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Alignment Overview

Query: NF11573_high_10 (Length: 401)

Name: NF11573_high_10
Description: NF11573
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11573_high_10
NF11573_high_10
[»] chr1 (13 HSPs)
chr1 (14-339)||(20254376-20254701)
chr1 (14-196)||(21650050-21650232)
chr1 (75-199)||(15861434-15861558)
chr1 (258-343)||(20893509-20893594)
chr1 (75-199)||(22367141-22367265)
chr1 (14-199)||(40436269-40436453)
chr1 (189-343)||(51452729-51452883)
chr1 (112-199)||(20194185-20194273)
chr1 (112-199)||(25094019-25094106)
chr1 (81-172)||(44035006-44035097)
chr1 (14-92)||(7641048-7641125)
chr1 (14-71)||(49997409-49997465)
chr1 (287-343)||(20913353-20913409)
[»] chr5 (27 HSPs)
chr5 (8-343)||(17909562-17909897)
chr5 (14-196)||(7528963-7529145)
chr5 (14-196)||(9730393-9730575)
chr5 (14-196)||(108843-109025)
chr5 (14-199)||(16105706-16105890)
chr5 (233-343)||(9730236-9730347)
chr5 (187-343)||(32950930-32951086)
chr5 (187-343)||(34939512-34939669)
chr5 (247-340)||(7529206-7529299)
chr5 (46-199)||(21650789-21650942)
chr5 (98-199)||(22662683-22662784)
chr5 (51-199)||(25004915-25005063)
chr5 (75-199)||(2031933-2032057)
chr5 (75-199)||(11342808-11342932)
chr5 (233-343)||(108686-108797)
chr5 (269-342)||(25005137-25005210)
chr5 (258-343)||(27182429-27182514)
chr5 (75-199)||(21205049-21205173)
chr5 (188-343)||(20623205-20623360)
chr5 (188-343)||(21233400-21233555)
chr5 (271-343)||(2032135-2032207)
chr5 (271-343)||(18530946-18531018)
chr5 (188-343)||(16536433-16536588)
chr5 (188-343)||(37052980-37053135)
chr5 (269-343)||(22053711-22053785)
chr5 (188-302)||(25900319-25900433)
chr5 (14-71)||(6456687-6456743)
[»] chr8 (37 HSPs)
chr8 (14-343)||(22147501-22147830)
chr8 (14-343)||(18612469-18612798)
chr8 (9-343)||(2545004-2545339)
chr8 (76-343)||(16038744-16039012)
chr8 (14-197)||(18619374-18619557)
chr8 (14-196)||(22886390-22886571)
chr8 (14-196)||(3431291-3431473)
chr8 (14-196)||(21494471-21494641)
chr8 (233-343)||(3431134-3431245)
chr8 (247-343)||(21494314-21494410)
chr8 (54-199)||(21259499-21259644)
chr8 (247-343)||(22886632-22886728)
chr8 (50-199)||(17502259-17502408)
chr8 (188-343)||(22907086-22907241)
chr8 (49-199)||(23217974-23218124)
chr8 (75-177)||(41506839-41506941)
chr8 (46-199)||(22321454-22321607)
chr8 (75-199)||(24385760-24385884)
chr8 (188-343)||(5238323-5238478)
chr8 (188-343)||(24661120-24661275)
chr8 (98-177)||(39115421-39115500)
chr8 (188-343)||(43685782-43685937)
chr8 (14-199)||(45558937-45559121)
chr8 (50-179)||(4233953-4234082)
chr8 (258-343)||(43373350-43373435)
chr8 (101-177)||(274592-274668)
chr8 (101-177)||(641181-641257)
chr8 (101-177)||(826987-827063)
chr8 (14-80)||(18261590-18261655)
chr8 (269-343)||(24385610-24385684)
chr8 (14-80)||(33172291-33172356)
chr8 (269-339)||(41506671-41506741)
chr8 (270-343)||(7000478-7000551)
chr8 (14-71)||(27233195-27233251)
chr8 (115-199)||(18118289-18118373)
chr8 (14-62)||(19331451-19331498)
chr8 (47-79)||(22981286-22981318)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (14-343)||(164829-165158)
scaffold0001 (258-343)||(172199-172284)
scaffold0001 (258-343)||(177902-177987)
[»] chr6 (33 HSPs)
chr6 (14-343)||(19629393-19629721)
chr6 (14-343)||(16299844-16300173)
chr6 (14-196)||(32276774-32276956)
chr6 (9-196)||(18823398-18823585)
chr6 (9-196)||(18839253-18839440)
chr6 (14-199)||(4991135-4991319)
chr6 (46-199)||(22585554-22585707)
chr6 (46-199)||(22590385-22590538)
chr6 (268-343)||(13620669-13620744)
chr6 (46-199)||(15889714-15889867)
chr6 (47-199)||(25640564-25640715)
chr6 (247-343)||(32276617-32276713)
chr6 (233-343)||(18823241-18823352)
chr6 (233-343)||(18839096-18839207)
chr6 (187-339)||(35009314-35009467)
chr6 (75-199)||(26089858-26089982)
chr6 (46-199)||(15004915-15005067)
chr6 (287-343)||(15742078-15742134)
chr6 (75-199)||(35015165-35015289)
chr6 (68-199)||(18002504-18002635)
chr6 (187-343)||(27751660-27751816)
chr6 (269-343)||(18002353-18002427)
chr6 (269-343)||(26090059-26090133)
chr6 (75-172)||(18583440-18583537)
chr6 (98-199)||(19983300-19983401)
chr6 (258-343)||(23148292-23148377)
chr6 (258-343)||(23153743-23153828)
chr6 (187-302)||(1657660-1657776)
chr6 (115-199)||(17374927-17375011)
chr6 (98-199)||(15742227-15742329)
chr6 (269-343)||(23995247-23995321)
chr6 (14-92)||(29869890-29869967)
chr6 (115-199)||(19175314-19175398)
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (14-343)||(19697236-19697565)
chr4 (14-343)||(19707821-19708150)
chr4 (14-301)||(14996190-14996477)
chr4 (14-343)||(9795279-9795607)
chr4 (14-196)||(14500227-14500409)
chr4 (14-196)||(16522881-16523063)
chr4 (14-196)||(9295757-9295939)
chr4 (14-196)||(8045005-8045189)
chr4 (14-196)||(32460718-32460888)
chr4 (247-343)||(32460561-32460657)
chr4 (233-339)||(16523109-16523216)
chr4 (233-343)||(8045235-8045346)
chr4 (268-343)||(19020792-19020867)
chr4 (49-199)||(34177648-34177797)
chr4 (261-342)||(40885418-40885499)
chr4 (46-199)||(19559457-19559606)
chr4 (233-339)||(14500074-14500181)
chr4 (75-199)||(14951885-14952009)
chr4 (248-343)||(15674967-15675062)
chr4 (188-343)||(26680436-26680591)
chr4 (75-177)||(5682557-5682659)
chr4 (188-301)||(16327840-16327953)
chr4 (100-177)||(25119237-25119314)
chr4 (270-343)||(55376452-55376525)
chr4 (8-80)||(47468467-47468538)
chr4 (115-199)||(49071850-49071934)
chr4 (269-343)||(10104128-10104202)
chr4 (188-242)||(13048194-13048248)
chr4 (269-343)||(15135865-15135939)
chr4 (269-343)||(15272169-15272243)
chr4 (14-80)||(18238276-18238341)
chr4 (14-92)||(26339084-26339161)
chr4 (258-343)||(13246726-13246811)
chr4 (14-55)||(22352197-22352238)
chr4 (270-343)||(22738577-22738650)
chr4 (75-199)||(15272320-15272444)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (14-343)||(49710-50040)
[»] chr3 (49 HSPs)
chr3 (14-343)||(11477053-11477383)
chr3 (18-302)||(8275749-8276033)
chr3 (18-302)||(8268649-8268933)
chr3 (14-273)||(9303032-9303292)
chr3 (14-196)||(14285024-14285206)
chr3 (14-196)||(16933984-16934166)
chr3 (9-196)||(19946756-19946943)
chr3 (187-343)||(11986038-11986194)
chr3 (47-199)||(18970016-18970168)
chr3 (49-199)||(48421674-48421824)
chr3 (233-343)||(16933827-16933938)
chr3 (268-343)||(12901965-12902040)
chr3 (57-199)||(15550703-15550845)
chr3 (247-343)||(14285267-14285363)
chr3 (247-343)||(19947004-19947100)
chr3 (268-343)||(15938352-15938427)
chr3 (46-172)||(38168008-38168134)
chr3 (188-343)||(17912356-17912510)
chr3 (115-199)||(12539069-12539153)
chr3 (75-199)||(30153065-30153189)
chr3 (75-199)||(45581754-45581878)
chr3 (75-199)||(54685309-54685433)
chr3 (14-199)||(10912948-10913133)
chr3 (188-343)||(13954762-13954917)
chr3 (268-343)||(15936510-15936585)
chr3 (188-242)||(13975695-13975749)
chr3 (188-242)||(45861041-45861095)
chr3 (98-199)||(38375696-38375797)
chr3 (75-172)||(54038159-54038256)
chr3 (188-343)||(2449110-2449265)
chr3 (100-199)||(7854130-7854229)
chr3 (75-165)||(2844314-2844404)
chr3 (75-177)||(3992673-3992775)
chr3 (269-343)||(16261777-16261851)
chr3 (75-177)||(33342004-33342106)
chr3 (269-342)||(51960990-51961063)
chr3 (98-199)||(55513016-55513117)
chr3 (115-199)||(11402753-11402837)
chr3 (75-199)||(53771164-53771288)
chr3 (14-81)||(31412451-31412517)
chr3 (269-343)||(53771365-53771439)
chr3 (258-343)||(2050104-2050189)
chr3 (306-343)||(9302999-9303036)
chr3 (224-343)||(54651720-54651838)
chr3 (75-199)||(16261576-16261700)
chr3 (115-199)||(17393597-17393681)
chr3 (101-165)||(17956026-17956090)
chr3 (81-177)||(23492502-23492598)
chr3 (14-70)||(50313250-50313305)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (76-343)||(9370-9638)
[»] scaffold0162 (3 HSPs)
scaffold0162 (14-343)||(11808-12137)
scaffold0162 (187-342)||(8051-8208)
scaffold0162 (258-343)||(26298-26383)
[»] scaffold0173 (2 HSPs)
scaffold0173 (14-196)||(5284-5466)
scaffold0173 (247-343)||(5527-5623)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (102-343)||(95129-95372)
[»] scaffold0335 (2 HSPs)
scaffold0335 (14-196)||(5591-5773)
scaffold0335 (247-343)||(5434-5530)
[»] scaffold0207 (2 HSPs)
scaffold0207 (14-196)||(17761-17943)
scaffold0207 (233-343)||(17989-18100)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (14-196)||(24826729-24826911)
chr2 (14-196)||(15633276-15633458)
chr2 (14-196)||(17204394-17204576)
chr2 (14-196)||(28031249-28031431)
chr2 (14-196)||(33128108-33128289)
chr2 (14-199)||(25213111-25213295)
chr2 (183-343)||(7507715-7507876)
chr2 (247-343)||(28031092-28031188)
chr2 (233-343)||(33128335-33128446)
chr2 (47-199)||(7321612-7321764)
chr2 (268-343)||(23777920-23777995)
chr2 (187-343)||(25265261-25265418)
chr2 (233-343)||(17204622-17204733)
chr2 (75-177)||(22274845-22274947)
chr2 (75-177)||(22284078-22284180)
chr2 (188-301)||(19689315-19689428)
chr2 (98-177)||(9652926-9653005)
chr2 (188-343)||(14906312-14906467)
chr2 (188-343)||(23820307-23820462)
chr2 (188-242)||(17396626-17396680)
chr2 (270-343)||(21142203-21142276)
chr2 (14-89)||(9636808-9636883)
chr2 (248-343)||(24341267-24341362)
chr2 (14-92)||(5888744-5888821)
chr2 (258-343)||(463032-463117)
chr2 (270-343)||(5888505-5888578)
chr2 (98-199)||(21274057-21274158)
chr2 (115-199)||(20279574-20279658)
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (14-196)||(371152-371334)
chr7 (233-343)||(371380-371491)
chr7 (50-199)||(39291517-39291666)
chr7 (46-199)||(13352046-13352199)
chr7 (268-343)||(18253718-18253793)
chr7 (187-343)||(13321251-13321408)
chr7 (187-343)||(47480902-47481059)
chr7 (268-343)||(15862225-15862300)
chr7 (188-343)||(7293252-7293407)
chr7 (128-199)||(17984756-17984827)
chr7 (188-343)||(30262001-30262156)
chr7 (75-177)||(126538-126640)
chr7 (269-343)||(25124450-25124524)
chr7 (75-199)||(111277-111401)
chr7 (115-199)||(8563347-8563431)
chr7 (17-92)||(10000484-10000558)
chr7 (188-343)||(11516463-11516618)
chr7 (188-343)||(15441436-15441591)
chr7 (188-302)||(14113902-14114016)
chr7 (188-242)||(14423612-14423666)
chr7 (46-199)||(15977849-15978002)
chr7 (75-172)||(2029044-2029141)
chr7 (258-343)||(36052960-36053045)
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chr7 (269-343)||(2029244-2029318)
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chr7 (188-242)||(25292311-25292365)
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Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 13)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 14 - 339
Target Start/End: Original strand, 20254376 - 20254701
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  20254376 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattaagcataatttcataacaactcattttcatacat 20254475  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaatttaacaacaattatca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20254476 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacggatttaacaacaattatca 20254575  T
Q  214 attcattccaatcaacccatttcatacaacaaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  20254576 attcattccaatcaacccatttcatacaacaaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgatcaa 20254675  T
Q  314 ttcaaacttgggcttcactttagctc 339  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  20254676 ttcaaacttgagcttcactttagctc 20254701  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 21650232 - 21650050
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  21650232 caacaacatcaattgaaacttgattctcaccttaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacat 21650133  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21650132 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaatcttatcaccaaaacaagagcacgaa 21650050  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15861558 - 15861434
Alignment:
Q  75 caattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaactt 174  Q
    ||||| ||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |    
T  15861558 caattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacat 15861459  T
Q  175 atcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    ||| | | ||||  |||||||||||    
T  15861458 atctctacaacataagcacgaattt 15861434  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20893594 - 20893509
Alignment:
Q  258 acaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||| || |||||||||| ||| || |||||||||||||||||| | ||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  20893594 acaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 20893509  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 75 - 199
Target Start/End: Original strand, 22367141 - 22367265
Alignment:
Q  75 caattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaactt 174  Q
    ||||| ||||||||||   ||| || |||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |    
T  22367141 caattgagcataatttacaaactactcattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacat 22367240  T
Q  175 atcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    ||| | | ||||  |||||||||||    
T  22367241 atctctacaacataagcacgaattt 22367265  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 40436453 - 40436269
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaatta-agcataatttcataacaacccattttaataca 112  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| | ||| |||||||||||||  ||||||| | |||||| |||| |||| || || |   |||||| | | |    
T  40436453 caacaacatcaattaaa-cataattctcatcacaaatcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaatt-cacaatatatcattttcacata 40436356  T
Q  113 ttatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||   | || | ||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  40436355 ttatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaatttcatatattcaaacatatcatcataacaagagcacgaattt 40436269  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 343
Target Start/End: Original strand, 51452729 - 51452883
Alignment:
Q  189 agcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaacc 286  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||  || | ||||||||||  | ||| | |||||||| ||  || ||     
T  51452729 agcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatacaaatcatgaaaaattgcaa--agaatgaacatgattaagataaagact 51452826  T
Q  287 aacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    |||||||||||||||| | | ||| |   ||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  51452827 aacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaa 51452883  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 199
Target Start/End: Original strand, 20194185 - 20194273
Alignment:
Q  112 attatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactc-aaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||   |||| | |||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  20194185 attatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaaattcatatactcaaaacatatcatcataacaagagcacgaattt 20194273  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 199
Target Start/End: Original strand, 25094019 - 25094106
Alignment:
Q  112 attatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    |||||| |||||  ||||||||| |||||||||| ||||||   |||| |  ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  25094019 attatggacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaattt 25094106  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 44035097 - 44035006
Alignment:
Q  81 agcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaac 172  Q
    ||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||| | |||  |||||||||| ||||||    
T  44035097 agcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcattaaacatcaaattaacatattcaaac 44035006  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 7641125 - 7641048
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttca 92  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||| | || ||||| ||| |||||||    
T  7641125 caacaacatccattgaaacttgtttctcacctcaattcaac-acaacttatcacaaatcattaattaggcaaaatttca 7641048  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 49997465 - 49997409
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaatt 71  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  49997465 caacaacatcagttaaa-catgattctcaccttaattcaacaacaacatagcacaatt 49997409  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 287 - 343
Target Start/End: Original strand, 20913353 - 20913409
Alignment:
Q  287 aacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    |||||||||||||||| | | ||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20913353 aacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 20913409  T

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Target: chr5 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 27)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 8 - 343
Target Start/End: Original strand, 17909562 - 17909897
Alignment:
Q  8 catcatcaacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccatttta 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17909562 catcagcaacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattaagcataatttcataacaacccattttc 17909661  T
Q  108 atacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaatttaacaacaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17909662 atacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaatttaacaacaa 17909761  T
Q  208 ttatcaattcattccaatcaacccatttcatacaacaaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttat 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  17909762 ttatcaattcattccaatcaacccatttcatacaacaaggaaaattgctaacaaaacaatcatgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttat 17909861  T
Q  308 gatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  17909862 gattaatccaaacttaggcttcactttaactcctaa 17909897  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Original strand, 7528963 - 7529145
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||     
T  7528963 caacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcatacac 7529062  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7529063 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 7529145  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 9730575 - 9730393
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  9730575 caacaacatcaatcgaaacttgattctcaccttaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacat 9730476  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9730475 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaatcttatcaccaaaacaagagcacgaa 9730393  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 109025 - 108843
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  109025 caacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaatccattttcatacat 108926  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 196  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108925 tatgaacatgttaattcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 108843  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 199
Target Start/End: Original strand, 16105706 - 16105890
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16105706 caacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacat 16105805  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||| | | ||||  |||||||||||    
T  16105806 tatgaacatattatttcatcatcaaccattcatttaaca-tcaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaattt 16105890  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 233 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 9730347 - 9730236
Alignment:
Q  233 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttca 330  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9730347 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaac-aattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttca 9730249  T
Q  331 ctttagctcctaa 343  Q
    |||||||||||||    
T  9730248 ctttagctcctaa 9730236  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 187 - 343
Target Start/End: Original strand, 32950930 - 32951086
Alignment:
Q  187 agagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaac-aagga-aaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaa 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||   || | | |||| |||||| ||| |    
T  32950930 agagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaacaaaggagaagttgcaa--taattgaacatggttatgatgaaga 32951027  T
Q  285 ccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    | |||||||||||||||  | ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  32951028 ctaacccccttaccttaaataatgattaattcaaacttagacttcaatttagctcctaa 32951086  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 187 - 343
Target Start/End: Original strand, 34939512 - 34939669
Alignment:
Q  187 agagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccat-ttcatacaacaa--ggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaa 283  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| | ||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||   |||| | |||||||||||||||     
T  34939512 agagcacgaatttagcaacagttatccatttattcaattcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaat--aaatgaacatgattatgaagaac 34939609  T
Q  284 accaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  34939610 actaacccccttaccttaggttatgattaattcacacttagacttcactttagctcctaa 34939669  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 247 - 340
Target Start/End: Original strand, 7529206 - 7529299
Alignment:
Q  247 gaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcc 340  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  7529206 gaaaattgcaaacaaaacaattatgattatgaagaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcactttagctcc 7529299  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 199
Target Start/End: Original strand, 21650789 - 21650942
Alignment:
Q  46 caattcaacaacaac-atgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 144  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| | ||||| ||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  21650789 caattcaacaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattc 21650887  T
Q  145 atttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    ||||| |||  |||||||||| |||||| |||| | | ||||  |||||||||||    
T  21650888 atttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaattt 21650942  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22662784 - 22662683
Alignment:
Q  98 acccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaat 197  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||| |||||  |||||| | |||| ||||||||||    
T  22662784 acccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaattatcatcaaattaacatattcaaatatatcactacaacatgagcacgaat 22662685  T
Q  198 tt 199  Q
    ||    
T  22662684 tt 22662683  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 199
Target Start/End: Original strand, 25004915 - 25005063
Alignment:
Q  51 caacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatt-tcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcattta 149  Q
    |||||||||||||||| || | | ||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||| |||||||||  ||||||| |  ||||||||| |||    
T  25004915 caacaacaacatgtcataaatcaccaattgagcataattctca-aactacccatttacatacatcatgaacatgcaatttcataattaacaattcaatta 25005013  T
Q  150 tcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    || || |||||||| |||||||| ||||||   |||| ||||||||||||    
T  25005014 tccttaaattaacacactcaaacatatcacttcaacatgagcacgaattt 25005063  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 199
Target Start/End: Original strand, 2031933 - 2032057
Alignment:
Q  75 caattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaactt 174  Q
    ||||| ||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |    
T  2031933 caattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacat 2032032  T
Q  175 atcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    ||| | | ||||  |||||||||||    
T  2032033 atctctacaacataagcacgaattt 2032057  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 199
Target Start/End: Original strand, 11342808 - 11342932
Alignment:
Q  75 caattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaactt 174  Q
    ||||| ||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |    
T  11342808 caattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacat 11342907  T
Q  175 atcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    ||| | | ||||  |||||||||||    
T  11342908 atctctacaacataagcacgaattt 11342932  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 108797 - 108686
Alignment:
Q  233 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttca 330  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||| | | ||| ||| | ||||| |||||||    
T  108797 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaac-aattatgattatgatgaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttca 108699  T
Q  331 ctttagctcctaa 343  Q
    ||||| |||||||    
T  108698 ctttacctcctaa 108686  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 342
Target Start/End: Original strand, 25005137 - 25005210
Alignment:
Q  269 atgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctccta 342  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||||| |||| | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  25005137 atgattatgatgaagactaacccccttactttagataatgattaatccaaacttaggcttcactttagctccta 25005210  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27182514 - 27182429
Alignment:
Q  258 acaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||| || |||||||||| ||| || |||||||||||||||||| | ||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  27182514 acaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 27182429  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 75 - 199
Target Start/End: Original strand, 21205049 - 21205173
Alignment:
Q  75 caattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaactt 174  Q
    ||||| ||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| |    
T  21205049 caattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatatccaaacat 21205148  T
Q  175 atcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    ||| | | ||||  |||||||||||    
T  21205149 atctctacaacataagcacgaattt 21205173  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 343
Target Start/End: Original strand, 20623205 - 20623360
Alignment:
Q  188 gagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaac 285  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| |||  || | ||||||||||  | ||| | |||||||||||  || ||    
T  20623205 gagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaa--agaatgaacatgattatgataaagac 20623302  T
Q  286 caacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
     |||||||||||||||| | | ||| |   ||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  20623303 taacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaa 20623360  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21233555 - 21233400
Alignment:
Q  188 gagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaac 285  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| |||  || | ||||||||||  | ||| | |||||||||||  || ||    
T  21233555 gagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaa--agaatgaacatgattatgataaagac 21233458  T
Q  286 caacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
     |||||||||||||||| | | ||| |   ||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  21233457 taacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaa 21233400  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 343
Target Start/End: Original strand, 2032135 - 2032207
Alignment:
Q  271 gattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| | | ||| ||  ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2032135 gattatgatgaaaactaacccccttaccttagataaggattaacccaaacttaggcttcaatttagctcctaa 2032207  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18531018 - 18530946
Alignment:
Q  271 gattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||| ||    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18531018 gattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttaggcttcactttagctcctaa 18530946  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 343
Target Start/End: Original strand, 16536433 - 16536588
Alignment:
Q  188 gagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaac 285  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| |||  || | ||||||||||  | ||| | |||||||||||  || ||    
T  16536433 gagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaa--agaatgaacatgattatgataaagac 16536530  T
Q  286 caacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
     |||||||||| ||||| | | ||| |   ||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  16536531 taacccccttatcttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaa 16536588  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 343
Target Start/End: Original strand, 37052980 - 37053135
Alignment:
Q  188 gagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaac 285  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   ||||||||| |||| |||  || | ||||||||||  | ||| | |||||||||||  || ||    
T  37052980 gagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatctcatccaaatcatgaaaaattgcaa--agaatgaacatgattatgataaagac 37053077  T
Q  286 caacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
     |||||||||||||||| | | ||| |   ||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  37053078 taacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaa 37053135  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22053785 - 22053711
Alignment:
Q  269 atgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||| ||    ||||| | ||||||||||||||||||    
T  22053785 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttagacttcactttagctcctaa 22053711  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 25900433 - 25900319
Alignment:
Q  188 gagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaac 285  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||   |||||||||||||| |||  || | ||||||||||  | ||| | |||||||||||  || ||    
T  25900433 gagcacgaatttagcaacaattatccgttcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaa--agaatgaacatgattatgataaagac 25900336  T
Q  286 caacccccttaccttag 302  Q
     ||||||||||||||||    
T  25900335 taacccccttaccttag 25900319  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 71
Target Start/End: Original strand, 6456687 - 6456743
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaatt 71  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||    
T  6456687 caacaacatcaattaaa-catgattctcatcacaattcaacaacaacataacacaatt 6456743  T

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Target: chr8 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 37)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 14 - 343
Target Start/End: Original strand, 22147501 - 22147830
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22147501 caacaacatcaattaaaatttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacat 22147600  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaatttaacaacaattatca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22147601 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaatttaacaacaattatca 22147700  T
Q  214 attcattccaatcaacccatttcatacaacaaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  22147701 attcattccaatcaacccatttcatacaacaaggaaaattgaaaacaaaacaatcatgattatgaagaacactaaaccccttaccttaggttatgatcaa 22147800  T
Q  314 ttcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22147801 ttcaaacttgagcttcaccttagctcctaa 22147830  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 14 - 343
Target Start/End: Original strand, 18612469 - 18612798
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18612469 caacaacatcaattaaatcttgatttccacctcaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattaagcataatttcataacaatccattttcatacat 18612568  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaatttaacaacaattatca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18612569 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaatttaacaacaattatca 18612668  T
Q  214 attcattccaatcaacccatttcatacaacaaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  18612669 attcattccaatcaacccatttcatacaacaaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattgtgaagaacactaacccccttaccttaggttatgatcaa 18612768  T
Q  314 ttcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18612769 ttcaaatttgggcttcactttagctcctaa 18612798  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 9 - 343
Target Start/End: Original strand, 2545004 - 2545339
Alignment:
Q  9 atcatcaacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaa 108  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |    
T  2545004 atcaacaacaacatcaattgaaacttgattcccacctcaattcaacaacaacatgttataattcatcaattaagcataattttacaactacccattttca 2545103  T
Q  109 tacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa-tttaacaacaa 207  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  2545104 cacattatgaatatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttattaccaaaataagagcacgaattttaacaacaa 2545203  T
Q  208 ttatcaattcattccaatcaacccatttcatacaacaaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttat 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  2545204 ttatcaattcattccaatcaacccatttcatacaacaaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttat 2545303  T
Q  308 gatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  2545304 gattaattcaaatttaagcttcactttagctcctaa 2545339  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 76 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16039012 - 16038744
Alignment:
Q  76 aattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaactta 175  Q
    |||| ||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16039012 aattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttc 16038913  T
Q  176 tcaccaaaacaagagcacgaatttaa-caacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaacaaggaaaattgcaaacaaaataatcatgatt 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16038912 tcaccaaaacaagagcacgaatttaaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaacaaagaaaattgcaaacaaaacaatcatgatt 16038813  T
Q  275 atgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16038812 atgatgaagacaaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 16038744  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Original strand, 18619374 - 18619557
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18619374 caacaacatcaattaaatcttgatttccacctcaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattaagcataatttcataacaatccattttcatacat 18619473  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18619474 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaat 18619557  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Original strand, 22886390 - 22886571
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22886390 caacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattca-caacaacatgtcatagttcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacat 22886488  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22886489 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttattaccaaaacaagagcacgaa 22886571  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 3431473 - 3431291
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  3431473 caacaacatcaatcgaaacttgattctcaccttaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaactcattttcatacat 3431374  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3431373 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaatcttatcaccaaaacaagagcacgaa 3431291  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 21494641 - 21494471
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||            |||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||    
T  21494641 caacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaatccaacaacaacat------------caattaagcataatttcacaactaccccttttcatacat 21494554  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21494553 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaaattatcaccaaaacaagagcacgaa 21494471  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 233 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 3431245 - 3431134
Alignment:
Q  233 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttca 330  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3431245 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaac-aattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaatccaaacttgggcttca 3431147  T
Q  331 ctttagctcctaa 343  Q
    |||||||||||||    
T  3431146 ctttagctcctaa 3431134  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21494410 - 21494314
Alignment:
Q  247 gaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21494410 gaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgaagaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcactttagctcctaa 21494314  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21259644 - 21259499
Alignment:
Q  54 caacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcat 153  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    ||| ||||||||  |||||| |||||||||  ||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  21259644 caacaacatgtcacaattcatcaattgagcacaattcacaaactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaaaaattcaattatcat 21259545  T
Q  154 tcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
      ||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||    
T  21259544 caaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaattt 21259499  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Original strand, 22886632 - 22886728
Alignment:
Q  247 gaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||||  || || |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  22886632 gaaaattgcaaaaaaaacaattatgattatgattaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacttaagcttcactttagctcctaa 22886728  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 199
Target Start/End: Original strand, 17502259 - 17502408
Alignment:
Q  50 tcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcattta 149  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||| | |||||||    ||| |||| |||  |||||| |||||||||  |||||||||  ||||||||| | |    
T  17502259 tcaacaaaaacatgtcataattcatcaattgaacataattcacaaactacccttttatatacatcatgaacatgcaatttcatcattaacaattcaatca 17502358  T
Q  150 tcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||| |||||    
T  17502359 tcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacaaattt 17502408  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22907241 - 22907086
Alignment:
Q  188 gagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaac 285  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||  || | ||||||||||  | ||| | |||||||||||  || ||    
T  22907241 gagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatacaaatcatgaaaaattgcaa--agaatgaacatgattatgataaagac 22907144  T
Q  286 caacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
     |||||||||||||||| | | ||| |   ||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  22907143 taacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaa 22907086  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 49 - 199
Target Start/End: Original strand, 23217974 - 23218124
Alignment:
Q  49 ttcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcattt 148  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||    ||| | ||||||  |||||| || ||||||  |||||||||  ||||||||| |     
T  23217974 ttcaacaacaacatgtcataattcatcaattgaacataattcacaaactagccatttatatacatcattaacatgcaatttcatcattaacaattcaatc 23218073  T
Q  149 atcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||| |  |||  |||||||||||    
T  23218074 atcatcaaattaacatactcaaacatatcactaccacataagcacgaattt 23218124  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 41506941 - 41506839
Alignment:
Q  75 caattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaactt 174  Q
    ||||| ||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |    
T  41506941 caattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacat 41506842  T
Q  175 atc 177  Q
    |||    
T  41506841 atc 41506839  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22321607 - 22321454
Alignment:
Q  46 caattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 145  Q
    ||||| ||||| ||||||| | |||| | ||||| ||||||||||   ||| ||||||||| |||| | |||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  22321607 caatttaacaataacatgttataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacgtcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 22321508  T
Q  146 tttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
     ||| |||  |||||||||| |||||| |||| | | |||  ||||||||||||    
T  22321507 attaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacctgagcacgaattt 22321454  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 75 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 24385884 - 24385760
Alignment:
Q  75 caattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaactt 174  Q
    ||||| ||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  ||||| |||| |||||| |    
T  24385884 caattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattatcatattcaaacat 24385785  T
Q  175 atcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    ||| | | ||||  |||||||||||    
T  24385784 atctctacaacataagcacgaattt 24385760  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 343
Target Start/End: Original strand, 5238323 - 5238478
Alignment:
Q  188 gagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaac 285  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| |||  || | ||||||||||  | ||| | |||||||||||  || ||    
T  5238323 gagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaa--agaatgaacatgattatgataaagac 5238420  T
Q  286 caacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
     |||||||||||||||| | | ||| |   ||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  5238421 taacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaa 5238478  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24661275 - 24661120
Alignment:
Q  188 gagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaac 285  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| |||  || | ||||||||||  | ||| | |||||||||||  || ||    
T  24661275 gagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaa--agaatgaacatgattatgataaagac 24661178  T
Q  286 caacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
     |||||||||||||||| | | ||| |   ||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  24661177 taacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaa 24661120  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 177
Target Start/End: Original strand, 39115421 - 39115500
Alignment:
Q  98 acccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 177  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  39115421 acccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatc 39115500  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 343
Target Start/End: Original strand, 43685782 - 43685937
Alignment:
Q  188 gagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaac 285  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| |||  || | ||||||||||  | ||| | |||||||||||  || ||    
T  43685782 gagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaa--agaatgaacatgattatgataaagac 43685879  T
Q  286 caacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
     |||||||||||||||| | | ||| |   ||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  43685880 taacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaa 43685937  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 45559121 - 45558937
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaatta-agcataatttcataacaacccattttaataca 112  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||| | |||||| |||| || |||| || |   |||||| | | |    
T  45559121 caacaacatcaattaaa-catgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcacaa-ttcacaatatatcattttcacata 45559024  T
Q  113 ttatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
     ||||||||||  |||||| || |||||||||| |||||| | | || |  ||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||    
T  45559023 ctatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcatgaattt 45558937  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 179
Target Start/End: Original strand, 4233953 - 4234082
Alignment:
Q  50 tcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcattta 149  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||| |  ||||||    ||| ||||||||  |||||| || ||||||  |||||||||  ||||||||| | |    
T  4233953 tcaacaacaacttgtcataattcatcaattgaaaataattcacaaactacccatttatatacatcataaacatgcaatttcatcattaacaattcaatca 4234052  T
Q  150 tcattcaattaacatactcaaacttatcac 179  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  4234053 tcatcaaattaacatactcaaacatatcac 4234082  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 258 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 43373435 - 43373350
Alignment:
Q  258 acaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||| || ||||||||||  || || |||||||||||||||| | | ||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  43373435 acaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 43373350  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 177
Target Start/End: Original strand, 274592 - 274668
Alignment:
Q  101 cattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 177  Q
    |||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  274592 cattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttagcatcaaattaacatattcaaacatatc 274668  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 641257 - 641181
Alignment:
Q  101 cattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 177  Q
    |||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  641257 cattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttagcatcaaattaacatattcaaacatatc 641181  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 827063 - 826987
Alignment:
Q  101 cattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 177  Q
    |||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  827063 cattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttagcatcaaattaacatattcaaacatatc 826987  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 18261655 - 18261590
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaatta 80  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||| | ||||||    
T  18261655 caacaacatcaattaaa-catgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatta 18261590  T

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Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24385684 - 24385610
Alignment:
Q  269 atgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||||  || || |||||||||||||||| | | ||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24385684 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 24385610  T

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Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 80
Target Start/End: Original strand, 33172291 - 33172356
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaatta 80  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||| | ||||||    
T  33172291 caacaacatcaattaaa-catgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatta 33172356  T

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Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 41506741 - 41506671
Alignment:
Q  269 atgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctc 339  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||| | | ||| ||  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  41506741 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttagataaggattaacccaaacttaggcttcaatttagctc 41506671  T

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Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 7000551 - 7000478
Alignment:
Q  270 tgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| |||| | | ||| ||  ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  7000551 tgattatgatgaaaactaacccccttactttagataaggattaacccaaacttaggcttcaatttagctcctaa 7000478  T

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Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 27233251 - 27233195
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaatt 71  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||    
T  27233251 caacaacatcaattaaa-catgattctcatcacaattcaacaacaacataacacaatt 27233195  T

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Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18118373 - 18118289
Alignment:
Q  115 atgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||  |||| | |||| ||||| |||| | | |||| ||||||||||||    
T  18118373 atgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcatcaaatttatatacgcaaacatatctctataacacgagcacgaattt 18118289  T

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Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 19331498 - 19331451
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacat 62  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  19331498 caacaacatcaattaaa-catgattctcatcacaattcaacaacaacat 19331451  T

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Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 79
Target Start/End: Original strand, 22981286 - 22981318
Alignment:
Q  47 aattcaacaacaacatgtcacaattaatcaatt 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22981286 aattcaacaacaacatgtcacaattcatcaatt 22981318  T

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Target: scaffold0001 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 14 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 165158 - 164829
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  165158 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcataagaacccattttcatacat 165059  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaatttaacaacaattatca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  165058 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaatttaacaacaattatca 164959  T
Q  214 attcattccaatcaacccatttcatacaacaaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaa 313  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||    
T  164958 attcattccaatcaatccatttcatacaacaaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgattaa 164859  T
Q  314 ttcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    |||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  164858 ttcaaatttaagcttcactttagctcctaa 164829  T

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Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 258 - 343
Target Start/End: Original strand, 172199 - 172284
Alignment:
Q  258 acaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||| || ||||||||||  || || |||||||||||||||| | | ||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  172199 acaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 172284  T

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Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 258 - 343
Target Start/End: Original strand, 177902 - 177987
Alignment:
Q  258 acaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||| || ||||||||||  || || |||||||||||||||| | | ||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  177902 acaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 177987  T

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Target: chr6 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 33)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 14 - 343
Target Start/End: Original strand, 19629393 - 19629721
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19629393 caacaacatcaattaaatcttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacat 19629492  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaatttaacaacaattatca 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19629493 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccacaacaagagcacgaatttaacaacaattatca 19629592  T
Q  214 attcattccaatcaacccatttcatacaacaaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  19629593 attcattccaatcaacccatttcatacaacaaggaaaattccaaacaaaacaatcatgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgatcaa 19629692  T
Q  314 ttcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  19629693 ttcaaatttgagcttcac-ttagctcctaa 19629721  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 14 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16300173 - 16299844
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16300173 caacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattcaaccacaacatgtcataatttatcaattaggcataatttcacaacaacccattttcatacat 16300074  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa-tttaacaacaattatc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16300073 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccgaaacaagagcacgaattttaacaacaattatc 16299974  T
Q  213 aattcattccaatcaacccatttcatacaacaaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatca 312  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||| |    
T  16299973 aattcattctaatcaacccatttcatacaacaaggaaaattgcaaac-aaacaatcatgattaagaagaagactaacccccttaccttaggtaatgatta 16299875  T
Q  313 attcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16299874 atccaaacttaggcttcactttagctcctaa 16299844  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 32276956 - 32276774
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  32276956 caacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattcaacaataacatgtcacaattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcatacat 32276857  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32276856 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 32276774  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 18823585 - 18823398
Alignment:
Q  9 atcatcaacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaa 108  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |    
T  18823585 atcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccgcaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataacttcacaacaacccattttca 18823486  T
Q  109 tacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18823485 tacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 18823398  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 18839440 - 18839253
Alignment:
Q  9 atcatcaacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaa 108  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  18839440 atcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaataacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttca 18839341  T
Q  109 tacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18839340 tacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcagttaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 18839253  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 199
Target Start/End: Original strand, 4991135 - 4991319
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  4991135 caacaacatcaattgaaacttgattcacacaccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacat 4991234  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || |||| |||||||  ||||| |||| | | ||||  |||||||||||    
T  4991235 tatgaacatattatttcatcatcaaccattcatttaaca-tcaaataacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaattt 4991319  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 46 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22585707 - 22585554
Alignment:
Q  46 caattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 145  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||    ||| ||||||||  |||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  22585707 caattcaacaacaacatgtcataattcttcaattgagcataattcacaaactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattca 22585608  T
Q  146 tttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
     |||||||  |||||| |||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||    
T  22585607 attatcatcaaattaaaatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaattt 22585554  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 46 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22590538 - 22590385
Alignment:
Q  46 caattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 145  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||    ||| ||||||||  |||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  22590538 caattcaacaacaacatgtcataattcttcaattgagcataattcacaaactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattca 22590439  T
Q  146 tttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
     |||||||  |||||| |||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||    
T  22590438 attatcatcaaattaaaatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaattt 22590385  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 268 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 13620744 - 13620669
Alignment:
Q  268 catgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  13620744 catgattatgaagaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaactcaggcttcactttagctcctaa 13620669  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15889867 - 15889714
Alignment:
Q  46 caattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 145  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| |||| || | |||||||    ||| ||||||||  |||||| |||||||||  ||||||||| |||||| |||    
T  15889867 caattcatcaacaacatgtcataattcatcagttgaacataattcacaaactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaaatca 15889768  T
Q  146 tttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
     |||||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||    
T  15889767 attatcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaattt 15889714  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 25640715 - 25640564
Alignment:
Q  47 aattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcat 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    ||| ||||||||   ||||| |||||||||  ||||||||| ||| ||||||     
T  25640715 aattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattgagcacaattcacaaactacccatttatctacatcatgaacatgcaatttcatcatcaaaaattcaa 25640616  T
Q  147 ttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||| | | |||| ||||||||||||    
T  25640615 ttatcatcaaattaacatactcaaacatatc-ctacaacatgagcacgaattt 25640564  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 32276713 - 32276617
Alignment:
Q  247 gaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  32276713 gaaaattgcaaacaaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaagcttcactttagctcctaa 32276617  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 233 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18823352 - 18823241
Alignment:
Q  233 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttca 330  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||   |||||    
T  18823352 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaac-aattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaatccaaacttaaacttca 18823254  T
Q  331 ctttagctcctaa 343  Q
    |||||||||||||    
T  18823253 ctttagctcctaa 18823241  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 233 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18839207 - 18839096
Alignment:
Q  233 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttca 330  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||    
T  18839207 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaac-aattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaatccaaacttaagcttca 18839109  T
Q  331 ctttagctcctaa 343  Q
    |||||||| ||||    
T  18839108 ctttagcttctaa 18839096  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 187 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 35009467 - 35009314
Alignment:
Q  187 agagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccat-ttcatacaacaa--ggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaa 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||  ||| | ||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||   |||| | ||||||||||| |||     
T  35009467 agagcacgaatttagcaacaattatccatttcttcaattcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaat--aaatgaacatgattatgatgaag 35009370  T
Q  284 accaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctc 339  Q
    || ||||||||||| |||| | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  35009369 actaacccccttactttagataatgattaatccaaactttggcttcactttagctc 35009314  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 75 - 199
Target Start/End: Original strand, 26089858 - 26089982
Alignment:
Q  75 caattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaactt 174  Q
    ||||| ||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |    
T  26089858 caattgagcataatttacaaactacccattttcatacattatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacat 26089957  T
Q  175 atcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    ||| | | ||||  |||||||||||    
T  26089958 atctctacaacataagcacgaattt 26089982  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15005067 - 15004915
Alignment:
Q  46 caattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 145  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||    ||| ||||||||  |||||| || ||||||  ||||| ||| ||||||||||    
T  15005067 caattcaacaacaacatgtcataattcatcaattgaacataattcacaaactacccatttatatacatcataaacatgcaatttcctcatcaacaattca 15004968  T
Q  146 tttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
     | | || |||| | |||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||    
T  15004967 atcaaca-tcaaattacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaattt 15004915  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15742134 - 15742078
Alignment:
Q  287 aacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15742134 aacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacttaggcttcactttagctcctaa 15742078  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 35015289 - 35015165
Alignment:
Q  75 caattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaactt 174  Q
    ||||| ||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |    
T  35015289 caattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacat 35015190  T
Q  175 atcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    ||| | | ||||  |||||||||||    
T  35015189 atctctacaacataagcacgaattt 35015165  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18002635 - 18002504
Alignment:
Q  68 aattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatact 167  Q
    |||| ||||||| ||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  ||| |||||| |    
T  18002635 aattcatcaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaatgaacatatt 18002536  T
Q  168 caaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    ||||| |||| | | ||||  |||||||||||    
T  18002535 caaacatatctctacaacataagcacgaattt 18002504  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 343
Target Start/End: Original strand, 27751660 - 27751816
Alignment:
Q  187 agagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccat-ttcatacaacaagga-aaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaa 284  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||| ||| |||| | ||||||||| ||||||||  || || |||||||||   |||| | ||||||||||| ||| |    
T  27751660 agagcacgaatttagctacatttatccatttattcaattcaacccatattcatacacaaatgagaaattgcaat--aaatgaacatgattatgatgaaga 27751757  T
Q  285 ccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    | |||||||||||||||| | | ||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  27751758 ctaacccccttaccttagataaagattaatccaaacttaggcttcaatttagctcctaa 27751816  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 269 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18002427 - 18002353
Alignment:
Q  269 atgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||| |||  |||||| | ||||||||||||||||||    
T  18002427 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggttatgattaatctaaacttagccttcactttagctcctaa 18002353  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 269 - 343
Target Start/End: Original strand, 26090059 - 26090133
Alignment:
Q  269 atgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||||  || || |||||||||||||||||| ||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  26090059 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 26090133  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 172
Target Start/End: Original strand, 18583440 - 18583537
Alignment:
Q  75 caattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaac 172  Q
    ||||| ||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  18583440 caattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaac 18583537  T

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Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 19983401 - 19983300
Alignment:
Q  98 acccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaat 197  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |||| | | ||||  |||||||||    
T  19983401 acccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaat 19983302  T
Q  198 tt 199  Q
    ||    
T  19983301 tt 19983300  T

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Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 343
Target Start/End: Original strand, 23148292 - 23148377
Alignment:
Q  258 acaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||| || |||||||||| ||| || |||||||||||||||||| | ||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  23148292 acaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 23148377  T

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Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 343
Target Start/End: Original strand, 23153743 - 23153828
Alignment:
Q  258 acaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||| || |||||||||| ||| || |||||||||||||||||| | ||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  23153743 acaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 23153828  T

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Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 187 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 1657776 - 1657660
Alignment:
Q  187 agagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccat-ttcatacaacaa--ggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaa 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | ||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||   |||| | ||||||||||| |||     
T  1657776 agagcacgaatttagcaacaattatccatttattcaattcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaa--taaatgaacatgattatgatgaag 1657679  T
Q  284 accaacccccttaccttag 302  Q
    || ||||||||||||||||    
T  1657678 actaacccccttaccttag 1657660  T

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Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 17375011 - 17374927
Alignment:
Q  115 atgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||   ||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||    
T  17375011 atgaacatgtaatttcatcatcaataattcaattatcaacaaattagcatactcaaacatatcactacaactagagcacgaattt 17374927  T

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Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15742329 - 15742227
Alignment:
Q  98 acccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcattt-atcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 196  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||| |||| | | ||||  ||||||||    
T  15742329 acccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaatcatcaaattaacataatcaaacatatctctacaacataagcacgaa 15742230  T
Q  197 ttt 199  Q
    |||    
T  15742229 ttt 15742227  T

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Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 343
Target Start/End: Original strand, 23995247 - 23995321
Alignment:
Q  269 atgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||||  || || |||||||||||||||| | | ||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23995247 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 23995321  T

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Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 29869967 - 29869890
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttca 92  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||| | || ||||| ||| |||||||    
T  29869967 caacaacatccattgaaacttgtttctcacctcaattcaac-acaacttatcacaaatcattaattaggcaaaatttca 29869890  T

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Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 199
Target Start/End: Original strand, 19175314 - 19175398
Alignment:
Q  115 atgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    |||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||  | || | |||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||    
T  19175314 atgaacatgcaattttatcaacaacaattcaattatcatcaattttatatactcaaacatatcatcataacaagagcacaaattt 19175398  T

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Target: chr4 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 14 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 19697565 - 19697236
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  19697565 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcataacaactcattctcatacat 19697466  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaatttaacaacaattatca 213  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19697465 tatgaacatgttatttcataactaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaaattatcaccaaaacaagagcacgaatttaacaacaattatca 19697366  T
Q  214 attcattccaatcaacccatttcatacaacaaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||    
T  19697365 attcattccaatcaacccatttcatacaacaaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgattaa 19697266  T
Q  314 ttcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  19697265 ttcacacttaggcttcactttacctcctaa 19697236  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 14 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 19708150 - 19707821
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  19708150 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcataacaactcattctcatacat 19708051  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaatttaacaacaattatca 213  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19708050 tatgaacatgttatttcataactaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaaattatcaccaaaacaagagcacgaatttaacaacaattatca 19707951  T
Q  214 attcattccaatcaacccatttcatacaacaaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||    
T  19707950 attcattccaatcaacccatttcatacaacaaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgattaa 19707851  T
Q  314 ttcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  19707850 ttcacacttaggcttcactttacctcctaa 19707821  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 14 - 301
Target Start/End: Original strand, 14996190 - 14996477
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  14996190 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacat 14996289  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaatttaacaacaattatca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14996290 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcttttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcaggaatttaacaacaattatca 14996389  T
Q  214 attcattccaatcaacccatttcatacaacaaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttacctta 301  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||    
T  14996390 attcattccaatcaatccatttcatacaacaaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgataataactaacccccttacctta 14996477  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 343
Target Start/End: Original strand, 9795279 - 9795607
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||| ||| || |||||| | ||||    
T  9795279 caacaacatcaattgaaacttgatttccacctcaattcaacaacaacatgtcataattcaccaattaaacataatttcacaactactcattttgacacat 9795378  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa-tttaacaacaattatc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9795379 tatgaacatgttatttcatcaccaagaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattttaacaacaattatc 9795478  T
Q  213 aattcattccaatcaacccatttcatacaacaaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatca 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||  || ||| | | ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9795479 aattcattccaatcaacccatttcatacaacatgagaaaatg--aaaaaattgaacatgattatgatgataactaacccccttaccttaggttatgatca 9795576  T
Q  313 attcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9795577 attcaaacttgagcttcactttagctcctaa 9795607  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 14500409 - 14500227
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  14500409 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcatacat 14500310  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14500309 tatgaacatgttatttcatcaccaataattcatttatcattaaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 14500227  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Original strand, 16522881 - 16523063
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16522881 caacaacatcaattgaaacttgattcacacctcaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacat 16522980  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16522981 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 16523063  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Original strand, 9295757 - 9295939
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  9295757 caacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacat 9295856  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9295857 tatgaacatgttatttcattaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 9295939  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Original strand, 8045005 - 8045189
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcac--ctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatac 111  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  8045005 caacaacatcaattggaacttgattcacacacctcaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattctcatac 8045104  T
Q  112 attatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8045105 attatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 8045189  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 32460888 - 32460718
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||             |||||| |||||||||| ||| |||| |||| ||||||    
T  32460888 caacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaatccaacaacaacatt------------aattaaccataatttcacaactaccccttttcatacat 32460801  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  32460800 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaaattataaccaaaacaagagcacgaa 32460718  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 32460657 - 32460561
Alignment:
Q  247 gaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32460657 gaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgaagaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcactttagctcctaa 32460561  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 233 - 339
Target Start/End: Original strand, 16523109 - 16523216
Alignment:
Q  233 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttca 330  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16523109 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaac-aattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 16523207  T
Q  331 ctttagctc 339  Q
    |||||||||    
T  16523208 ctttagctc 16523216  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 233 - 343
Target Start/End: Original strand, 8045235 - 8045346
Alignment:
Q  233 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttca 330  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||    
T  8045235 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaac-aattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaattcaaacttagacttca 8045333  T
Q  331 ctttagctcctaa 343  Q
    |||||||||||||    
T  8045334 ctttagctcctaa 8045346  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 268 - 343
Target Start/End: Original strand, 19020792 - 19020867
Alignment:
Q  268 catgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  19020792 catgattatgatggtaactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcaccttagctcctaa 19020867  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 49 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 34177797 - 34177648
Alignment:
Q  49 ttcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcattt 148  Q
    ||||||||||||| |||| |||| | ||||| | ||||||| |  ||| ||||||||  |||||| |||||||||  |||| |||| |||||||||| ||    
T  34177797 ttcaacaacaacaagtcataattcaccaattgaacataatt-ctcaactacccatttatatacatcatgaacatgcaattttatcatcaacaattcaatt 34177699  T
Q  149 atcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||    
T  34177698 atcatgtaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaattt 34177648  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 261 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 40885499 - 40885418
Alignment:
Q  261 aaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctccta 342  Q
    |||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  40885499 aaataatcatgattatgatgaattctaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcactttagctccta 40885418  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 199
Target Start/End: Original strand, 19559457 - 19559606
Alignment:
Q  46 caattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 145  Q
    |||||||||||||||||||||    |||| |||| |||||||||    ||| ||||||||  |||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  19559457 caattcaacaacaacatgtca----taataaattgagcataattcacaaactacccatttacatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattca 19559552  T
Q  146 tttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
     ||| |||  ||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||| ||||||    
T  19559553 attaacatcaaattaacatgctcaaacatatcactacaacatgagcaggaattt 19559606  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 14500181 - 14500074
Alignment:
Q  233 tttcatacaa-caaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcac 331  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||  | |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||  |||||||    
T  14500181 tttcatacaaacaaagaaaattgcaagcaaaacaattatgattatgatgaagcctaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaagcttcac 14500082  T
Q  332 tttagctc 339  Q
    ||||||||    
T  14500081 tttagctc 14500074  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 199
Target Start/End: Original strand, 14951885 - 14952009
Alignment:
Q  75 caattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaactt 174  Q
    ||||| ||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |    
T  14951885 caattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacat 14951984  T
Q  175 atcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    ||| | | ||||  |||||||||||    
T  14951985 atctctacaacataagcacgaattt 14952009  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15675062 - 15674967
Alignment:
Q  248 aaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||||| |  || || |||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||| ||    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15675062 aaaattgcaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttaggcttcactttagctcctaa 15674967  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 343
Target Start/End: Original strand, 26680436 - 26680591
Alignment:
Q  188 gagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaac 285  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||||||||| |||||||  || | ||||||||||  | ||| | |||||||||||  || ||    
T  26680436 gagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccattccatacaaatcatgaaaaattgcaa--agaatgaacatgattatgataaagac 26680533  T
Q  286 caacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
     |||||||||||||||| | | ||| |   ||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  26680534 taacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaa 26680591  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 5682659 - 5682557
Alignment:
Q  75 caattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaactt 174  Q
    ||||| ||||||||||   ||| ||||| ||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |    
T  5682659 caattgagcataatttacaaactacccaatttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacat 5682560  T
Q  175 atc 177  Q
    |||    
T  5682559 atc 5682557  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 188 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 16327953 - 16327840
Alignment:
Q  188 gagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaac 285  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| |||  || | ||||||||||  | ||| | |||||||||||  || ||    
T  16327953 gagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaa--agaatgaacatgattatgataaagac 16327856  T
Q  286 caacccccttacctta 301  Q
     |||||||||||||||    
T  16327855 taacccccttacctta 16327840  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 25119314 - 25119237
Alignment:
Q  100 ccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 177  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  25119314 ccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatc 25119237  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 270 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 55376525 - 55376452
Alignment:
Q  270 tgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||||| | | ||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  55376525 tgattatgatgaagactaacccccttaccttagataaggatcaacccaaacttaggcttcaatttagctcctaa 55376452  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 47468538 - 47468467
Alignment:
Q  8 catcatcaacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaatta 80  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||| | ||||||    
T  47468538 catcaacaacaacatcaattaaa-catgattctcatcacaattcaacaacaacataacacaattcaacaatta 47468467  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 199
Target Start/End: Original strand, 49071850 - 49071934
Alignment:
Q  115 atgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    |||||||||  ||||||||| ||| |||||| ||| |||  ||||||||||||||||| |||||| | || | ||||||||||||    
T  49071850 atgaacatgcaatttcatcatcaataattcaattaacatcaaattaacatactcaaacatatcactacaatatgagcacgaattt 49071934  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 10104202 - 10104128
Alignment:
Q  269 atgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||| ||    ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10104202 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttaggctttactttagctcctaa 10104128  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13048248 - 13048194
Alignment:
Q  188 gagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaa 242  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  13048248 gagcatgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatacaa 13048194  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15135939 - 15135865
Alignment:
Q  269 atgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||||  || || |||||||||||||||| | | ||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15135939 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 15135865  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15272243 - 15272169
Alignment:
Q  269 atgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||||  || || |||||||||||||||| | | ||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15272243 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 15272169  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 18238341 - 18238276
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaatta 80  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||| | ||||||    
T  18238341 caacaacatcaattaaa-catgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaatta 18238276  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 92
Target Start/End: Original strand, 26339084 - 26339161
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttca 92  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| | |||||| | || ||||||||| |||||||    
T  26339084 caacaacatccattgaaacttgtttctctcctcaattcaac-acaacttatcacaaatcattaattaagcaaaatttca 26339161  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 343
Target Start/End: Original strand, 13246726 - 13246811
Alignment:
Q  258 acaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||| || ||||||||||  || || |||||||||||||||| | | ||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  13246726 acaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 13246811  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 22352238 - 22352197
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaaca 55  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22352238 caacaacatccattgaaacttgtttctcacctcaattcaaca 22352197  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 343
Target Start/End: Original strand, 22738577 - 22738650
Alignment:
Q  270 tgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||||| | ||| | |||   ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22738577 tgattatgatgaagacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactttagctcctaa 22738650  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15272444 - 15272320
Alignment:
Q  75 caattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaactt 174  Q
    ||||| ||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||| |||| |||| |||  ||||||||||  ||||| |    
T  15272444 caattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaccattcgtttaacatcaaattaacatatccaaacat 15272345  T
Q  175 atcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    ||| | | ||||  |||||||||||    
T  15272344 atctctacaacataagcacgaattt 15272320  T

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Target: scaffold0029 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 14 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 50040 - 49710
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||     
T  50040 caacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattcaaccacaacatgtcataattcatcaattaagtataatttcacaactacccattttcatacac 49941  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcac-gaatttaacaacaattatc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  49940 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacggattttaacaacaattatc 49841  T
Q  213 aattcattccaatcaacccatttcatacaacaaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatca 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |    
T  49840 aattcattccaatcaacccatttcatacaacaaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgaagaagactaacccccttaccttaggtaatgatta 49741  T
Q  313 attcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49740 atccaaacttaggcttcactttagctcctaa 49710  T

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Target: chr3 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 49)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 14 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 11477383 - 11477053
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||    
T  11477383 caacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattcaaccacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatgcat 11477284  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa-tttaacaacaattatc 212  Q
    |||||||||||||||| || | | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11477283 tatgaacatgttattttattaaccacaaatcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattttaacaacaattatc 11477184  T
Q  213 aattcattccaatcaacccatttcatacaacaaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatca 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |    
T  11477183 aattcattccaatcaacccatttcatacaacaaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgaagaagactaacccccttaccttaggtaatgatta 11477084  T
Q  313 attcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  11477083 attcaaacttaggcttcactttaactcctaa 11477053  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 18 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 8276033 - 8275749
Alignment:
Q  18 aacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8276033 aacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatg 8275934  T
Q  118 aacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaatttaacaacaattatcaattc 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8275933 aacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcgttcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaatttaacaacaattatcaattc 8275834  T
Q  218 attccaatcaacccatttcatacaacaaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttag 302  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||    
T  8275833 attccaatcaacctatttcataaaacaaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgataataactaacccccttaccttag 8275749  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 18 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 8268933 - 8268649
Alignment:
Q  18 aacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8268933 aacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcataacaaccaattttcatacattatg 8268834  T
Q  118 aacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaatttaacaacaattatcaattc 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8268833 aacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcgttcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaatttaacaacaattatcaattc 8268734  T
Q  218 attccaatcaacccatttcatacaacaaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttag 302  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||    
T  8268733 attccaatcaacctatttcataaaacaaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgataataactaacccccttaccttag 8268649  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 9303292 - 9303032
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  9303292 caacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacagcaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacat 9303193  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa-tttaacaacaattatc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  9303192 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattttaacaacaaatatc 9303093  T
Q  213 aattcattccaatcaacccatttcatacaacaaggaaaattgcaaacaaaataatcatgat 273  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  9303092 aattcattccaatcaatccatttcatacaacaaagaaaattgcaaacaaaacaatcatgat 9303032  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Original strand, 14285024 - 14285206
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||     
T  14285024 caacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcatattttcacaactacccattttcatacac 14285123  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14285124 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 14285206  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 16934166 - 16933984
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16934166 caacaacatcaattgaaacttgattctcaccttaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacat 16934067  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  16934066 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaatcttatcatcaaaacaagagcacgaa 16933984  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 196
Target Start/End: Original strand, 19946756 - 19946943
Alignment:
Q  9 atcatcaacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaa 108  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||| || |||||| |    
T  19946756 atcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacctcaattcaacaacaacatgtcataaatcatcaattaagcataatttcacaactactcattttca 19946855  T
Q  109 tacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19946856 tacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaatttatcaccaaaacaagagcacgaa 19946943  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 187 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 11986194 - 11986038
Alignment:
Q  187 agagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaac-aagga-aaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaa 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||   || | | ||||||||||| ||| |    
T  11986194 agagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaacaaaggagaagttgcaa--taattgaacatgattatgatgaaga 11986097  T
Q  285 ccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    | |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  11986096 ctaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcaatttagctcctaa 11986038  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 199
Target Start/End: Original strand, 18970016 - 18970168
Alignment:
Q  47 aattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcat 146  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    ||| ||||||||  |||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||     
T  18970016 aattcaacaacaacatgtcataattcatcaattgagcataattcacaaactacccatttacatacatcatgaacatgaaatttcatcatcaacaattcaa 18970115  T
Q  147 ttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    ||| |||  |||||||||||| |||| |||||| | |||| ||||||||||||    
T  18970116 ttaacatcaaattaacatacttaaacatatcactacaacatgagcacgaattt 18970168  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 199
Target Start/End: Original strand, 48421674 - 48421824
Alignment:
Q  49 ttcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatt-tcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatt 147  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||| | ||||||| ||| ||| ||||||||  |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  48421674 ttcaacaacaacatgtcataattcaccaattgaacataattctca-aactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcaccaacaattcaat 48421772  T
Q  148 tatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||| ||||||    
T  48421773 tatcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcatgaattt 48421824  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 233 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16933938 - 16933827
Alignment:
Q  233 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttca 330  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16933938 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaactaac-aattatgattatgataaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 16933840  T
Q  331 ctttagctcctaa 343  Q
    |||||||||||||    
T  16933839 ctttagctcctaa 16933827  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 268 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 12902040 - 12901965
Alignment:
Q  268 catgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12902040 catgattatgatgataactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttaactcctaa 12901965  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 199
Target Start/End: Original strand, 15550703 - 15550845
Alignment:
Q  57 caacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattca 156  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    ||| ||||||||  |||||| |||||||||  ||||||||| ||| |||||| |||||||  |    
T  15550703 caacatgtcacaattcatcaattgagcacaattcacaaactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaaaaattcaattatcatcaa 15550802  T
Q  157 attaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||    
T  15550803 attaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaattt 15550845  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Original strand, 14285267 - 14285363
Alignment:
Q  247 gaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  14285267 gaaaattgcaaacaaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaagcttcactttagctcctaa 14285363  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Original strand, 19947004 - 19947100
Alignment:
Q  247 gaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||||||  ||| ||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  19947004 gaaaattgcaaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaatccaaacttaggcttcactttaactcctaa 19947100  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 268 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15938427 - 15938352
Alignment:
Q  268 catgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||| | || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15938427 catgattataatgataactaacccccttaccttaggctatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 15938352  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 172
Target Start/End: Original strand, 38168008 - 38168134
Alignment:
Q  46 caattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 145  Q
    ||||||| |||||||||  || |||| | ||||| ||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  38168008 caattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 38168107  T
Q  146 tttatcattcaattaacatactcaaac 172  Q
    |||| |||  |||||||||| ||||||    
T  38168108 tttaacatcaaattaacatattcaaac 38168134  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 17912510 - 17912356
Alignment:
Q  188 gagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatac-aacaaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaacc 286  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| || || |||||||||||   |||| | |||||||||||  || ||     
T  17912510 gagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatacaaataatgaaaattgcaa--taaatgaacatgattatgataaagact 17912413  T
Q  287 aacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    |||||||||||||||| | | ||| ||| | | ||  ||||||| ||||||||||||    
T  17912412 aacccccttaccttagataaagattaatcccacctcaggcttcaatttagctcctaa 17912356  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12539153 - 12539069
Alignment:
Q  115 atgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||   |||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  12539153 atgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaattatcaacaaattcacatactcaaccatatcactaaaacaagagcacgaattt 12539069  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 199
Target Start/End: Original strand, 30153065 - 30153189
Alignment:
Q  75 caattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaactt 174  Q
    ||||| ||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |    
T  30153065 caattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacat 30153164  T
Q  175 atcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    ||| | | ||||  |||||||||||    
T  30153165 atctctacaacataagcacgaattt 30153189  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 199
Target Start/End: Original strand, 45581754 - 45581878
Alignment:
Q  75 caattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaactt 174  Q
    ||||| ||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||| |||||| |    
T  45581754 caattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcattaatcatcaaattaacatattcaaacat 45581853  T
Q  175 atcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    ||| | | ||||  |||||||||||    
T  45581854 atctctacaacataagcacgaattt 45581878  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 54685433 - 54685309
Alignment:
Q  75 caattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaactt 174  Q
    ||||| ||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |    
T  54685433 caattgagcataatttaccaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacat 54685334  T
Q  175 atcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    ||| | | ||||  |||||||||||    
T  54685333 atctctacaacataagcacgaattt 54685309  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 199
Target Start/End: Original strand, 10912948 - 10913133
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaatta-agcataatttcataaca-acccattttaatac 111  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||| || |||||| |||||||  ||||||| | |||||| |||| |||| || || | ||||||||| | |     
T  10912948 caacaacatcaattaaa-catgaatctcaccacatttcaaccacaacatagcacaattcaacaattagagcacaatt-cacaatatacccattttcacat 10913045  T
Q  112 attatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    |||||| |||||  ||||||||| |||||||||| ||||||   |||| |  ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  10913046 attatggacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaattt 10913133  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 13954917 - 13954762
Alignment:
Q  188 gagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaac 285  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||  || | ||||||||||  | ||| | ||||||||||   || ||    
T  13954917 gagcacgaatttagcaacaattatccattcattcctttcaacccatttcatacaattcatgaaaaattgcaa--agaatgaacatgattatggtaaagac 13954820  T
Q  286 caacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
     |||||||||||||||| | | ||| |   ||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  13954819 taacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaa 13954762  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15936585 - 15936510
Alignment:
Q  268 catgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||| | || ||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  15936585 catgattataatgataactaacccccataccttaggctacgatcaattcaaacttgagcttcacttttgctcctaa 15936510  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 188 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13975749 - 13975695
Alignment:
Q  188 gagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaa 242  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  13975749 gagcacgaatttagcaacaattatccattcattcctttcaacccatttcatacaa 13975695  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 188 - 242
Target Start/End: Original strand, 45861041 - 45861095
Alignment:
Q  188 gagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaa 242  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  45861041 gagcacgaatttagcaacaattatccattcattcctttcaacccatttcatacaa 45861095  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 38375797 - 38375696
Alignment:
Q  98 acccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaat 197  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||  ||||||||  |||||||||| |||||||  |||| |  ||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  38375797 acccattttcacaaattatgaacatgcaatttcatctacaacaattcaattatcatcaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaat 38375698  T
Q  198 tt 199  Q
    ||    
T  38375697 tt 38375696  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 54038256 - 54038159
Alignment:
Q  75 caattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaac 172  Q
    ||||| ||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  54038256 caatttagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaac 54038159  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 2449265 - 2449110
Alignment:
Q  188 gagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaac 285  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| |||  || | ||||||||||  | ||| | |||||||||||  || ||    
T  2449265 gagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaa--agaatgaacatgattatgataaagac 2449168  T
Q  286 caacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
     |||||||||||||||| | | ||| |   ||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  2449167 taacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaa 2449110  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Original strand, 7854130 - 7854229
Alignment:
Q  100 ccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |||| | | ||||  |||||||||||    
T  7854130 ccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaattt 7854229  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 165
Target Start/End: Original strand, 2844314 - 2844404
Alignment:
Q  75 caattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacata 165  Q
    ||||| ||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  2844314 caattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacata 2844404  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 177
Target Start/End: Original strand, 3992673 - 3992775
Alignment:
Q  75 caattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaactt 174  Q
    ||||| ||||||||||   ||| |||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |    
T  3992673 caattgagcataatttacaaactacccattttcctacatcatgaacctgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacat 3992772  T
Q  175 atc 177  Q
    |||    
T  3992773 atc 3992775  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 343
Target Start/End: Original strand, 16261777 - 16261851
Alignment:
Q  269 atgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||||  || || |||||||||||||||| | | ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16261777 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaattccaacttaggcttcactttagctcctaa 16261851  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 177
Target Start/End: Original strand, 33342004 - 33342106
Alignment:
Q  75 caattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaactt 174  Q
    ||||| ||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||| | |||  |||||||||| |||||| |    
T  33342004 caattgagcataatttaccaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcattaaacatcaaattaacatattcaaacat 33342103  T
Q  175 atc 177  Q
    |||    
T  33342104 atc 33342106  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 269 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 51961063 - 51960990
Alignment:
Q  269 atgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctccta 342  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| | |||||||||| ||||||    
T  51961063 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttagacttcactttacctccta 51960990  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Original strand, 55513016 - 55513117
Alignment:
Q  98 acccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaat 197  Q
    ||||||||| |||||| || ||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |||| | | ||||  |||||||||    
T  55513016 acccattttcatacatcattaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcgaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaat 55513115  T
Q  198 tt 199  Q
    ||    
T  55513116 tt 55513117  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 199
Target Start/End: Original strand, 11402753 - 11402837
Alignment:
Q  115 atgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||  |||| | |||||||||| |||||| | || | ||||||||||||    
T  11402753 atgaacatgaaatttcatcaacaacaattcaattatcatcaaattcatatactcaaacatatcactataatatgagcacgaattt 11402837  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 199
Target Start/End: Original strand, 53771164 - 53771288
Alignment:
Q  75 caattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaactt 174  Q
    ||||| ||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||  ||||| |    
T  53771164 caattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaccattcatttaacatcaaattaacatatccaaacat 53771263  T
Q  175 atcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    ||| | | ||||  |||||||||||    
T  53771264 atctctacaacataagcacgaattt 53771288  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 31412517 - 31412451
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaa 81  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  31412517 caacaacatcaattaaaccta-attctcatcacaattcaacaacaacatatcacaattcaacaattaa 31412451  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 343
Target Start/End: Original strand, 53771365 - 53771439
Alignment:
Q  269 atgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||||  || || |||||||||||||||| | | ||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  53771365 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 53771439  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 343
Target Start/End: Original strand, 2050104 - 2050189
Alignment:
Q  258 acaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||| || ||||||||||  || || |||||||||||||||| | | ||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2050104 acaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 2050189  T

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Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 9303036 - 9302999
Alignment:
Q  306 atgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  9303036 atgatcaattcaaacttgagcttcactttaactcctaa 9302999  T

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Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 343
Target Start/End: Original strand, 54651720 - 54651838
Alignment:
Q  224 atcaacccattt-catacaacaaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaactt 322  Q
    |||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||  || | | ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| | ||||| ||  |||||||    
T  54651720 atcaacccattttcatacaacatgagaaattgcaaa--aattgaacatgattatgatgaagacaaacccccttaccttagatgatgattaacccaaactt 54651817  T
Q  323 gggcttcactttagctcctaa 343  Q
      |||||| || |||||||||    
T  54651818 ttgcttcaattaagctcctaa 54651838  T

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Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 199
Target Start/End: Original strand, 16261576 - 16261700
Alignment:
Q  75 caattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaactt 174  Q
    ||||| ||||||||||   ||| |||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||  ||||| |    
T  16261576 caattgagcataatttacaaactacccattttcgtacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaccattcatttaacatcaaattaacatatccaaacat 16261675  T
Q  175 atcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    ||| | | ||||  |||||||||||    
T  16261676 atctctacaacataagcacgaattt 16261700  T

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Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 199
Target Start/End: Original strand, 17393597 - 17393681
Alignment:
Q  115 atgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    |||||||||  ||||||||  ||| |||||| ||||||   ||||||||||| ||||| |||||| | ||| |||||||||||||    
T  17393597 atgaacatgcaatttcatcgtcaataattcaattatcaacaaattaacatacccaaacatatcactacaactagagcacgaattt 17393681  T

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Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 17956090 - 17956026
Alignment:
Q  101 cattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacata 165  Q
    |||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  17956090 cattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacata 17956026  T

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Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 177
Target Start/End: Original strand, 23492502 - 23492598
Alignment:
Q  81 agcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 177  Q
    ||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||| | |||||||||||||| |||  |||||||| | |||||| ||||    
T  23492502 agcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcataatcaacaattcatttaacatcaaattaacacattcaaacatatc 23492598  T

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Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 70
Target Start/End: Original strand, 50313250 - 50313305
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaat 70  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||||| |||||||    
T  50313250 caacaacatcaattaaa-catgattcccatcacaattcaacaacaacatatcacaat 50313305  T

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Target: scaffold0574 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 76 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 9638 - 9370
Alignment:
Q  76 aattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaactta 175  Q
    |||| ||||||||||   ||| ||||||||| |||||| || ||| ||  ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  9638 aattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcataaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttagcaatcaattaacatactcaaactta 9539  T
Q  176 tcaccaaaacaagagcacgaattt-aacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaacaaggaaaattgcaaacaaaataatcatgatt 274  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9538 tcaccaaaacaagagcacgaattttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaacaaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgatt 9439  T
Q  275 atgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9438 atgaagaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 9370  T

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Target: scaffold0162 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 3)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 343
Target Start/End: Original strand, 11808 - 12137
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||    
T  11808 caacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattcaacaa-aacatgtcatgattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcaaacat 11906  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacg-aatttaacaacaattatc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  11907 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaatagcacgaaatttaacaacaattatc 12006  T
Q  213 aattcattccaatcaacccatttcatacaac-aagga-aaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgat 310  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||   || | | ||||||||||| ||| || |||||||||| ||||| | |||||    
T  12007 aattcattgcaatcaacccgtttcatacaacaaaggagaagttgcaa--taattgaacatgattatgatgaagactaacccccttatcttagataatgat 12104  T
Q  311 caattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
     ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  12105 taatccaaactttggcttcaatttagctcctaa 12137  T

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Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 187 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8208 - 8051
Alignment:
Q  187 agagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccat-ttcatacaacaa--ggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaa 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | ||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||   |||| | ||||||||||| |||     
T  8208 agagcacgaatttagcaacaattatccatttattcaattcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaat--aaatgaacatgattatgatgaag 8111  T
Q  284 accaaccccc-ttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctccta 342  Q
    || ||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8110 actaaccccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcattttagctccta 8051  T

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Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26383 - 26298
Alignment:
Q  258 acaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||| |||||||||||||  || || |||||||||||||||| | | ||| ||| | | ||| ||||||| ||||||||||||    
T  26383 acaaaatgatcatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccatcttaggcttcaatttagctcctaa 26298  T

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Target: scaffold0173 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Original strand, 5284 - 5466
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5284 caacaacatcaattaaatcttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacat 5383  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5384 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcaatcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 5466  T

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Target: scaffold0173; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Original strand, 5527 - 5623
Alignment:
Q  247 gaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5527 gaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacttgggcttcattttagctcctaa 5623  T

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Target: scaffold0037 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 102 - 343
Target Start/End: Original strand, 95129 - 95372
Alignment:
Q  102 attttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt-a 200  Q
    ||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  95129 attttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaatttta 95228  T
Q  201 acaacaattatcaattcattccaatcaa-cccatttcatacaacaaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttacct 299  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  95229 acaacaattatcaactcatttcaatcaaacccatttcatacaacaaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgaagaagactaacccccttacct 95328  T
Q  300 taggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  95329 taggtaatgattaatccaaacctaggcttcactttagctcctaa 95372  T

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Target: scaffold0335 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 5773 - 5591
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5773 caacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcattaattaagcataatttcaaaacaacccattttcatacat 5674  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5673 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 5591  T

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Target: scaffold0335; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 5530 - 5434
Alignment:
Q  247 gaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  5530 gaaaattgcaaacaaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaatcttaggcttcactttagctcctaa 5434  T

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Target: scaffold0207 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Original strand, 17761 - 17943
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  17761 caacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcatacat 17860  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17861 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 17943  T

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Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 233 - 343
Target Start/End: Original strand, 17989 - 18100
Alignment:
Q  233 tttcatacaa-caaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcac 331  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  17989 tttcatacaaacaaagaaaattgcaaacaaaataattatgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcac 18088  T
Q  332 tttagctcctaa 343  Q
    |||| |||||||    
T  18089 tttaactcctaa 18100  T

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Target: chr2 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 24826911 - 24826729
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  24826911 caacaacatcaattgaaacttgattcacacctcaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacat 24826812  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24826811 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 24826729  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Original strand, 15633276 - 15633458
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||    
T  15633276 caacaacatcaattgaaacttgtttctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcaaacat 15633375  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15633376 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 15633458  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Original strand, 17204394 - 17204576
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  17204394 caacaacatcaattgaaacttgattcacacctcaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacat 17204493  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17204494 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatgatgcaattaacatactcaatcttatcaccaaaacaagagcacgaa 17204576  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 28031431 - 28031249
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||    
T  28031431 caacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatatcataattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcacacat 28031332  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28031331 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcaatcaattaacatactaaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 28031249  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Original strand, 33128108 - 33128289
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  33128108 caacaatatcaattaaa-catgattctcatcacaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacat 33128206  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33128207 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 33128289  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 199
Target Start/End: Original strand, 25213111 - 25213295
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  25213111 caacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacat 25213210  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||| | | ||||  |||||||||||    
T  25213211 tatgaacatattatttcatcatcaaccattcatttaaca-tcaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaattt 25213295  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 7507876 - 7507715
Alignment:
Q  183 aacaagagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccat-ttcatacaacaa--ggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaa 279  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||   |||| | |||||||||||     
T  7507876 aacaagagcacgaatttagcaataattattcattcattcaattcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaat--aaatgaacatgattatgat 7507779  T
Q  280 gaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  7507778 gaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagtttcactttaactcctaa 7507715  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 28031188 - 28031092
Alignment:
Q  247 gaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  28031188 gaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaatgattaattcaaacttaggcttcactttaactcctaa 28031092  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 233 - 343
Target Start/End: Original strand, 33128335 - 33128446
Alignment:
Q  233 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttca 330  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  33128335 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaac-aattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaatccaaacttaggcttca 33128433  T
Q  331 ctttagctcctaa 343  Q
    |||||||||||||    
T  33128434 ctttagctcctaa 33128446  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 199
Target Start/End: Original strand, 7321612 - 7321764
Alignment:
Q  47 aattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcat 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    ||| ||||||||  |||||| || ||||||  |||||||||  || ||||||     
T  7321612 aattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattgagcacaattcacaaactacccatttatatacatcataaacatgaaatttcatcataaaaaattcaa 7321711  T
Q  147 ttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||    
T  7321712 ttatcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaattt 7321764  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 268 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 23777995 - 23777920
Alignment:
Q  268 catgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  23777995 catgattatgatgataactaacccctttaccttaggttatgatcaattcaaatttgagcttcactttagctcctaa 23777920  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 25265418 - 25265261
Alignment:
Q  187 agagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccat-ttcatacaacaa--ggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaa 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | ||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||   |||| | ||||||||||| |||     
T  25265418 agagcacgaatttagcaacaattatccatttattcaattcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaat--aaatgaacatgattatgatgaag 25265321  T
Q  284 accaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    || ||||||||||| |||| | ||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  25265320 actaacccccttacattagataatgattaatccaaacctaggcttcactttagctcctaa 25265261  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 233 - 343
Target Start/End: Original strand, 17204622 - 17204733
Alignment:
Q  233 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttca 330  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| | |||||    
T  17204622 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaac-aattatgattatgatgaagactaacccccttactttaggttatgattaatccaaacttagacttca 17204720  T
Q  331 ctttagctcctaa 343  Q
    ||||| |||||||    
T  17204721 ctttaactcctaa 17204733  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 177
Target Start/End: Original strand, 22274845 - 22274947
Alignment:
Q  75 caattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaactt 174  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |    
T  22274845 caattgagcataatttacaaacaacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacat 22274944  T
Q  175 atc 177  Q
    |||    
T  22274945 atc 22274947  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 177
Target Start/End: Original strand, 22284078 - 22284180
Alignment:
Q  75 caattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaactt 174  Q
    ||||| ||||||||||  |||| |  |||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |    
T  22284078 caattgagcataatttactaactattcattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacattaaattaacatattcaaacat 22284177  T
Q  175 atc 177  Q
    |||    
T  22284178 atc 22284180  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 19689428 - 19689315
Alignment:
Q  188 gagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaac 285  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||  || | ||||||||||  | ||| | |||||||||||  || ||    
T  19689428 gagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatacaaatcatgaaaaattgcaa--agaatgaacatgattatgataaagac 19689331  T
Q  286 caacccccttacctta 301  Q
     |||||||||||||||    
T  19689330 taacccccttacctta 19689315  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 9653005 - 9652926
Alignment:
Q  98 acccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 177  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  9653005 acccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatc 9652926  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14906467 - 14906312
Alignment:
Q  188 gagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaac 285  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| |||  || | ||||||||||  | ||| | |||||||||||  || ||    
T  14906467 gagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaa--agaatgaacatgattatgataaagac 14906370  T
Q  286 caacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
     |||||||||||||||| | | ||| |   ||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  14906369 taacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaa 14906312  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 343
Target Start/End: Original strand, 23820307 - 23820462
Alignment:
Q  188 gagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaac 285  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| |||  || | ||||||||||  | ||| | |||||||||||  || ||    
T  23820307 gagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaa--agaatgaacatgattatgataaagac 23820404  T
Q  286 caacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
     |||||||||||||||| | | ||| |   ||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  23820405 taacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaa 23820462  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17396680 - 17396626
Alignment:
Q  188 gagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaa 242  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  17396680 gagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatgtcaacccatttcatacaa 17396626  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 270 - 343
Target Start/End: Original strand, 21142203 - 21142276
Alignment:
Q  270 tgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||| | |||   ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21142203 tgattatgatgaaaacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactttagctcctaa 21142276  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 89
Target Start/End: Original strand, 9636808 - 9636883
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaatta-agcataatt 89  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||| | |||||| |||||||||    
T  9636808 caacaacatcaattaaa-catgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcataatt 9636883  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 248 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24341362 - 24341267
Alignment:
Q  248 aaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||||| |  || || |||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||| ||    ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  24341362 aaaattgcaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttaggcttcattttagctcctaa 24341267  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 5888821 - 5888744
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttca 92  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||| | || ||||| ||| |||||||    
T  5888821 caacaacatccattgaaacttgtttctcacctcaattcaac-acaacttatcacaaatcattaattaggcaaaatttca 5888744  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 343
Target Start/End: Original strand, 463032 - 463117
Alignment:
Q  258 acaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||| || ||||||||||  || || |||||||||||||||| | | ||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  463032 acaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 463117  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 5888578 - 5888505
Alignment:
Q  270 tgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||| | |||   |||||  |||||||||||||||||||    
T  5888578 tgattatgatgaaaacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaagcttcactttagctcctaa 5888505  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21274158 - 21274057
Alignment:
Q  98 acccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaat 197  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||  ||||| |||| | | ||||  |||||||||    
T  21274158 acccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaccattcatttaacatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaat 21274059  T
Q  198 tt 199  Q
    ||    
T  21274058 tt 21274057  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 199
Target Start/End: Original strand, 20279574 - 20279658
Alignment:
Q  115 atgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||  |||| | |||| ||||| |||| | | |||| ||||||||||||    
T  20279574 atgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcatcaaattcatatacccaaacatatctctataacatgagcacgaattt 20279658  T

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Target: chr7 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Original strand, 371152 - 371334
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  371152 caacaacatcaatcgaaacttgattctcaccttaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacat 371251  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  371252 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaatcttatcaccaaaacaagagcacgaa 371334  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 233 - 343
Target Start/End: Original strand, 371380 - 371491
Alignment:
Q  233 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttca 330  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  371380 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaac-aattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttca 371478  T
Q  331 ctttagctcctaa 343  Q
    |||||||||||||    
T  371479 ctttagctcctaa 371491  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 50 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 39291666 - 39291517
Alignment:
Q  50 tcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcattta 149  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||    ||| ||||||||  |||||| || ||||||  ||||||||| |||||||||| |||    
T  39291666 tcaacaacaatatgtcacaattcaccaattgagcataattcacaaactacccatttatatacatcatcaacatgcaatttcatcatcaacaattcaatta 39291567  T
Q  150 tcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||    
T  39291566 tcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaattt 39291517  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 199
Target Start/End: Original strand, 13352046 - 13352199
Alignment:
Q  46 caattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 145  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||  |  || ||||||||  |||||| |||||||||  |||||| || |||||| |||    
T  13352046 caattcaacaacaacatgtcataattcatcaattgagcataattaaaatactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcaccatcaacaaatca 13352145  T
Q  146 tttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
      ||||||  |||||||||||| |||| |||||| | |||| ||||||||||||    
T  13352146 aatatcatcaaattaacatactgaaacatatcactacaacatgagcacgaattt 13352199  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 268 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18253793 - 18253718
Alignment:
Q  268 catgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  18253793 catgattataatgataactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaatttgagcttcactttagctcctaa 18253718  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 343
Target Start/End: Original strand, 13321251 - 13321408
Alignment:
Q  187 agagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccat-ttcatacaacaa--ggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaa 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | | |||| | ||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||   |||| | ||||||||||| |||     
T  13321251 agagcacgaatttagcaacaattatccacttattcaattcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaat--aaatgaacatgattatgatgaag 13321348  T
Q  284 accaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    || |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  13321349 actaacccccttaccttagataatgattaatccaaacctaggcttcactttagctcctaa 13321408  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 47481059 - 47480902
Alignment:
Q  187 agagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccat-ttcatacaacaa--ggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaa 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | ||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||   |||| |  |||||||||| |||     
T  47481059 agagcacgaatttagcaacaattatccatttattcaattcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaat--aaatgaatatgattatgatgaag 47480962  T
Q  284 accaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    || |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  47480961 actaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcactttacctcctaa 47480902  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 268 - 343
Target Start/End: Original strand, 15862225 - 15862300
Alignment:
Q  268 catgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    |||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||    
T  15862225 catgattatgataataactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcaacttaactcctaa 15862300  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 343
Target Start/End: Original strand, 7293252 - 7293407
Alignment:
Q  188 gagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaac 285  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||  || | ||||||||||  | ||| | |||||||||||  || ||    
T  7293252 gagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatacaaatcatgaaaaattgcaa--agaatgaacatgattatgataaagac 7293349  T
Q  286 caacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
     |||||||||||||||| | | ||| |   ||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  7293350 taacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaa 7293407  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 17984827 - 17984756
Alignment:
Q  128 ttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||   ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  17984827 ttcatcatcaacaattcaattatcaacaaattaacatacccaaacatatcactaaaacaagagcacgaattt 17984756  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 30262156 - 30262001
Alignment:
Q  188 gagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaac 285  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||  || | ||||||||||  | ||| | |||||||||||  || ||    
T  30262156 gagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatacaaatcatgaaaaattgcaa--agaatgaacatgattatgataaagac 30262059  T
Q  286 caacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
     |||||||||||||||| | | ||| |   ||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  30262058 taacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaa 30262001  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 177
Target Start/End: Original strand, 126538 - 126640
Alignment:
Q  75 caattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaactt 174  Q
    ||||| ||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |    
T  126538 caattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacat 126637  T
Q  175 atc 177  Q
    |||    
T  126638 atc 126640  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 269 - 343
Target Start/End: Original strand, 25124450 - 25124524
Alignment:
Q  269 atgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||||| | ||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25124450 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 25124524  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 75 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 111401 - 111277
Alignment:
Q  75 caattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaactt 174  Q
    ||||| ||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||| ||||||||| |||  |||||||||| |||||| |    
T  111401 caattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaccattcatttaacatcaaattaacatattcaaacat 111302  T
Q  175 atcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    ||| | | ||||  |||||||||||    
T  111301 atctctacaacataagcacgaattt 111277  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 8563431 - 8563347
Alignment:
Q  115 atgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||  |||| | |||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||    
T  8563431 atgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcatcaaattcatatactcaaacatatcatcataacaagagcacaaattt 8563347  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 10000558 - 10000484
Alignment:
Q  17 caacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttca 92  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||| | |||||||||||| |||||||    
T  10000558 caacatccattgaaacttgtttctcacctcaattcaac-acaacttatcacaaatcatcaattaagcaaaatttca 10000484  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 343
Target Start/End: Original strand, 11516463 - 11516618
Alignment:
Q  188 gagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaac 285  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| |||  || | ||||||||||  | ||| | |||||||||||  || ||    
T  11516463 gagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaa--agaatgaacatgattatgataaagac 11516560  T
Q  286 caacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
     |||||||||||||||| | | ||| |   ||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  11516561 taacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaa 11516618  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15441591 - 15441436
Alignment:
Q  188 gagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaac 285  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| |||  || | ||||||||||  | ||| | |||||||||||  || ||    
T  15441591 gagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaa--agaatgaacatgattatgataaagac 15441494  T
Q  286 caacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
     |||||||||||||||| | | ||| |   ||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  15441493 taacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaa 15441436  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 14114016 - 14113902
Alignment:
Q  188 gagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaac 285  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| |||  || | ||||||||||  | ||| | |||||||||||  || ||    
T  14114016 gagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaa--agaatgaacatgattatgataaagac 14113919  T
Q  286 caacccccttaccttag 302  Q
     ||||||||||||||||    
T  14113918 taacccccttaccttag 14113902  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 14423666 - 14423612
Alignment:
Q  188 gagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaa 242  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  14423666 gagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatacaa 14423612  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15978002 - 15977849
Alignment:
Q  46 caattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcat-aacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 144  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| || || |||||| ||| ||  | |||| |  |||||  |||||||||  ||||||||| ||| |||||    
T  15978002 caattcaacaacaacatgtcataattcatcatttgagtataatt-catcaagtatccatatatatacaccatgaacatgcaatttcatcatcaataattc 15977904  T
Q  145 atttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    | ||||||   ||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||| ||||||    
T  15977903 aattatcaacaaattaacatactcaaacatatcactacaactagagcatgaattt 15977849  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 172
Target Start/End: Original strand, 2029044 - 2029141
Alignment:
Q  75 caattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaac 172  Q
    ||||| ||||||||||   ||| |||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  2029044 caattgagcataatttacaaactacccattttcgtacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaac 2029141  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 258 - 343
Target Start/End: Original strand, 36052960 - 36053045
Alignment:
Q  258 acaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||| || ||||||||||  || || |||||||||||||||| | | ||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  36052960 acaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 36053045  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 270 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 48622614 - 48622541
Alignment:
Q  270 tgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||| | |||   ||||| ||||||||||||||||||||    
T  48622614 tgattatgatgaaaacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactttagctcctaa 48622541  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 343
Target Start/End: Original strand, 2029244 - 2029318
Alignment:
Q  269 atgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||||  || || |||||||||||||||| | | ||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2029244 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaattccaacttaggcttcaatttagctcctaa 2029318  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 92
Target Start/End: Original strand, 16418562 - 16418639
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttca 92  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||| | || ||||| ||| |||||||    
T  16418562 caacaacatccattgaaacttgtttctcacctcaattcaac-acaacttatcacaaatcattaattaggcaaaatttca 16418639  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 25292365 - 25292311
Alignment:
Q  188 gagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaa 242  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  25292365 gagcacaaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatacaa 25292311  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 42056220 - 42056146
Alignment:
Q  269 atgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||||  || || |||||||||||||||| | | ||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  42056220 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 42056146  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 10000318 - 10000245
Alignment:
Q  270 tgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||||| | ||| | |||   ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10000318 tgattatgatgaagacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactttagctcctaa 10000245  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 13036981 - 13036896
Alignment:
Q  258 acaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||| || |||||||||  ||| || |||||||||||||||| | | ||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  13036981 acaaaatgatgatgattatggtgaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 13036896  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 343
Target Start/End: Original strand, 16212060 - 16212145
Alignment:
Q  258 acaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||| || ||||||||||  || || |||||||||||||||| | | ||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  16212060 acaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 16212145  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 71
Target Start/End: Original strand, 31501236 - 31501292
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaatt 71  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||    
T  31501236 caacaacatcaattaaa-catgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaatt 31501292  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 42056398 - 42056297
Alignment:
Q  98 acccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaat 197  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||  ||||| |||| | | ||||  |||||||||    
T  42056398 acccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaccattcatttaacatcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaat 42056299  T
Q  198 tt 199  Q
    ||    
T  42056298 tt 42056297  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 2190318 - 2190194
Alignment:
Q  75 caattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaactt 174  Q
    ||||| ||||||||||   ||| | ||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||  ||||| |    
T  2190318 caattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaccattcatttaacatcaaattaacatatccaaacat 2190219  T
Q  175 atcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    ||| | | ||||  |||||||||||    
T  2190218 atctctacaacataagcacgaattt 2190194  T

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Target: scaffold0615 (Bit Score: 146; Significance: 8e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 6411 - 6226
Alignment:
Q  11 catcaacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaata 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  6411 catcaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcttaatttcacaacaacccattttcata 6312  T
Q  111 cattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6311 cattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaatcttatcaccaaaacaagagcacgaa 6226  T

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Target: scaffold0615; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 233 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 6179 - 6068
Alignment:
Q  233 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttca 330  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||  ||| |||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6179 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaac-aattatgattatgtttaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttca 6081  T
Q  331 ctttagctcctaa 343  Q
    |||||||||||||    
T  6080 ctttagctcctaa 6068  T

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Target: scaffold0118 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 34605 - 34423
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||    
T  34605 caacaacatcaattgaaacttgattttcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcacacat 34506  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  34505 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcattaaaacaagagcacgaa 34423  T

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Target: scaffold0118; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 34362 - 34266
Alignment:
Q  247 gaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  34362 gaaaattgcaaacaaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcattttagctcctaa 34266  T

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Target: scaffold0023 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 61418 - 61237
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  61418 caacaacatcaattaaa-catgattctcatcacaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacat 61320  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  61319 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 61237  T

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Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 233 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 61191 - 61084
Alignment:
Q  233 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttca 330  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  61191 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaac-aattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttaa 61093  T
Q  331 ctttagctc 339  Q
    |||||||||    
T  61092 ctttagctc 61084  T

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Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 343
Target Start/End: Original strand, 48892 - 48977
Alignment:
Q  258 acaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||| || ||||||||||  || || |||||||||||||||||| ||| |||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  48892 acaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggctttactttagctcctaa 48977  T

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Target: scaffold0367 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 17505 - 17324
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  17505 caacaacatcaattaaa-catgattctcatcacaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacagcaacccattttcatacat 17407  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  17406 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcatacttatcaccaaaacaagagtacgaa 17324  T

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Target: scaffold0367; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 233 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 17278 - 17208
Alignment:
Q  233 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttag 302  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  17278 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaac-aattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 17208  T

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Target: scaffold0049 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 188 - 343
Target Start/End: Original strand, 48423 - 48578
Alignment:
Q  188 gagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaacaaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaacca 287  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || |    
T  48423 gagcacgaatttagcaacaattatcaattcattccaaccaacccatttcatacaacaaggaaaattgcaaacaaaacattcatgattatgaagaagacta 48522  T
Q  288 acccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48523 acccccttacattaggttatgattaattcaaatttgggcttcactttagctcctaa 48578  T

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Target: scaffold0032 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 173 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 13394 - 13225
Alignment:
Q  173 ttatcaccaaaacaagagcacgaattt-aacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaacaaggaaaattgcaaacaaaataatcatg 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||  ||| | | ||||    
T  13394 ttatcaccaaaacaagagcacgaattttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaacatgagaaaatgcaa--aaattgaacatg 13297  T
Q  272 attatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13296 attatgatgataactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 13225  T

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Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 13476 - 13398
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttca 92  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  13476 caacaacatcaattgaaacttgatttccacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaaacataatttca 13398  T

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Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 172
Target Start/End: Original strand, 55704 - 55801
Alignment:
Q  75 caattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaac 172  Q
    ||||| ||||||||||   ||| |||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  55704 caattgagcataatttacaaactacccattttcctacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaac 55801  T

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Target: scaffold0028 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 199
Target Start/End: Original strand, 130619 - 130803
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacat 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  130619 caacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacat 130718  T
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||  ||||| |||| | | |||| ||||||||||||    
T  130719 tatgaacatattatttcatcatcaaccattcatttaaca-tcaattaacgtatccaaacatatctctacaacatgagcacgaattt 130803  T

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Target: scaffold0387 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 169 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 7199 - 7127
Alignment:
Q  169 aaacttatcaccaaaacaagagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcataca 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7199 aaacttatcaccaaaacaagagcacaaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcataca 7127  T

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Target: scaffold0387; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 268 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 7128 - 7053
Alignment:
Q  268 catgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  7128 catgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgattaattcaaatttaagcttcactttagctcctaa 7053  T

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Target: scaffold0125 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 187 - 343
Target Start/End: Original strand, 41883 - 42039
Alignment:
Q  187 agagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccat-ttcatacaacaagga-aaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaa 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||| |||||||||||| || |||||| ||   |||| | ||||||||||| ||| |    
T  41883 agagcacgaatttaacaacaattatccatttattcaattcaacccatattcatacaacaatgagaaattgaaat--aaatgaacatgattatgatgaaga 41980  T
Q  285 ccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41981 ctaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacttaggcttcactttagctcctaa 42039  T

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Target: scaffold0507 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 1659 - 1509
Alignment:
Q  49 ttcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatt-tcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatt 147  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||| ||| || |||||  |||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| |    
T  1659 ttcaacaacaacatgtcataattcatcaattgagcataattctca-aactactcatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaat 1561  T
Q  148 tatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||    
T  1560 tatcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaattt 1509  T

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Target: scaffold0075 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 34488 - 34331
Alignment:
Q  187 agagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccat-ttcatacaacaa--ggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaa 283  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||   |||| | |||||||||||  | |    
T  34488 agagcacgaatttagcaataattatccattcattcaattcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaat--aaatgaacatgattatgataata 34391  T
Q  284 accaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    || ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  34390 actaaccctcttaccttaggtaatgatcaattcaagcttgagcttcactttagctcctaa 34331  T

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Target: scaffold1295 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 49 - 199
Target Start/End: Original strand, 203 - 353
Alignment:
Q  49 ttcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcattt 148  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||    ||| || |||||  |||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| ||    
T  203 ttcaacaacaacatgtcataattcaacaattgagcataattcacaaactacacatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaatt 302  T
Q  149 atcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||| ||||||    
T  303 atcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcaagaattt 353  T

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Target: scaffold0361 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 343
Target Start/End: Original strand, 3425 - 3578
Alignment:
Q  187 agagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaacaagga-aaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaac 285  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||   |||| | ||||||||||| ||| |     
T  3425 agagcacgaatttagcatcaattatccatttattc-aatcaacccatttcacataacaaggagaaattgcaat--aaatgaacatgattatgaggaagaa 3521  T
Q  286 caacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
     |||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3522 taacccc-ttaccttagatgatgattaattcaaacttaggcttcactttagctcctaa 3578  T

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Target: scaffold0132 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 335
Target Start/End: Original strand, 13741 - 13890
Alignment:
Q  187 agagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccat-ttcatacaacaa--ggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaa 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | ||||||||| ||||||||||||  |  |||||||||   |||||| ||||||||||| |||     
T  13741 agagcacgaatttagcaacaattatccatttattcaattcaacccatattcatacaacaaatgagaaattgcaat--aaataaacatgattatgatgaag 13838  T
Q  284 accaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcacttta 335  Q
    || |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  13839 actaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcacttta 13890  T

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Target: scaffold0084 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 187 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 56127 - 56067
Alignment:
Q  187 agagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaacaagg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  56127 agagcacgaatttaacaacaattatctattcattccaatcaaccaatttcatacaacaagg 56067  T

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Target: scaffold0063 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 44275 - 44122
Alignment:
Q  46 caattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 145  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||| |    ||| ||  ||||  |||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  44275 caattcaacaacaacatgtcataattcgtcaattgagcataactcacaaactacttatttacatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattca 44176  T
Q  146 tttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
     ||| |||  ||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||    
T  44175 attaccatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaattt 44122  T

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Target: scaffold0026 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 268 - 343
Target Start/End: Original strand, 108052 - 108127
Alignment:
Q  268 catgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||| | || ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  108052 catgattataatgataactaacccccttaccttaggctataatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 108127  T

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Target: scaffold0057 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 199
Target Start/End: Original strand, 5977 - 6130
Alignment:
Q  46 caattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||| || | ||||||| |||| ||||    ||| ||||||||   || || |||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  5977 caattcaactacaacatgtcataaatcatcaattgagcacaattcacaaactacccatttacttatatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattca 6076  T
Q  146 tttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
     |||||||  | ||||||||||||||| |||||| | |||| |||||| |||||    
T  6077 attatcatcaatttaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacaaattt 6130  T

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Target: scaffold0303 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 3)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 160 - 36
Alignment:
Q  75 caattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaactt 174  Q
    ||||| ||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |    
T  160 caattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacat 61  T
Q  175 atcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    ||| | | ||||  |||||||||||    
T  60 atctctacaacataagcacgaattt 36  T

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Target: scaffold0303; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 287 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 4360 - 4304
Alignment:
Q  287 aacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  4360 aacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacttttgcttcactttagctcctaa 4304  T

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Target: scaffold0303; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 4579 - 4489
Alignment:
Q  75 caattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacata 165  Q
    ||||| ||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  4579 caattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacata 4489  T

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Target: scaffold0116 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 177
Target Start/End: Original strand, 30217 - 30319
Alignment:
Q  75 caattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaactt 174  Q
    ||||| ||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |    
T  30217 caattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacat 30316  T
Q  175 atc 177  Q
    |||    
T  30317 atc 30319  T

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Target: scaffold0004 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 193620 - 193518
Alignment:
Q  75 caattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaactt 174  Q
    ||||| ||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |    
T  193620 caattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacat 193521  T
Q  175 atc 177  Q
    |||    
T  193520 atc 193518  T

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Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 186658 - 186561
Alignment:
Q  75 caattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaac 172  Q
    ||||| ||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  186658 caattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaac 186561  T

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Target: scaffold0601 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 981 - 880
Alignment:
Q  98 acccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaat 197  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||   |||| |  ||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  981 acccattttcacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaaattcatttactcaaacatatcatcataacaagagcacgaat 882  T
Q  198 tt 199  Q
    ||    
T  881 tt 880  T

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Target: scaffold0465 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 10092 - 9991
Alignment:
Q  98 acccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaat 197  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| |||| | | ||||  |||||||||    
T  10092 acccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaat 9993  T
Q  198 tt 199  Q
    ||    
T  9992 tt 9991  T

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Target: scaffold0184 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 31412 - 31315
Alignment:
Q  75 caattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaac 172  Q
    ||||| ||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  31412 caattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaac 31315  T

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Target: scaffold0078 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 172
Target Start/End: Original strand, 41432 - 41529
Alignment:
Q  75 caattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaac 172  Q
    ||||| ||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  41432 caattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaac 41529  T

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Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 37093 - 37039
Alignment:
Q  188 gagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaa 242  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  37093 gagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatacaa 37039  T

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Target: scaffold0706 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 75 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 6675 - 6551
Alignment:
Q  75 caattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaactt 174  Q
    ||||| ||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||  |||  |||||||||| |||||| |    
T  6675 caattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttgacatcaaattaacatattcaaacat 6576  T
Q  175 atcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    ||| | | ||||  |||||||||||    
T  6575 atctctacaacataagcacgaattt 6551  T

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Target: scaffold0467 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 10289 - 10218
Alignment:
Q  268 catgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctc 339  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||| ||  | ||||| ||||||||||||||||    
T  10289 catgattatgaagaagacaaacccccttaccttagatgatgattaaccccaacttaggcttcactttagctc 10218  T

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Target: scaffold0231 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12832 - 12733
Alignment:
Q  100 ccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    ||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||| | | | || | || ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  12832 ccattttaacatattatgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaattatgaataatttcatatcctcaaacatatcactaaaactagagcacgaattt 12733  T

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Target: scaffold0124 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1609 - 1454
Alignment:
Q  188 gagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaac 285  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| |||  || | ||||||||||  | ||| | |||||||||||  || ||    
T  1609 gagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaa--agaatgaacatgattatgataaagac 1512  T
Q  286 caacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
     |||||||||||||||| | | ||| |   ||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  1511 taacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaa 1454  T

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Target: scaffold0597 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 1110 - 1020
Alignment:
Q  75 caattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacata 165  Q
    ||||| ||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  1110 caattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacata 1020  T

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Target: scaffold0234 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 17536 - 17434
Alignment:
Q  75 caattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaactt 174  Q
    ||||| ||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||  ||  |||||||||| |||||| |    
T  17536 caattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaaaatcaaattaacatattcaaacat 17437  T
Q  175 atc 177  Q
    |||    
T  17436 atc 17434  T

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Target: scaffold0079 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 4002 - 3876
Alignment:
Q  46 caattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 145  Q
    |||||||| |||||||||||  |||| ||||||| | |||||||    ||| ||||||||  ||| || |||||||||  |||||||||  |||||||||    
T  4002 caattcaataacaacatgtcgtaattcatcaattgaacataattcacaaactacccatttatatatatcatgaacatgcaatttcatcattaacaattca 3903  T
Q  146 tttatcattcaattaacatactcaaac 172  Q
     | |||||  |||||||||||||||||    
T  3902 atcatcatcaaattaacatactcaaac 3876  T

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Target: scaffold0160 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 270 - 343
Target Start/End: Original strand, 339 - 412
Alignment:
Q  270 tgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||||| | | ||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  339 tgattatgatgaagactaacccccttaccttagataaggattaatccaaacttaggcttcaatttagctcctaa 412  T

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Target: scaffold0251 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 13518 - 13394
Alignment:
Q  75 caattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaactt 174  Q
    ||||| ||||||||||   ||| ||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||  ||||| |    
T  13518 caattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaccattcatttaacatcaaattaacatatccaaacat 13419  T
Q  175 atcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    ||| | | ||||  |||||||||||    
T  13418 atctctacaacataagcacgaattt 13394  T

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Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 13317 - 13243
Alignment:
Q  269 atgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||||  || || |||||||||||||||| | | ||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  13317 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 13243  T

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Target: scaffold0175 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 177
Target Start/End: Original strand, 15098 - 15174
Alignment:
Q  101 cattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 177  Q
    |||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  15098 cattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatc 15174  T

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Target: scaffold0141 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 343
Target Start/End: Original strand, 22776 - 22931
Alignment:
Q  188 gagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaac 285  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||   |||||||||||||| |||  || | ||||||||||  | ||| | |||||||||||  || ||    
T  22776 gagcacgaatttagcaacaattattcattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaa--agaatgaacatgattatgataaagac 22873  T
Q  286 caacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
     |||||||||||||||| | | ||| |   ||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  22874 taacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaa 22931  T

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Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 343
Target Start/End: Original strand, 27031 - 27186
Alignment:
Q  188 gagcacgaatttaacaacaattatcaattcattccaatcaacccatttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaataatcatgattatgaagaaaac 285  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| |||  || | ||||||||||  | ||  | |||||||||||  || ||    
T  27031 gagcacgaatttagcaacaattatccattcattcatttcaacccatttcatccaaatcatgaaaaattgcaa--agaaggaacatgattatgataaagac 27128  T
Q  286 caacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
     |||||||||||||||| | | ||| |   ||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  27129 taacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaa 27186  T

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Target: scaffold0066 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 268 - 343
Target Start/End: Original strand, 45337 - 45412
Alignment:
Q  268 catgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| | ||| | ||| ||||||| ||||||| || |||||||||    
T  45337 catgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatggttaatccaaacttaggcttcaattaagctcctaa 45412  T

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Target: scaffold0011 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 260 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 123128 - 123045
Alignment:
Q  260 aaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||| || |||||||||  ||| || |||||||||||||||||| | ||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  123128 aaaattatgatgattatggtgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 123045  T

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Target: scaffold0009 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 258 - 341
Target Start/End: Original strand, 272319 - 272402
Alignment:
Q  258 acaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcct 341  Q
    ||||||| || ||||||||||  || || |||||||||||||||| | | ||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  272319 acaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcct 272402  T

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Target: scaffold0498 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 343
Target Start/End: Original strand, 9183 - 9257
Alignment:
Q  269 atgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||||  || || |||||||||||||||| | | ||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  9183 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 9257  T

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Target: scaffold0266 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 3540 - 3466
Alignment:
Q  269 atgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||||  || || |||||||||||||||| | | ||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3540 atgattatgacaaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 3466  T

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Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 343
Target Start/End: Original strand, 1419 - 1504
Alignment:
Q  258 acaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||| || ||||||||||  || || |||||||||||||||| | | ||| |||   ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1419 acaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcacaacttaggcttcactttagctcctaa 1504  T

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Target: scaffold0155 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 23940 - 23863
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttca 92  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||| | || ||||| ||| |||||||    
T  23940 caacaacatccattgaaacttgtttctcacctcaattcaac-acaacttatcacaaatcattaattaggcaaaatttca 23863  T

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Target: scaffold0003 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 92
Target Start/End: Original strand, 7274 - 7351
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttca 92  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||| | || ||||| ||| |||||||    
T  7274 caacaacatccattgaaacttgtttctcacctcaattcaac-acaacttatcacaaatcattaattaggcaaaatttca 7351  T

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Target: scaffold0516 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 12075 - 12002
Alignment:
Q  270 tgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    |||||||||  | ||| |||||||||||||||| | ||| | ||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12075 tgattatgataataactaacccccttaccttagatgatgtttaattttaacttaggcttcactttagctcctaa 12002  T

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Target: scaffold0317 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12748 - 12603
Alignment:
Q  54 caacaacatgtcacaattaatcaattaagcataatttcataacaacccattttaatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcat 153  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||   ||  |  |||||  ||| |  |||||||||  ||||||||| ||| |||||| ||||||     
T  12748 caacaacatgtcacaattcatcaattgagcataatttatcaattattcatttatatataacatgaacatgcaatttcatcatcaataattcaattatcaa 12649  T
Q  154 tcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
      | ||||||||| ||| | |||||| ||||| ||||||| |||||    
T  12648 caagttaacatacccaatcatatcactaaaactagagcacaaattt 12603  T

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Target: scaffold0158 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 343
Target Start/End: Original strand, 25532 - 25605
Alignment:
Q  270 tgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||||| | | ||| ||  ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  25532 tgattatgatgaagactaacccccttaccttagataaggattaacccaaacttaggcttcaatttagctcctaa 25605  T

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Target: scaffold0151 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 22606 - 22550
Alignment:
Q  14 caacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaatt 71  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||  |||||||    
T  22606 caacaacatcaattaaa-catgattcacatctcaattcaacaacaacatagcacaatt 22550  T

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Target: scaffold0065 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 67982 - 67897
Alignment:
Q  114 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaattt 199  Q
    ||||||||||  |||||| || |||||||||| ||||||   | || || ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  67982 tatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaatttcacgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaattt 67897  T

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Target: scaffold0025 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 343
Target Start/End: Original strand, 146895 - 146980
Alignment:
Q  258 acaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||| || ||||||||||  || || |||||||||||||||| | | ||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  146895 acaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 146980  T

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Target: scaffold0017 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 343
Target Start/End: Original strand, 54182 - 54255
Alignment:
Q  270 tgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||| | |||   ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  54182 tgattatgatgaaaacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactatagctcctaa 54255  T

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Target: scaffold0012 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 247409 - 247324
Alignment:
Q  258 acaaaataatcatgattatgaagaaaaccaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaa 343  Q
    ||||||| || ||||||||||  || || |||||||||||||||| | | ||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  247409 acaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 247324  T

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