View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11507_high_6 (Length: 317)

Name: NF11507_high_6
Description: NF11507
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11507_high_6
NF11507_high_6
[»] chr8 (100 HSPs)
chr8 (1-212)||(11674880-11675092)
chr8 (1-214)||(36325420-36325634)
chr8 (1-215)||(40775646-40775861)
chr8 (1-204)||(44406864-44407068)
chr8 (1-215)||(38845295-38845510)
chr8 (1-215)||(3041452-3041667)
chr8 (1-214)||(2266678-2266892)
chr8 (1-190)||(1425074-1425264)
chr8 (1-190)||(13186276-13186466)
chr8 (1-189)||(36928693-36928882)
chr8 (1-190)||(12198971-12199161)
chr8 (1-190)||(12443399-12443589)
chr8 (1-190)||(23663566-23663756)
chr8 (1-190)||(38955889-38956079)
chr8 (1-190)||(40317985-40318175)
chr8 (1-192)||(22915408-22915600)
chr8 (25-190)||(16388767-16388933)
chr8 (81-212)||(23505051-23505183)
chr8 (81-212)||(23507722-23507854)
chr8 (75-222)||(36325223-36325371)
chr8 (100-212)||(11674694-11674807)
chr8 (1-190)||(34685475-34685664)
chr8 (25-190)||(40318205-40318371)
chr8 (1-190)||(35756799-35756990)
chr8 (1-132)||(4405742-4405873)
chr8 (72-215)||(15230217-15230361)
chr8 (1-121)||(31608604-31608724)
chr8 (25-190)||(31608754-31608920)
chr8 (1-135)||(4994734-4994868)
chr8 (25-190)||(13186081-13186247)
chr8 (25-190)||(39071697-39071863)
chr8 (72-208)||(10445621-10445758)
chr8 (25-188)||(35756606-35756769)
chr8 (72-211)||(44664508-44664648)
chr8 (25-190)||(4994898-4995063)
chr8 (81-212)||(234035-234167)
chr8 (81-212)||(710446-710578)
chr8 (81-212)||(747658-747790)
chr8 (81-212)||(871553-871685)
chr8 (25-190)||(4405903-4406067)
chr8 (72-213)||(25124561-25124703)
chr8 (25-186)||(36928501-36928663)
chr8 (75-222)||(2266481-2266629)
chr8 (72-211)||(25124849-25124989)
chr8 (75-212)||(3041716-3041854)
chr8 (75-212)||(38845559-38845697)
chr8 (72-213)||(42945400-42945542)
chr8 (72-212)||(35634385-35634526)
chr8 (81-212)||(7983427-7983559)
chr8 (81-211)||(15229931-15230062)
chr8 (72-215)||(8997975-8998119)
chr8 (25-149)||(36186308-36186432)
chr8 (76-190)||(8316674-8316789)
chr8 (100-190)||(35449894-35449985)
chr8 (72-213)||(37542222-37542364)
chr8 (72-209)||(44664794-44664932)
chr8 (72-208)||(6471693-6471830)
chr8 (75-211)||(40775910-40776047)
chr8 (75-211)||(44407117-44407254)
chr8 (76-190)||(12272939-12273054)
chr8 (76-190)||(38862855-38862970)
chr8 (8-89)||(31873017-31873099)
chr8 (72-213)||(41353859-41354001)
chr8 (76-188)||(2535842-2535955)
chr8 (53-190)||(30711986-30712123)
chr8 (53-190)||(30719763-30719900)
chr8 (1-53)||(8316778-8316830)
chr8 (75-190)||(8316879-8316995)
chr8 (1-53)||(12273043-12273095)
chr8 (75-190)||(23663805-23663921)
chr8 (1-53)||(23698434-23698486)
chr8 (72-186)||(37542511-37542626)
chr8 (72-209)||(21432695-21432833)
chr8 (76-149)||(39071934-39072007)
chr8 (1-53)||(38862814-38862866)
chr8 (72-160)||(42945166-42945254)
chr8 (53-156)||(8747533-8747636)
chr8 (100-190)||(12273169-12273260)
chr8 (100-190)||(23698560-23698651)
chr8 (25-91)||(31873142-31873206)
chr8 (67-188)||(8746347-8746469)
chr8 (53-190)||(20385589-20385727)
chr8 (53-189)||(9337048-9337185)
chr8 (127-215)||(38003747-38003836)
chr8 (76-190)||(23698329-23698445)
chr8 (1-53)||(39071893-39071945)
chr8 (81-208)||(41353577-41353705)
chr8 (75-190)||(1425313-1425428)
chr8 (81-148)||(6471985-6472052)
chr8 (126-208)||(8997859-8997942)
chr8 (100-190)||(20386746-20386837)
chr8 (109-190)||(10749833-10749915)
chr8 (76-158)||(39474600-39474681)
chr8 (1-53)||(16388686-16388738)
chr8 (1-53)||(36186226-36186278)
chr8 (72-190)||(34061616-34061735)
chr8 (165-211)||(6472395-6472441)
chr8 (106-190)||(22915680-22915765)
chr8 (105-188)||(11761863-11761947)
chr8 (74-158)||(21432981-21433065)
[»] chr7 (95 HSPs)
chr7 (1-212)||(32680594-32680806)
chr7 (1-213)||(34928648-34928861)
chr7 (1-190)||(30948181-30948371)
chr7 (1-190)||(39686555-39686745)
chr7 (1-190)||(27991925-27992115)
chr7 (1-190)||(17102206-17102396)
chr7 (1-186)||(2640203-2640389)
chr7 (1-160)||(22871360-22871519)
chr7 (1-149)||(42731636-42731784)
chr7 (25-190)||(28469249-28469415)
chr7 (1-149)||(32053206-32053354)
chr7 (1-192)||(48788822-48789014)
chr7 (1-190)||(6253657-6253847)
chr7 (1-186)||(19204675-19204861)
chr7 (1-190)||(28469031-28469220)
chr7 (1-132)||(37657067-37657198)
chr7 (75-212)||(32680855-32680993)
chr7 (1-149)||(3914355-3914503)
chr7 (1-190)||(10936011-10936201)
chr7 (212-301)||(37351134-37351223)
chr7 (25-190)||(10935815-10935981)
chr7 (1-190)||(42019618-42019808)
chr7 (25-190)||(42731440-42731606)
chr7 (25-186)||(32053384-32053546)
chr7 (72-221)||(32934338-32934488)
chr7 (25-190)||(40379790-40379956)
chr7 (25-189)||(23181235-23181400)
chr7 (72-208)||(25628481-25628618)
chr7 (72-208)||(42618197-42618334)
chr7 (72-212)||(43266265-43266406)
chr7 (75-214)||(30948420-30948560)
chr7 (72-211)||(32068382-32068522)
chr7 (72-211)||(22081560-22081699)
chr7 (75-221)||(39686794-39686941)
chr7 (72-213)||(23058715-23058857)
chr7 (25-190)||(24388840-24389006)
chr7 (25-190)||(27396836-27397002)
chr7 (72-213)||(28890577-28890719)
chr7 (25-190)||(42019838-42020004)
chr7 (80-212)||(33828268-33828401)
chr7 (1-82)||(45010812-45010893)
chr7 (72-211)||(25453128-25453268)
chr7 (81-212)||(43266561-43266693)
chr7 (75-212)||(34928910-34929048)
chr7 (25-185)||(2640419-2640580)
chr7 (72-208)||(32068099-32068236)
chr7 (25-121)||(3914229-3914325)
chr7 (75-214)||(32934637-32934777)
chr7 (72-211)||(42617911-42618051)
chr7 (60-190)||(17885649-17885780)
chr7 (72-202)||(18087626-18087757)
chr7 (80-217)||(25628772-25628910)
chr7 (80-208)||(10600243-10600372)
chr7 (72-211)||(22081845-22081985)
chr7 (84-211)||(23058429-23058557)
chr7 (25-161)||(48789044-48789180)
chr7 (25-190)||(37656873-37657037)
chr7 (25-158)||(45010652-45010782)
chr7 (72-213)||(27138227-27138369)
chr7 (72-213)||(46205595-46205737)
chr7 (53-190)||(13386016-13386154)
chr7 (77-190)||(24389078-24389192)
chr7 (72-208)||(39274873-39275011)
chr7 (79-208)||(46204424-46204554)
chr7 (76-168)||(6571240-6571332)
chr7 (100-190)||(6571034-6571125)
chr7 (72-190)||(17886778-17886897)
chr7 (100-202)||(18086298-18086401)
chr7 (72-190)||(32688506-32688625)
chr7 (53-190)||(5457176-5457314)
chr7 (105-190)||(22871598-22871684)
chr7 (100-188)||(18855970-18856059)
chr7 (72-208)||(25453414-25453551)
chr7 (98-190)||(42362471-42362564)
chr7 (1-53)||(6571199-6571251)
chr7 (108-190)||(13050104-13050188)
chr7 (25-91)||(13311277-13311340)
chr7 (75-190)||(17102041-17102157)
chr7 (75-190)||(32298996-32299112)
chr7 (105-216)||(32687392-32687504)
chr7 (100-190)||(6253492-6253583)
chr7 (54-161)||(12229342-12229449)
chr7 (100-190)||(19204510-19204601)
chr7 (136-217)||(10600020-10600102)
chr7 (1-53)||(24389036-24389088)
chr7 (5-53)||(32298895-32298943)
chr7 (53-190)||(22828087-22828225)
chr7 (106-190)||(16803967-16804052)
chr7 (1-53)||(27396754-27396806)
chr7 (75-190)||(27991760-27991876)
chr7 (76-190)||(27396650-27396765)
chr7 (100-190)||(40380000-40380091)
chr7 (77-190)||(13044693-13044807)
chr7 (101-190)||(45010921-45011011)
chr7 (139-202)||(23608817-23608881)
[»] chr3 (100 HSPs)
chr3 (1-212)||(36314297-36314509)
chr3 (1-212)||(48322376-48322588)
chr3 (1-208)||(10770493-10770701)
chr3 (1-204)||(54466609-54466813)
chr3 (1-204)||(8041802-8042006)
chr3 (1-190)||(23458000-23458190)
chr3 (1-190)||(36417905-36418095)
chr3 (1-186)||(46474998-46475183)
chr3 (1-190)||(43384500-43384690)
chr3 (1-190)||(33689403-33689591)
chr3 (1-188)||(19740946-19741134)
chr3 (1-132)||(55052359-55052490)
chr3 (75-212)||(48322637-48322775)
chr3 (75-211)||(36314558-36314695)
chr3 (75-208)||(10770751-10770885)
chr3 (72-217)||(37778559-37778705)
chr3 (25-189)||(33689620-33689785)
chr3 (25-190)||(23458220-23458386)
chr3 (1-192)||(53756941-53757132)
chr3 (25-190)||(9294199-9294365)
chr3 (26-190)||(36417709-36417874)
chr3 (76-211)||(47921466-47921602)
chr3 (72-213)||(29118824-29118966)
chr3 (72-213)||(40788706-40788848)
chr3 (72-214)||(3469197-3469340)
chr3 (76-213)||(47551491-47551629)
chr3 (72-214)||(32306421-32306564)
chr3 (72-190)||(35643872-35643991)
chr3 (25-190)||(40758168-40758331)
chr3 (75-212)||(8041615-8041753)
chr3 (75-204)||(54466430-54466560)
chr3 (72-212)||(3469486-3469627)
chr3 (80-212)||(13948779-13948912)
chr3 (72-208)||(52032141-52032278)
chr3 (1-121)||(9294049-9294169)
chr3 (53-208)||(33156263-33156419)
chr3 (72-209)||(29685943-29686081)
chr3 (72-208)||(32306710-32306847)
chr3 (82-214)||(52032435-52032568)
chr3 (74-209)||(11910701-11910837)
chr3 (29-121)||(26463843-26463935)
chr3 (82-211)||(10294567-10294697)
chr3 (24-173)||(43384321-43384471)
chr3 (72-208)||(41421975-41422112)
chr3 (72-215)||(10294845-10294989)
chr3 (1-65)||(40033637-40033701)
chr3 (25-121)||(41988053-41988148)
chr3 (67-188)||(21185978-21186100)
chr3 (72-209)||(29686226-29686364)
chr3 (72-185)||(43998171-43998285)
chr3 (75-190)||(2796200-2796316)
chr3 (72-215)||(3596105-3596249)
chr3 (72-175)||(10307661-10307765)
chr3 (88-215)||(33506252-33506380)
chr3 (26-189)||(53756766-53756930)
chr3 (76-190)||(40758402-40758517)
chr3 (53-186)||(9367766-9367900)
chr3 (100-188)||(1079537-1079626)
chr3 (53-188)||(25108364-25108500)
chr3 (80-211)||(42855601-42855733)
chr3 (33-190)||(40506036-40506195)
chr3 (77-190)||(26463653-26463767)
chr3 (72-188)||(4323490-4323607)
chr3 (1-53)||(2796365-2796417)
chr3 (108-188)||(4322615-4322695)
chr3 (1-53)||(42342982-42343034)
chr3 (1-53)||(51994076-51994128)
chr3 (2-53)||(26463757-26463808)
chr3 (100-190)||(40033772-40033863)
chr3 (100-186)||(42342816-42342903)
chr3 (55-188)||(25107236-25107370)
chr3 (80-209)||(29118529-29118670)
chr3 (64-185)||(32431472-32431594)
chr3 (72-185)||(47857533-47857647)
chr3 (97-188)||(3849054-3849146)
chr3 (1-53)||(40758361-40758413)
chr3 (71-190)||(51994173-51994293)
chr3 (105-139)||(8741314-8741348)
chr3 (105-190)||(19741213-19741299)
chr3 (100-189)||(46474837-46474927)
chr3 (83-188)||(47856410-47856516)
chr3 (100-188)||(6956271-6956360)
chr3 (100-188)||(23276299-23276388)
chr3 (100-188)||(33154900-33154989)
chr3 (76-141)||(42343023-42343088)
chr3 (100-188)||(43608798-43608887)
chr3 (97-188)||(41558195-41558287)
chr3 (77-121)||(51994042-51994086)
chr3 (164-211)||(13949074-13949121)
chr3 (55-89)||(23272946-23272980)
chr3 (25-71)||(42342906-42342952)
chr3 (53-91)||(42854554-42854592)
chr3 (100-188)||(1078560-1078648)
chr3 (76-121)||(2796406-2796451)
chr3 (164-209)||(33506180-33506225)
chr3 (60-132)||(35712111-35712183)
chr3 (53-89)||(39399361-39399397)
chr3 (25-53)||(40033731-40033759)
chr3 (81-208)||(40788423-40788551)
chr3 (105-192)||(41558027-41558115)
[»] chr4 (135 HSPs)
chr4 (1-211)||(9400519-9400730)
chr4 (1-211)||(4982726-4982937)
chr4 (1-190)||(33247295-33247484)
chr4 (1-212)||(42738030-42738242)
chr4 (1-214)||(34837071-34837285)
chr4 (1-204)||(9144773-9144977)
chr4 (2-212)||(32950329-32950540)
chr4 (1-211)||(38012356-38012567)
chr4 (1-214)||(22566985-22567186)
chr4 (1-203)||(27934718-27934907)
chr4 (1-190)||(49879228-49879418)
chr4 (1-190)||(7452020-7452210)
chr4 (1-190)||(50418689-50418879)
chr4 (1-190)||(44967090-44967280)
chr4 (1-190)||(24711297-24711487)
chr4 (1-190)||(35028019-35028209)
chr4 (1-190)||(37248422-37248612)
chr4 (1-190)||(46661131-46661321)
chr4 (1-190)||(34765401-34765591)
chr4 (1-190)||(17355946-17356136)
chr4 (1-135)||(36008921-36009055)
chr4 (5-190)||(43155550-43155736)
chr4 (1-190)||(51692736-51692926)
chr4 (1-131)||(53702029-53702159)
chr4 (1-190)||(18831534-18831724)
chr4 (1-190)||(23613495-23613685)
chr4 (1-121)||(16006024-16006143)
chr4 (1-131)||(14801953-14802082)
chr4 (1-131)||(37976234-37976364)
chr4 (75-215)||(27934528-27934669)
chr4 (1-170)||(53129548-53129717)
chr4 (105-215)||(9400809-9400920)
chr4 (25-190)||(14801757-14801923)
chr4 (25-190)||(34765621-34765787)
chr4 (1-190)||(52909470-52909660)
chr4 (1-190)||(15507694-15507884)
chr4 (1-190)||(54086716-54086906)
chr4 (72-215)||(54858556-54858700)
chr4 (78-212)||(51203608-51203743)
chr4 (72-214)||(54858846-54858989)
chr4 (75-211)||(4982986-4983123)
chr4 (1-109)||(24411575-24411683)
chr4 (105-208)||(33247563-33247667)
chr4 (25-190)||(53701833-53701999)
chr4 (72-212)||(27068909-27069050)
chr4 (76-211)||(10408179-10408315)
chr4 (53-212)||(16605601-16605761)
chr4 (105-212)||(22566798-22566906)
chr4 (25-149)||(35028239-35028363)
chr4 (25-187)||(24411382-24411545)
chr4 (25-190)||(15507914-15508079)
chr4 (72-213)||(27069196-27069338)
chr4 (77-213)||(3032580-3032717)
chr4 (72-212)||(50504111-50504252)
chr4 (72-212)||(52573227-52573368)
chr4 (25-189)||(52909275-52909440)
chr4 (60-190)||(13058258-13058389)
chr4 (75-213)||(42738291-42738430)
chr4 (72-214)||(45463070-45463213)
chr4 (1-131)||(35508322-35508451)
chr4 (75-215)||(9145026-9145167)
chr4 (72-208)||(45463359-45463496)
chr4 (25-185)||(54086936-54087097)
chr4 (72-215)||(50503821-50503965)
chr4 (78-196)||(6237114-6237233)
chr4 (83-208)||(11523952-11524078)
chr4 (88-213)||(27149298-27149423)
chr4 (75-212)||(34837334-34837472)
chr4 (105-213)||(32950140-32950249)
chr4 (25-189)||(35508481-35508646)
chr4 (100-196)||(6236846-6236942)
chr4 (72-211)||(10407889-10408029)
chr4 (72-215)||(52573514-52573658)
chr4 (25-187)||(37976394-37976557)
chr4 (25-190)||(53129747-53129913)
chr4 (80-208)||(5818069-5818198)
chr4 (72-212)||(27891583-27891724)
chr4 (56-188)||(30642418-30642551)
chr4 (72-208)||(39667062-39667199)
chr4 (72-208)||(39701195-39701332)
chr4 (25-186)||(17356166-17356325)
chr4 (105-211)||(38012170-38012277)
chr4 (82-214)||(22987147-22987280)
chr4 (72-212)||(51859692-51859833)
chr4 (67-187)||(8438305-8438425)
chr4 (56-158)||(8439496-8439598)
chr4 (72-185)||(22718225-22718339)
chr4 (72-185)||(22986877-22986991)
chr4 (53-190)||(24349695-24349833)
chr4 (72-161)||(9731498-9731587)
chr4 (82-214)||(22717936-22718069)
chr4 (53-188)||(41582470-41582606)
chr4 (76-148)||(51859471-51859543)
chr4 (71-189)||(1179087-1179206)
chr4 (100-190)||(7451855-7451946)
chr4 (60-190)||(39539194-39539325)
chr4 (72-177)||(22923172-22923278)
chr4 (72-177)||(22927825-22927931)
chr4 (72-177)||(22984104-22984210)
chr4 (72-177)||(22997692-22997798)
chr4 (105-190)||(37248257-37248343)
chr4 (72-188)||(50750910-50751027)
chr4 (108-188)||(50751822-50751902)
chr4 (100-190)||(24711132-24711223)
chr4 (75-185)||(43155787-43155898)
chr4 (53-190)||(10781753-10781891)
chr4 (53-159)||(56014778-56014884)
chr4 (72-188)||(32063624-32063741)
chr4 (75-190)||(5368968-5369084)
chr4 (75-190)||(13058058-13058174)
chr4 (75-190)||(23613330-23613446)
chr4 (81-132)||(1178123-1178174)
chr4 (100-190)||(44967354-44967445)
chr4 (100-190)||(50418953-50419044)
chr4 (100-190)||(54435413-54435504)
chr4 (56-186)||(56015919-56016049)
chr4 (1-39)||(13058223-13058261)
chr4 (105-186)||(18831374-18831456)
chr4 (53-190)||(29321174-29321312)
chr4 (71-188)||(40387490-40387608)
chr4 (71-188)||(41583518-41583636)
chr4 (97-185)||(32062615-32062704)
chr4 (72-192)||(39700928-39701049)
chr4 (53-122)||(40388375-40388444)
chr4 (100-188)||(55867430-55867519)
chr4 (1-41)||(5369133-5369173)
chr4 (75-190)||(49879467-49879583)
chr4 (75-173)||(36009104-36009203)
chr4 (105-190)||(10780734-10780820)
chr4 (105-190)||(10974343-10974429)
chr4 (100-186)||(30641545-30641630)
chr4 (100-188)||(148071-148160)
chr4 (98-151)||(5369181-5369234)
chr4 (100-188)||(11446293-11446382)
chr4 (98-190)||(24350746-24350839)
[»] chr1 (106 HSPs)
chr1 (1-212)||(24905166-24905378)
chr1 (1-222)||(28011549-28011776)
chr1 (1-224)||(33442581-33442805)
chr1 (1-211)||(52134254-52134465)
chr1 (1-213)||(31514316-31514529)
chr1 (1-213)||(4716466-4716679)
chr1 (1-190)||(34464470-34464660)
chr1 (1-186)||(183246-183432)
chr1 (1-190)||(6367779-6367969)
chr1 (1-190)||(13914089-13914279)
chr1 (1-190)||(26024609-26024799)
chr1 (1-190)||(17661873-17662061)
chr1 (1-190)||(30711544-30711734)
chr1 (2-190)||(48779337-48779526)
chr1 (1-190)||(37578213-37578403)
chr1 (1-190)||(43759039-43759229)
chr1 (1-190)||(47999144-47999334)
chr1 (1-192)||(32917477-32917669)
chr1 (1-173)||(7821171-7821343)
chr1 (1-131)||(1841676-1841806)
chr1 (1-131)||(19017710-19017840)
chr1 (1-151)||(23209422-23209572)
chr1 (1-186)||(41098950-41099136)
chr1 (1-190)||(49722944-49723133)
chr1 (1-132)||(35152560-35152691)
chr1 (1-190)||(1103678-1103868)
chr1 (25-190)||(6367583-6367749)
chr1 (1-121)||(14879188-14879308)
chr1 (29-190)||(7820975-7821137)
chr1 (1-190)||(36694303-36694493)
chr1 (1-190)||(36710404-36710594)
chr1 (1-149)||(40210433-40210581)
chr1 (25-190)||(17662091-17662257)
chr1 (25-190)||(34464690-34464856)
chr1 (25-189)||(4960562-4960727)
chr1 (75-208)||(24905427-24905560)
chr1 (25-189)||(40210611-40210776)
chr1 (72-212)||(40714443-40714584)
chr1 (25-192)||(41098752-41098920)
chr1 (1-132)||(40772690-40772820)
chr1 (25-190)||(24009782-24009948)
chr1 (25-190)||(37578433-37578599)
chr1 (25-190)||(13914309-13914474)
chr1 (72-212)||(49955633-49955774)
chr1 (76-211)||(49955347-49955483)
chr1 (25-160)||(1103513-1103648)
chr1 (25-190)||(14878992-14879158)
chr1 (1-91)||(19516002-19516092)
chr1 (25-190)||(30711348-30711514)
chr1 (25-130)||(19322974-19323079)
chr1 (1-130)||(19323109-19323238)
chr1 (72-212)||(40714729-40714870)
chr1 (81-212)||(20760800-20760932)
chr1 (1-131)||(42248690-42248818)
chr1 (25-190)||(19017870-19018036)
chr1 (75-184)||(28011390-28011500)
chr1 (72-212)||(31050949-31051090)
chr1 (72-211)||(17188954-17189094)
chr1 (72-215)||(45749838-45749982)
chr1 (81-212)||(28325099-28325230)
chr1 (75-209)||(33442854-33442989)
chr1 (25-190)||(32917281-32917447)
chr1 (25-91)||(43758943-43759009)
chr1 (80-212)||(37929417-37929550)
chr1 (72-212)||(45750128-45750269)
chr1 (25-185)||(46163056-46163217)
chr1 (72-214)||(8898514-8898657)
chr1 (72-213)||(31058343-31058485)
chr1 (25-190)||(42248494-42248660)
chr1 (25-91)||(48779238-48779304)
chr1 (72-208)||(7371293-7371430)
chr1 (80-212)||(12905953-12906086)
chr1 (72-213)||(28324803-28324944)
chr1 (72-208)||(35040900-35041037)
chr1 (72-211)||(30326496-30326636)
chr1 (72-213)||(8898803-8898945)
chr1 (75-204)||(31514577-31514707)
chr1 (25-190)||(35152364-35152530)
chr1 (75-212)||(52134067-52134205)
chr1 (25-189)||(1841481-1841646)
chr1 (108-211)||(17189173-17189277)
chr1 (105-204)||(4716758-4716857)
chr1 (80-190)||(35473652-35473763)
chr1 (53-209)||(44523405-44523562)
chr1 (75-190)||(25647905-25648021)
chr1 (75-192)||(26024442-26024560)
chr1 (72-208)||(35038458-35038595)
chr1 (98-212)||(32558419-32558534)
chr1 (100-190)||(5734031-5734121)
chr1 (53-190)||(34850334-34850472)
chr1 (105-190)||(36694569-36694655)
chr1 (105-190)||(36710670-36710756)
chr1 (76-149)||(4960801-4960874)
chr1 (8-53)||(10304048-10304093)
chr1 (74-190)||(24009596-24009713)
chr1 (158-215)||(25885366-25885423)
chr1 (97-173)||(32133236-32133313)
chr1 (100-190)||(23209643-23209734)
chr1 (1-53)||(24009700-24009752)
chr1 (71-190)||(34849032-34849152)
chr1 (100-190)||(19515840-19515931)
chr1 (72-186)||(32132329-32132444)
chr1 (100-190)||(40772528-40772619)
chr1 (25-54)||(49722885-49722914)
chr1 (105-188)||(31197088-31197167)
chr1 (107-190)||(47999415-47999499)
[»] chr6 (65 HSPs)
chr6 (1-213)||(14196613-14196826)
chr6 (19-216)||(362865-363063)
chr6 (1-204)||(28000392-28000596)
chr6 (1-190)||(30337635-30337825)
chr6 (1-190)||(33517751-33517941)
chr6 (1-149)||(21627776-21627924)
chr6 (1-190)||(30725976-30726166)
chr6 (1-190)||(17734217-17734405)
chr6 (1-190)||(30804078-30804268)
chr6 (80-208)||(25485956-25486085)
chr6 (3-190)||(33647170-33647358)
chr6 (4-190)||(3059476-3059663)
chr6 (1-190)||(12080853-12081043)
chr6 (105-210)||(14196905-14197011)
chr6 (25-190)||(21627954-21628120)
chr6 (72-208)||(21836035-21836170)
chr6 (25-192)||(30725779-30725946)
chr6 (77-212)||(32593489-32593625)
chr6 (25-190)||(3059278-3059444)
chr6 (25-190)||(33517555-33517721)
chr6 (25-183)||(11392866-11393025)
chr6 (25-160)||(33647015-33647150)
chr6 (25-190)||(12080657-12080823)
chr6 (72-213)||(22503060-22503202)
chr6 (100-213)||(25486211-25486325)
chr6 (25-190)||(30803882-30804048)
chr6 (72-208)||(7160807-7160944)
chr6 (82-210)||(7905244-7905373)
chr6 (85-221)||(22367415-22367552)
chr6 (72-208)||(31407164-31407301)
chr6 (75-213)||(28000645-28000784)
chr6 (77-190)||(22372950-22373064)
chr6 (72-212)||(21836316-21836457)
chr6 (72-208)||(22502777-22502914)
chr6 (72-211)||(6517503-6517642)
chr6 (72-215)||(7905529-7905673)
chr6 (72-211)||(31406878-31407018)
chr6 (75-211)||(363090-363227)
chr6 (60-190)||(11434823-11434954)
chr6 (72-208)||(15913551-15913688)
chr6 (75-190)||(30337470-30337586)
chr6 (72-212)||(15913834-15913975)
chr6 (1-57)||(25486084-25486140)
chr6 (82-212)||(7161100-7161231)
chr6 (53-190)||(680997-681135)
chr6 (80-189)||(12065242-12065352)
chr6 (59-185)||(24210557-24210684)
chr6 (70-188)||(26463202-26463321)
chr6 (57-188)||(28498298-28498430)
chr6 (72-178)||(10781444-10781551)
chr6 (72-190)||(15115360-15115479)
chr6 (100-190)||(15116548-15116639)
chr6 (105-190)||(141061-141147)
chr6 (105-190)||(149082-149168)
chr6 (53-190)||(679887-680025)
chr6 (100-188)||(8089466-8089555)
chr6 (128-212)||(10781146-10781231)
chr6 (1-53)||(11393055-11393107)
chr6 (53-121)||(12407599-12407667)
chr6 (100-190)||(8090243-8090334)
chr6 (76-185)||(11393096-11393206)
chr6 (72-134)||(20651935-20651997)
chr6 (135-188)||(26464550-26464604)
chr6 (100-188)||(13379798-13379887)
chr6 (57-121)||(29810709-29810773)
[»] chr5 (101 HSPs)
chr5 (1-213)||(41930702-41930915)
chr5 (1-200)||(6757876-6758076)
chr5 (1-211)||(31482402-31482613)
chr5 (1-213)||(1506153-1506366)
chr5 (1-212)||(297013-297225)
chr5 (1-190)||(3528894-3529084)
chr5 (1-190)||(11761934-11762124)
chr5 (1-190)||(19892329-19892519)
chr5 (1-189)||(6301760-6301949)
chr5 (5-190)||(32242463-32242648)
chr5 (4-190)||(39453519-39453706)
chr5 (1-190)||(27587332-27587522)
chr5 (1-190)||(6150637-6150827)
chr5 (1-190)||(14194444-14194634)
chr5 (1-190)||(16156876-16157066)
chr5 (1-177)||(38475067-38475244)
chr5 (1-187)||(21265167-21265354)
chr5 (1-190)||(8322621-8322811)
chr5 (1-190)||(17202616-17202806)
chr5 (1-190)||(19517824-19518014)
chr5 (1-190)||(28770890-28771080)
chr5 (1-190)||(11047654-11047843)
chr5 (1-150)||(13362289-13362438)
chr5 (1-189)||(28269444-28269633)
chr5 (1-149)||(35920291-35920439)
chr5 (1-190)||(186636-186826)
chr5 (1-190)||(5994106-5994296)
chr5 (25-190)||(13962885-13963051)
chr5 (1-190)||(5024040-5024230)
chr5 (1-190)||(29646383-29646573)
chr5 (1-190)||(38442284-38442474)
chr5 (75-214)||(6758125-6758265)
chr5 (1-149)||(16083160-16083308)
chr5 (25-190)||(19892549-19892715)
chr5 (1-121)||(18670382-18670502)
chr5 (75-214)||(41930513-41930653)
chr5 (25-190)||(39453321-39453487)
chr5 (1-186)||(20814161-20814346)
chr5 (25-190)||(5993910-5994076)
chr5 (25-190)||(32242263-32242429)
chr5 (25-190)||(35512169-35512335)
chr5 (25-190)||(43159055-43159221)
chr5 (25-173)||(6301581-6301730)
chr5 (4-149)||(10684158-10684303)
chr5 (80-212)||(17544342-17544475)
chr5 (25-190)||(20814376-20814542)
chr5 (25-189)||(13362469-13362634)
chr5 (25-190)||(14194664-14194829)
chr5 (25-189)||(38442090-38442255)
chr5 (72-211)||(8875449-8875589)
chr5 (25-190)||(5024259-5024425)
chr5 (72-211)||(33871339-33871479)
chr5 (72-215)||(33871624-33871768)
chr5 (25-191)||(186439-186606)
chr5 (25-190)||(11047459-11047624)
chr5 (25-186)||(17202424-17202586)
chr5 (4-92)||(18247303-18247391)
chr5 (27-190)||(20840554-20840718)
chr5 (25-190)||(18247107-18247271)
chr5 (72-212)||(20153204-20153342)
chr5 (75-212)||(1505966-1506104)
chr5 (25-190)||(16157096-16157262)
chr5 (25-87)||(27937260-27937322)
chr5 (100-213)||(31482687-31482801)
chr5 (72-211)||(20152781-20152921)
chr5 (75-213)||(297274-297413)
chr5 (25-121)||(10684030-10684126)
chr5 (25-158)||(29646603-29646736)
chr5 (25-149)||(8322467-8322591)
chr5 (76-190)||(35512406-35512521)
chr5 (25-91)||(4700352-4700418)
chr5 (13-91)||(12904875-12904953)
chr5 (25-91)||(21265384-21265450)
chr5 (105-188)||(24141475-24141559)
chr5 (1-53)||(24547315-24547367)
chr5 (100-190)||(38475315-38475406)
chr5 (100-221)||(11761739-11761861)
chr5 (72-189)||(22298564-22298682)
chr5 (54-190)||(11740708-11740845)
chr5 (75-190)||(3529133-3529249)
chr5 (1-53)||(13963080-13963132)
chr5 (71-190)||(24547412-24547532)
chr5 (1-53)||(27937178-27937230)
chr5 (67-158)||(5255072-5255162)
chr5 (80-174)||(17544085-17544180)
chr5 (137-205)||(8875618-8875687)
chr5 (82-189)||(30005175-30005283)
chr5 (97-188)||(37991222-37991314)
chr5 (76-151)||(13963121-13963196)
chr5 (76-186)||(16083002-16083113)
chr5 (100-190)||(27587169-27587260)
chr5 (65-215)||(40150095-40150246)
chr5 (72-158)||(21287797-21287883)
chr5 (82-211)||(21287953-21288083)
chr5 (79-149)||(27937116-27937186)
chr5 (100-177)||(42063288-42063366)
chr5 (1-53)||(35512365-35512417)
chr5 (100-187)||(35920500-35920588)
chr5 (100-190)||(5256328-5256418)
chr5 (100-190)||(6150475-6150566)
chr5 (76-135)||(24547267-24547326)
[»] chr2 (73 HSPs)
chr2 (1-214)||(1695737-1695951)
chr2 (1-214)||(33062047-33062261)
chr2 (1-212)||(13995672-13995884)
chr2 (1-212)||(14900495-14900694)
chr2 (1-204)||(41248566-41248770)
chr2 (1-212)||(33739889-33740101)
chr2 (1-190)||(10712940-10713130)
chr2 (1-190)||(6658064-6658254)
chr2 (1-190)||(16099241-16099431)
chr2 (1-190)||(37895368-37895558)
chr2 (1-190)||(39498496-39498686)
chr2 (1-173)||(11163092-11163265)
chr2 (1-132)||(15848305-15848436)
chr2 (1-190)||(36479935-36480125)
chr2 (1-190)||(36755310-36755495)
chr2 (1-190)||(39423732-39423922)
chr2 (1-118)||(22051088-22051205)
chr2 (14-190)||(34448025-34448202)
chr2 (25-190)||(15848109-15848275)
chr2 (25-190)||(44714002-44714168)
chr2 (25-190)||(10712744-10712910)
chr2 (72-214)||(8710754-8710897)
chr2 (72-214)||(15604336-15604479)
chr2 (72-213)||(15604625-15604767)
chr2 (25-190)||(36382182-36382348)
chr2 (25-190)||(37895588-37895754)
chr2 (25-190)||(39423536-39423702)
chr2 (75-214)||(14900743-14900881)
chr2 (25-190)||(2318180-2318345)
chr2 (75-216)||(33739698-33739840)
chr2 (1-118)||(2318375-2318492)
chr2 (72-213)||(41587233-41587374)
chr2 (72-211)||(28226030-28226170)
chr2 (75-220)||(33062310-33062456)
chr2 (72-208)||(8342190-8342327)
chr2 (25-189)||(36479740-36479905)
chr2 (72-210)||(11830365-11830504)
chr2 (47-192)||(9076330-9076476)
chr2 (65-190)||(13692501-13692627)
chr2 (75-212)||(13995933-13996071)
chr2 (25-91)||(34447933-34447999)
chr2 (25-91)||(36755214-36755280)
chr2 (75-212)||(41248819-41248957)
chr2 (100-204)||(1696025-1696130)
chr2 (72-213)||(8342465-8342607)
chr2 (72-210)||(41588344-41588483)
chr2 (100-185)||(202672-202758)
chr2 (54-212)||(6573542-6573699)
chr2 (1-53)||(36382378-36382430)
chr2 (75-192)||(16099074-16099192)
chr2 (72-158)||(39936535-39936621)
chr2 (53-177)||(3653349-3653473)
chr2 (76-149)||(44713858-44713931)
chr2 (1-53)||(44713920-44713972)
chr2 (54-188)||(25231118-25231253)
chr2 (76-190)||(36382419-36382534)
chr2 (47-192)||(22051257-22051402)
chr2 (77-190)||(45556340-45556454)
chr2 (108-208)||(6573050-6573150)
chr2 (8-53)||(17266523-17266568)
chr2 (105-188)||(6589680-6589764)
chr2 (75-190)||(39498331-39498447)
chr2 (72-190)||(3556297-3556416)
chr2 (72-190)||(6588704-6588823)
chr2 (100-190)||(11163339-11163430)
chr2 (100-190)||(45556133-45556224)
chr2 (77-190)||(3555271-3555385)
chr2 (100-188)||(25230125-25230214)
chr2 (100-188)||(44045318-44045407)
chr2 (1-53)||(45556298-45556350)
chr2 (105-177)||(28230060-28230133)
chr2 (105-188)||(28228693-28228777)
chr2 (105-188)||(39935478-39935562)
[»] scaffold0024 (2 HSPs)
scaffold0024 (1-204)||(141601-141805)
scaffold0024 (75-212)||(141854-141992)
[»] scaffold0559 (2 HSPs)
scaffold0559 (1-170)||(1419-1590)
scaffold0559 (75-211)||(1233-1370)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (1-190)||(69182-69372)
scaffold0031 (25-190)||(68986-69152)
[»] scaffold0295 (2 HSPs)
scaffold0295 (1-132)||(2360-2491)
scaffold0295 (25-121)||(2234-2330)
[»] scaffold0205 (3 HSPs)
scaffold0205 (103-214)||(21006-21118)
scaffold0205 (106-211)||(21260-21366)
scaffold0205 (1-53)||(21128-21180)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (10-189)||(14451-14631)
scaffold0075 (25-91)||(14670-14736)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (1-190)||(1955-2148)
scaffold0007 (75-190)||(1790-1906)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (1-131)||(37645-37774)
scaffold0005 (25-190)||(37804-37970)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (1-135)||(139858-139992)
scaffold0020 (75-190)||(139693-139809)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (72-208)||(221794-221929)
scaffold0006 (72-212)||(222075-222216)
[»] scaffold0328 (2 HSPs)
scaffold0328 (72-212)||(11426-11567)
scaffold0328 (72-208)||(11143-11280)
[»] scaffold0388 (2 HSPs)
scaffold0388 (72-208)||(12525-12662)
scaffold0388 (72-149)||(12303-12379)
[»] scaffold0771 (2 HSPs)
scaffold0771 (80-212)||(919-1052)
scaffold0771 (164-211)||(1214-1261)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (74-209)||(2395-2531)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (72-209)||(12066-12204)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (53-190)||(239820-239958)
[»] scaffold0775 (2 HSPs)
scaffold0775 (72-149)||(5025-5102)
scaffold0775 (72-190)||(6266-6385)
[»] scaffold0707 (1 HSPs)
scaffold0707 (98-190)||(6393-6486)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (54-177)||(23265-23389)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 100)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 11674880 - 11675092
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11674880 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtccaag 11674979  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  11674980 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 11675079  T
Q  200 catcattaagcct 212  Q
    |||||||||||||    
T  11675080 catcattaagcct 11675092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 36325420 - 36325634
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36325420 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaagttagtgacgtggcagtgattaagttggtccaag 36325519  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  36325520 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagagacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 36325619  T
Q  200 catcattaagccttt 214  Q
    ||||||||| |||||    
T  36325620 catcattaaaccttt 36325634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 40775861 - 40775646
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  40775861 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgtaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 40775762  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatca 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  40775761 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattaacaattacaggaacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 40775662  T
Q  200 catcattaagcctttt 215  Q
    ||||| ||||||||||    
T  40775661 catcaataagcctttt 40775646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 44407068 - 44406864
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  44407068 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 44406969  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatca 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  44406968 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 44406869  T
Q  200 catca 204  Q
    |||||    
T  44406868 catca 44406864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 38845510 - 38845295
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  38845510 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtaacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 38845411  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatca 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||   ||| ||    
T  38845410 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggttaaaca 38845311  T
Q  200 catcattaagcctttt 215  Q
    ||||| ||| ||||||    
T  38845310 catcaataaacctttt 38845295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3041667 - 3041452
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  3041667 tattttgtcctcttcttaaggtcaaaattggaattttatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 3041568  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatca 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||  |||| ||    
T  3041567 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacatggacgaatttttaaatgccgcttaattgcaagggctaaaca 3041468  T
Q  200 catcattaagcctttt 215  Q
    ||||| ||| ||||||    
T  3041467 catcaataaacctttt 3041452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 2266678 - 2266892
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||| |||    
T  2266678 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgatgtggaagtgattaatttggtcaaag 2266777  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatca 199  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  2266778 gatcaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 2266877  T
Q  200 catcattaagccttt 214  Q
    ||||| |||||||||    
T  2266878 catcaataagccttt 2266892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 1425264 - 1425074
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  1425264 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcaatgattaagttggtcaaag 1425165  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||   | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  1425164 gactaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 1425074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 13186276 - 13186466
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||     
T  13186276 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaacttggtcaaat 13186375  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | | |||| | || |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  13186376 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacatgaaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 13186466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 36928693 - 36928882
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  36928693 tattttgtcctcttcttaaaggcaaaattggaatttcacgtgtgatagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 36928792  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaa 189  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| || | ||||||||||    
T  36928793 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcaaatacatagaccaatttttaaacgatatctaattgcaa 36928882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 12199161 - 12198971
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||    
T  12199161 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggccgtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtgacagtgattaaattggtcaaag 12199062  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| ||||||| | |||| | |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  12199061 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgattatagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 12198971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 12443589 - 12443399
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||    
T  12443589 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggccgtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtgacagtgattaaattggtcaaag 12443490  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| ||||||| | |||| | |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  12443489 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgattatagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 12443399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 23663756 - 23663566
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  23663756 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgaaatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 23663657  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||| ||||| ||  || | ||||||||| | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  23663656 gacgaaattttaaatgattaatgatttcaaggttagtttccaaggattaacgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 23663566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 38955889 - 38956079
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||    
T  38955889 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtgacagtgattaagttgatcaaag 38955988  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  || | ||||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  38955989 gactaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttacaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 38956079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 40318175 - 40317985
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  40318175 tattttgtcctcttcttaagggcaagattggaatttcatgtgtgatagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaat 40318076  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||  ||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | | ||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  40318075 gacgcaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagagacaaatttttaaacgacccctaattgcaag 40317985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 22915600 - 22915408
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||     
T  22915600 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgatttccacgtcatcaaattagtgacgtggcaatgattaaattggtcaaaa 22915501  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaa 192  Q
    ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | |||||| |||| |||||||||||||   |||||||||||||    
T  22915500 gacgaaattgtaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgattacatggaccaatttttaaatgatctctaattgcaagaa 22915408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 16388767 - 16388933
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  16388767 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 16388866  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||||| |||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  16388867 atgcaagggtaaattgccaggattagcaattacatgaaccaatttttaaatgacccctaattgcaag 16388933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 81 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23505183 - 23505051
Alignment:
Q  81 agtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacac 179  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  23505183 agtgattaatttggtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaagggtaaattgccaagattagcaattacatggacgaatttttaaatgacgc 23505084  T
Q  180 ctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23505083 ctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 23505051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 81 - 212
Target Start/End: Original strand, 23507722 - 23507854
Alignment:
Q  81 agtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacac 179  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  23507722 agtgattaatttggtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaagggtaaattgcaaggattagcaattacagggacgtatttttaaatgacgc 23507821  T
Q  180 ctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23507822 ctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 23507854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 36325371 - 36325223
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36325371 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagggacgaatttttaaa 36325272  T
Q  174 tgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagccttttataaata 222  Q
     ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36325271 cgacccctaattgtaaggactaatcacatcattaagccttttacaaata 36325223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 100 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11674807 - 11674694
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatc 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  11674807 ggacgaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagggacgaatttttaaacgacgcctaattgcaaggactaatc 11674708  T
Q  199 acatcattaagcct 212  Q
    ||||||||||||||    
T  11674707 acatcattaagcct 11674694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 34685475 - 34685664
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||     
T  34685475 tattttgtcctcttcttaaaggaaaaattagaatttcatatgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtgacagtgattaagttggtcaaat 34685574  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacaggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||| |||||||  |||| ||||||| | | |||| ||| |||||||||| ||  ||||||||||||    
T  34685575 gacgaaattttaaatgattaatgattgtaaggctagtttgcaaggattagcgaatacaagaccaatttttaaacgatccctaattgcaag 34685664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 40318205 - 40318371
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||| |||||||||||||||||  |    
T  40318205 aaattggaatttcatgtatgactgtgattgccacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtgaggagaaggacgaaattttaaatgattaaaca 40318304  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||    
T  40318305 atgcaagggtaaattgccaggattagcgattacatggactaatttttaaacaacccctaattgcaag 40318371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 35756799 - 35756990
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  35756799 tattttgtcatcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtgtggtagtgattgtcacgtcatcgtattagtgacgtggcagtgcttaagttggtcaaag 35756898  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatga-cacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| ||||||||| | ||||| ||| |||||||||| || | ||||||||||||    
T  35756899 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattaacgaatacagagaccaatttttaaacgaccccctaattgcaag 35756990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 4405873 - 4405742
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||     
T  4405873 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgtcatgtcatcaaattagtgacgtgacagtgattaagttggtcaaat 4405774  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaagg 132  Q
    ||| |||||| |||| |||||  |||||||||    
T  4405773 gacgaaatttaaaataattaatgattgcaagg 4405742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 215
Target Start/End: Original strand, 15230217 - 15230361
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| || ||||| | |||||| |||| |||||||    
T  15230217 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaagattagcgattacagggactaattttt 15230316  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcctttt 215  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  15230317 aaatgacacctaattgcaaggacaaaacacatcattaagcctttt 15230361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 31608724 - 31608604
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  31608724 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatatgtgatagtgattggcacatcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtttgtcaaat 31608625  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaa 121  Q
    ||| ||||||||||| |||||    
T  31608624 gacgaaattttaaattattaa 31608604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 31608754 - 31608920
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgatta-aca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||| |||    
T  31608754 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgccatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattagaca 31608853  T
Q  124 attgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    | ||||||| |||||||| ||||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| | ||||||||||    
T  31608854 a-tgcaagggtaaattgcaaggattagcgaatacatggaccaatttttaaacgacccttaattgcaag 31608920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 4994868 - 4994734
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||     
T  4994868 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtcattgtcacgtcatcgaattagcgacgtggtagtgattaagttggtcaaaa 4994769  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggcta 135  Q
    ||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  4994768 gacgaaattttaaataattaatgattgcaaggcta 4994734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 13186247 - 13186081
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |   |  ||| |||||||||||||||||  |    
T  13186247 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcattaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagagacgaaattttaaatgattaaaca 13186148  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||||| ||||||| |||||||| | |||||| | || |||||||||| ||  ||||||||||||    
T  13186147 atgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacatgaaccaatttttaaacgatccctaattgcaag 13186081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 39071863 - 39071697
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  39071863 aaattggaatttcatttgtgatagtgattgccacgtcgtcaaattagtgacgcggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 39071764  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||||| ||||||| |||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  39071763 atgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 39071697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 208
Target Start/End: Original strand, 10445621 - 10445758
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||    
T  10445621 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaagacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggactaattttt 10445720  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaa 208  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  10445721 aaatgacacctaattgcaaggacgaaacacatcattaa 10445758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 35756769 - 35756606
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgatt-aaca 123  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||| ||||    
T  35756769 aaattggaatttcatatatgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 35756670  T
Q  124 attgcaaggctaaattgccaggattaacaattacaggacgaatttttaaatgacacctaattgca 188  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||||   |||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  35756669 att-caaggataaattgtcaggattagtgattataagaccaatttttaaatgacccctaattgca 35756606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 44664648 - 44664508
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  44664648 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaaggttaaattgccaggattaacgattacagggactaattttt 44664549  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcc 211  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||| ||||||||    
T  44664548 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacataattaagcc 44664508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 4994898 - 4995063
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||  |   | |||| |||||| ||||||||||  |    
T  4994898 aaattggaatttcatgtatggtagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatgacatggattaagtggggagagggacgaaatttgaaatgattaaaca 4994997  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattacaggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  4994998 atgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacaggaccaatttttaaatgacccctaattgcaag 4995063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 81 - 212
Target Start/End: Original strand, 234035 - 234167
Alignment:
Q  81 agtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacac 179  Q
    ||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |    
T  234035 agtgattaagttgatcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattaacaattacagggactaatttttaaatgatgc 234134  T
Q  180 ctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  234135 ctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 234167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 81 - 212
Target Start/End: Original strand, 710446 - 710578
Alignment:
Q  81 agtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacac 179  Q
    ||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |    
T  710446 agtgattaagttgatcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattaacaattacagggactaatttttaaatgatgc 710545  T
Q  180 ctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  710546 ctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 710578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 81 - 212
Target Start/End: Original strand, 747658 - 747790
Alignment:
Q  81 agtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacac 179  Q
    ||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |    
T  747658 agtgattaagttgatcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattaacaattacagggactaatttttaaatgatgc 747757  T
Q  180 ctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  747758 ctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 747790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 81 - 212
Target Start/End: Original strand, 871553 - 871685
Alignment:
Q  81 agtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacac 179  Q
    ||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |    
T  871553 agtgattaagttgatcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattaacaattacagggactaatttttaaatgatgc 871652  T
Q  180 ctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  871653 ctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 871685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 4405903 - 4406067
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  4405903 aaatttgaatttcatgtg--acagtgattgccacgtcttcaaattagtgacgtgacagtgattaagtgggaagagggacgaaattttaaatgattaaaca 4406000  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||  || ||||||| ||||    
T  4406001 ttgcaagggtaaattgcaaggattaacaaatacatggaccaatttttaaacaacccctaattacaag 4406067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25124703 - 25124561
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||    
T  25124703 tgacttggcagtggttaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacatggactaattttt 25124604  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcctt 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||    
T  25124603 aaatgacgcctaattgcaagaacgaaatacatcattaaacctt 25124561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 36928663 - 36928501
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  36928663 aaattgaaatttcatgtatgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 36928564  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattg 186  Q
     ||||||| ||||||| |||||||| | ||||||  ||| |||||||||| ||| | ||||||    
T  36928563 atgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacatagaccaatttttaaacgacccttaattg 36928501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 2266629 - 2266481
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  2266629 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagagacgaatttttaaa 2266530  T
Q  174 tgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagccttttataaata 222  Q
    || | ||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  2266529 tgccgcctaattgcaagggctaaacacatcaataagccttttctaaata 2266481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 211
Target Start/End: Original strand, 25124849 - 25124989
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaattttt 170  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||  |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||| |||| | ||||||| ||| |||||||    
T  25124849 tgacgtggcagtgattaagttgttcaaaggatgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccagaattagcgattacagagactaattttt 25124948  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcc 211  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||    
T  25124949 aaatgacacctaattgcaaggacgaaacacatgattaagcc 25124989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Original strand, 3041716 - 3041854
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  3041716 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgagtttttaaa 3041815  T
Q  174 tgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    || | ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  3041816 tgccgcctaattgcaagagctaaacacatcaataagcct 3041854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Original strand, 38845559 - 38845697
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  38845559 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaa 38845658  T
Q  174 tgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    || | ||||||||||||  |||| ||||||| |||||||    
T  38845659 tgccgcctaattgcaagggctaaacacatcaataagcct 38845697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 42945400 - 42945542
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaattttt 170  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||||||| |||||||| | |||||||| || |||||||    
T  42945400 tgacttggcagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagagtaaattgtcaggattagcgattacaggaactaattttt 42945499  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcctt 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  42945500 aaatgacgcctaattgcaagaacgaaacacatcattaaacctt 42945542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Original strand, 35634385 - 35634526
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||| | |||||| |||| |||||||    
T  35634385 tgacgtgacagtgattaagttggttaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagggactaattttt 35634484  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    ||||||| | |||||||||| || || |||||||||||||||    
T  35634485 aaatgacgcttaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 35634526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 81 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7983559 - 7983427
Alignment:
Q  81 agtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacac 179  Q
    ||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| |    
T  7983559 agtgattaagtttttcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggactaatttttaaatgacgc 7983460  T
Q  180 ctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    ||||||||||| || || ||||| |||||||||    
T  7983459 ctaattgcaaggacgaaacacataattaagcct 7983427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 81 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 15230062 - 15229931
Alignment:
Q  81 agtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacac 179  Q
    ||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| |    
T  15230062 agtgattaagttgatcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatccaagggtaaattgccaggattagcgattacagggactaatttttaaatgacgc 15229963  T
Q  180 ctaattgcaagaactaatcacatcattaagcc 211  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  15229962 ctaattgcaaggacaaaacacatcattaagcc 15229931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 215
Target Start/End: Original strand, 8997975 - 8998119
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| || ||||| | |||||| | || |||||||    
T  8997975 tgacgtgacagtgattaagttggtcaaaggacggaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcatgattagcgattacatgaactaattttt 8998074  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcctttt 215  Q
    ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||| |||||    
T  8998075 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagtctttt 8998119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 149
Target Start/End: Original strand, 36186308 - 36186432
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  36186308 aaattggaatttcatgtgtgacactgattgtcacgtcatcaaattagtaatgtggcagtgattaagtagggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 36186407  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggatta 149  Q
     ||||| | ||||||| ||||||||    
T  36186408 atgcaaaggtaaattgtcaggatta 36186432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 76 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 8316789 - 8316674
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaat 174  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||||| | |||| |||| ||||||||||     
T  8316789 gtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattaacgaatacatggaccaatttttaaac 8316690  T
Q  175 gacacctaattgcaag 190  Q
    ||| ||||||||||||    
T  8316689 gacccctaattgcaag 8316674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 100 - 190
Target Start/End: Original strand, 35449894 - 35449985
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  35449894 ggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacatggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaag 35449985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 37542364 - 37542222
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | |||| | |||| |||||||    
T  37542364 tgacttggcggtgattaagttggtcaaagaacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattaaagggactaattttt 37542265  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcctt 213  Q
    ||||||| |||||||||||  || || ||||||||||| ||||    
T  37542264 aaatgacgcctaattgcaaagacgaaacacatcattaaacctt 37542222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Original strand, 44664794 - 44664932
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaattttt 170  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||| ||  || |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  44664794 tgacttggcaatgattaagttggtcaaataacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagagactaattttt 44664893  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaag 209  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||    
T  44664894 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaag 44664932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 6471830 - 6471693
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaattttt 170  Q
    |||||||||||||||||||||  |  || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | |||| || |||  ||||||    
T  6471830 tgacgtggcagtgattaagttgataaaaagacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattatagagactcattttt 6471731  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaa 208  Q
    ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||    
T  6471730 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaa 6471693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 75 - 211
Target Start/End: Original strand, 40775910 - 40776047
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  40775910 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgtcaggattagcaattacagggacgaatttttaaa 40776009  T
Q  174 tgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcc 211  Q
    || | ||||||||||||   ||| ||||||| ||||||    
T  40776010 tgccgcctaattgcaagggttaaacacatcaataagcc 40776047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 75 - 211
Target Start/End: Original strand, 44407117 - 44407254
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  44407117 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgctaggattagcaattacagggatgaatttttaaa 44407216  T
Q  174 tgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcc 211  Q
    || | ||||||||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  44407217 tgccgcctaattgcaagggctaaacacatcaataagcc 44407254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 12273054 - 12272939
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaat 174  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||| | ||||||| ||| ||||||||||     
T  12273054 gtggcagtgattaaattggtcaaaggacgaaattttaaatgattaataattgcaaggctagtttgcaaggattagcgattacagagaccaatttttaaac 12272955  T
Q  175 gacacctaattgcaag 190  Q
    ||  ||||||||||||    
T  12272954 gatccctaattgcaag 12272939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 190
Target Start/End: Original strand, 38862855 - 38862970
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaat 174  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | | ||||| ||| ||||||||||     
T  38862855 gtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagagaccaatttttaaac 38862954  T
Q  175 gacacctaattgcaag 190  Q
    ||| ||||||||||||    
T  38862955 gacccctaattgcaag 38862970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 31873099 - 31873017
Alignment:
Q  8 tcctcttcttaa-gggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaa 89  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  31873099 tcctcttcttaaagggaaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacatcatcaaattagtgacgtgacggtgattaa 31873017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 41353859 - 41354001
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| ||| ||||||| ||||||||   |||||| |||| |||||||    
T  41353859 tgacgtgacggtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaataatgctagggtaaattgtcaggattagtgattacagggactaattttt 41353958  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcctt 213  Q
    ||||||| |||||||  ||| || || ||||||||||||||||    
T  41353959 aaatgacgcctaattataaggacgaaacacatcattaagcctt 41354001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 76 - 188
Target Start/End: Original strand, 2535842 - 2535955
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaat 174  Q
    |||||||| |||||||  ||| | |||| |||||||||||||||||   ||| |||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  2535842 gtggcagtcattaagtgggtcaagggacgaaattttaaatgattaaactttgtaagggtaatttgccaggattaacgattacagggaccaatttttaaat 2535941  T
Q  175 gacacctaattgca 188  Q
    ||| ||||||||||    
T  2535942 gacccctaattgca 2535955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 190
Target Start/End: Original strand, 30711986 - 30712123
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaaca 152  Q
    |||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| |  || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| ||    
T  30711986 tgccacgtcagctaatcagtgatgtggcagtaattaactgggttcagggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagca 30712085  T
Q  153 attacaggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    | |||||||| |||||||||| | | |||||| |||||    
T  30712086 aatacaggaccaatttttaaacggcccctaatcgcaag 30712123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 190
Target Start/End: Original strand, 30719763 - 30719900
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaaca 152  Q
    |||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| |  || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| ||    
T  30719763 tgccacgtcagctaatcagtgatgtggcagtaattaactgggttcagggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagca 30719862  T
Q  153 attacaggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    | |||||||| |||||||||| | | |||||| |||||    
T  30719863 aatacaggaccaatttttaaacggcccctaatcgcaag 30719900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 8316830 - 8316778
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8316830 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgatt 8316778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 75 - 190
Target Start/End: Original strand, 8316879 - 8316995
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||    
T  8316879 cgtggcagtgattaagtggggagatggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacaaggaccaatttttaaa 8316978  T
Q  174 tgacacctaattgcaag 190  Q
     ||| ||||||||||||    
T  8316979 cgacccctaattgcaag 8316995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 12273095 - 12273043
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12273095 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgatt 12273043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 75 - 190
Target Start/End: Original strand, 23663805 - 23663921
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||    
T  23663805 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagagaccaatttttaaa 23663904  T
Q  174 tgacacctaattgcaag 190  Q
     ||| ||||||||||||    
T  23663905 cgacccctaattgcaag 23663921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 23698486 - 23698434
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23698486 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgatt 23698434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Original strand, 37542511 - 37542626
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaattttt 170  Q
    |||||| | |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||  ||| |||||| || ||||| || |||||||    
T  37542511 tgacgttggagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattatcagaattaacgataacaggaaccaattttt 37542610  T
Q  171 aaatgacacctaattg 186  Q
    ||||||| ||||||||    
T  37542611 aaatgacgcctaattg 37542626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21432833 - 21432695
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaattttt 170  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| ||  ||||   ||||||| ||| |||||||    
T  21432833 tgacttgggagtgattaagttagtcaaaagacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaaaattagtgattacagagactaattttt 21432734  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaag 209  Q
    | |||||  ||||||||||| || || ||||||||||||    
T  21432733 atatgacgtctaattgcaaggacgaaacacatcattaag 21432695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 76 - 149
Target Start/End: Original strand, 39071934 - 39072007
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggatta 149  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||    
T  39071934 gtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggatta 39072007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 38862814 - 38862866
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38862814 tattttgtcctcttcttaagagcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgatt 38862866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 42945254 - 42945166
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg 160  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | |  |||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  42945254 tgacttggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatataagggtaaattgtcaggattagcaattacagg 42945166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 156
Target Start/End: Original strand, 8747533 - 8747636
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaaca 152  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||  | |||| |||||||||||||||||   |||||||| ||| ||  ||||||||||     
T  8747533 tgccacgtcatcaaattactgacgtggcggtgattaagtgggttaagggacgaaattttaaatgattaatgtttgcaagggtaatttttcaggattaacg 8747632  T
Q  153 atta 156  Q
    ||||    
T  8747633 atta 8747636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 190
Target Start/End: Original strand, 12273169 - 12273260
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  12273169 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgacgggattaacgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 12273260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 190
Target Start/End: Original strand, 23698560 - 23698651
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  23698560 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattacaag 23698651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 91
Target Start/End: Original strand, 31873142 - 31873206
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagt 91  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  31873142 aaattggaatttcatgtgg--caatgattgccacgtcatcaaattagtgatgtagcagtgattaagt 31873206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 8746469 - 8746347
Alignment:
Q  67 attagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaa 165  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||  ||| |  ||| |||||||||||||||||   |||||||| ||| ||| || ||||||| ||||||| |||  |    
T  8746469 attactgacgtggcggtgattaagtgggtcaagtgacgaaattttaaatgattaaggtttgcaagggtaatttgtcacgattaacgattacagtgaccga 8746370  T
Q  166 tttttaaatgacacctaattgca 188  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  8746369 tttttaaatgacccctaattgca 8746347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 20385727 - 20385589
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaaca 152  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| |  |  || |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| ||||||| |     
T  20385727 tgccacgtcagctaatcagtgacgtggcagtaattaactgggctcagggacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcg 20385628  T
Q  153 attaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  20385627 aatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 20385589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 9337185 - 9337048
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaaca 152  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |  ||  | ||||||| | ||||||||||||   ||| |||| ||| ||||||  ||||||     
T  9337185 tgccacgtaagcaaattagtgacgtggcagtgattaactaggttgagggaccaattcttaaatgattaaactttgaaagggtaatttgccaaaattaacg 9337086  T
Q  153 attac-aggacgaatttttaaatgacacctaattgcaa 189  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||  ||||||||||    
T  9337085 attacaaggaccaattttaaaatgacctctaattgcaa 9337048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 215
Target Start/End: Original strand, 38003747 - 38003836
Alignment:
Q  127 gcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcctttt 215  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||| ||  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||    
T  38003747 gcaagggtaaattgccaggattagcgattacagagactaatttttaaattacgactaattgcaaggacgaaacacatcattaaacctttt 38003836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 23698445 - 23698329
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaat 174  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||  |||| || |||| | |||||| |||| ||||||||||     
T  23698445 gtggcagtgattaaattggtcaaaggacgaaattttaactgattaatgattgcaaggctagtttgcaagaattagcgattacagggactaatttttaaac 23698346  T
Q  175 ga-cacctaattgcaag 190  Q
    || | ||||||||||||    
T  23698345 gaccccctaattgcaag 23698329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 39071893 - 39071945
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||    
T  39071893 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaattttatatgtggcagtgatt 39071945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 81 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 41353705 - 41353577
Alignment:
Q  81 agtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatgacac 179  Q
    ||||||||||||  || || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||  ||||||| | |||||||  || |||||||||||||| |    
T  41353705 agtgattaagttgctcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgttaggattagcgattacagaaactaatttttaaatgacgc 41353606  T
Q  180 ctaattgcaagaactaatcacatcattaa 208  Q
    ||||||| ||| || || || ||||||||    
T  41353605 ctaattgtaaggacgaaacatatcattaa 41353577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 190
Target Start/End: Original strand, 1425313 - 1425428
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacaggacgaatttttaaat 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | |||| || ||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||     
T  1425313 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaggggtaaattgccaggattagtgattacaggaccaatttttaaac 1425412  T
Q  175 gacacctaattgcaag 190  Q
    |||  |||||| ||||    
T  1425413 gacctctaattacaag 1425428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 148
Target Start/End: Original strand, 6471985 - 6472052
Alignment:
Q  81 agtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggatt 148  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||    
T  6471985 agtgattaagttggtcaaaggacaaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggatt 6472052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 8997942 - 8997859
Alignment:
Q  126 tgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaa 208  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||    
T  8997942 tgcaagggtaaattgtcaggattagcgattgcagggactaatttttaaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaa 8997859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 190
Target Start/End: Original strand, 20386746 - 20386837
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||| ||||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  20386746 ggacgaaattttaaatgattaataattgcgaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 20386837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 190
Target Start/End: Original strand, 10749833 - 10749915
Alignment:
Q  109 tttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||||| ||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  10749833 tttaagtgattaacgtttgcaagggtaatttgacaggattaacgattacatggaccaatttttaaatgatccctaattgcaag 10749915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 39474681 - 39474600
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca 158  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||    
T  39474681 gtggcagtgattaagttggtcaaag-acgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaagattagcgattaca 39474600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 16388738 - 16388686
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16388738 tattgtgtcctcttcttaagtgcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgatt 16388686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 36186278 - 36186226
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  36186278 tattttgtcctcttcttaagtgcaaaattgatatttcatgtgggacagtgatt 36186226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 190
Target Start/End: Original strand, 34061616 - 34061735
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||  | |||||||  || |||| ||||||| | | |||| |||  |||||||    
T  34061616 tgacatggcagtgattaacttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaagaatgcaagggcaatttgcaaggattagcgaatacatggatcaattttt 34061715  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||  |||||||||||    
T  34061716 aaacgacgtctaattgcaag 34061735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 211
Target Start/End: Original strand, 6472395 - 6472441
Alignment:
Q  165 atttttaaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcc 211  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  6472395 atttttaaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcc 6472441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 190
Target Start/End: Original strand, 22915680 - 22915765
Alignment:
Q  106 aattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | |||||| |||| |||||||||| ||  |||| |||||||    
T  22915680 aattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaagattagcgattacatggaccaatttttaaacgatccctagttgcaag 22915765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 105 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 11761947 - 11761863
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatgacacctaattgca 188  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||  || ||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  11761947 aaattttaaatgattaacgtttgcaggggcaatttgacaagattaacgattacagagacgaatttttaaataatccctaattgca 11761863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 158
Target Start/End: Original strand, 21432981 - 21433065
Alignment:
Q  74 acgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca 158  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||| | ||| |||||||||||  | ||||||| ||||||| ||  |||||| ||||||    
T  21432981 acgtgtcagtgattaagttggtcaaaggacgacattgtaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaaaattaacgattaca 21433065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 95)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 32680806 - 32680594
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32680806 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtccaag 32680707  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatca 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  32680706 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgtcaggattagcaattacaggaacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 32680607  T
Q  200 catcattaagcct 212  Q
    |||||||||||||    
T  32680606 catcattaagcct 32680594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 34928861 - 34928648
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  34928861 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacaatgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 34928762  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatca 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  34928761 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 34928662  T
Q  200 catcattaagcctt 213  Q
    ||||| ||||||||    
T  34928661 catcaataagcctt 34928648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 30948371 - 30948181
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  30948371 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtaacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 30948272  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  30948271 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaag 30948181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 39686745 - 39686555
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  39686745 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacggtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 39686646  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  39686645 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaag 39686555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 27991925 - 27992115
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  27991925 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 27992024  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  27992025 gactaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 27992115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 17102206 - 17102396
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  17102206 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccacgtcataaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 17102305  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  17102306 gactaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgctaggattagcgaatacatggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 17102396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 2640389 - 2640203
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  2640389 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 2640290  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaatttttaaatgacacctaattg 186  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||||| | | |||||| || |||||||||| ||| ||||||||    
T  2640289 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagcgaatacaggtaccaatttttaaacgacccctaattg 2640203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 22871519 - 22871360
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||    
T  22871519 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgttgcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaaattggtcaaag 22871420  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg 160  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||   |||| ||||||| | ||||||||    
T  22871419 gacgaaattttaaatgattaataattgcaagactggtttgcaaggattagcgattacagg 22871360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 42731636 - 42731784
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  42731636 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgggagtgattgccacgtcattgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 42731735  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggatta 149  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||| |||||||    
T  42731736 gacgaaattttaaatgattaataattgcaaagctagcttgcaaggatta 42731784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 28469249 - 28469415
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  28469249 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggtagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 28469348  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  28469349 atgcaagggtaaattgccaggattaacgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 28469415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 32053354 - 32053206
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||     
T  32053354 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcaagtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgatgtggcagtgattaagttggtcaaaa 32053255  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggatta 149  Q
    ||  |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||    
T  32053254 gatgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggatta 32053206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 48789014 - 48788822
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| ||     
T  48789014 tattttgtcctcttcttaagtgcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtgacactgattaagttggtcaaat 48788915  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaa 192  Q
    ||  |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  48788914 gatgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaagaa 48788822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 6253657 - 6253847
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  6253657 tattttgtcctctacttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgtcatgtcatcaaattagtgacgtgacagtgattaagttggtcaaag 6253756  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||| ||   |||| ||||||| | | ||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  6253757 gactaaattttaaatgattaatgattgcaagacttgtttgcaaggattagcgaatacaaggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 6253847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 19204675 - 19204861
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||     
T  19204675 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaaattggtcaaat 19204774  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattg 186  Q
    ||  ||||||||||| |||||  ||||||| ||||  |||| ||||||| | |||||| | || ||||||||||  || ||||||||    
T  19204775 gatgaaattttaaataattaatgattgcaaagctagtttgcaaggattagcgattacatgaaccaatttttaaaccacccctaattg 19204861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 28469220 - 28469031
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||    
T  28469220 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcacgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacg-ggcaatgattaagttggtcaaag 28469122  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaac-aattacaggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | |||   ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  28469121 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaagattagcgaatataaggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 28469031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 37657067 - 37657198
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  37657067 tattttgtcttcttcttaagggcaaaattggaatttcacgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagcgacgtgtcagtgattaagttggtcaaag 37657166  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaagg 132  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  37657167 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaagg 37657198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Original strand, 32680855 - 32680993
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  32680855 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacatggacgaatttttaaa 32680954  T
Q  174 tgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
     ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32680955 cgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 32680993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 3914355 - 3914503
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||     
T  3914355 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccatgtcatcgaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaat 3914454  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggatta 149  Q
    ||  |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||    
T  3914455 gatgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggatta 3914503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 10936011 - 10936201
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtcc-aa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||    
T  10936011 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtaatgattgtcacgtcatctaattagtgacgcggcaatgattaagtt-gtccaaa 10936109  T
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | | ||| ||||| ||||||||||  || ||||||||||||    
T  10936110 ggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacaaggaccaatttttaaacaacccctaattgcaag 10936201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 212 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 37351223 - 37351134
Alignment:
Q  212 ttttataaatatccaaaattagaagagataagtaaacacattaagaccaagacttaacactacactacaccttagaattttgaaaatact 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37351223 ttttataaatatccaaaattagaagagataagtaaacacattaagaccaagacttaacattacactacaccttagaattttgaagatact 37351134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 10935981 - 10935815
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      | |||| |||||||||||||||||  |    
T  10935981 aaattggaatttcatgtatggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggagagagggacgaaattttaaatgattaaaca 10935882  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  10935881 atgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 10935815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 42019808 - 42019618
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||| |||    
T  42019808 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttaatgtgtggtagtgattgccacatcatcgaattagtgacgtagcagtgattaatttggtcaaag 42019709  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     || |||||||||||||||||  ||| ||| ||||  |||| ||||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| | ||||||||||    
T  42019708 aacgaaattttaaatgattaatgattacaaagctagtttgcaaggattagcgaatacatggaccaatttttaaacgacccttaattgcaag 42019618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 42731606 - 42731440
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  42731606 aaattggaatttcatgtatggcagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 42731507  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     |||| || |||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  42731506 atgcaggggtaaattgccaggattagcgattacaaggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 42731440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 186
Target Start/End: Original strand, 32053384 - 32053546
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  32053384 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccatgtcatcaaattagtgacgtgacagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 32053483  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaatttttaaatgacacctaattg 186  Q
     ||||| | |||||||| ||||||||| |||| ||| || |||||||||| ||  ||||||||    
T  32053484 atgcaatgataaattgctaggattaacgattataggaaccaatttttaaacgatccctaattg 32053546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 72 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32934488 - 32934338
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaattttt 170  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  32934488 tgacttggtagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagcgactaattttt 32934389  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagccttttataaat 221  Q
    |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||||||||||    
T  32934388 aaatgacacctaattgcaaggatgaaacacatcattaaaccttttataaat 32934338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 40379956 - 40379790
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  40379956 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcattgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 40379857  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     | ||| | |||||||| ||||||| | | ||| | ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  40379856 atacaaaggtaaattgcaaggattagcgaatacaaagaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 40379790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 189
Target Start/End: Original strand, 23181235 - 23181400
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||      | |||| |||||||||||||||||  |    
T  23181235 aaattggaatttcatgtatgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatgacagtgattaagtggagagagggacgaaattttaaatgattaaaca 23181334  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaa 189  Q
     ||||||| |||||||||| ||||| | |||||| |||| ||| |||||| ||| |||||||||||    
T  23181335 atgcaagggtaaattgccaagattagcgattacatggaccaatatttaaacgacccctaattgcaa 23181400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 25628618 - 25628481
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaattttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | ||||| | ||| |||||||    
T  25628618 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattatcgattacaatgactaattttt 25628519  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaa 208  Q
    ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||    
T  25628518 aaatgacgcctaattgcaagcacgaaacacatcattaa 25628481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 208
Target Start/End: Original strand, 42618197 - 42618334
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaattttt 170  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | |||||||| || |||||||    
T  42618197 tgacgtgacagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacaggaactaattttt 42618296  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaa 208  Q
    ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||    
T  42618297 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaa 42618334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 43266406 - 43266265
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  43266406 tgacgtgacagtgattaagttggtcaaatgatgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattaacgattacatggactaattttt 43266307  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  43266306 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 43266265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 214
Target Start/End: Original strand, 30948420 - 30948560
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  30948420 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaa 30948519  T
Q  174 tgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagccttt 214  Q
    || | ||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||    
T  30948520 tgccgcctaattgcaagggctaaacacatcaataagccttt 30948560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 211
Target Start/End: Original strand, 32068382 - 32068522
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||| | |||||| |||  |||||||    
T  32068382 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattggcaggattagcgattacagggattaattttt 32068481  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcc 211  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  32068482 aaatgactcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcc 32068522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 22081699 - 22081560
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacaggacgaattttta 171  Q
    |||| ||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||    
T  22081699 tgacttggcagtgattaagttgatcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccagcattagcgattagaggactaattttta 22081600  T
Q  172 aatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcc 211  Q
    |||||| | |||||||||| || || ||||||||||||||    
T  22081599 aatgacgcataattgcaaggacgaaacacatcattaagcc 22081560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 221
Target Start/End: Original strand, 39686794 - 39686941
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  39686794 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaa 39686893  T
Q  174 tgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagccttttataaat 221  Q
    || | ||||||||||||  |||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  39686894 tgccgcctaattgcaagggctaaacacatcaataagcctattataaat 39686941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 23058715 - 23058857
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaattttt 170  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||    
T  23058715 tgacgtggcagtaattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcgagggtaaattgccaggattaacgattacaaggattaattttt 23058814  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcctt 213  Q
    ||||||| || ||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  23058815 aaatgacgccgaattgcaaggacgaaacacatcattaagcctt 23058857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 24389006 - 24388840
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||| |||||||  |    
T  24389006 aaattggaatttcatatgtgacagtgattgccacgtcatcaaattggtgatgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaagtgattaaaca 24388907  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     | ||||| |||||||||| ||||| | | ||||| ||| |||||||||| ||| | ||||||||||    
T  24388906 atacaagggtaaattgccatgattagcgaatacagagaccaatttttaaacgacccataattgcaag 24388840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 27396836 - 27397002
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  27396836 aaattggaatttcatgtgtaacagtgattgacacgtcatcaaattcttgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 27396935  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||  | | ||||| |||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  27396936 atgcagtggtgaattgtcaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 27397002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28890719 - 28890577
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaattttt 170  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| ||||||| | ||||| ||||| |||||||    
T  28890719 tgacgtgacagtgattaagttagtcaaaagacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgctaggattagcgattacaaggactaattttt 28890620  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcctt 213  Q
    |||||||  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  28890619 aaatgacgtctaattgcaaggacgaaacacatcattaaacctt 28890577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 42019838 - 42020004
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |  ||| ||||||||||| |||||  |    
T  42019838 aaattggaatttcatgtatgacagtgattaccacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtgaggagagagacgaaattttaaataattaaaca 42019937  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||||  |||||||||| ||||| | |||| ||| || ||||||||||  || ||||||||||||    
T  42019938 atgcaagagtaaattgccaagattagcgattataggaaccaatttttaaacaacccctaattgcaag 42020004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 80 - 212
Target Start/End: Original strand, 33828268 - 33828401
Alignment:
Q  80 cagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatgaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  33828268 cagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagagactaatttttaaatgaca 33828367  T
Q  179 cctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    |||||||||||| || || | |||||||||||||    
T  33828368 cctaattgcaaggacgaaactcatcattaagcct 33828401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 45010812 - 45010893
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcag 82  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45010812 tattttgtcctcttcttaaaggcaaaattggaatttcatgtgtggcaatgattgctacgtcatcaaattagtgacgtggcag 45010893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 72 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 25453268 - 25453128
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||| | |||| | |||| |||||||    
T  25453268 tgacttggtagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaataatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattatagggactaattttt 25453169  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcc 211  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  25453168 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcc 25453128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 81 - 212
Target Start/End: Original strand, 43266561 - 43266693
Alignment:
Q  81 agtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacac 179  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| ||| |||| | |||||| |||| |||||||||||||| |    
T  43266561 agtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcagaattagcgattacatggactaatttttaaatgacgc 43266660  T
Q  180 ctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  43266661 ctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 43266693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Original strand, 34928910 - 34929048
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  34928910 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaa 34929009  T
Q  174 tgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    || | ||||||||||||  |||| ||||||| |||||||    
T  34929010 tgccgcctaattgcaagggctaaacacatcaataagcct 34929048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 185
Target Start/End: Original strand, 2640419 - 2640580
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |   |  ||| |||||||||||||||||  |    
T  2640419 aaattggaatttcatgtatggcagggattgccacgtcatcaaattagtgacatgacagtgattaagtggggagagagacgaaattttaaatgattaaaca 2640518  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatgacacctaatt 185  Q
     ||||||| ||||||||||| |||| | ||||||| | | |||||||||| ||| |||||||    
T  2640519 atgcaagggtaaattgccagaattagcgattacagaggccaatttttaaacgacccctaatt 2640580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 32068236 - 32068099
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaattttt 170  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||    
T  32068236 tgacttggcattgattaagttggtcaaagtacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacaaggactaattttt 32068137  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaa 208  Q
    |||||||  ||||||||||| || || |||||||||||    
T  32068136 aaatgacgtctaattgcaaggacgaaacacatcattaa 32068099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 3914325 - 3914229
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaa 121  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   | |||| |||||||||||||||||    
T  3914325 aaattggaatttcatgtatgacagtgattatcacgtcatcaaattagtgatgtggcagtgattaagttggaagagggacgaaattttaaatgattaa 3914229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 75 - 214
Target Start/End: Original strand, 32934637 - 32934777
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaatttttaaa 173  Q
    |||| ||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | || |||  ||||||| |||||||| | |||||||| || ||||||||||    
T  32934637 cgtgacagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgtaagagtaaattgtcaggattagcgattacagggactaatttttaaa 32934736  T
Q  174 tgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagccttt 214  Q
    |||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  32934737 tgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagccttt 32934777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 42618051 - 42617911
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    |||| ||| ||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||| | |||| | |||| |||||||    
T  42618051 tgacttggtagtgattaagttgatcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattaaagggactaattttt 42617952  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcc 211  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  42617951 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcc 42617911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 60 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 17885780 - 17885649
Alignment:
Q  60 tcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca- 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||   | ||||     
T  17885780 tcatcaaattagtgacgtggcagtgattaactgggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagagaatacag 17885681  T
Q  159 ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  17885680 ggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 17885649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 72 - 202
Target Start/End: Original strand, 18087626 - 18087757
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaattttt 170  Q
    |||||||||||| |||||||  ||  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  18087626 tgacgtggcagtcattaagtgggttaagggacaaaattttaaatgattaataattgcaaggctattttgcaaggattagcgattacagtgaccaattttt 18087725  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacat 202  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  18087726 aaatgacccctaattgcaaggactaaacacat 18087757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 80 - 217
Target Start/End: Original strand, 25628772 - 25628910
Alignment:
Q  80 cagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||| | ||||||  ||| ||||||||||||||     
T  25628772 cagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacatagactaatttttaaatgacg 25628871  T
Q  179 cctaattgcaagaactaatcacatcattaagccttttat 217  Q
    | |||||||||| || |  |||||||||||| |||||||    
T  25628872 cataattgcaaggacgagacacatcattaagtcttttat 25628910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 80 - 208
Target Start/End: Original strand, 10600243 - 10600372
Alignment:
Q  80 cagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaatgaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||     
T  10600243 cagtgattaagttggtcaaaggacaaaattttgaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacaaggactaatttttaaatgacg 10600342  T
Q  179 cctaattgcaagaactaatcacatcattaa 208  Q
    |||||||||||  || || |||||||||||    
T  10600343 cctaattgcaatgacgaaacacatcattaa 10600372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 211
Target Start/End: Original strand, 22081845 - 22081985
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaattttt 170  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | |||||||  || |||||||    
T  22081845 tgacttggcaatgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagaaactaattttt 22081944  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcc 211  Q
    ||||||| | |||||||||| || || || |||||||||||    
T  22081945 aaatgacgcataattgcaaggacgaaacaaatcattaagcc 22081985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 23058557 - 23058429
Alignment:
Q  84 gattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacaccta 182  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||| | || |||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||| | ||    
T  23058557 gattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaatggtatattgccaggattagtaattacagggactaatttttaaatgactctta 23058458  T
Q  183 attgcaagaactaatcacatcattaagcc 211  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||    
T  23058457 attgcaaggacgaaacacatcattaagcc 23058429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 161
Target Start/End: Original strand, 48789044 - 48789180
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| || || |||| ||||  |   | |||  |||||||||||||||||  |    
T  48789044 aaattggaatttcatgtatgacagtgatcgccacatcatcaaattagtgacatgacaatgatcaagtggggagagggatgaaattttaaatgattaaaca 48789143  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagga 161  Q
     ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  48789144 atgcaagggtaaattgccagaattaacgattacagga 48789180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 37657037 - 37656873
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |   | |||| ||||||||||| | |||  |    
T  37657037 aaattggaatttcatgtg--acagtaattgccacgtcatcaaattagtgacgtgccggtgattaagtggggagagggacgaaattttaaataaataaaca 37656940  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||||  |||||||| ||||||| | ||||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||||||    
T  37656939 atgcaagcgtaaattgcgaggattagcgattacagagaccaatttttaaacgattcctaattgcaag 37656873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 45010782 - 45010652
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  45010782 aaattggaatttcatgtgtgacaatgattgcca---catcaaattagtgacttggcagtgattaagtggggagatggacgaaattttaaatgattaaaca 45010686  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca 158  Q
     ||||||  |||||||||| ||||| | ||||||    
T  45010685 atgcaagcgtaaattgccaagattagcgattaca 45010652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 27138227 - 27138369
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaattttt 170  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||| ||| |  |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||| | ||||| ||||| |||||||    
T  27138227 tgacttggcggtgattaagttggtcaaagaaagaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacaaggactaattttt 27138326  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcctt 213  Q
    ||||||| ||| |||| ||| || || ||||||||||||||||    
T  27138327 aaatgacgcctgattgaaaggacgaaacacatcattaagcctt 27138369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 46205595 - 46205737
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaattttt 170  Q
    |||||||  |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||| || ||| |||    
T  46205595 tgacgtgatagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaatttgtcaggattaacgattacaggaaccaatcttt 46205694  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcctt 213  Q
    ||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  46205695 aaatgatcattaattgcaagaacgaaacacatcattaaacctt 46205737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 190
Target Start/End: Original strand, 13386016 - 13386154
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaaca 152  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| |     
T  13386016 tgccacctcatcagattagtgacatggcagtgattaactgggtcaaaggataaaattttaaatgattaaacattgcaaggctagtttgcaaggattagcg 13386115  T
Q  153 attaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    | || | |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  13386116 aatatagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 13386154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 190
Target Start/End: Original strand, 24389078 - 24389192
Alignment:
Q  77 tggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatg 175  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||| ||||||| | | |||| |||| |||||||||| |    
T  24389078 tggcagtgattaagttggtcaaaggacaaaattttaaatgattaatgattgcaatgctagtttgcaaggattagcgaatacatggaccaatttttaaacg 24389177  T
Q  176 acacctaattgcaag 190  Q
    || ||||||||||||    
T  24389178 acccctaattgcaag 24389192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 39275011 - 39274873
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaa-ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttt 169  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||  | ||||| | |||||| | ||||||| | ||||||| ||| ||||||    
T  39275011 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaaaggtaaattactaggattagcgattacagagactaatttt 39274912  T
Q  170 taaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaa 208  Q
    ||||| || || ||||||||| || || |||||||||||    
T  39274911 taaataacgccaaattgcaaggacaaaacacatcattaa 39274873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 46204554 - 46204424
Alignment:
Q  79 gcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaatttttaaatgac 177  Q
    |||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||| ||  | ||||| | ||||||| |||| ||| | |||||||| || ||||||||||||||    
T  46204554 gcagtgattaagttggtcaatggacgaaattttaaatgataaaataatgcaatggtaaattgtcaggtttagcgattacagggactaatttttaaatgac 46204455  T
Q  178 acctaattgcaagaactaatcacatcattaa 208  Q
     |||||||||||| || || |||||||||||    
T  46204454 gcctaattgcaaggacgaaacacatcattaa 46204424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 168
Target Start/End: Original strand, 6571240 - 6571332
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacaggacgaattt 168  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| || |||||| | |||| ||| |||||    
T  6571240 gtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaataattgcaaggctagtttgcaagaattaacgagtacatgaccaattt 6571332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 100 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 6571125 - 6571034
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  6571125 ggacaaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattaacgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 6571034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 190
Target Start/End: Original strand, 17886778 - 17886897
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| | |||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||  |||| ||||||||| | |||| |||  |||||||    
T  17886778 tgacgtggcagtgattaagtgggtcaagggacgaaattttaaatgattaatatttgcaagggtagtttgcaaggattaacgaatacatggatcaattttt 17886877  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||||||  ||||||||||||    
T  17886878 aaatgatccctaattgcaag 17886897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 100 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18086401 - 18086298
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatc 198  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |    
T  18086401 ggacgaaattttaagtgattaataattgcaaggctaatttgcaaggattatcgtttacagggaccaatttttaaacgactcctaattgcaaggactaaac 18086302  T
Q  199 acat 202  Q
    ||||    
T  18086301 acat 18086298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 190
Target Start/End: Original strand, 32688506 - 32688625
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaattttt 170  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| | |||| ||||||||||||||||| | ||||||||  || ||| |||||||| | ||||| ||||| || ||||    
T  32688506 tgacgtggcagttattaagtgggtcaagggacgaaattttaaatgattaatatttgcaagggcaatttgtcaggattagcgattacaaggaccaaatttt 32688605  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  32688606 aaatgacccctaattgcaag 32688625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 190
Target Start/End: Original strand, 5457176 - 5457314
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaaca 152  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |  |   | |||| |||||||||||||||||  |||| |||| ||| |||| |||||||||     
T  5457176 tgccacgtcagctaatcagtgacgtggcagtgattaactgggatgagggacgaaattttaaatgattaaacattgaaagggtaatttgcaaggattaacg 5457275  T
Q  153 attac-aggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    | ||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  5457276 aatacaaggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 5457314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 190
Target Start/End: Original strand, 22871598 - 22871684
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| ||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22871598 aaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgcaaggattagctattacagggaccaatttttaaatgacccctaattgcaag 22871684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 100 - 188
Target Start/End: Original strand, 18855970 - 18856059
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgca 188  Q
    |||| |||||||||||||||||   |||||||| ||| |||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  18855970 ggacgaaattttaaatgattaaactttgcaagggtaatttgccaagattaacgattacagggaccaatttttaaatgacccctaattgca 18856059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 72 - 208
Target Start/End: Original strand, 25453414 - 25453551
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||| ||||||||||||  | ||||||| |||||||| ||||||| | ||| || |||| |||||||    
T  25453414 tgacgtggcggtgattaagctggtcaaaggacgaaatgttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgctaggattagcgatttcagggactaattttt 25453513  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaa 208  Q
    ||||||| | ||||| |||  || || |||||||||||    
T  25453514 aaatgacgcttaattacaaagacgaaacacatcattaa 25453551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 42362564 - 42362471
Alignment:
Q  98 aaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||| ||||||||| | ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  42362564 aaggacgaaattttaaatgattaaagaatgcaagggtaatttgcaaggattaacgaatacaaggaccaatttttaaacgacacctaattgcaag 42362471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 6571199 - 6571251
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  6571199 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtgtggcagtgatt 6571251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 190
Target Start/End: Original strand, 13050104 - 13050188
Alignment:
Q  108 ttttaaatgattaa-caattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||| || ||||||||||||    
T  13050104 ttttaaatgattaaacaattgcaagggtaaattaccaggattaacgattacagggacgaaatttaaaattacgcctaattgcaag 13050188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 91
Target Start/End: Original strand, 13311277 - 13311340
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagt 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  13311277 aaattggaatttcatgtgtggcagtgattgtcacgtcatcaaatta---atgtggcagtgattaagt 13311340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 17102157 - 17102041
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | |||| || |||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||    
T  17102157 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaggggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaa 17102058  T
Q  174 tgacacctaattgcaag 190  Q
     ||| ||||||||||||    
T  17102057 cgacccctaattgcaag 17102041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 190
Target Start/End: Original strand, 32298996 - 32299112
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||| |||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||    
T  32298996 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttcaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaa 32299095  T
Q  174 tgacacctaattgcaag 190  Q
     ||| ||||||||||||    
T  32299096 cgactcctaattgcaag 32299112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 32687504 - 32687392
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatcacatc 203  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||  || |||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||| ||||||| |||| || || |||||     
T  32687504 aaattttaaatgattaatatttgcaagggcaatttgccaggattaacgattacagggaccaaattttaaatgacccctaattacaaggacaaaacacata 32687405  T
Q  204 attaagcctttta 216  Q
     | ||||||||||    
T  32687404 ttaaagcctttta 32687392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 6253583 - 6253492
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||| || |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  6253583 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaggggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 6253492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 161
Target Start/End: Original strand, 12229342 - 12229449
Alignment:
Q  54 gccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaa 153  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||  | |||| ||||||| |||||||||   |||||||  ||| ||| ||||||||||||    
T  12229342 gccacgtcatcaaattaatgacgtggcagtcattaagtgggttaagggacgaaatttttaatgattaaactttgcaagaataatttgtcaggattaacaa 12229441  T
Q  154 ttacagga 161  Q
    ||| ||||    
T  12229442 ttatagga 12229449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 19204601 - 19204510
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  19204601 ggacaaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccagaattaacgattacagggaccaatttttaaacgacccctaatttcaag 19204510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10600102 - 10600020
Alignment:
Q  136 aattgccaggattaacaattacagg-acgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagccttttat 217  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||| |||| |||||    
T  10600102 aattgccaggattaacgattatagggactaatttttaaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcatttagccatttat 10600020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 24389036 - 24389088
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24389036 tattttgtcatcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtatggcagtgatt 24389088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 32298943 - 32298895
Alignment:
Q  5 ttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  32298943 ttgtcctcttcttaagggcaaaaatggaatttcatgtgtggcagtgatt 32298895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 190
Target Start/End: Original strand, 22828087 - 22828225
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaaca 152  Q
    |||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||  ||  |  ||  |||||||||||||||||   ||||| || ||| ||| || |||||||     
T  22828087 tgccacgtcatcaaattactaacatggcggtgattaagtgggttaagtgatgaaattttaaatgattaaggtttgcaggggtaatttgtcaagattaacg 22828186  T
Q  153 attaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22828187 attacaaggaccaatttttaaatgacccctaattacaag 22828225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 190
Target Start/End: Original strand, 16803967 - 16804052
Alignment:
Q  106 aattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| ||||||  | |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  16803967 aattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgctaggattggcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 16804052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 27396806 - 27396754
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27396806 tattttgtcatcttcttaagggcagaattggaattttatgtgtggcagtgatt 27396754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 27991876 - 27991760
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | |||| || |||||||||||||||| | |||||| |||  ||||| ||||    
T  27991876 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaggggtaaattgccaggattagcgattacagggatcaatttctaaa 27991777  T
Q  174 tgacacctaattgcaag 190  Q
     ||| ||||||||||||    
T  27991776 cgacccctaattgcaag 27991760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 27396765 - 27396650
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaat 174  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| ||||||| | | |||| |||| ||||||||||     
T  27396765 gtggcagtgattaagttggtcaaatgatgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgaatacatggaccaatttttaaac 27396666  T
Q  175 gacacctaattgcaag 190  Q
    | | ||||||| ||||    
T  27396665 ggcccctaattacaag 27396650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 190
Target Start/End: Original strand, 40380000 - 40380091
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||  | | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  40380000 ggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattggcgaatacatggaccaatttttaaacgactcctaattgcaag 40380091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 13044807 - 13044693
Alignment:
Q  77 tggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaatg 175  Q
    |||||||||||||||| ||  | |||| || ||||||||||||||  | ||||| | ||||||| ||||| || | |||||  ||||||| |||||||||    
T  13044807 tggcagtgattaagtttgttaagggacgaatttttaaatgattaaacaatgcaatggtaaattgtcaggagtagcgattactgggacgaaattttaaatg 13044708  T
Q  176 acacctaattgcaag 190  Q
     | ||||||||||||    
T  13044707 gcgcctaattgcaag 13044693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 190
Target Start/End: Original strand, 45010921 - 45011011
Alignment:
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| ||||||| | | |||| | || |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  45010921 gacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgcaaggattagcgaatacatgaaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 45011011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 23608881 - 23608817
Alignment:
Q  139 tgccaggattaacaattacagg-acgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatcacat 202  Q
    |||||||||||| || |||||| || |||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||    
T  23608881 tgccaggattaagaaatacagggaccaatttttaaatgacccctatttgcaaggactaaacacat 23608817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 100)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36314509 - 36314297
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36314509 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtccaag 36314410  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  36314409 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 36314310  T
Q  200 catcattaagcct 212  Q
    |||||||||||||    
T  36314309 catcattaagcct 36314297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 48322588 - 48322376
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48322588 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtccaag 48322489  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||    
T  48322488 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgatgtctaattgcaaggactaatca 48322389  T
Q  200 catcattaagcct 212  Q
    |||||||||||||    
T  48322388 catcattaagcct 48322376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 10770701 - 10770493
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  10770701 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacggtgattgccacgtcatcaaattagtgatgtggcagtgattaagttggtccaag 10770602  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  10770601 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 10770502  T
Q  200 catcattaa 208  Q
    |||||||||    
T  10770501 catcattaa 10770493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 54466609 - 54466813
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  54466609 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 54466708  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatca 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  54466709 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattaccaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 54466808  T
Q  200 catca 204  Q
    |||||    
T  54466809 catca 54466813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 8041802 - 8042006
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  8041802 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgtaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttgttccaag 8041901  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatca 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  8041902 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatatttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 8042001  T
Q  200 catca 204  Q
    |||||    
T  8042002 catca 8042006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 23458190 - 23458000
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  23458190 tattttgtcctcttcttaagagaaaaattggaatttcatgtgtgatagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 23458091  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| | ||||||||||    
T  23458090 gacgaaattttaaatgattaattattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccttaattgcaag 23458000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 36417905 - 36418095
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  36417905 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagtttgtcaaag 36418004  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | | |||||| || |||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  36418005 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacaggaaccaatttttaaacgacccctaattacaag 36418095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 46474998 - 46475183
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  46474998 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 46475097  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacaggacgaatttttaaatgacacctaattg 186  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | | ||||| |  |||||||||| ||| ||||||||    
T  46475098 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagtatcaatttttaaacgacccctaattg 46475183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 43384500 - 43384690
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  43384500 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 43384599  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||  |||| ||||||||| | || || ||| |||||||||| ||  ||||||||||||    
T  43384600 gacgaaattttaaatgactaatgattgcaaggctagtttgcaaggattaacgaatatagagacaaatttttaaacgattcctaattgcaag 43384690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 33689591 - 33689403
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  33689591 tattttgtcctcttcttaagg-caaaattggaatttcatgtgtgatagtgattgtcacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 33689493  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacaggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| || |||| | | |||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  33689492 gacaaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaagaattagcgaatacatgaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 33689403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 19741134 - 19740946
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||    
T  19741134 tattttgtcctcttcttaaaggtaaaattggaatttcatgtgtgccagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcaatgattaaattggtcaaag 19741035  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgca 188  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||  ||||||||||    
T  19741034 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgatccctaattgca 19740946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 55052490 - 55052359
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  55052490 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtttgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 55052391  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaagg 132  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  55052390 gactaaattttaaatgattaatgattgcaagg 55052359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Original strand, 48322637 - 48322775
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48322637 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagggacgaatttttaaa 48322736  T
Q  174 tgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
     ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48322737 cgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcct 48322775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 211
Target Start/End: Original strand, 36314558 - 36314695
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36314558 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagggacgaatttttaaa 36314657  T
Q  174 tgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcc 211  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36314658 cgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcc 36314695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 75 - 208
Target Start/End: Original strand, 10770751 - 10770885
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10770751 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagggacgaatttttaaa 10770850  T
Q  174 tgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaa 208  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  10770851 tgacgcctaattgtaaggactaatcacatcattaa 10770885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 72 - 217
Target Start/End: Original strand, 37778559 - 37778705
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  37778559 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggatgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcaattacagggactaattttt 37778658  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagccttttat 217  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  37778659 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagccttttat 37778705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 189
Target Start/End: Original strand, 33689620 - 33689785
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  33689620 aaattggaatttcatgtatgacagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaata 33689719  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaa 189  Q
     ||||||| |||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||| ||| |||||||||||    
T  33689720 atgcaagggtaaattgccaggattagcgattacatgaaccaatttttaaacgacccctaattgcaa 33689785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 23458220 - 23458386
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  23458220 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattggcacgtcatcaaattagtgatgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 23458319  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||||| |||||||| ||||||| | ||||||| ||| |||||||||| ||| | ||||||||||    
T  23458320 atgcaagggtaaattgcaaggattagcgattacagagaccaatttttaaacgacccataattgcaag 23458386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 53756941 - 53757132
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||  |||    
T  53756941 tattttgtcctcttcttcaggga-aaattggaatttcatgtgtggtagtgattgtcacgtcatcgaattagtgacgcggtagtgattaagttggttaaag 53757039  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaa 192  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||  |||| ||||||| | | |||| |||| |||||||||| |||  |||||||||||||    
T  53757040 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggttagtttgcaaggattagcgaatacatggaccaatttttaaacgacttctaattgcaagaa 53757132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 9294199 - 9294365
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  9294199 aaattggaatttcatgtatggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatgacagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 9294298  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||||| |||||||||||||||| | |||| | |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  9294299 atgcaagggtaaattgccaggattagcgattatagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 9294365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 36417874 - 36417709
Alignment:
Q  26 aattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaat 125  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  ||    
T  36417874 aattggaatttcatgtatgatagtgattgccacatcatcaaattagtgacatgacggtgattaagtttgtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgat 36417775  T
Q  126 tgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||||||||||  |||| ||||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  36417774 tgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattacaag 36417709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 76 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 47921602 - 47921466
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaat 174  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47921602 gtggcagtgattaatttggtccaaggaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaagattaacaattacagggacgaatttttaaat 47921503  T
Q  175 gacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcc 211  Q
    | | ||||||||||||   ||| ||||||| ||||||    
T  47921502 gccgcctaattgcaagggttaaacacatcaataagcc 47921466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 29118824 - 29118966
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaattttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||| | |||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  29118824 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaatggtaaattgccaggattagcgattacagtgactaattttt 29118923  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcctt 213  Q
    ||||||| |||||||||||| || || |||||||||| |||||    
T  29118924 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattatgcctt 29118966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 40788706 - 40788848
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||  | ||||||  |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||    
T  40788706 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaaagattaaacaatgcaagagtaaattgccaggattagcgattacagggactaattttt 40788805  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcctt 213  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  40788806 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcctt 40788848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3469340 - 3469197
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||   |||||| |||| |||||||    
T  3469340 tgacgtggccgtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagtgattacatggactaattttt 3469241  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagccttt 214  Q
    ||||||| |||||||||||  || || |||||||||||||||||    
T  3469240 aaatgacgcctaattgcaaagacgaaacacatcattaagccttt 3469197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 76 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 47551629 - 47551491
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaat 174  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||| |||| | |||||| |||| |||||||||||    
T  47551629 gtggcagtgattaagttggtcaaaggatgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccagtattagcgattacagggactaatttttaaat 47551530  T
Q  175 gacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcctt 213  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  47551529 gacatctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcctt 47551491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 32306564 - 32306421
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| || ||||| | |||||| | || |||||||    
T  32306564 tgacgtggtagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaagattagcgattacatgaactaattttt 32306465  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagccttt 214  Q
    ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  32306464 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagccttt 32306421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 35643991 - 35643872
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | |||| || |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||    
T  35643991 tgacgtggcagtgattaagtttgtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcacgggtaaattgccaggattagcgattacagggactaattttt 35643892  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  35643891 aaatgacgcctaattgcaag 35643872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 40758331 - 40758168
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  40758331 aaattgaaatttcatgtgtgacggtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggtagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 40758232  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     |||  || ||||||| |||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  40758231 atgc--gggtaaattg-caggattagcgattacatggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 40758168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8041753 - 8041615
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  8041753 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaa 8041654  T
Q  174 tgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    || | ||||||||||||  |||| ||||||| |||||||    
T  8041653 tgccgcctaattgcaagggctaaacacatcaataagcct 8041615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 75 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 54466560 - 54466430
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54466560 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattaacaattacagggacgaatttttaaa 54466461  T
Q  174 tgacacctaattgcaagaactaatcacatca 204  Q
    || | ||||||||||||  |||| |||||||    
T  54466460 tgccgcctaattgcaagggctaaacacatca 54466430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Original strand, 3469486 - 3469627
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaattttt 170  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | |||||||| || |||||||    
T  3469486 tgacttggtagtgattaagttggtcaaaggacggaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacaggaactaattttt 3469585  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    ||||||| |||||||||||| || || || ||||||||||||    
T  3469586 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacagatcattaagcct 3469627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 80 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13948912 - 13948779
Alignment:
Q  80 cagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | |||||| |||| |||||||||||||      
T  13948912 cagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaagattagcgattacatggactaatttttaaatgatg 13948813  T
Q  179 cctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  13948812 cctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 13948779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 52032278 - 52032141
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaattttt 170  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| ||||||| | ||||| ||||  |||||||    
T  52032278 tgacgtggtagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgctaggattagcgattacaaggattaattttt 52032179  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaa 208  Q
    ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||    
T  52032178 aaatgacgcctaattgcaaggacaaaacacatcattaa 52032141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 9294169 - 9294049
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  9294169 tattttgtcatcttcttaacggcaaaattagaatttcatgtgtggtagtgattgccacctccccgtattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaaa 9294070  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaa 121  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  9294069 gacaaaattttaaatgattaa 9294049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 53 - 208
Target Start/End: Original strand, 33156263 - 33156419
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaaca 152  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | || |||| |||||||||| |||||||     
T  33156263 tgccacgtcagctaattagtgacgtggcagtgattaagtggggggagggacgaaattttaaatgattaaacaatgaaagggtaaattgccaagattaacg 33156362  T
Q  153 attacag-gacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaa 208  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||    
T  33156363 attacaatgactaatttttaaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaa 33156419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29686081 - 29685943
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||| || |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||| | |||||| |||| |||||||    
T  29686081 tgacgtggcagtgatcaagttggtcaaagaacgaaattttaaatgattaaacaatgcaaggataaattgtcaggattagcgattacagggactaattttt 29685982  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaag 209  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||  |||||||||||    
T  29685981 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaatacatcattaag 29685943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 208
Target Start/End: Original strand, 32306710 - 32306847
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | ||||||  ||| |||||||    
T  32306710 tgacttggtagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacattgactaattttt 32306809  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaa 208  Q
    ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||    
T  32306810 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaa 32306847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 214
Target Start/End: Original strand, 52032435 - 52032568
Alignment:
Q  82 gtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacc 180  Q
    ||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||  | ||||||| || ||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||  |    
T  52032435 gtgattaagttggtcaaaggaagaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtatattgccaggattagcgattacagggactaatttttaaatgacgtc 52032534  T
Q  181 taattgcaagaactaatcacatcattaagccttt 214  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  52032535 taattgcaaggacgaaacacatcattaagccttt 52032568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 74 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11910837 - 11910701
Alignment:
Q  74 acgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaa 172  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| ||||||| | |||||| |||  |||||||||    
T  11910837 acgtggtagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgctaggattagcgattacagggattaatttttaa 11910738  T
Q  173 atgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaag 209  Q
    |||||  ||||||||||| || || ||||||||||||    
T  11910737 atgacgtctaattgcaaggacgaaacacatcattaag 11910701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 121
Target Start/End: Original strand, 26463843 - 26463935
Alignment:
Q  29 tggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||    
T  26463843 tggaatttcatgtgtgacagtgattgccatgtcatcaaattagtgacgtgacagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaa 26463935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 10294697 - 10294567
Alignment:
Q  82 gtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaatttttaaatgacacc 180  Q
    ||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||  | | ||||| ||||||| || ||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  10294697 gtgattaagttggttaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatacaagggtaaattgtcatgattagcaattacagggactaatttttaaatgacgcc 10294598  T
Q  181 taattgcaagaactaatcacatcattaagcc 211  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||    
T  10294597 taattgcaaggacgaaacacatcattaagcc 10294567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 43384471 - 43384321
Alignment:
Q  24 gaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaaca 123  Q
    ||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |   |  ||| |||||||||||||||||      
T  43384471 gaaattggaattttatgtatggtagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatgacagtgattaagtggggagagagacgaaattttaaatgattaaac 43384372  T
Q  124 attgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    | ||||||| ||||||| |||||||| | |||||| |||| ||||||||||    
T  43384371 aatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagggaccaatttttaaa 43384321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 41422112 - 41421975
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaattttt 170  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | || |||| ||||||| || ||||||| |||||||| || |||||||    
T  41422112 tgacgtgacagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgtaagggtaaattgtcaagattaacgattacaggaactaattttt 41422013  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaa 208  Q
    || |||| |||||||||||| || || |||||||||||    
T  41422012 aactgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaa 41421975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 215
Target Start/End: Original strand, 10294845 - 10294989
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaattttt 170  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||  || |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| ||||||| | |||||||| || |||||||    
T  10294845 tgacttggcagtgattaagttggtcaaaaaacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgcgaggattagcgattacaggaactaattttt 10294944  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcctttt 215  Q
    |||| ||  || |||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  10294945 aaattacgtctgattgcaaggacgaaacacatcattaagcctttt 10294989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 40033701 - 40033637
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatca 65  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40033701 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatca 40033637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 41988148 - 41988053
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaa 121  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||   |  ||| |||||||||||||||||    
T  41988148 aaattggaatttcatgtgtaacagtgattgccacgt-atcaaattagtgatgtggcagtgattaagtgaggagagagacgaaattttaaatgattaa 41988053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 67 - 188
Target Start/End: Original strand, 21185978 - 21186100
Alignment:
Q  67 attagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaa 165  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||  ||| | |||| |||||||||||||||||   |||||||| ||| |||||||||||||| |||||| | || ||    
T  21185978 attactgacgtggcggtgattaagtgggtcaagggacgaaattttaaatgattaaggtttgcaagggtaatttgccaggattaacgattacatgtaccaa 21186077  T
Q  166 tttttaaatgacacctaattgca 188  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  21186078 tttttaaatgacccctaattgca 21186100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Original strand, 29686226 - 29686364
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaattttt 170  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||   ||||| | ||| ||||||     
T  29686226 tgacttggtagtgattaagttggtcaaatgacaaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagtgattacaatgactaatttta 29686325  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaag 209  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||    
T  29686326 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaag 29686364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 43998285 - 43998171
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaattttt 170  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||    
T  43998285 tgacttggtagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccagaattaacgattacaaggactaattttt 43998186  T
Q  171 aaatgacacctaatt 185  Q
    ||||||||| |||||    
T  43998185 aaatgacacataatt 43998171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 2796316 - 2796200
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||    
T  2796316 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaa 2796217  T
Q  174 tgacacctaattgcaag 190  Q
    |||| ||||||||||||    
T  2796216 tgacccctaattgcaag 2796200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3596249 - 3596105
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||  | ||||| | ||||||| |||||||| | ||||||  ||| |||||||    
T  3596249 tgacatggtagtgattaagttggtcaaagaacgaaattttaaatgattaaataatgcaaaggtaaattgtcaggattagcgattacattgactaattttt 3596150  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcctttt 215  Q
    |||| || |||||||||||| || || ||||||||||| ||||||    
T  3596149 aaatcacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaaacctttt 3596105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 175
Target Start/End: Original strand, 10307661 - 10307765
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaattttt 170  Q
    |||||||  |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  10307661 tgacgtgcgagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagagactaattttt 10307760  T
Q  171 aaatg 175  Q
    |||||    
T  10307761 aaatg 10307765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 88 - 215
Target Start/End: Original strand, 33506252 - 33506380
Alignment:
Q  88 aagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaatttttaaatgacacctaattg 186  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | || |||  |||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  33506252 aagttggtcaaaggacaaaattttaaatgattaaacaatgtaagagtaaattgccaggattagcgattacagggactaatttttaaataacgcctaattg 33506351  T
Q  187 caagaactaatcacatcattaagcctttt 215  Q
     ||| || || ||||||||||||||||||    
T  33506352 aaaggacgaaacacatcattaagcctttt 33506380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 53756930 - 53756766
Alignment:
Q  26 aattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaat 125  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||| |  |   | |||| |||||||||||||||||  |     
T  53756930 aattggaatttcatgtatgatagtgattgccacatcatcaaattagtgacatgacaatgattaaatgggaagatggacgaaattttaaatgattaaacaa 53756831  T
Q  126 tgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaa 189  Q
    ||||||| |||||| | | ||||||| |||||| | |  |||||||||| ||| |||||||||||    
T  53756830 tgcaagggtaaattactaagattaacgattacatgaatcaatttttaaacgacccctaattgcaa 53756766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 190
Target Start/End: Original strand, 40758402 - 40758517
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaat 174  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| ||||||| | | ||||  ||| |||||||||||    
T  40758402 gtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgaatacatagaccaatttttaaat 40758501  T
Q  175 gacacctaattgcaag 190  Q
    ||| ||||||||||||    
T  40758502 gacccctaattgcaag 40758517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 9367900 - 9367766
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaaca 152  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |   | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||| |     
T  9367900 tgccacctcatcaaattagtgacgtggcagtgattaattgggatgagggacgaaattttaaatgattaataattgcaaggctagtttgcaaggattagcg 9367801  T
Q  153 attacag-gacgaatttttaaatgacacctaattg 186  Q
    | ||||| ||| | |||||||| ||| ||||||||    
T  9367800 aatacagagaccattttttaaacgacccctaattg 9367766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 188
Target Start/End: Original strand, 1079537 - 1079626
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgca 188  Q
    |||| |||||||||| ||||||   |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  1079537 ggacgaaattttaaaagattaaactttgcaaggctaatttgccaggattaacgattacagggaccaatttttaaatgacccctaattgca 1079626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 188
Target Start/End: Original strand, 25108364 - 25108500
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaaca 152  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |  |   |||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||  |  |||||||||||| ||    
T  25108364 tgccacgtcagctaatcagtgacgtggcagtgattaactgtgatgaaggacgaaattttaaatgattaacgtttgcagggacagtttgccaggattagca 25108463  T
Q  153 attaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgca 188  Q
    |||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  25108464 attacagggaccaaattttaaatgacccctaattgca 25108500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 211
Target Start/End: Original strand, 42855601 - 42855733
Alignment:
Q  80 cagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgaca 178  Q
    ||||||||||   |||| |||||  |||||||||||||||||  | ||||||||||  |||| ||||||| | | |||| |||| ||||||||||||||     
T  42855601 cagtgattaaccgagtcaaaggatgaaattttaaatgattaaagaatgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacatggactaatttttaaatgacg 42855700  T
Q  179 cctaattgcaagaactaatcacatcattaagcc 211  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  42855701 cctaattgcaagggctaaacacatcattaagcc 42855733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 190
Target Start/End: Original strand, 40506036 - 40506195
Alignment:
Q  33 atttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaagg 132  Q
    ||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||  |   |  ||| |||||||||||||||||  | || ||||    
T  40506036 atttcatgtatggcaatgattgccacatcatcaaattagttacatgacagtgattaagtgcggagagagacgaaattttaaatgattaaataatgtaagg 40506135  T
Q  133 ctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaatttttaaatgacacc-taattgcaag 190  Q
     ||||||| |||||||||| |||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||    
T  40506136 gtaaattgtcaggattaacgattacaggaaccaacttttaaatgaccccataattgcaag 40506195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 26463767 - 26463653
Alignment:
Q  77 tggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaatg 175  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||||| | | ||| ||||  |||||||||| |    
T  26463767 tggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattaccgaatacaaggatcaatttttaaacg 26463668  T
Q  176 acacctaattgcaag 190  Q
    || | ||||||||||    
T  26463667 acccttaattgcaag 26463653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 72 - 188
Target Start/End: Original strand, 4323490 - 4323607
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    |||||||||||| |||||||  || ||  ||| || ||||||||||||||  | ||||||| ||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  4323490 tgacgtggcagtcattaagtgggttcagtgacgaatttttaaatgattaaacaatgcaaggttaatttgccaggattagcgattacagggacgaattttt 4323589  T
Q  171 aaatgacacctaattgca 188  Q
    ||| ||| ||||||||||    
T  4323590 aaacgacgcctaattgca 4323607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 2796365 - 2796417
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2796365 tattttgtcctcttctaaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgatt 2796417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 4322695 - 4322615
Alignment:
Q  108 ttttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacaggacgaatttttaaatgacacctaattgca 188  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| ||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  4322695 ttttaaatgattaaacaatgcaaggttaatttgtcaggattagcgattacaggacgaatttttaaacgacgcctaattgca 4322615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 42342982 - 42343034
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  42342982 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcactgatt 42343034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 51994128 - 51994076
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  51994128 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgatt 51994076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 26463808 - 26463757
Alignment:
Q  2 attttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26463808 attttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtatggcagtgatt 26463757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 190
Target Start/End: Original strand, 40033772 - 40033863
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  || |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  40033772 ggacaaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcaattatagaaaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 40033863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 42342903 - 42342816
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattg 186  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  42342903 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggactagcaattacatggaccaatttttaaacgacccctaattg 42342816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 25107370 - 25107236
Alignment:
Q  55 ccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaat 154  Q
    |||||||| | ||| | |||||||||||||||||| |  |   | |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  || |||||||||||| | ||    
T  25107370 ccacgtcagctaatcactgacgtggcagtgattaactgtgatgagggacgaaattttaaatgattaacatttgcaggggcaatttgccaggattagcgat 25107271  T
Q  155 tacag-gacgaatttttaaatgacacctaattgca 188  Q
    || || ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  25107270 tagagagaccaatttttaaatgacccctaattgca 25107236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29118670 - 29118529
Alignment:
Q  80 cagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaa-caat----------tgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaatt 167  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||          ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| || ||||    
T  29118670 cagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaaggacaatgcaagggtaaattgccagaattagcgattacagggactaatt 29118571  T
Q  168 tttaaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaag 209  Q
    |||||||||| | |||||||||| || || ||||||||||||    
T  29118570 tttaaatgacgcataattgcaaggacgaaacacatcattaag 29118529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 185
Target Start/End: Original strand, 32431472 - 32431594
Alignment:
Q  64 caaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggac 162  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||||   ||| | |||| |||||||||||| ||||   |||||||||||| ||| |||||||||| ||| || ||||    
T  32431472 caaattaatgacgtggcaatcattaagcgggtcaagggacgaaattttaaatggttaaactttgcaaggctaatttgtcaggattaacgattgcagggac 32431571  T
Q  163 gaatttttaaatgacacctaatt 185  Q
     |||||||||||||| |||||||    
T  32431572 caatttttaaatgacccctaatt 32431594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 185
Target Start/End: Original strand, 47857533 - 47857647
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaattttt 170  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||   |||||||| ||| || |||| |||||| ||||| | ||  |||||||    
T  47857533 tgacgtggcattgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaactttgcaaggataatttaccagaattaacgattacaaagatcaattttt 47857632  T
Q  171 aaatgacacctaatt 185  Q
    ||| |||||||||||    
T  47857633 aaacgacacctaatt 47857647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 3849146 - 3849054
Alignment:
Q  97 caaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgca 188  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||  |||| ||||||||| | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  3849146 caaggacgaaattttaaatgattaatgattgcagggctagtttgcaaggattaacgaatacagggaccaatttttaaacgactcctaattgca 3849054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 40758361 - 40758413
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  40758361 tattttgtcctcttcttaagggcaaagttggaatttcacgtgtggcagtgatt 40758413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 71 - 190
Target Start/End: Original strand, 51994173 - 51994293
Alignment:
Q  71 gtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttt 169  Q
    |||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | |||| || ||||||||||| |||| | ||||| ||||| ||||||    
T  51994173 gtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaggggtaaattgccagaattagcgattacaaggaccaatttt 51994272  T
Q  170 taaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||| ||  ||||||||||||    
T  51994273 taaacgatccctaattgcaag 51994293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 139
Target Start/End: Original strand, 8741314 - 8741348
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaatt 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8741314 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaatt 8741348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 190
Target Start/End: Original strand, 19741213 - 19741299
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||||| ||||| | |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19741213 aaattttaaatgattaaacaatacaagggtaaattgccaagattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 19741299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 46474927 - 46474837
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatgacacctaattgcaa 189  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||| | |||||||||| ||||| | ||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  46474927 ggacaaaattttaaatgattaaacaatgcaatggtaaattgccaagattagcgattacagagaccaatttttaaacgacccctaattgcaa 46474837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 47856516 - 47856410
Alignment:
Q  83 tgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaatgacacct 181  Q
    |||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||   |||||||  ||| ||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| | |    
T  47856516 tgattaagttggtcaaatgacaaaattttaaatgattaaactttgcaagagtaatttgtcaggattaacgattacaaggaccaatttttaaacgacgctt 47856417  T
Q  182 aattgca 188  Q
    |||||||    
T  47856416 aattgca 47856410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 6956360 - 6956271
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgca 188  Q
    |||| ||||||||||||||| |   |||||||| ||| |||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  6956360 ggacgaaattttaaatgatttaagtttgcaagggtaatttgccaggattaacgattatagggactaatttttaaatgatccctaattgca 6956271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 188
Target Start/End: Original strand, 23276299 - 23276388
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaatttttaaatgacacctaattgca 188  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||| | || ||| ||||| |||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  23276299 ggacaaaattttaaatgattaacgtttgtaggggtaatttgccgggattagcgattacagggaccaatttttaaatgacccctaattgca 23276388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 33154989 - 33154900
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaatttttaaatgacacctaattgca 188  Q
    ||||||| | ||||||||||||   || ||||| ||| ||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  33154989 ggaccaattcttaaatgattaaactttacaaggataatttgtcaggattaacgattacagggaccaatttttaaatgacccctaattgca 33154900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 141
Target Start/End: Original strand, 42343023 - 42343088
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgc 141  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  42343023 gtggcactgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatcattgcaagactaatttgc 42343088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 188
Target Start/End: Original strand, 43608798 - 43608887
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatgacacctaattgca 188  Q
    |||| |||||||||||||||||   |||||||| ||| || | ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  43608798 ggacgaaattttaaatgattaaactttgcaaggttaatttacgaggattaacgattacagagaccaatttttaaatgatccctaattgca 43608887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 188
Target Start/End: Original strand, 41558195 - 41558287
Alignment:
Q  97 caaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgca 188  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||||| | | |||| |||  |||||||||| ||| ||||||||||    
T  41558195 caaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagcgaatacatggattaatttttaaacgacccctaattgca 41558287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 51994086 - 51994042
Alignment:
Q  77 tggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaa 121  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  51994086 tggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaa 51994042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 164 - 211
Target Start/End: Original strand, 13949074 - 13949121
Alignment:
Q  164 aatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcc 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  13949074 aatttttaaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcc 13949121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 23272980 - 23272946
Alignment:
Q  55 ccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaa 89  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23272980 ccacgtcatcaaatcagtgacgtggcagtgattaa 23272946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 42342952 - 42342906
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattag 71  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||    
T  42342952 aaattggaatttcatgtgtgacattgattgtcatgtcatctaattag 42342906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 42854592 - 42854554
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagt 91  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  42854592 tgccacgtcatcaaattactgaggtggcagtgattaagt 42854554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 1078648 - 1078560
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaatttttaaatgacacctaattgca 188  Q
    |||| |||||||||||||||||   || ||||| ||| || |||| |||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  1078648 ggacgaaattttaaatgattaaactttacaaggttaatttaccag-attaacgattacagggaccaatttttaaatgacccctaattgca 1078560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 121
Target Start/End: Original strand, 2796406 - 2796451
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaa 121  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  2796406 gtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaactgattaa 2796451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 33506225 - 33506180
Alignment:
Q  164 aatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaag 209  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||    
T  33506225 aatttttaaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaag 33506180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 35712183 - 35712111
Alignment:
Q  60 tcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaagg 132  Q
    |||||| ||||||||| || |||||||||| |  ||| || ||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  35712183 tcatcagattagtgacctgacagtgattaactgggtcaaaagacgaaattttaaatgattaaacattgcaagg 35712111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 89
Target Start/End: Original strand, 39399361 - 39399397
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaa 89  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39399361 tgccacctcatcagattagtgacgtggcagtgattaa 39399397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 53
Target Start/End: Original strand, 40033731 - 40033759
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40033731 aaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 40033759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 40788551 - 40788423
Alignment:
Q  81 agtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacac 179  Q
    ||||||||||||  || || ||| |||||||||||||||||  | ||||| | ||||||| ||| |||| | |||| | |||| ||||||||||| || |    
T  40788551 agtgattaagttgatcaaatgacgaaattttaaatgattaaataatgcaaaggtaaattgtcagaattagcgattagagggactaatttttaaataacgc 40788452  T
Q  180 ctaattgcaagaactaatcacatcattaa 208  Q
     |||||||||| |  || |||||||||||    
T  40788451 ttaattgcaaggaagaaacacatcattaa 40788423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 105 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 41558115 - 41558027
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaa 192  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||| ||||||| | | ||| || || |||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  41558115 aaattttaaatgattaataattgcaaggttaatgtgcaaggattagcgaatacaagtaccaatttttaaacgacccataattgcaagaa 41558027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 135)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 9400730 - 9400519
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  9400730 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatctgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtgacagtgattaagttggtccaag 9400631  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9400630 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgacacctaattgcaaggactaatca 9400531  T
Q  200 catcattaagcc 211  Q
    ||||||||||||    
T  9400530 catcattaagcc 9400519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 4982937 - 4982726
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  4982937 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgaggcagtgattaagttggtccaag 4982838  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||    
T  4982837 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaagattagcaattacatggacgaatttttaaattacgtctaattgcaaggactaatca 4982738  T
Q  200 catcattaagcc 211  Q
    ||||||||||||    
T  4982737 catcattaagcc 4982726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 33247484 - 33247295
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33247484 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatctgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtccaag 33247385  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33247384 gaccaaa-tttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 33247295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 42738242 - 42738030
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  42738242 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 42738143  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatca 199  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  42738142 gaccaaattttaaacgattaacaattgcaaggttaaaatgccaggattaacaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 42738043  T
Q  200 catcattaagcct 212  Q
    ||||| |||||||    
T  42738042 catcaataagcct 42738030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 34837285 - 34837071
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  34837285 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 34837186  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatca 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  34837185 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 34837086  T
Q  200 catcattaagccttt 214  Q
    ||||| |||||||||    
T  34837085 catcaataagccttt 34837071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 9144977 - 9144773
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  9144977 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 9144878  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  9144877 gaccaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 9144778  T
Q  200 catca 204  Q
    |||||    
T  9144777 catca 9144773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Original strand, 32950329 - 32950540
Alignment:
Q  2 attttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaagg 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  32950329 attttgtcctcttcttaagggcaaaattgtaattttatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgatgtggcagtgattaatttggtccaagg 32950428  T
Q  102 accaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatcac 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||    
T  32950429 accaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccacctaattgcaagggctaaacac 32950528  T
Q  201 atcattaagcct 212  Q
    |||| |||||||    
T  32950529 atcaataagcct 32950540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 38012356 - 38012567
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||    
T  38012356 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacatcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtcaaag 38012455  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatca 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  38012456 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 38012555  T
Q  200 catcattaagcc 211  Q
    ||||| ||||||    
T  38012556 catcaataagcc 38012567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 22566985 - 22567186
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22566985 tattttgtccttttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattattgacgtggcagtgattaagttggtccaag 22567084  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatca 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||             ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22567085 gaccaaattttaaatgattaacaattgca-------------aggattagcaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 22567171  T
Q  200 catcattaagccttt 214  Q
    |||||||||||||||    
T  22567172 catcattaagccttt 22567186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 27934718 - 27934907
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  27934718 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgc-acgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtccaag 27934816  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatca 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||             ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  27934817 gaccaaattttaaatgattaacaattgca-------------aggattagcaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 27934903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 49879418 - 49879228
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||    
T  49879418 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaaattggtcaaag 49879319  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  49879318 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcaattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 49879228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 7452020 - 7452210
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  7452020 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 7452119  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | | ||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  7452120 gactaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagagaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 7452210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 50418879 - 50418689
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||    
T  50418879 tattttgtcctctccttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaaattggtcaaag 50418780  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  50418779 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattaacgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 50418689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 44967280 - 44967090
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  44967280 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 44967181  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||  ||||||| | | ||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  44967180 gactaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgtaaggattagcgaatacagagaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 44967090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 24711297 - 24711487
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||     
T  24711297 tattttgtcatcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccatgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaaattggtcaaat 24711396  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||||| || ||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  24711397 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattaacgatgacatggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 24711487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 35028209 - 35028019
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  35028209 tattttgtcctcttcttaagggcaaagttggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcggtgattaagttggtcaaaa 35028110  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | | |||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  35028109 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacaggaaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 35028019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 37248422 - 37248612
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||    
T  37248422 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcaatgattaaattggtcaaag 37248521  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||| ||||||||||  |||||||| |||  |||| ||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  37248522 gacgaaatttaaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 37248612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 46661131 - 46661321
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  46661131 tattttgttctattcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 46661230  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||  || |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  46661231 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcgaggattagtaaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 46661321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 34765591 - 34765401
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||    
T  34765591 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtgacagtgattaagttgatcaaag 34765492  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | | ||| |||||  ||||||||| ||| | ||||||||||    
T  34765491 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacaaggaccgatttttaaacgacccttaattgcaag 34765401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 17356136 - 17355946
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  17356136 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaat 17356037  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  | |||||| |||  |||| | ||||| | | |||||  || |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  17356036 gacgaaattttaaatgattaatgaatgcaagactagtttgcaaagattagcgaatacagcaaccaatttttaaacgactcctaattgcaag 17355946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 36009055 - 36008921
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  36009055 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggtagtgattaagttggtcaaag 36008956  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggcta 135  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36008955 gactaaattttaaatgattaatgattgcaaggcta 36008921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 43155736 - 43155550
Alignment:
Q  5 ttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggacc 104  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||     
T  43155736 ttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtttggcagtgattgccacatcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaatgact 43155637  T
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| | ||||||||||    
T  43155636 aaattttaaatgattaacgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccttaattgcaag 43155550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 51692736 - 51692926
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||| |||    
T  51692736 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattagaatttcatgtgtgatagtaattgccacgtcatcgaattagtgacatgacagtgattaagttggtcaaag 51692835  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  51692836 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 51692926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 53702029 - 53702159
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||     
T  53702029 tattttgtcctcttcttaagggcagaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcattgattaagttggtcaaat 53702128  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaag 131  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  53702129 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaag 53702159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 18831534 - 18831724
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  18831534 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgcgacgtcatcaaataagtgacgtggcggtgattaagttggtcaaat 18831633  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||  |||| | ||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  18831634 gatgaaattttaaatgattaatgattgcaaggttagtttgcaatgattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 18831724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 23613495 - 23613685
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  23613495 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtttggcagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggtagtgattaagttggtcaaag 23613594  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     || ||||||||||||||||   |||||||| |||| |||| ||||||| | | |||| |||  |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  23613595 aactaaattttaaatgattagtgattgcaagactaatttgcaaggattagcgaatacagggatcaatttttaaacgacccctaattgcaag 23613685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 16006024 - 16006143
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  16006024 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggt-aaag 16006122  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaa 121  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  16006123 gactaaattttaaatgattaa 16006143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 14801953 - 14802082
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  14801953 tattttgttctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtca-caaattagtgatgtggcagtgattaagttggtcaaag 14802051  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaag 131  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  14802052 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaag 14802082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 37976364 - 37976234
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  37976364 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatatgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggcaatgattaagttggtcaaag 37976265  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaag 131  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  37976264 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaag 37976234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 75 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27934669 - 27934528
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  27934669 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacaaatttttaaa 27934570  T
Q  174 tgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcctttt 215  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27934569 cgacccctaattgcaaggactaatcacatcattaagcctttt 27934528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 53129717 - 53129548
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||    
T  53129717 tattttgtcatcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgtcacgtcatcaaattagtgaagttgcagtgattaagttggtcaaag 53129618  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacaggacgaattttt 170  Q
     || |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||  ||||||| ||| |||| ||| |||||||    
T  53129617 aacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgtaaggattagcaaatacatgaccaattttt 53129548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 215
Target Start/End: Original strand, 9400809 - 9400920
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatcacatc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  9400809 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaacgacccctaattgcaaggactaatcacatc 9400908  T
Q  204 attaagcctttt 215  Q
    |||||| |||||    
T  9400909 attaagtctttt 9400920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 14801923 - 14801757
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  14801923 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 14801824  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     | ||||| ||||||| |||||||| | ||||| | ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  14801823 atacaagggtaaattgtcaggattagcgattacaaagaccaatttttaaacgactcctaattgcaag 14801757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 34765621 - 34765787
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  34765621 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcctcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 34765720  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||| | |||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  34765721 atgcaaaggtaaattgccaggattagcgattacatgaaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 34765787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 52909470 - 52909660
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  52909470 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggttgtgattgccacatcatcgaatttgtgacgtgacagtgattaagttggtcaaag 52909569  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | | ||||  ||| |||||||||||||  | ||||||||||    
T  52909570 gacgaaattttaaataattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacatagaccaatttttaaatgatccataattgcaag 52909660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 15507884 - 15507694
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||    
T  15507884 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaattttatatgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtgacaatgattaagttggtcaaag 15507785  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||| |||||| |||  |||||| | |||  |||| ||||||| | | || | |||| |||||||||| ||| | ||||||||||    
T  15507784 gacgaaatttgaaatgaataatgattgcacgactagtttgcaaggattagcgaatatagggaccaatttttaaacgacccttaattgcaag 15507694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 54086906 - 54086716
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  54086906 tattttatcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatatgtggtagtgattgtcatgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 54086807  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||| |||| |||  ||   ||||||| | | ||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  54086806 gacaaaattttaaatgattaatgattacaagactagctttgaaggattagcgaatacagagaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 54086716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 54858700 - 54858556
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||| | |||||| |||| |||||||    
T  54858700 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagggactaattttt 54858601  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcctttt 215  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  54858600 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcctttt 54858556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 78 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 51203743 - 51203608
Alignment:
Q  78 ggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatga 176  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  51203743 ggcagtgattaatttggtccaaggaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgc 51203644  T
Q  177 cacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    | ||||||||||||  |||| ||||||| |||||||    
T  51203643 cgcctaattgcaagggctaaacacatcaataagcct 51203608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 214
Target Start/End: Original strand, 54858846 - 54858989
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  54858846 tgacttggtagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattaacgattacatggactaattttt 54858945  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagccttt 214  Q
    ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  54858946 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagccttt 54858989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 75 - 211
Target Start/End: Original strand, 4982986 - 4983123
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  4982986 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaataattgcaaggctaaattgcgaggattagcaattacaaggatgaatttttaaa 4983085  T
Q  174 tgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcc 211  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4983086 cgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagcc 4983123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 24411575 - 24411683
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  24411575 tattttgtcatcttcttaagggcaaaattggaatttcatgggtggcagtgattgccacatcatcaaattagtgacgtggtagtgattaagttggtcaaag 24411674  T
Q  101 gaccaaatt 109  Q
    ||| |||||    
T  24411675 gacgaaatt 24411683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 208
Target Start/End: Original strand, 33247563 - 33247667
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatcacatc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  33247563 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacggatttttaaacgatccctaattgcaaggactaatcacatc 33247662  T
Q  204 attaa 208  Q
    |||||    
T  33247663 attaa 33247667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 53701999 - 53701833
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   | |||  |||||||||||||||||  |    
T  53701999 aaataggaatttcatgtgtgacagtgattaccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggaagaaattttaaatgattaaaca 53701900  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||||| ||||||| ||||||||   ||||||| ||  |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  53701899 atgcaaggataaattgtcaggattagagattacagagatcaatttttaaacgacccctaattgcaag 53701833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 27069050 - 27068909
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||    
T  27069050 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggactaattttt 27068951  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    ||||||  |||||||||||| || || |||||| ||||||||    
T  27068950 aaatgatgcctaattgcaaggacgaaacacatccttaagcct 27068909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 76 - 211
Target Start/End: Original strand, 10408179 - 10408315
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaat 174  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||    
T  10408179 gtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggactaatttttaaat 10408278  T
Q  175 gacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcc 211  Q
    ||| |||||||||||| || || |||| |||||||||    
T  10408279 gacgcctaattgcaaggacgaaacacaacattaagcc 10408315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 53 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16605761 - 16605601
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaaca 152  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||| || ||     
T  16605761 tgccacgtcagctaattagtgacgtggcagtgattaagtggggggagggacgaaattttaaatgattaatcaatgcaagggtaaattggcaggtttgacg 16605662  T
Q  153 attacagg-acgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  16605661 attacagggactaatttttaaatgacacctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 16605601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 105 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22566906 - 22566798
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatcacatc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||| |||| ||||||||| |     
T  22566906 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacaggaacgaatttttaaacgatccctaattacaaggactaatcacttt 22566807  T
Q  204 attaagcct 212  Q
    |||||||||    
T  22566806 attaagcct 22566798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 149
Target Start/End: Original strand, 35028239 - 35028363
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   |  ||| |||||||||||||||||  |    
T  35028239 aaattggaatttcatgtgtgaaagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagtgacgaaattttaaatgattaaaca 35028338  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggatta 149  Q
     ||||||| |||||||| |||||||    
T  35028339 atgcaagggtaaattgcaaggatta 35028363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 24411545 - 24411382
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |   | |||| ||  |||||||||||||  |    
T  24411545 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtgggagtgattaagtgggaagagggacgaatctttaaatgattaaaca 24411446  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgc 187  Q
     ||||||| ||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||||||||  || |||||||||    
T  24411445 atgcaagggtaaattgtcagggttagcgattacagggaccaatttttaaactacccctaattgc 24411382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 15507914 - 15508079
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |   |  ||| |||||||||||||||||       
T  15507914 aaattggaatttcatgtgtgatagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgcggcagtgattaagtggggagagagacgaaattttaaatgattaaacc 15508013  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||| | ||||||| |||||||| | ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  15508014 atgcaatggtaaattgtcaggattagcgattacaaggac-aatttttaaacgacccctaattgcaag 15508079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 27069196 - 27069338
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    |||| |||| |||||||| || ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  27069196 tgacttggcggtgattaaattggtcaaaagacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcaattacagggactaattttt 27069295  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcctt 213  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  27069296 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcctt 27069338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 77 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3032717 - 3032580
Alignment:
Q  77 tggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaatg 175  Q
    |||| ||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  3032717 tggcggtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacaaggactaatttttaaatg 3032618  T
Q  176 acacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcctt 213  Q
    || |||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  3032617 acgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcctt 3032580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Original strand, 50504111 - 50504252
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaattttt 170  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  50504111 tgacttgggagtgattaagtttgtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgcctggattaacgattacagagactaattttt 50504210  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    ||||||| ||||||| |||| || || |||||||||||||||    
T  50504211 aaatgacgcctaattacaaggacgaaacacatcattaagcct 50504252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 52573368 - 52573227
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaattttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | || |||  |||||||||||||||| | |||||||| || |||||||    
T  52573368 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgtaagagtaaattgccaggattagcgattacaggtactaattttt 52573269  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    ||||||| |||||||||||  || || |||||||||||||||    
T  52573268 aaatgacgcctaattgcaaagacgaaacacatcattaagcct 52573227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 52909440 - 52909275
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  52909440 aaattgaaatttcatgtatggcagtgattgccacatcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggagatggacgaaattttaaatgattaaaca 52909341  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatgacacctaattgcaa 189  Q
     ||||||| ||||||| |||||||| | ||||||| ||| ||||||| || ||| |||||||||||    
T  52909340 atgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagtgaccaatttttgaacgacccctaattgcaa 52909275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 190
Target Start/End: Original strand, 13058258 - 13058389
Alignment:
Q  60 tcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca- 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | | ||||     
T  13058258 tcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggactaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacag 13058357  T
Q  159 ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||| |||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  13058358 ggaccaatttttaaacgaccccttattgcaag 13058389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 213
Target Start/End: Original strand, 42738291 - 42738430
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  42738291 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaa 42738390  T
Q  174 tgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcctt 213  Q
    || | ||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||    
T  42738391 tgccgcctaattgcaagggctaaacacatcaataagcctt 42738430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 45463213 - 45463070
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaattttt 170  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  45463213 tgacttggtagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagagactaattttt 45463114  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagccttt 214  Q
    ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||| ||||    
T  45463113 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagtcttt 45463070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 35508451 - 35508322
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||  |||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| || |||     
T  35508451 tattttgtccgcttcttaagggtaaaattggaatttaatgtgtggtagtgtttgccacgtcttcgaattagtgacgtgacagtgattaagttggt-caaa 35508353  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaag 131  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  35508352 gacaaaattttaaatgattaatgattgcaag 35508322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 75 - 215
Target Start/End: Original strand, 9145026 - 9145167
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  9145026 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgcatttttaaa 9145125  T
Q  174 tgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcctttt 215  Q
    || | ||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||    
T  9145126 tgccgcctaattgcaagggctaaacacatcaataagcctttt 9145167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 208
Target Start/End: Original strand, 45463359 - 45463496
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||  | ||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  45463359 tgacgtggtagtgattaagttggtcaaagaacaaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtagattgccaggattagcaattacagggactaattttt 45463458  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaa 208  Q
    ||||||| |||||||||||| || || || ||||||||    
T  45463459 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacatatcattaa 45463496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 185
Target Start/End: Original strand, 54086936 - 54087097
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  |   |  ||| |||||||||||||||||  |    
T  54086936 aaattgaaatttcatgtatgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatgttagtgattaagtggggagagagacgaaattttaaatgattaaaca 54087035  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaatt 185  Q
     ||||||| ||||||| || ||||||| |||||| |||| |||||||||| ||| |||||||    
T  54087036 atgcaagggtaaattgtcatgattaacgattacagggaccaatttttaaacgacccctaatt 54087097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 72 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 50503965 - 50503821
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| | ||||||| |||||| ||||  ||||||    
T  50503965 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggacggaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgctaagattaacgattacatggactgattttt 50503866  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcctttt 215  Q
    ||||||  ||||||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  50503865 aaatgatgcctaattgcgaggacgaaacacatcattaagcctttt 50503821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 78 - 196
Target Start/End: Original strand, 6237114 - 6237233
Alignment:
Q  78 ggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatga 176  Q
    |||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||    
T  6237114 ggcagtcattaagttggttcaagaaccaaattttaaatgattaacaattgtaagggtaaattctcaggattagcaattacagagactaaattttaaatga 6237213  T
Q  177 cacctaattgcaagaactaa 196  Q
    | |||||||| |||||||||    
T  6237214 cgcctaattgtaagaactaa 6237233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 83 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 11524078 - 11523952
Alignment:
Q  83 tgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatgacacct 181  Q
    |||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  11524078 tgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtatattgccaggattaacgattacagagactaatttttaaatgacgcct 11523979  T
Q  182 aattgcaagaactaatcacatcattaa 208  Q
    ||||||||| || || |||||||||||    
T  11523978 aattgcaaggacgaaacacatcattaa 11523952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 88 - 213
Target Start/End: Original strand, 27149298 - 27149423
Alignment:
Q  88 aagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattg 186  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  27149298 aagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcaattacagggactaa-ttttaaatgacgcctaattg 27149396  T
Q  187 caagaactaatcacatcattaagcctt 213  Q
    |||| || || ||||||||||||||||    
T  27149397 caaggacgaaacacatcattaagcctt 27149423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Original strand, 34837334 - 34837472
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  34837334 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagagacgaatttttaaa 34837433  T
Q  174 tgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    || | ||||||||||||  |||| ||||||| |||||||    
T  34837434 tgccgcctaattgcaagggctaaacacatcaataagcct 34837472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 32950249 - 32950140
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatcacatc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||||||    
T  32950249 aaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattactgggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaacacatc 32950150  T
Q  204 attaagcctt 213  Q
    | ||||||||    
T  32950149 aataagcctt 32950140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 189
Target Start/End: Original strand, 35508481 - 35508646
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |   |   || |||||||||||||||||  |    
T  35508481 aaattggaatttcatgtatggcagtgattgccacgtcatcaaattaatgacatggcagtgattaagtggggagagatacgaaattttaaatgattaaaca 35508580  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaatgacacctaattgcaa 189  Q
     ||||||| |||||||  || |||||| ||||| ||||  |||||||||| ||| |||||||||||    
T  35508581 atgcaagggtaaattgttagaattaacgattacaaggattaatttttaaacgacccctaattgcaa 35508646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 6236942 - 6236846
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacaggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||| ||| || |||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  6236942 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaagggtaaattcccgggattaacgattacaagactaaattttaaatgacgtctaattgcaaggactaa 6236846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 10408029 - 10407889
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    |||| ||| ||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||| | |||||| |||  |||||||    
T  10408029 tgacttggtagtgattaagttgatcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagggagtaattttt 10407930  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcc 211  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  10407929 aaatgactcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcc 10407889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 215
Target Start/End: Original strand, 52573514 - 52573658
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    |||||||||||||||||| ||  || ||||||  ||||||||||||||||  | ||||| | |||||||| |||||||   |||||| |||| |||||||    
T  52573514 tgacgtggcagtgattaaattgatcaaaggacggaattttaaatgattaaacaatgcaatggtaaattgctaggattagtgattacatggactaattttt 52573613  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcctttt 215  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  52573614 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcctttt 52573658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 187
Target Start/End: Original strand, 37976394 - 37976557
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |   |  ||| |||||||||||||||||  |    
T  37976394 aaattggaatttcatgtatgactgtgattgtcacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggagagtgacgaaattttaaatgattaaaca 37976493  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgc 187  Q
     ||||| | ||||||| ||| |||| | |||||| |||  |||||||||| ||| |||||||||    
T  37976494 atgcaatgataaattgtcagaattagcgattacagggatcaatttttaaacgacccctaattgc 37976557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 53129747 - 53129913
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||| ||| ||  |    
T  53129747 aaattagaatttcatgtgtgatagtgattgtcacgtcatcaaattagtgatgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaacgatgaaaca 53129846  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||| ||| |||||||| ||||||| | ||||| ||||  |||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  53129847 atgcgagggtaaattgcaaggattagcgattacgaggatcaatttttaaacgacccctgattgcaag 53129913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 80 - 208
Target Start/End: Original strand, 5818069 - 5818198
Alignment:
Q  80 cagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||     
T  5818069 cagtgattaagttggtcaaaggatgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgacaggattaacgattacagggactaatttttaaatgacg 5818168  T
Q  179 cctaattgcaagaactaatcacatcattaa 208  Q
    ||||||| |||  || || |||||||||||    
T  5818169 cctaattacaaagacgaaacacatcattaa 5818198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 27891724 - 27891583
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||  |||| | |||||| |||| |||||||    
T  27891724 tgacgtgacagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaaaattagcgattacagggactaattttt 27891625  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    |||| |   ||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  27891624 aaataatgtctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 27891583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 56 - 188
Target Start/End: Original strand, 30642418 - 30642551
Alignment:
Q  56 cacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaatt 155  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||| |||| |||| ||||||||| |||    
T  30642418 cacgtcatcaaattaatgacgtggcagtcattaagtgggtcaagggacgaaattttaaatgattaaactttgcaagactaatttgctaggattaacgatt 30642517  T
Q  156 ac-aggacgaatttttaaatgacacctaattgca 188  Q
    || | || ||||||||||||||| | ||||||||    
T  30642518 acaatgatgaatttttaaatgacccataattgca 30642551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 208
Target Start/End: Original strand, 39667062 - 39667199
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||| || ||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  39667062 tgacgtggcggtgattaagttggtcaaaagacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaatttaccaggattaacgattacagggaccaattttt 39667161  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaa 208  Q
    ||||||| | ||||| |||| || || |||||||||||    
T  39667162 aaatgacccgtaattacaaggacgaaacacatcattaa 39667199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 208
Target Start/End: Original strand, 39701195 - 39701332
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||| | ||||||| || ||||||| ||||||  ||| |||||||    
T  39701195 tgacttggcagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaaaggtaaattgtcaagattaacgattacatagactaattttt 39701294  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaa 208  Q
    ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||    
T  39701295 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaa 39701332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 186
Target Start/End: Original strand, 17356166 - 17356325
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||| ||  |    
T  17356166 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgcca---catcaaattagtgacgtgacagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgatcaaaca 17356262  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattg 186  Q
     ||||||  |||||||||| ||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| | ||||||    
T  17356263 atgcaagagtaaattgccaagattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccgtaattg 17356325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 38012277 - 38012170
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatcacatc 203  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||  || | ||||||    
T  38012277 aaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctgaacacatc 38012178  T
Q  204 attaagcc 211  Q
    | ||||||    
T  38012177 aataagcc 38012170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 214
Target Start/End: Original strand, 22987147 - 22987280
Alignment:
Q  82 gtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacc 180  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  |  |||||| || |||| |||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||  |    
T  22987147 gtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaaagcaagggtatattgtcaggattagcgattacatggactaatttttaaatgacgtc 22987246  T
Q  181 taattgcaagaactaatcacatcattaagccttt 214  Q
    |||||| ||| || || |||||||||||||||||    
T  22987247 taattgtaaggacgaaacacatcattaagccttt 22987280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Original strand, 51859692 - 51859833
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaattttt 170  Q
    |||| ||| ||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||||||||||| | ||||| | ||| |||||||    
T  51859692 tgacttgggagtgattaagttgatcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatacaaggataaattgccaggattagcgattacaaagactaattttt 51859791  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    |||| ||  ||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  51859792 aaattacgtctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 51859833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 8438425 - 8438305
Alignment:
Q  67 attagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacaggacgaat 166  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||  ||| | |||| |||||||||||||||||   |||||||  ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  8438425 attactgacgtgacggtgattaagtgggtcaagggacgaaattttaaatgattaaggtttgcaagagtaatttgccaggattaacgattacatgaccaat 8438326  T
Q  167 ttttaaatgacacctaattgc 187  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  8438325 ttttaaatgacccctaattgc 8438305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 56 - 158
Target Start/End: Original strand, 8439496 - 8439598
Alignment:
Q  56 cacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaatt 155  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| | |||| |||||||||||||||||   |||||||| ||| |||| ||||||||| |||    
T  8439496 cacgtcatcaaattactgacgtggcggtgattaagtgggtcaagggacgaaattttaaatgattaatgtttgcaaggataatttgctaggattaacgatt 8439595  T
Q  156 aca 158  Q
    |||    
T  8439596 aca 8439598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 185
Target Start/End: Original strand, 22718225 - 22718339
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaattttt 170  Q
    ||||||| | |||||||| || ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  22718225 tgacgtgtcggtgattaaattggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagagtaaattgccaggattaacaattacagagagtaattttt 22718324  T
Q  171 aaatgacacctaatt 185  Q
    ||||||| |||||||    
T  22718325 aaatgacgcctaatt 22718339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 22986991 - 22986877
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaattttt 170  Q
    ||||||| | |||||||| || ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  22986991 tgacgtgtcggtgattaaattggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagagtaaattgccaggattaacaattacagagagtaattttt 22986892  T
Q  171 aaatgacacctaatt 185  Q
    ||||||| |||||||    
T  22986891 aaatgacgcctaatt 22986877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 24349833 - 24349695
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaaca 152  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |   | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| |     
T  24349833 tgccacctcatcagattagtgacgtggcagtgattaactggggagagggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcg 24349734  T
Q  153 attaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  24349733 aatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 24349695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 72 - 161
Target Start/End: Original strand, 9731498 - 9731587
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagga 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||  | | ||||| ||||||| |||||||| | |||||||||    
T  9731498 tgacgtggcagtgattaagttagtcaaagaacgaaattttaaatgattaaacaatacaaggataaattgtcaggattagcgattacagga 9731587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22718069 - 22717936
Alignment:
Q  82 gtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacc 180  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  |  |||||| || |||| |||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||  |    
T  22718069 gtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaaagcaagggtatattgtcaggattagcgattacatggactaatttttaaatgacgtc 22717970  T
Q  181 taattgcaagaactaatcacatcattaagccttt 214  Q
    |||||| ||| || || ||||||||||| |||||    
T  22717969 taattgtaaggacgaaacacatcattaaaccttt 22717936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 41582606 - 41582470
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaaca 152  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |   | |||| ||||||||||||||||||  ||||| ||  || ||||||||||||||     
T  41582606 tgccatgtcatcaaattagtgacgtggcaatgattaactgtgatgagggacgaaattttaaatgattaacttttgcaggggcaatttgccaggattaacg 41582507  T
Q  153 attaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgca 188  Q
    |||| | |||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  41582506 attagagggaccaatttttaaatgacccctgattgca 41582470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 51859543 - 51859471
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggatt 148  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||    
T  51859543 gtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaataatgcaagggtaaattgccaggatt 51859471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 189
Target Start/End: Original strand, 1179087 - 1179206
Alignment:
Q  71 gtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttt 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | | |||| |||| ||||||    
T  1179087 gtgatgtggcagtgattaagttggttaaaggatgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacatggaccaatttt 1179186  T
Q  170 taaatgacacctaattgcaa 189  Q
    |||| ||| |||||||||||    
T  1179187 taaacgacccctaattgcaa 1179206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 100 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 7451946 - 7451855
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||| || |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  7451946 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaggggtaaattgccaggattaacgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 7451855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 190
Target Start/End: Original strand, 39539194 - 39539325
Alignment:
Q  60 tcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca- 158  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||||| |  ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| |||| || |||||| ||||||     
T  39539194 tcatcaaattaatgatgtggcagtcattaactgggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaagaatgcaaggctaatttgcaagaattaacgattacat 39539293  T
Q  159 ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||| |||||||||| ||| | ||||||||||    
T  39539294 tgaccaatttttaaacgacccttaattgcaag 39539325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22923278 - 22923172
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaattttt 170  Q
    ||||||| |||||||||| || ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  22923278 tgacgtgtcagtgattaaattggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagagtaaattgtcaggattaacgattacagagactaattttt 22923179  T
Q  171 aaatgac 177  Q
    |||||||    
T  22923178 aaatgac 22923172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22927931 - 22927825
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaattttt 170  Q
    ||||||| |||||||||| || ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  22927931 tgacgtgtcagtgattaaattggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagagtaaattgtcaggattaacgattacagagactaattttt 22927832  T
Q  171 aaatgac 177  Q
    |||||||    
T  22927831 aaatgac 22927825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22984210 - 22984104
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaattttt 170  Q
    ||||||| |||||||||| || ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  22984210 tgacgtgtcagtgattaaattggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagagtaaattgtcaggattaacgattacagagactaattttt 22984111  T
Q  171 aaatgac 177  Q
    |||||||    
T  22984110 aaatgac 22984104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22997798 - 22997692
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaattttt 170  Q
    ||||||| |||||||||| || ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  22997798 tgacgtgtcagtgattaaattggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagagtaaattgtcaggattaacgattacagagactaattttt 22997699  T
Q  171 aaatgac 177  Q
    |||||||    
T  22997698 aaatgac 22997692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 37248343 - 37248257
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  37248343 aaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 37248257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 72 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 50751027 - 50750910
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    |||||||||||| |||||||  || ||  ||| || ||||||||||||||  | ||||||| ||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  50751027 tgacgtggcagtcattaagtgggttcagtgacgaatttttaaatgattaaacaatgcaaggttaatttgccaggattagcgattacagggacgaattttt 50750928  T
Q  171 aaatgacacctaattgca 188  Q
    ||| ||| ||||||||||    
T  50750927 aaacgacgcctaattgca 50750910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 188
Target Start/End: Original strand, 50751822 - 50751902
Alignment:
Q  108 ttttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacaggacgaatttttaaatgacacctaattgca 188  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| ||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  50751822 ttttaaatgattaaacaatgcaaggttaatttgtcaggattagcgattacaggacgaatttttaaacgacgcctaattgca 50751902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 24711223 - 24711132
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||| | |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  24711223 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaacggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 24711132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 185
Target Start/End: Original strand, 43155787 - 43155898
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | |||| || |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  43155787 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaataatgcagggataaattgccaggattaacgattacagggaccaatttttaaa 43155886  T
Q  174 tgacacctaatt 185  Q
     ||| |||||||    
T  43155887 cgacccctaatt 43155898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 190
Target Start/End: Original strand, 10781753 - 10781891
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaaca 152  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||| |  |   | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| |     
T  10781753 tgccacctcatcagattagtgacgtgacagtggttaactggggagagggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcg 10781852  T
Q  153 attaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  10781853 aatacatggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 10781891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 56014884 - 56014778
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaaca 152  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |   | |||| ||||||||||||||||||  ||||| ||  || |||||||||||| |     
T  56014884 tgccacgtcatcaaatcagtgacgtggcagtgattaactgtgatgagggacgaaattttaaatgattaacgtttgcaggggcaatttgccaggattagcg 56014785  T
Q  153 attacag 159  Q
    |||||||    
T  56014784 attacag 56014778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 188
Target Start/End: Original strand, 32063624 - 32063741
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaattttt 170  Q
    |||||||||| | |||||||  || || ||||  ||||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||  || |||||||    
T  32063624 tgacgtggcaataattaagtgcgtgcagggacggaattttaaatgattaaactttgcaagggtaatttgccagtattaacgattacagaaaccaattttt 32063723  T
Q  171 aaatgacacctaattgca 188  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  32063724 aaatgacccctaattgca 32063741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 75 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 5369084 - 5368968
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | |||| || |||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||    
T  5369084 cgtggcagtgattaagtggggagagggacaaaattttaaatgattaaacaatgcaggggtaaattgccaggattagcgattacaaggaccaatttttaaa 5368985  T
Q  174 tgacacctaattgcaag 190  Q
     ||  ||||||||||||    
T  5368984 cgatccctaattgcaag 5368968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 75 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 13058174 - 13058058
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | |||| || |||||| ||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||    
T  13058174 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaggggtaaattaccaggattagcgattacagagaccaatttttaaa 13058075  T
Q  174 tgacacctaattgcaag 190  Q
     ||| ||||||||||||    
T  13058074 cgacccctaattgcaag 13058058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 75 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 23613446 - 23613330
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | |||| || |||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||||||||    
T  23613446 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaggggtaaattgccaagattagcgattacatggaccaatttttaaa 23613347  T
Q  174 tgacacctaattgcaag 190  Q
     ||| ||||||||||||    
T  23613346 cgacccctaattgcaag 23613330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 1178174 - 1178123
Alignment:
Q  81 agtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaagg 132  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1178174 agtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaataattgcaagg 1178123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 190
Target Start/End: Original strand, 44967354 - 44967445
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||| || |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||| |||  |||||||||||    
T  44967354 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaggggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacctctaattgcaag 44967445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 190
Target Start/End: Original strand, 50418953 - 50419044
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||| || ||||||||||||| | |||| | |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  50418953 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtagattgccaggattagcgattagagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 50419044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 190
Target Start/End: Original strand, 54435413 - 54435504
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||| ||||| ||||| |||| |||||| || |||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  54435413 ggacgaaattttaaataattatcaaatgcaatgctaatttgcaaggattgacgattacatggatcaatttttaaacgacacctaattgcaag 54435504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 186
Target Start/End: Original strand, 56015919 - 56016049
Alignment:
Q  56 cacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaatt 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |   |||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||  || ||||||  |||| | |||    
T  56015919 cacgtcatcaaatcagtgacgtggcagtgattaactgtgatgaaggacgaaattttaaatgattaacgtttgcagggacaatttgccataattagcgatt 56016018  T
Q  156 aca-ggacgaatttttaaatgacacctaattg 186  Q
    | | |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  56016019 atatggaccaatttttaaatgac-cctaattg 56016049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 13058223 - 13058261
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcat 39  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13058223 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcat 13058261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 18831456 - 18831374
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattg 186  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  18831456 aaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattaccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattg 18831374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 190
Target Start/End: Original strand, 29321174 - 29321312
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaaca 152  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |  ||  | | ||||| | |||||||||||| | ||| || | ||| ||||||| ||||||     
T  29321174 tgccacgtaagcaaattagtgacgtggcagtgattaactaggttgaggaaccaattcttaaatgattaaaatttgaaaaggtaatttgccagaattaacg 29321273  T
Q  153 attacag-gacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||| ||  || |||||||||||||| | ||||||||||    
T  29321274 attatagaaaccaatttttaaatgacccttaattgcaag 29321312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 40387608 - 40387490
Alignment:
Q  71 gtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttt 169  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   | | || ||||||||||||||||||  ||||| ||  || |||||||||||| | | |||| |||| ||||||    
T  40387608 gtgacgtggcagtgattaagtgagaagaggaacgaaattttaaatgattaacttttgcaggggcaatttgccaggattagcgaatacagggaccaatttt 40387509  T
Q  170 taaatgacacctaattgca 188  Q
    |||||| | ||||||||||    
T  40387508 taaatggcccctaattgca 40387490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 188
Target Start/End: Original strand, 41583518 - 41583636
Alignment:
Q  71 gtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttt 169  Q
    ||||||||||||||||||||| ||   | |||| ||||||||||||||||||  ||||| ||  || |||||||||||| | | |||||  |  ||||||    
T  41583518 gtgacgtggcagtgattaagtgagaagagggacgaaattttaaatgattaacttttgcaggggcaatttgccaggattagcgaatacagaaatcaatttt 41583617  T
Q  170 taaatgacacctaattgca 188  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  41583618 taaatgacccctaattgca 41583636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 32062704 - 32062615
Alignment:
Q  97 caaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaatgacacctaatt 185  Q
    ||||||| |||||||||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||||   |||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  32062704 caaggacgaaattttaaatgattaaattttacaaggctaatttgtcaggattaatgtttacaaggaccaatttttaaatgacccctaatt 32062615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 39701049 - 39700928
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    |||||||  |||||||||||| ||| |||||  ||||||||||| |||||  | || |||| || |||| |||||||| | |||||| |||  |||||||    
T  39701049 tgacgtgagagtgattaagttggtcaaaggatgaaattttaaataattaaataatgtaagggtatattgtcaggattagcgattacatggattaattttt 39700950  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaa 192  Q
    |||| || ||||||||||||||    
T  39700949 aaataacgcctaattgcaagaa 39700928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 122
Target Start/End: Original strand, 40388375 - 40388444
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaac 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |  || |||| ||||||||||||||||||    
T  40388375 tgccatgtcatcaaattagtgacgtggcaatgattaactgtgatcagggacgaaattttaaatgattaac 40388444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 188
Target Start/End: Original strand, 55867430 - 55867519
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgca 188  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||  |||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  55867430 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtagtttgcaaggattaacgattacatggaccaatttttaaacgacccctaattgca 55867519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 5369133 - 5369173
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgt 41  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  5369133 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaattttatgt 5369173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 190
Target Start/End: Original strand, 49879467 - 49879583
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||| | ||||||| ||  | ||||||||    
T  49879467 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagagatcagtttttaaa 49879566  T
Q  174 tgacacctaattgcaag 190  Q
     ||| ||||||||||||    
T  49879567 cgacccctaattgcaag 49879583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 75 - 173
Target Start/End: Original strand, 36009104 - 36009203
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | |||| || |||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  36009104 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaggggtaaatttccaggattaacgattacagggaccaatttttaaa 36009203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 10780820 - 10780734
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | | | || |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  10780820 aaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatgcatggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 10780734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 10974429 - 10974343
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | | | || |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  10974429 aaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatgcatggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 10974343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 30641630 - 30641545
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacaggacgaatttttaaatgacacctaattg 186  Q
    |||| |||||||||||||||||   ||| || | ||| |||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  30641630 ggacgaaattttaaatgattaaactttgtaatggtaatttgcaaggattaacgattacag-acaaatttttaaatgacccctaattg 30641545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 188
Target Start/End: Original strand, 148071 - 148160
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaac-aattacaggacgaatttttaaatgacacctaattgca 188  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| ||||||||| ||| |  |||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  148071 ggacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattaacgaataaagggaccaatttttaaacgacccctaattgca 148160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 151
Target Start/End: Original strand, 5369181 - 5369234
Alignment:
Q  98 aaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaac 151  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||||    
T  5369181 aaggactaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattaac 5369234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 11446382 - 11446293
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgca 188  Q
    |||| |||||||||| ||||||   |||||||| ||| |||||||||||||| ||| || | || ||||||||||||||  |||||||||    
T  11446382 ggacgaaattttaaaagattaaactttgcaagggtaatttgccaggattaacgattccatgaaccaatttttaaatgacctctaattgca 11446293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 190
Target Start/End: Original strand, 24350746 - 24350839
Alignment:
Q  98 aaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||| ||||||| | | | || |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  24350746 aaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaagctagtttgcaaggattagcgaatgcagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 24350839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 106)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24905378 - 24905166
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24905378 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgcgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtccaag 24905279  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  24905278 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgcaaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 24905179  T
Q  200 catcattaagcct 212  Q
    |||||||||||||    
T  24905178 catcattaagcct 24905166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 28011549 - 28011776
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaattt-----catgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagt 95  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  28011549 tattttgtcctcttcttaagggtaaaattggaatttcatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtgacagtgattaagttggt 28011648  T
Q  96 ccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaact 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  28011649 ccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggact 28011748  T
Q  195 aatcacatcattaagccttttataaata 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28011749 aatcacatcattaagccttttttaaata 28011776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 33442805 - 33442581
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  33442805 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 33442706  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatca 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  33442705 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagagacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 33442606  T
Q  200 catcattaagccttttataaatatc 224  Q
    ||||| |||||| || |||| ||||    
T  33442605 catcaataagccattaataattatc 33442581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 52134254 - 52134465
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  52134254 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 52134353  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatca 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  52134354 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattaacaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 52134453  T
Q  200 catcattaagcc 211  Q
    ||||| ||||||    
T  52134454 catcaataagcc 52134465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 31514529 - 31514316
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  31514529 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 31514430  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatca 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  31514429 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccagaattaacaattacaggaacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 31514330  T
Q  200 catcattaagcctt 213  Q
    ||||| ||| ||||    
T  31514329 catcaataaacctt 31514316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4716679 - 4716466
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  4716679 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 4716580  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatca 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  || |||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||    
T  4716579 gaccaaattttaaacgattaacaattgccgggttaaaatgtcaggattagcaattacatggacgaatttttaaatgccacctaattgcaagggctaaaca 4716480  T
Q  200 catcattaagcctt 213  Q
    ||||| ||| ||||    
T  4716479 catcaataaacctt 4716466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 34464660 - 34464470
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  34464660 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaat 34464561  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||| | |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  34464560 gacgaaattttaaatgattaaacattgcaagggtaaattgccaagattagcgattacatggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 34464470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 183432 - 183246
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  183432 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 183333  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattg 186  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  183332 gactaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattg 183246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 6367779 - 6367969
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  6367779 tattttgtcctcttcttaagggaaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 6367878  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| | ||||||||||    
T  6367879 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccttaattgcaag 6367969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 13914279 - 13914089
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  13914279 tattttgtcctcttcttaagggtaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggtagtgattaagttggtcaaag 13914180  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||| ||||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  13914179 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactaatttgcaaggattagcgaatacatggactaatttttaaacgacccctaattgcaag 13914089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 26024609 - 26024799
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||    
T  26024609 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattagaatttcatgtgtggcagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaaattggtcaaag 26024708  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| ||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  26024709 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 26024799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 17662061 - 17661873
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  17662061 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgatagtgattgccgcgtcatcgaattagtgacgtggca-tgattaagttggtcaaag 17661963  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacaggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||| ||||||| | | |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  17661962 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaatgctagtttgcaaggattagcgaatacaggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 17661873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 30711544 - 30711734
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  30711544 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagcgattgcaacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaat 30711643  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | | ||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  30711644 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagagaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 30711734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 190
Target Start/End: Original strand, 48779337 - 48779526
Alignment:
Q  2 attttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaagg 101  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  48779337 attttgtcatcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaagg 48779436  T
Q  102 accaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| ||||||| ||| |||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||    
T  48779437 acgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcaaatacatggactaatttttaagcgactcctaattgcaag 48779526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 37578403 - 37578213
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||    
T  37578403 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatagcagtgattaagttggtcaaag 37578304  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     || |||||||||||||||||  |||| |||||||  |||| ||||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  37578303 aacgaaattttaaatgattaatgattggaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 37578213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 43759039 - 43759229
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| |||    
T  43759039 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgatgtgacagtggttaagttggtcaaag 43759138  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||  |||| ||||||| | | |||| ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  43759139 gacgaaattttaaatgattgaagattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccgatttttaaacgacccctaattgcaag 43759229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 47999334 - 47999144
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| |||    
T  47999334 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccacgtcatcaaattggtgacgtggcaataattaagttggtcaaag 47999235  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | | |||| |||| |||||||||| ||  ||||||||||||    
T  47999234 gactaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgatccctaattgcaag 47999144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 32917477 - 32917669
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  32917477 tattttgtcctatttttaagggtaaaattggaatttcatatgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcaatgattaagttggtcaaag 32917576  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaa 192  Q
    ||  |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||||| | ||||| ||| |||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  32917577 gatgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattaacgaatacagagaccaatttttaaacgacccttaattgcaagaa 32917669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 7821171 - 7821343
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  7821171 tattttgtcctcttcttaagggcaaaaatggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtgacagtgattaagttggtcaaag 7821270  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacaggacgaatttttaaa 173  Q
    ||| ||||| |||||||||||  |||||| |||||  |||| ||||||| | | |||| ||| ||||||||||    
T  7821271 gacgaaattataaatgattaatgattgcacggctagtttgcaaggattagcgaatacatgaccaatttttaaa 7821343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 1841676 - 1841806
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  1841676 tattttgtcctcttcttaagggcaaaatttgaatttcatgtgtggtagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 1841775  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaag 131  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  1841776 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaag 1841806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 19017840 - 19017710
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  19017840 tattttgtcctcttctcaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacaatgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaacg 19017741  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaag 131  Q
     || |||||||||||||||||  ||||||||    
T  19017740 aacgaaattttaaatgattaatgattgcaag 19017710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 23209572 - 23209422
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  23209572 tattttgtcctcttcttaagggaaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgtcacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 23209473  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaac 151  Q
     || |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||||    
T  23209472 aacaaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattaac 23209422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 41098950 - 41099136
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||     
T  41098950 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcacgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatgacagtgattaagttggtcaaat 41099049  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatgacacctaattg 186  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||| |||| ||  |||| ||||||| | | ||||| ||| |||||||||| |||  |||||||    
T  41099050 gacgaaattttaaatgattaatgattgtaaggttagtttgcaaggattagcgaatacagagaccaatttttaaacgaccactaattg 41099136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 49722944 - 49723133
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  49722944 tattttgtcctcttcttaagggcaaaat-ggagtttcatgtgtggtagtgattgccacgttatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 49723042  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||  |||||||||||||||||  |||| |||||||  |||| ||||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  49723043 gatgaaattttaaatgattaatgattgaaaggctagtttgcaaggattagcgaatacatggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 49723133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 35152560 - 35152691
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||    
T  35152560 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgatgtgacagtgattaagttggtcaaag 35152659  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaagg 132  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  35152660 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaagg 35152691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 1103678 - 1103868
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  1103678 tattttgtcctcttcttaagggtaaaattggaatttcatgagtggtagtgattgccacatcatcaaattagtgacgtggcagtgaataagttggtcaaag 1103777  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| ||||||| | | |||| |||| |||||||||| |||   ||||||||||    
T  1103778 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacctttaattgcaag 1103868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 6367749 - 6367583
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  6367749 aaattggagtttcatgtgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 6367650  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  6367649 atgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 6367583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 14879188 - 14879308
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  14879188 tattttgtcatcttcttaagggcaaaattggagtttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 14879287  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaa 121  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  14879288 gacgaaattttaaatgattaa 14879308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 7821137 - 7820975
Alignment:
Q  29 tggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgc 128  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | |||    
T  7821137 tggattttcatgcgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattacgttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgc 7821038  T
Q  129 aaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||| |||||||  ||||||| | |||||| |||| |||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  7821037 aagggtaaattgtaaggattagcgattacagggactaattattaaaggacccctaattgcaag 7820975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 36694493 - 36694303
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||| |||    
T  36694493 tattttgtcctcttcttaaaggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgctacgtcatcgaattagtgacttgacagtgattaagttggtcaaag 36694394  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    | | |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| ||||||| | | ||||  ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  36694393 ggcgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgaatacatagaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 36694303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 36710594 - 36710404
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||| |||    
T  36710594 tattttgtcctcttcttaaaggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgctacgtcatcgaattagtgacttgacagtgattaagttggtcaaag 36710495  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    | | |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| ||||||| | | ||||  ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  36710494 ggcgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgaatacatagaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 36710404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 40210581 - 40210433
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||    
T  40210581 tattttgttctcttcttaagggcaaaattggaatttcacatgtaacagtgattgccatgtcatcaaattaatgtcgtggcagtgattaagttggtcaaag 40210482  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggatta 149  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| |||||||    
T  40210481 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaagtctagtttgcaaggatta 40210433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 17662091 - 17662257
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  17662091 aaattggaatttcatgtatgtcagtgattgccacttcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtgggaagagggacgaaattttaaatgattaaaca 17662190  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||| ||| || |||||||||    
T  17662191 atgcaagggtaaattgccaggattaacgattaaaggaaccaatttttaaacgaccccaaattgcaag 17662257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 34464690 - 34464856
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  34464690 aaattggaatttcatgtatgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggagagggacaaaattttaaatgattaaaca 34464789  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||    
T  34464790 ttgcaagggtaaattgccaagattagcgattacatggaccaatttttaaacaacccctaattgcaag 34464856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 4960727 - 4960562
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  4960727 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtgggaagagggacgaaattttaaatgattaaaca 4960628  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaatgacacctaattgcaa 189  Q
     ||||||| |||||||| ||||||| | | ||| | ||  |||||||||| ||| |||||||||||    
T  4960627 atgcaagggtaaattgcaaggattagcgaatacaaagagcaatttttaaacgacccctaattgcaa 4960562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 75 - 208
Target Start/End: Original strand, 24905427 - 24905560
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacaggacgaatttttaaat 174  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  24905427 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggctaaattgccaggattagcaattacaggacgaatttttaaac 24905526  T
Q  175 gacacctaattgcaagaactaatcacatcattaa 208  Q
    ||  | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  24905527 gatccataattgcaaggactaatcacatcattaa 24905560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 189
Target Start/End: Original strand, 40210611 - 40210776
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  40210611 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaatttagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 40210710  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaatgacacctaattgcaa 189  Q
     ||||||| ||||||||||| |||| | ||||| | ||| |||||||||| | | |||||||||||    
T  40210711 atgcaagggtaaattgccagaattagcgattacaaagaccaatttttaaacggcccctaattgcaa 40210776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 40714584 - 40714443
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  40714584 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattaacgattacagggactaattttt 40714485  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  40714484 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 40714443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 41098920 - 41098752
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |     |||| |||||||||||||||||  |    
T  41098920 aaattggaatttcatatgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgatgtggtagtgattaagtggggagggggacaaaattttaaatgattaaaca 41098821  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaa 192  Q
     ||||||| ||||||| |||||||| | ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  41098820 atgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagagaccaatttttaaacgacccctaattgcaagaa 41098752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 40772690 - 40772820
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  40772690 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgggagtgattgccaagtcatcgaattagtgacgt-gcagtgattaagttggtcaaag 40772788  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaagg 132  Q
    ||| |||||| |||| |||||  |||||||||    
T  40772789 gacgaaatttgaaataattaatgattgcaagg 40772820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 24009782 - 24009948
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  24009782 aaattggaatttcatgtgcgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgatgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 24009881  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||||| |||||||||||||||  | ||||| | ||| |||||||||| ||  ||||||||||||    
T  24009882 atgcaagggtaaattgccaggattggcgattacaatgaccaatttttaaacgatccctaattgcaag 24009948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 37578433 - 37578599
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   |  ||| |||||||||||||||||  |    
T  37578433 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagtgacgaaattttaaatgattaatca 37578532  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     || |||| |||||||||||||||| | ||||| |  || |||||||||| ||| || |||||||||    
T  37578533 atgtaagggtaaattgccaggattagcgattacaaaaaccaatttttaaacgacccccaattgcaag 37578599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 13914309 - 13914474
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  13914309 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgc-acgtcatcaaattagtgacgtggcagtgatttagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 13914407  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     | ||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||  ||  |||||||||||    
T  13914408 atacaagggtaaattgccaggattagcgattacatggaccaatttttaaacaacctctaattgcaag 13914474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Original strand, 49955633 - 49955774
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaattttt 170  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||    
T  49955633 tgacttggcggtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattaacgattacaaagactaattttt 49955732  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  49955733 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 49955774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 76 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 49955483 - 49955347
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaat 174  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||    
T  49955483 gtggcagtgattaagttggtcaaaggacaaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggactaatttttaaat 49955384  T
Q  175 gacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcc 211  Q
    ||  |||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  49955383 gatgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcc 49955347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 1103648 - 1103513
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  1103648 aaattggaatttcatgtatgacagtgattgccacatcatcaaattagtgacatgacagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 1103549  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg 160  Q
     ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  1103548 atgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagg 1103513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 14879158 - 14878992
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  14879158 aaattggaatttcatgtatctcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatgacagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 14879059  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||||| |||||||||| ||||| | |||||| | || |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  14879058 atgcaagggtaaattgccaagattagcgattacatgaaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 14878992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 19516002 - 19516092
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagt 91  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  19516002 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcacgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggcaatgattaagt 19516092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 30711514 - 30711348
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  | | | |||| |||||||||||||||||  |    
T  30711514 aaattggaatttcatgtatggcagtgattgccacgtcgtcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggcgagggacgaaattttaaatgattaaaca 30711415  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||||| |||||||| ||||||| | |||| || ||  ||||||||||  || ||||||||||||    
T  30711414 atgcaaggataaattgctaggattagcgattatagagatcaatttttaaacaacccctaattgcaag 30711348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 19323079 - 19322974
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||||  |    
T  19323079 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacatggtagtgattaagttggtcaaagaacgaacttttaaatgattaatga 19322980  T
Q  125 ttgcaa 130  Q
    ||||||    
T  19322979 ttgcaa 19322974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 19323109 - 19323238
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    |||||| |||| ||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||    
T  19323109 tattttatccttttcttgagggtaaaattgaaatttcatgtgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacatggtagtgattaagttggtcaaag 19323208  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaa 130  Q
     || || ||||||||||||||  |||||||    
T  19323209 aacgaacttttaaatgattaatgattgcaa 19323238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Original strand, 40714729 - 40714870
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||| | |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||    
T  40714729 tgacttggtagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaaaggtaaattgccaggattagcgattacatggactaattttt 40714828  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  40714829 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 40714870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 81 - 212
Target Start/End: Original strand, 20760800 - 20760932
Alignment:
Q  81 agtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatgacac 179  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||| |    
T  20760800 agtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagagactaatttttaaatgacgc 20760899  T
Q  180 ctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    ||||||| ||| || || |||||||||||||||    
T  20760900 ctaattgtaaggacgaaacacatcattaagcct 20760932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 42248690 - 42248818
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| ||     
T  42248690 tattttgtcatcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgc--cgtcatcgaattagtgacgtgacaatgattaagttggtcaaat 42248787  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaag 131  Q
    | | ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  42248788 gtcgaaattttaaataattaataattgcaag 42248818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 19017870 - 19018036
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  19017870 aaattggaatttcatgcgtggcagtgattgtcacgtcatcaaattagtgatgcggcagtgattaagtgggaagagggacaaaattttaaatgattaaata 19017969  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||||| |||||||||||||||| | | |||| |||| |||||||||| |||   ||||||||||    
T  19017970 atgcaagggtaaattgccaggattagcgaatacatggaccaatttttaaacgacctgtaattgcaag 19018036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 75 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 28011500 - 28011390
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  28011500 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaa 28011401  T
Q  174 tgacacctaat 184  Q
     ||| ||||||    
T  28011400 cgacccctaat 28011390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 31051090 - 31050949
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaattttt 170  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||| | |||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  31051090 tgacttggtagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaaaggtaaattgccaggattagcgattacagagactaattttt 31050991  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    |||| || |||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  31050990 aaataacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 31050949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 72 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 17189094 - 17188954
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    |||| ||| |||||||||| | ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||    
T  17189094 tgacttggtagtgattaagctggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaataatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggactaattttt 17188995  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcc 211  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  17188994 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcc 17188954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 72 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 45749982 - 45749838
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaattttt 170  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||||||| |||||||||| ||||| | ||| |||||||    
T  45749982 tgacttggtagtgattaagtttgtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagtgtaaattgtcaggattaacgattacaaagactaattttt 45749883  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcctttt 215  Q
    ||||||| |||||||||||| |  || ||||||||||||||||||    
T  45749882 aaatgacgcctaattgcaaggatgaaacacatcattaagcctttt 45749838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 81 - 212
Target Start/End: Original strand, 28325099 - 28325230
Alignment:
Q  81 agtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacaggacgaatttttaaatgacacc 180  Q
    |||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||  |||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  28325099 agtgattaagttggtcaaaagacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccataattaacgattacatgactaatttttaaatgacgcc 28325198  T
Q  181 taattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    ||||||||||  | || |||||||||||||||    
T  28325199 taattgcaaggccgaaacacatcattaagcct 28325230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Original strand, 33442854 - 33442989
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  33442854 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaa 33442953  T
Q  174 tgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaag 209  Q
    || | ||||||||||||  |||| ||||||| ||||    
T  33442954 tgccgcctaattgcaagggctaaacacatcaataag 33442989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 32917447 - 32917281
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |   |  ||| |||||||||||||||||  |    
T  32917447 aaattggaatgtcatgtgtgacagtaattgccacgtcgtcaaattagtgatgtggcagtgattaagtggggagagagacgaaattttaaatgattaaaca 32917348  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||||  |||| || |||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||  ||||||||||||    
T  32917347 atgcaagagtaaactgtcaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgattcctaattgcaag 32917281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 43759009 - 43758943
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagt 91  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43759009 aaattagaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagt 43758943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 37929550 - 37929417
Alignment:
Q  80 cagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaatttttaaatgaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||| | || ||||| || ||||||||||||||     
T  37929550 cagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaataatgtaagggtaaattgtcaggattagcgataacagggactaatttttaaatgacg 37929451  T
Q  179 cctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  37929450 cctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 37929417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Original strand, 45750128 - 45750269
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaattttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||  | ||||||  |||||||| ||||||| | ||||| | ||| |||||||    
T  45750128 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaatgatgaaattttaaatgattaaacaatgcaagagtaaattgctaggattagcgattacaaagactaattttt 45750227  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  45750228 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 45750269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 46163217 - 46163056
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  |   |  ||| |||||||||||||||||  |    
T  46163217 aaattggaatttcatgtatggcagtaattgccacgtcatcaaattagtgacatgacagtaattaagtggggagagagacgaaattttaaatgattaaaca 46163118  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaatt 185  Q
     ||||||| ||||||| |||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||| |||||||    
T  46163117 atgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacatggaccaatttttaaacgacccctaatt 46163056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 72 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8898657 - 8898514
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaattttt 170  Q
    ||||||| |||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||  | | ||||  |||||| |||| |||| | ||||||| ||| |||||||    
T  8898657 tgacgtgacagtgattaaattggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatacaagagtaaattaccagaattagcgattacagtgactaattttt 8898558  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagccttt 214  Q
    ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  8898557 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagccttt 8898514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 31058343 - 31058485
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||  || |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||  ||| |||||||    
T  31058343 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaatacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaagattatcgattacattgactaattttt 31058442  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcctt 213  Q
    ||||||   ||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  31058443 aaatgatgtctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcctt 31058485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 42248660 - 42248494
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  42248660 aaattggaatttcatgtatggtagtgattgccacatcaacaaattagtcacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 42248561  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||||| |||||||||| ||||| | | ||| | ||| |||||||||| |||  |||||||||||    
T  42248560 atgcaagggtaaattgccacgattagcgactacaaagaccaatttttaaacgaccactaattgcaag 42248494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 48779304 - 48779238
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagt 91  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48779304 aaattggaatttcatgtatgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagt 48779238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 7371430 - 7371293
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaattttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||  | ||||||| |||||| |||| || | | |||||||  || |||||||    
T  7371430 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaataattaaacaatgcaaggataaattaccagaatcagcgattacagaaactaattttt 7371331  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaa 208  Q
    |||||||||||||||||||| || || || ||||||||    
T  7371330 aaatgacacctaattgcaaggacgaaacatatcattaa 7371293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 80 - 212
Target Start/End: Original strand, 12905953 - 12906086
Alignment:
Q  80 cagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||      
T  12905953 cagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacatggactaatttttaaatgatg 12906052  T
Q  179 cctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
     | ||||||||| || || |||||||||||||||    
T  12906053 tcaaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 12906086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28324944 - 28324803
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacaggacgaattttta 171  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||| | |||||| ||   | |||||    
T  28324944 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaagacgaaattttaaatgattaaataatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacatgaactaatttta 28324845  T
Q  172 aatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcctt 213  Q
    || ||| |||||||||||| |  || ||||||||||||||||    
T  28324844 aacgacgcctaattgcaaggaggaaacacatcattaagcctt 28324803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 208
Target Start/End: Original strand, 35040900 - 35041037
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||| | |||||| |||| |||||||    
T  35040900 tgacttggtagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacatggactaattttt 35040999  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaa 208  Q
    |||||||  |||||| |||| || || |||||||||||    
T  35041000 aaatgacggctaattacaaggacgaaacacatcattaa 35041037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 30326636 - 30326496
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaattttt 170  Q
    |||| ||| |||||||||||||||  || | | |||||||||||||||||  | ||||||| |||||| |||| |||| | ||||||| ||| |||||||    
T  30326636 tgacttggtagtgattaagttagttaaatgtcgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattaccagaattagcgattacagagactaattttt 30326537  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcc 211  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  30326536 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcc 30326496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 8898803 - 8898945
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaattttt 170  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| ||| ||||   ||||||| ||| |||||||    
T  8898803 tgacttggtagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcagtattagtgattacagagactaattttt 8898902  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcctt 213  Q
    ||||||| ||||||| |||| || || ||||||||||||||||    
T  8898903 aaatgacgcctaattacaaggacgaaacacatcattaagcctt 8898945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 204
Target Start/End: Original strand, 31514577 - 31514707
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  31514577 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaataattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaa 31514676  T
Q  174 tgacacctaattgcaagaactaatcacatca 204  Q
    || | |||||||| |||  |||| |||||||    
T  31514677 tgccgcctaattgtaagggctaaacacatca 31514707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 35152530 - 35152364
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  35152530 aaattggaatttcatgtatggtagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacattgcagtgattaagtggggagagggacaaaattttaaatgattaaaca 35152431  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     || |||| ||||||| ||| |||| | |||| | |||| |||||||||| |||  |||||||||||    
T  35152430 atgtaagggtaaattggcagtattagcgattatagggaccaatttttaaacgacctctaattgcaag 35152364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 52134205 - 52134067
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||| ||||||||||| || || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  52134205 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaacgattaacaattacagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaa 52134106  T
Q  174 tgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    |  | ||||||||||||  |||| ||||||| |||||||    
T  52134105 taccgcctaattgcaagggctaaacacatcaataagcct 52134067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 1841646 - 1841481
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |   |  ||| |||||||||||||||||  |    
T  1841646 aaattggaatttcatatatggcagtgattgtcacatcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggagagtgacgaaattttaaatgattaaaca 1841547  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatgacacctaattgcaa 189  Q
     || |||| ||||||| |||||||| | ||||| | ||| |||||||||| ||| | |||||||||    
T  1841546 atgtaagggtaaattgtcaggattagcgattacggagaccaatttttaaacgactcttaattgcaa 1841481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 108 - 211
Target Start/End: Original strand, 17189173 - 17189277
Alignment:
Q  108 ttttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcatt 206  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||| || || |||||||||    
T  17189173 ttttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggactaatttttaaatgacgtctaattgcaaggacgaaacacatcatt 17189272  T
Q  207 aagcc 211  Q
    |||||    
T  17189273 aagcc 17189277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 204
Target Start/End: Original strand, 4716758 - 4716857
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacaggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatcacatca 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    ||||||||||||  |||| |||||||    
T  4716758 aaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaatttcaggacaaatttttaaatattgcctaattgcaagggctaaacacatca 4716857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 35473763 - 35473652
Alignment:
Q  80 cagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||  ||| ||||||||  |||||||||||| | |||||| |||| |||||||||| |||     
T  35473763 cagtgattaagttggtcaaaggacaaaattttaaatgtttaatgattacaaggctagtttgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacc 35473664  T
Q  179 cctaattgcaag 190  Q
    ||||||||||||    
T  35473663 cctaattgcaag 35473652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 209
Target Start/End: Original strand, 44523405 - 44523562
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaaca 152  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |    | |||  |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| |     
T  44523405 tgccacgtcagctaattagtgacgtggcagtgattaagtgaagggagggatgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccatgattagcg 44523504  T
Q  153 attacag-gacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaag 209  Q
    |||| ||  |  |||||||||||||  |||||||||||| || || ||||||||||||    
T  44523505 attatagatattaatttttaaatgaggcctaattgcaaggacgaaacacatcattaag 44523562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 75 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 25648021 - 25647905
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | |||| || |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  25648021 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaataatgcaggggtaaattgccaggattaacgattacagggaccaatttttaaa 25647922  T
Q  174 tgacacctaattgcaag 190  Q
     ||| ||||||||||||    
T  25647921 cgacccctaattgcaag 25647905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 26024560 - 26024442
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| || ||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||    
T  26024560 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaacttttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagagaccaatttttaaa 26024461  T
Q  174 tgacacctaattgcaagaa 192  Q
     ||| ||||||||||||||    
T  26024460 cgacccctaattgcaagaa 26024442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 72 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 35038595 - 35038458
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | | |||   ||| |||| ||||||||| |||||| |||  |||||||    
T  35038595 tgacgtggcagtgattgagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatacaaaagtaatttgctaggattaacgattacatggatcaattttt 35038496  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaa 208  Q
    ||||||| | |||||||||| || || ||||| |||||    
T  35038495 aaatgacccttaattgcaaggacgaaacacattattaa 35038458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 212
Target Start/End: Original strand, 32558419 - 32558534
Alignment:
Q  98 aaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagga-cgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaa 196  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||  |||||||| | |||| |||| | ||||||||||||||  ||||||| ||| || ||    
T  32558419 aaggacgaaattttaaatgattaaacattacaagggtaaattatcaggattagcgattataggaactaatttttaaatgacgtctaattgtaaggacaaa 32558518  T
Q  197 tcacatcattaagcct 212  Q
     |||||||||||||||    
T  32558519 acacatcattaagcct 32558534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 5734121 - 5734031
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacaggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||||| |||| |||| ||||||| | |||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  5734121 ggacaaaattttaaatgattaaacaatgcaagactaatttgcaaggattagcgattacatgaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 5734031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 190
Target Start/End: Original strand, 34850334 - 34850472
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaaca 152  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||  |   | |||  |||||||||||||||||   |||||||| ||| |||| ||||||| |     
T  34850334 tgccacgtcagctaatcagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggatgaaattttaaatgattaaattttgcaagggtaatttgcaaggattagcg 34850433  T
Q  153 attaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  34850434 aatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 34850472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 190
Target Start/End: Original strand, 36694569 - 36694655
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||| | ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  36694569 aaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagagaccaatttttaaacaacacctaattgcaag 36694655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 190
Target Start/End: Original strand, 36710670 - 36710756
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||| | ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  36710670 aaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagagaccaatttttaaacaacacctaattgcaag 36710756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 149
Target Start/End: Original strand, 4960801 - 4960874
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggatta 149  Q
    |||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||    
T  4960801 gtggcagtgattaagttgatcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggatta 4960874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 10304093 - 10304048
Alignment:
Q  8 tcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10304093 tcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgatt 10304048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 24009713 - 24009596
Alignment:
Q  74 acgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaa 172  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||  | || |||||||   | ||| ||||| |||||||||    
T  24009713 acgtgacagtgattaagttggtcaaaggatgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagttggcaaggattagtgaatacaaggaccaatttttaa 24009614  T
Q  173 atgacacctaattgcaag 190  Q
    | ||| ||||||||||||    
T  24009613 acgacccctaattgcaag 24009596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 215
Target Start/End: Original strand, 25885366 - 25885423
Alignment:
Q  158 aggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcctttt 215  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  25885366 aggactaatttttaaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcctttt 25885423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 173
Target Start/End: Original strand, 32133236 - 32133313
Alignment:
Q  97 caaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaa 173  Q
    ||||||| |||||||||||||||||   |||| ||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  32133236 caaggacgaaattttaaatgattaaactttgcgaggctaatttgccaagattaacgattacaaggacgaatttttaaa 32133313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 190
Target Start/End: Original strand, 23209643 - 23209734
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgatt-aacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  23209643 ggacgaaattgtaaatgattgaacaat-gcaagggtaaattgccaggattagcgattacaaggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 23209734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 24009752 - 24009700
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||    
T  24009752 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcacacgtgacagtgatt 24009700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 34849152 - 34849032
Alignment:
Q  71 gtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttt 169  Q
    ||||||||||||||||||||   |   | |||| |||||||||||||||||   |||||||| ||| |||| ||||||| | | |||| |||| ||||||    
T  34849152 gtgacgtggcagtgattaagaggggagagggacgaaattttaaatgattaaattttgcaagggtaatttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttt 34849053  T
Q  170 taaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||    
T  34849052 taaaagacccctaattgcaag 34849032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 19515931 - 19515840
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||| ||||||||||| |||||  | ||||||| |||||| |||| |||||| ||||| | ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19515931 ggacgaaattttaaataattaaacaatgcaagggtaaatttccagaattaacgattacaaagaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 19515840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 32132444 - 32132329
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    |||||||||||| |||||||  ||  | |||| ||||||||| |||||||   ||| |||  ||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  32132444 tgacgtggcagtaattaagtgggtgtagggacgaaattttaattgattaaactttgtaagagtaatttgcaaggattaacgattacatggacgaattttt 32132345  T
Q  171 aaatgacacctaattg 186  Q
    |||||||  |||||||    
T  32132344 aaatgaccactaattg 32132329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 40772619 - 40772528
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||||||| |||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||| | ||||||||||    
T  40772619 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagagtaaattgtcaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccataattgcaag 40772528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 49722914 - 49722885
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattg 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49722914 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattg 49722885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 105 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 31197167 - 31197088
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatgacacctaattgca 188  Q
    ||||||||||||||||     ||||||| ||| || ||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  31197167 aaattttaaatgatta-----tgcaagggtaattttccaggattaacgaatacagagacaaatttttaaatgacccctaattgca 31197088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 190
Target Start/End: Original strand, 47999415 - 47999499
Alignment:
Q  107 attttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||||||||||||||  | |||| || |||||||||| ||||| | |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  47999415 attttaaatgattaaataatgcaggggtaaattgccaagattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattacaag 47999499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 65)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 14196826 - 14196613
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  14196826 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtgacagtgattaagttggtccaag 14196727  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatca 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  14196726 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaagctaaattgccagaattagcaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 14196627  T
Q  200 catcattaagcctt 213  Q
    ||||||||||||||    
T  14196626 catcattaagcctt 14196613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 363063 - 362865
Alignment:
Q  19 agggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgat 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    
T  363063 agggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaaggaccaaattttaaacgat 362964  T
Q  119 taacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcctttta 216  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||    
T  362963 taacaattgcagggttaaaatgccaggattaacaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaacacatcaataagcctttta 362865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 28000596 - 28000392
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  28000596 tattttgtcatcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 28000497  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatca 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| || |||||||| |||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  28000496 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgacaggattagcaattaaagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 28000397  T
Q  200 catca 204  Q
    |||||    
T  28000396 catca 28000392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 30337635 - 30337825
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||    
T  30337635 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccatgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaaattggtcaaag 30337734  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  30337735 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgattacagggaccaatttttaaatgacccctaattgcaag 30337825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 33517751 - 33517941
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  33517751 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtgtgtcattgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 33517850  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  33517851 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctactttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 33517941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 21627924 - 21627776
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  21627924 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 21627825  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggatta 149  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||    
T  21627824 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggatta 21627776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 30725976 - 30726166
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  30725976 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgcaacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 30726075  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||| ||||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  30726076 gacgaaattttaaatgattaatgatttcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 30726166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 17734405 - 17734217
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||    
T  17734405 tattttgtcctctt--taagggcaaaattgtaatttcatgtgtggcagtaattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaaattggtcaaag 17734308  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| ||||||| || || |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  17734307 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcaattacaagaaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 17734217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 30804078 - 30804268
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  30804078 tattttgtcctcttcttaagggtaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 30804177  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||| || |||| | | |||| |||  |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  30804178 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaacgctagtttgcaagaattagcgaatacagggatcaatttttaaacgacccctaattgcaag 30804268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 80 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 25486085 - 25485956
Alignment:
Q  80 cagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgaca 178  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||     
T  25486085 cagtgattaaattggtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgacg 25485986  T
Q  179 cctaattgcaagaactaatcacatcattaa 208  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  25485985 cttaattgcaaggactaatcacatcattaa 25485956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 190
Target Start/End: Original strand, 33647170 - 33647358
Alignment:
Q  3 ttttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaagga 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  33647170 ttttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcacgtgtggtagtgattgccatgtcatcaaatttgtgacgtggcagtgattaagtttgtcaaagga 33647269  T
Q  103 ccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    | |||||||||||||||||  ||||||||| ||  |||| ||||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  33647270 ctaaattttaaatgattaatgattgcaaggttagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 33647358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Original strand, 3059476 - 3059663
Alignment:
Q  4 tttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggac 103  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||     
T  3059476 tttgtccacttcttaagggcaaaattggaatttcacgtgtggcagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaagat 3059575  T
Q  104 caaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  3059576 gaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 3059663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 12080853 - 12081043
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||| || |||| |||||||| ||| |||    
T  12080853 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgtcacgtcatcgaattagtgacatgacagtaattaagttggtcaaag 12080952  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| ||||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  12080953 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgaatacagggacaaatttttaaacgactcctaattgcaag 12081043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 105 - 210
Target Start/End: Original strand, 14196905 - 14197011
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatcacatc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  14196905 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaacgacgcctaattgcaaggactaatcacatc 14197004  T
Q  204 attaagc 210  Q
    |||||||    
T  14197005 attaagc 14197011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 21627954 - 21628120
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  21627954 aaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacaaaattttaaatgattaaaca 21628053  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||||| ||||||| |||||||| | |||||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||||    
T  21628054 atgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagggaccaatttttaagcgacccctaattgcaag 21628120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 21836170 - 21836035
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacaggacgaattttta 171  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||    
T  21836170 tgacgtggcagtgattaagtt-gtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacaagactaattttta 21836072  T
Q  172 aatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaa 208  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21836071 aatgacgcctaattgcaagaacgaaacacatcattaa 21836035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 30725946 - 30725779
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  30725946 aaattggaatttcatgtatggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaaatggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 30725847  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaa 192  Q
     ||||||| ||||||| |||||||| | ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  30725846 gtgcaagggtaaattggcaggattagcgattacagagaccaatttttaaacgac-cctaattgcaagaa 30725779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 77 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 32593625 - 32593489
Alignment:
Q  77 tggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatg 175  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| | |||| | |||| ||||||||||||    
T  32593625 tggcagtgattaagttggtccaaagacgaaattttaaatgattaacaaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattatagggactaatttttaaatg 32593526  T
Q  176 acacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  32593525 acgcctaattgaaaggactaaacacatcattaagcct 32593489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 3059444 - 3059278
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  3059444 aaattggaatttcatgtgtgacaatgattgccacgtcatcacattagtgacatggcagtgattaagtgaggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 3059345  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||||| |||||||| ||||||| | |||||| |||| |  ||||||| ||| | ||||||||||    
T  3059344 atgcaagggtaaattgctaggattagcgattacatggacaatattttaaacgacccttaattgcaag 3059278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 33517721 - 33517555
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  33517721 aaattgaaatttcatgtatgacaatgattgccacgtcatcaaattagtgacgtagcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 33517622  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||  ||||||| ||||    
T  33517621 atgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgatccctaattacaag 33517555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 11393025 - 11392866
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   |  ||| |||||||||||||||||  |    
T  11393025 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttgggagatagacgaaattttaaatgattaaaca 11392926  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaatgacacctaa 183  Q
     ||||||| ||||||   ||||||| | ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||    
T  11392925 atgcaagggtaaattattaggattagcgattacaaggaccaatttttaaacgactcctaa 11392866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 33647150 - 33647015
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |   |  ||| |||||||||||||||||  |    
T  33647150 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaaatggggagagagacgaaattttaaatgattaaata 33647051  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg 160  Q
     ||||||| ||||||| || ||||| | ||||||||    
T  33647050 atgcaagggtaaattggcaagattagcgattacagg 33647015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 12080823 - 12080657
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  12080823 aaattggaatttcatatatgacagtgattgccacatcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 12080724  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     |||| || |||||||||| ||||| | |||||| |||  |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  12080723 atgcaggggtaaattgccatgattagcgattacagggagcaatttttaaacgacccctaattgcaag 12080657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 22503060 - 22503202
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaattttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||| |||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||    
T  22503060 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaatgacgaaaatttaaatgattaaacaatgcaaggataaattgccaggattagcgattacaaggactaattttt 22503159  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcctt 213  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  22503160 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacattattaagcctt 22503202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 100 - 213
Target Start/End: Original strand, 25486211 - 25486325
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatc 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||||| ||||| |    
T  25486211 ggacgaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccgggattagcaattacagggacgaatttttaaacgacgcttagttgcaaggactaacc 25486310  T
Q  199 acatcattaagcctt 213  Q
    | |||||||||||||    
T  25486311 atatcattaagcctt 25486325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 30804048 - 30803882
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  30804048 aaattgaaatttcatgtatggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgagatggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 30803949  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     || |||| |||||||||||||||||| ||||||  ||  |||||||||| |||||||| |||||||    
T  30803948 atgtaagggtaaattgccaggattaacgattacatagatcaatttttaaacgacacctagttgcaag 30803882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 7160944 - 7160807
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaattttt 170  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||  |||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  7160944 tgacgtggtagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagagtaaattgccaggattagcgattacagagactaattttt 7160845  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaa 208  Q
    ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||    
T  7160844 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaa 7160807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 82 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7905373 - 7905244
Alignment:
Q  82 gtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaatgacacc 180  Q
    ||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  7905373 gtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaataatgcaagggtaaattgccaggattaacgattacaaggactaatttttaaatgacgcc 7905274  T
Q  181 taattgcaagaactaatcacatcattaagc 210  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||    
T  7905273 taattgcaaggacgaaacacatcattaagc 7905244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 85 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22367552 - 22367415
Alignment:
Q  85 attaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaa 183  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||   |||||    
T  22367552 attaatttggtcaaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgctgcctaa 22367453  T
Q  184 ttgcaagaactaatcacatcattaagccttttataaat 221  Q
    |||||||  | ||| |||||| |||||||| |||||||    
T  22367452 ttgcaagggcaaataacatcaataagccttatataaat 22367415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 208
Target Start/End: Original strand, 31407164 - 31407301
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||| | |||||| |||| |||||||    
T  31407164 tgacgtgacagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagggactaattttt 31407263  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaa 208  Q
    ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||    
T  31407264 aaatgacgcctaattgcaaggacgaagcacatcattaa 31407301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 213
Target Start/End: Original strand, 28000645 - 28000784
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  28000645 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccagaattagcaattacagagacaaatttttaaa 28000744  T
Q  174 tgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcctt 213  Q
    || | ||||||||||||  |||| || |||| ||||||||    
T  28000745 tgccgcctaattgcaagggctaaacagatcaataagcctt 28000784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 77 - 190
Target Start/End: Original strand, 22372950 - 22373064
Alignment:
Q  77 tggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatg 175  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  22372950 tggcagtcattaatttggtccaaggatcaaattttaaatgattaacaattgcaggattaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatg 22373049  T
Q  176 acacctaattgcaag 190  Q
     | ||||||||||||    
T  22373050 ccgcctaattgcaag 22373064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Original strand, 21836316 - 21836457
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaattttt 170  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||| | ||||| || || |||||||    
T  21836316 tgacttggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacaagaactaattttt 21836415  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    ||||||| |||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  21836416 aaatgacgcctaattgcaaggatgaaacacatcattaagcct 21836457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22502914 - 22502777
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaattttt 170  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||| | ||||| ||||| |||||||    
T  22502914 tgacttggcagttattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacaaggactaattttt 22502815  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaa 208  Q
    ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||    
T  22502814 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaa 22502777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 72 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 6517642 - 6517503
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaattttt 170  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | ||||||  ||| |||||||    
T  6517642 tgacttggtagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagg-taaattgccaggattagcgattacaaagactaattttt 6517544  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcc 211  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  6517543 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcc 6517503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 72 - 215
Target Start/End: Original strand, 7905529 - 7905673
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||| ||||||||||  | ||||||| ||||||||||| |||| | |||| | |||| ||||| |    
T  7905529 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaatgacgaaatttgaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccagaattagcgattatagggacaaatttat 7905628  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcctttt 215  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||    
T  7905629 aaatgacacctaattgcaaggacgaaacacatcattaaacctttt 7905673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 72 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 31407018 - 31406878
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | |||||||  ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  31407018 tgacttgggagtgattaagtttgtcaaaggacgaaattttaaatgattaaataatgcaaggacaaattaccaggattaacgattacagggactaattttt 31406919  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcc 211  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||| ||||||||    
T  31406918 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacattattaagcc 31406878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 75 - 211
Target Start/End: Original strand, 363090 - 363227
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  363090 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaa 363189  T
Q  174 tgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcc 211  Q
    || | ||||||||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  363190 tgccgcctaattgcaagggctaaacacatcaataagcc 363227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 11434954 - 11434823
Alignment:
Q  60 tcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca- 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | ||||     
T  11434954 tcatcaaattagtgacgtggcagtgattaactgggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaacgattagcgaatacat 11434855  T
Q  159 ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||| |||||||||| ||| | ||||||||||    
T  11434854 ggaccaatttttaaacgacccttaattgcaag 11434823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15913688 - 15913551
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaattttt 170  Q
    |||| ||| ||||||||||||  || || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||| |||| |||| ||||||| | ||| |||||||    
T  15913688 tgacttggtagtgattaagttgttcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattaccagaattagcaattacaaagactaattttt 15913589  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaa 208  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  15913588 aaatgacgcctaattgcaataacgaaacacatcattaa 15913551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 30337586 - 30337470
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||    
T  30337586 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaccaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaa 30337487  T
Q  174 tgacacctaattgcaag 190  Q
     ||| ||||||||||||    
T  30337486 cgacccctaattgcaag 30337470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Original strand, 15913834 - 15913975
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||  | | || || ||| || ||| ||||||| |||| | |||| |||||||    
T  15913834 tgacgtgacagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaattattaaacaatacaggggtaattttccaagattaacgattatatggacaaattttt 15913933  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    ||||||| | |||||||||| || || |||||||||||||||    
T  15913934 aaatgacccttaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 15913975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 25486140 - 25486084
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgcca 57  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25486140 tattttgtccccttcttaagagcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgcca 25486084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 212
Target Start/End: Original strand, 7161100 - 7161231
Alignment:
Q  82 gtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacc 180  Q
    ||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| ||||||||   |||| | |||| |||||||||||||| ||    
T  7161100 gtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagtgattatagggactaatttttaaatgacgcc 7161199  T
Q  181 taattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    |||||||||| || ||  | ||||||||||||    
T  7161200 taattgcaaggacgaaatatatcattaagcct 7161231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 190
Target Start/End: Original strand, 680997 - 681135
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaaca 152  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| |  |  || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| |     
T  680997 tgccacgtcagctaatcagtgacgtggcagtaattaactgggctcatggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcg 681096  T
Q  153 attacag-gacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    | ||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  681097 aatacagagaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 681135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 12065352 - 12065242
Alignment:
Q  80 cagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaaca-attgcaaggctaaattgccaggattaacaattacaggacgaatttttaaatgaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||| | | | ||||| ||||||||||| |||| | |||||| ||| |||||||||||||      
T  12065352 cagtgattaagttggtcaaaggtcgaaattttaaatgattaaaacaatacaagggtaaattgccagaattagcgattacatgactaatttttaaatgatg 12065253  T
Q  179 cctaattgcaa 189  Q
    |||||||||||    
T  12065252 cctaattgcaa 12065242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 24210684 - 24210557
Alignment:
Q  59 gtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca 158  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |   |   | |||  |||||||||||||||||   |||||||| ||| |||| | ||||||||||||||    
T  24210684 gtcatcaaattagtgacgtggcggtgattaggcggggagagggatgaaattttaaatgattaaactttgcaagggtaatttgctatgattaacaattaca 24210585  T
Q  159 g-gacgaatttttaaatgacacctaatt 185  Q
    | ||| |||||||||||||| |||||||    
T  24210584 gagaccaatttttaaatgacccctaatt 24210557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 26463321 - 26463202
Alignment:
Q  70 agtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattt 168  Q
    |||||||||||||||||||| |  |   | |||| |||||||||||||||||   |||||||| ||| |||||||||||||| | |||| |||| |||||    
T  26463321 agtgacgtggcagtgattaactgggatgagggacgaaattttaaatgattaaactttgcaagggtaatttgccaggattaacgaatacagggaccaattt 26463222  T
Q  169 ttaaatgacacctaattgca 188  Q
    ||||| ||| ||||||||||    
T  26463221 ttaaacgacccctaattgca 26463202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 57 - 188
Target Start/End: Original strand, 28498298 - 28498430
Alignment:
Q  57 acgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaatta 156  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||||| |  |  || ||||||||||||||||||||||   |||  ||| ||  |||||||||||| | ||||    
T  28498298 acgtcagctaatcagtgacgtggcagtgattaactgggctcagggaccaaattttaaatgattaaactttgggagggtagtttgccaggattagcgatta 28498397  T
Q  157 c-aggacgaatttttaaatgacacctaattgca 188  Q
    | ||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  28498398 caaggaccaatttttaaatgagccctaattgca 28498430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 178
Target Start/End: Original strand, 10781444 - 10781551
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaattttt 170  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| ||| || ||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| | | | |||||||    
T  10781444 tgacttggtagtgattaagttggtcaaagaacaaaattttaaataattaaacaatgcaaggataaattgtcaggattaacgattacaatggctaattttt 10781543  T
Q  171 aaatgaca 178  Q
    ||||||||    
T  10781544 aaatgaca 10781551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 15115479 - 15115360
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    |||||||| ||| |||||||  ||  |||||| |||||||||||||||||   |||||||||||| |||| ||||||||| |||| | |||| |||||||    
T  15115479 tgacgtggtagtaattaagtgggtgtaaggactaaattttaaatgattaaactttgcaaggctaatttgcaaggattaacgattatagggaccaattttt 15115380  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| ||   |||||||||||    
T  15115379 aaacgatctctaattgcaag 15115360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 190
Target Start/End: Original strand, 15116548 - 15116639
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||  |||| ||||||| | ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  15116548 ggaccaatttttaaatgattaaactttgcaaggctagtttgcaaggattagcgattacgaggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 15116639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 190
Target Start/End: Original strand, 141061 - 141147
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||||||||||||||||   |||||||  ||| |||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  141061 aaattttaaatgattaatttttgcaagagtaatttgcaaggattaacgattacaggaacaaatttttaaataacatctaattgcaag 141147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 190
Target Start/End: Original strand, 149082 - 149168
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||||||||||||||||   |||||||  ||| |||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  149082 aaattttaaatgattaatttttgcaagagtaatttgcaaggattaacgattacaggaacaaatttttaaataacatctaattgcaag 149168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 680025 - 679887
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaaca 152  Q
    |||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| |  |  || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| |     
T  680025 tgccacgtcagctaatcagtgatgtggcagtaattaactgggctcatggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcg 679926  T
Q  153 attacag-gacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    | ||||| ||| |||||||||| ||| | ||||||||||    
T  679925 aatacagagaccaatttttaaacgacccttaattgcaag 679887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 8089555 - 8089466
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgca 188  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||| ||||||||| |||| | |||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  8089555 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaatttgcaaggattaacgattatagggaccaatttttaaacgacccctaattgca 8089466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 128 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10781231 - 10781146
Alignment:
Q  128 caaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    ||||| |||||||||| || |||| ||| |||| || |||||||||||||| |||||||| ||| || || |||||||||||||||    
T  10781231 caagggtaaattgccacgaataacgattgcagggactaatttttaaatgacgcctaattgtaaggacgaaacacatcattaagcct 10781146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 11393055 - 11393107
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  11393055 tattttgccatcttcttaagggcaaaattggaatttcacgtgtggcagtgatt 11393107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 12407667 - 12407599
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaa 121  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||| ||||| |  || || ||||||||||||||||||||||    
T  12407667 tgccacgtgagctaattagtgacgtggcagtaattaactaggttcagggaccaaattttaaatgattaa 12407599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 190
Target Start/End: Original strand, 8090243 - 8090334
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| |||| |||||||   | ||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  8090243 ggaccaaattttaaatgattaaactttgcaagggtaatttgcaaggattagtgaatacaaggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 8090334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 185
Target Start/End: Original strand, 11393096 - 11393206
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaat 174  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||| |||||| ||||||||||  |||||||| |||  |||| ||||||| | | |||  |||| ||||||||||     
T  11393096 gtggcagtgattaagttggtcaaatgacgaaatttgaaatgattaatgattgcaagtctagtttgcaaggattagcgaatacggggaccaatttttaaac 11393195  T
Q  175 gacacctaatt 185  Q
    ||| |||||||    
T  11393196 gacccctaatt 11393206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 134
Target Start/End: Original strand, 20651935 - 20651997
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggct 134  Q
    |||||||||||| ||||| |  || || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20651935 tgacgtggcagtaattaactgggttcagggacgaaattttaaatgattaacgattgcaaggct 20651997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 188
Target Start/End: Original strand, 26464550 - 26464604
Alignment:
Q  135 aaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgca 188  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  26464550 aaattgccaggattaacaaatacagggaccattttttaaatgacccctaattgca 26464604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 188
Target Start/End: Original strand, 13379798 - 13379887
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgca 188  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| || |||| | | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  13379798 ggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaagaattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgca 13379887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 121
Target Start/End: Original strand, 29810709 - 29810773
Alignment:
Q  57 acgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaa 121  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||||| |  |  || ||||||||||||||||||||||    
T  29810709 acgtcagctaatcagtgacgtggcagtgattaactgggctcagggaccaaattttaaatgattaa 29810773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 101)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 41930702 - 41930915
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  41930702 tattttgtcatcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacctcatcaaattagtgacgtggtagtgattaagttggtccaag 41930801  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  41930802 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgcaaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattacaaggactaatca 41930901  T
Q  200 catcattaagcctt 213  Q
    ||||||||| ||||    
T  41930902 catcattaaacctt 41930915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 6758076 - 6757876
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6758076 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtccaag 6757977  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatca 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  6757976 gaccaaattttaaatgattaacaattgcgagactaaattgccaggattagcaattacagggacaaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatca 6757877  T
Q  200 c 200  Q
    |    
T  6757876 c 6757876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 31482613 - 31482402
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  31482613 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 31482514  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatca 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  31482513 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 31482414  T
Q  200 catcattaagcc 211  Q
    ||||| ||||||    
T  31482413 catcaataagcc 31482402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 1506153 - 1506366
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  1506153 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 1506252  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatca 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  1506253 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 1506352  T
Q  200 catcattaagcctt 213  Q
    ||||| ||| ||||    
T  1506353 catcaataaacctt 1506366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 297225 - 297013
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  297225 tattttgtcctcttcttgagggcaaaattgtaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgatgtggcagtgattaatttggtccaag 297126  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatca 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  297125 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaataccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 297026  T
Q  200 catcattaagcct 212  Q
    ||||| |||||||    
T  297025 catcaataagcct 297013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 3529084 - 3528894
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  3529084 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgtcacatcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 3528985  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||| ||| |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  3528984 gactaaattttaaatgattaacgattgcaaggctagtttgcaaggattagcaaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 3528894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 11761934 - 11762124
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  11761934 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccacatcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 11762033  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  11762034 gactaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 11762124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 19892519 - 19892329
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||    
T  19892519 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgccagtgattgccacgtcatcaaattagttacgtggcagtgattaagttgatcaaag 19892420  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||| ||||||||| | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19892419 gacgaaattttaaatgattaatgattacaaggctagtttgcaaggattaacgaatacatggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 19892329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 6301760 - 6301949
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||    
T  6301760 tattttgtcctcttcttaaggccaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaaattggtcaaag 6301859  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaatgacacctaattgcaa 189  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| ||||||||| | ||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  6301860 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattaacgaatacaaggaccaatttttaaacgacccctaattgcaa 6301949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 190
Target Start/End: Original strand, 32242463 - 32242648
Alignment:
Q  5 ttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggacc 104  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||     
T  32242463 ttgtcctcttcgtaagggaaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggaca 32242562  T
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacaggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | | |||||||| ||||||||||  || ||||||||||||    
T  32242563 aaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacaggactaatttttaaacaacccctaattgcaag 32242648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Original strand, 39453519 - 39453706
Alignment:
Q  4 tttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggac 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  39453519 tttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggac 39453618  T
Q  104 caaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  39453619 gaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaagattagcgaatacagggaccaatttttaaatgacccctaattgcaag 39453706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 27587332 - 27587522
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  27587332 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttagcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtagcagtgattaagttggtcaaag 27587431  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | | ||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  27587432 gactaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacaaggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 27587522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 6150637 - 6150827
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  6150637 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaattttatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 6150736  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||||| | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  6150737 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaagattaacgaatacatggactaatttttaaacgacccctaattgcaag 6150827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 14194634 - 14194444
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  14194634 tattttgtcctcttcttaagggctaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgatgtggcagtgattaagttggtcaaag 14194535  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| ||||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  14194534 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 14194444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 16157066 - 16156876
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  16157066 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgggagtgattgccatgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 16156967  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| ||||||||| | ||||  ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  16156966 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattaacgaatacatagaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 16156876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 38475244 - 38475067
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  38475244 tattttgtcctcttcttaagggtaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaat 38475145  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgac 177  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||  |||| ||||||| | | |||| |||| ||||||||||||||    
T  38475144 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggttagtttgcaaggattagcgaatacatggaccaatttttaaatgac 38475067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 21265354 - 21265167
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  21265354 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgttatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 21265255  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgc 187  Q
    ||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||  |||| ||||||| ||| |||| |||| |||||||||| |||  ||||||||    
T  21265254 gacgaaattttaaataattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcaaatacatggaccaatttttaaacgacctctaattgc 21265167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 8322621 - 8322811
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  8322621 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaattttcatgtgtggtggtgattgccacgtcatcgaattagtgacgcggcagtgattaagttggtcaaag 8322720  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||||| | |||  |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  8322721 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattaacgaatacggggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 8322811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 17202616 - 17202806
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  17202616 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacatcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaat 17202715  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| ||||||| | | |||| ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  17202716 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgaatacagggaccgatttttaaacgacccctaattgcaag 17202806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 19517824 - 19518014
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||     
T  19517824 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggtatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaaa 19517923  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | |||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||    
T  19517924 gacaaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaagattagcgaatacatggactaatttttaaactacccctaattgcaag 19518014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 28771080 - 28770890
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  28771080 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatatttggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaat 28770981  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||  |||| ||||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  28770980 gactaaattttaaatgatcaatgattgtaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 28770890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 11047654 - 11047843
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  11047654 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgcatggtagtgattgccacgtcattgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 11047753  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacaggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||   | |||| ||| |||||||||| ||| |||| |||||||    
T  11047754 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagtgaatacatgaccaatttttaaacgacccctacttgcaag 11047843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 13362438 - 13362289
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  13362438 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgtctgtgatttgcacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcagag 13362339  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaa 150  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||||    
T  13362338 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattaa 13362289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 28269633 - 28269444
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  28269633 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattaaaatttcatgtgtggtagtgattgtcacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 28269534  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaatgacacctaattgcaa 189  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | | |||  |||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  28269533 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatactgggaccaatttttaaacgacccctaattgcaa 28269444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 35920439 - 35920291
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||| ||| |||    
T  35920439 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtgatattgattaagttggtcaaag 35920340  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggatta 149  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||    
T  35920339 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctaatttgcaaggatta 35920291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 186636 - 186826
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| |||    
T  186636 tattttgtcctcttcttaagggcaaacttgaaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtgacaatgattaagttggtcaaag 186735  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| ||| |||| |||| |||||||||| |||  |||||||||||    
T  186736 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaagattagcaaatacagggaccaatttttaaacgacctctaattgcaag 186826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 5994106 - 5994296
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  5994106 tattttatcctcttcttaagggaaaaattggaatttcatgtgtgatagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaag 5994205  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| ||||||| | | |||| | || |||||||||| ||| | ||||||||||    
T  5994206 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgaatacatgaaccaatttttaaacgacccttaattgcaag 5994296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 13963051 - 13962885
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  13963051 aaattggaatttcatgtgtgatagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtgacagtgattaagtgaggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 13962952  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  13962951 atgcaagggtaaattaccaggattagcaattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 13962885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 5024230 - 5024040
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  5024230 tattttgtcttcttcttaacggaaaaattggaatttcacgtatggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 5024131  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||  |||| ||||||| | | |||| | |  |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  5024130 gacaaaattttaaatgattagtgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacatgtatcaatttttaaacgacccctaattgcaag 5024040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 29646573 - 29646383
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  29646573 tattttgtcctcttcttaagggaaaaattggaatttcatgtgtggtagtgatcgcaacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 29646474  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||  |||||||||||||||||  |||| |||||||  |||| ||||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  29646473 gataaaattttaaatgattaatgattggaaggctagtttgcaaggattagcgaatacatggaccaatttttaaaagacccctaattacaag 29646383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 38442284 - 38442474
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||    
T  38442284 tattttgtcctcttcttaagggcaaagttggaatttcacgtgtggcagtgattgtcacatcatcaaattagtgatgtgacagtgattaagttggtcaaag 38442383  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||  |||| ||||||||| | ||| || ||  ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  38442384 gacgaaattttaaatggttaatgattgcaaggctagtttgcaaggattaacgaatacaagaacccatttttaaacgacccctaattgcaag 38442474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 214
Target Start/End: Original strand, 6758125 - 6758265
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6758125 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcaaggttaaattgccagaattaacaattacagggacgaatttttaaa 6758224  T
Q  174 tgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagccttt 214  Q
     ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6758225 cgacgcctaattgcaaggactaatcacatcattaagccttt 6758265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 16083160 - 16083308
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||     
T  16083160 tattttgtcatcttcttaagggcaaaataggaatttcatgtgtgtcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagttggtcaaat 16083259  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggatta 149  Q
     || |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| |||||||    
T  16083260 aacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggatta 16083308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 19892549 - 19892715
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   || ||| |||||||||||||||||  |    
T  19892549 aaattgggatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagaatgacgaaattttaaatgattaaaca 19892648  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||||| |||||||  ||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||  |||||||||||    
T  19892649 atgcaagggtaaattgttaggattaacgattacagagaccaatttttaaacgacctctaattgcaag 19892715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 18670382 - 18670502
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||     
T  18670382 tattttgtactcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggttaaat 18670481  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaa 121  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  18670482 gacgaaattttaaatgattaa 18670502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 41930653 - 41930513
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  41930653 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacaaatttttaaa 41930554  T
Q  174 tgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagccttt 214  Q
     |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41930553 cgacctctaattgcaaggactaatcacatcattaagccttt 41930513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 39453487 - 39453321
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  39453487 aaattggaatttcatgtatggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatgccagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 39453388  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  39453387 atgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagagaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 39453321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20814346 - 20814161
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  20814346 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtgtggtagtgatcgtcacgtgatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggttaaag 20814247  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacaggacgaatttttaaatgacacctaattg 186  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||  |||  |||| ||||||| | | |||| ||| |||||||||| |||  |||||||    
T  20814246 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaatactagtttgcaaggattagcgaatacaagaccaatttttaaacgacctctaattg 20814161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 5994076 - 5993910
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  5994076 aaattggaatttcatgtatggcagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 5993977  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||||| ||||||||||| |||| | |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  5993976 atgcaagggtaaattgccagaattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 5993910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 32242429 - 32242263
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  32242429 aaattggaatttcgtgtgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 32242330  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||||  |||||||||| ||||| | |||||| |||  |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  32242329 atgcaagagtaaattgccatgattagctattacagggatcaatttttaaacgacccctaattgcaag 32242263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 35512335 - 35512169
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  35512335 aaattggaatttcatgtgtgacagggattgtcatgtcatcaaattagtgatgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 35512236  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||| | ||||||||||    
T  35512235 atgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccttaattgcaag 35512169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 43159055 - 43159221
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  |    
T  43159055 aaattggaatttcatgtgtggtagtgattatcacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatga 43159154  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||||||||||  |||  ||||||| | | ||| | ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  43159155 ttgcaaggctagtttgtaaggattagcgaatacaacgaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 43159221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 6301730 - 6301581
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||| |||||  |    
T  6301730 aaattggaatttcatgtgtggcagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaaattggtcaaaggacgaaattttaaataattaatga 6301631  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaa 173  Q
    ||||||| |||  |||| ||||||| | | ||| ||||| ||||||||||    
T  6301630 ttgcaagactagtttgcaaggattagcgaatacaaggaccaatttttaaa 6301581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 149
Target Start/End: Original strand, 10684158 - 10684303
Alignment:
Q  4 tttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggac 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||| || |||    
T  10684158 tttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgttatcaaattagtgatgttacagtgattaagttggtcaaatgac 10684257  T
Q  104 caaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggatta 149  Q
     ||| |||||||||||||  |||||||| |||  |||| |||||||    
T  10684258 gaaactttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggatta 10684303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 80 - 212
Target Start/End: Original strand, 17544342 - 17544475
Alignment:
Q  80 cagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaatttttaaatgaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||     
T  17544342 cagtgattaagttggtcaaaggacaaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattaacgattacaggaactaatttttaaatgacg 17544441  T
Q  179 cctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  17544442 cctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 17544475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 20814376 - 20814542
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  20814376 aaattggaatttcatgtatgacagtgattgtcatgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtagggagagggacaaaattttaaatgattaaaca 20814475  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||||  |||||||| ||||||| | ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  20814476 atgcaagtgtaaattgctaggattagcgattacagtgaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 20814542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 189
Target Start/End: Original strand, 13362469 - 13362634
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |   |  ||| |||||||||||||||||  |    
T  13362469 aaattggaatttcatgcgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgatgtagcagtgattaagtggggagagagactaaattttaaatgattaaaca 13362568  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaatgacacctaattgcaa 189  Q
     ||||||| |||||||||| ||||| | ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  13362569 atgcaagggtaaattgccatgattagcgattacaaggaccaatttttaaacgacccctaattgcaa 13362634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 14194664 - 14194829
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  14194664 aaattagaatttcatgtatggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatagcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 14194763  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattacaggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||||| ||||||||||||||||  ||||||| | | |||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  14194764 atgcaagggtaaattgccaggattagtaattacatggccaatttttaaacgacccctaattacaag 14194829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 38442255 - 38442090
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  38442255 aaattggaatttcatgtatgacagtgattgccacgtcatcaaattagttatgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 38442156  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaatgacacctaattgcaa 189  Q
     ||||||  ||||||| |||||||| | ||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  38442155 atgcaagagtaaattgtcaggattagcgattacaatgaccaatttttaaataacccctaattgcaa 38442090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 8875589 - 8875449
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||  | ||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  8875589 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaagaacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagtgtaaattgccaggattaacgattacagggactaattttt 8875490  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcc 211  Q
    ||||||| | |||||||||| || || ||||||||||||||    
T  8875489 aaatgacgcttaattgcaaggacgaaacacatcattaagcc 8875449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 5024259 - 5024425
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |   | | || |||||||||||||||||  |    
T  5024259 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgtcgcgtcatcaaattagtgatgtggcagtgattaagtggggagaggaacgaaattttaaatgattaaaca 5024358  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||| | ||||||| |||||||| | ||||| | ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  5024359 atgcaatggtaaattgtcaggattagcgattacaatgaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 5024425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 33871479 - 33871339
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||| |||| | |||||| |||| |||||||    
T  33871479 tgacttggcggtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccagaattagcgattacagggactaattttt 33871380  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcc 211  Q
    ||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||    
T  33871379 aaatgacacttaattgcaaggacaaaacacatcattaagcc 33871339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 215
Target Start/End: Original strand, 33871624 - 33871768
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaattttt 170  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||    
T  33871624 tgacgtagcagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattactgattacagagactaattttt 33871723  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcctttt 215  Q
    ||||| | |||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  33871724 aaatggcgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcctttt 33871768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 186606 - 186439
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  186606 aaattggaatttcatgtatggtagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatggtagtgattaagtggggggagggacgaaattttaaatgattaaaca 186507  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaatgacacctaattgcaaga 191  Q
     ||||||| |||||| |||| |||||| ||||| | ||| |||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  186506 atgcaaggttaaatttccagaattaacgattacaatgactaatttttaaacgacccctaatttcaaga 186439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 11047624 - 11047459
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |   |  ||| |||||||||||||||||  |    
T  11047624 aaattgaaattttatgtatggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggagagagacgaaattttaaatgattaaaca 11047525  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattacaggacgaatttttaaa-tgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||||| |||||||||| ||||| | ||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  11047524 atgcaagggtaaattgccaagattagcgattacgggac-aatttttaaactgactcctaattgcaag 11047459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 17202586 - 17202424
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |     |||| |||||||||||| ||||  |    
T  17202586 aaattggaatttcatgtatggcagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggagggggacgaaattttaaatgcttaaaca 17202487  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatgacacctaattg 186  Q
     ||||||| ||||||| |||||||| | ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  17202486 atgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacagtgaccaatttttaaacgacccctaattg 17202424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Original strand, 18247303 - 18247391
Alignment:
Q  4 tttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtt 92  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18247303 tttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgtcacgtcattgaattaatgacgtggcagtgattaagtt 18247391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 20840718 - 20840554
Alignment:
Q  27 attggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaatt 126  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||| |||||  | |    
T  20840718 attgaaatttcatgtgtggtagtgatcgtcacgtgatcgaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacaaaattttaaatcattaaacaat 20840619  T
Q  127 gcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  20840618 gcaagggtaaattgctaggattaacgattacaggtaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 20840554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 18247271 - 18247107
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |   | |||| ||||| |||||||||||  |    
T  18247271 aaattgaaattttatgtatgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatggcggtgattaagtggggagagggacgaaattctaaatgattaaata 18247172  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||||| ||||||||||  |||| | |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  18247171 atgcaagggtaaattgcca--attagcgattacatggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 18247107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Original strand, 20153204 - 20153342
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||   ||||| | |||||| |||| |||||||    
T  20153204 tgacgtagcagtgattaagttggtcaaaggatgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgc---gattagcgattacaaggactaattttt 20153300  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  20153301 aaatgacacctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 20153342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1506104 - 1505966
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  1506104 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaa 1506005  T
Q  174 tgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    || | ||||||||||||  |||| ||||||| |||||||    
T  1506004 tgccgcctaattgcaagggctaaacacatcaataagcct 1505966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 16157096 - 16157262
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||| |||||||||  || ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  16157096 aaattgaaatttcatgcatggcagtgattgctgcgtcatcaaattagtgacatggcagggattaagtggggagagggacaaaattttaaatgattaaaca 16157195  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||||| ||||||| |||||||||| |||| | |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  16157196 atgcaagggtaaattgtcaggattaacgattatagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 16157262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 87
Target Start/End: Original strand, 27937260 - 27937322
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgatt 87  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27937260 aaattggaatttcatgtgtgatagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgatt 27937322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 213
Target Start/End: Original strand, 31482687 - 31482801
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatc 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||  |||| |    
T  31482687 ggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacaaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaac 31482786  T
Q  199 acatcattaagcctt 213  Q
    |||||| ||||||||    
T  31482787 acatcaataagcctt 31482801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 20152921 - 20152781
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaattttt 170  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  20152921 tgacttggtagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaatttccaggattagcgattacagagactaattttt 20152822  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcc 211  Q
    ||||||| | |||||||| | || || ||||||||||||||    
T  20152821 aaatgacgcttaattgcatggacgaaacacatcattaagcc 20152781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 75 - 213
Target Start/End: Original strand, 297274 - 297413
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  297274 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaa 297373  T
Q  174 tgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcctt 213  Q
    || | ||||||| ||||  |||| ||||||| ||| ||||    
T  297374 tgtcgcctaattacaagggctaaacacatcaataaacctt 297413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 10684126 - 10684030
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaa 121  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||   |  ||| |||||||||||||||||    
T  10684126 aaattggaatttcatgtatggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatgacagtgattaagtgaggaaagtgacaaaattttaaatgattaa 10684030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 158
Target Start/End: Original strand, 29646603 - 29646736
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||| ||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  29646603 aaattggaaattcatgtatggtagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacatgacagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 29646702  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca 158  Q
     ||||||| ||||||| |||||||| | ||||||    
T  29646703 atgcaagggtaaattgtcaggattagcgattaca 29646736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 8322591 - 8322467
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  8322591 aaattggaattttatgtatggcagtgattgcaacgtcatcaaattagtgaaatgacagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 8322492  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggatta 149  Q
     ||||||| |||||||||| |||||    
T  8322491 atgcaaggataaattgccaagatta 8322467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 190
Target Start/End: Original strand, 35512406 - 35512521
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaat 174  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||  | | |||| |||| ||||||||||     
T  35512406 gtggcagtgattaagttagtcaaatgacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattggcgaatacagggaccaatttttaaac 35512505  T
Q  175 gacacctaattgcaag 190  Q
    ||| ||||||||||||    
T  35512506 gacccctaattgcaag 35512521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 91
Target Start/End: Original strand, 4700352 - 4700418
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagt 91  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||    
T  4700352 aaattggaattttatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaatttatgatgtggcagtaattaagt 4700418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 12904953 - 12904875
Alignment:
Q  13 ttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagt 91  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  12904953 ttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtgtggcagtgattgtaacgttatcaaattagtgacgtgacattgattaagt 12904875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 91
Target Start/End: Original strand, 21265384 - 21265450
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagt 91  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21265384 aaattggaatttcatgtatgacagtgattgtcatgtcatcaaattagtgacatagcagtgattaagt 21265450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 24141559 - 24141475
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgca 188  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  24141559 aaattttaaatgattaaactttgcaaggctaatttgccaggattaacgattacagggaccaatttttaaatgacgtctaattgca 24141475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 24547367 - 24547315
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24547367 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgatt 24547315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 100 - 190
Target Start/End: Original strand, 38475315 - 38475406
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  38475315 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattaacgattacatggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 38475406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11761861 - 11761739
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatc 198  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||| || |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||| |  ||      
T  11761861 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaggggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaaggatcaaat 11761762  T
Q  199 acatcattaagccttttataaat 221  Q
    ||||  |||||||||||||||||    
T  11761761 acatatttaagccttttataaat 11761739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 22298682 - 22298564
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||  | || |||| |||||||||  ||||| | |||||| |||| |||||||    
T  22298682 tgacttggtagtgattaagttggtcaaaggatgaaattttaaatgattaaacaatgtaagggtaaattgccccgattagcgattacatggactaattttt 22298583  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaa 189  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  22298582 aaatgacgcctaattgcaa 22298564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 11740845 - 11740708
Alignment:
Q  54 gccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaa 153  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |  ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||  |||| ||||||| | |    
T  11740845 gccacgtcatcaaattaatgacgtgacagtcattaactgggtcaaaggacaaaattttaaatgattaaagaatgcaaggctagtttgcaaggattagcga 11740746  T
Q  154 ttaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     || | |||  |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  11740745 atatatggatcaatttttaaacgacccctaattgcaag 11740708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 190
Target Start/End: Original strand, 3529133 - 3529249
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | || | || |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  3529133 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgtaggggtaaattgccaggattaacgattacagggaccaatttttaaa 3529232  T
Q  174 tgacacctaattgcaag 190  Q
     ||| ||||||||||||    
T  3529233 cgacccctaattgcaag 3529249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 13963080 - 13963132
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13963080 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcacgtgtggcagtgatt 13963132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 190
Target Start/End: Original strand, 24547412 - 24547532
Alignment:
Q  71 gtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaatta-caggacgaatttt 169  Q
    |||||||||||||| ||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | ||||  ||||| ||||||    
T  24547412 gtgacgtggcagtggttaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattataaggaccaatttt 24547511  T
Q  170 taaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||    
T  24547512 taaacgacccctaattgcaag 24547532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 27937230 - 27937178
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27937230 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgttgcagtgatt 27937178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 5255162 - 5255072
Alignment:
Q  67 attagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca 158  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||| | ||||||    
T  5255162 attagtgacgtgacagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaataaatgcaaggttaatttg-caggattagcgattaca 5255072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 17544180 - 17544085
Alignment:
Q  80 cagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaat 174  Q
    ||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  17544180 cagtgattaagttggtcaaatgacaaaattttaaatgattaaacaatgcaagagtaaattgtcaggattagcaattacagggactaatttttaaat 17544085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 205
Target Start/End: Original strand, 8875618 - 8875687
Alignment:
Q  137 attgccaggattaacaattacagg-acgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcat 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||    
T  8875618 attgccaggattaacgattacagggactaatttttaaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcat 8875687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 30005283 - 30005175
Alignment:
Q  82 gtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagga-cgaatttttaaatgacacc 180  Q
    ||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||  | |||||   ||||||| |||||||| |||||| | || | |||||||||||||||||    
T  30005283 gtgattaagttggtcaaaagataaaattttaaatgattaaataatgcaaatgtaaattgtcaggattagcaattatatgaactaatttttaaatgacacc 30005184  T
Q  181 taattgcaa 189  Q
    |||||||||    
T  30005183 taattgcaa 30005175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 37991314 - 37991222
Alignment:
Q  97 caaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgca 188  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||||| | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  37991314 caaggacgaaatttgaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattaacgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgca 37991222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 151
Target Start/End: Original strand, 13963121 - 13963196
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaac 151  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| |||||||||    
T  13963121 gtggcagtgattaagttggtcaaagaacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattaac 13963196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 16083113 - 16083002
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaat 174  Q
    ||||||||||||||||| |   | | || |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||     
T  16083113 gtggcagtgattaagttgggagaggtacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattatcgattacagggactaatttttaaac 16083014  T
Q  175 gacacctaattg 186  Q
     || ||||||||    
T  16083013 aacccctaattg 16083002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 27587260 - 27587169
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||| |||||||||||||||||    |||| || |||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  27587260 ggacgaaattttaaatgattaaacgatgcaggggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 27587169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 215
Target Start/End: Original strand, 40150095 - 40150246
Alignment:
Q  65 aaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacg 163  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |  ||  | ||||||| | ||||||||||||   ||| |||| ||| || | ||||||||| |||||| ||||     
T  40150095 aaattagtgatgtggcagtgattaattaggttgagggaccaattcttaaatgattaaactttgaaagggtaattttctaggattaacgattacagggacc 40150194  T
Q  164 aatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcctttt 215  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| || || |||||  | |||||||||    
T  40150195 aattttaaaatgacccctaattgcaaggacgaaacacatattaaagcctttt 40150246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 21287883 - 21287797
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca 158  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | | ||||| ||||||||||| |||| | ||||||    
T  21287883 tgacgtggtagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatacaagggtaaattgccagaattagcgattaca 21287797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 211
Target Start/End: Original strand, 21287953 - 21288083
Alignment:
Q  82 gtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacc 180  Q
    ||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||  | ||||||| |  ||||||| ||||| | |||||| |||  |||||||||| |||  |    
T  21287953 gtgattaagttggtcaaaggaagaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtgtattgccatgattagcgattacatggattaatttttaaacgacgtc 21288052  T
Q  181 taattgcaagaactaatcacatcattaagcc 211  Q
    ||||| |||| || || ||||||||||||||    
T  21288053 taattacaaggacaaaacacatcattaagcc 21288083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 27937186 - 27937116
Alignment:
Q  79 gcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggatta 149  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||    
T  27937186 gcagtgattaagttggtcaaatgacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggatta 27937116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 42063366 - 42063288
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatgac 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  || |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  42063366 ggacaaaattttaaatgattaacatttgcaggggcaatttgccaggattagcgattacagagaccaatttttaaatgac 42063288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 35512365 - 35512417
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  35512365 tattttgtcctcttcttaagggaaaaattagaatttcacgtgtggcagtgatt 35512417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 187
Target Start/End: Original strand, 35920500 - 35920588
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgc 187  Q
    |||| |||||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  35920500 ggacgaaattttaaatgattaaacaatggaaggataaattgtcaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgc 35920588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 190
Target Start/End: Original strand, 5256328 - 5256418
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||   ||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  5256328 ggacgaaattttaaatgattaacaaatgtaaggctaatttgcaaggattagtcattacattgaccaatttttaaacgac-cctaattgcaag 5256418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 6150566 - 6150475
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||||| |||||||| ||||||||   |||||| | || |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  6150566 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagactaaattgtcaggattagtgattacatgaaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 6150475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 24547326 - 24547267
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggcta 135  Q
    |||||||||||||| || ||| || ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24547326 gtggcagtgattaaattggtcaaatgacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggcta 24547267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 73)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1695951 - 1695737
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||    
T  1695951 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtcaaag 1695852  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  1695851 gaccaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 1695752  T
Q  200 catcattaagccttt 214  Q
    ||||| |||||||||    
T  1695751 catcaataagccttt 1695737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33062261 - 33062047
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  33062261 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 33062162  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatca 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  33062161 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 33062062  T
Q  200 catcattaagccttt 214  Q
    ||||| |||||||||    
T  33062061 catcaataagccttt 33062047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13995884 - 13995672
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||    
T  13995884 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtcaaag 13995785  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatca 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  13995784 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 13995685  T
Q  200 catcattaagcct 212  Q
    ||||| |||||||    
T  13995684 catcaataagcct 13995672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14900694 - 14900495
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  14900694 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggtagtgattaagtttgtccaag 14900595  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatca 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||             ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  14900594 gaccaaattttaaatgattaacaattgca-------------aggattagcaattacagggacgaatttttgaatgacgcctaattgcaaggactaatca 14900508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 41248770 - 41248566
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||    
T  41248770 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgatgtggcagtgattaatttggtcaaag 41248671  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatca 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  41248670 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggatgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaaca 41248571  T
Q  200 catca 204  Q
    |||||    
T  41248570 catca 41248566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Original strand, 33739889 - 33740101
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  33739889 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgtaatttcatgtgtgacagtgattgccgcgttatcaaattagtgatgtggcagtgattaatttggtccaag 33739988  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatca 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||  |||| ||    
T  33739989 gaccaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgcctaattgtaagggctaaaca 33740088  T
Q  200 catcattaagcct 212  Q
    ||||| |||||||    
T  33740089 catcaataagcct 33740101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 10712940 - 10713130
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  10712940 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgttgcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 10713039  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | | |||||  || |||||||||| ||| | ||||||||||    
T  10713040 gacgacattttaaatgattaacgattgcaaggctaatttgcaaggattagcgaatacagaaaccaatttttaaacgacccttaattgcaag 10713130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 6658064 - 6658254
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  6658064 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 6658163  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||| |||||||  |||| ||||||| | | |||| |||| |||||||||| |||  |||||||||||    
T  6658164 gactaaattttaaatgattaatgattgtaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacctctaattgcaag 6658254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 16099241 - 16099431
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  16099241 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcggtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 16099340  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||   | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  16099341 gactaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagtgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 16099431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 37895558 - 37895368
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  37895558 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgttatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 37895459  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||  |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| | ||||||||||    
T  37895458 gatgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccttaattgcaag 37895368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 39498496 - 39498686
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  39498496 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtttggcagtgattgccacgtcatcatattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 39498595  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||  |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | | |||| |||| |||||||||| ||  ||||||||||||    
T  39498596 gattaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacatggaccaatttttaaacgatccctaattgcaag 39498686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 11163265 - 11163092
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  11163265 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtttgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 11163166  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| ||||||| | | |||| |||| ||||||||||    
T  11163165 gactaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaa 11163092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 15848305 - 15848436
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  15848305 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcacgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 15848404  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaagg 132  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  15848405 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaagg 15848436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 36479935 - 36480125
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  36479935 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgcgtggtagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 36480034  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | | || | |||| |||||||||| ||| | ||||||||||    
T  36480035 gacgaaattttaaattattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatatagggaccaatttttaaacgacccttaattgcaag 36480125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 36755310 - 36755495
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||     ||||||||||||| ||| |||    
T  36755310 tattttgtcctcttcttaagggagaaattggaatttcatgtgtgccagtgattgccatgtcatcaaattagtga-----cagtgattaagttggtcaaag 36755404  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | |||| | |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  36755405 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgattatagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 36755495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 39423732 - 39423922
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  39423732 tattttgtcatcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgggagtgattgccacgtcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 39423831  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| ||||||| | | || | |||  |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  39423832 gacaaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattagcgaatatagggatcaatttttaaacgacccctaattgcaag 39423922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 22051205 - 22051088
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  22051205 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtgatagtgattgccacatcatcgaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaag 22051106  T
Q  101 gaccaaattttaaatgat 118  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  22051105 gacgaaattttaaatgat 22051088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Original strand, 34448025 - 34448202
Alignment:
Q  14 tcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaa 113  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  34448025 tcttaaggacaaaattgaaatttcatgtgtgccagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaa 34448124  T
Q  114 atgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||||||||  |||||||| |||  |||| ||||||||| | || | |||| ||||||||||  || ||||||||||||    
T  34448125 atgattaatgattgcaagactagtttgcaaggattaacgaatatagggaccaatttttaaacaacccctaattgcaag 34448202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 15848275 - 15848109
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  15848275 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacatcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 15848176  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||||| |||||| ||||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  15848175 atgcaagggtaaattaccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 15848109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 44714002 - 44714168
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  44714002 aaattggaatttcatgtgtgacaatgattgtcacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 44714101  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  44714102 atgcaagggtaaattgccaggattagcaattacagggactaatttttaaacgacccctaattgcaag 44714168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 10712910 - 10712744
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |   | |||  |||||||||||||||||  |    
T  10712910 aaattggaattttatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggtagtgattaagtggggagagggatgaaattttaaatgattaaaca 10712811  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaatta-caggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||||| |||||||||||||||||  ||||  ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||    
T  10712810 atgcaagggtaaattgccaggattaatgattataaggaccaatttttaaacgaaccctaattgcaag 10712744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 214
Target Start/End: Original strand, 8710754 - 8710897
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||| | |||||| |||| |||||||    
T  8710754 tgacgtggcagtgataaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacatggactaattttt 8710853  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagccttt 214  Q
    ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  8710854 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagccttt 8710897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15604479 - 15604336
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    |||| ||| ||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||    
T  15604479 tgacttggtagtgattaagttgatcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggactaattttt 15604380  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagccttt 214  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  15604379 aaatgacacctaattgcaaggacgaaacacatcattaagccttt 15604336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 15604625 - 15604767
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| | |||||    
T  15604625 tgacggggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggactagttttt 15604724  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcctt 213  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||    
T  15604725 aaatgacacctaattgcaaggacaaaacacatcattaaacctt 15604767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 36382348 - 36382182
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   | |||  |||||||||||||||||  |    
T  36382348 aaattggaattttatgtctgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggatgaaattttaaatgattaaaca 36382249  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||||| ||||||| |||||||| | |||| | |||| |||||||||| ||  ||||||||||||    
T  36382248 atgcaagggtaaattgtcaggattagcgattatagggaccaatttttaaacgaaccctaattgcaag 36382182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 37895588 - 37895754
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  37895588 aaattgaaatttcatgtgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 37895687  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||||  |||||||||||||||| | ||||| || || | |||||||| ||| | ||||||||||    
T  37895688 atgcaagtgtaaattgccaggattagcgattacgggaaccattttttaaacgacccataattgcaag 37895754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 39423702 - 39423536
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  39423702 aaattggaatttcatgtatgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 39423603  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     | ||||| ||||||||||| |||| | ||||||| ||| |||||||||| ||| | ||||| ||||    
T  39423602 atacaaggataaattgccagaattagcgattacagagaccaatttttaaacgacccgtaattacaag 39423536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 214
Target Start/End: Original strand, 14900743 - 14900881
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  14900743 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaca--tacaaggctaaattgccaggattagcaattacagggacaaatttttaaa 14900840  T
Q  174 tgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagccttt 214  Q
     ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14900841 cgacccctaattgcaaggactaatcacatcattaagccttt 14900881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 2318345 - 2318180
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  2318345 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggcattaattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 2318246  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||| ||||||||||  || ||||||||||||    
T  2318245 atgcaagggtaaattgccagaattagcgattacatagaccaatttttaaactac-cctaattgcaag 2318180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 75 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33739840 - 33739698
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  33739840 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaa 33739741  T
Q  174 tgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcctttta 216  Q
    || | ||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||    
T  33739740 tgccgcctaattgcaagggctaaacacatcaataagcctttta 33739698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 2318375 - 2318492
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||     
T  2318375 tattgtgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgtcacgtcatcaaattaatgatgtggcagtgattaagttggtcaaaa 2318474  T
Q  101 gaccaaattttaaatgat 118  Q
    ||  ||||||||| ||||    
T  2318475 gatgaaattttaagtgat 2318492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 41587374 - 41587233
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacaggacgaattttta 171  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||  |||||  |||||||||||||||||  | ||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  41587374 tgacgtgacagtgattaagttggttaaaggatgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaattttccaggattaacgattacaggaccaattttta 41587275  T
Q  172 aatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcctt 213  Q
    |||||| | |||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  41587274 aatgactcttaattgcaaggacgaaacacatcattaagcctt 41587233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 211
Target Start/End: Original strand, 28226030 - 28226170
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||    
T  28226030 tgacttggtagtgattaagttggtcaaagtacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacagggactaattttt 28226129  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcc 211  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  28226130 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcc 28226170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 75 - 220
Target Start/End: Original strand, 33062310 - 33062456
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  33062310 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattataaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaa 33062409  T
Q  174 tgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagccttttataaa 220  Q
    || | ||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  33062410 tgccgcctaattgcaagggctaaacacatcaataagccttttctaaa 33062456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 8342327 - 8342190
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||    
T  8342327 tgacttggtagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaaggataaattgccaggattaccaattacatagactaattttt 8342228  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaa 208  Q
    ||||||| | |||||||||| || || |||||||||||    
T  8342227 aaatgacgcttaattgcaaggacgaaacacatcattaa 8342190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 36479905 - 36479740
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  36479905 aaattggagtttcatgtatgacagttattgtcacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagtggggagatggacgaaattttaaatgattaaaca 36479806  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaa 189  Q
     ||||||| |||| ||| | ||||| | |||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  36479805 atgcaagggtaaaatgctaagattagcgattacatggaccaatttttaaacgacccctaattgcaa 36479740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 72 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11830504 - 11830365
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||  ||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  11830504 tgacgtggcagtgattgagtttgtcaaatgacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgttaggattagcaattacagggactaattttt 11830405  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagc 210  Q
    |||||||  ||||||||||| || || |||||||||||||    
T  11830404 aaatgacgtctaattgcaaggacgaaacacatcattaagc 11830365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 47 - 192
Target Start/End: Original strand, 9076330 - 9076476
Alignment:
Q  47 agtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccagga 146  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||  || ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||  |||| ||||    
T  9076330 agtgattgtcacgtcatcgaattagtgatgtggcagtgattaagttggttaaatgacgaaattttaaatgattaatgattgcaagactagtttgcaagga 9076429  T
Q  147 ttaacaattacag-gacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaa 192  Q
    ||||| | ||| | ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  9076430 ttaacgaatacggagaccaatttttaaacgacccctaattgcaagaa 9076476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 190
Target Start/End: Original strand, 13692501 - 13692627
Alignment:
Q  65 aaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacg 163  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | | |||| ||||     
T  13692501 aaattagtgacgtgacagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggacc 13692600  T
Q  164 aatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  13692601 aatttttaaacgacccctaattgcaag 13692627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Original strand, 13995933 - 13996071
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  13995933 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaa 13996032  T
Q  174 tgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    || | ||||||||||||  |||| ||||||| |||||||    
T  13996033 tgccgcctaattgcaagggctaaacacatcaataagcct 13996071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 34447999 - 34447933
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagt 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34447999 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgatgtggcagtgattaagt 34447933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 36755280 - 36755214
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagt 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36755280 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtgacagtgattaagt 36755214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Original strand, 41248819 - 41248957
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  41248819 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaa 41248918  T
Q  174 tgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    || | ||||||||||||   ||| ||||||| |||||||    
T  41248919 tgccgcctaattgcaagggttaaacacatcaataagcct 41248957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 100 - 204
Target Start/End: Original strand, 1696025 - 1696130
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatc 198  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| |    
T  1696025 ggacgaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacaggaacgaatttttaaatgccgcctaattgcaagggctaaac 1696124  T
Q  199 acatca 204  Q
    ||||||    
T  1696125 acatca 1696130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 213
Target Start/End: Original strand, 8342465 - 8342607
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaattttt 170  Q
    ||||| |||||||||||||||  || |||||| ||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||| ||||||||   ||||||| ||| |||||||    
T  8342465 tgacgcggcagtgattaagttgttcaaaggacgaaattttaaataattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattattgattacagagactaattttt 8342564  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcctt 213  Q
    ||||||| |||||||| ||| || || ||||||||||| ||||    
T  8342565 aaatgacgcctaattgtaaggacgaaacacatcattaaacctt 8342607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 210
Target Start/End: Original strand, 41588344 - 41588483
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||  | || |||  ||||||||||| |||| | |||||| |||| |||||||    
T  41588344 tgacttggcagtgattaagttggtcaaaggatgaaattttaaatgattaaacaatgtaagtgtaaattgccagaattagcgattacagggactaattttt 41588443  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagc 210  Q
    ||||||| |||||||| ||| || || ||||| |||||||    
T  41588444 aaatgacgcctaattgtaaggacgaaacacattattaagc 41588483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 100 - 185
Target Start/End: Original strand, 202672 - 202758
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaatt 185  Q
    |||| |||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  202672 ggacgaaattttaaatgattaaactctgcaaggctaatttgccaggattaacgattacatggacgaatttttaaatgacccctaatt 202758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6573699 - 6573542
Alignment:
Q  54 gccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaa-caattgcaaggctaaattgccaggattaaca 152  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |   | |||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |     
T  6573699 gccacgtcagctaattagggacgtggcagtgattaagggggg--agggacaaatttttaaatgattaaacaatt-caagggtaaattgccaggattagcg 6573603  T
Q  153 attaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | | |  || |||||||||||||||    
T  6573602 attacatggacgaatttttaaatgacgcctaattggagggatgaaacacatcattaagcct 6573542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 36382378 - 36382430
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36382378 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgatt 36382430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16099192 - 16099074
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | |||| || ||||||||||||||||   |||||||| || ||||||||||    
T  16099192 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaggggtaaattgccaggattagtgattacagggaccaatttttaaa 16099093  T
Q  174 tgacacctaattgcaagaa 192  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  16099092 tgacccctaattgcaagaa 16099074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 158
Target Start/End: Original strand, 39936535 - 39936621
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca 158  Q
    |||||||||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||   |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  39936535 tgacgtggcattgattaaattggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaactttgcaagggtaatttgccaggattaacgattaca 39936621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 53 - 177
Target Start/End: Original strand, 3653349 - 3653473
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaaca 152  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| || |   | |||| |||||||||||||||||   |||||||| ||| |||||| |||||||     
T  3653349 tgccacctcatcagattagtgacgtggtagtgattaacttggaagagggacgaaattttaaatgattaaactttgcaagggtaatttgcca-gattaacg 3653447  T
Q  153 attaca-ggacgaatttttaaatgac 177  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||    
T  3653448 attacatggaccaatttttaaatgac 3653473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 76 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 44713931 - 44713858
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggatta 149  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||    
T  44713931 gtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggatta 44713858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 44713972 - 44713920
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  44713972 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcacgtgtggcagtgatt 44713920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 188
Target Start/End: Original strand, 25231118 - 25231253
Alignment:
Q  54 gccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaa 153  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |  | | | |||| |||||||||||||||||   |||||||| ||| |||| ||||||| | |    
T  25231118 gccacgtcatcatattaatgacgtggcagtcattaactgggacaagggacgaaattttaaatgattaaagtttgcaagggtaatttgctaggattagcga 25231217  T
Q  154 ttaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgca 188  Q
     |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  25231218 atacatggaccaatttttaaacgacccctaattgca 25231253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 190
Target Start/End: Original strand, 36382419 - 36382534
Alignment:
Q  76 gtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaat 174  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||  |||||| | | |||| |||| ||||||||||     
T  36382419 gtggcagtgattaagttggccaaaggacgaaattttaaatgattaacgattgcaagactagtttgcatggattagcgaatacagggaccaatttttaaac 36382518  T
Q  175 gacacctaattgcaag 190  Q
    ||| | ||||||||||    
T  36382519 gacccttaattgcaag 36382534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 192
Target Start/End: Original strand, 22051257 - 22051402
Alignment:
Q  47 agtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccagga 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  |    || || |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| ||||    
T  22051257 agtgattgtcacgtcatcaaattagtgatatggcagtgattaggtgggagagag-acgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgctagga 22051355  T
Q  147 ttaacaattacag-gacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaa 192  Q
    ||| | ||||||| ||| ||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  22051356 ttagcgattacagagactaatttttaaacaacctctaattgcaagaa 22051402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 190
Target Start/End: Original strand, 45556340 - 45556454
Alignment:
Q  77 tggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatg 175  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| | ||||| | | ||||| ||| |||||||||| |    
T  45556340 tggcagtgattaagttggtcaaaggattaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaagattagcgaatacagcgaccaatttttaaacg 45556439  T
Q  176 acacctaattgcaag 190  Q
    || ||||||| ||||    
T  45556440 acccctaattacaag 45556454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 6573150 - 6573050
Alignment:
Q  108 ttttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcatt 206  Q
    ||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| | || || |||||||||    
T  6573150 ttttaaatgattaaacaatgcaagg-taaattgccaagattagcgattacatggacaaatttttaaatgacgcctaattgcagggacgaaacacatcatt 6573052  T
Q  207 aa 208  Q
    ||    
T  6573051 aa 6573050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 17266568 - 17266523
Alignment:
Q  8 tcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17266568 tcctcttcttaagggcaaaattggaatatcatgtgtgacagtgatt 17266523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 188
Target Start/End: Original strand, 6589680 - 6589764
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgca 188  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  6589680 aaattttaaatgattaaactttgcaagggtaatttgccagaattaacgattacatggaccaatttttaaatgacccttaattgca 6589764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 75 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 39498447 - 39498331
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | || | || |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  39498447 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgtaggggtaaattgccaggattaacgattacagggaccaatttttaaa 39498348  T
Q  174 tgacacctaattgcaag 190  Q
     ||| ||||||| ||||    
T  39498347 cgacccctaattacaag 39498331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 190
Target Start/End: Original strand, 3556297 - 3556416
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaattttt 170  Q
    |||||||||| ||||||  | |||  |||||  |||||||||||||||||  | ||||||||||  |||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  3556297 tgacgtggcattgattagctgagttaaaggaggaaattttaaatgattaaagaatgcaaggctagtttgcaaggattaacgattacagagaccaattttt 3556396  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| ||| | ||||||||||    
T  3556397 aaacgacccataattgcaag 3556416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 6588823 - 6588704
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    |||| |||||||||| || |  ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||  |||| ||||||| | | |||| |||| |||||||    
T  6588823 tgacctggcagtgatcaactgggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaagaatgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacatggaccaattttt 6588724  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| ||| ||||||||||||    
T  6588723 aaacgacccctaattgcaag 6588704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 190
Target Start/End: Original strand, 11163339 - 11163430
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||  | |||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  11163339 ggacgaaattttaaatgattaaacaatgcagaggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 11163430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 45556224 - 45556133
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||| || |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||  ||||||||||||    
T  45556224 ggacaaaattttaaatgattaaacaatgcagggataaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaaacgatccctaattgcaag 45556133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 3555385 - 3555271
Alignment:
Q  77 tggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaatttttaaatg 175  Q
    ||||||||||||| |  ||  |||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| |||  |||| |||| | ||||| ||| |||||||||| |    
T  3555385 tggcagtgattaactgggttaaaggacgaaattttaaatgattaaagaatgcaaggctaatttgtaaggaataacgaatacagagaccaatttttaaacg 3555286  T
Q  176 acacctaattgcaag 190  Q
    || ||||||||||||    
T  3555285 acccctaattgcaag 3555271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 25230214 - 25230125
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgca 188  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  25230214 ggacgaaattttaaatgattagtaattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgca 25230125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 188
Target Start/End: Original strand, 44045318 - 44045407
Alignment:
Q  100 ggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgca 188  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  44045318 ggacaaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgca 44045407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 45556298 - 45556350
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  45556298 tattttgtcatcttcttaaggacaaaattggaatttcatgtttggcagtgatt 45556350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 177
Target Start/End: Original strand, 28230060 - 28230133
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgac 177  Q
    |||||||||||||||||   ||| |||| ||| |||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  28230060 aaattttaaatgattaaactttgaaagggtaatttgctaggattaacgattacagggaccaatttttaaatgac 28230133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 105 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 28228777 - 28228693
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaatttttaaatgacacctaattgca 188  Q
    |||||| ||||||||||   ||| |||  ||| |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  28228777 aaatttcaaatgattaaactttgaaagagtaatttgccacgattaacgattacagggaccaatttttaaatgacccctaattgca 28228693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 105 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 39935562 - 39935478
Alignment:
Q  105 aaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaatta-caggacgaatttttaaatgacacctaattgca 188  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| ||| ||| |||||||||| ||||  || || ||||||||||  |||||||||||||    
T  39935562 aaattttaaatgattaaactttgcaaggataatttgtcaggattaacgattataagaaccaatttttaaaccacacctaattgca 39935478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 129; Significance: 9e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 141805 - 141601
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  141805 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaattttatgtgtgacagtgattgtcacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 141706  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatca 199  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| ||    
T  141705 gactaaattttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgccgtctaattgcaagggctaaaca 141606  T
Q  200 catca 204  Q
    |||||    
T  141605 catca 141601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Original strand, 141854 - 141992
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  141854 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattagcaattacagggatgaatttttaaa 141953  T
Q  174 tgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    || | ||||||||||||  |||| ||||||| |||||||    
T  141954 tgccgcctaattgcaagggctaaacacatcaataagcct 141992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0559 (Bit Score: 124; Significance: 9e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0559
Description:

Target: scaffold0559; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 1419 - 1590
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  1419 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgtaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaatttggtccaag 1518  T
Q  101 gaccaaa-ttttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaattttt 170  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1519 gaccaaatttttaaacgattaacaattgcagggttaaaatgccaggattaacaattacaggaacgaattttt 1590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0559; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 75 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 1370 - 1233
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  1370 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaacaattgcagggttaaaatgtcaggattagcaattacagggacgaatttttaaa 1271  T
Q  174 tgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcc 211  Q
    || | ||||||||||||   ||| ||||||| ||||||    
T  1270 tgccgcctaattgcaagggttaaacacatcaataagcc 1233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 69182 - 69372
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||  |||    
T  69182 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcgtattagtaacgtggcagtgattaagttggttaaag 69281  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | | |||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  69282 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacatctaattgcaag 69372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 69152 - 68986
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  69152 aaattggaatttcatgtatggcagttattgcaacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 69053  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     ||||||| ||||||||||||||||   |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  69052 atgcaagggtaaattgccaggattagtgattacagggaccaatttttaaatgacccctaattgcaag 68986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0295 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0295
Description:

Target: scaffold0295; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 2360 - 2491
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  2360 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgatgtggcagtgattaagttggtcaaag 2459  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaagg 132  Q
    | | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2460 ggcgaaattttaaatgattaataattgcaagg 2491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0295; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 2330 - 2234
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||    
T  2330 aaattggaatttcatgtgtgacgatgattgccacgtcatcaaattattgacatggcagtgattaagtggggagagggacaaaattttaaatgattaa 2234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 103 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21118 - 21006
Alignment:
Q  103 ccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatcaca 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21118 ccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgcaaggattagcaattacagggacgaatttttaaatgacgcctaattgcaaggactaatcaca 21019  T
Q  202 tcattaagccttt 214  Q
    |||||||||||||    
T  21018 tcattaagccttt 21006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 106 - 211
Target Start/End: Original strand, 21260 - 21366
Alignment:
Q  106 aattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatcacatca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  21260 aattttaaatgattaacaattgcaagactaaattgccatgattagcaattacagggacgaatttttaaacgacctctaattgcaaggactaatcacatca 21359  T
Q  205 ttaagcc 211  Q
    |||||||    
T  21360 ttaagcc 21366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 21180 - 21128
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgatt 53  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21180 tattttgtcctcttcttaagggcaaaattgaaatttcatgtgtgacagtgatt 21128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 14631 - 14451
Alignment:
Q  10 ctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaatt 109  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  14631 ctcttcttaagggcaaaattggtatttcatgtgtggtagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttggtcaaaagacaaaatt 14532  T
Q  110 ttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaac-aattacaggacgaatttttaaatgacacctaattgcaa 189  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | ||| |   ||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  14531 ttaaatgattaatgattgcaaggctagtttgcaaggattagcgaataaatagactaatttttaaacgactcctaattgcaa 14451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 91
Target Start/End: Original strand, 14670 - 14736
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagt 91  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14670 aaattggaatttcatgtatgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacatggcagtgattaagt 14736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 1955 - 2148
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtga---cgtggcagtgattaagttagtcc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| || |||     
T  1955 tattttgtcctcttcttaagggaaaaattgaaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtcgtggcagtgattaaattggtca 2054  T
Q  98 aaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    ||| || |||||||||||||||||  ||||||||| ||  |||| | ||||| ||||| || |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2055 aagaacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggatagtttgcaaagattagcaatttcagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 2148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 75 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 1906 - 1790
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaa 173  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||||| ||    
T  1906 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaagattagcgattacagggaccaattttttaa 1807  T
Q  174 tgacacctaattgcaag 190  Q
     ||| ||||||||||||    
T  1806 cgacccctaattgcaag 1790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 37774 - 37645
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  37774 tattttgttctcttcttaagggcaaaattggaatttcatgtgtggcagtgattgccacgtca-caaattagtgatgtggcagtgattaagttggtcaaag 37676  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaag 131  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  37675 gacgaaattttaaatgattaatgattgcaag 37645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 190
Target Start/End: Original strand, 37804 - 37970
Alignment:
Q  25 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   | |||| |||||||||||||||||  |    
T  37804 aaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaaaca 37903  T
Q  125 ttgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
     | ||||| ||||||| |||||||| | ||||| | ||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  37904 atacaagggtaaattgtcaggattagcgattacaaagaccaatttttaaacgactcctaattgcaag 37970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 139858 - 139992
Alignment:
Q  1 tattttgtcctcttcttaagggcgaaattggaatttcatgtgtgacagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaag 100  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  139858 tattttatcctcttcttaagagcaaaattgaaatttcatgtttggcagtgattgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagttattaagttggtcaaag 139957  T
Q  101 gaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggcta 135  Q
    ||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  139958 gactaaattttaaataattaatgattgcaaggcta 139992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 139809 - 139693
Alignment:
Q  75 cgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaa-caattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacagg-acgaatttttaa 172  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||    
T  139809 cgtggcagtgattaagtggggagagggacgaaattttaaatgattaatcaatt-catgggtaaattgccaggattagcgattacagggaccaatttttaa 139711  T
Q  173 atgacacctaattgcaag 190  Q
    | ||| ||||||||||||    
T  139710 acgacccctaattgcaag 139693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 221929 - 221794
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacaggacgaattttta 171  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||    
T  221929 tgacgtggcagtgattaagtt-gtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattagcgattacaagactaattttta 221831  T
Q  172 aatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaa 208  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  221830 aatgacgcctaattgcaagaacgaaacacatcattaa 221794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Original strand, 222075 - 222216
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||| | |||||| | || |||||||    
T  222075 tgacttggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgtcaggattagcgattacatgtactaattttt 222174  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  222175 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 222216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 212
Target Start/End: Original strand, 11426 - 11567
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  11426 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaagacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattaacgattacatggactaattttt 11525  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    ||||||| |||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  11526 aaatgacgcctaattgcaaggatgaaacacatcattaagcct 11567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 11280 - 11143
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattacag-gacgaattttt 170  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | || |||| ||| |||||||    
T  11280 tgacttggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaagattagcgatcacagagactaattttt 11181  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaa 208  Q
    | |||||  ||||||||||  || || |||||||||||    
T  11180 agatgacgactaattgcaacgacgaaacacatcattaa 11143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0388 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0388
Description:

Target: scaffold0388; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 208
Target Start/End: Original strand, 12525 - 12662
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaattttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||| || |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  12525 tgacgtggcagtgattaagtaggtcaaagaacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggattaacgattacagggactaattttt 12624  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaa 208  Q
    ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||    
T  12625 aaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaa 12662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0388; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 12379 - 12303
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggatta 149  Q
    |||| ||| ||||||| |||| ||| ||| || |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||    
T  12379 tgacttgggagtgatttagtttgtcaaag-acgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaggatta 12303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 80 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1052 - 919
Alignment:
Q  80 cagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||||| | |||||| |||| |||||||||||||      
T  1052 cagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgccaagattagcgattacatggactaatttttaaatgatg 953  T
Q  179 cctaattgcaagaactaatcacatcattaagcct 212  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  952 cctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcct 919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 164 - 211
Target Start/End: Original strand, 1214 - 1261
Alignment:
Q  164 aatttttaaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaagcc 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  1214 aatttttaaatgacgcctaattgcaaggacgaaacacatcattaagcc 1261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 74 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2531 - 2395
Alignment:
Q  74 acgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaa 172  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| ||||||| | |||||| |||  |||||||||    
T  2531 acgtggtagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgctaggattagcgattacagggattaatttttaa 2432  T
Q  173 atgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaag 209  Q
    |||||  ||||||||||| || || ||||||||||||    
T  2431 atgacgtctaattgcaaggacgaaacacatcattaag 2395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Original strand, 12066 - 12204
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattac-aggacgaattttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| ||||||| | |||||  |||  |||||||    
T  12066 tgacgtggcagtgattaagttggtcaaaggacgaaattttaaatgattaaacaatgcaagggtaaattgctaggattagcgattactgggattaattttt 12165  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaagaactaatcacatcattaag 209  Q
    |||||||   |||||||||| || || ||||||||||||    
T  12166 aaatgacgtttaattgcaaggacgaaacacatcattaag 12204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 190
Target Start/End: Original strand, 239820 - 239958
Alignment:
Q  53 tgccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaaca 152  Q
    |||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||  ||  | |||| |||||||||||||||||   ||| |||| ||| |||||||||||| |     
T  239820 tgccacgtcagctaatcagtgatgtggcagtaattaagtgggtgtagggacgaaattttaaatgattaaactttggaagggtaatttgccaggattatcg 239919  T
Q  153 attacagg-acgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  239920 attacaggaaccaatttttaaatgacccctaagtgcaag 239958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0775 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0775
Description:

Target: scaffold0775; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 5102 - 5025
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggatta 149  Q
    ||||||||||| |||||| |  ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||    
T  5102 tgacgtggcagcgattaattaggtcaaaggacgaaattttaaatgattaataattgcaaggctagtttgcaaggatta 5025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0775; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 190
Target Start/End: Original strand, 6266 - 6385
Alignment:
Q  72 tgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaatta-caggacgaattttt 170  Q
    |||||||||||| |||||||  ||  | | || |||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||| ||||||| | ||||  ||||| |||||||    
T  6266 tgacgtggcagtcattaagtgggttaaggaacgaaattttaaatgattaaacattgcaagggtaatttgcaaggattatcgattataaggaccaattttt 6365  T
Q  171 aaatgacacctaattgcaag 190  Q
    || |||| ||||||| ||||    
T  6366 aagtgacccctaatttcaag 6385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0707 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0707
Description:

Target: scaffold0707; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 190
Target Start/End: Original strand, 6393 - 6486
Alignment:
Q  98 aaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaattaca-ggacgaatttttaaatgacacctaattgcaag 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  6393 aaggacgaaattttaaatgattaatgattgcaaggctactttgcaaggattagcgaatacagggaccaatttttaaacgacccctaattgcaag 6486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 23389 - 23265
Alignment:
Q  54 gccacgtcatcaaattagtgacgtggcagtgattaagttagtccaaggaccaaattttaaatgattaacaattgcaaggctaaattgccaggattaacaa 153  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |   |   ||||||||||||||||||||   ||| |||| || |||| ||||||||||||    
T  23389 gccacgtcagcaaattactgacgtggcagtgattaagtggggggagaaaccaaattttaaatgattaaactttggaaggatagattgacaggattaacaa 23290  T
Q  154 ttaca-ggacgaatttttaaatgac 177  Q
     ||||  ||| ||||||||||||||    
T  23289 atacatagaccaatttttaaatgac 23265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University