View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11519_high_36 (Length: 264)

Name: NF11519_high_36
Description: NF11519
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11519_high_36
NF11519_high_36
[»] chr4 (15 HSPs)
chr4 (75-264)||(3672274-3672463)
chr4 (75-264)||(28093098-28093287)
chr4 (75-264)||(6112630-6112818)
chr4 (75-264)||(7217765-7217954)
chr4 (75-264)||(44275706-44275894)
chr4 (74-264)||(49243814-49244003)
chr4 (75-264)||(21390958-21391146)
chr4 (75-264)||(46192359-46192548)
chr4 (75-264)||(35544912-35545101)
chr4 (73-264)||(45829260-45829450)
chr4 (91-264)||(51038779-51038953)
chr4 (75-161)||(52191305-52191391)
chr4 (80-206)||(54849793-54849919)
chr4 (97-158)||(36157857-36157918)
chr4 (75-139)||(25437012-25437076)
[»] chr5 (18 HSPs)
chr5 (75-264)||(13347128-13347317)
chr5 (73-264)||(39370925-39371116)
chr5 (74-264)||(2237275-2237465)
chr5 (75-264)||(40887944-40888133)
chr5 (90-264)||(14831559-14831733)
chr5 (75-251)||(9408054-9408230)
chr5 (75-264)||(1815622-1815807)
chr5 (75-264)||(27553376-27553564)
chr5 (112-264)||(31800595-31800746)
chr5 (75-173)||(33404529-33404627)
chr5 (75-217)||(17225319-17225459)
chr5 (146-264)||(42683670-42683788)
chr5 (74-264)||(19596070-19596259)
chr5 (75-264)||(4300546-4300734)
chr5 (84-264)||(41003853-41004031)
chr5 (72-253)||(12164248-12164432)
chr5 (79-206)||(19124532-19124657)
chr5 (76-169)||(37505869-37505964)
[»] scaffold0062 (1 HSPs)
scaffold0062 (72-264)||(6715-6907)
[»] chr7 (29 HSPs)
chr7 (75-264)||(26972205-26972394)
chr7 (75-264)||(36346567-36346755)
chr7 (73-264)||(28307497-28307688)
chr7 (74-264)||(34108425-34108615)
chr7 (74-264)||(45782662-45782852)
chr7 (75-264)||(7699885-7700074)
chr7 (75-264)||(7700083-7700272)
chr7 (75-264)||(7700281-7700470)
chr7 (75-264)||(7700479-7700668)
chr7 (73-253)||(30887698-30887877)
chr7 (73-264)||(42220966-42221156)
chr7 (81-264)||(31148296-31148478)
chr7 (75-264)||(5811166-5811354)
chr7 (74-264)||(13108147-13108335)
chr7 (78-264)||(34828069-34828253)
chr7 (81-264)||(23980137-23980319)
chr7 (73-264)||(21807325-21807515)
chr7 (75-219)||(15020282-15020423)
chr7 (96-264)||(36957450-36957616)
chr7 (117-264)||(46475066-46475213)
chr7 (169-264)||(29953574-29953669)
chr7 (80-168)||(38321014-38321102)
chr7 (110-204)||(20086690-20086784)
chr7 (117-170)||(42950109-42950162)
chr7 (109-140)||(29953661-29953692)
chr7 (83-139)||(28713685-28713742)
chr7 (83-139)||(42974495-42974552)
chr7 (83-116)||(43970967-43971000)
chr7 (192-264)||(42950039-42950110)
[»] chr3 (24 HSPs)
chr3 (75-264)||(22894680-22894868)
chr3 (75-264)||(21559561-21559750)
chr3 (75-264)||(34749900-34750089)
chr3 (75-264)||(36749406-36749595)
chr3 (75-264)||(43999989-44000178)
chr3 (75-264)||(36370340-36370529)
chr3 (75-264)||(51339786-51339972)
chr3 (79-264)||(46111946-46112131)
chr3 (72-264)||(48200682-48200874)
chr3 (75-264)||(30735498-30735686)
chr3 (73-264)||(38231291-38231481)
chr3 (75-171)||(29460660-29460756)
chr3 (75-171)||(29471512-29471608)
chr3 (75-264)||(39467104-39467292)
chr3 (75-264)||(39072281-39072464)
chr3 (83-239)||(20856182-20856334)
chr3 (75-204)||(50966131-50966256)
chr3 (75-204)||(51069266-51069391)
chr3 (97-209)||(53638157-53638269)
chr3 (82-168)||(29820397-29820483)
chr3 (178-264)||(29472912-29472997)
chr3 (91-165)||(5417684-5417758)
chr3 (83-139)||(12224120-12224177)
chr3 (83-139)||(23004764-23004821)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (75-264)||(34307140-34307329)
chr1 (79-264)||(2509028-2509213)
chr1 (75-264)||(39249865-39250054)
chr1 (74-264)||(46901737-46901927)
chr1 (75-264)||(19258675-19258863)
chr1 (73-264)||(28647351-28647541)
chr1 (79-198)||(29099821-29099939)
chr1 (80-158)||(10146971-10147049)
chr1 (93-264)||(9642869-9643039)
chr1 (74-111)||(8374694-8374731)
chr1 (83-139)||(39858355-39858412)
[»] chr8 (17 HSPs)
chr8 (75-264)||(42162598-42162787)
chr8 (76-259)||(44081781-44081964)
chr8 (75-264)||(31318805-31318994)
chr8 (74-264)||(30432338-30432527)
chr8 (79-264)||(10203668-10203853)
chr8 (78-264)||(12665347-12665534)
chr8 (74-264)||(36189215-36189403)
chr8 (79-264)||(43186031-43186215)
chr8 (78-264)||(18184556-18184741)
chr8 (81-264)||(33726017-33726200)
chr8 (95-210)||(42668838-42668952)
chr8 (91-166)||(31547-31622)
chr8 (123-264)||(38845025-38845165)
chr8 (80-168)||(3690700-3690788)
chr8 (83-139)||(8368488-8368545)
chr8 (83-139)||(11904861-11904918)
chr8 (83-139)||(28898003-28898060)
[»] chr2 (13 HSPs)
chr2 (74-264)||(33732568-33732757)
chr2 (78-264)||(44958116-44958302)
chr2 (75-264)||(16089822-16090009)
chr2 (75-245)||(14572995-14573165)
chr2 (75-264)||(3830900-3831086)
chr2 (75-264)||(37498865-37499056)
chr2 (75-264)||(36315561-36315750)
chr2 (75-264)||(37914239-37914427)
chr2 (72-264)||(6376241-6376427)
chr2 (74-209)||(24137149-24137288)
chr2 (1-62)||(33414841-33414902)
chr2 (1-63)||(33409307-33409369)
chr2 (83-264)||(41188777-41188958)
[»] chr6 (7 HSPs)
chr6 (75-264)||(3986908-3987096)
chr6 (75-264)||(3118049-3118238)
chr6 (74-264)||(14022933-14023122)
chr6 (75-264)||(15345662-15345848)
chr6 (74-264)||(24208443-24208632)
chr6 (73-264)||(13697567-13697756)
chr6 (83-128)||(16717998-16718044)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (79-264)||(87165-87350)
[»] scaffold0277 (1 HSPs)
scaffold0277 (102-140)||(5943-5981)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 15)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Original strand, 3672274 - 3672463
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3672274 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacatccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 3672373  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  3672374 gtgatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaagggtatctacctatctttt 3672463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 28093287 - 28093098
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28093287 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaaggagagatgaaaaagg 28093188  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28093187 gtgatgatatgatgtaaaaatactcaaatacccctaatacatgggggtgtacataagaagtgtatgaaaaaggatgtctacctatctttt 28093098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Original strand, 6112630 - 6112818
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6112630 gagctcttatacatgaaccaccttagatggcatacaccattttacacccacacatatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 6112729  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
     | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6112730 atgatgatatgatgtaaaattactcaaatacccctaatacatg-gagtgtacataagaagtgtatgaaaaagagtgtctacctatctttt 6112818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Original strand, 7217765 - 7217954
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  7217765 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacaccctttaacacctacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattaaaataagagataaaaaagg 7217864  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7217865 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacctataacacatgagggtgtacataagaggtgtatgaaaaagggtgtttacctatctttt 7217954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Original strand, 44275706 - 44275894
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  44275706 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatataccattttacactcacacacatttgtgacacgtgccaaaaatattgaaagaagagattaaaaagg 44275805  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  44275806 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatg-gggtgtacataagaggtgtatgaaaaagggtgtctatctatctttt 44275894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 74 - 264
Target Start/End: Original strand, 49243814 - 49244003
Alignment:
Q  74 tgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaag 173  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  49243814 tgagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacatccacacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagataaaaaaa 49243913  T
Q  174 ggtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
     || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  49243914 agtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaatacatg-gagtgtacataagaggtgtatgaaaaaggatgtctacatatctttt 49244003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21391146 - 21390958
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |     
T  21391146 gagctcttatacatgaaccaccttagatggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaatattgaaagaagagatgaaaatga 21391047  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    || |  |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21391046 gtgaatatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatga-ggtgtacataaaaggtgtatgaaaaagggtgtctacctatctttt 21390958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Original strand, 46192359 - 46192548
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  46192359 gagctcttatacatgaatcaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagataaaaaggg 46192458  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaa-ggtgtctacctatctttt 264  Q
    || || || ||||||  ||| | | ||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  46192459 gtgataatgtgatgtgaaatgattaaaatacccctggtacatg-gggtgtacataagaggtgtatcaaaaaagggtgtctacctatctttt 46192548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Original strand, 35544912 - 35545101
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||    
T  35544912 gagctcttatacatgaaccatcttaggtggtatacaccattttacatccacatacatttgtgatacgtggcaaaaacattgaaagaagatataaaaaggg 35545011  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattact-caaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    || ||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||| | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35545012 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaaatacccctaacacatg-gagtgtacataagtggtgtatgaaaaagggtgtctacctatctttt 35545101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 45829450 - 45829260
Alignment:
Q  73 ttgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaa 172  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  45829450 ttgagctcttatacatgaaccactttaggtgacatacacctttttacacccacacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagataaaaag 45829351  T
Q  173 gggtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaa-ggtgtctacctatctttt 264  Q
    |||| || || ||||||  ||| | | ||||||||||   | ||| |||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  45829350 gggtgataatgtgatgtgaaatgattaaaatacccctggcatatg-gggtgtacataa-aggtgtatcaaaaaagggtgtctacctatctttt 45829260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 91 - 264
Target Start/End: Original strand, 51038779 - 51038953
Alignment:
Q  91 accaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaa-agggtaatgatatgatgt 189  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| | ||||||    
T  51038779 accaccttaggtggcatacaaactttgacacccacacacaattgtgacatgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaagggggtgatggtgtgatgt 51038878  T
Q  190 ataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
      ||||||| ||||| | ||   ||||  |||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  51038879 gaaattactaaaatatctctgccacataggggtgtacatgagatgtacatgaaaaaaggtgtctgcctatctttt 51038953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 52191391 - 52191305
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaa 161  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  52191391 gagcccttatacatggaccaccttaggtggcatataccttttaacagccacacagaattgtgacatgtgacaaaaacattgaaagaa 52191305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 206
Target Start/End: Original strand, 54849793 - 54849919
Alignment:
Q  80 cttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagggtaat 179  Q
    ||||||||| ||||||||||| | || ||||| |||| | |||||||| || |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| | ||| | ||    
T  54849793 cttatacatgaaccaccttagatagcgtacacactttgatacccacacgcagttgtgacaagtgacaaaaatattgaaagaagagatgagagaggatgat 54849892  T
Q  180 gatatgatgtataattactcaaatacc 206  Q
    ||| ||||||  ||||| | |||||||    
T  54849893 gatgtgatgtgaaattattaaaatacc 54849919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 97 - 158
Target Start/End: Original strand, 36157857 - 36157918
Alignment:
Q  97 ttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaa 158  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| || ||| | |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  36157857 ttaggtggcatacactctttgacactcatacataattgtgatacgtgacaaaaacattgaaa 36157918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 25437076 - 25437012
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgaca 139  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| ||||| ||||||||    
T  25437076 gagcccttatacatggaccaccttaggtgacatacaccttttaacatccatacacaattgtgaca 25437012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 18)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Original strand, 13347128 - 13347317
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  13347128 gagcttttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaatagatgaaaaaga 13347227  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13347228 gtgatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaagggtgtctacctatctttt 13347317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Original strand, 39370925 - 39371116
Alignment:
Q  73 ttgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaa 172  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39370925 ttgagctcttatacatgaaccaccttagatggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtgccaaaaacattgaaagaagagatgaaaaa 39371024  T
Q  173 gggtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39371025 gggtgatgatatgatgtaaaattactcaaatacccctaatacatgggggtgtacataagaagtgtatgaaaaagggtgtctacctatctttt 39371116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 74 - 264
Target Start/End: Original strand, 2237275 - 2237465
Alignment:
Q  74 tgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaag 173  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2237275 tgagcttttatacatgaaccaccttaggtgacatacacccttttacacccacacatatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaag 2237374  T
Q  174 ggtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2237375 ggtgatgatatgatgtaaaattactcaaatacccctaatacttgggggtgtacataagaagtgtatgaaaaagggtgtctacctatctttt 2237465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 40888133 - 40887944
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40888133 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacactcttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 40888034  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    ||  |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40888033 gtggtgatatgatgtaaaattactaaaatacctctaatagatgggggtgtacataagaggtgtatgaaaaagggtgtctacctatctttt 40887944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 90 - 264
Target Start/End: Original strand, 14831559 - 14831733
Alignment:
Q  90 aaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagggtaatgatatgatgt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14831559 aaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgatacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagggtgatgatatgatgt 14831658  T
Q  190 ataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  14831659 aaaattattcaaatacccctaatacgtaggggtgtacataagaagtgtatgaaaaagggtgtttacctatctttt 14831733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 75 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 9408230 - 9408054
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9408230 gagctcttatacatgaaccacctcaggtgacatacgcccttttacactcacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 9408131  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgt 251  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9408130 gtgatgatatgatgtaaaattactcaaatacccctaatatatgggggtgtacataagaagtgtatgaaaaatggtgt 9408054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 1815807 - 1815622
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1815807 gagctcttatacatgaaccatcttaggtgacatacacccttttacatccacacatatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaggg 1815708  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||      | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1815707 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacat-agggtgtacat---ttctttatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 1815622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27553564 - 27553376
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  27553564 gagctcttatacatgaaccattttaggtggcatataccattttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagaagaaaaatg 27553465  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    || || || ||||||| ||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  27553464 gtgattatctgatgtaaaattactaaaatactcctaacacat-agggtgtacataagaggtgtatgaaaaagggtgtctatctatttttt 27553376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 112 - 264
Target Start/End: Original strand, 31800595 - 31800746
Alignment:
Q  112 ccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagggtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  31800595 ccttttacacccacacacatttatgacacgtggcaaaaatattgaaagaaaagatgaaaaggggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaa 31800694  T
Q  212 tacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
     | ||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  31800695 catatg-gggtgtacacaagaggtgtatgaaaaagggtgtctgcctatctttt 31800746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 33404627 - 33404529
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaag 173  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33404627 gagctcttatacatgaaccaccttaggtgccatacacacttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaag 33404529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 217
Target Start/End: Original strand, 17225319 - 17225459
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  17225319 gagctcttatacatgaaccactttaggtggcatactc--ttttacacccacacacatttgtgacatgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaagag 17225416  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatg 217  Q
    || ||||| ||||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  17225417 gtgatgatgtgatgtgaaattactaaaatacccctgatacatg 17225459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 146 - 264
Target Start/End: Original strand, 42683670 - 42683788
Alignment:
Q  146 aaaaacattgaaagaagagatgaaaaagggtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaa 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  42683670 aaaaacattgaaagaagagatgaaaaaggatggtgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaatatatgggggtgtacataagaggtgtatgaaaaa 42683769  T
Q  246 aggtgtctacctatctttt 264  Q
     | |||||| |||||||||    
T  42683770 ggatgtctatctatctttt 42683788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 74 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19596259 - 19596070
Alignment:
Q  74 tgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaag 173  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  19596259 tgagctgttatacatgaaccaccttaggtggcatacacctttttacatccacgcacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagaggtg-aaaat 19596161  T
Q  174 ggtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaagg-tgtctacctatctttt 264  Q
     || || || | ||||  ||| ||| || ||||||| | ||||| |||||||||||||| || | | |||||||| ||||||||||||||||    
T  19596160 agtgataatgtaatgtgaaatgactaaactacccctgacacatg-gggtgtacataagaggtatttcaaaaaaggatgtctacctatctttt 19596070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 4300734 - 4300546
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  4300734 gagctcttatacatgaaccattttaggtgacatatatccttttacacccacacatatttgtgacatatggcaaaaacattgaaataagagataaaaaatg 4300635  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    ||  |||| ||||||  ||||| | ||||| |||||| |||||| ||||||||| |||  ||||| ||||| | |||||| | |||||||    
T  4300634 gtggtgatgtgatgtgaaattattaaaatatccctaacacatga-ggtgtacatgagagatgtataaaaaaggatgtctatcaatctttt 4300546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 41004031 - 41003853
Alignment:
Q  84 tacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagggtaatgata 183  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||| || |||| || | |||||     
T  41004031 tacatgaaccactttaggtggcatacacccttttacactcatacacatttatgacatgtggcaaaaatattgaaa-aagatataaaaagggatgatgatg 41003933  T
Q  184 tgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatga-aaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||| | | ||| |||||||||| ||| |||||| | |||||||| |||  |||||||||    
T  41003932 tgatgtaaaattact-aaatatccctgacatatg-gggtgtacatgagaggtgtataacaaaaaggtttctgtctatctttt 41003853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 253
Target Start/End: Original strand, 12164248 - 12164432
Alignment:
Q  72 attgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattga---aagaagagatga 168  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||| | || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||   |||||||||||     
T  12164248 attgaactcttatacatgaaccatcttaggtggcacacattctttaatactcacacacagttgtggcatgtggcaaaaacattgaaagaagaagagatgg 12164347  T
Q  169 aaaagggtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtct 253  Q
     | ||||| ||| | ||||||  ||||||| |||| |||||  ||||||  ||||||||||||| ||| || ||||| |||||||    
T  12164348 gagagggtgatggtgtgatgtgaaattactaaaatgcccctgctacatggaggtgtacataagaggtgcataaaaaagggtgtct 12164432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19124657 - 19124532
Alignment:
Q  79 tcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagggtaa 178  Q
    ||||||||||  || | ||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |  || |    
T  19124657 tcttatacatggactatcttagatggcatacaca-tttgacacccacacacaattgtgacgtgtggcaaaaacatt-aaagaagagatgaaagaatgtga 19124560  T
Q  179 tgatatgatgtataattactcaaatacc 206  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  19124559 tgatatgatgtaaaattactaaaatacc 19124532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 169
Target Start/End: Original strand, 37505869 - 37505964
Alignment:
Q  76 agctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacat--ttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaa 169  Q
    |||||||||||||  | || ||||  || |||||||||||| ||||  ||| ||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  37505869 agctcttatacatggatcatcttatatgacatacaccctttgacacatacatacataattgtgacatgtggcaaaatcattgaaagaagatatgaa 37505964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0062
Description:

Target: scaffold0062; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 72 - 264
Target Start/End: Original strand, 6715 - 6907
Alignment:
Q  72 attgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaa 171  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6715 attgagttcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaa 6814  T
Q  172 agggtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6815 agggtgatgatatgatgtaaaattacttaaatatccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtatctacctatctttt 6907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 29)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26972394 - 26972205
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26972394 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttatgacacgtggcaaaaacattgaaaggagagatgaaaaagg 26972295  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26972294 gtgatgatatgatgtaaaattactcaaatacccctaatacatgggggtgtacataagaagtgtatgaaaaagggtgtctacctatctttt 26972205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 36346755 - 36346567
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36346755 gagctcttatacataaaccatcttaggtggcatacacccttttacacccagacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaa-g 36346657  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36346656 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagggtgtacataagaggtgtatgaaaaagggtgtctacctatctttt 36346567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 28307688 - 28307497
Alignment:
Q  73 ttgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaa 172  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28307688 ttgagctcttatacataaactaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgcgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaa 28307589  T
Q  173 gggtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28307588 gggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccttaacatatgggggtgtacataagaggtgtatgaaaaaagatgtctacctatctttt 28307497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 74 - 264
Target Start/End: Original strand, 34108425 - 34108615
Alignment:
Q  74 tgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaag 173  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34108425 tgagctcttatacatgaaccaccttaggtgacatacacccttttacacccacacatatttgtgacatatgacaaaaacattgaatgaagagatgaaaaag 34108524  T
Q  174 ggtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  34108525 ggtgatgatatgatgtaaaattactcaaatacccctaatacatgggagtgtacataagaagtgtatgaaaaagggtgtttacctatctttt 34108615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 74 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 45782852 - 45782662
Alignment:
Q  74 tgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaag 173  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45782852 tgagctcttatacatcaaccactttaggtggcatacatcattttacacccacacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaaag 45782753  T
Q  174 ggtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  45782752 ggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgggagtgtacataaaaagtgtataaaaaagggtgtctacctatctttt 45782662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 7700074 - 7699885
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7700074 gagctcttatacataaaccaccttagatggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagataaaaaagg 7699975  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
     | |||||||||| || ||||||| |||||||| ||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7699974 atgatgatatgatataaaattactaaaatacccataacacatgaaggtgtatataagaggtgtatgaaaaagggtgtttacctatctttt 7699885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 7700272 - 7700083
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7700272 gagctcttatacataaaccaccttagatggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagataaaaaagg 7700173  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
     | |||||||||| || ||||||| |||||||| ||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7700172 atgatgatatgatataaaattactaaaatacccataacacatgaaggtgtatataagaggtgtatgaaaaagggtgtttacctatctttt 7700083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 7700470 - 7700281
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7700470 gagctcttatacataaaccaccttagatggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagataaaaaagg 7700371  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
     | |||||||||| || ||||||| |||||||| ||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7700370 atgatgatatgatataaaattactaaaatacccataacacatgaaggtgtatataagaggtgtatgaaaaagggtgtttacctatctttt 7700281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 7700668 - 7700479
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7700668 gagctcttatacataaaccaccttagatggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagataaaaaagg 7700569  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
     | |||||||||| || ||||||| |||||||| ||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7700568 atgatgatatgatataaaattactaaaatacccataacacatgaaggtgtatataagaggtgtatgaaaaagggtgtttacctatctttt 7700479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 73 - 253
Target Start/End: Original strand, 30887698 - 30887877
Alignment:
Q  73 ttgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaa 172  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30887698 ttgagctcttatacatgaacaatcttaggtggcatacacacttttacacccacatacatttgtgacacgtagcaaaaacattgaatgaagagatgaaaaa 30887797  T
Q  173 gggtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtct 253  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  30887798 gggtgatgatatgatgtaaaattacttaaatacctctaatacatg-gggtgtatataagaagtgtatgaaaaagggtgtct 30887877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 42221156 - 42220966
Alignment:
Q  73 ttgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaa 172  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  42221156 ttgagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacttttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagatataaaaag 42221057  T
Q  173 gggtaatgatatgatgtataattact-caaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||  |||||||||||| ||||| | |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42221056 gggtgatgatatgatgttaaattactaaaaatacccctaacacatg-gagtgtacataagtggtgtatg-aaaaaggtgtctacctatctttt 42220966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 81 - 264
Target Start/End: Original strand, 31148296 - 31148478
Alignment:
Q  81 ttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagggtaatg 180  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  31148296 ttatacatgaaccatcttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacatggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaatgggtgatg 31148395  T
Q  181 atatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    |||||||||| ||||||| |||||  ||||| | ||| ||||||  |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  31148396 atatgatgtaaaattactaaaataagcctaacatatg-gggtgtgtataagaggtgtatgaaaaagagtgtctacctatctttt 31148478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 5811354 - 5811166
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5811354 gagctattatacataaaccaccataggtggcatacatcctttttcacccacacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaggg 5811255  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    || | ||| ||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||  || |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5811254 gtgaggatgtgatgtgaaattactaaaatacccctaacacatga-ggtgtacatgggaggtgtataaaaaagggtgtctacctatctttt 5811166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 74 - 264
Target Start/End: Original strand, 13108147 - 13108335
Alignment:
Q  74 tgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaag 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  13108147 tgagctgttatacataaaccaccttaggcggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacatgtggcaaaaacgttgaaagaagagatg-aaagg 13108245  T
Q  174 ggtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    ||| | ||| ||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  13108246 ggtgaggatgtgatgtgaaattactaaaatacccctaacacatga-ggtgtacatgaaaggtgtataaaaaagggtgtctacctatctttt 13108335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 78 - 264
Target Start/End: Original strand, 34828069 - 34828253
Alignment:
Q  78 ctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagggta 177  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |     
T  34828069 ctcttatacatgaaccaccttgggtg-catacatccttttacatccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaagtgatg 34828167  T
Q  178 atgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||| |||||| ||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  34828168 atgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacatatg-gggtgtgcataagtggtgtatgaaaaaggatgtctacctatctttt 34828253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 81 - 264
Target Start/End: Original strand, 23980137 - 23980319
Alignment:
Q  81 ttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagggtaatg 180  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |    
T  23980137 ttatacataaaccaccataggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaggggtgagg 23980236  T
Q  181 atatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    || ||||||  ||||||| ||||||| |||| | |||| | |||||||   || ||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  23980237 atgtgatgtgaaattactaaaatacctctaacatatga-gatgtacatggaaaatgtataaaaaaggatgtctacctatctttt 23980319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21807515 - 21807325
Alignment:
Q  73 ttgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaa 172  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  21807515 ttgagttcttatacatgaaccaccttagatggcatacaccattttacacccacacaaatttgtgatatgtggcaaaaatattgaaagaagagatgaaaat 21807416  T
Q  173 gggtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    || | ||||| | ||||  ||||||| |||||||||||| || || ||||||| || |||||||||| ||||| | |||| |||||||||||    
T  21807415 ggatgatgatgttatgtgaaattactaaaatacccctaacacgtg-gggtgtatatgagaagtgtataaaaaaggttgtcaacctatctttt 21807325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 219
Target Start/End: Original strand, 15020282 - 15020423
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||| ||    
T  15020282 gagctgttatacataaaccaccataggtggcatacaaccttttacacc--cacacatttgtgacatatggcaaaaacattgaaagaagagacg-aaaggg 15020378  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgag 219  Q
    || | ||||||||||  ||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  15020379 gtgaagatatgatgtgaaattactaaaatatccctaacacatgag 15020423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 96 - 264
Target Start/End: Original strand, 36957450 - 36957616
Alignment:
Q  96 cttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagggtaatgatatgatgtataatt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| || | || || | ||||| ||||    
T  36957450 cttaggtggcatacacccttttacatccatacatatttgtgacacgtgacaaaaatattgtaagaagagatgaaaatggatgataatgtaatgtaaaatt 36957549  T
Q  196 actcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    ||| ||||||||| || ||||  ||||||| || | | |||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  36957550 actaaaatacccccaacacat--gggtgtatatgaaaggtgtataaaaaattgtgtctacctatctttt 36957616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 117 - 264
Target Start/End: Original strand, 46475066 - 46475213
Alignment:
Q  117 tacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagggtaatgatatgatgtataattactcaaatacccc-taataca 215  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||| |||    
T  46475066 tacacccatacacatttgtgacatgtaacaaaaacattgaaagaagagatgaaaaggggtgacgatgtgatgtgaaattactaaaataccccataacaca 46475165  T
Q  216 tgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    ||| | ||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  46475166 tga-gatgtacatgagaggtgtataaaaaagggtgtctacctatctttt 46475213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 169 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 29953669 - 29953574
Alignment:
Q  169 aaaagggtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||   || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29953669 aaaagggtgatgatatgatgtaaaattactcaaatatccctaatacatggaagtctacataagaagtgtatgaaaaagggtgtctacctatctttt 29953574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 168
Target Start/End: Original strand, 38321014 - 38321102
Alignment:
Q  80 cttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatga 168  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38321014 cttatacattaaccatcttaggtggcatacacattttaacacccacatacaattgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagatatga 38321102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20086784 - 20086690
Alignment:
Q  110 acccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagggtaatgatatgatgtataattactcaaata 204  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||  ||||||| |||||    
T  20086784 acccttttacacccacatacatttgagacatctggcaaaaacattaaaagaagagataaaaaggggtgatgatgtgatgtgaaattactaaaata 20086690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 42950162 - 42950109
Alignment:
Q  117 tacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaa 170  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  42950162 tacacccacacacatttgtgatatgtggcaaatacattgaaaaaagagatgaaa 42950109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 140
Target Start/End: Original strand, 29953661 - 29953692
Alignment:
Q  109 cacccttttacacccacacacatttgtgacac 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29953661 cacccttttacacccacacacatttgtgacac 29953692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 28713685 - 28713742
Alignment:
Q  83 atacataaaccaccttaggtggcatacacc-cttttacacccacacacatttgtgaca 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| | | ||||||||    
T  28713685 atacataaaccaccttaggtggcatataccacttgtacacccacatataattgtgaca 28713742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 42974552 - 42974495
Alignment:
Q  83 atacataaaccaccttaggtggcatacacc-cttttacacccacacacatttgtgaca 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  42974552 atacataaaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattgtgaca 42974495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 116
Target Start/End: Original strand, 43970967 - 43971000
Alignment:
Q  83 atacataaaccaccttaggtggcatacacccttt 116  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43970967 atacatagaccaccttaggtggcatacacccttt 43971000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 42950110 - 42950039
Alignment:
Q  192 aattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||   | |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  42950110 aattactaaaatacccctgaaacatg-gggtgtacatgctaggtgtataaaaaagggtgtctacctatctttt 42950039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 24)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Original strand, 22894680 - 22894868
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22894680 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 22894779  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  22894780 atgatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatg-aaaagggtgtctatctatctttt 22894868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Original strand, 21559561 - 21559750
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21559561 gagctcttatacataaaccatcttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaatattgaaagaagagatgaaaaagg 21559660  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21559661 gtaatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgggggtgtacataagaggtgtatgaaaaatggtgtctatctatctttt 21559750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 34750089 - 34749900
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34750089 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacatatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 34749990  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||    
T  34749989 gtgatgatatgatgtaaaattactcaaatacccctaatacataggggtgtacataagaagtgtatgaaaaaggatgtctggctatctttt 34749900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Original strand, 36749406 - 36749595
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36749406 gagctcttatacatgaaccaccttagatgtcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 36749505  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  36749506 gtgatgatatgatgtaaaattactcaaatacctctaatacatgagggtgtacataaaaagtgtatgaaaaagagtgtctacctatctttt 36749595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Original strand, 43999989 - 44000178
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43999989 gagctcttatacatgaaccaccttaggtgtcatacacctttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 44000088  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  44000089 gtgatgatatgatgtaaaattactcaaatacctctaatacatgagggcgtacataaaaagtgtatgaaaaagagtgtctacctatctttt 44000178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 36370529 - 36370340
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36370529 gagctcttatacatgaaccaccttaggtgtcatacacctttttacacccacacacatttgtgacatgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 36370430  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  36370429 gtgatgatatgatgtaaaattactcaaatacccctaatacatgagggtgtatataaaaagtgtatgaaaaagagtatctacctatctttt 36370340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 51339972 - 51339786
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51339972 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacatccttttacacccacaca--tttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 51339875  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51339874 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacctctaacacatga-tgtgtacataagaggtgtatgaaaaagggtgtctacctatctttt 51339786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 46112131 - 46111946
Alignment:
Q  79 tcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagggtaa 178  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  46112131 tcttatacatgaaccatcttaggtgacatacaccattttacatccacacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagggtga 46112032  T
Q  179 tgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46112031 tgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaatacatggggatgtatataaaaggtgtatgaaaaatggtgtctacctatctttt 46111946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 72 - 264
Target Start/End: Original strand, 48200682 - 48200874
Alignment:
Q  72 attgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaa 171  Q
    ||||| ||||||| ||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48200682 attgaactcttattcatgaatcatcttaggtggcatacacctttttacatccacatatatttgtgacacgtggcaaaaatattgaaagaagagatgaaaa 48200781  T
Q  172 agggtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  48200782 aggatgatgatatgatgtaaaattactcaaatacccataatacatgggggtgtacataaaaagtgtatgaaaaaggatgtctacctatctttt 48200874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 30735686 - 30735498
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  30735686 gagctcttatatatgaaccaccttagatggcatacacccttttacacccacacacatctgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagatat-aaaaagg 30735588  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattact-caaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    || ||||||||||||  |||||||  |||||||||||| ||||| | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30735587 gtgatgatatgatgttaaattactaaaaatacccctaacacatg-gagtgtacataagtggtgtatgaaaaagggtgtctacctatctttt 30735498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Original strand, 38231291 - 38231481
Alignment:
Q  73 ttgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaa 172  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  38231291 ttgagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagatatg-aaaa 38231389  T
Q  173 gggtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaagg-tgtctacctatctttt 264  Q
     |||||| || | ||||  ||| ||| || ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  38231390 tggtaataatgtaatgtgaaatgactaaactacccctgacacatg-gggtgtacataagaggtgtatcaaaaaaggatgtctacctatctttt 38231481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 171
Target Start/End: Original strand, 29460660 - 29460756
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaa 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29460660 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacttttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaa 29460756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 171
Target Start/End: Original strand, 29471512 - 29471608
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaa 171  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29471512 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacttttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaa 29471608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 39467292 - 39467104
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  39467292 gagctgttatccataaaccaccatagatgacatacacccttttacacccacacatatttgtgacatgtgccaaaaatattgaaagaagagatgaaaaggg 39467193  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    || | ||| |||| |  ||||||| ||||| || ||| |||||| |||||||||  || |||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  39467192 gtgaggatgtgatatgaaattactaaaatatccataacacatga-ggtgtacatgggaggtgtataaaaaagggtgtgtacctatctttt 39467104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 39072464 - 39072281
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  39072464 gagctattatacatgaatcaccttagatgacatacacccttttacacccacatacatttgtgacatgtggcataaacattaaaagaagagatgaaaatgg 39072365  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    || ||||| |||||     ||||| |||||||| | | ||||| |||||||||| | |  ||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  39072364 gtgatgatgtgatg-----ttactaaaatacccttgacacatg-gggtgtacatcaaagatgtataaaaaagtgtgtctacctatctttt 39072281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 20856334 - 20856182
Alignment:
Q  83 atacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagggtaatgat 182  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||| | |||||    
T  20856334 atacatgaaccactttaggtggcatacacccttttacacccatacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaa-aagatat-aaaaaggatgatgat 20856237  T
Q  183 atgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtat 239  Q
     |||| || ||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  20856236 gtgatataaaattact-aaatacccctgacacatg-gggtgtacatgagaggtgtat 20856182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 204
Target Start/End: Original strand, 50966131 - 50966256
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50966131 gagctcttatacatgaac-atcttaggtggcatacacccttttacatctattcacatttgtgacacgtgacaaaaatattgaaagaagagatgaaaaagg 50966229  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaata 204  Q
       ||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  50966230 ---atgatataatgtaaaattactaaaata 50966256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 204
Target Start/End: Original strand, 51069266 - 51069391
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51069266 gagctcttatacatgaac-atcttaggtggcatacacccttttacatctattcacatttgtgacacgtgacaaaaatattgaaagaagagatgaaaaagg 51069364  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaata 204  Q
       ||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  51069365 ---atgatataatgtaaaattactaaaata 51069391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 97 - 209
Target Start/End: Original strand, 53638157 - 53638269
Alignment:
Q  97 ttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagggtaatgatatgatgtataatta 196  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |  |||| ||||| ||||||| ||||     
T  53638157 ttaggtggcatacaccctttaacacccacacacaatcgtgacatgtggtaaaaacatggaaagaagagatgagagggggtgatgatgtgatgtaaaattg 53638256  T
Q  197 ctcaaatacccct 209  Q
    || ||||||||||    
T  53638257 ctaaaatacccct 53638269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 82 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 29820483 - 29820397
Alignment:
Q  82 tatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatga 168  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||| | || ||||||||||| |||||||||||||    
T  29820483 tatacatagaccaccttaggtggcatacacactttgacacccacatacaattgtgagatgtagcaaaaacattaaaagaagagatga 29820397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 178 - 264
Target Start/End: Original strand, 29472912 - 29472997
Alignment:
Q  178 atgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  29472912 atgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatg-gggtgtgcataagtggtgtatgaaaaaggatgtctacctatctttt 29472997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 5417758 - 5417684
Alignment:
Q  91 accaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagaga 165  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||| ||| || | ||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  5417758 accactttaggtggcatacacactttgacactcacatacaattataacatgtggcaaaaatattaaaagaagaga 5417684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 12224177 - 12224120
Alignment:
Q  83 atacataaaccaccttaggtggcatacacccttt-tacacccacacacatttgtgaca 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| || |||||    
T  12224177 atacataaaccaccttaggtggcatgtaccatttgtacacccacacacaattttgaca 12224120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 23004764 - 23004821
Alignment:
Q  83 atacataaaccaccttaggtggcatacacc-cttttacacccacacacatttgtgaca 139  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23004764 atacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgaca 23004821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 34307329 - 34307140
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34307329 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacatccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagatatgaaaaagg 34307230  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34307229 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgggagtgtacataagaggtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 34307140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Original strand, 2509028 - 2509213
Alignment:
Q  79 tcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagggtaa 178  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  2509028 tcttatacatgaaccaccttaggtgacatacatccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagggtgg 2509127  T
Q  179 tgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2509128 tgatatgatgtaaaattactaaaatatccctaatacatgagggtgtacataagaggtgtatgaaaaaaagtgtctacctatctttt 2509213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 39250054 - 39249865
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39250054 gagctcttatacatgaaccatcttaggtggcatacacccttttacacccatacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 39249955  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
     |  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39249954 atggtgatataatgtaaaattactaaaatacccctaatacatgggggtgtacataagaggtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 39249865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 74 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 46901927 - 46901737
Alignment:
Q  74 tgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaag 173  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46901927 tgagctcttatacatgaaccaccttaggtgacatacaccattttacaccaacacatatttgtgacacgtggcaaaaacattaaaagaagagatgaaaaag 46901828  T
Q  174 ggtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  46901827 ggtgatgatatgatgtaaaattactcaaatactcctgatacatggcggtgtacataagaaatgtatgaaaaaggatgtctacctatctttt 46901737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19258863 - 19258675
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  19258863 gagctattatacataaaccatctaaggtggcatacacctttttacacccacatatatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaaaaagagatgaaaaggg 19258764  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    ||  |||| ||||||  ||||| | |||||  ||||| ||||| |||||||||| |||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  19258763 gtggtgatgtgatgtgaaattattaaaatattcctaacacatg-gggtgtacatgagagatgtataaaaaagggtgtctacctatctttt 19258675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Original strand, 28647351 - 28647541
Alignment:
Q  73 ttgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaa 172  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||     
T  28647351 ttgagctattatacatgaaccacctaaggttgcatacatctttttacacccacacatatttgtgatatttggcaaaaacattgaaagaatagatgaaaag 28647450  T
Q  173 gggtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    ||||  |||| ||||||  ||||| | |||||  ||||| ||||| || ||||||| |||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  28647451 gggtggtgatgtgatgtgaaattattaaaatattcctaacacatg-ggatgtacatgagagatgtataaaaaagggtgtctacctatctttt 28647541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 198
Target Start/End: Original strand, 29099821 - 29099939
Alignment:
Q  79 tcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagggtaa 178  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| || |||| |||| |    
T  29099821 tcttatacataaaccaccttagatggcatacactcttt-acgtccacacacatttgtgacatgtgacaaaaacattgaaaaaagaaattaaaaggggtga 29099919  T
Q  179 tgatatgatgtataattact 198  Q
    |||| ||||||  |||||||    
T  29099920 tgatgtgatgtgaaattact 29099939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 80 - 158
Target Start/End: Original strand, 10146971 - 10147049
Alignment:
Q  80 cttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaa 158  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  10146971 cttatacatggaccaccttaggtggcatacaccctttgacccccacacacaattgtgacatgtggcaaaaacagtgaaa 10147049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 9643039 - 9642869
Alignment:
Q  93 caccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatga-aaaagggtaatgatatgatgtat 191  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||      
T  9643039 caccttagatggcatataccttttaacacccacacataattgtgacacatgacaaaaacaatgaaagaagagatgagaagggggtgatgatatgatgtga 9642940  T
Q  192 aattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    ||||||| ||| | |||| | ||||||  |||| ||||| |  ||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  9642939 aattactaaaacatccct-acacatga-agtgtgcataatagatgtataaaaaaaaatgtctacctatctttt 9642869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 74 - 111
Target Start/End: Original strand, 8374694 - 8374731
Alignment:
Q  74 tgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacac 111  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8374694 tgagcacttatacatagaccaccttaggtggcatacac 8374731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 39858355 - 39858412
Alignment:
Q  83 atacataaaccaccttaggtggcatacacc-cttttacacccacacacatttgtgaca 139  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  39858355 atacatagaccaccttaggtggcatataccacttatacacccatacacaattgtgaca 39858412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 17)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Original strand, 42162598 - 42162787
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42162598 gagctcttatacatgaaccaccttaggtgtcatacacccttttacacccaaacacatttgtgacacgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 42162697  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  42162698 gtgatgatatgatgtaaaattactcaaatacccctaatacatgggggtgtacataaaaagtgtatgaaaaagagtgtctacctatctttt 42162787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Original strand, 44081781 - 44081964
Alignment:
Q  76 agctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaaggg 175  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44081781 agctcttatacatgaaccatcttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtaacacgtggaaaaaacattgaaagaagagatgaaaaaggg 44081880  T
Q  176 taatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctat 259  Q
    | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44081881 tgatgatataatgtaaaattactcaaatacccctaatacatgggggtgtacataagaagtgtatgaaaaagggtgtctacctat 44081964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Original strand, 31318805 - 31318994
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31318805 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatataactttttacatccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 31318904  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  31318905 gtgatgatatgatgtaaaattactcaaatactcctaatacatgggggtgtatataagaagtgtatgaaaaatgatgtctacctatctttt 31318994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 74 - 264
Target Start/End: Original strand, 30432338 - 30432527
Alignment:
Q  74 tgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaag 173  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30432338 tgagctcttatacatgaaccaccttagatggcatacacccttttatacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaagg 30432437  T
Q  174 ggtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  30432438 ggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccataatatatg-ggatgtacataagaggtgtatgaaaaagggtgtctatcaatctttt 30432527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Original strand, 10203668 - 10203853
Alignment:
Q  79 tcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagggtaa 178  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||      
T  10203668 tcttatacatgaaccaccttaggtgacatacatccttttacatccacacacatttgtgacacgtgacaaaaatattgaaagaagagatgaaaaagggtgg 10203767  T
Q  179 tgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10203768 tgatatgatataaaattactaaaatatccctaatacatgagggtgtacataagagatgtatgaaaaagggtgtctacctatctttt 10203853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 78 - 264
Target Start/End: Original strand, 12665347 - 12665534
Alignment:
Q  78 ctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagat-gaaaaagggt 176  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  12665347 ctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacactcacacacatttgtaacatgtggcaaaaacattgaaagaagagataaaaaaagggt 12665446  T
Q  177 aatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
     ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  12665447 gatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagggtatacataagaggtgtacgaaaaaggatgtctacctatctttt 12665534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 74 - 264
Target Start/End: Original strand, 36189215 - 36189403
Alignment:
Q  74 tgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaag 173  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  36189215 tgagctcttatacatgaaccatcttaggtggcatacacccttttacacccacatacatttgtgacacgtggcaaaaatattgaaagaagagatgaaaagg 36189314  T
Q  174 ggtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
     || |||||||||| || ||||| | |||||||||||  ||||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36189315 agtgatgatatgatataaaattattaaaataccccta--acatatgggtgtacataagtggtgtatgaaaaagggtgtctacctatctttt 36189403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Original strand, 43186031 - 43186215
Alignment:
Q  79 tcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagggtaa 178  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  43186031 tcttatacatcaaccactttaggtggcatatactcttttacacctgcacacatttgtgatatgtggcaaaaacattgaaagaaaagatgaaaaaaggtga 43186130  T
Q  179 tgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  43186131 tgatatgatataaaattactcaaatgcccctaatacat-agggtgtacataagaagtgtatgaaaaatgatgtctacctatctttt 43186215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 78 - 264
Target Start/End: Original strand, 18184556 - 18184741
Alignment:
Q  78 ctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagggta 177  Q
    |||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||     
T  18184556 ctcttatatatgaaccaccttaagtgacatacacccttttacatccacacatatttgtgacacgtggtgaaaacattgaatgaagagatgaaaaggggtg 18184655  T
Q  178 atgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  18184656 atgatatgatataaaattactaaaatacccctaacacatga-ggtgtacataaaaggtgtatgaaaaaggatgtctacctatctttt 18184741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 81 - 264
Target Start/End: Original strand, 33726017 - 33726200
Alignment:
Q  81 ttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaa-agggtaat 179  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || | |     
T  33726017 ttatacataaaccactttaggtggcatacacctttttacacccacaaacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaagtggatgac 33726116  T
Q  180 gatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    ||| ||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||  || |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  33726117 gatgtgatgtgaaattactaaaatacccctaacacatga-agtgtacatgggaggtgtataaaaaagggtgtctacctatctttt 33726200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 95 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 42668952 - 42668838
Alignment:
Q  95 ccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagggtaatgatatgatgtataat 194  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | | ||| ||| ||||||||  |||    
T  42668952 ccttaggtggcatacacactttgacacccacacacaattgtgacacgtggcaaaaacattaaaagaagatatgagaga-ggtgatggtatgatgtgaaat 42668854  T
Q  195 tactcaaataccccta 210  Q
    ||||  ||||||||||    
T  42668853 tactacaataccccta 42668838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 31622 - 31547
Alignment:
Q  91 accaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagat 166  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31622 accatcttaggtagcatacacactttgacacccacatacaattgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagat 31547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 38845165 - 38845025
Alignment:
Q  123 cacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagggtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggt 222  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| |||| || | |||| ||||| |||||   ||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  38845165 cacacacaattgtgacatgtggaaaaaatattgaaagaaaagat-aagaggggtgatgatgtgatgagaaattactaaaataaccctaacacataagggt 38845067  T
Q  223 gtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    |||||| |   |||||| ||||| ||||| || |||||||||    
T  38845066 gtacatgaagggtgtataaaaaatggtgtttatctatctttt 38845025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 3690788 - 3690700
Alignment:
Q  80 cttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatga 168  Q
    ||||||||| || || |||||||| |||||| ||||| | | ||||||||| |||||||| || || |||| ||| |||||||||||||    
T  3690788 cttatacatgaatcatcttaggtgacatacatcctttgatatccacacacacttgtgacatgtagcgaaaatattaaaagaagagatga 3690700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 8368545 - 8368488
Alignment:
Q  83 atacataaaccaccttaggtggcatacacc-cttttacacccacacacatttgtgaca 139  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  8368545 atacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgaca 8368488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 11904861 - 11904918
Alignment:
Q  83 atacataaaccaccttaggtggcatacacc-cttttacacccacacacatttgtgaca 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| | | ||||||||    
T  11904861 atacataaaccaccttaggtggcatataccacttgtacacccacatataattgtgaca 11904918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 28898003 - 28898060
Alignment:
Q  83 atacataaaccaccttaggtggcatacacc-cttttacacccacacacatttgtgaca 139  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  28898003 atacatagaccaccttaggtggcatataccacttatacacccatacacaattgtgaca 28898060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 13)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 74 - 264
Target Start/End: Original strand, 33732568 - 33732757
Alignment:
Q  74 tgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaag 173  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33732568 tgagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaag 33732667  T
Q  174 ggtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    |||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33732668 ggtggtgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaatatatg-gggtgtacataagaggtgtatgaaaaagggtgtctacctatctttt 33732757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 78 - 264
Target Start/End: Original strand, 44958116 - 44958302
Alignment:
Q  78 ctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagggta 177  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  44958116 ctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagataaaaaagggtg 44958215  T
Q  178 atgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  44958216 atgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgagggtatacataagaggtgtatgaaaaaggatgtctacctatctttt 44958302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Original strand, 16089822 - 16090009
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  16089822 gagctcttatacatgaaccaccttaagtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagat-aaaaaag 16089920  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    ||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16089921 gtggtgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatg-gggtgtacataagaggtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 16090009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 75 - 245
Target Start/End: Original strand, 14572995 - 14573165
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14572995 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatccacccttttacatccacacacatttgtgacacgtagcaaaaacattgaaagaagagatggaaaagg 14573094  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaa 245  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  14573095 gtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatgggggtgtacataagaggtgtatgtaaaa 14573165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 3831086 - 3830900
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  3831086 gagcacttatacatgaaccaccttaggtgacatacacccttttacacccacaca--tttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaagtg 3830989  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    || || || ||||||| ||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3830988 gtgattatctgatgtaaaattactaatatacccctaacacatg-gggtgtacataagaggtgtatgaaaaagggtgtctacctatctttt 3830900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 37499056 - 37498865
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaa--a 172  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  37499056 gagctcttatatatcaaccatcttaactggcatacatccttttacactcacacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaaga 37498957  T
Q  173 gggtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  37498956 gggtgatgatatgatgtaaaattactaaaatacccctaacacatggggatgtacataagaggtgtataaaaaagggtgtctacctatctttt 37498865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Original strand, 36315561 - 36315750
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  36315561 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagataaaaagag 36315660  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaagg-tgtctacctatctttt 264  Q
    || || || ||||||  ||| | | |||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  36315661 gtgataatgtgatgtgaaatgattaaaatacccctgacacatga-ggtgtacataagaggtgtatcaaaaaaggatgtctacctatctttt 36315750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 37914427 - 37914239
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  37914427 gagcttttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacatccacacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagataaaaaggg 37914328  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaa-ggtgtctacctatctttt 264  Q
    || || || ||||||  ||| | | ||||| ||||  |||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  37914327 gtgataatgtgatgtgaaatgattaaaata-ccctggtacatg-gggtgtacataagaggtgtatcaaaaaagggtgtctacctatctttt 37914239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 72 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 6376427 - 6376241
Alignment:
Q  72 attgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaa 171  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     |||||||||||||||||||||    
T  6376427 attgagctgttatacataaaccaccataggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacatgtggc-----cattgaaagaagagatgaaaa 6376333  T
Q  172 agggtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
     |||| | ||| ||||||  ||||||| ||||||| |||| |||||| | |||||||  || |||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  6376332 tgggtgaggatgtgatgtgaaattactaaaatacctctaacacatga-gatgtacatgggaggtgtataaaaaaggatgtctacctatctttt 6376241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 74 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24137288 - 24137149
Alignment:
Q  74 tgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacc----cacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaa 169  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24137288 tgagctgttatacataaaccaccttaggtggtatacaccctttgacacctacccacacacatttgtgacatgtgacaaaaacattgaaagaagagatgaa 24137189  T
Q  170 aaagggtaatgatatgatgtataattactcaaatacccct 209  Q
    || || | | ||| ||||||  ||||||| ||||||||||    
T  24137188 aagggatgaggatgtgatgtgaaattactaaaatacccct 24137149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 33414841 - 33414902
Alignment:
Q  1 tgcaagcaaaaccaaattaaagttttaatataggtttaagtgtattttttaacttttaacta 62  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33414841 tgcaagcaaaaccaatttaaagttttaatataggtttaagtgtattttttaacttttaacta 33414902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 33409307 - 33409369
Alignment:
Q  1 tgcaagcaaaaccaaattaaagttttaatataggtttaagtgtattttttaacttttaactat 63  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  33409307 tgcacgcaaaaccaatttaaagtttaaatataggtttaaatgtattttttaccttttaactat 33409369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 264
Target Start/End: Original strand, 41188777 - 41188958
Alignment:
Q  83 atacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagggtaatgat 182  Q
    |||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||| | | | ||| |||| ||||| |||||||||||||||||| | || ||||||| || | |||||    
T  41188777 atacatgaaccactttatgtgacatacacccttttatatctatacatatttatgacatgtggcaaaaacattgaaaaatgatatgaaaagggatgatgat 41188876  T
Q  183 atgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatga-aaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
     ||||||| ||||||| ||||| | || | |||||  | ||||||| ||| |||||| | |||| ||||||| ||||||||||    
T  41188877 gtgatgtaaaattactaaaatatctctgacacatg-tgatgtacatgagaggtgtataacaaaagggtgtctgcctatctttt 41188958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 134; Significance: 8e-70; HSPs: 7)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 3987096 - 3986908
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3987096 gagctcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaggg 3986997  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
     | || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  3986996 atgataatatgatgtaaaattactcaaatacccttaatacatg-gggtatacataataaatgtatgaaaaatgatgtctacctatctttt 3986908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 3118238 - 3118049
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  3118238 gagctcttatatatgaaccaccttaggtggcatacacccttttacactcacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaatagataaaaaagg 3118139  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    ||  ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  3118138 gtggtgacatgatgtaaaattactaaaatacccctaatacatgggagtgtacataagagatgtatgaaaaaggatgtctacctatctttt 3118049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 74 - 264
Target Start/End: Original strand, 14022933 - 14023122
Alignment:
Q  74 tgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaag 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  14022933 tgagctattatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacatgtggcaaaaacattgaaagaagagatgacaagg 14023032  T
Q  174 ggtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    ||| | ||| ||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||  || |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  14023033 ggtgacgatgtgatgtgaaattactaaaatacccctaacacatga-ggtgtacatgggaggtgtataaaaaagggtgtctacctatctttt 14023122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 15345848 - 15345662
Alignment:
Q  75 gagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagg 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  15345848 gagctcttatacatcaaccaccttaggtggcatatactcttttacacccataca--tttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaaaagatgaaaaaag 15345751  T
Q  175 gtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    || |||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15345750 gtgatgatatgatatcaaattactcaaatgcccctaatacat-agggtgtacataagaagtgtatgaaaaaagatgtctacctatttttt 15345662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 74 - 264
Target Start/End: Original strand, 24208443 - 24208632
Alignment:
Q  74 tgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaag 173  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24208443 tgagctgttatacataaaccatcataggtggtatacactattttacacccacacacatttgtgatatgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaag 24208542  T
Q  174 ggtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    ||| | ||| ||||||  ||||||| |||||||||||| |||||| |||||| || ||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  24208543 ggtgaggatgtgatgtgaaattactaaaatacccctaacacatga-ggtgtaaatgagaggtgtataaaaaaggatgtctacctatctttt 24208632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Original strand, 13697567 - 13697756
Alignment:
Q  73 ttgagctcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaa 172  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  13697567 ttgagctcttatacataaaccatcttagatgacatgcacccttttacacc-atacacatttgtgatacgtggtaaaaacattgaaagaagagatgaaaac 13697665  T
Q  173 gggtaatgatatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    |||| |||||||||| || ||||||| ||||| | |||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  13697666 gggtgatgatatgatataaaattactaaaatatctctaacacatg-gggtgtacataagtaatgtatgaaaaatgatctctacctatctttt 13697756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 128
Target Start/End: Original strand, 16717998 - 16718044
Alignment:
Q  83 atacataaaccaccttaggtggcatacacc-cttttacacccacaca 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  16717998 atacataaaccaccttaggtggcatataccacttgtacacccacaca 16718044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 79 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 87350 - 87165
Alignment:
Q  79 tcttatacataaaccaccttaggtggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaagggtaa 178  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  87350 tcttatacatgaaccaccttaggtggcatacacccttgtacacc-acacacatttgtgacacgtggcaaaaacattgaaagaagagatgaaaaatagtga 87252  T
Q  179 tg--atatgatgtataattactcaaatacccctaatacatgagggtgtacataagaagtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 264  Q
    ||  |||| || || ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  87251 tgatatataatataaaattactaaaatacccctaacacatg-gggtgtacataaaaggtgtatgaaaaaaggtgtctacctatctttt 87165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 102 - 140
Target Start/End: Original strand, 5943 - 5981
Alignment:
Q  102 tggcatacacccttttacacccacacacatttgtgacac 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5943 tggcatacacccttttacacccacgcacatttgtgacac 5981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University