View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11582_low_11 (Length: 590)

Name: NF11582_low_11
Description: NF11582
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11582_low_11
NF11582_low_11
[»] scaffold0103 (2 HSPs)
scaffold0103 (121-571)||(26498-26948)
scaffold0103 (18-114)||(26929-27025)
[»] chr3 (4 HSPs)
chr3 (154-571)||(12899795-12900221)
chr3 (154-557)||(30683761-30684173)
chr3 (42-86)||(12900261-12900305)
chr3 (42-86)||(30683676-30683720)
[»] chr2 (4 HSPs)
chr2 (154-571)||(41895752-41896178)
chr2 (154-571)||(22634350-22634776)
chr2 (42-86)||(22634265-22634309)
chr2 (42-86)||(41895668-41895712)
[»] chr4 (4 HSPs)
chr4 (154-564)||(14932022-14932442)
chr4 (154-564)||(14941227-14941647)
chr4 (188-236)||(30627309-30627357)
chr4 (42-86)||(14941143-14941187)
[»] chr5 (10 HSPs)
chr5 (154-565)||(15321429-15321849)
chr5 (154-565)||(15330432-15330852)
chr5 (154-565)||(18707905-18708325)
chr5 (154-565)||(18716919-18717339)
chr5 (154-571)||(29958126-29958552)
chr5 (42-86)||(15321890-15321934)
chr5 (42-86)||(15330893-15330937)
chr5 (42-86)||(18707820-18707864)
chr5 (42-86)||(18716834-18716878)
chr5 (42-86)||(29958041-29958085)
[»] chr8 (4 HSPs)
chr8 (154-564)||(45489865-45490286)
chr8 (154-564)||(45498823-45499244)
chr8 (42-86)||(45490327-45490371)
chr8 (42-86)||(45499285-45499329)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (154-557)||(4321-4733)
scaffold0113 (54-86)||(4249-4281)
[»] chr1 (1 HSPs)
chr1 (154-232)||(19419390-19419468)


Alignment Details
Target: scaffold0103 (Bit Score: 395; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 121 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 26948 - 26498
Alignment:
Q  121 aaaggtttccaaaggaagggccattgatatcatgacaacacatcaaggtgaaagacaaattgcaatactatgatcccttggatattcactttttggtcac 220  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26948 aaaggtttacaaaggaagggccaatgatatcatgacaacacatcaaggtgaaagataaattgtaatactatgatcccttggatattcactttttggtcac 26849  T
Q  221 ctcacaacatgacaagaatagtaacatagtacaacaaaaggcttttctttgggctcaagacttatgctccagcaagaagtgataaagcaatgagctgcac 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  26848 ctcacaacatgacaagaatagtaacatagtacaacaaaaggcttttctttgggcttaagacttatgctccagcaagaaatgataaaacaatgagctgtac 26749  T
Q  321 aaagctcagctctcacgaagcaaacaaagaaatgcttcagcagaatttgagatcgatctcaattcatcataagaacagtttcatctcaaaggctccttta 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26748 aaagctcagctctcacgaagcaaacaaagaaatgcttcagcaggatttgagatcgatctcaattcatcttaagaacagtttcacctcaaaggctccttta 26649  T
Q  421 agacttgcgctacaagaaaaggagaagttaccaaaagttcctctgctataaatagaagacttcagcaagaggaagaaacaacttttgagcaaaagaaaaa 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26648 agacttgcgctacaagaaaaggagaagttaccaagagttcctctcctataaatagaagacttcagcaagaggaagaaacaatttttgagcaaaagaaaaa 26549  T
Q  521 gaatatattcatcaagcatctctttgtttacaaatcaatcaagaattatat 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26548 gaatatattcatcaagcatctctttgtttacaaatcaatcaagaattatat 26498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 27025 - 26929
Alignment:
Q  18 atcacaaggaaatattatattagct-actacatttgaacatatgaacaaaaagaacacatttaatatcatatggaacaaaaggtttacaaaggaaggg 114  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27025 atcacaaggaaatgttctattagcttactac-tttgaacatatgaacaaaaagaacacatttaatatcatatgcagcaaaaggtttacaaaggaaggg 26929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 4)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 154 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 12900221 - 12899795
Alignment:
Q  154 gacaacacatcaag-gtgaaagacaaattgcaatactatgatcccttggatattcactttttggtcacctcacaacatgacaagaatagtaacatagtac 252  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||    
T  12900221 gacaacacatcaagagtgtaagacaaata-caaaactatgaacctttggatattcactttatggtcacctcacaacatgacaagaa-agctacctagtac 12900124  T
Q  253 aacaaaaggcttttctttgggctcaagacttatgctccagcaagaagtgataaagcaatgagctgcacaaagctcagctctcacgaagcaa--------- 343  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| || | |||||| || ||||||||||  ||||||| |||||             
T  12900123 aagaaaagccttttctttgggctcaagacttatgttacagcaacaagtgaaaaggaaatgagttgtacaaagctcatgtctcacgtagcaagcaacaaag 12900024  T
Q  344 -acaaagaaatgcttcagcagaatttgagatcgatctcaattcatcataagaacagtttcatctcaaaggctcctttaagacttgcgctacaagaaaagg 442  Q
     |||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| |  | | | ||||||||||||||||||||||||  | |  |||||||| ||||||| |     
T  12900023 tacaaaggaaagcttcagcagatttagagatcgatctcaactt-tgaaaggaacagtttcatctcaaaggctcccatgattcttgcgctgcaagaaagga 12899925  T
Q  443 agaagttaccaaaagttcctctgctataaatagaagacttcagcaagaggaagaaacaacttttgagcaaaaga-aaaagaatatattcatcaagcatct 541  Q
    |||| ||| ||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| || |    
T  12899924 agaatttatcaagagtttttctcctataaatagaagacttcagcaagagagaaaaacaacttttgagcaaaagaaaaaagacaatattcatcaagaattt 12899825  T
Q  542 ctttgtttacaaatcaatcaagaattatat 571  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  12899824 ctttgtttacaaatcactcaagaactatat 12899795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 154 - 557
Target Start/End: Original strand, 30683761 - 30684173
Alignment:
Q  154 gacaacacatcaag-gtgaaagacaaattgcaatactatgatcccttggatattcactttttggtcacctcacaacatgacaagaatagtaacatagtac 252  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||| | || ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||  || ||||||    
T  30683761 gacaacacatcaagagtgtaagacaaata-caaaactataaacctttggatatttactttatggtcacttcacaacatgacaagaa-agctacctagtac 30683858  T
Q  253 aacaaaaggcttttctttgggctcaagacttatgctccagcaagaagtgataaagcaatgagctgcacaaagctcagctctcacgaagcaa--------- 343  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||             
T  30683859 aagaaaagccttttctttgggctcaagtcttatggtacagcaacaagtgaaaaggaaatgagctgtacaaagctcatgtctcacgtagcaagcaacaaag 30683958  T
Q  344 -acaaagaaatgcttcagcagaatttgagatcgatctcaattcatcataag-aacagtttcatctcaaaggctcctttaagacttgcgctacaagaaaag 441  Q
     |||||| || || |||||||| || |||||||||||||| |  ||  ||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| |    
T  30683959 tacaaaggaaagcctcagcagatttagagatcgatctcaact--tcgaaaggaacagtttcatctcaaaggctcccttgaaacttgcgctgcaagaaagg 30684056  T
Q  442 gagaagttaccaaaagttcctctgctataaatagaagacttcagcaagaggaagaaacaacttttgagcaaaaga-aaaagaatatattcatcaagcatc 540  Q
     |||| ||| ||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||| ||| ||     
T  30684057 aagaatttaacaagagtttttctcctataaatagaagacttcagcaagagagaaaaacaacttttgagaaaaagagaaaagataatattcattaagaatt 30684156  T
Q  541 tctttgtttacaaatca 557  Q
    |||||||||||||||||    
T  30684157 tctttgtttacaaatca 30684173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 12900305 - 12900261
Alignment:
Q  42 tactacatttgaacatatgaacaaaaagaacacatttaatatcat 86  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  12900305 tactacaaatgaacatatgaacaaaaagaacatatttaatgtcat 12900261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 86
Target Start/End: Original strand, 30683676 - 30683720
Alignment:
Q  42 tactacatttgaacatatgaacaaaaagaacacatttaatatcat 86  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  30683676 tactacaaatgaacatatgaacaaaaagaacatatttaatgtcat 30683720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 4)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 154 - 571
Target Start/End: Original strand, 41895752 - 41896178
Alignment:
Q  154 gacaacacatcaag-gtgaaagacaaattgcaatactatgatcccttggatattcactttttggtcacctcacaacatgacaagaatagtaacatagtac 252  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||    
T  41895752 gacaacacatcaagagtgtaagacaaata-caaaactatgaacctttggatattcactttatggtcacctcacaacatgacaagaa-agctacctagtac 41895849  T
Q  253 aacaaaaggcttttctttgggctcaagacttatgctccagcaagaagtgataaagcaatgagctgcacaaagctcagctctcacgaagcaa--------- 343  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||| || | ||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||             
T  41895850 aagaaaagccttttctttgggctcaagacttatgttacagcaacaaatgaaaaggaaatgagctgtacaaagctcatgtctcacgtagcaagcaacaaag 41895949  T
Q  344 -acaaagaaatgcttcagcagaatttgagatcgatctcaattcatcataagaacagtttcatctcaaaggctcctttaagacttgcgctacaagaaaagg 442  Q
     |||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |  | | | ||||||||||||||||||||||||  | |  |||||||| ||||||| |     
T  41895950 tacaaaggaaagcttcggcagatttagagatcgatctcaact-ttaaaaggaacagtttcatctcaaaggctcccatgattcttgcgctgcaagaaagga 41896048  T
Q  443 agaagttaccaaaagttcctctgctataaatagaagacttcagcaagaggaagaaacaacttttgagcaaaag-aaaaagaatatattcatcaagcatct 541  Q
    |||| ||| ||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||| || |    
T  41896049 agaatttatcaagagtttttctcctataaatagaagacttcagcaagagagaaaaacaacttttgagcaaaagaaaaaagacaatattcattaagaattt 41896148  T
Q  542 ctttgtttacaaatcaatcaagaattatat 571  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  41896149 ctttgtttacaaatcactcaagaactatat 41896178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 154 - 571
Target Start/End: Original strand, 22634350 - 22634776
Alignment:
Q  154 gacaacacatcaag-gtgaaagacaaattgcaatactatgatcccttggatattcactttttggtcacctcacaacatgacaagaatagtaacatagtac 252  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||    
T  22634350 gacaacacatcaagagtgtaagacaaata-caatactatgaacctttggatattcactttatggtcacctcacaacatgacaagaa-agctacctagtac 22634447  T
Q  253 aacaaaaggcttttctttgggctcaagacttatgctccagcaagaagtgataaagcaatgagctgcacaaagctcagctctcacgaagcaa--------- 343  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| || | |||||| || ||||||||||  ||||||| |||||             
T  22634448 aagaaaagccttttctttgggctcaagacttatgttacagcaacaagtgaaaaggaaatgagttgtacaaagctcatgtctcacgtagcaagcaacaaag 22634547  T
Q  344 -acaaagaaatgcttcagcagaatttgagatcgatctcaattcatcataagaacagtttcatctcaaaggctcctttaagacttgcgctacaagaaaagg 442  Q
     |||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| |  | | | |||||  |||||||||||||||||  | |  |||||||| ||||||| |     
T  22634548 tacaaaggaaagcttcagcagatttagagatcgatctcaact-ttaaaaggaacaaattcatctcaaaggctcccatgattcttgcgctgcaagaaagga 22634646  T
Q  443 agaagttaccaaaagttcctctgctataaatagaagacttcagcaagaggaagaaacaacttttgagcaaaag-aaaaagaatatattcatcaagcatct 541  Q
    ||||  || ||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||| || |    
T  22634647 agaatgtatcaagagtttttctcctataaatagaagacttcagcaagagagaaaaacaacttttgagcaaaagaaaaaagacaatattcattaagaattt 22634746  T
Q  542 ctttgtttacaaatcaatcaagaattatat 571  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  22634747 ctttgtttacaaatcacttaagaactatat 22634776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 86
Target Start/End: Original strand, 22634265 - 22634309
Alignment:
Q  42 tactacatttgaacatatgaacaaaaagaacacatttaatatcat 86  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22634265 tactacaaatgaacatatgaacaaaaagaacatatttaatgtcat 22634309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 86
Target Start/End: Original strand, 41895668 - 41895712
Alignment:
Q  42 tactacatttgaacatatgaacaaaaagaacacatttaatatcat 86  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  41895668 tactacaaatgaacatatgaacaaaaagaacatatttaatgtcat 41895712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 4)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 154 - 564
Target Start/End: Original strand, 14932022 - 14932442
Alignment:
Q  154 gacaacacatcaag-gtgaaagacaaattgcaatactatgatcccttggatattcactttttggtcacctcacaacatgacaagaatagtaacatagtac 252  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||    
T  14932022 gacaacacatcaagagtgaaagacaaata-caaaactatgaacctttggatattcactttatggtcacctcacaacatgacaagaa-agctacctagtac 14932119  T
Q  253 aacaaaaggcttttctttgggctcaagactt-atgctccagcaagaagtgataaagcaatgagctgcacaaagctcagctctcacgaagcaa-------- 343  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||| || ||| || | ||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||            
T  14932120 aagaaaagccttttctttgggctcaagacttaatgttacagcaacaaatgaaaaggaaatgagctgtacaaagctcatgtctcacgtagcaagcaacaaa 14932219  T
Q  344 --acaaagaaatgcttcagcagaatttgagatcgatctcaattcatcataagaacagtttcatctcaaaggctcctttaagacttgcgctacaagaaaag 441  Q
      |||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| |  | | | ||||||||||||||||| ||||||  | |  |||||||| ||||||| |    
T  14932220 gtacaaaggaaagcttcagcagatttagagatcgatctcaact-ttaaaaggaacagtttcatctcaacggctcccatgattcttgcgctgcaagaaagg 14932318  T
Q  442 gagaagttaccaaaagttcctctgctataaatagaagacttcagcaagaggaagaaacaacttttgagcaaaaga-aaaagaatatattcatcaagcatc 540  Q
     |||| ||| ||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||     
T  14932319 aagaatttatcaagagtttttctcctataaatagaagacttcagcaagtgagaaaaacaacttttgagcaaaagagaaaagacaatattcatcaagaatt 14932418  T
Q  541 tctttgtttacaaatcaatcaaga 564  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  14932419 tctttgtttacaaatcactcaaga 14932442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 154 - 564
Target Start/End: Original strand, 14941227 - 14941647
Alignment:
Q  154 gacaacacatcaag-gtgaaagacaaattgcaatactatgatcccttggatattcactttttggtcacctcacaacatgacaagaatagtaacatagtac 252  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||    
T  14941227 gacaacacatcaagagtgaaagacaaata-caaaactatgaacctttggatattcactttatggtcacctcacaacatgacaagaa-agctacctagtac 14941324  T
Q  253 aacaaaaggcttttctttgggctcaagactt-atgctccagcaagaagtgataaagcaatgagctgcacaaagctcagctctcacgaagcaa-------- 343  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||| || ||| || | ||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||            
T  14941325 aagaaaagccttttctttgggctcaagacttaatgttacagcaacaaatgaaaaggaaatgagctgtacaaagctcatgtctcacgtagcaagcaacaaa 14941424  T
Q  344 --acaaagaaatgcttcagcagaatttgagatcgatctcaattcatcataagaacagtttcatctcaaaggctcctttaagacttgcgctacaagaaaag 441  Q
      |||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| |  | | | ||||||||||||||||| ||||||  | |  |||||||| ||||||| |    
T  14941425 gtacaaaggaaagcttcagcagatttagagatcgatctcaact-ttaaaaggaacagtttcatctcaacggctcccatgattcttgcgctgcaagaaagg 14941523  T
Q  442 gagaagttaccaaaagttcctctgctataaatagaagacttcagcaagaggaagaaacaacttttgagcaaaaga-aaaagaatatattcatcaagcatc 540  Q
     |||| ||| ||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||     
T  14941524 aagaatttatcaagagtttttctcctataaatagaagacttcagcaagtgagaaaaacaacttttgagcaaaagagaaaagacaatattcatcaagaatt 14941623  T
Q  541 tctttgtttacaaatcaatcaaga 564  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  14941624 tctttgtttacaaatcactcaaga 14941647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30627357 - 30627309
Alignment:
Q  188 ctatgatcccttggatattcactttttggtcacctcacaacatgacaag 236  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  30627357 ctatgatcctttggatattctctttatggtcacctcacaacatgacaag 30627309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 86
Target Start/End: Original strand, 14941143 - 14941187
Alignment:
Q  42 tactacatttgaacatatgaacaaaaagaacacatttaatatcat 86  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  14941143 tactacaaatgaacatatgaacaaaaagaacatatttaatgtcat 14941187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 123; Significance: 7e-63; HSPs: 10)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 154 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 15321849 - 15321429
Alignment:
Q  154 gacaacacatcaag-gtgaaagacaaattgcaatactatgatcccttggatattcactttttggtcacctcacaacatgacaagaatagtaacatagtac 252  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||| | || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||    
T  15321849 gacaacacatcaagagtgtaagacaaata-caaaactataaacctttggatatttactttatggtcacctcacaacatgacaagaa-agctacctagtac 15321752  T
Q  253 aacaaaaggcttttctttgggctcaagacttatgctccagcaagaagtgataaagcaatgagctgcacaaagctcagctctcacgaagcaa--------- 343  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||             
T  15321751 aagaaaagccttttctttgggctcaagtcttatggtacagcaacaagtgaaaaggaaatgagctgtacaaagctcatgtctcacgtagcaagcaacaaag 15321652  T
Q  344 -acaaagaaatgcttcagcagaatttgagatcgatctcaattcatcataag-aacagtttcatctcaaaggctcctttaagacttgcgctacaagaaaag 441  Q
     |||||| || || |||||||| || |||||||||||||| |  ||  ||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| |    
T  15321651 tacaaaggaaagcctcagcagatttagagatcgatctcaact--tcgaaaggaacagtttcatctcaaaggctcccttgaaacttgcgctgcaagaaagg 15321554  T
Q  442 gagaagttaccaaaagttcctctgctataaatagaagacttcagcaagaggaagaaacaacttttgagcaaaaga-aaaagaatatattcatcaagcatc 540  Q
     |||| ||| ||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||| ||| ||     
T  15321553 aagaatttaacaagagtttttctcctataaatagaagacttcagcaagagagaaaaacaacttttgagaaaaagagaaaagacaatattcattaagaatt 15321454  T
Q  541 tctttgtttacaaatcaatcaagaa 565  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  15321453 tctttgtttacaaatcactcaagaa 15321429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 154 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 15330852 - 15330432
Alignment:
Q  154 gacaacacatcaag-gtgaaagacaaattgcaatactatgatcccttggatattcactttttggtcacctcacaacatgacaagaatagtaacatagtac 252  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||| | || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||    
T  15330852 gacaacacatcaagagtgtaagacaaata-caaaactataaacctttggatatttactttatggtcacctcacaacatgacaagaa-agctacctagtac 15330755  T
Q  253 aacaaaaggcttttctttgggctcaagacttatgctccagcaagaagtgataaagcaatgagctgcacaaagctcagctctcacgaagcaa--------- 343  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||             
T  15330754 aagaaaagccttttctttgggctcaagtcttatggtacagcaacaagtgaaaaggaaatgagctgtacaaagctcatgtctcacgtagcaagcaacaaag 15330655  T
Q  344 -acaaagaaatgcttcagcagaatttgagatcgatctcaattcatcataag-aacagtttcatctcaaaggctcctttaagacttgcgctacaagaaaag 441  Q
     |||||| || || |||||||| || |||||||||||||| |  ||  ||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| |    
T  15330654 tacaaaggaaagcctcagcagatttagagatcgatctcaact--tcgaaaggaacagtttcatctcaaaggctcccttgaaacttgcgctgcaagaaagg 15330557  T
Q  442 gagaagttaccaaaagttcctctgctataaatagaagacttcagcaagaggaagaaacaacttttgagcaaaaga-aaaagaatatattcatcaagcatc 540  Q
     |||| ||| ||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||| ||| ||     
T  15330556 aagaatttaacaagagtttttctcctataaatagaagacttcagcaagagagaaaaacaacttttgagaaaaagagaaaagacaatattcattaagaatt 15330457  T
Q  541 tctttgtttacaaatcaatcaagaa 565  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  15330456 tctttgtttacaaatcactcaagaa 15330432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 154 - 565
Target Start/End: Original strand, 18707905 - 18708325
Alignment:
Q  154 gacaacacatcaag-gtgaaagacaaattgcaatactatgatcccttggatattcactttttggtcacctcacaacatgacaagaatagtaacatagtac 252  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||| | || ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||  || ||||||    
T  18707905 gacaacacatcaagagtgtaagacaaata-caaaactataaacctttggatatttactttatggtcacttcacaacatgacaagaa-agctacctagtac 18708002  T
Q  253 aacaaaaggcttttctttgggctcaagacttatgctccagcaagaagtgataaagcaatgagctgcacaaagctcagctctcacgaagcaa--------- 343  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||             
T  18708003 aagaaaagccttttctttgggctcaagtcttatggtacagcaacaagtgaaaaggaaatgagctgtacaaagctcatgtctcacgtagcaagcaacaaag 18708102  T
Q  344 -acaaagaaatgcttcagcagaatttgagatcgatctcaattcatcataag-aacagtttcatctcaaaggctcctttaagacttgcgctacaagaaaag 441  Q
     |||||| || || |||||||| || |||||||||||||| |  ||  ||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| |    
T  18708103 tacaaaggaaagcctcagcagatttagagatcgatctcaact--tcgaaaggaacagtttcatctcaaaggctcccttgaaacttgcgctgcaagaaagg 18708200  T
Q  442 gagaagttaccaaaagttcctctgctataaatagaagacttcagcaagaggaagaaacaacttttgagcaaaaga-aaaagaatatattcatcaagcatc 540  Q
     |||| ||| ||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||| ||| ||     
T  18708201 aagaatttaacaagagtttttctcctataaatagaagacttcagcaagagagaaaaacaacttttgagaaaaagagaaaagacaatattcattaagaatt 18708300  T
Q  541 tctttgtttacaaatcaatcaagaa 565  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  18708301 tctttgtttacaaatcactcaagaa 18708325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 154 - 565
Target Start/End: Original strand, 18716919 - 18717339
Alignment:
Q  154 gacaacacatcaag-gtgaaagacaaattgcaatactatgatcccttggatattcactttttggtcacctcacaacatgacaagaatagtaacatagtac 252  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||| | || ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||  || ||||||    
T  18716919 gacaacacatcaagagtgtaagacaaata-caaaactataaacctttggatatttactttatggtcacttcacaacatgacaagaa-agctacctagtac 18717016  T
Q  253 aacaaaaggcttttctttgggctcaagacttatgctccagcaagaagtgataaagcaatgagctgcacaaagctcagctctcacgaagcaa--------- 343  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||             
T  18717017 aagaaaagccttttctttgggctcaagtcttatggtacagcaacaagtgaaaaggaaatgagctgtacaaagctcatgtctcacgtagcaagcaacaaag 18717116  T
Q  344 -acaaagaaatgcttcagcagaatttgagatcgatctcaattcatcataag-aacagtttcatctcaaaggctcctttaagacttgcgctacaagaaaag 441  Q
     |||||| || || |||||||| || |||||||||||||| |  ||  ||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| |    
T  18717117 tacaaaggaaagcctcagcagatttagagatcgatctcaact--tcgaaaggaacagtttcatctcaaaggctcccttgaaacttgcgctgcaagaaagg 18717214  T
Q  442 gagaagttaccaaaagttcctctgctataaatagaagacttcagcaagaggaagaaacaacttttgagcaaaaga-aaaagaatatattcatcaagcatc 540  Q
     |||| ||| ||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||| ||| ||     
T  18717215 aagaatttaacaagagtttttctcctataaatagaagacttcagcaagagagaaaaacaacttttgagaaaaagagaaaagacaatattcattaagaatt 18717314  T
Q  541 tctttgtttacaaatcaatcaagaa 565  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  18717315 tctttgtttacaaatcactcaagaa 18717339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 154 - 571
Target Start/End: Original strand, 29958126 - 29958552
Alignment:
Q  154 gacaacacatcaag-gtgaaagacaaattgcaatactatgatcccttggatattcactttttggtcacctcacaacatgacaagaatagtaacatagtac 252  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   | ||||||    
T  29958126 gacaacacatcaagagtgtaagacaaata-caaaactatgaacctttggatattcactttatggtcacctcacaacatgacaagaa-agctgcctagtac 29958223  T
Q  253 aacaaaaggcttttctttgggctcaagacttatgctccagcaagaagtgataaagcaatgagctgcacaaagctcagctctcacgaagcaa--------- 343  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||             
T  29958224 aagaaaagccttttctttgggctcaagtcttatggtacagcaacaagtgaaaaggaaatgagctgtacaaagctcatgtctcacgtagcaagcaacaaag 29958323  T
Q  344 -acaaagaaatgcttcagcagaatttgagatcgatctcaattcatcataagaacagtttcatctcaaaggctcctttaagacttgcgctacaagaaaagg 442  Q
     |||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| |  | | | |||||||| ||||||||||||||| || |  |||| ||| ||||||| |     
T  29958324 tacaaaggaaagcttcagcagatttagagatcgatctcaactt-tgaaaggaacagttccatctcaaaggctcccttgaatcttgtgctgcaagaaagga 29958422  T
Q  443 agaagttaccaaaagttcctctgctataaatagaagacttcagcaagaggaagaaacaacttttgagcaaaag-aaaaagaatatattcatcaagcatct 541  Q
    |||| ||| |||  |||  ||| |||||||||||||||| ||||||| |  | |||||||||||||||||||| |||||||  | |||| | ||| || |    
T  29958423 agaatttaacaagggtttttctcctataaatagaagactccagcaagtgagaaaaacaacttttgagcaaaagaaaaaagacaacattctttaagaattt 29958522  T
Q  542 ctttgtttacaaatcaatcaagaattatat 571  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  29958523 ctttgtttacaaatcactcaagaatcatat 29958552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 15321934 - 15321890
Alignment:
Q  42 tactacatttgaacatatgaacaaaaagaacacatttaatatcat 86  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  15321934 tactacaaatgaacatatgaacaaaaagaacatatttaatgtcat 15321890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 15330937 - 15330893
Alignment:
Q  42 tactacatttgaacatatgaacaaaaagaacacatttaatatcat 86  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  15330937 tactacaaatgaacatatgaacaaaaagaacatatttaatgtcat 15330893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 86
Target Start/End: Original strand, 18707820 - 18707864
Alignment:
Q  42 tactacatttgaacatatgaacaaaaagaacacatttaatatcat 86  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18707820 tactacaaatgaacatatgaacaaaaagaacatatttaatgtcat 18707864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 86
Target Start/End: Original strand, 18716834 - 18716878
Alignment:
Q  42 tactacatttgaacatatgaacaaaaagaacacatttaatatcat 86  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18716834 tactacaaatgaacatatgaacaaaaagaacatatttaatgtcat 18716878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 86
Target Start/End: Original strand, 29958041 - 29958085
Alignment:
Q  42 tactacatttgaacatatgaacaaaaagaacacatttaatatcat 86  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  29958041 tactacaaatgaacatatgaacaaaaagaacatatttaatgtcat 29958085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 154 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 45490286 - 45489865
Alignment:
Q  154 gacaacacatcaag-gtgaaagacaaattgcaatactatgatcccttggatattcactttttggtcacctcacaacatgacaagaatagtaacatagtac 252  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||    
T  45490286 gacaacacatcaagagtgaaagacaaata-caaaactatgaacctttggatattcactttatggtcacctcacaacatgacaagaa-agctacctagtac 45490189  T
Q  253 aacaaaaggcttttctttgggctcaagactt-atgctccagcaagaagtgataaagcaatgagctgcacaaagctcagctctcacgaagca---aacaaa 348  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||| || ||| || | |||||| || ||||||||||  ||||||| ||||   ||||||    
T  45490188 aagaaaagccttttctttgggctcaagacttaatgttacagcaacaaatgaaaaggaaatgagttgtacaaagctcatgtctcacgtagcaagcaacaaa 45490089  T
Q  349 g---aaat----gcttcagcagaatttgagatcgatctcaattcatcataagaacagtttcatctcaaaggctcctttaagacttgcgctacaagaaaag 441  Q
    |   ||||    ||||||||||| || |||||||||||||| |  | | | ||||||||||||||||| ||||||  | |  |||||||| ||||||| |    
T  45490088 gtacaaatgaaagcttcagcagatttagagatcgatctcaact-ttaaaaggaacagtttcatctcaacggctcccatgattcttgcgctgcaagaaagg 45489990  T
Q  442 gagaagttaccaaaagttcctctgctataaatagaagacttcagcaagaggaagaaacaacttttgagcaaaaga-aaaagaatatattcatc-aagcat 539  Q
     |||| ||| ||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||| ||    
T  45489989 aagaatttatcaagagtttttctcctataaatagaagacttcagcaagtgagaaaaacaacttttgagcaaaagagaaaagacaatattcatcaaagaat 45489890  T
Q  540 ctctttgtttacaaatcaatcaaga 564  Q
     ||||||||||||||||| ||||||    
T  45489889 ttctttgtttacaaatcactcaaga 45489865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 154 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 45499244 - 45498823
Alignment:
Q  154 gacaacacatcaag-gtgaaagacaaattgcaatactatgatcccttggatattcactttttggtcacctcacaacatgacaagaatagtaacatagtac 252  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||    
T  45499244 gacaacacatcaagagtgaaagacaaata-caaaactatgaacctttggatattcactttatggtcacctcacaacatgacaagaa-agctacctagtac 45499147  T
Q  253 aacaaaaggcttttctttgggctcaagactt-atgctccagcaagaagtgataaagcaatgagctgcacaaagctcagctctcacgaagca---aacaaa 348  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||| || ||| || | ||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||   ||||||    
T  45499146 aagaaaagccttttctttgggctcaagacttaatgttacagcaacaaatgaaaaggaaatgagctgtacaaagctcatgtctcacgtagcaagcaacaaa 45499047  T
Q  349 g---aaat----gcttcagcagaatttgagatcgatctcaattcatcataagaacagtttcatctcaaaggctcctttaagacttgcgctacaagaaaag 441  Q
    |   ||||    ||||||||||| || |||||||||||||| |  | | | |||| |||||||||||| ||||||  | |  |||||||| ||||||| |    
T  45499046 gtacaaatgaaagcttcagcagatttagagatcgatctcaact-ttaaaaggaacggtttcatctcaacggctcccatgattcttgcgctgcaagaaagg 45498948  T
Q  442 gagaagttaccaaaagttcctctgctataaatagaagacttcagcaagaggaagaaacaacttttgagcaaaaga-aaaagaatatattcatc-aagcat 539  Q
     |||| ||| ||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||| ||    
T  45498947 aagaatttatcaagagtttttctcctataaatagaagacttcagcaagtgagaaaaacaacttttgagcaaaagagaaaagacaatattcatcaaagaat 45498848  T
Q  540 ctctttgtttacaaatcaatcaaga 564  Q
     ||||||||||||||||| ||||||    
T  45498847 ttctttgtttacaaatcactcaaga 45498823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 45490371 - 45490327
Alignment:
Q  42 tactacatttgaacatatgaacaaaaagaacacatttaatatcat 86  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  45490371 tactacaaatgaacatatgaacaaaaagaacatatttaatgtcat 45490327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 45499329 - 45499285
Alignment:
Q  42 tactacatttgaacatatgaacaaaaagaacacatttaatatcat 86  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  45499329 tactacaaatgaacatatgaacaaaaagaacatatttaatgtcat 45499285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 81; Significance: 8e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 154 - 557
Target Start/End: Original strand, 4321 - 4733
Alignment:
Q  154 gacaacacatcaag-gtgaaagacaaattgcaatactatgatcccttggatattcactttttggtcacctcacaacatgacaagaatagtaacatagtac 252  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||    
T  4321 gacaacacatcaagagtgtaagacaaata-caaaactatgatcctttggatattcactttatggtcacctcacaacataacaagaa-agcaacctagtac 4418  T
Q  253 aacaaaaggcttttctttgggctcaagact-tatgctccagcaagaagtgataaagcaatgagctgcacaaagctcagctctcacg----aagcaa---- 343  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |  | ||| ||||||||| ||  ||   |||||| || |||||||||   |||||||    ||||||        
T  4419 aacaaaagccttttctttgggctcaagattgaaagctacagcaagaa-tggaaagaaaatgagttgtacaaagctcttgtctcacgtactaagcaacaaa 4517  T
Q  344 --acaaagaaatgcttcagcagaatttgagatcgatctcaattcatcataagaacagtttcatctc-aaaggctcctttaagacttgcgctacaagaaaa 440  Q
      ||||||||| | ||||  ||| || |||||||||||||| |  | | ||||||| |||| |||| |||||||||  | || ||| |||| ||||||||    
T  4518 gtacaaagaaaagtttcaatagatttagagatcgatctcaact-ttgaaaagaacaatttcgtctcaaaaggctcccatgagtctttcgctgcaagaaaa 4616  T
Q  441 ggagaagttaccaaaagttcctctgctataaatagaagacttcagcaagaggaagaaacaacttttgagcaaaagaaaaagaatatattcatcaagcatc 540  Q
      | |||||| |||   ||||||| ||||||||||||  || || ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  4617 aaaaaagttatcaagtattcctctactataaatagaaagctacaacaagatgaaacaacaacttttgagcaaaagaaaaagaacttattcatcaagaatc 4716  T
Q  541 tctttgtttacaaatca 557  Q
    |||||||||| ||||||    
T  4717 tctttgtttataaatca 4733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 4249 - 4281
Alignment:
Q  54 acatatgaacaaaaagaacacatttaatatcat 86  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4249 acatatgaacaaaaagaacatatttaatatcat 4281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 232
Target Start/End: Original strand, 19419390 - 19419468
Alignment:
Q  154 gacaacacatcaag-gtgaaagacaaattgcaatactatgatcccttggatattcactttttggtcacctcacaacatga 232  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||   ||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19419390 gacaacacatcaagagtgtaagacaaaaa-caaaactatgaacctttggatattcactttatggtcacctcacaacatga 19419468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University