| Q |
65 |
atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaaca |
164 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||||||||| |||| | || ||| |||| |||||| ||| ||||||||| ||||| |||| || |||| |||| | |||||| | |
|
|
| T |
70543 |
atgaattatgaatacccaagccaagaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattgaacatggtcctcatcataattcaacaacaata |
70444 |
T |
 |
| Q |
165 |
taacataattca-ccaattgagcata |
189 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
70443 |
taacataattcacccaattgagcata |
70418 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0125 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:
Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 184
Target Start/End: Original strand, 41666 - 41778
Alignment:
| Q |
72 |
atgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacata |
171 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| | | || ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| |||| || |||| |||| | |||||||||| || | |
|
|
| T |
41666 |
atgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaa |
41765 |
T |
 |
| Q |
172 |
attcaccaattga |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
41766 |
attcaccaattga |
41778 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0132 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:
Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 187
Target Start/End: Original strand, 13524 - 13639
Alignment:
| Q |
72 |
atgcatacccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacata |
171 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| | | || ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| |||| || |||| |||| | |||||||||| || | |
|
|
| T |
13524 |
atgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaa |
13623 |
T |
 |
| Q |
172 |
attcaccaattgagca |
187 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13624 |
attcatcaattgagca |
13639 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0138 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:
Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 288 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 22443 - 22328
Alignment:
| Q |
288 |
ttagagcacgaattttatcatttatgaacaattaatcaattaatccaattaagcactt-ttcacacaaataatt-gaaaattgcaat-aagtgattatga |
384 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||||| ||||| |||| || ||||||| ||||| || | || ||||||||| |
|
|
| T |
22443 |
ttagagcacgaattttaacatctatgaacaatcaatcaa-tcatccaattaatcacttattcatac-aataattaaaaaataacactaaaatgattatga |
22346 |
T |
 |
| Q |
385 |
tgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22345 |
tgaattctaaccccctta |
22328 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1734 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1734
Description:
Target: scaffold1734; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 76
Target Start/End: Original strand, 1358 - 1420
Alignment:
| Q |
14 |
tcaccattttcaccaaaccagcaacaacaatttatttccaaacaacaaattatgaatcatgca |
76 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1358 |
tcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgca |
1420 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0193 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:
Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 176
Target Start/End: Original strand, 4628 - 4726
Alignment:
| Q |
78 |
acccaagccatgaattagcatcaataacaccacttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacataacataattca |
176 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | || ||| || || |||||||||||||||||| ||| | ||||| | ||||||||| | ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
4628 |
acccaagccatgaatcatcaacaacaaaacttcttaacaacaacaacatcaattaaacatgattcccatcacaattcaacaacaacataacacaattca |
4726 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0260 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:
Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 402
Target Start/End: Original strand, 8665 - 8694
Alignment:
| Q |
373 |
aagtgattatgatgaattctaaccccctta |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8665 |
aagtgattatgatgaattctaaccccctta |
8694 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0165 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:
Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 166
Target Start/End: Original strand, 22054 - 22110
Alignment:
| Q |
110 |
cttaacaacaacaacatccattgatcatgaaacttatcacaatttatcaacaacata |
166 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| | |||||| || ||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
22054 |
cttaacaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacata |
22110 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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