View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11534_low_14 (Length: 250)

Name: NF11534_low_14
Description: NF11534
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11534_low_14
NF11534_low_14
[»] chr6 (39 HSPs)
chr6 (49-233)||(6330951-6331136)
chr6 (49-233)||(3652408-3652593)
chr6 (53-233)||(20126221-20126402)
chr6 (49-233)||(23986356-23986541)
chr6 (49-233)||(20896727-20896912)
chr6 (125-237)||(14771754-14771866)
chr6 (125-233)||(16519967-16520075)
chr6 (124-226)||(17731159-17731261)
chr6 (49-233)||(2681255-2681440)
chr6 (49-233)||(21311893-21312078)
chr6 (105-233)||(23776420-23776548)
chr6 (49-226)||(2720610-2720788)
chr6 (121-226)||(17027577-17027682)
chr6 (121-233)||(7911873-7911985)
chr6 (121-233)||(7912305-7912417)
chr6 (121-233)||(13492784-13492896)
chr6 (125-233)||(31821731-31821839)
chr6 (49-233)||(20850243-20850428)
chr6 (121-233)||(13191552-13191664)
chr6 (126-233)||(9352062-9352169)
chr6 (121-215)||(9440485-9440579)
chr6 (115-233)||(11062275-11062392)
chr6 (52-233)||(15929507-15929689)
chr6 (125-233)||(9440348-9440456)
chr6 (101-233)||(17851349-17851481)
chr6 (115-226)||(27334150-27334261)
chr6 (115-226)||(27394890-27395001)
chr6 (127-233)||(20735696-20735802)
chr6 (51-195)||(3652903-3653048)
chr6 (125-226)||(21311514-21311615)
chr6 (146-237)||(15929219-15929310)
chr6 (128-226)||(32292887-32292985)
chr6 (128-233)||(28065877-28065982)
chr6 (105-233)||(17850897-17851025)
chr6 (162-237)||(20732614-20732689)
chr6 (162-223)||(10964340-10964401)
chr6 (125-223)||(2890888-2890985)
chr6 (191-233)||(13492397-13492439)
chr6 (175-233)||(28583012-28583070)
[»] chr2 (35 HSPs)
chr2 (49-233)||(33174880-33175065)
chr2 (49-233)||(1706964-1707148)
chr2 (49-233)||(18447957-18448142)
chr2 (105-233)||(33174484-33174610)
chr2 (105-233)||(11388168-11388294)
chr2 (105-233)||(18098917-18099045)
chr2 (121-233)||(30966229-30966341)
chr2 (111-233)||(1912510-1912632)
chr2 (125-233)||(1953154-1953262)
chr2 (51-233)||(38898951-38899134)
chr2 (52-233)||(41754214-41754396)
chr2 (49-233)||(29804604-29804789)
chr2 (121-233)||(30966685-30966797)
chr2 (49-233)||(25338036-25338221)
chr2 (49-233)||(25434095-25434280)
chr2 (121-233)||(24818321-24818433)
chr2 (134-233)||(8256534-8256633)
chr2 (118-233)||(16379385-16379500)
chr2 (122-233)||(29259659-29259770)
chr2 (127-233)||(16378938-16379044)
chr2 (124-233)||(5399856-5399965)
chr2 (137-226)||(8181397-8181486)
chr2 (146-233)||(11394555-11394641)
chr2 (115-226)||(15619887-15619998)
chr2 (125-236)||(30961919-30962038)
chr2 (135-233)||(30963759-30963857)
chr2 (125-226)||(16541984-16542085)
chr2 (49-233)||(33770932-33771108)
chr2 (162-233)||(8073928-8073999)
chr2 (121-226)||(83012-83117)
chr2 (128-233)||(30963302-30963407)
chr2 (125-233)||(27882965-27883073)
chr2 (136-187)||(9909102-9909153)
chr2 (162-233)||(13191010-13191081)
chr2 (176-231)||(20502073-20502128)
[»] chr4 (54 HSPs)
chr4 (49-233)||(50398571-50398756)
chr4 (121-233)||(44471358-44471470)
chr4 (49-225)||(50399034-50399210)
chr4 (51-233)||(4127470-4127654)
chr4 (106-226)||(29628707-29628827)
chr4 (105-215)||(53854858-53854968)
chr4 (49-233)||(1645782-1645967)
chr4 (125-233)||(4127922-4128030)
chr4 (106-233)||(3169186-3169313)
chr4 (52-233)||(23942822-23943001)
chr4 (49-233)||(12692032-12692217)
chr4 (124-233)||(14572183-14572292)
chr4 (101-233)||(1464122-1464254)
chr4 (121-233)||(23350316-23350428)
chr4 (121-233)||(35871623-35871735)
chr4 (121-233)||(44470907-44471019)
chr4 (115-233)||(21220364-21220482)
chr4 (49-226)||(51331321-51331499)
chr4 (121-233)||(49998631-49998743)
chr4 (53-233)||(9423891-9424072)
chr4 (107-226)||(53996155-53996274)
chr4 (129-233)||(8467833-8467937)
chr4 (106-233)||(24629466-24629593)
chr4 (105-233)||(21067261-21067389)
chr4 (120-233)||(24629010-24629126)
chr4 (56-226)||(21067666-21067834)
chr4 (49-233)||(27026426-27026610)
chr4 (121-226)||(41869913-41870018)
chr4 (121-233)||(14571754-14571866)
chr4 (128-236)||(24271580-24271690)
chr4 (121-231)||(17028869-17028979)
chr4 (125-223)||(27578952-27579050)
chr4 (161-233)||(7678655-7678727)
chr4 (105-233)||(14351774-14351902)
chr4 (137-233)||(43928996-43929092)
chr4 (106-233)||(13613930-13614057)
chr4 (130-233)||(42838628-42838730)
chr4 (49-233)||(31817431-31817616)
chr4 (121-236)||(17029325-17029440)
chr4 (166-233)||(27029317-27029384)
chr4 (128-239)||(52048693-52048804)
chr4 (129-236)||(53391890-53391997)
chr4 (176-233)||(17628561-17628618)
chr4 (176-233)||(23943275-23943332)
chr4 (176-233)||(31817885-31817942)
chr4 (128-237)||(26200314-26200425)
chr4 (104-144)||(44830977-44831017)
chr4 (124-159)||(35477801-35477836)
chr4 (111-149)||(10165939-10165977)
chr4 (64-149)||(33987188-33987274)
chr4 (124-233)||(13266084-13266193)
chr4 (180-233)||(23976252-23976305)
chr4 (164-233)||(33764898-33764967)
chr4 (133-213)||(2499647-2499727)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (105-233)||(18173-18301)
scaffold0047 (105-225)||(17645-17765)
[»] chr8 (39 HSPs)
chr8 (105-233)||(2044037-2044165)
chr8 (49-233)||(8080381-8080566)
chr8 (49-233)||(22840568-22840753)
chr8 (49-233)||(27022377-27022562)
chr8 (49-233)||(28453261-28453445)
chr8 (121-233)||(34308518-34308630)
chr8 (131-226)||(17103086-17103181)
chr8 (112-223)||(29971450-29971561)
chr8 (121-220)||(34308991-34309090)
chr8 (49-233)||(10844805-10844990)
chr8 (49-233)||(22549034-22549219)
chr8 (49-233)||(41659144-41659328)
chr8 (121-233)||(25147531-25147643)
chr8 (49-233)||(22026301-22026486)
chr8 (125-233)||(6464949-6465057)
chr8 (106-233)||(27925879-27926006)
chr8 (115-233)||(12827293-12827411)
chr8 (135-233)||(22705181-22705279)
chr8 (120-226)||(33852304-33852410)
chr8 (121-233)||(12100687-12100798)
chr8 (49-233)||(27021918-27022107)
chr8 (105-233)||(28375093-28375221)
chr8 (49-233)||(22548588-22548773)
chr8 (121-237)||(25147962-25148078)
chr8 (125-233)||(27819285-27819393)
chr8 (161-232)||(3744673-3744744)
chr8 (115-226)||(32292386-32292497)
chr8 (124-233)||(21316148-21316257)
chr8 (129-233)||(10844654-10844758)
chr8 (121-233)||(25144767-25144879)
chr8 (126-239)||(17429501-17429613)
chr8 (49-189)||(25307687-25307828)
chr8 (125-226)||(30334954-30335055)
chr8 (162-226)||(1297043-1297107)
chr8 (138-233)||(15568044-15568139)
chr8 (164-234)||(36968433-36968503)
chr8 (121-226)||(15567602-15567707)
chr8 (170-233)||(3745145-3745208)
chr8 (162-231)||(41913006-41913075)
[»] chr7 (41 HSPs)
chr7 (49-233)||(6747637-6747822)
chr7 (105-233)||(42515523-42515651)
chr7 (49-233)||(2611691-2611876)
chr7 (124-233)||(42515090-42515199)
chr7 (121-233)||(9124954-9125066)
chr7 (53-226)||(26957603-26957777)
chr7 (49-225)||(34405638-34405815)
chr7 (121-233)||(2941796-2941908)
chr7 (121-233)||(11517428-11517539)
chr7 (107-233)||(28495835-28495961)
chr7 (120-233)||(6719113-6719226)
chr7 (105-237)||(679796-679927)
chr7 (128-226)||(25182363-25182461)
chr7 (115-233)||(43233402-43233520)
chr7 (125-233)||(29039059-29039167)
chr7 (125-233)||(35474160-35474268)
chr7 (106-233)||(2193236-2193363)
chr7 (121-233)||(5406627-5406739)
chr7 (121-233)||(13125175-13125287)
chr7 (125-233)||(28495647-28495755)
chr7 (125-233)||(36422251-36422359)
chr7 (125-233)||(46425740-46425848)
chr7 (49-207)||(3305377-3305536)
chr7 (175-236)||(26421341-26421402)
chr7 (121-233)||(18833281-18833393)
chr7 (52-233)||(2189069-2189251)
chr7 (115-233)||(22529274-22529392)
chr7 (161-226)||(2465959-2466024)
chr7 (106-226)||(33316707-33316828)
chr7 (105-233)||(29357495-29357622)
chr7 (125-233)||(31406623-31406731)
chr7 (170-233)||(2465777-2465840)
chr7 (106-233)||(9623188-9623315)
chr7 (121-216)||(13124757-13124852)
chr7 (115-237)||(35527156-35527278)
chr7 (115-231)||(36015452-36015568)
chr7 (130-236)||(20966055-20966161)
chr7 (161-225)||(11372486-11372550)
chr7 (155-206)||(16811912-16811963)
chr7 (180-226)||(6585662-6585708)
chr7 (121-233)||(31743863-31743975)
[»] chr3 (40 HSPs)
chr3 (49-233)||(30529609-30529794)
chr3 (105-233)||(39640916-39641044)
chr3 (51-233)||(28561670-28561853)
chr3 (105-233)||(20885156-20885283)
chr3 (50-233)||(32227260-32227444)
chr3 (105-233)||(25230744-25230872)
chr3 (105-233)||(25238331-25238459)
chr3 (122-233)||(41472297-41472407)
chr3 (49-233)||(16811303-16811488)
chr3 (49-233)||(39653086-39653271)
chr3 (121-233)||(31284315-31284427)
chr3 (126-233)||(7493881-7493988)
chr3 (105-226)||(25230294-25230415)
chr3 (105-226)||(25237881-25238002)
chr3 (49-233)||(50347668-50347853)
chr3 (125-233)||(32796974-32797082)
chr3 (134-233)||(11180073-11180172)
chr3 (115-233)||(14813938-14814056)
chr3 (104-233)||(13150138-13150267)
chr3 (126-226)||(7477191-7477291)
chr3 (125-233)||(25239116-25239224)
chr3 (122-226)||(41473993-41474097)
chr3 (49-233)||(16810847-16811032)
chr3 (105-226)||(37045014-37045135)
chr3 (121-233)||(25248106-25248218)
chr3 (105-233)||(32227480-32227607)
chr3 (115-237)||(2911084-2911206)
chr3 (124-233)||(8067278-8067387)
chr3 (166-233)||(25238723-25238790)
chr3 (49-219)||(25803057-25803228)
chr3 (162-233)||(32386773-32386844)
chr3 (128-233)||(29224326-29224431)
chr3 (169-233)||(13150593-13150657)
chr3 (178-233)||(4067399-4067454)
chr3 (124-222)||(27187380-27187478)
chr3 (106-233)||(14820134-14820261)
chr3 (162-233)||(31103999-31104070)
chr3 (135-233)||(25802587-25802685)
chr3 (121-185)||(12820639-12820703)
chr3 (176-233)||(47518358-47518415)
[»] chr1 (36 HSPs)
chr1 (49-233)||(43057562-43057747)
chr1 (49-233)||(30872989-30873175)
chr1 (49-233)||(43057104-43057288)
chr1 (125-233)||(50002746-50002854)
chr1 (49-233)||(16451972-16452157)
chr1 (49-233)||(16461125-16461310)
chr1 (49-233)||(20054119-20054304)
chr1 (49-233)||(20054575-20054760)
chr1 (49-233)||(20055031-20055216)
chr1 (49-233)||(20055487-20055672)
chr1 (49-233)||(20055943-20056128)
chr1 (49-233)||(20056399-20056584)
chr1 (49-233)||(20057302-20057487)
chr1 (124-233)||(35760953-35761062)
chr1 (115-233)||(50002324-50002442)
chr1 (49-233)||(20845700-20845885)
chr1 (124-233)||(35759647-35759756)
chr1 (49-233)||(52250128-52250313)
chr1 (126-233)||(31822702-31822809)
chr1 (49-233)||(12883446-12883631)
chr1 (106-239)||(38340886-38341019)
chr1 (121-233)||(2328310-2328422)
chr1 (121-237)||(7548086-7548202)
chr1 (121-233)||(20061230-20061342)
chr1 (51-233)||(51372913-51373096)
chr1 (115-233)||(20057758-20057876)
chr1 (105-223)||(10820571-10820689)
chr1 (124-226)||(23180728-23180830)
chr1 (124-233)||(46693774-46693884)
chr1 (49-233)||(20056855-20057031)
chr1 (120-233)||(50003114-50003227)
chr1 (125-233)||(2634923-2635031)
chr1 (161-233)||(12728026-12728099)
chr1 (162-226)||(16907270-16907334)
chr1 (158-226)||(2739554-2739622)
chr1 (181-233)||(20060379-20060431)
[»] chr5 (36 HSPs)
chr5 (107-233)||(10927442-10927568)
chr5 (49-233)||(42788685-42788869)
chr5 (49-233)||(20039513-20039698)
chr5 (106-233)||(39146919-39147046)
chr5 (107-233)||(17445494-17445620)
chr5 (50-233)||(10926985-10927170)
chr5 (121-233)||(3887096-3887208)
chr5 (121-226)||(189063-189168)
chr5 (49-233)||(2193738-2193923)
chr5 (121-233)||(2474400-2474512)
chr5 (111-237)||(42429131-42429256)
chr5 (121-233)||(2473954-2474066)
chr5 (121-233)||(22556531-22556643)
chr5 (105-233)||(27646874-27647002)
chr5 (106-233)||(34867770-34867897)
chr5 (124-233)||(1821904-1822013)
chr5 (125-237)||(2058691-2058803)
chr5 (125-233)||(8391361-8391468)
chr5 (105-237)||(11160716-11160848)
chr5 (121-233)||(22556964-22557076)
chr5 (49-233)||(4658032-4658216)
chr5 (124-233)||(8642073-8642182)
chr5 (124-233)||(3886640-3886749)
chr5 (49-233)||(34371534-34371719)
chr5 (49-233)||(34371990-34372175)
chr5 (128-226)||(16370754-16370852)
chr5 (115-233)||(21886185-21886303)
chr5 (108-233)||(5066930-5067055)
chr5 (112-233)||(15513051-15513173)
chr5 (105-237)||(18304410-18304542)
chr5 (121-206)||(22975076-22975161)
chr5 (136-195)||(29680177-29680236)
chr5 (164-233)||(24182284-24182353)
chr5 (121-226)||(5549339-5549445)
chr5 (164-233)||(39801501-39801571)
chr5 (140-233)||(18750235-18750328)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (49-237)||(2664-2853)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (121-233)||(162717-162829)
scaffold0022 (162-225)||(69862-69925)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (121-233)||(107502-107614)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (124-233)||(245084-245193)
scaffold0005 (121-233)||(245510-245622)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (121-233)||(2249-2361)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (121-233)||(105715-105827)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (121-233)||(142313-142425)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (121-226)||(18961-19066)
scaffold0322 (122-189)||(18204-18271)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (49-233)||(1142-1327)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (121-233)||(10295-10407)
[»] scaffold0499 (1 HSPs)
scaffold0499 (120-233)||(2090-2203)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (104-233)||(154735-154864)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (115-233)||(23662-23780)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (106-233)||(4541-4668)
scaffold0333 (106-233)||(4996-5128)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (126-239)||(45387-45499)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (124-233)||(4021-4130)
[»] scaffold0557 (2 HSPs)
scaffold0557 (105-174)||(729-798)
scaffold0557 (171-233)||(2150-2212)
[»] scaffold1138 (1 HSPs)
scaffold1138 (157-195)||(774-812)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 39)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6331136 - 6330951
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    |||||||||||| |||||||||| | | || || ||||||| |||||||| | ||  ||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||  ||    
T  6331136 ggctgacgagggtggggagtggtcgccggtgcacaaggcatgacaatgagcggctcccgacaacttctagacaagccgaatcacatcggaatgagatgga 6331037  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  6331036 tcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaatatgcat 6330951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Original strand, 3652408 - 3652593
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  3652408 ggctgatgagggcggggagtggtcgtcggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaaccgaatcacatcggaatgagaggga 3652507  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3652508 tcctgaggctgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtctgatactacctatatcaacaagatgcat 3652593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 53 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20126402 - 20126221
Alignment:
Q  53 gacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcct 151  Q
    ||||||||||||||||||| | | || || ||||||| |||||||| | ||   |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20126402 gacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcatgacaatgagcggctcctgacaacttctagacaagctgaatcacatcggaatgagagggatcct 20126303  T
Q  152 gaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
     | || || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20126302 aaggctgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaatggtttgatactacctatatcaacaagatgcat 20126221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23986541 - 23986356
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||| |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  23986541 ggctgacgagggcggggagtggtcgtcggtgcacaaggcatgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaaccgaatcacatcggaatgagaggga 23986442  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  23986441 tccggaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggtaggcttataagaattgtttggtactacctatatgaacaagatgcat 23986356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20896912 - 20896727
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| | |  | || ||||||| |||||||| | ||  ||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||| ||    
T  20896912 ggctgacgaggacggagagtggtcgccgttgcacaaggcatgacaatgagcggctcccgacaacttctagacaagccgaatcacatcggaatgagaggga 20896813  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  20896812 tccttaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 20896727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14771866 - 14771754
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14771866 gaatcacgccggaatgagagggatcccgaagccgtgtaggtatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 14771767  T
Q  225 aacatgcatattc 237  Q
    || || |||||||    
T  14771766 aagatccatattc 14771754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 233
Target Start/End: Original strand, 16519967 - 16520075
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16519967 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgagactacatggtcgaaggaaggcttatgagatttgtttggtactacctatatcaac 16520066  T
Q  225 aacatgcat 233  Q
    || ||||||    
T  16520067 aagatgcat 16520075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 124 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17731261 - 17731159
Alignment:
Q  124 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17731261 tgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgttcaggtatgggactgcatggttaaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaa 17731162  T
Q  224 caa 226  Q
    |||    
T  17731161 caa 17731159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2681440 - 2681255
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||  |||||||| | ||   ||||  || |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  2681440 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtacacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagtttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 2681341  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  2681340 tcctgaggccgtgtaggtttgggactgcatggttgaatgaagacttataagaattgtttggtactacccatatcaacaagatgcat 2681255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Original strand, 21311893 - 21312078
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |||| || |||||| ||||||||| ||||  ||| | ||| || | ||||||||||||| | ||||||||| |     
T  21311893 ggctgacgagggcgggaagtggtcgccagtgcacaaggcacaacaatgagcgactcccgatagcttctaaaggaactgaatcacaccagaatgagagggt 21311992  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    || ||| || ||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  21311993 tcatgaggctgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgttaggtactacctatatcaacaagatgcat 21312078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 105 - 233
Target Start/End: Original strand, 23776420 - 23776548
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||  |||||||||||  ||||||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  23776420 cgacagcttctagaggaactgaatcacgccggaatgagaggtatcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaagacttataagaatcgt 23776519  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
     || |||||||||||||||||| ||||||    
T  23776520 ctggtactacctatatcaacaagatgcat 23776548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2720788 - 2720610
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||| ||  |||||||| |||||  |||| ||| |||||||||  ||||| | ||||||||||| ||    
T  2720788 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaagtcacgacaatgagcgacttcggacagcttctagacgaaccaaatcataccggaatgagaggga 2720689  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaa 226  Q
    |||  | | |||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  2720688 tcccaaggtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatattaacaa 2720610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17027682 - 17027577
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17027682 aactaaatcacatcggaatgagagggatccagaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 17027583  T
Q  221 caacaa 226  Q
    ||||||    
T  17027582 caacaa 17027577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Original strand, 7911873 - 7911985
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||  ||||||  ||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  7911873 aactgaatcacatcggaatgagagggatctcgaggccgtgcaggtataggactgcatggttgaaggaaaacttataagaattgtttggtactacctatat 7911972  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||||    
T  7911973 caacaagatgcat 7911985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Original strand, 7912305 - 7912417
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||  ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  7912305 aactgaatcacatcggaatgagagggatctcgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaaacttatatgaattgtttggtactacctatat 7912404  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||||    
T  7912405 caacaagatgcat 7912417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Original strand, 13492784 - 13492896
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||| || ||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  13492784 aactgaatcatatcggaatgagaaggatcctgaggctgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataataattgtttggtactacctatat 13492883  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||||    
T  13492884 caacaagatgcat 13492896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 125 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31821839 - 31821731
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  31821839 gaatcacatcggaatgagagggatcatgaggccatgtaggtatgagactacatggttgaaggaatgcttataagaattatttggtactaactatatcaac 31821740  T
Q  225 aacatgcat 233  Q
    || ||||||    
T  31821739 aagatgcat 31821731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Original strand, 20850243 - 20850428
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    |||||||||||||| |||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  20850243 ggctgacgagggcgaggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 20850342  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    || ||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  20850343 tcatgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgttttgtactacctatatcaacaagatgcat 20850428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13191664 - 13191552
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |  |  | |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  13191664 aactaaatcacatcggaatgagagggatcctaagactatgtaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 13191565  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||||    
T  13191564 caacaagatgcat 13191552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 233
Target Start/End: Original strand, 9352062 - 9352169
Alignment:
Q  126 aatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaaca 225  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| | | ||||||| |||||||||||| ||||    
T  9352062 aatcacatcgaaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgagactacatggtcgaagggagacttataatatttgtttggtactacctatataaaca 9352161  T
Q  226 acatgcat 233  Q
    | ||||||    
T  9352162 agatgcat 9352169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 121 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 9440579 - 9440485
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||| ||||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  9440579 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaagtcgtgcaggtatgggacttcatggttgaatgaaggcttataagaattgtttggtactacc 9440485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 233
Target Start/End: Original strand, 11062275 - 11062392
Alignment:
Q  115 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 214  Q
    |||| |||| |||||||||||  ||||||| |||||||| || || ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||||    
T  11062275 tagaggaaccgaatcacatcgacatgagag-gatcctgaggctgtgtaggtatgaaactacatggttgaaggaaggcttataagaagtgttttgtactac 11062373  T
Q  215 ctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  11062374 ctatatcaacaagatgcat 11062392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 52 - 233
Target Start/End: Original strand, 15929507 - 15929689
Alignment:
Q  52 tgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcc 150  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||  || |||||||||| |||||||| | ||   |||||||| |||| |||  |||||||||| |||| ||||||||||    
T  15929507 tgacgagggccgggtgtggtcgttggtgcataaggcatgacaatgagcggctccggacaacttctagatgaatcgaatcacatcagaataagagagatcc 15929606  T
Q  151 tgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    | | ||| | || ||||  ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  15929607 taatgccttgtatgtattggactacatggttgaatgaaggcttataagaattatttggtactacctatatcaacaaaatgcat 15929689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9440456 - 9440348
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||  |||  ||||||||| |||  ||||| ||||||||| | |||||| |||||||||    
T  9440456 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaagtcgtgcaggtatggaactgcatggttgaatgaaagcttataagaattgttcggtactacttatatcaac 9440357  T
Q  225 aacatgcat 233  Q
    || ||||||    
T  9440356 aagatgcat 9440348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 101 - 233
Target Start/End: Original strand, 17851349 - 17851481
Alignment:
Q  101 ctttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaa 200  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||  | ||||| ||||  |||||| || |||| ||||| |||     
T  17851349 ctttagacaacttctagacgaaccgaatcacaccggaatgagagggatcccgaggccgtgcaagtatgggactgcatggttaaaagaaggcttataagat 17851448  T
Q  201 ttgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
     |||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  17851449 atgtttggtactacctttatcaacaagatgcat 17851481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 226
Target Start/End: Original strand, 27334150 - 27334261
Alignment:
Q  115 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 214  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||| | |||  |||||||  |||  |||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||    
T  27334150 tagaggaactgaatcacaccggaacgagagggttcctgaggtcgtgcaggtatggaactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactac 27334249  T
Q  215 ctatatcaacaa 226  Q
    ||||||||||||    
T  27334250 ctatatcaacaa 27334261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 226
Target Start/End: Original strand, 27394890 - 27395001
Alignment:
Q  115 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 214  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||| | |||  |||||||  |||  |||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||    
T  27394890 tagaggaactgaatcacaccggaacgagagggttcctgaggtcgtgcaggtatggaactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactac 27394989  T
Q  215 ctatatcaacaa 226  Q
    ||||||||||||    
T  27394990 ctatatcaacaa 27395001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 233
Target Start/End: Original strand, 20735696 - 20735802
Alignment:
Q  127 atcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaa 226  Q
    ||||||||  |||||||| |||| |||  | || |||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20735696 atcacatcataatgagagggatcttgagactgtgtaggtatgtgactacatgattgtaggaaggcttataagaattgtttgatactacttatatcaacaa 20735795  T
Q  227 catgcat 233  Q
     ||||||    
T  20735796 gatgcat 20735802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 195
Target Start/End: Original strand, 3652903 - 3653048
Alignment:
Q  51 ctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatc 149  Q
    ||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  3652903 ctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagatgaaccgactcacatcggaatgagagggatc 3653002  T
Q  150 ctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttat 195  Q
    |||| || || |||||||| ||||  ||||||||| |||| |||||    
T  3653003 ctgaggctgtgtaggtatgggactgcatggttgaacgaaggcttat 3653048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 125 - 226
Target Start/End: Original strand, 21311514 - 21311615
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||| |||||| | ||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| || |||    
T  21311514 gaatcacatcggaatgagagggttcatgaggccgtacaagtatgggactgcatggttgaaggaagccttataagaattgtttggtattacctagataaac 21311613  T
Q  225 aa 226  Q
    ||    
T  21311614 aa 21311615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 146 - 237
Target Start/End: Original strand, 15929219 - 15929310
Alignment:
Q  146 gatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattc 237  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||| ||  ||||| ||||||||||| || | |||||||||| || ||||||||||    
T  15929219 gatcctgaggccgtttaggtatgagactacaaggttgaagaaaagcttataagaattgtttggtaatgcctatatcaataagatgcatattc 15929310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 128 - 226
Target Start/End: Original strand, 32292887 - 32292985
Alignment:
Q  128 tcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaa 226  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |   |||  ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  32292887 tcacattggaatgagagaaatccttagatcgtgcaggtatgagactgcatggttgaatgaaggcttataagaattgtttggtactacctataccaacaa 32292985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28065982 - 28065877
Alignment:
Q  128 tcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaac 227  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | | ||| |||  |||||||| |||| ||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||     
T  28065982 tcacatcggaatgagagggatcctaaggtcgtgtagaaatgagactgtatgattgaatgaaagcttataagaattgtttggtactatctctatcaacaag 28065883  T
Q  228 atgcat 233  Q
    ||||||    
T  28065882 atgcat 28065877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 233
Target Start/End: Original strand, 17850897 - 17851025
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| | |||  | ||||| ||||  |||||| || |||  || || |||  |||    
T  17850897 cgacaacttctagacgaaccgaatcacaccggaatgagagggatcctgaggtcgtgcaagtatgggactgcatggttaaaagaatgctgataagatatgt 17850996  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  17850997 ttggtactacctttatcaacaagatgcat 17851025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 237
Target Start/End: Original strand, 20732614 - 20732689
Alignment:
Q  162 aggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattc 237  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||| || || ||||||||||    
T  20732614 aggtatgtgactacatggttgtaggaaggcttataagaattatttggtactacctatattaataatatgcatattc 20732689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 223
Target Start/End: Original strand, 10964340 - 10964401
Alignment:
Q  162 aggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 223  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  10964340 aggtatgagactgtatggtagaagaaagacttacaagaattgtttggtactacatatatcaa 10964401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2890985 - 2890888
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 223  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||| || |||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||  |||| ||||||||| |  ||||||||||||||    
T  2890985 gaatcacattagaatgagag-gatcccgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggtttataagaattgttagggactacctatatcaa 2890888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 233
Target Start/End: Original strand, 13492397 - 13492439
Alignment:
Q  191 cttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13492397 cttataagaattgtttgatattacctatatcaacaagatgcat 13492439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 233
Target Start/End: Original strand, 28583012 - 28583070
Alignment:
Q  175 tatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  28583012 tatggttgaatgaaggcttataagaattatttgatacgatctatatcaacaagatgcat 28583070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 35)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Original strand, 33174880 - 33175065
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||| |||||||| | ||  ||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||| ||    
T  33174880 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcatgacaatgagtggctcccgacaacttctagacaagccgaatcacatcggaatgagaggga 33174979  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  33174980 tcctgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 33175065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Original strand, 1706964 - 1707148
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| || || ||||||  |||||||| | ||  |||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  1706964 ggctaacgagggcggggagtggtcgtcggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacaatttctagaggaaccgaatcacatcggaatgagag-ga 1707062  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||||||  | || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  1707063 tcctgagactgtgtaggtatgagactacatgattgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 1707148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18448142 - 18447957
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgaggactttc-gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | | || || ||||||  ||||||||   || | |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||    
T  18448142 ggctggcgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggttcccgacagcttttagaggaaccgaatcacatcggaatgataggga 18448043  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||    
T  18448042 tcctgaggccgtgtaggtatgtgactacatggttgaagtaagacttataagaattgtttggtactacttgtatcaacaagatgcat 18447957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 105 - 233
Target Start/End: Original strand, 33174484 - 33174610
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  33174484 cgacagcttctagacgaaccgaatcacatcggaatgagagggatcctgatgccgtgtaggtatgggactaca--gttgaaggaaggcttataagaattgt 33174581  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  33174582 ttggtactacctatatcaacaagatgcat 33174610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 105 - 233
Target Start/End: Original strand, 11388168 - 11388294
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||  | ||||||    
T  11388168 cgacaacttttagaggaaccgaatcacatcggaatgagag-gatcctgatgccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaatgctta-aaaaattgt 11388265  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  11388266 ttggtactacctatatcaacaagatgcat 11388294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 105 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18099045 - 18098917
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| ||||||||    
T  18099045 cgacagcttatagaggaaccgaatcacatcggaatgagaggaatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaagggatgcttataagaattgt 18098946  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  18098945 ttggtactacctatatcaacaagatgcat 18098917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Original strand, 30966229 - 30966341
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  30966229 aactgaatcgcatcggaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 30966328  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||||    
T  30966329 caacaagatgcat 30966341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 111 - 233
Target Start/End: Original strand, 1912510 - 1912632
Alignment:
Q  111 cttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgata 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |   | |||||||||||||| ||||||||| | ||| |||| ||||||||||| ||    
T  1912510 cttttagaggaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggttatgtaggtatgagactacatggttgaaagtagatttataagaattgtttggta 1912609  T
Q  211 ctacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  1912610 ctacctatatcaacaagatgcat 1912632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 125 - 233
Target Start/End: Original strand, 1953154 - 1953262
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1953154 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaagacctataagaattgtttggtactacctatatcaac 1953253  T
Q  225 aacatgcat 233  Q
     | ||||||    
T  1953254 tagatgcat 1953262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 51 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 38899134 - 38898951
Alignment:
Q  51 ctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatc 149  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||| | |||||| | ||  ||||||||| ||||| | |  ||||||||||||| ||||| ||||    
T  38899134 ctgacgagggcggggagtggtcgttggtgcataagacatgaaaatgagtggctcccgacaacttctagacaagccaaatcacatcggaaggagagtgatc 38899035  T
Q  150 ctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
     ||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  38899034 ttgaggccgtgtaggtatcagactacatggttgaaggagagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 38898951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 52 - 233
Target Start/End: Original strand, 41754214 - 41754396
Alignment:
Q  52 tgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcc 150  Q
    |||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||     
T  41754214 tgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaactgaatcacaccggaatgagagggttct 41754313  T
Q  151 tgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||| |||||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  41754314 tgaggccgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactatctatatcaacaagatgcat 41754396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Original strand, 29804604 - 29804789
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | | || || ||||||  | |||||| | ||  ||||| ||| |||| |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  29804604 ggctgacgaggacggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgataatgagcggctcccgacagcttctagaggaatcgaatcacatcggaatgagaggga 29804703  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||| | |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  29804704 tcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggcaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcat 29804789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Original strand, 30966685 - 30966797
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||  ||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  30966685 aactgaatcgcatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggattataagaattgtttggtactacctatat 30966784  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||||    
T  30966785 caacaagatgcat 30966797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25338221 - 25338036
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    |||||||||||||| |||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |     
T  25338221 ggctgacgagggcgaggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaactgaatcacaccggaatgagagggt 25338122  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| | |||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  25338121 tcctgaggtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcat 25338036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25434280 - 25434095
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||  | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| || |||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  25434280 ggctgacgagggcggggagtggccgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctaaacgaaccgaatcacaccggaatgagaggga 25434181  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| |||||   |||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  25434180 tcctgaggccgtgctggtatgggacttcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgatacaacctttatcaacaagatgcat 25434095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Original strand, 24818321 - 24818433
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| ||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  24818321 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgcatgtatgggactgcatggttcaaggaaggcttataagaattgtttagtactacctatat 24818420  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||||    
T  24818421 caacaagatgcat 24818433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 233
Target Start/End: Original strand, 8256534 - 8256633
Alignment:
Q  134 cggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  8256534 cggaatgagagggatcttgaagccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcat 8256633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 118 - 233
Target Start/End: Original strand, 16379385 - 16379500
Alignment:
Q  118 acgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactaccta 217  Q
    |||||| |||||| || |||||||||| ||||| || |||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  16379385 acgaaccgaatcaaattggaatgagagggatcccgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaagacttatacgaattgtttggtactaccta 16379484  T
Q  218 tatcaacaacatgcat 233  Q
    ||||||||| ||||||    
T  16379485 tatcaacaagatgcat 16379500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29259770 - 29259659
Alignment:
Q  122 actgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||| ||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| ||||||    
T  29259770 actgaatcacatcggaatgagagggatcctgagaccgtacaagtatgggactgcatggttgaaggaaggcttattaaaattgtttggtactacatatatc 29259671  T
Q  222 aacaacatgcat 233  Q
    ||||| ||||||    
T  29259670 aacaagatgcat 29259659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 233
Target Start/End: Original strand, 16378938 - 16379044
Alignment:
Q  127 atcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaa 226  Q
    |||||| ||||||||||| ||| | || |||||  | ||||||||||  |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16378938 atcacaccggaatgagagggattccgaggccgtgcaagtatgagactgcatggttgaaggaagtcttatacgaattgtttgatactacctatatcaacaa 16379037  T
Q  227 catgcat 233  Q
     ||||||    
T  16379038 gatgcat 16379044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 5399965 - 5399856
Alignment:
Q  124 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||  | ||||| || | ||||||| |||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5399965 tgaatcacatcggaatgagagggatcttgaggtcgtgcaagtatgggagtgtatggtttaagggaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaa 5399866  T
Q  224 caacatgcat 233  Q
    ||| ||||||    
T  5399865 caagatgcat 5399856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 137 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8181486 - 8181397
Alignment:
Q  137 aatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaa 226  Q
    |||||||| ||||| ||  || |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8181486 aatgagagggatcccgagaccttataggtatgggactttgtggttgaaggaagacttttaagaattgtttggtactacctatatcaacaa 8181397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 146 - 233
Target Start/End: Original strand, 11394555 - 11394641
Alignment:
Q  146 gatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||  | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  11394555 gatcctgatgccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaatgctta-aaaaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 11394641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 226
Target Start/End: Original strand, 15619887 - 15619998
Alignment:
Q  115 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 214  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||| || |||||  | ||||||||||  || |||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||    
T  15619887 tagacgaaccgaattacatcagaatgagagggatcccgatgccgtgcaagtatgagactgcatagttgaaggcaagcttataagaattgtttggtactac 15619986  T
Q  215 ctatatcaacaa 226  Q
    ||||||||||||    
T  15619987 ctatatcaacaa 15619998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30962038 - 30961919
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttga--------aggaagacttatgagaattgtttgatactacct 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||        |||||| ||||| ||| ||| ||| ||||||||    
T  30962038 gaatcacatcagaatgagagagatcctgaagccgtgtaggtatgggattgcatggttgaaggatttaaggaagtcttataagatttgattggtactacct 30961939  T
Q  217 atatcaacaacatgcatatt 236  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  30961938 atatcaacaagatgcatatt 30961919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30963857 - 30963759
Alignment:
Q  135 ggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||| |  ||||||||||||| |||||| |||||||| || | |||||||||||||||| ||||||    
T  30963857 ggaatgagagggatcatgaagccgtgcaggtaagagaatgcatggttgaaggaaaacttataagaattgtatggttctacctatatcaacaagatgcat 30963759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 125 - 226
Target Start/End: Original strand, 16541984 - 16542085
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    |||||||||| |||||| || |||||   ||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||    
T  16541984 gaatcacatcagaatgatagggatcccagagctgtgtaggtatgactctacatggttgaaggaagacttataataattgttttgtactacctatatcaac 16542083  T
Q  225 aa 226  Q
    ||    
T  16542084 aa 16542085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Original strand, 33770932 - 33771108
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |     
T  33770932 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaactgaatcacaccggaatgagagggt 33771031  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||||||         |||||| ||||  | |||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  33771032 tcctga---------ggtatgggactgcagggttgaagaaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 33771108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 162 - 233
Target Start/End: Original strand, 8073928 - 8073999
Alignment:
Q  162 aggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  8073928 aggtatgggtctataaggttgaagggagacttataagaattgtttggtactacctataccaacaagatgcat 8073999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 226
Target Start/End: Original strand, 83012 - 83117
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    ||  ||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||     
T  83012 aactgaatcacgtcgaaatgagagggatcctgagattgtgcaggtatgagactacatggttgaaggtatgcttataagaatcgtttggtactacctatac 83111  T
Q  221 caacaa 226  Q
    ||||||    
T  83112 caacaa 83117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30963407 - 30963302
Alignment:
Q  128 tcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaac 227  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||| | | ||||  || |  ||| |||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  30963407 tcacatcagaatgagagggatcatgaagccgcacatgtatatgaatgcatgattgaaggaaggcttataagaattgttaggtactacctatatcaacaag 30963308  T
Q  228 atgcat 233  Q
    ||||||    
T  30963307 atgcat 30963302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 125 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27883073 - 27882965
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||| |||||  | ||||||||||  || ||||||||||  ||||| ||||||||||| || || |||||||||     
T  27883073 gaatcacaccgaaatgagagggatcctgaggccgtgcatgtatgagactgcattgttgaaggaatgcttataagaattgtttggtattatctatatcaat 27882974  T
Q  225 aacatgcat 233  Q
    || ||||||    
T  27882973 aagatgcat 27882965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 187
Target Start/End: Original strand, 9909102 - 9909153
Alignment:
Q  136 gaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaagga 187  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9909102 gaatgagagggatcctgaaatcgtataagtatgagactatatggttgaagga 9909153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 233
Target Start/End: Original strand, 13191010 - 13191081
Alignment:
Q  162 aggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| |||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||    
T  13191010 aggtataagactgcatggttcaaggaagacttataagaattgtttggtactacatataccaacaagatgcat 13191081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 231
Target Start/End: Original strand, 20502073 - 20502128
Alignment:
Q  176 atggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgc 231  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||    
T  20502073 atggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactttctatatcaacaagatgc 20502128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 54)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 50398756 - 50398571
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||| |||||||| | ||  ||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||| ||    
T  50398756 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcatgacaatgagcggctcccgacaacttctagacaagccgaatcacatcggaatgagaggga 50398657  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  50398656 tcctgaggccgtgtaggtataggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 50398571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 44471470 - 44471358
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  44471470 aactgaatcacatcggaatgagagagatcttgaggccgtacaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatat 44471371  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||||    
T  44471370 caacaagatgcat 44471358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 49 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 50399210 - 50399034
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |||| || ||||||| |||||||| | |||  |||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||| ||    
T  50399210 ggctgacgagggcggg-agtggtcgccagtgcacaaggcatgacaatgagcggcttctgacaacttctagacaagccgaatcacatcggaatgagaggga 50399112  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaaca 225  Q
    ||||||  |||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50399111 tcctgagaccgtgtaggtatgagattacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaaca 50399034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 51 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4127654 - 4127470
Alignment:
Q  51 ctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaactttta-gacgaactgaatcacatcggaatgagagagat 148  Q
    ||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||  ||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||| |||    
T  4127654 ctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacaacttctaagaggaaccgaatcacatcggaatgagagggat 4127555  T
Q  149 cctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  4127554 cctgaggccatgtaggtatgggactacatagttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 4127470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 106 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29628827 - 29628707
Alignment:
Q  106 gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtt 205  Q
    |||| ||| |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29628827 gacagcttctagaggaaccgaatcacatcgaaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagaattgtt 29628728  T
Q  206 tgatactacctatatcaacaa 226  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  29628727 tggtactacctatatcaacaa 29628707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 105 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 53854968 - 53854858
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53854968 cgacagcttatagacgaaccgaatcacatcggaatgagagggatcatgaagcagtgtaggtatgagactatatggttgaaggaagacttataagaattgt 53854869  T
Q  205 ttgatactacc 215  Q
    ||| |||||||    
T  53854868 ttggtactacc 53854858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1645967 - 1645782
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||  |    
T  1645967 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacatcggaatgagaggaa 1645868  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    || ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  1645867 tcttgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtattacctatatcaacaagatgcat 1645782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 125 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4128030 - 4127922
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4128030 gaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatgtaggcatgagactatatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 4127931  T
Q  225 aacatgcat 233  Q
    || ||||||    
T  4127930 aagatgcat 4127922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 233
Target Start/End: Original strand, 3169186 - 3169313
Alignment:
Q  106 gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtt 205  Q
    |||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  3169186 gacagcttatagaggaaccgaatcacatcggaatgagaggaatcatgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaagacttataaaaattgtt 3169285  T
Q  206 tgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||    
T  3169286 tggtactacctatatcaacaagatgcat 3169313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23943001 - 23942822
Alignment:
Q  52 tgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgaggactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcct 151  Q
    |||||||||||||||||||| | | || || ||||||  ||||||||  | |  |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  23943001 tgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagctcct--gacagcttctagaggaaccgaatcacatcggaatgagagggatcct 23942904  T
Q  152 gaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |  ||||| ||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  23942903 ggggccgtgtaggtatggaactacatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 23942822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12692217 - 12692032
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  12692217 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 12692118  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  12692117 tcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 12692032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 124 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14572292 - 14572183
Alignment:
Q  124 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14572292 tgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatgtaggtatgggactacatggttgaagggaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaa 14572193  T
Q  224 caacatgcat 233  Q
    ||| ||||||    
T  14572192 caagatgcat 14572183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 233
Target Start/End: Original strand, 1464122 - 1464254
Alignment:
Q  101 ctttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaa 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||   |||| ||||||||||| || || |||||| ||| |||||| ||||    
T  1464122 ctttcgacaccttttagacgaaccgaatcacatcagaatgagagggatcatgcgaccgtgtaggtatgagaatacatagttgaaagaaaacttataagaa 1464221  T
Q  201 ttgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  1464222 ttgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 1464254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23350428 - 23350316
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  23350428 aactgaatcacatcggaatgagagagatcttgaggccgtacaggtaggggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtacttcctatat 23350329  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||||    
T  23350328 caacaagatgcat 23350316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Original strand, 35871623 - 35871735
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||    
T  35871623 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgggacttcatggttgaaggaaggcttatatgaattgtttggtaccacctatat 35871722  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||||    
T  35871723 caacaagatgcat 35871735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 44471019 - 44470907
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| | ||||| |||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  44471019 aactgaatcacatcggaatgagagagatcatgacgctgtacaagtatgtgactgtatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 44470920  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||||    
T  44470919 caacaagatgcat 44470907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 115 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21220482 - 21220364
Alignment:
Q  115 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 214  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||||||| |||| ||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||    
T  21220482 tagaggaaccgaatcacatcagaatgagagggatcatgaggccatgtaggtatgaaactatatggttgaaggaatgcttataagaattgtttggtactac 21220383  T
Q  215 ctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  21220382 ctatatcaacaagatgcat 21220364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 51331499 - 51331321
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgaggactttcg-acaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||| | ||||||   || |  | ||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||  |    
T  51331499 ggctgatgagggcggggagtggttgtcggtgcacaaggcatgataatgagcggttccctataacttctagacaagccgaatcacatcggaatgagaggaa 51331400  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaa 226  Q
    || ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  51331399 tcatgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactatctatatcaacaa 51331321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Original strand, 49998631 - 49998743
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| | || || |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  49998631 aactaaatcacatcggaatgagagggatcctaaggctgtgtaggcatgggactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatat 49998730  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||||    
T  49998731 caacaagatgcat 49998743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9424072 - 9423891
Alignment:
Q  53 gacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcct 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || || ||||||  |||| ||| | ||  |||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  9424072 gacgagggcggggagtggtcgtcggtgcacaaggcacgacaaagagtggctcccgacgacttctagacgaaccgaatcacaccggaatgagagggatcct 9423973  T
Q  152 gaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    || | |||  | ||||| ||||  ||||||||| |||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  9423972 gaggtcgtgcatgtatgggactgcatggttgaaagaaggcttataataattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 9423891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 53996274 - 53996155
Alignment:
Q  107 acaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgttt 206  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||  | ||| |||| ||||| |||||||||||||  ||||| | ||||||||    
T  53996274 acaacttttagaggaaccgaatcacatcggaatgagaaggatcctgaggctatgtagatatgggactacatggttgaaggaatgcttataaaaattgttt 53996175  T
Q  207 gatactacctatatcaacaa 226  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  53996174 ggtactacctatatcaacaa 53996155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 129 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8467937 - 8467833
Alignment:
Q  129 cacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaaca 228  Q
    |||||| |||||| || ||||||||  | ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  8467937 cacatcagaatgaaagggatcctgagactgtgcaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctataccaacaaga 8467838  T
Q  229 tgcat 233  Q
    |||||    
T  8467837 tgcat 8467833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24629593 - 24629466
Alignment:
Q  106 gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtt 205  Q
    |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| | |||||| | ||| |||||||| ||||  |||||| ||||||  ||||| |||||||||    
T  24629593 gacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggttcctgaggtcgtgtaggtatgggactgcatggttaaaggaatgcttataagaattgtt 24629494  T
Q  206 tgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||    
T  24629493 tggtactacctatatcaacaagatgcat 24629466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 233
Target Start/End: Original strand, 21067261 - 21067389
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| || | |||  | ||||||||||  ||||||||||||||||| || | |||| |    
T  21067261 cgacaacttatagacgaatcgaatcacaccggaatgagagggatcccgaggtcgtgcatgtatgagactgcatggttgaaggaagactaataataattat 21067360  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  21067361 ttggtactacatatatcaacaagatgcat 21067389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24629126 - 24629010
Alignment:
Q  120 gaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaa---gacttatgagaattgtttgatactacct 216  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||  |||||| ||||||   | ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24629126 gaaccgaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgtaggtatgggactgcatggttaaaggaattaggcttataagaattgtttggtactacct 24629027  T
Q  217 atatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||||||| ||||||    
T  24629026 atatcaacaagatgcat 24629010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 226
Target Start/End: Original strand, 21067666 - 21067834
Alignment:
Q  56 gagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaa 154  Q
    |||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||  |||||| || ||||||||| |||||||| | |||||   || |||| ||     
T  21067666 gagggcggggagtggtcgccggtgcagaaggcacgacaatgagcggctcccgacaaattatagacgaaccgaatcacaccagaatg---gaaatcccgag 21067762  T
Q  155 gccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaa 226  Q
    |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  21067763 gccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtgctacctatatcaacaa 21067834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Original strand, 27026426 - 27026610
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||| || || ||||||| |||||||| ||||   |  | ||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  27026426 ggctgacgagaacggggagtggtcgtcggtgcacaaggcatgacaatgagcgactcctggtagcttttaggcaaaccgaatcacatcagaatgagaggga 27026525  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |  || | | ||  ||||||| ||||| | | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27026526 tattgga-cggtgcaggtatgggactacacgattgaaggaaggcttataagaattgtttgatactacctatatcaacaagatgcat 27026610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 121 - 226
Target Start/End: Original strand, 41869913 - 41870018
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| |  |||| ||||  ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  41869913 aactaaatcacatcggagtgagagggatcctgagactgtacatatatgggactgcatgattgaaggaagacttataagaattgtatgatactacctatat 41870012  T
Q  221 caacaa 226  Q
    ||||||    
T  41870013 caacaa 41870018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14571866 - 14571754
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    ||||||||||||||  ||||| || |||| |||  |||| |||||||| ||||  ||||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14571866 aactgaatcacatcataatgaaagggatcttgagtccgtgtaggtatgggacttcatggttgaagggatgcttataagaattgtttggtactacctatat 14571767  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||||    
T  14571766 caacaagatgcat 14571754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24271690 - 24271580
Alignment:
Q  128 tcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtat--aggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaaca 225  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| | ||| |  ||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||  ||||    
T  24271690 tcacatcggaatgagagggttcctgaggtcgtgtgcaggtatgagactacatggttaaagtaagacatataagaattatttgatactacctatacgaaca 24271591  T
Q  226 acatgcatatt 236  Q
    | |||||||||    
T  24271590 agatgcatatt 24271580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 231
Target Start/End: Original strand, 17028869 - 17028979
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  | ||||| ||||  || ||||||||| || || | ||||||||| | | ||||||||||    
T  17028869 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaagccttgcatgtatgggactgcatagttgaaggaggatttgtaagaattgttaggtgctacctatat 17028968  T
Q  221 caacaacatgc 231  Q
    |||||| ||||    
T  17028969 caacaagatgc 17028979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27579050 - 27578952
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 223  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| | ||| ||| ||||||||| ||||  |||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  27579050 gaatcacatcggaataagagggatcttaaagtcgtgtaggtatgacactacttggttgactgaagacttataagaattgtttggtactacatatatcaa 27578952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7678727 - 7678655
Alignment:
Q  161 taggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  7678727 taggtatggggctacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcat 7678655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 233
Target Start/End: Original strand, 14351774 - 14351902
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||| | ||||||||| |||||||| | |||  | ||||||| ||  |||||||||||||| ||| | ||| || |    
T  14351774 cgacaacttctagacaaaccgaatcacaccagaatgagagggatcctgaggtcgtgcatgtatgagtctgcatggttgaaggaaggcttgtaagagtttt 14351873  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  14351874 ttggtactatctatatcaacaagatgcat 14351902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 43929092 - 43928996
Alignment:
Q  137 aatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||  ||||  ||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||    
T  43929092 aatgagagggttcctgaagccgtgcaggtatgagactatttggtcgaaggaaagcttacaagaattgtttggtactacatataccaacaagatgcat 43928996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 106 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13614057 - 13613930
Alignment:
Q  106 gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtt 205  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||||| ||||| || |  ||  | | ||||||||  ||||| ||||||  |||||| |||||||||    
T  13614057 gacaacttttagataaaccgaatcacaatggaatgagagggatccagaggttgtgcatgcatgagactccatggtagaaggagtacttataagaattgtt 13613958  T
Q  206 tgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13613957 tgataccacctatatcaacaagatgcat 13613930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 233
Target Start/End: Original strand, 42838628 - 42838730
Alignment:
Q  130 acatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacat 229  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||  | || || ||||||||||| || ||| ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  42838628 acatcagaatgagag-gatcctgagactgtgtaagtatgagactacatagttcaaggaagacgtataaaaattgtttggtactacctatatcaacaaaat 42838726  T
Q  230 gcat 233  Q
    ||||    
T  42838727 gcat 42838730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31817616 - 31817431
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgaggactttc-gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||| |||||||||||   |||| || ||||||| ||||||||   || | ||||| |||||||| |   ||||||||||| ||| |||| ||    
T  31817616 ggctgacgaggccggggagtggtcaccagtgcacaaggcatgacaatgagcggttcccgacaatttttagacaaggagaatcacatcgaaataagaggga 31817517  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    || ||| | |||  | ||||||||||  |||||||||||||   |||| | ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  31817516 tcatgaggtcgtgcatgtatgagacttcatggttgaaggaacgtttataataattgtttggtactacctataccaacaaaatgcat 31817431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 236
Target Start/End: Original strand, 17029325 - 17029440
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||  || | |||  | ||||| ||||  || |||||| |||||||| | | ||||||||  ||||||||||||    
T  17029325 aactgaattacatcggaatgagagggatctagaggtcgtgcaagtatgggactgcatagttgaatgaagacttgtaataattgtttagtactacctatat 17029424  T
Q  221 caacaacatgcatatt 236  Q
    |||||| |||||||||    
T  17029425 caacaagatgcatatt 17029440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 233
Target Start/End: Original strand, 27029317 - 27029384
Alignment:
Q  166 atgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  27029317 atgagactacacgattgaaggaagacttataagaattatttggtactacttatatcaacaagatgcat 27029384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 52048804 - 52048693
Alignment:
Q  128 tcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaac 227  Q
    |||| |||||||||||| | |||| | |||||| |||||||| |||  || | |||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||  |||||     
T  52048804 tcacgtcggaatgagagggttcctaaggccgtacaggtatgaaactgcatagctgaaggaaaatttataagaattgtttgatactacgtatactaacaag 52048705  T
Q  228 atgcatattcat 239  Q
    |||||| |||||    
T  52048704 atgcatcttcat 52048693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 236
Target Start/End: Original strand, 53391890 - 53391997
Alignment:
Q  129 cacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaaca 228  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  |||   ||||||||||  |||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||| | |||||||||||| |    
T  53391890 cacatcagaatgagagagatcttgaagttgtaagagtatgagactgcatggttgaagaaatgcttataaaaattgtttgataccatctatatcaacaaga 53391989  T
Q  229 tgcatatt 236  Q
    | ||||||    
T  53391990 tacatatt 53391997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 233
Target Start/End: Original strand, 17628561 - 17628618
Alignment:
Q  176 atggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  17628561 atggttgaaggtaggcttataagaattgtttggtactacctataccaacaagatgcat 17628618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23943332 - 23943275
Alignment:
Q  176 atggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||||||||||||||||| | || | |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  23943332 atggttgaaggaagacttataaaaaatatttggtactacctatatcaacaagatgcat 23943275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31817942 - 31817885
Alignment:
Q  176 atggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||    
T  31817942 atggttgaaggaaggcttataagaattgttcggtactacctataccaacaagatgcat 31817885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26200425 - 26200314
Alignment:
Q  128 tcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaaga--cttatgagaattgtttgatactacctatatcaaca 225  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    || |||||||| |||   |||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||| |||||  ||||    
T  26200425 tcacatcagaatgagagggatcctgatattgtgtaggtatgggacatcatggttgaaggaagaggcttataacaattgtttgatactaactatacaaaca 26200326  T
Q  226 acatgcatattc 237  Q
    | ||||||||||    
T  26200325 agatgcatattc 26200314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 144
Target Start/End: Original strand, 44830977 - 44831017
Alignment:
Q  104 tcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagag 144  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  44830977 tcgacaacttttagatgaaccgaatcacatcggaatgagag 44831017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 159
Target Start/End: Original strand, 35477801 - 35477836
Alignment:
Q  124 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgt 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35477801 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaggccgt 35477836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 149
Target Start/End: Original strand, 10165939 - 10165977
Alignment:
Q  111 cttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatc 149  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  10165939 cttttagacgaaccgaatcacatcggaatgagaaagatc 10165977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 33987274 - 33987188
Alignment:
Q  64 ggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatc 149  Q
    |||||||| |||||| || ||||||| |||||||| |||| | | || ||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33987274 ggagtggtcgtcagtgcacaaggcatgacaatgagcgactcttggcagcttctaggcaaactgaatcacatcggaatgagagggatc 33987188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 124 - 233
Target Start/End: Original strand, 13266084 - 13266193
Alignment:
Q  124 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 223  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| | |||||||  ||||||| || |  |||||||||||||| ||||| | |||| |||  |||| ||||||||||    
T  13266084 tgaatcacattagaatgagagggatcttaaagccgtgcaggtatgggaatgcatggttgaaggaaggcttataataattttttagtactccctatatcaa 13266183  T
Q  224 caacatgcat 233  Q
     || ||||||    
T  13266184 taagatgcat 13266193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 180 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23976305 - 23976252
Alignment:
Q  180 ttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||    
T  23976305 ttgaaggaagagttataagaattgtttggtactacctatactaacaagatgcat 23976252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 164 - 233
Target Start/End: Original strand, 33764898 - 33764967
Alignment:
Q  164 gtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||| |||||| ||||||| | |||||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||    
T  33764898 gtataagactacatggttggatgaagacttttaagaattgtttggtgctacctataccaacaagatgcat 33764967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 2499727 - 2499647
Alignment:
Q  133 tcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatacta 213  Q
    |||||||||||| ||| || || ||||  ||||||||||||  |||||||||| || |||||| | ||||||||| |||||    
T  2499727 tcggaatgagagggattctaaaaccgtgcaggtatgagacttcatggttgaagcaacacttataaaaattgtttggtacta 2499647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18301 - 18173
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  18301 cgacagcttctagaggaactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgtgactacatagttgaaggaagacttataagaattgt 18202  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18201 ttgatactacctatatcaacaagatgcat 18173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 105 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17765 - 17645
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||||||| | || |||| |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  17765 cgacaacttcttgaggaaccgaatgacatcagaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaagcttataagaattgt 17666  T
Q  205 ttgatactacctatatcaaca 225  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  17665 ttggtactacctatatcaaca 17645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 39)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 233
Target Start/End: Original strand, 2044037 - 2044165
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  2044037 cgacaacttctagaggaacagaatcacatcggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaattgt 2044136  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2044137 ttgatactacctatatcaacaagatgcat 2044165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8080566 - 8080381
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    |||||||||||||| |||||||| | | || || ||||||  |||||||| | || |  ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8080566 ggctgacgagggcgaggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcttaacagcttctagaggaactgaatcacatcggaatgagaggga 8080467  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||  || || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  8080466 tcctgaagccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaagctgataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 8080381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22840753 - 22840568
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | | || |||||| ||  | |||||| | ||  ||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22840753 ggctgacaagggcggggagtggtcgccggtgcataagacacgataatgagcggctcccgataacttctagagtaactgaatcacatcggaatgagagaga 22840654  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||  | |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  22840653 tcctgaggctttgtaggtatgagactacatggtcgaatgaagacttataagaattgtttggtactatctatatcaacaagatgcat 22840568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27022562 - 27022377
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| || | |||||||||||||||||||| ||    
T  27022562 ggctgacgaggacggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggagccgaatcacatcggaatgagaggga 27022463  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    || ||| ||| | |||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27022462 tcttgaggccatgtaggtatgggactacatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaacatgcat 27022377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Original strand, 28453261 - 28453445
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||  |||||||| | ||  |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||    
T  28453261 ggctgacgagggcggggagtggttgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacaacttttagatga-ctgaatcacaccggaatgagaggga 28453359  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||| || | |||  ||||||||||||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  28453360 tcccgaggtcgtgcaggtatgagacttcatggttgaaagaaaacttataagaattgttttatactacctatattaacaagatgcat 28453445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 34308630 - 34308518
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  34308630 aactgaatcacatcggaatgaaagggatcctgaggccgtacaagtatgagactgtatggttgaaggaaggcttataagaactgtttggtactacctatat 34308531  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||||    
T  34308530 caacaagatgcat 34308518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 131 - 226
Target Start/End: Original strand, 17103086 - 17103181
Alignment:
Q  131 catcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  17103086 catcggaatgagagagatcctgaggccgtacaggtatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactgcctatatcaacaa 17103181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29971561 - 29971450
Alignment:
Q  112 ttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatac 211  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||  |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  29971561 ttttagacgaactgaatcacatcagaattggaaggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagatttataagaattgtttgatac 29971462  T
Q  212 tacctatatcaa 223  Q
    || |||||||||    
T  29971461 tatctatatcaa 29971450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 34309090 - 34308991
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  34309090 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacaagtatgagactgtatggttgaaggaaggcttataagaactgtttggtactacctatat 34308991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Original strand, 10844805 - 10844990
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  10844805 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 10844904  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  10844905 tcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 10844990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22549219 - 22549034
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| |||||||||||       
T  22549219 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagaggct 22549120  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| || ||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  22549119 tcctgaggctgtgcaggtatgtgactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 22549034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 41659328 - 41659144
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||| ||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  41659328 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaag-cacgacaatgagtggctcccgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 41659230  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| | |||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  41659229 tcctgatgtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 41659144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Original strand, 25147531 - 25147643
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |  | || |||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  25147531 aactaaatcacatcggaatgagagagatcctaagactgtgtaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtgctacctatat 25147630  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||||    
T  25147631 caacaagatgcat 25147643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Original strand, 22026301 - 22026486
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    |||||||||||||| |||||||| | | || || ||||||| |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  22026301 ggctgacgagggcgaggagtggtcgccggtgcacaaggcatgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 22026400  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    || ||| |||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  22026401 tcgtgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaatgaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 22026486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 125 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6465057 - 6464949
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||| ||| ||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6465057 gaatcacattggaatgagaggaatcatgaggccgtgtaggtatggaactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 6464958  T
Q  225 aacatgcat 233  Q
    || ||||||    
T  6464957 aagatgcat 6464949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 233
Target Start/End: Original strand, 27925879 - 27926006
Alignment:
Q  106 gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtt 205  Q
    |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| | |||||| |||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  27925879 gacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggattataagaattgtt 27925978  T
Q  206 tgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||    
T  27925979 tggtactacctatatcaacaagatgcat 27926006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 115 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12827411 - 12827293
Alignment:
Q  115 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 214  Q
    |||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  12827411 tagaagaaccgaatcacgccggaatgagagggatcctgaggccttgtaggtatgggactacttggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactac 12827312  T
Q  215 ctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  12827311 ctatatcaacaagatgcat 12827293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 135 - 233
Target Start/End: Original strand, 22705181 - 22705279
Alignment:
Q  135 ggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  ||| ||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  22705181 ggaatgagagggatcctgaagccgtgtaggtatgggactggatgattgaaggaagggttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 22705279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 33852410 - 33852304
Alignment:
Q  120 gaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctata 219  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||  ||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  33852410 gaactgaatcacaccagaatgagagggatcccgagaccgtgcaggtatgagactgtatggttgaaggaaaacttataagaattgtttggtactacctata 33852311  T
Q  220 tcaacaa 226  Q
    | |||||    
T  33852310 ttaacaa 33852304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Original strand, 12100687 - 12100798
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||| |  ||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  12100687 aactgaatcacatcgaaatgaga-agatcctgaggccgtacaggtatgagactgcatggttgaaggcaagcttataagatttgtttggtactacctatat 12100785  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    ||| || ||||||    
T  12100786 caataagatgcat 12100798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27022107 - 27021918
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatga----ga 143  Q
    |||||||||||| |||||||||| |   || || ||||||  |||||||| | ||  ||||||||| |||| || | |||||||||||||||||    ||    
T  27022107 ggctgacgagggtggggagtggtcgcgggtgcacaaggcacgacaatgagtggctcccgacaacttctagaggagccgaatcacatcggaatgaatgaga 27022008  T
Q  144 gagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    | |||||||| ||| | ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  27022007 gggatcctgaggccatgtaggtataagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacttatatcaacaagatgcat 27021918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28375221 - 28375093
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||| ||| ||||||||  |||||||| |  |||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||  ||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  28375221 cgacagcttctagacgaaacgaatcacaccataatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatgattgaaggaaggcttataagaattgt 28375122  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  28375121 ttggtactacctacatcaacaagatgcat 28375093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22548773 - 22548588
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    |||||| ||||| |||||||||| | |||| || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| ||||  ||||||| ||||||||||| |     
T  22548773 ggctgatgagggtggggagtggtcgccagtgcacaaggcactacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaacctaatcacaccggaatgagagggt 22548674  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| || ||  ||||||| ||||  ||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  22548673 tcctgaggctgtgcaggtatgtgactgcatggttgaaggaagttttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 22548588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 121 - 237
Target Start/End: Original strand, 25147962 - 25148078
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||| || | ||| |||||||| |||| | | ||||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||    
T  25147962 aactgaatcacataagaatgagagggatcccgaggtcgtgtaggtatgggactgtgtcgttgaaggaaggcttataagaattgtttggtcttacctatat 25148061  T
Q  221 caacaacatgcatattc 237  Q
    |||||| ||||||||||    
T  25148062 caacaagatgcatattc 25148078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27819393 - 27819285
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||||| | |  | ||||||||||  |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27819393 gaatcacatcagaatgagagggatcatgaagtcatgcaagtatgagacttcatggttgaaggaaggctaataagaattgtttggtactacctatatcaac 27819294  T
Q  225 aacatgcat 233  Q
    || ||||||    
T  27819293 aaaatgcat 27819285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 232
Target Start/End: Original strand, 3744673 - 3744744
Alignment:
Q  161 taggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgca 232  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  3744673 taggtatgggactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttgacactacctataccaacaatatgca 3744744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 226
Target Start/End: Original strand, 32292386 - 32292497
Alignment:
Q  115 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 214  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| | |||||| |||||  | ||||| ||||  |||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||     
T  32292386 tagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaagtatgggactgcatggttgaaggaatgcttataagaattgtttggtactat 32292485  T
Q  215 ctatatcaacaa 226  Q
    ||||||||||||    
T  32292486 ctatatcaacaa 32292497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21316257 - 21316148
Alignment:
Q  124 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 223  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||| | |||||  |||||||||||| ||||||| || ||   ||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21316257 tgaatcacatcgcgatgagagggatcctaaggccgtgcaggtatgagactgtatggttaaatgagcgcttaaaagaattgtttggtactacctatatcaa 21316158  T
Q  224 caacatgcat 233  Q
    ||| ||||||    
T  21316157 caagatgcat 21316148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10844758 - 10844654
Alignment:
Q  129 cacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaaca 228  Q
    |||| ||||||||||| | |||||| ||| |  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  10844758 cacaccggaatgagagggttcctgaggccttgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagagttgtttggtactacctatattaacaaga 10844659  T
Q  229 tgcat 233  Q
    |||||    
T  10844658 tgcat 10844654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Original strand, 25144767 - 25144879
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  || | |||  ||||||| || |  ||| ||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  25144767 aactgaatcacatcagaatgagagagatctcgaggtcgtgcaggtatgggattgcatgattgaaggcaggcttataagaattgtttggtactacctatat 25144866  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    || ||| ||||||    
T  25144867 cagcaagatgcat 25144879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 239
Target Start/End: Original strand, 17429501 - 17429613
Alignment:
Q  126 aatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaaca 225  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  ||||  |  |||| ||||  || |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  17429501 aatcacatcggaatgagag-gatcttgagaccgtgcatatatgtgactgcattgttgaaggaagacttatgagtattatttggtactacctatatcaaca 17429599  T
Q  226 acatgcatattcat 239  Q
    | ||| || |||||    
T  17429600 agatgtatcttcat 17429613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 189
Target Start/End: Original strand, 25307687 - 25307828
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| ||  | ||| ||  |||||||| |  |||||||| |||| |||| ||||||||||||  |||||||||| ||    
T  25307687 ggctgacgagggccgggagtggtagtcggtgtacaagacacgacaatgagcggttttcgacagctttgagacaaactgaatcacactggaatgagagcga 25307786  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaag 189  Q
    | |  | |||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  25307787 ttccaaggccgtgcaggtatgagactgtatggttgaaggaag 25307828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 30335055 - 30334954
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||  | ||  ||||||| ||||  | ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  30335055 gaatcacatcggaattagatggatcctgagactgtgcaggtatgcgactgcaaggttgaaagaagacttataaaaattgtttgatactacctataccaac 30334956  T
Q  225 aa 226  Q
    ||    
T  30334955 aa 30334954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 226
Target Start/End: Original strand, 1297043 - 1297107
Alignment:
Q  162 aggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaa 226  Q
    ||||||||||||  |||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  1297043 aggtatgagactgcatggttgaagtaaaacttataagaattgtttggtactacctataccaacaa 1297107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15568139 - 15568044
Alignment:
Q  138 atgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |  |||| ||||   ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||    
T  15568139 atgagagagatcctgagaccgtacaaatatgtgacttcttggttgaaggaagacttataacaattgtttggtatgacctatatcaacaagatgcat 15568044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 164 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 36968503 - 36968433
Alignment:
Q  164 gtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcata 234  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||| |||||||    
T  36968503 gtatgaaactgtatggttgaaggatgacttataagaattgattggtgctacttatatcaacaagatgcata 36968433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15567707 - 15567602
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||   | |||| ||||   ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||     
T  15567707 aactgaatcacatcggaatgagagagatcttgacatcgcgcaagtattagacatcatggtggaaggaaggcttataagaattgtttgacactacatatac 15567608  T
Q  221 caacaa 226  Q
    ||||||    
T  15567607 caacaa 15567602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 233
Target Start/End: Original strand, 3745145 - 3745208
Alignment:
Q  170 gactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  3745145 gactacatggttgaaggaaaacttataagaactgtttagtactacctataccaacaatatgcat 3745208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 162 - 231
Target Start/End: Original strand, 41913006 - 41913075
Alignment:
Q  162 aggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgc 231  Q
    ||||||| ||||  ||| ||||| |||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  41913006 aggtatgggactgcatgtttgaaagaaggcttataagaattgtttggtgctacctatatcaacaagatgc 41913075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 41)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6747822 - 6747637
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | | || || ||||||| |||||||| | ||  ||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||    
T  6747822 ggctgacgagggcagggagtggtcgccggtgcacaaggcatgacaatgagcggctcccgacaacttctagacaagctgaatcacattggaatgagaggga 6747723  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  6747722 tcctgaggccgtgtaggtatgatactacatggttgaaggaaggattataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 6747637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 105 - 233
Target Start/End: Original strand, 42515523 - 42515651
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  42515523 cgacagcttctagacgaaccgaatcacatcagaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaagtgt 42515622  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  42515623 ttggtactacctatatcaacaagatgcat 42515651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2611876 - 2611691
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    |||||||||||| |||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |     
T  2611876 ggctgacgagggtggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaactgaatcacatcggaatgagagggg 2611777  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| | | | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  2611776 tcctgaggtcatgtaggtatgagactatatggtggaaggaaggcttataagaattgtttggtactatctataacaacaagatgcat 2611691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 124 - 233
Target Start/End: Original strand, 42515090 - 42515199
Alignment:
Q  124 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  42515090 tgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatgattgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaa 42515189  T
Q  224 caacatgcat 233  Q
    ||| ||||||    
T  42515190 caagatgcat 42515199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Original strand, 9124954 - 9125066
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  9124954 aactgaatcacatcggaatgagagagatcttgaggccgtgcaggtatgagactgtatggttaaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatat 9125053  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||||    
T  9125054 caacaagatgcat 9125066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 53 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26957777 - 26957603
Alignment:
Q  53 gacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcct 151  Q
    |||||||||||| |||||| ||| || || ||||||  |||||||| | ||  ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |    
T  26957777 gacgagggcgggaagtggtcgtcggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacaacttctagaggaaccgaatcacatcggaatgagagggatctt 26957678  T
Q  152 gaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaa 226  Q
    || || || ||||||||  |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26957677 gaggctgtgtaggtatggaactacatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaa 26957603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 49 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 34405815 - 34405638
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  34405815 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagaggga 34405716  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaaca 225  Q
    |||| | ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  34405715 tcctaaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaaca 34405638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2941908 - 2941796
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||    
T  2941908 aactgaatcacatcagaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggctgataagaattgtttggtactacctatat 2941809  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||||    
T  2941808 caacaagatgcat 2941796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11517539 - 11517428
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  11517539 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgggactgcatggt-gaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 11517441  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||||    
T  11517440 caacaagatgcat 11517428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 233
Target Start/End: Original strand, 28495835 - 28495961
Alignment:
Q  107 acaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgttt 206  Q
    ||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||     
T  28495835 acaacttctagaggaatcgaatcacatcggaatgagagggatcttgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaactgttg 28495934  T
Q  207 gatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||    
T  28495935 ggtactacctatatcaacaagatgcat 28495961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 120 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6719226 - 6719113
Alignment:
Q  120 gaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctata 219  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  6719226 gaaccgaatcacattggaatgagagggatcctgaggctgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaatgcttataagaattgtttggtactacctata 6719127  T
Q  220 tcaacaacatgcat 233  Q
    ||||||| ||||||    
T  6719126 tcaacaagatgcat 6719113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 105 - 237
Target Start/End: Original strand, 679796 - 679927
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||| |||||||| || || |||| ||||||||| ||||| |||||||     
T  679796 cgacagcttctagaggaactgaatcacatcagaatgagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggagtacatggctgaaggaaggcttataagaattg- 679894  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcatattc 237  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  679895 ttggtactacctatatcaacaagatgcatattc 679927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 128 - 226
Target Start/End: Original strand, 25182363 - 25182461
Alignment:
Q  128 tcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaa 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25182363 tcacatcggaatgagagagatcctgagactgtgcaagtatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaa 25182461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 233
Target Start/End: Original strand, 43233402 - 43233520
Alignment:
Q  115 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 214  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  43233402 tagaggaaccgaatcacaccgaaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtatgtgactgtatggttaaaggaagacttataagaattgtttggtactat 43233501  T
Q  215 ctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  43233502 ctatatcaacaagatgcat 43233520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 125 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29039167 - 29039059
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||||||| | || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29039167 gaatcacatcggaatgagaggcatcctgaggccgtgtagatatgtgactacatggttgaatggaggcttacaagaattgtttggtactacctatatcaac 29039068  T
Q  225 aacatgcat 233  Q
    |||||||||    
T  29039067 aacatgcat 29039059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 125 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 35474268 - 35474160
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| | | ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||    
T  35474268 gaatcacaccggaatgagagggatccttaggtcgtgtaggtatgagactacatggttgaagaaagacttataagaattgtttagtactacttatatcaac 35474169  T
Q  225 aacatgcat 233  Q
    || ||||||    
T  35474168 aagatgcat 35474160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 233
Target Start/End: Original strand, 2193236 - 2193363
Alignment:
Q  106 gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtt 205  Q
    |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| | ||||||  ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2193236 gacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggttcctgagaccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtt 2193335  T
Q  206 tgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||    
T  2193336 tggtactacctatatcaacaagatgcat 2193363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 5406739 - 5406627
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||   |||||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||    
T  5406739 aactgaatcacatcggaatgatagggatcctaaagtcgtgccggtatgggactgcatggttgaaggaagatttataagaattgtttggtattacctatat 5406640  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||||    
T  5406639 caacaagatgcat 5406627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13125287 - 13125175
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  13125287 aactgaatcatatcggaatgagagggatcttgaggccctgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 13125188  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
     ||||| ||||||    
T  13125187 taacaagatgcat 13125175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 125 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28495755 - 28495647
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||   |  |||||||||||||    
T  28495755 gaatcccatcggaatgagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaagacttataagaattgttgagttttacctatatcaac 28495656  T
Q  225 aacatgcat 233  Q
    || ||||||    
T  28495655 aagatgcat 28495647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 125 - 233
Target Start/End: Original strand, 36422251 - 36422359
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||| | ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  36422251 gaatcacgccggaatgagagggatcctaaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaac 36422350  T
Q  225 aacatgcat 233  Q
    || ||||||    
T  36422351 aagatgcat 36422359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 125 - 233
Target Start/End: Original strand, 46425740 - 46425848
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  || | |||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  46425740 gaatcacatcggaatgagagggatcctgagaccatgtaggtatgggactacatggttgaaataaggcttataagaattgtttggtattacctatatcaac 46425839  T
Q  225 aacatgcat 233  Q
    || ||||||    
T  46425840 aagatgcat 46425848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 3305536 - 3305377
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgagga-ctttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | | ||  ||||||||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||| ||||||||||| |||||| | ||    
T  3305536 ggctgacgagggcggagagtggtcgccggtggataaggcacgacaatgagcagctcccgacagcttctagaggaaccgaatcacatcgaaatgaggggga 3305437  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttg 207  Q
    |||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  3305436 tcctgaggccgtgtaagtatgggactacatggttgaatgaaggcttatgagaattgtttg 3305377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 175 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26421402 - 26421341
Alignment:
Q  175 tatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatatt 236  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26421402 tatggttgaaggaagacttataagaattgcttgatactacctatatcaacaagatgcatatt 26421341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Original strand, 18833281 - 18833393
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||  |||  |||||||| ||||  |||||  |||||||||  ||||||||||||    
T  18833281 aactgaatcacatcggaatgagagggttcctgaggccgtacaggtatggaactgcatggttgagggaaagcttatatgaattgtttagtactacctatat 18833380  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||||    
T  18833381 caacaagatgcat 18833393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 52 - 233
Target Start/End: Original strand, 2189069 - 2189251
Alignment:
Q  52 tgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcc 150  Q
    |||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| | |||    
T  2189069 tgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggttcc 2189168  T
Q  151 tgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||| || ||  |||| || ||||  ||||||||| |||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  2189169 tgaggctgtgcaggtgtgggactgcatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggcactacctatatcaacaagatgcat 2189251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22529392 - 22529274
Alignment:
Q  115 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 214  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||| | | | || ||||| | ||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||     
T  22529392 tagacgaaccgaatcatatccgaatgagagggatcctgaggtcatgtaagtatgggcctacatggttgaaggaaggcttataagaaatgtttggtactat 22529293  T
Q  215 ctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||| ||||||    
T  22529292 ctatataaacaagatgcat 22529274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 226
Target Start/End: Original strand, 2465959 - 2466024
Alignment:
Q  161 taggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaa 226  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  2465959 taggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagagttgtttggtactacctatatcaacaa 2466024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 226
Target Start/End: Original strand, 33316707 - 33316828
Alignment:
Q  106 gacaacttttagacgaactgaatc-acatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||  ||| | |||  ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  33316707 gacagcttctagacaaactgaatccacatcggaatgagataaattttgatgtcgtgcaggtatgagactacatggttgaaggaaaaattataagaattgt 33316806  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaa 226  Q
    |||| | ||| |||||||||||    
T  33316807 ttgacaatacttatatcaacaa 33316828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29357622 - 29357495
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||  |||| || | |||  ||||||| ||||  |||||||||||||   |||| ||||||||    
T  29357622 cgacaacttctagatgaactgaatcacaccg-aatgagaggtatcccgaggtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaatgtttataagaattgt 29357524  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  29357523 ttggtactaactatatcaacaagatgcat 29357495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31406731 - 31406623
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  || | || ||||  ||||||||| || ||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  31406731 gaatcacatcaaaatgagagggatcctgaagccgtgcagatctgggactgaatggttgaaagatgacttattagaattgtttggtgttacctatatcaac 31406632  T
Q  225 aacatgcat 233  Q
    || ||||||    
T  31406631 aagatgcat 31406623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 170 - 233
Target Start/End: Original strand, 2465777 - 2465840
Alignment:
Q  170 gactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  2465777 gactacatggttgaaggaaggcttataagagttgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 2465840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 106 - 233
Target Start/End: Original strand, 9623188 - 9623315
Alignment:
Q  106 gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtt 205  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||||| ||||| || |  ||  | | ||||||||  ||||| ||||||  |||||| |||||||||    
T  9623188 gacaacttttagataaaccgaatcacaatggaatgagagggatccagaggttgtgcatgcatgagactccatggtagaaggagtacttataagaattgtt 9623287  T
Q  206 tgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  9623288 tgataccacctatatcaacaagatgcat 9623315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 121 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13124852 - 13124757
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacct 216  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||| ||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  13124852 aactgaatcatattggaatgagagggatcttgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtgtggtactacct 13124757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 35527278 - 35527156
Alignment:
Q  115 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 214  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || | |||  |  |||| ||||   |||||||| |||| ||||| ||||||||||| | ||||    
T  35527278 tagacgaaccgaatcacaccgaaatgagagggatcccgaggtcgtgcaaatatgggactggttggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtgctac 35527179  T
Q  215 ctatatcaacaacatgcatattc 237  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  35527178 ctatatcaacaagatgcatattc 35527156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 36015568 - 36015452
Alignment:
Q  115 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 214  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||  | || ||  | ||||||||||  |||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||    
T  36015568 tagacgaaccaaatcacaccggaatgagagggatcccaaggcagtgcaagtatgagactccatggttgaaggaaagcttaaaagaattgtttggtactac 36015469  T
Q  215 ctatatcaacaacatgc 231  Q
     ||||||||||| ||||    
T  36015468 atatatcaacaagatgc 36015452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 236
Target Start/End: Original strand, 20966055 - 20966161
Alignment:
Q  130 acatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacat 229  Q
    ||||||||||||||| | || ||| ||| | |||||||||||||  ||| |||||||| ||||||| |||||| |||  || |||||||| |||||| ||    
T  20966055 acatcggaatgagagtggtcttgaggccatctaggtatgagactgcatgattgaaggatgacttataagaattattttgtaatacctataccaacaagat 20966154  T
Q  230 gcatatt 236  Q
    | |||||    
T  20966155 gtatatt 20966161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 225
Target Start/End: Original strand, 11372486 - 11372550
Alignment:
Q  161 taggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaaca 225  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  11372486 taggtatgaaattgtatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctgtaccaaca 11372550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16811963 - 16811912
Alignment:
Q  155 gccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgttt 206  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  16811963 gccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaatgcttataagaattgttt 16811912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 226
Target Start/End: Original strand, 6585662 - 6585708
Alignment:
Q  180 ttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaa 226  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6585662 ttgaaagaagacttataaaaattgtttggtactacctatatcaacaa 6585708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31743975 - 31743863
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||| |||| |||||||  |||| ||||  |||  | | ||||||||  |||||||||||||  ||||| ||||| ||||| | ||| ||||||    
T  31743975 aactgaatcatatcgaaatgagatggatcttgaaatcgtgcaagcatgagactgcatggttgaaggaatgcttataagaatggtttggtgctatctatat 31743876  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||||    
T  31743875 caacaagatgcat 31743863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 40)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Original strand, 30529609 - 30529794
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgagga-ctttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||| || ||||||  ||||| || | ||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30529609 ggctgacgagggcgatgagtggtcgtcagtgcacaaggcacgacaataagcagctcccgacaacttctagaggaactgaatcacatcggaatgagaggga 30529708  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| || || |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  30529709 tcctgaggctgtgtaggtatgagactacatggttgaagtaaggcttataagaattttttggtactacctatatcaacaagatgcat 30529794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 105 - 233
Target Start/End: Original strand, 39640916 - 39641044
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||| |||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  39640916 cgacagcttttagaagaatcgaatcacatcagaatgagagagatcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagacttataagagttgt 39641015  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  39641016 ttggtactacctatatcaataagatgcat 39641044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 51 - 233
Target Start/End: Original strand, 28561670 - 28561853
Alignment:
Q  51 ctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatc 149  Q
    ||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  28561670 ctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctactgacaacttctagaggaactgaatcacaccggaatgagagggttc 28561769  T
Q  150 ctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  28561770 ctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 28561853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 105 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20885283 - 20885156
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||||||| |||| ||||  |||||||||| |||||||| |||| ||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20885283 cgacaacttctagaggaacc-aatcacatcgcaatgagagggatcttgaggtcgtgtaggtatgtgactacatggttgaaggaagacttataagaattgt 20885185  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20885184 ttgatactacctatatcaacaagatgcat 20885156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 50 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 32227444 - 32227260
Alignment:
Q  50 gctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| || |||||| ||||||||| | ||  | ||||||| |||| |||| |||||||  ||||||||||| |||    
T  32227444 gctgacgagggcggggagtggtcgccagtgcacaaggcacaacaatgagcggctcccaacaacttctagaggaaccgaatcacgccggaatgagagggat 32227345  T
Q  149 cctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||| | ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||    
T  32227344 cctaaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatattaacaagatgcat 32227260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25230872 - 25230744
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||| ||| |||| ||||  |||||||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  25230872 cgacagcttatagaggaaccaaatcacattggaatgagagggatcctgaggccatgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggtttataagaattgt 25230773  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  25230772 ttggtactacctatatcaacaagatgcat 25230744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25238459 - 25238331
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||| ||| |||| ||||  |||||||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  25238459 cgacagcttatagaggaaccaaatcacattggaatgagagggatcctgaggccatgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggtttataagaattgt 25238360  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  25238359 ttggtactacctatatcaacaagatgcat 25238331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 122 - 233
Target Start/End: Original strand, 41472297 - 41472407
Alignment:
Q  122 actgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatc 221  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  41472297 actgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggtcgtacaggtatgagactgcatggttgaaggaag-cttataagaattgtttggtactacatatatc 41472395  T
Q  222 aacaacatgcat 233  Q
    ||||| ||||||    
T  41472396 aacaagatgcat 41472407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Original strand, 16811303 - 16811488
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    |||||||||||| |||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  16811303 ggctgacgagggtggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaatcgaatcacatcggaatgagaggga 16811402  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||    
T  16811403 tcctgaggccgtgtaggtttgggactccatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatttcaacaagatgcat 16811488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Original strand, 39653086 - 39653271
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |     
T  39653086 ggctgacgaggacggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaactgaatcacaccggaatgagagggt 39653185  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  39653186 tcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgttggatactacctatatcaacaagatgcat 39653271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31284427 - 31284315
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  31284427 aactgaatcacatcggaatgagagggatcttgaggtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 31284328  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||||    
T  31284327 caacaagatgcat 31284315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 233
Target Start/End: Original strand, 7493881 - 7493988
Alignment:
Q  126 aatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaaca 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  7493881 aatcacatcggaatgagagagatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 7493980  T
Q  226 acatgcat 233  Q
    | ||||||    
T  7493981 agatgcat 7493988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25230415 - 25230294
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||| ||| |||| ||||  ||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  25230415 cgacatcttatagaggaaccaaatcacatcggaaggagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattat 25230316  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaa 226  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  25230315 ttggtactacctatatcaacaa 25230294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25238002 - 25237881
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||| ||| |||| ||||  ||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  25238002 cgacatcttatagaggaaccaaatcacatcggaaggagagggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattat 25237903  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaa 226  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  25237902 ttggtactacctatatcaacaa 25237881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Original strand, 50347668 - 50347853
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||| | | | || || |||| |  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||| |||||||  ||||||||||| ||    
T  50347668 ggctgacgagggcggggagtgatcgccggtgcacaaggaacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaaccgaatcacgccggaatgagaggga 50347767  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||| | || |||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  50347768 tcctgaggccttgtatgtatgagactacttggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcat 50347853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 125 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 32797082 - 32796974
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||  || | ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32797082 gaatcacatcgaaataagagggatcctgagaccatgtaggtatgaaactacatggttgaagcaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaac 32796983  T
Q  225 aacatgcat 233  Q
    || ||||||    
T  32796982 aagatgcat 32796974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11180172 - 11180073
Alignment:
Q  134 cggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  11180172 cggaatgagagggatcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcat 11180073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 115 - 233
Target Start/End: Original strand, 14813938 - 14814056
Alignment:
Q  115 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 214  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||  |||||| ||||||| ||||| | ||||||||| ||||||    
T  14813938 tagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgtaggtatgagactgcatggttaaaggaaggcttataataattgtttggtactac 14814037  T
Q  215 ctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||||||||| || ||||||    
T  14814038 ctatatcaataagatgcat 14814056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13150267 - 13150138
Alignment:
Q  104 tcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattg 203  Q
    |||||| ||| |||| |||| |||||||  ||||||||||| | |||||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13150267 tcgacagcttctagaggaaccgaatcacgccggaatgagagggctcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattg 13150168  T
Q  204 tttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    || | |||||||| ||||||||| ||||||    
T  13150167 ttgggtactacctgtatcaacaagatgcat 13150138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 226
Target Start/End: Original strand, 7477191 - 7477291
Alignment:
Q  126 aatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaaca 225  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  7477191 aatcacatcggaatgagagggatcctaaagtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattttttggtactacttatatcaaca 7477290  T
Q  226 a 226  Q
    |    
T  7477291 a 7477291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 125 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25239224 - 25239116
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||| |||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  25239224 gaatcacaccggtatgagagggattctgaggtcgtgtaggtatgggactatatggttgaaggaacgcttataagaattttttggtactacctatatcaac 25239125  T
Q  225 aacatgcat 233  Q
    || ||||||    
T  25239124 aagatgcat 25239116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 226
Target Start/End: Original strand, 41473993 - 41474097
Alignment:
Q  122 actgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatc 221  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||| | |||  ||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  41473993 actgaatcacatcgaaatgagagggatcttgaggtcgttcaggtatgtgactggatggttaaaggaagacttataagaattgtttgatacttcctatatc 41474092  T
Q  222 aacaa 226  Q
    |||||    
T  41474093 aacaa 41474097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Original strand, 16810847 - 16811032
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  16810847 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaatcgaatcacatcggaatgagaggga 16810946  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    || ||| ||||| ||| |||| ||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||   ||||| ||||||| |||| ||||||    
T  16810947 tcttgaggccgtgtagatatgggactgcatggttgatggaaggcttataagaattgttgcgtactaactatatctacaagatgcat 16811032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 226
Target Start/End: Original strand, 37045014 - 37045135
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||| ||| |||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||  ||||||||  ||||| ||||||||    
T  37045014 cgacagcttctagaggaaccgaatcacatctgaatgagagggatcctgaggccgtgtaggtgtgggactacatgaatgaaggaatgcttataagaattgt 37045113  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaa 226  Q
    ||| || |||||||||||||||    
T  37045114 ttggtaatacctatatcaacaa 37045135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Original strand, 25248106 - 25248218
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||  ||||||| ||||  |||||| ||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  25248106 aactgaatcacatcggaatgagagggattctaaggccgtgcaggtatgggactgcatggttaaaggaatgtttataagaattgtttggtactacctatat 25248205  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||||    
T  25248206 caacaagatgcat 25248218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 233
Target Start/End: Original strand, 32227480 - 32227607
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||| ||| |||| |||| |||||||  ||||||||||| |||| ||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  32227480 cgacagcttctagaggaaccgaatcacgccggaatgagagggatc-tgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgt 32227578  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    | | |||||||||||| ||||| ||||||    
T  32227579 tgggtactacctatattaacaagatgcat 32227607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 237
Target Start/End: Original strand, 2911084 - 2911206
Alignment:
Q  115 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 214  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||| || |||||  ||||||| ||| | ||||||||| |||   |||| | |||||||||||| |||    
T  2911084 tagacgaaccgaatcacacctgaatgagagggatcccgaggccgtgcaggtatgggaccacatggttgaaagaatggttataaaaattgtttgatattac 2911183  T
Q  215 ctatatcaacaacatgcatattc 237  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  2911184 ctatatcaacaagatgcatattc 2911206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 233
Target Start/End: Original strand, 8067278 - 8067387
Alignment:
Q  124 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||  ||||||| || |  |||||||||||  | ||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  8067278 tgaatcacatcggaatgagagggaccctgaggccgtgcaggtatgggattgcatggttgaaggccggcttataagaattgtttagtactacctatatcaa 8067377  T
Q  224 caacatgcat 233  Q
    ||| ||||||    
T  8067378 caagatgcat 8067387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25238790 - 25238723
Alignment:
Q  166 atgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||    
T  25238790 atgagactacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactatctttatcaacaagatgcat 25238723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 49 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 25803228 - 25803057
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |   || || |||||||||||||||| | ||| | ||| ||| |||| |||| |||||| |||||||| |||| |     
T  25803228 ggctgactaggacggggagtggtcgctggtgcacaaggcataacaatgagcggcttccaacagcttctagatgaaccgaatcatatcggaataagagggt 25803129  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctata 219  Q
    |||| | | ||| |||||||| ||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  25803128 tcctaatgtcgtgtaggtatgggactgcatggttgaagtaagacttgtaagaattgtttggtactacctata 25803057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 162 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 32386844 - 32386773
Alignment:
Q  162 aggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  32386844 aggtatgggactgtatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatattaacaagatgcat 32386773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Original strand, 29224326 - 29224431
Alignment:
Q  128 tcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaac 227  Q
    ||||||| |||||| || | || ||| ||| | ||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||     
T  29224326 tcacatcagaatgaaagggttcatgaggccatgtagatatgagactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatactaacaag 29224425  T
Q  228 atgcat 233  Q
    ||||||    
T  29224426 atgcat 29224431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13150657 - 13150593
Alignment:
Q  169 agactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  13150657 agactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcat 13150593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4067454 - 4067399
Alignment:
Q  178 ggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  4067454 ggttgaaggaagacttataaaaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 4067399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27187478 - 27187380
Alignment:
Q  124 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatca 222  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| || ||  | ||||| ||||  |||||| || |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27187478 tgaatcacattggaatgagagggatcctgaggctgtgcatgtatgggactgcatggttaaatgaaggcttataagaattgtttggtactacctatatca 27187380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 233
Target Start/End: Original strand, 14820134 - 14820261
Alignment:
Q  106 gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtt 205  Q
    |||| ||| |||| |||| |||||||| || |||||||| | ||||||  |||| |||||||| | ||  | || | ||||||| ||||| |||||||||    
T  14820134 gacagcttctagaggaaccgaatcacaccgcaatgagagggttcctgagcccgtgtaggtatggggctgcacggctaaaggaaggcttataagaattgtt 14820233  T
Q  206 tgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    || |||||| ||||||||||| ||||||    
T  14820234 tggtactacttatatcaacaagatgcat 14820261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31104070 - 31103999
Alignment:
Q  162 aggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||    
T  31104070 aggtatgagattgcatggttcaaggaagacttataagaattgtttgatactatctataccaactagatgcat 31103999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 135 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25802685 - 25802587
Alignment:
Q  135 ggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||||||| |||| ||  ||| | |||||||||||||  |||||| | ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  25802685 ggaatgagagggatcatgtggccatgtaggtatgagactgcatggttaacggaaggctgataagaatggtttggtactacctatatcaacaagatgcat 25802587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 185
Target Start/End: Original strand, 12820639 - 12820703
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaag 185  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||||| ||||  ||||||||||    
T  12820639 aactgaatcacatcggaatgagagggattctaaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaag 12820703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 176 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 47518415 - 47518358
Alignment:
Q  176 atggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| || || |||||| ||||||    
T  47518415 atggttgaaggaaaacttataagaattgtttgaaactatctctaccaacaagatgcat 47518358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 43057747 - 43057562
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    |||||| ||||||||||| |||| | | || || |||||||  ||||||| | ||  ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  43057747 ggctgaagagggcggggaatggtcgccggtgcacaaggcatgccaatgagcggctcccgacagcttttagaggaaccgaatcacatcggaatgagaggga 43057648  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  43057647 tcctgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatattaacaagatgcat 43057562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30873175 - 30872989
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggg--gagtggttgtcagtacataaggcataacaatgaggactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagag 146  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| ||| || || ||||||  ||||||||    |||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  30873175 ggctgacgagggcgcgtggagtggtcgtcggtgcacaaggcacgacaatgagcggcttcgacaatttctagacgaaccgaatcacaccggaatgagaggg 30873076  T
Q  147 atcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    || |||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30873075 attctgaggccgtgcaggtatgagactgtatggttgaaggaagacttttaagaattgtttgatactacctatatcaacaagatgcat 30872989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 43057288 - 43057104
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | || || ||||||| |||||||| ||||  |||||| || |||| |||| |||||||||| ||||||| | ||    
T  43057288 ggctgacgaggacggggagtggttgccggtgcacaaggcatgacaatgagcgactcccgacaatttctagaggaaccgaatcacatcagaatgaggg-ga 43057190  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||| | ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43057189 tcctaaggccgtgtaggtatgtgactacatggttgaaggaaggcttagaagaattgtttgatactacctatatcaacaagatgcat 43057104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 50002854 - 50002746
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50002854 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaggccgtgtaggcatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaac 50002755  T
Q  225 aacatgcat 233  Q
    || ||||||    
T  50002754 aagatgcat 50002746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16452157 - 16451972
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  16452157 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaatcgaatcacatcggaatgagaggga 16452058  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||| | |||||| | ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  16452057 tcctgaggccttgtaggtaggggactacatggttgaaggaaagcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcat 16451972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16461310 - 16461125
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  16461310 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaatcgaatcacatcggaatgagaggga 16461211  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||| | |||||| | ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  16461210 tcctgaggccttgtaggtaggggactacatggttgaaggaaagcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcat 16461125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20054304 - 20054119
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  20054304 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 20054205  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  20054204 tcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 20054119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20054760 - 20054575
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  20054760 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 20054661  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  20054660 tcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 20054575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20055216 - 20055031
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  20055216 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 20055117  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  20055116 tcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 20055031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20055672 - 20055487
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  20055672 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 20055573  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  20055572 tcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 20055487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20056128 - 20055943
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  20056128 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 20056029  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  20056028 tcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 20055943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20056584 - 20056399
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  20056584 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 20056485  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  20056484 tcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 20056399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20057487 - 20057302
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  20057487 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 20057388  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  20057387 tcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 20057302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 124 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 35761062 - 35760953
Alignment:
Q  124 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||  |||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  35761062 tgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaa 35760963  T
Q  224 caacatgcat 233  Q
    ||| ||||||    
T  35760962 caagatgcat 35760953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 115 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 50002442 - 50002324
Alignment:
Q  115 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 214  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  50002442 tagaggaaccgaatcacatcggaatgagagggatcatgaggccgtgtaggcatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactac 50002343  T
Q  215 ctatatcaacaacatgcat 233  Q
    || ||||||||| ||||||    
T  50002342 ctttatcaacaagatgcat 50002324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20845885 - 20845700
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||  |     
T  20845885 ggctgacgaggacggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagacggt 20845786  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  20845785 tcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgttactacctatatcaacaagatgcat 20845700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 124 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 35759756 - 35759647
Alignment:
Q  124 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  35759756 tgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaa 35759657  T
Q  224 caacatgcat 233  Q
    ||| ||||||    
T  35759656 caagatgcat 35759647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Original strand, 52250128 - 52250313
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | | || || ||||||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  52250128 ggctgacgagggcggggagcggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagaggga 52250227  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    || ||| ||| | |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  52250228 tcatgaggccttgtaggtatgggactacatggtcgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcat 52250313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31822809 - 31822702
Alignment:
Q  126 aatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaaca 225  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  31822809 aatcacatcagaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaagatttataagaattatttggtactacatatatcaaca 31822710  T
Q  226 acatgcat 233  Q
    | ||||||    
T  31822709 atatgcat 31822702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Original strand, 12883446 - 12883631
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    |||| ||||||| || ||||||| ||| || || ||||||  |||||||| | || |||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||  ||    
T  12883446 ggctaacgagggtggtgagtggtcgtcggtgcacaaggcacgacaatgagcggctctcgacagcttctagacgaaccgaatcacaccggaatgagatgga 12883545  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||| || || ||  ||||||| ||||  ||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  12883546 tcccgaggctgtgcaggtatgggactgcatgattgaaggaatacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 12883631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 239
Target Start/End: Original strand, 38340886 - 38341019
Alignment:
Q  106 gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtt 205  Q
    |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||  | |||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  38340886 gacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagatggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtt 38340985  T
Q  206 tgatactacctatatcaacaacatgcatattcat 239  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  38340986 tggtactacctatatcaacaagatgcatcttcat 38341019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Original strand, 2328310 - 2328422
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||  ||| |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  2328310 aactgaatcacattggaatgagagaaattatgaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 2328409  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
     ||||| ||||||    
T  2328410 taacaagatgcat 2328422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 237
Target Start/End: Original strand, 7548086 - 7548202
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| | ||||||||| || || ||||||    
T  7548086 aactgaatcacattgcaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtatgagactacatgattaaaggaagacttataaaaattgtttggtattaactatat 7548185  T
Q  221 caacaacatgcatattc 237  Q
    |||||| ||||||||||    
T  7548186 caacaagatgcatattc 7548202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20061342 - 20061230
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||  ||||||| ||||  |||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  20061342 aactgaatcacatcagaatgagagggatcctgaggtcgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatat 20061243  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||||    
T  20061242 caacaagatgcat 20061230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 51373096 - 51372913
Alignment:
Q  51 ctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatc 149  Q
    ||||||||| ||  ||||||||| |||| |||||||||  |||||||| ||||  ||||| ||| |||||| ||  |||||||   ||||||||| ||||    
T  51373096 ctgacgaggacgaagagtggttgccagtgcataaggcacgacaatgagcgactcccgacatcttctagacgtaccaaatcacactagaatgagagggatc 51372997  T
Q  150 ctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    | || ||| || ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||    
T  51372996 ccgaggccatacaggtatgtgactgtatggttgaaggaaggcttataagaattgtttagtactacctatatcgacaagatgcat 51372913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 115 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20057876 - 20057758
Alignment:
Q  115 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 214  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||| | |||||| |||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  20057876 tagaggaactgaatcacaccgaaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactac 20057777  T
Q  215 ctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  20057776 ctatatcaacaagatgcat 20057758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 223
Target Start/End: Original strand, 10820571 - 10820689
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||| |||  ||| || || || ||||  ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  10820571 cgacaacttctagatgaaccgaatcacatcggagtgagagggattatgaggcggtgtatgtattggactacatggttgaaggaagatttataagaattgt 10820670  T
Q  205 ttgatactacctatatcaa 223  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  10820671 ttggtactacctatatcaa 10820689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 226
Target Start/End: Original strand, 23180728 - 23180830
Alignment:
Q  124 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 223  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| |||||  ||||||||||||   |||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  23180728 tgaatcacattggaatgagagggatcttgaagccgtgtaggaatgggactacgtggttgaaggaatgattataagaattgcttggtactacctatatcaa 23180827  T
Q  224 caa 226  Q
    |||    
T  23180828 caa 23180830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 124 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 46693884 - 46693774
Alignment:
Q  124 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactat-atggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatca 222  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | | |||  | ||||| |||| | |||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  46693884 tgaatcacatcggaatgagagggatcctaaggtcgtgcatgtatgggactgtgatggttgaaggaaggcttataaaaattgtttggtactacctatatca 46693785  T
Q  223 acaacatgcat 233  Q
    |||| ||||||    
T  46693784 acaagatgcat 46693774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20057031 - 20056855
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  20057031 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 20056932  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||||||         |||||| ||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  20056931 tcctga---------ggtatgggactgcagggttgaaggaaggcttatgagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 20056855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 120 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 50003227 - 50003114
Alignment:
Q  120 gaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctata 219  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||  ||||  |||||| |||| |||||||| | ||||||| | |||||||||||    
T  50003227 gaaccgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatgcaggtataggactgcatggttaaagggagacttataataattgttgggtactacctata 50003128  T
Q  220 tcaacaacatgcat 233  Q
    ||||||| ||||||    
T  50003127 tcaacaagatgcat 50003114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 233
Target Start/End: Original strand, 2634923 - 2635031
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |  ||  ||||||| ||||  ||||||||||||  ||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2634923 gaatcacatcggaatgagagggatcatgaggttgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggataactcataagaattgtttggtactacctataccaac 2635022  T
Q  225 aacatgcat 233  Q
    || ||||||    
T  2635023 aagatgcat 2635031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Original strand, 12728026 - 12728099
Alignment:
Q  161 taggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgttt-gatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||    
T  12728026 taggtatgggacaacatggttgaaggaagacttataagaattgtttggttactgcctatatcaacaagatgcat 12728099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 226
Target Start/End: Original strand, 16907270 - 16907334
Alignment:
Q  162 aggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaa 226  Q
    |||||||| |||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16907270 aggtatgaaactgcatggttgaaagaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaa 16907334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 226
Target Start/End: Original strand, 2739554 - 2739622
Alignment:
Q  158 gtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaa 226  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||| ||||||||||   ||||| |||||||||||    
T  2739554 gtataggtatgagactgtatggttaaggaaagacttataagaattgtttagcactacatatatcaacaa 2739622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20060431 - 20060379
Alignment:
Q  181 tgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  20060431 tgaaggaaagcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 20060379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 36)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 107 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10927568 - 10927442
Alignment:
Q  107 acaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgttt 206  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  10927568 acaacttatagaggaaccgaatcacatcggaatgagagggatcttgaggccgtgtaggtatgagactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttt 10927469  T
Q  207 gatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||    
T  10927468 ggtactacctatatcaacaagatgcat 10927442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 42788869 - 42788685
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || |||||| |||| |||| | || |||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  42788869 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacaaca-tgagcggctctcgacaacttctagaggaaccgaatcacaacggaatgagaggga 42788771  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||| ||||  || ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  42788770 tcctgaggccgtgtaggattgggactacatggttgaaagaagacttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 42788685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20039698 - 20039513
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgagga-ctttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    |||||||||||||||||| |||| | | || || ||||||| |||||||| | ||  ||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||    
T  20039698 ggctgacgagggcggggaatggtcgccggtgcacaaggcatgacaatgagcagctcccgacagcttctagacaaaccgaatcacatcggaatgagaggga 20039599  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    || ||| ||||| |||||||  ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  20039598 tcatgaggccgtgtaggtataggactacatagttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 20039513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 233
Target Start/End: Original strand, 39146919 - 39147046
Alignment:
Q  106 gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtt 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  39146919 gacaacttctagaggaactgaatcacatcgaaatgagagggatcatgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggtagacttataagaattgtt 39147018  T
Q  206 tgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  39147019 tgatactacttatattaacaagatgcat 39147046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 107 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17445620 - 17445494
Alignment:
Q  107 acaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgttt 206  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  17445620 acaacttctagaggaaccgaatcacatcgaaatgagagggatcctgaggccgtgtaggcatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttt 17445521  T
Q  207 gatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||    
T  17445520 ggtactacctatatcaacaagatgcat 17445494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 50 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10927170 - 10926985
Alignment:
Q  50 gctgacgagggc-ggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgagga-ctttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||| || || ||||||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  10927170 gctgacgagggcaggggagtgatcgtcggtgcacaaggcacgacaatgagtagctcccgacagcttatagaggaaccgaatcacatcagaatgagaggga 10927071  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  10927070 tcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 10926985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3887208 - 3887096
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||    
T  3887208 aactgaatcacatcggaatgagagtgatcctgaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaagacttatatgaattatttggtactacctatat 3887109  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||||    
T  3887108 caacaagatgcat 3887096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 121 - 226
Target Start/End: Original strand, 189063 - 189168
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  189063 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacatgtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 189162  T
Q  221 caacaa 226  Q
    ||||||    
T  189163 caacaa 189168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Original strand, 2193738 - 2193923
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||  ||||| ||| |||| |||| |||||||  ||||||||||| ||    
T  2193738 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcccgacagcttctagaggaaccgaatcacgccggaatgagaggga 2193837  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    || ||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  2193838 tcatgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcat 2193923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Original strand, 2474400 - 2474512
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| || |||| ||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  2474400 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctaaggtcgtacagatatgggactgcatggttgaaggaagacttaaaagaattgtttggtactacctatat 2474499  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||||    
T  2474500 caacaagatgcat 2474512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 111 - 237
Target Start/End: Original strand, 42429131 - 42429256
Alignment:
Q  111 cttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgata 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| |||||||| ||  | |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  42429131 cttttagacgaaccgaatcacatcggaataagag-gatcctgagaccgtgtaggtatgtgaacacatggttgaaggaggacttataagaattgtttggta 42429229  T
Q  211 ctacctatatcaacaacatgcatattc 237  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  42429230 ctacctttatcaacaatatgcatattc 42429256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Original strand, 2473954 - 2474066
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||| ||| ||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  2473954 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctaaggtcgtacaggcatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactgcctatat 2474053  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||||    
T  2474054 caacaagatgcat 2474066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Original strand, 22556531 - 22556643
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  22556531 aactgaatcacatcggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattgtttggtactacctatat 22556630  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||||    
T  22556631 caacaagatgcat 22556643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 105 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27647002 - 27646874
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27647002 cgacagcttctagaggaaccgaatcacatcggaatgagagggatcctagggccgtgtaggtatggggctacatggttgaaggaaggcttataagaattgt 27646903  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  27646902 ttggtactacctataacaacaagatgcat 27646874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 233
Target Start/End: Original strand, 34867770 - 34867897
Alignment:
Q  106 gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtt 205  Q
    |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| | |||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  34867770 gacagcttctagaagaaccgaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtt 34867869  T
Q  206 tgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||    
T  34867870 tggtactacctatatcaacaagatgcat 34867897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 124 - 233
Target Start/End: Original strand, 1821904 - 1822013
Alignment:
Q  124 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | | | |||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  1821904 tgaattacatcggaatgagagagatcttaaggtcgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaa 1822003  T
Q  224 caacatgcat 233  Q
    ||| ||||||    
T  1822004 caagatgcat 1822013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 125 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 2058803 - 2058691
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |  || |||||||||  ||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  2058803 gaatcacatcggattgagagagatcctgaagtcatgcagctatgagactggatgattgaaggaagacttatatgaattgtttggtactacctatatcaac 2058704  T
Q  225 aacatgcatattc 237  Q
    || ||||| ||||    
T  2058703 aagatgcaaattc 2058691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 125 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8391468 - 8391361
Alignment:
Q  125 gaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaac 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  8391468 gaatcacatcggaatgagagggattctgaggccgtgtaggcatgagactacatgattgaaggaagacttataagaattgtttggtact-cctgtatcaac 8391370  T
Q  225 aacatgcat 233  Q
    || ||||||    
T  8391369 aagatgcat 8391361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 11160848 - 11160716
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||| |||| || ||||||||||| ||||| | ||||||    
T  11160848 cgacaatttttagatgaaccgaattgcatcggaatgagagggatcatgaagtcgtgtaggtatgacactacatagttgaaggaaggcttataataattgt 11160749  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcatattc 237  Q
    ||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  11160748 ttggtactatctatgtcaacaagatgcatattc 11160716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Original strand, 22556964 - 22557076
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| ||||    
T  22556964 aactgaatcacatcggaatgagagagttcatgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttatatgaattgtttggtactaccaatat 22557063  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||||    
T  22557064 caacaagatgcat 22557076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4658216 - 4658032
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| | |||| ||||| |||| |||||||  ||||   |||| | | ||| | ||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  4658216 ggctgacaaggacggggagtggtcgccagtgcataatgcatgacaatgaccgactcctgacagcctctaggcaaactgaatcacatcgaaataagaggga 4658117  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    || |||| ||||  ||||||||||||  ||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4658116 tcttgaaaccgtgcaggtatgagacttcatggttgaacgaaga-ttataagacttgtttgatactacctataacaacaacatgcat 4658032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8642182 - 8642073
Alignment:
Q  124 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 223  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  8642182 tgaatcacatcagaatgagagggatcctaaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattatttggtactacctatatcaa 8642083  T
Q  224 caacatgcat 233  Q
    ||| ||||||    
T  8642082 caagatgcat 8642073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 124 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3886749 - 3886640
Alignment:
Q  124 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| | ||||| ||||  ||||| |||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  3886749 tgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggtcgtacaagtatgggactgcatggtagaaggaatgcttatatgaattgtttggtactacctatatcaa 3886650  T
Q  224 caacatgcat 233  Q
    ||| ||||||    
T  3886649 caagatgcat 3886640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Original strand, 34371534 - 34371719
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| |     
T  34371534 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggt 34371633  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||  | |||||| |||| || ||||  |||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  34371634 tcccaaggccgtacaggtgtgggactgcatggttgaaggaatgcttaaaagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 34371719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Original strand, 34371990 - 34372175
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||| ||| |||| |||| |||||||| | ||||||||| |     
T  34371990 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcaggacaatgagcggctcctgacagcttctagaggaaccgaatcacaccagaatgagagggt 34372089  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||  | |||||| | ||||| ||||| |||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  34372090 tcccaaggccgtacaagtatgggactacatggttgaaggaatgcttaaaagaattgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 34372175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16370852 - 16370754
Alignment:
Q  128 tcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaa 226  Q
    |||||||| |||||||| | |||||| ||| | ||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  16370852 tcacatcgaaatgagagggttcctgatgccatgtaggtataagactgcatggttgaaggaaaacttataagaattgtttggtactacttatatcaacaa 16370754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21886303 - 21886185
Alignment:
Q  115 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 214  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||| | |||||| |  ||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  21886303 tagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggttcctgaggttgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactac 21886204  T
Q  215 ctatatcaacaacatgcat 233  Q
     ||||||||||| ||||||    
T  21886203 atatatcaacaagatgcat 21886185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 5067055 - 5066930
Alignment:
Q  108 caacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttg 207  Q
    |||||| ||||| ||  |||||||| | ||||||||||||||| || |||||  | |||||||||| |||| || |||||| |||||| |||||||||||    
T  5067055 caacttctagacaaatcgaatcacaccagaatgagagagatcccgaggccgtgcatgtatgagactgtatgattaaaggaaaacttataagaattgtttg 5066956  T
Q  208 atactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
     || || |||||||||||| ||||||    
T  5066955 gtattatctatatcaacaagatgcat 5066930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 112 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15513173 - 15513051
Alignment:
Q  112 ttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaaga--cttatgagaattgtttgat 209  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| | | || || |||||||| ||||| ||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||| |    
T  15513173 ttttagaggaaccgaatcacatcggaatgagagggatcattaggctgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaatatgcttataagaattg-ttggt 15513075  T
Q  210 actacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| |||||||||| ||||||    
T  15513074 actaccaatatcaacaagatgcat 15513051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 237
Target Start/End: Original strand, 18304410 - 18304542
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgt 204  Q
    ||||| ||| |||||||||  ||||||| ||||||||||  |||||||| | ||| |||||||| ||||| |||| ||| | ||  |||||   ||||||    
T  18304410 cgacagcttctagacgaaccaaatcacaacggaatgagaaggatcctgaggtcgtgtaggtatgggactacatggatgatgaaaagcttatataaattgt 18304509  T
Q  205 ttgatactacctatatcaacaacatgcatattc 237  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18304510 ttggtactacctatatcaacaagatgcatattc 18304542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22975161 - 22975076
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgttt 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||| ||  ||||| ||||||||||    
T  22975161 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgtgactgcatggttgaagaaaagcttataagaattgttt 22975076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 29680236 - 29680177
Alignment:
Q  136 gaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttat 195  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  29680236 gaatgagagagatcttgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttat 29680177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24182353 - 24182284
Alignment:
Q  164 gtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  24182353 gtatgagacgaaatggttgaaggaaggcttataagaattatttggtactatctataccaacaagatgcat 24182284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 226
Target Start/End: Original strand, 5549339 - 5549445
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttat-gagaattgtttgatactacctata 219  Q
    |||||||||||||||||||||||  | || |||| || | ||||||||||| | |||  ||||||||| ||||||  | ||||||||| |||||| ||||    
T  5549339 aactgaatcacatcggaatgagatggttcatgaaaccatgtaggtatgagattgtataattgaaggaaaacttataaaaaattgtttggtactacgtata 5549438  T
Q  220 tcaacaa 226  Q
     ||||||    
T  5549439 ccaacaa 5549445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 39801571 - 39801501
Alignment:
Q  164 gtatgagactatatggttgaaggaagactta-tgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||  | | ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  39801571 gtatgagactatatggttaaaagaagactttctaaaaatcgtttggtactacctatatcaacaagatgcat 39801501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 140 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18750328 - 18750235
Alignment:
Q  140 gagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||||||||||||| |||  |||| ||  |||  ||||||||||||||  |||| | ||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||    
T  18750328 gagagagatcctgaagtcgtgcaggtttggaactgcatggttgaaggaaggattataacaattgtttggtactacctataccaaaaagatgcat 18750235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Original strand, 2664 - 2853
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | |  || ||||||  |||||||| | ||  ||||||||| |||| |||  ||||||||||| |||||||| ||    
T  2664 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggagcacaaggcacgacaatgagtggctcccgacaacttctagaggaatcgaatcacatcgaaatgagaggga 2763  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcatattc 237  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2764 tcctgaggccgtgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgttgggtactacctatatcaacaagatgcatattc 2853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 162829 - 162717
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  162829 aactgaattacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatgtgactgcatggttgaaggaagacttataagaattgtttggtactacctatat 162730  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
     ||||| ||||||    
T  162729 taacaagatgcat 162717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 69925 - 69862
Alignment:
Q  162 aggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaaca 225  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||  ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  69925 aggtatgagactgcatcgttgaaggaatgcttataataattgtttggtactacctatatcaaca 69862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 107614 - 107502
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  107614 aactgaatcacatcggaatgagagggattctgaggccgtacaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttgatactaccaatat 107515  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||||    
T  107514 caacaagatgcat 107502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 124 - 233
Target Start/End: Original strand, 245084 - 245193
Alignment:
Q  124 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  245084 tgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatgtaggtatgggactacatggttgaagggaggcttataagaattgtttggtactacctatatcaa 245183  T
Q  224 caacatgcat 233  Q
    ||| ||||||    
T  245184 caagatgcat 245193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Original strand, 245510 - 245622
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    ||||||||||||||  ||||| || |||| |||  |||| |||||||| ||||  ||||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  245510 aactgaatcacatcataatgaaagggatcttgagtccgtgtaggtatgggacttcatggttgaagggatgcttataagaattgtttggtactacctatat 245609  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||||    
T  245610 caacaagatgcat 245622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2361 - 2249
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  2361 aactgaatcacatcggaatgagaaggatcctaaggccgtgcaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 2262  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||||    
T  2261 caacaagatgcat 2249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Original strand, 105715 - 105827
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||  |||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  105715 aactaaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtacaggtatggaactgcagggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 105814  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||||    
T  105815 caacaaaatgcat 105827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 142425 - 142313
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  142425 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgcaggtatgggacttcatggttgaaggaatgtttataagaattgtttggtactacctatat 142326  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||||    
T  142325 caacaagatgcat 142313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 226
Target Start/End: Original strand, 18961 - 19066
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  18961 aactaaatcacatcggaatgagagggatccagaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatat 19060  T
Q  221 caacaa 226  Q
    ||||||    
T  19061 caacaa 19066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18271 - 18204
Alignment:
Q  122 actgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaag 189  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  18271 actgaatcacatcggaatgagagggatccagaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaag 18204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Original strand, 1142 - 1327
Alignment:
Q  49 ggctgacgagggcggggagtggttgtcagtacataaggcataacaatgag-gactttcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagaga 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || || ||||||  |||||||| | ||   |||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||  |     
T  1142 ggctgacgagggcggggagtggtcgccggtgcacaaggcacgacaatgagcggctcctgacaacttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagacggt 1241  T
Q  148 tcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||| |  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  1242 tcctgaggccatgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctatataaacaagatgcat 1327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Original strand, 10295 - 10407
Alignment:
Q  121 aactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||| ||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  10295 aactgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccgtgcatgtatgggactgcatggttcaaggaaggcttataagaattgtttagtactacctatat 10394  T
Q  221 caacaacatgcat 233  Q
    |||||| ||||||    
T  10395 caacaagatgcat 10407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0499 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0499
Description:

Target: scaffold0499; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2203 - 2090
Alignment:
Q  120 gaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctata 219  Q
    |||| |||||||| | |||||| || | |||||| |||||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  2203 gaaccgaatcacaccagaatgaaagggttcctgaggccgtgcaggtatgagactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactacctata 2104  T
Q  220 tcaacaacatgcat 233  Q
    ||||||| ||||||    
T  2103 tcaacaagatgcat 2090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 233
Target Start/End: Original strand, 154735 - 154864
Alignment:
Q  104 tcgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattg 203  Q
    |||||| ||| |||| |||| |||||||  ||||||||||| | |||||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  154735 tcgacagcttctagaggaaccgaatcacgccggaatgagagggctcctgaggccttgtaggtatgggactacatggttgaaggaaggcttataagaattg 154834  T
Q  204 tttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    || | |||||||| ||||||||| ||||||    
T  154835 ttgggtactacctgtatcaacaagatgcat 154864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 233
Target Start/End: Original strand, 23662 - 23780
Alignment:
Q  115 tagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactac 214  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||||| | || ||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  23662 tagaggaaccgaatcacaccgaaatgagagggttcttgaggccgtgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactac 23761  T
Q  215 ctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  23762 ctatatcaacaagatgcat 23780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 233
Target Start/End: Original strand, 4541 - 4668
Alignment:
Q  106 gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtt 205  Q
    |||| ||| |||| |||| |||||||||||||| ||||| | |||||| ||| |  ||||||| ||||  ||||||||||||||  |||  |||||||||    
T  4541 gacagcttctagaggaaccgaatcacatcggaaggagagggttcctgaggccatgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggtttagaagaattgtt 4640  T
Q  206 tgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||    
T  4641 tggtactacctatatcaacaagatgcat 4668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 233
Target Start/End: Original strand, 4996 - 5128
Alignment:
Q  106 gacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagactt-----atgagaa 200  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||| | |||||| ||| |  ||||||| ||||  ||||||||||||||  ||     |  ||||    
T  4996 gacaacttctagaggaaccgaatcacaccggaatgagagggttcctgaggccatgcaggtatgggactgcatggttgaaggaaggtttaaaagagaagaa 5095  T
Q  201 ttgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  5096 ttgtttggtactacctatattaacaagatgcat 5128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 239
Target Start/End: Original strand, 45387 - 45499
Alignment:
Q  126 aatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaaca 225  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  ||||  |  |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  45387 aatcacatcggaatgagag-gatcttgagaccgtgcatatatgtgactacattgttgaaggaagacttatgagaattatttggtactacctatatcaaca 45485  T
Q  226 acatgcatattcat 239  Q
    | ||| || |||||    
T  45486 agatgtatcttcat 45499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4130 - 4021
Alignment:
Q  124 tgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaa 223  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||| || |||||  ||||||| ||||  || ||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  4130 tgaatcacaccagaatgagagggatcccgaggccgtgcaggtatgggactgcattgttgaaggaatgcttataagaattgtttggtactacctgtatcaa 4031  T
Q  224 caacatgcat 233  Q
    ||| ||||||    
T  4030 caagatgcat 4021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0557 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0557
Description:

Target: scaffold0557; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 174
Target Start/End: Original strand, 729 - 798
Alignment:
Q  105 cgacaacttttagacgaactgaatcacatcggaatgagagagatcctgaagccgtataggtatgagacta 174  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||    
T  729 cgacaacttatagaggaaccgaatcacatcggaatgagagggatcctgaggccatgtaggtatgggacta 798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0557; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 171 - 233
Target Start/End: Original strand, 2150 - 2212
Alignment:
Q  171 actatatggttgaaggaagacttatgagaattgtttgatactacctatatcaacaacatgcat 233  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||    
T  2150 actacatggttgaaggaaggcttataagaattgtttggtactccctatataaacaagatgcat 2212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1138 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1138
Description:

Target: scaffold1138; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 812 - 774
Alignment:
Q  157 cgtataggtatgagactatatggttgaaggaagacttat 195  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  812 cgtataggtatgagattatatggttgaaggaggacttat 774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University