View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1149_high_11 (Length: 610)

Name: NF1149_high_11
Description: NF1149
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1149_high_11
NF1149_high_11
[»] chr8 (46 HSPs)
chr8 (29-610)||(1204565-1205146)
chr8 (390-605)||(12876108-12876323)
chr8 (388-610)||(36694937-36695159)
chr8 (399-610)||(37970490-37970701)
chr8 (390-610)||(13307622-13307842)
chr8 (390-603)||(10555180-10555393)
chr8 (390-610)||(6098489-6098709)
chr8 (380-610)||(9864137-9864367)
chr8 (388-610)||(43643566-43643788)
chr8 (388-607)||(16222860-16223079)
chr8 (402-608)||(23854404-23854610)
chr8 (380-610)||(30654554-30654784)
chr8 (389-610)||(27082809-27083030)
chr8 (380-596)||(1150090-1150306)
chr8 (389-610)||(16446846-16447067)
chr8 (392-602)||(465843-466053)
chr8 (451-610)||(1149603-1149762)
chr8 (387-601)||(34894963-34895177)
chr8 (388-610)||(38643975-38644197)
chr8 (390-607)||(5299920-5300137)
chr8 (388-610)||(40862416-40862638)
chr8 (404-610)||(11727037-11727243)
chr8 (403-605)||(31933862-31934064)
chr8 (392-607)||(7890931-7891137)
chr8 (390-583)||(41362517-41362707)
chr8 (390-610)||(33906223-33906431)
chr8 (389-610)||(8803788-8803998)
chr8 (389-584)||(34952028-34952223)
chr8 (387-610)||(39099090-39099303)
chr8 (490-610)||(41910959-41911079)
chr8 (391-610)||(35459682-35459888)
chr8 (390-610)||(44869495-44869716)
chr8 (422-610)||(43025733-43025921)
chr8 (490-610)||(1953959-1954081)
chr8 (390-514)||(4133077-4133199)
chr8 (516-610)||(4132657-4132750)
chr8 (541-606)||(18259233-18259298)
chr8 (498-584)||(7998401-7998488)
chr8 (390-455)||(15009241-15009306)
chr8 (388-454)||(24823399-24823465)
chr8 (387-438)||(4108912-4108963)
chr8 (390-445)||(33197891-33197946)
chr8 (490-545)||(33197948-33198003)
chr8 (389-430)||(7998361-7998402)
chr8 (389-438)||(38110352-38110401)
chr8 (476-504)||(34463673-34463701)
[»] chr1 (56 HSPs)
chr1 (392-607)||(15752027-15752242)
chr1 (389-610)||(10181968-10182189)
chr1 (389-610)||(18422646-18422867)
chr1 (387-610)||(32267027-32267250)
chr1 (391-609)||(10922724-10922942)
chr1 (427-610)||(32216088-32216271)
chr1 (380-610)||(238473-238702)
chr1 (389-610)||(2959743-2959964)
chr1 (390-610)||(38823210-38823430)
chr1 (388-610)||(15382927-15383149)
chr1 (389-609)||(30254419-30254638)
chr1 (386-602)||(1547279-1547487)
chr1 (388-610)||(16415639-16415862)
chr1 (390-610)||(27227445-27227657)
chr1 (396-610)||(47279191-47279405)
chr1 (384-602)||(48620627-48620845)
chr1 (390-610)||(7079023-7079254)
chr1 (389-610)||(19899729-19899950)
chr1 (390-607)||(42721035-42721252)
chr1 (390-610)||(23999343-23999563)
chr1 (385-583)||(11742338-11742535)
chr1 (391-588)||(14758038-14758235)
chr1 (400-605)||(28564746-28564951)
chr1 (387-601)||(34012346-34012560)
chr1 (420-610)||(51128885-51129075)
chr1 (392-610)||(28769651-28769869)
chr1 (420-610)||(9903014-9903204)
chr1 (387-604)||(3534925-3535142)
chr1 (388-610)||(8222125-8222344)
chr1 (390-610)||(30326912-30327132)
chr1 (385-602)||(37618860-37619081)
chr1 (400-610)||(37451292-37451501)
chr1 (390-610)||(47682454-47682673)
chr1 (390-610)||(27267160-27267376)
chr1 (392-604)||(41926161-41926373)
chr1 (387-610)||(39393376-39393600)
chr1 (403-610)||(4330288-4330497)
chr1 (429-610)||(27763271-27763451)
chr1 (406-610)||(27532941-27533144)
chr1 (385-558)||(3309139-3309311)
chr1 (477-610)||(25160715-25160848)
chr1 (429-610)||(27563865-27564046)
chr1 (429-610)||(46931446-46931625)
chr1 (387-606)||(15168082-15168308)
chr1 (390-610)||(31621514-31621733)
chr1 (422-610)||(40884841-40885029)
chr1 (392-610)||(33725560-33725778)
chr1 (390-538)||(21289661-21289816)
chr1 (489-610)||(22170806-22170927)
chr1 (450-610)||(38759583-38759749)
chr1 (430-521)||(1359932-1360022)
chr1 (389-489)||(30254853-30254952)
chr1 (390-438)||(43579242-43579290)
chr1 (388-435)||(4150490-4150537)
chr1 (387-446)||(22170747-22170806)
chr1 (389-439)||(26970260-26970310)
[»] chr5 (60 HSPs)
chr5 (402-610)||(27318442-27318650)
chr5 (392-610)||(699152-699370)
chr5 (389-602)||(39572818-39573031)
chr5 (391-610)||(22980794-22981013)
chr5 (388-610)||(36860421-36860644)
chr5 (404-610)||(30969279-30969485)
chr5 (388-609)||(5112270-5112490)
chr5 (385-610)||(19119854-19120079)
chr5 (390-602)||(7693230-7693442)
chr5 (390-610)||(36866762-36866982)
chr5 (388-610)||(38528192-38528413)
chr5 (389-602)||(9200232-9200445)
chr5 (387-610)||(8741841-8742065)
chr5 (388-610)||(12910348-12910575)
chr5 (392-607)||(25500884-25501099)
chr5 (388-607)||(35826442-35826660)
chr5 (387-610)||(14919483-14919707)
chr5 (387-584)||(24886099-24886298)
chr5 (390-610)||(40133385-40133605)
chr5 (388-610)||(27330304-27330524)
chr5 (386-610)||(22974037-22974261)
chr5 (403-610)||(26268087-26268294)
chr5 (391-602)||(32563150-32563361)
chr5 (392-610)||(5837557-5837775)
chr5 (391-608)||(31705569-31705785)
chr5 (390-610)||(23116177-23116397)
chr5 (429-608)||(17157988-17158166)
chr5 (388-610)||(22255179-22255402)
chr5 (390-602)||(22019632-22019844)
chr5 (390-610)||(31786601-31786821)
chr5 (402-610)||(33908245-33908453)
chr5 (422-610)||(7208819-7209006)
chr5 (390-601)||(35511441-35511652)
chr5 (422-607)||(21088724-21088908)
chr5 (390-610)||(15724490-15724708)
chr5 (451-610)||(6824434-6824595)
chr5 (452-610)||(35504427-35504585)
chr5 (398-610)||(43308607-43308819)
chr5 (389-584)||(1429126-1429321)
chr5 (422-610)||(5829929-5830112)
chr5 (390-582)||(14409310-14409501)
chr5 (429-602)||(28416490-28416663)
chr5 (389-610)||(35933901-35934116)
chr5 (448-610)||(23954744-23954907)
chr5 (473-610)||(15992495-15992632)
chr5 (388-584)||(8466743-8466938)
chr5 (432-602)||(42342775-42342942)
chr5 (403-607)||(8436979-8437182)
chr5 (427-545)||(25668687-25668804)
chr5 (388-610)||(13956317-13956522)
chr5 (392-526)||(11898004-11898138)
chr5 (390-467)||(16004474-16004552)
chr5 (541-610)||(2888400-2888469)
chr5 (390-470)||(26317779-26317859)
chr5 (393-444)||(13380498-13380549)
chr5 (387-438)||(22616491-22616542)
chr5 (541-602)||(25669737-25669797)
chr5 (389-438)||(36055874-36055923)
chr5 (389-438)||(27579038-27579087)
chr5 (430-470)||(22255615-22255655)
[»] chr2 (49 HSPs)
chr2 (390-610)||(33550969-33551189)
chr2 (389-610)||(17071720-17071941)
chr2 (382-610)||(3176931-3177159)
chr2 (389-610)||(19424611-19424832)
chr2 (389-610)||(17054079-17054300)
chr2 (388-610)||(4166920-4167142)
chr2 (388-609)||(31570718-31570939)
chr2 (392-610)||(36641988-36642208)
chr2 (422-610)||(37905740-37905930)
chr2 (388-610)||(29242121-29242343)
chr2 (390-605)||(33902068-33902281)
chr2 (388-600)||(39167356-39167568)
chr2 (386-610)||(2325361-2325577)
chr2 (427-610)||(43648228-43648411)
chr2 (389-602)||(27349930-27350143)
chr2 (392-601)||(33660360-33660569)
chr2 (389-610)||(4264060-4264281)
chr2 (390-602)||(19313852-19314063)
chr2 (390-610)||(26357577-26357797)
chr2 (389-610)||(11366364-11366585)
chr2 (390-610)||(4763628-4763851)
chr2 (390-610)||(44913662-44913884)
chr2 (392-610)||(41463833-41464051)
chr2 (386-610)||(19289306-19289525)
chr2 (422-610)||(33709215-33709403)
chr2 (392-602)||(43770830-43771039)
chr2 (392-610)||(44285951-44286169)
chr2 (427-606)||(4478406-4478581)
chr2 (386-610)||(13711460-13711679)
chr2 (489-607)||(41960939-41961057)
chr2 (487-610)||(45327817-45327940)
chr2 (389-602)||(5881533-5881750)
chr2 (386-610)||(18494264-18494475)
chr2 (486-605)||(31861948-31862067)
chr2 (390-610)||(35958909-35959116)
chr2 (390-610)||(41465509-41465721)
chr2 (460-584)||(7006930-7007054)
chr2 (531-610)||(18258270-18258349)
chr2 (420-535)||(41051263-41051379)
chr2 (387-438)||(19093410-19093461)
chr2 (385-438)||(22963395-22963448)
chr2 (385-438)||(22998029-22998082)
chr2 (394-438)||(18947598-18947642)
chr2 (493-560)||(19501773-19501839)
chr2 (388-438)||(6177773-6177823)
chr2 (389-435)||(39788580-39788626)
chr2 (390-438)||(18514771-18514819)
chr2 (390-438)||(31861895-31861943)
chr2 (389-437)||(43446463-43446511)
[»] chr4 (60 HSPs)
chr4 (387-610)||(35021026-35021249)
chr4 (390-610)||(19089444-19089664)
chr4 (389-610)||(37663732-37663951)
chr4 (389-610)||(879539-879760)
chr4 (389-610)||(25184112-25184333)
chr4 (387-607)||(25701050-25701271)
chr4 (388-610)||(55477882-55478108)
chr4 (392-610)||(36493680-36493897)
chr4 (390-606)||(19440643-19440860)
chr4 (388-605)||(34361488-34361704)
chr4 (390-610)||(28002977-28003197)
chr4 (392-610)||(17167715-17167933)
chr4 (392-610)||(17173292-17173510)
chr4 (385-610)||(29584191-29584414)
chr4 (392-610)||(34948086-34948306)
chr4 (385-610)||(55241096-55241320)
chr4 (392-608)||(27396618-27396834)
chr4 (388-610)||(32912571-32912793)
chr4 (384-610)||(38011848-38012074)
chr4 (392-610)||(47253751-47253960)
chr4 (407-610)||(23761089-23761291)
chr4 (387-602)||(30002631-30002838)
chr4 (389-610)||(42199728-42199949)
chr4 (388-607)||(9139245-9139462)
chr4 (390-610)||(7703517-7703729)
chr4 (393-610)||(6864038-6864255)
chr4 (393-602)||(32592096-32592305)
chr4 (385-610)||(3042606-3042839)
chr4 (391-602)||(37775670-37775879)
chr4 (391-602)||(4597994-4598203)
chr4 (387-610)||(50697239-50697461)
chr4 (427-610)||(4934193-4934375)
chr4 (390-596)||(39397918-39398115)
chr4 (392-610)||(33341397-33341618)
chr4 (390-607)||(49375966-49376184)
chr4 (387-561)||(50764732-50764901)
chr4 (420-610)||(54499228-54499420)
chr4 (404-610)||(5047957-5048162)
chr4 (392-598)||(33816536-33816742)
chr4 (404-604)||(46888154-46888354)
chr4 (387-610)||(32579441-32579666)
chr4 (389-610)||(35025587-35025800)
chr4 (498-610)||(1815409-1815521)
chr4 (389-610)||(37287732-37287948)
chr4 (380-495)||(4205106-4205221)
chr4 (489-610)||(17272067-17272184)
chr4 (388-470)||(4396324-4396406)
chr4 (392-446)||(52516599-52516653)
chr4 (388-438)||(2704510-2704560)
chr4 (388-470)||(7152237-7152319)
chr4 (388-446)||(17272009-17272067)
chr4 (388-438)||(38812260-38812310)
chr4 (392-444)||(20097485-20097537)
chr4 (390-438)||(38811813-38811861)
chr4 (390-470)||(53124287-53124367)
chr4 (387-417)||(1012306-1012336)
chr4 (385-439)||(47073656-47073710)
chr4 (431-504)||(23518400-23518473)
chr4 (532-605)||(46884105-46884177)
chr4 (391-444)||(51204580-51204633)
[»] chr7 (56 HSPs)
chr7 (388-610)||(32821019-32821241)
chr7 (388-610)||(18797302-18797522)
chr7 (386-610)||(30055497-30055722)
chr7 (391-610)||(38258521-38258740)
chr7 (389-610)||(21991610-21991831)
chr7 (390-610)||(37109847-37110069)
chr7 (390-607)||(7334769-7334986)
chr7 (390-610)||(4582894-4583114)
chr7 (404-610)||(22687228-22687434)
chr7 (392-610)||(27421346-27421563)
chr7 (388-610)||(17842550-17842774)
chr7 (392-610)||(23111167-23111387)
chr7 (389-610)||(43686015-43686235)
chr7 (390-610)||(5657447-5657667)
chr7 (388-610)||(9355792-9356014)
chr7 (389-610)||(31579030-31579256)
chr7 (390-610)||(27283719-27283939)
chr7 (391-610)||(48928530-48928748)
chr7 (430-610)||(10481619-10481800)
chr7 (385-610)||(24211711-24211936)
chr7 (389-610)||(32432431-32432647)
chr7 (390-610)||(15612725-15612944)
chr7 (390-610)||(37346997-37347216)
chr7 (392-610)||(25691510-25691729)
chr7 (390-608)||(8861260-8861478)
chr7 (390-584)||(31520716-31520909)
chr7 (388-610)||(41765044-41765266)
chr7 (392-607)||(11071182-11071398)
chr7 (420-576)||(29173545-29173701)
chr7 (385-584)||(12390622-12390821)
chr7 (390-602)||(12165727-12165939)
chr7 (406-610)||(48928263-48928466)
chr7 (390-605)||(6546494-6546709)
chr7 (430-604)||(44413351-44413525)
chr7 (390-610)||(10359180-10359400)
chr7 (391-610)||(33688228-33688446)
chr7 (388-540)||(26524363-26524515)
chr7 (420-584)||(26980328-26980492)
chr7 (499-610)||(37704241-37704352)
chr7 (508-610)||(15672728-15672830)
chr7 (490-610)||(44598741-44598861)
chr7 (429-605)||(43925120-43925291)
chr7 (422-584)||(38053493-38053647)
chr7 (476-610)||(37703464-37703590)
chr7 (534-610)||(26588050-26588126)
chr7 (390-520)||(34362205-34362334)
chr7 (437-584)||(32593181-32593327)
chr7 (479-610)||(46481095-46481218)
chr7 (427-610)||(35353120-35353303)
chr7 (392-456)||(8299192-8299256)
chr7 (390-438)||(23402371-23402419)
chr7 (392-438)||(3953733-3953779)
chr7 (384-438)||(4902334-4902388)
chr7 (388-438)||(40381938-40381988)
chr7 (424-470)||(44598373-44598419)
chr7 (430-485)||(37704182-37704238)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (389-610)||(133-354)
scaffold0002 (420-610)||(94348-94538)
scaffold0002 (451-610)||(408394-408552)
[»] chr3 (64 HSPs)
chr3 (392-610)||(46297727-46297945)
chr3 (389-610)||(3655167-3655388)
chr3 (387-607)||(35844314-35844535)
chr3 (390-610)||(37203058-37203278)
chr3 (380-610)||(34132916-34133146)
chr3 (389-604)||(40552230-40552445)
chr3 (390-601)||(51212955-51213166)
chr3 (388-610)||(48354930-48355152)
chr3 (390-610)||(37157699-37157918)
chr3 (400-599)||(29099356-29099555)
chr3 (388-610)||(4761613-4761838)
chr3 (384-610)||(47481507-47481733)
chr3 (389-610)||(11466814-11467035)
chr3 (436-610)||(42506040-42506214)
chr3 (389-610)||(52040887-52041109)
chr3 (389-610)||(26941225-26941446)
chr3 (390-610)||(4015451-4015671)
chr3 (385-610)||(53229117-53229343)
chr3 (390-610)||(45174494-45174717)
chr3 (388-610)||(22450957-22451179)
chr3 (391-610)||(25579731-25579950)
chr3 (389-610)||(7327447-7327669)
chr3 (388-610)||(39282642-39282863)
chr3 (429-610)||(24488927-24489108)
chr3 (388-605)||(21193595-21193812)
chr3 (384-568)||(20373303-20373487)
chr3 (392-602)||(43975861-43976068)
chr3 (420-610)||(53176076-53176265)
chr3 (392-610)||(54828666-54828883)
chr3 (405-584)||(11357355-11357535)
chr3 (384-610)||(33378750-33378973)
chr3 (422-610)||(3362276-3362466)
chr3 (388-610)||(21009767-21009992)
chr3 (389-591)||(44186485-44186687)
chr3 (390-610)||(44891498-44891708)
chr3 (388-610)||(46994626-46994837)
chr3 (403-561)||(40935995-40936153)
chr3 (430-610)||(2007964-2008143)
chr3 (387-610)||(32373460-32373681)
chr3 (390-610)||(54505799-54506018)
chr3 (459-605)||(24708085-24708231)
chr3 (451-602)||(14586643-14586794)
chr3 (493-602)||(29163912-29164021)
chr3 (511-610)||(33698265-33698364)
chr3 (460-610)||(43348319-43348468)
chr3 (390-586)||(27480368-27480564)
chr3 (393-610)||(22446030-22446247)
chr3 (513-610)||(22622683-22622780)
chr3 (432-610)||(38591727-38591909)
chr3 (501-610)||(11835592-11835702)
chr3 (506-610)||(36012244-36012349)
chr3 (548-610)||(1089842-1089905)
chr3 (387-456)||(55343403-55343472)
chr3 (390-470)||(33698183-33698259)
chr3 (391-485)||(11835701-11835790)
chr3 (388-438)||(40640634-40640684)
chr3 (391-446)||(29163839-29163894)
chr3 (392-438)||(53818509-53818555)
chr3 (388-438)||(38392628-38392678)
chr3 (385-427)||(53175709-53175751)
chr3 (389-438)||(45879498-45879547)
chr3 (385-469)||(1089717-1089800)
chr3 (390-438)||(47930666-47930714)
chr3 (390-438)||(53811976-53812024)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (387-610)||(7884-8107)
[»] chr6 (19 HSPs)
chr6 (381-610)||(4318786-4319016)
chr6 (389-610)||(3879903-3880124)
chr6 (393-605)||(6091152-6091363)
chr6 (389-610)||(7055179-7055400)
chr6 (388-610)||(1945831-1946054)
chr6 (388-610)||(5627389-5627611)
chr6 (392-610)||(21017076-21017294)
chr6 (389-610)||(8513232-8513448)
chr6 (390-610)||(7234999-7235218)
chr6 (406-605)||(15491631-15491830)
chr6 (392-610)||(29182165-29182384)
chr6 (392-610)||(30353322-30353540)
chr6 (390-602)||(33892975-33893186)
chr6 (391-607)||(20768087-20768299)
chr6 (392-575)||(6088910-6089094)
chr6 (390-566)||(33618834-33619010)
chr6 (384-520)||(18498427-18498564)
chr6 (386-438)||(11084152-11084204)
chr6 (388-438)||(19631747-19631797)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (392-606)||(43959-44173)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (392-606)||(154614-154828)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (392-610)||(145981-146199)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (392-610)||(11908-12129)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (389-605)||(267281-267499)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (389-470)||(42347-42428)
scaffold0009 (386-463)||(100817-100894)
[»] scaffold0262 (1 HSPs)
scaffold0262 (390-439)||(12137-12186)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 501; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 501; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 610
Target Start/End: Original strand, 1204565 - 1205146
Alignment:
Q  29 aagtgttacacaagtaaaactatcacgttagaacacttatgaccaacaacgaaaaagatgagatagaaagaatatgagagagcgatgaattagaaacgga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1204565 aagtgttacacaagtaaaactatcacgttagaacacttatgaccaacaacgaaaaagatgagatagaaagaatatgagagagcgatgaattagaaacgga 1204664  T
Q  129 tttattgacataagttaattannnnnnnattagagacggaagttagagacgcaatcacaacagtatttcgtgtccaaattcgtctctattgggtcaaatt 228  Q
    |||||||||||||||||||||       ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1204665 tttattgacataagttaattatttttttattagagacggaagcaagagacgcagtcacaacagtatttcgtgtccacattcgtctctattgggtcaaatt 1204764  T
Q  229 tctgtttttataaagtcaacaattattcggagacgacatttagagacataattgttccgtgtcaaatgagcttcatctctagttccatctccaactaaaa 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1204765 tctgtttttataaagtcaacaattatacggagacgacatttacagacataattgttccgtgtcaaatgagcttcatctctagttccatctccaactaaaa 1204864  T
Q  329 aactaaactataaggcaagtttttccactattttggctccaaacacctgatttaataaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctg 428  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  1204865 aaataaactataaggcaattttttccactattttggctccaaacacctgatttaataaaaaggaaaattttacggtgaagtcatgagaatgacttttctg 1204964  T
Q  429 gtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcatta 528  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1204965 gtgaagttaacactataacataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcatca 1205064  T
Q  529 gattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1205065 tattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttgttttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 1205146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 390 - 605
Target Start/End: Original strand, 12876108 - 12876323
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||| |||||| || ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  12876108 ggaaaattctatggttaagtcacgaaaatgacttttctgatgaagttaacactataatataaaaaatgttgtgagtaacacccaactgtttgtacaatga 12876207  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12876208 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaagaaggatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccac 12876307  T
Q  590 aaagtgtaacacttaa 605  Q
    ||||||||||||||||    
T  12876308 aaagtgtaacacttaa 12876323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 388 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 36695159 - 36694937
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  36695159 aaggaaaattctatggtgaagtcaggaaaatgacttttctgatgaagttaacactataatatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaat 36695060  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||    
T  36695059 gacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacccc 36694960  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  36694959 acaaagtgtaacacttaagacta 36694937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 399 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 37970701 - 37970490
Alignment:
Q  399 tatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaag 498  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  37970701 tatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatgccatcaaaag 37970602  T
Q  499 ttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaa 598  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  37970601 ttcagccctcatagtatcatcaattcatatgattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaa 37970502  T
Q  599 cacttaagacta 610  Q
    ||||||||||||    
T  37970501 cacttaagacta 37970490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 390 - 610
Target Start/End: Original strand, 13307622 - 13307842
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  13307622 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactatttgtacagtga 13307721  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||    
T  13307722 catcaaaagttcagtccccatagtattatcaattcatcagattagcaagaatacacttaatctaattttatcctactttattttaaatgtaacaccccac 13307821  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13307822 aaagtgtaacacttaagacta 13307842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 390 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 10555393 - 10555180
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10555393 ggaaaattctacggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacactccactgtttgtacaatga 10555294  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||| |||    
T  10555293 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgcaacacctcac 10555194  T
Q  590 aaagtgtaacactt 603  Q
    |||  |||||||||    
T  10555193 aaaacgtaacactt 10555180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 390 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 6098709 - 6098489
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||  || |||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  6098709 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaataacttttttggtgaagttaatactatagcatcaaaaatatagtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 6098610  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||    
T  6098609 catcaaaagttcagtccccatagtatcgtcaattcatcagattaacaagactacatttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaacaccccac 6098510  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  6098509 aaagtgtaacacttaagacta 6098489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 380 - 610
Target Start/End: Original strand, 9864137 - 9864367
Alignment:
Q  380 ttaataaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtt 479  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||| || ||  |||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||  |||||||    
T  9864137 ttaataaaaaggaaaattctataatgaagtcacgaaaatgacttttttggtgaaattaacactatagtatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtt 9864236  T
Q  480 tgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgt 579  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  9864237 tgtacaatgacatcaaaagttcagtccccataatatcatcaattcatcagactaataagaatacacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgt 9864336  T
Q  580 aacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9864337 aacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 9864367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 388 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 43643788 - 43643566
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||    
T  43643788 aaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgactattttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacactctactgtttgtacaat 43643689  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |    
T  43643688 gacatccaaagttcaatcttcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttgatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctc 43643589  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  43643588 acaaagtgtaacacttaagacta 43643566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 388 - 607
Target Start/End: Original strand, 16222860 - 16223079
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||   |  ||| |||||||||||    
T  16222860 aaggaaaattctacggtgaaatcatgagaatgacttttctggtgaatttaacactataacataaaaaatatagtgagtagttccccacagtttgtacaat 16222959  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||    
T  16222960 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatccgattaacaagactacacttaatctaattttatccttccttgttttaaacgtaacacccc 16223059  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaaga 607  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  16223060 aaaaagtgtaacacttaaga 16223079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 402 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 23854610 - 23854404
Alignment:
Q  402 ggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttc 501  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23854610 ggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacacccaactgtttgtgcaatgacatcaaaagttc 23854511  T
Q  502 agtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacac 601  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||| || ||||||||||||    
T  23854510 agtcctcatagtatcatcaactcattagattaacaatactacaattaatctaattttatcttacctagttataagtgtaacaccgcataaagtgtaacac 23854411  T
Q  602 ttaagac 608  Q
    |||||||    
T  23854410 ttaagac 23854404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 380 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 30654784 - 30654554
Alignment:
Q  380 ttaataaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtt 479  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||   | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  30654784 ttaaaaaataggaaaattttatggtgaagtcataagagtgatttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtt 30654685  T
Q  480 tgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgt 579  Q
    |||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| || ||||||||||    
T  30654684 tgttgaatgacatcaaaagttcagccttcatagtatcatcacttcatcaggttaacaagactacacttaatttaattttaccatacattgttttaagcgt 30654585  T
Q  580 aacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30654584 aacaccctacaaagtgtaacacttaagacta 30654554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 389 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 27083030 - 27082809
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||  |||||||||| || ||    
T  27083030 aggaaaattctatggtgaagtcatcagactgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtaacaccccactgtttgtgcagtg 27082931  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||     
T  27082930 gcattaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcttaccatgttttaagtctaacaccccg 27082831  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27082830 caaagtgtaacacttaagacta 27082809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 380 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 1150306 - 1150090
Alignment:
Q  380 ttaataaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtt 479  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||   |||||||    
T  1150306 ttaataattaggaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttttggtgaagttaacgctataacatcaaaaatgtaatgagtaacatcccactgtt 1150207  T
Q  480 tgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgt 579  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  1150206 tgtacaacgacatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgt 1150107  T
Q  580 aacaccccacaaagtgt 596  Q
    |||||||||||||||||    
T  1150106 aacaccccacaaagtgt 1150090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 389 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 16447067 - 16446846
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  16447067 aggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctgataaagttaacactataacatcaaaattgtagtgagtaacaccccactgtttgtataatg 16446968  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
     ||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||    
T  16446967 gcatcaaaagtttagtccccatactatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatttaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacacccca 16446868  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  16446867 caaagcgtaacacttaagacta 16446846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 392 - 602
Target Start/End: Original strand, 465843 - 466053
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  |||||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| || ||    
T  465843 aaaattttatggtgaagtcattaaaatgacttttgtggtgaagttaacacgataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggca 465942  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  465943 tcaaaaattcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacaccccacaa 466042  T
Q  592 agtgtaacact 602  Q
    |||||||||||    
T  466043 agtgtaacact 466053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 451 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 1149762 - 1149603
Alignment:
Q  451 aaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaat 550  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1149762 aaaaatgtaatgagtaacaacccactgtttgtacaatgacatcaaaagttctgtcctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaat 1149663  T
Q  551 ctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1149662 ctaattttatcttaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 1149603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 387 - 601
Target Start/End: Original strand, 34894963 - 34895177
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 486  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||  ||||||||||| |     
T  34894963 aaaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctgatgaagttaacactataacatcaacactgtagtgagtaacactccactgtttgtaaag 34895062  T
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 586  Q
    || |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||| |||||||||    
T  34895063 tggcatcaaaagttcagtcatcatactatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaacaccc 34895162  T
Q  587 cacaaagtgtaacac 601  Q
    |||||| ||||||||    
T  34895163 cacaaaatgtaacac 34895177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 388 - 610
Target Start/End: Original strand, 38643975 - 38644197
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||  | |    
T  38643975 aaggaaaattctatggtgaaatcatgagaatgacttttttggtcaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtctagt 38644074  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||    
T  38644075 ggcatcaaaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactcc 38644174  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    | ||||||||||||| |||||||    
T  38644175 ataaagtgtaacactcaagacta 38644197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 390 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 5300137 - 5299920
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||  || |||| ||| || |||| |||   |||||||||||| ||     
T  5300137 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttaatgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtaagtagcactctactgtttgtacagtgg 5300038  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  5300037 catcaaaagttcagtccttatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatccaaccttgttttaagtgtaacaccccac 5299938  T
Q  590 aaagtgtaacacttaaga 607  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5299937 aaagtgtaacacttaaga 5299920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 388 - 610
Target Start/End: Original strand, 40862416 - 40862638
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatat-aaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 486  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  40862416 aaggaaaattctatagtgaagtcacgaaaataacttttctggtgaagttaacactataatatcaaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaa 40862515  T
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 586  Q
    || |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||  | | | |||||| | ||||||||||||||||||||| ||| || || |||| ||||||| |    
T  40862516 tggcatcaaaagttcagtc-tcatggtatcatcaatttttcatactaacaaaaatacacttaatctaattttatcctactttgttctaagtgtaacactc 40862614  T
Q  587 cacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  40862615 cacaaagtgtaacacttaagacta 40862638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 404 - 610
Target Start/End: Original strand, 11727037 - 11727243
Alignment:
Q  404 tgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcag 503  Q
    |||||| |||||||  | |||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| || ||||||||  |||| |||||| | || ||||||||||||||    
T  11727037 tgaagttatgagaatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtaagtaacaccccactatttgtatagtggcatcaaaagttcag 11727136  T
Q  504 tcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacactt 603  Q
    |||||||| |||||||| ||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11727137 tcctcataatatcatcaattcatcaaattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacactt 11727236  T
Q  604 aagacta 610  Q
    |||||||    
T  11727237 aagacta 11727243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 403 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 31934064 - 31933862
Alignment:
Q  403 gtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttca 502  Q
    ||||||| |||||||  | |||| |||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  31934064 gtgaagttatgagaatgatttttttggtgaagttaacactatgatatcaaaaatataatgagtaacaccccactctttatacaatgacatcaaaagttca 31933965  T
Q  503 gtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacact 602  Q
    ||| | |||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  31933964 gtcattatagtatcatcaattcatccgattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagcataataccgcacaaagtgtaacact 31933865  T
Q  603 taa 605  Q
    |||    
T  31933864 taa 31933862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 392 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 7891137 - 7890931
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||| || ||||||         |||||  ||| |||||||||||| ||    
T  7891137 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgactttttttgtgaagttaacactataacatcaaaaat---------aacactccaccgtttgtacaatggca 7891047  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  7891046 tcaaaagttcggtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaagactacactcaatctagttttatcttactttgttataagcgtaacaccccacaa 7890947  T
Q  592 agtgtaacacttaaga 607  Q
     |||||||||||||||    
T  7890946 cgtgtaacacttaaga 7890931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 390 - 583
Target Start/End: Original strand, 41362517 - 41362707
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||||||  |||| |||||| | |||    
T  41362517 ggaaaattctatggtgaagttatgaaaatgacttttttggtgaagttaacactagcata---aaaatgtagtgagtaacaccccactatttgtatagtga 41362613  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca 583  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||| || |||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  41362614 catcaaaagttcagacctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactaaacttgatataattttatcataccttgttttaagtgtaaca 41362707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 390 - 610
Target Start/End: Original strand, 33906223 - 33906431
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||  |||||||| ||          
T  33906223 ggaaaattctatggtgaaattatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactatagtattaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttata------ 33906316  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
          |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||  |||     
T  33906317 ------aagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcataccttgttttaagggtaacattccaa 33906410  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  33906411 aaagtgtaacacttaagacta 33906431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 389 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 8803998 - 8803788
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  |||| |||||| ||||    
T  8803998 aggaaaattctatggtgaagtcatatga----cttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacactccactatttgtagaatg 8803903  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    ||||||||||||||| |       |||||||| || || || ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||| |    
T  8803902 acatcaaaagttcagcc-------tatcatcaatttatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacacccta 8803810  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagacta 610  Q
     |||||||||||||||| ||||    
T  8803809 aaaagtgtaacacttaatacta 8803788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 389 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 34952223 - 34952028
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| ||| || ||||||| | ||  ||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||| ||||||||||   ||||||||||||| ||    
T  34952223 aggaaaattctatagtaaagtcattaaaatgacttttctggtcaagttaacactatatcatcaaaagtgttgtgagtaacagcccactgtttgtacagtg 34952124  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacac 584  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||    
T  34952123 acatcaaaagttcagtccctttagtatcatcaattcatcaaattaataagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacac 34952028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 387 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 39099303 - 39099090
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 486  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||        ||||||| || ||||  || |  ||||||||  |||| ||||||||     
T  39099303 aaaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctgatg--------actataacatcaaaa--gttgcaagtaacaccccactctttgtacac 39099214  T
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 586  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||    
T  39099213 tagcatcaaaagttcagtcctcatagtatcgtcaattcatcagattaacaaaaatacacttaatctaattttatcttaccctgttttaagtgtaacatcc 39099114  T
Q  587 cacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||| | |||||||||||||    
T  39099113 cacaaagtatcacacttaagacta 39099090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 490 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 41911079 - 41910959
Alignment:
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  41911079 catcaaaaattcagtcaacatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 41910980  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  41910979 aaagtgtaacacttaatacta 41910959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 391 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 35459888 - 35459682
Alignment:
Q  391 gaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgac 490  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||| ||||||||||||||||| |             |||||| ||||||||||||    
T  35459888 gaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttcgtaaagttaatactataatataaaaaatct-------------tcactgattgtacaatgac 35459802  T
Q  491 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 590  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || || |||  |||||| ||||||    
T  35459801 attaaaagttcagtcctcataatatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctactttgttataaatgtaacatcccaca 35459702  T
Q  591 aagtgtaacacttaagacta 610  Q
     | | |||||||||||||||    
T  35459701 gattataacacttaagacta 35459682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 390 - 610
Target Start/End: Original strand, 44869495 - 44869716
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaa--atgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||| || |||||| | || |||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || | |||||| |  |  ||||||||| |||||    
T  44869495 ggaaaattctacggtgaaattataagaataacttttttggtgaagttaacactataacattaaaagtattttgtgagtgatccc-cactgtttgcacaat 44869593  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaa-ttttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 586  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||    |||    
T  44869594 gacatcaaaagttcaatcgtcatagtatcatcaatttatcagattaacaataatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgt-tgtccc 44869692  T
Q  587 cacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  44869693 cacaaagtgtaacacttaagacta 44869716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 422 - 610
Target Start/End: Original strand, 43025733 - 43025921
Alignment:
Q  422 ttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcag 521  Q
    |||| |||||||||||||  |||| ||| |||| ||| |||| ||| ||  |||| |||||||||||  || ||||||||||| |  ||| ||||||||     
T  43025733 ttttatggtgaagttaacgatatagtatcaaaagtgttgtgattaataccccactctttgtacaatggtattaaaagttcagttcatataatatcatcaa 43025832  T
Q  522 ttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||| ||| ||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  43025833 ttcatcagactaagaagaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaactgtaacaccccacaaaatgtaacacttaaaacta 43025921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 490 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 1954081 - 1953959
Alignment:
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatc-atcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca-cccc 587  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||| | || |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||    
T  1954081 catcaaaagttcagccctcatagtatctatcaattcatcagattaatatgactacactaaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacatcccc 1953982  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  1953981 acaaagtgtaacacttaagacta 1953959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 390 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 4133199 - 4133077
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||  ||| |||| ||  ||||||||| || | |||||||||||| ||     
T  4133199 ggaaaattttatggtcaagtcatcagaatgacttttttggtgaagttaacactagcataaaaaagat--agtgagtaatacctgactgtttgtacagtgg 4133102  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagta 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  4133101 catcaaaagttcagtcctcatagta 4133077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 516 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 4132750 - 4132657
Alignment:
Q  516 catcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4132750 catcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttgttt-aagtgtaacaccccacaaagtgtaacacataagacta 4132657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 541 - 606
Target Start/End: Original strand, 18259233 - 18259298
Alignment:
Q  541 tacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaag 606  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  18259233 tacatttaatttaattttatcataccttattttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacacctaag 18259298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 498 - 584
Target Start/End: Original strand, 7998401 - 7998488
Alignment:
Q  498 gttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaa-ttttatcttaccttattttaagcgtaacac 584  Q
    |||| |||| |||| |||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  7998401 gttcggtccccataatatcatcaatacatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacac 7998488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 390 - 455
Target Start/End: Original strand, 15009241 - 15009306
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaa 455  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  15009241 ggaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaa 15009306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 24823465 - 24823399
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaa 454  Q
    |||||||||  |||||| |||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24823465 aaggaaaatactatggtaaagttatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataatatcaaaa 24823399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 4108963 - 4108912
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||| |||||||    
T  4108963 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgaaaatgacttttttggtaaagttaa 4108912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 445
Target Start/End: Original strand, 33197891 - 33197946
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactata 445  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| ||||||    
T  33197891 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaataatttttctgattaagttaatactata 33197946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 490 - 545
Target Start/End: Original strand, 33197948 - 33198003
Alignment:
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacac 545  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  33197948 catcaaaagttcagtctccataatatcatcaattcatcagattaacaagaatacac 33198003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 389 - 430
Target Start/End: Original strand, 7998361 - 7998402
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggt 430  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  7998361 aggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggt 7998402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 389 - 438
Target Start/End: Original strand, 38110352 - 38110401
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||| |||||||||    
T  38110352 aggaaaattttatggtgaagtcatgaaaatgatttttctgatgaagttaa 38110401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 476 - 504
Target Start/End: Original strand, 34463673 - 34463701
Alignment:
Q  476 tgtttgtacaatgacatcaaaagttcagt 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34463673 tgtttgtacaatgacatcaaaagttcagt 34463701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 160; Significance: 6e-85; HSPs: 56)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 392 - 607
Target Start/End: Original strand, 15752027 - 15752242
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  15752027 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatatagtgagtaacacctcactgtttgtacaatggca 15752126  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  15752127 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagcgtaacaccccataa 15752226  T
Q  592 agtgtaacacttaaga 607  Q
    ||||||||||||||||    
T  15752227 agtgtaacacttaaga 15752242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 389 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 10182189 - 10181968
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  10182189 aggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttttggtgaagttaaaactgtaacataaaaaatatagtgcgtaacacgccactgtttgtacagtg 10182090  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  10182089 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcgtcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccca 10181990  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10181989 caaagtgtaacacttaagacta 10181968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 389 - 610
Target Start/End: Original strand, 18422646 - 18422867
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||  |||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||  |||||||||  ||| ||||||||||||    
T  18422646 aggaaaattctatggtgaagtcataaaaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatataacgagtaacaccccaccgtttgtacaatg 18422745  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||    
T  18422746 acatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttatatgcgtaacacccca 18422845  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18422846 caaagtgtaacacttaagacta 18422867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 387 - 610
Target Start/End: Original strand, 32267027 - 32267250
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  32267027 aaaggaaaattttatggtgaagtcataagaatgactttttttgtgaagttaacaatataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaa 32267126  T
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 586  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |    
T  32267127 tgacatcaaaagttcactcctcatattatcatcaacccatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacactc 32267226  T
Q  587 cacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  32267227 cacaaagtgtaacactcaagacta 32267250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 391 - 609
Target Start/End: Original strand, 10922724 - 10922942
Alignment:
Q  391 gaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgac 490  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  10922724 gaaaattttatggtgaaatcatgagaatgatttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaagaccccactgtttgtacaatgac 10922823  T
Q  491 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 590  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| || |||| |||||||| ||||    
T  10922824 atcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatcttattttatcataccttgttataagggtaacacctcaca 10922923  T
Q  591 aagtgtaacacttaagact 609  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10922924 aagtgtaacacttaagact 10922942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 427 - 610
Target Start/End: Original strand, 32216088 - 32216271
Alignment:
Q  427 tggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcat 526  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  32216088 tggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtagtgagtaacacaccactgtttgtacaatggcgtcaaaagttcagtcctcgtagtatcatcaattcat 32216187  T
Q  527 tagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||| | || |||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32216188 tagattaacaaaactaaacttaatcaaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 32216271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 380 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 238702 - 238473
Alignment:
Q  380 ttaataaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtt 479  Q
    |||||| |||| |||||| ||| ||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||   |||||||    
T  238702 ttaatataaagaaaaattctatagtgaagtcacgaaaataacttttttggtgaagttaacactatagtattaaaaatgttgtgagtaacatc-cactgtt 238604  T
Q  480 tgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgt 579  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||    
T  238603 tgtacaatgacatcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattaatcagactaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgt 238504  T
Q  580 aacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  238503 aacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 238473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 389 - 610
Target Start/End: Original strand, 2959743 - 2959964
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||   ||||||||||||| ||    
T  2959743 aggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctgatgaagttaacactataacatcaaaactgtagtaagtaacatcccactgtttgtacagtg 2959842  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||| ||||    
T  2959843 acatcaaaagttcagtcctcatagtgtcatcaattcatcagattaacaagaccacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacatccca 2959942  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  2959943 caaattgtaacacttaagacta 2959964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 390 - 610
Target Start/End: Original strand, 38823210 - 38823430
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||| | |||||||||  |||| |||||||| ||     
T  38823210 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggttaagttaacactatagcatcaaaattgttgcgagtaacaccccactatttgtacagtgt 38823309  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  38823310 catcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttattttaagtgtaacacccaac 38823409  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  38823410 aaagtgtaacacttaagacta 38823430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 388 - 610
Target Start/End: Original strand, 15382927 - 15383149
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| ||||||||||| || | ||  |||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||   ||| |||||||||||    
T  15382927 aaggaaaattctatggtgaagttataaaaatgacttttttggtgaaattaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacatcccaccgtttgtacaat 15383026  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  15383027 gtcatcaaaagttcagtcatcgtagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacccc 15383126  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  15383127 acaaagtgtaacacttaaaacta 15383149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 389 - 609
Target Start/End: Original strand, 30254419 - 30254638
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||  |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  30254419 aggaaaattctatggtgaagttataagaatgacttttttgttgaagttaacaatataacatcaaaaatgtaatgagtaataca-cactgtttgtacaatg 30254517  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| |    
T  30254518 acatcaaaagttcagtcctcaaagtatcatcaattcatcagattaacaagactagacttaatctaattttatcctaccttgttataagcataacacccta 30254617  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagact 609  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  30254618 taaagtgtaacacttaagact 30254638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 386 - 602
Target Start/End: Original strand, 1547279 - 1547487
Alignment:
Q  386 aaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtaca 485  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||    
T  1547279 aaaaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactataacataaaaaatgttgtgagtaacactccactgtttgtgca 1547378  T
Q  486 atgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacc 585  Q
     || ||||||||||||||| ||||||||||||||        |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||    
T  1547379 gtggcatcaaaagttcagttctcatagtatcatc--------agattaacaaaaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacacc 1547470  T
Q  586 ccacaaagtgtaacact 602  Q
    |||||||||||||||||    
T  1547471 ccacaaagtgtaacact 1547487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 388 - 610
Target Start/End: Original strand, 16415639 - 16415862
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacaca-tcactgtttgtacaa 486  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||  | | ||||||||||     
T  16415639 aaggaaaattctaaggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtaacaccctaaatgtttgtacag 16415738  T
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 586  Q
    || |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||    
T  16415739 tggcatcaaaagttcagccatcatagtatcatcaattcattagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccc 16415838  T
Q  587 cacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||| | ||||| |||||||||||    
T  16415839 cacatattgtaatacttaagacta 16415862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 390 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 27227657 - 27227445
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||  |||  ||||||||| |      ||| |||||||||||||| ||     
T  27227657 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttttggtgaagttaacactagcata--aaaaatgtact------cacctcactgtttgtacagtgg 27227566  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  27227565 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 27227466  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  27227465 aaagtgcaacacttaagacta 27227445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 396 - 610
Target Start/End: Original strand, 47279191 - 47279405
Alignment:
Q  396 ttttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaa 495  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| || |||| |    
T  47279191 ttttttggtgaagtcatgagaatgatttttttggtgaagttaacattatactatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcga 47279290  T
Q  496 aagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtg 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||| |||| ||||||    
T  47279291 aagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaattgtaacatcccataaagtg 47279390  T
Q  596 taacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||    
T  47279391 taacacttaagacta 47279405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 384 - 602
Target Start/End: Original strand, 48620627 - 48620845
Alignment:
Q  384 taaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgta 483  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| || | ||  |||||||| |||||||||||| ||||| || |||| ||| |||||||||||  |||||||||||    
T  48620627 taaaaaggaaaattctatgttgaagttattaaaatgacttttcttgtgaagttaacaatataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgta 48620726  T
Q  484 caatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca 583  Q
    || |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||    
T  48620727 cagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaaca 48620826  T
Q  584 ccccacaaagtgtaacact 602  Q
    |||||||||||||||||||    
T  48620827 ccccacaaagtgtaacact 48620845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 390 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 7079254 - 7079023
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacaca-----------tcactgt 478  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||            |||||||    
T  7079254 ggaaaattttatggtaaagtcatgataatgacttttttggtgaagttaacactataatatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactaacacctcactgt 7079155  T
Q  479 ttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcg 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  7079154 ttgtacaatgacatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtg 7079055  T
Q  579 taacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  7079054 taacaccccacaaagtataagacttaagacta 7079023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 389 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 19899950 - 19899729
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||  | |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  19899950 aggaaaattctatggtgaagtcataataatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaacgagtaacacctcactgtttgtagaatg 19899851  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
     |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || || |||||||||||||| |    
T  19899850 gcatcaaaagttcaaccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcatacattgttctaagcgtaacacccta 19899751  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19899750 caaagtgtaacacttaagacta 19899729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 390 - 607
Target Start/End: Original strand, 42721035 - 42721252
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||  | |||| ||||||||||| | |||||  ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| | |    
T  42721035 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgatttttttggtgaagttagccctatatcataaaaaatatagtgagtaacaccccactgtttgtacagtaa 42721134  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||    
T  42721135 catcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccac 42721234  T
Q  590 aaagtgtaacacttaaga 607  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  42721235 aaagtataacacttaaga 42721252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 390 - 610
Target Start/End: Original strand, 23999343 - 23999563
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  | |||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||  |||||||||  |||| |||||| |||||    
T  23999343 ggaaaattttatggtgaagtcataagaatgatttttttggtgaagttaacactacaacataaaaaatataacgagtaacaccccactatttgtagaatga 23999442  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || ||||| |||||||| ||    
T  23999443 catcaaaagttcagccctcatagtattatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctac 23999542  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23999543 aaagtgtaacacttaagacta 23999563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 385 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 11742535 - 11742338
Alignment:
Q  385 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtac 484  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  11742535 aaaaaggaaaattttatcgtgaagttatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatattatcaaaagtgttgtaagtaacaccccactgtttgtac 11742436  T
Q  485 aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca 583  Q
    | |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  11742435 agtgacatcaaaagttcagtcc-cataatatcatcaattcatcggattaacaagaatacacttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaaca 11742338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 391 - 588
Target Start/End: Original strand, 14758038 - 14758235
Alignment:
Q  391 gaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgac 490  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||  || |    
T  14758038 gaaaattttacggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgagtagcacacaactgtttgtacggtggc 14758137  T
Q  491 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  14758138 atcaaaagttcagtccccatagtttcatcaattcattagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccca 14758235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 400 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 28564951 - 28564746
Alignment:
Q  400 atggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagt 499  Q
    |||||||||| |||| ||  | |||| || ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  28564951 atggtgaagttatgaaaatgatttttttgatgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccttactgtttgtacaatgacatcaaaagt 28564852  T
Q  500 tcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaac 599  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| || ||||| |||||||||  ||||||||||    
T  28564851 tcagtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcatgccttgttataagcataacaccccgtaaagtgtaac 28564752  T
Q  600 acttaa 605  Q
    ||||||    
T  28564751 acttaa 28564746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 387 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 34012560 - 34012346
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 486  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||  || ||| || ||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||  ||||||||||| |     
T  34012560 aaaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacgtttatgatgaagttaacactataacatcaacactgtagtgagtaacactccactgtttgtaaag 34012461  T
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 586  Q
    || |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||| |||||||||    
T  34012460 tggcatcaaaagttcagtcatcatactatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaacaccc 34012361  T
Q  587 cacaaagtgtaacac 601  Q
    |||||| ||||||||    
T  34012360 cacaaaatgtaacac 34012346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 420 - 610
Target Start/End: Original strand, 51128885 - 51129075
Alignment:
Q  420 acttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatc 519  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  51128885 acttttttagtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacactccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcattatagtatcatc 51128984  T
Q  520 agttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    | ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  51128985 aattcatcatattaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaacaattaaaacta 51129075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 392 - 610
Target Start/End: Original strand, 28769651 - 28769869
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| |||||||||||||| | || ||||||| | |||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||| ||    
T  28769651 aaaattctatggtgaagtcataaaaataactttttttgtgaagttaacactatgacatcaaaaatgtaatgagtaacacc-caccgtttgtacaatggca 28769749  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca-ccccaca 590  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||| |||||||    
T  28769750 tcaaaggttcggtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataaacgtaacacccccaca 28769849  T
Q  591 aagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  28769850 aagtgtaacgcttaagacta 28769869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 420 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 9903204 - 9903014
Alignment:
Q  420 acttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatc 519  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  9903204 acttttttgatgaagttaacactataacatcaaaactgtagtgagtaacaccccgctgtttgtacagtgacatcaaaagttcaatccacatactatcatc 9903105  T
Q  520 agttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    | ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9903104 aattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcttacattgtttcaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagacta 9903014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 387 - 604
Target Start/End: Original strand, 3534925 - 3535142
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 486  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| | ||||||||| ||     
T  3534925 aaaggaaaattctattatgaagtcattagaattaattttctagtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccttactgtttgtgcag 3535024  T
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 586  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||| |||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||    
T  3535025 tgacatcaaaagttcagtccccttaatattatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctgccttgttttaagtgtaacaccc 3535124  T
Q  587 cacaaagtgtaacactta 604  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3535125 cacaaagtgtaacactta 3535142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 388 - 610
Target Start/End: Original strand, 8222125 - 8222344
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| || ||||||||||| | ||  || ||| | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||| |||   |||||    
T  8222125 aaggaaaattctacggtgaagtcataaaaatgacctttttagtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccacaccgtt---acaat 8222221  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  8222222 ggcatcaaaagttcagttctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctcattttatcctaccttgttataagcgtaacacccc 8222321  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  8222322 acaaagtgtaacacttaaaacta 8222344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 390 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 30327132 - 30326912
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| ||| |||||||||| | ||  |||||| | ||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||   || |||||||||||      
T  30327132 ggaaaattctatagtgaagtcataaaaatgactttttttgtgaatttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaatacccaaccgtttgtacaatag 30327033  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  30327032 catcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctcattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccac 30326933  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  30326932 aaagtgtaacacttaaaacta 30326912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 385 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 37619081 - 37618860
Alignment:
Q  385 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatc--actgtttgt 482  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  |||||| |||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||| ||| |  |||||||||    
T  37619081 aaaaaggaaaattctatggtgaagttataagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatttaatgagtaaaacaccccactgtttgt 37618982  T
Q  483 acaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtat--catcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgta 580  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||    
T  37618981 aaaatgacatcaaaagttcagttctcatagtatatcatcaattcatcagattaacaatactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcata 37618882  T
Q  581 acaccccacaaagtgtaacact 602  Q
    ||| |||| |||||||||||||    
T  37618881 acatcccataaagtgtaacact 37618860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 400 - 610
Target Start/End: Original strand, 37451292 - 37451501
Alignment:
Q  400 atggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagt 499  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  37451292 atggtgaagtcataaaaatgacttttttggtaaagttaacactataacatcaaaaatgtaataagtaacaccctaccgtttgtacaatgacatcaaaagt 37451391  T
Q  500 tcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaac 599  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||| || ||||||||||    
T  37451392 tcagtcctc-tagtatcatcaatttatcatattaacaagactacacttaatctaattttatctgaccttgttataagtgtaacacctcaaaaagtgtaac 37451490  T
Q  600 acttaagacta 610  Q
    |||||||||||    
T  37451491 acttaagacta 37451501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 390 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 47682673 - 47682454
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatc-actgtttgtacaatg 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||  |||  |||||||| |||||||||||  | |||| ||||||| ||    
T  47682673 ggaaaattttatggtgaagtcatgagagtgacttttttggtgaagttaacactagcata--aaaaatgttgtgagtaacactcccactgcttgtacagtg 47682576  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||  | |||| ||||||| |||||||| ||    
T  47682575 gtatcaaaagttcattcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacatttaaactaattttattctgccttgttttaagtgtaacacctca 47682476  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  47682475 caaagtgtaacacttaagacta 47682454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 390 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 27267376 - 27267160
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||     
T  27267376 ggaaaattatatg-tgaagtcatgagaatgatttttttggtgaagttaacactagcata--aaaaatgtagtgagtgacaccccactgtttgtacagtgg 27267280  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||||||    
T  27267279 cattaaaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttaatc-taccttgttttgagtgtaacaccccac 27267181  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  27267180 aaagtgcaacacttaagacta 27267160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 392 - 604
Target Start/End: Original strand, 41926161 - 41926373
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||  | |||| || ||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||| |   ||||||||||||| || ||    
T  41926161 aaaattctatggtgaagttatgaaaatgatttttttgatgaagttaatactataacatcaaaaatatagtgagtaatatcccactgtttgtacagtggca 41926260  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||| ||||||    
T  41926261 tcacaagttcagtccctatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacactccacaa 41926360  T
Q  592 agtgtaacactta 604  Q
    |||||||||||||    
T  41926361 agtgtaacactta 41926373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 387 - 610
Target Start/End: Original strand, 39393376 - 39393600
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 486  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||||||  ||||||||||||||||  || |||| ||| |||||||| || ||| ||||||||||     
T  39393376 aaaggaaaattctacggtgaagttatgagaatgacttttctaatgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaatacttcattgtttgtacag 39393475  T
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaa-ttttatcttaccttattttaagcgtaacacc 585  Q
    || ||||||||||| | ||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||| |    
T  39393476 tggcatcaaaagtttaatccccatagtatcataaattcatcagattaacaagaatacacttcatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacatc 39393575  T
Q  586 ccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  39393576 ctacaaagtgtaacacttaagacta 39393600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 403 - 610
Target Start/End: Original strand, 4330288 - 4330497
Alignment:
Q  403 gtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa-cactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatc-actgtttgtacaatgacatcaaaagtt 500  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||| ||||| ||| |||||||  || |||| |||||||||||||||  | | |||||||||| ||  ||||||||||    
T  4330288 gtgaagttatgagaatgacttttctgatgaagataaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtaacacccccaatgtttgtacagtgggatcaaaagtt 4330387  T
Q  501 cagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaaca 600  Q
    ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  4330388 cagtcatcatagtatcatcaatttatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaaatgtaaca 4330487  T
Q  601 cttaagacta 610  Q
    ||||||||||    
T  4330488 cttaagacta 4330497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 429 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 27763451 - 27763271
Alignment:
Q  429 gtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcatta 528  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || || |    
T  27763451 gtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacacc-catagtttgtagaatgacatcaaaagtccagccctcatagtatcatcaatttatca 27763353  T
Q  529 gattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27763352 ggttaacaagactacacttaatctaattttatcatacctagttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaatacttaagacta 27763271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 406 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 27533144 - 27532941
Alignment:
Q  406 aagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtc 505  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||  || |||| | | ||| ||||||   |||| |||||||| || ||||||||||||| ||    
T  27533144 aagttatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtattgtgggtaacaacccactctttgtacagtggcatcaaaagttcaatc 27533045  T
Q  506 ctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaa 605  Q
    | ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  27533044 cccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatc-aattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacactcaa 27532946  T
Q  606 gacta 610  Q
    |||||    
T  27532945 gacta 27532941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 385 - 558
Target Start/End: Original strand, 3309139 - 3309311
Alignment:
Q  385 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtac 484  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  3309139 aaaatggaaaattctatggtaaagtcatgagaatgacttttctggtaaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacc-cactgtttgtac 3309237  T
Q  485 aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaatttt 558  Q
    | ||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3309238 agtggtatcaaaagttcaatcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttt 3309311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 477 - 610
Target Start/End: Original strand, 25160715 - 25160848
Alignment:
Q  477 gtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaag 576  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||| || ||||    
T  25160715 gtttgtacaatggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcattagattaataagactacacttaatctcattttatcctaccttgttataag 25160814  T
Q  577 cgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  25160815 tgtaacaccccacaaagtataacacttaaaacta 25160848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 429 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 27564046 - 27563865
Alignment:
Q  429 gtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcatta 528  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||| |  ||| ||| |||| ||||| |    
T  27564046 gtgaagttaacactataactttaaaaatatagtgagtaacactccactgtttgtatagtgacatcaaaagttcagttccgataatattatcaattcatca 27563947  T
Q  529 gattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  27563946 gattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtataataccccacaaagaggaacacttaagacta 27563865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 429 - 610
Target Start/End: Original strand, 46931446 - 46931625
Alignment:
Q  429 gtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcatta 528  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||  ||||||||||| || | |||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||| |    
T  46931446 gtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaataccccactgtttgtagaacggcatcaaaaattcagccctcataatatcatcaattcatca 46931545  T
Q  529 gattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    | ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46931546 ggttaacaagactacacttaatataattttatcatacct--tgttcagcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagacta 46931625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 387 - 606
Target Start/End: Original strand, 15168082 - 15168308
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 486  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||||    |||||||||||||| |||||||||  || |||| ||||||||||| |||  ||||||||||||      
T  15168082 aaaggaaaattctatcgtgaagtgatgagaatgctttttctggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttgtacgt 15168181  T
Q  487 tga-------catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgt 579  Q
    ||        ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  15168182 tgtacggtggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcagttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgt 15168281  T
Q  580 aacaccccacaaagtgtaacacttaag 606  Q
    |||||| || |||||||||||||||||    
T  15168282 aacacctcagaaagtgtaacacttaag 15168308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 390 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 31621733 - 31621514
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||| || |||  |||| |||||| |||  | || |||||||  ||     
T  31621733 ggaaaattctacggtgaagtcatgagaatgacttttctagtgaagtcaacactataacatcaaaggtgtattgagtagcaccccgctatttgtacggtgg 31621634  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | || ||||||     
T  31621633 catcaaaaattcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgcaatacccca- 31621535  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagacta 610  Q
     |||||| |||||||||||||    
T  31621534 gaagtgtgacacttaagacta 31621514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 422 - 610
Target Start/End: Original strand, 40884841 - 40885029
Alignment:
Q  422 ttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcag 521  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| || |||| ||||||||||| |||  ||||||||||||  || |||||||||||||||||  |||||||| |||     
T  40884841 ttttctggtgaagtcaacaccataacatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtccctatagtatcttcaa 40884940  T
Q  522 ttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| ||||||  ||  |||||||||||||||||||||    
T  40884941 ttcatcagattaacaagattgcacttaatctagttttatcctatcttgttttaagtgtaacattccgaaaagtgtaacacttaagacta 40885029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 392 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 33725778 - 33725560
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||  |||||||| ||||||| ||| |||||  || |||| |||| |||||| ||   |||| ||| |    || ||    
T  33725778 aaaattctatggtaaagtcaagagaatgacttttctagtgaagtcaacgctatatcatcaaaagtgtattgagtagcagcccactatttctttggtggca 33725679  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  33725678 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacaccccagaa 33725579  T
Q  592 agtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  33725578 agtgtaacatttaagacta 33725560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 390 - 538
Target Start/End: Original strand, 21289661 - 21289816
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactata------ata-taaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgt 482  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||      ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21289661 ggaaaaatctattgtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatatcataaataataaaaaatgtagtgagtaacaccccactgtttgt 21289760  T
Q  483 acaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaag 538  Q
    ||| || |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21289761 acagtggcatcaaaagttcagtccctatagtatcatcaattcatcagattaacaag 21289816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 489 - 610
Target Start/End: Original strand, 22170806 - 22170927
Alignment:
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||||||||    
T  22170806 acatcaaaagttcagtctacataatatcatcaattcattagattaataacactacacttaatctaatttcatcctaccttgtttcaaatgtaacacccca 22170905  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22170906 caaagtgtaacacttaagacta 22170927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 450 - 610
Target Start/End: Original strand, 38759583 - 38759749
Alignment:
Q  450 aaaaaatgtagtgagtaacacatcact--gtttgtacaatgacatcaaaagttcag----tcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattac 543  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||    || || || |||||||| ||||| | ||||| || | |||    
T  38759583 aaaaaatatagtgagtaacacctcgctctgtttgtacagtgacatcaaaagttcagccagtcttcgtaatatcatcaattcatcatattaataaaactac 38759682  T
Q  544 acttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    | ||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38759683 atttaatttaattttatcatatcttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttgagacta 38759749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 430 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 1360022 - 1359932
Alignment:
Q  430 tgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcag 521  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||| |||||| ||| |  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1360022 tgaagttaatactataacattaaaaatatagtga-taatatttcagtgtttgtataatgacatcaaaagttcagtcctcgtagtatcatcag 1359932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 389 - 489
Target Start/End: Original strand, 30254853 - 30254952
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||  |||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||||    
T  30254853 aggaaaattctatggtgaagtcataataatgacttttttgatgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatggataacac-ccactgtttgtacaatg 30254951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 390 - 438
Target Start/End: Original strand, 43579242 - 43579290
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  43579242 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctagtgaagttaa 43579290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 4150537 - 4150490
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagt 435  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  4150537 aaggaaaattctatggtgaagtcatgataatgacttttctggtgaagt 4150490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 446
Target Start/End: Original strand, 22170747 - 22170806
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataa 446  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||||  |||||||||||||||||    
T  22170747 aaaggaaaattctatggtgaaatcatgaaaatgacttttctaatgaagttaacactataa 22170806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 389 - 439
Target Start/End: Original strand, 26970260 - 26970310
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaac 439  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| |||||||||||||    
T  26970260 aggaaaattttatggtaaagtcatgataatgacttttttggtgaagttaac 26970310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 153; Significance: 9e-81; HSPs: 60)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 402 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 27318650 - 27318442
Alignment:
Q  402 ggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttc 501  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  27318650 ggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaacactaaaacataaaaaatgtagtgagtaacacaccactgtttgtacaatgacatcaaaagttt 27318551  T
Q  502 agtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacac 601  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27318550 agttctcacagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacac 27318451  T
Q  602 ttaagacta 610  Q
    |||||||||    
T  27318450 ttaagacta 27318442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 392 - 610
Target Start/End: Original strand, 699152 - 699370
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  699152 aaaattttatggtgaagttatgagaatgacttttctgatgaagttaacactatagcataaaaaatctagtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 699251  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  699252 tcaaaagttcagtcatcataatatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttattttaagtgtaacactccacaa 699351  T
Q  592 agtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  699352 agtgtaatacttaagacta 699370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 389 - 602
Target Start/End: Original strand, 39572818 - 39573031
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| || ||    
T  39572818 aggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctagttaagttaatactataatataaaaaatgttgtgagtaacactccactgtttgtgcagtg 39572917  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||    
T  39572918 acatcaaaagttcagttctcatagtatcataaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatccca 39573017  T
Q  589 caaagtgtaacact 602  Q
    ||||||||||||||    
T  39573018 caaagtgtaacact 39573031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 391 - 610
Target Start/End: Original strand, 22980794 - 22981013
Alignment:
Q  391 gaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgac 490  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||| ||  |||||||||  |||||||    
T  22980794 gaaaattttatgatgaagttatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatagtatcaaaaatacagtgagtaataccccactgtttgagcaatgac 22980893  T
Q  491 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 590  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  22980894 atcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcaca 22980993  T
Q  591 aagtgtaacacttaagacta 610  Q
    || |||||||||||||||||    
T  22980994 aaatgtaacacttaagacta 22981013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 388 - 610
Target Start/End: Original strand, 36860421 - 36860644
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  36860421 aaggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgatttttctggtgaagttaacactatagtataaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaat 36860520  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttacc-ttattttaagcgtaacaccc 586  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| | | |||||||| |||| |||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||    
T  36860521 gacatcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcatcatactaacaagagtacatttaatctaattttatcctaccttttttttaagtgtaacaccc 36860620  T
Q  587 cacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  36860621 cacaaagtgtaacacttaaaacta 36860644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 404 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 30969485 - 30969279
Alignment:
Q  404 tgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcag 503  Q
    ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  30969485 tgaagtcatgagaatgatttatctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactatttatacaatgacatcaaaagttcag 30969386  T
Q  504 tcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacactt 603  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  30969385 tcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacactt 30969286  T
Q  604 aagacta 610  Q
    |||||||    
T  30969285 aagacta 30969279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 388 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 5112490 - 5112270
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  5112490 aaggaaaattttatggtgaagtcatgaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacataaaaaatatagtgagtaacaccccactgtttgtacagt 5112391  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||| |||||    
T  5112390 ggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcattaaattaacaagactatacttaatctaattttatcataccatgttttaagtgtaa-acccc 5112292  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagact 609  Q
    |||||||  |||||||||||||    
T  5112291 acaaagtacaacacttaagact 5112270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 385 - 610
Target Start/End: Original strand, 19119854 - 19120079
Alignment:
Q  385 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtac 484  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||  || |||| ||| |  ||||||||  ||||||||||||    
T  19119854 aaaaaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttgtggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgctagtaacaccccactgtttgtac 19119953  T
Q  485 aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacac 584  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||| |||||||  ||||||    
T  19119954 agtgacatcaaaagttcagtccccatagtgtcatcaattcatcagattaacaagaataaacttactctaattttatcctaccttgttttaagtataacac 19120053  T
Q  585 cccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  19120054 cccacaaagtgtaacacttaagacta 19120079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 390 - 602
Target Start/End: Original strand, 7693230 - 7693442
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||   ||||||||||||| ||     
T  7693230 ggaaaattctatggtgaagtcattaaaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacatcccactgtttgtacagtgg 7693329  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  7693330 catcaaaagttcaatcctcttagtatcatcaattcattagattaacatgaatacgcttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacaccccac 7693429  T
Q  590 aaagtgtaacact 602  Q
    |||||||||||||    
T  7693430 aaagtgtaacact 7693442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 390 - 610
Target Start/End: Original strand, 36866762 - 36866982
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||     
T  36866762 ggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgatttttctggtgaagttaacactataatatcaaaaatattgtgagtaacaccccactgtttgtacaatgg 36866861  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| || ||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  36866862 catcaaaagttcagtcccgatagtatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 36866961  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  36866962 aaagtgtaacacttaaaacta 36866982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 388 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 38528413 - 38528192
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||    ||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||  || ||||| |||| |    
T  38528413 aaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatggtttttctgatgaagttaacactataacatcaaaattgtaatgagtaacaccccattgtttatacagt 38528314  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  38528313 gacatcaaaagttcagtc-tcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcttaccttgtttcaagtgtaacacccc 38528215  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  38528214 acaaagtgtaacacttaagacta 38528192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 389 - 602
Target Start/End: Original strand, 9200232 - 9200445
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  ||| ||||||||| ||    
T  9200232 aggaaaattttatggtgaagtcattaaaataacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccacagtttgtacagtg 9200331  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||  |||    
T  9200332 acatcaaaagtttagtcctcttagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacattcca 9200431  T
Q  589 caaagtgtaacact 602  Q
    ||||||||||||||    
T  9200432 caaagtgtaacact 9200445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 387 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 8742065 - 8741841
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatc-actgtttgtaca 485  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||  | | ||||||||||    
T  8742065 aaaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacacccccattgtttgtaca 8741966  T
Q  486 atgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacc 585  Q
    ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||    
T  8741965 atggcatcaaaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacaattaatctaattttgtcataccttgttttaagtgtaacacc 8741866  T
Q  586 ccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  8741865 ctacaaagtgtaacacttaagacta 8741841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 388 - 610
Target Start/End: Original strand, 12910348 - 12910575
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |    
T  12910348 aaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttttggtgaagttaaaactataacatcaaaaatatagtgcgtaacaccccactgtttgtacagt 12910447  T
Q  488 -----gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaac 582  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  12910448 acagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcgtcaattcatcagattaacatgactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaac 12910547  T
Q  583 accccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12910548 accccacaaagtgtaacacctaagacta 12910575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 392 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 25501099 - 25500884
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||| |||| |||||| |||||||||||||| || ||    
T  25501099 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtaaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgaataacacctcactgtttgtacactgcca 25501000  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  25500999 tcaaaagttaagtccctatagtatcatcaattcatcagattaacaagaataaacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 25500900  T
Q  592 agtgtaacacttaaga 607  Q
    ||||||||||||||||    
T  25500899 agtgtaacacttaaga 25500884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 388 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 35826660 - 35826442
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||| | |||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |    
T  35826660 aaggaaaattctatggtgaagtcatgataatgactttttttgtgaagttaatactataacatcaaaaatgtactgagtaacacttcattgtttgtacagt 35826561  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||| |||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||| ||    
T  35826560 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttca-tagattaacaataccacatttaatctaattttattctacattgttttaagcgtaacactcc 35826462  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaaga 607  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  35826461 acaaagtgtaacccttaaga 35826442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 387 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 14919707 - 14919483
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctgg-tgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtaca 485  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||| | | ||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||| || |    
T  14919707 aaaggaaaattatatggtgaagtcatgagaattattttttttgatgaagttaacattataacatcaaaaatgtaatgagtaacacctcactgtttatata 14919608  T
Q  486 atgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacc 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  14919607 atgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatcatattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttattataagtgtaacacc 14919508  T
Q  586 ccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
     |||||| ||||| |||||||||||    
T  14919507 tcacaaattgtaatacttaagacta 14919483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 387 - 584
Target Start/End: Original strand, 24886099 - 24886298
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttct--ggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtac 484  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  24886099 aaaggaaaattttatggtgaaatcatgagaatgacttttttttggtgaagttaatactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtac 24886198  T
Q  485 aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacac 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  24886199 aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattataagtgtaacac 24886298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 390 - 610
Target Start/End: Original strand, 40133385 - 40133605
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||  |||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||     
T  40133385 ggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttgtggtgaagttaacattatagtatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactatttgtacaatgg 40133484  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  40133485 catcaaaagttcagtccccataatatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 40133584  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  40133585 aaagtgtaacacttaaaacta 40133605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 388 - 610
Target Start/End: Original strand, 27330304 - 27330524
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||  |||||||||| | ||||||||||||||    
T  27330304 aaggaaaattctatggtgaagtcgtgggaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgt--tgagtaacaccttactgtttgtacaat 27330401  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||    
T  27330402 ggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacacccc 27330501  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |  |||||| |||||||||||||    
T  27330502 atgaagtgtcacacttaagacta 27330524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 386 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 22974261 - 22974037
Alignment:
Q  386 aaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtaca 485  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||   |||||||||||||    
T  22974261 aaaaggaaaattctatggtgaagttatgagaatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaaagtaatgagtaacatcccactgtttgtaca 22974162  T
Q  486 atgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacc 585  Q
    || |||||||||||||| | |||||| ||||||||  |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||    
T  22974161 ataacatcaaaagttcaattctcatattatcatcaactcatcagaataacaagactacacttaatctaattttatcctatcttgttataagcgtaacacc 22974062  T
Q  586 ccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
     |||||| |||||||||||||||||    
T  22974061 tcacaaaatgtaacacttaagacta 22974037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 403 - 610
Target Start/End: Original strand, 26268087 - 26268294
Alignment:
Q  403 gtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttca 502  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  || |||| |||  ||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  26268087 gtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttttgagtaacaccccactgtttgtacggtgacatcaaaagttta 26268186  T
Q  503 gtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacact 602  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  26268187 gtccacatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacaattaatcaaattttatcataccttgttttaagtgtaacaccgcacaaagtgtaacact 26268286  T
Q  603 taagacta 610  Q
    ||||||||    
T  26268287 taagacta 26268294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 391 - 602
Target Start/End: Original strand, 32563150 - 32563361
Alignment:
Q  391 gaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgac 490  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||  | ||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  |||||| |||||| ||||    
T  32563150 gaaaattctatggtgaagtcattaaaatgatttttctgatgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacactccactgtctgtacagtgac 32563249  T
Q  491 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 590  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  32563250 atcaaaagttcagtccccttaatatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacagcccaca 32563349  T
Q  591 aagtgtaacact 602  Q
    ||||||||||||    
T  32563350 aagtgtaacact 32563361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 392 - 610
Target Start/End: Original strand, 5837557 - 5837775
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| || |||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  5837557 aaaattctacggtgaattcatgagaatgacttttctggtgaaggtaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 5837656  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||| |||||||||    
T  5837657 tcaaaatttcagtctccatagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatctaatttaatcctacattgttttaagtgtaataccccacaa 5837756  T
Q  592 agtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5837757 agtgtaacacttaagacta 5837775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 391 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 31705785 - 31705569
Alignment:
Q  391 gaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgac 490  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||  | |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||   || ||||||||||||||    
T  31705785 gaaaattctatggtgaagtcataaaaatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaacgagtaacaccctaccgtttgtacaatgac 31705686  T
Q  491 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 590  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||||    
T  31705685 atcaaaagtccagtcctc-tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagcgtaacatctcaca 31705587  T
Q  591 aagtgtaacacttaagac 608  Q
    || |||||||||||||||    
T  31705586 aaatgtaacacttaagac 31705569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 390 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 23116397 - 23116177
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||  |||||| |  ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||     
T  23116397 ggaaaattctatggtgacgtcatgaaaatgactttttttatgaagttaacattataacatcaaaactgtagtgagtagcaccccactgtttgtacagtgg 23116298  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
     ||||||||||||||   ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  23116297 aatcaaaagttcagtttacatagtatcatcaattcatcagattaacaatattacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccac 23116198  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23116197 aaagtgtaacacttaagacta 23116177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 429 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 17158166 - 17157988
Alignment:
Q  429 gtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcatta 528  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| | ||||| |    
T  17158166 gtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacactccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttc-gtcattatagtatcattaattcatca 17158068  T
Q  529 gattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagac 608  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17158067 gattaacaagactacacttagtataattgtatcttaccttattataagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagac 17157988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 388 - 610
Target Start/End: Original strand, 22255179 - 22255402
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatat-aaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 486  Q
    |||||||| | || ||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||    
T  22255179 aaggaaaactctacggtgaagtcataaaaataacttttttggtgaagttaacattataacatcaaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaa 22255278  T
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 586  Q
    || ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  || || |||||||||||||     
T  22255279 tggcatcaaaagttcagttctcatattatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttagcctattttgttataagcgtaacacca 22255378  T
Q  587 cacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  22255379 cacaaagtgtaacacttaaaacta 22255402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 390 - 602
Target Start/End: Original strand, 22019632 - 22019844
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||| ||||||  || |||| ||| |||||||||||  || |||||||| | |||    
T  22019632 ggaaatttctatggtgaagttattagaatgacttttctggtgaagttaaaactatagaatcaaaagtgttgtgagtaacaccccattgtttgtatagtga 22019731  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22019732 catcaaaagttaagtccccttagtatcatcacttcatcatattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccac 22019831  T
Q  590 aaagtgtaacact 602  Q
    ||||| |||||||    
T  22019832 aaagtataacact 22019844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 390 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 31786821 - 31786601
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| ||| |||||||  ||||||  |||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |   |  ||||||||||||| ||     
T  31786821 ggaaaattctatagtgaagtagtgagaatgacttttttggtgaagttaacactatagcatgaaaaatgtagtgagcactgccccactgtttgtacagtgg 31786722  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||| ||    
T  31786721 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaacaccctac 31786622  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  31786621 aaagtgtaacacttaaaacta 31786601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 402 - 610
Target Start/End: Original strand, 33908245 - 33908453
Alignment:
Q  402 ggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttc 501  Q
    ||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||  || |||| ||||||||||| |||  ||||||||||||  || ||||||||||||    
T  33908245 ggtgaagtcatgagaatgaactttctggtgaagtcaacactatatcatcaaaagtgtagtgagtagcactccactgtttgtacggtggcatcaaaagttc 33908344  T
Q  502 agtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacac 601  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  33908345 agtcctcatagtatcatcaattattcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcataccttgttttaaatgtaacaccccagaaagtgtaacac 33908444  T
Q  602 ttaagacta 610  Q
    |||||||||    
T  33908445 ttaagacta 33908453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 422 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 7209006 - 7208819
Alignment:
Q  422 ttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcag 521  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||||||||| |  |||||||||   || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  7209006 ttttttggtgaagttaacattgtaacataaaaaatgcaacgagtaacaccctaccgtttgtacattgacatcaaaagttcagtcctc-tagtatcatcaa 7208908  T
Q  522 ttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7208907 ttcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataaacgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagacta 7208819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 35511652 - 35511441
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||||| ||||| || || | |||||||||||||||  ||||||||||| | |||    
T  35511652 ggaaaatcctatggtgaagtcatgaaaatgacgtttctgatgaagttaacattataacatcaacactgtagtgagtaacactccactgtttgtaaagtga 35511553  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  35511552 catcaaaagttcagtcatcatactatcaccaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaacaccccac 35511453  T
Q  590 aaagtgtaacac 601  Q
    ||| ||||||||    
T  35511452 aaaatgtaacac 35511441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 422 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 21088908 - 21088724
Alignment:
Q  422 ttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcag 521  Q
    |||| |||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  21088908 ttttttggtgaagttaa-actgtagtataaaaaatgttgtgagtgacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtccccatagtatcaacaa 21088810  T
Q  522 ttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaga 607  Q
    ||||| | | |||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21088809 ttcatcatactaacaagaatacatttaatctaactttatcctaccttgttttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacacttaaga 21088724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 390 - 610
Target Start/End: Original strand, 15724490 - 15724708
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||| || |||| | | |||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  15724490 ggaaaattctatggtgaagttatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagttttgtgagtaacaccccactgtttatacaatga 15724589  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||  |||||| || |    
T  15724590 catc-aaagttcagtcc-cataatatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttattttaagtataacacgcccc 15724687  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||| || |||||||||    
T  15724688 aaagtgtatcaattaagacta 15724708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 451 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 6824595 - 6824434
Alignment:
Q  451 aaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagt--tcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacactta 548  Q
    |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||    
T  6824595 aaaagtgttgtgagtaacactccactgtttgtacagtgacatcaaaagtgttcagtcttcatagtatcatcaatttatcagattaacaagaatacactta 6824496  T
Q  549 atctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6824495 atctaattttatcataccttgttttaaatgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 6824434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 452 - 610
Target Start/End: Original strand, 35504427 - 35504585
Alignment:
Q  452 aaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatc 551  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||     
T  35504427 aaaatgtaatgagtaacacctcaccgtttgtatgatgacatcaaaagttcaatcattatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaata 35504526  T
Q  552 taattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35504527 taattttatcctaccatattataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 35504585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 398 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 43308819 - 43308607
Alignment:
Q  398 ttatggtgaagtcatgagaacaacttttctg-gtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaa 496  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |  || ||||||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  43308819 ttatggtgaagtcatgagaatgactttttttagtaaagttaacattataacatcaaaaatgtaatgaataacacc-cactgttcgtacaatggcatcaaa 43308721  T
Q  497 agttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgt 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||   |||||||    
T  43308720 agttcagtcctcatagtatcatcaactcatcagcttaacaaaactatacttaatctaattttatcttaccttgttataagtgtaacaccctgaaaagtgt 43308621  T
Q  597 aacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||||||    
T  43308620 aacacttaagacta 43308607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 389 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 1429321 - 1429126
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  1429321 aggaaaaatctatggtgaagtcatgaaaatgactcttttggtgaagttaacactatagcatcaaaaatatagtgagtaacaccccactgtttgtacactg 1429222  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacac 584  Q
     |||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  1429221 gcatcaaaaattcagtctccatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 1429126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 422 - 610
Target Start/End: Original strand, 5829929 - 5830112
Alignment:
Q  422 ttttctggtgaagttaacactataat----ataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatca 517  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||    |||||||||||| ||||||||||   || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5829929 ttttttggtgaagttaacattataattaacataaaaaatgtaatgagtaacaccctaccgtttgtacaatgacatcaaaagtttagtcctcatagtatca 5830028  T
Q  518 tcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||         |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5830029 tca---------attaacaagactacacttaatctcattttatcttaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaacta 5830112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 390 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 14409501 - 14409310
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||  |||| ||  |||  ||     
T  14409501 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagtcaacactataacatcaaaaatgtagtgagtagcaccccactcttaatacggtgg 14409402  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaac 582  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||    
T  14409401 catcaaaagttcagt-ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaac 14409310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 429 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 28416663 - 28416490
Alignment:
Q  429 gtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcatta 528  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||   ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||  | || |||||||| ||||| |    
T  28416663 gtgaagttaacactataatatcaaaagtattgtgagtaacatcccactgtttgtacagtggaatcaaaagttcaatctccttaatatcatcaattcatca 28416564  T
Q  529 gattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacact 602  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28416563 gattaacaagaatacacttaatctaattttattctgccttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 28416490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 389 - 610
Target Start/End: Original strand, 35933901 - 35934116
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  | |||| || ||||||||||||||||  || |||| ||| ||||||||||| |||||        | ||    
T  35933901 aggaaaattgtatggtgaagtcatgagaatgatttttttgatgaagttaacactatagaatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactt-------agtg 35933993  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatcta-attttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
     |||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||||||     
T  35933994 gcatcaaaagtccagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctagtttttatcctaccttgttttaagtgtaacaccct 35934093  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  35934094 acaaagtgtaacacttaagacta 35934116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 448 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 23954907 - 23954744
Alignment:
Q  448 ataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa-tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacact 546  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||| | || |||||||||||||||   ||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||    
T  23954907 ataaaaaatatagtgagtaacaccccactgtttttactagtggcatcaaaagttcagtttccatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacact 23954808  T
Q  547 taatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  23954807 taatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcacaaaatgtaacacttaagacta 23954744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 473 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 15992632 - 15992495
Alignment:
Q  473 cactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattt 572  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||  ||    
T  15992632 cactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttgatctaattttattctaccttgatt 15992533  T
Q  573 taagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    | || | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15992532 tgagtgcaacaccccacaaagtgtcacacttaagacta 15992495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 388 - 584
Target Start/End: Original strand, 8466743 - 8466938
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||| |||| ||||||  | || |||||||| |    
T  8466743 aaggaaaattctatgatgaggtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactgtaacatcaaaagtgttgtgaataacacccc-ctctttgtacagt 8466841  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacac 584  Q
    |  |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||| ||||||  |||||||    
T  8466842 ggtatcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttgttttaaatgtaacac 8466938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 432 - 602
Target Start/End: Original strand, 42342775 - 42342942
Alignment:
Q  432 aagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagat 531  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||| |||||||| ||  |||||||| |||| |||||||||||  |   ||| | ||||||||||| ||||| ||||    
T  42342775 aagttaatactataacatcaaaaatgttgtgagtaataccccactgtttatacagtgacatcaaaaaatt--tccccttagtatcatcaattcatcagat 42342872  T
Q  532 taacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacact 602  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  42342873 taacaagaatacacttaatctaattttatctta-cttgttttaagtgtaatacaccacaaagtgtaacact 42342942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 403 - 607
Target Start/End: Original strand, 8436979 - 8437182
Alignment:
Q  403 gtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttca 502  Q
    |||||||||||||||  | |||| ||||||| |||||||||||   |  ||| ||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  8436979 gtgaagtcatgagaatgatttttttggtgaaattaacactatagcttccaaagtgtagtgagtaacatcccattgtttgtacagtgacatcaaaagttca 8437078  T
Q  503 gtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacact 602  Q
    ||||||||  ||||||||   ||| ||||| |||| | ||  ||||||||||||||||| | |||| |||||||    ||||||||||| ||||||||||    
T  8437079 gtcctcattatatcatca-accatcagatttacaaaactatgcttaatctaattttatcctgccttgttttaagttatacaccccacaatgtgtaacact 8437177  T
Q  603 taaga 607  Q
    |||||    
T  8437178 taaga 8437182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 427 - 545
Target Start/End: Original strand, 25668687 - 25668804
Alignment:
Q  427 tggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcat 526  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||| ||| |||||||||||  ||||||||| ||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  25668687 tggtgaagttaacact-taacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgaacagtggcatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcat 25668785  T
Q  527 tagattaacaagattacac 545  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  25668786 tagattaacaagaatacac 25668804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 388 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 13956522 - 13956317
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  13956522 aaggaaaattctacggtgaagtcatgaaaatgacttttctcatgaagttaacactataacatcaaaactgtagtgagtaacacctcactgtttgtacact 13956423  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
      |||                || ||||||||| ||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||| |||||||||     
T  13956422 tgcat----------------at-gtatcatcaattcatcagattaacaaaacttcacttaatctaattttattttatcttgtttcaagtgtaacaccct 13956340  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  13956339 acaaagcgtaacacttaagacta 13956317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 392 - 526
Target Start/End: Original strand, 11898004 - 11898138
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| | ||||  || |||| || | ||||||||||   |||  ||||||| |||||    
T  11898004 aaaattttagggtgaagtcatgataataacttttctggtaaagttaatattatagcatcaaaagtgcactgagtaacaccctactagttgtacagtgaca 11898103  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcat 526  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  11898104 tcaaaagtttagtcctcatagtatcatcaattcat 11898138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 390 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 16004552 - 16004474
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaaca-acttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaa 467  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  16004552 ggaaaattctatggtaaagtcatgagaattgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaaatgttgtgagtaa 16004474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 541 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 2888469 - 2888400
Alignment:
Q  541 tacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  2888469 tacacttaatctaattttattttaccttgtttcaagtttaacattccataaagtgtaacacttaagacta 2888400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 26317859 - 26317779
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacac 470  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||  |||||||||    
T  26317859 ggaaaattctatgatgaagtcatgaaaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatataacgagtaacac 26317779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 393 - 444
Target Start/End: Original strand, 13380498 - 13380549
Alignment:
Q  393 aaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactat 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||    
T  13380498 aaattttatggtgaagtcatgagaatgacttttctagtgaagttaaccctat 13380549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 387 - 438
Target Start/End: Original strand, 22616491 - 22616542
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  22616491 aaaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctggtgaagttaa 22616542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 541 - 602
Target Start/End: Original strand, 25669737 - 25669797
Alignment:
Q  541 tacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacact 602  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  25669737 tacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacactccac-aagtgtaacact 25669797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 389 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 36055923 - 36055874
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  36055923 aggaaaattttatggtgatgtcatgagaatgacttttcttgtgaagttaa 36055874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 389 - 438
Target Start/End: Original strand, 27579038 - 27579087
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  27579038 aggaaaattttatggtgaaatcgtgaaaacgacttttttggtgaagttaa 27579087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 430 - 470
Target Start/End: Original strand, 22255615 - 22255655
Alignment:
Q  430 tgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacac 470  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  22255615 tgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacac 22255655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 49)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 390 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 33551189 - 33550969
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  33551189 ggaaaattctacggtgaagtcatgagaatgacttttttagtgaagttaacactataacatcaaaaatgtagtgagtaacaccccactgtttgtacaatga 33551090  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  33551089 catcaaaagttcggtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctacgttgttttaagcgtaacaccccac 33550990  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  33550989 aaagtgtaacacttaagacta 33550969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 389 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 17071941 - 17071720
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||  ||| | |||||||||||    
T  17071941 aggaaaattctatggtgaagtcatgcgaatgacttttttggtgaagttaacactataacaacaaaaatgtagtaagtaacatctcattatttgtacaatg 17071842  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17071841 acatcaaaagttcggtattcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacacccca 17071742  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17071741 caaagtgtaacacttaagacta 17071720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 382 - 610
Target Start/End: Original strand, 3176931 - 3177159
Alignment:
Q  382 aataaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttg 481  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||| | || ||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||   ||||||||    
T  3176931 aataaagagaaaaattctatggtgaagttacgaaaatgacttttctgatgaagttaatactataatatcaaaaatgttttgagtaacacgcaactgtttg 3177030  T
Q  482 tacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaa 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  3177031 tacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaa 3177130  T
Q  582 caccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3177131 caccccacaaagtgtaacacttaagacta 3177159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 389 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 19424832 - 19424611
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  || ||||| || | ||    
T  19424832 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaatggcttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccattgtttatatagtg 19424733  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  19424732 gcatcaaaagtttagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacgcttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacacccca 19424633  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  19424632 caaagtgtaacatttaagacta 19424611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 389 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 17054300 - 17054079
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||    
T  17054300 aggaaaattctatggtgaagtcatgcgaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaaatgtagtaagtaacatctcattgtttgtacaatg 17054201  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    ||||||||||| | ||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17054200 acatcaaaagtncggtattcataatatcatcaattcatcagattaacaagaccacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacacccca 17054101  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  17054100 caaagtgtaacacttaanacta 17054079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 388 - 610
Target Start/End: Original strand, 4166920 - 4167142
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| | |||||||||||  |||||||||||||||    
T  4166920 aaggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttctggtgaagttaacattatagtatcaaaaatattgtgagtaacaccccactgtttgtacaat 4167019  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  4167020 ggcatcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccc 4167119  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  4167120 acaaagtgtaacacttaaaacta 4167142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 388 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 31570939 - 31570718
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||| || ||||||||  |||| ||| || | |    
T  31570939 aaggaaaattctatggtgaagttatgagaataacttttctggtgaaattaacactataacattaaaagtgttgtaagtaacaccccactatttttatagt 31570840  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  31570839 gacatcaaaagttcagtccacatagtatcatgaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacacccc 31570740  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagact 609  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  31570739 acaaaatgtaacacttaagact 31570718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 392 - 610
Target Start/End: Original strand, 36641988 - 36642208
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||  || |||| ||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  36641988 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaaattaatactatagcatcaaaagtgttgcgagtaacacctcactgtttgtacagtgaca 36642087  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaa--ttttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  36642088 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatctaattttttatcctaccttgttttaagtgtaacaccctac 36642187  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  36642188 aaagtgtaacacttaagacta 36642208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 422 - 610
Target Start/End: Original strand, 37905740 - 37905930
Alignment:
Q  422 ttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcag 521  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37905740 ttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaacgagtaacaccccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaa 37905839  T
Q  522 ttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca--ccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  37905840 ttcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccccacaaagtgtaacacttaaaacta 37905930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 388 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 29242343 - 29242121
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||    |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |    
T  29242343 aaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatggtttttttggtgaagttaaaactataacataaaaaatatagtgcgtaacaccccactgtttgtacagt 29242244  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  29242243 ggtatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccc 29242144  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  29242143 acaaagtgtaacacctaagacta 29242121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 390 - 605
Target Start/End: Original strand, 33902068 - 33902281
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||| ||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||    
T  33902068 ggaaaattctatgatgaagtcgttagaatgacttttctggtgaagttaacacta--acataaaaaatgtagtgagtaataccccactgtttgtaaaatga 33902165  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  33902166 catcaaaagttcagtcctcaaagtatcatcagttcatcagattaacaagactatatttaatcgaattttatcctaccttgttttaagggtagcaccccac 33902265  T
Q  590 aaagtgtaacacttaa 605  Q
    ||||||||||||||||    
T  33902266 aaagtgtaacacttaa 33902281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 388 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 39167568 - 39167356
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  | |||| || |||||||||||  ||| ||| |||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39167568 aaggaaaattttatggtgaagtcacgagaatgatttttttgatgaagttaacagaatagtatcaaaagtattgtgagtaacacctcactgtttgtacaat 39167469  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||  |||||| ||||||| |||||| |||    
T  39167468 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcattagagtaacaagaatacacttattctaattttattataccttgttttaagtgtaacatccc 39167369  T
Q  588 acaaagtgtaaca 600  Q
    |||||||||||||    
T  39167368 acaaagtgtaaca 39167356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 386 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 2325577 - 2325361
Alignment:
Q  386 aaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtaca 485  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||| |||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||  || ||||||||||    
T  2325577 aaaaggaaaattctatggtgaagttatgtgaatgacttttctcgtgaagttaacaatataacatcataaatgtattgagtaacaccccattgtttgtaca 2325478  T
Q  486 atgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacc 585  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2325477 ctggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaa--------attaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacacc 2325386  T
Q  586 ccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  2325385 ccacaaagtgtaacacttaagacta 2325361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 427 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 43648411 - 43648228
Alignment:
Q  427 tggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcat 526  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  43648411 tggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacacctcactgtttgtataatgacatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaactcat 43648312  T
Q  527 tagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  43648311 cagattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagtgtaacaccacacaaagtataacacttaagacta 43648228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 389 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 27350143 - 27349930
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaac-ttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||  |||| |||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |    
T  27350143 aggaaaattttatggtgaagtcattaaaataatattttttggtgaagttaacactatagcatcaaaaatgttgtgagtaacaccacactgtttgtacagt 27350044  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||    
T  27350043 gacatcaaaagttcagtcc-cttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatccaaccttgttttaagtgtaacacccc 27349945  T
Q  588 acaaagtgtaacact 602  Q
    |||||||||||||||    
T  27349944 acaaagtgtaacact 27349930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 392 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 33660569 - 33660360
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||  |||||||| || ||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||   |||||||||||| || ||    
T  33660569 aaaattctatggtgaagtcattaaaatgacttttctagttaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacccaactgtttgtacagtggca 33660470  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  33660469 tcaaaagttcagtcctcttagtatcatcaattcattagattaacaggaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 33660370  T
Q  592 agtgtaacac 601  Q
    ||||||||||    
T  33660369 agtgtaacac 33660360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 389 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 4264281 - 4264060
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||| ||||||||||   ||||||||||||| ||    
T  4264281 aggaaaattctatggtgaagtcatcataatgacttttctggtaaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacatcccactgtttgtacagtg 4264182  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||    
T  4264181 acatcaaaagttcagtctccatagtattatcaattcatcatattaagaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtttaacacccca 4264082  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4264081 caaagtgtaacacttaagacta 4264060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 390 - 602
Target Start/End: Original strand, 19313852 - 19314063
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||  || |||| ||| ||||||||||| | ||| ||| |||| |||    
T  19313852 ggaaaattctatggtgaagtcattagaatgacttttctggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccttactatttatacagtga 19313951  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  19313952 catcaaaagttcagtcct-atagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatcgaattttaccctaccttgttttaagtgtaacaccccac 19314050  T
Q  590 aaagtgtaacact 602  Q
    |||||||||||||    
T  19314051 aaagtgtaacact 19314063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 390 - 610
Target Start/End: Original strand, 26357577 - 26357797
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||   ||||||||||||| |||    
T  26357577 ggaaaattttatggtgaagtcatgaaaatgacttttctgatgaagttaacactataacatcaaaactgtagtgagtaacatcccactgtttgtacagtga 26357676  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||||||| || ||||  | |||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||| |||||    
T  26357677 catcaaaagttcagttcttatagagttatcaattcatcatattaacaagatcacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacatcccac 26357776  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||| |||||||||||| ||||    
T  26357777 aaattgtaacacttaaaacta 26357797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 389 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 11366585 - 11366364
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||    
T  11366585 aggaaaattctatggtgaaatcataagaatgacttttttggtgaaattaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacatctcactatttgtataatg 11366486  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||| |||||||||| || ||| || ||| | |||||||| |    
T  11366485 acatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacatttaatataattttatcatatcttgttctaaacataacacccta 11366386  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11366385 caaagtgtaacacttaagacta 11366364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 390 - 610
Target Start/End: Original strand, 4763628 - 4763851
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaaca---ctataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 486  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||   |||||  |  |||| |||||||||||||||  |||||||||||||     
T  4763628 ggaaaattctatgatgaagtcatgaaaatgacttttctgatgaagttaacaacactatatcaacaaaactgtagtgagtaacaccccactgtttgtacag 4763727  T
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 586  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||| ||| |||||    
T  4763728 tgacatcaaaagttcagttcccatagtataatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttattctaccttgtttcaagtgtagcaccc 4763827  T
Q  587 cacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  4763828 cacaaagtgtaacacttaagacta 4763851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 390 - 610
Target Start/End: Original strand, 44913662 - 44913884
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcact-gtttgtacaatg 488  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||  |||||| || ||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  44913662 ggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttatg-tgaagttaacactgtagtatcaaaaatgttgtgagtaacacctcacttgtttgtaaaatg 44913760  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctc-atagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca-ccc 586  Q
    |||| ||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||| |||    
T  44913761 acataaaaagttcaatcccccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaacacccc 44913860  T
Q  587 cacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  44913861 cacaaagtgtaacacttaagacta 44913884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 392 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 41464051 - 41463833
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||  || ||| |||||||||||| ||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  41464051 aaaattctatggtgaagtcgtgagaatgacatttttggtgaagttaatactataaaatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactgtttgtacagtggca 41463952  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||| || ||||||  |||||||| |||||    
T  41463951 tcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacttttaatataattttatcatactttgttttaattgtaacacctcacaa 41463852  T
Q  592 agtgtaacacttaagacta 610  Q
    | ||||||| |||||||||    
T  41463851 aatgtaacatttaagacta 41463833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 386 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 19289525 - 19289306
Alignment:
Q  386 aaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtaca 485  Q
    |||||||||||| |||||||||||||     |  |||||| || ||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||  || ||||||||||    
T  19289525 aaaaggaaaattctatggtgaagtca-----atgacttttttgatgaagttaacactataacatcaaaaatataatgagtaacaccccattgtttgtaca 19289431  T
Q  486 atgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacc 585  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| || || |||  |||||| |    
T  19289430 atgacatcaaaagttaagttctcacagtatcatcaactcatcagattaataagactacacttaatctaattttatcctacattgttataaatgtaacatc 19289331  T
Q  586 ccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  19289330 ccacaaagtgtaacacttaagacta 19289306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 422 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 33709403 - 33709215
Alignment:
Q  422 ttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcag 521  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| | |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  33709403 ttttatggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgcgagtaacactccactgttagtacagtgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaa 33709304  T
Q  522 ttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
     |  | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  33709303 atattcagattaacaagaatacgcttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccctacaaagtgtcacacttaagacta 33709215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 392 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 43771039 - 43770830
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||  | |||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  |||||||| |||| || ||    
T  43771039 aaaattctatggtgaagtcattagaatgattttt-tggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttatacagtggca 43770941  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||| | |||| ||||||| |||||||| |||||    
T  43770940 tcaaaagttcagtccccttaatatcatcaattcatcagattaacaagaatatacttaatttaattttatcctgccttgttttaagtgtaacacctcacaa 43770841  T
Q  592 agtgtaacact 602  Q
    |||||||||||    
T  43770840 agtgtaacact 43770830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 392 - 610
Target Start/End: Original strand, 44285951 - 44286169
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| || |||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||||||||||  || |||| ||| | ||| || |  |||||||||||| | || ||    
T  44285951 aaaattatacggtgaagtcatgcgaatgatttttctgatgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgcgagcaatatctcactgtttgtatagtggca 44286050  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  44286051 tcaaaagtttagtccacatagtatcataaattcatcagattaacaataatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 44286150  T
Q  592 agtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||    
T  44286151 agtgtaacacttaagacta 44286169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 427 - 606
Target Start/End: Original strand, 4478406 - 4478581
Alignment:
Q  427 tggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcat 526  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  || |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  4478406 tggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacactccattgtttgtacagtggcatcaaaagtttagtcctcatagtatcatcaattcat 4478505  T
Q  527 tagattaacaagattacacttaatctaa-ttttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaag 606  Q
     |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||     ||||||||||||||||||||    
T  4478506 cagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaa-----cacaaagtgtaacacttaag 4478581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 386 - 610
Target Start/End: Original strand, 13711460 - 13711679
Alignment:
Q  386 aaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtaca 485  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||  || |||| ||| |||||||||||  ||| |||||||||    
T  13711460 aaaatgaaaattctatggtgaagtcatcagaatgacttttctggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccacagtttgtaca 13711559  T
Q  486 atgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacc 585  Q
     |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||     | | ||||||| ||||||||    
T  13711560 gtgacatcaaaagtttagtccacatggtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttat-----catgttttaagtgtaacacc 13711654  T
Q  586 ccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||| ||||| ||| | |||||||||    
T  13711655 ccataaagtataatagttaagacta 13711679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 489 - 607
Target Start/End: Original strand, 41960939 - 41961057
Alignment:
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||    
T  41960939 acatcaaaagttcagtccacatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacacccca 41961038  T
Q  589 caaagtgtaacacttaaga 607  Q
    |||||||||||||||||||    
T  41961039 caaagtgtaacacttaaga 41961057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 487 - 610
Target Start/End: Original strand, 45327817 - 45327940
Alignment:
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 586  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||     
T  45327817 tgacatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacct 45327916  T
Q  587 cacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    || |||||||||||| ||||||||    
T  45327917 cagaaagtgtaacacataagacta 45327940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 389 - 602
Target Start/End: Original strand, 5881533 - 5881750
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaa-----tgtagtgagtaacacatcactgtttgta 483  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||||||||| | | ||||| || ||||      ||| |||||||||||  |||||||||||    
T  5881533 aggaaaattttattgtgaagtcattaaaatgacttttctggtgaagttgatattataacatcaaaacaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgta 5881632  T
Q  484 caatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca 583  Q
    || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| | |||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||| |    
T  5881633 cagtgacatcaaaagttgagtccccttagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacatttaatctaa-tttatcataccttgttttaagtgtaata 5881731  T
Q  584 ccccacaaagtgtaacact 602  Q
    || ||||||||||||||||    
T  5881732 cctcacaaagtgtaacact 5881750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 386 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 18494475 - 18494264
Alignment:
Q  386 aaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtaca 485  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||  |||              
T  18494475 aaaaggaaaattctgtggtgaagtcatgaaaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccac---------- 18494386  T
Q  486 atgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacc 585  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||| |||| |||    
T  18494385 --gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattcactagaatacacttgatctaattttatcctaccttgtattaagtgtaa-acc 18494289  T
Q  586 ccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
     ||||||| || |||||||||||||    
T  18494288 tcacaaagagtcacacttaagacta 18494264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 486 - 605
Target Start/End: Original strand, 31861948 - 31862067
Alignment:
Q  486 atgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacc 585  Q
    |||| ||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| || || |||||||||||||    
T  31861948 atgatatcaaaatttcagtcattatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttaacatacattgttataagcgtaacacc 31862047  T
Q  586 ccacaaagtgtaacacttaa 605  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31862048 ccacaaagtgtaacacttaa 31862067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 390 - 610
Target Start/End: Original strand, 35958909 - 35959116
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||| ||||||||| | ||  |||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||    
T  35958909 ggaaaattctatgatgaagtcataaaaatgacttttttggtgaagttgccactataacataaaaaatgtaatgagcaacaccccactgtttgtacaatga 35959008  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||| ||||||||||            ||||| ||||| | |||||||||| | |||||||| ||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  35959009 cattaaaagttcag------------catcaattcatcatattaacaagactgcacttaatataa-tttatcctaccttgttataagcgtaacaccccac 35959095  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  35959096 aaagtgtaacagttaagacta 35959116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 390 - 610
Target Start/End: Original strand, 41465509 - 41465721
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  || |||  ||||||||||| |||   |  | | |||          
T  41465509 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaggtgtagtgagtagcaccctaacgctggta------ 41465602  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
      |||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||| ||     
T  41465603 --tcaaaagttcagtccctataatatcatcaattcattagattcacaagactgaacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacacctcag 41465700  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  41465701 aaagtgtaacacttaagacta 41465721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 460 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 7007054 - 7006930
Alignment:
Q  460 gtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaatttta 559  Q
    ||||||||||   ||||||||||||| |  ||||||||||| ||| | ||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7007054 gtgagtaacatcccactgtttgtacagtagcatcaaaagtttagttcccatagtatcatcaatttataagattaacaagaatacacttaatctaatttta 7006955  T
Q  560 tcttaccttattttaagcgtaacac 584  Q
    || |||||| ||||||| |||||||    
T  7006954 tcataccttgttttaagtgtaacac 7006930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 531 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 18258349 - 18258270
Alignment:
Q  531 ttaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18258349 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctacatttttttaagtgtaacaccccataaagtgtaacacttaagacta 18258270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 420 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 41051379 - 41051263
Alignment:
Q  420 acttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa-tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcat 518  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||  || |||| ||| |||  |||||| ||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41051379 acttttctgatgaagctaatactatagcatcaaaagtgttgtgtataacacttcactatttgtaccagtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcat 41051280  T
Q  519 cagttcattagattaac 535  Q
    || ||||| ||||||||    
T  41051279 caattcatcagattaac 41051263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 438
Target Start/End: Original strand, 19093410 - 19093461
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  19093410 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaa 19093461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 385 - 438
Target Start/End: Original strand, 22963395 - 22963448
Alignment:
Q  385 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||    
T  22963395 aaaatggaaaattttatggtgaagtcataagaatgacttttctggtaaagttaa 22963448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 385 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 22998082 - 22998029
Alignment:
Q  385 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||    
T  22998082 aaaatggaaaattttatggtgaagtcataagaatgacttttctggtaaagttaa 22998029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 394 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 18947642 - 18947598
Alignment:
Q  394 aattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18947642 aattctatggtgaagtcatgaaaataacttttctggtgaagttaa 18947598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 493 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 19501839 - 19501773
Alignment:
Q  493 caaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttat 560  Q
    |||||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  19501839 caaaagttcagtctctatagtatcatcaattcatcagattaacaa-actacatttaatctaattttat 19501773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 388 - 438
Target Start/End: Original strand, 6177773 - 6177823
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6177773 aaggaaaattctacggcgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaa 6177823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 389 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 39788626 - 39788580
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagt 435  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||    
T  39788626 aggaaaattttatggtgaagtcataagaatgacttttctagtgaagt 39788580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 390 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 18514819 - 18514771
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||| || |||||||||    
T  18514819 ggaaaattttatagtgaagtcatgagaatgacttttttgatgaagttaa 18514771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 390 - 438
Target Start/End: Original strand, 31861895 - 31861943
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  31861895 ggaaaattctatggtgaagttatgagaatgacttttttggtgaagttaa 31861943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 389 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 43446511 - 43446463
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagtta 437  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||    
T  43446511 aggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgactttttcggtgaagtta 43446463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 148; Significance: 8e-78; HSPs: 60)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 387 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 35021249 - 35021026
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 486  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  35021249 aaaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctggtgaagttaacattataacatcaaaaatgtagtgagtaacacaccactgtttgtacat 35021150  T
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 586  Q
    || | |||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  35021149 tggcgtcaaaagtttcgtcctcgtagtatcatcaattcattagattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagcgtaacaccc 35021050  T
Q  587 cacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  35021049 cacaaagtgtaacacttaagacta 35021026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 390 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 19089664 - 19089444
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  19089664 ggaaaattctatggtgaagtcataagaataacttttttgatgaagttaacactataatatcaaaattgtaatgagtaacaccccactgtttgtataatga 19089565  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | || ||||||||||| ||    
T  19089564 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctatatgcgtaacaccctac 19089465  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  19089464 aaagtgtaacacttaagacta 19089444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 389 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 37663951 - 37663732
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||||||  | || |||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  37663951 aggaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttttgatgaagttaacacta--acattaaaactgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatg 37663854  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||    
T  37663853 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaacacccca 37663754  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  37663753 caaagtgtaacacttaagacta 37663732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 389 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 879760 - 879539
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  879760 aggaaaattttaaggtgaagtcatgagaataatttttttggtgaagtaaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacacctcattgtttgtacaatg 879661  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||    
T  879660 acatcaaaagtttaatcttcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacataatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctca 879561  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  879560 caaagtgtaacatttaagacta 879539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 389 - 610
Target Start/End: Original strand, 25184112 - 25184333
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||    
T  25184112 aggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgactattttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacactctactgtttgtacaatg 25184211  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||    
T  25184212 acatccaaagttcaatcttcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttgatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctca 25184311  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  25184312 caaagtgtaacacttaagacta 25184333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 387 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 25701271 - 25701050
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||| ||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||   ||||||||||||     
T  25701271 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgataatgacttttttggtaaagttaacattataacatcaaaagtgtagtgagtaacaccctactgtttgtacag 25701172  T
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca-cc 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||    
T  25701171 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaggactacactaaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatcc 25701072  T
Q  586 ccacaaagtgtaacacttaaga 607  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  25701071 ccacaaagtgtaacacttaaga 25701050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 388 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 55478108 - 55477882
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcac----tgtttgta 483  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||  |||    ||||||||    
T  55478108 aaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaacgagtaacactccactgtttgtttgta 55478009  T
Q  484 caatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| || |||| ||||||    
T  55478008 caatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaacttgttataagtgtaaca 55477909  T
Q  584 ccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||    
T  55477908 ccccacaacgtgtaacactgaagacta 55477882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 392 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 36493897 - 36493680
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||  || |||||| |||||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  36493897 aaaattctatggtgaagtcatgaaaataacttttttggtgaagttaatactataccatcaaaaatatagtgagtaacaccccattgtttgtacagtgaca 36493798  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||| || ||||||    
T  36493797 tcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcattaaattaacaagactacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaa-actccacaa 36493699  T
Q  592 agtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||    
T  36493698 agtgtaacacttaagacta 36493680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 390 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 19440860 - 19440643
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaa-gtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||||||    
T  19440860 ggaaaattctatggtgaaagtcatgagaatgacttttttggtgatgttaacactataacatcaaaaatgtaatgattaacactccaccgtttgtacaatg 19440761  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  19440760 gcatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcttagcttgttataagcgtaacacccca 19440661  T
Q  589 caaagtgtaacacttaag 606  Q
    ||| ||||||| ||||||    
T  19440660 caacgtgtaacccttaag 19440643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 388 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 34361704 - 34361488
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||    
T  34361704 aaggaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtagaat 34361605  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||  | ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||     
T  34361604 gacattaaaagttcag-cctcataatatcatcaattcatccggttaacaaaattacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccct 34361506  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaa 605  Q
    ||||||||||||||||||    
T  34361505 acaaagtgtaacacttaa 34361488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 390 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 28003197 - 28002977
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||  || |||| |||||| ||||  ||  ||||||||||||| |||    
T  28003197 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtcagtagtactccactgtttgtacagtga 28003098  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||     
T  28003097 catcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcggattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccag 28002998  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  28002997 aaagtgtaacacttaaaacta 28002977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 392 - 610
Target Start/End: Original strand, 17167715 - 17167933
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| ||||||||||| | || ||  ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  17167715 aaaattctatggtgaagttacgaaaatgacttttctgatgaagttaacattataatatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaatgaca 17167814  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  17167815 tcaaaagttcattctccatagtatcattaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaa 17167914  T
Q  592 agtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17167915 agtgtaacacttaagacta 17167933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 392 - 610
Target Start/End: Original strand, 17173292 - 17173510
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| ||||||||||| | || ||  ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  17173292 aaaattctatggtgaagttacgaaaatgacttttctgatgaagttaacattataatatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaatgaca 17173391  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  17173392 tcaaaagttcaatctccatagtatcattaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaa 17173491  T
Q  592 agtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17173492 agtgtaacacttaagacta 17173510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 385 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 29584414 - 29584191
Alignment:
Q  385 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtac 484  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||  |||||||||| |||||||||||||    
T  29584414 aaaaaggaaaattctatggtgaagtcgtgggaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgt--tgagtaacacctcactgtttgtac 29584317  T
Q  485 aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacac 584  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || ||||    
T  29584316 aatggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgttacac 29584217  T
Q  585 cccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||  |||||| |||||||||||||    
T  29584216 cccatgaagtgtcacacttaagacta 29584191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 392 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 34948306 - 34948086
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||| | || ||    
T  34948306 aaaattttatggtgaagtcatgagaatgacttttctggcgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtaaagtggca 34948207  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||| | ||||||||||||    
T  34948206 tcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatctaattttatcctatcttgtttaaagtgcaacaccccacaa 34948107  T
Q  592 agtgtaac--acttaagacta 610  Q
    ||||||||  |||||||||||    
T  34948106 agtgtaacgtacttaagacta 34948086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 385 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 55241320 - 55241096
Alignment:
Q  385 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtac 484  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| ||| | |||||||||  ||||||||||||    
T  55241320 aaaatggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctagtgaagttaatactatattatcaaaattgttgcgagtaacaccccactgtttgtac 55241221  T
Q  485 aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacac 584  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  55241220 agtggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaatttatcaga-taagaagaatacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacac 55241122  T
Q  585 cccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  55241121 ctcacaaagtgtaacacttaagacta 55241096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 392 - 608
Target Start/End: Original strand, 27396618 - 27396834
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  || |||| |||  ||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  27396618 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacattatagcattaaaagtgttatgagtaacaccctactgtttgtacaatgaca 27396717  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||| ||||||| |||||| |||| ||    
T  27396718 tcaaaagtttcgtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttgttttaagtgtaacatcccataa 27396817  T
Q  592 agtgtaacacttaagac 608  Q
    ||||| |||||||||||    
T  27396818 agtgtcacacttaagac 27396834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 388 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 32912793 - 32912571
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||   | | |||||| |||    
T  32912793 aaggaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccctagtatttgtagaat 32912694  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    || |||||||||||||  |||||| |||||||| || || || ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||     
T  32912693 gatatcaaaagttcagcactcataatatcatcaatttatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccct 32912594  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  32912593 acaaagtgtaacacttaagacta 32912571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 384 - 610
Target Start/End: Original strand, 38011848 - 38012074
Alignment:
Q  384 taaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgta 483  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||| || |||  |||||||||||    
T  38011848 taaaaaggaaaattctatggtgaaatcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgaatagcaccccactgtttgta 38011947  T
Q  484 caatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca 583  Q
    |  || ||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||| ||||||| ||||||    
T  38011948 cggtgccatcaaaagttcagtccccataatattatcaattcatcagattaacaagactacacttaatttaattttattataccttgttttaagtgtaaca 38012047  T
Q  584 ccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
     |||| |||||||||| ||||||||||    
T  38012048 tcccagaaagtgtaacgcttaagacta 38012074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 392 - 610
Target Start/End: Original strand, 47253751 - 47253960
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||  || ||||| |||| |||||    
T  47253751 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactatatcatcaaaagtgttgtgagtaacac-ccattgtttatacagtgaca 47253849  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  47253850 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatc--------agattaacaagaatacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 47253941  T
Q  592 agtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||    
T  47253942 agtgtaacacttaagacta 47253960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 407 - 610
Target Start/End: Original strand, 23761089 - 23761291
Alignment:
Q  407 agtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcc 506  Q
    |||||||||||  ||| |||| || ||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  23761089 agtcatgagaatgactattcttgtaaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactgtttgtatagtgacatcaaaagttcagtcc 23761188  T
Q  507 tcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaag 606  Q
     ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| || ||||||| ||| |||||    
T  23761189 ccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatc-taccttgttttaagtgtaacacctcataaagtgtcacatttaag 23761287  T
Q  607 acta 610  Q
    ||||    
T  23761288 acta 23761291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 387 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 30002838 - 30002631
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 486  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||||| ||  || |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||     
T  30002838 aaaggaaaactctatggtgaagtcattaaaatgatttttctggtgaagttaacactgtagcatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactgtttgtacag 30002739  T
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 586  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||        |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  30002738 tgacatcaaaagttcagtcttcttagtatcatc--------agattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccc 30002647  T
Q  587 cacaaagtgtaacact 602  Q
    ||||||||||||||||    
T  30002646 cacaaagtgtaacact 30002631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 389 - 610
Target Start/End: Original strand, 42199728 - 42199949
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||| | ||||||||| |||| ||||  | |||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||| ||  || | |||||| ||||    
T  42199728 aggaaaaatctatggtgaaatcataagaatgatttttttggtgaagttaatactataacatcaaaaatgtaatgagtaataccccattatttgtagaatg 42199827  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || ||||| |||||||| |    
T  42199828 acataaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacacccta 42199927  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  42199928 caaagtgtaacacttaagacta 42199949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 388 - 607
Target Start/End: Original strand, 9139245 - 9139462
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||||  ||||  |||||||||  ||||||||||||  ||| ||||||||| |    
T  9139245 aaggaaaattctatggtgaagtcatgaaattgacttttttggtgaagttaacgttatagcataaaaaat--agtgagtaacaccccaccgtttgtacagt 9139342  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||     
T  9139343 gacataaaaagttcaatccccatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaactgtaacaccct 9139442  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaaga 607  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9139443 acaaagtgtaacacttaaga 9139462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 390 - 610
Target Start/End: Original strand, 7703517 - 7703729
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| || ||||||||  ||||||||||||  |||    
T  7703517 ggaaaattctatgttaaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtcagtaacaccccactgtttgtacggtga 7703616  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||        |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  7703617 catcaaaagttcagtccccatagtatcatc--------agattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacactccac 7703708  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  7703709 aaagtgtcacacttaagacta 7703729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 393 - 610
Target Start/End: Original strand, 6864038 - 6864255
Alignment:
Q  393 aaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacat 492  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| || ||| |||||    ||| ||||||||||  |||    
T  6864038 aaattgtatggtgatgtcatgagaatgacttttttggtgaagttatcactataacatcaaaaatttaatgaataacatccaactttttgtacaatagcat 6864137  T
Q  493 caaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaa 592  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  6864138 caaaagtccagtcctcatagtatcatcaatttatcagattaacaagactacatttaatttaattttatcataccttgttataagcgtaacaccccacaaa 6864237  T
Q  593 gtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||| |||||||||||    
T  6864238 gtgtaatacttaagacta 6864255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 393 - 602
Target Start/End: Original strand, 32592096 - 32592305
Alignment:
Q  393 aaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacat 492  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||  |||||| || |||||||||||||| | ||| |||| ||| | |||||||||  ||||||||||| | ||||||    
T  32592096 aaattttattgtgaagtcattataatgacttttttgatgaagttaacactacagtatcaaaagtgttgagagtaacactccactgtttgtatagtgacat 32592195  T
Q  493 caaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaa 592  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32592196 caaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaa 32592295  T
Q  593 gtgtaacact 602  Q
    ||||||||||    
T  32592296 gtgtaacact 32592305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 385 - 610
Target Start/End: Original strand, 3042606 - 3042839
Alignment:
Q  385 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtac 484  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||  | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||  ||| |||| |||    
T  3042606 aaaaaggaaaattctatggtgaaatcataaaaatgatttttttggtgaagttaacactataacatacaaaatgtaatgagtaataccccaccgtttatac 3042705  T
Q  485 aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatca--------tcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaag 576  Q
    ||||||||||||| ||||||| | | |||||||        ||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  3042706 aatgacatcaaaaattcagtcattagagtatcaatgtatcatcaattcatcatattaacaagattacacttaatataattttatcataccttattataag 3042805  T
Q  577 cgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3042806 cgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 3042839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 391 - 602
Target Start/End: Original strand, 37775670 - 37775879
Alignment:
Q  391 gaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgac 490  Q
    ||||||| || ||||||||||| | ||  | |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| || |    
T  37775670 gaaaattctacggtgaagtcattaaaatgatttttttggtgaagttagcactataatattaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggc 37775769  T
Q  491 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 590  Q
    |||||||||||   |||  ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  37775770 atcaaaagttcccccct--tagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccaca 37775867  T
Q  591 aagtgtaacact 602  Q
    ||||||||||||    
T  37775868 aagtgtaacact 37775879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 391 - 602
Target Start/End: Original strand, 4597994 - 4598203
Alignment:
Q  391 gaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgac 490  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||| |||||||||||  ||||||||||||| || |    
T  4597994 gaaaattttatggtgaagtcattagaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaag-tgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggc 4598092  T
Q  491 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 590  Q
    |||||||||||||||| | |||  |||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||| |  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  4598093 atcaaaagttcagtccccttagactcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatttaattttatcct-gcttgttttaagtgtaacaccccaca 4598191  T
Q  591 aagtgtaacact 602  Q
    ||||||||||||    
T  4598192 aagtgtaacact 4598203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 387 - 610
Target Start/End: Original strand, 50697239 - 50697461
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 486  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | ||  | |||| | ||||||| |||||||||| ||||||||| ||  |||||||||   || ||||||||||    
T  50697239 aaaggaaaattctacggtgaagtcataaaaatgatttttttagtgaagtaaacactataacataaaaaatataacgagtaacaccctaccgtttgtacaa 50697338  T
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 586  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||     
T  50697339 tgacatcaaaagttcaattctc-tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctaccttgttataagcgtaacacca 50697437  T
Q  587 cacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  50697438 cacaaagtgcaacacttaagacta 50697461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 427 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 4934375 - 4934193
Alignment:
Q  427 tggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatc-actgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttca 525  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  4934375 tggtgaagttaacactag--tataaaaaatgtagtgagtaacacccccattgtttgtacactggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcatttca 4934278  T
Q  526 ttagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4934277 tcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtccaacacctcacaaagtgtaacacttaagacta 4934193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 390 - 596
Target Start/End: Original strand, 39397918 - 39398115
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  || |||||||||| |||    
T  39397918 ggaaaattctatggtgaagtcattagaatgacttttatggtgaagttaacactataacattaaaagtgttgtgagtaacaccccattgtttgtacagtga 39398017  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||         |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  39398018 catcaaaagttcagtcttctcagtatcatca---------attaacaagaatacacttaatctaattttatcctgccttattttaagtgtaacaccccac 39398108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 392 - 610
Target Start/End: Original strand, 33341397 - 33341618
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatg----tagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||  || |||| ||    | | ||| |||||  ||||||||||||| |    
T  33341397 aaaattctatagtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaaattaacactatatcatcaaaattgattgttgcgaggaacaccccactgtttgtacagt 33341496  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |    
T  33341497 ggcatcaaaagttcagtcc-catagtatcatcaattcatcagattaacaagaatatacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctc 33341595  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  33341596 acaaagtgtaacacttaagacta 33341618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 390 - 607
Target Start/End: Original strand, 49375966 - 49376184
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaactttt-ctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||  || |||| ||| |||||||||||  ||||| ||||||| ||    
T  49375966 ggaaaattctacggtgaagtcatgagaatgactttttctggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgtcgtgagtaacaccccactgcttgtacagtg 49376065  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  | ||||  ||||||    ||||||||    
T  49376066 gcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacgcttgatctaattttattctgccttgatttaagttatacacccca 49376165  T
Q  589 caaagtgtaacacttaaga 607  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  49376166 caatgtgtaacacttaaga 49376184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 387 - 561
Target Start/End: Original strand, 50764732 - 50764901
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 486  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||  | || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||      
T  50764732 aaaggaaaattttatg---aagtcatgagaataacttttttgatgaagttaacacta--acatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacgg 50764826  T
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatc 561  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  50764827 tgacatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcattagattaacaagaatacatttaatctaattttatc 50764901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 420 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 54499420 - 54499228
Alignment:
Q  420 acttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtac-aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcat 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  54499420 acttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccaccgtttgtactaatgacatcaaaagttcagtctctatagtatcat 54499321  T
Q  519 cagttcattagattaacaagattacacttaatctaa-ttttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    || ||||| | |||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  54499320 caattcatcatattaacaagaatatacttaatctaatttttatcataccttgttttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacttttaagacta 54499228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 404 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 5048162 - 5047957
Alignment:
Q  404 tgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcag 503  Q
    |||||| |||||||  | |||||||||||||| ||| |||||| || |||| |||||||||||  ||  |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  5048162 tgaagttatgagaatgatttttctggtgaagtcaactctataacatcaaaagtgtagtgagtaggaccacactgtttgtacgatgatatcaaaagttcag 5048063  T
Q  504 tcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacactt 603  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| | ||| |||| ||||||||||    
T  5048062 ttcccatagtatcatcaattcatgagattaacaagactgcatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaata-cccgcaaaatgtaacactt 5047964  T
Q  604 aagacta 610  Q
    |||||||    
T  5047963 aagacta 5047957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 392 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 33816742 - 33816536
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||  | |||||||||||||| |||| | ||  || |||| ||||||||||| ||| ||||| ||| |||  || ||    
T  33816742 aaaattatatgcttaagtcatgagaatgatttttctggtgaagtcaacattgtagcatcaaaagtgtagtgagtagcacctcactatttatacggtggca 33816643  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  33816642 tcaaaagttcagtctccatagtatcatcaatttatcagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccagaa 33816543  T
Q  592 agtgtaa 598  Q
    |||||||    
T  33816542 agtgtaa 33816536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 404 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 46888354 - 46888154
Alignment:
Q  404 tgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcag 503  Q
    |||||||| || || |||||||||| ||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||| ||  |||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  46888354 tgaagtcaagaaaataacttttctgatgaagttaatactataacatcaaaattgtagtgagtaataccccactatttgtacagcggcatcaaaagttcag 46888255  T
Q  504 tcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacactt 603  Q
    ||| |||| |||| | | ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  46888254 tccccatactatcgttaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaaacgtaacactt 46888155  T
Q  604 a 604  Q
    |    
T  46888154 a 46888154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 387 - 610
Target Start/End: Original strand, 32579441 - 32579666
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgt---a 483  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||| |||| ||||| || |||| || |||||||| |||  || |||||||   |    
T  32579441 aaaggaaaattttatggtgaagttctgagaatgacttttctggtgaagtcaacattataacatcaaaagtgcagtgagtagcaccccagtgtttgttgta 32579540  T
Q  484 caatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca 583  Q
    |  || ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| || |  |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |    
T  32579541 cggtgccatcaaaagtttagtc-tcatagtattatcagttcatcagattaacatgactgtacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaga 32579639  T
Q  584 ccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    || || |||||||||| ||||||||||    
T  32579640 cctcagaaagtgtaactcttaagacta 32579666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 389 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 35025800 - 35025587
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||||  || |||| ||||||||||| |||  |||||||| |||  ||    
T  35025800 aggaaaattctatgctgaagtcatgaaaatgatttttctggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttatacgttg 35025701  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||        |||||||||||| | || ||||| |||||||||| || ||| ||||||| || ||||||||    
T  35025700 acatcaaaagttcagtcctcgtagtatcatc--------agattaacaagactgcatttaatataattttatcctatcttgttttaagtgtcacacccca 35025609  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagacta 610  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  35025608 gaaagtgtaacacttaagacta 35025587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 498 - 610
Target Start/End: Original strand, 1815409 - 1815521
Alignment:
Q  498 gttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgta 597  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1815409 gttcagtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacatttactctaattttatcctaccttgttttaagggtaacaccccacaaagtgta 1815508  T
Q  598 acacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||    
T  1815509 acacttaagacta 1815521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 389 - 610
Target Start/End: Original strand, 37287732 - 37287948
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttct-ggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||| | ||| ||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| |    
T  37287732 aggaaaattctatggtgaagtaatgagaatgactttttttggtaaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagt 37287831  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaa-ttttatcttaccttattttaagcgtaac-acc 585  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||        |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||| || ||||||| |||||  ||    
T  37287832 ggcatcaaaagttcaatcctcataata--------tcataagattaacaagaatacacttaatctaatttttaacctactttgttttaagtgtaacgccc 37287923  T
Q  586 ccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  37287924 ccacaaaatgtaacacttaagacta 37287948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 380 - 495
Target Start/End: Original strand, 4205106 - 4205221
Alignment:
Q  380 ttaataaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtt 479  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||  |||||||    
T  4205106 ttaataaaaaggaaaattctatggtgaagtcaggaaaatgacttttctgatgaagttaacactataatatcaaaaatgttctgaataacaccccactgtt 4205205  T
Q  480 tgtacaatgacatcaa 495  Q
    ||||||||||||||||    
T  4205206 tgtacaatgacatcaa 4205221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 489 - 610
Target Start/End: Original strand, 17272067 - 17272184
Alignment:
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||    
T  17272067 acatcaaaagttcagtc----tagtatcatcaattcatcagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacacccca 17272162  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagacta 610  Q
      |||||| |||||||||||||    
T  17272163 tgaagtgtcacacttaagacta 17272184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 388 - 470
Target Start/End: Original strand, 4396324 - 4396406
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacac 470  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | ||  |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  4396324 aaggaaaattctatagtgaagtcataaaaatgacttttttagtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacac 4396406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 392 - 446
Target Start/End: Original strand, 52516599 - 52516653
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  52516599 aaaattttatggtgaagtcatgagaatgacttttatggtgaagttaacactataa 52516653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 388 - 438
Target Start/End: Original strand, 2704510 - 2704560
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  2704510 aaggaaaattttatggtgaagtcatgaaaatgacttttctggtgaagttaa 2704560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 388 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 7152319 - 7152237
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacac 470  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||  ||||||||||| ||||||||| ||||| || |||| | |||||||||||||    
T  7152319 aaggaaaattctatggtgaagtcatgctaatgacttttctggtaaagttaacattataacatcaaaagtatagtgagtaacac 7152237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 388 - 446
Target Start/End: Original strand, 17272009 - 17272067
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataa 446  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  17272009 aaggaaaattctatggtgaagtcgtgggaatgacttttctggtgaagttaacactataa 17272067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 388 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 38812310 - 38812260
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  38812310 aaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaa 38812260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 20097537 - 20097485
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactat 444  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  20097537 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaaccctat 20097485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 390 - 438
Target Start/End: Original strand, 38811813 - 38811861
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  38811813 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaa 38811861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 390 - 470
Target Start/End: Original strand, 53124287 - 53124367
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacac 470  Q
    |||||||| |||| ||||||||| | ||  | |||| |||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||    
T  53124287 ggaaaattatatgatgaagtcattaaaatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatataatgagtaacac 53124367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 387 - 417
Target Start/End: Original strand, 1012306 - 1012336
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaa 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1012306 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaa 1012336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 385 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 47073710 - 47073656
Alignment:
Q  385 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaac 439  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||  |||||| |||||||||||||    
T  47073710 aaaaaggaaaattctatggtaaagtcatgataatgacttttttggtgaagttaac 47073656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 431 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 23518473 - 23518400
Alignment:
Q  431 gaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagt 504  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||  |||||||  |||| || |||||||| ||||||    
T  23518473 gaagttaacactataacattaaaactgtagtgactaacaccccactgttaatacagtggcatcaaaaattcagt 23518400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 532 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 46884177 - 46884105
Alignment:
Q  532 taacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaa 605  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||| | |||||| ||||||||||||    
T  46884177 taacgagactacacttaatctaattttatcatatcttgttataagc-taacatctcacaaaatgtaacacttaa 46884105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 391 - 444
Target Start/End: Original strand, 51204580 - 51204633
Alignment:
Q  391 gaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactat 444  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  51204580 gaaaattctatggtgaagtcataaaaatgacttttctggtgaagttaaccctat 51204633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 143; Significance: 8e-75; HSPs: 56)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 388 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 32821241 - 32821019
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||  | |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32821241 aaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgatttttttggtgaagttaacaatataacatcaaaaatgtagtgagtaacacaccactgtttgtacaat 32821142  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  32821141 ggcatcaaaagttcagtcctcgtagtatcatcaattcattagattaacaagactacagttaatttagttttatcctaccttgttttaagcgtaacacccc 32821042  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  32821041 ataaagtgtaacacttaagacta 32821019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 388 - 610
Target Start/End: Original strand, 18797302 - 18797522
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  18797302 aaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacacta--acataaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaat 18797399  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |    
T  18797400 gacatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacacctc 18797499  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  18797500 acaaagtgtaacacttaagacta 18797522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 386 - 610
Target Start/End: Original strand, 30055497 - 30055722
Alignment:
Q  386 aaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctgg-tgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtac 484  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||| | | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  30055497 aaaaggaaaattctatggtgaagtcataagaatgactttttttgatgaagttaacactataatatcaaaattgtaatgagtaacaccccactgtttgtac 30055596  T
Q  485 aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacac 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  30055597 aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcattaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaacac 30055696  T
Q  585 cccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  30055697 cctacaaagtgtaacacttaagacta 30055722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 391 - 610
Target Start/End: Original strand, 38258521 - 38258740
Alignment:
Q  391 gaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgac 490  Q
    ||||||| || ||||||||||| | ||  | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  38258521 gaaaattctacggtgaagtcataaaaatgatttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccacaccgtttgtacaatgac 38258620  T
Q  491 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 590  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  38258621 atcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccaca 38258720  T
Q  591 aagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  38258721 aagtgtaacacttaagacta 38258740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 389 - 610
Target Start/End: Original strand, 21991610 - 21991831
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||  || |||| ||| | |||||||||  ||||||||||||| ||    
T  21991610 aggaaaattctagggtgaagtcatgagaatgatttttatggtgaagttaacactatagcatcaaaattgttgcgagtaacaccccactgtttgtacagtg 21991709  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  21991710 tcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccca 21991809  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21991810 caaagtgtaacacttaagacta 21991831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 390 - 610
Target Start/End: Original strand, 37109847 - 37110069
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  37109847 ggaaaattctatggtgaagtcataaaaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaatga 37109946  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatc--ttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||| || |||||||||||||||    
T  37109947 catcaaaagttcagtcattataatatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctataccttgttataagcgtaacacccc 37110046  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  37110047 acaaagtgtaacacttaagacta 37110069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 390 - 607
Target Start/End: Original strand, 7334769 - 7334986
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||  |||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  7334769 ggaaaattctacggtgaagtcgtgagaatgacttttttgatgaagttaacactataacataaaatatgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatga 7334868  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||    
T  7334869 catcaaaagttcagttctcatagtatcatcaactcatcagcttaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccac 7334968  T
Q  590 aaagtgtaacacttaaga 607  Q
    | ||||||||||||||||    
T  7334969 agagtgtaacacttaaga 7334986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 390 - 610
Target Start/End: Original strand, 4582894 - 4583114
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  4582894 ggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttctggtgaagttaatactatagtatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactatttgtacaatga 4582993  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||    
T  4582994 catcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacaccccac 4583093  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  4583094 aaagtgtaacacttaaaacta 4583114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 404 - 610
Target Start/End: Original strand, 22687228 - 22687434
Alignment:
Q  404 tgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcag 503  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  |||||||||| || ||  |||||||||||||    
T  22687228 tgaagtcatgagaatgacttttctgatgaagttaacactataacatcaaaaatgttgtgagtaacactccactgtttgtgcagtggtatcaaaagttcag 22687327  T
Q  504 tcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacactt 603  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  22687328 tccccatagtatcatcaattcatcagattaacaataatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactc 22687427  T
Q  604 aagacta 610  Q
    |||||||    
T  22687428 aagacta 22687434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 392 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 27421563 - 27421346
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||  | |||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27421563 aaaattctatggtgaagtcgtgataatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacactccactgtttgtacaatgaca 27421464  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| | || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27421463 tcaaaagttcagtcct-ataatatcataaatttatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacatcccacaa 27421365  T
Q  592 agtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27421364 agtgtaacacttaagacta 27421346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 388 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 17842774 - 17842550
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | ||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||    
T  17842774 aaggaaaattctatggtgaagtcataaaaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaat 17842675  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatc--ttaccttattttaagcgtaacacc 585  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||||| || ||||||||||| |    
T  17842674 gacatcaaaagctcagtcattataatatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctataccttgttataagcgtaacatc 17842575  T
Q  586 ccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  17842574 ccacaaagtgtaacacttaagacta 17842550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 392 - 610
Target Start/End: Original strand, 23111167 - 23111387
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  23111167 aaaattctgtggtgaagtcatgaaaatgatttttctggtgaagttaacactataacatcaaaaatattgtgagtaacacaccactatttgtacaatggca 23111266  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattt--tatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  23111267 tcaaaagttcaaccatcgtagtatcatcaattcattagattaacaagactacacttaatctaattttatatcatactttgttttaagcgtaacaccccac 23111366  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23111367 aaagtgtaacacttaagacta 23111387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 389 - 610
Target Start/End: Original strand, 43686015 - 43686235
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  43686015 aggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgactttttgggtgaagttaacactataatatcaaaaatgttgtgagtaacacc-cactgtttgtacaatg 43686113  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
     |||||||||||||||||  ||||||||| || ||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  43686114 gcatcaaaagttcagtccctatagtatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccca 43686213  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  43686214 caaagtgtaacacttaaaacta 43686235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 390 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 5657667 - 5657447
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||     
T  5657667 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctagtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgg 5657568  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||| | |||||||||| |||||||||| ||| || ||||||| |||||| |||||    
T  5657567 catcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcatattaacaaaaatacacttaatttaattttatcctactttgttttaagtgtaacagcccac 5657468  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  5657467 aaagtgtaatacttaagacta 5657447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 388 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 9356014 - 9355792
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||  || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| |    
T  9356014 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaatgaccattttggtgaatttaacactatagcataaaaaatgtagtgagcaataccccactgtttgtacagt 9355915  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||| | | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  9355914 gacatcaaaagtttagttctcatattatcgttaattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttcatcctaccttgttttaagtgtaacacccc 9355815  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  9355814 acaaagtgtaacacttaaaacta 9355792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 389 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 31579256 - 31579030
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttg-----ta 483  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||||||      ||    
T  31579256 aggaaaattctatggtgaagtcataagaataatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttaatttata 31579157  T
Q  484 caatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca 583  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||  |||||    
T  31579156 caatgacatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtataaca 31579057  T
Q  584 ccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||    
T  31579056 ccctataaagtgtaacacttaagacta 31579030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 390 - 610
Target Start/End: Original strand, 27283719 - 27283939
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| ||||||||||| || | ||  | |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  27283719 ggaaaattctatggtgaagttataaaaatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaatga 27283818  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||    
T  27283819 aatcaaaagttcagtcctcatagtattatcaatttatcagattaacaagactatacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccac 27283918  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  27283919 aaagtgtaacacttaaaacta 27283939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 391 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 48928748 - 48928530
Alignment:
Q  391 gaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgac 490  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||| |||  |||| |||||||  || |    
T  48928748 gaaaattttatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactatttgtacggtgcc 48928649  T
Q  491 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 590  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| || |    
T  48928648 atcaaaagttcagtcc-catagtattatcaattcatcagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctacattattttaagtgtaacacctcaga 48928550  T
Q  591 aagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  48928549 aagtgtaatgcttaagacta 48928530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 430 - 610
Target Start/End: Original strand, 10481619 - 10481800
Alignment:
Q  430 tgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatc-actgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcatta 528  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||| |    
T  10481619 tgaagttaacactataacataaaaaatataatgagtaacacccccactgtttgtacaatgacatcaaaaattcagtctttatagtatcatcaattcatca 10481718  T
Q  529 gattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10481719 gattaacaagactacgcttaatctaattttatcttaccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 10481800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 385 - 610
Target Start/End: Original strand, 24211711 - 24211936
Alignment:
Q  385 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtac 484  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||   ||||||| ||     
T  24211711 aaaaaagaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccctactgtttatag 24211810  T
Q  485 aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacac 584  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || |||| ||||||     
T  24211811 aatggcatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagtgtaacat 24211910  T
Q  585 cccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    || |||||||||||||| ||||||||    
T  24211911 cctacaaagtgtaacacctaagacta 24211936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 389 - 610
Target Start/End: Original strand, 32432431 - 32432647
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||||||||| |     ||||||| |||||||||||  || |||||||||||||    
T  32432431 aggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgatttttctggtgaagttaacactatca-----aaaatgttgtgagtaacaccccattgtttgtacaatg 32432525  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  32432526 acatcaaaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacagttaatataattttatcctaccttattttaagtgtaacacccca 32432625  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  32432626 caaaatgtaacacttaagacta 32432647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 390 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 15612944 - 15612725
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| || |||  |||  ||||||||||  || |||||||| | ||     
T  15612944 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaataacgtttcttgtgaagttaacactataacatcaaag-tgttatgagtaacaccccagtgtttgtagagtgg 15612846  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  15612845 catcaaaagttcagtccctataatatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 15612746  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15612745 aaagtgtaacacttaagacta 15612725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 390 - 610
Target Start/End: Original strand, 37346997 - 37347216
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  | |||| |||||||||||| ||||||  || |||||| || ||||||||||  || |||||||||| |||    
T  37346997 ggaaaattttatggtgaagtcatgaaaatgatttttttggtgaagttaatactataccatcaaaaatataatgagtaacaccccattgtttgtacagtga 37347096  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||| || ||||    
T  37347097 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaatttattaaattaacaggactacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaa-actccac 37347195  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  37347196 aaagtgtaacacttaagacta 37347216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 392 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 25691729 - 25691510
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaac-acatcactgtttgtacaatgac 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| || |||| | | ||||||||  || |||||||||||||| || |    
T  25691729 aaaattttatggtgaagtcatgagaatgacttttctcgtgaagttaacactataacatcaaaagtattgtgagtaattacctcactgtttgtacagtggc 25691630  T
Q  491 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 590  Q
    ||||| |||||||| || ||||||| |||| ||||| | |||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  25691629 atcaacagttcagttcttatagtattatcaattcatcatattaacaaaaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccaca 25691530  T
Q  591 aagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  25691529 aagtgtcacacttaagacta 25691510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 390 - 608
Target Start/End: Original strand, 8861260 - 8861478
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||  || |||| |||  ||| ||||||  ||||||||||||| ||     
T  8861260 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctcgcgaagttaacactatagcatcaaaagtgttatgaataacaccccactgtttgtacagtgg 8861359  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| || || |||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |    
T  8861360 catcaaaagttaagtccccatagtatcatcaattaatcagattaacaacaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccgc 8861459  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagac 608  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  8861460 aaagtgtaacactcaagac 8861478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 390 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 31520909 - 31520716
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||||| ||||||  || |||||| |||||||||||||  || |||||||||| |||    
T  31520909 ggaaaattttatgatgaagtcatgaaaatgacttttttggtgaagttaatactataccatcaaaaatatagtgagtaacactccattgtttgtacagtga 31520810  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacac 584  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  31520809 catcaaaagttcagtcc-catagtatcatcaattcattaaattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacac 31520716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 388 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 41765266 - 41765044
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||| | |||| || ||||||  || |||| ||||||||||| |||  ||||||||||||  |    
T  41765266 aaggaaaattccatggtgaagtcatgagaatgacttttctgataaagtcaatactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttgtacggt 41765167  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||   |||||| ||||||| ||||||||||    
T  41765166 ggcatcaaaagtccagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttactctaccttgttttaagtgtaacacccc 41765067  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  41765066 agaaagtgtaacacttaagacta 41765044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 392 - 607
Target Start/End: Original strand, 11071182 - 11071398
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaaca-acttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgac 490  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||   | |||| |||| ||||||  ||||||  || |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  11071182 aaaattctatggtgaagtcatgaaaatgtatttttttggtaaagttagtactatatcatcaaaaatatagcgagtaacactccactgtttgtacagtgac 11071281  T
Q  491 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 590  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  11071282 atcaaaagttcagttctcatagtatcatcaattcatcagattaacaacactacgcttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccaca 11071381  T
Q  591 aagtgtaacacttaaga 607  Q
    |||||||||||||||||    
T  11071382 aagtgtaacacttaaga 11071398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 420 - 576
Target Start/End: Original strand, 29173545 - 29173701
Alignment:
Q  420 acttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatc 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29173545 acttttctggtgaagttaacactgtagtatcaaaagtgttgtgagtaacactccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatc 29173644  T
Q  520 agttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaag 576  Q
    | ||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  29173645 aattcatcaaactaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaag 29173701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 385 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 12390821 - 12390622
Alignment:
Q  385 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtac 484  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||   |||||||||| |    
T  12390821 aaaaaggaaaattctatggtgaagtcatcagatcgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgtaatgagtaacatcccactgtttgtgc 12390722  T
Q  485 aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacac 584  Q
    | ||||||||||||||  |||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||    
T  12390721 agtgacatcaaaagttatgtccccatagtattatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttcttttaagtgtaacac 12390622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 390 - 602
Target Start/End: Original strand, 12165727 - 12165939
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| || ||||||||| | | ||  ||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||     
T  12165727 ggaaaattctacggtgaagtcgttaaaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatccaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgg 12165826  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||| |||||    |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  12165827 catcaaaagttaagtcccttaagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccac 12165926  T
Q  590 aaagtgtaacact 602  Q
    |||||||||||||    
T  12165927 aaagtgtaacact 12165939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 406 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 48928466 - 48928263
Alignment:
Q  406 aagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtc 505  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||| |||  |||| |||||||  || ||||||||||||||||    
T  48928466 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactatttgtacggtgccatcaaaagttcagtc 48928367  T
Q  506 ctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaa 605  Q
    | |||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||| || |||||||||  |||||    
T  48928366 c-catagtattatcaattcatcagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacctcagaaagtgtaatgcttaa 48928268  T
Q  606 gacta 610  Q
    |||||    
T  48928267 gacta 48928263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 390 - 605
Target Start/End: Original strand, 6546494 - 6546709
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||  || |||| ||| | |||||||||  |||| |||||||| | |    
T  6546494 ggaaaattctatggtgaagtcataagaatgatttttctagtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgcgagtaacaccccactatttgtacagtaa 6546593  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||| | |   ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  6546594 catcaaaagtttactatccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 6546693  T
Q  590 aaagtgtaacacttaa 605  Q
    ||||| ||||||||||    
T  6546694 aaagtataacacttaa 6546709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 430 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 44413525 - 44413351
Alignment:
Q  430 tgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattag 529  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||  || |||||||||| ||| ||||||||||| |||  ||||||||| ||| ||||| |     
T  44413525 tgaagttaacactataacatcaaaaatatagtgagtaacaccccaatgtttgtacactgaaatcaaaagttcggtctccatagtatcttcaattcatcaa 44413426  T
Q  530 attaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacactta 604  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44413425 attaacaaggctacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactta 44413351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 390 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 10359400 - 10359180
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||| || ||||   ||||  || |||| ||||||||||||||    ||| ||| |||| |||    
T  10359400 ggaaaattctatggtgaagtcatgataatgacttttctggtaaaattaatcttatagcatcaaaagtgtagtgagtaacatcctactatttatacagtga 10359301  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaa-tctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  10359300 catcaaaagttcagtc-tgatagtatcatcaattcatcagatcaacaagactacacttaaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacacccca 10359202  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10359201 caaagtgtaacacttaagacta 10359180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 391 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 33688446 - 33688228
Alignment:
Q  391 gaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgac 490  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||  |||||||||    ||||||||| || || |    
T  33688446 gaaaattatatggtgaagttatgagaatgacttttctggt-aagttaacactataacatcaaaagtgttatgagtaacatcctactgtttgtccagtggc 33688348  T
Q  491 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 590  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||| ||| |    
T  33688347 atcaaaagttcagtctctatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcatactttgttttaagtgtaacactccata 33688248  T
Q  591 aagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  33688247 aagtgtaacattcaagacta 33688228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 388 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 26524515 - 26524363
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||  || ||||||| || |    
T  26524515 aaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgatgttaacactataacatcaaaaatgttgtgactaacactccattgtttgtgcagt 26524416  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagat 540  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||| || || | |||||||||||    
T  26524415 ggcatcaaaagtccagtcctcatagtatcatcaatttatcatattaacaagat 26524363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 420 - 584
Target Start/End: Original strand, 26980328 - 26980492
Alignment:
Q  420 acttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatc 519  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||  || |||| ||| |||||||||||  ||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  26980328 acttttatggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccacggtttgtacagtggcatcaaaagttcagtccccataatatcatc 26980427  T
Q  520 agttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacac 584  Q
    | ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||    
T  26980428 aattcatcaaattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacac 26980492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 499 - 610
Target Start/End: Original strand, 37704241 - 37704352
Alignment:
Q  499 ttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaa 598  Q
    |||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37704241 ttcagtccccatagtatcatcaatttatcagattaacaagactacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaa 37704340  T
Q  599 cacttaagacta 610  Q
    ||||||||||||    
T  37704341 cacttaagacta 37704352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 508 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 15672830 - 15672728
Alignment:
Q  508 catagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaga 607  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15672830 catagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccacaaagtgtaacacttaaga 15672731  T
Q  608 cta 610  Q
    |||    
T  15672730 cta 15672728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 490 - 610
Target Start/End: Original strand, 44598741 - 44598861
Alignment:
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  44598741 catcaaaaattcaatccccatagtatcataaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccac 44598840  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  44598841 aaagtgtaacacctaagacta 44598861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 429 - 605
Target Start/End: Original strand, 43925120 - 43925291
Alignment:
Q  429 gtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcatta 528  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  | || |    
T  43925120 gtgaagttaacattgtagtataaaaaatgttgtgagtaacacctcactgt----acaatgacatcaaaagttcagtctacatagtatcatcaact-atca 43925214  T
Q  529 gattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaa 605  Q
    || |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||| ||||| || ||| ||||||    
T  43925215 gactaacaataatacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgcaacacctcacaacgtttaatacttaa 43925291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 422 - 584
Target Start/End: Original strand, 38053493 - 38053647
Alignment:
Q  422 ttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcag 521  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||      
T  38053493 ttttttggtgaagttaatactataacataaaaaatgtaatgagtaaaaccctactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagttctcatagtgtcatc-- 38053590  T
Q  522 ttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacac 584  Q
          | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || || |||| |||||||    
T  38053591 ------aaattaacaagactacacttaatctaattttatcatactttgttataagtgtaacac 38053647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 476 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 37703590 - 37703464
Alignment:
Q  476 tgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaa 575  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||        ||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  37703590 tgtttgtatagtgacatcaaaagttcagtctccatagtatcatcag--------attaataagactacacttaatctaattttatcatatcttattttaa 37703499  T
Q  576 gcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  37703498 gtgtaacatcccacaaagtgtaccacttaagacta 37703464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 534 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 26588126 - 26588050
Alignment:
Q  534 acaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26588126 acaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaagacta 26588050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 390 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 34362334 - 34362205
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||  |||||||| |  ||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||     
T  34362334 ggaaaattctatggtgaaattatgagaatgacttttctaggaaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgg 34362235  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatca 520  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  34362234 catc-aaagttcagttctcatagtatcatca 34362205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 437 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 32593327 - 32593181
Alignment:
Q  437 aacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaaca 536  Q
    |||||||||  || |||| ||||||||||| |||  |||||||| ||   ||  ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||| ||    
T  32593327 aacactatagcattaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttatatggtggtatcaaaagttcagtc-tcacagtatcatcaattcatcagattatca 32593229  T
Q  537 agattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacac 584  Q
    | | | || |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  32593228 aaactgcatttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacac 32593181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 479 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 46481218 - 46481095
Alignment:
Q  479 ttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcg 578  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||        |||||||||| || |||| || |||||||||  ||| || ||||||| |    
T  46481218 ttgtacaatgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcag--------attaacaagactatacttgatgtaattttattctacattgttttaagtg 46481127  T
Q  579 taacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  46481126 taacatctcataaagtgtaacacttaagacta 46481095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 427 - 610
Target Start/End: Original strand, 35353120 - 35353303
Alignment:
Q  427 tggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaag-ttcagtcctcatagtatcatcagttca 525  Q
    ||||||||| |||||||||  || |||| ||||||||||| |||  || ||||||||| |||  |||||||| ||| |||| |||||||||| || ||||    
T  35353120 tggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcaccccattgtttgtacgatggaatcaaaagtttctgtccccatagtatcaccaattca 35353219  T
Q  526 ttagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    | |||||||||||| | || ||| |  |  |    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  35353220 tcagattaacaagactgca-ttactagatgtaacacttaccttgttttaagtgtaacaccccagaaaatgtaacacttaagacta 35353303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 456
Target Start/End: Original strand, 8299192 - 8299256
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaat 456  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  8299192 aaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttctggtgaagttaacactatagtatcaaaaat 8299256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 390 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 23402419 - 23402371
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  23402419 ggaaaattctatggcgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaa 23402371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 392 - 438
Target Start/End: Original strand, 3953733 - 3953779
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  3953733 aaaattctatgatgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaa 3953779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 384 - 438
Target Start/End: Original strand, 4902334 - 4902388
Alignment:
Q  384 taaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||| ||||    
T  4902334 taaaagggaaaattttatggtgaagtcatgaaaataatttttttggtgaatttaa 4902388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 388 - 438
Target Start/End: Original strand, 40381938 - 40381988
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  40381938 aaggaaaattctacggtgaagttatgagaatgacttttctggtgaagttaa 40381988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 424 - 470
Target Start/End: Original strand, 44598373 - 44598419
Alignment:
Q  424 ttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacac 470  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  44598373 ttctcgtgaagttaatactataatatcaaaaatgttgtgagtaacac 44598419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 430 - 485
Target Start/End: Original strand, 37704182 - 37704238
Alignment:
Q  430 tgaagttaacactataatataaaa-aatgtagtgagtaacacatcactgtttgtaca 485  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  37704182 tgaagttaacactatagcataaaaaaatgtagtgagtaacaccccattgtttgtaca 37704238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 389 - 610
Target Start/End: Original strand, 133 - 354
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  133 aggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttctggtgaagttaacactgtagtataaaaaatgttgtgagtaacactccactgtttgtacaatg 232  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  233 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctatcttattttaagtgtaacacccca 332  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagacta 610  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  333 taaagtgtaacacttaagacta 354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 420 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 94538 - 94348
Alignment:
Q  420 acttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatc 519  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||  |||| |||| |||||||    
T  94538 acttttctgatgaagttaacattataacatcaaaattgtagtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagtttggtccccatactatcatc 94439  T
Q  520 agttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    | ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||  || ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94438 aattcatgagattaacaagactacacttaatttaattttattctagcttgtttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 94348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 451 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 408552 - 408394
Alignment:
Q  451 aaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaat 550  Q
    ||||||||| |||||||||| | || ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  408552 aaaaatgtaatgagtaacaccttaccgtttgtaaaatgaaatcaaaagttcagtcctc-tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaat 408454  T
Q  551 ctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  408453 ctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtggaacacttaagacta 408394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 64)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 392 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 46297945 - 46297727
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |     
T  46297945 aaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaaatatagtgagtaacacaccactgtttgtacaatggcg 46297846  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  46297845 tcaaaagttcagtccccgtagtatcatcaattcattagattaacaaaactacacttaatcaaactttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 46297746  T
Q  592 agtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||    
T  46297745 agtgtaacacttaagacta 46297727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 389 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 3655388 - 3655167
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||  |||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  3655388 aggaaaattttatggtgaagtcataaaaatgacttttttgataaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaatg 3655289  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||| |||    
T  3655288 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttagaagcgtaacacacca 3655189  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||| |||||||||||| ||||    
T  3655188 caaaatgtaacacttaaaacta 3655167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 387 - 607
Target Start/End: Original strand, 35844314 - 35844535
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 486  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||     
T  35844314 aaaggaaaattctatggtgaagtcatgataatgacttttctggtgaagttaacactataacaacaaaaatgttgtgagtaacacctcactgtttgtacag 35844413  T
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaa-ttttatcttaccttattttaagcgtaacacc 585  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||||    
T  35844414 tgacatcaaaagtttagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctacctagttttaagtgtaacacc 35844513  T
Q  586 ccacaaagtgtaacacttaaga 607  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  35844514 ctacaaagtgtaacacttaaga 35844535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 390 - 610
Target Start/End: Original strand, 37203058 - 37203278
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||  | |||| || ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||     
T  37203058 ggaaaattctatggtgaagtcataaaaatgatttttttgatgaagttaacactataacatcaaaattgtagtgagtaacaccccactgtttgtacagtgg 37203157  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||    
T  37203158 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcataagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttatttttagtgtatcaccccac 37203257  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  37203258 aaagtgtaacacttaagacta 37203278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 380 - 610
Target Start/End: Original strand, 34132916 - 34133146
Alignment:
Q  380 ttaataaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtt 479  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||| || ||  |||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||  |||||||    
T  34132916 ttaataaaaaggaaaattctataatgaagtcacgaaaatgacttttttggtgaaattaacactatagtatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtt 34133015  T
Q  480 tgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgt 579  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  34133016 tgtacaatgacatcaaaagttcagtccccataatatcatcaattcatcagactaataagaatacacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgt 34133115  T
Q  580 aacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34133116 aacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 34133146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 389 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 40552445 - 40552230
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  40552445 aggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggagaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacactccaccgtttgtacaatg 40552346  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||    
T  40552345 acatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaacactacacttaatttaattttatcttagcttgttataagcgtaacatccca 40552246  T
Q  589 caaagtgtaacactta 604  Q
    ||| ||||||||||||    
T  40552245 caacgtgtaacactta 40552230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 51213166 - 51212955
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||     
T  51213166 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactgtaacataaaaaatgtaatgagcaacaccccactgtttgtacaatgg 51213067  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||    
T  51213066 catcaaaagttgagtcctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccac 51212967  T
Q  590 aaagtgtaacac 601  Q
    ||||||||||||    
T  51212966 aaagtgtaacac 51212955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 388 - 610
Target Start/End: Original strand, 48354930 - 48355152
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||    
T  48354930 aaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttatggtgaagttaacactataatattaaaaatgtaatgagtaacaccccattgtttgtacaat 48355029  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| || |||  ||||||  ||    
T  48355030 ggcatcaaaagttcagttctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttagtctaattttatcctaccttgttataaatgtaacatacc 48355129  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  48355130 acaaagtgtaacacttaagacta 48355152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 390 - 610
Target Start/End: Original strand, 37157699 - 37157918
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||   ||||| || ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||     
T  37157699 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatggcttttttgatgaagttaacactataacatcaaaattgtagtgagtaacaccccactgtt-gtacagtgg 37157797  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  37157798 catcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaatttataagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttatttcaagtgtaacaccccac 37157897  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  37157898 aaagtgtaacacttaagacta 37157918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 400 - 599
Target Start/End: Original strand, 29099356 - 29099555
Alignment:
Q  400 atggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagt 499  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  29099356 atggtgaagtcattagaatgacttttctggtgaagttaacactataacataaaaaatgtcgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatctaaagt 29099455  T
Q  500 tcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaac 599  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29099456 tcagtccccttagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatttaattttatcgtgccttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaac 29099555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 388 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 4761838 - 4761613
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttct--ggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtaca 485  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||| |  ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  4761838 aaggaaaattctatggtgaattcatgagattgacttttttttggtgaagttaatactataatatcaaaaatgtaatgagtaacacttcactgtttgtaca 4761739  T
Q  486 atgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca-c 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||  ||||| |    
T  4761738 atgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatctgattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtataacacc 4761639  T
Q  585 cccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  4761638 cccacaaagtataacacttaagacta 4761613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 384 - 610
Target Start/End: Original strand, 47481507 - 47481733
Alignment:
Q  384 taaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgta 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||  |  ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  47481507 taaaaaggaaaattttatggtgaagtcataggaatgatgtttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgta 47481606  T
Q  484 caatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca 583  Q
     |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |  ||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||| |||||    
T  47481607 gaatgacatcaaaagtttagccctcatagtatcatcaattcatcatgttaacaagactacacttaatataattttattataccttattctaagcataaca 47481706  T
Q  584 ccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  47481707 ccctacaaagtgtaacacttaagacta 47481733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 389 - 610
Target Start/End: Original strand, 11466814 - 11467035
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||| ||   || ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  11466814 aggaaaattctatggtgaagtcttgagaatgacttttctgatgaagttaagactataacatcgcaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtg 11466913  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||    
T  11466914 gcatcaaaagtttagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaatacccca 11467013  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11467014 caaagtgtaacacttaagacta 11467035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 436 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 42506214 - 42506040
Alignment:
Q  436 taacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaac 535  Q
    ||||||||||| || |||| |||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  42506214 taacactataacatcaaaattgtaatgagtaataccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaac 42506115  T
Q  536 aagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42506114 aagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 42506040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 389 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 52041109 - 52040887
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcac-tgtttgtacaat 487  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| |  ||  |||||||| | |    
T  52041109 aggaaaattctgaggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaatactataacatcaaaagtgtagtgagtaactccccaaatgtttgtatagt 52041010  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||    
T  52041009 ggcatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaatacccc 52040910  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  52040909 acatagtgtaacacttaagacta 52040887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 389 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 26941446 - 26941225
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||  | |||| |||||||||||||||||||| || |||| | || ||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  26941446 aggaaaattctatggtgaagtcataagaatgatttttttggtgaagttaacactataaaatcaaaattataatgagtaacaccccactgtttgtataatg 26941347  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||| ||    
T  26941346 acatcaaaagttcagtcctcatggtatcattaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaatacctca 26941247  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagacta 610  Q
     |||||||||||||||| ||||    
T  26941246 taaagtgtaacacttaaaacta 26941225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 390 - 610
Target Start/End: Original strand, 4015451 - 4015671
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||   |||||||||| | |||    
T  4015451 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctgatgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacacccaactgtttgtagagtga 4015550  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| || | ||| |||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||    
T  4015551 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagaatataattagtctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccac 4015650  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  4015651 aaagtgtcacacttaagacta 4015671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 385 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 53229343 - 53229117
Alignment:
Q  385 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacaca-tcactgtttgta 483  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||||| |||||||||||  || |||| ||||||||| |||||  ||| ||||||||    
T  53229343 aaaaagaaaaattttaaggtgaagtcatgaaaattatttttctggtgaaattaacactatagcatcaaaagtgtagtgagcaacaccctcaatgtttgta 53229244  T
Q  484 caatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca 583  Q
    || |  |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  53229243 cagttgcatcaaaagttcagtcatcataatatcatcaattcatcagattaacaagactacagttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaact 53229144  T
Q  584 ccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  53229143 ccccacaaagtgtaacacttaagacta 53229117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 390 - 610
Target Start/End: Original strand, 45174494 - 45174717
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtg--agtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||  |||||||| |||||||||||||| |    
T  45174494 ggaaaattttatggtgaagttgtgagaataacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgtgagtaacacttcactgtttgtacagt 45174593  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaa-ttttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 586  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| |    
T  45174594 agcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatttaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacactc 45174693  T
Q  587 cacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  45174694 tacaaagtgtaacacttaagacta 45174717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 388 - 610
Target Start/End: Original strand, 22450957 - 22451179
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||  || |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||   |    
T  22450957 aaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcacctcactgtttgtatggt 22451056  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22451057 ggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcatattaacaagactgcacttaatctaattttaccttaccttgttttaagtgtaacacccc 22451156  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |  |||||||||| |||| ||||    
T  22451157 agtaagtgtaacatttaacacta 22451179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 391 - 610
Target Start/End: Original strand, 25579731 - 25579950
Alignment:
Q  391 gaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgac 490  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||  | ||||||||||||||||| ||||||  || |||| ||| |||| |||||    ||| ||| |||| ||||    
T  25579731 gaaaattttatggttaagttatgagaatgatttttctggtgaagttaatactatagcatcaaaagtgttgtgaataacattctactatttatacagtgac 25579830  T
Q  491 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 590  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||    
T  25579831 atcaaaagttcagtccccatattatcatcagtttattagattaacaaaaatacacttaatctaattttatcctaccttgtttttagtgtaacaccccaca 25579930  T
Q  591 aagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  25579931 aagtgtaacacttaagacta 25579950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 389 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 7327669 - 7327447
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa-cactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||| | |||||||||| |||||||| || |||| ||| |||||||||||  || | |||||||| |    
T  7327669 aggaaaattctatggtgaagttatgagaatgacttttttagtgaagttaaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacactccattatttgtacagt 7327570  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||| |||  || ||||||||||    
T  7327569 gacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcggattaacaagaatacacttaatttatttttatcctaccttctttctagtgtaacacccc 7327470  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  7327469 acaaagtgtaacacttaagacta 7327447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 388 - 610
Target Start/End: Original strand, 39282642 - 39282863
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||| | || |||||||||||| || |||| ||| |||||||| ||  |||||||| |||| |    
T  39282642 aaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgatttttctgataaaattaacactataacatcaaaactgt-gtgagtaataccccactgtttatacagt 39282740  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    | ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||    
T  39282741 ggcatcaaaagttcagttctcatattatcatccattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacacccc 39282840  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  39282841 acaaagtgtaacacttaagacta 39282863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 429 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 24489108 - 24488927
Alignment:
Q  429 gtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcatta 528  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |    
T  24489108 gtgaagttaagactatagtattaaaaatgttgtgagtaacattccactgtttgcacaatgacatcaaaagttcagtccccatattatcatcaattcatca 24489009  T
Q  529 gattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24489008 gactaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacacctcacaaggtgtaacacttaagacta 24488927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 388 - 605
Target Start/End: Original strand, 21193595 - 21193812
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |   || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||| | |    
T  21193595 aaggaaaattctatggtaaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactgttgaatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtagagt 21193694  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||    
T  21193695 gacatcaaaagttcagtccccatggtatcattaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactcc 21193794  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaa 605  Q
    | ||||  ||||||||||    
T  21193795 ataaaggataacacttaa 21193812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 384 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 20373487 - 20373303
Alignment:
Q  384 taaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgta 483  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||  | |||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||  |||||||||  |||||||||||    
T  20373487 taaaatggaaaattttatagtgaagtcataagaatgatttttttggtgaagttaatactataacatcaaaaatgtaacgagtaacaccccactgtttgta 20373388  T
Q  484 caatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttacctt 568  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20373387 caatgacatcaaaagttcagttctcatggtatcatcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcctacctt 20373303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 392 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 43976068 - 43975861
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||   |||| |||||||||  || |||| ||||||||||| |||  |||| ||||||| ||||||    
T  43976068 aaaattttatggtgaagtcatgagaatgacttttttg---aagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcactccactatttgtacgatgaca 43975972  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  43975971 tcaaaagtttaatcctcataatatcatcaattcatcagattaacaaaattgcacttaatctaattttatcttatcttgttttaagtgtaacaccccagaa 43975872  T
Q  592 agtgtaacact 602  Q
    |||||||||||    
T  43975871 agtgtaacact 43975861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 420 - 610
Target Start/End: Original strand, 53176076 - 53176265
Alignment:
Q  420 acttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatc 519  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||| || |||||||| || |||||     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53176076 acttttctgatgaagttaacatcataacatcaaaaatgttgtaagtaatgtc-cactgtttgtacaataacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatc 53176174  T
Q  520 agttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53176175 aattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatccaacctcattttaaatataacactccacaaagtgtaacacttaagacta 53176265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 392 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 54828883 - 54828666
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    ||||||||||||||||||||| | || || |||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||  ||| ||||  |||| ||||    
T  54828883 aaaattttatggtgaagtcataaaaataatttttttggtaaagttaacactataacataaaaa-tgtaatgagtaacaccccaccgtttaaacaacgaca 54828785  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    |||||| |||| || |||||| ||||||| ||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  54828784 tcaaaaattcattcttcatagcatcatcaattcatcatatgaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattataagtgtaacatcccacaa 54828685  T
Q  592 agtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  54828684 agtgtaacacttaaaacta 54828666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 405 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 11357535 - 11357355
Alignment:
Q  405 gaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatc-actgtttgtacaatgacatcaaaagttcag 503  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  || |||| | |||||||||||||  | |||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  11357535 gaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtatagtgagtaacacccccactgtttgtacagttgcatcaaaagttcag 11357436  T
Q  504 tcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacac 584  Q
    || |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  11357435 tcatcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacac 11357355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 384 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 33378973 - 33378750
Alignment:
Q  384 taaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgta 483  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| |||||||  ||||||   ||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||  ||  || | ||||||    
T  33378973 taaaaaggaaaattctatggcaaagttatgagaatgactttt---gtgaagtcaacactatagtatcaaaagtgtagtgagtagtaccccaatatttgta 33378877  T
Q  484 caatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca 583  Q
    |  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  33378876 cggtgacatcaaaagttcagtccccatagtattatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca 33378777  T
Q  584 ccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||    
T  33378776 ccccaagaagtgtaatacttaagacta 33378750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 422 - 610
Target Start/End: Original strand, 3362276 - 3362466
Alignment:
Q  422 ttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcag 521  Q
    |||| |||||||||||||||||||  || | |||| ||||||||||||   |||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  3362276 ttttttggtgaagttaacactatagcatcagaaatatagtgagtaacatcccactatttgtacagtggcatcaaaagttcactcctcatggtatcatcaa 3362375  T
Q  522 ttcattagattaacaagattacact--taatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||| |  ||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3362376 ttcatcatgttaacaagactacactattaatctaattttatcctaccttattttaagtgaaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 3362466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 388 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 21009992 - 21009767
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctg---gtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtac 484  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||  | |||| |    ||||| || ||||||||| || ||||||||| ||||||||||  |||| ||||||     
T  21009992 aaggaaaattttatggtgaagttataagaatgatttttttttttgtgaatttgacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactatttgtag 21009893  T
Q  485 aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacac 584  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||| || ||||| ||||||    
T  21009892 aatgacatcaaaagttcagccctcatattatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataacttgttctaagcataacac 21009793  T
Q  585 cccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
     | |||||||||||||||||||||||    
T  21009792 tctacaaagtgtaacacttaagacta 21009767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 389 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 44186687 - 44186485
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| |||| |||||||  |||||  | |||| |||||||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||  | |||||| |||| ||    
T  44186687 aggaaaattctatgatgaagtcgagagaatgatttttttggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccgctgtttatacagtg 44186588  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||    
T  44186587 acatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcaaattaacaaaaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaaatgtaacacccca 44186488  T
Q  589 caa 591  Q
    |||    
T  44186487 caa 44186485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 390 - 610
Target Start/End: Original strand, 44891498 - 44891708
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||   ||||||         |     
T  44891498 ggaaaattatacggtgaagtcatgaaaatgactttt-tggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacatcccactgt---------gg 44891587  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  44891588 catcaaaagtttagtccacatagtatcatcaattaatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccac 44891687  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  44891688 aaagtgtaacacttaagacta 44891708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 388 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 46994837 - 46994626
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| || ||||||||| | ||||  | |||| |||||||||||| ||||||| || |||| |||| ||||||||||||          |||||    
T  46994837 aaggaaaattctacggtgaagtcgtaagaatgatttttttggtgaagttaatactataacatcaaaa-tgtaatgagtaacacat----------acaat 46994749  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||||    
T  46994748 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatatgattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacgcccc 46994649  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  46994648 acaaaatgtaacacttaagacta 46994626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 403 - 561
Target Start/End: Original strand, 40935995 - 40936153
Alignment:
Q  403 gtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttca 502  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| | ||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  40935995 gtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgcgagtaacacctcattgtttatacagtgacatcaaaagttca 40936094  T
Q  503 gtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatc 561  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  40936095 gtcctcatagtatcatctattcatcagattaacaagaatacacttaatataattttatc 40936153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 430 - 610
Target Start/End: Original strand, 2007964 - 2008143
Alignment:
Q  430 tgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattag 529  Q
    ||||||||||||||||   | |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||| ||    
T  2007964 tgaagttaacactatagcgttaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcaatccccatagcatcatcaattcatcag 2008063  T
Q  530 attaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||  ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2008064 attaacaagaatatacttaatctaattttatcctacctcgttttaagtgt-acactccacaaagtgtaacacttaagacta 2008143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 387 - 610
Target Start/End: Original strand, 32373460 - 32373681
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 486  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||  |||||||   | ||||||||||||||  || |||| ||| ||||||||| |  |||||||||||||     
T  32373460 aaagggaaattctatgatgaagtcatgagaatgacttttccaataaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaactc--cactgtttgtacag 32373557  T
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 586  Q
    || ||||||||||||   ||  || ||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||    
T  32373558 tggcatcaaaagttccaccccaatggtatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatcc 32373657  T
Q  587 cacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  32373658 cacaaagtgtgacacttaagacta 32373681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 390 - 610
Target Start/End: Original strand, 54505799 - 54506018
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    ||||||||||||| |||||||   ||||  |||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  || | ||| || |||||    
T  54505799 ggaaaattttatgatgaagtcgcaagaatgacttttttgttgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccattatttatagaatga 54505898  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| | | |||  | ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || ||||| |||||| | ||    
T  54505899 catcaaaaattcag-cctcatagtatcataaatacatcgggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacactctac 54505997  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  54505998 aaagtgtaacacttaagacta 54506018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 459 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 24708231 - 24708085
Alignment:
Q  459 agtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacac--ttaatctaatt 556  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||  || ||||||||    
T  24708231 agtgagtaacacctcactgt--gtacagtgacatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttttgatctaatt 24708134  T
Q  557 ttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaa 605  Q
    ||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24708133 ttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaa 24708085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 451 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 14586794 - 14586643
Alignment:
Q  451 aaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaat 550  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||  |||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  14586794 aaaagtgttgtgagtaacacctcactatttatacagtgatatcaaaagttttgtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaat 14586695  T
Q  551 ctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacact 602  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14586694 ctaactttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 14586643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 493 - 602
Target Start/End: Original strand, 29163912 - 29164021
Alignment:
Q  493 caaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaa 592  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  29163912 caaaagttcagtcctcttagtatcatcaattcatcagattaataagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaa 29164011  T
Q  593 gtgtaacact 602  Q
    ||||||||||    
T  29164012 gtgtaacact 29164021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 511 - 610
Target Start/End: Original strand, 33698265 - 33698364
Alignment:
Q  511 agtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33698265 agtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 33698364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 460 - 610
Target Start/End: Original strand, 43348319 - 43348468
Alignment:
Q  460 gtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaatttta 559  Q
    ||||| |||||  ||||||||||  | || |||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43348319 gtgagcaacaccccactgtttgtttagtggcatcaaaagttcagtcttt-tagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttta 43348417  T
Q  560 tcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    || |||||| ||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  43348418 tcctaccttgttttaagtgtaacatcccataaagtgtgacacttaagacta 43348468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 390 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 27480564 - 27480368
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||  |  ||| |||| |||| |||||||||| || |||| | || |||||| ||    | |||||||||  |||    
T  27480564 ggaaaattctatgatgaagtcatgagaatgatatttttggtaaagtcaacactataacatcaaaagtataatgagtagcatccaattgtttgtacggtga 27480465  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 586  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||    
T  27480464 catcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcatattaacaagactgcacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccc 27480368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 22446247 - 22446030
Alignment:
Q  393 aaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttct-ggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||  |||||| | ||||||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||||  |||| |||||||| || ||    
T  22446247 aaattctacggtgaagtcatgaaaatgactttttttggtgaagttaacattatatcatcaaaaatatagtgagtaacaccccact-tttgtacagtggca 22446149  T
Q  492 tcaaaagttcagtcc-tcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 590  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| ||||| | || || |||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||| | ||||    
T  22446148 tcaaaagttcaaaccctcatagtatcatcaattcatcatataaataagactacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca-ctcaca 22446050  T
Q  591 aagtgtaacacttaagacta 610  Q
    | || ||||||| |||||||    
T  22446049 atgtataacactcaagacta 22446030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 513 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 22622780 - 22622683
Alignment:
Q  513 tatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22622780 tatcatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttatcataccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagcgtaacacttaagacta 22622683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 432 - 610
Target Start/End: Original strand, 38591727 - 38591909
Alignment:
Q  432 aagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgt----ttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcatt 527  Q
    ||||||||||||||| || |||| | ||| ||||||||  ||| |||    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||  ||||     
T  38591727 aagttaacactataacatcaaaattatagggagtaacatctcattgtattgttgtacaatggcatcaaaagttaagtccacatattattatcaactcatc 38591826  T
Q  528 agattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||| |||| ||||||||||  || |||||||||||||    
T  38591827 agattaacaagactacacttaatctaattttatcctatcttgtttcaagtgtaataccccacaaaacgtgacacttaagacta 38591909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 501 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 11835702 - 11835592
Alignment:
Q  501 cagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaat-tttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaac 599  Q
    |||||| ||||||||||||| || || | |||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  11835702 cagtccccatagtatcatcaatttatcatattaacaaaaatacacttaatctaatatttatcctaccttgttttaagtgtaacaacctacaaagtgtaac 11835603  T
Q  600 acttaagacta 610  Q
    | |||||||||    
T  11835602 aattaagacta 11835592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 506 - 610
Target Start/End: Original strand, 36012244 - 36012349
Alignment:
Q  506 ctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaatttt-atcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacactta 604  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| || |||||| |||||||| |||||||||||    
T  36012244 ctcataatatcatcaattcatcagatgaacaagaatacacctaatctaatttttatcctaccttgttttcagtgtaacatcccacaaaatgtaacactta 36012343  T
Q  605 agacta 610  Q
    ||||||    
T  36012344 agacta 36012349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 548 - 610
Target Start/End: Original strand, 1089842 - 1089905
Alignment:
Q  548 aatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca-ccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1089842 aatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatccccacaaagtgtaacacttaagacta 1089905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 387 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 55343472 - 55343403
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaat 456  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  55343472 aaaggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttctgatgaagttaacactataatatcaaaaat 55343403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 470
Target Start/End: Original strand, 33698183 - 33698259
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacac 470  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    || ||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  33698183 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaa----ttctctagtgaagttaacactataacatcaaaaatgttgtgagtaacac 33698259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 391 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 11835790 - 11835701
Alignment:
Q  391 gaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtaca 485  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||| |     ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11835790 gaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttttggtgaagttaacactatca-----aaagtgttgtgagtaacacctcactgtttgtaca 11835701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 388 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 40640684 - 40640634
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  40640684 aaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaa 40640634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 391 - 446
Target Start/End: Original strand, 29163839 - 29163894
Alignment:
Q  391 gaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataa 446  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  29163839 gaaaattttatggtgaagtcattaaaatgatttttctggtgaagttaacactataa 29163894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 53818555 - 53818509
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  53818555 aaaattttatggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaa 53818509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 388 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 38392678 - 38392628
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  38392678 aagggaaattatatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaa 38392628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 385 - 427
Target Start/End: Original strand, 53175709 - 53175751
Alignment:
Q  385 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttct 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  53175709 aaaaaggaaaattttatggtgaagttatgagaatgacttttct 53175751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 389 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 45879547 - 45879498
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  45879547 aggaaaattctatgctgaagtcatgagaatgacttttctggtaaagttaa 45879498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 385 - 469
Target Start/End: Original strand, 1089717 - 1089800
Alignment:
Q  385 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaaca 469  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||| ||  | |||||| || ||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  1089717 aaaatggaaaattctatggtgaagt-atgataatgatttttctagtaaagttaatattatagtatcaaaaatgtagtgagtaaca 1089800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 390 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 47930714 - 47930666
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  47930714 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgatttttctggtgaagttaa 47930666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 390 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 53812024 - 53811976
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  53812024 ggaaaattctacggtgaagtcatgagaatgacttttctgatgaagttaa 53811976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 387 - 610
Target Start/End: Original strand, 7884 - 8107
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 486  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || ||||  |||||| || ||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  7884 aaagaaaaattctatggtgaagttataagaatgacttttttgatgaagttaacactataacatcaaaattgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaa 7983  T
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  | ||||||||||||||    
T  7984 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaacttgctataagcgtaacaccc 8083  T
Q  587 cacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  8084 cacaaagtgtaacacttaagacta 8107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 135; Significance: 5e-70; HSPs: 19)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 381 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 4319016 - 4318786
Alignment:
Q  381 taataaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgttt 480  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||  ||||||||||  ||||||||    
T  4319016 taataaaaaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttatgagtaacaccccactgttt 4318917  T
Q  481 gtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaa-ttttatcttaccttattttaagcgt 579  Q
    ||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||    
T  4318916 gtacagtgacatcaaaagttcaacccccatagtatcatcaattcattagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgt 4318817  T
Q  580 aacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  4318816 aacaccctataaagtgtaacacttaagacta 4318786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 389 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 3880124 - 3879903
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||||   |||||||||||||||    
T  3880124 aggaaaattctatggtgaagtcacgagaatgacttttctggtgaagttaacattatagtatcaaaagtgttgtgagtaacaccctactgtttgtacaatg 3880025  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| || ||||| |||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||    
T  3880024 acatcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatatacttattctaattttatcctaccttgttttaaatgtaacacccca 3879925  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  3879924 caaagtgtaacacttaagacta 3879903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 393 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 6091363 - 6091152
Alignment:
Q  393 aaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacat 492  Q
    ||||| ||| |||||||||||| || || |||| |||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  6091363 aaattctattgtgaagtcatgaaaataatttttttggtaaagttaaca-tgtaacataaaaaatgtagtgagtaacacaccattgtttgtacaatgccat 6091265  T
Q  493 caaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaa 592  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  6091264 caaaagttcagtactcgtagtatcatcaattcattagattaacaaaactacacttaatctaattttatcataccttgttttaagcgtaacacccaacaaa 6091165  T
Q  593 gtgtaacacttaa 605  Q
    |||||||||||||    
T  6091164 gtgtaacacttaa 6091152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 389 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 7055400 - 7055179
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||| ||||| |||||| ||||    
T  7055400 aggaaaattttatggtgaagtcataagaatgatttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatataattagtaacacctcactatttgtagaatg 7055301  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || |||| ||||||| | |    
T  7055300 acatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagtgtaacacgcta 7055201  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  7055200 caaagtgtaacacttaaaacta 7055179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 388 - 610
Target Start/End: Original strand, 1945831 - 1946054
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttct-ggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 486  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||  |||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||    
T  1945831 aaggaaaattctacggtgaagtcataagaatgactttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtagaa 1945930  T
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 586  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  1945931 tgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatgaattcatcaagttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccc 1946030  T
Q  587 cacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  1946031 tacaaagtgtaacacttaagacta 1946054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 388 - 610
Target Start/End: Original strand, 5627389 - 5627611
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||  |||| |||||| |||    
T  5627389 aaggaaaattctaaggtgaagtcataagaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatataatgagtaacaccccactatttgtagaat 5627488  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || ||||| ||||||||     
T  5627489 gacatcaaaagttcagccctcatagtattatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccct 5627588  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  5627589 acaaagtgtaatacttaagacta 5627611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 392 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 21017294 - 21017076
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| || |||||||||| || ||  |||||| |||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||  || | ||||||||||| ||    
T  21017294 aaaattatacggtgaagtcacgaaaatgacttttttggtgaagttaacattgtagtataaaaaatgttgtgagtaacaccccattatttgtacaatggca 21017195  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  21017194 tcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaataaacttaatctaattttatcctacgttattttaagtgtaacaccccacaa 21017095  T
Q  592 agtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||    
T  21017094 agtgtaacacttaagacta 21017076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 389 - 610
Target Start/End: Original strand, 8513232 - 8513448
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  8513232 aggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactataatatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtg 8513331  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaa-ttttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| | |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||| |||      ||||||||     
T  8513332 acatcaaaagttcagtccccataatatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttgatctaatttttatcctaccttgttt------taacaccct 8513425  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  8513426 acaaagtgtaacacttaagacta 8513448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 390 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 7235218 - 7234999
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||| |||  ||||||||||||  ||     
T  7235218 ggaaaattctatggtgaagttatgagaatgacttttccggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttgtacggtgc 7235119  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||     
T  7235118 catcaaaagttcagtc-tcatagtattatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccag 7235020  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  7235019 aaagtgtaacgcttaagacta 7234999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 406 - 605
Target Start/End: Original strand, 15491631 - 15491830
Alignment:
Q  406 aagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtc 505  Q
    |||| |||||||  |||||||| |||||||||||| | ||| || |||| ||| |||||||||||  |||| |||||||| || |||||||||||||| |    
T  15491631 aagttatgagaatgacttttctcgtgaagttaacattgtaacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactatttgtacagtggcatcaaaagttcagcc 15491730  T
Q  506 ctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaa 605  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15491731 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatgcacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaa 15491830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 392 - 610
Target Start/End: Original strand, 29182165 - 29182384
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | |||  || ||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  |||||||| |||| || ||    
T  29182165 aaaattttatggtgaagtcatgagaatgattttattgatgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttatacagtgtca 29182264  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca-ccccaca 590  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||| |    
T  29182265 tcaaaagttcagtctccatattatcatcaattcatcagattaataagaatacacttaatctaattttatcctaccatattttaagtgtaacacccccata 29182364  T
Q  591 aagtgtaacacttaagacta 610  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29182365 aagtgtaacacttaagacta 29182384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 392 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 30353540 - 30353322
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||| | |||||| |  |||||||||||||| || ||    
T  30353540 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacattataacatcaaaagtgttgcgagtaatatctcactgtttgtacagtggca 30353441  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    || | |||||||||  ||||||||||||| ||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||| |||||||    
T  30353440 tcgatagttcagtctccatagtatcatcaattcatcatataaacaagaatacacttaatctaattttatcatgccttgttttaagtgtaacatcccacaa 30353341  T
Q  592 agtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||    
T  30353340 agtgtaacacttaagacta 30353322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 390 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 33893186 - 33892975
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||| || |||| | |||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  33893186 ggaaaattctatggtaaagtcattagaataatttttttagtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactatttgtacaatga 33893087  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
     || ||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  |||||||||||    
T  33893086 tattaaaagttcagtcc-cttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttatgtataacaccccac 33892988  T
Q  590 aaagtgtaacact 602  Q
    |||||||||||||    
T  33892987 aaagtgtaacact 33892975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 391 - 607
Target Start/End: Original strand, 20768087 - 20768299
Alignment:
Q  391 gaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgac 490  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||  || |||| ||||||||||| ||   || |||||||  | || |    
T  20768087 gaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcatc-cattgtttgtt-agtggc 20768184  T
Q  491 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 590  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||| |||| |    
T  20768185 atcaaaagttcagtcctcatagtatcattaattcatcagattaacaagatt--acttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacatcccata 20768282  T
Q  591 aagtgtaacacttaaga 607  Q
    |||||||||||||||||    
T  20768283 aagtgtaacacttaaga 20768299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 392 - 575
Target Start/End: Original strand, 6088910 - 6089094
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||| |  ||||||||||| | || ||    
T  6088910 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaacactatagtatcaaaagtgttgtgagtaacgccccactgtttgtaaagtggca 6089009  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaa-ttttatcttaccttattttaa 575  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||| |||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  6089010 tcaaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatatccttgatctaatttttatcctaccttgttttaa 6089094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 390 - 566
Target Start/End: Original strand, 33618834 - 33619010
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| || |||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || | |||||||  ||     
T  33618834 ggaaaattctacggtgaagtcatgggaaatacttttctggtgaagtcaacactatcgcatcaaaagtgtagtgagtagcaacccattatttgtacggtgg 33618933  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttacc 566  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  33618934 catcaaaagttcagttctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctacc 33619010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 384 - 520
Target Start/End: Original strand, 18498427 - 18498564
Alignment:
Q  384 taaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaaca-catcactgtttgt 482  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||  || |||| ||||||||| |||| |  ||| ||||||    
T  18498427 taaaaaggaaaaatctatagtgaagtcatgagaatgactttcctggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgtagtgagcaacacccccacagtttgt 18498526  T
Q  483 acaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatca 520  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18498527 acagtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatca 18498564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 11084204 - 11084152
Alignment:
Q  386 aaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  11084204 aaaaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaataacttttctggtaaagttaa 11084152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 438
Target Start/End: Original strand, 19631747 - 19631797
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  19631747 aaggaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttctggtgaagttaa 19631797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 392 - 606
Target Start/End: Original strand, 43959 - 44173
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |  ||||||||||||| ||    
T  43959 aaaattctatggtgaagtcgtaagaaagacttttttggtgaagttaacgctataatatcaaaaatgtaatgagtaacaccccgttgtttgtacaatggca 44058  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||| ||||| |||||||||| || ||| || ||||| |||||||||||||    
T  44059 taaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaataagactacatttaatataattttatcatatcttgttataagcttaacaccccacaa 44158  T
Q  592 agtgtaacacttaag 606  Q
    |||||||||||||||    
T  44159 agtgtaacacttaag 44173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 392 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 154828 - 154614
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |  ||||||||||||| ||    
T  154828 aaaattctatggtgaagtcgtaagaaagacttttttggtgaagttaacgctataatatcaaaaatgtaatgagtaacaccccgttgtttgtacaatggca 154729  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||| ||||| |||||||||| || ||| || ||||| |||||||||||||    
T  154728 taaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaataagactacatttaatataattttatcatatcttgttataagcttaacaccccacaa 154629  T
Q  592 agtgtaacacttaag 606  Q
    |||||||||||||||    
T  154628 agtgtaacacttaag 154614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 392 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 146199 - 145981
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||  | |||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||  || | |||||| |||||||    
T  146199 aaaattctacggtgaagtcataagaatgatttttttggttaagttaacattataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccattatttgtagaatgaca 146100  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  146099 tcaaaagttcagccttcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctacaa 146000  T
Q  592 agtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||||||||||||    
T  145999 agtgtaacacttaagacta 145981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 392 - 610
Target Start/End: Original strand, 11908 - 12129
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaaca-acttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatc-actgtttgta-caatg 488  Q
    |||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||| |||| || |||| ||| |||||||||||  | | |||||||| || ||    
T  11908 aaaattctatggtgaagtcatgagaaatgacttttctggtgaaattaacaccataacattaaaagtgttgtgagtaacacccccattgtttgtatcagtg 12007  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
      ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||    
T  12008 gtatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaacacccca 12107  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  12108 caaagtgtcacacttaagacta 12129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 389 - 605
Target Start/End: Original strand, 267281 - 267499
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttct-ggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgttt-gtacaa 486  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||  | |||| | ||| |  || ||||||||  || |||||| ||||||||||||    ||||||| |||||     
T  267281 aggaaaattctatggtgaagtcatgaaaattattttttttggtaatatttacactatagcatcaaaaatatagtgagtaacatccaactgttttgtacag 267380  T
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 586  Q
    || ||||||||||||||||   ||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||| ||    
T  267381 tgtcatcaaaagttcagtctctataatatcatcaattcattagattagcaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaaatgtaacatcc 267480  T
Q  587 cacaaagtgtaacacttaa 605  Q
    |||||||||||||||||||    
T  267481 cacaaagtgtaacacttaa 267499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 389 - 470
Target Start/End: Original strand, 42347 - 42428
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacac 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||    
T  42347 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaataatttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacac 42428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 463
Target Start/End: Original strand, 100817 - 100894
Alignment:
Q  386 aaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtga 463  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||    
T  100817 aaaaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttttggtgaagttaacgctataacatcaaaaacgtagtga 100894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 12186 - 12137
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaac 439  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  12186 ggaaaattctatgatgaagttatgagaatgacttttctggtgaagttaac 12137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University