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Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11512_low_2 (Length: 711)

Name: NF11512_low_2
Description: NF11512
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11512_low_2
NF11512_low_2
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (37-699)||(52998037-52998700)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 584; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 584; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 37 - 699
Target Start/End: Original strand, 52998037 - 52998700
Alignment:
Q  37 tttctttctgacaagagataaaagtttaatatttctactcatataaatttttcttatcggatccgtctgcattacaatcaaacggatctttaacttttag 136  Q
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T  52998037 tttctttctgacaagagataaaagtttaatatttctactcatataaatttttcttatcggatccgtctacattacaatcaaacggatctttaacttttag 52998136  T
Q  137 gagaaaactattgtcatattgaagtatatacaatgtacaggaagcttttatatacagctatatttaatc-ttttgctaactaacataagagaatacagtt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  52998137 gagaaaactattgtcatattgaagtatatacaatgtacaggaagcttttatgtacagctatatttaatctttttactagctaacataagagaatacagtt 52998236  T
Q  236 ggaatgaactaatctgcaacgaactaatcagaagttaaactaacttataacaaatttataatactaaaatttacacacacaacaaaattaattaatattg 335  Q
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T  52998237 ggaatgaactaacctgcaacgaactaatcagaagttaaactaacttataacaaatttataatactaaaatttacacacacaacaaaattaattaatattg 52998336  T
Q  336 ggggcggaatatatgcacatgcagtactactcctcatatatatcccacatttagaatgcatattataagagataagggattggctgcatacaatgtggtc 435  Q
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T  52998337 ggtgcggaatatatgcacatgcagtactactcctc------atcccacatttagaatgcatattataagagataagggattggctgcatacaatgtggtc 52998430  T
Q  436 ctcgttctatctacaatatat------tatatagagatatagcagaatgatagtcatattcagatataaattttggtcgataaaatattaattggtagag 529  Q
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T  52998431 ctcgttctatctgcaatatattatatatatatagagatatagcagaatgatagtcatattcagatataaattttggtcgataaaatattaattggtagag 52998530  T
Q  530 aatcatattgatatggaggattggtatttctatctgcagaattaactactagctagttagacatttttgtttttcattcaattcccatgttctaaggtca 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52998531 aatcatattgatatggaggattggtatttctatctgcagaattaactactagctagttagacatttttgtttttcattcaattcccatgttctaaggtca 52998630  T
Q  630 atattaatcccaaatatatacaatctcatcatgtagctaatgcaaccgcgtcttgttctttgttcttctc 699  Q
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T  52998631 atattaatcccaaatatatacaatctcatcatgtacctaatgcaaccgcgtcttgttctttgttcttctc 52998700  T

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