View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11586_high_5 (Length: 258)

Name: NF11586_high_5
Description: NF11586
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11586_high_5
NF11586_high_5
[»] chr5 (12 HSPs)
chr5 (1-240)||(37593752-37593991)
chr5 (1-240)||(37696143-37696382)
chr5 (1-240)||(37532648-37532887)
chr5 (7-239)||(37401372-37401604)
chr5 (7-239)||(37639300-37639532)
chr5 (7-239)||(37823458-37823690)
chr5 (7-239)||(37711058-37711290)
chr5 (1-240)||(37382699-37382938)
chr5 (1-240)||(37702231-37702470)
chr5 (1-240)||(37393250-37393489)
chr5 (1-231)||(37413547-37413777)
chr5 (1-240)||(37435258-37435497)
[»] chr4 (3 HSPs)
chr4 (1-240)||(16843369-16843608)
chr4 (1-240)||(16846033-16846276)
chr4 (4-240)||(24218104-24218340)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (1-240)||(14552920-14553159)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 12)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 37593752 - 37593991
Alignment:
Q  1 ctctatgttgttgtcaccaaggtccaaaacttcaagaaataaacagtgagacaaagactgtggtaatggtccttccaattggtttccattcaactttata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37593752 ctctatgttgttgtcaccaaggtccaaaacttcaagaaatgaacagtgagacaaagactgtggtaatggtccttccaattggtttccattcaactttata 37593851  T
Q  101 gtctgaaatgcattttctttggaaaaggttctaggaatgtttccatagaggttgttcatttgcatatccaatacattaagagaagttaatgttcccaggc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37593852 gtctgaaatgcattttctttggaaaaggttctaggaatgtttccatagaggttgttcatttgcatatccaatacattaagagaagttaatgttcccaggc 37593951  T
Q  201 attgtggaatcatacctgttaaattgttgtgagccaaatt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37593952 attgtggaatcatacctgttaaattgttgtgagccaaatt 37593991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 37696143 - 37696382
Alignment:
Q  1 ctctatgttgttgtcaccaaggtccaaaacttcaagaaataaacagtgagacaaagactgtggtaatggtccttccaattggtttccattcaactttata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37696143 ctctatgttgttgtcaccaaggtccaaaacttcaagaaatgaacagtgagacaaagactgtggtaatggtccttccaattggtttccattcaactttata 37696242  T
Q  101 gtctgaaatgcattttctttggaaaaggttctaggaatgtttccatagaggttgttcatttgcatatccaatacattaagagaagttaatgttcccaggc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37696243 gtctgaaatgcattttctttggaaaaggttctaggaatgtttccatagaggttgttcatttgcatatccaatacattaagagaagttaatgttcccaggc 37696342  T
Q  201 attgtggaatcatacctgttaaattgttgtgagccaaatt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37696343 attgtggaatcatacctgttaaattgttgtgagccaaatt 37696382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 37532648 - 37532887
Alignment:
Q  1 ctctatgttgttgtcaccaaggtccaaaacttcaagaaataaacagtgagacaaagactgtggtaatggtccttccaattggtttccattcaactttata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37532648 ctctatgttgttgtcaccaaggtccaaaacttcaagaaatgaacagtgagacaaagactggggtaatggtccttccaattggtttccattcaactttata 37532747  T
Q  101 gtctgaaatgcattttctttggaaaaggttctaggaatgtttccatagaggttgttcatttgcatatccaatacattaagagaagttaatgttcccaggc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37532748 gtctgaaatgcattttctttggaaaaggttctaggaatgtttccatagaggttgttcatttgcatatccaatacattaagagaagttaatgttcccaggc 37532847  T
Q  201 attgtggaatcatacctgttaaattgttgtgagccaaatt 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37532848 attgtggaatcatacctgtcaaattgttgtgagccaaatt 37532887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 7 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 37401604 - 37401372
Alignment:
Q  7 gttgttgtcaccaaggtccaaaacttcaagaaataaacagtgagacaaagactgtggtaatggtccttccaattggtttccattcaactttatagtctga 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  37401604 gttgttgtcaccaaggtccaaaacttcaagatatgaacagttagccaaagattgtggtaatggtccttccaattggttgccattcaactttatagtctca 37401505  T
Q  107 aatgcattttctttggaaaaggttctaggaatgtttccatagaggttgttcatttgcatatccaatacattaagagaagttaatgttcccaggcattgtg 206  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37401504 aatgcatttcctttggtaaaggttctaggaatgcttccatagaggttgttcatttgcatatccaatacattaagagaagttaatgttcccaggcattgtg 37401405  T
Q  207 gaatcatacctgttaaattgttgtgagccaaat 239  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37401404 gaatcatacctgtcaaattgttgtgagccaaat 37401372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 7 - 239
Target Start/End: Original strand, 37639300 - 37639532
Alignment:
Q  7 gttgttgtcaccaaggtccaaaacttcaagaaataaacagtgagacaaagactgtggtaatggtccttccaattggtttccattcaactttatagtctga 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  37639300 gttgttgtcaccaaggtccaaaacttcaagatatgaacagttagccaaagattgtggtaatggtccttccaattggttgccattcaactttatagtctca 37639399  T
Q  107 aatgcattttctttggaaaaggttctaggaatgtttccatagaggttgttcatttgcatatccaatacattaagagaagttaatgttcccaggcattgtg 206  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37639400 aatgcatttcctttggagaaggttctaggaatgcttccatagaggttgttcatttgcatatccaatacagtaagagaagttaatgttcccaggcattgtg 37639499  T
Q  207 gaatcatacctgttaaattgttgtgagccaaat 239  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37639500 gaatcatacctgtcaaattgttgtgagccaaat 37639532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 239
Target Start/End: Original strand, 37823458 - 37823690
Alignment:
Q  7 gttgttgtcaccaaggtccaaaacttcaagaaataaacagtgagacaaagactgtggtaatggtccttccaattggtttccattcaactttatagtctga 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  37823458 gttgttgtcaccaaggtccaaaacttcaagatatgaacagttagccaaagattgtggtaatggtccttccaattggttgccattcaactttatagtctca 37823557  T
Q  107 aatgcattttctttggaaaaggttctaggaatgtttccatagaggttgttcatttgcatatccaatacattaagagaagttaatgttcccaggcattgtg 206  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37823558 aatgcatttcctttggtaaaggttctaggaatgcttccatagaggttgttcatttgcatatccaatacatgaagagaatttaatgttcccaggcattgtg 37823657  T
Q  207 gaatcatacctgttaaattgttgtgagccaaat 239  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37823658 gaatcatacctgtcaaattgttgtgagccaaat 37823690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 239
Target Start/End: Original strand, 37711058 - 37711290
Alignment:
Q  7 gttgttgtcaccaaggtccaaaacttcaagaaataaacagtgagacaaagactgtggtaatggtccttccaattggtttccattcaactttatagtctga 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  37711058 gttgttgtcaccaaggtccaaaacttcaagatatgaacagttagccaaagattgtggtaatgatccttccaattggttgccattcaactttatagtctca 37711157  T
Q  107 aatgcattttctttggaaaaggttctaggaatgtttccatagaggttgttcatttgcatatccaatacattaagagaagttaatgttcccaggcattgtg 206  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||  |||||||| ||||||||||    
T  37711158 aatgcatttcctttggtaaaggttctaggaatgcttccatagaggttgttcatttgcatatccaaaacatagagattaggaaatgttcctaggcattgtg 37711257  T
Q  207 gaatcatacctgttaaattgttgtgagccaaat 239  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  37711258 gaatcatacctttcaaattgttgtgagccaaat 37711290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 37382938 - 37382699
Alignment:
Q  1 ctctatgttgttgtcaccaaggtccaaaacttcaagaaataaacagtgagacaaagactgtggtaatggtccttccaattggtttccattcaactttata 100  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||   |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  37382938 ctctacgttgttgtctccaaggtccaaaacttcgagttttgtacagtgagccaaagactgtggtaatggtccttccaatcggtttccattcaactttatt 37382839  T
Q  101 gtctgaaatgcattttctttggaaaaggttctaggaatgtttccatagaggttgttcatttgcatatccaatacattaagagaagttaatgttcccaggc 200  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||  |||||||||| ||    
T  37382838 gtctcaaatgcatttcctttggagaaggttctaggaatgtgtccatagaggttgttcatttgcatatccaataccgaaagagaaggaaatgttcccaagc 37382739  T
Q  201 attgtggaatcatacctgttaaattgttgtgagccaaatt 240  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  37382738 attgtggaatcatgccagttaaattgttgtgagccaaatt 37382699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 37702231 - 37702470
Alignment:
Q  1 ctctatgttgttgtcaccaaggtccaaaacttcaagaaataaacagtgagacaaagactgtggtaatggtccttccaattggtttccattcaactttata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37702231 ctctatgttgttgtcaccaaggtccaatacttcaagatttgaacattgagccaaagactgcggtaatggtccttccaattggttgccattcaactttata 37702330  T
Q  101 gtctgaaatgcattttctttggaaaaggttctaggaatgtttccatagaggttgttcatttgcatatccaatacattaagagaagttaatgttcccaggc 200  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |||  ||  ||||||||||| |    
T  37702331 gtctcaaatgcatttcctttggagaaggttctaggaatgcttccatagaggttgttcatttgcatatccaaaatagagagatgaggaaatgttcccagac 37702430  T
Q  201 attgtggaatcatacctgttaaattgttgtgagccaaatt 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37702431 attgtggaatcatacctgtcaaattgttgtgagccaaatt 37702470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 37393489 - 37393250
Alignment:
Q  1 ctctatgttgttgtcaccaaggtccaaaacttcaagaaataaacagtgagacaaagactgtggtaatggtccttccaattggtttccattcaactttata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37393489 ctctatgttgttgtcaccaaggtccaatacttcaagatatgaacagtaagccaaacattgtggtaatggtccttccaattggtttccattcaattttata 37393390  T
Q  101 gtctgaaatgcattttctttggaaaaggttctaggaatgtttccatagaggttgttcatttgcatatccaatacattaagagaagttaatgttcccaggc 200  Q
    |||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |   ||| |||  |||||||| || |    
T  37393389 gtctcaaatatatttcctttggaaaaggttccaggaatgcttccacagaggttgttcatttgcatatccaaaatagagagataagaaaatgttcctagac 37393290  T
Q  201 attgtggaatcatacctgttaaattgttgtgagccaaatt 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37393289 attgtggaatcatacctgtcaaattgttgtgagccaaatt 37393250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 37413777 - 37413547
Alignment:
Q  1 ctctatgttgttgtcaccaaggtccaaaacttcaagaaataaacagtgagacaaagactgtggtaatggtccttccaattggtttccattcaactttata 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  || | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
T  37413777 ctctatattgttgtcaccaaggtccagaacttcaagatttatgcactaagccaaagactgtggtaatggtccttccaattgatttccgttcaactttatc 37413678  T
Q  101 gtctgaaatgcattttctttggaaaaggttctaggaatgtttccatagaggttgttcatttgcatatccaatacattaagagaagttaatgttcccaggc 200  Q
     ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||| ||||    
T  37413677 atctcaaatgtatttcctttggaaaaggttctaggaaagcttccatacaagttgttcatttgcatatccaatatagaaagagaaggaaatgttcctaggc 37413578  T
Q  201 attgtggaatcatacctgttaaattgttgtg 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37413577 attgtggaatcatgcctgttaaattgttgtg 37413547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 37435258 - 37435497
Alignment:
Q  1 ctctatgttgttgtcaccaaggtccaaaacttcaagaaataaacagtgagacaaagactgtggtaatggtccttccaattggtttccattcaactttata 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||  ||   |  |||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  37435258 ctctatgttgttgtatccaaggtccaaaattttgagttctgtacagtgagccaaagattgaggtaatggtccttctaattggttgccattcaactttata 37435357  T
Q  101 gtctgaaatgcattttctttggaaaaggttctaggaatgtttccatagaggttgttcatttgcatatccaatacattaagagaagttaatgttcccaggc 200  Q
    ||||  || |||||| || ||||||| ||| |||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||   |||| |||  |||||||||||||    
T  37435358 gtctcgaaggcatttcctctggaaaaagttttaggcatgcttccattaaggttgttcatttgcatatccaaaacggaaagaaaaggaaatgttcccaggc 37435457  T
Q  201 attgtggaatcatacctgttaaattgttgtgagccaaatt 240  Q
    ||| |||||| || ||||| || |||||||| ||||||||    
T  37435458 attttggaattatgcctgtcaatttgttgtgggccaaatt 37435497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 3)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16843608 - 16843369
Alignment:
Q  1 ctctatgttgttgtcaccaaggtccaaaacttcaagaaataaacagtgagacaaagactgtggtaatggtccttccaattggtttccattcaactttata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16843608 ctctatgttgttgtcaccaaggtccaaaacttcaagatatgaacagtgagacaaagactgtggtaatggtccttccaattggtttccattcaactttata 16843509  T
Q  101 gtctgaaatgcattttctttggaaaaggttctaggaatgtttccatagaggttgttcatttgcatatccaatacattaagagaagttaatgttcccaggc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16843508 gtctgaaatgcatttcctttggaaaaggttttaggaatgcttccatagaggttgttcatttgcatatccaatacattaagagaagttaatgttcctaggc 16843409  T
Q  201 attgtggaatcatacctgttaaattgttgtgagccaaatt 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16843408 attgtggaatcatacctgtcaaattgttgtgagccaaatt 16843369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16846276 - 16846033
Alignment:
Q  1 ctctatgttgttgtcaccaaggtccaaaacttcaagaaataaacagtgagacaaagactgtggtaatggtccttccaattggtttccattcaactttata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16846276 ctctatgttgttgtcaccaaggtccaaaacttcaagatatgaacagttagctaaagaccgtggtaatggtccttccaattggttgccattcaactttata 16846177  T
Q  101 gtctgaaatgcattttctttggaaaaggttctaggaatgtttccatagaggttgttcatttgcatatccaatacattaagagaagttaatgttcccaggc 200  Q
    ||   |||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16846176 gtgacaaacacatttcctttggaaaaggttctaggaatgcttccaaagaggttgttcatttgcatatccaatacattaagagaagttaatgttcccaagc 16846077  T
Q  201 attgtgga----atcatacctgttaaattgttgtgagccaaatt 240  Q
    ||||||||    ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16846076 attgtggaatatatcatacatattaaattgttgtgagccaaatt 16846033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24218340 - 24218104
Alignment:
Q  4 tatgttgttgtcaccaaggtccaaaacttcaagaaataaacagtgagacaaagactgtggtaatggtccttccaattggtttccattcaactttatagtc 103  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||   |   ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24218340 tatgatgttgtctccaaggtccaaaacttcaagttgtgtgcagtgagccaaagactgtggtaatggtccctccaattggttgccattcaactttatagtc 24218241  T
Q  104 tgaaatgcattttctttggaaaaggttctaggaatgtttccatagaggttgttcatttgcatatccaatacattaagagaagttaatgttcccaggcatt 203  Q
    |  ||||||||| |||  ||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||    
T  24218240 tcgaatgcatttccttccgaaaatgttttaggcatgcttccatagaggttgttcatttgcatatccaatacagaaagataaggaaatgttcccaggcatt 24218141  T
Q  204 gtggaatcatacctgttaaattgttgtgagccaaatt 240  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  24218140 gtggaatcgttcctgttaaattgttgttagccaaatt 24218104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 14552920 - 14553159
Alignment:
Q  1 ctctatgttgttgtcaccaaggtccaaaacttcaagaaataaacagtgagacaaagactgtggtaatggtccttccaattggtttccattcaactttata 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||  | ||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14552920 ctctatgctgttgtcaccaaggtctaatacttcaagatttgaacagtgagccaatgactgtggtagtggtcctttcaattggtttccattcaactttata 14553019  T
Q  101 gtctgaaatgcattttctttggaaaaggttctaggaatgtttccatagaggttgttcatttgcatatccaatacattaagagaagttaatgttcccaggc 200  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |||  ||  ||||| |||||||    
T  14553020 gtctcaaatgcatttccttttgaaaaggttctaggaatgattccatagaggttgttcatttgcatatccaaaatagagagaagaggaaatgtccccaggc 14553119  T
Q  201 attgtggaatcatacctgttaaattgttgtgagccaaatt 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14553120 attgtggaatcatacctgtcaaattgttgtgagccaaatt 14553159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University