View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11573_high_1 (Length: 658)

Name: NF11573_high_1
Description: NF11573
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11573_high_1
NF11573_high_1
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (265-640)||(52245096-52245472)
chr4 (265-640)||(790589-790960)
chr4 (260-594)||(8015981-8016313)
chr4 (130-227)||(52245513-52245610)
chr4 (265-586)||(32105468-32105782)
chr4 (514-640)||(13434744-13434868)
chr4 (175-227)||(32105381-32105433)
chr4 (342-468)||(20808999-20809125)
chr4 (61-93)||(54136440-54136472)
[»] chr2 (13 HSPs)
chr2 (264-642)||(24003064-24003448)
chr2 (349-630)||(20125575-20125857)
chr2 (369-575)||(37787111-37787317)
chr2 (363-591)||(22999637-22999871)
chr2 (265-640)||(42757570-42757941)
chr2 (142-223)||(42757982-42758066)
chr2 (11-54)||(29078057-29078100)
chr2 (142-195)||(24002969-24003022)
chr2 (19-55)||(29076603-29076639)
chr2 (19-53)||(3607008-3607042)
chr2 (467-508)||(22381724-22381765)
chr2 (467-508)||(22913750-22913791)
chr2 (11-51)||(3603561-3603601)
[»] chr6 (6 HSPs)
chr6 (265-640)||(12522198-12522569)
chr6 (142-223)||(34188373-34188456)
chr6 (11-53)||(29467246-29467288)
chr6 (19-53)||(29465810-29465844)
chr6 (175-223)||(12522644-12522692)
chr6 (13-53)||(17971810-17971850)
[»] chr5 (18 HSPs)
chr5 (270-640)||(15029900-15030265)
chr5 (270-586)||(26228028-26228342)
chr5 (404-640)||(11077483-11077721)
chr5 (366-552)||(31253810-31253998)
chr5 (404-577)||(5325224-5325403)
chr5 (319-503)||(42478314-42478495)
chr5 (448-640)||(17361087-17361278)
chr5 (143-227)||(11077247-11077331)
chr5 (278-434)||(20127940-20128096)
chr5 (143-210)||(14622897-14622964)
chr5 (260-354)||(17361280-17361374)
chr5 (13-55)||(33957347-33957389)
chr5 (150-227)||(31251340-31251417)
chr5 (175-227)||(20127833-20127885)
chr5 (13-55)||(37966867-37966909)
chr5 (265-362)||(11077366-11077463)
chr5 (145-226)||(26228384-26228465)
chr5 (178-227)||(15579496-15579547)
[»] chr1 (13 HSPs)
chr1 (265-642)||(33473449-33473832)
chr1 (270-586)||(32907811-32908124)
chr1 (260-486)||(31038093-31038318)
chr1 (265-553)||(51995241-51995523)
chr1 (366-640)||(25646690-25646963)
chr1 (477-578)||(16814843-16814948)
chr1 (144-221)||(33473877-33473954)
chr1 (467-584)||(17888418-17888537)
chr1 (514-585)||(18467746-18467817)
chr1 (170-227)||(31038007-31038064)
chr1 (368-468)||(27572081-27572181)
chr1 (175-223)||(32908171-32908219)
chr1 (265-373)||(20415922-20416030)
[»] chr7 (19 HSPs)
chr7 (271-584)||(24688126-24688441)
chr7 (272-553)||(39605710-39605987)
chr7 (272-640)||(18995234-18995601)
chr7 (272-586)||(23846199-23846514)
chr7 (265-630)||(46857476-46857839)
chr7 (261-508)||(24056280-24056525)
chr7 (284-553)||(7193919-7194185)
chr7 (265-451)||(31135539-31135724)
chr7 (143-227)||(23846073-23846157)
chr7 (142-227)||(46857875-46857960)
chr7 (168-227)||(39606029-39606088)
chr7 (145-226)||(24688491-24688572)
chr7 (11-53)||(19543545-19543587)
chr7 (175-223)||(28086413-28086461)
chr7 (173-227)||(24056554-24056608)
chr7 (162-220)||(29127699-29127756)
chr7 (56-108)||(19543476-19543528)
chr7 (57-93)||(24446322-24446358)
chr7 (13-53)||(40740012-40740052)
[»] chr3 (17 HSPs)
chr3 (264-642)||(3330528-3330909)
chr3 (265-640)||(6512673-6513043)
chr3 (265-585)||(6472936-6473247)
chr3 (264-576)||(6748241-6748549)
chr3 (264-543)||(15819845-15820124)
chr3 (265-574)||(6473453-6473758)
chr3 (265-640)||(40474927-40475297)
chr3 (265-586)||(818039-818356)
chr3 (448-640)||(38111863-38112053)
chr3 (426-640)||(37978779-37978992)
chr3 (144-227)||(3330410-3330493)
chr3 (367-506)||(4611681-4611816)
chr3 (175-223)||(817942-817990)
chr3 (175-223)||(15820163-15820211)
chr3 (175-223)||(41696324-41696372)
chr3 (514-576)||(11985204-11985266)
chr3 (177-223)||(40475345-40475391)
[»] chr8 (7 HSPs)
chr8 (265-573)||(34967647-34967954)
chr8 (357-468)||(22998337-22998448)
chr8 (356-468)||(7406474-7406586)
chr8 (143-227)||(34967989-34968071)
chr8 (518-586)||(13151654-13151723)
chr8 (175-227)||(13151368-13151420)
chr8 (173-223)||(35003967-35004017)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (265-576)||(21916-22227)
scaffold0044 (143-227)||(22241-22325)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (270-547)||(19260-19538)
[»] scaffold0625 (1 HSPs)
scaffold0625 (272-640)||(1055-1422)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (275-546)||(93007-93278)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 265 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 52245472 - 52245096
Alignment:
Q  265 ggggtacataaacctaacccaatcaattcacacaacgtgtattccaacccaatcgggtgatacaatgcaataagaaaaacaccggtgaatttctaacatg 364  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||| ||||||| |    
T  52245472 gggggacataaacctaacctagtcaattcacacaaagtgtattcaaacccaatcgagtgatacaatgaaataaaaacaacatcggtgaatgtctaacaag 52245373  T
Q  365 tggtgtatggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagtccaac 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  52245372 tggtgtatggacaaaccgtcaacatagaatgaatccaaaaaccaacatctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctctttcgagccaagcagtccgac 52245273  T
Q  465 atcaggtagactgatgaggattatgaaacctcccccaagttatacaaagaaacttcgtgaag--gtgagagattctaccgccaacacggatgcataagcc 562  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||| || || ||    
T  52245272 attaggtagactgatgagaattatgaaacct-ccccaagttatacagagaaacttcgtacaggtgtgagagattctaccgccaacacggatacagaaccc 52245174  T
Q  563 cacgcctacaacccactatgctgcaacaaaaatctttcatggttatttctagccaaatccagtagaaagaaactcaaa 640  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |   ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  52245173 cacgcctacaacccactatgctgcgacagaaagctttcacgaccatttctagccaaatccaatagaaagcaactcaaa 52245096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 265 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 790960 - 790589
Alignment:
Q  265 ggggtacataaacctaacccaatcaattcacacaacgtgtattccaacccaatcgggtgatacaatgcaataagaaaaacaccggtgaatttctaacatg 364  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||| ||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||| | ||||| || |||||||| |||| |||||| ||    
T  790960 gggggacataaacctaactcagtcaatccacacaaagagtatgccaacacaatcgggtgatacaaagaaataaaaacaacaccggggaatgtctaacttg 790861  T
Q  365 tggtgtatggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagtccaac 464  Q
     ||| ||||||| ||||||||||| | |||||||  || |||||||| ||||||| || ||||||||||||||  ||| ||| ||||||| |||||||||    
T  790860 cggtatatggaccaaccgtcaacacgaaatggatacaagaaccaacaactccttgtgacagcaacaagcataacatctttttcgagccaaacagtccaac 790761  T
Q  465 atcaggtagactgatgaggattatgaaacctcccccaagttatacaaagaaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggatgcataagccca 564  Q
    ||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||    
T  790760 atca--aagactgatgaggattttgaaacctcccccaagttatagtgccaaacttcgtgaaggtgggagattcgaccgccaacacggatacagaa-ccca 790664  T
Q  565 cgcctacaacccactatgctgcaacaaaaatctttcatggttatttctagccaaatccagtagaaagaaactcaaa 640  Q
    |||||||||||| | ||| ||| ||| ||| | |||| |   ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  790663 cgcctacaacccgccatgttgcgacagaaagc-ttcacgaccatttctagccaaatccaatagaaatcaactcaaa 790589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 260 - 594
Target Start/End: Original strand, 8015981 - 8016313
Alignment:
Q  260 gaactggggtacataaacctaacccaatcaattcacacaacgtgtattccaacccaatcgggtgatacaatgcaataagaaaaacaccggtgaatttcta 359  Q
    ||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||   |||||  | |||||||||| || || |    
T  8015981 gaactgggggacataaacctaaattagtcaatccacacaaagtgtatgccaacccaattgggtgatacaaataaataaacacaacaccggtggatgtcca 8016080  T
Q  360 acatgtggtgtatggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagt 459  Q
    ||  |  ||||| |||| || ||||||||   |||||||| || |||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||| || |    
T  8016081 actagcagtgtacggaccaatcgtcaacacaaaatggatccaagaaccaacaactccttgcgacatcaacaagcataacgtctctttcgagccaaacaat 8016180  T
Q  460 ccaacatcaggtagactgatgaggattatgaaacctcccccaagttatacaaag--aaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggatgcat 557  Q
    |||||||||   |||||||||| || | |||||||||||||| |||||| |  |  |||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  8016181 ccaacatca--aagactgatgaagaatttgaaacctcccccatgttatatagtgccaaacttc--gaaggtgagagattcgaccaccaacacggatacat 8016276  T
Q  558 aagcccacgcctacaacccactatgctgcaacaaaaa 594  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8016277 aaccccatgcctacaacccactatgctgcgacaaaaa 8016313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 130 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 52245610 - 52245513
Alignment:
Q  130 ggccagagaccgatgacataaaaaaggaacggaaaacggtccaaaagttggaatgtcttgcagattccaatctatgtcaggtactcatatatattatt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52245610 ggccagagaccgatgacataaaaaaggaacagaaaacggttcaaaagttggaatgtcttgtagattccaatctatgtcaggtattcatatatattatt 52245513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 265 - 586
Target Start/End: Original strand, 32105468 - 32105782
Alignment:
Q  265 ggggtacataaacctaacccaatcaattcacacaacgtgtattccaacccaatcgggtgatacaatgcaataagaaaaacaccggtgaatttctaacatg 364  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||| |  |||||| |||||||||||| |||||||||   ||| | |  |||||||||| ||  | |   |     
T  32105468 gggggacataaacctaacccagtcaatccacaga--gtgtatgccaacccaatcgagtgatacaaaaaaatcaaagcaacaccggtggatgccga---ta 32105562  T
Q  365 tggtgtatggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagtccaac 464  Q
    |||||||||||| | ||||||||| | ||| || | || |||||||| |||||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||| ||| |||||||||    
T  32105563 tggtgtatggaccatccgtcaacacgaaattgaaccaagaaccaacaactccttgcgacagcaacaagcaaagcgtctctttcgagacaaacagtccaac 32105662  T
Q  465 atcaggtagactgatgaggattatgaaacctcccccaagttatacaaagaaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggatgcataagccca 564  Q
    |||||  ||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||     |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |  |  ||||    
T  32105663 atcag--agactgatgcggattttgaaacat-ccccaagttatagtgtcaaacttcgtgaaggtgggagattcgaccgccaacacggatacggatcccca 32105759  T
Q  565 cgcctac-aacccactatgctgc 586  Q
    ||||||| |||||| ||||||||    
T  32105760 cgcctacaaacccattatgctgc 32105782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 514 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 13434868 - 13434744
Alignment:
Q  514 aaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggatgcataagcccacgcctacaacccactatgctgcaacaaaaatctttcatggttatttcta 613  Q
    ||||||| ||||| |||||||||   |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||  ||| | |||| ||  |||||||    
T  13434868 aaacttcatgaagatgagagatttgtccgccaacacggatacagaa-cccacgcctacaacccactatgctgcgaccgaaagc-ttcacggccatttcta 13434771  T
Q  614 gccaaatccagtagaaagaaactcaaa 640  Q
    |||||||| | || |||||||||||||    
T  13434770 gccaaatctaataaaaagaaactcaaa 13434744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 175 - 227
Target Start/End: Original strand, 32105381 - 32105433
Alignment:
Q  175 agttggaatgtcttgcagattccaatctatgtcaggtactcatatatattatt 227  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  32105381 agttggagtgtcttgcagattccattctatgtcaggtgctcatatatattatt 32105433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 20809125 - 20808999
Alignment:
Q  342 aacaccggtgaatttctaacatgtggtgtatggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtc 441  Q
    |||||| ||| || ||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||   || |  || ||||||||||| |||||||| | |||||||||  ||| |||    
T  20809125 aacaccagtggatgtctaaaatgcggtgtatggaccaaccatcaacacagaacgagtccaaaaaccaacaactccttgcaacagcaacaagtctaacgtc 20809026  T
Q  442 tcttttgagccaagcagtccaacatca 468  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  20809025 tcttttgaggcaaacagtccaacatca 20808999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 61 - 93
Target Start/End: Original strand, 54136440 - 54136472
Alignment:
Q  61 taaatagttaaaggacaaaaatagcaatttagc 93  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54136440 taaatagttaaaggacaaaaattgcaatttagc 54136472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 153; Significance: 9e-81; HSPs: 13)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 264 - 642
Target Start/End: Original strand, 24003064 - 24003448
Alignment:
Q  264 tggggtacataaacctaacccaatcaattcacacaacgtgtattccaacccaatcgggtgatacaatgcaataagaaaaacaccggtgaatttctaacat 363  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||| || |||||| |||| | ||||||||    
T  24003064 tgggggacataaacctaacccagtcaatccacacaaagtgtatgccaacccaatcgggtgatgcaaagaaataaaaacaacaccagtgagtgtctaacat 24003163  T
Q  364 gtggtgtatggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagtccaa 463  Q
    |||||||||||||||||||||| ||   |||||| | || |||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  24003164 gtggtgtatggacaaaccgtcagcacagaatggaaccaagaaccaacaactccttgcgacagcaacaaacataacgtctctttcgagccaaacagtccaa 24003263  T
Q  464 ------catcaggtagactgatgaggattatgaaacctcccccaagttatacaaag--aaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggatgc 555  Q
          |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24003264 catcagcatcaggtagaccgatgaggattttgaaa-ctcccccaagttatatagagtcaaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggatac 24003362  T
Q  556 ataagcccacgcctacaacccactatgctgcaacaaaaatctttcatggttatttctagccaaatccagtagaaagaaactcaaaac 642  Q
    | || ||||||||||||||||| |||| ||| | | ||| | || | ||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24003363 aaaaccccacgcctacaacccattatgatgcgatagaaagc-ttgacggccatttctaaccaaatccaatagaaagcaactcaaaac 24003448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 349 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 20125857 - 20125575
Alignment:
Q  349 gtgaatttctaacatgtggtgtatggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttg 448  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||| || || ||| | |||||||||| |  |||||| |||| ||||||||      
T  20125857 gtgaatgtctaacatgcggtttatggacaaaccgtcaacacggaatggatctaagaatcaagaactccttgcgacaagaacaagtataacgtctctttca 20125758  T
Q  449 agccaagcagtccaacatcaggtagactgatgaggattatgaaacctcccccaagttatacaaag--aaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaa 546  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20125757 agccaaatagtccaacatcatgtagactgatgaggattttgaaacctcccccaagttatatagagccaaacttcgtgaaggtgaaagattctactgccaa 20125658  T
Q  547 cacggatgcataagcccacgcctacaacccactatgctgcaacaaaaatctttcatggttatttctagccaaatccagtagaaa 630  Q
    ||||||| || || | ||| |  |||| ||||| |||||||||| |||   |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20125657 cacggatacaaaacctcacacagacaatccactttgctgcaacagaaa-ggttcacggtcatttctagccaaatccaatagaaa 20125575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 369 - 575
Target Start/End: Original strand, 37787111 - 37787317
Alignment:
Q  369 gtatggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagtccaacatca 468  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||||| ||  |||| || |||||||||| |||||||||||||  ||||||||   |||||  ||||||||||||    
T  37787111 gtatggaccaaccgtcatcatgaaatggatccaaggaccaccaactccttgcgacagcaacaagcatagcgtctctttcatgccaaagagtccaacatca 37787210  T
Q  469 ggtagactgatgaggattatgaaacctcccccaagttatacaaag----aaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggatgcataagccca 564  Q
      || |||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||    ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||  | || ||||    
T  37787211 --taaactgataaggattttgaaacctcccccaagtta--caaagtgccaaacttcgtgaaggtgataaattcaaccgccaacacagatatagaacccca 37787306  T
Q  565 cgcctacaacc 575  Q
    |||||||||||    
T  37787307 cgcctacaacc 37787317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 363 - 591
Target Start/End: Original strand, 22999637 - 22999871
Alignment:
Q  363 tgtggtgtatggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagtcca 462  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| || | ||| || |||||||| ||| ||||   | |||||||||||| |||| ||| |||  || || ||||    
T  22999637 tgtggtgtatgaaccaaccgtcaacatggaacgaatctaagaaccaacaactcgttgcagcaacaacaagcataacgtctatttcgagtgaaacaatcca 22999736  T
Q  463 ac----atcaggtagactgatgaggattatgaaacctcccccaagttataca--aagaaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggatgca 556  Q
    ||    | |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || ||    
T  22999737 acttcaaacaggtagaatgatgaggattttgaaacctcccctaagttatatagtaacaaacttcgtgaaggtgaaagattctaccaccaacacaaataca 22999836  T
Q  557 taagcccacgcctacaacccactatgctgcaacaa 591  Q
     || |||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  22999837 aaaccccacgccaacaatccactatgctgcgacaa 22999871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 265 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 42757941 - 42757570
Alignment:
Q  265 ggggtacataaacctaacccaatcaattcacacaacgtgtattccaacccaatcgggtgatacaatgcaataagaaaaacaccggtgaatttctaacatg 364  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | || || || |||||| ||| || |||||| ||    
T  42757941 gggggacataaacctgacccagtcaatccacacaaagtgtatgccaacccaagcgggtgatacaaagaaaaaataacaacacctgtggatgtctaacgtg 42757842  T
Q  365 tggtgtatggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagtccaac 464  Q
     ||||||||||| ||| || |||| |  || |||  || ||||||||||||||||| | |||||||||||       ||||| ||||||| |||||||||    
T  42757841 cggtgtatggaccaactgtaaacacgagatagatacaagaaccaacagctccttgcaacagcaacaagca-------tctttcgagccaaacagtccaac 42757749  T
Q  465 atcaggtagactgatgaggattatgaaacctccccca-agttata-----caaagaaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggatgcata 558  Q
    ||||   ||||||||| | ||| |||||| ||| |||  ||||||     | ||   |||||||||  || |||||||| ||||||||||||||| |  |    
T  42757748 atca--aagactgatgcgaattttgaaacatccaccagtgttatatagtgccaaactacttcgtgacagttagagattcgaccgccaacacggatacgga 42757651  T
Q  559 agcccacgcctacaacccactatgctgcaacaaaaatctttcatggttatttctagccaaatccagtagaaagaaactcaaa 640  Q
    | | |||||||||||||  ||||||| | ||| ||  | |||||||  |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  42757650 atctcacgcctacaacctgctatgctacgacataaggc-ttcatgggcatttctagccaactccaatagaaagcaactcaaa 42757570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 42758066 - 42757982
Alignment:
Q  142 atgacataaaaaaggaacggaaaacggtccaaa---agttggaatgtcttgcagattccaatctatgtcaggtactcatatatat 223  Q
    ||||||||| |||||||| ||| || ||||||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  42758066 atgacataacaaaggaacagaagacagtccaatcagagttggaatgtcttgcagattccaatttatgtcaggtgctcatatatat 42757982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 54
Target Start/End: Original strand, 29078057 - 29078100
Alignment:
Q  11 cagagataaacttaaaatatcaaaacggaacaaattttaattat 54  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29078057 cagagataaacttaaaataccaaaacggaacaaattttaattat 29078100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 195
Target Start/End: Original strand, 24002969 - 24003022
Alignment:
Q  142 atgacataaaaaaggaacggaaaacggtccaaaagttggaatgtcttgcagatt 195  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24002969 atgacataaaaaaggaatagaaaacagtccaaaagttgaaatgttttgcagatt 24003022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 29076639 - 29076603
Alignment:
Q  19 aacttaaaatatcaaaacggaacaaattttaattatg 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29076639 aacttaaaatatcaaaacggaacaaatttaaattatg 29076603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 53
Target Start/End: Original strand, 3607008 - 3607042
Alignment:
Q  19 aacttaaaatatcaaaacggaacaaattttaatta 53  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3607008 aacttaaaatatcaaaacggaataaattttaatta 3607042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 467 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 22381765 - 22381724
Alignment:
Q  467 caggtagactgatgaggattatgaaacctcccccaagttata 508  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22381765 caggtagaatgatgaggattttgaaacctcccctaagttata 22381724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 467 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 22913791 - 22913750
Alignment:
Q  467 caggtagactgatgaggattatgaaacctcccccaagttata 508  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22913791 caggtagaatgatgaggattttgaaacctcccctaagttata 22913750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 3603601 - 3603561
Alignment:
Q  11 cagagataaacttaaaatatcaaaacggaacaaattttaat 51  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  3603601 cagagataaacttaaaataccaaaacataacaaattttaat 3603561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 6)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 265 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 12522569 - 12522198
Alignment:
Q  265 ggggtacataaacctaacccaatcaattcacacaacgtgtattccaacccaatcgggtgatacaatgcaataagaaaaacaccggtgaatttctaacatg 364  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||  |||||| |||||| ||    
T  12522569 gggggacataaacctaacccagtcaatccacacaaagtgtatgccaacccaatcgggtgatacaaagaaataaaaacaacactagtgaatgtctaacttg 12522470  T
Q  365 tggtgtatggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagtccaac 464  Q
     ||||||||||| ||||||||||| | |||||||| || |||||||| |||||||||| | ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  12522469 cggtgtatggaccaaccgtcaacacgaaatggatccaagaaccaacaactccttgcgacaacaacaagcataacatctctttcgagccaaacagtccaac 12522370  T
Q  465 atcaggtagactgatgaggattatgaaacctcccccaagttatacaaagaaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggatgcataagccca 564  Q
    ||||   |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||     |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||    
T  12522369 atca--aagactggtgaggattttgaaacctcccccaagttatagtgccaaacttcgtgaaagtgagagattcgaccgccaacacggataca-aaaccca 12522273  T
Q  565 cgcctacaacccactatgctgcaacaaaaatctttcatggttatttctagccaaatccagtagaaagaaactcaaa 640  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||| | |||| |   ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  12522272 cgcctacaacccgccatgctgcgacagaaagc-ttcacgaccatttctagccaaatccaatggaaagcaactcaaa 12522198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 223
Target Start/End: Original strand, 34188373 - 34188456
Alignment:
Q  142 atgacataaaaaaggaacggaaaacggtccaa--aagttggaatgtcttgcagattccaatctatgtcaggtactcatatatat 223  Q
    |||||||||||||||||  ||| || ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  34188373 atgacataaaaaaggaatagaagacagtccaacaaagtttgaatgtcttgcagattccaatctatgtcagatgctcatatatat 34188456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 53
Target Start/End: Original strand, 29467246 - 29467288
Alignment:
Q  11 cagagataaacttaaaatatcaaaacggaacaaattttaatta 53  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29467246 cagagataaacttaaaatatctaaacggaacaaattttaatta 29467288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 29465844 - 29465810
Alignment:
Q  19 aacttaaaatatcaaaacggaacaaattttaatta 53  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29465844 aacttaaaataccaaaacggaacaaattttaatta 29465810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 175 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12522692 - 12522644
Alignment:
Q  175 agttggaatgtcttgcagattccaatctatgtcaggtactcatatatat 223  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  12522692 agttggaatgacttgcaaattccagtctatgtcaggtgcttatatatat 12522644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Original strand, 17971810 - 17971850
Alignment:
Q  13 gagataaacttaaaatatcaaaacggaacaaattttaatta 53  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  17971810 gagataaacttaaaataccaaaatggaacaaatttgaatta 17971850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 148; Significance: 9e-78; HSPs: 18)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 270 - 640
Target Start/End: Original strand, 15029900 - 15030265
Alignment:
Q  270 acataaacctaacccaatcaattcacacaacgtgtattccaacccaatcgggtgatacaatgcaataagaaaaacaccggtgaatttctaacatgtggtg 369  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| | ||||| || ||||  ||||||| |||||| || ||||    
T  15029900 acataaacataactcagtcaatccacacaaagtgtatgc-aacccaatcgggtgatacaaagaaataaaaacaacattggtgaatgtctaacttgcggtg 15029998  T
Q  370 tatggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagtccaacatcag 469  Q
    ||||||| |||||||||||   |||||||| || |||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||     
T  15029999 tatggaccaaccgtcaacacaaaatggatccaagaaccaacaactccttgcgacaacaacaagcataacgtctctttcgagccaaacagtccaacatca- 15030097  T
Q  470 gtagactgatgaggattatgaaacctcccccaagttatacaaagaaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggatgcataagcccacgcct 569  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||    
T  15030098 -aagactgatgaggattttgaaacctcccccaagttatagtgtcaaacttcgtgaaggtgagagattcgaccgccaacacggatacagaa-cccacgcct 15030195  T
Q  570 acaacccactatgctgcaacaaaaatctttcatggttatttctagccaaatccagtagaaagaaactcaaa 640  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||| | |||| |   ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15030196 acaacccaccatgctgcgacagaaagc-ttcacgaccatttctagccaaatccaatagaaagcaactcaaa 15030265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 270 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 26228342 - 26228028
Alignment:
Q  270 acataaacctaacccaatcaattcacacaacgtgtattccaacccaatcgggtgatacaatgcaataagaaaaacaccggtgaatttctaacatgtggtg 369  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||  |||||| || |||||| |||||| |||||| ||| |||    
T  26228342 acataaacctaacccagtcaatccacaca--gtgtatgtcaacccaatcgggtaatacaaa-caataaaaacaacaccagtgaatgtctaacttgtagtg 26228246  T
Q  370 tatggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagtccaacatcag 469  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||| || |||||||| ||| |||| | | ||||||||| ||  ||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  26228245 tatggacaaaccgtcaacactgaatggatccaagaaccaacaactcattgcaacaacaacaagcacaacatctctttcgagccaaatagtccaacatcag 26228146  T
Q  470 gtagactgatgaggattatgaaacctcccccaagttatacaaag-aaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggatgcataagcccacgcc 568  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||  || ||| || |||| | |||||||||||||| ||||||| || || ||||| ||    
T  26228145 gtagactgatgaggattttgaaatctcccccaagttatatagagccaaattcatgcaggtaaaagattctaccgccatcacggatacagaaccccacacc 26228046  T
Q  569 tacaacccactatgctgc 586  Q
    |||||||| |||||||||    
T  26228045 tacaacccgctatgctgc 26228028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 404 - 640
Target Start/End: Original strand, 11077483 - 11077721
Alignment:
Q  404 aaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagtccaacatcaggtagactgatgaggattatgaaacctcccccaag 503  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||| |  |||||    
T  11077483 aaccaacaactccttgcgacagcaacaagcctaatgtctctttcgagccaaacagtccaacatcagacagacagatgaggattttgaaaccgcatccaag 11077582  T
Q  504 ttatacaaag--aaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggatg--cataagcccacgcctacaacccactatgctgcaacaaaaatcttt 599  Q
    |||||   ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||| ||||||||| ||||||||| ||  ||| | ||    
T  11077583 ttatatggagccaaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggatgatcagaaccccacgtctacaaccc-ctatgctgcgacggaaagc-tt 11077680  T
Q  600 catggttatttctagccaaatccagtagaaagaaactcaaa 640  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  11077681 catggccatttctagccaaatccaatagaaagcaattcaaa 11077721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 366 - 552
Target Start/End: Original strand, 31253810 - 31253998
Alignment:
Q  366 ggtgtatggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagtccaaca 465  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||| ||| || |||||||| |||||||||| | |||||||| |||  ||||| | ||||||| ||||||||||    
T  31253810 ggtgtattgacaaaccgtcaacacggaatgaatccaagaaccaacaactccttgcgacaacaacaagcctaacatctctatcgagccaaacagtccaaca 31253909  T
Q  466 tcaggtagactgatgaggattatgaaacctcccccaagttatacaaag--aaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacgga 552  Q
    |||   |||| |||||||||| ||||||| |  ||||| |||| | ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31253910 tcaaacagaccgatgaggattttgaaaccgcatccaagatatatagagtcaaacttcgtgaaggtgagagcttctaccgccaacacgga 31253998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 404 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 5325403 - 5325224
Alignment:
Q  404 aaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagtccaacatcag----gtagactgatgaggattatgaaacctcccc 499  Q
    |||||||| |||||| | | | |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||    ||||| | |||| |||| |||||||||||     
T  5325403 aaccaacaactccttacaacaacaacaagcataacgtctcttttgagccaaacaatccaacatcagacaggtagaataatgaagattttgaaacctccct 5325304  T
Q  500 caagttataca--aagaaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggatgcataagcccacgcctacaaccca 577  Q
     |||||||| |  |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  | || |||||||||||||||||    
T  5325303 taagttatatagtaccaaacttcgtgaaggtgagagattcaaccgccaacatggatatagaaccccacgcctacaaccca 5325224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 319 - 503
Target Start/End: Original strand, 42478314 - 42478495
Alignment:
Q  319 gggtgatacaatgcaataagaaaaacaccggtgaatttctaacatgtggtgtatggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctcctt 418  Q
    ||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||| ||||   || ||||||||||| |||||||||||   |||||||| || |||||||| || |||    
T  42478314 gggtgatacaaagaaataa-aaacacaccggtgaatgtctattgtgcggtgtatggaccaaccgtcaacacaaaatggatccaagaaccaacaacttctt 42478412  T
Q  419 gcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagtccaacatcaggtagactgatgaggattatgaaacctcccccaag 503  Q
     ||| ||||||||| |||| |||| ||| ||| ||| |||||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  42478413 acgacagcaacaagtataacgtctttttcgagtcaaacagtccaacatca--aagactgatgagaattttgaaacctcccccaag 42478495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 448 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 17361278 - 17361087
Alignment:
Q  448 gagccaagcagtccaacatcaggtagactgatgaggattatgaaacctcccccaagttatacaaag--aaacttcgtgaaggtgagagattctaccgcca 545  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |  |  |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  17361278 gagccaaacagtccaacatcaaata--ctgatgaggattttgaaacctccctcaagttatatagtgtcaaacttcgtgaaggtgagagattcgaccgcga 17361181  T
Q  546 acacggatgcataagcccacgcctacaacccactatgctgcaacaaaaatctttcatggttatttctagccaaatccagtagaaagaaactcaaa 640  Q
    ||| |||| || || ||||| | |||||||   |||||||| ||||||| | |||| ||  ||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  17361180 acatggatacaaaaccccacacatacaacctgttatgctgcgacaaaaagc-ttcacggccatttctagccaaatccaatataaagcaactcaaa 17361087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 227
Target Start/End: Original strand, 11077247 - 11077331
Alignment:
Q  143 tgacataaaaaaggaacggaaaacggtccaaaagttggaatgtcttgcagattccaatctatgtcaggtactcatatatattatt 227  Q
    ||||||||||||||||  ||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11077247 tgacataaaaaaggaatagaaaacaatccaaaagatagaatgtcttgcagattccagtctatgttaggtactcatatatattatt 11077331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 278 - 434
Target Start/End: Original strand, 20127940 - 20128096
Alignment:
Q  278 ctaacccaatcaattcacacaacgtgtattccaacccaatcgggtgatacaatgcaataagaaaaacaccggtgaatttctaacatgtggtgtatggaca 377  Q
    ||||| || ||||| ||||||| |||||  |||||||||||| || |||||| | ||||| || ||||||| | ||| |||||  || |||||||||||     
T  20127940 ctaactcagtcaatccacacaaagtgtaagccaacccaatcgagtaatacaaagaaataaaaacaacaccgataaatatctaatgtgcggtgtatggacc 20128039  T
Q  378 aaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagca 434  Q
    ||||||||||| | |||||||  || |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  20128040 aaccgtcaacacgaaatggattcaagaaccaacaactccttgcgatagcaacaagca 20128096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 210
Target Start/End: Original strand, 14622897 - 14622964
Alignment:
Q  143 tgacataaaaaaggaacggaaaacggtccaaaagttggaatgtcttgcagattccaatctatgtcagg 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14622897 tgacataaaaaaggaacagaaaacaatctaaaagatggaatgtcttgcagattccagtctatgtcagg 14622964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 17361374 - 17361280
Alignment:
Q  260 gaactggggt-acataaacctaacccaatcaattcacacaacgtgtattccaacccaatcgggtgatacaatgcaataagaaaaacaccggtgaat 354  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||||    
T  17361374 gaactggggtgacataaacctaacccagtcaatccacataaagtgtaggccaacccaatcgggtgatacaa-acaataaaaacaacactggtgaat 17361280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 55
Target Start/End: Original strand, 33957347 - 33957389
Alignment:
Q  13 gagataaacttaaaatatcaaaacggaacaaattttaattatg 55  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33957347 gagataaacttaaaatatcaaaacggaataaattttaattatg 33957389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 227
Target Start/End: Original strand, 31251340 - 31251417
Alignment:
Q  150 aaaaaggaacggaaaacggtccaaaagttggaatgtcttgcagattccaatctatgtcaggtactcatatatattatt 227  Q
    |||||||||  ||||||  |||||||| |||||| || |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31251340 aaaaaggaatagaaaacaatccaaaagatggaatatcctgcagactccggtctatgtcaggtactcatatatattatt 31251417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 227
Target Start/End: Original strand, 20127833 - 20127885
Alignment:
Q  175 agttggaatgtcttgcagattccaatctatgtcaggtactcatatatattatt 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  20127833 agttggaatgtcttgtagattccagtctatgtcaggtgctcataaatattatt 20127885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 37966909 - 37966867
Alignment:
Q  13 gagataaacttaaaatatcaaaacggaacaaattttaattatg 55  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37966909 gagataaatttaaaataccaaaacggaacaaattttaattatg 37966867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 362
Target Start/End: Original strand, 11077366 - 11077463
Alignment:
Q  265 ggggtacataaacctaacccaatcaattcacacaacgtgtattccaacccaatcgggtgatacaatgcaataagaaaaacaccggtgaatttctaaca 362  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| ||| |  ||||||||| | ||||| || || ||||||| || |||||||    
T  11077366 gggggacataaacctaacccagtcaatccacacaaagtgtatgccaacacaaacaagtgatacaaagaaataaaaacaataccggtggatgtctaaca 11077463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26228465 - 26228384
Alignment:
Q  145 acataaaaaaggaacggaaaacggtccaaaagttggaatgtcttgcagattccaatctatgtcaggtactcatatatattat 226  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||  |||||||| ||||||||||| |||  | | |||||||||| ||||||||||||||    
T  26228465 acataaaaaaggaatagaaaacagtttaaaagttgaaatgtcttgcatattttagtttatgtcaggtgctcatatatattat 26228384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 227
Target Start/End: Original strand, 15579496 - 15579547
Alignment:
Q  178 tggaatgtcttgcagattccaatctatgtc--aggtactcatatatattatt 227  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15579496 tggaatgtcttacagattccggtctatgtcagaggtactcatatatattatt 15579547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 13)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 265 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 33473832 - 33473449
Alignment:
Q  265 ggggtacataaacctaacccaatcaattcacacaacgtgtattccaacccaatcgggtgatacaatgcaataagaaaaacaccggtgaatttctaacatg 364  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||| || |||  |||||| |||  ||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  33473832 gggggacataaacttaacccagtcaatccatacatagtgtatgccagtccaatcgggtgatacaaagaaataaaaacaacaccggtgaatgtctaacatg 33473733  T
Q  365 tggtgtatggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaa-----cagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagt 459  Q
      |||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||     || |||||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||| || |    
T  33473732 cagtgtatggacaaaccgtcaacacggaatggatccaagaaccaacaactcaactccttgcgacaacaacaagcatgacgtctcttttgagccaaacaat 33473633  T
Q  460 ccaacatcaggtagactgatgaggattatgaaacctcccccaagttatacaaag--aaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggatgcat 557  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||  |||||||||| | ||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||     
T  33473632 ccaacatcaggtagagtgatgtggattttgaaacctcatccaagttatatagagccaaacttcatgaaggtcagagattctaccgccaacacagatacag 33473533  T
Q  558 aagcccacgcctacaacccactatgctgcaacaaaaatctttcatggttatttctagccaaatccagtagaaagaaactcaaaac 642  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||| |   ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  33473532 aaccccatgcctacaacccactatgctgcgacagaaagc-ttcacgaccatttctagccaaatccaatagaaagcaactcaaaac 33473449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 270 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 32908124 - 32907811
Alignment:
Q  270 acataaacctaacccaatcaattcacacaacgtgtattccaacccaatcgggtgatacaatgcaataagaaaaacaccggtgaatttctaacatgtggtg 369  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||| | ||||| || |||| |||||||| |||||| || ||||    
T  32908124 acataaacctaacccagtcaatccacacaaagtgtatgtcaacccaaccgggtgatacaaagaaataaaaacaacatcggtgaatgtctaacttgcggtg 32908025  T
Q  370 tatggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagtccaacatcag 469  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||| || |||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||  | ||||||| || || |||||||     
T  32908024 tatggaccaaccgtcaacacgaaatggatccaagaaccgacaactccttgcgacaacaacaagcataatgtctccatcgagccaaacaatctaacatca- 32907926  T
Q  470 gtagactgatgaggattatgaaacctcccccaagttatacaaagaaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggatgcataagcccacgcct 569  Q
      |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||     ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  32907925 -aagactggtgaggattttgaaacctccccaaagttatagtgccaaacttcgtgaaggtgagagattcgtccgccaacacggatacataa-cccacgcct 32907828  T
Q  570 acaacccactatgctgc 586  Q
    |||||||  ||||||||    
T  32907827 acaacccgttatgctgc 32907811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 260 - 486
Target Start/End: Original strand, 31038093 - 31038318
Alignment:
Q  260 gaactggggtacataaacctaacccaatcaattcacacaacgtgtattccaacccaatcgggtgatacaatgcaataagaaaaacaccggtgaatttcta 359  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||  |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||  |||    
T  31038093 gaactggggaacataaacctaacc-agtcaatcgacacaaagtgtatgccaacccaaacgggtgatacaaagaaataaaaacaacactggtgaatgccta 31038191  T
Q  360 acatgtggtgtatggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagt 459  Q
    ||| | |||||||||||||| ||||| || | |||||||| || ||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  31038192 acaagaggtgtatggacaaagcgtcagcacgcaatggatccaagaaccagcaactccttgcgacaacaacaagcataatgtctctttcgagccaaacagt 31038291  T
Q  460 ccaacatcaggtagactgatgaggatt 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  31038292 ccaacatcaggtagactgatgaggatt 31038318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 265 - 553
Target Start/End: Original strand, 51995241 - 51995523
Alignment:
Q  265 ggggtacataaacctaacccaatcaattcacacaacgtgtattccaacccaatcgggtgatacaatgcaataagaaaaacaccggtgaatttctaacatg 364  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||   | ||| || ||||||| || ||  |||| ||     
T  51995241 gggggacataaacctaacccagtcaatccacaga--gtgtatgccaacccaatcgggtgatacaaaaaattaa-aacaacaccgatggatgcctaaaata 51995337  T
Q  365 tggtgtatggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagtccaac 464  Q
    |||||||||||| | ||||||||| | ||| || | || |||||||| |||||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||| ||| || ||||||    
T  51995338 tggtgtatggaccatccgtcaacacgaaattgaaccaagaaccaacaactccttgcgacagcaacaagcaaagcgtctctttcgagacaaacaatccaac 51995437  T
Q  465 atcaggtagactgatgaggattatgaaacctcccccaagttatacaaagaaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggat 553  Q
    |||||  ||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||     |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  51995438 atcag--agactgatgcggattttgaaacat-ccccaagttatagtgtcaaacttcgtgaaggtgggagattcgaccgccaacacggat 51995523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 366 - 640
Target Start/End: Original strand, 25646690 - 25646963
Alignment:
Q  366 ggtgtatggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagtccaaca 465  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |  || |||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| ||  | |||||||    
T  25646690 ggtgtatggaccaaccatcaacacgagatagatccaagaaccaacaactccttgcgacagcaacaagcatagcgtctctttcgagctaaaaaatccaaca 25646789  T
Q  466 tcaggtagactgatgaggattatgaaacctcccccaagttatacaaag--aaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggatgcataagccc 563  Q
    |||   |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |  ||||||||||||||||||| || | |||||||||||  || || || | |    
T  25646790 tca--aagaccgatgaggattttgaaacctcccccaagttatatagtgctaaacttcgtgaaggtgagaaatccgaccgccaacacaaatacagaaccac 25646887  T
Q  564 acgcctacaacccactatgctgcaacaaaaatctttcatggttatttctagccaaatccagtagaaagaaactcaaa 640  Q
    || |||||||||| | ||||||||||| ||| | ||||     ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  25646888 actcctacaacccgcgatgctgcaacagaaagc-ttcacatccatttctagccaaatccaatagaaagcagctcaaa 25646963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 477 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 16814948 - 16814843
Alignment:
Q  477 gatgaggattatgaaacctcccccaagttatacaaag----aaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggatgcataagcccacgcctaca 572  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||    ||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| || || ||||||||||||    
T  16814948 gatgaggattttgaaacctccctcaagttatatatagtaccaaatttcgtgaaggtgagggattcgaccgtcaacacggatacagaaccccacgcctaca 16814849  T
Q  573 acccac 578  Q
    ||||||    
T  16814848 acccac 16814843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33473954 - 33473877
Alignment:
Q  144 gacataaaaaaggaacggaaaacggtccaaaagttggaatgtcttgcagattccaatctatgtcaggtactcatatat 221  Q
    ||||| |||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||    
T  33473954 gacatgaaaaaggaatagaaaacagttcaaaagttggaatgtcttgcaaattccagtctatgtcaagttctcatatat 33473877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 467 - 584
Target Start/End: Original strand, 17888418 - 17888537
Alignment:
Q  467 caggtagactgatgaggattatgaaacctcccccaagtta--tacaaagaaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggatgcataagccca 564  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |   |  |||||||||||||||||||  ||  ||| ||||||||||| || || | ||    
T  17888418 caggtagactgatgaggattttgaaacctcccccaagttattttgtaccaaacttcgtgaaggtgagatgtttaaccaccaacacggatacagaatctca 17888517  T
Q  565 cgcctacaacccactatgct 584  Q
    ||||||||||| ||| ||||    
T  17888518 cgcctacaacctactgtgct 17888537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 514 - 585
Target Start/End: Original strand, 18467746 - 18467817
Alignment:
Q  514 aaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggatgcataagcccacgcctacaacccactatgctg 585  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  18467746 aaactttgtgaaggtgggagattcgaccgccaacaaggatacataaccccactcctacaacccactctgctg 18467817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 227
Target Start/End: Original strand, 31038007 - 31038064
Alignment:
Q  170 ccaaaagttggaatgtcttgcagattccaatctatgtcaggtactcatatatattatt 227  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  31038007 ccaaaagttagaatgttttgcagattccagtatatgtcaggtgctcatatatattatt 31038064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 368 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 27572181 - 27572081
Alignment:
Q  368 tgtatggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagtccaacatc 467  Q
    ||||||||| ||||||||||| | || | ||| || |||||||| ||| |||| | | ||||||||||||  ||||||| ||||||| || |||||||||    
T  27572181 tgtatggaccaaccgtcaacaaggaacgaatccaagaaccaacaactctttgcaacaacaacaagcataacatctctttcgagccaaacaatccaacatc 27572082  T
Q  468 a 468  Q
    |    
T  27572081 a 27572081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 32908219 - 32908171
Alignment:
Q  175 agttggaatgtcttgcagattccaatctatgtcaggtactcatatatat 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  32908219 agttggaatgacttgcagattccggtctatgtcaggtgctcatatatat 32908171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 265 - 373
Target Start/End: Original strand, 20415922 - 20416030
Alignment:
Q  265 ggggtacataaacctaacccaatcaattcacacaacgtgtattccaacccaatcgggtgatacaatgcaataagaaaaacaccggtgaatttctaacatg 364  Q
    |||| |||||||| ||||||| | ||| ||||||| |||||   |||||||||| |||||||| |   ||||| || ||||| |||| || ||||| |||    
T  20415922 gggggacataaacttaacccagtaaatccacacaaagtgtacgtcaacccaatcaggtgatacgaaaaaataaaaacaacactggtggatgtctaaaatg 20416021  T
Q  365 tggtgtatg 373  Q
    |||||||||    
T  20416022 tggtgtatg 20416030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 19)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 271 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 24688441 - 24688126
Alignment:
Q  271 cataaacctaacccaatcaattcacacaacgtgtattccaacccaatcgggtgatacaatgcaataagaaaaacaccggtgaatttctaacatgtggtgt 370  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||  |||||||| | |||||||||| | ||||| || ||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  24688441 cataaacctaactcaatcaatccacacaaagtgtatgtcaacccaaacaggtgatacaaagaaataaaaacaacaccggtgaatgtctaatatgcggtgt 24688342  T
Q  371 atggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagtccaacatcagg 470  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||| |||||||| | ||||||||| |||| |||||||| |||||||  |||| ||||| |||    
T  24688341 atggacaaaccgtcaacacggaatggatccaagaaccaacaactccttgcaacagcaacaagtataacgtctctttcgagccaaagagtcgaacattagg 24688242  T
Q  471 tagactgatgaggattatgaaacctcccccaagttatacaaag--aaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggatgcataagcccacgcc 568  Q
    |||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| | | ||  ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  24688241 tagactgatgaggattttgaaaacctccccaagttaaatagagccaaaattggtgaaggtgagagattctaccaccaacacggatacaaaaccccacgcc 24688142  T
Q  569 tacaacccactatgct 584  Q
    ||||||||||||||||    
T  24688141 tacaacccactatgct 24688126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 272 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 39605987 - 39605710
Alignment:
Q  272 ataaacctaacccaatcaattcacacaacgtgtattccaacccaatcgggtgatacaatgcaataagaaaaacaccggtgaatttctaacatgtggtgta 371  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||     ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  39605987 ataaatctaacccagtcaattcacacatagtgta-----acccaatcgggtgatacaaagaaataa-aacaacaccagtgaatgtctaacatgcggtgta 39605894  T
Q  372 tggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagtccaacatcaggt 471  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||| || |||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  39605893 tggacaaaccgtcaacacggaatgtatccaagaaccaacaactccttgcgacagcaacaagtataacgtctctttcgagccaaacagtccaacatcaggt 39605794  T
Q  472 agactgatgaggattatgaaacctcccccaagttatacaaag--aaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggat 553  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39605793 agactgatgaggattttgcaacctccccgaagttatatagagtcaaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggat 39605710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 272 - 640
Target Start/End: Original strand, 18995234 - 18995601
Alignment:
Q  272 ataaacctaacccaatcaattcacacaacgtgtattccaacccaatcgggtgatacaatgcaataagaaaaacaccggtgaatttctaacatgtggtgta 371  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||   ||||| || |||| ||||| || |||||| |||| ||||    
T  18995234 ataaacctaacccagccaatccacacaaagtgtatgccaatccaatcggatgatacaaaaaaataaaaacaacatcggtggatgtctaacgtgtgatgta 18995333  T
Q  372 tggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagtccaacatcaggt 471  Q
    ||||| || | |||||| | |||||||| || |||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||| || || || |||||||       
T  18995334 tggactaatcatcaacacgaaatggatctaagaaccaacaactccttgcgacaacaacaagcatagtgtctctttcgagcaaaccaatctaacatca--a 18995431  T
Q  472 agactgatgaggattatgaaacctcccccaagttatacaaag--aaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggatgcataagcccacgcct 569  Q
    ||  |||||   ||| | ||||||| ||||||||||| |  |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||    
T  18995432 aggttgatgcaaatttttaaacctctcccaagttatatagtgccaaacttcgtgaaggtgagagattcgaccgccaacacggatacagaaccccacgcct 18995531  T
Q  570 acaacccactatgctgcaacaaaaatctttcatggttatttctagccaaatccagtagaaagaaactcaaa 640  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||||   ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  18995532 acaacccgctatgctacgacaaaaagc-ttcatgaccatttctagccaaatccattagaaagcaacccaaa 18995601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 272 - 586
Target Start/End: Original strand, 23846199 - 23846514
Alignment:
Q  272 ataaacctaacccaatcaattcacacaacgtgtattccaacccaatcgggtgatacaatgcaataagaaaaacaccggtgaattt--ctaacatgtggtg 369  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||| | ||||||||||   ||||| || |||||  ||| || |  |||||| | ||||    
T  23846199 ataaacctaacccaatcaatccacacaaagtgtatgtcaacccaaacaggtgatacaaa--aataaaaacaacactagtggatatgtctaacaggcggtg 23846296  T
Q  370 tatggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagtccaacatcag 469  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||| || |||||||| |||||||||| |||||||||| |||  ||||||| ||||||| |||||||||||||     
T  23846297 tatggacaaaccgtcaacacgaaatgaatccaagaaccaacaactccttgcgacagcaacaagcctaacatctctttcgagccaaacagtccaacatcaa 23846396  T
Q  470 gtagactgatgaggattatgaaacctcccccaagttatacaaag--aaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggatgcataagcccacgc 567  Q
      |||| |||||||||| ||||||| |  |||||||||| | ||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || | ||| |    
T  23846397 acagaccgatgaggattttgaaaccgcatccaagttatatagagtcaaacttagtgaaggtgagagattctaccaccaacacggattcagaaccacacac 23846496  T
Q  568 ctacaacccactatgctgc 586  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  23846497 ctacaaccc-ctatgctgc 23846514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 265 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 46857839 - 46857476
Alignment:
Q  265 ggggtacataaacctaacccaatcaattcacacaacgtgtattccaacccaatcgggtgatacaatgcaataagaaaaacaccggtgaattt--ctaaca 362  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||  ||| |||| | ||||||||||   ||||| || |||||| ||| || |  ||||||    
T  46857839 gggggacataaacctaacccagtcaatccacacaaagtgtatgtcaatccaaacaggtgatacaaa--aataaaaacaacaccagtggatgtgtctaaca 46857742  T
Q  363 tgtggtgtatggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagtcca 462  Q
     | |||||||| |||||||||||||| | |||| ||| || |||||||| |||||||||| |||||||||| |||  ||||||| ||||||| |  ||||    
T  46857741 ggcggtgtatgaacaaaccgtcaacacggaatgaatccaagaaccaacaactccttgcgacagcaacaagcctaacatctctttcgagccaaacgatcca 46857642  T
Q  463 acatcaggtagactgatgaggattatgaaacctcccccaagttatacaaag--aaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggatgcataag 560  Q
    ||||||   |||  |||||||||| ||||||| |||  |||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||     
T  46857641 acatcaaacagatcgatgaggattttgaaaccaccc--aagttatatagagtcaaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggattcagaac 46857544  T
Q  561 cccacgcctacaacccactatgctgcaacaaaaatctttcatggttatttctagccaaatccagtagaaa 630  Q
    | |||||||||||||| ||||||||| ||  ||| | |||| ||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  46857543 cacacgcctacaaccc-ctatgctgcgacggaaagc-ttcacggccatttctagccaaatccaatagaaa 46857476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 261 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 24056525 - 24056280
Alignment:
Q  261 aactggggtacataaacctaacccaatcaattcacacaacgtgtattccaacccaatcgggtgatacaatgcaataagaaaaacaccggtgaatttctaa 360  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||| || | |||||||||||||||||||| | ||||| || ||||| || |||| ||||     
T  24056525 aactgggggacataaacctaacccagtcaattcacacagagtgcatgcaaacccaatcgggtgatacaaagaaataaaaataacactggcgaatgtctag 24056426  T
Q  361 catgtggtgtatggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagtc 460  Q
    | || ||||||||||| |||| | |||| |  || |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| ||  | ||    
T  24056425 cgtgcggtgtatggaccaaccattaacacgagatagatccaaaaaccaacaactccttgcgacagcaacaagcatagcgtctctttcgagctaaaaaatc 24056326  T
Q  461 caacatcaggtagactgatgaggattatgaaacctcccccaagttata 508  Q
    ||||||||   |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24056325 caacatca--aagaccgatgaggattttgaaacctcccccaagttata 24056280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 284 - 553
Target Start/End: Original strand, 7193919 - 7194185
Alignment:
Q  284 caatcaattcacacaacgtgtattccaacccaatcgggtgatacaatgcaataagaaaaacaccggtgaatttctaacatgtggtgtatggacaaaccgt 383  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||   ||||| || || | |||||||| |||||  || ||||||| ||   ||| |    
T  7193919 caatcaatccacacaatgtgtatgccaacccaatcggataatacaaataaataaaaacaatatcggtgaatgtctaatgtgcggtgtataga---accat 7194015  T
Q  384 caacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagtccaacatcaggtagactgatgagg 483  Q
    |||||   |||||||| || |||||||| |||||||| | ||| |||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||   | ||||||||||    
T  7194016 caacacaaaatggatccaagaaccaacaactccttgcaacagccacaaacataacgtctctttcgagccaaacagtccaacatca--aaaactgatgagg 7194113  T
Q  484 attatgaaacctcccccaagttatacaaag--aaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggat 553  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |  |  |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  7194114 attttgaaacctcccccaagttatagagtgccaaacttcgtgaatgtgagaaattcgaccgccaacacggat 7194185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 31135724 - 31135539
Alignment:
Q  265 ggggtacataaacctaacccaatcaattcacacaacgtgtattccaacccaatcgggtgatacaatgcaataagaaaaacaccggtgaatttctaacatg 364  Q
    |||| ||||||||||||| || || || |||||||  ||||  |||| |||||| |||||||||| | |||||||| ||||  ||||||| |||||| ||    
T  31135724 gggggacataaacctaactcagtcgatccacacaaa-tgtaagccaatccaatcaggtgatacaaagaaataagaataacattggtgaatgtctaacgtg 31135626  T
Q  365 tggtgtatggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagc 451  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||  || |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  31135625 tggtgtatagaccaaccgtcaacatgaaatggattcaagaaccaacaactccttgcgattgcaacaaacataacgtctctttcgagc 31135539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 227
Target Start/End: Original strand, 23846073 - 23846157
Alignment:
Q  143 tgacataaaaaaggaacggaaaacggtccaaaagttggaatgtcttgcagattccaatctatgtcaggtactcatatatattatt 227  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23846073 tgacataaaaaaggaatagaaaacagtccaaaagatggaatgtcctatagattccgatctatgtcaggtactcatatatattatt 23846157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 46857960 - 46857875
Alignment:
Q  142 atgacataaaaaaggaacggaaaacggtccaaaagttggaatgtcttgcagattccaatctatgtcaggtactcatatatattatt 227  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46857960 atgacataaaaaaggaatagaaaacagtctaaaagatggaatgtcctgcagatttcgatctatgtcaggtcctcatatatattatt 46857875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 39606088 - 39606029
Alignment:
Q  168 gtccaaaagttggaatgtcttgcagattccaatctatgtcaggtactcatatatattatt 227  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  39606088 gtccaaaagttgaaatgtcttgcagattccagtctatgtcgggaactcatatatattatt 39606029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24688572 - 24688491
Alignment:
Q  145 acataaaaaaggaacggaaaacggtccaaaagttggaatgtcttgcagattccaatctatgtcaggtactcatatatattat 226  Q
    ||||||||||||||  |||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||    
T  24688572 acataaaaaaggaatagaaagcagtccaaaagatggaatgtcttggagattccagtttatgtcaggtgctcatgtatattat 24688491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 19543587 - 19543545
Alignment:
Q  11 cagagataaacttaaaatatcaaaacggaacaaattttaatta 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19543587 cagagataaacttaaaatatcaaaacggaataaattttaatta 19543545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 223
Target Start/End: Original strand, 28086413 - 28086461
Alignment:
Q  175 agttggaatgtcttgcagattccaatctatgtcaggtactcatatatat 223  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  28086413 agttggaatgacttgcagattctagtctatgtcaggtgctcatatatat 28086461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24056608 - 24056554
Alignment:
Q  173 aaagttggaatgtcttgcagattccaatctatgtcaggtactcatatatattatt 227  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  24056608 aaagttgaaatgtcttatagattcccgtttatgtcaggtactcatatatattatt 24056554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29127756 - 29127699
Alignment:
Q  162 aaaacggtccaaaagttggaatgtcttgcagattccaatctatgtcaggtactcatata 220  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29127756 aaaacagtccgaaaattggaatgt-ttacagattccaatctatgtcaggttctcatata 29127699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 56 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 19543528 - 19543476
Alignment:
Q  56 ctaattaaatagttaaaggacaaaaatagcaatttagcttattttttactccc 108  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  19543528 ctaaataaatagttaagggacgaaaatagcaattaagtttatattttactccc 19543476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 57 - 93
Target Start/End: Original strand, 24446322 - 24446358
Alignment:
Q  57 taattaaatagttaaaggacaaaaatagcaatttagc 93  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24446322 taattaaatagttaagggacaaaaataacaatttagc 24446358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Original strand, 40740012 - 40740052
Alignment:
Q  13 gagataaacttaaaatatcaaaacggaacaaattttaatta 53  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  40740012 gagataaacttaaaataccaaaacggaacgtattttaatta 40740052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 17)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 264 - 642
Target Start/End: Original strand, 3330528 - 3330909
Alignment:
Q  264 tggggtacataaacctaacccaatcaattcacacaacgtgtattccaacccaatcgggtgatacaatgcaataagaaaaacaccggtgaatttctaacat 363  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||||| | |||||||||  |  |||| || |||||||||| || |||||||     
T  3330528 tgggggacataaacctaacccagtcaatccacacaaagtgtatgtcaacccaaacaggtgatacagggggataaaaacaacaccggtggatgtctaacag 3330627  T
Q  364 gtggtgtatggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaa--gcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagtcc 461  Q
    | ||||||||||||||||||| ||| | |||| ||| || |||||||| |||||||||| |  ||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  3330628 gcggtgtatggacaaaccgtcgacacggaatgaatccaagaaccaacaactccttgcgacatagcaacaagcctaacgtctctttcgagccaaacagtcc 3330727  T
Q  462 aacatcaggtagactgatgaggattatgaaacctcccccaagttatacaaag--aaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggatgcataa 559  Q
    ||||||||| | || || ||||||| ||||||| |  |||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  3330728 aacatcaggcataccgaagaggattttgaaaccgcatccaagttatatagagtgaaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggatacagaa 3330827  T
Q  560 gcccacgcctacaacccactatgctgcaacaaaaatctttcatggttatttctagccaaatccagtagaaagaaactcaaaac 642  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |   ||| | |||| ||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  3330828 ccccacgcctacaacccactatgctgcgatggaaagc-ttcacggccatttctagccaaatcccatagaaagtaactcaaaac 3330909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 265 - 640
Target Start/End: Original strand, 6512673 - 6513043
Alignment:
Q  265 ggggtacataaacctaacccaatcaattcacacaacgtgtattccaacccaatcgggtgatacaatgcaataagaaaaacaccggtgaatttctaacatg 364  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||  || ||||||  ||||||||| | || |||||| | ||||| || ||||||||||||| |||||| ||    
T  6512673 gggggacataaacctaacccagtcaattcactgaaagtgtatgtcaacccaattgagtaatacaaagaaataa-aacaacaccggtgaatgtctaacttg 6512771  T
Q  365 tggtgtatggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagtccaac 464  Q
     ||||||||||| ||||||||||| | |||||||| || |||||||| ||| |||| | | || |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  6512772 cggtgtatggaccaaccgtcaacacgaaatggatccaagaaccaacaactctttgcaacaacagcaagaataatgtctctttcgagccaaacagtccagc 6512871  T
Q  465 atcaggtagactgatgaggattatgaaacctcccccaagttatacaaagaaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggatgcataagccca 564  Q
    ||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||    
T  6512872 atca--aagactgatgaggattttgaaacctcccccaagttatagtgctaaactttgtgaaggtgagagattcgaccgccaacacggatacagaa-ccca 6512968  T
Q  565 cgcctacaacccactatgctgcaacaaaaatctttcatggttatttctagccaaatccagtagaaagaaactcaaa 640  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| ||| | |||| |   ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  6512969 cgcctacaacccgctatgctgcgacagaaagc-ttcacgaccatttctagccaaatccaatagaaagcaactcaaa 6513043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 265 - 585
Target Start/End: Original strand, 6472936 - 6473247
Alignment:
Q  265 ggggtacataaacctaacccaatcaattcacacaacgtgtattccaacccaatcgggtgatacaatgcaataagaaaaacaccggtgaatttctaacatg 364  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||| ||||| |||||| ||    
T  6472936 gggggacataaacctaacccagtcaattcactcaaagtgtatgtcaacccaatcgggtgatacaaagaaataa-aacaacaccgatgaatgtctaacttg 6473034  T
Q  365 tggtgtatggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagtccaac 464  Q
     ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| | | ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  6473035 cggtgtatggaccaaccgtcaacacgaaatggatcaaagaaccaacaactccttgcaacaacaacaagaataatgtctctttcgagccaaacagtccatc 6473134  T
Q  465 atcaggtagactgatgaggattatgaaacctcccccaagttatacaaagaaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggatgcataagccca 564  Q
    ||||   ||||||||||||||| |||||     |||||||||||     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||    
T  6473135 atca--aagactgatgaggattttgaaa-----cccaagttatagtgccaaactttgtgaaggtgagagattcgaccgccaacacggatacagaa-ccca 6473226  T
Q  565 cgcctacaacccactatgctg 585  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  6473227 cgcctacaacccgctatgctg 6473247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 264 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 6748549 - 6748241
Alignment:
Q  264 tggggtacataaacctaacccaatcaattcacacaacgtgtattccaacccaatcgggtgatacaatgcaataagaaaaacaccggtgaatttctaacat 363  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||| | |||| |    
T  6748549 tgggggacataaacctaacccagtcaattcactcaaagtgtatgtcaacccaatcgggtgatacaaagaaataa-aacaacaccggtgaatgtttaactt 6748451  T
Q  364 gtggtgtatggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagtccaa 463  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| | |||||||| || |||||||| |||||||| | | ||||||| ||||||||||||| |||| || || ||||     
T  6748450 gcggtgtatggaccaaccgtcaacacgaaatggatccaagaaccaacaactccttgcaacaacaacaagaataatgtctctttcgagctaaacaatccat 6748351  T
Q  464 catcaggtagactgatgaggattatgaaacctcccccaagttatacaaagaaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggatgcataagccc 563  Q
    |||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| || || |||    
T  6748350 catca--aagactgatgaggattttgaaacctcccccaagttatagtgccaaactttgtgaaggtgagagatttgaccgccaacacggatacagaa-ccc 6748254  T
Q  564 acgcctacaaccc 576  Q
    |||||||||||||    
T  6748253 acgcctacaaccc 6748241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 264 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 15820124 - 15819845
Alignment:
Q  264 tggggtacataaacctaacccaatcaattcacacaacgtgtattccaacccaatcgggtgatacaatgcaataagaaaaacaccggtgaatttctaacat 363  Q
    ||||| ||||| |||||||| | ||||| || |||| |||||  |||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||| | |||||  |    
T  15820124 tgggggacatatacctaacctagtcaatccatacaaagtgtaaaccaacccaatcgggtgatacaaagaaataaaaacaacaccggtgattgtctaatgt 15820025  T
Q  364 gtggtgtatggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagtccaa 463  Q
    | ||||||||||| |||||| |||| | |||||||| || |||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  15820024 gcggtgtatggaccaaccgtgaacacgaaatggatccaagaaccaacaactccttgcgatagaaacaagcataacgtctctttcgagccaaacagtccaa 15819925  T
Q  464 catcaggtagactgatgaggattatgaaacctcccccaagttatacaaag--aaacttcgtgaaggtgagagattctaccgc 543  Q
    |||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |  |  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15819924 catca--aagactgatgaggattttgaaacctcccccaagatatatagtgccaaacttcgtgaaggtgagagattcgaccgc 15819845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 265 - 574
Target Start/End: Original strand, 6473453 - 6473758
Alignment:
Q  265 ggggtacataaacctaacccaatcaattcacacaacgtgtattccaacccaatcgggtgatacaatgcaataagaaaaacaccggtgaatttctaacatg 364  Q
    |||| |||||||| ||| |||  |||||||| ||| ||||||  |||||||||||| |||||||| | ||||| || ||||||||||||| |||||| ||    
T  6473453 gggggacataaacttaagccagacaattcactcaaagtgtatgtcaacccaatcggatgatacaaagaaataa-aacaacaccggtgaatgtctaacttg 6473551  T
Q  365 tggtgtatggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagtccaac 464  Q
     ||||||||||| ||||||||||| | |||||||| || |||||||| ||| |||| | | ||||||| ||||||||||||| |||| ||  |||||| |    
T  6473552 cggtgtatggaccaaccgtcaacacgaaatggatccaagaaccaacaactctttgcaacaacaacaagaataatgtctctttcgagctaaagagtccatc 6473651  T
Q  465 atcaggtagactgatgaggattatgaaacctcccccaagttatacaaagaaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggatgcataagccca 564  Q
    ||||   ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||     ||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||| || || ||||    
T  6473652 atca--aagactgatgaggattttgaaacctccctcaagttatagtgccaaactttttgaaggtgagagatttgaccgccaacacggatacagaa-ccca 6473748  T
Q  565 cgcctacaac 574  Q
    ||||||||||    
T  6473749 cgcctacaac 6473758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 265 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 40475297 - 40474927
Alignment:
Q  265 ggggtacataaacctaacccaatcaattcacacaacgtgtattccaacccaatcgggtgatacaatgcaataagaaaaacaccggtgaatttctaacatg 364  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||   ||| | || |||||||||| ||  |||| ||     
T  40475297 gggggacataaacctaacccagtcaatccacaga--gtgtatgccaacccaatcgggtgatacaaaaaaatcaaaacaacaccggtggatgcctaatata 40475200  T
Q  365 tggtgtatggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagtccaac 464  Q
    || ||||||||| | ||||||||| | ||| || | || |||||||| |||||||||| | ||||||||| ||  ||||||| ||| ||| |||||||||    
T  40475199 tgatgtatggaccatccgtcaacacggaattgaaccaagaaccaacaactccttgcgacaacaacaagcaaaacatctctttcgagacaaacagtccaac 40475100  T
Q  465 atcaggtagactgatgaggattatgaaacctcccccaagttatacaaagaaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggatgcataagccca 564  Q
    |||||  ||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||     |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |  |  ||||    
T  40475099 atcag--agactgatgcggattttgaaacat-ccccaagttatagtgtcaaacttcgtgaaggtgggagattcgaccgccaacacggatacggatcccca 40475003  T
Q  565 cgcctac-aacccactatgctgcaacaaaaatctttcatggttatttctagccaaatccagtagaaagaaactcaaa 640  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||  || | |||| |   |||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  40475002 cgcctacaaacccattatgctgcgacagtaagc-ttcacgaccatttctagccaaatccaacagaaagcaactcaaa 40474927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 265 - 586
Target Start/End: Original strand, 818039 - 818356
Alignment:
Q  265 ggggtacataaacctaacccaatcaattcacacaacgtgtattccaacccaatcgggtgatacaatgcaataagaaaaacaccggtgaatttctaacatg 364  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||| |||| |  |||||| |||||||||||||| |||||||   ||| | || |||||||||| ||  |||| ||     
T  818039 gggggacataaacctaactcagtcaatccacaga--gtgtatgccaacccaatcgggggatacaaaaaaatcaaaacaacaccggtggatgcctaatata 818136  T
Q  365 tggtgtatggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagtccaac 464  Q
     ||||||||||| | ||||||||||| ||| || | || |||||||| |||||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||| ||| || ||||||    
T  818137 aggtgtatggaccatccgtcaacatgaaattgaaccaagaaccaacaactccttgcgacagcaacaagcaaagcgtctctttcgagacaaacaatccaac 818236  T
Q  465 atcaggtagactgatgaggattatgaaacctcccccaagttatacaaagaaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggatgcataagccca 564  Q
    |||||  ||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||     |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |  |  ||||    
T  818237 atcag--agactgatgcggattttgaaacat-ccccaagttatagtgtcaaacttcgtgaaggtgggagattcgaccgccaacacggatacggatcccca 818333  T
Q  565 cgcctac-aacccactatgctgc 586  Q
    ||||||| |||||| ||||||||    
T  818334 cgcctacaaacccattatgctgc 818356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 448 - 640
Target Start/End: Original strand, 38111863 - 38112053
Alignment:
Q  448 gagccaagcagtccaacatcaggtagactgatgaggattatgaaacctcccccaagttatacaaag--aaacttcgtgaaggtgagagattctaccgcca 545  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |  |  |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  38111863 gagccaaacagtccaacatcaaata--ctgatgtggattttgaaacc-cccccaagttatatagtgtcaaacttcgtgaaggtgggagattcgaccgcca 38111959  T
Q  546 acacggatgcataagcccacgcctacaacccactatgctgcaacaaaaatctttcatggttatttctagccaaatccagtagaaagaaactcaaa 640  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||  |||||||  ||||||| | |||| ||  ||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  38111960 acacggatacagaaccccacacctacaacccgttatgctgtgacaaaaaac-ttcacggccatttctagccaaatccaatataaagtaactcaaa 38112053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 426 - 640
Target Start/End: Original strand, 37978779 - 37978992
Alignment:
Q  426 caacaagcataatgtctcttttgagccaagcagtccaacatcaggtagactgatgaggattatgaaacctcccccaagttatacaaag--aaacttcgtg 523  Q
    |||||||||||  |||||||| |||| || || ||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |  ||||||||||    
T  37978779 caacaagcatagcgtctctttcgagctaaacaatccaacatcaa--agactgatgaggattttgaaacctcccccaagttatatagtgctaaacttcgtg 37978876  T
Q  524 aaggtgagagattctaccgccaacacggatgcataagcccacgcctacaacccactatgctgcaacaaaaatctttcatggttatttctagccaaatcca 623  Q
    ||||||||| || | |||||||||||  || || || | ||| |||||||||| | ||||||||||| ||| | ||||     |||||||||||||||||    
T  37978877 aaggtgagaaatccgaccgccaacacaaatacagaacctcactcctacaacccgcgatgctgcaacagaaagc-ttcacaaccatttctagccaaatcca 37978975  T
Q  624 gtagaaagaaactcaaa 640  Q
     ||||||| | ||||||    
T  37978976 atagaaagcagctcaaa 37978992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 227
Target Start/End: Original strand, 3330410 - 3330493
Alignment:
Q  144 gacataaaaaaggaacggaaaacggtccaaaagttggaatgtcttgcagattccaatctatgtcaggtactcatatatattatt 227  Q
    |||||||||||||||  ||||   ||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3330410 gacataaaaaaggaatagaaagtagtctaaaagatggaatgtcttacagattccagtctatgtcaggtactcatatatattatt 3330493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 367 - 506
Target Start/End: Original strand, 4611681 - 4611816
Alignment:
Q  367 gtgtatggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagtccaacat 466  Q
    |||||||||  | ||||||||| | || | ||| || |||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||  || || || || |     
T  4611681 gtgtatggatcatccgtcaacacggaacgaatccaagaaccaacaactccttgcaacaacaacaagcataatgtctctttcgagttaaaca-tcaaata- 4611778  T
Q  467 caggtagactgatgaggattatgaaacctcccccaagtta 506  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4611779 --ggtagactgatgaggattttgaaacctcccccaagtta 4611816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 223
Target Start/End: Original strand, 817942 - 817990
Alignment:
Q  175 agttggaatgtcttgcagattccaatctatgtcaggtactcatatatat 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  817942 agttggagtgtcttgcagattccagtctatgtcaggtgctcatatatat 817990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15820211 - 15820163
Alignment:
Q  175 agttggaatgtcttgcagattccaatctatgtcaggtactcatatatat 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  15820211 agttggaatgtcttgcagattccagtctaggtcaggtgctcatatatat 15820163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 223
Target Start/End: Original strand, 41696324 - 41696372
Alignment:
Q  175 agttggaatgtcttgcagattccaatctatgtcaggtactcatatatat 223  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  41696324 agttggagtgtcttgcagattccaatctatgtcaggtgcttatatatat 41696372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 514 - 576
Target Start/End: Original strand, 11985204 - 11985266
Alignment:
Q  514 aaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggatgcataagcccacgcctacaaccc 576  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |  || ||||| ||||||||||    
T  11985204 aaacttcgtgaaggtgagagattcgatcgccaacacgaatacggaaccccacacctacaaccc 11985266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 40475391 - 40475345
Alignment:
Q  177 ttggaatgtcttgcagattccaatctatgtcaggtactcatatatat 223  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  40475391 ttggagtgtcttgcagattccagtctatatcaggtgctcatatatat 40475345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 7)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 265 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 34967954 - 34967647
Alignment:
Q  265 ggggtacataaacctaacccaatcaattcacacaacgtgtattccaacccaatcgggtgatacaatgcaataagaaaaacaccggtgaatttctaacatg 364  Q
    |||| ||||| |||||||| | ||||| ||||||| ||||||  ||||||||| | ||||||||| | ||||| || | |||  |||||| |||||||||    
T  34967954 gggggacatacacctaacctagtcaatccacacaaagtgtatgtcaacccaatagagtgatacaaagaaataaaaacatcactagtgaatgtctaacatg 34967855  T
Q  365 tggtgtatggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagtccaac 464  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||| | ||| |  ||| ||||||| | |||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  34967854 tggtgtatgga-aaaccgtcaacacggaatggatcaaagaaccaaaaactcatctcgacagcaacaggtataacgtctctttcgagccaaacagtccaac 34967756  T
Q  465 atcaggtagactgatgaggattatgaaacctcccccaagttatacaaag--aaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggatgcataagcc 562  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||   ||| |||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  34967755 atcaggtagactgatgaggattttgaaac--tcccgaagttatatagagccaaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggatacataacct 34967658  T
Q  563 cacgcctacaa 573  Q
    |||||||||||    
T  34967657 cacgcctacaa 34967647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 357 - 468
Target Start/End: Original strand, 22998337 - 22998448
Alignment:
Q  357 ctaacatgtggtgtatggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagc 456  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||  ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  22998337 ctaacatgcggtgtatggaccaaccgtcaacacgaaattcatccaagaaccaacagctccttgcgacagcaacaagcataacgtctctttcgagccaaac 22998436  T
Q  457 agtccaacatca 468  Q
    ||||||||||||    
T  22998437 agtccaacatca 22998448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 356 - 468
Target Start/End: Original strand, 7406474 - 7406586
Alignment:
Q  356 tctaacatgtggtgtatggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaag 455  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||   || | ||  || |||||||| || ||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||     
T  7406474 tctaaaatgtggtgtatggaccaaccgtcaacacaaaacgaattcaagaaccaacaactacttgcaacaacaacaagcataacgtctcttttgagccaaa 7406573  T
Q  456 cagtccaacatca 468  Q
     ||||||||||||    
T  7406574 aagtccaacatca 7406586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34968071 - 34967989
Alignment:
Q  143 tgacataaaaaaggaacggaaaacggtccaaaagttggaatgtcttgcagattccaatctatgtcaggtactcatatatattatt 227  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||  || |||||||||||||||    
T  34968071 tgacataaaaaaggaatagaaaacagtccaaaagttggaat-acttgca-attccagtctatgtctagtgctcatatatattatt 34967989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 518 - 586
Target Start/End: Original strand, 13151654 - 13151723
Alignment:
Q  518 ttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggatgcataagccc-acgcctacaacccactatgctgc 586  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || || ||| | |||||||||||||| ||||||    
T  13151654 ttcgtgaaggtgagagattcgaccaccaacacggatacagaaccccaatgcctacaacccactgtgctgc 13151723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 227
Target Start/End: Original strand, 13151368 - 13151420
Alignment:
Q  175 agttggaatgtcttgcagattccaatctatgtcaggtactcatatatattatt 227  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  13151368 agttgaaatgtcttgcagatttcagtctttgtcaggtgctcatatatattatt 13151420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 35004017 - 35003967
Alignment:
Q  173 aaagttggaatgtcttgcagattccaatctatgtcaggtactcatatatat 223  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||    
T  35004017 aaagttagaatgtcttgcagattccagtctatgtcatgtgctcctatatat 35003967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 120; Significance: 5e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 265 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 22227 - 21916
Alignment:
Q  265 ggggtacataaacctaacccaatcaattcacacaacgtgtattccaacccaatcgggtgatacaatgcaataagaaaaacaccggtgaatttctaacatg 364  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||||| | ||||||||||   ||||| || || ||| ||| || |||||||||    
T  22227 gggggacataaacttaacccagtcaatccacacaaagtgtatgtcaacccaaacaggtgatacaaa--aataaaaacaataccagtggatgtctaacatg 22130  T
Q  365 tggtgtatggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagtccaac 464  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| ||| || |||||||| |||||||||| | |||||||| |||  || ||||  |||||| |||||||||    
T  22129 tggtgtatggacaaaccgtcaacacggaatgaatcgaagaaccaacaactccttgcgacatcaacaagcctaacatcactttcaagccaaacagtccaac 22030  T
Q  465 atcaggtagactgatgaggattatgaaacctcccccaagttatacaaag--aaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggatgcataagcc 562  Q
    |||||  |||| |||||||||| ||||||| |  |||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||    
T  22029 atcagacagaccgatgaggattttgaaaccgcatccaagttatatagagtcaaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggattcagaaccc 21930  T
Q  563 cacgcctacaaccc 576  Q
    ||||||||||||||    
T  21929 cacgcctacaaccc 21916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 143 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22325 - 22241
Alignment:
Q  143 tgacataaaaaaggaacggaaaacggtccaaaagttggaatgtcttgcagattccaatctatgtcaggtactcatatatattatt 227  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22325 tgacataaaaaaggaatagaaaatagtccaaaagatggaatgtcctgcagattccaatctatgtcaggtactcatatatattatt 22241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 108; Significance: 7e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 270 - 547
Target Start/End: Original strand, 19260 - 19538
Alignment:
Q  270 acataaacctaacccaatcaattcacacaacgtgtattccaacccaatcgggtgatacaatgcaataagaaaaacaccggtgaatttctaacat---gtg 366  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| ||||||||   || || ||||||||  |||||| ||||||||   |||    
T  19260 acattaacctaactcaatcaatccacacaaagtgtatgtcaatccaatcggatgatacaa---aaaaaaaaaaacactagtgaatgtctaacatacagtg 19356  T
Q  367 gtgtatggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagtccaacat 466  Q
     |||| |||||||||||||||| | |||||||| || |||||| | |||||||| | ||||| ||| |||| |||||||| ||||||| ||||||| |||    
T  19357 -tgtaaggacaaaccgtcaacacggaatggatccaagaaccaagaactccttgctacagcaataagtataacgtctctttcgagccaaacagtccagcat 19455  T
Q  467 caggtagactgatgaggattatgaaacctcccccaagttatacaaag--aaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaac 547  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19456 caggtagactgatgaggattttgaaacctcccccaagttatatagagccaaacttcgtaaaggtgagagattctaccgccaac 19538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0625 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0625
Description:

Target: scaffold0625; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 272 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 1422 - 1055
Alignment:
Q  272 ataaacctaacccaatcaattcacacaacgtgtattccaacccaatcgggtgatacaatgcaataagaaaaacaccggtgaatttctaacatgtggtgta 371  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||   ||||| || |||| ||||| || |||||| |||| ||||    
T  1422 ataaacctaacccagccaatccacacaaagtgtatgccaatccaatcggatgatacaaaaaaataaaaacaacatcggtggatgtctaacgtgtgatgta 1323  T
Q  372 tggacaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagtccaacatcaggt 471  Q
    ||||| || | |||||| | |||||||| || |||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||| || || || |||||||       
T  1322 tggactaatcatcaacacgaaatggatctaagaaccaacaactccttgcgacaacaacaagcatagtgtctctttcgagcaaaccaatctaacatca--a 1225  T
Q  472 agactgatgaggattatgaaacctcccccaagttatacaaag--aaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaacacggatgcataagcccacgcct 569  Q
    ||  |||||   ||| | ||||||| ||||||||||| |  |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||    
T  1224 aggttgatgcaaatttttaaacctctcccaagttatatagtgccaaacttcgtgaaggtgagagattcgaccgccaacacggatacagaaccccacgcct 1125  T
Q  570 acaacccactatgctgcaacaaaaatctttcatggttatttctagccaaatccagtagaaagaaactcaaa 640  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||| | ||||||   ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  1124 acaacccgctatgctacgacaaaaagc-ttcatgaccatttctagccaaatccattagaaagcaacccaaa 1055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 91; Significance: 9e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 275 - 546
Target Start/End: Original strand, 93007 - 93278
Alignment:
Q  275 aacctaacccaatcaattcacacaacgtgtattccaacccaatcgggtgatacaatgcaataagaaaaacaccggtgaatttctaacatgtggtgtatgg 374  Q
    |||||||| |||||||| |||| || ||||||  |||||||||| ||| ||||||   || || || |||||  |||||| ||||||||  |||||||||    
T  93007 aacctaacacaatcaatccacataaagtgtatgtcaacccaatcaggtaatacaaaaaaaaaa-aacaacactagtgaatgtctaacatacggtgtatgg 93105  T
Q  375 acaaaccgtcaacatgtaatggatcaaaaaaccaacagctccttgcgaaagcaacaagcataatgtctcttttgagccaagcagtccaacatcaggtaga 474  Q
    ||||| ||| |||| | |||||||| || |||||| | |||||||| | | ||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  93106 acaaatcgttaacacggaatggatccaagaaccaagaactccttgcaataacaacaagtataacgtctctttcgagccaaacagtccaacatcaggtaga 93205  T
Q  475 ctgatgaggattatgaaacctcccccaagttatacaaag--aaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaa 546  Q
    ||||||| |||| ||||| || |||||| ||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  93206 ctgatgatgattttgaaatct-ccccaaattatatagagccaaacttcgtgaaggtgagagattctaccgccaa 93278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University