View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11530_low_1 (Length: 823)

Name: NF11530_low_1
Description: NF11530
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11530_low_1
NF11530_low_1
[»] chr2 (124 HSPs)
chr2 (1-669)||(45367641-45368310)
chr2 (4-668)||(11992125-11992788)
chr2 (4-668)||(41763060-41763731)
chr2 (4-668)||(3865672-3866337)
chr2 (4-668)||(8180380-8181045)
chr2 (41-668)||(3243670-3244293)
chr2 (4-668)||(4807192-4807860)
chr2 (126-668)||(41197244-41197792)
chr2 (4-665)||(451668-452298)
chr2 (221-668)||(38429700-38430149)
chr2 (4-400)||(2610128-2610523)
chr2 (190-659)||(23997402-23997858)
chr2 (211-668)||(36183257-36183716)
chr2 (201-668)||(12734502-12734965)
chr2 (4-455)||(30743223-30743674)
chr2 (4-389)||(24583904-24584288)
chr2 (330-668)||(38452703-38453046)
chr2 (335-668)||(18424395-18424727)
chr2 (106-663)||(6237775-6238334)
chr2 (393-668)||(25834671-25834943)
chr2 (4-249)||(38453058-38453301)
chr2 (393-668)||(2610578-2610853)
chr2 (46-400)||(13148953-13149308)
chr2 (693-807)||(45367504-45367619)
chr2 (410-668)||(24583648-24583907)
chr2 (445-668)||(7326177-7326400)
chr2 (289-479)||(16097192-16097388)
chr2 (474-668)||(28508749-28508943)
chr2 (460-646)||(39029638-39029824)
chr2 (43-174)||(37281746-37281878)
chr2 (46-199)||(17581112-17581262)
chr2 (399-483)||(43238296-43238379)
chr2 (565-668)||(30306194-30306297)
chr2 (586-668)||(3635340-3635422)
chr2 (325-668)||(38434871-38435217)
chr2 (330-472)||(4598775-4598921)
chr2 (393-473)||(43752159-43752239)
chr2 (326-473)||(9578915-9579062)
chr2 (553-668)||(35643098-35643213)
chr2 (574-668)||(227360-227454)
chr2 (294-472)||(23714474-23714651)
chr2 (294-472)||(24102146-24102323)
chr2 (291-439)||(19337096-19337245)
chr2 (556-668)||(31959674-31959786)
chr2 (574-669)||(19336909-19337004)
chr2 (556-668)||(45543090-45543201)
chr2 (574-665)||(9496037-9496128)
chr2 (59-199)||(14769943-14770090)
chr2 (53-199)||(33594757-33594904)
chr2 (327-470)||(42092441-42092584)
chr2 (326-517)||(9556537-9556729)
chr2 (556-659)||(9996652-9996755)
chr2 (588-667)||(39709219-39709298)
chr2 (301-472)||(7825254-7825429)
chr2 (327-480)||(9647814-9647965)
chr2 (357-511)||(11017268-11017422)
chr2 (575-668)||(12882062-12882155)
chr2 (612-668)||(12474944-12475000)
chr2 (4-78)||(12475031-12475103)
chr2 (398-480)||(12141539-12141621)
chr2 (62-199)||(12904624-12904762)
chr2 (355-472)||(40759049-40759169)
chr2 (390-467)||(6218954-6219031)
chr2 (615-668)||(17670680-17670733)
chr2 (564-668)||(4598579-4598683)
chr2 (556-668)||(13149485-13149597)
chr2 (607-659)||(19334178-19334230)
chr2 (612-668)||(38328387-38328443)
chr2 (393-440)||(227312-227359)
chr2 (393-480)||(11412711-11412798)
chr2 (557-668)||(12489819-12489930)
chr2 (601-668)||(12520079-12520146)
chr2 (581-668)||(43573147-43573234)
chr2 (557-668)||(44437738-44437849)
chr2 (305-471)||(18188683-18188848)
chr2 (586-668)||(18959094-18959176)
chr2 (619-668)||(522445-522494)
chr2 (371-455)||(18958872-18958959)
chr2 (586-647)||(36650625-36650686)
chr2 (328-472)||(44411639-44411781)
chr2 (403-473)||(3481144-3481211)
chr2 (600-668)||(9531617-9531685)
chr2 (604-668)||(15025695-15025759)
chr2 (556-668)||(41545558-41545670)
chr2 (416-472)||(41858744-41858800)
chr2 (306-378)||(45077649-45077721)
chr2 (589-669)||(45077915-45077995)
chr2 (52-106)||(876778-876833)
chr2 (590-665)||(3720435-3720510)
chr2 (612-659)||(19224990-19225037)
chr2 (371-470)||(41545372-41545474)
chr2 (401-472)||(44437934-44438005)
chr2 (393-471)||(12905084-12905162)
chr2 (369-472)||(13240958-13241063)
chr2 (590-668)||(33504411-33504489)
chr2 (586-668)||(35755262-35755344)
chr2 (395-473)||(38860165-38860243)
chr2 (395-469)||(41330121-41330195)
chr2 (52-152)||(7135220-7135321)
chr2 (43-181)||(28317383-28317517)
chr2 (403-455)||(12882270-12882322)
chr2 (600-668)||(13443925-13443993)
chr2 (601-669)||(19863432-19863500)
chr2 (601-669)||(19867764-19867832)
chr2 (601-669)||(19872665-19872733)
chr2 (556-668)||(37470150-37470262)
chr2 (565-648)||(6219127-6219210)
chr2 (357-464)||(7615251-7615358)
chr2 (3-108)||(13592930-13593031)
chr2 (565-640)||(30743691-30743766)
chr2 (586-645)||(36616871-36616930)
chr2 (393-472)||(37481830-37481909)
chr2 (433-471)||(907710-907748)
chr2 (586-668)||(8197558-8197640)
chr2 (586-668)||(8202318-8202400)
chr2 (586-668)||(19024361-19024443)
chr2 (614-668)||(25384680-25384734)
chr2 (611-668)||(887082-887139)
chr2 (55-199)||(6465370-6465515)
chr2 (91-199)||(7292673-7292782)
chr2 (403-472)||(13149331-13149400)
chr2 (615-668)||(17626284-17626337)
chr2 (586-655)||(21834737-21834806)
chr2 (607-656)||(23915722-23915771)
[»] chr3 (127 HSPs)
chr3 (4-668)||(25190979-25191642)
chr3 (62-668)||(28245093-28245702)
chr3 (4-668)||(51447734-51448391)
chr3 (176-668)||(5168599-5169097)
chr3 (158-668)||(52138553-52139065)
chr3 (172-668)||(53519353-53519845)
chr3 (4-400)||(38849694-38850089)
chr3 (325-669)||(21993-22338)
chr3 (240-661)||(54278855-54279278)
chr3 (5-481)||(27917173-27917648)
chr3 (7-367)||(47542032-47542390)
chr3 (314-668)||(47233613-47233969)
chr3 (393-650)||(35033136-35033393)
chr3 (265-584)||(33272124-33272450)
chr3 (53-473)||(26489964-26490385)
chr3 (226-669)||(43694787-43695226)
chr3 (327-668)||(54128300-54128644)
chr3 (285-543)||(45728025-45728290)
chr3 (436-668)||(48508268-48508500)
chr3 (4-464)||(29817105-29817565)
chr3 (393-534)||(38060421-38060562)
chr3 (136-471)||(3186500-3186836)
chr3 (50-388)||(30345175-30345506)
chr3 (268-473)||(49503766-49503978)
chr3 (393-669)||(38850110-38850387)
chr3 (82-224)||(54425369-54425511)
chr3 (4-157)||(19757668-19757820)
chr3 (337-480)||(36820166-36820309)
chr3 (553-668)||(52156101-52156216)
chr3 (327-516)||(19736918-19737110)
chr3 (4-124)||(52138428-52138547)
chr3 (332-668)||(19757826-19758151)
chr3 (339-471)||(48734349-48734481)
chr3 (43-185)||(48221421-48221564)
chr3 (410-650)||(48953454-48953697)
chr3 (565-668)||(53262303-53262406)
chr3 (288-473)||(344923-345110)
chr3 (565-668)||(12096722-12096825)
chr3 (4-157)||(19736766-19736914)
chr3 (553-668)||(38060864-38060979)
chr3 (556-658)||(49042089-49042192)
chr3 (574-668)||(311326-311420)
chr3 (419-650)||(39235154-39235384)
chr3 (393-668)||(45289108-45289385)
chr3 (396-473)||(50960845-50960922)
chr3 (330-668)||(19676098-19676447)
chr3 (369-628)||(54425022-54425289)
chr3 (4-115)||(9258483-9258589)
chr3 (302-472)||(50249278-50249456)
chr3 (578-668)||(2133629-2133719)
chr3 (300-471)||(2340928-2341101)
chr3 (352-668)||(39600698-39601016)
chr3 (263-389)||(48953694-48953819)
chr3 (289-543)||(52678990-52679246)
chr3 (574-667)||(29601063-29601156)
chr3 (612-668)||(7895897-7895953)
chr3 (53-176)||(30724311-30724435)
chr3 (393-472)||(3987037-3987116)
chr3 (300-399)||(45236751-45236850)
chr3 (581-668)||(47555349-47555436)
chr3 (607-665)||(40273225-40273283)
chr3 (607-668)||(31566178-31566239)
chr3 (556-668)||(15296060-15296172)
chr3 (346-424)||(33307087-33307165)
chr3 (369-534)||(38430807-38430979)
chr3 (390-468)||(54365194-54365271)
chr3 (393-626)||(30294180-30294416)
chr3 (607-668)||(31454242-31454303)
chr3 (398-659)||(42510042-42510301)
chr3 (298-466)||(23534787-23534958)
chr3 (586-662)||(36304149-36304225)
chr3 (404-480)||(41842716-41842792)
chr3 (614-669)||(7278675-7278730)
chr3 (381-471)||(31454441-31454531)
chr3 (338-425)||(37227863-37227950)
chr3 (586-668)||(40106637-40106719)
chr3 (574-668)||(40116355-40116449)
chr3 (264-378)||(43308425-43308539)
chr3 (607-668)||(48532161-48532223)
chr3 (558-668)||(49503585-49503695)
chr3 (600-650)||(54365010-54365060)
chr3 (612-661)||(33271934-33271983)
chr3 (586-667)||(39208791-39208872)
chr3 (398-471)||(44134044-44134117)
chr3 (327-480)||(46140356-46140509)
chr3 (612-669)||(46367403-46367460)
chr3 (393-472)||(21200540-21200617)
chr3 (343-454)||(31337757-31337868)
chr3 (564-668)||(48734164-48734268)
chr3 (393-472)||(11581434-11581513)
chr3 (553-668)||(17022689-17022804)
chr3 (383-472)||(31453151-31453242)
chr3 (336-411)||(38054613-38054688)
chr3 (617-668)||(41529975-41530026)
chr3 (610-668)||(24778626-24778684)
chr3 (414-471)||(29600910-29600968)
chr3 (602-668)||(37351606-37351672)
chr3 (586-668)||(40991614-40991696)
chr3 (52-121)||(46145799-46145869)
chr3 (328-472)||(49841534-49841688)
chr3 (575-668)||(19737156-19737248)
chr3 (56-178)||(44395080-44395200)
chr3 (607-664)||(46148232-46148289)
chr3 (327-400)||(46568038-46568111)
chr3 (587-668)||(48712092-48712173)
chr3 (600-668)||(24541349-24541417)
chr3 (608-668)||(27893294-27893354)
chr3 (578-646)||(41842562-41842630)
chr3 (601-669)||(45486865-45486933)
chr3 (620-668)||(45834617-45834665)
chr3 (556-668)||(50960654-50960766)
chr3 (590-669)||(32170592-32170671)
chr3 (56-162)||(32490249-32490356)
chr3 (565-628)||(54422900-54422963)
chr3 (52-101)||(1470683-1470733)
chr3 (56-185)||(15750888-15751018)
chr3 (610-668)||(20208205-20208263)
chr3 (618-668)||(35481143-35481193)
chr3 (395-473)||(39535652-39535730)
chr3 (603-669)||(40122614-40122680)
chr3 (166-308)||(40674492-40674634)
chr3 (586-656)||(49841799-49841869)
chr3 (411-472)||(4472553-4472614)
chr3 (393-470)||(34719287-34719364)
chr3 (343-464)||(34812636-34812757)
chr3 (576-621)||(38431021-38431066)
chr3 (618-659)||(49888402-49888443)
[»] chr8 (134 HSPs)
chr8 (25-668)||(42854021-42854665)
chr8 (4-668)||(36565258-36565923)
chr8 (4-668)||(36544752-36545414)
chr8 (53-669)||(18124825-18125437)
chr8 (151-637)||(39946603-39947091)
chr8 (4-413)||(12492116-12492524)
chr8 (12-400)||(15215558-15215944)
chr8 (197-668)||(36394965-36395443)
chr8 (12-476)||(8879649-8880108)
chr8 (130-669)||(37077490-37078015)
chr8 (176-668)||(2796326-2796818)
chr8 (216-543)||(18752018-18752344)
chr8 (306-669)||(40813223-40813590)
chr8 (4-264)||(4032917-4033176)
chr8 (371-668)||(11523740-11524040)
chr8 (405-668)||(12491155-12491418)
chr8 (380-659)||(8932679-8932959)
chr8 (118-417)||(25299950-25300251)
chr8 (118-417)||(25288613-25288916)
chr8 (352-665)||(21121105-21121407)
chr8 (325-668)||(45419159-45419500)
chr8 (477-668)||(42469744-42469935)
chr8 (45-494)||(6510619-6511059)
chr8 (43-213)||(13984672-13984842)
chr8 (43-400)||(29735454-29735802)
chr8 (58-466)||(30113416-30113827)
chr8 (118-260)||(25439249-25439391)
chr8 (423-668)||(26904924-26905168)
chr8 (46-199)||(28300596-28300747)
chr8 (551-668)||(14742099-14742213)
chr8 (337-473)||(32043522-32043660)
chr8 (55-191)||(19293776-19293913)
chr8 (354-650)||(43904700-43905000)
chr8 (504-668)||(2027631-2027795)
chr8 (264-469)||(13171865-13172072)
chr8 (43-181)||(41444809-41444949)
chr8 (461-668)||(12025847-12026045)
chr8 (565-668)||(15215429-15215532)
chr8 (553-668)||(25473420-25473535)
chr8 (93-207)||(35601686-35601799)
chr8 (574-668)||(44529396-44529490)
chr8 (43-199)||(33830721-33830875)
chr8 (52-199)||(38667205-38667351)
chr8 (339-473)||(44681251-44681387)
chr8 (374-485)||(12796900-12797011)
chr8 (4-190)||(18849624-18849797)
chr8 (43-199)||(25985179-25985334)
chr8 (330-480)||(30748384-30748534)
chr8 (328-473)||(10080119-10080264)
chr8 (576-668)||(44047549-44047641)
chr8 (50-212)||(13589084-13589247)
chr8 (328-455)||(42493536-42493663)
chr8 (574-668)||(490506-490600)
chr8 (294-445)||(13986383-13986536)
chr8 (346-436)||(25985462-25985552)
chr8 (556-668)||(29520802-29520914)
chr8 (357-480)||(9695583-9695708)
chr8 (566-656)||(25300262-25300352)
chr8 (607-665)||(36042402-36042460)
chr8 (356-478)||(7046285-7046409)
chr8 (555-668)||(45041333-45041445)
chr8 (393-480)||(2776434-2776522)
chr8 (294-471)||(45512709-45512889)
chr8 (336-472)||(2518605-2518742)
chr8 (328-424)||(29520583-29520681)
chr8 (279-473)||(36143243-36143435)
chr8 (264-350)||(9905223-9905309)
chr8 (58-135)||(45332039-45332117)
chr8 (556-645)||(30559846-30559935)
chr8 (166-229)||(10824546-10824609)
chr8 (266-426)||(39760683-39760845)
chr8 (108-186)||(6986525-6986603)
chr8 (566-656)||(25288927-25289017)
chr8 (354-436)||(33666748-33666829)
chr8 (586-668)||(35914618-35914700)
chr8 (586-668)||(39967516-39967598)
chr8 (390-472)||(41971991-41972072)
chr8 (586-668)||(43733390-43733471)
chr8 (607-668)||(30689939-30690000)
chr8 (556-668)||(35643625-35643735)
chr8 (403-464)||(41444547-41444608)
chr8 (327-424)||(16351312-16351411)
chr8 (612-668)||(32569727-32569783)
chr8 (600-656)||(36143538-36143594)
chr8 (613-668)||(1928604-1928659)
chr8 (557-668)||(7531661-7531772)
chr8 (613-668)||(10668514-10668569)
chr8 (571-650)||(10824224-10824303)
chr8 (335-417)||(25439397-25439477)
chr8 (578-665)||(30812836-30812923)
chr8 (556-669)||(8879462-8879573)
chr8 (406-472)||(18474173-18474239)
chr8 (586-668)||(23492217-23492299)
chr8 (403-473)||(25985812-25985881)
chr8 (395-473)||(29700268-29700346)
chr8 (556-650)||(30456329-30456423)
chr8 (414-472)||(35643814-35643872)
chr8 (586-663)||(7615613-7615690)
chr8 (325-454)||(16252855-16252984)
chr8 (343-473)||(16705700-16705832)
chr8 (612-669)||(32276894-32276951)
chr8 (556-665)||(32931114-32931222)
chr8 (93-190)||(35601501-35601598)
chr8 (324-393)||(37256011-37256080)
chr8 (53-101)||(43732230-43732279)
chr8 (156-197)||(43732355-43732396)
chr8 (393-473)||(13589476-13589556)
chr8 (301-470)||(16917080-16917251)
chr8 (612-668)||(26055630-26055686)
chr8 (575-647)||(31715992-31716064)
chr8 (556-668)||(39953281-39953393)
chr8 (353-480)||(78988-79120)
chr8 (574-657)||(2216458-2216540)
chr8 (410-473)||(29645044-29645107)
chr8 (395-466)||(34196064-34196135)
chr8 (327-467)||(39953482-39953624)
chr8 (357-436)||(5908594-5908675)
chr8 (556-650)||(14459048-14459142)
chr8 (574-668)||(16917354-16917447)
chr8 (610-668)||(18473989-18474047)
chr8 (586-660)||(28299984-28300058)
chr8 (326-396)||(30783331-30783401)
chr8 (556-630)||(33827812-33827886)
chr8 (335-401)||(36069573-36069639)
chr8 (410-472)||(43732563-43732625)
chr8 (555-668)||(3464188-3464299)
chr8 (133-186)||(13172147-13172200)
chr8 (278-319)||(17491994-17492035)
chr8 (613-650)||(24558693-24558730)
chr8 (612-669)||(27556318-27556375)
chr8 (575-668)||(36069774-36069867)
chr8 (586-659)||(38391919-38391992)
chr8 (556-668)||(41444356-41444469)
chr8 (612-665)||(44699675-44699728)
[»] chr5 (120 HSPs)
chr5 (4-668)||(3301449-3302109)
chr5 (4-668)||(1274865-1275529)
chr5 (4-668)||(12492401-12493069)
chr5 (4-668)||(28976876-28977539)
chr5 (43-668)||(2075490-2076119)
chr5 (4-668)||(1287596-1288271)
chr5 (4-662)||(24178124-24178769)
chr5 (4-668)||(10638897-10639567)
chr5 (188-668)||(16347397-16347877)
chr5 (4-410)||(20318591-20318989)
chr5 (4-285)||(3394311-3394593)
chr5 (151-648)||(34272768-34273258)
chr5 (370-668)||(38684932-38685232)
chr5 (335-668)||(4496312-4496649)
chr5 (406-668)||(20456776-20457038)
chr5 (353-668)||(14665658-14665977)
chr5 (4-211)||(16347879-16348084)
chr5 (133-454)||(27622-27944)
chr5 (50-387)||(36200426-36200764)
chr5 (336-668)||(26884706-26885040)
chr5 (500-668)||(13561403-13561571)
chr5 (461-668)||(2915513-2915719)
chr5 (500-668)||(14911269-14911437)
chr5 (4-186)||(27302451-27302629)
chr5 (336-480)||(15168721-15168869)
chr5 (352-481)||(31636124-31636253)
chr5 (322-462)||(32516475-32516615)
chr5 (52-183)||(43558318-43558450)
chr5 (553-668)||(29816532-29816647)
chr5 (393-473)||(14749297-14749377)
chr5 (553-668)||(16913899-16914015)
chr5 (443-668)||(38501435-38501660)
chr5 (565-668)||(39040918-39041021)
chr5 (43-140)||(17341748-17341846)
chr5 (327-541)||(36215422-36215636)
chr5 (560-669)||(2393034-2393143)
chr5 (52-446)||(3096828-3097216)
chr5 (327-463)||(11002645-11002781)
chr5 (381-473)||(33667194-33667286)
chr5 (576-668)||(5558314-5558406)
chr5 (354-469)||(418201-418318)
chr5 (586-668)||(30213758-30213840)
chr5 (104-182)||(43423578-43423656)
chr5 (343-472)||(6888931-6889062)
chr5 (328-470)||(21952274-21952424)
chr5 (343-480)||(4026540-4026678)
chr5 (329-472)||(10082952-10083096)
chr5 (586-668)||(32442142-32442224)
chr5 (574-667)||(418052-418145)
chr5 (404-473)||(28676596-28676665)
chr5 (393-473)||(79503-79583)
chr5 (92-199)||(20077305-20077413)
chr5 (556-668)||(30588600-30588712)
chr5 (336-436)||(219702-219804)
chr5 (285-400)||(5305496-5305611)
chr5 (410-476)||(1525651-1525717)
chr5 (395-473)||(2712936-2713014)
chr5 (393-455)||(14667753-14667815)
chr5 (403-480)||(18351112-18351190)
chr5 (336-471)||(31906592-31906729)
chr5 (556-668)||(2090566-2090678)
chr5 (600-668)||(7640524-7640592)
chr5 (264-396)||(7678340-7678471)
chr5 (556-668)||(9235200-9235311)
chr5 (588-668)||(43557850-43557930)
chr5 (556-647)||(28035-28126)
chr5 (335-538)||(17340583-17340789)
chr5 (59-199)||(38578992-38579130)
chr5 (614-668)||(408511-408565)
chr5 (586-668)||(14667954-14668036)
chr5 (393-471)||(15489706-15489784)
chr5 (299-373)||(27998317-27998391)
chr5 (566-668)||(31220546-31220647)
chr5 (607-668)||(3442888-3442949)
chr5 (556-668)||(11675682-11675795)
chr5 (586-650)||(18350937-18351001)
chr5 (327-399)||(28186956-28187028)
chr5 (556-648)||(28276391-28276483)
chr5 (328-400)||(34039960-34040032)
chr5 (4-78)||(27530-27602)
chr5 (52-134)||(6368478-6368561)
chr5 (294-373)||(16454600-16454679)
chr5 (52-138)||(21915532-21915619)
chr5 (43-113)||(37124207-37124278)
chr5 (613-668)||(42272687-42272742)
chr5 (406-481)||(43475243-43475318)
chr5 (336-398)||(9235000-9235062)
chr5 (594-668)||(18855798-18855872)
chr5 (129-191)||(28676253-28676314)
chr5 (335-417)||(34194766-34194848)
chr5 (559-668)||(37065632-37065742)
chr5 (395-472)||(6859373-6859450)
chr5 (589-638)||(14749493-14749542)
chr5 (292-365)||(21093663-21093736)
chr5 (3-106)||(23979831-23979930)
chr5 (571-628)||(23980112-23980169)
chr5 (53-113)||(25937719-25937780)
chr5 (623-668)||(39322096-39322141)
chr5 (393-482)||(43558030-43558119)
chr5 (586-658)||(20367076-20367148)
chr5 (612-668)||(28411885-28411941)
chr5 (330-454)||(33006587-33006711)
chr5 (407-471)||(37065533-37065597)
chr5 (612-668)||(38132545-38132601)
chr5 (416-472)||(42199299-42199355)
chr5 (613-668)||(2713146-2713201)
chr5 (556-647)||(6889146-6889237)
chr5 (590-665)||(7359281-7359355)
chr5 (586-669)||(7678661-7678743)
chr5 (589-668)||(15252761-15252840)
chr5 (617-668)||(27386554-27386605)
chr5 (612-667)||(27998650-27998705)
chr5 (575-650)||(35615455-35615530)
chr5 (405-471)||(7359474-7359539)
chr5 (574-668)||(15588407-15588501)
chr5 (325-395)||(27553760-27553830)
chr5 (586-652)||(41808105-41808171)
chr5 (395-478)||(41833789-41833874)
chr5 (301-362)||(5848401-5848462)
chr5 (329-366)||(43558135-43558172)
[»] chr4 (164 HSPs)
chr4 (4-668)||(27450197-27450855)
chr4 (4-668)||(31959831-31960496)
chr4 (4-668)||(435829-436494)
chr4 (4-656)||(33226809-33227462)
chr4 (4-668)||(1777034-1777697)
chr4 (4-668)||(48174110-48174775)
chr4 (4-668)||(23906314-23906983)
chr4 (4-668)||(56374890-56375555)
chr4 (4-668)||(53707394-53708059)
chr4 (4-668)||(48622560-48623209)
chr4 (60-659)||(50286625-50287217)
chr4 (130-668)||(43433643-43434189)
chr4 (4-668)||(47265212-47265886)
chr4 (115-648)||(46582862-46583396)
chr4 (7-667)||(16002532-16003190)
chr4 (215-668)||(52569532-52569987)
chr4 (231-668)||(4440682-4441118)
chr4 (274-668)||(33190865-33191261)
chr4 (61-668)||(1211409-1212017)
chr4 (288-668)||(27983083-27983458)
chr4 (273-668)||(39100553-39100947)
chr4 (4-361)||(39708057-39708414)
chr4 (336-668)||(37797783-37798116)
chr4 (118-621)||(41009414-41009922)
chr4 (300-668)||(28236080-28236447)
chr4 (327-668)||(37773468-37773810)
chr4 (393-668)||(26037522-26037797)
chr4 (422-659)||(32479057-32479294)
chr4 (261-668)||(1793316-1793727)
chr4 (384-668)||(39708412-39708698)
chr4 (273-447)||(12494618-12494794)
chr4 (252-471)||(31458875-31459098)
chr4 (395-669)||(20192025-20192298)
chr4 (339-669)||(51421666-51421996)
chr4 (142-425)||(35690042-35690326)
chr4 (255-668)||(45204857-45205280)
chr4 (314-543)||(20601788-20602019)
chr4 (427-668)||(8286455-8286704)
chr4 (330-638)||(20591353-20591657)
chr4 (52-453)||(10775654-10776055)
chr4 (553-668)||(6957748-6957863)
chr4 (500-668)||(21236955-21237123)
chr4 (93-471)||(55578722-55579100)
chr4 (53-481)||(7092424-7092847)
chr4 (43-199)||(17666526-17666680)
chr4 (551-668)||(21528436-21528553)
chr4 (553-668)||(12494813-12494928)
chr4 (355-472)||(51252674-51252791)
chr4 (55-191)||(54787741-54787878)
chr4 (557-668)||(51811296-51811406)
chr4 (59-182)||(1629084-1629208)
chr4 (327-472)||(54470129-54470276)
chr4 (94-258)||(54914618-54914781)
chr4 (327-470)||(56224987-56225133)
chr4 (553-668)||(4548172-4548287)
chr4 (574-667)||(53518342-53518434)
chr4 (580-668)||(19969358-19969446)
chr4 (337-473)||(25257793-25257929)
chr4 (327-471)||(33709841-33709992)
chr4 (335-480)||(44047553-44047700)
chr4 (325-472)||(50662309-50662457)
chr4 (553-668)||(7947087-7947202)
chr4 (330-473)||(17900405-17900550)
chr4 (327-462)||(49987350-49987487)
chr4 (574-668)||(55007917-55008011)
chr4 (237-366)||(11389552-11389681)
chr4 (575-668)||(19154880-19154973)
chr4 (52-276)||(39754782-39755007)
chr4 (393-473)||(35555859-35555939)
chr4 (335-480)||(41192764-41192913)
chr4 (45-199)||(17667817-17667969)
chr4 (52-138)||(30807244-30807331)
chr4 (503-635)||(50679604-50679736)
chr4 (344-473)||(10208977-10209104)
chr4 (610-668)||(49939751-49939809)
chr4 (607-668)||(44360290-44360351)
chr4 (325-397)||(20105761-20105833)
chr4 (556-668)||(28550472-28550584)
chr4 (556-668)||(31961283-31961395)
chr4 (335-472)||(38570960-38571098)
chr4 (78-190)||(52280695-52280807)
chr4 (393-472)||(42639233-42639312)
chr4 (55-148)||(42037510-42037604)
chr4 (327-424)||(43070029-43070124)
chr4 (328-469)||(45423542-45423681)
chr4 (600-657)||(883388-883445)
chr4 (575-668)||(35690443-35690536)
chr4 (126-191)||(45185477-45185542)
chr4 (336-473)||(50471459-50471596)
chr4 (612-668)||(19061952-19062008)
chr4 (54-185)||(20917630-20917762)
chr4 (327-472)||(44360006-44360155)
chr4 (81-212)||(3273098-3273229)
chr4 (393-472)||(28497480-28497558)
chr4 (556-659)||(31043225-31043328)
chr4 (285-425)||(34233291-34233435)
chr4 (586-668)||(2589255-2589337)
chr4 (327-393)||(18966475-18966541)
chr4 (410-472)||(26356626-26356688)
chr4 (294-473)||(29398708-29398888)
chr4 (586-668)||(31339707-31339789)
chr4 (327-425)||(31403276-31403380)
chr4 (285-378)||(40933205-40933298)
chr4 (600-668)||(6958255-6958323)
chr4 (265-333)||(26037836-26037904)
chr4 (556-668)||(31897445-31897557)
chr4 (609-665)||(32633426-32633482)
chr4 (576-668)||(34208286-34208378)
chr4 (393-469)||(36557246-36557321)
chr4 (413-473)||(42285912-42285972)
chr4 (325-472)||(45175928-45176075)
chr4 (576-668)||(56225241-56225333)
chr4 (581-668)||(20601669-20601756)
chr4 (616-667)||(32613643-32613694)
chr4 (397-472)||(46372018-46372093)
chr4 (621-668)||(50238632-50238679)
chr4 (621-668)||(50238718-50238765)
chr4 (43-101)||(55768963-55769022)
chr4 (43-101)||(55833219-55833278)
chr4 (586-668)||(25575007-25575089)
chr4 (326-400)||(25967554-25967628)
chr4 (586-668)||(29209192-29209274)
chr4 (393-471)||(30621418-30621496)
chr4 (43-120)||(30853053-30853131)
chr4 (299-373)||(30853310-30853384)
chr4 (55-140)||(41427488-41427574)
chr4 (255-473)||(934648-934867)
chr4 (329-394)||(2588905-2588970)
chr4 (607-668)||(13262416-13262477)
chr4 (583-668)||(22873616-22873701)
chr4 (322-473)||(25755234-25755387)
chr4 (555-668)||(31459146-31459259)
chr4 (300-409)||(44667520-44667629)
chr4 (300-409)||(44686845-44686954)
chr4 (381-472)||(46715585-46715673)
chr4 (586-667)||(47372834-47372915)
chr4 (362-454)||(290026-290118)
chr4 (604-648)||(3979121-3979165)
chr4 (608-668)||(7066516-7066575)
chr4 (556-664)||(28351712-28351820)
chr4 (588-668)||(37042681-37042761)
chr4 (301-401)||(45185303-45185403)
chr4 (417-473)||(47611741-47611797)
chr4 (393-469)||(55768717-55768793)
chr4 (393-469)||(55832973-55833049)
chr4 (633-668)||(8598913-8598948)
chr4 (81-199)||(8917815-8917938)
chr4 (600-655)||(12443292-12443347)
chr4 (557-668)||(26024867-26024978)
chr4 (586-641)||(41729494-41729549)
chr4 (382-473)||(1427496-1427589)
chr4 (403-469)||(2588991-2589056)
chr4 (612-666)||(8284348-8284402)
chr4 (610-668)||(8598958-8599016)
chr4 (618-668)||(15661889-15661939)
chr4 (437-483)||(20821209-20821255)
chr4 (359-425)||(28467238-28467304)
chr4 (335-373)||(51841505-51841543)
chr4 (591-668)||(25427879-25427956)
chr4 (393-473)||(31897640-31897718)
chr4 (612-669)||(40018205-40018262)
chr4 (403-480)||(49738809-49738886)
chr4 (278-367)||(49739114-49739203)
chr4 (607-668)||(50869897-50869958)
[»] chr6 (75 HSPs)
chr6 (4-668)||(5258165-5258832)
chr6 (4-645)||(5631417-5632064)
chr6 (4-668)||(9706376-9707035)
chr6 (4-543)||(10100001-10100539)
chr6 (4-669)||(20427653-20428318)
chr6 (151-668)||(607905-608426)
chr6 (240-668)||(30031091-30031521)
chr6 (157-669)||(14030558-14031061)
chr6 (273-660)||(35043466-35043855)
chr6 (226-668)||(28085197-28085641)
chr6 (327-664)||(32755841-32756182)
chr6 (63-534)||(2689313-2689771)
chr6 (351-650)||(21351872-21352171)
chr6 (4-413)||(33495807-33496194)
chr6 (128-425)||(6056032-6056329)
chr6 (380-668)||(12890559-12890840)
chr6 (71-472)||(26291444-26291848)
chr6 (325-517)||(9593874-9594074)
chr6 (264-543)||(28026969-28027248)
chr6 (414-668)||(30679417-30679661)
chr6 (695-805)||(432441-432550)
chr6 (468-646)||(5080905-5081083)
chr6 (566-668)||(3206476-3206578)
chr6 (149-320)||(30679218-30679389)
chr6 (2-199)||(27790754-27790950)
chr6 (142-419)||(2065018-2065302)
chr6 (326-436)||(5080776-5080888)
chr6 (553-668)||(34143782-34143897)
chr6 (553-668)||(34156398-34156513)
chr6 (556-668)||(5095987-5096099)
chr6 (576-668)||(31819004-31819096)
chr6 (330-473)||(33083983-33084128)
chr6 (405-642)||(33496963-33497198)
chr6 (574-668)||(34934847-34934941)
chr6 (607-668)||(30789091-30789152)
chr6 (452-580)||(7133795-7133923)
chr6 (452-580)||(7136718-7136846)
chr6 (554-668)||(10098913-10099025)
chr6 (411-480)||(24665818-24665887)
chr6 (335-472)||(9568590-9568731)
chr6 (43-113)||(3632653-3632724)
chr6 (564-668)||(5897618-5897722)
chr6 (556-659)||(31818684-31818787)
chr6 (586-668)||(34522-34604)
chr6 (612-668)||(1615240-1615296)
chr6 (352-466)||(8364523-8364635)
chr6 (390-473)||(14389380-14389462)
chr6 (575-650)||(24665983-24666058)
chr6 (612-670)||(586059-586117)
chr6 (556-650)||(6055806-6055900)
chr6 (591-668)||(4245889-4245966)
chr6 (608-668)||(12119659-12119720)
chr6 (327-400)||(33998291-33998364)
chr6 (279-455)||(21870303-21870473)
chr6 (575-646)||(1747984-1748055)
chr6 (348-440)||(5095816-5095910)
chr6 (613-668)||(21886314-21886369)
chr6 (4-74)||(30670488-30670556)
chr6 (327-401)||(7150604-7150678)
chr6 (604-650)||(10453264-10453310)
chr6 (84-181)||(6641916-6642013)
chr6 (389-469)||(7513607-7513687)
chr6 (339-473)||(10617444-10617574)
chr6 (404-471)||(2079341-2079408)
chr6 (565-668)||(7492551-7492654)
chr6 (588-667)||(9568884-9568962)
chr6 (301-445)||(12134141-12134287)
chr6 (618-669)||(32068635-32068686)
chr6 (623-669)||(579638-579684)
chr6 (280-358)||(2079208-2079286)
chr6 (335-466)||(6641628-6641761)
chr6 (303-365)||(7513305-7513367)
chr6 (607-665)||(8364760-8364818)
chr6 (614-668)||(18130831-18130885)
chr6 (556-668)||(9593727-9593837)
[»] chr7 (139 HSPs)
chr7 (4-664)||(38606606-38607253)
chr7 (118-665)||(43281389-43281936)
chr7 (4-668)||(33349823-33350488)
chr7 (4-668)||(11593559-11594225)
chr7 (4-668)||(36651594-36652257)
chr7 (4-668)||(46355873-46356533)
chr7 (4-667)||(49028867-49029540)
chr7 (92-668)||(35906218-35906796)
chr7 (4-603)||(31004824-31005423)
chr7 (4-668)||(39906389-39907061)
chr7 (155-668)||(34869170-34869685)
chr7 (4-445)||(32630207-32630636)
chr7 (189-668)||(12841292-12841773)
chr7 (117-543)||(33072666-33073092)
chr7 (296-668)||(45836499-45836871)
chr7 (273-668)||(37617812-37618210)
chr7 (4-400)||(36869576-36869971)
chr7 (217-632)||(13859061-13859476)
chr7 (370-668)||(29650349-29650649)
chr7 (4-279)||(37616516-37616790)
chr7 (335-668)||(44855191-44855524)
chr7 (145-484)||(7272780-7273120)
chr7 (168-543)||(23404181-23404557)
chr7 (370-668)||(6374833-6375133)
chr7 (328-647)||(35559031-35559353)
chr7 (394-668)||(2885739-2886013)
chr7 (314-668)||(43491217-43491573)
chr7 (404-668)||(31682619-31682883)
chr7 (4-248)||(48918988-48919231)
chr7 (406-668)||(22349623-22349885)
chr7 (442-668)||(32631615-32631829)
chr7 (402-668)||(36869254-36869527)
chr7 (142-469)||(7189442-7189777)
chr7 (413-669)||(15682184-15682440)
chr7 (4-168)||(24177714-24177877)
chr7 (151-472)||(25579290-25579612)
chr7 (294-468)||(36514424-36514598)
chr7 (237-472)||(47848506-47848743)
chr7 (336-621)||(36136695-36136982)
chr7 (381-485)||(46014381-46014486)
chr7 (556-668)||(40979945-40980057)
chr7 (461-668)||(24598205-24598411)
chr7 (565-668)||(48919274-48919377)
chr7 (262-668)||(28627950-28628355)
chr7 (299-472)||(43282299-43282477)
chr7 (52-198)||(24550178-24550320)
chr7 (340-481)||(8492437-8492580)
chr7 (565-668)||(27648942-27649045)
chr7 (553-668)||(38900107-38900221)
chr7 (505-668)||(7273202-7273365)
chr7 (326-480)||(19262638-19262792)
chr7 (327-471)||(5335844-5335988)
chr7 (553-665)||(31681040-31681152)
chr7 (299-480)||(42187365-42187547)
chr7 (575-666)||(34035173-34035264)
chr7 (590-668)||(28208345-28208423)
chr7 (393-471)||(27021906-27021984)
chr7 (330-473)||(48736111-48736256)
chr7 (575-668)||(9210721-9210814)
chr7 (579-668)||(33073105-33073194)
chr7 (555-668)||(36101794-36101907)
chr7 (554-650)||(21078068-21078164)
chr7 (53-186)||(21517826-21517959)
chr7 (606-668)||(31869119-31869181)
chr7 (394-480)||(40169640-40169726)
chr7 (612-669)||(24777170-24777227)
chr7 (325-471)||(39811877-39812025)
chr7 (52-135)||(43793592-43793676)
chr7 (335-418)||(24598409-24598498)
chr7 (330-400)||(25731640-25731709)
chr7 (327-473)||(14593683-14593835)
chr7 (551-668)||(34745895-34746012)
chr7 (327-473)||(36101977-36102125)
chr7 (575-668)||(42969870-42969963)
chr7 (392-469)||(45558351-45558428)
chr7 (556-668)||(14057631-14057743)
chr7 (556-668)||(14367659-14367771)
chr7 (609-669)||(19119440-19119500)
chr7 (336-400)||(27021993-27022057)
chr7 (421-658)||(38135240-38135476)
chr7 (406-477)||(12966025-12966096)
chr7 (369-464)||(27893769-27893864)
chr7 (335-471)||(28020894-28021032)
chr7 (327-473)||(30200175-30200319)
chr7 (590-665)||(30814145-30814220)
chr7 (589-668)||(34926539-34926618)
chr7 (404-466)||(26742115-26742177)
chr7 (398-468)||(38920789-38920859)
chr7 (586-668)||(45601659-45601741)
chr7 (557-642)||(35922407-35922492)
chr7 (325-406)||(40008698-40008779)
chr7 (556-668)||(42187594-42187706)
chr7 (556-668)||(1011200-1011311)
chr7 (336-400)||(1523747-1523811)
chr7 (556-648)||(36239833-36239925)
chr7 (612-668)||(48515484-48515540)
chr7 (59-199)||(18637233-18637371)
chr7 (59-199)||(18650668-18650806)
chr7 (95-186)||(23087603-23087694)
chr7 (590-669)||(24177643-24177721)
chr7 (584-659)||(26741920-26741995)
chr7 (570-645)||(31859042-31859117)
chr7 (557-668)||(33103080-33103191)
chr7 (564-659)||(40415168-40415263)
chr7 (581-668)||(47852265-47852352)
chr7 (287-357)||(21517656-21517726)
chr7 (612-650)||(44951364-44951402)
chr7 (327-473)||(16013206-16013358)
chr7 (59-181)||(18608199-18608319)
chr7 (389-470)||(30632954-30633035)
chr7 (403-472)||(35713695-35713764)
chr7 (67-138)||(5843105-5843177)
chr7 (559-659)||(7220912-7221012)
chr7 (264-320)||(15681216-15681272)
chr7 (404-472)||(18605359-18605427)
chr7 (59-138)||(18626559-18626639)
chr7 (404-472)||(18637563-18637631)
chr7 (404-472)||(18650997-18651065)
chr7 (612-668)||(40138965-40139021)
chr7 (335-471)||(40139133-40139268)
chr7 (621-665)||(40630652-40630696)
chr7 (368-473)||(41948479-41948586)
chr7 (586-657)||(1569199-1569270)
chr7 (409-472)||(7220750-7220813)
chr7 (393-472)||(9797917-9797995)
chr7 (629-668)||(31005431-31005470)
chr7 (140-211)||(33139006-33139077)
chr7 (586-668)||(33732017-33732097)
chr7 (556-659)||(40391849-40391952)
chr7 (362-473)||(40830183-40830293)
chr7 (607-646)||(45558534-45558573)
chr7 (600-650)||(26332908-26332958)
chr7 (618-668)||(28708596-28708646)
chr7 (455-493)||(33139206-33139244)
chr7 (586-668)||(34341412-34341494)
chr7 (574-648)||(37976406-37976480)
chr7 (392-462)||(47796359-47796429)
chr7 (607-668)||(4604751-4604812)
chr7 (556-648)||(44401164-44401254)
[»] chr1 (160 HSPs)
chr1 (4-665)||(32082776-32083427)
chr1 (4-668)||(1210345-1211010)
chr1 (4-668)||(8671520-8672183)
chr1 (4-668)||(49347410-49348076)
chr1 (4-668)||(51601658-51602321)
chr1 (4-668)||(51440782-51441446)
chr1 (86-668)||(30202147-30202731)
chr1 (4-668)||(43240396-43241063)
chr1 (160-659)||(8391525-8392028)
chr1 (134-668)||(9592463-9592999)
chr1 (205-668)||(696069-696535)
chr1 (137-668)||(22089826-22090361)
chr1 (199-668)||(15085728-15086187)
chr1 (267-668)||(34792366-34792768)
chr1 (292-665)||(4001475-4001848)
chr1 (4-668)||(37462893-37463544)
chr1 (60-440)||(19936175-19936551)
chr1 (285-642)||(32230997-32231356)
chr1 (4-482)||(34827307-34827784)
chr1 (393-668)||(4029112-4029387)
chr1 (251-668)||(38807688-38808106)
chr1 (421-668)||(25979248-25979495)
chr1 (45-250)||(27445537-27445743)
chr1 (284-668)||(18469099-18469483)
chr1 (500-665)||(37311775-37311940)
chr1 (43-197)||(32066761-32066913)
chr1 (327-482)||(9509240-9509397)
chr1 (240-668)||(39140349-39140780)
chr1 (115-420)||(46226549-46226853)
chr1 (58-401)||(51234267-51234611)
chr1 (164-647)||(9599432-9599917)
chr1 (336-543)||(27847947-27848155)
chr1 (53-194)||(7921574-7921716)
chr1 (466-668)||(39318193-39318393)
chr1 (52-199)||(28528227-28528375)
chr1 (43-186)||(35828894-35829038)
chr1 (519-668)||(52921196-52921345)
chr1 (243-473)||(1661264-1661500)
chr1 (335-472)||(43423647-43423788)
chr1 (52-177)||(6640772-6640898)
chr1 (237-472)||(40419471-40419708)
chr1 (56-189)||(52739965-52740098)
chr1 (393-473)||(2544589-2544669)
chr1 (510-650)||(4415455-4415596)
chr1 (567-668)||(46423233-46423331)
chr1 (567-668)||(4707238-4707338)
chr1 (343-467)||(14226047-14226171)
chr1 (348-453)||(52561843-52561950)
chr1 (404-668)||(32404543-32404807)
chr1 (433-668)||(52561606-52561841)
chr1 (43-186)||(12807587-12807732)
chr1 (330-472)||(18793201-18793345)
chr1 (575-668)||(41560401-41560494)
chr1 (564-668)||(10200323-10200427)
chr1 (280-473)||(26016312-26016507)
chr1 (612-668)||(28533676-28533732)
chr1 (553-668)||(32079194-32079307)
chr1 (574-669)||(43375614-43375709)
chr1 (575-668)||(24020284-24020377)
chr1 (403-472)||(48431619-48431688)
chr1 (43-187)||(52421067-52421210)
chr1 (556-665)||(52532636-52532745)
chr1 (612-668)||(29577461-29577517)
chr1 (617-668)||(3777277-3777328)
chr1 (327-471)||(4379927-4380081)
chr1 (390-473)||(13827929-13828012)
chr1 (330-473)||(16822234-16822376)
chr1 (593-668)||(28090711-28090786)
chr1 (586-668)||(6025788-6025870)
chr1 (553-667)||(28511819-28511933)
chr1 (586-668)||(40568427-40568509)
chr1 (395-472)||(52073675-52073753)
chr1 (92-229)||(21275588-21275725)
chr1 (595-668)||(21769728-21769801)
chr1 (53-105)||(40419328-40419381)
chr1 (607-668)||(44941793-44941854)
chr1 (44-112)||(46226887-46226956)
chr1 (556-668)||(7762454-7762566)
chr1 (600-668)||(29808053-29808121)
chr1 (393-473)||(35828762-35828842)
chr1 (393-473)||(36340015-36340095)
chr1 (612-668)||(44751693-44751749)
chr1 (325-642)||(52831968-52832284)
chr1 (613-668)||(38877360-38877415)
chr1 (393-480)||(40416361-40416448)
chr1 (52-177)||(3877495-3877621)
chr1 (586-668)||(6084158-6084240)
chr1 (586-668)||(8796392-8796474)
chr1 (574-668)||(27847817-27847911)
chr1 (369-472)||(36624080-36624184)
chr1 (566-659)||(14557731-14557824)
chr1 (335-468)||(17815405-17815537)
chr1 (555-668)||(19936612-19936725)
chr1 (556-668)||(29128936-29129049)
chr1 (556-668)||(3818873-3818985)
chr1 (612-668)||(5113952-5114008)
chr1 (406-482)||(5338727-5338803)
chr1 (50-137)||(16142399-16142487)
chr1 (576-668)||(19908052-19908144)
chr1 (397-469)||(37263325-37263397)
chr1 (612-668)||(42337765-42337821)
chr1 (80-183)||(11331568-11331666)
chr1 (80-183)||(11489589-11489687)
chr1 (602-669)||(30445304-30445371)
chr1 (586-669)||(45510849-45510932)
chr1 (46-108)||(52641033-52641093)
chr1 (556-642)||(11331247-11331333)
chr1 (556-642)||(11489268-11489354)
chr1 (401-471)||(13827784-13827854)
chr1 (556-646)||(16142019-16142109)
chr1 (325-391)||(22167643-22167709)
chr1 (586-668)||(25715343-25715425)
chr1 (586-668)||(34444539-34444621)
chr1 (330-400)||(52442791-52442861)
chr1 (586-659)||(2544776-2544849)
chr1 (330-399)||(16142172-16142241)
chr1 (612-665)||(38869091-38869144)
chr1 (115-192)||(52640920-52640997)
chr1 (612-668)||(4590549-4590605)
chr1 (586-668)||(8342901-8342980)
chr1 (607-659)||(28528559-28528611)
chr1 (417-473)||(34074366-34074421)
chr1 (558-626)||(44905415-44905483)
chr1 (393-469)||(51812515-51812591)
chr1 (393-472)||(3819069-3819148)
chr1 (335-398)||(4590813-4590876)
chr1 (588-659)||(12930337-12930408)
chr1 (609-668)||(13578919-13578978)
chr1 (574-659)||(15438822-15438904)
chr1 (46-104)||(16273415-16273471)
chr1 (405-472)||(27637846-27637913)
chr1 (429-464)||(31274578-31274613)
chr1 (555-610)||(36623959-36624014)
chr1 (336-412)||(41611103-41611181)
chr1 (414-469)||(44905548-44905603)
chr1 (574-645)||(52900682-52900753)
chr1 (411-469)||(7921843-7921901)
chr1 (403-473)||(8343070-8343140)
chr1 (606-668)||(15437145-15437207)
chr1 (394-472)||(16943166-16943243)
chr1 (607-665)||(17269009-17269067)
chr1 (622-668)||(26299287-26299333)
chr1 (600-650)||(27072522-27072572)
chr1 (395-517)||(39422211-39422332)
chr1 (586-644)||(39776936-39776994)
chr1 (586-664)||(40416554-40416632)
chr1 (330-400)||(40920824-40920894)
chr1 (623-665)||(41165502-41165544)
chr1 (177-271)||(52831830-52831924)
chr1 (612-657)||(109021-109066)
chr1 (628-665)||(4318865-4318902)
chr1 (404-473)||(10272260-10272329)
chr1 (553-645)||(16272861-16272953)
chr1 (391-472)||(23791857-23791938)
chr1 (607-668)||(26113456-26113517)
chr1 (612-665)||(27704159-27704212)
chr1 (612-669)||(34375048-34375105)
chr1 (343-481)||(39894722-39894860)
chr1 (600-665)||(50846759-50846824)
chr1 (607-668)||(51584948-51585009)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (4-668)||(31068-31733)
scaffold0018 (325-473)||(44080-44233)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (41-668)||(82356-82983)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (5-471)||(11810-12279)
scaffold0113 (445-668)||(11566-11787)
[»] scaffold0570 (2 HSPs)
scaffold0570 (5-363)||(2594-2951)
scaffold0570 (362-668)||(965-1271)
[»] scaffold0045 (2 HSPs)
scaffold0045 (92-667)||(86627-87204)
scaffold0045 (4-96)||(88514-88605)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (272-668)||(4297-4687)
[»] scaffold0157 (2 HSPs)
scaffold0157 (273-447)||(25683-25859)
scaffold0157 (553-668)||(25549-25664)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (512-668)||(16687-16843)
[»] scaffold0171 (3 HSPs)
scaffold0171 (48-124)||(5834-5911)
scaffold0171 (384-516)||(7422-7554)
scaffold0171 (556-669)||(7593-7706)
[»] scaffold1318 (1 HSPs)
scaffold1318 (553-668)||(481-596)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (473-668)||(4706-4901)
[»] scaffold1493 (1 HSPs)
scaffold1493 (118-231)||(41-156)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (556-669)||(14736-14849)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (612-668)||(28906-28962)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (586-668)||(58243-58325)
[»] scaffold0606 (1 HSPs)
scaffold0606 (52-182)||(9303-9434)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (407-471)||(11802-11866)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (609-650)||(163229-163270)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 537; Significance: 0; HSPs: 124)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 537; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 45368310 - 45367641
Alignment:
Q  1 ggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacccaagttacacggtttaaata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45368310 ggggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacccaaattacacggtttaaata 45368211  T
Q  101 tcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45368210 tcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttg 45368111  T
Q  201 tgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagcc 300  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45368110 tgcgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttttatcggacaacagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcgattaagagcc 45368011  T
Q  301 aacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagag 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45368010 aacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgctggatgaatggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagag 45367911  T
Q  401 tg-ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatat 499  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  45367910 tggggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataaccttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagggtag 45367811  T
Q  500 atcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatct 599  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||         ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  45367810 atcaaatggaggagagtctagttaaaagaggtagaggaagactcaagaaaaccattagagaaatcattagaaaggatttagaggtaaatgagttggatcc 45367711  T
Q  600 aaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataaa 669  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  45367710 aaatatgatttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtcgccgaccccacttagtgggataaa 45367641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 11992788 - 11992125
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11992788 gtatatggaatgtaacttcagtaaaaagagaagtg--ggtctaccttagaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatc 11992691  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11992690 ttgggtctatagtacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaatcatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtg 11992591  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  11992590 cgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctatcggacagcagtctgaccggcaatgttgtatggtacggagtgatgggcggttaagagtcaa 11992491  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtg 402  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11992490 cacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaatactagacatgataagattaggaatgacaccattagagagagtg 11992391  T
Q  403 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatc 502  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||    
T  11992390 agggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatatagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtggatc 11992291  T
Q  503 aaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaa 602  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||       ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||    
T  11992290 aaatggaggagagtcgggttaaaagaggtaaaggaagacctaagaaaaccattagggaaatcattagaaaggatttagaggtcaatgagttagatccaaa 11992191  T
Q  603 tatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||  |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||    
T  11992190 tatgatttttgatagaacattatggcgttatttgatccatgtagctgaccccacttagtggaataa 11992125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 41763731 - 41763060
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  41763731 gtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagaagtg--ggtctaccttggaggtgaaagttggagattatatcataccccaagttgcacgatttaaatatc 41763634  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaa--------tggagaagagtctcaggt 194  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||    
T  41763633 ttgggtccatagtacaaaatgtcggagaaatagaagcagatgtaaatcatcgtattcaagctgggtggttgaaaacttgaaatggagaagagcctcaggt 41763534  T
Q  195 gttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggtta 294  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||| ||||| | | || |||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  41763533 gttttgtgcgataagaaagtaccacttaagctaaaaggaaagttctatcgaagaacaatcagaccggcaatgttgtatggtacagagtgttgggcggtta 41763434  T
Q  295 agagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattag 394  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41763433 agaaccaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgatggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattag 41763334  T
Q  395 agagagtg-ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaa 493  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  41763333 agagagagtggggtaacacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgcagagagaagacctgtagatgccgttgtaagaa 41763234  T
Q  494 ggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagtt 593  Q
       || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||       ||||| ||||||  ||||||||  ||||| |||| ||| ||||    
T  41763233 aagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaaaaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaaaattta-aggtcaattagtt 41763135  T
Q  594 ggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  41763134 ggatccaaatatgttttttgatagaacacccgggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 41763060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Original strand, 3865672 - 3866337
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcata-cccaagttacacggtttaaatatc 102  Q
    ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||| |    
T  3865672 gtatatgaaatgtaacttcagcggaaggagaagtacg--tctaccttggaggtgaaagttggagatcatattgtatcccaagttacacggtttcaataac 3865769  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    |||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  3865770 ttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcaaatgtaagctatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcagatgttttgtg 3865869  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
     |||||||||  || ||||||| |||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  3865870 tgataagaaagtactacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacagtcagaccgacgttgttgtatggtacggagtgttggacggttaagagtcaa 3865969  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt--agagagag 400  Q
    || |||| | |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  3865970 catgagaatcaagtaagtgtagcagagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattggagagagag 3866069  T
Q  401 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatata 500  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||  || |    
T  3866070 tgggggtagcacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgtgcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtaga 3866169  T
Q  501 tcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatcta 600  Q
    ||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |    
T  3866170 tcaaatggaggagagacaaattaaaagaggtagaggaaaacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcca 3866269  T
Q  601 aatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||| | || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  3866270 aatttggtgtatgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataa 3866337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Original strand, 8180380 - 8181045
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatac-ccaagttacacggtttaaatatc 102  Q
    ||||||||||||||| ||||    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  8180380 gtatatggaatgtaatttcagtggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatactccaagttacacggtttaaatatt 8180477  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    |||||||| |  || ||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  8180478 ttgggtccttcttataaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaagagttttgtg 8180577  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||| ||||||||||  |  ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  8180578 cgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacatcagtcagaccagcgttgttgtatggtacggagtgttggacggttaagagtcaa 8180677  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt--agagagag 400  Q
    || |||| | |||||||| || | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  8180678 catgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 8180777  T
Q  401 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatata 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || |||||  || |    
T  8180778 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtggatgccgtggtaagaagagtaga 8180877  T
Q  501 tcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatcta 600  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||| || |       | |||||| |||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |    
T  8180878 tcaaatggaggagagtcaagttaaaagcggtagaggaagacataggaaaactattagataaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcca 8180977  T
Q  601 aatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||| | || | ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  8180978 aatttggtgtatgatagaacactatagtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 8181045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 41 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 3244293 - 3243670
Alignment:
Q  41 ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacccaagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagca 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||    
T  3244293 ggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatc----ccaagttacacggtttaaatatcttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagca 3244198  T
Q  141 gatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggtttt 240  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||| || ||| |    
T  3244197 gatgtaagccatcgtattcaagctgggtggtagaaatggagatgagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttatgttgaaaggaaagttct 3244098  T
Q  241 atcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgtt 340  Q
    |||||||||||||| ||||| |  ||||| | ||||||||||| ||| | |||||||| ||||| |||| | |||||||| || | ||||| | ||||||    
T  3244097 atcggacagcagtccgaccggcgttgttgaatggtacggagtgttggacagttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagataaggatgtt 3243998  T
Q  341 gcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 440  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  3243997 gcgttggatgagtagtaagactacacatgataggattatgaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtaaaaaagttgatggaaaatag 3243898  T
Q  441 tcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaa 540  Q
     ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |    
T  3243897 gcttagatggtttgggaatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagaatagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagaggaaga 3243798  T
Q  541 cctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatcc 640  Q
    |||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || | | || | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3243797 cctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaagtttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 3243698  T
Q  641 atgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||||    
T  3243697 aggtagccgaccccacttagtgggataa 3243670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Original strand, 4807192 - 4807860
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  4807192 gtatatggaatgtaacttcagtggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacagtttaaatatc 4807289  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    |||||||  |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4807290 ttgggtctttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagatgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 4807389  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    ||||||||||  |||| ||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||| |  || ||||| || ||||||||||| |||    
T  4807390 cgataagaaagtaccatttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccgacgttgttgtatgacacagagtgttgagcggttaagagtcaa 4807489  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt------agag 396  Q
    || |||| | |||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||      ||||    
T  4807490 catgagaattaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgaatggtaagaatagacatgataggattatgaatgacatcattagagagagag 4807589  T
Q  397 agagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagga 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| | ||| |||||||||||| |||||||| ||| || |||||      
T  4807590 agagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtag-aaataggcttagatagtttcggcatatagagagaagactcgtagatgtcgtggtaagaagag 4807688  T
Q  497 tatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttgga 596  Q
    || |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||       | ||||||||||  ||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  4807689 tagatcaaatgaaggagagtcaagttaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaagtatttagaggtcaatgagttgga 4807788  T
Q  597 tctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    || ||||   || |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  4807789 tccaaattcggtgtacgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 4807860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 126 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 41197792 - 41197244
Alignment:
Q  126 ggagaaatagaagcagatgtaaattatc---gtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccactta 222  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  41197792 ggagaaatagaagcatatgtgaatcatcatcgtattcaagttgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataaaaaagtaccactta 41197693  T
Q  223 agctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtat 322  Q
    ||||||||| || ||| ||||| ||| ||||||||||  |||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41197692 agctgaaaggaaagttctatcgaacaacagtcagaccagcaatgttgtatggtacaaagtgttgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtgt 41197593  T
Q  323 aacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagag--agagtgggggtagcacctatagta 420  Q
    | ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||    
T  41197592 agcggagatgaggatgttgcgctagatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagatagagtgagggtagcacctataata 41197493  T
Q  421 gaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctgg 520  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||| ||    
T  41197492 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagatccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcagg 41197393  T
Q  521 tt-aaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaa 619  Q
    || |||| |||||||  || ||||       ||||| ||||||  |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  41197392 ttaaaaaaaggtagagaaagacctaagaaaaccatttgagaaaccattataaaagatttagaggtcaacgagttggatcccaatatggtttttgatagaa 41197293  T
Q  620 cactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    || |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  41197292 cattatggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttgatgggataa 41197244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 4 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 452298 - 451668
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||   ||||||||||||||||      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  452298 gtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagta--ggtctaccttggaggt------tggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatc 452207  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    |||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  452206 ttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtg 452107  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  452106 cgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccgacgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaa 452007  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtg 402  Q
    || |||| | |||||||| || | |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||              ||||||||||    
T  452006 catgagaatcaagtaagtgtagcagagatgagtatgttgcgttagatgagtggtaagactagacatgataggatta-------------gagagagagtg 451920  T
Q  403 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatc 502  Q
    ||||||||||           ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||  || |||    
T  451919 ggggtagcac-----------aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaaaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatc 451831  T
Q  503 aaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaa 602  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  451830 aaatggaggagagtcaagttaaaaaaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgagttggatccaaa 451731  T
Q  603 tatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggga 665  Q
    | |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  451730 tttagtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggga 451668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 221 - 668
Target Start/End: Original strand, 38429700 - 38430149
Alignment:
Q  221 taagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagt 320  Q
    |||||| |||| || ||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  38429700 taagctaaaaggaaagttctatcagacagcagtcaaaccggcaatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagaaccaacacgagagtagagtaagt 38429799  T
Q  321 ataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt--agagagagtgggggtagcacctatag 418  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  38429800 gtagcggagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggcagcacctatag 38429899  T
Q  419 tagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtct 518  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||     
T  38429900 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtaaagagaagacccgtatatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtca 38429999  T
Q  519 ggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgataga 618  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||       ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  38430000 ggttaaaagaagtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgataga 38430099  T
Q  619 acactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  38430100 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataa 38430149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 4 - 400
Target Start/End: Original strand, 2610128 - 2610523
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2610128 gtatatgaaatgtaacttcagcagaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatc 2610225  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    |||||||| |  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  2610226 ttgggtccttcgtacaaaatgacagagaaatagaagcagatgtaaaccatcatattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttatg 2610325  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||| ||||||||| | |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  2610326 cgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacagtcagactggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaa 2610425  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagag 400  Q
    || |||| | |||||||| || | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2610426 catgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgctgcgttggatgagtggtaagactagacaggacaggattaggaatgacaccattagagagag 2610523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 190 - 659
Target Start/End: Original strand, 23997402 - 23997858
Alignment:
Q  190 caggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggc 289  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  23997402 caggtgttttgtgcgatgagaaaataccacttaagctgaaaggaaagttctatcggacaacagtaagaccgacaatgttgtatggtacgaagtgttgggc 23997501  T
Q  290 ggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacacc 389  Q
     |||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  23997502 agttaagagtcaacacgagagccaagtaagtgtaacggagatgaagatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatcggattaggaatgacacc 23997601  T
Q  390 attagag--agagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttg 487  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||   ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  23997602 attagagatagagtgggtgtagcaccta---tagaaaatttggtagaaaatagccttagatggttttgacatgtagaaagaagacccgtagatgtcgttg 23997698  T
Q  488 ttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaa 587  Q
    | |||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||            ||| |||  |||||||| ||||||||||| ||    
T  23997699 taagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtggaagaagaccta-----------aga-aaaccattagaaaagatttagaggtcaa 23997786  T
Q  588 tgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 659  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  23997787 tgagttggatccaaatatggtttttgataaaacactatggcgttatttgattcatgtatccgaccccactta 23997858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 211 - 668
Target Start/End: Original strand, 36183257 - 36183716
Alignment:
Q  211 aaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagag 310  Q
    |||||| ||||||| |||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||     
T  36183257 aaaaactacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacagtccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaa 36183356  T
Q  311 taaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt--agagagagtgggggta 408  Q
    | |||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||  ||||||||| ||||||    
T  36183357 tcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacacaattagagagagagtaggggta 36183456  T
Q  409 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatgg 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  || || ||||||    
T  36183457 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaataatcttagttggtttcggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagataaaatgg 36183556  T
Q  509 aggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagt 608  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| |  |    
T  36183557 aggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaagtcaatgagttggatccaaatttgat 36183656  T
Q  609 ttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
     | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  36183657 gtatgatagaacactatggtgccatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataa 36183716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 201 - 668
Target Start/End: Original strand, 12734502 - 12734965
Alignment:
Q  201 tgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagcc 300  Q
    ||||| ||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||| ||| |||||| |||  | |||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  12734502 tgcgacaagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcg-acaacagtcaaaccatcgatgttgtatggtacagagtgttgggcggtttagagcc 12734600  T
Q  301 aacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagag 400  Q
    |||| |||| | ||||     ||  |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  12734601 aacatgagaatcaagtg----tagtggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagactagacgggataggattagaaatgacaccattagagagag 12734696  T
Q  401 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatata 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||  || |    
T  12734697 tgggggtagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtaaagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtaga 12734796  T
Q  501 tcaaatggaggagagtctggttaaaaga-ggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatct 599  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | | ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||     
T  12734797 tcaaatggaggagagtcaggttaaaagagggtagagggagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc 12734896  T
Q  600 aaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  12734897 aaatatggtttatgatagaacactatggtgtaatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataa 12734965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 455
Target Start/End: Original strand, 30743223 - 30743674
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcata-cccaagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30743223 gtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagaaatt--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcataccatatcccaagttacacggtttaaatatc 30743320  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    || |||| ||| |||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  30743321 ttaggtcaatagtacaaaatgacggataaatagaagtagatataaatcatcgtattcaagctgagtgattgaaattgagaagagcctcatgtgttttgtg 30743420  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
     |||||||||  |||||||||| |||||| || |||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| | | |||| |||| ||||||    
T  30743421 tgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttttaccggatagcggtcagaccgacgatgttgtatggtacggagagttaggcgattaaaagccaa 30743520  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattag--agagag 400  Q
    ||||||| | |||||||| |   |||||||| |||||||||   |||||||| |||||||||||  |||||||||  ||||| |||| ||||  ||||||    
T  30743521 cacgagaatcaagtaagtgttgtggagatgaggatgttgcgcatgatgagtgctaagactagacgggataggattgggaatgtcaccgttaggaagagag 30743620  T
Q  401 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttgg 455  Q
    | |||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||    
T  30743621 t-ggggtagcacttatggtagaaaaattggtagaaattagaattagatggtttgg 30743674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 24584288 - 24583904
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  24584288 gtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagaattatg--tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcagaccgcaagttacacggtttaaatatc 24584191  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||   ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||  ||||||||||    
T  24584190 ttgggtccatagtacaaaatgatggagaaatataggcagatttaagccatcatattcaagctgggtggtggaaatggagaatagcctcgtgtgttttgtg 24584091  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||| | |  || || |  ||||||||| |||||||| |||||  | || |||||||||||||| |||    
T  24584090 cgaaaagaaaataccacttaagttgaaagaaaagttctgttagatagtatccagaccgacgatgttgtatggtacaaaatgttgggcggttaagagtcaa 24583991  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacacc 389  Q
    ||||||| | |||||||| || | ||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  24583990 cacgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaagatgttgtgcgggatgagtggtaagactaaacatgatatgattaagaatgacacc 24583904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 330 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 38453046 - 38452703
Alignment:
Q  330 atgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagag------tgggggtagcacctatagtagaa 423  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||      ||||||||||| |||||||||||    
T  38453046 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatcataggattaggaatgacaccattagagagagagagagtgggggtagcatctatagtagaa 38452947  T
Q  424 aagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggtta 523  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||| ||||  ||||    
T  38452946 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaa-gatagatcaaatggaggaaagtcaagtta 38452848  T
Q  524 aaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacact 623  Q
    ||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | || | ||||| ||||||    
T  38452847 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataaaacact 38452748  T
Q  624 atgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||  |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  38452747 atggtgtcattcgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 38452703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 335 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 18424727 - 18424395
Alignment:
Q  335 gatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtaga 434  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18424727 gatgttacgtcggatgagtggtaagactagatatgatatgattaagaatgataccattagagagagtgggtgtagcatctatagtagaaaagttggtaga 18424628  T
Q  435 aaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtaga 534  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||  || ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  18424627 aaataggcttagatggtttggacatgtagagagacgacccgtagatgccgacgtaagaagattagatcaattggatgagagtcaggttaaaagaggtaga 18424528  T
Q  535 tgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatt 634  Q
     ||| || |       | ||||||||||  |||| ||| ||||||||| | ||| |||| ||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  18424527 ggaagacataggaaaactattagagaaaccattataaaggatttagagatcaataagtttgatccgaatatggtttatgatagaacactatgacgtcatt 18424428  T
Q  635 tgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||| |||  |||||||| ||||||||    
T  18424427 tgatccatgta-ccgtccccacttagtgggataa 18424395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 106 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 6238334 - 6237775
Alignment:
Q  106 ggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcga 205  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||| || || |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  6238334 ggtccatagtacaaaatgtcggagaaataaaaacatatgtaaatcatcgtattcaagttggatggttgaaatggagaagagcctcatgtgttttgtgtga 6238235  T
Q  206 taagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacac 305  Q
    ||| |||| |||||||||| |||||  ||  || ||||||||| |||| |||| ||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  6238234 taa-aaaataccacttaagttgaaaagaaaattctatcggacaacagttagactgacgatgttgtatggtacggagtgttgggtggttaagagtcaacac 6238136  T
Q  306 gagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacacc-attagagagagtggg 404  Q
    |||| | || ||| |  | || |  ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||  ||||||||||     
T  6238135 gagaatcaaataattgcagcgaatgtgaggatgttgcgctggatgagcggtaagactagacatgatagaattaggaatgacaccaatgggagagagtgga 6238036  T
Q  405 ggtagcacct--atagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatc 502  Q
      ||||||||  | |  ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||| || |||||  || |||    
T  6238035 catagcacctaaaaaaaagataagttggtagaaaacatgcttagatggtttggacatgtagagagtagacccgtaaacgtcgtcgtaagaagagtagatc 6237936  T
Q  503 aaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaa 602  Q
    | ||||||||||| |  || ||||||||||||  || ||||       | |  ||| |||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||    
T  6237935 agatggaggagagacatgtcaaaagaggtagagtaagacctagaaaaactagaagataaaccattagaaatgatttagaggtcaatcagttggattcaaa 6237836  T
Q  603 tatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgg 663  Q
    |||||||| |||||||||||||||   | |||||||| || ||| ||| ||||||||||||    
T  6237835 tatagtttatgatagaacactatgggatgatttgatctatatagtcgaccccacttaatgg 6237775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 393 - 668
Target Start/End: Original strand, 25834671 - 25834943
Alignment:
Q  393 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttaga 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  25834671 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtggatgccgttgtaaga 25834770  T
Q  493 aggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagt 592  Q
    ||  || |||||||||||  ||||  |||||||||||||||| ||| ||||        | ||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  25834771 agagtagatcaaatggag--gagttaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaa-ctttaaagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 25834867  T
Q  593 tggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  25834868 tggatccaaatatggtttatgatagaacactgtggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 25834943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 38453301 - 38453058
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||| ||| |  ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  38453301 gtatatggaatgtaacatcagcggaaggagaagta---gtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacgatttaaatatc 38453205  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  38453204 ttgggtccttcatacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaagccatcatattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcatgtgttttgtg 38453105  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacag 249  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||    
T  38453104 cgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacag 38453058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 393 - 668
Target Start/End: Original strand, 2610578 - 2610853
Alignment:
Q  393 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttaga 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| || |||    
T  2610578 agagagagtgggggtagcacctatagtggaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgtcgtggtaaga 2610677  T
Q  493 aggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagt 592  Q
    ||  || |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  2610678 agagtagatcaaatggatgagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 2610777  T
Q  593 tggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||| |||| | || | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||| || |||||    
T  2610778 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgttatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgagataa 2610853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 46 - 400
Target Start/End: Original strand, 13148953 - 13149308
Alignment:
Q  46 accttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||     
T  13148953 accttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatctcaggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagtagata 13149052  T
Q  145 taaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcg 244  Q
     |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||  |  |||||||||  |||||| ||| | |||| ||  || ||| |    
T  13149053 caaatcatcgtattcaagttggatggttgaaatgaagaagagcttcaggtgtttcatatgataagaaagtaccactcaagttaaaaggaaaattatattg 13149152  T
Q  245 gacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgt 344  Q
    |||| ||  ||| |  || |||||||| ||||| |||||   || |||||||| ||||||||| | | ||| |||| |||| ||||||| | ||||| ||    
T  13149153 gacaacaaccaggctaacgatgttgtacggtacagagtgtcaggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagcaagtgtaacagagatgagggtgttgtgt 13149252  T
Q  345 tggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagag 400  Q
    ||||  ||||||||||||| |   |||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  13149253 tggacaagtggtaagactaaaagggataagattaggaatgacaccatttgagagag 13149308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 693 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 45367619 - 45367504
Alignment:
Q  693 atgcattcattcatcttcactctattttattttcaccacacacaaatacaaatattcaagta-aaaactcaattttgtcattcagaattttttcacagtt 791  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45367619 atgcattcattcatcttcactctattttattttcaccacacacaaatacaaatattcaagtaaaaaactcaattttgtcattcagaattttttcacagtt 45367520  T
Q  792 caatttagtctttttt 807  Q
    ||||||||||||||||    
T  45367519 caatttagtctttttt 45367504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 410 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 24583907 - 24583648
Alignment:
Q  410 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatgga 509  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||  || ||||||||||    
T  24583907 cacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcaaatgga 24583808  T
Q  510 ggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtt 609  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||| ||         | | ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |  ||||    
T  24583807 ggagagtcaagttaaaagagatagatgaagacaaaaaaaaactaatagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcaaatttgagtt 24583708  T
Q  610 tt-tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    || |||||| |||||||||||| |||| ||| |||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  24583707 ttgtgatagcacactatgacgtaatttaatcaatgttgccgaccccacttaatgagataa 24583648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 445 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 7326400 - 7326177
Alignment:
Q  445 agatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctn 544  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||  || |||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||| || |     
T  7326400 agatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacata 7326301  T
Q  545 nnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgt 644  Q
          | ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7326300 ggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgt 7326201  T
Q  645 agccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||| | |||||||| ||||||||    
T  7326200 agccaaccccacttagtgggataa 7326177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 289 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 16097388 - 16097192
Alignment:
Q  289 cggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacac 388  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||| || ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||   |||| |||||  ||||||||    
T  16097388 cggttaagagccaacatgagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcactggatgagtggtaagactagatgggatatgattagaaatgacac 16097289  T
Q  389 cattagagagagt------gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtaga 479  Q
    | |||||||||||      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16097288 cgttagagagagttagagtgggggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttggacatgtagagagaagacctgtaga 16097192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 474 - 668
Target Start/End: Original strand, 28508749 - 28508943
Alignment:
Q  474 cgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaat 573  Q
    |||||||||||| || | |||  || ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| ||||       | ||||||||||  ||||||||     
T  28508749 cgtagatgccgtggtaataagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagatgtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaag 28508848  T
Q  574 gatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  28508849 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 28508943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 460 - 646
Target Start/End: Original strand, 39029638 - 39029824
Alignment:
Q  460 gtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagag 559  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  || ||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| ||||        |||| |||    
T  39029638 gtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaattggaggaaagtcaggtaaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaacattcgag 39029737  T
Q  560 aaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtag 646  Q
    |||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  39029738 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtag 39029824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 43 - 174
Target Start/End: Original strand, 37281746 - 37281878
Alignment:
Q  43 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcag 141  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||| | |||||| || ||||||| ||||||||||||| ||    
T  37281746 tctaccttggaggtgaaagtttgagatcatgtcataccccaagttacacattttaaatatcttagctccatagtataaaatgaaggagaaatagaagtag 37281845  T
Q  142 atgtaaattatcgtattcaagctgggtggttga 174  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  37281846 atgtaaatcatcctattcaagttgggtggttga 37281878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 46 - 199
Target Start/End: Original strand, 17581112 - 17581262
Alignment:
Q  46 accttggaggtgaaagttggagatcatatcatacccaagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgt 145  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||| |||  ||||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  17581112 accttagaagtgaaagttagagatcatatcatac--aagttacacagtttaaat-tcttgggttcattgtacaaaatgacaaagaaataaaagcagatgt 17581208  T
Q  146 aaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtttt 199  Q
    ||||  || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17581209 aaatcctcatattcaagttggatggttcaaatggagaagagtctcaggtgtttt 17581262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 399 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 43238379 - 43238296
Alignment:
Q  399 agtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgcc 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  43238379 agtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaaagagaaga-ccgtagatgcc 43238296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 565 - 668
Target Start/End: Original strand, 30306194 - 30306297
Alignment:
Q  565 attagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggg 664  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  30306194 attagaaaggatttagaggtcattgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggg 30306293  T
Q  665 ataa 668  Q
    ||||    
T  30306294 ataa 30306297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 586 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 3635422 - 3635340
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  3635422 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 3635340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 325 - 668
Target Start/End: Original strand, 38434871 - 38435217
Alignment:
Q  325 cggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtaga 422  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| | |||||  ||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  38434871 cggagatgaggatgttgcattggatgcgtggtaaaactagacgagagaagattagaaatgacaacattagagagagaattggggtagcacctatagtaga 38434970  T
Q  423 aaagttggtagaaaatagtc-ttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggt 521  Q
    |||| |||| |||| ||| | || | |||||||| |||||| |||||||||  ||||||||  | || || ||  || |||| |||||||| |||| | |    
T  38434971 aaagatggtggaaactagactttgggtggtttgggcatgtaaagagaagacttgtagatgctttagtaaggagagtagatcatatggaggatagtcagat 38435070  T
Q  522 taaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaaca 621  Q
     |  ||||| ||| | | ||||       | |  ||||||| |||||  || ||| ||||| | |||| |||||||| |||| | |||| |||| |||||    
T  38435071 cactagaggcagaggtagacctagaaaaactacaagagaaactattaagaaagatctagagattaatgtgttggatcgaaatttggtttatgattgaaca 38435170  T
Q  622 ctatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
     |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  38435171 ttatggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagtggcataa 38435217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 330 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 4598921 - 4598775
Alignment:
Q  330 atgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtg----ggggtagcacctatagtagaaaa 425  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||| | ||||||  |||||||||||| |    ||||||||||||||||||| |||    
T  4598921 atgatgatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacgggatagaattcaaaatgacgacattagagagagagagttggggtagcacctatagtagtaaa 4598822  T
Q  426 gttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    | ||||||||| ||| ||| | |||||||||||| |||| |||||||    
T  4598821 gatggtagaaactagactttggtggtttggacatatagaaagaagac 4598775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 393 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 43752239 - 43752159
Alignment:
Q  393 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  43752239 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaaggtggtagaaaataggcttaggtgatttggacatgtagagagaagacc 43752159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 326 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 9579062 - 9578915
Alignment:
Q  326 ggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaa 425  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||| ||||| |||||||   ||||||||||| |||||  ||| |||||||| |||    
T  9579062 ggagataaagatgttgcgttggatgtgtggtaagaatagatatgatagaattaaaaatgacaatgttagagagagttggggtgacacatatagtagtaaa 9578963  T
Q  426 gttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    | || |  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9578962 gatgatgtaaaatagacttaggtggtttggacatgtagagagaagacc 9578915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 553 - 668
Target Start/End: Original strand, 35643098 - 35643213
Alignment:
Q  553 attagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatc 652  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |    
T  35643098 attagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacatcatttaatacatgtagccgacc 35643197  T
Q  653 ccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||| ||||||||    
T  35643198 ccacttagtgggataa 35643213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 574 - 668
Target Start/End: Original strand, 227360 - 227454
Alignment:
Q  574 gatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  227360 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 227454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 294 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 23714651 - 23714474
Alignment:
Q  294 aagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatta 393  Q
    |||| ||||||||| | |||| |||| ||| | ||||| |  |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||    
T  23714651 aagaaccaacacgaaaataaattaagcatagcagagattagaatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaaaataggattaaaaatgacgacatta 23714552  T
Q  394 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    || |||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||| ||||  | |||| | ||||||||||||||||    
T  23714551 gatagagt-tgggtagcacatatagtagaaaagatggtggaaactagacttatgtagtttaggcatgtagagagaagac 23714474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 294 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 24102323 - 24102146
Alignment:
Q  294 aagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatta 393  Q
    |||| ||||||||| | |||| |||| ||| | ||||| |  |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||    
T  24102323 aagaaccaacacgaaaataaattaagcatagcagagattagaatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaaaataggattaaaaatgacgacatta 24102224  T
Q  394 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    || |||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||| ||||  | |||| | ||||||||||||||||    
T  24102223 gatagagt-tgggtagcacatatagtagaaaagatggtggaaactagacttatgtagtttaggcatgtagagagaagac 24102146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 291 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 19337245 - 19337096
Alignment:
Q  291 gttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagact-agacaagataggattaagaatgacacc 389  Q
    |||||||  |||||||||| |||| ||||  ||  |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||  ||||| | |    
T  19337245 gttaagaatcaacacgagaataaaataagcgtagtggagatgaggatgttacgttggatgtgtggtaagacttaggcaggataggattataaatgagaac 19337146  T
Q  390 attagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaata 439  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  19337145 attagagagagttggggtagcacctatagtagtaaagatggtggaaaata 19337096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 556 - 668
Target Start/End: Original strand, 31959674 - 31959786
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccca 655  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||||| || ||||    
T  31959674 agagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcataatttgatccatgtagcagacccca 31959773  T
Q  656 cttaatgggataa 668  Q
    |||| | ||||||    
T  31959774 cttagtaggataa 31959786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 574 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 19337004 - 19336909
Alignment:
Q  574 gatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataaa 669  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  19337004 gatttagagattaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaatcccacttattgggataaa 19336909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 556 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 45543201 - 45543090
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccca 655  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||| |||||||||| |||| |||  ||||||| |||||||||| ||||    
T  45543201 agagaaactattagaaaagatttagaggt-aatgagttcgatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtactttgatctatgtagccgacccca 45543103  T
Q  656 cttaatgggataa 668  Q
    |||| ||||||||    
T  45543102 cttagtgggataa 45543090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 574 - 665
Target Start/End: Original strand, 9496037 - 9496128
Alignment:
Q  574 gatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggga 665  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  9496037 gatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtggga 9496128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 59 - 199
Target Start/End: Original strand, 14769943 - 14770090
Alignment:
Q  59 aagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaat-----tat 152  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||  |  |||||||  ||||| ||||||||     |||    
T  14769943 aagttggagatcatatcatagcataagttacacggtttaaatatcttagggccatagtacaaaacaacagagaaattcaagcatatgtaaatcattatat 14770042  T
Q  153 cgtattcaagct-gggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtttt 199  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14770043 catattcaagctggggtggttgaaatggagaagagtgtaaggtgtttt 14770090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 53 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 33594904 - 33594757
Alignment:
Q  53 aggtgaaagttggagatcatatcataccca-agttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaatta 151  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||   | |||||| ||||||||||||| |||  ||| ||||||| |  ||||||||||||| |||||||||  |    
T  33594904 aggtgaaagttggagttcatatcataccagcatttacacagtttaaatatcttaggtatatagtacaaaacgtcggagaaatagaaggagatgtaaaaca 33594805  T
Q  152 tcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtttt 199  Q
    ||  |||||| |||||||||||| |||||| || |||| |||||||||    
T  33594804 tcaaattcaaactgggtggttgagatggaggagtgtcttaggtgtttt 33594757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 470
Target Start/End: Original strand, 42092441 - 42092584
Alignment:
Q  327 gagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaag 426  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||  |||| |||||  |||||||   ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  42092441 gagatgatgatgttgcattggatgtgtagtaagactagacgggatatgattagaaatgacaatgttagagagagttggggtagcgcctatactagaaaag 42092540  T
Q  427 ttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaag 470  Q
     ||||||||| ||   |||| || | ||| ||||||||||||||    
T  42092541 atggtagaaactaagattaggtgatctgggcatgtagagagaag 42092584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 326 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 9556729 - 9556537
Alignment:
Q  326 ggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagag--agtgggggtagcacctatagtagaa 423  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||  ||||||| ||||||||||  ||| |||||| ||| ||||||||||    
T  9556729 ggagttgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagattagacgggatatgattagaaatgacaacattagagagaaagttggggtaacacttatagtagaa 9556630  T
Q  424 aagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtc 517  Q
    ||  |||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||  |||||| | || || ||||   ||||||| |||||||| ||||    
T  9556629 aa-atggtggaaaataggcttaggtggtttaggcatgtagagagaagacaagtagattctgtagtaagaaaagtatatcagatggaggatagtc 9556537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 556 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 9996755 - 9996652
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccca 655  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||| |||| ||||  ||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||    
T  9996755 agagaaaccattagaaaggatttagaggtcaacgagttggatccaaatatggtttatgattaaacactatggcataatttgatccatgtagccgacccca 9996656  T
Q  656 ctta 659  Q
    ||||    
T  9996655 ctta 9996652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 588 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 39709298 - 39709219
Alignment:
Q  588 tgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggata 667  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  39709298 tgagttggatcaaaatatggtttatgattgaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggata 39709219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 301 - 472
Target Start/End: Original strand, 7825254 - 7825429
Alignment:
Q  301 aacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagag 400  Q
    |||| |||| |||||||||  || | ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||  |||||||| |||||||||||    
T  7825254 aacatgagaataaagtaagcgtagcagagattaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagactggatatgattagaaatgacactattagagagag 7825353  T
Q  401 tg----ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
     |    || |||||||||||||| | |||  ||||  ||||||  ||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  7825354 agtgttggagtagcacctatagttgtaaatatggtgaaaaataagcttagttggtttgagcatgtagagagaagac 7825429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 327 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 9647965 - 9647814
Alignment:
Q  327 gagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaag 426  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||  |||| || ||||  | ||||| |||| || |||||||||||||| |    
T  9647965 gagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgtgataagattagaaatgtcaacatt--atagagttggggcagtacctatagtagaaatg 9647868  T
Q  427 ttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagat 480  Q
     |||| |||| |||  |||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  9647867 atggtggaaactagctttaggtggtttggacatgtaaaaagaagacctgtagat 9647814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 357 - 511
Target Start/End: Original strand, 11017268 - 11017422
Alignment:
Q  357 aagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttgga 456  Q
    |||||||||  ||||| ||||| |||||| |  |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| | || |||| | | ||||  ||||||||     
T  11017268 aagactagatgagataagattaggaatgaaaatattaaagagagttgaggtagcacctatagtagaaaagatcgtggaaactcggcttaagtggtttggg 11017367  T
Q  457 catgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggagg 511  Q
     |||| ||||||||||||||||||   || ||||||||| || ||||||||||||    
T  11017368 tatgtggagagaagacccgtagattttgtagttagaagggtagatcaaatggagg 11017422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 575 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 12882155 - 12882062
Alignment:
Q  575 atttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||    
T  12882155 atttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttgtgatagaacattttggcgtaatttgatccatgtagcctacctcacttagtgggataa 12882062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 612 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 12475000 - 12474944
Alignment:
Q  612 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  12475000 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 12474944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 12475103 - 12475031
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcata 78  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12475103 gtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagta--ggtctaccttagaggtgaaagttggagatcatatcata 12475031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 398 - 480
Target Start/End: Original strand, 12141539 - 12141621
Alignment:
Q  398 gagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagat 480  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||    
T  12141539 gagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaagaggcttaggtggtttgggcacgtagaaagaagacctgtagat 12141621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 199
Target Start/End: Original strand, 12904624 - 12904762
Alignment:
Q  62 ttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattca 160  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | | ||| ||| |||||||| |||||||| | | || |||||||||  || | |||||    
T  12904624 ttggagatcatatcatatcacaagttacacggtttaaatatatggtgtctatagtacaaaataatggagaagttggaggagatgtaaaccatagaattca 12904723  T
Q  161 agctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtttt 199  Q
    || | ||||||||||||  |  || ||||||||||||||    
T  12904724 agttaggtggttgaaataaacgagtgtctcaggtgtttt 12904762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 355 - 472
Target Start/End: Original strand, 40759049 - 40759169
Alignment:
Q  355 gtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagaga---gtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggt 451  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||||  |||| |||| |||  |||| ||||    
T  40759049 gtaagactagacaagataagattagaaatgacaacattagagagagaggttgggttagcacttatagtagaaaaaatggtggaaactagagttaggtggt 40759148  T
Q  452 ttggacatgtagagagaagac 472  Q
    |||  ||||||||||||||||    
T  40759149 ttgtgcatgtagagagaagac 40759169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 467
Target Start/End: Original strand, 6218954 - 6219031
Alignment:
Q  390 attagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagag 467  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| | || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  6218954 attagatagagttggggtagcacttatagtagaaaagatagtggataataggcttaggtggtttggacatgtagagag 6219031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 615 - 668
Target Start/End: Original strand, 17670680 - 17670733
Alignment:
Q  615 tagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17670680 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 17670733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 564 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 4598683 - 4598579
Alignment:
Q  564 tattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgg 663  Q
    |||||| || ||| ||||| |||||||||||||   | | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||    
T  4598683 tattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatagattttgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtaaccgattccacttagcgg 4598584  T
Q  664 gataa 668  Q
    |||||    
T  4598583 gataa 4598579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 556 - 668
Target Start/End: Original strand, 13149485 - 13149597
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccca 655  Q
    ||||||| |||||  || ||||||||||| ||||||| | ||| |||||| |||  |||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||| ||    
T  13149485 agagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtagaatccaaatatcgttgatgatagaacattatgacataatttgatccatatagccgatctca 13149584  T
Q  656 cttaatgggataa 668  Q
     |||||| |||||    
T  13149585 attaatgagataa 13149597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 607 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 19334230 - 19334178
Alignment:
Q  607 gtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 659  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  19334230 gtttttgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccgactccactta 19334178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 612 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 38328443 - 38328387
Alignment:
Q  612 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  38328443 tgatagaacactatggcttcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 38328387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 440
Target Start/End: Original strand, 227312 - 227359
Alignment:
Q  393 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 440  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  227312 agagagagtgggggtagcacctatggtagaaaagtttgtagaaaatag 227359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 480
Target Start/End: Original strand, 11412711 - 11412798
Alignment:
Q  393 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagat 480  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| | |||||| ||| |||||| |||| | ||||||    
T  11412711 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaatatggtggaaaataggcttaggttgtttgggcatttagagataagaactgtagat 11412798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 557 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 12489930 - 12489819
Alignment:
Q  557 gagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccac 656  Q
    |||||| |||||| || ||| ||||| |||||||||||||   | | || |||||||||| |||||| || |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  12489930 gagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatggtttttgatataacactttggcgtcgtttgattcatgtagccgaccccac 12489831  T
Q  657 ttaatgggataa 668  Q
    ||| ||||||||    
T  12489830 ttagtgggataa 12489819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 601 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 12520146 - 12520079
Alignment:
Q  601 aatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  12520146 aatatggtttatgataaaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 12520079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 581 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 43573234 - 43573147
Alignment:
Q  581 aggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  43573234 aggttaatgagttggatccaaatatgatttatgatcgaacgttatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 43573147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 557 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 44437849 - 44437738
Alignment:
Q  557 gagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccac 656  Q
    |||||| |||||  || ||| ||||| |||||||||||||   ||| || |||||||||||||||||||| |||  ||| || ||||||||||| |||||    
T  44437849 gagaaactattaagaaggatctagagataaatgagttggagaaaaacatggtttttgatagaacactatggcgttgtttaattcatgtagccgaccccac 44437750  T
Q  657 ttaatgggataa 668  Q
    ||| ||||||||    
T  44437749 ttagtgggataa 44437738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 471
Target Start/End: Original strand, 18188683 - 18188848
Alignment:
Q  305 cgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtggg 404  Q
    ||||| |||| ||||| ||||  |||||| ||||||| |||||||| ||| |||| ||||||  |||| ||| |  ||||||| |||| |||||||| ||    
T  18188683 cgagaataaattaagtgtaacaaagatgaggatgttgtgttggatgtgtg-taaggctagacgggatatgatcagaaatgacaacattggagagagttgg 18188781  T
Q  405 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaaga 471  Q
    |||||||||| |  |||||||| |||| |||  | | ||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  18188782 ggtagcacctcttctagaaaagatggtggaagctcgacttaggtggtttgggcatgtaaagagaaga 18188848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 668
Target Start/End: Original strand, 18959094 - 18959176
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||| |||||| || | |||||||||| |||| | | |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  18959094 aatgagttggatcaaaatatggtctatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataa 18959176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 619 - 668
Target Start/End: Original strand, 522445 - 522494
Alignment:
Q  619 acactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  522445 acactatggcgtcatttgatccatgtagcagatcacacttaatgggataa 522494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 371 - 455
Target Start/End: Original strand, 18958872 - 18958959
Alignment:
Q  371 taggattaagaatgacaccattagagag---agtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttgg 455  Q
    |||||||| |||| | | ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  18958872 taggattaggaataaaaacattagagagttcagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgg 18958959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 586 - 647
Target Start/End: Original strand, 36650625 - 36650686
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagc 647  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  36650625 aatgagttagatcaaaatatagtttatgatagaacactataacgtaatttgatccgtgtagc 36650686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 328 - 472
Target Start/End: Original strand, 44411639 - 44411781
Alignment:
Q  328 agatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagt 427  Q
    ||||||| || ||||||| |||| || |||||||||||  ||||| |||||  ||||||| ||||||||||  | |  |||||||||||||||| ||||     
T  44411639 agatgataatattgcgtttgatgtgttgtaagactagatgagatatgattacaaatgacaacattagagag--ttgaagtagcacctatagtaggaaaga 44411736  T
Q  428 tggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    |||| |||||||| |||   |||||| |||||||  |||||||||    
T  44411737 tggtggaaaataggcttccgtggttttgacatgtttagagaagac 44411781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 473
Target Start/End: Original strand, 3481144 - 3481211
Alignment:
Q  403 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    ||||||||||||||||||   ||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3481144 ggggtagcacctatagta---aagatggtggaaaacaggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacc 3481211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 600 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 9531685 - 9531617
Alignment:
Q  600 aaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||| |||| |||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  9531685 aaatatggtttatgatggaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 9531617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 604 - 668
Target Start/End: Original strand, 15025695 - 15025759
Alignment:
Q  604 atagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  15025695 atagtttttgatagaacactatggcatcgtttgattcatgtagccgatgcaacttagtgggataa 15025759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 556 - 668
Target Start/End: Original strand, 41545558 - 41545670
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccca 655  Q
    |||||||  |||| ||| ||| |||||||  |||||||| ||  |||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||  || ||||||||| ||    
T  41545558 agagaaaccattataaaagatgtagaggtccatgagttgaattcaaatatggtttatgatagaacactatgacttaatttgatttatttagccgatctca 41545657  T
Q  656 cttaatgggataa 668  Q
    ||||||| |||||    
T  41545658 cttaatgagataa 41545670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 416 - 472
Target Start/End: Original strand, 41858744 - 41858800
Alignment:
Q  416 tagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    ||||||||||| |||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41858744 tagtagaaaagatggtggaaactgggcttagatggtttggacatgtagagagaagac 41858800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 378
Target Start/End: Original strand, 45077649 - 45077721
Alignment:
Q  306 gagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggatta 378  Q
    |||| |||| |||| ||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  45077649 gagaataaaataagcatagctgagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagactagatagaatta 45077721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 589 - 669
Target Start/End: Original strand, 45077915 - 45077995
Alignment:
Q  589 gagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataaa 669  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| | | |||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||    
T  45077915 gagttggatcgaaatatagtttatgatagaacataatggcataatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgagataaa 45077995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 106
Target Start/End: Original strand, 876778 - 876833
Alignment:
Q  52 gaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  876778 gaggtgaaagttggagatcatatcctaccacaagttacacagtttaaatatgttgg 876833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 590 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 3720510 - 3720435
Alignment:
Q  590 agttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggga 665  Q
    ||||||||| ||| || |||| |||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  3720510 agttggatcgaaaaatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtggga 3720435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 612 - 659
Target Start/End: Original strand, 19224990 - 19225037
Alignment:
Q  612 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 659  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  19224990 tgatagaacactatgatgtcgtttgatccatgtagccgaccccactta 19225037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 371 - 470
Target Start/End: Original strand, 41545372 - 41545474
Alignment:
Q  371 taggattaagaatgacaccatta--gagagagtgggggtagcacctatagt-agaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagag 467  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||  |||| || |||||  |||||||| ||    
T  41545372 taggattaagaatgacaccattagggagagagcgagggtaacacctataataaaaaaagttggtagaaaatatgcttaaatagtttgagcatgtagaaag 41545471  T
Q  468 aag 470  Q
    |||    
T  41545472 aag 41545474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 401 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 44438005 - 44437934
Alignment:
Q  401 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  44438005 tgggggtaacccctatagtagaaaagatggtagaaactagacataggtggtttcggcatgtagagagaagac 44437934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 471
Target Start/End: Original strand, 12905084 - 12905162
Alignment:
Q  393 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaaga 471  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||  |||  |||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  12905084 agagagagttggggtagcacctatagcagaaaagattgtagaagctagaattaggtagtttgaacatgtagagagaaga 12905162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 369 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 13241063 - 13240958
Alignment:
Q  369 gataggattaagaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagaga 466  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||  | || ||||||  |||  |||||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  13241063 gataggattagaaatgacaacattagagagagaattggagtagcaagtatgttagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagaga 13240964  T
Q  467 gaagac 472  Q
    ||||||    
T  13240963 gaagac 13240958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 590 - 668
Target Start/End: Original strand, 33504411 - 33504489
Alignment:
Q  590 agttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||  |||||| || | |||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  33504411 agttggattgaaatatggtatatgatagaacattatggcgtaatttgatccatctagccgaccccacttagtgggataa 33504489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 35755344 - 35755262
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||| |||||||| |||||| |||| |||||||||| | || ||| |||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||    
T  35755344 aatgggttggatccaaatatggtttatgatagaacattgtgccgtaatttgatccatgcagccgaccctacttagtgggataa 35755262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 395 - 473
Target Start/End: Original strand, 38860165 - 38860243
Alignment:
Q  395 agagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||| | ||| |||| ||||||||    
T  38860165 agagagtgggggcagcacccatagtagaaaagattgtggaaaataggcttaggtggtttaggcatttagaaagaagacc 38860243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 395 - 469
Target Start/End: Original strand, 41330121 - 41330195
Alignment:
Q  395 agagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaa 469  Q
    ||||||| | |||| ||||| ||||||||||| || |  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41330121 agagagttgaggtaacacctttagtagaaaagatgatcaaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaa 41330195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 7135321 - 7135220
Alignment:
Q  52 gaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaatt 150  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||| ||| |||  ||||||||||| | |||||||  ||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  7135321 gaggtgaaatttagatatcatatcataccacaagttacacagttaaaaagtcttgggtccacagtacaaaacaataaagaaatagaagtagaagtaaatt 7135222  T
Q  151 at 152  Q
    ||    
T  7135221 at 7135220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 181
Target Start/End: Original strand, 28317383 - 28317517
Alignment:
Q  43 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacccaagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcaga 142  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    |||| |||||  |||| |||| |||| ||  || |||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  28317383 tctagcttagaggtgaaagttggagatcatatca----caaggtacacaatttatatattttggatctgtagtacaaaatgatggataaaaagaagtaga 28317478  T
Q  143 tgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggag 181  Q
    |||| |  || | || ||||||| |||||||||| ||||    
T  28317479 tgtataccattgaatccaagctgagtggttgaaacggag 28317517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 403 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 12882322 - 12882270
Alignment:
Q  403 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttgg 455  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12882322 ggggcagcacctatactagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgg 12882270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 600 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 13443993 - 13443925
Alignment:
Q  600 aaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||| |||| | |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  13443993 aaatatggtttattatagaacattatggcgtcatttgatcgatgtagccgaccccatttagtgggataa 13443925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 601 - 669
Target Start/End: Original strand, 19863432 - 19863500
Alignment:
Q  601 aatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataaa 669  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  19863432 aatatggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaa 19863500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 601 - 669
Target Start/End: Original strand, 19867764 - 19867832
Alignment:
Q  601 aatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataaa 669  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  19867764 aatatggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaa 19867832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 601 - 669
Target Start/End: Original strand, 19872665 - 19872733
Alignment:
Q  601 aatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataaa 669  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  19872665 aatatggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaa 19872733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 556 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 37470262 - 37470150
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccca 655  Q
    ||||||| |||||| |  ||| ||||| | ||||||||||||| |||||| |  | |||||||||| ||||  ||  |||||||||||||||  ||||||    
T  37470262 agagaaactattaggacagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggcatatgatagaacattatggtgtagtttgatccatgtagctaatccca 37470163  T
Q  656 cttaatgggataa 668  Q
    |||| ||||||||    
T  37470162 cttagtgggataa 37470150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 565 - 648
Target Start/End: Original strand, 6219127 - 6219210
Alignment:
Q  565 attagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagcc 648  Q
    ||||| || ||||||||| | | ||||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  6219127 attaggaaagatttagagattagtgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagcc 6219210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 357 - 464
Target Start/End: Original strand, 7615251 - 7615358
Alignment:
Q  357 aagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttgga 456  Q
    ||||||||||  ||||||| ||  ||||||  ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| |||  |||| | |||| ||    
T  7615251 aagactagacgggataggactagaaatgaccacattagagagacttggggtaacacctatagtagaaaagatggtgcaaactagggttaggttgtttaga 7615350  T
Q  457 catgtaga 464  Q
    ||||||||    
T  7615351 catgtaga 7615358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 13593031 - 13592930
Alignment:
Q  3 ggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacccaagttacacggtttaaatatc 102  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||  |||||   | || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||    
T  13593031 ggtatgtgtaatgtaacttcaacaaaagacgaagta--gttcaaacttagaggtgaaagttgaagatcatatcata--gaagttacacagtttagatatc 13592936  T
Q  103 ttgggt 108  Q
    ||||||    
T  13592935 ttgggt 13592930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 565 - 640
Target Start/End: Original strand, 30743691 - 30743766
Alignment:
Q  565 attagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatcc 640  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  ||| | |||||||| |||| | | |||||||||    
T  30743691 attagaaatgatttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttataatagaacaatatgtcataatttgatcc 30743766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 645
Target Start/End: Original strand, 36616871 - 36616930
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgta 645  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||| ||||    
T  36616871 aatgagttagatcaaaatatagtttatgatagaacactataatgtaatttgatccgtgta 36616930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 37481909 - 37481830
Alignment:
Q  393 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||| |||| |||  ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  37481909 agagagagttggggtagttcctatagtaaaaaagatggttgaacctaggcttaggtggtttgagcatgtagagagaagac 37481830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 433 - 471
Target Start/End: Original strand, 907710 - 907748
Alignment:
Q  433 gaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaaga 471  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  907710 gaaaatagccttagatggtttgggcatgtagagagaaga 907748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 586 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 8197640 - 8197558
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||  ||||||  | | |||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  8197640 aatgagttggatagaaatatgatatatgatagaatattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataa 8197558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 586 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 8202400 - 8202318
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||  ||||||  | | |||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  8202400 aatgagttggatagaaatatgatatatgatagaatattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataa 8202318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 586 - 668
Target Start/End: Original strand, 19024361 - 19024443
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||||||| |||||| | | |||||||||||  |||| |||| ||||||| || ||||||| |||||| | ||||||||    
T  19024361 aatgagttggatataaatacaatatttgatagaactttatggcgtcgtttgatctatatagccgaccccactcagtgggataa 19024443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 614 - 668
Target Start/End: Original strand, 25384680 - 25384734
Alignment:
Q  614 atagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||    
T  25384680 atagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccaacctcacttagtgggataa 25384734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 611 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 887139 - 887082
Alignment:
Q  611 ttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| || |||||||  ||||||||    
T  887139 ttgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttggtgggataa 887082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 199
Target Start/End: Original strand, 6465370 - 6465515
Alignment:
Q  55 gtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatc 153  Q
    |||||||||||||||||||| | | | ||||||||||  ||| ||||| ||||    ||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||| |||| |||    
T  6465370 gtgaaagttggagatcatattaaaacacaagttacacaattttaatattttggcattatactacaaaatgactgagaaattgaagcatatgcaaatcatc 6465469  T
Q  154 gtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtttt 199  Q
      |||||||   ||||| ||| |||||||||||||| || ||||||    
T  6465470 aaattcaagtcaggtggctgagatggagaagagtcttagctgtttt 6465515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 199
Target Start/End: Original strand, 7292673 - 7292782
Alignment:
Q  91 ggtttaaatatcttggg-tccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtct 189  Q
    ||||||||||||| ||| || ||| |||||| ||| || | |||||||| |||||||||  |||  || |||| ||||||||||||||| || || | ||    
T  7292673 ggtttaaatatctcggggtctatagtacaaactgacgggggaatagaaggagatgtaaaccatcaaatccaagttgggtggttgaaatgaaggagtgact 7292772  T
Q  190 caggtgtttt 199  Q
    ||||||||||    
T  7292773 caggtgtttt 7292782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 403 - 472
Target Start/End: Original strand, 13149331 - 13149400
Alignment:
Q  403 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    |||||||||||||||   |||||| || |||||||||| ||| | |||| ||| ||||||||||||||||    
T  13149331 ggggtagcacctataaacgaaaagatgatagaaaatagacttcggtggtctggccatgtagagagaagac 13149400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 615 - 668
Target Start/End: Original strand, 17626284 - 17626337
Alignment:
Q  615 tagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||  ||||||||    
T  17626284 tagaacactatggcgtcatttgttccatgtagccgaaccaactttgtgggataa 17626337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 655
Target Start/End: Original strand, 21834737 - 21834806
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccca 655  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||| |  |||| ||||||||| ||| ||||    
T  21834737 aatgagttggatctaaatttggtttatgatagaacaatatgacatattttggtccatgtagtcgacccca 21834806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 607 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 23915771 - 23915722
Alignment:
Q  607 gtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccac 656  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  23915771 gtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgcagccgaccccac 23915722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 402; Significance: 0; HSPs: 127)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Original strand, 25190979 - 25191642
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcata-cccaagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25190979 gtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagaagtg--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatagcccaagttacacggtttaaatatc 25191076  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25191077 ttgggtctatagtacaaaatgatggagaaatagaagcaaatgtaaatcatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 25191176  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| |||||| ||||| |||  ||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||    
T  25191177 cgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaggttctatcgaacaatagtcagaccggaaatgttgtatggtacagagtgttgggctgttaagagtcaa 25191276  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtg 402  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  25191277 cacgagagtaaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatatgattaagaatgacatcattagagagaatg 25191376  T
Q  403 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatc 502  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   | |||    
T  25191377 ggggtagcacctatagtagaaaaattggaagaaaatagacttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 25191476  T
Q  503 aaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaa 602  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| | ||        |||| ||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||    
T  25191477 aaatggaggagagcccggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaatcatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgaattagatcaaaa 25191576  T
Q  603 tatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  25191577 tatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgatcccacttagtgggataa 25191642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 668
Target Start/End: Original strand, 28245093 - 28245702
Alignment:
Q  62 ttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattca 160  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  28245093 ttggagatcatataataccccaagttacacggcttaaatatcttggatccttcgtacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattca 28245192  T
Q  161 agctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccg 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  28245193 agctgggtggttgaaatggagaagagtctcagttgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccg 28245292  T
Q  261 acaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaaga 360  Q
     |  ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||| | |||||||| || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28245293 gcgttgttgtacggtacggagtgttgggcggttaaaagtcaacatgagaattaagtaagtgtagcaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaga 28245392  T
Q  361 ctagacaagataggattaagaatgacaccatt--agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggaca 458  Q
    |||| |  |||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  28245393 ctagcctggataggattaggaatgacatcattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttgggca 28245492  T
Q  459 tgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattaga 558  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||       | ||||||    
T  28245493 tgtagagagaaaacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactattaga 28245592  T
Q  559 gaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccactt 658  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28245593 gaaacgattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtataatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccactt 28245692  T
Q  659 aatgggataa 668  Q
    | || |||||    
T  28245693 agtgagataa 28245702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 51448391 - 51447734
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51448391 gtatatgaaatgtaacttcagcggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatc 51448294  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    |||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  51448293 ttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagctatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcgggtgttttgtg 51448194  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  51448193 cgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttatatcggacagcagtccgaccgacgttgttgtatggtacggagtgttaggcggttaagagtcaa 51448094  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtg 402  Q
    || |||| | || ||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  51448093 catgagaatcaactaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagag 51447994  T
Q  403 -ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatat 501  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||  || ||    
T  51447993 tagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatagtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgtggtaagaagagtagat 51447894  T
Q  502 caaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaa 601  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||       ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  51447893 caaatggaggagagtcaagttaaaaga-------gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaa 51447801  T
Q  602 atatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    || | || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||| ||| ||||||||    
T  51447800 atttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtagccggccccatttagtgggataa 51447734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 176 - 668
Target Start/End: Original strand, 5168599 - 5169097
Alignment:
Q  176 atggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggt 275  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  || ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  5168599 atggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaaattctatcggacaacagtcagaccggcaatgttgtatggt 5168698  T
Q  276 acggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagatagga 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  5168699 acggagtgctgggcggttaagagccaacatgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgctggatgataggtaagactagacaggatagga 5168798  T
Q  376 ttaagaatgacaccattagag------agagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaa 469  Q
    ||| |||||||||||||||||      |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5168799 ttaggaatgacaccattagagagagagagagtgggggtagcacctatggtagaaaagttggtagaaaatacgcttagatggtttgaacatgtagagagaa 5168898  T
Q  470 gacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattag 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||       ||||||||||||  |||||    
T  5168899 gacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtctagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattagagaaaccattag 5168998  T
Q  570 aaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  5168999 aaaggatttataggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 5169097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 158 - 668
Target Start/End: Original strand, 52138553 - 52139065
Alignment:
Q  158 tcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcaga 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| ||    
T  52138553 tcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtcttgtgcgataagaaaataccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccga 52138652  T
Q  258 ccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggta 357  Q
    ||| |  ||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| | |||| | |||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52138653 ccggcgttgttgtatggtacgaagtgttgggcggttaagagtcaagatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggta 52138752  T
Q  358 agactagacaagataggattaagaatgacaccatt--agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttgg 455  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52138753 agactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgg 52138852  T
Q  456 acatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccatt 555  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | |||    
T  52138853 gcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagaatagattaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatt 52138952  T
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccca 655  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  52138953 agagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgttatttgatccatgtagccgacccca 52139052  T
Q  656 cttaatgggataa 668  Q
    |||| ||||||||    
T  52139053 cttagtgggataa 52139065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 172 - 668
Target Start/End: Original strand, 53519353 - 53519845
Alignment:
Q  172 tgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgta 271  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||| ||   | |||||||||||||||||| || |||||||||     
T  53519353 tgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtatcacttaagcttaaaggaaaaatctatcggacagcagtcagatcggcaatgttgtg 53519452  T
Q  272 aggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagat 371  Q
      |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  53519453 ttgtacggagtgttaagcggttaagagccaacacgagagtaaagttagtgtagcggaaatgaggatgttgcgttggatgagtggtaatactagacaggat 53519552  T
Q  372 aggattaagaatgacaccattag--agagagtgggggtagcacc------tatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtag 463  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |     
T  53519553 aggattaagaatgacaccattagacagagagtgggggtagcacctatatatatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgttttggacatgaat 53519652  T
Q  464 agagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaat 563  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||            ||| |||     
T  53519653 agagaagaaccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcatgttaaaagaggtagaggaagaccta-----------aga-aaac 53519740  T
Q  564 tattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgg 663  Q
     |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||     
T  53519741 cattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaataaggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtga 53519840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 4 - 400
Target Start/End: Original strand, 38849694 - 38850089
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatc 102  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  38849694 gtatatggaatgtaactacatcaaaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacctcaatttacacggtttaaatatc 38849791  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38849792 ttgggtccacagtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccattgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtg 38849891  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    |||||| |||  |||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||  |||| |||||||||||||| |||    
T  38849892 cgataacaaagtaccacttaagttgaaagaaattttttatcggacaacagtcacaccgacgatgttgtatggtacaaagtgttgggcggttaagagtcaa 38849991  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagag 400  Q
    ||||||| | |||||||| || | ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  38849992 cacgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagtagtaagactagacatgatatgattaggaatgacatcatgagagagag 38850089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 325 - 669
Target Start/End: Original strand, 21993 - 22338
Alignment:
Q  325 cggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtaga 422  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21993 cggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgtcaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtaga 22092  T
Q  423 aaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggtt 522  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || || ||||||||||||||| ||||    
T  22093 aaagttggtagaaa-taggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagattaaatggaggagagtcgggtt 22191  T
Q  523 aaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacac 622  Q
    |||||||||||| ||| || |       ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22192 aaaagaggtagaggaagacttaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacac 22291  T
Q  623 tatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataaa 669  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  22292 tatggcgtcatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaa 22338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 240 - 661
Target Start/End: Original strand, 54278855 - 54279278
Alignment:
Q  240 tatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 339  Q
    ||||||||||||||||||||  |  ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||| | | |||||| || | ||||||| |||||    
T  54278855 tatcggacagcagtcagaccagcgttgttgtatggtacggagtgttgggcagttaagagtcaacataagaatcaggtaagtgtagcagagatgaggatgt 54278954  T
Q  340 tgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa 437  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54278955 tgcgttggataagtggtaagactagacaagatagaattaggaatgacaccattagagagagagtaggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa 54279054  T
Q  438 tagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatga 537  Q
    ||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || | |||  || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||    
T  54279055 taggcttagacggtttgggcacgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaaaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaaga 54279154  T
Q  538 aaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttga 637  Q
    | ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  54279155 agacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttga 54279254  T
Q  638 tccatgtagccgatcccacttaat 661  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  54279255 tcaatgtagccgatcccacttaat 54279278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 481
Target Start/End: Original strand, 27917173 - 27917648
Alignment:
Q  5 tatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcata-cccaagttacacggtttaaatatct 103  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||| |   | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27917173 tatatggattgtaacttcagtaaaaggagaacta--gttctaccttgaaggtgaaagttggagatcatatcatatcccaagttacacggtttaaatatct 27917270  T
Q  104 tgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgc 203  Q
    || ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||||||| |||| ||||||| ||     
T  27917271 tgagtccatagtacaaaatgacggagaaatataagcatatataaatcatcgtattcaagttgggtagctgaaatagagaagagcctcatgtgttttatgt 27917370  T
Q  204 gataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaac 303  Q
    ||||| |||  |||||||||| |||| ||||  || ||||| ||| |||||| |||| | |||||||| |||||  |||| || || ||||||| ||||     
T  27917371 gataaaaaagtaccacttaagttgaatgaaaaattctatcgaacatcagtcacaccggcgatgttgtatggtacaaagtgatgtgcagttaagaaccaaa 27917470  T
Q  304 acgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgg 403  Q
    |||||| | |||||||  || | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||| |    
T  27917471 acgagaatcaagtaagcgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagcctagacgagatttgattaggaatgaccccattagagaaagttg 27917570  T
Q  404 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatg 481  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  27917571 gggtagcacctatagtagaaaagatggtaggaaataggcttagatggtttggacatgtagaaagaagacttgtagatg 27917648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 7 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 47542390 - 47542032
Alignment:
Q  7 tatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttg 105  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47542390 tatggaatgtaacttcagcagaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatttcataccccaagttacacggtttaaatatcttg 47542293  T
Q  106 ggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcga 205  Q
    ||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47542292 ggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcatattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcga 47542193  T
Q  206 taagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacac 305  Q
    |||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||| ||| ||||| |  ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||     
T  47542192 taagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcggtctgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcagttaagagtcaacat 47542093  T
Q  306 gagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagaca 367  Q
    |||| | ||| |||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47542092 gagaat-aagaaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaca 47542032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 314 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 47233969 - 47233613
Alignment:
Q  314 agtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagag--tgggggtagca 411  Q
    ||||||| || || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  47233969 agtaagtgtagcgaagatgaggatattgcgttggatgagtggtaagactagacatgataagattagaaatgacaccattagagagagaatggaggtagca 47233870  T
Q  412 cctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggagg 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  47233869 cctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggagg 47233770  T
Q  512 agagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttt 611  Q
    |||||| |||||||||| || || ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||| |||||    
T  47233769 agagtcaggttaaaagatgttgaagaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggaattagaggtcaatgaattagatccaaatatggtttt 47233670  T
Q  612 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  47233669 tgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtagccgaccccagttagtgggataa 47233613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 393 - 650
Target Start/End: Original strand, 35033136 - 35033393
Alignment:
Q  393 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttaga 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  35033136 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttatatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccattgtaaga 35033235  T
Q  493 aggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagt 592  Q
    ||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||       ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  35033236 agagtaaatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 35033335  T
Q  593 tggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccga 650  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  35033336 tggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgttatttgatccatgtagccga 35033393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 265 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 33272450 - 33272124
Alignment:
Q  265 tgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactag 364  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| | |||||||| || | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33272450 tgttgtatggtacggagtgttgggcagttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcattggatgagtggtaagactag 33272351  T
Q  365 acaagataggattaagaatgacaccattagag----agagtgggggtagcacc----tatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttgga 456  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  33272350 acatgataggattaagaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatatatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggg 33272251  T
Q  457 catgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccatta 556  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | ||||    
T  33272250 catgtagagagaaga-ctgtagatgccgtggtaagaagtgtatatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactatta 33272152  T
Q  557 gagaaattattagaaatgatttagaggt 584  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  33272151 gagaaaccattagaaatgatttagaggt 33272124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 53 - 473
Target Start/End: Original strand, 26489964 - 26490385
Alignment:
Q  53 aggtgaaagttggagatcatatcatac-ccaagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaatta 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  26489964 aggtgaaagtgggagatcatatcatactccaagttacatgatttaaatatcttggttccatgatataaaatgacggagaaatagaagcagatgtaaatca 26490063  T
Q  152 tcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagca 251  Q
    || |||| ||| || |||||||| ||| |||| || || ||  ||||| ||  || |||||| ||| |||||  | |||| ||  || ||||||||| ||    
T  26490064 tcatattgaagttgagtggttgagatgaagaatagccttaga-gttttatgtaatgagaaaataccgcttaaatttaaaggaaaattatatcggacaaca 26490162  T
Q  252 gtcagaccgacaatgttgt--aaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggat 349  Q
    ||||||||| | |||||||  | |||| | | || ||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  26490163 gtcagaccggcgatgttgtgtatggtaagta-tgttgggcggttaagaaccaacaagagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgttggat 26490261  T
Q  350 gagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatg 449  Q
    |||||||||||| ||||  |||| |||||  ||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  26490262 gagtggtaagacaagacgggatatgattagcaatgacgtcattagacagagttgaggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtg 26490361  T
Q  450 gtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    
T  26490362 gtttggacatgtagataaaagacc 26490385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 226 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 43695226 - 43694787
Alignment:
Q  226 tgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataac 325  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||| |||| |||| |||   ||||||||| | |||||||| ||||    
T  43695226 tgaaagaaaagttctatcggacagcagttagaccggcgatgttgtatggtacggagtgttgggtggttgagaattaacacgagaatcaagtaagtgtaac 43695127  T
Q  326 ggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagacta-----gacaagataggattaagaatgacaccattagagagagt-gggggtagcacctatagt 419  Q
     ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |     |||| |||||||||| ||||||||     ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43695126 agagatgaggatgttgcgttggatgaatggtaagaccagacatgacatgataggattaggaatgaca----gagagagagtggggggtagcacctatagt 43695031  T
Q  420 agaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctg 519  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||  || |||||||| ||||           
T  43695030 agaaaagttggtagaaaatttgcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgtcgtcgtaagaagattagatcaaatgaagga------a 43694937  T
Q  520 gttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaa 619  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||       | ||||||||||  |||| ||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    |||| ||||||||    
T  43694936 gttaaaagaggtagaggaaaatctaggaaaactattagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatggattggatctaaactaggtttatgatagaa 43694837  T
Q  620 cactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataaa 669  Q
    || || |||||||||||||| |||||| ||| |||| ||| |||||||||    
T  43694836 caatacgacgtcatttgatctatgtagtcgaccccatttagtgggataaa 43694787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 327 - 668
Target Start/End: Original strand, 54128300 - 54128644
Alignment:
Q  327 gagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtg--ggggtagcacctatagtagaaa 424  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  54128300 gagatgaggatgttgcgtttgatgagtggtaaaactagacgcgataggattatgaatgacaccattagagagagtgttggggtagcacctatagtagaaa 54128399  T
Q  425 agttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaa 524  Q
    || ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||  |  ||  | ||  || |||| |||||||  |||| | |  |    
T  54128400 agatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagaaaagacctgtagatgatgcagtacgtagagtagatcagatggaggttagtcagatcga 54128499  T
Q  525 aagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccatt-agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacact 623  Q
    |||||||||| ||| ||||       | ||| ||||||| ||| || || ||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||| |||||||||| |    
T  54128500 aagaggtagaggaagacctagaaaaactattaagagaaactataaggaaagatttagaggtcaatgagttggacccaaatatggtttatgatagaacatt 54128599  T
Q  624 atgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||| | | ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  54128600 atggcataatttgatccatgtaggcgaccccacttagtgggataa 54128644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 285 - 543
Target Start/End: Original strand, 45728025 - 45728290
Alignment:
Q  285 tgggcggttaagagcc-aacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaat 383  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| || | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||  |||    
T  45728025 tgggcggttaagagcccaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagacgagacgaaataggattagaaat 45728124  T
Q  384 gacaccatt---agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagag-aagacccgtaga 479  Q
    |||| ||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||    
T  45728125 gacatcatttagagagagagtgggggtagcacatatagtagaaaagttggtagaaagtaggatcagatggttttgacatgtagagagaaaaacccataga 45728224  T
Q  480 tgccgttgttaga--aggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacct 543  Q
    || |||||| |||  || ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||| ||||    
T  45728225 tgtcgttgtaagaagagtatatatcaaatggaggagagtcatgttaaaagagatagaggaagacct 45728290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 436 - 668
Target Start/End: Original strand, 48508268 - 48508500
Alignment:
Q  436 aatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagat 535  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || || |||||  || |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||     
T  48508268 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagag 48508367  T
Q  536 gaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcattt 635  Q
    ||| ||||       | || |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  48508368 gaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaattt 48508467  T
Q  636 gatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  48508468 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 48508500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 464
Target Start/End: Original strand, 29817105 - 29817565
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||   | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  29817105 gtatatggaatgtaacttcatcaaaaggtgaagtt--gttctatcttggaggtgaaagttggagatcatatcataccataagttacacggttcaaatatc 29817202  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    || |  ||||| |||||||||| ||| |||||   |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    |||||| ||    
T  29817203 tttga-ccatagtacaaaatgacggataaataacggcagatgtaaatcatcgtattcaagttgggtggttgaaatagagaatagtctgttatgttttatg 29817301  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
     |||||||||  | | |||||| |||||||||  || || |||||| |||| ||||||| |||||||||   || |||||| |  | |||||||| | ||    
T  29817302 tgataagaaagtaacgcttaagttgaaagaaaatttctaccggacaacagttagaccgataatgttgtataatatggagtgttaagtggttaagaactaa 29817401  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattag--agagag 400  Q
     || | | | ||  |||| || |  |||||| ||||||||||||||| ||||  || ||| |||| ||||  |||| |||||||||   |||  | |||     
T  29817402 tacaaaaatcaatcaagtgtagcaaagatgaggatgttgcgttggataagtgacaaaactggacatgatataattaggaatgacactgatagaaatagaa 29817501  T
Q  401 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtaga 464  Q
    | || ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||   |||| |||||||||||||||||    
T  29817502 ttggtgtagcacctatagtagaaaagattgtagaaagtaagtttaggtggtttggacatgtaga 29817565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 393 - 534
Target Start/End: Original strand, 38060421 - 38060562
Alignment:
Q  393 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttaga 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  38060421 agagagagtgggggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtagatgccgtcgtaaga 38060520  T
Q  493 aggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtaga 534  Q
    ||  || || ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  38060521 agagtagattaaatggaggagagtcaggttaaaaaaggtaga 38060562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 136 - 471
Target Start/End: Original strand, 3186500 - 3186836
Alignment:
Q  136 aagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaag 235  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||| | | ||| |||||||  | |||||||||  | |||||||| |||||| ||     
T  3186500 aagcagatgtaaaacatcgtattcaagttgggtggttgaaatgaagaatattttcatgtgttttaggtgataagaaagtatcacttaagttgaaaggaaa 3186599  T
Q  236 gttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatg 335  Q
    ||| ||||||||| |||||  ||| || |||||||| | ||   |||| |||||| ||||||| |||||||||| | |||||| | || || ||||||      
T  3186600 gttatatcggacaacagtcccaccaacgatgttgtatgatatatagtgttgggcgattaagagtcaacacgagaatcaagtaaatgtagcgtagatgaga 3186699  T
Q  336 atgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatta--gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtag 433  Q
    || ||  |||||||||| ||||||||| | |  |||| ||||| ||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3186700 atcttatgttggatgagcggtaagacttggcgggataagattaggaatgacaccattatggaaagagtggtggtagcacctatagtgggaaagttggtag 3186799  T
Q  434 aaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaaga 471  Q
    ||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  3186800 aaaataggc-tagatgatttgggcatgtagagagaaga 3186836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 50 - 388
Target Start/End: Original strand, 30345175 - 30345506
Alignment:
Q  50 tggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaa 148  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    ||| |||| ||||||| ||  |||||||| || || || ||||    
T  30345175 tggaggtgaaagtggaagctcatatcataccccaagctacaaggtttaaatat----ggttcatagtacaaaaagaaagagaaataaaaacatatataaa 30345270  T
Q  149 ttatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggaca 248  Q
    | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||| ||  || || | |||     
T  30345271 tcatagtattcaagttgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttatgcgataagaaagtaccgcttaaattgaaaggaaaattctaccagacg 30345370  T
Q  249 gcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttgga 348  Q
      | |||||  ||| ||||| ||  |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||    ||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  30345371 aaaatcagattgacgatgttatattgtacggagtgatgggcggttaagaaccaacatga----aaattaagtatagcggagatgaggatgttgtgttgga 30345466  T
Q  349 tgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacac 388  Q
    |||| ||||||| | |||| ||||| |||| |||||||||    
T  30345467 tgagcggtaagattggacatgatagaattatgaatgacac 30345506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 268 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 49503978 - 49503766
Alignment:
Q  268 tgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggat-----gagtggtaagact 362  Q
    |||| |||| |||||| ||| |||||||||  ||||| || | | |||||||| || ||||||| | |||||||||||||||     |||||||||||||    
T  49503978 tgtatggtatggagtgttggacggttaagaatcaacatgaaaatcaagtaagtgtagcggagataaggatgttgcgttggattggatgagtggtaagact 49503879  T
Q  363 agacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtggg--ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatg 460  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  49503878 agacgagataggattgggaatgacaccattagagagagagttcaggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatg 49503779  T
Q  461 tagagagaagacc 473  Q
    |||||||||||||    
T  49503778 tagagagaagacc 49503766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 393 - 669
Target Start/End: Original strand, 38850110 - 38850387
Alignment:
Q  393 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttaga 492  Q
    |||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| | ||| || |||    
T  38850110 agagagagagagagtagcacatatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagagaagatcagtagaggtcgtcgtaaga 38850209  T
Q  493 aggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattag-aaatgatttagaggtaaatgag 591  Q
    ||  || ||| ||||||||||||||  |||| |||||||||| ||| ||||         |||||| |||  ||||| ||| ||| |||| || |||||     
T  38850210 agagtagatcgaatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaattattagataaaccattagaaaaggatctagaagtcaatgaa 38850309  T
Q  592 ttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataaa 669  Q
    ||| ||  |||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  38850310 ttgaattcaaatttggtttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaa 38850387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 54425511 - 54425369
Alignment:
Q  82 aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggag 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||| |     
T  54425511 aagttacacggtttaaatatcttggatccatagtaaaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaaatcatcgtatttaagctaggcggttgaaatgaaa 54425412  T
Q  182 aagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaag 224  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  54425411 aagagtctcatgtgttttgtgtgataagaaagtaccacttaag 54425369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 157
Target Start/End: Original strand, 19757668 - 19757820
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  ||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  19757668 gtatatggaatgtaactttagcaaaaggcaaagta--gtcctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacatggtttaaatatc 19757765  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtat 157  Q
    ||||||||||| |||||||| |  ||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  19757766 ttgggtccatagtacaaaataacagagaaataagagcagatgtaaatcatcgtat 19757820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 337 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 36820309 - 36820166
Alignment:
Q  337 tgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 436  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||    
T  36820309 tgttgcgttggatgtgtggtaagactagacgagataggattagaaatgacgacattagagagagttggggtagcacctatattagcaaagatggtggaaa 36820210  T
Q  437 atagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagat 480  Q
     ||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  36820209 ctaggcttaggtggtttagacatgtaaagagaagacccatagat 36820166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 553 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 52156216 - 52156101
Alignment:
Q  553 attagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatc 652  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |    
T  52156216 attagagaaatcattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatctgatccatgtagccgacc 52156117  T
Q  653 ccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||| ||||||||    
T  52156116 ccacttagtgggataa 52156101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 327 - 516
Target Start/End: Original strand, 19736918 - 19737110
Alignment:
Q  327 gagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagag---tgggggtagcacctatagtagaa 423  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||  | ||| | ||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||    
T  19736918 gagatgatgatgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggatacgattagaagtgaaatcattagagagagagttgggggcagcacctatagtagaa 19737017  T
Q  424 aagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagt 516  Q
    ||| |||||||||||||  |||| |||||||  |||| |||||||||||| |||||||  || || |||||  || |||| ||||||||||||    
T  19737018 aagatggtagaaaataggtttaggtggtttgagcatgcagagagaagacctgtagatgttgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagt 19737110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 124
Target Start/End: Original strand, 52138428 - 52138547
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcata-cccaagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52138428 gtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatc 52138525  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatga 124  Q
    |||||||| |  ||||||||||    
T  52138526 ttgggtccttcgtacaaaatga 52138547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 332 - 668
Target Start/End: Original strand, 19757826 - 19758151
Alignment:
Q  332 gatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagag---tgggggtagcacctatagtagaaaagtt 428  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||  | ||| | ||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  19757826 gatgatgttgtgttggatgagtggtaagactacacgagatacgattagaagtgaaatcattagagagagagttgggggcagcacctatagtagaaaagat 19757925  T
Q  429 ggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaaga 528  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||  |||| |||||||||||| |||||||  || || |||||  || |||| |||||||||||| | | | ||| |    
T  19757926 ggtagaaaataggtttaggtggtttgagcatgcagagagaagacctgtagatgttgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagt-tagatcaaaaa 19758024  T
Q  529 ggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgac 628  Q
    |||||| ||| |||            |||| ||| |||||| ||  |||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||      
T  19758025 ggtagaggaagacc------------tagaaaaactattaggaaatatttagagattaatgagttggatctcaatatggtttatgatagaacattatggt 19758112  T
Q  629 gtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
     | ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  19758113 ataatttgatccatgtag-cgaccccacttagtgggataa 19758151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 339 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 48734481 - 48734349
Alignment:
Q  339 ttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 438  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |  |||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||| || |||||||||||    
T  48734481 ttgcgttggatgagtggtaaaactaggcgggataagattatgaatgacaccattagagagtgttggggtagcgcgtatagtagaacagatggtagaaaat 48734382  T
Q  439 agtcttagatggtttggacatgtagagagaaga 471  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  48734381 aggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaga 48734349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 43 - 185
Target Start/End: Original strand, 48221421 - 48221564
Alignment:
Q  43 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcag 141  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| | |||| ||||||||||  ||||| ||||||||     
T  48221421 tctatcttagaggtgaaagttgaagatcatatcataccacaagttacacattttaaatatcttggattcatagtacaaaatgacagagaagtagaagcat 48221520  T
Q  142 atgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaaga 185  Q
    |||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  48221521 atgtaaatcatcgaattcaaactggatggttgaaatgaagaaga 48221564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 410 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 48953697 - 48953454
Alignment:
Q  410 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagag-aagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatgg 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||  || || |||||  || |||| ||||    
T  48953697 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataaacttagatgatttgggcatgtaaagagaaagacccgcagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatgg 48953598  T
Q  509 aggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatga--tttagaggtaaatgagttggatctaaatata 606  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||| ||| ||||       | || |||||||| |||| |||  |  | || |||| ||||||||||||| ||||||     
T  48953597 aggagagtcgggtcaaaagaagtagaggaagacctaggaaaactataagagaaatcattaaaaagaacttataaaggtcaatgagttggatccaaatatg 48953498  T
Q  607 gtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccga 650  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  48953497 atttatgatagaacactatgacgtaatttaatccatgtagccga 48953454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 565 - 668
Target Start/End: Original strand, 53262303 - 53262406
Alignment:
Q  565 attagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggg 664  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  53262303 attagaagagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatctatgtagccgaccccacttagtggg 53262402  T
Q  665 ataa 668  Q
    ||||    
T  53262403 ataa 53262406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 288 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 345110 - 344923
Alignment:
Q  288 gcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgaca 387  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||| || | ||||||  |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||  |||||      
T  345110 gcggttaagaaccaacacaagaataaagtaagcatagcggaaattaggatgttatgttggatttgtggtaagactagacgagataggattagaaatgatg 345011  T
Q  388 ccattagagagagtg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
     |||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||  | |||||| |||||||||||| ||||    
T  345010 acattagagagagagttggggtagcacttatagtagaaaagatgttagaaaataggcttaagtagtttggtcatgtagagagaggacc 344923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 565 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 12096825 - 12096722
Alignment:
Q  565 attagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggg 664  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  12096825 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggg 12096726  T
Q  665 ataa 668  Q
    ||||    
T  12096725 ataa 12096722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 157
Target Start/End: Original strand, 19736766 - 19736914
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcata-cccaagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   || || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19736766 gtatatggaatgtaacttcagcaaaaggc--agagtagtcctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacatggtttaaatatc 19736863  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtat 157  Q
    |    |||||| |||||||| |  ||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  19736864 t----tccatagtacaaaataacagagaaataagagcagatgtaaatcatcgtat 19736914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 553 - 668
Target Start/End: Original strand, 38060864 - 38060979
Alignment:
Q  553 attagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatc 652  Q
    ||||||||||  |||||||| | |||||| || ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  38060864 attagagaaaccattagaaaggttttagaagtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacaccatggcgtaatttgatccatgtagccgacc 38060963  T
Q  653 ccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||| ||||||||    
T  38060964 ccacttagtgggataa 38060979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 556 - 658
Target Start/End: Original strand, 49042089 - 49042192
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttt-tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccc 654  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  49042089 agagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggttttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgacccc 49042188  T
Q  655 actt 658  Q
    ||||    
T  49042189 actt 49042192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 574 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 311420 - 311326
Alignment:
Q  574 gatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  311420 gatttagaggtcaattagttggatccagatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccgaccccacttagtgggataa 311326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 419 - 650
Target Start/End: Original strand, 39235154 - 39235384
Alignment:
Q  419 tagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtct 518  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  || ||  ||||  || |||| |||||||| ||||     
T  39235154 tagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgttgtagtacgaagagtagatcagatggaggaaagtca 39235253  T
Q  519 ggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgataga 618  Q
    | | |||||||||||| ||| |||        | ||  || ||| |||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  39235254 gatcaaaagaggtagaggaagacccaaaaaaactataggataaactattaggaaagatttagaagttaatgagttggatctaaatatggtttacgataga 39235353  T
Q  619 acactatgacgtcatttgatccatgtagccga 650  Q
    ||| |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  39235354 acattatgtcgtga-ttgatccatgtagccga 39235384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 393 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 45289385 - 45289108
Alignment:
Q  393 agagagagtgggggtagcacctat--agtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtta 490  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||| ||  ||||||   || || |    
T  45289385 agagagagttggggtagcacctattcagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcacgtagagagaacacttgtagattttgtagtaa 45289286  T
Q  491 gaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatga 590  Q
    ||||  || |||| |||||||| |||  | ||| ||||| |||| ||| | ||       | || ||||||| |||||| || ||||||||| | |||||    
T  45289285 gaagagtagatcagatggaggatagttagattacaagagatagaggaagatctatgaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatga 45289186  T
Q  591 gttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||| |||  | | ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||    
T  45289185 gttggatccaaatatggtttatgatagaacattatagcataatttgatccatgtcgccaaccccacttagtgggataa 45289108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 396 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 50960922 - 50960845
Alignment:
Q  396 gagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  50960922 gagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacc 50960845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 330 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 19676447 - 19676098
Alignment:
Q  330 atgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtg------------ggggtagcacctata 417  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||   |||| ||||| || |||||||||||||||||| |            |||||||||||||||    
T  19676447 atgaggatgttgcattggatgagcggtaagactagatgggataagattaggagtgacaccattagagagagagagagagagtgttggggtagcacctata 19676348  T
Q  418 gtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtc 517  Q
    ||| ||||| || |||||||| | ||||| |||| | | ||||||||||||||||| |||||||| || ||   |||   | |||| || ||||||||||    
T  19676347 gtacaaaagatgatagaaaattggcttaggtggtattggcatgtagagagaagacctgtagatgctgtagtacaaagagaagatcagatagaggagagtc 19676248  T
Q  518 tggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatag 617  Q
     | | |||||||||| | ||| ||||       |  | ||||||| |||||| ||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||  | | ||||||    
T  19676247 agatcaaaagaggta-aggaagacctagaaaaactgtaagagaaactattaggaaaaatttagaggttaatgagttggatccaaatatgctgtatgatag 19676149  T
Q  618 aacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    | || |||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  19676148 agcattatggcgtgatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataa 19676098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 369 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 54425289 - 54425022
Alignment:
Q  369 gataggattaagaatgacaccattag--agagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagaga 466  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||| || || || ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| | |||| |||||||| ||    
T  54425289 gataggattatgaatgacaccattaggaagagagtgagg-tatcatctataatagaaaagtttgtagaaaatagacttagaagatttgaacatgtaggga 54425191  T
Q  467 gaagacccgtagatgccgttgttagaagga-------tatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagag 559  Q
    ||||||| | |||||||||||| || ||||       || |||| |||||||||| || ||| |||||||||||| ||| ||||       | || ||||    
T  54425190 gaagacctgcagatgccgttgtaagtaggatttagagtagatcagatggaggagattcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaagaaagctataagag 54425091  T
Q  560 aaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgac 628  Q
      |  |||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||| | |||||| ||||||||    
T  54425090 ggaccattaaaaaggatttagaggtcaatgggttggatccaaatatggtttattatagaaaactatgac 54425022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 115
Target Start/End: Original strand, 9258483 - 9258589
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcata-cccaagttacacggtttaaatatc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||    | ||||||||  || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9258483 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagta--ggtct----tagaggtgaacattagatatcatatcatatcccaagttacacggtttaaatatc 9258576  T
Q  103 ttgggtccataat 115  Q
    |||||||||||||    
T  9258577 ttgggtccataat 9258589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 302 - 472
Target Start/End: Original strand, 50249278 - 50249456
Alignment:
Q  302 acacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagatag---gattaagaatgacaccatt--agag 396  Q
    |||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||   |||||  ||||| | ||||  ||||    
T  50249278 acacgagaataaaataagcatagcggagatgatgatgtttcgttggatgtgtggtaggactagacgagataggatgattagaaatgataacattagagag 50249377  T
Q  397 agagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtctta---gatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||| |||| |||| ||| ||||   | |||||||| ||||||||| ||||||    
T  50249378 agagttggggtagcgcgtatagtagaaaagatggtggaaactagacttaggtggtggtttgggcatgtagagtgaagac 50249456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 578 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 2133719 - 2133629
Alignment:
Q  578 tagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||    
T  2133719 tagaggtcaatgagttgaatccaaatatagtttatgatagaacactatggcgtgatttgatccatgtactcgaccccacttagtgggataa 2133629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 300 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 2341101 - 2340928
Alignment:
Q  300 caacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagaga 399  Q
    |||| ||||| |||| |||| |||  |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| | ||||||||||     
T  2341101 caacgcgagaataaaataaggatagtggagatgaggatgttgcattggatgtgtggtaagactagacatgatagaattagaaatgaaaacattagagagg 2341002  T
Q  400 gtg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaaga 471  Q
    |||  |||||||||||  | ||||||||| |||| ||||||  |||||  |||||||  |||||||||| ||||    
T  2341001 gtgttggggtagcaccattcgtagaaaagatggtggaaaatcatcttacgtggtttgagcatgtagagaaaaga 2340928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 352 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 39601016 - 39600698
Alignment:
Q  352 gtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatg 449  Q
    ||||||||||||||   |||| |||||  ||||||| |||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||    
T  39601016 gtggtaagactagatgggataagattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagtacctatagtagaaaagatggtggaaaacaagcttaggtg 39600917  T
Q  450 gtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnn 549  Q
    |||| | |||||| |||||||||| |||||| | || |  || ||  || |||| || ||||| |||| | ||  |||||||||| ||| ||||          
T  39600916 gttttggcatgtaaagagaagacctgtagattctgtagcgaggagagtagatcagatcgaggatagtcagattgcaagaggtagaggaagacctagaaaa 39600817  T
Q  550 nccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccg 649  Q
     | || ||||||| |||||  || ||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||  ||||||||| ||||  || ||||||||||| || ||     
T  39600816 actataagagaaactattaagaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatctggtttacgatagaacattatggtgtaatttgatccatctaacca 39600717  T
Q  650 atcccacttaatgggataa 668  Q
    | |||||||  ||||||||    
T  39600716 accccactttgtgggataa 39600698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 263 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 48953819 - 48953694
Alignment:
Q  263 aatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagact 362  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||   |||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  48953819 aatgttgtatgttacggagtgttgggcgtttaagatccaacacaagaaacaagtaagtgtg-cggagatgaggatgttgcgttggatgagcggtaagatt 48953721  T
Q  363 agacaagataggattaagaatgacacc 389  Q
     ||  ||||||||||||||||||||||    
T  48953720 ggatgagataggattaagaatgacacc 48953694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 289 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 52679246 - 52678990
Alignment:
Q  289 cggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacac 388  Q
    |||||||||| |||||| ||| | || || | ||||| ||||||  |||||||| |||||| || ||||| |||| |  |||||  ||||| ||||||||    
T  52679246 cggttaagagtcaacacaagaatcaaataggcataacagagatggggatgttgcattggatcagcggtaaaactatatgagataatattaaaaatgacac 52679147  T
Q  389 cattaga----gagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccg 484  Q
    |||||||    ||||||||   ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||  |||||||       
T  52679146 cattagaaagagagagtggaaatagcatctatagcagaaaagttggaagaaaataggctctggtgatttggacatgtagagagaagacttgtagatg--t 52679049  T
Q  485 ttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacct 543  Q
    | || ||||  ||| |||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||    
T  52679048 tggtaagaaaaatagatcggatggaggagagtcgggttaaaagatgtagaagaagacct 52678990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 574 - 667
Target Start/End: Original strand, 29601063 - 29601156
Alignment:
Q  574 gatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggata 667  Q
    ||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  29601063 gatttagagattaatgagttggattcaaatatagtttatgatagaacattatgatgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggata 29601156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 612 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 7895953 - 7895897
Alignment:
Q  612 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7895953 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataa 7895897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 30724435 - 30724311
Alignment:
Q  53 aggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaatta 151  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||| |  |||||||||||  | ||||||||||    
T  30724435 aggtgaacgttggagatcatatcatactataagttacacagtttagatatcttggatacatattacaaaataagtgagaaatagaatgatatgtaaatta 30724336  T
Q  152 tcgtattcaagctgggtggttgaaa 176  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||    
T  30724335 tcgaattcaagttgggtggtagaaa 30724311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 393 - 472
Target Start/End: Original strand, 3987037 - 3987116
Alignment:
Q  393 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  3987037 agagagagttggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggaatgtagagagaagac 3987116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 300 - 399
Target Start/End: Original strand, 45236751 - 45236850
Alignment:
Q  300 caacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagaga 399  Q
    |||||||||| |||||||||  || | ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  45236751 caacacgagaataaagtaagcctagccgagattaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagactggatatgattagaaatgacaccattagagaga 45236850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 581 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 47555436 - 47555349
Alignment:
Q  581 aggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||| ||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  47555436 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataa 47555349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 607 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 40273283 - 40273225
Alignment:
Q  607 gtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggga 665  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  40273283 gtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggga 40273225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 607 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 31566239 - 31566178
Alignment:
Q  607 gtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  31566239 gtttttgatagaacactatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 31566178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 556 - 668
Target Start/End: Original strand, 15296060 - 15296172
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccca 655  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||  ||||||||| ||||  || ||||||||||||| ||||| ||||    
T  15296060 agagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaattggatccaaatatgatttcggatagaacattatggtgtaatttgatccatgtggccgacccca 15296159  T
Q  656 cttaatgggataa 668  Q
    |||| ||||||||    
T  15296160 cttagtgggataa 15296172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 346 - 424
Target Start/End: Original strand, 33307087 - 33307165
Alignment:
Q  346 ggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 424  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||| |||||  || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33307087 ggatgtgtggtaagactaaacatgataagattagaaacgacaacattagagagagttggggtagcacctatagtagaaa 33307165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 369 - 534
Target Start/End: Original strand, 38430807 - 38430979
Alignment:
Q  369 gataggattaagaatgacaccattagag-------agagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgt 461  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||       || || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | | |||| |||||    
T  38430807 gataggattaggaatgacaccattagagcgtttagagcgttgaggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggttgattgggcatgt 38430906  T
Q  462 agagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtaga 534  Q
    ||||||| |||| | |||||  || ||  ||||  || |||| |||||||||||||   | ||||||||||||    
T  38430907 agagagacgacctgcagatgttgtagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcaaatcaaaagaggtaga 38430979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 390 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 54365271 - 54365194
Alignment:
Q  390 attagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagaga 468  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||  |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  54365271 attagagagagttggggtagcacctatagtagaaaatatggcggaaaatag-cttaggtggtttgggcatgtagagaga 54365194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 30294416 - 30294180
Alignment:
Q  393 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggaca---tgtagagagaagacccgtagatgccgttgtt 489  Q
    |||||||| | | ||||||| |||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||   ||||||||||||||  |||||||||   ||     
T  30294416 agagagagagagagtagcacatatactaaaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgagcatattgtagagagaagacttgtagatgccaccgta 30294317  T
Q  490 agaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatg 589  Q
    |||||  || || | ||  ||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||       | || ||| ||| ||||| ||| |||||| |||| ||||    
T  30294316 agaagagtaaattagattaaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagacctagaagaactataagataaactattaaaaaagatttataggtcaatg 30294217  T
Q  590 agttggatctaaatatagtttttgatagaacactatg 626  Q
    |||||||||||| |||  ||| ||||| |||||||||    
T  30294216 agttggatctaagtatgatttatgataaaacactatg 30294180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 607 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 31454303 - 31454242
Alignment:
Q  607 gtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  31454303 gtttttgatagaacactatggcgtcatttgattcatttagccgaccccacttagtgggataa 31454242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 398 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 42510301 - 42510042
Alignment:
Q  398 gagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggat 497  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||  |||||   || || || ||  |    
T  42510301 gagttgggatagcacctatagtagaaaagatagtggaaaataggcttaggtggtttggacatgta--gagaagacctatagattttgtggtaaggagagt 42510204  T
Q  498 atatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggat 597  Q
    | |||| |||||||| |||| | | |  ||||| | | ||| ||||       | || |||||||  ||||| || ||||| ||  |||||||||||||     
T  42510203 agatcagatggaggatagtcagatcactagaggcaaaggaagacctagaaaaactatcagagaaaccattaggaaagatttggaaataaatgagttggac 42510104  T
Q  598 ctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 659  Q
    | |||||| |||| |||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42510103 caaaatatggtttatgattgaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 42510042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 298 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 23534958 - 23534787
Alignment:
Q  298 gccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagaga 397  Q
    ||||||| |||| |||| ||||  || |||||| || ||||||||||| ||||  || ||| ||||||  ||||| |||||  |||||||  ||||||||    
T  23534958 gccaacatgagaataaaataagcgtagcggagaagaggatgttgcgttagatgtttgataaaactagatcagataagattagaaatgacaatattagaga 23534859  T
Q  398 gag-tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtag--aaaatagtcttagatggtttggacatgtagaga 466  Q
    ||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||  || |||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  23534858 gagttgggggtagcatttatagtaaaaaagatggtagataatataagcttagatggtttggatatgtagaga 23534787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 586 - 662
Target Start/End: Original strand, 36304149 - 36304225
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatg 662  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  36304149 aatgagttggatcaaaatatggtttatgataggacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactcaatg 36304225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 404 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 41842792 - 41842716
Alignment:
Q  404 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagat 480  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  41842792 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaccagtcttaggtggtttgggtatgtagagagaagagcggtagat 41842716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 614 - 669
Target Start/End: Original strand, 7278675 - 7278730
Alignment:
Q  614 atagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataaa 669  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  7278675 atagaacattataacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaa 7278730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 381 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 31454531 - 31454441
Alignment:
Q  381 aatgacaccattagagagagtgggggt-agcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaaga 471  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | |||||||  |||||||||||||||    
T  31454531 aatgacaacattagagagagtgttggttagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagactt-ggtggtttgtgcatgtagagagaaga 31454441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 425
Target Start/End: Original strand, 37227863 - 37227950
Alignment:
Q  338 gttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaa 425  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||    
T  37227863 gttgtgttggttgtgtggtaagactagacaatataggattagaaatgaccacattagagagagttggagtagcagctatcgtagaaaa 37227950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 40106719 - 40106637
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||| | |||||||| ||||||  || |||||||| ||||||||    
T  40106719 aatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacataatttgatcaatgtagtggaccccacttagtgggataa 40106637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 574 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 40116449 - 40116355
Alignment:
Q  574 gatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | |||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| | | |||| ||||||||    
T  40116449 gatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccacgtagccgacctcgcttagtgggataa 40116355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 378
Target Start/End: Original strand, 43308425 - 43308539
Alignment:
Q  264 atgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagacta 363  Q
    |||||||| || | |||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||| |||   |||| |||| || | |||||||||| ||  ||||||||||||    
T  43308425 atgttgtatgggatggagtgttgggcggtaaagaaccaacacgagaataaaataatcgtaaccgagacgaaggtgttgcgttgaatttgtggtaagacta 43308524  T
Q  364 gacaagataggatta 378  Q
    |||| ||||||||||    
T  43308525 gacatgataggatta 43308539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 668
Target Start/End: Original strand, 48532161 - 48532223
Alignment:
Q  607 gtttttgatagaacactatgacgtcatttgatcc-atgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  48532161 gtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccaatgtagccgaccccacttagtgggataa 48532223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 558 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 49503695 - 49503585
Alignment:
Q  558 agaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccact 657  Q
    ||||| |||||| || ||||||  ||| |||||||||| || |||||| ||||| |||| || | |||| ||| ||||||||||||||||||| || |||    
T  49503695 agaaactattaggaaagatttaacggttaatgagttgggtccaaatatggttttggatataatattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccctact 49503596  T
Q  658 taatgggataa 668  Q
    || ||||||||    
T  49503595 tagtgggataa 49503585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 600 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 54365060 - 54365010
Alignment:
Q  600 aaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccga 650  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54365060 aaatatggtttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccga 54365010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 612 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 33271983 - 33271934
Alignment:
Q  612 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaat 661  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  33271983 tgatagaacactatgacgtcatttgatctatgtagccaaccccacttaat 33271934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 586 - 667
Target Start/End: Original strand, 39208791 - 39208872
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggata 667  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||  || |||| ||| |||||||    
T  39208791 aatgagtaggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagaggaccccagttagtgggata 39208872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 398 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 44134117 - 44134044
Alignment:
Q  398 gagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaaga 471  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  44134117 gagttggggtagcgcctctagtagaaaagatggtggaaaatagacttaggtggtttggacatctagatagaaga 44134044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 327 - 480
Target Start/End: Original strand, 46140356 - 46140509
Alignment:
Q  327 gagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaag 426  Q
    |||||||||||||||| ||| |||  | ||||||||||||   ||| |||||  | |||||  ||||| |||||| ||||||  || | |||||||||||    
T  46140356 gagatgatgatgttgctttgaatgtattgtaagactagacggtatatgattagaattgacaatattagtgagagttggggtaatacatgtagtagaaaag 46140455  T
Q  427 ttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagat 480  Q
      ||| |||| ||| || || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  46140456 acggtggaaactagactcaggtggtttggacatatagagagaagacctgtagat 46140509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 612 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 46367460 - 46367403
Alignment:
Q  612 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataaa 669  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  46367460 tgatagaacattatgacgtcgtttgatccatgtagcctaccccacttaattggataaa 46367403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 472
Target Start/End: Original strand, 21200540 - 21200617
Alignment:
Q  393 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    ||||||| | |||||||||||||  ||||||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  21200540 agagagaattggggtagcaccta--gtagaaaagatggtggaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 21200617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 31337868 - 31337757
Alignment:
Q  343 gttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgg-gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagt 441  Q
    |||||||| ||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||| |||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||     
T  31337868 gttggatgtgtgataagactagatgggataggattaa-aatgacagcattagagagaaagttgggtagcacctatagtagaaaagatggttgaaactagg 31337770  T
Q  442 cttagatggtttg 454  Q
    ||||  |||||||    
T  31337769 cttaagtggtttg 31337757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 564 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 48734268 - 48734164
Alignment:
Q  564 tattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgg 663  Q
    ||||||| | |||||| |||| || ||||||| || ||| || |||| |||||||||| |||| ||| | |||||||||||||| || |||||||| |||    
T  48734268 tattagagaagatttaaaggtcaacgagttgggtccaaacatggtttatgatagaacattatggcgtaagttgatccatgtagctgaccccacttagtgg 48734169  T
Q  664 gataa 668  Q
    |||||    
T  48734168 gataa 48734164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 393 - 472
Target Start/End: Original strand, 11581434 - 11581513
Alignment:
Q  393 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    |||||||||  |||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  11581434 agagagagttagggtagaacctacaatagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggtatgtagagagaagac 11581513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 553 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 17022804 - 17022689
Alignment:
Q  553 attagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatc 652  Q
    ||||||||||  |||| ||| || |||||||| ||||||||||||| || | |||||| |||||||| | ||||  ||||||| || ||||||||||| |    
T  17022804 attagagaaaccattaaaaaggaattagaggtcaatgagttggatccaattttagtttatgatagaatattatggtgtcatttaattcatgtagccgacc 17022705  T
Q  653 ccacttaatgggataa 668  Q
     || ||| ||||||||    
T  17022704 tcatttagtgggataa 17022689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 383 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 31453242 - 31453151
Alignment:
Q  383 tgacaccattaga-gagagtgggggtagcacctatagta-gaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| | |||| | ||||||||||||||||    
T  31453242 tgacaacattagaagagagttggggcagcacctatagtaagaaaagatggtagaaactagacttaggttgttttggcatgtagagagaagac 31453151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 336 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 38054688 - 38054613
Alignment:
Q  336 atgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagca 411  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||  ||||| | ||||||||||||| | |||||||    
T  38054688 atgttgcgttgaatgggtggtaagactagacgggataggattagaaatgataacattagagagagttgaggtagca 38054613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 617 - 668
Target Start/End: Original strand, 41529975 - 41530026
Alignment:
Q  617 gaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  41529975 gaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 41530026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 610 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 24778684 - 24778626
Alignment:
Q  610 tttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  24778684 tttgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 24778626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 414 - 471
Target Start/End: Original strand, 29600910 - 29600968
Alignment:
Q  414 tatagtagaaaagttggtagaaaatag-tcttagatggtttggacatgtagagagaaga 471  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29600910 tatagtaaaaaagatggtagaaaataggttttagatggtttgggcatgtagagagaaga 29600968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 668
Target Start/End: Original strand, 37351606 - 37351672
Alignment:
Q  602 atatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  37351606 atatggtttttgttagaacactacgacgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtggaataa 37351672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 668
Target Start/End: Original strand, 40991614 - 40991696
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||||  || |||||||||||||||| || |||||||| || |||||    
T  40991614 aatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgagataa 40991696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 121
Target Start/End: Original strand, 46145799 - 46145869
Alignment:
Q  52 gaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaa 121  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  46145799 gaggttaaagttggagattatgtcataccacaagttatacggtttaaatattttgagtccatagtacaaaa 46145869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 472
Target Start/End: Original strand, 49841534 - 49841688
Alignment:
Q  328 agatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagag-----tgggg-----gtagcacctata 417  Q
    |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||| || || |||||  ||||||| |||||| |||||     |||||     ||||||||||||    
T  49841534 agatgaggatgttgtgttggatgtgtagtaagactagacgaggtaagattagaaatgacaacattagtgagagagagttggggtagccgtagcacctata 49841633  T
Q  418 gtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
     |||||||| |||| |||| ||| || || |||||||| | ||||||||||||||    
T  49841634 ttagaaaagatggtggaaactagactaaggtggtttgggcgtgtagagagaagac 49841688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 575 - 668
Target Start/End: Original strand, 19737156 - 19737248
Alignment:
Q  575 atttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||| ||||   | ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  19737156 atttagagattaatgagttggatctcaatatggtttatgataaaacattatggtataatttgatccatgtag-cgaccccacttagtgggataa 19737248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 178
Target Start/End: Original strand, 44395080 - 44395200
Alignment:
Q  56 tgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcg 154  Q
    |||||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||  |  ||||||||||   |||||||||  ||||    
T  44395080 tgaaagttggagatcataccacaacgcaagttacacgatttaaatatctcgggtccatagtactaaacaacagagaaataga---agatgtaaaccatcg 44395176  T
Q  155 tattcaagctgggtggttgaaatg 178  Q
     ||||||| |  ||||||||||||    
T  44395177 aattcaagttaagtggttgaaatg 44395200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 664
Target Start/End: Original strand, 46148232 - 46148289
Alignment:
Q  607 gtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggg 664  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  46148232 gtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtggg 46148289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 400
Target Start/End: Original strand, 46568038 - 46568111
Alignment:
Q  327 gagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagag 400  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||| | ||||  ||||||| ||||||||||||    
T  46568038 gagatgaggatgttgtgttggatgtgtgttaagactagaccagattgaattagaaatgacaacattagagagag 46568111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 587 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 48712173 - 48712092
Alignment:
Q  587 atgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||||||  |||||| |||| ||||| |||| |||||| | |||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  48712173 atgagttggattcaaatatggtttatgatataacattatgacattatttcatccatgtagttgatcccacttagtgggataa 48712092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 600 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 24541417 - 24541349
Alignment:
Q  600 aaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||| ||||  ||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  24541417 aaatatggtttaggatagaacattatggcgtaatttgatccatgtacccgaccccacttagtgggataa 24541349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 608 - 668
Target Start/End: Original strand, 27893294 - 27893354
Alignment:
Q  608 tttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||| ||||||||||| | |  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27893294 tttttgaaagaacactatggcattgtttgattcatgtagccgatcccacttagtgggataa 27893354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 578 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 41842630 - 41842562
Alignment:
Q  578 tagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtag 646  Q
    ||||||| |||||||| |||  |||||| ||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||    
T  41842630 tagaggttaatgagttagattgaaatatggtttttgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtag 41842562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 601 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 45486933 - 45486865
Alignment:
Q  601 aatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataaa 669  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  45486933 aatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccggccccacttagtgggataaa 45486865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 620 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 45834665 - 45834617
Alignment:
Q  620 cactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  45834665 cactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataa 45834617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 556 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 50960766 - 50960654
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccca 655  Q
    ||||||| |||||| || | ||||||| | ||||||||||||| |||||| || | | ||||| || ||||  || ||||||||||| ||||| | ||||    
T  50960766 agagaaactattaggaaaggtttagagattaatgagttggatccaaatatggtgtatcatagaccattatggtgtaatttgatccatttagccaacccca 50960667  T
Q  656 cttaatgggataa 668  Q
    |||| ||||||||    
T  50960666 cttagtgggataa 50960654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 590 - 669
Target Start/End: Original strand, 32170592 - 32170671
Alignment:
Q  590 agttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataaa 669  Q
    ||||||||  |||||| || | ||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  32170592 agttggatagaaatatggtctatgatataacattatgacataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaa 32170671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 32490356 - 32490249
Alignment:
Q  56 tgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcg 154  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||| || || | || | | ||||||||  |||| |||| |||||    
T  32490356 tgaaagttgaagatcatatcataccacaagttacacaatttaaatttcttgggtctatattataagacgacgaaaaaatagaactagatataaactatcg 32490257  T
Q  155 tattcaag 162  Q
     |||||||    
T  32490256 aattcaag 32490249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 565 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 54422963 - 54422900
Alignment:
Q  565 attagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgac 628  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| | |||||| ||||||||    
T  54422963 attaaaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttattatagaaaactatgac 54422900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 52 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 1470733 - 1470683
Alignment:
Q  52 gaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||    
T  1470733 gaggtgaaagttggagatcatatcataccaaaagttgcatggtttaaatat 1470683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 185
Target Start/End: Original strand, 15750888 - 15751018
Alignment:
Q  56 tgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcg 154  Q
    ||||||||||||||||||| | | | ||| ||||| | |||||| || |||||| |||||| ||||| || ||||| || |||||| |||||||  |||     
T  15750888 tgaaagttggagatcatatgacatctcaaattacatgatttaaacattttgggttcataatgcaaaacgaaggagacatcgaagcatatgtaaaacatca 15750987  T
Q  155 tattcaagctgggtggttgaaatggagaaga 185  Q
    || ||| | | ||||||||||||| ||||||    
T  15750988 tactcatgttaggtggttgaaatgaagaaga 15751018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 610 - 668
Target Start/End: Original strand, 20208205 - 20208263
Alignment:
Q  610 tttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  20208205 tttgatagaactttatggcatcatttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataa 20208263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 618 - 668
Target Start/End: Original strand, 35481143 - 35481193
Alignment:
Q  618 aacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  35481143 aacattatgacgtaatttgattcatttagccgaccccacttaatgggataa 35481193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 39535730 - 39535652
Alignment:
Q  395 agagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||   | ||||| |||||| | || ||||||||||||||    
T  39535730 agagagttggggcaacacctatagtagaaaagatggtagaaacccggcttaggtggtttaggcaagtagagagaagacc 39535652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 603 - 669
Target Start/End: Original strand, 40122614 - 40122680
Alignment:
Q  603 tatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataaa 669  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  40122614 tatagtttatgattgaacattatgacttaacttgatccatgtagccgaccccacttagttggataaa 40122680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 40674634 - 40674492
Alignment:
Q  166 ggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaat 265  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| || |||||| || |||||||||  | |||||||| |||||| ||  || ||||| | | ||| |||| | |||||    
T  40674634 ggtggttgaagtggggaagagtctgagatgttttatgtgataagaaagtatcacttaagttgaaaggaaaattctatcgaatatcaggcagatcaacaat 40674535  T
Q  266 gttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgag 308  Q
    ||||||  |||||||||| ||| | | |||||  |||||||||    
T  40674534 gttgtatagtacggagtgttggactgataagaatcaacacgag 40674492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 586 - 656
Target Start/End: Original strand, 49841799 - 49841869
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccac 656  Q
    ||||||||||||| |||||| || | |||||||||| |||| | | |||||||||||||||| || |||||    
T  49841799 aatgagttggatcgaaatatggtatatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagctgaccccac 49841869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 411 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 4472614 - 4472553
Alignment:
Q  411 acctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |  |||| |||||||| ||||||||    
T  4472614 acctataatagaaaagatggtagaaaatagtcttaagtaatttgaacatgtagtgagaagac 4472553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 34719364 - 34719287
Alignment:
Q  393 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaag 470  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |   ||||| || |||| |||| ||||||||||    
T  34719364 agagagagttggggtagcacctatcgtagaaaagatggtggaaagtcaacttaggtgttttgaacatatagagagaag 34719287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 464
Target Start/End: Original strand, 34812636 - 34812757
Alignment:
Q  343 gttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtc 442  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||  ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||  || || ||| ||| ||||||||| |||  | || ||| |    
T  34812636 gttgaatgcgtggtaaaactagattagataggataagaaatgacaacattagagagagttaggttatcacatatggtagaaaagatggggggaactagcc 34812735  T
Q  443 ttagatggtttggacatgtaga 464  Q
    |||  |||||||||||||||||    
T  34812736 ttaagtggtttggacatgtaga 34812757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 576 - 621
Target Start/End: Original strand, 38431021 - 38431066
Alignment:
Q  576 tttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaaca 621  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  38431021 tttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaaca 38431066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 618 - 659
Target Start/End: Original strand, 49888402 - 49888443
Alignment:
Q  618 aacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 659  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49888402 aacattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 49888443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 400; Significance: 0; HSPs: 134)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 42854665 - 42854021
Alignment:
Q  25 caaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatg 123  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  42854665 caaaaggagaagtg--ggtctaccttggaggtgaaaggtggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatcttgggtccatcgtacaaaatg 42854568  T
Q  124 atggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaa 223  Q
     | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  42854567 tttgagaaatagaagcagatgtaaatcatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcatgtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaa 42854468  T
Q  224 gctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtata 323  Q
    |||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  42854467 gctgaaaggaaaattctatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagccaacacgagagtaaagttagtgta 42854368  T
Q  324 acggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccat--tagagagagtgggggtagcacctatagtag 421  Q
     ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  42854367 gcggagatgacgatgttgcgctggataagtggtaagactagacagaataggattaggaatgacaccatcagagagagagtgggggtaacacctatagcag 42854268  T
Q  422 aaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggt 521  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||| |||    
T  42854267 agaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggt 42854168  T
Q  522 taaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaaca 621  Q
    ||||||||||||| ||| ||||       ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  42854167 taaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatataaca 42854068  T
Q  622 ctatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  42854067 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataa 42854021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 36565923 - 36565258
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36565923 gtatatgaaatgtaacttcaacggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatc 36565826  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    |||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36565825 ttgggtcctttgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtg 36565726  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  36565725 cgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaa 36565626  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagag--agag 400  Q
     | |||| | |||||||| || | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  36565625 tatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgatgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagag 36565526  T
Q  401 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatata 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| || |    
T  36565525 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaatacccgtagatgccgtggtaagaagggtaga 36565426  T
Q  501 tcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatcta 600  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |    
T  36565425 tcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcca 36565326  T
Q  601 aatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||| | || | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  36565325 aatttggtgtatgatagaacactatggcgttatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 36565258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Original strand, 36544752 - 36545414
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||| | |  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  36544752 gtatatggaatgtaactttagcggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacaaggtttaaatatc 36544849  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
     |||| |  |  |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  36544850 atggggctttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagtcatcgtattcaagttgggtggttgaaatggataagagcctcaggtgttttgtg 36544949  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||  || ||| ||||||| ||||  |||     |  ||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| |||    
T  36544950 cgataagaaagtaccacttaagttgaaaagaaagttctatcggatagcaaccag-----cgttgttgtatggtaccgagtgttgggtggttaagagtcaa 36545044  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagag----ag 398  Q
    || |||| | |||||||| || | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    ||    
T  36545045 catgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 36545144  T
Q  399 agtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggata 498  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||    
T  36545145 agtgggggtaacacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagta 36545244  T
Q  499 tatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatc 598  Q
     ||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  36545245 gatcaaatggaggatagtcaagttaaaagacgtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatc 36545344  T
Q  599 taaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
     |||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  36545345 caaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 36545414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 53 - 669
Target Start/End: Original strand, 18124825 - 18125437
Alignment:
Q  53 aggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaatta 151  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||| || |||||| | ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  18124825 aggtaaaagtttgagatcataccatatcctaagttatatggtttaaatattttg--tccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaactca 18124922  T
Q  152 tcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagca 251  Q
    ||| ||||||||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||| || |||||||||  |||||||| | |||||| || ||| ||||||||| ||    
T  18124923 tcgaattcaagctgaatggttgaaatggagaaaaacctcaggtgttttatgtgataagaaagtaccactta-gttgaaaggaaagttctatcggacaaca 18125021  T
Q  252 gtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatga 351  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||| || |||||||||  |||||||| |||||||    
T  18125022 gtcagaccaacaatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagccaacatgagaatcaagtaagtgtagcggagatgagcatgttgcgctggatga 18125121  T
Q  352 gtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggt 451  Q
    |||  ||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18125122 gtgacaagacgagacatgataggattagaaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggt 18125221  T
Q  452 ttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnc 551  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | | ||||       |    
T  18125222 ttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaatagtagatcaaatggaggagagtcgggtt-aaagaggtagagggagacctagaaaaac 18125320  T
Q  552 cattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgat 651  Q
     ||||||||||  |||||||| |||||| | || ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| ||||||  || |||||||| |||||| | |     
T  18125321 tattagagaaaccattagaaaagatttaaaagtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagaatactatggtgt-atttgatcaatgtagtcaac 18125419  T
Q  652 cccacttaatgggataaa 669  Q
    || ||||| |||||||||    
T  18125420 ccgacttagtgggataaa 18125437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 151 - 637
Target Start/End: Original strand, 39946603 - 39947091
Alignment:
Q  151 atcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagc 250  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||| || ||| |||||||||||    
T  39946603 atcgtattcaagctggatggttgaaatggagaagagccttaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaaattgaaaggaaagttctatcggacagc 39946702  T
Q  251 agtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatg 350  Q
    |||||| ||| | |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| | |||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||    
T  39946703 agtcaggccggcgatgttgtatggtacggaatgttgggcggttaagagtcaacacgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatg 39946802  T
Q  351 agtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccat--tagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagat 448  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39946803 agtggtaagactagacatgataggattatgaatgacaccattatagaaagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagat 39946902  T
Q  449 ggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnn 548  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||  || ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||| ||  ||||         
T  39946903 ggtttggacatgtagaaagaagacctgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagactcaagttagaagaggtagaggacgacctagaaa 39947002  T
Q  549 nnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttga 637  Q
      | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||| | |||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  39947003 aactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtttatgatagaacgctatggcgtcatttga 39947091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 12492524 - 12492116
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12492524 gtatatggaatgtaacttcagcggaaggataagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatc 12492427  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    |||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12492426 ttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagctatcgtattcaggttgggtggttgaaatggagaagagcctcatgtgttttgtg 12492327  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||| ||| ||||| |  ||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  12492326 cgataagaaagtaccacttaagatgaaaggaaagttctatcggacagccgtccgaccggcgttgttgcatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaa 12492227  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtg 402  Q
    || |||| | | |||||| || | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  12492226 catgagaatcatgtaagtgtagcagatatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacaccattagagagaatg 12492127  T
Q  403 ggggtagcacc 413  Q
    |||||||||||    
T  12492126 ggggtagcacc 12492116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 15215944 - 15215558
Alignment:
Q  12 aatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacccaa-gttacacggtttaaatatcttgggtcc 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  15215944 aatgtaacttcagcaaaaggagaagtg--ggtctaccatggaggtgaaagttggagatcatatcatacccaaagttacacggtttaaatatattgggtcc 15215847  T
Q  111 ataatacaaaatgatggagaaatagaa-gcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataag 209  Q
    ||| |||||| |||   |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||| ||||    
T  15215846 atagtacaaagtgac--agaaatagaaagcagatgtaaatcatcgtattcaagctaggtggttgaaatggagaagagcctccagtgtcttgtgcggtaag 15215749  T
Q  210 aaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgaga 309  Q
    |||  | ||||||||||||||| || ||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15215748 aaagtatcacttaagctgaaaggaaagttctatcgaacagtagtcagaccgaaaatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagccaacacgaga 15215649  T
Q  310 gtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagag 400  Q
    |||||||||||  | ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15215648 gtaaagtaagtgaagcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagactatacaggataggattagaaatgacaccattagagagag 15215558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 197 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 36395443 - 36394965
Alignment:
Q  197 tttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaag 296  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  36395443 tttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaag 36395344  T
Q  297 agccaacacgagagtaaagtaagtat---aacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatta 393  Q
    || ||||| |||| | |||||||| |   | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  36395343 agtcaacatgagaatcaagtaagtgttgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccatta 36395244  T
Q  394 gag--agagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtc-ttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtta 490  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  36395243 gagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaa 36395144  T
Q  491 gaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatga 590  Q
    ||||  || ||||||||||||| ||||  ||||||||||||| | ||| ||||       | ||| ||||||   ||||||| ||||||||||| |||||    
T  36395143 gaagagtagatcaaatggaggaaagtcaagttaaaagaggtataggaagacctaggaaaactatttgagaaaccgttagaaaggatttagaggtcaatga 36395044  T
Q  591 gttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtca-tttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||| |||| |||| | || | ||||||||||||||   | || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  36395043 gttagatccaaatttggtgtatgatagaacactattgtggcattttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 36394965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 8880108 - 8879649
Alignment:
Q  12 aatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcata-cccaagttacacggtttaaatatcttgggtcc 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||   |||| ||| || |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  8880108 aatgtaacttcagcaaaaggagaagta--ggtcgaccgtgaaggtgaaagttgaaaatcatatcatatcccaagttacacggtttaaatatcttgggctc 8880011  T
Q  111 ataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataaga 210  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| | |  |||||||||| | ||| |||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  8880010 atagtacaaaatgaaggagaaatagaaccagatgaatagcatcgtattcatgttggatggttgaaatagagaagaaccttaggtgttttgtgcgataaga 8879911  T
Q  211 aaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagag 310  Q
    ||  |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||       | ||| |||||||| |||||||| ||| |||     
T  8879910 aagtaccacttaagttgaaagaaaagttctatcggacagcagtcagacctactatgttgta------tgtgtgttgggcggtgaagagccagcacaagaa 8879817  T
Q  311 taaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagag--tgggggta 408  Q
    | |||||||| || |||||||||  |||||||  | ||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||| |    
T  8879816 tcaagtaagtgtagcggagatgagaatgttgcacttgataagtggtaagactggactagataggattaggaatgacacaattagagagagaatgggggaa 8879717  T
Q  409 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgt 476  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  8879716 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttgggtatgtagagagaagacccgt 8879649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 130 - 669
Target Start/End: Original strand, 37077490 - 37078015
Alignment:
Q  130 aaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaa 229  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||| ||||    
T  37077490 aaatagaagccgatgtaaatcatcgtattcaagctaagtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgtgataagtaagtaccacttaagttgaa 37077589  T
Q  230 agaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggag 329  Q
    ||  | ||| | || |||| ||||||||||| | ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |  |||||    
T  37077590 agggaagttatgtcagacaacagtcagaccgtcgatgctgtatggtacggagtgttgggcagttaagagccaacacgagaatcaagtaagtgtggcggag 37077689  T
Q  330 atgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattag--agagagtgggggtagcacctatagtagaaaagt 427  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||| ||            ||||||||||    
T  37077690 atgaggatgttgcgctggatgagtggtaaaactagacgagataggattaggaatgacaccattcggaagagagtgagg------------gtagaaaagt 37077777  T
Q  428 tggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaag 527  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||| || |||||  || |||||||||||||||||| ||| ||||     
T  37077778 tggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagag--gacccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcgggtcaaaat 37077875  T
Q  528 aggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatga 627  Q
    ||||||||||| ||||         || |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||   |    ||||||||||  |||    
T  37077876 aggtagatgaagacctaggaaaattataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatactttggaagatagaacac--tga 37077973  T
Q  628 cgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataaa 669  Q
    ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  37077974 cgtaatttgatccatgcagccgaccccacttaatgggataaa 37078015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 176 - 668
Target Start/End: Original strand, 2796326 - 2796818
Alignment:
Q  176 atggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggt 275  Q
    ||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||| ||||| |||| ||||||||  |||| || |||    
T  2796326 atggagaagagccttcggtgttctgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttatattggacaacagttagaccgacgttgttatatggt 2796425  T
Q  276 acggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagac--tagacaagatag 373  Q
    || ||||  |||| ||||||||| |||||||||| | |||||||| || |  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  2796426 accgagtcttgggtggttaagagtcaacacgagaatcaagtaagtgtagcaaagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactatagacatgatag 2796525  T
Q  374 gattaagaatgacaccatt--agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaaga 471  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||       
T  2796526 gattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcgcctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaga--- 2796622  T
Q  472 cccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaa 571  Q
     | ||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||    
T  2796623 -ctgtagatgccattgtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtcatgttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaa 2796721  T
Q  572 atgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    | ||||||||||| ||| ||||| |   |||| | ||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  2796722 aggatttagaggtcaattagttgaactcaaatttggtttttgatagaacagtatggcgtaatttgattcatgtagacgaccccacttagtgggataa 2796818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 216 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 18752344 - 18752018
Alignment:
Q  216 ccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaag 315  Q
    ||||||||||| |||| || ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18752344 ccacttaagctcaaaggaaagttctatcggacaacagtcagaccggcaatgttgtatggtacggagtgctggacggttaagagccaacacgagagtaaag 18752245  T
Q  316 taagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcaccta 415  Q
    ||||| || |||||||||  |||||||| || ||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18752244 taagtgtagcggagatgagaatgttgcgctgaatgagtgttaagactagacataataggattagggatgacaccattagagagagtgggggtagcaccta 18752145  T
Q  416 tagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagag 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||  |  ||||||||||  | ||    
T  18752144 tagtagaaaagttggtagaaaatag-cttagatggtttggacatgtagagagaggatccatagatgccgttgttaaaagagtggatcaaatggaaaatag 18752046  T
Q  516 tctggttaaaagaggtagatgaaaacct 543  Q
    |  | |||||||||||||| ||| ||||    
T  18752045 ttagattaaaagaggtagaggaatacct 18752018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 306 - 669
Target Start/End: Original strand, 40813223 - 40813590
Alignment:
Q  306 gagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagag----agagt 401  Q
    |||| |||||||||| || | ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  40813223 gagaataaagtaagtgtagcagagattaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacataataggattaagaatgacaccattagagagagagagt 40813322  T
Q  402 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatat 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||  || ||    
T  40813323 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagatctgtagatgccgtggtaagaagagtagat 40813422  T
Q  502 caaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaa 601  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||    
T  40813423 caaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgagttggatccaa 40813522  T
Q  602 atatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataaa 669  Q
    || | || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  40813523 atttggtgtgtgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaa 40813590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 4033176 - 4032917
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  4033176 gtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagtagaa--ggtctaccttggagatgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaagtatc 4033079  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4033078 ttgggttcatagtacacaatgatggagaaataaaagcatatgtaaatcatcatattcaagttgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtg 4032979  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaa 264  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4032978 cgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttttatcggacaacagtcagaccgacaa 4032917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 371 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 11524040 - 11523740
Alignment:
Q  371 taggattaagaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtctt-agatggtttggacatgtagagag 467  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  11524040 taggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagttaataggctttagatggtttgggcatgtagagag 11523941  T
Q  468 aagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattatt 567  Q
    |||||||||||||||||| || |||||  || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||    
T  11523940 aagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatt 11523841  T
Q  568 agaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggata 667  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  11523840 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggata 11523741  T
Q  668 a 668  Q
    |    
T  11523740 a 11523740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 405 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 12491418 - 12491155
Alignment:
Q  405 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaa 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  || |||||    
T  12491418 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaa 12491319  T
Q  505 atggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaata 604  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||     
T  12491318 atgaaggagagtcaagttaaaagaggtagatgaagacctatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt 12491219  T
Q  605 tagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    | || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  12491218 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 12491155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 380 - 659
Target Start/End: Original strand, 8932679 - 8932959
Alignment:
Q  380 gaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccg-tag 478  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||     
T  8932679 gaatgacaccattagagagagtgggggtagcacatacagtagaaaagttggtagaaaatagatttagatggtttggacatgtagaaagaagatccgttaa 8932778  T
Q  479 atgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgattt 578  Q
    ||||| |||| |||||  || |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       ||||| ||||||  |||||||| |||||    
T  8932779 atgccattgtaagaagagtaaatcaaatggaagagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagattt 8932878  T
Q  579 agaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 659  Q
    | |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  8932879 aaaggttaatgagttggatcaaaatatggcttttgataaaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccactta 8932959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 118 - 417
Target Start/End: Original strand, 25299950 - 25300251
Alignment:
Q  118 aaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaacc 217  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  25299950 aaaatgatggggaaatagaagcatatgtaaatcatcgtatgcaagcagggggtttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtacc 25300049  T
Q  218 acttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagta 317  Q
    | ||||| |||||| || ||| ||||  ||| ||||  ||||| | |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||    
T  25300050 aattaagttgaaaggaaagttctatcacacaacagttcgaccggcgatgttgtatgctacggagtgttgggcggttaagagccaacacgagaatcaaata 25300149  T
Q  318 agtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagaga--gtgggggtagcaccta 415  Q
    ||| || | || |||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  25300150 agtgtagcagatatgaggatgttgagctggattagtggtaagactagatgagataggattaggaaggacaccattagagagagtgtgggggtagcaccta 25300249  T
Q  416 ta 417  Q
    ||    
T  25300250 ta 25300251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 118 - 417
Target Start/End: Original strand, 25288613 - 25288916
Alignment:
Q  118 aaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctggg--tggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaa 215  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |    
T  25288613 aaaatgacggggaaatagaagcatatgtaaatcatcgtatgcaagcagggggtgtttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagta 25288712  T
Q  216 ccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaag 315  Q
    ||| ||||| |||||| || ||| ||||  ||| ||||  ||||| | |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  25288713 ccaattaagttgaaaggaaagttctatcacacaacagttcgaccggcgatgttgtatgctacggagtgttgggcggttaagagccaacacgagaatcaaa 25288812  T
Q  316 taagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagaga--gtgggggtagcacc 413  Q
    ||||| || | || |||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  25288813 taagtgtagcagatatgaggatgttgagctggattagtggtaagactagatgagataggattaggaaggacaccattagagagagtgtgggggtagcacc 25288912  T
Q  414 tata 417  Q
    ||||    
T  25288913 tata 25288916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 352 - 665
Target Start/End: Original strand, 21121105 - 21121407
Alignment:
Q  352 gtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatg 449  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||  |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||            |||  |||||||    
T  21121105 gtggtaagactagacgggataggattagaaatggcaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtacaaaa------------taggtttagatg 21121192  T
Q  450 gtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnn 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  || |||||||||| ||||||  |||||||||||||||| | | ||||          
T  21121193 gtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggacgagagttaggttaaaagaggtagagggagacctaagaaa 21121292  T
Q  550 nccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccg 649  Q
     | ||||||||||  |||||||| |||||||| || |||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  21121293 tctattagagaaaccattagaaaggatttagaagtcaatgagttggatcctaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgat-catgtagccg 21121391  T
Q  650 atcccacttaatggga 665  Q
    | |||||||| |||||    
T  21121392 accccacttagtggga 21121407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 325 - 668
Target Start/End: Original strand, 45419159 - 45419500
Alignment:
Q  325 cggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 424  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||   |||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  45419159 cggagatgaagatgttgcgttggattagtggtaagactagaagggataagattaggaatgacaccattagagagaattggggtagcacctatagtagaaa 45419258  T
Q  425 agttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaa 524  Q
    || ||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||  | ||  ||||  || |||| ||||||||||||| | |       
T  45419259 agatggtataaaatagacttaggtggtttgggcatgtagagataagacctgtagaggc--tagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcagatctg 45419356  T
Q  525 aagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacacta 624  Q
    |||||||||| ||| ||||       | || ||||||| |||||| || | |||| |    |||||||| |||| |||| | |||| |||||||||| ||    
T  45419357 aagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaaggtttaaatcataatgagtttgatccaaatttggtttatgatagaacatta 45419456  T
Q  625 tgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||  || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  45419457 tggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 45419500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 477 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 42469935 - 42469744
Alignment:
Q  477 agatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgat 576  Q
    |||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||       ||||| ||||||  |||||||| |||    
T  42469935 agatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagat 42469836  T
Q  577 ttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  42469835 ttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttattgggataa 42469744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 6511059 - 6510619
Alignment:
Q  45 taccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacccaagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatg 144  Q
    |||||||||||| || |||| |||||| || |  ||||||||||| ||| |||||||||||| ||| || || ||| ||| |||||||| ||||||| |     
T  6511059 taccttggaggtaaaggttgaagatcacataac-cccaagttacatggtataaatatcttggatccgtagtataaagtgaaggagaaatggaagcaggtc 6510961  T
Q  145 -taaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttg-tgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttat 242  Q
     ||||| || | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||  ||  |||||| |||||| || ||| ||     
T  6510960 ataaatcattgcattcaagttgagtggttgaaatggagaagagtctcatgtggtttgatgtgataagaaagtactgcttaagttgaaaggaaagttctaa 6510861  T
Q  243 cggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgc 342  Q
    | ||||  |||||||||||| |||         ||  |||  ||| |||||||| |||||||    | |  ||||||| || ||| |||||||||||||     
T  6510860 cagacattagtcagaccgacgatg---------acatagtcttggacggttaagtgccaacatactaatcgagtaagtgtagcgg-gatgatgatgttgt 6510771  T
Q  343 gttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtc 442  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||  ||||||||||||  |||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |       
T  6510770 gttggataagtggtaagactagatgagatatgattagaaatgacaccattgaagagagagagcgtagcacctataatagaaaagttggtagaaaacaaat 6510671  T
Q  443 ttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaag 494  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||    
T  6510670 ttagatggtttgggcatgtagagagaagatctgtagatgccgtcgtaagaag 6510619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 213
Target Start/End: Original strand, 13984672 - 13984842
Alignment:
Q  43 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcag 141  Q
    ||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||   ||||||| ||||||    
T  13984672 tctaccttgaaggtgaaagaagaagatcatatcataccccaagatacacggtttaaatatcttgggtccatagta-aaaatgacaaagaaataaaagcag 13984770  T
Q  142 atgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaa 213  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| || ||||||||||    
T  13984771 atgtaaatcatcgtatttaagttggatggttgaaatgaagaagagcctcaagtgttttatgtgataagaaaa 13984842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 400
Target Start/End: Original strand, 29735454 - 29735802
Alignment:
Q  43 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcag 141  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||        ||||||| | |||||||| |||||||||||||||     
T  29735454 tctaccatggaggtgaaagtgggagatcatatcataccccaagttatacgatttaaac-------gtccatagttcaaaatgacggagaaatagaagcat 29735546  T
Q  142 atgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggtttta 241  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||| || |  | |||||||  ||  |||||| |||||  ||  || ||    
T  29735547 atgtaaatcatcttattcaagttgggtggttgaaatggagatgagt-tcatgtgtgttatctggtaagaaagcactgcttaagttgaaatgaaaattcta 29735645  T
Q  242 tcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttg 341  Q
    |||||||| |||||||   || |||||||| ||||  ||||| || | | |||| | ||||||||||| | || ||||  ||  |||||||| |||||||    
T  29735646 tcggacagtagtcaga---acgatgttgtatggtaaagagtgttgagtgattaaaaaccaacacgagaatgaaataagcgtagtggagatgaggatgttg 29735742  T
Q  342 cgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacacca-ttagagagag 400  Q
     ||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  29735743 tgttggatgaatggtaagactagacgagaaagaattaagaataacaccatttagagagag 29735802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 58 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 30113827 - 30113416
Alignment:
Q  58 aaagttggagatcatatcatac-ccaagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaata-gaagcagatgtaaattatcgt 155  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| |  ||| ||||||||||  ||  ||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| || ||    
T  30113827 aaagttggagatcatatcatactccaaattatatagttcaaatatcttgaatctgtaatataaaatgacggagaaaaaagaagcagatgtaaatcattgt 30113728  T
Q  156 attcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtca 255  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||| |||  ||||| |||||||||  || ||||| ||| |  |||    
T  30113727 attcaagctaaatggttgaaatggagaagagtcgcaggtgttttatgtgataag-aaataccgattaagttgaaagaaaaattatatcgaacaactatca 30113629  T
Q  256 gaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtgg 355  Q
     |  ||| |||||||| | || ||| || |  |||||||||| |||||| |||| |||| ||||  ||  ||||||||  |||||| | | ||||  ||     
T  30113628 aattgacgatgttgtatgatatggaatgttatgcggttaagaaccaacatgagaataaaataagcgtagaggagatgagaatgttgtgctagatgtttgt 30113529  T
Q  356 taagactagacaagataggattaagaatgacaccatt--agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggttt 453  Q
    ||||| |||| | |||| ||||| ||||||||  |||  ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||    
T  30113528 taagaatagatatgataagattatgaatgacattattagagagagagtcggggtaacacatatagtagaaaagatggtagaaaataggtttaattggttt 30113429  T
Q  454 ggacatgtagaga 466  Q
    || ||| ||||||    
T  30113428 gggcatatagaga 30113416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 118 - 260
Target Start/End: Original strand, 25439249 - 25439391
Alignment:
Q  118 aaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaacc 217  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||    
T  25439249 aaaatgacggagaaatagaagcatatgtaaatcatcgtatgcaagcaggatggttgaaatggagaagagtctcgggtgttttgtgtgataagaaagtacc 25439348  T
Q  218 acttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccg 260  Q
    ||||||| |||||| || ||| ||||  ||| |||||||||||    
T  25439349 acttaagttgaaaggaaagttctatcacacaacagtcagaccg 25439391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 423 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 26905168 - 26904924
Alignment:
Q  423 aaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggtt 522  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||| || | || |||||||||| |||||  || |||||||||| ||||||| | |     
T  26905168 aaagttggtagaaaataggcttagatgatttagatatgtagagagaaaactcatacatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaagagagtcagata 26905069  T
Q  523 aaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacac 622  Q
    |||||||||||| | | ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||| | ||| |||||    
T  26905068 aaaagaggtagagggagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaataagttgga-ccaaatatagtttataataaaacac 26904970  T
Q  623 tatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||| ||| |||  ||||||| ||||    
T  26904969 tatgtcgtaatttgatccatatagtcgaccccgtttaatggaataa 26904924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 46 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 28300747 - 28300596
Alignment:
Q  46 accttggaggtgaaagttggagatcatatcatacccaagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgt 145  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||  |||| ||| ||||||||||    
T  28300747 accttagaggtgaaagctggagatcatatcatac--aagttacacagtttaaatatcttgggttcatggtacaaaatgactgagatataaaagcagatgt 28300650  T
Q  146 aaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtttt 199  Q
    | || |||||||||||| ||| ||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  28300649 acatcatcgtattcaagttggatggttaaattggagaagagactcggatgtttt 28300596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 551 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 14742213 - 14742099
Alignment:
Q  551 ccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccga 650  Q
    ||||| ||||||  |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14742213 ccattcgagaaaccattagaaaagatttagaagtcaatgagttggatccaaatat---ttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 14742117  T
Q  651 tcccacttaatgggataa 668  Q
     |||||||| ||||||||    
T  14742116 ccccacttagtgggataa 14742099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 337 - 473
Target Start/End: Original strand, 32043522 - 32043660
Alignment:
Q  337 tgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggtaga 434  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  32043522 tgttgcgttggatgtgtggtaagactagacgggatagaattagaaatgacaacattagagagagagttggggtatcacctatagtacaaaagatggtaga 32043621  T
Q  435 aaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    || ||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  32043622 aactagactttggtggtttggccatgtagagagaagacc 32043660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 55 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 19293913 - 19293776
Alignment:
Q  55 gtgaaagttggagatcatatcatacccaag-ttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatc 153  Q
    |||||||||| ||| | ||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |  |||||| | |||||||||||||| |||    
T  19293913 gtgaaagttgaagaacgtatcaaaccccagattacacggtttaaatatctttggtccagagtacaaaatcacagagaaaaaaaagcagatgtaaataatc 19293814  T
Q  154 gtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctca 191  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  19293813 gtatttaagttgggtggttgaaatggagaatagtctca 19293776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 354 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 43905000 - 43904700
Alignment:
Q  354 ggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagag-tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagt---cttagatg 449  Q
    ||||||||||||  | ||||||| || ||||||| ||||||||||   | || |||||| |||||||||||||| |||  ||||||| |   ||||| ||    
T  43905000 ggtaagactagatgaaataggataaaaaatgacaacattagagaggtattggcgtagcatctatagtagaaaagatggaggaaaataataagcttaggtg 43904901  T
Q  450 gtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnn 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||  || || ||||| ||| |||| |||||||| ||||   ||| |||||||| | ||| ||||          
T  43904900 gtttggacatgtagagagaagacctatagatgttgtagtaagaagaatagatcagatggaggatagtcaaattacaagaggtacaggaagacctagaaat 43904801  T
Q  550 nccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccg 649  Q
     | || |||||||   |||  |  ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  43904800 actataagagaaacggttatgagagatttagagattaatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccg 43904701  T
Q  650 a 650  Q
    |    
T  43904700 a 43904700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 504 - 668
Target Start/End: Original strand, 2027631 - 2027795
Alignment:
Q  504 aatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaat 603  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||  ||  ||||    
T  2027631 aatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttatattcaaat 2027730  T
Q  604 atagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccga-tcccacttaatgggataa 668  Q
    || |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |  |||||||| ||||||||    
T  2027731 atggtttatgatagaacactatgacgccatttgatcc-tgtagccaacccccacttagtgggataa 2027795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 264 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 13172072 - 13171865
Alignment:
Q  264 atgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagacta 363  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||  | | |||| |||| | | | |||||||  ||||||| ||||||| || |||||||||    
T  13172072 atgttgtatggtacagagtgttgggcggttaagaaccaacataaaaataaattaagcacatcagagatgagaatgttgcattggatgtgtagtaagacta 13171973  T
Q  364 gacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgt 461  Q
    |||  ||||||||||  |||||||  ||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| |||||||| ||| |    
T  13171972 gacgggataggattagaaatgacaagattagagagagagttggggaagcacctatagtagaaaagatggtggaaaatatgcttaggtggtttgggcatat 13171873  T
Q  462 agagagaa 469  Q
    | ||||||    
T  13171872 aaagagaa 13171865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 41444949 - 41444809
Alignment:
Q  43 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtcca-taatacaaaatgatggagaaatagaagca 140  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  41444949 tctaacttagaggtgaaaggtggagatcatatcataccacaagttacttggtttaaatatcttgggttcaatgatacaaaatgatgtagaaatagaagca 41444850  T
Q  141 gatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggag 181  Q
      ||||||| || | || |||||  ||||||||||||||||    
T  41444849 agtgtaaatcattgaatacaagcaaggtggttgaaatggag 41444809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 461 - 668
Target Start/End: Original strand, 12025847 - 12026045
Alignment:
Q  461 tagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagaga 560  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||  || ||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||            ||| |    
T  12025847 tagagagaagatccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatagagaagagtcaggttaaaagaggtaaatgaagaccta-----------aga-a 12025934  T
Q  561 aattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatga---cgtcatttgatccatgtagccgatcccact 657  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||| || |||    
T  12025935 aaccattagaaaagatttagaggtcaataagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcgtcatttgatccatgtaaccgaccctact 12026034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 565 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 15215532 - 15215429
Alignment:
Q  565 attagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggg 664  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  15215532 attagaaaagatttagagatcaatgagtttgatccaaatatggtttttaatagaacactatgacgtcatatgatccatgtagccgaccccacttagtagg 15215433  T
Q  665 ataa 668  Q
    ||||    
T  15215432 ataa 15215429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 553 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 25473535 - 25473420
Alignment:
Q  553 attagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatc 652  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||| | || | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  25473535 attagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagtttgatccaaatttggtgtatgatagaacactatagcgtcatttgatccatgtagccgacc 25473436  T
Q  653 ccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||| ||||||||    
T  25473435 ccacttagtgggataa 25473420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 93 - 207
Target Start/End: Original strand, 35601686 - 35601799
Alignment:
Q  93 tttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcag 192  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||  |||||| | ||||||||||||| |||||     
T  35601686 tttaaatatcttggatccataatacaaaatgacagagaaatagacgtagatgtaaattatcgaattcaa-ttgggtgatagaaatggagaagactctcaa 35601784  T
Q  193 gtgttttgtgcgata 207  Q
    |||||||||| ||||    
T  35601785 gtgttttgtgtgata 35601799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 574 - 668
Target Start/End: Original strand, 44529396 - 44529490
Alignment:
Q  574 gatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  44529396 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 44529490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 33830875 - 33830721
Alignment:
Q  43 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacccaagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcaga 142  Q
    |||||||| ||  ||||||||||| ||| |||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||| | ||||||| ||||| |    
T  33830875 tctaccttagacatgaaagttggatatcttatcatat--aagttacacagtttaaatattttgggtccattgtacaaaatgacgaagaaataaaagcata 33830778  T
Q  143 tgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtttt 199  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||||  ||||||||||| |||||||    
T  33830777 tgtaaatcatcgtgttcaagttggatggttaaaatgttgaagagtctcaagtgtttt 33830721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 199
Target Start/End: Original strand, 38667205 - 38667351
Alignment:
Q  52 gaggtgaaagttggagatcatatcatacccaagttacacggttt-aaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaatt 150  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||     
T  38667205 gaggtgaaacttggagatcatatcatac--aagttacaaagttttaaatatcttgggttcatagtacaaaacgatagagaaataaaagaagatgtaaatc 38667302  T
Q  151 atcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtttt 199  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||| ||| |||| || | |||||||    
T  38667303 atcgtattaaagttggatggttgaaatagagtagagcctaatgtgtttt 38667351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 339 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 44681387 - 44681251
Alignment:
Q  339 ttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagaga--gtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 436  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||||||  || | ||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  44681387 ttgcattggatgtgtggtaagactagacgagataagattagaaatgacaacattagagagacagttgtggtagcacctataatagaaaagatggtggaaa 44681288  T
Q  437 atagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    |||  |||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  44681287 ataagcttagaaggtttggaaatctagagagaagacc 44681251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 374 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 12797011 - 12796900
Alignment:
Q  374 gattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||| |||||||||||     
T  12797011 gattaggaataacaccattagaaagagtggaggtaacacctatagaagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttaggcatgcagagagaagact 12796912  T
Q  474 cgtagatgccgt 485  Q
    ||| ||| ||||    
T  12796911 cgttgattccgt 12796900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 18849797 - 18849624
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||   | | | |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18849797 gtatatggaatataacgtcaacaaaaggtgaagta--gttatgccttagaggtaaaaattggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatc 18849700  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctc 190  Q
    ||       || || ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||     |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18849699 tt-------tagtataaagtgacggagaaatagaagcaaatgtaaatcatc-----caagctgggtggttgaaatggataagagtctc 18849624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 199
Target Start/End: Original strand, 25985179 - 25985334
Alignment:
Q  43 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcag 141  Q
    |||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||  ||||||||||||||| ||    
T  25985179 tctagcttagaggtgaaagttgga--tcatatcataccacaagttacacggtttaaatatattggatctatagtacaaaaatatggagaaatagaaggag 25985276  T
Q  142 atgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtttt 199  Q
    |||||||  || | || |||  ||||| |||||||||||| || | |||| |||||||    
T  25985277 atgtaaaccattgaatccaaaatgggtagttgaaatggaggagtgcctcaagtgtttt 25985334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 330 - 480
Target Start/End: Original strand, 30748384 - 30748534
Alignment:
Q  330 atgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttg 429  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| | ||| |||||  ||||||||||| ||    
T  30748384 atgaggatgtttcgttggatgtgtggttagattagacatgataggattagaaatgacaacattacagagagttgtggtcgcaccagtagtagaaaagatg 30748483  T
Q  430 gtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagat 480  Q
    || |||   || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  30748484 gtggaatcaaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagat 30748534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 328 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 10080264 - 10080119
Alignment:
Q  328 agatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagag--agagtgggggtagcacctatagtagaaaa 425  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||  ||||| | ||||||| ||| |||||||||    
T  10080264 agatgatgatgttgcgttgggtgtttggtaagactagacgagataagattagaaatgacaacattagagagagagttgaggtagcatcta-agtagaaaa 10080166  T
Q  426 gttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    | |||| |||| ||| | | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  10080165 gatggtggaaactaggcct-gatggtttgggcatgtagagagaagacc 10080119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 576 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 44047641 - 44047549
Alignment:
Q  576 tttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  44047641 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacaccatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataa 44047549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 50 - 212
Target Start/End: Original strand, 13589084 - 13589247
Alignment:
Q  50 tggaggtgaaagttggagatcatatcata-cccaagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaa 148  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||| | |  ||| || |||||||  || || ||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  13589084 tggaggtgaaagtgagagatcatatcaaatcccaagttacatgatacaaaaatattgggtcgttagtataaaatgatgaagaaatagaagcatatgaaaa 13589183  T
Q  149 ttatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaa 212  Q
    | | | |||||||| ||| ||||||||||||||||||| || | ||||||| ||| ||||||||    
T  13589184 tcaccatattcaaggtggatggttgaaatggagaagagcctgatgtgttttatgctataagaaa 13589247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 328 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 42493663 - 42493536
Alignment:
Q  328 agatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagt 427  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| |||||   ||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||     
T  42493663 agatgaggatgttgcgttggttgtgtggtaagattagtcaagattggattgtaaatgacaacattggagagagttggggtaacacctatagtagaaaaga 42493564  T
Q  428 tggtagaaaatagtcttagatggtttgg 455  Q
    | || |||| ||| ||||| ||||||||    
T  42493563 ttgtggaaactaggcttaggtggtttgg 42493536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 574 - 668
Target Start/End: Original strand, 490506 - 490600
Alignment:
Q  574 gatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||| |  |||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  490506 gatttagagattgatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 490600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 294 - 445
Target Start/End: Original strand, 13986383 - 13986536
Alignment:
Q  294 aagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt- 392  Q
    |||| ||||||||||| | | ||||| ||| ||||||||| |||||| |  |||||||||||||| ||||||| |||||  |||| |||||||| ||||     
T  13986383 aagaaccaacacgagaatcaggtaagcatagcggagatgaggatgttacactggatgagtggtaatactagacgagatataattaggaatgacatcatta 13986482  T
Q  393 -agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtctta 445  Q
     |||| || | |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||    
T  13986483 aagagggatttggggtagcacctatagtacaaaatatggtagaaaatagactta 13986536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 346 - 436
Target Start/End: Original strand, 25985462 - 25985552
Alignment:
Q  346 ggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 436  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25985462 ggatgtgtggtaagacaagacaggatagaattagaaacgacaacattagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaa 25985552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 556 - 668
Target Start/End: Original strand, 29520802 - 29520914
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccca 655  Q
    ||||||| | |||| || ||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  29520802 agagaaactgttaggaacgatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagcccacccca 29520901  T
Q  656 cttaatgggataa 668  Q
     ||| ||||||||    
T  29520902 tttagtgggataa 29520914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 357 - 480
Target Start/End: Original strand, 9695583 - 9695708
Alignment:
Q  357 aagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttg 454  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  ||||||| ||||| |||||   | |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | ||||| |||||||    
T  9695583 aagactagacaggatagaattagaaatgacaacattatagagatatttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactcggcttaggtggtttg 9695682  T
Q  455 gacatgtagagagaagacccgtagat 480  Q
    | |||||||||||||| || ||||||    
T  9695683 ggcatgtagagagaagtcctgtagat 9695708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 566 - 656
Target Start/End: Original strand, 25300262 - 25300352
Alignment:
Q  566 ttagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccac 656  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||| || |||||    
T  25300262 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatataacactatgacataatttgatctatgtagctgaccccac 25300352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 607 - 665
Target Start/End: Original strand, 36042402 - 36042460
Alignment:
Q  607 gtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggga 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  36042402 gtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagcggaccccaattaatggga 36042460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 356 - 478
Target Start/End: Original strand, 7046285 - 7046409
Alignment:
Q  356 taagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgg--gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggttt 453  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||  |||||||||| || ||||||||| |||| |||  | | ||||| ||||||    
T  7046285 taagactagacatgataggattagaaatgacaacattagagagagaggctgggtagcaccaatcgtagaaaagatggtggaacctcggcttagctggttt 7046384  T
Q  454 ggacatgtagagagaagacccgtag 478  Q
    || ||||||||||||| || |||||    
T  7046385 gggcatgtagagagaaaacacgtag 7046409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 555 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 45041445 - 45041333
Alignment:
Q  555 tagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccc 654  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||| ||||||  || |||| ||| |||||||||||||||| || |||    
T  45041445 tagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaa-tatggtttatgatagcgcattatggcgtaatttgatccatgtagctgacccc 45041347  T
Q  655 acttaatgggataa 668  Q
    ||||| ||||||||    
T  45041346 acttagtgggataa 45041333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 393 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 2776522 - 2776434
Alignment:
Q  393 agagagag-tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagat 480  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| | | ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  2776522 agagagagctgggggtagcacctatcgtagaaatgatggtagaaactcggcttaggtggtttgggcatgttgagagaagacccgtagat 2776434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 294 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 45512889 - 45512709
Alignment:
Q  294 aagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatta 393  Q
    |||| ||||||||| | |||| |||| ||| |||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||| | | |||| |||  ||||| |  ||||    
T  45512889 aagaaccaacacgaaaataaaataagcatagcggagatgagaatgtttcgttggatgtgtggtaagactagatagg-tagggttagaaatgaaaatatta 45512791  T
Q  394 gagagagtg----ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaaga 471  Q
     |||||| |    |||||||||||||||||||||||| || | |||||||  |||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  45512790 aagagagggagttggggtagcacctatagtagaaaagatgatggaaaataagcttagatggtttgggcatataaagagaaga 45512709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 2518742 - 2518605
Alignment:
Q  336 atgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtag 433  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||  ||||||||||   | ||||||||||||  |||||||||| |||| |    
T  2518742 atgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcacctcaagtagaaaagatggtgg 2518644  T
Q  434 aaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    |||||||  |||| |||||||   |||||||||||||||    
T  2518643 aaaataggtttaggtggtttgattatgtagagagaagac 2518605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 424
Target Start/End: Original strand, 29520583 - 29520681
Alignment:
Q  328 agatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt--agagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 424  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||  ||||| ||||||  ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  29520583 agatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgggataggattagaaatgataccattagagagagagttggggtggcatctatagtagaaa 29520681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 473
Target Start/End: Original strand, 36143243 - 36143435
Alignment:
Q  279 gagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggatta 378  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||| | |   || | ||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  36143243 gagtgttgggcggtgaagaaccaacacgagaataaaatcaacgtagcagagatgaggatgttgtgttggtcgtgtggtaagactagatgagataggatta 36143342  T
Q  379 agaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
      || || |  |||||||||  | | |||||||||||||| |||| || |||| |||||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||    
T  36143343 gaaaggaaaagattagagag--tcgaggtagcacctatagcagaatagatggtggaaaatagacttaggtggtttgggcatttagagaaaagacc 36143435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9905309 - 9905223
Alignment:
Q  264 atgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatg 350  Q
    |||||||| |||||  |||| ||| ||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  9905309 atgttgtatggtacatagtgttggacggttaataaccaacacgagaataaagttagtataacggagatgaggatgttgcattggatg 9905223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 45332117 - 45332039
Alignment:
Q  58 aaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatag 135  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||| | |||||||||||    
T  45332117 aaagttggagatcatgtcataccacaagttacacggtttaaatatcctggcttcatagtacaaaacggtggagaaatag 45332039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 556 - 645
Target Start/End: Original strand, 30559846 - 30559935
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgta 645  Q
    ||||||| ||| || || ||||||||| | ||||||||||||| | |||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  30559846 agagaaactatcaggaaagatttagagattaatgagttggatccatatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgta 30559935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10824609 - 10824546
Alignment:
Q  166 ggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaa 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||| ||||| ||||    
T  10824609 ggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttatgtgatacgaaaataccagttaagttgaa 10824546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 39760845 - 39760683
Alignment:
Q  266 gttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 365  Q
    |||||| || |||| ||| ||| |||| |||| |||| ||||||  |||  |||| || | ||||||| ||||||| |||||||| |||||| || ||||    
T  39760845 gttgtatgggacggggtgttggacggtaaagaaccaatacgagaaaaaatgaagtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaggattaga 39760746  T
Q  366 caagataggattaagaatgacaccattagag--agagtgggggtagcacctatagtagaaaag 426  Q
    |||||||||| ||  ||||| | ||||||||  ||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  39760745 caagataggagtagaaatgataacattagagacagagttgggttagcacctatcgtagaaaag 39760683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 186
Target Start/End: Original strand, 6986525 - 6986603
Alignment:
Q  108 tccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagag 186  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||   |||||| |||||||    
T  6986525 tccataatacaaaatgatagagaaatcgaagcatatgtaaattatcgaattcaatctgagtgaccgaaatgaagaagag 6986603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 566 - 656
Target Start/End: Original strand, 25288927 - 25289017
Alignment:
Q  566 ttagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccac 656  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||||| | |||||||| || |||| || |||||    
T  25288927 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatataactctatgacataatttgatctatttagctgaccccac 25289017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 33666829 - 33666748
Alignment:
Q  354 ggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 436  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  33666829 ggtaaggctagatgagataggattaagaatgacataag-agagagagttggggtagcacctatcgtagaaaagatggtagaaa 33666748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 35914700 - 35914618
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||| | |||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| || |||||    
T  35914700 aatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgagataa 35914618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 39967598 - 39967516
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||  | ||||||||| || ||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  39967598 aatgagttggattgagatatagtttatgttagaacattatggcgtagtttgatccatgtagccgatcccacttattgtgataa 39967516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 41972072 - 41971991
Alignment:
Q  390 attagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41972072 attagagagagttagggtaacaccta-agtagaaaagatggtggaaaataagtttaggtggtttggacatgtagagagaagac 41971991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 668
Target Start/End: Original strand, 43733390 - 43733471
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||  |||| | ||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43733390 aatgagttggataaaaatgt-gttttggatagaacactatggcgtcgtttcattcatgtagccgatcccacttagtgggataa 43733471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 607 - 668
Target Start/End: Original strand, 30689939 - 30690000
Alignment:
Q  607 gtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  30689939 gtttatgatataacattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 30690000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 556 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 35643735 - 35643625
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccca 655  Q
    |||||||||||||  || ||| ||||| | ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||  || | |  |||||||||||||||| | ||||    
T  35643735 agagaaattattaagaaagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacac--tgccatattttgatccatgtagcctacccca 35643638  T
Q  656 cttaatgggataa 668  Q
    |||| ||||||||    
T  35643637 cttagtgggataa 35643625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 403 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 41444608 - 41444547
Alignment:
Q  403 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtaga 464  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||  |||| |||||||||||||||||    
T  41444608 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggtttaggtggtttggacatgtaga 41444547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 327 - 424
Target Start/End: Original strand, 16351312 - 16351411
Alignment:
Q  327 gagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtagaaa 424  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||   ||||  |||  ||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||    
T  16351312 gagatgaagatgttgcgttggatatgtggtaagactagacggaatagagttagaaatgacaacattagagagagaattagggtagcacctatagtagaaa 16351411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 612 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 32569783 - 32569727
Alignment:
Q  612 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  32569783 tgatagaacactatgacgtcatttgatttatgtagccgaccccatttagtgggataa 32569727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 600 - 656
Target Start/End: Original strand, 36143538 - 36143594
Alignment:
Q  600 aaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccac 656  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  36143538 aaatatggtttatgatagaacattatgacgtcatctgatccatgtagccgaccccac 36143594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 613 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 1928659 - 1928604
Alignment:
Q  613 gatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  1928659 gatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 1928604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 557 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 7531772 - 7531661
Alignment:
Q  557 gagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccac 656  Q
    |||||| |||||| || ||| ||||| |||||||||||||   | | || ||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| | |||    
T  7531772 gagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatggtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcatgtagccgaactcac 7531673  T
Q  657 ttaatgggataa 668  Q
    ||| | ||||||    
T  7531672 ttagtaggataa 7531661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 613 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 10668569 - 10668514
Alignment:
Q  613 gatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||    
T  10668569 gatagaacactatgaggtcatttgatcgatgtagccgacctcacttagtgggataa 10668514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 571 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 10824303 - 10824224
Alignment:
Q  571 aatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccga 650  Q
    |||||||| ||| | ||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||    
T  10824303 aatgatttggagattaatgaattggaccaaaatatggtttttgatagaacattatgaagtaagttgatccatgtagccga 10824224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 335 - 417
Target Start/End: Original strand, 25439397 - 25439477
Alignment:
Q  335 gatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctata 417  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||| || ||| || ||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  25439397 gatgttgcgctggattagtggtaagactagatgagataggaataggaacgataccatt--agagagtgggggtagcaactata 25439477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 578 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 30812923 - 30812836
Alignment:
Q  578 tagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggga 665  Q
    ||||| |||||||||||||   | | || ||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  30812923 tagagataaatgagttggaaaaagacatggtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtggga 30812836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 556 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 8879573 - 8879462
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccca 655  Q
    |||||||  |||| |||||||||||| || ||| ||||| ||| |||||| |||| ||||| |||||  |||||| |||| ||||||||||||||  |||    
T  8879573 agagaaaccattaaaaatgatttagaagtcaataagttgaatccaaatatggtttatgatataacac--tgacgtaatttaatccatgtagccgactcca 8879476  T
Q  656 cttaatgggataaa 669  Q
    |||| | |||||||    
T  8879475 cttattaggataaa 8879462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 406 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 18474239 - 18474173
Alignment:
Q  406 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  18474239 gtagcacctatagtagaaatgatggtggaaactaggcttagttggtttgagcatgtagagagaagac 18474173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 668
Target Start/End: Original strand, 23492217 - 23492299
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||  ||||||  | | |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  23492217 aatgagttggatagaaatatgatatatgatagaacactatggtgtcatttaatccatgtagccgaccccacttagtgagataa 23492299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 403 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 25985881 - 25985812
Alignment:
Q  403 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||  |||||||  ||| |||||||||||||    
T  25985881 ggggtagcacctatagtagaaaagtttgtagaaactagactta-ttggtttgtgcatttagagagaagacc 25985812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 395 - 473
Target Start/End: Original strand, 29700268 - 29700346
Alignment:
Q  395 agagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||| | | ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||    
T  29700268 agagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggaggaaagttggcttaggtggtttgggcatatagagaaaagacc 29700346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 556 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 30456423 - 30456329
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccga 650  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||  ||| | |||| ||   | |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  30456423 agagaaactattagaaatgatctagatataactaagttcgagaaagatattgtttttgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccga 30456329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 414 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 35643872 - 35643814
Alignment:
Q  414 tatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  35643872 tatagtagaaaagatggtggaaaatatgcttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 35643814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 7615690 - 7615613
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgg 663  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||| || |||||||| ||||| |||||  ||||||||||    
T  7615690 aatgagttggatcgaaatatagtttatgataaaatattatgatgtaatttgatcgatgtaaccgatgacacttaatgg 7615613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 454
Target Start/End: Original strand, 16252855 - 16252984
Alignment:
Q  325 cggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 424  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||  |||||  ||||  ||||||| ||||||||||||| | ||| || ||||| | |||||    
T  16252855 cggaaatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagattagatgagataaaattagaaatgacaacattagagagagttgaggttgctcctatggaagaaa 16252954  T
Q  425 agttggtagaaaatagtcttagatggtttg 454  Q
    || || |||||| ||| ||  |||||||||    
T  16252955 agatgatagaaactagactaggatggtttg 16252984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 473
Target Start/End: Original strand, 16705700 - 16705832
Alignment:
Q  343 gttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtc 442  Q
    ||||| || ||||||||||||||   ||||| ||||  ||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||| |||| || | ||| |    
T  16705700 gttggttgtgtggtaagactagatgggatagaattagaaatgacaacattagagagagttggagtagcatctatagtaaaaaagatggtggagactaggc 16705799  T
Q  443 ttagatggtttgg--acatgtagagagaagacc 473  Q
    |||  | ||||||  | ||||||||||||||||    
T  16705800 ttaagtagtttgggcatatgtagagagaagacc 16705832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 612 - 669
Target Start/End: Original strand, 32276894 - 32276951
Alignment:
Q  612 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataaa 669  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  32276894 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagacgaacccacttagtgggataaa 32276951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 556 - 665
Target Start/End: Original strand, 32931114 - 32931222
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccca 655  Q
    ||||||| |||||| || ||||| ||  | ||||||||||| | |||||| || | |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| ||||    
T  32931114 agagaaactattaggaaagattttgaaattaatgagttgga-cgaaatatggtgtatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgacccca 32931212  T
Q  656 cttaatggga 665  Q
    |||| |||||    
T  32931213 cttagtggga 32931222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 190
Target Start/End: Original strand, 35601501 - 35601598
Alignment:
Q  93 tttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctc 190  Q
    |||||||||||||| || | | |||| || || | ||||| ||| | ||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  35601501 tttaaatatcttggatctaaagtacacaacgacgaagaaagagacgtagatgtaaattatcgaattcaatccgggtgattgaaatggagaatagtctc 35601598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 37256080 - 37256011
Alignment:
Q  324 acggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatta 393  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |  |||||| ||||  |||||||||||||    
T  37256080 acggagatgatgatgttgcgttgaatgagtggttaaactaaatgagatagaattagaaatgacaccatta 37256011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 43732279 - 43732230
Alignment:
Q  53 aggtgaaagttggagatcatatcata-cccaagttacacggtttaaatat 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  43732279 aggtgaaagttggagatcatatcatagcacaagtaacacggtttaaatat 43732230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 197
Target Start/End: Original strand, 43732355 - 43732396
Alignment:
Q  156 attcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 197  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43732355 attcaagttgggtggttgaaatggagaagagtctcaagtgtt 43732396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 393 - 473
Target Start/End: Original strand, 13589476 - 13589556
Alignment:
Q  393 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    ||||||||| | |||||| |||||| |||||||  ||||||||||||   |||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  13589476 agagagagttgaggtagcgcctataatagaaaatatggtagaaaatatgattaggtggtttgaacatgttgagagaagacc 13589556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 301 - 470
Target Start/End: Original strand, 16917080 - 16917251
Alignment:
Q  301 aacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatta--gagag 398  Q
    ||||||| | |||| |||| ||| | |||||||  |||||||||||  |  ||||||||||| | |  ||||||||||| ||||||| |||||  || |     
T  16917080 aacacgaaaataaattaagcatagcagagatgagaatgttgcgttgactttgtggtaagactcggctggataggattaaaaatgacaacattagtgataa 16917179  T
Q  399 agtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaag 470  Q
    ||| ||||||| ||| | |||||||||| ||||  ||| ||| ||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  16917180 agttggggtagtaccgaaagtagaaaagatggtgcaaactaggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaag 16917251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 612 - 668
Target Start/End: Original strand, 26055630 - 26055686
Alignment:
Q  612 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||| ||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26055630 tgattgaacattatgatggcgtttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataa 26055686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 575 - 647
Target Start/End: Original strand, 31715992 - 31716064
Alignment:
Q  575 atttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagc 647  Q
    |||||||| | ||| ||||||||| |||||| ||||  ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  31715992 atttagagattaattagttggatccaaatatggtttaagatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagc 31716064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 556 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 39953393 - 39953281
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccca 655  Q
    ||||||| |||||| || ||| ||||| |||||||||| ||   ||| || ||||||||| | ||||||||  ||  |||||| ||||||||||| ||||    
T  39953393 agagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttagagaaaaacatggtttttgatgggacactatggagttgtttgattcatgtagccgacccca 39953294  T
Q  656 cttaatgggataa 668  Q
    |||| ||||||||    
T  39953293 cttagtgggataa 39953281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 480
Target Start/End: Original strand, 78988 - 79120
Alignment:
Q  353 tggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa---aatagtcttaga 447  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||  ||  ||| ||||||||||||  |  ||||| |||||| |||||||| | ||||||||   | ||| |||||     
T  78988 tggtaagactagacgggataggattagaaacaacaacattagagagagcattcgggtaacacctacagtagaaatgatggtagaaattactaggcttagg 79087  T
Q  448 tggtttggacatgtagagagaagacccgtagat 480  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  79088 tggtttgggcatgtatagagaagacctgtagat 79120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 574 - 657
Target Start/End: Original strand, 2216458 - 2216540
Alignment:
Q  574 gatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccact 657  Q
    ||||||||| | |||||||||||||  ||||| |||| |||||||||| |||   || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  2216458 gatttagagatcaatgagttggatcctaatat-gtttatgatagaacattatagtgtaatttgatccatgtagccgaccccact 2216540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 410 - 473
Target Start/End: Original strand, 29645044 - 29645107
Alignment:
Q  410 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||  |||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  29645044 cacctatagtataaaagatggtggaaaataggtttaattggtttggacatgtaaagagaagacc 29645107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 466
Target Start/End: Original strand, 34196064 - 34196135
Alignment:
Q  395 agagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagaga 466  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||| ||| ||||  |||||||| ||||||||||    
T  34196064 agagagttggggtagcacctatagtagaaaaaacagtagaaactagacttatgtggtttgggcatgtagaga 34196135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 327 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 39953624 - 39953482
Alignment:
Q  327 gagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtg--ggggtagcacctatagtagaaa 424  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||  ||||  ||| |   |||||||||||| |  ||| |||||||||||  |||||    
T  39953624 gagatgagaatgttgcgttggatgtgtggtaagattaaacatgatataattagaaataatgacattagagagagagttgggatagcacctatatgagaaa 39953525  T
Q  425 agttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagag 467  Q
    || ||||||||| |||  |||| |||||| | |||||||||||    
T  39953524 agatggtagaaactagatttaggtggtttaggcatgtagagag 39953482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 357 - 436
Target Start/End: Original strand, 5908594 - 5908675
Alignment:
Q  357 aagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 436  Q
    ||||||||||  |||| |||||  ||||||| |||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  5908594 aagactagacgggataagattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagaacctatagtagaaaagatggttgaaa 5908675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 556 - 650
Target Start/End: Original strand, 14459048 - 14459142
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccga 650  Q
    ||||||| |||||| || ||||| ||| | |||||||| || | |||||| |||| |||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||    
T  14459048 agagaaactattaggaaagatttggagattaatgagttagaccaaaatatggtttatgatggaacattatggtgtaatttgatccatgtagccga 14459142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 574 - 668
Target Start/End: Original strand, 16917354 - 16917447
Alignment:
Q  574 gatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||| | ||||||||||||  |||||| || | |||||||||| | ||||  | |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  16917354 gatttagagattaatgagttggatagaaatatggtatatgatagaacatt-tgactgcttttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataa 16917447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 610 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 18474047 - 18473989
Alignment:
Q  610 tttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  18474047 tttgatagaacattatgacttcgtttgattcatgtagccgacaccacttagtgggataa 18473989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 586 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 28300058 - 28299984
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaa 660  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||| ||||| |||| ||||||||  || | ||||||||| |||||||||||||    
T  28300058 aatgagttggatctaaacatgatttatgataaaacaatatgacgtatttcggtccatgtagtcgatcccacttaa 28299984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 326 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 30783401 - 30783331
Alignment:
Q  326 ggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagag 396  Q
    |||||||| ||| |||||||||||  |||| ||||||||| | ||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  30783401 ggagatgaggatcttgcgttggatctgtggcaagactagataggataggattagaaatgacaacattagag 30783331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 556 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 33827886 - 33827812
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgt 630  Q
    ||||||| ||||| |||  ||||| || | ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  33827886 agagaaactattaaaaaatatttatagattaatgaattggatctaaatatggtttatgatagaacaatatgacgt 33827812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 335 - 401
Target Start/End: Original strand, 36069573 - 36069639
Alignment:
Q  335 gatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagt 401  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||| |||||  || |||| |||||||||||||    
T  36069573 gatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacgggataagattagaaacgacaacattagagagagt 36069639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 410 - 472
Target Start/End: Original strand, 43732563 - 43732625
Alignment:
Q  410 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  || ||||| ||||||| ||||||| | |||||||    
T  43732563 cacctatagtagaaaagatggtagaaacaagacttaggtggtttgcacatgtaaaaagaagac 43732625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 555 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 3464299 - 3464188
Alignment:
Q  555 tagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccc 654  Q
    |||| |||||||||| || |||| | |||| ||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| ||||   |  |||||||||| ||| |||| ||    
T  3464299 tagaaaaattattaggaaagattaa-aggtcaatgagttggacc-aaatataatttatgatagaacattatggtatagtttgatccatatagtcgattcc 3464202  T
Q  655 acttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||||    
T  3464201 acttaatgggataa 3464188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 13172200 - 13172147
Alignment:
Q  133 tagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagag 186  Q
    |||||||| |||| ||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  13172200 tagaagcaaatgtgaatcattgtattcaagcagggtggttgaaatagagaagag 13172147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 17492035 - 17491994
Alignment:
Q  278 ggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaag 319  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17492035 ggagtgttgggcggttaagaaccaacacgagaataaagtaag 17491994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 613 - 650
Target Start/End: Original strand, 24558693 - 24558730
Alignment:
Q  613 gatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccga 650  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  24558693 gatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagccga 24558730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 612 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 27556375 - 27556318
Alignment:
Q  612 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataaa 669  Q
    |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  27556375 tgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggttaaa 27556318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 575 - 668
Target Start/End: Original strand, 36069774 - 36069867
Alignment:
Q  575 atttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||| | |||||||||| |  |||||| |||| |||||||||| || | ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| ||| ||||    
T  36069774 atttagagattaatgagttgggtagaaatatggtttatgatagaacattacggcgtaatttgatccatatagccaaacccacttactggaataa 36069867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 38391992 - 38391919
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 659  Q
    ||||||| ||||| |||||| || | |||||||| | |||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  38391992 aatgagtgggatcgaaatatggtatatgatagaatattatggcgtaatttcatccatgtggccgatcccactta 38391919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 556 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 41444469 - 41444356
Alignment:
Q  556 agagaaattatta-gaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccc 654  Q
    ||||||| ||||| |||| | ||||||| | |||| ||| |||| |||||| |||| ||||| |||| ||  |||| |||||| |||||||||| | |||    
T  41444469 agagaaactattaagaaaaggtttagagattaatgggtttgatcaaaatatggtttatgatataacattacaacgtaatttgaaccatgtagccaaaccc 41444370  T
Q  655 acttaatgggataa 668  Q
    ||||||||| ||||    
T  41444369 acttaatggaataa 41444356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 612 - 665
Target Start/End: Original strand, 44699675 - 44699728
Alignment:
Q  612 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggga 665  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  44699675 tgatagaacactatggcgtaatttgatccctgtagcagaccccacttagtggga 44699728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 397; Significance: 0; HSPs: 120)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Original strand, 3301449 - 3302109
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3301449 gtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagaagtg--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatc 3301546  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  3301547 ttgggtccatagtaccaaatgaaggagaaatagaagcagatgcaaatcatcgtattcaagctgggtggttgaaatagagatgagcctcaggtgttttgtg 3301646  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    ||||||||||  |||||||||  |||||| || ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  3301647 cgataagaaagtaccacttaaattgaaaggaaagttctatcggacagtagtcagactgacaatgttgtatggtacgaagtgttgggcggttaagagccaa 3301746  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt--agagagag 400  Q
    ||||     ||||||||| || ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||  ||||||||    
T  3301747 cacg-----aaagtaagtgtagcggagatggggatgttgcgcttgatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgtcaccattagagagagag 3301841  T
Q  401 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatata 500  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  3301842 tgagggtagcccctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagaatgaa 3301941  T
Q  501 tcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatcta 600  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||       ||||||||||||  |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |    
T  3301942 tcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattagagaaaccattataaaagatttagaggtcaatgagttggatcca 3302041  T
Q  601 aatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  3302042 aatatggtttttgatagaacactacggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 3302109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Original strand, 1274865 - 1275529
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1274865 gtatatggaatgtaacttcagcgaaaggagaagta--ggtctaccttggagatgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatc 1274962  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    |||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  1274963 ttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatgaagaagagcctaaggtgttttgtg 1275062  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  1275063 cgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttacgagtcaa 1275162  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtg 402  Q
    || |||| | ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  1275163 catgagaatcaagtaagcatagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatggtaggattaggaatgacaccattagagagagag 1275262  T
Q  403 -ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatat 501  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||  || ||    
T  1275263 tggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtaaatgccgtggtaagaagagtagat 1275362  T
Q  502 caaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaa 601  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || |||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||| ||| ||||||||||| ||| ||||| ||| ||    
T  1275363 caaatggaggagagtcaagttaacaggggtagaggaagacctagaaaaactattagagaaaccattataaaggatttagaggttaatcagttgaatccaa 1275462  T
Q  602 atatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    || | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  1275463 atttggtgtttgatagaacattatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 1275529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 12493069 - 12492401
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||   | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12493069 gtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagta--gctctaccttggaggtaaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatc 12492972  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    |||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12492971 ttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtg 12492872  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    | ||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  12492871 caataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggctttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaa 12492772  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagag--agag 400  Q
    || |||| | |||||||| || | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  12492771 catgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttacgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccattagagagagag 12492672  T
Q  401 tgggggtagcac---ctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggat 497  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  |    
T  12492671 tgggggtagcacctactatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagagt 12492572  T
Q  498 atatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggat 597  Q
    | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12492571 agatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggat 12492472  T
Q  598 ctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    | |||| | || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  12492471 ccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatgcatgtagccgaccccacttagtgggataa 12492401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 28977539 - 28976876
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  28977539 gtatatggaatgtaacttcaacggaaggagaagta--ggtctaccttagaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagtcacacggtttaaatatc 28977442  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    |||||||| |  |||||||||| |||| |||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  28977441 ttgggtccttcgtacaaaatgacggagtaatagaagtagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcgggtgttttgtg 28977342  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||| ||||| || ||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  28977341 cgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacatcagtccgaacgacgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaa 28977242  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtg 402  Q
    || |||| | |||||||| || | |||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28977241 catgagaatcaagtaagtgtagcagagatgagtatgttgtgttggatgagtggtaaaactagaaatgataggattaggaatgacaccattagagagagtg 28977142  T
Q  403 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatc 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| || |||    
T  28977141 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgtgcatgtagagagaagacccgtatatgccgtggtaagaagggtagatc 28977042  T
Q  503 aaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaa 602  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  28977041 aaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattataaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaa 28976942  T
Q  603 tatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    | | || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  28976941 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataa 28976876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 43 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 2076119 - 2075490
Alignment:
Q  43 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcag 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||  |||||||||||||||    
T  2076119 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatcttgggtccttcgtacaaaatgacagagaaatagaagcag 2076020  T
Q  142 atgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggtttta 241  Q
    ||||||   |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||    
T  2076019 atgtaagccatcgtattcaagttgggtggttgaaatgaagaagagcctcaggtgttttgtgcaataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttcta 2075920  T
Q  242 tcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttg 341  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| | |||||||| || | ||||||| |||||||    
T  2075919 tcggacagcagtccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaattaagtaagtgtagcagagatgaggatgttg 2075820  T
Q  342 cgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagag--agagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaata 439  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  2075819 cgttggatgagttgtaagactagacaagataggattaggaatgacaacattagagagagagtgggggtaacacctacagtagaaaagttggtagacaata 2075720  T
Q  440 gtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaa 539  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||     
T  2075719 ggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaag 2075620  T
Q  540 acctnnnnnnnccattagagaaattattag-aaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgat 638  Q
    ||||       | ||||||||||  ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | || | |||||||| |||||| |||||||||||    
T  2075619 acctaggataactattagagaaaccattagaaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaatactatggcgtcatttgat 2075520  T
Q  639 ccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
     ||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  2075519 tcatgtagccaaccccacttagtgggataa 2075490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 1288271 - 1287596
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1288271 gtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagtaag--tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatc 1288174  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    ||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  1288173 ttgagtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagttggatggttgaaatggagaagagcctcatgtgttttgtg 1288074  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    ||||||||||  |||| ||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||| || || |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  1288073 cgataagaaagtaccatttaagttgaaaggaaagttctatcgaacagcagtccgatcggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaa 1287974  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagag------ 396  Q
    || |||| | |||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||          
T  1287973 catgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacatcattagagagagag 1287874  T
Q  397 ------agagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtta 490  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  1287873 agagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgccgtggtaa 1287774  T
Q  491 gaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatga 590  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||    
T  1287773 gaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatga 1287674  T
Q  591 gttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||| |||| | || | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  1287673 gttggatccaaatttggtgtatgatagtacactatggcgtcagttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 1287596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 4 - 662
Target Start/End: Original strand, 24178124 - 24178769
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  24178124 gtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagta--ggtctaccttggaagtgaaagttggagatcatatcataccctaagttacacggtttaaagatc 24178221  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    |||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  24178222 ttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcatattcaagttgggtggttgaaatggagaagagcctcaagtgttttgtg 24178321  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||              |||||||||||||| |||    
T  24178322 cgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcgggcagcagtcagaccgacgttgttgt--------------tgggcggttaagagtcaa 24178407  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagag--agag 400  Q
    || |||| | |||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  24178408 catgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactatacatgataggattaagaatgacaccattagagagagag 24178507  T
Q  401 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatata 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||  || |    
T  24178508 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtggagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtaga 24178607  T
Q  501 tcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatcta 600  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |    
T  24178608 tcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagagttcaatgagttggatcca 24178707  T
Q  601 aatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatg 662  Q
    ||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  24178708 aatttagtgtatgatagaacactatggcatcatttgatctatgtagccgaccccacttaatg 24178769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Original strand, 10638897 - 10639567
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10638897 gtatatggaatgtaacttcagtggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggaaatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatc 10638994  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    |||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  10638995 ttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagccttaggtgttttgtg 10639094  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  10639095 cgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcgaacagcagtccgaccgacgttgttgtatggtacggagtgttgggcggtgaagagtcaa 10639194  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt--agagagag 400  Q
    || |||| | |||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  10639195 catgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacagaataggattaggaatgacaccattagagagagag 10639294  T
Q  401 tgggggtagcac-------ctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaa 493  Q
    ||||| ||||||       |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||    
T  10639295 tggggctagcacctatagactatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgaattgggcatgtagagagaagacctgtagatgccatggtaagaa 10639394  T
Q  494 ggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagtt 593  Q
    |  || | |||||||||  |||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10639395 gagtagaacaaatggag--gagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagtt 10639492  T
Q  594 ggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||| |||| | || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  10639493 ggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactttgtgggataa 10639567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 188 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 16347877 - 16347397
Alignment:
Q  188 ctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgg 287  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||| || |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||     
T  16347877 ctcatgtgatttgtgcaataagaaattaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacactcagaccgacgatattgtatggtacggagtgttga 16347778  T
Q  288 gcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgaca 387  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |    
T  16347777 gcggttaagagccaacacgagagttaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaatatatgattaaaaatgaaa 16347678  T
Q  388 ccattagag--agagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgt 485  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16347677 ccattagagagagagcgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgcctt 16347578  T
Q  486 tgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggta 585  Q
    ||  |||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||       | |||| |||||  |||||||| |||||||||||     
T  16347577 tgcaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaaagaaaccattagaaaagatttagaggtc 16347478  T
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||| ||||||  |||||| |||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  16347477 aatgatttggatacaaatatggtttatgatagaacac--tggcgtcatttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataa 16347397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 410
Target Start/End: Original strand, 20318591 - 20318989
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20318591 gtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagta--gttctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatc 20318688  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    |||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20318689 ttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcatattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtg 20318788  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    |||||||     |||||||||| |||||| || ||| ||||||| ||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  20318789 cgataag----taccacttaagttgaaaggaaagttatatcggatagcagtccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgcgcggttaagagtcaa 20318884  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagag--agag 400  Q
    || |||| | |||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  20318885 catgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact-----ggataggattaggaatgacaccattagagaaagag 20318979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 285
Target Start/End: Original strand, 3394311 - 3394593
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3394311 gtatatggaatgtaa-ttcagcaaaaggagaagtg--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatc 3394407  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  3394408 ttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaaatcatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagatgagcctcaggtgttttgtg 3394507  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaa---agaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgct 285  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||   || || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  3394508 cgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggcaatgttgtatagtacggagtgct 3394593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 151 - 648
Target Start/End: Original strand, 34272768 - 34273258
Alignment:
Q  151 atcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagc 250  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || |||  ||||||||||    
T  34272768 atcgtattcaagttgggtggttaaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttcaatcggacagc 34272867  T
Q  251 agtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatg 350  Q
    |||| | |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||| | |||||||| || | ||||||| |||||||| |||||||    
T  34272868 agtccggccgacgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaatatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcattggatg 34272967  T
Q  351 agtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt------------agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 438  Q
    ||||||||||||||||     ||||||| |||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34272968 agtggtaagactagac-----aggattaggaatgacaccattagagagagagagagagagagtgggggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaat 34273062  T
Q  439 agtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaa 538  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||| || ||||              ||||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  34273063 aggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgcagatgtcgtggtaagaa--------------gaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaa 34273148  T
Q  539 aacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgat 638  Q
     ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  34273149 gacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcattcgat 34273248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 370 - 668
Target Start/End: Original strand, 38684932 - 38685232
Alignment:
Q  370 ataggattaagaatgacaccattagag--agagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagag 467  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38684932 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagag 38685031  T
Q  468 aagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattatt 567  Q
    |||||||||||||||||| || |||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||    
T  38685032 aagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatt 38685131  T
Q  568 agaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggata 667  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  38685132 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacaatatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggata 38685231  T
Q  668 a 668  Q
    |    
T  38685232 a 38685232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 335 - 668
Target Start/End: Original strand, 4496312 - 4496649
Alignment:
Q  335 gatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaa--gataggattaagaatgacaccattagag--agagtgggggtagcacctatagtagaaaagttgg 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4496312 gatgttgcgttggatgagtggtaagactagacacaggataggattaggaatgacacctttagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagctgg 4496411  T
Q  431 tagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagagg 530  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  || ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4496412 tagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagagg 4496511  T
Q  531 tagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgt 630  Q
    |||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||||| | |    
T  4496512 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcat 4496611  T
Q  631 catttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  4496612 catttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 4496649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 406 - 668
Target Start/End: Original strand, 20456776 - 20457038
Alignment:
Q  406 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaa 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  || ||||||    
T  20456776 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaa 20456875  T
Q  506 tggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatat 605  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| |    
T  20456876 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaataagttgaatctaaattt 20456975  T
Q  606 agtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
      | | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  20456976 gatgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 20457038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 353 - 668
Target Start/End: Original strand, 14665658 - 14665977
Alignment:
Q  353 tggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagag------agagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttag 446  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  14665658 tggtaagcctagacatgataggattagaaatgacaccattagagagagagagagtgggggtagcacctatagtagagaagttgatagaaaataggcttag 14665757  T
Q  447 atggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnn 546  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | | ||||       
T  14665758 atggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggagcagagtcaggttaaaagaggtagagggagacctagg 14665857  T
Q  547 nnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtag 646  Q
        | ||||||||||  ||||| ||  ||||||| || ||||||||||||| |||||| |||| |||||||  ||| || ||| |||||||| ||||||    
T  14665858 aaaactattagagaaaccattaggaagaatttagaagtcaatgagttggatccaaatatggtttatgataga--actctggcgtaatttgatctatgtag 14665955  T
Q  647 ccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||| |||||||| ||||||||    
T  14665956 ccgaccccacttagtgggataa 14665977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 16348084 - 16347879
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16348084 gtatatgaaatgtaacttcagcaaaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatc 16347987  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16347986 ttgtgtccatagtacaaaatgacggagaaataaaagcgtatgtaaatcatcgtattcaag-taggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtg 16347888  T
Q  203 cgataagaa 211  Q
    | |||||||    
T  16347887 caataagaa 16347879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 133 - 454
Target Start/End: Original strand, 27622 - 27944
Alignment:
Q  133 tagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaaga 232  Q
    ||||| || |||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||  | |||||||||  |||||||||| ||||||     
T  27622 tagaatcaaatgtaaatcatcatattcaagttgggtggtggaaatagagaagagtctcgagtgttttacgtgataagaaagtaccacttaagttgaaagg 27721  T
Q  233 aaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatg 332  Q
    ||  || |||| ||||  |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| ||||||||||||    
T  27722 aaaattctatctgacaatagtcggacagacgatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagaaccaacatgagaattaagtaagcataacggagatg 27821  T
Q  333 atgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt--agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttgg 430  Q
    | |||||||| || |||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||  | | |||||  ||||||||||||||||||||||| ||     
T  27822 aggatgttgcattagatgagtggtaaaacta-acaagatatgattatgaatgacaccatttgaaaaagagttagggtagcacctatagtagaaaagatga 27920  T
Q  431 tagaaaatagtcttagatggtttg 454  Q
    | |||||||| ||||| |||||||    
T  27921 tggaaaataggcttaggtggtttg 27944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 50 - 387
Target Start/End: Original strand, 36200426 - 36200764
Alignment:
Q  50 tggaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaa 148  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||   |||||||| |||| |||||||    
T  36200426 tggaggtgaaagtgggaggtcatatcatacctcaagttacaccgtttaaatattttgggttcatagtacaaaatgacatagaaatagtagcatatgtaaa 36200525  T
Q  149 ttatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggaca 248  Q
    | ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||  |   ||||| |||||| ||  || || ||||||    
T  36200526 tcatcatatttaagttgggtggttgaaatggagaagagactcatgtgttttatgtgataagaaaatgctgtttaagttgaaaggaaaattctaccggaca 36200625  T
Q  249 gcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttgga 348  Q
     |||||| || | |||||||||| | |||  |||| | ||||||||||| |||||  |||| | |||||||  || | ||||||| ||||||||||||||    
T  36200626 acagtcaaactggcaatgttgtatgatacaaagtggtaggcggttaagaaccaacgtgagaatcaagtaagcgtatcagagatgaggatgttgcgttgga 36200725  T
Q  349 tgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgaca 387  Q
    |||| |||||||||| | | |||| ||||| ||||||||    
T  36200726 tgagcggtaagactaaataggataagattaggaatgaca 36200764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 336 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 26885040 - 26884706
Alignment:
Q  336 atgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattag--agagagtgggggtagcacctatagta-gaaaagttggta 432  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  26885040 atgttgcgttggatgagtggtaaaactagacgggataggattaggaataacaccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggta 26884941  T
Q  433 gaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggta 532  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||   |||||||  || || |||||  || |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26884940 gaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagataagatttgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggta 26884841  T
Q  533 gatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggat-ctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtc 631  Q
    || ||  | ||       |  | ||| ||| |||||| || ||||||||||| |||| || |||| | ||||||  ||| ||||||||||||| ||||      
T  26884840 gaggatgagctaggaaaac--taagaaaaactattaggaaagatttagaggttaatgggtcggatccaaaatatgatttatgatagaacactacgacgca 26884743  T
Q  632 atttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  26884742 atttgatccatgtagccgaccccacttagtggaataa 26884706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 500 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 13561571 - 13561403
Alignment:
Q  500 atcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatct 599  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||       ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||     
T  13561571 atcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcc 13561472  T
Q  600 aaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  13561471 aactatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 13561403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 461 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 2915719 - 2915513
Alignment:
Q  461 tagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagaga 560  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||||  || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||    
T  2915719 tagagagaagacccgtagatgccttggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggataactattagaga 2915620  T
Q  561 aattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaa 660  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  2915619 aaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggttat-gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttag 2915521  T
Q  661 tgggataa 668  Q
    ||||||||    
T  2915520 tgggataa 2915513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 500 - 668
Target Start/End: Original strand, 14911269 - 14911437
Alignment:
Q  500 atcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatct 599  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||       ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||     
T  14911269 atcaaatgaaggagagtcgggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggttaatgagttggatcc 14911368  T
Q  600 aaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  14911369 aaatatgatttttgatagaatactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatggaataa 14911437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 27302629 - 27302451
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||   | ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  27302629 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggtaaagta--gttctaccttgaaggtgagtgttggagatcatatcatacctcaaactacacggtttaaatatc 27302532  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagag 186  Q
    ||| ||||||||||||||| |  |||||||||||   |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  27302531 ttgtgtccataatacaaaacggcggagaaataga---agatgtaaatcatcgtattcaagttgagtggttgaaatggaaaagag 27302451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 336 - 480
Target Start/End: Original strand, 15168721 - 15168869
Alignment:
Q  336 atgttgcgttggatgagtggta--agactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagt--gggggtagcacctatagtagaaaagttggt 431  Q
    |||||||||| ||||||||| |  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15168721 atgttgcgttagatgagtggcacaagattagacgagataggattaagaatgacaccattagagggagttggggggtagcacctatagtagaaaagatggt 15168820  T
Q  432 agaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagat 480  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| |||| | |||| ||||||    
T  15168821 agaaaataggctaaggtggtttggacatgttgagaaatgacctgtagat 15168869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 352 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 31636253 - 31636124
Alignment:
Q  352 gtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggt 451  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||  ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||    
T  31636253 gtggtaagactagactggatagaattataaatgacagcattagagaaagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggt 31636154  T
Q  452 ttggacatgtagagagaagacccgtagatg 481  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  31636153 ttgggcatgtagagagaagacccgtggatg 31636124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 322 - 462
Target Start/End: Original strand, 32516475 - 32516615
Alignment:
Q  322 taacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtag 421  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||  |||  ||||||| ||||||||||||| || ||| ||| ||||||||    
T  32516475 taacggagatgatgatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaggatagacttagaaatgacaacattagagagagttggagtaacacttatagtag 32516574  T
Q  422 aaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgta 462  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  32516575 aaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttagacttgta 32516615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 43558450 - 43558318
Alignment:
Q  52 gaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaatt 150  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||  |  |||||||||||||||||||||||     
T  43558450 gaggtgaaagttggagatcatagcataccacaagttacacgatttaaatatcttaggtccattgtacaaaaccacagagaaatagaagcagatgtaaatc 43558351  T
Q  151 atcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaa 183  Q
    |||| |||||||| |||| || |||||||||||    
T  43558350 atcgaattcaagcagggtagtggaaatggagaa 43558318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 553 - 668
Target Start/End: Original strand, 29816532 - 29816647
Alignment:
Q  553 attagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatc 652  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  29816532 attagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgacc 29816631  T
Q  653 ccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||| ||||||||    
T  29816632 ccacttagtgggataa 29816647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 393 - 473
Target Start/End: Original strand, 14749297 - 14749377
Alignment:
Q  393 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14749297 agagagagttggtgtagcacctatagtagaaaaattggtagaaactagacttagatggtttggacatgtagagagaagacc 14749377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 553 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 16914015 - 16913899
Alignment:
Q  553 attagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccga-t 651  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||      
T  16914015 attagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttacgatagaacaccatggcgtcatttgatccatgtagccgacc 16913916  T
Q  652 cccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||| ||||||||    
T  16913915 cccacttagtgggataa 16913899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 443 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 38501660 - 38501435
Alignment:
Q  443 ttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacc 542  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| || |||||  || || | ||||||||||||| | | ||||||| | |||||| |||    
T  38501660 ttagatggtttggacatgtaaagagaagacttgtagatgccgtcgtaagaagagtagattagatggaggagagtcggatcaaaagagatggatgaagacc 38501561  T
Q  543 tnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccat 642  Q
    |       | || | ||||| |||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||| |||||   || || ||||| ||    
T  38501560 taggagaactataaaagaaactattagaaagtatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttatgatagaaaactatagtgtaatatgatcgat 38501461  T
Q  643 gtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  38501460 gtagccgatcccacttagtgggataa 38501435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 565 - 668
Target Start/End: Original strand, 39040918 - 39041021
Alignment:
Q  565 attagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggg 664  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39040918 attagaaaagatttagaggtcaataagttgcatctaaatatggtttttgatataacaccatagtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatggg 39041017  T
Q  665 ataa 668  Q
    ||||    
T  39041018 ataa 39041021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 17341846 - 17341748
Alignment:
Q  43 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagca 140  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  17341846 tctaccttggaggtggaagttggagatcatatcatacctgaaattacatggtttaaatatattgggtccatagtagaaaatgatagagaaatagaagca 17341748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 327 - 541
Target Start/End: Original strand, 36215422 - 36215636
Alignment:
Q  327 gagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattag--agagagtgggggtagcacctatagtagaaa 424  Q
    |||||||  |||||||| | ||||||  |||| |||||| | |||| ||||| |||||||  ||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  36215422 gagatgagtatgttgcgctagatgagcagtaaaactagatatgatatgattatgaatgac--cattagggagagagtggaggtagcatctatagtagaaa 36215519  T
Q  425 agttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaa 524  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||| | || ||||| |||| || |||| ||| |||||  |||||  || |||  ||||||||||||| ||| ||    
T  36215520 agttggtaggaaatatgcttagatggtttcggcacgtagaaagaaaactcgtatatgtcgttgaaagaagagtagatcggatggaggagagtcaggtcaa 36215619  T
Q  525 aagaggtagatgaaaac 541  Q
    |||||||||| ||||||    
T  36215620 aagaggtagaggaaaac 36215636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 560 - 669
Target Start/End: Original strand, 2393034 - 2393143
Alignment:
Q  560 aaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 659  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || | ||||||||||| | |||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2393034 aaatcattagaaaagatttagaggtcaatgaattagacccaaatatagtttctaatagaatactatggtatcatttgatccatgtagccgatcccactta 2393133  T
Q  660 atgggataaa 669  Q
    ||||||||||    
T  2393134 atgggataaa 2393143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 446
Target Start/End: Original strand, 3096828 - 3097216
Alignment:
Q  52 gaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaatt 150  Q
    |||||||||||| |||||||||||  | | ||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||       ||| |||  ||| ||||      
T  3096828 gaggtgaaagttagagatcatatctcagcacaagttacatggtttaaatatcttgggtttatagtacaaaatgac------atataaggggatataaacc 3096921  T
Q  151 atcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagc 250  Q
    |||  ||||||| |||||||||||||||||  |||| || ||||||||| || |||  ||||| ||| |||||| |||| ||||  |||||||| ||| |    
T  3096922 atcaaattcaagttgggtggttgaaatggatgagagccttaggtgttttatgtgatgtgaaaataccgcttaagttgaaggaaa-tttttatcgaacaac 3097020  T
Q  251 agtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatg 350  Q
     || |||||||| |||||||| || ||  | || ||| |||| || | |||||||||   | |||||||| | || |||| || |||||| |||||||||    
T  3097021 ggtaagaccgacgatgttgtacgggacaaaatgttggacggtaaataaccaacacgaacattaagtaagtgtgacagagacgaggatgttacgttggatg 3097120  T
Q  351 agtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttag 446  Q
     ||  ||| ||||||  |||||  ||||| ||||||  ||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| || |||||| ||| |||||    
T  3097121 tgttataaaactagatgagataaaattaaaaatgacgacattatagagagttggggtaacacctatattagaaaagatgctagaaactagacttag 3097216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 327 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 11002781 - 11002645
Alignment:
Q  327 gagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaag 426  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||   ||||| ||||  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||     
T  11002781 gagatgaggatgttgcgctggatgtgtggtaagacgagatgggatagaattagaaatgacaacattagagagagttcgggtagcacctacagtagaaaac 11002682  T
Q  427 ttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtag 463  Q
     ||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||    
T  11002681 atggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtag 11002645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 381 - 473
Target Start/End: Original strand, 33667194 - 33667286
Alignment:
Q  381 aatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    ||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  33667194 aatgacaacattaacgagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacc 33667286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 576 - 668
Target Start/End: Original strand, 5558314 - 5558406
Alignment:
Q  576 tttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  5558314 tttagaggtcaatgagtaggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 5558406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 354 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 418318 - 418201
Alignment:
Q  354 ggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttaga--tggt 451  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| | | ||||||  ||||    
T  418318 ggtaagacgagacatgatagaattagaaatgacaacattagagagagttggggtagcacctatggtagaaaagatggcagaaatttggcttagacctggt 418219  T
Q  452 ttggacatgtagagagaa 469  Q
    |||| |||||||||||||    
T  418218 ttgggcatgtagagagaa 418201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 586 - 668
Target Start/End: Original strand, 30213758 - 30213840
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  30213758 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 30213840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 43423656 - 43423578
Alignment:
Q  104 tgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggaga 182  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  43423656 tgggtccgtagtacaaaatgacggagaaacagaagcagatgtaaatcatcatattcaagttgggtggttgaaatggaga 43423578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 343 - 472
Target Start/End: Original strand, 6888931 - 6889062
Alignment:
Q  343 gttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagaga--gagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 440  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||  |||||||  |||| |||  |||| |||||||||| |||||  |||||| |||| ||||||||    
T  6888931 gttggatgtgtggtaagactagatgagatatgattagaaatgacaatattacagaaagagttggggtagcacgtatagaggaaaagatggtggaaaatag 6889030  T
Q  441 tcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  6889031 gcttaagtggtttggacatgtagagagaagac 6889062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 328 - 470
Target Start/End: Original strand, 21952274 - 21952424
Alignment:
Q  328 agatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt----agagagagtgggggta----gcacctatagt 419  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||    |||||| || ||||||     ||||||||||    
T  21952274 agatgaggatgttgcgttgcatgtgtggtaagactagacgagataagattagaaatgacagcattaaagagagagggttggggtaacacacacctatagt 21952373  T
Q  420 agaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaag 470  Q
    ||||||| ||| ||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  21952374 agaaaagatggcagaaactagactcaggtggtttggacatgtagagagaag 21952424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 343 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 4026678 - 4026540
Alignment:
Q  343 gttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatta-gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagt 441  Q
    |||| ||| ||||||||||||||  ||||| |||||| || || | ||| | |||||||| |||||| ||| || |||| ||||| |||| |||| ||||    
T  4026678 gttgtatgtgtggtaagactagatgagataagattaaaaacgagaacatgaagagagagttggggtaacacgtaaagtaaaaaagatggtggaaactagt 4026579  T
Q  442 cttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagat 480  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  4026578 cttaggtggtttggacatgtagagaggagacctgtagat 4026540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 329 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 10083096 - 10082952
Alignment:
Q  329 gatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtagaaaag 426  Q
    ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||  ||||| ||||  ||||| | |||||| |||||  | |||||| |||||||||||||||||    
T  10083096 gatgaggatgttgctttg-atgtgtggtaagactagacgggatagaattagaaatgagaacattagggagagcattggggtatcacctatagtagaaaag 10082998  T
Q  427 ttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
     ||||||||| ||| ||||  |||||| | ||||||||||||||||    
T  10082997 atggtagaaactagacttaagtggtttcggcatgtagagagaagac 10082952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 586 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 32442224 - 32442142
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  32442224 aatgagttggatccaaatatggttttggatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgactccacttagtgggataa 32442142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 574 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 418145 - 418052
Alignment:
Q  574 gatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggata 667  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||| | |||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  418145 gatttagagattaatgagttggatccaaatgtggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttggtgggata 418052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 404 - 473
Target Start/End: Original strand, 28676596 - 28676665
Alignment:
Q  404 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  28676596 gggtagcagctatagtagaaaagatggtggaaaatagtcttaggtggtttcggcatgtagagagaagacc 28676665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 393 - 473
Target Start/End: Original strand, 79503 - 79583
Alignment:
Q  393 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |   |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  79503 agagagagttggggtagtacctatagtagaaaagatggtggaaaacataattaggtggtttggacatgtagagagaagacc 79583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 20077413 - 20077305
Alignment:
Q  92 gtttaaatatcttgggtccata-atacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctc 190  Q
    |||||||||| |||||| |||  ||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| ||| | |||| | ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  20077413 gtttaaatattttgggttcatttatacaaaatgacggagaaattaaagcagatgcaaatcatcattttcaggttggatggttgaaatggagaagagcctc 20077314  T
Q  191 aggtgtttt 199  Q
    |||||||||    
T  20077313 aggtgtttt 20077305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 556 - 668
Target Start/End: Original strand, 30588600 - 30588712
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccca 655  Q
    ||||||||| |||  || ||| ||||| | ||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||  |||    
T  30588600 agagaaattgttaagaaagatctagagatgaatgagttggatcgaaatatggtttataatagaacattatgacgtgatatgatccatgtagccgactcca 30588699  T
Q  656 cttaatgggataa 668  Q
    |||| ||||||||    
T  30588700 cttagtgggataa 30588712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 219804 - 219702
Alignment:
Q  336 atgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt--agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtag 433  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||| |    
T  219804 atgttgcgttggatgcgtgttaagacaagacgagataagattacgaatgacaacattggagagagagttggggtagcacctatcgttgaaaaggtggtgg 219705  T
Q  434 aaa 436  Q
    |||    
T  219704 aaa 219702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 400
Target Start/End: Original strand, 5305496 - 5305611
Alignment:
Q  285 tgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatg 384  Q
    |||||||||| || | ||||||||| |||| |||| ||| |  ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||     
T  5305496 tgggcggttatgaacgaacacgagaataaaataagaatagcaaagacggggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacaagatagaattagaaata 5305595  T
Q  385 acaccattagagagag 400  Q
    ||| ||||||||||||    
T  5305596 acaacattagagagag 5305611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 410 - 476
Target Start/End: Original strand, 1525651 - 1525717
Alignment:
Q  410 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgt 476  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1525651 cacctattgtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggcttggacatgtagagagaagacccgt 1525717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 395 - 473
Target Start/End: Original strand, 2712936 - 2713014
Alignment:
Q  395 agagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  2712936 agagagttggggtagcacctatagtctaaaagatggtagagactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacc 2713014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 393 - 455
Target Start/End: Original strand, 14667753 - 14667815
Alignment:
Q  393 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttgg 455  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  14667753 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaatagacttaggtggtttgg 14667815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 403 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 18351190 - 18351112
Alignment:
Q  403 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggaca-tgtagagagaagacccgtagat 480  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  18351190 ggggtagcacctatagtagaaaatatggtagaaactaggcttaggtggtttgggcattgtagagagaagacctgtagat 18351112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 336 - 471
Target Start/End: Original strand, 31906592 - 31906729
Alignment:
Q  336 atgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattag--agagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtag 433  Q
    |||||||||| |||||  ||||| |||||||   ||||||||| |||||||| ||||||  |||||||| | ||  |||||| | ||||||||||||| |    
T  31906592 atgttgcgttcgatgaacggtaaaactagacggaataggattaggaatgacatcattagggagagagtgagagtgacacctacaatagaaaagttggtcg 31906691  T
Q  434 aaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaaga 471  Q
     ||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  31906692 gaaatattcttagatagtttagacatgtagatagaaga 31906729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 556 - 668
Target Start/End: Original strand, 2090566 - 2090678
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccca 655  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||| ||||  |||| |||| ||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  2090566 agagaaaatattaggaaagatttagaggttaatgagcttgatccaaatatagtttatgatccaacattatggcgtaatttgatccatgtacccgacccca 2090665  T
Q  656 cttaatgggataa 668  Q
     | | ||||||||    
T  2090666 ttgagtgggataa 2090678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 600 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 7640592 - 7640524
Alignment:
Q  600 aaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  7640592 aaatatggtttatgatagaacactacggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagtggaataa 7640524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 264 - 396
Target Start/End: Original strand, 7678340 - 7678471
Alignment:
Q  264 atgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagacta 363  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| | |||| ||||||||||| || |  |||| ||  |||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||    
T  7678340 atgttgtatggaacggagtgttgggcg-tgaagaaccaacacgagaatagaacaagtgtagtggagatgaggatgttgcgttggatctgtggcaagacta 7678438  T
Q  364 gacaagataggattaagaatgacaccattagag 396  Q
    || | ||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  7678439 gataggataggattagaaatgacaacattagag 7678471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 556 - 668
Target Start/End: Original strand, 9235200 - 9235311
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccca 655  Q
    ||||||| |||||  || ||| ||||| | |||||| |||||| |||||| |||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| ||||    
T  9235200 agagaaactattaagaaagatatagagattaatgagctggatcgaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccga-ccca 9235298  T
Q  656 cttaatgggataa 668  Q
    |||| ||||||||    
T  9235299 cttagtgggataa 9235311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 588 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 43557930 - 43557850
Alignment:
Q  588 tgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||| | | |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  43557930 tgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatgacttaagttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataa 43557850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 556 - 647
Target Start/End: Original strand, 28035 - 28126
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagc 647  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||    
T  28035 agagaaactattaggaaagatttagaggttaataagttggatccaaatatgatttctgatagaacactatggcataatttgatacatgtagc 28126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 17340789 - 17340583
Alignment:
Q  335 gatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagaga--gtgggggtagcac-ctatagtagaaaagttggt 431  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||  ||||| ||||||||||||||||||||  || | | || |||  |||||||||||  ||  |    
T  17340789 gatgttgcgttggatgagtggtaaaactagaagaaatgtgattaggaatgacaccattagagagagggttgagataacactttatagtagaaacattatt 17340690  T
Q  432 agaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggt 531  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||  |||||| || || |||||  || ||  ||||  || |||| ||||||||||||| ||| ||||  |||    
T  17340689 agaaaataggcttaggtggttttgacatgttaagagaaaactcgcagatgatgtagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaaagggt 17340590  T
Q  532 agatgaa 538  Q
    |||||||    
T  17340589 agatgaa 17340583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 38579130 - 38578992
Alignment:
Q  59 aagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtat 157  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||| ||  ||| |||||||||| ||  ||| |||||   |||||||  |||| ||    
T  38579130 aagttggagatcatattatagcacaagttacacagtttaaatatcttgagttgatagtacaaaatgacgggaaaacagaag---atgtaaacgatcgaat 38579034  T
Q  158 tcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtttt 199  Q
     ||||||| ||||||||||||||| || | |||| |||||||    
T  38579033 ccaagctgagtggttgaaatggaggagtgcctcatgtgtttt 38578992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 614 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 408565 - 408511
Alignment:
Q  614 atagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  408565 atagaatactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 408511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 668
Target Start/End: Original strand, 14667954 - 14668036
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||| || ||| |||| |||||||||| ||||  || |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  14667954 aatgagttggatccaagtatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgggataa 14668036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 393 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 15489784 - 15489706
Alignment:
Q  393 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaaga 471  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||| |||| |   |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15489784 agagagagttggggtagtacctattgtagaaaagatggttgaaactcagcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 15489706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 299 - 373
Target Start/End: Original strand, 27998317 - 27998391
Alignment:
Q  299 ccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagatag 373  Q
    ||||||||| ||| || |||| ||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  27998317 ccaacacgaaagtgaattaagcatatcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacaaaatag 27998391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 566 - 668
Target Start/End: Original strand, 31220546 - 31220647
Alignment:
Q  566 ttagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggga 665  Q
    ||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||| | | ||||| |||||||||||||| ||| |||||| | |||||| ||    
T  31220546 ttagaaaagattttgagatcaatgagttggatctaaatatgatttttgatag-atattatgatgtcatttgatccatatagtcgatcctatttaatgaga 31220644  T
Q  666 taa 668  Q
    |||    
T  31220645 taa 31220647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 607 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 3442949 - 3442888
Alignment:
Q  607 gtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  3442949 gtttttgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtggcataa 3442888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 556 - 668
Target Start/End: Original strand, 11675682 - 11675795
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatct-aaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccc 654  Q
    ||||||| |||||| |  ||||||||| | |||||||||||| | |||||| |||| |||||||||| |||| |||  ||| |||||||||||||| |||    
T  11675682 agagaaactattaggacagatttagagattaatgagttggattttaaatatggtttatgatagaacattatggcgtagtttaatccatgtagccgacccc 11675781  T
Q  655 acttaatgggataa 668  Q
    ||||| | ||||||    
T  11675782 acttagttggataa 11675795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 18351001 - 18350937
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccga 650  Q
    ||||||||||||  |||||| || |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18351001 aatgagttggatagaaatatggtatttgttagaacattatgacgtcgtttgatccatgtagccga 18350937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 327 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 28187028 - 28186956
Alignment:
Q  327 gagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagaga 399  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  28187028 gagatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagacatggtaggattagaaatgacaacattagagaga 28186956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 556 - 648
Target Start/End: Original strand, 28276391 - 28276483
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagcc 648  Q
    |||||||  ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||  |||||| |||| |||||||| ||||||  || |||||||||||||||||    
T  28276391 agagaaaccattagaaagaatttagaggtcaataagttggattcaaatattgtttatgatagaaaactatggtgtaatttgatccatgtagcc 28276483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 400
Target Start/End: Original strand, 34039960 - 34040032
Alignment:
Q  328 agatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagag 400  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| || ||| |||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  34039960 agatgaggatgtcgcgttggatgaatgataaaactagatatgataggattaaaaattacaccattagagagag 34040032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 78
Target Start/End: Original strand, 27530 - 27602
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcata 78  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||   | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27530 gtatagggaatgtaacttcaacaataggcgaagta--gttatgccttggaggtgaaagttggagatcatatcata 27602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 6368561 - 6368478
Alignment:
Q  52 gaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaata 134  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||  || ||| ||||||| || |||||||||    
T  6368561 gaggtgaaagatggagatcataacataccacaagttacacaatttaaatatcttgtatctatagtacaaaacgacggagaaata 6368478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 294 - 373
Target Start/End: Original strand, 16454600 - 16454679
Alignment:
Q  294 aagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagatag 373  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||| ||| |||||||  |||||| |||||||| |||||    
T  16454600 aagaaccaacacgagagtaaagtaagtgtagcagagatgaggatgatgcattggatgtttggtaaaactagacatgatag 16454679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 138
Target Start/End: Original strand, 21915532 - 21915619
Alignment:
Q  52 gaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaag 138  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||| | | |||||||||||    
T  21915532 gaggtgaaagttcgagattatatcataatacaagttacacggtttaaatatattggttcaatagtacaaaataacgaagaaatagaag 21915619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 113
Target Start/End: Original strand, 37124207 - 37124278
Alignment:
Q  43 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatac-ccaagttacacggtttaaatatcttgggtccata 113  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||  ||||||||| |||| |||||||    
T  37124207 tctaccttagaggtgaaagttggagatcaaatcatacaacaagttacattgtttaaatagcttgagtccata 37124278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 613 - 668
Target Start/End: Original strand, 42272687 - 42272742
Alignment:
Q  613 gatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  42272687 gatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataa 42272742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 406 - 481
Target Start/End: Original strand, 43475243 - 43475318
Alignment:
Q  406 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatg 481  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||||  ||  |||||||||||| |||||||    
T  43475243 gtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttgggtattcagagagaagacctgtagatg 43475318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 336 - 398
Target Start/End: Original strand, 9235000 - 9235062
Alignment:
Q  336 atgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagag 398  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  9235000 atgttgcattggatgtgtggtaagactagacgggataggattataaatgacaacattagagag 9235062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 594 - 668
Target Start/End: Original strand, 18855798 - 18855872
Alignment:
Q  594 ggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||| |||  | | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  18855798 ggatccaaatatggtttatgatagaacattatagcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 18855872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 191
Target Start/End: Original strand, 28676253 - 28676314
Alignment:
Q  129 gaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctca 191  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  28676253 gaaatagaagcatatgcaaatcatcgtattcaag-tgtgtggttgaaatggagaagaatctca 28676314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 34194848 - 34194766
Alignment:
Q  335 gatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctata 417  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||  ||||  | ||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  34194848 gatgttgtgttggatgtgtggtaaaactagacaggataggattagaaatgtaaacattagagagagttgggataacacctata 34194766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 559 - 668
Target Start/End: Original strand, 37065632 - 37065742
Alignment:
Q  559 gaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccca-ct 657  Q
    |||| |||||| || ||| ||||| |||||||||||||   | | || |||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||| ||    
T  37065632 gaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatggtttttgatagagcactatgaagtcgtttgattcatgtagccgaccccagct 37065731  T
Q  658 taatgggataa 668  Q
    || ||||||||    
T  37065732 tagtgggataa 37065742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 395 - 472
Target Start/End: Original strand, 6859373 - 6859450
Alignment:
Q  395 agagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | ||| |||| ||||| || | ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  6859373 agagagttggggtagcacctatagtgaagaagatggtggaaaacaggcataggtggtttggacacgtagagagaagac 6859450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 638
Target Start/End: Original strand, 14749493 - 14749542
Alignment:
Q  589 gagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgat 638  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14749493 gagttggatagaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgat 14749542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 365
Target Start/End: Original strand, 21093663 - 21093736
Alignment:
Q  292 ttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 365  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||| ||  ||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21093663 ttaagaaccaacacgagaataaaataagtgtagtggatatgaggatgttgcgttgtatgtgtggtaagactaga 21093736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 106
Target Start/End: Original strand, 23979831 - 23979930
Alignment:
Q  3 ggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacccaagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||   | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  |||| |||||    
T  23979831 ggtatatgtaatgtaacttcaacaaaagacaaagta--gttcaaccttagaggtgaaagttggagatcatatcata--gaagttacacaatttagatatc 23979926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 571 - 628
Target Start/End: Original strand, 23980112 - 23980169
Alignment:
Q  571 aatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgac 628  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  23980112 aatgatttatagattaatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacaatatgac 23980169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 113
Target Start/End: Original strand, 25937719 - 25937780
Alignment:
Q  53 aggtgaaagttggagatcatatca-tacccaagttacacggtttaaatatcttgggtccata 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||    
T  25937719 aggtgaaagttggagatcatatcattccccaaattacacaaattaaatatcttgggtccata 25937780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 623 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 39322141 - 39322096
Alignment:
Q  623 tatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39322141 tatggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataa 39322096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 393 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 43558119 - 43558030
Alignment:
Q  393 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgc 482  Q
    |||||||||  |||||||| ||||| |||||||| |||| |||| ||  ||||| |||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  43558119 agagagagttagggtagcatctataatagaaaagatggtggaaactaagcttaggtggtttgggcatatagagagaagacttgtagatgc 43558030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 586 - 658
Target Start/End: Original strand, 20367076 - 20367148
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccactt 658  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||| | |||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||    
T  20367076 aatgagttggatccaaatatggtttatgacataacattatgacgtaatttgatccatatagccaaccccactt 20367148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 612 - 668
Target Start/End: Original strand, 28411885 - 28411941
Alignment:
Q  612 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  28411885 tgatagaacactatggcgttgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataa 28411941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 330 - 454
Target Start/End: Original strand, 33006587 - 33006711
Alignment:
Q  330 atgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttg 429  Q
    |||| ||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||| |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| | ||| || | ||||| ||||||| ||    
T  33006587 atgaggatgttgtgttgaatgtgttctaagattagacgagataaaattaaaaatgacaacattagagagagttgaggttgctcatatagaagaaaagatg 33006686  T
Q  430 gtagaaaatagtcttagatggtttg 454  Q
     || ||| ||| |||||||||||||    
T  33006687 atataaattagacttagatggtttg 33006711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 407 - 471
Target Start/End: Original strand, 37065533 - 37065597
Alignment:
Q  407 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaaga 471  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | |  ||||| |||||||||||||||    
T  37065533 tagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttgggtcatttgggcatgtagagagaaga 37065597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 612 - 668
Target Start/End: Original strand, 38132545 - 38132601
Alignment:
Q  612 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  38132545 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtggccgaccccacttagtgggataa 38132601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 416 - 472
Target Start/End: Original strand, 42199299 - 42199355
Alignment:
Q  416 tagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  42199299 tagtagaaaagatggtggaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 42199355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 613 - 668
Target Start/End: Original strand, 2713146 - 2713201
Alignment:
Q  613 gatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  2713146 gatagaacactatggcatcgtttgattcatgtagccgagcccacttagtgggataa 2713201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 556 - 647
Target Start/End: Original strand, 6889146 - 6889237
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagc 647  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||| | ||| ||||||  | |||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  6889146 agagaaactattaggaaagatttagagattaattagttgggccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagc 6889237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 590 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 7359355 - 7359281
Alignment:
Q  590 agttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggga 665  Q
    ||||||||| |||||| ||||  |||| |||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  7359355 agttggatcgaaatatggtttacgata-aacattatgacgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtggga 7359281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 669
Target Start/End: Original strand, 7678661 - 7678743
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataaa 669  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| | ||| |||| ||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  7678661 aatgagttggatcgaaatacggtttataata-aacattatgaggtagtttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaa 7678743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 589 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 15252840 - 15252761
Alignment:
Q  589 gagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||||| |||||  |||| |||||||||| ||||| ||  ||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15252840 gagttggatcgaaatagggtttatgatagaacattatgatgtagtttaattcatgtagccgaccccacttagtgggataa 15252761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 617 - 668
Target Start/End: Original strand, 27386554 - 27386605
Alignment:
Q  617 gaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  27386554 gaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 27386605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 612 - 667
Target Start/End: Original strand, 27998650 - 27998705
Alignment:
Q  612 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggata 667  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  27998650 tgatagaatattatgacgtcgtttgatccatgtaaccgaccccacttagtgggata 27998705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 575 - 650
Target Start/End: Original strand, 35615455 - 35615530
Alignment:
Q  575 atttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccga 650  Q
    |||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||| | | ||||| ||| |||||||    
T  35615455 atttagagattaatgagttggataaaaatatagtttatgatagaacattatgacctaacttgattcatatagccga 35615530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 405 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 7359539 - 7359474
Alignment:
Q  405 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaaga 471  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  7359539 ggtaacacctatagtagaaaatatggtggaaaataggtttaggtggtttgg-catgtagagagaaga 7359474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 574 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 15588501 - 15588407
Alignment:
Q  574 gatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||||  |||||||||||||  ||| || || | ||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||    
T  15588501 gatttagagagaaatgagttggataaaaacatggtatatgacagaacattatggcgtcgtttgatctatgtagccgaccctacttagtgggataa 15588407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 325 - 395
Target Start/End: Original strand, 27553760 - 27553830
Alignment:
Q  325 cggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattaga 395  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||  |||||| ||||| ||| |||| ||||||    
T  27553760 cggagatgaagatgttgtgttggatgaatagtaagactagaagagatagaattaaaaattacactattaga 27553830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 586 - 652
Target Start/End: Original strand, 41808105 - 41808171
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatc 652  Q
    |||||||||||| |||||||  | | |||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||    
T  41808105 aatgagttggatataaatatgatgtatgatagaacattatgacatcgtttgatccatgtagtcgatc 41808171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 41833874 - 41833789
Alignment:
Q  395 agagagtgggggtagcacctatag--tagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtag 478  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| |||  ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  41833874 agagagttggggtagcacctatggtatagaaaagatggtggaacatatgcttaggtggtttgggcatgtagagacaagacctgtag 41833789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 5848462 - 5848401
Alignment:
Q  301 aacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagact 362  Q
    |||| ||||||||| ||||| || | ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  5848462 aacatgagagtaaaataagtgtagcagagatgaggatgttgcattggatgtgtggtaagact 5848401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 43558172 - 43558135
Alignment:
Q  329 gatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagac 366  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43558172 gatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagac 43558135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 397; Significance: 0; HSPs: 164)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 27450855 - 27450197
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  27450855 gtatttggaatgtaacttcagcaaaaggagaagtg--ggtataccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacagtttacatatc 27450758  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27450757 ttgggtccatagtgcaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaatcatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaagtgttttgtg 27450658  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||  || |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27450657 cgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaaattctatcagacaacagtcagaccgacaatgttgtatggtacggagtgttgggcagttaagagccaa 27450558  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtg 402  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    || ||||||||||||||||||||||    
T  27450557 cacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatag----aataatgacaccattagagagagtg 27450462  T
Q  403 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatc 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||    
T  27450461 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttttgacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatc 27450362  T
Q  503 aaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaa 602  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||| | ||| ||||        |||| ||||||  ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  27450361 aaatggagtagaatcaggttaaaagaggtaaaggaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattggaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaa 27450262  T
Q  603 tatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  27450261 tat-gattttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 27450197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 31960496 - 31959831
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  31960496 gtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaatttacacggtttaaatatc 31960399  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    |||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  31960398 ttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcatattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcatatgttttgtg 31960299  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  31960298 cgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaa 31960199  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagag--agag 400  Q
    || |||| | |||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  31960198 catgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagag 31960099  T
Q  401 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatata 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  || |    
T  31960098 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtaga 31959999  T
Q  501 tcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatcta 600  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |    
T  31959998 tcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcca 31959899  T
Q  601 aatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||| | || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  31959898 aatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 31959831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Original strand, 435829 - 436494
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  435829 gtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatc 435926  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    |||||||| |  || ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  435927 ttgggtccttcgtataaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagtcatcgtattcaagctgagtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtg 436026  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  436027 cgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaa 436126  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt--agagagag 400  Q
    || |||| | |||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  436127 catgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtcgtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagag 436226  T
Q  401 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatata 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||  || |    
T  436227 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtaga 436326  T
Q  501 tcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatcta 600  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  | |||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  436327 tcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccactagaaaggatttagaggtcaatgagttgaatcca 436426  T
Q  601 aatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||| | || | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  436427 aatttggtgtatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 436494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 656
Target Start/End: Original strand, 33226809 - 33227462
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33226809 gtatatggaatgtaacttcagcggaaggacaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatc 33226906  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    |||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33226907 ttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcatattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgta 33227006  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  33227007 cgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaa 33227106  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt--agagagag 400  Q
    || |||| | | |||||| || | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  33227107 catgagaatcatgtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagag 33227206  T
Q  401 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatata 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  || |    
T  33227207 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagattgtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagagtaga 33227306  T
Q  501 tcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatcta 600  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||       | |||||| |||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |    
T  33227307 tcaaatggaagagagtcaagttaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcca 33227406  T
Q  601 aatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccac 656  Q
    ||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33227407 aatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccac 33227462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 1777697 - 1777034
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  1777697 gtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggaaatcatatcataccccaagttacacgttttaaatatc 1777600  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    |||||||| |  ||||||||||  |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1777599 ttgggtccttcgtacaaaatgacagagaaatagaagcaaatgtaagtcatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtg 1777500  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||| ||   ||||||||| |||    
T  1777499 cgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccgacgttgttgtatgatacggagtgttgaaaggttaagagtcaa 1777400  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtg 402  Q
    || || | | ||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1777399 catgaaaatcaagtaagtatagcaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagtg 1777300  T
Q  403 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatc 502  Q
    |   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| || |||||  || |||    
T  1777299 gaaatagcacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatctagagagaagactcatagatgccgtggtaagaagagtagatc 1777200  T
Q  503 aaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaa 602  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  1777199 aaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaa 1777100  T
Q  603 tatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    | | || | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1777099 tttggtgtatgatagaacagtatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataa 1777034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 48174775 - 48174110
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48174775 gtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatc 48174678  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    |||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48174677 ttgggtccttcgtacaaagtgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctaggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtg 48174578  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    | ||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  48174577 caataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggcgttgttgtatggtacggagtgttggacggttaagagtcaa 48174478  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagag--agag 400  Q
    || || | | ||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  48174477 catgaaaatcaagtaagtatagcaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacaccattagagagagag 48174378  T
Q  401 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatata 500  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  || |    
T  48174377 tgggggtaacacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtaga 48174278  T
Q  501 tcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatcta 600  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |    
T  48174277 tcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcca 48174178  T
Q  601 aatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||| | || | ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  48174177 aatttggtgtatgataaaacattatggcgtcatttgatccatgtagcagaccccacttagtgggataa 48174110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 23906983 - 23906314
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23906983 gtatatggaatgtaacttcaacggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatc 23906886  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    |||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23906885 ttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtg 23906786  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |  ||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||    
T  23906785 cgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgtatggtacgaagtgttgggcggttaagagtcaa 23906686  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagag------ 396  Q
    || |||| | |||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||          
T  23906685 catgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggcaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagag 23906586  T
Q  397 --agagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaag 494  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||| || |||||    
T  23906585 agagagtgggggtagcacctatagtagaaaagtttgtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtagagagaaga--cgtagatgccgtggtaagaag 23906488  T
Q  495 gatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttg 594  Q
      || || |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  23906487 agtagattaaatggaggagagtcaagttaaaaaaggtaaatgaagacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 23906388  T
Q  595 gatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||| |||| | || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  23906387 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataa 23906314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Original strand, 56374890 - 56375555
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  56374890 gtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagagcatatcataccccaagttacacggtttaaatatc 56374987  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    |||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  56374988 ttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatataagccatcgtattcaagctgggtggttgaaattgagaagagcctcaggtgttttgtg 56375087  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    ||||||||||  |||||||||  |||||| || | | ||||||||||||||||||||  |  | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  56375088 cgataagaaagtaccacttaatttgaaaggaaagatctatcggacagcagtcagaccagcgttattgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaa 56375187  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt--agagagag 400  Q
    || |||| | ||  |||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  56375188 catgagaatcaaacaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataagattaggaatgacaccattagagagagag 56375287  T
Q  401 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatata 500  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  || |    
T  56375288 taggggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaacaggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtaga 56375387  T
Q  501 tcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatcta 600  Q
    | |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |    
T  56375388 taaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtgaatgagttggatcca 56375487  T
Q  601 aatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  56375488 aatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataa 56375555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Original strand, 53707394 - 53708059
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||| |||||||||||||    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  53707394 gtatatcgaatgtaacttcagtggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcataccccaagttacacggtctaaatatc 53707491  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    |||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  53707492 ttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagactcagatgttttgtg 53707591  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| |||||| ||||| || ||||| |  || |||| ||||  ||||| |||||||||||||| |||    
T  53707592 cgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggccagcattccgaccggcgttgatgtatggtagagagtgttgggcggttaagagtcaa 53707691  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattag--agagag 400  Q
    || |||| | |||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||  ||||||    
T  53707692 catgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtagtaagactagacatgataggactaggaatgacaccattagaaagagag 53707791  T
Q  401 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatata 500  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||    
T  53707792 tggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtata 53707891  T
Q  501 tcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatcta 600  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||| |||        | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |    
T  53707892 tcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcca 53707991  T
Q  601 aatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||   |||||| ||||||||    
T  53707992 aatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatccatttagtcgacatcacttagtgggataa 53708059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 48623209 - 48622560
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  48623209 gtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagagcatatcataccccaaattacacgatttaaatatc 48623112  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    |||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  48623111 ttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaaaagcctcaggtgttttgtg 48623012  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |  | ||||| |||              ||||| ||| |||    
T  48623011 cgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggcgttattgtatggt--------------ggttaggagtcaa 48622926  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtg 402  Q
    || |||| | |||||||| || | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48622925 catgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgctttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagtg 48622826  T
Q  403 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatc 502  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||    | |||    
T  48622825 ggggtagcacccatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgccgtggtaagaaaagaagatc 48622726  T
Q  503 aaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaa 602  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||    
T  48622725 aaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaatcattagaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaa 48622626  T
Q  603 tatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    | | || | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  48622625 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 48622560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 60 - 659
Target Start/End: Original strand, 50286625 - 50287217
Alignment:
Q  60 agttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtatt 158  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  50286625 agttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatattgtgtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtatt 50286724  T
Q  159 caagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagac 258  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||| || ||| ||||||||| | ||||||     
T  50286725 caagctgggtggttgaaatgaagaagagtcacatgtgttttgtgcgataagaaagtaccatttaagttgaaaggaaagttctatcggacaaccgtcagat 50286824  T
Q  259 cgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaa 358  Q
    ||||  ||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| | |||||||| || | ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  50286825 cgacgttgttgtatgatacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggaagttgcgttggatgagtggtaa 50286924  T
Q  359 gactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggaca 458  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||       |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||    
T  50286925 gactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagggg-------acctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttggatggtttgggca 50287017  T
Q  459 tgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattaga 558  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||  || ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||    
T  50287018 tgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcgaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaagaagacctatgaaaactattaga 50287117  T
Q  559 gaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccactt 658  Q
    | ||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |  | | |||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  50287118 gtaatcattataaaggatttagaggtcaatgagttggatctaaatttgatgtatgatagaacactatg-ggccatttgatccatgtagtcgaccccactt 50287216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 130 - 668
Target Start/End: Original strand, 43433643 - 43434189
Alignment:
Q  130 aaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaa 229  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||| ||||    
T  43433643 aaatagaagcagatgtaaaccatcgtattcaagctgggtgattgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtgtcacttaagttgaa 43433742  T
Q  230 agaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggag 329  Q
    || || ||| |||||||||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| | |||||||| || | |||    
T  43433743 aggaaagttctatcggacagcaatcagaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagag 43433842  T
Q  330 atgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt--------agagagagtgggggtagcacctatagtag 421  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43433843 atgaggatgttgcgttggatgagtggcaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagagagagtgggggtagcacctatagtag 43433942  T
Q  422 aaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggt 521  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  || ||||||||||||||||||  ||    
T  43433943 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtcaagt 43434042  T
Q  522 taaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaaca 621  Q
    ||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||  ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |  | |  |||||||||    
T  43434043 taaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattgaaaatgatttagaggtcaatgagtcggatccaaatttgatgtaggatagaaca 43434142  T
Q  622 ctatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  43434143 ctacggcgtcatttgatccatgtagtcgagcccacttagtgggataa 43434189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 47265886 - 47265212
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  47265886 gtatatgaaatgtaacttcagcaaaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggaggtcatatcataccccaagttacatagtttaaatatc 47265789  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    |||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||   ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  47265788 ttggatccatagtataaaatgacggagaaatagaagcaaatgtaagccatcgt-ttcaagctgggtgattgaaatgaagaagagccttaggtgttttgtg 47265690  T
Q  203 cgataagaa---aaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagc 299  Q
    |||||||||   |  |||||||||| |||||  || ||| |||| |||| ||||||||||  | |||||||| |||||  |||  ||| ||||||||||     
T  47265689 cgataagaaagtagtaccacttaagttgaaatgaaagttctatctgacaacagtcagaccagcgatgttgtatggtacaaagtattggacggttaagagt 47265590  T
Q  300 caacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccat--tagaga 397  Q
    |||||||||| | ||||| || || |  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||  ||||||    
T  47265589 caacacgagaatcaagtaggtgtagcaaagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataagattatgaatgacaccattatagaga 47265490  T
Q  398 gagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac-------ccgtagatgccgttgtta 490  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||       ||||||||||||| || |    
T  47265489 gagtgggggtaacacctatagtagaaaaggtagtagaaaataggtttagatgatttgggcatgtagagagaagacacgtagtccgtagatgccgtcgtaa 47265390  T
Q  491 gaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatga 590  Q
    ||||  || |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  ||||||||  |||||||||| |||||    
T  47265389 gaagagtagactaaatggaggagattctagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaagaatttagaggtcaatga 47265290  T
Q  591 gttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||| |||| |  | | ||||||||||||||   || ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  47265289 gttggatccaaatttgatctatgatagaacactatagtgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataa 47265212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 115 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 46583396 - 46582862
Alignment:
Q  115 tacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaa 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||      
T  46583396 tacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcatattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtattttgtgcgataagaaagt 46583297  T
Q  215 accacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaa 314  Q
    | |||||||  |||||| || ||| ||| |||||||||||||| || |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| | ||    
T  46583296 atcacttaatttgaaaggaaagttctattggacagcagtcagatcggcgctgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaa 46583197  T
Q  315 gtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt--agagagagtgggggtagcac 412  Q
    |||||| || | ||||||| |||||||| || ||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  46583196 gtaagtgtagcagagatgaggatgttgcattagagaagtggtaagactagacagcataggattaggaatgacaccattcgagagagagtggggatagcac 46583097  T
Q  413 ctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaaga-cccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggagg 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||  |||||||| |||||||||| ||| || |||||  || ||||||||||||    
T  46583096 ctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgggttgggcatgt--agagaagaccccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggagg 46582999  T
Q  512 agagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttt 611  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  ||| |||| |||||| |||| ||||||||||||| |||| | || |     
T  46582998 agagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactattagagaaaccattggaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatttggtgta 46582899  T
Q  612 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagcc 648  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  46582898 tgatagaaccctatggcgtcatttgatccatgtagcc 46582862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 7 - 667
Target Start/End: Original strand, 16002532 - 16003190
Alignment:
Q  7 tatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttg 105  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||  |  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  16002532 tatggaatataactttagcaaaaggagaagttag--tctaccttggaggtaaaagttggaaatcatatcataccccaaattacacggtttaaa-atcttg 16002628  T
Q  106 ggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcga 205  Q
    | |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  16002629 gttccatagtacaaaatgacggagacatagaagcagatgtaaatcatcgtatttaagctgagtggttgaaattgagaagagcctcaggtgttttgtgtga 16002728  T
Q  206 taagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacac 305  Q
    |||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||| |||| |||| |||||  | ||||||| | | ||| |||| |||| ||||||||| ||||||    
T  16002729 taagaaagtaccacttaagttcaaagaaaagttttatcagacatcagttagaccagcgatgttgt-atgaacgaagtgttgggaggttaagagtcaacac 16002827  T
Q  306 gagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccat--tagagagagtgg 403  Q
    |||| | |||||||| ||  | ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||     
T  16002828 gagaatcaagtaagtgtagtgaagacgatgatgttgtgctggatgagtggtaagactagacgaaataggattaggaatgacaccattatagagtgagtga 16002927  T
Q  404 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatca 503  Q
    || | |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||| || ||||    
T  16002928 ggatggcacctatggtataaaagttgatagaaaatagtcttagatgg-ttgaacatttagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagggtaaatca 16003026  T
Q  504 aatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaat 603  Q
     ||||| || |||   || ||||||  |||| ||| |||        | || |||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16003027 gatggatgaaagttatgtcaaaagaaatagaggaataccgtaaaaaactataagagaaaccattagaaaaaatttagaggtcaatgagttggatctaaat 16003126  T
Q  604 atagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggata 667  Q
    ||  ||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||  |||||||| ||||| |||||    
T  16003127 atgatttatgataaaacactatgacgtaatttaatccatataagcgatcccatttaataggata 16003190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 215 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 52569987 - 52569532
Alignment:
Q  215 accacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaa 314  Q
    |||||||||| |||||| || ||| ||| ||||| |||||||||||    ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||||| |||| | ||    
T  52569987 accacttaagttgaaaggaaagttctattggacaacagtcagaccggtgttgttgtatggtacggagtgttgttcggttaagagtcaacatgagaatcaa 52569888  T
Q  315 gtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagag--tgggggtagcac 412  Q
    |||||| || | ||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  52569887 gtaagtgtagcagagatcaggatgttgtgttggatgaggggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcac 52569788  T
Q  413 ctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggagga 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  || |||||||||||||    
T  52569787 ctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggagga 52569688  T
Q  513 gagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagttttt 612  Q
    |||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | |||| |||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | || | |    
T  52569687 gagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtat 52569588  T
Q  613 gatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  52569587 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 52569532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 231 - 668
Target Start/End: Original strand, 4440682 - 4441118
Alignment:
Q  231 gaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggaga 330  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| | ||||| ||| ||| |||||||||| ||||| |||| | |||||||| || | ||||    
T  4440682 gaaaagttctatcggacagcagtcagaccaacgttgttgtatgatacggggtgttgg-cggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagaga 4440780  T
Q  331 tgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttgg 430  Q
    | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4440781 ttaggatgttgcgttcgatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatggcaccattagagagagtgggggcagcacctatagtagaaaagttgg 4440880  T
Q  431 tagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagagg 530  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || || |||||  || ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4440881 tagaaaataggcttagatggtttgggcatctagagagaagacccgtagatgctgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagagg 4440980  T
Q  531 tagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgt 630  Q
    |||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||||| |||    
T  4440981 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 4441080  T
Q  631 catttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  4441081 catttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 4441118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 274 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 33191261 - 33190865
Alignment:
Q  274 gtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagatag 373  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||| | |||||||| || | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||    
T  33191261 gtacggagtgttgggcgattaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagattagataggatag 33191162  T
Q  374 gattaagaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaaga 471  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  33191161 gattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagattgtttgggcatgtagagagaaga 33191062  T
Q  472 cccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaa 571  Q
    ||||||||||||||  | |||||| || ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||    
T  33191061 cccgtagatgccgtgttaagaagggtagatcaaatggagaagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaa 33190962  T
Q  572 atgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    | ||||||||||| ||||||||| ||| |||| | || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  33190961 aggatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgacccatgtagccgaccccacctagtgggataa 33190865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 61 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 1212017 - 1211409
Alignment:
Q  61 gttggagatcatatcatacccaa-gttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattc 159  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||| |  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1212017 gttggagatcatatcataccttacgttacatagtttaaatatcttgtgtccatagtacaaaataacagagaaatagaagcaggtgtaaatcatcgtattc 1211918  T
Q  160 aagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagacc 259  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||| || ||| ||||||||| ||||||||||    
T  1211917 aagttaggtagttgaaatggagaagagcctcaaatgttttgtatgataagaaaataccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacagtcagacc 1211818  T
Q  260 gacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaag 359  Q
    |   |||||||  ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||| |||| ||||||||  ||||||||||||||     
T  1211817 ggtgatgttgtgtggtacagagtgttggacggttaagagccaacacgagaatcaagtaagtgtagcggatatgaggatgttgcactggatgagtggtaaa 1211718  T
Q  360 actagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtag--aaaatagtcttagatggtttggac 457  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||  || |||  |||| |||||||||      
T  1211717 actagacatgatatgattaggaatgacaccattcgagagagtgggagcagcacctatagtaaacaagttggtaggaaatatatgcttaaatggtttggga 1211618  T
Q  458 atgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattag 557  Q
    ||||||||||||||||  |||||   || || |||||  || |||| |||||| |||||| | | ||||||| |||| ||| || |       | || ||    
T  1211617 atgtagagagaagacctatagatattgtcgtaagaagagtagatcagatggagtagagtcggatcaaaagagatagaggaagacataggagaactataag 1211518  T
Q  558 agaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgt-catttgatccatgtagccgatcccac 656  Q
    | |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||   || | |||| | ||||||||||| | |||  ||||||| ||||||||||| |||||    
T  1211517 ataaattattagaaa-aaattagaggtcaatgagttggatc--catttggtttctcatagaacactaaggcgtaaatttgattcatgtagccgaccccac 1211421  T
Q  657 ttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||    
T  1211420 ttaatgggataa 1211409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 288 - 668
Target Start/End: Original strand, 27983083 - 27983458
Alignment:
Q  288 gcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgaca 387  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||| | | ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  27983083 gcggttaagagtcaacatgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatattgtgctagatgagtggtaagactatacatgataggattaggaatgaca 27983182  T
Q  388 ccatt--agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgt 485  Q
    |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||       ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27983183 ccattagagagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttgg-------taggcttagatggtttgaacatgtagagagaagactcgtagatgccgt 27983275  T
Q  486 tgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggta 585  Q
    ||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |       ||||| || |||   ||||||| ||||||||| |     
T  27983276 tgtaagaagagtatatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacataagaaaaccattcgataaacctttagaaaagatttagagttc 27983375  T
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27983376 aatgaattggatcaaaatatggatttttatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccaattaatgggataa 27983458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 273 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 39100947 - 39100553
Alignment:
Q  273 ggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagata 372  Q
    ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||| |||||||||    |||||||||||||||||| | ||||    
T  39100947 ggtacagagtgttggacagttaagagccaacacgagagtcatgtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgccaaatgagtggtaagactagaaatgata 39100848  T
Q  373 ggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  39100847 ggattaggaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagaagaaaagttgatagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagat 39100748  T
Q  473 ccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaa 572  Q
    ||||||||| |||||| |||||  || |||| ||||| || |||| |||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  ||||||||    
T  39100747 ccgtagatg-cgttgtaagaagagtagatcagatggaagatagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaa 39100649  T
Q  573 tgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| |||| ||| || | |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  39100648 ggatttggaggtcaatgagttggatccaaatattgtttatcatagaacattatggcgtaatataatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 39100553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 361
Target Start/End: Original strand, 39708057 - 39708414
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatc 102  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  39708057 gtatatggaatataacttcagcaaaaggagaatta--ggtctatcttggaggtgaaatttggagatcatattatacctcaagttatgcggtttaaatatc 39708154  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtg-ttttgt 201  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |    
T  39708155 ttgggtcgatagtacaaaatgacggagaaatagaagcaggtgtaaatcctcgtattcaagctggatggttgaaatggataagagccttaggtggtttttt 39708254  T
Q  202 gcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagcca 301  Q
    | |||||||||  |||||||||| |||||| || ||| |||||| || ||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  39708255 gtgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcgggcaacagtccgatcgacaatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagaggca 39708354  T
Q  302 acacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagac 361  Q
    |||||||| | |||||||| ||  | |||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  39708355 acacgagaatcaagtaagtgtagtgcagatgaggatgttgcgttggatgagcagtaagac 39708414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 336 - 668
Target Start/End: Original strand, 37797783 - 37798116
Alignment:
Q  336 atgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagag--agagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtag 433  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37797783 atgttgcgttggatgagtgataagactagacatgataagattagaaatgacaccattagagagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtag 37797882  T
Q  434 aaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtag 533  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||  || |||||||||| ||||||| ||||||||||  |||    
T  37797883 aaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagattcgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggatgagagtcaggttaaaaga-ttag 37797981  T
Q  534 atgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcat 633  Q
    | ||| | ||       | ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  37797982 aggaagatctaggaaaactattagagaaatcattagaaaggatttagaagtcaatgagttgaatccaaatatggtttatgatagaacaatatgacgtcat 37798081  T
Q  634 ttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||    
T  37798082 ttgatcaatgtagccgactccatttagtgggataa 37798116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 118 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 41009922 - 41009414
Alignment:
Q  118 aaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagt---ctcaggtgttttgtgcgataagaaaaa 214  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |   || ||||| |||||  ||||||||||     
T  41009922 aaaatgacggagaaatagaagcaaatgtaaatcttcgtattcaagttaggtggttgaaatggagaagattaatctgaggtgatttgtatgataagaaaat 41009823  T
Q  215 accacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaa 314  Q
    |||||||||| ||  | ||| ||| ||| ||||| || |||||||  | ||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| | ||    
T  41009822 accacttaagttgggaaaaaagttctattggacaacaatcagaccagcgatgttgtatagtacggagtgttgggcgattaagagccaacatgagaatcaa 41009723  T
Q  315 gtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatta--gagagagtgggggtagcac 412  Q
    |||||| || |||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||  ||||||| |||||  |||| | ||||||||||||    
T  41009722 gtaagtgtagcggaaatgaggatgttgcgttggatgatcggtaagactagacatggtaggattagaaatgacatcattagggagataatgggggtagcac 41009623  T
Q  413 ctatagtagaaaagttggt-agaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggagg 511  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||  || ||||| || || ||||  ||| |||| |||||||    
T  41009622 ctatagtagaaaagttggtaaaaaaatagacttagatggtttgtgcatgtagaaagaagacatgttgatgcagtcgtaagaaaaatagatcagatggagg 41009523  T
Q  512 agagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttt 611  Q
    |||||| ||| ||||| |||||| ||| ||||       | || ||||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||  |||||| ||||     
T  41009522 agagtcaggtcaaaagtggtagaggaagacct-ggaaaactataagagaaactattagaaatgatttagaagtcaatgagatggattcaaatatggttta 41009424  T
Q  612 tgatagaaca 621  Q
    ||||| ||||    
T  41009423 tgatataaca 41009414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 300 - 668
Target Start/End: Original strand, 28236080 - 28236447
Alignment:
Q  300 caacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagaga 399  Q
    ||||| |||| | |||||||| || | ||||| |||||| ||| |||||||| |||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28236080 caacatgagaatcaagtaagtgtagcagagattatgatgctgcattggatgaatggtaagattagatatgataggattaggaatgacaccattagagaga 28236179  T
Q  400 gtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatat 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| || |||||  |      
T  28236180 gtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtggaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatgtcgtcgtaagaagagttg 28236279  T
Q  500 atcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatct 599  Q
    ||||||||| ||||| ||  |||||||  |||||| ||| ||||       | |||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||     
T  28236280 atcaaatggcggagaatcaagttaaaa-tggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaatctttataaatgatttagaggtcaatgagttggatcc 28236378  T
Q  600 aaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||| | |||| |||||||| | ||||  || |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  28236379 aaatttggtttatgatagaatattatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataa 28236447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 327 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 37773810 - 37773468
Alignment:
Q  327 gagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtg-ggggtagcacctatagtagaaaa 425  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  37773810 gagatgagaatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatagaattatgaatgataccattagagagagtaaggggtagcacctatagtagaaaa 37773711  T
Q  426 gttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaa 525  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||  |||||| || ||  || |||||||||| |||||||   |||||    
T  37773710 gtcggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagatagacgacccgtaaatatcgttgtaagtagagtagatcaaatggatgagagtcaatttaaa 37773611  T
Q  526 agaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactat 625  Q
    ||||||||||||| ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| | || | |||| ||||||||||||||    
T  37773610 agaggtagatgaatacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttggaggtcaatgagttggatccagatttggtttatgatagaacactat 37773511  T
Q  626 gacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||| | |||||||| || ||||||| ||| ||||||| |||||    
T  37773510 gacataatttgatctatatagccgaccccgcttaatgagataa 37773468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 393 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 26037797 - 26037522
Alignment:
Q  393 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttaga 492  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    | ||||||||||||| ||| ||||||| || |||    
T  26037797 agagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgatattatagagagaagacctgtaaatgccgtcgtaaga 26037698  T
Q  493 aggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagt 592  Q
    ||  || |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||       |||| ||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||    
T  26037697 agagtagatcagatggaggagagtcaggttaaaagaggcagaggaaaacctaggaaaaccataagagaaactattaggaaagatttagaggtgaatgagt 26037598  T
Q  593 tggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  26037597 tggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaattggatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 26037522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 422 - 659
Target Start/End: Original strand, 32479057 - 32479294
Alignment:
Q  422 aaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggt 521  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  || |||||||||||||||| | |||    
T  32479057 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagaggagacctgtagaggccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagacaggt 32479156  T
Q  522 taaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaaca 621  Q
    | ||||||||||| ||| ||||       ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  32479157 tgaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcaaaatatggtttttgatagaaca 32479256  T
Q  622 ctatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 659  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32479257 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactta 32479294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 261 - 668
Target Start/End: Original strand, 1793316 - 1793727
Alignment:
Q  261 acaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaaga 360  Q
    ||||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  1793316 acaatgttgtatgatacagagtgtttggcggttaagagccaacactagaatcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgtgttggatgaacggtaaga 1793415  T
Q  361 ctagacaagataggattaagaatgacaccattag--agagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggaca 458  Q
    ||  ||  |||| ||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1793416 cttaacgggataagattaggaatgacaccattagggagagagcgggggtagcacctatagtaaaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggaca 1793515  T
Q  459 tgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattaga 558  Q
    ||||||||||||||  || |||| ||| || ||||   || |||| ||||||  |||||   | ||||||||||||  || ||||       | || |||    
T  1793516 tgtagagagaagacttgttgatgtcgtcgtaagaatagtagatcagatggag--gagtcgtatcaaaagaggtagagaaagacctcgaaaaactataaga 1793613  T
Q  559 gaaa----ttattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccc 654  Q
    ||||    | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  1793614 gaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctc 1793713  T
Q  655 acttaatgggataa 668  Q
    ||||| || |||||    
T  1793714 acttagtgagataa 1793727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 384 - 668
Target Start/End: Original strand, 39708412 - 39708698
Alignment:
Q  384 gacaccattag--agagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatg 481  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||| | ||||||    
T  39708412 gacaccattagggagagagtgagggtagctcctgtagtataaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtatagagaagacacatagatg 39708511  T
Q  482 ccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttaga 581  Q
    |||| || |||||  || |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||       | || |||||||  |||||||| ||||||||    
T  39708512 ccgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttaga 39708611  T
Q  582 ggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  39708612 ggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatgtcgtaatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataa 39708698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 273 - 447
Target Start/End: Original strand, 12494618 - 12494794
Alignment:
Q  273 ggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagata 372  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| | |||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12494618 ggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgata 12494717  T
Q  373 ggattaagaatgacaccatt--agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttaga 447  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12494718 ggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttaga 12494794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 252 - 471
Target Start/End: Original strand, 31458875 - 31459098
Alignment:
Q  252 gtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatga 351  Q
    ||||||||| | ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||| || |  |||||| ||||||||||||| |||    
T  31458875 gtcagaccggcgatgttttatggtacggagtgttgggcagttaagaaccaacacgaaaataaagtaagtgtagcacagatgaggatgttgcgttggttga 31458974  T
Q  352 gtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagaga----gtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttaga 447  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  31458975 gtggtaagactagacatgataggattaggaatgataccattagagagacagagtcgaggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttagg 31459074  T
Q  448 tggtttggacatgtagagagaaga 471  Q
    |||||||| |||||| ||||||||    
T  31459075 tggtttgggcatgtaaagagaaga 31459098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 395 - 669
Target Start/End: Original strand, 20192025 - 20192298
Alignment:
Q  395 agagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaag 494  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  20192025 agagagtgggggtagcacttatagtagaaaagttgatagaaaataagcttagatagtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtggtaagaag 20192124  T
Q  495 gatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttg 594  Q
      |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| | || ||||    
T  20192125 agtatatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagtggaagacctgaaaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgggttg 20192224  T
Q  595 gatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataaa 669  Q
    |||| |||| |  | | |||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||    
T  20192225 gatccaaatttgatgtatgatagaacattatgacgttatttgat-caagtagccgaccctacttagtgggataaa 20192298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 339 - 669
Target Start/End: Original strand, 51421666 - 51421996
Alignment:
Q  339 ttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 438  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||  || || ||||||||    
T  51421666 ttgcgttggatgagtagtaagactagacgagataggattatgaatgacaccattagagagtgttggggtagcacatatagtagattagatgatagaaaat 51421765  T
Q  439 agtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaa 538  Q
    || ||||| |||||||| ||| || |||||||||| |||||||  ||  |  ||||  || ||||||||||||   ||| | | |||||||||||| |||    
T  51421766 aggcttaggtggtttgggcatatacagagaagaccggtagatgttgtaatacgaagagtagatcaaatggaggtttgtcagatcaaaagaggtagaggaa 51421865  T
Q  539 aacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgat 638  Q
     |  |       | || ||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||||||| ||| || |||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  51421866 gatttagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaattggatccaaaaatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgat 51421965  T
Q  639 ccatgtagccgatcccacttaatgggataaa 669  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  51421966 ccatgtagccaatctcacttagtgggataaa 51421996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 142 - 425
Target Start/End: Original strand, 35690042 - 35690326
Alignment:
Q  142 atgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggtttta 241  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| || |||||||||   ||  ||||| ||| || ||  || ||    
T  35690042 atgtaaatcatcgtattcaagttgggtggttgaaatggagaagagtg-cgggtgttttatgtgataagaaagtgccgtttaagttgagaggaaaattcta 35690140  T
Q  242 tcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttg 341  Q
    || |||| |||| |||||||| |||||||| | || ||| || || | |||||||| |||||| |||| | |||||||| || | ||||||| |||||||    
T  35690141 tcagacaacagttagaccgacgatgttgtatgatatggaatgttgtgtggttaagaaccaacatgagaatcaagtaagtgtagccgagatgaggatgttg 35690240  T
Q  342 cgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt--agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaa 425  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35690241 cgttggatgagtagtaagactagacgagataggattaggaatgacacctttaaagagagagttggggtagcacctatagtagaaaa 35690326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 255 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 45205280 - 45204857
Alignment:
Q  255 agaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtg 354  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||  || ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  45205280 agaccggcgatgttgtatggtacggagtgttgggcagttaagaaccaacacgagaatcaagtaagcgtagcggagatgaggatgttgtgttggatgagtg 45205181  T
Q  355 gtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatta--gagagag-tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag--tcttagatg 449  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||  | |||| ||    
T  45205180 gtaagactagacgggataggattaggaatgacaccattaacgagagagttgggggtagtgcctatagtagaaaagatggtagaaaatagacttttaggtg 45205081  T
Q  450 gtttggacatgtagagagaagac-------ccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacc 542  Q
    |||||  || |||||||||||||       | |||||||  |||||  ||||  || |||| ||||||||||| | | | ||||||||| || ||| |||    
T  45205080 gtttgtgcacgtagagagaagacctgtagtctgtagatgatgttgtacgaagagtagatcagatggaggagag-cagatcaaaagaggtggaggaagacc 45204982  T
Q  543 tnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccat 642  Q
    |       | || ||||||| |||||| || ||||||||| | ||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||| || | ||| |||||||| ||    
T  45204981 tagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagtttaataagttggatccaaatatggtttatgatagaacatta-ggcgtaatttgatctat 45204883  T
Q  643 gtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||| | || ||||| ||||||||    
T  45204882 gtagcccacccaacttagtgggataa 45204857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 314 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 20602019 - 20601788
Alignment:
Q  314 agtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattag--agagagtgggggtagca 411  Q
    ||||||| || |||| |||| ||||||||| |||||||| | |||||| | ||| ||||| ||| |||||||||||| |||  ||||||||| | || ||    
T  20602019 agtaagtgtagcggatatgaggatgttgcgctggatgagcgctaagacaatacatgatagaattgagaatgacaccactagggagagagtggagataaca 20601920  T
Q  412 cctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggagg 511  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||| | |||||||    
T  20601919 cttatagtagaaaagttggtagaaaataggattagatggtttgtgcatgtagagagaagacctgtagatgccgttgtaagaagagtatataagatggagg 20601820  T
Q  512 agagtctggttaaaagaggtagatgaaaacct 543  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||    
T  20601819 agagtcaggtcaaaagaggtagaagaagacct 20601788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 427 - 668
Target Start/End: Original strand, 8286455 - 8286704
Alignment:
Q  427 ttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaa 526  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  || || |||||||||||||||  |||| ||    
T  8286455 ttggtagaaaataggcttagatggtttaggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatgaaatggaggagagtcaagttagaa 8286554  T
Q  527 gagg--------tagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgataga 618  Q
    ||||        |||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| |||||||    
T  8286555 gaggacaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgataga 8286654  T
Q  619 acactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  8286655 acactatgacgtcatttgatccatgtagccgcccccacttagtgggataa 8286704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 330 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 20591657 - 20591353
Alignment:
Q  330 atgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattag--agagagtgggggtagcacctatagtagaaaagt 427  Q
    |||| ||||||| | ||||||| | ||||||||||||   ||  |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20591657 atgaggatgttgtgctggatgaatagtaagactagacggaattagattgagaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacttatagtagaaaagt 20591558  T
Q  428 tggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaag 527  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| || ||| |||||  ||||||| |||||||||||||  ||    ||    
T  20591557 tggtagaaaataagattagatggtttgggcatgtagagagaagactcatagatgtcg-tgtaagaagagtatatcagatggaggagagtcaagt----ag 20591463  T
Q  528 aggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatga 627  Q
    ||||||| ||| ||||       | || |||||    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||| | || ||||||||||| ||||    
T  20591462 aggtagaggaagacctaagaaaactataagagaccccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggattcaaatat-ggttatgatagaacacaatga 20591364  T
Q  628 cgtcatttgat 638  Q
    ||| |||||||    
T  20591363 cgtaatttgat 20591353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 10776055 - 10775654
Alignment:
Q  52 gaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaatt 150  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |   |||||||||      
T  10776055 gaggggaaagttggagatcatatcataccacaagttacatggtttaaatatcttgggtctataatacaaaatgatggagaagttta---agatgtaaacc 10775959  T
Q  151 atcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagc 250  Q
    || | ||||||  |||||||||||||||||| || | || |  |||||| || |||  ||||  ||| || ||| |||| | ||  |||||| ||||| |    
T  10775958 atagaattcaaaatgggtggttgaaatggaggagtgccttacttgttttatgtgatgcgaaagcacccctcaagttgaagggaaaattttattggacaac 10775859  T
Q  251 agtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatg 350  Q
     || ||||| |  |||||||| || |  ||||| |||||||| |||| | ||  | | | |||| ||||  || | ||||||||||||||| ||||||||    
T  10775858 ggtaagaccaatgatgttgtatgggaaagagtgttgggcggtaaagaactaatgcaaaaataaattaagcgtagcagagatgatgatgttgtgttggatg 10775759  T
Q  351 agtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagat 448  Q
     |||| | ||| ||||| || || ||||  ||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||| |    
T  10775758 cgtggcaggaccagacaggaaagaattagaaatgacaacattagagagagtgttggggtaacacctatagtagaaaagatggtagaaactagacataggt 10775659  T
Q  449 ggttt 453  Q
    |||||    
T  10775658 ggttt 10775654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 553 - 668
Target Start/End: Original strand, 6957748 - 6957863
Alignment:
Q  553 attagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatc 652  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6957748 attagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatc 6957847  T
Q  653 ccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||| ||||||||    
T  6957848 ccacttagtgggataa 6957863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 500 - 668
Target Start/End: Original strand, 21236955 - 21237123
Alignment:
Q  500 atcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatct 599  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||     
T  21236955 atcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc 21237054  T
Q  600 aaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||| | || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  21237055 aaatttggtatatgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccaaccccacttagtgggataa 21237123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 93 - 471
Target Start/End: Original strand, 55578722 - 55579100
Alignment:
Q  93 tttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcag 192  Q
    |||||||||||||| || ||| || |||||||  |||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||   ||||    
T  55578722 tttaaatatcttggatctatagtataaaatgactgagaaatagaagcatacataaatcatcgtatttaagttaggtggttaaaatggagaagatcttcag 55578821  T
Q  193 gtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggt 292  Q
     |||||| || ||||| |      | |||||| || ||| ||  || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| | |||| ||||||||    
T  55578822 atgttttatgtgataacatgt---cgcttaagttggaaggaaaattctatcggacaacagtcagaccaacaatgttgtatggtatgaagtgttgggcggt 55578918  T
Q  293 taagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccat- 391  Q
    ||||| ||||||||||| | || ||||| || |  | |||| ||||||| |||| || ||||||||||  | || ||||| ||||| ||||||||| ||     
T  55578919 taagaaccaacacgagaatcaattaagtgtagcatatatgaggatgttgtgttgaataagtggtaagaggaaacgagataagattatgaatgacactatt 55579018  T
Q  392 ---tagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaaga 471  Q
       |||||||||| ||  || |||||||||| |||||  ||||||||||||  ||||| ||||| || |||||| ||||||||    
T  55579019 ttatagagagagttggaataacacctatagt-gaaaaaatggtagaaaatatgcttaggtggttcgggcatgtaaagagaaga 55579100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 7092847 - 7092424
Alignment:
Q  53 aggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaatta 151  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |  || |||||||||||||||||  |||||| ||| || ||||| | | | ||||||| ||||||||| || |    
T  7092847 aggtgaaagttgaagatcatatcatatcttaaattacacggtttaaatattgtgggtctatagtataaaataacgaataaatagatgcagatgtacatca 7092748  T
Q  152 tcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagca 251  Q
    |  |||||||| |||||||||||||||||  |  | ||||   ||||| | | ||||||||  ||||       |||||| ||  || |||  |||||||    
T  7092747 tattattcaagttgggtggttgaaatggaagaatgcctcataagttttatacaataagaaagtacca-------tgaaaggaaaattctattagacagca 7092655  T
Q  252 gtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatga 351  Q
    || ||| || | |||||||| ||||||||||  | ||| ||||||| |||||||||||   |||||||| || | ||||||| ||||||| | |||||||    
T  7092654 gttagatcggcgatgttgtatggtacggagttttaggcagttaagaaccaacacgagaagcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgtgctggatga 7092555  T
Q  352 gtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagag--agagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatg 449  Q
    |||||||| |||||   |||| |||| |||||||||  |||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||  || ||||||||||  |||  ||    
T  7092554 gtggtaagtctagaagggatatgatt-agaatgacatgattagagacagagttggaatagcacctatagtagaaaatatgatagaaaataggtttaagtg 7092456  T
Q  450 gtttggacatgtagagagaagacccgtagatg 481  Q
    |||||| ||| ||||||||||||  |||||||    
T  7092455 gtttgggcatatagagagaagacatgtagatg 7092424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 17666680 - 17666526
Alignment:
Q  43 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacccaagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcaga 142  Q
    |||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||  | ||||||| ||||| |    
T  17666680 tctatcttagaggtgaacgttagagatcatatcatac--aagttacacagtttaaatatcttgggttcaaagtacaaaatgtcgaagaaataaaagcaaa 17666583  T
Q  143 tgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtttt 199  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  17666582 tgtaaatcatcgtattcaagttggattgttgaaatggagaagagcatcatgtgtttt 17666526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 551 - 668
Target Start/End: Original strand, 21528436 - 21528553
Alignment:
Q  551 ccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccga 650  Q
    ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  21528436 ccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttttgatagaacactatggtggcatttgatccatgtagccga 21528535  T
Q  651 tcccacttaatgggataa 668  Q
     |||||||| ||||||||    
T  21528536 ccccacttagtgggataa 21528553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 553 - 668
Target Start/End: Original strand, 12494813 - 12494928
Alignment:
Q  553 attagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatc 652  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  12494813 attagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttaatccatgtagcggacc 12494912  T
Q  653 ccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||| ||||||||    
T  12494913 ccacttagtgggataa 12494928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 355 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 51252791 - 51252674
Alignment:
Q  355 gtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttg 454  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||||| |||| ||    
T  51252791 gtaagactagacgagataggattagaaatgactacattagagagagttggggtagcacctctagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtatg 51252692  T
Q  455 gacatgtagagagaagac 472  Q
    | ||||||||||||||||    
T  51252691 ggcatgtagagagaagac 51252674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 55 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 54787878 - 54787741
Alignment:
Q  55 gtgaaagttggagatcatatcatacccaag-ttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatc 153  Q
    |||||||||| ||| | ||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |  |||||| | |||||||||||||| |||    
T  54787878 gtgaaagttgaagaacgtatcaaaccccagattacacggtttaaatatctttggtccagagtacaaaatcacagagaaaaaaaagcagatgtaaataatc 54787779  T
Q  154 gtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctca 191  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  54787778 gtatttaagttgggtggttgaaatggagaatagtctca 54787741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 557 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 51811406 - 51811296
Alignment:
Q  557 gagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccac 656  Q
    ||||||| ||||||||   ||| ||| | |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51811406 gagaaatcattagaaaaagtttcgagctcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccga-cccac 51811308  T
Q  657 ttaatgggataa 668  Q
    ||| ||||||||    
T  51811307 ttagtgggataa 51811296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 59 - 182
Target Start/End: Original strand, 1629084 - 1629208
Alignment:
Q  59 aagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtat 157  Q
    ||||| ||||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||||  | |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1629084 aagtttgagatcatatcgtgccacaagttacatagtttaaatatcttgaattcatagtataaaacgatggagaaatagaagcagatgtaaatcatcgtat 1629183  T
Q  158 tcaagctgggtggttgaaatggaga 182  Q
    ||||  || ||||||||||||||||    
T  1629184 tcaacttgagtggttgaaatggaga 1629208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 327 - 472
Target Start/End: Original strand, 54470129 - 54470276
Alignment:
Q  327 gagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt--agagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 424  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||   |||| ||||   ||| ||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54470129 gagatgaggatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgggatatgatttgaaataacaacattagagagagagttggggtagcacctatagtagaaa 54470228  T
Q  425 agttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    || |||| |||| ||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  54470229 agatggtggaaactagacttaagtggtttgggcatgtagagagaagac 54470276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 94 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 54914781 - 54914618
Alignment:
Q  94 ttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcagg 193  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||     ||||||||||||||||| || ||  ||    
T  54914781 ttaaatatcttgggtccatggtataaaatgatggagaaatagaaacagatgtaaatccttgtattcaaatcatgtggttgaaatggagaaaag-ctttgg 54914683  T
Q  194 tgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagac 258  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||| |||||| ||  || |||||| ||| ||||||||    
T  54914682 tgttttatgtgataagaaaataccacttaagttgaaaggaaaattctatcggtcaggagtcagac 54914618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 327 - 470
Target Start/End: Original strand, 56224987 - 56225133
Alignment:
Q  327 gagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagact---agacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaa 423  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    ||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||| ||| ||| ||  |||||||||| ||    
T  56224987 gagatgatgatgttgtggtggatgagtggtaagacactaagacatgatatgattaggaatgacaccataagagaaagttgggataatacctatagtataa 56225086  T
Q  424 aagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaag 470  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||   |||||||||||||    
T  56225087 aagatggtagaaaataggcttaggtggtttgagtatgtagagagaag 56225133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 553 - 668
Target Start/End: Original strand, 4548172 - 4548287
Alignment:
Q  553 attagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatc 652  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| | |    
T  4548172 attagagaaatcattagaaatattttagaggtcaataagttggatctaaatttggtttatgatagaacactaaggcgtaatttgatccatgtagccaacc 4548271  T
Q  653 ccacttaatgggataa 668  Q
    | ||||| ||||||||    
T  4548272 caacttagtgggataa 4548287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 574 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 53518434 - 53518342
Alignment:
Q  574 gatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggata 667  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||| |||||||| |||||||    
T  53518434 gatttagaggttaatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgcag-cgaccccacttagtgggata 53518342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 580 - 668
Target Start/End: Original strand, 19969358 - 19969446
Alignment:
Q  580 gaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| | |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19969358 gaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacgctatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 19969446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 337 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 25257929 - 25257793
Alignment:
Q  337 tgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 436  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||  ||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| | || ||||| ||||||||     
T  25257929 tgttgtgttggatgtgtagtaagactagacatgatagaattagaaatgacaacattagagagagttgaggtaacacctacaatataaaagatggtagaag 25257830  T
Q  437 atagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
     ||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  25257829 ctagacttaggtggtttgagcatgtagagagaagacc 25257793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 327 - 471
Target Start/End: Original strand, 33709841 - 33709992
Alignment:
Q  327 gagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagac-----aagataggattaagaatgacaccatt--agagagagtgggggtagcacctatagt 419  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     | ||||||||||  |||| || ||||  ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  33709841 gagatgatgatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacatgataggataggattagaaatggcaacattagagagagagttggggtaacacctatagt 33709940  T
Q  420 agaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaaga 471  Q
    ||||||| |||| |||| |||  |||| |||||| | ||||| |||||||||    
T  33709941 agaaaagatggtggaaactaggtttaggtggtttaggcatgtggagagaaga 33709992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 335 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 44047700 - 44047553
Alignment:
Q  335 gatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggta 432  Q
    |||||||| ||| ||| |||||| || ||| |  ||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44047700 gatgttgcattgaatgcgtggtaggattaggcgggatagaattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaaggtggta 44047601  T
Q  433 gaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagat 480  Q
    |||  ||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  44047600 gaatctaggcttaggtggtttggacatgtagagttaagacctgtagat 44047553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 325 - 472
Target Start/End: Original strand, 50662309 - 50662457
Alignment:
Q  325 cggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 424  Q
    |||||| || ||||||| || ||||| |||||||||||| |  ||||||||||   ||||||| |||||||||||||  ||| | |||||||||||||||    
T  50662309 cggagacgaggatgttgtgtaggatgtgtggtaagactatatgagataggattggaaatgacagcattagagagagtttgggcaacacctatagtagaaa 50662408  T
Q  425 agttggtagaaaatagtcttagatgg-tttggacatgtagagagaagac 472  Q
    || |||| |||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  50662409 agatggtggaaagtaggcttaggtggttttgggcatgtagagagaagac 50662457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 553 - 668
Target Start/End: Original strand, 7947087 - 7947202
Alignment:
Q  553 attagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatc 652  Q
    ||||||||||  ||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||| |  ||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |    
T  7947087 attagagaaaccatttgaaaggatttagaggtcaatcagttggatccaaatttgatttatgatagaacactatcatgtaatttgatccatgtagccgacc 7947186  T
Q  653 ccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||| ||||||||    
T  7947187 ccacttagtgggataa 7947202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 330 - 473
Target Start/End: Original strand, 17900405 - 17900550
Alignment:
Q  330 atgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagaga--gagtgggggtagcacctatagtagaaaagt 427  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||  ||||  ||||||  |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||     
T  17900405 atgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgggataaaattagaaatgacgacattagagacggagttggggtagcacctatagtagaaaaga 17900504  T
Q  428 tggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
     |||||||| ||| || |  |||||||| || ||||||||||||||    
T  17900505 cggtagaaactagactcatgtggtttgggcacgtagagagaagacc 17900550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 327 - 462
Target Start/End: Original strand, 49987350 - 49987487
Alignment:
Q  327 gagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattaga--gagagtgggggtagcacctatagtagaaa 424  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||  | ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||  ||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  49987350 gagatgaggatgttgtgttgaatgtttagtaagactagacatgataggattagaaatgacaacattagatagagagtctgggtcacacctatagtagaaa 49987449  T
Q  425 agttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgta 462  Q
    || |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  49987450 agatggtggaaaataggcttaggtggtttggtcatgta 49987487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 574 - 668
Target Start/End: Original strand, 55007917 - 55008011
Alignment:
Q  574 gatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | |||||| |||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  55007917 gatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagatcattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 55008011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 366
Target Start/End: Original strand, 11389552 - 11389681
Alignment:
Q  237 ttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatga 336  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||| || | | |||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||  || | ||||||| ||    
T  11389552 ttttatcggacagttgtaagaccgacaatgttgtatggaaagtagtgttgggcggttaagaaccaactcgagaataaagtaagcgtagcagagatgagga 11389651  T
Q  337 tgttgcgttggatgagtggtaagactagac 366  Q
    |||||  ||||||| ||||||| |||||||    
T  11389652 tgttggattggatgtgtggtaaaactagac 11389681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 575 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 19154973 - 19154880
Alignment:
Q  575 atttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  19154973 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgttatttgatccatgcagctgaccccacttagtgggataa 19154880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 39755007 - 39754782
Alignment:
Q  52 gaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaatt 150  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| |||||| ||| ||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||     
T  39755007 gaggtgaaagttgaagatcatatcataccacaagtcacacactttaaatatcatgggtctatagtacaaaacgacaaagaaatagaaggagatgtaaatc 39754908  T
Q  151 atcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagc 250  Q
    || | || |||| |  |||||||||||| |  || | |||| ||||||| || |||  ||||| |||||||||| |||| |||   ||||||| |||| |    
T  39754907 attgaatccaagtttagtggttgaaatgaaccagtgcctcaagtgttttatgtgatgcgaaaataccacttaagttgaaggaattattttatcagacaac 39754808  T
Q  251 agtcagaccgacaatgttgtaaggta 276  Q
     ||  ||||||| |||||||| ||||    
T  39754807 ggtatgaccgacgatgttgtacggta 39754782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 393 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 35555939 - 35555859
Alignment:
Q  393 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  35555939 agagagagttcgggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatttagagagaagacc 35555859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 335 - 480
Target Start/End: Original strand, 41192764 - 41192913
Alignment:
Q  335 gatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt----agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttgg 430  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||  ||||  ||||||| | ||    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  41192764 gatgttgcgttggatgtgtggtatgattagacaggatacaattataaatgacagcgttagagagagagagttggggtagcacctacagtagaaaagatgg 41192863  T
Q  431 tagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagat 480  Q
    | |||| ||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  41192864 tggaaactagacttaggtgatttgtgcatgtagagagaagacctgtagat 41192913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 17667969 - 17667817
Alignment:
Q  45 taccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacccaagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatg 144  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |  |||||||||| |||||| |||| ||||||||||   ||||||| | ||| |||    
T  17667969 taccttagaggtgaaagttggatatcatatcatac--aagttatatagtttaaatatattgggttcatagtacaaaatgacttagaaataaacgcaaatg 17667872  T
Q  145 taaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtttt 199  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||  |||| ||||| |   |||||||||||    
T  17667871 taaatcatcgtattcaagttggatggtataaatagagaaaaacttcaggtgtttt 17667817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 52 - 138
Target Start/End: Original strand, 30807244 - 30807331
Alignment:
Q  52 gaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaag 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | | ||| ||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  30807244 gaggtgaaagttggagatcatatcataccacaagttacacggtttaaatgtttggagtctatagtacaaaatgactgagaaatagaag 30807331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 503 - 635
Target Start/End: Original strand, 50679604 - 50679736
Alignment:
Q  503 aaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaa 602  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  50679604 aaatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaa 50679703  T
Q  603 tatagtttttgatagaacactatgacgtcattt 635  Q
    | | |||| ||||| || |||||||||||||||    
T  50679704 tttggtttatgataaaatactatgacgtcattt 50679736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 473
Target Start/End: Original strand, 10208977 - 10209104
Alignment:
Q  344 ttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtct 443  Q
    ||||||| ||||||||||||||   ||||| ||||  ||||||| ||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||  ||    
T  10208977 ttggatgtgtggtaagactagatgggatagaattagaaatgacaacattagagag--ttggggtagaacctatagtagaaaagatggcagaaactaaact 10209074  T
Q  444 tagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    ||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  10209075 tagttggtttgggcatgtagcgagaagacc 10209104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 610 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 49939809 - 49939751
Alignment:
Q  610 tttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  49939809 tttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 49939751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 607 - 668
Target Start/End: Original strand, 44360290 - 44360351
Alignment:
Q  607 gtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  44360290 gtttttgatagaacactatgacgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttaataggataa 44360351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 325 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 20105833 - 20105761
Alignment:
Q  325 cggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagaga 397  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||||    
T  20105833 cggagatgatgatgttgcgatggatgtgtggtaagactagacgagatatgattagaaatgacaacattagaga 20105761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 556 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 28550584 - 28550472
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccca 655  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||  |||||   | |||||||| ||||||| || ||||    
T  28550584 agagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaaagctatgttataatttgatcaatgtagctgacccca 28550485  T
Q  656 cttaatgggataa 668  Q
    |||| ||||||||    
T  28550484 cttattgggataa 28550472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 556 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 31961395 - 31961283
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccca 655  Q
    ||||||| |||||| || ||| ||||| |||||||||||||   | | || ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||    
T  31961395 agagaaactattaggaaagatctagagataaatgagttggagaaagacatggttgttgatagaacactatgacgtcgtttgattcatgtagccgacctca 31961296  T
Q  656 cttaatgggataa 668  Q
    |||| ||||||||    
T  31961295 cttagtgggataa 31961283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 335 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 38571098 - 38570960
Alignment:
Q  335 gatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggta 432  Q
    ||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||   ||||||| |||| ||||||| |  |||| ||||||||||||| ||||| | ||     
T  38571098 gatgttgtgttggatgtgtggtac-actagacaagataggattggaaatgacaacatttgagagagagctggggaagcacctatagtacaaaagatagtg 38571000  T
Q  433 gaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    |||| ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  38570999 gaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagaaagaagac 38570960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 78 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 52280807 - 52280695
Alignment:
Q  78 acccaagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaat 177  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| | | |||||||| | |||||||  ||||||  ||||||| |||||||||| | || |||||||||||    
T  52280807 acccaggttacacgatttaaatattttgggtctaaagtacaaaataaaggagaaactgaagcaagtgtaaataatcgtattcacgttgtgtggttgaaat 52280708  T
Q  178 ggagaagagtctc 190  Q
    ||||||| |||||    
T  52280707 ggagaagggtctc 52280695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 393 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 42639312 - 42639233
Alignment:
Q  393 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| ||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42639312 agagagagttagggttgcacctatagtagaaaagatggtggaaaccaggcttaggtggtttggacatgtagagagaagac 42639233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 148
Target Start/End: Original strand, 42037510 - 42037604
Alignment:
Q  55 gtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaa 148  Q
    |||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||  |||||||| ||| |||||||||    
T  42037510 gtgaaatttgaagatcatatcatcccacaagttacacggtttaaatatcttgaatctatagtacaaaatgactgagaaatataaggagatgtaaa 42037604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 327 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 43070124 - 43070029
Alignment:
Q  327 gagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 424  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||  | | |||||| |||||||||||||    
T  43070124 gagatgatcatgttgggttggatgtgtggtaagattagacaggataggattagaaatgacaacattagagag--ttgaggtagcgcctatagtagaaa 43070029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 328 - 469
Target Start/End: Original strand, 45423542 - 45423681
Alignment:
Q  328 agatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagt 427  Q
    |||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||  ||||| ||||  ||||||| ||||| ||||  | | ||||||||||||| ||||||||     
T  45423542 agatgaggatgttgtgttggttgtgtggtaagactagacgggatagaattagaaatgacaacattatagag--ttgaggtagcacctataatagaaaaga 45423639  T
Q  428 tggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaa 469  Q
    ||||||||| | | ||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  45423640 tggtagaaacttgacttacgtggttttgacatgtagaaagaa 45423681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 600 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 883445 - 883388
Alignment:
Q  600 aaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccact 657  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  883445 aaatataatttttgatagaacactatgacatcatttaatccatgtagccgaccccact 883388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 575 - 668
Target Start/End: Original strand, 35690443 - 35690536
Alignment:
Q  575 atttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||  |  |||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  35690443 atttagaggttaatgagtttgatccaatcagggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 35690536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 45185542 - 45185477
Alignment:
Q  126 ggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctca 191  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||    
T  45185542 ggagaaatagaagcagatgtaaatcattgtattcaagcttagtggttgaaagggagaagagcctca 45185477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 473
Target Start/End: Original strand, 50471459 - 50471596
Alignment:
Q  336 atgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 435  Q
    |||||| ||||||||  || ||||||| |||   |||||||||   |||||| ||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||| |||| |||    
T  50471459 atgttgtgttggatgtttgctaagacttgacgtaataggattagagatgacaacattagagagactcggggtagcactaatagtagaaaagatggtggaa 50471558  T
Q  436 aatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    | |||  |||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  50471559 actaggtttaagtggtttgggcatgtagagagaagacc 50471596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 612 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 19062008 - 19061952
Alignment:
Q  612 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  19062008 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacctagtgggataa 19061952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 185
Target Start/End: Original strand, 20917630 - 20917762
Alignment:
Q  54 ggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattat 152  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   | |||||| || ||||  | |||||||||||| || |||||| | ||    
T  20917630 ggtgaaagttgaagatcatatcataccataagttacacagtttaaatatccgagctccatagtataaaacaacggagaaatagaaacatatgtaagtcat 20917729  T
Q  153 cgtattcaagctgggtggttgaaatggagaaga 185  Q
    || |||||| || | ||||| ||||||||||||    
T  20917730 cgaattcaatctagatggttaaaatggagaaga 20917762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 327 - 472
Target Start/End: Original strand, 44360006 - 44360155
Alignment:
Q  327 gagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattaga------gagagtgggggtagcacctatagta 420  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||| | |||||| ||||  |||||||  ||||||      |||||| |||||| |||||||||||    
T  44360006 gagatgat-atgttgtgttggatgtgtggtaggactaggcgagatagaattagaaatgacaatattagatggagagagagttggggtatcacctatagta 44360104  T
Q  421 gaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    |||||| ||||||||| |||  |||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  44360105 gaaaagatggtagaaactag-attaggttgtttgggcatgtagagagaagac 44360155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 212
Target Start/End: Original strand, 3273098 - 3273229
Alignment:
Q  81 caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatgga 180  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||   ||||||||||||| || ||||  |||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  3273098 caagttacacaatttaaacatcttaggtccatagtacaaaacgacaaagaaatagaagcaaatataaaccatcgaattcaagttggatggttgaaatgga 3273197  T
Q  181 gaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaa 212  Q
    || ||| ||||  |||||| || |||| ||||    
T  3273198 gatgagcctcatttgttttatgtgatacgaaa 3273229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 472
Target Start/End: Original strand, 28497480 - 28497558
Alignment:
Q  393 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  28497480 agagagagttggggtagcacctttagtagaaaagattgtggaaaa-aggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 28497558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 556 - 659
Target Start/End: Original strand, 31043225 - 31043328
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccca 655  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||  | | ||||||||| || ||| || ||||    
T  31043225 agagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttgtgatagaacactattgcataatttgatccttgcagctgacccca 31043324  T
Q  656 ctta 659  Q
    ||||    
T  31043325 ctta 31043328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 285 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 34233435 - 34233291
Alignment:
Q  285 tgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatg 384  Q
    ||||| || |||| |||||||| || |||  ||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||   ||||||||||  || |    
T  34233435 tgggcagtgaagaaccaacacgggaataagataagtgtagtggagatgatgatgttgtgttggatgtgtgataagactagatgtgataggattagaaacg 34233336  T
Q  385 acaccattag----agagagtgggggtagcacctatagtagaaaa 425  Q
    ||| ||||||    ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  34233335 acaacattagagatagagagttgggatagcacctatagtagaaaa 34233291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 668
Target Start/End: Original strand, 2589255 - 2589337
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||  | |||| ||| ||||||||    
T  2589255 aatgagttggatgaaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagctaaccccagttagtgggataa 2589337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 393
Target Start/End: Original strand, 18966475 - 18966541
Alignment:
Q  327 gagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatta 393  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||| |||||    
T  18966475 gagatgaagatgttgcgttggatgtgtggtaagattagacaaaataggattataaatgacaacatta 18966541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 410 - 472
Target Start/End: Original strand, 26356626 - 26356688
Alignment:
Q  410 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||||    
T  26356626 cacctatagtagaaaagatggtagaaaatagacttaggtggtttgggcacttagagagaagac 26356688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 473
Target Start/End: Original strand, 29398708 - 29398888
Alignment:
Q  294 aagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatta 393  Q
    |||| |||||| |||| |||| ||||| || ||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| ||||    || ||||||  |||||||  ||||    
T  29398708 aagaaccaacatgagaataaaataagtgtagcggagatgaggatgttgc-ttggatttgtggtaagattagatggaattggattacaaatgacaatatta 29398806  T
Q  394 gaga--gagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    | ||  |||| | | |||||||||| ||||||||| |||| |||||||  ||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  29398807 gggaaagagttgcgatagcacctatggtagaaaagatggtggaaaatatgcttatgtggtttgggcatgtagagagaagacc 29398888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 668
Target Start/End: Original strand, 31339707 - 31339789
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||| |||||| ||   |||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  31339707 aatgagttggatcgaaatatggtacatgatagaacattatgacgtcgtttggtccatgtatccgaccccacttagtgggataa 31339789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 327 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 31403380 - 31403276
Alignment:
Q  327 gagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagag------agagtgggggtagcacctatagta 420  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||| |||||  ||||||||||  ||||||| ||||||||      ||||| ||||||||||||||||||    
T  31403380 gagatgatgatgttgagttgaatgtgtggtgagattagacgggataggattagaaatgacaacattagagacagatagagttggggtagcacctatagta 31403281  T
Q  421 gaaaa 425  Q
    |||||    
T  31403280 gaaaa 31403276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 40933298 - 40933205
Alignment:
Q  285 tgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggatta 378  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||| ||||| || || |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| | ||| ||||| ||||    
T  40933298 tgggcggaaaagaaccaacacgagagtaaaataagtgtagcgtagatgaggatgttgcgttgaatgtgtggtaagacaatacatgatagaatta 40933205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 600 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 6958323 - 6958255
Alignment:
Q  600 aaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  6958323 aaatatggttttggatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccctacttagtgggataa 6958255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 26037904 - 26037836
Alignment:
Q  265 tgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatga 333  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||    
T  26037904 tgttgtatgatacggagtgttgggcggttaagagccaacacgagaatcaagtaagtggagcggagatga 26037836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 556 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 31897557 - 31897445
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccca 655  Q
    ||||||| |||||| || ||| ||||| |||||||||||||   | | || ||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| | | ||    
T  31897557 agagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatggttgttgatagaacactatgacgccgtttgattcatgtagccaacctca 31897458  T
Q  656 cttaatgggataa 668  Q
    |||| ||||||||    
T  31897457 cttagtgggataa 31897445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 609 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 32633482 - 32633426
Alignment:
Q  609 ttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggga 665  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||    
T  32633482 ttttgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccaaccccacttagtggga 32633426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 576 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 34208378 - 34208286
Alignment:
Q  576 tttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||  ||| ||| |||| ||||||||    
T  34208378 tttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgcaatttgatccatgtactcgaccccccttattgggataa 34208286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 36557321 - 36557246
Alignment:
Q  393 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaa 469  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  36557321 agagagagttggggcagcacccatagtagaaaagatggtagaaactagacttag-tggtttgggaatgtagagagaa 36557246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 413 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 42285972 - 42285912
Alignment:
Q  413 ctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  42285972 ctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtatagagaagacc 42285912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 472
Target Start/End: Original strand, 45175928 - 45176075
Alignment:
Q  325 cggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt-agagagagtgggggtagcacctatagtagaa 423  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||| ||||||  |||||||||||||  ||||  |||||||   || ||||||||| |||||||  ||||| ||||||    
T  45175928 cggagatgaggatgttgtcttggatgtgtggtagtactagacaagataatattagaaatgacaatgttaagagagagttggggtagtgcctattgtagaa 45176027  T
Q  424 aagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    ||| |  || ||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  45176028 aagattcta-aaaattggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 45176075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 576 - 668
Target Start/End: Original strand, 56225241 - 56225333
Alignment:
Q  576 tttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||| ||| | || |||| |||||| || ||| |||||||||||||| || ||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||    
T  56225241 tttagaggttaataaatttgatccaaatatggtattttatagaacactatgatgtaatttgatccatgtggtcgaccccacttagtgggataa 56225333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 581 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 20601756 - 20601669
Alignment:
Q  581 aggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||  ||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||| | || |||||||| ||||||||    
T  20601756 aggtcaatgagttggattcaaatatgatttatgatagaacattatgacgtaatttgattcatgtaactgaacccacttagtgggataa 20601669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 616 - 667
Target Start/End: Original strand, 32613643 - 32613694
Alignment:
Q  616 agaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggata 667  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  32613643 agaacattatgacgtcgtttgatccatgtagccaatcacacttaatgggata 32613694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 397 - 472
Target Start/End: Original strand, 46372018 - 46372093
Alignment:
Q  397 agagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||  | ||||||| ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  46372018 agagttggggtagcacctatagtcgaaaatattgtagaaactagacttaggtggtttgtgcatgtagagagaagac 46372093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 621 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 50238679 - 50238632
Alignment:
Q  621 actatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  50238679 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 50238632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 621 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 50238765 - 50238718
Alignment:
Q  621 actatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  50238765 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 50238718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 55769022 - 55768963
Alignment:
Q  43 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatat 101  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  55769022 tctaccttagaggtgaaagttgaagatcatgtcataccacaagtaacacggtttaaatat 55768963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 55833278 - 55833219
Alignment:
Q  43 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatat 101  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  55833278 tctaccttagaggtgaaagttgaagatcatgtcataccacaagtaacacggtttaaatat 55833219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 668
Target Start/End: Original strand, 25575007 - 25575089
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| | ||  || |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||    
T  25575007 aatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattgtggtgtaatttgatccatgtagcagaccccatttagtgggataa 25575089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 326 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 25967628 - 25967554
Alignment:
Q  326 ggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagag 400  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||  ||||||  ||||||||||||    
T  25967628 ggaggtgaggatgttgcgatggatgtgtggtaagactagacatggtaggattagaaatgactacattagagagag 25967554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 29209274 - 29209192
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||  |||||| || | ||||||| || |||| |||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  29209274 aatgagttggatagaaatatggtatatgatagagcattatggcgttgtttgatcaatgtagccgaccccacttaatgggataa 29209192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 30621496 - 30621418
Alignment:
Q  393 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaaga 471  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||| || ||||| || ||||||||||||    
T  30621496 agagggagttggggtagcacttatagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtgatttgggcacgtagagagaaga 30621418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 120
Target Start/End: Original strand, 30853053 - 30853131
Alignment:
Q  43 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaa 120  Q
    |||| ||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30853053 tctagcttagagttgaaatttggagaacatgtcataccacaagctacacagtttaaatatcttgggtccatagtacaaa 30853131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 299 - 373
Target Start/End: Original strand, 30853310 - 30853384
Alignment:
Q  299 ccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagatag 373  Q
    ||||||||||| |||| ||||   | ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  30853310 ccaacacgagaataaaataagcgcagcggagatgaagatgttgtgttggatgtatggtaagactagacaagatag 30853384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 140
Target Start/End: Original strand, 41427488 - 41427574
Alignment:
Q  55 gtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagca 140  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |  |||| |||| ||||| ||||||||| |||||    
T  41427488 gtgaaaattgaagatcatatcataccccaagttacacgacttaaatatcttgtgctcatagtacagaatgacggagaaatataagca 41427574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 934867 - 934648
Alignment:
Q  255 agaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtg 354  Q
    |||||| |||||||||| || |||| ||| | ||| || |||| | |||| ||||||||| ||||| ||  || ||||| | ||||||||||| || |||    
T  934867 agaccggcaatgttgtatgggacggggtgttaggcagtaaagaactaacatgagagtaaaataagtgtagtggggatgaggttgttgcgttggctgtgtg 934768  T
Q  355 gtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagaga--gtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtt 452  Q
    ||| ||||||  | ||||| ||||  ||||| |  ||||||||||  || |||||| |||||||  | |||||| ||||||||| |  |||||| |||||    
T  934767 gtatgactaggtatgatagaattagaaatgataatattagagagagggttggggtatcacctatcat-gaaaagatggtagaaactcatcttaggtggtt 934669  T
Q  453 tggacatgtagagagaagacc 473  Q
    ||| || |||||||| |||||    
T  934668 tgggcaagtagagaggagacc 934648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 394
Target Start/End: Original strand, 2588905 - 2588970
Alignment:
Q  329 gatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattag 394  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||  ||||||| ||||||    
T  2588905 gatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagaagggataggattagaaatgacaacattag 2588970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 607 - 668
Target Start/End: Original strand, 13262416 - 13262477
Alignment:
Q  607 gtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||| || |||||    
T  13262416 gtttttgatagaaaactatgacgtcgtttgattcatgtagccgactccacttagtgtgataa 13262477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 583 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 22873701 - 22873616
Alignment:
Q  583 gtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||| || |||||| | || |||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||    
T  22873701 gtaaatgagttggttccaaatatgggttatgatagaacattataacgtaatttaatccatgtagccaaccccatttagtgggataa 22873616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 473
Target Start/End: Original strand, 25755234 - 25755387
Alignment:
Q  322 taacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattag-agagagtgggggtagcacctatagta 420  Q
    |||| |||||||  |||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||   ||||| | || ||| | ||||| ||||||||||||||  ||    
T  25755234 taacagagatgagaatgttgtgttagatgtgtggtaagactagacatgatatgattggaaatgaaaacaatagaaaagagttggggtagcacctatctta 25755333  T
Q  421 gaaaag-ttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    ||||||   ||| |||||| | | ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  25755334 gaaaagaaaggtggaaaatcggcatagatggtttggacacgtagagcgaagacc 25755387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 555 - 668
Target Start/End: Original strand, 31459146 - 31459259
Alignment:
Q  555 tagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccc 654  Q
    |||| ||| |||||| || ||||||||| | |||||||||||||  ||||| || | |||| ||||| |||| ||  | |||||||||||| |||| |||    
T  31459146 tagaaaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatcccaatatggtgtgtgattgaacattatggcggaacttgatccatgtacccgacccc 31459245  T
Q  655 acttaatgggataa 668  Q
    ||||| ||||||||    
T  31459246 acttagtgggataa 31459259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 44667629 - 44667520
Alignment:
Q  300 caacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagaga 399  Q
    |||||||||| |||| |||| ||   ||||||||  ||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||  | |||||  ||||||||||    
T  44667629 caacacgagattaaaataagcattgaggagatgagaatgttgcgttggatatgcggtaatactagacaagatagtattagaagtgacaatattagagaga 44667530  T
Q  400 gtgggggtag 409  Q
    || |||||||    
T  44667529 gttggggtag 44667520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 44686954 - 44686845
Alignment:
Q  300 caacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagaga 399  Q
    |||||||||| |||| |||| ||   ||||||||  |||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||  | ||||| |||||||||||    
T  44686954 caacacgagattaaaataagcattgaggagatgagaatgttgtgttggatatgcggtaatactagacaagatagtattagaagtgacaacattagagaga 44686855  T
Q  400 gtgggggtag 409  Q
    || |||||||    
T  44686854 gttggggtag 44686845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 381 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 46715673 - 46715585
Alignment:
Q  381 aatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    ||||||| |||||||||||| | |   ||||||||| ||||||||| |||| |||| ||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  46715673 aatgacaacattagagagagagag---agcacctattgtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtgtgggcatgtagagagaagac 46715585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 667
Target Start/End: Original strand, 47372834 - 47372915
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggata 667  Q
    ||||||||||||  |||||| || | | |||||||| ||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  47372834 aatgagttggatagaaatatggtatattatagaacattatggagtcgtttgatccatgtagcccatcccacttagtgggata 47372915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 362 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 290118 - 290026
Alignment:
Q  362 tagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttg 454  Q
    ||||| |||||  ||||| ||||||| |||| |||||||| | ||| || ||||||| ||||||| || |||||| ||| |||||||||||||    
T  290118 tagacgagataaaattaaaaatgacaacattggagagagttgaggttgctcctatagaagaaaagatgatagaaattagacttagatggtttg 290026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 604 - 648
Target Start/End: Original strand, 3979121 - 3979165
Alignment:
Q  604 atagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagcc 648  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  3979121 atagtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagcc 3979165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 608 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 7066575 - 7066516
Alignment:
Q  608 tttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||||||    
T  7066575 tttttgatagaacactatg-cgtcatttgattcatgtagctgaccccatttagtgggataa 7066516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 556 - 664
Target Start/End: Original strand, 28351712 - 28351820
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccca 655  Q
    ||||||| |||||  || ||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||| |  ||||||  ||||   | ||||||||||||||||||| ||||    
T  28351712 agagaaactattacgaaagatttagagattattgagttggatccaaatatagtttatagtagaaccttatggaattatttgatccatgtagccgacccca 28351811  T
Q  656 cttaatggg 664  Q
    |||| ||||    
T  28351812 cttagtggg 28351820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 588 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 37042761 - 37042681
Alignment:
Q  588 tgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||  |||||  || |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  37042761 tgagttggatagaaatacggtatttgatagaacattatggtgtcgtttgatccatgtagccgacccgacttagtgggataa 37042681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 301 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 45185403 - 45185303
Alignment:
Q  301 aacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagag 400  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||| ||| |  || ||| |||||||| || |||||||||||  |||||| ||||  ||||||| ||||||||||||    
T  45185403 aacacgagaataaagtaagtgtagcggtgataagaatattgtgttggatgtgtagtaagactagatgagatagaattagaaatgacaacattagagagag 45185304  T
Q  401 t 401  Q
    |    
T  45185303 t 45185303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 417 - 473
Target Start/End: Original strand, 47611741 - 47611797
Alignment:
Q  417 agtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    |||||||||| || | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  47611741 agtagaaaagatgatggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacc 47611797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 393 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 55768793 - 55768717
Alignment:
Q  393 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaa 469  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||  |||| |||||| |||||||| ||||||    
T  55768793 agagatagtaggggtagcacctatagtagaaaagatcatggaaaataggtttaggtggtttagacatgtaaagagaa 55768717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 393 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 55833049 - 55832973
Alignment:
Q  393 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaa 469  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||  |||| |||||| |||||||| ||||||    
T  55833049 agagatagtaggggtagcacctatagtagaaaagatcatggaaaataggtttaggtggtttagacatgtaaagagaa 55832973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 633 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 8598948 - 8598913
Alignment:
Q  633 tttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8598948 tttgattcatgtagccgatcccacttaatgggataa 8598913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 8917938 - 8917815
Alignment:
Q  81 caagttacacggtttaaatatcttgggtccata-----atacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaa 175  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||      |||||||||||  |||||||| |||||||  ||||| ||||| |||||| ||| |  |||||    
T  8917938 caagttacacagtttaaatatattgggttcatttaattatacaaaatgacagagaaataaaagcagacataaatcatcgttttcaagttggataattgaa 8917839  T
Q  176 atggagaagagtctcaggtgtttt 199  Q
    || |||||||| |||| |||||||    
T  8917838 attgagaagagcctcaagtgtttt 8917815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 600 - 655
Target Start/End: Original strand, 12443292 - 12443347
Alignment:
Q  600 aaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccca 655  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  12443292 aaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgatccca 12443347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 557 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 26024978 - 26024867
Alignment:
Q  557 gagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccac 656  Q
    |||||| |||||  || ||| ||||| | ||||||||||||| | | || |||| |||||||||| ||||  || |||| |||||||||||||| | |||    
T  26024978 gagaaactattaagaaagatctagagattaatgagttggatcgagacatggtttatgatagaacattatggtgtaattttatccatgtagccgacctcac 26024879  T
Q  657 ttaatgggataa 668  Q
    ||| ||||||||    
T  26024878 ttagtgggataa 26024867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 41729549 - 41729494
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatcca 641  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  41729549 aatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtagtttgatcca 41729494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 382 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 1427589 - 1427496
Alignment:
Q  382 atgacaccattagagagagtgg--gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    |||||| |||||||||||| |   |||||| || ||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  1427589 atgacaacattagagagagagccagggtagaacatatagtagaaaacatggtggaaactaggcttagatggtttgagcatgtagagagaggacc 1427496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 403 - 469
Target Start/End: Original strand, 2588991 - 2589056
Alignment:
Q  403 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaa 469  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| | |||||||||||||    
T  2588991 ggggtagtacctatagt-gaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttaggcatgtagagagaa 2589056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 612 - 666
Target Start/End: Original strand, 8284348 - 8284402
Alignment:
Q  612 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggat 666  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  8284348 tgatagatcattatggcgtcatttgatccatatagccgatcctacttagtgggat 8284402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 610 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 8599016 - 8598958
Alignment:
Q  610 tttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  8599016 tttgatagaacattatggcgtcgtttgattcatgtagccgacgccacttagtgggataa 8598958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 618 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 15661939 - 15661889
Alignment:
Q  618 aacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15661939 aacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 15661889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 437 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 20821255 - 20821209
Alignment:
Q  437 atagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgcc 483  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20821255 ataggcttagatggtttaggcatgtagagagaagacctgtagatgcc 20821209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 359 - 425
Target Start/End: Original strand, 28467238 - 28467304
Alignment:
Q  359 gactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaa 425  Q
    ||||| ||| ||||||||||  ||||| ||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  28467238 gactaaacatgataggattacaaatgaaaccattaaagagagatgaggtagcacctatagtagaaaa 28467304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 335 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 51841543 - 51841505
Alignment:
Q  335 gatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagatag 373  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51841543 gatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaagatag 51841505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 591 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 25427956 - 25427879
Alignment:
Q  591 gttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||| | || | |||| |||||||| |  || |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  25427956 gttggatctaaatttggtctatgattgaacactacggtgtaatttgatccatgtaaccgaccccacttaatgagataa 25427879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 31897718 - 31897640
Alignment:
Q  393 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    ||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||| | |||||||  ||||||||||| |||||    
T  31897718 agagatagttggggtagcaccta--gtagaaaagatggtagaaactagacttgggtggtttgcgcatgtagagagcagacc 31897640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 612 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 40018262 - 40018205
Alignment:
Q  612 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataaa 669  Q
    |||||||||| || | |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  40018262 tgatagaacattacggcgtcgtttgatccatgtagccgaccccacttagtggaataaa 40018205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 403 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 49738886 - 49738809
Alignment:
Q  403 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagat 480  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | | ||||| || ||||  | |||| ||||||||||| |||||    
T  49738886 ggggtagcacctattgtagaaaagatggtagaaactcggcttaggtgatttgagcgtgtaaagagaagacccatagat 49738809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 49739203 - 49739114
Alignment:
Q  278 ggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagaca 367  Q
    |||||| |||||| | |||| |||||| ||||||||| ||||  ||  ||| |||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  49739203 ggagtgttgggcgataaagaaccaacaagagagtaaaataagcgtagtggaaatggggatgttgcgttagatgtgtggtaagactagaca 49739114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 607 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 50869958 - 50869897
Alignment:
Q  607 gtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||| ||| || |||||||| ||||||||    
T  50869958 gtttttggtagaacactatggcgtcgtttgattcatgcagctgaccccacttagtgggataa 50869897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 75)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 5258832 - 5258165
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  5258832 gtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagaagtg--ggtctaccttggaagtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacagtttaaatatc 5258735  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  5258734 ttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagctgatgtacatcatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcatgtgttttttg 5258635  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    |||| |||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  5258634 cgatgagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctatcggacaacagtcagaccggcaatgttgtatggtacggagtgttgggcggcgaagagccaa 5258535  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt----agagag 398  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    ||||||    
T  5258534 cacgagagcaaagtaagtgtagcggaggtgagaatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattatgaatgacaccgttagagagagag 5258435  T
Q  399 agtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggata 498  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||    
T  5258434 agtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagattccgttgtaagaagagta 5258335  T
Q  499 tatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatc 598  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||||||  || ||||       ||||| ||||||| |||||| | ||||||||||| |||||| | ||||    
T  5258334 gatcaaatggaggagagtcatgttaaaagaggtagagaaagacctaagaaaaccattcgagaaatcattagacaagatttagaggtcaatgagctagatc 5258235  T
Q  599 taaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
     |||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  5258234 caaatatggtttttgattaaacactatggcgtcatttgatccacgtagccgaccccacttagtgggataa 5258165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 645
Target Start/End: Original strand, 5631417 - 5632064
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  5631417 gtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagaagtg--ggtctaccttgcaggtgaaagttagagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatt 5631514  T
Q  103 tt-gggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgt 201  Q
    || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5631515 tttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaaatcatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcgggtgttttgt 5631614  T
Q  202 gcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagcca 301  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  5631615 gcgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaaattctatcggacaacagtcagaccgacaatgttgtatggtatggagtgttgggcggttaagagcca 5631714  T
Q  302 acacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt------aga 395  Q
    || |||||||||||||||| || || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||      |||    
T  5631715 acgcgagagtaaagtaagtgtagcgaagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagaccggatatgattaggaatgacaccattagagagaga 5631814  T
Q  396 gagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagg 495  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||      
T  5631815 gagagtgggggtaacacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccttcgtaagaata 5631914  T
Q  496 atatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttgg 595  Q
     || |||||||||||||||||| | |||||||||  | | ||| || |       ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5631915 gtagatcaaatggaggagagtcagattaaaagagacaaaggaagacttaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttgg 5632014  T
Q  596 atctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgta 645  Q
    ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5632015 atccaaatatggtttttgatataacactatgacgtcatttgatccatgta 5632064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Original strand, 9706376 - 9707035
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9706376 gtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagaagtg--ggtataccttggagatgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatc 9706473  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  9706474 ttgggtccatggtacaaaatgatggagaaatagaagcaggtgtaaatcatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcatcaggtgttttgtg 9706573  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| | || ||||||||| |||    
T  9706574 cgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctatcgaacagcagtcagaccggcaatgttgtatggtacgaagtgttaggtggttaagagtcaa 9706673  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt--agagagag 400  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  9706674 cacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcactggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 9706773  T
Q  401 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatata 500  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||      |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  || |    
T  9706774 tggaggtagcacctattgtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtt------tgtagagagaagacccatagaagccgttgttagaagagtaga 9706867  T
Q  501 tcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatcta 600  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||   |||   ||       |||||||| |||   |||| || ||||||||||| ||||||||||||| |    
T  9706868 tcaaatggagaagagtcaggttaaaagaggtacgggaagggctaagtaaaccattagataaaccgttaggaaggatttagaggttaatgagttggatcca 9706967  T
Q  601 aatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  9706968 aatatggtttttgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 9707035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 10100539 - 10100001
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10100539 gtatatggaatgtaactttagcaaaatgagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatc 10100442  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  10100441 ttgggtccatagtacaaaatgtcggagaaatagaagctgatataaatcatcgtattcaagctgggtggttggaatggagaagagcctcatgtgttttgtg 10100342  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
     |||||||||  |||||||||| |||||| || ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  10100341 agataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagtagtcagaccgacgatgttgtatggtacggagtgttgggaggttaagagccaa 10100242  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtg 402  Q
     |||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10100241 gacgagagtcaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgttagatgagtggtaagactagacaatatatgattagaaatgacaccattagagagagtg 10100142  T
Q  403 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatc 502  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  || |||    
T  10100141 ggggtcgcacatatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagactcgtagatgccgttgtaagaagagtagatc 10100042  T
Q  503 aaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacct 543  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||    
T  10100041 aaatgaaggagagtcagtttaaaagaggtagaggaagacct 10100001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 20428318 - 20427653
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||     
T  20428318 gtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagaatta--ggtctacctaggaggtgaaagttggagatcatatcataccacaagttacgcggtttaaatata 20428221  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    ||||||||| | ||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  20428220 ttgggtccacagtacaaaacgacggaaaaatagaagcagatgtaaatcatcgtatccaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcgggtgttttgtg 20428121  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||| ||  | |||||||||  |||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  20428120 cgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctattggacagcagtcaaactaaaaatgttgtatagtacagagtgttgggtggttaagagccaa 20428021  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagag--agag 400  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  20428020 cacgagagtcaaataagtgtagcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaggacaagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagag 20427921  T
Q  401 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatata 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  || |    
T  20427920 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgaacgtgtatagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtaaa 20427821  T
Q  501 tcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatcta 600  Q
    |||||| |||| ||||| ||||| ||||||| || ||| ||||       | ||||||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |    
T  20427820 tcaaatagaggggagtcaggttacaagaggttgaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaa-aatttagaggttaatgagttggatcca 20427722  T
Q  601 aatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataaa 669  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||| || ||||| ||| |||||||||| || ||||| |||||||||    
T  20427721 aatatggtttttaatagaatactatggcgacatttaatcaatgtagccgacccgacttagtgggataaa 20427653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 151 - 668
Target Start/End: Original strand, 607905 - 608426
Alignment:
Q  151 atcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagc 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  607905 atcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagacatgaccacttaaactgaaagaaaagttctatcggacagc 608004  T
Q  251 agtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatg 350  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||    
T  608005 agtcagaccggcaatgttgtattgtacggagtgttgggcggttaagagccaacacgagaataaagtaagtgtagcggagatgaggatgttccgttggatg 608104  T
Q  351 agtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatgg 450  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  608105 agtggtaagactagataggataggattaggaatgacaccattagagagagtgagggtatcacctatagtagaaaagttgatagaaaataggcttagatgg 608204  T
Q  451 tttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacc----tnnn 546  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||  |  |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||    |       
T  608205 tttggacatgtagagagaagacctgtagatgcctttgtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcagattaaaagaggttgatgaagacctaattaag 608304  T
Q  547 nnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtag 646  Q
        | ||| ||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  608305 aaaactattcgagaaaccattagaaaagatttagagttcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaatactatgacgtcatttgatccatgtag 608404  T
Q  647 ccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||| || ||||| ||||||||    
T  608405 ccgaccctacttagtgggataa 608426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 240 - 668
Target Start/End: Original strand, 30031091 - 30031521
Alignment:
Q  240 tatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 339  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||| ||| || ||||||||| | |||    
T  30031091 tatcggacagcagtcagaccaatgatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagccaacatgagaatcaagttagtgtagcggagatgaggttgt 30031190  T
Q  340 tgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagag--agtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa 437  Q
    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30031191 tgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggattagaaatgtcaccattagagagggagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa 30031290  T
Q  438 tagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatga 537  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |     
T  30031291 taggcttagatgagttggacatgtagagagaagacccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggg 30031390  T
Q  538 aaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttga 637  Q
    | ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  30031391 agacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatttaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttga 30031490  T
Q  638 tccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  30031491 tccatgtagccgacctcacttagtgggataa 30031521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 157 - 669
Target Start/End: Original strand, 14030558 - 14031061
Alignment:
Q  157 ttcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcag 256  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  || ||| ||||||||| ||||||     
T  14030558 ttcaaactgggtggttgaaatggagaatagtctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagctgaaatgaaagttctatcggacaacagtcaa 14030657  T
Q  257 accgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtgg- 355  Q
    ||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||| |||||||||||     
T  14030658 actagcaatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaaaagtcaacacgagagtaaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgatggatgagtggt 14030757  T
Q  356 taagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagag--agtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggttt 453  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  14030758 taagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagatagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagataataggcttaaatggttt 14030857  T
Q  454 ggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnncca 553  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| |||||||||| |||||  || ||||||| | |||||||| | |||||||||||||| ||| ||||              
T  14030858 ggacatgtatagagaagacatgtaaatgccgttgtaagaagagtagatcaaatagtggagagtcggattaaaagaggtagaggaagaccta--------- 14030948  T
Q  554 ttagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcc 653  Q
      ||| |||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||| ||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||| ||    
T  14030949 --aga-aaaacattagaaaagatttagaggtcaatgggttagatccaaatatgatttttgatagaatactataacgtcatttgatccatataaccgaccc 14031045  T
Q  654 cacttaatgggataaa 669  Q
     | ||| |||||||||    
T  14031046 tatttagtgggataaa 14031061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 273 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 35043855 - 35043466
Alignment:
Q  273 ggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagata 372  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  35043855 ggtacggagtgttggacggttaagagccaacatgagagtcaagtaagtgtagcggagatgaagatgttgcgctggatgattggtaagattagacatgata 35043756  T
Q  373 ggattaagaatgacaccattagag--agagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaag 470  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  35043755 ggattatgaatgacaccattagagggagagtgagggtagtacctaaagtagaaaagttggttgaaaataggcttagattgtttggacatgtagagagaat 35043656  T
Q  471 acccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattaga 570  Q
    |||||||||||||||||| ||||   || |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||       ||||||||||||  ||||||    
T  35043655 acccgtagatgccgttgtaagaaaagtagatcaaatggacgagagtcaggttaaaagaagtagatgaagacctaagaaaaccattagagaaaccattaga 35043556  T
Q  571 aatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaa 660  Q
    || ||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  35043555 aaggatttagaggtcaatgtgttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatcaatgtagctgatcccacttaa 35043466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 226 - 668
Target Start/End: Original strand, 28085197 - 28085641
Alignment:
Q  226 tgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataac 325  Q
    |||||| || ||| |||||||||||||||||||||    || |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||| | |||||||| || |    
T  28085197 tgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggtgttgctgtatggtacggagtgttgggcggctaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagc 28085296  T
Q  326 ggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt--agagagagtgggggtagcacctatagtagaa 423  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28085297 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattacgaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaa 28085396  T
Q  424 aagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggtta 523  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   || || |||||  || ||||||||||| ||||||  ||||    
T  28085397 aagttggtagaaaataggcttagatggtttggccatgtagagagaagacccgtaaataaagtggtaagaagagtagatcaaatggagtagagtcaagtta 28085496  T
Q  524 aaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacact 623  Q
    ||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||    
T  28085497 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 28085596  T
Q  624 atgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  28085597 atggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 28085641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 327 - 664
Target Start/End: Original strand, 32755841 - 32756182
Alignment:
Q  327 gagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagag----agagtgggggtagcacctatagtaga 422  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  32755841 gagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataatattaggaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatagtaga 32755940  T
Q  423 aaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggtt 522  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||  | |||||  || ||||||||||||||||||  |||    
T  32755941 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagggaagacccgaagatgtcgtaataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtt 32756040  T
Q  523 aaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacac 622  Q
    ||||||||||||  || ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | || | |||||||||||    
T  32756041 aaaagaggtagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 32756140  T
Q  623 tatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggg 664  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32756141 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggg 32756182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 63 - 534
Target Start/End: Original strand, 2689313 - 2689771
Alignment:
Q  63 tggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaa 161  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  2689313 tggagatcatatcataccctaagttacacggtttaaatattttgggtctatagtacaaaacgacggagaaatagaatcagatgtaaatcatcgtagtcaa 2689412  T
Q  162 gctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccga 261  Q
    ||||| || |||||||||||||| | |||| || ||||||| |||||||||  || ||||||| |||||| || |||  ||||||||||||||||||||     
T  2689413 gctggatgattgaaatggagaagtgcctcatgtattttgtgtgataagaaagcactacttaagttgaaaggaaagttcaatcggacagcagtcagaccgt 2689512  T
Q  262 caatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagac 361  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| | |||||| | ||  |||||||| ||||||| | ||||||||  |||||||    
T  2689513 cgatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaacagccaacgcgagaattaagtaaatgtagtggagatgaggatgttgtgatggatgagcagtaagac 2689612  T
Q  362 tagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgt 461  Q
    || | | |||||||||| ||||||||||||              || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||  |||||    
T  2689613 taaataggataggattaggaatgacaccat--------------gttgcacctatagttgaaaagtttgtagaaaataggcttagatgatttgagcatgt 2689698  T
Q  462 agagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtaga 534  Q
    |||||||||||  |||||||||||  | |||||  || |||| || ||| ||||||  || ||||||||||||    
T  2689699 agagagaagacatgtagatgccgtcataagaagagtagatcagatagagtagagtcatgtcaaaagaggtaga 2689771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 351 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 21352171 - 21351872
Alignment:
Q  351 agtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatgg 450  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  21352171 agtggtaagactagatatgataggattaggaataacatcgttagagagagtggaggtagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagatga 21352072  T
Q  451 tttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnn 550  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||           
T  21352071 tttggacatgtagagagaagacctgtcgatgccattgttagaagaatagaacaaatggagaagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaa 21351972  T
Q  551 ccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccga 650  Q
    ||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  21351971 ccaatagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatatgatttttgatagaacactatgacgttaattgatccatgtagccga 21351872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Original strand, 33495807 - 33496194
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacccaagttacacggtttaaatatct 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||         ||||    
T  33495807 gtatatggaatgtaacttcatcaaaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcataccctagttacac---------atct 33495895  T
Q  104 tgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgc 203  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  33495896 tgggtccatagtacaaaataacggagaaatagaagcatatgtaactcatcatattcaagctggatggttgaaatggagaagagtctcagatgttttgtgt 33495995  T
Q  204 gataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaac 303  Q
    |||||||||  ||||||||||             ||||  ||||| ||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| | |||||    
T  33495996 gataagaaagtaccacttaag-------------tttaaaggacaacagtcagacctgcaatgttgtatggtacagagtgttggacggttaaaaaccaac 33496082  T
Q  304 acgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt--agagagagt 401  Q
    | |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || | | |||| |||||  ||||||||||||  ||||| |||    
T  33496083 atgagaatcaagtaagtgtaacggagatgatgatgttgcattggatgaatggtaagattaaataggataagattagaaatgacaccattacagagatagt 33496182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 128 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 6056329 - 6056032
Alignment:
Q  128 agaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctg 227  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||| ||||||||||||| | || ||||| ||    
T  6056329 agaaatagaagcatatgtaaaatatcgtaggcaagttgggtggttgaaatgtagaagagcttcaagtgttttatgcgataagaaaatatcatttaagttg 6056230  T
Q  228 aaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacgg 327  Q
    |||| |   || ||||||||| | ||||||||||||||||| || | ||||||||| |||| |||||||| ||||||||| | | |||||||  ||   |    
T  6056229 aaaggataattctatcggacaacggtcagaccgacaatgttatatgatacggagtgttgggtggttaagaaccaacacgaaaatcaagtaagcgtagtag 6056130  T
Q  328 agatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaa 425  Q
    | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  6056129 aaatgcggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaa 6056032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 380 - 668
Target Start/End: Original strand, 12890559 - 12890840
Alignment:
Q  380 gaatgacaccattag--agagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgta 477  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||         |||| ||    
T  12890559 gaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttacatggtttgggcatgt---------acccata 12890649  T
Q  478 gatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatt 577  Q
    |||||||| || |||||  || |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||       | || |||||||  |||||||| ||||    
T  12890650 gatgccgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtaaggtcaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatt 12890749  T
Q  578 tagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||| || |||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  12890750 tagacgtcaatgagttagatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 12890840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 71 - 472
Target Start/End: Original strand, 26291444 - 26291848
Alignment:
Q  71 atatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtg 169  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | |||| | |||||||||| ||| ||    
T  26291444 atatcataccctaagttacaccgtttaaatatcttgagtccatagtagaaaatgatggagaaatagaagcatacgcaaatcaacgtattcaagttggatg 26291543  T
Q  170 gttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttg 269  Q
    ||||||||| |||| |  |||| || |||| || |||||||||  ||   ||||| || ||| ||  || ||||| ||| |  ||| ||  |||||||||    
T  26291544 gttgaaatgtagaataacctcatgtattttatgtgataagaaagcacatgttaagttggaagtaaaattatatcgaacaactatcatactaacaatgttg 26291643  T
Q  270 taaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaag 369  Q
    || ||||||||||| | |||| | || | |||||| |||| |||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||  |    
T  26291644 tatggtacggagtgttaggcgttgaaaa-ccaacatgagaataaagtaagtgtaattgagatgatgatgttgtgttgaatgtgtggtaagtctagacttg 26291742  T
Q  370 ataggattaagaatgacaccattagaga----gagtgggggtag-cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtaga 464  Q
    |||| |||| |||||| || ||||||||    ||||  |||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||    
T  26291743 atagtattaggaatgatactattagagatagagagttagggtagacacctataatagaaaatatggtagaaaatagacttaggtggtttg--catgtaga 26291840  T
Q  465 gagaagac 472  Q
    ||||||||    
T  26291841 gagaagac 26291848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 325 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 9594074 - 9593874
Alignment:
Q  325 cggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagaga--------gagtgggggtagcacctat 416  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||        |||| |||||||||||  |    
T  9594074 cggagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacgggataggattaggaatgacaccattagagagagagagggagttggggtagcaccatt 9593975  T
Q  417 agtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagt 516  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || |||||  || |||| ||||||||||||    
T  9593974 agtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagatgctgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagt 9593875  T
Q  517 c 517  Q
    |    
T  9593874 c 9593874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 264 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 28027248 - 28026969
Alignment:
Q  264 atgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagacta 363  Q
    |||||||| |||| |||||| |||| |||||||| |||||| |||| | ||||||| ||| | |||| || ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  28027248 atgttgtatggtatggagtgttgggaggttaagaaccaacatgagaatcaagtaagcatagcagagacgaggatgttatgttggatgagtggtaagacta 28027149  T
Q  364 gacaagataggattaagaatgacaccattagagagag-tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgta 462  Q
    ||    ||||||||| |||||||  | ||||| ||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  28027148 gatggcataggattaggaatgacgtcgttagatagagaatggggtagcacctatagtagaaaatgtggtagaaaataggctt-ggtggtttggacatgta 28027050  T
Q  463 gagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacct 543  Q
    |||| || ||| |||||||| || ||  ||||  ||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||| ||| ||||    
T  28027049 gagataacacctgtagatgcggtagtacgaagagtatatcagatggaggagagtcagattagaagaggtagaggaagacct 28026969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 414 - 668
Target Start/End: Original strand, 30679417 - 30679661
Alignment:
Q  414 tatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggag 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||   || ||||||||||| ||    
T  30679417 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagaggagacccgtagatgtcgtcgtaagaatagtagatcaaatggagtag 30679516  T
Q  514 agtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttg 613  Q
    ||||  |||| |||||||| | ||| |          | ||||||||||  |||| ||| |||||||| || ||| ||||||||| ||||   || | ||    
T  30679517 agtcaagttataagaggtataggaaga----------ctattagagaaaccattaaaaaggatttagaagtcaataagttggatccaaattcggtctatg 30679606  T
Q  614 atagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30679607 atagaacattataacgtcatttgatctatgtagccgatcccacttaatgggataa 30679661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 695 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 432550 - 432441
Alignment:
Q  695 gcattcattcatcttcactctattttattttcaccacacacaaatacaaatattcaagtaaaaactcaattttgtcattcagaattttttcacagttcaa 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||| || ||||||||    
T  432550 gcattcattcatcttcactctattt-attttcaccacacacaaacacaaatattaaagtaaaaactcaatttcgtccttcacaattttctcgcagttcaa 432452  T
Q  795 tttagtctttt 805  Q
    |||||||||||    
T  432451 tttagtctttt 432441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 468 - 646
Target Start/End: Original strand, 5080905 - 5081083
Alignment:
Q  468 aagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattatt 567  Q
    ||||||||||||||| || || |||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||       | ||||||||||| |||    
T  5080905 aagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtctcgttaaaagagatagatgaagacctaggaaaactattagagaaatcatt 5081004  T
Q  568 agaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtag 646  Q
      |||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5081005 caaaattatttagaggtcaatgagttggatacaaatatgatttatgatagaacactataacgtcatttgatccatgtag 5081083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 566 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 3206578 - 3206476
Alignment:
Q  566 ttagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggga 665  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  3206578 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttaatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggga 3206479  T
Q  666 taa 668  Q
    |||    
T  3206478 taa 3206476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 149 - 320
Target Start/End: Original strand, 30679218 - 30679389
Alignment:
Q  149 ttatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggaca 248  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||| |||||| || ||| |||| ||||    
T  30679218 ttatcgtattcaagttgggtggttgaaatagagaagaggctcaggtgttttgagcgataagaaagtaccacataagttgaaaggaaagttctatcagaca 30679317  T
Q  249 gcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagt 320  Q
     ||||||||||||| |||||||| ||| |  | || ||| | |||||||  |||||||||| | ||||||||    
T  30679318 acagtcagaccgacgatgttgtatggtgcataatgttggacagttaagaatcaacacgagaatcaagtaagt 30679389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 199
Target Start/End: Original strand, 27790754 - 27790950
Alignment:
Q  2 gggtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatac-ccaagttacacggtttaaata 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   | |||||| |||||||||| || |||| |||||  |||| |||| ||||| ||||||||||    
T  27790754 gggtatatggagtgtaacttcaacaaaaggataagta--gttctaccatggaggtgaaggtgggaggtcataaaatactccaaattacatggtttaaata 27790851  T
Q  101 tcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtttt 199  Q
    |||||| |||||| |||||||||| | | |||||||||||  | ||||| ||| || | ||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  27790852 tcttggatccatagtacaaaatgacgcataaatagaagcaagtctaaatcatcataataaagttgagtggttgaaatagagaagagcctcaagtgtttt 27790950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 142 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 2065302 - 2065018
Alignment:
Q  142 atgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcagg-tgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggtttt 240  Q
    |||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||  || |||||| |  |||||||||  ||  |||||| |||||| ||  || |    
T  2065302 atgtaaatcatcgtattcaagatgtgttgttgaaatggaaaagagactttgggtgttttatttgataagaaagtacatcttaagttgaaaggaaacttct 2065203  T
Q  241 atcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgtt 340  Q
    |||||||| | || | || | | |||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| || || ||||||||| |||| |    
T  2065202 atcggacaaccgtaaaactggcgatgttgtatggtacggaatgttggacggttaagagccaacacgagaatcaagtacgtgtagcggagatgaggatgct 2065103  T
Q  341 gcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt------agagagagtgggggtagcacctatagt 419  Q
     |  |||||||| |||||||||| | | ||||||||||  ||||||||||||      |||||||||||||| ||||||||||||    
T  2065102 accctggatgagcggtaagactacatatgataggattagtaatgacaccattagaaaaagagagagtgggggaagcacctatagt 2065018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 326 - 436
Target Start/End: Original strand, 5080776 - 5080888
Alignment:
Q  326 ggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagaga--gagtgggggtagcacctatagtagaa 423  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5080776 ggagatgaggatgttgcgctggataactggtaagattagacataataagattaggaatgacaccattagagaacgagtgggggtatcacctatagtagaa 5080875  T
Q  424 aagttggtagaaa 436  Q
    |||||||||||||    
T  5080876 aagttggtagaaa 5080888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 553 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 34143897 - 34143782
Alignment:
Q  553 attagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatc 652  Q
    ||||||||||  |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  34143897 attagagaaaccattacaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagtcgacc 34143798  T
Q  653 ccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||| ||||||||    
T  34143797 ccacttattgggataa 34143782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 553 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 34156513 - 34156398
Alignment:
Q  553 attagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatc 652  Q
    ||||||||||  |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  34156513 attagagaaaccattacaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagtcgacc 34156414  T
Q  653 ccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||| ||||||||    
T  34156413 ccacttattgggataa 34156398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 556 - 668
Target Start/End: Original strand, 5095987 - 5096099
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccca 655  Q
    ||||||| | |||| || ||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  5095987 agagaaactcttaggaaagatttagtggttaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatctatgtagccgatccca 5096086  T
Q  656 cttaatgggataa 668  Q
    |||| ||||||||    
T  5096087 cttagtgggataa 5096099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 576 - 668
Target Start/End: Original strand, 31819004 - 31819096
Alignment:
Q  576 tttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  31819004 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 31819096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 330 - 473
Target Start/End: Original strand, 33083983 - 33084128
Alignment:
Q  330 atgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt--agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagt 427  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||   ||||| ||||  ||||||   |||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  33083983 atgaggatgctgcgttggatgtgtggtaagactagatgggatagaattagaaatgacgatattagagagagagttggggtagcacctatggtagaaaaga 33084082  T
Q  428 tggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  33084083 tggtagaaactagacttaggtggtttgggaatgtagagagaagacc 33084128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 405 - 642
Target Start/End: Original strand, 33496963 - 33497198
Alignment:
Q  405 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa-tagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatca 503  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || || || |||||   | ||||    
T  33496963 ggtagcacctatggtagaaaagttagtagaaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaaga-ccgtaaacgctgtcgtaagaagagaagatca 33497061  T
Q  504 aatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaat 603  Q
    |||| ||  |||||  ||||||||||||||| | | | ||       | ||||||||||   ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  33497062 aatgaag--gagtcaagttaaaagaggtagagggagatctagaaaaactattagagaaacctttagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaat 33497159  T
Q  604 atagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccat 642  Q
    ||  ||| ||||| ||||||||  ||| |||||||||||    
T  33497160 atgatttatgatataacactatagcgtaatttgatccat 33497198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 574 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 34934941 - 34934847
Alignment:
Q  574 gatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  34934941 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcctcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 34934847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 607 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 30789152 - 30789091
Alignment:
Q  607 gtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  30789152 gtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcctacttagtgggataa 30789091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 452 - 580
Target Start/End: Original strand, 7133795 - 7133923
Alignment:
Q  452 ttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnc 551  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||  || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       |    
T  7133795 ttgggcatgtagagagaagacccgaagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagaaaaac 7133894  T
Q  552 cattagagaaattattagaaatgatttag 580  Q
     ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  7133895 tattagagaaaccattagaaatgatttag 7133923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 452 - 580
Target Start/End: Original strand, 7136718 - 7136846
Alignment:
Q  452 ttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnc 551  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||  || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       |    
T  7136718 ttgggcatgtagagagaagacccgaagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagaaaaac 7136817  T
Q  552 cattagagaaattattagaaatgatttag 580  Q
     ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  7136818 tattagagaaaccattagaaatgatttag 7136846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 554 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 10099025 - 10098913
Alignment:
Q  554 ttagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcc 653  Q
    |||||||||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||| ||    
T  10099025 ttagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatttaaatatggtgtatgatagaacacta--acgtcatttgatccatgtaatcgaccc 10098928  T
Q  654 cacttaatgggataa 668  Q
    |||||| ||||||||    
T  10098927 cacttagtgggataa 10098913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 411 - 480
Target Start/End: Original strand, 24665818 - 24665887
Alignment:
Q  411 acctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagat 480  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24665818 acctatagtagaaaatatggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctgtagat 24665887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 335 - 472
Target Start/End: Original strand, 9568590 - 9568731
Alignment:
Q  335 gatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagag----agagtgggggtagcacctatagtagaaaagttgg 430  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||| ||||||||    || || | |||||||| ||||||||||||| ||     
T  9568590 gatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacatgatagaattataaatgacaacattagagcgccagtgttgaggtagcacttatagtagaaaagatga 9568689  T
Q  431 tagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    | |||||| | |||||||||||||| ||  ||||| ||||||    
T  9568690 tggaaaatggacttagatggtttgggcaactagagggaagac 9568731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 113
Target Start/End: Original strand, 3632653 - 3632724
Alignment:
Q  43 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccata 113  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  3632653 tctacctttgaggtgaaagttggagatcatatcataccctaaattacacgatttaaatatcttggatccata 3632724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 564 - 668
Target Start/End: Original strand, 5897618 - 5897722
Alignment:
Q  564 tattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgg 663  Q
    ||||||||| ||||||||  | |||| |||||||| |||||| || | || ||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  5897618 tattagaaaagatttagatattaatgtgttggatcaaaatatggtatatggtagaatattatgacgtaatttgatccatgtagcggatcccacttagtgg 5897717  T
Q  664 gataa 668  Q
    |||||    
T  5897718 gataa 5897722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 556 - 659
Target Start/End: Original strand, 31818684 - 31818787
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccca 655  Q
    ||||||| |||||| || | ||| ||| | ||||||||||||| || ||| |||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  31818684 agagaaactattaggaaaggtttggagattaatgagttggatcaaagtatggtttatgatagaacattatgtcgtaatttgatccatgtagccgacccca 31818783  T
Q  656 ctta 659  Q
    ||||    
T  31818784 ctta 31818787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 586 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 34604 - 34522
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  34604 aatgagttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataa 34522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 612 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 1615296 - 1615240
Alignment:
Q  612 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||    
T  1615296 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgacctcatttagtgggataa 1615240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 352 - 466
Target Start/End: Original strand, 8364523 - 8364635
Alignment:
Q  352 gtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggt 451  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||  |||||||  |||||| ||  | || |||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||    
T  8364523 gtggtaagactagatgggataggattagaaatgacaatattagacag--ttggagtagcaactatagtagaaaaggtggttgaaaataggcttaggtggt 8364620  T
Q  452 ttggacatgtagaga 466  Q
    |||| ||||||||||    
T  8364621 ttgggcatgtagaga 8364635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 14389462 - 14389380
Alignment:
Q  390 attagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14389462 attagagagagttgaggtagcacctatcgtagaaaagatggtggaaacaaa-cttaggtggtttggacatgtagagagaagacc 14389380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 575 - 650
Target Start/End: Original strand, 24665983 - 24666058
Alignment:
Q  575 atttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccga 650  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||| | ||||||||  |||||||||    
T  24665983 atttagaggtcaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatgacttaatttgatctgtgtagccga 24666058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 612 - 670
Target Start/End: Original strand, 586059 - 586117
Alignment:
Q  612 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataaac 670  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  586059 tgatagaacattatgacgtcatttgattcatggagccgacctcacttaatgggataaac 586117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 556 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 6055900 - 6055806
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccga 650  Q
    ||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| | | |||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||    
T  6055900 agagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgtaatttgatgcatgtagccga 6055806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 591 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 4245966 - 4245889
Alignment:
Q  591 gttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||  |||||| || |||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  4245966 gttggataaaaatatggtatttgatagaacattatgacatcgtttgatccaagtagccgaccccacttagtgggataa 4245889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 608 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 12119720 - 12119659
Alignment:
Q  608 tttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccga-tcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  12119720 tttttaatagaacattatgacgtcatttgatccatgtagccgacccccacttagtgggataa 12119659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 327 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 33998364 - 33998291
Alignment:
Q  327 gagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagag 400  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||  ||||||  ||||||||||||    
T  33998364 gagatgaagatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgtgataggattagaaatgactacattagagagag 33998291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 21870473 - 21870303
Alignment:
Q  279 gagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggatta 378  Q
    ||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||| | ||| ||  |||||| |  ||||||| |||||    ||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  21870473 gagtgttggtcggttcagaaccaacacgagagtaaaattagtttagaggagattagaatgttgcattgga----tggtatgactagacatgatagaatta 21870378  T
Q  379 agaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttgg 455  Q
      |||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | | ||||| ||||||||    
T  21870377 gaaatgtcaatatt--agagagttggggtagcacctgtagtagaaaagatggtagaaactcggcttaggtggtttgg 21870303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 575 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 1748055 - 1747984
Alignment:
Q  575 atttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtag 646  Q
    |||||||| | ||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  1748055 atttagagattaatgagttggatagaaatatagtatatgatagaacattacgacgtcgtttgatccatgtag 1747984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 348 - 440
Target Start/End: Original strand, 5095816 - 5095910
Alignment:
Q  348 atgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 440  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||  |||||||| |||||  ||| || |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  5095816 atgagtggtaagactggaagggataggattaggaatgactacattagagggagtgttgggatatcacctatagtagaatagatggtagaaaatag 5095910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 613 - 668
Target Start/End: Original strand, 21886314 - 21886369
Alignment:
Q  613 gatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||    
T  21886314 gatagaacacaatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccatttagtggtataa 21886369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 74
Target Start/End: Original strand, 30670488 - 30670556
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatat 74  Q
    |||||| ||||||| ||| | |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30670488 gtatatagaatgtatctttagcaaaaggagaagta--ggtataccttggaggtgaaagttggagatcatat 30670556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 327 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 7150678 - 7150604
Alignment:
Q  327 gagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagt 401  Q
    |||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||| || | |||||||||||||    
T  7150678 gagatgctaatgttgctttggatgtgtggtaagactagacgagataggatttggaacgaaaacattagagagagt 7150604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 604 - 650
Target Start/End: Original strand, 10453264 - 10453310
Alignment:
Q  604 atagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccga 650  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  10453264 atagtttttgatagaacactatggcgtcttttgattcatgtagccga 10453310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 6642013 - 6641916
Alignment:
Q  84 gttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggag 181  Q
    ||||||| ||||||  ||||| || | ||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||  || | ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  6642013 gttacacagtttaagcatcttagggctatagtacaaaatgagagagaaatagaaggagatgtaaaccattgaattaaagttgggtggttgaaatggag 6641916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 389 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 7513687 - 7513607
Alignment:
Q  389 cattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaa 469  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||| ||||||||  ||| ||||| |||||||| |||| | ||||||    
T  7513687 cattagagagagttcggggagcacctataatagaaaagatggtagaacctagacttaggtggtttgggcatgcaaagagaa 7513607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 339 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 10617574 - 10617444
Alignment:
Q  339 ttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 438  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| ||||  |||||||  |   | |||||| |||||||||| |||||||||||||   ||||||| |    
T  10617574 ttgcgttggatgtgtgttaagactagacgaaatagaattagaaatgacaaga---gcgagagttggggtagcacttatagtagaaaag-acgtagaaact 10617479  T
Q  439 agtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    || ||||| |||||||  |||||||| ||||||||    
T  10617478 agacttaggtggtttgagcatgtagaaagaagacc 10617444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 471
Target Start/End: Original strand, 2079341 - 2079408
Alignment:
Q  404 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaaga 471  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||  |||||| |  ||||||||||||||    
T  2079341 gggtagcatctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaagtggtttaggtatgtagagagaaga 2079408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 565 - 668
Target Start/End: Original strand, 7492551 - 7492654
Alignment:
Q  565 attagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggg 664  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||  ||||||||| |||  ||| |||||  ||| |||||||| |||||||| ||||    
T  7492551 attaggaaagatttagaggttaatgagttttatccaaatatggtttcggatagaacattatagcgttatttgtaccaagtagccgaccccacttagtggg 7492650  T
Q  665 ataa 668  Q
    ||||    
T  7492651 ataa 7492654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 667
Target Start/End: Original strand, 9568884 - 9568962
Alignment:
Q  588 tgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggata 667  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  9568884 tgagttggatccaaatatggtttatgatagaccgttatggcgtaatttgatccatatagcc-aacccacttaatgggata 9568962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 12134287 - 12134141
Alignment:
Q  301 aacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagag 400  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| | |||||||  |||||| |||||||| |||| ||||| |||  | |||| ||||  |||||||  |||||||||||    
T  12134287 aacacgagaataaactaagcatagcagagatgagaatgttgtgttggatgtgtggcaagacaagatgatatagaattagaaatgacaatattagagagag 12134188  T
Q  401 --tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtctta 445  Q
      | | ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  12134187 aattgaggtacgacctatagtagaaaagatggtggaaaataggctta 12134141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 618 - 669
Target Start/End: Original strand, 32068635 - 32068686
Alignment:
Q  618 aacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataaa 669  Q
    |||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32068635 aacattatggcgtaatttgatacatgtagccgatcccacttagtgggataaa 32068686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 623 - 669
Target Start/End: Original strand, 579638 - 579684
Alignment:
Q  623 tatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataaa 669  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  579638 tatggcgtaatttgatctatgtagccgatcccacttagtgggataaa 579684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 280 - 358
Target Start/End: Original strand, 2079208 - 2079286
Alignment:
Q  280 agtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaa 358  Q
    |||| ||| |||| |||| | ||||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  2079208 agtgatggacggtgaagaactaacacgagaataaaataagcgtagcggagatgatgatgttgtgttggatgtgtggtaa 2079286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 335 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 6641761 - 6641628
Alignment:
Q  335 gatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagaga--gagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggta 432  Q
    ||||||||||| ||||  | |||||||||||   |||| ||||   |||||||  ||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  6641761 gatgttgcgttcgatgttttgtaagactagatgggataagattggaaatgacaatattagagatagagttggggtatcacctatagtagaaaagatggta 6641662  T
Q  433 gaaaatagtcttagatggtttggacatgtagaga 466  Q
    |||| ||| ||| | | |||||| ||| ||||||    
T  6641661 gaaactagacttgggttgtttgggcatctagaga 6641628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 303 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 7513367 - 7513305
Alignment:
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactaga 365  Q
    ||||||||||||  ||| |||  ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7513367 cacgagagtaaaacaagaatagtggagacgaagatgttgcgttggatgtgtggtaagactaga 7513305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 607 - 665
Target Start/End: Original strand, 8364760 - 8364818
Alignment:
Q  607 gtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggga 665  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  8364760 gtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccgcttagtggga 8364818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 614 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 18130885 - 18130831
Alignment:
Q  614 atagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18130885 atagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacctaatgggataa 18130831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 556 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 9593837 - 9593727
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccca 655  Q
    ||||||| |||||| || || |||||| | |||||||||||||  ||||| |||| |||||||||| ||||  || ||||||||||| |||| || | ||    
T  9593837 agagaaactattaggaaagacttagagattaatgagttggatcccaatatggtttatgatagaacattatg--gtaatttgatccatatagctgaccaca 9593740  T
Q  656 cttaatgggataa 668  Q
    |||| ||| ||||    
T  9593739 cttagtggcataa 9593727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 383; Significance: 0; HSPs: 139)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 664
Target Start/End: Original strand, 38606606 - 38607253
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcata-cccaagttacacggtttaaatatc 102  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38606606 gtatatggaatgtaatttttgcaaaaggagaagtg--ggtctaccttg-aggtgaaagttggagatcatatcatatcccaagttacacggtttaaatatc 38606702  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  38606703 ttgggtccatagtacaaaatgacgaagaaatagaagcagatgtaaaccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagccttaggtgttttgtg 38606802  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38606803 cgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctatcggacaacagtcagaccggcaatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagccaa 38606902  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt-agagagagt 401  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  38606903 cacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgataatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaacattaagagagagt 38607002  T
Q  402 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatat 501  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  38607003 gggggtagcacctatagtagaaaggttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagat 38607102  T
Q  502 caaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaa 601  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||| ||| ||| ||||            ||| |||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  38607103 caaatggaggagagtcacgttagaagagggagaggaagaccta-----------aga-aaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaa 38607190  T
Q  602 atatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggg 664  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  38607191 atatggtttttgatagaacactatggcgtcgtttgatccatgtagccgactccacttagtggg 38607253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 118 - 665
Target Start/End: Original strand, 43281389 - 43281936
Alignment:
Q  118 aaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaacc 217  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||    
T  43281389 aaaatgacggagaaatagaagcagatgtaaatcatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggcgttttgtgcgataagaaagtacc 43281488  T
Q  218 acttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagta 317  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  43281489 acttaagctgaaaggaaagttctatcggacagcagtcaaaccggcaatgttgtatggtacagagtgttgggcggttaagagccaacgcaagagtaaagta 43281588  T
Q  318 agtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctata 417  Q
    ||| || ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43281589 agtgtagcggggatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacaatataggattaggaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctata 43281688  T
Q  418 gtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtc 517  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||    
T  43281689 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtc 43281788  T
Q  518 tggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatag 617  Q
     |||||||||||||||| ||| ||||       ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  43281789 aggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatag 43281888  T
Q  618 aacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggga 665  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  43281889 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggga 43281936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 33350488 - 33349823
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33350488 gtatatggaatgtaacttcagcggaagaagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatc 33350391  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    | |||||  |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  33350390 tagggtctttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaagtgttttgtg 33350291  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||| || || ||| ||||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  33350290 cgataagaaagtaccacttaagttgacaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaa 33350191  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagag--agag 400  Q
    || |||| | |||||||| || | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  33350190 catgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgccttggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagag 33350091  T
Q  401 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatata 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  || |    
T  33350090 tgggggttgcacctatagtagaaaagttgctagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtaga 33349991  T
Q  501 tcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatcta 600  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  33349990 tcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatcca 33349891  T
Q  601 aatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||| | || | |  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  33349890 aatttggtgtatagtagaacactatagcgtcatttgatccatgtagccgacctcacttaatgggataa 33349823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Original strand, 11593559 - 11594225
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaaca-aaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatat 101  Q
    ||||||| |||||||||||| |  |||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  11593559 gtatatgaaatgtaacttcagcggaaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttgaagatcatatcataccccaagttagacggtttaaatat 11593656  T
Q  102 cttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgt 201  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11593657 cttgggtccttcgtacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgt 11593756  T
Q  202 gcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagcca 301  Q
    ||||||| |||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||| ||||  ||||| |  ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||    
T  11593757 gcgataaaaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacagttcgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttggacggttaagagtca 11593856  T
Q  302 acacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt--agagaga 399  Q
    ||| |||| | |||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||  |||||||    
T  11593857 acatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccatttgagagaga 11593956  T
Q  400 gtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatat 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||  ||     
T  11593957 gtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatacggttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccatggtaagaagagtag 11594056  T
Q  500 atcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatct 599  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||     
T  11594057 atcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc 11594156  T
Q  600 aaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||| | || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11594157 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 11594225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Original strand, 36651594 - 36652257
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||| ||||||| |  ||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  36651594 gtatatggaatggaacttcagcggaagaagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacgcggtttaaatatc 36651691  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    |||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36651692 ttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtg 36651791  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| |||||||||||| || ||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  36651792 cgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcaatccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaa 36651891  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtg 402  Q
    || |||| | |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||     
T  36651892 catgagaatcaagtaagtgtaacagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagggta 36651991  T
Q  403 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatc 502  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  || |||    
T  36651992 ggggtggcatccatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttcagcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatc 36652091  T
Q  503 aaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaa 602  Q
    |||| ||||| ||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| |||| |||||| ||||||||| ||| |||    
T  36652092 aaatagaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggattcagaggtcaatgagttgaatccaaa 36652191  T
Q  603 tatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    | | || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  36652192 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 36652257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 46356533 - 46355873
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46356533 gtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatc 46356436  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    |||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46356435 ttgggtcctttgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagttgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtg 46356336  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    ||||||||||  || ||||||| |||||| || ||| |||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  46356335 cgataagaaagtactacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagtagtcagaccggcattgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaa 46356236  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagag-- 400  Q
    || |||    ||  |||| || | ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||      
T  46356235 catgag----aatcaagtgtagcagagatg-ggatgttgcgttgaatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccatcagagagagaa 46356141  T
Q  401 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatata 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  || || |||||  || |    
T  46356140 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgttgtggtaagaagagtaga 46356041  T
Q  501 tcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatcta 600  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||       | |||| |||||  |||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |    
T  46356040 tcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaaaacctaggaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatcca 46355941  T
Q  601 aatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||| | || | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  46355940 aatctggtgtatgatagaacactatgccatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataa 46355873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 4 - 667
Target Start/End: Original strand, 49028867 - 49029540
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49028867 gtatatggaatgtaacttcaggggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcagatcataccccaagttacacggtttaaatatc 49028964  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttg--------------aaatggagaagagtc 188  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||              ||||||||||||| |    
T  49028965 ttgggtcctttgtacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtatgccatcgtattcaagctgggtggttggttgtggttggttgaaatggagaagagcc 49029064  T
Q  189 tcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctggg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||     ||||| || ||| |||||||||||||||  ||||    ||||||| ||||||||||| ||||    
T  49029065 tcaggtgttttgtgcgataagaaaataccactt-----gaaaggaaagttctatcggacagcagtccaaccggtgttgttgtatggtacggagtgttggg 49029159  T
Q  289 cggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacac 388  Q
    |||||||||| ||||| |||| | |||||||| || | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  49029160 cggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttacgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacac 49029259  T
Q  389 cattagag--agagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtt 486  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  49029260 cattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtg 49029359  T
Q  487 gttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaa 586  Q
    || ||| | ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| |    
T  49029360 gtaagacgaatagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtca 49029459  T
Q  587 atgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggata 667  Q
    |||||||||||| |||| | || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  49029460 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggata 49029540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 92 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 35906796 - 35906218
Alignment:
Q  92 gtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctca 191  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  35906796 gtttaaatatcttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagatcttca 35906697  T
Q  192 ggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcgg 291  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |  ||||||| | ||||||||| |||| ||    
T  35906696 ggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgtatgatacggagtgttgggtgg 35906597  T
Q  292 ttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccat 391  Q
    ||||||| ||||| |||| | |||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  35906596 ttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccat 35906497  T
Q  392 tagag--agagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtt 489  Q
    |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  35906496 tagagagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggta 35906397  T
Q  490 agaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatg 589  Q
    |||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  35906396 agaagagtatatcatatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttcgaggtcaatg 35906297  T
Q  590 agttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||| |||| | || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  35906296 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 35906218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 4 - 603
Target Start/End: Original strand, 31004824 - 31005423
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  31004824 gtatatggaatgttacttcagcggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacg-tttaaatatc 31004920  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    |||| ||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31004921 ttggctccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagttgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtg 31005020  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  31005021 cgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttaggcggttaagagtcaa 31005120  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt--agagagag 400  Q
    || |||| | |||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||||||    
T  31005121 catgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaataacaccattagagagagag 31005220  T
Q  401 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatata 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  || |    
T  31005221 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtaga 31005320  T
Q  501 tcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatcta 600  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  ||| |||| |||| |||| | ||||||||||||| |    
T  31005321 tcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatttgaaaggattcagagatcaatgagttggatcca 31005420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 39907061 - 39906389
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcata-cccaagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  39907061 gtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatatcccatgttacacggtttaaatatc 39906964  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttg----aaatggagaagagtctcaggtgttt 198  Q
    |||||||  |  |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||| |||||    
T  39906963 ttgggtcattcgtacaaaatgacggagaaatagaagtagatgcaagccatcgtattcaagctgggtggttggttgaaatggagaagagcctcagatgttt 39906864  T
Q  199 tgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagag 298  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||| | |||| |||||||    
T  39906863 tgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggcgttgttgtatggtacggagtgttaggcgattaagag 39906764  T
Q  299 ccaacacgagagtaaagtaagtataac-----ggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt- 392  Q
     ||||| |||| | |||||||| || |      ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||     
T  39906763 tcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgagatgaggatgctgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccatta 39906664  T
Q  393 -agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttag 491  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| || ||    
T  39906663 gagagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccatagatgtcgtggtaag 39906564  T
Q  492 aaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgag 591  Q
    |||  || |||||||||||  |||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||     
T  39906563 aagagtagatcaaatggag--gagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgac 39906466  T
Q  592 ttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||| |||| | || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  39906465 ttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 39906389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 155 - 668
Target Start/End: Original strand, 34869170 - 34869685
Alignment:
Q  155 tattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtc 254  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||    
T  34869170 tattcaagctgggtggttgaattggagaagagcctcaggcgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtc 34869269  T
Q  255 agaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtg 354  Q
    |||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| | |||||||| ||   ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34869270 agaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagtagagatgaggatgttgcgttggatgagtg 34869369  T
Q  355 gtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt--agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtt 452  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34869370 gtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtt 34869469  T
Q  453 tggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnncc 552  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||  || ||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       |     
T  34869470 tgggcatgtagagagaagacccgtaaatgccgtggtaagaagagtagatccaatggtggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaact 34869569  T
Q  553 attagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatc 652  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  34869570 attagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgacc 34869669  T
Q  653 ccacttaatgggataa 668  Q
    | | ||| ||||||||    
T  34869670 ctaattagtgggataa 34869685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 4 - 445
Target Start/End: Original strand, 32630207 - 32630636
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32630207 gtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagaagtg--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatc 32630304  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || |            | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  32630305 ttgggtccatattacaaaatgatggagaattaca------------tcatcgtattcaagctgggtagttgaaatggagaagagcctcgagtgttttgtg 32630392  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||| || ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32630393 cgataagaaagtatcacttaagctgaaaggaaagttctatcggacatcaatcagaccgacaatgttgtatggtacggagtgctgggcggttaagaaccaa 32630492  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt--agagagag 400  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||  ||||||||    
T  32630493 cacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgagctggatgagtggtaagactagacatgataggatt-aggatgataccattggagagagag 32630591  T
Q  401 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtctta 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32630592 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctta 32630636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 189 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 12841773 - 12841292
Alignment:
Q  189 tcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctggg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  12841773 tcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcgtacagcagtctgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttggg 12841674  T
Q  289 cggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacac 388  Q
     ||||||||| ||||| |||| | |||||||| || | ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |    
T  12841673 tggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaaaactagacatgataggattaggaatgaccc 12841574  T
Q  389 cattagag--agagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtt 486  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  12841573 cattagagagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtg 12841474  T
Q  487 gttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaa 586  Q
    || |||||  || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| |    
T  12841473 gtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtca 12841374  T
Q  587 atgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||| ||| |||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  12841373 atgagttgtatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 12841292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 117 - 543
Target Start/End: Original strand, 33072666 - 33073092
Alignment:
Q  117 caaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaac 216  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  33072666 caaaatgacggataattagaagcagatgtaagccatcgtattcaagttggatggttgaaatggagaagagcctcaagtgttttgtgcgataagaaagtac 33072765  T
Q  217 cacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagt 316  Q
    |||||||| | |||| || ||| ||||||||| |||| |||||| |  ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||| | || |    
T  33072766 cacttaagttaaaaggaaagttctatcggacaacagttagaccggcgttgttgtatggtacagagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaaat 33072865  T
Q  317 aagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctat 416  Q
    |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33072866 aagtgtagcagagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctat 33072965  T
Q  417 agtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagt 516  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||  || ||||||||||| |||||    
T  33072966 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggagaagagt 33073065  T
Q  517 ctggttaaaagaggtagatgaaaacct 543  Q
    |  ||||||||||||||| ||| ||||    
T  33073066 caagttaaaagaggtagaggaagacct 33073092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 296 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 45836871 - 45836499
Alignment:
Q  296 gagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattaga 395  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45836871 gagccaacacgagagtcaagtaagtgcagcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagagtagacaagataggattaggaatgacaccattaga 45836772  T
Q  396 gagag--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaa 493  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45836771 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaa 45836672  T
Q  494 ggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagtt 593  Q
    |  || |||||||||||||||||  ||||  | |||||||| | | ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  45836671 gagtagatcaaatggaggagagttaggtt--atgaggtagagggagacctaggacaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagtt 45836574  T
Q  594 ggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  45836573 ggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 45836499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 273 - 668
Target Start/End: Original strand, 37617812 - 37618210
Alignment:
Q  273 ggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagata 372  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||| | ||| |||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37617812 ggtacggagtcttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagcaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagata 37617911  T
Q  373 ggattaagaatgacaccatt--agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtag-aaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaa 469  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  37617912 ggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 37618011  T
Q  470 gacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattag 569  Q
    |||||||||||||||| || |||||  || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||    
T  37618012 gacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattag 37618111  T
Q  570 aaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||| | || | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  37618112 aaaggatttagaggtcaataagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 37618210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 4 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 36869971 - 36869576
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  36869971 gtatatggaatgtaacttcaggaaaagggaaagtatg--tctaccctggaggtgaaagttggagagcatatcataccccaaattacgcggtttaaatatc 36869874  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    |||| |||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  36869873 ttggatccatagtacaaaatgacgaagaaataaaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggggttttgtg 36869774  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||||| |||||||| || || |||  |||||| |||    
T  36869773 cgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacagtcaggccggcgatgttgtatggtacggaatgttgagcgactaagagtcaa 36869674  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagag 400  Q
    |||| || | |||||||| || | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36869673 cacgtgaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactggacatgataggattaggaatgacaccattagagagag 36869576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 217 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 13859476 - 13859061
Alignment:
Q  217 cacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagt 316  Q
    |||||||| |||||| || ||| ||| | |||||||| |||||| || ||||||  |||||||| || ||||||||||||||  ||||||||| | ||||    
T  13859476 cacttaagttgaaaggaaagttctattgaacagcagttagaccggcagtgttgtttggtacggaatgttgggcggttaagagttaacacgagaatcaagt 13859377  T
Q  317 aagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacct 414  Q
    |||||  |  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  13859376 aagtagca--gagatgaggatgttgcgttggacgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacct 13859279  T
Q  415 atagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggaga 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||  || |||||||||||||||    
T  13859278 atagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggaga 13859179  T
Q  515 gtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttga 614  Q
    |||  |||| |||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||| | |||| |||    
T  13859178 gtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggccaatgagttggatccaaatttggtttatga 13859079  T
Q  615 tagaacactatgacgtca 632  Q
    |||||||||||| |||||    
T  13859078 tagaacactatggcgtca 13859061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 370 - 668
Target Start/End: Original strand, 29650349 - 29650649
Alignment:
Q  370 ataggattaagaatgacaccatt--agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagag 467  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29650349 ataggattaggaatgacaccattcgagagagagtgggggcagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagag 29650448  T
Q  468 aagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattatt 567  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||       ||||| ||||||  |||    
T  29650449 aagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtaaaggaaaacctaagaaaaccattcgagaaaccatt 29650548  T
Q  568 agaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggata 667  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  29650549 agaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaacactaaggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggata 29650648  T
Q  668 a 668  Q
    |    
T  29650649 a 29650649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Original strand, 37616516 - 37616790
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  37616516 gtatatggaatgtaacttcagcagaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaaggtggagatcatatcataccccaagttacacgatttaaatatc 37616613  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    |||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  37616614 ttgggtcctttgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccattgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaagtgttttgtg 37616713  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacgg 279  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  37616714 cgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttatatcggccagcagtcagaccgacattgttgtatggtacgg 37616790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 335 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 44855524 - 44855191
Alignment:
Q  335 gatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggta 432  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  44855524 gatgttgtgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggatagtacctatagtagaaaagttggta 44855425  T
Q  433 gaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggta 532  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  || ||||||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  44855424 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaagta 44855325  T
Q  533 gatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtca 632  Q
    || ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| ||||  ||||||||| ||| |    
T  44855324 gaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgat--aacactatggcgtaa 44855227  T
Q  633 tttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  44855226 tttggtccatgtagccgaccccacttagtgggataa 44855191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 145 - 484
Target Start/End: Original strand, 7272780 - 7273120
Alignment:
Q  145 taaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcg 244  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||| ||| || || ||| |||||    
T  7272780 taaatcatcgtattcaagctgggtggttgagattgagaa-agcctcaggtattttgtgtgataagaaagtaccacttaagttgagaggaaagttgtatcg 7272878  T
Q  245 gacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgt 344  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||| ||||||| |     
T  7272879 gtcagcagtcaaaccgacaatgttgtatgatacagagtgttgggcggttgagagccaacacgagaatcaagtaagtgtaccggagatgaggatgttgtgc 7272978  T
Q  345 tggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatta--gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtc 442  Q
    |||||||| |||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| |||  ||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7272979 tggatgagcggtaagactacacgggataggattaggaatgacacctttagggagagaacgggagtatcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggc 7273078  T
Q  443 ttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccg 484  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  7273079 ttagatggtttgggcatgtacagagaagacctgtagatgccg 7273120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 168 - 543
Target Start/End: Original strand, 23404181 - 23404557
Alignment:
Q  168 tggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgt 267  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||  |||||||||| |||||| ||  || ||||||||| ||||||||||||| || |    
T  23404181 tggttaaaatggagaagagcctcaggtgttttctgagataagaaaggaccacttaagttgaaaggaaaattctatcggacaacagtcagaccgacgatat 23404280  T
Q  268 tgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagaca 367  Q
    |||| |||||| |||  ||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||| ||  ||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  23404281 tgtatggtacgaagttttgggcggttaaaagccagcacgagaatcaagtaagtgtattggaaatgaggatgttgcgctggatgagcggtaagactataca 23404380  T
Q  368 agataggattaagaatgacaccatta--gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagag 465  Q
     |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||| ||||||||     
T  23404381 tgataggattaggaatgacaccattagggagagagtgggggtaacacttatagtagaaaagttgggagaaaataggcttagacagtttgg-catgtagat 23404479  T
Q  466 agaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacct 543  Q
     |||||| |||||||| |||  | |||||  || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||    
T  23404480 tgaagactcgtagatgtcgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaagaagacct 23404557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 370 - 668
Target Start/End: Original strand, 6374833 - 6375133
Alignment:
Q  370 ataggattaagaatgacaccattagag--agagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagag 467  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  6374833 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtagagag 6374932  T
Q  468 aagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattatt 567  Q
    |||||| |||||||| || || |||||| || |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||| ||| | ||       | ||||||||||  |||    
T  6374933 aagaccagtagatgctgtggtaagaagggtagatcaaatgtaggagaatcaagttaaaagaggtagaggaagatctaggaaaactattagagaaaccatt 6375032  T
Q  568 agaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggata 667  Q
    |||||  |||||||||| | ||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  6375033 agaaagaatttagaggtcagtgagttggatccaaatttagtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggata 6375132  T
Q  668 a 668  Q
    |    
T  6375133 a 6375133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 328 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 35559353 - 35559031
Alignment:
Q  328 agatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt--agagagagtgggggtagcacct-atagtagaaa 424  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||   |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35559353 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagatcagatttgataggattaggaatgacaccatttgagagagagtgggggtagcaccttatagtagaaa 35559254  T
Q  425 agttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaa 524  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||| || |||||  || ||||||||||||||||||  |||||    
T  35559253 agttggtagaaaataggcttagatgatttggacatttagtgagaagacccctagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaa 35559154  T
Q  525 aagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacacta 624  Q
    |||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| || ||||||| ||    
T  35559153 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttagtttatggtagaacatta 35559054  T
Q  625 tgacgtcatttgatccatgtagc 647  Q
    |  | ||||||||||||||||||    
T  35559053 tagcatcatttgatccatgtagc 35559031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 394 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 2886013 - 2885739
Alignment:
Q  394 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaa 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  2886013 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgttgtacgaa 2885914  T
Q  494 ggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagtt 593  Q
    |  || |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||       | || |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  2885913 gagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaagaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaatgatttagtggtcaatgagtt 2885814  T
Q  594 ggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||| | |||||| |||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  2885813 ggacccaaatatggtttatgatagaacactatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 2885739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 314 - 668
Target Start/End: Original strand, 43491217 - 43491573
Alignment:
Q  314 agtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattag--agagagtgggggtagca 411  Q
    ||||||| || | ||||||| ||||||| | |||||||| ||||||| ||||   |||| ||||| ||||||||||||| |  ||||||| |||||| ||    
T  43491217 agtaagtgtagccgagatgaggatgttgtgctggatgagcggtaagattagatgggatatgattaggaatgacaccattggggagagagtaggggtaaca 43491316  T
Q  412 cctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggagg 511  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |  |||| |||||||    
T  43491317 cctatagtataaaaattggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagttgatcagatggagg 43491416  T
Q  512 agagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttt 611  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||         || |||||||  ||||||||  |||||||||| ||| ||||||||| ||||||  |||     
T  43491417 agagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaattataagagaaaccattagaaagaatttagaggtcaataagttggatccaaatatgattta 43491516  T
Q  612 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  43491517 tgatagaacactatgatgtaatttcatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 43491573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 404 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 31682883 - 31682619
Alignment:
Q  404 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatca 503  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  || ||||    
T  31682883 gggtagcacatatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggtatgtagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatca 31682784  T
Q  504 aatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaat 603  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| | ||    
T  31682783 aatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgaattggatccatat 31682684  T
Q  604 atagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
     | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  31682683 ttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 31682619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 248
Target Start/End: Original strand, 48918988 - 48919231
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||   ||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||     
T  48918988 gtatatggaatgtgacttcagcaaatggagaagta--ggtctacattgaaggtaaaagtaggagatcatattacaccccaagttacacggtttaaatatt 48919085  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48919086 ttggatccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtgaatcatcgtattcaagctgggtagttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtg 48919185  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggaca 248  Q
    ||||||||||  ||| |||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  48919186 cgataagaaagtaccccttaagttgaaaggaaggttatatcggaca 48919231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 406 - 668
Target Start/End: Original strand, 22349623 - 22349885
Alignment:
Q  406 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaa 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||  || | | || |||||  || ||||||    
T  22349623 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttttggcatgtagagagaagacccgtaattgtcatggtaagaagagtagatcaaa 22349722  T
Q  506 tggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatat 605  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||| | ||       | ||||||||||  |||| ||| |||||| |||| ||| ||||||||| |||| |    
T  22349723 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagaactaggaaaactattagagaaaccattaaaaaggatttaaaggtcaataagttggatccaaattt 22349822  T
Q  606 agtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
     || | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  22349823 ggtatatgatagaatactatggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataa 22349885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 442 - 668
Target Start/End: Original strand, 32631615 - 32631829
Alignment:
Q  442 cttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaac 541  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  32631615 cttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtggatcaaatggaggatagtcaggttaaaagaggtagaggaagac 32631714  T
Q  542 ctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatcca 641  Q
    ||            ||| |||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  32631715 cta-----------aga-aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacgctatggcgtcatttgatcta 32631802  T
Q  642 tgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  32631803 tgtagccgaccccacttagtgggataa 32631829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 402 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 36869527 - 36869254
Alignment:
Q  402 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatat 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    |||||  || ||    
T  36869527 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcagaagaagagtagat 36869428  T
Q  502 caaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaa 601  Q
    ||||||||||||||||  |||| || ||||||| ||| ||||       | |||| |||||  |||||||| |||||||| || |||||||| |||  ||    
T  36869427 caaatggaggagagtcaagttagaataggtagaggaagacctgggaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttagatgtcaatgagttagattcaa 36869328  T
Q  602 atatagtttttgatagaacactatgacgtcatt-------tgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    || |  ||| ||||||||||||||| |||||||       |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36869327 atttgatttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgatccatgtagccgaccccacttaatgggataa 36869254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 142 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 7189777 - 7189442
Alignment:
Q  142 atgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggtttta 241  Q
    |||||||| || ||||| | | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||  |  ||||||  ||||||| |  |||||    
T  7189777 atgtaaatcattgtatttatgttgagtggttgaaatggagaaaagtctcaggtgttttatttgataagaaagtattacttaaattgaaagagaaatttta 7189678  T
Q  242 tcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttg 341  Q
    |  ||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| |||||||| ||||||| | | | ||||||| |||  |||||||| |||||||    
T  7189677 t-agacagtagtcagaccgacgatgttgtatggtacagagtgttgggtggttaagaaccaacacaaaaatcaagtaagcatagtggagatgaggatgttg 7189579  T
Q  342 cgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt----------agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggt 431  Q
     |||| ||||  ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||          ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  7189578 tgttgaatgaccggtaagattagacgagatagga-tatgaatgacaccattagagagagaaagagagagttggggtcgcacctatagtagaaaagatggt 7189480  T
Q  432 agaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaa 469  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  7189479 agaaaataagcttaggtggtttgggcatgtagagagaa 7189442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 413 - 669
Target Start/End: Original strand, 15682184 - 15682440
Alignment:
Q  413 ctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggagga 512  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | || |||||||||||| || |||||||||| || |||||  || ||||||| |||||    
T  15682184 ctatagtagaaaagttggtaggaaataggcttagatggtttaggcaggtagagagaagatccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaattgagga 15682283  T
Q  513 gagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagttttt 612  Q
     ||||  || ||||||||| ||  |||||||       | || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||| |    
T  15682284 aagtcaagtcaaaagaggtggagaaaaacctaggaaaactataagagaaatcattagaaaggatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttat 15682383  T
Q  613 gatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataaa 669  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||| | |||||||| || ||||||    
T  15682384 gatagaacactatggcgtactttgatccatgtagccaaccccacttagtgagataaa 15682440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 24177877 - 24177714
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||   |||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  24177877 gtatatggaatgtaacttcagcaaaagaagaagta--ggtctagcttgtagatgaaggttggagatcatatcataccccaatttacacggtttaaatatc 24177780  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggt 168  Q
      ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  24177779 acgggtcaatagtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaaatcatcatattcaagttgggt 24177714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 151 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 25579612 - 25579290
Alignment:
Q  151 atcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagt--ctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaac---cacttaagctgaaagaaaggttttatcgg 245  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   ||| ||| |||| || |||| |||||||    | || ||| |||| | ||  || ||||||    
T  25579612 atcgtattcaagttgggtggttaaaatggagaagagagcctcgggtattttatgtgatacgaaaaaaagtacgctcaagttgaagggaaaattctatcgg 25579513  T
Q  246 acagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgtt 345  Q
    ||||| || |||||| | |||||||| || ||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  ||  |||||||| |||||||||||    
T  25579512 acagctgtaagaccggcgatgttgtatggaacggaatgttgggcggttaagaaccaacacgagaataaaataagcgtagaggagatgaggatgttgcgtt 25579413  T
Q  346 ggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggg-gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtctt 444  Q
    ||||| ||||||| |||     |||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||  |||| |||||||| |||    
T  25579412 ggatgtgtggtaatact-----agataggattagaaatgaccacattagagagagtggggagtagcacccatagcagaaaaaatggtggaaaataggctt 25579318  T
Q  445 agatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    || ||||||||  |||||||||||||||    
T  25579317 aggtggtttggggatgtagagagaagac 25579290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 294 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 36514598 - 36514424
Alignment:
Q  294 aagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatta 393  Q
    |||| ||||||||| | |||| ||||| || | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||  || |||| |||||    
T  36514598 aagaaccaacacgaaaataaattaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactaaacgggatagaattagaaaggacaacatta 36514499  T
Q  394 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagaga 468  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  36514498 gagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagaga 36514424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 237 - 472
Target Start/End: Original strand, 47848506 - 47848743
Alignment:
Q  237 ttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatga 336  Q
    |||||||||||| | |  |||||||| ||| || | || | |||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||  |||||||| ||    
T  47848506 ttttatcggacaactgcaagaccgactatgatgaatggaatggagtgttgggtggttaagaaccaacacgagaataaaataagtctaggggagatgagga 47848605  T
Q  337 tgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt--agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtaga 434  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||| |  | ||| | ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  47848606 tgttgtgttggatgtgtggtaagactagacgggataggatcagaagtgataacattagagagagagttggggtagcgcctatagtagaaaagatggtgga 47848705  T
Q  435 aaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  47848706 aaataggcttaggtggtttgggcatgtcgagagaagac 47848743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 336 - 621
Target Start/End: Original strand, 36136695 - 36136982
Alignment:
Q  336 atgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggtag 433  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||   |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36136695 atgttgtgttggatgggtggtaagactagaagggataggtttaggaatgacaccattagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtag 36136794  T
Q  434 aaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtag 533  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| |||  ||||||  || ||  ||||   | |||| ||||||||||||| | | | |||| ||||    
T  36136795 aaaatagtcttaggttgtttgggcatatagagagaatacctatagatgttgtagtacgaagagcagatcagatggaggagagtcagatcagaagaagtag 36136894  T
Q  534 atgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaaca 621  Q
    | ||| ||||       | || ||||||| |||| | || |||||||| || ||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  36136895 aggaagacctagaaaaactataagagaaactatttggaaagatttagatgttaatgaattggatccaaatatggtttatgatagaaca 36136982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 381 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 46014486 - 46014381
Alignment:
Q  381 aatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtag 478  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  46014486 aatgacaccattagagagagagtgggggttgcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgg-ttggacatgtagagagaagacccatag 46014388  T
Q  479 atgccgt 485  Q
    |||||||    
T  46014387 atgccgt 46014381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 556 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 40980057 - 40979945
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccca 655  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  40980057 agagaaactattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgacccca 40979958  T
Q  656 cttaatgggataa 668  Q
    |||| ||||||||    
T  40979957 cttagtgggataa 40979945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 461 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 24598411 - 24598205
Alignment:
Q  461 tagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagaga 560  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||        |||| ||||    
T  24598411 tagagagcagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaatcattcgaga 24598312  T
Q  561 aattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaa 660  Q
    ||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  |||||||||||| | | || | ||||||||||||||||||||| | || ||||    
T  24598311 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaatattttggcatcatttgatccatgtagccga-ctcatttaa 24598213  T
Q  661 tgggataa 668  Q
    ||||||||    
T  24598212 tgggataa 24598205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 565 - 668
Target Start/End: Original strand, 48919274 - 48919377
Alignment:
Q  565 attagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggg 664  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  48919274 attagaaatgatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttatgataaaccactatggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttaatggg 48919373  T
Q  665 ataa 668  Q
    ||||    
T  48919374 ataa 48919377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 262 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 28628355 - 28627950
Alignment:
Q  262 caatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagac 361  Q
    |||||||||| || ||  |||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||  || | ||||| |||   |||| |||||||  |||||||||    
T  28628355 caatgttgtatggaacaaagtgttgggcggttgagaaccaacacgagaataaagtaagcgtagcagagattatg---ttgccttggatgtatggtaagac 28628259  T
Q  362 tagacaagataggattaagaatgacaccattagagag--agtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacat 459  Q
     | ||  ||| ||||||  ||| ||| ||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||| | |||| |||||| | ||||| |||||||| |||    
T  28628258 catacgggatgggattagaaattacaacattagagagggagttggagtagcacctagagtagaaatgatggtggaaaattggcttaggtggtttgggcat 28628159  T
Q  460 gtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagag 559  Q
    ||| |||||| ||| ||||||   || || || ||  || |||  |||||||| ||||   | | |||||||||| ||| ||||       | || ||||    
T  28628158 gtaaagagaaaacctgtagattatgtagtaaggagagtagatccgatggaggatagtcaaatcacaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagag 28628059  T
Q  560 aaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 659  Q
    ||| |||||| || ||||||||| | ||||||||||||  |||| | |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  28628058 aaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatgcaaatgtggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgactccactta 28627959  T
Q  660 atgggataa 668  Q
     ||||||||    
T  28627958 gtgggataa 28627950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 299 - 472
Target Start/End: Original strand, 43282299 - 43282477
Alignment:
Q  299 ccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt-----a 393  Q
    ||||||| ||| |||| |||| | |||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||| |||||  ||||||| ||||     |    
T  43282299 ccaacacaagaataaattaagcacaacggatatgaggatgttgcgttagatgtgtggtaagtctagacatgatatgattagaaatgacaacatttagaga 43282398  T
Q  394 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  43282399 gagagagttggggtagcacctatagtagaaaagtcggtggaaactaggcttaggtgaattgggcatgtagagagaagac 43282477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24550320 - 24550178
Alignment:
Q  52 gaggtgaaagttggagatcatatcatacccaagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaatta 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| || |||  |||||||| |||||||||||     
T  24550320 gaggtgaaagttgaagatcatatcata----agttacacgatttaaatatctttagtccatattacaaaacgacggattaatagaaggagatgtaaattg 24550225  T
Q  152 tcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttt 198  Q
    | | ||||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  24550224 ttgaattcaagttgggtggttgaaatggaggagggtctcacgtgttt 24550178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 340 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 8492580 - 8492437
Alignment:
Q  340 tgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatta--gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa 437  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  |||||| | |||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  8492580 tgcgttggatgagtggcaagactagacgggataggattacgaatgacaccattagggagagatttggggtaacacctatagtaaaaatgatggtagaaaa 8492481  T
Q  438 tagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatg 481  Q
    ||| || || ||||||| || |||||||| |||||  |||||||    
T  8492480 taggctaaggtggtttgaacttgtagagaaaagacttgtagatg 8492437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 565 - 668
Target Start/End: Original strand, 27648942 - 27649045
Alignment:
Q  565 attagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggg 664  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  27648942 attagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactgtggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtggg 27649041  T
Q  665 ataa 668  Q
    ||||    
T  27649042 ataa 27649045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 553 - 668
Target Start/End: Original strand, 38900107 - 38900221
Alignment:
Q  553 attagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatc 652  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | || | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  38900107 attagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgattgaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga-c 38900205  T
Q  653 ccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||| ||||||||    
T  38900206 ccacttagtgggataa 38900221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 505 - 668
Target Start/End: Original strand, 7273202 - 7273365
Alignment:
Q  505 atggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaata 604  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||       | || |||||||  ||||||||  ||| |||||| ||||||||||||  |||||    
T  7273202 atggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactataagagaaaccattagaaaatattcagaggtcaatgagttggattcaaata 7273301  T
Q  605 tagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    | |||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  7273302 tggtttatgatatagcactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 7273365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 326 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 19262792 - 19262638
Alignment:
Q  326 ggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaa 425  Q
    |||||||| |||||| |||  |||  ||||||| |||||||| |||||  |||  |||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19262792 ggagatgaggatgttacgtgtgatatgtggtaatactagacatgatagagttagaaatgacaatattagagagagttggggtagcacctattgtagaaaa 19262693  T
Q  426 gttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagat 480  Q
    | ||||||||| | | ||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  19262692 gatggtagaaacttggcttaggtggtttgagcatgtagagagaagacctgtagat 19262638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 327 - 471
Target Start/End: Original strand, 5335844 - 5335988
Alignment:
Q  327 gagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaag 426  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||   ||||  ||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  5335844 gagatgaggatgttgcgttgaatgtgtggtaagactagacagaatgcaattagaaatgataacattagagagagttggggtagcatctatagtaggaaag 5335943  T
Q  427 ttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaaga 471  Q
     |||| |||| ||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  5335944 atggtcgaaactagacttaggtggtttgggcatatagagagaaga 5335988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 553 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 31681152 - 31681040
Alignment:
Q  553 attagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatc 652  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| |||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  31681152 attagagaaaccattagaaaggatttaagggtcaatgagttggatccaaatatggcttatgatagaatactatgacgtaatttgatccatgtagccgacc 31681053  T
Q  653 ccacttaatggga 665  Q
    ||||||| |||||    
T  31681052 ccacttagtggga 31681040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 299 - 480
Target Start/End: Original strand, 42187365 - 42187547
Alignment:
Q  299 ccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattaga--g 396  Q
    ||||||| ||| || ||||||  || ||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||  ||||  ||||  |||| || |||||||  |    
T  42187365 ccaacacaagaatagagtaagcgtagcggagatgaggatgttgtgttggatgtgtagtaagactagacgggatat-attagaaatggcagcattagaaag 42187463  T
Q  397 agagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagat 480  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||| || ||||||    
T  42187464 agagtcggggtagcacctataatagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaggcctgtagat 42187547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 575 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 34035264 - 34035173
Alignment:
Q  575 atttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggat 666  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  34035264 atttagagatcaatgagttggatccaaatatggttcatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggat 34035173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 590 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 28208423 - 28208345
Alignment:
Q  590 agttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  28208423 agttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 28208345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 393 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 27021984 - 27021906
Alignment:
Q  393 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaaga 471  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27021984 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagttggtgaaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaga 27021906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 330 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 48736256 - 48736111
Alignment:
Q  330 atgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatta--gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagt 427  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||  ||||  ||||||  |||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  48736256 atgaggatgttgcgttgaatgtgtggtaagactagatgagataaaattagaaatgacgacattatagagagagttggggtagcacctacagtagaaaaga 48736157  T
Q  428 tggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    ||| ||||| ||| ||||| |||||||  ||||||||| |||||||    
T  48736156 tgggagaaactagacttaggtggtttgctcatgtagagcgaagacc 48736111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 575 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 9210814 - 9210721
Alignment:
Q  575 atttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  9210814 atttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatacaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataa 9210721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 579 - 668
Target Start/End: Original strand, 33073105 - 33073194
Alignment:
Q  579 agaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| | || | | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33073105 agaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtataataaaacaatatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataa 33073194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 555 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 36101907 - 36101794
Alignment:
Q  555 tagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccc 654  Q
    |||| |||||||||  || |||||| || | ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||  || |||    
T  36101907 tagaaaaattattatgaaagatttatagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagttgacccc 36101808  T
Q  655 acttaatgggataa 668  Q
    ||||| ||||||||    
T  36101807 acttagtgggataa 36101794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 554 - 650
Target Start/End: Original strand, 21078068 - 21078164
Alignment:
Q  554 ttagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccga 650  Q
    |||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||| | || | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21078068 ttagagaaaccattagtaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccga 21078164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 21517959 - 21517826
Alignment:
Q  53 aggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaatta 151  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||| ||||||||||||||| | |||| |||||| ||| | |||||||  | || |||||||| |    
T  21517959 aggtgaaagttggagaccacatgatacctcaatttacacagtttaaatatcttggattcatagtacaaa-tgacgaagaaataataacatatgtaaatca 21517861  T
Q  152 tcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagag 186  Q
    || |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21517860 tcatattcaagttgggtggttgaaatcgagaagag 21517826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 606 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 31869181 - 31869119
Alignment:
Q  606 agtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  31869181 agtttttgatagaacactctggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 31869119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 394 - 480
Target Start/End: Original strand, 40169640 - 40169726
Alignment:
Q  394 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagat 480  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  40169640 gagagaattggggtagcacttatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagataagacacgtagat 40169726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 612 - 669
Target Start/End: Original strand, 24777170 - 24777227
Alignment:
Q  612 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataaa 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24777170 tgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccgatcctacttagtgggataaa 24777227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 325 - 471
Target Start/End: Original strand, 39811877 - 39812025
Alignment:
Q  325 cggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt--agagagagtgggggtagcacctatagtaga 422  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||| |||||||||  ||||    
T  39811877 cggatatgaggatgttgctttggatgtgtggtaagactagacgtgataggattagaaatgacaacattagagagagagttggggcagcacctatcataga 39811976  T
Q  423 aaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaaga 471  Q
    |||  ||||  ||| | | ||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  39811977 aaaaatggtgaaaactcggcttaggtagtttgggcatgtagagagaaga 39812025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 52 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 43793676 - 43793592
Alignment:
Q  52 gaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatag 135  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||    
T  43793676 gaggtgaaagttagagatcatatcataccactagttacacattttaaatatcttgggtctatagtacaaaatgacgaagaaatag 43793592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 335 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 24598498 - 24598409
Alignment:
Q  335 gatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt------agagagagtgggggtagcacctatag 418  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||      |||||||||||||||| |||||||||    
T  24598498 gatgttgtgttggatgagtggtaagtttagacatgataggattaggaatgacaccattatagaaagagagagtgggggtatcacctatag 24598409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 330 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 25731709 - 25731640
Alignment:
Q  330 atgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagag 400  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25731709 atgatgatgttgt-ttggatgaatggtaagactagacgagaaaggattaagaatgacacctttagagagag 25731640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 327 - 473
Target Start/End: Original strand, 14593683 - 14593835
Alignment:
Q  327 gagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtg------ggggtagcacctatagta 420  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||   |  | ||||  ||||||| |||||||||||| |      |||||  |||||||||||    
T  14593683 gagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacggaaccgaattagaaatgacaacattagagagagagtgagctggggtgacacctatagta 14593782  T
Q  421 gaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    |||||  ||||||||| ||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||||    
T  14593783 gaaaaaatggtagaaactagacttaggtgatttgggcatgtagtgagaagacc 14593835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 551 - 668
Target Start/End: Original strand, 34745895 - 34746012
Alignment:
Q  551 ccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccga 650  Q
    |||| ||||||| |||||| || ||| || || |||||||||||||   ||| || |||||||||||||| ||||| |||  |||||| |||||||||||    
T  34745895 ccataagagaaactattaggaaggatctaaagataaatgagttggagaaaaacatggtttttgatagaacgctatggcgttgtttgattcatgtagccga 34745994  T
Q  651 tcccacttaatgggataa 668  Q
     |||||||| ||||||||    
T  34745995 ccccacttagtgggataa 34746012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 327 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 36102125 - 36101977
Alignment:
Q  327 gagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagag--agagtgggggtagcacctatagtagaaa 424  Q
    |||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||   |||  |||||  ||||||| |||| |||  ||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  36102125 gagatgaaaatgttgagttcgatgtgtggtaagactagatgggatgagattagaaatgacaacatttgaggaagagtgaaggtagcacctataatagaaa 36102026  T
Q  425 agttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    || || | |||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  36102025 agatgttggaaaataggcttaggtggtttggggatgtagagagaagacc 36101977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 575 - 668
Target Start/End: Original strand, 42969870 - 42969963
Alignment:
Q  575 atttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||| |||    | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  42969870 atttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgattgaacattatcgtataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 42969963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 469
Target Start/End: Original strand, 45558351 - 45558428
Alignment:
Q  392 tagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaa 469  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||  || ||||||||||    
T  45558351 tagagagagttggggtaccacctatagtagaaaagttggtagaaactcgacttaggtggtttgtgcacgtagagagaa 45558428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 556 - 668
Target Start/End: Original strand, 14057631 - 14057743
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccca 655  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||| |||| ||| |||  |||||| |||| |||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| | ||||    
T  14057631 agagaaactattaggaaagatttagaggttaatgcgttcgattcaaatatggtttatgatagaacattatggggtaatttgatccatgtagccaacccca 14057730  T
Q  656 cttaatgggataa 668  Q
    |||| | ||||||    
T  14057731 cttagtaggataa 14057743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 556 - 668
Target Start/End: Original strand, 14367659 - 14367771
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccca 655  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||| |||| ||| |||  |||||| |||| |||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| | ||||    
T  14367659 agagaaactattaggaaagatttagaggttaatgcgttcgattcaaatatggtttatgatagaacattatggggtaatttgatccatgtagccaacccca 14367758  T
Q  656 cttaatgggataa 668  Q
    |||| | ||||||    
T  14367759 cttagtaggataa 14367771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 609 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 19119500 - 19119440
Alignment:
Q  609 ttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataaa 669  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  19119500 ttttgatacaacactatgacgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaa 19119440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 336 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 27022057 - 27021993
Alignment:
Q  336 atgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagag 400  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  27022057 atgttgcattggatgtgtgataagactagacaggataggattaaaaatgacaacattagagagag 27021993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 421 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 38135476 - 38135240
Alignment:
Q  421 gaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctgg 520  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||   || || || | |||| |||| |||||||| |||| |     
T  38135476 gaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggacatgtagacagaagaccagtagattttgtagtaagga-gatagatcagatggaggatagtcaga 38135378  T
Q  521 ttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaac 620  Q
    | |  ||||| ||||||| ||||         || ||||||| ||||| ||| ||||||||| | ||||||||||| | |||||| | || ||||||||     
T  38135377 tcattagaggcagatgaagacctagaaaaagtataagagaaactattaaaaaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatgggttatgatagaat 38135278  T
Q  621 actatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccactt 658  Q
    | |||| ||| ||||||||||| |||| || |||||||    
T  38135277 attatggcgtaatttgatccatctagctgaccccactt 38135240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 406 - 477
Target Start/End: Original strand, 12966025 - 12966096
Alignment:
Q  406 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgta 477  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12966025 gtagcacctatagaagaaaagatggtggaaactatgcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacccgta 12966096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 369 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 27893864 - 27893769
Alignment:
Q  369 gataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtaga 464  Q
    ||||||||||  || ||||  |||||||||||| | |||| |||||||||||||| || |||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  27893864 gataggattagaaacgacaatattagagagagttgaggtaacacctatagtagaatagatggtggaaaataggcttaggtggtttgaacatgtaga 27893769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 471
Target Start/End: Original strand, 28020894 - 28021032
Alignment:
Q  335 gatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagaga--gagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggta 432  Q
    |||||||| || |||| ||| ||||||| |||| |||| ||||   ||||| | |||||||||  |||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||     
T  28020894 gatgttgcattagatgtgtgataagactggacatgatatgattcgaaatgataacattagagaaagagttggggtagcacttatcgtagaaaagatggtg 28020993  T
Q  433 gaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaaga 471  Q
    |||| | | ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  28020994 gaaacttggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaga 28021032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 327 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 30200319 - 30200175
Alignment:
Q  327 gagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaag 426  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||   |||| |||||  ||||||| ||||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||    
T  30200319 gagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagattagatgggatatgattagaaatgacaacattagagag--ttagggtaacacctatagtagaaaag 30200222  T
Q  427 ttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
     |||| |||| ||| ||||| || ||| | |||||| | ||||||||    
T  30200221 atggtggaaactaggcttaggtgattttggcatgtaaatagaagacc 30200175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 590 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 30814220 - 30814145
Alignment:
Q  590 agttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggga 665  Q
    ||||||||| ||||||  ||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  30814220 agttggatcgaaatatgttttatgatagaacattatcacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtggga 30814145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 589 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 34926618 - 34926539
Alignment:
Q  589 gagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||   ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  34926618 gagttggatcgaaatatggtttatgatagaacttaatggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagcgggataa 34926539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 26742177 - 26742115
Alignment:
Q  404 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagaga 466  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||| |||||||||||    
T  26742177 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggattaggtggtttgaacatgtagaga 26742115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 468
Target Start/End: Original strand, 38920789 - 38920859
Alignment:
Q  398 gagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagaga 468  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||  |||||||| ||||||||||||    
T  38920789 gagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaagtggtttgggcatgtagagaga 38920859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 668
Target Start/End: Original strand, 45601659 - 45601741
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||| || | |||||| ||||||||    
T  45601659 aatgagttggatcaaaatatgatttatgatagaacactatggtgtaatttgatccatgtagctgaactcacttagtgggataa 45601741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 557 - 642
Target Start/End: Original strand, 35922407 - 35922492
Alignment:
Q  557 gagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccat 642  Q
    |||||| |||||  || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  35922407 gagaaactattaagaaagatttagaggttaatgagttgaatctaaatatgatttatgatagaacattatgacctaatttgatccat 35922492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 325 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 40008779 - 40008698
Alignment:
Q  325 cggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtggggg 406  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | || ||||  ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  40008779 cggagatgaagatgttgcgtaggatgtgtggtaaaactagacaaaaaagaattagaaatgacaacattagagagagttgggg 40008698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 556 - 668
Target Start/End: Original strand, 42187594 - 42187706
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacact-atgacgtcatttgatccatgtagccgatccc 654  Q
    ||||||| |||||| ||  |||||||| | ||| ||||||||| |||| | |||| |||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  42187594 agagaaactattaggaaatatttagagattaattagttggatccaaat-tggtttatgatagaacatttatggcgtaatttgatccatgtagccgacccc 42187692  T
Q  655 acttaatgggataa 668  Q
    ||||| ||||||||    
T  42187693 acttagtgggataa 42187706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 556 - 668
Target Start/End: Original strand, 1011200 - 1011311
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccca 655  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| |||| ||||| |||||||  ||||| ||||  ||||||||| ||||  || |||||||| |||||||||| ||||    
T  1011200 agagaaattattaggaaatatttaaaggttaatgatttggatc-caatatggtttaggatagaacattatggtgtaatttgatctatgtagccgacccca 1011298  T
Q  656 cttaatgggataa 668  Q
    |||| ||||||||    
T  1011299 cttagtgggataa 1011311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 400
Target Start/End: Original strand, 1523747 - 1523811
Alignment:
Q  336 atgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagag 400  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1523747 atgttgcgttgcatgagtgacaagactagacgtgataggattattaatgacaccattagagagag 1523811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 556 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 36239925 - 36239833
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagcc 648  Q
    ||||||| |||||| ||  |||||||| | || |||||||||| ||||||  ||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  36239925 agagaaactattaggaaaaatttagagattaacgagttggatccaaatatgctttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagcc 36239833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 612 - 668
Target Start/End: Original strand, 48515484 - 48515540
Alignment:
Q  612 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  48515484 tgatagtacactatgacgtaatttgatccgtgtagccgaccccacttagtgggataa 48515540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 199
Target Start/End: Original strand, 18637233 - 18637371
Alignment:
Q  59 aagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtat 157  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||  ||  ||| |||||||||| || ||||||||   |||||||||  |||| ||    
T  18637233 aagttggagatcatatcatatcacaagttacacattttaaatatcttaagttgatagtacaaaatgacggggaaataga---agatgtaaaccatcgaat 18637329  T
Q  158 tcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtttt 199  Q
     ||||||| |  |||||||||||| || | |||| |||||||    
T  18637330 ccaagctgagcagttgaaatggaggagtgcctcatgtgtttt 18637371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 199
Target Start/End: Original strand, 18650668 - 18650806
Alignment:
Q  59 aagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtat 157  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||  ||  ||| |||||||||| || ||||||||   |||||||||  |||| ||    
T  18650668 aagttggagatcatatcatatcacaagttacacattttaaatatcttaagttgatagtacaaaatgacggggaaataga---agatgtaaaccatcgaat 18650764  T
Q  158 tcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtttt 199  Q
     ||||||| |  |||||||||||| || | |||| |||||||    
T  18650765 ccaagctgagcagttgaaatggaggagtgcctcatgtgtttt 18650806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 23087694 - 23087603
Alignment:
Q  95 taaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagag 186  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||   |||||||| || ||||||||| | | ||||||||||||| |||||    
T  23087694 taaatctcttgggttcatagtacaaaatgaaggagaaataaaagtgtatgtaaatcattgtattcaagttagatggttgaaatggaaaagag 23087603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 590 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 24177721 - 24177643
Alignment:
Q  590 agttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataaa 669  Q
    |||||| || |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||| | |||||||    
T  24177721 agttgggtccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtca-ttgatccatgtagccaaccccacttagtaggataaa 24177643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 584 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 26741995 - 26741920
Alignment:
Q  584 taaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 659  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| || ||||||||||    
T  26741995 taaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatcaatgtaaccaatcccactta 26741920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 570 - 645
Target Start/End: Original strand, 31859042 - 31859117
Alignment:
Q  570 aaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgta 645  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||| || ||| | ||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  31859042 aaatgatttagaagtcaatgagttggatccaaatttaatttataatagaacactatgacataatttgattcatgta 31859117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 557 - 668
Target Start/End: Original strand, 33103080 - 33103191
Alignment:
Q  557 gagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccac 656  Q
    |||||||||||   || || |||||| | ||||||||| |||  ||||| |||| ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  33103080 gagaaattattttgaaagacttagagattaatgagttgaatcggaatatggtttatgatagaacaccatagcgtaatttgatccatgtagccgaccccac 33103179  T
Q  657 ttaatgggataa 668  Q
    ||| | ||||||    
T  33103180 ttagtaggataa 33103191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 564 - 659
Target Start/End: Original strand, 40415168 - 40415263
Alignment:
Q  564 tattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 659  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||||||  ||| |||| |||| ||||  | | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40415168 tattaggaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatgttttatgattgaaccctatagcttaatttgatccatgtagccgaccccactta 40415263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 581 - 668
Target Start/End: Original strand, 47852265 - 47852352
Alignment:
Q  581 aggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||| ||||||||||||| |||| | || | | |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  47852265 aggttaatgagttggatccaaatgtggtgtatcatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagggggataa 47852352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 21517726 - 21517656
Alignment:
Q  287 ggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggta 357  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||| ||||||||||||| || |||| ||||||    
T  21517726 ggcggttaagaaccaacacgagaataaaataagcataatggatatgatgatgttgcattagatgtgtggta 21517656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 612 - 650
Target Start/End: Original strand, 44951364 - 44951402
Alignment:
Q  612 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccga 650  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44951364 tgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccga 44951402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 473
Target Start/End: Original strand, 16013206 - 16013358
Alignment:
Q  327 gagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtg------ggggtagcacctatagta 420  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||   |    ||||  ||||||| |||||||||||| |      |||||  |||||||||||    
T  16013206 gagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacggaaccaaattagaaatgacaacattagagagagagtgagctggggtgacacctatagta 16013305  T
Q  421 gaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
     ||||  ||||||||| ||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||||    
T  16013306 caaaaaatggtagaaactagacttaggtgatttgggcatgtagtgagaagacc 16013358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 18608319 - 18608199
Alignment:
Q  59 aagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtat 157  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||  ||  ||| |||||||||| || ||||||||   |||||||||  |||| ||    
T  18608319 aagttggagatcatatcatatcacaagttacacattttaaatatcttaagttgatagtacaaaatgacggggaaataga---agatgtaaaccatcgaat 18608223  T
Q  158 tcaagctgggtggttgaaatggag 181  Q
     ||||||| |  ||||||||||||    
T  18608222 ccaagctgagcagttgaaatggag 18608199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 470
Target Start/End: Original strand, 30632954 - 30633035
Alignment:
Q  389 cattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaag 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||  |||| |||  | | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30632954 cattagagagagtcggggtagcacctatcataaaaaaaatggtggaagctcggcttagatggtttgggcatgtagagagaag 30633035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 403 - 472
Target Start/End: Original strand, 35713695 - 35713764
Alignment:
Q  403 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    ||||||| || |||||| |||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  35713695 ggggtaggacatatagttgaaaaaatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 35713764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 138
Target Start/End: Original strand, 5843105 - 5843177
Alignment:
Q  67 gatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaag 138  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||  ||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  5843105 gatcatatcataccacaagttacacgatttaaatattttaggtttataatacaaaacgatgaagaaatcgaag 5843177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 559 - 659
Target Start/End: Original strand, 7220912 - 7221012
Alignment:
Q  559 gaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccactt 658  Q
    ||||||||||  || ||||||||| | |||| |||||||  | ||||| | | |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  7220912 gaaattattaacaaagatttagagattaatgtgttggataaagatataatatgtgatagaaaattatgacatcatttgatccatgtagccaaccccactt 7221011  T
Q  659 a 659  Q
    |    
T  7221012 a 7221012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 320
Target Start/End: Original strand, 15681216 - 15681272
Alignment:
Q  264 atgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagt 320  Q
    |||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15681216 atgttgtatggtatagagtgttgggcggttaagagccaacacgagactcaagtaagt 15681272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 18605427 - 18605359
Alignment:
Q  404 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  18605427 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagac 18605359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 138
Target Start/End: Original strand, 18626559 - 18626639
Alignment:
Q  59 aagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaag 138  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||  ||  ||| |||||||||| || ||||||||||    
T  18626559 aagttggagatcatatcatatcacaagttacacattttaaatatcttaagttgatagtacaaaatgacggggaaatagaag 18626639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 472
Target Start/End: Original strand, 18637563 - 18637631
Alignment:
Q  404 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  18637563 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagac 18637631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 472
Target Start/End: Original strand, 18650997 - 18651065
Alignment:
Q  404 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  18650997 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagac 18651065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 612 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 40139021 - 40138965
Alignment:
Q  612 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||    
T  40139021 tgatagaatattatgacgtcatttgatccatgtagcagaccccacttagtgcgataa 40138965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 335 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 40139268 - 40139133
Alignment:
Q  335 gatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtaga 434  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||  |||| |||||  || |||| |||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||  |||| ||    
T  40139268 gatgttgtgtgggatgtgtggtaagactagacgggataagattagaaaagacaacattagagagagt-cgggtttcacctatagtagaaaatatggtgga 40139170  T
Q  435 aaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaaga 471  Q
    || | | ||||| || | ||| ||||||| |||||||    
T  40139169 aactgggcttaggtgatctgggcatgtagggagaaga 40139133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 621 - 665
Target Start/End: Original strand, 40630652 - 40630696
Alignment:
Q  621 actatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggga 665  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  40630652 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggga 40630696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 368 - 473
Target Start/End: Original strand, 41948479 - 41948586
Alignment:
Q  368 agataggattaagaatgacaccattagag--agagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagag 465  Q
    ||||| |||||  ||||||| ||||||||  ||||| || ||||||| || | |||||||| |||| |||| ||| ||||  |||||||| |||||||||    
T  41948479 agatacgattagaaatgacaacattagagtgagagttggcgtagcacttacaatagaaaagatggtggaaactaggcttaagtggtttgggcatgtagag 41948578  T
Q  466 agaagacc 473  Q
    ||||||||    
T  41948579 agaagacc 41948586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 657
Target Start/End: Original strand, 1569199 - 1569270
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccact 657  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| || | ||| |||||||| |||||| ||| ||||||    
T  1569199 aatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacattacggcgtaatttgatcgatgtagtcgaccccact 1569270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 409 - 472
Target Start/End: Original strand, 7220750 - 7220813
Alignment:
Q  409 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||| | | ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  7220750 gcacctattgtagaaaagatgatagaaacttggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 7220813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 9797995 - 9797917
Alignment:
Q  393 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    ||||||||| |||||||  ||||| ||||||||| |  | |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9797995 agagagagttggggtagtgcctattgtagaaaagattct-gaaaattggcttaggtggtttggacatgtagagagaagac 9797917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 629 - 668
Target Start/End: Original strand, 31005431 - 31005470
Alignment:
Q  629 gtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  31005431 gtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 31005470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 211
Target Start/End: Original strand, 33139006 - 33139077
Alignment:
Q  140 agatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaa 211  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||  | | |||| ||||||| ||||||    
T  33139006 agatgtaaatcatcgtattcatgttgggtgattgaaatggagaagagcttaatgtgtattgtgcgctaagaa 33139077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 668
Target Start/End: Original strand, 33732017 - 33732097
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||  |||| |||||| |||| |||||||||| |||| |   |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  33732017 aatgagtgagatcgaaatatggtttatgatagaacattatggca--atttgatccatgtagccggtcccacttagtgggataa 33732097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 556 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 40391952 - 40391849
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccca 655  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||  | ||| ||||||| | |||||| | || |||||||||| |||| ||| ||||||||||| || |||| ||||    
T  40391952 agagaaactagtaggaatgatttagaaattaataagttggaccgaaatatggcttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatctaaccgacccca 40391853  T
Q  656 ctta 659  Q
    ||||    
T  40391852 ctta 40391849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 362 - 473
Target Start/End: Original strand, 40830183 - 40830293
Alignment:
Q  362 tagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgt 461  Q
    |||||| ||||| ||||  |||||||  |||||| ||||| ||| |||||||||| | ||||||| ||||||||| |   ||||| |||||||| ||||     
T  40830183 tagacatgatagaattagaaatgacaatattagaaagagttggg-tagcacctattgaagaaaagatggtagaaactctacttaggtggtttgggcatga 40830281  T
Q  462 agagagaagacc 473  Q
    ||||||||||||    
T  40830282 agagagaagacc 40830293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 607 - 646
Target Start/End: Original strand, 45558534 - 45558573
Alignment:
Q  607 gtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtag 646  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  45558534 gtttttgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtag 45558573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 600 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 26332958 - 26332908
Alignment:
Q  600 aaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccga 650  Q
    |||||| |||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  26332958 aaatatggtttatgatagaatattatgacgtaatttgatccatgtagccga 26332908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 618 - 668
Target Start/End: Original strand, 28708596 - 28708646
Alignment:
Q  618 aacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  28708596 aacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 28708646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 455 - 493
Target Start/End: Original strand, 33139206 - 33139244
Alignment:
Q  455 gacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaa 493  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  33139206 gacatgtagagagaagacccgcagatgccgttgtaagaa 33139244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 586 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 34341494 - 34341412
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||| | |||||||||| |||| ||| ||| ||||    
T  34341494 aatgagttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgaccaatgtagccgaccccatttagtggaataa 34341412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 574 - 648
Target Start/End: Original strand, 37976406 - 37976480
Alignment:
Q  574 gatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagcc 648  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||| |   ||| |||||||||||||    
T  37976406 gatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggctaaattagatccatgtagcc 37976480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 392 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 47796429 - 47796359
Alignment:
Q  392 tagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgta 462  Q
    |||||||||| || ||| || |||||||||||||| |||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||    
T  47796429 tagagagagttggagtaccaactatagtagaaaaggtggttgaaaataggcgtaggtggtttgggcatgta 47796359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 607 - 668
Target Start/End: Original strand, 4604751 - 4604812
Alignment:
Q  607 gtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||| |||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  4604751 gtttatgatagaacattatggcgtactttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataa 4604812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 556 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 44401254 - 44401164
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagcc 648  Q
    ||||||| |||||  || ||||||||| | || |||||  ||| ||||||  ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  44401254 agagaaactattaagaaagatttagagattaacgagtt--atcaaaatatgttttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagcc 44401164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 371; Significance: 0; HSPs: 160)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 32083427 - 32082776
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||    
T  32083427 gtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagaagtg--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttgcacaatttaaatatc 32083330  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  32083329 ttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaggcaaatgtaaatcatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttctatg 32083230  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  32083229 cgataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctatcagacaacagtcagaccgacaatgttgtatggtacagagtgttgggcggttaagagtcaa 32083130  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagag--agag 400  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  32083129 cacgagagtaaagtatgtgtagcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacagggtaggattaggaatgacaccattagagagagag 32083030  T
Q  401 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatata 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||  || |    
T  32083029 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgcagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtaga 32082930  T
Q  501 tcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatcta 600  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||            ||| |||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |    
T  32082929 tcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagaccta-----------aga-aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggattca 32082842  T
Q  601 aatatagtttttgatagaacactatgac-gtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggga 665  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  32082841 aatatggtttttgatagaacactacggcagtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggga 32082776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Original strand, 1210345 - 1211010
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  1210345 gtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacagtttaaatatc 1210442  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    |||||||  |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  1210443 ttgggtctttcgtacaaaatgatggagaaataaaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatgaagaagagcctgaggtgttttgtg 1210542  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||  ||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  1210543 cgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagttcgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaa 1210642  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt--agagagag 400  Q
    || |||| | |||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  1210643 catgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagag 1210742  T
Q  401 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatata 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  || |    
T  1210743 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtaga 1210842  T
Q  501 tcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatcta 600  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |    
T  1210843 tcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcca 1210942  T
Q  601 aatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||| | || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  1210943 aatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 1211010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Original strand, 8671520 - 8672183
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8671520 gtatatggaatgtaacttcagcagaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccctaagttacacggtttaaatatc 8671617  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    |||||||| |  |||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8671618 ttgggtccttcgtacaaaatgacgaagaaatagaagcagatgtaagtcatcgtattcaagctgggtggttaaaatggagaagagactcaggtgttttgtg 8671717  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| |||| |||| ||||||||||| |  ||||||| |||||| | || ||| |||||||||| |||    
T  8671718 cgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcagacaacagtcagaccggcgttgttgtatggtacgaaatgttggacggttaagagtcaa 8671817  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtg 402  Q
    || |||| | |||||||| || | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8671818 catgagaatcaagtaagtgtagcagagataaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagtg 8671917  T
Q  403 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatc 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||  || |||    
T  8671918 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgtggtaagaagagtagatc 8672017  T
Q  503 aaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaa 602  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  8672018 aaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaa 8672117  T
Q  603 tatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    | | || | ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| | |||||||| | ||||||    
T  8672118 tttggtgtatgatagaacactatagcgtcatttgatccatatagccaaccccacttagtaggataa 8672183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 49348076 - 49347410
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacac-ggtttaaatat 101  Q
    |||||| ||||||||||||| |  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  49348076 gtatatcgaatgtaacttcagcggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacactggtttaaatat 49347979  T
Q  102 cttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgt 201  Q
    ||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49347978 cttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcaggtgtaagccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgt 49347879  T
Q  202 gcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagcca 301  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| ||   | ||||||||||||||| |||| ||  ||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||    
T  49347878 gcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaaaatctatcggacagcagtccgaccaaccttgttgtatggtacgaagtgttgggcggttaagagtca 49347779  T
Q  302 acacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt--agagaga 399  Q
    ||| |||| | |||||||| || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  49347778 acatgagaatcaagtaagtgtagcaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattggagagaga 49347679  T
Q  400 gtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatat 499  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  ||     
T  49347678 gtaggggtagcatctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggtcatgcagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtag 49347579  T
Q  500 atcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatct 599  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||     
T  49347578 atcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc 49347479  T
Q  600 aaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||| | || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  49347478 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 49347410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Original strand, 51601658 - 51602321
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51601658 gtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagta--ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatc 51601755  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    |||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  51601756 ttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagctgggtggtggaaatagagaagagtctcaggtgttttgtt 51601855  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    ||||||||||  ||| |||||| |||||  || ||| |||||||||| |||| ||||| |  ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  51601856 cgataagaaagtaccccttaagttgaaatgaaagttctatcggacagtagtccgaccggcgttgttgtatggtacggagtgttgggtggttaagagtcaa 51601955  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtg 402  Q
    || |||| | |||||||| ||   || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51601956 catgagaatcaagtaagtgtagtagatatgaggatgttgcgttagatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacaccattagagagagtg 51602055  T
Q  403 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatc 502  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||  || |||    
T  51602056 agggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatc 51602155  T
Q  503 aaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaa 602  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | |||||| |||  |||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  51602156 aaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaagggatttagaggtcaatgagttggatccaaa 51602255  T
Q  603 tatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    | | || | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  51602256 tttggtgtatgatagaacatcatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataa 51602321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 51441446 - 51440782
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  51441446 gtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagta--ggtctaccttgaaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacagtttaaatatc 51441349  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    |||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  51441348 ttgggtctttcatacaaaatgacggagaaatagaagcagatctaagccatcatattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaagtgtttt-tg 51441250  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  51441249 cgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccgacgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaa 51441150  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagag--agag 400  Q
    || |||| | |||| ||| || | ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  51441149 catgagaatcaagtgagtgtagcagagatgaggatgttgcattggacgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 51441050  T
Q  401 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatata 500  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||  || |    
T  51441049 tgggggtaacacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccggagatgccgtggtaagaagagtaga 51440950  T
Q  501 tcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatcta 600  Q
     ||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |    
T  51440949 gcaaatggaggagagtcaagttaaaggaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttataggtcaatgagttggatcca 51440850  T
Q  601 aatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||| | || | ||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  51440849 aatttggtgtatgatagaacactacggcgtcatttgattcatgtaaccgaccccacttagtgggataa 51440782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 86 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 30202731 - 30202147
Alignment:
Q  86 tacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaaga 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30202731 tacacggtttaaatatcttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtaagccatcgtattcaagccgggtggttgaaatggagaaga 30202632  T
Q  186 gtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgct 285  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||| |  ||||||  ||||| ||||| |    
T  30202631 gcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacaacagtccgaccggcgttgttgtgtggtacagagtgtt 30202532  T
Q  286 gggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatga 385  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| | |||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  30202531 gggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatga 30202432  T
Q  386 caccattagag--agagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgcc 483  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30202431 caccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaggttggtagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgcc 30202332  T
Q  484 gttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagagg 583  Q
    || || |||||  || |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  30202331 gtggtaagaagagtagatcaaatggacgagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagagg 30202232  T
Q  584 taaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    | ||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  30202231 tcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 30202147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 43241063 - 43240396
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43241063 gtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagta--gatctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatc 43240966  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    |||| ||| |  |||||||||| |||||||| |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43240965 ttggatccttcgtacaaaatgacggagaaatggaagcagatgtaagccatcatattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtg 43240866  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    | ||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| ||||| |  ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  43240865 caataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgtatgatacggagtgttgggaggttaagagtcaa 43240766  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagag----ag 398  Q
    || |||| | |||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    ||    
T  43240765 catgagaatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacgccattagagagagag 43240666  T
Q  399 agtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggata 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||  || || |||||  ||    
T  43240665 agtgggggtagcacctatagtagaaaaattgatagaaaataggcttagatagtttgagcatgtagagagaagacccgtagatgttgtggtaagaagagta 43240566  T
Q  499 tatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatc 598  Q
     |||||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||| ||||       | ||||||||||  ||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  43240565 gatcaaatggaggagagttaagttaaaaaaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttatatgtcaatgagttggatc 43240466  T
Q  599 taaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
     |||| | || | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  43240465 caaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtagccgacctcacttagtgggataa 43240396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 160 - 659
Target Start/End: Original strand, 8391525 - 8392028
Alignment:
Q  160 aagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagacc 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  8391525 aagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagcttaaaggaatgttttatcggacagcagtcagacc 8391624  T
Q  260 gacaatgttgtaa--ggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggta 357  Q
    | |||||| |||   ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8391625 ggcaatgtcgtatatggtacagagtgttgggcggttaagagtcaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaagatgttgtgttggatgagtggta 8391724  T
Q  358 agactagacaagataggattaagaatgacaccattagag--agagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttgg 455  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  8391725 agactacacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggtttagattgtttgg 8391824  T
Q  456 acatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccatt 555  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| |||||||||  |||||| |||||| ||||| ||||       |||||    
T  8391825 acatgtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcatgttaaaggaggtatatgaagacctaagaaaaccatt 8391924  T
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccca 655  Q
     ||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  8391925 cgagaaatcattagaaaagatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttttgatagaatactatggcgtcatttgatccatgtagccaacccca 8392024  T
Q  656 ctta 659  Q
    ||||    
T  8392025 ctta 8392028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 134 - 668
Target Start/End: Original strand, 9592463 - 9592999
Alignment:
Q  134 agaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaa 233  Q
    ||||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |    
T  9592463 agaagcagaggtaagccatcgtattcaagttgggtggttgaaatggagaagagtctcgggtgttttgtgcgataagaaagtaccacttaagttgaaagga 9592562  T
Q  234 aggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatga 333  Q
    | ||| |||||||||  |||||||| |||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||| | |||||||| || | |||||||    
T  9592563 aagttctatcggacaatagtcagactgacgttgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagaatcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatga 9592662  T
Q  334 tgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt--agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggt 431  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9592663 ggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagtttgt 9592762  T
Q  432 agaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggt 531  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  || ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9592763 agaaaataggcttagatgggttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggt 9592862  T
Q  532 agatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtc 631  Q
    ||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| | || | ||||||||||||||  ||||    
T  9592863 agaggaagacctaggaaacctattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttagatttaaatttggtgtatgatagaacactatagcgtc 9592962  T
Q  632 atttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9592963 atttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataa 9592999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 205 - 668
Target Start/End: Original strand, 696069 - 696535
Alignment:
Q  205 ataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaaca 304  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  696069 ataagaaagtaccacttaagctgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagaccggcaatgttgtatggtacggagtgttgggtggttaagagccaaca 696168  T
Q  305 cgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt--agagagagtg 402  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  696169 cgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtg 696268  T
Q  403 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatc 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||    
T  696269 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggcttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatc 696368  T
Q  503 aaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaa 602  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||       ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||    
T  696369 atatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaa 696468  T
Q  603 tatagtttttgatagaacacta-tgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  696469 tatggtttttgatagaacactattggcgtcatttgatcaatgtagccgaccccacttagtgggataa 696535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 137 - 668
Target Start/End: Original strand, 22089826 - 22090361
Alignment:
Q  137 agcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaagg 236  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| || |    
T  22089826 agcagatgtaagtcatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcagatgttttgtgcaataagaaaataccacttaagttgaaaggaaag 22089925  T
Q  237 ttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatga 336  Q
    || ||||||||||||||| ||||| |  ||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| | |||||||| || | ||||||| ||    
T  22089926 ttctatcggacagcagtccgaccggcgttgttgtgtggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagatgagga 22090025  T
Q  337 tgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt----agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggta 432  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22090026 tgctgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattatgaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggta 22090125  T
Q  433 gaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggta 532  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||   || ||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  22090126 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagggagaagacccgtagatgccgtggtaagaaaagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaaggggta 22090225  T
Q  533 gatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtca 632  Q
    || ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | || | |||||||||||||||||||||    
T  22090226 gaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtca 22090325  T
Q  633 tttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  22090326 tttgatccatgtagccgaccccactaagtgggataa 22090361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 199 - 668
Target Start/End: Original strand, 15085728 - 15086187
Alignment:
Q  199 tgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagag 298  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15085728 tgtgcgataagaaagcaccacttaagctgaaaggaaagttctatcagacagcagtcaaaccggcaatgttgtatggtacggagtgttgggcggttaagag 15085827  T
Q  299 ccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt--agag 396  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||  ||||    
T  15085828 ccaacacgagagtaaagtaagtgtagcggagatgaggatgttgcgctggacgagtggtaagactagataggataggattaggaatgacaccattagagag 15085927  T
Q  397 agagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagga 496  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  15085928 agagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagag 15086027  T
Q  497 tatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttgga 596  Q
    || |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||            ||| |||  |||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  15086028 tagatcaaatggaggagagtcagattaaaagaggtagaggaagaccta-----------aga-aaaccattagataggatttagaggtcaatgagttgga 15086115  T
Q  597 tctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  15086116 tccaaatatgatttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataa 15086187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 267 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 34792768 - 34792366
Alignment:
Q  267 ttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagac 366  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||| |||| || | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34792768 ttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacacgagaatcaag-aagtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagac 34792670  T
Q  367 aagataggattaagaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtaga 464  Q
    | |||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  34792669 atgataggattaggaatgaaaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaagtaggcttagatggtttgggcatgtaga 34792570  T
Q  465 gagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaatt 564  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||  || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||      
T  34792569 gagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacc 34792470  T
Q  565 attagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggg 664  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34792469 attagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatggg 34792370  T
Q  665 ataa 668  Q
    ||||    
T  34792369 ataa 34792366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 292 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 4001848 - 4001475
Alignment:
Q  292 ttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccat 391  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  4001848 ttaagagtcaacacgagagtaaagtaagtag--cgaagatgaggatgttgcgctagatgagtggtaagactagacaaaataggattaggaatgacaccat 4001751  T
Q  392 tagagagag--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtt 489  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  4001750 tagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagaggagacccgtagatgccgttgta 4001651  T
Q  490 agaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatg 589  Q
    |||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||       ||||| ||||||  |||| ||| ||||||||||| ||||    
T  4001650 agaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatg 4001551  T
Q  590 agttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggga 665  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  4001550 agttggatccaaatatggtttttgatagaaccctatgacatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtggga 4001475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 37463544 - 37462893
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatac-ccaagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  | |||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  37463544 gtatatggaatgtaacttcagcaaaagccggagt-----tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatactccgagttacacagtttaaatatc 37463450  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||  ||     
T  37463449 ttgagtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcagatgtatatcattgtatttaagctaggtggttgatatggagaagagccttaggtgttaggt- 37463351  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
     |||||||||  ||   ||||| |||||| ||  || |||| |||| |||||||||   |||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||| ||||    
T  37463350 -gataagaaagcactgattaagttgaaaggaaaattctatcagacaacagtcagactagcaatgttgtatggtacagagtgttgggtggttaagaaccaa 37463252  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtg 402  Q
    ||| ||| | ||||  ||| |  |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  37463251 cacaagaatcaagt--gtaga--ggagatgaggatgtttcattggatgagtggtaagactagacaggttaggattaggaatgacaccattagagagagtt 37463156  T
Q  403 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatc 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||| |||||||| |   || |||| ||||  ||||||||||| ||  ||||  || |||    
T  37463155 ggggtagcacctatagtagaaaagacagtagaaaataggcttaggtggtttgggc---tatagagtagacatgtagatgccgtagtacgaagagtagatc 37463059  T
Q  503 aaatggaggagagtctggt-taaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaa 601  Q
    | ||||||||||||| | |  |||||||||||| ||  ||||       | || |||||||  || || |||||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  37463058 agatggaggagagtcggatcaaaaagaggtagaggattacctagaaaaactataagagaaacgatcaggaatgatttagaggttaatgagtttgatc-aa 37462960  T
Q  602 atatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||| |||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  37462959 atatggtttatcatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 37462893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 60 - 440
Target Start/End: Original strand, 19936175 - 19936551
Alignment:
Q  60 agttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaa-tgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtat 157  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  19936175 agttggagatcatatcataccccaagttacatggtttaaatatcttgggtccataatacaaaaatgaaggagaaatagaagcatatgtaaatcatcgtat 19936274  T
Q  158 tcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcaga 257  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| || |||||||||  ||| |||||  |||||| ||  || |||||||||||||| |||    
T  19936275 tcaagctgggtggttgaaatggataagaacctcaagtgttttatgtgataagaaagtaccgcttaaaatgaaaggaaaattatatcggacagcagttaga 19936374  T
Q  258 ccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggta 357  Q
    ||  ||||||| || ||||  ||||| ||||||||||||| |||||| |||| | || |||| ||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  19936375 ccagcaatgttatagggtatagagtgttgggcggttaagaaccaacatgagaatcaaataagcatagcggagatgagaatgttgtgttggatgagtggta 19936474  T
Q  358 agactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 440  Q
    ||||||||   ||||||| || ||||||||||      ||||||  ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  19936475 agactagatgggataggaataggaatgacacc------gagagttagggtagcacctatagcaaaaaagatggtagaaaatag 19936551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 285 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 32231356 - 32230997
Alignment:
Q  285 tgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatg 384  Q
    |||||||||||| | |||||||||| | |||||||| ||   ||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  32231356 tgggcggttaagggtcaacacgagaatcaagtaagtgtagtagagatgaggatgttgcgctagatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatg 32231257  T
Q  385 acaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgc 482  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  32231256 acaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatgc 32231157  T
Q  483 cgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagag 582  Q
    |||  | |||||  || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  32231156 cgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagag 32231057  T
Q  583 gtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccat 642  Q
    || ||||||||||||| |||  | || | |||||||||||||||  || |||||||||||    
T  32231056 gtcaatgagttggatccaaagttggtctatgatagaacactatggtgtaatttgatccat 32230997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 34827784 - 34827307
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  | |   ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  34827784 gtatatggaatgtaacttcatcaaaagaagaagtg--gtcccatgatggaggtgaaagtgggagatcatatcataccctaagttacaaggtttaaatatc 34827687  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  34827686 ttgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaaatcattgtattcaagttgaatggttgaaatggagaagagcctcatgtgttttatg 34827587  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
     |||||||||  ||  |||||  |||||| ||  || ||| ||||| |||||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||| ||||    
T  34827586 tgataagaaagtactgcttaaattgaaaggaaaattatattggacaacagtcagatcaacgatgttgtatggtacagagtgttgttcggttaagaaccaa 34827487  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtg 402  Q
    ||||| |   || ||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||  ||||||     |  |||||||     
T  34827486 cacgaaaaacaaataagtgtaactgagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacgatataagattagaaatgactattatgtagagagtt 34827387  T
Q  403 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgc 482  Q
    |||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  34827386 ggggtagcgcatatagaagtaaagatggtagaaaataggcttctttggtttggacatgtaaagagaagaccgatagatgc 34827307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 393 - 668
Target Start/End: Original strand, 4029112 - 4029387
Alignment:
Q  393 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttaga 492  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  4029112 agagagagtgggggtagcacctagagtagacaagttggtagaaaataggcttagaaggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 4029211  T
Q  493 aggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagt 592  Q
    || ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| |||||| |||| |||||||    
T  4029212 agaatagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagt 4029311  T
Q  593 tggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||| |||| | || | ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  4029312 tggatccaaatttggtgtatgatataacactatggcgacatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 4029387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 251 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 38808106 - 38807688
Alignment:
Q  251 agtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatg 350  Q
    |||| ||||| | |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||    |||||| | |||||||  |  |||| |||| ||||||| |||||||     
T  38808106 agtccgaccggcgatgttgtacggtacagagtgttgggaggttaagagc----acgagaattaagtaagcgtggcggatatgaggatgttgtgttggat- 38808012  T
Q  351 agtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagag------tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtctt 444  Q
    ||||||||||| ||||  ||||| ||||  ||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38808011 agtggtaagaccagacgggatagaattagaaatgacaccattagagagagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt 38807912  T
Q  445 agatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctn 544  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||  || | || ||||||||||||| | | ||||||| |||  ||| ||||     
T  38807911 agatggtttaggcatgtaaagagaagacccttagatgccgtcgtaagaagagtagaccagatggaggagagtcagatcaaaagagctaggggaagaccta 38807812  T
Q  545 nnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgt 644  Q
          | || |||||||  |||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  38807811 agaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaacgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgttccatgt 38807712  T
Q  645 agccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||| |||||||| ||||||||    
T  38807711 agccgaccccacttagtgggataa 38807688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 421 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 25979495 - 25979248
Alignment:
Q  421 gaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctgg 520  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  || ||| |||||||||||||| ||    
T  25979495 gaaaagttagtagaaactaggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgctgttgtaaggagagtagatcgaatggaggagagtcagg 25979396  T
Q  521 ttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaac 620  Q
    |||||||||||||| ||| |||        | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  25979395 ttaaaagaggtagaggaagacccatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaac 25979296  T
Q  621 actatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  25979295 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 25979248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 45 - 250
Target Start/End: Original strand, 27445537 - 27445743
Alignment:
Q  45 taccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagat 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27445537 taccttgcaggtgaaagttggagatcttatcataccccaagttacacggtttaattatgttgggtccatagtacaaaatgatggagaaatagaagcagat 27445636  T
Q  144 gtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatc 243  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |  ||||||| || |||||||||  |||||||||  |||||| || ||| ||||    
T  27445637 gtaaatcatcgtattcaagttggttggttgaaatggagaagagttccgagtgttttatgtgataagaaagtaccacttaaattgaaaggaaagttctatc 27445736  T
Q  244 ggacagc 250  Q
    || ||||    
T  27445737 gggcagc 27445743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 284 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 18469483 - 18469099
Alignment:
Q  284 ctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaat 383  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||   || ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  18469483 ctgggcggttaagaaccaacacgagaatcaagtaaacgtagcggagatgacgatgctgcgttgtatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaat 18469384  T
Q  384 gacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgcc 483  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||  |||| | |||||||||| ||| ||||||||  |||||||      
T  18469383 gacacaattagagagagttggggtaacacctatagtagagaagatgatagaaaataggattaggtagtttggacatatagtgagaagactggtagatgtt 18469284  T
Q  484 gttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagagg 583  Q
    || ||  ||||  || |||| |||||| |||||| | | |||||||||||||||| || |         || ||||||| | |||| ||  ||| |||||    
T  18469283 gtagtacgaagagtaaatcagatggagaagagtcggatcaaaagaggtagatgaagacttagaaaaattataagagaaacttttaggaaatattaagagg 18469184  T
Q  584 taaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||| ||||  || ||||| | ||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  18469183 tcaatgagttggatacaaatatagtttatgatcgaacattatggtgtaatttggttcatgtagacgaccccacttagtgggataa 18469099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 500 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 37311940 - 37311775
Alignment:
Q  500 atcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatct 599  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||       ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||     
T  37311940 atcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggtagacctaggaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcc 37311841  T
Q  600 aaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggga 665  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  37311840 aaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggga 37311775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 43 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 32066913 - 32066761
Alignment:
Q  43 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacccaagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcaga 142  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||  |||||||| ||||| |    
T  32066913 tctaccttagaggtgaaaattggagatcatatcatac--aagttacacagtttaaatattttgggttcatagtacaaaatgacagagaaataaaagcaaa 32066816  T
Q  143 tgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtt 197  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  32066815 tgtaaatcatcgtattcaagttggatggttaaaatggagaagagcctcaggtgtt 32066761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 327 - 482
Target Start/End: Original strand, 9509240 - 9509397
Alignment:
Q  327 gagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtg--ggggtagcacctatagtagaaa 424  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  9509240 gagatgaggatgttgtgttggatgagtgataagactagacaggatatgattagaaatgacaccattagagagagagttggggtagcacctatagtagaaa 9509339  T
Q  425 agttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgc 482  Q
    || ||||| ||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  9509340 agatggtaaaaaataggcttaggtagtttgggcatgtagagagaagaccggtatatgc 9509397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 240 - 668
Target Start/End: Original strand, 39140349 - 39140780
Alignment:
Q  240 tatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 339  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| |||| ||||| ||||||| ||| || || | | |||||||  ||   ||||||| |||||    
T  39140349 tatcggacagcagtcagaccggtgatgttgtatggtacg-agtgttgggcagttaagaaccatcatgaaaatcaagtaagcgtagtagagatgaggatgt 39140447  T
Q  340 tgcgttggatgagtggtaa-------gactagacaagataggattaagaatgacaccatta--gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttgg 430  Q
    |||||||||||||||||||       |||||||  ||||||||||| |||||| |||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    
T  39140448 tgcgttggatgagtggtaactggtaagactagatgagataggattaggaatgaaaccattacagagagagttggcgtagcacctatagtagaaaagatgg 39140547  T
Q  431 tagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagagg 530  Q
     | ||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||  || |||  || ||  ||||  || |||| ||||| ||||||| | ||| ||||||    
T  39140548 caaaaaattggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagaccgatacatgttgtagtacgaagagtagatcagatggatgagagtcagattagaagagg 39140647  T
Q  531 tagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgt 630  Q
    |||| |||   ||         ||  |||||| |||||| ||  |||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||  ||||||||| |||| |||    
T  39140648 tagaggaa---ctaaaaaagttat--gagaaactattaggaaaaatttagaggttaattagttggatccaaatatggtttcagatagaacattatggcgt 39140742  T
Q  631 catttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
     ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  39140743 aatttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataa 39140780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 115 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 46226853 - 46226549
Alignment:
Q  115 tacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaa 214  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||| || | |||||||      
T  46226853 tacaaaatgatggagaaacaaaagcagatgtaaat-attgtattcaagttggatggttgaaatggagaagagcatcaagtgttttatgtgctaagaaagt 46226755  T
Q  215 accacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaa 314  Q
    |   |||||| |||||||||  || |||| |||| | |||| |  ||| |||||||| |||||| | || || ||  |||| | ||||||||||| | ||    
T  46226754 agtgcttaagttgaaagaaaaattctatcagacaactgtcatagtgacgatgttgtatggtacgaaatgttgagcaattaacaaccaacacgagaatcaa 46226655  T
Q  315 gtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacct 414  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||| ||| |||||  |||  |||||||||||   |||||||| |    
T  46226654 gtaagtttagcggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtgagactagacgtaatagaattgagaataccactgttagagagagttatggtagcactt 46226555  T
Q  415 atagta 420  Q
    ||||||    
T  46226554 atagta 46226549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 58 - 401
Target Start/End: Original strand, 51234267 - 51234611
Alignment:
Q  58 aaagttggagatcatatcatacccaagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtat 157  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| ||  |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||    
T  51234267 aaagttggagatcatatcataaacaagtttcatagtttaaatatcttgagtccatagtgcaaaatgatggagaaattgaagcagatgtaaatcatcaaat 51234366  T
Q  158 tcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcaga 257  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||| || |||| ||||  ||| || ||| |||| | ||  ||| ||| | |||| || | |    
T  51234367 tcaagttgggtggttgaaatggagaatagcctcaggtcttttatgtgatacgaaagcaccgctcaagttgaagggaaaatttgatcagtcagctgtaaaa 51234466  T
Q  258 ccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggta 357  Q
    ||| |||| ||||| || ||  | || ||||| || |||| ||||||||  | |||| || |  ||| | |||||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  51234467 ccggcaattttgtacggaacaaaatgttgggcagtaaagaaccaacacgcaaataaaataggcgtaaggtagatgaggatgttgtgttggacgtgtggta 51234566  T
Q  358 agact-agacaagataggattaagaatgacaccattagagagagt 401  Q
    ||||| | ||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||    
T  51234567 agactaaaacatgataggattagaaattacaacattagagagagt 51234611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 164 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 9599917 - 9599432
Alignment:
Q  164 tgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgaca 263  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||| || |||||||||  ||| ||| || |||||  ||  || |||| ||| |||||||||||  |     
T  9599917 tgggtggtttaaatggataagagcctcaagtgttttatgtgataagaaagtaccgcttcagttgaaatgaaaattctatcagaccgcagtcagaccagcg 9599818  T
Q  264 atgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagacta 363  Q
    |||| ||| | |||  |||| || |||||| ||| ||||||| | | | |||||||  || | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9599817 atgtggtatgatacaaagtgttgtgcggttgagaaccaacacaataatcaagtaagcgtagcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagacta 9599718  T
Q  364 gacaagataggattaagaatgacaccattagag--agagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgt 461  Q
    |||  |||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| || ||| |    
T  9599717 gacgggatatgattaggaatgacatcattagagagagagttggagtaacacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggttcgggcatat 9599618  T
Q  462 agagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaa 561  Q
    | | ||| |||| | |||||   | ||   |||  || |||| ||||||||||||| | | | |||||||||| ||| ||||       | |  ||||||    
T  9599617 aaatagatgacctgcagatgttatagtacaaagagtagatcagatggaggagagtcagatcataagaggtagaggaagacctagaaaaactacaagagaa 9599518  T
Q  562 attattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagc 647  Q
    | |||||| ||  |||||||| | |||||||| |||| | |||| |||| |||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||    
T  9599517 actattaggaaatatttagagtttaatgagtttgatccagatatggtttatgatagaacgttatggcgtaatttgatccatgtagc 9599432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 336 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 27848155 - 27847947
Alignment:
Q  336 atgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggtag 433  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||| |||||||||||||||| |  | |||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  27848155 atgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggat-aggaataacaccattagagagagagttgtggtagcacctgtggtagaaaagatggtag 27848057  T
Q  434 aaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtag 533  Q
    ||||||  ||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| || ||  ||||  ||||||| ||||||||||||| | | | |||||||||    
T  27848056 aaaataagcttaggtggtttgggcatgcagagagaagacctgtagatgctgtagtatgaagagtatatcagatggaggagagtcagctcagaagaggtag 27847957  T
Q  534 atgaaaacct 543  Q
    | ||| ||||    
T  27847956 aggaagacct 27847947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 53 - 194
Target Start/End: Original strand, 7921574 - 7921716
Alignment:
Q  53 aggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaatta 151  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||  |    
T  7921574 aggtgaaagttggagatcatatcttaccacaagttacacgatttatatatcttggatccatagtacaaaacgattgagaaatagaaggagatgtaaacca 7921673  T
Q  152 tcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggt 194  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||||||||  || |||||||||    
T  7921674 tcgaattcaagttgggttgttgaaatggatgagggtctcaggt 7921716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 466 - 668
Target Start/End: Original strand, 39318193 - 39318393
Alignment:
Q  466 agaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaatta 565  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||   | |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||       | || |||||||  |    
T  39318193 agaagacccgtagatgc-gtcgtaagaagagcagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaacca 39318291  T
Q  566 ttagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggga 665  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  39318292 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccga-cccgcttagtggga 39318390  T
Q  666 taa 668  Q
    |||    
T  39318391 taa 39318393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 199
Target Start/End: Original strand, 28528227 - 28528375
Alignment:
Q  52 gaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaatt 150  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||| || ||||||      
T  28528227 gaggtgaaagttggagatcatagcataccacaagttacacagtttaaatatcttgggtctatgttacaaaacaatggagaaatagaaggaggtgtaaacc 28528326  T
Q  151 atcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgtttt 199  Q
    |||| || | ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||    
T  28528327 atcgaatccgagctgggtggttgaaattgaggagtgcctcaggtgtttt 28528375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 43 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 35829038 - 35828894
Alignment:
Q  43 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcag 141  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| | | ||||| |||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||     
T  35829038 tctaccttggaggtgaaagctagagatcatatcataccacaagttacgctgcttaaacatcttgggtccatagtacaaagcgacggagaaatagaagcat 35828939  T
Q  142 atgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagag 186  Q
    |||||||| |||| |||| | ||| |||||||||||||| |||||    
T  35828938 atgtaaatcatcgaattcgatctgtgtggttgaaatggaaaagag 35828894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 519 - 668
Target Start/End: Original strand, 52921196 - 52921345
Alignment:
Q  519 ggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgataga 618  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||       | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||| |||||||    
T  52921196 ggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgaattggatccaaatatggtttatgataga 52921295  T
Q  619 acactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  52921296 acactattgcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 52921345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 243 - 473
Target Start/End: Original strand, 1661264 - 1661500
Alignment:
Q  243 cggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgc 342  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||||| || |  ||| | |||||||| || | ||||||||||| |||| |||| ||| | ||||||| |||||||     
T  1661264 cggacagcagtaagaccaacgatattgtatgggatagagcgttgggcggtgaaaaaccaacacgagaataaaataagcatagcagagatgaagatgttgt 1661363  T
Q  343 gttggatgagtggtaagactagacaagataggattaa----gaatgacaccatt--agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 436  Q
    |||| |||  || ||||||||||   ||||||||||     ||||||||  |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1661364 gttgaatgtctgataagactagatgtgataggattagaaatgaatgacaatatttgagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaa 1661463  T
Q  437 atagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    |||| || ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1661464 ataggctcagatggtttgagcatgtagagagaagacc 1661500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 335 - 472
Target Start/End: Original strand, 43423647 - 43423788
Alignment:
Q  335 gatgttgcgttggatgagtggt--aagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtg--ggggtagcacctatagtagaaaagttgg 430  Q
    |||||||||||||||| ||||   ||||||||||| ||||||||||  ||||||  |||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||| |||    
T  43423647 gatgttgcgttggatgtgtgggggaagactagacaggataggattagaaatgaccacattagagagagagttggggtaacacctatagtagaaaagatgg 43423746  T
Q  431 tagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  43423747 tggaaactaggcttaggtggtttggccatgtagagagaagac 43423788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 177
Target Start/End: Original strand, 6640772 - 6640898
Alignment:
Q  52 gaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaatt 150  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||      
T  6640772 gaggtgaaagttagagatcatattacaccacaagttacacggtttaaatatcttgagtctatagtacaaaattatggagaaatagaaggaggtgtaaacc 6640871  T
Q  151 atcgtattcaagctgggtggttgaaat 177  Q
    || | || |||| ||||||||||||||    
T  6640872 attggatccaagttgggtggttgaaat 6640898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 237 - 472
Target Start/End: Original strand, 40419471 - 40419708
Alignment:
Q  237 ttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatga 336  Q
    |||||| ||||| | || ||| |||| |||||||| || || ||||| |||| ||| |||| |||||||||   |||||||||| || | ||||||| ||    
T  40419471 ttttataggacatcggtaagatcgacgatgttgtacggaacagagtgttgggtggtaaagaaccaacacgaacataaagtaagtgtagcagagatgagga 40419570  T
Q  337 tgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt--agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtaga 434  Q
    || ||||||| |||  |||||| ||||||  |||||| ||||  ||||||| ||||  ||||||||| ||||||| || |||||||||| || ||||||     
T  40419571 tggtgcgttgaatgtatggtaaaactagatgagatagaattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagaacttatagtagaatagatggtagt 40419670  T
Q  435 aaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    || ||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  40419671 aactagacttaagtggtttgggcatgtagagagaagac 40419708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 56 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 52740098 - 52739965
Alignment:
Q  56 tgaaagttggagatcatatcatacccaagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgt 155  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||| ||||  | ||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||| | ||| |    
T  52740098 tgaaagttggagatcatatcatgcttaagttgcacggtttgaatattttggacctatagtacaaagtgacggagaaatagaagtagatgtaagtcatctt 52739999  T
Q  156 attcaagctgggtggttgaaatggagaagagtct 189  Q
    | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  52739998 actcaagttggatggttgaaatggagaagagtct 52739965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 393 - 473
Target Start/End: Original strand, 2544589 - 2544669
Alignment:
Q  393 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2544589 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaacagacttaggtggtttggacatgtagagagaagacc 2544669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 510 - 650
Target Start/End: Original strand, 4415455 - 4415596
Alignment:
Q  510 ggagagtctggttaaaaga-ggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagt 608  Q
    |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||       ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |    
T  4415455 ggagagtcaggttaaaaaaaggtagaggaaaacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatctaaatatgat 4415554  T
Q  609 ttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccga 650  Q
    |||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  4415555 tttttatagaacattatggcatcatttgatccatgtagccga 4415596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 567 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 46423331 - 46423233
Alignment:
Q  567 tagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggat 666  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||   ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  46423331 tagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgattgaac---atggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggat 46423235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 567 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 4707338 - 4707238
Alignment:
Q  567 tagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggat 666  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  4707338 tagaaaggatttagaggttaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtaatttgat-catgtagccgaccccacttagtgggat 4707240  T
Q  667 aa 668  Q
    ||    
T  4707239 aa 4707238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 343 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 14226171 - 14226047
Alignment:
Q  343 gttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtc 442  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  |||| || |||| |||||||| |  |||||||||||  |||||||| |||| |||||||| |    
T  14226171 gttggatgtgtggtaaggctagacatgataggattagaaatggcaacattggagagagttgcagtagcacctatcatagaaaagatggtggaaaataggc 14226072  T
Q  443 ttagatggtttggacatgtagagag 467  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  14226071 ttaggtggtttgggcatgtagagag 14226047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 348 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 52561950 - 52561843
Alignment:
Q  348 atgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagag--agagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtctta 445  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||| | || |||||||||| ||||    
T  52561950 atgagtggtaagactagacgggatatgattaggaatgacaccattagagagagagttggggtagcacctttagtagaaatgatgatagaaaataggctta 52561851  T
Q  446 gatggttt 453  Q
    | ||||||    
T  52561850 ggtggttt 52561843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 404 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 32404807 - 32404543
Alignment:
Q  404 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatca 503  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |  | || || ||  || |  |    
T  32404807 gggtaacacctatagtaaaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggatatgtagagagaagacctgtagattctatagtaaggagagtagagaa 32404708  T
Q  504 aatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaat 603  Q
     |||||||| ||||   | | |||||||||| ||| ||||       | || ||||||| |||||| || ||||||||| | ||||||||  ||| |||     
T  32404707 gatggaggatagtcatatcacaagaggtagaggaagacctacaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttaaatccaaac 32404608  T
Q  604 atagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    || |||| ||||| ||||  ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  32404607 atggtttatgatataacataatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 32404543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 433 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 52561841 - 52561606
Alignment:
Q  433 gaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggta 532  Q
    |||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||  ||||||  |  ||  ||||  || |||| ||||||||||||  | ||| ||||||||    
T  52561841 gaaaataggcttaggtggtttcggcatgtagagagaagaccgatagatgttgcagtacgaagagtagatcagatggaggagagttagattagaagaggta 52561742  T
Q  533 gatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtca 632  Q
    || ||| || |       | || ||||||| | |||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  | ||||||| |||| ||  |    
T  52561741 gaggaagacttagaaaaactataagagaaactgttaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttcgggtagaacattatggcgaaa 52561642  T
Q  633 tttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  52561641 tttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 52561606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 12807732 - 12807587
Alignment:
Q  43 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcag 141  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||| |||||| || |||| || | |||||||||||| |    
T  12807732 tctaccttagaggtgaaagttgaggatcgtatcatactacaagttacacaatttaaatatcttggatccatagtataaaacgacgaagaaatagaagctg 12807633  T
Q  142 atgtaaattatcgtattcaagctgggtgg-ttgaaatggagaagag 186  Q
    |||||||| |||| ||| |  || ||||| ||||||||||||||||    
T  12807632 atgtaaatcatcgaatttattctaggtggtttgaaatggagaagag 12807587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 330 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 18793345 - 18793201
Alignment:
Q  330 atgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt--agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagt 427  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||  ||||  |||||| || ||||||| || ||| |||||||||     
T  18793345 atgatgatgttgcgttggatgtgtggaaagactagacaggatagaactaaaaatgacgacattaaagagagggttggggtaggacttattgtagaaaaga 18793246  T
Q  428 tggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    ||||||||| ||| ||||| || ||| | |||| |||||||||||    
T  18793245 tggtagaaactagacttagttgattttggcatgcagagagaagac 18793201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 575 - 668
Target Start/End: Original strand, 41560401 - 41560494
Alignment:
Q  575 atttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |||||| | || |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  41560401 atttagagattaatgagttggatccaaatatgggttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 41560494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 564 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 10200427 - 10200323
Alignment:
Q  564 tattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgg 663  Q
    ||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  |||  || ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  10200427 tattagaaaagatttagagatcgatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacatcatggtgtaatttgatccatgtagccgacctcacttaatgg 10200328  T
Q  664 gataa 668  Q
    |||||    
T  10200327 gataa 10200323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 280 - 473
Target Start/End: Original strand, 26016312 - 26016507
Alignment:
Q  280 agtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaa 379  Q
    |||| |||||||| |||| |||||| ||   |||||||||  || | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||     
T  26016312 agtgttgggcggtaaagaaccaacaagaacataaagtaagcgtagcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacaggatataattat 26016411  T
Q  380 gaatgacaccatt--agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
     ||| |   ||||  ||||||||| |||||| ||||||||  ||||||| ||||||||| |||  |||| ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  26016412 aaataatggcattagagagagagttggggtaacacctatatgagaaaagatggtagaaactagatttaggtggtttgggtatgtagaaagaagacc 26016507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 612 - 668
Target Start/End: Original strand, 28533676 - 28533732
Alignment:
Q  612 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  28533676 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 28533732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 553 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 32079307 - 32079194
Alignment:
Q  553 attagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatc 652  Q
    ||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||  || |||||||||||| |||||||||| |    
T  32079307 attagagaaaccatcagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatctggtttatgatagaacac--tggcgtcatttgatcgatgtagccgacc 32079210  T
Q  653 ccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||  ||||||||    
T  32079209 ccacttggtgggataa 32079194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 574 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 43375709 - 43375614
Alignment:
Q  574 gatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataaa 669  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | |||||| |||  |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  43375709 gatttagagattaatgagttggaccgaaatatggttcatgatagaacattatgacataatttgatccatgtagccaatcccacttagtgggataaa 43375614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 575 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 24020377 - 24020284
Alignment:
Q  575 atttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||  ||||||||    
T  24020377 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgcagccaaccccactttgtgggataa 24020284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 403 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 48431688 - 48431619
Alignment:
Q  403 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  48431688 ggggtagcccctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 48431619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 187
Target Start/End: Original strand, 52421067 - 52421210
Alignment:
Q  43 tctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcag 141  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||  || ||||||| ||   ||||||| |||||     
T  52421067 tctaccttataggtgaaagttagagatcatatcatgccacaagttacaag-tttaaatagcttgggtctttagtacaaaa-gacatagaaataaaagcat 52421164  T
Q  142 atgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagt 187  Q
    |||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  52421165 atgttaatcatcgaattcaagttgggtggttgaaatagagaagagt 52421210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 556 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 52532745 - 52532636
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccca 655  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||  | ||||||||||| | |||||| |||| |||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  52532745 agagaaactattaggaaagatttagaaattaatgagttggaacaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagccgacccca 52532646  T
Q  656 cttaatggga 665  Q
    |||| |||||    
T  52532645 cttagtggga 52532636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 612 - 668
Target Start/End: Original strand, 29577461 - 29577517
Alignment:
Q  612 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  29577461 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 29577517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 617 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 3777328 - 3777277
Alignment:
Q  617 gaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  3777328 gaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtaggataa 3777277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 471
Target Start/End: Original strand, 4379927 - 4380081
Alignment:
Q  327 gagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagaga----------gtgggggtagcacctat 416  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||          || ||||||||| ||||    
T  4379927 gagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagaaaagatatgattagaaatgacaacattagagagagagagtgagtgttggggtagcaactat 4380026  T
Q  417 agtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaaga 471  Q
    |||||||||| |||| |||| ||   |||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  4380027 agtagaaaagatggtggaaactaaggttaggtggtttatacatgtagagagaaga 4380081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 13828012 - 13827929
Alignment:
Q  390 attagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  13828012 attagagagatttggggcagcacctatagtagaaaagatggtggaaactagggttaggtggtttgaacatgtagagagaagacc 13827929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 16822376 - 16822234
Alignment:
Q  330 atgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttg 429  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||  |||||  |||||  || ||| || ||  ||||| ||| ||    
T  16822376 atgaggatgttgtgttggatgtgtggtaatactagataagataggattagaaatgacagtattagtaagagttaggatagaacttac-gtagacaagatg 16822278  T
Q  430 gtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    ||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16822277 gtagaaactcggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacc 16822234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 593 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 28090786 - 28090711
Alignment:
Q  593 tggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  28090786 tggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 28090711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 586 - 668
Target Start/End: Original strand, 6025788 - 6025870
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||  |||||| || | ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  6025788 aatgagttggatagaaatatggtatctgatagaacatgatggcgtcatttgatccatgtagccgattccacttagtgggataa 6025870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 553 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 28511933 - 28511819
Alignment:
Q  553 attagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatc 652  Q
    ||||||||||||| ||| || || || ||| | ||||||||||| | ||| || |||| |||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||| |    
T  28511933 attagagaaattactaggaaagacttggagattaatgagttggaccaaaacatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatcaatgtagccgacc 28511834  T
Q  653 ccacttaatgggata 667  Q
    ||||||| |||||||    
T  28511833 ccacttagtgggata 28511819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 586 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 40568509 - 40568427
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||| | |||||| |||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  40568509 aatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaaaactatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataa 40568427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 395 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 52073753 - 52073675
Alignment:
Q  395 agagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa-tagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52073753 agagagttggggtagcacctattgtagaaaagatggtaaaaaactcggcttaggtggtttggacatgtagagagaagac 52073675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 229
Target Start/End: Original strand, 21275588 - 21275725
Alignment:
Q  92 gtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctca 191  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||| ||  |||| ||| |||  ||||||||| || | || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  21275588 gtttaaatatcttgggtcgatagtgcaaaacgacagagatataaaagttgatgtaaatcattgaatccaagctgagtggttgaaataaagaagagtctca 21275687  T
Q  192 ggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaa 229  Q
     ||| ||| |  |||||||||  |||||||||||||||    
T  21275688 tgtgctttatttgataagaaagtaccacttaagctgaa 21275725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 595 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 21769801 - 21769728
Alignment:
Q  595 gatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  21769801 gatctaaatatggtttgtgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgtgataa 21769728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 105
Target Start/End: Original strand, 40419328 - 40419381
Alignment:
Q  53 aggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  40419328 aggtgaaagttggagatcatatcataccacaagttacacagtttaaatatcttg 40419381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 607 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 44941854 - 44941793
Alignment:
Q  607 gtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  44941854 gtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 44941793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 46226956 - 46226887
Alignment:
Q  44 ctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccca-agttacacggtttaaatatcttgggtccat 112  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46226956 ctactttggaggtgcaagttggagatcataccataccttgagttacacggtttaaatatcttgggtccat 46226887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 556 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 7762566 - 7762454
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccca 655  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||  || |||||||  ||||| ||| |  ||    
T  7762566 agagaaactattagaaaagatttagatgttaatgagttggatctaaatatggtttataatagaacattatggtgtaatttgatttatgtaaccgtttaca 7762467  T
Q  656 cttaatgggataa 668  Q
    |||||| ||||||    
T  7762466 cttaataggataa 7762454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 600 - 668
Target Start/End: Original strand, 29808053 - 29808121
Alignment:
Q  600 aaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  29808053 aaatatggtttttgataaaacactatggcgacatttgattcatgtagccgattccacttagtgggataa 29808121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 393 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 35828842 - 35828762
Alignment:
Q  393 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    |||||||||  | ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  35828842 agagagagtttgagtagcacctatggtagaaaagatggtggaaaatagggttaggtggtttggacgtgtagagagaagacc 35828762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 393 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 36340095 - 36340015
Alignment:
Q  393 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  |||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  36340095 agagagagttggtgtagcacctatattagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttagacatggagagagaagacc 36340015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 612 - 668
Target Start/End: Original strand, 44751693 - 44751749
Alignment:
Q  612 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  44751693 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataa 44751749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 325 - 642
Target Start/End: Original strand, 52831968 - 52832284
Alignment:
Q  325 cggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 424  Q
    ||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||| |  |  |||||||||| | || |||| ||||| ||||||| ||||||| | ||| ||||||||    
T  52831968 cggagatgaggatgt-gtgttgaatgagtggtaagatttaatgagataggattcaaaaagacatcattaaagagagttggggtagtagctacagtagaaa 52832066  T
Q  425 agttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaa 524  Q
    || || || ||||||   |||| |||||||| |||||  ||||||||||  ||||||  |||||    ||  || || | |||||||||||||   |||     
T  52832067 agatgatacaaaataaatttaggtggtttgggcatgttaagagaagaccgatagatgttgttgtacagagagtagataagatggaggagagtcgtattag 52832166  T
Q  525 aagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacacta 624  Q
    || ||||||| ||| ||||       |||  ||||||| ||||||||| |||||||||||  || ||||| ||  |||||| ||||  ||||||||| ||    
T  52832167 aataggtagaggaatacctagaaaaaccaaaagagaaagtattagaaaagatttagaggttgataagttgaatacaaatattgtttcagatagaacatta 52832266  T
Q  625 tgacgtcatttgatccat 642  Q
    |||||| |||||||||||    
T  52832267 tgacgtaatttgatccat 52832284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 613 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 38877415 - 38877360
Alignment:
Q  613 gatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  38877415 gatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgaacccacttagtgggataa 38877360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 480
Target Start/End: Original strand, 40416361 - 40416448
Alignment:
Q  393 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagat 480  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||  || ||||| |||||| | ||||||||||||||| | ||||||    
T  40416361 agagagagttggagtagcacctatagtagaaaagatggtggaaacgaggcttaggtggtttaggcatgtagagagaagaactgtagat 40416448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 177
Target Start/End: Original strand, 3877495 - 3877621
Alignment:
Q  52 gaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaatt 150  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||  | ||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| |     
T  3877495 gaggtaaaaattggagattatatcatttcacaaattacacaatttaaatatcatgggtccataatataaaacgatggagaaatagaagcaaatataattc 3877594  T
Q  151 atcgtattcaagctgggtggttgaaat 177  Q
    |||  ||||||  |||||| |||||||    
T  3877595 atcaaattcaatatgggtgcttgaaat 3877621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 668
Target Start/End: Original strand, 6084158 - 6084240
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||   |||| |||||| ||||||||    
T  6084158 aatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacaatatggcgtaatttgatccatgtatttgatctcacttagtgggataa 6084240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 668
Target Start/End: Original strand, 8796392 - 8796474
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||| ||||||  |||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  8796392 aatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 8796474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 574 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 27847911 - 27847817
Alignment:
Q  574 gatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||| |||||||| | |  |||||| |||| |||| ||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  27847911 gatttagaggttaatgagtttggttgaaatatggtttatgatggaacattatgccgtaattttatccatgtagccgatctcacttagtgggataa 27847817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 36624184 - 36624080
Alignment:
Q  369 gataggattaagaatgacaccattagagagagtg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagaga 466  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||| || |  |||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  36624184 gatagaattaggaatgacaccattagagagagagttggggtagtacttgcagtagaaaagattgtagaaaataggcttaggtggtttgg-catgtcgaga 36624086  T
Q  467 gaagac 472  Q
    ||||||    
T  36624085 gaagac 36624080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 566 - 659
Target Start/End: Original strand, 14557731 - 14557824
Alignment:
Q  566 ttagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 659  Q
    |||| |||||||||||  | ||||||||||| | |||| |||||| |||||||||| |||| |||  ||||||||| || ||||||||||||||    
T  14557731 ttaggaatgatttagaaattaatgagttggaccgaaatgtagtttatgatagaacattatggcgtattttgatccacgtggccgatcccactta 14557824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 335 - 468
Target Start/End: Original strand, 17815405 - 17815537
Alignment:
Q  335 gatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtaga 434  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||  |||||||  |||||||||||  | ||||| || |||| | |||||| |||| ||    
T  17815405 gatgttgtgttggatgtgtggta-gactagacgggatagcattagaaatgacaatattagagagagatgaggtaggacttataatggaaaagatggtgga 17815503  T
Q  435 aaatagtcttagatggtttggacatgtagagaga 468  Q
    || ||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  17815504 aactaggcttagttggtttgggcatgtagagaga 17815537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 555 - 668
Target Start/End: Original strand, 19936612 - 19936725
Alignment:
Q  555 tagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccc 654  Q
    |||| ||| |||||| || |||||||| || |||||||| |||| |||||| |||  |||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||  ||    
T  19936612 tagaaaaactattaggaaagatttagatgttaatgagttagatccaaatatggttaatgatagaacattacggcgtaatttgatccatgtagccgactcc 19936711  T
Q  655 acttaatgggataa 668  Q
     |||| ||||||||    
T  19936712 gcttagtgggataa 19936725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 556 - 668
Target Start/End: Original strand, 29128936 - 29129049
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgat-ccatgtagccgatccc 654  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||  || || |||| |||||||||||| |||    
T  29128936 agagaaactattaggaaagatttagaggttaacaagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatatgatcccatgtagccgacccc 29129035  T
Q  655 acttaatgggataa 668  Q
    ||||| || |||||    
T  29129036 acttagtgagataa 29129049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 556 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 3818985 - 3818873
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccca 655  Q
    ||||||| |||||  || ||||||||| | ||||||||| ||  |||||| |||| |||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||   ||    
T  3818985 agagaaactattaagaaagatttagagattaatgagttgaatagaaatatggtttatgatggaacattatgtcgccatttgatccatgtagccgactgca 3818886  T
Q  656 cttaatgggataa 668  Q
    |||| ||||||||    
T  3818885 cttagtgggataa 3818873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 612 - 668
Target Start/End: Original strand, 5113952 - 5114008
Alignment:
Q  612 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||| ||||||||    
T  5113952 tgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccgacctcaattagtgggataa 5114008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 406 - 482
Target Start/End: Original strand, 5338727 - 5338803
Alignment:
Q  406 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgc 482  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| |   ||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  5338727 gtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactgagcttaggtggtttgggcatgcagagagaagacctgtagatgc 5338803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 16142487 - 16142399
Alignment:
Q  50 tggaggtgaaagttggagatcatatcata-cccaagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaa 137  Q
    |||||||||| || ||||  ||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  16142487 tggaggtgaaggtgggagggcatatcatatcccaagtgacacattttaaatatcttgggttcataatacaaaatgacgaagaaaaagaa 16142399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 576 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 19908144 - 19908052
Alignment:
Q  576 tttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||| | ||||||||||||  |||||| |||| |||| ||||| |||  ||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19908144 tttagagattaatgagttggattcaaatatggtttatgattgaacattattgcgtaattttatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 19908052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 469
Target Start/End: Original strand, 37263325 - 37263397
Alignment:
Q  397 agagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaa 469  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||   |||||||| |||||||||||||    
T  37263325 agagttggggtagcacctatagtagaaaagatagtagaaactagacttcagtggtttgggcatgtagagagaa 37263397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 612 - 668
Target Start/End: Original strand, 42337765 - 42337821
Alignment:
Q  612 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  42337765 tgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataa 42337821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 80 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 11331666 - 11331568
Alignment:
Q  80 ccaagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatgg 179  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||||||||     |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  || ||| ||| ||||| ||||||    
T  11331666 ccaagttacacgatttaaatatatttggtccataa-----aatgacagagaaatagaagcagatgtaaattaccgcttttaagttggatggtttaaatgg 11331572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 80 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 11489687 - 11489589
Alignment:
Q  80 ccaagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatgg 179  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||||||||     |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  || ||| ||| ||||| ||||||    
T  11489687 ccaagttacacgatttaaatatatttggtccataa-----aatgacagagaaatagaagcagatgtaaattaccgcttttaagttggatggtttaaatgg 11489593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 602 - 669
Target Start/End: Original strand, 30445304 - 30445371
Alignment:
Q  602 atatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataaa 669  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |  ||||||| |||||||||    
T  30445304 atatggtttttgatagaacaccatgacgtcgtttgattcatgtagccaactccacttagtgggataaa 30445371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 586 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 45510932 - 45510849
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataaa 669  Q
    ||||||||| |||  ||||| |||| ||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  45510932 aatgagttgaatcggaatatggtttatgatagaacaccatagcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataaa 45510849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 46 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 52641093 - 52641033
Alignment:
Q  46 accttggaggtgaaagttggagatcatatcatacccaagttacacggtttaaatatcttgggt 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  52641093 accttagaggtgaaagttggagatcatatcata--caagttacacaatttaaatatattgggt 52641033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 556 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 11331333 - 11331247
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccat 642  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||||  |||| ||||| || |||||||||||    
T  11331333 agagaaactatttgaaaagatttagaggttaataagttggatttaaatatggtttatgatgaaacattatgatgtaatttgatccat 11331247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 556 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 11489354 - 11489268
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccat 642  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||||  |||| ||||| || |||||||||||    
T  11489354 agagaaactatttgaaaagatttagaggttaataagttggatttaaatatggtttatgatgaaacattatgatgtaatttgatccat 11489268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 401 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 13827854 - 13827784
Alignment:
Q  401 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaaga 471  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||| |||  | || ||||||||||||||||||||||||    
T  13827854 tgggggtagtacctatagtagaaaagacggtggaaactagggtaaggtggtttggacatgtagagagaaga 13827784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 556 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 16142109 - 16142019
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtag 646  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||| | ||| |||| |||| || ||| |||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16142109 agagaaaccattagaaaagatttagagtttaataagttagatccaattatggtttatgatcgaacaatatgacgtaatttgatccatgtag 16142019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 325 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 22167709 - 22167643
Alignment:
Q  325 cggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccat 391  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| | ||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22167709 cggagataaggatgttgcgttggatgagggttaaaacaagacgagatatgattaagaatgacaccat 22167643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 25715425 - 25715343
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||| | | |||||| |||| |||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  25715425 aatgagttgaaccgaaatatggtttatgatagaatattatggcgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataa 25715343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 668
Target Start/End: Original strand, 34444539 - 34444621
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| | ||| |||| ||||  || |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  34444539 aatgagttggatccaaatatggtttataataaaacattatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataa 34444621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 330 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 52442861 - 52442791
Alignment:
Q  330 atgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagag 400  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||| | |||| |||||||    
T  52442861 atgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaagataagattagaaatgagaacattggagagag 52442791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 659
Target Start/End: Original strand, 2544776 - 2544849
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 659  Q
    ||||||||||| | |||||| |||| | |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2544776 aatgagttggagcgaaatatggtttataatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccactta 2544849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 16142241 - 16142172
Alignment:
Q  330 atgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagaga 399  Q
    |||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||  |||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  16142241 atgaagatgttatgttggatgtgtggtaagactagacgggataggatcaggaatgccaccattagagaga 16142172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 612 - 665
Target Start/End: Original strand, 38869091 - 38869144
Alignment:
Q  612 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggga 665  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  38869091 tgatagaacattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccccacttagtggga 38869144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 52640997 - 52640920
Alignment:
Q  115 tacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcag 192  Q
    ||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| ||||||| |||||    
T  52640997 tacaaaatgacagagagataaaagcatatgtaaattatcgtattcaagttgaattgttgaaatgaagaagagcctcag 52640920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 612 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 4590605 - 4590549
Alignment:
Q  612 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  4590605 tgatagaacaatatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 4590549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 586 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 8342980 - 8342901
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||| |||||||   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  8342980 aatgagttggatagaaatatagtatttgatggaacattatgacg---tttgatcaatgtatctgatcccacttagtgggataa 8342901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 607 - 659
Target Start/End: Original strand, 28528559 - 28528611
Alignment:
Q  607 gtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 659  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28528559 gtttttgatagaccactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccccactta 28528611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 417 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 34074421 - 34074366
Alignment:
Q  417 agtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    ||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34074421 agtagaaaaatttgtagaaaataat-ttagatggtttggatatgtagagagaagacc 34074366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 558 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 44905483 - 44905415
Alignment:
Q  558 agaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatg 626  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| |||| | |||||||||||||    
T  44905483 agaaactataagaaatgatttataggttaatgagtttgatccaaatatggtttatcatagaacactatg 44905415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 393 - 469
Target Start/End: Original strand, 51812515 - 51812591
Alignment:
Q  393 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaa 469  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||| |||| ||| ||||  || ||||| |||||||||||||    
T  51812515 agagagagttggggtaacaactatagtagaaaagatggtggaaactaggcttatgtgatttgggcatgtagagagaa 51812591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 3819148 - 3819069
Alignment:
Q  393 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||| | || ||| ||||  |||||||| |||||||| |||||||    
T  3819148 agagagagttgaggtagcacctatggtagaaaagatggtggtaactagacttaagtggtttgggcatgtagaaagaagac 3819069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 4590876 - 4590813
Alignment:
Q  335 gatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagag 398  Q
    |||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||    
T  4590876 gatgttgcgttgaatgtgcggtgagactagacaagataggattagaaatgacaatattagagag 4590813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 12930408 - 12930337
Alignment:
Q  588 tgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 659  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| |||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  12930408 tgagttggatccaaatatgatttatgatagaagattatgacgtaatttgatccgtgtagccaaccccactta 12930337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 609 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 13578978 - 13578919
Alignment:
Q  609 ttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||  ||||||| ||| ||||    
T  13578978 ttttgatagaacactatgacgtcgtttgattcatatagccgactccacttagtggaataa 13578919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 574 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 15438904 - 15438822
Alignment:
Q  574 gatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 659  Q
    ||||||||| | |||||||| |||| |||||| |||| |||||||| |   |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15438904 gatttagagattaatgagttagatcaaaatatggtttatgatagaaaa---tgacgttatttgatgcatgtagccgaccccactta 15438822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 16273471 - 16273415
Alignment:
Q  46 accttggaggtgaaagttggagatcatatcatacccaagttacacggtttaaatatctt 104  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||    
T  16273471 accttagagatgaaagttggagatcatatcata--caagttacacaatttaaatatctt 16273415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 27637913 - 27637846
Alignment:
Q  405 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||| |||||    
T  27637913 ggtagcacctatagcagaaaagatgatagaaactagacttaggtgttttgggcatgtagagaaaagac 27637846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 31274613 - 31274578
Alignment:
Q  429 ggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtaga 464  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31274613 ggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtaga 31274578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 555 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 36624014 - 36623959
Alignment:
Q  555 tagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagttt 610  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||    
T  36624014 tagagaaactattagaaaagatttagaggctaatgagttggatccaaatatggttt 36623959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 412
Target Start/End: Original strand, 41611103 - 41611181
Alignment:
Q  336 atgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtg--ggggtagcac 412  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | |||  |||| ||||| ||||||| | |||||||||||||  ||||||||||    
T  41611103 atgttgcgttggatgagtagtaagaatggacgggatatgattaggaatgacgctattagagagagtgttggggtagcac 41611181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 44905603 - 44905548
Alignment:
Q  414 tatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaa 469  Q
    |||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  44905603 tatagtagaaaagacggtagaaaatatgcttaggtggtttggacatgtaaagagaa 44905548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 574 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 52900753 - 52900682
Alignment:
Q  574 gatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgta 645  Q
    ||||||||| | |||||||||||   |||||| |||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  52900753 gatttagagattaatgagttggactgaaatatggtttatgatagaacactatggcggaatttgatccatgta 52900682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 411 - 469
Target Start/End: Original strand, 7921843 - 7921901
Alignment:
Q  411 acctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaa 469  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||    
T  7921843 acctatagtagaaaagatggtggaaactaggtttatgtggtttggacatgtagagagaa 7921901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 403 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 8343140 - 8343070
Alignment:
Q  403 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||||| |||  ||| |||||||||||||||||    
T  8343140 ggggtaacacctttagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggactgggcatgtagagagaagacc 8343070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 606 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 15437207 - 15437145
Alignment:
Q  606 agtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||    
T  15437207 agtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcatgtagccaaccccacatagtgggataa 15437145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 394 - 472
Target Start/End: Original strand, 16943166 - 16943243
Alignment:
Q  394 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||  |||| |||||||| | ||||| ||||||||    
T  16943166 gagagagttggggtagtacctatagtagaaaagatggtggaaactagatttag-tggtttgggcgtgtagggagaagac 16943243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 607 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 17269067 - 17269009
Alignment:
Q  607 gtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggga 665  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  17269067 gtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccatttagtggga 17269009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 622 - 668
Target Start/End: Original strand, 26299287 - 26299333
Alignment:
Q  622 ctatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  26299287 ctatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 26299333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 600 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 27072572 - 27072522
Alignment:
Q  600 aaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccga 650  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27072572 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccga 27072522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 39422332 - 39422211
Alignment:
Q  395 agagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaag 494  Q
    ||||||| || ||| ||| ||||||||||||| | ||||||| ||| ||||| || || |||||||||||||||||||  ||||||   || ||||| ||    
T  39422332 agagagttggagtaacacatatagtagaaaagatagtagaaactagacttaggtgctt-ggacatgtagagagaagacatgtagattatgtagttaggag 39422234  T
Q  495 gatatatcaaatggaggagagtc 517  Q
     ||| |||| ||||||| |||||    
T  39422233 aatagatcatatggaggggagtc 39422211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 586 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 39776994 - 39776936
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgt 644  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||    
T  39776994 aatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacacaatggcgtaatttgatcaatgt 39776936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 586 - 664
Target Start/End: Original strand, 40416554 - 40416632
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggg 664  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||  || || |||||| | ||||||| |||||||| ||||    
T  40416554 aatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatgtgatccctttagccgaccccacttagtggg 40416632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 330 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 40920894 - 40920824
Alignment:
Q  330 atgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagag 400  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||  ||| |||  |||||||||||    
T  40920894 atgaagatgttgcattggatgtgtggtaagattagacgagataggattagaaattacaatattagagagag 40920824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 623 - 665
Target Start/End: Original strand, 41165502 - 41165544
Alignment:
Q  623 tatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggga 665  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  41165502 tatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggga 41165544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 177 - 271
Target Start/End: Original strand, 52831830 - 52831924
Alignment:
Q  177 tggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgta 271  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    || ||||  |||||||||  || ||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  52831830 tggagaagagcctcatgtgttttatgcgataagaaagtgtcatttaaattgaaagaaaaattgtatcggacgacagttagaccgacaatgttgta 52831924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 612 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 109066 - 109021
Alignment:
Q  612 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccact 657  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  109066 tgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagcctgtcccact 109021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 628 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 4318902 - 4318865
Alignment:
Q  628 cgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggga 665  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  4318902 cgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggga 4318865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 473
Target Start/End: Original strand, 10272260 - 10272329
Alignment:
Q  404 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || |  |||||| | |||||||||||||||||    
T  10272260 gggttgcacctgtagtagaaaagatggtagaaactagactaaagtggttttggcatgtagagagaagacc 10272329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 553 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 16272953 - 16272861
Alignment:
Q  553 attagagaaattatta-gaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgta 645  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| || | ||||||| | |||||| ||| |||| |||||||||| |||||| |  |||||||||||||    
T  16272953 attagagaaattattatgaaat-atttatagattaatgagtagtatctaattatggtttatgatagaacaatatgacatattttgatccatgta 16272861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 391 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 23791938 - 23791857
Alignment:
Q  391 ttagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagac 472  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| || ||||||||| ||||||| | ||  ||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  23791938 ttagagagagatggggtaggacccatggtagaaaagatggtagatactaaacttaggtggtttgtgcatgtagagagaagac 23791857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 607 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 26113517 - 26113456
Alignment:
Q  607 gtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  26113517 gtttatgatagaacattatggcttaatttgatccatgtagccgagctcacttagtgggataa 26113456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 612 - 665
Target Start/End: Original strand, 27704159 - 27704212
Alignment:
Q  612 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggga 665  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  27704159 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccgcttagtggga 27704212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 612 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 34375105 - 34375048
Alignment:
Q  612 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataaa 669  Q
    |||||||||| | ||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  34375105 tgatagaacattgtgatgtcgtttgatctatgtagtcgatcccacttaatggaataaa 34375048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 481
Target Start/End: Original strand, 39894722 - 39894860
Alignment:
Q  343 gttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccat--tagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 440  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||  |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  39894722 gttggataagtggcaagattagatgagataggattaagaataacactatcatagagagaat-tgggtagcccctatagtagaaaagatggga-aaaatag 39894819  T
Q  441 tcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatg 481  Q
       ||| |||||||| ||||||  ||||||||  |||||||    
T  39894820 atctaggtggtttgggcatgtacggagaagacttgtagatg 39894860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 600 - 665
Target Start/End: Original strand, 50846759 - 50846824
Alignment:
Q  600 aaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggga 665  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||||||| ||||||||||  ||||||| |||||    
T  50846759 aaatatagtttatgatagaacattatggcataatttgatctatgtagccgacaccacttagtggga 50846824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 607 - 668
Target Start/End: Original strand, 51584948 - 51585009
Alignment:
Q  607 gtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||| || |||||||| | ||||||    
T  51584948 gtttttgatagaacactatgacattgtttgattcatgtagcagaccccacttagtaggataa 51585009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 668
Target Start/End: Original strand, 31068 - 31733
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatc 102  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  31068 gtatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagta--ggtctaccttggaagtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaacatc 31165  T
Q  103 ttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtg 202  Q
    |||||||| |  |||||||||| ||||||||| ||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  31166 ttgggtccttcgtacaaaatgacggagaaataaaagtagatgtaggccatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaagtgttttgtg 31265  T
Q  203 cgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaa 302  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  31266 cgataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcgaacagcagtcagaccggcggtgttgtacggtacggagtgttgggtggttaagagtcaa 31365  T
Q  303 cacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt--agagagag 400  Q
    || |||| | |||||||| || | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  31366 catgagaatcaagtaagtgtagcagagattaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccattagagagagag 31465  T
Q  401 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatata 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||  || |    
T  31466 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccatggtaagaagagtaga 31565  T
Q  501 tcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatcta 600  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| |||        | ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |    
T  31566 tcaaatggaggagagtcaagttaaaagatgtagaggaagacccaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcca 31665  T
Q  601 aatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||| | || | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  31666 aatttggtgtatgatagaacactgtgaagtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 31733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 325 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 44233 - 44080
Alignment:
Q  325 cggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgaca-----ccattagagagagtgggggtagcacctatagt 419  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    |||| ||||| |||||||     | ||   ||||||| |||||||||||||||||    
T  44233 cggagatgaggatgttgcgttggatgtgcggtaagactagatggtatagtattaaaaatgacaattgacaatattagagagttggggtagcacctatagt 44134  T
Q  420 agaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacc 473  Q
    ||||||| |||  |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  44133 agaaaagatggcggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacc 44080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 332; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 41 - 668
Target Start/End: Original strand, 82356 - 82983
Alignment:
Q  41 ggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatacc-caagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagc 139  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  82356 ggtctgccttggaggcgaaagttggagattatatcataccacaagttacacggtttaaatatcttgggtccatagtaaaaaatgacggagaaatagaagc 82455  T
Q  140 agatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttt 239  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||  |||||| |||||| || |||     
T  82456 agatgtaaatcatcgtattcaagctgggtggttgcaatgggaaagagcctcatgtgttttgtgcgataagaaagtactccttaagttgaaaggaaagttc 82555  T
Q  240 tatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgt 339  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||  | ||||||||| |||||    
T  82556 tatcggacaacagtcagaccgacgatcttgtatggtacggagtgttgggcggttaagagccaacatgagaatcaagtaagtgcagcggagatgaggatgt 82655  T
Q  340 tgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccatt--agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa 437  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  82656 tgcactggatgagtagtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa 82755  T
Q  438 tagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatga 537  Q
    | | |||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  82756 tgggcttagatgatttggacatatagagagaagatccatagatgcagtcgtaagaagggtatatcaaatggaggagag--tggttaagagaggtagagga 82853  T
Q  538 aaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttga 637  Q
    | ||||       | | ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  82854 agacctaggaaaacta-tagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagaacactatgacgtcatttga 82952  T
Q  638 tccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  82953 tccatgtagccgaccccacttaatggaataa 82983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 5 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 12279 - 11810
Alignment:
Q  5 tatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatct 103  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12279 tatatagaatgtaacttcagcaaaaggagaagta--ggtctaccttcgcggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacatggtttaaatatct 12182  T
Q  104 tgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgc 203  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  12181 tgggtccatagtacaaaatgacggagaaatagaagcatatgtaagccatcgtatttaagctgggtcgttgaaatggagaagaacctcaagtgttttgtgc 12082  T
Q  204 gataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaac 303  Q
    |||||||||  ||| |||||| | |||| || |||||||||| ||||| ||||| ||    ||||| | |||||  | || ||||||| |||||| ||||    
T  12081 gataagaaagtacctcttaagttaaaaggaaagttttatcggtcagcaatcagaacggagttgttgcatggtacaaaatgttgggcgggtaagagtcaac 11982  T
Q  304 acgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagag----a 399  Q
    | |||| | ||||| || || | ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||    |    
T  11981 atgagaatcaagtatgtgtagcagagatgaggatgttgcgctggatgagcggtaagactagacataataggattaggaatgacaccatcagagagagata 11882  T
Q  400 gtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaaga 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  11881 gtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagacagaaga 11810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 445 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 11787 - 11566
Alignment:
Q  445 agatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctn 544  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||  || |||||||||| |||||||  |||| |||||||||| ||| ||||     
T  11787 agatgatttgggcatgtagagcgaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggatgagagtcaagttagaagaggtagacgaataccta 11688  T
Q  545 nnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgt 644  Q
          | |||||||||||  |||||||  ||||||| || |||  |||||||| |||| | ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  11687 ggaaaactattagagaaatcgttagaaagaatttagaagtcaattggttggatccaaatttggttt--gatagagtactatgacgtcatttgatccatgt 11590  T
Q  645 agccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    |||||| |||||||| | ||||||    
T  11589 agccgaccccacttagtaggataa 11566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 2951 - 2594
Alignment:
Q  5 tatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatct 103  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2951 tatatggaatgtaacttcagcggaaggagaagtcag--tctacattggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatct 2854  T
Q  104 tgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgc 203  Q
    ||||||| |  |||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2853 tgggtccttcgtacaaaatgacgaagaaatagaagcagatgtaagtcatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgc 2754  T
Q  204 gataagaaaaaaccacttaagctgaaagaaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctgggcggttaagagccaac 303  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  2753 gataagaaagtaccacttaagttgaaaggaaagttctatcggacagcagtcagactgacgttgttgtatggtatggagtgttgggcggttaagagtcaac 2654  T
Q  304 acgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagacta 363  Q
    | || | | |||||||| || | ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  2653 atgataatcaagtaagtgtagcagagatgaggatgtttcattggatgagtggtaagacta 2594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 362 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 1271 - 965
Alignment:
Q  362 tagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgt 461  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  1271 tagacaggataggattatgaatgacaccattagagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggccatgt 1172  T
Q  462 agagagaagacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaa 561  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||  || ||||||||||| ||||||   |||||||||||||| ||| ||||       | |||||||||    
T  1171 agagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggagaagagtcaaattaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaa 1072  T
Q  562 attattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaat 661  Q
    |  |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| |    
T  1071 accattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccatttagt 972  T
Q  662 gggataa 668  Q
    |||||||    
T  971 gggataa 965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 161; Significance: 2e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 92 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 87204 - 86627
Alignment:
Q  92 gtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctgggtggttgaaatggagaagagtctca 191  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| | | | |||||||||||||||| || |||     
T  87204 gtttaaatatcttgggtccatagtataaaatgtcggagaaatagaatcagatgtaactcatcatattcatgtttgatggttgaaatggagaaaagcctcg 87105  T
Q  192 ggtgttttgtgcgataagaaaaaaccacttaagctgaaag-----aaaggttttatcggacagcagtcagaccgacaatgttgtaaggtacggagtgctg 286  Q
    || ||||| ||| ||||||||  | |||||||| |||||      ||| | | ||| |||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||| ||    
T  87104 ggggttttatgcaataagaaagtatcacttaagttgaaaagaaaaaaaagctctattggacagcagtcagaccaacgattttgtatggtac--agtgttg 87007  T
Q  287 ggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaagaatgac 386  Q
    | |||||||||||| ||| |||| | |||||||| ||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||| |||||  ||||||    
T  87006 g-cggttaagagccgacatgagactcaagtaagtgtagaggagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagaccagaaaggataagattagaaatgac 86908  T
Q  387 accattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtt 486  Q
    |||||||||||||| | | |    |   | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  86907 accattagagagagagagagagagagagagagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatagtttggacatgtaaagagaagacccgtagatgccgtc 86808  T
Q  487 gttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaa 586  Q
    || |||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||       |  |||||||||  | |||||| |||||||||||      
T  86807 gtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagatggagacctaggaaaactgttagagaaaccactagaaaggatttagaggtcg 86708  T
Q  587 atgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggata 667  Q
    |   |||||||| ||||||  | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||||||| |||||||    
T  86707 acaggttggatccaaatatgatgtatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagtcggctccacttagtgggata 86627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 88605 - 88514
Alignment:
Q  4 gtatatggaatgtaacttcaacaaaaggagaagtgtgggtctaccttggaggtgaaagttggagatcatatcatac-ccaagttacacggttta 96  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| |||||||||| |||||| |||| |||||| |||||  ||||||||| ||||||    
T  88605 gtatatggaatgtaacttcagcaaaaggagaa--gtaggtttaccttggagatgaaagatggaaatcataccatacttcaagttacatggttta 88514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 152; Significance: 5e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 272 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 4687 - 4297
Alignment:
Q  272 aggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagat 371  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||| | |||||| | |||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  4687 aggtacggagtgttggacggttatgagtcaacacgagaatcaagtaaatttaacagatatgaggatgttgcgttggatgaatggtaagactagacatgat 4588  T
Q  372 aggattaagaatgacaccattagagagagtg---ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagaga 468  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |   ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||    
T  4587 aggattataaatgacaccattagagagagagagtggggtggcacctatagtagaaaagttggtaaaaaataggcttagatagtttgggcatgtagaaaga 4488  T
Q  469 agacccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattatta 568  Q
    |||| |||||| || || || |||||  || ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| | |||||          | ||||||||||  ||||    
T  4487 agactcgtagaagctgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagaatcaagttaaaagaggtataggaaaa----------ctattagagaaaccatta 4398  T
Q  569 gaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccga-tcccacttaatgggata 667  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||    
T  4397 gaaaggatttagaggtcaatgagttggatctaaatttggtttataatagaacactatgacgttatttgatccatgtaggcgacccccatttaatgggata 4298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 110; Significance: 5e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 273 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 25859 - 25683
Alignment:
Q  273 ggtacggagtgctgggcggttaagagccaacacgagagtaaagtaagtataacggagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagata 372  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| | |||||||| || | ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25859 ggtacggagtgttgggcggttaagagtcaacatgagaatcaagtaagtgtagcagagattaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgata 25760  T
Q  373 ggattaagaatgacaccattagag--agagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttaga 447  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25759 ggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttaga 25683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 553 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 25664 - 25549
Alignment:
Q  553 attagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatc 652  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  25664 attagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttaatccatgtagcggacc 25565  T
Q  653 ccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||| ||||||||    
T  25564 ccacttagtgggataa 25549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 76; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 512 - 668
Target Start/End: Original strand, 16687 - 16843
Alignment:
Q  512 agagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttt 611  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| ||||       ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  16687 agagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttt 16786  T
Q  612 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  16787 tgatagaacactatggcgtcatttgatctatgtagccgactccacttagtgggataa 16843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 66; Significance: 1e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 124
Target Start/End: Original strand, 5834 - 5911
Alignment:
Q  48 cttggaggtgaaagttggagatcatatcataccc-aagttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5834 cttggaggtgaaagttggagatcatatcataccccaagttacacggtttaaatatcttgggtccacaatacaaaatga 5911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 384 - 516
Target Start/End: Original strand, 7422 - 7554
Alignment:
Q  384 gacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgcc 483  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| || |||| ||||||| |||||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||| |    
T  7422 gacaccattagagagagtctgggtagcacgtaaagtacaaaagtttgtagaaaacacgcttagttggtttgggcatgtagagagaaggcatgtagatgtc 7521  T
Q  484 gttgttagaaggatatatcaaatggaggagagt 516  Q
     |  | |||||  ||||||| ||||||||||||    
T  7522 ttcataagaagagtatatcagatggaggagagt 7554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 556 - 669
Target Start/End: Original strand, 7593 - 7706
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatc-cc 654  Q
    ||| ||| ||||||||| |||| |||||| | | ||||||||  |||||| |||   |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||| ||    
T  7593 agataaactattagaaaagattcagaggtcatttagttggattcaaatatggttcacgatagaacactatggcgtaatttgatccatgcagcc-atctcc 7691  T
Q  655 acttaatgggataaa 669  Q
    ||||| |||||||||    
T  7692 acttagtgggataaa 7706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1318 (Bit Score: 60; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1318
Description:

Target: scaffold1318; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 553 - 668
Target Start/End: Original strand, 481 - 596
Alignment:
Q  553 attagagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatc 652  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| | | |||| | || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  481 attagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgtacccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgacc 580  T
Q  653 ccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||| ||||||||    
T  581 ccacttagtgggataa 596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 473 - 668
Target Start/End: Original strand, 4706 - 4901
Alignment:
Q  473 ccgtagatgccgttgttagaaggatatatcaaatggaggagagtctggttaaaagaggtagatgaaaacctnnnnnnnccattagagaaattattagaaa 572  Q
    ||||||||||||| || |||||  || |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||  | |       |||| |||||||  ||||||||    
T  4706 ccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtaagattaaaagaggtagatgaaggcgtaggaaaaccataagagaaaccattagaaa 4805  T
Q  573 tgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
     |||||||| || ||||||||  ||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||    
T  4806 ggatttagacgtcaatgagttaaatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccgtgtagccgaccccactttgtgggataa 4901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1493 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1493
Description:

Target: scaffold1493; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 118 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 156 - 41
Alignment:
Q  118 aaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaattatcgtattcaagctggg--tggttgaaatggagaagagtctcaggtgttttgtgcgataagaaaaaa 215  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |    
T  156 aaaatgacggggaaatagaagcatatgtaaatcatcgtatgcaagcagggggtgtttgaaatggagaagagcctcaggtgttttgtgcgataagaaagta 57  T
Q  216 ccacttaagctgaaag 231  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  56 ccaattaagttgaaag 41  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 556 - 669
Target Start/End: Original strand, 14736 - 14849
Alignment:
Q  556 agagaaattattagaaatgatttagaggtaaatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatccca 655  Q
    |||||||  |||||||| |||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  14736 agagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgattgaacactatggcgtaatttgatccatgtagccaacccca 14835  T
Q  656 cttaatgggataaa 669  Q
    | || |||||||||    
T  14836 cgtagtgggataaa 14849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 612 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 28962 - 28906
Alignment:
Q  612 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  28962 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataa 28906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 58325 - 58243
Alignment:
Q  586 aatgagttggatctaaatatagtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgggataa 668  Q
    ||||||||||| | | |||| |||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  58325 aatgagttggaccaagatatggtttatgatagaacattatgtcgtaatttgatccatgtagccgacccaacttagtgggataa 58243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0606 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0606
Description:

Target: scaffold0606; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 182
Target Start/End: Original strand, 9303 - 9434
Alignment:
Q  52 gaggtgaaagttggagatcatatcataccca-agttacacggtttaaatatcttgggtccataatacaaaatgatggagaaatagaagcagatgtaaatt 150  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||     ||||||||| |||||||||||| |||  ||| || |||| |||| |||||| |||| |||||||||      
T  9303 gaggtaaaagttggagatcatatcatattattagttacacgatttaaatatcttaggtttatattataaaacgatgaagaaatggaaggagatgtaaaac 9402  T
Q  151 atcgtattcaagctgggtggttgaaatggaga 182  Q
    || | |||||| |||||| ||||||| |||||    
T  9403 ataggattcaaactgggtagttgaaagggaga 9434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 407 - 471
Target Start/End: Original strand, 11802 - 11866
Alignment:
Q  407 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatggtttggacatgtagagagaaga 471  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| || | | ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  11802 tagcacctattgtagaaaagatggtaggaactcggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaga 11866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 609 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 163270 - 163229
Alignment:
Q  609 ttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccga 650  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  163270 ttttgatagaacactatgacgtcgtttgattcatatagccga 163229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University