View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11571_high_1 (Length: 1180)

Name: NF11571_high_1
Description: NF11571
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11571_high_1
NF11571_high_1
[»] chr1 (9 HSPs)
chr1 (156-1172)||(43591232-43592260)
chr1 (717-1172)||(26315731-26316174)
chr1 (717-890)||(16588462-16588635)
chr1 (717-890)||(39793831-39794004)
chr1 (717-890)||(26311522-26311683)
chr1 (737-891)||(10504435-10504588)
chr1 (453-518)||(32295523-32295588)
chr1 (1066-1100)||(47144736-47144770)
chr1 (1042-1139)||(30647116-30647213)
[»] chr4 (20 HSPs)
chr4 (562-1172)||(8892443-8893060)
chr4 (737-1172)||(44151276-44151715)
chr4 (685-1157)||(50627889-50628354)
chr4 (737-1176)||(31358866-31359303)
chr4 (669-890)||(10316994-10317220)
chr4 (717-891)||(31670089-31670264)
chr4 (717-891)||(53722006-53722180)
chr4 (685-890)||(27186142-27186356)
chr4 (685-883)||(43683621-43683813)
chr4 (737-890)||(3770842-3770999)
chr4 (737-890)||(44147023-44147180)
chr4 (669-794)||(35842843-35842973)
chr4 (737-890)||(41884925-41885076)
chr4 (562-645)||(10316884-10316968)
chr4 (737-891)||(49274517-49274669)
chr4 (562-645)||(49274317-49274407)
chr4 (813-863)||(35842797-35842847)
chr4 (795-890)||(31354678-31354772)
chr4 (787-842)||(45976222-45976277)
chr4 (595-630)||(31670354-31670389)
[»] chr7 (14 HSPs)
chr7 (717-1172)||(27761115-27761570)
chr7 (737-1172)||(7940083-7940522)
chr7 (718-1149)||(13828087-13828520)
chr7 (677-891)||(35705633-35705853)
chr7 (562-890)||(7466345-7466669)
chr7 (717-890)||(22901154-22901329)
chr7 (717-890)||(27756846-27757019)
chr7 (717-884)||(47419562-47419729)
chr7 (737-890)||(7944636-7944793)
chr7 (685-823)||(733614-733756)
chr7 (562-645)||(30430026-30430110)
chr7 (879-1172)||(22580645-22580938)
chr7 (558-645)||(2962257-2962346)
chr7 (595-630)||(47419435-47419470)
[»] chr3 (16 HSPs)
chr3 (717-1172)||(21849917-21850374)
chr3 (737-1172)||(54167344-54167783)
chr3 (813-1159)||(43554023-43554371)
chr3 (679-890)||(11004344-11004560)
chr3 (698-890)||(9105275-9105472)
chr3 (882-1159)||(53353126-53353408)
chr3 (685-891)||(43547722-43547935)
chr3 (685-890)||(9697586-9697798)
chr3 (717-892)||(21847107-21847284)
chr3 (737-891)||(54171924-54172082)
chr3 (718-814)||(43554645-43554741)
chr3 (737-890)||(39399127-39399279)
chr3 (740-829)||(755891-755981)
chr3 (595-645)||(1253053-1253103)
chr3 (737-844)||(38175790-38175896)
chr3 (882-911)||(1299046-1299075)
[»] chr2 (12 HSPs)
chr2 (717-1172)||(8055110-8055565)
chr2 (737-1172)||(36674769-36675208)
chr2 (737-1172)||(35950443-35950877)
chr2 (670-890)||(12999393-12999622)
chr2 (717-890)||(8050839-8051012)
chr2 (737-891)||(36670502-36670660)
chr2 (717-890)||(6463422-6463583)
chr2 (728-890)||(13270980-13271131)
chr2 (737-890)||(41093824-41093976)
chr2 (790-877)||(29767953-29768041)
chr2 (737-825)||(34590280-34590366)
chr2 (616-645)||(42515218-42515247)
[»] chr6 (18 HSPs)
chr6 (717-1172)||(8315487-8315943)
chr6 (669-1172)||(17886779-17887284)
chr6 (717-1076)||(27552094-27552453)
chr6 (562-890)||(14531610-14531945)
chr6 (669-890)||(17895654-17895881)
chr6 (717-890)||(17096258-17096431)
chr6 (717-890)||(8320026-8320199)
chr6 (788-1082)||(17163433-17163730)
chr6 (717-890)||(17779914-17780088)
chr6 (717-891)||(27574722-27574885)
chr6 (1074-1172)||(27568524-27568622)
chr6 (986-1129)||(3596333-3596476)
chr6 (788-877)||(17159610-17159700)
chr6 (787-878)||(7888212-7888305)
chr6 (737-852)||(6440865-6440979)
chr6 (595-630)||(17886718-17886753)
chr6 (595-630)||(17895593-17895628)
chr6 (883-916)||(3597592-3597625)
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (737-1172)||(43807485-43807922)
chr8 (737-1172)||(197684-198123)
chr8 (737-1172)||(312521-312960)
chr8 (717-1172)||(30405804-30406242)
chr8 (790-1172)||(41949528-41949902)
chr8 (877-1157)||(1291057-1291337)
chr8 (669-890)||(33071918-33072144)
chr8 (694-890)||(42234650-42234851)
chr8 (902-1157)||(31473324-31473579)
chr8 (717-890)||(28644562-28644735)
chr8 (717-890)||(30410313-30410486)
chr8 (810-1154)||(27435261-27435602)
chr8 (737-890)||(43812044-43812199)
chr8 (737-891)||(202202-202360)
chr8 (737-891)||(317039-317197)
chr8 (717-890)||(38757003-38757164)
chr8 (813-890)||(41945339-41945416)
chr8 (883-1097)||(17782356-17782570)
chr8 (595-630)||(30405678-30405713)
chr8 (595-630)||(30410187-30410222)
chr8 (453-518)||(2474903-2474968)
chr8 (717-766)||(27435174-27435223)
[»] chr5 (23 HSPs)
chr5 (737-1172)||(7099374-7099813)
chr5 (737-1172)||(16798387-16798826)
chr5 (737-1172)||(12023007-12023446)
chr5 (717-1172)||(40367595-40368039)
chr5 (787-1172)||(10276922-10277307)
chr5 (737-1172)||(37681754-37682182)
chr5 (686-1037)||(26336753-26337111)
chr5 (562-890)||(36632314-36632636)
chr5 (557-890)||(32485803-32486143)
chr5 (669-890)||(19502307-19502535)
chr5 (717-890)||(30695293-30695466)
chr5 (717-868)||(43384974-43385125)
chr5 (737-890)||(7103943-7104100)
chr5 (737-890)||(12018731-12018888)
chr5 (737-890)||(16794108-16794265)
chr5 (748-890)||(40371750-40371892)
chr5 (717-839)||(20830312-20830434)
chr5 (570-645)||(26336626-26336701)
chr5 (737-890)||(10274546-10274698)
chr5 (882-1140)||(26454406-26454664)
chr5 (737-890)||(37658732-37658878)
chr5 (768-839)||(20808675-20808746)
chr5 (1030-1090)||(30067034-30067094)
[»] scaffold0440 (2 HSPs)
scaffold0440 (737-1172)||(7224-7662)
scaffold0440 (737-1135)||(2735-3137)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (737-1172)||(44865-45304)
scaffold0044 (737-890)||(49445-49602)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (559-606)||(64430-64477)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (788-856)||(60201-60270)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 655; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 655; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 156 - 1172
Target Start/End: Original strand, 43591232 - 43592260
Alignment:
Q  156 tgaatgagtatatatatgttttaacagattaattctcgaatgtagcattaaaccagcaaggttttgatttttaataacagtttgaaggaatcgaattctt 255  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43591232 tgaatgagtatatatatgttctaacagattaattctcgaatgtagcactaaaccagcaaggttttgatttttaataacagtttgaaggaatcgaattctt 43591331  T
Q  256 tctttta-aaaaggcaaaatgggtatataactagaaaaagtaggaatcaaaattcaaaattttaacactaataatattaagcatcaccaaaattcaaaac 354  Q
    | ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43591332 ttttttttaaaaggcaaaatgg-tatataactagaaaaagtaggaatcaaaattcaaaattttaacactcgtaatattaagcatcaccaaaattcaaaac 43591430  T
Q  355 aattatttaagatttagtcacaaccacattagcacaggctaaaattggcaccatcaaaaccaataaaatgccagcaagcatcagcagagtacactaaagc 454  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43591431 aattatgtaagatttagtcacaaccacattagcaccggctaaaattggcaccatcaaaaccaataaaatgacagcaagcatcagcagagtacactaaagc 43591530  T
Q  455 tttgtttgggagtttagagaggagggga--------agactttggcaaaaagaaagtagtaagtagaagaaacaaaagagnnnnnnnnnnnnnnnggtgg 546  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||        ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||               |||||    
T  43591531 tttgtttgggagtttagaggggaggggaggagggaaagactttggaaaaaagaaagtagtaagtagaataaataaaagagtctttttttttttt-ggtgg 43591629  T
Q  547 tggctgcaattatgttagcgcagcacttgatgcttgttacacaagcaacagaagcagtttctgattctagggtttatgtgaatttgtgatttgtgaattn 646  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  43591630 tggctggaattttgttagcgcaacacttaatgcttgttacacaagcaacagaagcagtttctacttctagggtttatgtgaatttctgatttgtgaatta 43591729  T
Q  647 nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagttatgatgaaattgttattgatgcttatgaaaatatacaaagaaggta-----tatacaatgtctagctaagttgc 741  Q
                          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     ||||||||||||||| |||||||    
T  43591730 gagagaattgagagaagagagaagttatgatgaaattgttattgatgcttatgaaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagccaagttgc 43591829  T
Q  742 ttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgattaatc 841  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  43591830 ttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagattttatttgctaacctctaacaatattgtaacaaacttcataacaaactaaaataaagtgcgattaatc 43591929  T
Q  842 actgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttctacttccttcatttcattcaagcttctgag 941  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  43591930 actgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttctacttccttcattccaatcaagcttttgag 43592029  T
Q  942 tttgatgagcctgttaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagttgtagctcagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttgttcacttgg 1041  Q
     ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  43592030 cttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagttgtagctcagtagagcaatgaacaatctacagagctcccttgttcacttgg 43592129  T
Q  1042 tccctcagaaaatggaacttagcttctatatgcttgcttctcccatgcataactggatttcttgctaagcttatagtagatttgttgtctatgaacaatt 1141  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43592130 tccctcataaaatggaacttagcttttatatgcttgcttctcccatgcagaactgaatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgaacaatt 43592229  T
Q  1142 ctataggtctgctaaccttgatgtccatctc 1172  Q
     |||||||||||||||||  || ||||||||    
T  43592230 atataggtctgctaacctctatctccatctc 43592260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 717 - 1172
Target Start/End: Complemental strand, 26316174 - 26315731
Alignment:
Q  717 tatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataac 816  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||            |||    
T  26316174 tatatacaatatctagctaggttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgt------------aac 26316087  T
Q  817 aaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttctactt 916  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26316086 aaactaaaacagaatgtgattaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccactt 26315987  T
Q  917 ccttcatttcattcaagcttctgagtttgatgagcctgttaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagttgtagctcagtagagcaatgaacaat 1016  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  26315986 ccttcattccaatcaagcttctgagcttgatgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagaacaatgaacaat 26315887  T
Q  1017 ctgcagtgctcccttgttcacttggtccctcagaaaatggaacttagcttctatatgcttgcttctcccatgcataactggatttcttgctaagcttata 1116  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26315886 ctgaagtgctcccttgttcacttgctccctcagaaaatggaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttata 26315787  T
Q  1117 gtagatttgttgtctatgaacaattctataggtctgctaaccttgatgtccatctc 1172  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  26315786 gcagatttgttgtctatgagcaattctataggtctgctaacctctatctccatctc 26315731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 717 - 890
Target Start/End: Original strand, 16588462 - 16588635
Alignment:
Q  717 tatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataac 816  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16588462 tatatacaatgtctagctaagttgcttaaaacacaagcaatgtaacaaactctagatcttatatgataacctctaacaaacttgtaacaaacttcataac 16588561  T
Q  817 aaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaactaaca 890  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16588562 aaactaaaacaaaatgtgattaaccacttattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 16588635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 717 - 890
Target Start/End: Complemental strand, 39794004 - 39793831
Alignment:
Q  717 tatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataac 816  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39794004 tatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataac 39793905  T
Q  817 aaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaactaaca 890  Q
    ||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39793904 aaactaaaacagaatgagattaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 39793831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 717 - 890
Target Start/End: Complemental strand, 26311683 - 26311522
Alignment:
Q  717 tatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataac 816  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||            ||||    
T  26311683 tatatacaatatctagctaggttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttg------------taac 26311596  T
Q  817 aaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaactaaca 890  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26311595 aaactaaaacagaatgtgattaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 26311522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 737 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 10504588 - 10504435
Alignment:
Q  737 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgat 836  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||  | ||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| || | || ||||||    
T  10504588 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatgtgat 10504490  T
Q  837 taatcactgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaactaacat 891  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10504489 taatcactaattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 10504435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 453 - 518
Target Start/End: Original strand, 32295523 - 32295588
Alignment:
Q  453 gctttgtttgggagtttagagaggaggggaagactttggcaaaaagaaagtagtaagtagaagaaa 518  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||  ||| || |||| |||||||    
T  32295523 gctttgtttgggagtttagaggggaggggaagattttggaaaaaaagaaggagcaagtggaagaaa 32295588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1066 - 1100
Target Start/End: Complemental strand, 47144770 - 47144736
Alignment:
Q  1066 tctatatgcttgcttctcccatgcataactggatt 1100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47144770 tctatatgcttgcatctcccatgcataactggatt 47144736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1042 - 1139
Target Start/End: Complemental strand, 30647213 - 30647116
Alignment:
Q  1042 tccctcagaaaatggaacttagcttctatatgcttgcttctcccatgcataactggatttcttgctaagcttatagtagatttgttgtctatgaacaa 1139  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||| |||||| ||| | | |||| |||||||  | ||||||||||| |||||    
T  30647213 tccctaagaaaatggaactttgcttcaatgtgtttgctccttccatgcaaaactgggtttttggataagtttatagttaacttgttgtctataaacaa 30647116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 349; Significance: 0; HSPs: 20)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 562 - 1172
Target Start/End: Original strand, 8892443 - 8893060
Alignment:
Q  562 tagcgcagcacttgatgcttgttacacaagcaacagaagcagtttc-tgattctagggtttatgtgaatttgtgatttgtgaattnnnnnnnnnnnnnnn 660  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||                   
T  8892443 tagcgcaacaattgatgcttgttacacaagcaacagaagcacttttatgattctagggtttatgtaaatttgtgatttgtgaattagagagagttgagag 8892542  T
Q  661 nnnnnnnnagttatgatgaaattgttattgatgcttatgaaaatatacaaagaaggta-----tatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagca 755  Q
            |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  8892543 aagagagaagttatgatgaaattgttattgatacttgtgaaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagttaagttgcttgaagcacaagcg 8892642  T
Q  756 atgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgatta 855  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8892643 atgtaacaaactctatatcttatttgctaatctctaacaaatttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaatcactgattgtgatta 8892742  T
Q  856 tcactaaa-ctaaatttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttctacttccttcatttcattcaagcttctgagtttgatgagcctg 954  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||| ||| |||| |||||||  |||    
T  8892743 tcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaaatttccacttccttcattccaatcaaccttttgagcttgatgaatctg 8892842  T
Q  955 ttaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagttgtagctcagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttgttcacttggtccctcagaaaat 1054  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8892843 tcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagttgcagctcagtagagcaatgaacaatctgtagtgctcccttgttcacttgctccctcagaaaat 8892942  T
Q  1055 ggaacttagcttctatatgcttgcttctcccatgcataactggatttcttgctaagcttatagtagatttgttgtctatgaacaattctataggtctgct 1154  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8892943 ggaactcagcttctatatgtttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgattaattctataggtctgct 8893042  T
Q  1155 aaccttgatgtccatctc 1172  Q
    |||||  || ||||||||    
T  8893043 aacctctatctccatctc 8893060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 737 - 1172
Target Start/End: Complemental strand, 44151715 - 44151276
Alignment:
Q  737 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagt-gt 833  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  44151715 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 44151616  T
Q  834 gattaatcactgattgtgattatcact-aaactaaatttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttctacttccttcatttcattcaa 932  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  44151615 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 44151516  T
Q  933 gcttctgagtttgatgagcctgttaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagttgtagctcagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttg 1032  Q
    ||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  44151515 gcttctgagcttgatgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagcttagtagaacaatgaacaatctgaagtgctcccttg 44151416  T
Q  1033 ttcacttggtccctcagaaaatggaacttagcttctatatgcttgcttctcccatgcataactggatttcttgctaagcttatagtagatttgttgtcta 1132  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44151415 ttcacttgctccctcagaaaatggaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtcta 44151316  T
Q  1133 tgaacaattctataggtctgctaaccttgatgtccatctc 1172  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  44151315 tgagcaattctataggtctgctaacctctatctccatctc 44151276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 685 - 1157
Target Start/End: Original strand, 50627889 - 50628354
Alignment:
Q  685 ttattgatgcttatgaaaatatacaaagaaggta-----tatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatt 779  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||| |||||     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50627889 ttattgattctgatgaaaatatataaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagtacaagcaatgtaacaaactctagatcttatt 50627988  T
Q  780 tgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaa-ctaaatttgaattaa 878  Q
    || |||||||||||||||||||            |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||    
T  50627989 tgctaacctctaacaaacttgt------------aacaaactaaaaaaaaaagtgattaatcactgattgtgatta-cactaaaactaatcttgaattaa 50628075  T
Q  879 aacaaactaacatcctcccttaattcaagtttctacttccttcatttcattcaagcttctgagtttgatgagcctgttaaccttcaatgccttagtgaat 978  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50628076 aacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccactgccttcattccaatcaagcttctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaat 50628175  T
Q  979 atgtctacaagttgtagctcagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttgttcacttggtccctcagaaaatggaacttagcttctatatgcttgc 1078  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  50628176 atgtctgcaagctgcagctcagtagagcaatgaacaatctacagtgctcccttgttcacttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgc 50628275  T
Q  1079 ttctcccatgcataactggatttcttgctaagcttatagtagatttgttgtctatgaacaattctataggtctgctaac 1157  Q
    |||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50628276 ttcttccatgcggaactgaatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgaacaattctataggtctgctaac 50628354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 737 - 1176
Target Start/End: Complemental strand, 31359303 - 31358866
Alignment:
Q  737 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgat 836  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||  | ||| ||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||| || | || ||||||    
T  31359303 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcatagcaaactgaatctaaatgtgat 31359205  T
Q  837 taatcactgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttctacttccttcatttcattcaagctt 936  Q
    ||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||     
T  31359204 taaccactaattgtgattatcattaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagct- 31359106  T
Q  937 ctgagtttgatgagcctgttaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagttgtagctcagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttgttca 1036  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31359105 ctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttaatgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagagcaatgaacaatctacagtgctcccttgttca 31359006  T
Q  1037 cttggtccctcagaaaatggaacttagcttctatatgcttgcttctcccatgcataactggatttcttgctaagcttatagtagatttgttgtctatgaa 1136  Q
    |||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  31359005 cttgctccctcagaaaatgaaacttgacttctatatgcttgcttctcccatgcataactagatttctttctaagcttataacagatttgttgtctatgaa 31358906  T
Q  1137 caattctataggtctgctaaccttgatgtccatctcattg 1176  Q
    |||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  31358905 caatgctataggtctgctaacctctatctccatctcattg 31358866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 669 - 890
Target Start/End: Original strand, 10316994 - 10317220
Alignment:
Q  669 agttatgatgaaattgttattgatgcttatgaaaatatacaaagaaggta-----tatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaaca 763  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10316994 agttatgatgaaaatgttattaattcttatgaaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagttaagttgcttgaagcacaagcaatgtaaca 10317093  T
Q  764 aactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaa 863  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10317094 aactctagatcttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactacaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattataactaaa 10317193  T
Q  864 ctaaatttgaattaaaacaaactaaca 890  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10317194 ctaaacttgaattaaaacaaactaaca 10317220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 717 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 31670264 - 31670089
Alignment:
Q  717 tatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataac 816  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31670264 tatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcagaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataac 31670165  T
Q  817 aaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcact-aaactaaatttgaattaaaacaaactaacat 891  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31670164 aaactaaaacaaactgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 31670089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 717 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 53722180 - 53722006
Alignment:
Q  717 tatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataac 816  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53722180 tatatacaatatatagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctagcctctaacaaacttgtaacaaacttcataac 53722081  T
Q  817 aaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaactaacat 891  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53722080 aaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 53722006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 685 - 890
Target Start/End: Complemental strand, 27186356 - 27186142
Alignment:
Q  685 ttattgatgcttatgaaaatatacaaagaagg-----tatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatt 779  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27186356 ttattgattctcatgaaaatatacaaaggaggcagcttatatacaatgtctagctaagtttcttgaagcacaagcaatgttacaaactctagatcttatt 27186257  T
Q  780 tgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataac-aaact--aaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcact-aaactaaatttgaat 875  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27186256 tgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaaactaaaaaacaaaatgtgattaatcactaattgtgattatcactaaaactaaacttgaat 27186157  T
Q  876 taaaacaaactaaca 890  Q
    |||||||||||||||    
T  27186156 taaaacaaactaaca 27186142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 685 - 883
Target Start/End: Original strand, 43683621 - 43683813
Alignment:
Q  685 ttattgatgcttatgaaaatatacaaagaaggta-----tatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatt 779  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| | |||     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  43683621 ttattaattcttatgaaaatatacaaaggatgtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctatatcttatt 43683720  T
Q  780 tgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaa 879  Q
    || |||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  43683721 tgctaacctctaacaa-----------acttcataacaaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaaataaacttgaattaaa 43683809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 737 - 890
Target Start/End: Complemental strand, 3770999 - 3770842
Alignment:
Q  737 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaa-gtgt 833  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  3770999 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 3770900  T
Q  834 gattaatcactgattgtgattatcact-aaactaaatttgaattaaaacaaactaaca 890  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3770899 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 3770842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 737 - 890
Target Start/End: Complemental strand, 44147180 - 44147023
Alignment:
Q  737 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaa-gtgt 833  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  44147180 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 44147081  T
Q  834 gattaatcactgattgtgattatcact-aaactaaatttgaattaaaacaaactaaca 890  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44147080 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 44147023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 669 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 35842973 - 35842843
Alignment:
Q  669 agttatgatgaaattgttattgatgcttatgaaaatatacaaagaaggta-----tatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaaca 763  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35842973 agttatgatgaaattgttattgatgcttatgaaaatatacaaaggaggtagtttatatacaatgtctaactaagttgcttgaagcacaagcattgtaaca 35842874  T
Q  764 aactctagatcttatttgttaacctctaaca 794  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35842873 aactctagatcttatttgctaacctctaaca 35842843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 737 - 890
Target Start/End: Complemental strand, 41885076 - 41884925
Alignment:
Q  737 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgat 836  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| |||||||  | ||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| || | || ||||||    
T  41885076 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-atcttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtgat 41884979  T
Q  837 taatcactgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaactaaca 890  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  41884978 taaccactaattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaaccaaca 41884925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 562 - 645
Target Start/End: Original strand, 10316884 - 10316968
Alignment:
Q  562 tagcgcagcacttgatgcttgttacacaagcaacagaagcagtttc-tgattctagggtttatgtgaatttgtgatttgtgaatt 645  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10316884 tagcgcaacaattgatgcttgttacacaagcaacataagcagttttatgattctagggtttatgtgaatttgtgatttgtgaatt 10316968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 737 - 891
Target Start/End: Original strand, 49274517 - 49274669
Alignment:
Q  737 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgat 836  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||  | ||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| || | || ||||||    
T  49274517 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaa-ttcataacaaactgaatctaaatgtgat 49274614  T
Q  837 taatcactgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaactaacat 891  Q
    ||| |||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49274615 taaccactaattatgatcatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 49274669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 562 - 645
Target Start/End: Original strand, 49274317 - 49274407
Alignment:
Q  562 tagcgcagcacttgatgcttgttacacaagcaa-------cagaagcagtttctgattctagggtttatgtgaatttgtgatttgtgaatt 645  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49274317 tagcgcaacacttgatgcttgttacacaagcaatgaaaaccagaagcagtttctgattttagggtttatgtgaatttgtgatttgtgaatt 49274407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 813 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 35842847 - 35842797
Alignment:
Q  813 taacaaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaa 863  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35842847 taacatactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaa 35842797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 795 - 890
Target Start/End: Complemental strand, 31354772 - 31354678
Alignment:
Q  795 aacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaactaaca 890  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| || || | || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  31354772 aacttgtaacaaaattcataacaa-ctgaatctaaatgtgattaaccactaattgtaattatcactaaactaaacttaaattaaaacaaactaaca 31354678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 787 - 842
Target Start/End: Original strand, 45976222 - 45976277
Alignment:
Q  787 ctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgattaatca 842  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  45976222 ctctaaaaaacttgtaacaaacttcaaaacaaactaaaacaagatgtgattaatca 45976277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 595 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 31670389 - 31670354
Alignment:
Q  595 cagaagcagtttctgattctagggtttatgtgaatt 630  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31670389 cagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 31670354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 328; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 717 - 1172
Target Start/End: Complemental strand, 27761570 - 27761115
Alignment:
Q  717 tatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataac 816  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27761570 tatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctacaaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataac 27761471  T
Q  817 aaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttctactt 916  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27761470 aaactaaaacagaatgtgattaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccactt 27761371  T
Q  917 ccttcatttcattcaagcttctgagtttgatgagcctgttaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagttgtagctcagtagagcaatgaacaat 1016  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27761370 ccttcattccaatcaagcttctgagcttgatgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagagcaatgaacaat 27761271  T
Q  1017 ctgcagtgctcccttgttcacttggtccctcagaaaatggaacttagcttctatatgcttgcttctcccatgcataactggatttcttgctaagcttata 1116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27761270 ctgcagtgctcccttgttcacttgctcccttagaaaatgaaactttgtttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttata 27761171  T
Q  1117 gtagatttgttgtctatgaacaattctataggtctgctaaccttgatgtccatctc 1172  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  27761170 gcagatttgttgtctatgagcaattctataggtctgctaacctctatctccatctc 27761115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 737 - 1172
Target Start/End: Original strand, 7940083 - 7940522
Alignment:
Q  737 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagt-gt 833  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  7940083 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 7940182  T
Q  834 gattaatcactgattgtgattatcact-aaactaaatttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttctacttccttcatttcattcaa 932  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  7940183 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 7940282  T
Q  933 gcttctgagtttgatgagcctgttaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagttgtagctcagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttg 1032  Q
    ||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  7940283 gcttctgagcttgatgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgaagtgctcccttg 7940382  T
Q  1033 ttcacttggtccctcagaaaatggaacttagcttctatatgcttgcttctcccatgcataactggatttcttgctaagcttatagtagatttgttgtcta 1132  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7940383 ttcacttgctccctcagaaaatggaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtcta 7940482  T
Q  1133 tgaacaattctataggtctgctaaccttgatgtccatctc 1172  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  7940483 tgagcaattctataggtctgctaacctctatctccatctc 7940522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 718 - 1149
Target Start/End: Original strand, 13828087 - 13828520
Alignment:
Q  718 atatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataaca 817  Q
    ||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| | ||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  13828087 atatacactatctagttaggtagcttgaagcacaagcaatgtaacagaccctaactattattagatacactctaacaaacttgtaacaaacttcagaaca 13828186  T
Q  818 aactaaaacaaagtgtgattaatca-ctgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaa-aacaa-actaacatcctcccttaattcaagtttctac 914  Q
    ||| |||  ||| ||||||||| || || |   |||||||||||||  |||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13828187 aacaaaatgaaaatgtgattaaccaactaaacatgattatcactaaggtaaacttgaattaacaactagactaacatcctcccttaattcaagtttccac 13828286  T
Q  915 ttccttcatttcattcaagcttctgagtttgatgagcctgttaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagttgtagctcagtagagcaatgaaca 1014  Q
    |||||||||  || |||| |||||||| ||||||| || || |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  13828287 ttccttcatgccaatcaaacttctgagcttgatgaacccgtcaacctttaatgc-ttagtgaatatgtctgcaagttgcagctcagtggagcaatggaca 13828385  T
Q  1015 atctgcagtgctcccttgttcacttggtccctcagaaaatggaacttagcttctatatgcttgcttctcccatgcataactggatttcttgctaagctta 1114  Q
    |||| || ||| || ||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13828386 atctacaatgcacctttgtttacttgctccctcaaaaaatgaaacttagcctctatgtgtttgcttcttccatgcaaaactggatttcttgctaagctta 13828485  T
Q  1115 tagtagatttgttgtctatgaacaattctataggt 1149  Q
    | ||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  13828486 ttgtagatttgttatctatgaacaatgcaataggt 13828520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 677 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 35705853 - 35705633
Alignment:
Q  677 tgaaattgttattgatgcttatgaaaatatacaaagaagg------tatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactcta 770  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |      ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35705853 tgaacttgttattgatacttatgaaaatatacaaagaaaggtagcttatatacaatgtctagctg-gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactcta 35705755  T
Q  771 gatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataa-caaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaat 869  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35705754 gatcttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaactccataaacaaactaaaacaaaatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaac 35705655  T
Q  870 ttgaattaaaacaaactaacat 891  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  35705654 ttgaattaaaacaaactaacat 35705633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 562 - 890
Target Start/End: Original strand, 7466345 - 7466669
Alignment:
Q  562 tagcgcagcacttgatgcttgttacacaagcaacagaagcagtttc-tgattctagggtttatgtgaatttgtgattt-gtgaattnnnnnnnnnnnnnn 659  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||                  
T  7466345 tagcgcaacaattgatgcttgttacacaagcaacagaagcagttttatgattatagggtttatgtaaatttgtgattttgtgaattagagagagttgaga 7466444  T
Q  660 nnnnnnnnnagttatgatgaaattgttattgatgcttatgaaaatatacaaagaaggta-----tatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagc 754  Q
             |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7466445 gaagagagaagttatgatgaaattgttattgatacttatgaaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaac 7466544  T
Q  755 aatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgatt 854  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||            ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  7466545 aatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaacaaacttg------------taacaaactaaaacaaaatgtgattaatcattgattgtgatt 7466632  T
Q  855 atcact-aaactaaatttgaattaaaacaaactaaca 890  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7466633 atcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 7466669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 717 - 890
Target Start/End: Complemental strand, 22901329 - 22901154
Alignment:
Q  717 tatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataac 816  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22901329 tatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataac 22901230  T
Q  817 aaactaaaacaaa-gtgtgattaatcactgattgtgattatcact-aaactaaatttgaattaaaacaaactaaca 890  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  22901229 aaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaactttaattaaaacaaactaaca 22901154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 717 - 890
Target Start/End: Complemental strand, 27757019 - 27756846
Alignment:
Q  717 tatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataac 816  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27757019 tatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctacaaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataac 27756920  T
Q  817 aaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaactaaca 890  Q
    ||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27756919 aaactaaaacagaatgcgattaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 27756846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 717 - 884
Target Start/End: Original strand, 47419562 - 47419729
Alignment:
Q  717 tatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataac 816  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  47419562 tatatacaatgtctagctaagttgcttgaaacacaaacaatgtaacaaactctagatattatctgctaacctctaagaaacttgtaacaaacttcataac 47419661  T
Q  817 aaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaa 884  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47419662 aaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaa 47419729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 737 - 890
Target Start/End: Original strand, 7944636 - 7944793
Alignment:
Q  737 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaa-gtgt 833  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  7944636 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 7944735  T
Q  834 gattaatcactgattgtgattatcact-aaactaaatttgaattaaaacaaactaaca 890  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7944736 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 7944793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 685 - 823
Target Start/End: Original strand, 733614 - 733756
Alignment:
Q  685 ttattgatgcttatgaaaatatacaaagaaggta-----tatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatt 779  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  733614 ttattgat-cttatgaaagtatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgctcgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatt 733712  T
Q  780 tgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaa 823  Q
    || |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  733713 tgctaacctctaacaaaattgtaacaaatttcataacaaactaa 733756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 562 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 30430110 - 30430026
Alignment:
Q  562 tagcgcagcacttgatgcttgttacacaagcaacagaagcagtttc-tgattctagggtttatgtgaatttgtgatttgtgaatt 645  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30430110 tagcgcaacaattgatgcttgttacacaagcaacagaagcagttttatgattctagggtttatgtgaatttgtgatttgtgaatt 30430026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 879 - 1172
Target Start/End: Complemental strand, 22580938 - 22580645
Alignment:
Q  879 aacaaactaacatcctcccttaattcaagtttctacttccttcatttcattcaagcttctgagtttgatgagcctgttaaccttcaatgccttagtgaat 978  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||   | | | |||||| || ||||||| | ||| ||||||||  |  || |||||     
T  22580938 aacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccactttcaccatactaattatgcttcttagcttgatgaacgtgtcaaccttcataggtttggtgaac 22580839  T
Q  979 atgtctacaagttgtagctcagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttgttcacttggtccctcagaaaatggaacttagcttctatatgcttgc 1078  Q
    |  ||| |||| || || ||||| ||||| |||||||||| || |||| ||||||| ||||| ||  | ||||||||||| || || || || |||||||    
T  22580838 aaatctgcaagctgcagttcagtggagcagtgaacaatcttcaatgcttccttgtttacttgttctataagaaaatggaatttggcctcaatgtgcttgc 22580739  T
Q  1079 ttctcccatgcataactggatttcttgctaagcttatagtagatttgttgtctatgaacaattctataggtctgctaaccttgatgtccatctc 1172  Q
    | || ||||| | |||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| || ||||||  || ||||||||    
T  22580738 tccttccatgtaaaactggatttttagctaagtttatagttgatttgttgtctataaacaaacctataggtttgttaacctcaatttccatctc 22580645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 558 - 645
Target Start/End: Original strand, 2962257 - 2962346
Alignment:
Q  558 atgttagcgcagcacttgatgcttgttacacaagcaacagaagcag-tttctgattctagggtttatgtga-atttgtgatttgtgaatt 645  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  2962257 atgttagcgctgtaattgatgcttgttacacaagcaacataagcagttttcaacttctagggtttatgagagttttgtgatttgtgaatt 2962346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 595 - 630
Target Start/End: Original strand, 47419435 - 47419470
Alignment:
Q  595 cagaagcagtttctgattctagggtttatgtgaatt 630  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47419435 cagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 47419470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 717 - 1172
Target Start/End: Complemental strand, 21850374 - 21849917
Alignment:
Q  717 tatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataac 816  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21850374 tatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataac 21850275  T
Q  817 aaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaa-ctaaatttgaattaaaa-caaactaacatcctcccttaattcaagtttctac 914  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21850274 aaactaaaacaaactgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccac 21850175  T
Q  915 ttccttcatttcattcaagcttctgagtttgatgagcctgttaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagttgtagctcagtagagcaatgaaca 1014  Q
    |||||||||| || | ||||||||||| ||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  21850174 ttccttcattccaataaagcttctgagcttgttgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagagcaatgaaca 21850075  T
Q  1015 atctgcagtgctcccttgttcacttggtccctcagaaaatggaacttagcttctatatgcttgcttctcccatgcataactggatttcttgctaagctta 1114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21850074 atctgcagtgctcccttgttcacttgctcccttagaaaatgaaactttgcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagctta 21849975  T
Q  1115 tagtagatttgttgtctatgaacaattctataggtctgctaaccttgatgtccatctc 1172  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  21849974 tagcagatttgttgtctatgagcaattctataggtctgctaacctctatctccatctc 21849917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 737 - 1172
Target Start/End: Original strand, 54167344 - 54167783
Alignment:
Q  737 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatc--ttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagt-gt 833  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  54167344 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacacccttatttggtaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 54167443  T
Q  834 gattaatcactgattgtgattatcact-aaactaaatttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttctacttccttcatttcattcaa 932  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  54167444 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 54167543  T
Q  933 gcttctgagtttgatgagcctgttaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagttgtagctcagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttg 1032  Q
     |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  54167544 acttctgagcttgatgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttg 54167643  T
Q  1033 ttcacttggtccctcagaaaatggaacttagcttctatatgcttgcttctcccatgcataactggatttcttgctaagcttatagtagatttgttgtcta 1132  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54167644 ttcacttgctccctcagaaaatgaaactttgcttctatgtgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtcta 54167743  T
Q  1133 tgaacaattctataggtctgctaaccttgatgtccatctc 1172  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  54167744 tgagcaattctataggtctgctaacctctatctccatctc 54167783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 813 - 1159
Target Start/End: Complemental strand, 43554371 - 43554023
Alignment:
Q  813 taacaaactaaaa-caaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaa-ctaaatttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagttt 910  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  43554371 taacaaactaaaaacaaaatgtgactaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatctccccttaattcaagttt 43554272  T
Q  911 ctacttccttcatttcattcaagcttctgagtttgatgagcctgttaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagttgtagctcagtagagcaatg 1010  Q
    | ||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||| ||||||||||    
T  43554271 ccacttccttcattcaaatcaagcttctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtttgcaagctgcagctcaatagagcaatg 43554172  T
Q  1011 aacaatctgcagtgctcccttgttcacttggtccctcagaaaatggaacttagcttctatatgcttgcttctcccatgcataactggatttcttgctaag 1110  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  43554171 aacaatctacaatgcttccttgttcactagctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaag 43554072  T
Q  1111 cttatagtagatttgttgtctatgaacaattctataggtctgctaacct 1159  Q
     |||||  | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  43554071 attataccatatttgttgtctatgaacaatgccataggtctgctaacct 43554023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 679 - 890
Target Start/End: Original strand, 11004344 - 11004560
Alignment:
Q  679 aaattgttattgatgcttatgaaaatatacaaagaaggta-----tatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagat 773  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||     ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11004344 aaattgttattgatacttatgaaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaggttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagat 11004443  T
Q  774 cttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaatttga 873  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11004444 cttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaatcttcataacaagctaaaacaaaatgtgattattcactgattgtgattatcactaaactaaacttga 11004543  T
Q  874 attaaaacaaactaaca 890  Q
    |||||||||||||||||    
T  11004544 attaaaacaaactaaca 11004560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 698 - 890
Target Start/End: Complemental strand, 9105472 - 9105275
Alignment:
Q  698 tgaaaatatacaaagaaggta-----tatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaa 792  Q
    ||||||||||||||| |||||     |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9105472 tgaaaatatacaaaggaggtagctcatatacaatgtctagttaggttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaa 9105373  T
Q  793 caaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaactaaca 890  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9105372 caaacttgtaacatacttcataacaaactaaagcaaaatgtgattaatcattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 9105275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 882 - 1159
Target Start/End: Original strand, 53353126 - 53353408
Alignment:
Q  882 aaactaacatcctcccttaattcaagtttctacttccttcatttcattcaagcttctgagtttgat-----gagcctgttaaccttcaatgccttagtga 976  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| |||||     || ||||| |||||||||||| || ||||    
T  53353126 aaactagcatcctctcttaatttaagtttccacttccttcatgccaatcaagcttctgagcttgatatgatgaacctgtcaaccttcaatgcttttgtga 53353225  T
Q  977 atatgtctacaagttgtagctcagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttgttcacttggtccctcagaaaatggaacttagcttctatatgctt 1076  Q
    |||||||| |||| || |||||||| |||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  53353226 atatgtctgcaagctgcagctcagtggagcaatggacaatctgcaatgcacctttgttcacttgctcccttagaaaatggaatttagcctttatatgctt 53353325  T
Q  1077 gcttctcccatgcataactggatttcttgctaagcttatagtagatttgttgtctatgaacaattctataggtctgctaacct 1159  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53353326 gcttctcccatgcagaactggatttattgctaagcttatagcatatttgttgtcgatgaacaatgctataggtctgctaacct 53353408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 685 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 43547935 - 43547722
Alignment:
Q  685 ttattgatgcttatgaaaatatacaaagaaggta-----tatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatt 779  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| || ||     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43547935 ttattgattctgatgaaaatatacaaaggagatagcttatatacaatgtcttgctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatt 43547836  T
Q  780 tgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaact-aaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcact-aaactaaatttgaatta 877  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  43547835 tgttaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaaacaaaatgtaattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaatta 43547736  T
Q  878 aaacaaactaacat 891  Q
    |||||| |||||||    
T  43547735 aaacaagctaacat 43547722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 685 - 890
Target Start/End: Complemental strand, 9697798 - 9697586
Alignment:
Q  685 ttattgatgcttatgaaaatatacaaagaagg-----tatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatt 779  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9697798 ttattgattctcatgaaaatatacaaaggaggcagcttatatacaatgtctagctaagtttcttgaagcacaagcaatgttacaaactctagatcttatt 9697699  T
Q  780 tgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaact-aaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcact-aaactaaatttgaatta 877  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  9697698 tgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaaacaaaatgtgattaatcactaattgtgattatcactaaaactaaacttgaatta 9697599  T
Q  878 aaacaaactaaca 890  Q
    |||||||||||||    
T  9697598 aaacaaactaaca 9697586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 717 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 21847284 - 21847107
Alignment:
Q  717 tatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataac 816  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21847284 tatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataac 21847185  T
Q  817 aaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcact-aaactaaatttgaatt-aaaacaaactaacatc 892  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21847184 aaactaaaacaaactgtgattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaaacaaactaacatc 21847107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 737 - 891
Target Start/End: Original strand, 54171924 - 54172082
Alignment:
Q  737 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaa-gtgt 833  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  54171924 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 54172023  T
Q  834 gattaatcactgattgtgattatcact-aaactaaatttgaattaaaacaaactaacat 891  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54172024 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 54172082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 718 - 814
Target Start/End: Complemental strand, 43554741 - 43554645
Alignment:
Q  718 atatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcata 814  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43554741 atatacaatgtcttactaagttgcttgaaacagaagcaatgtaataaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtaacaaacttcata 43554645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 737 - 890
Target Start/End: Original strand, 39399127 - 39399279
Alignment:
Q  737 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgat 836  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||  | ||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| || | || ||||||    
T  39399127 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatgtgat 39399225  T
Q  837 taatcactgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaactaaca 890  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39399226 taaccactaattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 39399279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 740 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 755981 - 755891
Alignment:
Q  740 gcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaga-tcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaa 829  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||   | ||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  755981 gcttgaagcacaagcaatgtaacaaaccctaaccttttattagttacactctaacaaacttgtaacaaacttcaaaacaaactaaaacaaa 755891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 595 - 645
Target Start/End: Original strand, 1253053 - 1253103
Alignment:
Q  595 cagaagcagtttctgattctagggtttatgtgaatttgtgatttgtgaatt 645  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1253053 cagaagcagtttcagattctagggtttatgtgaatttgtgatttgtgaatt 1253103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 737 - 844
Target Start/End: Original strand, 38175790 - 38175896
Alignment:
Q  737 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgat 836  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| |||||||  | ||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||| || ||||||    
T  38175790 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-atcttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaaactaaatgtgat 38175888  T
Q  837 taatcact 844  Q
    ||| ||||    
T  38175889 taaccact 38175896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 882 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 1299075 - 1299046
Alignment:
Q  882 aaactaacatcctcccttaattcaagtttc 911  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1299075 aaactaacatcctcccttaattcaagtttc 1299046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 717 - 1172
Target Start/End: Complemental strand, 8055565 - 8055110
Alignment:
Q  717 tatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataac 816  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  8055565 tatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgcaacaaacttcataac 8055466  T
Q  817 aaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttctactt 916  Q
    ||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8055465 aaactaaaatagaatgtgattaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccactt 8055366  T
Q  917 ccttcatttcattcaagcttctgagtttgatgagcctgttaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagttgtagctcagtagagcaatgaacaat 1016  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||| |||||||||||    
T  8055365 ccttcattccaatcaagcttctgagcttgatgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaaactgcagctcagtagaacaatgaacaat 8055266  T
Q  1017 ctgcagtgctcccttgttcacttggtccctcagaaaatggaacttagcttctatatgcttgcttctcccatgcataactggatttcttgctaagcttata 1116  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  8055265 ctgtagtgctcccttgttcacttgctccctcagaaaatgaaactttgcttctatatgcttgcttcttccatgtagaactggatttcttgctaagcttata 8055166  T
Q  1117 gtagatttgttgtctatgaacaattctataggtctgctaaccttgatgtccatctc 1172  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  8055165 gcagatttgttgtctatgagcaattctataggtctgctaacctctatctccatctc 8055110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 737 - 1172
Target Start/End: Complemental strand, 36675208 - 36674769
Alignment:
Q  737 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagt-gt 833  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  36675208 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 36675109  T
Q  834 gattaatcactgattgtgattatcact-aaactaaatttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttctacttccttcatttcattcaa 932  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  36675108 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccgtaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 36675009  T
Q  933 gcttctgagtttgatgagcctgttaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagttgtagctcagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttg 1032  Q
    ||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  36675008 gcttctgagcttgatgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgaagtgctcccttg 36674909  T
Q  1033 ttcacttggtccctcagaaaatggaacttagcttctatatgcttgcttctcccatgcataactggatttcttgctaagcttatagtagatttgttgtcta 1132  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36674908 ttcacttgctccctcagaaaatggaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtcta 36674809  T
Q  1133 tgaacaattctataggtctgctaaccttgatgtccatctc 1172  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  36674808 tgagcaattctataggtctgctaacctctatctccatctc 36674769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 737 - 1172
Target Start/End: Original strand, 35950443 - 35950877
Alignment:
Q  737 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgat 836  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | ||||   | ||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| || | || ||||||    
T  35950443 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttacgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaacctaaatgtgat 35950541  T
Q  837 taatcactgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttctacttccttcatttcattcaagctt 936  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  35950542 taaccactaattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagctt 35950641  T
Q  937 ctgagtttgatgagcctgttaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagttgtagctcagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttgttca 1036  Q
    || || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35950642 ctaagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgtagctcagtggagcaatgaacaatctgcagtgctcccttgttca 35950741  T
Q  1037 cttggtccctcagaaaatggaacttagcttctatatgcttgcttctcccatgcataactggatttcttgctaagcttatagtagatttgttgtctatgaa 1136  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35950742 cttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcataactggatttattgctaagcttatagcagatttgttgtctatgaa 35950841  T
Q  1137 caattctataggtctgctaaccttgatgtccatctc 1172  Q
    ||||| |||||||||||||||||  || ||||||||    
T  35950842 caattatataggtctgctaacctctatctccatctc 35950877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 670 - 890
Target Start/End: Original strand, 12999393 - 12999622
Alignment:
Q  670 gttatgatgaaattgttattgatgcttatg---aaaatatacaaagaaggta-----tatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaa 761  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||    ||||||||||||| || ||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12999393 gttatgatgaaattgtaattgattcttatttttaaaatatacaaaggagatagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagtaatgtaa 12999492  T
Q  762 caaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcact- 860  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  12999493 caaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattgttattatcacta 12999592  T
Q  861 aaactaaatttgaattaaaacaaactaaca 890  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  12999593 aaactaaacttaaattaaaacaaactaaca 12999622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 717 - 890
Target Start/End: Complemental strand, 8051012 - 8050839
Alignment:
Q  717 tatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataac 816  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8051012 tatatacaatatctagctaggttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataac 8050913  T
Q  817 aaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaactaaca 890  Q
    ||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8050912 aaactaaaatagaatgtgattaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 8050839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 737 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 36670660 - 36670502
Alignment:
Q  737 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaa-gtgt 833  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  36670660 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 36670561  T
Q  834 gattaatcactgattgtgattatcact-aaactaaatttgaattaaaacaaactaacat 891  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36670560 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 36670502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 717 - 890
Target Start/End: Original strand, 6463422 - 6463583
Alignment:
Q  717 tatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataac 816  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||            |||    
T  6463422 tatatacaatatctagctaggttgcttgaagcacaaataatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgt------------aac 6463509  T
Q  817 aaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaactaaca 890  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  6463510 aaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaagacaaactaaca 6463583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 728 - 890
Target Start/End: Original strand, 13270980 - 13271131
Alignment:
Q  728 tctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaaca 827  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||            |||||||||||||| |    
T  13270980 tctagctaagttgcttgaagcaaaaacaatgtaacaaactttagatcttatttactaacctctaacaaactt------------ataacaaactaaaata 13271067  T
Q  828 aagtgtgattaatcactgattgtgattatcact-aaactaaatttgaattaaaacaaactaaca 890  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13271068 aagtgtaattaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 13271131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 737 - 890
Target Start/End: Complemental strand, 41093976 - 41093824
Alignment:
Q  737 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgat 836  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||  | ||| ||||||| || |||| ||||| ||||||||||||| || | || | ||||    
T  41093976 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaatttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatatgat 41093878  T
Q  837 taatcactgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaactaaca 890  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41093877 taatcactaattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaaccaaca 41093824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 790 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 29768041 - 29767953
Alignment:
Q  790 taacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattg-tgattatcactaaactaaatttgaatta 877  Q
    |||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| | | |  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29768041 taaccaacttgtaacaaactttaaaacaaactaaaacaaagtgtgatcaatcaattaatcatgattatcactaaactaaacttgaatta 29767953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 737 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 34590366 - 34590280
Alignment:
Q  737 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaa 825  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||| |||  ||| || || ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  34590366 gttgcttaaagcacaagctatataacaaaccctaactct-atatgctaatctctaacaaacttgtaacaaa-ttcataacaaactaaaa 34590280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 616 - 645
Target Start/End: Original strand, 42515218 - 42515247
Alignment:
Q  616 gggtttatgtgaatttgtgatttgtgaatt 645  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42515218 gggtttatgtgaatttgtgatttgtgaatt 42515247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 18)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 717 - 1172
Target Start/End: Original strand, 8315487 - 8315943
Alignment:
Q  717 tatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataac 816  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8315487 tatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataac 8315586  T
Q  817 aaactaaaacaaagt-gtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttctact 915  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8315587 aaactaaaacaaacttgtgattaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccact 8315686  T
Q  916 tccttcatttcattcaagcttctgagtttgatgagcctgttaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagttgtagctcagtagagcaatgaacaa 1015  Q
    ||||||||| || |||| |||||||| |||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||| ||||||||||    
T  8315687 tccttcattccaatcaaacttctgagcttgatgaatctgtcaacctttaatgccttagtgaatatgtctgcaagcttcagctcagtagatcaatgaacaa 8315786  T
Q  1016 tctgcagtgctcccttgttcacttggtccctcagaaaatggaacttagcttctatatgcttgcttctcccatgcataactggatttcttgctaagcttat 1115  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  8315787 tctgtagtgctcccttgttcacttgctccctcagaaaatgaaactttgcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaaacttat 8315886  T
Q  1116 agtagatttgttgtctatgaacaattctataggtctgctaaccttgatgtccatctc 1172  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  8315887 agcagatttgttgtctatgagcaattctataggtctgctaacctctatctccatctc 8315943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 669 - 1172
Target Start/End: Original strand, 17886779 - 17887284
Alignment:
Q  669 agttatgatgaaattgttattgatgcttatgaaaatatacaaagaaggta-----tatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaaca 763  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||| |||||     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17886779 agttatgatgaaattgctatttattcttatgaaaaaatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagctgcttgaagcacaagcaatgtaaca 17886878  T
Q  764 aactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaa 863  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||       |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17886879 aactctagatcttatttgctaacctctaacaaacttt------actttataacaaactaaaacaaaatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaa 17886972  T
Q  864 -ctaaatttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttctac--ttccttcatttcattcaagcttctgagtttgatgagcctgttaacc 960  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| || ||||||||||||| |||||||  |||| ||||    
T  17886973 actaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacacttccttcattccaatcaagcttctgagcttgatgaatctgtcaacc 17887072  T
Q  961 ttcaatgccttagtgaatatgtctacaagttgtagctcagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttgttcacttggtccctcagaaaatggaact 1060  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  17887073 ttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttgtttacttgctccctcagaaaatggaagt 17887172  T
Q  1061 tagcttctatatgcttgcttctcccatgcataactggatttcttgctaagcttatagtagatttgttgtctatgaacaattctataggtctgctaacctt 1160  Q
    ||||||||| ||| || ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17887173 tagcttctacatgtttacttcttccatgcagaactagatttcttgctaagcttatagctgatttgttgtctatgaacaattctataggtctgctaacctc 17887272  T
Q  1161 gatgtccatctc 1172  Q
     || ||||||||    
T  17887273 tatctccatctc 17887284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 717 - 1076
Target Start/End: Original strand, 27552094 - 27552453
Alignment:
Q  717 tatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataac 816  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  27552094 tatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacgtttaacaaacctgtaacaaacttcataac 27552193  T
Q  817 aaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttctactt 916  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27552194 aaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccactt 27552293  T
Q  917 ccttcatttcattcaagcttctgagtttgatgagcctgttaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagttgtagctcagtagagcaatgaacaat 1016  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27552294 ccttcattccaatcaagcttctgagcttgatgaatatgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagagcaatgaacaat 27552393  T
Q  1017 ctgcagtgctcccttgttcacttggtccctcagaaaatggaacttagcttctatatgctt 1076  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27552394 ctgcagtgctcccttgtttacttgctcccttagaaaatgaaacttggcttctatatgctt 27552453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 562 - 890
Target Start/End: Original strand, 14531610 - 14531945
Alignment:
Q  562 tagcgcagcacttgatgcttgttacacaagcaacagaagcagtttc-tgattctagggtttatgtgaatttgtgatttgtgaattnnnnnnnnnnnnnnn 660  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   
T  14531610 tagcgcagcaattgatgcttgtttcacaagcaacagaagcaattttatgattctagggtttatgtgaatttgtgatttgtgaattagagagaattgaaag 14531709  T
Q  661 nnnnnnnnagttatgatgaaattgttattgatgcttatgaaaatatacaaagaaggta-----tatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagca 755  Q
            |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14531710 aagagagaagttatgatgaaattgttattgattctaatgaaaatatacaaaggtggtagagtatatacaatgtctagctaagttgcttcaagcacaagca 14531809  T
Q  756 atgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgatta 855  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  14531810 atgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaacaaacctgtaacaaacttcataacgaactaaaacaaaatgtgattaatcattgattgtgatta 14531909  T
Q  856 tcact-aaactaaatttgaattaaaacaaactaaca 890  Q
    | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14531910 taactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 14531945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 669 - 890
Target Start/End: Original strand, 17895654 - 17895881
Alignment:
Q  669 agttatgatgaaattgttattgatgcttatgaaaatatacaaagaaggta-----tatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaaca 763  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17895654 agttatgatgaaattgttatttattcttatgaaaaaatacaaaggaggtagcttatatacaatgcctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaaca 17895753  T
Q  764 aactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcact-aa 862  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17895754 aattctagatcttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcagaacaaactaaaataaaatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaa 17895853  T
Q  863 actaaatttgaattaaaacaaactaaca 890  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  17895854 actaaacttgaattaaaacaaactaaca 17895881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 717 - 890
Target Start/End: Original strand, 17096258 - 17096431
Alignment:
Q  717 tatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataac 816  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17096258 tatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactatagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataac 17096357  T
Q  817 aaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaactaaca 890  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17096358 aaactaaaacaaaatgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 17096431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 717 - 890
Target Start/End: Original strand, 8320026 - 8320199
Alignment:
Q  717 tatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataac 816  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8320026 tatatacaatatctagctaagtttcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataac 8320125  T
Q  817 aaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaactaaca 890  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8320126 aaactaaaacatattgtgattaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 8320199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 788 - 1082
Target Start/End: Complemental strand, 17163730 - 17163433
Alignment:
Q  788 tctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgattaatca-ctgattgtgattatcactaaactaaatttgaatta--aaacaaa 884  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||   ||| |||||||| ||||| ||||||||  ||  |||    
T  17163730 tctaaccaacttgtaacaaacttcaaaacaaactaaaacaaagtgtgatcaatcaactaatcacgatcatcactaatctaaacttgaattatcaactaaa 17163631  T
Q  885 ctaacatcctcccttaattcaagtttctacttccttcatttcattcaagcttctgagtttgatgagcctgttaaccttcaatgccttagtgaatatgtct 984  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17163630 ctaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcataccaatcaagcttctgagcttgatgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtct 17163531  T
Q  985 acaagttgtagctcagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttgttcacttggtccctcagaaaatggaacttagcttctatatgcttgcttct 1082  Q
     ||||  | |||||||| |||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||    
T  17163530 gcaagaagcagctcagtggagcaatggacaatctgcaatgcacctttgttcactttctccctcagaaaatggaactttgcctctacgtgtttgcttct 17163433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 717 - 890
Target Start/End: Complemental strand, 17780088 - 17779914
Alignment:
Q  717 tatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataac 816  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  17780088 tatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaaatcttatctactagcctctaacaaacttttaacaaacttcataac 17779989  T
Q  817 aaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaatttgaatt-aaaacaaactaaca 890  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  17779988 aaactaaaacaaaatgtgattaatctctgattgtgattatcactaaactaaacttgaattcaaaacaaactaaca 17779914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 717 - 891
Target Start/End: Original strand, 27574722 - 27574885
Alignment:
Q  717 tatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataac 816  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||           ||||||||||    
T  27574722 tatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactttagatcttatctgctaacctctaacaa-----------acttcataac 27574810  T
Q  817 aaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaactaacat 891  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27574811 aaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 27574885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1074 - 1172
Target Start/End: Original strand, 27568524 - 27568622
Alignment:
Q  1074 cttgcttctcccatgcataactggatttcttgctaagcttatagtagatttgttgtctatgaacaattctataggtctgctaaccttgatgtccatctc 1172  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  27568524 cttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatgagcaattctataggtctgctaacctctatctccatctc 27568622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 986 - 1129
Target Start/End: Complemental strand, 3596476 - 3596333
Alignment:
Q  986 caagttgtagctcagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttgttcacttggtccctcagaaaatggaacttagcttctatatgcttgcttctccc 1085  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||  |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| || || ||    
T  3596476 caagttgcagctcagtagaacaatggacaatcttcaatgcttgcttgtttacttgttccctaagaaagtgaaacttagcttcaatgtgcttcctccttcc 3596377  T
Q  1086 atgcataactggatttcttgctaagcttatagtagatttgttgt 1129  Q
    ||||| |||||||||  || ||||| ||||||  ||||||||||    
T  3596376 atgcaaaactggattctttactaagtttatagccgatttgttgt 3596333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 788 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 17159700 - 17159610
Alignment:
Q  788 tctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgattaatc-actgattgtgattatcactaaactaaatttgaatta 877  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||  ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  17159700 tctaaccaacttgtaacaaacgtcaaaacaaactaaaacaaagtatgatcaatcaactaatcatgattatcactaatctaaacttgaatta 17159610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 787 - 878
Target Start/End: Original strand, 7888212 - 7888305
Alignment:
Q  787 ctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaa-caaagtgtgattaatca-ctgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaa 878  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |   |||||||||||||  |||| |||||||||    
T  7888212 ctctaacaaagttgtaacaaacttcaaaacaaactaaaatcaaagtgtgattaatcaactaaacatgattatcactaatgtaaacttgaattaa 7888305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 737 - 852
Target Start/End: Original strand, 6440865 - 6440979
Alignment:
Q  737 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgat 836  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||  | ||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| || | || ||||||    
T  6440865 gttgcttgaagtacaagctaagtaacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatgtgat 6440963  T
Q  837 taatcactgattgtga 852  Q
    ||| |||| |||||||    
T  6440964 taaccactaattgtga 6440979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 595 - 630
Target Start/End: Original strand, 17886718 - 17886753
Alignment:
Q  595 cagaagcagtttctgattctagggtttatgtgaatt 630  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17886718 cagaagcagttactgattctagggtttatgtgaatt 17886753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 595 - 630
Target Start/End: Original strand, 17895593 - 17895628
Alignment:
Q  595 cagaagcagtttctgattctagggtttatgtgaatt 630  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17895593 cagaagcagttactgattctagggtttatgtgaatt 17895628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 883 - 916
Target Start/End: Complemental strand, 3597625 - 3597592
Alignment:
Q  883 aactaacatcctcccttaattcaagtttctactt 916  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3597625 aactaacatcctcccttaattcaagtttcaactt 3597592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 307; Significance: 1e-172; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 737 - 1172
Target Start/End: Original strand, 43807485 - 43807922
Alignment:
Q  737 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtg 834  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  43807485 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacagaatgtg 43807584  T
Q  835 attaatcactgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttctacttccttcatttcattcaagc 934  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  43807585 attaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaagctaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagc 43807684  T
Q  935 ttctgagtttgatgagcctgttaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagttgtagctcagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttgtt 1034  Q
    ||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43807685 ttctgagcttgatgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgaagtgctcccttgtt 43807784  T
Q  1035 cacttggtccctcagaaaatggaacttagcttctatatgcttgcttctcccatgcataactggatttcttgctaagcttatagtagatttgttgtctatg 1134  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43807785 cacttgctccctcagaaaatggaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctatg 43807884  T
Q  1135 aacaattctataggtctgctaaccttgatgtccatctc 1172  Q
    | |||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  43807885 agcaattctataggtctgctaacctctatctccatctc 43807922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 737 - 1172
Target Start/End: Original strand, 197684 - 198123
Alignment:
Q  737 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagt-gt 833  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  197684 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 197783  T
Q  834 gattaatcactgattgtgattatcactaaa-ctaaatttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttctacttccttcatttcattcaa 932  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  197784 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 197883  T
Q  933 gcttctgagtttgatgagcctgttaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagttgtagctcagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttg 1032  Q
     |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  197884 acttctgagcttgatgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttg 197983  T
Q  1033 ttcacttggtccctcagaaaatggaacttagcttctatatgcttgcttctcccatgcataactggatttcttgctaagcttatagtagatttgttgtcta 1132  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  197984 ttcacttgctccctcagaaaatgaaactttgcttctatgtgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtcta 198083  T
Q  1133 tgaacaattctataggtctgctaaccttgatgtccatctc 1172  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  198084 tgagcaattctataggtctgctaacctctatctccatctc 198123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 737 - 1172
Target Start/End: Original strand, 312521 - 312960
Alignment:
Q  737 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagt-gt 833  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  312521 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 312620  T
Q  834 gattaatcactgattgtgattatcactaaa-ctaaatttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttctacttccttcatttcattcaa 932  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  312621 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 312720  T
Q  933 gcttctgagtttgatgagcctgttaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagttgtagctcagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttg 1032  Q
     |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  312721 acttctgagcttgatgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttg 312820  T
Q  1033 ttcacttggtccctcagaaaatggaacttagcttctatatgcttgcttctcccatgcataactggatttcttgctaagcttatagtagatttgttgtcta 1132  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  312821 ttcacttgctccctcagaaaatgaaactttgcttctatgtgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtcta 312920  T
Q  1133 tgaacaattctataggtctgctaaccttgatgtccatctc 1172  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  312921 tgagcaattctataggtctgctaacctctatctccatctc 312960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 717 - 1172
Target Start/End: Original strand, 30405804 - 30406242
Alignment:
Q  717 tatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataac 816  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30405804 tatatacaatatctagctaggttgcttgaagtacaagcaatgtaacaaattctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataac 30405903  T
Q  817 aaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttctactt 916  Q
    |||||||||||                 || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30405904 aaactaaaaca-----------------gaatgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccactt 30405986  T
Q  917 ccttcatttcattcaagcttctgagtttgatgagcctgttaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagttgtagctcagtagagcaatgaacaat 1016  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  30405987 ccttcattccaatcaagcttctgagcttgatgaatctgtcaatcttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagaacaatgaacaat 30406086  T
Q  1017 ctgcagtgctcccttgttcacttggtccctcagaaaatggaacttagcttctatatgcttgcttctcccatgcataactggatttcttgctaagcttata 1116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30406087 ctgcagtgctcccttgttcacttgttcccttagaaaatggaactttgcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttata 30406186  T
Q  1117 gtagatttgttgtctatgaacaattctataggtctgctaaccttgatgtccatctc 1172  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  30406187 gcagatttgttgtctatgagcaattctataggtctgctaacctctatctccatctc 30406242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 790 - 1172
Target Start/End: Complemental strand, 41949902 - 41949528
Alignment:
Q  790 taacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaactaac 889  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  41949902 taaccaacttgtaacaaacttcaaaacaaactaaaacagagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaagcttgaattaaaagaaactaac 41949803  T
Q  890 atcctcccttaattcaagtttctacttccttcatttcattcaagcttctgagtttgatgagcctgttaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaag 989  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41949802 atcctcccttaattcaagtttccacttccttcattcaaatcaagcttctgagcttgatgaaactgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaag 41949703  T
Q  990 ttgtagctcagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttgttcacttggtccctcagaaaatggaacttagcttctatatgcttgcttctcccatgc 1089  Q
     || |||||||||||||||||||||||||| ||        |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  41949702 ctgcagctcagtagagcaatgaacaatctgtag--------tgttcacttgctccctcaaaaaatggaacttagcttatatgtgcttgcttctcccatac 41949611  T
Q  1090 ataactggatttcttgctaagcttatagtagatttgttgtctatgaacaattctataggtctgctaaccttgatgtccatctc 1172  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  41949610 aaaattggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtccatgaacaattctataggtctgctaacctctatctccatctc 41949528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 877 - 1157
Target Start/End: Complemental strand, 1291337 - 1291057
Alignment:
Q  877 aaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttctacttccttcatttcattcaagcttctgagtttgatgagcctgttaaccttcaatgccttagtga 976  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| || |||||||    
T  1291337 aaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagcttctgagtttgatgaatctgtcaaccttcaaagctttagtga 1291238  T
Q  977 atatgtctacaagttgtagctcagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttgttcacttggtccctcagaaaatggaacttagcttctatatgctt 1076  Q
    |||| ||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1291237 atatatctgcaagctgatgctcagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttgttcacttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgctt 1291138  T
Q  1077 gcttctcccatgcataactggatttcttgctaagcttatagtagatttgttgtctatgaacaattctataggtctgctaac 1157  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  1291137 gcttctcccaagcagaactggatttcttgccaagcttatagtagatttgttgtctatgaacaatattataggtctgttaac 1291057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 669 - 890
Target Start/End: Complemental strand, 33072144 - 33071918
Alignment:
Q  669 agttatgatgaaattgttattgatgcttatgaaaatatacaaagaaggta-----tatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaaca 763  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33072144 agttatgatgaaattgttattgatgctaatgaaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaaca 33072045  T
Q  764 aactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaa 863  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33072044 aactctagatcttatttgctaacctccaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaagaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaa 33071945  T
Q  864 ctaaatttgaattaaaacaaactaaca 890  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  33071944 ctaaacttgaattaaaacaaactaaca 33071918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 694 - 890
Target Start/End: Original strand, 42234650 - 42234851
Alignment:
Q  694 cttatgaaaatatacaaagaaggta-----tatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacct 788  Q
    |||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42234650 cttatgaaaatatacaaagaaggtagtttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacct 42234749  T
Q  789 ctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaactaa 888  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42234750 ctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaa 42234849  T
Q  889 ca 890  Q
    ||    
T  42234850 ca 42234851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 902 - 1157
Target Start/End: Original strand, 31473324 - 31473579
Alignment:
Q  902 ttcaagtttctacttccttcatttcattcaagcttctgagtttgatgagcctgttaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagttgtagctcagt 1001  Q
    |||||||||| |||||||||||  || |||| ||||| || ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  31473324 ttcaagtttccacttccttcatggcagtcaaacttcttagcttgatgaacctgtcaaccttcaataccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagt 31473423  T
Q  1002 agagcaatgaacaatctgcagtgctcccttgttcacttggtccctcagaaaatggaacttagcttctatatgcttgcttctcccatgcataactggattt 1101  Q
     |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||    
T  31473424 ggagcaatggacaatctgcagttctcccttgttcacttgctccctcagaaaatggaacttagcttctatatgcttgcttcttccatgaagaattggattt 31473523  T
Q  1102 cttgctaagcttatagtagatttgttgtctatgaacaattctataggtctgctaac 1157  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  31473524 cttgctaagcttatagaagatttgttatctatgaacaatgcaataggtctgctaac 31473579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 717 - 890
Target Start/End: Complemental strand, 28644735 - 28644562
Alignment:
Q  717 tatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataac 816  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28644735 tatatacactgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataac 28644636  T
Q  817 aaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaactaaca 890  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28644635 aaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 28644562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 717 - 890
Target Start/End: Original strand, 30410313 - 30410486
Alignment:
Q  717 tatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataac 816  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30410313 tatatacaatatctagctaggttgcttgaagtacaagcaatgtaacaaaatctagatcttatctactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataac 30410412  T
Q  817 aaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaactaaca 890  Q
    ||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30410413 aaattaaaacagaatgtgattaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 30410486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 810 - 1154
Target Start/End: Original strand, 27435261 - 27435602
Alignment:
Q  810 tcataacaaactaaaacaa-agtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagt 908  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| | || ||||||||||||  |||| | |||||||     |||||  ||||| ||||||||||||    
T  27435261 tcataacaaactaaaacaataatgtgattaaccactaagtgagattatcactaag-taaactagaattaact---actaaattcctctcttaattcaagt 27435356  T
Q  909 ttctacttccttcatttcattcaagcttctgagtttgatgagcctgttaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagttgtagctcagtagagcaa 1008  Q
    ||  ||||| |||||  || |||| ||  | || ||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||| ||| |||| || |||| |||  | |||    
T  27435357 tttcacttctttcatgccaatcaaactctttagcttgatgaacctgtcatccttcaatggcttagtgaatatttctgcaagctgcagcttagtgaaacaa 27435456  T
Q  1009 tgaacaatctgcagtgctcccttgttcacttggtccctcagaaaatggaacttagcttctatatgcttgcttctcccatgcataactggatttcttgcta 1108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  27435457 tgaacaatctgcaatgctcccttgttcacttgctccctcagaaaatggaacttagcctctatgtgtttgcttcttccaagcaaaactggatttcttgcta 27435556  T
Q  1109 agcttatagtagatttgttgtctatgaacaattctataggtctgct 1154  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| ||||||||  ||| ||||||||    
T  27435557 agcttatagcagatctgttatctttgaacaatgttattggtctgct 27435602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 737 - 890
Target Start/End: Original strand, 43812044 - 43812199
Alignment:
Q  737 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtg 834  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  43812044 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacagaatgtg 43812143  T
Q  835 attaatcactgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaactaaca 890  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43812144 attaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaagctaaca 43812199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 737 - 891
Target Start/End: Original strand, 202202 - 202360
Alignment:
Q  737 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaa-gtgt 833  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  202202 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 202301  T
Q  834 gattaatcactgattgtgattatcact-aaactaaatttgaattaaaacaaactaacat 891  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  202302 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 202360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 737 - 891
Target Start/End: Original strand, 317039 - 317197
Alignment:
Q  737 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaa-gtgt 833  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  317039 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 317138  T
Q  834 gattaatcactgattgtgattatcact-aaactaaatttgaattaaaacaaactaacat 891  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  317139 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacat 317197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 717 - 890
Target Start/End: Complemental strand, 38757164 - 38757003
Alignment:
Q  717 tatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataac 816  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||            |||    
T  38757164 tatatacaatatctggctaggttgcttgaatcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactaacctctaacaaacttgt------------aac 38757077  T
Q  817 aaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaactaaca 890  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38757076 aaactaaaacagaatgtgattaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 38757003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 813 - 890
Target Start/End: Complemental strand, 41945416 - 41945339
Alignment:
Q  813 taacaaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaactaaca 890  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41945416 taacaaactaaaacaaagtgtgattaatcattgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 41945339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 883 - 1097
Target Start/End: Original strand, 17782356 - 17782570
Alignment:
Q  883 aactaacatcctcccttaattcaagtttctacttccttcatttcattcaagcttctgagtttgatgagcctgttaaccttcaatgccttagtgaatatgt 982  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||  || |||||||||| || ||||||| ||||| ||  ||||  |  ||| |||| |  |    
T  17782356 aactaacatcctcccttaattcaagtttccactttcaccataccaatcaagcttcttagcttgatgaacctgtcaaatttcagaggtttaatgaacaaat 17782455  T
Q  983 ctacaagttgtagctcagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttgttcacttggtccctcagaaaatggaacttagcttctatatgcttgcttct 1082  Q
    ||||||  || || |||||||| ||||| ||||||| || |||| ||||||| ||||| || || ||||||| ||  || ||||| || || ||||||||    
T  17782456 ctacaatctgcagttcagtagaacaatggacaatcttcaatgcttccttgtttacttgttctctaagaaaatcgattttggcttcaatgtgtttgcttct 17782555  T
Q  1083 cccatgcataactgg 1097  Q
     ||||||| ||||||    
T  17782556 tccatgcaaaactgg 17782570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 595 - 630
Target Start/End: Original strand, 30405678 - 30405713
Alignment:
Q  595 cagaagcagtttctgattctagggtttatgtgaatt 630  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30405678 cagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 30405713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 595 - 630
Target Start/End: Original strand, 30410187 - 30410222
Alignment:
Q  595 cagaagcagtttctgattctagggtttatgtgaatt 630  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30410187 cagaagcagtttctgattctaaggtttatgtgaatt 30410222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 453 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 2474968 - 2474903
Alignment:
Q  453 gctttgtttgggagtttagagaggaggggaagactttggcaaaaagaaagtagtaagtagaagaaa 518  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||  |||||| ||| ||||||| |||||||    
T  2474968 gctttgtttgggagtttggaggggaggggaggattttgaaaaaaaggaaggagtaagtggaagaaa 2474903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 717 - 766
Target Start/End: Original strand, 27435174 - 27435223
Alignment:
Q  717 tatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaac 766  Q
    |||||||||| ||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27435174 tatatacaatatctacttaggttgcttgaagcacaagctatgtaacaaac 27435223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 23)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 737 - 1172
Target Start/End: Original strand, 7099374 - 7099813
Alignment:
Q  737 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagt-gt 833  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  7099374 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 7099473  T
Q  834 gattaatcactgattgtgattatcact-aaactaaatttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttctacttccttcatttcattcaa 932  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  7099474 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 7099573  T
Q  933 gcttctgagtttgatgagcctgttaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagttgtagctcagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttg 1032  Q
    ||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  7099574 gcttctgagcttgatgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgaagtgctcccttg 7099673  T
Q  1033 ttcacttggtccctcagaaaatggaacttagcttctatatgcttgcttctcccatgcataactggatttcttgctaagcttatagtagatttgttgtcta 1132  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7099674 ttcacttgctccctcagaaaatggaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtcta 7099773  T
Q  1133 tgaacaattctataggtctgctaaccttgatgtccatctc 1172  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  7099774 tgagcaattctataggtctgctaacctctatctccatctc 7099813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 737 - 1172
Target Start/End: Complemental strand, 16798826 - 16798387
Alignment:
Q  737 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagt-gt 833  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  16798826 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 16798727  T
Q  834 gattaatcactgattgtgattatcact-aaactaaatttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttctacttccttcatttcattcaa 932  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  16798726 gattaaccacttattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 16798627  T
Q  933 gcttctgagtttgatgagcctgttaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagttgtagctcagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttg 1032  Q
    ||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  16798626 gcttctgagcttgatgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgaagtgctcccttg 16798527  T
Q  1033 ttcacttggtccctcagaaaatggaacttagcttctatatgcttgcttctcccatgcataactggatttcttgctaagcttatagtagatttgttgtcta 1132  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16798526 ttcacttgctccctcagaaaatggaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtcta 16798427  T
Q  1133 tgaacaattctataggtctgctaaccttgatgtccatctc 1172  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  16798426 tgagcaattctataggtctgctaacctctatctccatctc 16798387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 737 - 1172
Target Start/End: Complemental strand, 12023446 - 12023007
Alignment:
Q  737 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagt-gt 833  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  12023446 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 12023347  T
Q  834 gattaatcactgattgtgattatcactaaa-ctaaatttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttctacttccttcatttcattcaa 932  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  12023346 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 12023247  T
Q  933 gcttctgagtttgatgagcctgttaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagttgtagctcagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttg 1032  Q
    ||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  12023246 gcttctgagcttgatgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttg 12023147  T
Q  1033 ttcacttggtccctcagaaaatggaacttagcttctatatgcttgcttctcccatgcataactggatttcttgctaagcttatagtagatttgttgtcta 1132  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12023146 ttcacttgctccctcagaaaatgaaactttgcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtcta 12023047  T
Q  1133 tgaacaattctataggtctgctaaccttgatgtccatctc 1172  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  12023046 tgagtaattctataggtctgctaacctctatctccatctc 12023007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 717 - 1172
Target Start/End: Original strand, 40367595 - 40368039
Alignment:
Q  717 tatatacaatgtctagctaagtt-gcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataa 815  Q
    |||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||            ||    
T  40367595 tatatacaatatctaaccaagtttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatctactagcctctaacaaacttgt------------aa 40367682  T
Q  816 caaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttctact 915  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40367683 caaactaaaacaaaatgtgattaatctctgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccact 40367782  T
Q  916 tccttcatttcattcaagcttctgagtttgatgagcctgttaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagttgtagctcagtagagcaatgaacaa 1015  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||    
T  40367783 tccttcattccaatcaagcttctgagcttgatgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagcttagtagagcaatgaacaa 40367882  T
Q  1016 tctgcagtgctcccttgttcacttggtccctcagaaaatggaacttagcttctatatgcttgcttctcccatgcataactggatttcttgctaagcttat 1115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40367883 tctgcagtgctcccttgttcacttgctcccttagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttat 40367982  T
Q  1116 agtagatttgttgtctatgaacaattctataggtctgctaaccttgatgtccatctc 1172  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  40367983 agcagatttgttgtctatgagcaattctataggtctgctaacctctatctccatctc 40368039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 787 - 1172
Target Start/End: Complemental strand, 10277307 - 10276922
Alignment:
Q  787 ctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaact 886  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| || | || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10277307 ctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatgtgattaaccactaattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaact 10277208  T
Q  887 aacatcctcccttaattcaagtttctacttccttcatttcattcaagcttctgagtttgatgagcctgttaaccttcaatgccttagtgaatatgtctac 986  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  10277207 aacatcctctcttaattcgagtttccacttccttcattccaatcaagcttctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtccgc 10277108  T
Q  987 aagttgtagctcagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttgttcacttggtccctcagaaaatggaacttagcttctatatgcttgcttctccca 1086  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  10277107 aagctgtagctcagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttgttcacttgctccctcagaaaatgaaacttggcttctatatgcttgcttcttcca 10277008  T
Q  1087 tgcataactggatttcttgctaagcttatagtagatttgttgtctatgaacaattctataggtctgctaaccttgatgtccatctc 1172  Q
    |||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||    
T  10277007 tgcagaattggatttcttactaagcttatagcagatttgttgtatatgaacaattatataggtctgctaacctctatctccatctc 10276922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 737 - 1172
Target Start/End: Complemental strand, 37682182 - 37681754
Alignment:
Q  737 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagt-gt 833  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| |||||||||||||||||           ||||||||||||||||||| | ||    
T  37682182 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaactt-----------cataacaaactaaaacaaacttgt 37682094  T
Q  834 gattaatcactgattgtgattatcactaaa-ctaaatttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttctacttccttcatttcattcaa 932  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  37682093 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 37681994  T
Q  933 gcttctgagtttgatgagcctgttaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagttgtagctcagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttg 1032  Q
    ||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  37681993 gcttctgagcttgatgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttg 37681894  T
Q  1033 ttcacttggtccctcagaaaatggaacttagcttctatatgcttgcttctcccatgcataactggatttcttgctaagcttatagtagatttgttgtcta 1132  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  37681893 ttcatttgctccctcagaaaatgaaactttgcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcaaatttgttgtcta 37681794  T
Q  1133 tgaacaattctataggtctgctaaccttgatgtccatctc 1172  Q
    |||  |||||||||||||| |||||||  || ||||||||    
T  37681793 tgagtaattctataggtctactaacctctatctccatctc 37681754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 686 - 1037
Target Start/End: Original strand, 26336753 - 26337111
Alignment:
Q  686 tattgatgcttatgaaaatatacaaagaaggta-----tatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttattt 780  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| |||||     |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26336753 tattgattctaatgaaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagttaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaactctagatcttattt 26336852  T
Q  781 gttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaa-caaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaact-aaatttgaattaa 878  Q
    | ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  26336853 gctaacctctaacaaacatgtaacaaacatcataacaaactaaaaacaaaatgtgattaatcaccgattgtgattatcactaaaattaaacttgaattaa 26336952  T
Q  879 aacaaactaacatcctcccttaattcaagtttctacttccttcatttcattcaagcttctgagtttgatgagcctgttaaccttcaatgccttagtgaat 978  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26336953 aacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaagcttctgagcttgatgaacctgtcaaccttcaatgccttagtgaat 26337052  T
Q  979 atgtctacaagttgtagctcagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttgttcac 1037  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26337053 atgtctacaagctgcagctcagtagagcaatgaaaaatctgcagtgctcccttgttcac 26337111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 562 - 890
Target Start/End: Complemental strand, 36632636 - 36632314
Alignment:
Q  562 tagcgcagcacttgatgcttgttacacaagcaacagaagcag-tttctgattctagggtttatgtgaatttgtgatttgtgaattnnnnnnnnnnnnnnn 660  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   
T  36632636 tagcgcatcaattgatgcttgttacacaagcaacagaagcagatttatgattctagggtttatgtgaatttgtgatttgtgaattagagagaattgagag 36632537  T
Q  661 nnnnnnnnagttatgatgaaattgttattgatgcttatgaaaatatacaaagaaggta-----tatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagca 755  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36632536 aagagagaagttatgatgaaattgttattgatgcttatgaaaatatacaaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagca 36632437  T
Q  756 atgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgatta 855  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36632436 atgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaacaaacttg------------taacaaactaaaacaaagtgtgattattcactgattgtgatta 36632349  T
Q  856 tcactaaactaaatttgaattaaaacaaactaaca 890  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36632348 tcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 36632314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 557 - 890
Target Start/End: Original strand, 32485803 - 32486143
Alignment:
Q  557 tatgttagcgcagcacttgatgcttgttacacaagcaacagaagcagtttct-gattctagggtttatgtgaatttgtgatttgtgaattnnnnnnnnnn 655  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||              
T  32485803 tatgatagcgcagcaattgatgcttgttacacaagcaacagaagcagttttacgattctagggtttatgtgaatttgtgatttttgaattagagagaatt 32485902  T
Q  656 nnnnnnnnnnnnnagttatgatgaaattgttattgatgcttatgaaaatatacaaagaaggta-----tatacaatgtctagctaagttgcttgaagcac 750  Q
                 | ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||| |||||     |||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  32485903 gagagaagagagaaattatgatgaaattgttattgattttaatgaaaatatataaaggaggtagcttatatacaatgtctagctaaggaggttgaagcac 32486002  T
Q  751 aagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgt 850  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  32486003 aagcaatgtaacaaactctagatcttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaatcattgattgt 32486102  T
Q  851 gattatcact-aaactaaatttgaattaaaacaaactaaca 890  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32486103 gattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 32486143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 669 - 890
Target Start/End: Complemental strand, 19502535 - 19502307
Alignment:
Q  669 agttatgatgaaattgttattgatgcttatgaaaatatacaaagaaggta-----tatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaaca 763  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||     |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19502535 agttatgatgaaattgttattgattcttatgaaaatatataaaggaggtagcttatatacaatgtttagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaaca 19502436  T
Q  764 aactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtga-ttaatcactgattgtgattatcact-a 861  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  19502435 aactctatatcttattttctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaaatgtgatttaatcactgattgtgattatcactaa 19502336  T
Q  862 aactaaatttgaattaaaacaaactaaca 890  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  19502335 aactaaacttaaattaaaacaaactaaca 19502307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 717 - 890
Target Start/End: Complemental strand, 30695466 - 30695293
Alignment:
Q  717 tatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataac 816  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30695466 tatatacaatatctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatatactaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataac 30695367  T
Q  817 aaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaactaaca 890  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30695366 aaactaaaacaaaatgtgattaaccactgattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 30695293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 717 - 868
Target Start/End: Complemental strand, 43385125 - 43384974
Alignment:
Q  717 tatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataac 816  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43385125 tatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaaacaatgtaacaaaccctagattttatttgctaacttctaacaaacttgtaacaaacttcataac 43385026  T
Q  817 aaactaaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattatcactaaactaaa 868  Q
    |||||||||  || ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  43385025 aaactaaaagcaaatgtgattaaccactaattatgattatcactaaactaaa 43384974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 737 - 890
Target Start/End: Original strand, 7103943 - 7104100
Alignment:
Q  737 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaa-gtgt 833  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  7103943 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 7104042  T
Q  834 gattaatcactgattgtgattatcact-aaactaaatttgaattaaaacaaactaaca 890  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7104043 gattaaccactgattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 7104100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 737 - 890
Target Start/End: Complemental strand, 12018888 - 12018731
Alignment:
Q  737 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaa-gtgt 833  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  12018888 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 12018789  T
Q  834 gattaatcactgattgtgattatcact-aaactaaatttgaattaaaacaaactaaca 890  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12018788 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 12018731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 737 - 890
Target Start/End: Complemental strand, 16794265 - 16794108
Alignment:
Q  737 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaa-gtgt 833  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  16794265 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 16794166  T
Q  834 gattaatcactgattgtgattatcact-aaactaaatttgaattaaaacaaactaaca 890  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16794165 gattaaccacttattgtgattatcactgaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 16794108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 748 - 890
Target Start/End: Original strand, 40371750 - 40371892
Alignment:
Q  748 cacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgattaatcactgat 847  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| |  || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  40371750 cacaaacaatgtaataaactctagatcttatctactagcctctaacaaacttgtaacaatcttcataacaaactaaaacaaaatgtgattaatctctgat 40371849  T
Q  848 tgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaactaaca 890  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40371850 tgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 40371892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 717 - 839
Target Start/End: Original strand, 20830312 - 20830434
Alignment:
Q  717 tatatacaatgtctagctaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataac 816  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20830312 tatatacaatgtctagttaagttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaacacttgatcttatttgctaatctctaacaaacttgtaacaaacttcataac 20830411  T
Q  817 aaactaaaacaaagtgtgattaa 839  Q
    ||||| |||| || |||||||||    
T  20830412 aaactgaaactaaatgtgattaa 20830434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 570 - 645
Target Start/End: Original strand, 26336626 - 26336701
Alignment:
Q  570 cacttgatgcttgttacacaagcaacagaagcagtttctgattctagggtttatgtgaatttgtgatttgtgaatt 645  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  26336626 cacttgatgcttgttacacaagcaacggaagcagtttctgattctagggtttatgtgaatatgttatttgtgaatt 26336701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 737 - 890
Target Start/End: Complemental strand, 10274698 - 10274546
Alignment:
Q  737 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgat 836  Q
    ||||||||||| |||||| |  |||||||| ||| | |||||  | ||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| || | || ||||||    
T  10274698 gttgcttgaagtacaagctaaataacaaacccta-accttatgagctaatctctaactaacttgtaacaaaattcataacaaactgaatctaaatgtgat 10274600  T
Q  837 taatcactgattgtgattatcactaaactaaatttgaattaaaacaaactaaca 890  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10274599 taaccattaattgtgattatcactaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 10274546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 882 - 1140
Target Start/End: Original strand, 26454406 - 26454664
Alignment:
Q  882 aaactaacatcctcccttaattcaagtttctacttccttcatttcattcaagcttctgagtttgatgagcctgttaaccttcaatgccttagtgaatatg 981  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||   |||  || ||| ||| || || |||||||   ||| ||||||||| |  |||||||||||     
T  26454406 aaactaacttcctcccttaattcaagtttccacttcaaccataccaatcatgctccttagcttgatgaatatgtcaaccttcaaaggtttagtgaatata 26454505  T
Q  982 tctacaagttgtagctcagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttgttcacttggtccctcagaaaatggaacttagcttctatatgcttgcttc 1081  Q
    ||| ||||||| |||||| | || ||||||||||| |||| |||  ||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| |||| || || || ||      
T  26454506 tctgcaagttgcagctcaatggaacaatgaacaatttgcaatgcctccttgttaacttgttccctcagaaagtgaaacttaacttcaatgtgtttactca 26454605  T
Q  1082 tcccatgcataactggatttcttgctaagcttatagtagatttgttgtctatgaacaat 1140  Q
    | ||||||| || ||||||  |||||||| | ||||  |||||||| ||||||||||||    
T  26454606 ttccatgcaaaattggattatttgctaagttaatagatgatttgttatctatgaacaat 26454664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 737 - 890
Target Start/End: Complemental strand, 37658878 - 37658732
Alignment:
Q  737 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagt-gt 833  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| |||||||||||||||||           |||||||| |||||||||| | ||    
T  37658878 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaactt-----------cataacaagctaaaacaaacttgt 37658790  T
Q  834 gattaatcactgattgtgattatcactaaa-ctaaatttgaattaaaacaaactaaca 890  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  37658789 gattaaccactgattatgattatgactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 37658732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 768 - 839
Target Start/End: Original strand, 20808675 - 20808746
Alignment:
Q  768 ctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtgattaa 839  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  20808675 ctagatcttatttgttaacctctaacaaacttgtaactaacttcataacaaactgaaactaaatgtgattaa 20808746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1030 - 1090
Target Start/End: Complemental strand, 30067094 - 30067034
Alignment:
Q  1030 ttgttcacttggtccctcagaaaatggaacttagcttctatatgcttgcttctcccatgca 1090  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  30067094 ttgttcacttgttctctgagaaaatgaaactttgcttcaatatgcttgcttcttccatgca 30067034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440 (Bit Score: 292; Significance: 1e-163; HSPs: 2)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 737 - 1172
Target Start/End: Complemental strand, 7662 - 7224
Alignment:
Q  737 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagtgtg 834  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7662 gttgcttgaaacacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaattgtg 7563  T
Q  835 attaatcactgattgtgattatcactaaa-ctaaatttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttctacttccttcatttcattcaag 933  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||     
T  7562 attaatcactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaaa 7463  T
Q  934 cttctgagtttgatgagcctgttaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagttgtagctcagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttgt 1033  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  7462 cttctgagcttgatgaatctgtcaacctttaatgccttagtgaatatgtctgcaagctacagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttgt 7363  T
Q  1034 tcacttggtccctcagaaaatggaacttagcttctatatgcttgcttctcccatgcataactggatttcttgctaagcttatagtagatttgttgtctat 1133  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7362 tcacttgctccctcagaaaatgaaactttgcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtctat 7263  T
Q  1134 gaacaattctataggtctgctaaccttgatgtccatctc 1172  Q
    || |||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  7262 gagcaattctataggtctgctaacctctatctccatctc 7224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 737 - 1135
Target Start/End: Complemental strand, 3137 - 2735
Alignment:
Q  737 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagt-gt 833  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  3137 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 3038  T
Q  834 gattaatcactgattgtgattatcactaaa-ctaaatttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttctacttccttcatttcattcaa 932  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  3037 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 2938  T
Q  933 gcttctgagtttgatgagcctgttaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagttgtagctcagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttg 1032  Q
     |||||||| |||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  2937 acttctgagcttgatgaatctgtcaacctttaatgccttagtgaatatgtctgcaagcttcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttg 2838  T
Q  1033 ttcacttggtccctcagaaaatggaacttagcttctatatgcttgcttctcccatgcataactggatttcttgctaagcttatagtagatttgttgtcta 1132  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2837 ttcacttgctccctcagaaaatgtaactttgcttctatatgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtcta 2738  T
Q  1133 tga 1135  Q
    |||    
T  2737 tga 2735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 289; Significance: 1e-161; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 737 - 1172
Target Start/End: Original strand, 44865 - 45304
Alignment:
Q  737 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaagt-gt 833  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  44865 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 44964  T
Q  834 gattaatcactgattgtgattatcactaaa-ctaaatttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttctacttccttcatttcattcaa 932  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||    
T  44965 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaacatcctcccttaattcaagtttccacttccttcattccaatcaa 45064  T
Q  933 gcttctgagtttgatgagcctgttaaccttcaatgccttagtgaatatgtctacaagttgtagctcagtagagcaatgaacaatctgcagtgctcccttg 1032  Q
     |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  45065 acttctgagcttgatgaatctgtcaaccttcaatgccttagtgaatatgtctgcaagctgcagctcagtagaacaatgaacaatctgtagtgctcccttg 45164  T
Q  1033 ttcacttggtccctcagaaaatggaacttagcttctatatgcttgcttctcccatgcataactggatttcttgctaagcttatagtagatttgttgtcta 1132  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45165 ttcacttgctccctcagaaaatgaaactttgcttctatgtgcttgcttcttccatgcagaactggatttcttgctaagcttatagcagatttgttgtcta 45264  T
Q  1133 tgaacaattctataggtctgctaaccttgatgtccatctc 1172  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  45265 tgagcaattctataggtctgctaacctctatctccatctc 45304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 737 - 890
Target Start/End: Original strand, 49445 - 49602
Alignment:
Q  737 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctag--atcttatttgttaacctctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaactaaaacaaa-gtgt 833  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  49445 gttgcttgaagcacaagcaatgtaacaaactctaacaaccttatttgctaacctctaacaaacttgtaacaaacttcataacaaactaaaacaaacttgt 49544  T
Q  834 gattaatcactgattgtgattatcact-aaactaaatttgaattaaaacaaactaaca 890  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49545 gattaaccactgattgtgattatcactaaaactaaacttgaattaaaacaaactaaca 49602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 559 - 606
Target Start/End: Original strand, 64430 - 64477
Alignment:
Q  559 tgttagcgcagcacttgatgcttgttacacaagcaacagaagcagttt 606  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  64430 tgttagcgcagcaattgatgcttgttacataagcaacataagtagttt 64477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 788 - 856
Target Start/End: Original strand, 60201 - 60270
Alignment:
Q  788 tctaacaaacttgtcacaaacttcataacaaact-aaaacaaagtgtgattaatcactgattgtgattat 856  Q
    ||||||||||| || ||||| || |||||||||| ||||  || |||||||||||||| |||||||||||    
T  60201 tctaacaaactggtaacaaaatttataacaaactaaaaattaaatgtgattaatcactaattgtgattat 60270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University