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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11535_low_1 (Length: 636)

Name: NF11535_low_1
Description: NF11535
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11535_low_1
NF11535_low_1
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (11-619)||(37829-38437)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (11-620)||(75683-76293)
scaffold0029 (11-620)||(87408-88018)
[»] chr5 (8 HSPs)
chr5 (11-619)||(34657908-34658515)
chr5 (180-619)||(19184157-19184596)
chr5 (11-229)||(20933073-20933291)
chr5 (11-229)||(20928980-20929198)
chr5 (373-601)||(20928761-20928989)
chr5 (373-606)||(20933282-20933515)
chr5 (373-619)||(31233073-31233318)
chr5 (11-113)||(19185710-19185812)
[»] chr3 (8 HSPs)
chr3 (11-620)||(11176429-11177039)
chr3 (39-607)||(11295778-11296340)
chr3 (14-337)||(23047660-23047986)
chr3 (11-345)||(3791175-3791508)
chr3 (47-582)||(3779685-3780212)
chr3 (238-383)||(3829169-3829313)
chr3 (522-619)||(23047394-23047491)
chr3 (48-173)||(3828990-3829114)
[»] chr6 (3 HSPs)
chr6 (18-619)||(7960349-7960950)
chr6 (11-394)||(7845646-7846032)
chr6 (15-394)||(7839664-7840044)
[»] chr7 (9 HSPs)
chr7 (11-620)||(7159544-7160157)
chr7 (373-620)||(15941843-15942090)
chr7 (373-620)||(15933500-15933747)
chr7 (11-252)||(47921038-47921279)
chr7 (48-620)||(22075273-22075846)
chr7 (11-229)||(15933738-15933956)
chr7 (11-229)||(15942081-15942299)
chr7 (284-424)||(47921263-47921403)
chr7 (48-426)||(3844936-3845311)
[»] chr4 (17 HSPs)
chr4 (11-620)||(11164939-11165550)
chr4 (11-229)||(39372537-39372756)
chr4 (373-607)||(14224335-14224569)
chr4 (373-607)||(14234430-14234664)
chr4 (14-383)||(25157222-25157585)
chr4 (69-620)||(50878827-50879380)
chr4 (109-618)||(16636456-16636957)
chr4 (47-620)||(50883960-50884535)
chr4 (51-350)||(27078999-27079296)
chr4 (18-364)||(35975731-35976077)
chr4 (11-203)||(14224586-14224778)
chr4 (11-203)||(14234681-14234873)
chr4 (447-582)||(27079576-27079710)
chr4 (200-329)||(27079382-27079511)
chr4 (11-77)||(16636949-16637015)
chr4 (452-508)||(35975561-35975617)
chr4 (373-441)||(39372478-39372546)
[»] scaffold0453 (1 HSPs)
scaffold0453 (14-620)||(12380-12987)
[»] scaffold0158 (3 HSPs)
scaffold0158 (12-606)||(35306-35899)
scaffold0158 (11-243)||(27902-28136)
scaffold0158 (562-607)||(28133-28178)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (11-229)||(19900604-19900822)
chr8 (373-606)||(19900813-19901046)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (11-229)||(117100-117319)
scaffold0010 (373-601)||(116881-117109)
[»] chr1 (7 HSPs)
chr1 (373-607)||(18487000-18487234)
chr1 (373-607)||(18476904-18477138)
chr1 (11-229)||(18486790-18487009)
chr1 (11-229)||(18476695-18476913)
chr1 (491-620)||(7588407-7588542)
chr1 (211-294)||(7588214-7588297)
chr1 (23-91)||(7588079-7588146)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (373-607)||(186978-187212)
scaffold0001 (11-229)||(187203-187421)
[»] scaffold0177 (2 HSPs)
scaffold0177 (373-607)||(33053-33287)
scaffold0177 (11-229)||(33278-33497)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (373-607)||(28386890-28387124)
chr2 (376-619)||(23689500-23689742)
chr2 (11-143)||(28387201-28387333)
[»] scaffold1407 (2 HSPs)
scaffold1407 (373-607)||(545-779)
scaffold1407 (11-229)||(335-554)
[»] scaffold0035 (4 HSPs)
scaffold0035 (377-607)||(87053-87283)
scaffold0035 (377-607)||(96747-96977)
scaffold0035 (14-217)||(86843-87046)
scaffold0035 (11-217)||(96534-96740)
[»] scaffold0226 (2 HSPs)
scaffold0226 (373-607)||(4423-4657)
scaffold0226 (11-229)||(4648-4867)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (452-620)||(17022-17190)
[»] scaffold0513 (2 HSPs)
scaffold0513 (373-555)||(5931-6113)
scaffold0513 (11-229)||(6104-6323)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (120-383)||(4780-5042)


Alignment Details
Target: scaffold0059 (Bit Score: 421; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 619
Target Start/End: Original strand, 37829 - 38437
Alignment:
Q  11 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  37829 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcagattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgtttttaa 37928  T
Q  111 ttaatactaatgacaagagaccggaatataattcacgtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttcgcgcgtg 210  Q
    ||| |   |||||| |||| ||| |||||||||   ||| |||||   | |||  ||| ||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  37929 ttactttaaatgacgagagcccgaaatataatttgtgtcgaccgttgatgcttactaaattgcattttattattgtaacaggataatattttcgcgcgta 38028  T
Q  211 aaaagaattaatttaaaggggtcgtcagctttcacttgtacaacaccgaatttcgactttgtaatctattcgacagctttcgcgtgtacgccttacaagt 310  Q
    ||||||||||| |||||||||||  || ||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |    
T  38029 aaaagaattaaattaaaggggtcaccaactttcgcgtgtacgacaccgaattttgactttgtaatctattcgaccgctttcgcgtgtatgccttacaact 38128  T
Q  311 ttaaaataccgtttgaaaactaatcaatttatgcgcgaaaagtaatttttagtaaagattttaatttaaaggtaccgtcagctttcgcgcgcccggtacc 410  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38129 tcaaaattccgtttgaaaactaatcaatttatgcgcgaaaagttatttttagtaaagattttaatttaaaggtaccgtcggctttcgcgcgcccggtacc 38228  T
Q  411 gtattttaaactcacaagtgccagctttcgcatgtacgaccacaagtttaaaatagcctttttgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaacgc 510  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38229 gtattttaaactcacaagcgccagctttcgcatgtacgatcacaagtttaaaatagcctttttgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaacgc 38328  T
Q  511 tttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacatgtttcactctttcgatatgaaaccggtatcactttatttcagctttcgcc 610  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  38329 tttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacgttcagatacaggtttcactctttcgatatgaaaccggtatcactttatttcaactttcacc 38428  T
Q  611 gtaaatatt 619  Q
    |||||||||    
T  38429 gtaaatatt 38437  T

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Target: scaffold0029 (Bit Score: 421; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 620
Target Start/End: Original strand, 75683 - 76293
Alignment:
Q  11 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  75683 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcagattaattttgttgcaaa-ttgggaaaataacttgtttttaa 75781  T
Q  111 ttaatact--aatgacaagagaccggaatataattcacgtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttcgcgcg 208  Q
    ||| |  |  |||||| |||| ||||||| ||||||  |||  ||||   | |||| ||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  75782 ttactttttaaatgacgagagcccggaatgtaattcgtgtcgtccgttgatgcttgctaaattgtattttattattgtaacaggataatattttcgcacg 75881  T
Q  209 tgaaaagaattaatttaaaggggtcgtcagctttcacttgtacaacaccgaatttcgactttgtaatctattcgacagctttcgcgtgtacgccttacaa 308  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  75882 taaaaagaattaaattaaaggggtcgtcagctttcgcgtgtacgacaccgaattttgactttgtaatctattcgaccgctttcgcgtgtacgccttacaa 75981  T
Q  309 gtttaaaataccgtttgaaaactaatcaatttatgcgcgaaaagtaatttttagtaaagattttaatttaaaggtaccgtcagctttcgcgcgcccggta 408  Q
     || ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  75982 cttcaaaactccgtttgaaaactaatcaatttatgcacgaaaagttatttttagtaaagattttaatttaaacgtaccgtcggctttcgcgcgcccggta 76081  T
Q  409 ccgtattttaaactcacaagtgccagctttcgcatgtacgaccacaagtttaaaatagcctttttgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaac 508  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  76082 ccgtattttaaactcacaagcgccagctttcgcatgtacaaccacaagtttaaaatagcctttttgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaac 76181  T
Q  509 gctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacatgtttcactctttcgatatgaaaccggtatcactttatttcagctttcg 608  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  76182 gctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacagtcagatacaggtttcactctttcgatatgaaaccggtatcactttatttcagctttcg 76281  T
Q  609 ccgtaaatattc 620  Q
    ||||||||||||    
T  76282 ccgtaaatattc 76293  T

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Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 620
Target Start/End: Original strand, 87408 - 88018
Alignment:
Q  11 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  87408 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatcaaaggcgatgcagattaatttcgttgcaaa-ttgggaaaataacttgtttttaa 87506  T
Q  111 ttaatact--aatgacaagagaccggaatataattcacgtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttcgcgcg 208  Q
    ||| |  |  |||||| |||| ||||||| ||||||  |||  ||||   | |||| ||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  87507 ttactttttaaatgacgagagcccggaatgtaattcgtgtcgtccgttgatgcttgctaaattgtattttattattgtaacaggataatattttcgcgcg 87606  T
Q  209 tgaaaagaattaatttaaaggggtcgtcagctttcacttgtacaacaccgaatttcgactttgtaatctattcgacagctttcgcgtgtacgccttacaa 308  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  87607 taaaaagaattaaattaaaggggtcgtcagctttcgcgtgtacgacatcgaattttgactttgtaatctattcgaccgctttcgcgtgtacgccttacaa 87706  T
Q  309 gtttaaaataccgtttgaaaactaatcaatttatgcgcgaaaagtaatttttagtaaagattttaatttaaaggtaccgtcagctttcgcgcgcccggta 408  Q
     || ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||    
T  87707 cttcaaaactccgtttgaaaactaatcaatttatgcacgaaaagttatttttagtaaagattttaatttaaacgtaccgtcggctttcgcgcgcctagta 87806  T
Q  409 ccgtattttaaactcacaagtgccagctttcgcatgtacgaccacaagtttaaaatagcctttttgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaac 508  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  87807 ccgtattttaaactcacaagcgccagctttcgcatgtacaaccacaagtttaaaatagcctttttgaatattagaaatttctaaattaattaaagaaaac 87906  T
Q  509 gctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacatgtttcactctttcgatatgaaaccggtatcactttatttcagctttcg 608  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  87907 gctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacagtcagatacaggtttcactctttcgatatgaaaccggtatcactttatttcagctttcg 88006  T
Q  609 ccgtaaatattc 620  Q
    ||||||||||||    
T  88007 ccgtaaatattc 88018  T

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Target: chr5 (Bit Score: 417; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 34658515 - 34657908
Alignment:
Q  11 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||| |    
T  34658515 cagagaccaatgtcaagtaccgttatctattgtcacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggctacaaaattgggaaaataacttt-tttaga 34658417  T
Q  111 ttaatactaatgacaagagaccggaatataattcacgtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttcgcgcgtg 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||     
T  34658416 ttaattctaatgacaagagaccggaatataattcacgttgaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaacaggacaatatttttgcgcgta 34658317  T
Q  211 aaaagaattaatttaaaggggtcgtcagctttcacttgtacaacaccgaatttcgactttgtaatctattcgacagctttcgcgtgtacgccttacaagt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  34658316 aaaagaattaatttaaaggggtcgtcagctttcacttgtacgacagcgaatttcaactttgtaatctattcgacagctttcgcgtgtaccccttacaaat 34658217  T
Q  311 ttaaaataccgtttgaaaactaatcaatttatgcgcgaaaagtaatttttagtaaagattttaatttaaaggtaccgtcagctttcgcgcgcccggtacc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  34658216 ttaaaataccgtttgaaaactaatcaatttacgtgcaaaaatttatttttagtagaaattttaatttaaaggtaccgtcggctttcgcgcgcccgttacc 34658117  T
Q  411 gtattttaaactcacaagtgccagctttcgcatgtacgaccacaagtttaaaatagcctttttgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaacgc 510  Q
    |||||||||||||| |   |||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34658116 gtattttaaactcatagacgccagctttcacgtgtacgcctacaagtttaaaatagcctttttgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaacgc 34658017  T
Q  511 tttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacatgtttcactctttcgatatgaaaccggtatcactttatttcagctttcgcc 610  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  34658016 tttcgttgtatttcaaaaccaatttctgaatcttctacggtcagatacaggtttcactctttcgatatgaaatcggtatcactttatttcaactttcgct 34657917  T
Q  611 gtaaatatt 619  Q
    |||||||||    
T  34657916 gtaaatatt 34657908  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 180 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 19184596 - 19184157
Alignment:
Q  180 ttattgtaataggacaatattttcgcgcgtgaaaagaattaatttaaaggggtcgtcagctttcacttgtacaacaccgaatttcgactttgtaatctat 279  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  19184596 ttattgtaacaagacaatattttcgcgtgtaaaaagaattaaattaaaggggtcgccagctttcacgtgtacgacaccaaattttgactttgtaatctat 19184497  T
Q  280 tcgacagctttcgcgtgtacgccttacaagtttaaaataccgtttgaaaactaatcaatttatgcgcgaaaagtaatttttagtaaagattttaatttaa 379  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  19184496 ttgaccgctttcgcgtgtacgccttacaacttcaaaactccatttgaaaactaatcaatttacgcgcgaaaagttatttttagtaaaaatattaatttaa 19184397  T
Q  380 aggtaccgtcagctttcgcgcgcccggtaccgtattttaaactcacaagtgccagctttcgcatgtacgaccacaagtttaaaatagcctttttgaaaat 479  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  19184396 aggtaccgtcggttttcgcgtgcccgataccgtattttaaactcacaagcgccagctttcgcatgtacgaccataagtttaaaatagtctttttgaaaat 19184297  T
Q  480 tagaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacatgtttcactctttcgatatg 579  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  19184296 tagaaatttctaaattaattaaagaaaatgctttaactgtatttcaaaatcaattcctaaaaattccatgatcagatacagatttcactctttcgatatg 19184197  T
Q  580 aaaccggtatcactttatttcagctttcgccgtaaatatt 619  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  19184196 aaaccggtgtcactttatttcaactttcgctgtaaatatt 19184157  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Original strand, 20933073 - 20933291
Alignment:
Q  11 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20933073 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaa 20933172  T
Q  111 ttaatactaatgacaagagaccggaatataattcacgtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttcgcgcgtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  20933173 ttaatactaatgacaagagaccggaatataattcacgtcgaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaacaggacaatattttcgcgtgta 20933272  T
Q  211 aaaagaattaatttaaagg 229  Q
    |||||||  ||||||||||    
T  20933273 aaaagaacaaatttaaagg 20933291  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20929198 - 20928980
Alignment:
Q  11 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20929198 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaacttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaa 20929099  T
Q  111 ttaatactaatgacaagagaccggaatataattcacgtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttcgcgcgtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||     
T  20929098 ttaatactaatgacaagagaccggaatataattcacgtcgaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaacatgacaatattttcgcgtgta 20928999  T
Q  211 aaaagaattaatttaaagg 229  Q
    |||||||  ||||||||||    
T  20928998 aaaagaacaaatttaaagg 20928980  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 373 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 20928989 - 20928761
Alignment:
Q  373 aatttaaaggtaccgtcagctttcgcgcgcccggtaccgtattttaaactcacaagtgccagctttcgcatgtacgaccacaagtttaaaatagcctttt 472  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||  || ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20928989 aatttaaaggcaccgtcgactttcgtacgtccgataccgtattttaaactcacaagcgtcagctttcgcatgtacgaccgcaagtttaaaatagcctttt 20928890  T
Q  473 tgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacatgtttcactcttt 572  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20928889 tgaaaatttgaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacaggtttcactcttt 20928790  T
Q  573 cgatatgaaaccggtatcactttatttca 601  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||    
T  20928789 agatatgaaaccggtatcactgtatttca 20928761  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 373 - 606
Target Start/End: Original strand, 20933282 - 20933515
Alignment:
Q  373 aatttaaaggtaccgtcagctttcgcgcgcccggtaccgtattttaaactcacaagtgccagctttcgcatgtacgaccacaagtttaaaatagcctttt 472  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||  || ||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20933282 aatttaaaggcaccgtcgactttcgtacgtccgataccgtatgttaaactcacaagcgtcagctttcgcatgtacgaccacaagtttaaaatagcctttt 20933381  T
Q  473 tgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacatgtttcactcttt 572  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20933382 tgaaaatttgaaatttctaaattaattaaagaaaatgctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacaggtttcactcttt 20933481  T
Q  573 cgatatgaaaccggtatcactttatttcagcttt 606  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  20933482 cgatatgaaaccggtatcattgtatttcaacttt 20933515  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 373 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 31233318 - 31233073
Alignment:
Q  373 aatttaaaggtaccgtcagctttcgcgcgcccggtaccgtattttaaactcacaagtgccagctttcgcatgtacgaccacaagtttaaaatagcctttt 472  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||| ||||||||   | | || |||||||||||||| ||||||    
T  31233318 aatttaaaggtagcgtcggctttcgcgcgcccgttaccgtattttaaactcacagacgcccgctttcgcgcatgccactacaagtttaaaata-cctttt 31233220  T
Q  473 tgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacatgtttcactcttt 572  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| || ||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  31233219 tgaaaattagtaatttctaaatcaattaaagaaaacactttcgctgtatttcaaaattcatttctgaaatttctaaggttagatacaagtttcactcttt 31233120  T
Q  573 cgatatgaaaccggtatcactttatttcagctttcgccgtaaatatt 619  Q
    ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31233119 cgacatgaaacctatatcactttatttcagctttcgccgtaaatatt 31233073  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 19185812 - 19185710
Alignment:
Q  11 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||| || ||  ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  19185812 cagagaccaatgtcaagtactgttatctattgtcacgttgtttatctaaggcgaaacaaattattttggttgcaaaattgggaaaataacttgtttttaa 19185713  T
Q  111 tta 113  Q
    |||    
T  19185712 tta 19185710  T

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Target: chr3 (Bit Score: 409; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 620
Target Start/End: Original strand, 11176429 - 11177039
Alignment:
Q  11 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||    
T  11176429 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgacgcagattaatttggttgcaaa-ttgagaaaataacttgtttttaa 11176527  T
Q  111 ttaatact--aatgacaagagaccggaatataattcacgtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttcgcgcg 208  Q
    ||| |  |  |||||| |||| ||||||| |||||   |||  ||||   | |||| ||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  11176528 ttactttttaaatgacgagagtccggaatgtaatttgtgtcgtccgttgatgcttgctaaattgtattttattattgtaacaggataatattttcgagcg 11176627  T
Q  209 tgaaaagaattaatttaaaggggtcgtcagctttcacttgtacaacaccgaatttcgactttgtaatctattcgacagctttcgcgtgtacgccttacaa 308  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  11176628 taaaaagaattaaattaaaggggtcgtcagctttcgcgtgtacgacaccgaattttgactttgtaatctattcaaccgctttcgcgtgtacgccttacaa 11176727  T
Q  309 gtttaaaataccgtttgaaaactaatcaatttatgcgcgaaaagtaatttttagtaaagattttaatttaaaggtaccgtcagctttcgcgcgcccggta 408  Q
     || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  11176728 cttcaaaactccgtttgaaaactaatcaatttatgcgcgaaaagttatttttagtaaagattttaatttaaaggtaccgtcggctttcgcgcgcccgata 11176827  T
Q  409 ccgtattttaaactcacaagtgccagctttcgcatgtacgaccacaagtttaaaatagcctttttgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaac 508  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11176828 ccgtattttaaactcacaagcgccagctttcgcatgtacgaccacaagtttaaaatagcctttttgaaaattaaaaatttctaaattaattaaagaaaac 11176927  T
Q  509 gctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacatgtttcactctttcgatatgaaaccggtatcactttatttcagctttcg 608  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11176928 gctttcactgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacagtcagatacaggtttcactctttcgatatgaaaccggtatcactttatttcagctttcg 11177027  T
Q  609 ccgtaaatattc 620  Q
    ||||||||||||    
T  11177028 ccgtaaatattc 11177039  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 39 - 607
Target Start/End: Original strand, 11295778 - 11296340
Alignment:
Q  39 attgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaattaatactaatgacaagagaccggaata 138  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |   |||||| |||| ||||||||    
T  11295778 attgtcacgttgtttatctaaggcgatgtaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataatttgtttttaattactttaaatgacgagagcccggaata 11295877  T
Q  139 taattcacgtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttcgcgcgtgaaaagaattaatttaaaggggtcgtcag 238  Q
    ||||| | ||| |||||   | |||| ||| ||  |||||||| ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  11295878 taatttatgtcgaccgttgatgcttgctaaattgcattttattgttgtaactggacaacattttcgcgcgtaaaaagaattaaattaaagggatcgtcag 11295977  T
Q  239 ctttcacttgtacaacaccgaatttcgactttgtaatctattcgacagctttcgcgtgtacgccttacaagtttaaaataccgtttgaaaactaatcaat 338  Q
    |||||   ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| || ||||  ||||||||||||| ||||||    
T  11295978 ctttcgtgtgtacgacaccgaattttgactttgtaatctattcgaccactttctcgggtacgccttacaacttcaaaactccgtttgaaaactgatcaat 11296077  T
Q  339 ttatgcgcgaaaagtaatttttagtaaagattttaatttaaaggtaccgtcagctttcgcgcgcccggtaccgtattttaaactcacaagtgccagcttt 438  Q
    ||| || |||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||    
T  11296078 ttacgcccgaaaagttacttttagtaaaaaatttaatttaaaggtaccgtcggctttcgcgcgcccggtaccgtattttaaactcaca------agcttt 11296171  T
Q  439 cgcatgtacgaccacaagtttaaaatagcctttttgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgctgtatttcaaaatcaattccta 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11296172 cgcatgtacgaccacaagtttaaaatagcctttttgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcactgtatttcaaaatcaattccta 11296271  T
Q  539 aaaattctacggtcagatacatgtttcactctttcgatatgaaaccggtatcactttatttcagctttc 607  Q
    ||||||||| || |||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  11296272 aaaattctatggacagagacaagtttcactctttcaatgtgaaaccggtatcgcgttatttcagttttc 11296340  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 23047986 - 23047660
Alignment:
Q  14 agaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaatta 113  Q
    |||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  23047986 agaccaatgtcaagtatcgttatctattgtcacgttgtttatctaaggcgatgctaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgtttctaatta 23047887  T
Q  114 a--tactaatgacaagagaccggaatataattcacgtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttcgcgcgtga 211  Q
    |  |  ||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||| |||  |    
T  23047886 attttttaaagacaagaggtcggaatataattcgcgtcaacggtgaatacttgttaagttatatttaataattgtaaca-gacaatattttcgtgcgaaa 23047788  T
Q  212 aaagaattaatttaaaggggtcgtcagctttcacttgtacaacaccgaatttcgactttg--taatctattcgacagctttcgcgtgtacgccttacaag 309  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||||| | ||||||||| |||||||  |||| | |||||| ||| || |  |||||||||||||     
T  23047787 aaaggattaaattaaaggggtcgtcagctttcgtatgtacgataccgaattttgactttgtataatattttcgaccgctctcacacgtacgccttacaac 23047688  T
Q  310 tttaaaataccgtttgaaaactaatcaa 337  Q
    || ||||  ||||| ||||| |||||||    
T  23047687 ttcaaaactccgttggaaaaataatcaa 23047660  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 345
Target Start/End: Original strand, 3791175 - 3791508
Alignment:
Q  11 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||  ||||| ||||| ||||||| ||  ||    
T  3791175 cagagaccaatgtcaagtaccattatctattgtcacattgtttatctaaggtgatgctaattagtttgattgtgaaattaggaaattaacttgtttctaa 3791274  T
Q  111 ttaatactaatgacaagagaccggaatataattcacgtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttcgcgcgtg 210  Q
    || ||  | ||||| |||||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||||| |||     
T  3791275 tt-atttttatgacgagagaccggaatataattcgtgtcgatcgtgaatacttcttaagttatatcttattattataacaagaaaatattttcgcacgt- 3791372  T
Q  211 aaaagaattaatttaaaggggtcg-tcagctttcacttgtacaacaccgaatttcgactttgtaatctattcgacagctttcgcgtgtacgccttacaag 309  Q
    || ||  |||| |||||| || || || |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||| ||||||     
T  3791373 aacaggtttaaattaaagaggccgctccgctttcgcgtgtacgacaccgaatttcgactttgtaatctattcaacctctttcgcgcgtacgcattacaac 3791472  T
Q  310 tttaaaataccgtttgaaaactaatcaatttatgcg 345  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  3791473 ttcaaaattccgtttgaaaaataatcaatttttgcg 3791508  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 3780212 - 3779685
Alignment:
Q  47 gttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaattaatactaatgacaagagaccggaatataattcac 146  Q
    |||||||||||||||   ||| ||||| |||| |||| ||||| | ||| ||||||| ||| ||||| |  || |||||||||||  ||||||||||       
T  3780212 gttgtttatctaaggtagtgctaattagtttgattgcgaaattagaaaattaacttgtttttaattattttta-tgacaagagacaagaatataatttgt 3780114  T
Q  147 gtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttcgcgcgtgaaaagaattaatttaaaggggtcgtcag-ctttcac 245  Q
    ||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || | ||||| ||||| |||||| ||  |  |  ||||  |    
T  3780113 gtcgatcgcgaatacttgttaagttatattttattattgtaacaggaaaatattttcgtgctt-aaaaggattaaattaaagaggctgctacacttttgc 3780015  T
Q  246 ttgtacaacaccgaatttcgactttgtaatctattcgacagctttcgcgtgtacgccttacaagtttaaaataccgtttgaaaactaatcaatttatgcg 345  Q
     ||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||| |||||| |||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||    
T  3780014 gtgtgcgacaccgaatttcgacttcgtaatctatttgacctctttcgcgcgtacgcattacaactttaaaatttagtttgaaaaataatcaatttttgcg 3779915  T
Q  346 cgaaaagtaatttttagtaaagattttaatttaaaggtaccgtcagctttcgcgcgcccggtaccgtatttt-aaactcacaagtgccagctttcgcatg 444  Q
     ||||||| |||||||||| | | |||||||||||||| | ||   |||||||    | |  ||| |||||| |||||||||   ||  |||||||| ||    
T  3779914 tgaaaagttatttttagtaga-aatttaatttaaaggttctgtttactttcgcatagctgaaaccatattttaaaactcacagaagctcgctttcgcgtg 3779816  T
Q  445 tacgaccacaagtttaaaatagcctttttgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaatt 544  Q
    | |  | |||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  3779815 tccagctacaagtttaaaatgac--ttttgaaaattagtaatttctaaattaattaaagaaaatgctctgactgtattttaaaatcaattcctaaatctt 3779718  T
Q  545 ctacggtcagatacatgtttcactctttcgatatgaaa 582  Q
    ||||     |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  3779717 ctac-----gatacatgtttcactctttcaagatgaaa 3779685  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 238 - 383
Target Start/End: Original strand, 3829169 - 3829313
Alignment:
Q  238 gctttcacttgtacaacaccgaatttcgactttgtaatctattcgacagctttcgcgtgtacgccttacaagtttaaaataccgtttgaaaactaatcaa 337  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| | |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  3829169 gctttcgcgtgtacgacaccgaatttcgactttgtaatctattcaacctctttcgcgcgtacacattacaacttcaaaattccgtttgaaaaataatcaa 3829268  T
Q  338 tttatgcgcgaaaagtaatttttagtaaagattttaatttaaaggt 383  Q
    ||| |||| ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  3829269 tttttgcgtgaaaagttattttaagtaaa-aatttaatttaaaggt 3829313  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 522 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 23047491 - 23047394
Alignment:
Q  522 ttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacatgtttcactctttcgatatgaaaccggtatcactttatttcagctttcgccgtaaatatt 619  Q
    ||||||||||||| || ||  ||||||  ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||    
T  23047491 ttcaaaatcaatttctgaattttctacaatcagatacaggtttcactctctcaatatgaaaccggtatcgcattatttcaactttcgctgtaaatatt 23047394  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 48 - 173
Target Start/End: Original strand, 3828990 - 3829114
Alignment:
Q  48 ttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaattaatactaatgacaagagaccggaatataattcacg 147  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||  ||||| ||||| ||||||| ||  |||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||  |    
T  3828990 ttgtttatctaaggtgatgctaattagtttgattgtgaaattaggaaattaacttgtttctaatt-atttttatgacgagagaccggaatataattcgtg 3829088  T
Q  148 tcaaccgtgagtacttgttaagttat 173  Q
    || | ||||| ||||| |||||||||    
T  3829089 tcgatcgtgaatacttcttaagttat 3829114  T

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Target: chr6 (Bit Score: 406; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 7960950 - 7960349
Alignment:
Q  18 caatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaattaatac 117  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  7960950 caatgtcaagtaccgttatctattgtcacgttgtttatctaaggcgatgcaaattagtttggttgcaaaattgggaaaataacttgttttaaattaattc 7960851  T
Q  118 taatgacaagagaccggaatataattcacgtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttcgcgcgtgaaaagaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  7960850 taatgacaagagaccggaatataattcccgtcgaccataagtacttgttaagttatattttaatattctaacgggacaatattttcgcgcgtaaaaagaa 7960751  T
Q  218 ttaatttaaaggggtcgtcagctttcacttgtacaacaccgaatttcgactttgtaatctattcgacagctttcgcgtgtacgccttacaagtttaaaat 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7960750 ttaatttaaaggggtcgtcagctttcacttgtacaacaccaaatttcgactttgtaatctattcgacagttttcgcgtgtacgccttacaagtttaaaat 7960651  T
Q  318 accgtttgaaaactaatcaatttatgcgcgaaaagtaatttttagtaaagattttaatttaaaggtaccgtcagctttcgcgcgcccggtaccgtatttt 417  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||||  || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7960650 accgtttgaaaactaatcaatttacgtgcaaaaagttgttattagtagaaattttaatttaaaggtaccgtcagctttcgcgcgcccgttaccgtatttt 7960551  T
Q  418 aaactcacaagtgccagctttcgcatgtacgaccacaagtttaaaatagcctttttgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgct 517  Q
    ||||||| |   |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7960550 aaactcatagacgccagctttcgcgtgtacgcctacaagtttaaaatagcttgtttgaaaattagcaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgct 7960451  T
Q  518 gtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacatgtttcactctttcgatatgaaaccggtatcactttatttcagctttcgccgtaaata 617  Q
     |||||||||| ||||| |||||  |||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  7960450 atatttcaaaaccaatttctaaattttctatagttagatacaggtttcactctttcgatatgaaaccggtatcgctttatttcaactttcgctgtaaata 7960351  T
Q  618 tt 619  Q
    ||    
T  7960350 tt 7960349  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 7846032 - 7845646
Alignment:
Q  11 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaa 110  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||    
T  7846032 cagagaccaacgtcaagtaccgttatatattgtcacattgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaatttggaaaataacttgtttttaa 7845933  T
Q  111 ttaatactaatgacaagagaccggaatataattcacgtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttcgcgcgtg 210  Q
    ||| |   |||||| |||| ||| |||||||||   | | || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  7845932 ttactttaaatgacgagagcccgaaatataatttgtgccgactgtgagtgcttgttaagttatatattattattgtaacaggacaatattttcacgcgta 7845833  T
Q  211 aaaagaattaatttaaaggggtcgtcagctttcacttgtacaacaccgaatttcgactttgtaatctattcgacagctttcgcgtgtacgccttacaagt 310  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  7845832 aaaagaattaaattaaaggggtcgccagctttcgtgtgtacaacaccgaattttgactttgtaaactattcgaccgctttcgcgtgtacgccttacaact 7845733  T
Q  311 ttaaaataccgtt--tgaaaactaatcaattt--atgcgcgaaaagtaatttttagtaaagattttaatttaaaggtaccgtcagctt 394  Q
    | ||||  |||||  |||||||||||||||||  |||| |||| ||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  7845732 tcaaaactccgtttgtgaaaactaatcaatttacatgc-cgaagagttatttttattagaaattttaatttaaaggtaccgtcggctt 7845646  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 7840044 - 7839664
Alignment:
Q  15 gaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaattaa 114  Q
    |||||| |||||||||||| ||  ||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||     
T  7840044 gaccaacgtcaagtaccgttatctattatcacgtcgtttatctaaggcgatacaaattaatttggttgcaaaatttgaaaaataacttgtttttaattac 7839945  T
Q  115 tactaatgacaagagaccggaatataattcacgtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttcgcgcgtgaaaa 214  Q
    |   |||||| |||| |||||||||||||   ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  7839944 tttaaatgacgagagtccggaatataatttgtgtcaaccatgagtgcttgttaagttatattttattattgtaacaggacaatattttcgcacgtaaaaa 7839845  T
Q  215 gaattaatttaaaggggtcgtcagctttcacttgtacaacaccgaatttcgactttgtaatctattcgacagctttcgcgtgtacgccttacaagtttaa 314  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||   ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  7839844 gaattaaattaaagtggtcgccaactttcgtgtgtaggacaccgaattttgactttgtaatctattcgaccgctttcgcgtgtacgccttacaacttcaa 7839745  T
Q  315 aataccgtttgaaaactaatcaatttatgcg-cgaaaagtaatttttagtaaagattttaatttaaaggtaccgtcagctt 394  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||  || |||||| | ||||||| || | ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  7839744 aacttcgtttgaaaactaatcaatttacacgccgaaaatttatttttaatagaaattataatttaaaggtaccgtcggctt 7839664  T

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Target: chr7 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 7160157 - 7159544
Alignment:
Q  11 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  7160157 cagagaccaatgtcaagtaccgttaactattgtcacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattggaaaaataacttgtttttaa 7160058  T
Q  111 ttaatactaatgacaagagaccggaatataattcacgtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttcgcgcgtg 210  Q
    ||| |   |||||| |||| |||||||||| ||   ||| |||||   | |||| ||| ||  ||||||||||||||| | || |||||||||||||||     
T  7160057 ttactttaaatgacgagagcccggaatatattttgtgtcgaccgttgatgcttgctaaattgcattttattattgtaacaagataatattttcgcgcgta 7159958  T
Q  211 aaaagaattaatttaaaggggtcgtcagctttcacttgtacaacaccgaatttcgactttgtaatctattcgacagctttcgcgtgtacgccttacaagt 310  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  7159957 aaaagaattaaattaaaggggtcgccagctttcgtgtgtacgacaccgaattttgactttgtaatctattcgaccgctttcgcgtgtacgccttacaact 7159858  T
Q  311 ttaaaataccgtttgaaaactaatcaatttatgcgcgaaaagtaatttttagtaaagattttaatttaaaggtaccgtcagctttcgcgcgcccggtacc 410  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7159857 tcaaaactccgtttgaaaactaatcaatttatgcgcgaaaagttatttttagtaaaaaaattaatttaaaggtaccgtcagctttcgcgcgcccggtacc 7159758  T
Q  411 gta----ttttaaactcacaagtgccagctttcgcatgtacgaccacaagtttaaaatagcctttttgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaa 506  Q
    |||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7159757 gtacgtattttaaactcacaagcgccagctttcgcatgtacgaccacaagtttaaaatagcctttttgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaa 7159658  T
Q  507 acgctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacatgtttcactctttcgatatgaaaccggtatcactttatttcagcttt 606  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7159657 acgctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattatactgtcatacacaggtttcactctttcgatatgaaaccggtatcactttatttcagcttt 7159558  T
Q  607 cgccgtaaatattc 620  Q
    ||||||||||||||    
T  7159557 cgccgtaaatattc 7159544  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 373 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 15942090 - 15941843
Alignment:
Q  373 aatttaaaggtaccgtcagctttcgcgcgcccggtaccgtattttaaactcacaagtgccagctttcgcatgtacgaccacaagtttaaaatagcctttt 472  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||  || ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15942090 aatttaaaggcaccgtcgactttcgtacgtccgataccgtattttaaactcacaagcgtcagctttcgcatgtacgaccgcaagtttaaaatagcctttt 15941991  T
Q  473 tgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacatgtttcactcttt 572  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15941990 tgaaaatttgaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgctatatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacaggtttcactcttt 15941891  T
Q  573 cgatatgaaaccggtatcactttatttcagctttcgccgtaaatattc 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15941890 cgatatgaaaccggtatcactttatttcagctttcgccgtaaatattc 15941843  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 373 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 15933747 - 15933500
Alignment:
Q  373 aatttaaaggtaccgtcagctttcgcgcgcccggtaccgtattttaaactcacaagtgccagctttcgcatgtacgaccacaagtttaaaatagcctttt 472  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||  || ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15933747 aatttaaaggcaccgtcgactttcgtacgtccgataccgtattttaaactcacaagcgtcagctttcgcatgtacgaccgcaagtttaaaatagcctttt 15933648  T
Q  473 tgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacatgtttcactcttt 572  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  15933647 tgaaaatttgaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgctatatttcaaaatcaattcctaaaaattctacgatcagatacaggtttcactcttt 15933548  T
Q  573 cgatatgaaaccggtatcactttatttcagctttcgccgtaaatattc 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15933547 cgatatgaaaccggtatcactttatttcagctttcgccgtaaatattc 15933500  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Original strand, 47921038 - 47921279
Alignment:
Q  11 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaa 110  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  47921038 cagagatcaatgtcaagtaccgttatctattgtcacgttgtttatctaaggcgatgctaattaatttggttgtaaaattgggaaaataacttgttttaaa 47921137  T
Q  111 ttaatactaatgacaagagaccggaatataattcacgtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttcgcgcgtg 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |     
T  47921138 ttaattctaatgacaagagaccggaatataattcaagtcgacagtgagtacttgttaagttatattttattattgtaacaggacaatattttcgcgttta 47921237  T
Q  211 aaaagaattaatttaaaggggtcgtcagctttcacttgtaca 252  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  47921238 aaaagaattaatttaaagggatcgtcagctttcgcgtgtaca 47921279  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 48 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 22075846 - 22075273
Alignment:
Q  48 ttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataactt-gctttaaattaatactaatgacaagagaccggaatataattcac 146  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||  ||| |   ||||||||| ||||||||| |    
T  22075846 ttgtttatctaatgcgatcctaattagttttgttgcaaaattgagaaaataactttgtttttaattaattttaacgttgagagaccgggatataattcgc 22075747  T
Q  147 gtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttcgcgcgtgaaaagaattaatttaaaggggtcgtcagctttcact 246  Q
    ||| |   |   | |||| ||| || ||| ||| |||||||| |||| |||| |||||||||| ||||  ||||| |||||| || || ||| ||||||     
T  22075746 gtcgatttttgatgcttgctaaattgtatcttaatattgtaacaggaaaatactttcgcgcgtaaaaatgattaaattaaagaggccgccagttttcacg 22075647  T
Q  247 tgtacaacaccgaatttc-gactttgtaatctattcgacagctttcgcgtgtacgccttacaagtttaaaataccgtttgaaaactaatcaatttatgcg 345  Q
    ||||| |||| ||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||  || |||| || ||||  ||||||||||| ||||||||||| | |    
T  22075646 tgtacgacactgaatttttgacattgtaatctattcgaccgctttcgcgcgtacaactcacaacttcaaaaccccgtttgaaaaataatcaatttacgtg 22075547  T
Q  346 cgaaaagtaatttttagtaaagattttaatttaaaggtaccgtcagctttcgcgcgcccggtaccgtattttaaactcacaagtgccagctttcgcatgt 445  Q
    | |||||| |||||||||| | |||| ||||||||||| | ||  |||||||| |  |||  |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||     
T  22075546 caaaaagttatttttagtagaaattt-aatttaaaggttctgtttgctttcgcacagccgaaaccgtattttaaactcacagacgccaactttcgcatgc 22075448  T
Q  446 acgaccacaagtttaaaatagcctttttgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattc 545  Q
    |||   || ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| | || ||| |||||| |||| ||||| ||||||| ||   |     
T  22075447 acggttacgagtttaaaatagcgtttttaaaaattagtaatttctaaattatttaaaaagaaagctatcgctgaattttaaaattaattcctgaattata 22075348  T
Q  546 tacggtcagatacatgtttcactctttcgatatgaaaccggtatcactttatttcagctttcgccgtaaatattc 620  Q
    ||  |  ||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||| | ||||||||| |||| | ||||||||||    
T  22075347 taaagagagatacaagtttcactctttcgatatcaaatcagtatcgcgttatttcagttttcactgtaaatattc 22075273  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15933956 - 15933738
Alignment:
Q  11 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  15933956 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcagattaatttggttgc-aaattgggaaaataacttgtttttaa 15933858  T
Q  111 ttaatact-aatgacaagagaccggaatataattcacgtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttcgcgcgt 209  Q
    ||| |  | |||||| |||| ||||||||||||||  |||  ||||   | |||| ||| || |||||||||||||||| | |||||||||||| || ||    
T  15933857 ttacttttaaatgacgagagcccggaatataattcgtgtcgtccgttgatgcttgctaaattgtattttattattgtaacatgacaatattttcacgtgt 15933758  T
Q  210 gaaaagaattaatttaaagg 229  Q
     |||||||  ||||||||||    
T  15933757 aaaaagaacaaatttaaagg 15933738  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15942299 - 15942081
Alignment:
Q  11 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  15942299 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcagattaatttggttgc-aaattgggaaaataacttgtttttaa 15942201  T
Q  111 ttaatact-aatgacaagagaccggaatataattcacgtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttcgcgcgt 209  Q
    ||| |  | |||||| |||| ||| ||||||||||  |||  ||||   | |||| ||| || |||||||||||||||| | |||||||||||| || ||    
T  15942200 ttacttttaaatgacgagagcccgaaatataattcgtgtcgtccgttgatgcttgctaaattgtattttattattgtaacatgacaatattttcacgtgt 15942101  T
Q  210 gaaaagaattaatttaaagg 229  Q
     |||||||  ||||||||||    
T  15942100 aaaaagaacaaatttaaagg 15942081  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 284 - 424
Target Start/End: Original strand, 47921263 - 47921403
Alignment:
Q  284 cagctttcgcgtgtacgccttacaagtttaaaataccgtttgaaaactaatcaatttatgcgcgaaaagtaatttttagtaaagattttaatttaaaggt 383  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  47921263 cagctttcgcgtgtacaccttacaaattcaaaactccgtttgaaaactaatcaatttacgtgcaaaaagttatttttagtagaaattttaatttaaaggt 47921362  T
Q  384 accgtcagctttcgcgcgcccggtaccgtattttaaactca 424  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  47921363 accgtcggctttcgcgcgcccattaccgtattttaaactca 47921403  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 48 - 426
Target Start/End: Original strand, 3844936 - 3845311
Alignment:
Q  48 ttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaattaatactaatgacaagagaccggaatataattcacg 147  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| |  ||||||| | | ||| |||||||||||  |    
T  3844936 ttgtttatctaaggcggtgctaattagtttgattgcaaaattaggaaattaacttgtttttaattactt-taatgacgacataccagaatataattcgtg 3845034  T
Q  148 tcaaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttcgcgcgtgaaaagaattaatt-taaaggggtcgtcagctttcact 246  Q
    |  ||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||  | | ||||||||  ||||| ||| ||  ||||| || |||  || || ||||||||     
T  3845035 tggaccatgtatacttgttaagttatattttattattataactgcaaaatatttttacgcgtaaaaggatataattatagaggcctc-tccgctttcacg 3845133  T
Q  247 tgtacaacaccgaatttcgactttgtaatctattcgacagctttcgcgtgtacgccttacaagtttaaaataccgtttgaaaactaatcaatttatgcgc 346  Q
    ||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||| || |||||   | |||||||  ||||||||| || |     
T  3845134 tgtacgacaa-gaatttcaactttgtaatctattcgaccgctttcgcgggtatgcattacaacttcaaaattatggttgaaaaacaatcaatttttgagt 3845232  T
Q  347 gaaaagtaatttttagtaaagattttaatttaaaggtaccgtcagctttcgcgcgcccggtaccgtattttaaactcaca 426  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||| || |  |||||||||   |||  |||||||||||||||||||    
T  3845233 gaaaagttatttttagtaaa-aatttaattgaaaggttccatttgctttcgcgtagccgaaaccgtattttaaactcaca 3845311  T

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Target: chr4 (Bit Score: 377; Significance: 0; HSPs: 17)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 11165550 - 11164939
Alignment:
Q  11 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaa 110  Q
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T  11165550 cagagaccaatgtcaagtaccgtagttaattgttacgttgtttatctaaggcgtttgtaaatgacatgggtgcaaaattggaaaaataacttgtttttaa 11165451  T
Q  111 ttaatact--aatgacaagagaccggaatataattcacgtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttcgcgcg 208  Q
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T  11165450 ttaatttttaaatgacgagagcccggaatgtaattcgtgtcgtccgttgatgcttgctaaattgtattttattattgtaacaggataatattttcgcgcg 11165351  T
Q  209 tgaaaagaattaatttaaaggggtcgtcagctttcacttgtacaacaccgaatttcgactttgtaatctattcgacagctttcgcgtgtacgccttacaa 308  Q
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T  11165350 taagaagaattaaattaaaggggtcgctagctttcgcgtgtacgacaccgaattttgactttgtaatttattcgaccactttcgcgtgtacgccttacaa 11165251  T
Q  309 gtttaaaataccgtttgaaaactaatcaatttatgcgcgaaaagtaatttttagtaaagattttaatttaaaggtaccgtcagctttcgcgcgcccggta 408  Q
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T  11165250 cttcaaaactccgtttgaaaactaatcaatttatgcgcgaaaagttatttttagtaaagattttaatttaaaggtaccgtcggctttcgcgcgcccggta 11165151  T
Q  409 ccgtattttaaactcacaagtgccagctttcgcatgtacgaccacaagtttaaaatagcctttttgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaac 508  Q
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T  11165150 ccgtattttaaactcacaagcgtcagctttcgcatgtacgaccacaaatttaaaatagcctttttgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaac 11165051  T
Q  509 gctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacatgtttcactctttcgatatgaaaccggtatcactttatttcagctttcg 608  Q
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T  11165050 gttttcactgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacagtcagatacatgtttcactctttcgatatgaaactggtatcactttatttcagctttcg 11164951  T
Q  609 ccgtaaatattc 620  Q
    ||||||||||||    
T  11164950 ccgtaaatattc 11164939  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 39372756 - 39372537
Alignment:
Q  11 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaa 110  Q
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T  39372756 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataagttgctttaaa 39372657  T
Q  111 ttaatactaatgacaagagaccggaatataattcacgtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttatta-ttgtaataggacaatattttcgcgcgt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||    
T  39372656 ttaatactaatgacaagagaccggaatataatttacgtcgaccgtgagtacttgttaagttatattttattatttgcaacaggacaatattttcgcgtgt 39372557  T
Q  210 gaaaagaattaatttaaagg 229  Q
     |||||||  ||||||||||    
T  39372556 aaaaagaacaaatttaaagg 39372537  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 373 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 14224569 - 14224335
Alignment:
Q  373 aatttaaaggtaccgtcagctttcgcgcgcccggtaccgtattttaaactcacaagtgccagctttcgcatgtacgaccacaagtttaaaatagcctttt 472  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||  || ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14224569 aatttaaaggcaccgtcgactttcgtacgtccgataccgtattttaaactcacaagcgtcagctttcgcatgtacgaccgcaagtttaaaatagcctttt 14224470  T
Q  473 tgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacatgtttcactcttt 572  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  14224469 tgaaaatttgaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctaccgtcagatacaggtttcactcttt 14224370  T
Q  573 cgatatgaaaccggtatcactttatttcagctttc 607  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  14224369 cgatatgaaaccggtatcactgtatttcaactttc 14224335  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 373 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 14234664 - 14234430
Alignment:
Q  373 aatttaaaggtaccgtcagctttcgcgcgcccggtaccgtattttaaactcacaagtgccagctttcgcatgtacgaccacaagtttaaaatagcctttt 472  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||  || ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14234664 aatttaaaggcaccgtcgactttcgtacgtccgataccgtattttaaactcacaagcgtcagctttcgcatgtacgaccgcaagtttaaaatagcctttt 14234565  T
Q  473 tgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacatgtttcactcttt 572  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  14234564 tgaaaatttgaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctaccgtcagatacaggtttcactcttt 14234465  T
Q  573 cgatatgaaaccggtatcactttatttcagctttc 607  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  14234464 cgatatgaaaccggtatcactgtatttcaactttc 14234430  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 25157585 - 25157222
Alignment:
Q  14 agaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaatta 113  Q
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T  25157585 agaccaatgtcaagtatcgttatttattgtcatgttgtttatctaaggcgatgct------tttggttgcaaaattgggaaaataacttgtttttaatta 25157492  T
Q  114 atactaatgacaagagaccggaatataattcacgtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttcgcgcgtgaaa 213  Q
     |  ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||    
T  25157491 cttttaaagacaagagaccggaatataattcgcgtcgaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaacaggaaaatatttttgcgcgtaaaa 25157392  T
Q  214 agaattaatttaaaggggtcgtcagctttcacttgtacaacaccgaatttcgactttgtaatctattcgacagctttcgcgtgtacgccttacaagttta 313  Q
    | |||||| |||||||||||| || ||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| || |    
T  25157391 ataattaaattaaaggggtcgccaactttcgcgtgtacaacatcgaattttgactttgtaatctattcgaccgctttcgtgtgtatgccttacaacttca 25157292  T
Q  314 aaataccgtttgaaaactaatcaatttatgcgcg-aaaagtaatttttagtaaagattttaatttaaaggt 383  Q
    |||  |||||| |||| |||||||| || ||||| |||| | |||||||||| | | ||||||||||||||    
T  25157291 aaactccgtttaaaaaataatcaatatacgcgcgaaaaaattatttttagtaga-aatttaatttaaaggt 25157222  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 69 - 620
Target Start/End: Original strand, 50878827 - 50879380
Alignment:
Q  69 aattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaattaatact-aatgacaagagaccggaatataattcacgtcaaccgtgagtacttgtta 167  Q
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T  50878827 aattaatttggttgcaaaaatggaaaaataacttgtttttagtttctttttaatgacgagagcctcgaatataattcacgtcgatcgttgatgctagcta 50878926  T
Q  168 agttatattttattattgtaataggacaatattttcgcgcgtgaaaagaattaatttaaaggggtcgtcagctttcacttgtacaacaccgaatttcgac 267  Q
      || |||||||||||| ||| | || ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||   | ||| ||||||||||| |||    
T  50878927 cattgtattttattattataacatgaaaatattttcgcgcgttaaaaggattaaattaaagggatcgccagctttcgactatacgacaccgaattttgac 50879026  T
Q  268 tttgtaatctattcgacagctttcgcgtgtacgccttacaagtttaaaataccgtttgaaaac-taatcaatttatgcgcgaaaagtaatttttagtaaa 366  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| || ||||  | || ||||||  ||||||||||| ||  ||||||| |||| ||||| |    
T  50879027 tttgtaatctattcgaccgctttcgcgcgtacgcctttcaacttcaaaactctgtatgaaaaaataatcaatttacgcttgaaaagttatttatagtaga 50879126  T
Q  367 gattttaatttaaaggtaccgtcagctttcgcgcgcccggtaccgtattttaaactcacaagtgccagctttcgcatgtacgaccacaagtttaaaatag 466  Q
     |||||||||||||| |   || ||||||| |    || ||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  50879127 aattttaatttaaagatcatgttagctttcacataaccagtaccgtatattaaactcacaaacgccggctttcgcgtgtacggccacaagtttaaaatag 50879226  T
Q  467 cctttttgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacatgtttca 566  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | | |||||| |||| ||||| ||||| | ||   ||||||| |||||||||||||||    
T  50879227 catttttgaaaattagaaatttctaaattaattaaaaagaatgttgtcgctgaattttaaaattaattcttgaatcatctacggacagatacatgtttca 50879326  T
Q  567 ctctttcgatatgaaaccggtatcactttatttcagctttcgccgtaaatattc 620  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  50879327 ctctttcgatatgaaaccggtatcgcattattccagttttcaccgtaaatattc 50879380  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 109 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 16636957 - 16636456
Alignment:
Q  109 aattaatactaatgacaagagaccggaatataattcacgtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttcgcgcg 208  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||    
T  16636957 aattaattttaatgacaagagaccagaatataattcgcgtcgaccctgagtacttgttaagttatattttattattgcaacaagacaatattttcacgcg 16636858  T
Q  209 tgaaaagaattaatttaaaggggtcgtcagctttcacttgtacaacaccgaatttcgactttgtaatctattcgacagctttcgcgtgtacgccttacaa 308  Q
    | ||||||||||| |||||| ||||| || ||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||    
T  16636857 taaaaagaattaaattaaagtggtcgccaactttcgcctgtacgacatcgaatttcgactttgtaatctattcgaccgctttcgggcgtaggccttacaa 16636758  T
Q  309 gtttaaaataccgtttgaaaactaatcaatttatgcgcgaaaagtaatttttagtaaagattttaatttaaaggtaccgtcagctttcgcgcgcccggta 408  Q
      | ||||  ||||||||||| |||||||||| |||   ||| || |||||||||| | |    |||||||||||| |||| |||||||| || ||| ||    
T  16636757 cgtcaaaactccgtttgaaaaataatcaatttttgcttaaaacgttatttttagtaga-aaacaaatttaaaggtatcgtcggctttcgcacgtccgtta 16636659  T
Q  409 ccgtattttaaactcacaagtgccagctttcgcatgtacgaccacaagtttaaaatagcctttttgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaac 508  Q
    ||  ||||||| || | || || ||||||||||| | || |  || | ||||||||   ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16636658 ccagattttaagcttataactgtcagctttcgcacgcacaattactattttaaaat-ctctttttggaaatttgtaatttctaaattaattaaagaaaac 16636560  T
Q  509 gctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacatgtttcactctttcgatatgaaaccggtatcactttatttcagctttcg 608  Q
     |||| || ||||||||||||||||||||  |  ||||| |||      || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16636559 ccttttgccgtatttcaaaatcaattcctggattttctatggt------caagtttcactgtttcgatatgaaaccggtatcactttattccatctttcg 16636466  T
Q  609 ccgtaaatat 618  Q
      ||||||||    
T  16636465 ttgtaaatat 16636456  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 47 - 620
Target Start/End: Original strand, 50883960 - 50884535
Alignment:
Q  47 gttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgcttt-aaattaatactaatgacaagagaccggaatataattca 145  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| |||||| ||| |||  || | ||||||| ||||   |||||||||||||    
T  50883960 gttgtttatctaaggcgatgctaattaatttggttgcaaaaatgaaaaaacaacttgtttttaaaaaaaaattaatgacgagagcatggaatataattca 50884059  T
Q  146 cgtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttcgcgcgtgaaaagaattaatttaaaggggtcgtcagctttcac 245  Q
    |||| | |||   | || | ||| || |||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||| ||||  ||||| |||||||||||| || ||||| |    
T  50884060 cgtcgatcgttgatgctagctaaattgtattttattattataacaggaaaatactttcgcgcgttaaaatgattaaattaaaggggtcgccatctttcgc 50884159  T
Q  246 ttgtacaacaccgaatttcgactttgtaatctattcgacagctttcgcgtgtacgccttacaagtttaaaataccgtttg-aaaactaatcaatttatgc 344  Q
     || ||  || ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| || |||| |||||||| || ||||  | ||||| |||| ||||||||||| ||    
T  50884160 gtgcacggcatcgaattttgactttgtaatttattcgaccgctttcacgcgtacaccttacaacttcaaaactctgtttgaaaaaataatcaatttacgc 50884259  T
Q  345 gcgaaaagtaatttttagtaaagattttaatttaaaggtaccgtcagctttcgcgcgcccggtaccgtattttaaactcacaagtgccagctttcgcatg 444  Q
      ||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||   ||  |||||| |    ||| |||||||||||||||| | |   | |||||||||| ||    
T  50884260 ttgaaaaattatttttagtagaaattttaatttaaaggtcatgtttgctttcacataaccgataccgtattttaaacttatagacgtcagctttcgcgtg 50884359  T
Q  445 tacgaccacaagtttaaaatagcctttttgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaatt 544  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||   | | |||| |||| ||||| ||||| | ||   |    
T  50884360 tacggtcacaagtttaaaatagcatttttgaaaattataaatttctaaattaattaaaaagaataatgttgctgaattttaaaataaattcttgaatcat 50884459  T
Q  545 ctacggtcagatacatgtttcactctttcgatatgaaaccggtatcactttatttcagctttcgccgtaaatattc 620  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||  || |||| ||||||||||||    
T  50884460 ctacggacagatacatgtttcactcttccgatatgaaatcggtatcgcattattctagttttcaccgtaaatattc 50884535  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 51 - 350
Target Start/End: Original strand, 27078999 - 27079296
Alignment:
Q  51 tttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataactt-gctttaaattaatactaatgacaagagaccggaatataattcacgtc 149  Q
    |||||||||||  |||| || || ||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  27078999 tttatctaagg--atgctaaatagtttagttgcaaaattgggaaaataactttgtttttaattagttttaatgacaagagatcggaatataattcgcgtc 27079096  T
Q  150 aaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttcgcgcgtgaaaagaattaatttaaaggggtcgtcagctttcacttgt 249  Q
     ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | || |||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||| |||||    
T  27079097 gaccatgagtactagttaagttatattttattattataacaagaaaatattctcgcgcgtaaaaaggattaaattaaagtggt-gtccgctttcgcttgt 27079195  T
Q  250 acaacaccgaatttcgactttgtaatctattcgacagctttcgcgtgtacgccttacaagtttaaaataccgtttgaaaactaatcaatttatgcgcgaa 349  Q
     | ||||| ||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| || ||||  |||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  27079196 tcgacaccaaatcttgactttgtaatctattcgaccgttttcgcgtgtacgcctaacaacttcaaaactccgtttgaaaaggaatcaatttacgcgcgaa 27079295  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 35976077 - 35975731
Alignment:
Q  18 caatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaattaatac 117  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||  ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| |      
T  35976077 caatgtcaagtaccgttatctattgccacagtgtttatctaaggcgatgctaattaatttggttgcaaaattgggaacataagttgtttttaattacttt 35975978  T
Q  118 taatgacaagagaccggaatataattcacgtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttcgcgcgtgaaaaga- 216  Q
    | | ||| ||||||| ||||||||||| | |  ||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||  |||| |     
T  35975977 tgaggacgagagaccagaatataattcgcattgaccgtgaatatatgttaagttatattttattattataataggaaaatatttttgcacgaaaaaaaag 35975878  T
Q  217 attaatttaaaggggtcgtcagctttcacttgtacaacaccgaatttcgactttgtaatctattcgacagctttcgcgtgtacgccttacaagtttaaaa 316  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||| | | ||| || || |||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| || ||||    
T  35975877 attaaattaaagaggtcgcctgctttcgcatatacgactccaaattttaactttgtaatctattcgaccgctttcgtgtgta-accttacaacttcaaaa 35975779  T
Q  317 taccgtttgaaaactaatcaatttatgcgcgaaaagtaatttttagta 364  Q
       | |||||||  |||||||||| |||  ||||||| ||||||||||    
T  35975778 cttcctttgaaagataatcaatttgtgcttgaaaagttatttttagta 35975731  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 14224778 - 14224586
Alignment:
Q  11 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  14224778 cagagaccaatgtcaagtatcgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcagattaatttggttgc-aaattgggaaattaacttgtttttaa 14224680  T
Q  111 ttaatact-aatgacaagagaccggaatataattcacgtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttc 203  Q
    ||| |  | |||||| |||| ||||||||||||||   ||  ||||   | |||| ||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  14224679 ttacttttgaatgacgagagcccggaatataattcgtatcgtccgttgatgcttgctaaattgtattttattattgtaacatgacaatattttc 14224586  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 14234873 - 14234681
Alignment:
Q  11 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  14234873 cagagaccaatgtcaagtatcgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcagattaatttggttgc-aaattgggaaattaacttgtttttaa 14234775  T
Q  111 ttaatact-aatgacaagagaccggaatataattcacgtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttc 203  Q
    ||| |  | |||||| |||| ||||||||||||||   ||  ||||   | |||| ||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  14234774 ttacttttgaatgacgagagcccggaatataattcgtatcgtccgttgatgcttgctaaattgtattttattattgtaacatgacaatattttc 14234681  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 447 - 582
Target Start/End: Original strand, 27079576 - 27079710
Alignment:
Q  447 cgaccacaagtttaaaatagcctttttgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattct 546  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  27079576 cgactacaagtttgaaata-cctttttaaaaattagtaatttctaaatcaattaaagaaaacactttcgatgtatttcaaaatcaatttctaaattttct 27079674  T
Q  547 acggtcagatacatgtttcactctttcgatatgaaa 582  Q
    |||||   ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  27079675 acggtaccatacaggttttactctttcgatatgaaa 27079710  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 329
Target Start/End: Original strand, 27079382 - 27079511
Alignment:
Q  200 tttcgcgcgtgaaaagaattaatttaaaggggtcgtcagctttcacttgtacaacaccgaatttcgactttgtaatctattcgacagctttcgcgtgtac 299  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| | ||||  ||| | ||||||||||||| |||| | ||||||||| | ||    
T  27079382 tttcgcgcgtaaaaagaattaaattaaagtggtcgtcagctttcgcttgttcgacacaaaatcttgactttgtaatcttttcgtccgctttcgcgcgaac 27079481  T
Q  300 gccttacaagtttaaaataccgtttgaaaa 329  Q
    |||| |||| || ||||  |||||||||||    
T  27079482 gcctgacaacttcaaaactccgtttgaaaa 27079511  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 16637015 - 16636949
Alignment:
Q  11 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaattt 77  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16637015 cagagaccaatgtcaagtaccgttatctattgtcacgttgtttatctaaggcgatgctaattaattt 16636949  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 452 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 35975617 - 35975561
Alignment:
Q  452 acaagtttaaaatagcctttttgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaac 508  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||    
T  35975617 acaagtttaaaatagtgtttttgaaaatcagtaatatctaaattaattaaaaaaaac 35975561  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 373 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 39372546 - 39372478
Alignment:
Q  373 aatttaaaggtaccgtcagctttcgcgcgcccggtaccgtattttaaactcacaagtgccagctttcgc 441  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||  || ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  39372546 aatttaaaggcaccgtcgactttcgtacgtccgataccgtattttaaactcacaagcgtcagctttcgc 39372478  T

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Target: scaffold0453 (Bit Score: 362; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0453
Description:

Target: scaffold0453; HSP #1
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 12987 - 12380
Alignment:
Q  14 agaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaatta 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  12987 agaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttatgttgtttatctaaggcgacgcagattaatttggttgcaaa-ttgggaaaataacttgtttttaatta 12889  T
Q  114 atact--aatgacaagagaccggaatataattcacgtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttcgcgcgtga 211  Q
     |  |  |||||| | || |  |||| ||||||  |||  ||||   | |||| ||| || |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| || |    
T  12888 ctttttaaatgacgaaagcctagaatgtaattcgtgtcgtccgttgatgcttgctaaattgtattttattattgtaacaggatgatattttcgcgagtaa 12789  T
Q  212 aaagaattaatttaaaggggtcgtcagctttcacttgtacaacaccgaatttcgactttgtaatctattcgacagctttcgcgtgtacgccttacaagtt 311  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||    
T  12788 aaagaattaaattaaaggggtcgttagctttcgcgtgtacgacaccgaattttaactttgtaatctattcaaccgctttcgcgtgtacgcctcacaactt 12689  T
Q  312 taaaataccgtttgaaaactaatcaatttatgcgcgaaaagtaatttttagtaaagattttaatttaaaggtaccgtcagctttcgcgcgcccggtaccg 411  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  12688 caaaactccgtttgaaaactaatcaatttatgcgcaaaaagttatttttagtaaagattttaatttaaaggtaccgttggctttcgcgcgcccggtaccg 12589  T
Q  412 tattttaaactcacaagtgccagctttcgcatgtacgaccacaagtttaaaatagcctttttgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaacgct 511  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12588 tattttaaactctcaagcgccagctttcgcatgtacgaccacaagtttaaaatagcctttttgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaacgct 12489  T
Q  512 ttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacatgtttcactctttcgatatgaaaccggtatcactttatttcagctttcgccg 611  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12488 ttcgctgtattttaaaatcaattcctaaaaattttactttcatatacagttttcactctttcgatatgaaaccggtatcactttatttcagctttcgccg 12389  T
Q  612 taaatattc 620  Q
    |||||||||    
T  12388 taaatattc 12380  T

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Target: scaffold0158 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 3)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 12 - 606
Target Start/End: Original strand, 35306 - 35899
Alignment:
Q  12 agagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaa-ttgggaaaataacttgctttaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |   || | || ||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  35306 agagaccaatgtcaagtacagtaattaattgttacgttgtttatcaaaggcgtttgtaaatgatatgggtgcaaaaattgggaaaataacttgtttttaa 35405  T
Q  111 ttaatactaa-tgacaagagaccggaatataattcacgtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttcgcgcgt 209  Q
    ||| |  ||| |||| |||| ||| ||||||||||  ||   ||||   |||||| ||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  35406 ttacttttaaatgacgagagcccgaaatataattcgtgttgtccgttgatacttgctaaattgtattttattattgtaacaagacaatattttcgcgtgt 35505  T
Q  210 gaaaagaattaatttaaaggggtcgtcagctttcacttgtacaacaccgaatttcgactttgtaatctattcgacagctttcgcgtgtacgccttacaag 309  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||| ||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  35506 aaaaagaattaatttaaaggggtcgtcagctgtcgcatatacgacatcttatttcgacgttgtaatctattcgacagctttcgcgtgtacgtcttacaat 35605  T
Q  310 tttaaaataccgtttgaaaact-aatcaatttatgcgcgaaaagtaatttttagtaaagattttaatttaaaggtaccgtcagctttcgcgcgcccggta 408  Q
    || ||||  ||||||||||| | |||||||||| | ||||||||| |||||||||| | |    || ||||||| ||||||  ||| ||| || ||| ||    
T  35606 ttcaaaactccgtttgaaaatttaatcaatttacgtgcgaaaagttatttttagtagaaaaacaaacttaaaggcaccgtcgacttacgcacgtccgtta 35705  T
Q  409 ccgtattttaaactcacaagtgccagctttcgcatgtacgaccacaagtttaaaatagcctttttgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaac 508  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||    
T  35706 ccgtattttaaactcacaagcgtcagctttcgcatgtacgaccgcaagtttaaaatagcctttttgaaaatttgaaatttctaaatt----aaagaaaac 35801  T
Q  509 gctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacatgtttcactctttcgatatgaaaccggtatcactttatttcagcttt 606  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35802 gctctcgctgtatttcaaaaccaattcctaaaaattctacagtcagatacaagtttcgctctttcgatatgaaaccggtatcactttatttcaacttt 35899  T

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Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 243
Target Start/End: Original strand, 27902 - 28136
Alignment:
Q  11 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaa-ttgggaaaataacttgctttaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   || | || ||| ||||||| || ||||||||||||| ||| |    
T  27902 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttaagttgtttatctaaggcgtttgtaaatgatatgggtgcaaaaattaggaaaataacttgttttta 28001  T
Q  110 attaatactaa-tgacaagagaccggaatataattcacgtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttcgcgcg 208  Q
    |||| |  ||| |||| |||| ||| ||||||||||  |||  ||||   | |||| ||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  28002 attacttttaaatgacgagagcccgaaatataattcgtgtcgtccgttgatgcttgctaaattgtattttattattgtaacatgacaatattttcgcgtg 28101  T
Q  209 tgaaaagaattaatttaaaggggtcgtcagctttc 243  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28102 taaaaagaattaatttaaaggggtcgtcagctttc 28136  T

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Target: scaffold0158; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 562 - 607
Target Start/End: Original strand, 28133 - 28178
Alignment:
Q  562 tttcactctttcgatatgaaaccggtatcactttatttcagctttc 607  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28133 tttcgctctttcgatatgaaaccggtatcactttatttcaactttc 28178  T

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Target: chr8 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Original strand, 19900604 - 19900822
Alignment:
Q  11 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19900604 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaa 19900703  T
Q  111 ttaatactaatgacaagagaccggaatataattcacgtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttcgcgcgtg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  19900704 ttaatactaatgacaagagaccggaatataattcacgtcgaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaacaggacaatattttcgcgtgta 19900803  T
Q  211 aaaagaattaatttaaagg 229  Q
    |||||||  ||||||||||    
T  19900804 aaaagaacaaatttaaagg 19900822  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 373 - 606
Target Start/End: Original strand, 19900813 - 19901046
Alignment:
Q  373 aatttaaaggtaccgtcagctttcgcgcgcccggtaccgtattttaaactcacaagtgccagctttcgcatgtacgaccacaagtttaaaatagcctttt 472  Q
    |||||||||| ||| ||  ||||||  || ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19900813 aatttaaaggcaccatcgactttcgtacgtccgataccgtattttaaactcacaagcgtcagctttcgcatgtacgaccgcaagtttaaaatagcctttt 19900912  T
Q  473 tgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacatgtttcactcttt 572  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  19900913 tgaaaatttgaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctccggtcagatacaggtttcactcttt 19901012  T
Q  573 cgatatgaaaccggtatcactttatttcagcttt 606  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  19901013 tgatatgaaaccggtatcactgtatttcaacttt 19901046  T

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Target: scaffold0010 (Bit Score: 184; Significance: 3e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 117319 - 117100
Alignment:
Q  11 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  117319 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaa 117220  T
Q  111 ttaatactaatgacaagagaccggaatataattcacgtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttatta-ttgtaataggacaatattttcgcgcgt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  117219 ttaatactaatgacaagagaccggaatataattcacgtcgatcgtgagtacttgttaagttatattttattatttgtaacaggacaatattttcgcgtgt 117120  T
Q  210 gaaaagaattaatttaaagg 229  Q
     |||||||  ||||||||||    
T  117119 aaaaagaacaaatttaaagg 117100  T

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Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 373 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 117109 - 116881
Alignment:
Q  373 aatttaaaggtaccgtcagctttcgcgcgcccggtaccgtattttaaactcacaagtgccagctttcgcatgtacgaccacaagtttaaaatagcctttt 472  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||  || ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  117109 aatttaaaggcaccgtcgactttcgtacgtccgataccgtattttaaactcacaagcgtcagctttcgcatgtacgaaagcaagtttaaaatagcctttt 117010  T
Q  473 tgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacatgtttcactcttt 572  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  117009 tgaaaatttgaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacaggtttcactcttt 116910  T
Q  573 cgatatgaaaccggtatcactttatttca 601  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  116909 cgatatgaaaccggtatcactgtatttca 116881  T

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Target: chr1 (Bit Score: 175; Significance: 7e-94; HSPs: 7)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 373 - 607
Target Start/End: Original strand, 18487000 - 18487234
Alignment:
Q  373 aatttaaaggtaccgtcagctttcgcgcgcccggtaccgtattttaaactcacaagtgccagctttcgcatgtacgaccacaagtttaaaatagcctttt 472  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||  || ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18487000 aatttaaaggcaccgtcgactttcgtacgtccgataccgtattttaaactcacaagcgtcagctttcgcatgtacgaccgcaagtttaaaatagcctttt 18487099  T
Q  473 tgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacatgtttcactcttt 572  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18487100 tgaaaatttgaaatctctaaattaattaaagaaaacgctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacaggtttcactcttt 18487199  T
Q  573 cgatatgaaaccggtatcactttatttcagctttc 607  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  18487200 cgatatgaaaccggtatcactgtatttcaactttc 18487234  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 373 - 607
Target Start/End: Original strand, 18476904 - 18477138
Alignment:
Q  373 aatttaaaggtaccgtcagctttcgcgcgcccggtaccgtattttaaactcacaagtgccagctttcgcatgtacgaccacaagtttaaaatagcctttt 472  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||  ||  || ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18476904 aatttaaaggcaccgtcgactttcgtacgtgcgataccgtactttaaactcacaagcgtcagctttcgcatgtacgaccgcaagtttaaaatagcctttt 18477003  T
Q  473 tgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacatgtttcactcttt 572  Q
    | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18477004 ttaaaatttgaaatctctaaattaattaaagaaaacgctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacaggtttcactcttt 18477103  T
Q  573 cgatatgaaaccggtatcactttatttcagctttc 607  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  18477104 cgatatgaaaccgatatcactgtatttcaactttc 18477138  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Original strand, 18486790 - 18487009
Alignment:
Q  11 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  18486790 cagagaccaatgtcaagtatcgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgtttttaa 18486889  T
Q  111 ttaatact-aatgacaagagaccggaatataattcacgtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttcgcgcgt 209  Q
    ||| |  | |||||| |||| ||||||||||||||  |||  ||||   | |||| ||| || |||||||||||||||| | |||||||||||| || ||    
T  18486890 ttacttttaaatgacgagagcccggaatataattcgtgtcgtccgttgatgcttgctaaattgtattttattattgtaacatgacaatattttcacgtgt 18486989  T
Q  210 gaaaagaattaatttaaagg 229  Q
     |||||||  ||||||||||    
T  18486990 aaaaagaacaaatttaaagg 18487009  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Original strand, 18476695 - 18476913
Alignment:
Q  11 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaa 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  18476695 cagacaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgacgcagattaatttggttgc-aaattgggataataacttgtttttaa 18476793  T
Q  111 ttaatact-aatgacaagagaccggaatataattcacgtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttcgcgcgt 209  Q
    ||| |  | |||||| |||| ||| ||||||||||  |||  ||||   | |||| ||| || ||||||||||||||||   |||||||||||| || ||    
T  18476794 ttacttttaaatgacgagagcccgaaatataattcgtgtcgtccgttgatgcttgctaaattgtattttattattgtaacttgacaatattttcacgtgt 18476893  T
Q  210 gaaaagaattaatttaaagg 229  Q
     |||||||  ||||||||||    
T  18476894 aaaaagaacaaatttaaagg 18476913  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 491 - 620
Target Start/End: Original strand, 7588407 - 7588542
Alignment:
Q  491 aaattaattaaagaaaacgctttcgctgtatttcaaaatcaattc-----ctaaaaa-ttctacggtcagatacatgtttcactctttcgatatgaaacc 584  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||     ||||||| ||||||   ||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  7588407 aaattaattaaagaaaacgctctcgctgaattttaaaattaattctaattctaaaaaattctacaaacagataatagtttcactctttcgatatgaaacc 7588506  T
Q  585 ggtatcactttatttcagctttcgccgtaaatattc 620  Q
     ||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  7588507 agtatcgcgttattccagctttcgccctaaatattc 7588542  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 211 - 294
Target Start/End: Original strand, 7588214 - 7588297
Alignment:
Q  211 aaaagaattaatttaaaggggtcgtcagctttcacttgtacaacaccgaatttcgactttgtaatctattcgacagctttcgcg 294  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| || |||||   ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  7588214 aaaagaattaaattaaagggatcgccaactttcgtgtgtacgacaccgaattttaactttgtaatctattcgaccactttcgcg 7588297  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 23 - 91
Target Start/End: Original strand, 7588079 - 7588146
Alignment:
Q  23 tcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgg 91  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||| |||||||||||||    
T  7588079 tcaagtaccgttatctattgttacgttgcttatct-aggcgatgttaattagtttagttgcaaaattgg 7588146  T

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Target: scaffold0001 (Bit Score: 171; Significance: 2e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 373 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 187212 - 186978
Alignment:
Q  373 aatttaaaggtaccgtcagctttcgcgcgcccggtaccgtattttaaactcacaagtgccagctttcgcatgtacgaccacaagtttaaaatagcctttt 472  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||  || ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  187212 aatttaaaggcaccgtcgactttcgtacgtccgataccgtattttaaactcacaagcgtcagctttcgcatgtacgaccgcaagtttaaaatagcctttt 187113  T
Q  473 tgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacatgtttcactcttt 572  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  187112 ttaaaatttgaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgttatatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacaggtttcactcttt 187013  T
Q  573 cgatatgaaaccggtatcactttatttcagctttc 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  187012 cgatatgaaaccggtatcactttatttcaactttc 186978  T

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Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 187421 - 187203
Alignment:
Q  11 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  187421 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcagattaatttggttgc-aaattgggaaaataacttgcttttaa 187323  T
Q  111 ttaatact-aatgacaagagaccggaatataattcacgtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttcgcgcgt 209  Q
    ||| |  | |||||| |||| ||||||||||||||  |||  ||||   | |||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||    
T  187322 ttacttttaaatgacgagagcccggaatataattcgtgtcgtccgttgatgcttgttaaattgtattttattattgtaacatgacaatatttttgcgtgt 187223  T
Q  210 gaaaagaattaatttaaagg 229  Q
     |||||||  ||||||||||    
T  187222 aaaaagaacaaatttaaagg 187203  T

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Target: scaffold0177 (Bit Score: 163; Significance: 1e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 373 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 33287 - 33053
Alignment:
Q  373 aatttaaaggtaccgtcagctttcgcgcgcccggtaccgtattttaaactcacaagtgccagctttcgcatgtacgaccacaagtttaaaatagcctttt 472  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  33287 aatttaaaggcaccgtcgactttcgtacgtccgataccgtattttaaactcacaagaatcaactttcgcatgtacgaccgcaagtttaaaataacctttt 33188  T
Q  473 tgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacatgtttcactcttt 572  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33187 tgaaaatttgaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgctgaatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacaggtttcactcttt 33088  T
Q  573 cgatatgaaaccggtatcactttatttcagctttc 607  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  33087 cgatatgaaaccggtatcactgtatttcaactttc 33053  T

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Target: scaffold0177; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 33497 - 33278
Alignment:
Q  11 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  33497 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgattttaa 33398  T
Q  111 ttaatact-aatgacaagagaccggaatataattcacgtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttcgcgcgt 209  Q
    ||| |  | |||||| |||| ||||||||||||||  |||  ||||  || |||| ||| || |||||||||||| ||| | |||||||||||| || ||    
T  33397 ttacttttaaatgacgagagcccggaatataattcgtgtcgtccgttggtgcttgctaaattgtattttattattataacatgacaatattttcacgtgt 33298  T
Q  210 gaaaagaattaatttaaagg 229  Q
     |||||||  ||||||||||    
T  33297 aaaaagaacaaatttaaagg 33278  T

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Target: chr2 (Bit Score: 163; Significance: 1e-86; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 373 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 28387124 - 28386890
Alignment:
Q  373 aatttaaaggtaccgtcagctttcgcgcgcccggtaccgtattttaaactcacaagtgccagctttcgcatgtacgaccacaagtttaaaatagcctttt 472  Q
    |||||||||| || |||  ||||||  || ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28387124 aatttaaaggcactgtcgactttcgtacgtccgataccgtattttaaactcacaagcgtcagctttcgcatgtacgaccgcaagtttaaaatagcctttt 28387025  T
Q  473 tgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacatgtttcactcttt 572  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28387024 tgaaaattttaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgctgagtttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacaggtttcactcttt 28386925  T
Q  573 cgatatgaaaccggtatcactttatttcagctttc 607  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  28386924 cgatatgaaaccggtatcactctatttcaactttc 28386890  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 376 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 23689742 - 23689500
Alignment:
Q  376 ttaaaggtaccgtcagctttcgcgcgcccggtaccgtattttaaactcacaagtgccagctttcgcatgtacgaccacaagtttaaaatagcctttttga 475  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||| || | || |||||||||||||||| |     |||| |||||| |  | |||| ||    
T  23689742 ttaaaggtaccgtcggctttcgcgcgcccgttaccagattttaagcttataactgccagctttcgcatgcaaagttacaattttaaagtctc-ttttcga 23689644  T
Q  476 aaattagaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacatgtttcactctttcga 575  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  23689643 aaattagtaatttctaaatcaattaaagaaaacgctttcgctgtatttcaaaatcaatttctgaatttcctacggtcagatacaggtttcaatctttcga 23689544  T
Q  576 tatgaaaccggtatcactttatttcagctttcgccgtaaatatt 619  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23689543 tatgaaaccggtgtcactttatttcagctttcgctgaaaatatt 23689500  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 28387333 - 28387201
Alignment:
Q  11 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  28387333 cagagaccaatgtcaagtatcgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcagattaatttggttgc-aaattgggaaattaacttgtttttaa 28387235  T
Q  111 ttaatact-aatgacaagagaccggaatataatt 143  Q
    ||| |  | |||||| |||| |||||||||||||    
T  28387234 ttacttttaaatgacgagagcccggaatataatt 28387201  T

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Target: scaffold1407 (Bit Score: 155; Significance: 6e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold1407
Description:

Target: scaffold1407; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 373 - 607
Target Start/End: Original strand, 545 - 779
Alignment:
Q  373 aatttaaaggtaccgtcagctttcgcgcgcccggtaccgtattttaaactcacaagtgccagctttcgcatgtacgaccacaagtttaaaatagcctttt 472  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  545 aatttaaaggcaccgtcgactttcgtacgtccgataccgtattttaaactcacaagcatcaactttcgcatgtacgaaagcaagtttaaaatagcctttt 644  T
Q  473 tgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacatgtttcactcttt 572  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  645 tgaaaatttgaaatttctaaattaattaaagaaaaagctttcgctgtaattcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacatgtttcactcttt 744  T
Q  573 cgatatgaaaccggtatcactttatttcagctttc 607  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  745 cgatatgaaaccgatatcactgtatttcaactttc 779  T

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Target: scaffold1407; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Original strand, 335 - 554
Alignment:
Q  11 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  335 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgccaattaatttggttgcaaaaatgggaaaataacttgattttaa 434  T
Q  111 ttaatact-aatgacaagagaccggaatataattcacgtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttcgcgcgt 209  Q
    ||| |  | |||||| |||| ||||||||||||||  |||  ||||   | |||| ||| || |||||||||||||||| | ||||||||| || || ||    
T  435 ttacttttaaatgacgagagtccggaatataattcgtgtcgtccgttgatgcttgctaaattgtattttattattgtaacatgacaatattatcacgtgt 534  T
Q  210 gaaaagaattaatttaaagg 229  Q
     |||||||  ||||||||||    
T  535 aaaaagaacaaatttaaagg 554  T

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Target: scaffold0035 (Bit Score: 155; Significance: 6e-82; HSPs: 4)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 377 - 607
Target Start/End: Original strand, 87053 - 87283
Alignment:
Q  377 taaaggtaccgtcagctttcgcgcgcccggtaccgtattttaaactcacaagtgccagctttcgcatgtacgaccacaagtttaaaatagcctttttgaa 476  Q
    |||||| ||||||  ||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  87053 taaaggcaccgtcgactttcgtacgtccgataccgtattttaaactcacaagcatcagctttcgcatgtacgaccgcaagtttaaaatagcctttttgaa 87152  T
Q  477 aattagaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacatgtttcactctttcgat 576  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  87153 aatttgaaaattctaaattaattaaagaaaatgctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaacattctacggtcagatacaggtatcactctttcgat 87252  T
Q  577 atgaaaccggtatcactttatttcagctttc 607  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  87253 atgaaaccggtatcactgtatttcaactttc 87283  T

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Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 377 - 607
Target Start/End: Original strand, 96747 - 96977
Alignment:
Q  377 taaaggtaccgtcagctttcgcgcgcccggtaccgtattttaaactcacaagtgccagctttcgcatgtacgaccacaagtttaaaatagcctttttgaa 476  Q
    |||||| ||||||  ||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  96747 taaaggcaccgtcgactttcgtacgtccgataccgtattttaaactcacaagcatcagctttcgcatgtacgaccgcaagtttaaaatagcctttttgaa 96846  T
Q  477 aattagaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacatgtttcactctttcgat 576  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  96847 aatttgaaacttctaaattaattaaagaaaatgctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaacattctacggtcagatacaggtatcactctttcgat 96946  T
Q  577 atgaaaccggtatcactttatttcagctttc 607  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  96947 atgaaaccggtatcactgtatttcaactttc 96977  T

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Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 86843 - 87046
Alignment:
Q  14 agaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaatta 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  86843 agaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcagattaatttggttgc-aaattgggaaaataacttgtttttaatta 86941  T
Q  114 atact-aatgacaagagaccggaatataattcacgtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttcgcgcgtgaa 212  Q
     |  | |||||| ||||  ||||||||||||   |||  ||||   | |||| ||| || |||||||||||||||| | |||||||||||| || || ||    
T  86942 cttttaaatgacgagagcacggaatataatttgtgtcgtccgttgatgcttgctaaattgtattttattattgtaacatgacaatattttcacgtgtaaa 87041  T
Q  213 aagaa 217  Q
    |||||    
T  87042 aagaa 87046  T

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Target: scaffold0035; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 96534 - 96740
Alignment:
Q  11 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaa 110  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  96534 cagagaccagtgtcaagtaccataattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcagattaatttggttgc-aaattgggaaaataacttgtttttaa 96632  T
Q  111 ttaatact-aatgacaagagaccggaatataattcacgtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttcgcgcgt 209  Q
    ||| |  | |||||| ||||  ||||||||||||   |||  ||||   | |||| ||| || |||||||||||||||| | |||||||||||| || ||    
T  96633 ttacttttaaatgacgagagctcggaatataatttgtgtcgtccgttgatgcttgctaaattgtattttattattgtaacatgacaatattttcacgtgt 96732  T
Q  210 gaaaagaa 217  Q
     |||||||    
T  96733 aaaaagaa 96740  T

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Target: scaffold0226 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 373 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 4657 - 4423
Alignment:
Q  373 aatttaaaggtaccgtcagctttcgcgcgcccggtaccgtattttaaactcacaagtgccagctttcgcatgtacgaccacaagtttaaaatagcctttt 472  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||  || ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4657 aatttaaaggcaccgtcgactttcgtacgtccgataccgtattttaaactcacaagcgtcagcttttgcatctacgaccgcaagtttaaaatagcctttt 4558  T
Q  473 tgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacatgtttcactcttt 572  Q
    | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4557 taaaaatttgaaatctctaaattaattaaagaaaacgctttctctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcagatacaggtttcactcttt 4458  T
Q  573 cgatatgaaaccggtatcactttatttcagctttc 607  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||    
T  4457 cgatatgaaacctttatcactgtatttcaactttc 4423  T

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Target: scaffold0226; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4867 - 4648
Alignment:
Q  11 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  4867 cagagaccaatgtcaagtatcgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcggtgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgtttttaa 4768  T
Q  111 ttaatact-aatgacaagagaccggaatataattcacgtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttcgcgcgt 209  Q
    ||| |  | |||||| |||| | | ||||||||||  |||  ||||   | |||| ||| || |||||||||||||||| | |||||||||||| || ||    
T  4767 ttacttttaaatgacgagagcctgtaatataattcgtgtcgtccgttgatgcttgctaaattgtattttattattgtaacatgacaatattttcacgtgt 4668  T
Q  210 gaaaagaattaatttaaagg 229  Q
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T  4667 aaaaagaacaaatttaaagg 4648  T

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Target: scaffold0334 (Bit Score: 145; Significance: 5e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 452 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 17190 - 17022
Alignment:
Q  452 acaagtttaaaatagcctttttgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggt 551  Q
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T  17190 acaagtttaaaatagcctttttgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacagt 17091  T
Q  552 cagatacatgtttcactctttcgatatgaaaccggtatcactttatttcagctttcgccgtaaatattc 620  Q
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T  17090 cagatataggtttcactctttcgatatgaaatcgatatcactttattccagctttcgccgtaaatattc 17022  T

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Target: scaffold0513 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 373 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 6113 - 5931
Alignment:
Q  373 aatttaaaggtaccgtcagctttcgcgcgcccggtaccgtattttaaactcacaagtgccagctttcgcatgtacgaccacaagtttaaaatagcctttt 472  Q
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T  6113 aatttaaaggcaccgtcgactttcgtacgtccgataccgtattttaaactcacaagtttcagctttcgcatgtacgaccgcaagtttaaaatagcctttt 6014  T
Q  473 tgaaaattagaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcaga 555  Q
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T  6013 tgaaaatttgaaatttctaaattaattaaagaaaacgctttcgctgtatttcaaaatcaattcctaaaaattctacggtcaga 5931  T

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Target: scaffold0513; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6323 - 6104
Alignment:
Q  11 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgctttaaa 110  Q
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T  6323 cagagaccaatgtcaagtaccgtaattaattgttacgttgtttatctaaggcgatgcaaattaatttggttgcaaaattgggaaaataacttgattttaa 6224  T
Q  111 ttaatact-aatgacaagagaccggaatataattcacgtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttcgcgcgt 209  Q
    ||| |  | |||||| |||| ||||||||||||||  |||  ||||  || |||| ||| || |||||||||||| ||| | |||||||||||| || ||    
T  6223 ttacttttaaatgacgagagcccggaatataattcgtgtcgtccgttggtgcttgctaaattgtattttattattataacatgacaatattttcacgtgt 6124  T
Q  210 gaaaagaattaatttaaagg 229  Q
     |||||||  ||||||||||    
T  6123 aaaaagaacaaatttaaagg 6104  T

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Target: scaffold0267 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 120 - 383
Target Start/End: Original strand, 4780 - 5042
Alignment:
Q  120 atgacaagagaccggaatataattcacgtcaaccgtgagtacttgttaagttatattttattattgtaataggacaatattttcgcgcgtgaaaagaatt 219  Q
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T  4780 atgacgagagaccggaatataatttgtgtccatcgtgaatacttcttaagttatgtcttattattataacaagaaaatattttcgcgcgt-aacaggttt 4878  T
Q  220 aatttaaaggggtcg-tcagctttcacttgtacaacaccgaatttcgactttgtaatctattcgacagctttcgcgtgtacgccttacaagtttaaaata 318  Q
    || |||||| || || || |||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| | |||||| || |||||     
T  4879 aaattaaagaggccgctctgctttcgcgtgtatgacaccgaatttcgactttgtaatctattcaacctctttcgcgcgtacacattacaacttcaaaatt 4978  T
Q  319 ccgtttgaaaactaatcaatttatgcgcgaaaagtaatttttagtaaagattttaatttaaaggt 383  Q
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T  4979 ccgtttgaaaaataatcaatttttgcatgaaaagttattttaagtaaa-aatttaatttaaaggt 5042  T

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