View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11579_high_5 (Length: 516)

Name: NF11579_high_5
Description: NF11579
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11579_high_5
NF11579_high_5
[»] chr1 (46 HSPs)
chr1 (19-358)||(42134485-42134828)
chr1 (18-318)||(45380757-45381065)
chr1 (47-358)||(36895323-36895631)
chr1 (107-358)||(44157436-44157687)
chr1 (131-358)||(33685143-33685369)
chr1 (47-358)||(46638619-46638928)
chr1 (47-305)||(31801689-31801945)
chr1 (112-363)||(18183818-18184069)
chr1 (112-358)||(35479850-35480096)
chr1 (47-363)||(27940606-27940921)
chr1 (137-292)||(6575261-6575414)
chr1 (47-358)||(47269267-47269577)
chr1 (143-305)||(15104497-15104659)
chr1 (143-305)||(31238401-31238563)
chr1 (143-305)||(34778045-34778206)
chr1 (143-296)||(6818584-6818737)
chr1 (143-351)||(50556003-50556211)
chr1 (143-305)||(4855873-4856034)
chr1 (151-305)||(27087339-27087492)
chr1 (143-351)||(2869589-2869797)
chr1 (143-351)||(25278274-25278482)
chr1 (143-351)||(37344352-37344560)
chr1 (149-305)||(51121961-51122117)
chr1 (143-351)||(3013376-3013590)
chr1 (16-96)||(44158050-44158135)
chr1 (238-305)||(51896153-51896220)
chr1 (143-297)||(33602550-33602704)
chr1 (256-308)||(42136230-42136282)
chr1 (143-263)||(43868712-43868832)
chr1 (256-363)||(5784853-5784960)
chr1 (256-358)||(31803686-31803788)
chr1 (256-358)||(33679262-33679364)
chr1 (143-305)||(46583462-46583624)
chr1 (47-96)||(33685061-33685110)
chr1 (47-95)||(6575431-6575479)
chr1 (143-206)||(26225460-26225523)
chr1 (270-305)||(27952500-27952535)
chr1 (53-96)||(35479789-35479832)
chr1 (256-307)||(45379139-45379190)
chr1 (272-351)||(52643650-52643729)
chr1 (256-318)||(18180543-18180605)
chr1 (256-358)||(44159280-44159382)
chr1 (272-305)||(6577107-6577140)
chr1 (256-305)||(11152601-11152650)
chr1 (143-199)||(5783505-5783561)
chr1 (238-298)||(9121669-9121729)
[»] chr3 (52 HSPs)
chr3 (18-358)||(18430051-18430392)
chr3 (47-358)||(24382702-24383014)
chr3 (16-358)||(45256997-45257341)
chr3 (55-358)||(48633880-48634186)
chr3 (62-358)||(23774155-23774449)
chr3 (107-358)||(31887320-31887573)
chr3 (55-358)||(33852497-33852791)
chr3 (47-363)||(23888585-23888898)
chr3 (107-358)||(2977198-2977450)
chr3 (112-358)||(33113055-33113301)
chr3 (68-358)||(41020835-41021124)
chr3 (144-305)||(1845840-1846001)
chr3 (131-358)||(51454140-51454371)
chr3 (180-358)||(40508854-40509032)
chr3 (143-305)||(53190686-53190847)
chr3 (168-358)||(39641770-39641960)
chr3 (24-183)||(45898163-45898323)
chr3 (143-351)||(27899007-27899215)
chr3 (143-351)||(54898447-54898654)
chr3 (143-305)||(2226079-2226240)
chr3 (143-305)||(35905639-35905800)
chr3 (224-358)||(45898335-45898469)
chr3 (143-351)||(51684620-51684828)
chr3 (143-305)||(30599844-30600006)
chr3 (143-299)||(41977812-41977967)
chr3 (143-305)||(23293096-23293258)
chr3 (143-305)||(42279563-42279725)
chr3 (143-283)||(7884800-7884939)
chr3 (143-318)||(21348766-21348941)
chr3 (143-318)||(17515353-17515528)
chr3 (143-298)||(48830732-48830887)
chr3 (143-305)||(43765193-43765355)
chr3 (143-288)||(2377102-2377247)
chr3 (55-166)||(40508748-40508859)
chr3 (270-350)||(2975471-2975551)
chr3 (271-348)||(31885531-31885608)
chr3 (47-95)||(51454069-51454117)
chr3 (149-264)||(600806-600921)
chr3 (256-358)||(1847631-1847733)
chr3 (256-358)||(33111844-33111946)
chr3 (143-305)||(44794263-44794425)
chr3 (256-358)||(45897053-45897155)
chr3 (143-305)||(46112543-46112705)
chr3 (143-264)||(5125898-5126019)
chr3 (270-358)||(23887201-23887289)
chr3 (270-358)||(48635373-48635461)
chr3 (256-363)||(40508491-40508598)
chr3 (143-305)||(3152144-3152306)
chr3 (256-305)||(37865440-37865489)
chr3 (143-202)||(41944712-41944771)
chr3 (143-197)||(41623816-41623870)
chr3 (256-361)||(45255483-45255588)
[»] chr7 (54 HSPs)
chr7 (16-358)||(47341462-47341807)
chr7 (47-358)||(46812394-46812703)
chr7 (47-358)||(40784349-40784659)
chr7 (56-358)||(46996523-46996823)
chr7 (114-358)||(33038673-33038918)
chr7 (112-358)||(23953808-23954056)
chr7 (143-358)||(2167482-2167697)
chr7 (25-358)||(8423062-8423402)
chr7 (47-358)||(35344101-35344411)
chr7 (143-358)||(27955373-27955588)
chr7 (143-356)||(2492332-2492544)
chr7 (143-305)||(6602391-6602553)
chr7 (143-305)||(39859135-39859297)
chr7 (221-358)||(38614896-38615032)
chr7 (143-318)||(13168163-13168341)
chr7 (143-305)||(34776821-34776983)
chr7 (143-305)||(45359392-45359554)
chr7 (221-358)||(38613465-38613602)
chr7 (114-214)||(38613610-38613712)
chr7 (160-305)||(37796104-37796249)
chr7 (143-318)||(30940331-30940506)
chr7 (143-305)||(1546343-1546505)
chr7 (151-305)||(38474057-38474211)
chr7 (143-351)||(47386115-47386323)
chr7 (143-286)||(35693276-35693419)
chr7 (143-305)||(24228315-24228477)
chr7 (256-358)||(45465170-45465272)
chr7 (139-264)||(31913566-31913691)
chr7 (256-358)||(2168820-2168922)
chr7 (256-358)||(40785534-40785636)
chr7 (143-264)||(6056863-6056984)
chr7 (139-288)||(23962377-23962526)
chr7 (256-307)||(4321092-4321143)
chr7 (256-363)||(30108563-30108670)
chr7 (272-351)||(33775418-33775497)
chr7 (112-204)||(48704337-48704431)
chr7 (256-358)||(46994663-46994765)
chr7 (114-305)||(48852222-48852415)
chr7 (47-96)||(33038617-33038666)
chr7 (256-305)||(46810761-46810810)
chr7 (143-199)||(34691136-34691192)
chr7 (270-305)||(8421472-8421507)
chr7 (270-305)||(35342481-35342516)
chr7 (226-305)||(37115515-37115594)
chr7 (143-206)||(46439436-46439499)
chr7 (143-246)||(46867841-46867943)
chr7 (143-202)||(48303576-48303635)
chr7 (256-358)||(3690153-3690255)
chr7 (256-358)||(38614778-38614880)
chr7 (256-305)||(56386-56435)
chr7 (146-214)||(13034820-13034888)
chr7 (238-306)||(19712264-19712332)
chr7 (238-298)||(20478105-20478165)
chr7 (143-199)||(45463811-45463867)
[»] chr2 (44 HSPs)
chr2 (47-358)||(15432331-15432638)
chr2 (47-358)||(25619663-25619976)
chr2 (57-358)||(37417276-37417581)
chr2 (47-305)||(39210-39465)
chr2 (24-305)||(29909448-29909728)
chr2 (47-305)||(92160-92415)
chr2 (157-357)||(42879360-42879559)
chr2 (131-358)||(42001613-42001839)
chr2 (25-358)||(41706542-41706873)
chr2 (47-305)||(15372555-15372812)
chr2 (197-357)||(39560-39720)
chr2 (143-305)||(19908172-19908334)
chr2 (143-351)||(16763086-16763293)
chr2 (143-298)||(39664674-39664829)
chr2 (143-305)||(14389010-14389172)
chr2 (143-305)||(44709671-44709833)
chr2 (143-296)||(42519131-42519284)
chr2 (143-305)||(40560279-40560441)
chr2 (143-305)||(17946150-17946312)
chr2 (113-206)||(10716777-10716872)
chr2 (143-305)||(6797563-6797725)
chr2 (143-305)||(7744099-7744261)
chr2 (143-296)||(17696271-17696424)
chr2 (143-351)||(2766944-2767152)
chr2 (47-96)||(42001873-42001922)
chr2 (139-260)||(862214-862335)
chr2 (143-204)||(11315263-11315324)
chr2 (238-298)||(11315336-11315396)
chr2 (270-358)||(42880811-42880899)
chr2 (256-358)||(28248161-28248263)
chr2 (25-95)||(39788-39866)
chr2 (256-305)||(11021589-11021638)
chr2 (55-96)||(42879579-42879620)
chr2 (143-202)||(11022940-11022999)
chr2 (226-305)||(16377206-16377285)
chr2 (238-305)||(24208063-24208130)
chr2 (143-202)||(28246801-28246860)
chr2 (143-198)||(40097711-40097766)
chr2 (270-305)||(41708430-41708465)
chr2 (256-358)||(33196-33298)
chr2 (272-358)||(41144-41230)
chr2 (256-358)||(37418755-37418857)
chr2 (238-307)||(6786002-6786071)
chr2 (256-305)||(42003476-42003525)
[»] chr8 (47 HSPs)
chr8 (55-358)||(42897592-42897895)
chr8 (55-358)||(1320620-1320909)
chr8 (55-358)||(38882614-38882918)
chr8 (53-358)||(462187-462491)
chr8 (47-358)||(32822364-32822674)
chr8 (47-356)||(33159962-33160267)
chr8 (24-305)||(33750170-33750452)
chr8 (113-358)||(37525898-37526144)
chr8 (107-305)||(8654556-8654754)
chr8 (20-358)||(31200928-31201264)
chr8 (47-358)||(31821421-31821720)
chr8 (143-305)||(8609714-8609875)
chr8 (143-305)||(13108263-13108424)
chr8 (143-305)||(38547284-38547445)
chr8 (143-351)||(41825570-41825778)
chr8 (143-299)||(9184445-9184601)
chr8 (143-297)||(9673091-9673245)
chr8 (178-305)||(13282534-13282660)
chr8 (143-305)||(26242240-26242402)
chr8 (143-297)||(41042510-41042664)
chr8 (143-300)||(13486025-13486182)
chr8 (143-351)||(7745038-7745246)
chr8 (143-297)||(5036509-5036667)
chr8 (149-305)||(40339612-40339768)
chr8 (143-351)||(42941784-42941992)
chr8 (270-358)||(33158659-33158747)
chr8 (256-358)||(33368762-33368864)
chr8 (256-346)||(37524873-37524963)
chr8 (256-353)||(42894784-42894881)
chr8 (139-197)||(15145664-15145722)
chr8 (143-305)||(27691210-27691372)
chr8 (256-358)||(40019159-40019261)
chr8 (256-353)||(461184-461281)
chr8 (143-199)||(28433643-28433699)
chr8 (55-91)||(37525843-37525879)
chr8 (160-215)||(11722732-11722787)
chr8 (256-363)||(33748330-33748437)
chr8 (256-318)||(25707287-25707349)
chr8 (256-305)||(9186631-9186680)
chr8 (272-349)||(9671989-9672066)
chr8 (256-305)||(11031485-11031534)
chr8 (256-305)||(24526952-24527001)
chr8 (256-305)||(25373608-25373657)
chr8 (270-307)||(31199539-31199576)
chr8 (256-305)||(31823462-31823511)
chr8 (256-305)||(32824257-32824306)
chr8 (256-320)||(9876548-9876612)
[»] chr5 (33 HSPs)
chr5 (47-358)||(18728414-18728723)
chr5 (24-358)||(32087517-32087852)
chr5 (55-358)||(38177911-38178214)
chr5 (55-358)||(38205135-38205438)
chr5 (112-358)||(43317934-43318181)
chr5 (47-358)||(33256403-33256711)
chr5 (47-358)||(35395336-35395642)
chr5 (112-358)||(35292256-35292502)
chr5 (149-294)||(38597012-38597157)
chr5 (143-305)||(17574374-17574535)
chr5 (55-301)||(32838327-32838567)
chr5 (143-318)||(30468186-30468361)
chr5 (143-305)||(7267899-7268060)
chr5 (224-358)||(38596871-38597005)
chr5 (143-351)||(18624914-18625122)
chr5 (143-297)||(2179851-2180005)
chr5 (143-351)||(8539685-8539893)
chr5 (146-305)||(24496799-24496958)
chr5 (143-305)||(34327691-34327853)
chr5 (150-305)||(36057526-36057681)
chr5 (272-358)||(32835879-32835965)
chr5 (256-353)||(33257746-33257843)
chr5 (256-358)||(32089911-32090013)
chr5 (256-318)||(43316823-43316885)
chr5 (15-85)||(43317844-43317913)
chr5 (256-305)||(18726621-18726670)
chr5 (270-307)||(38176686-38176723)
chr5 (270-307)||(38203910-38203947)
chr5 (270-305)||(40330515-40330550)
chr5 (255-305)||(24541230-24541280)
chr5 (256-358)||(42619292-42619394)
chr5 (256-305)||(24498053-24498102)
chr5 (238-298)||(29621782-29621842)
[»] chr4 (49 HSPs)
chr4 (47-358)||(44558303-44558614)
chr4 (61-358)||(51041758-51042051)
chr4 (47-305)||(35996119-35996376)
chr4 (137-351)||(27624816-27625030)
chr4 (25-305)||(2350292-2350575)
chr4 (54-305)||(2827460-2827709)
chr4 (68-358)||(47941814-47942103)
chr4 (47-358)||(44794571-44794881)
chr4 (362-498)||(27296518-27296654)
chr4 (143-358)||(4519379-4519594)
chr4 (25-358)||(10762584-10762924)
chr4 (142-358)||(10372611-10372827)
chr4 (143-351)||(51011936-51012143)
chr4 (143-305)||(2693159-2693320)
chr4 (149-305)||(41761658-41761814)
chr4 (143-342)||(48646653-48646852)
chr4 (143-319)||(35404351-35404527)
chr4 (256-358)||(39922993-39923095)
chr4 (143-204)||(11255846-11255907)
chr4 (112-204)||(25993653-25993747)
chr4 (143-298)||(42980698-42980853)
chr4 (53-91)||(27625059-27625097)
chr4 (143-305)||(41781595-41781757)
chr4 (256-358)||(43778392-43778494)
chr4 (143-305)||(49523180-49523342)
chr4 (143-283)||(26296800-26296940)
chr4 (143-194)||(27382284-27382335)
chr4 (256-358)||(39085138-39085240)
chr4 (143-197)||(50131326-50131380)
chr4 (256-318)||(51040778-51040840)
chr4 (180-318)||(52868092-52868230)
chr4 (25-95)||(10372457-10372535)
chr4 (112-286)||(11601745-11601921)
chr4 (256-305)||(27626714-27626763)
chr4 (143-202)||(5484678-5484737)
chr4 (227-298)||(13450970-13451041)
chr4 (143-202)||(32652237-32652296)
chr4 (143-202)||(42880688-42880747)
chr4 (143-202)||(43779794-43779853)
chr4 (270-305)||(44792990-44793025)
chr4 (256-358)||(42879278-42879380)
chr4 (256-358)||(44992811-44992913)
chr4 (256-305)||(230492-230541)
chr4 (256-305)||(2828397-2828446)
chr4 (256-305)||(39190805-39190854)
chr4 (256-305)||(44556676-44556725)
chr4 (270-318)||(34460268-34460316)
chr4 (143-199)||(39083780-39083836)
chr4 (143-199)||(39189523-39189579)
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (68-358)||(29077331-29077620)
chr6 (131-305)||(2968195-2968369)
chr6 (25-305)||(29112356-29112643)
chr6 (47-358)||(4641358-4641668)
chr6 (143-305)||(3018338-3018500)
chr6 (143-318)||(20523409-20523584)
chr6 (143-353)||(10568407-10568617)
chr6 (160-305)||(32439015-32439159)
chr6 (143-351)||(6899495-6899703)
chr6 (143-297)||(11355286-11355440)
chr6 (143-283)||(7049835-7049975)
chr6 (143-305)||(9398716-9398878)
chr6 (143-282)||(14338381-14338520)
chr6 (143-318)||(30891167-30891342)
chr6 (112-204)||(24662615-24662709)
chr6 (256-358)||(17950564-17950666)
chr6 (55-92)||(30641149-30641186)
chr6 (270-358)||(4646216-4646304)
chr6 (131-179)||(30641223-30641271)
chr6 (238-305)||(7372959-7373026)
chr6 (272-351)||(9400035-9400114)
chr6 (238-305)||(13613583-13613650)
chr6 (143-202)||(17951969-17952028)
chr6 (143-282)||(25172015-25172154)
chr6 (143-202)||(35175790-35175849)
chr6 (143-264)||(32516974-32517095)
chr6 (238-298)||(3456811-3456871)
[»] scaffold0477 (1 HSPs)
scaffold0477 (131-358)||(6528-6755)
[»] scaffold1454 (1 HSPs)
scaffold1454 (143-297)||(1327-1480)
[»] scaffold0564 (1 HSPs)
scaffold0564 (143-305)||(8318-8478)
[»] scaffold0129 (1 HSPs)
scaffold0129 (139-264)||(4556-4681)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (238-305)||(3350-3417)
scaffold0058 (238-305)||(4522-4589)
[»] scaffold1041 (2 HSPs)
scaffold1041 (256-318)||(2141-2203)
scaffold1041 (262-311)||(2883-2932)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (143-199)||(37366-37422)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 46)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 42134828 - 42134485
Alignment:
Q  19 tgaaaggtcaaggatgtttttgatgttt--------aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||           |||    
T  42134828 tgaaaggtcaaggatgtttttgatgtttctgactgaaatgtgaagaaagaggtatgggtaatgccggggcaaaatgggaaaagcagaaaaaa-----aaa 42134734  T
Q  111 gtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcaggg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42134733 gtgaaaagtgaaaactggactttttccaattcaatcaaattagtccttgaacatgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcaggg 42134634  T
Q  210 cgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaa 309  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |      
T  42134633 tgacatgtcaacatggctaacggagcacttggacggagggacctttttgatggacgtctgacaaattcagggactaagttgatatttcgcataattgagg 42134534  T
Q  310 gatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 358  Q
    ||||| |||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42134533 gatgattttggccgacccgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 42134485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 318
Target Start/End: Original strand, 45380757 - 45381065
Alignment:
Q  18 gtgaaaggtcaaggatgtttttgatgttt--------aatgtcaagaagg-aggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnnta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||| |||||| ||||||||   |||||||||||||||||||          ||    
T  45380757 gtgaaaggtcaaggatgtttttgatgtttctgactgaaatgtgaagaagggaggtatcggtaatgctatggcaaaatgggaaaagcagaaaaaaaa--ta 45380854  T
Q  109 aagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcag 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45380855 aagtgaaaagtgaaaattggactttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcag 45380954  T
Q  208 ggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaa 307  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |    
T  45380955 ggcgacatgtcaccatggctaacggagcacttggacggaggaacctttttgatggacgtctgacaaattcatgaactaagttgatatttcgcataattga 45381054  T
Q  308 aagatgaattt 318  Q
      |||||||||    
T  45381055 gggatgaattt 45381065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 47 - 358
Target Start/End: Original strand, 36895323 - 36895631
Alignment:
Q  47 aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaactggac-ttttccaattcaatc 145  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  36895323 aatgtgaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagaaaaaa----taaattgaaaagtgaaaactcaacattttccaattcaatc 36895418  T
Q  146 aaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacgg 245  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  36895419 aaattcgtccctgaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaagacaacacaacatgcaagacgacagatcagcatggctaacggagcacttggacga 36895518  T
Q  246 atggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacga 345  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  || ||| || |  |||  || |||||||| |||| |    
T  36895519 agggacctttttgatggacgtctgacaaattcagggactaagttgatatttcgcataattgatggacgaagttgaccgacgcgtgaaaattcagggacaa 36895618  T
Q  346 atttgatggttca 358  Q
    |||||||||||||    
T  36895619 atttgatggttca 36895631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 107 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 44157687 - 44157436
Alignment:
Q  107 taaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 205  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44157687 taaagtgaaaagtgaaaactgaactttttccaattcaatcaaattagtc-ttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacaacatgc 44157589  T
Q  206 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  44157588 agggcgacatgtcactatggctgacggagcacttagacggaaggactttttttatggacgtctaacaaattcagggactaagttgatattttgcataatt 44157489  T
Q  306 aaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 358  Q
     |  |||||||||    |||| || |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  44157488 gagggatgaatttggccgacccgtgaaaatttaaggacgagtttgatggttca 44157436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 131 - 358
Target Start/End: Original strand, 33685143 - 33685369
Alignment:
Q  131 ttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaac 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  33685143 ttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaactcaacatgcagggcgacacatcggcatggctaac 33685242  T
Q  231 ggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgta 330  Q
    |||||||||||| ||| ||| | |||||||||| || |||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |  |||| |||    
T  33685243 ggagcacttggatggagggatc-ttttgatggagatgtgacaaattcaatgattaaattgatatttcgcataattgagggatgaatttgaccgacccgta 33685341  T
Q  331 aaaattcaaggacgaatttgatggttca 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  33685342 aaaattcagggacgaatttgatggttca 33685369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 47 - 358
Target Start/End: Original strand, 46638619 - 46638928
Alignment:
Q  47 aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaactggac-ttttccaattcaatc 145  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||          |||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  46638619 aatgtgaagaaggagttatggataatgcaggggaaaaatgcgaaaagcagaaaaaaa---taaactgaaaagtgaaaactcaacattttccaattcaatc 46638715  T
Q  146 aaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacgg 245  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46638716 aaattcgtccctgaacacgtggcttcctttttgccacgcgtacaagacaacacaacatgcaaggcgacagatcagcatggctaacggagcacttggacgg 46638815  T
Q  246 atggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacga 345  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |  |||||| ||    |||  || |||||||| | ||||    
T  46638816 agggacctttttggtggacgtctgacaaattcaaggactaagttgatatttcgcataattgagggatgaagttggccgacgcgtgaaaattcaggaacga 46638915  T
Q  346 atttgatggttca 358  Q
    |||||||||||||    
T  46638916 atttgatggttca 46638928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 47 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 31801945 - 31801689
Alignment:
Q  47 aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaactggac-ttttccaattcaatc 145  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||          |||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  31801945 aatgtgaagaagtaggtatgggtaatgcagaggcaaaatgagaaaagcagaaaaaaa---taaactgaaaagtgaaaactcaacattttccaattcaatc 31801849  T
Q  146 aaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacgg 245  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31801848 aaattcgtccctgaacacgtgacttccttcttgccacgcgtacaagacaacacaacatgcaagacgacaaatcagcatggctaacggagcacttggacgg 31801749  T
Q  246 atggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    | ||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  31801748 agggacctttttgatggacgtctcacaaatttaaggactaagttgatatttcgcataatt 31801689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 112 - 363
Target Start/End: Original strand, 18183818 - 18184069
Alignment:
Q  112 tgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggc 210  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  18183818 tgaaaagtgaaaactggaatttttccacttccatcaaattagtccttgaacacgtggcttcttttttgccacgtgtacaagacaacacaacatgctggac 18183917  T
Q  211 gacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaag 310  Q
    ||||  ||| ||||||||||||||||||| || | | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |    
T  18183918 gacaaatcagcatggctaacggagcactt-gatgaagggacatttttgatggacgtctgacaaattcagggactaagttgatatttcgcataattgaggg 18184016  T
Q  311 atgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttcaatcgt 363  Q
    |||| |||    || | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18184017 atgattttggccgaaccgtaaaaattcaaagacgaatttgatggttcactcgt 18184069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 112 - 358
Target Start/End: Original strand, 35479850 - 35480096
Alignment:
Q  112 tgaaaagtgaaaactggacttttccaa-ttcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggc 210  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||    
T  35479850 tgaaaagtgaaaattgaactttttcaaattcaatcaaattagtccctgaacacgtggcttctttcttgccacgcgtacaagacaacaaagcatgcatggc 35479949  T
Q  211 gacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaag 310  Q
    ||||  ||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||| |  |    
T  35479950 gacagatcagcat-gctaacagagcacttggacggaaggacctttttgatggacgtctgacaaattcatagattaagttgatatttcgcataattgaggg 35480048  T
Q  311 atgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 358  Q
    ||||||||   ||| | || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  35480049 atgaatttggctgatccgtgaaaattcaaggacgaagttgatggttca 35480096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 47 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 27940921 - 27940606
Alignment:
Q  47 aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatc 145  Q
    ||||| |||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||           |||| |||||| |||||| || |||||| |||| ||||||    
T  27940921 aatgtgaagaaggaggaatatgtaatgcaggggtaaaatgggaaaagca--cgaaaaaattaaattgaaaaatgaaaagtgaactttttccaaatcaatc 27940824  T
Q  146 aaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacgg 245  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| | |  ||||    
T  27940823 aaattcgtccctgaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaagacagcacatcatgcaaggttacatgtcagcatggctaacggagcccgttaacgg 27940724  T
Q  246 atggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacga 345  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |  || |||||| |   |||||| |||||||| |||| |    
T  27940723 agggacctttttgatggacgtctgataaattcaaggattaaattgatatttcgcataattgagggacgaatttgaccaacctgtgaaaattcagggacta 27940624  T
Q  346 atttgatggttcaatcgt 363  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  27940623 aattgatggttcactcgt 27940606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 137 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 6575414 - 6575261
Alignment:
Q  137 aattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagca 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| ||||||  || |||||    
T  6575414 aattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaagacaacaaagcatgcatgacgacatatcagcatggc--acagagca 6575317  T
Q  237 cttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgat 292  Q
    ||| |||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  6575316 ctttgacggaaggacctttttgatagatgtctgacaaattcagggactaagttgat 6575261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 47 - 358
Target Start/End: Original strand, 47269267 - 47269577
Alignment:
Q  47 aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatc 145  Q
    ||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||           |||| |||||| |||||| || |||||| |||| ||||||    
T  47269267 aatgtgaagaagaaggaatatgtaatgcaggggcaaaatgggaaaagca--cgaaaaaattaaattgaaaaatgaaaagtgaactttttccaaatcaatc 47269364  T
Q  146 aaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacgg 245  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||  | |||||||||| ||||||||||||||| | |  ||||    
T  47269365 aaattcgtccctgaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaggacagcacaccatgccagacgacatgtcagcatggctaacggagcccgttaacgg 47269464  T
Q  246 atggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacga 345  Q
    | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||| |  ||  |||||    |||  || |||||||| ||||||    
T  47269465 agggacctttttgatggacgtttgacaaattcagggatgaaattgaaatttcgtataattgagggactaatttggccgacgcgtgaaaattcagggacga 47269564  T
Q  346 atttgatggttca 358  Q
    |||||||||||||    
T  47269565 atttgatggttca 47269577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15104659 - 15104497
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||  ||||||   |||| |||||  |||||    
T  15104659 atcaaattagtccttgtacacgtggctgccttattgacacgtgtacaagacaacacagcatgcaagaagacacatcatcaccactaatggagcttttgga 15104560  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15104559 cggaaggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 15104497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Original strand, 31238401 - 31238563
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||| | |  |||| |||||||   ||||||||||  |||||    
T  31238401 atcaaattagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacatgacaacacagcatggaagaggacacgtcatcaccactaacggagcttttgga 31238500  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  31238501 cagatggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 31238563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Original strand, 34778045 - 34778206
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||| || |||| |||||||   ||||||||||  |||||    
T  34778045 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacaagacaacacaatatgcaagg-gacacgtcatcaccactaacggagcttttgga 34778143  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  34778144 cggagggaccattttgatggacatctgtaaaattcagggactaatttgatatttcgcaaaatt 34778206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 143 - 296
Target Start/End: Original strand, 6818584 - 6818737
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||||||||||   ||||||||||  |||||    
T  6818584 atcaaattagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacatgacaacacaacatgcaagaggacatgtcatcaccactaacggagcttttgga 6818683  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatattt 296  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  6818684 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatattt 6818737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 143 - 351
Target Start/End: Original strand, 50556003 - 50556211
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |  |||| | |||||   ||||||||||  |||||    
T  50556003 atcaaattagtccttgtacacgtgactcccttgttgacacgtgtacatgacaacacagcatgcaagatgacacgccatcaccactaacggagcttttgga 50556102  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 342  Q
    |||| ||||| ||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| | ||| |||||| | |||  | | ||||||||| ||    
T  50556103 cggagggaccattttgatagacgtctgtaaaatttagggactaaatagatatttcgcaaaattcagagacgaatttgactgattttttaaaattcaaaga 50556202  T
Q  343 cgaatttga 351  Q
    |||||||||    
T  50556203 cgaatttga 50556211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Original strand, 4855873 - 4856034
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||    |||||||||  |||||    
T  4855873 atcaatttagtccttgtacacgtgactgccttgttgacacgtgtacaagacaacacaacatgcaagg-gacacgtcatcaccattaacggagcttttgga 4855971  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  4855972 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaatttgatatttcgcaaaatt 4856034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 151 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 27087492 - 27087339
Alignment:
Q  151 agtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatgga 250  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||   ||||||||||  ||||||||||||     
T  27087492 agtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacaagacaacacagcatgcaagg-gacacatcatcaccactaacggagcttttggacggatggg 27087394  T
Q  251 cctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    || ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27087393 ccattttgatggacgtttgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 27087339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 2869797 - 2869589
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||  ||||||   ||||| ||||  |||||    
T  2869797 atcaatttagtccttgtacatgtggctgccttgttgacacgtgtacaggacaacacatcatgcaagatgacacatcatcaccactaacagagcttttgga 2869698  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 342  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||| |  || |||||| |  ||  | | ||||||||||||    
T  2869697 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaatttagagactaaatagatatttcgcaaaattcagggacgaatttgaccgatttttgaaaattcaagga 2869598  T
Q  343 cgaatttga 351  Q
    |||||||||    
T  2869597 cgaatttga 2869589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 351
Target Start/End: Original strand, 25278274 - 25278482
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||| |||| ||| |||||||||| |||| |||| |||||| |  |||| |||||||   ||||||||||  |||||    
T  25278274 atcaatttagtccttatacacgtggctgccttgttgacacgtgtacatgacagcacatcatgcaagaggacacgtcatcaccactaacggagcttttgga 25278373  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 342  Q
    |||| ||||| ||||||||||| | ||  ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| |  || |||||| |  ||  | | ||||||||||||    
T  25278374 cggagggaccattttgatggacgtatgtaaaattcaaggactaaataggtatttcgcaaaattcagggacgaatttgaccgattttttaaaattcaagga 25278473  T
Q  343 cgaatttga 351  Q
    |||||||||    
T  25278474 cgaatttga 25278482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 37344560 - 37344352
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |  |||| |||||||   ||||||||||  |||||    
T  37344560 atcaatttagtccttatacacgtggctgccttgttgacacgtgtacatgacaacacatcatgcaagaggacacgtcatcaccactaacggagcttttgga 37344461  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 342  Q
    |||| ||||| ||||||||||| | ||  |||||||  |||||||| | ||||||||| |||| |  || |||||| |  ||  | | ||||||||||||    
T  37344460 cggagggaccattttgatggacgtatgtaaaattcaaagactaaataggtatttcgcaaaattcagggacgaatttgaccgattttttaaaattcaagga 37344361  T
Q  343 cgaatttga 351  Q
    |||||||||    
T  37344360 cgaatttga 37344352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 51122117 - 51121961
Alignment:
Q  149 ttagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatg 248  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||  ||| |||  ||||| || |  ||||||||| |    
T  51122117 ttagtccttgtacacgtgacttcctttttgacacgtgtacatgacaacacaacatgcagggagccagctcaacatcactaacagaccttttggacggagg 51122018  T
Q  249 gacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||| ||||||||||| |  || |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  51122017 gaccattttgatggacgtgagagaaattcagggacgaaattgatattttgcaaaatt 51121961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 351
Target Start/End: Original strand, 3013376 - 3013590
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||| |  || |  ||||||   ||||||||||  |||||    
T  3013376 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacatgacaacacggcatgcaagaggatacatcatcaccactaacggagcttttgga 3013475  T
Q  243 cggatggacctttttgatg------gacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaatt 336  Q
    |||| ||||  ||||||||      ||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |  || |||||| | |||  | | ||||||    
T  3013476 cggagggactattttgatgtccatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaattcatggacgaatttgactgatgttttaaaatt 3013575  T
Q  337 caaggacgaatttga 351  Q
    |||||||||||||||    
T  3013576 caaggacgaatttga 3013590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 44158135 - 44158050
Alignment:
Q  16 aggtgaaaggtcaaggatgtttttgatgttt--------aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcag 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||        |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44158135 aggtgaaaggtcaaggatgtttttgatgtttctgactgaaatgt---gaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcag 44158050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 305
Target Start/End: Original strand, 51896153 - 51896220
Alignment:
Q  238 ttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  51896153 ttggacggagggactattttgatggacatctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 51896220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 143 - 297
Target Start/End: Original strand, 33602550 - 33602704
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||  |||  || |||||||||||||||||||| |||||| |  | ||  |||||||  |||||||| |  |||||    
T  33602550 atcaatttagtccttgtacacatggctgacttgctgacacgtgtacaagacaacacaacatgcaagaagccacatcatcattactaacggaccttttgga 33602649  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttc 297  Q
    |||| ||||   ||||| |||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  33602650 cggagggactaatttgacggacgtctgtaaaattcagggactaatttgatatttc 33602704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 308
Target Start/End: Original strand, 42136230 - 42136282
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaa 308  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42136230 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcataattaaa 42136282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 43868832 - 43868712
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||   |||||| | |||||  ||| ||   ||||||||||| |||||    
T  43868832 atcaaattggtccttgtacacgtgacttccttgtagacacgtgtacaagacaacatgacatgcatgacgacaactcagcagcactaacggagcatttgga 43868733  T
Q  243 cggatggacctttttgatgga 263  Q
    |||| ||||  ||||||||||    
T  43868732 cggaaggactattttgatgga 43868712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 363
Target Start/End: Original strand, 5784853 - 5784960
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 355  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  || ||| || |  |||| || |||||||| ||||||| |||||| |    
T  5784853 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcataattgagggacgaagttgaccgacccgtgaaaattcagggacgaagttgatgat 5784952  T
Q  356 tcaatcgt 363  Q
    ||| ||||    
T  5784953 tcactcgt 5784960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 358
Target Start/End: Original strand, 31803686 - 31803788
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 355  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||| ||    |||| || |||||||| ||||||| |||||| |    
T  31803686 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcataattgaaggacgaagttggccgacccgtgaaaattcagggacgaagttgatgat 31803785  T
Q  356 tca 358  Q
    |||    
T  31803786 tca 31803788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 33679364 - 33679262
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 355  Q
    ||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |  || ||||||   ||||| ||||||||||| |||| || |||||| |    
T  33679364 ttgattgacatttaacaaattcaaggattaaattgatatttcgcataattgagggacgaatttggctgacccgtaaaaattcatggacaaaattgatgat 33679265  T
Q  356 tca 358  Q
    |||    
T  33679264 tca 33679262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Original strand, 46583462 - 46583624
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||  |||  || |||||||||| ||||| | |||||||| |  | ||  ||||||    ||||||| |  |||||    
T  46583462 atcaatttagtccttgtacacgtggctgacttgctgacacgtgtacatgacaagaaagcatgcaagaagccacatcatcaccattaacggaccttttgga 46583561  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||| ||||   |||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  46583562 cggagggacaaatttgatggacgtctgtaaaattcagggactaatttgatatttcgcaaaatt 46583624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 96
Target Start/End: Original strand, 33685061 - 33685110
Alignment:
Q  47 aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcag 96  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  33685061 aatgtgaagaaggagatatgggtaatgtagaggcaaaatgggaaaagcag 33685110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 6575479 - 6575431
Alignment:
Q  47 aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagca 95  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  6575479 aatgtgaagaaggaggtatgggtaatgcagggttaaaatgagaaaagca 6575431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 206
Target Start/End: Original strand, 26225460 - 26225523
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgca 206  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||| | || ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  26225460 atcaatttagtccttgtacatgtggctgctttgttgacacgtgtacaagacaacacatcatgca 26225523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 305
Target Start/End: Original strand, 27952500 - 27952535
Alignment:
Q  270 acaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27952500 acaaattcagggattaaattgatatttcgcataatt 27952535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 96
Target Start/End: Original strand, 35479789 - 35479832
Alignment:
Q  53 aagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcag 96  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  35479789 aagaaggatgtatgggtaatgtaggggcaaaatggaaaaagcag 35479832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 45379190 - 45379139
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaa 307  Q
    ||||| ||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45379190 ttgattgacatttaacaaatttagggattaaattgatatttcgcataattaa 45379139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 351
Target Start/End: Original strand, 52643650 - 52643729
Alignment:
Q  272 aaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttga 351  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||| |  || |||||||| |||  | |||||||| ||||||||||||||    
T  52643650 aaattcagggactaaataaatatttcgcaaaattcagggacgaatttaactgatttttaaaaatttaaggacgaatttga 52643729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 18180605 - 18180543
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaattt 318  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  18180605 ttgattgacatttaacaaattcaggaattaaattgatatttcgcataattgagggatgaattt 18180543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 358
Target Start/End: Original strand, 44159280 - 44159382
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 355  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||  || ||| || |  || |||| |||||||| ||||||| |||||| |    
T  44159280 ttgattgacatttaacaaattcaggaattaaattgatattttgcataattaagggacgaaattgaccgatctgtgaaaattcagggacgaagttgatgat 44159379  T
Q  356 tca 358  Q
    |||    
T  44159380 tca 44159382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 305
Target Start/End: Original strand, 6577107 - 6577140
Alignment:
Q  272 aaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6577107 aaattcagggattaaattgatatttcgcataatt 6577140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 11152650 - 11152601
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  11152650 ttgattgacatttaacaaattctgggattaaattgatatttcgcataatt 11152601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 5783561 - 5783505
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacaca 199  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||    
T  5783561 atcaatttagtccctgtacacgtggctttctttttcccacgtgtacaagccaacaca 5783505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 298
Target Start/End: Original strand, 9121669 - 9121729
Alignment:
Q  238 ttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcg 298  Q
    ||||||||| ||||   |||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  9121669 ttggacggagggactgatttgatggacgtctgcaaaattcagggactaatttgatatttcg 9121729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 52)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 358
Target Start/End: Original strand, 18430051 - 18430392
Alignment:
Q  18 gtgaaaggtcaaggatgtttttgatgttt--------aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||        ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||    
T  18430051 gtgaaaggtcaaggatgtttttgatgcttctgactgaaatgtgaagaatgaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcaggaaaa------aa 18430144  T
Q  110 agtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagg 208  Q
    | |  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18430145 aat--aaagtgaaaattggactttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggtttccttcttgccacgtgtacaagacaacacggcatgcagg 18430242  T
Q  209 gcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaa 308  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |     
T  18430243 gcgacatgtcaccatggctaacggagcacttggacggagggacctttttattggacgtctgacatattcagggactaagttgatatttcgcataattgag 18430342  T
Q  309 agatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 358  Q
     |||||||||   ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18430343 ggatgaatttggctgacccgttaaaattcaaggacgaatttgatggttca 18430392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 47 - 358
Target Start/End: Original strand, 24382702 - 24383014
Alignment:
Q  47 aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatc 145  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||          |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  24382702 aatgtgaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatggaaaaagcagaaagaaaaaataaactgaaaagtgaaaactgaactttttccaattcaatc 24382801  T
Q  146 aaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacgg 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  24382802 aaattagtccttgaacacgtggcttcctttttgccccgtatataagacaacacaacatgcagggcgacatatcagcatggctaacggatgacttggacgg 24382901  T
Q  246 atggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacga 345  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||    |||| |||||||||||||||| |    
T  24382902 agggacctttttgatggacgtctgacaaatccatggactaagttgatatttctcataattgaaggatgaatttggccgacccgtaaaaattcaaggacca 24383001  T
Q  346 atttgatggttca 358  Q
    |||||||||||||    
T  24383002 atttgatggttca 24383014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 358
Target Start/End: Original strand, 45256997 - 45257341
Alignment:
Q  16 aggtgaaaggtcaaggatgtttttgatgtttaatgtcaa----gaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaag 111  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    | ||    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||          |||||    
T  45256997 aggtaaaaggtcaaggatgtttttgatgttttgactaaaatgtgaaggatgtatgggtaatgcaggggcaaaatggggaaagcagaaaaaaa---taaag 45257093  T
Q  112 tgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45257094 tgaaaagtgaaaactggactttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttcattcttgccacgtgtacaagacaacacaacatgcagggc 45257193  T
Q  211 gacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaag 310  Q
    | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||| |  |    
T  45257194 ggcatgtcagcatgactaacggagcacttggacggagggacattttttatggacgtctgacaaattcaggaactaagttgatattttacataattgaggg 45257293  T
Q  311 atgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 358  Q
    ||||||||    |||| || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  45257294 atgaatttggccgacccgtgaaaattcaagaacgaatttgatggttca 45257341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 55 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 48634186 - 48633880
Alignment:
Q  55 gaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaactggacttttc---caattcaatcaaatta 151  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||          |||| ||||||||||||| | |||||||    ||||||||||||||||    
T  48634186 gaaggaagtaaggataatgcaggggcaaaatgggaaaagcagaaaaat----taaactgaaaagtgaaaattagacttttttttcaattcaatcaaatta 48634091  T
Q  152 gtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaa----cacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  48634090 gtccttgaacacgtggcttcctttttgccacgtgtacaagacaaacaacacatcatgcagggcgacagatcaacatggctaacggagcacttggacggag 48633991  T
Q  248 ggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaat 347  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  || |||||| |  |||| || |||||||||||||||||    
T  48633990 ggacctttttgatggacgtctgacaaattcagggactaagttgatatttcgcataattgatggacgaatttgaccgacccgtgaaaattcaaggacgaat 48633891  T
Q  348 ttgatggttca 358  Q
    |||||||||||    
T  48633890 ttgatggttca 48633880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 62 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 23774449 - 23774155
Alignment:
Q  62 gtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaa 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||          |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  23774449 gtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagtagaaaaaaat--taaactgaaaagtgaaaattggactttttccaaatcaatcgaattagtccttgaa 23774352  T
Q  161 cacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgat 260  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||| ||| || |||| ||||||||    
T  23774351 cacgtggcttccttattgccacgtgtacaagacaacacatcatgcagggcgacagatcaacatggctaacagagcacttagac-gagggacttttttgat 23774253  T
Q  261 ggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 358  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||    |||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23774252 ggacgtctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattgagggacgaatttggccgactcgtgaaaattcaaggacgaatttgatggttca 23774155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 107 - 358
Target Start/End: Original strand, 31887320 - 31887573
Alignment:
Q  107 taaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaat-tcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatg 204  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||| | || ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31887320 taaactgaaaagtgaaaactggaatttttccactatccatcaaattagtccttgaacatatggcttcctttttgccacgtgtacaagacaacacagcatg 31887419  T
Q  205 cagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataat 304  Q
    || |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31887420 caaggcgacaaatcagcatggctaacggagcacttggacggagggacctttttgatagacatctgacaaattcagggactaagttgatatttcgcataat 31887519  T
Q  305 taaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 358  Q
    | |  | ||||||| |  || | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31887520 tgatggttgaatttgaccgatccgtgaaaattcaaggacgaatttgatggttca 31887573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 55 - 358
Target Start/End: Original strand, 33852497 - 33852791
Alignment:
Q  55 gaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagt 153  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||           ||| |   ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  33852497 gaaggaggtatgggtaatgcagtggcaaaatgggaaaagcagaaaa-------aaatt---aagtgaaaattggattttttccaattcaatcaaattagt 33852586  T
Q  154 ccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacct 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  33852587 ccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtctacaagacaacacaacatgcagggcgacatgtcaccatggctaacggagcacttggacagagggacct 33852686  T
Q  254 ttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatg 353  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||| |   ||| |||||||||||||||| ||||| |||    
T  33852687 ttttgatggacgtctgataaattcagaaattaaattgatatttcgcataattgagggataaatttgaccaacccgtaaaaattcaaggacaaatttaatg 33852786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 47 - 363
Target Start/End: Original strand, 23888585 - 23888898
Alignment:
Q  47 aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaactggac-ttttccaattcaatc 145  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||          |||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  23888585 aatgtgaagaaagagatatgggtaatgcaggggtaaaatgggaaaaggagaaaaaa----taaactgaaaagtgaaaactcaacattttccaattcaatc 23888680  T
Q  146 aaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacgg 245  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||  ||| || ||||||||||| | ||||||||    
T  23888681 aaattagtccctgaacatgtggcttccttcttgccacgcgtacaagacaacacagtatgcaaggcgacagatcagcaaggctaacggaggatttggacgg 23888780  T
Q  246 atggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacga 345  Q
    | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  || ||| ||    ||| ||| |||||||| ||||||    
T  23888781 agggacctttttgatggacgtttgacaaattcagggactaagctgatatttcgcataattgagggacgaagttggccgacgtgtgaaaattcagggacga 23888880  T
Q  346 atttgatggttcaatcgt 363  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  23888881 atttgatggttcactcgt 23888898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 107 - 358
Target Start/End: Original strand, 2977198 - 2977450
Alignment:
Q  107 taaagtgaaaagtgaaaactggacttttc-caattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 205  Q
    |||| |||||||| |||| |||| ||||  || ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  2977198 taaactgaaaagtcaaaattggaattttttcacttccatcaaattagtccttgaacatgtggtttccttcttgccacgtgtattagacaacatagcatgc 2977297  T
Q  206 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2977298 agggcgacaaatcagcatcgctaacggagcacttgggcggatggacctttttgatggacgtatgacaaatttagggactgaattgatatttcgcataatt 2977397  T
Q  306 aaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 358  Q
    ||  |||||||||    ||   |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2977398 aagggatgaatttggccgattcgtaaaaattcaaggacgaatttgatgattca 2977450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 112 - 358
Target Start/End: Original strand, 33113055 - 33113301
Alignment:
Q  112 tgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggc 210  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||| ||||    
T  33113055 tgaaaagtgaaaagtggaatttttccacttccatcaaattagtccttgaacacgtggcttcctttttgccacgtgtacaagacagcgcaacatgctgggc 33113154  T
Q  211 gacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaag 310  Q
    ||||  ||  ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |  |    
T  33113155 gacagatcggcatggctaacggatcactt-gacggagggacctttttgatggacgtctgacaaatttagggactaagttgatatttcgcataattgaggg 33113253  T
Q  311 atgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 358  Q
    |||| |||    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33113254 atgattttggccgacccgtaaaaattcaaggactaatttgatggttca 33113301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 68 - 358
Target Start/End: Original strand, 41020835 - 41021124
Alignment:
Q  68 gtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtg 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||           |||| |||||| |||||| || |||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  41020835 gtaatgcaggggcaaaatgggaaaagca--cgaaaaaattaaattgaaaaatgaaaagtgaactttttccaaatcaatcaaattcgtccctgaacacgtg 41020932  T
Q  167 gcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacat 266  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||| |    
T  41020933 gcttccttcttgccacgcgtacaggacagcacagcatgccaggcgacatgtcagcatggctaacggagcccgttaacggagggacctttttgatggacgt 41021032  T
Q  267 ctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 358  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |  ||  |||||    |||  || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  41021033 ctgacaaattcagggatgaaattgaaatttcgcataattgagggactaatttggccgacgcgtgaaaattcagggacgaatttgatggttca 41021124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 144 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 1846001 - 1845840
Alignment:
Q  144 tcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggac 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1846001 tcaaattagtccttgaacacgtggcttcctttttgccacgtgtataggacatcacatcatgcagggcgacatatcaacatggttaacggagcacttggac 1845902  T
Q  244 ggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||    
T  1845901 ggagggacgtttttgatggacgtctgtcaaattcaaagactaagttgatattttgcataatt 1845840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 131 - 358
Target Start/End: Original strand, 51454140 - 51454371
Alignment:
Q  131 ttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgac----atgtcatcatggc 226  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||    || | | ||||||    
T  51454140 tttttcaatttaatctaattagtccttgaacacgtggcctccttcttgccacgtgtataagacaacacatcatgcagggggacatatatatgaacatggc 51454239  T
Q  227 taacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacc 326  Q
    ||||||| ||||||||| || |||| ||||| |||||  | |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |   ||||||||    || |    
T  51454240 taacggatcacttggacagagggacattttttatggatgtttgacaaattcaaagactaatttgatatttcgcataattgaggaatgaatttggccgatc 51454339  T
Q  327 tgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 358  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51454340 cgtgaaaattcaaggacgaatttgatggttca 51454371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 180 - 358
Target Start/End: Original strand, 40508854 - 40509032
Alignment:
Q  180 cacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcag 279  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||| || | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||     
T  40508854 cacgtgtacatgacaacacaacatgcagggcgacagatcagcacgactaacggaacacttggacggagggacatttttgatggacgtctgacaaattcaa 40508953  T
Q  280 ggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 358  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||| |  || ||||||    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40508954 ggattaagttgatatttcgcataattgagggacgaatttggccgacccgtgaaaattcaaggacgaatttgatggttca 40509032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Original strand, 53190686 - 53190847
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||   ||||||||||  |||||    
T  53190686 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacaagacaacacaacatgcaagg-gacacgtcatcaccactaacggagcttttgga 53190784  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  53190785 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 53190847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 168 - 358
Target Start/End: Original strand, 39641770 - 39641960
Alignment:
Q  168 cttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatc 267  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||  |  ||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| || ||    
T  39641770 cttccttcttaccacatgtataagacaacacaacatgcaggacggtagatcaacatggctaacggagtacttgaacggagggaccttttttatgaacgtc 39641869  T
Q  268 tgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 358  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| || | |||||| | ||||||||||    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39641870 tgacaaatttaaggactaagttgatactttgaataattgagagatgaatttggccgacccgtaaaaattcaaggacaaatttgatggttca 39641960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 183
Target Start/End: Original strand, 45898163 - 45898323
Alignment:
Q  24 ggtcaaggatgtttttgatgttt---aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtg 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||          |||| |||||||||    
T  45898163 ggtcaaggacgtttttgatgttctgaaatgtgaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaaggagaaaaaaa---taaactgaaaagtg 45898259  T
Q  121 aaaactggac-ttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacg 183  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  45898260 aaaactcaacattttccaattcaatcaaattagtccctaaacacgtggcttccttcttgccacg 45898323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 143 - 351
Target Start/End: Original strand, 27899007 - 27899215
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |  |||| |||||||   ||||||||||  |||||    
T  27899007 atcaaattagtccttgtacacatggctgccttgttgacacgtgtacatgacaacacaacatgcaagaggacacgtcatcaccactaacggagcttttgga 27899106  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 342  Q
    |||| ||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || || ||||||    ||  | | ||||||||||||    
T  27899107 cggagggaccatttttatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaattcaaggacgaatttggccgattttttaaaattcaagga 27899206  T
Q  343 cgaatttga 351  Q
    |||||||||    
T  27899207 cgaatttga 27899215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 143 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 54898654 - 54898447
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||| || |||| |||||| |  ||||||||||  |||||    
T  54898654 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacaagacaacgcaacatgcaagg-gacacgtcatcgtcactaacggagcttttgga 54898556  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 342  Q
    ||||  |||| |||||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |  || |||||| |  ||  | | ||||||||||||    
T  54898555 cggagagaccattttgatgaacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaattcagggacgaatttgaccgattttttaaaattcaagga 54898456  T
Q  343 cgaatttga 351  Q
    |||||||||    
T  54898455 cgaatttga 54898447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Original strand, 2226079 - 2226240
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||   ||||| |||   |||||    
T  2226079 atcaatttagtccttgtacacgtggctaccttgttgacacgtgtacaagacaacacagcatgcaagg-gacacgtcatcaccactaacagagtttttgga 2226177  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||| ||| | |||||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2226178 cggagggaacattttgatgaacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 2226240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Original strand, 35905639 - 35905800
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||| || |||| |||||||   ||| ||||||  |||||    
T  35905639 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacaagacaacccatcatgcaagg-gacacgtcatcaccactaccggagcttttgga 35905737  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  35905738 cggagggaccattttgatgaacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 35905800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 224 - 358
Target Start/End: Original strand, 45898335 - 45898469
Alignment:
Q  224 ggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattg 323  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |  ||  || ||  | |    
T  45898335 ggctaacggaggacttggacggagggacctttttgatagacgtctgacaaattcaaggactaagttgatatttcgcataattcagggacaaagttggtcg 45898434  T
Q  324 acctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 358  Q
    || ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  45898435 acgtgtgaaaattcagggacgaatttgatggttca 45898469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 143 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 51684828 - 51684620
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||| ||| |||||||||| ||||||||| || ||| |  ||||  ||||||   ||||||||||  |||||    
T  51684828 atcaaattagtccttgtacacgtgtctgccttgttgacacgtgtacaggacaacacaacacgcaagaggacacatcatcaccactaacggagcttttgga 51684729  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 342  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||| |  |||||||||   |||  | | ||||||||||||    
T  51684728 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcaaggactaaatagatattttgcaaaattcagggatgaatttggctgatttttgaaaattcaagga 51684629  T
Q  343 cgaatttga 351  Q
    |||||||||    
T  51684628 cgaatttga 51684620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Original strand, 30599844 - 30600006
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |  ||||  ||||||   ||||| ||||  |||||    
T  30599844 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttattgacatgtgtacaagacaacacagcatgcaagaggacacatcatcaccactaacagagcttttgga 30599943  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||| ||||| ||||||| ||| |||   ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  30599944 cggagggaccattttgatcgacgtctctaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 30600006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 143 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 41977967 - 41977812
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||    ||||| |||  |||||    
T  41977967 atcaatttagtccttgtacacgtgactgccttgttgacacgtgtacaagacaacacaacatgcaagg-gacacgtcatcaccattaacgaagcttttgga 41977869  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgc 299  Q
    |||| ||||| |||||| |||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41977868 cggagggaccattttgacggacgtctgtaaaattcagggactaatttgatatttcgc 41977812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Original strand, 23293096 - 23293258
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||  ||||||   ||||||||||  |||||    
T  23293096 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacatgacaacacaacatgcaagaggacacatcatcaccactaacggagcttttgga 23293195  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||| ||||  ||||||||||| | ||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23293196 cggagggactattttgatggacgtttgtaaaattcatggactaaatagatatttcgcaaaatt 23293258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 42279725 - 42279563
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||| |  ||||  ||||||   ||||| ||||  |||||    
T  42279725 atcaaattagtccttgtacacgtgtctgccttgttgacacgtgtataagacaacacaacatgcaagaggacacatcatcaccactaacagagcttttgga 42279626  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||| ||||| ||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  42279625 cggagggaccattttgatagacgtctgtaaaattcagggactaaatagatattttgcaaaatt 42279563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 283
Target Start/End: Original strand, 7884800 - 7884939
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||  ||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||   |||||||| |  |||||    
T  7884800 atcaatttagtccttatacatgtggctgccttgttgacacgtgtacaagacaacacaacatgcaagg-gacatgtcatcaccactaacggaacttttgga 7884898  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggac 283  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  7884899 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggac 7884939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 21348941 - 21348766
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||  |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||  | ||||   ||||| ||||  |||||    
T  21348941 atcaatttagtctttgtacacgtggccgccttattgacacgtgtacatgacaacacaacatgcaagaggacacattatcaccactaacagagcttttgga 21348842  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaattt 318  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || || ||||||    
T  21348841 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaattcaaggacgaattt 21348766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 17515528 - 17515353
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||    ||||  ||||||   ||||||| |   |||||    
T  17515528 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttattgacaagtgtacaagacaacacaacatgcaaaaggacacatcatcaccactaacggtgattttgga 17515429  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaattt 318  Q
    | || ||||| ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |  |||||||||    
T  17515428 cagagggaccattttgatggacgtttgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaattcagcgatgaattt 17515353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 298
Target Start/End: Original strand, 48830732 - 48830887
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||  ||||||   ||||| ||||  |||||    
T  48830732 atcaaattagtccttgtacacgtggttgccttgttgacacgtgtacatgacaacacaacatgcaagaggacacatcatcaccactaacagagcttttgga 48830831  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcg 298  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || |  |||||||  |||||||| |||||||||    
T  48830832 cggagggaccattttgatggacgtccgtaaaattcaaagactaaatagatatttcg 48830887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 43765355 - 43765193
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||| | |  ||||  ||||||   ||||||||||  |||||    
T  43765355 atcaatttagtcattgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacatgacaacacaacatgtaagaggacacatcatcaccactaacggagcttttgga 43765256  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
     ||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  43765255 tggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagaaactaaatagatatttcgcaaaatt 43765193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 2377247 - 2377102
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||||||||||||   |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |  |||| |||||||   ||||||||||  || ||    
T  2377247 atcaaattagtcctattacacgtggctgccttgttgacacgtgtacatgacaacacatcatgcaagaggacacgtcatcaccactaacggagcttttaga 2377148  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaat 288  Q
    |||| | ||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||    
T  2377147 cggaggaaccattttgatggacgtctgtaaaattcagagactaaat 2377102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 55 - 166
Target Start/End: Original strand, 40508748 - 40508859
Alignment:
Q  55 gaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaactggac-ttttccaattcaatcaaattagt 153  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||    
T  40508748 gaaggaagtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcag-aaaaaaaattaaactgaaaagtgaaaattggactttttccaaatcaaaaaaattagt 40508846  T
Q  154 ccttgaacacgtg 166  Q
    |||||||||||||    
T  40508847 ccttgaacacgtg 40508859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 270 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 2975551 - 2975471
Alignment:
Q  270 acaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttg 350  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  2975551 acaaattcagggattaaattgatatttcgcatcattgagggatgaatttagctgatccgtaaaaattcaaggacgaatttg 2975471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 31885608 - 31885531
Alignment:
Q  271 caaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatt 348  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||| |||||||| ||||||||||||    
T  31885608 caaattcaagtactaaattgatatttcgcataattaagggatgaatttgaccgacccgtaaaaatccaaggacgaatt 31885531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 95
Target Start/End: Original strand, 51454069 - 51454117
Alignment:
Q  47 aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagca 95  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51454069 aatgtgaagaaggaggtatgtgtaatgcaggggcaaaatgggaaaagca 51454117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 600921 - 600806
Alignment:
Q  149 ttagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatg 248  Q
    |||||||||| |||||||||| | || ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |  |||| |||||||   ||||||||||  || |||||| |    
T  600921 ttagtccttgtacacgtggctgctttgttgacacgtgtacatgacaacacaacatgcaagaggacacgtcatcaccactaacggagcttttagacggagg 600822  T
Q  249 gacctttttgatggac 264  Q
    |||| |||||||||||    
T  600821 gaccattttgatggac 600806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 358
Target Start/End: Original strand, 1847631 - 1847733
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 355  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  |||||||||    |||| || ||||||||||||| ||||||||| |    
T  1847631 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatattttgcataattgagggatgaatttggccgacccgtgaaaattcaaggacaaatttgatgat 1847730  T
Q  356 tca 358  Q
    |||    
T  1847731 tca 1847733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 33111946 - 33111844
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 355  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |  || | || |||||||| ||||||| |||||| |    
T  33111946 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcataattgagggatgaatttgaccgagccgtgaaaattcagggacgaagttgatgat 33111847  T
Q  356 tca 358  Q
    |||    
T  33111846 tca 33111844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 44794425 - 44794263
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||  |||  || |||||||||| ||||||| |||||||| |  | ||  ||||||    ||||||| |  |||||    
T  44794425 atcaatttagtccttgtacacgtggctgacttgctgacacgtgtacaggacaacaaagcatgcaagaagccacatcatcactattaacggaccttttgga 44794326  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||| ||||   |||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  44794325 cggagggacgaatttgatggacttctgcaaaattcagggactaatttgatatttcgcaaaatt 44794263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 45897155 - 45897053
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 355  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  || ||| ||    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  45897155 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcataattgagggacgaagttggccgacccgtaaaaattcaaggacgaagttgatgat 45897056  T
Q  356 tca 358  Q
    |||    
T  45897055 tca 45897053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 46112705 - 46112543
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||| ||  ||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |  |||| |||||||   |||||  |||  ||| |    
T  46112705 atcaatttagtctttgtacacgtgactgacttgttgacacgtgtacatgacaacacaacatgcaagaggacacgtcatcaccactaacatagcttttgaa 46112606  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  46112605 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcatggactaaatagatattttgcaaaatt 46112543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 5126019 - 5125898
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| || | | ||||||||||||||||||   |||||||| |||||  ||| ||   ||||||||||| |||||    
T  5126019 atcaaattggtccttgtacacgtggcttctttgtagacacgtgtacaagacaacaggacatgcaggacgacaactcagcagcactaacggagcatttgga 5125920  T
Q  243 cggatggacctttttgatggac 264  Q
    | || ||||  |||||||||||    
T  5125919 ccgaaggactattttgatggac 5125898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 23887289 - 23887201
Alignment:
Q  270 acaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 358  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  || ||| |||   ||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  23887289 acaaattcagggattaaattgatatttcgcataattgagggacgaagttagccgacccataaaaattcaaggacgaagttgatgattca 23887201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 358
Target Start/End: Original strand, 48635373 - 48635461
Alignment:
Q  270 acaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 358  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||| |  || | || |||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  48635373 acaaattcagggattaaattgatatttcgcataattaagggacgaatttgaccgatccgtgaaaattcagggacgaaattgatgattca 48635461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 40508598 - 40508491
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 355  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  || ||||||    |||| || |||||||| ||||||| |||||| |    
T  40508598 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgagatttcgcataattaagggacgaatttgtccgacccgtgaaaattcagggacgaagttgatgat 40508499  T
Q  356 tcaatcgt 363  Q
    ||| ||||    
T  40508498 tcactcgt 40508491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Original strand, 3152144 - 3152306
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||  |||  || |||||||||| ||||||| |||||| | |  | ||  ||||||    ||||||| |  |||||    
T  3152144 atcaatttagtccttgtacacgtggctgacttgctgacacgtgtacatgacaacaaagcatgtaagaagccacatcatcactattaacggaccttttgga 3152243  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||| ||||   |||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  3152244 cggagggacggatttgatggacgtctgtaaaattcagggactaatttgatatttcgcaaaatt 3152306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 256 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 37865489 - 37865440
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37865489 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcataatt 37865440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 41944771 - 41944712
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagca 202  Q
    ||||| ||||||| || ||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  41944771 atcaatttagtccctgtacacgcggcttcctttttcccacgtgtacaagccaacacagca 41944712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 41623870 - 41623816
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaaca 197  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||    
T  41623870 atcaaattggtccttgtacacgtggcttccttgtagacacgtatacaagacaaca 41623816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 45255588 - 45255483
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 355  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| |||| | |||||| |||||||| |  |||||| || |  || | ||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  45255588 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaagtaatattttgcataattgagtgatgaagttgaccgatccgtaaaaattcagggacgaagttgatgat 45255489  T
Q  356 tcaatc 361  Q
    ||||||    
T  45255488 tcaatc 45255483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 54)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 358
Target Start/End: Original strand, 47341462 - 47341807
Alignment:
Q  16 aggtgaaaggtcaaggatgtttttgatgttt--------aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnnt 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  47341462 aggtgaaatgtcaaggatgtttttgatgtttctcactgaaatgtgaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagaaa-------- 47341553  T
Q  108 aaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacaca----gca 202  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||    
T  47341554 aaaat--aaagtgaaaactggactttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgca 47341651  T
Q  203 tgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcata 302  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47341652 tgcagggcgacatgtccccatggctaacggagcacttggacggagatacctttttgattaacgtctgacaaattcagggactaagttgatatttcgcata 47341751  T
Q  303 attaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 358  Q
    ||| |  |||||||||    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47341752 attgagggatgaatttggccgacccgtgaaaattcaaggacgaatttgatggttca 47341807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 47 - 358
Target Start/End: Original strand, 46812394 - 46812703
Alignment:
Q  47 aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaactggac-ttttccaattcaatc 145  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||           ||| ||||||||||||| || || ||||| |||||||||    
T  46812394 aatgtgaagaatgaggtatgagtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagaataaaga---aaactgaaaagtgaaaattgaaccttttcaaattcaatc 46812490  T
Q  146 aaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacgg 245  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  46812491 aaagtagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacacgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatatcagcatggctaacagagcacttggacgg 46812590  T
Q  246 atggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacga 345  Q
    |  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |  |||||||||    |||  ||||||||||||||||||    
T  46812591 aatgacctttttgatggacgtctgacaaatttagggactaaattgatatttcacgtaattgagggatgaatttggccgactcgtaaaaattcaaggacga 46812690  T
Q  346 atttgatggttca 358  Q
    | |||||||||||    
T  46812691 agttgatggttca 46812703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 47 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 40784659 - 40784349
Alignment:
Q  47 aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaactggac-ttttccaattcaatc 145  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||          |||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  40784659 aatgtgaagaaggaggtatgagtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagaaaaaaaa--taaactgaaaagtgaaaatttgaccttttccaattcaatc 40784562  T
Q  146 aaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacgg 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||  |||| | ||| ||||||||    
T  40784561 aaattagtccttgaacatgtggcttccttcttgccacgtgtataagacaacacaacatgcaggacgacagatcagcatgattaacagcgcatttggacgg 40784462  T
Q  246 atggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacga 345  Q
    | ||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||  ||||||||||||| ||||    
T  40784461 agggacctttttgatggatgtctgacaaattcaaagactaagttgatatttcgcataattgaaggatgaatttagctgacgcgtaaaaattcaagaacga 40784362  T
Q  346 atttgatggttca 358  Q
    |||||||||||||    
T  40784361 atttgatggttca 40784349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 56 - 358
Target Start/End: Original strand, 46996523 - 46996823
Alignment:
Q  56 aaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaactggac-ttttccaattcaatcaaattagtc 154  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||          |||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||    
T  46996523 aaggaggtatgggtaatgtaggggcaaaatgggaaaagcagaaaaaaa---taaactgaaaagtgaaaactcaacattttccaattcaatcaaattcgtc 46996619  T
Q  155 cttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46996620 cttgaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaagacaacacagcatgcaaggcgacagatcagcatcgctaacggagcacttggacggagggacctt 46996719  T
Q  255 tttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatgg 354  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |  || ||| ||    |||  || |||||||| |||||||||||||||    
T  46996720 tttgatggacgtctgacaaattcagtgactaagttgatatttcgcataattgagggacgaagttggccgacgcgtgaaaattcagggacgaatttgatgg 46996819  T
Q  355 ttca 358  Q
    ||||    
T  46996820 ttca 46996823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 114 - 358
Target Start/End: Original strand, 33038673 - 33038918
Alignment:
Q  114 aaaagtgaaaactggac-ttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcga 212  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  33038673 aaaagtgaaaactagacattttccaattcaatcaaatcagtccttgaacacatggcttccttcttgacacgtgtataagacaacacaacatgcaggacga 33038772  T
Q  213 catgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagat 312  Q
    ||  ||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||    
T  33038773 cagatcaacatgcctaacagagcacttggacggagggacctttttgatggacgtctgaaaaattcagggactaagttgatatttcgcataattgagggat 33038872  T
Q  313 gaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 358  Q
    |||||| |  ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33038873 gaatttgaccgacccataaaaattcaaggacgaatttgatgattca 33038918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 112 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 23954056 - 23953808
Alignment:
Q  112 tgaaaagtgaaaactggactttt-ccaat-tcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcaggg 209  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  23954056 tgaaaagtgaaaattggaatttttccactatccatcaaattagtcctggaacacgtggcttcctttttgccacgtgtacaagacaacacaacatgcatgg 23953957  T
Q  210 cgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaa 309  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |      
T  23953956 cgacatatcagcatggctaacggagcacttggacggagggacctttttgattgacgtctgacaaattcacggactaagttgatatttcgcataattgatg 23953857  T
Q  310 gatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 358  Q
    || |||||| |  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23953856 gacgaattttaccgacccgtaaaaatttaaggacgaatttgatggttca 23953808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 143 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 2167697 - 2167482
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2167697 atcaaattagtccttgaacgcgtggctttctttttgccacgtgtacaagacaacacatcatgcagggtgacacgtcagcatggctaatggagcacttgga 2167598  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 342  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||| |  |||| |||  ||||||||||    
T  2167597 cggagggacctttttgatgggcgtctgacaaattcagggactaagttgatatttcgcataattgagggatgaatttgaccgacccgtactaattcaagga 2167498  T
Q  343 cgaatttgatggttca 358  Q
    |  |||||||||||||    
T  2167497 catatttgatggttca 2167482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 358
Target Start/End: Original strand, 8423062 - 8423402
Alignment:
Q  25 gtcaaggatgtttttgatgttt--------aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||        ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||           |||| |||||    
T  8423062 gtcaaggatgtttttgatgtttctgagtaaaatgtgaagaaggaggaatatgtaatgcaggggcaaaatgggaaaagca--tgaaaaaattaaattgaaa 8423159  T
Q  117 agtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacat 215  Q
    | |||||| || |||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  8423160 aatgaaaagtgaactttttccaaatcaatcaaattcgtccctgaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaagacagcacagcatgcaaggcgacat 8423259  T
Q  216 gtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaa 315  Q
    |||| ||||||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||  ||    
T  8423260 gtcagcatggctaacggagcccgttaacggagggacctttttgattgacgtctgataaattcagggattaaattgatatttcgcataattgagggacaaa 8423359  T
Q  316 tttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 358  Q
    |||   ||||| || |||||||| |||| || |||||||||||    
T  8423360 tttggctgacccgtgaaaattcagggactaaattgatggttca 8423402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 47 - 358
Target Start/End: Original strand, 35344101 - 35344411
Alignment:
Q  47 aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatc 145  Q
    ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||           |||| |||||| |||||| || |||||| |||| ||||||    
T  35344101 aatgtgaagaaggaggaatatgtaatgcaggggcaaaatgggaaaagca--cgaaaaaattaaattgaaaaatgaaaagtgaactttttccaaatcaatc 35344198  T
Q  146 aaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacgg 245  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | |  ||||    
T  35344199 aaattcgtccctgaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaagacagcacagcatgcaaggcaacatgtcagcatggctaacggagcccgttaacgg 35344298  T
Q  246 atggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacga 345  Q
    | ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  || ||||||   ||||| || |||||||  |||| |    
T  35344299 agggacctttttgatggacgtcttataaattcagggattaaattgatatttcgcataattgagggacgaatttggctgacccgtgaaaattcggggacta 35344398  T
Q  346 atttgatggttca 358  Q
    | |||||||||||    
T  35344399 aattgatggttca 35344411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 143 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 27955588 - 27955373
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||  ||| |||| |||||||||||||||||    
T  27955588 atcaaattggtccttgaacacatggcttccttgttgccaagtgtacaagacaacacaacatgcagcacgacacatcagcatgactaacggagcacttgga 27955489  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 342  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||||| | |||| |  ||||||||||  ||| | |||||||||||||||    
T  27955488 cggagggacctctttgatggacgtctgacaaattcagaaattaagttgatatttcgtaaaattgagggatgaatttagctgatccgtaaaaattcaagga 27955389  T
Q  343 cgaatttgatggttca 358  Q
    ||||||||||| ||||    
T  27955388 cgaatttgatgattca 27955373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 143 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 2492544 - 2492332
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||  |||||| |  ||| |||||||||||||||||||| |    
T  2492544 atcaaattagtccttgaacacgtgacttcctttttgccacgtgtacaagacagcagagcatgttgggcgatagatcaacatggctaacggagcacttgaa 2492445  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 342  Q
    |||| ||| |||||| |||||| | ||| ||||||| | | ||| |||||||||||||||||| || ||| | ||| |  |||| |||||||||| ||||    
T  2492444 cgga-ggaacttttttatggacgtttgaaaaattcaagtattaagttgatatttcgcataattgaaggataattttgaccgacccgtaaaaattcgagga 2492346  T
Q  343 cgaatttgatggtt 356  Q
    ||||||||||||||    
T  2492345 cgaatttgatggtt 2492332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 6602553 - 6602391
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||||||   ||||||||||  |||||    
T  6602553 atcaaattagtccttgtacacgtggctgcctggttgacacgtgtacatgacaacacagcatgcaaaaggacatgtcatcaccactaacggagcttttgga 6602454  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6602453 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 6602391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Original strand, 39859135 - 39859297
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||   ||||||||||  |||||    
T  39859135 atcaaattagtccttgtacacgtggctgtcttgttgacacgtgtacatgacaacacagcatgcaagaggacacgtcatcaccactaacggagcttttgga 39859234  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||| ||||| |||||| |||| ||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  39859235 cggagggaccattttgacggacgtctgtaaaattcaaggactaaatagatatttcgcaaaatt 39859297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 221 - 358
Target Start/End: Original strand, 38614896 - 38615032
Alignment:
Q  221 catggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaa 320  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |  ||||||||| |    
T  38614896 catggctaacagagcacttagacggagggacattttt-atggacgtctgacaaattcagggactaagttaatatttcgcataattgagggatgaatttga 38614994  T
Q  321 ttgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 358  Q
    | |||| || |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  38614995 tcgacccgtgaaaatttaaggacgaatttgatgtttca 38615032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 143 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 13168341 - 13168163
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||  ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||   ||||||||||  |||||    
T  13168341 atcaaattagtccttgtacacgtgtctgtcttgttgacacgtgtacatgacaacacagcatgcaagatgacacgtcatcaccactaacggagcttttgga 13168242  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattc---agggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaattt 318  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||   ||||||||||| ||||||||||| |||| || || ||||||    
T  13168241 cggatggaccattttgatggacgtctgtaaaattcaggagggactaaatagatatttcgcaaaattcaaggacgaattt 13168163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Original strand, 34776821 - 34776983
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||| | |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |  |||| ||||||||  |||||||||   |||||    
T  34776821 atcaaattagttcttgtacatgtggttgccttgttggcacgtgtacatgacaacacaacatgcaagaggacacgtcatcatcactaacggagtttttgga 34776920  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  34776921 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 34776983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 45359554 - 45359392
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||| |||  ||||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||   ||||||||||  |||||    
T  45359554 atcaaattagtccttgtacacgtgactgcctttttgaaacgtgtacatgacaacacagcatgcaagaggacacgtcatcaccactaacggagcttttgga 45359455  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
     ||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  45359454 tggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcaaggactaaatagatatttcgcaaaatt 45359392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 221 - 358
Target Start/End: Original strand, 38613465 - 38613602
Alignment:
Q  221 catggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaa 320  Q
    ||||||||||  | ||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||      
T  38613465 catggctaacataacacttagacgaatggacattttttatggacgtctgacaaattcagggactaagttgatatttcgcataattgagggatgaatttgg 38613564  T
Q  321 ttgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 358  Q
      |||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  38613565 ccgacccgtgaaaattgaaggacgaatttgatggttca 38613602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 38613712 - 38613610
Alignment:
Q  114 aaaagtgaaaactggac-ttttccaat-tcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcg 211  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38613712 aaaagtgaaaactggaaattttccactatccatcaagttagtccttgaacacgtggctttctttttcccacgtgtacaagacaacacaccatgcagggcg 38613613  T
Q  212 aca 214  Q
    |||    
T  38613612 aca 38613610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 305
Target Start/End: Original strand, 37796104 - 37796249
Alignment:
Q  160 acacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttga 259  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |  ||||  ||| ||| |||||||||||   |||||||| ||||  ||||||    
T  37796104 acacgtggctgccttcttgacacgtgtagaagacaacacaacatgcaagaggacacatcagcatcgctaacggagcttatggacggagggactattttga 37796203  T
Q  260 tggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||||| || |  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  37796204 tggacgtccgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 37796249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 318
Target Start/End: Original strand, 30940331 - 30940506
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||    ||||  ||||||   ||||||||||  |||||    
T  30940331 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacatgtgtacaggacaacacagcatgcaataggacacatcatcaccactaacggagcttttgga 30940430  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaattt 318  Q
    ||||  |||| |||||||| || | ||  ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||| ||||||    
T  30940431 cggagagaccattttgatgaacgtttgtaaaattcagggactaaatagatatttcgtaaaattaagagacgaattt 30940506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 1546505 - 1546343
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||| | ||  ||| |||  |||||||| |  |||||    
T  1546505 atcaatttagtccttgtacacgtgacttcctttttgacacgtatataagacaacacaacatgcagggagccagctcagcatcactaacggaccttttgga 1546406  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |  || ||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||    
T  1546405 cggagggaccattttgatggacgtgagagaaattcaaggacgcaattgatatttcgcaaaatt 1546343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 151 - 305
Target Start/End: Original strand, 38474057 - 38474211
Alignment:
Q  151 agtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatgga 250  Q
    |||||||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||||||||| || |  ||||  ||||||   ||||||||||  |||||||||||||    
T  38474057 agtccttgcacacgtggctgtcttgttgacacgtgtacaggacaacacagcatacaagaggacacatcatcaccactaacggagcttttggacggatgga 38474156  T
Q  251 cctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    || ||||||| | | ||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  38474157 ccattttgataggcgtctgtaaaattcaaggactaaatagatatttcgcaaaatt 38474211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 351
Target Start/End: Original strand, 47386115 - 47386323
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||| |||||| ||||||||| |||||| |   |||  ||||||   ||||||||||  |||||    
T  47386115 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacttgtacaggacaacacatcatgcaagagaacacatcatcaccactaacggagcttttgga 47386214  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 342  Q
    ||||  |||| ||||||||||| ||||  ||||| || ||||||||  |||||||||| |||| || || |||||| | |||  | | |||||| |||||    
T  47386215 cggaatgaccattttgatggacgtctgtaaaatttagagactaaataaatatttcgcaaaattcaaggacgaatttgactgattttttaaaattaaagga 47386314  T
Q  343 cgaatttga 351  Q
    |||||||||    
T  47386315 cgaatttga 47386323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 286
Target Start/End: Original strand, 35693276 - 35693419
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||  |||||| |  ||||  ||||||   ||||| || |  |||||    
T  35693276 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacaagacaacactacatgcaagaggacacatcatcaccactaacagaacttttgga 35693375  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaa 286  Q
     ||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  35693376 tggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaa 35693419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Original strand, 24228315 - 24228477
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||| | | |||||||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||| |||||| |  ||||  ||||||   |||| |||||  |||||    
T  24228315 atcaatttagtcttcgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtatatgacaacacaacatgcaagaggacacatcatcaccactaatggagcttttgga 24228414  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    || | ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  24228415 cgaagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagagactaaatagatatttcgcaaaatt 24228477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 358
Target Start/End: Original strand, 45465170 - 45465272
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 355  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  || ||| || |  |||| ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  45465170 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcataattgagggacgaagttgaccgacccgtaaaaattcaaggacgaagttgatgat 45465269  T
Q  356 tca 358  Q
    |||    
T  45465270 tca 45465272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 31913691 - 31913566
Alignment:
Q  139 ttcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcact 238  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||   |||||||| |||||  ||| ||   ||||||||||| |    
T  31913691 ttcaatcaaattggtccttgtacacgtggcttccttgtagacacgtgtgcaagacaacaagccatgcaggacgacaactcagcaacactaacggagcatt 31913592  T
Q  239 tggacggatggacctttttgatggac 264  Q
    |||||||| | ||  |||||||||||    
T  31913591 tggacggaagaactattttgatggac 31913566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 358
Target Start/End: Original strand, 2168820 - 2168922
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 355  Q
    ||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||  |||||||||    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  2168820 ttgattgacatttaacaaattcaaggactaaattgatatttttcttaattaagggatgaatttggacgaccagtaaaaattcaaggacgaagttgatgat 2168919  T
Q  356 tca 358  Q
    |||    
T  2168920 tca 2168922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 358
Target Start/End: Original strand, 40785534 - 40785636
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 355  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| | ||||||||||    |||| || |||||||||||||||| |||||| |    
T  40785534 ttgattgacatttaacaaattcagggattagattgatatttcacataattgagagatgaatttggccgacccgtgaaaattcaaggacgaaattgatgat 40785633  T
Q  356 tca 358  Q
    |||    
T  40785634 tca 40785636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 6056984 - 6056863
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||   |||||||| |||||  ||| ||   ||||||||||| |||||    
T  6056984 atcaaattggtccttgtagacgtggcttccttgtagacacgtgtacaatacaacaggacatgcaggacgacagctcagcagcactaacggagcatttgga 6056885  T
Q  243 cggatggacctttttgatggac 264  Q
    |||| ||||  |||||||||||    
T  6056884 cggaaggactattttgatggac 6056863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 23962526 - 23962377
Alignment:
Q  139 ttcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcact 238  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||   ||||||||  ||||  ||| ||   ||||||||||| |    
T  23962526 ttcaatcaaattggtccttgtacatgtggcttccttgtaggcacgtgtacaagacaacaagccatgcaggaagacaactcagcagcactaacggagcatt 23962427  T
Q  239 tggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaat 288  Q
    | |||||| ||||  ||||||| ||| | ||  |||||||||||| ||||    
T  23962426 ttgacggaaggactattttgattgacgtttgttaaattcagggacaaaat 23962377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 4321143 - 4321092
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaa 307  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4321143 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcataattaa 4321092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 30108670 - 30108563
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 355  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  || ||| ||    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  30108670 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcataattgagggacgaagttggccgacccgtaaaaattcagggacgaagttgatgat 30108571  T
Q  356 tcaatcgt 363  Q
    ||| ||||    
T  30108570 tcactcgt 30108563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 33775497 - 33775418
Alignment:
Q  272 aaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttga 351  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||| || |  |||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  33775497 aaattcagggattaaattgatatttcgcataattgaaggacgaagttgaccgacccgtaaaaattcagggacgaagttga 33775418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 48704431 - 48704337
Alignment:
Q  112 tgaaaagtgaaaactggacttttc--caattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatg 204  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |  ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  48704431 tgaaaagtgaaaactgaaattttcatcgtttccatcaaattggtccttgtacacgtgacttccttgttgacacgtgtacacgacaacacaacatg 48704337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 46994765 - 46994663
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 355  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||| ||    |||| || |||||||| ||||||| |||||| |    
T  46994765 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcataattgaaggacgaagttggccgacccgtgaaaattcagggacgaagttgatgat 46994666  T
Q  356 tca 358  Q
    |||    
T  46994665 tca 46994663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 305
Target Start/End: Original strand, 48852222 - 48852415
Alignment:
Q  114 aaaagtgaaaactggactttt--ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcg 211  Q
    |||||| ||||||||| ||||  ||| ||| ||||||||||| |||| ||||||| ||  ||| ||| ||| |||||||||||||||| |||| | |  |    
T  48852222 aaaagttaaaactggaatttttaccatttccatcaaattagttcttgtacacgtgactgtcttgttgacacatgtacaagacaacacatcatgtaagagg 48852321  T
Q  212 acatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||  ||||||   ||||| ||||  |||||| ||  |||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||    
T  48852322 acacatcatcaccactaacagagcttttggaccgagagaccattttgatggacgtctgtaaaattcaaggattaaatagatattttgcaaaatt 48852415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 47 - 96
Target Start/End: Original strand, 33038617 - 33038666
Alignment:
Q  47 aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcag 96  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  33038617 aatgtgaagaaggaggtatgtataatgcaggggcaaaatgagaaaagcag 33038666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 256 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 46810810 - 46810761
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46810810 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcataatt 46810761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 34691192 - 34691136
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacaca 199  Q
    ||||| ||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  34691192 atcaatttaatccctgtacacgtggcttccttgttgccacgtgtacaagccaacaca 34691136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 8421507 - 8421472
Alignment:
Q  270 acaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8421507 acaaattcagggattaaattgatatttcgcataatt 8421472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 35342516 - 35342481
Alignment:
Q  270 acaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35342516 acaaattcagggattaaattgatatttcgcataatt 35342481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 305
Target Start/End: Original strand, 37115515 - 37115594
Alignment:
Q  226 ctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||  ||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  37115515 ctaacggagcttttggacggagggactattttgatggacgtctgtaaaattcaggtactaaatagatattttgcaaaatt 37115594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 206
Target Start/End: Original strand, 46439436 - 46439499
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgca 206  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  46439436 atcaatttagtccatgtacacgtggctgccctgttgacacgtgtacaagacaacacaacatgca 46439499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 246
Target Start/End: Original strand, 46867841 - 46867943
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||  ||| ||   ||||||||||| |||||    
T  46867841 atcaaattggtccttgtacatgtggcttccttgaagacacgtgtacaagacaaca-tgcatgcaggacgacagctcagcagcactaacggagcatttgga 46867939  T
Q  243 cgga 246  Q
    ||||    
T  46867940 cgga 46867943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 202
Target Start/End: Original strand, 48303576 - 48303635
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagca 202  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  48303576 atcaatttagtccctgtacacgtggctttctttttcccacgtgtacaagccaacacagca 48303635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 3690255 - 3690153
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 355  Q
    ||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |   | ||| ||    || ||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  3690255 ttgattgacatttaacaaattcaaggattaaattgatatttcgcataattgaggaacgaagttggccgaactgtaaaaattcaaggacgaagttgatgat 3690156  T
Q  356 tca 358  Q
    |||    
T  3690155 tca 3690153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 358
Target Start/End: Original strand, 38614778 - 38614880
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 355  Q
    ||||| ||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||| |  ||||||||| |  ||||  |||||||||||||||| | |||||| |    
T  38614778 ttgattgacatttaacaaactcaaggactaagttgatattttgcataattgagggatgaatttgaccgacccataaaaattcaaggacgtagttgatgat 38614877  T
Q  356 tca 358  Q
    |||    
T  38614878 tca 38614880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 56435 - 56386
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  56435 ttgatggacgtctgtaaaattcagggactaatttgatatttcgcaaaatt 56386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13034888 - 13034820
Alignment:
Q  146 aaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgaca 214  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||  ||   || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  13034888 aaattggtccttgtacacgtggctgactagatgacacgtgtacaggacaacacagcatgcaggacgaca 13034820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 306
Target Start/End: Original strand, 19712264 - 19712332
Alignment:
Q  238 ttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatta 306  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||    
T  19712264 ttggacggtgggaccattttgatggacgtctaataaattcagagactaatgtgatatttcacataatta 19712332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 20478165 - 20478105
Alignment:
Q  238 ttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcg 298  Q
    ||||||||| ||||   |||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20478165 ttggacggagggactgatttgatggacgtctgcaaaattcagggactaatttgatatttcg 20478105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 45463867 - 45463811
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacaca 199  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||    
T  45463867 atcaatttagtccctgtacacgtggctttctttttcccacgtgtacaagccaacaca 45463811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 158; Significance: 8e-84; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 47 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 15432638 - 15432331
Alignment:
Q  47 aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatc 145  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||          |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  15432638 aatgtgaagaagg-ggtatgagtaatgtaggggcaaaatgggaaaagcagaaaaaa----taaactgaaaagtgaaaactgaactttttccaattcaatc 15432544  T
Q  146 aaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacgg 245  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||     
T  15432543 aaattagtccttgaacacatgacttccttcttgccacgtgtacaagacaacacaacatgcagggcgacatgtcagcatgactaatagagcacttggacga 15432444  T
Q  246 atggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacga 345  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |  ||||  ||||||||||||||  |    
T  15432443 atgaacctttttgatggacgtctgacaaattcagagactaaattgatatttcgcataattgagggatgaatttgaccgacccataaaaattcaaggataa 15432344  T
Q  346 atttgatggttca 358  Q
    |||||||||||||    
T  15432343 atttgatggttca 15432331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 47 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 25619976 - 25619663
Alignment:
Q  47 aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnn-taaagtgaaaagtgaaaactggacttttc-caattcaat 144  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| | |||||||||||||  ||||||  |||||||||    
T  25619976 aatgtgaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagaagagaaaaaataaactaaaaagtgaaaactaaacttttttcaattcaat 25619877  T
Q  145 caaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacg 244  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |    
T  25619876 caaattagtccttgaacatgtggcttctttcttgccacgtgtataagacaacgcaacatgcagagcgacagatcaacatggctaacggagcacttggatg 25619777  T
Q  245 gatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacg 344  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |  ||||||||| |  ||||  ||||||||||||||||    
T  25619776 gagggacctttttgatggacatatgacaaattcagggactaagttgatattttgcataattgagggatgaatttgaccgacccataaaaattcaaggacg 25619677  T
Q  345 aatttgatggttca 358  Q
    ||||||||||||||    
T  25619676 aatttgatggttca 25619663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 57 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 37417581 - 37417276
Alignment:
Q  57 aggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnn---taaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattag 152  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||             |||| |||||| |||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  37417581 aggaagtatgggtaatgcacgggcaaaatgggaaaagcagaagaaaaaataattaaactgaaaattgaaaattggactttttccaaatcaattaaattag 37417482  T
Q  153 tccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacc 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  37417481 tccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcaacagatcagcatggctaacggagcacttggacgaagggacc 37417382  T
Q  253 tttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgat 352  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||    ||||  | ||||||||||||||||| ||||    
T  37417381 tttttgatggacgtctgacaaattcagggactaagttgatatttcgcataattgagggatgaatttggccgacccatgaaaattcaaggacgaatatgat 37417282  T
Q  353 ggttca 358  Q
    ||||||    
T  37417281 ggttca 37417276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 47 - 305
Target Start/End: Original strand, 39210 - 39465
Alignment:
Q  47 aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaactggac-ttttccaattcaatc 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||          |||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  39210 aatgtgaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgagaaaagcagaaaaaa----taaactgaaaagtgaaaactcaacattttccaattcaatc 39305  T
Q  146 aaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacgg 245  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  39306 aaatttgtccctgaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaagacaacacagcatgcaagacgacatatcagcatggctaacggaacacttggacgg 39405  T
Q  246 atggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
      |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39406 ggggacctttttgatgaacgtctgacaaattcagggactaagttgatatttcgcataatt 39465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 24 - 305
Target Start/End: Original strand, 29909448 - 29909728
Alignment:
Q  24 ggtcaaggatgtttttgatgttt---aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtg 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||           ||| |||||||||    
T  29909448 ggtcaaggacgtttttgatgttctgaaatgtgaagaaggaggtatgggtaatgcatgggaaaaatgggaaaagcagaaaaaa-----aaattgaaaagtg 29909542  T
Q  121 aaaactggacttttccaa-ttcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtca 219  Q
    ||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||  |||    
T  29909543 aaaactcaactttttcaaattcaatcaaattagtcccttaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaagacaacacaacatgcaacgcgacagatca 29909642  T
Q  220 tcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
     |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29909643 acatggctaacagagcacttggacggagggacctttttgatggacgtctgacaaattaagggactaaattgatatttcgcataatt 29909728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 47 - 305
Target Start/End: Original strand, 92160 - 92415
Alignment:
Q  47 aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaactggac-ttttccaattcaatc 145  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||          |||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  92160 aatgtgaagaaggaggtatgggtaatgcaagggcaaaatgagaaaagcagaaaaaa----taaactgaaaagtgaaaactcaacattttccaattcaatc 92255  T
Q  146 aaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacgg 245  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  92256 aaatttgtccctgaacacgtggcttccttcttgccacacgtacaagacaacacagcatgcaagacgacatatcagcatggctaacggagcacttggactg 92355  T
Q  246 atggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    | |||||||||||||| || |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  92356 agggacctttttgatgaacgtctgacaaattcaaagactaagttgatatttcgcataatt 92415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 157 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 42879559 - 42879360
Alignment:
Q  157 tgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttt 256  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  42879559 tgaacacgtgacttccttcttgtcacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatatcagcatgactaacggaacacttggacggagggacctttt 42879460  T
Q  257 tgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggtt 356  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||| |  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42879459 tgatggacgtctgacaaattcatagactaagttgat-tttcgcataattaagggatgaatttgaccgacccgtaaaaatttaaggacgaatttgatggtt 42879361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 131 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 42001839 - 42001613
Alignment:
Q  131 ttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaac 230  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  42001839 ttttccaattcaatcaaatcagtccttgaacacgtgacttccttcttgtcacgtgtacaagacaactcaacatgcagggcgacacatcaacatggctaac 42001740  T
Q  231 ggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgta 330  Q
    | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |  ||| |||||     ||| |||    
T  42001739 gaagcacttggatggatgaacctttttgat-gatgtctgacaaattcaaggattaaattgatatttcgcataatagagggataaatttggacaacccgta 42001641  T
Q  331 aaaattcaaggacgaatttgatggttca 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42001640 aaaattcaaggacgaatttgatggttca 42001613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 41706873 - 41706542
Alignment:
Q  25 gtcaaggatgtttttgatgtttaatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaa 124  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||||||           |||| |||||| ||||||    
T  41706873 gtcaaggatgtttttga-gtaaaatgtgaagaaggaggaatatgaaatgcaggggcaaaatgagaaaagca--cgaaaaaattaaattgaaaaatgaaaa 41706777  T
Q  125 ctggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcat 223  Q
     || |||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  41706776 gtgaactttttccaaatcaatcaaattcgtccctgaacacgtgacttccttcttgccacgcgtacaagacagcacagcatgcaaggcgacatgtcagcat 41706677  T
Q  224 ggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattg 323  Q
    |||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||| |  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  || |||||| |  |    
T  41706676 ggctaacggagcccgttaacggagggacctttttgatggacgttcgataaattcagggattaaattgatatttcgcataattgagggacgaatttgaccg 41706577  T
Q  324 acctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 358  Q
    ||| || |||||||| | || || |||||||||||    
T  41706576 acccgtgaaaattcaggaactaaattgatggttca 41706542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 47 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15372812 - 15372555
Alignment:
Q  47 aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatc 145  Q
    ||||| |||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||           |||| |||||| |||||| || |||||| |||| ||||||    
T  15372812 aatgtgaagaaggaggaatatgtaatgcaggggtaaaatgggaaaagca--cgaaaaaattaaattgaaaaatgaaaagtgaactttttccaaatcaatc 15372715  T
Q  146 aaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacgg 245  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||| | |  ||||    
T  15372714 aaattcgtccctgaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaagacagcacaacatgcaaggcgacatgttagcatggctaacggagcccgttaacgg 15372615  T
Q  246 atggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  15372614 agggacctttttgatggacgtctgataaattcagggattaaattgatattttgcataatt 15372555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 197 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 39720 - 39560
Alignment:
Q  197 acagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatattt 296  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||  |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  39720 acagcacgcatggcgacatgtcagcatggctaacgaagcacttggacggagggacctttttaatcgacgcctgataaattcagggattaaattgatattt 39621  T
Q  297 cgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttc 357  Q
    ||||||||| |  || ||||||    |||| ||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  39620 cgcataattgagggacgaatttggccgacccgtaaaaattcagggactaaattgatggttc 39560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Original strand, 19908172 - 19908334
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||   ||||||||||  |||||    
T  19908172 atcaaattagtccttgtacacgtggctgtcttgttgacacgtgtacatgacaacacagcatgcaagaggacacgtcatcaccactaacggagcttttgga 19908271  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||| ||||| |||||| |||| ||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19908272 cggagggaccattttgacggacgtctgtaaaattcaaggactaaatagatatttcgcaaaatt 19908334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 143 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 16763293 - 16763086
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||| || |||| ||||||    ||||| |||   |||||    
T  16763293 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacaagacaaaacaacatgcaagg-gacacgtcatcgccactaacagagattttgga 16763195  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 342  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |  || |||||| |  ||  | ||||||||||||||    
T  16763194 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaattcagggacgaatttgaccgatttttaaaaattcaagga 16763095  T
Q  343 cgaatttga 351  Q
    |||||||||    
T  16763094 cgaatttga 16763086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 143 - 298
Target Start/End: Original strand, 39664674 - 39664829
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||  ||| |  ||||  ||||||   ||||||||||  |||||    
T  39664674 atcaaattagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacatgacaacacagctagcaagaggacacatcatcaccactaacggagcttttgga 39664773  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcg 298  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  39664774 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcg 39664829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Original strand, 14389010 - 14389172
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |  ||||  ||||||   |||||| | |  |||||    
T  14389010 atcaagttagtccttgtacacgtggctgccttattgacacgtgtacaagacaacacaacatgcaagaggacacatcatcactactaacgaaacttttgga 14389109  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14389110 cggagggaccattttgatggacatttggaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 14389172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Original strand, 44709671 - 44709833
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |  ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |  ||||| ||||||   |||||| |||  |||||    
T  44709671 atcaatttagtccttgtacacgtggatgtcttgttgacacgtgtacaagacaacacaacatgcaagaggacatatcatcaccactaacgaagcttttgga 44709770  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  44709771 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagttatttcgcaaaatt 44709833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 143 - 296
Target Start/End: Original strand, 42519131 - 42519284
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| || |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |  ||||  ||||||   ||||||||||  |||||    
T  42519131 atcaatttagtccttgtacacgtgactgccttgttgacacgtgtacaggacaacacagcatgcaagaggacacatcatcaccactaacggagcttttgga 42519230  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatattt 296  Q
     ||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  42519231 tggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatattt 42519284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 40560441 - 40560279
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||| |  ||||  ||||||   ||||| || |  |||||    
T  40560441 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgcgtacatgacaacacagcatgcaagaggacacatcatcaccactaacagaacttttgga 40560342  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||| ||||  ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  40560341 cggagggactattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 40560279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 17946312 - 17946150
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||| || ||||||| ||||||||| ||| ||||| | ||  | | |||  |||||||| |  |||||    
T  17946312 atcaatttagtccttgtacacgtgacttcctttttgacatgtgtacatgacaacacaacatacagggagccagcttagcatcactaacggaccttttgga 17946213  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  17946212 cggagggaccattttgatggacatgagagaaattcagggacaaaattgatattttgcaaaatt 17946150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 206
Target Start/End: Original strand, 10716777 - 10716872
Alignment:
Q  113 gaaaagtgaaaactggacttttc--caattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgca 206  Q
    ||||||||||||||| | |||||  || ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  10716777 gaaaagtgaaaactgaaattttcatcatttccatcaaattggtccttgtacacgtggcttccttgttgacacgtgtacaagacaacacaacatgca 10716872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 6797725 - 6797563
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |  || |  ||||||    |||| ||||  |||||    
T  6797725 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacaagacaacacatcatgcaagaggatacatcatcacccgtaacagagcttttgga 6797626  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||| | ||| ||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6797625 cggaggaaccattttgatagacgtctgtaaaattaagggactaaatagatatttcgcaaaatt 6797563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 7744261 - 7744099
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||| ||| ||| | |  |  ||| |||  |||||||| |  |||||    
T  7744261 atcaatttagtcattgtacacgtggcttcctttttgacatgtgtacatgacaacacaacatacagagagctaactcagcatcactaacggaccttttgga 7744162  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
     ||| ||||| |||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  7744161 tggagggaccattttgatggacatgagagaaattcagggacgaaattgatatttcgcaaaatt 7744099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 17696424 - 17696271
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||  ||||||   ||||||||||  |||||    
T  17696424 atcaatttagtccttgtacacatggctgccttgttgacacgtgtacaggacaacacaacatgcaagatgacacatcatcaccactaacggagcttttgga 17696325  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatattt 296  Q
    ||||  |||| ||||||| ||| | ||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  17696324 cggagtgaccattttgattgacgtttgtaaaattcagggactaaatagatattt 17696271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 2767152 - 2766944
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| ||| ||| || ||||||| || |||| ||  |||||||||| ||||||||| ||| || |  ||||  ||||||   ||||||||||  |||||    
T  2767152 atcaatttaatccatgtacacgtgactgccttgttaacacgtgtacaggacaacacaacatacaagaggacacatcatcaccactaacggagcttttgga 2767053  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 342  Q
    | || ||||| ||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || || || ||| |  ||  | ||||||||||||||    
T  2767052 cagagggaccattttgatagacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaattcaaggacgagtttgaccgatttttaaaaattcaagga 2766953  T
Q  343 cgaatttga 351  Q
    |||||||||    
T  2766952 cgaatttga 2766944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 42001922 - 42001873
Alignment:
Q  47 aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcag 96  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42001922 aatgtgaagaaggaggtatgggtaatgcagaggcaaaatgggaaaagcag 42001873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 260
Target Start/End: Original strand, 862214 - 862335
Alignment:
Q  139 ttcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcact 238  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||   ||||||||  ||||  ||| ||   ||||||||||| |    
T  862214 ttcaatcaaattggtccttgtacacatggcttccttgtagacacgtgtacaagacaacaagccatgcaggaagacaactcaacagcactaacggagcatt 862313  T
Q  239 tggacggatggacctttttgat 260  Q
    |||||||| ||||  |||||||    
T  862314 tggacggaaggactattttgat 862335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 204
Target Start/End: Original strand, 11315263 - 11315324
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatg 204  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  11315263 atcaaattggtccttgtacatgtggcttccttgttgacacgtgtacaagacaacacaacatg 11315324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 298
Target Start/End: Original strand, 11315336 - 11315396
Alignment:
Q  238 ttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcg 298  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  11315336 ttggacggagggaccattttgatggacgtctgacaaattcaggaactattttgatatttcg 11315396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 358
Target Start/End: Original strand, 42880811 - 42880899
Alignment:
Q  270 acaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 358  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||| |  |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  42880811 acaaatttatggattaaattgatatttcgcataattaagggacgaatttgaccgacccgtaaaaattcagggacgaagttgatgattca 42880899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 358
Target Start/End: Original strand, 28248161 - 28248263
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 355  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  || ||| ||    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  28248161 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcataattgagggacgaagttggccgacccgtaaaaattcagggacgaagttgatgat 28248260  T
Q  356 tca 358  Q
    |||    
T  28248261 tca 28248263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 39866 - 39788
Alignment:
Q  25 gtcaaggatgtttttgatgttt--------aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagca 95  Q
    ||||||||||||||||||||||        ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39866 gtcaaggatgtttttgatgtttctgactaaaatgtgaagaaggaggaatatgtaatgcaggggcaaaatgggaaaagca 39788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 256 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 11021638 - 11021589
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11021638 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcataatt 11021589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 55 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 42879620 - 42879579
Alignment:
Q  55 gaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcag 96  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42879620 gaaggaagtatgggtaatgcatgggcaaaatgggaaaagcag 42879579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 202
Target Start/End: Original strand, 11022940 - 11022999
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagca 202  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  11022940 atcaatttagtccctgtacacgtggctttctttttcccacgtgtacaagccaacacagca 11022999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 305
Target Start/End: Original strand, 16377206 - 16377285
Alignment:
Q  226 ctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||| | ||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  16377206 ctaacggagcttttggacggagggaccattttgatggacgtatgtaaaattcaaggactaaatagatattttgcaaaatt 16377285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 305
Target Start/End: Original strand, 24208063 - 24208130
Alignment:
Q  238 ttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||||||||| ||||   |||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24208063 ttggacggagggactgatttgatggacgtctgtaaaattcagggactaatttgatatttcgaataatt 24208130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 28246860 - 28246801
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagca 202  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  28246860 atcaatttagtccctgtacacgtggctttctttttcccacgtgtacaagccaacacagca 28246801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 40097766 - 40097711
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacac 198  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||    
T  40097766 atcaaattagttcttgtacacgtggcttccttgttgacacgtatataagacaacac 40097711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 305
Target Start/End: Original strand, 41708430 - 41708465
Alignment:
Q  270 acaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41708430 acaaattcagggattaaattgatatttcgcataatt 41708465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 33298 - 33196
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 355  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || || ||| ||    |||| || |||||||| ||||||| |||||| |    
T  33298 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcacataattgaaggacgaagttggccgacccgtgaaaattcagggacgaagttgatgat 33199  T
Q  356 tca 358  Q
    |||    
T  33198 tca 33196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 358
Target Start/End: Original strand, 41144 - 41230
Alignment:
Q  272 aaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 358  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  || ||||||    |||| || |||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  41144 aaattcagggattaaattgatatttcgcataattgagggacgaatttggccgacccgtgaaaattcagggacgaagttgatgattca 41230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 358
Target Start/End: Original strand, 37418755 - 37418857
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 355  Q
    ||||| ||||| | ||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| || ||||||    |||| || |||||||||| ||||| |||||| |    
T  37418755 ttgattgacatttaacaaatttagggattagattgatattttgcataattaaaggacgaatttggccgacccgtgaaaattcaagtacgaagttgatgat 37418854  T
Q  356 tca 358  Q
    |||    
T  37418855 tca 37418857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 307
Target Start/End: Original strand, 6786002 - 6786071
Alignment:
Q  238 ttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaa 307  Q
    ||||||||| ||||   |||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  6786002 ttggacggagggactgatttgatggacgtctgtaaaattcagggactaatttgatatttcaaataattaa 6786071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 305
Target Start/End: Original strand, 42003476 - 42003525
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||||| ||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  42003476 ttgattgacatttaacaaattcagagattaaattgatatttcgcataatt 42003525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 47)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 55 - 358
Target Start/End: Original strand, 42897592 - 42897895
Alignment:
Q  55 gaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagt 153  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||          |||| |||||||||| || ||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  42897592 gaaggaagtatcggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagaaaaaaaat-taaattgaaaagtgataattggactttttccaaataaatcaaattagt 42897690  T
Q  154 ccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacct 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  42897691 ccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcaggacgacagatcagcatggctaacagagcacttggacggagggacct 42897790  T
Q  254 ttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatg 353  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |  || ||||||    |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  42897791 ttttgatggacgtctgacaaattcaaggactaagttgatatttcacataattgagggacgaatttggccgacccgtaaaaattcaaggacggatttgatg 42897890  T
Q  354 gttca 358  Q
    |||||    
T  42897891 gttca 42897895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 55 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 1320909 - 1320620
Alignment:
Q  55 gaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaactggac-ttttccaattcaatcaaattagt 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||           ||    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  1320909 gaaggaggtatgggtaatgcagggacaaaatgggaaaagcag-----------aa----aaaagtgaaaactgaacttttttcaattcaatcaaattagt 1320825  T
Q  154 ccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacct 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  1320824 ccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacatagcatgcagggcgacatgtcaccatggctgacggaacacttggacggaaggacct 1320725  T
Q  254 ttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatg 353  Q
    | || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |  ||||||||||   |||| || |||||| |||||| |||||||||    
T  1320724 tatttatggacgtctgacaaattcagggactaagttgatattttgcataattgagggatgaatttagccgacccgtgaaaatttaaggacaaatttgatg 1320625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 55 - 358
Target Start/End: Original strand, 38882614 - 38882918
Alignment:
Q  55 gaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagt 153  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||          |||| |||||||||||||||| | |||| ||| ||| || ||||| ||    
T  38882614 gaaggaggtatgggtaatacaggggcaaaatgagaaaagcagaaaaaaaaattaaactgaaaagtgaaaactgtaatttttccacttccattaaattggt 38882713  T
Q  154 ccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacct 253  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  38882714 ccttgaacacgtgacttccttgttgccacgagtacaagacaacacagcatgcaggacgacagatcaacatggctaacggagcacttggacggagggacat 38882813  T
Q  254 ttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatg 353  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || || ||||||||| |  || | || |||||||||||||||||||||||    
T  38882814 tttttatggacgtctgacaaattcagggattaaattgatatctcgcatagttgaaggatgaatttgaccgatccgtgaaaattcaaggacgaatttgatg 38882913  T
Q  354 gttca 358  Q
    |||||    
T  38882914 gttca 38882918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 53 - 358
Target Start/End: Original strand, 462187 - 462491
Alignment:
Q  53 aagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaactggacttttccaa-ttcaatcaaatta 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||          |||| |||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  462187 aagaaggaggtatgggtaacgcaggggcaaaatggaaaaagcagaagaaaaaaataaactgaagagtgaaaactgaactttttcaaattcaatcaaatta 462286  T
Q  152 gtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggac 251  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||     
T  462287 gtccttgaacact--gcttccttcttgccacgtgtataagataacacaacatgcacggcgacaaatcagcatggctaacagagcacttggatggagggat 462384  T
Q  252 ctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttga 351  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||    || |||||||||||||| |||||||||||    
T  462385 ctttttgatggacgtttgacaaattcaaggactaagttgatatttcgcataattgacggatgaatttggccgatctgtaaaaattcaatgacgaatttga 462484  T
Q  352 tggttca 358  Q
    |||||||    
T  462485 tggttca 462491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 47 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 32822674 - 32822364
Alignment:
Q  47 aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaactggacttttccaa-ttcaatc 145  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||          |||| | ||||||||||| || |||||| ||| |||||||    
T  32822674 aatgtgaagaaggaggtatgggtaatgtaggggcaaaatgggaaaagcagaaaaaaaaa-taaactaaaaagtgaaaattgaactttttcaaattcaatc 32822576  T
Q  146 aaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacgg 245  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||  ||| ||| ||||||  |||||||||||||    
T  32822575 aaattagtccctgaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaagacaacaaagcatgcatggcgacagatcagcat-gctaacaaagcacttggacgg 32822477  T
Q  246 atggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacga 345  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||| |  |||||||||    || |  |||||||||||||||||    
T  32822476 aaggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaagttgatattttaaataattgagggatgaatttggccgatccataaaaattcaaggacga 32822377  T
Q  346 atttgatggttca 358  Q
    | |||||||||||    
T  32822376 agttgatggttca 32822364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 47 - 356
Target Start/End: Original strand, 33159962 - 33160267
Alignment:
Q  47 aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatc 145  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||           ||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  33159962 aatgtgaagaaggaggtatgggtgatgcaggggcaaaataggaaaagcagaaaaaa-----aaactgaaaagtgaaaacttgaatttttccaattcaatc 33160056  T
Q  146 aaattagtccttgaacacgtg-gcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacg 244  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||| |  |    
T  33160057 aaattagtccttgaacacgtgagctt-cttcttgccacgtgtataagacaacacaacatgcagggcgacagatcagcatggctaacagagcacttaggtg 33160155  T
Q  245 gatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacg 344  Q
    || ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |  |||||||||    ||||||| ||||||||||||||    
T  33160156 gagggacctttttgatgggcgtctgacaaattcagagactaagttgatatttcacataattgagggatgaatttggccgacctgtgaaaattcaaggacg 33160255  T
Q  345 aatttgatggtt 356  Q
    ||||||||||||    
T  33160256 aatttgatggtt 33160267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 305
Target Start/End: Original strand, 33750170 - 33750452
Alignment:
Q  24 ggtcaaggatgtttttgatgttta---atgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtg 120  Q
    ||||||||| |||||||||||| |   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||| |||||||||    
T  33750170 ggtcaaggacgtttttgatgttcagaaatgtgaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagca---aaaaaaaataaactgaaaagtg 33750266  T
Q  121 aaaactggac-ttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtca 219  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||  |||    
T  33750267 aaaactcaacattttccaattcaatcaaattcgtccctgaacacatggcttccttcttgccacgcgtacaagacaacacaacatgcaagacgacagatca 33750366  T
Q  220 tcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
     ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33750367 acatcgctaacagagcacttggacggagggacctttttgatgaatgtctgacaaattcagggactaagttgatatttcgcataatt 33750452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 113 - 358
Target Start/End: Original strand, 37525898 - 37526144
Alignment:
Q  113 gaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcg 211  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||    
T  37525898 gaaaagtgaaaatttgactttttccaattgaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtataagacaacacaacatacaggacg 37525997  T
Q  212 acatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaaga 311  Q
    |||  ||| |||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |    
T  37525998 acagatcaacatgactaacagcgcacttggacggagggacctttttgatggatgtctgaaaaattcagggactaagttgatatttcgcataattgaagaa 37526097  T
Q  312 tgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 358  Q
    ||||||| |  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37526098 tgaatttgaccgacgcgtgaaaattcaaggacgaatttgatggttca 37526144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 107 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 8654754 - 8654556
Alignment:
Q  107 taaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgc 205  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  8654754 taaattgaaaagtgaaaagtgaactttttccaattcaatcaaattagtccttgaacatgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacattgcatgc 8654655  T
Q  206 agggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| | | |||| |||||||||||||||||    
T  8654654 agggcgacatgtcagcatggctaacggagcacttggacggagggacccttttgatggacgtctgataaattcaagaattaaa-tgatatttcgcataatt 8654556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 358
Target Start/End: Original strand, 31200928 - 31201264
Alignment:
Q  20 gaaaggtcaaggatgtttttgatgtttaatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagt 119  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||           |||| |||||| |    
T  31200928 gaaaagtcaaggatgtttttga-gtaaaatgtgaagaaggaggaatatgtaatgcaagggcaaaatgggaaaagca--cgaaaaaattaaattgaaaaat 31201024  T
Q  120 gaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtc 218  Q
    ||||| || |||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  31201025 gaaaagtgaactttttccaaatcaatcaaattcgtccctgaacacatgacttccttcttgccacgcatacaagacaacacatcatgcaaggcgacatgtc 31201124  T
Q  219 atcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaattt 318  Q
    | ||||||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  || ||||||    
T  31201125 agcatggctaacggagcccgttaacggagggacctttttgatggacgtctgataaattcagggattaaattgatatttcgcataattgatggacgaattt 31201224  T
Q  319 aattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 358  Q
        |||| || |||||||| |||| || |||||||||||    
T  31201225 ggccgacccgtgaaaattcagggactaaattgatggttca 31201264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 31821720 - 31821421
Alignment:
Q  47 aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaactggacttttccaattcaatca 146  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||          |||| ||||| |||||||||  | |||| |||||||||||    
T  31821720 aatgtgaagaaggatgtatgggtaatgcaagggcaaaatgggaaaaggagaaaaaaa---taaactgaaatgtgaaaactcaaatttttcaattcaatca 31821624  T
Q  147 aattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacgga 246  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||         ||||||||||||| |||||| | |||||  ||| || ||||||| ||| |||||||||||    
T  31821623 aattagtccctgaacacgtggcttccttctt---------acaagacaacacatcatgcaagacgacagatcagcaaggctaacagaggacttggacgga 31821533  T
Q  247 tggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaa 346  Q
     ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |  || ||| || |  ||| ||| |||||||| |||||||    
T  31821532 gggacctttttgatggacgtctgataaattctgggactaagttgatatttcgcataattgagggacgaagttgaccgacgtgtgaaaattcagggacgaa 31821433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Original strand, 8609714 - 8609875
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||   ||||||||||  |||||    
T  8609714 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgtcgacacgtgtacaagacaacacagcatgcaagg-gacacgtcatcaccactaacggagcttttgga 8609812  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8609813 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 8609875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Original strand, 13108263 - 13108424
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||   |||||| |||  |||||    
T  13108263 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacaagacaacacagcatgcaagg-gacacgtcatcaccactaacgaagcttttgga 13108361  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  13108362 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaatttgatatttcgcaaaatt 13108424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 38547445 - 38547284
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||   ||||||||||  |||||    
T  38547445 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacaagacaacacagcatgcaagg-gacacgtcatcaccactaacggagcttttgga 38547347  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
     ||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  38547346 tggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaatttgatatttcgcaaaatt 38547284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 143 - 351
Target Start/End: Original strand, 41825570 - 41825778
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||| ||| || ||||||| |||||||||||||||| |  ||||  ||||||   ||||| ||||  |||||    
T  41825570 atcaaattagtccttgtacacgtgactgccttgttgacatgtgtacaggacaacacagcatgcaagaagacacatcatcactactaacagagcttttgga 41825669  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 342  Q
    ||||  |||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || || ||||||| ||||  | | ||||||||||||    
T  41825670 cggagtgaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaattcaaggacgaatttatttgatttttgaaaattcaagga 41825769  T
Q  343 cgaatttga 351  Q
    |||||||||    
T  41825770 cgaatttga 41825778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 143 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9184601 - 9184445
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||   |||| | |||| |||||    
T  9184601 atcaaattggtctttgtacacgtggattccttgttgacacatgtacaagacaacacatcatgcagggcgacagatcagcagcactaatgaagcatttgga 9184502  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgc 299  Q
    |||| ||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9184501 cggagggaccatttcgatcgacgtctgacaaattcagggactaatttgatatttcgc 9184445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 143 - 297
Target Start/End: Original strand, 9673091 - 9673245
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||  ||||||   |||||| |||  || ||    
T  9673091 atcaaattagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacatgacaacacaacatgcaagaagacacatcatcaccactaacgaagcttttaga 9673190  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttc 297  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9673191 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggattaaatagatatttc 9673245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 178 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 13282660 - 13282534
Alignment:
Q  178 gccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattc 277  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  ||||||   ||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||| | ||  ||||||    
T  13282660 gccacgtgtacaagacaacagagcatgcaagg-gacacatcatcaccactaacggagcttttggacggagggaccattttgatggacgtttgtaaaattc 13282562  T
Q  278 agggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  13282561 agggactaaatagatatttcgcaaaatt 13282534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Original strand, 26242240 - 26242402
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    |||||||||||  ||| |||| ||| | |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |  ||||  |||||    ||||||||||  |||||    
T  26242240 atcaaattagttattgtacacatggttgccttgttgacacgtgtacaagacaacacaacatgcaagaggacacatcatcgccactaacggagcttttgga 26242339  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  26242340 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagagactaaatagatatttcgcaaaatt 26242402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 297
Target Start/End: Original strand, 41042510 - 41042664
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||| |||| ||| ||| ||| || |||||||||||||||| |  ||||  ||||||   ||||||||||  |||||    
T  41042510 atcaatttagtccttgtacccgtggctgccttgttgacacatgtgcaggacaacacagcatgcaagaggacacatcatcaccactaacggagcttttgga 41042609  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttc 297  Q
    |||| ||||| |||||||||||  |||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  41042610 cggagggaccattttgatggacgcctgtaaaattcagggactaaatagatatttc 41042664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 300
Target Start/End: Original strand, 13486025 - 13486182
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| || |||| ||| |||||||||| | ||||||| |||||| |  ||||  ||||||   |||| |||||  |||||    
T  13486025 atcaatttagtccttgtacacgtgactgccttgttgacacgtgtacagggcaacacaacatgcaagaggacacatcatcactactaatggagcttttgga 13486124  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgca 300  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13486125 cagagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgca 13486182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 351
Target Start/End: Original strand, 7745038 - 7745246
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    |||||||||||||||| |||  || || |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |  ||||  ||||||   ||||||||||  |||||    
T  7745038 atcaaattagtccttgtacatatgactgccttgttgacacgtgtacaagacaacacatcatgcaagaggacacatcatcaccactaacggagcttttgga 7745137  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 342  Q
     ||| ||||| ||||||||||  ||||  |||| ||||||||||||  |||||||||| |||| | ||| ||||||   |||  | | ||||||||| ||    
T  7745138 tggagggaccattttgatggatgtctgtaaaatacagggactaaataaatatttcgcaaaattcagagacgaatttggctgatttttgaaaattcaaaga 7745237  T
Q  343 cgaatttga 351  Q
    |||||||||    
T  7745238 cgaatttga 7745246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 5036667 - 5036509
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagc----act 238  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |  ||||  |||||||  ||||| ||||    | |    
T  5036667 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacaagacaacacaacatgcaagaggacacatcatcatcactaacagagctttaatt 5036568  T
Q  239 tggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttc 297  Q
    ||||||||  |||| ||||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  5036567 tggacggagagaccattttgatagacgtctgtaaaattcaaggactaaatagatatttc 5036509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 40339612 - 40339768
Alignment:
Q  149 ttagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatg 248  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||| || ||||||| ||||||||| ||||||    || |  ||||||   ||||||||||  ||||| | | |    
T  40339612 ttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacaggtgtacatgacaacacaacatgcaaaaggatacatcatcactactaacggagcttttggatgaagg 40339711  T
Q  249 gacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  40339712 gaccattttgatggacatctgtaaaattcatggactaaatagatatttcacataatt 40339768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 42941992 - 42941784
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||| |||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||| |  ||||  |||||    |||||||||   |||||    
T  42941992 atcaatttagtccttgtacatgtggctgccttgttgacacgtgtacctgacaacacaacatgcaagaggacacatcatctccactaacggagattttgga 42941893  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 342  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||| || |||| |  || ||||||   |||  | | ||||||||||||    
T  42941892 cggagggactattttgatggacatctgtaaaattcagggactaaataaatatttctcaaaattcagggacgaatttggctgattttttaaaattcaagga 42941793  T
Q  343 cgaatttga 351  Q
    |||||||||    
T  42941792 cgaatttga 42941784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 270 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 33158747 - 33158659
Alignment:
Q  270 acaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 358  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |   |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  33158747 acaaattcaaggattaaattgatatttcgcataattgaataatgaatttgagccacctataaaaattcaaggacgaagttgatgattca 33158659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 33368864 - 33368762
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 355  Q
    ||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  |  ||   |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  33368864 ttgattgacatttaacaaattcaaggattaaattgatatttcgcataattgagagatgaattcgaccgattcgtaaaaattcaaagacgaatttgatgat 33368765  T
Q  356 tca 358  Q
    |||    
T  33368764 tca 33368762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 37524963 - 37524873
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaa 346  Q
    ||||| ||||| | |||||||||| || || ||||||||||| |||||||||  ||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||    
T  37524963 ttgattgacatttaacaaattcagagattagattgatatttcacataattaagggatgaatttgaccgacccgtaaaaattcaaggacgaa 37524873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 42894881 - 42894784
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatg 353  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||  | |||| || ||||||||| ||| || ||||||    
T  42894881 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcataattaagggacgaatttggtcgacccgtgaaaattcaaagacaaagttgatg 42894784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 197
Target Start/End: Original strand, 15145664 - 15145722
Alignment:
Q  139 ttcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaaca 197  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  15145664 ttcaatcaaattggtccttgtacatgtggcttccttgtcgacacgtgtacaagacaaca 15145722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 27691372 - 27691210
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||  |||  || |||||||||| ||||||| |||||||| |  | ||  ||||||    | ||||| |  |||||    
T  27691372 atcaatttagtccttgtacacgtggctgacttgctgacacgtgtacaggacaacaaagcatgcaagaagccacatcatcactattgacggaccttttgga 27691273  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||| ||||   |||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  27691272 cggagggacggatttgatggacgtctgtaaaattcagggactaatttgatatttcgcaaaatt 27691210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 40019261 - 40019159
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 355  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  || ||| ||    |||| |||||||||||| |||||| |||||| |    
T  40019261 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcataattgagggacgaagttggccgacccgtaaaaattcaaagacgaagttgatgat 40019162  T
Q  356 tca 358  Q
    |||    
T  40019161 tca 40019159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 461281 - 461184
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatg 353  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |  |||||||||    |||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  461281 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgttatttcacataattgagggatgaatttggccgacccgtgaaaattcaaggacgaagttgatg 461184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 199
Target Start/End: Original strand, 28433643 - 28433699
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacaca 199  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  28433643 atcaatttagtccatgtacacgtggcttcctttttcccacgtgtacaagccaacaca 28433699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 91
Target Start/End: Original strand, 37525843 - 37525879
Alignment:
Q  55 gaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaa 91  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37525843 gaaggaggtatgggtaatgcatgggcaaaatgggaaa 37525879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 215
Target Start/End: Original strand, 11722732 - 11722787
Alignment:
Q  160 acacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacat 215  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||    
T  11722732 acacgtggcttccttgttgacacgtgtacaacacaacacaacatgcaagacgacat 11722787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 33748437 - 33748330
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 355  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || || ||| ||    |||| || |||||||| ||||||| |||||| |    
T  33748437 ttgattgacatttaacaaattcaggaattaaattgatatttcgcataattgaaggacgaagttggccgacccgtgaaaattcagggacgaagttgatgat 33748338  T
Q  356 tcaatcgt 363  Q
    ||| ||||    
T  33748337 tcactcgt 33748330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 318
Target Start/End: Original strand, 25707287 - 25707349
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaattt 318  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  25707287 ttgattgacgtctcacaaattcagggattaagttgatatttcgcataattgagggatgaattt 25707349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 305
Target Start/End: Original strand, 9186631 - 9186680
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||||| ||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9186631 ttgattgacatatgccaaatttagggactaatttgatatttcgcataatt 9186680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 9672066 - 9671989
Alignment:
Q  272 aaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaattt 349  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |  || |||||| |||||   || |||||||||||||||||||    
T  9672066 aaattcggggactaaatagatatttcgcaaaattcatggacgaatttgattgattggtgaaaattcaaggacgaattt 9671989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 11031534 - 11031485
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  11031534 ttgattgacatatgacaaactcaggaactaatttgatatttcgcataatt 11031485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 24527001 - 24526952
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  24527001 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcacataatt 24526952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 305
Target Start/End: Original strand, 25373608 - 25373657
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  25373608 ttgattgacgtctgacaaattcaggaattaagttgatatttcgcataatt 25373657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 31199576 - 31199539
Alignment:
Q  270 acaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaa 307  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  31199576 acaaattcagggattaaattgatatttctcataattaa 31199539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 305
Target Start/End: Original strand, 31823462 - 31823511
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||||| ||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31823462 ttgattgacatttaacaaatttagggattaaattgatatttcgcataatt 31823511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 305
Target Start/End: Original strand, 32824257 - 32824306
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||||| ||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  32824257 ttgattgacatttaacaaattcagtgattaaattgatatttcgcataatt 32824306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Original strand, 9876548 - 9876612
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaa 320  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||    
T  9876548 ttgattgacatttaacaaattcaggtattaaattgatattttgcataattaagggatgaagttaa 9876612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 33)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 47 - 358
Target Start/End: Original strand, 18728414 - 18728723
Alignment:
Q  47 aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaactggac-ttttccaattcaatc 145  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||          |||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  18728414 aatgtgaagaaggaggtatgggtaatgcaggggtaaaatgggaaaagcagaaaaaaa---taaactgaaaagtgaaaactcaacattttccaattcaatc 18728510  T
Q  146 aaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacgg 245  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  18728511 aaattagtcccttaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcaaggtgacagatcagcaaggctaacagagcacttggacgg 18728610  T
Q  246 atggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacga 345  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||| ||    |||  || |||||||| ||||||    
T  18728611 agggacctttttgatggacgtctgacaaattcagggactaagttgatatttcgcataattaagggacgaagttggccgacaagtgaaaattcagggacga 18728710  T
Q  346 atttgatggttca 358  Q
    |||||||||||||    
T  18728711 atttgatggttca 18728723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 24 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 32087852 - 32087517
Alignment:
Q  24 ggtcaaggatgtttttgatgttt---aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtg 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||          |||| |||||||||    
T  32087852 ggtcaaggacgtttttgatgttctgaaatgtgaagaaggaggtatgggtaatataggggcaaaatgggaaaaacagaaaaaaa---taaactgaaaagtg 32087756  T
Q  121 aaaactggac-ttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtca 219  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |  |||    
T  32087755 aaaactcaacattttccaattcaatcaaattagtccctgaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaagacaacacagcatgcaaggcgatagatca 32087656  T
Q  220 tcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaattta 319  Q
     || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||| ||     
T  32087655 gcaaggctaacagagcacttggacggagggacctttttgatggacgtctgaaaaattaagggactaagttgatatttcgcataattaagggacgaagttg 32087556  T
Q  320 attgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 358  Q
    || |||  || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  32087555 atcgacgcgtgaaaattcagggacgaatttgatggttca 32087517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 55 - 358
Target Start/End: Original strand, 38177911 - 38178214
Alignment:
Q  55 gaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaactggacttttc-caattcaatcaaattagt 153  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||| ||||||||||||| || ||||||  ||| |||||||| |||||    
T  38177911 gaaggaagtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagaaaaaaaat-taaactgaaaagtgaaaattgaacttttttcaaatcaatcaagttagt 38178009  T
Q  154 ccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacct 253  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  38178010 ccttgaacacgtgacttcctttttgctacgtgtacaagacaacacagcatgcaggacgacatatcagcatggctaacggagcacatggacgaagggacct 38178109  T
Q  254 ttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatg 353  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |  |||| || |||||| |||||||||||||||     
T  38178110 ttttgatggacgtctgacaaattcagatactaaattgatatttcgcataattgagggatgaatttgaccgacccgtgaaaatttaaggacgaatttgata 38178209  T
Q  354 gttca 358  Q
    |||||    
T  38178210 gttca 38178214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 55 - 358
Target Start/End: Original strand, 38205135 - 38205438
Alignment:
Q  55 gaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaactggacttttc-caattcaatcaaattagt 153  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||| ||||||||||||| || ||||||  ||| |||||||| |||||    
T  38205135 gaaggaagtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagaaaaaaaat-taaactgaaaagtgaaaattgaacttttttcaaatcaatcaagttagt 38205233  T
Q  154 ccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacct 253  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  38205234 ccttgaacacgtgacttcctttttgctacgtgtacaagacaacacagcatgcaggacgacatatcagcatggctaacggagcacatggacgaagggacct 38205333  T
Q  254 ttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatg 353  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |  |||| || |||||| |||||||||||||||     
T  38205334 ttttgatggacgtctgacaaattcagatactaaattgatatttcgcataattgagggatgaatttgaccgacccgtgaaaatttaaggacgaatttgata 38205433  T
Q  354 gttca 358  Q
    |||||    
T  38205434 gttca 38205438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 112 - 358
Target Start/End: Original strand, 43317934 - 43318181
Alignment:
Q  112 tgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggc 210  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  43317934 tgaaaagtgaaaactgaaatttttccactttcatcaaattagtccttgaacacgtggcttcctttttgccacatgtacaagacagcacaacatgctgggc 43318033  T
Q  211 gacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaag 310  Q
    ||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |    
T  43318034 gacatatcggcatggctaacagagcacttggacggagggaccttttttatggacgtctgacaaattcagggactaagttgatatttcgcataattgaggg 43318133  T
Q  311 atgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 358  Q
    |||| |||    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43318134 atgattttggccgacccataaaaattcaaggacgaatttgatggttca 43318181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 47 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 33256711 - 33256403
Alignment:
Q  47 aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaactggac-ttttccaattcaatc 145  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||  |          |||| |||||||||||||||  || |||| ||||||||||    
T  33256711 aatgtgaagaaggaggtatgggtaatgcacggaaaaaatgggaaaaggggaaaaaa----taaactgaaaagtgaaaactcaacatttttcaattcaatc 33256616  T
Q  146 aaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacgg 245  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||  ||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  33256615 aaattagtccctgaacacgtggcttccttcttgccactcgtacaagacaacacagcatgcaaggtgacagatcagcaaggctaacggaggacttggacgg 33256516  T
Q  246 atggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacga 345  Q
    | |||| |||||||||||| |||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||| || |||||| ||    ||| |||||||||||| ||||||    
T  33256515 agggacttttttgatggacgtctgacaaattcaaagattaagttgatatttcgcataattgaaggatgaagttggccgacgtgtaaaaattcagggacga 33256416  T
Q  346 atttgatggttca 358  Q
    |||||||||||||    
T  33256415 atttgatggttca 33256403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 47 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 35395642 - 35395336
Alignment:
Q  47 aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatc 145  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||           |||| |||||||| ||| |   |||||| |||||||||||    
T  35395642 aatgtgaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaataggaaaagca---aaaaataataaattgaaaagttaaa-cgcaactttttccaattcaatc 35395547  T
Q  146 aaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacgg 245  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  35395546 aaattagtccctgaacatgtggcttccttcttgccacgcgtacaagacaacac--catgcaaggcgacatatcagcatggctaacagagcacttggacgg 35395449  T
Q  246 atggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacga 345  Q
    | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  || ||| ||    ||| ||| |||||||| ||| ||    
T  35395448 agggacctttttgatggacgtctaacaaattcaggaactaaattgatatttcgcataattgagggacgaagttggccgacgtgtgaaaattcagggatga 35395349  T
Q  346 atttgatggttca 358  Q
    |||||||||||||    
T  35395348 atttgatggttca 35395336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 112 - 358
Target Start/End: Original strand, 35292256 - 35292502
Alignment:
Q  112 tgaaaagtgaaaactggacttttc-caattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggc 210  Q
    |||||||||||||||||| ||||  || ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||    
T  35292256 tgaaaagtgaaaactggaattttttcactttcatcaaattagtccttgaacacgtagcttcctttttgccacgtgtacaagacagcacaacatgttgggc 35292355  T
Q  211 gacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaag 310  Q
    ||||  |||  || |||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |    
T  35292356 gacagatcagaatagctaacggagcatttggacggaggaaccttttttatggacgtctgacaaattcagggactaagttgatatttcgcataattgaagg 35292455  T
Q  311 atgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 358  Q
    ||| ||||     |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35292456 atg-attttggccacccataaaaattcaaggacgaatttgatggttca 35292502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 149 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 38597157 - 38597012
Alignment:
Q  149 ttagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatg 248  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||| || |    
T  38597157 ttagtccttgaacacgcggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacagatcagcacggctaacggaacacttggacagagg 38597058  T
Q  249 gacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatat 294  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  38597057 gacctttttgatggacgtctgacaaattaagggactaagttgatat 38597012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 17574535 - 17574374
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||   ||||||||||  |||||    
T  17574535 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacaagacaacacagcatgcaagg-gacacgtcatcaccactaacggagcttttgga 17574437  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17574436 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 17574374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 301
Target Start/End: Original strand, 32838327 - 32838567
Alignment:
Q  55 gaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaactggacttttccaattcaatcaaattagtc 154  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          | ||||||||| ||||  ||    |||||||| ||| |||||||| ||    
T  32838327 gaaggaagtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcaggaaaaaa---ttaagtgaaaattgaa--ct----ttttccaaatcattcaaattattc 32838417  T
Q  155 cttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||| ||  ||||||    
T  32838418 cttgaacacgtggcttccttcttgctatgtgtacaagacaacacagcatgtaggacgacatatcaacatgactaacggagcactttgacagaaagacctt 32838517  T
Q  255 t---ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcat 301  Q
    |   || |||| | ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  32838518 ttaattaatggtcgtctgacaaattcagaaattaagttgatatttcgcat 32838567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 143 - 318
Target Start/End: Original strand, 30468186 - 30468361
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |  |||| |||||||   ||||||||||  |||||    
T  30468186 atcaaattagtccttgtacacgtggttgccttgttgacacgtgtacatgacaacacaacatgcaagaggacacgtcatcaccactaacggagcttttgga 30468285  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaattt 318  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| | ||| ||||||    
T  30468286 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcaaggactaaatagatatttcgcaaaattgagagacgaattt 30468361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 7268060 - 7267899
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||  || |||| |||||||   ||||||||||  |||||    
T  7268060 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacaagacaacacatcatgcgagg-gacacgtcatcaccactaacggagcttttgga 7267962  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  7267961 cggagggatcattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 7267899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 224 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 38597005 - 38596871
Alignment:
Q  224 ggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattg 323  Q
    |||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  || ||||||    |    
T  38597005 ggctaacggaacacttggacagaaagacctttttgatggacgtctaacaaattcagggactaagttgatatttcgcataattgagggacgaatttggccg 38596906  T
Q  324 acctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 358  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38596905 acccataaaaattcaaggacgaatttgatggttca 38596871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 143 - 351
Target Start/End: Original strand, 18624914 - 18625122
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||| |  ||||  ||||||   ||||||||||  |||||    
T  18624914 atcaaattagtccttgtacacgtggttgccttgttgacacgtgtataagacaacacaacatgcaagaagacacatcatcactactaacggagcttttgga 18625013  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 342  Q
    |||| ||||| |||||||||||   ||  ||||||||||||||||| |||||||| || |||| |  || |||||||  ||| | || ||||||||||||    
T  18625014 cggaaggaccattttgatggacgagtgtaaaattcagggactaaatagatatttcacaaaattcagggacgaatttagctgatcagtgaaaattcaagga 18625113  T
Q  343 cgaatttga 351  Q
    |||||||||    
T  18625114 cgaatttga 18625122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 143 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 2180005 - 2179851
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||||||||||   |||| |||||  |||||    
T  2180005 atcaaattagtccttgtacatgtggctgccttgttgacacgtgtacatgacaacacaacatgcaagaggacatgtcatcaccactaatggagcttttgga 2179906  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttc 297  Q
    |||| ||||| ||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  2179905 cggagggaccattttgatggatgtctgtaaaattcagggattaaatagatatttc 2179851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 143 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 8539893 - 8539685
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||   |||||   ||||||||||  |||||    
T  8539893 atcaatttagtccttgcacacgtggctgccttgttgacacgtgtacatgacaacacaacatgcaagaggacacaccatcaacactaacggagcttttgga 8539794  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 342  Q
     |||  |||  ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  | |||||| |||||  | | ||||||||||||    
T  8539793 tggagcgactattttgatggacgtttgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaattcaagaacgaatttgattgatttttcaaaattcaagga 8539694  T
Q  343 cgaatttga 351  Q
    |||||||||    
T  8539693 cgaatttga 8539685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 146 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 24496958 - 24496799
Alignment:
Q  146 aaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacgg 245  Q
    ||||| ||||||| |||| || ||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||  ||| ||    |||| || || ||||||||    
T  24496958 aaattggtccttgtacacatgacttccttgttgacacgtgtacgagacaacatagcatgcaggacgacagatcagcaatagtaacagaacatttggacgg 24496859  T
Q  246 atggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  24496858 atggaccattttgatgaacgtctcacaaattcagggattaatttgatatttcacataatt 24496799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 34327853 - 34327691
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| || |||||| |  ||||  ||||||   ||||| ||||  |||||    
T  34327853 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacatgacaacgcaacatgcaagaggacacatcatcaccactaacagagcttttgga 34327754  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||||  |||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  34327753 cggagagaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 34327691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 150 - 305
Target Start/End: Original strand, 36057526 - 36057681
Alignment:
Q  150 tagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatgg 249  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||  ||||||    |||||||||  ||||||||| ||    
T  36057526 tagtccttgtacatgtggctgccttgttgacacgtgtacatgacaacacaacatgcaagatgacacatcatcaccattaacggagcttttggacggaggg 36057625  T
Q  250 acctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||| ||||||||||| ||||  |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  36057626 accattttgatggacgtctgtaaaattcagggtctaaatagatatttcgcaaaatt 36057681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 272 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 32835965 - 32835879
Alignment:
Q  272 aaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 358  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||| |  |||| || |||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  32835965 aaattcagggattaaattgatatttcgcataattaagggacgaatttgaccgacccgtgaaaattcagggacgaagttgatgattca 32835879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 353
Target Start/End: Original strand, 33257746 - 33257843
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatg 353  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||| ||    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  33257746 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcataattaagggacgaagttggccgacccgtaaaaattcagggacgaagttgatg 33257843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 358
Target Start/End: Original strand, 32089911 - 32090013
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 355  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  || ||| ||    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  32089911 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcataattgagggacgaagttggccgacccgtaaaaattcagggacgaagttgatgat 32090010  T
Q  356 tca 358  Q
    |||    
T  32090011 tca 32090013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 43316885 - 43316823
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaattt 318  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  43316885 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcatagttgaaggatgaattt 43316823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 85
Target Start/End: Original strand, 43317844 - 43317913
Alignment:
Q  15 gaggtgaaaggtcaaggatgtttttgatgtttaatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaat 85  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43317844 gaggagaagggtcaaggatgtttttga-gtggaatgtgaggaaggaggtatgggtaatacaggggcaaaat 43317913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 256 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 18726670 - 18726621
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18726670 ttgattgacatttaacaaattaagggactaaattgatatttcgcataatt 18726621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 270 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 38176723 - 38176686
Alignment:
Q  270 acaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaa 307  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38176723 acaaattcagggattaaattgatatttcgcataattaa 38176686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 270 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 38203947 - 38203910
Alignment:
Q  270 acaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaa 307  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38203947 acaaattcagggattaaattgatatttcgcataattaa 38203910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 305
Target Start/End: Original strand, 40330515 - 40330550
Alignment:
Q  270 acaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40330515 acaaattcagggattaaattgatatttcgcataatt 40330550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 255 - 305
Target Start/End: Original strand, 24541230 - 24541280
Alignment:
Q  255 tttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  24541230 tttgatggacgtctgtaaaattcagggactaatttgatatttcgcaaaatt 24541280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 42619394 - 42619292
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 355  Q
    ||||| ||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |  || ||| || |  |||| || |||||||| ||||||| |||||| |    
T  42619394 ttgattgacatttaacaaattctgggattaaattgatatttcgcataattgagggacgaaattgaccgacccgtgaaaattcagggacgaagttgatgat 42619295  T
Q  356 tca 358  Q
    |||    
T  42619294 tca 42619292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 305
Target Start/End: Original strand, 24498053 - 24498102
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  24498053 ttgattgacatatgacaaattcagggactaatttgatttatcgcataatt 24498102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 298
Target Start/End: Original strand, 29621782 - 29621842
Alignment:
Q  238 ttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcg 298  Q
    ||||||||| ||||   |||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  29621782 ttggacggagggactgatttgatggacgtctgcaaaattcagggactaatttgatatttcg 29621842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 49)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 47 - 358
Target Start/End: Original strand, 44558303 - 44558614
Alignment:
Q  47 aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaactggacttttccaa-ttcaatc 145  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||           |||  ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  44558303 aatgtaaagaaggaggtatgggtaatgcaggggaaaaatgggaaaagcagaaagaaaaaa-aaaccgaaaagtgaaaactgaactttttcaaattcaatc 44558401  T
Q  146 aaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacgg 245  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  44558402 aaatgagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaagacaacagagcatgcatggtgacagatcagcatggctaacatagcacttggacgg 44558501  T
Q  246 atggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacga 345  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||    |||| || |||||||||||||||    
T  44558502 aaggacctttttgatggacgtctgacaaattcagggactaagttgatatttcgcataattgagggatgaatttggccgacccgtgaaaattcaaggacga 44558601  T
Q  346 atttgatggttca 358  Q
    | |||||||||||    
T  44558602 agttgatggttca 44558614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 61 - 358
Target Start/End: Original strand, 51041758 - 51042051
Alignment:
Q  61 ggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51041758 ggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagaaaaaa----taaactgaaaagtgaaagctagactttttccaattcaatcaaattagtccttga 51041853  T
Q  160 acacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttga 259  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  51041854 acatgtggcttccttcttgccacgtgtataagacaacacaacatgcagggcgacagatcagcatggctaacaaagcacttggatggagggacctttttga 51041953  T
Q  260 tggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 358  Q
    | ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |  ||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  51041954 t-gacgtctgacaaattcatggactaagttgatatttcacataattgagggatgaatttgaccgacctgtaaaaatttaaggacgaatttgacggttca 51042051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 47 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 35996376 - 35996119
Alignment:
Q  47 aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatc 145  Q
    ||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||          |||| ||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||    
T  35996376 aatgtgaagaaggaggaatatgtaatgcaggggcaaaatggaaaaagcaggaaaacaa--taaattgaaaagtgaaaagtgatctttttccaattcaatc 35996279  T
Q  146 aaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacgg 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35996278 aaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacaacatgcatggcgacatgtcagcatggctaacggagcacttggacgg 35996179  T
Q  246 atggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  35996178 agggacctttttgatggacgtctgataaattcagggattaaattgatattttgcacaatt 35996119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 137 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 27625030 - 27624816
Alignment:
Q  137 aattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagca 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||  ||| |||||||||| |||||    
T  27625030 aattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacacgtacaagacaacaaagcatgcatggcgacagatcaacatggctaacagagca 27624931  T
Q  237 cttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaatt 336  Q
    ||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |   ||| |||||||||    
T  27624930 ctttgacggaatgacctttttgatggacgtctgacaaattcagggactaagttgatatttcgcataattgaaagatgaatttgaccaacccgtaaaaatt 27624831  T
Q  337 caaggacgaatttga 351  Q
    ||||| |||| ||||    
T  27624830 caagggcgaagttga 27624816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 25 - 305
Target Start/End: Original strand, 2350292 - 2350575
Alignment:
Q  25 gtcaaggatgtttttgatgttt--------aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||        ||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||          |||| |||||    
T  2350292 gtcaaggatgtttttgatgtttctaactgaaatgtgaagaaggaggaatatgtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcaggaaaaaaa--taaattgaaa 2350389  T
Q  117 agtgaaaactggacttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaaga---caacacagcatgcagggcgac 213  Q
    ||||||  ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||    
T  2350390 agtgaa--ct----ttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagagtacaacacagcatgcagagcgac 2350483  T
Q  214 atgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  2350484 atgtcagcatggctaacggagcacttggacagagggacctttttgatgaacgtctgataaattcagagattaaattgatatttcgcataatt 2350575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 54 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 2827709 - 2827460
Alignment:
Q  54 agaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaactggac-ttttccaattcaatcaaattag 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||          |||| |||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||    
T  2827709 agaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaaggagaaaaaaa---taaactgaaaagtgaaaactcaacatttttcaattcaatcaaattag 2827613  T
Q  153 tccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacc 252  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||  ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  2827612 tccctgaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaagacaacacatcatgcaagacgacagatcagcaaggctaacggaggacttggacggagggacc 2827513  T
Q  253 tttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  2827512 tttttgatggacgtctgacaaattcaaggactaagttgatatttcacataatt 2827460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 68 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 47942103 - 47941814
Alignment:
Q  68 gtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtg 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||           |||| |||||| |||||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  47942103 gtaatgcaggggcaaaatgggaaaagca--cgaaaaaattaaattgaaaaatgaaaagtgaactttttccaaatcaatcaaattcgtccttgaacacgtg 47942006  T
Q  167 gcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacat 266  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||| |    
T  47942005 gcttccttcttgccacgcgtacaagacagcacaacatgcaaggcgacatgtcagcatggctaacggagcccgttaacggagggacctttttgatggacgt 47941906  T
Q  267 ctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 358  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |  |||| ||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  47941905 ctgataaattcagggattaaattgatatttcgcataattgagagacgaatttgaccgacccgtaaaaattcagggactaaattgatggttca 47941814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 47 - 358
Target Start/End: Original strand, 44794571 - 44794881
Alignment:
Q  47 aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatc 145  Q
    ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||           |||| |||||| |||||| || |||||| |||| ||||||    
T  44794571 aatgtgaagaaggaggaatatgtaatgcaggggcaaaatgggaaaagca--cgaaaaaattaaattgaaaaatgaaaagtgaactttttccaaatcaatc 44794668  T
Q  146 aaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacgg 245  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |  ||||    
T  44794669 aaattcgtccctgaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaagacatcacagcatgcaaggcgacatgtcagcatggctaacggagcccgttaacgg 44794768  T
Q  246 atggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacga 345  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  || |||||| |  ||| ||| |||||||| |||| |    
T  44794769 agggacctttttgatggacgtctgataaattcagggattaaattgatatttcgcataattgagggacgaatttgaccgacgtgtgaaaattcagggacta 44794868  T
Q  346 atttgatggttca 358  Q
    | |||||||||||    
T  44794869 aattgatggttca 44794881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 362 - 498
Target Start/End: Original strand, 27296518 - 27296654
Alignment:
Q  362 gtaatcattaaagattgctcttgatgatatggatcccacaagatatggctataatttggagggattgttctcccattctccttctcgagaattcttacat 461  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27296518 gtaatcattaaggattgctcttgatgatatggatcccacaagatatggccataatttggagggattgttctcccattctccttctcgagaattcttacat 27296617  T
Q  462 gtggatagaaattgacatctttaaattgtatatataa 498  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27296618 gtggatagaaattgacatctctaaattgtatatataa 27296654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 143 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 4519594 - 4519379
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||    
T  4519594 atcaaattagtccttgaacacgtgactttctttttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacagatcagcatggctaacggagcatttgga 4519495  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 342  Q
    |||| |||||||||||||| |  ||| |||||||||  | ||||  ||||||||||||||||| |  |||||||||     ||| |||||||||||||||    
T  4519494 cggagggacctttttgatgaatgtctaacaaattcaaaggctaagctgatatttcgcataattgagggatgaatttggccaaccggtaaaaattcaagga 4519395  T
Q  343 cgaatttgatggttca 358  Q
    |||||||||| |||||    
T  4519394 cgaatttgattgttca 4519379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 10762924 - 10762584
Alignment:
Q  25 gtcaaggatgtttttgatgttt--------aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||        ||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||           |||| |||||    
T  10762924 gtcaaggatgtttttgatgtttctgagtaaaatgtgaagaagaaggaatatgtaatgcaggggcaaaatgggaaaagca--cgaaaaaattaaattgaaa 10762827  T
Q  117 agtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacat 215  Q
    | |||||| || |||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||  ||||||||    
T  10762826 aatgaaaagtgaactttttccaaatcaatcaaattcgtccctgaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaggacagcacagcatgccaggcgacat 10762727  T
Q  216 gtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaa 315  Q
    |||| ||||||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |  ||  ||    
T  10762726 gtcagcatggctaacggagcccgttaacggagggacctttttgatggacgtctgacaaattcagggatgaaattgaaatttcgcataattgagggactaa 10762627  T
Q  316 tttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 358  Q
    |||    |||  || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  10762626 tttggccgacgcgtgaaaattcagggacgaatttgatggttca 10762584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 142 - 358
Target Start/End: Original strand, 10372611 - 10372827
Alignment:
Q  142 aatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgg 241  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  | |      
T  10372611 aatcaaattcgtccctgaacacgtggcttctttcttgccacgcgtacaagacagcacagcatgcaaggcgacatgtcagcatggctaacggagtccgtta 10372710  T
Q  242 acggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagg 341  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |  ||  |||||    |||  || |||||||| ||    
T  10372711 acggagggacctttttgatggacgtctgacaaattcagggatgaaattgatatttcgcataattgagggactaatttggccgacgcgtgaaaattcaggg 10372810  T
Q  342 acgaatttgatggttca 358  Q
    |||||||||||||||||    
T  10372811 acgaatttgatggttca 10372827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 143 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 51012143 - 51011936
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||   ||||| ||||  |||||    
T  51012143 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacaagacaacacatcatgcaagg-gacacgtcatcactactaacagagcttttgga 51012045  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 342  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||  | |||||| |  ||  | | ||||||||||||    
T  51012044 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagagactaaatagatatttcgcaaaattcaagaaagaatttgaccgattttttaaaattcaagga 51011945  T
Q  343 cgaatttga 351  Q
    |||||||||    
T  51011944 cgaatttga 51011936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Original strand, 2693159 - 2693320
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |  ||||  |||||||  |||| ||| |   ||||    
T  2693159 atcaaattagtccttgtacacgtggctgccttcttgacacgtgtacaggacaacacagcatgcaagatgacacatcatcatcactaatggaacttatgga 2693258  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | | |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||    
T  2693259 cggatggaccattttgatggacatttta-aaattcaaagactaaatagatatttcgcaaaatt 2693320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 41761658 - 41761814
Alignment:
Q  149 ttagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatg 248  Q
    |||||||||| ||||||| || |||| ||| |||||||||| || ||||||||||||| |  ||||  ||||||   |||||| |||  ||||||||| |    
T  41761658 ttagtccttgtacacgtgactgccttgttgacacgtgtacatgagaacacagcatgcaagaggacacatcatcaccactaacgaagcttttggacggagg 41761757  T
Q  249 gacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  41761758 gaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 41761814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 342
Target Start/End: Original strand, 48646653 - 48646852
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |||| ||| |||||||| | ||||||||| |||||| |  ||||  ||||||   |||||| |||  |||||    
T  48646653 atcaaattagtccttgtacacgtggttgccttgttgacacgtgtaaatgacaacacaacatgcaagaggacacatcatcaccactaacgaagcttttgga 48646752  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 342  Q
    |||| ||||| |||||||| |  ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  |||| || || |||||||  |||| | | ||||||||||||    
T  48646753 cggaaggaccattttgatgaaggtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgctaaattcaaggacgaatttagctgacttttgaaaattcaagga 48646852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 319
Target Start/End: Original strand, 35404351 - 35404527
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||||| ||||||||| |||| | |  |||| |||||||   ||||||||||  |||||    
T  35404351 atcaatttagtcattgtacacgtggctgtcttgttgacacatgtacatgacaacacaacatggaagaggacacgtcatcaccactaacggagcttttgga 35404450  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaattta 319  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||| |||| || || |||||||    
T  35404451 cggatggaccattttgttggacgtctgtaaaattcagggattaaataaatatttcgcaaaattgaaggacgaattta 35404527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 358
Target Start/End: Original strand, 39922993 - 39923095
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 355  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  || ||| ||    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  39922993 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcataattgagggacgaagttggccgacctgtaaaaattcagggacgaaattgatggt 39923092  T
Q  356 tca 358  Q
    |||    
T  39923093 tca 39923095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 204
Target Start/End: Original strand, 11255846 - 11255907
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatg 204  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11255846 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacaagacaacacagcatg 11255907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25993747 - 25993653
Alignment:
Q  112 tgaaaagtgaaaactggacttttc--caattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatg 204  Q
    |||||||||||||||| | |||||  || ||| |||||||| |||| || |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  25993747 tgaaaagtgaaaactgcaattttcatcatttccatcaaattggtccatgtacacgtggcttcattgttgacacgtgtacaagacaacacatcatg 25993653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 42980853 - 42980698
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||| ||  ||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||  ||||||   ||||| ||||  |||||    
T  42980853 atcaatttagtctttgtacacgtgactgtcttgttgacacgtgtacaggacaacacaacatgcaagaggacacatcatcaccactaacagagcttttgga 42980754  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcg 298  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| || ||||||    
T  42980753 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattaagggactaaatagaaatttcg 42980698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 53 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 27625097 - 27625059
Alignment:
Q  53 aagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaa 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27625097 aagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaa 27625059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 41781757 - 41781595
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| ||||| |||| |||| ||||| | || ||| |||  ||||| ||||||||| |||||| |  ||||  |||||||  ||||||||||  |||||    
T  41781757 atcaatttagttcttgtacacatggctgctttgttgacacacgtacatgacaacacatcatgcaagaggacacatcatcatcactaacggagcttttgga 41781658  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||| ||||| ||||||||||  ||||  |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||    
T  41781657 cggagggaccattttgatggatgtctgtaaaattcagggactaaataaatattttgcaaaatt 41781595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 43778494 - 43778392
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 355  Q
    ||||| ||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |  || ||| || |  |||| ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  43778494 ttgattgacatttaacaaatttagggattaaattgatatttcgcataattgagggacgaagttgaccgacccgtaaaaattcaaggacgaagttgatgat 43778395  T
Q  356 tca 358  Q
    |||    
T  43778394 tca 43778392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 49523342 - 49523180
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||| ||| ||||| || |  ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |  | ||  ||||||   ||||||||    |||||    
T  49523342 atcaatttagtctttgtacacgcggttgtcttgttgacacgtgtacaagacaacacaacatgcaagaaggcacatcatcaccactaacggattttttgga 49523243  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  49523242 cggagggaccattttgatgaacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 49523180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 283
Target Start/End: Original strand, 26296800 - 26296940
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||   |||||| | |||||  ||||||   ||||| || || |||||    
T  26296800 atcaaattggtccttgtatacgtggcttccttgtagacacgtgtacaagacaacatgacatgcaagacgacagctcatcaacactaacagatcatttgga 26296899  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggac 283  Q
     |||  |||  ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  26296900 tggaatgactattttgatggacgtttgacaaattcagggac 26296940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 27382335 - 27382284
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagaca 194  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  27382335 atcaaattagtccttgtacacgtggctttcttgttgacacgtgtacaagaca 27382284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 358
Target Start/End: Original strand, 39085138 - 39085240
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 355  Q
    ||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |  || ||| || |  |||| ||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  39085138 ttgattgacatttaacaaattcatggattaaattgatatttcgcataattgagggacgaagttgaccgacccgtaaaaattcagggacgaagttgatgat 39085237  T
Q  356 tca 358  Q
    |||    
T  39085238 tca 39085240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 50131380 - 50131326
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaaca 197  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  50131380 atcaaattagtccttgtacacgtgacttccttgtagacacgtgtacaagacaaca 50131326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 51040840 - 51040778
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaattt 318  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  51040840 ttgattgacatttaacaaattcagggattgaattgatatttcgcataattgaaggatgaattt 51040778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 318
Target Start/End: Original strand, 52868092 - 52868230
Alignment:
Q  180 cacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcag 279  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||    ||||||||||  ||||||| |  |||| ||||||| | | ||||  ||||||||    
T  52868092 cacgtgtacatgacaacacagcatgcaagaggacacgtcatcgccactaacggagcttttggacgaagtgaccattttgataggcgtctgttaaattcag 52868191  T
Q  280 ggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaattt 318  Q
     |||||||| ||||||||||| |||| | ||| ||||||    
T  52868192 agactaaatagatatttcgcaaaatttatagacgaattt 52868230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 95
Target Start/End: Original strand, 10372457 - 10372535
Alignment:
Q  25 gtcaaggatgtttttgatgttt--------aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagca 95  Q
    ||||||||||||||||||||||        ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10372457 gtcaaggatgtttttgatgtttctaagtaaaatgtgaagaaggaggaatatgtaatgcaggggcaaaatgggaaaagca 10372535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 112 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 11601921 - 11601745
Alignment:
Q  112 tgaaaagtgaaaactggactttt--ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcaggg 209  Q
    |||||||| ||||||| | ||||  ||| ||| |||||||||||||||  |||||||  | |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||| |     
T  11601921 tgaaaagttaaaactgcaatttttaccatttccatcaaattagtccttatacacgtgattgccttcttgacacgtgtacatgacaacacaacacgcaaga 11601822  T
Q  210 cgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaa 286  Q
     ||||  ||| |||  |||||| |||   ||||| || ||||  ||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  11601821 ggacacatcagcatcactaacgaagcttgtggacagagggactattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaa 11601745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 256 - 305
Target Start/End: Original strand, 27626714 - 27626763
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27626714 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcataatt 27626763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 5484737 - 5484678
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagca 202  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  5484737 atcaatttagtccctgtacacgtggctttctttttcccacgtgtacaagccaacacagca 5484678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 298
Target Start/End: Original strand, 13450970 - 13451041
Alignment:
Q  227 taacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcg 298  Q
    |||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  13450970 taacagagcatttggatggagggaccattttgatggacgtctgataaattcaaggactattttgatatttcg 13451041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 32652296 - 32652237
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagca 202  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||    
T  32652296 atcaatttagtccatgtacacgtggcttcctttttcccacgtgtataagccaacacagca 32652237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 202
Target Start/End: Original strand, 42880688 - 42880747
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagca 202  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  42880688 atcaatttagtccctgtacacgtggctttctttttcccacgtgtacaagtcaacacagca 42880747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 202
Target Start/End: Original strand, 43779794 - 43779853
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagca 202  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  43779794 atcaatttagtccctgtacacgtggctttctttttcccacgtgtacaagccaacacagca 43779853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 44793025 - 44792990
Alignment:
Q  270 acaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44793025 acaaattcagggattaaattgatatttcgcataatt 44792990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 42879380 - 42879278
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 355  Q
    ||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |  || ||| ||    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  42879380 ttgattgacatttaacaaattcatggattaaattgatatttcgcataattgagggacgaagttggccgacccgtaaaaattcagggacgaagttgatgat 42879281  T
Q  356 tca 358  Q
    |||    
T  42879280 tca 42879278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 44992913 - 44992811
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 355  Q
    ||||| ||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |  || ||| ||    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  44992913 ttgattgacatttaacaaactcagggattaaattgatatttcgcataattgagggacgaagttggccgacccgtaaaaattcagggacgaagttgatgat 44992814  T
Q  356 tca 358  Q
    |||    
T  44992813 tca 44992811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 230541 - 230492
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  230541 ttgatcgacatatgccaaattcagagactaatttgatatttcgcataatt 230492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 305
Target Start/End: Original strand, 2828397 - 2828446
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  2828397 ttgattgacatttaacaaattcaaggattaaattgatatttcgcataatt 2828446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 305
Target Start/End: Original strand, 39190805 - 39190854
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  39190805 ttgattgacatttaacaaattcacggattaaattgatatttcgcataatt 39190854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 44556725 - 44556676
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  44556725 ttgattgacatttaacaaattcatggactaaattgatatttcacataatt 44556676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 270 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 34460316 - 34460268
Alignment:
Q  270 acaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaattt 318  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  34460316 acaaatttagggattaaattgatattttgcataattaagagacgaattt 34460268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 39083836 - 39083780
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacaca 199  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||    
T  39083836 atcaatttagtccctgtacacgtggctttctttttcccacgtgtacaagccaacaca 39083780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 39189579 - 39189523
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacaca 199  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||    
T  39189579 atcaatttagtccctgtacacgtggctttctttttcccacgtgtacaagccaacaca 39189523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 118; Significance: 6e-60; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 68 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 29077620 - 29077331
Alignment:
Q  68 gtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtg 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||           |||| |||||| |||||| || |||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  29077620 gtaatgcaggggcaaaatgggaaaagca--cgaaaaaattaaattgaaaaatgaaaagtgaactttttccaaatcaatcaaattcgtccctgaacacgtg 29077523  T
Q  167 gcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacat 266  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||| |    
T  29077522 gcttccttcttgccacgcgtacaagacaacacagcatgcaaggcgacatgtcagcatggctaacggagcccgttaacggagggacctttttgatggacgt 29077423  T
Q  267 ctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 358  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |  ||  |||||    |||  || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  29077422 ctgacaaattcagggatgaaattgaaatttcgcataattgagggactaatttggccgacgcgtgaaaattcagggacgaatttgatggttca 29077331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 131 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 2968369 - 2968195
Alignment:
Q  131 ttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaac 230  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||| || |||||||    
T  2968369 ttttccaaatcaatcaaattcgtctctgaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaagacagcacaacatgcaaggcgacatgtcagcacggctaac 2968270  T
Q  231 ggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||||| | |  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2968269 ggagcccgttaacggatggacctttttgatggacgtctgataaattcagggattaaattgatatttcgcataatt 2968195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 29112643 - 29112356
Alignment:
Q  25 gtcaaggatgtttttgatgttt--------aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||||||        ||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||           |||| |||||    
T  29112643 gtcaaggatgtttttgatgtttctaagtaaaatgtgaagaagaaggaatatgtaatgcaggggcaaaatgggaaaagca--cgaaaaaattaaattgaaa 29112546  T
Q  117 agtgaaaactggactttt-ccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacat 215  Q
    | |||||| || |||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||  ||||||||    
T  29112545 aatgaaaagtgaactttttccaaatcaatcaaattcgtccctgaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaggacagcacagcatgccaggcgacat 29112446  T
Q  216 gtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||| ||||||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  29112445 gtcagcatggctaacggagcccgttaacggagggacctttttgatggacgtctgacaaattcagggatgaaattgaaatttcgcataatt 29112356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 47 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 4641668 - 4641358
Alignment:
Q  47 aatgtcaagaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaagcagnnnnnnnnnntaaagtgaaaagtgaaaactggactttt-ccaattcaatc 145  Q
    ||||| |||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||           |||| |||||| |||||| || |||||| |||| ||||||    
T  4641668 aatgtgaagaaggaggaatatgtaatgcaggggaaaaatgggaaaagca--cgaaaaaattaaattgaaaaatgaaaagtgaactttttccaaatcaatc 4641571  T
Q  146 aaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacgg 245  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| | |  ||||    
T  4641570 aaattcgtccctgaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaagacagcacagcatgcaaggaaacatgtcagcatggctaacggagcccgttaacgg 4641471  T
Q  246 atggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacga 345  Q
    | ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |  || ||||||    |||| || |||||||| |||| |    
T  4641470 agggacctttttgatggaggtctgataaattcagggattaaattgatatttcacataattgagggacgaatttggccgacccgtgaaaattcagggacta 4641371  T
Q  346 atttgatggttca 358  Q
    | |||||||||||    
T  4641370 aattgatggttca 4641358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Original strand, 3018338 - 3018500
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||| |  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  3018338 atcaaattcgtccctgaacatgtggcttccgtcttgccacgcgtacaagacaacacatcatgcaagacgatagatcaacatggctaacggagcacttgga 3018437  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
     ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3018438 tggagggacctttttgatggacgtctgacaaattcagggactaagttgatatttcgcataatt 3018500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 143 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 20523584 - 20523409
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||| |  ||||  ||||||   ||||| || |  |||||    
T  20523584 atcaatttagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacaggacaacacggcatgcaagaagacacatcatcaccactaacagaacttttgga 20523485  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaattt 318  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || || ||||||    
T  20523484 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaattcaaggacgaattt 20523409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 143 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 10568617 - 10568407
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||    ||||  ||||||   ||||||||||  |||||    
T  10568617 atcaaattagtccttgtacatgtggctgccttgttgacacgtgtacatgacaacacaacatgcaaaaggacacatcatcaccactaacggagcttttgga 10568518  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 342  Q
    |||| ||||  ||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||  |||| || || |||||| | |||  | | ||||||||||||    
T  10568517 cggagggactattttgatagacgtctgtaaaattcagggactaaataaatatttcgctaaattcaaggacgaatttgactgatttttgaaaattcaagga 10568418  T
Q  343 cgaatttgatg 353  Q
    |||||||||||    
T  10568417 cgaatttgatg 10568407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 160 - 305
Target Start/End: Original strand, 32439015 - 32439159
Alignment:
Q  160 acacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttggacggatggacctttttga 259  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||   ||||| || |  ||||||||| ||||| ||||||    
T  32439015 acacgtggctgccttgttgacacgtgtacaagacaacacatcatgcaagg-gacacgtcatcactactaacagatcttttggacggagggaccattttga 32439113  T
Q  260 tggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  32439114 tggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 32439159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 6899703 - 6899495
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |||| ||| |||||||||| || |||||| |||||| |  ||||  ||||||   ||||||||||  |||||    
T  6899703 atcaaattagtccttgtacacgtggttgccttgttgacacgtgtacatgataacacaacatgcaagaggacacatcatcaacactaacggagcttttgga 6899604  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaagga 342  Q
    || | ||||| ||||||||||  ||||  ||||| ||||||||||| |||||||| || |||| | ||| |||||| | |||  | | ||||||||||||    
T  6899603 cgaagggaccattttgatggatgtctgtaaaatttagggactaaatagatatttcacaaaatttagagacgaatttgactgatttttgaaaattcaagga 6899504  T
Q  343 cgaatttga 351  Q
    | |||||||    
T  6899503 caaatttga 6899495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 11355440 - 11355286
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |  |||| |||||||   ||| ||||||  |||||    
T  11355440 atcaaattagtccttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacatgacaacacaacatgcaagaggacacgtcatcaccactaccggagcttttgga 11355341  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttc 297  Q
    |||| ||||| ||||| ||| | ||||  ||||||||||| | ||| ||||||||    
T  11355340 cggagggaccattttggtggccgtctgtaaaattcagggagttaatagatatttc 11355286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 7049975 - 7049835
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||  ||||||   | ||||||||  |||||    
T  7049975 atcaaattagtccttgtacacgtggatgccttgttgacacgtgtacatgacaacacaacatgcaagaggacacatcatcaccacgaacggagcttttgga 7049876  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggac 283  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  7049875 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggac 7049835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 9398878 - 9398716
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||    ||||  ||||||   |||||||| |  |||||    
T  9398878 atcaatttagtccttgtacacgtggctgtcttgttgacacgtgtacaggacaacacaacatgcaaaatgacacatcatcaccactaacggaacttttgga 9398779  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||| ||||| |||||||| || |||   ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  9398778 cggagggaccattttgatgaacgtctataaaattcagggactaaatagatatttcgcaaaatt 9398716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 282
Target Start/End: Original strand, 14338381 - 14338520
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||    || |  |||||||   |||||||||  ||| |    
T  14338381 atcaaattggtccttgtacacgtggcttccttgttgacacgtgtacaggacaacacatcatgcaacaggatacatcatcatcagtaacggagcttttgaa 14338480  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcaggga 282  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  14338481 cggagggaccattttgatggacgtctgtgaaattcaggga 14338520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 30891342 - 30891167
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  || ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||  | || |   ||||  ||||| |||||    
T  30891342 atcaaattggtccttgtacacgtggcttgtttgttgacacgtgtacaagacaagactacatgcagggtgacaaattataagcactaatagagcatttgga 30891243  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaattt 318  Q
    |||| ||||   |||| ||||| ||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||| || ||| |||||    
T  30891242 cggagggactactttgttggacgtctgacaaattcagggactaaacgtatattttgcataatttaaggataaattt 30891167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24662709 - 24662615
Alignment:
Q  112 tgaaaagtgaaaactggacttttc--caattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatg 204  Q
    |||||||||||||||| | |||||  || ||| |||||||| | ||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  24662709 tgaaaagtgaaaactgaaattttcatcatttccatcaaattggcccttgtacacgtgtcttccttgttgacacgtgtacaagacaacacaacatg 24662615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 17950666 - 17950564
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggt 355  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  || ||| ||    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  17950666 ttgattgacatttaacaaattcagggattaaattgatatttcgcataattgagggacgaagttggccgacccgtaaaaattcagggatgaaattgatggt 17950567  T
Q  356 tca 358  Q
    |||    
T  17950566 tca 17950564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 55 - 92
Target Start/End: Original strand, 30641149 - 30641186
Alignment:
Q  55 gaaggaggtatgggtaatgcaggggcaaaatgggaaaa 92  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30641149 gaaggaggtatgagtaatgcaggggcaaaatgggaaaa 30641186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 270 - 358
Target Start/End: Original strand, 4646216 - 4646304
Alignment:
Q  270 acaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttgatggttca 358  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |  || ||||||||  || | ||||||||||| |||  || |||||||||||    
T  4646216 acaaatttagggattaaattgatatttcgcataattgatggacgaatttaaccgatccgtaaaaattcagggattaagttgatggttca 4646304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 179
Target Start/End: Original strand, 30641223 - 30641271
Alignment:
Q  131 ttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgc 179  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  30641223 ttttcaaattcaatcaaattagtcctcgaacatgtggctttcttcttgc 30641271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 305
Target Start/End: Original strand, 7372959 - 7373026
Alignment:
Q  238 ttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||  |||  |||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  7372959 ttggacggagggaccattttgatggacgcctgtaaaattcagggactaaataaatatttcgcaaaatt 7373026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 351
Target Start/End: Original strand, 9400035 - 9400114
Alignment:
Q  272 aaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgtaaaaattcaaggacgaatttga 351  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||| |||| || ||||||||| | |||  | | |||||||||||||||||||||    
T  9400035 aaattcggggactaattagatatttcgcaaaattcaaggatgaatttgactgatttttcaaaattcaaggacgaatttga 9400114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 305
Target Start/End: Original strand, 13613583 - 13613650
Alignment:
Q  238 ttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||||||||| ||||   |||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  13613583 ttggacggagggactaatttgatggacgtctgtaaaattcagggactaatttgatatttcgcaaaatt 13613650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 202
Target Start/End: Original strand, 17951969 - 17952028
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagca 202  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  17951969 atcaatttagtccctgtacacgtggctttctttttcccacgtgtacaagccaacacagca 17952028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 282
Target Start/End: Original strand, 25172015 - 25172154
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||   |||||||| | |||  ||| ||   |||| |||||| |||||    
T  25172015 atcaaattggtccttgtacatgtgacttccttgttgacacgtgtacaagacaacatgacatgcaggacaacaactcaacaatactaatggagcatttgga 25172114  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcaggga 282  Q
    |||| ||||  |||| |||||| | ||  |||||||||||    
T  25172115 cggaaggactatttttatggacgtttgttaaattcaggga 25172154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 202
Target Start/End: Original strand, 35175790 - 35175849
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagca 202  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  35175790 atcaatttagtccctgtacacgtggctttctttttcccacgtgtacaagccaacacagca 35175849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 32517095 - 32516974
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||| |||| ||  |||||||||| |||| |||| |||||| |   ||| |||||||   ||||||||||  |||||    
T  32517095 atcaatttagtccttatacacgtggctgccttgttaacacgtgtacatgacagcacatcatgcaagagaacacgtcatcaccactaacggagcttttgga 32516996  T
Q  243 cggatggacctttttgatggac 264  Q
    |||| ||||  |||||||||||    
T  32516995 cggagggacaattttgatggac 32516974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 3456871 - 3456811
Alignment:
Q  238 ttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcg 298  Q
    ||||||||| ||||   |||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  3456871 ttggacggagggactgatttgatggacgtctgcaaaattcagggactaatttgatatttcg 3456811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 131 - 358
Target Start/End: Original strand, 6528 - 6755
Alignment:
Q  131 ttttccaattcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaac 230  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  6528 ttttccaaatcaatcaaattcgtccctgaacacgtggcttccttcttgccacgcgtacaagacagcacagcatgcaaggtgacatgtcagcatggctaac 6627  T
Q  231 ggagcacttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaatttaattgacctgta 330  Q
    ||||| | |  ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |  || ||||||    |||| ||     
T  6628 ggagcccgttaacggagggacctttttgatggaggtctgataaattcagggattaaattgatatttcacataattgagggacgaatttggccgacccgtg 6727  T
Q  331 aaaattcaaggacgaatttgatggttca 358  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||    
T  6728 aaaattcagggactaaattgatggttca 6755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1454 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1454
Description:

Target: scaffold1454; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 143 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 1480 - 1327
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||   ||||||||||  |||||    
T  1480 atcaatttagtccttgtacacgtggttgccttgttgacacgtgtacaagacaacacagcatgcaagg-gatacgtcatcaccactaacggagcttttgga 1382  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttc 297  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1381 cggagggaccattttgatggacgtctgtaaaattcagggactaaatagatatttc 1327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0564 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0564
Description:

Target: scaffold0564; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 8478 - 8318
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcacttgga 242  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| | |||| |  |||| |||||||   |||||| |||  |||||    
T  8478 atcaatttagtacttgtacacgtggctgccttgttgacacgtgtacaagacaacacatcttgcaagaggacacgtcatcaccactaacgaagcttttgga 8379  T
Q  243 cggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    |||||| ||| ||||||||||| | |   ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  8378 cggatgtaccattttgatggacgtat--aaaattcagggactaaatagatattttgcaaaatt 8318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0129 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0129
Description:

Target: scaffold0129; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 4681 - 4556
Alignment:
Q  139 ttcaatcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacacagcatgcagggcgacatgtcatcatggctaacggagcact 238  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||   |||||||| |||||  ||| ||   ||||| || || |    
T  4681 ttcaatcaaattggtccttgtacacgtggcttccttgtagacacgtgtacaagacaacaagccatgcaggacgacaactcagcaacactaacagaacatt 4582  T
Q  239 tggacggatggacctttttgatggac 264  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||    
T  4581 tggacggaaggactattttgatggac 4556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 3417 - 3350
Alignment:
Q  238 ttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||||||||| ||||   |||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  3417 ttggacggagggacgaatttgatggacgtctgtaaaattcagggactaatttgatatttcgcaaaatt 3350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 4589 - 4522
Alignment:
Q  238 ttggacggatggacctttttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataatt 305  Q
    ||||||||| ||||   |||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  4589 ttggacggagggacgaatttgatggacgtctgtaaaattcagggactaatttgatatttcgcaaaatt 4522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1041 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 2)
Name: scaffold1041
Description:

Target: scaffold1041; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 2203 - 2141
Alignment:
Q  256 ttgatggacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaagatgaattt 318  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  2203 ttgattgacgtctgacaaatttagggattaagttgatatttcgcataattgagggatgaattt 2141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1041; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 311
Target Start/End: Original strand, 2883 - 2932
Alignment:
Q  262 gacatctgacaaattcagggactaaattgatatttcgcataattaaaaga 311  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  2883 gacatttgacaaattcaaggattaaattgttatttctcataattaaaaga 2932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 37422 - 37366
Alignment:
Q  143 atcaaattagtccttgaacacgtggcttccttcttgccacgtgtacaagacaacaca 199  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |||| ||| |||||||| | |||||||||    
T  37422 atcaaattagtccttgtacacgtggttgccttgttgacacgtgtaaaggacaacaca 37366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University