View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11523_low_2 (Length: 787)

Name: NF11523_low_2
Description: NF11523
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11523_low_2
NF11523_low_2
[»] chr5 (14 HSPs)
chr5 (1-770)||(33574542-33575320)
chr5 (1-767)||(15532217-15532992)
chr5 (1-770)||(15542396-15543174)
chr5 (1-685)||(26712439-26713133)
chr5 (1-685)||(26982177-26982871)
chr5 (4-713)||(34405306-34406023)
chr5 (4-713)||(14616499-14617216)
chr5 (15-770)||(22159212-22159978)
chr5 (100-713)||(7650012-7650632)
chr5 (130-444)||(11989166-11989480)
chr5 (524-705)||(11988942-11989127)
chr5 (679-770)||(26711478-26711567)
chr5 (679-770)||(26981215-26981304)
chr5 (273-378)||(23993447-23993552)
[»] chr3 (12 HSPs)
chr3 (1-770)||(22626326-22627104)
chr3 (1-770)||(11138584-11139361)
chr3 (4-770)||(39563524-39564294)
chr3 (106-617)||(13979050-13979565)
chr3 (68-490)||(35365901-35366319)
chr3 (1-146)||(1096863-1097007)
chr3 (128-490)||(47411772-47412125)
chr3 (1-183)||(31878278-31878461)
chr3 (439-598)||(46731386-46731555)
chr3 (639-718)||(20536401-20536479)
chr3 (622-713)||(35366459-35366549)
chr3 (587-660)||(50096830-50096903)
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (1-770)||(13017203-13017981)
chr6 (5-737)||(22221182-22221921)
chr6 (5-737)||(22247017-22247756)
chr6 (4-713)||(14790076-14790793)
chr6 (13-713)||(14795113-14795821)
chr6 (4-708)||(19664741-19665452)
chr6 (4-617)||(32704421-32705041)
chr6 (4-603)||(1837931-1838539)
chr6 (123-659)||(20527286-20527832)
chr6 (125-657)||(16883254-16883795)
chr6 (1-452)||(32426823-32427271)
chr6 (448-673)||(30978321-30978557)
chr6 (4-370)||(15534546-15534912)
chr6 (180-501)||(12983670-12983994)
chr6 (198-501)||(12980783-12981089)
chr6 (80-584)||(7769588-7770112)
chr6 (414-713)||(15534923-15535230)
chr6 (362-484)||(15538036-15538158)
chr6 (4-204)||(15537741-15537940)
chr6 (523-616)||(27649087-27649180)
chr6 (12-109)||(32426651-32426748)
chr6 (542-713)||(15540574-15540744)
chr6 (254-320)||(15537971-15538037)
chr6 (523-598)||(32427286-32427362)
chr6 (587-657)||(11183962-11184032)
chr6 (661-750)||(1838598-1838687)
chr6 (273-314)||(2330478-2330519)
[»] chr2 (9 HSPs)
chr2 (1-770)||(31527843-31528621)
chr2 (1-769)||(31626001-31626779)
chr2 (1-770)||(40017432-40018210)
chr2 (1-770)||(13709526-13710301)
chr2 (198-713)||(16294550-16295073)
chr2 (12-634)||(36326386-36327022)
chr2 (142-713)||(23673415-23673995)
chr2 (13-583)||(32575887-32576464)
chr2 (333-394)||(8426783-8426844)
[»] chr4 (10 HSPs)
chr4 (1-770)||(12171436-12172204)
chr4 (4-713)||(647274-647991)
chr4 (4-713)||(650546-651264)
chr4 (28-713)||(26062762-26063457)
chr4 (123-592)||(26060163-26060641)
chr4 (123-770)||(2541461-2542114)
chr4 (527-588)||(11649429-11649490)
chr4 (275-445)||(16926976-16927144)
chr4 (273-314)||(13978982-13979023)
chr4 (273-314)||(56089543-56089584)
[»] chr7 (19 HSPs)
chr7 (1-770)||(23759623-23760400)
chr7 (1-770)||(11278946-11279722)
chr7 (4-769)||(33312460-33313224)
chr7 (12-770)||(294330-295092)
chr7 (95-770)||(46846326-46847007)
chr7 (106-766)||(36222327-36222993)
chr7 (4-713)||(6966605-6967322)
chr7 (13-713)||(17866424-17867132)
chr7 (4-676)||(17863202-17863882)
chr7 (4-690)||(24782863-24783560)
chr7 (157-656)||(23107597-23108106)
chr7 (123-586)||(36843135-36843607)
chr7 (80-722)||(3861968-3862607)
chr7 (123-603)||(9765373-9765867)
chr7 (123-321)||(23313673-23313871)
chr7 (4-269)||(35773054-35773319)
chr7 (382-661)||(23313382-23313671)
chr7 (273-442)||(2719269-2719438)
chr7 (399-440)||(27796686-27796727)
[»] scaffold0440 (2 HSPs)
scaffold0440 (291-770)||(9606-10095)
scaffold0440 (1-146)||(9463-9608)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (5-598)||(7177-7780)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (1-598)||(2145-2754)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (233-718)||(24250-24743)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (1-588)||(2799-3398)
[»] chr1 (19 HSPs)
chr1 (43-713)||(13492759-13493437)
chr1 (1-713)||(32505931-32506644)
chr1 (43-713)||(13495484-13496162)
chr1 (57-586)||(27282305-27282842)
chr1 (132-661)||(34065929-34066468)
chr1 (47-713)||(1936128-1936804)
chr1 (1-662)||(16190299-16190967)
chr1 (206-481)||(22104683-22104956)
chr1 (126-501)||(23990380-23990754)
chr1 (288-713)||(39545983-39546417)
chr1 (162-501)||(21152871-21153209)
chr1 (287-501)||(22453427-22453641)
chr1 (162-492)||(22456792-22457123)
chr1 (262-501)||(15297047-15297286)
chr1 (4-237)||(10759579-10759811)
chr1 (457-713)||(10764829-10765094)
chr1 (587-660)||(8435285-8435358)
chr1 (532-577)||(22456699-22456744)
chr1 (532-577)||(49147891-49147936)
[»] chr8 (8 HSPs)
chr8 (43-770)||(12575314-12576048)
chr8 (123-598)||(13096606-13097081)
chr8 (154-598)||(44007909-44008356)
chr8 (314-661)||(41778864-41779213)
chr8 (523-713)||(14418450-14418639)
chr8 (152-237)||(41779232-41779317)
chr8 (527-588)||(41836418-41836479)
chr8 (354-398)||(14418355-14418399)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (123-598)||(5995-6479)
[»] scaffold0665 (1 HSPs)
scaffold0665 (4-436)||(1-432)
[»] scaffold0363 (2 HSPs)
scaffold0363 (523-713)||(79-268)
scaffold0363 (354-398)||(319-363)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (273-314)||(7086-7127)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 645; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 645; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 770
Target Start/End: Original strand, 33574542 - 33575320
Alignment:
Q  1 atctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaacta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33574542 atctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaacta 33574641  T
Q  101 attcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttatt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33574642 attcttttgtggttaattcctgagatgaatctgatgtaaccctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttatt 33574741  T
Q  201 catactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccacta 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33574742 catattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccacta 33574841  T
Q  301 accctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtt 400  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33574842 accctaacttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacattcgtt 33574941  T
Q  401 taatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaat 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33574942 taatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctagatcaagagattgggtagaattactaagttaat 33575041  T
Q  501 ccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaatt 590  Q
    ||||          ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33575042 ccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtaattaggagtgcaaattaccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaatt 33575141  T
Q  591 ttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttttaataa 690  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33575142 ttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttttaataa 33575241  T
Q  691 tgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggttcacttg 770  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||| |||  | | ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  33575242 taaaattgctaaatagaagttaaatacagtcctcgtgaaaacgaatt-ttttattacttcgattgaatttggttcacttg 33575320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 603; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 15532992 - 15532217
Alignment:
Q  1 atctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaacta 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15532992 atctggtggggaaccatcaaaactaagagtcaatcttccttcacatggatgaatccgttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaacta 15532893  T
Q  101 attcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttatt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15532892 attcttttgtggttaattcatgagatgaatctgatgtaaccctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttatt 15532793  T
Q  201 catactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccacta 300  Q
    | || ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15532792 cttattactttgtgcttaatgccttatgtacgtttatgatagactattaaccctagcgttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccacta 15532693  T
Q  301 accctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15532692 accctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcg-t 15532594  T
Q  401 taatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaat 500  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15532593 taatacctccattggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaat 15532494  T
Q  501 ccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaatt 590  Q
    | ||          ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15532493 ctgtcgtgaaactaaataatcattgatcgtatttaggagtgcaaattaccacaggagagctttagaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaatt 15532394  T
Q  591 ttc-taaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttttaata 689  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15532393 ttcttaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttttaata 15532294  T
Q  690 atgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggttcac 767  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15532293 atgaaattgctaagtagaagttaaatacagtcctcgtggaaacgaatt-ttttattacttcgatcgaatttggttcac 15532217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 602; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 15543174 - 15542396
Alignment:
Q  1 atctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaacta 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15543174 atctggtggggaaccatcaaaactaagagtcaatcttccttcacatgtatgaatccgttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaacta 15543075  T
Q  101 attcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttatt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15543074 attcttttgtggttaattcatgagatgaatctgatgtaaccctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttatt 15542975  T
Q  201 catactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccacta 300  Q
    | || ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15542974 cttattactttgtgcttaatgccttatgtacgtttatgatagactattaaccctagcgttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccacta 15542875  T
Q  301 accctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15542874 accctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcg-t 15542776  T
Q  401 taatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaat 500  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15542775 taatacctccattggtttcgaattcacttaagagatcaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaat 15542676  T
Q  501 ccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaatt 590  Q
    | ||          ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15542675 ctgtcgtgaaactaaataatcattgatcgtatttaggagtgcaaattaccacaggagagctttagaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaatt 15542576  T
Q  591 ttc-taaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttttaata 689  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15542575 ttcttaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttttaata 15542476  T
Q  690 atgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggttcacttg 770  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15542475 atgaaattgttaagtagaagttaaatacagtcctcgtggaaacgaatt-ttttattacttcgatcgaatttggttcacttg 15542396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 26713133 - 26712439
Alignment:
Q  1 atctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaacta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26713133 atctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatcctttacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaacta 26713034  T
Q  101 attcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttatt 200  Q
    |||   ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26713033 att---ttgtggttaattcctgagataaatctgatgtaatcctacgg-aaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtctttatt 26712938  T
Q  201 catactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccacta 300  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26712937 catattaccttgtgtttaatgctttatgtatgtttatcattgactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccacta 26712838  T
Q  301 accctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagataga---tcattattaggttatgatatagggattaacgttc 397  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26712837 accctggcttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcatcattattaggttatgacatagggattaacgttc 26712738  T
Q  398 gtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagtt 497  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26712737 ttttaatacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagtt 26712638  T
Q  498 aatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctca 587  Q
    |||| ||          ||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  26712637 aatctgtcgtgaaactaaataatcattgattg-aattaggagtgcaaattatcataggagagcgtcggaggattcgaaagacttaaccattcttctctca 26712539  T
Q  588 -attttctaaaaaccaattctttattgtttttaa-tcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaa-tttatacatcctttt 684  Q
     ||||||| |||||||||  |||| | ||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  26712538 gattttct-aaaaccaatcttttactatttttaattttgtttatgttacaaaatcaactcaactgtctagggcactaatataaattttacacatcctttt 26712440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 26982871 - 26982177
Alignment:
Q  1 atctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaacta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26982871 atctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatcctttacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaacta 26982772  T
Q  101 attcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttatt 200  Q
    |||   ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26982771 att---ttgtggttaattcctgagataaatctgatgtaatcctacgg-aaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtctttatt 26982676  T
Q  201 catactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccacta 300  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26982675 catattaccttgtgtttaatgctttatgtatgtttatcattgactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccacta 26982576  T
Q  301 accctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagataga---tcattattaggttatgatatagggattaacgttc 397  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26982575 accctggcttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcatcattattaggttatgacatagggattaacgttc 26982476  T
Q  398 gtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagtt 497  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26982475 ttttaatacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagtt 26982376  T
Q  498 aatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctca 587  Q
    |||| ||          ||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  26982375 aatctgtcgtgaaactaaataatcattgattg-aattaggagtgcaaattatcataggagagcgtcggaggattcgaaagacttaaccattcttctctca 26982277  T
Q  588 -attttctaaaaaccaattctttattgtttttaa-tcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaa-tttatacatcctttt 684  Q
     ||||||| |||||||||  |||| | ||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  26982276 gattttct-aaaaccaatcttttactatttttaattttgtttatgttacaaaatcaactcaactgtctagggcactaatataaattttacacatcctttt 26982178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 4 - 713
Target Start/End: Original strand, 34405306 - 34406023
Alignment:
Q  4 tggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaatt 103  Q
    |||||| | ||||||| |||| | ||||||| ||||   |||| |||||||||||  | |||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||     
T  34405306 tggtgggagaccatcacaactcatagtcaattatccaatacatatatgaatccttgattttatgtgagttatcttgtactgtagttatgagtaactaatc 34405405  T
Q  104 cttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcat 203  Q
      ||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  34405406 tctttatggttcag-cttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcattgaaagtctagttttaattcat 34405504  T
Q  204 actaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaacc 303  Q
    | ||| || ||||| |||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  34405505 attactttatgttttatgctttttgtatgtttatcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatgaccactaacc 34405604  T
Q  304 ctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaa 403  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  34405605 ctggcttttgactctgatctaggtaataagtttaacttaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgagatagggattaacgttcttttaa 34405704  T
Q  404 tacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatccg 503  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  34405705 aacctccaacggttttgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcgaggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctg 34405804  T
Q  504 t----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aatttt 592  Q
    |           |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||    
T  34405805 tcgttaaactagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggatttgaaggtcttaaccatacttctctctaatatt 34405903  T
Q  593 ctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggc-accaatataaatttatacatcctttttaataat 691  Q
    || |||||||| | |||||||||||   |  ||||||||||| | | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  34405904 ctgaaaaccaact-tttattgttttatttacgtttatgttac-acaacaactcaactgcctagggcaatcaatataaatttatacatcctttttgataaa 34406001  T
Q  692 gaaattgctaagtagaagttaa 713  Q
    ||||||||  ||||||| ||||    
T  34406002 gaaattgccgagtagaaattaa 34406023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 4 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 14617216 - 14616499
Alignment:
Q  4 tggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaatt 103  Q
    |||||| | ||||||| |||| | ||||||| ||||   |||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||     
T  14617216 tggtgggagaccatcacaactcatagtcaattatccaatacatgtatgaatccttgtttttatgtgagttatcttgtactttagttatgagtaactaatc 14617117  T
Q  104 cttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcat 203  Q
      ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  14617116 tctttctggttaag-cttgagatgaatatgatgtaatcctatgagaaccctagtttgttgaactcctttaaatatcaatgaaagtctagttttaattcat 14617018  T
Q  204 actaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaacc 303  Q
    | ||| || |||||||||| || ||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  14617017 attactttatgtttaatgctttttgtatgtttatcatcgaatactaaccctaactttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccactaacc 14616918  T
Q  304 ctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaa 403  Q
     |||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||   ||||    
T  14616917 atggcttttgactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttttgttaa 14616818  T
Q  404 tacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatccg 503  Q
     |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  14616817 aacctccaacggtttcgaattcactcaagagattaagggcttgtcacttgcggggagaattataggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctg 14616718  T
Q  504 t----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aatttt 592  Q
    |           |||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||    
T  14616717 tcgttaaactagataatcattgattg-aattaggagtgaaaattaccataggagaacttcggaggattcaaaggtcttaaccatacttctctctaatatt 14616619  T
Q  593 ctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctaggg-caccaatataaatttatacatcctttttaataat 691  Q
    || |||| ||| | |||||||||||   |  ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||||||| ||||     
T  14616618 cttaaaatcaact-tttattgttttatttacgtttatgttac-aaaacaactcaacttcctagggtaatcaatataaattcatacatcctttttgataaa 14616521  T
Q  692 gaaattgctaagtagaagttaa 713  Q
    ||||||||  ||||||| ||||    
T  14616520 gaaattgccgagtagaaattaa 14616499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 15 - 770
Target Start/End: Original strand, 22159212 - 22159978
Alignment:
Q  15 catcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaattcttttgtggtt 114  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||   |||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||   |||||||||    
T  22159212 catcacaactcatagtcaatcatccaatacatgtatgaatccttgtttttatgtgagttatcttgtactttagttatgagtaactaatctctttgtggtt 22159311  T
Q  115 aattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtg 214  Q
     |   | |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  22159312 gagaat-gagatgaatccgatgtaatcctacgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctagtttttattcatattactttgtg 22159410  T
Q  215 tttaatgccttatgtat-gtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggctttta 313  Q
    |||||||| || ||||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||     
T  22159411 tttaatgctttttgtattgtttatcatcgactactaaccatagctttatgaatatacaaattgatgttagagattgaatgaccattaaccctggcttttg 22159510  T
Q  314 actctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaat 413  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  22159511 actctgatctaggtaataggtttaacctaagtaatcaaactagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttctgttaaaacctccaat 22159610  T
Q  414 ggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatc---cgt------ 504  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||   |||          
T  22159611 ggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgttacttgtggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctatcgttgaact 22159710  T
Q  505 -aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaacca 602  Q
      ||| |||||||||| |  ||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||    
T  22159711 agatagtcattgattg-aactaggagtgcgatttaccataggagaacttcggaggattcaaaggtcttaaccatatttctctctaatattcttaaaacca 22159809  T
Q  603 attctttattgtttttaatcagtttatgtta-ctaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatt--tatacatcctttttaataatgaaattgc 699  Q
    ||| |||||||||||   |  |||||  |||   ||| |||  ||||||||||||||| |  |  || ||  |||||||||||||| | || ||||||||    
T  22159810 att-tttattgttttatttacgtttactttataaaaaccaatccaactgcctagggcaacctttgaatttaatatacatcctttttgacaaagaaattgc 22159908  T
Q  700 taagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggttcacttg 770  Q
    ||||||||||||||||||| |||  | |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  22159909 taagtagaagttaaatacagtcctcgtggaaacaaatt-ttttattacttcgatcgaatttggtacacttg 22159978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 100 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 7650632 - 7650012
Alignment:
Q  100 aattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttat 199  Q
    |||||| ||||||||||  || ||||||||| |||||||||  ||||| || ||||||||||||||||      || |||||||||||| |||| |||||    
T  7650632 aattctcttgtggttaag-ctcgagatgaatttgatgtaattttatgg-aaccctaatttgttgaact------aatatcaatgaaagtctagtctttat 7650541  T
Q  200 tcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccact 299  Q
    ||||  ||| || |||||||||  || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  7650540 tcatgttactttatgtttaatgttttttgtatgtttatcatcgactactaaccctaactttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaataaccact 7650441  T
Q  300 aaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcatta---------ttaggttatgatatagggatt 390  Q
    ||||   |||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||         ||||||||||| |||||||||    
T  7650440 aacc---gcttttgactcagaactaggtaataagtttaacctaaaaaatcaagctagagatagatcattattaggttatttaggttatgacatagggatt 7650344  T
Q  391 aacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaatta 490  Q
    ||| |||  |||| |||||||  | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  7650343 aaccttctattaaaacctccagcgatttcgaattcactcaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtaaagagattgagtagaatta 7650244  T
Q  491 ctaagttaatc----------cgtaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatact 580  Q
    |   |||||||          |   |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||    
T  7650243 ccttgttaatctatctttaaactagataatcattgattg-aattaggagtgcaaattaccatagaagaacttcgtaggattcaaatgtcttaaccatact 7650145  T
Q  581 tctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggc-accaatataaatttatacat 678  Q
    |||||| ||| |||| |||| ||| | |||||||||||   |  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  7650144 tctctctaatattcttaaaagcaact-tttattgttttatttacgtttatgttac-aaaacaactcaactgcctagggcaatcaatataaatttatacat 7650047  T
Q  679 cctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaa 713  Q
    ||||||| |||| ||||||| | ||||||| ||||    
T  7650046 cctttttgataaagaaattgttgagtagaaattaa 7650012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 130 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 11989480 - 11989166
Alignment:
Q  130 tctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgt 229  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||| || |||    
T  11989480 tctgatgtaattttatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtctagtttttattcatattactttatgtttaatgctttttgt 11989381  T
Q  230 atgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaa 329  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||  ||||||     
T  11989380 atgtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatacaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccttcgcttttgactctgatctaggtat 11989281  T
Q  330 taggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcactt 429  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  11989280 taggtttaacctatgtaatcaagttagagatagatcattattaggttttaacatagagattaacgttctattaaaacctccaacggtttcgaattcactt 11989181  T
Q  430 aaaagattaaggggt 444  Q
    || ||||||||||||    
T  11989180 aagagattaaggggt 11989166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 524 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 11989127 - 11988942
Alignment:
Q  524 taggagtgcaaattgccata--ggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaa 620  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||  ||||| ||||||||    
T  11989127 taggagtgcaaattaccatataggagaactttggaggattcgaaggtcttaaccttacttctctctaattttct-aaaatcaatcttttatcgtttttaa 11989029  T
Q  621 tcagtttatgttac-taaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatt--tatacatcctttttaataatgaaattgctaagta 705  Q
    || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||  || ||  ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  11989028 tctgtttatgttacaaaaatcaactcaactgcctaggggacc-attgaatttaatatacgtccttattactaatgaaattgctaagta 11988942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 679 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 26711567 - 26711478
Alignment:
Q  679 cctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggttcacttg 770  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  | ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26711567 cctttttgataatgaaattgctaagtagaagtt-aatacagtcctcgtggaaacgaatt-ttttattacttcaattgaatttggttcacttg 26711478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 679 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 26981304 - 26981215
Alignment:
Q  679 cctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggttcacttg 770  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  | ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26981304 cctttttgataatgaaattgctaagtagaagtt-aatacagtcctcgtggaaacgaatt-ttttattacttcaattgaatttggttcacttg 26981215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 23993552 - 23993447
Alignment:
Q  273 attgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattatta 372  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| | |||||  |||| |||| | ||||||| || ||| ||||||||||||||  |||||||    
T  23993552 attgatcttagaacttgaatgaccactagccatgacttttgaatctgatctaggaaatatggttaacctaagaaattaagctagagatagacaattatta 23993453  T
Q  373 ggttat 378  Q
    ||||||    
T  23993452 ggttat 23993447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 638; Significance: 0; HSPs: 12)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 638; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 22627104 - 22626326
Alignment:
Q  1 atctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaacta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22627104 atctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaacta 22627005  T
Q  101 attcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttatt 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22627004 attcttttgtggttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttatt 22626905  T
Q  201 catactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccacta 300  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626904 catattactttgtgcttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagcgttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccacta 22626805  T
Q  301 accctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagat-agatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgt 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626804 accctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagataagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgt 22626705  T
Q  400 ttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaa 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  22626704 ttaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattggatagaattactaagttaa 22626605  T
Q  500 tccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaat 589  Q
    |||||          ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626604 tccgtcgtgaaactaaataatcattgatcgtatttaggagtgcaaattaccataggagagctttggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaat 22626505  T
Q  590 tttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttttaata 689  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626504 tttct-aaatccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttttaata 22626406  T
Q  690 atgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggttcacttg 770  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22626405 atgaaattgctaagtagaagttaaatacagtcctcgtggaaacgaact-ttttattacttcgatcgaatttggttcacttg 22626326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 598; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 11139361 - 11138584
Alignment:
Q  1 atctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatccttttt-cttatgttagttagcttatactttagctatgagtaact 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11139361 atctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatccttttttcttatgttagttatcttatactttagctttgagtaact 11139262  T
Q  100 aattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11139261 aattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttat 11139162  T
Q  200 tcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccact 299  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11139161 tcatattactttgtgcttaatgccttatgtatgtttatgataaactattaaccctagcgttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatggccact 11139062  T
Q  300 aaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgt 399  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11139061 aaccctggcttttaactctgaaata-gtaataggtttaacctcagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgt 11138963  T
Q  400 ttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaa 499  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  11138962 ttaatacctcctatggtttcgaattcacttaagagattaaggagttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattggatagaattactaagttaa 11138863  T
Q  500 tccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaat 589  Q
    |||||          ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11138862 tccgtcgtgaaactaaataatcattgatcgtatttaggagtgcaaattaccataggagagctttggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaat 11138763  T
Q  590 tttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttttaata 689  Q
    |||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11138762 tttct-gaatccaattctatattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttttaata 11138664  T
Q  690 atgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggttcacttg 770  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11138663 atgaaattgctaagtagaagttaaatacagtcctcgtggaaacgaact-ttttattacttcgatcgaatttggttcacttg 11138584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 479; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 39564294 - 39563524
Alignment:
Q  4 tggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaatt 103  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39564294 tggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatcctttacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaatt 39564195  T
Q  104 cttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcat 203  Q
       ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  39564194 ---ttgtggttaattcctgagataaatctgatgtaatcctacga-aaccctaatttgttgaactcctttgaacattaatgaaagtttagtctttattcat 39564099  T
Q  204 actaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaacc 303  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39564098 attaccttgtgtttaatgctttatgtatgtttatcattgactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaacc 39563999  T
Q  304 ctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaa 403  Q
    ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  39563998 ctgacttttaa-tctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaa 39563900  T
Q  404 tacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatccg 503  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39563899 tacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatctg 39563800  T
Q  504 t----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctca-atttt 592  Q
    |          ||||| ||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  39563799 tcgtgaaactaaataaccattgattg-aattaggagtgcaaattatcataggagagcgtcggaggattcgaaggacttaaccattcttctctcagatttt 39563701  T
Q  593 ctaaaaaccaattctttattgtttttaa-tcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaa-tttatacatcctttttaataa 690  Q
    || |||||||||  |||| | ||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  39563700 ct-aaaaccaatcttttactatttttaattttgtttatgttacaaaatcaactcaactgcctagggcactaatataaattttacacatccttttttataa 39563602  T
Q  691 tgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggttcacttg 770  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||  | ||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  39563601 tgaaattgctaagtagaagtt-aatacagtcctcgtggaaacgaatt-ttttattactttgattgaatttggttcacttg 39563524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 106 - 617
Target Start/End: Original strand, 13979050 - 13979565
Alignment:
Q  106 tttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatac 205  Q
    |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| ||||||     
T  13979050 tttgtggttaagactt-agacgaatctgaggtaatcttatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatttaaatgaaagtttagtcttttttcatat 13979148  T
Q  206 taccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccct 305  Q
    ||| || |||||||||  ||  ||||   ||| || ||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  13979149 tactttttgtttaatgtttttcgtat---tatcatcgactactgaccctagctttatgaa-atgcaaattgatcgtagagattgaatgaccactgaccct 13979244  T
Q  306 ggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaata 405  Q
    | ||||  |||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  13979245 gactttcgactctgaactaggtaatagttttaacttaagtaatcaagttggagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaata 13979344  T
Q  406 cctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatccgt- 504  Q
    |||| || | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||| ||     
T  13979345 cctcgaacgatttcgaattcacttaagagattaagaggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagggattggatagagttactaagttaatctgtc 13979444  T
Q  505 ---------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttct 594  Q
             ||||||||||| ||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  13979445 atgaaactaaataatcattgtttgaactt-ggagtgcaaattaccataggagagcttcggaggattcaaaggtcttaaccatacttctctctaatattct 13979543  T
Q  595 aaaaaccaattctttattgtttt 617  Q
     |||||||| | |||||||||||    
T  13979544 taaaaccaact-tttattgtttt 13979565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 68 - 490
Target Start/End: Original strand, 35365901 - 35366319
Alignment:
Q  68 ttagttagcttatactttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgt-tgaac 166  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    |||| ||| |  ||| || ||||||||||||||  |||||| || |||||||||| |||||    
T  35365901 ttagttatcttgtactttagctatgagtaactaatctccttgtagttgagactt-ag-tgaatctgatgtaactctatggaaa-cctaatttgtatgaac 35365997  T
Q  167 tcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaat 266  Q
    ||  ||||| || ||||||||  ||||||  ||||||| ||||||||||||||||   | | ||||||||| || ||||| || | ||||| |  |||||    
T  35365998 tctcttgaatattaatgaaagactagttta-attcatattaccttgtgtttaatgttgttt-tatgtttattattgactactagcactagcatcgtgaat 35366095  T
Q  267 atgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatca 366  Q
     |||| ||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||  |    
T  35366096 gtgcaaattgatcttaaaacttgaatgaccactagccttggcttttgactctgatctaggtaataggtttaacctaagtaattaagttagagatagaaaa 35366195  T
Q  367 ttattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattct 466  Q
    |||||||| |||||   | |||||||||  |  |||| ||||||||  || | |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||| ||||    
T  35366196 ttattaggctatgactcatggattaacggactgttaaaacctccaagagtcttgaattcacttaagagattaagggattgtcactcgcggagagagttct 35366295  T
Q  467 aggttaagagattgggtagaatta 490  Q
    |||| ||||||||| |||||||||    
T  35366296 aggtcaagagattgagtagaatta 35366319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 1097007 - 1096863
Alignment:
Q  1 atctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaacta 100  Q
    |||||||||  |||||||| |||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1097007 atctggtgggcaaccatcacaactcatagtcaatcatccattacatgtatgaatcctttttcttatgttagttaacttatactttagctatgagtaacta 1096908  T
Q  101 attcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatg 146  Q
    |||| |||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  1096907 attcctttgtggttaa-gcttgacatgaatctgatataattctatg 1096863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 128 - 490
Target Start/End: Original strand, 47411772 - 47412125
Alignment:
Q  128 aatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgt-tgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgcctta 226  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||   |     
T  47411772 aatctgatgtaattttatggaaa-cctaatatgtatgaactcccttgaatatcaatgaaagtctagttta-attcatattaccttgtgtttaatgttgtt 47411869  T
Q  227 tgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattagg 326  Q
    ||||||||||| || ||||| || | ||| |||  |||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||||  |||| ||||| |||||||  ||||    
T  47411870 tgtatgtttattattgactactagcactaacttcttgaatatgaaaattgatcttagaacttgaatgatcactagtcctgccttttgactctgatctagg 47411969  T
Q  327 taataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattca 426  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||  |||||||| || |||   || |||||||   |  |||| | ||| ||| ||  ||||||||    
T  47411970 taataggtttaacctaagtaattaagttagagatagaaaattattagattgtgactcagagattaacagactgttaaaatctctaatagtcccgaattca 47412069  T
Q  427 cttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaatta 490  Q
    ||||| |||        ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  47412070 cttaagaga--------ttgtcacttgcggagagaattctaggtcaagagattgagtagaatta 47412125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 31878461 - 31878278
Alignment:
Q  1 atctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaacta 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||   |||||||||||||||| || ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  31878461 atctggtgggcaaccatcaaaactcatagtcaatcatccaatacatgtatgaatccttgtttttatgttagttattttgtactttagctatgagtaacta 31878362  T
Q  101 attcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcc--taatttgttgaactcctttgaacatcaatg 183  Q
    ||   ||| ||||| |  ||| ||||||||||||| ||||| |||| ||| ||  ||||||||  ||||||||| || |||||||    
T  31878361 atctctttatggttgagactt-agatgaatctgatataatcttatgagaaccctgtaatttgtcaaactcctttaaatatcaatg 31878278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 439 - 598
Target Start/End: Original strand, 46731386 - 46731555
Alignment:
Q  439 aggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatccgta----------ataatcattgattgtatttagga 528  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||  ||||||  ||           |||||||||||||| ||| ||||    
T  46731386 aggggttgttacttgcggggagaactccaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatatgtcgttgaactagataatcattgattgaatt-agga 46731484  T
Q  529 gtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaa 598  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  46731485 gtgcaaattaccatatgagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccttacatctctctaattttctaaaa 46731555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 20536479 - 20536401
Alignment:
Q  639 tcaactcaactgcctagggcaccaatataaattta-tacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaataca 718  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |   |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20536479 tcaacccaactgcctagggcacccttg--aatttactacatcctttttaataatgaaatttctaagtagaagttaaataca 20536401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 622 - 713
Target Start/End: Original strand, 35366459 - 35366549
Alignment:
Q  622 cagtttatgttactaa-atcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaa 713  Q
    ||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||| |  || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35366459 cagtttatgttacaaataccaactcgactgcctagggcaacc-taaaatttaatacatccttttta-taatgaaattgctaagtagaagttaa 35366549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 587 - 660
Target Start/End: Original strand, 50096830 - 50096903
Alignment:
Q  587 aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaa-tcaactcaactgcctagggcac 660  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  50096830 aattttctaaaaaccaact-tttactgtttttattacgtttatgttacaaaaatcaactcaactgcttagggcac 50096903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 610; Significance: 0; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 610; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 13017981 - 13017203
Alignment:
Q  1 atctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaacta 100  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13017981 atctggttggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttgtgttagttagcttatacgttagctatgagtaacta 13017882  T
Q  101 attcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttatt 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13017881 attcttttgtggttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacataaatgaaagtttagtttttatt 13017782  T
Q  201 catactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccacta 300  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13017781 catattactttgtgcttaatgccttatgtacgtttatgatagactattaaccctagcgttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccacta 13017682  T
Q  301 accctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtt 400  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13017681 accctggctcttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagttagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcg-t 13017583  T
Q  401 taatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaat 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13017582 taatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaat 13017483  T
Q  501 ccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaatt 590  Q
    ||||          |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13017482 ccgtcgtgaaactaaataatcattgatcatatttaggagtgcaaattaccataggagagctttggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaatt 13017383  T
Q  591 ttct-aaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttttaata 689  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13017382 ttctgaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttttaata 13017283  T
Q  690 atgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggttcacttg 770  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||  | ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13017282 atgaaattgctaagtagaagttaaatatagtcctcgtggaaacgaact-ttttattacttcgatcgaatttggttcacttg 13017203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 561; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 737
Target Start/End: Original strand, 22221182 - 22221921
Alignment:
Q  5 ggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaattc 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22221182 ggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcattcttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttcgctatgagtaactaattc 22221281  T
Q  105 ttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcata 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22221282 ttttgtggttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgg-aaccctaatttgttgaactcttttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcata 22221380  T
Q  205 ctaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccc 304  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22221381 ttaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccc 22221480  T
Q  305 tggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaat 404  Q
    |||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22221481 tggcttttaaatctaaaaaaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatatggattaacgtttgtttaat 22221580  T
Q  405 acctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatccgt 504  Q
     |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22221581 tcctctaatggtttcgaattcacttgagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgt 22221680  T
Q  505 ----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaattttct 594  Q
              ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22221681 cgtgatactaaataatcattgattgtatttaagagtgcaaattaccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatgcttctctcaattttct 22221780  T
Q  595 aaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttttaataatgaa 694  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22221781 aaaaaccaattctttattgtttttaattagttta--ttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaataataatttatacatcctttttaataatgaa 22221878  T
Q  695 attgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaatt 737  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||  | |||||||||||    
T  22221879 attgcttagtagaagctaaatatagtcctcgtggaaacgaatt 22221921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 561; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 737
Target Start/End: Original strand, 22247017 - 22247756
Alignment:
Q  5 ggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaattc 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22247017 ggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcattcttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttcgctatgagtaactaattc 22247116  T
Q  105 ttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcata 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22247117 ttttgtggttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgg-aaccctaatttgttgaactcttttgaacatcaatgaaagtttggtttttattcata 22247215  T
Q  205 ctaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccc 304  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22247216 ttaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccatagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccc 22247315  T
Q  305 tggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaat 404  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22247316 tggcttttaactctgaaccaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatatggattaacgtttgtttaat 22247415  T
Q  405 acctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatccgt 504  Q
     |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22247416 tcctctaatggtttcgaattcacttgagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgt 22247515  T
Q  505 ----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaattttct 594  Q
              ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22247516 cgtgatactaaataatcattgattgtatttaagagtgcaaattaccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatgcttctctcaattttct 22247615  T
Q  595 aaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttttaataatgaa 694  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22247616 aaaaaccaattctttattgtttttaattagttta--ttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaataataatttatacatcctttttaataatgaa 22247713  T
Q  695 attgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaatt 737  Q
    |||||| |||||||| |||||| | |||  | |||||||||||    
T  22247714 attgcttagtagaagctaaatatagtcctcgtggaaacgaatt 22247756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 713
Target Start/End: Original strand, 14790076 - 14790793
Alignment:
Q  4 tggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaatt 103  Q
    |||||| | ||||||| |||| | ||||||| ||||   ||||||||||||||||  | |||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||     
T  14790076 tggtgggagaccatcacaactcatagtcaattatccaatacatgtatgaatccttgattttatgtgagttatcttgtactgtagttatgagtaactaatc 14790175  T
Q  104 cttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcat 203  Q
      ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  14790176 tctttatggttaag-cttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcattgaaagtctagttttaattcat 14790274  T
Q  204 actaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaacc 303  Q
    | ||| || ||||| |||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  14790275 attactttatgttttatgctttttgtatgtttatcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatgaccactaacc 14790374  T
Q  304 ctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaa 403  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  14790375 ctggcttttgactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaa 14790474  T
Q  404 tacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatccg 503  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  14790475 aacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctg 14790574  T
Q  504 t----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aatttt 592  Q
    |           |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||    
T  14790575 tcgttaaactagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattcgaaggtcttaaccatacttctctctaatatt 14790673  T
Q  593 ctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggc-accaatataaatttatacatcctttttaataat 691  Q
    || |||||||| | |||||||||||   |  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  14790674 ctgaaaaccaact-tttattgttttatttacgtttatgttac-aaaacaactcaactgcctagggcaatcaatataaatttatacatcctttttgataaa 14790771  T
Q  692 gaaattgctaagtagaagttaa 713  Q
    ||||||||  ||||||| ||||    
T  14790772 gaaattgccgagtagaaattaa 14790793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 713
Target Start/End: Original strand, 14795113 - 14795821
Alignment:
Q  13 accatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaattcttttgtgg 112  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||   ||||||||||||||||  | |||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||   ||  |||    
T  14795113 accatcacaactcatagtcaattatccaatacatgtatgaatccttgattttatgtgagttatcttgtactgtagttatgagtaactaatctcttcatgg 14795212  T
Q  113 ttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttg 212  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||     
T  14795213 ttaag-cttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcattgaaagtctagttttaattcatattacttta 14795311  T
Q  213 tgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggctttt 312  Q
    ||||| |||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14795312 tgttttatgctttttgtatgtttatcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatgaccactaaccctggctttt 14795411  T
Q  313 aactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaa 412  Q
     |||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14795412 gactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaaaacctccaa 14795511  T
Q  413 tggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatccgt-------- 504  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||            
T  14795512 cggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaac 14795611  T
Q  505 --aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaacc 601  Q
       |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  14795612 tagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattcgaaggtcttaaccatacttctctctaatattctgaaaacc 14795710  T
Q  602 aattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggc-accaatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgct 700  Q
    || | |||||||||||   |  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||     
T  14795711 aact-tttattgttttatttacgtttatgttac-aaaacaactcaactgcctagggcaatcaatataaatttatacatcctttttgataaagaaattgcc 14795808  T
Q  701 aagtagaagttaa 713  Q
     ||||||| ||||    
T  14795809 gagtagaaattaa 14795821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 4 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 19665452 - 19664741
Alignment:
Q  4 tggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaatt 103  Q
    |||||| | ||||||| |||| | ||||||||||||   |||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| |||||||  ||||||||||||||     
T  19665452 tggtgggagaccatcacaactcatagtcaatcatccaatacatgtatgaatccttgtttttatgtgagttatcttgtactttatatatgagtaactaatc 19665353  T
Q  104 cttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcat 203  Q
      ||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19665352 tctttgtggttgagact-gagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcatttgaatgtcaatgaaagtctagtttttattcat 19665254  T
Q  204 actaccttgtgtttaatgccttatgtat-gtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaac 302  Q
    | ||| ||||||| ||||| || ||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||    
T  19665253 attactttgtgttaaatgctttttgtattgtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgatcactaac 19665154  T
Q  303 cctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgttta 402  Q
    |||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  19665153 cctgacttttaattctgatctaggtaataggtttaacctaagtaatcaagatagagatagatca-tattaggttatgacatagggattaacgttctatta 19665055  T
Q  403 atacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatcc 502  Q
    | | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||  |||||||     
T  19665054 aaatctccaatgatttcgaattcacttaagagattaaggggatgttacttgcggggagaactctaggtcaagatattgggtagagttactttgttaatct 19664955  T
Q  503 gt---------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aatttt 592  Q
    ||          |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  19664954 gtcgtgaactagataatcattgattg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccatacatctctctaatttt 19664856  T
Q  593 ctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaa-atcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttttaataat 691  Q
    ||  |||||||   |||||||||||||||| |||||| |||| || | |||  ||||||||||||||| |  |  || || ||||||||||||| ||||     
T  19664855 ct-taaaccaaacttttattgtttttaatccgtttattttacaaataccaatccaactgcctagggcaac-cttgaatttaatacatcctttttgataaa 19664758  T
Q  692 gaaattgctaagtagaa 708  Q
    ||||||| | |||||||    
T  19664757 gaaattgttgagtagaa 19664741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 4 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 32705041 - 32704421
Alignment:
Q  4 tggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaatt 103  Q
    |||||| | ||||||| |||| | ||||||| ||||   ||||||||||||||||  | |||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||     
T  32705041 tggtgggagaccatcacaactcatagtcaattatccaatacatgtatgaatccttgattttatgtgagttatcttgtactgtagttatgagtaactaatc 32704942  T
Q  104 cttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcat 203  Q
      ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||     
T  32704941 tctttatggttaag-cttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtctagttttaagtca- 32704844  T
Q  204 actaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaacc 303  Q
    | ||| || |||||||||  || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  32704843 attactttatgtttaatgttttttgtatgtttatcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatgaccactaacc 32704744  T
Q  304 ctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaa 403  Q
    ||||||||| |||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  32704743 ctggcttttgactctgatctaagtaataagtttaacctaagtaatcaagatagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaa 32704644  T
Q  404 tacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatccg 503  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  32704643 aacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctatttcaagagattgggtagaattactctgttaatctg 32704544  T
Q  504 t----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aatttt 592  Q
    |           |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||    
T  32704543 tcgttaaactagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattcgaaggtcttaaccatacttctctctaatatt 32704445  T
Q  593 ctaaaaaccaattctttattgtttt 617  Q
    || |||||||| | |||||||||||    
T  32704444 ctgaaaaccaact-tttattgtttt 32704421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 4 - 603
Target Start/End: Original strand, 1837931 - 1838539
Alignment:
Q  4 tggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaatt 103  Q
    |||||| | ||||||| |||| | ||||||||||||   ||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||     
T  1837931 tggtgggagaccatcacaactcatagtcaatcatccaatacatgtatgaaaccttatttttatgtgagttatcttgtactttagatatgagtaactaatc 1838030  T
Q  104 cttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcat 203  Q
      ||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1838031 tctttgtggttgagact-gagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctagtttttattcat 1838129  T
Q  204 actaccttgtgtttaatgccttatgtat-gtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaac 302  Q
    | ||| ||||||| ||||| || ||||| |||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  1838130 attactttgtgttaaatgctttttgtattgtttatcatcgactactaaccctaactttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaac 1838229  T
Q  303 cctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgttta 402  Q
    |||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||    
T  1838230 cctgacttttgactctgatctaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttatgtta 1838329  T
Q  403 atacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatcc 502  Q
    | | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||     
T  1838330 aaatctccaatggtttcaaattcacttaagagattaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatct 1838429  T
Q  503 gt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattt 591  Q
    ||          ||||||| ||||||| |  ||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  1838430 gtcgttgaactaaataatcgttgattg-aactaggagtgcgaatt-acataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccatacttctctctaatat 1838527  T
Q  592 tctaaaaaccaa 603  Q
    ||| ||||||||    
T  1838528 tcttaaaaccaa 1838539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 123 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 20527832 - 20527286
Alignment:
Q  123 agatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgc 222  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||| ||| || | ||||||||    
T  20527832 agatgaatctgatgtaattttatgggaaccttaatgtgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtctaatctttattcatattactttatatttaatgc 20527733  T
Q  223 cttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaat 322  Q
     || ||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  20527732 tttttgtatgtttatcatcgactcctaaccctagctttatgaatatgcaaattgattttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgaac 20527633  T
Q  323 taggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaa 422  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||| ||    
T  20527632 taggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattagattatgacatagggattaacgttctgttaaaacctccaacggtttcaaa 20527533  T
Q  423 ttcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatca 512  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |  ||||||| ||           |||||||    
T  20527532 ttcacttaagagattaa-gggttgttacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtaaagttaatttgttaatctgtcgtgaagttagataatca 20527434  T
Q  513 ttgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttat 611  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | |||||    
T  20527433 ttgattg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccatacttctctctaatattcttaaaaccaact-tttat 20527336  T
Q  612 tgtttttaatca-gtttatgttac-taaatcaactcaactgcctagggca 659  Q
    |||||||| | | ||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  20527335 tgtttttatttatgtttacgttacaaaaatcaattcaactgcctagggca 20527286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 125 - 657
Target Start/End: Original strand, 16883254 - 16883795
Alignment:
Q  125 atgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgcct 224  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||| || | |||||||| |    
T  16883254 atgaatctgatgtaattttatgagaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtctagtctttattcatgttactttatctttaatgctt 16883353  T
Q  225 tatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaatta 324  Q
    | ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||    
T  16883354 tttgtatgtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccctcacttttgactctgaacta 16883453  T
Q  325 ggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaatt 424  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||  |||| |||||||| ||||| |||||    
T  16883454 ggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggtgatg-catagggattaatgttctgttaaaacctccaacggttttgaatt 16883552  T
Q  425 cacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatc---cgt-------aataatcatt 514  Q
    ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |  |||||||   |||        |||||||||    
T  16883553 cacataagagattaaggggttgccacttgtggggagaattctaggtcaagagattgggtagggttattgtgttaatctttcgtgaacatagataatcatt 16883652  T
Q  515 gattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattg 613  Q
    | ||| | |||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||    
T  16883653 gtttg-aattagtagtgcaaattaccataggagaacttcgaaggattcgaatgtcttaaccatacttctctctaattttct-aaaaccaatcttttattg 16883750  T
Q  614 tttttaatcagtttatgttac-taaatcaactcaactgcctaggg 657  Q
    ||||||||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  16883751 tttttaattcgtttatgttacaaaaatcaattcaactgcctaggg 16883795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 452
Target Start/End: Original strand, 32426823 - 32427271
Alignment:
Q  1 atctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaacta 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||   |||||||||||||||| || ||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  32426823 atctggtgggcaaccatcaaaactcatagtcaatcatccaatacatgtatgaatccttgtttttacgttagttatcttgtactttagctaggagtaacta 32426922  T
Q  101 attcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttatt 200  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  32426923 attcttttgtggttaag-cttgagatgaatatgatataatcctatgagaaccctagtttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtctagttttaatt 32427021  T
Q  201 catactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccacta 300  Q
     ||| ||| || |||||||||| || ||||||||||| || ||| | ||||||| |||||| || |||||| || |||| |||| |||||||||||||||    
T  32427022 tatattactttatgtttaatgctttttgtatgtttatcatcgaccactaaccctggctttaggagtatgcaaatcgatcttagagattgaatgaccacta 32427121  T
Q  301 accctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtt 400  Q
    || |||| |||| |  ||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||  |    
T  32427122 actctggattttga--ctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaatctagagatagatcattattatgttatgacatagggattaacattctgt 32427219  T
Q  401 taatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcactt 452  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32427220 taatacctccaacggttttgaattcacttaagagattaaggggttgtcactt 32427271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 448 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 30978557 - 30978321
Alignment:
Q  448 cacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaatt 537  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30978557 cacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgatcgtatttaggagtgcaaatt 30978458  T
Q  538 gccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaattttct-aaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttacta 636  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30978457 accataggagagctttggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaattttcttaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttacta 30978358  T
Q  637 aatcaactcaactgcctagggcaccaatataaattta 673  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30978357 aatcaactcaactgcctagggcaccaatataaattta 30978321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 370
Target Start/End: Original strand, 15534546 - 15534912
Alignment:
Q  4 tggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaatt 103  Q
    |||||| | ||||||| |||| | ||||||||||||   |||| ||||||||||| || |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||     
T  15534546 tggtgggagaccatcacaactcatagtcaatcatccaatacatatatgaatccttgtttttatgtgagttatcttgtactttagatatgagtaactaatc 15534645  T
Q  104 cttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcat 203  Q
      ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15534646 tctttgtggttgaga-ttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctagtttttattcat 15534744  T
Q  204 actaccttgtgtttaatgccttatgta-tgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaac 302  Q
    | ||| ||||||| ||||| || |||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||  |||| ||||| ||||||||||     
T  15534745 attactttgtgttaaatgctttttgtattgtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgaaaattgatgttagagattgagtgaccactaaa 15534844  T
Q  303 cctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattat 370  Q
    | || |||||||||||||  | ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  15534845 cttgacttttaactctgatcttggtaataggtttaacataagtaatcaagctagtgatagatcattat 15534912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 180 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 12983994 - 12983670
Alignment:
Q  180 aatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgata--gactattaaccctagc-tttatgaatatgcatattg 276  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| |||  || || || | ||||| ||| |||||||||| | ||    
T  12983994 aatggaagtctagttttaattcatattaccttgtgtttaatgctgtctgtatgtttattatattgagtactagcactagcgtttttgaatatgcaaactg 12983895  T
Q  277 atcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggtt 376  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  12983894 atcttagaacttgaatgaccactagccctgacttttgactctgatctaggtaatatgtttaacctaagtaattaagctagagatagaaaattattaggtt 12983795  T
Q  377 atgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagag 476  Q
    |||| | | |||||||||  |  |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  12983794 atgacacatggattaacggactgttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggagagaattcaaggtcaagag 12983695  T
Q  477 attgggtagaattactaagttaatc 501  Q
    ||||||||||||||||  |||||||    
T  12983694 attgggtagaattactttgttaatc 12983670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 198 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 12981089 - 12980783
Alignment:
Q  198 attcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgata--gactattaaccctagc-tttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatga 294  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   | ||||||||||| |||  ||||| || | ||||| ||| |||||||||| | ||||| ||||| ||||||||    
T  12981089 attcatattaccttgtgtttaatgttgtctgtatgtttattatattgactactagcactagcgtttttgaatatgcaaactgatcttagaacttgaatga 12980990  T
Q  295 ccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacg 394  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||   | |||||||||    
T  12980989 ccactagccctgacttttgactctgatctaggtaatatgtttaacctaagtaattaagctagagatagaaaagtattaggttatgactcatggattaacg 12980890  T
Q  395 ttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaa 494  Q
      |  |||| ||||||||   |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  12980889 gactgttaaaacctccaacaatttcgaattcacttaagagattaagcggttgtcacttgcggagagaattctaggtcaagagattgggtagaattacttt 12980790  T
Q  495 gttaatc 501  Q
    |||||||    
T  12980789 gttaatc 12980783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 80 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 7770112 - 7769588
Alignment:
Q  80 tactttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaat-cctaatttgt-tgaactcctttgaaca 177  Q
    ||||||| |||||||||||||||    |||||||| |  ||| |||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  7770112 tactttatctatgagtaactaatctccttgtggttgagactt-agatgaatctgatgtaattccatg--aatacctaatttgtatgaactcccttgaata 7770016  T
Q  178 tcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattga 277  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||| || | ||||| |  ||||| || | ||| |    
T  7770015 tcaatgaaagtctagttta-attcatatttccttgtgtttaatgacatatgtatgtttatgattaactactagcactagcatcttgaatgtgtaaattta 7769917  T
Q  278 tc--atagaaattgaatgaccactaac----cctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattatt 371  Q
    ||  |||||| |||||||||||||| |    | |||||||| | |||||  |||| |||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||  ||||||    
T  7769916 tcttatagaacttgaatgaccactagccatgcatggcttttgaatctgatctaggaaatatgtttaacctaagtaattaagttagagatagacaattatt 7769817  T
Q  372 aggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaat---tcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaatt---- 464  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |  |||| |||||||| | ||||||||   ||||| || |||||||||||||  ||||||| | |||||||        
T  7769816 aggttatgatttagggattaacggactgttaaaacctccaaagatttcgaattcatcactgaagagattaaggggttagcacttgcagagagaattatag 7769717  T
Q  465 ctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcg 554  Q
    |||||| || |||||| |||||||||||  ||||||  ||          ||| | ||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||  ||||| |||    
T  7769716 ctaggtcaaaagattgagtagaattactttgttaatatgtcgttaaactaaatgaacattgattgaattgagg-gtgcaaattaccatataagagcatcg 7769618  T
Q  555 gaggattcgaaggacttaaccatacttctc 584  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  7769617 gaggattcgaaggtcttaaccatatttctc 7769588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 414 - 713
Target Start/End: Original strand, 15534923 - 15535230
Alignment:
Q  414 ggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatccgt--------- 504  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||  ||||||| ||             
T  15534923 ggtttcgaattcacttaagagattaagaggttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattggttagagttactttgttaatctgtcgttgaact 15535022  T
Q  505 -aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctc-tcaattttctaaaaacca 602  Q
      |||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||| || | | |||||| | |||||||    
T  15535023 agataatcattgattg-aattaggaatgcaaattaccataggaaaacttcggaggatttgaaggtcttaaccatacatcactttaattttgt-aaaacca 15535120  T
Q  603 attctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaa 702  Q
    |   ||||||||||||||||  ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |  |  || || ||||||||||||| |||| ||||| ||| |    
T  15535121 aacttttattgtttttaatctatttgttttacaaaatcaactcaactgcctagggcaac-cttgaatttaatacatccttttttataaagaaatggctga 15535219  T
Q  703 gtagaagttaa 713  Q
    |||||||||||    
T  15535220 gtagaagttaa 15535230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 362 - 484
Target Start/End: Original strand, 15538036 - 15538158
Alignment:
Q  362 gatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggaga 461  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15538036 gatcattattaagttatgacatagggattaacgttctgttaaaacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggtgttgttacttgcggggaga 15538135  T
Q  462 attctaggttaagagattgggta 484  Q
    | ||||||| |||||||||||||    
T  15538136 actctaggtcaagagattgggta 15538158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 204
Target Start/End: Original strand, 15537741 - 15537940
Alignment:
Q  4 tggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaatt 103  Q
    |||||| | ||||||| |||| | |||||||||||    |||||||||| ||||| || |||||| ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||     
T  15537741 tggtgggagaccatcacaactcatagtcaatcatctaatacatgtatgactccttgtttttatgtgagttatcttgtacattagatatgagtaactaatc 15537840  T
Q  104 cttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcat 203  Q
      ||||||||| |  || ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||    
T  15537841 tctttgtggttgagact-gagatgaatttgatgtaatcatatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaatttttattcat 15537939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 523 - 616
Target Start/End: Original strand, 27649087 - 27649180
Alignment:
Q  523 ttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgttt 616  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  27649087 ttagaagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccatacttcgctctaattttcttaaaaccaact-tttattgttt 27649180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 109
Target Start/End: Original strand, 32426651 - 32426748
Alignment:
Q  12 aaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaattcttttg 109  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||   ||| |||||||||||| || ||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32426651 aaccatcaaaactcatagtcaatcatccaatacacgtatgaatccttgtttttacgttagttatcttgtactttagctaggagtaactaattcttttg 32426748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 542 - 713
Target Start/End: Original strand, 15540574 - 15540744
Alignment:
Q  542 taggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatc 640  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||   || | ||||||||||||||||  ||||| |||  |||||    
T  15540574 taggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccataaatctctttaattttctaaaactaaact-tttattgtttttaatccctttattttagaaaatc 15540672  T
Q  641 aactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaa 713  Q
    ||||||||||||||||| | |  |  || || ||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||    
T  15540673 aactcaactgcctagggaaac-cttgaatttaatacatcctttttgatatagaaattgctgagtagaagttaa 15540744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 320
Target Start/End: Original strand, 15537971 - 15538037
Alignment:
Q  254 tagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctga 320  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  15537971 tagttttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgatcactaacccttgcttttaactctga 15538037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 523 - 598
Target Start/End: Original strand, 32427286 - 32427362
Alignment:
Q  523 ttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaa 598  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||| ||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  32427286 ttaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattcaaaggtcttaatcaaacatctctctaattttctaaaa 32427362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 587 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 11184032 - 11183962
Alignment:
Q  587 aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaa-tcaactcaactgcctaggg 657  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  11184032 aattttctaaaaaccaact-tttattgtttttattacgtttatgttacaaaaatcaactcaactgcctaggg 11183962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 661 - 750
Target Start/End: Original strand, 1838598 - 1838687
Alignment:
Q  661 caatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttc 750  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||||  ||  ||| || ||| |||||||  |||||||||||    
T  1838598 caatataaatttatacatcctttttgataaagaaattgccgagtagaaattaacaacggtccttgtggatacgaatttatttattacttc 1838687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 314
Target Start/End: Original strand, 2330478 - 2330519
Alignment:
Q  273 attgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaa 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  2330478 attgatcttagaaattgaatgactactaaccctagcttttaa 2330519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 610; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 610; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 770
Target Start/End: Original strand, 31527843 - 31528621
Alignment:
Q  1 atctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaacta 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31527843 atctggtggggaaccatcaaaactaagagtcaatcttccttcacatgtatgaatccgttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaacta 31527942  T
Q  101 attcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttatt 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31527943 attcttttgtggttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttatt 31528042  T
Q  201 catactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccacta 300  Q
    | || ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31528043 cttattactttgtgcttaatgccttatgtacgtttatgatagactattaaccctagcgttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccacta 31528142  T
Q  301 accctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31528143 accctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcg-t 31528241  T
Q  401 taatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaat 500  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31528242 taatacctccattggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaat 31528341  T
Q  501 ccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaatt 590  Q
    | ||          ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31528342 ctgtcgtgaaactaaataatcattgatcgtatttaggagtgcaaattaccacaggagagctttagaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaatt 31528441  T
Q  591 ttc-taaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttttaata 689  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31528442 ttcttaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttttaata 31528541  T
Q  690 atgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggttcacttg 770  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31528542 atgaaattgctaagtagaagttaaatacagtcctcgtggaaacaaatt-ttttattacttcgatcgaatttggttcacttg 31528621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 769
Target Start/End: Original strand, 31626001 - 31626779
Alignment:
Q  1 atctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaacta 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31626001 atctggtgggcaaccatcaaaactatgagtcaatcatcctttacatgtacgaatcatttttcttatgtgagttagcttatactttagctatgagtaacta 31626100  T
Q  101 attcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttt--ta 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||     | || |  |  ||    
T  31626101 attcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctacgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatacatattgatgtaatcctacta 31626200  T
Q  199 ttcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccac 298  Q
    |||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31626201 ttcatattaccctgtgtttaatgttttatgtatgtttatcatcgactattaaccctagctttatgaatatacatattgattatagaaattgaatgaccac 31626300  T
Q  299 taaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcg 398  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||     
T  31626301 taaccctggcttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttataacataaggattaacgttct 31626400  T
Q  399 tttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagtta 498  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31626401 tttaatacctccaacgatttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcagggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagtta 31626500  T
Q  499 atccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctca- 587  Q
    ||| ||          |||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  31626501 atctgtcgtgaaactaaataataattgattg-aattaggagtgcaaattaccataggagagcttcggaggattcgaatgacttaaccattcttctctcag 31626599  T
Q  588 attttctaaaaaccaattctttattgtttttaa-tcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaa-tttatacatccttttt 685  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  31626600 attttct-aaaaccaatcctttattatttttaattccttttatgttacaaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaattttacacatccttttt 31626698  T
Q  686 aataatgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggttcactt 769  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||     |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  31626699 aataatgaaattgctaagtagaagtt-aatacagtcctcattgaaacgaat--ttttattacttcgattgaatttggttcactt 31626779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 770
Target Start/End: Original strand, 40017432 - 40018210
Alignment:
Q  1 atctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaacta 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40017432 atctggtggacaaccatcaaaactcatagtcagtcatccattacatgtatgaatccttcttcctatgttagttagcttatactttaactatgagtaacta 40017531  T
Q  101 attcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttatt 200  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  40017532 attcttttgtggttaag-cttgagatgaatatgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatttcaatgaaagtttagtctttatt 40017630  T
Q  201 catactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccacta 300  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||     
T  40017631 catattaccttgtgtttaatgctttttgtatgtttatcatcgactactgaccctatctttatgaatatgcaaattgatcgtagagattgaatgaccactg 40017730  T
Q  301 accctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtt 400  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||| ||    
T  40017731 accctggcttttgactttgaactaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggtcatgacatatgaattaacgttcttt 40017830  T
Q  401 taatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaat 500  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||| |||| |||||||    
T  40017831 taatacctccaacagtttcgaattcacttaagagaataa-gggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaaaggattggggagaagtactgagttaat 40017929  T
Q  501 ccgt-------------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctca 587  Q
    | ||             ||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40017930 ctgtcgtaaaacttataaataatcattggttg-aattaggagtgcaaattaccataggagagtttcggaggattcgaaggtcttaaccatacttctctca 40018028  T
Q  588 attttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaa-tttatacatccttttta 686  Q
    |||||    |||||| |   ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  40018029 atttttcttaaaccagtctcttattgtttttaatccgtttatgttac-aaatcaactcaactgcctagggcatcaatataaattttatacatccttttta 40018127  T
Q  687 ataatgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggttcacttg 770  Q
    ||||  ||||||| |||| |||||||||| || ||| || | |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  40018128 ataaaaaaattgccaagtcgaagttaaatgcactccttgtgaaaacaaatt-ttttattacttcgattgaatttggttcacttg 40018210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 770
Target Start/End: Original strand, 13709526 - 13710301
Alignment:
Q  1 atctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaacta 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13709526 atctggtgggcaaccatcaaaactaatagtcaatcatccattacatgtatgaatccttattcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaacta 13709625  T
Q  101 attcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttatt 200  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |   ||| |||||||||||| || |||| |||    
T  13709626 attctcttgtggttaattct-gagatgaatctgatgtaatcctatgtgaaccctaatttgttgaacttcaa-gaatatcaatgaaagtctaattttaatt 13709723  T
Q  201 catactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccacta 300  Q
    |||| ||| || |||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  13709724 catattactttatgtttaatgctttttgtatgtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgtaaattgatcttagagattgaatgaccacta 13709823  T
Q  301 accctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtt 400  Q
    ||||||| |||| |||||||  ||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |    
T  13709824 accctggattttgactctgacctaggtgataagtttaacccaagtaatcaagctagatatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttttgt 13709923  T
Q  401 taatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaat 500  Q
    ||| |||||||| | ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  13709924 taaaacctccaacgatttcgaattcactaaagagattatggggttgtcacttgaggggagaattatgggtcaagagatcgggtagaattactttgttaat 13710023  T
Q  501 ccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagc-ttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aa 588  Q
    | ||           ||||||||||  |  | |||||||||||||||  ||||||||||| ||| || |||| ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  13710024 ctgttgttgaactagataatcattgcct-aaattaggagtgcaaattatcataggagagctttcagatgatttgaaggtcttaaccatacttctctcaaa 13710122  T
Q  589 ttttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaa-tttatacatcctttttaa 687  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13710123 ttttct-aaaaccaatcttttattgtttttaatccgtttatgttac-aactcaactcaacttcctcaggcatcaatataaattttatacatcctttttaa 13710220  T
Q  688 taatgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggttcacttg 770  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |   ||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  13710221 taatgaaattgctaagtagaagttaaatacagttctcgtaaaaacgaat--ttttattacttcgattgaatttggttcacttg 13710301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 198 - 713
Target Start/End: Original strand, 16294550 - 16295073
Alignment:
Q  198 attcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgacca 297  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16294550 attcatattaccttgtgtttaatgctttgtgtatgtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgacca 16294649  T
Q  298 ctaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttc 397  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16294650 ctaactctggcttttaactctgaactatgtaataggtttaacctaagtaatcaagttagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttc 16294749  T
Q  398 gtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagtt 497  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16294750 -tttaatacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagtt 16294848  T
Q  498 aatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctca 587  Q
    |||| ||          ||||||||||||||  |  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16294849 aatctgtcgtgaaactaaataatcattgatt-aaactaggagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctca 16294947  T
Q  588 attttctaaaaaccaattcttta-ttgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaa-tttatacatccttttt 685  Q
    ||||||| ||||| || |||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||     
T  16294948 attttctgaaaactaa-tctttatttgtttttaatcggtttatgatacaaaatcaactcaactgcctagggcatcaatataaattttatacatcc-tttc 16295045  T
Q  686 aataatgaaattgctaagtagaagttaa 713  Q
     |||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  16295046 gataacgaaattgctgagtagaaattaa 16295073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 12 - 634
Target Start/End: Original strand, 36326386 - 36327022
Alignment:
Q  12 aaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatg----aatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaattcttt 107  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||   ||| |||||    ||||||| || ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36326386 aaccatcaaaactcatagtcaatcatccaatacacgtatgaatcaatccttgtttttacgttagttatcttgtactttatctatgagtaactaattcttt 36326485  T
Q  108 tgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatacta 207  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  36326486 tgtggttaa-gcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctagtttgttgaactcatttgaatatcaatgaaagtctagttttaattcatatta 36326584  T
Q  208 ccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctgg 307  Q
    | || |||||||||| || ||  ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  36326585 ctttatgtttaatgctttttg--tgtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgcaaatcgatcttagagattgaatgaccactaaccctgg 36326682  T
Q  308 cttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacc 407  Q
    ||||| ||| |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  36326683 cttttgactttgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggctatgacacagggattaacgttctgttaatacc 36326782  T
Q  408 tccaatggtttc----gaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatc-- 501  Q
    |||||  |||||     ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||      
T  36326783 tccaacagtttcaaattaattcacttaagagattaaggagttgtcacttgcagggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatcta 36326882  T
Q  502 -cgt-------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aatttt 592  Q
     |||        |||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  36326883 tcgttaaattagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaggattcaaaggtcttaaccatacatctctctaatttt 36326981  T
Q  593 ctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttac 634  Q
    || ||||||||   |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  36326982 ct-aaaaccaaacttttattgtttttaatccgtttattttac 36327022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 142 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 23673995 - 23673415
Alignment:
Q  142 ctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgata 241  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||| || |||||||||| || ||||||||||| ||     
T  23673995 ctatgggaaccttaatttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtctagttttaattcatattactttatgtttaatgctttttgtatgtttatcatc 23673896  T
Q  242 gactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacct 341  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||||| |||||||||    
T  23673895 gactactaaccctaactttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccactatccctgacttttgactctgatctaggtaataagtttaacct 23673796  T
Q  342 tagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaagg 441  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23673795 aagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttctgttaaaacctccaactgtttcgaattcacttaagagattaagg 23673696  T
Q  442 ggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtg 531  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||  ||           |||||||||||||| | |||||||||    
T  23673695 ggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatttgtcgttaaactagataatcattgattg-aattaggagtg 23673597  T
Q  532 caaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatg 630  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||   |||||||||||||||| ||||||     
T  23673596 caaattaccataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccatacatctctctaattttct-aaaaccaaacttttattgtttttaatccgtttatt 23673498  T
Q  631 ttactaaat--caactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaa 713  Q
    |||| ||||  |||  ||||||||||||||| |  |  || || ||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||| ||||    
T  23673497 ttac-aaatgccaatccaactgcctagggcaac-cttgaatttaatacatcctttttgataaagaaattgttgagtagaaattaa 23673415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 32576464 - 32575887
Alignment:
Q  13 accatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaattcttttgtgg 112  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||   || ||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||   |||||||    
T  32576464 accatcaaaactcacagtcagtcatccaatacttgtatgaatccttgtttttatgttagttatcttctactttagctatcaataactaatctctttgtgg 32576365  T
Q  113 ttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttg 212  Q
    || |  ||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||     
T  32576364 ttgagactt-agatgaatatgatgtaatcctataggaaccctaatttgttgaactcctttgaatttcaatgaaagtttagtctttatccatattactttt 32576266  T
Q  213 tgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggctttt 312  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || ||||| | | |||| ||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||| |||| |||||| |||||    
T  32576265 tgtt-aatgctttttgcatgtttatcattgactactgatcctaactttatgaatatgcaaattgatcgtatagattgaatgatcactgaccctgtctttt 32576167  T
Q  313 aactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaa 412  Q
     ||| |||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32576166 gactatgaactaggtaatatgtttaacctaaataatcaagctaaagatagatctttattaggttacgacatagggattaacgttcttttaatacctccaa 32576067  T
Q  413 tggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatccgt-------- 504  Q
       ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||| ||            
T  32576066 caatttcgaattcagtcaagagattaaggggttgtcacttgtggggagaattctaggtcaagggatttggtagagttactaagttaatctgtcgtgaaac 32575967  T
Q  505 --aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttct 583  Q
      ||||||||||  ||| |  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32575966 taaataatcattttttg-aactaggagtgcaaattatcataggagagcttcggaggattcgaaggtcttaaccatacttct 32575887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 394
Target Start/End: Original strand, 8426783 - 8426844
Alignment:
Q  333 gtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacg 394  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8426783 gtttaacctaagtaattaagctagagatagaaaattattaggttatgatttagggattaacg 8426844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 583; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 583; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 770
Target Start/End: Original strand, 12171436 - 12172204
Alignment:
Q  1 atctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaacta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12171436 atctggtgggaaaccatcaaaactaagagtaaatcatccgtcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttctactttagctatgagtaacta 12171535  T
Q  101 attcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttatt 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12171536 attcttttgtggttaatttctgagatgaatctgatgtaaccctattggaacccaaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttatt 12171635  T
Q  201 catactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccacta 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12171636 catattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccacta 12171735  T
Q  301 accctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtt 400  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12171736 accctggcttttaattcttaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtt 12171835  T
Q  401 taatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaat 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12171836 taatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattgtaggtcaagagattgggtagaattactaagttaat 12171935  T
Q  501 ccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaatt 590  Q
    ||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||               
T  12171936 ccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattaccataggcgagcttcggaagattccaaggacttaaccatac----------- 12172024  T
Q  591 ttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttttaataa 690  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12172025 ttctagaaaccaaatctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttttaataa 12172124  T
Q  691 tgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggttcacttg 770  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12172125 tgaaattgctaagtagaagttaaatacagtcctcgtggaaacgatcttttttattacttcgatcgaatttggttcacttg 12172204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 4 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 647991 - 647274
Alignment:
Q  4 tggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaatt 103  Q
    |||||| | ||||||| |||| | ||||||| ||||   |||| |||||||||||  | |||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||     
T  647991 tggtgggagaccatcacaactcatagtcaattatccaatacatatatgaatccttgattttatgtgagttatcttgtactgtagttatgagtaactaatc 647892  T
Q  104 cttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcat 203  Q
      ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  647891 tctttatggttaag-cttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcattgaaagtctagttttaattcat 647793  T
Q  204 actaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaacc 303  Q
    | ||| || ||||| |||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||| |||||||||    
T  647792 attactttatgttttatgctttttgtatgtttatcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatggccactaacc 647693  T
Q  304 ctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaa 403  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  647692 ctggcttttgactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaa 647593  T
Q  404 tacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatccg 503  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  647592 aacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctg 647493  T
Q  504 t----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aatttt 592  Q
    |           |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||    
T  647492 tcgttaaactagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattcgaagatcttaaccatacttctctctaatatt 647394  T
Q  593 ctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggc-accaatataaatttatacatcctttttaataat 691  Q
    || |||||||| | |||||||||||   |  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  647393 ctgaaaaccaact-tttattgttttatttacgtttatgttac-aaaacaactcaaatgcctagggcaatcaatataaatttatacatcctttttgataaa 647296  T
Q  692 gaaattgctaagtagaagttaa 713  Q
    ||||||||  ||||||| ||||    
T  647295 gaaattgccgagtagaaattaa 647274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 4 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 651264 - 650546
Alignment:
Q  4 tggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaatt 103  Q
    |||||| | ||||||| |||| | ||||||| ||||   |||| |||||||||||  | |||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||     
T  651264 tggtgggagaccatcacaactcatagtcaattatcccatacatatatgaatccttgattttatgtgagttatcttgtactgtagttatgagtaactaatc 651165  T
Q  104 cttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcc-taatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattca 202  Q
      ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||    
T  651164 tctttatggttaag-cttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaacccctaatttgttgaactcctttgaatatcattgaaagtctagttttaattca 651066  T
Q  203 tactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaac 302  Q
    || ||| || ||||| |||| || ||||||||||| || |  |  |||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||| ||||||||    
T  651065 tattactttatgttttatgctttttgtatgtttatcattgtttcctaaccctaactttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatggccactaac 650966  T
Q  303 cctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgttta 402  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  650965 cctggcttttgactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttctttta 650866  T
Q  403 atacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatcc 502  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||     
T  650865 aaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatct 650766  T
Q  503 gt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattt 591  Q
    ||           |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  650765 gtcgttaaactagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattcgaaggtcttaaccatacttctctctaatat 650667  T
Q  592 tctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggc-accaatataaatttatacatcctttttaataa 690  Q
    | | |||||||| | |||||||||||   |  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  650666 tatgaaaaccaact-tttattgttttatttacgtttatgttac-aaaacaactcaaatgcctagggcaatcaatataaatttatacatcctttttgatat 650569  T
Q  691 tgaaattgctaagtagaagttaa 713  Q
     ||||||||  ||||||| ||||    
T  650568 agaaattgccgagtagaaattaa 650546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 28 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 26063457 - 26062762
Alignment:
Q  28 agtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatg 127  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |  || ||||||    
T  26063457 agtcaatcatccaatacatgtatgaatccttgtttttatgtgagttatcttgtactttagatatgagtaactaatttctttgtggttgagact-gagatg 26063359  T
Q  128 aatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttat 227  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |    
T  26063358 aatctaatgtaatcatatgggaaccctgatttgttgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctagtttttattcatattactttgtgtttaatgcttttt 26063259  T
Q  228 gtat-gtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattagg 326  Q
    |||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  26063258 gtattgtttatcatcgactaataaccctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctagg 26063159  T
Q  327 taataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattca 426  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  26063158 taataggtt-aacctaagtaatcaagctagagattgatcattattaggttatgacatatggataaacgttctgttaaaacctccaatggtttcgaattca 26063060  T
Q  427 cttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattga 516  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||| ||           |||||||||||    
T  26063059 cttaagagattaaggggttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgtcgttgaactagataatcattga 26062960  T
Q  517 ttgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc---aattttctaaaaaccaattctttattg 613  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||   |||||||| ||||||||   |||||||    
T  26062959 ttg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcaaaggtcttaaccatacatctctctctaattttct-aaaaccaaacttttattg 26062862  T
Q  614 tttttaatcagtttatgttactaa-atcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagtta 712  Q
    ||||||||| |||||| |||| || | |||  ||||| ||||||||| |  |  || || ||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||    
T  26062861 tttttaatccgtttattttacaaataccaatccaactacctagggcaac-cttgaatttaatacatcctttttgataaagaaattgttgagtagaagtta 26062763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 123 - 592
Target Start/End: Original strand, 26060163 - 26060641
Alignment:
Q  123 agatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgc 222  Q
    |||||||| |||| ||||  |||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  26060163 agatgaatatgatataattgtatgagaatcctagtttgttgaactcttttgaatatcaataaaagtctagattttattcatattactttatgtttaatgc 26060262  T
Q  223 cttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaat 322  Q
     || ||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||      
T  26060263 tttttgtatgtttatcatcgactactaaccctagcttcatgaatatacaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccatgacttttgactctgatc 26060362  T
Q  323 taggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaa 422  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||    
T  26060363 taggtaatatgtttaacttaagtaatcaagctagagatagaccattattaggttatgacatagggattaacgttctattaaaacctccaacggtttcgaa 26060462  T
Q  423 ttcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatc---cg------ta-ataatca 512  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||   ||      || |||||||    
T  26060463 ttcacttaagacattaaggggttgttatttgcagggagaattctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctatcgggaagctagataatca 26060562  T
Q  513 ttgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaatttt 592  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  26060563 ttgcttg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccatgcttctctcaatttt 26060641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 123 - 770
Target Start/End: Original strand, 2541461 - 2542114
Alignment:
Q  123 agatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgc 222  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  2541461 agatgaatctaatgtaatcttatgggaactctaatttgttgaattcctttcat-atcaataaaagtctagtttttattcatattatcttgtgtttaatga 2541559  T
Q  223 cttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaat 322  Q
     ||  |||||||||| || |||||  |  |||||||| || | | ||||   ||||| ||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||     
T  2541560 ttttcgtatgtttattattgactacaagtcctagcttgataagtttgcaggctgatcttagaacttgattgaccactaacaccggcttttaactctgaac 2541659  T
Q  323 taggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaa 422  Q
    |||||   | ||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |  |||| |||| ||||||||| |||    
T  2541660 taggtggaatgtttaacctaagtaattaagctagagatagacaattattaggttatgatatagggattaacggactgttaaaaccttcaatggttttgaa 2541759  T
Q  423 ttcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatccgta----------ataatca 512  Q
    |||| |||| ||||||| || |||| | || || | |||||| ||||| |||||||||| || |||||||  ||||||| ||           |||||||    
T  2541760 ttcatttaagagattaatggattgttatttccgagaagaattttaggtcaagagattggataaaattactttgttaatctgtcgtttaactagataatca 2541859  T
Q  513 ttgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaattttctaaaaaccaattctttatt 612  Q
    ||| ||| | | |||||| |||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||| ||||||| ||  ||||||    
T  2541860 ttgcttgaaat-aggagtacaaattaccataagagaacttcagaggattcgaaggtcttaaccatacctcttt-aattttcaaaaaacctatattttatt 2541957  T
Q  613 gtttttaatcagtttatgttacta-aatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagtt 711  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2541958 gtttttaatccgtttatgttacaagaataaactcaactgcctagggcaccattg-aatttaatacatcctttttaataatgaaattgctcagtagaagtt 2542056  T
Q  712 aaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggttcacttg 770  Q
    ||||||| |||  | ||| |||||||  ||||||||||| || || |||||| ||||||    
T  2542057 aaatacagtcctcgtggatacgaatt-atttattacttcgattgactttggtacacttg 2542114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 527 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 11649490 - 11649429
Alignment:
Q  527 gagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaa 588  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  11649490 gagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccatgcttctctcaa 11649429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 16927144 - 16926976
Alignment:
Q  275 tgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattagg 374  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| || ||| |  |||| |||| | ||||||| |||||| ||  |||||||  |  |||||||||    
T  16927144 tgatcttagaacttaaatgaccactagccatggctttgaa-tcttatctaggaaatatggttaacctaagtaattaaattagagatgaacaattattagg 16927046  T
Q  375 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggtt 445  Q
    ||||||| ||| |||||||   |  |||| |||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  16927045 ttatgatctagagattaacaaactattaaaacctccaacggtt-ctaattcacttaagagattaaggggtt 16926976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 314
Target Start/End: Original strand, 13978982 - 13979023
Alignment:
Q  273 attgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaa 314  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13978982 attgatcttaggaattgaatgaccactaaccctagcttttaa 13979023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 56089584 - 56089543
Alignment:
Q  273 attgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaa 314  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  56089584 attgatcttaggaattgaatgaccactaaccctagcttttaa 56089543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 578; Significance: 0; HSPs: 19)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 578; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 23760400 - 23759623
Alignment:
Q  1 atctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaacta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23760400 atctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacttgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaacta 23760301  T
Q  101 attcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttatt 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23760300 attcttttgtggttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacattaatgaaagtttagtttttatt 23760201  T
Q  201 catactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccacta 300  Q
    |||| ||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23760200 catattactttgtgcttagtaccttatgtacgtttatgatagactattaatcctagcgtcgtgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccacta 23760101  T
Q  301 accctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtt 400  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23760100 accctggcttttaactccgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcg-t 23760002  T
Q  401 taatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaat 500  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23760001 taatacctccaatggttttgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctagggcaagagattgggtagaattactaagttaat 23759902  T
Q  501 ccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaatt 590  Q
    ||||          ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23759901 ccgtcgtgaaactaaataatcattgatcgtatttaggagtgcaaattaccataggagagctttggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcgatt 23759802  T
Q  591 ttc-taaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttttaata 689  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23759801 ttcttaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttttaa-a 23759703  T
Q  690 atgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggttcacttg 770  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |  |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  23759702 atgaatttgctaagtagaagttaaatacagtcctcgtagaaacgaact-ttttattacttcgattgaatttggttcacttg 23759623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 504; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 770
Target Start/End: Original strand, 11278946 - 11279722
Alignment:
Q  1 atctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaacta 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11278946 atctggtgggcaaccatcaaaactaagagtcaatcatcctttacatgtatgaatcatttttcttatgttagttagcttatactttacctatgagtaacta 11279045  T
Q  101 attcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttatt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  11279046 attcttttgtggttaattcgtgagatgaatctgatgtaaccctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtttagtctttatt 11279145  T
Q  201 catactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccacta 300  Q
    |||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11279146 catattaccttgtgcttaatgctttttgtatgtttatcatcgactactaaccctagctttatgaacatgcatattgatcatagaaattgaatgaccacta 11279245  T
Q  301 accctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtt 400  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |    
T  11279246 accctggcttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagagattaacgttc-at 11279344  T
Q  401 taatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaat 500  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11279345 taatacctccaacggtttcagattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaatcctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaat 11279444  T
Q  501 ccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaatt 590  Q
    | ||          |||||||||| |||| |  |||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11279445 ctgtcgtgaaactaaataatcatttattg-aactaggagtgcaaattaccagaggagaacttcgaaagattcgaaggacttaaccatacttctctcaatc 11279543  T
Q  591 ttctaaaaaccaattctttatt-gtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaa-tttatacatcctttttaat 688  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11279544 ttctaaaaaccaa-tctttattcgtttttaatcagtttatgttacaaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaattttatacatcctttttaat 11279642  T
Q  689 aatgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggttcacttg 770  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | ||| || |||||| |||  |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11279643 aatgaaattgctaagtagaaattaaatatagtccttgtggaaacaaat--ttttattacttcgattgaatttggttcacttg 11279722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 465; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 769
Target Start/End: Original strand, 33312460 - 33313224
Alignment:
Q  4 tggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaatt 103  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33312460 tggtgggaaaccatcgaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttctta---------gcttatactttagctatgagtaactaatt 33312550  T
Q  104 cttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcat 203  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  33312551 cttttgtggttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctacgggaaccctaatttgttgaactccattgaacattaatgaaaatttagtctttattcat 33312650  T
Q  204 actaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaacc 303  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33312651 attaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatcatcgactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaacc 33312750  T
Q  304 ctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaa 403  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  33312751 ctgacttttaactctgaactaggtaatatgtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgttcttttaa 33312850  T
Q  404 tacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatccg 503  Q
    |||||||   ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33312851 tacctccgccggtttcgaattcatttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaaaagattgggtagaattactaagttaattcg 33312950  T
Q  504 t----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctca-atttt 592  Q
    |          ||||||||||||||| | ||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  33312951 tcgtgaaactaaataatcattgattg-aattaggaaagcaaattaccataggagagcttcagaggattcgaaggacttaaccatttttctctcagatttt 33313049  T
Q  593 ctaaaaaccaattctttattgtttttaa-tcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaa-tttatacatcctttttaataa 690  Q
    || ||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  33313050 ct-aaaaccaatcctttattatttttaattccgtttatgttacaaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaattttacacatcctttttaataa 33313148  T
Q  691 tgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggttcactt 769  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||  |  |||||||||  |||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  33313149 tgaaattgctaagtagaagtt-aatacagtcctcgtagaaacgaat--ttttattacttcgattgaatttgtttcactt 33313224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 770
Target Start/End: Original strand, 294330 - 295092
Alignment:
Q  12 aaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaattcttttgtg 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  294330 aaccatcaaaactaatagtcaatcatccattacatgtatgaatctttcttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaattctcttgtg 294429  T
Q  112 gttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactacctt 211  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||| ||| ||    
T  294430 gttaatcct-gagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctagtttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtataattttaattcatattacttt 294528  T
Q  212 gtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttt 311  Q
     |||||||||| |  ||||||||||| ||  ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  294529 atgtttaatgcttattgtatgtttatcatgaactattaactctagttttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccctggcttt 294628  T
Q  312 taactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctcca 411  Q
    | |||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||| || ||||    
T  294629 tgactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttttgttaaaacatcca 294728  T
Q  412 atggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatccgt------- 504  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||  ||||||| ||           
T  294729 acagtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttatggggagaattctagttcaagagattgggtataattactttgttaatctgtcgttgaa 294828  T
Q  505 ---aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaattttctaaaaacc 601  Q
        |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  294829 ttagataatcattgattgca-ttaggagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcgaaagacttaaccatacttctctcaattttct-aaaacc 294926  T
Q  602 aattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaattta-tacatcctttttaataatgaaattgct 700  Q
    ||| |||  ||| |||||| ||| ||||||||| ||| |||||  ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  294927 aatccttatttgcttttaaccagcttatgttac-aaaacaact--actgcctcgggcatcaatataaatttattacatcctttttaataatgaaattgct 295023  T
Q  701 aagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggttcacttg 770  Q
    |||||||||||||||||| |||  | ||| || |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  295024 aagtagaagttaaatacagtcctcgtggacacaaatt-ttttattacttcgattgaatttggttcacttg 295092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 95 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 46847007 - 46846326
Alignment:
Q  95 taactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtt 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  46847007 taactaattcttttgtggttaattcctgagatgaatctgatgtaaccctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtttagtc 46846908  T
Q  195 tttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatga 294  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46846907 tttattcatattaccttgtgtttaatgctttttgtatgtttatcatcgactattaaccctagctt---gaacatgcatattgatcatggaaattgaatga 46846811  T
Q  295 ccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacg 394  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46846810 tcactaaccctgacttttaactctgaactaagtaataggtttaacctaagtaatcaagttagagatagattattattaggttatgacatagggattaacg 46846711  T
Q  395 ttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaa 494  Q
     || ||||| |||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||     
T  46846710 atcttttaaaacctccaacgttttcgaattcagttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattattag 46846611  T
Q  495 gttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctc 584  Q
    ||||||| ||          ||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46846610 gttaatctgtcgtgaaactaaataatcattgattg-aactaggagtgcaaattaccatagaagaacttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctc 46846512  T
Q  585 tcaattttctaaaaaccaattctttattg-tttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaa-tttatacatcctt 682  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46846511 tcaattttctaaaaaccaatcttttattgttttttagtcagtttataataagaattcaactcaactgcctagggcaccaatataaattttatacatcctt 46846412  T
Q  683 tttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggttcacttg 770  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | ||||||  ||  |||||||||||| || |||| || ||||||||    
T  46846411 tttaataatgaaattgctaagtagaaattaaatacagtcctcgtggaaac--atatttttattacttcgattgaatctgattcacttg 46846326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 106 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 36222993 - 36222327
Alignment:
Q  106 tttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatca------atgaaagtttagttttta- 198  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||      ||||||||||||| ||||     
T  36222993 tttgtggtta-ttcctgaggtgaatctgatgtaa-cctatgggaatcctaatttgttgaactc-tttgaatatcatattcaatgaaagtttagtctttaa 36222897  T
Q  199 ttcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccac 298  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36222896 ttcatattaccttgtgtttaatgctttttgtatgtttatcatcgactactagccctagctttatgaacatgcatattgatcatggaaattgaatgaccac 36222797  T
Q  299 taaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcg 398  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||     
T  36222796 taaccctcgcttttaactctgaactagctaatagatttaacctaagtaatcaagttagagatagatcattattaggttatgacatagagattaacgttc- 36222698  T
Q  399 tttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagtta 498  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  36222697 ttaaatacttccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcact-----ggagaattctaggtcaagagattaggtaaaattactaagtta 36222603  T
Q  499 atccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaa 588  Q
    ||  ||          ||||||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36222602 atttgtagtgaaactaaataatcattgattg-aactaggagtgaaaattaccataggagaacttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaa 36222504  T
Q  589 ttttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaa-tttatacatcctttttaa 687  Q
    | ||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36222503 tcttctaaaaaccaatctttctttgtttttaatcagtttatgttagaaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaattttatacatcctttttaa 36222404  T
Q  688 taatgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggttca 766  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||  | || |||||||  |||||||||||| || ||||||||||||    
T  36222403 taatgaaattgctacgtagaaattaaatacaatcctcgtggtaacgaat--ttttattacttcaattgaatttggttca 36222327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 713
Target Start/End: Original strand, 6966605 - 6967322
Alignment:
Q  4 tggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaatt 103  Q
    |||||| | ||||||| |||| | ||||||| ||||   ||||||||||||||||  | |||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||     
T  6966605 tggtgggagaccatcacaactcatagtcaattatccaatacatgtatgaatccttgattttatgtgagttatcttgtactgtagttatgagtaactaatc 6966704  T
Q  104 cttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcat 203  Q
      ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  6966705 tctttatggttaag-cttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcattgaaagtctagttttaattcat 6966803  T
Q  204 actaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaacc 303  Q
    | ||| || ||||| |||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  6966804 attactttatgttttatgctttttgtatgtttatcattgactactaaccctagctttatgaatattcaaactgatcttagagattaaatgaccactaacc 6966903  T
Q  304 ctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaa 403  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  6966904 ctggcttttgactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaa 6967003  T
Q  404 tacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatc-- 501  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||      
T  6967004 aacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactttgttaatcta 6967103  T
Q  502 -cgt-------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aatttt 592  Q
     |||        |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||    
T  6967104 tcgttaaactagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattcgaaggtcttaaccatacttctctctaatatt 6967202  T
Q  593 ctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggc-accaatataaatttatacatcctttttaataat 691  Q
    || |||||||| | |||||||||||   |  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  6967203 ctgaaaaccaact-tttattgttttatttacgtttatgttac-aaaacaactcaactgcctagggcaatcaatataaatttatacatcctttttgataaa 6967300  T
Q  692 gaaattgctaagtagaagttaa 713  Q
    ||||||||  ||||||| ||||    
T  6967301 gaaattgccgagtagaaattaa 6967322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 13 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 17867132 - 17866424
Alignment:
Q  13 accatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaattcttttgtgg 112  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||   ||||||||||||||||  | |||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||   ||| |||    
T  17867132 accatcacaactcatagtcaattatccaatacatgtatgaatccttgattttatgtgagttatcttgtactgtagttatgagtaactaatctctttatgg 17867033  T
Q  113 ttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttg 212  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||     
T  17867032 ttaag-cttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcattgaaagtctagttttaattcatattacttta 17866934  T
Q  213 tgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggctttt 312  Q
    ||||| |||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17866933 tgttttatgctttttgtatgtttatcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatgaccactaaccctggctttt 17866834  T
Q  313 aactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaa 412  Q
     |||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  17866833 gactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaaaacctccaa 17866734  T
Q  413 tggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatccgt-------- 504  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||            
T  17866733 cggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaac 17866634  T
Q  505 --aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaacc 601  Q
       |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  17866633 tagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattcgaaggtctaaaccatacttctctctaatattctgaaaacc 17866535  T
Q  602 aattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggc-accaatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgct 700  Q
    || | |||||||||||   |  ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||     
T  17866534 aact-tttattgttttatttacgtttatgttac-aaaacagctcaactgcctagggcaatcaatataaatttatacatcctttttgataaagaaattgcc 17866437  T
Q  701 aagtagaagttaa 713  Q
     ||||||| ||||    
T  17866436 gagtagaaattaa 17866424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 4 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 17863882 - 17863202
Alignment:
Q  4 tggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaatt 103  Q
    |||||| | ||||||| |||| | ||||||| ||||   ||||||||||||||||  | |||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||     
T  17863882 tggtgggagaccatcacaactcatagtcaattatccaatacatgtatgaatccttgattttatgtgagttatcttgtactgtagttatgagtaactaatc 17863783  T
Q  104 cttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcat 203  Q
      ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  17863782 tctttatggttaag-cttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcattgaaagtctagttttaattcat 17863684  T
Q  204 actaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaacc 303  Q
    | ||| || ||||| |||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  17863683 attactttatgttttatgctttttgtatgtttatcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatgaccactaacc 17863584  T
Q  304 ctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaa 403  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  17863583 ctggcttttgactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaa 17863484  T
Q  404 tacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatccg 503  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  17863483 aacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctg 17863384  T
Q  504 t----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aatttt 592  Q
    |           |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||    
T  17863383 tcgttaaactagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattcgaaggtcttaaccatacttctctctaatatt 17863285  T
Q  593 ctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggc-accaatataaatttatac 676  Q
    || |||||||| | |||||||||||   |  ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  17863284 ctgaaaaccaact-tttattgttttatttacgtttatgttac-aaaacagctcaactgcctagggcaatcaatataaatttatac 17863202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 4 - 690
Target Start/End: Original strand, 24782863 - 24783560
Alignment:
Q  4 tggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaatt 103  Q
    |||||| | ||||||| |||| | ||||||| ||||   |||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||     
T  24782863 tggtgggagaccatcacaactcatagtcaattatccaatacatgtatgaatccttgtttttatgtgagttatcttgtactttagttatgagtaactaatc 24782962  T
Q  104 cttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcat 203  Q
     ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||    
T  24782963 tttttgtggttaag-cttaagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccgtagtttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtctagttttaatccat 24783061  T
Q  204 actaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaacc 303  Q
    | ||| || ||||| |||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  24783062 attactttatgtttgatgctttttgtatgtttatcatcgactactaaccatagctttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccactaacc 24783161  T
Q  304 ctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacct---tagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtt 400  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |    
T  24783162 ctggcttttgactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaataatcaagctagagatatatcattattaggttatgacatagggattaacgttctgt 24783261  T
Q  401 taatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaat 500  Q
    ||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  24783262 taaaatctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggagagaattctaggtcaagagattgggtataattactttgttaat 24783361  T
Q  501 c---cgt-------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aat 589  Q
    |   |||        |||||||||||||| | |||||| || ||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||    
T  24783362 ctctcgttaaactagataatcattgattg-aattaggaatgaaaattaccatatgagaacttcggaggattcaaaggtcttaaccatacttctctctaat 24783460  T
Q  590 tttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggc-accaatataaatttatacatcctttttaat 688  Q
     |||| |||||||| | |||||||||||   | |||||||||||| ||| |||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24783461 attcttaaaaccaact-tttattgttttatttaagtttatgttac-aaaacaactcaactgccttggacaatcaatataaatttatacatcctttttgat 24783558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 157 - 656
Target Start/End: Original strand, 23107597 - 23108106
Alignment:
Q  157 tttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctag 256  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||     
T  23107597 tttgttgaactcctttgaatttcaatgaaagtttagtctttattcatattactttttgtttaatgctttttgcatgtttatcatcgactattaaccctaa 23107696  T
Q  257 ctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctag 356  Q
    | ||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||| |||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  23107697 cgttatgaatatgcaaattgatagtagagattgaatgaccactgacccagacttttgactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagttag 23107796  T
Q  357 agatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcgg 456  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23107797 agatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaatacctcaaacaatttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcgg 23107896  T
Q  457 ggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccatagga 546  Q
    |||||||| ||| | |||  |||||||||| |||||||||||||| ||          ||||||||||| ||| |  |||||||||||||| ||||||||    
T  23107897 ggagaattatagctcaaggaattgggtagagttactaagttaatctgttgtgaaactaaataatcattgtttg-aactaggagtgcaaattaccatagga 23107995  T
Q  547 gagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaa-atcaact 644  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||    
T  23107996 gagcttcggatgattcgaaggtcttaaccacatttctctctaattttct-aaaaccaatcttttattgtttttaattcgtttatgttacaaacatcaact 23108094  T
Q  645 caactgcctagg 656  Q
    |||||| |||||    
T  23108095 caactgtctagg 23108106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 123 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 36843607 - 36843135
Alignment:
Q  123 agatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgc 222  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  36843607 agatgaatttgatgtaatcttgtgggaactctaatttgttgaactc-tttgaatgtcaatgaaagtctagtttttattcatattactttgtgtttaatgc 36843509  T
Q  223 cttatgtat-gtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaa 321  Q
     || | ||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  36843508 tttttatattgtttatcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaatcctggcttttgactctgat 36843409  T
Q  322 ttaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcga 421  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  36843408 ctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttctgttaaaacctccaatggtttcga 36843309  T
Q  422 attcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatc 511  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||| ||           ||||||    
T  36843308 attcacttaagagattaaggggttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttaatttgttaatctgtcgttgaactagataatc 36843209  T
Q  512 attgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc 586  Q
    |||||||| |  ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36843208 attgattg-aagtaggagtgcgaattaccataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccatacttctctc 36843135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 80 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 3862607 - 3861968
Alignment:
Q  80 tactttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatc 179  Q
    ||||||||||||| |||||||||   ||||| ||| |  ||| || ||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||    
T  3862607 tactttagctatgggtaactaatctctttgtagttgagactt-agttgaatctaatgtaatcttatgagaaccctaatttgttgaactcctttaaatatc 3862509  T
Q  180 aatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatc 279  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||  | ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || |||       || ||| |||| | || ||    
T  3862508 aatgaaagtctagtttttatttatatcatcttgtttttaatgctttgtgtatgtttattattgactactagccc-------ataaatttgcagactggtc 3862416  T
Q  280 atagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatg 379  Q
     ||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |  ||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  3862415 ttagaacttaattgaccactaaccctggctttaaactctgaactaggtggtgtgtttaacctaagtaattaagctagagatagaaaattattaggttatg 3862316  T
Q  380 atatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaa----gattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaaga 475  Q
    ||||||||||||| |  || |||| || |||||  |||| |||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3862315 atatagggattaaaggacggttaaaacttccaacagttttgaattcacttaagacattaattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaaga 3862216  T
Q  476 gattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaa 565  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||           |||||||||  ||| | |||||||||        ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3862215 gattgggtagaattactttgttaatctgtcgttgaactagataatcatttcttg-aattaggagtg--------cataggagaacttcgaaggattcgaa 3862125  T
Q  566 ggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttac--taaatcaactcaactgcctagggcacca 662  Q
    || ||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||| |     
T  3862124 ggtcttaatcatacttctctctaattttat-aaaaccaatcttttattgtttttaatcagtttatgttacaaaaaatcaattgaactgcctagggcatc- 3862027  T
Q  663 atataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacaatcc 722  Q
    ||  || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  3862026 attgaatttaatacatcc-ttttaataatgaaattgctaagtagaagttaataacaatcc 3861968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 123 - 603
Target Start/End: Original strand, 9765373 - 9765867
Alignment:
Q  123 agatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgc 222  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  9765373 agatgaatatgatgtaatcctatgagaaccctaatttgttgaacttctttgaatatgaataaaagtctagtttttattcatattactttatgtttaatgc 9765472  T
Q  223 cttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaat 322  Q
     || || |||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||      ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||       
T  9765473 gttttgcatgtttaccatcgactattaaccctagctttatggatatgcaaattgatcg-----attgaatgaccactaaccctgacttttgactctggtc 9765567  T
Q  323 taggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaa 422  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||   |||| ||||| ||||||||||||    
T  9765568 taggtaataagtttaacttaagtaatcaagctagagatagatgattattaggttatgacataaggactaatgttttgttaaaacctctaatggtttcgaa 9765667  T
Q  423 ttcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaat---ccgt--------------- 504  Q
    ||||||||| ||||||||||  | | |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||   ||||                   
T  9765668 ttcacttaagagattaagggtattttacttgcagggagaattataggtcaagagattgggtagagttactttgttaatctgccgtgaaactcgtgaaact 9765767  T
Q  505 -aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaacca 602  Q
      |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  9765768 agataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcagaggattcgaaggtcttaaccatacttctctctaatattcttaaaacca 9765866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 123 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 23313871 - 23313673
Alignment:
Q  123 agatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgc 222  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||| || ||||||||||    
T  23313871 agatgaatccgatgtaatcttatgggaactctaatttgttaaactcctttgaatatcaatgaaagtctagtctttattcatgttactttatgtttaatgc 23313772  T
Q  223 cttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaa 321  Q
     || ||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  23313771 tttttgtatgtttatcatcgactacaaaccctagctttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccttggcttttgactctgaa 23313673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 35773319 - 35773054
Alignment:
Q  4 tggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaatt 103  Q
    |||||| | ||||||| |||| | ||||||||||||   |||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||     
T  35773319 tggtgggagaccatcacaactcatagtcaatcatccaatacatgtatgaatccttgtttttatgtgagttatcttgtacgttagatatgagtaactaatc 35773220  T
Q  104 cttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcat 203  Q
      ||||||||| |  || ||||||||||| ||||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  35773219 tgtttgtggttgagact-gagatgaatcttatgtaatcctataagaactctaatttgttgaactcatttgaatgtcaatgaaagtttagtttttattcat 35773121  T
Q  204 actaccttgtgtttaatgccttatgta-tgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatg 269  Q
    | ||| ||||||| ||||| || |||| ||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  35773120 attactttgtgttaaatgctttttgtattgtttatcatcaactactaaccctaactttatgaatatg 35773054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 382 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 23313671 - 23313382
Alignment:
Q  382 atagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgg 481  Q
    |||||| |||||||||  |||| |||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23313671 ataggggttaacgttctgttaaaacctccaacgattttgaattcacttaagagattaaggggtttccacttgcggggagaattctaggccaagagattgg 23313572  T
Q  482 gtagaattactaagttaatccgta----------ataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggactt 571  Q
    ||||| ||||   ||||||  ||           |||||||||| ||| ||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||    
T  23313571 gtagagttacagtgttaatatgttgtgaacctagataatcattgtttgaatt-agtagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcaaaggtctt 23313473  T
Q  572 aaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttac-taaatcaactcaactgcctagggcacc 661  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |  |||||||||||||||  |||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||    
T  23313472 aaccatacttctctctaattttct-aaaaccattcttttattgtttttaattcgtttatgttacaaaaatcaattcaactacctagggcacc 23313382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 442
Target Start/End: Original strand, 2719269 - 2719438
Alignment:
Q  273 attgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattatta 372  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |  ||| | |||||  || |||||  | ||||| | | |||| ||||||||||||||  ||| |||    
T  2719269 attgatcatagaatttgaatgactactagccctagtgtttgaatctgatctaagtaatccgattaacttaattaattaagctagagatagacaattgtta 2719368  T
Q  373 ggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggg 442  Q
     |||||||| ||  |||||||| ||  | || |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  2719369 agttatgatttatagattaacgatctataaaaacctccaacggttttgaattcacttaagagattaaggg 2719438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 399 - 440
Target Start/End: Original strand, 27796686 - 27796727
Alignment:
Q  399 tttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaag 440  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  27796686 tttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaag 27796727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440 (Bit Score: 419; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 291 - 770
Target Start/End: Original strand, 9606 - 10095
Alignment:
Q  291 atgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggatt 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9606 atgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctaaagatagatcattattaggttatgatatagggatt 9705  T
Q  391 aacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaatta 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9706 aacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaatta 9805  T
Q  491 ctaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatact 580  Q
    ||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9806 ctaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatact 9905  T
Q  581 tctctcaattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcc 680  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9906 tctctcaattttctaaaaaccaattatttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctaggggaccaatataaatttatacatcc 10005  T
Q  681 tttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgaggaaacgaattcttttattacttccatcgaatttggttcacttg 770  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  10006 tttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacagtccctgaggaaacgaattcttttattacttcgatcgaatttgattcacttg 10095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 9463 - 9608
Alignment:
Q  1 atctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaacta 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9463 atctagtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaacta 9562  T
Q  101 attcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatg 146  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9563 attcttttgtggttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatg 9608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 406; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 7780 - 7177
Alignment:
Q  5 ggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaattc 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7780 ggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatcctctacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagttatgagtaactaattc 7681  T
Q  105 ttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcata 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7680 ttttgtggttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctacgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacataaatgaaagtttagtttttattcata 7581  T
Q  205 ctaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccc 304  Q
     ||| ||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  7580 ttactttgagtttaatgctttatgtatgtttatcatcgactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaatttgattgaccactaaccc 7481  T
Q  305 tggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaat 404  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  7480 tggctttttactcagaactaggtaataggtttaacctaagtaataaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaat 7381  T
Q  405 acctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatccgt 504  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||| ||    
T  7380 acctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaagtcaagagattgaatagaattactaagttaatctgt 7281  T
Q  505 ----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctca-attttc 593  Q
              ||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  7280 cgtgaaactaaataatcattgattg-aattaggagtacaaattaccataggagagtatcagaggattcgaaggacttaaccattcttctctcagattttc 7182  T
Q  594 taaaa 598  Q
    |||||    
T  7181 taaaa 7177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 397; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 598
Target Start/End: Original strand, 2145 - 2754
Alignment:
Q  1 atctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaacta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2145 atctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatcctttacatgtatgaatcctttctcttatgttagttaacttatactttagctatgagtaacta 2244  T
Q  101 attcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttatt 200  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  2245 attcttttgtggttaattcctaagatgaatctgatgtaatcctacgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacttcaatgaaagtttagtctttatt 2344  T
Q  201 catactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccacta 300  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  2345 catattactttgtgtttaatgctttatgtatgtttatcatcaactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaaataaatgaccacta 2444  T
Q  301 accctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtt 400  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  2445 accctggctttttactctgaactaggtaataggtttgacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggatcaacgttcttt 2544  T
Q  401 taatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtaga--attactaagtta 498  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  2545 taatacctccaacggtttcgaattcacttaagagatttaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgagtagaatattactaagtta 2644  T
Q  499 atccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctca- 587  Q
    ||| ||          ||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  2645 atctgtcgtgaaactaaataatcattgattg-aattaggagtgcaagttaccataggagagtatcagaggattcgaaggacttaaccattcttctctcag 2743  T
Q  588 attttctaaaa 598  Q
    |||||||||||    
T  2744 attttctaaaa 2754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 378; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 233 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 24743 - 24250
Alignment:
Q  233 tttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaatag 332  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  24743 tttatgatagactattaaccatagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaaccaggtaatag 24644  T
Q  333 gtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaa 432  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  24643 gtttaacctaagtaatcaagctagagatatatcattattaggttatgatatagggattaacgtttatttaattcctccaatggtttcgaattcacataag 24544  T
Q  433 agattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtat 522  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||| |||||||    
T  24543 agattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgatactaaataatcatttattgtat 24444  T
Q  523 ttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatc 622  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24443 ttaggagtgcaaattaccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatgcttctctcaattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatc 24344  T
Q  623 agtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaataca 718  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  24343 agttta--ttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaataataatttatacatcctttttaataatgaaattgttgagtagaagttaaataca 24250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 3398 - 2799
Alignment:
Q  1 atctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaacta 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3398 atctggtgggcaaccatcaaaactaagagtcaatcatcctttacatgtatgaatccttcttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaacta 3299  T
Q  101 attcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttatt 200  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||| |||| |    
T  3298 attcttttgtggtta-ttcctgagatgaatcttatgtaatcttatggaaatcctaatttgttgaactcatttgaatttaaatgaaagtttagtctttact 3200  T
Q  201 catactacct---tgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagcttt-atgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgacc 296  Q
    |||| ||| |   |||||||||||  || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |    
T  3199 catattacttctttgtgtttaatgttttttgtatgtttatcatcgactactaaccctagcttttatgaatatgcaaattgatcacagaatttgaatgaac 3100  T
Q  297 actaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgtt 396  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||    
T  3099 actaaccatggctttcaactctgaactaggtaatacgtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattagattatgacacaaggattaacgtt 3000  T
Q  397 cgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagt 496  Q
    | ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |    
T  2999 cttttaatacctccaatagttttgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagatttggtagaattactacct 2900  T
Q  497 taatc---cgt-------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc 586  Q
    |||||   |||        |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  2899 taatctttcgtgaaactatataatcattgattg-aactaggagtgcaaattaccataggagagcttcggaggattcaaaggtcttaacgatacttctctc 2801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 19)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 43 - 713
Target Start/End: Original strand, 13492759 - 13493437
Alignment:
Q  43 acatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcc 142  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||  ||| |||||||  ||||||||| ||||   |||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||     
T  13492759 acatgtatgaatccttgtttttatgtgagttttcttgtactttatttatgagtaattaatctctttgtggttaaa-cttgagataaatttgatgtaatct 13492857  T
Q  143 tatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatag 242  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||| || |||||||||| || ||||||||||| || |    
T  13492858 tatgggaaccctagtttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtctagttttaattcatattactttatgtttaatgctttttgtatgtttatcatcg 13492957  T
Q  243 actattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctt 342  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||     
T  13492958 actactaaccctagctttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataagtttaaccta 13493057  T
Q  343 agtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggg 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13493058 agtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttctgttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggg 13493157  T
Q  443 gttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgc 532  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||           |||||||||| ||| | ||||||||||    
T  13493158 gttgtcacatgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagataatcattgcttg-aattaggagtgc 13493256  T
Q  533 aaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgt 631  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||   |  ||||||||    
T  13493257 aaattaccataggagaacttcagaggattcgaaggtcttaaccatacttctctctaatattctgaaaaccaact-tttattgttttatttacgtttatgt 13493355  T
Q  632 tactaaatcaactcaactgcctagggc-accaatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaa 713  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||||    
T  13493356 tac-aaaacaactcaactgcctagggcaatcaatataaatttatacatcctttttgataaagaaattgccgagtagaaattaa 13493437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 32506644 - 32505931
Alignment:
Q  1 atctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaacta 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||   ||| |||||||||||| || ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  32506644 atctggtgggcaaccatcaaaactcatagtcaatcatccaatacacgtatgaatccttgtttttacgttagttatcttgtactttagctatgagtaacta 32506545  T
Q  101 attcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactccttt--gaacatcaatgaaagtttagttttta 198  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||| |    
T  32506544 attcttttgtgattaag-cttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctagtttgttgaactcctttttgaatatcaatgaaagtctagttttaa 32506446  T
Q  199 ttcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccac 298  Q
       ||| ||| || |||||||||  || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||    
T  32506445 ---atattactttatgtttaatgttttttgtatgtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgcaaatcgatcttagagattgaatgaccac 32506349  T
Q  299 taaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcg 398  Q
    |||||||| ||||| |||||||  ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  32506348 taaccctgacttttgactctgatctaggtaataagtttaacttaagtaatcaagctagagataggtcattattaggttatgacatagggattaacgttct 32506249  T
Q  399 tttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagtta 498  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  32506248 gttaatacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgtta 32506149  T
Q  499 atccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctct-ca 587  Q
    ||| ||           |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |    
T  32506148 atctgtcgttaaactagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccacacttctctata 32506050  T
Q  588 attttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttttaa 687  Q
    || |||| |||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||  |||      |||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  32506049 atattcttaaaaccaact-tttattgtttttaattcgtttatgttagaaaa------caactgcctcacgcatcaatataaatttatacatcctttttga 32505957  T
Q  688 taatgaaattgctaagtagaagttaa 713  Q
    ||| |||||||   ||||||||||||    
T  32505956 taaagaaattgtcgagtagaagttaa 32505931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 43 - 713
Target Start/End: Original strand, 13495484 - 13496162
Alignment:
Q  43 acatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcc 142  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||  ||| |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||    
T  13495484 acatgtatgaatccttgtttttatgtgagttgtcttgtactttagttatgagtaactaatctctttgtggttaaa-cttgagataaatatgatgtaatcc 13495582  T
Q  143 tatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatag 242  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||| || |||||||||| || ||||||||||| || |    
T  13495583 tatgggaaccctagtttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtctagttttaattcatattactttatgtttaatgctttttgtatgtttatcatcg 13495682  T
Q  243 actattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctt 342  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||| |||||||||     
T  13495683 actactaaccctagctttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccctagcttttgactctgatctaggtaataagtttaaccta 13495782  T
Q  343 agtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggg 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13495783 agtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttctgctaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggg 13495882  T
Q  443 gttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgc 532  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||   |||||| ||           |||||||||||||| | ||||||||||    
T  13495883 gttgtcacttgcgggtagaattctaggtcaagagattggatataattactttcttaatctgtcgttaaagtagataatcattgattg-aattaggagtgc 13495981  T
Q  533 aaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgt 631  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||| | |||||||||||   |  ||||||||    
T  13495982 aaattaccataggagaacttcggaggattcaaaggtcttaaccatacttctctctaatattcttaaaatcaact-tttattgttttatttacgtttatgt 13496080  T
Q  632 tactaaatcaactcaactgcctagggc-accaatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaa 713  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||||    
T  13496081 tac-aaaacaattcaactgcctaggacaatcaatataaatttatacatcctttttgataaagaaattgccgagtagaaattaa 13496162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 57 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 27282842 - 27282305
Alignment:
Q  57 tttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaa 156  Q
    ||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27282842 ttttttttatgtgagttatcttgtactttagctatgagtaactaatctctttgtggttaatcct-gagatgaatctgatataatcctatgggaaccctaa 27282744  T
Q  157 tttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctag 256  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||| || |||||||| | || ||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  27282743 tttgttgaacacctttgaatatcaatgaaagtctagttttaattcatattactttatgtttaatcctttttgtatctttatcatcgactactaaccctag 27282644  T
Q  257 ctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctag 356  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  27282643 ctttatgaatatgaaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccctggattttgactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctag 27282544  T
Q  357 agatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcgg 456  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27282543 agatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaaaacctccaacgattttgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcgg 27282444  T
Q  457 ggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccatagga 546  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||           |||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  27282443 ggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatcggtcgttgaactagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccatagga 27282345  T
Q  547 gagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc 586  Q
    || |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  27282344 gaacttcggagaattcgaaagtcttaaccatacttctctc 27282305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 132 - 661
Target Start/End: Original strand, 34065929 - 34066468
Alignment:
Q  132 tgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtat 231  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| | ||||||| ||||||| ||| || |||||||||| || ||||     
T  34065929 tgatgtaatcttatgggaatcctaatttgttgaacttttttgaatatcaatgaaaatctagttttaattcatattacgttatgtttaatgctttttgtac 34066028  T
Q  232 gtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaata 331  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  34066029 gtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgcaaattgatcttagagattaaatgaccactaaccctggcttttgactctgacctaggtaata 34066128  T
Q  332 ggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaa 431  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  34066129 agtttaacctaagtaatcaagttagagatagatcattattaggttatgacatagagattaacgttctgttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaa 34066228  T
Q  432 aagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatc---cgt-------aataatcattgattgta 521  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||   |||        |||||||||||||| |    
T  34066229 gagattaaggggttgtcacttgcggagagaattcaaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctatcgttaaactagataatcattgattg-a 34066327  T
Q  522 tttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaa 620  Q
     |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  34066328 attaggagtgcaaattatcataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccatacttctctctaattttct-aaaaccaatcttttattgtttttaa 34066426  T
Q  621 tcagtttatgttac-taaatcaactcaactgcctagggcacc 661  Q
    |  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  34066427 ttcgtttatgttacaaaaatcaattcaactgcctagggcacc 34066468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 47 - 713
Target Start/End: Original strand, 1936128 - 1936804
Alignment:
Q  47 gtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatg 146  Q
    |||||||||||| ||  |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  ||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  1936128 gtatgaatccttgtttctatggtagttatcttgtactttagctatgagtaactaatctctttgtggttgagactt-agatgaatctcatgtaatcttatg 1936226  T
Q  147 ggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagacta 246  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| || |||||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  1936227 ggaaccataatttgttgaactcctttgaatatcaatggaagtctagttttaattcatattactttatgtttaatgctttttgtatgtttatcatcgacta 1936326  T
Q  247 ttaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagta 346  Q
     |||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||  | | |||   |||||||| ||||||||| ||||    
T  1936327 ctaaccctaactttatgaatatgaaaattgatcttagagattaaatgaccactaaccatggctttcgaatttgatccaggtaataagtttaacctaagta 1936426  T
Q  347 atcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttg 446  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| |||| |||  ||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  1936427 atcatgctagagatagatcattattaggttatgacatagggaataacattcttttaaaacct-caaacgtttcaaattcacttaagagattaagggattg 1936525  T
Q  447 tcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatc---cgt-------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaat 536  Q
    | |||||||||||||| | ||  | |||||||| |||||| |||||  |||||||   |||        |||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  1936526 ttacttgcggggagaactataaatcaagagatttggtagagttactttgttaatctttcgtgaagctagataatcattgattg-aactaggagtgcaaat 1936624  T
Q  537 tgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaa-tcagtttatgttac 634  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   ||||  |||||||| |||||||||| |||    
T  1936625 taccataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccatacttctctctaattttct-aaaaccaaaattttaccgtttttaattcagtttatgatac 1936723  T
Q  635 ta-aatcaactcaactgcctagggc-accaatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaa 713  Q
     | |||||||||||||||||||| | ||| ||  || || ||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  1936724 aacaatcaactcaactgcctaggtcaacccattgaatttaatacatcgttattactaatgaaattgccaagtagaagttaa 1936804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 16190967 - 16190299
Alignment:
Q  1 atctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaacta 100  Q
    |||||||||  ||||||||||| | | ||||||||||||   |||||||||||||||| || |||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||    
T  16190967 atctggtgggcaaccatcaaaattcatagtcaatcatccaatacatgtatgaatccttgtttttatgttagttatcgtttactttagctataagtaacta 16190868  T
Q  101 attcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactccttt-----gaacatcaatgaaagtttagttt 195  Q
    ||   ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||     ||| |||||||||||| ||||||    
T  16190867 atctatttgtggttgagtctt-agatgaatctgatgtaatcttataggaaccctaatttgttgaactcctttaatttgaatatcaatgaaagtctagttt 16190769  T
Q  196 ttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgac 295  Q
    | ||| ||| ||| || |||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||    
T  16190768 taatttatattactttatgtttaatgctttttgtatgtttatcatcgactactaaccttagctttatgaatatgcaaattgatcctagagattggatgac 16190669  T
Q  296 cactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgt 395  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||           
T  16190668 cactaaccttggcttttaactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagttagagatagatcaatattaggttatgacataggga------- 16190576  T
Q  396 tcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaag----attaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtaga-atta 490  Q
        |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||| | |||||||||| | ||| ||||||||||||| | ||||    
T  16190575 ----ttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaattaaggggttgtcactcgtggggagaattatgggtcaagagattgggtatatatta 16190480  T
Q  491 ctaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatact 580  Q
     |  ||||||  ||           |||||||||| ||| | ||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16190479 ttttgttaatttgtcgttaaactagataatcattgcttg-aattaagagtgcaaattatcataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccatact 16190381  T
Q  581 tctc-tcaattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaa-atcaactcaactgcctagggcacca 662  Q
    |||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||    
T  16190380 tctctttaattttct-aaaaccaa-tctttattgtttttaattcgtttatgttacaaacatcaactcaatttcctagggcacca 16190299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 206 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 22104956 - 22104683
Alignment:
Q  206 taccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccct 305  Q
    ||||||||||||||||  || |||| |||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  22104956 taccttgtgtttaatgttttgtgtaggtttatcatcgactactaactctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaattct 22104857  T
Q  306 ggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaata 405  Q
    || ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22104856 ggtttttaactctgaactatgtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttc-tttaata 22104758  T
Q  406 cctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgg 481  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22104757 cctccaacgattttgaattcacttaagagattaa-ggtctgtcacttacggggagaattctaggtcaagagattgg 22104683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 126 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 23990754 - 23990380
Alignment:
Q  126 tgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgcctt 225  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||  | |||||| ||||||| ||||| | ||  || | || ||||  ||    
T  23990754 tgaatctgatttaatcttatgggaacactaatttgttgaactcctctgaatatttaagaaagtctagttttaattcacattatattatcttcaatgtttt 23990655  T
Q  226 atgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatc--at--agaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaa 321  Q
     ||||||||||| || ||||| |||     |||||||||||||||| |||||||  ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  23990654 ttgtatgtttatcattgactactaa-----gctttatgaatatgcaaattgatctaattaagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgat 23990560  T
Q  322 ttaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcga 421  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||    
T  23990559 ctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagattgatcattattaggttatgacatagggattaacgttctgttaaaacctccaacggtttcga 23990460  T
Q  422 attcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatc 501  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  23990459 attcacttaagagtttaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagtgattgggtagaattactttgttaatc 23990380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 288 - 713
Target Start/End: Original strand, 39545983 - 39546417
Alignment:
Q  288 tgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatataggg 387  Q
    |||||||| ||||||  ||| |||| |||||||  ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39545983 tgaatgacaactaacaatggattttgactctgatctaggtaataagtttaacttaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacataggg 39546082  T
Q  388 attaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaa 487  Q
    ||||||||||  |||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  39546083 attaacgttctattaaaacctccaacgatttcgaattcacttaagagattaaggggttgttacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagag 39546182  T
Q  488 ttactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccat 577  Q
    |||||  ||||||| ||           |||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  39546183 ttactttgttaatctgtcgtgaaactagataatcattgcttg-aattaggagtgcaaattaccatatgagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccat 39546281  T
Q  578 acttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttac-taaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttata 675  Q
    ||||||||| ||| || | |||||||| | |||||||||||   |  ||||| |||||  ||| |||  ||||||||||||||| ||||  || || |||    
T  39546282 acttctctctaatatttttaaaaccaact-tttattgttttatttgcgtttacgttacaaaaaccaatccaactgcctagggcaacaattgaatttaata 39546380  T
Q  676 catcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaa 713  Q
    ||||| |||  |||||||||||||| |||| |||||||    
T  39546381 catcc-tttcgataatgaaattgctgagtaaaagttaa 39546417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 162 - 501
Target Start/End: Original strand, 21152871 - 21153209
Alignment:
Q  162 tgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagcttta 261  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||  ||||||| | |||| |||||||||   | | |||||||||||| ||||| || | ||||| |      
T  21152871 tgaactcccttgaatatcaatgaaagtctagttta-attcatatttccttctgtttaatgttgtttatatgtttatgattgactactagcactagcatct 21152969  T
Q  262 tgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagata 361  Q
    ||||| || | ||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  |||| ||||  |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  21152970 tgaatgtgtaaattgaacttagaacttgaatgaccactagccctgacttttgactctgatctagggaatatatttaacctaagtaattaagctagagata 21153069  T
Q  362 gatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggaga 461  Q
    ||   ||||||||||||||| ||||||||||||  |  |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21153070 gacagttattaggttatgatttagggattaacggactattaaaacctccaaaggtttcaaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggagaga 21153169  T
Q  462 attctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatc 501  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  21153170 attctaggtcaagagattgagtagaattactgtgttaatc 21153209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 287 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 22453641 - 22453427
Alignment:
Q  287 ttgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagg 386  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||   | |    
T  22453641 ttgaatgaccactagccctggcttttgactctgatttaggtaataggtttaacctaagtaattaagctagagatagaaaattattaggttatgactcatg 22453542  T
Q  387 gattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtaga 486  Q
    ||||||||  |  |||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22453541 gattaacggactgttaaaacctccaacagtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggagagaattctaggtcaagagattgggtaga 22453442  T
Q  487 attactaagttaatc 501  Q
    ||||||  |||||||    
T  22453441 attactttgttaatc 22453427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 162 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 22457123 - 22456792
Alignment:
Q  162 tgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgata--gactattaaccctagc-t 258  Q
    |||||||| |||||  | |||| |||| ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||   | ||||||||||| |||  ||||| || | ||||| |    
T  22457123 tgaactcccttgaattttaatggaagtctagttttaattcatattacctt-tgttcaatgttgtttgtatgtttattatattgactactagcactagcgt 22457025  T
Q  259 ttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagag 358  Q
    || |||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  22457024 ttttgaatatgcaaactgatcttagaacttgaatgaccactagccctgacttttgactctgttttaggtaataggtttaacctaagtaattaagcaagag 22456925  T
Q  359 atagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcgggg 458  Q
    |||||  |||||||||||||||   | |||||||||  |  |||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |    
T  22456924 atagaaaattattaggttatgactcatggattaacggactgttaaaacctccaacagtttcgaattcacttaagagattaa-gagttgtcacttgcggag 22456826  T
Q  459 agaattctaggttaagagattgggtagaattact 492  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22456825 agaattctaggtcaagagattgggtagaattact 22456792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 501
Target Start/End: Original strand, 15297047 - 15297286
Alignment:
Q  262 tgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagata 361  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| | |||||  |||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  15297047 tgaatatgcaaattgatcttagaacttgaatgaccactagctctggcttttgaatctgatctaggtaatagttttaacctaagtaattaagttagagata 15297146  T
Q  362 gatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggaga 461  Q
    ||  |||||||||||||||   | |||||||||  |  |||| ||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||| | ||||    
T  15297147 gaaaattattaggttatgactcatggattaacggactgttaaaacctccaacagtttcaaattcacttaagagatttaagggttgtcacttgcagagaga 15297246  T
Q  462 attctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatc 501  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15297247 attctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatc 15297286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 237
Target Start/End: Original strand, 10759579 - 10759811
Alignment:
Q  4 tggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaatt 103  Q
    |||||| | ||||||| |||| | ||||||| ||||   |||| |||||||||||  | |||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||     
T  10759579 tggtgggagaccatcacaactcatagtcaattatccaatacatatatgaatccttgattttatgtgagttatcttgtactgtagttatgagtaactaatc 10759678  T
Q  104 cttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcat 203  Q
      ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  10759679 tctttatggttaag-cttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcattgaaagtctagttttaattcat 10759777  T
Q  204 actaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttat 237  Q
    | ||| || ||||| |||| || |||||||||||    
T  10759778 attactttatgttttatgctttttgtatgtttat 10759811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 457 - 713
Target Start/End: Original strand, 10764829 - 10765094
Alignment:
Q  457 ggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatccgta----------ataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccatagga 546  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||           |||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||||||||    
T  10764829 ggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagataatcattgcttgaatt-aggagtgcaagttaccatagga 10764927  T
Q  547 gagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaatcaactc 645  Q
    || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||   |  ||||||||||| ||| ||||||    
T  10764928 gaacttcagaggattcgaaggtcttaaccatacttctctctaatattctgaaaaccaact-tttattgttttatttacgtttatgttac-aaaacaactc 10765025  T
Q  646 aactgcctagggc-accaatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaa 713  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||||    
T  10765026 aactgcctagggcaatcaatataaatttatacatcctttttgataaagaaattgccgagtagaaattaa 10765094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 587 - 660
Target Start/End: Original strand, 8435285 - 8435358
Alignment:
Q  587 aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatgttactaaa-tcaactcaactgcctagggcac 660  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  8435285 aattttctaaaaaccaact-tttattgtttttattatgtttatgttacaaaaatcaactcaactgcctagggcac 8435358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 532 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 22456744 - 22456699
Alignment:
Q  532 caaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccat 577  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  22456744 caaatttccataggagaacttcggaggattcgaaggtcttgaccat 22456699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 532 - 577
Target Start/End: Original strand, 49147891 - 49147936
Alignment:
Q  532 caaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccat 577  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  49147891 caaatttccataggagaacttcggaggattcgaaggtcttgaccat 49147936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 8)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 43 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 12576048 - 12575314
Alignment:
Q  43 acatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcc 142  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||    
T  12576048 acatgtatgaatcattgtttttatgttagttatcttgtactttagcgatgagtaactaatctctttgtggttgagactt-agatgaatctgatgtaatcc 12575950  T
Q  143 tatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatag 242  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| || || || ||||| ||||| ||      
T  12575949 tataggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtctagtttttattcatattactttgtgttcaacgctttttgtatctttatcatca 12575850  T
Q  243 actattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctt 342  Q
    || | || ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||   |||||||||||||||| |     
T  12575849 acaactagccctaactttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgactactaaccttggcttttgactttgatcaaggtaataggtttaacata 12575750  T
Q  343 agtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggg 442  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  12575749 agtaatcaagttagagatagatcattattaggttatgatataaggattaacgtattgttaaaacctccaatggtttctaattcacttaagagattaa-gg 12575651  T
Q  443 gttgtcacttgcggggagaattctagg-ttaagagattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtg 531  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||           || ||||||| ||| | |||||||||    
T  12575650 gttgttacttgcggggagaattctaggtttaagagattaggtagaattactttgttaatctgtcgttaaactagattatcattgcttg-aattaggagtg 12575552  T
Q  532 caaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaatcagtttatg 630  Q
    |||||| ||||| || | ||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  12575551 caaattaccataagaaaacttcggaggattcaatggtcttaaccatacttctctctaattttct-aaaaccaatcttttattgtttttaatcaatttatg 12575453  T
Q  631 ttac-taaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaaatacaatccctgagga 729  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||  || || |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||  ||| |||  | |||    
T  12575452 ttacaaaaatcaactcaactgcctagggcacc-attgaatttaatacatcctttttaataatgaacttgttgagtagaagttaacaacagtcctcgtgga 12575354  T
Q  730 aacgaattcttttattacttccatcgaatttggttcacttg 770  Q
     |||||||  ||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  12575353 tacgaatt-atttattacttcgattgaatttggtacacttg 12575314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 123 - 598
Target Start/End: Original strand, 13096606 - 13097081
Alignment:
Q  123 agatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgc 222  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||          |||||||||    
T  13096606 agatgaacctgatgtaatcctatgggaaccctgatttattgaactcctttgaatatcaatgaaagtctagttttaattgat----------gtttaatgc 13096695  T
Q  223 cttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaac-cctggc-ttttaactctga 320  Q
     || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  13096696 ttt-tgtatgtttatcatcgactactatccctagctttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgatcactaactcctggccttttaactctga 13096794  T
Q  321 attaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcg 420  Q
      ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| | ||||||     
T  13096795 cctaggtaataagtttaagctaagtaatcaagctagagatagatcattattagattatgacatagggatttacgttctgttaaaacctcccacggtttca 13096894  T
Q  421 aattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatc----------cgtaataat 510  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||          |   |||||    
T  13096895 aattcacttaagacattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggccaagagattgggtagaattactttgttaatctttcattgaactagataat 13096994  T
Q  511 cattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaa 598  Q
    ||||| ||  | |||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13096995 cattgctt-aaattaggagtgcaaatt-acataggataacttcggaggattcgaaggtcttaaccatacttctctctaattttctaaaa 13097081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 154 - 598
Target Start/End: Original strand, 44007909 - 44008356
Alignment:
Q  154 taatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccc 253  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| || |||  | |||||||||| || | ||||||||| || ||||||| ||||    
T  44007909 taatttgttgaactcctttgaatttcaattaaagtttagtctttattcttattactctttgtttaatgcttttt-tatgtttatcatcgactattgaccc 44008007  T
Q  254 tagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagc 353  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| | |||| ||||||||| |||| || ||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  44008008 tagctttatgaaaatgcaaattgaccgtagagattgaatgaacactgactctggcttttgattctgaactaggtaataagtttaacctaactaatcaagc 44008107  T
Q  354 tagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttg 453  Q
    |||| |||||||||| |||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  44008108 tagaaatagatcattgttaggttacgacacagggattaacgttcttttaatacctccaacgatttcaaattcacttatgagattaaggagttgtcacttg 44008207  T
Q  454 cggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagtta-----atccgtaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggaga 548  Q
    | |||||||||||||||  || |||| |||||| |||||||  ||     |  |  ||||||||||| ||| |  |||||||||| ||| ||| ||| ||    
T  44008208 c-gggagaattctaggtcgagggatttggtagagttactaatctatcgtgaaactaaataatcattgtttg-aactaggagtgcagattaccaaaggcga 44008305  T
Q  549 gcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaa 598  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||| || ||||||||||||    
T  44008306 gcttcggaggattcgaaggtcataaccataattctttctaattttctaaaa 44008356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 314 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 41779213 - 41778864
Alignment:
Q  314 actctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaat 413  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||       ||||| |     |    
T  41779213 actctgaactaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattgac------ataataac-atttt 41779121  T
Q  414 ggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatccgt--------- 504  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||| ||             
T  41779120 ggttttgaattcacttaagatattaaggggttgccacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagagttattgtgttaatctgtcgtgaacct 41779021  T
Q  505 -aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctc-tcaattttctaaaaacca 602  Q
      |||||||||| ||| | |||  ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| | ||| ||||  ||| ||    
T  41779020 agataatcattgtttg-aattactagtgcaaattagcataggagaacttcggaagatttgaaggtcttaaccatacttctctttaatcttct--aaatca 41778924  T
Q  603 attctttattgtttttaatcagtttatgttac-taaatcaactcaactgcctagggcacc 661  Q
    ||  |||||||||||||||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  41778923 atcttttattgtttttaattcgtttatgttacaaaaatcaattcaactgcctagggcacc 41778864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 523 - 713
Target Start/End: Original strand, 14418450 - 14418639
Alignment:
Q  523 ttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaat 621  Q
    |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  14418450 ttaggagtgcaaattatcataggagaaattcggaggattcgaatgtcttaaccatacttctctctaatattcttaaaaccaact-tttattgtttttaat 14418548  T
Q  622 cagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaa 713  Q
      ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | ||  || || | | ||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||    
T  14418549 ttgtttatgtta-aaaaccaactcaactgcctagggcaaccattgaatttaacatatcctttttgataaagaaattgctaagttgtagttaa 14418639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 41779317 - 41779232
Alignment:
Q  152 cctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttat 237  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||  ||| || |||||||||| || |||||||||||    
T  41779317 cctaatttgttgaactcctttaaatatcaatgaaagtttagtctttatccatgttactttatgtttaatgctttttgtatgtttat 41779232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 527 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 41836479 - 41836418
Alignment:
Q  527 gagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctcaa 588  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  41836479 gagtgcaaattaccataggagaacttcggaggattcgaaggtcttaaccatgcttctctcaa 41836418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 354 - 398
Target Start/End: Original strand, 14418355 - 14418399
Alignment:
Q  354 tagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcg 398  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14418355 tagagatagatcattattagattatgatatagggattaacgttcg 14418399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 123 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 6479 - 5995
Alignment:
Q  123 agatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgc 222  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||  ||| || ||||||||||    
T  6479 agatgaatctgatgtaatcttatgggaaccttaatttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtc-agtgtttattcatgttactttatgtttaatgc 6381  T
Q  223 cttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaat 322  Q
     || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  6380 tttttgtatgtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccctgacttttgactctgaac 6281  T
Q  323 taggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaa 422  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||| |||||||||| ||| |||    
T  6280 taggtaataagtttaatctaagtaatcaacctagagatagatcattattaggttatgacatagggtttaacgttctgttaaaacctccaatgattttgaa 6181  T
Q  423 ttcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatca 512  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |  ||||||| ||           |||||||    
T  6180 ttcacttaagagattaaggggttgccacttgcggggagaattctagatcaagagattgggtagagttattgtgttaatctgtcgtgaacctagataatca 6081  T
Q  513 ttgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaa 598  Q
    ||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6080 ttgtttg-aattagtagtgcaaattaccataggagaacctcggaggattcgaaggtcttaaccatacttctctctaattttctaaaa 5995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0665 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0665
Description:

Target: scaffold0665; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 4 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 432 - 1
Alignment:
Q  4 tggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaatt 103  Q
    |||||| | ||||||| |||| | ||||||| ||||   ||||||||||||||||  | |||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||     
T  432 tggtgggagaccatcacaactcatagtcaattatccaatacatgtatgaatccttgattttatgtgagttatcttgtactgtagttatgagtaactaatc 333  T
Q  104 cttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcat 203  Q
      ||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  332 tcttcatggttaag-cttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcattgaaagtctagttttaattcat 234  T
Q  204 actaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaacc 303  Q
    | ||| || ||||| |||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  233 attactttatgttttatgctttttgtatgtttatcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatgactactaacc 134  T
Q  304 ctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaa 403  Q
    |||| |||| |||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  133 ctggtttttgactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaa 34  T
Q  404 tacctccaatggtttcgaattcacttaaaagat 436  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  33 aacctccaacggtttcgaattcacttaagagat 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 68; Significance: 6e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 523 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 268 - 79
Alignment:
Q  523 ttaggagtgcaaattgccataggagagcttcggaggattcgaaggacttaaccatacttctctc-aattttctaaaaaccaattctttattgtttttaat 621  Q
    |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  268 ttaggagtgcaaattatcataggagaaattcggaggattcgaatgtcttaaccatacttctctctaatattcttaaaaccaact-tttattgtttttaat 170  T
Q  622 cagtttatgttactaaatcaactcaactgcctagggcaccaatataaatttatacatcctttttaataatgaaattgctaagtagaagttaa 713  Q
      ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | ||  || || | | ||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||    
T  169 ttgtttatgtta-aaaaccaactcaactgcctagggcaaccattgaatttaacatatcctttttgataaagaaattgctaagttgtagttaa 79  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 354 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 363 - 319
Alignment:
Q  354 tagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcg 398  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  363 tagagatagatcattattagattatgatatagggattaacgttcg 319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 314
Target Start/End: Original strand, 7086 - 7127
Alignment:
Q  273 attgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaa 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  7086 attgatcttagaaattgaatgactactaaccctagcttttaa 7127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University