View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11499_high_4 (Length: 542)

Name: NF11499_high_4
Description: NF11499
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11499_high_4
NF11499_high_4
[»] chr8 (67 HSPs)
chr8 (12-251)||(39045218-39045456)
chr8 (252-436)||(32984077-32984262)
chr8 (252-437)||(13356120-13356306)
chr8 (252-434)||(43328706-43328889)
chr8 (253-434)||(37301326-37301508)
chr8 (251-434)||(24079900-24080084)
chr8 (252-435)||(41862218-41862402)
chr8 (252-438)||(5946042-5946229)
chr8 (252-434)||(33730641-33730824)
chr8 (252-433)||(2275913-2276094)
chr8 (252-418)||(9303574-9303740)
chr8 (256-432)||(31830959-31831136)
chr8 (249-432)||(10646124-10646308)
chr8 (250-437)||(37419936-37420124)
chr8 (252-438)||(17718722-17718909)
chr8 (252-419)||(35628792-35628959)
chr8 (252-433)||(40435153-40435335)
chr8 (252-434)||(33981663-33981846)
chr8 (252-434)||(37956420-37956603)
chr8 (250-436)||(41653892-41654079)
chr8 (252-434)||(13760646-13760831)
chr8 (252-418)||(45066592-45066758)
chr8 (252-435)||(45236565-45236749)
chr8 (252-434)||(6365985-6366168)
chr8 (251-432)||(2714550-2714731)
chr8 (252-433)||(9013684-9013865)
chr8 (252-433)||(9734255-9734435)
chr8 (252-436)||(25248036-25248215)
chr8 (276-440)||(29048427-29048592)
chr8 (252-434)||(41231945-41232128)
chr8 (252-435)||(25185897-25186081)
chr8 (254-418)||(32114265-32114429)
chr8 (253-436)||(41639911-41640095)
chr8 (253-435)||(22878389-22878572)
chr8 (255-432)||(44088446-44088624)
chr8 (435-523)||(39045138-39045226)
chr8 (252-378)||(12032986-12033112)
chr8 (264-432)||(42701301-42701471)
chr8 (252-433)||(45258510-45258691)
chr8 (327-418)||(39915887-39915978)
chr8 (249-368)||(41981534-41981653)
chr8 (251-385)||(3904126-3904259)
chr8 (252-434)||(4447295-4447467)
chr8 (252-365)||(31336163-31336276)
chr8 (252-437)||(33896843-33897017)
chr8 (249-434)||(31940314-31940488)
chr8 (251-418)||(117328-117484)
chr8 (338-438)||(27243214-27243315)
chr8 (338-438)||(27254789-27254890)
chr8 (332-413)||(41981454-41981535)
chr8 (338-418)||(4975482-4975562)
chr8 (338-418)||(40458847-40458927)
chr8 (252-410)||(3211229-3211376)
chr8 (252-437)||(10378305-10378480)
chr8 (249-434)||(41843252-41843427)
chr8 (338-410)||(32373801-32373873)
chr8 (338-418)||(38631668-38631748)
chr8 (349-435)||(3490485-3490572)
chr8 (338-439)||(9509475-9509577)
chr8 (249-434)||(9713688-9713860)
chr8 (251-435)||(2379138-2379312)
chr8 (327-437)||(26196381-26196491)
chr8 (326-435)||(31148954-31149063)
chr8 (369-418)||(33622571-33622620)
chr8 (338-418)||(40649906-40649986)
chr8 (343-411)||(164745-164812)
chr8 (252-324)||(9509400-9509472)
[»] chr4 (124 HSPs)
chr4 (241-443)||(31532124-31532327)
chr4 (250-437)||(26091256-26091444)
chr4 (250-435)||(23437590-23437776)
chr4 (252-436)||(47344653-47344838)
chr4 (251-434)||(54607961-54608145)
chr4 (251-436)||(21366608-21366794)
chr4 (252-436)||(42085204-42085389)
chr4 (253-432)||(6019929-6020109)
chr4 (252-435)||(39077543-39077727)
chr4 (250-437)||(51363003-51363190)
chr4 (252-418)||(34276563-34276729)
chr4 (252-436)||(2826682-2826866)
chr4 (252-440)||(42765842-42766030)
chr4 (251-434)||(9798464-9798648)
chr4 (253-440)||(32366661-32366849)
chr4 (249-436)||(54574937-54575125)
chr4 (243-439)||(47662093-47662290)
chr4 (250-434)||(53854428-53854612)
chr4 (251-436)||(54086407-54086591)
chr4 (252-435)||(237475-237659)
chr4 (252-435)||(31914196-31914379)
chr4 (251-430)||(31972335-31972515)
chr4 (248-434)||(27373075-27373261)
chr4 (251-418)||(41560344-41560511)
chr4 (251-418)||(44984777-44984944)
chr4 (251-436)||(42033172-42033358)
chr4 (254-434)||(397401-397582)
chr4 (252-436)||(3170623-3170808)
chr4 (252-436)||(53461816-53462001)
chr4 (250-433)||(18462011-18462195)
chr4 (253-432)||(53834055-53834235)
chr4 (252-434)||(2243457-2243640)
chr4 (254-436)||(41702461-41702644)
chr4 (251-434)||(41949381-41949567)
chr4 (252-434)||(43471695-43471878)
chr4 (248-435)||(49881055-49881247)
chr4 (245-434)||(3692203-3692393)
chr4 (248-418)||(6285323-6285493)
chr4 (251-436)||(29478357-29478543)
chr4 (250-434)||(55519826-55520011)
chr4 (250-434)||(56022996-56023181)
chr4 (252-435)||(19387688-19387872)
chr4 (252-434)||(1932762-1932945)
chr4 (252-434)||(29777257-29777440)
chr4 (252-434)||(55056259-55056442)
chr4 (252-433)||(146429-146611)
chr4 (250-434)||(407753-407936)
chr4 (252-432)||(22618514-22618693)
chr4 (261-418)||(33897504-33897661)
chr4 (250-434)||(48313556-48313739)
chr4 (252-436)||(50233997-50234182)
chr4 (252-435)||(45797477-45797661)
chr4 (252-435)||(55776043-55776226)
chr4 (252-435)||(55840221-55840404)
chr4 (278-432)||(22468796-22468951)
chr4 (251-432)||(42222292-42222474)
chr4 (256-437)||(50536628-50536810)
chr4 (254-434)||(50457812-50457993)
chr4 (251-434)||(23609086-23609270)
chr4 (252-434)||(31070074-31070256)
chr4 (252-415)||(54425001-54425163)
chr4 (252-434)||(38591667-38591846)
chr4 (256-418)||(50534647-50534809)
chr4 (252-435)||(14017376-14017558)
chr4 (250-437)||(41632005-41632192)
chr4 (252-436)||(54805614-54805803)
chr4 (251-433)||(35446506-35446688)
chr4 (252-394)||(48657858-48658000)
chr4 (252-432)||(48259512-48259691)
chr4 (269-434)||(39587796-39587962)
chr4 (252-394)||(52728307-52728448)
chr4 (252-418)||(48654830-48655002)
chr4 (252-378)||(36532830-36532956)
chr4 (252-418)||(45633779-45633934)
chr4 (335-436)||(34835174-34835276)
chr4 (326-434)||(27398666-27398775)
chr4 (251-436)||(22620590-22620765)
chr4 (252-437)||(37239090-37239265)
chr4 (346-434)||(43231502-43231590)
chr4 (254-437)||(51951678-51951861)
chr4 (338-437)||(54216309-54216409)
chr4 (250-434)||(9997929-9998103)
chr4 (327-432)||(14335165-14335271)
chr4 (327-432)||(27580120-27580226)
chr4 (251-434)||(34552318-34552491)
chr4 (327-434)||(1662323-1662431)
chr4 (338-418)||(5117513-5117593)
chr4 (327-434)||(38547665-38547773)
chr4 (327-434)||(46720024-46720132)
chr4 (350-432)||(42557583-42557666)
chr4 (251-434)||(15060288-15060461)
chr4 (338-415)||(31881389-31881466)
chr4 (251-418)||(49014114-49014270)
chr4 (338-437)||(3293098-3293198)
chr4 (338-437)||(11972204-11972304)
chr4 (251-379)||(42509351-42509479)
chr4 (338-418)||(46708816-46708896)
chr4 (338-440)||(54216811-54216914)
chr4 (338-434)||(4486656-4486753)
chr4 (252-434)||(52688348-52688520)
chr4 (338-418)||(20351917-20351997)
chr4 (338-418)||(33558017-33558097)
chr4 (249-349)||(35595772-35595872)
chr4 (252-418)||(43890944-43891099)
chr4 (295-386)||(52396774-52396866)
chr4 (252-418)||(54715051-54715206)
chr4 (250-434)||(33289702-33289875)
chr4 (349-433)||(6371335-6371420)
chr4 (252-411)||(52461386-52461534)
chr4 (327-434)||(573802-573910)
chr4 (327-406)||(27872607-27872686)
chr4 (338-434)||(27873623-27873720)
chr4 (328-432)||(49057933-49058038)
chr4 (253-321)||(33048994-33049062)
chr4 (252-418)||(47811922-47812077)
chr4 (383-435)||(17555617-17555670)
chr4 (253-354)||(35344868-35344968)
chr4 (252-357)||(42558270-42558367)
chr4 (338-397)||(51981554-51981613)
chr4 (252-321)||(48259704-48259772)
chr4 (349-417)||(18206608-18206676)
chr4 (252-321)||(20351842-20351911)
chr4 (252-305)||(34835295-34835348)
chr4 (252-304)||(1662261-1662313)
[»] chr7 (98 HSPs)
chr7 (248-436)||(22979643-22979832)
chr7 (250-435)||(27018115-27018301)
chr7 (252-435)||(35355887-35356071)
chr7 (250-432)||(23393049-23393232)
chr7 (250-436)||(33695819-33696006)
chr7 (251-436)||(25893916-25894102)
chr7 (252-435)||(17855427-17855611)
chr7 (252-435)||(33839715-33839899)
chr7 (253-435)||(33423276-33423459)
chr7 (252-434)||(40670563-40670746)
chr7 (250-436)||(47740329-47740516)
chr7 (252-437)||(33332786-33332971)
chr7 (252-414)||(36389377-36389539)
chr7 (243-443)||(48609668-48609869)
chr7 (252-432)||(49171362-49171543)
chr7 (252-436)||(46913107-46913294)
chr7 (250-435)||(33411259-33411445)
chr7 (252-418)||(45690097-45690263)
chr7 (241-440)||(2341650-2341851)
chr7 (252-434)||(26579717-26579900)
chr7 (252-434)||(47066977-47067160)
chr7 (252-435)||(45482657-45482841)
chr7 (251-434)||(10028488-10028674)
chr7 (252-434)||(31586848-31587031)
chr7 (252-415)||(35328069-35328232)
chr7 (251-436)||(19563445-19563631)
chr7 (251-432)||(20165813-20165995)
chr7 (249-434)||(31429472-31429658)
chr7 (252-432)||(31625706-31625886)
chr7 (252-434)||(35757020-35757203)
chr7 (247-436)||(5712166-5712356)
chr7 (252-410)||(29446863-29447020)
chr7 (250-435)||(43499484-43499670)
chr7 (253-435)||(33870244-33870424)
chr7 (252-434)||(37846016-37846199)
chr7 (252-418)||(5183825-5183991)
chr7 (264-418)||(41990870-41991024)
chr7 (252-434)||(10618298-10618474)
chr7 (261-431)||(15877553-15877724)
chr7 (251-439)||(45063356-45063543)
chr7 (273-417)||(44564356-44564500)
chr7 (252-390)||(35767519-35767657)
chr7 (287-435)||(33720071-33720220)
chr7 (252-380)||(30076527-30076655)
chr7 (252-434)||(35752034-35752206)
chr7 (252-418)||(37127954-37128109)
chr7 (251-389)||(28233935-28234073)
chr7 (248-435)||(36816841-36817018)
chr7 (252-435)||(24228540-24228713)
chr7 (251-434)||(43489218-43489391)
chr7 (327-435)||(7257380-7257489)
chr7 (338-418)||(26941607-26941687)
chr7 (342-433)||(29098752-29098844)
chr7 (338-436)||(46817496-46817595)
chr7 (327-436)||(15644010-15644120)
chr7 (338-434)||(24923099-24923196)
chr7 (252-434)||(29610635-29610807)
chr7 (338-415)||(33455116-33455193)
chr7 (338-434)||(39323616-39323713)
chr7 (346-434)||(39453558-39453647)
chr7 (252-434)||(48085858-48086030)
chr7 (253-434)||(33393328-33393499)
chr7 (326-418)||(38448511-38448603)
chr7 (338-418)||(41855076-41855156)
chr7 (327-438)||(44003434-44003546)
chr7 (338-436)||(25037583-25037682)
chr7 (252-371)||(44405412-44405531)
chr7 (327-410)||(47460836-47460919)
chr7 (338-435)||(32556681-32556779)
chr7 (252-435)||(44659843-44660015)
chr7 (252-435)||(46898016-46898189)
chr7 (247-418)||(7876323-7876483)
chr7 (327-435)||(16482847-16482956)
chr7 (338-434)||(47906834-47906931)
chr7 (338-418)||(498263-498343)
chr7 (338-418)||(39866682-39866762)
chr7 (252-368)||(41904272-41904388)
chr7 (253-433)||(45502817-45502987)
chr7 (338-434)||(2332019-2332116)
chr7 (338-434)||(21718117-21718214)
chr7 (338-437)||(35484633-35484734)
chr7 (338-418)||(26371066-26371146)
chr7 (327-395)||(37443666-37443734)
chr7 (334-418)||(29863032-29863116)
chr7 (338-418)||(45237608-45237688)
chr7 (338-418)||(46103138-46103217)
chr7 (367-418)||(35557747-35557798)
chr7 (325-387)||(26456157-26456219)
chr7 (370-434)||(30077043-30077108)
chr7 (334-418)||(7720574-7720658)
chr7 (372-435)||(35823289-35823353)
chr7 (254-324)||(39453484-39453554)
chr7 (252-321)||(24923024-24923093)
chr7 (252-305)||(44003370-44003423)
chr7 (252-321)||(46817421-46817490)
chr7 (249-321)||(2332122-2332194)
chr7 (252-320)||(39323712-39323779)
chr7 (253-321)||(46103223-46103291)
[»] chr5 (75 HSPs)
chr5 (248-438)||(24253377-24253568)
chr5 (250-437)||(27501053-27501241)
chr5 (250-432)||(2484290-2484473)
chr5 (252-434)||(5184971-5185154)
chr5 (254-436)||(6901796-6901979)
chr5 (252-433)||(12648797-12648979)
chr5 (252-436)||(43326379-43326564)
chr5 (252-435)||(3466681-3466865)
chr5 (252-437)||(43262183-43262369)
chr5 (252-435)||(5137713-5137897)
chr5 (253-432)||(15398483-15398663)
chr5 (246-432)||(18479662-18479849)
chr5 (252-434)||(35626037-35626220)
chr5 (252-436)||(27938894-27939080)
chr5 (250-434)||(40886026-40886210)
chr5 (252-435)||(7722047-7722231)
chr5 (251-418)||(31938913-31939080)
chr5 (252-434)||(39932578-39932761)
chr5 (252-436)||(739704-739889)
chr5 (252-439)||(15683785-15683973)
chr5 (250-418)||(40278856-40279024)
chr5 (253-434)||(27278474-27278660)
chr5 (252-439)||(25831515-25831702)
chr5 (252-397)||(29789295-29789440)
chr5 (252-435)||(28424795-28424977)
chr5 (254-442)||(40110225-40110413)
chr5 (252-437)||(890902-891087)
chr5 (250-414)||(13504740-13504904)
chr5 (252-418)||(38756487-38756654)
chr5 (249-432)||(31293986-31294170)
chr5 (250-392)||(34451292-34451434)
chr5 (326-437)||(12558093-12558204)
chr5 (261-441)||(42658671-42658841)
chr5 (252-433)||(763723-763905)
chr5 (252-434)||(23195248-23195420)
chr5 (253-434)||(9424593-9424764)
chr5 (251-436)||(27503376-27503551)
chr5 (343-434)||(40632498-40632590)
chr5 (251-438)||(19295725-19295902)
chr5 (327-436)||(36472348-36472458)
chr5 (346-434)||(2585461-2585550)
chr5 (252-434)||(33617584-33617756)
chr5 (239-418)||(38015501-38015669)
chr5 (323-418)||(5120041-5120135)
chr5 (327-418)||(27390613-27390704)
chr5 (252-435)||(5497271-5497444)
chr5 (338-435)||(13957668-13957766)
chr5 (251-419)||(14971993-14972150)
chr5 (346-435)||(42247865-42247955)
chr5 (356-436)||(4149691-4149772)
chr5 (327-435)||(18327237-18327346)
chr5 (338-434)||(36365520-36365617)
chr5 (338-418)||(6973079-6973159)
chr5 (252-418)||(9374502-9374657)
chr5 (346-435)||(38637993-38638083)
chr5 (327-434)||(24167848-24167956)
chr5 (346-435)||(1402588-1402678)
chr5 (335-432)||(40686900-40686998)
chr5 (338-417)||(6206901-6206980)
chr5 (251-407)||(3656567-3656712)
chr5 (349-418)||(9171111-9171180)
chr5 (343-408)||(36948569-36948633)
chr5 (343-410)||(3940411-3940478)
chr5 (343-418)||(33624019-33624094)
chr5 (338-400)||(38492647-38492709)
chr5 (367-418)||(9527124-9527175)
chr5 (346-408)||(612839-612900)
chr5 (352-418)||(15300962-15301028)
chr5 (287-340)||(4149778-4149831)
chr5 (252-321)||(13957772-13957841)
chr5 (250-283)||(21786001-21786034)
chr5 (252-327)||(612757-612833)
chr5 (249-305)||(24167781-24167837)
chr5 (252-304)||(27390716-27390768)
chr5 (374-418)||(28756094-28756138)
[»] chr1 (111 HSPs)
chr1 (240-437)||(26085386-26085583)
chr1 (252-436)||(44661967-44662152)
chr1 (241-440)||(47671579-47671779)
chr1 (252-434)||(5981169-5981352)
chr1 (249-435)||(45538151-45538338)
chr1 (250-438)||(3611131-3611320)
chr1 (250-437)||(26277173-26277361)
chr1 (252-435)||(31307999-31308183)
chr1 (251-436)||(25058685-25058871)
chr1 (252-436)||(23984752-23984937)
chr1 (250-434)||(25678257-25678442)
chr1 (252-433)||(26524889-26525071)
chr1 (249-433)||(21139409-21139594)
chr1 (252-434)||(17994951-17995134)
chr1 (251-437)||(24245024-24245211)
chr1 (252-434)||(31040708-31040891)
chr1 (256-418)||(26794320-26794482)
chr1 (252-437)||(38331859-38332045)
chr1 (250-434)||(35273595-35273780)
chr1 (252-432)||(38790197-38790378)
chr1 (252-436)||(46616546-46616731)
chr1 (258-437)||(4068689-4068869)
chr1 (252-435)||(33112818-33113001)
chr1 (252-434)||(23932509-23932692)
chr1 (252-434)||(24885500-24885683)
chr1 (249-431)||(43251713-43251896)
chr1 (252-437)||(6327548-6327733)
chr1 (248-418)||(47317331-47317501)
chr1 (253-435)||(3285400-3285582)
chr1 (252-434)||(39646567-39646750)
chr1 (251-418)||(47383731-47383898)
chr1 (255-432)||(28888582-28888760)
chr1 (252-433)||(33884088-33884270)
chr1 (252-433)||(33959982-33960164)
chr1 (252-434)||(42313361-42313548)
chr1 (241-433)||(46784423-46784616)
chr1 (251-434)||(46967040-46967224)
chr1 (252-434)||(37620192-37620375)
chr1 (249-434)||(36566329-36566515)
chr1 (252-418)||(50774233-50774399)
chr1 (252-435)||(35692663-35692848)
chr1 (252-435)||(41999813-41999997)
chr1 (252-434)||(5980067-5980250)
chr1 (250-434)||(23220933-23221112)
chr1 (251-436)||(51057068-51057254)
chr1 (287-435)||(31844374-31844523)
chr1 (265-418)||(42863881-42864034)
chr1 (251-434)||(49398987-49399171)
chr1 (252-434)||(49253975-49254158)
chr1 (296-432)||(25518815-25518952)
chr1 (252-437)||(47187101-47187287)
chr1 (251-399)||(2450529-2450677)
chr1 (252-438)||(48373499-48373677)
chr1 (315-436)||(2556909-2557031)
chr1 (250-393)||(51045594-51045737)
chr1 (328-433)||(51403083-51403189)
chr1 (252-418)||(36003146-36003315)
chr1 (251-436)||(27983602-27983772)
chr1 (252-437)||(33073207-33073382)
chr1 (249-434)||(41467629-41467804)
chr1 (322-436)||(33187337-33187452)
chr1 (252-418)||(2657319-2657474)
chr1 (326-431)||(31980009-31980115)
chr1 (252-380)||(47772172-47772300)
chr1 (253-418)||(6626025-6626179)
chr1 (342-436)||(24649801-24649896)
chr1 (338-436)||(26472254-26472353)
chr1 (327-436)||(5961331-5961441)
chr1 (343-440)||(13313254-13313354)
chr1 (327-434)||(2954854-2954962)
chr1 (252-380)||(4808699-4808827)
chr1 (327-434)||(26685855-26685963)
chr1 (327-434)||(27924722-27924830)
chr1 (252-437)||(42234836-42235010)
chr1 (338-418)||(44544121-44544201)
chr1 (252-436)||(10928064-10928238)
chr1 (247-442)||(29770661-29770846)
chr1 (251-435)||(52323936-52324111)
chr1 (327-435)||(10920198-10920307)
chr1 (276-397)||(45475867-45475987)
chr1 (338-418)||(32448664-32448744)
chr1 (327-434)||(38716311-38716419)
chr1 (258-418)||(34752320-34752469)
chr1 (252-380)||(4156441-4156576)
chr1 (327-430)||(1388476-1388580)
chr1 (338-418)||(4953068-4953148)
chr1 (326-436)||(39475846-39475956)
chr1 (346-435)||(4243573-4243663)
chr1 (338-439)||(13281637-13281739)
chr1 (344-434)||(39637899-39637986)
chr1 (251-340)||(13312530-13312619)
chr1 (251-418)||(41895163-41895319)
chr1 (338-438)||(46428328-46428429)
chr1 (338-418)||(30289985-30290065)
chr1 (338-437)||(44293530-44293630)
chr1 (327-434)||(52367882-52367990)
chr1 (327-410)||(48683394-48683477)
chr1 (338-434)||(51155664-51155761)
chr1 (338-418)||(35991674-35991754)
chr1 (353-418)||(7561632-7561697)
chr1 (375-434)||(4156188-4156248)
chr1 (250-399)||(38718165-38718309)
chr1 (375-435)||(10919306-10919367)
chr1 (248-305)||(33187452-33187509)
chr1 (251-315)||(7561527-7561591)
chr1 (252-294)||(5961267-5961309)
chr1 (252-305)||(2954973-2955026)
chr1 (338-391)||(24215806-24215859)
chr1 (248-321)||(30289906-30289979)
chr1 (250-294)||(1388602-1388646)
chr1 (346-418)||(15611686-15611758)
[»] chr2 (79 HSPs)
chr2 (251-434)||(746464-746648)
chr2 (252-436)||(6594458-6594643)
chr2 (250-434)||(45370988-45371173)
chr2 (251-436)||(23901775-23901961)
chr2 (243-444)||(40735452-40735654)
chr2 (241-439)||(26710338-26710537)
chr2 (250-432)||(32327361-32327544)
chr2 (252-433)||(38997100-38997282)
chr2 (252-436)||(17600832-17601017)
chr2 (247-434)||(27024413-27024601)
chr2 (252-434)||(1091951-1092134)
chr2 (252-434)||(4034590-4034773)
chr2 (252-434)||(10244582-10244765)
chr2 (249-435)||(13815215-13815402)
chr2 (252-418)||(14660461-14660627)
chr2 (252-434)||(2324889-2325072)
chr2 (252-434)||(11184970-11185153)
chr2 (250-436)||(27400399-27400586)
chr2 (252-434)||(27651034-27651217)
chr2 (252-434)||(40635216-40635399)
chr2 (252-418)||(34518382-34518548)
chr2 (258-434)||(6430471-6430648)
chr2 (255-435)||(10424592-10424773)
chr2 (251-433)||(5726128-5726311)
chr2 (252-418)||(32856436-32856602)
chr2 (251-418)||(4609641-4609808)
chr2 (252-434)||(40037141-40037323)
chr2 (252-433)||(7892688-7892870)
chr2 (249-433)||(32948445-32948629)
chr2 (252-432)||(33427647-33427828)
chr2 (250-418)||(2914136-2914304)
chr2 (248-435)||(14697533-14697721)
chr2 (252-418)||(11159637-11159802)
chr2 (287-436)||(32608376-32608526)
chr2 (251-435)||(37620866-37621054)
chr2 (258-437)||(15925075-15925255)
chr2 (278-436)||(8432942-8433101)
chr2 (255-380)||(25294888-25295013)
chr2 (252-435)||(37255337-37255516)
chr2 (252-432)||(9444683-9444874)
chr2 (310-439)||(42899908-42900038)
chr2 (287-418)||(12842118-12842249)
chr2 (251-434)||(28641291-28641464)
chr2 (287-437)||(41172454-41172604)
chr2 (253-441)||(39103038-39103216)
chr2 (251-418)||(35158049-35158205)
chr2 (354-437)||(12814609-12814693)
chr2 (327-434)||(44481826-44481934)
chr2 (338-436)||(40544151-40544250)
chr2 (252-435)||(21734900-21735073)
chr2 (251-434)||(29687039-29687212)
chr2 (244-434)||(43898963-43899142)
chr2 (327-434)||(35126778-35126886)
chr2 (338-418)||(39301272-39301352)
chr2 (248-359)||(447629-447740)
chr2 (338-436)||(28566773-28566872)
chr2 (254-418)||(145297-145450)
chr2 (252-385)||(1229675-1229809)
chr2 (343-436)||(12333575-12333669)
chr2 (338-435)||(27764937-27765035)
chr2 (338-438)||(2000412-2000513)
chr2 (338-434)||(12730059-12730156)
chr2 (251-418)||(19428425-19428581)
chr2 (338-417)||(3266312-3266391)
chr2 (250-434)||(4258488-4258661)
chr2 (252-417)||(13543624-13543778)
chr2 (338-418)||(27331313-27331393)
chr2 (345-417)||(30545837-30545909)
chr2 (252-418)||(34249280-34249435)
chr2 (338-434)||(43356097-43356191)
chr2 (338-418)||(8056641-8056721)
chr2 (290-362)||(28014856-28014928)
chr2 (338-436)||(2688804-2688903)
chr2 (338-401)||(3711665-3711728)
chr2 (252-359)||(12827137-12827243)
chr2 (278-351)||(17799272-17799345)
chr2 (390-435)||(28019959-28020005)
chr2 (327-401)||(38985342-38985415)
chr2 (252-321)||(2688729-2688798)
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (252-434)||(24168090-24168273)
chr6 (252-434)||(5882505-5882688)
chr6 (248-437)||(22551057-22551247)
chr6 (249-433)||(959901-960086)
chr6 (248-444)||(28947076-28947273)
chr6 (252-435)||(19415533-19415717)
chr6 (252-434)||(26377204-26377387)
chr6 (252-418)||(11988974-11989140)
chr6 (249-430)||(18101492-18101674)
chr6 (252-435)||(2593852-2594036)
chr6 (256-435)||(14891383-14891563)
chr6 (254-432)||(2892189-2892368)
chr6 (251-436)||(8615237-8615423)
chr6 (253-440)||(19281056-19281244)
chr6 (249-435)||(599890-600077)
chr6 (252-437)||(5294801-5294987)
chr6 (252-437)||(5299353-5299539)
chr6 (252-434)||(34527862-34528045)
chr6 (252-436)||(1970708-1970893)
chr6 (252-436)||(7393586-7393771)
chr6 (261-436)||(16703363-16703539)
chr6 (246-418)||(22341782-22341956)
chr6 (254-434)||(7345114-7345295)
chr6 (252-434)||(10507908-10508091)
chr6 (248-432)||(33452568-33452753)
chr6 (242-418)||(24224060-24224236)
chr6 (310-434)||(30467661-30467786)
chr6 (252-432)||(30743448-30743629)
chr6 (246-441)||(28948839-28949024)
chr6 (252-434)||(15965432-15965604)
chr6 (252-401)||(23261929-23262078)
chr6 (352-435)||(929657-929741)
chr6 (327-435)||(7167580-7167689)
chr6 (259-436)||(13329378-13329545)
chr6 (338-418)||(3291024-3291104)
chr6 (252-435)||(1398551-1398724)
chr6 (338-415)||(4487546-4487623)
chr6 (336-436)||(375797-375898)
chr6 (343-418)||(1939584-1939659)
chr6 (251-433)||(3786749-3786921)
chr6 (327-418)||(13844852-13844943)
chr6 (251-321)||(18661836-18661906)
chr6 (252-305)||(7167700-7167753)
[»] chr3 (114 HSPs)
chr3 (252-434)||(47257792-47257975)
chr3 (250-437)||(24100279-24100466)
chr3 (252-435)||(49330035-49330219)
chr3 (253-436)||(51170034-51170218)
chr3 (246-435)||(28048386-28048576)
chr3 (252-434)||(35748311-35748494)
chr3 (252-432)||(38416724-38416905)
chr3 (252-435)||(43612047-43612231)
chr3 (252-434)||(47809596-47809780)
chr3 (252-438)||(27066978-27067165)
chr3 (251-437)||(37313395-37313582)
chr3 (252-437)||(7855114-7855300)
chr3 (252-441)||(29625827-29626017)
chr3 (252-437)||(32234398-32234583)
chr3 (252-437)||(37324537-37324723)
chr3 (249-434)||(40643799-40643985)
chr3 (251-436)||(41464349-41464535)
chr3 (252-436)||(40130959-40131144)
chr3 (252-435)||(42291840-42292024)
chr3 (251-434)||(52628953-52629136)
chr3 (249-435)||(22399095-22399281)
chr3 (252-434)||(40419834-40420017)
chr3 (254-432)||(48609724-48609903)
chr3 (252-438)||(51102378-51102565)
chr3 (252-435)||(48739233-48739417)
chr3 (252-434)||(7755307-7755489)
chr3 (252-434)||(20754393-20754576)
chr3 (252-438)||(40804510-40804697)
chr3 (252-434)||(44806683-44806866)
chr3 (252-434)||(53943588-53943770)
chr3 (252-433)||(39634572-39634753)
chr3 (251-436)||(41732525-41732711)
chr3 (251-435)||(44222827-44223012)
chr3 (256-435)||(35594119-35594299)
chr3 (251-434)||(36368938-36369121)
chr3 (253-436)||(55453245-55453429)
chr3 (252-434)||(2665999-2666182)
chr3 (252-411)||(46126010-46126168)
chr3 (252-438)||(51452751-51452937)
chr3 (249-432)||(46134357-46134541)
chr3 (252-438)||(5560025-5560219)
chr3 (252-434)||(39053393-39053576)
chr3 (253-418)||(43021730-43021896)
chr3 (254-434)||(47894822-47895003)
chr3 (250-434)||(51146213-51146398)
chr3 (252-436)||(52638839-52639024)
chr3 (252-431)||(41293319-41293498)
chr3 (276-436)||(43125828-43125989)
chr3 (254-433)||(53832486-53832666)
chr3 (315-436)||(54159051-54159173)
chr3 (254-418)||(43183928-43184092)
chr3 (287-433)||(53637841-53637988)
chr3 (277-434)||(24376572-24376730)
chr3 (287-432)||(52215077-52215223)
chr3 (252-432)||(18946904-18947085)
chr3 (241-445)||(34279710-34279904)
chr3 (252-434)||(41216454-41216637)
chr3 (254-436)||(48546842-48547014)
chr3 (288-437)||(37758925-37759075)
chr3 (252-374)||(52864550-52864671)
chr3 (249-435)||(47510937-47511113)
chr3 (252-435)||(25641644-25641817)
chr3 (269-418)||(46949391-46949538)
chr3 (327-434)||(53115446-53115554)
chr3 (252-434)||(42589829-42590001)
chr3 (327-438)||(25353549-25353661)
chr3 (252-418)||(31286793-31286948)
chr3 (252-418)||(38156632-38156787)
chr3 (327-434)||(55379984-55380092)
chr3 (276-434)||(39141148-39141298)
chr3 (252-436)||(54707220-54707394)
chr3 (254-418)||(45058899-45059052)
chr3 (252-434)||(41635800-41635972)
chr3 (338-418)||(40022090-40022170)
chr3 (252-418)||(54401203-54401358)
chr3 (338-436)||(17665599-17665698)
chr3 (252-440)||(24688107-24688285)
chr3 (346-432)||(41882074-41882161)
chr3 (252-436)||(51415966-51416140)
chr3 (327-436)||(30251565-30251675)
chr3 (251-418)||(37028739-37028895)
chr3 (338-438)||(51224113-51224213)
chr3 (252-434)||(55000178-55000350)
chr3 (327-434)||(42998853-42998960)
chr3 (255-436)||(49130575-49130746)
chr3 (327-418)||(51143833-51143924)
chr3 (346-438)||(21597231-21597324)
chr3 (326-437)||(2227998-2228110)
chr3 (346-418)||(50731997-50732069)
chr3 (346-418)||(50780787-50780859)
chr3 (252-367)||(33550467-33550582)
chr3 (326-443)||(8847721-8847838)
chr3 (327-432)||(43176802-43176908)
chr3 (348-418)||(44946014-44946084)
chr3 (346-438)||(28576195-28576288)
chr3 (310-385)||(47182049-47182124)
chr3 (358-434)||(52434138-52434216)
chr3 (326-418)||(47402813-47402904)
chr3 (343-434)||(48726078-48726170)
chr3 (358-418)||(48752101-48752161)
chr3 (327-401)||(40165684-40165758)
chr3 (338-399)||(52756146-52756207)
chr3 (252-339)||(30429227-30429314)
chr3 (349-418)||(177177-177246)
chr3 (252-304)||(25353673-25353725)
chr3 (251-299)||(50731913-50731961)
chr3 (251-303)||(50780891-50780943)
chr3 (250-305)||(55380103-55380158)
chr3 (382-435)||(37741433-37741487)
chr3 (248-294)||(52756063-52756109)
chr3 (252-293)||(43176738-43176779)
chr3 (252-321)||(48534007-48534076)
chr3 (338-378)||(48534082-48534122)
chr3 (253-305)||(51143935-51143987)
[»] scaffold0949 (1 HSPs)
scaffold0949 (251-431)||(1871-2052)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (252-434)||(39556-39739)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (252-434)||(13762-13945)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (251-436)||(11132-11317)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (252-434)||(75244-75427)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (251-434)||(2431-2615)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (252-434)||(18854-19037)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (252-434)||(278005-278190)
scaffold0007 (252-418)||(176670-176836)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (287-434)||(32560-32708)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (251-392)||(4595-4736)
[»] scaffold2003 (1 HSPs)
scaffold2003 (327-437)||(98-209)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (327-437)||(14740-14851)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (252-381)||(3132-3261)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (327-433)||(20541-20648)
scaffold0125 (252-305)||(20477-20530)
[»] scaffold0721 (1 HSPs)
scaffold0721 (251-434)||(7089-7263)
[»] scaffold0684 (2 HSPs)
scaffold0684 (327-441)||(4618-4734)
scaffold0684 (246-304)||(4548-4606)
[»] scaffold0163 (2 HSPs)
scaffold0163 (327-441)||(3384-3500)
scaffold0163 (246-304)||(3512-3570)
[»] scaffold0271 (1 HSPs)
scaffold0271 (353-434)||(17905-17987)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (349-417)||(19234-19302)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 67)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 39045456 - 39045218
Alignment:
Q  12 agagagtgcagtgcaggagtagtagtggccacgtcctcatcacccactctactccattaaaaccaacacgtgaaccgtttctgaactcacgatcacgaga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39045456 agagagtgcagtgcaggagtagtagtggccacgtcctcatcacccactctactccattaaaaccaacacgtgaaccgtttctgaactcacgatcacgaga 39045357  T
Q  112 catcaaaatgctactacagtacacccatgaaacttgacctcaagccagcaataaacagtaataacatcaattaattaaagaattctccattaatcaatga 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39045356 catcaaaatgctactacagtacacccatg-accttgaccacaagccagcaataaacagtaataacatcaattaattaaagaattctccattaatcaatga 39045258  T
Q  212 attaccataaacaaagcacaaccgtccaaatttatattat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39045257 attaccataaacaaagcacaaccgtccaaatttatattat 39045218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 252 - 436
Target Start/End: Original strand, 32984077 - 32984262
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  32984077 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 32984176  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  32984177 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 32984262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 252 - 437
Target Start/End: Original strand, 13356120 - 13356306
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  13356120 ggtgacaactagagtacccatggaagaatgatggataatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 13356219  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctta 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  13356220 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccacctttcttcaaatgtaatctaaaaaaaacctta 13356306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 43328889 - 43328706
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||| | |||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  43328889 ggtgacaattagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 43328790  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  43328789 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 43328706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 253 - 434
Target Start/End: Original strand, 37301326 - 37301508
Alignment:
Q  253 gtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatc 352  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||     
T  37301326 gtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactatt 37301425  T
Q  353 ttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  37301426 ttggccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 37301508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 251 - 434
Target Start/End: Original strand, 24079900 - 24080084
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||    
T  24079900 tggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 24079999  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  24080000 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctacaaaaaacc 24080084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 252 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 41862402 - 41862218
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| || ||||||||||| |||  |||||||||    
T  41862402 ggtgacaattaggatacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 41862303  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  41862302 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 41862218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 252 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 5946229 - 5946042
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  5946229 ggtgacaactagggtacctatgaaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 5946130  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaaccttat 438  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  5946129 cttgaccccaccaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttat 5946042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Original strand, 33730641 - 33730824
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  33730641 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 33730740  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  33730741 cttgaccccaccaacaaattgctcatattaattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacc 33730824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 252 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 2276094 - 2275913
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||    
T  2276094 ggtgacaactagtctacccatggaagaatgatgggtaatttaccctaatcaatacacattagccacataagcatatttt-aagtggtatccatgaactat 2275996  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaac 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  2275995 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 2275913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 252 - 418
Target Start/End: Original strand, 9303574 - 9303740
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| || | ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  9303574 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccgaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 9303673  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9303674 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaag 9303740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 256 - 432
Target Start/End: Original strand, 31830959 - 31831136
Alignment:
Q  256 acaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttg 355  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||| | |||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  31830959 acaactagggtacccatggaagaatggtaggtaatttacccaaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttg 31831058  T
Q  356 accccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaa 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  31831059 accccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 31831136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 249 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 10646308 - 10646124
Alignment:
Q  249 tatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaac 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||  | |||||||||||||||  ||||||    
T  10646308 tatggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagaacatttttaagtggtatccatgaac 10646209  T
Q  349 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaa 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||| |||||||    
T  10646208 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccactatttttcaaaggtaatctagaaaaaa 10646124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 250 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 37420124 - 37419936
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||   |||||||| || |||| ||||||| || |||||||||| ||||  |||||||    
T  37420124 atggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccttaatcaatacacattagtcacataagcacatttttaagtagtatccatgaact 37420025  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctta 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  37420024 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 37419936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 252 - 438
Target Start/End: Original strand, 17718722 - 17718909
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  17718722 ggtgacagctagggtacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 17718821  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaaccttat 438  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  17718822 cttgaccccatcaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaatcttat 17718909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 252 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 35628959 - 35628792
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||| ||||||||||||| ||||| || |||| ||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||    
T  35628959 ggtgacaactagggtactcatagaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtattcttgaactat 35628860  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaagt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35628859 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagt 35628792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 252 - 433
Target Start/End: Original strand, 40435153 - 40435335
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  40435153 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 40435252  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaac 433  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  40435253 cttgacctcaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaagttacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 40435335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Original strand, 33981663 - 33981846
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||| ||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  33981663 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccgcataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 33981762  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  33981763 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaagataatctaaaaaaaacc 33981846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 37956603 - 37956420
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||  | |||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  37956603 ggtgacaactagggtatccatgaaataatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 37956504  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  37956503 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 37956420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 250 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 41654079 - 41653892
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||| |    
T  41654079 atggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaatt 41653980  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  41653979 attttgaccccatcaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 41653892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Original strand, 13760646 - 13760831
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtac--ccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||| || ||||||||| || || |||||||| ||||||  |||||||    
T  13760646 ggtgacaactagggtacacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacagaagcacatttttaaatggtatccatgaact 13760745  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13760746 atcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtaggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatcttgaaaaaacc 13760831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 252 - 418
Target Start/End: Original strand, 45066592 - 45066758
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |  |||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  45066592 ggtgagaattagggtacccatggaagaatgatgggtaatttattataatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 45066691  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  45066692 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccattattcttcaaag 45066758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 252 - 435
Target Start/End: Original strand, 45236565 - 45236749
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||| |||||||   |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  45236565 ggtgacaactaggatacccataaaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 45236664  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  45236665 cttgaccccaccaataaattgctcattttcattggttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 45236749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 6366168 - 6365985
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||| ||| |||||||  |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  6366168 ggtgacaactagggtatccatgaaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 6366069  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  6366068 attgaccccaccaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 6365985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 251 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 2714731 - 2714550
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||    
T  2714731 tggtgacaactaaagtacc-atggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 2714633  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaa 432  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  2714632 tcttgaccctaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 2714550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 252 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 9013865 - 9013684
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| | || ||||| || ||||||||||||  | |||||||||||||||  |||||||||    
T  9013865 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttac-ctaaccaatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatccatgaactat 9013767  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaac 433  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  9013766 cttgactccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacctaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 9013684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 252 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 9734435 - 9734255
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| || |||| ||||| || |||||||||||| || ||||||||||| |||  |||||||||    
T  9734435 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatt-accccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtg-tatccatgaactat 9734338  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaac 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  9734337 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 9734255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 252 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 25248215 - 25248036
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| || ||||| |||||||||  |||||||||    
T  25248215 ggtgacaattagggtatccatggaagaatgatgggtaatttactccaaccaatacacattagcaacataagcacattttaaagtggtatccatgaactat 25248116  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  25248115 cttgaccccaccaacaaattgctcatttt------ttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 25248036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 276 - 440
Target Start/End: Original strand, 29048427 - 29048592
Alignment:
Q  276 agaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctc 375  Q
    |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29048427 agaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccactaacaaattgctc 29048526  T
Q  376 attttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaaccttatat 440  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  29048527 attttcattggttagtgggtaaattatccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacctaatat 29048592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 41232128 - 41231945
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||  ||| |||||||| |||| ||||| || || | ||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  41232128 ggtgacaactagggtatccatggaggaatagtgggtaatttaccccaaccaatacacattggtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 41232029  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  41232028 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacc 41231945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 252 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 25186081 - 25185897
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||| | ||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||| |||    
T  25186081 ggtgacgattagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaattat 25185982  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||    
T  25185981 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaatacct 25185897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 254 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 32114429 - 32114265
Alignment:
Q  254 tgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatct 353  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||  ||| ||||| || |||| ||||||| || |||||||||||||||  ||||||||| |    
T  32114429 tgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactattt 32114330  T
Q  354 tgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32114329 tgaccctaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 32114265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 253 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 41640095 - 41639911
Alignment:
Q  253 gtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatc 352  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||| ||| |||||||  ||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  41640095 gtgacaactagggtatctatggaagaatggtgggtaatttatcccaactaatacacattagccacataaacatatttttaagcggtatctatgaactatc 41639996  T
Q  353 ttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  41639995 ttgaccccaccaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattactcatcattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacctt 41639911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 253 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 22878572 - 22878389
Alignment:
Q  253 gtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatc 352  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||  ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||    
T  22878572 gtgacaactagggtacccatagaagaattgtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 22878473  T
Q  353 ttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22878472 ttgaccccaacaaaaaattgatcattttcattggaaggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 22878389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 255 - 432
Target Start/End: Original strand, 44088446 - 44088624
Alignment:
Q  255 gacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatctt 354  Q
    ||||| ||| ||| |||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||| ||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  44088446 gacaattagagtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatctt 44088545  T
Q  355 gaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaa 432  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  44088546 gatcccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgagtaaattattcatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 44088624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 435 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 39045226 - 39045138
Alignment:
Q  435 ttatattattggccataaagttaaaacataatactccattacgaccaaacatacacatttgctgtataaaataaaatcacaaccatgaa 523  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39045226 ttatattattgaccataaagttaaaacataatactccattacgaccaaacatacacagttgctgtataaaataaaatcacaaccatgaa 39045138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12033112 - 12032986
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  12033112 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 12033013  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcatt 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  12033012 cttgaccgcaccaacaaattgctcatt 12032986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 264 - 432
Target Start/End: Original strand, 42701301 - 42701471
Alignment:
Q  264 ggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttt-taagtggtatttatgaactatcttgaccccac 362  Q
    ||||||||||| || ||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||| ||||   |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42701301 ggtacccatggaaggatggtggataatttaccccaaccaatacacattagtcacaagcacattttttttaagtggtattcatgaactatcttgaccccac 42701400  T
Q  363 caacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaa 432  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  42701401 taacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattattcaaaggtaatctagaaaaaa 42701471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 252 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 45258691 - 45258510
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||| |||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || ||||  ||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||    
T  45258691 ggtgataactagagtacc-atggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagttacataaacacatttttaaatggtatccatgaactat 45258593  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttc-aaagtaatcttgaaaaaac 433  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  45258592 cttgacccctccaacaaattgctcatttacattggttggtgggtaaattaccgaccattcttcaaaagtaatctaaaaaaaac 45258510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 327 - 418
Target Start/End: Original strand, 39915887 - 39915978
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39915887 tttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 39915978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 249 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 41981653 - 41981534
Alignment:
Q  249 tatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaac 348  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||    
T  41981653 tatggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 41981554  T
Q  349 tatcttgaccccaccaacaa 368  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  41981553 tatcttgaccccaccaacaa 41981534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 251 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 3904259 - 3904126
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| | || ||||| ||  ||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||    
T  3904259 tggtgataactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacaatagccacataagcacatttttaagtggta-tcatgaacta 3904161  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattg 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3904160 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattg 3904126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Original strand, 4447295 - 4447467
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| || ||           ||| |||||||||    
T  4447295 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcacat-----------attcatgaactat 4447383  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | |||||||||    
T  4447384 cttgaccccacctataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacc 4447467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 252 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 31336276 - 31336163
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| | |||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  31336276 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttgccccaaccaatacacattagccatataaacatatttttaagtggtatccatgaactat 31336177  T
Q  352 cttgaccccaccaa 365  Q
    ||||||||||||||    
T  31336176 cttgaccccaccaa 31336163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 252 - 437
Target Start/End: Original strand, 33896843 - 33897017
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||| ||| ||||||||||||| ||||| || ||           ||| |||||| ||||||| ||| ||||||    
T  33896843 ggtgacaactagggtacccatgaaaaaatggtgggtaatttactccaaccaataaacatt-----------catctttttaggtggtatctataaactat 33896931  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctta 437  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  33896932 cttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatt-ttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 33897017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 249 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 31940488 - 31940314
Alignment:
Q  249 tatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaac 348  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||           ||| ||||||    
T  31940488 tatggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttac-ccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------attcatgaac 31940401  T
Q  349 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  31940400 tatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 31940314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 251 - 418
Target Start/End: Original strand, 117328 - 117484
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||||| | || ||||| || |||||||||||| || ||           ||| ||||||||    
T  117328 tggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgaataatttacccgaaccaatacacattagccacataagcacat-----------attcatgaacta 117416  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  117417 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 117484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 338 - 438
Target Start/End: Original strand, 27243214 - 27243315
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  27243214 tattcatgaactatcttggccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 27243313  T
Q  437 at 438  Q
    ||    
T  27243314 at 27243315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 338 - 438
Target Start/End: Original strand, 27254789 - 27254890
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  27254789 tattcatgaactatcttggccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 27254888  T
Q  437 at 438  Q
    ||    
T  27254889 at 27254890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 332 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 41981535 - 41981454
Alignment:
Q  332 aagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattctt 413  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  41981535 aagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacctaccattctt 41981454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 338 - 418
Target Start/End: Original strand, 4975482 - 4975562
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4975482 tattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 4975562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 338 - 418
Target Start/End: Original strand, 40458847 - 40458927
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40458847 tattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 40458927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 252 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 3211376 - 3211229
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||  |||| || |||||||||||| || ||           ||| |||||||||    
T  3211376 ggtgacaactatggtacccatggaagaatggtgggtaatttactccaacgaatacacattagccacataagcacat-----------attcatgaactat 3211288  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccatt 410  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3211287 cttaaccccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatt 3211229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 252 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 10378480 - 10378305
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||  ||| ||||| |  |||||||||||| || |           |||| |||||||||    
T  10378480 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacatattagccacataagcaca-----------tattcatgaactat 10378392  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctta 437  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||    
T  10378391 cttgaccccacctataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 10378305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 249 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 41843427 - 41843252
Alignment:
Q  249 tatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaac 348  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||           ||| ||||||    
T  41843427 tatggtgataactaagctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------attcatgaac 41843339  T
Q  349 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | |||||||||    
T  41843338 tatctggaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacc 41843252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 338 - 410
Target Start/End: Original strand, 32373801 - 32373873
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccatt 410  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32373801 tattcatgaactatcttgaccccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatt 32373873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 338 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 38631748 - 38631668
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  38631748 tattcatgaactatcttgaccacaccaataaattgctcatattcattggttgatgggtaaattatccaccatttttcaaag 38631668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 349 - 435
Target Start/End: Original strand, 3490485 - 3490572
Alignment:
Q  349 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | ||||||||||    
T  3490485 tatcttgaccccaccaataaattgctcattataattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacct 3490572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 338 - 439
Target Start/End: Original strand, 9509475 - 9509577
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||| | ||||||||| |    
T  9509475 tattcatgaactatcttaaccccacaaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacacaccattctttaaaggtaatttagaaaaaaccat 9509574  T
Q  437 ata 439  Q
    |||    
T  9509575 ata 9509577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 249 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 9713860 - 9713688
Alignment:
Q  249 tatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaac 348  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||           ||| ||||||    
T  9713860 tatggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------attcatgaac 9713772  T
Q  349 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  9713771 tatcttgatcccacaaataaattgctcattttcattggt---tgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 9713688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 251 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 2379312 - 2379138
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||||||| || |||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||| ||||||| || ||           ||| ||||||||    
T  2379312 tggtgacaactaggctatccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacat-----------attcatgaacta 2379224  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    | |||| ||||| || |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  2379223 ttttgatcccacaaataaattgttcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 2379138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 437
Target Start/End: Original strand, 26196381 - 26196491
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatctt 425  Q
    |||||| |||||||  || |||||| ||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||     
T  26196381 tttttaggtggtatccataaactattttgaccccaccaataaattgtt-attatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatcta 26196479  T
Q  426 gaaaaaacctta 437  Q
     |||||||||||    
T  26196480 aaaaaaacctta 26196491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 326 - 435
Target Start/End: Original strand, 31148954 - 31149063
Alignment:
Q  326 atttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatct 424  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||| ||||||| |||  ||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  31148954 atttttaagtggtatc-atgaactatcttaaccccatcaataaatagctcattttcattggttagtgaataaattacccaccatttttcaaaggtaatct 31149052  T
Q  425 tgaaaaaacct 435  Q
     ||||||||||    
T  31149053 agaaaaaacct 31149063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 418
Target Start/End: Original strand, 33622571 - 33622620
Alignment:
Q  369 attgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33622571 attgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 33622620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 418
Target Start/End: Original strand, 40649906 - 40649986
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||| ||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  40649906 tattcatgaattattttgatcccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccatcattctttaaag 40649986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 164812 - 164745
Alignment:
Q  343 atgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattc 411  Q
    ||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  164812 atgaactatttagactccacca-caaattgctcatttttattggttggtggataaattacccatcattc 164745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 252 - 324
Target Start/End: Original strand, 9509400 - 9509472
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaaca 324  Q
    ||||| ||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| |  || ||||||||||||    
T  9509400 ggtgaaaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaataaaaatttgccacataaaca 9509472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 124)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 241 - 443
Target Start/End: Original strand, 31532124 - 31532327
Alignment:
Q  241 atttatattatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtat 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | || ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  31532124 atttatattatggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtat 31532223  T
Q  341 ttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaaccttata 439  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  31532224 ccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtaggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttata 31532323  T
Q  440 ttat 443  Q
    ||||    
T  31532324 ttat 31532327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 250 - 437
Target Start/End: Original strand, 26091256 - 26091444
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  26091256 atggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaact 26091355  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaacctta 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||    
T  26091356 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttccaagataatttagaaaaaacctta 26091444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 250 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 23437776 - 23437590
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  23437776 atggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaact 23437677  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  23437676 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 23437590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 252 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 47344838 - 47344653
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  47344838 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgaataatttaccccaaccaatacacattagccacataaacatatttttaagtggtatccatgaactat 47344739  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  47344738 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 47344653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 251 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 54608145 - 54607961
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  54608145 tggtgactactagggtatccatggaagaatgatggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatacatgaacta 54608046  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttc-aaagtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  54608045 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaatctagaaaaaacc 54607961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 251 - 436
Target Start/End: Original strand, 21366608 - 21366794
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||    
T  21366608 tggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 21366707  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  21366708 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaccctt 21366794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 252 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 42085389 - 42085204
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  42085389 ggtgacaactatggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 42085290  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  42085289 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacctt 42085204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 253 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 6020109 - 6019929
Alignment:
Q  253 gtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatc 352  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||     
T  6020109 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatt 6020010  T
Q  353 ttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaa 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  6020009 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 6019929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 252 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 39077727 - 39077543
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  39077727 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgttgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 39077628  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  39077627 cttaaccccaccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 39077543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 250 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 51363190 - 51363003
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||    
T  51363190 atggtgacaactagggtacc-atggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 51363092  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctta 437  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  51363091 atcttgactccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 51363003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 252 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 34276729 - 34276563
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  34276729 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 34276630  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34276629 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 34276563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 252 - 436
Target Start/End: Original strand, 2826682 - 2826866
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  2826682 ggtgacaactagggtacc-atggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 2826780  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  2826781 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagggaatctagaaaaaacctt 2826866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 252 - 440
Target Start/End: Original strand, 42765842 - 42766030
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||| | || |||||||||||||||  |||||||||    
T  42765842 ggtgacaactaaggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacattagcacatttttaagtggtatc-atgaactat 42765940  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaaccttatat 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  42765941 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccatatat 42766030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 251 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 9798648 - 9798464
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| | || ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||    
T  9798648 tggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 9798549  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  9798548 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 9798464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 253 - 440
Target Start/End: Original strand, 32366661 - 32366849
Alignment:
Q  253 gtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatc 352  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||  ||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||    
T  32366661 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccacaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 32366760  T
Q  353 ttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaaccttatat 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  32366761 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgagtaaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacctaatat 32366849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 249 - 436
Target Start/End: Original strand, 54574937 - 54575125
Alignment:
Q  249 tatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaac 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||    
T  54574937 tatggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 54575036  T
Q  349 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  54575037 tatcttgaccccaccaccaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttctaagataatctagaaaaaacctt 54575125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 243 - 439
Target Start/End: Original strand, 47662093 - 47662290
Alignment:
Q  243 ttatattatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtattt 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  47662093 ttatattaaggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatcc 47662192  T
Q  343 atgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaaccttata 439  Q
    || |||||| ||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  47662193 attaactatattgacaccactaacaaattactcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattattcaaaggtaatctagaaaaaaccttata 47662290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 250 - 434
Target Start/End: Original strand, 53854428 - 53854612
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||  ||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||    
T  53854428 atggtgacaactagggtacc-atggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 53854526  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  53854527 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 53854612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 251 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 54086591 - 54086407
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||  || |||||||||||| || ||||||||| |||||  ||||||||    
T  54086591 tggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatgcacattagccacataagcacatttttaagcggtatccatgaacta 54086492  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaagtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54086491 tcttgaccc-accaacaaattactcattttcattggttggtggataaattatccaccattcttcaaagtaatctagaaaaaacctt 54086407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 252 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 237659 - 237475
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||||||||||| |||  |||||||||    
T  237659 ggtgataactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgttatccatgaactat 237560  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  237559 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacct 237475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 252 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 31914379 - 31914196
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||| ||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  31914379 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagcc-cataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 31914281  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||    
T  31914280 cttgaccccaccaacaaattgctcagtttcattggttggtgggtaaattatccacaattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacct 31914196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 251 - 430
Target Start/End: Original strand, 31972335 - 31972515
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  31972335 tggtgacaattagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcatgaacta 31972434  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaa 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  31972435 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaa 31972515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 248 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 27373261 - 27373075
Alignment:
Q  248 ttatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaa 347  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  27373261 ttatggtgacaattagagtacc-atggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaa 27373163  T
Q  348 ctatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  27373162 ctatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacc 27373075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 251 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 41560511 - 41560344
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||    
T  41560511 tggtgacagctagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 41560412  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41560411 tcttgatcccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 41560344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 251 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 44984944 - 44984777
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||  |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||    
T  44984944 tggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 44984845  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  44984844 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaag 44984777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 251 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 42033358 - 42033172
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||   ||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  42033358 tggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatctcaaccaatatacattagctacataaacacatttttaagtggtatccatgaacta 42033259  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  42033258 tcttgactccaccaacaaattgctcattttaattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacctt 42033172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 254 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 397582 - 397401
Alignment:
Q  254 tgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatct 353  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  397582 tgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataaacacatttttaagtggtatccatgaactatct 397483  T
Q  354 tgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  397482 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 397401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 252 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 3170808 - 3170623
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||    
T  3170808 ggtgacaactagagtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatattcatgaactat 3170709  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  3170708 cttgaccccaccaacaaattgttcatttttattggttggtgggtaaattacacaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 3170623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 252 - 436
Target Start/End: Original strand, 53461816 - 53462001
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  53461816 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 53461915  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttca-aagtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||| | |||||||||||    
T  53461916 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaatttacccaccattcttcataggtaatttagaaaaaacctt 53462001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 250 - 433
Target Start/End: Original strand, 18462011 - 18462195
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| | ||||||  ||| ||||| || |||||||||||| || ||||||||||| |||  |||||||    
T  18462011 atggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtgatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaact 18462110  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaac 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18462111 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 18462195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 253 - 432
Target Start/End: Original strand, 53834055 - 53834235
Alignment:
Q  253 gtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatc 352  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||    
T  53834055 gtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttacttcaatcaatatacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 53834154  T
Q  353 ttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttc-aaagtaatcttgaaaaaa 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  53834155 ttgaccgcaccaacaaattgctcattttcattgattgttgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaatctagaaaaaa 53834235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 2243640 - 2243457
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||  |||| || | ||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||    
T  2243640 ggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttactccaactaatacacataagccacataaatacatttttaagtggtatccatgaactat 2243541  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  2243540 cttgacccgaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 2243457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 254 - 436
Target Start/End: Original strand, 41702461 - 41702644
Alignment:
Q  254 tgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatct 353  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||    
T  41702461 tgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 41702560  T
Q  354 tgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  41702561 taaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaagttacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 41702644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 251 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 41949567 - 41949381
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaa--catatttttaagtggtatttatgaac 348  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |  || |||||||||||||||  ||||||    
T  41949567 tggtgacaactagggtacctatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacatataagcacatttttaagtggtatccatgaac 41949468  T
Q  349 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  41949467 tatcttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 41949381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Original strand, 43471695 - 43471878
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  43471695 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataatcacatttttaagtggtatccatgaactat 43471794  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  43471795 cttgaccacaccaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 43471878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 248 - 435
Target Start/End: Original strand, 49881055 - 49881247
Alignment:
Q  248 ttatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactcc----aatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtattta 343  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||  ||    || ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  |    
T  49881055 ttatggtgacaactagagtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccgcccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatcca 49881154  T
Q  344 tgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  49881155 tgaactatcttgactccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 49881247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 434
Target Start/End: Original strand, 3692203 - 3692393
Alignment:
Q  245 atattatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttat 344  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| | || ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  3692203 atattaaggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatcaat 3692302  T
Q  345 gaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
     ||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  3692303 aaactatcttaatcccaccaacaaattactcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattattcaaaggtaatctagaaaaaacc 3692393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 248 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 6285493 - 6285323
Alignment:
Q  248 ttatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaa 347  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||| ||||||| || |||||||||||||||  |||||    
T  6285493 ttatggggacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 6285394  T
Q  348 ctatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6285393 ctattttgaccccaccaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 6285323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 251 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 29478543 - 29478357
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||  |||| || ||||||| |||| || |||||||||||||||  ||||||||    
T  29478543 tggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaactaatacacattagccatataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 29478444  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  29478443 tcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 29478357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 250 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 55520011 - 55519826
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||  ||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||    
T  55520011 atggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttaccacaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 55519912  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttc-aaagtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  55519911 atcttgatcccaccaaaaaattgctcattttcattagttggtggataaattatccaccattcttcaaaagtaatctagaaaaaacc 55519826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 250 - 434
Target Start/End: Original strand, 56022996 - 56023181
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||| |||| ||||| || ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||    
T  56022996 atggtgacaactagggtacccatgaaaaaatgatggataatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 56023095  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  56023096 atcttgaccccactaacaaattggtcattttcattggttggtgggtaaattacccactattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 56023181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 252 - 435
Target Start/End: Original strand, 19387688 - 19387872
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||| ||    
T  19387688 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacaat 19387787  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  19387788 cttgaccccaccaacaaatttctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccatttttcaaacgtaatctagaaaaaacct 19387872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 1932945 - 1932762
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||  | |||||||| |||||||  |||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  1932945 ggtgataactagggtacccatgaaaaaatgatggataatttatcccaaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 1932846  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1932845 cttgaccccactaacaaattggtcattttcattggttggtgggtaaattacctactattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 1932762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Original strand, 29777257 - 29777440
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||| ||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||   | ||||||    
T  29777257 ggtgacaattagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtggtatccgtaaactat 29777356  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  29777357 ctcgaccccaccaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 29777440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Original strand, 55056259 - 55056442
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||| ||||||| || |||||||||| ||||  |||||||||    
T  55056259 ggtgacaacaagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagttgtatccatgaactat 55056358  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  55056359 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 55056442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 252 - 433
Target Start/End: Original strand, 146429 - 146611
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||| |||| ||| | |||||| ||| ||||||||  ||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  146429 ggtgacaactagagtacgcatagaagaatggtgggtaatttaccacaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 146528  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaac 433  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  146529 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 146611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 250 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 407936 - 407753
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||| || |||| ||||| || |||||||||||| || ||||||||||| |||  |||||||    
T  407936 atggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtggataatt-accccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtg-tatccatgaact 407839  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  407838 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 407753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 252 - 432
Target Start/End: Original strand, 22618514 - 22618693
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| | || ||||| |  |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  22618514 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttac-ctaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 22618612  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaa 432  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  22618613 cttgaccc-accaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 22618693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 261 - 418
Target Start/End: Original strand, 33897504 - 33897661
Alignment:
Q  261 tagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttgacccc 360  Q
    ||||||||| || | |||||| ||| ||||||| |||||| |||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  33897504 tagggtacctatagaagaatggtgggtaatttattccaattaatacacattagccatataatcatatttttaagtggtatccatgaactatcttgacccc 33897603  T
Q  361 accaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33897604 accaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 33897661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 250 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 48313739 - 48313556
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | || |||||||  ||||| |||||| |||||||| |||||||||  |||||||    
T  48313739 atggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccctaaccaatatatattagctacataagcatatttt-aagtggtatccatgaact 48313641  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  48313640 atcttgaccc-accaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 48313556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 252 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 50234182 - 50233997
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| || |||||||||||||||  || ||||||    
T  50234182 ggtgacaactagggtatccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccattaactat 50234083  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  50234082 cttgatcccaccaacaaatttctcattttcattggttggtggataaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 50233997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 252 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 45797661 - 45797477
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| | | |||||||  |||| ||||| || ||||||||||||  | |||||||||||||||  |||||||||    
T  45797661 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtaggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatccatgaactat 45797562  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  45797561 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctaaaaaaaacct 45797477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 252 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 55776226 - 55776043
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||||||||  |||  |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  55776226 ggtgacaactagggtacttatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 55776127  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaacct 435  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  55776126 cttgaccc-accaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctaaaaaaaacct 55776043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 252 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 55840404 - 55840221
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||||||||  |||  |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  55840404 ggtgacaactagggtacttatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 55840305  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaacct 435  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  55840304 cttgaccc-accaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctaaaaaaaacct 55840221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 278 - 432
Target Start/End: Original strand, 22468796 - 22468951
Alignment:
Q  278 aatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcat 377  Q
    |||| ||| ||||||||  ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22468796 aatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataaacatatttttaagtggtatctatgaactatcttgatcccaccaacaaattgctcat 22468895  T
Q  378 tttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaa 432  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  22468896 tttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 22468951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 251 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 42222474 - 42222292
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||| ||  ||||||||  ||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||    
T  42222474 tggtgacaactagggtacccataaaagaatggtgtgtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatcaatgaacta 42222375  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaa 432  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  42222374 tcttgaccccaccaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 42222292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 256 - 437
Target Start/End: Original strand, 50536628 - 50536810
Alignment:
Q  256 acaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttg 355  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||| ||||  |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  50536628 acaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccaactaatacacattagtcacataaacatatttttaagtggtatccattaactatcttg 50536727  T
Q  356 accccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctta 437  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  50536728 accccaccaacaaatttctcattttcatcggttggtgggtaaattacccactattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacctta 50536810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 254 - 434
Target Start/End: Original strand, 50457812 - 50457993
Alignment:
Q  254 tgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatct 353  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||  ||| ||||| || ||||| |||||| || |||||||||||||||  |||||||||||    
T  50457812 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgtataatttacctcaaccaatacacattagcaacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 50457911  T
Q  354 tgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  50457912 tgatcccaccaacaaattgctcattttcattgattggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 50457993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 251 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 23609270 - 23609086
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||  ||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||   |||||||    
T  23609270 tggtgacaaatagggtacccatggaagaatggtgagtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccgtgaacta 23609171  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  23609170 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcgttgattggtgggtaaattacccactattcttcaaagataatctagaaaaaacc 23609086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Original strand, 31070074 - 31070256
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||  ||| ||||| || |||| ||||| | || |||||||||||||||  |||||||||    
T  31070074 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagtcacatgagcacatttttaagtggtatc-atgaactat 31070172  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  31070173 cttgactccaccagcaaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 31070256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 252 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 54425163 - 54425001
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||  ||| |||||||| |||| ||||| || |||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  54425163 ggtgacaactagtgtacc-atggaagaatcgtgggtaatttaccccaaccaatagacattagtcacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 54425065  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttca 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  54425064 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggtcggtgggtaaattacccaccattcttca 54425001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 38591846 - 38591667
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||  ||| ||||| || |||||||||||| || |||    | ||||||  |||||||||    
T  38591846 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatt----aatggtatccatgaactat 38591751  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  38591750 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgagtaaattacccaccattcttcaaatgtaatctagaaaaaacc 38591667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 256 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 50534809 - 50534647
Alignment:
Q  256 acaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttg 355  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  50534809 acaactaaggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttg 50534710  T
Q  356 accccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  50534709 accccaccaataaattgctcatttttattgattggtgggtaagttacccaccattcttcaaag 50534647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 252 - 435
Target Start/End: Original strand, 14017376 - 14017558
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||   | ||||||||  ||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  |||||||||  |||||||||    
T  14017376 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggcaggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataaacacactt--aagtggtatccatgaactat 14017473  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  14017474 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcgttggttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 14017558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 250 - 437
Target Start/End: Original strand, 41632005 - 41632192
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| |  ||||||| ||||  | ||||||||| | |||  |||||||    
T  41632005 atggtgacaactaggatacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacatattagccatataagtacatttttaagcgatatccatgaact 41632104  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctta 437  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  41632105 atcttgaccc-accaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 41632192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 252 - 436
Target Start/End: Original strand, 54805614 - 54805803
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaa----catatttttaagtggtatttatgaa 347  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||  |||||||  |||| ||||| || |||||||||||||    || ||||||||||||||| ||||||    
T  54805614 ggtgacatctagggtacccatggaacaatgatgagtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaataaacacatttttaagtggtatctatgaa 54805713  T
Q  348 ctatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  54805714 ctatcttaatcccaccaacaaattgttcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 54805803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 251 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 35446688 - 35446506
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || ||||||| |||| || ||||||||||| |||  ||||||||    
T  35446688 tggtaacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccaaataagcacatttttaagtgatatccatgaacta 35446589  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaac 433  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  35446588 tcttgaccccatcaacaaattgctcattttcattggtcggt-ggtaaattacccaccattcttaaaaggtaatctagaaaaaac 35446506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 252 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 48658000 - 48657858
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||| ||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  48658000 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 48657901  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtggg 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  48657900 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattagttggtggg 48657858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 252 - 432
Target Start/End: Original strand, 48259512 - 48259691
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||| || ||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| | |||||||| |  |||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||    
T  48259512 ggtgataagtagggtacc-atggaagaatggtgggtaatttaccctaatcaatacatattagccacataagcacatttt-aagtggtattcatgaactat 48259609  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaa-agtaatcttgaaaaaa 432  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  48259610 cttgactccaccaactaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaagggtaatctagaaaaaa 48259691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 269 - 434
Target Start/End: Original strand, 39587796 - 39587962
Alignment:
Q  269 ccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaa 368  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||| | || |||||||| ||||  | |||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  39587796 ccatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatatacattagttatataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaa 39587895  T
Q  369 attgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  39587896 attgctcatattcattggttggtaggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 39587962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 252 - 394
Target Start/End: Original strand, 52728307 - 52728448
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||  ||| |||||  | |||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  52728307 ggtgacaactagggtacc-atggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacgcattagtcacataagcacatttttaagtggtattcatgaactat 52728405  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtggg 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52728406 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggg 52728448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 252 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 48655002 - 48654830
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgt------tagccacataaacatatttttaagtggtatttatg 345  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||| | | |||||||| |||| ||||| || |      |||||||||||  | ||||||||||||||| |||     
T  48655002 ggtgacaattagggtagccatggaagaatggtaggtaatttaccccaaccaatacacatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatctatc 48654903  T
Q  346 aactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48654902 aactatcttgactccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccatttttcaaag 48654830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Original strand, 36532830 - 36532956
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||   || ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  36532830 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttaccataaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 36532929  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcatt 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  36532930 cttgaccccaccaacaaattgctcatt 36532956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 252 - 418
Target Start/End: Original strand, 45633779 - 45633934
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||           ||| |||||||||    
T  45633779 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------attcatgaactat 45633867  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45633868 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 45633934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 335 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 34835276 - 34835174
Alignment:
Q  335 tggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaac 433  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  34835276 tggtattcataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaac 34835177  T
Q  434 ctt 436  Q
    |||    
T  34835176 ctt 34835174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 326 - 434
Target Start/End: Original strand, 27398666 - 27398775
Alignment:
Q  326 atttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttc-aaagtaatct 424  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  27398666 atttttaagtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgcgcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaagtaatct 27398765  T
Q  425 tgaaaaaacc 434  Q
     |||||||||    
T  27398766 agaaaaaacc 27398775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 251 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 22620765 - 22620590
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    ||||| |||||||| |||||||   |||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| || ||           ||| ||||||||    
T  22620765 tggtggcaactaggctacccataaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcacat-----------attcatgaacta 22620677  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  22620676 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccatcattcttcaaagataatttagaaaaaacctt 22620590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 252 - 437
Target Start/End: Original strand, 37239090 - 37239265
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||| |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||           ||| |||||||||    
T  37239090 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------attcatgaactat 37239178  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctta 437  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  37239179 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 37239265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 346 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 43231590 - 43231502
Alignment:
Q  346 aactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaagtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43231590 aactatcttgaccccaccaataaattgctcatttttattggttgatggataaattacccaccattcttcaaagtaatctagaaaaaacc 43231502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 254 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 51951861 - 51951678
Alignment:
Q  254 tgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatct 353  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||| ||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||| || |||||||| || |||  |||||||||||    
T  51951861 tgacaattagggtatccatggaagaatggtgggtaatttacac-aaccaatatacattagccacataagcacatttttaactgatatccatgaactatct 51951763  T
Q  354 tgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttc-aaagtaatcttgaaaaaacctta 437  Q
    |||| |||  ||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||  || |||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  51951762 tgactccattaacaaattgttcattttcattgattggtggataaattactcatcattcttcaaaagtaatctagaaaaaatctta 51951678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 338 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 54216409 - 54216309
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  54216409 tattcatgaactatcttgatcccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 54216310  T
Q  437 a 437  Q
    |    
T  54216309 a 54216309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 250 - 434
Target Start/End: Original strand, 9997929 - 9998103
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||           ||| |||||||    
T  9997929 atggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------attcatgaact 9998017  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | |||||||||    
T  9998018 atcttgatcccaccaataaattactcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacc 9998103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 327 - 432
Target Start/End: Original strand, 14335165 - 14335271
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatctt 425  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||     
T  14335165 tttttaggtggtatctatgaactatcttgaccctaccaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacctaccatttttcaaaggtaatcta 14335264  T
Q  426 gaaaaaa 432  Q
    |||||||    
T  14335265 gaaaaaa 14335271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 327 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27580226 - 27580120
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatctt 425  Q
    |||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||     
T  27580226 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatcta 27580127  T
Q  426 gaaaaaa 432  Q
    |||||||    
T  27580126 gaaaaaa 27580120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 251 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 34552491 - 34552318
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||| ||||| || ||           ||| ||||||||    
T  34552491 tggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttactccaaccaatacacattagccgcataagcacat-----------attcatgaacta 34552403  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||| |||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  34552402 tcttgacaccataaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 34552318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 327 - 434
Target Start/End: Original strand, 1662323 - 1662431
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatctt 425  Q
    |||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||     
T  1662323 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtaggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatcta 1662422  T
Q  426 gaaaaaacc 434  Q
    |||||||||    
T  1662423 gaaaaaacc 1662431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 338 - 418
Target Start/End: Original strand, 5117513 - 5117593
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5117513 tattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 5117593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 327 - 434
Target Start/End: Original strand, 38547665 - 38547773
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatctt 425  Q
    |||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||     
T  38547665 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatcta 38547764  T
Q  426 gaaaaaacc 434  Q
     ||||||||    
T  38547765 aaaaaaacc 38547773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 327 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 46720132 - 46720024
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatctt 425  Q
    |||||| |||||||  || |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||     
T  46720132 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccccatcaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaagttaatcta 46720033  T
Q  426 gaaaaaacc 434  Q
    |||||||||    
T  46720032 gaaaaaacc 46720024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 350 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 42557666 - 42557583
Alignment:
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaa 432  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  42557666 atcttgaccccaccaacaaattactcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 42557583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 251 - 434
Target Start/End: Original strand, 15060288 - 15060461
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||  |||| ||||| || || ||||||||| || ||           ||| ||||||||    
T  15060288 tggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattggccacataagcacat-----------attcatgaacta 15060376  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  15060377 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 15060461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 338 - 415
Target Start/End: Original strand, 31881389 - 31881466
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttca 415  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31881389 tattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttca 31881466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 251 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 49014270 - 49014114
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||  ||||||||  ||||||||| || ||||||||||||  | ||           ||| ||||||||    
T  49014270 tggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttacctcaatcaatacacattagccacataagtacat-----------attcatgaacta 49014182  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49014181 tcttgaccccacaaataaattactcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 49014114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 338 - 437
Target Start/End: Original strand, 3293098 - 3293198
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | |||||||||||    
T  3293098 tattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 3293197  T
Q  437 a 437  Q
    |    
T  3293198 a 3293198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 338 - 437
Target Start/End: Original strand, 11972204 - 11972304
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  11972204 tattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgagtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 11972303  T
Q  437 a 437  Q
    |    
T  11972304 a 11972304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 251 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 42509479 - 42509351
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||  | || ||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  42509479 tggtgataactagggtactcatggaagaatggtggataatttatcctaaccaatacacattagtcacataaacacatttttaagtggtatccatgaacta 42509380  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattt 379  Q
    | ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  42509379 ttttgaccccaccaataaattggtcattt 42509351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 338 - 418
Target Start/End: Original strand, 46708816 - 46708896
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46708816 tattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaag 46708896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 338 - 440
Target Start/End: Original strand, 54216811 - 54216914
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | ||||||||||     
T  54216811 tattcatgaactatcttgaccccaccaataaattgttcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaaccta 54216910  T
Q  437 atat 440  Q
    ||||    
T  54216911 atat 54216914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 338 - 434
Target Start/End: Original strand, 4486656 - 4486753
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| | |||||||||    
T  4486656 tattcatgaattatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccgttcttcaaagataatttagaaaaaacc 4486753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 52688520 - 52688348
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||| |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| |||||           ||| |||||||||    
T  52688520 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatat-----------attcatgaactat 52688432  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttc-aaagtaatcttgaaaaaacc 434  Q
     |||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| | |||||||||    
T  52688431 tttgatcccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttctaaggtaatttagaaaaaacc 52688348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 338 - 418
Target Start/End: Original strand, 20351917 - 20351997
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20351917 tattcatgaactatcttgatcccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 20351997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 338 - 418
Target Start/End: Original strand, 33558017 - 33558097
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33558017 tattcatgaactatcttgaccctacaaataaattcctcattttcattggttggtggataaattatccaccattcttcaaag 33558097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 249 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 35595872 - 35595772
Alignment:
Q  249 tatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaac 348  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||    
T  35595872 tatggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 35595773  T
Q  349 t 349  Q
    |    
T  35595772 t 35595772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 252 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 43891099 - 43890944
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||           ||| |||||||||    
T  43891099 ggtgacaactatggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------attcatgaactat 43891011  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
     ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  43891010 attgactccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaag 43890944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 295 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 52396866 - 52396774
Alignment:
Q  295 tccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatc-ttgaccccaccaacaaattgctcattttgattgg 386  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52396866 tccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactatctttaaccccaccaacaaattgctcattttcattgg 52396774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 252 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 54715206 - 54715051
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||  |||  |||| || |||||||||||| || |           |||| |||||||||    
T  54715206 ggtgataactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaactaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactat 54715118  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  54715117 gttgaccccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaag 54715051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 33289875 - 33289702
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    |||||||||| |||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| ||            ||||| |||||||    
T  33289875 atggtgacaa-taggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcac-----------gtattcatgaact 33289788  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||| || || || |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  33289787 atcttgatcctacaaataaattgctcattttcattagttggtggataaattatccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 33289702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 349 - 433
Target Start/End: Original strand, 6371335 - 6371420
Alignment:
Q  349 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaac 433  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  6371335 tatcttgaccccaccaataaattgctcattataattggttggtgggtaaattacccactatttttcaaaggtaatctagaaaaaac 6371420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 52461534 - 52461386
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||| |||||||| || |||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |           |||| |||||||||    
T  52461534 ggtggcaactaggctatccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactat 52461446  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattc 411  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  52461445 cttgaccccacaaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacacaccattc 52461386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 327 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 573910 - 573802
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatctt 425  Q
    |||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||| |||||||     
T  573910 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgttcattatgattggttggtaggtaaattacccaccattttttaaaggtaatcta 573811  T
Q  426 gaaaaaacc 434  Q
    |||| ||||    
T  573810 gaaacaacc 573802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 27872686 - 27872607
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccac 406  Q
    |||||| |||||||  || ||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27872686 tttttaggtggtatccataaactatcttgatcccactaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattatccac 27872607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 338 - 434
Target Start/End: Original strand, 27873623 - 27873720
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  27873623 tattcatgaactatcttaaccccacaaataaattactcattttcattgattggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 27873720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 432
Target Start/End: Original strand, 49057933 - 49058038
Alignment:
Q  328 ttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttg 426  Q
    |||||| |||||| |||||||||| || ||| || ||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||| |    
T  49057933 ttttaaatggtatctatgaactattttaacctcatcaataaattattcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattctttaaaggtaatctag 49058032  T
Q  427 aaaaaa 432  Q
    ||||||    
T  49058033 aaaaaa 49058038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 33049062 - 33048994
Alignment:
Q  253 gtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataa 321  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||    
T  33049062 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataa 33048994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 47812077 - 47811922
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||| ||||||| |||| | |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |           |||| |||||||||    
T  47812077 ggtgacaattagggtatccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactat 47811989  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||||| | | ||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  47811988 cttgactcaatcaataaattgctcatattcattggttgatgggtaaattacccaccatttttcaaag 47811922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 383 - 435
Target Start/End: Original strand, 17555617 - 17555670
Alignment:
Q  383 ttggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  17555617 ttggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 17555670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 35344968 - 35344868
Alignment:
Q  253 gtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatc 352  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||| ||| |||||||| | || ||||| || |||||||||||| || ||||| |||||||||  ||||||||||    
T  35344968 gtgacaactaggatacctatggaagaatggtggataatttac-caaaccaatacacattagccacataagcacattttcaagtggtatccatgaactatc 35344870  T
Q  353 tt 354  Q
    ||    
T  35344869 tt 35344868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 42558367 - 42558270
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||| ||| |||||||| | |||||||| || ||||||||        ||||||||||||||| ||||||||||    
T  42558367 ggtgacaactaagatacccatggaagaatggtggataatttaccctaatcaatacacattagccac--------atttttaagtggtatctatgaactat 42558276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 338 - 397
Target Start/End: Original strand, 51981554 - 51981613
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaa 397  Q
    |||| |||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51981554 tattcatgaactatcttaatcccacaaataaattgctcatttttattggttggtgggtaa 51981613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 252 - 321
Target Start/End: Original strand, 48259704 - 48259772
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataa 321  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||||| |  ||||||||||||    
T  48259704 ggtgacaactagggtacc-atggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacatattagccacataa 48259772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 349 - 417
Target Start/End: Original strand, 18206608 - 18206676
Alignment:
Q  349 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa 417  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||   ||||||||| ||||| |||||||||    
T  18206608 tatcttgaccccaccaataaattgttcattttcattgattgagaggtaaattacccaccgttcttcaaa 18206676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 321
Target Start/End: Original strand, 20351842 - 20351911
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataa 321  Q
    ||||||||||||  ||||||||  |||||||||| |||||||  |||| ||||| || ||||||||||||    
T  20351842 ggtgacaactagactacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataa 20351911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 34835348 - 34835295
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaata 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| |||| |||||    
T  34835348 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaata 34835295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 252 - 304
Target Start/End: Original strand, 1662261 - 1662313
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaat 304  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  1662261 ggtgacaactagggtacctatggaagaatgatgagtaatttaccccaaccaat 1662313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 98)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 248 - 436
Target Start/End: Original strand, 22979643 - 22979832
Alignment:
Q  248 ttatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaa 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  22979643 ttatggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaa 22979742  T
Q  348 ctatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22979743 ctatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 22979832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 250 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 27018301 - 27018115
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||    
T  27018301 atggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 27018202  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  27018201 atcttgaccacaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 27018115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 252 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 35356071 - 35355887
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  35356071 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 35355972  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  35355971 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacct 35355887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 250 - 432
Target Start/End: Original strand, 23393049 - 23393232
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  23393049 atggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaact 23393148  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaa 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  23393149 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccactattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 23393232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 250 - 436
Target Start/End: Original strand, 33695819 - 33696006
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||    
T  33695819 atggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 33695918  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  33695919 atcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 33696006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 251 - 436
Target Start/End: Original strand, 25893916 - 25894102
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||    
T  25893916 tggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 25894015  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  25894016 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 25894102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 252 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 17855611 - 17855427
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||| || |||||||||| ||||  |||||||||    
T  17855611 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtagtatccatgaactat 17855512  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  17855511 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacct 17855427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 252 - 435
Target Start/End: Original strand, 33839715 - 33839899
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  33839715 ggtgacaactaaggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 33839814  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  33839815 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 33839899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 253 - 435
Target Start/End: Original strand, 33423276 - 33423459
Alignment:
Q  253 gtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatc 352  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||    
T  33423276 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 33423375  T
Q  353 ttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  33423376 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 33423459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 40670746 - 40670563
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  40670746 ggtgacaactaaggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 40670647  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  40670646 cttgaccccaccaataaattgctcattttcattggttggttggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 40670563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 250 - 436
Target Start/End: Original strand, 47740329 - 47740516
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||    
T  47740329 atggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatattcatgaact 47740428  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  47740429 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 47740516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 252 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 33332971 - 33332786
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||  ||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  33332971 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttacctcaatcaatacacattagccgcataagcatatttttaagtggtatc-atgaactat 33332873  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctta 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  33332872 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 33332786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 252 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 36389539 - 36389377
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  36389539 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 36389440  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttc 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36389439 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttc 36389377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 243 - 443
Target Start/End: Original strand, 48609668 - 48609869
Alignment:
Q  243 ttatattatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtattt 342  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||      
T  48609668 ttattttatggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgtataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatac 48609767  T
Q  343 atgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaaccttatatt 441  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||    
T  48609768 atgaattatcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttatttt 48609867  T
Q  442 at 443  Q
    ||    
T  48609868 at 48609869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 252 - 432
Target Start/End: Original strand, 49171362 - 49171543
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||| | || ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  49171362 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 49171461  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaa 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  49171462 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 49171543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 252 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 46913294 - 46913107
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataa--acatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||  ||| |||||||||||||||  |||||||    
T  46913294 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacacatttttaagtggtatccatgaact 46913195  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  46913194 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtaggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 46913107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 250 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 33411445 - 33411259
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||| ||| |||||||  |||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  33411445 atggtgacaactagggtacttatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaact 33411346  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  33411345 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatcaagaaaaaacct 33411259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 252 - 418
Target Start/End: Original strand, 45690097 - 45690263
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  45690097 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 45690196  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  45690197 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaag 45690263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 241 - 440
Target Start/End: Original strand, 2341650 - 2341851
Alignment:
Q  241 atttatattatggtgacaactagggtaccc-atgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggta 339  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||| ||||||| || |||||||||| |||    
T  2341650 atttatataaaggtgacaactagggtaccccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagttgta 2341749  T
Q  340 tttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaaccttat 438  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  2341750 tccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaaccttat 2341849  T
Q  439 at 440  Q
    ||    
T  2341850 at 2341851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Original strand, 26579717 - 26579900
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  26579717 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatacatgaactat 26579816  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  26579817 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattgatttgtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 26579900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Original strand, 47066977 - 47067160
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  47066977 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 47067076  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  47067077 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacc 47067160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 252 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 45482841 - 45482657
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||  ||| ||||| || | || ||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  45482841 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacatcagtcacataagcatatttttaagtgatatccatgaactat 45482742  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  45482741 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 45482657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 251 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 10028674 - 10028488
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggta--cccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaac 348  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||| |||||||| | || ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||    
T  10028674 tggtgacaactagggtatacccatggaagaatagtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccataaac 10028575  T
Q  349 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  10028574 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 10028488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 31587031 - 31586848
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||| |||||||||||  |||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  31587031 ggtgagaactagggtacttatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 31586932  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  31586931 cttgaccccaccaataaattgctcattttcattggttagtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 31586848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 252 - 415
Target Start/End: Original strand, 35328069 - 35328232
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  35328069 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 35328168  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttca 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  35328169 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaatttacccaccattcttca 35328232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 251 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 19563631 - 19563445
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||   || ||||| || |||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||    
T  19563631 tggtgacaattagagtacccatggaagaatggtgggtaatttaccttaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatattcatgaacta 19563532  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  19563531 tcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtggataaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 19563445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 251 - 432
Target Start/End: Original strand, 20165813 - 20165995
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||  ||| | ||| || ||||||||||||  | |||||||||||||||  ||||||||    
T  20165813 tggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgagtaatttacctcaacctatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatccatgaacta 20165912  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaa 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  20165913 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 20165995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 249 - 434
Target Start/End: Original strand, 31429472 - 31429658
Alignment:
Q  249 tatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaac 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||| ||| ||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||  ||| ||    
T  31429472 tatggtgacaactagggtacccatgaaagaatgatgagtaatttacttcaaccaatacacattagtcacataaacacatttttaagtggtatccatgtac 31429571  T
Q  349 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  31429572 tatcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaatcacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacc 31429658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 252 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 31625886 - 31625706
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  31625886 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgg-taatttactccaaccaatatacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 31625788  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttc-aaagtaatcttgaaaaaa 432  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  31625787 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcgaaggtaatctagaaaaaa 31625706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Original strand, 35757020 - 35757203
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactcc-aatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||| || || ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||    
T  35757020 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgagtaatttacccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatc-atgaacta 35757118  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  35757119 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcgttggttggtggataaattatccaccattcttcaaagttaatctagaaaaaacc 35757203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 247 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 5712356 - 5712166
Alignment:
Q  247 attatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatga 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  || |    
T  5712356 attatggtgacaactagggtacccatgaaaaaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccataa 5712257  T
Q  347 actatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  5712256 actatcttgaccccactaataaattggtcattttcattggttggtgggtaaattacccactattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 5712166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 252 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 29447020 - 29446863
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  29447020 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatt-actccaaccaatacacattagtcacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 29446922  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccatt 410  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29446921 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatt 29446863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 250 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 43499670 - 43499484
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||| ||||  ||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||    
T  43499670 atggtgagaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaactaatatacattggccacataagtatatttttaagtggtatccatgaact 43499571  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||  |||||||||    
T  43499570 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattctttaaaggtaatctaaaaaaaacct 43499484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 253 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 33870424 - 33870244
Alignment:
Q  253 gtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatc 352  Q
    ||||||||||| ||||||||   |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  33870424 gtgacaactagagtacccat---agaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatggtattcatgaactatc 33870328  T
Q  353 ttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||    
T  33870327 ttgaccccaccaacaaattgctcatttacattggttggtgggtaaattatccaccattctttaaaggtgatctagaaaaaacct 33870244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Original strand, 37846016 - 37846199
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||  |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  || || |||    
T  37846016 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccataaattat 37846115  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  37846116 cttgatcccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacc 37846199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 252 - 418
Target Start/End: Original strand, 5183825 - 5183991
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||  ||| ||||| || |||||||||||| || ||||||||||| |||  |||||||||    
T  5183825 ggtgataactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgttatccatgaactat 5183924  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5183925 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaag 5183991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 264 - 418
Target Start/End: Original strand, 41990870 - 41991024
Alignment:
Q  264 ggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccacc 363  Q
    ||||||||||| |||||| ||  |||||||  | || ||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41990870 ggtacccatggaagaatggtgagtaatttatccaaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactatcttgaccccacc 41990969  T
Q  364 aacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41990970 aacaaattgctcattttcattggttggtgtgtaaattatccaccattcttcaaag 41991024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 10618474 - 10618298
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||  |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10618474 ggtgataactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaacatatttttaagtggtattcatgaactat 10618375  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
           |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  10618374 -------ccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaatgtaatctagaaaaaacc 10618298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 261 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 15877724 - 15877553
Alignment:
Q  261 tagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttgacccc 360  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||||||  |||| ||||| |  |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15877724 tagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgacccc 15877625  T
Q  361 accaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaa 431  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15877624 accaacaaattgctcattttcatttgttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaa 15877553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 251 - 439
Target Start/End: Original strand, 45063356 - 45063543
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  |||||| ||| ||||||||  |||   ||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||    
T  45063356 tggtgacaactagagtaccaatgaaagaatggtggataatttacctcaac--atacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 45063453  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaaccttata 439  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  45063454 tcttgactccatcaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttata 45063543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 273 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 44564500 - 44564356
Alignment:
Q  273 gggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattg 372  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  44564500 gggagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcatatttttaagtggtatctatgaactatcttgacaccactaataaattg 44564401  T
Q  373 ctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa 417  Q
    || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44564400 cttatttttattgattggtgggtaaattatccaccattcttcaaa 44564356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 252 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 35767657 - 35767519
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  35767657 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccatataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 35767558  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttgg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  35767557 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattgg 35767519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 287 - 435
Target Start/End: Original strand, 33720071 - 33720220
Alignment:
Q  287 taatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattgg 386  Q
    |||||||| | || ||||| || ||||||||||||  | |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  33720071 taatttaccctaaccaatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatccatgaactatcttgactccatcaacaaattgctcatttttattgg 33720170  T
Q  387 ttggtgggtaaattatccaccattcttc-aaagtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  33720171 ttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaatctagaaaaaacct 33720220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 252 - 380
Target Start/End: Original strand, 30076527 - 30076655
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||  |||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  30076527 ggtgacaactagggtatccatggaagaatgatgggtaatttacgccaactaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 30076626  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcatttt 380  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30076627 cttgaccccaccaacaaattgatcatttt 30076655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Original strand, 35752034 - 35752206
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||           ||| |||||||||    
T  35752034 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------attcatgaactat 35752122  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  35752123 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 35752206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 252 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 37128109 - 37127954
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| || ||           |||||||||||||    
T  37128109 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaaccaatacacattagctacataagcacat-----------atttatgaactat 37128021  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37128020 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 37127954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 251 - 389
Target Start/End: Original strand, 28233935 - 28234073
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| | ||| || ||||| |||| ||||| || |||| ||||||| || |||||||||||||||  ||||||||    
T  28233935 tggtgacaactagggtacccatgaaagaaaggtgggtagtttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 28234034  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttg 389  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  28234035 tcttaaccccaccaacaaattgctcattttcattagttg 28234073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 248 - 435
Target Start/End: Original strand, 36816841 - 36817018
Alignment:
Q  248 ttatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaa 347  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| || ||           ||| |||||    
T  36816841 ttatggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaaccaatacatattagccacataagcacat-----------attcatgaa 36816929  T
Q  348 ctatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  36816930 ctatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 36817018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 252 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 24228713 - 24228540
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||| |||| ||||||||  |||||||||| |||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||           ||| |||||||||    
T  24228713 ggtgacaattaggctacccatgaaagaatgatggataatttacccaaaccaatacacattagccacataagcatat-----------attcatgaactat 24228625  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  24228624 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggttggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 24228540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 251 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 43489391 - 43489218
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||||||  ||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||           ||| ||||||||    
T  43489391 tggtgacaactagactacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------attcatgaacta 43489303  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | |||||||||    
T  43489302 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattattcaaaggtaatttagaaaaaacc 43489218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 327 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 7257489 - 7257380
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttc-aaagtaatctt 425  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| || |||||||     
T  7257489 tttttaggtggtattcataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccatcatttttcgaaggtaatcta 7257390  T
Q  426 gaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||    
T  7257389 gaaaaaacct 7257380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 338 - 418
Target Start/End: Original strand, 26941607 - 26941687
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26941607 tattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 26941687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 342 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 29098844 - 29098752
Alignment:
Q  342 tatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaac 433  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  29098844 tatgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaatgtaatttagaaaaaac 29098752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 338 - 436
Target Start/End: Original strand, 46817496 - 46817595
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  46817496 tattcatgaactatcttgaccccacaaataaattactcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 46817595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 327 - 436
Target Start/End: Original strand, 15644010 - 15644120
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatctt 425  Q
    |||||| |||||||  || |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||     
T  15644010 tttttaggtggtatccataaactattttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccattttttaaagataatcta 15644109  T
Q  426 gaaaaaacctt 436  Q
    |||||||||||    
T  15644110 gaaaaaacctt 15644120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 338 - 434
Target Start/End: Original strand, 24923099 - 24923196
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  24923099 tattcatgaattatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 24923196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 29610807 - 29610635
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||| |||||| | ||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||           ||| |||||||||    
T  29610807 ggtggcaactatgctacccatgaaagaatgatgagtaatttactccaatcaatacacattagccacataagcacat-----------attcatgaactat 29610719  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||| ||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  29610718 cttaaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 29610635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 338 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 33455193 - 33455116
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttca 415  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33455193 tattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgttcatttttattggttggtgggtaaattatccaccattcttca 33455116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 338 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 39323713 - 39323616
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  39323713 tattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgttcattttaattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 39323616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 346 - 434
Target Start/End: Original strand, 39453558 - 39453647
Alignment:
Q  346 aactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttc-aaagtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  39453558 aactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaatttagaaaaaacc 39453647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 48086030 - 48085858
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||| || |||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |           |||| |||||||||    
T  48086030 ggtgataattaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactat 48085942  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  48085941 cttgatcccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 48085858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 253 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 33393499 - 33393328
Alignment:
Q  253 gtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatc 352  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||  || ||| ||           |||||| |||||||  || |||||||    
T  33393499 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatgaacattaacc-----------tttttaggtggtatccataaactatc 33393411  T
Q  353 ttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  33393410 ttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccactattttttaaaggtaatctagaaaaaacc 33393328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 326 - 418
Target Start/End: Original strand, 38448511 - 38448603
Alignment:
Q  326 atttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  38448511 atttttaggtgatattcataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattgattggtgggtaaattatccacaatttttcaaag 38448603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 338 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 41855156 - 41855076
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41855156 tatttatgaactatcttgactccaccaataaattgctcacattcattggttggtgggtaaattatccaccatttttcaaag 41855076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 327 - 438
Target Start/End: Original strand, 44003434 - 44003546
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatctt 425  Q
    |||||| |||||||  || |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |     
T  44003434 tttttaggtggtatccataaactatcttgactccaccaataaattgctcattatgattagttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaattta 44003533  T
Q  426 gaaaaaaccttat 438  Q
    |||||||||||||    
T  44003534 gaaaaaaccttat 44003546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 338 - 436
Target Start/End: Original strand, 25037583 - 25037682
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  25037583 tattcatgaactatcttgaccccaccaataaattgatcattttaattgattggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 25037682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 252 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 44405531 - 44405412
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||| | | ||||||||  ||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  44405531 ggtgacaactagaatacccatggaagaatggtaggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 44405432  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaatt 371  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  44405431 cttgaccctaccaataaatt 44405412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Original strand, 47460836 - 47460919
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccatt 410  Q
    |||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47460836 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattataattggttggtgggtaaattatccaccatt 47460919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 338 - 435
Target Start/End: Original strand, 32556681 - 32556779
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  32556681 tattcatgaactatcttgtccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 32556779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 44660015 - 44659843
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||| |||||||| |||||||   |||||||||| ||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||           ||| |||||||||    
T  44660015 ggtggcaactaggctacccataaaagaatgatggataatttactccaaccgatacacattagccacataagcatat-----------attcatgaactat 44659927  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  44659926 cttgaccccataaataaattgctcattttcattggttggtggataaatta-ccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 44659843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 435
Target Start/End: Original strand, 46898016 - 46898189
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||           ||| |||||||||    
T  46898016 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------attcatgaactat 46898104  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||| | ||||||||||    
T  46898105 tttgaccccatcaataaattgctcatatttattggttggtggataaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacct 46898189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 247 - 418
Target Start/End: Original strand, 7876323 - 7876483
Alignment:
Q  247 attatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatga 346  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||  | ||           ||| ||||    
T  7876323 attaaggtgacaactaggctaccaatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagtacat-----------attcatga 7876411  T
Q  347 actatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  7876412 actatcttgatcccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaag 7876483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 327 - 435
Target Start/End: Original strand, 16482847 - 16482956
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatctt 425  Q
    |||||| |||||||  || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||     
T  16482847 tttttaggtggtatccataaaccatcttgaccccaccaataaattgctcattatcattgattggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatcta 16482946  T
Q  426 gaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||    
T  16482947 gaaaaaacct 16482956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 338 - 434
Target Start/End: Original strand, 47906834 - 47906931
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  47906834 tattcatgaactatcttgatcccacaaataaattgctcattttcattggttggtaggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 47906931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 338 - 418
Target Start/End: Original strand, 498263 - 498343
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  498263 tattcatgaactatcttgaccccacaaataaattactcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 498343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 338 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 39866762 - 39866682
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  39866762 tattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgagtaaattacccaccattcttcaaag 39866682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 252 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 41904388 - 41904272
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||| |||  |||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||| ||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  41904388 ggtgacaactaggatacttatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 41904289  T
Q  352 cttgaccccaccaacaa 368  Q
    ||||||| |||||||||    
T  41904288 cttgacctcaccaacaa 41904272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 253 - 433
Target Start/End: Original strand, 45502817 - 45502987
Alignment:
Q  253 gtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatc 352  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||| | ||| ||||||||  ||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||           |    
T  45502817 gtgacaactaaggtatccatggaagaacggtgggtaatttacctcaaccaatatacattagctacataagcatatttttaaatggtat-----------c 45502905  T
Q  353 ttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaac 433  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  45502906 ttgacccaactaacaaattgctcattttcattgattggtaggtaaattactcaccattcttcaaagttaatctagaaaaaac 45502987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 338 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 2332116 - 2332019
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||| | |||||||||    
T  2332116 tattcatgaactatcttgatcccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattactcaccatttttcaaagataatttagaaaaaacc 2332019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 338 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 21718214 - 21718117
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||| ||||| | |||||||||    
T  21718214 tattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccgttattcaaaggtaatttagaaaaaacc 21718117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 338 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 35484734 - 35484633
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaa-ttatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaacct 435  Q
    |||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  35484734 tattcatgaactatcttgaccccataaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaatttacccaccattcttcaaagataatttagaaaaaacct 35484635  T
Q  436 ta 437  Q
    ||    
T  35484634 ta 35484633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 338 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 26371146 - 26371066
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  26371146 tattcatgaactattttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttgatggataaattacccaccattcttcaaag 26371066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 327 - 395
Target Start/End: Original strand, 37443666 - 37443734
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggt 395  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37443666 tttttaggtggtatctataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggt 37443734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 29863116 - 29863032
Alignment:
Q  334 gtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||||||  ||||||||| ||||  ||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29863116 gtggtatccatgaactattttgattccaccaataaattattcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 29863032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 338 - 418
Target Start/End: Original strand, 45237608 - 45237688
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||    
T  45237608 tattcatgaattatcttgacctcacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacctatcattcttcaaag 45237688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 338 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 46103217 - 46103138
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  46103217 tattcatgaactattttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggt-ggtaaattacccaccatttttcaaag 46103138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 35557798 - 35557747
Alignment:
Q  367 aaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  35557798 aaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaag 35557747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 325 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 26456219 - 26456157
Alignment:
Q  325 tatttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggt 387  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26456219 tatttttaagaagtattcatgaactatcttgatcccaccaataaattgctcattttcattggt 26456157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 370 - 434
Target Start/End: Original strand, 30077043 - 30077108
Alignment:
Q  370 ttgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  30077043 ttgcccattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacc 30077108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 418
Target Start/End: Original strand, 7720574 - 7720658
Alignment:
Q  334 gtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||||||  |||||||||||| |||| | | | |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  7720574 gtggtatccatgaactatcttaacccaatctataaattgcttatttttattggttagtggataaattacccaccatttttcaaag 7720658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 372 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 35823353 - 35823289
Alignment:
Q  372 gctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttc-aaagtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| | ||||||||||    
T  35823353 gctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttctaaggtaatttagaaaaaacct 35823289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 324
Target Start/End: Original strand, 39453484 - 39453554
Alignment:
Q  254 tgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaaca 324  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||| || || || |||| ||||||||||    
T  39453484 tgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccattacacattagtcacataaaca 39453554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 321
Target Start/End: Original strand, 24923024 - 24923093
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataa 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||| ||||| ||||||||  ||| ||||| || ||||||||||||    
T  24923024 ggtgacaactaggctacccatgaaagaaggatgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataa 24923093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 305
Target Start/End: Original strand, 44003370 - 44003423
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaata 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| |||| |||||    
T  44003370 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaata 44003423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 321
Target Start/End: Original strand, 46817421 - 46817490
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataa 321  Q
    |||| |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||  |||| ||||| || ||||||||||||    
T  46817421 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataa 46817490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 249 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 2332194 - 2332122
Alignment:
Q  249 tatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataa 321  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||| |||||||| |||| ||||| ||  || ||||||||    
T  2332194 tatggtgacaacttgggtacccatggaaaaatggtggataatttaccccaaccaatacacagtaaccacataa 2332122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 252 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 39323779 - 39323712
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacata 320  Q
    ||||||||||||| ||| ||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||    
T  39323779 ggtgacaactaggctactcatgaaagaatgatgggtaatttac-ccaaccaatacacattagccacata 39323712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 253 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 46103291 - 46103223
Alignment:
Q  253 gtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataa 321  Q
    |||||||||||  ||||||||  |||||||||  |||||||||||||  |||| || ||||||||||||    
T  46103291 gtgacaactagactacccatgaaagaatgatgagtaatttactccaactaatacacattagccacataa 46103223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 75)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 248 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 24253568 - 24253377
Alignment:
Q  248 ttatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaa 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||    
T  24253568 ttatggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 24253469  T
Q  348 ctatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaaccttat 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  24253468 ctatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttat 24253377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 250 - 437
Target Start/End: Original strand, 27501053 - 27501241
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||    
T  27501053 atggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaacaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 27501152  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctta 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  27501153 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtggataaattatccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacctta 27501241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 250 - 432
Target Start/End: Original strand, 2484290 - 2484473
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||    
T  2484290 atggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtagtatccatgaact 2484389  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaa 432  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  2484390 atcttgaccctaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaagataatctagaaaaaa 2484473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 5185154 - 5184971
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  5185154 ggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgagtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcatgaactat 5185055  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  5185054 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 5184971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 254 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 6901979 - 6901796
Alignment:
Q  254 tgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatct 353  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||  ||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6901979 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcatgaactatct 6901880  T
Q  354 tgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaacctt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  6901879 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacctt 6901796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 252 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 12648979 - 12648797
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  12648979 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 12648880  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaac 433  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  12648879 cttaaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaagataatctagaaaaaac 12648797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 252 - 436
Target Start/End: Original strand, 43326379 - 43326564
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||  || |||||||||||||||  |||||||||    
T  43326379 ggtgccaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataggcacatttttaagtggtatccatgaactat 43326478  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  43326479 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 43326564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 252 - 435
Target Start/End: Original strand, 3466681 - 3466865
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3466681 ggtgacaactagggtacccataaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 3466780  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  3466781 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 3466865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 252 - 437
Target Start/End: Original strand, 43262183 - 43262369
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  43262183 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 43262282  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctta 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  43262283 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtaggttaattacccaccattcttcaaaggtaatatagaaaaaacctta 43262369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 252 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 5137897 - 5137713
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||   |||| |||||| ||| |||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  5137897 ggtgacaactagggtattaatggaagaatggtggataatttactcaaatcaatacatattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 5137798  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  5137797 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 5137713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 253 - 432
Target Start/End: Original strand, 15398483 - 15398663
Alignment:
Q  253 gtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatc 352  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||    
T  15398483 gtgacaactagagtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 15398582  T
Q  353 ttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaa 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15398583 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 15398663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 246 - 432
Target Start/End: Original strand, 18479662 - 18479849
Alignment:
Q  246 tattatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatg 345  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| | |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||    
T  18479662 tattatggtgactactagggtatccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatg 18479761  T
Q  346 aactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaa 432  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  18479762 aactattttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 18479849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 35626220 - 35626037
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  35626220 ggtgacaactagagtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 35626121  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  35626120 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 35626037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 252 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 27939080 - 27938894
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggta-cccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||    
T  27939080 ggtgacaactagggtaacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 27938981  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttc-aaagtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  27938980 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaaataatctagaaaaaacctt 27938894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 250 - 434
Target Start/End: Original strand, 40886026 - 40886210
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| | || ||||| || |||||||||||| || ||||| |||||||||  |||||||    
T  40886026 atggtgaaaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttt-aagtggtatccatgaact 40886124  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  40886125 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 40886210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 252 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 7722231 - 7722047
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||| | || ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  7722231 ggtgacaattagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccaaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 7722132  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  7722131 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgagtaaattacccaccattcttcaaaggcaatctagaaaaaacct 7722047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 251 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 31939080 - 31938913
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||| || ||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  31939080 tggtgacaattagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcatataaacacatttttaagtggtatccatgaacta 31938981  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  31938980 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaag 31938913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 39932761 - 39932578
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| | | ||||||||  ||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  39932761 ggtgacaactagagtacccatggaagaatggttggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 39932662  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  39932661 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 39932578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 252 - 436
Target Start/End: Original strand, 739704 - 739889
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||  |||| ||||| || ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  739704 ggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 739803  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  739804 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 739889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 252 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 15683973 - 15683785
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || ||||||| |||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  15683973 ggtgacaactagggtacttatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccatataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 15683874  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaaccttata 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  15683873 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacacatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaactttata 15683785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 250 - 418
Target Start/End: Original strand, 40278856 - 40279024
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||   ||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||| |    
T  40278856 atggtgacaactagggtattcatggaagaatgatgggtaatttatctcaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaatt 40278955  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40278956 atgttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 40279024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 253 - 434
Target Start/End: Original strand, 27278474 - 27278660
Alignment:
Q  253 gtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaa----c 348  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||| |||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||  |||||    |    
T  27278474 gtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacgtaagcacatttttaagtggtatccatgaattatc 27278573  T
Q  349 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27278574 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 27278660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 252 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 25831702 - 25831515
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||| || ||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||| ||||||  |||||||||    
T  25831702 ggtgacaaataaggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaattggtatccatgaactat 25831603  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaaccttata 439  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  25831602 -ttgaccccaccaacaaattgcttattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttata 25831515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 252 - 397
Target Start/End: Original strand, 29789295 - 29789440
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||  |||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||  |||||||||    
T  29789295 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 29789394  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaa 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29789395 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaa 29789440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 252 - 435
Target Start/End: Original strand, 28424795 - 28424977
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  28424795 ggtgacaactagagtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcatgaactat 28424894  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| ||||||| |||| || ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  28424895 cttgaccccaccaacaaattg--cattttcattggttgatggataaattacccactatccttcaaaggtaatctagaaaaaacct 28424977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 254 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 40110413 - 40110225
Alignment:
Q  254 tgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatct 353  Q
    |||||| |||| ||| ||||| |||||| | | |||||||| | ||  ||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40110413 tgacaattaggatactcatggaagaatggtagataatttaccctaactaatatacattaaccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactatct 40110314  T
Q  354 tgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaaccttatatta 442  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||    
T  40110313 tgaccc-accaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaatgtaatatagaaaaaaccttaaatta 40110225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 252 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 891087 - 890902
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||| | | |||||||| | || ||||| || |||||||||||| || ||||| |||||||||  |||||||||    
T  891087 ggtgacaattaggatacccatggaagaatggtaggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttt-aagtggtatccatgaactat 890989  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttc-aaagtaatcttgaaaaaacctta 437  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  890988 cttgactcgaccaacaaattgctcattttcattagttggtggataaattatccaccattcttcaaaagtaatctagaaaaaacctta 890902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 250 - 414
Target Start/End: Original strand, 13504740 - 13504904
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||  ||||  |||| |  |||| ||||||| || |||||||||||||||  |||||||    
T  13504740 atggtgacaactagggtatccatggaagaatggtggataatttatcccaactaatacatattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 13504839  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttc 414  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  13504840 atcttgaccccaccaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttc 13504904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 252 - 418
Target Start/End: Original strand, 38756487 - 38756654
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatggga-gaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| |||||||   |||  |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  38756487 ggtgacaactagggtacctatgggaagaattgtgggtaatttatctcaactaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaacta 38756586  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38756587 tcttgatcccaccaacaaattgctcattttcatttattggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 38756654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 249 - 432
Target Start/End: Original strand, 31293986 - 31294170
Alignment:
Q  249 tatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaac 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||| |||||  | | |  ||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  31293986 tatggtgacaactagggtacccatgtaagaatggtgggtaatttactccaaccaataaccatcaatcacgtaagcatatttttaagtggtattcatggac 31294085  T
Q  349 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaa 432  Q
    || |  ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  31294086 tacccggaccctaccaataatttgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaa 31294170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 250 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 34451434 - 34451292
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||    
T  34451434 atggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 34451335  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtg 392  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  34451334 atattgaccccaccaataaattgctcattttcattggttggtg 34451292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 326 - 437
Target Start/End: Original strand, 12558093 - 12558204
Alignment:
Q  326 atttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatct 424  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12558093 atttttaagtggtatc-atgaactatcttgaccacatcaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatct 12558191  T
Q  425 tgaaaaaacctta 437  Q
     ||||||||||||    
T  12558192 agaaaaaacctta 12558204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 261 - 441
Target Start/End: Original strand, 42658671 - 42658841
Alignment:
Q  261 tagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttgacccc 360  Q
    |||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| |||||           ||| ||||||||||||||||||    
T  42658671 taggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatat-----------attcatgaactatcttgacccc 42658759  T
Q  361 accaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaaccttatatt 441  Q
    || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  42658760 acaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaattttgaaaaaaccttttatt 42658841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 252 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 763905 - 763723
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||| ||| ||||   |||||||||| |||||||| ||||  |||| |  ||||||||||||  | ||||||||||| |||  |||||||||    
T  763905 ggtgacaactagagtatccatcaaagaatgatgggtaatttaccccaactaatacatattagccacataagtacatttttaagtgatatccatgaactat 763806  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttc-aaagtaatcttgaaaaaac 433  Q
    ||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  763805 cttaactccaccaacaaattactcatttttattggttggtgagtaaattacccaccattcttcaaaaataatctagaaaaaac 763723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Original strand, 23195248 - 23195420
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||| || ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| || ||           ||| |||||||||    
T  23195248 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgacgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------attcatgaactat 23195336  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||    
T  23195337 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatttagaaaaaacc 23195420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 253 - 434
Target Start/End: Original strand, 9424593 - 9424764
Alignment:
Q  253 gtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatc 352  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||  |||| ||||| || |||||||||||| |||||           ||| ||||||||||    
T  9424593 gtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcatat-----------attcatgaactatc 9424681  T
Q  353 ttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  9424682 ttgaccccacaaataaattactcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 9424764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 251 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 27503551 - 27503376
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||           ||| ||||||||    
T  27503551 tggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------attcatgaacta 27503463  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  27503462 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 27503376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 343 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 40632590 - 40632498
Alignment:
Q  343 atgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  40632590 atgaactatcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacc 40632498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 251 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 19295902 - 19295725
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||           ||  ||||||||    
T  19295902 tggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------atacatgaacta 19295814  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaaccttat 438  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||    
T  19295813 tcttaaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaaccttat 19295725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 327 - 436
Target Start/End: Original strand, 36472348 - 36472458
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatctt 425  Q
    |||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||     
T  36472348 ttttaaagtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtggataaattacccaccatttttcaaaggtaatcta 36472447  T
Q  426 gaaaaaacctt 436  Q
    |||||||||||    
T  36472448 gaaaaaacctt 36472458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 346 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 2585550 - 2585461
Alignment:
Q  346 aactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  2585550 aactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacc 2585461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 33617756 - 33617584
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||  |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||           ||| |||||||||    
T  33617756 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------attcatgaactat 33617668  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | |||||||||    
T  33617667 cttgaccccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacc 33617584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 239 - 418
Target Start/End: Original strand, 38015501 - 38015669
Alignment:
Q  239 aaatttatattatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggt 338  Q
    ||||||| | || |||| |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||               
T  38015501 aaatttaaaataaggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat----------- 38015589  T
Q  339 atttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38015590 attcatgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 38015669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 323 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 5120135 - 5120041
Alignment:
Q  323 catatttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  5120135 catatttttaagtggtatc-atgaactatcttgaccctaccaataaattggtcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcatcaaag 5120041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 327 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 27390704 - 27390613
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27390704 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaactatccaccatttttcaaag 27390613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 252 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 5497444 - 5497271
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||  |||| ||||| || |||||||||||| || ||           ||| |||||||||    
T  5497444 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------attcatgaactat 5497356  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaacct 435  Q
     |||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  5497355 tttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatttagaaaaaacct 5497271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 338 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 13957766 - 13957668
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  13957766 tattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 13957668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 251 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 14972150 - 14971993
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||  | |||||||| || |||| ||||||| || ||           ||| || |||||    
T  14972150 tggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcctaatcaatacacattagtcacataagcacat-----------attcataaacta 14972062  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaagt 419  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14972061 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagt 14971993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 346 - 435
Target Start/End: Original strand, 42247865 - 42247955
Alignment:
Q  346 aactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  42247865 aactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 42247955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 356 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 4149772 - 4149691
Alignment:
Q  356 accccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  4149772 accccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatatagaaaaaacctt 4149691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 327 - 435
Target Start/End: Original strand, 18327237 - 18327346
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatctt 425  Q
    |||||| |||||||  || |||||||||||| ||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  18327237 tttttaggtggtatccataaactatcttgactccaccaataaattgcgcattataattggttggtgggtaaattatccaccatttttcaaagataatcta 18327336  T
Q  426 gaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||    
T  18327337 gaaaaaacct 18327346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 338 - 434
Target Start/End: Original strand, 36365520 - 36365617
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  36365520 tattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 36365617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 338 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 6973159 - 6973079
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6973159 tattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 6973079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 252 - 418
Target Start/End: Original strand, 9374502 - 9374657
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||| |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||| |||||| ||           ||| |||||||||    
T  9374502 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacctaaacacat-----------attcatgaactat 9374590  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  9374591 cttgaccccataaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaag 9374657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 346 - 435
Target Start/End: Original strand, 38637993 - 38638083
Alignment:
Q  346 aactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  38637993 aactatcttgaccccaccaataaattactcattatgattggttggtggataaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacct 38638083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 327 - 434
Target Start/End: Original strand, 24167848 - 24167956
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatctt 425  Q
    |||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||     
T  24167848 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgtttattatgattggttggtggataaattacccaccatttttcaaaggtaatcta 24167947  T
Q  426 gaaaaaacc 434  Q
    |||||||||    
T  24167948 gaaaaaacc 24167956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 346 - 435
Target Start/End: Original strand, 1402588 - 1402678
Alignment:
Q  346 aactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  1402588 aactatcttgatcccaccaataaattactcattatgattggttggtggataaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacct 1402678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 335 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 40686998 - 40686900
Alignment:
Q  335 tggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaa 432  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||| ||||||| |||||||    
T  40686998 tggtattcataaactatcttgaccccaccaataaattactcattatgattggttggtggataaattacccaccatttctcaaaggtaatctagaaaaaa 40686900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 338 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 6206980 - 6206901
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa 417  Q
    |||| ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  6206980 tattcatgaactattttgaccccccaaataaattgctcattttaattggttggtgggtaaattacccactattcttcaaa 6206901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 251 - 407
Target Start/End: Original strand, 3656567 - 3656712
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||  |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||           ||| ||||||||    
T  3656567 tggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------attcatgaacta 3656655  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccacc 407  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  3656656 tcttgaccccaaaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccacc 3656712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 349 - 418
Target Start/End: Original strand, 9171111 - 9171180
Alignment:
Q  349 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  9171111 tatcttgaccccacaaataaattgctcattttcatttgttggtggataaattacccaccattcttcaaag 9171180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 343 - 408
Target Start/End: Original strand, 36948569 - 36948633
Alignment:
Q  343 atgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccacca 408  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36948569 atgaactatctt-accctaccaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccacca 36948633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 343 - 410
Target Start/End: Original strand, 3940411 - 3940478
Alignment:
Q  343 atgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccatt 410  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  3940411 atgaattatcttgaccgcaccaataaattgctcattttcatttgttggtgggtaaattacccaccatt 3940478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 343 - 418
Target Start/End: Original strand, 33624019 - 33624094
Alignment:
Q  343 atgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  33624019 atgaattattttgatcccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatctaccattattcaaag 33624094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 38492709 - 38492647
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaatt 400  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  38492709 tattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaatt 38492647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 418
Target Start/End: Original strand, 9527124 - 9527175
Alignment:
Q  367 aaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9527124 aaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 9527175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 408
Target Start/End: Original strand, 612839 - 612900
Alignment:
Q  346 aactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccacca 408  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||    
T  612839 aactatcttgaccccaccaataaattgttcattttca-tggttggtggttaaattacccacca 612900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 352 - 418
Target Start/End: Original strand, 15300962 - 15301028
Alignment:
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||| || |||||||| | | ||||||||||||    
T  15300962 cttgactccaccgataaattgctcattttcattggttgatgtgtaaattaccaatcattcttcaaag 15301028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 4149831 - 4149778
Alignment:
Q  287 taatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtat 340  Q
    |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  4149831 taatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtat 4149778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 13957841 - 13957772
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataa 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||  ||| ||||| || |||| |||||||    
T  13957841 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttacctcaaccaatacacattagtcacataa 13957772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 21786034 - 21786001
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgat 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21786034 atggtgacaactagggtacccatggaagaatgat 21786001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 252 - 327
Target Start/End: Original strand, 612757 - 612833
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttact-ccaatcaatatacgttagccacataaacatat 327  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||  ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||| |||||    
T  612757 ggtgacaactaggatacccatggaagaatactgagtaatttactcccaaccaatacacattagccacataagcatat 612833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 249 - 305
Target Start/End: Original strand, 24167781 - 24167837
Alignment:
Q  249 tatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaata 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||  |||||||| |||| |||||    
T  24167781 tatggtgacaactagggtacccatggaaaaatgttgagtaatttaccccaaccaata 24167837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 252 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 27390768 - 27390716
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaat 304  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||    
T  27390768 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtggataatttaccccaaccaat 27390716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 374 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 28756138 - 28756094
Alignment:
Q  374 tcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  28756138 tcattttcattgcttggtgggtaaattatccacctttctttaaag 28756094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 111)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 240 - 437
Target Start/End: Original strand, 26085386 - 26085583
Alignment:
Q  240 aatttatattatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggta 339  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||  |||| ||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  26085386 aatttaaatcatggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggta 26085485  T
Q  340 tttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaagtaatcttgaaaaaacctta 437  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  26085486 ttcatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaggtaatctagtaaaaacctta 26085583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 252 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 44662152 - 44661967
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  44662152 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 44662053  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  44662052 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 44661967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 241 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 47671779 - 47671579
Alignment:
Q  241 atttatattatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtat 340  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  47671779 atttatatattggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtat 47671680  T
Q  341 ttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaaccttata 439  Q
      |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  47671679 ccatgaactatcttgacccctccaacaaatagctcattttcattggttggtcggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttata 47671580  T
Q  440 t 440  Q
    |    
T  47671579 t 47671579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 5981352 - 5981169
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  5981352 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 5981253  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  5981252 cttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 5981169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 249 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 45538338 - 45538151
Alignment:
Q  249 tatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaac 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||    
T  45538338 tatggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 45538239  T
Q  349 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  45538238 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 45538151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 250 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 3611320 - 3611131
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||    
T  3611320 atggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 3611221  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaaccttat 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  3611220 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaaccttat 3611131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 250 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 26277361 - 26277173
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||  |||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  26277361 atggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaacaaatttttaagtggtatccatgaact 26277262  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctta 437  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  26277261 atcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 26277173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 252 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 31308183 - 31307999
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  31308183 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 31308084  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  31308083 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 31307999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 251 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 25058871 - 25058685
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||    
T  25058871 tggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 25058772  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  25058771 ttttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 25058685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 252 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 23984937 - 23984752
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||| || ||||| |||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  23984937 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 23984838  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  23984837 cttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 23984752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 250 - 434
Target Start/End: Original strand, 25678257 - 25678442
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||    
T  25678257 atggtgacaactatggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 25678356  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  25678357 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 25678442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 252 - 433
Target Start/End: Original strand, 26524889 - 26525071
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||  ||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26524889 ggtgacaactagggtatccatggaagaatagtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatctataaactat 26524988  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaac 433  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  26524989 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 26525071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 249 - 433
Target Start/End: Original strand, 21139409 - 21139594
Alignment:
Q  249 tatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaac 348  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||    
T  21139409 tatggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 21139508  T
Q  349 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaac 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  21139509 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatacttcaaaggtaatctagaaaaaac 21139594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Original strand, 17994951 - 17995134
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||| |||    
T  17994951 ggtgccaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaattat 17995050  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  17995051 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 17995134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 251 - 437
Target Start/End: Original strand, 24245024 - 24245211
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||  |||| || |||| ||||||| || |||||||||||||||  ||||||||    
T  24245024 tggtgataactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaactaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 24245123  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctta 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  24245124 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 24245211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 31040891 - 31040708
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||  ||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  31040891 ggtgacaactagggtacccatggaataatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 31040792  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  31040791 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 31040708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 256 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 26794482 - 26794320
Alignment:
Q  256 acaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttg 355  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  26794482 acaactagggtacccatggaagaatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactattttg 26794383  T
Q  356 accccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26794382 accccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 26794320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 252 - 437
Target Start/End: Original strand, 38331859 - 38332045
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||  |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  38331859 ggtgacaactagagtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatattcatgaactat 38331958  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctta 437  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  38331959 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 38332045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 250 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 35273780 - 35273595
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||  ||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||    
T  35273780 atggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgtgtaatttacctcaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 35273681  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  35273680 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattgatgggtaaattatccaccattcttcaaagataatttagaaaaaacc 35273595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 252 - 432
Target Start/End: Original strand, 38790197 - 38790378
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||  |||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||    
T  38790197 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccataaactat 38790296  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaa 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  38790297 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattaccaaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 38790378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 252 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 46616731 - 46616546
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  46616731 ggtgacacctagagtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtgatattcatgaactat 46616632  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  46616631 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 46616546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 258 - 437
Target Start/End: Original strand, 4068689 - 4068869
Alignment:
Q  258 aactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttgac 357  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4068689 aactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgac 4068788  T
Q  358 cccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctta 437  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||    
T  4068789 cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaagcctta 4068869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 252 - 435
Target Start/End: Original strand, 33112818 - 33113001
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  33112818 ggtgacaactagggtacc-atgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 33112916  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  33112917 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaatttacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 33113001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Original strand, 23932509 - 23932692
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |  ||||||| || |||||||||||| || ||||||||||||| |  |||||||||    
T  23932509 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctgatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtgtccatgaactat 23932608  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  23932609 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatcaagaaaaaacc 23932692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 24885683 - 24885500
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| |||||||| | || ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  24885683 ggtgacaactagggtattcatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattatccacataaacatatttttaagtggtatccatgaactat 24885584  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24885583 cttgaccccaccaacaaattgatcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 24885500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 249 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 43251896 - 43251713
Alignment:
Q  249 tatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaac 348  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||    
T  43251896 tatgatgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 43251797  T
Q  349 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaa 431  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  43251796 tatcttgacctcaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaatctagaaaaa 43251713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 252 - 437
Target Start/End: Original strand, 6327548 - 6327733
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||| |||| ||||| || |||| || |||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  6327548 ggtgacaactagggtacccatggaagaatagtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtca-ataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 6327646  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctta 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  6327647 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 6327733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 248 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 47317501 - 47317331
Alignment:
Q  248 ttatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaa 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||    
T  47317501 ttatggtgacaactagggtacccatagaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatacatgaa 47317402  T
Q  348 ctatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  47317401 ctatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgaataaattacccaccattcttcaaag 47317331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 253 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 3285582 - 3285400
Alignment:
Q  253 gtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatc 352  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||| | |||||||| || |||||||||||| || ||||| |||||||||  ||||||||||    
T  3285582 gtgacaattagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaatcaatacacattagccacataagcacatttt-aagtggtatccatgaactatc 3285484  T
Q  353 ttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  3285483 ttgaccccaccaacaaattactcattttcattggttggtggataaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 3285400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 39646750 - 39646567
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || ||||  |||||| || |||||||||||||||  |||| ||||    
T  39646750 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagttacataagcacatttttaagtggtatccatgacctat 39646651  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  39646650 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggcaatctagaaaaaacc 39646567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 251 - 418
Target Start/End: Original strand, 47383731 - 47383898
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||| ||| |||||||  |||||||||| || ||||| |||||| || |||||||||||||||  ||||||||    
T  47383731 tggtgacaactagggtaccaatgaaagaatggtgggtaatttatcccaatcaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 47383830  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47383831 tcttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 47383898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 255 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 28888760 - 28888582
Alignment:
Q  255 gacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatctt 354  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||   ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  28888760 gacaactagggtactcatggaagaatggtggataatttatctcaatcaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactatctt 28888661  T
Q  355 gaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaa 432  Q
    || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  28888660 gatcccaccaacaaattgatcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagttaatctagaaaaaa 28888582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 252 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 33884270 - 33884088
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||    
T  33884270 ggtgacaattagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatggtatctatgaactat 33884171  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaac 433  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  33884170 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaac 33884088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 252 - 433
Target Start/End: Original strand, 33959982 - 33960164
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||    
T  33959982 ggtgacaattagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatggtatctatgaactat 33960081  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaac 433  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  33960082 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaac 33960164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Original strand, 42313361 - 42313548
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  42313361 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtattaatgaactat 42313460  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaat----tatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  42313461 cttgactccaccaataaatttctcattttcattggttggtgggtaaattatatatccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacc 42313548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 241 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 46784616 - 46784423
Alignment:
Q  241 atttatattatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtat 340  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  46784616 atttagattttggtgacaattagggtacccatggaagaatgatgggtaatttactccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtat 46784517  T
Q  341 ttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaac 433  Q
      |||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  46784516 ccatgaactatctttacttctccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcctcaaaggtaatctagaaaaaac 46784423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 251 - 434
Target Start/End: Original strand, 46967040 - 46967224
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||  | ||  |||| |  |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||    
T  46967040 tggtgacaactagggtacccatgaaagaatgatgggtaatttatcctaacaaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 46967139  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  46967140 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 46967224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Original strand, 37620192 - 37620375
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||  | |||||||||||||||  |||||||||    
T  37620192 ggtgacaactagggtacacatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaggacatttttaagtggtatccatgaactat 37620291  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  37620292 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 37620375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 249 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 36566515 - 36566329
Alignment:
Q  249 tatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaac 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| | || ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||    
T  36566515 tatggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccgaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 36566416  T
Q  349 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  || |||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  36566415 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgaatatattacccactattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 36566329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 252 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 50774399 - 50774233
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||  |||| ||||| || || | ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  50774399 ggtgacaactagggtacccatggaagaaaggtgggtaatttatcccaaccaatacacattggtcacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 50774300  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  50774299 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggttaattacccaccattcttcaaag 50774233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 252 - 435
Target Start/End: Original strand, 35692663 - 35692848
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||| | ||| ||||||||  ||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||    
T  35692663 ggtgacaactagagtatccatggaagaacggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagcggtatccatgaactat 35692762  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtggg-taaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  35692763 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 35692848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 252 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 41999997 - 41999813
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||| ||    
T  41999997 ggtgataactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacaat 41999898  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  41999897 cttgaccccaccaacaaatttctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacct 41999813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 5980250 - 5980067
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||| |||||||||| |||| | |||| ||| |||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |  |||||||||||||||  || ||||||    
T  5980250 ggtgacagctagggtacctatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataagctaatttttaagtggtatccattaactat 5980151  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  5980150 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 5980067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 250 - 434
Target Start/End: Original strand, 23220933 - 23221112
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||       |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||    
T  23220933 atggtcacaactagggtacccatggaagaatggtggatac------ccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 23221026  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  23221027 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 23221112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 251 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 51057254 - 51057068
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||  |||  |||| || ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||| |||    
T  51057254 tggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttacctcaactaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgatcta 51057155  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  51057154 tcttgaccctaccaacaaattgctcattttcattggttggttggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 51057068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 287 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 31844523 - 31844374
Alignment:
Q  287 taatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattgg 386  Q
    |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  31844523 taatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgacctcaccaacaaattgctcattttcattgg 31844424  T
Q  387 ttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  31844423 ttggtgggtaaattatccaccattcctcaaaggtaatctagaaaaaacct 31844374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 265 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 42864034 - 42863881
Alignment:
Q  265 gtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccacca 364  Q
    |||| ||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  42864034 gtactcatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtagtatccatgaactatcttgaccccacca 42863935  T
Q  365 acaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42863934 acaaatagctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 42863881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 251 - 434
Target Start/End: Original strand, 49398987 - 49399171
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||    
T  49398987 tggtgacaactaggatacccatggaagaatagtgggtaatttaccccaaccaatagacattagccacataaacacatttttaagtggtatccataaacta 49399086  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  49399087 tcttaactccaccaacaaattgctcattttcattgattggtggataaattacctaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 49399171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Original strand, 49253975 - 49254158
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||| || ||||||| |||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| |  ||||||| |||| || |||||||||||||||  || ||||||    
T  49253975 ggtgataattagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccatataagcacatttttaagtggtatccataaactat 49254074  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  49254075 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 49254158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 296 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 25518952 - 25518815
Alignment:
Q  296 ccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggt 395  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25518952 ccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggt 25518853  T
Q  396 aaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaa 432  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  25518852 aaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaa 25518815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 252 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 47187287 - 47187101
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| ||||||||   || ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  || ||||||    
T  47187287 ggtgacaactacggtacccatgaaagaatggtggataatttaccataaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccataaactat 47187188  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctta 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  || || |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  47187187 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgagtaaattactcatcaatcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 47187101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 251 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 2450677 - 2450529
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  2450677 tggtgacaactaggatacccatggaagaatgataggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaacta 2450578  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaat 399  Q
    ||||||  |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  2450577 tcttgattccactaacaaattactcattttcattggttggtgggtaaat 2450529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 252 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 48373677 - 48373499
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||| ||| |||||||| |||| |||||         ||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  48373677 ggtgacaactaaggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaata---------cacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 48373587  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaaccttat 438  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  48373586 cttgaccccaccaataaactgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttat 48373499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 315 - 436
Target Start/End: Original strand, 2556909 - 2557031
Alignment:
Q  315 cacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttc 414  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  2556909 cacataaacacatttttaagtggtattcatgaactatcttgaccccaccaacagattgctcattttcattagttagtggataaattatccaccattcttc 2557008  T
Q  415 aaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    ||| ||||||| |||||||||||    
T  2557009 aaaggtaatctagaaaaaacctt 2557031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 250 - 393
Target Start/End: Original strand, 51045594 - 51045737
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    ||||||||||||||| ||||| | | |||||| ||| |||||||| | |||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||| || ||||    
T  51045594 atggtgacaactaggatacccgtagaagaatggtgggtaatttaccctaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcataaact 51045693  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgg 393  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  51045694 atcttgaccccaccaacaaattactcattttcattggttggtgg 51045737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 328 - 433
Target Start/End: Original strand, 51403083 - 51403189
Alignment:
Q  328 ttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttg 426  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |    
T  51403083 ttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctag 51403182  T
Q  427 aaaaaac 433  Q
    |||||||    
T  51403183 aaaaaac 51403189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 252 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 36003315 - 36003146
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatg---ggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaac 348  Q
    |||||||||||||||||| |||   | |||||| ||| |||||||  | || ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||    
T  36003315 ggtgacaactagggtacctatgaaagaagaatggtgggtaatttatccgaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 36003216  T
Q  349 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  36003215 tatcttgaccccaccagtaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattactcaccattcttcaaag 36003146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 251 - 436
Target Start/End: Original strand, 27983602 - 27983772
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||| ||||||              
T  27983602 tggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatggtat---------- 27983691  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
          |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27983692 ------ccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 27983772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 252 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 33073382 - 33073207
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| || ||           ||| |||||||||    
T  33073382 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcacat-----------attcatgaactat 33073294  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctta 437  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||    
T  33073293 cttgaccccacctataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 33073207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 249 - 434
Target Start/End: Original strand, 41467629 - 41467804
Alignment:
Q  249 tatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaac 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||           ||| ||||||    
T  41467629 tatggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------attcatgaac 41467717  T
Q  349 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  41467718 tatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 41467804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 322 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 33187452 - 33187337
Alignment:
Q  322 acatatttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-ta 420  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||    
T  33187452 acatatttttaagtggtatctataaactatcttgatccaaccaataaattgctcattttcattggttggtgtgtaaattatccaccattctttaaagata 33187353  T
Q  421 atcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||| |||||||||||    
T  33187352 atctagaaaaaacctt 33187337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 252 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 2657474 - 2657319
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||           ||| |||||||||    
T  2657474 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------attcatgaactat 2657386  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2657385 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 2657319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 326 - 431
Target Start/End: Original strand, 31980009 - 31980115
Alignment:
Q  326 atttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatct 424  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  31980009 atttttaagtggtatccatgaactatcttgaccctaacaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatct 31980108  T
Q  425 tgaaaaa 431  Q
     ||||||    
T  31980109 agaaaaa 31980115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 252 - 380
Target Start/End: Original strand, 47772172 - 47772300
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||    
T  47772172 ggtgacaattaaggtacccatggaagaatggtgtgtaatttactccaaccaatatacattagtcacataaacacatttttaaatggtatatataaactat 47772271  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcatttt 380  Q
     ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  47772272 tttgaccctaccaacaaattgcttatttt 47772300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 253 - 418
Target Start/End: Original strand, 6626025 - 6626179
Alignment:
Q  253 gtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatc 352  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||           ||| ||||||||||    
T  6626025 gtgacaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------attcatgaactatc 6626113  T
Q  353 ttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  6626114 ttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaag 6626179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 342 - 436
Target Start/End: Original strand, 24649801 - 24649896
Alignment:
Q  342 tatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  24649801 tatgaactatcttgaccccaccaataaataactcattttcattggttggtgggtaaattatccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 24649896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 338 - 436
Target Start/End: Original strand, 26472254 - 26472353
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  26472254 tattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 26472353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 327 - 436
Target Start/End: Original strand, 5961331 - 5961441
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttc-aaagtaatctt 425  Q
    |||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||     
T  5961331 tttttaggtggtatccataaactatcttgatcccaccaataaattgctcattatgatttgttggtgggtaaattatccaccatttttcaaaagtaatcta 5961430  T
Q  426 gaaaaaacctt 436  Q
    |||||||||||    
T  5961431 gaaaaaacctt 5961441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 343 - 440
Target Start/End: Original strand, 13313254 - 13313354
Alignment:
Q  343 atgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag---taatcttgaaaaaaccttata 439  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||   |||||| ||||||||||||||    
T  13313254 atgaactatcttaaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccacaattcttcaaaggtataatctagaaaaaaccttata 13313353  T
Q  440 t 440  Q
    |    
T  13313354 t 13313354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 327 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 2954962 - 2954854
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatctt 425  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||     
T  2954962 tttttaagtggtatccattaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattgattggtgggtaaattacccaccatttgtcaaaggtaatcta 2954863  T
Q  426 gaaaaaacc 434  Q
    |||||||||    
T  2954862 gaaaaaacc 2954854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 252 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 4808827 - 4808699
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||| ||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  4808827 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 4808728  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcatttt 380  Q
    |||||||| | ||| |||||| |||||||    
T  4808727 cttgaccctatcaataaattgttcatttt 4808699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 327 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 26685963 - 26685855
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatctt 425  Q
    |||||| |||||||  || |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||     
T  26685963 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccctaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatcta 26685864  T
Q  426 gaaaaaacc 434  Q
    |||||||||    
T  26685863 gaaaaaacc 26685855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 327 - 434
Target Start/End: Original strand, 27924722 - 27924830
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttc-aaagtaatctt 425  Q
    |||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||     
T  27924722 tttttaggtggtatccataaactatcttgatcccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaagtaatcta 27924821  T
Q  426 gaaaaaacc 434  Q
    |||||||||    
T  27924822 gaaaaaacc 27924830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 252 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 42235010 - 42234836
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| || ||| |||||||| || |           |||| |||||||||    
T  42235010 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttac-ccaaccaatacacattaaccacataagcaca-----------tattcatgaactat 42234923  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctta 437  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  42234922 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 42234836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 338 - 418
Target Start/End: Original strand, 44544121 - 44544201
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44544121 tattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 44544201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 252 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 10928238 - 10928064
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||           ||| |||||||||    
T  10928238 ggtgacaactagggtattcatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------attcatgaactat 10928150  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | |||||||||||    
T  10928149 cttgaccccaccaataaattgttcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 10928064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 247 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 29770846 - 29770661
Alignment:
Q  247 attatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatga 346  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||  | |||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||           ||| ||||    
T  29770846 attaaggtggcaactaggctacccatgaaaaaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------attcatga 29770758  T
Q  347 actatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaaccttatatta 442  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||    
T  29770757 actatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattagttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaaccttaaatta 29770661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 251 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 52324111 - 52323936
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||  || ||           ||  |||||| |||||||| || || ||    
T  52324111 tggtgacaactagggtacccatggaagattggtgggtaatttactccaatcaatgaacattt----------cacctttttaggtggtattcataaatta 52324022  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||  |||||||||    
T  52324021 tcttgaccccaccaataaattgttcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctaaaaaaaacct 52323936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 327 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 10920307 - 10920198
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatctt 425  Q
    |||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||     
T  10920307 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgtgcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaagataatcta 10920208  T
Q  426 gaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||    
T  10920207 gaaaaaacct 10920198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 276 - 397
Target Start/End: Original strand, 45475867 - 45475987
Alignment:
Q  276 agaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctc 375  Q
    |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45475867 agaatggtgggtaatttac-ccaaccaatacacattagccacataagcacatttgtaagtggtatccatcaactatcttgaccccaccaataaattgctc 45475965  T
Q  376 attttgattggttggtgggtaa 397  Q
    ||||| |||| |||||||||||    
T  45475966 attttcattgattggtgggtaa 45475987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 338 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 32448744 - 32448664
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32448744 tattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaag 32448664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 327 - 434
Target Start/End: Original strand, 38716311 - 38716419
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatctt 425  Q
    |||||| |||||||  || || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||     
T  38716311 tttttaggtggtatccataaattatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccattttttaaagataatcta 38716410  T
Q  426 gaaaaaacc 434  Q
    |||||||||    
T  38716411 gaaaaaacc 38716419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 258 - 418
Target Start/End: Original strand, 34752320 - 34752469
Alignment:
Q  258 aactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttgac 357  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| || ||           ||| |||||||||||| |     
T  34752320 aactaggttacccatgaaagaatgatgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------attcatgaactatcttaag 34752408  T
Q  358 cccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34752409 cccacaaataaattgctcattttatttggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 34752469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 4156576 - 4156441
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta- 350  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||  || |||||     
T  4156576 ggtgacaactagagtacccatggaaaaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaatacatttttaagtggtatccataaactat 4156477  T
Q  351 ------tcttgaccccaccaacaaattgctcatttt 380  Q
          |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4156476 attgagtcttgaccccaccaacaaattggtcatttt 4156441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 327 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 1388580 - 1388476
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatctt 425  Q
    |||||| |||||||  || |||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||     
T  1388580 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccctaccaataaattgctcatcatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaatgtaatcta 1388481  T
Q  426 gaaaa 430  Q
    |||||    
T  1388480 gaaaa 1388476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 338 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 4953148 - 4953068
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4953148 tattcatgaactatcttgatcccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 4953068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 326 - 436
Target Start/End: Original strand, 39475846 - 39475956
Alignment:
Q  326 atttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatct 424  Q
    ||||||| |||||||  || |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||| |||    
T  39475846 atttttaggtggtatccataaactatcttgaccc-accaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccatcatttttcaaaggtactct 39475944  T
Q  425 tgaaaaaacctt 436  Q
     |||||||||||    
T  39475945 agaaaaaacctt 39475956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 346 - 435
Target Start/End: Original strand, 4243573 - 4243663
Alignment:
Q  346 aactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | ||||||||||    
T  4243573 aactatcttgaccccacaaataaattactcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattattcaaaggtaatttagaaaaaacct 4243663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 338 - 439
Target Start/End: Original strand, 13281637 - 13281739
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||    
T  13281637 tattcatgaactattttgaccccacaaataaattgttcattgtcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacttt 13281736  T
Q  437 ata 439  Q
    |||    
T  13281737 ata 13281739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 344 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 39637986 - 39637899
Alignment:
Q  344 tgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttca-aagtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  39637986 tgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttta----ttggtgggtaaattacccaccattcttcataggtaatctagaaaaaacc 39637899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 251 - 340
Target Start/End: Original strand, 13312530 - 13312619
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtat 340  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||    
T  13312530 tggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcacatatttaagtggtat 13312619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 251 - 418
Target Start/End: Original strand, 41895163 - 41895319
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||           ||| ||||||||    
T  41895163 tggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttacaccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------attcatgaacta 41895251  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||||||| ||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  41895252 tcttgacctcacaaataaattgctaattgttattggttggtgggtaaattacccacaattctttaaag 41895319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 338 - 438
Target Start/End: Original strand, 46428328 - 46428429
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | |||||||| ||    
T  46428328 tattcatgaactatcttgaccccatcaataaattgctcatattcattggttgctgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacatt 46428427  T
Q  437 at 438  Q
    ||    
T  46428428 at 46428429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 338 - 418
Target Start/End: Original strand, 30289985 - 30290065
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  30289985 tattcatgaactatcttgactccaccaataaattgctcatattcactggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaag 30290065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 338 - 437
Target Start/End: Original strand, 44293530 - 44293630
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| | || |||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  44293530 tattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttgatgggtaaattacctactattcttcaaaggtaattttaaaaaaacctt 44293629  T
Q  437 a 437  Q
    |    
T  44293630 a 44293630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 327 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 52367990 - 52367882
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatctt 425  Q
    |||||| |||||||  || |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||| ||||||      
T  52367990 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccctaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccacaattttttaaaggtaatcca 52367891  T
Q  426 gaaaaaacc 434  Q
    |||||||||    
T  52367890 gaaaaaacc 52367882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 327 - 410
Target Start/End: Original strand, 48683394 - 48683477
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccatt 410  Q
    |||||| |||||||  || |||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48683394 tttttaggtggtatccataaactatcttgactccaccaataaattgttcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatt 48683477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 338 - 434
Target Start/End: Original strand, 51155664 - 51155761
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| | |||||||||    
T  51155664 tattcatgaactatcttgactccaccaataaattgttcatattcattggttggtgggtaaattacccatcatttttcaaaggtaatttagaaaaaacc 51155761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 338 - 418
Target Start/End: Original strand, 35991674 - 35991754
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | | |||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  35991674 tattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcaattgttggtggataaattacccacaattcttcaaag 35991754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 353 - 418
Target Start/End: Original strand, 7561632 - 7561697
Alignment:
Q  353 ttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  7561632 ttgaccccaccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacctaccatttttcaaag 7561697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 375 - 434
Target Start/End: Original strand, 4156188 - 4156248
Alignment:
Q  375 cattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4156188 cattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 4156248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 250 - 399
Target Start/End: Original strand, 38718165 - 38718309
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactcc-aatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaac 348  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||||| || | |||||| |||||||||||| || || || |     |||||||||||    
T  38718165 atggtgacaactaggctacc-atgaaagaatgatgggtaatttactcccaaccgatatacattagccacataagcacatattca-----tatttatgaac 38718258  T
Q  349 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaat 399  Q
    ||||||||  |||| || |||||| ||||||| |||||| ||||| |||||    
T  38718259 tatcttgatgccacaaataaattgttcatttttattggtcggtggataaat 38718309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 375 - 435
Target Start/End: Original strand, 10919306 - 10919367
Alignment:
Q  375 cattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaacct 435  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  10919306 cattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaagataatctagaaaaaacct 10919367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 33187509 - 33187452
Alignment:
Q  248 ttatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaata 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| |||||    
T  33187509 ttatggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaata 33187452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 315
Target Start/End: Original strand, 7561527 - 7561591
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagcc 315  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||  |||| ||||| || ||||||    
T  7561527 tggtgacaactagggtatccatggaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagcc 7561591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 294
Target Start/End: Original strand, 5961267 - 5961309
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttac 294  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  5961267 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatgatgggtaatttac 5961309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 2955026 - 2954973
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaata 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| |||| |||||    
T  2955026 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaata 2954973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 24215859 - 24215806
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggt 391  Q
    |||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  24215859 tattcatgaactatcttgatcctacaaataaattgctcattttcattggttggt 24215806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 321
Target Start/End: Original strand, 30289906 - 30289979
Alignment:
Q  248 ttatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataa 321  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||||||||  ||| ||||| || ||| ||||||||    
T  30289906 ttatggtgacaactaaggtactcatggaagaatggtggataatttacctcaaccaatacacattaaccacataa 30289979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 250 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 1388646 - 1388602
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttac 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||    
T  1388646 atggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttac 1388602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 346 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 15611758 - 15611686
Alignment:
Q  346 aactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||| | ||||| ||||||| || ||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  15611758 aactatcttgacctcatcaataaattgtttatttttattggttagtaggtaagttatccaccgttctttaaag 15611686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 79)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 251 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 746648 - 746464
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  746648 tggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaacta 746549  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  746548 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 746464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 252 - 436
Target Start/End: Original strand, 6594458 - 6594643
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  6594458 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 6594557  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  6594558 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 6594643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 250 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 45371173 - 45370988
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||    
T  45371173 atggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 45371074  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  45371073 atcttgaccccgccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 45370988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 251 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 23901961 - 23901775
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||    
T  23901961 tggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 23901862  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  23901861 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaccctt 23901775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 243 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 40735654 - 40735452
Alignment:
Q  243 ttatattatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtattt 342  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| || |||||| |||||  | |||||||||||||||      
T  40735654 ttatattatggtgacaattagggtactcatggaagaatgatgggtaatttacctcaatcaatacacattagccgcataagtacatttttaagtggtatcc 40735555  T
Q  343 atgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaaccttatatt 441  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  40735554 ataaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttatatt 40735455  T
Q  442 att 444  Q
    |||    
T  40735454 att 40735452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 241 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 26710537 - 26710338
Alignment:
Q  241 atttatattatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtat 340  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || | |||||||||| || |||||||||||||||    
T  26710537 atttatactttggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacatcagccacataagcacatttttaagtggtat 26710438  T
Q  341 ttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaaccttata 439  Q
      ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  26710437 ccatgaactatcttgaccccaccaacaaaatgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttata 26710338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 250 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 32327544 - 32327361
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| | || ||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  32327544 atggtgacaactagggtacctatggaagaatgatggataatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaact 32327445  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaa 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  32327444 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggctggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 32327361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 252 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 38997282 - 38997100
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  38997282 ggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatagacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 38997183  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaac 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  38997182 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 38997100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 252 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 17601017 - 17600832
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  17601017 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 17600918  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  17600917 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 17600832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 247 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 27024601 - 27024413
Alignment:
Q  247 attatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatga 346  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| ||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  27024601 attaaggtgacaactagggtacccatggaagaataatgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataatcatatttttaagtggtatccatga 27024502  T
Q  347 actatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27024501 actatcttgaccccaccaataaattgctcattttcattggtttgtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 27024413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Original strand, 1091951 - 1092134
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| |||| ||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  1091951 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 1092050  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  1092051 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 1092134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 4034773 - 4034590
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  4034773 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 4034674  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4034673 cttaaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 4034590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Original strand, 10244582 - 10244765
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  10244582 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatatacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 10244681  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  10244682 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 10244765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 249 - 435
Target Start/End: Original strand, 13815215 - 13815402
Alignment:
Q  249 tatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaac 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| | ||| |||||||| |||| ||||| || |||| ||||||| || |||||||||||||||  ||||||    
T  13815215 tatggtgacaactagggtacccatgaaagaaaggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 13815314  T
Q  349 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  13815315 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 13815402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 252 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 14660627 - 14660461
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  14660627 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttacaccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 14660528  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14660527 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 14660461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Original strand, 2324889 - 2325072
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| |||||||  |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  2324889 ggtgacaactagggtattcatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 2324988  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  2324989 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 2325072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 11185153 - 11184970
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||| || |||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  11185153 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcatataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 11185054  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  11185053 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacctaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 11184970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 250 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 27400586 - 27400399
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | |||||||||||||||  |||||||    
T  27400586 atggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagctacataagtacatttttaagtggtatccatgaact 27400487  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27400486 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 27400399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Original strand, 27651034 - 27651217
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||  ||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  27651034 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 27651133  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27651134 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgggcggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 27651217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 40635399 - 40635216
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  40635399 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 40635300  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  40635299 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaatttacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 40635216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 252 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 34518548 - 34518382
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  34518548 ggtgacaactagggtacccatggaagaatagtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 34518449  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34518448 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 34518382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 258 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 6430648 - 6430471
Alignment:
Q  258 aactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttgac 357  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6430648 aactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgac 6430549  T
Q  358 cccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttc-aaagtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  6430548 cccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcgaaggtaatctagaaaaaacc 6430471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 255 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 10424773 - 10424592
Alignment:
Q  255 gacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatctt 354  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||  ||| ||||| |  |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  10424773 gacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatctt 10424674  T
Q  355 gaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  10424673 gaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 10424592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 251 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 5726311 - 5726128
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||| | || ||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||||    
T  5726311 tggtgacaactagggtatccatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccatataaacacatttttaagtggtaaccatgaacta 5726212  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaac 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  5726211 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 5726128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 252 - 418
Target Start/End: Original strand, 32856436 - 32856602
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||  |||||||||    
T  32856436 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatatacattagccacataagcacatttgtaagtggtatccatgaactat 32856535  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32856536 cttgatcccactaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 32856602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 251 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 4609808 - 4609641
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||| ||||||| || |||||||||||||||  ||||||||    
T  4609808 tggtgacaactagggtacccatggaagaatgttggataatttaccccaaccaatacacattaggcacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 4609709  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4609708 tcttgaccccaccaacaaattacttattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 4609641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 40037323 - 40037141
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||  ||| ||||| || ||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  40037323 ggtgacaactagggtacccatgaaa-aatgatgggtaatttacctcaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 40037225  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  40037224 cttgaccccaccaacaaattggtcattttcattggttggtgggtaaattacccactattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 40037141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 252 - 433
Target Start/End: Original strand, 7892688 - 7892870
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||| ||| |||||||| | || ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  7892688 ggtgacaactagggtatctatggaagaatggtgggtaatttacccaaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 7892787  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaac 433  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7892788 attgaccccgccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 7892870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 249 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 32948629 - 32948445
Alignment:
Q  249 tatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaac 348  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||  ||| ||||| || |||| ||||||| || |||||||||||||||  ||||||    
T  32948629 tatggtgacaactagagtacccatagaagaatgatgggtaatttacctcaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 32948530  T
Q  349 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaac 433  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  32948529 t-tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaac 32948445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 252 - 432
Target Start/End: Original strand, 33427647 - 33427828
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||| ||  |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  33427647 ggtgataactagggtacccatgaaagaatggtgtgtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatctatgaactat 33427746  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaa 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  33427747 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatggataaattacccaccattattcaaaggtaatctagaaaaaa 33427828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 250 - 418
Target Start/End: Original strand, 2914136 - 2914304
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||| ||| ||||||||  ||| | ||| || | |||||||||| || |||||||||||||||  |||||||    
T  2914136 atggtgacaactaggatatccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccgatacacatcagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaact 2914235  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2914236 atcttgactccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 2914304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 248 - 435
Target Start/End: Original strand, 14697533 - 14697721
Alignment:
Q  248 ttatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaa 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||| || | ||||| || ||||| |||||| || |||||||||||||||  |||||    
T  14697533 ttatggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccgaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaa 14697632  T
Q  348 ctatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttc-aaagtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  14697633 ctatcttgatcacaccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaatctaaaaaaaacct 14697721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 252 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 11159802 - 11159637
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||| |||  ||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||    
T  11159802 ggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccatccaatacacaatagccacataaacacatttttaagtggcatccatgaactat 11159703  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  11159702 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtaggtaaatta-ccaccatttttcaaag 11159637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 287 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 32608526 - 32608376
Alignment:
Q  287 taatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattgg 386  Q
    |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  32608526 taatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatacatgaactatcttgacaccaccaacaaattgctcattttcattgg 32608427  T
Q  387 ttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  32608426 ttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 32608376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 251 - 435
Target Start/End: Original strand, 37620866 - 37621054
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||  | || ||||| || | |||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||    
T  37620866 tggtgacaactagggtactcatggaagaatggtggataatttatccaaaccaatacacataagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 37620965  T
Q  351 tcttga---ccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  37620966 tcttgagtaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacct 37621054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 258 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 15925255 - 15925075
Alignment:
Q  258 aactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttgac 357  Q
    |||||||||| | |||  |||||||||| ||||||||  ||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15925255 aactagggtatctatgaaagaatgatggataatttacctcaaccaatacacattagctacataagcatatttttaagtggtatccatgaactatcttgac 15925156  T
Q  358 cccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctta 437  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  15925155 cccaccaataaattactcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttgaaaggtaatctagaaaaaacctta 15925075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 278 - 436
Target Start/End: Original strand, 8432942 - 8433101
Alignment:
Q  278 aatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcat 377  Q
    |||| ||| |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||  ||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8432942 aatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagtatattttaaagtggtatccatgaactatcttgaccacaccaacaaattgctcat 8433041  T
Q  378 tttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaacctt 436  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  8433042 tttcattggttggcaggtaaattatccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacctt 8433101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 255 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 25295013 - 25294888
Alignment:
Q  255 gacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatctt 354  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25295013 gacaactagggtactcatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactatctt 25294914  T
Q  355 gaccccaccaacaaattgctcatttt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  25294913 gaccccaccaacaaattgctcatttt 25294888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 252 - 435
Target Start/End: Original strand, 37255337 - 37255516
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||  |||| ||||| || ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  37255337 ggtgacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 37255436  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||     |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  37255437 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaatt-----ccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 37255516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 252 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9444874 - 9444683
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggc---taatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaac 348  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||    
T  9444874 ggtgacaactagggtatccatggaagaataatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 9444775  T
Q  349 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgg-------gtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaa 432  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||       |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  9444774 tatcttgaccccaccagcaaattgctcattttcattggttggtgggtaattggtaaattacccaccattcttcaaatgtaatctagaaaaaa 9444683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 310 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 42900038 - 42899908
Alignment:
Q  310 ttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccat 409  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  42900038 ttagccacataagcgcatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattaccaaccat 42899939  T
Q  410 tcttc-aaagtaatcttgaaaaaaccttata 439  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||| ||||    
T  42899938 tcttcgaaggtaatctagaaaaaaccatata 42899908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 287 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 12842249 - 12842118
Alignment:
Q  287 taatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattgg 386  Q
    |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  12842249 taatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaattggtatccaagaactatcttgactccaccaacaaattactcattttcattgg 12842150  T
Q  387 ttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  12842149 ttggtggataaattacccaccattcttcaaag 12842118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 251 - 434
Target Start/End: Original strand, 28641291 - 28641464
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||           ||| ||||||||    
T  28641291 tggtgacaactaggctacccatgaaagaataatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacatat-----------attcatgaacta 28641379  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  28641380 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 28641464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 287 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 41172604 - 41172454
Alignment:
Q  287 taatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattgg 386  Q
    |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  41172604 taatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtacctttgaactatcttgacctcaccaataaattactcattttcattgg 41172505  T
Q  387 ttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctta 437  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  41172504 ttggtgggtaaattacccatcattcttcaaatgtaat-ttaaaaaaacctta 41172454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 253 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 39103216 - 39103038
Alignment:
Q  253 gtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatc 352  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||           ||| |||||||||     
T  39103216 gtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------attcatgaactatt 39103128  T
Q  353 ttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaaccttatatt 441  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  39103127 ttgaccccatcaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaaccttatatt 39103038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 251 - 418
Target Start/End: Original strand, 35158049 - 35158205
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||| ||||||| || ||           ||| ||||||||    
T  35158049 tggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacat-----------attcatgaacta 35158137  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35158138 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 35158205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 354 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 12814693 - 12814609
Alignment:
Q  354 tgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctta 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  12814693 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 12814609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 327 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 44481934 - 44481826
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatctt 425  Q
    |||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||     
T  44481934 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatcta 44481835  T
Q  426 gaaaaaacc 434  Q
    |||||||||    
T  44481834 gaaaaaacc 44481826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 338 - 436
Target Start/End: Original strand, 40544151 - 40544250
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  40544151 tattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaactatccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 40544250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 252 - 435
Target Start/End: Original strand, 21734900 - 21735073
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| || ||           ||| |||||||||    
T  21734900 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatatacattagccacataagcacat-----------attcatgaactat 21734988  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | ||||||||||    
T  21734989 cttgacccccccaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacct 21735073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 251 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 29687212 - 29687039
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||   || ||||| || |||||||||||| || ||           ||| ||||||||    
T  29687212 tggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccataaccaatacacattagccacataagcacat-----------attcatgaacta 29687124  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  29687123 tcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatttagaaaaaacc 29687039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 244 - 434
Target Start/End: Original strand, 43898963 - 43899142
Alignment:
Q  244 tatattatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtattta 343  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||           ||| |    
T  43898963 tatatgatggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttac-ccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------attca 43899050  T
Q  344 tgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||    
T  43899051 tgaactatcttgaccccataaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacc 43899142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 327 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 35126886 - 35126778
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatctt 425  Q
    |||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||     
T  35126886 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccgtttttcaaaggtaatcta 35126787  T
Q  426 gaaaaaacc 434  Q
    |||||||||    
T  35126786 gaaaaaacc 35126778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 338 - 418
Target Start/End: Original strand, 39301272 - 39301352
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39301272 tattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 39301352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 248 - 359
Target Start/End: Original strand, 447629 - 447740
Alignment:
Q  248 ttatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaa 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||  |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||    
T  447629 ttatggtgacaactagggtacccatggatgaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatacatgaa 447728  T
Q  348 ctatcttgaccc 359  Q
    ||||||||||||    
T  447729 ctatcttgaccc 447740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 338 - 436
Target Start/End: Original strand, 28566773 - 28566872
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttc-aaagtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  28566773 tattcatgaactatcttgaccccagaaataaattgctcattttcattagttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaagtaatttagaaaaaacctt 28566872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 254 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 145450 - 145297
Alignment:
Q  254 tgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatct 353  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||  |||| ||||| || |||||||||||| ||            ||||| |||||||||||    
T  145450 tgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcac-----------gtattcatgaactatct 145362  T
Q  354 tgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  145361 tgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaag 145297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 252 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 1229809 - 1229675
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggta-cccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||| |||||||  |||| |||||||  ||||||| |||| || |||||||||||||||  ||||||||    
T  1229809 ggtgacaacttgggtaacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatatatattagccagataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 1229710  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattg 385  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  1229709 tcttgaccccatcaacaaattgttcattttcattg 1229675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 343 - 436
Target Start/End: Original strand, 12333575 - 12333669
Alignment:
Q  343 atgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  12333575 atgaactatcttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 12333669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 338 - 435
Target Start/End: Original strand, 27764937 - 27765035
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  27764937 tattcatgaactattttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaatgtaatttagaaaaaacct 27765035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 338 - 438
Target Start/End: Original strand, 2000412 - 2000513
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  2000412 tatttatgaactattttgatcccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 2000511  T
Q  437 at 438  Q
    ||    
T  2000512 at 2000513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 338 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 12730156 - 12730059
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  12730156 tatttatgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 12730059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 251 - 418
Target Start/End: Original strand, 19428425 - 19428581
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||           ||| ||||||||    
T  19428425 tggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------attcatgaacta 19428513  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19428514 tcttgaccccacaagtaaattgctcattttcattggtcggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 19428581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 338 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 3266391 - 3266312
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa 417  Q
    |||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3266391 tattcatgaactatcttgaccccataaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaa 3266312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 250 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 4258661 - 4258488
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||  |||| ||||| || |||||||||||| || ||           ||| |||||||    
T  4258661 atggtgacaactaggctacccatgaacgaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------attcatgaact 4258573  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  4258572 atcttgaccc-acaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatttagaaaaaacc 4258488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 252 - 417
Target Start/End: Original strand, 13543624 - 13543778
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| | || ||||| || |||||||||||| || ||           ||| |||||||||    
T  13543624 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacat-----------attcatgaactat 13543712  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa 417  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  13543713 cttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtaggtaaattacccaccattcttcaaa 13543778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 338 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 27331393 - 27331313
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27331393 tattcatgaactatcttgaccctacaaataaattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 27331313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 345 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 30545909 - 30545837
Alignment:
Q  345 gaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa 417  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30545909 gaactatcttgaccccaccaataagttgctcatttttattgtttggtaggtaaattatccaccattcttcaaa 30545837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 252 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 34249435 - 34249280
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||  ||||||||| || |||| ||||||| || ||           ||| || ||||||    
T  34249435 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttacctcaatcaatacacattagtcacataagcacat-----------attcataaactat 34249347  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  34249346 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtaggtaaattactcaccattcttcaaag 34249280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 338 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 43356191 - 43356097
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  43356191 tattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggt---ttacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 43356097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 338 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 8056721 - 8056641
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||| |||||||||||| || |||| || |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  8056721 tattcatgaactatcttcactccacaaataaatagttcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattcttcaaag 8056641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 362
Target Start/End: Original strand, 28014856 - 28014928
Alignment:
Q  290 tttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccac 362  Q
    ||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  28014856 tttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccac 28014928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 436
Target Start/End: Original strand, 2688804 - 2688903
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||  | ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  2688804 tattcatgaactatcttgaccctacaaataaattgctaattttcattaatcggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 2688903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 3711728 - 3711665
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaatta 401  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  3711728 tattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattgattggtaggtaaatta 3711665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12827243 - 12827137
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||| | |||  ||| | |||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||    
T  12827243 ggtgacaactagagcacctgtggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggta-tcatgaactat 12827145  T
Q  352 cttgaccc 359  Q
    ||| ||||    
T  12827144 cttaaccc 12827137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 278 - 351
Target Start/End: Original strand, 17799272 - 17799345
Alignment:
Q  278 aatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||| ||||||||   ||| |||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17799272 aatgatggataatttacattaattaataaacattagccacatattcatatttttaagtggtattcatgaactat 17799345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 390 - 435
Target Start/End: Original strand, 28019959 - 28020005
Alignment:
Q  390 gtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  28019959 gtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 28020005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 327 - 401
Target Start/End: Original strand, 38985342 - 38985415
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaatta 401  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||   | ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  38985342 tttttaggtggtatccatgaactatcttgacat-atcaataaattgctcattttcattggttggtgagtaaatta 38985415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 321
Target Start/End: Original strand, 2688729 - 2688798
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataa 321  Q
    ||||||||||||| || |||||  |||||||||  |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||    
T  2688729 ggtgacaactaggctatccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataa 2688798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 24168273 - 24168090
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  24168273 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 24168174  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24168173 cttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 24168090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 5882688 - 5882505
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  5882688 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 5882589  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  5882588 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 5882505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 248 - 437
Target Start/End: Original strand, 22551057 - 22551247
Alignment:
Q  248 ttatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaa 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||||||| |||||||  |||||    
T  22551057 ttatggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaggtggtatccatgaa 22551156  T
Q  348 ctatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctta 437  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  22551157 ctatcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 22551247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 249 - 433
Target Start/End: Original strand, 959901 - 960086
Alignment:
Q  249 tatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaac 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||     
T  959901 tatggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatctatgaat 960000  T
Q  349 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaac 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  960001 tatcttgaccccaccaacaaattgctcatttccattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 960086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 248 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 28947273 - 28947076
Alignment:
Q  248 ttatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaa 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||  ||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  28947273 ttatggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatacatgaa 28947174  T
Q  348 ctatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaaccttatattatt 444  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||    
T  28947173 ttatcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctaatgttatt 28947076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 252 - 435
Target Start/End: Original strand, 19415533 - 19415717
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||||    
T  19415533 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgagctat 19415632  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  19415633 cttgaccccaccaacaaattggtcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 19415717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Original strand, 26377204 - 26377387
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  26377204 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 26377303  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  26377304 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatttagaaaaaacc 26377387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 252 - 418
Target Start/End: Original strand, 11988974 - 11989140
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  11988974 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 11989073  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11989074 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttagtgggtaaattacccaccattcttcaaag 11989140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 249 - 430
Target Start/End: Original strand, 18101492 - 18101674
Alignment:
Q  249 tatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaac 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||    
T  18101492 tatggtgacaactaggatacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 18101591  T
Q  349 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaa 430  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  18101592 tattttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaa 18101674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 252 - 435
Target Start/End: Original strand, 2593852 - 2594036
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||  |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  2593852 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtggataatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 2593951  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  2593952 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccacaattcttcaaagataatctagaaaaaacct 2594036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 256 - 435
Target Start/End: Original strand, 14891383 - 14891563
Alignment:
Q  256 acaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttg 355  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14891383 acaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttg 14891482  T
Q  356 accccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  14891483 accccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggcaatctagaaaaaacct 14891563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 254 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 2892368 - 2892189
Alignment:
Q  254 tgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatct 353  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||    
T  2892368 tgacaactagggtacccatagaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 2892269  T
Q  354 tgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaa 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  2892268 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 2892189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 251 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 8615423 - 8615237
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||| | || ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||    
T  8615423 tggtgacaactagggtacccatggaagaatagtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 8615324  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8615323 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 8615237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 253 - 440
Target Start/End: Original strand, 19281056 - 19281244
Alignment:
Q  253 gtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatc 352  Q
    |||||||||||| |||| |||  |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19281056 gtgacaactaggctacctatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatattcatgaactatc 19281155  T
Q  353 ttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaaccttatat 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  19281156 ttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggcaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccatatat 19281244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 249 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 600077 - 599890
Alignment:
Q  249 tatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaac 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||  |||| ||||| |  |||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||    
T  600077 tatggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtggataatttatcccaaccaatacaaattagtcacataaacacatttttaagtggtatccatgaac 599978  T
Q  349 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  599977 tatcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 599890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 252 - 437
Target Start/End: Original strand, 5294801 - 5294987
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||  ||||||||  |||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  5294801 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgagtaatttacctcaatcaatatacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 5294900  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttc-aaagtaatcttgaaaaaacctta 437  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  5294901 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccactattcttcaaaagtaatctagaaaaaatctta 5294987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 252 - 437
Target Start/End: Original strand, 5299353 - 5299539
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||  ||||||||  |||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  5299353 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtgagtaatttacctcaatcaatatacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 5299452  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttc-aaagtaatcttgaaaaaacctta 437  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  5299453 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccactattcttcaaaagtaatctagaaaaaatctta 5299539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Original strand, 34527862 - 34528045
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||| ||||||| || |||||||||||||||  ||||| |||    
T  34527862 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaattat 34527961  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||  ||||||||    
T  34527962 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 34528045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 252 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 1970893 - 1970708
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||| ||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||    
T  1970893 ggtgacaactaaagtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtgatattcatgaactat 1970794  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  1970793 cttgaccccaccaacaaattgtttattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 1970708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 252 - 436
Target Start/End: Original strand, 7393586 - 7393771
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  7393586 ggtgacaattatggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 7393685  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  7393686 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattactcaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacctt 7393771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 261 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 16703539 - 16703363
Alignment:
Q  261 tagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttgacccc 360  Q
    |||| ||||||||| |||||||||  |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| || |||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  16703539 taggatacccatggaagaatgatgcgtaatttaccccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccataaactatcttgacccc 16703440  T
Q  361 accaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  16703439 accaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 16703363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 246 - 418
Target Start/End: Original strand, 22341782 - 22341956
Alignment:
Q  246 tattatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatg 345  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||    
T  22341782 tattaaggtgacaactaaggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatg 22341881  T
Q  346 aactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggt--tggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22341882 aactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttgtgttgggtaaattacccaccattcttcaaag 22341956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 254 - 434
Target Start/End: Original strand, 7345114 - 7345295
Alignment:
Q  254 tgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatct 353  Q
    ||||||||| ||||  ||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||| |    
T  7345114 tgacaactaaggtagacatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactattt 7345213  T
Q  354 tgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  7345214 tgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccactattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 7345295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Original strand, 10507908 - 10508091
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||| ||| || ||||| |||| ||||| || |||||||| ||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  10507908 ggtgacaactagggtagccatcgaagaatggtgggtagtttaccccaaccaatacacattagccacgtaagcacatttttaagtggtatccatgaactat 10508007  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  10508008 cttgaccccaccaacaaattgctcattatcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacc 10508091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 248 - 432
Target Start/End: Original strand, 33452568 - 33452753
Alignment:
Q  248 ttatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaa 347  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||  | |||||||||||||||  |||||    
T  33452568 ttatggtgacaactaggatacccatggaagaatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatccatgaa 33452667  T
Q  348 ctatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaa 432  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  33452668 ctatcttgaccccaacaacaaattattcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaa 33452753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 418
Target Start/End: Original strand, 24224060 - 24224236
Alignment:
Q  242 tttatattatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatt 341  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||  |||||  | | ||||||||  ||| ||||| || |||| ||||||| || |||||||||||||||     
T  24224060 tttattttatggtgacaactaggatactcatgaaagaatagtaggtaatttacctcaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatc 24224159  T
Q  342 tatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24224160 catgaactatcttgaccctaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 24224236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 310 - 434
Target Start/End: Original strand, 30467661 - 30467786
Alignment:
Q  310 ttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccat 409  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  30467661 ttagccacataagcacatgtttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgtttggtgggtaaattacccaccat 30467760  T
Q  410 tcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||    
T  30467761 tcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 30467786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 252 - 432
Target Start/End: Original strand, 30743448 - 30743629
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||| || ||||||| |||||  |||||| | | |||||||  |||| ||||| |  |||||||||||| || |||||||||||||||  || ||||||    
T  30743448 ggtgataattagggtatccatgaaagaatggtaggtaatttatcccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccataaactat 30743547  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaa 432  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  30743548 cttgatctcaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 30743629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 246 - 441
Target Start/End: Original strand, 28948839 - 28949024
Alignment:
Q  246 tattatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatg 345  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| |||||           ||| |||    
T  28948839 tattttggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatat-----------attcatg 28948927  T
Q  346 aactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaaccttatatt 441  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    
T  28948928 aattatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaaccttctatt 28949024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 15965604 - 15965432
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||           ||| ||||| |||    
T  15965604 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacat-----------attcatgaagtat 15965516  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  15965515 cttaaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatttagaaaaaacc 15965432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 252 - 401
Target Start/End: Original strand, 23261929 - 23262078
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||| | ||| |||||||| |||| ||||| |  ||| || ||||| || ||||||||||| |||  |||||||||    
T  23261929 ggtgacaactagggtacctatgaaagaacggtggataatttaccccaaccaatacatattaacctcataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 23262028  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaatta 401  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23262029 cttaaccccatcaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaatta 23262078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 352 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 929741 - 929657
Alignment:
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  929741 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 929657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 327 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 7167689 - 7167580
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatctt 425  Q
    |||||| |||||||  || ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||     
T  7167689 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccccactaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatcta 7167590  T
Q  426 gaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||    
T  7167589 gaaaaaacct 7167580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 259 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 13329545 - 13329378
Alignment:
Q  259 actagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttgacc 358  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||           |||||||||||||||| |||    
T  13329545 actaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------atttatgaactatcttaacc 13329457  T
Q  359 ccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  13329456 ccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 13329378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 338 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 3291104 - 3291024
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3291104 tatttatgaactatcttaaccccacaaataaattgttcattttaattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 3291024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 1398724 - 1398551
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||| |||| |||  ||||||| || ||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| || |           |||| || ||||||    
T  1398724 ggtgacaactaggctacctatgaaagaatgacgggtaatttactccaaccaatacatattagccacataagcaca-----------tattcatcaactat 1398636  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||    
T  1398635 cttgacctcacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccatttttcaaagataatttagaaaaaacct 1398551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 338 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 4487623 - 4487546
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttca 415  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4487623 tattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattagttggtgggtaaattacccaccattcttca 4487546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 336 - 436
Target Start/End: Original strand, 375797 - 375898
Alignment:
Q  336 ggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttc-aaagtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||  ||||||||    
T  375797 ggtattcataaactatcttgaccccaccaataaattgcgcattatgattagttggtaggtaaattacccaccatttttcaaaagtaatctaaaaaaaacc 375896  T
Q  435 tt 436  Q
    ||    
T  375897 tt 375898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 343 - 418
Target Start/End: Original strand, 1939584 - 1939659
Alignment:
Q  343 atgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  1939584 atgaattatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggtttataggtaaattatccaccattcttcaaag 1939659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 251 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 3786921 - 3786749
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| ||||  |||| || |||||||||||| || ||           ||| ||||||||    
T  3786921 tggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttaccccaactaatacacattagccacataagcacat-----------attcatgaacta 3786833  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttc-aaagtaatcttgaaaaaac 433  Q
    | |||||||||| || |||||  ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  3786832 tattgaccccacaaataaattcttcattttcattgattggtaggtaaattatccaccattcttcaaaagtaatttagaaaaaac 3786749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 327 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 13844943 - 13844852
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||| |||| ||| ||| |||||||| |||||||    
T  13844943 tttttaggtggtatttatgaactattttgactccatcaataaattgttcattttcatttgttagtggttaagttaaccaccatttttcaaag 13844852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 251 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 18661906 - 18661836
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataa 321  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||  |||| ||||| |  ||||||||||||    
T  18661906 tggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatggataatttatcccaaccaatacatattagccacataa 18661836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 7167753 - 7167700
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaata 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| |||| |||||    
T  7167753 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaata 7167700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 114)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 47257975 - 47257792
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  47257975 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtattcatgaactat 47257876  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  47257875 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 47257792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 250 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 24100466 - 24100279
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||  ||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  24100466 atggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatc-atgaact 24100368  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctta 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  24100367 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 24100279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 252 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 49330219 - 49330035
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  49330219 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 49330120  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  49330119 cttgaccccaccaacaaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 49330035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 253 - 436
Target Start/End: Original strand, 51170034 - 51170218
Alignment:
Q  253 gtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatc 352  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||    
T  51170034 gtgacaactatggtacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 51170133  T
Q  353 ttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  51170134 ttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacctt 51170218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 246 - 435
Target Start/End: Original strand, 28048386 - 28048576
Alignment:
Q  246 tattatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatg 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| | ||| |||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||    
T  28048386 tattatggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccaaattaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatg 28048485  T
Q  346 aactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  28048486 aactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 28048576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Original strand, 35748311 - 35748494
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||  |||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  35748311 ggtgacaactagggtatccatggaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 35748410  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  35748411 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccactattcttcaaagctaatctaaaaaaaacc 35748494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 252 - 432
Target Start/End: Original strand, 38416724 - 38416905
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||| ||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  38416724 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacgtaagcacatttttaagtggtatccatgaactat 38416823  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaa 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  38416824 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaa 38416905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 252 - 435
Target Start/End: Original strand, 43612047 - 43612231
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||| ||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  43612047 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 43612146  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  43612147 cttgaccacgccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaatgtaatctagaaaaaacct 43612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Original strand, 47809596 - 47809780
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactcc-aatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| || || ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  47809596 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaacta 47809695  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  47809696 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 47809780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 252 - 438
Target Start/End: Original strand, 27066978 - 27067165
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||  |||| ||||| || |||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||    
T  27066978 ggtgacaactagggtatccatggaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatattcatgaactat 27067077  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaaccttat 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  27067078 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggttggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacgttat 27067165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 251 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 37313582 - 37313395
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  37313582 tggtgacacctagagtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtgatattcatgaacta 37313483  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctta 437  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  37313482 tcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 37313395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 252 - 437
Target Start/End: Original strand, 7855114 - 7855300
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||  |||| ||||| |  |||||||||||| || |||||||||||||||   ||||||||    
T  7855114 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccttgaactat 7855213  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttc-aaagtaatcttgaaaaaacctta 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  7855214 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaatctagaaaaaacctta 7855300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 252 - 441
Target Start/End: Original strand, 29625827 - 29626017
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||| || |||||||||||| | |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  29625827 ggtgataattagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcatatttttaagtggtatccatgaactat 29625926  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaaccttatatt 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  29625927 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttttatt 29626017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 252 - 437
Target Start/End: Original strand, 32234398 - 32234583
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||| | || ||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||    
T  32234398 ggtgacaactagggtacccatggaagaatagtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcatatttt-aagtggtatccatgaactat 32234496  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctta 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  32234497 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctta 32234583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 252 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 37324723 - 37324537
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||  |||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  37324723 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaatatatttttaagtggtatacatgaactat 37324624  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctta 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  37324623 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattacctaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctta 37324537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 249 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 40643985 - 40643799
Alignment:
Q  249 tatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaac 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||| || |||  || |||    
T  40643985 tatggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatgatatccataaac 40643886  T
Q  349 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  40643885 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaagataatttagaaaaaacc 40643799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 251 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 41464535 - 41464349
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||  ||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||    
T  41464535 tggtgacaactagagtacccatggaagaatgctgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 41464436  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  41464435 tcttgactccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 41464349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 252 - 436
Target Start/End: Original strand, 40130959 - 40131144
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  40130959 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 40131058  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  40131059 cttgaccccacagacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 40131144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 252 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 42292024 - 42291840
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||  | ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  42292024 ggtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagtacattttcaagtggtatctatgaactat 42291925  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  42291924 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 42291840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 251 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 52629136 - 52628953
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  52629136 tggtgacaactagggtacc-atggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaacta 52629038  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  52629037 tcttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaataaacc 52628953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 249 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 22399281 - 22399095
Alignment:
Q  249 tatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaac 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| || ||||| ||||||| |  ||||||    
T  22399281 tatggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagctacataagcacatttt-aagtggtttccatgaac 22399183  T
Q  349 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22399182 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacct 22399095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 40420017 - 40419834
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  40420017 ggtgacaactagggtacccatgaaagaatggtgagtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 40419918  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  40419917 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 40419834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 254 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 48609903 - 48609724
Alignment:
Q  254 tgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatct 353  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| | || ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||    
T  48609903 tgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 48609804  T
Q  354 tgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttc-aaagtaatcttgaaaaaa 432  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  48609803 taaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattatccaccattcttcgaaggtaatcttaaaaaaa 48609724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 252 - 438
Target Start/End: Original strand, 51102378 - 51102565
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||| | ||||||||||| |||  |||||||||    
T  51102378 ggtgacaactagggtaccaacggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaatacatttttaagtgatatccatgaactat 51102477  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaaccttat 438  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  51102478 cttgaccccaccaacaaattactcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttat 51102565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 252 - 435
Target Start/End: Original strand, 48739233 - 48739417
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||| ||    
T  48739233 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacaat 48739332  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttc-aaagtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  48739333 cttgaccccaccaacaaatttctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccatttttcaaaagtaatctagaaaaaacct 48739417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Original strand, 7755307 - 7755489
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||||| |||||||||  || | ||||    
T  7755307 ggtgacaagtagggtacccatggaagaatgatgggttatttaccccaagcaatacacattagccacataagcacatttt-aagtggtatccataatctat 7755405  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  7755406 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 7755489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Original strand, 20754393 - 20754576
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||| ||| |||||||  |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  20754393 ggtgacaactagggtactcatggaataatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaacatatttttaagtgatatccatgaactat 20754492  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  20754493 cttgactctaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 20754576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 252 - 438
Target Start/End: Original strand, 40804510 - 40804697
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| | ||  |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  40804510 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccctaactaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactat 40804609  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaaccttat 438  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  40804610 cttgatcctaccaacaaattgctcattttcattggttgatgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaatcttat 40804697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 44806866 - 44806683
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||| ||| ||||| |  |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  44806866 ggtgacaactagggtacccatgaaagaattgtggataatttacttcaaccaatacatattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 44806767  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  44806766 cttgattccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 44806683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Original strand, 53943588 - 53943770
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  |||||||||||||||||  |||||||||    
T  53943588 ggtgacaactagagtacc-atggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagctacataagtatatttttaagtggtatccatgaactat 53943686  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  53943687 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 53943770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 252 - 433
Target Start/End: Original strand, 39634572 - 39634753
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  39634572 ggtgacaactagggtacccatggaagaattgtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 39634671  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttc-aaagtaatcttgaaaaaac 433  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  39634672 -ttgaccccaccaacaaattactcattttcattggttggtgggtaaaatacccaccattcttcaaaagtaatctagaaaaaac 39634753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 251 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 41732711 - 41732525
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| || ||| ||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||    
T  41732711 tggtgacaactggggtatccatggaaggatggtgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 41732612  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  41732611 tcttgaccccactaacaaattgctcattttcattgattgatggataaattatccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 41732525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 251 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 44223012 - 44222827
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || ||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||| |    
T  44223012 tggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtattcatgaacaa 44222913  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||| ||||| | ||||||||||    
T  44222912 tcttgaccccaccaacaaatttctcattttcattggttgatgggtaaattacccactatttttcaaaggtaatttagaaaaaacct 44222827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 256 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 35594299 - 35594119
Alignment:
Q  256 acaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttg 355  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||  ||||  |||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  35594299 acaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaactaatacacattagccacataagcatatttttaagtgatatccatgaactatcttg 35594200  T
Q  356 accccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaacct 435  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  35594199 accccatcaacaaattgctcatttttattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctaaaaaaaacct 35594119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 251 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 36369121 - 36368938
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||| |||||| | |||||||| ||| || ||| |||||||| | || |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||    
T  36369121 tggtgataactagagcacccatggaaga-tggtgggtaatttaccctaaccaatatacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 36369023  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  36369022 tcttgaccccaccaacaaattgctcatttttattagttggtgggtaaattatcgaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 36368938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 253 - 436
Target Start/End: Original strand, 55453245 - 55453429
Alignment:
Q  253 gtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatc 352  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||  ||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||    
T  55453245 gtgacaactagggtacctatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatc 55453344  T
Q  353 ttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  55453345 ttgaccccaccaataaattgctcattttcattggttgatgagtaaattacccaccattcttcaaaggtaacctagaaaaaacctt 55453429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 2666182 - 2665999
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||  ||| ||||||||   || ||||| || |||||||||||| || | |||||||||||||  |||||||||    
T  2666182 ggtgacaactagagtacccatgaaagaatagtgggtaatttaccataaccaatacacattagccacataagcacagttttaagtggtatccatgaactat 2666083  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  2666082 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 2665999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 252 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 46126168 - 46126010
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||| ||||||  |||||||||    
T  46126168 ggtgacaactagggtacc-atggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaaatggtatccatgaactat 46126070  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46126069 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattagttggtgggtaaattatccaccattc 46126010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 252 - 438
Target Start/End: Original strand, 51452751 - 51452937
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| | || ||||| || ||||| |||||| || |||||||||||||||  || ||||||    
T  51452751 ggtgacaattagggtacc-atggaagaatgatgggtaatttaccctaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccataaactat 51452849  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaaccttat 438  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  51452850 cttgaccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaactttat 51452937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 249 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 46134541 - 46134357
Alignment:
Q  249 tatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaac 348  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||  |||||| ||  ||||||||  ||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||    
T  46134541 tatggtgacaattagggtatccatgaaagaatggtgaataatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaac 46134442  T
Q  349 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaa 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  46134441 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtaggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaa 46134357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 252 - 438
Target Start/End: Original strand, 5560025 - 5560219
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgtta--gccacataaacatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||  | ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  5560025 ggtgacaactagggtactcatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatagacattatagtcacataagcatatttttaagtggtatccatgaact 5560124  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattt-----tgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaaccttat 438  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||     | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  5560125 atcttgaccccacaaacaaattgctcatttaattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaaccttat 5560219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 39053576 - 39053393
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||| ||| ||||   | |||||||| |||||||| ||||  |||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  39053576 ggtgacaactagagtatccataaaaaaatgatgggtaatttaccccaacgaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 39053477  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  39053476 cttgaccccatcaacaaattgatcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 39053393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 253 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 43021896 - 43021730
Alignment:
Q  253 gtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatc 352  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||| ||| |||||||| |||| ||||| |  ||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  43021896 gtgacaactagggtacctatgaaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacatattagctacataagcacatttttaagtggtattcatgaactatc 43021797  T
Q  353 ttga-ccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43021796 ttgacccccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 43021730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 254 - 434
Target Start/End: Original strand, 47894822 - 47895003
Alignment:
Q  254 tgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatct 353  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||  |||  ||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||    
T  47894822 tgacaactagggtacccatggaagaatggtggatgatttacctcaactaatatacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 47894921  T
Q  354 tgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||    
T  47894922 tgaccccaccaacaaattgttcattttcattagttggtaggtaaattatccaccattctttaaaggtaatctaaaaaaaacc 47895003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 250 - 434
Target Start/End: Original strand, 51146213 - 51146398
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaact 349  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||  ||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||    
T  51146213 atggtggcaactagggtacccatgaaagaatggtgggtaatttacctcaatcaatacacattagccacataagcaaatttttaagtggtatccatgaact 51146312  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| || |||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  51146313 atcttgaccccaccaataaattgttcattttcattgattgatgtgtaaattacctaccattcttcaaagataatctagaaaaaacc 51146398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 252 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 52639024 - 52638839
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||| | | |||| ||| ||||||||  ||||||||| || ||||||||| || || |||||||||||||||  ||||| |||    
T  52639024 ggtgacaactagggtacccatagaataatggtgggtaatttacctcaatcaatacacattagccacagaagcacatttttaagtggtatccatgaattat 52638925  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  52638924 cttgatcccaccaacaaattgctcattttcattggttcgttggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctagaaaaaacctt 52638839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 252 - 431
Target Start/End: Original strand, 41293319 - 41293498
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||| ||| |||||||| | || ||||| || |||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||| |||    
T  41293319 ggtgacaattagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccctaaccaatacacattagccacataagcacatttt-aagtggtattcatgaattat 41293417  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaa 431  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  41293418 cttgatcccaccaacaaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaa 41293498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 276 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 43125989 - 43125828
Alignment:
Q  276 agaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctc 375  Q
    |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||| ||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43125989 agaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgaccccaccaataaattgctc 43125890  T
Q  376 attttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    ||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  43125889 attttcattgattagtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacctt 43125828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 254 - 433
Target Start/End: Original strand, 53832486 - 53832666
Alignment:
Q  254 tgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatct 353  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |   ||||||| ||||||  || ||||||||    
T  53832486 tgacaactagggaacacatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacatattagccacataagcccctttttaattggtatccataaactatct 53832585  T
Q  354 tgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttc-aaagtaatcttgaaaaaac 433  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  53832586 tgacaccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaatctagaaaaaac 53832666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 315 - 436
Target Start/End: Original strand, 54159051 - 54159173
Alignment:
Q  315 cacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttc 414  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54159051 cacataagcacatttttaagtggtatctatgaactatcttgactccaccaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttc 54159150  T
Q  415 -aaagtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
     |||||||||| |||||||||||    
T  54159151 aaaagtaatctagaaaaaacctt 54159173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 254 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 43184092 - 43183928
Alignment:
Q  254 tgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatct 353  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||  ||||||||  ||| ||||| || ||||| |||||| || |||||||||||||||  |||||||||||    
T  43184092 tgacaactagggtacctatggaagaatggtgagtaatttacctcaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatct 43183993  T
Q  354 tgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  43183992 tgatctcaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataaattactcaccattcttcaaag 43183928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 287 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 53637988 - 53637841
Alignment:
Q  287 taatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattgg 386  Q
    ||||||||  ||| ||||| || ||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  53637988 taatttacctcaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaattatcctgaccccactaacaaattgctcattttcattgg 53637889  T
Q  387 ttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaac 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  53637888 ttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaac 53637841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 277 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 24376730 - 24376572
Alignment:
Q  277 gaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctca 376  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||  |||| || | |||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24376730 gaatggtgggtaatttaccccaacaaatacacataagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgatcccaccaacaaattgctca 24376631  T
Q  377 ttttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24376630 ttttcattggttggtgcgtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 24376572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 287 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 52215223 - 52215077
Alignment:
Q  287 taatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattgg 386  Q
    |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |    
T  52215223 taatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactatcttgactccaccaacaaattgctcatgttcattag 52215124  T
Q  387 ttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaa 432  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  52215123 ttggtgggtaaattacccatcattcttcaaaggtaatctagaaaaaa 52215077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 252 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18947085 - 18946904
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||    ||| ||||| || |||| ||||||| || |||||||| ||||||  |||||||||    
T  18947085 ggtgacaagtagggtacccatggaagaatggtgggtaatttgtctcaaccaatacacattagtcacataagcacatttttaactggtatccatgaactat 18946986  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaa 432  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18946985 cttgaccccacaaacaaattgttcattttcattggttggtaggtaaattacgcaccattcttcaaagataatctagaaaaaa 18946904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 241 - 445
Target Start/End: Original strand, 34279710 - 34279904
Alignment:
Q  241 atttatattatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtat 340  Q
    |||||| |||||||| |||||||| || |||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||           ||    
T  34279710 atttattttatggtggcaactaggctatccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------at 34279798  T
Q  341 ttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaaccttata 439  Q
    | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||     
T  34279799 tcatgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaaccttatt 34279898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 41216637 - 41216454
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||  ||| |||||||  ||||| |||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  41216637 ggtgacaactagagtacctatggaagaatagtgggtaatttatcccaattaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 41216538  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
     || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||    
T  41216537 attaaccccaccaacaaattgcttattttcattggttgatggataaattacccaccatcctttaaaggtaatctagaaaaaacc 41216454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 254 - 436
Target Start/End: Original strand, 48546842 - 48547014
Alignment:
Q  254 tgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatct 353  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||         ||||||| || |||||||||||||||  ||||||||| |    
T  48546842 tgacaactagggtatccatggaagaatggtggataatttaccccaatcaata---------cacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat-t 48546931  T
Q  354 tgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  48546932 tgaccc-accaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacctt 48547014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 288 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 37759075 - 37758925
Alignment:
Q  288 aatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggt 387  Q
    ||||||| |||| ||||| || ||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||    
T  37759075 aatttaccccaaccaatacacattagccacataagtacatttttaagtggtatctatgaactatcttgacttcatcaacaaattgctcattttcattggt 37758976  T
Q  388 tggtgggtaaattatccaccattcttc-aaagtaatcttgaaaaaacctta 437  Q
    || ||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  37758975 tgatggataaattattcaccattcttcaaaagcaatctagaaaaaacctta 37758925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 252 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 52864671 - 52864550
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||    
T  52864671 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttactc-aaccaatatacattagctacataaacacatttttaaatggtatccatgaactat 52864573  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgct 374  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  52864572 cttgaccccaccaacaaattgct 52864550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 249 - 435
Target Start/End: Original strand, 47510937 - 47511113
Alignment:
Q  249 tatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaac 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||           ||| ||||||    
T  47510937 tatggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttactccaatcaatacacattagccacataagcacat-----------attcatgaac 47511025  T
Q  349 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | ||||||||||    
T  47511026 tatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacct 47511113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 252 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 25641817 - 25641644
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||| |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||           |||||||||||||    
T  25641817 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------atttatgaactat 25641729  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  25641728 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacct 25641644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 269 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 46949538 - 46949391
Alignment:
Q  269 ccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaa 368  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||    
T  46949538 ccatggaagaatggtgggtaattta-tccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatccatgaactatcttgatcccgccaacaa 46949440  T
Q  369 attgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  46949439 attgttcattttcattggtcggtgggtaaattacacacca-tcttcaaag 46949391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 327 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 53115554 - 53115446
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatctt 425  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||     
T  53115554 tttttaagtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatcta 53115455  T
Q  426 gaaaaaacc 434  Q
    |||||||||    
T  53115454 gaaaaaacc 53115446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 42590001 - 42589829
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||| |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||           ||| |||||||||    
T  42590001 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------attcatgaactat 42589913  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  42589912 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 42589829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 327 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 25353661 - 25353549
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatctt 425  Q
    |||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||     
T  25353661 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgcttattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatcta 25353562  T
Q  426 gaaaaaaccttat 438  Q
    |||||||||||||    
T  25353561 gaaaaaaccttat 25353549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 252 - 418
Target Start/End: Original strand, 31286793 - 31286948
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||| ||| ||||  |||||||||  ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| || ||           ||| |||||||||    
T  31286793 ggtgacaactaggctactcatgaaagaatgatgagtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------attcatgaactat 31286881  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31286882 cttgaccccacaaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 31286948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 252 - 418
Target Start/End: Original strand, 38156632 - 38156787
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||           ||| |||||||||    
T  38156632 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------attcatgaactat 38156720  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38156721 cttgaccccacaaataaattgttcattttaattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 38156787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 327 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 55380092 - 55379984
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatctt 425  Q
    |||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||     
T  55380092 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatcta 55379993  T
Q  426 gaaaaaacc 434  Q
    |||||||||    
T  55379992 gaaaaaacc 55379984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 276 - 434
Target Start/End: Original strand, 39141148 - 39141298
Alignment:
Q  276 agaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctc 375  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||| || || |         ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  39141148 agaatgatgggtaatttaccccaatcaatacacattagccacataagcacatat---------attcatgaactatcttgaccccacaaataaattgctc 39141238  T
Q  376 attttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttc-aaagtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  39141239 attttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaagtaatttagaaaaaacc 39141298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 252 - 436
Target Start/End: Original strand, 54707220 - 54707394
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||| |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||           ||| |||||||||    
T  54707220 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------attcatgaactat 54707308  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  54707309 cttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 54707394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 254 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 45059052 - 45058899
Alignment:
Q  254 tgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatct 353  Q
    ||||||||||| | ||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || ||           ||| |||||||||||    
T  45059052 tgacaactaggctgcccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaatcaatatacattagcaacataagcacat-----------attcatgaactatct 45058964  T
Q  354 tgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  45058963 tgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaag 45058899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Original strand, 41635800 - 41635972
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||  ||||||||| || |||||||||||| || ||           ||| |||||||||    
T  41635800 ggtgacaactagattacccatgaaagaatgatgggtaatttacctcaatcaatacacattagccacataagcacat-----------attcatgaactat 41635888  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  41635889 cttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 41635972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 338 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 40022170 - 40022090
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40022170 tattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgctcatttttattggttggtgggtaaattatccatcattcttcaaag 40022090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 252 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 54401358 - 54401203
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    |||| ||| |||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |           |||| |||||||||    
T  54401358 ggtggcaattaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcaca-----------tattcatgaactat 54401270  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54401269 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaag 54401203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 338 - 436
Target Start/End: Original strand, 17665599 - 17665698
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttca-aagtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| | |||||||||||    
T  17665599 tattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcataggtaatttagaaaaaacctt 17665698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 252 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 24688285 - 24688107
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||| || || || ||||||||||||||| ||           ||| |||||||||    
T  24688285 ggtgacaactaggttacccatgaaagaatgatggataatttaccccaaccagtagacattagccacataaacacat-----------attcatgaactat 24688197  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaaccttatat 440  Q
     |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||| | |||||||| ||||||    
T  24688196 tttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccacaatttttcaaaggtaatttagaaaaaacattatat 24688107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 346 - 432
Target Start/End: Original strand, 41882074 - 41882161
Alignment:
Q  346 aactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaa 432  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  41882074 aactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaa 41882161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 252 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 51416140 - 51415966
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||           ||  |||||||||    
T  51416140 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------atacatgaactat 51416052  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  51416051 cttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 51415966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 327 - 436
Target Start/End: Original strand, 30251565 - 30251675
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatctt 425  Q
    |||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||| |||     
T  30251565 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgagtaaattacccaccatttttcaaaggtagtcta 30251664  T
Q  426 gaaaaaacctt 436  Q
    |||||||||||    
T  30251665 gaaaaaacctt 30251675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 251 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 37028895 - 37028739
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||           ||| ||||||||    
T  37028895 tggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacat-----------attcatgaacta 37028807  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  37028806 tcttgactccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattctttaaag 37028739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 338 - 438
Target Start/End: Original strand, 51224113 - 51224213
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  51224113 tattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgctcatttttatt-gttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 51224211  T
Q  437 at 438  Q
    ||    
T  51224212 at 51224213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Original strand, 55000178 - 55000350
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||           ||| |||||||||    
T  55000178 ggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------attcatgaactat 55000266  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttc-aaagtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||| | |||||||||    
T  55000267 cttgaccctacaaataaattgctcattttcattggttagtgggtaaattacccaccattcttctaaggtaatttagaaaaaacc 55000350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 327 - 434
Target Start/End: Original strand, 42998853 - 42998960
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatctt 425  Q
    |||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||     
T  42998853 tttttaggtggtatccataaactatcttgaccccaccaataaattgatcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatt-ttcaaaggtaatcta 42998951  T
Q  426 gaaaaaacc 434  Q
    |||||||||    
T  42998952 gaaaaaacc 42998960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 255 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 49130746 - 49130575
Alignment:
Q  255 gacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatctt 354  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||           ||| ||||||||||||    
T  49130746 gacaactagggtacccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacat-----------attcatgaactatctt 49130658  T
Q  355 gaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | |||||||||||    
T  49130657 gacctcatcaataaattgctcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacctt 49130575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 327 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 51143924 - 51143833
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||||| |||||||  || |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  51143924 tttttaggtggtatccataaactatattgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaag 51143833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 346 - 438
Target Start/End: Original strand, 21597231 - 21597324
Alignment:
Q  346 aactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaaccttat 438  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  21597231 aactatcttgatcccaccaataaattgctcattataattggttggtgggtaaattactcaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaaccttat 21597324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 326 - 437
Target Start/End: Original strand, 2227998 - 2228110
Alignment:
Q  326 atttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatct 424  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||| | ||||||||  |||||||| |||||| |||||||    
T  2227998 attttgaagtgatatctatgaactatcttgacctcaccaataaattgcttattttcattggttgatcggtaaatttcccaccatttttcaaaggtaatct 2228097  T
Q  425 tgaaaaaacctta 437  Q
     ||||||||||||    
T  2228098 agaaaaaacctta 2228110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 346 - 418
Target Start/End: Original strand, 50731997 - 50732069
Alignment:
Q  346 aactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  50731997 aactaccttgaccccaccaacaaattgctcattaagattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaag 50732069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 346 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 50780859 - 50780787
Alignment:
Q  346 aactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  50780859 aactaccttgaccccaccaacaaattgctcattaagattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaag 50780787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 252 - 367
Target Start/End: Original strand, 33550467 - 33550582
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| ||||||||  ||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||| |||    
T  33550467 ggtgacaactagggtattcatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaattat 33550566  T
Q  352 cttgaccccaccaaca 367  Q
    ||| ||||||||||||    
T  33550567 cttaaccccaccaaca 33550582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 326 - 443
Target Start/End: Original strand, 8847721 - 8847838
Alignment:
Q  326 atttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatct 424  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||  ||||||||| ||| |||||||||| ||||| |    
T  8847721 atttttaagtggtattcgtgaactattttgatcccaccaataaattgttcatttttattagttggtatgtaaattatacactattcttcaaaggtaat-t 8847819  T
Q  425 tgaaaaaaccttatattat 443  Q
    | |||||||||||||||||    
T  8847820 taaaaaaaccttatattat 8847838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 432
Target Start/End: Original strand, 43176802 - 43176908
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatctt 425  Q
    |||||| |||||||  || ||||||||||||  |||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||     
T  43176802 tttttaggtggtatccataaactatcttgacatcaccaataaattgttcattatgattggttggtggataaattatccaccatttttcaaaggtaatcta 43176901  T
Q  426 gaaaaaa 432  Q
    |||||||    
T  43176902 gaaaaaa 43176908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 348 - 418
Target Start/End: Original strand, 44946014 - 44946084
Alignment:
Q  348 ctatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  44946014 ctatcttgaccccacaaataaattgctcattttcattggttggtggataaattacccaccattcttcaaag 44946084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 346 - 438
Target Start/End: Original strand, 28576195 - 28576288
Alignment:
Q  346 aactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaaccttat 438  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  28576195 aactatcttgaccccaccaataaattgttcattttcatcggttgatgggtaaattacccatcatacttcaaaggtaatctagaaaaaaccttat 28576288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 310 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 47182124 - 47182049
Alignment:
Q  310 ttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattg 385  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47182124 ttagccacataagtacatttttaagtggtatccataaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattg 47182049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 358 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 52434216 - 52434138
Alignment:
Q  358 cccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggt-aaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  52434216 cccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaaacc 52434138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 326 - 418
Target Start/End: Original strand, 47402813 - 47402904
Alignment:
Q  326 atttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  47402813 atttttaaatggtatc-atgaactatcttgaccctaccaataaattgttcattttcattgattgatggataaattacccaccattctttaaag 47402904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 343 - 434
Target Start/End: Original strand, 48726078 - 48726170
Alignment:
Q  343 atgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||| ||||||| | ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||    
T  48726078 atgaactgtcttgactctaccaataaattgcttattttcattgattggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatttagaaaaaacc 48726170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 358 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 48752161 - 48752101
Alignment:
Q  358 cccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  48752161 cccaccaataaattgcacattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaag 48752101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 327 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 40165758 - 40165684
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaatta 401  Q
    |||||| |||||||  || |||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  40165758 tttttaggtggtatccataaactatcttgactccaccaataaattactcattatgattgcttggtgggtaaatta 40165684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 399
Target Start/End: Original strand, 52756146 - 52756207
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaat 399  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  52756146 tattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgttcattttcattggttagtgggtaaat 52756207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 339
Target Start/End: Original strand, 30429227 - 30429314
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggta 339  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||| ||| |||||||  ||||| |||| |  |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  30429227 ggtgacaactagggtacctacggaagaatggtggataatttatcccaattaatacatattagtcacataaacacatttttaagtggta 30429314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 349 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 177246 - 177177
Alignment:
Q  349 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||| || |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  177246 tatcttgatcccaccaataaattactcgttatgattggttggtgactaaattacccaccatttttcaaag 177177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 25353725 - 25353673
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaat 304  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||    
T  25353725 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttaccccaaccaat 25353673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 299
Target Start/End: Original strand, 50731913 - 50731961
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||    
T  50731913 tggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggaaatttactccaa 50731961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 50780943 - 50780891
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaa 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||| |||    
T  50780943 tggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggaaatttactccaaccaa 50780891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 55380158 - 55380103
Alignment:
Q  250 atggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaata 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| |||| |||||    
T  55380158 atggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaata 55380103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 382 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 37741487 - 37741433
Alignment:
Q  382 attggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacct 435  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  |||||||||    
T  37741487 attggttggtgggtaaattacccaccattctttaaaggtaatctaaaaaaaacct 37741433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 294
Target Start/End: Original strand, 52756063 - 52756109
Alignment:
Q  248 ttatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttac 294  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  52756063 ttatggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttac 52756109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 293
Target Start/End: Original strand, 43176738 - 43176779
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaattta 293  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  43176738 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatgatgggtaattta 43176779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 321
Target Start/End: Original strand, 48534007 - 48534076
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataa 321  Q
    |||| |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||| | ||| || ||||||||||||    
T  48534007 ggtggcaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttaccccaaccgatacacattagccacataa 48534076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 338 - 378
Target Start/End: Original strand, 48534082 - 48534122
Alignment:
Q  338 tatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcatt 378  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  48534082 tattcatgaactatcttgaccccacaaataaattgctcatt 48534122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 253 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 51143987 - 51143935
Alignment:
Q  253 gtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaata 305  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  51143987 gtgacaactagggtacccatgaaaaaatggtgggtaatttactccaaccaata 51143935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0949 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0949
Description:

Target: scaffold0949; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 251 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 2052 - 1871
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  2052 tggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttactccaaccaatacacattagccacataagcatatttttaagtggtatccatgaacta 1953  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaa 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  1952 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatctagaaaaa 1871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Original strand, 39556 - 39739
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||| || ||| |||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  39556 ggtgacaactagggtacccatggaagaatgatgggtaatttaccccaaccaatacacattaaccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 39655  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  39656 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 39739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Original strand, 13762 - 13945
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||  ||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||    
T  13762 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttacctcaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaactat 13861  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  13862 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 13945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 118; Significance: 6e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 251 - 436
Target Start/End: Original strand, 11132 - 11317
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||    
T  11132 tggtgacaactagggtacccatggaagaatggtggataatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 11231  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaagtaatcttgaaaaaacctt 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||    
T  11232 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttaaaggtaatctagaaaaaccctt 11317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Original strand, 75244 - 75427
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||| ||  |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  75244 ggtgacaactaggttaccaatggaagaatggtgaataatttaccccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggtatgcatgaactat 75343  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  75344 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 75427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 251 - 434
Target Start/End: Original strand, 2431 - 2615
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||    
T  2431 tggtgataactagggtacccatggaagaatgatgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtggtatccatgaacta 2530  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  2531 tcttgaccctaccaacaaattgctcattttcattggttggtggataatttacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 2615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Original strand, 18854 - 19037
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||| |||||  |||| || |||| ||||||| || |||||||||||||||  ||||| |||    
T  18854 ggtgacaactagggtacccatggaagaattgtggataatttattccaactaatacacattagtcacataagcacatttttaagtggtatccatgaattat 18953  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag-taatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  18954 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaagataatctagaaaaaacc 19037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 252 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 278190 - 278005
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtgg--tatttatgaact 349  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||  |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||  |||  |||||||    
T  278190 ggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagccacataaacacatttttaagtggggtatccatgaact 278091  T
Q  350 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  278090 atcttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtgagtaatttacccaccattcttcaaaggtaatctaaaaaaaacc 278005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 252 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 176836 - 176670
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||||| ||| |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||  | ||||| |||||||||  |||||||||    
T  176836 ggtgacaactaggatacccatagaagaatggtgggtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagtacattttcaagtggtatccatgaactat 176737  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaag 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  176736 cttgaccccaccaacaaattgctcattttcattggttggtcggtaaattacccaccattcttcaaag 176670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 287 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 32708 - 32560
Alignment:
Q  287 taatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattgg 386  Q
    |||||||| |||| ||||| || ||| ||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32708 taatttaccccaaccaatacacattaaccacataaacacatttttaaatggtatccatgaactatcttgatcccaccaacaaattgctcattttcattgg 32609  T
Q  387 ttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  32608 ttggtgggttaattacccaccattcttcaaaggtaatctagaaaaaacc 32560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 251 - 392
Target Start/End: Original strand, 4595 - 4736
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||  |||| ||||| || ||||| |||||| || |||||||||||||||  || |||||    
T  4595 tggtgacaactagggtacccatggaagaatggtgggtaatttatcccaaccaatacacattagctacataagcacatttttaagtggtatccataaacta 4694  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtg 392  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  4695 tctttaccccaccaacaaattgttcatttttattagttggtg 4736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2003 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold2003
Description:

Target: scaffold2003; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 327 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 209 - 98
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatctt 425  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||     
T  209 tttttaggtggtattcataaactatcttgactccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatcta 110  T
Q  426 gaaaaaacctta 437  Q
    ||||||||||||    
T  109 gaaaaaacctta 98  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 327 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 14851 - 14740
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatctt 425  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||     
T  14851 tttttaggtggtattcataaactatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatcta 14752  T
Q  426 gaaaaaacctta 437  Q
    || |||||||||    
T  14751 gacaaaacctta 14740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 252 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 3261 - 3132
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaactat 351  Q
    ||||||||||| |||| |||| | |||||| ||  |||||||| |||| ||||| || |||||||||||| || ||||||||||| |||  |||||||||    
T  3261 ggtgacaactaaggtatccatagaagaatggtgagtaatttaccccaaccaatacacattagccacataagcacatttttaagtgatatccatgaactat 3162  T
Q  352 cttgaccccaccaacaaattgctcattttg 381  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3161 cttgatcccaccaacaaattgctcattttg 3132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 327 - 433
Target Start/End: Original strand, 20541 - 20648
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatctt 425  Q
    |||||| |||||||  || || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||     
T  20541 tttttaggtggtatccataaattatcttgaccccaccaataaattgctcattatgattggttgatgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatcta 20640  T
Q  426 gaaaaaac 433  Q
    ||||||||    
T  20641 gaaaaaac 20648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 305
Target Start/End: Original strand, 20477 - 20530
Alignment:
Q  252 ggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaata 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| |||| |||||    
T  20477 ggtgacaactagggtacccatggaaaaatggtgggtaatttaccccaaccaata 20530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0721 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0721
Description:

Target: scaffold0721; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 251 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 7263 - 7089
Alignment:
Q  251 tggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaatatacgttagccacataaacatatttttaagtggtatttatgaacta 350  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||  |||| ||||| || || ||||||||| || ||           ||| ||||||||    
T  7263 tggtgacaactaggctacccatgaaagaatgatgggtaatttatcccaaccaatacacattggccacataagcacat-----------attcatgaacta 7175  T
Q  351 tcttgaccccaccaacaaattgctca-ttttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  7174 tcttgaccccacaaataaattgctcatttttcattgattggtgggtaaattacccaccattcttcaaaggtaatttagaaaaaacc 7089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 327 - 441
Target Start/End: Original strand, 4618 - 4734
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctca-ttttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatct 424  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||| |||||||    
T  4618 tttttaaatggtatccatgaactatcttgacctcaccaataaattactcatttttcattggttggtggataaattacccaccatttttgaaaggtaatct 4717  T
Q  425 tgaaaaaaccttatatt 441  Q
     ||||||||||| ||||    
T  4718 agaaaaaaccttctatt 4734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 246 - 304
Target Start/End: Original strand, 4548 - 4606
Alignment:
Q  246 tattatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaat 304  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||| ||||    
T  4548 tattctggtgacaactagagtacccatggaagaatggtggataatttacttcaaccaat 4606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 327 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 3500 - 3384
Alignment:
Q  327 tttttaagtggtatttatgaactatcttgaccccaccaacaaattgctca-ttttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatct 424  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||| |||||||    
T  3500 tttttaaatggtatccatgaactatcttgacctcaccaataaattactcatttttcattggttggtggataaattacccaccatttttgaaaggtaatct 3401  T
Q  425 tgaaaaaaccttatatt 441  Q
     ||||||||||| ||||    
T  3400 agaaaaaaccttctatt 3384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 246 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 3570 - 3512
Alignment:
Q  246 tattatggtgacaactagggtacccatgggagaatgatggctaatttactccaatcaat 304  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||| ||||    
T  3570 tattctggtgacaactagagtacccatggaagaatggtggataatttacttcaaccaat 3512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0271 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0271
Description:

Target: scaffold0271; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 17987 - 17905
Alignment:
Q  353 ttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa-gtaatcttgaaaaaacc 434  Q
    ||||| ||| ||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| | |||||||||    
T  17987 ttgactccatcaataaattgatcatattcattggttggtgggtaaattacccaccatttttcaaaggtaatttagaaaaaacc 17905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 349 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 19302 - 19234
Alignment:
Q  349 tatcttgaccccaccaacaaattgctcattttgattggttggtgggtaaattatccaccattcttcaaa 417  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||   ||||||||| ||||| |||||||||    
T  19302 tatcttgaccccaccaataaattgttcattttcattgattgagaggtaaattacccaccgttcttcaaa 19234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University