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 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11587_low_6 (Length: 339)

Name: NF11587_low_6
Description: NF11587
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11587_low_6
NF11587_low_6
[»] chr4 (50 HSPs)
chr4 (22-292)||(24420488-24420758)
chr4 (22-292)||(24470868-24471138)
chr4 (19-292)||(24420392-24420665)
chr4 (18-292)||(24470960-24471234)
chr4 (46-290)||(24470605-24470849)
chr4 (22-290)||(24420778-24421046)
chr4 (42-290)||(24421210-24421458)
chr4 (19-292)||(24420872-24421145)
chr4 (19-287)||(24421021-24421289)
chr4 (217-292)||(24406527-24406602)
chr4 (18-287)||(24421165-24421434)
chr4 (46-271)||(24470413-24470638)
chr4 (25-281)||(24470488-24470744)
chr4 (22-269)||(24420751-24420998)
chr4 (97-292)||(24476790-24476976)
chr4 (42-292)||(24470265-24470515)
chr4 (18-276)||(24470337-24470595)
chr4 (140-236)||(24476885-24476981)
chr4 (18-245)||(24420967-24421194)
chr4 (18-271)||(24470529-24470782)
chr4 (136-292)||(24406425-24406587)
chr4 (22-287)||(24420637-24420902)
chr4 (18-287)||(24470721-24470989)
chr4 (25-281)||(24420979-24421235)
chr4 (18-290)||(24470289-24470561)
chr4 (19-263)||(24477374-24477618)
chr4 (18-261)||(24420327-24420570)
chr4 (18-245)||(24421159-24421386)
chr4 (18-292)||(24420584-24420858)
chr4 (79-271)||(24421277-24421469)
chr4 (136-276)||(24421320-24421460)
chr4 (42-290)||(24477491-24477739)
chr4 (79-271)||(24470254-24470446)
chr4 (136-276)||(24470263-24470403)
chr4 (163-254)||(24477065-24477156)
chr4 (46-271)||(24477462-24477687)
chr4 (18-111)||(24477064-24477157)
chr4 (277-317)||(24406379-24406419)
chr4 (277-317)||(24406481-24406521)
chr4 (136-247)||(24477630-24477741)
chr4 (19-221)||(24470913-24471115)
chr4 (104-236)||(24471142-24471274)
chr4 (223-291)||(24482187-24482255)
chr4 (64-147)||(24481477-24481559)
chr4 (61-176)||(24406499-24406614)
chr4 (61-167)||(24471147-24471253)
chr4 (42-74)||(24421495-24421527)
chr4 (42-74)||(24470196-24470228)
chr4 (223-263)||(24476729-24476769)
chr4 (219-271)||(24477291-24477343)
[»] scaffold0879 (7 HSPs)
scaffold0879 (46-263)||(4464-4681)
scaffold0879 (19-287)||(4485-4753)
scaffold0879 (18-245)||(4580-4807)
scaffold0879 (22-281)||(4536-4795)
scaffold0879 (136-287)||(4458-4609)
scaffold0879 (19-254)||(4629-4864)
scaffold0879 (151-290)||(4425-4564)
[»] chr2 (14 HSPs)
chr2 (79-269)||(41899872-41900062)
chr2 (25-263)||(41899830-41900068)
chr2 (52-254)||(41900127-41900329)
chr2 (22-219)||(41899826-41900023)
chr2 (82-271)||(41900302-41900491)
chr2 (79-246)||(41900279-41900446)
chr2 (18-171)||(41899826-41899979)
chr2 (19-244)||(41900089-41900314)
chr2 (223-290)||(41900571-41900638)
chr2 (136-254)||(41900511-41900629)
chr2 (79-206)||(41900511-41900638)
chr2 (29-271)||(41900158-41900400)
chr2 (31-187)||(41900290-41900446)
chr2 (18-125)||(41899824-41899931)
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (31-170)||(11879442-11879581)
chr1 (79-182)||(11879442-11879545)
chr1 (16-170)||(11882285-11882439)
chr1 (16-170)||(11891519-11891673)
chr1 (127-251)||(11879442-11879566)
chr1 (79-251)||(11902038-11902210)
chr1 (31-167)||(11902038-11902174)
chr1 (199-268)||(11879349-11879418)
chr1 (46-170)||(11882411-11882535)
chr1 (46-170)||(11891645-11891769)
chr1 (78-123)||(11902373-11902418)
chr1 (30-182)||(11904952-11905104)
chr1 (58-146)||(11879661-11879749)
chr1 (19-170)||(11902074-11902225)
chr1 (197-287)||(11879464-11879554)
chr1 (200-290)||(11902063-11902153)
chr1 (30-152)||(11905000-11905122)
chr1 (22-95)||(52821569-52821642)
chr1 (19-119)||(11879526-11879626)
chr1 (223-263)||(11881952-11881992)
chr1 (223-263)||(11891186-11891226)
chr1 (127-287)||(11902038-11902198)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 50)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 22 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24420758 - 24420488
Alignment:
Q  22 ccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccat 121  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  24420758 ccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccat 24420659  T
Q  122 atatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24420658 atatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccacctccatatgtctataagtcccctcctcctccttctccttcaccccctcctccatatgt 24420559  T
Q  222 ttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcctt 292  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  24420558 ttacaaatctcctcccccaccatctccttcaccccctccaccctatgtctataagtcacctccacctcctt 24420488  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 22 - 292
Target Start/End: Original strand, 24470868 - 24471138
Alignment:
Q  22 ccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccat 121  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  24470868 ccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagtcacctcctccagcatctccttcaccacctcctccat 24470967  T
Q  122 atatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgt 221  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24470968 atatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatacgtctataagtcccctcctcctccttctccttcaccccctcctccatatgt 24471067  T
Q  222 ttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcctt 292  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  24471068 ttacaaatctcctcccccaccatctccttcacctcctccaccctatgtccataagtcacctccacctcctt 24471138  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24420665 - 24420392
Alignment:
Q  19 cctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctc 118  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||| ||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  24420665 cctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccacctccatatgtctataagtcccctcctcctccttctccttcaccccctcctc 24420566  T
Q  119 catatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccata 218  Q
    ||||| | ||||  || || || |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||| ||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  24420565 catatgtttacaaatctcctcccccaccatctccttcaccccctccaccctatgtctataagtcacctccacctccttcagcttcaccacctcctccata 24420466  T
Q  219 tgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcctt 292  Q
        |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  24420465 ctactacaaatctccacctccaccttctccatcacctcctccaccatatggctataagtcaccgccacctcctt 24420392  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 292
Target Start/End: Original strand, 24470960 - 24471234
Alignment:
Q  18 tcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcct 117  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  24470960 tcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatacgtctataagtcccctcctcctccttctccttcaccccctcct 24471059  T
Q  118 ccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccat 217  Q
    |||||| | ||||  || || || |||||||| |||||||| || || || |||||| ||||||| ||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  24471060 ccatatgtttacaaatctcctcccccaccatctccttcacctcctccaccctatgtccataagtcacctccacctccttcagcttcaccacctcctccat 24471159  T
Q  218 atgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcctt 292  Q
    |    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  24471160 actactacaaatctccacctccaccttctccatcacctcctccaccatatgtctataggtcaccgccacctcctt 24471234  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 46 - 290
Target Start/End: Original strand, 24470605 - 24470849
Alignment:
Q  46 ccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccac 145  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || || ||||| || | ||| |||||||| |    
T  24470605 ccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccttctcctcccccaccctatatttataagtcgccaccacctc 24470704  T
Q  146 catccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatc 245  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| || | ||| || || || || || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24470705 catctccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccaccaccatatgtctacaaatctccacccccaccatc 24470804  T
Q  246 tccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcc 290  Q
     |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| || |||||    
T  24470805 accttcaccccctccaccatatgtatataagtcaccacctcctcc 24470849  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 24421046 - 24420778
Alignment:
Q  22 ccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccat 121  Q
    |||||||| || || |||| ||| || || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| || ||||| ||||| || || ||||| |||||||    
T  24421046 ccatatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccacctccat 24420947  T
Q  122 atatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgt 221  Q
    || ||||||  || ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| || |  |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  24420946 atgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcaccccctccaccatatgtatataagtcaccaccacctccttccccttcccctcctcctccatatgt 24420847  T
Q  222 ttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcc 290  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | | |||||| || ||||||||    
T  24420846 ttacaagtccccacccccaccatcaccttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctcc 24420778  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 42 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 24421458 - 24421210
Alignment:
Q  42 acctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccacca 141  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || || || |||||||| || || |||||||||||| |||||| |||||||||     
T  24421458 acctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacct 24421359  T
Q  142 ccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccac 241  Q
    || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||   || |  || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||    
T  24421358 cctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccac 24421259  T
Q  242 catctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcc 290  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||    
T  24421258 catcaccctcacctcccccaccttatgtttacaagtcaccaccacctcc 24421210  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24421145 - 24420872
Alignment:
Q  19 cctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctc 118  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| || ||||| || || || |||||  | ||||||||||||||||| ||||| || || || || || |    
T  24421145 cctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatatatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccac 24421046  T
Q  119 catatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccata 218  Q
    ||||| | || |  ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || | ||| || || || || || || ||||||||    
T  24421045 catatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccacctccata 24420946  T
Q  219 tgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcctt 292  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  24420945 tgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcaccccctccaccatatgtatataagtcaccaccacctcctt 24420872  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24421289 - 24421021
Alignment:
Q  19 cctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctc 118  Q
    ||||||||||| |||||||| |  |||||||| || || || || || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||    
T  24421289 cctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccttatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctc 24421190  T
Q  119 catatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccata 218  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||| |  || || || || ||||||||||| |||||    
T  24421189 catatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccata 24421090  T
Q  219 tgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacc 287  Q
    | | ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| ||||| | ||| ||||| |||||    
T  24421089 tatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacc 24421021  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 217 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24406602 - 24406527
Alignment:
Q  217 tatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcctt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24406602 tatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccaccacctcctt 24406527  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24421434 - 24421165
Alignment:
Q  18 tcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcct 117  Q
    |||||| ||||| |||||||| | ||| || || ||||| || || || |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  24421434 tcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctccccca 24421335  T
Q  118 ccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccat 217  Q
    |||||| |||| | |   ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| || || || ||||| || || || |    
T  24421334 ccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccacctt 24421235  T
Q  218 atgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacc 287  Q
    |||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||||| |||||    
T  24421234 atgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccacc 24421165  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 271
Target Start/End: Original strand, 24470413 - 24470638
Alignment:
Q  46 ccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccac 145  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | || ||||| || || || ||| | |||| |||||||||||| |    
T  24470413 ccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccaacaccctcacctcccccgccctatgtttacaagtcaccaccacctc 24470512  T
Q  146 catccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatc 245  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||   |||||| ||||| ||    
T  24470513 cttccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctc 24470612  T
Q  246 tccttcacctcctccaccttatgtct 271  Q
    ||| ||||| || || || |||||||    
T  24470613 tccatcaccaccacctccatatgtct 24470638  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 281
Target Start/End: Original strand, 24470488 - 24470744
Alignment:
Q  25 tatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatata 124  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||| || || || || |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||     
T  24470488 tatgtttacaagtcaccaccacctccttccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatg 24470587  T
Q  125 tctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgttta 224  Q
    |||| | |   ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| || || ||||| || || || || ||| ||||    
T  24470588 tctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccttctcctcccccaccctatattta 24470687  T
Q  225 caaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcacc 281  Q
     || || ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||    
T  24470688 taagtcgccaccacctccatctccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcacc 24470744  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 24420998 - 24420751
Alignment:
Q  22 ccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccat 121  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  24420998 ccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccacctccatatgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcaccccctccaccat 24420899  T
Q  122 atatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgt 221  Q
    || | || | |||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| |  || || || ||||| || ||||| || ||| |    
T  24420898 atgtatataagtcaccaccacctccttccccttcccctcctcctccatatgtttacaagtccccacccccaccatcaccttctcctcctccaccctatat 24420799  T
Q  222 ttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgt 269  Q
    ||| || || ||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  24420798 ttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgt 24420751  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 97 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24476976 - 24476790
Alignment:
Q  97 ccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctcctt 196  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||| || || || |  || |||||| |||| ||||||||||||||||| || || |             
T  24476976 ccatccccttcaccaccccctccatatgtctatatgtcccctcctcctcattctccttcatcacctcctccatatgtctataattctccac--------- 24476886  T
Q  197 ctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcctt 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  24476885 ctccttcaccccctcctccatatgtttatgaatctccacccccaccatctccttcacctcccccatcctatgtctataagtcacatccacctcctt 24476790  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Original strand, 24470265 - 24470515
Alignment:
Q  42 acctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccacca 141  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || || || |||||||| || || |||||||||||| |||||| |||||||||     
T  24470265 acctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacct 24470364  T
Q  142 ccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccac 241  Q
    || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||   || |  || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||    
T  24470365 cctccatcaccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccac 24470464  T
Q  242 catctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcctt 292  Q
    || | || |||||||| || || ||||| |  |||||||| ||||||||||    
T  24470465 caacaccctcacctcccccgccctatgtttacaagtcaccaccacctcctt 24470515  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Original strand, 24470337 - 24470595
Alignment:
Q  18 tcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcct 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| || || || || || || || ||||| || || |||  ||| || || || ||||| |||||||| |||    
T  24470337 tcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatcaccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacct 24470436  T
Q  118 ccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccat 217  Q
    |||||| |||||| ||| || || |||||| | || ||||| ||||| || ||||| || ||||| || |  |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  24470437 ccatatgtctacaagtctcctcctccaccaacaccctcacctcccccgccctatgtttacaagtcaccaccacctccttccccttcacctcctcctccat 24470536  T
Q  218 atgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaag 276  Q
    |||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  24470537 atgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataag 24470595  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 140 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24476981 - 24476885
Alignment:
Q  140 caccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacc 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||    
T  24476981 caccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctatatgtcccctcctcctcattctccttcatcacctcctccatatgtctataattctccacc 24476885  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24421194 - 24420967
Alignment:
Q  18 tcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcct 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||  |||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||     
T  24421194 tcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctcca 24421095  T
Q  118 ccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccat 217  Q
    |||||||| |||| ||| || || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| || || |  || || ||||| || |||||||| ||||    
T  24421094 ccatatatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccat 24420995  T
Q  218 atgtttacaaatctccacccccaccatc 245  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  24420994 atgtctacaagtcaccacctccaccatc 24420967  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 271
Target Start/End: Original strand, 24470529 - 24470782
Alignment:
Q  18 tcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcct 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||| || || || || ||||| || || |||  ||| || || || ||||| |||||||| |||    
T  24470529 tcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacct 24470628  T
Q  118 ccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccat 217  Q
    |||||| |||||| ||| || || |||||||| ||||| || ||||| || ||| | |||||||| || |  ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24470629 ccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccttctcctcccccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccttcacctcctcctccat 24470728  T
Q  218 atgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtct 271  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||||| || || || || ||||| |||||||    
T  24470729 atgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccaccaccatatgtct 24470782  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 136 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24406587 - 24406425
Alignment:
Q  136 ccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaa------at 229  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || || || ||||||| |||||| || |  |||||||| |||||||| || ||||| ||| | |||||      |     
T  24406587 ccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccaccacctccttcgccttcaccgccacctccttatatctacaagactccac 24406488  T
Q  230 ctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcctt 292  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24406487 ctccacctccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccaccacctcctt 24406425  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24420902 - 24420637
Alignment:
Q  22 ccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccat 121  Q
    |||||||| || ||||||| ||| || ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| || |    
T  24420902 ccatatgtatataagtcaccaccacctccttccccttcccctcctcctccatatgtttacaagtccccacccccaccatcaccttctcctcctccaccct 24420803  T
Q  122 atatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgt 221  Q
    |||| || | ||| |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| || | ||| || ||||| || || || |||||||| ||    
T  24420802 atatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgt 24420703  T
Q  222 ttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacc 287  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||||||||| || || || ||| |||  |||||||| |||||    
T  24420702 ttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccacc 24420637  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 287
Target Start/End: Original strand, 24470721 - 24470989
Alignment:
Q  18 tcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcct 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||     
T  24470721 tcctccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccaccaccatatgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcaccccctcca 24470820  T
Q  118 ccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccat 217  Q
    |||||| | || | ||||||||| || ||||| || || ||  |||| |||||||| || ||||| || | ||| || ||||| || || || |||||||    
T  24470821 ccatatgtatataagtcaccacctcctccatctccctctcc-tccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccat 24470919  T
Q  218 atgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacc 287  Q
    | ||||| || || || || ||| ||||||||||||| ||||| || ||| |||  |||||||| |||||    
T  24470920 acgtttataagtcacctcctccagcatctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccacc 24470989  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 24421235 - 24420979
Alignment:
Q  25 tatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatata 124  Q
    |||||||||||||||| ||| || || || || || || || |||||||| || |||||||| || || || ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  24421235 tatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatata 24421136  T
Q  125 tctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgttta 224  Q
    | |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||| | || ||||| |||| ||| || || || || || || || |||||||| ||    
T  24421135 tttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatatatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtata 24421036  T
Q  225 caaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcacc 281  Q
     ||||| ||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||  ||||||||    
T  24421035 taaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcacc 24420979  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 24470289 - 24470561
Alignment:
Q  18 tcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcct 117  Q
    |||||| ||||| |||||||| | ||| || || ||||| || || || |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||     
T  24470289 tcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatcaccttcacctccccca 24470388  T
Q  118 ccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccat 217  Q
    |||||| |||| | |   ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| ||  | || ||||| || || || |    
T  24470389 ccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccaacaccctcacctcccccgccct 24470488  T
Q  218 atgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcc 290  Q
    |||||||||| || ||||| || || || |||||||||||||| || |||||||  |||||||| || |||||    
T  24470489 atgtttacaagtcaccaccacctccttccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctcc 24470561  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24477618 - 24477374
Alignment:
Q  19 cctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctc 118  Q
    |||||| |||| ||||| |||| |||||| || ||||| | ||| || || ||||| || || |||  ||| || || |||||||| ||||| || ||||    
T  24477618 cctccacatgtctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctc 24477519  T
Q  119 catatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccata 218  Q
    ||||| |||||| ||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||   |||| ||  |||||||| ||||| || ||||||||    
T  24477518 catatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctcctctaccttctccatcaccaccacctccata 24477419  T
Q  219 tgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccacc 263  Q
    ||| ||||| ||||| || |||||||| ||  || ||||||||||    
T  24477418 tgtctacaagtctcctcctccaccatcacccccaactcctccacc 24477374  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 24420570 - 24420327
Alignment:
Q  18 tcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcct 117  Q
    |||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||| || || || || || || || || ||||| ||||| || || ||  ||||||||||||||    
T  24420570 tcctccatatgtttacaaatctcctcccccaccatctccttcaccccctccaccctatgtctataagtcacctccacctccttcagcttcaccacctcct 24420471  T
Q  118 ccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccat 217  Q
    |||||   |||||  || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||| ||||||||| || |  |||||||| |||||||| || ||||| |    
T  24420470 ccatactactacaaatctccacctccaccttctccatcacctcctccaccatatggctataagtcaccgccacctccttcgccttcaccaccgcctcctt 24420371  T
Q  218 atgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctcca 261  Q
    || ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24420370 atatttacaagtctccacctccaccatctccatcacctcctcca 24420327  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24421386 - 24421159
Alignment:
Q  18 tcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcct 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||| || || || || ||||| || || |||  ||| || || || ||||| |||||||| |||    
T  24421386 tcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacct 24421287  T
Q  118 ccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccat 217  Q
    |||||| |||||| ||| || || |||||||| || ||||| ||||| || ||||| || ||||| || |  ||||| || |||||||| ||||||||||    
T  24421286 ccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccttatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccat 24421187  T
Q  218 atgtttacaaatctccacccccaccatc 245  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  24421186 atgtctacaagtcaccaccaccaccatc 24421159  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24420858 - 24420584
Alignment:
Q  18 tcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| ||||| || || || || || || || ||  |||| ||||| || || || |||||||| || || || ||     
T  24420858 tcctccatatgtttacaagtccccacccccaccatcaccttctcctcctccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccctctcctccccca 24420759  T
Q  118 ccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccat 217  Q
    |||||| | |||| ||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| || |||| ||| || ||||||||||| || |||||||    
T  24420758 ccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccat 24420659  T
Q  218 atgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcctt 292  Q
    || | ||||| || ||||| |||||||| |||||||| || || || ||||||| |||||| || || |||||||    
T  24420658 atatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccacctccatatgtctataagtcccctcctcctcctt 24420584  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 24421469 - 24421277
Alignment:
Q  79 tacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctata 178  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | |||| ||| |||||||| ||||| || || || || |||||||||||||| |    
T  24421469 tacaaatctccacctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctaca 24421370  T
Q  179 agtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtct 271  Q
    |||| || | |||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||   |||||| ||||| ||||| ||||| || || || |||||||    
T  24421369 agtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtct 24421277  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 136 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 24421460 - 24421320
Alignment:
Q  136 ccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccac 235  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||    
T  24421460 ccacctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccac 24421361  T
Q  236 ccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaag 276  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  24421360 ctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataag 24421320  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 24477739 - 24477491
Alignment:
Q  42 acctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccacca 141  Q
    ||||||||  || ||||| |||||||| || || || || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||    
T  24477739 acctccacgatccccatcaccaccaccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccacctcctccatatgtgtacaagtccccacca 24477640  T
Q  142 ccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccac 241  Q
    || ||||| |  || || || |||||| ||||||| || || || | |||||| |||||||  || || || |||||||| || ||   |||||| ||||    
T  24477639 cctccatctctctctcctccgcctccacatgtctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccac 24477540  T
Q  242 catctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcc 290  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||  |||||||| || |||||    
T  24477539 catctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacctcctcc 24477491  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 271
Target Start/End: Original strand, 24470254 - 24470446
Alignment:
Q  79 tacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctata 178  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | |||| ||| |||||||| ||||| || || || || |||||||||||||| |    
T  24470254 tacaaatctccacctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctaca 24470353  T
Q  179 agtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtct 271  Q
    |||| || | |||||| || |||||||| || || |||||||| || ||   |||||| ||||| ||||| ||||| || || || |||||||    
T  24470354 agtcaccacctcctccatcaccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtct 24470446  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 276
Target Start/End: Original strand, 24470263 - 24470403
Alignment:
Q  136 ccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccac 235  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||    
T  24470263 ccacctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccac 24470362  T
Q  236 ccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaag 276  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  24470363 ctcctccatcaccttcacctcccccaccatatgtctataag 24470403  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24477156 - 24477065
Alignment:
Q  163 cctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacc 254  Q
    |||||||||||||||||| | || | |||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24477156 cctccatatgtctataaggcaccacctcctccatctccatccccaccacctccatatgtttacaaatctccacccccaccatcccctccacc 24477065  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 24477687 - 24477462
Alignment:
Q  46 ccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccac 145  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || || || |||||||  || || || |||||| || ||||||  |||||||| || |    
T  24477687 ccaccatctccctcaccacctcctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctccacatgtctacaaatcaccacctcctc 24477588  T
Q  146 catccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatc 245  Q
    | || ||||  || ||||| |||||||||||||||   || |  || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||    
T  24477587 cgtctcctttccctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatc 24477488  T
Q  246 tccttcacctcctccaccttatgtct 271  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||    
T  24477487 tccttcacctcccccaccatatgtct 24477462  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 24477157 - 24477064
Alignment:
Q  18 tcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcacca 111  Q
    |||||||||||| || ||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||| |||||    
T  24477157 tcctccatatgtctataaggcaccacctcctccatctccatccccaccacctccatatgtttacaaatctccacccccaccatcccctccacca 24477064  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 24406419 - 24406379
Alignment:
Q  277 tcaccgccacctccttatatctacaagactccacctccacc 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24406419 tcaccgccacctccttatatctacaagactccacctccacc 24406379  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 24406521 - 24406481
Alignment:
Q  277 tcaccgccacctccttatatctacaagactccacctccacc 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24406521 tcaccgccacctccttatatctacaagactccacctccacc 24406481  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24477741 - 24477630
Alignment:
Q  136 ccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccac 235  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||  || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||    
T  24477741 ccacctccacgatccccatcaccaccaccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccacctcctccatatgtgtacaagtccccac 24477642  T
Q  236 ccccaccatctc 247  Q
    | || |||||||    
T  24477641 cacctccatctc 24477630  T

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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 221
Target Start/End: Original strand, 24470913 - 24471115
Alignment:
Q  19 cctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctc 118  Q
    |||||||| ||||| |||||||  |||||| | ||||| || ||||| ||||||||  | |||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||    
T  24470913 cctccatacgtttataagtcacctcctccagcatctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctc 24471012  T
Q  119 catatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccata 218  Q
    ||||  |||| | ||| || || || || || |||||||| || ||||||||||| || || || ||||  || || ||||||||||| ||||| || ||    
T  24471013 catacgtctataagtcccctcctcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctcctcccccaccatctccttcacctcctccacccta 24471112  T
Q  219 tgt 221  Q
    |||    
T  24471113 tgt 24471115  T

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Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 104 - 236
Target Start/End: Original strand, 24471142 - 24471274
Alignment:
Q  104 cttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttc 203  Q
    |||||||||||||||||||   |||||  || ||||| ||||| || || ||||| || || ||||||||||||| ||| || |  |||||||| |||||    
T  24471142 cttcaccacctcctccatactactacaaatctccacctccaccttctccatcacctcctccaccatatgtctataggtcaccgccacctccttcgccttc 24471241  T
Q  204 accccctcctccatatgtttacaaatctccacc 236  Q
    ||| || ||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  24471242 accaccgcctccttatatttacaagtctccacc 24471274  T

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Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 24482255 - 24482187
Alignment:
Q  223 tacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcct 291  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  24482255 tacaaatctccaccaccaccatctccatcaccaccacctccttatgtctataaatcaccaccacctcct 24482187  T

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Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 24481559 - 24481477
Alignment:
Q  64 ccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccacca 147  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||| | |||| ||| ||||| ||||||    
T  24481559 ccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatctccatcaccacc-ccaccatatgtatacaagtcgccacctccacca 24481477  T

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Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 24406614 - 24406499
Alignment:
Q  61 ccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccac 160  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||| |||  | |||||||||||| || || |||||||| |    
T  24406614 ccaccaccaccgtatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccaccacctccttcgccttcaccgc 24406515  T
Q  161 cccctccatatgtcta 176  Q
    | ||||| ||| ||||    
T  24406514 cacctccttatatcta 24406499  T

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Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 167
Target Start/End: Original strand, 24471147 - 24471253
Alignment:
Q  61 ccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccac 160  Q
    ||||| |||||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |||| | |||||| ||||| || || ||||||||||    
T  24471147 ccacctcctccatactactacaaatctccacctccaccttctccatcacctcctccaccatatgtctataggtcaccgccacctccttcgccttcaccac 24471246  T
Q  161 cccctcc 167  Q
    | |||||    
T  24471247 cgcctcc 24471253  T

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Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 24421527 - 24421495
Alignment:
Q  42 acctccaccttctccatccccaccacctccata 74  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24421527 acctccaccttctccatcgccaccacctccata 24421495  T

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Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 74
Target Start/End: Original strand, 24470196 - 24470228
Alignment:
Q  42 acctccaccttctccatccccaccacctccata 74  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24470196 acctccaccttctccatcgccaccacctccata 24470228  T

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Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24476769 - 24476729
Alignment:
Q  223 tacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccacc 263  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24476769 tacaaatctccacctccaccttctccatcacctcctccacc 24476729  T

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Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 219 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 24477343 - 24477291
Alignment:
Q  219 tgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtct 271  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  24477343 tgtttacaaatcaccaccacctccatccccttcccctccttcaccttatgtct 24477291  T

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Target: scaffold0879 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 7)
Name: scaffold0879
Description:

Target: scaffold0879; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 46 - 263
Target Start/End: Original strand, 4464 - 4681
Alignment:
Q  46 ccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccac 145  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || |||||| | |||| |||||||||||| |    
T  4464 ccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccatatgtttacaagtcaccaccacctc 4563  T
Q  146 catccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatc 245  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |  || || || || || || || ||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||    
T  4564 catccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatc 4663  T
Q  246 tccttcacctcctccacc 263  Q
     || ||||| ||||||||    
T  4664 cccatcaccccctccacc 4681  T

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Target: scaffold0879; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 287
Target Start/End: Original strand, 4485 - 4753
Alignment:
Q  19 cctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctc 118  Q
    ||||||||||| |||||||| |  |||||||| || || || || || || ||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||    
T  4485 cctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccatatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctc 4584  T
Q  119 catatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccata 218  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| | || |||||||| |  || || || || ||||||||||| |||||    
T  4585 catatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccata 4684  T
Q  219 tgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacc 287  Q
    | | ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| ||||| | ||| ||||| |||||    
T  4685 tatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacc 4753  T

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Target: scaffold0879; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 245
Target Start/End: Original strand, 4580 - 4807
Alignment:
Q  18 tcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcct 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||  |||||||||| || || || ||||| || ||||| |||||     
T  4580 tcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctcca 4679  T
Q  118 ccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccat 217  Q
    |||||||| |||| ||| || || |||||||| || || || ||||| |||||||| ||||| || || |  || || ||||| || |||||||| ||||    
T  4680 ccatatatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccat 4779  T
Q  218 atgtttacaaatctccacccccaccatc 245  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  4780 atgtctacaagtcaccacctccaccatc 4807  T

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Target: scaffold0879; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 281
Target Start/End: Original strand, 4536 - 4795
Alignment:
Q  22 ccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccat 121  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || || || || || || || |||||||| || |||||||| || || || ||||| || || ||||| |||||||    
T  4536 ccatatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccat 4635  T
Q  122 atatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgt 221  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || || |||||| | || ||||| |||| ||| || || || || || || || ||||||||    
T  4636 atatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatatatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccaccatatgt 4735  T
Q  222 ttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcacc 281  Q
     || ||||| ||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||  ||||||||    
T  4736 atataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcacc 4795  T

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Target: scaffold0879; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 136 - 287
Target Start/End: Original strand, 4458 - 4609
Alignment:
Q  136 ccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccac 235  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||| || || || ||||| || || |||||||||||||| || ||||    
T  4458 ccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccatatgtttacaagtcaccac 4557  T
Q  236 ccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacc 287  Q
    | || ||||| |||||||||||||| || |||||||  |||||||| |||||    
T  4558 cacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccacc 4609  T

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Target: scaffold0879; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 254
Target Start/End: Original strand, 4629 - 4864
Alignment:
Q  19 cctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctc 118  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| || ||||| || || || |||||  | ||||||||||||||||| ||||| || || || || || |    
T  4629 cctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatatatatacaagtctcctcctccaccatcaccctcccctcccccac 4728  T
Q  119 catatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccata 218  Q
    ||||| | || |  ||||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||| || | ||| || || || || || || ||||||||    
T  4729 catatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccacctccata 4828  T
Q  219 tgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacc 254  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4829 tgtctacaaatctccacccccaccatcaccttcacc 4864  T

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Target: scaffold0879; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 290
Target Start/End: Original strand, 4425 - 4564
Alignment:
Q  151 ccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctcctt 250  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||   || |  || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || |    
T  4425 ccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccct 4524  T
Q  251 cacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcc 290  Q
    ||||||| ||||| ||||| |  |||||||| ||||||||    
T  4525 cacctcccccaccatatgtttacaagtcaccaccacctcc 4564  T

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Target: chr2 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 14)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 41900062 - 41899872
Alignment:
Q  79 tacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctata 178  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |    
T  41900062 tacaactctccacctcctccctctccttcacctccaccaccatatgtctacaagtccccaccaccaccttccccctcaccacctcctccatatgtttaca 41899963  T
Q  179 agtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgt 269  Q
    ||||||| |  || ||||| || |||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  41899962 agtccccaccaccgccttccccgtcaccccctcctccatatgcgtacaagtctcctcccccaccatcaccttcaccgcctcctccatatgt 41899872  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 41900068 - 41899830
Alignment:
Q  25 tatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatata 124  Q
    ||||| ||||| || | |||||| || ||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || || || || || ||||||||||||||||||     
T  41900068 tatgtctacaactctccacctcctccctctccttcacctccaccaccatatgtctacaagtccccaccaccaccttccccctcaccacctcctccatatg 41899969  T
Q  125 tctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgttta 224  Q
    | |||| ||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||  || ||||| ||||  || || || |||||||| |||||||||||||||||    
T  41899968 tttacaagtccccaccaccgccttccccgtcaccccctcctccatatgcgtacaagtctcctcccccaccatcaccttcaccgcctcctccatatgttta 41899869  T
Q  225 caaatctccacccccaccatctccttcacctcctccacc 263  Q
    ||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  41899868 caagtctccacctccaccttcttcttcacctcctccacc 41899830  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 41900329 - 41900127
Alignment:
Q  52 tctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccc 151  Q
    ||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| | |||| ||| | | | || ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  41900329 tctccttcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatccc 41900230  T
Q  152 cttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttc 251  Q
    | |||||||| || || |||||  | ||||| || |  | ||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||    
T  41900229 catcaccacctccgccttatgtgcacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttc 41900130  T
Q  252 acc 254  Q
    |||    
T  41900129 acc 41900127  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 41900023 - 41899826
Alignment:
Q  22 ccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccat 121  Q
    |||||||| |||||||| | ||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  41900023 ccatatgtctacaagtccccaccaccaccttccccctcaccacctcctccatatgtttacaagtccccaccaccgccttccccgtcaccccctcctccat 41899924  T
Q  122 atatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatat 219  Q
    ||   |||| ||| || || |||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || | ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  41899923 atgcgtacaagtctcctcccccaccatcaccttcaccgcctcctccatatgtttacaagtctccacctccaccttcttcttcacctcctccaccatat 41899826  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 41900491 - 41900302
Alignment:
Q  82 aagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagt 181  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||| ||| | | | || ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||| | || ||||    
T  41900491 aagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccaccttatatttacaagt 41900392  T
Q  182 cccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtct 271  Q
    | || |  ||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| || || || |||||||    
T  41900391 caccaccacctccttctccttcacttcctccaccatatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccacctccatatgtct 41900302  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 41900446 - 41900279
Alignment:
Q  79 tacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctata 178  Q
    |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||| || || |||||||  || || ||||||||||| |    
T  41900446 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccaccttatatttacaagtcaccaccacctccttctccttcacttcctccaccatatgtctaca 41900347  T
Q  179 agtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatct 246  Q
    | || ||||  ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||    
T  41900346 aatctcctccacctccctctccttcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatct 41900279  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 41899979 - 41899826
Alignment:
Q  18 tcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| || || || || |||||||| |  |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||    
T  41899979 tcctccatatgtttacaagtccccaccaccgccttccccgtcaccccctcctccatatgcgtacaagtctcctcccccaccatcaccttcaccgcctcct 41899880  T
Q  118 ccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatat 171  Q
    |||||| | |||| ||| ||||| ||||| ||  ||||||| || || ||||||    
T  41899879 ccatatgtttacaagtctccacctccaccttcttcttcacctcctccaccatat 41899826  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 41900314 - 41900089
Alignment:
Q  19 cctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctc 118  Q
    ||||||||||| |||||||| |  |||||||| ||| |||| | ||| | | | ||| | |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| |    
T  41900314 cctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgc 41900215  T
Q  119 catatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccata 218  Q
    | ||| |  ||| |||||||||||  || || || ||||| || || || |||||||| || || ||||  ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  41900214 cttatgtgcacaagtcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccgcctccata 41900115  T
Q  219 tgtttacaaatctccacccccaccat 244  Q
    ||||||||||||||| || |||||||    
T  41900114 tgtttacaaatctcctccaccaccat 41900089  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 223 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 41900638 - 41900571
Alignment:
Q  223 tacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcc 290  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||| ||||||||    
T  41900638 tacaaatctccaccaccaccatctccttcaccacctccaccttatatttataagtcaccaccacctcc 41900571  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 41900629 - 41900511
Alignment:
Q  136 ccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccac 235  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || ||| | |||||||| || |  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  41900629 ccaccaccaccatctccttcaccacctccaccttatatttataagtcaccaccacctccctctccttcacctcctccgccatatgtctacaaatctcctc 41900530  T
Q  236 ccccaccatctccttcacc 254  Q
    | || || ||||| |||||    
T  41900529 cacctccctctccatcacc 41900511  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 41900638 - 41900511
Alignment:
Q  79 tacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctata 178  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||| || || |||||||| || || ||||||||||| |    
T  41900638 tacaaatctccaccaccaccatctccttcaccacctccaccttatatttataagtcaccaccacctccctctccttcacctcctccgccatatgtctaca 41900539  T
Q  179 agtcccctcttcctccttctccttcacc 206  Q
    | || ||||  ||||| ||||| |||||    
T  41900538 aatctcctccacctccctctccatcacc 41900511  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 41900400 - 41900158
Alignment:
Q  29 tttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatcta 128  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||| || |  || || ||||| || ||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  41900400 tttacaagtcaccaccacctccttctccttcacttcctccaccatatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccacctccatatgtcta 41900301  T
Q  129 catgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaa 228  Q
    || ||| || || ||||||||  | |||| ||||| | | ||  |||| |||||||| |  || || || || ||||| ||||| || |||||  ||||     
T  41900300 caagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccgccttatgtgcacaag 41900201  T
Q  229 tctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtct 271  Q
    || ||||| |  || ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  41900200 tcaccaccacatccttctccctcacctcctccaccgtatgtct 41900158  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 41900446 - 41900290
Alignment:
Q  31 tacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctaca 130  Q
    |||||||| | ||| ||||| || ||||| ||||| || || ||  |||||||||| || || || || ||||||||||  ||||| |||||| ||||||    
T  41900446 tacaagtccccaccaccaccatccccatcaccacctccaccttatatttacaagtcaccaccacctccttctccttcacttcctccaccatatgtctaca 41900347  T
Q  131 tgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctc 187  Q
      || || ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  41900346 aatctcctccacctccctctccttcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctc 41900290  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 41899931 - 41899824
Alignment:
Q  18 tcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcct 117  Q
    |||||||||||  |||||||| |  || ||||| || || || || || |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| |||||     
T  41899931 tcctccatatgcgtacaagtctcctcccccaccatcaccttcaccgcctcctccatatgtttacaagtctccacctccaccttcttcttcacctcctcca 41899832  T
Q  118 ccatatat 125  Q
    ||||||||    
T  41899831 ccatatat 41899824  T

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Target: chr1 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 170
Target Start/End: Original strand, 11879442 - 11879581
Alignment:
Q  31 tacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctaca 130  Q
    |||||||||| ||| |||||  |||| || ||||||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||    
T  11879442 tacaagtcaccaccaccaccaactccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccgccatctccttcaccaccacctccttatgtgtaca 11879541  T
Q  131 tgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccata 170  Q
     ||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  11879542 agtcaccaccaccaccctcaccttccccaccaccaccata 11879581  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 182
Target Start/End: Original strand, 11879442 - 11879545
Alignment:
Q  79 tacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctata 178  Q
    |||||||| || || || ||| ||||||||||||| ||||| ||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |    
T  11879442 tacaagtcaccaccaccaccaactccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccgccatctccttcaccaccacctccttatgtgtaca 11879541  T
Q  179 agtc 182  Q
    ||||    
T  11879542 agtc 11879545  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 170
Target Start/End: Original strand, 11882285 - 11882439
Alignment:
Q  16 catcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctc 115  Q
    ||||||||||||   || ||||||| ||| ||||| || |||||||| || |||||||||  |||||| |||||||| || ||||| || |||||||| |    
T  11882285 catcctccatataactataagtcaccacccccaccatcaccatcccctccccctccatactattacaaatctcctccaccaccatcaccatcaccaccac 11882384  T
Q  116 ctccata-tatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccata 170  Q
    |||| || ||| ||||  ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  11882385 ctccctactat-tacaaatcacctccaccaccatcaccatcacctccccctccata 11882439  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 170
Target Start/End: Original strand, 11891519 - 11891673
Alignment:
Q  16 catcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctc 115  Q
    ||||||||||||   || ||||||| ||| ||||| || |||||||| || |||||||||  |||||| |||||||| || ||||| || |||||||| |    
T  11891519 catcctccatataactataagtcaccacccccaccatcaccatcccctccccctccatactattacaaatctcctccaccaccatcaccatcaccaccac 11891618  T
Q  116 ctccata-tatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccata 170  Q
    |||| || ||| ||||  ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  11891619 ctccctactat-tacaaatcacctccaccaccatcaccatcacctccccctccata 11891673  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 251
Target Start/End: Original strand, 11879442 - 11879566
Alignment:
Q  127 tacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttaca 226  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || |  || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  11879442 tacaagtcaccaccaccaccaactccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccgccatctccttcaccaccacctccttatgtgtaca 11879541  T
Q  227 aatctccacccccaccatctccttc 251  Q
    | || ||||| ||||| || |||||    
T  11879542 agtcaccaccaccaccctcaccttc 11879566  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 251
Target Start/End: Original strand, 11902038 - 11902210
Alignment:
Q  79 tacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctata 178  Q
    |||||||| || || || ||| || |||||||||| ||||| ||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||  | ||||| ||||| || |    
T  11902038 tacaagtcaccaccaccaccaacttcttcaccaccacctccttatgtatacaagtcaccaccaccaccatctccttcaccgtcacctccttatgtgtaca 11902137  T
Q  179 agtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttc 251  Q
    |||| || |  ||||| || || |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  11902138 agtcaccaccacctccatccccatcacccccacctccttacgtgtacaagtcaccaccaccaccctcgccttc 11902210  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 167
Target Start/End: Original strand, 11902038 - 11902174
Alignment:
Q  31 tacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctaca 130  Q
    |||||||||| ||| |||||  || | || ||||||||||| || || |||||||| || || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||    
T  11902038 tacaagtcaccaccaccaccaacttcttcaccaccacctccttatgtatacaagtcaccaccaccaccatctccttcaccgtcacctccttatgtgtaca 11902137  T
Q  131 tgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctcc 167  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  11902138 agtcaccaccacctccatccccatcacccccacctcc 11902174  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 199 - 268
Target Start/End: Original strand, 11879349 - 11879418
Alignment:
Q  199 ccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatg 268  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||    
T  11879349 ccttcaccaccacctccttatgtttacaaatcgccacctcctccatccccatcacctccaccaccttatg 11879418  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 46 - 170
Target Start/End: Original strand, 11882411 - 11882535
Alignment:
Q  46 ccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccata-tatctacatgtcaccaccacca 144  Q
    ||||| || ||||| || || |||||||||  |||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||  ||||| ||||||    
T  11882411 ccaccatcaccatcacctccccctccatactattacaaatctcctccaccaccatcaccatcaccaccacctccttactat-tacaaatcacctccacca 11882509  T
Q  145 ccatccccttcaccaccccctccata 170  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||    
T  11882510 ccatccccatcaccaccacctccata 11882535  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 46 - 170
Target Start/End: Original strand, 11891645 - 11891769
Alignment:
Q  46 ccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccata-tatctacatgtcaccaccacca 144  Q
    ||||| || ||||| || || |||||||||  |||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||  ||||| ||||||    
T  11891645 ccaccatcaccatcacctccccctccatactattacaaatctcctccaccaccatcaccatcaccaccacctccttactat-tacaaatcacctccacca 11891743  T
Q  145 ccatccccttcaccaccccctccata 170  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||    
T  11891744 ccatccccatcaccaccacctccata 11891769  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 78 - 123
Target Start/End: Original strand, 11902373 - 11902418
Alignment:
Q  78 ttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatat 123  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  11902373 ttacaagtctcctccaccaccatctccctcaccacctcctccatat 11902418  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 182
Target Start/End: Original strand, 11904952 - 11905104
Alignment:
Q  30 ttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccata-tatcta 128  Q
    ||||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||||  ||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||| ||    
T  11904952 ttacaagtccccccctccaccatcaccatctccaccaccaccatactattacaagtcaccacctccaccatctccatctcctcctccaccatactat-ta 11905050  T
Q  129 catgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtc 182  Q
     | ||||||||| ||||||||||| || || || || ||||||  |||||||||    
T  11905051 taagtcaccacctccaccatccccatcccctcctccaccatattactataagtc 11905104  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 146
Target Start/End: Original strand, 11879661 - 11879749
Alignment:
Q  58 tccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctacatgtcaccaccaccacc 146  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||||  ||||| ||| || ||||||||    
T  11879661 tccccaccaccaccatactattacaagtctcctccaccaccatctccctcacctccaccaccatattactacaagtctcccccaccacc 11879749  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 170
Target Start/End: Original strand, 11902074 - 11902225
Alignment:
Q  19 cctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctc 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| || ||  ||||||| || || |||||||| || || || ||||| || ||||| || ||||    
T  11902074 cctccttatgtatacaagtcaccaccaccaccatctccttcaccgtcacctccttatgtgtacaagtcaccaccacctccatccccatcacccccacctc 11902173  T
Q  119 catatatctacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccata 170  Q
    | ||  | |||| ||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||    
T  11902174 cttacgtgtacaagtcaccaccaccaccctcgccttccccgcccccaccata 11902225  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 287
Target Start/End: Original strand, 11879464 - 11879554
Alignment:
Q  197 ctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacc 287  Q
    |||||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| || || |||||||| |  |||||||| |||||    
T  11879464 ctccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccgccatctccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccacc 11879554  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 290
Target Start/End: Original strand, 11902063 - 11902153
Alignment:
Q  200 cttcaccccctcctccatatgtttacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacctcc 290  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||  | || |||||||| |  |||||||| ||||||||    
T  11902063 cttcaccaccacctccttatgtatacaagtcaccaccaccaccatctccttcaccgtcacctccttatgtgtacaagtcaccaccacctcc 11902153  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 152
Target Start/End: Original strand, 11905000 - 11905122
Alignment:
Q  30 ttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatatctac 129  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| || || || ||||||  ||| ||||| || ||||| ||||| || || || ||||| ||||||  |||     
T  11905000 ttacaagtcaccacctccaccatctccatctcctcctccaccatactattataagtcaccacctccaccatccccatcccctcctccaccatattactat 11905099  T
Q  130 atgtcaccaccaccaccatcccc 152  Q
    | ||||||| | |||||||||||    
T  11905100 aagtcaccagctccaccatcccc 11905122  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 52821642 - 52821569
Alignment:
Q  22 ccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctcc 95  Q
    |||||||  |||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||| || |||||    
T  52821642 ccatatgagtacaagtctccacctccaccttccccatcccctccacctccttatgtatacaagtcaccacctcc 52821569  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 119
Target Start/End: Original strand, 11879526 - 11879626
Alignment:
Q  19 cctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctc 118  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| || || ||||||||||| ||||||   ||||||  |||||| || || ||||||||||| || ||||    
T  11879526 cctccttatgtgtacaagtcaccaccaccaccctcaccttccccaccaccaccatactactacaagagtcctccaccaccttctccttcacctccacctc 11879625  T
Q  119 c 119  Q
    |    
T  11879626 c 11879626  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 263
Target Start/End: Original strand, 11881952 - 11881992
Alignment:
Q  223 tacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccacc 263  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11881952 tacaagtcaccacccccaccatctccatcacctcctccacc 11881992  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 263
Target Start/End: Original strand, 11891186 - 11891226
Alignment:
Q  223 tacaaatctccacccccaccatctccttcacctcctccacc 263  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11891186 tacaagtcaccacccccaccatctccatcacctcctccacc 11891226  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 287
Target Start/End: Original strand, 11902038 - 11902198
Alignment:
Q  127 tacatgtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatatgtctataagtcccctcttcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttaca 226  Q
    |||| |||||||||||||||| |  |||||||||| ||||| ||||| || ||||| || |  || || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||    
T  11902038 tacaagtcaccaccaccaccaacttcttcaccaccacctccttatgtatacaagtcaccaccaccaccatctccttcaccgtcacctccttatgtgtaca 11902137  T
Q  227 aatctccacccccaccatctccttcacctcctccaccttatgtctttaagtcaccgccacc 287  Q
    | || ||||| || ||||| || ||||| || || ||||| || |  |||||||| |||||    
T  11902138 agtcaccaccacctccatccccatcacccccacctccttacgtgtacaagtcaccaccacc 11902198  T

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