View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11480_high_9 (Length: 506)

Name: NF11480_high_9
Description: NF11480
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11480_high_9
NF11480_high_9
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (1-487)||(1330352-1330850)
[»] chr3 (4 HSPs)
chr3 (1-270)||(22361019-22361300)
chr3 (1-270)||(22365406-22365687)
chr3 (54-218)||(23397192-23397357)
chr3 (1-37)||(36028876-36028912)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (1-270)||(200600-200870)
chr5 (1-270)||(196221-196491)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (1-270)||(7162477-7162761)
chr8 (1-270)||(30045121-30045406)
chr8 (1-270)||(30049524-30049809)
[»] chr4 (2 HSPs)
chr4 (1-270)||(3941379-3941664)
chr4 (1-270)||(3945778-3946063)
[»] chr7 (2 HSPs)
chr7 (1-270)||(39949373-39949652)
chr7 (1-270)||(39953765-39954044)
[»] scaffold1453 (1 HSPs)
scaffold1453 (1-111)||(1-111)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 422; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 1330850 - 1330352
Alignment:
Q  1 aaatggaagagaaagggacaataacaatgtttactatgctgcaaatttgatacataccatccttacatccttcttacatacttatagccaaatacttagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  1330850 aaatggaagagaaagggacaataacaatgtttactatgctgcaaatttgatacataccatccttacatccttcttacatacttatagtcaaatacttact 1330751  T
Q  101 aatgactcagcctatgctttgctgatgtcatatgacataaacctacttaacttgtgcagataacattacttgtgcagcatagttttactgataaaacaag 200  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  1330750 aatgactcaacctatactttgctgatgtcatatgacataaacctacttaacttgtgcagataacattacttgtgcagtatagttttactaacaaaacaag 1330651  T
Q  201 ttaaaatgattacacacataagc------------taaacaataaagtattcagacaagttttataggtcaatcagtcaacaatattgctaatcaatgat 288  Q
    |||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1330650 ttaaaatgattacacacataagcaatagagtaacataaacaataaagtattcagacaagttttataggtcaattagtcaacaatattgctaatcaatgat 1330551  T
Q  289 gaataattttttactagttttctgaaaggggcaaagaaactaagaaagaaaaacaagtgtttcttaggagaggggttatcacattaatcttcaaagttct 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1330550 gaataattttttactagttttctgaaaggggcaaagaaactaagaaagaaaaacaagtgtttcttaggagaggggatatcacattaatcttcaaagttct 1330451  T
Q  389 aacaagacttgagaacaagcttttctaatgaaggtggataaaattgcctgccttggaatgaagaaaaagagttccaactaataaaaaattattctagtc 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1330450 aacaagacttgagaacaagcttttctaatgaaggtggataaaattgcctgccttggaatgaagaaaaagagttccaactaataaaaaattattctagtc 1330352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 4)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 22361300 - 22361019
Alignment:
Q  1 aaatggaagagaaagggacaataacaatgtttactatgctgcaaatttgatacataccatccttacatccttcttacatacttatagccaaatacttagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22361300 aaatggaagagaaagggacaataacaatgtttactatgctgcaaatttgatacataccatccatacatccttcttacatacttatagccaaatacttagt 22361201  T
Q  101 aatgactcagcctatgctttgctgatgtcatatgacataaacctacttaacttgtgcagataacattacttgtgcagcatagttttactgataaaacaag 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  22361200 aatgactcagcctatgcttagctgatgtcatatgacataaacctacttaacttgtgcagataaccttacttgtgcagcatagctttactaacaaaacaag 22361101  T
Q  201 ttaaaatgattacacacataagc------------taaacaataaagtattcagacaagttttataggtcaatcagtcaaca 270  Q
    ||||||| |||||||||||||||            |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22361100 ttaaaataattacacacataagcaataaagtaacataaacaataaagtattcagaaaagttttataggtcaattagtcaaca 22361019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 22365687 - 22365406
Alignment:
Q  1 aaatggaagagaaagggacaataacaatgtttactatgctgcaaatttgatacataccatccttacatccttcttacatacttatagccaaatacttagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22365687 aaatggaagagaaagggacaataacaatgtttactatactgcaaatttgatacatatcatccatacatccttcttacatacttatagccaaatacttagt 22365588  T
Q  101 aatgactcagcctatgctttgctgatgtcatatgacataaacctacttaacttgtgcagataacattacttgtgcagcatagttttactgataaaacaag 200  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  22365587 aatgactcagcctatgcttagttgatgtcatatgacataaacctacttaacttgtgcagataaccttacttatgcagcatagttttactaacaaaacaag 22365488  T
Q  201 ttaaaatgattacacacataagc------------taaacaataaagtattcagacaagttttataggtcaatcagtcaaca 270  Q
    ||||||| |||||||||||||||            |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22365487 ttaaaataattacacacataagcaataaagtaacataaacaataaagtattcagaaaagttttataggtcaattagtcaaca 22365406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 218
Target Start/End: Original strand, 23397192 - 23397357
Alignment:
Q  54 ataccatccttacatccttcttacatacttatagccaaatacttagtaatgactcagcctatgctttgctgatgtcatatgacataaacctacttaactt 153  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||  | | ||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  23397192 ataccatccatacatctttcttacatatttagagtcaaatacttagtaatgacataacttatactttgttgatgtcatacgacataaacctatttaactt 23397291  T
Q  154 gtgcagataacattacttgtgcagcatagttttactgataaaac-aagttaaaatgattacacaca 218  Q
    || ||||  || |||||||||||| | ||| |||| || ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23397292 gtacagaacaccttacttgtgcaggaaagtattaccgacaaaactaagttaaaatcattacacaca 23397357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 36028876 - 36028912
Alignment:
Q  1 aaatggaagagaaagggacaataacaatgtttactat 37  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36028876 aaatggaagagaaagggacaataacaatgtttactat 36028912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 200600 - 200870
Alignment:
Q  1 aaatggaagagaaagggacaataacaatgtttactatgctgcaaatttgatacataccatccttacatccttcttacatacttatagccaaatacttagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  200600 aaatggaagagaaagggacaataacaatgtttactatgctgcaaatttgatacataccatccatacatccttcttacatacttatagccaaatacttagt 200699  T
Q  101 aatgactcagcctatgctttgctgatgtcatatgacataaacctacttaacttgtgcagataacattacttgtgcagcatagttttactgataaaacaag 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  200700 aatgactcagcctatgcttagctgatgtcatatgaggtaaacctacttaacttgtgcagataaccttacttgtgcagcatagttttactaacaaaacaag 200799  T
Q  201 ttaaaatgattacacacataagctaaacaataa-agtattcagacaagttttataggtcaatcagtcaaca 270  Q
    ||||||||||||||||||||| | | | | ||| |  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  200800 ttaaaatgattacacacataaacaataaagtaacataattcagaaaagttttataggtcaattagtcaaca 200870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 196221 - 196491
Alignment:
Q  1 aaatggaagagaaagggacaataacaatgtttactatgctgcaaatttgatacataccatccttacatccttcttacatacttatagccaaatacttagt 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  196221 aaatggaagagaaagagacaataacaatgtttactatgctgcaaatttgatacataccatccatacatccttcttacatacttatagccaaatacttagt 196320  T
Q  101 aatgactcagcctatgctttgctgatgtcatatgacataaacctacttaacttgtgcagataacattacttgtgcagcatagttttactgataaaacaag 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  196321 aatgactcagcctatgcttagctgatgtcatatgacgtaaacctacttaactcgtgcagataaccttacttgtgcagcatagttttactaacaaaacaag 196420  T
Q  201 ttaaaatgattacacacataagctaaacaataa-agtattcagacaagttttataggtcaatcagtcaaca 270  Q
    ||||||||||||||||||||| | | | | ||| |  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  196421 ttaaaatgattacacacataaacaataaagtaacataattcagaaaagttttataggtcaattagtcaaca 196491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 7162761 - 7162477
Alignment:
Q  1 aaatggaagagaaagggacaataacaatgtttactatgctgcaaatttgatacataccatccttacatccttcttacatacttatagccaaatacttagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7162761 aaatggaagagaaagggacaataacaatgtttactatgctgcaaatttaatacaaaccatccatacatccttcttacatacttatagccaaatacttagt 7162662  T
Q  101 aatgactcagcctatgctttgctgatgtcatatgacataaacctacttaacttgtgcagataac---attacttgtgcagcatagttttactgataaaac 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| | ||||     
T  7162661 aatgactcagcctatgcttagctgatgtcatatgacataaacctgcttaacttgtgcagataaccttattacttgtgcagcatagttttactaacaaaat 7162562  T
Q  198 aagttaaaatgattacacacataagc------------taaacaataaagtattcagacaagttttataggtcaatcagtcaaca 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7162561 aagttaaaatgattacacacataagcaataaagtaacataaacaataaagtattcagaaaagttttataggtcaattagtcaaca 7162477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 30045406 - 30045121
Alignment:
Q  1 aaatggaagagaaagggacaataacaatgtttactatgctgcaaatttgatacataccatccttacatccttcttacatacttatagccaaatacttagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30045406 aaatggaagagaaagggacaataacaatgtttactatgctgcaaatttgatacataccatccatacatccttcttacatacttatagccaaatactaagt 30045307  T
Q  101 aatgactcagcctatgctttgctgatgtc----atatgacataaacctacttaacttgtgcagataacattacttgtgcagcatagttttactgataaaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  30045306 aatgactcagcctatgcttagctgatgtcatatatatgacataaacctacttaacttgtgcagataatcttacttgtgcagcatagttttactaacaaaa 30045207  T
Q  197 caagttaaaatgattacacacataagc------------taaacaataaagtattcagacaagttttataggtcaatcagtcaaca 270  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||            |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  30045206 caagttaaaataattacacacataagcaataaagtaacataaacaataaagtattcagaaaagttttataggtcaattagtcaaca 30045121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 30049809 - 30049524
Alignment:
Q  1 aaatggaagagaaagggacaataacaatgtttactatgctgcaaatttgatacataccatccttacatccttcttacatacttatagccaaatacttagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30049809 aaatggaagagaaagggacaataacaatgtttactatgctgcaaatttgatacataccatccatacatccttcttacatacttatagccaaatactaagt 30049710  T
Q  101 aatgactcagcctatgctttgctgatgtc----atatgacataaacctacttaacttgtgcagataacattacttgtgcagcatagttttactgataaaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  30049709 aatgactcagcctatgcttagctgatgtcatatatatgacataaacctacttaacttgtgcagataatcttacttgtgcagcatagttttactaacaaaa 30049610  T
Q  197 caagttaaaatgattacacacataagc------------taaacaataaagtattcagacaagttttataggtcaatcagtcaaca 270  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||            |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  30049609 caagttaaaataattacacacataagcaataaagtaacataaacaataaagtattcagaaaagttttataggtcaattagtcaaca 30049524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 3941664 - 3941379
Alignment:
Q  1 aaatggaagagaaagggacaataacaatgtttactatgctgcaaatttgatacataccatccttacatccttcttacatacttatagccaaatacttagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3941664 aaatggaagagaaagggacaataacaatgtttactatgctgcaaatttgatacataccatccatacatccttcttacatacttatagccaaatactaagt 3941565  T
Q  101 aatgactcagcctatgctttgctgatgtc----atatgacataaacctacttaacttgtgcagataacattacttgtgcagcatagttttactgataaaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  3941564 aatgactcagcctatgcttagctgatgtcatatatatgacataaacctacttaacttgtgcagataatcttacttgtgcagcatagttttactaacaaaa 3941465  T
Q  197 caagttaaaatgattacacacataagc------------taaacaataaagtattcagacaagttttataggtcaatcagtcaaca 270  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||            |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  3941464 caagttaaaataattacacacataagcaataaagtaacataaacaataaagtattcagaaaagttttataggtcaattagtcaaca 3941379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 3946063 - 3945778
Alignment:
Q  1 aaatggaagagaaagggacaataacaatgtttactatgctgcaaatttgatacataccatccttacatccttcttacatacttatagccaaatacttagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3946063 aaatggaagagaaagggacaataacaatgtttactatgctgcaaatttgatacataccatccatacatccttcttacatacttatagccaaatactaagt 3945964  T
Q  101 aatgactcagcctatgctttgctgatgtc----atatgacataaacctacttaacttgtgcagataacattacttgtgcagcatagttttactgataaaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  3945963 aatgactcagcctatgcttagctgatgtcatatatatgacataaacctacttaacttgtgcagataatcttacttgtgcagcatagttttactaacaaaa 3945864  T
Q  197 caagttaaaatgattacacacataagc------------taaacaataaagtattcagacaagttttataggtcaatcagtcaaca 270  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||            |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  3945863 caagttaaaataattacacacataagcaataaagtaacataaacaataaagtattcagaaaagttttataggtcaattagtcaaca 3945778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 2)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 39949373 - 39949652
Alignment:
Q  1 aaatggaagagaaagggacaataacaatgtttactatgctgcaaatttgatacataccatccttacatccttcttacatacttatagccaaatacttagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39949373 aaatggaagagaaagggacaataacaatgtttactatgctgcaaattttttatatatcatccatacatccttcttacatacttatagccaaatacttagt 39949472  T
Q  101 aatgactcagcctatgctttgctgatgtcatatgacataaacctacttaacttgtgcagataacattacttgtgcagcatagttttactgataaaacaag 200  Q
    ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  39949473 aataactcagcctatgtttagctgatgtcatatgacataaacctacttaact--tgcagataaccttacttgtgcagcatagttttactaacaaaacaag 39949570  T
Q  201 ttaaaatgattacacacataagc------------taaacaataaagtattcagacaagttttataggtcaatcagtcaaca 270  Q
    ||||||| |||||||||||||||            |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  39949571 ttaaaataattacacacataagcaataaagtaacataaacaataaagtataaagaaaagttttataggtcaattagtcaaca 39949652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 39953765 - 39954044
Alignment:
Q  1 aaatggaagagaaagggacaataacaatgtttactatgctgcaaatttgatacataccatccttacatccttcttacatacttatagccaaatacttagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39953765 aaatggaagagaaagggacaataacaatgtttactatgctgcaaattttttatatatcatccatacatccttcttacatacttatagccaaatacttagt 39953864  T
Q  101 aatgactcagcctatgctttgctgatgtcatatgacataaacctacttaacttgtgcagataacattacttgtgcagcatagttttactgataaaacaag 200  Q
    ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  39953865 aataactcagtctatgtttagctgatgtcatatgacataaacctacttaact--tgcagataaccttacttgtgcagcatagttttactaacaaaacaag 39953962  T
Q  201 ttaaaatgattacacacataagc------------taaacaataaagtattcagacaagttttataggtcaatcagtcaaca 270  Q
    ||||||| |||||||||||||||            |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  39953963 ttaaaataattacacacataagcaataaagtaacataaacaataaagtataaagaaaagttttataggtcaattagtcaaca 39954044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1453 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold1453
Description:

Target: scaffold1453; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 111 - 1
Alignment:
Q  1 aaatggaagagaaagggacaataacaatgtttactatgctgcaaatttgatacataccatccttacatccttcttacatacttatagccaaatacttagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  111 aaatggaagagaaagggacaataacaatgtttactatgctgcaaatttgatacataccatccatacatccttcttacatacttatagccaaatacttagt 12  T
Q  101 aatgactcagc 111  Q
    |||||||||||    
T  11 aatgactcagc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University