View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1158_high_62 (Length: 289)

Name: NF1158_high_62
Description: NF1158
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1158_high_62
NF1158_high_62
[»] chr7 (52 HSPs)
chr7 (37-289)||(8197039-8197291)
chr7 (37-289)||(1317846-1318098)
chr7 (37-289)||(26089790-26090042)
chr7 (37-289)||(48987760-48988012)
chr7 (37-289)||(749923-750175)
chr7 (37-289)||(40684602-40684854)
chr7 (37-289)||(5187082-5187335)
chr7 (37-272)||(17726189-17726424)
chr7 (37-255)||(30602735-30602953)
chr7 (37-272)||(18437023-18437258)
chr7 (37-272)||(33404733-33404968)
chr7 (37-272)||(11899165-11899401)
chr7 (37-272)||(11339851-11340086)
chr7 (37-282)||(37285289-37285535)
chr7 (37-282)||(49158822-49159068)
chr7 (37-255)||(13963874-13964094)
chr7 (37-255)||(32627477-32627694)
chr7 (37-272)||(2438964-2439200)
chr7 (37-272)||(11879147-11879382)
chr7 (37-255)||(26113630-26113847)
chr7 (39-255)||(642632-642847)
chr7 (39-174)||(40922876-40923012)
chr7 (37-255)||(26120243-26120460)
chr7 (37-156)||(11299626-11299745)
chr7 (37-156)||(11307990-11308109)
chr7 (37-175)||(49150665-49150804)
chr7 (37-175)||(49157355-49157494)
chr7 (37-175)||(42058629-42058769)
chr7 (37-182)||(2281166-2281312)
chr7 (37-182)||(20019617-20019763)
chr7 (37-171)||(2026181-2026316)
chr7 (37-174)||(21757373-21757509)
chr7 (37-174)||(13453756-13453892)
chr7 (37-156)||(17468226-17468344)
chr7 (37-156)||(17584870-17584988)
chr7 (37-156)||(37379971-37380089)
chr7 (37-174)||(46174405-46174542)
chr7 (37-136)||(2388551-2388649)
chr7 (37-100)||(8213299-8213362)
chr7 (70-136)||(46649882-46649948)
chr7 (82-136)||(15838736-15838791)
chr7 (82-136)||(16843865-16843920)
chr7 (82-136)||(12461640-12461695)
chr7 (82-136)||(19439434-19439489)
chr7 (82-136)||(23521124-23521179)
chr7 (82-136)||(30271776-30271831)
chr7 (82-136)||(13019830-13019885)
chr7 (81-127)||(18607025-18607071)
chr7 (81-126)||(14281617-14281662)
chr7 (84-136)||(32771662-32771715)
chr7 (81-126)||(35962709-35962754)
chr7 (84-127)||(16073934-16073978)
[»] chr5 (58 HSPs)
chr5 (37-289)||(1111506-1111758)
chr5 (37-289)||(14614778-14615030)
chr5 (37-255)||(43029070-43029288)
chr5 (37-255)||(40010834-40011052)
chr5 (37-272)||(30781094-30781330)
chr5 (37-255)||(10686174-10686391)
chr5 (37-272)||(5582122-5582357)
chr5 (37-282)||(597303-597549)
chr5 (37-255)||(15461501-15461719)
chr5 (39-272)||(25846375-25846610)
chr5 (37-255)||(18894858-18895075)
chr5 (37-255)||(5454518-5454735)
chr5 (37-282)||(19800174-19800420)
chr5 (37-272)||(20340569-20340802)
chr5 (37-175)||(22248182-22248321)
chr5 (37-272)||(20347173-20347406)
chr5 (45-175)||(24008089-24008219)
chr5 (37-175)||(24794958-24795096)
chr5 (37-175)||(24800325-24800463)
chr5 (37-174)||(38013763-38013901)
chr5 (37-175)||(14882256-14882395)
chr5 (37-175)||(14888933-14889072)
chr5 (37-175)||(37539899-37540038)
chr5 (37-175)||(37547443-37547582)
chr5 (37-255)||(7507877-7508095)
chr5 (37-175)||(11995166-11995305)
chr5 (37-180)||(25853005-25853150)
chr5 (37-175)||(17938824-17938964)
chr5 (37-175)||(19508192-19508331)
chr5 (37-182)||(22501008-22501152)
chr5 (37-182)||(22507589-22507733)
chr5 (37-174)||(29746535-29746673)
chr5 (37-174)||(18566619-18566755)
chr5 (72-173)||(16774986-16775087)
chr5 (72-174)||(37566152-37566254)
chr5 (70-136)||(41877985-41878051)
chr5 (70-174)||(28259817-28259920)
chr5 (82-136)||(5341700-5341755)
chr5 (82-136)||(19362721-19362776)
chr5 (70-136)||(20990413-20990479)
chr5 (82-136)||(23076272-23076327)
chr5 (82-136)||(23081720-23081775)
chr5 (82-136)||(23544842-23544897)
chr5 (70-136)||(41877815-41877881)
chr5 (82-136)||(18941195-18941250)
chr5 (82-136)||(19801866-19801921)
chr5 (82-135)||(22379604-22379658)
chr5 (70-136)||(7773629-7773695)
chr5 (84-136)||(24057724-24057777)
chr5 (82-127)||(25419943-25419988)
chr5 (82-136)||(26650524-26650579)
chr5 (82-136)||(26922109-26922164)
chr5 (82-136)||(39608854-39608909)
chr5 (81-127)||(23112708-23112754)
chr5 (81-127)||(34829190-34829236)
chr5 (81-126)||(20937754-20937799)
chr5 (81-126)||(22312801-22312846)
chr5 (84-127)||(23444167-23444211)
[»] chr8 (45 HSPs)
chr8 (37-289)||(9205148-9205400)
chr8 (37-275)||(23224559-23224797)
chr8 (37-255)||(28980805-28981025)
chr8 (37-255)||(28986025-28986245)
chr8 (37-275)||(14736632-14736871)
chr8 (37-272)||(16887112-16887348)
chr8 (37-272)||(3224497-3224733)
chr8 (37-272)||(26485834-26486070)
chr8 (37-272)||(35541129-35541364)
chr8 (37-175)||(27909495-27909634)
chr8 (37-175)||(27955914-27956053)
chr8 (37-175)||(36800353-36800492)
chr8 (37-175)||(214023-214162)
chr8 (37-175)||(238092-238231)
chr8 (37-175)||(727646-727785)
chr8 (37-175)||(800147-800286)
chr8 (37-175)||(851540-851679)
chr8 (37-175)||(4520644-4520784)
chr8 (37-156)||(14563622-14563741)
chr8 (37-175)||(23117290-23117429)
chr8 (37-174)||(14765668-14765806)
chr8 (37-175)||(3697724-3697863)
chr8 (37-175)||(10956597-10956735)
chr8 (82-175)||(10948515-10948608)
chr8 (37-175)||(14746430-14746570)
chr8 (37-182)||(27345797-27345941)
chr8 (37-182)||(6588151-6588295)
chr8 (37-174)||(40144208-40144344)
chr8 (37-172)||(16266784-16266920)
chr8 (70-205)||(27948654-27948791)
chr8 (70-182)||(27873866-27873978)
chr8 (70-205)||(27889996-27890133)
chr8 (82-174)||(11392519-11392612)
chr8 (45-174)||(25701481-25701610)
chr8 (117-175)||(807950-808008)
chr8 (70-136)||(14416525-14416591)
chr8 (82-136)||(29299030-29299085)
chr8 (82-136)||(29305576-29305631)
chr8 (70-136)||(29328308-29328374)
chr8 (111-205)||(27902275-27902372)
chr8 (142-182)||(19296705-19296745)
chr8 (81-127)||(22063558-22063604)
chr8 (81-127)||(22176030-22176076)
chr8 (84-136)||(20006386-20006439)
chr8 (84-127)||(39363648-39363692)
[»] chr6 (33 HSPs)
chr6 (37-289)||(16223476-16223728)
chr6 (37-289)||(25463920-25464172)
chr6 (37-274)||(29159148-29159385)
chr6 (62-274)||(19096620-19096832)
chr6 (37-272)||(34133803-34134040)
chr6 (37-272)||(24369266-24369501)
chr6 (37-255)||(24362647-24362865)
chr6 (37-255)||(25315498-25315715)
chr6 (37-255)||(26202992-26203209)
chr6 (37-198)||(1070697-1070858)
chr6 (37-272)||(30799273-30799507)
chr6 (37-175)||(15332053-15332192)
chr6 (37-175)||(17309753-17309892)
chr6 (37-174)||(8069626-8069764)
chr6 (47-175)||(22406712-22406840)
chr6 (37-175)||(4106776-4106911)
chr6 (37-174)||(94427-94564)
chr6 (70-205)||(10470636-10470773)
chr6 (70-173)||(27767471-27767574)
chr6 (71-136)||(10464185-10464250)
chr6 (82-127)||(14582927-14582972)
chr6 (82-136)||(12447172-12447227)
chr6 (70-136)||(13128242-13128308)
chr6 (82-136)||(17207714-17207769)
chr6 (82-136)||(23021325-23021380)
chr6 (82-136)||(29925817-29925872)
chr6 (75-127)||(14133011-14133064)
chr6 (62-127)||(19300639-19300702)
chr6 (82-137)||(13940556-13940612)
chr6 (81-127)||(8768145-8768191)
chr6 (81-126)||(19726765-19726810)
chr6 (82-129)||(17027156-17027204)
chr6 (84-127)||(18786230-18786274)
[»] chr4 (52 HSPs)
chr4 (37-289)||(3266421-3266673)
chr4 (37-289)||(49240646-49240898)
chr4 (37-289)||(49749360-49749612)
chr4 (37-274)||(21396845-21397082)
chr4 (37-272)||(52500579-52500814)
chr4 (37-258)||(3259824-3260045)
chr4 (37-272)||(391194-391430)
chr4 (37-282)||(29382573-29382818)
chr4 (37-282)||(45142357-45142603)
chr4 (37-229)||(1583938-1584130)
chr4 (37-175)||(26395713-26395852)
chr4 (37-175)||(11937186-11937325)
chr4 (37-171)||(23435901-23436036)
chr4 (37-255)||(39266073-39266291)
chr4 (37-174)||(29448592-29448730)
chr4 (37-174)||(29455276-29455414)
chr4 (37-205)||(7359276-7359444)
chr4 (62-272)||(50082273-50082483)
chr4 (45-203)||(5938961-5939119)
chr4 (37-175)||(11202345-11202484)
chr4 (37-174)||(45959657-45959795)
chr4 (70-182)||(31665122-31665234)
chr4 (37-127)||(34772196-34772286)
chr4 (37-174)||(42955938-42956075)
chr4 (70-174)||(2972649-2972753)
chr4 (82-174)||(19128259-19128352)
chr4 (70-174)||(20895056-20895160)
chr4 (70-174)||(36037625-36037729)
chr4 (72-174)||(20889439-20889541)
chr4 (72-182)||(21881656-21881766)
chr4 (37-136)||(47872376-47872475)
chr4 (71-136)||(49548538-49548603)
chr4 (37-127)||(54844912-54845001)
chr4 (82-136)||(899666-899721)
chr4 (82-136)||(30396269-30396324)
chr4 (82-136)||(33097166-33097221)
chr4 (70-136)||(35462566-35462632)
chr4 (70-136)||(49548323-49548389)
chr4 (220-282)||(34772381-34772443)
chr4 (83-136)||(41404662-41404716)
chr4 (70-136)||(33221432-33221498)
chr4 (82-136)||(42220504-42220559)
chr4 (82-136)||(46044825-46044880)
chr4 (37-82)||(391154-391199)
chr4 (37-93)||(7356283-7356339)
chr4 (56-127)||(14910723-14910792)
chr4 (142-182)||(54826083-54826123)
chr4 (81-127)||(14485671-14485717)
chr4 (81-127)||(18212297-18212343)
chr4 (81-127)||(26077682-26077728)
chr4 (81-126)||(17000139-17000184)
chr4 (84-127)||(10972873-10972917)
[»] chr1 (38 HSPs)
chr1 (37-289)||(6740597-6740849)
chr1 (37-289)||(48427932-48428184)
chr1 (37-289)||(31535084-31535336)
chr1 (37-289)||(31563801-31564053)
chr1 (62-275)||(20396671-20396884)
chr1 (45-282)||(20299401-20299634)
chr1 (37-272)||(18026553-18026788)
chr1 (45-282)||(20292767-20293005)
chr1 (62-282)||(36211842-36212062)
chr1 (39-255)||(18418205-18418422)
chr1 (37-252)||(20277074-20277288)
chr1 (37-272)||(28556304-28556538)
chr1 (37-175)||(38907952-38908090)
chr1 (37-175)||(37682165-37682304)
chr1 (37-174)||(39094400-39094538)
chr1 (37-175)||(39189579-39189717)
chr1 (37-175)||(37675472-37675611)
chr1 (45-175)||(20570828-20570959)
chr1 (37-143)||(22185534-22185640)
chr1 (37-282)||(4231267-4231514)
chr1 (94-229)||(17149454-17149589)
chr1 (70-182)||(42626312-42626423)
chr1 (37-275)||(21963084-21963324)
chr1 (37-174)||(20076849-20076987)
chr1 (46-136)||(21920884-21920974)
chr1 (70-136)||(29602229-29602295)
chr1 (37-93)||(3652679-3652735)
chr1 (82-136)||(36615058-36615113)
chr1 (82-136)||(49328155-49328210)
chr1 (37-98)||(17146336-17146397)
chr1 (70-136)||(29596794-29596860)
chr1 (82-125)||(43088514-43088557)
chr1 (56-127)||(19961273-19961342)
chr1 (82-136)||(47484229-47484284)
chr1 (81-127)||(20242693-20242739)
chr1 (81-126)||(23066673-23066718)
chr1 (83-127)||(20824329-20824373)
chr1 (84-127)||(21698261-21698305)
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (62-289)||(71313-71540)
chr2 (37-271)||(24426658-24426892)
chr2 (37-274)||(2385737-2385973)
chr2 (37-272)||(44090905-44091140)
chr2 (37-272)||(27037325-27037561)
chr2 (37-255)||(27729589-27729807)
chr2 (37-272)||(4077501-4077736)
chr2 (37-175)||(20850270-20850409)
chr2 (37-175)||(21604845-21604984)
chr2 (37-174)||(1067177-1067315)
chr2 (37-174)||(24481513-24481651)
chr2 (37-175)||(4071457-4071596)
chr2 (37-174)||(30196428-30196566)
chr2 (37-255)||(31828693-31828911)
chr2 (37-255)||(31834045-31834263)
chr2 (37-255)||(36984399-36984617)
chr2 (37-174)||(1061794-1061932)
chr2 (37-175)||(34131-34270)
chr2 (37-174)||(11360157-11360291)
chr2 (37-275)||(22012948-22013164)
chr2 (37-282)||(28292800-28293047)
chr2 (37-174)||(35243948-35244086)
chr2 (37-174)||(11466152-11466289)
chr2 (70-182)||(27272365-27272477)
chr2 (70-174)||(17592455-17592558)
chr2 (70-174)||(14563945-14564045)
chr2 (82-136)||(36800680-36800735)
chr2 (82-136)||(45028632-45028687)
chr2 (72-136)||(13101133-13101197)
chr2 (82-136)||(15643249-15643304)
chr2 (82-136)||(25590161-25590216)
chr2 (82-136)||(32911442-32911497)
chr2 (81-127)||(9241492-9241538)
chr2 (81-127)||(22810042-22810088)
[»] chr3 (50 HSPs)
chr3 (37-289)||(43723899-43724151)
chr3 (37-289)||(47121209-47121461)
chr3 (37-289)||(47128577-47128829)
chr3 (37-289)||(28758961-28759213)
chr3 (37-289)||(50142604-50142856)
chr3 (37-272)||(21151309-21151544)
chr3 (37-282)||(2498885-2499131)
chr3 (69-282)||(6927382-6927596)
chr3 (37-282)||(54833029-54833274)
chr3 (37-175)||(10382001-10382140)
chr3 (37-175)||(10410654-10410793)
chr3 (37-272)||(10767818-10768053)
chr3 (37-174)||(50655937-50656075)
chr3 (37-255)||(3782621-3782839)
chr3 (37-174)||(53571183-53571321)
chr3 (37-272)||(45611728-45611953)
chr3 (37-175)||(9771864-9772003)
chr3 (37-163)||(29493615-29493742)
chr3 (125-271)||(16414136-16414281)
chr3 (37-175)||(12271343-12271482)
chr3 (45-175)||(38743004-38743135)
chr3 (39-154)||(14845137-14845253)
chr3 (37-174)||(48774567-48774705)
chr3 (70-205)||(54091654-54091791)
chr3 (70-182)||(16331536-16331648)
chr3 (70-182)||(16833329-16833441)
chr3 (70-174)||(15374748-15374852)
chr3 (82-174)||(29545113-29545206)
chr3 (70-136)||(3802605-3802671)
chr3 (70-136)||(54520154-54520220)
chr3 (72-181)||(19344097-19344205)
chr3 (82-136)||(8373914-8373969)
chr3 (70-136)||(9691396-9691462)
chr3 (82-136)||(11956585-11956640)
chr3 (70-136)||(20187849-20187915)
chr3 (70-136)||(20377229-20377295)
chr3 (82-136)||(30596848-30596903)
chr3 (70-136)||(54520369-54520435)
chr3 (70-136)||(3802767-3802833)
chr3 (82-136)||(32388006-32388061)
chr3 (82-127)||(18961077-18961122)
chr3 (72-136)||(46071099-46071163)
chr3 (82-127)||(49163272-49163317)
chr3 (82-136)||(12725113-12725168)
chr3 (82-136)||(29551042-29551097)
chr3 (65-127)||(13313907-13313967)
chr3 (81-127)||(23173921-23173967)
chr3 (67-127)||(12274375-12274435)
chr3 (75-127)||(17512698-17512751)
chr3 (84-127)||(15934960-15935004)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (37-282)||(18254-18499)
[»] scaffold0457 (1 HSPs)
scaffold0457 (37-251)||(12093-12307)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (37-272)||(104367-104602)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (37-255)||(18386-18603)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (39-174)||(50083-50219)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (37-175)||(13486-13625)
[»] scaffold0279 (1 HSPs)
scaffold0279 (37-175)||(5663-5802)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (37-174)||(31720-31858)
[»] scaffold0103 (2 HSPs)
scaffold0103 (37-174)||(19688-19824)
scaffold0103 (37-174)||(23760-23897)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (37-174)||(512478-512614)
scaffold0001 (82-136)||(179126-179181)
scaffold0001 (84-127)||(488350-488394)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (45-173)||(25128-25255)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (37-174)||(960-1098)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (45-175)||(4581-4710)
[»] scaffold0320 (1 HSPs)
scaffold0320 (37-282)||(972-1219)
[»] scaffold0276 (1 HSPs)
scaffold0276 (101-255)||(21948-22101)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (82-182)||(19337-19438)
scaffold0113 (82-182)||(15239-15340)
[»] scaffold0214 (1 HSPs)
scaffold0214 (37-174)||(15141-15278)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (70-174)||(12972-13076)
scaffold0310 (70-107)||(7825-7861)
[»] scaffold1427 (2 HSPs)
scaffold1427 (70-136)||(736-802)
scaffold1427 (81-127)||(999-1045)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (70-182)||(24759-24872)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (70-174)||(65246-65350)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (37-136)||(15182-15281)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (70-136)||(2126-2192)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (70-136)||(9866-9932)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (82-136)||(184-239)
scaffold0076 (81-127)||(51672-51718)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (82-136)||(74112-74167)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (82-136)||(137199-137254)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (70-182)||(101599-101710)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (82-136)||(20102-20157)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (82-136)||(30955-31010)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (82-136)||(247142-247197)
scaffold0009 (82-136)||(253656-253711)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (82-136)||(41353-41408)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (56-127)||(11912-11981)
[»] scaffold0261 (3 HSPs)
scaffold0261 (56-127)||(24472-24541)
scaffold0261 (84-127)||(10626-10670)
scaffold0261 (84-127)||(18805-18849)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (81-127)||(139-185)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (90-127)||(5377-5415)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (81-127)||(7409-7455)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (81-127)||(36789-36835)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (81-127)||(41588-41634)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (81-127)||(10076-10122)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (81-127)||(20489-20535)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (81-126)||(14469-14514)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (81-126)||(42090-42135)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (81-122)||(50948-50989)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (81-126)||(17637-17682)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (84-127)||(6293-6337)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (84-127)||(4091-4135)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (82-129)||(19439-19487)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (84-127)||(55912-55956)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (84-127)||(38723-38767)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 52)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 37 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 8197291 - 8197039
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8197291 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 8197192  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8197191 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtactcatcaattcagcaatcaaatcaa 8197092  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacactacaacactaaggt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  8197091 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaggt 8197039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 37 - 289
Target Start/End: Original strand, 1317846 - 1318098
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1317846 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 1317945  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||    
T  1317946 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcaatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 1318045  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacactacaacactaaggt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1318046 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaggt 1318098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 37 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 26090042 - 26089790
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26090042 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 26089943  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||    
T  26089942 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcaatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 26089843  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacactacaacactaaggt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  26089842 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaggt 26089790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 37 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 48988012 - 48987760
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48988012 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 48987913  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||    
T  48987912 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcgatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 48987813  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacactacaacactaaggt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  48987812 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaggt 48987760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 37 - 289
Target Start/End: Original strand, 749923 - 750175
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  749923 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 750022  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||    
T  750023 atgcaactccatgtgactcaactttaacaacatgtatgattcgatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 750122  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacactacaacactaaggt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  750123 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaggt 750175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 37 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 40684854 - 40684602
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40684854 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 40684755  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||    
T  40684754 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcgatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaacacaa 40684655  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacactacaacactaaggt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  40684654 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaggt 40684602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 37 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 5187335 - 5187082
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5187335 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgcgtatatctacatacaactgaccatgc 5187236  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  5187235 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaaca 5187136  T
Q  236 accacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacactacaacactaaggt 289  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  5187135 accacaataatgcataatcacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaggt 5187082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17726424 - 17726189
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17726424 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 17726325  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  17726324 atgcaactccatatgattccactttaacaatatgtatgattcaataattagcatacatttcaaccatcatcagtaatcatcaattcagtaattcaatcaa 17726225  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaa 272  Q
    ||| ||||||||||||||| ||  ||| ||||||||    
T  17726224 ccaaaataatgcataattatatataaccatgctcaa 17726189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 30602953 - 30602735
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30602953 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 30602854  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||  ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||    
T  30602853 atgcaactctatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcaataattagcatacatttcaaccatcatcagtattcattaatgcagcaatccaatcaa 30602754  T
Q  237 ccacaataatgcataatta 255  Q
    ||| || ||||||||||||    
T  30602753 ccaaaacaatgcataatta 30602735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18437258 - 18437023
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18437258 gctgttgagcaactagtactccaggactgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 18437159  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||    
T  18437158 atgcaactccatatgactccactttaacaatatgtatgattcaataattagcatacatttcaaccatcatcagtaatcatcaatccagtaattcaatcaa 18437059  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaa 272  Q
    ||| ||||||||||||||| ||  ||| ||||||||    
T  18437058 ccaaaataatgcataattatatataaccatgctcaa 18437023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Original strand, 33404733 - 33404968
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33404733 gctgttgagcaactagtactctaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 33404832  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||    
T  33404833 atgcaactccatatgactccactttaacaatatgtatgattcaataattagcatacatttcaaccatcatcagtaatcatcaatccagtaattcaatcaa 33404932  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaa 272  Q
    ||| ||||||||||||||| ||  ||| ||||||||    
T  33404933 ccaaaataatgcataattatatataaccatgctcaa 33404968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 11899401 - 11899165
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11899401 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 11899302  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga-ctcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatca 235  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  |||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||  |||||    
T  11899301 atgcaactccatatgactccactttaacaatatgtatgatttcaataattagcatacatttcaaccatcatcagtaatcatcaatccagtaattcaatca 11899202  T
Q  236 accacaataatgcataattacatgaaactatgctcaa 272  Q
    |||| ||||||||||||||| ||  ||| ||||||||    
T  11899201 accaaaataatgcataattatatataaccatgctcaa 11899165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Original strand, 11339851 - 11340086
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11339851 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 11339950  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||| || ||||||||||| || || |||||||| |||| | || ||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||| | |  ||||||    
T  11339951 atgcaactcaatatgactccactttaataatatgtatgattcaacaattggcatacatttcaaccatcatcagtaatcattaatccagtagttcaatcaa 11340050  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaa 272  Q
    ||| ||||||||||||||| ||  ||| ||||||||    
T  11340051 ccaaaataatgcataattatatataaccatgctcaa 11340086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 37 - 282
Target Start/End: Original strand, 37285289 - 37285535
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||   || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37285289 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcatctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 37285388  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatca 235  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||  |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  37285389 atgcaaacttcatgtgacaccacttaaacaacatgtgtgattcaataaataacatacatttcagtcatcatcagtaatcatcaatccagcaatccaatca 37285488  T
Q  236 accacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacactacaaca 282  Q
     ||  ||||||||||||||||||  ||| ||||| || |||||||||    
T  37285489 tcccaaataatgcataattacatataaccatgctaaaaactacaaca 37285535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 282
Target Start/End: Original strand, 49158822 - 49159068
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49158822 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 49158921  T
Q  137 atgc-aactccatgt-gactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatc-atcaattcagcaatcaaat 233  Q
    |||| |||||||| |  ||||||||| |||||||||||||  | |||| |  ||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  49158922 atgcaaactccatataaactccactttaacaacatgtatg-gttaataataagcataca-ttcagtcatcatcagcaatcaatcaattcagcaatcaaat 49159019  T
Q  234 caaccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacactacaaca 282  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49159020 catccagaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaaca 49159068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 13964094 - 13963874
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13964094 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 13963995  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatca 235  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  13963994 atgcaaactccatgtgacaccacttaaacaacatgtatgattcaataaataacatacatttcagtcatcatcagtaatcatcaatccaacaatccaatca 13963895  T
Q  236 acca-caataatgcataatta 255  Q
     |||  ||||||||| |||||    
T  13963894 tccagaaataatgcacaatta 13963874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Original strand, 32627477 - 32627694
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32627477 gctgttgagcaactagtactccagaaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 32627576  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||||||  |  |||||| ||||  |||||||| |||||||| || |||||||  || |||    
T  32627577 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 32627675  T
Q  237 ccacaataatgcataatta 255  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  32627676 ccaaaataatgcataatta 32627694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Original strand, 2438964 - 2439200
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2438964 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctatatacaactgaccatgca 2439063  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaa-catgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatca 235  Q
    |||||||||  | ||||||||||| || ||  |||||||| |||||  || ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||   |||||    
T  2439064 atgcaactcattatgactccactttaataattatgtatgattcaatgattagcatacatttcaaccatcatcagtaatcatcaatccagtaaatcaatca 2439163  T
Q  236 accacaataatgcataattacatgaaactatgctcaa 272  Q
    |||| | ||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  2439164 accaaagtaatgcataattatatgtaaccatgctcaa 2439200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Original strand, 11879147 - 11879382
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11879147 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttcatgcatatgcaatggacctacttgtttatatctacatacaactgaccatgca 11879246  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||| |  |||  |  |||||||||||  ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||    
T  11879247 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattatataagtaacatacatttcaaccatcatcagtattcatcaatccaacaatccaatcaa 11879346  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaa 272  Q
    ||| |||||||  |||||| ||  ||| ||||||||    
T  11879347 ccaaaataatgtgtaattatatacaaccatgctcaa 11879382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 26113847 - 26113630
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26113847 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttaatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 26113748  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||||||  |  |||||| ||||  |||||||| |||||||| || ||||| |  || |||    
T  26113747 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcagttcaaacaa 26113649  T
Q  237 ccacaataatgcataatta 255  Q
    |||  ||||||||||||||    
T  26113648 ccaatataatgcataatta 26113630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Original strand, 642632 - 642847
Alignment:
Q  39 tgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaat 138  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  642632 tgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaaatgaccatgcaat 642731  T
Q  139 gcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaacc 238  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||| | ||  |||||| ||||   ||||||||||||| | ||| ||| | |  ||||||||    
T  642732 gcaactcaatatgactccactttaacaatatgtatgattcaacaattgacataca-ttcaactatcatcagtaatcgttaatccagtagttcaatcaacc 642830  T
Q  239 acaataatgcataatta 255  Q
    | |||||||||||||||    
T  642831 aaaataatgcataatta 642847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 39 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 40923012 - 40922876
Alignment:
Q  39 tgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaat 138  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40923012 tgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaat 40922913  T
Q  139 gcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatg 174  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  40922912 gcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatg 40922876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 26120460 - 26120243
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26120460 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtggatatctacatacaactgaccatgca 26120361  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    |||||||  ||||||||||||||  || || |||||||| ||||||  |  |||||| ||||  |||||||| |||||||| || ||||| |  || |||    
T  26120360 atgcaacaacatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcagttcaaacaa 26120262  T
Q  237 ccacaataatgcataatta 255  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  26120261 ccaaaataatgcataatta 26120243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 11299745 - 11299626
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11299745 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 11299646  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcc 156  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11299645 atgcaactccatgtgactcc 11299626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 11308109 - 11307990
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11308109 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 11308010  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcc 156  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11308009 atgcaactccatgtgactcc 11307990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Original strand, 49150665 - 49150804
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49150665 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 49150764  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 175  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  49150765 aatgcaactccatgtgaccccacttaactaacatgtatga 49150804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Original strand, 49157355 - 49157494
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49157355 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 49157454  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 175  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  49157455 aatgcaactccatgtgaccccacttaactaacatgtatga 49157494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Original strand, 42058629 - 42058769
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42058629 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 42058728  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatga 175  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  42058729 aatgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatga 42058769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 37 - 182
Target Start/End: Original strand, 2281166 - 2281312
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2281166 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctatttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgc 2281265  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaata 182  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  2281266 aatgcaactccatatgacaccacttaaatgacatgtatgactcaata 2281312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 37 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 20019763 - 20019617
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20019763 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 20019664  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaata 182  Q
    |    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  20019663 atacaaactccatgtgactccacttaaaaaacatgtatgattcaata 20019617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 2026316 - 2026181
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2026316 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagctctcaccgttgttttatgcatatggaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 2026217  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgt 171  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  2026216 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgt 2026181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Original strand, 21757373 - 21757509
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    |||||||  |||||||| |||||| ||   || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21757373 gctgttgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 21757471  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 174  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21757472 tacaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 21757509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13453892 - 13453756
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    |||||||  |||||||| |||||| ||   || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13453892 gctgttgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 13453794  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 174  Q
        |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13453793 tacaaacttcatgtgactccacttaaataacatgtatg 13453756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 17468344 - 17468226
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||   || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17468344 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 17468246  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcc 156  Q
        ||||||||||||||||    
T  17468245 tacaaactccatgtgactcc 17468226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Original strand, 17584870 - 17584988
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||   || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17584870 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 17584968  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcc 156  Q
        ||||||||||||||||    
T  17584969 tacaaactccatgtgactcc 17584988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Original strand, 37379971 - 37380089
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||   || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37379971 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 37380069  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcc 156  Q
        ||||||||||||||||    
T  37380070 tacaaactccatgtgactcc 37380089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Original strand, 46174405 - 46174542
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||   || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46174405 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcccctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacatgaccatgc 46174503  T
Q  136 aatgca-actccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 174  Q
     || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46174504 -atacatactccatatgactccacttaaacaacatgtatg 46174542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 2388649 - 2388551
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||   || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2388649 gctgttgagcaactagtgctccagaacatgagtcctctctgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 2388551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 8213362 - 8213299
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatgga 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8213362 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatgga 8213299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 70 - 136
Target Start/End: Original strand, 46649882 - 46649948
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46649882 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 46649948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 15838736 - 15838791
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15838736 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 15838791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 16843920 - 16843865
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16843920 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 16843865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 12461640 - 12461695
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12461640 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 12461695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 19439434 - 19439489
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19439434 tttatgcatattctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 19439489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 23521124 - 23521179
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23521124 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 23521179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 30271831 - 30271776
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30271831 tttatgcatatgctgtggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 30271776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 13019830 - 13019885
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13019830 tttatgcatatgttatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 13019885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Original strand, 18607025 - 18607071
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18607025 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 18607071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 14281662 - 14281617
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 126  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14281662 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 14281617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 136
Target Start/End: Original strand, 32771662 - 32771715
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  32771662 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaacttacaatgca 32771715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 35962754 - 35962709
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 126  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  35962754 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 35962709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 16073978 - 16073934
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16073978 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 16073934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 58)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 37 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 1111758 - 1111506
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1111758 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 1111659  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1111658 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtactcatcaattcagcaatcaaatcaa 1111559  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacactacaacactaaggt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1111558 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaggt 1111506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 37 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 14615030 - 14614778
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14615030 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 14614931  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14614930 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcactactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 14614831  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacactacaacactaaggt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  14614830 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaggt 14614778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Original strand, 43029070 - 43029288
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43029070 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 43029169  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  43029170 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttaaatcatcatcagtattcatcaattcagcaatccaatcaa 43029269  T
Q  237 ccacaataatgcataatta 255  Q
    ||| || |||| |||||||    
T  43029270 ccaaaacaatgtataatta 43029288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 40011052 - 40010834
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40011052 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatgaacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 40010953  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  40010952 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttaaatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 40010853  T
Q  237 ccacaataatgcataatta 255  Q
    ||| ||||||| |||||||    
T  40010852 ccaaaataatgtataatta 40010834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Original strand, 30781094 - 30781330
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30781094 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 30781193  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||  |||||||||||  |||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||    
T  30781194 atgcaactccatgtgactccactttaacaatatgtatgattcaataattaacatacatttcaaccatcatcaataatcatcaatccaacaattcaatcaa 30781293  T
Q  237 -ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaa 272  Q
     ||| ||||||||||||||| ||  ||| ||||||||    
T  30781294 cccaaaataatgcataattatatataaccatgctcaa 30781330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Original strand, 10686174 - 10686391
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10686174 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccataca 10686273  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  10686274 atgcaacttcatgtgattccactt-aacaacatgtatgattcaataattaacatacatttaaatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 10686372  T
Q  237 ccacaataatgcataatta 255  Q
    ||| || ||||||||||||    
T  10686373 ccaaaacaatgcataatta 10686391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 5582357 - 5582122
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5582357 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 5582258  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||||||  |  |||||||||||  ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||    
T  5582257 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacatttcaaccatcatcagtattcatcaatccaacaatccaatcaa 5582158  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaa 272  Q
    ||| ||||||| ||||||| ||  ||| ||||||||    
T  5582157 ccaaaataatgtataattatatacaaccatgctcaa 5582122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 282
Target Start/End: Original strand, 597303 - 597549
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  597303 gctgttgagcaactagtactcctggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 597402  T
Q  137 atgc-aactccatgt-gactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatc-atcaattcagcaatcaaat 233  Q
    |||| |||||||| |  ||||||||| |||||||||||||  | |||| |  ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  597403 atgcaaactccatataaactccactttaacaacatgtatg-gttaataataagcataca-ttcagtcatcatcagtaatcaatcaattcagcaatcaaat 597500  T
Q  234 caaccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacactacaaca 282  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  597501 catccagaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaaca 597549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Original strand, 15461501 - 15461719
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15461501 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaacggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 15461600  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||||||  |  |||||||||||  |||||||| |||||||| || |||||||  || |||    
T  15461601 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacatttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 15461700  T
Q  237 ccacaataatgcataatta 255  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  15461701 ccaaaataatgcataatta 15461719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 39 - 272
Target Start/End: Original strand, 25846375 - 25846610
Alignment:
Q  39 tgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaat 138  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25846375 tgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaat 25846474  T
Q  139 gcaactc--catgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    |||||||   || ||||||||||| |||||||||||||| |||| | || ||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||| | |  ||||||    
T  25846475 gcaactcaatatatgactccactttaacaacatgtatgattcaacaattggcatacatttcaaccatcatcagtaatcattaatccagtagttcaatcaa 25846574  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaa 272  Q
    ||  ||||||||||||||| ||  ||| ||||||||    
T  25846575 cccaaataatgcataattatatataaccatgctcaa 25846610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18895075 - 18894858
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18895075 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 18894976  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||||||  |  |||||| ||||  |||||||| |||||||| || |||||||  || |||    
T  18894975 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 18894877  T
Q  237 ccacaataatgcataatta 255  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  18894876 ccaaaataatgcataatta 18894858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Original strand, 5454518 - 5454735
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5454518 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 5454617  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    |||||||||||||||||| ||||  || || |||||||| ||||||  |  |||||| ||||  |||||||| |||||||| || |||||||  || |||    
T  5454618 atgcaactccatgtgacttcactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 5454716  T
Q  237 ccacaataatgcataatta 255  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  5454717 ccaaaataatgcataatta 5454735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19800420 - 19800174
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||   || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19800420 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccactgttttatgcatatgcagtggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 19800321  T
Q  136 aatgcaactccatgtga-ctccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatc 234  Q
    |    |||||||| | | ||||||||||||||||||||||  | |||| |  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  19800320 atacaaactccatataaactccacttaaacaacatgtatggtt-aataataagcatacatttcagtcatcatcagtaatcaacaattcagcaatccaatc 19800222  T
Q  235 aaccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacactacaaca 282  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19800221 atccagaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaaca 19800174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Original strand, 20340569 - 20340802
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||   || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340569 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatgaacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 20340668  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatca 235  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||  |  ||| ||||||| |||||||   ||||||||||| |||||||| |||||    
T  20340669 atgcaaactccatgtgacaccacttaaacaacatgtgtgattcaataaataacatccatttcagtcatcat---taatcatcaatccagcaatccaatca 20340765  T
Q  236 accacaataatgcataattacatgaaactatgctcaa 272  Q
     ||  ||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  20340766 tcccaaataatgcataattacatataaccatgctcaa 20340802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22248321 - 22248182
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22248321 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 22248222  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatga 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22248221 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatga 22248182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Original strand, 20347173 - 20347406
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20347173 gctgttgagcaactagtactccaggacatgaatcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 20347272  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatca 235  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||  |  ||| ||||||| |||||||   ||||||||||| |||||||| |||||    
T  20347273 atgcaaactccatgtgacaccacttaaacaacatgtgtgattcaataaataacatccatttcagtcatcat---taatcatcaatccagcaatccaatca 20347369  T
Q  236 accacaataatgcataattacatgaaactatgctcaa 272  Q
     ||  |||||| |||||||||||  ||| ||||||||    
T  20347370 tcccaaataattcataattacatataaccatgctcaa 20347406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 45 - 175
Target Start/End: Original strand, 24008089 - 24008219
Alignment:
Q  45 gcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaact 144  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24008089 gcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacatgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaact 24008188  T
Q  145 ccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 175  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24008189 ccatgtgactccacttaaacgacatgtatga 24008219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 24795096 - 24794958
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24795096 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 24794997  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  24794996 atgcaactccatgtgactccacttaatcgacaagtatga 24794958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 24800463 - 24800325
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24800463 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 24800364  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  24800363 atgcaactccatgtgactccacttaatcgacaagtatga 24800325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Original strand, 38013763 - 38013901
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38013763 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 38013862  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatg 174  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  38013863 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatg 38013901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 14882395 - 14882256
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14882395 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 14882296  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14882295 aatgcaactccatgtgactccacttaactaacatgtatga 14882256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 14889072 - 14888933
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14889072 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 14888973  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14888972 aatgcaactccatgtgactccacttaactaacatgtatga 14888933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 37540038 - 37539899
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37540038 gctgttgagtaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 37539939  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactt-aaacaacatgtatga 175  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  37539938 atgcaactccatgtgactccaattaaaacaacatgtatga 37539899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 37547582 - 37547443
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37547582 gctgttgagtaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 37547483  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactt-aaacaacatgtatga 175  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  37547482 atgcaactccatgtgactccaattaaaacaacatgtatga 37547443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 7508095 - 7507877
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7508095 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgc 7507996  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatca 235  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||  | |||||||  |||  ||||||||||| ||   ||| ||||| || |||||    
T  7507995 aatgcaactccatatgacaccacttaaatgacatgtatgactcaataaatagcataca-atcaaccatcatcagtattcggtaatgcagcactccaatca 7507897  T
Q  236 accacaataatgcataatta 255  Q
    |||| || ||||||| ||||    
T  7507896 accaaaacaatgcatgatta 7507877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Original strand, 11995166 - 11995305
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11995166 gctgttgagcaactagtactctaggaccgaagccctcaccgcagttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 11995265  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatga 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  11995266 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatga 11995305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 180
Target Start/End: Original strand, 25853005 - 25853150
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25853005 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 25853104  T
Q  137 atgcaactc--catgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaa 180  Q
    |||||||||   || ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  25853105 atgcaactcaatatatgactccactttaacaacatgtatgattcaa 25853150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 17938964 - 17938824
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17938964 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 17938865  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccactta-aacaacatgtatga 175  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  17938864 aatgcaactccatgtgactccaattattacaacatgtatga 17938824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Original strand, 19508192 - 19508331
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||   || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19508192 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgccatagacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 19508291  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 175  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19508292 atgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 19508331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 182
Target Start/End: Original strand, 22501008 - 22501152
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||  ||   || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22501008 gctgttgagcaactagtgctccaagacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 22501106  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaata 182  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22501107 tacaaactccatgtgactccacttaaacaacatatatgattcaata 22501152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 182
Target Start/End: Original strand, 22507589 - 22507733
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||   || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22507589 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtatatatctacatacaactgaccatgca 22507687  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaata 182  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22507688 tacaaactccatgtgactccacttaaacaacatctatgattcaata 22507733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 29746673 - 29746535
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29746673 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 29746574  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 174  Q
    |    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  29746573 atacaaactccatatgacttcacttaaacaacatgtatg 29746535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Original strand, 18566619 - 18566755
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||   || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18566619 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaattgaccatgca 18566717  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 174  Q
        |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  18566718 tacaaactccttgtgactccacttaaacaacgtgtatg 18566755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 72 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 16775087 - 16774986
Alignment:
Q  72 tctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaacat 169  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16775087 tctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccacttaaataacat 16774990  T
Q  170 gtat 173  Q
    ||||    
T  16774989 gtat 16774986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 174
Target Start/End: Original strand, 37566152 - 37566254
Alignment:
Q  72 tctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaacat 169  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  37566152 tctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccaattatacaacat 37566249  T
Q  170 gtatg 174  Q
    |||||    
T  37566250 gtatg 37566254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 41878051 - 41877985
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41878051 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 41877985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 28259920 - 28259817
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaacaaca 168  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||   |||| |||||||| ||| ||||||    
T  28259920 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca-tacattcccatatgactccaattatacaaca 28259823  T
Q  169 tgtatg 174  Q
    ||||||    
T  28259822 tgtatg 28259817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 5341755 - 5341700
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5341755 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 5341700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 19362721 - 19362776
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19362721 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 19362776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 136
Target Start/End: Original strand, 20990413 - 20990479
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20990413 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 20990479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23076327 - 23076272
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23076327 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 23076272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23081775 - 23081720
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23081775 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 23081720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23544897 - 23544842
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23544897 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 23544842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 41877881 - 41877815
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41877881 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 41877815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 18941250 - 18941195
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18941250 tttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 18941195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 19801921 - 19801866
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19801921 tttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 19801866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 135
Target Start/End: Original strand, 22379604 - 22379658
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22379604 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 22379658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 7773695 - 7773629
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  7773695 cctctccgctgttt-atgcatatgaaatggacccactcgtgtatttctacatacaactagaccatgca 7773629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 136
Target Start/End: Original strand, 24057724 - 24057777
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  24057724 tatgcatatgctatggacccacttgtgtatatcaacatacaacttgaccatgca 24057777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 127
Target Start/End: Original strand, 25419943 - 25419988
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25419943 tttatgcatatgttatggacccacttgtgtatatctacatacaact 25419988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 26650524 - 26650579
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26650524 tttatgcatatgctatggactcactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 26650579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 26922109 - 26922164
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26922109 tttatgcatatgctatggactcactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 26922164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 39608909 - 39608854
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39608909 tttatgcatatgttatggactcacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 39608854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 23112754 - 23112708
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23112754 ttttatgcttatgcaaatgacccacttgtgtatatctacatacaact 23112708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Original strand, 34829190 - 34829236
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34829190 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 34829236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Original strand, 20937754 - 20937799
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 126  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20937754 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 20937799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 22312846 - 22312801
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 126  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22312846 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 22312801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 23444211 - 23444167
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  23444211 tatgcttatgcaatggactctacttgtgtatatctacataaaact 23444167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 45)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 37 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 9205400 - 9205148
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9205400 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 9205301  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||    
T  9205300 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcaatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 9205201  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacactacaacactaaggt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  9205200 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaggt 9205148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 37 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23224797 - 23224559
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23224797 gctgttgagcaactagtactccaggaacgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 23224698  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  23224697 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattagcatacatttcaatcatcatcagtaattatcaactcagcaatccaatcaa 23224598  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacac 275  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23224597 ccaaaataatgcataattacatgaaactatgctcaacac 23224559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Original strand, 28980805 - 28981025
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28980805 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 28980904  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa--acaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatc 234  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28980905 atgcaactccatgtgactccaattaaatacaacatgtatgattcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtactcatcaattcagcaatcaaatc 28981004  T
Q  235 aaccacaataatgcataatta 255  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  28981005 aatcacaataatgtataatta 28981025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Original strand, 28986025 - 28986245
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28986025 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 28986124  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa--acaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatc 234  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28986125 atgcaactccatgtgactccaattaaatacaacatgtatgattcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtactcatcaattcagcaatcaaatc 28986224  T
Q  235 aaccacaataatgcataatta 255  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  28986225 aatcacaataatgtataatta 28986245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 37 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 14736871 - 14736632
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14736871 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctattttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 14736772  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactt-aaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||||||  || ||    
T  14736771 atgcaactccatgtgactccacttaaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttaaatcatcatcaatattcatcaatccagcaattcaaaca 14736672  T
Q  236 accacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacac 275  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14736671 accaacataatgcataattacatgaaactatgctcaacac 14736632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 16887348 - 16887112
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16887348 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 16887249  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacat-ttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||| |  | |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  16887248 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatctaaaatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatca 16887149  T
Q  236 accacaataatgcataattacatgaaactatgctcaa 272  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||  ||| ||||||||    
T  16887148 accaaaataatgtataattatatacaaccatgctcaa 16887112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 3224733 - 3224497
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3224733 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 3224634  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatca 235  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||  | |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  3224633 atgcaaactccatgtgacaccacttgaacaacatgtatgattcaataaatagcatacatttcagtcatcaacagtaatcatcaatccagcaatccaatca 3224534  T
Q  236 accacaataatgcataattacatgaaactatgctcaa 272  Q
     ||  |||||| |||||||||||  ||| ||||||||    
T  3224533 tcccaaataatacataattacatataaccatgctcaa 3224497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 26486070 - 26485834
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26486070 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccactgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaattgaccatgca 26485971  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatca 235  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  26485970 atgcaaactccatgtgacaccacttaaacaacatgtatgattcaataaataacatacacttcagtcatcatcagtaatcatcaatccaacaatccaatca 26485871  T
Q  236 accacaataatgcataattacatgaaactatgctcaa 272  Q
     ||  ||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  26485870 tcccaaataatgcataattacatataaccatgctcaa 26485834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Original strand, 35541129 - 35541364
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35541129 gctgttgagcaactcgtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 35541228  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||| || ||||||| ||| || || |||||||| |||| | || ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||| ||| | |  ||||||    
T  35541229 atgcaactcaatatgactcccctttaataatatgtatgattcaacaattggcatacatttcaaccatcatcagtaaccattaatccagtagttcaatcaa 35541328  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaa 272  Q
    ||| ||||||||||||||| ||  ||| ||||||||    
T  35541329 ccaaaataatgcataattatatataaccatgctcaa 35541364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 27909634 - 27909495
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27909634 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 27909535  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatga 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  27909534 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatga 27909495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 27956053 - 27955914
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27956053 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 27955954  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatga 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  27955953 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatga 27955914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 36800492 - 36800353
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36800492 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 36800393  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatga 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  36800392 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatga 36800353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Original strand, 214023 - 214162
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  214023 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 214122  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  214123 aatgcaactccatgtgactccacttaatcgacatgtatga 214162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 238231 - 238092
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  238231 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 238132  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  238131 aatgcaactccatgtgactccacttaatcgacatgtatga 238092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Original strand, 727646 - 727785
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  727646 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 727745  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  727746 aatgcaactccatgtgactccacttaatcgacatgtatga 727785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Original strand, 800147 - 800286
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  800147 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 800246  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  800247 aatgcaactccatgtgactccacttaatcgacatgtatga 800286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Original strand, 851540 - 851679
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  851540 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 851639  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  851640 aatgcaactccatgtgactccacttaatcgacatgtatga 851679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 4520784 - 4520644
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4520784 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 4520685  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatga 175  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  4520684 aatgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatga 4520644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 156
Target Start/End: Original strand, 14563622 - 14563741
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14563622 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 14563721  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcc 156  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14563722 atgcaactccatgtgactcc 14563741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Original strand, 23117290 - 23117429
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23117290 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 23117389  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 175  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23117390 atgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 23117429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Original strand, 14765668 - 14765806
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14765668 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccactgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 14765767  T
Q  137 atgcaactccatgtgactcc-acttaaacaacatgtatg 174  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  14765768 atgcaactccatgtgactccaatttatacaacatgtatg 14765806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Original strand, 3697724 - 3697863
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3697724 gctgttgagcaactagtactccagtacatgagtcctcaccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 3697823  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 175  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3697824 atgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 3697863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 10956735 - 10956597
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |   || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10956735 gctgttgagcaactagtactccagggcatgagtcctctccgttgttttatgcatatgcaatggatctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 10956636  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10956635 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 10956597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 82 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 10948608 - 10948515
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10948608 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 10948515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 14746570 - 14746430
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||   || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14746570 gctgttgagcaactagtgctccaggacttgagtcctctccgctgtttttatgcatatgcaatcgacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 14746471  T
Q  136 aatgc-aactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 175  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14746470 aatgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 14746430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 37 - 182
Target Start/End: Original strand, 27345797 - 27345941
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||   || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27345797 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 27345895  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaata 182  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27345896 tacaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaata 27345941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 182
Target Start/End: Original strand, 6588151 - 6588295
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||   || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6588151 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 6588249  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaata 182  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  6588250 tacaaactccatgtgactccacttaaacaacatctatgattcaata 6588295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 40144344 - 40144208
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||   || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40144344 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 40144246  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 174  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40144245 tacaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 40144208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 37 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 16266920 - 16266784
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgt--atatctacatacaactgaccatg 134  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||   || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16266920 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatatctacatacaactgaccatg 16266822  T
Q  135 caatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgta 172  Q
    ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16266821 catacaaactccatgtgactccacttaaacaacatgta 16266784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 205
Target Start/End: Original strand, 27948654 - 27948791
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaac 167  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||||||| |||||    
T  27948654 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccacttatacaac 27948751  T
Q  168 atgtatgactcaatacttt--gcatacatttcattcatca 205  Q
    |||||||| |||||| |||  ||||||||| || ||||||    
T  27948752 atgtatgattcaataattttagcatacattacagtcatca 27948791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 182
Target Start/End: Original strand, 27873866 - 27873978
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaac 167  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||||||| |||||    
T  27873866 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccacttatacaac 27873963  T
Q  168 atgtatgactcaata 182  Q
    |||||||| ||||||    
T  27873964 atgtatgattcaata 27873978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 205
Target Start/End: Original strand, 27889996 - 27890133
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatac-aactgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaac 167  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || || ||||||| |||||||||||| |||||    
T  27889996 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaaattgaccatgc-atacatactccatatgactccacttatacaac 27890093  T
Q  168 atgtatgactcaatacttt--gcatacatttcattcatca 205  Q
    |||||||| |||||| |||  ||||||||| || ||||||    
T  27890094 atgtatgattcaataattttagcatacattacagtcatca 27890133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 82 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 11392612 - 11392519
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  11392612 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccacttatacaacatgtatg 11392519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 25701610 - 25701481
Alignment:
Q  45 gcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgca-a 142  Q
    ||||||||| |||||| ||   || ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | || |    
T  25701610 gcaactagtgctccaggacatgagtcctttccgctgttt-atgcttatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgatcatgca-tacata 25701513  T
Q  143 ctccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 174  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  25701512 ctccatatgactccacttatacaacatgtatg 25701481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 117 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 808008 - 807950
Alignment:
Q  117 tacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  808008 tacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaatcgacatgtatga 807950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 70 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 14416591 - 14416525
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14416591 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 14416525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 29299085 - 29299030
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29299085 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 29299030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 29305631 - 29305576
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29305631 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 29305576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 136
Target Start/End: Original strand, 29328308 - 29328374
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29328308 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 29328374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 205
Target Start/End: Original strand, 27902275 - 27902372
Alignment:
Q  111 tatatctacatacaact-gaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatacttt--gcatacatttcattcatca 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||  ||||||||| || ||||||    
T  27902275 tatatctacatacaacttgaccatgca-tacatactccatatgactccacttatacaacatgtatgattcaataattttagcatacattacagtcatca 27902372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 182
Target Start/End: Original strand, 19296705 - 19296745
Alignment:
Q  142 actccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaata 182  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19296705 actccatatgactccacttaaacaacatgtatgattcaata 19296745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 22063604 - 22063558
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22063604 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 22063558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 22176076 - 22176030
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22176076 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 22176030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 136
Target Start/End: Original strand, 20006386 - 20006439
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20006386 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaacttacaatgca 20006439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Original strand, 39363648 - 39363692
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  39363648 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 39363692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 33)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 37 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16223728 - 16223476
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16223728 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 16223629  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||    
T  16223628 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcaatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 16223529  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacactacaacactaaggt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16223528 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaggt 16223476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 37 - 289
Target Start/End: Original strand, 25463920 - 25464172
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25463920 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 25464019  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||    
T  25464020 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcgatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 25464119  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacactacaacactaaggt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  25464120 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaggt 25464172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 37 - 274
Target Start/End: Original strand, 29159148 - 29159385
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29159148 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 29159247  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  29159248 atgcaactccatatgattccacttaaacaacatgtatgattcgataattagcatacacttcaatcatcatcagaaatcatcaattcagcaatccaatcaa 29159347  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaaca 274  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29159348 ccaaaataatgcataattacatgaaaccatgctcaaca 29159385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 62 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19096832 - 19096620
Alignment:
Q  62 accgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccactta 161  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19096832 accgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgactccactta 19096733  T
Q  162 aacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaaccacaataatgcataattacatgaa 261  Q
    |||||||||||||| || ||| || ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19096732 aacaacatgtatgattcgataattagcatacacttcaatcatcatcagaaatcatcaattcagcaatccaatcaaccaaaataatgcataattacatgaa 19096633  T
Q  262 actatgctcaaca 274  Q
    || ||||||||||    
T  19096632 accatgctcaaca 19096620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 34134040 - 34133803
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34134040 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 34133941  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactt-tgcatacatttcattcatcatcagta---atcatcaattcagcaatcaaa 232  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||   |||||| | |||||||||||| ||   ||||||||| |||||||  ||    
T  34133940 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcaatacttaaacatacaatgcattcatcatcattaatcatcatcaatccagcaattcaa 34133841  T
Q  233 tcaaccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaa 272  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  34133840 tcaatcacaacaatgcataattatat--aactatgctcaa 34133803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Original strand, 24369266 - 24369501
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24369266 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 24369365  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||| || ||||||||||| || || |||||||| |||| | || ||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||| | || ||||||    
T  24369366 atgcaactcaatatgactccactttaataatatgtatgattcaacaattagcatacatttcaaccatcatcagtaatcattaatccagtagtccaatcaa 24369465  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaa 272  Q
    ||| ||||||||||||||| ||  ||| ||||||||    
T  24369466 ccaaaataatgcataattatatataaccatgctcaa 24369501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Original strand, 24362647 - 24362865
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24362647 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 24362746  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||| || ||||||||||| || || |||||||| |||| | || ||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||| | || ||||||    
T  24362747 atgcaactcaatatgactccactttaataatatgtatgattcaacaattagcatacatttcaaccatcatcagtaatcattaatccagtagtccaatcaa 24362846  T
Q  237 ccacaataatgcataatta 255  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  24362847 ccaaaataatgcataatta 24362865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 25315715 - 25315498
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25315715 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 25315616  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||||||  |  |||||| ||||  |||||||| |||||||| || ||||||| ||| |||    
T  25315615 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattaaaacaa 25315517  T
Q  237 ccacaataatgcataatta 255  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  25315516 ccaaaataatgcataatta 25315498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 26203209 - 26202992
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26203209 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 26203110  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||||||  |  |||||| ||||  |||||||| |||||||| || ||||||| ||| |||    
T  26203109 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattaaaacaa 26203011  T
Q  237 ccacaataatgcataatta 255  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  26203010 ccaaaataatgcataatta 26202992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 198
Target Start/End: Original strand, 1070697 - 1070858
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1070697 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 1070796  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttca 198  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  1070797 atgcaactaaatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaatatttagcatacatttca 1070858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 30799507 - 30799273
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30799507 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 30799408  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||||||| |||||||||  || || |||||||| ||||||  |  |||||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||  |||| |    
T  30799407 atgcaactccatgcgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcaatccagcaattcaatcga 30799309  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaa 272  Q
    ||| ||||||||||||||| ||  ||| ||||||||    
T  30799308 ccaaaataatgcataattatatataaccatgctcaa 30799273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 15332192 - 15332053
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15332192 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 15332093  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatga 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  15332092 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatga 15332053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Original strand, 17309753 - 17309892
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17309753 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 17309852  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatga 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  17309853 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatga 17309892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 8069764 - 8069626
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8069764 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 8069665  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 174  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8069664 atgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 8069626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 47 - 175
Target Start/End: Original strand, 22406712 - 22406840
Alignment:
Q  47 aactagtactccagtaccgaagccctctccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactc 145  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22406712 aactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctact-gtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactc 22406810  T
Q  146 catgtgactccacttaaacaacatgtatga 175  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  22406811 catatgactccacttaactaacatgtatga 22406840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Original strand, 4106776 - 4106911
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4106776 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagccctctccgctgttttatgcatatgccatggacc----tgtgtatgtctacatacaactgaccatgca 4106871  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 175  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4106872 atgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 4106911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 94564 - 94427
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||   || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  94564 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 94466  T
Q  136 aatgca-actccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 174  Q
     || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  94465 -atacatactccatatgactccacttaaacaacatgtatg 94427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 10470773 - 10470636
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaac 167  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||||||| |||||    
T  10470773 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccacttatacaac 10470676  T
Q  168 atgtatgactcaatacttt--gcatacatttcattcatca 205  Q
    |||||||| |||||| |||  ||||||||| || ||||||    
T  10470675 atgtatgattcaataattttagcatacattacagtcatca 10470636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 173
Target Start/End: Original strand, 27767471 - 27767574
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaac 167  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||||||| | |||    
T  27767471 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccacttatataac 27767568  T
Q  168 atgtat 173  Q
    ||||||    
T  27767569 atgtat 27767574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 10464250 - 10464185
Alignment:
Q  71 ctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10464250 ctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 10464185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 127
Target Start/End: Original strand, 14582927 - 14582972
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14582927 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaact 14582972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 12447227 - 12447172
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12447227 tttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 12447172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 13128308 - 13128242
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13128308 cctctccgctgttt-atggatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 13128242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 17207769 - 17207714
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17207769 tttatgcatatgcaatggaccaactagtgtatatctacatacaacttgaccatgca 17207714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23021380 - 23021325
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23021380 tttatgcatatgcaatggacccccttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 23021325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 29925817 - 29925872
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29925817 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 29925872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 14133064 - 14133011
Alignment:
Q  75 ccgctgttttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  14133064 ccgctgttttatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 14133011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 19300702 - 19300639
Alignment:
Q  62 accgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  19300702 accgaagccctcaccgct--tttatgcttatgcaattgacccacttatgtatatctacatacaact 19300639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 137
Target Start/End: Original strand, 13940556 - 13940612
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaa 137  Q
    ||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13940556 tttatgcatatgttatggacccaattgtgtatatctacatacaacatgaccatgcaa 13940612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 8768191 - 8768145
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8768191 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 8768145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Original strand, 19726765 - 19726810
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 126  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19726765 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 19726810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 17027204 - 17027156
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaactga 129  Q
    ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  17027204 tttatgcttatgcaatgaactccacttgtgtatatctacatacaactga 17027156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Original strand, 18786230 - 18786274
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18786230 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 18786274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 52)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 37 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 3266673 - 3266421
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3266673 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 3266574  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||    
T  3266573 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcaatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 3266474  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacactacaacactaaggt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  3266473 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaggt 3266421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 37 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 49240898 - 49240646
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49240898 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 49240799  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||    
T  49240798 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcattactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagaaatcaaaacaa 49240699  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacactacaacactaaggt 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  49240698 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaatacaacaacattaaggt 49240646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 37 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 49749612 - 49749360
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49749612 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 49749513  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||    
T  49749512 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcattactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagaaatcaaaacaa 49749413  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacactacaacactaaggt 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  49749412 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaatacaacaacattaaggt 49749360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 37 - 274
Target Start/End: Original strand, 21396845 - 21397082
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21396845 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 21396944  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21396945 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcgataattagcatacatttcaatcatcatcagtaatcatcaattcagcaatccaatcaa 21397044  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaaca 274  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21397045 ccaaaataatgcataattacatgaaactatgctcaaca 21397082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Original strand, 52500579 - 52500814
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52500579 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 52500678  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||  | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  52500679 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacattaaaatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 52500778  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaa 272  Q
    ||| ||||||| ||||||| ||  ||| ||||||||    
T  52500779 ccaaaataatgtataattatatacaaccatgctcaa 52500814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 37 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 3260045 - 3259824
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3260045 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatataactgaccatgca 3259946  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  3259945 atgcaacttcatgtgactccactttaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttcaatcatcattagtaatcatcaatccaacaatcaaatcaa 3259846  T
Q  237 ccacaataatgcataattacat 258  Q
    ||| || |||||||||||||||    
T  3259845 ccaaaacaatgcataattacat 3259824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Original strand, 391194 - 391430
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  391194 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 391293  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacattt-cattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||| ||  |||||||||  | |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  391294 atgcaactccatgtgactccactttaataatatgtatgattcaataattaacatacatttaaaatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatca 391393  T
Q  236 accacaataatgcataattacatgaaactatgctcaa 272  Q
    |||| |||||||  |||||| ||  ||| ||||||||    
T  391394 accaaaataatgtgtaattatatacaaccatgctcaa 391430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 37 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 29382818 - 29382573
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29382818 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcacatgcaatggatctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 29382719  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||| || ||||||||||| || || |||||||| |||| | || ||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||| |  ||||||    
T  29382718 atgcaactcaatatgactccactttaataatatgtatgattcaacaattggcatacatttcaaccatcatcagtaatcattaatccagcagttcaatcaa 29382619  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacactacaaca 282  Q
    ||| ||||||||||||||| ||  ||| |||||||| || ||||||    
T  29382618 ccaaaataatgcataattatatataaccatgctcaaaacaacaaca 29382573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 45142603 - 45142357
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45142603 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 45142504  T
Q  136 aatgcaactccatgtga-ctccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatc 234  Q
    |    |||||||| | | ||||||||||||||||||||||  | |||| |  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  45142503 atacaaactccatataaactccacttaaacaacatgtatggtt-aataataagcatacatttcagtcatcatcagtaatcaacaattcagcaatccaatc 45142405  T
Q  235 aaccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacactacaaca 282  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45142404 atccagaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaaca 45142357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 229
Target Start/End: Original strand, 1583938 - 1584130
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||   || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1583938 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcatctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 1584037  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatc 229  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||   | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1584038 atgcaaactccatgtgacaccactt-aacaacatgtatgattcaatcaatagcatacatttcagtcatcatcagtaatcatcaatccagcaatc 1584130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Original strand, 26395713 - 26395852
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26395713 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 26395812  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatga 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  26395813 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatga 26395852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Original strand, 11937186 - 11937325
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11937186 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccttcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 11937285  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11937286 aatgcaactccatgtgactccacttaaacgacatgtatga 11937325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 23436036 - 23435901
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23436036 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 23435937  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgt 171  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  23435936 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgt 23435901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 39266291 - 39266073
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39266291 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 39266192  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||   || || |||||||| ||| ||  |  |||||| ||||  |||||||| |||||||| || |||||||  || |||    
T  39266191 atgcaactccatgtgactccaccataataatatgtatgattcactaaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 39266093  T
Q  237 cc-acaataatgcataatta 255  Q
    || | |||||||||||||||    
T  39266092 ccaaaaataatgcataatta 39266073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 29448730 - 29448592
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29448730 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgga 29448631  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatg 174  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  29448630 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatg 29448592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 29455414 - 29455276
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29455414 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 29455315  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatg 174  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  29455314 atgcaactccatatgactccaattaatacaacatgtatg 29455276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 205
Target Start/End: Original strand, 7359276 - 7359444
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7359276 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 7359375  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatca 205  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||    
T  7359376 atgcaaactccatgtgacaccactt-aacaacatgtatgattcaatagttagcatacatttcagtcatca 7359444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 62 - 272
Target Start/End: Original strand, 50082273 - 50082483
Alignment:
Q  62 accgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccactta 161  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  50082273 accgaagccctcaccgctgttttatgcatatgccacggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactcaatatgactccacttt 50082372  T
Q  162 aacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaaccacaataatgcataattacatgaa 261  Q
    || || |||||||| |||| | || ||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||| | |  ||||||||  |||||||||||||| |||  |    
T  50082373 aataatatgtatgattcaacaattggcatacatttcaaccatcatcagtaatcattaatccagtagttcaatcaaccgaaataatgcataattgcatata 50082472  T
Q  262 actatgctcaa 272  Q
    || ||||||||    
T  50082473 accatgctcaa 50082483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 45 - 203
Target Start/End: Original strand, 5938961 - 5939119
Alignment:
Q  45 gcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aac 143  Q
    |||||||||||||||  ||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5938961 gcaactagtactccaagacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaac 5939060  T
Q  144 tccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcat 203  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||    
T  5939061 tccatgtgacaccactt-aacagcatgtatgattcaatagttagcatacatttcagtcat 5939119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 11202484 - 11202345
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||   || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11202484 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctcaccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacagctgaccatgca 11202385  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 175  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11202384 atgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 11202345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 45959795 - 45959657
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45959795 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 45959696  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 174  Q
    |    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45959695 atacaaactccatatgactccacttaaacaacatgtatg 45959657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 70 - 182
Target Start/End: Original strand, 31665122 - 31665234
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaac 167  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||| |||||||||    
T  31665122 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctatatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccatttaaacaac 31665219  T
Q  168 atgtatgactcaata 182  Q
    |||||||| ||||||    
T  31665220 atgtatgattcaata 31665234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 127
Target Start/End: Original strand, 34772196 - 34772286
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34772196 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 34772286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 42956075 - 42955938
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||   || | |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42956075 gctgttgagcaactagtgctccagaacatgagtcatctctgctgttt-atgcatatgcaacggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 42955977  T
Q  136 aatgca-actccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 174  Q
     || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42955976 -atacatactccatatgactccacttaaacaacatgtatg 42955938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 70 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 2972753 - 2972649
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaac 167  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||| ||| |||||    
T  2972753 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccaattatacaac 2972656  T
Q  168 atgtatg 174  Q
    |||||||    
T  2972655 atgtatg 2972649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 82 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 19128352 - 19128259
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  19128352 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccacttatacaacatgtatg 19128259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 70 - 174
Target Start/End: Original strand, 20895056 - 20895160
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaac 167  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||||||  |||||    
T  20895056 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccacttttacaac 20895153  T
Q  168 atgtatg 174  Q
    |||||||    
T  20895154 atgtatg 20895160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 70 - 174
Target Start/End: Original strand, 36037625 - 36037729
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaac 167  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||||||  |||||    
T  36037625 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccacttttacaac 36037722  T
Q  168 atgtatg 174  Q
    |||||||    
T  36037723 atgtatg 36037729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 174
Target Start/End: Original strand, 20889439 - 20889541
Alignment:
Q  72 tctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaacat 169  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||||||  |||||||    
T  20889439 tctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccacttttacaacat 20889536  T
Q  170 gtatg 174  Q
    |||||    
T  20889537 gtatg 20889541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 182
Target Start/End: Original strand, 21881656 - 21881766
Alignment:
Q  72 tctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaacat 169  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||  || ||| |||||||||||| |||||||    
T  21881656 tctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctactcgtgtatatctacatacaactagaccatgc-atacatccttcatatgactccacttatacaacat 21881753  T
Q  170 gtatgactcaata 182  Q
    |||||| ||||||    
T  21881754 gtatgattcaata 21881766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 47872475 - 47872376
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| ||| || ||   || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47872475 gctgttgagcaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 47872377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 71 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 49548603 - 49548538
Alignment:
Q  71 ctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49548603 ctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 49548538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 37 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 54845001 - 54844912
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||   || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54845001 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatacaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 54844912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 899666 - 899721
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  899666 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 899721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 30396269 - 30396324
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30396269 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 30396324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 33097166 - 33097221
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33097166 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 33097221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 35462632 - 35462566
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35462632 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 35462566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 49548389 - 49548323
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49548389 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatggaccaactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 49548323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 282
Target Start/End: Original strand, 34772381 - 34772443
Alignment:
Q  220 ttcagcaatcaaatcaaccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacactacaaca 282  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34772381 ttcagcaatccaatcatccagaatagtgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaaca 34772443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 41404716 - 41404662
Alignment:
Q  83 ttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41404716 ttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 41404662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 136
Target Start/End: Original strand, 33221432 - 33221498
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  33221432 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctatatacaactagaccatgca 33221498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 42220504 - 42220559
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42220504 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 42220559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 46044880 - 46044825
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46044880 tttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 46044825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 82
Target Start/End: Original strand, 391154 - 391199
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgtt 82  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  391154 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtt 391199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 93
Target Start/End: Original strand, 7356283 - 7356339
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatg 93  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||   || ||||||||||||||||||||||||    
T  7356283 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatg 7356339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Original strand, 14910723 - 14910792
Alignment:
Q  56 tccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14910723 tccaggaccgaggccctcaccgct--tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 14910792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 54826123 - 54826083
Alignment:
Q  142 actccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaata 182  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54826123 actccatatgactccacttaaacaacatgtatgattcaata 54826083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Original strand, 14485671 - 14485717
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14485671 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 14485717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Original strand, 18212297 - 18212343
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18212297 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 18212343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 26077728 - 26077682
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26077728 ttttatgcttatgtaattgacccacttgtgtatatctacatacaact 26077682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 17000184 - 17000139
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 126  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17000184 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 17000139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 10972917 - 10972873
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10972917 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 10972873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 38)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 37 - 289
Target Start/End: Original strand, 6740597 - 6740849
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6740597 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 6740696  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||    
T  6740697 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcaatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 6740796  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacactacaacactaaggt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  6740797 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaggt 6740849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 37 - 289
Target Start/End: Original strand, 48427932 - 48428184
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48427932 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 48428031  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||    
T  48428032 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcaatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 48428131  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacactacaacactaaggt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  48428132 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaggt 48428184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 37 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 31535336 - 31535084
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31535336 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 31535237  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||    
T  31535236 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcgatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 31535137  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacactacaacactaaggt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  31535136 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaggt 31535084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 37 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 31564053 - 31563801
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31564053 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 31563954  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||    
T  31563953 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcgatactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 31563854  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacactacaacactaaggt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  31563853 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaggt 31563801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 62 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 20396884 - 20396671
Alignment:
Q  62 accgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccactta 161  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20396884 accgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccactta 20396785  T
Q  162 aacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaaccacaataatgcataattacatgaa 261  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  20396784 aacaacatgtatgattcaataattagcatacatttcaatcatcatcagtaatcatcaattcaacaatccaatcaaccaaaataatgcaaaattacatgaa 20396685  T
Q  262 actatgctcaacac 275  Q
    ||||||||||||||    
T  20396684 actatgctcaacac 20396671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 45 - 282
Target Start/End: Original strand, 20299401 - 20299634
Alignment:
Q  45 gcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaact 144  Q
    |||||||||||||||| ||   || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |    
T  20299401 gcaactagtactccaggacatgagtcatctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatg----t 20299496  T
Q  145 ccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaaccacaata 244  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  20299497 ccatgtgacaccacttaaacaacatgtatgattcaataattagcatacatttcagtcatcatcagtaatcatcaattcagcaatccaatcatccaaaata 20299596  T
Q  245 atgcataattacatgaaactatgctcaacactacaaca 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20299597 atgcataattacatgaaactatgctcaacacttcaaca 20299634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18026788 - 18026553
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18026788 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 18026689  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||    
T  18026688 atgcaactccatatgactccactttaacaatatgtatgattcaataattagcatacatttcaaccatcatcagtaatcatcaatccagtaattcaatcaa 18026589  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaa 272  Q
    ||| ||||||||||||||| ||  ||| ||||||||    
T  18026588 ccaaaataatgcataattatatataaccatgctcaa 18026553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 45 - 282
Target Start/End: Original strand, 20292767 - 20293005
Alignment:
Q  45 gcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaa-c 143  Q
    |||||||||||||||| ||   || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20292767 gcaactagtactccaggacatgagtcatctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaac 20292866  T
Q  144 tccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaaccacaat 243  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||| |||    
T  20292867 tccatgtaacaccacttaaacaacatgtatgattcaataattagcatacattttagtcatcatcagtaatcatcaattcaacaattcaatcatccaaaat 20292966  T
Q  244 aatgcataattacatgaaactatgctcaacactacaaca 282  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  20292967 aatgcataattacatgaaattatgctcaacgcttcaaca 20293005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 62 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 36212062 - 36211842
Alignment:
Q  62 accgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccactta 161  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36212062 accgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccactta 36211963  T
Q  162 aacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaaccacaataatgcataattacatgaa 261  Q
    |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| | |||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||  |    
T  36211962 aacaacatgtatgattcaataattaacatacatttaaatcatcatcagtattcatcaatctagcaatccaatcaaccaaaacaatgcataattaaatata 36211863  T
Q  262 actatgctcaacactacaaca 282  Q
    ||||||| ||| || ||||||    
T  36211862 actatgcccaaaacaacaaca 36211842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 39 - 255
Target Start/End: Original strand, 18418205 - 18418422
Alignment:
Q  39 tgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaat 138  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18418205 tgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaac 18418304  T
Q  139 gcaactccatgtgactccactt-aaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagc-aatcaaatcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||    
T  18418305 gcaactccatgtgactccacttaaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttaaatcatcatcagtattcatcaatccagcaaatcaaa-caa 18418403  T
Q  237 ccacaataatgcataatta 255  Q
    |||  ||||||||||||||    
T  18418404 ccaacataatgcataatta 18418422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 20277288 - 20277074
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20277288 gctgttgagcaactagtactccaggaccaaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 20277189  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||||||  |  |||||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||  || |||    
T  20277188 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcaatccagcaattcaaacaa 20277090  T
Q  237 ccacaataatgcataa 252  Q
    ||| ||||||||||||    
T  20277089 ccaaaataatgcataa 20277074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 28556538 - 28556304
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28556538 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 28556439  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||||||| |||||||||  || || |||||||| ||||||  |  |||||| | ||  |||||||| ||||||||||| |||||||  |||| |    
T  28556438 atgcaactccatgcgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-tgcaaccatcatcaataatcatcaatccagcaattcaatcga 28556340  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaa 272  Q
    ||| ||||||||||||||| ||  ||| ||||||||    
T  28556339 ccaaaataatgcataattatatataaccatgctcaa 28556304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 38908090 - 38907952
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38908090 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 38907991  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 175  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38907990 atgcaacttcatgtgactccacttaaacgacatgtatga 38907952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Original strand, 37682165 - 37682304
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37682165 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 37682264  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37682265 aatgcaactccatgtgactccacttaaacgacatgtatga 37682304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Original strand, 39094400 - 39094538
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39094400 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 39094499  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatg 174  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  39094500 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatg 39094538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 39189717 - 39189579
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39189717 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 39189618  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  39189617 atgcaactccatgtgactccacttaatcgacaagtatga 39189579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Original strand, 37675472 - 37675611
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37675472 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccttcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 37675571  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37675572 aatgcaactccatgtgactccacttaaacgacatgtatga 37675611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 175
Target Start/End: Original strand, 20570828 - 20570959
Alignment:
Q  45 gcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aac 143  Q
    |||||||||||||||| ||   || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20570828 gcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaac 20570927  T
Q  144 tccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20570928 tccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 20570959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 22185640 - 22185534
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22185640 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 22185541  T
Q  137 atgcaac 143  Q
    |||||||    
T  22185540 atgcaac 22185534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 282
Target Start/End: Original strand, 4231267 - 4231514
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4231267 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 4231366  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaat-actttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatc 234  Q
    |    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||  | ||| ||    |||||||  ||  |||||  |  | ||| ||||||||||||| ||||    
T  4231367 atacaaactccatatgactccacttctacaacatgtatgcttaaataaccaatcatacatcacaaccatcagtaacattcaacaattcagcaatccaatc 4231466  T
Q  235 aaccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacactacaaca 282  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4231467 acccagaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaaca 4231514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 94 - 229
Target Start/End: Original strand, 17149454 - 17149589
Alignment:
Q  94 caatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatac 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||   | ||||||    
T  17149454 caatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgacaccactt-aacaacatgtatgattcaatcaatagcatac 17149552  T
Q  193 atttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatc 229  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17149553 atttcagtcatcatcagtaatcatcaatccagcaatc 17149589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 70 - 182
Target Start/End: Original strand, 42626312 - 42626423
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaacaacat 169  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42626312 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcatacaaactccatgtgactccacttaaacaacat 42626410  T
Q  170 gtatgactcaata 182  Q
     ||||| ||||||    
T  42626411 ctatgattcaata 42626423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 275
Target Start/End: Original strand, 21963084 - 21963324
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||   || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21963084 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 21963183  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaat-actttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatc 234  Q
    |    |||||||| |||||||||||  |||||||| |||  | ||| ||    |||||||  ||  |||||  |  | ||| ||||||||||||| ||||    
T  21963184 atacaaactccatatgactccacttctacaacatgcatgtttaaatgacaaatcatacatcacaaccatcagtaacattcaacaattcagcaatccaatc 21963283  T
Q  235 aaccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacac 275  Q
    | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21963284 atccgaaataatgcataattacatgaaaccatgctcaacac 21963324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 20076987 - 20076849
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||   || |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20076987 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctctgctgttttatgcatatgcaatggacttacttgtgtatatctacatacaacatgaccatgc 20076888  T
Q  136 aatgca-actccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 174  Q
     || || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  20076887 -atacatactccatatgactccacttaaataacatgtatg 20076849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 136
Target Start/End: Original strand, 21920884 - 21920974
Alignment:
Q  46 caactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21920884 caactagtactccaggacataagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatgaaccaactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 21920974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 29602295 - 29602229
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29602295 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 29602229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 3652735 - 3652679
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatg 93  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  3652735 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgttgttttatgcatatg 3652679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 36615058 - 36615113
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36615058 tttatgcatatgcaatggacccccttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 36615113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 49328155 - 49328210
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49328155 tttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 49328210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 98
Target Start/End: Original strand, 17146336 - 17146397
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatg 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||   || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17146336 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatg 17146397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 29596860 - 29596794
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  29596860 cctctccgctgttt-atgcatatgtaatggacccactcgtgtatttctacatacaactagaccatgca 29596794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 125
Target Start/End: Original strand, 43088514 - 43088557
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa 125  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  43088514 tttatgcatatgcaatggacccccttgtgtatatctacatacaa 43088557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Original strand, 19961273 - 19961342
Alignment:
Q  56 tccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19961273 tccaggaccgaggccctcaccgct--tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 19961342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 47484229 - 47484284
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47484229 tttatgcatatgctatagacccactagtgtatatctacatacaacttgaccatgca 47484284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Original strand, 20242693 - 20242739
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20242693 ttttatgcttatgcaaatgacccacttgtgtatatctacatacaact 20242739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 23066718 - 23066673
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 126  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23066718 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 23066673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 20824373 - 20824329
Alignment:
Q  83 ttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20824373 ttatgcttatgcaactaacctacttgtgtatatctacatacaact 20824329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Original strand, 21698261 - 21698305
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  21698261 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 21698305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 62 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 71540 - 71313
Alignment:
Q  62 accgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccactta 161  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  71540 accgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccactta 71441  T
Q  162 aacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaaccacaataatgcataattacatgaa 261  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  71440 aacaacatgtatgattcactactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaaccacaataatgcataattacatgaa 71341  T
Q  262 actatgctcaacactacaacactaaggt 289  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  71340 actatgctcaacacaacaacattaaggt 71313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 37 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 24426892 - 24426658
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24426892 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 24426793  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24426792 atgcaactccatatgactccacttaaacaacatgtatgattcgataattagcatacatttcaatcatcatcagtaatcatcaattcagcaatccaatcaa 24426693  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctca 271  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24426692 ccaaaataatgcataattacatgaaactatgctca 24426658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 37 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 2385973 - 2385737
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2385973 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 2385874  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | | || |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |    
T  2385873 atgcaactccatatgactccacttaaacaacatgtatgattcga-aattagcatacatttcaatcatcatcaataatcattaattcagcaatccaatcca 2385775  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaaca 274  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2385774 tcaaaataatgcataattacatgaaactatgatcaaca 2385737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 44091140 - 44090905
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44091140 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 44091041  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  44091040 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcactaattaacatacatttaaatcatcatcagtaatcatcaatccagcaatccaatcaa 44090941  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaa 272  Q
    ||| ||||||| ||||||| ||  ||| ||||||||    
T  44090940 ccaaaataatgtataattatatacaaccatgctcaa 44090905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Original strand, 27037325 - 27037561
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27037325 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 27037424  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatca 235  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  27037425 atgcaaactccatgtgacaccacttaaacaacatgtatgattcaataaataacatacatttcagtcatcatcagtaatcatcaatccagcaatccaatca 27037524  T
Q  236 accacaataatgcataattacatgaaactatgctcaa 272  Q
     ||  ||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  27037525 tcccaaataatgcataattacatataaccatgctcaa 27037561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Original strand, 27729589 - 27729807
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27729589 gctgttgagcaactagtactctagggccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttatgtatatctacatacaactgaccatgca 27729688  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| | || ||||||||  |||||||| |||||||| ||||||    
T  27729689 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttaaatcttcatcagtgttcatcaatccagcaatccaatcaa 27729788  T
Q  237 ccacaataatgcataatta 255  Q
    ||| ||||||| |||||||    
T  27729789 ccaaaataatgtataatta 27729807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Original strand, 4077501 - 4077736
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4077501 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 4077600  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || | |||||| ||||||  |  |||||||||||  ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||    
T  4077601 atgcaactccatgtgactccactataataatacgtatgagtcaataaataacatacatttcaaccatcatcagtattcatcaatccaacaatccaatcaa 4077700  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaa 272  Q
    ||| ||||||| ||||||| ||  ||| ||||||||    
T  4077701 ccaaaataatgtataattatatacaaccatgctcaa 4077736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Original strand, 20850270 - 20850409
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20850270 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 20850369  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20850370 aatgcaactccatgtgactccacttaaacgacatgtatga 20850409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Original strand, 21604845 - 21604984
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21604845 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 21604944  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatga 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  21604945 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatga 21604984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Original strand, 1067177 - 1067315
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1067177 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 1067276  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatg 174  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  1067277 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatg 1067315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 24481651 - 24481513
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24481651 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 24481552  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatg 174  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  24481551 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatg 24481513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 4071596 - 4071457
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4071596 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 4071497  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 175  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  4071496 aatgcaactccaagtgactccacttaaataacatgtatga 4071457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 30196566 - 30196428
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30196566 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgca 30196467  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatg 174  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  30196466 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatg 30196428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Original strand, 31828693 - 31828911
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31828693 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgc 31828792  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatca 235  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||  | |||||||  |||  ||||||||||| ||   ||| ||||| || |||||    
T  31828793 aatgcaactccatatgacaccacttaaatgacatgtatgactcaataaatagcataca-atcaaccatcatcagtattcggtaatgcagcactccaatca 31828891  T
Q  236 accacaataatgcataatta 255  Q
    |||| || ||||||| ||||    
T  31828892 accaaaacaatgcatgatta 31828911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Original strand, 31834045 - 31834263
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31834045 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgc 31834144  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatca 235  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||  | |||||||  |||  ||||||||||| ||   ||| ||||| || |||||    
T  31834145 aatgcaactccatatgacaccacttaaatgacatgtatgactcaataaatagcataca-atcaaccatcatcagtattcggtaatgcagcactccaatca 31834243  T
Q  236 accacaataatgcataatta 255  Q
    |||| || ||||||| ||||    
T  31834244 accaaaacaatgcatgatta 31834263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 36984617 - 36984399
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36984617 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgc 36984518  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatca 235  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||  | |||||||  |||  ||||||||||| ||   ||| ||||| || |||||    
T  36984517 aatgcaactccatatgacaccacttaaatgacatgtatgactcaataaatagcataca-atcaaccatcatcagtattcggtaatgcagcactccaatca 36984419  T
Q  236 accacaataatgcataatta 255  Q
    |||| || ||||||| ||||    
T  36984418 accaaaacaatgcatgatta 36984399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Original strand, 1061794 - 1061932
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1061794 gctgttgagcaactactactccaggaccgaagccctcatcgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 1061893  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatg 174  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  1061894 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatg 1061932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Original strand, 34131 - 34270
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||   || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34131 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 34230  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 175  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34231 atgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 34270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 11360291 - 11360157
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11360291 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttat----atgcaatggacctacttgtgtatatctatatacaactgaccatgca 11360196  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatg 174  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  11360195 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatg 11360157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22013164 - 22012948
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||   || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22013164 gctgttgagcaactaatactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggaactacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 22013065  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||         ||||||             | ||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  22013064 atgcaa---------actcca-------------tgtgattcaataattagcatacatttcagtcatcatcagtaatcatcaattcagcaatccaatcat 22012987  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacac 275  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  22012986 ccaaaataatgcataattacaggaaactatgttcaacac 22012948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 282
Target Start/End: Original strand, 28292800 - 28293047
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||  ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  28292800 gctgttgagcaactagtactccaggacaaaagacatcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccttgc 28292899  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaat-actttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatc 234  Q
    |    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||  | ||| ||    |||||||  ||  |||||  |  | ||| ||||||||||||| ||||    
T  28292900 atacaaactccatatgactccacttttacaacatgtatgtttaaataacaaatcatacatcacaaccatcagtaacattcaacaattcagcaatccaatc 28292999  T
Q  235 aaccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacactacaaca 282  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28293000 acccagaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaaca 28293047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 35244086 - 35243948
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35244086 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 35243987  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 174  Q
    |    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35243986 atacaaactccatatgactccacttaaacaacatgtatg 35243948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Original strand, 11466152 - 11466289
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| ||| || ||   || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11466152 gctgttgagcaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 11466250  T
Q  136 aatgca-actccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 174  Q
     || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11466251 -atacatactccatatgactccacttaaacaacatgtatg 11466289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 182
Target Start/End: Original strand, 27272365 - 27272477
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaac 167  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  27272365 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccacttaaacaac 27272462  T
Q  168 atgtatgactcaata 182  Q
    || ||||| ||||||    
T  27272463 atatatgattcaata 27272477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 17592558 - 17592455
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaac 167  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| ||||||||| || |||||    
T  17592558 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccac-tatacaac 17592462  T
Q  168 atgtatg 174  Q
    |||||||    
T  17592461 atgtatg 17592455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 174
Target Start/End: Original strand, 14563945 - 14564045
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaacaaca 168  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||     ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  14563945 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatgaacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccataca----tactccatatgactccacttatacaaca 14564039  T
Q  169 tgtatg 174  Q
    ||||||    
T  14564040 tgtatg 14564045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 36800680 - 36800735
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36800680 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 36800735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 45028632 - 45028687
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45028632 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 45028687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 13101197 - 13101133
Alignment:
Q  72 tctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13101197 tctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 13101133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 15643304 - 15643249
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15643304 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 15643249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 25590216 - 25590161
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25590216 tttatgcatatgaaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 25590161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 32911497 - 32911442
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32911497 tttatgcatatgctatgcacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 32911442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Original strand, 9241492 - 9241538
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9241492 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 9241538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Original strand, 22810042 - 22810088
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22810042 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 22810088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 50)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 37 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 43724151 - 43723899
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43724151 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 43724052  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||    
T  43724051 atgcaactccatgagactcaacttaaacaacatgtatgattcaatactttgcatacatttcattcatcaccagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 43723952  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacactacaacactaaggt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  43723951 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaggt 43723899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 37 - 289
Target Start/End: Original strand, 47121209 - 47121461
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47121209 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatccacatacaactgaccatgca 47121308  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||    
T  47121309 atgcaactccatgtgactcgacttaaacaacatgtatgattcattactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 47121408  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacactacaacactaaggt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  47121409 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaggt 47121461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 37 - 289
Target Start/End: Original strand, 47128577 - 47128829
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47128577 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatccacatacaactgaccatgca 47128676  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||    
T  47128677 atgcaactccatgtgactcgacttaaacaacatgtatgattcattactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagcaatcaaaacaa 47128776  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacactacaacactaaggt 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  47128777 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacacaacaacattaaggt 47128829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 37 - 289
Target Start/End: Original strand, 28758961 - 28759213
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28758961 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 28759060  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||    
T  28759061 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcattactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagaaatcaaaacaa 28759160  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacactacaacactaaggt 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  28759161 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaatacaacaacattaaggt 28759213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 37 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 50142856 - 50142604
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50142856 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 50142757  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||    
T  50142756 atgcaactccatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcattactttgcatacatttcattcatcatcagcaatcatcaatccagaaatcaaaacaa 50142657  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacactacaacactaaggt 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  50142656 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaatacaacaacattaaggt 50142604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 21151544 - 21151309
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21151544 gctgttgagcaactattactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 21151445  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| | |||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||    
T  21151444 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttaaatcatcatcagtgttcatcaatccagcaatccaatcaa 21151345  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaa 272  Q
    ||| ||||||| ||||||| ||  ||| ||||||||    
T  21151344 ccaaaataatgtataattatatacaaccatgctcaa 21151309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 37 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 2499131 - 2498885
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2499131 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 2499032  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccactt-aaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||   |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  2499031 atgcaactccatgtgactccacttaaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatca 2498932  T
Q  236 accacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacactacaaca 282  Q
    |||| || |||||||| ||| ||  |||||||| ||| || ||||||    
T  2498931 accaaaacaatgcatagttaaatataactatgcccaaaacaacaaca 2498885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 69 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 6927596 - 6927382
Alignment:
Q  69 ccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccactt-aaacaac 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6927596 ccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaaacaac 6927497  T
Q  168 atgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaaccacaataatgcataattacatgaaactatg 267  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| || |||| ||||||| ||| |||||||    
T  6927496 atgtatgattcaataattaacatacatttaaatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaaccaaaacaatgtataattaaatgtaactatg 6927397  T
Q  268 ctcaacactacaaca 282  Q
    | ||| || ||||||    
T  6927396 cccaaaacaacaaca 6927382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 54833274 - 54833029
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54833274 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgttgttttatgcacatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 54833175  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||| || ||||||||||| || || |||||||| |||| | || ||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||| | |  ||||||    
T  54833174 atgcaactcaatatgactccactttaataatatgtatgattcaacaattggcatacatttcaaccatcatcagtaatcattaatccagtagttcaatcaa 54833075  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacactacaaca 282  Q
    ||| ||||||||||||||| ||  ||| |||||||| || ||||||    
T  54833074 ccaaaataatgcataattatatataaccatgctcaaaacaacaaca 54833029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Original strand, 10382001 - 10382140
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10382001 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 10382100  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10382101 aatgcaactccatgtgactccacttaaacgacatgtatga 10382140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Original strand, 10410654 - 10410793
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10410654 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 10410753  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10410754 aatgcaactccatgtgactccacttaaacgacatgtatga 10410793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Original strand, 10767818 - 10768053
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10767818 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgttgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 10767917  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |  || |||||||| |||| | ||  |||||||||||  ||||||||||||||||  || ||| | |  ||||||    
T  10767918 atgcaactcaatatgactccactttattaatatgtatgattcaacaattgacatacatttcaaccatcatcagtaatcatttatccagtagttcaatcaa 10768017  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaa 272  Q
    ||| ||||||||||||||| ||  ||| ||||||||    
T  10768018 ccaaaataatgcataattatatataaccatgctcaa 10768053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 50656075 - 50655937
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50656075 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 50655976  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatg 174  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  50655975 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatg 50655937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 3782839 - 3782621
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3782839 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgc 3782740  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatca 235  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||  | |||||||  ||| |||||||||||| ||   ||| ||||| || |||||    
T  3782739 aatgcaactccatatgacaccacttaaatgacatgtatgactcaataaatagcataca-atcaatcatcatcagtattcggtaatgcagcactccaatca 3782641  T
Q  236 accacaataatgcataatta 255  Q
    |||| || ||||||| ||||    
T  3782640 accaaaacaatgcatgatta 3782621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 53571321 - 53571183
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53571321 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgca 53571222  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatg 174  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  53571221 atgcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatg 53571183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Original strand, 45611728 - 45611953
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45611728 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 45611827  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    |||||          ||||||||  || || |||||||| ||||||  | ||||||||||||  ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||    
T  45611828 atgca----------actccactataataatatgtatgattcaataaatagcatacatttcaaccatcatcagtattcatcaatccaacaatccaatcaa 45611917  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaa 272  Q
    ||| ||||||| ||||||| ||  ||| ||||||||    
T  45611918 ccaaaataatgtataattatatacaaccatgctcaa 45611953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 9772003 - 9771864
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9772003 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 9771904  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 175  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9771903 atgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 9771864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 163
Target Start/End: Original strand, 29493615 - 29493742
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29493615 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 29493714  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaa 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29493715 aatgcaactccatgtgactccacttaaa 29493742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 125 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16414281 - 16414136
Alignment:
Q  125 actgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcag 224  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  16414281 actgaccatgcaatgca-ctccatgtgactccacttaaacatcatgtatgattcaataatttgcatgcatttcattcatcatgagtaatcatcaattaag 16414183  T
Q  225 caatcaaatcaaccacaataatgcataattacatgaaactatgctca 271  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16414182 caaaccaatcaaccacaataatgcataattacatgaaactatgctca 16414136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 12271482 - 12271343
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||   || | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12271482 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcatcaccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 12271383  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 175  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12271382 atgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 12271343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 45 - 175
Target Start/End: Original strand, 38743004 - 38743135
Alignment:
Q  45 gcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aac 143  Q
    ||||||||| |||||| ||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  38743004 gcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacgtacaactgaccatgcaatgcaaac 38743103  T
Q  144 tccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38743104 tccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 38743135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 14845253 - 14845137
Alignment:
Q  39 tgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaa 137  Q
    ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14845253 tgttgagcaactagtgctccagaaccgaagccctcactgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaa 14845154  T
Q  138 tgcaactccatgtgact 154  Q
    |||||||||||| ||||    
T  14845153 tgcaactccatgagact 14845137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 48774705 - 48774567
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||   || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48774705 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccactgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 48774606  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 174  Q
    |    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48774605 atacaaactccatatgactccacttaaacaacatgtatg 48774567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 54091791 - 54091654
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaac 167  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||||||| |||||    
T  54091791 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccacttatacaac 54091694  T
Q  168 atgtatgactcaatacttt--gcatacatttcattcatca 205  Q
    |||||||| |||||| |||  ||||||||| || ||||||    
T  54091693 atgtatgattcaataattttagcatacattacagtcatca 54091654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 16331648 - 16331536
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaac 167  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16331648 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccacttaatcaac 16331551  T
Q  168 atgtatgactcaata 182  Q
    |||||||| ||||||    
T  16331550 atgtatgattcaata 16331536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 182
Target Start/End: Original strand, 16833329 - 16833441
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaac 167  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||||||| |||||    
T  16833329 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccacttatacaac 16833426  T
Q  168 atgtatgactcaata 182  Q
    |||||||| ||||||    
T  16833427 atgtatgattcaata 16833441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 174
Target Start/End: Original strand, 15374748 - 15374852
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaac 167  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  || ||| |||||||||||| |||||    
T  15374748 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacatgaccatgc-atacattcttcatatgactccacttatacaac 15374845  T
Q  168 atgtatg 174  Q
    |||||||    
T  15374846 atgtatg 15374852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 29545206 - 29545113
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  29545206 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccacttttacaacatgtatg 29545113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 136
Target Start/End: Original strand, 3802605 - 3802671
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3802605 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 3802671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 136
Target Start/End: Original strand, 54520154 - 54520220
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54520154 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 54520220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 19344205 - 19344097
Alignment:
Q  72 tctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatg 170  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||  |||||  ||||||| ||| ||||||||    
T  19344205 tctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccataca-tacatttccatacgactccaattacacaacatg 19344108  T
Q  171 tatgactcaat 181  Q
    ||||| |||||    
T  19344107 tatgattcaat 19344097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 8373969 - 8373914
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8373969 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 8373914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 9691462 - 9691396
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9691462 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 9691396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 11956640 - 11956585
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11956640 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 11956585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 136
Target Start/End: Original strand, 20187849 - 20187915
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20187849 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 20187915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 20377295 - 20377229
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20377295 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 20377229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 30596903 - 30596848
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30596903 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 30596848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 136
Target Start/End: Original strand, 54520369 - 54520435
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54520369 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatggaccaactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 54520435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 136
Target Start/End: Original strand, 3802767 - 3802833
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3802767 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatggactcactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 3802833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 32388061 - 32388006
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32388061 tttatgcatatgttatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 32388006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 127
Target Start/End: Original strand, 18961077 - 18961122
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18961077 tttatgcatatgcaatggactcacttgtgtatatctacatacaact 18961122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 46071163 - 46071099
Alignment:
Q  72 tctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  46071163 tctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtatatatctacatacaactagaccatgca 46071099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 127
Target Start/End: Original strand, 49163272 - 49163317
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49163272 tttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaact 49163317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 12725168 - 12725113
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12725168 tttatgcatatgaaatggacccactagtgtatatctacatacaacttgaccatgca 12725113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 29551042 - 29551097
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  29551042 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatttacatacaacatgaccatgca 29551097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 13313967 - 13313907
Alignment:
Q  65 gaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||||| |||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13313967 gaagccctcaccgct--tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 13313907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Original strand, 23173921 - 23173967
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23173921 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 23173967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 127
Target Start/End: Original strand, 12274375 - 12274435
Alignment:
Q  67 agccctctccgctgttttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  12274375 agccctccccgct-ttatatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 12274435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 127
Target Start/End: Original strand, 17512698 - 17512751
Alignment:
Q  75 ccgctgttttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17512698 ccgcttttatatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 17512751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 15935004 - 15934960
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  15935004 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 15934960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 37 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18499 - 18254
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18499 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcc 18400  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  18399 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttaaatcatcatcagtattcatcaatccagcaatccaatcaa 18300  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacactacaaca 282  Q
    ||| || |||||||||||| ||  |||||||| ||| || ||||||    
T  18299 ccaaaacaatgcataattaaatataactatgcccaaaacaacaaca 18254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0457
Description:

Target: scaffold0457; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 37 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 12307 - 12093
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12307 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 12208  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||  ||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||    
T  12207 atgcaactctatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattagcatacaattcaaccatcatcagtattcatcaacccagcaatccaatcaa 12108  T
Q  237 ccacaataatgcata 251  Q
    ||| || ||||||||    
T  12107 ccaaaacaatgcata 12093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 37 - 272
Target Start/End: Original strand, 104367 - 104602
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  104367 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 104466  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    ||||||||| || ||||||||||| || || |||||||| |||| | || ||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||    
T  104467 atgcaactcaatatgactccactttaataatatgtatgattcaacaattggcatacatttcaaccatcatcagtaatcattaatccagtaattcaatcaa 104566  T
Q  237 ccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaa 272  Q
    ||| ||||||||||||||| ||  ||| ||||||||    
T  104567 ccaaaataatgcataattatatataaccatgctcaa 104602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18603 - 18386
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18603 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccttgca 18504  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||||||  |  |||||| ||||  |||||||| |||||||| || |||||||  || |||    
T  18503 atgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcaataatcatcgatccagcaattcaaacaa 18405  T
Q  237 ccacaataatgcataatta 255  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  18404 ccaaaataatgcataatta 18386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 39 - 174
Target Start/End: Original strand, 50083 - 50219
Alignment:
Q  39 tgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaat 138  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50083 tgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaat 50182  T
Q  139 gcaactccatgtgactccacttaa-acaacatgtatg 174  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  50183 gcaactccatgtgactccaattaatacaacatgtatg 50219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Original strand, 13486 - 13625
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13486 gctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatccaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc 13585  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13586 aatgcaactccatgtgactccacttaaacgacatgtatga 13625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0279 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0279
Description:

Target: scaffold0279; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 5802 - 5663
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||   || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5802 gctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctcaccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 5703  T
Q  137 atgc-aactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 175  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5702 atgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 5663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Original strand, 31720 - 31858
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||  ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  31720 gctgttgagcaactagtactccaggacaaaagacctcaccgctgtttaatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttaaccatgc 31819  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 174  Q
    |    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31820 atacaaactccatatgactccacttaaacaacatgtatg 31858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Original strand, 19688 - 19824
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||   || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19688 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-attcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 19786  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 174  Q
        |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19787 tacaaactccatatgactccacttaaacaacatgtatg 19824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 23897 - 23760
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||   || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23897 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-attcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 23799  T
Q  136 aatgca-actccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 174  Q
     || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23798 -atacatactccatatgactccacttaaacaacatgtatg 23760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 512614 - 512478
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| ||| || ||   || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  512614 gctgttgagcaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 512516  T
Q  137 atgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 174  Q
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  512515 tacaaactccttgtgactccacttaaacaacatgtatg 512478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 179126 - 179181
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  179126 tttatgcatatgcaatggacccacttttgtatatctacatacaacttgaccatgca 179181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 488394 - 488350
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  488394 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 488350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 173
Target Start/End: Original strand, 25128 - 25255
Alignment:
Q  45 gcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaact 144  Q
    ||||||||| |||||| ||   || |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  25128 gcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgtaatggatcaacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc-atacaact 25226  T
Q  145 ccatgtgactccacttaaacaacatgtat 173  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25227 ccatgtgactccacataaacaacatgtat 25255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 1098 - 960
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||   || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1098 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttctatgcatatgcaatcgacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 999  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 174  Q
    |    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  998 atacaaactccatatgactccacttaaacaacatgtatg 960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 45 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 4710 - 4581
Alignment:
Q  45 gcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaact 144  Q
    ||||||||| |||||| ||   || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||    
T  4710 gcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcatacaaact 4612  T
Q  145 ccatgtgactccacttaaacaacatgtatga 175  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4611 ccttgtgactccacttaaataacatgtatga 4581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0320 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0320
Description:

Target: scaffold0320; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 282
Target Start/End: Original strand, 972 - 1219
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  972 gctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 1071  T
Q  136 aatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatg---actcaatactttgcatacatttcattcatcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaa 232  Q
    |    ||||||||  ||||||||||  ||||| ||||||   | | || |  |  |||||||  ||  |||||  |  | ||| ||||||||||||| ||    
T  1072 atacaaactccataggactccacttttacaacttgtatgtttatttaacaaat--catacatcacaaccatcaataacattcaacaattcagcaatctaa 1169  T
Q  233 tcaaccacaataatgcataattacatgaaactatgctcaacactacaaca 282  Q
    ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1170 tcatccagaataatgcataaatacatgaaactatgctcaacacaacaaca 1219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0276 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0276
Description:

Target: scaffold0276; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 101 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22101 - 21948
Alignment:
Q  101 cctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactcaatactttgcatacatttcatt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||  | |||||||  |||      
T  22101 cctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgacaccacttaaatgacatgtatgactcaataaatagcataca-atcaac 22003  T
Q  201 catcatcagtaatcatcaattcagcaatcaaatcaaccacaataatgcataatta 255  Q
    ||||||||||| ||   ||| ||||| || ||||||||| || ||||||| ||||    
T  22002 catcatcagtattcggtaatgcagcactccaatcaaccaaaacaatgcatgatta 21948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 82 - 182
Target Start/End: Original strand, 19337 - 19438
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactca 179  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  19337 tttatgcatatgaaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatgtgactccatttaaacaacatgtatgattca 19435  T
Q  180 ata 182  Q
    |||    
T  19436 ata 19438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 82 - 182
Target Start/End: Original strand, 15239 - 15340
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaacatgtatgactca 179  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  15239 tttacgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgatcatgca-tacatactccatgtgactccatttaaacaacatgtatgattca 15337  T
Q  180 ata 182  Q
    |||    
T  15338 ata 15340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0214 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0214
Description:

Target: scaffold0214; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15278 - 15141
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| | ||||||| |||||| ||   || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15278 gctgttgagtaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctatttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 15180  T
Q  136 aatgca-actccatgtgactccacttaaacaacatgtatg 174  Q
     || || || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15179 -atacatacaccatatgactccacttaaacaacatgtatg 15141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 70 - 174
Target Start/End: Original strand, 12972 - 13076
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatac-aactgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaac 167  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || || ||||||| |||||||||||| |||||    
T  12972 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaaattgaccatgc-atacatactccatatgactccacttatacaac 13069  T
Q  168 atgtatg 174  Q
    |||||||    
T  13070 atgtatg 13076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 107
Target Start/End: Original strand, 7825 - 7861
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctactt 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7825 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctactt 7861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 136
Target Start/End: Original strand, 736 - 802
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  736 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Original strand, 999 - 1045
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  999 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 1045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 182
Target Start/End: Original strand, 24759 - 24872
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactcca-cttaaacaa 166  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || || ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  24759 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtttatatctacatagaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccattttaaacaa 24856  T
Q  167 catgtatgactcaata 182  Q
    ||||||||| ||||||    
T  24857 catgtatgattcaata 24872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 70 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 65350 - 65246
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaac 167  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| |||||||||||  |||||    
T  65350 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatgaaactacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccacttttacaac 65253  T
Q  168 atgtatg 174  Q
    |||||||    
T  65252 atgtatg 65246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 136
Target Start/End: Original strand, 15182 - 15281
Alignment:
Q  37 gctgttgcgcaactagtactccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 135  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |    || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15182 gctgttgagcaactagtgctccaggaaatgagtcctccccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 15280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 136
Target Start/End: Original strand, 2126 - 2192
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2126 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 2192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 136
Target Start/End: Original strand, 9866 - 9932
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9866 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 9932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 184 - 239
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  184 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 51718 - 51672
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51718 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 51672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 74167 - 74112
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  74167 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 74112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 137199 - 137254
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  137199 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 137254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 101710 - 101599
Alignment:
Q  70 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaacaac 167  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||  || ||| |||||||||||| |||||    
T  101710 cctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacccactcgtg-atatctacatacaacatgaccatgc-atacatccttcatatgactccacttatacaac 101614  T
Q  168 atgtatgactcaata 182  Q
    |||||||| ||||||    
T  101613 atgtatgattcaata 101599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 20157 - 20102
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20157 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 20102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 30955 - 31010
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30955 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 31010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 247142 - 247197
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  247142 tttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 247197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 253656 - 253711
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  253656 tttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 253711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 136
Target Start/End: Original strand, 41353 - 41408
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 136  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41353 tttatgcatatgatatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 41408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 11981 - 11912
Alignment:
Q  56 tccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11981 tccaggaccgaggccctcaccgct--tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 11912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 24541 - 24472
Alignment:
Q  56 tccagtaccgaagccctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24541 tccaggaccgaggccctcaccgct--tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 24472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 10670 - 10626
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10670 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 10626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 18849 - 18805
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18849 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 18805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 185 - 139
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  185 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 5415 - 5377
Alignment:
Q  90 tatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5415 tatgcaatggactctacttgtgtatatctacatacaact 5377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Original strand, 7409 - 7455
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7409 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 7455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 36835 - 36789
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36835 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 36789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 41634 - 41588
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41634 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 41588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 10122 - 10076
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10122 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 10076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 20535 - 20489
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20535 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 20489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 14514 - 14469
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 126  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14514 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 14469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Original strand, 42090 - 42135
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 126  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  42090 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 42135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 50989 - 50948
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacata 122  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  50989 ttttatgcttatgcaactgacctacttgtgtatatctacata 50948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 126
Target Start/End: Original strand, 17637 - 17682
Alignment:
Q  81 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 126  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17637 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 17682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Original strand, 6293 - 6337
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  6293 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 6337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 4135 - 4091
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  4135 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 4091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 129
Target Start/End: Original strand, 19439 - 19487
Alignment:
Q  82 tttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaactga 129  Q
    ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  19439 tttatgcttatgcaatgaactccacttgtgtatatctacatacaactga 19487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 55956 - 55912
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  55956 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 55912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 38767 - 38723
Alignment:
Q  84 tatgcatatgcaatggacct-acttgtgtatatctacatacaact 127  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  38767 tatgcttatgcaatggacttcacttgtgtatatctacatacaact 38723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University