View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11557A_low_56 (Length: 376)

Name: NF11557A_low_56
Description: NF11557A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11557A_low_56
NF11557A_low_56
[»] chr1 (33 HSPs)
chr1 (150-373)||(44241355-44241579)
chr1 (150-372)||(29001730-29001953)
chr1 (150-376)||(9869100-9869327)
chr1 (150-373)||(31072316-31072540)
chr1 (148-372)||(4599527-4599753)
chr1 (150-372)||(1174604-1174828)
chr1 (150-372)||(6238654-6238877)
chr1 (150-372)||(39053338-39053561)
chr1 (150-372)||(39059710-39059933)
chr1 (150-372)||(42091895-42092118)
chr1 (150-372)||(45015780-45016003)
chr1 (150-372)||(26621468-26621692)
chr1 (150-372)||(41305514-41305738)
chr1 (150-372)||(44916329-44916560)
chr1 (150-372)||(41297515-41297739)
chr1 (150-367)||(11913262-11913479)
chr1 (181-372)||(27240161-27240354)
chr1 (150-372)||(43686626-43686851)
chr1 (150-372)||(32797735-32797945)
chr1 (150-372)||(41299188-41299412)
chr1 (150-371)||(1115982-1116206)
chr1 (239-372)||(23764521-23764655)
chr1 (214-372)||(5445028-5445186)
chr1 (155-372)||(28413678-28413897)
chr1 (150-229)||(23762336-23762415)
chr1 (155-371)||(39806057-39806274)
chr1 (172-372)||(38672788-38672991)
chr1 (155-372)||(2824824-2825042)
chr1 (159-285)||(47646755-47646883)
chr1 (156-372)||(23251342-23251568)
chr1 (155-262)||(5357752-5357861)
chr1 (155-262)||(45620149-45620258)
chr1 (154-198)||(9316137-9316181)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (150-373)||(2643-2867)
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (150-373)||(37026046-37026270)
chr7 (150-372)||(26601911-26602134)
chr7 (150-372)||(15914637-15914860)
chr7 (150-372)||(39432907-39433129)
chr7 (150-372)||(15949158-15949381)
chr7 (150-372)||(3924093-3924316)
chr7 (150-372)||(36875544-36875767)
chr7 (150-372)||(5049912-5050135)
chr7 (150-372)||(14287714-14287937)
chr7 (150-371)||(14298900-14299122)
chr7 (150-372)||(6795437-6795660)
chr7 (150-372)||(23612388-23612611)
chr7 (150-372)||(9642916-9643141)
chr7 (150-372)||(1948633-1948857)
chr7 (150-372)||(6020864-6021088)
chr7 (150-372)||(8185392-8185616)
chr7 (150-372)||(8192952-8193176)
chr7 (150-372)||(48353480-48353704)
chr7 (150-372)||(2446645-2446868)
chr7 (153-373)||(45433583-45433805)
chr7 (150-354)||(21642535-21642740)
chr7 (150-372)||(19089806-19090030)
chr7 (150-372)||(48347096-48347320)
chr7 (150-371)||(33850643-33850865)
chr7 (150-372)||(5056307-5056531)
chr7 (150-372)||(1378946-1379169)
chr7 (150-372)||(8142446-8142669)
chr7 (7-152)||(42422112-42422257)
chr7 (155-372)||(10831130-10831349)
chr7 (155-372)||(11024922-11025141)
chr7 (150-224)||(13774130-13774204)
chr7 (155-372)||(21901193-21901413)
chr7 (321-373)||(1942043-1942095)
chr7 (155-216)||(27954243-27954303)
chr7 (155-198)||(28442628-28442671)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (150-372)||(13671817-13672040)
chr6 (150-369)||(27670096-27670316)
chr6 (150-372)||(31547894-31548117)
chr6 (150-372)||(32328493-32328716)
chr6 (150-372)||(1428423-1428646)
chr6 (150-372)||(34711557-34711780)
chr6 (150-372)||(9864760-9864984)
chr6 (150-372)||(4186684-4186907)
chr6 (150-372)||(11058150-11058373)
chr6 (150-369)||(21262574-21262795)
chr6 (150-372)||(4020235-4020459)
chr6 (150-372)||(4026661-4026885)
chr6 (150-372)||(34655249-34655473)
chr6 (150-372)||(34648798-34649022)
chr6 (150-372)||(4738323-4738547)
chr6 (150-362)||(7069702-7069916)
chr6 (217-373)||(29906888-29907045)
chr6 (217-373)||(30117335-30117492)
chr6 (245-372)||(7062578-7062707)
chr6 (150-293)||(1167480-1167630)
chr6 (155-348)||(10081567-10081762)
chr6 (150-212)||(7062516-7062578)
chr6 (155-291)||(9846601-9846738)
chr6 (150-187)||(29907044-29907081)
chr6 (150-187)||(30117299-30117336)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (150-372)||(22359963-22360186)
chr5 (150-371)||(4973563-4973785)
chr5 (150-372)||(22313829-22314052)
chr5 (150-371)||(5876218-5876440)
chr5 (150-372)||(34357288-34357511)
chr5 (150-372)||(34359079-34359302)
chr5 (150-372)||(2957857-2958081)
chr5 (150-372)||(2966326-2966550)
chr5 (150-372)||(29980458-29980681)
chr5 (150-372)||(30041244-30041467)
chr5 (150-372)||(40958617-40958840)
chr5 (150-372)||(25894649-25894873)
chr5 (150-373)||(2438799-2439022)
chr5 (152-372)||(42150817-42151039)
chr5 (150-372)||(12505765-12505996)
chr5 (150-372)||(29414669-29414892)
chr5 (155-372)||(33794091-33794309)
chr5 (155-372)||(9843348-9843566)
chr5 (155-372)||(2156125-2156341)
chr5 (159-261)||(19853484-19853588)
chr5 (155-262)||(12918955-12919064)
chr5 (155-262)||(30580195-30580304)
[»] chr2 (24 HSPs)
chr2 (150-372)||(21341882-21342105)
chr2 (150-369)||(2021448-2021668)
chr2 (150-372)||(21331994-21332217)
chr2 (150-372)||(42931372-42931595)
chr2 (150-372)||(16856487-16856709)
chr2 (150-372)||(12950795-12951018)
chr2 (150-372)||(16817330-16817552)
chr2 (150-372)||(36782184-36782408)
chr2 (150-372)||(34834812-34835035)
chr2 (150-372)||(34841256-34841479)
chr2 (150-372)||(29484925-29485149)
chr2 (150-372)||(45011981-45012205)
chr2 (150-373)||(2164026-2164250)
chr2 (150-372)||(15852548-15852772)
chr2 (150-372)||(43267857-43268081)
chr2 (150-372)||(2157611-2157834)
chr2 (150-372)||(13901957-13902180)
chr2 (150-372)||(21067958-21068181)
chr2 (150-299)||(45700644-45700793)
chr2 (155-373)||(41455604-41455823)
chr2 (150-314)||(11909950-11910116)
chr2 (155-314)||(17784443-17784604)
chr2 (159-297)||(13162892-13163032)
chr2 (155-314)||(17789096-17789257)
[»] chr4 (18 HSPs)
chr4 (150-373)||(16405340-16405568)
chr4 (150-372)||(55462772-55462995)
chr4 (150-372)||(16838359-16838581)
chr4 (150-372)||(27590304-27590527)
chr4 (150-373)||(41372984-41373209)
chr4 (151-372)||(37368315-37368538)
chr4 (150-372)||(13594105-13594330)
chr4 (150-372)||(7780406-7780629)
chr4 (150-372)||(8103880-8104104)
chr4 (150-372)||(30238259-30238482)
chr4 (150-372)||(17456853-17457077)
chr4 (150-367)||(36754791-36755017)
chr4 (150-344)||(30211536-30211731)
chr4 (150-297)||(5660549-5660696)
chr4 (173-373)||(13003809-13004011)
chr4 (155-372)||(2947844-2948062)
chr4 (276-372)||(48914898-48914996)
chr4 (340-372)||(5660743-5660775)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (150-372)||(12768743-12768966)
chr8 (150-372)||(11358193-11358417)
chr8 (150-372)||(7311348-7311571)
chr8 (150-372)||(8013320-8013543)
chr8 (150-372)||(36005482-36005705)
chr8 (150-373)||(36075965-36076189)
chr8 (150-372)||(36425730-36425954)
chr8 (150-372)||(6464576-6464799)
chr8 (150-366)||(15012393-15012610)
chr8 (150-372)||(36021799-36022023)
chr8 (150-372)||(41242116-41242339)
chr8 (150-372)||(1238212-1238436)
chr8 (150-372)||(16710668-16710892)
chr8 (150-376)||(31017394-31017608)
chr8 (150-293)||(26250591-26250734)
chr8 (150-342)||(45068416-45068609)
chr8 (155-372)||(7933931-7934150)
chr8 (319-372)||(14393733-14393786)
[»] chr3 (21 HSPs)
chr3 (150-372)||(4311486-4311709)
chr3 (150-373)||(10941304-10941528)
chr3 (150-372)||(32746369-32746592)
chr3 (150-372)||(6036265-6036488)
chr3 (150-372)||(24179072-24179296)
chr3 (150-373)||(9570548-9570774)
chr3 (150-372)||(27501967-27502191)
chr3 (150-372)||(13014985-13015208)
chr3 (150-373)||(9577050-9577276)
chr3 (150-372)||(43995068-43995300)
chr3 (150-372)||(25893229-25893458)
chr3 (150-372)||(43931581-43931799)
chr3 (150-373)||(23068462-23068686)
chr3 (246-372)||(41353860-41353987)
chr3 (160-297)||(20651135-20651272)
chr3 (222-372)||(41354142-41354293)
chr3 (155-373)||(4590792-4591012)
chr3 (306-373)||(3577095-3577162)
chr3 (155-373)||(20952759-20952987)
chr3 (155-262)||(4644354-4644463)
chr3 (155-212)||(2785865-2785922)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (150-373)||(49689-49912)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (150-373)||(15169-15393)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (150-372)||(5005-5228)
[»] scaffold0936 (1 HSPs)
scaffold0936 (150-372)||(3264-3486)
[»] scaffold0510 (2 HSPs)
scaffold0510 (150-372)||(8881-9105)
scaffold0510 (150-372)||(2560-2784)
[»] scaffold0513 (2 HSPs)
scaffold0513 (150-291)||(12014-12155)
scaffold0513 (308-372)||(11949-12014)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (266-372)||(99913-100020)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (173-373)||(24268-24470)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 33)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 150 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 44241579 - 44241355
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44241579 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 44241480  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44241479 aatgaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaacttcatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 44241380  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtct 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  44241379 aatgatatttggtgtcgaacggtct 44241355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 29001953 - 29001730
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  29001953 tattatttggacatgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgacc 29001854  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29001853 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccttattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 29001754  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  29001753 aatgatatttggtgtcgaacggtc 29001730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 150 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 9869327 - 9869100
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9869327 tattgtttggacacgaaagatgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 9869228  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  9869227 aaggaactctaatcctaacaagtttcacaccttattaatctcaattttatcatttgcaacttagtcattaaaacaaactaccaattatcttttaacttag 9869128  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtctatg 376  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9869127 aatgatatttggtgtcgaacggtttatg 9869100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 150 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 31072540 - 31072316
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  31072540 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagagtccatgtatggtcattaggttacgtgtgacgcttgatt 31072441  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  31072440 aaggaactctaatcctaacaagtttcatgccttattaatctcaattttattattcgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattatcttttagcttag 31072341  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtct 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  31072340 aatgatatttggtgtcgaacggtct 31072316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 148 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 4599753 - 4599527
Alignment:
Q  148 agtattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttga 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  4599753 agtattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttaa 4599654  T
Q  248 tcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaact 345  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4599653 tcaaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatcttttaact 4599554  T
Q  346 tagaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  4599553 tagaatgatatttggtgtcgaacggtc 4599527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 1174828 - 1174604
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  1174828 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgctc 1174729  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  1174728 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatctttcaactta 1174629  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  1174628 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 1174604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 6238877 - 6238654
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  6238877 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 6238778  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  6238777 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatctagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 6238678  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6238677 aatgatatttggtgtcgaacggtc 6238654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 39053338 - 39053561
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  39053338 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 39053437  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  39053438 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 39053537  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  39053538 aatgatatttggtgtcgaacggtc 39053561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 39059710 - 39059933
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  39059710 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 39059809  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  39059810 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 39059909  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  39059910 aatgatatttggtgtcgaacggtc 39059933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 42092118 - 42091895
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  42092118 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 42092019  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  42092018 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 42091919  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  42091918 aatgatatttggtgtcgaacggtc 42091895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 45016003 - 45015780
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  45016003 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 45015904  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  45015903 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 45015804  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  45015803 aatgatatttggtgtcgaacggtc 45015780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 26621692 - 26621468
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  26621692 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttaatc 26621593  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaa-caaattatcgtttaactta 347  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  | || | || ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  26621592 aaggaaccctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgaaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatcttttaactta 26621493  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  26621492 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 26621468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 41305514 - 41305738
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  41305514 tattgtttggacatgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttaatc 41305613  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  41305614 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatctttaaactta 41305713  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  41305714 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 41305738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 44916560 - 44916329
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |     
T  44916560 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttacgtgtgacgtttggtt 44916461  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgc---------aacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtt 340  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  44916460 aaggaattctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatttcaacatagttaacttagtttttaaaacaaacaacaaactatcttt 44916361  T
Q  341 taacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44916360 taatttagaatgatatttggtgtcgaatggtc 44916329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 41297739 - 41297515
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||    
T  41297739 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgaggatcgatc 41297640  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| || ||||||    
T  41297639 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttactttagcaatttagttactaaaacaaacaaacaaactatctttcaactta 41297540  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  41297539 gaatgatatttggagtcgaacggtc 41297515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 150 - 367
Target Start/End: Original strand, 11913262 - 11913479
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||| ||    
T  11913262 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttacatgtgatgcttggtc 11913361  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgttt-aactt 346  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||   || |||||||| |||||  |||| ||| |||||    
T  11913362 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaattttattattcgcaacttag---tttaaacaaacaaacaatctatcttttaaactt 11913458  T
Q  347 agaatgatatttggtgtcgaa 367  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11913459 agaatgatatttggtgtcgaa 11913479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 181 - 372
Target Start/End: Original strand, 27240161 - 27240354
Alignment:
Q  181 gatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgcc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27240161 gatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatcaaggaactctaatcctaacaagtttcacgcc 27240260  T
Q  281 ttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27240261 ttattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttggaatggtatttggtgtcgaacggtc 27240354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 43686851 - 43686626
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||    
T  43686851 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttaaatgagacgctcgatc 43686752  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatc-gtttaactt 346  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||  ||||||||    
T  43686751 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctgttaatctcaacttttacattagcaatttagttactaaaacaaacaaacagattatctttttaactt 43686652  T
Q  347 agaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
     ||||| |||||||||||||||||||    
T  43686651 ggaatggtatttggtgtcgaacggtc 43686626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 32797945 - 32797735
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  32797945 tattgtttggacacgaattgtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttacgtgtgacgcttgatt 32797846  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaag-tttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| ||            |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32797845 aaggaactctaatcctaacaagtttttacgccctattactc------------ttgcaacttagtttctaaaacaaacaacaaattatc-tttaacttag 32797759  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  32797758 aatgatatttggtgtcgaacggtc 32797735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 41299188 - 41299412
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||| |||    
T  41299188 tattgtttggaaaagaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagcttgaatccatgaatggtcattaggttatatgtgacgcttaatc 41299287  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  41299288 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaataaattatcttttaactta 41299387  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  41299388 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 41299412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 150 - 371
Target Start/End: Original strand, 1115982 - 1116206
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggt---gttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttg 246  Q
    |||||||||||||| ||||||   ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  1115982 tattgtttggacacaaatggtagtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaaggtagaatccatgtatagtcattaggttacgtgtgacgcttg 1116081  T
Q  247 atcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaact 345  Q
    || |||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||    
T  1116082 attaaggaactctaatcataagaagtttcacaccttattactctcaacttttactcttgcaacttagttact-aaacaaacaacaaattagcttttaact 1116180  T
Q  346 tagaatgatatttggtgtcgaacggt 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  1116181 tagaatgatatttggtgtcgaacggt 1116206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 239 - 372
Target Start/End: Original strand, 23764521 - 23764655
Alignment:
Q  239 gacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc 337  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23764521 gacgcttgatcaaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatc 23764620  T
Q  338 gtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23764621 gtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 23764655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 214 - 372
Target Start/End: Original strand, 5445028 - 5445186
Alignment:
Q  214 catgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttag 312  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||   |||||||||||    
T  5445028 catgtatggtcattaggttatgtgtgaggcttgatcaaggaactctaatcctaacaagtttcacaccttattaatctcaacttttactcttgcaacttag 5445127  T
Q  313 ttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5445128 ttactaaaacaaacaacaaattatc-tttaacttagaatgatagttggtgtcgaacggtc 5445186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 155 - 372
Target Start/End: Original strand, 28413678 - 28413897
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||     ||| |||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  28413678 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatattggtaaaatgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 28413777  T
Q  253 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaat 351  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||||||  | || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28413778 gaactctaattccaacgttttt-acgccttattactctcaacttttacttttgcaacttggttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttagaat 28413876  T
Q  352 gatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  28413877 gatatttggtgtcgaacggtc 28413897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 150 - 229
Target Start/End: Original strand, 23762336 - 23762415
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattag 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23762336 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattag 23762415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 155 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 39806274 - 39806057
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||| ||| |||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  39806274 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctggaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 39806175  T
Q  253 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaat 351  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| |||||| |||  |  |||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||    
T  39806174 gaactctaattccaacgttttt-acgccttattactctcaatttttactcttgcaacttagtttctaaaacgaacaacaaattatc-tttaacttaaaat 39806077  T
Q  352 gatatttggtgtcgaacggt 371  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  39806076 gatatttggtgtcaaacggt 39806057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 172 - 372
Target Start/End: Original strand, 38672788 - 38672991
Alignment:
Q  172 ttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaaca 269  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || || || ||| || |||||||| |||||||||||||||| | ||      
T  38672788 ttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattatcaggttatgtttgacgcttaatcaaggaactctaattccaatg 38672887  T
Q  270 agtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaa-cttagaatgatatttggtgtcgaa 367  Q
      ||| ||||||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||  |||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  38672888 ttttt-acgccttattactctcaacttttactcttgcaacttagtttctaaaacgaacaacaaattatctttcaaacttagaatgatatttggtgtcgaa 38672986  T
Q  368 cggtc 372  Q
    |||||    
T  38672987 cggtc 38672991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 155 - 372
Target Start/End: Original strand, 2824824 - 2825042
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||||||| ||||  | |||||||| |||||||||||||||     ||| |||||||| ||| ||||  || ||||| ||| || |||||| | ||||||    
T  2824824 tttggacatgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatgggtaaaacgctagaattcatatatgtgattattaggttatgtttgacgcataatcaag 2824923  T
Q  253 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatg 352  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||||||  | ||   |||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  2824924 gaactctaattccaacgttttt-acgccttattactctcaactttcacttttatacttggttactaaaacaaacaacatattatcttttaacttagaatg 2825022  T
Q  353 atatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  2825023 atatttggtgtcgaatggtc 2825042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 47646883 - 47646755
Alignment:
Q  159 gacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatcc--atgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaac 256  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||  || | |||||||||| |||  |||||  |||| |||| ||||    
T  47646883 gacatgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcgattaaaagctagaatccgtatatgtgatcattaggttatatgtgattcttggtcaacgaac 47646784  T
Q  257 tctaatactaacaagtttcacgccttatt 285  Q
    ||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  47646783 tctaatcataacaagttttacgccttatt 47646755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 23251568 - 23251342
Alignment:
Q  156 ttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtat--gatcattagattacgtgtgacgcttgatcaagg 253  Q
    ||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| |||  ||| ||||| ||| || |||||||| |||||||    
T  23251568 ttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgcgattattaggttatgtttgacgcttaatcaagg 23251469  T
Q  254 aactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagtta--tta-----aaacaaac-aacaaattatcgtttaac 344  Q
    ||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||| |||||  |||| | |||||||  |||     |||||||| ||||| |  || ||||||    
T  23251468 aactctaattccaac-gtttttacgccttattactctcaacttttattcttgcgaattagttaacttagttacaaacaaacaaacaactactcttttaac 23251370  T
Q  345 ttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  23251369 ttcgaatgatatttggtgtcgaacggtc 23251342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 262
Target Start/End: Original strand, 5357752 - 5357861
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||     ||| |||||||||||| ||  |||| ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  5357752 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatattgggaaaatgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 5357851  T
Q  253 gaactctaat 262  Q
    ||||||||||    
T  5357852 gaactctaat 5357861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 262
Target Start/End: Original strand, 45620149 - 45620258
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||||||||||||  | |||| ||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||  |||| ||||| ||| || ||| |||| ||||||    
T  45620149 tttggacacgaataatcttgtcgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgaagcttaatcaag 45620248  T
Q  253 gaactctaat 262  Q
    ||||||||||    
T  45620249 gaactctaat 45620258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 9316181 - 9316137
Alignment:
Q  154 gtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaa 198  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  9316181 gtttggacacgaatgatgttgttgagcaatatgtgataatatcaa 9316137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 150 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 2867 - 2643
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2867 tattgtttggatacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctataatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 2768  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2767 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatttgcagcttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 2668  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtct 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  2667 aatgatatttggtgtcgaacggtct 2643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 150 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 37026270 - 37026046
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37026270 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaaactagaatcaatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 37026171  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37026170 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatttacaacttagttagtcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 37026071  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtct 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  37026070 aatgatatttggtgtcgaacggtct 37026046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 26602134 - 26601911
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  26602134 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgttcattaggttatgtgtgacgcttgatc 26602035  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26602034 aaggaattctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 26601935  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  26601934 aatgatatttggtgtcgaacggtc 26601911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 15914860 - 15914637
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  15914860 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgcgacgcttgatc 15914761  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15914760 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 15914661  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  15914660 aatgatatttggtgtcgaacggtc 15914637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 39433129 - 39432907
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39433129 tattgtttggacacgaatggcgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaattcatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 39433030  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttaga 349  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39433029 aaggaactctaatcctaacaagtttcacaccttattaatctcaactttatcatttgcacttggttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttaga 39432930  T
Q  350 atgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  39432929 atgatatttgttgtcgaacggtc 39432907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 15949381 - 15949158
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || |||||||||||    
T  15949381 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatatgcgacgcttgatc 15949282  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15949281 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 15949182  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  15949181 aatgatatttggtgtcgaacggtc 15949158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 3924093 - 3924316
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  3924093 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 3924192  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  3924193 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 3924292  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  3924293 aatgatatttggtatcgaacggtc 3924316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 36875767 - 36875544
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  36875767 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatatatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 36875668  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  36875667 aaggaactccaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttag 36875568  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  36875567 aatgatatttggtgtcgaacggtc 36875544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 5049912 - 5050135
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  5049912 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 5050011  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || ||||||||||||| |    
T  5050012 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttgg 5050111  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  5050112 aatgatatttggtgtcgaacggtc 5050135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 14287937 - 14287714
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| | ||||    
T  14287937 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagggtacgtgcgacgttcgatc 14287838  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  14287837 aaggaactctaatcctaacaagatttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttag 14287738  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  14287737 aatgatatttggtgtcgaacggtc 14287714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 150 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 14299122 - 14298900
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| | ||||    
T  14299122 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagggtacgtgcgacgttcgatc 14299023  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  14299022 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttag 14298923  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggt 371  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  14298922 aatgatatttggtgtcaaacggt 14298900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 6795660 - 6795437
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  6795660 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 6795561  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  6795560 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 6795461  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6795460 aatgatatttggtgtcgaacggtc 6795437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 23612611 - 23612388
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  23612611 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 23612512  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  23612511 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgtaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 23612412  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  23612411 aatgatatttcgtgtcgaacggtc 23612388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 9642916 - 9643141
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9642916 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 9643015  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatc-gtttaactt 346  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||  ||||||||    
T  9643016 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctgttaatctcaacttttacattagcaatttagttactaaaacaaacaaacatattatctttttaactt 9643115  T
Q  347 agaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  9643116 agaatgatatttggtgtcgaacggtc 9643141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 1948633 - 1948857
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||     
T  1948633 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatctcaaagaaaatctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatt 1948732  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  1948733 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaactttatcttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatcttttaactta 1948832  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  1948833 gaatgatatttggtgttgaacggtc 1948857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 6020864 - 6021088
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6020864 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 6020963  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  6020964 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 6021063  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  6021064 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 6021088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 8185392 - 8185616
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8185392 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 8185491  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttt-aactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  8185492 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttg 8185591  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  8185592 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 8185616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 8192952 - 8193176
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8192952 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 8193051  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttt-aactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  8193052 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttg 8193151  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  8193152 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 8193176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 48353480 - 48353704
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  48353480 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 48353579  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttt-aactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  48353580 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttg 48353679  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  48353680 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 48353704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 2446868 - 2446645
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  2446868 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 2446769  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  2446768 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 2446669  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  2446668 aatgatatttggtgtcgaatggtc 2446645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 153 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 45433805 - 45433583
Alignment:
Q  153 tgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  45433805 tgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaatctagaatccatgtatggtcattaggttacgtgtgacgcttgattaag 45433706  T
Q  253 gaactctaatactaacaag-tttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaa 350  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||   ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45433705 gaactctaatcctaacaagtttttacgccttattactctcaacttttactcttgaaacttagttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttagaa 45433606  T
Q  351 tgatatttggtgtcgaacggtct 373  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  45433605 tgatatttggtgtcgaacggtct 45433583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 150 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 21642740 - 21642535
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  21642740 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaatgaaaagctagaatccatgtttgttcattaggttatgtgtgatgcttgatc 21642641  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21642640 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 21642541  T
Q  349 aatgat 354  Q
    ||||||    
T  21642540 aatgat 21642535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 19090030 - 19089806
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  19090030 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagttagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 19089931  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19089930 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatcttttaactta 19089831  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  19089830 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 19089806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 48347096 - 48347320
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  48347096 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 48347195  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttt-aactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  48347196 aaggaactctaatcctaacaagtttcatgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttg 48347295  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  48347296 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 48347320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 150 - 371
Target Start/End: Original strand, 33850643 - 33850865
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||     
T  33850643 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatacatgtatagtcattaggttacgtgtgacgcttgatt 33850742  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  33850743 aaggaactctaatcctaacaagtttaacgccttactactctcaacttttactattgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattgacttttaacttag 33850842  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggt 371  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  33850843 aatgatatttggtgtcaaacggt 33850865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 5056307 - 5056531
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  5056307 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 5056406  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||     
T  5056407 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaaacaacttatctttttacttg 5056506  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
     ||||||| ||||||||||||||||    
T  5056507 aaatgataattggtgtcgaacggtc 5056531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 1379169 - 1378946
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  1379169 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagacaagctagaatccatgtatgctcattaggttacgtgcgacgctcgatc 1379070  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  1379069 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 1378970  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  1378969 aatgatatttggtgtcgaacggtc 1378946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 8142446 - 8142669
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  8142446 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagacaagctagaatccatgtatgctcattaggttacgtgcgacgctcgatc 8142545  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| ||| || | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  8142546 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgtaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 8142645  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  8142646 aatgatatttggtgtcgaacggtc 8142669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 42422257 - 42422112
Alignment:
Q  7 gagagcatgtagctcttgtgctgctttgaaaatagtccaacatcgggagcttttaaacaatagagaggaagtttatatataaaacacaacgcttatcact 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  42422257 gagagcatgtagctcttgtgctgttgtgaaaatattccaacatcgggagcttttaaacaatagagaggaagtttatatataaaatgcagcgcttatcact 42422158  T
Q  107 ccttggtggtctacaaagtaaatgtcaatcttaaaagttatagtat 152  Q
     ||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  42422157 tcttagtggcctacaaagcaaatggcaatcttaaaagttatagtat 42422112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 155 - 372
Target Start/End: Original strand, 10831130 - 10831349
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||||||| ||||  | |||||||| ||||||||||||||||    |||  ||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  10831130 tttggacatgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaactctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 10831229  T
Q  253 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaat 351  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||||||  | || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10831230 gaactctaattccaacgttttt-acgccttattactctcaacttttacttttgcaacttggttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttagaat 10831328  T
Q  352 gatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  10831329 gatatttggtgtcgaacggtc 10831349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 155 - 372
Target Start/End: Original strand, 11024922 - 11025141
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||||||| ||||  | |||||||| ||||||||||||||||    |||  ||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  11024922 tttggacatgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaactctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 11025021  T
Q  253 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaat 351  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||||||  | || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11025022 gaactctaattccaacgttttt-acgccttattactctcaacttttacttttgcaacttggttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttagaat 11025120  T
Q  352 gatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11025121 gatatttggtgtcgaacggtc 11025141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 150 - 224
Target Start/End: Original strand, 13774130 - 13774204
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatc 224  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13774130 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatc 13774204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 155 - 372
Target Start/End: Original strand, 21901193 - 21901413
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || ||||||||| || |||||||| ||||||    
T  21901193 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattagattatgtttgacgcttaatcaag 21901292  T
Q  253 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaa-caaattatcgtttaacttagaa 350  Q
    ||||||| || |||||   ||| ||||| ||||| ||||||||||  | || | || ||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  21901293 gaactctgattctaacgttttt-acgccctattactctcaacttttacttttgaaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatctttcaacttagaa 21901391  T
Q  351 tgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  21901392 tgatatatggtgtcgaacggtc 21901413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 321 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 1942095 - 1942043
Alignment:
Q  321 acaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtct 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1942095 acaaacaacaaattatcgtttaacttataatgatatttggtgtcgaacggtct 1942043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 27954303 - 27954243
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccat 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  27954303 tttggacacgaatgatgttgttgaggaatatgtgataatatc-gagtaaagctagaatccat 27954243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 28442671 - 28442628
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaa 198  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  28442671 tttggacacgaatgatgttgttgagcgatatgtgataatatcaa 28442628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 13671817 - 13672040
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13671817 tattgtttggacactaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 13671916  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  13671917 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgcattattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaataaacaacaaattatcgtttaacttat 13672016  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  13672017 aatgatatttggtgtcgaacggtc 13672040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 150 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 27670316 - 27670096
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  27670316 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaattcatgtatgattattaggttacgtgtgacacttgatc 27670217  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27670216 aaggaactctaatcctaacaagtttcacactttattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 27670117  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacg 369  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27670116 aatgatatttggtgtcgaacg 27670096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 31548117 - 31547894
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31548117 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtgtgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 31548018  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  31548017 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaactaag 31547918  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  31547917 aatgatatttggtgtcgaacggtc 31547894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 32328493 - 32328716
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||    
T  32328493 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttatatgtgacgctcgatc 32328592  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  32328593 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttag 32328692  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  32328693 aatgatatctggtgtcgaacggtc 32328716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 1428423 - 1428646
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  1428423 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 1428522  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  1428523 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccttattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 1428622  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  1428623 aatgatatttggtgtcgaacggtc 1428646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 34711557 - 34711780
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  34711557 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 34711656  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  34711657 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 34711756  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34711757 aatgatatttggtgtcgaacggtc 34711780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 9864760 - 9864984
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9864760 tattgtttggacacgaatagtattgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaagttacgtgtgacgcttgatc 9864859  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  9864860 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaactta 9864959  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  9864960 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 9864984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 4186907 - 4186684
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  4186907 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagttagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 4186808  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4186807 aaggaactctaatcctaacaagttctacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttag 4186708  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  4186707 aattatatttggtgtcgaacggtc 4186684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 11058150 - 11058373
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  11058150 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 11058249  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  11058250 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 11058349  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  11058350 aatgatatttggtgtcgaacggtc 11058373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 150 - 369
Target Start/End: Original strand, 21262574 - 21262795
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  21262574 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaaactagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttaatc 21262673  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21262674 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattatcttttaactta 21262773  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacg 369  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21262774 gaatgatatttggtgtcgaacg 21262795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 4020235 - 4020459
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  4020235 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 4020334  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  4020335 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 4020434  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  4020435 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 4020459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 4026661 - 4026885
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  4026661 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 4026760  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  4026761 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 4026860  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  4026861 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 4026885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 34655473 - 34655249
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  34655473 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 34655374  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  34655373 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 34655274  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  34655273 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 34655249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 34649022 - 34648798
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  34649022 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 34648923  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | || || ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  34648922 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagatactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 34648823  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  34648822 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 34648798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 4738323 - 4738547
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  4738323 tattgtttggactcgaatagtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 4738422  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  4738423 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 4738522  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  4738523 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 4738547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 150 - 362
Target Start/End: Original strand, 7069702 - 7069916
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  7069702 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 7069801  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  7069802 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 7069901  T
Q  348 gaatgatatttggtg 362  Q
    ||||| |||||||||    
T  7069902 gaatggtatttggtg 7069916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 217 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 29907045 - 29906888
Alignment:
Q  217 gtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagtta 315  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||    
T  29907045 gtatggtcattaggttacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaattttattattagcaatttagtta 29906946  T
Q  316 ttaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtct 373  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29906945 ctaaaacaaacaacaaattatattttaacttagaatgatatttagtgtcgaacggtct 29906888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 217 - 373
Target Start/End: Original strand, 30117335 - 30117492
Alignment:
Q  217 gtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagtta 315  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||    
T  30117335 gtatggtccttaggttacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaattttattattagcaatttagtta 30117434  T
Q  316 ttaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtct 373  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30117435 ctaaaacaaacaacaaattatattttaacttagaatgatatttagtgtcgaacggtct 30117492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 245 - 372
Target Start/End: Original strand, 7062578 - 7062707
Alignment:
Q  245 tgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gttta 342  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||    
T  7062578 tgatcaaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttta 7062677  T
Q  343 acttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7062678 acttggaatggtatttggtgtcgaacggtc 7062707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 150 - 293
Target Start/End: Original strand, 1167480 - 1167630
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaaga-------aaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacg 242  Q
    |||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||| ||| |       ||| ||||||||| | ||||||||| || ||| ||||||||    
T  1167480 tattatttggacacgaacgatattgttgagggatacatgataatataaaaaataaaaaaaaaactagaatccgtatatgatcatcaggttatgtgtgacg 1167579  T
Q  243 cttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaa 293  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1167580 cttgatcaaagaattctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaa 1167630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 155 - 348
Target Start/End: Original strand, 10081567 - 10081762
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  10081567 tttggacacgaataatcttgttgagcgatatgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 10081666  T
Q  253 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctc-aactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| |||| || ||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10081667 gaactctaattccaac-gtttttacgccttattactctcaaattttactcttgcaacttagtttctaaaacaaacaacaaattatcttttaacttag 10081762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 150 - 212
Target Start/End: Original strand, 7062516 - 7062578
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaat 212  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7062516 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaat 7062578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 9846738 - 9846601
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatcc--atgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |  ||| ||||||||||  || | |||| || || ||| || |||||||| |||||     
T  9846738 tttgaacacgaatgatgttgtcgagcgatacgtgataatatcgataaaatgctagaatccgtatatgtgattatcaggttatgtttgacgcttaatcaac 9846639  T
Q  253 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctc 291  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||||||||    
T  9846638 gaactctaattccaac-gcttttacgccttattaatctc 9846601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 29907081 - 29907044
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgt 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  29907081 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggacacgt 29907044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 187
Target Start/End: Original strand, 30117299 - 30117336
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgt 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  30117299 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggacacgt 30117336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 22360186 - 22359963
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22360186 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttacgtgtgacgcttgatc 22360087  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22360086 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 22359987  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  22359986 aataatatttggtgtcgaacggtc 22359963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 150 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 4973785 - 4973563
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4973785 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattatgttacgtgtgacgcttgatc 4973686  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4973685 aaggaactctgatcctaacaagtttcaccccttattaatctcaattttatcatttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 4973586  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggt 371  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  4973585 aatgatatttggtgtcgaacggt 4973563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 22314052 - 22313829
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22314052 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtacggtcattaggttacgtgtgacgcttgatc 22313953  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22313952 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaataacaaattatcgtttaacttag 22313853  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  22313852 aatgatatttggtgtcgaacggtc 22313829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 150 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 5876440 - 5876218
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  5876440 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaatctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgcgacgcttgatc 5876341  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5876340 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 5876241  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggt 371  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  5876240 aatgatatttggtgttgaacggt 5876218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 34357288 - 34357511
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  34357288 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 34357387  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  34357388 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 34357487  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34357488 aatgatatttggtgtcgaacggtc 34357511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 34359079 - 34359302
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  34359079 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 34359178  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  34359179 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 34359278  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34359279 aatgatatttggtgtcgaacggtc 34359302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 2958081 - 2957857
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2958081 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 2957982  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttt-aactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  2957981 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttg 2957882  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  2957881 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 2957857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 2966550 - 2966326
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2966550 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 2966451  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttt-aactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  2966450 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttg 2966351  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  2966350 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 2966326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 29980681 - 29980458
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  29980681 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 29980582  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  29980581 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 29980482  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  29980481 aatgatatttggtgtcgaacggtc 29980458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 30041244 - 30041467
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  30041244 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 30041343  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  30041344 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 30041443  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  30041444 aatgatatttggtgtcgaacggtc 30041467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 40958617 - 40958840
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  40958617 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgaggaatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 40958716  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||| |    
T  40958717 aaggaactctaatcctaacaagtgttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaataaccaattatcttttaacttgg 40958816  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  40958817 aatgatatttggtgtcgaacggtc 40958840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 25894649 - 25894873
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  25894649 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatcgatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 25894748  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  25894749 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 25894848  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  25894849 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 25894873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 150 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 2439022 - 2438799
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  2439022 tattgtttggacacaaatgatgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgcatg-tcattaggttacgtgtgacgcttgatt 2438924  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||     
T  2438923 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcacttttattattcgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattttcttttaacttat 2438824  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtct 373  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||    
T  2438823 aatgatttttggtatcggacggtct 2438799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 152 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 42151039 - 42150817
Alignment:
Q  152 ttgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaa 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  42151039 ttgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaaactagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgattaa 42150940  T
Q  252 ggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaacttaga 349  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| || ||||||||    
T  42150939 ggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttactttagcaatttagttactaaaacaaacaaacaaactatctttcaacttaga 42150840  T
Q  350 atgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  42150839 atgatatttggagtcgaacggtc 42150817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 12505765 - 12505996
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  12505765 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagagaagctagaatccatgtataatcattaggttacgtgggactcttgatc 12505864  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagtta--tta------aaacaaacaacaaattatcgtt 340  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||  |||      ||| |||||||||| |||| ||    
T  12505865 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaactttattattcgcaacatagttaacttagtttctaaataaacaacaaactatcttt 12505964  T
Q  341 taacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  12505965 taacttaaaatggtatttggtgtcgaaaggtc 12505996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 29414669 - 29414892
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  29414669 tattgtttgaacatgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 29414768  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||| || |||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||| |||||    ||   | ||  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29414769 aagaaattctaatcctaataagttttacgccctattactctcgactttcaattttatatttgcttactaaaacaaacaaacaaattatcttttaacttag 29414868  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  29414869 aatgatatttggtgttgaacggtc 29414892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 155 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 33794309 - 33794091
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||||| ||||||  | |||||||| |||||||||||||||||   ||| |||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| |||||     
T  33794309 tttggatacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcagtaaaacgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaaa 33794210  T
Q  253 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaat 351  Q
    |||||||||| | ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  33794209 gaactctaattccaacattttt-acgccttattactctcaacttttactcttgcaacttagtttctaaaacatacaacaaattatc-tttaacttagaat 33794112  T
Q  352 gatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  33794111 gatatttggtgtcaaacggtc 33794091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 155 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 9843566 - 9843348
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || |||||||||  | ||| |||||||||||    
T  9843566 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattagattatatttgatgcttgatcaag 9843467  T
Q  253 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatg 352  Q
    |||||||||| | ||    ||| ||||| ||||| ||||||||||  | ||   | || |||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  9843466 gaactctaattccaatgttttt-acgccctattactctcaactttcacttttatatttggttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttagaatg 9843368  T
Q  353 atatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9843367 atatttggtgtcgaacggtc 9843348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 155 - 372
Target Start/End: Original strand, 2156125 - 2156341
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    |||  ||||||||||| ||  |||| ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  2156125 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacactagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 2156224  T
Q  253 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttt-aacttagaat 351  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||||||  | ||   |||| |||| |||||||   ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  2156225 gaactctaattccaac-gtttttacgccttattactctcaactttcacttttacacttggttactaaaaca---aacaaattatcttttaaacttagaat 2156320  T
Q  352 gatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2156321 gatatttggtgtcgaacggtc 2156341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 261
Target Start/End: Original strand, 19853484 - 19853588
Alignment:
Q  159 gacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaac 256  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||  |||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  19853484 gacatgaatgatgttgttgagtgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattagattatgtttgacgcttaatcaacgaac 19853583  T
Q  257 tctaa 261  Q
    |||||    
T  19853584 tctaa 19853588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 262
Target Start/End: Original strand, 12918955 - 12919064
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||  || | ||||| ||| || |||||||| | ||||    
T  12918955 tttggacacgaatagtcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtggttattaggttatgtttgacgcttaaccaag 12919054  T
Q  253 gaactctaat 262  Q
    ||||||||||    
T  12919055 gaactctaat 12919064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 262
Target Start/End: Original strand, 30580195 - 30580304
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||| |  ||| |||||||||||| ||  |||| ||||| ||| || |||||||| |||||     
T  30580195 tttggacacgaatgatgtcgtcgaccgatacgtgataatatcgataaaacgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaac 30580294  T
Q  253 gaactctaat 262  Q
    ||||||||||    
T  30580295 gaactctaat 30580304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 24)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 21341882 - 21342105
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21341882 tattgtttggacatgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 21341981  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  21341982 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagtcattaaaacaaacaaccaattatcttttaacttag 21342081  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  21342082 aatgatatttggtgtcgaacggtc 21342105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 150 - 369
Target Start/End: Original strand, 2021448 - 2021668
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  2021448 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 2021547  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2021548 aaggaactctaatcctaacaagttttacaccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 2021647  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacg 369  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2021648 aatgatatttggtgtcgaacg 2021668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 21331994 - 21332217
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21331994 tattgtttggacatgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 21332093  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  21332094 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcatttgaaatttagtcattaaaacaaacaaccaactatcttttaacttag 21332193  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  21332194 aatgatatttggtgtcgaacggtc 21332217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 42931372 - 42931595
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  42931372 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacatttgatc 42931471  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||| |    
T  42931472 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatctgttaacttgg 42931571  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  42931572 aatgatatttggtgtcgaacggtc 42931595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 16856487 - 16856709
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16856487 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 16856586  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||| ||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  16856587 aagaaactctaatcctaacaagtnttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatc-tttaactttg 16856685  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  16856686 aatgatatttgctgtcgaacggtc 16856709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 12951018 - 12950795
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  12951018 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 12950919  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  12950918 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccttattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 12950819  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  12950818 aatgatatttggtgtcgaacggtc 12950795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 16817330 - 16817552
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16817330 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 16817429  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||| ||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  16817430 aagaaactctaatcctaacaagtgttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatc-tttaactttg 16817528  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  16817529 aatgatatttgctgtcgaacggtc 16817552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 36782184 - 36782408
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  36782184 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 36782283  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  36782284 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 36782383  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  36782384 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 36782408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 34834812 - 34835035
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  34834812 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 34834911  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  34834912 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatctagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 34835011  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34835012 aatgatatttggtgtcgaacggtc 34835035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 34841256 - 34841479
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  34841256 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 34841355  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  34841356 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatctagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 34841455  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34841456 aatgatatttggtgtcgaacggtc 34841479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 29485149 - 29484925
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  29485149 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 29485050  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  29485049 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 29484950  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  29484949 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 29484925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 45012205 - 45011981
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  45012205 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 45012106  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  45012105 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 45012006  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  45012005 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 45011981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 150 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 2164250 - 2164026
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  2164250 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtataatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 2164151  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  2164150 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 2164051  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtct 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  2164050 aatgatatttggtgtcgaacggtct 2164026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 15852772 - 15852548
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15852772 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtgtgatcattaggttaagtgtgacgcttgatc 15852673  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  15852672 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 15852573  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  15852572 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 15852548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 43268081 - 43267857
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  43268081 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 43267982  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||     
T  43267981 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaaacaacttatcttttaacttg 43267882  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
     ||||||| ||||||||||||||||    
T  43267881 aaatgataattggtgtcgaacggtc 43267857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 2157834 - 2157611
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  2157834 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagatagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 2157735  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  2157734 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 2157635  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  2157634 aatgatatttggtgtcgaacggtc 2157611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 13901957 - 13902180
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  13901957 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagacaagctagaatccatgtatgctcattaggttacgtgcgacgctcgatc 13902056  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  13902057 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattgtatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 13902156  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  13902157 aatgatatttggtgtcgaacggtc 13902180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 21067958 - 21068181
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || || ||    
T  21067958 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttacgtgtgatgcctgctc 21068057  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 347  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21068058 aaggaactctaatcctaa-aagtttcacaccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaatacaaacaaacaaattatcttttaactta 21068156  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  21068157 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 21068181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 150 - 299
Target Start/End: Original strand, 45700644 - 45700793
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  45700644 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccaggtatgatcattaggttatgtgtgacgtttgatc 45700743  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttat 299  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45700744 aaggaactctaattctaacaagtttcacgccttattaatctcaactttat 45700793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 155 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 41455823 - 41455604
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||| | | |||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  41455823 tttggacacgaataatcttgttgagtgatacgtgataatatcggtaaaacggtggaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 41455724  T
Q  253 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatg 352  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||||||  | ||   |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41455723 gaactctaattccaacgttttt-acgccttattactctcaacttttacttttgcacttggttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttagaatg 41455625  T
Q  353 atatttggtgtcgaacggtct 373  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  41455624 atatttggtgtcgaacggtct 41455604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 150 - 314
Target Start/End: Original strand, 11909950 - 11910116
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatga--tcattagattacgtgtgacgcttga 247  Q
    |||| |||||||||||||  | |||| ||  |||||||||||||||  |  |||||||||||||| | ||||   ||||| |||||  || || ||||||    
T  11909950 tattatttggacacgaataatattgtcgactgatacgtgataatatagattaaaagctagaatccgtatatgtggtcattggattatatgggatgcttga 11910049  T
Q  248 tcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagtt 314  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||  |||||| ||||||    
T  11910050 tcaaggaactctaatcctaacaagttttacgccttattaatctcacttttattcttgcaaattagtt 11910116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 314
Target Start/End: Original strand, 17784443 - 17784604
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    ||| |||||||| ||| ||  |||| ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  17784443 tttggacacgaatgatgttgtcgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaattcatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 17784542  T
Q  253 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagtt 314  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  17784543 gaactctaattccaac-gcttttacgccttattactctcaacttttatctttgcaaattagtt 17784604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 159 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13163032 - 13162892
Alignment:
Q  159 gacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaac 256  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||  |  |||||||||||||  | ||||  |||||||  |||  || ||  |||| |||| ||||    
T  13163032 gacatgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatattgattaaaagctagaatctgtatatgtgatcattatgttatatgcgattcttggtcaatgaac 13162933  T
Q  257 tctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaacttt 297  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13162932 tctaatcctaacaagttttacgccttattactctcaacttt 13162892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 314
Target Start/End: Original strand, 17789096 - 17789257
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||  |||| ||||  ||| || |||||||| ||||||    
T  17789096 tttggacaggaatgatgttgtcgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattatgttatgtttgacgcttaatcaag 17789195  T
Q  253 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagtt 314  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  17789196 gaactctaattccaac-gcttttacgccttattactctcaacttttatctttgcaaattagtt 17789257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 18)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 150 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16405568 - 16405340
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatat----caaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgctt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16405568 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacattataatatatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctt 16405469  T
Q  246 gatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaac 344  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16405468 gatcaaggaactctaatcctaacaagttttacgccttattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaac 16405369  T
Q  345 ttagaatgatatttggtgtcgaacggtct 373  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16405368 ttagaacgatatttggtgtcgaacggtct 16405340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 55462772 - 55462995
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55462772 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 55462871  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  55462872 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 55462971  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  55462972 aatgatatttggtgtcgaacggtc 55462995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 16838359 - 16838581
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16838359 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagatagaatccatgtatggtcattaggttacgtgtgacgcttgatc 16838458  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16838459 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaacttttactcttgcaacttagttactaaaacaaacaacaaatcatc-tttaacttag 16838557  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  16838558 aatgatatttggtgtctaacggtc 16838581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 27590527 - 27590304
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27590527 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 27590428  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  27590427 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 27590328  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  27590327 aatggtatttggtgtcgaacggtc 27590304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 150 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 41373209 - 41372984
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  41373209 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 41373110  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  41373109 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaacaacttatcttttaactta 41373010  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtct 373  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  41373009 gaatgataattggtgtcgaacggtct 41372984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 151 - 372
Target Start/End: Original strand, 37368315 - 37368538
Alignment:
Q  151 attgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatca 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37368315 attgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatca 37368414  T
Q  251 aggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaacttag 348  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||| |    
T  37368415 aggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttgg 37368514  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  37368515 aatggtatttggtgtcgaacggtc 37368538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 13594330 - 13594105
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13594330 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 13594231  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatc-gtttaactt 346  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||  ||||||||    
T  13594230 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctgttaatctcaacttttacattagcaatttagttactaaaacaaacaaacatattatctttttaactt 13594131  T
Q  347 agaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  13594130 agaatgatatttggtgtcgaacggtc 13594105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 7780629 - 7780406
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  7780629 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttaatc 7780530  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  7780529 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttatcatttgcaatttcgttactaaaacaaacaacaaatcatc-tttaactta 7780431  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  7780430 gaatgatatttagtgtcgaacggtc 7780406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 8104104 - 8103880
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8104104 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtgtgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 8104005  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  8104004 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 8103905  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  8103904 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 8103880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 30238482 - 30238259
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  30238482 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggataaatgataatatcaaagaaaagctagaatacatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 30238383  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  30238382 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 30238283  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  30238282 aatgatatttggtgtcgaacggtc 30238259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 17457077 - 17456853
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  17457077 tattgtttggacatgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 17456978  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttt-aactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  17456977 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttgtcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttg 17456878  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  17456877 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 17456853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 150 - 367
Target Start/End: Original strand, 36754791 - 36755017
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||     
T  36754791 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggtaatgtgtgacgcttgatt 36754890  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgc---------aacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtt 340  Q
    ||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  36754891 aaggaacttcaatcctaataagtttcacgccttattaatctcaactttatcatttcaatatagttaacttagttactaaaacaaacaacaaactatcttt 36754990  T
Q  341 taacttagaatgatatttggtgtcgaa 367  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  36754991 taatttagaatgatatttggtgtcgaa 36755017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 150 - 344
Target Start/End: Original strand, 30211536 - 30211731
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||     
T  30211536 tattttttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaatctagaatccatgtatggtcattaagttatgtgtgacgcttgatt 30211635  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaac 344  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30211636 aaggaactctaatcataacaagtttcatgccttattaatctcaattttattattcgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattatcttttaac 30211731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 150 - 297
Target Start/End: Original strand, 5660549 - 5660696
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  5660549 tattatttggacacgaatgatattgtcgagggatacgtgattatatcaaagaaaagttagaatccgtatatgatcattaggttacatgtgatgcttgatc 5660648  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaacttt 297  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5660649 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaacttt 5660696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 173 - 373
Target Start/End: Original strand, 13003809 - 13004011
Alignment:
Q  173 tgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaa 270  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||| | |||      
T  13003809 tgttgagtgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaaagaactctaattccaacgt 13003908  T
Q  271 gtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacg 369  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||||  |  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  13003909 tttt-acgccttattactctcaacttttactcttgcaactttgttactaaaacaaacaacaaattgtcttttaacttataatgatatttggtgtcgaaca 13004007  T
Q  370 gtct 373  Q
    ||||    
T  13004008 gtct 13004011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 155 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 2948062 - 2947844
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || |||||||||  | ||| |||||||||||    
T  2948062 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattagattatatttgatgcttgatcaag 2947963  T
Q  253 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatg 352  Q
    |||||||||| | ||    ||| ||||| ||||| ||||||||||  | ||   | || |||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  2947962 gaactctaattccaatgttttt-acgccctattactctcaactttcacttttatatttggttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttagaatg 2947864  T
Q  353 atatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2947863 atatttggtgtcgaacggtc 2947844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 48914996 - 48914898
Alignment:
Q  276 acgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttt-aacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| || |||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  48914996 acgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttggaatggtatttggtgtcgaacggtc 48914898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 372
Target Start/End: Original strand, 5660743 - 5660775
Alignment:
Q  340 ttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5660743 ttaacttaaaatgatatttggtgtcgaacggtc 5660775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 168; Significance: 6e-90; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 12768966 - 12768743
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  12768966 tattgtttggacacgaatggtcttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaatctagaatccatgtataatcattaggttacgtgtgaagcttgatc 12768867  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  12768866 aaagaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatttgcaatttagttattaaaacaaacaacgaattatcatttaacttag 12768767  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  12768766 aatgatatttggtgtcgaacggtc 12768743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 11358193 - 11358417
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11358193 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 11358292  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  11358293 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 11358392  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  11358393 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 11358417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 7311571 - 7311348
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  7311571 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 7311472  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  7311471 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 7311372  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  7311371 aatgatatttggtgtcgaacggtc 7311348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 8013320 - 8013543
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  8013320 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 8013419  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  8013420 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 8013519  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  8013520 aatgatatttggtgtcgaacggtc 8013543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 36005482 - 36005705
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  36005482 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 36005581  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  36005582 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 36005681  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  36005682 aatgatatttggtgtcgaacggtc 36005705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 150 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 36076189 - 36075965
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  36076189 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 36076090  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || ||| |||||||||      
T  36076089 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactattgtttaacttga 36075990  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtct 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  36075989 aatgatatttggtgtcgaacggtct 36075965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 36425730 - 36425954
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  36425730 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 36425829  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  36425830 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 36425929  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  36425930 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 36425954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 6464576 - 6464799
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  6464576 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 6464675  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  6464676 aaggaactctaatcctaacgagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 6464775  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6464776 aatgatatttggtgtcgaacggtc 6464799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 150 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 15012610 - 15012393
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||     
T  15012610 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagatagaatccatgtatagtcattaggttccgtgtgacgcttgatt 15012511  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||   |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15012510 aaggaactctaatcctaacaagtttcacaccctattactctcaacttttactcttgcaacttagtaactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttag 15012411  T
Q  349 aatgatatttggtgtcga 366  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15012410 aatgatatttggtgtcga 15012393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 36021799 - 36022023
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  36021799 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 36021898  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||     
T  36021899 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaaacaacttatctttttacttg 36021998  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
     ||||||| ||||||||||||||||    
T  36021999 aaatgataattggtgtcgaacggtc 36022023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 41242116 - 41242339
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  41242116 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 41242215  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||| ||||||||      
T  41242216 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcatttaacttga 41242315  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    || ||||||||||||| |||||||    
T  41242316 aaagatatttggtgtcaaacggtc 41242339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 1238436 - 1238212
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||||||    
T  1238436 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcatcaggttatttgtgacgcttgatc 1238337  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattg-caacttagttattaaaacaaacaa-caaattatcgtttaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||  | ||  ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  1238336 aaggaactctaatcctaacaagttttacgctctattactctcaacttttactttttcaatttagttactaaaacaaacaaacaaattattttttaactta 1238237  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  1238236 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 1238212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 16710668 - 16710892
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16710668 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaattcatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 16710767  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||  ||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||||| |||| | |||| || ||||||    
T  16710768 aaggaactctaatcctaacaagttttatgccctattgctctcaacttttactttagcaatttagttactaaaacaaacaaacatactatctttcaactta 16710867  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  16710868 gaatgatatttggagtcgaacggtc 16710892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 150 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 31017608 - 31017394
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatg--tatgatcattagattacgtgtgacgcttga 247  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  31017608 tattttttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaaattagaatccatgtatatggtcattaggttacatgtgacgcttga 31017509  T
Q  248 tcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactta 347  Q
    | || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||              ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31017508 ttaaagaactctaatcctaactagtttcacgccttattattc--------------gcaactttgttactaaaacaaacaacaaattatcttttaactta 31017423  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtctatg 376  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31017422 aaatgatatttggtgtcgaacggtctatg 31017394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 150 - 293
Target Start/End: Original strand, 26250591 - 26250734
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||     
T  26250591 tattgtttggacacgaatgatattgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctataaaccatgtatggttattagattacgtgtgacgcttgatt 26250690  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaa 293  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26250691 aaggaactctaatcctaacaaatttcacgccttattaatctcaa 26250734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 150 - 342
Target Start/End: Original strand, 45068416 - 45068609
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||     
T  45068416 tattgttcggacacgaatggtgttatcgagggttacatgataatatcaaagaaaaactagaatccatgtatggtcattaggttacgtgcgacgcttgatt 45068515  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttta 342  Q
    || |||||||||| ||||||| ||| |||  |||||| ||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  45068516 aaagaactctaatcctaacaaattttacgttttattactctcaacttttactcttgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattatctttta 45068609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 372
Target Start/End: Original strand, 7933931 - 7934150
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||  |||| |||||||||  | ||| |||||||||||    
T  7933931 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattagattatatttgatgcttgatcaag 7934030  T
Q  253 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaa-cttagaat 351  Q
    |||||||||| | ||    ||| ||||| ||||| ||||||||||  | ||   | || |||| |||||||||| |  || |||||||||| ||||||||    
T  7934031 gaactctaattccaa-tgtttttacgccctattactctcaactttcacttttatatttggttactaaaacaaaccatcaactatcgtttaaccttagaat 7934129  T
Q  352 gatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  7934130 gatatttggtgtcgaacggtc 7934150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 319 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 14393786 - 14393733
Alignment:
Q  319 aaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||| ||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14393786 aaacaaacaaccaatcaacctttaacttaaaatgatatttggtgtcgaacggtc 14393733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 21)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 4311486 - 4311709
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||| ||||||    
T  4311486 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgcgacgattgatc 4311585  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4311586 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcatttaacttag 4311685  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  4311686 aatgatatttggtgttgaacggtc 4311709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 150 - 373
Target Start/End: Original strand, 10941304 - 10941528
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  10941304 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagttagaatccatatatggtcattaggttacgtgtgacgcttgatt 10941403  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10941404 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaattttattattcgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattatcttttaacttag 10941503  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtct 373  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||||    
T  10941504 aattatattaggtgtcaaacggtct 10941528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 32746592 - 32746369
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  32746592 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 32746493  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  32746492 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 32746393  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  32746392 aatgatatttggtgtcgaacggtc 32746369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 6036488 - 6036265
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6036488 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgagtgacgcttgatc 6036389  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  6036388 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcattttcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 6036289  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||| |||||||||||| |||||||    
T  6036288 aattatatttggtgtcaaacggtc 6036265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 24179296 - 24179072
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24179296 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttgatc 24179197  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gtttaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||     
T  24179196 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattatctttttaacttg 24179097  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  24179096 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 24179072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 150 - 373
Target Start/End: Original strand, 9570548 - 9570774
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9570548 tattgtttggacacgaatggtattgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 9570647  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcat-tgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgttt-aactt 346  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||    
T  9570648 aaggaattctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatctgcaatttagttactaaaacaaacaaacaacttatcttttaaactt 9570747  T
Q  347 agaatgatatttggtgtcgaacggtct 373  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  9570748 agaatgataattggtgtcgaacggtct 9570774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 27501967 - 27502191
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27501967 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgcttgatc 27502066  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgttt-aactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  27502067 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaaatgagttactaaaacaaacaaccaattatcttttcaacttg 27502166  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  27502167 gaatggtatttggtgtcgaacggtc 27502191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 13015208 - 13014985
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  13015208 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttatgtgtgacgcttgatc 13015109  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  13015108 aagaaactctaatcctaacaagttttacgccctgttaatctcaacttttacattagcaatttagttactaaaacaaacaaccaattatcttttaacttgg 13015009  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  13015008 aatgatatttggtgtcgaacggtc 13014985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 150 - 373
Target Start/End: Original strand, 9577050 - 9577276
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9577050 tattgtttggacacgaatggtattgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 9577149  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcat-tgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgttt-aactt 346  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||    
T  9577150 aaggaattctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatctgcaatttagttactaaaacaaacaaacaacttatcttttaaactt 9577249  T
Q  347 agaatgatatttggtgtcgaacggtct 373  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9577250 agaataataattggtgtcgaacggtct 9577276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 43995300 - 43995068
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaa-gaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgat 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  43995300 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtaataatatcaaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgcttggt 43995201  T
Q  249 caaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt---------gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgt 339  Q
     ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||  |||||||||||||||| |||| |    
T  43995200 taaggaactctaatcctgacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatttcaacatagtcaacttagtttctaaaacaaacaacaaactatctt 43995101  T
Q  340 ttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  43995100 ttaacttagaatgatatttgatgtcgaatggtc 43995068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 25893458 - 25893229
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  25893458 tattgtttggacacgaatagtattgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaagttacgtgtgacgcttgatc 25893359  T
Q  250 aagg-----aactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatc-attgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatc-gttta 342  Q
    ||||     ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||| |  ||||    
T  25893358 aaggaatttaactctaatcctaacaagtttcacgccctattaatctcaattttatcgtttgcaattgagttactaaaacaaacaaccaattaacttttta 25893259  T
Q  343 acttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25893258 acttagaatggtatttggtgtcgaacggtc 25893229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 43931799 - 43931581
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgt--gtgacgcttga 247  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  43931799 tattgtttgaacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataa-------gaaaagctagaatccatgtatggtcattaggttacgtatgtgacgcttga 43931707  T
Q  248 tcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaactt 346  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43931706 ttaaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaattttattatccgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattatcttttaactt 43931607  T
Q  347 agaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||    
T  43931606 agaatggtatttggtgtcggacggtc 43931581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 150 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 23068686 - 23068462
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||    
T  23068686 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaag-tagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgatgctcgatc 23068588  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatc-gtttaactt 346  Q
    || |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||  ||||||||    
T  23068587 aaagaactctaatcctaacaagtttc-cgccctattaatttcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaacagattatctttttaactt 23068489  T
Q  347 agaatgatatttggtgtcgaacggtct 373  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  23068488 agaatgatatttggtgacgaacggtct 23068462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 246 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 41353987 - 41353860
Alignment:
Q  246 gatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaac 344  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41353987 gatcaaggaactctaatcctaacaagttttacgtcctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaac 41353888  T
Q  345 ttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41353887 ttaaaatgatatttggtgtcgaacggtc 41353860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 160 - 297
Target Start/End: Original strand, 20651135 - 20651272
Alignment:
Q  160 acacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactct 259  Q
    ||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20651135 acacgaatgatattgtcaagggatacgtgataatatcaaagaaaaggtagaatccgtatatgatcattaaattacgtgtgatgcttgatcaaggaactct 20651234  T
Q  260 aatactaacaagtttcacgccttattaatctcaacttt 297  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20651235 aatcctaacgagtttcacgccttattaatctcaacttt 20651272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 222 - 372
Target Start/End: Original strand, 41354142 - 41354293
Alignment:
Q  222 atcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaa 320  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| ||||    
T  41354142 atcattaggttacgtgtgacgcttgctcaaggaactctaatcctaacaagtttcacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaa 41354241  T
Q  321 acaaac-aacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    |||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41354242 acaaacaaacaaattat-tttcaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 41354293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 155 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 4591012 - 4590792
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || |||||||||  | ||| |||||||||||    
T  4591012 tttggacacgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattagattatatttgatgcttgatcaag 4590913  T
Q  253 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaa-caaattatcgtttaacttagaat 351  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||   | || |||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||    
T  4590912 gaactctaattccaacgttttt-acgccctattactctcaactttaacttttatatttggttactaaaacaaacaaacaacttatcttttaacttggaat 4590814  T
Q  352 gatatttggtgtcgaacggtct 373  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  4590813 gataattggtgtcgaacggtct 4590792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 306 - 373
Target Start/End: Original strand, 3577095 - 3577162
Alignment:
Q  306 aacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtct 373  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3577095 aacttagttattcaaacaaacaacaaattatcatttaacttagaataatatttggtgtcgaacggtct 3577162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 373
Target Start/End: Original strand, 20952759 - 20952987
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    |||||||| ||||  | |||||||| ||||||||||||||||    ||  |||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  20952759 tttggacatgaataatcttgttgagcgatacgtgataatatcggtaaagcgctagaatccatatatgcgattattaggttatgtttgacgcttaatcaag 20952858  T
Q  253 gaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaacttt-atcattgcaacttagtta--tta-----aaacaaacaacaaatta-tcgtttaa 343  Q
    |||||||||| | |||   ||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||| |||||||  |||     ||| ||||||  ||||| || |||||    
T  20952859 gaactctaattccaacgttttt-acgccttattactctcaacttttattcttgcaaattagttaacttagttgcaaagaaacaaacaattactcttttaa 20952957  T
Q  344 cttagaatgatatttggtgtcgaacggtct 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20952958 cttagaatgatatttggtgtcgaacggtct 20952987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 262
Target Start/End: Original strand, 4644354 - 4644463
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgta--tgatcattagattacgtgtgacgcttgatcaag 252  Q
    ||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||  |||| ||||  ||| || |||||||| | ||||    
T  4644354 tttggacacgaatagtcttgttgaacgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattatgttatgtttgacgcttaaccaag 4644453  T
Q  253 gaactctaat 262  Q
    ||||||||||    
T  4644454 gaactctaat 4644463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2785922 - 2785865
Alignment:
Q  155 tttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaat 212  Q
    ||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  2785922 tttggacacaaatgattttgtcgagggatacgtgataatatcgattaaaagctagaat 2785865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 161; Significance: 9e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 150 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 49912 - 49689
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||     
T  49912 tattgtttggacacgaatagtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccgtgtatggtcattaggttatgtgcgacgcttgatg 49813  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49812 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatc-tttaacttag 49714  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtct 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  49713 aatgatatttggtgtcgaacggtct 49689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 150 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15393 - 15169
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||      
T  15393 tattgtttggacacgaacggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgacgctggaat 15294  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15293 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaattttactattcgcaacttagttactaaaacaaacaacaaattatcttttaagttag 15194  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtct 373  Q
    |||||||||| |||||||| |||||    
T  15193 aatgatattttgtgtcgaaaggtct 15169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 5005 - 5228
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  5005 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgcgacgctcgatc 5104  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||      
T  5105 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattaatctcaattttatcatttgcaattcagttactaaaacaaacaatcaactatcgtttaacttga 5204  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  5205 aatgatatttggtgtcgaacggtc 5228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0936 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0936
Description:

Target: scaffold0936; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 3264 - 3486
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| ||||||||    
T  3264 tattgtttggacacgaatgatgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatggtaattaggttaagtgtgaagcttgatc 3363  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttag 348  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3364 aaggaactctaatcctaacaagtttcacgccttattaatctcaacttttactcttgcaacttagttactaaaacaaacaacaaatcatc-tttaacttag 3462  T
Q  349 aatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    |||||||||| |||||||| ||||    
T  3463 aatgatatttagtgtcgaatggtc 3486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0510
Description:

Target: scaffold0510; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 8881 - 9105
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||    
T  8881 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatatgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattaggttacgtgtgaggatcgatc 8980  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| || ||||||    
T  8981 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttactttagcaatttagttactaaaacaaacaaacaaactatctttcaactta 9080  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  9081 gaatgatatttggagtcgaacggtc 9105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 150 - 372
Target Start/End: Original strand, 2560 - 2784
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||| |||    
T  2560 tattgtttggacatgaatggtgttgtcgagggatacatgataatatcaaagaaaagcttgaatccatgaatggtcattaggttatatgtgacgcttaatc 2659  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctcaac-tttatcattgcaacttagttattaaaacaaac-aacaaattatcgtttaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  2660 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctcaacttttacttttgcaatttagttactaaaacaaacaaataaattatcttttaactta 2759  T
Q  348 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  2760 gaatgatatttggtgtcgaacggtc 2784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 150 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 12155 - 12014
Alignment:
Q  150 tattgtttggacacgaatggtgttgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatgatcattagattacgtgtgacgcttgatc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12155 tattgtttggacacgaatggtgttgtcgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatttatgatcattaggttacgtgtgacgctcgatc 12056  T
Q  250 aaggaactctaatactaacaagtttcacgccttattaatctc 291  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  12055 aaggaactctaatcctaacaagttttacgccctattactctc 12014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 12014 - 11949
Alignment:
Q  308 cttagttattaaaacaaacaa-caaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacggtc 372  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12014 cttagttactaaaacaaacaaacaaactatctttcaacttagaatgatatttggagtcgaacggtc 11949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 266 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 100020 - 99913
Alignment:
Q  266 aacaagtttcacgccttattaatctcaactttatcatt-gcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtc 364  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100020 aacaagtttcacgccctattaatctcaactttatcatttgcaacttagttattcaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtc 99921  T
Q  365 gaacggtc 372  Q
    ||||||||    
T  99920 gaacggtc 99913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 173 - 373
Target Start/End: Original strand, 24268 - 24470
Alignment:
Q  173 tgttgagggatacgtgataatatcaaagaaaagctagaatccatgtatg--atcattagattacgtgtgacgcttgatcaaggaactctaatactaacaa 270  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||||  || ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||| | |||      
T  24268 tgttgagtgatacgtgataatatcggtaaaacgctagaatccatatatgtgattattaggttatgtttgacgcttaatcaaagaactctaattccaacgt 24367  T
Q  271 gtttcacgccttattaatctcaactttatca-ttgcaacttagttattaaaacaaacaacaaattatcgtttaacttagaatgatatttggtgtcgaacg 369  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||||  |  ||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  24368 tttt-acgccttattactctcaacttttactcttgcaactttgttactaaaacaaacaacaaattgtcttttaacttataatgatatttggtgtcgaaca 24466  T
Q  370 gtct 373  Q
    ||||    
T  24467 gtct 24470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University