View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11470_low_31 (Length: 318)

Name: NF11470_low_31
Description: NF11470
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11470_low_31
NF11470_low_31
[»] chr8 (39 HSPs)
chr8 (13-221)||(29938059-29938268)
chr8 (13-213)||(18594544-18594744)
chr8 (13-223)||(14422699-14422910)
chr8 (13-213)||(144401-144601)
chr8 (15-213)||(2042526-2042724)
chr8 (13-213)||(24113166-24113366)
chr8 (13-213)||(39206593-39206793)
chr8 (13-221)||(35118031-35118240)
chr8 (13-213)||(10836755-10836955)
chr8 (13-213)||(13110411-13110611)
chr8 (13-213)||(22260630-22260830)
chr8 (13-213)||(7791418-7791618)
chr8 (13-213)||(33278407-33278607)
chr8 (13-210)||(7774774-7774971)
chr8 (13-213)||(34679457-34679657)
chr8 (13-213)||(34842365-34842565)
chr8 (17-213)||(38167159-38167355)
chr8 (14-213)||(39218784-39218983)
chr8 (13-210)||(7812005-7812202)
chr8 (14-213)||(4035854-4036053)
chr8 (14-213)||(41575520-41575719)
chr8 (13-213)||(6144273-6144473)
chr8 (14-209)||(44804945-44805140)
chr8 (13-221)||(5320562-5320771)
chr8 (13-212)||(34998896-34999095)
chr8 (13-213)||(8021726-8021918)
chr8 (13-213)||(42571601-42571798)
chr8 (16-209)||(28639289-28639484)
chr8 (13-213)||(36491164-36491364)
chr8 (64-213)||(40117903-40118052)
chr8 (16-213)||(33287040-33287225)
chr8 (81-213)||(26783801-26783933)
chr8 (14-210)||(66180-66377)
chr8 (16-141)||(9807339-9807464)
chr8 (221-302)||(43803916-43803997)
chr8 (69-213)||(2322068-2322212)
chr8 (92-213)||(5005173-5005294)
chr8 (69-209)||(39220267-39220407)
chr8 (133-213)||(9806880-9806960)
[»] chr3 (39 HSPs)
chr3 (13-213)||(8042609-8042809)
chr3 (13-213)||(37698129-37698329)
chr3 (13-223)||(25999379-25999590)
chr3 (13-213)||(20842334-20842534)
chr3 (18-213)||(32244122-32244317)
chr3 (14-213)||(42307892-42308091)
chr3 (13-213)||(15520128-15520328)
chr3 (13-213)||(22174976-22175176)
chr3 (13-213)||(38856095-38856295)
chr3 (13-213)||(54870160-54870360)
chr3 (14-213)||(46452149-46452348)
chr3 (13-209)||(12117644-12117840)
chr3 (13-213)||(21581044-21581244)
chr3 (13-213)||(29445490-29445690)
chr3 (13-213)||(35226449-35226649)
chr3 (13-213)||(38933948-38934147)
chr3 (13-213)||(50528931-50529131)
chr3 (13-223)||(25494271-25494482)
chr3 (13-213)||(32359261-32359461)
chr3 (13-213)||(44609319-44609519)
chr3 (13-211)||(42104957-42105155)
chr3 (14-213)||(15520638-15520837)
chr3 (14-213)||(20699151-20699350)
chr3 (14-213)||(26122816-26123015)
chr3 (13-213)||(48924989-48925187)
chr3 (13-213)||(54534314-54534512)
chr3 (13-210)||(34700346-34700543)
chr3 (14-191)||(44688785-44688961)
chr3 (13-209)||(2895191-2895391)
chr3 (14-213)||(24835686-24835885)
chr3 (13-213)||(53028227-53028419)
chr3 (13-171)||(16354390-16354548)
chr3 (63-213)||(35643219-35643369)
chr3 (16-191)||(12915931-12916105)
chr3 (81-213)||(50529827-50529959)
chr3 (14-99)||(24366145-24366230)
chr3 (13-94)||(13696914-13696995)
chr3 (87-213)||(49128051-49128177)
chr3 (13-59)||(50528868-50528914)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (13-223)||(33359080-33359291)
chr7 (13-209)||(933295-933491)
chr7 (13-213)||(5280866-5281066)
chr7 (13-213)||(43067963-43068163)
chr7 (15-213)||(3511329-3511527)
chr7 (13-213)||(12097580-12097780)
chr7 (13-213)||(12101168-12101368)
chr7 (13-213)||(20346494-20346694)
chr7 (13-213)||(24792322-24792522)
chr7 (13-213)||(30181014-30181214)
chr7 (13-213)||(42964986-42965186)
chr7 (13-223)||(22649684-22649895)
chr7 (13-213)||(7164190-7164390)
chr7 (13-213)||(33846519-33846714)
chr7 (13-210)||(6394760-6394957)
chr7 (13-221)||(25748484-25748693)
chr7 (13-213)||(42204160-42204361)
chr7 (13-213)||(1803032-1803232)
chr7 (13-213)||(4477311-4477511)
chr7 (13-213)||(9452596-9452796)
chr7 (13-213)||(32041548-32041748)
chr7 (15-213)||(43156719-43156917)
chr7 (13-213)||(15655918-15656118)
chr7 (15-187)||(48865662-48865837)
chr7 (13-213)||(8630672-8630872)
chr7 (13-213)||(38866550-38866750)
chr7 (14-213)||(36890821-36891019)
chr7 (13-213)||(42673471-42673667)
chr7 (13-213)||(46891329-46891530)
chr7 (13-213)||(4347279-4347478)
chr7 (13-213)||(46134294-46134494)
chr7 (13-225)||(17753593-17753806)
chr7 (13-187)||(16894497-16894671)
chr7 (13-213)||(43021570-43021766)
chr7 (74-209)||(19828280-19828415)
chr7 (69-213)||(37005857-37006001)
chr7 (124-213)||(37704986-37705075)
chr7 (69-209)||(43405030-43405170)
chr7 (85-213)||(20163825-20163953)
chr7 (76-163)||(36849590-36849677)
chr7 (69-213)||(15655458-15655602)
chr7 (69-223)||(30075277-30075429)
chr7 (125-209)||(27691428-27691512)
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (13-213)||(3347523-3347723)
chr6 (13-213)||(26946876-26947076)
chr6 (13-213)||(6086599-6086799)
chr6 (13-213)||(9459570-9459770)
chr6 (13-213)||(2837552-2837752)
chr6 (13-213)||(11167247-11167447)
chr6 (13-213)||(30691858-30692058)
chr6 (13-213)||(26704339-26704539)
chr6 (13-213)||(17261073-17261273)
chr6 (13-213)||(18613545-18613745)
chr6 (13-203)||(21893472-21893662)
chr6 (13-210)||(1153603-1153800)
chr6 (13-223)||(20726787-20726994)
chr6 (13-213)||(34887292-34887492)
chr6 (13-213)||(3955769-3955966)
chr6 (13-213)||(28199508-28199709)
chr6 (18-213)||(30698934-30699129)
chr6 (20-213)||(16307015-16307208)
chr6 (14-209)||(35198295-35198489)
chr6 (13-150)||(33464399-33464536)
chr6 (64-213)||(52843-52992)
chr6 (13-127)||(53001-53115)
chr6 (142-213)||(33463708-33463779)
[»] chr4 (64 HSPs)
chr4 (13-222)||(19913618-19913828)
chr4 (13-213)||(15241016-15241216)
chr4 (14-213)||(20877052-20877251)
chr4 (13-224)||(38055150-38055362)
chr4 (13-213)||(53717452-53717652)
chr4 (13-213)||(54189550-54189750)
chr4 (13-213)||(1617089-1617289)
chr4 (13-213)||(1756752-1756952)
chr4 (13-213)||(14987797-14987997)
chr4 (15-213)||(23776449-23776647)
chr4 (13-225)||(50353793-50354006)
chr4 (13-213)||(6611348-6611548)
chr4 (13-213)||(16700786-16700986)
chr4 (13-209)||(33703850-33704046)
chr4 (13-209)||(37464730-37464926)
chr4 (13-213)||(53875662-53875862)
chr4 (13-213)||(54412633-54412833)
chr4 (16-213)||(23704200-23704397)
chr4 (13-210)||(28032700-28032897)
chr4 (13-213)||(27488636-27488836)
chr4 (13-213)||(44379175-44379375)
chr4 (13-213)||(45424522-45424722)
chr4 (22-213)||(50055098-50055289)
chr4 (13-203)||(31969696-31969886)
chr4 (16-213)||(30423556-30423752)
chr4 (13-213)||(2481396-2481596)
chr4 (13-213)||(15669188-15669388)
chr4 (13-213)||(30171585-30171785)
chr4 (13-209)||(40428708-40428904)
chr4 (13-213)||(44784905-44785105)
chr4 (13-208)||(8591080-8591275)
chr4 (15-213)||(48909851-48910049)
chr4 (16-213)||(43289951-43290148)
chr4 (16-213)||(52139208-52139405)
chr4 (13-213)||(11639566-11639766)
chr4 (13-213)||(35490761-35490961)
chr4 (14-210)||(37968746-37968942)
chr4 (13-213)||(27536092-27536288)
chr4 (13-213)||(6688615-6688809)
chr4 (13-213)||(19164961-19165160)
chr4 (12-213)||(8932165-8932366)
chr4 (13-213)||(47632039-47632240)
chr4 (13-213)||(40680026-40680226)
chr4 (16-196)||(16703843-16704023)
chr4 (14-213)||(53353060-53353267)
chr4 (22-213)||(44375850-44376041)
chr4 (13-213)||(27583620-27583820)
chr4 (13-209)||(55344813-55345009)
chr4 (47-213)||(28360435-28360602)
chr4 (13-209)||(38071314-38071504)
chr4 (13-141)||(23269034-23269162)
chr4 (69-213)||(50053448-50053592)
chr4 (13-99)||(53408138-53408225)
chr4 (13-116)||(9595890-9595982)
chr4 (133-213)||(23265865-23265945)
chr4 (13-76)||(23261874-23261937)
chr4 (70-152)||(51780763-51780845)
chr4 (69-204)||(44548185-44548320)
chr4 (13-59)||(50055304-50055350)
chr4 (13-79)||(48748197-48748263)
chr4 (69-211)||(17493340-17493482)
chr4 (13-47)||(55344681-55344715)
chr4 (85-223)||(46257269-46257407)
chr4 (74-127)||(55344724-55344777)
[»] chr5 (32 HSPs)
chr5 (16-213)||(1165604-1165801)
chr5 (16-213)||(1579044-1579241)
chr5 (16-213)||(1605574-1605771)
chr5 (13-213)||(9008057-9008257)
chr5 (13-213)||(24105671-24105871)
chr5 (13-213)||(8374339-8374538)
chr5 (13-213)||(16069361-16069561)
chr5 (13-209)||(16737447-16737643)
chr5 (17-213)||(27420866-27421062)
chr5 (13-213)||(27679169-27679369)
chr5 (13-213)||(31883152-31883352)
chr5 (13-213)||(3386486-3386686)
chr5 (13-213)||(33491196-33491396)
chr5 (13-213)||(4120945-4121145)
chr5 (13-213)||(19358534-19358734)
chr5 (13-209)||(33991152-33991348)
chr5 (13-213)||(38598450-38598650)
chr5 (14-223)||(5202969-5203179)
chr5 (13-213)||(3921589-3921789)
chr5 (13-209)||(20992146-20992342)
chr5 (13-213)||(35782644-35782844)
chr5 (13-187)||(26602942-26603116)
chr5 (13-172)||(27025005-27025164)
chr5 (16-213)||(31410484-31410681)
chr5 (86-213)||(20992354-20992485)
chr5 (80-213)||(33284642-33284775)
chr5 (85-191)||(31638175-31638281)
chr5 (13-67)||(35420424-35420478)
chr5 (86-155)||(41818536-41818605)
chr5 (20-51)||(27024822-27024853)
chr5 (69-210)||(25634593-25634732)
chr5 (87-171)||(19516044-19516128)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (13-213)||(36710-36910)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (13-213)||(6174828-6175028)
chr2 (13-213)||(42937724-42937925)
chr2 (13-224)||(31517215-31517427)
chr2 (13-213)||(18806884-18807084)
chr2 (13-213)||(3873244-3873444)
chr2 (13-213)||(33906047-33906247)
chr2 (13-213)||(4016044-4016244)
chr2 (14-213)||(39635457-39635656)
chr2 (13-210)||(5733407-5733604)
chr2 (13-213)||(26323186-26323386)
chr2 (13-213)||(4232142-4232342)
chr2 (13-213)||(30270679-30270879)
chr2 (33-220)||(1108277-1108464)
chr2 (16-204)||(19383938-19384126)
chr2 (13-213)||(28329839-28330037)
chr2 (21-209)||(16066302-16066490)
chr2 (13-210)||(1482903-1483099)
chr2 (18-213)||(19901143-19901337)
chr2 (13-171)||(2178769-2178927)
chr2 (15-213)||(30420181-30420367)
chr2 (13-213)||(851002-851202)
chr2 (13-213)||(16588776-16588976)
chr2 (13-209)||(44947549-44947738)
chr2 (17-171)||(429863-430017)
chr2 (69-213)||(42446625-42446769)
chr2 (76-171)||(22101210-22101305)
chr2 (69-171)||(3585337-3585439)
[»] chr1 (48 HSPs)
chr1 (13-213)||(33510489-33510689)
chr1 (13-221)||(42370795-42371004)
chr1 (13-213)||(20089476-20089676)
chr1 (13-213)||(38829074-38829274)
chr1 (14-213)||(16052101-16052300)
chr1 (14-213)||(29078521-29078720)
chr1 (16-213)||(1170447-1170644)
chr1 (13-213)||(19715161-19715361)
chr1 (13-213)||(25897379-25897579)
chr1 (13-213)||(26663263-26663463)
chr1 (13-213)||(39260346-39260546)
chr1 (13-213)||(29288154-29288352)
chr1 (13-213)||(1168508-1168708)
chr1 (13-213)||(1940747-1940947)
chr1 (13-213)||(8120874-8121074)
chr1 (13-213)||(52753147-52753347)
chr1 (14-213)||(46760971-46761170)
chr1 (13-213)||(2347661-2347862)
chr1 (13-213)||(5215390-5215590)
chr1 (13-213)||(26580270-26580470)
chr1 (13-213)||(41928495-41928695)
chr1 (13-213)||(17591696-17591893)
chr1 (13-221)||(970524-970735)
chr1 (13-209)||(23498469-23498665)
chr1 (13-213)||(40092496-40092696)
chr1 (13-213)||(52696796-52696996)
chr1 (13-213)||(12682825-12683025)
chr1 (13-213)||(32671584-32671784)
chr1 (13-213)||(43905659-43905859)
chr1 (18-213)||(6765464-6765659)
chr1 (14-213)||(8079710-8079909)
chr1 (13-187)||(40149494-40149668)
chr1 (13-221)||(51359217-51359425)
chr1 (13-213)||(7145212-7145412)
chr1 (16-213)||(2473727-2473924)
chr1 (13-202)||(17587505-17587694)
chr1 (13-213)||(13996723-13996923)
chr1 (13-213)||(49146177-49146377)
chr1 (13-223)||(15203106-15203317)
chr1 (13-213)||(46409440-46409642)
chr1 (16-213)||(15717790-15717986)
chr1 (13-213)||(15554152-15554344)
chr1 (52-213)||(29695680-29695842)
chr1 (14-209)||(38171841-38172023)
chr1 (70-205)||(23322897-23323032)
chr1 (89-213)||(52086272-52086396)
chr1 (69-213)||(5217840-5217983)
chr1 (147-213)||(5675110-5675176)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (18-213)||(22956-23151)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (13-213)||(295-495)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (14-213)||(145246-145445)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (13-213)||(10243-10443)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (13-209)||(6-202)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (13-213)||(3715-3915)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (13-213)||(6-207)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 39)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29938268 - 29938059
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29938268 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 29938169  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc- 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||     
T  29938168 atgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 29938069  T
Q  212 aacggggcca 221  Q
    ||||||||||    
T  29938068 aacggggcca 29938059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 18594744 - 18594544
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18594744 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 18594645  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18594644 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 18594545  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  18594544 a 18594544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14422910 - 14422699
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14422910 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 14422811  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc- 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||     
T  14422810 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatcca 14422711  T
Q  212 aacggggccata 223  Q
    ||||||||||||    
T  14422710 aacggggccata 14422699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 144601 - 144401
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  144601 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 144502  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  144501 atgaaactatgataaactatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacatatgctcaaaataagtcaatcca 144402  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  144401 a 144401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 2042526 - 2042724
Alignment:
Q  15 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2042526 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttat 2042625  T
Q  115 gaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  2042626 gaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 2042724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 24113166 - 24113366
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24113166 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 24113265  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  24113266 atgaaactatgataatctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagggttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatcca 24113365  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  24113366 a 24113366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 39206793 - 39206593
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  39206793 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagctt 39206694  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  39206693 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 39206594  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  39206593 a 39206593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 35118031 - 35118240
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35118031 cagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 35118130  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc- 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||     
T  35118131 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 35118230  T
Q  212 aacggggcca 221  Q
    ||||||||||    
T  35118231 aacggggcca 35118240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 10836755 - 10836955
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  10836755 cagagataatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagttt 10836854  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  10836855 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 10836954  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  10836955 a 10836955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13110611 - 13110411
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13110611 cagagagaatcgaaggaggttacataaactcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 13110512  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13110511 attaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcatatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 13110412  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  13110411 a 13110411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 22260630 - 22260830
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22260630 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 22260729  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22260730 atgaaactaggataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagacttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatcca 22260829  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  22260830 a 22260830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 7791618 - 7791418
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7791618 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaagcttattgaaatatgacataagcagctt 7791519  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  7791518 atgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatcca 7791419  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  7791418 a 7791418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 33278607 - 33278407
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33278607 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 33278508  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||  || |||  |||||||||||||||||||    
T  33278507 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgaaagtagataagtccatataaactcaaaataagccaatcca 33278408  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  33278407 a 33278407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7774971 - 7774774
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7774971 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttaataaaatatgacataagcagctt 7774872  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatc 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| | | |||| ||||||||||||||||||    
T  7774871 atgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaacccgcataagctcaaaataagccaatc 7774774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 34679457 - 34679657
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  34679457 cagaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggtataagcagctt 34679556  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  34679557 atgaaactatgataaactatttttatttatttattcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatcca 34679656  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  34679657 a 34679657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 34842365 - 34842565
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  34842365 cagagagaatcgaaggaggtcacataaattaataagctccttgttaagacggtgggtaagctggaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctt 34842464  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  34842465 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 34842564  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  34842565 a 34842565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 213
Target Start/End: Original strand, 38167159 - 38167355
Alignment:
Q  17 gagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38167159 gagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 38167258  T
Q  117 aactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  38167259 aactatgataaactagttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataagcccacataaactcaaaataggccaatccaa 38167355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 39218983 - 39218784
Alignment:
Q  14 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  39218983 agagagaatcgaaggaggtcacataaattcatcagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctta 39218884  T
Q  114 tgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  39218883 tgaagctatgataaaccatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 39218784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7812202 - 7812005
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7812202 cagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaagcttattgaaatatgacataagcagctt 7812103  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatc 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  7812102 atgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactaatggaagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatc 7812005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4036053 - 4035854
Alignment:
Q  14 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4036053 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 4035954  T
Q  114 tgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||| |||||| || ||| ||| ||||||| |||||||||    
T  4035953 tgaaactatgataagctatttttatttgtttacccaaacacctttaataaaacttatgggagtagataagcccatataagctaaaaataaaccaatccaa 4035854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 41575719 - 41575520
Alignment:
Q  14 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41575719 agagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagctta 41575620  T
Q  114 tgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||||| |||||||||||||||||||||    
T  41575619 tgaaactatgataagcaatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtctacataagctcaaaataagccaatccaa 41575520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 6144273 - 6144473
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6144273 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataagcagctt 6144372  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||| |||||||    
T  6144373 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacactgttaaaaaggcatatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagtcaatcca 6144472  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  6144473 a 6144473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Original strand, 44804945 - 44805140
Alignment:
Q  14 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44804945 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 44805044  T
Q  114 tgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |  ||||| |||||||||||||||||    
T  44805045 tgaaactatgataagctatttttatttatttatctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataaacctacataagctcaaaataagccaat 44805140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5320771 - 5320562
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  5320771 cagagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagttgaaaatttaggcttattgaaacatgacataagcaactt 5320672  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc- 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||     
T  5320671 atgaaactatgataaattatttttatttatttaccaaaacaactttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatcca 5320572  T
Q  212 aacggggcca 221  Q
    ||||||||||    
T  5320571 aacggggcca 5320562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 34998896 - 34999095
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34998896 cagagagaatcgaaggagattaaataaattcataagctccttgttaagccggagggcaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 34998995  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| | |  ||| ||||||||||||||||||||    
T  34998996 atgaaactaagataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccgtataagctcaaaataagccaatcca 34999095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8021918 - 8021726
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8021918 cagagagaatcgaagtaggttatataaactcataagctccttgttaagccgga--------tgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 8021827  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  8021826 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatcca 8021727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 42571798 - 42571601
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  42571798 cagagagaatcgaaagaggttgcataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggc--attgaaatatgacataagcagctt 42571701  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  42571700 atgaaactatgataagctatttttatt-atttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatcca 42571602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 28639484 - 28639289
Alignment:
Q  16 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28639484 agagaatcgaaggaggttacataa--tcataagctctatgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 28639387  T
Q  116 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt----atggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    || | |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  28639386 aaactatgataaactatttttatttatttaccaaaacacctttaaaaaagcttgtatataggagtagataagctcacataagcttaaaataagccaat 28639289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 36491364 - 36491164
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||    
T  36491364 cagagagaatcgaaagaggttacataaattcataagcttcttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacaagtt 36491265  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  | || |||| | |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  36491264 atgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaagacttatgcgattagataatcccacataagcttaaaataagccaatcca 36491165  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  36491164 a 36491164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 64 - 213
Target Start/End: Original strand, 40117903 - 40118052
Alignment:
Q  64 gaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 163  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40117903 gagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaa 40118002  T
Q  164 ggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    ||||||||| |||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  40118003 ggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaa 40118052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 213
Target Start/End: Original strand, 33287040 - 33287225
Alignment:
Q  16 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33287040 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagcta------------gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 33287127  T
Q  116 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||| |||| | |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  33287128 aaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaagcatatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaa 33287225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 81 - 213
Target Start/End: Original strand, 26783801 - 26783933
Alignment:
Q  81 ttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatat 180  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  26783801 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagat 26783900  T
Q  181 aagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26783901 aagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 26783933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 210
Target Start/End: Original strand, 66180 - 66377
Alignment:
Q  14 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccgga-ggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  66180 agagagaatcgaaggaggtcacgtaaattcataagctccttgttaagccgaaagggtaagctgaaaatttaaacttattgaaatatggcataagcagctt 66279  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatc 210  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| | || ||||||  ||| |  |||||||||||||||||    
T  66280 atgaaactattataagttatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagacatatgggaatagataagcctacagaaactcaaaataagccaatc 66377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 9807464 - 9807339
Alignment:
Q  16 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 115  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9807464 agagaaacgaaggaggtttcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 9807365  T
Q  116 aaactatgataaactatttttattta 141  Q
    || ||||||||| |||||||||||||    
T  9807364 aagctatgataagctatttttattta 9807339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 221 - 302
Target Start/End: Original strand, 43803916 - 43803997
Alignment:
Q  221 atatagtctttagataatataaaaggagatgattgcggcttttcaatatttgttgagatgggattaatgagagatatcaagt 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43803916 atatagtctttagataatataaaaggagatgattgcggcttttcaatatttattgagatgggattaatgagagatatcaagt 43803997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 69 - 213
Target Start/End: Original strand, 2322068 - 2322212
Alignment:
Q  69 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 168  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2322068 taagcttaaaatttaggcttatcaaaatatgatataagcagcttatgaaattgtgataagctgtttttattgatttacccaaacacctttaaaaaagctt 2322167  T
Q  169 atggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    |||  |||| ||||   || ||| ||||  |||||||||||||||    
T  2322168 atgttagtagataaatccatataagctccgaataagccaatccaa 2322212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 92 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5005294 - 5005173
Alignment:
Q  92 aaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacata 191  Q
    |||||||  ||||||||| |||||| | ||  |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  5005294 aaaatatagcataagcagtttatgagagtagcataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacata 5005195  T
Q  192 tgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
     ||| || ||||||||||||||    
T  5005194 agcttaagataagccaatccaa 5005173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 69 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 39220407 - 39220267
Alignment:
Q  69 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 168  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||   || |||||||||||||| |   |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |    
T  39220407 taagctcaaaatttgagcttattaaaatatagtatgagcagcttatgaaattggaataagctatttttattgatttactcaaacacctttaaaaagacat 39220308  T
Q  169 atggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 209  Q
    ||||| ||| ||||| ||| ||| |||||||||||| ||||    
T  39220307 atggatgtagataagttcatataagctcaaaataagtcaat 39220267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 9806960 - 9806880
Alignment:
Q  133 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| || |||  ||||||||||| ||||||||    
T  9806960 ttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcatatgggagtagataagcacatataaactcaaaataagtcaatccaa 9806880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 39)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8042809 - 8042609
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8042809 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 8042710  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  8042709 atgaaactatgataaactatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagctcaaaataagcccatcca 8042610  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  8042609 a 8042609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 37698129 - 37698329
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37698129 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 37698228  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  37698229 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 37698328  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  37698329 a 37698329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25999590 - 25999379
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25999590 cagagagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 25999491  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc- 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||     
T  25999490 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 25999391  T
Q  212 aacggggccata 223  Q
    ||||||||||||    
T  25999390 aacggggccata 25999379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 20842334 - 20842534
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20842334 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgatataagcagctt 20842433  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20842434 atgaaactatgataagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatcca 20842533  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  20842534 a 20842534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 32244317 - 32244122
Alignment:
Q  18 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32244317 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 32244218  T
Q  118 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32244217 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaa 32244122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Original strand, 42307892 - 42308091
Alignment:
Q  14 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42307892 agagagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 42307991  T
Q  114 tgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  42307992 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacgcctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 42308091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 15520128 - 15520328
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  15520128 cagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagttt 15520227  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15520228 atgaaacgatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 15520327  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  15520328 a 15520328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 22174976 - 22175176
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22174976 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 22175075  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22175076 atgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 22175175  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  22175176 a 22175176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 38856295 - 38856095
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38856295 cagagataatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 38856196  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  38856195 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatcca 38856096  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  38856095 a 38856095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 54870160 - 54870360
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54870160 cagaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 54870259  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||  |||||||||||||||||||    
T  54870260 atgaaacgatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataaactcaaaataagccaatcca 54870359  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  54870360 a 54870360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Original strand, 46452149 - 46452348
Alignment:
Q  14 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  46452149 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtgagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaactta 46452248  T
Q  114 tgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| ||||||  |||||||||||||    
T  46452249 tgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaacttaagccaatccaa 46452348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 12117644 - 12117840
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12117644 cagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaactt 12117743  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  12117744 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaat 12117840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21581244 - 21581044
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21581244 cagagagaatcgaaggatgttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 21581145  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  21581144 atgaaactatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatcca 21581045  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  21581044 a 21581044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29445690 - 29445490
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  29445690 cagatagaatggaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatagggcataaacagctt 29445591  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29445590 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatcca 29445491  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  29445490 a 29445490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 35226649 - 35226449
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35226649 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaggctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 35226550  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  35226549 atgaaactatgataagctgattttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataagcccacataagctcaaaataggccaatcca 35226450  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  35226449 a 35226449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 38934147 - 38933948
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38934147 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactggaaatttagacttattaaaatatgacataagcagctt 38934048  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  38934047 atgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataagc-cacataagctcaaaataagccaatcca 38933949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 50529131 - 50528931
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50529131 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 50529032  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  50529031 atgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 50528932  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  50528931 a 50528931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Original strand, 25494271 - 25494482
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25494271 cagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagcaggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 25494370  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc- 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||| | |||||| |||||||||||| ||||||     
T  25494371 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataaacccacataagctcaaaataagtcaatcca 25494470  T
Q  212 aacggggccata 223  Q
    ||||||||||||    
T  25494471 aacggggccata 25494482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 32359461 - 32359261
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32359461 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 32359362  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| || ||||   |||||| ||||||||||||||||||||    
T  32359361 atgaaactatgataaactatttttatttatttactcaaacacctttataaaagcttatggaaatagataaatccacataagctcaaaataagccaatcca 32359262  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  32359261 a 32359261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 44609319 - 44609519
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44609319 cagagagaatcgaaagaggttacataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 44609418  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  44609419 atgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcaagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatcca 44609518  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  44609519 a 44609519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 42104957 - 42105155
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42104957 cagagggaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcatgagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 42105056  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  42105057 atgaaactatgataaactatttttatttttttatccaaacacctttaaaaatgtttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatcc 42105155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15520837 - 15520638
Alignment:
Q  14 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15520837 agagagaatcgaaggaggttacaaaaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 15520738  T
Q  114 tgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15520737 tgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaa 15520638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20699350 - 20699151
Alignment:
Q  14 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20699350 agagagaatcgaaggaggttacaaaaattcctaagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctta 20699251  T
Q  114 tgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20699250 tgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 20699151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 26123015 - 26122816
Alignment:
Q  14 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 113  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26123015 agagagaatcgaagaatgttacgtaaattcataagctacttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagctta 26122916  T
Q  114 tgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | || |||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26122915 tgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggctcatgggaatagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaa 26122816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 48924989 - 48925187
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  48924989 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctaaaaatttagacttattaaaatatgacataaacagctt 48925088  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||| |||| | || |||  ||| |||||||||||||||    
T  48925089 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaa--acttttaaaaaagcttatggaagtagataaacccatataaactctaaataagccaatcca 48925186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 54534314 - 54534512
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  54534314 cagagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaa-tatggcataagcagctt 54534412  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  54534413 at-aaaccatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 54534511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 34700543 - 34700346
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34700543 cagagataatcaaaggaggttatataaattcataagcttcttcttaagccggagggtaaactaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 34700444  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatc 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||| ||||||    
T  34700443 atgaaactatgataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatggaagtaaataaacccacataagctcaaaataaaccaatc 34700346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 44688961 - 44688785
Alignment:
Q  14 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44688961 agagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatg-cataagcagctta 44688863  T
Q  114 tgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacata 191  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  44688862 tgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacata 44688785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2895391 - 2895191
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcata----agctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagca 108  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2895391 cagagagaatcgaaggaggttatataaattcatatataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagca 2895292  T
Q  109 gcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaa 208  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| | |||||| |||||||||||| |||    
T  2895291 gcttatgaaactatgataatttttttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaa 2895192  T
Q  209 t 209  Q
    |    
T  2895191 t 2895191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Original strand, 24835686 - 24835885
Alignment:
Q  14 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 113  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  24835686 agagataatcgaaggagtttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctta 24835785  T
Q  114 tgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||   | ||| |||||||||||  ||||||||    
T  24835786 tgaaactataataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagttgataagtctatataagctcaaaataaatcaatccaa 24835885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 53028419 - 53028227
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  53028419 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagttt 53028320  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||        |||| ||||||| ||||||| | || |||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  53028319 atgaaaatatgataagctatttttatttattt--------acctctaaaaagacttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagtcaatcca 53028228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 16354548 - 16354390
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  16354548 cagagataatcgcaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcaggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaacatggcattagcagctt 16354449  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 171  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16354448 atgaaactatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatg 16354390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 63 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 35643369 - 35643219
Alignment:
Q  63 ggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 162  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35643369 ggagggtaagctcaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaagcacctttaaaa 35643270  T
Q  163 aggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  35643269 aggcttatggaagtagataagttcacataagctcaaaataagtcaatccaa 35643219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 12916105 - 12915931
Alignment:
Q  16 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 115  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  12916105 agagaatcgaagggggttacataaattcataaactctttcttaaaccggagggtaagctgaaaacttaagcttatttaaatatgacataagcagtttatg 12916006  T
Q  116 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacata 191  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||||    
T  12916005 aaattatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagatttatgg-agtaaataagcccacata 12915931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 81 - 213
Target Start/End: Original strand, 50529827 - 50529959
Alignment:
Q  81 ttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatat 180  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  50529827 ttaggctcattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagat 50529926  T
Q  181 aagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    |||  ||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  50529927 aagtccacataaactcaaaataagtcaatccaa 50529959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 24366230 - 24366145
Alignment:
Q  14 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatg 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24366230 agagagaatctaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatg 24366145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 13696995 - 13696914
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaa 94  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13696995 cagagagaatcaaaggaggttacacaaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaa 13696914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 49128177 - 49128051
Alignment:
Q  87 ttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctc 186  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||| |||||| |    
T  49128177 ttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagttatttttattgatttacccaaacatctttaaaaagacttataggagtagataagccc 49128078  T
Q  187 acatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    ||||| | | |||||||| ||||||||    
T  49128077 acataagtttaaaataagtcaatccaa 49128051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 59
Target Start/End: Original strand, 50528868 - 50528914
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaa 59  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50528868 cagatagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaa 50528914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Original strand, 33359080 - 33359291
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33359080 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 33359179  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc- 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||     
T  33359180 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 33359279  T
Q  212 aacggggccata 223  Q
    ||||||||||||    
T  33359280 aacggggccata 33359291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 933491 - 933295
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  933491 cagagagattcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 933392  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  |||||||||||||||||    
T  933391 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacatgagctcaaaataagccaat 933295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5281066 - 5280866
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  5281066 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctt 5280967  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5280966 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgtgaatagataagctcacataagctcaaaataagccaatcca 5280867  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  5280866 a 5280866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 43067963 - 43068163
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43067963 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagaagctt 43068062  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||| |||||||    
T  43068063 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagtcaatcca 43068162  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  43068163 a 43068163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3511527 - 3511329
Alignment:
Q  15 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3511527 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 3511428  T
Q  115 gaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  3511427 gaaactatgataagctatttttatctatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagacaatccaa 3511329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 12097580 - 12097780
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12097580 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagtagctt 12097679  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||    
T  12097680 atgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagctcaacttaagccaatcca 12097779  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  12097780 a 12097780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 12101168 - 12101368
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12101168 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccatagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 12101267  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12101268 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatcca 12101367  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  12101368 a 12101368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20346694 - 20346494
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  20346694 cagagagaatcgaaggaggtttcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagctt 20346595  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  20346594 atgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 20346495  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  20346494 a 20346494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 24792322 - 24792522
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24792322 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 24792421  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| ||||||  ||||||||||||    
T  24792422 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagctcaacttaagccaatcca 24792521  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  24792522 a 24792522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 30181014 - 30181214
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30181014 cagagagaatcgaagggggttacataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 30181113  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  30181114 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 30181213  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  30181214 a 30181214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 42964986 - 42965186
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42964986 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 42965085  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  42965086 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 42965185  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  42965186 a 42965186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Original strand, 22649684 - 22649895
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22649684 cagagaaaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 22649783  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaa-tcc 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||     
T  22649784 atgaaattatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaattca 22649883  T
Q  212 aacggggccata 223  Q
    ||||||||||||    
T  22649884 aacggggccata 22649895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 7164390 - 7164190
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7164390 cagatagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 7164291  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  7164290 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatcca 7164191  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  7164190 a 7164190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 33846519 - 33846714
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33846519 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccc-----taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagttt 33846613  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  33846614 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 33846713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 6394957 - 6394760
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  6394957 cagagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctt 6394858  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatc 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  6394857 atgaaaccatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatc 6394760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25748693 - 25748484
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25748693 cagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 25748594  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc- 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| || | ||| ||||||  |||||||||||     
T  25748593 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactaatataagctcaacttaagccaatcca 25748494  T
Q  212 aacggggcca 221  Q
    ||||||||||    
T  25748493 aacggggcca 25748484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 42204361 - 42204160
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42204361 cagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 42204262  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacaccttta-aaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  42204261 atgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcc 42204162  T
Q  212 aa 213  Q
    ||    
T  42204161 aa 42204160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1803232 - 1803032
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||    
T  1803232 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatcgtataagcagctt 1803133  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  1803132 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatcca 1803033  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  1803032 a 1803032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 4477311 - 4477511
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  4477311 cagagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctt 4477410  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4477411 atgaaaccatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttgaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 4477510  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  4477511 a 4477511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 9452796 - 9452596
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  9452796 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagtgtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcatagacagctt 9452697  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  9452696 atgaaactatgataaactatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagaatagataagttcacataagctcaaaataagtcaatcca 9452597  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  9452596 a 9452596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 32041748 - 32041548
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32041748 cagagagaatcgaataaggttacataaatttataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatgaaaatatgacataagcagctt 32041649  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  32041648 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagcacaaaataagccaatcca 32041549  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  32041548 a 32041548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 43156917 - 43156719
Alignment:
Q  15 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||    
T  43156917 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagttctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatttgccataaacagcttat 43156818  T
Q  115 gaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  43156817 gaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 43156719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15656118 - 15655918
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15656118 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 15656019  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  || | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15656018 atgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagcagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 15655919  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  15655918 a 15655918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 48865837 - 48865662
Alignment:
Q  15 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48865837 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagcctgatgttaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 48865738  T
Q  115 gaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacaccttta---aaaaggcttatggaagtatataagctca 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||    
T  48865737 gaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaaaggcttatggaagtagataagctca 48865662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8630872 - 8630672
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8630872 cagagagaatcgaaggggattacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 8630773  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || | | ||||||  |||||||||| | ||||||    
T  8630772 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccgaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatcaacccacataacctcaaaataaacaaatcca 8630673  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  8630672 a 8630672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 38866750 - 38866550
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  38866750 cagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataaacagctt 38866651  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||| |||| | |||||| |||||||||||| | |||||    
T  38866650 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaaattatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagtcgatcca 38866551  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  38866550 a 38866550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Original strand, 36890821 - 36891019
Alignment:
Q  14 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  36890821 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaacttaggcttattgaaatatggcataagcaactta 36890920  T
Q  114 tgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||  ||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  36890921 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagctc-aaataagtcaatccaa 36891019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 42673667 - 42673471
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42673667 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 42673568  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| || ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||| ||||||| |||||||    
T  42673567 atgaaactatgataagctgtt----tttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctccaaataagtcaatcca 42673472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 46891329 - 46891530
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46891329 cagagacaatcgaaggaggttacataaactcataagctccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttaggctaattaaaatatgacataagcagctt 46891428  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacaccttt-aaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc 211  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||| ||||||  | ||| |||||||||||||||||||    
T  46891429 ataaaactatgacaaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaggtttataggagtagataagcctatataagctcaaaataagccaatcc 46891528  T
Q  212 aa 213  Q
    ||    
T  46891529 aa 46891530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4347478 - 4347279
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  4347478 cagagagaatagaagg-ggttacataaattcataagctccttgttaagctcgagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagctt 4347380  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  4347379 atgaaactatggtaagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagtttatgggagtagataagcccacataagcttaaaataagtcaatcca 4347280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 46134294 - 46134494
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||    
T  46134294 cagagagaatcgaatgaggttacataaattaataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcgtaaacagctt 46134393  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| | |||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  46134394 atgaaactataataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagagttataggagtagataaactcacataagctcaaaataagtcaatcca 46134493  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  46134494 a 46134494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17753806 - 17753593
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17753806 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagttgaagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 17753707  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc- 211  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||| |||||||   ||| ||||||||||||| |||||     
T  17753706 atgaaactatgttaagctatttttatttatttacccaaacaccttctaaaaggcttataggagtagataagcttgtataagctcaaaataagctaatcca 17753607  T
Q  212 aacggggccatata 225  Q
    ||||||| ||||||    
T  17753606 aacggggtcatata 17753593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 16894497 - 16894671
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16894497 cagaaagaatcgaaggatgttacataaattcataagctccctgttaagttgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 16894596  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctca 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  16894597 atgaaactatgataaactatttttatttgtttacccaaatacctttaaaaaagcttatgggagtagataagctca 16894671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 43021570 - 43021766
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| |  |    |||||| ||||||||||||    
T  43021570 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagagtaagctgaaaatttagaccga----aatatgccataagcagctt 43021665  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||  ||||||  || ||||||||||||||||    
T  43021666 atgaaactataataagttatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagacttattgaagtagataagtccacataaacttaaaataagccaatcca 43021765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 74 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19828415 - 19828280
Alignment:
Q  74 tgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgga 173  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  19828415 tgaaaattttggcttattaaaatatggcataagcaatttatgaaactatgataagctatttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatggg 19828316  T
Q  174 agtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 209  Q
    |||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  19828315 agtagataagccaacataaactcaaaataagccaat 19828280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 69 - 213
Target Start/End: Original strand, 37005857 - 37006001
Alignment:
Q  69 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 168  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||  |||    
T  37005857 taagctaaaaaattagccttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagctatttttactgatttacccaaacgcctttaaaaaaactt 37005956  T
Q  169 atggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    || |||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  37005957 atagaagtagataaactcacataagcttaaaataagccaatccaa 37006001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 124 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 37705075 - 37704986
Alignment:
Q  124 ataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  37705075 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaacccaa 37704986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 69 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 43405170 - 43405030
Alignment:
Q  69 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 168  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||||   | || || ||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||    
T  43405170 taagctaaaaaattgggcttattaaaatatagtagaaacaacttatgaaattacgataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagactt 43405071  T
Q  169 atggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 209  Q
    || | |||| ||||||  ||||| ||| |||||||| ||||    
T  43405070 ataggagtagataagccaacataagcttaaaataagtcaat 43405030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20163953 - 20163825
Alignment:
Q  85 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagc 184  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||| |||||||| | || | ||||| |||||   ||| ||||||    
T  20163953 gcttgttaaaatatgctataagcagcttatgaaactgtgataagctattttaattaattcacccaaacgcattcacaaaggattatgttggtaaataagc 20163854  T
Q  185 tcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    ||| ||| || ||||||||| ||||||||    
T  20163853 tcatataagcccaaaataagtcaatccaa 20163825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 163
Target Start/End: Original strand, 36849590 - 36849677
Alignment:
Q  76 aaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 163  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  36849590 aaaatttgagcttattaaaatatgacataaacagtttatgaaattgtgataagctgattttattgatttatccaaacacctttaaaaa 36849677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 213
Target Start/End: Original strand, 15655458 - 15655602
Alignment:
Q  69 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 168  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||| ||  |||||||| |||| ||| | || ||| ||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||| |||    
T  15655458 taagctcaaaatttgagcttattaaaatttggtataagcagtttataaaattgtggtaagctatttttattgatttatccaaatagttttaaaaagactt 15655557  T
Q  169 atggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    |||  |||| | ||||||||||| | | | |||||||||||||||    
T  15655558 atgttagtagacaagctcacataagtttagaataagccaatccaa 15655602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 223
Target Start/End: Original strand, 30075277 - 30075429
Alignment:
Q  69 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 168  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||  |||||| | |||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||   | | ||| |||||    
T  30075277 taagctcaaaattatggcttattaaaatatggtataagcggtttatgaaa-tat-ataagctattttta-ttatttacccaaacgtatctgaaagggctt 30075373  T
Q  169 atggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc-aacggggccata 223  Q
    |||  |||| |||| |||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  30075374 atgttagtagataaactcacataagcttaaaataagtcaatccaaacggggccata 30075429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 125 - 209
Target Start/End: Original strand, 27691428 - 27691512
Alignment:
Q  125 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| |||||| || |||   ||||||||| |||||    
T  27691428 taaaatatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagatttatgggagtagataagcccatataaattcaaaataaaccaat 27691512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 3347523 - 3347723
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3347523 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 3347622  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  3347623 atgaaactatgataagctgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 3347722  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  3347723 a 3347723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 26946876 - 26947076
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26946876 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 26946975  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  26946976 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatcca 26947075  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  26947076 a 26947076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 6086599 - 6086799
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6086599 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 6086698  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  6086699 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 6086798  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  6086799 a 6086799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 9459770 - 9459570
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9459770 cagagagaatcgaaggaggatacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 9459671  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9459670 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatggaaatagataagctcacataaactcaaaataagccaatcca 9459571  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  9459570 a 9459570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 2837752 - 2837552
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||     
T  2837752 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcatgagcagctc 2837653  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2837652 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 2837553  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  2837552 a 2837552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 11167447 - 11167247
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11167447 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggtgggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 11167348  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  11167347 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgaaaataaataagcacacataagctcaaaataagccaatcca 11167248  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  11167247 a 11167247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 30692058 - 30691858
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30692058 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 30691959  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  30691958 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 30691859  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  30691858 a 30691858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 26704339 - 26704539
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26704339 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 26704438  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||| || ||||||||||| ||||||||    
T  26704439 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataaaccaatcca 26704538  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  26704539 a 26704539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 17261073 - 17261273
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17261073 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagctt 17261172  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  17261173 atgaaaatattataagctatttttatttatttacccaaacacctttagaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 17261272  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  17261273 a 17261273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 18613745 - 18613545
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18613745 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 18613646  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  | |||| |||||||||||| |||||||    
T  18613645 atggaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccgcataagctcaaaataagtcaatcca 18613546  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  18613545 a 18613545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21893662 - 21893472
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21893662 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaaattaggcttattaaaatatggcataagcagctt 21893563  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataa 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||| |||||||||||    
T  21893562 atgaaactatgataagctatttttatatatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataa 21893472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1153800 - 1153603
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1153800 cagagagaaacgaaggaggttacataaatacataagcaccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 1153701  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatc 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||||    
T  1153700 atgaaactatgataatctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccaacataagcttaaaataagccaatc 1153603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20726994 - 20726787
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20726994 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 20726895  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc- 211  Q
    |||||||||||||||  ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||     
T  20726894 atgaaactatgataagttattttta----tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatcca 20726799  T
Q  212 aacggggccata 223  Q
    ||||||||||||    
T  20726798 aacggggccata 20726787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 34887292 - 34887492
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  34887292 cagagagaatcgaaggaggtcacataaattcattagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataaacagctt 34887391  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| | |||||| |||||||||||| |||||||    
T  34887392 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaggagataaacccacataagctcaaaataagtcaatcca 34887491  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  34887492 a 34887492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 3955769 - 3955966
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  3955769 cagagagaatcgaagg---ttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagttt 3955865  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  3955866 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatcca 3955965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 28199508 - 28199709
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |    
T  28199508 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataagcagcat 28199606  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgga--agtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatc 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   |||||  |||||| |||||||||||| |||||    
T  28199607 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggagtagatgataagtccacataagctcaaaataagtcaatc 28199706  T
Q  211 caa 213  Q
    |||    
T  28199707 caa 28199709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 213
Target Start/End: Original strand, 30698934 - 30699129
Alignment:
Q  18 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  30698934 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctaataaa 30699033  T
Q  118 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||  |||| |||||| ||||||||    
T  30699034 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaataaataagctcacataaactcataataagtcaatccaa 30699129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 213
Target Start/End: Original strand, 16307015 - 16307208
Alignment:
Q  20 aatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaac 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16307015 aatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaac 16307114  T
Q  120 tatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16307115 tatgataagctgtttttatttatttatccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagctcaaaataagtcaatccaa 16307208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 35198489 - 35198295
Alignment:
Q  14 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 113  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  35198489 agagagaatcgaatgagatcacataaattcataagttccttgttaagccggagagtaaactgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctta 35198390  T
Q  114 tgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  35198389 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa-gcttatggaagtagataagcccacataagttcaaaataagccaat 35198295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 33464536 - 33464399
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33464536 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 33464437  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaa 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33464436 atgaaactatgataaactatttttacttatttacccaa 33464399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 64 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 52992 - 52843
Alignment:
Q  64 gaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 163  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52992 gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 52893  T
Q  164 ggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
     |||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  52892 tgcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 52843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 53115 - 53001
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53115 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 53016  T
Q  113 atgaaactatgataa 127  Q
    |||||||||||||||    
T  53015 atgaaactatgataa 53001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 142 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 33463779 - 33463708
Alignment:
Q  142 tttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33463779 tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaa 33463708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 64)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 222
Target Start/End: Original strand, 19913618 - 19913828
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19913618 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 19913717  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc- 211  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||     
T  19913718 atgaaactatgataagctgttttaatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 19913817  T
Q  212 aacggggccat 222  Q
    |||||||||||    
T  19913818 aacggggccat 19913828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 15241016 - 15241216
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15241016 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 15241115  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15241116 atgaaactatgataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatcca 15241215  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  15241216 a 15241216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20877251 - 20877052
Alignment:
Q  14 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 113  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20877251 agagagaatctaaggaggttacgtaaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 20877152  T
Q  114 tgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20877151 tgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 20877052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 38055362 - 38055150
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38055362 cagagagaatcgatggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 38055263  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc- 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||     
T  38055262 atgaaactatgataaaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatcca 38055163  T
Q  212 aacggggccatat 224  Q
    |||||||||||||    
T  38055162 aacggggccatat 38055150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 53717452 - 53717652
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  53717452 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatagggcataagcagctt 53717551  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53717552 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatcca 53717651  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  53717652 a 53717652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 54189750 - 54189550
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54189750 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 54189651  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  54189650 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 54189551  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  54189550 a 54189550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1617289 - 1617089
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1617289 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacacaagcagctt 1617190  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1617189 atgaaactatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcacataagctcaaaataagccaatcca 1617090  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  1617089 a 1617089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 1756752 - 1756952
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1756752 cagagagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 1756851  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  1756852 atgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatcca 1756951  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  1756952 a 1756952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 14987997 - 14987797
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14987997 cagaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagcaagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 14987898  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  14987897 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaatggcttatgggagtatataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 14987798  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  14987797 a 14987797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 23776449 - 23776647
Alignment:
Q  15 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttat 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23776449 gagagaatcgaagaaggttacataaattcataagatccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 23776548  T
Q  115 gaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23776549 gaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 23776647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 50354006 - 50353793
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50354006 cagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaaattaggcttattaaaatatggcataagcagctt 50353907  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc- 211  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  50353906 atgaaactatcataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacagaagctcaaaataagccaatcca 50353807  T
Q  212 aacggggccatata 225  Q
    ||||||||| ||||    
T  50353806 aacggggccttata 50353793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 6611348 - 6611548
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6611348 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatcaaaatatgacataaacagctt 6611447  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  6611448 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataaaccaatcca 6611547  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  6611548 a 6611548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16700986 - 16700786
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16700986 cagagagaatcgaaggaggttacataaatttataagctccttgttaagctagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 16700887  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16700886 atgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 16700787  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  16700786 a 16700786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 33704046 - 33703850
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33704046 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 33703947  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 209  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  33703946 atgaaactatgataagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataaactcacataagctcaaaataagtcaat 33703850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37464926 - 37464730
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37464926 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaaaccggagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 37464827  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  37464826 atgaaactatgataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagcccacataagctcaaaataagccaat 37464730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 53875862 - 53875662
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53875862 cagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagctt 53875763  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  53875762 ataaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtatataagcccacataagcttaaaataagccaatcca 53875663  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  53875662 a 53875662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 54412833 - 54412633
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  54412833 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcatatgctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagacttattagaatatgacataagcagctt 54412734  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  54412733 atgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 54412634  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  54412633 a 54412633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 213
Target Start/End: Original strand, 23704200 - 23704397
Alignment:
Q  16 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 115  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23704200 agagaatcaaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatg 23704299  T
Q  116 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  23704300 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgtgagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaa 23704397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 28032700 - 28032897
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  28032700 cagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagctt 28032799  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatc 210  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  28032800 atgatactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatc 28032897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 27488636 - 27488836
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27488636 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagctt 27488735  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| ||||||  ||||||||||||    
T  27488736 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagctcaacttaagccaatcca 27488835  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  27488836 a 27488836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 44379175 - 44379375
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44379175 cagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaactt 44379274  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  | |||  ||||||||||| |||||||    
T  44379275 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatggaagtagataagcctatataaactcaaaataagtcaatcca 44379374  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  44379375 a 44379375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 45424522 - 45424722
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45424522 cagaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 45424621  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||  ||||| |||||||||||| |||||||    
T  45424622 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagctcaaaataagtcaatcca 45424721  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  45424722 a 45424722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 22 - 213
Target Start/End: Original strand, 50055098 - 50055289
Alignment:
Q  22 tcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaacta 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  50055098 tcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaacca 50055197  T
Q  122 tgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  50055198 tgataagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 50055289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 31969886 - 31969696
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31969886 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagctt 31969787  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataa 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||    
T  31969786 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataa 31969696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 213
Target Start/End: Original strand, 30423556 - 30423752
Alignment:
Q  16 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  30423556 agagaatcgaaggaggttacataaattc-taagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttatgcttattgaaatatggcataagcagcttatg 30423654  T
Q  116 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  30423655 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataaactcaaaataagccaatccaa 30423752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 2481396 - 2481596
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2481396 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaattttggcttattaaaatatggcataagcagctt 2481495  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2481496 atgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 2481595  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  2481596 a 2481596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15669388 - 15669188
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15669388 cagagagaatggaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggacggtaagctgaaaatttaggcttattaaagtatgacataagcagctt 15669289  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15669288 atgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagtcttatgtgattagataagctcacataagctcaaaataagccaatcca 15669189  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  15669188 a 15669188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 30171785 - 30171585
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  30171785 cagagagaatcgaaggaggttaaataaattcataagctccttgttaaaccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggtataagcagctt 30171686  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30171685 atgaaactatgataagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatggaataagataagctcacataagctcaaaataagccaatcca 30171586  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  30171585 a 30171585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 40428708 - 40428904
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  40428708 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatcaaaatatggtataagcagctt 40428807  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  40428808 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaat 40428904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 44784905 - 44785105
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  44784905 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaagtttaggcttattaaaatatggcataagcaactt 44785004  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  44785005 atgaaactatgataagctatttttatttgtttacccaaacacttttacaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 44785104  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  44785105 a 44785105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Original strand, 8591080 - 8591275
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8591080 cagagagaaccgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaacatatggcataagcagctt 8591179  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaa 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||  |||||||||||||||    
T  8591180 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatagaagtagataaacccacataaactcaaaataagccaa 8591275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 48910049 - 48909851
Alignment:
Q  15 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttat 114  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  48910049 gagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggtttgttaaaatatggcataagcagcttat 48909950  T
Q  115 gaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  48909949 gaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaa 48909851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 213
Target Start/End: Original strand, 43289951 - 43290148
Alignment:
Q  16 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43289951 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttattaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 43290050  T
Q  116 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| || | | |||||||||||||||||||||    
T  43290051 aaactatgataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgtgagtagataagcacataaaagctcaaaataagccaatccaa 43290148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 52139405 - 52139208
Alignment:
Q  16 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52139405 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 52139306  T
Q  116 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||| | |||||| | |||||||||||||||||||    
T  52139305 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaatagataaacccacataagttcaaaataagccaatccaa 52139208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 11639566 - 11639766
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11639566 cagagagaatcaaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 11639665  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| | ||||||||| ||||||||    
T  11639666 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagttcaaaataaaccaatcca 11639765  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  11639766 a 11639766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 35490761 - 35490961
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  35490761 cagagagaatcgaaggtggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaactt 35490860  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||  |||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  35490861 atgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatgagagtggataagcccatataagctcaaaataagccaatcca 35490960  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  35490961 a 35490961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 210
Target Start/End: Original strand, 37968746 - 37968942
Alignment:
Q  14 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  37968746 agagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctta 37968845  T
Q  114 tgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatc 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  37968846 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatc 37968942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 27536092 - 27536288
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  27536092 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagttt 27536191  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    ||||| |  ||| ||||||||||||||||||||    
T  27536192 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgggag----taagcccgtataagctcaaaataagccaatcca 27536287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 6688615 - 6688809
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        
T  6688615 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagca---- 6688710  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
      ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||  ||||||||||| |||||||    
T  6688711 --gaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataaactcaaaataagtcaatcca 6688808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 19164961 - 19165160
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  19164961 cagagaaaaacgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccg-agggtaagctgaaaatttaggcttattaaa-tatggcataagcagctt 19165058  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacaccttt-aaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  19165059 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcc 19165158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 213
Target Start/End: Original strand, 8932165 - 8932366
Alignment:
Q  12 gcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagct 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  8932165 gcagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagttccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagct 8932264  T
Q  112 tatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc 211  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  8932265 tatgaaactacgttaagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccgcataagctcaaaataagccaatcc 8932364  T
Q  212 aa 213  Q
    ||    
T  8932365 aa 8932366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 47632240 - 47632039
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47632240 cagagagaattgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagctt 47632141  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacc-tttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc 211  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||| |||||  ||||||  ||||||||||||||||||    
T  47632140 atgaaactatgagaagctatttttatttatttacccaaacaccttttaaaaaggtttatgagagtagataagtccacataaactcaaaataagccaatcc 47632041  T
Q  212 aa 213  Q
    ||    
T  47632040 aa 47632039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 40680026 - 40680226
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  40680026 cagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagctt 40680125  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   |||||||||| |||||||    
T  40680126 atgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaatacctttaaaaagacttatggaagtagataagctcacataaattcaaaataagtcaatcca 40680225  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  40680226 a 40680226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 16704023 - 16703843
Alignment:
Q  16 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16704023 agagaatcgaagggggttacataaatttataggctccttgttaagccggaggataaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 16703924  T
Q  116 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  16703923 aaactatgataaactatttttatttatttattcaaacaactttaaaaaagcttatggaagtagataagttcacataagctc 16703843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 53353267 - 53353060
Alignment:
Q  14 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttat----taaaatatgacataagcag 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||    
T  53353267 agagagaatcgaaggaggttacataaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatatattaaaatatggcataagcag 53353168  T
Q  110 cttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcaca----tatgctcaaaataagc 205  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| || |    || |||||||||||||    
T  53353167 cttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacatatgggagtagataagcccatataattaagctcaaaataagc 53353068  T
Q  206 caatccaa 213  Q
    ||||||||    
T  53353067 caatccaa 53353060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 44376041 - 44375850
Alignment:
Q  22 tcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaacta 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44376041 tcgaaggaggttacataaattcataagctcttttttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaacta 44375942  T
Q  122 tgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa-ggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||  ||||| || |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  44375941 tgataaactatttttatttatttacccgaacacctataaaaatggctattggaa-tagataagcccacataagcttaaaataagccaatccaa 44375850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 27583620 - 27583820
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  27583620 cagagagaattgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagctt 27583719  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||  ||||| |||||||||||| |||||||    
T  27583720 atgcaactatgataagttatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 27583819  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  27583820 a 27583820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 55344813 - 55345009
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| || ||     
T  55344813 cagagagaatcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggatggtaagctgaaaattttggcttattaaaatatggtataaacaactc 55344912  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 209  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||| | |||||| |||||||||||| ||||    
T  55344913 atgcaaatatgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaat 55345009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 47 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28360602 - 28360435
Alignment:
Q  47 agctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaata-tgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttattta 145  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28360602 agctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttataaaaataatggcataagcagcttataaaactatgataaactatttttatttattta 28360503  T
Q  146 cccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  28360502 cccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagaaaagcccacataagctcaaaataagtcaatccaa 28360435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 38071314 - 38071504
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38071314 cagagagaatcgaagg---ttacataaattcataagctccttgttaagccccg---taaactgaaaattcaggcttattaaaatatggcataagcagctt 38071407  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  38071408 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggattatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaat 38071504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 141
Target Start/End: Original strand, 23269034 - 23269162
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23269034 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagctt 23269133  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttattta 141  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23269134 atgaaactatgataagctatttttattta 23269162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 69 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 50053592 - 50053448
Alignment:
Q  69 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 168  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  50053592 taagatgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacatttaaaaaggctt 50053493  T
Q  169 atggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    |||| |||| |||||  || ||| |||||||||||||||||||||    
T  50053492 atgggagtagataagtccatataagctcaaaataagccaatccaa 50053448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 53408225 - 53408138
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccgg-aggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53408225 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatg 53408138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 116
Target Start/End: Original strand, 9595890 - 9595982
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||           | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9595890 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggag-----------agtttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 9595978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 133 - 213
Target Start/End: Original strand, 23265865 - 23265945
Alignment:
Q  133 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23265865 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 23265945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 76
Target Start/End: Original strand, 23261874 - 23261937
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctga 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  23261874 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctga 23261937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 152
Target Start/End: Original strand, 51780763 - 51780845
Alignment:
Q  70 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaac 152  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  51780763 aagcttaaaatttgggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattatgataagctatttttattgatttatccaaac 51780845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 69 - 204
Target Start/End: Original strand, 44548185 - 44548320
Alignment:
Q  69 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 168  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44548185 taagcttaaaatttgggcttaataaaatagggcataaacaacttataaaattgtgataagatgtttttattgatttatccaaacacctttaaaaaggctt 44548284  T
Q  169 atggaagtatataagctcacatatgctcaaaataag 204  Q
    |||  |||| |||||| |||||| |||| |||||||    
T  44548285 atgttagtagataagcccacataagctccaaataag 44548320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 50055350 - 50055304
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaa 59  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50055350 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaa 50055304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 48748263 - 48748197
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaa 79  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||    
T  48748263 cagagagaattgaaggagattacataaattcataagctccttattaagacggagggtatgctgaaaa 48748197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 17493482 - 17493340
Alignment:
Q  69 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 168  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| ||  ||||  |||||||||| |||||| ||||| || ||||||| ||||    
T  17493482 taagctcaaaatttgagcttattaaaacatggtataagcagcttataaaattagaataagatatttttattgatttactcaaacgcccttaaaaatgctt 17493383  T
Q  169 atggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc 211  Q
    || | |||| ||| | ||| |||   |||||||||| ||||||    
T  17493382 ataggagtagatatgttcatataaattcaaaataagtcaatcc 17493340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 47
Target Start/End: Original strand, 55344681 - 55344715
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataa 47  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55344681 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataa 55344715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 223
Target Start/End: Original strand, 46257269 - 46257407
Alignment:
Q  85 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagc 184  Q
    |||||||||| |||   |||| |||||||||||| | ||||||||| |||  ||| |||||||||||||  |||  ||| |||||||  |||| |||| |    
T  46257269 gcttattaaactatagaataaacagcttatgaaattgtgataaactctttcaattgatttacccaaacaattttgtaaatgcttatgtcagtagataaac 46257368  T
Q  185 tcacatatgctcaaaataagccaatccaacggggccata 223  Q
    | |||||  || ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  46257369 ttacataaacttaaaataagccaattcaatcgggccata 46257407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 127
Target Start/End: Original strand, 55344724 - 55344777
Alignment:
Q  74 tgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| || || |||||| ||||||||    
T  55344724 tgaaaattttggcttattaaaatatggcataaacaactcatgaaaatatgataa 55344777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 32)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 213
Target Start/End: Original strand, 1165604 - 1165801
Alignment:
Q  16 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1165604 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatg 1165703  T
Q  116 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  1165704 aaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagctcaaaataagtcaatccaa 1165801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1579241 - 1579044
Alignment:
Q  16 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1579241 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 1579142  T
Q  116 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  1579141 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaa 1579044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 213
Target Start/End: Original strand, 1605574 - 1605771
Alignment:
Q  16 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1605574 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatg 1605673  T
Q  116 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  1605674 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaa 1605771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 9008057 - 9008257
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9008057 cagagagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 9008156  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9008157 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 9008256  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  9008257 a 9008257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 24105671 - 24105871
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24105671 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgataatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 24105770  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24105771 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 24105870  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  24105871 a 24105871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 8374339 - 8374538
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8374339 cagagagaatcgaaggaggttacataaat-cataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 8374437  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  8374438 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagcttaaaataaggcaatcca 8374537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16069561 - 16069361
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16069561 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 16069462  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||| |||||||||||| |||||||    
T  16069461 atgaaactatgataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatcca 16069362  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  16069361 a 16069361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 16737447 - 16737643
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16737447 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 16737546  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  16737547 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaat 16737643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27421062 - 27420866
Alignment:
Q  17 gagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatga 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27421062 gagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 27420963  T
Q  117 aactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  27420962 aactatgataaactatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaa 27420866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 27679169 - 27679369
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27679169 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 27679268  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27679269 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 27679368  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  27679369 a 27679369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 31883352 - 31883152
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31883352 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 31883253  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||  |||||| |||||||||||| |||||||    
T  31883252 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagagtagataagtccacataagctcaaaataagtcaatcca 31883153  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  31883152 a 31883152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 3386486 - 3386686
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3386486 cagagataatcgaaggaggttacataaattcataggctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 3386585  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  3386586 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatcca 3386685  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  3386686 a 3386686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 33491196 - 33491396
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  33491196 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcaaaagcagctt 33491295  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  33491296 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatcca 33491395  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  33491396 a 33491396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4121145 - 4120945
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4121145 cagagagaatcaaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 4121046  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| | |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  4121045 atgaaactatgataaattatttttacttatttacccaaacacctttaaaagggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccattcca 4120946  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  4120945 a 4120945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 19358734 - 19358534
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  19358734 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagttggagggtaagctgaaaatttaggcttactaaaatatggcataagcagctt 19358635  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  19358634 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagctcaaaataaggcaatcca 19358535  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  19358534 a 19358534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 33991348 - 33991152
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  33991348 cagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaactt 33991249  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||  ||||||||||| ||||    
T  33991248 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacataaactcaaaataagtcaat 33991152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 38598450 - 38598650
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38598450 cagagagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 38598549  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  38598550 atgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagctcacataagttcaaagtaagccaatcca 38598649  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  38598650 a 38598650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5203179 - 5202969
Alignment:
Q  14 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 113  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  5203179 agagagaatcgaagaaggtgacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctta 5203080  T
Q  114 tgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc-a 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |  |||||  ||||||||||| |||||| |    
T  5203079 tgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaaccaacataaactcaaaataagtcaatccaa 5202980  T
Q  213 acggggccata 223  Q
    |||||||||||    
T  5202979 acggggccata 5202969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3921789 - 3921589
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3921789 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcctttttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 3921690  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || |||  ||||||||||  |||||||    
T  3921689 atgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccatataaactcaaaataaatcaatcca 3921590  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  3921589 a 3921589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 20992146 - 20992342
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  20992146 cagagagaatcgaagggggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataatcagctt 20992245  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 209  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  20992246 atgaaactatgatatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagaccacataagctcaaaataagccaat 20992342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 35782644 - 35782844
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35782644 cagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgtaagcacggagggtaggctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagctt 35782743  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  35782744 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataaggcaatcca 35782843  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  35782844 a 35782844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 26602942 - 26603116
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  26602942 cagagagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaaaccagagagtaaactgaaaaattatgcttattaaaatatggcataagcagttt 26603041  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctca 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  26603042 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctca 26603116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 27025164 - 27025005
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  27025164 cagagagaatcgaaggaggttacataaatttataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaaaatggcataagcagctt 27025065  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgg 172  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  27025064 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccgaacatctttaaaaagtcttatgg 27025005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 31410681 - 31410484
Alignment:
Q  16 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  31410681 agagaatcgaaggaggtcacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttata 31410582  T
Q  116 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||| |||| | || |||  ||||||||||  ||||||||    
T  31410581 aaactatgataagctatttttatttgtttactcaaacacctttaaaaagacttatgggggtagataaacccatataaactcaaaataaatcaatccaa 31410484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 86 - 213
Target Start/End: Original strand, 20992354 - 20992485
Alignment:
Q  86 cttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagct 185  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  20992354 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgatatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcc 20992453  T
Q  186 c----acatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    |    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20992454 catgtacataagctcaaaataagccaatccaa 20992485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 80 - 213
Target Start/End: Original strand, 33284642 - 33284775
Alignment:
Q  80 tttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtata 179  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  33284642 tttaggcttattgaaatatggtataagcagtttataaaactatgataagctatttttatttatttacttaaacacctttaaaaaggcttatgggagtaga 33284741  T
Q  180 taagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    ||||| || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  33284742 taagcccatataagctcaaaataagtcaatccaa 33284775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 31638281 - 31638175
Alignment:
Q  85 gcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagc 184  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||  |||||||||  ||||| |||||||| |||| |||||||||||  ||||  |||||    
T  31638281 gcttattaaaatatgacataagaagcttataaaattgtgataagttatttttatcgatttatccaaacacttttacaaaggcttatgttagtaggtaagc 31638182  T
Q  185 tcacata 191  Q
    |||||||    
T  31638181 tcacata 31638175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 67
Target Start/End: Original strand, 35420424 - 35420478
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggagg 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  35420424 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagg 35420478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 155
Target Start/End: Original strand, 41818536 - 41818605
Alignment:
Q  86 cttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacc 155  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  41818536 cttattaaaatacaatataagcagcttataaaaatatgataagctatttttattaatttacctaaacacc 41818605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 20 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 27024853 - 27024822
Alignment:
Q  20 aatcgaaggaggttacataaattcataagctc 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27024853 aatcgaaggaggttacataaattcataagctc 27024822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25634732 - 25634593
Alignment:
Q  69 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 168  Q
    |||||| ||||||  || |||||||||||||  |||||| |||||||||| | | |||| |||||||   ||||||||||||||   ||| |||  ||||    
T  25634732 taagctcaaaattatggtttattaaaatatggtataagcggcttatgaaattgttataagctatttt--attatttacccaaacgtatttgaaagagctt 25634635  T
Q  169 atggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatc 210  Q
    |||  |||| |||| ||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  25634634 atgttagtagataaactctcataagcttaaaataagccaatc 25634593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 171
Target Start/End: Original strand, 19516044 - 19516128
Alignment:
Q  87 ttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 171  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |   |||| |||||||||||  |||  |||||| || |||||||| ||||||    
T  19516044 ttattaaaatattacataagcagtttatgaaattgatataagctatttttattactttgtccaaacgccgttaaaaagacttatg 19516128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 36910 - 36710
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36910 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 36811  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  36810 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 36711  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  36710 a 36710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 6174828 - 6175028
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  6174828 cagagagaatcgaaggaggtcacgtaaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaatgaaatatgacataagcagctt 6174927  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6174928 atgaaactatgataaaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagctcacataagctcaaaataagccaatcca 6175027  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  6175028 a 6175028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 42937925 - 42937724
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggctt-attaaaatatgacataagcagct 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  42937925 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggctttattaaaatatggcataagcagct 42937826  T
Q  112 tatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  42937825 tatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataaactcacataagctcaaaataagccaatcc 42937726  T
Q  212 aa 213  Q
    ||    
T  42937725 aa 42937724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Original strand, 31517215 - 31517427
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  31517215 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagttt 31517314  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc- 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||     
T  31517315 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccaaataagctcaaaataagccaatcca 31517414  T
Q  212 aacggggccatat 224  Q
    |||||||||||||    
T  31517415 aacggggccatat 31517427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 18806884 - 18807084
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18806884 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagctt 18806983  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  18806984 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatcca 18807083  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  18807084 a 18807084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 3873244 - 3873444
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3873244 cagagagaatcgaatgaggttatataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 3873343  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  3873344 atgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 3873443  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  3873444 a 3873444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 33906047 - 33906247
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33906047 cagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 33906146  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| | |||||||||| |||||||    
T  33906147 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagttcaaaataagtcaatcca 33906246  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  33906247 a 33906247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4016244 - 4016044
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  4016244 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagctt 4016145  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4016144 atgaaactatgatacgttatttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatcca 4016045  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  4016044 a 4016044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 39635656 - 39635457
Alignment:
Q  14 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39635656 agagagaatcgaaggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatgacataagcagctta 39635557  T
Q  114 tgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  39635556 tgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataagctaatccaa 39635457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 5733604 - 5733407
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5733604 cagagagaatcgaaggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 5733505  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatc 210  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  5733504 atgaaactatgataagttgtttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggctgatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatc 5733407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 26323186 - 26323386
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26323186 cagagagaatcgaatgaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 26323285  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||  |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26323286 atgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaagacttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataaaccaatcca 26323385  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  26323386 a 26323386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 4232142 - 4232342
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  4232142 cagagataatcgaatgaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttgtgaaaatatggcataagcagctt 4232241  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  4232242 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagcacaaaataagccaatcca 4232341  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  4232342 a 4232342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 30270679 - 30270879
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30270679 cagagataatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 30270778  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  30270779 atgaaactatgataaactattttattttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaactcatataagcttaaaataagccaatcca 30270878  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  30270879 a 30270879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 33 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1108464 - 1108277
Alignment:
Q  33 tacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactat 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1108464 tacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataaactat 1108365  T
Q  133 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaacggggcc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||  | |||||||||    
T  1108364 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccatccaaacggggcc 1108277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 204
Target Start/End: Original strand, 19383938 - 19384126
Alignment:
Q  16 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  19383938 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacaacttatg 19384037  T
Q  116 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataag 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | || ||||||||| |||  |||||||||||    
T  19384038 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcatataaactcaaaataag 19384126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 28329839 - 28330037
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  28329839 cagaaagaatcgaaggaggttacataaattcatatgctccttgttaagct--agggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagttt 28329936  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  28329937 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggtgtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatcca 28330036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 16066302 - 16066490
Alignment:
Q  21 atcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaact 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16066302 atcgaaggaggttacataaattcataagctccttattaaatcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaact 16066401  T
Q  121 atgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 209  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  16066402 atgataagctatttttatttatttacccaaacactttaaaaaagacttatgaaagcagataagcccacataagctcaaaataagccaat 16066490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 1482903 - 1483099
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1482903 cagagagaatcgaaggatgttacataaattcataagctccttgttaagtcgaagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 1483002  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatc 210  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  1483003 atgaaacaataataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaagcttatgg-agtagataagcccacataagctcaaaataagccaatc 1483099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 213
Target Start/End: Original strand, 19901143 - 19901337
Alignment:
Q  18 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaa 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  19901143 agaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtgggctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagtttatgaa 19901242  T
Q  118 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19901243 actatgataagctattttta-ttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagagaagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 19901337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 171
Target Start/End: Original strand, 2178769 - 2178927
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2178769 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 2178868  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 171  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2178869 atgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatg 2178927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 30420181 - 30420367
Alignment:
Q  15 gagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttat 114  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30420181 gagagaatcgaagggggttacataaattcataagctccttgttaa------------gctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttat 30420268  T
Q  115 gaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  30420269 gaacctatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 30420367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 851202 - 851002
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  851202 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagctt 851103  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    || ||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||  ||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  851102 ataaaattatgataagctctatttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagcttaaaataagcaaatcca 851003  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  851002 a 851002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 16588776 - 16588976
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16588776 cagagataatcgacggaggttacattaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagctt 16588875  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  16588876 atgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacttctttaaaaagacttatgaaagtagataagcccacataaacacaaaataagccaatcca 16588975  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  16588976 a 16588976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 44947549 - 44947738
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||        ||||||| ||||||||||||    
T  44947549 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataaacttcttgttaagccggagggtaaactgaaaatttagc-------aaatatggcataagcagctt 44947641  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | || |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  44947642 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaatgcttatggcactagataaactcacataagatcaaaataagccaat 44947738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 430017 - 429863
Alignment:
Q  17 gagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatga 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |   |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  430017 gagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagtcgaattgtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatcgcataagcaacttatga 429918  T
Q  117 aactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 171  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  429917 aattatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatg 429863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 69 - 213
Target Start/End: Original strand, 42446625 - 42446769
Alignment:
Q  69 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 168  Q
    |||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||  | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42446625 taagcttaaaatttgatcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttacctaaacacctttaaaaaggctt 42446724  T
Q  169 atggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    |||  |||| ||||| || ||||  |||  |||||||||||||||    
T  42446725 atgttagtagataagttcgcataaactccgaataagccaatccaa 42446769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 76 - 171
Target Start/End: Original strand, 22101210 - 22101305
Alignment:
Q  76 aaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatg 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | |||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  22101210 aaaatttgggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttatacaaatacctttaaaaaggcttatg 22101305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 69 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 3585439 - 3585337
Alignment:
Q  69 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 168  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||| ||||||| |||||| ||||| |||| ||    
T  3585439 taagctcataattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataaattgtttttattaatttaccaaaacacatttaataaggttt 3585340  T
Q  169 atg 171  Q
    |||    
T  3585339 atg 3585337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 48)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 33510689 - 33510489
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33510689 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 33510590  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  33510589 atgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatcca 33510490  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  33510489 a 33510489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 42370795 - 42371004
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42370795 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacacaagcagctt 42370894  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc- 211  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||     
T  42370895 atgaaactatgataagttttttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagtcaatcca 42370994  T
Q  212 aacggggcca 221  Q
    ||||||||||    
T  42370995 aacggggcca 42371004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20089676 - 20089476
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20089676 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 20089577  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  20089576 atgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 20089477  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  20089476 a 20089476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 38829274 - 38829074
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  38829274 cagagagaatcgatggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcacaagcagctt 38829175  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  38829174 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccgacataagctcaaaataagccaatcca 38829075  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  38829074 a 38829074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16052300 - 16052101
Alignment:
Q  14 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16052300 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaattcaggcttattaaaatatggcataagcagctta 16052201  T
Q  114 tgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16052200 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacataaactcaaaataagccaatccaa 16052101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29078720 - 29078521
Alignment:
Q  14 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  29078720 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagctta 29078621  T
Q  114 tgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  29078620 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 29078521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 213
Target Start/End: Original strand, 1170447 - 1170644
Alignment:
Q  16 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1170447 agagaatcgaaggaggttacataaattcataaactccttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 1170546  T
Q  116 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  1170547 aaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacaaaagctcaaaataagccaatccaa 1170644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 19715161 - 19715361
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19715161 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 19715260  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19715261 atgaaacaatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagctcaaaataaaccaatcca 19715360  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  19715361 a 19715361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25897579 - 25897379
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25897579 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 25897480  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||| |||||||||||| |||||||    
T  25897479 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatatgcccacataagctcaaaataagtcaatcca 25897380  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  25897379 a 25897379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 26663463 - 26663263
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  26663463 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacagctt 26663364  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  26663363 atgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 26663264  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  26663263 a 26663263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 39260346 - 39260546
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  39260346 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaactt 39260445  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  39260446 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 39260545  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  39260546 a 39260546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29288352 - 29288154
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29288352 cagagagaatcgaaggaggttacata--ttcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 29288255  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  29288254 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatcca 29288155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1168708 - 1168508
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1168708 cagagagaatcaaaggagattacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 1168609  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  1168608 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 1168509  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  1168508 a 1168508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 1940747 - 1940947
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  1940747 cagagagaattgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataaacaactt 1940846  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  1940847 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatcca 1940946  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  1940947 a 1940947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8121074 - 8120874
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8121074 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaaactgaaaatttaagcttattaaaatatgacataagcagctt 8120975  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  8120974 atgaaactatgataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatcca 8120875  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  8120874 a 8120874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 52753147 - 52753347
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  52753147 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagtagctt 52753246  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  52753247 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 52753346  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  52753347 a 52753347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 46761170 - 46760971
Alignment:
Q  14 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 113  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  46761170 agagagaatcgaaggaagttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagttta 46761071  T
Q  114 tgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||    
T  46761070 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcaagtagataagctcatataagttcaaaataagtcaatccaa 46760971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 2347862 - 2347661
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaa-tatgacataagcagct 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2347862 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaaatatgacataagcagct 2347763  T
Q  112 tatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||  |||||||||| | |||||    
T  2347762 tatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccgcataaactcaaaataaacaaatcc 2347663  T
Q  212 aa 213  Q
    ||    
T  2347662 aa 2347661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5215590 - 5215390
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  5215590 cagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagttaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaactt 5215491  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  5215490 atgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgaaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 5215391  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  5215390 a 5215390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 26580270 - 26580470
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26580270 cagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 26580369  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  26580370 atgaaactatgataagctatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 26580469  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  26580470 a 26580470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 41928495 - 41928695
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  41928495 cagagagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagctt 41928594  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||  |||||| | ||||||||||||||||||    
T  41928595 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagtccacataagttcaaaataagccaatcca 41928694  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  41928695 a 41928695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 17591893 - 17591696
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17591893 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctggaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 17591794  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||    
T  17591793 atgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataagc-cacataagctc--aataagccaatcca 17591697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 970524 - 970735
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  970524 cagagagaatcgaaggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagctt 970623  T
Q  113 atgaaac--tatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatc 210  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  970624 atgaaactatatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatc 970723  T
Q  211 c-aacggggcca 221  Q
    | ||||||||||    
T  970724 caaacggggcca 970735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23498665 - 23498469
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  23498665 cagagagaatcgaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgatataagcaactt 23498566  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 209  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  23498565 atgaaactatgatgaactatttttatttatttacccaaacaccttgaaaaaggcttgtggaagtagataagcccacataagcttaaaataagccaat 23498469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 40092696 - 40092496
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40092696 cagagaaaatcgaaaaaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 40092597  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  40092596 atgaaactatgataagatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagctcaaaataagtcaatcca 40092497  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  40092496 a 40092496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 52696996 - 52696796
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52696996 cagagataatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 52696897  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  52696896 atgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcca 52696797  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  52696796 a 52696796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12683025 - 12682825
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  12683025 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctaaagatttaggcttatgaaaatatggcataagcagctt 12682926  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||  ||||||||||| |||||||    
T  12682925 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataaactcaaaataagtcaatcca 12682826  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  12682825 a 12682825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 32671784 - 32671584
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  32671784 cagagagaatcgaagggggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagtagctt 32671685  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||   |||||| ||||||||||||||||||||    
T  32671684 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaatccacataagctcaaaataagccaatcca 32671585  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  32671584 a 32671584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 43905859 - 43905659
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43905859 cagagacaatcgaaggaggttacgtaaattcataagctccttcttaagccggagggtaaactaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 43905760  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  43905759 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccaaataagctcaaaataagccaatcca 43905660  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  43905659 a 43905659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 6765659 - 6765464
Alignment:
Q  18 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaa 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6765659 agaatcgaaggagattacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctcatgaa 6765560  T
Q  118 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||  |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  6765559 aatatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataaaagtagataaattcacataaactcaaaataagccaatccaa 6765464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Original strand, 8079710 - 8079909
Alignment:
Q  14 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 113  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  8079710 agagagaatcaaaggagattacataaattcataaactccttgttaagccagagggtaagctgaaaacttaggcttattaaaatatggcataagtagctta 8079809  T
Q  114 tgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  8079810 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 8079909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 40149668 - 40149494
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40149668 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 40149569  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctca 187  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  40149568 ataaaactatgataaattatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagctca 40149494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 51359217 - 51359425
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  51359217 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataaactccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcacctt 51359316  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcc- 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||     
T  51359317 atgaaactatgataagctatttttaattatttacccaaa-acctttaagaaggcttatggcagtaaataagcccgcataagctcaaaataagccaatcca 51359415  T
Q  212 aacggggcca 221  Q
    ||||||||||    
T  51359416 aacggggcca 51359425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 7145412 - 7145212
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7145412 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 7145313  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctc-aaaataagccaatcc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||   |||||| |||| |||||||| ||||||    
T  7145312 atgaaactatgataaactatttttgtttatttaccc-aacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaatacacataagctcaaaaataagtcaatcc 7145214  T
Q  212 aa 213  Q
    ||    
T  7145213 aa 7145212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 2473924 - 2473727
Alignment:
Q  16 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 115  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2473924 agagactcgaaggaggtaacataaattcataagctccttgttaagtaggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatg 2473825  T
Q  116 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| |||||| ||||||||||| || ||||||    
T  2473824 aaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggcgtagataagcccacataagctcaaaataaaccgatccaa 2473727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 202
Target Start/End: Original strand, 17587505 - 17587694
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17587505 cagaaagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagtgtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 17587604  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaata 202  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||| ||||||||||    
T  17587605 atgaaaatatgataagctgtttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagctcacataagctcaaaata 17587694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 13996723 - 13996923
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13996723 cagagagaatcgaatgaggttacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 13996822  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||   ||||||||||||||||||    
T  13996823 atgaaaccattataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataatttcaaaataagccaatcca 13996922  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  13996923 a 13996923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 49146377 - 49146177
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  49146377 cagagagaatcgaatgacgttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagatgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagctt 49146278  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||   |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  49146277 atgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtatataaatccacataagctcaaaataaaccaatcca 49146178  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  49146177 a 49146177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15203317 - 15203106
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  15203317 cagagagaatcgaagaaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggttggctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataaacagctt 15203218  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaa-tcc 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||| | ||| |||||||| ||| ||     
T  15203217 atgaaactatgataagctatttttatttatttaccctaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacaaaagcttaaaataagtcaattca 15203118  T
Q  212 aacggggccata 223  Q
    ||||||||||||    
T  15203117 aacggggccata 15203106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 46409642 - 46409440
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaac--cggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagc 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  46409642 cagagagaatcgaaggaggtcacataaattcataagctccttgttaattgtcgaagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagc 46409543  T
Q  111 ttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatc 210  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||  |||||| |||||||||||| |||||    
T  46409542 ttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagattagataagtccacataagctcaaaataagtcaatc 46409443  T
Q  211 caa 213  Q
    |||    
T  46409442 caa 46409440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15717986 - 15717790
Alignment:
Q  16 agagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatg 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15717986 agagaattgaaggaggttacataaaatcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaattatggcataagcagcttatg 15717887  T
Q  116 aaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||| ||  |||||  ||||||||||| ||||||||    
T  15717886 aaactatga-aagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgaaattagataggccaacataaactcaaaataagtcaatccaa 15717790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 15554152 - 15554344
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||    
T  15554152 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcatcagcagttt 15554251  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    |||||   |||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| ||||||  ||||||||||||    
T  15554252 atgaa---atg-----ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaacttaagccaatcca 15554343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 52 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29695842 - 29695680
Alignment:
Q  52 cttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaa 151  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  29695842 cttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaattatttttatttatttatccaaa 29695743  T
Q  152 cacctttaaaaaggc-ttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    ||||||||||||    |||||| |||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  29695742 cacctttaaaaaaaaattatgggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaa 29695680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 38172023 - 38171841
Alignment:
Q  14 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||    
T  38172023 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctcattcttaagccggaggataagctgaaaatttaggc-------------acataagcagctta 38171937  T
Q  114 tgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 209  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| |||||||   |||||||||| ||||    
T  38171936 tgaaactatgataaactgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgtgagtagataagttcacataaattcaaaataagtcaat 38171841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 205
Target Start/End: Original strand, 23322897 - 23323032
Alignment:
Q  70 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctta 169  Q
    ||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||| ||||| | |||    
T  23322897 aagcttaaaatttgcgcttattaaagtatgacataagcagcttatgaaattatgataaactatttttattgatttattcaaacgccttaaaaaaagttta 23322996  T
Q  170 tggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagc 205  Q
    ||| |||| ||||||  | ||| |||||||||||||    
T  23322997 tgggagtagataagcctatataagctcaaaataagc 23323032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 89 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 52086396 - 52086272
Alignment:
Q  89 attaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcac 188  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||| | |||    
T  52086396 attaaattatggcataagcagcttatgaaattatgataagttatttttactgatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagcagataaacccac 52086297  T
Q  189 atatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    ||| ||| |||||||| ||||||||    
T  52086296 ataagcttaaaataagtcaatccaa 52086272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 213
Target Start/End: Original strand, 5217840 - 5217983
Alignment:
Q  69 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 168  Q
    |||||| ||||||  ||||||| ||||||||  |||||| |||||||||| |   |||| ||||||||||| |||||||||||    ||| |||  ||||    
T  5217840 taagctcaaaattatggcttataaaaatatggtataagcggcttatgaaattggtataagctatttttatt-atttacccaaatgtatttgaaagagctt 5217938  T
Q  169 atggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    |||  |||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  5217939 atgttagtagataagctctcataagcttaaaataagccaatccaa 5217983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5675176 - 5675110
Alignment:
Q  147 ccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||  |||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5675176 ccaaacatctttcaaaaagcttatgttagtagataagctaacataagcttaaaataagccaatccaa 5675110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 156; Significance: 7e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 213
Target Start/End: Original strand, 22956 - 23151
Alignment:
Q  18 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22956 agaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaa 23055  T
Q  118 actatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  23056 actatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaa 23151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 295 - 495
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  295 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaagcttattgaaatatgacataagcagctt 394  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  395 atgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatcca 494  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  495 a 495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Original strand, 145246 - 145445
Alignment:
Q  14 agagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  145246 agagagaatcgaaggaggttacataaatttataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctta 145345  T
Q  114 tgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatccaa 213  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  ||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  145346 tgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagtccacataaactcaaaataagtcaatccaa 145445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 10443 - 10243
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  10443 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggtataagcagctt 10344  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||| | || ||| |||||||||||| |||||||    
T  10343 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgagagtagataaacccatataagctcaaaataagtcaatcca 10244  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  10243 a 10243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 6 - 202
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  6 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggattattaaaatatggcataagcagctt 105  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaat 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||  |||||  |||||||||    
T  106 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataaactcaacttaagccaat 202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3915 - 3715
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3915 cagagagaatcaaaagaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctt 3816  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatcca 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| | ||||||||| ||||||||    
T  3815 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagttcaaaataaaccaatcca 3716  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  3715 a 3715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 6 - 207
Alignment:
Q  13 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |    
T  6 cagagagaatcgaaggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataagcagcat 104  T
Q  113 atgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgga--agtatataagctcacatatgctcaaaataagccaatc 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   |||||  |||||| |||||||||||| |||||    
T  105 atgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggagtagatgataagtccacataagctcaaaataagtcaatc 204  T
Q  211 caa 213  Q
    |||    
T  205 caa 207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University